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Reference ( family-3519 ) : AGCCGGCTACTTCTCAGGTGGTTGAAGATCGAGGTAGTGATT--TAAACAATTAAATCACTGGTTAAAGTATAAACT--AAGGCAGACTCCGCTTTAG-ATA--------TCT-CAA------------------TTAAA----T--------AA----A--------GT-AGGAAAGCAAAAGAGTAAACAAGATTATGCTCAATTTTC-TATACTTTAA------------------------T--TGT-------------------------CA--A--GT-GTGA------GT-AA-----------------CATGAATA-ATAATAC-TACAAA-ATGC-CAAC-TTAAT-T-CACTTAAAATAGACCTAAATAAATCAGTTTCCCNAAAA-TGCCTATAAGTCT-G--TTT-T--TGCTCTATATTTATTACACTATGCTTAGAGCTAATTC-ATAAAATGTGTTNAATTATAAGCTTT-AGAAATTAAA-------AGTAT--TTAATACTAACTAAGACTTCCAAAGAAAGAGACACGGAACTTCAGGTGTATTTATAAAGAAA-ATGTGCGGAGNC-CA-GAA-T-TCAGTTTGCACTGACTATTTATACATAAACTGATCCCGCAAATAAAAGTGCTGGAATCCCACAACATA-ATAGT-A-GGACTCCCGAAAAATGACGTCGTGGACGTCGTCCCGAATAAAATATGTGGGAAATCCCGCAT-AAAAA-C-TGTGGGAACGTCGTCCAGCAAATAACGGGAACTCGNAATAAATTCTACTATTCC-AAAAATGCACGGTACCATCACCTTTAAACCAGTGATTAAACAC--T-AT----AAAT--------G--TAT-TAAAGTATTACAATAAACTTTATGAATNAAA-----AGAACAAATATTAAACTACAATTTCATACCTTTGTACTAATTTTGCATACATTNTAAAGTATTTA--TTTTAACAAAGA-A-AAACTTNGTCAGTAATGAATTCTGGAGCTGTTATGTATCCGGT--AACCTAGTA-A-----CAGGCTCCCATAATGCTTTACTACAA---CAACAACAAACATGGCTTCCTCAACAATGACAGGTGCTCTTTTGAAAGTGA-TAAATCGATTTAAAC-AAAATACATGTAGTTATGACTATGACATAAGATGATNACTGA-CACTAGATAAGGTAATTAAA--CTATGANTGAAATGATGATAGTAAAGATTTA-ACTTATTTAAGTAGACTTAGCTTGTAGAAATGGTTATAA-C-CTGCACCACTTGCGTATA---CAAAA-ATGTAAACAACAGCACATCTTACCG--GA-ATATCCGGGCATAAC
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gi|11 : aagtcggtcataaagcggcgtatgccggaaacgAGCCGATTAAGTCTCGGGTGTTTGAAGACCGGAG----GATTAATATATGAT--ATTCACTGGTTAAAGTATAATCT--AAAACGGACTGATTTTTAACATAAGTTTAATTCTTCAA------------------TTAAA----T--------AA----ACAACAAAAGT-AGGAAATCAATAGAGTAAACAAGATCATTTTGAATTTTC-TATAATTTAA------------------------T--GGT-------------------------CAATA--GTCATCA------GTGAA-----------------TATCTATACATTATCCATACAAGTGTGCATAACATGAATATATACCTAATATTGACCTAAATAAATCAATTTCTCTAAAA-Tt
gi|12 : agACTTATCGCAATATGCT---A---AATTT-TTAAACTTTGTTTTATT-TA--CTTTTAGATATTAAATGGCTAGAATATAATTAAAATTATCTAAGACTTACTAAAAAA-----ATGGATCTGCAAGTGAATTTACTATGAAATATATTCGATGTT-CTTGTA-T-TCAGTTTGCCCTGACTATTTATAAAAGCACCAATCATGCAAATAtc
gi|13 : AGTCGGGTACTTCTCAGGTGTTTGAAGATCGAAGTAGTGGTC--AAAACAGTTAAATTAATGGTTAAAATACAAACT--AAAG-AGGTCTCG----AG-ATACTAAC---TCT-TAA------------------ATAAACAACC--------AA----A--------GT-ATGTAATCAAACATGCGAAAATGATTATGTCAAATGTTC-TACCATTTAA------------------------TAATGC-------------------------CC--A--AT----A------GT-AA-----------------cagg
gi|14 : gTGACTATTACATAAGATGATTACTGA-C--TAGATAATGTCAATAAA--CTATTGTTGAAATGATGATAGTA------TATACATATTTAAGTAGAATTAGCTTGTAAAAATGGTTATAA-CTCTGCACCACTTTACTATAATTC-AAA-ATGTACACAACGGCACATCTTACCGAAGA-A-ATCCGGGACTAACtca
gi|15 : GT--AACCTAGCA-A-----CAAGCTCCCATAATACTTTACTACAA---CAACATCAAACATGGCTGCTAAAACAATGGCAGGAGTTCTTTTGAAAGAGAGT--GTCAATTTAAAC-AAAATACAAGTATTTATGACTATGa
gi|16 : gataacttacttttgagtgaagctaAGCCGGCCACTT-TCTAGTGATTGAAGA
gi|16 : T-TAA------------------TAAAA----T--------AACCAAA--------GT-AGGAAGTCAAAGGAATAAACAAGATAAT-TTCGATTTTCAAATCATTTAA------------------------T--GAT-------------------------CA--A--cttaaattaataaaataaccaaagtaggaagtcaaaggaataaacaagataatttcgattttcaaatcatttaatgatcaa
gi|17 : agccggccactttctagtgattgaagacttaaaTATTACAAATGATGGTTACTAA-C--TAGA-GAGGTAATTAAA--CTATGCTTGAAATGGTGAAAGTAAAGATTTG-AC
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Reference ( family-3519 ) : AGCCGGCTACTTCTCAGGTGGTTGAAGATCGAGGTAGTGATT--TAAACAATTAAATCACTGGTTAAAGTATAAACT--AAGGCAGACTCCGCTTTAG-ATA--------TCT-CAA------------------TTAAA----T--------AA----A--------GT-AGGAAAGCAAAAGAGTAAACAAGATTATGCTCAATTTTC-TATACTTTAA------------------------T--TGT-------------------------CA--A--GT-GTGA------GT-AA-----------------CATGAATA-ATAATAC-TACAAA-ATGC-CAAC-TTAAT-T-CACTTAAAATAGACCTAAATAAATCAGTTTCCCNAAAA-TGCCTATAAGTCT-G--TTT-T--TGCTCTATATTTATTACACTATGCTTAGAGCTAATTC-ATAAAATGTGTTNAATTATAAGCTTT-AGAAATTAAA-------AGTAT--TTAATACTAACTAAGACTTCCAAAGAAAGAGACACGGAACTTCAGGTGTATTTATAAAGAAA-ATGTGCGGAGNC-CA-GAA-T-TCAGTTTGCACTGACTATTTATACATAAACTGATCCCGCAAATAAAAGTGCTGGAATCCCACAACATA-ATAGT-A-GGACTCCCGAAAAATGACGTCGTGGACGTCGTCCCGAATAAAATATGTGGGAAATCCCGCAT-AAAAA-C-TGTGGGAACGTCGTCCAGCAAATAACGGGAACTCGNAATAAATTCTACTATTCC-AAAAATGCACGGTACCATCACCTTTAAACCAGTGATTAAACAC--T-AT----AAAT--------G--TAT-TAAAGTATTACAATAAACTTTATGAATNAAA-----AGAACAAATATTAAACTACAATTTCATACCTTTGTACTAATTTTGCATACATTNTAAAGTATTTA--TTTTAACAAAGA-A-AAACTTNGTCAGTAATGAATTCTGGAGCTGTTATGTATCCGGT--AACCTAGTA-A-----CAGGCTCCCATAATGCTTTACTACAA---CAACAACAAACATGGCTTCCTCAACAATGACAGGTGCTCTTTTGAAAGTGA-TAAATCGATTTAAAC-AAAATACATGTAGTTATGACTATGACATAAGATGATNACTGA-CACTAGATAAGGTAANTAAACTATGANTGAAATGATGATAGTAAAGATTTA-ACTTATTTAAGTAGACTTAGCTTGTAGAAATGGTTATAA-C-CTGCACCACTTGCGTATA---CAAAA-ATGTAAACAACAGCACATCTTACCG--GA-ATATCCGGGCATAAC
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gi|6 : TAATACTACAAAATGT---CAACT-TAAGTC------ACTTAAA-------AGTAT--TTAATAATGACTAAGACTTACAAAGAAAGAGACACGGAACTTCAGCTGAATTTATAAAGAAA-ATATGCAGAGTC-CT-GAA-TCTCAgtatttaataatgactaagacttacaaagaaagagacacggaacttcagctgaatttataaagaaaatatgcagagtcctgaatctcacgactcccaaaaaatgacgtcgtggacgtcgtcctgaataaaatatttgggaaattccgcataaaaaactgtgggaacgtcttccagcaaataacgggaactcgcaataaagtctactattcccaaaaatgcccagtaccaccacctttaaaccaggattaaacactattaatgtatcaaggtattgaaataaactttatgaattaaaataacaaatattaaactacaatttcataactttgaacttattttgcatacattattaagtatttattttagcgatacaactttatcagtaatgaattctggagctgttatgtatctggtaacctagtaacagactccaataatgcttttctacaacaacaacaaacatgacttcctcaactatgacaggtgctcttttgaaagtgatagatcgatttaaacaaaatacatgtagttatgaatatgacataagatgatcactgactagataaggtaaataaaaaatgaatgaaataatgatagtaaagatttaacttatttaagtagacttagcttgtagaaatggttataatctgcaccacttacatatacaaaaatggaaacaacagcacattttactggagaaatccag
gi|6 : gctactcctcaggtggttgaagatcgaggtagtgatttaaccaattaaatcactggtaaaagtataaactgagacagactccgctttaaatatctcaattaaaaaagtagcaacgcaaaagttatgctcaattttctatactttaattgccaatcatgtaaacattggtaatctacaagtgtgtgtaacatgaagaaACTTACAAAGAAA--------GAGACACG-GAACT-TCAG------CTGA--ATTTATAAAGAAAAT-AT---GCAGA-----GTCCTG-AATCTCAC----------------GACTCCCAAAAAATGACGTCGTGGACGTCGTCCTGAATAAAATATTTGGGAAATTCCGCAT-AAAAAAC-TGTGGGAACGTCTTCCAGCAAATAACGGGAACTCGCAATAAAGTCTACTATTCCCAAAAATGCCCAGTACCACCACCTTTAAACCAG-GATTAAACAC--T-AT----TAAT--------G--TAT-CAAGGTATTGAAATAAACTTTATGAATTAAA-----ATAACAAATATTAAACTACAATTTCATAACTTTGAACTTATTTTGCATACATTATTAAGTATTTA--TTTTAGC---GATA-CAACTTTATCAGTAATGAATTCTGGAGCTGTTATGTATCTGGT--AACCTAGTA-A-----CAGACTCCAATAATGCTTTTCTACAA---CAACAACAAACATGACTTCCTCAACTATGACAGGTGCTCTTTTGAAAGTGA-TAGATCGATTTAAAC-AAAATACATGTAGTTATGAATATGACATAAGATGATCACTG---ACTAGATAAGGTAAATAAAAAATGAATGAAATAATGATAGTAAAGATTTA-ACTTATTTAAGTAGACTTAGCTTGTAGAAATGGTTATAA-T-CTGCACCACTTACATATA---CAAAA-ATGGAAACAACAGCACATTTTACTG--GAGAAATCCAGcgactcccaaaaaatgacgtcgtggacgtcgtcctgaataaaatatttgggaaattccgcataaaaaactgtgggaacgtcttccagcaaataacgggaactcgcaataaagtctactattcccaaaaatgcccagtaccaccacctttaaaccaggattaaacactattaatgtatcaaggtattgaaataaactttatgaattaaaataacaaatattaaactacaatttcataactttgaacttattttgcatacattattaagtatttattttagcgatacaactttatcagtaatgaattctggagctgttatgtatctggtaacctagtaacagactccaataatgcttttctacaacaacaacaaacatgacttcctcaactatgacaggtgctcttttgaaagtgatagatcgatttaaacaaaatacatgtagttatgaatatgacataagatgatcactgactagataaggtaaataaaaaatgaatgaaataatgatagtaaagatttaacttatttaagtagacttagcttgtagaaatggttataatctgcaccacttacatatacaaaaatggaaacaacagcacattttactggagaaatccag
gi|7 : gctactcctcaggtggttgaagatcgaggtagtgatttaaccaattaaatcactggtaaaagtataaactgagacagactccgctttaaatatctcaattaaaaaagtagcaacgcaaaagttatgctcaattttctatactttaattgccaatcatgtaaacattggtaatctacaagtgtgtgtaacatgaagaataatactacaaaatgtcaacttaagtcacttaaaagtatttaataatgactaagAGCCAGCTACTTTTCAGGTGGTTGAAGATCAAGGTAGTGATT--TAAACTATTAAATCACTGGTTCAAGTATAAACTTAAAGGCAGACT--GCTTTAG-ATA--------TGT-CAC------------------TTAAA----T--------AA----A--------AT-AGGAAAGCAAAAGAGTAAACAAGATTATGCTCAATTTTC-TATACTTTAA------------------------T--TGTCAATCAGGTAATCATTAATAATCTACA--A--GT-GTGA------GT-TA-----------------CGTAAATA-ATATTAC-TACAAA-ATGC-CAAC-TTAAT-T-CACTTAAAATAGACCTAAATAAATCAGTTTCTCAAAAA-CGCCTATAAGTCT-G-------------CTATATTTATTACACTATGCTTAGAGCTAATTC-ATAAAATGTGTTAAATTATAAGCTTT-AGAAATTAAA-------AGTAT--TTAATACTAACTAAATCTTCCAAAGAAAGAGACACGGAACTTCAGGTGTATTTATAAAGAAA-ATGTGCGGAGAC-CA-GAA-T-TCAGTTTGCACTGACTATTTATACATAAACTGATCCCGCAAATAAAAGTGCTGGAATCCCACAACATA-ATAGTAA-GGACTCCCGAATAATGACGTTGTGAACGTCGTCCCGAATAAAATATGTGGGAAATACCGCATAAAAAA-C-TGTGGGAACATCGTCCAGCAAATAACGGGAACTCGGAATAAATTCTACTATTCC-AAAAATGCACGGTTCCATCAACTTTAAACCAGTGATTAAACATGATGAT----AACT--------GACTAGATAAGGTA----AA-AAACTT--TGAGTGAAATAATGATAGTAAAGATTTAACT
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Reference ( family-3519 ) : AGCCGGCTACTTCTCAGGTGGTTGAAGATCGAGGTAGTGATT--TAAACAATTAAATCACTGGTTAAAGTATAAACT--AAGGCAGACTCCGCTTTAG-ATA--------TCT-CAA------------------TTAAA----T--------AA----A--------GT-AGGAAAGCAAAAGAGTAAACAAGATTATGCTCAATTTTC-TATACTTTAA------------------------T--TGT-------------------------CA--A--GT-GTGA------GT-AA-----------------CATGAATA-ATAATAC-TACAAA-ATGC-CAAC-TTAAT-T-CACTTAAAATAGACCTAAATAAATCAGTTTCCCNAAAA-TGCCTATAAGTCTGC--TTT--TGCTCTATATTTATTACACTATGCTTAGAGCTAATTC-ATAAAATGTGTTNAATTATAAGCTTT-AGAAATTAAA-------AGTAT--TTAATACTAACTAAGACTTCCAAAGAAAGAGACACGGAACTTCAGGTGTATTTATAAAGAAA-ATGTGCGGAGNC-CA-GAA-T-TCAGTTTGCACTGACTATTTATACATAAACTGATCCCGCAAATAAAAGTGCTGGAATCCCACAACATAATAGTAAGGACTCCCGAAAAATGACGTCGTGGACGTCGTCCCGAATAAAATATGTGGGAAATCCCGCAT-AAAAA-CTGTGGGAACGTCGTCCAGCAAATAACGGGAACTCGNAATAAATTCTACTATTCC-AAAAATGCACGGTACCATCACCTTTAAACCAGTGATTAAACAC--T-A----TAAAT--------G--TAT-TAAAGTATTACAATAAACTTTATGAATNAAA-----AGAACAAATATTAAACTACAATTTCATACCTTTGTACTAATTTTGCATACATTNTAAAGTATTTA--TTTTAACAAAGA-A-AAACTTNGTCAGTAATGAATTCTGGAGCTGTTATGTATCCGGT--AACCTAGTA-A-----CAGGCTCCCATAATGCTTTACTACAA---CAACAACAAACATGGCTTCCTCAACAATGACAGGTGCTCTTTTGAAAGTGA-TAAATCGATTTAAAC-AAAATACATGTAGTTATGACTATGACATAAGATGATNACTGA-CACTAGATAAGGTAAATAAACTATGANTGAAATGATGATAGTAAAGATTTA-ACTTATTTAAGTAGACTTAGCTTGTAGAAATGGTTATAA-C-CTGCACCACTTGCGTATA---CAAAA-ATGTAAACAACAGCACATCTTACCG--GA-ATATCCGGGCATAAC
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gi|12 : agACTTATCGCAATATGCT---A---AATTT-TTAAACTTTGTTTTATT-TA--CTTTTAGATATTAAATGGCTAGAATATAATTAAAATTATCTAAGACTTACTAAAAAA-----ATGGATCTGCAAGTGAATTTACTATGAAATATATTCGATGTT-CTTGTA-T-TCAGTTTGCCCTGACTATTTATAAAAGCACCAATCATGCAAATAtc
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