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gi|8                          : taaatttgaatggtataatacatttataattgataaatgcatgcactagtttttcccccaatgaagtcagttgctactgtagggaaatttgcagaaaacatggattaatttaacaaaatatggaaaatctcaatcaaaagaaccgaattaaagctgtgttgcaatattgtgtttaaatttaacagtgtcatttttacatgattgttaaacttaatgaaaaatggttcaaaataaccaagtatcgcacttgccaatgatacagcatccgtgaattttgtaataaaacatgggacgtacaaaaaatgcaaatagcatatacatgtaaacaatgatttcgagcttaatgtccttccaacagctatgcaaatttgcaagtttgcaggagagtaattcttcaaaatgatgacatcccagatttaattatattccatgtcaatgtaacaatataccacaaataattatgttgacaggatttgatataaacaacgctatttatgatattattatgcatatttaactatggtttgaacatatagatgaaccacgttattttaatgctaaaagtgccatccatatctttcagctcacaggtgcagaaaagcacgtccaatttAC------GCA--CCTTTTT--GCAAATC---C----AA--AA--A-GTGTGCGCGC-TTTTTGT-CATCCGTATATA---GGA---ATA-AATTTGtatca
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acaatgggtgagccactAC------ACG--CTTTTTTTTACA--TC---GGTG-AATTAA--T--TGCACGTGC-TT-TTCTACATCCCTGTAAAG--TG-TACATCGAATTCTGTACTCGTA--AGCTCAAGATACGGCAaatgttttaatatgtttgtaattgatacatgtaagcactactgttaattttttattgaaatcgggtgctgctgtagataaaaatgcataaaacattatttttaacgcgtattaacaaaatacggaaaatcacaatcaaaatagataccagaaacaaactggagtattaaattttttatattagcatttgttataatttaacagtttaacgttta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                a--CTTTTTC--GCA--CCCCGCGTGAAA--AA--G-GTGTAAACGTATTTCTG--CACCCGTGTATA---actggct
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gtttcaagacacgtgtaagcaaatttgcagaattacaaaagatgttggtatcccagattttattttaattttacgtcaatataactacatgccaattttacgtcaatgtaccgagtatgccgcgaataaaatattgccaggatttggcgaatacaacgtaaccgcggtttggatatttaaccatggttttggttatagatggacaatgttatgtcaccattaaatgtattcattcccttttatttttatttacgaatgtcgtgtcttaagctaacgggtgcacac-AAATA--GATTCCCTTGTCAGGTATTTAAATTTAAACAAATATGAATGTTT-AATACG--TATAGGATCGCCAAATGTATATGCT----ACACTGTTTTATCC-AC--TGAAACCAGTTGCTGCTGAGCCTGTA--GAAATTTGTATAAAACATGAGTTTT-AAATGCGAA-TTAACAAAAT--ACAG------------------------------AAGCAAACTGAAGTCATAAA-----TGTGTTGCAGTAT-----TATT-TTATTTTAATTTA-ACAATG---TCG-TTTTTAT--TTTATTGTTGAAGGAACTTAATGAAAATCGGTTTCAAATAGCCGCGCGAACAGCA-CCGCCAGGC-----------ACCCGTGAATTTTCT----------TATA-ACATTTTCAA------------GT-TAAAC-ATTAC--ATAG--TGGGT-ATGTAAACGATGATTTTGAGCCAAG----TGAGCGTCA---------AGT----TGCTA-----Cagcgtactggctcactccgtgtttatcggtatttataaatatttgcct
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cttAATAAATTTGAATGTTTTAATATGTTTGTA--ATTGATACATGTAAGCACTACTGTTA---ATTTTT--TAT--TGAAATCGGGTGCTGCTGTA---G-A--TAAAAATGCATAAAACATTATTTTTAA--CGCGTA-TTAACAAAAT--ACGGA--AA-ATCACAAT-CAAAATAGATACCAGAAACAAACTGGAGTATTAAATTTTTTATATT-----AG-----CATT-T-GTTATAATTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acaatgggtgagccactacgcacctttttgcaaatccaaaaagtgtgcgcgctttttgtcatccgtatataggTAAATTTGAATGGTATAATACATTTATA--ATTGATAAATGCATGCACT------A---GTTTTTCCCCCAATGAAGTCAGTTGCTACTGTA---G-G--GAAATTTGCAGAAAACATGGATT----------AATTTAACAAAAT--ATGGA--AA-ATCTCAAT-CAAA--AGA--AC-----CGAATTAAAGC-----------TGTGTTGCA--AT------ATTGT-GTTTAAATTTA-ACAGTG---TCA-TTTTTA-CATGA-TTGTT----AAACTTAATGAAAAATGGTTCAAAATAACCAAGT--ATCGCACTTGC----CAATGATACAGCATCCGTGAATTTTGT----------AATA---------AA-ACATGGGA--CGTACAAA-AAATGCAAATAGCATATAC-ATGTAAACAAT-------------GATTTCGAGCTT-----------AATGTCCTTCCAACAGCTATGCAAATTTGCA-AGT---TTGCAGGA-GAGTAATTCTTCAAAATGATGAC--ATCCCAGA------TTTAATTATAT----TCCATGTCAATGTAACAATATAC----CACAAATAATTATGTTGaacagtttaacgttta
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TACGCT----T-----TTTTTTTCTTT--AGAAAC---TTGCT-TTAAA---C-ATGGATATT---ACAAAAT--------------GCAAA-A-AACAAAATCAACCGAAATAGATCTAAGTACCAG--AAAT---------AAACTGAATTAAGAAT-----TATGTT-----ATATTAGCATT-T-GTTTTA---TG-TAA-CGATTTCA-TTTTTACC-TTT-TTGTTGAATTAATTTAATG---------TTCAA--AACCGATAGAACGGCATCCacaggatttgatataaacaacgctatttatgatattattatgcatatttaactatggtttgaacatatagatgaaccacgttattttaatgctaaaagtgccatccatatctttcagctcacaggtgcagaaaagcacgtccaatttttttcacatggtgcgaaaaaggatatactggctcaaccctcattatca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTAATTTAACGA-TA---TCACGTTTGATC-TTT-TTATTGAAGGAACTTACCTAAAATCGGTTTCAAA-AAGCTAGTGAACAGCACCCGTCAGACAATGATACGACATCCGTGAATATTCTAAAAAAGAAAAATG--------CAAGACACGTGTGTCGTACAAA-ACTTGC--ATAG--TGTGT-GTGAAAACGAT-------------GATATTGTGTTTAATGGGCGGTCAAT----AGCT-------ATTAAAATTTGCAGAAT-------TGGAGGAG----TCATCTGAATGA--AAGTATCCCGGATGTACTTTTA-TT---T----T--ATGTCAATGTAACAATATAC----TACAAATAAGTATGTTG
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5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|15 ): ATACGATGTACACCATACGCGGGTGTGAAAAAGTGCATACCGGCTCACTCCTGTATTTCTGTAACCGTTTAAGATACATATCT
Unaligned ( gi|16 ): TTGCTGTAACATGATATCATAATTTACATTTATTACTTTTCTTTTTATTTTACGAGTGCCGTATTATGAGCTTACG
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Reference ( family-341 )      :                                                                                                                                     AAGTNT-A-GCACA-GGGAGTGGG---GTTGAAC------ACG--CTTTTTC--GCA--CC---CGTG-AA--AA--G-G--TGTACGCGC-TTTTTGNCATCCGTGTATA-TGATACATACAATTCGGCACCCGTGAACACATGATACGGCACCCGAAGAATCAAACTTATTCTCGGTGTNATATGAC-AAATAAGGATTCTCTTGTCAGGTATTTNAATTTAAATAAATTTGAATGTTTTAATACGTTTATAATTGATAAATGCATGCGCT----TCA---TTTTTTCCTNT--TGAAATCAGTTGCTGCTGAA---G-AGAAATTTGCATAAAACATGAGTTTT-A--C-----GCGAA-TTAACAAAAT--ACGGANA---ATCTCAGT-CAAG--AGAT-AC---AAGCAAACTGAAGTAATAAATATGTTGCA--ATCATT-T-GTTTTAATTTANN-A-TGTCATTTTT-ACCATTT-TTGTTGAAGGAACTTAATGAAAATCGGTTTCAAATAACCGAGTGAACGGCACCCGCCAGGCAATGATACGGCACCCGTGAATTTTCTAA----------T-G--CATTTTCAAACACG---G--CGTACAAACAANTGC--ATAG--TGGGT-ATGTAAACGATGAT-T----------T--------GT--GCNTCA---------AATTGCTACATGNAAATTTGCAGAAT---TCGCTGGA-GAGT-A-TTCN--TCAAAATGATANC--TATCCCAGA-----TT---TTAT-----TTT----TATGTCAATGTAAC-AATATAC----CACAAATAANTATGTTG
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gi|2                          :                                                                                                                                     AAGTATTA-GCACA-GGGGATGGG---GTTGAAC------ATG--CTTTTTC--GCA--CC---CGTG-AA--AA--G-G--CGTACACGC-TTATTGTCATCCCTATATA-TGATACATACAATTCGGCACCCTTGAACACCTGGTATGGCACCCGAAGAATCAAACTTATTCTCGGT-TTATATGAC-AAATAAAGATTCTCTTGTCAGGTATTTTAATTTAAATAAATCTGAATGTTTTAATACGGTTATAATTGAAAGATGCGTGCGCT----TCA---TTTTTTCCTGT--TGAAATCAGTTGCTGCTGAA---G-AGATATTTGCATAAAATATGAGTTTT-A--C-----GCGGA-TTAACAAAAT--ACGGATA---ATCTCGGT-CAAG--AGATGACGA-AAGCAAATTGAAGTAATAAATATGTT-----ATCATT-T-GTTTTAATTTGTT-A-TGTCAATTTT-ACCATTT-TTATTGAAGGAACTTAATGAAAATAGGTTTCAAATAACCGAGTGAAGAGCACCCGCCAGGCAATAATACGGAACCCGTGAATTTTCTGA----------T-GTTTATTTTCAAAC---------CGTACAAACAAATGC--ATAG--TGGGT-ATGTAAACGATG--------------T--------GT--GCATCA---------AATTTCTACATGCAAATTTGCAGAATCCGTCGCTGGA-GAGT-A-TTCA--TCAAAATGA-ACC--TATCCCAGA------T---TTAT-----TTT----TATGTCAGTTTAAC-AATATACCACGCACGAATATTTATGTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAAATTTGAATGGTATAATACATTTATAATTGATAAATGCATGCACT------A---GTTTTTCCCCCAATGAAGTCAGTTGCTACTGTA---G-GGAAATTTGCAGAAAACATGGATT---------------AATTTAACAAAAT--ATGGAAA---ATCTCAAT-CAAA--AG-------------AACCGAATTAA-AGCTGTGTTGCA--AT-ATTGT-GTTTAAATTTAAC-AGTGTCATTTTT-A-CATGA-TTGTT----AAACTTAATGAAAAATGGTTCAAAATAACCAAGT--ATCGCACTTGC----CAATGATACAGCATCCGTGAATTTTGTAA----------T-A---------AAACATG---GGACGTACAAA-AAATGCAAATAGCATATAC-ATGTAAACAATGAT-TTCGAGCTTAAT--------GT--CCTTCC---------AACAGCT--ATGCAAATTTGCA-AGT---TTGCAGGA-GAGTAA-TTCT--TCAAAATGATGAC---ATCCCAGA-----TTTAATTATA----TTC----CATGTCAATGTAAC-AATATAC----CACAAATAATTATGTTG
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gi|4                          : taaatttgaatggtataatacatttataattgataaatgcatgcactagtttttcccccaatgaagtcagttgctactgtagggaaatttgcagaaaacatggattaatttaacaaaatatggaaaatctcaatcaaaagaaccgaattaaagctgtgttgcaatattgtgtttaaatttaacagtgtcatttttacatgattgttaaacttaatgaaaaatggttcaaaataaccaagtatcgcacttgccaatgatacagcatccgtgaattttgtaataaaacatgggacgtacaaaaaatgcaaatagcatatacatgtaaacaatgatttcgagcttaatgtccttccaacagctatgcaaatttgcaagtttgcaggagagtaattcttcaaaatgatgacatcccagatttaattatattccatgtcaatgtaacaatataccacaaataattatgttgacaggatttgatataaacaacgctatttatgatattattatgcatatttaactatggtttgaacatatagatgaaccacgttattttaatgctaaaagtgccatccatatctttcagctTTAATTTAACGA-TATCACGTTTGATC-TTT-TTATTGAAGGAACTTACCTAAAATCGGTTTCAAA-AAGCTAGTGAACAGCACCCGTCAGACAATGATACGACATCCGTGAATATTCTAAAAAAGAAAAAT-G--CA-----AGACACGTGTGT-CGTACAAA-ACTTGC--ATAG--TGTGT-GTGAAAACGATGATAT----------T--------GT--GTTTAATGGGCGGTCAATAGCT--ATTAAAATTTGCAGAAT-------TGGAGGAG-----TCA--TCTGAATGA-AAG--TATCCCGGATGTACTT---TTA------TTT----TATGTCAATGTAAC-AATATAC----TACAAATAAGTATGTTGtcattatca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -AAATA--GATTCCCTTGTCAGGTATTTAAATTTAAACAAATATGAATGTTT-AATACGTATAGGATCGCCAAATGTATATGCT----ACACTGTTTTATCC-AC--TGAAACCAGTTGCTGCTGAGCCTGTAGAAATTTGTATAAAACATGAGTTTT-AAAT-----GCGAA-TTAACAAAAT--ACAGA-------------------------------AGCAAACTGAAGTCATAAATGTGTTGCAGTATTATT-TTATTTTAATTTAAC-AATGTCGTTTTT-AT--TTTATTGTTGAAGGAACTTAATGAAAATCGGTTTCAAATAGCCGCGCGAACAGCA-CCGCCA-----------GGCACCCGTGAATTTTCTTA----------TAA--CATTTTCAA------------GT-TAAAC-ATTAC--ATAG--TGGGT-ATGTAAACGATGAT-T----------TTGAGCCAAGTGAGCGTCA---------AGTTGCTACccaggattaggcaaatacattgctatttacgatattataatattataatgcatatttaacaatggttttaatatatgtaaataataaaatcgtaattcaccaaaatgggtgcactttgctatcacgtgatattatttatattttgttcctattcgttcta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cttGCAAATTTGCAGAAT---T-------------A--------CAAAA-GATGTTGGTATCCCAGA-----TT---TTATTTTAATTT----TACGTCAATATAAC-TACATGC----CA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtttcaagacacgtgtaa-----TTT----TACGTCAATGTACCGAGTATGC----CGCGAATAAA-ATATTGattttacgtcaatgtaccgagtatgccgcgaataaaatattgccaggatttggcgaatacaacgtaaccgcggtttggatatttaaccatggttttggttatagatggacaatgttatgtcaccattaaatgtattcattcccttttatttttatttacgaatgtcgtgtcttaagctaacgggtgcacactatacacgggtgcagaaatacgtttacacctttttcacgcggggtgcgaaaaagagcgtactggctcactccgtgtttatcggtatttataaatatttgcct
gi|6                          :                                                 gtttcaagacacgtgtaagcaaatttgcagaattacaaaagatgttggtatcccagattttattttaattttacgtcaatataactacatgccaaACA-CGGAGTGAG---CCAGTAC------GCT--CTTTTTC--GCA--CCCCGCGTGAAA--AA--G-G--TGTAAACGTATTTCTG-CACCCGTGTATAGTG-T------------GCACCCGTTAGCTTAAGACACGACATTCGTA-AATAAAAccaggatttggcgaatacaacgtaaccgcggtttggatatttaaccatggttttggttatagatggacaatgttatgtcaccattaaatgtattcattcccttttatttttatttacgaatgtcgtgtcttaagctaacgggtgcacactatacacgggtgcagaaatacgtttacacctttttcacgcggggtgcgaaaaagagcgtactggctcactccgtgtttatcggtatttataaatatttgcct
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acaatgggtgagccactacgcacctttttgcaaatccaaaaagtgtgcgcgctttttgtcatccgtatataggATATG---A--TGTACAAA-AGGTGT--ATAG--TGGATTATGAAAATGATG-T-T----------T---------------------------AATTGCTA--TGAAACTTTGTAGGAT---TC-----------------T--TCAAAATGATGGC--AATCC-AGA-----TT---TTAT-----TTTATTATATGTCAATGTTAC-AATATA------ACAAATAAGTATGTTGgtttaacgttta
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-341 )      :                                                                                                                                                   AAGTGTTAGCACAGGGAGTGGGGCTGAACGCGCTTTTTCGCA--CC-C---GTGAA--AA--G-G--TGTACGCGC-TTTTTGNCACCCGTGTATAGTGATACATACAATTCGGCACCCGTGAACACATGATACGGCACCCGAAGAATCAAACTTATTCTCGGT-TTATATGAC-AAATAAAGATTCTCTTGTCAGGTATTTTAATTTAAATAAATCTGAATGTTTTAATACGTTTATAATTGANAGATGCGTGCGCT----TCA---TTTTTTCCTGT--TGAAATCAGTTGCTGCTGAA---G-AGAAATTTGCATAAAACATGAGTTTT-A--C-----GCGAA-TTAACAAAAT--ACGGAAA---ATCTCGGT-CAAG--AGAT-AC--AAAGCAAACTGAAGTAATAAATATGTTGCA-T-ATCATT-T-GTTTTAATTTAAC-A-TGTCANTTTT-ACCATTT-TTGTTGAAGGAACTTAATGAAAATCGGTTTCAAATAACCGAGTGAACAGCACCCGCCAGGCAATGATACGGCACCCGTGAATTTTCT----------GATGTTCATTTTCAAACACG-G---CGTACAAACAANTGC--ATAG--TGGG-TATGTAAACGATGAT-T----------T--------GT--GCNTCA---------AATTGCTACATGCAAATTTGCAGAAT---TCGCTGGA-GAGT-A-TTCN--TCAAAATGATGNC--TATCCCAGA-----TT---TTAT-----TTT----TATGTCAATGTAACAATATAC----CACG----AATAANTATGTTG
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gi|15                         :                                                                                                                                                            aACAGG-AGTGAGCCGGTATGCACTTTTTCACA--CC-C---GCG-T--AT--G-G--TGTACgtactggct
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atacgatAGT-AACTCT--TCAAAATGGCGA---TATCCCAGA-----TT---TTA------TTT----TATTTC-ATGTatttctgtaaccgtttaagatacatatct
gi|2                          :                                                                                                                                                   AAGTATTAGCACAGGGGATGGGGTTGAACATGCTTTTTCGCA--CC-C---GTGAA--AA--G-G--CGTACACGC-TTATTGTCATCCCTATATA-TGATACATACAATTCGGCACCCTTGAACACCTGGTATGGCACCCGAAGAATCAAACTTATTCTCGGT-TTATATGAC-AAATAAAGATTCTCTTGTCAGGTATTTTAATTTAAATAAATCTGAATGTTTTAATACGGTTATAATTGAAAGATGCGTGCGCT----TCA---TTTTTTCCTGT--TGAAATCAGTTGCTGCTGAA---G-AGATATTTGCATAAAATATGAGTTTT-A--C-----GCGGA-TTAACAAAAT--ACGGATA---ATCTCGGT-CAAG--AGATGACG-AAAGCAAATTGAAGTAATAAATATGT-----T-ATCATT-T-GTTTTAATTTGTT-A-TGTCAATTTT-ACCATTT-TTATTGAAGGAACTTAATGAAAATAGGTTTCAAATAACCGAGTGAAGAGCACCCGCCAGGCAATAATACGGAACCCGTGAATTTTCT----------GATGTTTATTTTCAAAC--------CGTACAAACAAATGC--ATAG--TGGG-TATGTAAACGATG--------------T--------GT--GCATCA---------AATTTCTACATGCAAATTTGCAGAATCCGTCGCTGGA-GAGT-A-TTCA--TCAAAATGA-ACC--TATCCCAGA------T---TTAT-----TTT----TATGTCAGTTTAACAATATACCACGCACG----AATATTTATGTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAAATTTGAATGGTATAATACATTTATAATTGATAAATGCATGCACT------A---GTTTTTCCCCCAATGAAGTCAGTTGCTACTGTA---G-GGAAATTTGCAGAAAACATGGATT---------------AATTTAACAAAAT--ATGGAAA---ATCTCAAT-CAAA--AG-------------AACCGAATTAA-AGCTGTGTTGCA---AT-ATTGT-GTTTAAATTTAAC-AGTGTCATTTTT-A-CATGA-TTGTT----AAACTTAATGAAAAATGGTTCAAAATAACCAAGT--ATCGCACTTGC----CAATGATACAGCATCCGTGAATTTTGT----------AATA---------AAACATG-GGA-CGTACAAA-AAATGCAAATAGCATATA-CATGTAAACAATGAT-TTCGAGCTTAAT--------GT--CCTTCC---------AACAGCT--ATGCAAATTTGCA-AGT---TTGCAGGA-GAGTAA-TTCT--TCAAAATGATGAC---ATCCCAGA-----TTTAATTATA----TTC----CATGTCAATGTAACAATATAC----CACA----AATAATTATGTTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                   CTTTTTCGCA--CCAT---GTGAA--AA--A-AATTGGACGTGC-TTTTCTGCACCTGTGacaggatttgatataaacaacgctatttatgatattattatgcatatttaactatggtttgaacatatagatgaaccacgttattttaatgctaaaagtgccatccatatctttcagctcacaggtgcagaaaagcacgtccaatttttttcacatggtgcgaaaaaggatatactggctcaaccctcattatca
gi|4                          : taaatttgaatggtataatacatttataattgataaatgcatgcactagtttttcccccaatgaagtcagttgctactgtagggaaatttgcagaaaacatggattaatttaacaaaatatggaaaatctcaatcaaaagaaccgaattaaagctgtgttgcaatattgtgtttaaatttaacagtgtcatttttacatgattgttaaacttaatgaaaaatggttcaaaataaccaagtatcgcacttgccaatgatacagcatccgtgaattttgtaataaaacatgggacgtacaaaaaatgcaaatagcatatacatgtaaacaatgatttcgagcttaatgtccttccaacagctatgcaaatttgcaagtttgcaggagagtaattcttcaaaatgatgacatcccagatttaattatattccatgtcaatgtaacaatataccacaaataattatgttgacaggatttgatataaacaacgctatttatgatattattatgcatatttaactatggtttgaacatatagatgaaccacgttattttaatgctaaaagtgccatccatatctttcagctTTAATTTAACGA-TATCACGTTTGATC-TTT-TTATTGAAGGAACTTACCTAAAATCGGTTTCAAA-AAGCTAGTGAACAGCACCCGTCAGACAATGATACGACATCCGTGAATATTCTAAAAAAGAAAAATG--CA-----AGACACGTGTGTCGTACAAA-ACTTGC--ATAG--TGTG-TGTGAAAACGATGATAT----------T--------GT--GTTTAATGGGCGGTCAATAGCT--ATTAAAATTTGCAGAAT-------TGGAGGAG-----TCA--TCTGAATGA-AAG--TATCCCGGATGTACTT---TTA------TTT----TATGTCAATGTAACAATATAC----TACA----AATAAGTATGTTGgatatactggctcaaccctcattatca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -AAATA--GATTCCCTTGTCAGGTATTTAAATTTAAACAAATATGAATGTTT-AATACGTATAGGATCGCCAAATGTATATGCT----ACACTGTTTTATCC-AC--TGAAACCAGTTGCTGCTGAGCCTGTAGAAATTTGTATAAAACATGAGTTTT-AAAT-----GCGAA-TTAACAAAAT--ACAGAA-------------------------------GCAAACTGAAGTCATAAATGTGTTGCAGT-ATTATT-TTATTTTAATTTAACAA-TGTCGTTTTT-AT--TTTATTGTTGAAGGAACTTAATGAAAATCGGTTTCAAATAGCCGCGCGAACAGCA-CCGCCA-----------GGCACCCGTGAATTTTCT----------TATA-ACATTTTCAA-----------GT-TAAAC-ATTAC--ATAG--TGGG-TATGTAAACGATGAT-T----------TTGAGCCAAGTGAGCGTCA---------AGTTGCTACccaggattaggcaaatacattgctatttacgatattataatattataatgcatatttaacaatggttttaatatatgtaaataataaaatcgtaattcaccaaaatgggtgcactttgctatcacgtgatattatttatattttgttcctattcgttcta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cttGCAAATTTGCAGAAT---T-------------A--------CAAAA-GATGTTGGTATCCCAGA-----TT---TTATTTTAATTT----TACGTCAATATAACTACATGC----CA
gi|6                          :                                                                                                                                           gtttcaagacacgtgtaaACACGGAGTGAGCCAGTACGCTCTTTTTCGCA--CC-CCGCGTGAA--AAA-G-G--TGTAAACGTATTTCTG-CACCCGTGTATAGTG-T------------GCACCCGTTAGCTTAAGACACGACATTCGTA-AATAAAAattttacgtcaatgtaccgagtatgccgcgaataaaatattgccaggatttggcgaatacaacgtaaccgcggtttggatatttaaccatggttttggttatagatggacaatgttatgtcaccattaaatgtattcattcccttttatttttatttacgaatgtcgtgtcttaagctaacgggtgcacactatacacgggtgcagaaatacgtttacacctttttcacgcggggtgcgaaaaagagcgtactggctcactccgtgtttatcggtatttataaatatttgcct
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gtttcaagacacgtgtaagcaaatttgcagaattacaaaagatgttggtatcccagattttattttaattttacgtcaatataactacatgccaattttacgtcaatgtaccgagtatgccgcgaataaaatattgccaggatttggcgaatacaacgtaaccgcggtttggatatttaaccatggttttggttatagatggacaatgttatgtcaccattaaatgtattcattcccttttat---TTGCAGCA-AAGT-A-TTTTATTTGAAATTAAGGC---ATTCCAGA-----TT---TGAT-----TTT----ATTGT--ATGTCACAATATGT----AAT-----AATAAGTATGTTGttatcggtatttataaatatttgcct
gi|8                          :                                                                                                                                                     atagaaattaaaacattacattacaACGCACCTTTTTGCAAATC-C------AA--AA--A-G--TGTGCGCGC-TTTTTGTCATCCGTATATAGGAATAAATccagaattggcaaatacaagcaattttcaatattttaaataattcgcatttaaccgtggtttggatatagatggacaatataaatgaaccatatagatggaccgatctataattgacatgggtggaaattgctgtaacgatataacttacattaaatatgttccttttctttttattaacaagtccgtatctcgagctttcggatgcaga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acaatgggtgagccactAATAAATTTGAATGTTTTAATATGTTTGTAATTGATACATGTAAGCACTACTGTTA---ATTTTT--TAT--TGAAATCGGGTGCTGCTGTA---G-ATAAAAATGCATAAAACATTATTTTTAA--C-----GCGTA-TTAACAAAAT--ACGGAAA---ATCACAAT-CAAAATAGAT-ACCAGAAACAAACTGGAGTATTAAATTTTTTATATT-AGCATT-T-GTTATAATTTAAC-A-ttgaatgttttaatatgtttgtaattgatacatgtaagcactactgttaattttttattgaaatcgggtgctgctgtagataaaaatgcataaaacattatttttaacgcgtattaacaaaatacggaaaatcacaatcaaaatagataccagaaacaaactggagtattaaattttttatattagcatttgttataatttaacagtttaacgttta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acaatgggtgagccactacgcacctttttgcaaatccaaaaagtgtgcgcgctttttgtcatccgtatataggATATG-A---TGTACAAA-AGGTGT--ATAG--TGGATTATGAAAATGATG-T-T----------T---------------------------AATTGCT--ATGAAACTTTGTAGG-------------------A-TTCT--TCAAAATGATGGC--AAT-CCAGA-----TT---TTAT-----TTTATTATATGTCAATGTTACAATATA------ACA----AATAAGTATGTTGgtttaacgttta
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): TTGCTGTAACATGATATCATAATTTACATTTATTACTTTTCTTTTTATTTTACGAGTGCCGTATTATGAGCTTACG
Unaligned ( gi|18 ): TCTAATACAATTTTGAGTCGAAAACAGCATGTGTTA






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Reference ( family-341 )      :                                                                                                                                                AAGTATTAGCACAGGGAGTGGGNCTGNACGCGCTTTTTC--GCA--CC-C---GTGAA--AA--G-G--TGTACGCGC-TTTTTGNCACCCGTGTATAGTGATACATACAATTCGGCACCCGTGAACACATGATACGGCACCCGAAGAATCAAACTTATTCTCGGT-TTATATGAC-AAATAAAGATTCTCTTGTCAGGTATTTTAATTTAAATAAATCTGAATGTTTTAATACGTTTATAATTGANAGATGCGTGCGCT----TCA---TTTTTTCCTGT--TGAAATCAGTTGCTGCTGAA---G-AGAAATTTGCATAAAACATGAGTTTT-A--C-----GCGAA-TTAACAAAAT--ACGGAAA---ATCTCGGTCAAG--AGAT-AC--G-AA-GCAAACTGAAGTAATAAATATGTTGCA-T-ATCATT-T-GTTTTAATTTAAC-A-TGTCANTTTT-ACCATTT-TTGTTGAAGGAACTTAATGAAAATCGGTTTCAAATAACCGAGTGAACAGCACCCGCCAGGCAATGATACGGCACCCGTGAATTTTCT----------GATGTTCATTTTCAAACACG-G---CGTACAAACAANTGC--ATAG--TGGG-TATGTAAACGATGAT-T----------T--------GT--GCNTCA---------AATTGCTACATGCAAATTTGCAGAAT---TCGCTGGA-GAGT-A-TTCN--TCAAAATGATGNC--TATCCCAGA-----TT---TTAT-----TTT----TATGTCAATGTAACAATATAC----CACG----AATAANTATGTTG
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gi|15                         :                                                                                                                                                         aACAGG-AGTGAGCCGGTATGCACTTTTTC--ACA--CC-C---GCG-T--AT--G-G--TGTACt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atacgatAGT-AACTCT--TCAAAATGGCGA---TATCCCAGA-----TT---TTA------TTT----TATTTC-ATGTatttctgtaaccgtttaagatacatatct
gi|2                          :                                                                                                                                                AAGTATTAGCACAGGGGATGGGGTTGAACATGCTTTTTC--GCA--CC-C---GTGAA--AA--G-G--CGTACACGC-TTATTGTCATCCCTATATA-TGATACATACAATTCGGCACCCTTGAACACCTGGTATGGCACCCGAAGAATCAAACTTATTCTCGGT-TTATATGAC-AAATAAAGATTCTCTTGTCAGGTATTTTAATTTAAATAAATCTGAATGTTTTAATACGGTTATAATTGAAAGATGCGTGCGCT----TCA---TTTTTTCCTGT--TGAAATCAGTTGCTGCTGAA---G-AGATATTTGCATAAAATATGAGTTTT-A--C-----GCGGA-TTAACAAAAT--ACGGATA---ATCTCGGTCAAG--AGATGAC--GAAA-GCAAATTGAAGTAATAAATATGT-----T-ATCATT-T-GTTTTAATTTGTT-A-TGTCAATTTT-ACCATTT-TTATTGAAGGAACTTAATGAAAATAGGTTTCAAATAACCGAGTGAAGAGCACCCGCCAGGCAATAATACGGAACCCGTGAATTTTCT----------GATGTTTATTTTCAAAC--------CGTACAAACAAATGC--ATAG--TGGG-TATGTAAACGATG--------------T--------GT--GCATCA---------AATTTCTACATGCAAATTTGCAGAATCCGTCGCTGGA-GAGT-A-TTCA--TCAAAATGA-ACC--TATCCCAGA------T---TTAT-----TTT----TATGTCAGTTTAACAATATACCACGCACG----AATATTTATGTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAATTTGAATGGTATAATACATTTATAATTGATAAATGCATGCACT------A---GTTTTTCCCCCAATGAAGTCAGTTGCTACTGTA---G-GGAAATTTGCAGAAAACATGGATT---------------AATTTAACAAAAT--ATGGAAA---ATCTCAATCAAA--AG---------------AACCGAATTAA-AGCTGTGTTGCA---AT-ATTGT-GTTTAAATTTAAC-AGTGTCATTTTT-A-CATGA-TTGTT----AAACTTAATGAAAAATGGTTCAAAATAACCAAGT--ATCGCACTTGC----CAATGATACAGCATCCGTGAATTTTGT----------AATA---------AAACATG-GGA-CGTACAAA-AAATGCAAATAGCATATA-CATGTAAACAATGAT-TTCGAGCTTAAT--------GT--CCTTCC---------AACAGCT--ATGCAAATTTGCA-AGT---TTGCAGGA-GAGTAA-TTCT--TCAAAATGATGAC---ATCCCAGA-----TTTAATTATA----TTC----CATGTCAATGTAACAATATAC----CACA----AATAATTATGTTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                CTTTTTC--GCA--CCAT---GTGAA--AA--A-AATTGGACGTGC-TTTTCTGCACCTGTGacaggatttgatataaacaacgctatttatgatattattatgcatatttaactatggtttgaacatatagatgaaccacgttattttaatgctaaaagtgccatccatatctttcagctcacaggtgcagaaaagcacgtccaatttttttcacatggtgcgaaaaaggatatactggctcaaccctcattatca
gi|4                          : taaatttgaatggtataatacatttataattgataaatgcatgcactagtttttcccccaatgaagtcagttgctactgtagggaaatttgcagaaaacatggattaatttaacaaaatatggaaaatctcaatcaaaagaaccgaattaaagctgtgttgcaatattgtgtttaaatttaacagtgtcatttttacatgattgttaaacttaatgaaaaatggttcaaaataaccaagtatcgcacttgccaatgatacagcatccgtgaattttgtaataaaacatgggacgtacaaaaaatgcaaatagcatatacatgtaaacaatgatttcgagcttaatgtccttccaacagctatgcaaatttgcaagtttgcaggagagtaattcttcaaaatgatgacatcccagatttaattatattccatgtcaatgtaacaatataccacaaataattatgttgacaggatttgatataaacaacgctatttatgatattattatgcatatttaactatggtttgaacatatagatgaaccacgttattttaatgctaaaagtgccatccatatctttcagctTTAATTTAACGA-TATCACGTTTGATC-TTT-TTATTGAAGGAACTTACCTAAAATCGGTTTCAAA-AAGCTAGTGAACAGCACCCGTCAGACAATGATACGACATCCGTGAATATTCTAAAAAAGAAAAATG--CA-----AGACACGTGTGTCGTACAAA-ACTTGC--ATAG--TGTG-TGTGAAAACGATGATAT----------T--------GT--GTTTAATGGGCGGTCAATAGCT--ATTAAAATTTGCAGAAT-------TGGAGGAG-----TCA--TCTGAATGA-AAG--TATCCCGGATGTACTT---TTA------TTT----TATGTCAATGTAACAATATAC----TACA----AATAAGTATGTTGgatatactggctcaaccctcattatca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -AAATA--GATTCCCTTGTCAGGTATTTAAATTTAAACAAATATGAATGTTT-AATACGTATAGGATCGCCAAATGTATATGCT----ACACTGTTTTATCC-AC--TGAAACCAGTTGCTGCTGAGCCTGTAGAAATTTGTATAAAACATGAGTTTT-AAAT-----GCGAA-TTAACAAAAT--ACAGAA--------------------------------GCAAACTGAAGTCATAAATGTGTTGCAGT-ATTATT-TTATTTTAATTTAACAA-TGTCGTTTTT-AT--TTTATTGTTGAAGGAACTTAATGAAAATCGGTTTCAAATAGCCGCGCGAACAGCA-CCGCCA-----------GGCACCCGTGAATTTTCT----------TATA-ACATTTTCAA-----------GT-TAAAC-ATTAC--ATAG--TGGG-TATGTAAACGATGAT-T----------TTGAGCCAAGTGAGCGTCA---------AGTTGCTACccaggattaggcaaatacattgctatttacgatattataatattataatgcatatttaacaatggttttaatatatgtaaataataaaatcgtaattcaccaaaatgggtgcactttgctatcacgtgatattatttatattttgttcctattcgttcta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cttGCAAATTTGCAGAAT---T-------------A--------CAAAA-GATGTTGGTATCCCAGA-----TT---TTATTTTAATTT----TACGTCAATATAACTACATGC----CA
gi|6                          :                                                                                                                                        gtttcaagacacgtgtaaACACGGAGTGAGCCAGTACGCTCTTTTTC--GCA--CC-CCGCGTGAA--AAA-G-G--TGTAAACGTATTTCTG-CACCCGTGTATAGTG-T------------GCACCCGTTAGCTTAAGACACGACATTCGTA-AATAAAAattttacgtcaatgtaccgagtatgccgcgaataaaatattgccaggatttggcgaatacaacgtaaccgcggtttggatatttaaccatggttttggttatagatggacaatgttatgtcaccattaaatgtattcattcccttttatttttatttacgaatgtcgtgtcttaagctaacgggtgcacactatacacgggtgcagaaatacgtttacacctttttcacgcggggtgcgaaaaagagcgtactggctcactccgtgtttatcggtatttataaatatttgcct
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gtttcaagacacgtgtaagcaaatttgcagaattacaaaagatgttggtatcccagattttattttaattttacgtcaatataactacatgccaattttacgtcaatgtaccgagtatgccgcgaataaaatattgccaggatttggcgaatacaacgtaaccgcggtttggatatttaaccatggttttggttatagatggacaatgttatgtcaccattaaatgtattcattcccttttat---TTGCAGCA-AAGT-A-TTTTATTTGAAATTAAGGC---ATTCCAGA-----TT---TGAT-----TTT----ATTGT--ATGTCACAATATGT----AAT-----AATAAGTATGTTGttatcggtatttataaatatttgcct
gi|8                          :                                                                                                                                 atagaaattaaaacattacattacaACAATGGGTGAGCCACTACGCACCTTTTT--GCAAATC-C------AA--AA--A-G--TGTGCGCGC-TTTTTGTCATCCGTATATAGGAATAAATccagaattggcaaatacaagcaattttcaatattttaaataattcgcatttaaccgtggtttggatatagatggacaatataaatgaaccatatagatggaccgatctataattgacatgggtggaaattgctgtaacgatataacttacattaaatatgttccttttctttttattaacaagtccgtatctcgagctttcggatgcaga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATAAATTTGAATGTTTTAATATGTTTGTAATTGATACATGTAAGCACTACTGTTA---ATTTTT--TAT--TGAAATCGGGTGCTGCTGTA---G-ATAAAAATGCATAAAACATTATTTTTAA--C-----GCGTA-TTAACAAAAT--ACGGAAA---ATCACAATCAAAATAGAT-ACCAG-AA-ACAAACTGGAGTATTAAATTTTTTATATT-AGCATT-T-GTTATAATTTAAC-A-ttgaatgttttaatatgtttgtaattgatacatgtaagcactactgttaattttttattgaaatcgggtgctgctgtagataaaaatgcataaaacattatttttaacgcgtattaacaaaatacggaaaatcacaatcaaaatagataccagaaacaaactggagtattaaattttttatattagcatttgttataatttaacagtttaacgttta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acaatgggtgagccactacgcacctttttgcaaatccaaaaagtgtgcgcgctttttgtcatccgtatataggATATG-A---TGTACAAA-AGGTGT--ATAG--TGGATTATGAAAATGATG-T-T----------T---------------------------AATTGCT--ATGAAACTTTGTAGG-------------------A-TTCT--TCAAAATGATGGC--AAT-CCAGA-----TT---TTAT-----TTTATTATATGTCAATGTTACAATATA------ACA----AATAAGTATGTTGgtttaacgttta
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): TTGCTGTAACATGATATCATAATTTACATTTATTACTTTTCTTTTTATTTTACGAGTGCCGTATTATGAGCTTACG
Unaligned ( gi|18 ): TCTAATACAATTTTGAGTCGAAAACAGCATGTGTTA






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Reference ( family-341 )      :                                                                                                                                                AAGTATTAGCACAGGGGGTGGGCCGGTACGCGCTTTTTC--GCA--CC---CGTG-AA--AA--G-G--TGTACGCGC-TTTTTGNCACCCGTGTATAGTGATACATACAATTCGGCACCCGTGAACACATGATACGGCACCCGAAGAATCAAACTTATTCTCGGT-TTATATGAC-AAATAAAGATTCTCTTGTCAGGTATTTTAATTTAAATAAATCTGAATGTTTTAATACGTTTATAATTGANAGATGCGTGCGCT----TCA---TTTTTTCCTGT--TGAAATCAGTTGCTGCTGAA---G-AGAAATTTGCATAAAACATGAGTTTT-A--C-----GCGAA-TTAACAAAAT--ACGGAAA---ATCTCGGTCAAG--AGAT-AC--G-AA-GCAAACTGAAGTAATAAATATGTTGCA-T-ATCATT-T-GTTTTAATTTAAC-A-TGTCANTTTT-ACCATTT-TTGTTGAAGGAACTTAATGAAAATCGGTTTCAAATAACCGAGTGAACAGCACCCGCCAGGCAATGATACGGCACCCGTGAATTTTCT----------GATGTTCATTTTCAAACACG-G---CGTACAAACAANTGC--ATAG--TGGG-TATGTAAACGATGAT-T----------T--------GT--GCNTCA---------AATTGCTACATGCAAATTTGCAGAAT---TCGCTGGA-GAGT-A-TTCN--TCAAAATGATGNC--TATCCCAGA-----TT---TTAT-----TTT----TATGTCAATGTAACAATATAC----CACG----AATAANTATGTTG
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gi|15                         :                                                                                                                                                         aACAGGAG-TGAGCCGGTATGCACTTTTTC--ACA--CC---CGCG--T--AT--G-G--TGTACt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atacgatAGT-AACTCT--TCAAAATGGCGA---TATCCCAGA-----TT---TTA------TTT----TATTTC-ATGTatttctgtaaccgtttaagatacatatct
gi|2                          :                                                                                                                                                AAGTATTAGCACAGGGGATGGGGTTGAACATGCTTTTTC--GCA--CC---CGTG-AA--AA--G-G--CGTACACGC-TTATTGTCATCCCTATATA-TGATACATACAATTCGGCACCCTTGAACACCTGGTATGGCACCCGAAGAATCAAACTTATTCTCGGT-TTATATGAC-AAATAAAGATTCTCTTGTCAGGTATTTTAATTTAAATAAATCTGAATGTTTTAATACGGTTATAATTGAAAGATGCGTGCGCT----TCA---TTTTTTCCTGT--TGAAATCAGTTGCTGCTGAA---G-AGATATTTGCATAAAATATGAGTTTT-A--C-----GCGGA-TTAACAAAAT--ACGGATA---ATCTCGGTCAAG--AGATGAC--GAAA-GCAAATTGAAGTAATAAATATGT-----T-ATCATT-T-GTTTTAATTTGTT-A-TGTCAATTTT-ACCATTT-TTATTGAAGGAACTTAATGAAAATAGGTTTCAAATAACCGAGTGAAGAGCACCCGCCAGGCAATAATACGGAACCCGTGAATTTTCT----------GATGTTTATTTTCAAAC--------CGTACAAACAAATGC--ATAG--TGGG-TATGTAAACGATG--------------T--------GT--GCATCA---------AATTTCTACATGCAAATTTGCAGAATCCGTCGCTGGA-GAGT-A-TTCA--TCAAAATGA-ACC--TATCCCAGA------T---TTAT-----TTT----TATGTCAGTTTAACAATATACCACGCACG----AATATTTATGTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAATTTGAATGGTATAATACATTTATAATTGATAAATGCATGCACT------A---GTTTTTCCCCCAATGAAGTCAGTTGCTACTGTA---G-GGAAATTTGCAGAAAACATGGATT---------------AATTTAACAAAAT--ATGGAAA---ATCTCAATCAAA--AG---------------AACCGAATTAA-AGCTGTGTTGCA---AT-ATTGT-GTTTAAATTTAAC-AGTGTCATTTTT-A-CATGA-TTGTT----AAACTTAATGAAAAATGGTTCAAAATAACCAAGT--ATCGCACTTGC----CAATGATACAGCATCCGTGAATTTTGT----------AATA---------AAACATG-GGA-CGTACAAA-AAATGCAAATAGCATATA-CATGTAAACAATGAT-TTCGAGCTTAAT--------GT--CCTTCC---------AACAGCT--ATGCAAATTTGCA-AGT---TTGCAGGA-GAGTAA-TTCT--TCAAAATGATGAC---ATCCCAGA-----TTTAATTATA----TTC----CATGTCAATGTAACAATATAC----CACA----AATAATTATGTTG
gi|3                          :                                                                                                                                                              GGGTTGAGCCAGTATATCCTTTTTC--GCA--CCA--TGTG-AA--AA--A-AATTGGACGTGC-TTTTCTGCACCTGTGacaggatttgatataaacaacgctatttatgatattattatgcatatttaactatggtttgaacatatagatgaaccacgttattttaatgctaaaagtgccatccatatctttcagctcacaggtgcagaaaagcacgtccaatttttttcacatggtgcgaaaaaggatatactggctcaaccctcattatca
gi|4                          : taaatttgaatggtataatacatttataattgataaatgcatgcactagtttttcccccaatgaagtcagttgctactgtagggaaatttgcagaaaacatggattaatttaacaaaatatggaaaatctcaatcaaaagaaccgaattaaagctgtgttgcaatattgtgtttaaatttaacagtgtcatttttacatgattgttaaacttaatgaaaaatggttcaaaataaccaagtatcgcacttgccaatgatacagcatccgtgaattttgtaataaaacatgggacgtacaaaaaatgcaaatagcatatacatgtaaacaatgatttcgagcttaatgtccttccaacagctatgcaaatttgcaagtttgcaggagagtaattcttcaaaatgatgacatcccagatttaattatattccatgtcaatgtaacaatataccacaaataattatgttgacaggatttgatataaacaacgctatttatgatattattatgcatatttaactatggtttgaacatatagatgaaccacgttattttaatgctaaaagtgccatccatatctttcagctTTAATTTAACGA-TATCACGTTTGATC-TTT-TTATTGAAGGAACTTACCTAAAATCGGTTTCAAA-AAGCTAGTGAACAGCACCCGTCAGACAATGATACGACATCCGTGAATATTCTAAAAAAGAAAAATG--CA-----AGACACGTGTGTCGTACAAA-ACTTGC--ATAG--TGTG-TGTGAAAACGATGATAT----------T--------GT--GTTTAATGGGCGGTCAATAGCT--ATTAAAATTTGCAGAAT-------TGGAGGAG-----TCA--TCTGAATGA-AAG--TATCCCGGATGTACTT---TTA------TTT----TATGTCAATGTAACAATATAC----TACA----AATAAGTATGTTGtcattatca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -AAATA--GATTCCCTTGTCAGGTATTTAAATTTAAACAAATATGAATGTTT-AATACGTATAGGATCGCCAAATGTATATGCT----ACACTGTTTTATCC-AC--TGAAACCAGTTGCTGCTGAGCCTGTAGAAATTTGTATAAAACATGAGTTTT-AAAT-----GCGAA-TTAACAAAAT--ACAGAA--------------------------------GCAAACTGAAGTCATAAATGTGTTGCAGT-ATTATT-TTATTTTAATTTAACAA-TGTCGTTTTT-AT--TTTATTGTTGAAGGAACTTAATGAAAATCGGTTTCAAATAGCCGCGCGAACAGCA-CCGCCA-----------GGCACCCGTGAATTTTCT----------TATA-ACATTTTCAA-----------GT-TAAAC-ATTAC--ATAG--TGGG-TATGTAAACGATGAT-T----------TTGAGCCAAGTGAGCGTCA---------AGTTGCTACccaggattaggcaaatacattgctatttacgatattataatattataatgcatatttaacaatggttttaatatatgtaaataataaaatcgtaattcaccaaaatgggtgcactttgctatcacgtgatattatttatattttgttcctattcgttcta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cttGCAAATTTGCAGAAT---T-------------A--------CAAAA-GATGTTGGTATCCCAGA-----TT---TTATTTTAATTT----TACGTCAATATAACTACATGC----CA
gi|6                          :                                                                                                                                        gtttcaagacacgtgtaaACACGGAGTGAGCCAGTACGCTCTTTTTC--GCA--CCCCGCGTGAAA--AA--G-G--TGTAAACGTATTTCTG-CACCCGTGTATAGTG-T------------GCACCCGTTAGCTTAAGACACGACATTCGTA-AATAAAAattttacgtcaatgtaccgagtatgccgcgaataaaatattgccaggatttggcgaatacaacgtaaccgcggtttggatatttaaccatggttttggttatagatggacaatgttatgtcaccattaaatgtattcattcccttttatttttatttacgaatgtcgtgtcttaagctaacgggtgcacactatacacgggtgcagaaatacgtttacacctttttcacgcggggtgcgaaaaagagcgtactggctcactccgtgtttatcggtatttataaatatttgcct
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gtttcaagacacgtgtaagcaaatttgcagaattacaaaagatgttggtatcccagattttattttaattttacgtcaatataactacatgccaattttacgtcaatgtaccgagtatgccgcgaataaaatattgccaggatttggcgaatacaacgtaaccgcggtttggatatttaaccatggttttggttatagatggacaatgttatgtcaccattaaatgtattcattcccttttat---TTGCAGCA-AAGT-A-TTTTATTTGAAATTAAGGC---ATTCCAGA-----TT---TGAT-----TTT----ATTGT--ATGTCACAATATGT----AAT-----AATAAGTATGTTGttatcggtatttataaatatttgcct
gi|8                          :                                                                                                                                 atagaaattaaaacattacattacaACAATGGGTGAGCCACTACGCACCTTTTT--GCAAATC---C----AA--AA--A-G--TGTGCGCGC-TTTTTGTCATCCGTATATAGGAATAAATccagaattggcaaatacaagcaattttcaatattttaaataattcgcatttaaccgtggtttggatatagatggacaatataaatgaaccatatagatggaccgatctataattgacatgggtggaaattgctgtaacgatataacttacattaaatatgttccttttctttttattaacaagtccgtatctcgagctttcggatgcaga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATAAATTTGAATGTTTTAATATGTTTGTAATTGATACATGTAAGCACTACTGTTA---ATTTTT--TAT--TGAAATCGGGTGCTGCTGTA---G-ATAAAAATGCATAAAACATTATTTTTAA--C-----GCGTA-TTAACAAAAT--ACGGAAA---ATCACAATCAAAATAGAT-ACCAG-AA-ACAAACTGGAGTATTAAATTTTTTATATT-AGCATT-T-GTTATAATTTAAC-A-ttgaatgttttaatatgtttgtaattgatacatgtaagcactactgttaattttttattgaaatcgggtgctgctgtagataaaaatgcataaaacattatttttaacgcgtattaacaaaatacggaaaatcacaatcaaaatagataccagaaacaaactggagtattaaattttttatattagcatttgttataatttaacagtttaacgttta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acaatgggtgagccactacgcacctttttgcaaatccaaaaagtgtgcgcgctttttgtcatccgtatataggATATG-A---TGTACAAA-AGGTGT--ATAG--TGGATTATGAAAATGATG-T-T----------T---------------------------AATTGCT--ATGAAACTTTGTAGG-------------------A-TTCT--TCAAAATGATGGC--AAT-CCAGA-----TT---TTAT-----TTTATTATATGTCAATGTTACAATATA------ACA----AATAAGTATGTTGgtttaacgttta
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): TTGCTGTAACATGATATCATAATTTACATTTATTACTTTTCTTTTTATTTTACGAGTGCCGTATTATGAGCTTACG
Unaligned ( gi|18 ): TCTAATACAATTTTGAGTCGAAAACAGCATGTGTTA






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Reference ( family-341 )      :                                                                                                                                                AAGTATTAGCACAGGGGGTGAGCCGGTACGCGCTTTTTC--GCA--CC---CGTG-AA--AA--G-G--TGTACGCGC-TTTTTGNCACCCGTGTATAGTGATACATACAATTCGGCACCCGTGAACACATGATACGGCACCCGAAGAATCAAACTTATTCTCGGT-TTATATGAC-AAATAAAGATTCTCTTGTCAGGTATTTTAATTTAAATAAATCTGAATGTTTTAATACGTTTATAATTGANAGATGCGTGCGCT----TCA---TTTTTTCCTGT--TGAAATCAGTTGCTGCTGAA---G-AGAAATTTGCATAAAACATGAGTTTT-A--C-----GCGAA-TTAACAAAAT--ACGGAAA---ATCTCGGTCAAG--AGAT-AC--G-AA-GCAAACTGAAGTAATAAATATGTTGCA-T-ATCATT-T-GTTTTAATTTAAC-A-TGTCANTTTT-ACCATTT-TTGTTGAAGGAACTTAATGAAAATCGGTTTCAAATAACCGAGTGAACAGCACCCGCCAGGCAATGATACGGCACCCGTGAATTTTCT----------GATGTTCATTTTCAAACACG-G---CGTACAAACAANTGC--ATAG--TGGG-TATGTAAACGATGAT-T----------T--------GT--GCNTCA---------AATTGCTACATGCAAATTTGCAGAAT---TCGCTGGA-GAGT-A-TTCN--TCAAAATGATGNC--TATCCCAGA-----TT---TTAT-----TTT----TATGTCAATGTAACAATATAC----CACG----AATAANTATGTTG
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gi|15                         :                                                                                                                                                         aACAGGAG-TGAGCCGGTATGCACTTTTTC--ACA--CC---CGCG--T--AT--G-G--TGTAC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atacgatAGT-AACTCT--TCAAAATGGCGA---TATCCCAGA-----TT---TTA------TTT----TATTTC-ATGTatttctgtaaccgtttaagatacatatct
gi|2                          :                                                                                                                                                AAGTATTAGCACAGGGGATGGGGTTGAACATGCTTTTTC--GCA--CC---CGTG-AA--AA--G-G--CGTACACGC-TTATTGTCATCCCTATATA-TGATACATACAATTCGGCACCCTTGAACACCTGGTATGGCACCCGAAGAATCAAACTTATTCTCGGT-TTATATGAC-AAATAAAGATTCTCTTGTCAGGTATTTTAATTTAAATAAATCTGAATGTTTTAATACGGTTATAATTGAAAGATGCGTGCGCT----TCA---TTTTTTCCTGT--TGAAATCAGTTGCTGCTGAA---G-AGATATTTGCATAAAATATGAGTTTT-A--C-----GCGGA-TTAACAAAAT--ACGGATA---ATCTCGGTCAAG--AGATGAC--GAAA-GCAAATTGAAGTAATAAATATGT-----T-ATCATT-T-GTTTTAATTTGTT-A-TGTCAATTTT-ACCATTT-TTATTGAAGGAACTTAATGAAAATAGGTTTCAAATAACCGAGTGAAGAGCACCCGCCAGGCAATAATACGGAACCCGTGAATTTTCT----------GATGTTTATTTTCAAAC--------CGTACAAACAAATGC--ATAG--TGGG-TATGTAAACGATG--------------T--------GT--GCATCA---------AATTTCTACATGCAAATTTGCAGAATCCGTCGCTGGA-GAGT-A-TTCA--TCAAAATGA-ACC--TATCCCAGA------T---TTAT-----TTT----TATGTCAGTTTAACAATATACCACGCACG----AATATTTATGTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAATTTGAATGGTATAATACATTTATAATTGATAAATGCATGCACT------A---GTTTTTCCCCCAATGAAGTCAGTTGCTACTGTA---G-GGAAATTTGCAGAAAACATGGATT---------------AATTTAACAAAAT--ATGGAAA---ATCTCAATCAAA--AG---------------AACCGAATTAA-AGCTGTGTTGCA---AT-ATTGT-GTTTAAATTTAAC-AGTGTCATTTTT-A-CATGA-TTGTT----AAACTTAATGAAAAATGGTTCAAAATAACCAAGT--ATCGCACTTGC----CAATGATACAGCATCCGTGAATTTTGT----------AATA---------AAACATG-GGA-CGTACAAA-AAATGCAAATAGCATATA-CATGTAAACAATGAT-TTCGAGCTTAAT--------GT--CCTTCC---------AACAGCT--ATGCAAATTTGCA-AGT---TTGCAGGA-GAGTAA-TTCT--TCAAAATGATGAC---ATCCCAGA-----TTTAATTATA----TTC----CATGTCAATGTAACAATATAC----CACA----AATAATTATGTTG
gi|3                          :                                                                                                                                                              GGGTTGAGCCAGTATATCCTTTTTC--GCA--CCA--TGTG-AA--AA--A-AATTGGACGTGC-TTTTCTGCACCTGTGacaggatttgatataaacaacgctatttatgatattattatgcatatttaactatggtttgaacatatagatgaaccacgttattttaatgctaaaagtgccatccatatctttcagctcacaggtgcagaaaagcacgtccaatttttttcacatggtgcgaaaaaggatatactggctcaaccctcattatca
gi|4                          : taaatttgaatggtataatacatttataattgataaatgcatgcactagtttttcccccaatgaagtcagttgctactgtagggaaatttgcagaaaacatggattaatttaacaaaatatggaaaatctcaatcaaaagaaccgaattaaagctgtgttgcaatattgtgtttaaatttaacagtgtcatttttacatgattgttaaacttaatgaaaaatggttcaaaataaccaagtatcgcacttgccaatgatacagcatccgtgaattttgtaataaaacatgggacgtacaaaaaatgcaaatagcatatacatgtaaacaatgatttcgagcttaatgtccttccaacagctatgcaaatttgcaagtttgcaggagagtaattcttcaaaatgatgacatcccagatttaattatattccatgtcaatgtaacaatataccacaaataattatgttgacaggatttgatataaacaacgctatttatgatattattatgcatatttaactatggtttgaacatatagatgaaccacgttattttaatgctaaaagtgccatccatatctttcagctTTAATTTAACGA-TATCACGTTTGATC-TTT-TTATTGAAGGAACTTACCTAAAATCGGTTTCAAA-AAGCTAGTGAACAGCACCCGTCAGACAATGATACGACATCCGTGAATATTCTAAAAAAGAAAAATG--CA-----AGACACGTGTGTCGTACAAA-ACTTGC--ATAG--TGTG-TGTGAAAACGATGATAT----------T--------GT--GTTTAATGGGCGGTCAATAGCT--ATTAAAATTTGCAGAAT-------TGGAGGAG-----TCA--TCTGAATGA-AAG--TATCCCGGATGTACTT---TTA------TTT----TATGTCAATGTAACAATATAC----TACA----AATAAGTATGTTGtcattatca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -AAATA--GATTCCCTTGTCAGGTATTTAAATTTAAACAAATATGAATGTTT-AATACGTATAGGATCGCCAAATGTATATGCT----ACACTGTTTTATCC-AC--TGAAACCAGTTGCTGCTGAGCCTGTAGAAATTTGTATAAAACATGAGTTTT-AAAT-----GCGAA-TTAACAAAAT--ACAGAA--------------------------------GCAAACTGAAGTCATAAATGTGTTGCAGT-ATTATT-TTATTTTAATTTAACAA-TGTCGTTTTT-AT--TTTATTGTTGAAGGAACTTAATGAAAATCGGTTTCAAATAGCCGCGCGAACAGCA-CCGCCA-----------GGCACCCGTGAATTTTCT----------TATA-ACATTTTCAA-----------GT-TAAAC-ATTAC--ATAG--TGGG-TATGTAAACGATGAT-T----------TTGAGCCAAGTGAGCGTCA---------AGTTGCTACccaggattaggcaaatacattgctatttacgatattataatattataatgcatatttaacaatggttttaatatatgtaaataataaaatcgtaattcaccaaaatgggtgcactttgctatcacgtgatattatttatattttgttcctattcgttcta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cttGCAAATTTGCAGAAT---T-------------A--------CAAAA-GATGTTGGTATCCCAGA-----TT---TTATTTTAATTT----TACGTCAATATAACTACATGC----CA
gi|6                          :                                                                                                                                        gtttcaagacacgtgtaaACACGGAGTGAGCCAGTACGCTCTTTTTC--GCA--CCCCGCGTGAAA--AA--G-G--TGTAAACGTATTTCTG-CACCCGTGTATAGTG-T------------GCACCCGTTAGCTTAAGACACGACATTCGTA-AATAAAAattttacgtcaatgtaccgagtatgccgcgaataaaatattgccaggatttggcgaatacaacgtaaccgcggtttggatatttaaccatggttttggttatagatggacaatgttatgtcaccattaaatgtattcattcccttttatttttatttacgaatgtcgtgtcttaagctaacgggtgcacactatacacgggtgcagaaatacgtttacacctttttcacgcggggtgcgaaaaagagcgtactggctcactccgtgtttatcggtatttataaatatttgcct
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gtttcaagacacgtgtaagcaaatttgcagaattacaaaagatgttggtatcccagattttattttaattttacgtcaatataactacatgccaattttacgtcaatgtaccgagtatgccgcgaataaaatattgccaggatttggcgaatacaacgtaaccgcggtttggatatttaaccatggttttggttatagatggacaatgttatgtcaccattaaatgtattcattcccttttat---TTGCAGCA-AAGT-A-TTTTATTTGAAATTAAGGC---ATTCCAGA-----TT---TGAT-----TTT----ATTGT--ATGTCACAATATGT----AAT-----AATAAGTATGTTGttatcggtatttataaatatttgcct
gi|8                          :                                                                                                                                 atagaaattaaaacattacattacaACAATGGGTGAGCCACTACGCACCTTTTT--GCAAATC---C----AA--AA--A-G--TGTGCGCGC-TTTTTGTCATCCGTATATAGGAATAAATccagaattggcaaatacaagcaattttcaatattttaaataattcgcatttaaccgtggtttggatatagatggacaatataaatgaaccatatagatggaccgatctataattgacatgggtggaaattgctgtaacgatataacttacattaaatatgttccttttctttttattaacaagtccgtatctcgagctttcggatgcaga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATAAATTTGAATGTTTTAATATGTTTGTAATTGATACATGTAAGCACTACTGTTA---ATTTTT--TAT--TGAAATCGGGTGCTGCTGTA---G-ATAAAAATGCATAAAACATTATTTTTAA--C-----GCGTA-TTAACAAAAT--ACGGAAA---ATCACAATCAAAATAGAT-ACCAG-AA-ACAAACTGGAGTATTAAATTTTTTATATT-AGCATT-T-GTTATAATTTAAC-A-ttgaatgttttaatatgtttgtaattgatacatgtaagcactactgttaattttttattgaaatcgggtgctgctgtagataaaaatgcataaaacattatttttaacgcgtattaacaaaatacggaaaatcacaatcaaaatagataccagaaacaaactggagtattaaattttttatattagcatttgttataatttaacagtttaacgttta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acaatgggtgagccactacgcacctttttgcaaatccaaaaagtgtgcgcgctttttgtcatccgtatataggATATG-A---TGTACAAA-AGGTGT--ATAG--TGGATTATGAAAATGATG-T-T----------T---------------------------AATTGCT--ATGAAACTTTGTAGG-------------------A-TTCT--TCAAAATGATGGC--AAT-CCAGA-----TT---TTAT-----TTTATTATATGTCAATGTTACAATATA------ACA----AATAAGTATGTTGgtttaacgttta


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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-341 )      :                                                                                                                                                           AAGTATTAGCACAGGGGGTGAGCCGGTACGCGCTTTTTC--GCA--CC---CGTG-AA--AA--G-G--TGTACGCGC-TTTTTGNCACCCGTGTATAGTGATACATACAATTCGGCACCCGTGAACACATGATACGGCACCCGAAGAATCAAACTTATTCTCGGT-TTATATGAC-AAATAAAGATTCTCTTGTCAGGTATTTTAATTTAAATAAATCTGAATGTTTTAATACGTTTATAATTGANAGATGCGTGCGCTAC---GTT--TTTTCCT-GTTGAAATCAGTTGCTGCTGAA---G-AGAAATTTGCATAAAACATGAGTTTTA----A-CGCGAATTAACAAAAT--ACGGAAA---ATCTCGGTCAAGA---ATG-CGGAAGCAAACTGAAGTAATAAATATGTTATATTATCATTT-GTTTTAATTTAAC-A-TGTCANTTTT-ACC-TTTTTGTTGAAGGAACTTAATGAAAATCGGTTTCAAATAACCGAGTGAACAGCACCCGCCA--CAATGATACGGCACCCGTGAATTTTCTNATA---------AA------------A--CTCG-----CGTACAAACAANTGCA--TAGTGGGT-A--TGTAAACGATGATTTCGAGCTTAATGNGCGTCCAATTGCT--ATGCAAATTTGCAGAA----TTGCAGGAGAGTAATTCNTC-AAAATGATGNCTATCCCAGA-----TT---TTAT-----TTT----TATGTCAATGTAACAATATAC----CACAAATAANTATGTTG
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gi|14                         :                                                                                                                                                         aagtgtaacacatggaaataaaAGCCAGTACACGCTTTTTTTTACA--TC---GGTG-AATTAA--T----TGCACGTGC-TTTTCTACATCCCTGTAAAGTG-TACATCGAATTCTGTACTCGTAAGCTCAAGATACGGCAcccgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                    aACAGGAG-TGAGCCGGTATGCACTTTTTC--ACA--CC---CGCG--T--AT--G-G--TGTAC
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atacgatAGTAACTCTTC-AAAATGGCGA-TATCCCAGA-----TT---TTA------TTT----TATTTC-ATGTatttctgtaaccgtttaagatacatatct
gi|2                          :                                                                                                                                                           AAGTATTAGCACAGGGGATGGGGTTGAACATGCTTTTTC--GCA--CC---CGTG-AA--AA--G-G--CGTACACGC-TTATTGTCATCCCTATATA-TGATACATACAATTCGGCACCCTTGAACACCTGGTATGGCACCCGAAGAATCAAACTTATTCTCGGT-TTATATGAC-AAATAAAGATTCTCTTGTCAGGTATTTTAATTTAAATAAATCTGAATGTTTTAATACGGTTATAATTGAAAGATGCGTGCGCTTC---ATT--TTTTCCT-GTTGAAATCAGTTGCTGCTGAA---G-AGATATTTGCATAAAATATGAGTTTT-----A-CGCGGATTAACAAAAT--ACGGATA---ATCTCGGTCAAGAG--ATGACGAAAGCAAATTGAAGTAATAAATATG-----TTATCATTT-GTTTTAATTTGTT-A-TGTCAATTTT-ACCATTTTTATTGAAGGAACTTAATGAAAATAGGTTTCAAATAACCGAGTGAAGAGCACCCGCCAGGCAATAATACGGAACCCGTGAATTTTCTGATGTTTATTTTCAA------------A--C--------CGTACAAACAAATGCA--TAGTGGGT-A--TGTAAACGATG-------------TGTGCATCAAATTTCTACATGCAAATTTGCAGAATCCGTCGCTGGAGAGT-ATTCATC-AAAATGA-ACCTATCCCAGA------T---TTAT-----TTT----TATGTCAGTTTAACAATATACCACGCACGAATATTTATGTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAAATTTGAATGGTATAATACATTTATAATTGATAAATGCATGCACTA----GTT--TTTCCCCCAATGAAGTCAGTTGCTACTGTA---G-GGAAATTTGCAGAAAACATGGATT--A----A-T-----TTAACAAAAT--ATGGAAA---ATCTCAATCAA------------AAG--AACCGAATTAA-AGCTGTGTTGCAATAT--TGT-GTTTAAATTTAAC-AGTGTCATTTTT-ACA-TGATTGTTAAA----CTTAATGAAAAATGGTTCAAAATAACCAAGT--ATCGCACTTGCCA----ATGATACAGCATCCGTGAATTTTGTAATA---------AA------------A--CATGGGA--CGTACAAA-AAATGCAAATAGCATAT-ACATGTAAACAATGATTTCGAGCTTAATGTCCTTCCAACAGCT--ATGCAAATTTGCAAGT----TTGCAGGAGAGTAATTCTTC-AAAATGATGAC-ATCCCAGA-----TTTAATTATA----TTC----CATGTCAATGTAACAATATAC----CACAAATAATTATGTTG
gi|3                          :                                                                                                                                                                         GGGTTGAGCCAGTATATCCTTTTTC--GCA--CCA--TGTG-AA--AA--A-AATTGGACGTGC-TTTTCTGCACCTGTGacaggatttgatataaacaacgctatttatgatattattatgcatatttaactatggtttgaacatatagatgaaccacgttattttaatgctaaaagtgccatccatatctttcagctcacaggtgcagaaaagcacgtccaatttttttcacatggtgcgaaaaaggatatactggctcaaccctcattatca
gi|4                          : taaatttgaatggtataatacatttataattgataaatgcatgcactagtttttcccccaatgaagtcagttgctactgtagggaaatttgcagaaaacatggattaatttaacaaaatatggaaaatctcaatcaaaagaaccgaattaaagctgtgttgcaatattgtgtttaaatttaacagtgtcatttttacatgattgttaaacttaatgaaaaatggttcaaaataaccaagtatcgcacttgccaatgatacagcatccgtgaattttgtaataaaacatgggacgtacaaaaaatgcaaatagcatatacatgtaaacaatgatttcgagcttaatgtccttccaacagctatgcaaatttgcaagtttgcaggagagtaattcttcaaaatgatgacatcccagatttaattatattccatgtcaatgtaacaatataccacaaataattatgttgacaggatttgatataaacaacgctatttatgatattattatgcatatttaactatggtttgaacatatagatgaaccacgttattttaatgctaaaagtgccatccatatctttcagctTTAATTTAACGA-TATCACGTTTGATC-TTTTTATTGAAGGAACTTACCTAAAATCGGTTTCAAA-AAGCTAGTGAACAGCACCCGTCAGACAATGATACGACATCCGTGAATATTCTAAAA---------AAGAAAAATGCAAGA--CACGTGTGTCGTACAAA-ACTTGCA--TAGTGTGT-G--TGAAAACGATGATATTGTGTTTAATGGGCGGTCAATAGCT--ATTAAAATTTGCAGAA----TTGGAGGAG------TCATC-TGAATGA-AAGTATCCCGGATGTACTT---TTA------TTT----TATGTCAATGTAACAATATAC----TACAAATAAGTATGTTGtcattatca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -AAATA--GATTCCCTTGTCAGGTATTTAAATTTAAACAAATATGAATGTTT-AATACGTATAGGATCGCCAAATGTATATGCTACACTGTT--TTATCC--ACTGAAACCAGTTGCTGCTGAGCCTGTAGAAATTTGTATAAAACATGAGTTTTA----AATGCGAATTAACAAAAT--ACAGAA-----------------------------GCAAACTGAAGTCATAAATGTGTTGCAGTATTATTTTATTTTAATTTAAC-AATGTCGTTTTT-ATT-TTATTGTTGAAGGAACTTAATGAAAATCGGTTTCAAATAGCCGCGCGAACAGCA-CCGCCA-----------GGCACCCGTGAATTTTCTTATA---------AC------------ATTTTCA-----AGT-TAAAC-ATTACA--TAGTGGGT-A--TGTAAACGATGATTTTGAGCCAAGTGAGCGTCAAGTTGCT--Accaggattaggcaaatacattgctatttacgatattataatattataatgcatatttaacaatggttttaatatatgtaaataataaaatcgtaattcaccaaaatgggtgcactttgctatcacgtgatattatttatattttgttcctattcgttcta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cttT--AAGCAAATTTGCAGAA----TTACAAAAGA---------------TGTTGG-TATCCCAGA-----TT---TTATTTTAATTT----TACGTCAATATAACTACATGC----CAc
gi|6                          :                                                                                                                                                      gtttcaagacacgtgACACGGAGTGAGCCAGTACGCTCTTTTTC--GCA--CCCCGCGTGAAA--AA--G-G--TGTAAACGTATTTCTG-CACCCGTGTATAGTG-T------------GCACCCGTTAGCTTAAGACACGACATTCGTA-AATAAAAattttacgtcaatgtaccgagtatgccgcgaataaaatattgccaggatttggcgaatacaacgtaaccgcggtttggatatttaaccatggttttggttatagatggacaatgttatgtcaccattaaatgtattcattcccttttatttttatttacgaatgtcgtgtcttaagctaacgggtgcacactatacacgggtgcagaaatacgtttacacctttttcacgcggggtgcgaaaaagagcgtactggctcactccgtgtttatcggtatttataaatatttgcct
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gtttcaagacacgtgtaagcaaatttgcagaattacaaaagatgttggtatcccagattttattttaattttacgtcaatataactacatgccaattttacgtcaatgtaccgagtatgccgcgaataaaatattgccaggatttggcgaatacaacgtaaccgcggtttggatatttaaccatggttttggttatagatggacaatgttatgtcaccattaaatgtattcattcccttttatA----TTGCAGCAAAGTATTTTATTTGAAATTAAGGC-ATTCCAGA-----TT---TGAT-----TTT----ATTGT--ATGTCACAATATGT----AATAA-TAAGTATGTTGttatcggtatttataaatatttgcct
gi|8                          :                                                                                                                                             atagaaattaaaacattacattacACAATGGGTGAGCCACTACGCACCTTTTT--GCAAATC---C----AA--AA--A-G--TGTGCGCGC-TTTTTGTCATCCGTATATAGGAATAAATccagaattggcaaatacaagcaattttcaatattttaaataattcgcatttaaccgtggtttggatatagatggacaatataaatgaaccatatagatggaccgatctataattgacatgggtggaaattgctgtaacgatataacttacattaaatatgttccttttctttttattaacaagtccgtatctcgagctttcggatgcaga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATAAATTTGAATGTTTTAATATGTTTGTAATTGATACATGTAAGCACTACT--GTTAATTTTT-T-ATTGAAATCGGGTGCTGCTGTA---G-ATAAAAATGCATAAAACATTATTTTTA----A-CGCGTATTAACAAAAT--ACGGAAA---ATCACAATCAAAATAGATACCAGAAACAAACTGGAGTATTAAATTTTTTATATTAGCATTT-GTTATAATTTAAC-A-ttgaatgttttaatatgtttgtaattgatacatgtaagcactactgttaattttttattgaaatcgggtgctgctgtagataaaaatgcataaaacattatttttaacgcgtattaacaaaatacggaaaatcacaatcaaaatagataccagaaacaaactggagtattaaattttttatattagcatttgttataatttaacagtttaacgttta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acaatgggtgagccactacgcacctttttgcaaatccaaaaagtgtgcgcgctttttgtcatccgtatataggGTACAAA-AGGTGTA--TAGTGGATTA--TGAAAATGATG-TTT------------------AATTGCT--ATG-AAACTT-----------TGTAGGA------TTCTTC-AAAATGATGGCAATCC-AGA-----TT---TTAT-----TTTATTATATGTCAATGTTACAATATA------ACAAATAAGTATGTTGgtttaacgttta
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): TTGCTGTAACATGATATCATAATTTACATTTATTACTTTTCTTTTTATTTTACGAGTGCCGTATTATGAGCTTACG
Unaligned ( gi|18 ): TCTAATACAATTTTGAGTCGAAAACAGCATGTGTTA