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Reference ( gi|3 ) : ATTATTGATGTTTTTTT--AATATATATAT---ATACAGTATAACT-----TCCATATATCGAACTTCAAT--A------TA-----TCGAATTTCTCGGTATATCGAACTTTTTCTCA-A--GTCCC---AA-----CTTTTT-----TCATTCTAA--ATCTATATGGAAAAAACGCAAATATATCGAAGTT--AT-ACAT----ATCGAATTTTTCAGTATATCAAAGTTTTTTT-ACGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATCTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGCGAGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--TG-GTGCGCCGGTGCGATGATCGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGTAAAGTCCCTTCGAGTGCTCGAATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGATTAATAAAAGGCAGAATGGTGTTAATTTACTGATAAAACACATTAATGTTGTGTACGCAAACATGGCGACTGTGTCTGTCATGATTACA--------T-A-TCACCAATTTACCGAAAACGGCTAATTAGCGACAAGCGCTGTTAACTACCAAAATAATGGCTAATATTCAATTTAAAATTAAACATTAGGCTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCG---ACTCGGACTAGCCCTACAGACTG-T---ATCTTTCTG-TG-ATGCTTATGTG---ATTTTGTGC--AGTGTATATGTG-TG---TT-----ATT-----CTAA-CGTAC--GTGAAA-ATCGTACGTAT-TGTATG-----AT----GTATACCGGAAGTGCTCCATGTAAGTTTT-TATGTTTGTACATGTTTGTAGTACTTTAGTTATATTGAATTTTAAACGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAAACACGATTTAATTTATG---TTTTATTT--CAACTTACCTTCACTACAAAAGGTACGACAGGTAGATCT--A--GTCATATACAAATTGCGATCTCATTACCAATCAAACTTTTACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCC-CGGTATATCAAACTTTTCATGACGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTAATA
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gi|6 : gtgacatttccttctttaatatcagttaatcagaatctgtttccattaaccattgacatttccttctctgatctcagttcatcaggttgtatgtgacatttccttctttaatatcattgacctttccttctctgatctcaagttcggtttcattaaccattgactttttcttctttaaccgcagtttatcagattctgtgtctttaaccattgacctttccttctctgatctcaattaatatagttcggtatccttaacaattggcttttctttctttaatctcagtttatctaattctgtttccattaaccattgacctttccttctctgatctcatttaatattgtttggtgttcttaaccattgttttttccttctttaaccaaagtttatcagattctatgtctttgcacagctaacagacaacagtttgttgtttacttctgccaagtaatgagataagaatttattgtgaccatggacgtttcttcctgtaatcagtgttaccaaattgttgttgtgtccatgtcaattgaccttttatcctgcaacctcgtctcatcagatatcattttatagttgaccattgaccttcataatttgttatggcgaccttgTTTT--AA-----ATCT---ATATGGAAAAACC-----GCAAAATATCGAAGTTATAC--A------TA-----TTGAATTTTTCAGTATATCAAAGTTTTTTTCACG--GCCCC---AAAGAGTCCTTTTACACATCAT--TAACCATCTATGTata
gi|15 : ccatatatcaaacttcaatatatcgaatttctcggtatatcaaactttttctcaagtcccaacttttttccT---ATACAGTATAACT-----TCCATATATCGAACTTCAAT--A------TA-----TCGAATTTCTCGGTATATCAAACTTTTTCTCA-A--GATCC---AT-----CTTTTT-----TCCTTCTAA--ATCTGTATGGAAAAACCGTAAATATATCTTAGTT--AT-ACAT----ATCAAATTTTTCAGTATATCAAAGTatcgaatatcgattacctgttcaaaatttcttgcgggagtgatgtacatgtatttcacacctgtggtgcaccggtgcgatgatcgtaggaacaaaggccccgctgatcatatagcgtaaagtcccttcgagtgctcggataaatgtatgttaggagtcacactttaataaacatttgattaattaaaggcagaatggtgttaatttagtgataaaacacattaacgttgtgtacgcaaacatggcgactgcgtctgtcatgattacatatcaccaatttatcgaaaacggctaattaccaacaagcgcttttaactacccaaattatgggtaatattcaatttaaaattaaacattaggctaattgataaatcttcgataatggattgtactcgacatgtcacctcattgtatataagcgactcggactagccctacagactgtatatgtgtgttattctaacgtatgtgtaaatcgtacgcattgtatggcatattccggaagtgctccatgtaagtttttatgtttgtacatgtttgtagtgcttcagttatattgtattttaaacgacatgcagggattcaataaataataaacacgatttaatttaagttttatttcaacttacctttactacaaaaggtatgacaggaagatctacagtcatatacatgttgcgatctcattaccaatcaaacttttaccattaccatcgagtgatccagacatgcacatatatcgaagtcccggtttatcgaacttttcatgacggtcccctgaacttcaatatatgggagttatactgt
gi|7 : ACAGTATAACT-----TCCATATATCGAAGTTCA
gi|8 : tatatcaaacttttctcaagtcccaacttttttccttctaaatctatatgaaaaaaccgcaaatatatcgaagttatacatatcgaatttttcagtatatcgaagttttttcacggccccaaagagtccttttacacatcattaaccatctatgtatcgaatatcgattacctgttcaaaatttctcgcgggagtgatgtacatgtatttcacacctgtagtgcgccggtgcgatgatcgtaggaaaaaaggccccgctgattatatagcgtaaagtcccttcgaatgctcggataaatgtttgttaggagtcacactttaataaacatttcattaattaaaggcagaatggtgttaatttactaacattgtgtacgaaaacatggcgactgcgtctgtcatgattacatatcaccaatttaccgaaaacggctaattaccgacaagcgctgttaactacccaaattatggctaatattcaatttaaaattaaacattaggctaattgataaatcttcgataatggattgtactcgacatgtcatctcacttgtatataagcgactcggactagccctacagactgtatatttctgtgatgcttatgtgattttgtgcagtgtatatgtgtgttattctaatgtacgtgtaaatcgtacgcgttgtatgacgtataccggaagtgctccatgtaagtttttatgtttgcacatgtctgtagtgctttagttatattgaattttaaacgacatgcagggattcaataaataataaacacgatttaatttatgttttatttcaacttacctttactacaaaaggtatgacaggtagatctacaatcatatacatgttgcgatctaattaccaatcaaacttttaccataaccatcgagtgatccagacatgcacatatatcgaagtcccggtatatcaaacttttcatgacagtccccACAGTATAACT-----TCCATATATCGAAGTTCA
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gi|11 : gacttaaacaaaatctcttaaaccgcactttaataaacatttgattacttaaaggcagaatggtgataattaactgataaaacacattaacttagtgtatgcaaacactgcggctgcgtctgtcatgattacatatcaccaatttaccaaaaaaggctaattaccgacaagcactgttaactacccaaattatggctaatattcaattaaaaatttagcattaggctaattgataaatcttcgatacttgattgtactcgacatgtcatctcacttgtacataagcctatgcttaacactaccaactgatggaa----GTATACCGGGAGTGCTCCATGTAAGTTTT-T--GTTTGTACATGTTTGTAGTGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAATGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAGACATGATTTAATTT------TTTTTTTT--CAACTTACCTTTACTAGTAAAAGTATGACAGGTAGATCT--ACAGTCATATACATGTTACGATCTCATTACCAATCAAACTTTAACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCAGATATATCGAAGTCC-CGGTATATCGAACTTTTCATGACGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTTATA
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gi|14 : aattattattaattacagatacaACGCAAATATATTGAAGTTA-TA-CATATCAAATTTTTCAttttccttctaaatctatatggaaaccgcaaatatatcaaagttatacatatcgaatttttcaatatatcaaagttttttcatggccccaaagagtccttttacacatcattaaccatttatgtatcgaatatcgattacctgttcaaaatttctcacgggagtgatgtacatgtatttcacacctgtggtgcgccggtgcgatgattgtaggaacaaaggccccgctgataatatagcgtaaagtcccttcgagtgctcggataaatgtttgttaggagtcacactttaataaacatttgattaattaaaggcagaatggtgttaatttactgataaaaca
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gi|1 : taGAAATTCGATATATGGAAGTTATAatacatgtatatcaaatttctcggtatatcaaactttttttcaagtcccaacttttttccttctaaatctatatg
Alignments
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Reference ( family-3086 ) : ATCATTGCCGTTTTTTTGCAAT-TAT-ATNT-ATACAGTATAACT-----TCCATATATCGAAGTTCAATA------TA-----TCGAATTTCTCGGTATATCGAACTTTTTCTCAAGTCCCAACTTTTTTCCTTCTAAATCTATATGGAAAAACCGCAAATATATCGAAGTTATACATATCGAATTTTTCAGTATATCGAAGTTTT-TTCACGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGCGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--CG-GTGCGCCGGTGCGATGATCGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGTAAAGTCCCTTCGAGTGCTCGGATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGATTAATTAAAGGCAGAATGGTGTTAATTTACTGATAAAACACATTAACTTTGTGTACGCAAACATGGCGGCTGCGTCTGTCATGATTACA--------T-A-TCACCAATTTACCGAAAACGGCTAATTACCGACAAGCGCTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATATTCAATTTAAAATTAAACATTAGGCTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCG---ACTCGGACTAGCCCTACAGACTG-T---ATATTTCTG-T-G-ATGCTT-----ATGTG---ATTTTGTGC--ANTGTATATGTG-TG---T----TATTC-TAA-CGTACGTGTAAATCGTACGCGTTGTATGACGTATA---CCG------G---------AAGTGC--TCCATGTAA---GTTTTTATGT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAACGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAAACACGATTTAATTTATG---TTTTATTT--CAACTTACCTTTACTAGNAAAAGTATGACAGGTAGATCTACACGTCATATACATGTTGCGATCTCATTACCAATCAAACTTTTACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCGAACTTTTCATGACGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTTATA
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gi|3 : ctcagttcatcaggttctgtgtgacatttccttcttaaaaatcagttaatcagaatctgtttccataaaacattgacctttccttctctgatctcaattaatatagtttggtatccttaacaattggcttttccttctttaatctcagtttatctaattctgtttccattaaccattgacctttccttctctgatctcatttaatattgtttggtgttcttaaccattgttttttccttctttaaccaaagtttatcagattctatgtctttgcacagctaacaggcaacagtttgttgtttacttctgccaagtaatgagataagaatttattgtgaccatggacgtttcttcctgtaatcagtgttaccaaattgttgttgtgtccttgtcaattgaccttttatcctgcaatctcgtctcatcagatatcattttatagttgaccattgaccttcataatttgttattgcgacctATTATTGATGTTTTTTT--AATATAT-ATAT-ATACAGTATAACT-----TCCATATATCGAACTTCAATA------TA-----TCGAATTTCTCGGTATATCGAACTTTTTCTCAAGTCCCAACTTTTTTCATTCTAAATCTATATGGAAAAAACGCAAATATATCGAAGTTATACATATCGAATTTTTCAGTATATCAAAGTTTT-TTTACGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATCTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGCGAGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--TG-GTGCGCCGGTGCGATGATCGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGTAAAGTCCCTTCGAGTGCTCGAATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGATTAATAAAAGGCAGAATGGTGTTAATTTACTGATAAAACACATTAATGTTGTGTACGCAAACATGGCGACTGTGTCTGTCATGATTACA--------T-A-TCACCAATTTACCGAAAACGGCTAATTAGCGACAAGCGCTGTTAACTACCAAAATAATGGCTAATATTCAATTTAAAATTAAACATTAGGCTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCG---ACTCGGACTAGCCCTACAGACTG-T---ATCTTTCTG-T-G-ATGCTT-----ATGTG---ATTTTGTGC--AGTGTATATGTG-TG---T----TATTC-TAA-CGTACGTGAAAATCGTACGTATTGTATGATGTATA---CCG------G---------AAGTGC--TCCATGTAA---GTTTTTATGT---TTGTACATGTTTGTAG-TACTTTAGTTATATTGAATTTTAAACGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAAACACGATTTAATTTATG---TTTTATTT--CAACTTACCTTCACTACAAAAGGTACGACAGGTAGATCTA---GTCATATACAAATTGCGATCTCATTACCAATCAAACTTTTACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCAAACTTTTCATGACGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTAATAct
gi|4 : GTATAACT-----TCCAAATATCAAACTTCAATA------TA-----TCGAATTTCTTGGTATATCAAACTTTTTCTCAAGTCCCAACTTTTTTCCTTCTAAATCTATATGGAAAAAACGCAAATATATCGAAGTTATACATATCGAATTTTTCAGTATATCGAAGTTTT-TTCACGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGTGGTAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--CG-GTGCGCCGGTGCGATGATCGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGTAAAGTCCCTTCGAGTGCTCGGATAAATGTTTGTTAGGAGTGACACACTTTAATTAACATTTGATTACTTTAAGGCAGAATGGTGATAATTTACTGATAAAACACATTAACTTTGTGTACGCAAACATGGTGGCTGTGTCTGTCATGATTACA--------T-A-TCACATATTTACCGAAAACGGCTAATTACTGACAATCGCTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATATTTAATTTAAAATTAAACAC-------ATTGTATGA-----CGTT--TAGTTTCGTAT----CATGTTATCTTGCAAGTGTAATTTATGAAC----ATTT--ATTAATGTT---TATTG-T---ACATGTATGTT-G-ATGTTT------TG-------TTTGTACCAACTG---ATGTGCTGA--TGGAATATTC---A-TGTACATGTA---TGTGCTTATTTT----CGTATA---CCG------G---------AAGTGC--TCCATGTAA---GTTTTTATGT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAATGACATGCAGGTATTCAATAAATAATAAACACGATTTAATTTTTT---TTTTTTTT--CAACTTACCTTTACTAGTAAAAGTATGACAGGTAGATCTACA-GTCATATACATGTAGCGATCTCATTACCGGTCAAACTTTTACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCGAACTTTTCATGACGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTTATA
gi|5 : GTATAACT-----TCCATATATCAAACTTCAATA------TA-----TCAAATTTCTCGGTATATCAAACTTTTTCTCAAGTCCCAACTTTTTTCCTTTTAAATCTATATGGAAAAACCGCAAATATATCGAAGTTATACATAT---ATTTTTCAGTATATCGAAGTTTT-TTCACGTCCCCAAAGAGTCCTTTTAGACATCATTAACCATCTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCACGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTGACTG-GTGCGCCGGTGCGATGATCGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCACATAGCGTAAAGTCCCTTCGAGTGCTGGGATAAATGTTTGTTATGAGT--CACACTTTAACAAACATTTGATTAATTAAAGGCAGAATGGTGTTAATTTACTGATAAAACACATTAACGTTGTGTACGCAAACATGGCCACTGTGTCTGTCATGACTACA--------T-A-TCACCAATTTACCGAAAACGGCTAATTACCGACAAGCGCTGTTAATAACCCAAATCATGGCTTATATTCAATTTAAACTTAAACATTAAGCTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCG---ACTCGGACTAGCCTTACAGACTG-T---ATCTTTCTG-T-G-ATGCTT-----ATGTG---ATTTTGTGC--AGTGTATA--TG-TG---T----TATTC-CAA-CGTACGTGTAAATCGTACGCATTGTATGACTTATA---CCG------G---------AAGTGC--TCCATGTAA---GTTTTTATGT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGAATTTTAAACGACATACAGGGATTCAATAAATAATAAACACGATTTAATTTATG---TTTTATTT--CAACTTACCTTTACTACAAAAGGTATGAC-GGTAGATCTACA-GTCATATACATGTTGCGATCTCATTACCAATCAAACTTTTACCATTACCATCGAGTGATCAAGACATGCACATATATCGAAGTCCTGGTATATCAAACTTTTTATGACGGTCCCCT
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Alignments
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Reference ( family-3086 ) : ATCATTGNCGTTTTTTTGCAATATATTGTNT-ATACAGTATAACT-----TCCATATATCGAACTTCAATA------TA-----TCGAATTTCTCGGTATATCAAACTTTTTCTCAAGTCCCAACTTTTTTCCTTCTAAATCTATATGGAAAAACCGCAAATATATCGAAGTTATACATATCGAATTTTTCAGTATATCGAAGTTTT-TTCACGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGCGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--CG-GTGCGCCGGTGCGATGATCGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGTAAAGTCCCTTCGAGTGCTCGGATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGATTAATTAAAGGCAGAATGGTGTTAATTTACTGATAAAACACATTAACTTTGTGTACGCAAACATGGCGACTGCGTCTGTCATGATTACA--------T-A-TCACCAATTTACCGAAAACGGCTAATTACCGACAAGCGCTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATATTCAATTTAAAATTAAACATTAGGCTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCG---ACTCGGACTAGCCCTACAGACTG-T---ATATTTCTG-T-G-ATGCTT-----ATGTG---ATTTTGTGC--ANTGTATATGTG-TG---T----TATTC-TAA-CGTACGTGTAAATCGTACGCATTGTATGACGTATA---CCG------G---------AAGTGC--TCCATGTAA---GTTTT-TATGT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAACGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAAACACGATTTAATTTATG---TTTTATTT--CAACTTACCTTTACTAGAAAAAGTATGACAGGTAGATCTACAGTCATATACATGTTGCGATCTCATTACCAATCAAACTTTTACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCGAACTTTTCATGACGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTTATA
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gi|10 : gtgacatttccttctttaatatcagttaatcagaatctgtttccattaaccattgacatttccttctctgatctcagttcatcaggttgtatgtgacatttccttctttaatatcattgacctttccttctctgatctcaagttcggtttcattaaccattgactttttcttctttaaccgcagtttatcagattctgtgtctttaaccattgacctttccttctctgatctcaattaatatagttcggtatccttaacaattggcttttctttctttaatctcagtttatctaattctgtttccattaaccattgacctttccttctctgatctcatttaatattgtttggtgttcttaaccattgttttttccttctttaaccaaagtttatcagattctatgtctttgcacagctaacagacaacagtttgttgtttacttctgccaagtaatgagataagaatttattgtgaccatggacgtttcttcctgtaatcagtgttaccaaattgttgttgtgtccatgtcaattgaccttttatcctgcaacctcgtctcatcagatatcattttatagttgaccattgaccttcataatttgttatggcgaccttgAATATATCTTAGTTATACATATCAAATTTTTCAGTATATCAAAGTTTT-TTCACGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGCGGGAGTGATGTATATATGTATTTCACACCTG--TG-GTGCGCCGGTGCGATGATTGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGTAAAGTCCCTTCCTGTGCTCAGATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGATTACTTAAAGGCAGAATGGTGATATTTTACTGATAAAACACATTAACTTTGTGTATGCAAACATGGCGGCTGCGTCTGTCATTTTTACATAATTTTTT-A-TCACCAATTAACTGAAAAAGGCTAATTACCGACAAGCGCTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATCTTCAATTTAAAATTAAGCATTAGGCTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCGTATACT-----TAACACTACCAACTG-------------A-T-G--TGCTG-----ATGGA---ATATT---C--A-TGTACATGCA-TGAGCT----TATTT-T---CGTAT------ACCGGAAGTGCTCCAT---GT-------------------------AAGT-T--TTTATGT------TTGTACATGT---TTG----------TAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAATGACATACAGGGATTCAATAAATAATAAACACAATTTACTTTGTT---TTTT-TTT--CAACTTACCTTTACTAGTAAAAGTATGACAGGTAGATCTACTGTCATATACATGTTGCGATCTCATTACCAATCAAACTTTTACCATAACCGTCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCAAACTTTTCACGAGGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTTATAata
gi|11 : ATATCGAAGTTATGCATATCGAATTTTTCAGTATATCGAAGTTTT-TTCATGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATTGATAACCTGTTCAAAATTTCTCGCGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--CG-GTGCGCCGGTGTGATGATCGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGCAAAGTCCCTTCGAGTGCTTGGATAGATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGGTTACTTAAAGGCAGAATGGTGATAATTTACTGATAAGACACATTAACTTTGTGTACGCAAACATGGCGGCTctg
gi|11 : CGGCTAATTACCGACAAGTGTTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATATTCAATTTAAAATTAAACATTAGGTTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCG---aattaccgacaagtgttgttaactacccaaattatggctaatattcaatttaaaattaaacattaggttaattgataaatcttcgataatggattgtactcgacatgtcatctcacttgtatataagcgtatgcttaacactacccatcgttcactgatgttaatcatggactccgtgactgatcattttcgtataccgggagtgctccatgtaagtttttgtttgtacatgtttgtagtgctttagttatattgatttttaaatgacatgcagggattcaataaataatagacatgatttaatttttttttttcaacttacctttactagtaaaagtatgacaggtagatctacagtcatatacatgttacgatctcattaccaatcaaactttaaccattaccatcgagtgatccagacatgcagatatatcgaagtcccggtatatcgaacttttcatgacggtcccctgaacttcgatatatggaagttatactgt
gi|11 : atatcgaagttatgcatatcgaatttttcagtatatcgaagttttttcatggccccaaagagtccttttacacatcattaaccatttatgtatcgaatattgataacctgttcaaaatttctcgcgggagtgatgtacatgtatttcacacctgcggtgcgccggtgtgatgatcgtaggaacaaaggccccgctgatcatatagcgcaaagtcccttcgagtgcttggatagatgtttgttaggagtcacactttaataaacatttggttacttaaaggcagaatggtgataatttactgataagacacattaactttgtgtacgcaaacatggCGTATA---CCG------G---------GAGTGC--TCCATGTAA---GTTTT-T--GT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAATGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAGACATGATTTAATTT------TTTTTTTT--CAACTTACCTTTACTAGTAAAAGTATGACAGGTAGATCTACAGTCATATACATGTTACGATCTCATTACCAATCAAACTTTAACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCAGATATATCGAAGTCCCGGTATATCGAACTTTTCATGACGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTTATAtatgcttaacactacccatcgttcactgatgttaatcatggactccgtgactgatcattttcgtataccgggagtgctccatgtaagtttttgtttgtacatgtttgtagtgctttagttatattgatttttaaatgacatgcagggattcaataaataatagacatgatttaatttttttttttcaacttacctttactagtaaaagtatgacaggtagatctacagtcatatacatgttacgatctcattaccaatcaaactttaaccattaccatcgagtgatccagacatgcagatatatcgaagtcccggtatatcgaacttttcatgacggtcccctgaacttcgatatatggaagttatactgt
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Alignments
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consensus : ATCATTGNCGTTTTTTTGCAATATATTGTNT-ATACAGTATAACT-----TCCATATATCGAACTTCAATA------TA-----TCGAATTTCTCGGTATATCAAACTTTTTCTCAAGTCCCAACTTTTTTCCTTCTAAATCTATATGGAAAAACCGCAAATATATCGAAGTTATACATATCGAATTTTTCAGTATATCGAAGTTTT-TTCACGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGCGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--CG-GTGCGCCGGTGCGATGATCGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGTAAAGTCCCTTCGAGTGCTCGGATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGATTAATTAAAGGCAGAATGGTGTTAATTTACTGATAAAACACATTAACTTTGTGTACGCAAACATGGCGACTGCGTCTGTCATGATTACA--------T-A-TCACCAATTTACCGAAAACGGCTAATTACCGACAAGCGCTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATATTCAATTTAAAATTAAACATTAGGCTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCG---ACTCGGACTAGCCCTACAGACTG-T---ATATTTCTG-T-G-ATGCTT-----ATGTG---ATTTTGTGC--ANTGTATATGTG-TG---T----TATTC-TAA-CGTACGTGTAAATCGTACGCATTGTATGACGTATA---CCG------G---------AAGTGC--TCCATGTAA---GTTTT-TATGT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAACGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAAACACGATTTAATTTATG---TTTTATTT--CAACTTACCTTTACTAGAAAAAGTATGACAGGTAGATCTACAGTCATATACATGTTGCGATCTCATTACCAATCAAACTTTTACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCGAACTTTTCATGACGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTTATA
Reference ( family-3086 ) : ATCATTGNCGTTTTTTTGCAATATATTGTNT-ATACAGTATAACT-----TCCATATATCGAACTTCAATA------TA-----TCGAATTTCTCGGTATATCAAACTTTTTCTCAAGTCCCAACTTTTTTCCTTCTAAATCTATATGGAAAAACCGCAAATATATCGAAGTTATACATATCGAATTTTTCAGTATATCGAAGTTTT-TTCACGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGCGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--CG-GTGCGCCGGTGCGATGATCGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGTAAAGTCCCTTCGAGTGCTCGGATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGATTAATTAAAGGCAGAATGGTGTTAATTTACTGATAAAACACATTAACTTTGTGTACGCAAACATGGCGACTGCGTCTGTCATGATTACA--------T-A-TCACCAATTTACCGAAAACGGCTAATTACCGACAAGCGCTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATATTCAATTTAAAATTAAACATTAGGCTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCG---ACTCGGACTAGCCCTACAGACTG-T---ATATTTCTG-T-G-ATGCTT-----ATGTG---ATTTTGTGC--ANTGTATATGTG-TG---T----TATTC-TAA-CGTACGTGTAAATCGTACGCATTGTATGACGTATA---CCG------G---------AAGTGC--TCCATGTAA---GTTTT-TATGT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAACGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAAACACGATTTAATTTATG---TTTTATTT--CAACTTACCTTTACTAGAAAAAGTATGACAGGTAGATCTACAGTCATATACATGTTGCGATCTCATTACCAATCAAACTTTTACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCGAACTTTTCATGACGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTTATA
gi|1 : ATCATTGCCGTTTTTTTGCAAT-TATTGTTTCAT-CAG-ATGTCTACCCGTCCATATA--------CAGTA------TA---------ACTTCC--ATATATCGAA---TTTCTC----------TTTTTTCCTTCTAAATTTATATGGAAAAACTGCAAATATATCGAAGTAATACATATCAAATTTTTCAGTATATCGAAGTTTT-TTCACGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGCGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--TG-GTGCGCCGGTGCGATGATCGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATAATATAGCGTAAAGTCCCTTCGAGTGCTCGGATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGATTAATTAAAGGCAGAATGGTGTTAATTTACTGATAAAACACATTAACTTTGTTTACGCAAACATGGCAACTGTGTCTGTCATGATAACA--------TAA-TTACCAATTTACCGAAAACGGCTAATTACCGACAAGCGCTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATATTCAATTTAAAATTAAACATTAGGCTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTGGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCG---ATTCGGACTAGCCCTACAGAC---T---ATCTTTTTG-T-G-ATGTTT-----ATGTG---ATTTTGTGC--ATTGTTTATGTG-TA---T----TATTC-TAA-CGTACGTGTAAATCGTACGCATTGTATGACGTATA---CCG------G---------AAGTGC--TCCATGTAA---GTTTT-TGTGT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAATGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAAACACGATTTAATTTATG---TTTTAATT--CAACTTACCTTTACTAGAAAAAGTATGACAGGTAGATCTACAGTCATATACATGCTGCGATCTCATAACCAACCAAACTTTTACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCGAACTTTTCATGATGGTCCCCTAAACTTCGATATATGGAATTTATA
gi|10 : gtgacatttccttctttaatatcagttaatcagaatctgtttccattaaccattgacatttccttctctgatctcagttcatcaggttgtatgtgacatttccttctttaatatcattgacctttccttctctgatctcaagttcggtttcattaaccattgactttttcttctttaaccgcagtttatcagattctgtgtctttaaccattgacctttccttctctgatctcaattaatatagttcggtatccttaacaattggcttttctttctttaatctcagtttatctaattctgtttccattaaccattgacctttccttctctgatctcatttaatattgtttggtgttcttaaccattgttttttccttctttaaccaaagtttatcagattctatgtctttgcacagctaacagacaacagtttgttgtttacttctgccaagtaatgagataagaatttattgtgaccatggacgtttcttcctgtaatcagtgttaccaaattgttgttgtgtccatgtcaattgaccttttatcctgcaacctcgtctcatcagatatcattttatagttgaccattgaccttcataatttgttatggcgaccttgAATATATCTTAGTTATACATATCAAATTTTTCAGTATATCAAAGTTTT-TTCACGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGCGGGAGTGATGTATATATGTATTTCACACCTG--TG-GTGCGCCGGTGCGATGATTGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGTAAAGTCCCTTCCTGTGCTCAGATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGATTACTTAAAGGCAGAATGGTGATATTTTACTGATAAAACACATTAACTTTGTGTATGCAAACATGGCGGCTGCGTCTGTCATTTTTACATAATTTTTT-A-TCACCAATTAACTGAAAAAGGCTAATTACCGACAAGCGCTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATCTTCAATTTAAAATTAAGCATTAGGCTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCGTATACT-----TAACACTACCAACTG-------------A-T-G--TGCTG-----ATGGA---ATATT---C--A-TGTACATGCA-TGAGCT----TATTT-T---CGTAT------ACCGGAAGTGCTCCAT---GT-------------------------AAGT-T--TTTATGT------TTGTACATGT---TTG----------TAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAATGACATACAGGGATTCAATAAATAATAAACACAATTTACTTTGTT---TTTT-TTT--CAACTTACCTTTACTAGTAAAAGTATGACAGGTAGATCTACTGTCATATACATGTTGCGATCTCATTACCAATCAAACTTTTACCATAACCGTCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCAAACTTTTCACGAGGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTTATAata
gi|11 : ATATCGAAGTTATGCATATCGAATTTTTCAGTATATCGAAGTTTT-TTCATGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATTGATAACCTGTTCAAAATTTCTCGCGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--CG-GTGCGCCGGTGTGATGATCGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGCAAAGTCCCTTCGAGTGCTTGGATAGATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGGTTACTTAAAGGCAGAATGGTGATAATTTACTGATAAGACACATTAACTTTGTGTACGCAAACATGGCGGCTctg
gi|11 : CGGCTAATTACCGACAAGTGTTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATATTCAATTTAAAATTAAACATTAGGTTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCG---aattaccgacaagtgttgttaactacccaaattatggctaatattcaatttaaaattaaacattaggttaattgataaatcttcgataatggattgtactcgacatgtcatctcacttgtatataagcgtatgcttaacactacccatcgttcactgatgttaatcatggactccgtgactgatcattttcgtataccgggagtgctccatgtaagtttttgtttgtacatgtttgtagtgctttagttatattgatttttaaatgacatgcagggattcaataaataatagacatgatttaatttttttttttcaacttacctttactagtaaaagtatgacaggtagatctacagtcatatacatgttacgatctcattaccaatcaaactttaaccattaccatcgagtgatccagacatgcagatatatcgaagtcccggtatatcgaacttttcatgacggtcccctgaacttcgatatatggaagttatactgt
gi|11 : atatcgaagttatgcatatcgaatttttcagtatatcgaagttttttcatggccccaaagagtccttttacacatcattaaccatttatgtatcgaatattgataacctgttcaaaatttctcgcgggagtgatgtacatgtatttcacacctgcggtgcgccggtgtgatgatcgtaggaacaaaggccccgctgatcatatagcgcaaagtcccttcgagtgcttggatagatgtttgttaggagtcacactttaataaacatttggttacttaaaggcagaatggtgataatttactgataagacacattaactttgtgtacgcaaacatggCGTATA---CCG------G---------GAGTGC--TCCATGTAA---GTTTT-T--GT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAATGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAGACATGATTTAATTT------TTTTTTTT--CAACTTACCTTTACTAGTAAAAGTATGACAGGTAGATCTACAGTCATATACATGTTACGATCTCATTACCAATCAAACTTTAACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCAGATATATCGAAGTCCCGGTATATCGAACTTTTCATGACGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTTATAtatgcttaacactacccatcgttcactgatgttaatcatggactccgtgactgatcattttcgtataccgggagtgctccatgtaagtttttgtttgtacatgtttgtagtgctttagttatattgatttttaaatgacatgcagggattcaataaataatagacatgatttaatttttttttttcaacttacctttactagtaaaagtatgacaggtagatctacagtcatatacatgttacgatctcattaccaatcaaactttaaccattaccatcgagtgatccagacatgcagatatatcgaagtcccggtatatcgaacttttcatgacggtcccctgaacttcgatatatggaagttatactgt
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gi|12 : gacttaaacaaaatctcttaaac----TATTC---A-TGTACATGTA---TGTGCTTATTTT----CGTATA---CCG------G---------AAGTGC--TCCATGTCA---GTTTT-TATGT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAATGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAAACATGATTTAATTTATGGGGTTTTTTTT--CAACTTACCATTACTAGTAAAAGTATAACAGGTAGATCTACTGTCATATACATGTTGCGATCTCATTACCATTCAAACTTTTACCATTACCATTGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCGAACTTTTCACGATGGTCCCCTGAACTTCGATATcgtataccggaagtgctccatgtcagtttttatgtttgtacatgtttgtagtgctttagttatattgatttttaaatgacatgcagggattcaataaataataaacatgatttaatttatggggttttttttcaacttaccattactagtaaaagtataacaggtagatctactgtcatatacatgttgcgatctcattaccattcaaacttttaccattaccattgagtgatccagacatgcacatatatcgaagtcccggtatatcgaacttttcacgatggtcccctgaacttcgatat
gi|13 : gacttaaacaaaatctcttaaaccgcactttaataaacatttgattacttaaaggcagaatggtgataattaactgataaaacacattaacttagtgtatgcaaacactgcggctgcgtctgtcatgattacatatcaccaatttaccaaaaaaggctaattaccgacaagcactgttaactacccaaattatggctaatattcaattaaaaatttagcattaggctaattgataaatcttcgatacttgattgtactcgacatgtcatctcacttgtacataagcctatgcttaacactaccaactgatggaaCAATA------TACAGTATCGAATTTCTCGGTATATCAAACTTTTTCTCAAGTCCCAACTTTTTTCCTTCTAAATCTATATGGAAA--CCGCAAATATATCAAAGTTATACATATCGAATTTTTCAATATATCAAAGTTTT-TTCATGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCACGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--TG-GTGCGCCGGTGCGATGATTGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATAATATAGCGTAAAGTCCCTTCGAGTGCTCGGATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGATTAATTAAAGGCAGAATGGTGTTAATTTACTGATAAAACA
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gi|4 : GTATAACT-----TCCAAATATCAAACTTCAATA------TA-----TCGAATTTCTTGGTATATCAAACTTTTTCTCAAGTCCCAACTTTTTTCCTTCTAAATCTATATGGAAAAAACGCAAATATATCGAAGTTATACATATCGAATTTTTCAGTATATCGAAGTTTT-TTCACGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGTGGTAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--CG-GTGCGCCGGTGCGATGATCGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGTAAAGTCCCTTCGAGTGCTCGGATAAATGTTTGTTAGGAGTGACACACTTTAATTAACATTTGATTACTTTAAGGCAGAATGGTGATAATTTACTGATAAAACACATTAACTTTGTGTACGCAAACATGGTGGCTGTGTCTGTCATGATTACA--------T-A-TCACATATTTACCGAAAACGGCTAATTACTGACAATCGCTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATATTTAATTTAAAATTAAACAC-------ATTGTATGA-----CGTT--TAGTTTCGTAT----CATGTTATCTTGCAAGTGTAATTTATGAAC----ATTT--ATTAATGTT---TATTG-T---ACATGTATGTT-G-ATGTTT------TG-------TTTGTACCAACTG---ATGTGCTGA--TGGAATATTC---A-TGTACATGTA---TGTGCTTATTTT----CGTATA---CCG------G---------AAGTGC--TCCATGTAA---GTTTT-TATGT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAATGACATGCAGGTATTCAATAAATAATAAACACGATTTAATTTTTT---TTTTTTTT--CAACTTACCTTTACTAGTAAAAGTATGACAGGTAGATCTACAGTCATATACATGTAGCGATCTCATTACCGGTCAAACTTTTACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCGAACTTTTCATGACGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTTATA
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gi|8 : ATATCAAACTTTT-CTCAAGTCCCAACTTTTTTCCTTCTAAATCTATATGAAAAAACCGCAAATATATCGAAGTTATACATATCGAATTTTTCAGTATATCGAAGTTTT-TTCACGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATCTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGCGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--TA-GTGCGCCGGTGCGATGATCGTAGGAAAAAAGGCCCCGCTGATTATATAGCGTAAAGTCCCTTCGAATGCTCGGATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTCATTAATTAAAGGCAGAATGGTGTTAATTTACT-----AACA--------TTGTGTACGAAAACATGGCGACTGCGTCTGTCATGATTACA--------T-A-TCACCAATTTACCGAAAACGGCTAATTACCGACAAGCGCTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATATTCAATTTAAAATTAAACATTAGGCTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCG---ACTCGGACTAGCCCTACAGACTG-T---ATATTTCTG-T-G-ATGCTT-----ATGTG---ATTTTGTGC--AGTGTATATGTG-TG---T----TATTC-TAA-TGTACGTGTAAATCGTACGCGTTGTATGACGTATA---CCG------G---------AAGTGC--TCCATGTAA---GTTTT-TATGT---TTGCACATGTCTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGAATTTTAAACGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAAACACGATTTAATTTATG---TTTTATTT--CAACTTACCTTTACTACAAAAGGTATGACAGGTAGATCTACAATCATATACATGTTGCGATCTAATTACCAATCAAACTTTTACCATAACCATCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCAAACTTTTCATGACAGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTTATActgt
gi|9 : AACTTCAATA------TA-----TCGAATTTCTCTGTATATCGAACTTTTTCTCAAGTCCCAACTTTTTTCCTTCTAAATCTATATGGAAAAACCGCAAATATATCGAAGTTATACATATCGAATTTTTCAGTATATCGAAGTTTT-TTCACGAGCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGCGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--CG-ATGCGCCATTGCGATAATCGTTGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGTAAAGTCTCTTCGAGTGCTCAGATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGATTACTTAAAGGCAGAATGGTGATTATTTACTGATAAAA-ACAATAACTTCGTGTACGCAAACATGGCGGCTGCGTCTGTCATGATTACA--------A-A-Tctgt
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gi|9 : tataacttcaatatatcgaatttctctgtatatcgaactttttctcaagtcccaacttttttccttctaaatctatatggaaaaaccgcaaatatatcgaagttatacatatcgaatttttcagtatatcgaagttttttcacgagcccaaagagtccttttacacatcattaaccatttatgtatcgaatatcgattacctgttcaaaatttctcgcgggagtgatgtacatgtatttcacacctgcgatgcgccattgcgataatcgttggaacaaaggccccgctgatcatatagcgtaaagtctcttcgagtgctcagataaatgtttgttaggagtcacactttaataaacatttgattacttaaaggcagaatggtgattatttactgataaaaacaataacttcgtgtacgcaaacatggcggctgcgtctgtcatgattacaaatacgtgATTG-T---ACATGTATG-TTG-ATGTTTTATTCATGTG---TGTTAGTACCAACTG---ATGTGCTGA--TGAAATATTC---A-TGTACATGTA---TGTGCTTATTTT----CGTATA---CCG------G---------AAGTGC--TCCATGTAA---GTTTT-TATGT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTATAGTTATATTGATTTTTAAATGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAAACTCGATTTAATTCA-G---TTTTTTTTTCCAACTTACCCTTACTAGTAAAAGTATGACAGGTAGATCTACGGTCATTTACATGTTGCGATCTCATTACCAATCGAACTTTTACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGGAGTCCCGGTATATCGAACTTTTCATGACGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGA---TATAgtgttagtaccaactgatgtgctgatgaaatattcatgtacatgtatgtgcttattttcgtataccggaagtgctccatgtaagtttttatgtttgtacatgtttgtagtgctatagttatattgatttttaaatgacatgcagggattcaataaataataaactcgatttaattcagtttttttttccaacttacccttactagtaaaagtatgacaggtagatctacggtcatttacatgttgcgatctcattaccaatcgaacttttaccattaccatcgagtgatccagacatgcacatatatcggagtcccggtatatcgaacttttcatgacggtcccctgaacttcgatatatggatatactg
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Alignments
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Reference ( family-3086 ) : ATCATTGNCGTTTTTTTGCAATATATTGTNT-ATACAGTATAACT-----TCCATATATCGAACTTCAATA------TA-----TCGAATTTCTCGGTATATCAAACTTTTTCTCAAGTCCCAACTTTTTTCCTTCTAAATCTATATGGAAAAACCGCAAATATATCGAAGTTATACATATCGAATTTTTCAGTATATCGAAGTTTT-TTCACGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGCGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--CG-GTGCGCCGGTGCGATGATCGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGTAAAGTCCCTTCGAGTGCTCGGATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGATTAATTAAAGGCAGAATGGTGTTAATTTACTGATAAAACACATTAACTTTGTGTACGCAAACATGGCGACTGCGTCTGTCATGATTACA--------T-A-TCACCAATTTACCGAAAACGGCTAATTACCGACAAGCGCTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATATTCAATTTAAAATTAAACATTAGGCTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCG---ACTCGGACTAGCCCTACAGACTG-T---ATATTTCTG-T-G-ATGCTT-----ATGTG---ATTTTGTGC--ANTGTATATGTG-TG---T----TATTC-TAA-CGTACGTGTAAATCGTACGCATTGTATGACGTATA---CCG------G---------AAGTGC--TCCATGTAA---GTTTT-TATGT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAACGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAAACACGATTTAATTTATG---TTTTATTT--CAACTTACCTTTACTAGAAAAAGTATGACAGGTAGATCTACAGTCATATACATGTTGCGATCTCATTACCAATCAAACTTTTACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCGAACTTTTCATGACGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTTATA
gi|1 : ATCATTGCCGTTTTTTTGCAAT-TATTGTTTCAT-CAG-ATGTCTACCCGTCCATATA--------CAGTA------TA---------ACTTCC--ATATATCGAA---TTTCTC----------TTTTTTCCTTCTAAATTTATATGGAAAAACTGCAAATATATCGAAGTAATACATATCAAATTTTTCAGTATATCGAAGTTTT-TTCACGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGCGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--TG-GTGCGCCGGTGCGATGATCGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATAATATAGCGTAAAGTCCCTTCGAGTGCTCGGATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGATTAATTAAAGGCAGAATGGTGTTAATTTACTGATAAAACACATTAACTTTGTTTACGCAAACATGGCAACTGTGTCTGTCATGATAACA--------TAA-TTACCAATTTACCGAAAACGGCTAATTACCGACAAGCGCTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATATTCAATTTAAAATTAAACATTAGGCTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTGGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCG---ATTCGGACTAGCCCTACAGAC---T---ATCTTTTTG-T-G-ATGTTT-----ATGTG---ATTTTGTGC--ATTGTTTATGTG-TA---T----TATTC-TAA-CGTACGTGTAAATCGTACGCATTGTATGACGTATA---CCG------G---------AAGTGC--TCCATGTAA---GTTTT-TGTGT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAATGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAAACACGATTTAATTTATG---TTTTAATT--CAACTTACCTTTACTAGAAAAAGTATGACAGGTAGATCTACAGTCATATACATGCTGCGATCTCATAACCAACCAAACTTTTACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCGAACTTTTCATGATGGTCCCCTAAACTTCGATATATGGAATTTATA
gi|10 : gtgacatttccttctttaatatcagttaatcagaatctgtttccattaaccattgacatttccttctctgatctcagttcatcaggttgtatgtgacatttccttctttaatatcattgacctttccttctctgatctcaagttcggtttcattaaccattgactttttcttctttaaccgcagtttatcagattctgtgtctttaaccattgacctttccttctctgatctcaattaatatagttcggtatccttaacaattggcttttctttctttaatctcagtttatctaattctgtttccattaaccattgacctttccttctctgatctcatttaatattgtttggtgttcttaaccattgttttttccttctttaaccaaagtttatcagattctatgtctttgcacagctaacagacaacagtttgttgtttacttctgccaagtaatgagataagaatttattgtgaccatggacgtttcttcctgtaatcagtgttaccaaattgttgttgtgtccatgtcaattgaccttttatcctgcaacctcgtctcatcagatatcattttatagttgaccattgaccttcataatttgttatggcgaccttgAATATATCTTAGTTATACATATCAAATTTTTCAGTATATCAAAGTTTT-TTCACGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCGCGGGAGTGATGTATATATGTATTTCACACCTG--TG-GTGCGCCGGTGCGATGATTGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGTAAAGTCCCTTCCTGTGCTCAGATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGATTACTTAAAGGCAGAATGGTGATATTTTACTGATAAAACACATTAACTTTGTGTATGCAAACATGGCGGCTGCGTCTGTCATTTTTACATAATTTTTT-A-TCACCAATTAACTGAAAAAGGCTAATTACCGACAAGCGCTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATCTTCAATTTAAAATTAAGCATTAGGCTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCGTATACT-----TAACACTACCAACTG-------------A-T-G--TGCTG-----ATGGA---ATATT---C--A-TGTACATGCA-TGAGCT----TATTT-T---CGTAT------ACCGGAAGTGCTCCAT---GT-------------------------AAGT-T--TTTATGT------TTGTACATGT---TTG----------TAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAATGACATACAGGGATTCAATAAATAATAAACACAATTTACTTTGTT---TTTT-TTT--CAACTTACCTTTACTAGTAAAAGTATGACAGGTAGATCTACTGTCATATACATGTTGCGATCTCATTACCAATCAAACTTTTACCATAACCGTCGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCAAACTTTTCACGAGGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTTATAata
gi|11 : ATATCGAAGTTATGCATATCGAATTTTTCAGTATATCGAAGTTTT-TTCATGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATTGATAACCTGTTCAAAATTTCTCGCGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--CG-GTGCGCCGGTGTGATGATCGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATCATATAGCGCAAAGTCCCTTCGAGTGCTTGGATAGATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGGTTACTTAAAGGCAGAATGGTGATAATTTACTGATAAGACACATTAACTTTGTGTACGCAAACATGGCGGCTctg
gi|11 : CGGCTAATTACCGACAAGTGTTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATATTCAATTTAAAATTAAACATTAGGTTAATTG-ATAAATCTTCGATAATGGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---TATAAGCG---aattaccgacaagtgttgttaactacccaaattatggctaatattcaatttaaaattaaacattaggttaattgataaatcttcgataatggattgtactcgacatgtcatctcacttgtatataagcgtatgcttaacactacccatcgttcactgatgttaatcatggactccgtgactgatcattttcgtataccgggagtgctccatgtaagtttttgtttgtacatgtttgtagtgctttagttatattgatttttaaatgacatgcagggattcaataaataatagacatgatttaatttttttttttcaacttacctttactagtaaaagtatgacaggtagatctacagtcatatacatgttacgatctcattaccaatcaaactttaaccattaccatcgagtgatccagacatgcagatatatcgaagtcccggtatatcgaacttttcatgacggtcccctgaacttcgatatatggaagttatactgt
gi|11 : atatcgaagttatgcatatcgaatttttcagtatatcgaagttttttcatggccccaaagagtccttttacacatcattaaccatttatgtatcgaatattgataacctgttcaaaatttctcgcgggagtgatgtacatgtatttcacacctgcggtgcgccggtgtgatgatcgtaggaacaaaggccccgctgatcatatagcgcaaagtcccttcgagtgcttggatagatgtttgttaggagtcacactttaataaacatttggttacttaaaggcagaatggtgataatttactgataagacacattaactttgtgtacgcaaacatggCGTATA---CCG------G---------GAGTGC--TCCATGTAA---GTTTT-T--GT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAATGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAGACATGATTTAATTT------TTTTTTTT--CAACTTACCTTTACTAGTAAAAGTATGACAGGTAGATCTACAGTCATATACATGTTACGATCTCATTACCAATCAAACTTTAACCATTACCATCGAGTGATCCAGACATGCAGATATATCGAAGTCCCGGTATATCGAACTTTTCATGACGGTCCCCTGAACTTCGATATATGGAAGTTATAtatgcttaacactacccatcgttcactgatgttaatcatggactccgtgactgatcattttcgtataccgggagtgctccatgtaagtttttgtttgtacatgtttgtagtgctttagttatattgatttttaaatgacatgcagggattcaataaataatagacatgatttaatttttttttttcaacttacctttactagtaaaagtatgacaggtagatctacagtcatatacatgttacgatctcattaccaatcaaactttaaccattaccatcgagtgatccagacatgcagatatatcgaagtcccggtatatcgaacttttcatgacggtcccctgaacttcgatatatggaagttatactgt
gi|12 : atatcgaagttatgcatatcgaatttttcagtatatcgaagttttttcatggccccaaagagtccttttacacatcattaaccatttatgtatcgaatattgataacctgttcaaaatttctcgcgggagtgatgtacatgtatttcacacctgcggtgcgccggtgtgatgatcgtaggaacaaaggccccgctgatcatatagcgcaaagtcccttcgagtgcttggatagatgtttgttaggagtcacactttaataaacatttggttacttaaaggcagaatggtgataatttactgataagacacattaactttgtgtacgcaaacatggcggctaattaccgacaagtgttgttaactacccaaattatggctaatattcaatttaaaattaaacattaggttaattgataaatcttcgataatggattgtactcgacatgtcatctcacttgtatataagcgtatgcttaacactacccatcgttcactgatgttaatcatggactccgtgactgatcatttt--CGCACTTTAATAAACATTTGATTACTTAAAGGCAGAATGGTGATAATTAACTGATAAAACACATTAACTTAGTGTATGCAAACACTGCGGCTGCGTCTGTCATGATTACA--------T-A-TCACCAATTTACCAAAAAAGGCTAATTACCGACAAGCACTGTTAACTACCCAAATTATGGCTAATATTCAATTAAAAATTTAGCATTAGGCTAATTG-ATAAATCTTCGATACTTGATT-GTACTCGACATGTCATCT--CACTTGTA---CATAAGC-----CTATGCTTAACACTACCAACTGATGGAATATTCATG-T-ACATG--T-----ATGTGCTTATTTTctgt
gi|12 : gacttaaacaaaatctcttaaac----TATTC---A-TGTACATGTA---TGTGCTTATTTT----CGTATA---CCG------G---------AAGTGC--TCCATGTCA---GTTTT-TATGT---TTGTACATGTTTGTAG-TGCTTTAGTTATATTGATTTTTAAATGACATGCAGGGATTCAATAAATAATAAACATGATTTAATTTATGGGGTTTTTTTT--CAACTTACCATTACTAGTAAAAGTATAACAGGTAGATCTACTGTCATATACATGTTGCGATCTCATTACCATTCAAACTTTTACCATTACCATTGAGTGATCCAGACATGCACATATATCGAAGTCCCGGTATATCGAACTTTTCACGATGGTCCCCTGAACTTCGATATcgtataccggaagtgctccatgtcagtttttatgtttgtacatgtttgtagtgctttagttatattgatttttaaatgacatgcagggattcaataaataataaacatgatttaatttatggggttttttttcaacttaccattactagtaaaagtataacaggtagatctactgtcatatacatgttgcgatctcattaccattcaaacttttaccattaccattgagtgatccagacatgcacatatatcgaagtcccggtatatcgaacttttcacgatggtcccctgaacttcgatat
gi|13 : gacttaaacaaaatctcttaaaccgcactttaataaacatttgattacttaaaggcagaatggtgataattaactgataaaacacattaacttagtgtatgcaaacactgcggctgcgtctgtcatgattacatatcaccaatttaccaaaaaaggctaattaccgacaagcactgttaactacccaaattatggctaatattcaattaaaaatttagcattaggctaattgataaatcttcgatacttgattgtactcgacatgtcatctcacttgtacataagcctatgcttaacactaccaactgatggaaCAATA------TACAGTATCGAATTTCTCGGTATATCAAACTTTTTCTCAAGTCCCAACTTTTTTCCTTCTAAATCTATATGGAAA--CCGCAAATATATCAAAGTTATACATATCGAATTTTTCAATATATCAAAGTTTT-TTCATGGCCCCAAAGAGTCCTTTTACACATCATTAACCATTTATGTATCGAATATCGATTACCTGTTCAAAATTTCTCACGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--TG-GTGCGCCGGTGCGATGATTGTAGGAACAAAGGCCCCGCTGATAATATAGCGTAAAGTCCCTTCGAGTGCTCGGATAAATGTTTGTTAGGAGT--CACACTTTAATAAACATTTGATTAATTAAAGGCAGAATGGTGTTAATTTACTGATAAAACA
gi|14 : aattattattaattacagataTTTCTCAAGTCCCAACTTTTTTCCTTCTAAATCTATATGGAAAAAACGCAAATATATTGAAGTTATACATATCAAATTTTTCACTATATTGAAGTTTT-TTCAAGGCCCCAAAGAGCCCTTTTACACATCATTAACCAATTATGTATCGCAAATCGATCACCTGTTCAAAATTGTTCATGGGAGTGATGTACAT--GTATTTCACACCTG--CACATGTGCCGGTGCGATGATCGTAGGAACAAAGG-CCCACTGATCATATAGCGTAAAGTCCCTT
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gi|16 : TAACT-----TCCATATATCGAACTTCAATACATGTATA-----TCAAATTTCTCGGTATATCAAACTTTTTTTCAAGTCCCAACTTTTTTCCTTCTAAATCTATATG
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