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Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AANNNNNNNNNNGGTCACACTTTGGGTTTGTTTGATAT-CACTTTGAGTCT--GTG--AGATTTTGTGTCCGGCCTGTA-A-T-TTGT-CATGCAT-GA-ATGGATTTTGTTAAT-ACTTG-CA-ACAAA-TGAT-CAACATAA-C---ATGAC--GAT-GTGTTGC-GAGTAAGAC--CCACATCT-GCAC---CTCAAAGGTCAAGGTCACA------C-T-----TTGAGTTTGC---ATG---------ACAATAC--TTTG-AGTCTGTGTGAGA---------TTTCGTGT-CAGGCCTGTAACTTTGTTATTCATACAT----GGATTTTGTTAATATTTGCTACAAATGAT-CAACATAA---CATGACTAT-GT--GTCA-CA--AGTAAGACCCACACCC-GTACCA---CAAAGGTCA-AGTTCAC-ACT-----TTGAGTTTG-TT-TGACATCA---CTTTGA----GTC----TGAG----------ATTT-CGTGTCCG-GTCTGTAACT-T--TGTCATGC--ATGA-ATGGA-TTTTG-T-T--A--AT--TTGCTA---CAAATGA--T-CAACATAAA-----ATGA--C----------GACGTGT----TG---TAAGA--AAG------ACC------CA------T------AC-----CT------CAAAGGTCAAGGTC---------------------ACA------CTTTGAGTTTGT--------------------GT--GAGA----TTTCATGTC----TGGCCTGTAACT-T--TGTC-------ATGCAT-AGATGGA-T-TT---TAT-------AAAT-ACCT-GC-TACAAA-TGATCA--AC---ACAA---C---ATGAC---A---T---GTC------------ACA--CT-TAACATCCA--GACTCCCACTTCA------AAGGTCAAGGTCACAATTTAACTTT---GTT-TGAC---ATCTCTTTCAGTCT--ATTTGAGA----TTT-CGTGTCCAGTCTGTAACTTTGTCAC-CTAT--AG-ATA-AATT---TCA--A--A-A--ACT-T----------AC----------CAGCATGACATGACTACA-TGTCACG-TGTAAGACCCACACCCATACCTTA----------------------AAGGTCAAGGTCACA----C--TT------T--GTTTGACTACATTTTGATGCTGTATGAGATTTCGTGTCTAGTCTGTAACTTTGTCGTGCATAGA-T-GATTTC-------TTTGAT---ATTTCGTGT-C------TGATCTGTAACTTTGTC--------------T----TT-----TA---------------CTTGGCT-CATTTGATCAAGA--TG--ACATGACGAT------G--------ACATGA--CAATGTGTCGCATGTAAGACCCAGATCTGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACA-AT------TTGAGTTTGTTCCA-CA------------A-CACTTTGAG--TATG-------T---------T-GAGATTT-CAAGTCCAGTCTGTAA-GTTTA---TCATGCATGGATGAATTTCA--AAAACACTTGGCT-TGATTTATCAATTTATCAACATGACATGACAAAGTGTCG----------------C----------------T---TTACC-TGA----------AAGGTTAAGGTC-----------------ACACTTTC---------------------AGTTTGT-------TTC-A-------TGTCTGGTC--T--AATTTTGTTTTACATGGAGGGA-T-T---TTA-A-AATAGCTTGACACAAGTGATCAGTATG---TGATGA--TGAT---GTGTC---ATCTGCATTTACCTGTAGAAATACCCACACCTTTTACATCAGATGTTAAGGTCAAGGTTACA--CAAAAGTCAAGGTCA----------CCCTTTAATGTGAA----A-AAAC-----------ATGAAATTGCATGTCTAGT-CGTAAACTTCAGTC---CATGGATCTTGATATTCATGGATACATCGCTACCTATTATAA---AA-TATATCGTTA-TTTTCACAGAC-CATT------T-GGG---G-G-C--ATGCAACACTTTCC------A------GTGACATTTCTTGTTAT-AG-AATA-AAAA---ACAT-G-T-T--AAATTCAGTTTGCTTATAATAGTTCATTATTATATATTATAT--TTTCTCCATGATATAAACAAAAA---GAAGAAACAAATAGAAAAGAACAAATTGTCTACCTGCCTAACCTTTTTTGTATT-TTGGTCAATAACTCTAAACACAGGTATTATTTTTTCT
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gi|13                         : gtctgtctgtccgggcaaacaaatgggtagttaagtgtctagggttatagtttttatggacagttgaaaagcagttaaaaaataattacgtggctgtttctagccacttaaaaaacagcatttaagtggctttttttctcttacgtggctaaaattatctaaaatttagccacacaagtaataagattgacgcaaagaagccacttaaatacccattcgtgagaacttccgtccgtccttccgtccggtatttcgtttccggcctgtaactttgtcatgcatagatggattttgttgaaacttgcaacaaatgatcaacagaacatgacatagtgttgcgagtaagacccacacccgtacctcaaaggtcaaCT--GT-----ATTTCGTGTCCGGCCTGTA-A-CGTTGT-CATGCAT-AG-ATGGATTTTGTTAAA-ACTTG-AT-ACAAA-TGAT-CAAgggggcatgtgacacttaacagtgacatttcttgtttccttctttc
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaaaggtctgtatctcaagggtcaaggtcacacaagagcattgaatttatgaaaaaaaaaacaacactatttataatattatagaacatactgtTGTTTGGTTCGTA-ACT-TTGT-CATCCATAGAGAGAGATTTAA--AATGACTT--CACACAAACTG-----GCATGA-CTTGGTGACCTGAC-ATGTTGC-AAGCTACAT--CCACTTCC-Gactaaatgttgaagttataacataatctcttttaatatgaatcccataaatgtttacatgtccggtccataaccttcatatgcagaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttTAAT-AC-------ACAAA-TTATTCACCATAA-T---GAGGC--AAT-GTTTGGC-ACACAAGGT--CCAGATCT-GTAG---GTCAAAGGTCATAGTCATA------C-T-----TAAAGGTTAT---ATcaaagtcaaggtcacactttaaggggaaaaaaaagaattctcttgaaatttaaatctcaacagaataagtatattattttaaggtcacttaatagaccacttagggtcacttggactggaccacttagggcgatgggacactttccagtgacatttcttgccatggtgagagtttacgtgatgtaaactggtttgttgttaatcaatattatattcatctggtttgtcca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAAC-A-TTG-CA--CAAA-TGTT-CACCATAATC---A-GCT--GAT-GTGTTGT-GCACAAGAC--CGAGATCT-G
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aT-CACCATAATC---A-GAC--AAT-GTTTTGT-GTGCAAGAC--CCA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          t-CAACATAA-A---GT--T--GAT-GTG---CAGAATGAAACAATCATGTCT-GTAA---CTCTGATGTCAAGGTCAGA------C-T-----Tggtca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aatctttaactcttacaagctaataaggattttaatataagtaggtacaagttttaTCT-GTAT---CTCAAGGGTCAAGGTCACACAAGAGC-A-----TTGAATTT-----ATGAAAAAAAAAACAACACTATTTATAATAT-TAT-AGAACATACTGTTTTCGTGT-C--------AACTT--TTA--CATGCATGAAAGGATTTT-------TTT-TTAAAAA------AGCAC----------CTAT-A---ATCA-CACCAATAAG--CCAGATCA-GTATCC---CAAAGGTCA-AGGTCACAACTAAATGTTGAA---G-TTATAACATAATCTCTTTTA----ATA----TGAATCCCATAAATGTTTACATGTCCG-GTCCATAACC-T--TCATATGC--A-GA-ATA-----------T--A--A-------TA---TAACT--------ACATAAAG----ATGA--CGT--------GACGTGT----AGAACTAAAA--AAgggcgttgaagttataaaaaaaaaattcaacctatttattgatataaaacatatgttcatacatatatttatgtctgctctatcaatgtatgcatgtaag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaaggC---CTCACAGGTAAAGGTCACA------CATTGGCGTTGAATTTATAAAAAA---------ACAATAA--TTTG-Aa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gcaaaaacaaggtatgtcA---------TTTCGTTT-CCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGAT----GGATTTTGTTGAAACTTGCAACAAATGAT-CAACAGAA---CATGAC-ATAGT--GTTG-CG--AGTAAGACCCACACCC-GTACCT---CAAAGGTCA-AGGTCAC-AAT-----TTCCGTTTG-TT-TGACAACA---CTTTGA----GTTTATGTGAA----------ATTT-CGTTTCTG-GCCTGCAACT-T--TGTCATGC--ATAG-ATTAA-TTTTA-A-T--G--ATACTTGCTA---CAAATGA--A-CAACATAAC-----ATCA--T----------GACATGT----TG---tatgaaccaatatttttttgtat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtctgtctgtccgggcaaacaaatgggtagttaagtgtctagggttatagtttttatggacagttgaaaagcagttaaaaaataattacgtggctgtttctagccacttaaaaaacagcatttaagtggctttttttctcttacgtggctaaaattatctaaaatttagccacacaagtaataagattgacgcaaagaagccacttaaatacccattcgtgagaacttccgtccgtccttccgtccggtA---------TTTCGTGT-CCGGCCTGTAACGTTGTCATGCATAGAT----GGATTTTGTTAAAACTTGATACAAATGAT-CAAgggggcatgtgacacttaacagtgacatttcttgtttccttctttc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagcatctgtttgtccatcctgtTTAAAAATTGGCA-AAATAAT-CAACATGA---CATTACAAT-GT--ATCGTCA----TAAGACCCAGACCCAGTATAAGCTCAGAGGTCA-AGGTCAC-ACT-----TTT-TTTTG-TT-TGGCAACC---ATTTAAATATGTT----TGAG----------ATTT-TTTTTTCTTATCTGTAACT-A--TGTCATAC--ATGG-ATAAA-TTTCA-A-A--A--AC--AC-CTATCTCAATTGA--T-TAACATGGC-----ATGA--T----------GACTTGT----TG---TGCGT--ATG------ACCATGAACTG------T------AC-----AT------CAA-GGTCAAGGTC---------------------ACA------CTTTCAGTTTGTTTTGGCAACCATTTGAATCTGTTTGAGA----TTTT-TTTC----TTGCCTGTAACTATAATGTC-------ATACAT-GGATAGA-C-TT---CAA-------AAAC-ACCT-GT-CTCAAT-TGATTA--AC---ATGA---C---ATGAC---AACTT---CTT------------GCG--TG-TATGA-CCATGAACTGC-ACATCA------A-GGTCAAGGTCACA----------------------------TTTTCAGCTT--GTTTGAGA----TTT-TGTGTCTTCTCTGTTATTGTCTCAC---AA--GG-AGG-GATT---GTA--G--A-ATAACT-TG---------ACA---------CAA-ATGTC-TGACAAAA-TGTCACC-TGCAATAACCAGGCCTGTACATCACATGTCAACGTCAAGGTCATACAAAGTCAAGGTCACA----C--TT------T--tgaacaaaga
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttACAAATTATTCACCATAA---TGAGGCAAT-GTTTGGCA-CA----CAAGGTCCAGATCT-GTAGGT---CAAAGGTCATAG-TCAT-ACT-----TAAAGGTTA-Taaggggaaaaaaaagaattctcttgaaatttaaatctcaacagaataagtatattattttaaggtcacttaatagaccacttagggtcacttggactggaccacttagggcgatgggacactttccagtgacatttcttgccatggtgagagtttacgtgatgtaaactggtttgttgttaatcaatattatattcatctggtttgtcca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taatac----GTC----CGGT----------ATTT-CGTTTCCG-GCCTGTAACT-T--TGTCATGC--ATAG-ATGGA-TTTTG-T-TGAA--AC--TTGCAA---CAAATGA--T-CAACAGAAC-----ATGA--C----------ATAGTGT----TG---CGAGT--AAG------ACC------CACACCCGT------AC-----CT------CAAAGGTCAAGGTCACAATTTCCGTTTGTTTGACAACA------CTTTGAGTTTAT--------------------GT--GAAA----TTTCGTTTC----TGGCCTGCAACT-T--TGTC-------ATGCAT-AGATTAA-T-TT---TAA-------TGAT-ACTT-GC-TACAAA-TGAACA--AC---ATAACATC---ATGAC---A---T---GTTGGGGGGCATGTGACA--CT-TAACAat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtctgtctgtccgggcaaacaaatgggtagttaagtgtctagggttatagtttttatggacagttgaaaagcagttaaaaaataattacgtggctgtttctagccacttaaaaaacagcatttaagtggctttttttctcttacgtggctaaaattatctaaaatttagccacacaagtaataagattgacgcaaagaagccacttaaatacccattcgtgagaacttccgtccgtccttcc----------ATTT-CGTGTCCG-GCCTGTAACG-T--TGTCATGC--ATAG-ATGGA-TTTTG-T-TAAA--AC--TTGATA---CAAATGA--T-CAAgtgacatttcttgtttccttctttc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagcatctgtttgtccatcctgtTTT-CGTGTC---------AACT-T--TTACATGC--ATGA-AAGGA-TTTT-----------T--TT-TTA---AAAA--A--G-CACC-TATA-----ATCA--C----------ACCA--------A---TAAGC--CAG------ATC------AG------T------AT-----CC------CAAAGGTCAAGGTC---------------------ACA------tgaacaaaga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaaaggtctgtatctcaagggtcaaggtcacacaagagcattgaatttatgaaaaaaaaaacaacactatttataatattatagaacatactgtT-CATGTTTG-GTTCGTAACT-T--TGTCATCC--ATAG-AGAGA------------G--AT--TTA-------AAATGACTT-C-ACACAAACTGGCATGA--CTTGGTGACCTGACATGT----TG---CAAGactaaatgttgaagttataacataatctcttttaatatgaatcccataaatgtttacatgtccggtccataaccttcatatgcagaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CCA-GCCTATAACT-T--TGCCATGC---TAAGATGGA-TTTTA-T-A--A--A-------CA---CAGATGG--T----TACAAA-----ATGctacatccacttccgt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCTTTAACT-C--TTACAAGCTAATAA---GGA-TTTTAATAT--A--AG--TAGGTA---CAAGTTT--TACAACATAAA-----GT----T----------GATGTGC----AG---AATGA--AAC------AAT------CA------TGTCTGTAA-----CT------CTGATGTCAAGGTC---------------------AGA------CTTgatacttcatatcca
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaA---CAAATTA--TTCACCATAA-------TGAGGC----------AATGTTT----GG---CACAC--AAG------GTC------CA------G------AT-----CTGTAGGTCAAAGGTCATAGTC---------------------ATA------CTTAAAGGTTAT--------------------AT--gggcgttgaagttataaaaaaaaaattcaacctatttattgatataaaacatatgttcatacatatatttatgtctgctctatcaatgtatgcatgtaag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taatacA--AAG------GTC------TG------T------AT-----CT------CAAGGGTCAAGGTC---------------------ACACAAGAGCATTGAATTTAT--------------------G
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aC-----CT------CACAGGTAAAGGTC---------------------ACA------CATTGaaaaaaaaaacaacactatttataatattatagaacatactgttttcgtgtcaacttttacatgcatgaaaggatttttttttaaaaaagcacctataatcacaccaataagccagatcagtatcccaaaggtcaaggtcacaactaaatgttgaagttataacataatctcttttaatatgaatcccataaatgtttacatgtccggtccataaccttcatatgcagaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gcaaaaacaaggtatgtcA----TTTCGTTTC----CGGCCTGTAACT-T--TGTC-------ATGCAT-AGATGGA-T-TT---TGT-------TGAA-ACTT-GC-AACAAA-TGATCA--AC---AGAA---C---ATGAC---A---TAGTGTT------------GCG--AG-TAAGACCCA--CACCCGTACCTCA------AAGGTCAAGGTCACAATTTCCGTTT---GTT-TGAC---AACACTTTGAGTTT--ATGTGAAA----TTT-CGTTTCTGGCCTGCAACTTTGTCAT-GCAT--AG-ATT-AATT---TTA--ATGA-T--ACT-T----------GCTACAAATGAACAACATAACATCATGACA-TGTgcgttgaatttataaaaaaacaataatttgatatgaaccaatatttttttgtat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gtctgtctgtccgggcaaacaaatgggtagttaagtgtctagggttatagtttttatggacagttgaaaagcagttaaaaaataattacgtggctgtttctagccacttaaaaaacagcatttaagtggctttttttctcttacgtggctaaaattatctaaaatttagccacacaagtaataagattgacgcaaagaagccacttaaatacccattcgtgagaacttccgtccgtccttccgtccggtA----TTTCGTGTC----CGGCCTGTAACG-T--TGTC-------ATGCAT-AGATGGA-T-TT---TGT-------TAAA-ACTT-GA-TACAAA-TGATCA--ATGA-ACAA---tggggggcatgtgacacttaacagtgacatttcttgtttccttctttc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagcatctgtttgtccatcctgt----TTTCGTGTC------------AACT-T--TTAC-------ATGCAT-GAAAGGA-T-TT---TTTTTTAAAAAAGC-ACCT---------A-TAATCA---C---ACCA-------ATAA------------GCC------------AGA---T-CAGTATCC--------------CA------AAGGTCAAGGTCACAACTAAATGTTGAAGTTATAACATAATCTCTTTTAATATGAATCCCATAAATGTTTACATGTCCGGTCCATAACCT--TCAT-ATGC--AGAATATAAT---------A--T-A--ACTAC----------AT----------AAAGATGACGTGACaga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaaaggtctgtatctcaagggtcaaggtcacacaagagcattgaatttatgaaaaaaaaaacaacactatttataatattatagaacatactgtTCATGTT----TGGTTCGTAACT-T--TGTC-------ATCCAT-AGAGAGA-GATT---TA--------AAAT-GACT-TCACACAAACTGG-CATGACTTGGTGA---C---CTGAC---A---T---GTT------------GCAAGCT---ACATCC----ACTTCCgtgtagaactaaaaaaa
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GCCTATAACT-T--TGCC-------ATGCTA-AGATGGA-T-TT---TAT-------AAA----------CACAGA-TGGT-----T---ACAA---A---ATGG---------------------------ATA--CT-TCATATCCA--gt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cca-------ATGCATTAGA-GGA-T-TTTAATAT-------AAA----CT-AG-TACAAA-TGTTCA--CC---ACAC---C---AAGA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cccgcgtcacattaacgaagggtgataaagtaatactcacagttcagttgtcctatttttccacaattttccaccattcttatC---ATCTGTTT--GTCC--ATCCTGTA----TTT-CGTGTCCGGCCTGTAACGTTGTCAT-GCAT--AG-ATG-GATT---TTGTTA--A-A--ACT-T----------tgat
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagA----TTT-CGTTTCCGGCCTGTAACTTTGTCAT-GCAT--AG-ATG-GATT---TTGTTG--A-A--ACT-T----------GCAACAAATGATCAACAGAACATGAC-ATAGTGTTGCG-AGTAAGACCCACACCCGTACCTCA----------------------AAGGTCAAGGTCACAATTTCCGTT------T--GTTTGACAACACTTTGAGTTTATGTGAAATTTCGTTTCTGGCCTGCAACTTTGTCATGCATAGATT-AATTTT-------AATGAT---ACTTgatacaaatgatcaatgaacaaaga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtctgtctgtccgggcaaacaaatgggtagttaagtgtctagggttatagtttttatggacagttgaaaagcagttaaaaaataattacgtggctgtttctagccacttaaaaaacagcatttaagtggctttttttctcttacgtggctaaaattatctaaaatttagccacacaagtaataagattgacgcaaagaagccacttaaatacccattcgtgagaacttccgtccgtccttccgtccggtT-CATGTTTGGTTCGTAACTTTGTCAT-CCATAGAG-AGA-GATT---TAA--A--ATG--ACT-TCACACAA---AC----------TGGCATGACTTGGTGACC-TGACATGTTGCAAG--CTACATCCAgctacaaatgaacaacataacatcatgacatgttggggggcatgtgacacttaacagtgacatttcttgtttccttctttc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CCAGCCTATAACTTTGCCATGCTA---AG-ATG-GATT---TTA--T--A-A--ACcttccgt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAAG--CCAGATCAGTATCCCA----------------------AAGGTCAAGGTCACA-----------------------ACTAAATGTTGAAGTTATAacagatggttacaaaatggatacttcatatcca
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaaaggtctgtatctcaagggtcaaggtcacacaagagcattgaatttatgaaaaaaaaaacaacactatttataatattatagaacatactgttttcgtgtcaacttttacatgcatgaaaggatttttttttaaaaaagcacctataatcacaccaaTATCTCA----------------------AGGGTCAAGGTCACA----C--acataatctcttttaatatgaatcccataaatgtttacatgtccggtccataaccttcatatgcagaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aaaaggtctgATTTCGTGTCCGGCCTGTAACGTTGTCATGCATAGA-TGGATTTT-------GTTAAA---ACTTaagagcattgaatttatgaaaaaaaaaacaacactatttataatattatagaacatactgttttcgtgtcaacttttacatgcatgaaaggatttttttttaaaaaagcacctataatcacaccaataagccagatcagtatcccaaaggtcaaggtcacaactaaatgttgaagttataacataatctcttttaatatgaatcccataaatgtttacatgtccggtccataaccttcatatgcagaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagcatctgtttgtccatcctgtTCATGTTTGGTTCGTAACTTTGTCATCCATAGA-gatacaaatgatcaatgaacaaaga
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -------TTTGAG---ATTTTTTTTTC------TTATCTGTAACTATGTCATACATGGATAAA-T----TT-----CAAAAACA---------CCTATCT-CAATTGATTAACA--TG--GCATGA---T------G--------ACTTGT-----TGTG-CGTATG----ACCATGAACTGTACATCAA-GGTCAAGGTCACA-CT------TTCAGTTTGTTTTGGCA------------A-CCATTTGAA--TCTG-------T---------TTGAGATTT-TT-TTCTTGCCTGTAA-CTATAATGTCATACATGGATAGACTTCA--AAAACACCTGTC---------TCAATTGATTAACATGACATGACAACTTCTTG----------------CG---------------TGTATGACCATGAACTGCACATCAAGGTCAAGGTC-----------------ACATTTTC---------------------AGCTTGT-------TTG-AGATTTTGTGTCTTCTC--T--GTTATTGTCTCACAAGGAGGGA-T-T---GTA-G-AATAACTTGACACAAATG-TC------------TGA--CAAA---ATGTC---ACCTGC-------------AATAACCAGGCC-TGTACATCACATGTCAACGTCAAGGTCATA--C-AAAGTCAAGGTCA----------CACTTTAAGGGGAA----A-AAAgagagatttaaaatgacttcacacaaactggcatgacttggtgacctgacatgttgcaagctacatccacttccgt
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gtctgtctgtccgggcaaacaaatgggtagttaagtgtctagggttatagtttttatggacagttgaaaagcagttaaaaaataattacgtggctgtttctagccacttaaaaaacagcatttaagtggctttttttctcttacgtggctaaaattatctaaaatttagccacacaagtaataagattgacgcaaagaagccacttaaatacccattcgtgagaacttccgtccgtccttccgtccT---ATTTCGTGT-C------CGGCCTGTAACGTTGTC--------------ttggggggcatgtgacacttaacagtgacatttcttgtttccttctttc
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gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taatacacaaattattcaccataGA--CAATGTTTTGTGTGCAAGACCCAGGTCat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttcaccataatcaATGTGCAGAATGAAACAATCATGTCTGTAACTCTGATGTCAAGGTCA-G-AC------TTGGGa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aatctttaactcttacaagctaataaggattttaatataagtaggtacaagttttacaacataaagttgGCAAAAACAAGGTATGTCCCTCACAGGTAAAGGTCACACAT------TGGCGTTcgttgaagttataaaaaaaaaattcaacctatttattgatataaaacatatgttcatacatatatttatgtctgctctatcaatgtatgcatgtaag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAAG--CCAGATCAGTATCCCAAAGGTCAAGGTCACA-ACTAAATGTTGAAGTTATAACA-TA------------ATCTCTTTTAA--TATGAATCCCAT---------A-AATGTTTACATGTCCGGTCCATAACCTTCA---T-ATGCAgaatttataaaaaaacaataatttgatatgaaccaatatttttttgtat
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaaggtctgtatctcaagggtcaaggtcacacaagagcattgaatttatgaaaaaaaaaacaacactatttataatattatagaacatactgttttcgtgtcaacttttacatgcatgaaaggatttttttttaaaaaagcacctataatcacaccaaGCATCTCAGAGGTCAAAGTTA-A-AT------CTGAGgaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTT-CGTTTCCGGCCTGTAA-CTTTG---TCATGCATAGATGGATTTTG--TTGAAACTTG---------CAACAAATGATCAACAGAACATGACATAGTGTTG----------------CGAGTAAGACCCACACCC---GTACC-TCA----------AAGGTCAAGGTC-----------------ACAATTTCCGTTTGTTTGACAACACTTTGAGTTTATGTGAAATTTC-G-------TTTCTGGCC--TGCAACTTTGTCATGCATAGATTAA-T-T---TTA-ATGATA-CTTGCTACAAATGAACAACATA---ACATCA--TGAC---ATGTagttgaaaatatataaaaaaaacaaactttcatatcagatgtatgtatataacattttgttt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gtctgtctgtccgggcaaacaaatgggtagttaagtgtctagggttatagtttttatggacagttgaaaagcagttaaaaaataattacgtggctgtttctagccacttaaaaaacagcatttaagtggctttttttctcttacgtggctaaaattatctaaaatttagccacacaagtaataagattgacgcaaagaagccacttaaatacccattcgtgagaacttccgtccgtccttccgtccggtATTT-CGTGTCCGGCCTGTAA-CGTTG---TCATGCATAGATGGATTTTGTTAAAA-------CT-TGA--TA-CAAATGATCA--ATGA----ACAAAGtggggggcatgtgacacttaacagtgacatttcttgtttccttctttc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagcatctgtttgtccatcctgtTAT-------TTC-G-------TTTCCGGCC--TGTAACTTTGTCATGCATAGATGGA-T-TTTGTTG-A-AA---CTTGCAACAAATGATCAACA------GAACA--TGACATAGTGT-------TGCG---------AGTAAGACCCACACC-CGTACCTCA------AAGGTCAAGGT--CA--CAA---------TTT----------CCGTTT-GTTTGAC----A-ACACTTTGAGTTTATGTGAAATTTCGTTTCTGGC-CTGCAACTTT-GTCATGCATAGA--TTAATTTTAAT-GATAC-TTGCTACAAATGA-AC---AA-CATAACATCA-T-------GACATGTT------G-GGG---G-G-C--ATGTGACACTTAAC------A------GTGACATTTCTTGTTa
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaggtcacaatttgagtttgtttgaatacactttgagtctgtgcgaaacttcgtgtccggcctgtaactttgtcatgcatagatggattttaatgatacttgctacaaatgatcaacataacacgacgacatgttgcgagtaagacccacacctgtaactcaaaggtcaaggtcactatttgagtttgtttgacaacacttcgagtttgtatgagattttgtgtccggcctgcaactttgtcatacatagatggattttaatgatacttgctacaattgatcaacataacatgaggatgtgtcgcgagtaagacccacacccatacctcaaagttcaaggtcacaatttgagtttgacaacactttgagtctgtgtgatattctgtgtccggcctgcaactttgtcatgcattgatggatttttataaatacttgttataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaattgaAAGGTCAAGGTCACAACTAAATGTTGAAGTTATAACATAATCTCTTTTAATATGAATCCCATAAAT-----------GT----TTACATGTCCGGTCCATAACCTTCAta
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaaaggtctgtatctcaagggtcaaggtcacacaagagcattgaatttatgaaaaaaaaaacaacactatttataatattatagaacatactgttttcgtgtcaacttttacatgcatgaaaggatttttttttaaaaaagcacctataatcacaccaataagccagatcagtatcccaTCACA--GAAAATTCACGGTCA----------CACTTTAAGATAAA----A-AAA-----------------ATTGTGTTTCT-GT-TG---------GT-----ATTGATCTT---ACTCTT---TATATC-CCA--TATTTTAA---AA-CGTATCGTTT-TTATCAACGAC-CACTTCTGGAT-GGGGTTG-G-C--ATGTGAGATTTACC------AGTCACTGTGGCATTTATCGTTCTGAGTAATA-TAAA---GCGTAA-T-T--AAtatgcagaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          A-TATATTAACA-TTTTCACAGAT-CATT------T-GTG---G-G-TGAATGCGGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTtcacccgtgagttgaca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatatatatagattactcattttatctgcatattTA-TATTCACAGAC-AATT------T-GGGC--G-G-C--ATGTGACA----CC------G------ATGACATTTCTTGTTTT-CT-AA-A-AGGA---ATAT-T-T-TTAAAAATCAGATTtg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     a-TTTGCACAGAC-CATT------T-GGG---GAG-C--GTGTTGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTGT-
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTCATAGAC-CATT------TTGGG---G-G-C--GTGCAACATTTACC------T------GTGAGATTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GAC-CACT------T-AGG---G-C-G--ATGGGACACTTTCC------A------GTGACATTTCTTGCCAT-GG---TG-AGAGTTTACGT-GATGT--AAACT-GGTTTGTTGTTAA----TCAATATTATAT-TCATCTGGTTTGTCCA
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttttaaaaattggcaaaataatcaacatgacattacaatgtatcgtcataagacccagacccagtataagctcagaggtcaaggtcacacttttttttgtttggcaaccatttaaatatgtttgagatttttttttcttatctgtaactatgtcatacatggataaatttcaaaaacacctatctcaattgattaacatggcatgatgacttgttgtgcgtatgaccatgaactgtacatcaaggtcaaggtcacactttcagtttgttttggcaaccatttgaatctgtttgagatttttttcttgcctgtaactataatgtcatacatggatagacttcaaaaacacctgtctcaattgattaacatgacatgacaacttcttgcgtgtatgaccatgaactgcacatcaaggtcaaggtcacattttcagcttgtttgagattttgtgtcttctctgttattgtctcacaaggagggattgtagaataacttgacacaaatgtctgacaaaatgtcacctgcaataaccaggcctgtacatcacatgtcaacgtcaaggtcatacaaagtcaaggtcacactttaaggggaaaaaaaagaattctcttgaaatttaaatctcaacagaataagtatattattttaaggtcacttaatagaccacttagggtcacttggactg-GGG---G-G-C--ATGTGACACTTGCCAGCCTGA------GTGACATTTCTTGTT
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gGG---G-G-C--ATGAGATATTTACC------A------ATGACATTTCTTGTTctttatg
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ga-C--ATGTGACACTTACC------A------GTGACTTTTCTTGTTtgtttttttatgcccatgaacaaattttgtaatat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTAA-AG-AACAGAAAA---ACAA-A-T-T--AAAATCAATTTGCTTATAAAAGTTCATCATTATG----ATAT--TTTCTCCATG----AAATAAAAATTTGAGAAAAATATTAGGAAAGAAAAAATTGCCTACCTACATACCCTTTT---TATTGTTG---AGTAACCCTAAACACAGGTATTATTTTTTCTt
11 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): GCACACGAATGGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTAATAATTTTTATGGACGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTGGCTGTTTCTAGAAACTTAAAAACAGCTTTGATGTGACTTTTTTACTTTTATGTGGCTAAACTTTAACCACACAAGTAATAAGCTTGGCGCAAAGCTGCCACTTAAATACCCATTCCTAGGAACGTCCATCCGTACGTCCGTACGCCCGTCCGTCCGTTCTTCTG
Unaligned ( gi|7 ): TCTGTCCGGGCACACGAATAGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTAAGGGTTAGTAATTGTTATGGGCGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTTGCTGTTTCTAGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTGGCTTTTTTTTCTTTTAGCCACACAAGTAATAAGCTTGACGCAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTCGTAGAACGTCCGTCCGTCCGCCCGACGTCCCTCTGTCAGTCCGTCTGG
Unaligned ( gi|9 ): GAACTGTTCGTCCACATACACGAATGGGGAATTAAGTGTCTTGGGTTCAGGGTTAGTATTTGTTGTGGACGGTTTGAAAACAGTTGAAAAAAAATATGTCGCTGTTTCTGGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTAGCTTACTTATGTGGCTAAGATTTAAACACACAAGTAACAGGCTGGGCGCAAAGAAGCCTCTTAACTACCCATTTGTG
Unaligned ( gi|11 ): CACACAAATGGGTATTTAAGTGTCTAGGTTTTTTTAGCAAGTTGAAAAACAGTTGAATAAAAATTATGTGGCTGTTTCTAAGACACTTAAAAATACTTTTATGTGGCTATAAATCTGTTATGTGGCTAAAATATAGCCACACAAGCAATCAGCTAGGCGCAAAGAAGCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|15 ): AAGATTTTAATGTAACTTTGTACATGTGTTCAGAACATACATGTAATAATATGCAGGACACACGTGACAGCAAACCGTTCTGAAACTCTAGGATAAGGTCAGTAGTAGGGGTTGAAGTTATA
Unaligned ( gi|19 ): CTGTTTGAAAAACAGTTGGAAAAAAAAAAGTAGCTGTACCTGAATACGCTAAAATACACAAATAATCAGCTGGGCTCATAGAATCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|27 ): TCTGTCTGTAAATAGGTATTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTTGTAATTTGTT
Unaligned ( gi|29 ): TTTTAATGCCCCCCGCCCCCTCCCCCAATTTTTGGGGTGGCATAGTAAT
Unaligned ( gi|32 ): TTCAGCATAATGAGGTGATGTTTCGCATGCAAGGCCCTGA
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Unaligned ( gi|34 ): CAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTTGTGAGAAC






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Reference ( family-279 )      :                                                                                            NNNNNNNNNNNNGGTCACAATTTNNGTTTGTTTGACANACACTTTGAGTCTGTG--AAATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGC--ATAGATGGATTTTGTT----AANACTTGCNACAAATGAT-CAACATAACGTGACGACGTGTCGCGAGTAAGAC--CCANATCC-GTAN---CTCAAAGGTCAAGGTCAC-ACT------TTGAGTTTGTNTGA-------CAA-CACT--TTG-AGTNTGTGT------GAGA---------TTT-CGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCAT-AGATGGATTTTANTG-ANACTTGCTACAAATGATCAAC-ATAA-CATGACGATGTGTCGCGAGTAAGACCCAGACCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTTTNAGTTTG-TTTGACAACACTTTGAGTT--TTTGAGAT-TTC-GTGTCCGGCCTGTAACT-T--TGTCATGCATAGATGGATTTTANTA---A--C-TTGCTACAAATGATCAACATAA-CATGACGACGTGTTGCGNGNAAGAC------CC------GTAC-----CTCAAAGGTCAAGGTCAC---------------------ACTTTGAGTTTGT---------------GT------GANATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTATAAAT-AC---TTGCCACAAATGATCAACACGACATGAC---G---TGTCGCACT-TAANACCCAGACCCCTACNTCA------AAGGTCAAGGTCACAATTTNANTTTGTTTGAC-A--C-CTTTCAGTCTATTCGANATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATNCATAGATGGAT-TTTA--A--AA--ACTT-AC----------CAA-----CATGACATGACGACNTGTCGCG-TGTAAGACCCAGACCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTT------T--GTTTGACAACACTTTGAANTTGTNTGAGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGA-TTTTNTTGATACTTCG-------TNTC------CGGCCTGTAACTTTGTCAT-CAT---GAT--ATTT----ATAGGGAC-CTTGNCTCAANTGATCAACATGACACGACGATG--------ACATGACAATGTGTNGCGTGCAAGACCCAGATCTGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACA-AT------TTGAGTTTG-T---TTNACAA-CNCTTTGAGTATGTAT------GAGATTT-CGTGTCCGGCCTGTAACT-T--TGTCATGCATAGATGGATTTTAATGATACTT-G-CT--A--TAACAANTGATCAACATGACATGACAANGTGTCGCGCGTAC---------CT-CA----AAGGTCAAGGTCACANTTTCAGTTTATGTGAA--TTCGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTAAAAT-A-CTTGACACAAATGATCAACATG-C-ATGATGACGTGTCANCTGCATTTA----TTG----AA-TACCCAGACC-CGTACATCA-A-TGTCAAGGTCAAGGTCACACAAAAGTCGAGGTCACGCTTTAATGTGAAAAAA---------CGTGAAATTGCGTNTCTGGTCNGAAACTTCAGTCCATTGATC-TT-ATATTCAT-GATACATCGCTA-CTATTATAA---AA-CA--TATCGTTA-TTTTCAC-AGACCATT------T-GGG---G-G-C--ATGCGACACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTNT-AG-AATA-AGAA---ACGT-ATT--AAAATCGGTTTGCTNNTAAAAGTTCANCATTATGT-TCATNTGGTTTNTCCATG----AAATAAAAATTTGAGAAAAATATTAGGAAAGAAAAAATTGCCTACCTACATACCCTTTT---TATTGTTG---AGTAACCCTAAACACAGGTATTATTTTTTCT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aannnnnnnnnnTCACAGAAAATTCACGGTCACACTTTAAGATAAAAAAA---------------ATTGTGTTTCTG----------TTGGT--ATTGATC-TT-AC--TCTT---TATATC-CCA--TATTTTAA---AA-CG--TATCGTTT-TTATCAA-CGACCACTTCTGGAT-GGGGTTG-G-C--ATGTGAGATTTACC------AGTCACTGTGGCATTTATCGTTCTGAGTAATA-TAAA---GCGTAATT--AA
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gi|13                         :                                                                                            atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagCTGT-----ATTTCGTGTCCGGCCTGTAACGTTGTCATGC--ATAGATGGATTTTGTT----AAAACTTGATACAAATGAT-CAAgatacaaatgatcaatgaacaaaga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagcatctgtttgtccatcATGCATTAGA-GGATTTTAATATAAACTAG-TACAAATGTTCACC-ACAC-CAAGATGATtgaacaaaga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cccgcgtcacattaacgaagggtgataaagtaatactcacagttcagttgtcctatttttccacaattttccaccattcttatTCATGTTTGGTTCGTAACTTTGTCATCCATAGAGAGAGATTTA--A--AATGACTTCACA---------CAAACTGGCATGACTTGGTGACCTGACATGTTGCAAG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATTATA-----------TATTAACA-TTTTCAC-AGATCATT------T-GTG---G-G-TGAATGCGGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTctacatccacttccgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatatatatagattactcattttatctgcaGCAAAAACAAGGTATGTCCCTCACAGGTAAAGGTCACACATTGGCG-TTGAATTTA-TAAAAAAACAA-TAATTTGA-TATGtg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ------GTCC-----CTCACAGGTAAAGGTCAC---------------------ACATTGaaccaatatttttttgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gcaaaaacaaggtatAT-TTC-GTTTCTGGCCTGTATCT-T--TGTCATGCACAGATGGATTTTGTTG---ATAC-TTGGTACAAATGATCAACATAA-CATGATGATTTGTCATGAGTAAAAC------CCACACCCGTAT-----CTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGAATACACTTTGAGTCTGT---------------GC------GAAACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTAATGAT-AC---TTGCTACAAATGATCAACATAACACGAC---GACATGTTGCGAG-TAAGACCCACACCTGTAACTCA------AAGGTCAAGGTCACTATTTGAGTTTGTTTGACAA--CACTTCGAGTTTGTATGAGATTTTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACATAGATGGAT-TTTA--ATGAT--ACTT-GCTACAATTGATCAA-----CATAACATGAGGATGTGTCGCG-AGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCACAATT------TGAGTTTGACAACACTTTGAGTCTGTGTGATATTCTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATACTTgcgttgaatttataaaaaaacaataatttgatatgaaccaatatttttttgtat
gi|2                          :                                            atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGA-ATACACTTTGAGTCTGTGCGAAACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGC--ATAGATGGATTTTAAT----GATACTTGCTACAAATGAT-CAACATAACACGACGACATGTTGCGAGTAAGAC--CCACACCT-GTAA---CTCAAAGGTCAAGGTCAC-TAT------TTGAGTTTGTTTGA-------CAA-CACT--TCG-AGTTTGTAT------GAGA---------TTT-TGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACAT-AGATGGATTTTAATG-ATACTTGCTACAATTGATCAAC-ATAA-CATGAGGATGTGTCGCGAGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCACAATTTGA----G-TTTGACAACACTTTGAGTC--TGTGTGATATTCTGTGTCCGGCCTGCAACT-T--TGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATA--C-TTGTTATAAATGATCAACATAA-CATGATGACGTTTTGCACTTAATAC------CC------AAACTCCCACTTAAAGGTCAAGGTCAC---------------------AATTTAACTTTGTTTGACAACACTTTCAGTCATTTTGACATTTCTTGTCCGGTC--TAATCT--------ATGGATAAATTTTA-AAATCAC---TTGGCTCAGTTGATCAACATGACATAATTAAG---TGTCGCATG-TAAGACCCAGAACCTTTCCTCA------AAGATCCAGGTCACACTTTCAATTTGTTT-----------------------GATATTGTGTGTCTGGTCTGTGACTTTGCC-TTTA-ACTTGGCT-C---------A--ATTT-AT----------CAA-----GATGAAATGACGACTTGTCATA-AGTAAGACCTAGACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTTTTAGTAT--GTATGACAACACTTTGAATCTGTTTGAGATTTCAAGACCGGCCTTTAACTTTATCATACATGGATGGA-TTTCAAAAATACTTGGTTCAATTTATCAACAATTGATCTGTAACTTTGTCTTACATTTAGGG--ATTTTAAAATAG-----CTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGGTGATGTTTCAGCAGCATT-TAAT-TGT----TGAAATACCCAGACCATTACATCAAATGTCAAGGTCAAA-GT------Tgttataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaattgatctgtaactttgtcttacatttagggattttaaaatagcttgacacaagtgatcagcatgtcatggtgatgtttcagcagcatttaattgttgaaatacccagaccattacatcaaatgtcaaggtcaaagttacacaaaggtcaaggtcacgctttaatgtaaaaaaacatgaaattgcaagtctagtctgaaacatcagtccattactctttatattcatggatacagcgctacctattataacataattatatagttatttttcaatgaccatttgggggacatgcgccatttaccagtaacattttttgttta
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gi|20                         :                                                                                                                                                                        atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaggtcacaatttgagtttgtttgaatacactttgagtctgtgcgaaacttcgtgtccggcctgtaactttgtcatgcatagatggattttaatgatacttgctacaaatgatcaacataacacgacgacatgttgcgagtaagacccacacctgtaactcaaaggtcaaggtcactatttgagtttgtttgacaacacttcgagtttgtatgagattttgtgtccggcctgcaactttgtcatacatagatggattttaatgatacttgctacaattgatcaacataacatgaggatgtgtcgcgagtaagacccacacccatacctcaaagttcaaggtcacaatttgagtttgacaacactttgagtctgtgtgatattctgtgtccggcctgcaactttgtcatgcattgatggatttttataaatacttgttataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaattgatCACCATAATG--------A---GGCAATGTTTGGCACACAAGGTCCAGATCTGTAGGTCAAAGGTCATAGTCATA-CT------TAAAGGTTA-T---ta
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taatacacaaattattGCATCTCAGAGGTCAAAGTTA-A-AT------CTGAGat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TA-TATTCAC-AGACAATT------T-GGGC--G-G-C--ATGTGACAC----C------G------ATGACATTTCTTGTTTT-CT-AA-A-AGGA---ATAT-TTTTAAAAATCAGATTagttgaaaatatataaaaaaaacaaactttcatatcagatgtatgtatataacattttgttt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aCCAGCCTATAACTTTGCCATGCTAAGATGGATTTTATAAAC-ACAGATGGTTACAAA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GG---G-G-C--ATGAGATATTTACC------A------ATGACATTTCTTGTTatggatacttcatatcca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaTA---A--CATTGC-ACAAATGTTCACCATAATCA-GCTGATGTGTTGTGCACAAGAC------Ctgtttttttatgcccatgaacaaattttgtaatat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aATGTGTTGTGCACAAGACCGAGATCTGgagatctg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ataacattgcacaaatgttcaccataatcagctg-TTTGCAC-AGACCATT------T-GGG---GAG-C--GTGTTGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTGT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -GGG---G-G-C--ATGTGACACTTGCCAGCCTGA------GTGACATTTCTTGTTCT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                    gTT----AAAAATTGGCA-AAATAAT-CAACATGACATTACAATGTATCGTCA-TAAGAC--CCAGACCCAGTATAAGCTCAGAGGTCAAGGTCAC-ACT------TTT-TTTTGTTTGG-------CAA-CCAT--TTA-AATATGTTT------GAGAT--------TTT-TTTTTCTTATCTGTAACTATGTCATACAT-GGATAAATTTCAAAA-ACACCTATCTCAATTGATTAAC-ATGG-CATGATGACTTGTTGTGCGTATGACCATGAACTGTACATC-AAGGTCAAGGTCACACTTTCAGTTTGTTTTGGCAACCATTTGAATCTGTTTGAGAT-TTT--TTTCTTGCCTGTAACTATAATGTCATACATGGATAGACTTCAAAAAC-A--C-CTGTCTCAATTGATTAACATGA-CATGACAACTTCTTGCGTGTATGACCATGAACT------GCAC-----ATC-AAGGTCAAGGTCAC---------------------ATTTTCAGCTTGT---------------TT------GAGATTTTGTGTCTTCTCTGTTA--TTGTCTCACAAGGAGGGATTGTA-GAATAAC---TTGACACAAATG-TC----TGACA--AA---A---TGTCAC-CTGCAATAACCAGGCCTGTACATCACATGTCAACGTCAAGGTCATAttatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ttGA-TTTTTTT-----TTCT-------TAT-----------CTGTAACTATGTCATACATG--GATAAATTT-----CAAAAACACCTATCTCAATTGATTAACATGGC---ATGATG--------AC-T-------TGTTGTGCGTATGACCATGAACTGTACATC-AAGGTCAAGGTCACA-CT------TTCAGTTTGTT---TTGGCAA-CCATTTGAATCTGTTT------GAGATTT-T-TTTCTTGCCTGTAACTATAATGTCATACATGGATAGACTTCAAAAACACCT-GTCT--------CAATTGATTAACATGACATGACAACTTCTTGCGTGTATGACCATGAACTGCACATCAAGGTCAAGGTCACATTTTCAGCTTGTTTGAGATTTTGTGTCTTCTCTGTTA--TTGTCTCACAAGGAGGGATTGTAGAATAA-CTTGACACAAATG-TC----------TGACAAAATGTCACCTGC----------------AA-TAACCAGGCC-TGTACATCACA-TGTCAACGTCAAGGTCATAC-AAAGTCAAGGTCACACTTTAAGGGGAAAAAAAAGAATTCTCTTGAAATT-TAAATCTCAACAGAA---TAAGTATATT-ATT-TT-A-----------AGGTCACT---TA--ATAG---AC-CACTTAGGGTCA-CTTGGACTGGACCACT------T-AGG---G-C-G--ATGGGACACTTTCC------A------GTGACATTTCTTGCCAT-GG---TG-AGAGTTTACGTGATG--TAAACTGGTTTGTTGTTAA----TCAATATTATAT-TCATCTGGTTTGTCCAcaaagtcaaggtcacactttaaggggaaaaaaaagaattctcttgaaatttaaatctcaacagaataagtatattattttaaggtcacttaatagaccacttagggtcacttggactggaccacttagggcgatgggacactttccagtgacatttcttgccatggtgagagtttacgtgatgtaaactggtttgttgttaatcaatattatattcatctggtttgtcca
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttttaaaaattggcaaaataatcaacatgacattacaatgtatcgtcataagacccagacccagtataagctcagaggtcaaggtcacacttttttttgtttggcaaccatttaaatatgtttgaTTTCAT-AGACCATT------TTGGG---G-G-C--GTGCAACATTTACC------T------GTGAGATTT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TCACC-ATAATCA-GACAATGTTTTGTGTGCAAGACCCAG
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tGACAATGTTTTGTGTGCAAGACCCAGGTCgtca
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttcaccataatca-C--ATGTGACACTTACC------A------GTGACTTTTCTTGTTa
gi|4                          :                                                                                                                                                      ATTTCGTTTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGC--ATAGATGGATTTTGTT----GAAACTTGCAACAAATGAT-CAACAGAACATGACATAGTGTTGCGAGTAAGAC--CCACACCC-GTAC---CTCAAAGGTCAAGGTCAC-AAT------TTCCGTTTGTTTGA-------CAA-CACT--TTG-AGTTTATGT------GAAA---------TTT-CGTTTCTGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATTAATTTTAATG-ATACTTGCTACAAATGAACAAC-ATAA-CATCATGACATGTTGt
gi|5                          :           gtctgtctgtccgggcaaacaaatgggtagttaagtgtctagggttatagtttttatggacagttgaaaagcagttaaaaaataattacgtggctgtttctagccacttaaaaaacagcatttaagtggctttttttctcttacgtggctaaaattatctaaaatttagccacacaagtaataagattgacgcaaagaagccacttaaatacccattcgtgagaacttccgtccgtccttccgtccggtAGGTCT-GTAT---CTCAAGGGTCAAGGTCAC-ACAAGAGCATTGAATTTATGAAAAAAAAAACAA-CACTATTTATAATAT-TAT-------AGAACATACTGTTTT-CGTGTC--------AACTTTTACATGCAT-GAAAGGATTTT---------TTTTTAAAAA--AGCACCTATAATCA-----------CACCAATAAG--CCAGATCAGTATCCCAAAGGTCAAGGTCACAgggggcatgtgacacttaacagtgacatttcttgtttccttctttc
gi|5                          :                                                                                                                                                    aaaTTTCGTGTC--------AACTTTTACATGC--ATGAAAGGATTTTTTTTTAAAAAA---GC-ACCTATAAT-CA-------------------CACCAATAAG----CCAGATCA-GTAT---CCCAAAGGTCAAGGTCACAACTAAATG-TTGAAGTTATAACA-------TAATCTCT--TTT-AATATGAATCCCATAAATG---------TTTACATGTCCGGTCCATAACCTTCATATGCAactaaatgttgaagttataacataatctcttttaatatgaatcccataaatgtttacatgtccggtccataaccttcatatgcagaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaaggtctgtatctcaagggtcaaggtcacacaagagcattgaatttatgaaaaaaaaaacaacactatttataatattatagaacatactgtCCAGATCAGTATCCCAAAGGTCAAGGTCACA-ACTAAATGTTGAAGTTA-T---AACATAATCTCTTTTAATATGAATCCCATAAATGTTTACATGTCCGGTCCATAACC-T--TCATATGCA-----GAAT----ATAA---------T--A--TAACTAC--ATAAAGATGACGTGAC---GTGTgaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa
gi|8                          : aaaaggtctgtatctcaagggtcaaggtcacacaagagcattgaatttatgaaaaaaaaaacaacactatttataatattatagaacatactgttttcgtgtcaacttttacatgcatgaaaggatttttttttaaaaaagcacctataatcacaccaataagCTTTAACTCTTACAAGCTAATAA--GGATTTTAAT----ATAAGTAGGTACAAGTTTTACAACATAAAGT--TGATGTG-CA-GAATGAAACAATCATGTCT-GTAA---CTCTGATGTCAAGGTCAG-ACT------Tagaactaaaaaaa
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|7 ): TCTGTCCGGGCACACGAATAGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTAAGGGTTAGTAATTGTTATGGGCGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTTGCTGTTTCTAGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTGGCTTTTTTTTCTTTTAGCCACACAAGTAATAAGCTTGACGCAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTCGTAGAACGTCCGTCCGTCCGCCCGACGTCCCTCTGTCAGTCCGTCTGG
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Unaligned ( gi|11 ): CACACAAATGGGTATTTAAGTGTCTAGGTTTTTTTAGCAAGTTGAAAAACAGTTGAATAAAAATTATGTGGCTGTTTCTAAGACACTTAAAAATACTTTTATGTGGCTATAAATCTGTTATGTGGCTAAAATATAGCCACACAAGCAATCAGCTAGGCGCAAAGAAGCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|15 ): AAGATTTTAATGTAACTTTGTACATGTGTTCAGAACATACATGTAATAATATGCAGGACACACGTGACAGCAAACCGTTCTGAAACTCTAGGATAAGGTCAGTAGTAGGGGTTGAAGTTATA
Unaligned ( gi|19 ): CTGTTTGAAAAACAGTTGGAAAAAAAAAAGTAGCTGTACCTGAATACGCTAAAATACACAAATAATCAGCTGGGCTCATAGAATCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|27 ): TCTGTCTGTAAATAGGTATTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTTGTAATTTGTT
Unaligned ( gi|29 ): TTTTAATGCCCCCCGCCCCCTCCCCCAATTTTTGGGGTGGCATAGTAAT
Unaligned ( gi|32 ): TTCAGCATAATGAGGTGATGTTTCGCATGCAAGGCCCTGA
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Unaligned ( gi|34 ): CAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTTGTGAGAAC






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Reference ( family-279 )      :                                                                                            NNNNNNNNNNNNGGTCACANTTTGGGTTTGTTTGATATACACTTTGAGTCTGTG--AGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGC--ATAGATGGATTTTGTTAAAACTTGCNACAAATGAT-CAACATAACATGACGACGTGTCGCGAGTAAGAC--CCACGCCC-GTAN---CTCAAAGGTCAAGGTCACA------CTTTGAGTTTGT-------NTGACAACAC--TTTG-AGTNTGTATGAGA---------TTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCAT-AGATGGATTTTAATA-ATACTTGCTACAAATGATCAAC-ATAA-CATGACGACGTGTCGCGAGTAAGACCCAGACCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCAC-ACT-----TTGAGTTTG-TTTGACAACA------CTT------TGAGTC--TNTGAGAT-TT--C-GTNTCCGGCCTGTAACT-T--TGTCATGCACGGATGGATTTCGNTAA--AC-TTGCTACAAATGATCAACATAA-CATGACGACGTGTTGCGCGTAAGAC------CC------GTAC-----CTCAAAGGTCAAGGTCAC---------------------ACTTTGA----GTTTG-----------------TGTGAGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCACGCATAGATGGATTTTATAAAT-AC---TTGNTACAAATGATCAACATGACACGAC---G---TGTCGCGCGTAANACCCAGACCCGTACCTCA------AAGGTCAAGGTCACAATTTNANTTTGTTTGACA--TCTTTNAGTCTATNCGANATTTCGTGTCCGGTCTGTAACTTTGTCATNCATAGATGGAT-TTTA--A--AA--ACTT-AC----------CAA-----CATGACATGACGACNTGTCACG-NGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTT------T--GTTTGACAACACTTTGANTCTGTNTGAGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCGTGCATNGATGGA-TTTCNTNAATACTTCG-------TATC------TGATCTGTAACTTTGTC-TACAT----GGAT----TT-----ACAGCTTGNCTCAATTGATCAACATGNCACGATGATG--------ACATGACAATGTGTTGCGCGCAAGACCCAGATCTGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACA-AT-----T------TGAGTTTAT---NNNA-CAA-CNNTTTGAATATG-------TT-GAGATTT-CATGTCCGGTCCGTAACT-T--TNTCATGCATGGATGAATTTCAAAAACACCTG-------CTATACAA-TT--ATNAACATGACGTGAC-AAGTGTC--GCGTNTACGACCATGAACTGNACATCAAGGTCAAGGTCACACTTTCAGCTTGTTTGAGATTTCGTGTCTNNTCTGTAACTTTGTCTTACATGGAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATG-C-ATGACGATGTGTCANCTGCATTTA----CTG----AA-TACCCAGACC-TTTACATCA-A-TGTCAAGGTCAAGGTCACACAAAAGTCAAGGTCACGCTTTAANGTGAAAAAACA---------TGAAATTGCANGTCTAGTCGGAAAC-TCGGTCCATTGATC-TT-ATATTCATGGATACATCGCTACCTATTATAA---AA-CA--TATNGTTA-TTTTCAC-AGACCATTT-------GGG--G-G-C--ATGCGACACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTNT-AG-AATA-AAAA---ACGT-ATT----AAAATCGGTTTGCTTATAA-A-GTTCATTATTATAT-TCATAT--TTTCTCCATGATATAAACAAAAATTTGAGGAAANNANTAGGAAAGAANAAATTGCCTACCTGCNTANCCTTTTTTGTATTGTTGGTCAGTAACCCTAAACACAGGTATTATTTTTTCT
gi|1                          :                                                                                                        GGTCACACTTTGGGTTTGTTTGATAT-CACTTTGAGTCTGTG--AGATTTTGTGTCCGGCCTGTAA-TTTGTCATGC--ATGAATGGATTTTGTTAATACTTGCAACAAATGAT-CAACATAACATGACGATGTGTTGCGAGTAAGAC--CCACATCT-GCAC---CTCAAAGGTCAAGGTCACA------CTTTGAGTTTGC-------ATGACAATAC--TTTG-AGTCTGTGTGAGA---------TTTCGTGTCAGGCCTGTAACTTTGTTATTCAT-ACATGGATTTTGTTA-ATATTTGCTACAAATGATCAAC-ATAA-CATGACTATGTGTCACAAGTAAGACCCACACCCGTACCACAAAGGTCAAGTTCAC-ACT-----TTGAGTTTG-TTTGACATCA------CTT------TGAGTC----TGAGAT-TT--C-GTGTCCGGTCTGTAACT-T--TGTCATGCATGAATGGATTTTGTT-A--AT-TTGCTACAAATGATCAACATAA-AATGACGACGTGTTGTAAGAAAGAC------CC------ATAC-----CTCAAAGGTCAAGGTCAC---------------------ACTTTGA----GTTTG-----------------TGTGAGATTTCATGTCTGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTATAAAT-AC---CTGCTACAAATGATCAACACAACATGAC---A---TGTCACACTTAACATCCAGACTCCCACTTCA------AAGGTCAAGGTCACAATTTAACTTTGTTTGACATCTCTTTCAGTCTATTTGAGATTTCGTGTCCAGTCTGTAACTTTGTCACCTATAGATAAAT-TTCA--A--AA--ACTT-AC----------CAG-----CATGACATGACTACATGTCACG-TGTAAGACCCACACCCATACCTTAAAGGTCAAGGTCACACTT------T--GTTTGACTACATTTTGATGCTGTATGAGATTTCGTGTCTAGTCTGTAACTTTGTCGTGCATAGAT-GA-TTTCTTTGATATTTCG-------TGTC------TGATCTGTAACTTTGTC-T-----------T----TT-----A---CTTGGCTCATTTGATCAAGATGACATGACGATG--------ACATGACAATGTGTCGCATGTAAGACCCAGATCTGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACA-AT-----T------TGAGTTTGT---TCCA-CAA-CACTTTGAGTATG-------TT-GAGATTT-CAAGTCCAGTCTGTAAGT-T--TATCATGCATGGATGAATTTCAAAAACACTTGGCTTGATTTAT-CAATTT--ATCAACATGACATGACAAAGTGTC--GC-TTTAC---------CTGA-----AAGGTTAAGGTCACACTTTCAGTTTG-------TTTCATGTCTGGTC--TAATTTTGTTTTACATGGAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGTATG-TGATGATGATGTGTCATCTGCATTTAC---CTGTAGAAA-TACCCACACCTTTTACATCAGA-TGTTAAGGTCAAGGTTACACAAAAGTCAAGGTCACCCTTTAATGTGAAAAAACA---------TGAAATTGCATGTCTAGTCGTAAACTTCAGTCCATGGATC-TTGATATTCATGGATACATCGCTACCTATTATAA---AA-TA--TATCGTTA-TTTTCAC-AGACCATTT-------GGG--G-G-C--ATGCAACACTTTCC------A------GTGACATTTCTTGTTAT-AG-AATA-AAAA---ACAT-GTT----AAATTCAGTTTGCTTATAATA-GTTCATTATTATATATTATAT--TTTCTCCATGATATAAACAAAAA---GAAGAAACAAATAGAAAAGAACAAATTGTCTACCTGCCTAACCTTTTTTGTATT-TTGGTCAATAACTCTAAACACAGGTATTATTTTTTCT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aannnnnnnnnnTCACAGAAAATTCACGGTCACACTTTAAGATAAAAAAA---------------ATTGTGTTTCT-GTTGG-----------TATTGATC-TT-AC--TCTT---TATATC-CCA--TATTTTAA---AA-CG--TATCGTTT-TTATCAA-CGACCACTTCTGGATGGGGTTG-G-C--ATGTGAGATTTACC------AGTCACTGTGGCATTTATCGTTCTGAGTAATA-TAAA---GCGTAATT----AA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -AG-AACAGAAAA---ACAA-ATT----AAAATCAATTTGCTTATAA-AAGTTCATCATTATG----ATAT--TTTCTCCATGA----AATAAAAATTTGAGAAAAATATTAGGAAAGAAAAAATTGCCTACCTACATACCCTTTT---TATTGTTG---AGTAACCCTAAACACAGGTATTATTTTTTCTtcacccgtgagttgaca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttaaCA--TCTGTTTGTCCATCCTGTATTTCGTGTCCGGCCTGTAACGTTGTCATGCATAGATGGAT-TTTGTTA--AA--ACTT-gc
gi|13                         :                                                                                            atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagCTGT-----ATTTCGTGTCCGGCCTGTAACGTTGTCATGC--ATAGATGGATTTTGTTAAAACTTGATACAAATGAT-CAAgatacaaatgatcaatgaacaaaga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagcatctgtttgtccatcATGCATTAGA-GGATTTTAATATAAACTAG-TACAAATGTTCACC-ACAC-CAAGATGAtgaacaaaga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cccgcgtcacattaacgaagggtgataaagtaatactcacagttcagttgtcctatttttccacaattttccaccattcttatTCATGTTTGGTTCGTAACTTTGTCATCCATAGAGAGAGATTTA--A--AATGACTTCACA---------CAAACTGGCATGACTTGGTGACCTGACATGTTGCAAG--CTACATCCAt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CTGCATATTATA-----------TATTAACA-TTTTCAC-AGATCATTT-------GTG--G-G-TGAATGCGGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTcttccgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tatatatatagattactcattttatGCAAAAACAAGGTATGTCCCTCACAGGTAAAGGTCACACATTGGCGT------TGAATTTATAAAAAAA-CAA-TAATTTG-ATATG-------tg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AT-TT--C-GTTTCTGGCCTGTATCT-T--TGTCATGCACAGATGGATTTTGTTGAT-AC-TTGGTACAAATGATCAACATAA-CATGATGATTTGTCATGAGTAAAAC------CCACACCCGTAT-----CTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGAATACACTTTGA----GTCTG-----------------TGCGAAACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTAATGAT-AC---TTGCTACAAATGATCAACATAACACGAC---GACATGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTAACTCA------AAGGTCAAGGTCACTATTTGAGTTTGTTTGACAACACTTCGAGTTTGTATGAGATTTTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACATAGATGGAT-TTTA--ATGAT--ACTT-GCTACAATTGATCAA-----CATAACATGAGGATGTGTCGCG-AGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCACAATT------TGAGTTTGACAACACTTTGAGTCTGTGTGATATTCTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATACTTaaccaatatttttttgtat
gi|2                          :                                            atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGA-ATACACTTTGAGTCTGTGCGAAACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGC--ATAGATGGATTTTAATGATACTTGCTACAAATGAT-CAACATAACACGACGACATGTTGCGAGTAAGAC--CCACACCT-GTAA---CTCAAAGGTCAAGGTCACT------ATTTGAGTTTGT-------TTGACAACAC--TTCG-AGTTTGTATGAGA---------TTTTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACAT-AGATGGATTTTAATG-ATACTTGCTACAATTGATCAAC-ATAA-CATGAGGATGTGTCGCGAGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCAC-AAT-----TTGA----G-TTTGACAACA------CTT------TGAGTC--TGTGTGATATT--CTGTGTCCGGCCTGCAACT-T--TGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATAC-TTGTTATAAATGATCAACATAA-CATGATGACGTTTTGCACTTAATAC------CC------AAACTCCCACTTAAAGGTCAAGGTCAC---------------------AATTTAACTTTGTTTGACAACACTTTCAGTCATTTTGACATTTCTTGTCCGGTC--TAATCT--------ATGGATAAATTTTA-AAATCAC---TTGGCTCAGTTGATCAACATGACATAATTAAG---TGTCGCATGTAAGACCCAGAACCTTTCCTCA------AAGATCCAGGTCACACTTTCAATTTGTTT---------------------GATATTGTGTGTCTGGTCTGTGACTTTGCC-TTTA-ACTTGGCT-C---------A--ATTT-AT----------CAA-----GATGAAATGACGACTTGTCATA-AGTAAGACCTAGACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTTTTAGTAT--GTATGACAACACTTTGAATCTGTTTGAGATTTCAAGACCGGCCTTTAACTTTATCATACATGGATGGA-TTTCAAAAATACTTGGTTCAATTTATCAACAATTGATCTGTAACTTTGTCTTACATTTAGGGAT----TTTAAA-ATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGGTGATGTTTCAGCAGCATT-TAAT-TGTT----GAAATACCCAGACCATTACATCAAATGTCAAGGTCAAA-GT-----T------gttataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaattgatctgtaactttgtcttacatttagggattttaaaatagcttgacacaagtgatcagcatgtcatggtgatgtttcagcagcatttaattgttgaaatacccagaccattacatcaaatgtcaaggtcaaagttacacaaaggtcaaggtcacgctttaatgtaaaaaaacatgaaattgcaagtctagtctgaaacatcagtccattactctttatattcatggatacagcgctacctattataacataattatatagttatttttcaatgaccatttgggggacatgcgccatttaccagtaacattttttgttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaTGATCTGTAACTTTGTCTTACATTTAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTC-ATGGTGATGTTTCAGCAGCATTTAATTGTTG----AAATACCCAGACC-ATTACATCA-AATGTCAAGGTCAAAGTTACACAAAGGTCAAGGTCACGCTTTAATGTAAAAAAACA---------TGAAATTGCAAGTCTAGTCTGAAACATCAGTCCATTACTCTTT-ATATTCATGGATACAGCGCTACCTATTATAACATAATTA--TATAGTTATTTTTCAA-TGACCATTT-------GGG--G-GAC--ATGCGCCATTTACC------A------GTAACATTTTTTGTTacacaaaggtcaaggtcacgctttaatgtaaaaaaacatgaaattgcaagtctagtctgaaacatcagtccattactctttatattcatggatacagcgctacctattataacataattatatagttatttttcaatgaccatttgggggacatgcgccatttaccagtaacattttttgttta
gi|20                         :                                                                                                                                                                            atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaggtcacaatttgagtttgtttgaatacactttgagtctgtgcgaaacttcgtgtccggcctgtaactttgtcatgcatagatggattttaatgatacttgctacaaatgatcaacataacacgacgacatgttgcgagtaagacccacacctgtaactcaaaggtcaaggtcactatttgagtttgtttgacaacacttcgagtttgtatgagattttgtgtccggcctgcaactttgtcatacatagatggattttaatgatacttgctacaattgatcaacataacatgaggatgtgtcgcgagtaagacccacacccatacctcaaagttcaaggtcacaatttgagtttgacaacactttgagtctgtgtgatattctgtgtccggcctgcaactttgtcatgcattgatggatttttataaatacttgttataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaatCACCATAATG--------A---GGCAATGTTTGGCACACAAGGTCCAGATCTGTAGGTCAAAGGTCATAGTCATA-CT-----T------AAAGGTTAT---ta
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taatacacaaattattGCATCTCAGAGGTCAAAGTTA-A-AT-----C------TGAGat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TA-TATTCAC-AGACAATTT-------GGGC-G-G-C--ATGTGACAC----C------G------ATGACATTTCTTGTTTT-----CTA-AAAG---GAAT-ATTTTTAAAAATCAGATTagttgaaaatatataaaaaaaacaaactttcatatcagatgtatgtatataacattttgttt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aCCAGCCTATAACTTTGCCATGCTAAGATGGATTTTATAAAC-ACAGATGGTTACAAA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GG--G-G-C--ATGAGATATTTACC------A------ATGACATTTCTTGTTatggatacttcatatcca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gaA--ACATTGC-ACAAATGTTCACCATAATCA-GCTGATGTGTTGTGCACAAGAC------Ctgtttttttatgcccatgaacaaattttgtaatat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          at-TTTGCAC-AGACCATTT-------GGG--GAG-C--GTGTTGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTGT-gagatctg
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -------GGG--G-G-C--ATGTGACACTTGCCAGCCTGA------GTGACATTTCTTGTTCT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                    gTTAAAAATTGGCA-AAATAAT-CAACATGACATTACAATGTATCGTCA-TAAGAC--CCAGACCCAGTATAAGCTCAGAGGTCAAGGTCACA------CTTTT-TTTTGT-------TTGGCAACCA--TTTA-AATATGTTTGAGAT--------TTTTTTTTCTTATCTGTAACTATGTCATACAT-GGATAAATTTCAAAA-ACACCTATCTCAATTGATTAAC-ATGG-CATGATGACTTGTTGTGCGTATGACCATGAACTGTACATC-AAGGTCAAGGTCAC-ACT-----TTCAGTTTGTTTTGGCAACC------ATT------TGAATCTGTTTGAGAT-TT--T--TTTCTTGCCTGTAACTATAATGTCATACATGGATAGACTTCAAAAAC-AC-CTGTCTCAATTGATTAACATGA-CATGACAACTTCTTGCGTGTATGACCATGAACT------GCAC-----ATC-AAGGTCAAGGTCAC---------------------ATTTTCA----GCTTG-----------------TTTGAGATTTTGTGTCTTCTCTGTTA--TTGTCTCACAAGGAGGGATTGTA-GAATAAC---TTGACACAAATG-TC----TGACA--AA---A---TGTCACCTGCAATAACCAGGCCTGTACATCACATGTCAACGTCAAGGTCATAttatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttTC------TTATCTGTAACTATGTCATACAT----GGATAAATTTCAAAAACA-CCTATCTCAATTGATTAACATGGCA---TGATG--------AC-------T-TGTTGTGCGTATGACCATGAACTGTACATCAA-GGTCAAGGTCACA-CT-----T------TCAGTTTGT---TTTGGCAA-CCATTTGAATCTG-------TTTGAGATTT-T-TTTCTTGCCTGTAACTATAATGTCATACATGGATAGACTTCAAAAACACCTGT------CT---CAA-TTG-ATTAACATGACATGAC-AACT-TCTTGCGTGTATGACCATGAACTGCACATCAAGGTCAAGGTCACATTTTCAGCTTGTTTGAGATTTTGTGTCTTCTCTGTTA--TTGTCTCACAAGGAGGGATTGTAGAATAACTTGACACAAATG-TC----------TGACAAAATGTCACCTGC----------------AA-TAACCAGGCC-TGTACATCACA-TGTCAACGTCAAGGTCATAC-AAAGTCAAGGTCACACTTTAAGGGGAAAAAAAAGAATTCTCTTGAAATT-TAAATCTCAACAGAA---TAAGT------ATA-TT-AT-TTTAAGG-----TC---ACTTA--ATAG---AC-CACTTAGGGTCA-CTTGGACTGGACCACTT-------AGG--G-C-G--ATGGGACACTTTCC------A------GTGACATTTCTTGCCAT-GG---TG-AGAGTTTACGTGATG----TAAACTGGTTTG-TTGTTA-A---TCAATATTATAT-TCATCTGGTTTGTCCAcaaagtcaaggtcacactttaaggggaaaaaaaagaattctcttgaaatttaaatctcaacagaataagtatattattttaaggtcacttaatagaccacttagggtcacttggactggaccacttagggcgatgggacactttccagtgacatttcttgccatggtgagagtttacgtgatgtaaactggtttgttgttaatcaatattatattcatctggtttgtcca
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttttaaaaattggcaaaataatcaacatgacattacaatgtatcgtcataagacccagacccagtataagctcagaggtcaaggtcacacttttttttgtttggcaaccatttaaatatgtttgagattttttttTTTCAT-AGACCATTTT------GGG--G-G-C--GTGCAACATTTACC------T------GTGAGATTT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CACCATAAT----------CA-GACAATGTTTTGTGTGCAAGACCCAGGTC
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tt-C--ATGTGACACTTACC------A------GTGACTTTTCTTGTTa
gi|4                          :                                                                                                                                                      ATTTCGTTTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGC--ATAGATGGATTTTGTTGAAACTTGCAACAAATGAT-CAACAGAACATGACATAGTGTTGCGAGTAAGAC--CCACACCC-GTAC---CTCAAAGGTCAAGGTCACA------ATTTCCGTTTGT-------TTGACAACAC--TTTG-AGTTTATGTGAAA---------TTTCGTTTCTGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATTAATTTTAATG-ATACTTGCTACAAATGAACAAC-ATAA-CATCATGACATGTTGt
gi|5                          :         gtctgtctgtccgggcaaacaaatgggtagttaagtgtctagggttatagtttttatggacagttgaaaagcagttaaaaaataattacgtggctgtttctagccacttaaaaaacagcatttaagtggctttttttctcttacgtggctaaaattatctaaaatttagccacacaagtaataagattgacgcaaagaagccacttaaatacccattcgtgagaacttccgtccgtccttccgtccggtGTCT-GTAT---CTCAAGGGTCAAGGTCACACAAGAGCATTGAATTTATGAAAAAAAAAACAACACTATTTATAATAT-TAT-AGAACATACTGTTTTCGTGTC--------AACTTTTACATGCAT-GAAAGGATTTT---------TTTTTAAAAA--AGCACCTATAATCA-----------CACCAATAAG--CCAGATCAGTATCCCAAAGGTCAAGGTCACAACTAAATGTTGAA---G-TT--ATAACATAATCTCTTTTAATATGAATC--CCATAAATGTTTAC-ATGTCCGGTCCATAACC-T--TCATATGCAgggggcatgtgacacttaacagtgacatttcttgtttccttctttc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaaagCCAGATCAGTATCCCAAAGGTCAAGGTCACA-AC-----TAAATGTTGAAGTTAT---AACA-TAATCTCTTTTAATATGAATCCCATA-AATGTTTACATGTCCGGTCCATAACC-T--TCATATGCA-----GAAT-------ATA-------------ATATAA-CTACATAAAGATGACGTGAC---GTGTgaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa
gi|8                          : aaaaggtctgtatctcaagggtcaaggtcacacaagagcattgaatttatgaaaaaaaaaacaacactatttataatattatagaacatactgttttcgtgtcaacttttacatgcatgaaaggatttttttttaaaaaagcacctataatcacaccaataagCTTTAACTCTTACAAGCTAATAA--GGATTTTAATATAAGTAGGTACAAGTTTTACAACATAAAGT--TGATGTG-CA-GAATGAAACAATCATGTCT-GTAA---CTCTGATGTCAAGGTCAGA------CTTagaactaaaaaaa
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): GCACACGAATGGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTAATAATTTTTATGGACGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTGGCTGTTTCTAGAAACTTAAAAACAGCTTTGATGTGACTTTTTTACTTTTATGTGGCTAAACTTTAACCACACAAGTAATAAGCTTGGCGCAAAGCTGCCACTTAAATACCCATTCCTAGGAACGTCCATCCGTACGTCCGTACGCCCGTCCGTCCGTTCTTCTG
Unaligned ( gi|7 ): TCTGTCCGGGCACACGAATAGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTAAGGGTTAGTAATTGTTATGGGCGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTTGCTGTTTCTAGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTGGCTTTTTTTTCTTTTAGCCACACAAGTAATAAGCTTGACGCAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTCGTAGAACGTCCGTCCGTCCGCCCGACGTCCCTCTGTCAGTCCGTCTGG
Unaligned ( gi|9 ): GAACTGTTCGTCCACATACACGAATGGGGAATTAAGTGTCTTGGGTTCAGGGTTAGTATTTGTTGTGGACGGTTTGAAAACAGTTGAAAAAAAATATGTCGCTGTTTCTGGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTAGCTTACTTATGTGGCTAAGATTTAAACACACAAGTAACAGGCTGGGCGCAAAGAAGCCTCTTAACTACCCATTTGTG
Unaligned ( gi|11 ): CACACAAATGGGTATTTAAGTGTCTAGGTTTTTTTAGCAAGTTGAAAAACAGTTGAATAAAAATTATGTGGCTGTTTCTAAGACACTTAAAAATACTTTTATGTGGCTATAAATCTGTTATGTGGCTAAAATATAGCCACACAAGCAATCAGCTAGGCGCAAAGAAGCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|15 ): AAGATTTTAATGTAACTTTGTACATGTGTTCAGAACATACATGTAATAATATGCAGGACACACGTGACAGCAAACCGTTCTGAAACTCTAGGATAAGGTCAGTAGTAGGGGTTGAAGTTATA
Unaligned ( gi|19 ): CTGTTTGAAAAACAGTTGGAAAAAAAAAAGTAGCTGTACCTGAATACGCTAAAATACACAAATAATCAGCTGGGCTCATAGAATCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|27 ): TCTGTCTGTAAATAGGTATTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTTGTAATTTGTT
Unaligned ( gi|29 ): TTTTAATGCCCCCCGCCCCCTCCCCCAATTTTTGGGGTGGCATAGTAAT
Unaligned ( gi|32 ): TTCAGCATAATGAGGTGATGTTTCGCATGCAAGGCCCTGA
Unaligned ( gi|33 ): AATAACATTGCACAAATATTCACCATAATCAGATGA
Unaligned ( gi|34 ): CAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTTGTGAGAAC






Alignments
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Reference ( family-279 )      :                                                                                       NNNNNNNNNNNNGGTCACANTTTGGGTTTGTTTGATATACACTTTGAGTCTGTG--AGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTAAAACTTGNNACAAATGATCAACATAACATGACGACGTGTCGCGAGTAAGACCCACACCC-GTAN---CTCAAAGGTCAAGGTCACA------CTTTGAGTTTGTTTG---------ACAACAC--TTTG-AGTNTGTGTGAGA---------TTTCGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATGGATTTTAATA-ATACTTGCTACAAATGAT-CAACATAACATGATGACGTGTCGCGAGTAAGAC--CCANACCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCAC-ACT-----TTGAGTTTG-TTTGACAACA------CTT------TGAGTC--TNTGAGAT-TT--C-GTGTCCGGCCTGTAACT-T--TGTCATGCACGGATGGATTTCGNTAA--AC-TTGCTACAAATGATCAACATAA-CATGACGACGTGTTGCGCGTAAGAC------CC------GTAC-----CTCAAAGGTCAAGGTCAC---------------------ACTTTGAGTTTGTNTG-----------AG----------ATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCACGCATAGATGGATTTTATAAAT-AC---TTGNTACAAATG-ATCAACA-TGACACGAC---G---TGTCGCGCGTAANACCCAGACCCGTACCTCA------AAGGTCAAGGTCACAATTTNANTTT---GTT-TGAC-A----CTCTTTNAGTCT--ATNCGANA----TTT-CGTGTCCGGTCTGTAACTTTGTCATNCATAG-ATGGAT-TTTAA--AA--ACTT-AC----------CAA-----CATGACATGACGACNTGTCACG-NGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTT------T--GTTTGACAACACTTTGANTCTGTNTGAGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCGTGCATNGATGGA-TTTCATAAATACTTNGTTCAATTTGTC------TGATCTGTAACTTTGTC-TACAT----GGAT----TTCAAAA-CA-CTTGNCTCAATTGATCAACATGNCACGATGATG--------ACATGACAATGTGTTGCGCGCAAGACCCAGATCTGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACA-AT------TTGAGTTTAT---NNCG-CAA-CNNTTTGAATATG-------TT-GAGATTT-CATGTCCGGTCCGTAACT-T--TNTCATGCATGGATGAATTTCAAAAACACCTG-------CTATCAATTGATNAACATGACGTGAC-AAGTGTCTTGCGTNTACGACCATGAACTGNACATCAAGGTCAAGGTCACACTTTCAGCTTGTTTGAGATTTCGTGTCTGNTCTGTAACTTTGTCTTACATGGAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATG-C-ATGACGATGTGTCANCTGCATTTA----CTG----AA-TACCCAGACC-TTTACATCA-A-TGTCAAGGTCAAGGTCACACAAAAGTCAAGGTCACGCTTTAANGTGAAAAAACA---------TGAAATTGCANGTCTAGTCGGAAAC-TCAGTCCATTGATC-TT-ATATTCATGGATACATCGCTACCTATTATAA---AA-CA--TATNGTTA-TTTTCAC-AGACCATTT-------GGG--G-G-C--ATGCGACACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTNT-AG-AATA-AAAA---ACGT-ATT----AAAATCGGTTTGCTTATAA-A-GTTCATTATTATAT-TCATAT--TTTCTCCATGATATAAACAAAAATTTGAGGAAANNANTAGGAAAGAANAAATTGCCTACCTGCNTANCCTTTTTTGTATTGTTGGTCAGTAACCCTAAACACAGGTATTATTTTTTCT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagcatctgtttgtccatcATGCATTAGA-GGATTTTAATATAAACTAG-TACAAATGTT-CACCACACCAAGATGAtgaacaaaga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cccgcgtcacattaacgaagggtgataaagtaatactcacagttcagttgtcctatttttccacaattttccaccattcttatT-CATGTTTGGTTCGTAACTTTGTCATCCATAG-AGAGAGATTTAA--AATGACTTCACA---------CAAACTGGCATGACTTGGTGACCTGACATGTTGCAAG--CTACATCCAt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTGCATATTATA-----------TATTAACA-TTTTCAC-AGATCATTT-------GTG--G-G-TGAATGCGGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTcttccgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tatatatatagattactcattttatGCAAAAACAAGGTATGTCCCTCACAGGTAAAGGTCACACATTGGCG-TTGAATTTATAAAAAAA-CAA-TAATTTG-ATATG-------tg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AT-TT--C-GTTTCTGGCCTGTATCT-T--TGTCATGCACAGATGGATTTTGTTGAT-AC-TTGGTACAAATGATCAACATAA-CATGATGATTTGTCATGAGTAAAAC------CCACACCCGTAT-----CTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGAATACACTTTGAGTCTGTGCG-----------AA----------ACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTAATGAT-AC---TTGCTACAAATG-ATCAACA-TAACACGAC---GACATGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTAACTCA------AAGGTCAAGGTCACTATTTGAGTTT---GTT-TGACAA----CACTTCGAGTTT--GTATGAGA----TTT-TGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACATAG-ATGGAT-TTTAATGAT--ACTT-GCTACAATTGATCAA-----CATAACATGAGGATGTGTCGCG-AGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCACAATT------TGAGTTTGACAACACTTTGAGTCTGTGTGATATTCTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATACTT-GTTaaccaatatttttttgtat
gi|2                          :                                       atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGA-ATACACTTTGAGTCTGTGCGAAACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTAATGATACTTGCTACAAATGATCAACATAACACGACGACATGTTGCGAGTAAGACCCACACCT-GTAA---CTCAAAGGTCAAGGTCACT------ATTTGAGTTTGTTTG---------ACAACAC--TTCG-AGTTTGTATGAGA---------TTTTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACAT-AGATGGATTTTAATG-ATACTTGCTACAATTGAT-CAACATAACATGAGGATGTGTCGCGAGTAAGAC--CCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCAC-AAT-----TTGA----G-TTTGACAACA------CTT------TGAGTC--TGTGTGATATT--CTGTGTCCGGCCTGCAACT-T--TGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATAC-TTGTTATAAATGATCAACATAA-CATGATGACGTTTTGCACTTAATAC------CC------AAACTCCCACTTAAAGGTCAAGGTCAC---------------------AATTTAACTTTGTTTGACAACACTTTCAGTCATTTTGACATTTCTTGTCCGGTC--TAATCT--------ATGGATAAATTTTA-AAATCAC---TTGGCTCAGTTG-ATCAACA-TGACATAATTAAG---TGTCGCATGTAAGACCCAGAACCTTTCCTCA------AAGATCCAGGTCACACTTTCAATTT---GTT-T---------------------------GATA----TTG-TGTGTCTGGTCTGTGACTTTGCC-TTTA-AC-TTGGCT-C-------A--ATTT-AT----------CAA-----GATGAAATGACGACTTGTCATA-AGTAAGACCTAGACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTTTTAGTAT--GTATGACAACACTTTGAATCTGTTTGAGATTTCAAGACCGGCCTTTAACTTTATCATACATGGATGGA-TTTCAAAAATACTTGGTTCAATTTATCAACAATTGATCTGTAACTTTGTCTTACATTTAGGGAT----TTTAAAA-TAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGGTGATGTTTCAGCAGCATT-TAAT-TGTT----GAAATACCCAGACCATTACATCAAATGTCAAGGTCAAA-GT------Tataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaattgatctgtaactttgtcttacatttagggattttaaaatagcttgacacaagtgatcagcatgtcatggtgatgtttcagcagcatttaattgttgaaatacccagaccattacatcaaatgtcaaggtcaaagttacacaaaggtcaaggtcacgctttaatgtaaaaaaacatgaaattgcaagtctagtctgaaacatcagtccattactctttatattcatggatacagcgctacctattataacataattatatagttatttttcaatgaccatttgggggacatgcgccatttaccagtaacattttttgttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaTGATCTGTAACTTTGTCTTACATTTAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTC-ATGGTGATGTTTCAGCAGCATTTAATTGTTG----AAATACCCAGACC-ATTACATCA-AATGTCAAGGTCAAAGTTACACAAAGGTCAAGGTCACGCTTTAATGTAAAAAAACA---------TGAAATTGCAAGTCTAGTCTGAAACATCAGTCCATTACTCTTT-ATATTCATGGATACAGCGCTACCTATTATAACATAATTA--TATAGTTATTTTTCAA-TGACCATTT-------GGG--G-GAC--ATGCGCCATTTACC------A------GTAACATTTTTTGTTacacaaaggtcaaggtcacgctttaatgtaaaaaaacatgaaattgcaagtctagtctgaaacatcagtccattactctttatattcatggatacagcgctacctattataacataattatatagttatttttcaatgaccatttgggggacatgcgccatttaccagtaacattttttgttta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                     atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaggtcacaatttgagtttgtttgaatacactttgagtctgtgcgaaacttcgtgtccggcctgtaactttgtcatgcatagatggattttaatgatacttgctacaaatgatcaacataacacgacgacatgttgcgagtaagacccacacctgtaactcaaaggtcaaggtcactatttgagtttgtttgacaacacttcgagtttgtatgagattttgtgtccggcctgcaactttgtcatacatagatggattttaatgatacttgctacaattgatcaacataacatgaggatgtgtcgcgagtaagacccacacccatacctcaaagttcaaggtcacaatttgagtttgacaacactttgagtctgtgtgatattctgtgtccggcctgcaactttgtcatgcattgatggatttttataaatacttgttataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaatCACCATAATG--------A---GGCAATGTTTGGCACACAAGGTCCAGATCTGTAGGTCAAAGGTCATAGTCATA-CT------TAAAGGTTAT---ta
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        taatacacaaattattGCATCTCAGAGGTCAAAGTTA-A-AT------CTGAGat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TA-TATTCAC-AGACAATTT-------GGGC-G-G-C--ATGTGACAC----C------G------ATGACATTTCTTGTTTT-----CTA-AAAG---GAAT-ATTTTTAAAAATCAGATTagttgaaaatatataaaaaaaacaaactttcatatcagatgtatgtatataacattttgttt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aCCAGCCTATAACTTTGCCATGCTAAGATGGATTTTATAAAC-ACAGATGGTTACAAA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GG--G-G-C--ATGAGATATTTACC------A------ATGACATTTCTTGTTatggatacttcatatcca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gaA--ACATTGC-ACAAATGTTCACCATAATCA-GCTGATGTGTTGTGCACAAGAC------Ctgtttttttatgcccatgaacaaattttgtaatat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           at-TTTGCAC-AGACCATTT-------GGG--GAG-C--GTGTTGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTGT-gagatctg
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -------GGG--G-G-C--ATGTGACACTTGCCAGCCTGA------GTGACATTTCTTGTTCT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                             gTTAAAAATTGGCA-AAATAATCAACATGACATTACAATGTATCGTCA-TAAGACCCAGACCCAGTATAAGCTCAGAGGTCAAGGTCACA------CTTTT-TTTTGTTTG---------GCAACCA--TTTA-AATATGTTTGAGAT--------TTTTTTTTCTTATCTGTAACTATGTCATACAT-GGATAAATTTCAAAA-ACACCTATCTCAATTGAT-TAACATGGCATGATGACTTGTTGTGCGTATGAC--CATGAACTGTACATC-AAGGTCAAGGTCAC-ACT-----TTCAGTTTGTTTTGGCAACC------ATT------TGAATCTGTTTGAGAT-TT--T--TTTCTTGCCTGTAACTATAATGTCATACATGGATAGACTTCAAAAAC-AC-CTGTCTCAATTGATTAACATGA-CATGACAACTTCTTGCGTGTATGACCATGAACT------GCAC-----ATC-AAGGTCAAGGTCAC---------------------ATTTTCAGCTTGTTTG-----------AG----------ATTTTGTGTCTTCTCTGTTA--TTGTCTCACAAGGAGGGATTGTA-GAATAAC---TTGACACAAATG--TC-----TGACA--AA---A---TGTCACCTGCAATAACCAGGCCTGTACATCACATGTCAACGTCAAGGTCATAttatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttTTTTTC------TTATCTGTAACTATGTCATACAT----GGATAAATTTCAAAAACA-CCTATCTCAATTGATTAACATGGCA---TGATG--------AC-------T-TGTTGTGCGTATGACCATGAACTGTACATCAA-GGTCAAGGTCACA-CT------TTCAGTTTGT---TTTGGCAA-CCATTTGAATCTG-------TTTGAGATTT-T-TTTCTTGCCTGTAACTATAATGTCATACATGGATAGACTTCAAAAACACCTG--------TCTCAATTGATTAACATGACATGAC-AACT-TCTTGCGTGTATGACCATGAACTGCACATCAAGGTCAAGGTCACATTTTCAGCTTGTTTGAGATTTTGTGTCTTCTCTGTTA--TTGTCTCACAAGGAGGGATTGTAGAATAACTTGACACAAATG-TC----------TGACAAAATGTCACCTGC----------------AA-TAACCAGGCC-TGTACATCACA-TGTCAACGTCAAGGTCATAC-AAAGTCAAGGTCACACTTTAAGGGGAAAAAAAAGAATTCTCTTGAAATT-TAAATCTCAACAGAA---TAAGT------ATA-TT-AT-TTTAAGG-----TC---ACTTA--ATAG---AC-CACTTAGGGTCA-CTTGGACTGGACCACTT-------AGG--G-C-G--ATGGGACACTTTCC------A------GTGACATTTCTTGCCAT-GG---TG-AGAGTTTACGTGATG----TAAACTGGTTTG-TTGTTA-A---TCAATATTATAT-TCATCTGGTTTGTCCAcaaagtcaaggtcacactttaaggggaaaaaaaagaattctcttgaaatttaaatctcaacagaataagtatattattttaaggtcacttaatagaccacttagggtcacttggactggaccacttagggcgatgggacactttccagtgacatttcttgccatggtgagagtttacgtgatgtaaactggtttgttgttaatcaatattatattcatctggtttgtcca
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttttaaaaattggcaaaataatcaacatgacattacaatgtatcgtcataagacccagacccagtataagctcagaggtcaaggtcacacttttttttgtttggcaaccatttaaatatgtttgagattttTTTCAT-AGACCATTTT------GGG--G-G-C--GTGCAACATTTACC------T------GTGAGATTT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CACCATAAT----------CA-GACAATGTTTTGTGTGCAAGACCCAGGTC
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tt-C--ATGTGACACTTACC------A------GTGACTTTTCTTGTTa
gi|4                          :                                                                                                                                                 ATTTCGTTTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTGAAACTTGCAACAAATGATCAACAGAACATGACATAGTGTTGCGAGTAAGACCCACACCC-GTAC---CTCAAAGGTCAAGGTCACA------ATTTCCGTTTGTTTG---------ACAACAC--TTTG-AGTTTATGTGAAA---------TTTCGTTTCTGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATTAATTTTAATG-ATACTTGCTACAAATGAA-CAACATAACATCATGACATGTTGt
gi|5                          : gtctgtctgtccgggcaaacaaatgggtagttaagtgtctagggttatagtttttatggacagttgaaaagcagttaaaaaataattacgtggctgtttctagccacttaaaaaacagcatttaagtggctttttttctcttacgtggctaaaattatctaaaatttagccacacaagtaataagattgacgcaaagaagccacttaaatacccattcgtgagaacttccgtccgtccttccgtccggtCT-GTAT---CTCAAGGGTCAAGGTCACACAAGAGCATTGAATTTA--TGAAAAAAAAAACAACACTATTTATAATAT-TAT-AGAACATACTGTTTTCGTGT--------CAACTTTTACATGCAT-GAAAGGATTTT---------TTTTTAAAAA--AG-CACC----TATAATCA-----CACCAATAAG----CCAGATCAGTATCCCAAAGGTCAAGGTCACAACTAAATGTTGAA---G-TT--ATAACATAATCTCTTTTAATATGAATC--CCATAAATGTTTAC-ATGTCCGGTCCATAACC-T--TCATATGCAgggggcatgtgacacttaacagtgacatttcttgtttccttctttc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaaaggtTTTCGTGTC--------AACTTTTACATGCATGAAAGGATTTT------------TTTTTAAAAAAGCACCTATAATCACACCA----------------ATAAG--CCAGATCAGTATCCCA------AAGGTCAAGGTCACAACTAAATGTTGAAGTTATAAC-ATAATCTCTTTTAATATGAATCCCATAAATGTTTACATGTCCGGTCCATAACCT--TCATATGCAGAATATAA-TATAA--CT--ACAT-A------------AA-----GATGACGTGACGgaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaaaggtctgtatctcaagggtcaaggtcacacaagagcattgaatttatgaaaaaaaaaacaacactatttataatattatagaacatactgtCCAGATCAGTATCCCAAAGGTCAAGGTCACA-ACTAAATGTTGAAGTTAT---AACA-TAATCTCTTTTAATATGAATCCCATA-AATGTTTACATGTCCGGTCCATAACC-T--TCATATGCA-----GAATAT--AATATAACTA-------C---------ATAAAGATGACGTGAC---GTGTtgtagaactaaaaaaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                           aaaaggtctgtatctcaagggtcaaggtcacacaagagcattgaatttatgaaaaaaaaaacaacactatttataatattatagaacatactgttttcgtgtcaacttttacatgcatgaaaggatttttttttaaaaaagcacctataatcacaccaataagGGATTTTAATA-TAAGTAGGTACAAGTTTTACAACATAAAGT--TGATGTG-CA-GAATGAAACAATCATGTCTGTAACTCTGATGTCAAGGTCAG-ACT-----Tagaactaaaaaaa
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|7 ): TCTGTCCGGGCACACGAATAGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTAAGGGTTAGTAATTGTTATGGGCGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTTGCTGTTTCTAGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTGGCTTTTTTTTCTTTTAGCCACACAAGTAATAAGCTTGACGCAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTCGTAGAACGTCCGTCCGTCCGCCCGACGTCCCTCTGTCAGTCCGTCTGG
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Unaligned ( gi|15 ): AAGATTTTAATGTAACTTTGTACATGTGTTCAGAACATACATGTAATAATATGCAGGACACACGTGACAGCAAACCGTTCTGAAACTCTAGGATAAGGTCAGTAGTAGGGGTTGAAGTTATA
Unaligned ( gi|19 ): CTGTTTGAAAAACAGTTGGAAAAAAAAAAGTAGCTGTACCTGAATACGCTAAAATACACAAATAATCAGCTGGGCTCATAGAATCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|27 ): TCTGTCTGTAAATAGGTATTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTTGTAATTTGTT
Unaligned ( gi|29 ): TTTTAATGCCCCCCGCCCCCTCCCCCAATTTTTGGGGTGGCATAGTAAT
Unaligned ( gi|32 ): TTCAGCATAATGAGGTGATGTTTCGCATGCAAGGCCCTGA
Unaligned ( gi|33 ): AATAACATTGCACAAATATTCACCATAATCAGATGA
Unaligned ( gi|34 ): CAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTTGTGAGAAC






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Reference ( family-279 )      :                                                                                       NNNNNNNNNNNNGGTCACANTTTGGGTTTGTTTGATATACACTTTGAGTCTGTG--AGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTAAAACTTGCNACAAATGATCAACATAACATGACGACGTGTTGCGAGTAAGACCCACACCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACACT------TTGAGTTTGTTTGA---------CAACACT--TTG-AGTNTGTGTGAGA---------TTTCGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATGGATTTTAATA-ANACTTGCTACAAATGAT-CAACATAA-CATGATGACGTGTCGCGAGTAAGAC--CCANACCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCAC-ACT-----TTGAGTTTGTTTGACAACA------CTT------TGAGTCTNTGAGAT-TT--C-GTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCACGGATGGATTTCGNTAA--ACTTGCTACAAATGATCAACATAACATGACGACGTGTTGCGCGTAAGACCC------GTAC-----CTCAAAGGTCAAGGTCAC---------------------ACTTTGAGTTTGTNTG-----------AG----------ATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATGGATGGATTTTA-A-AAT-AC---TTGNTACAAATG-ATCAACA-TGACACGAC---G---TGTCGCGCGTAAGACCCAGACCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTAANTTT---GTT-TGAC---ATCTCTTTNAGTNT--ATNCGANA----TTT-CGTGTCCGGTCCGTAACTTTGTCATNTATAG-ATAGAT-TTTA--A--AA--ACTT-AC----------CAA-----CATGACATGACGACNTGTCACG-NGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTT------T--GTTTGACAACACTTTGANTCTGTNTGAGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCGTGCATNGATGGA-TTTCATAAATACTT-GTTCAA------TTTNTC------TGATCTGTAACTTTGTC-TACAT----GGAT----TTCAAAA-CA-CTTGNCTCAATTGATCAACATGNCACGATGATG--------ACATGACAATGTGTTGCGCGCAAGACCCAGATCT-GTAC---CTCAAAGGTCAAGGTCACA-AT-----TTGAGTTTAT---NNCG-CAACNNTTTGAATATGTT-GAGATTTCATGTCCG-GTCCGTAACT-T--TNTCATGCATGGATGAATTTCAAAAACACCT-GCT-------TCAA-TT-ATNAACATGACGTGAC-AAGTGTCTTGCGTNTACGACCATGAACTGNACATCAAGGTCAAGGTCACACTTTCAGCTTGT----------------------TTGAGATTTCGTGTCTGNTCTGTAACT-T--TGTCTTACATGGAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATG-C-ATGACGATGTGTCANCTGCATTTA----CTG----AA-TACCCA-GACC-TTTA-CATCA-A-TGTCA-AGGTCAAGGTCACACAAAAGTCAAGGTCACGCTTTAANGTGAAAAAACA---------TGAAATTGCANGTCTAGTCGGAAAC-TCAGTCCATTGATC-TT-ATATTCATGGATACATCGCTACCTATTATAA---AA-CA--TATNGTTA-TTTTCAC-AGACCATTT-------GGG--G-G-C--ATGCGACACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTNT-AG-AATA-AAAA---ACGT-ATT----AAAATCGGTTTGCTTATAA-A-GTTCATTATTATAT-TCATAT--TTTCTCCATGATATAAACAAAAATTTGAGGAAANNANTAGGAAAGAANAAATTGCCTACCTGCNTANCCTTTTTTGTATTGTTGGTCAGTAACCCTAAACACAGGTATTATTTTTTCT
gi|1                          :                                                                                                   GGTCACACTTTGGGTTTGTTTGATAT-CACTTTGAGTCTGTG--AGATTTTGTGTCCGGCCTGTAA-TTTGTCATGCATGAATGGATTTTGTTAATACTTGCAACAAATGATCAACATAACATGACGATGTGTTGCGAGTAAGACCCACATCTGCACCTCAAAGGTCAAGGTCACACT------TTGAGTTTGCATGA---------CAATACT--TTG-AGTCTGTGTGAGA---------TTTCGTGTCAGGCCTGTAACTTTGTTATTCAT-ACATGGATTTTGTTA-ATATTTGCTACAAATGAT-CAACATAA-CATGACTATGTGTCACAAGTAAGAC--CCACACCCGTACCACAAAGGTCAAGTTCAC-ACT-----TTGAGTTTGTTTGACATCA------CTT------TGAGTC--TGAGAT-TT--C-GTGTCCGGTCTGTAACTTTGTCATGCATGAATGGATTTTGTT-A--ATTTGCTACAAATGATCAACATAAAATGACGACGTGTTGTAAGAAAGACCC------ATAC-----CTCAAAGGTCAAGGTCAC---------------------ACTTTGAGTTTGTGTG-----------AG----------ATTTCATGTCTGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTATA-AAT-AC---CTGCTACAAATG-ATCAACA-CAACATGAC---A---TGTCACACTTAACATCCAGACTCCCACTTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTAACTTT---GTT-TGAC---ATCTCTTTCAGTCT--ATTTGAGA----TTT-CGTGTCCAGTCTGTAACTTTGTCACCTATAG-ATAAAT-TTCA--A--AA--ACTT-AC----------CAG-----CATGACATGACTACATGTCACG-TGTAAGACCCACACCCATACCTTAAAGGTCAAGGTCACACTT------T--GTTTGACTACATTTTGATGCTGTATGAGATTTCGTGTCTAGTCTGTAACTTTGTCGTGCATAGAT-GA-TTTCTTTGATAT----TTCG---------TGTC------TGATCTGTAACTTTGTC-T-----------T----TT-------A-CTTGGCTCATTTGATCAAGATGACATGACGATG--------ACATGACAATGTGTCGCATGTAAGACCCAGATCT-GTAC---CTCAAAGGTCAAGGTCACA-AT-----TTGAGTTTGT---TCCA-CAACACTTTGAGTATGTT-GAGATTTCAAGTCCA-GTCTGTAAGT-T--TATCATGCATGGATGAATTTCAAAAACACTTGGCTTGATTTATCAATTT-ATCAACATGACATGACAAAGTGTC--GC-TTTAC---------CTGA-----AAGGTTAAGGTCACACTTTCAGTTTG-----------------------------TTTCATGTCTGGTC--TAATT-T--TGTTTTACATGGAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGTATG-TGATGATGATGTGTCATCTGCATTTAC---CTGTAGAAA-TACCCA-CACCTTTTA-CATCAGA-TGTTA-AGGTCAAGGTTACACAAAAGTCAAGGTCACCCTTTAATGTGAAAAAACA---------TGAAATTGCATGTCTAGTCGTAAACTTCAGTCCATGGATC-TTGATATTCATGGATACATCGCTACCTATTATAA---AA-TA--TATCGTTA-TTTTCAC-AGACCATTT-------GGG--G-G-C--ATGCAACACTTTCC------A------GTGACATTTCTTGTTAT-AG-AATA-AAAA---ACAT-GTT----AAATTCAGTTTGCTTATAATA-GTTCATTATTATATATTATAT--TTTCTCCATGATATAAACAAAAA---GAAGAAACAAATAGAAAAGAACAAATTGTCTACCTGCCTAACCTTTTTTGTATT-TTGGTCAATAACTCTAAACACAGGTATTATTTTTTCT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aannnnnnnnnnTCACAGAAAATTCACGGTCACACTTTAAGATAAAAAAA---------------ATTGTGTTTCT-GTTGG-----------TATTGATC-TT-AC--TCTT---TATATC-CCA--TATTTTAA---AA-CG--TATCGTTT-TTATCAA-CGACCACTTCTGGATGGGGTTG-G-C--ATGTGAGATTTACC------AGTCACTGTGGCATTTATCGTTCTGAGTAATA-TAAA---GCGTAATT----AA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -AG-AACAGAAAA---ACAA-ATT----AAAATCAATTTGCTTATAA-AAGTTCATCATTATG----ATAT--TTTCTCCATGA----AATAAAAATTTGAGAAAAATATTAGGAAAGAAAAAATTGCCTACCTACATACCCTTTT---TATTGTTG---AGTAACCCTAAACACAGGTATTATTTTTTCTtcacccgtgagttgaca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttaaC---ATCTGTTT--GTCC--ATCCTGTA----TTT-CGTGTCCGGCCTGTAACGTTGTCATGCATAG-ATGGAT-TTTGTTA--AA--ACTT-gc
gi|13                         :                                                                                       atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagCTGT-----ATTTCGTGTCCGGCCTGTAACGTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTAAAACTTGATACAAATGATCAAgatacaaatgatcaatgaacaaaga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagcatctgtttgtccatcATGCATTAGA-GGATTTTAATATAAACTAG-TACAAATGTT-CACCACAC-CAAGATGAtgaacaaaga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cccgcgtcacattaacgaagggtgataaagtaatactcacagttcagttgtcctatttttccacaattttccaccattcttatT-CATGTTTGGTTCGTAACTTTGTCATCCATAG-AGAGAGATTTA--A--AATGACTTCACA---------CAAACTGGCATGACTTGGTGACCTGACATGTTGCAAG--CTACATCCAt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTGCATATTATA-----------TATTAACA-TTTTCAC-AGATCATTT-------GTG--G-G-TGAATGCGGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTcttccgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatatatatagattactcattttatGCAAAAACAAGGTAT-GTCC---CTCACAGGTAAAGGTCACACATTGGCGTTGAATTTATAAAAAAA-CAATAATTTG-ATATGtg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AT-TT--C-GTTTCTGGCCTGTATCTTTGTCATGCACAGATGGATTTTGTTGAT-ACTTGGTACAAATGATCAACATAACATGATGATTTGTCATGAGTAAAACCCACACCCGTAT-----CTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGAATACACTTTGAGTCTGTGCG-----------AA----------ACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTA-ATGAT-AC---TTGCTACAAATG-ATCAACA-TAACACGAC---GACATGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTATTTGAGTTT---GTT-TGAC---AACACTTCGAGTTT--GTATGAGA----TTT-TGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACATAG-ATGGAT-TTTA--ATGAT--ACTT-GCTACAATTGATCAA-----CATAACATGAGGATGTGTCGCG-AGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCACAATT------TGAGTTTGACAACACTTTGAGTCTGTGTGATATTCTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATACTT-GTTaaccaatatttttttgtat
gi|2                          :                                       atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGA-ATACACTTTGAGTCTGTGCGAAACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTAATGATACTTGCTACAAATGATCAACATAACACGACGACATGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTAT------TTGAGTTTGTTTGA---------CAACACT--TCG-AGTTTGTATGAGA---------TTTTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACAT-AGATGGATTTTAATG-ATACTTGCTACAATTGAT-CAACATAA-CATGAGGATGTGTCGCGAGTAAGAC--CCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCAC-AAT-----TTGA----GTTTGACAACA------CTT------TGAGTCTGTGTGATATT--CTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATACTTGTTATAAATGATCAACATAACATGATGACGTTTTGCACTTAATACCC------AAACTCCCACTTAAAGGTCAAGGTCAC---------------------AATTTAACTTTGTTTGACAACACTTTCAGTCATTTTGACATTTCTTGTCCGGTC--TAATCT--------ATGGATAAATTTTA-A-AATCAC---TTGGCTCAGTTG-ATCAACA-TGACATAATTAAG---TGTCGCATGTAAGACCCAGAACCTTTCCTCAAAGATCCAGGTCACACTTTCAATTT---GTT-TGAT---AT---------TGT-------------------GTGTCTGGTCTGTGACTTTGCC-TTTA-AC-TTGGCT-C---------A--ATTT-AT----------CAA-----GATGAAATGACGACTTGTCATA-AGTAAGACCTAGACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTTTTAGTAT--GTATGACAACACTTTGAATCTGTTTGAGATTTCAAGACCGGCCTTTAACTTTATCATACATGGATGGA-TTTCAAAAATACTTGGTTCAA------TTTATCAACAATTGATCTGTAACTTTGTCTTACATTTAGGGAT----TTTAAAA-TAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGGTGATGTTTCAGCAGCATT-TAAT-TGTT----GAAATACCCAGACCA-TTAC---ATCAAATGTCAAGGTCAAA-GT-----Tataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaattgatctgtaactttgtcttacatttagggattttaaaatagcttgacacaagtgatcagcatgtcatggtgatgtttcagcagcatttaattgttgaaatacccagaccattacatcaaatgtcaaggtcaaagttacacaaaggtcaaggtcacgctttaatgtaaaaaaacatgaaattgcaagtctagtctgaaacatcagtccattactctttatattcatggatacagcgctacctattataacataattatatagttatttttcaatgaccatttgggggacatgcgccatttaccagtaacattttttgttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaTGATCTGTAACT-T--TGTCTTACATTTAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTC-ATGGTGATGTTTCAGCAGCATTTAATTGTTG----AAATACCCA-GACC-ATTA-CATCA-AATGTCA-AGGTCAAAGTTACACAAAGGTCAAGGTCACGCTTTAATGTAAAAAAACA---------TGAAATTGCAAGTCTAGTCTGAAACATCAGTCCATTACTCTTT-ATATTCATGGATACAGCGCTACCTATTATAACATAATTA--TATAGTTATTTTTCAA-TGACCATTT-------GGG--G-GAC--ATGCGCCATTTACC------A------GTAACATTTTTTGTTacacaaaggtcaaggtcacgctttaatgtaaaaaaacatgaaattgcaagtctagtctgaaacatcagtccattactctttatattcatggatacagcgctacctattataacataattatatagttatttttcaatgaccatttgggggacatgcgccatttaccagtaacattttttgttta
gi|20                         :                                                                                                                                                                      atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaggtcacaatttgagtttgtttgaatacactttgagtctgtgcgaaacttcgtgtccggcctgtaactttgtcatgcatagatggattttaatgatacttgctacaaatgatcaacataacacgacgacatgttgcgagtaagacccacacctgtaactcaaaggtcaaggtcactatttgagtttgtttgacaacacttcgagtttgtatgagattttgtgtccggcctgcaactttgtcatacatagatggattttaatgatacttgctacaattgatcaacataacatgaggatgtgtcgcgagtaagacccacacccatacctcaaagttcaaggtcacaatttgagtttgacaacactttgagtctgtgtgatattctgtgtccggcctgcaactttgtcatgcattgatggatttttataaatacttgttataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaatCACCATAATG--------A---GGCAATGTTTGGCACACAAGGTCCAGATCT-GTAG---GTCAAAGGTCATAGTCATA-CT-----TAAAGGTTAT---ta
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taatacacaaattatt-GCAT---CTCAGAGGTCAAAGTTA-A-AT-----CTGAGat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TA-TATTCAC-AGACAATTT-------GGGC-G-G-C--ATGTGACAC----C------G------ATGACATTTCTTGTTTT-----CTA-AAAG---GAAT-ATTTTTAAAAATCAGATTagttgaaaatatataaaaaaaacaaactttcatatcagatgtatgtatataacattttgttt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aCCAGCCTATAACTTTGCCATGCTAAGATGGATTTTATA-AAC-ACAGATGGTTACAAA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GG--G-G-C--ATGAGATATTTACC------A------ATGACATTTCTTGTTatggatacttcatatcca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaATA-ACA-TTGC-ACAAATGTT-CACCATAATCA-GCTGATGTGTTGTGCACAAGAC--CGAGATCTGtgtttttttatgcccatgaacaaattttgtaatat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -TTTGCAC-AGACCATTT-------GGG--GAG-C--GTGTTGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTGT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -------GGG--G-G-C--ATGTGACACTTGCCAGCCTGA------GTGACATTTCTTGTTCT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTTTTAAAA-A--TTGGCA-AAATAATCAACATGAC-ATTACAATGTATCGTC---AT--------------AA-GACCCA-GACC-C--AGTAT-A-A-GCTCAGAGGTCAAGGTCACACttatg
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gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttttaaaaattggcaaaataatcaacatgacattacaatgtatcgtcataagacccagacccagtataagctcagaggtcaaggtcacacttttttttgtttggcaaccattTTTCAT-AGACCATTTT------GGG--G-G-C--GTGCAACATTTACC------T------GTGAGATTT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CACCATAAT----------CA-GACAATGTTTTGTGTGCAAGACCCAGGTC
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tt-C--ATGTGACACTTACC------A------GTGACTTTTCTTGTTa
gi|4                          :                                                                                                                                                 ATTTCGTTTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTGAAACTTGCAACAAATGATCAACAGAACATGACATAGTGTTGCGAGTAAGACCCACACCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACAAT------TTCCGTTTGTTTGA---------CAACACT--TTG-AGTTTATGTGAAA---------TTTCGTTTCTGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATTAATTTTAATG-ATACTTGCTACAAATGAA-CAACATAA-CATCATGACATGTTGt
gi|5                          : gtctgtctgtccgggcaaacaaatgggtagttaagtgtctagggttatagtttttatggacagttgaaaagcagttaaaaaataattacgtggctgtttctagccacttaaaaaacagcatttaagtggctttttttctcttacgtggctaaaattatctaaaatttagccacacaagtaataagattgacgcaaagaagccacttaaatacccattcgtgagaacttccgtccgtccttccgtccggtCTGTATCTCAAGGGTCAAGGTCACACAAGAGCATTGAATTTAT--GAAAAAAAAAACAACACTATTTATAATAT-TAT-AGAACATACTGTTTTCGTGTC--------AACTTTTACATGCAT-GAAAGGATTTT---------TTTTTAAAAA--AG-CACC-----TATAATCACA-----CCAATAAG----CCAGATCAGTATCCCAAAGGTCAAGGTCACAACTAAATGTTGAA---GTT--ATAACATAATCTCTTTTAATATGAATCCCATAAATGTTTAC-ATGTCCGGTCCATAACCTTCATATGCAgggggcatgtgacacttaacagtgacatttcttgtttccttctttc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaaaggtTTTCGTGTC--------AACTTTTACATGCATGAAAGGATTTT-------------TTTTTAAAAAAGCACCTATAATCACACCA----------------ATAAG--CCAGATCAGTATCCCAAAGGTCAAGGTCACAACTAAATGTTGAAGTTATAACATAATCTCTTTTAATATGAATCCCATAAATGTTTACATGTCCGGTCCATAACCT--TCATATGCAGAATATAA-TATA--A--CT--ACAT-A------------AA-----GATGACGTGACGgaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaaaggtctgtatctcaagggtcaaggtcacacaagagcattgaatttatgaaaaaaaaaacaacactatttataatattatagaacatactgtGGATTTTAATA-TAAGTAGGTACAAGTTTTACAACATAA-AGT--TGATGTG-CA-GAATGAAACAATCATGTCTGTAACTCTGATGTCAAGGTCAG-ACT-----Ttgtagaactaaaaaaa
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): GCACACGAATGGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTAATAATTTTTATGGACGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTGGCTGTTTCTAGAAACTTAAAAACAGCTTTGATGTGACTTTTTTACTTTTATGTGGCTAAACTTTAACCACACAAGTAATAAGCTTGGCGCAAAGCTGCCACTTAAATACCCATTCCTAGGAACGTCCATCCGTACGTCCGTACGCCCGTCCGTCCGTTCTTCTG
Unaligned ( gi|7 ): TCTGTCCGGGCACACGAATAGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTAAGGGTTAGTAATTGTTATGGGCGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTTGCTGTTTCTAGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTGGCTTTTTTTTCTTTTAGCCACACAAGTAATAAGCTTGACGCAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTCGTAGAACGTCCGTCCGTCCGCCCGACGTCCCTCTGTCAGTCCGTCTGG
Unaligned ( gi|9 ): GAACTGTTCGTCCACATACACGAATGGGGAATTAAGTGTCTTGGGTTCAGGGTTAGTATTTGTTGTGGACGGTTTGAAAACAGTTGAAAAAAAATATGTCGCTGTTTCTGGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTAGCTTACTTATGTGGCTAAGATTTAAACACACAAGTAACAGGCTGGGCGCAAAGAAGCCTCTTAACTACCCATTTGTG
Unaligned ( gi|11 ): CACACAAATGGGTATTTAAGTGTCTAGGTTTTTTTAGCAAGTTGAAAAACAGTTGAATAAAAATTATGTGGCTGTTTCTAAGACACTTAAAAATACTTTTATGTGGCTATAAATCTGTTATGTGGCTAAAATATAGCCACACAAGCAATCAGCTAGGCGCAAAGAAGCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|15 ): AAGATTTTAATGTAACTTTGTACATGTGTTCAGAACATACATGTAATAATATGCAGGACACACGTGACAGCAAACCGTTCTGAAACTCTAGGATAAGGTCAGTAGTAGGGGTTGAAGTTATA
Unaligned ( gi|19 ): CTGTTTGAAAAACAGTTGGAAAAAAAAAAGTAGCTGTACCTGAATACGCTAAAATACACAAATAATCAGCTGGGCTCATAGAATCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|27 ): TCTGTCTGTAAATAGGTATTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTTGTAATTTGTT
Unaligned ( gi|29 ): TTTTAATGCCCCCCGCCCCCTCCCCCAATTTTTGGGGTGGCATAGTAAT
Unaligned ( gi|32 ): TTCAGCATAATGAGGTGATGTTTCGCATGCAAGGCCCTGA
Unaligned ( gi|33 ): AATAACATTGCACAAATATTCACCATAATCAGATGA
Unaligned ( gi|34 ): CAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTTGTGAGAAC






Alignments
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Reference ( family-279 )      :                                                                                       NNNNNNNNNNNNGGTCACANTTTGGGTTTGTTTGATATACACTTTGAGTCTGTG--AGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTGANACTTGCNACAAATGATCAACATAACACGACGACGTGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACANT------TTGAGTTTGTTTGA---------CAACACT--TTG-AGT-TTGTGTGAGA---------TTTCGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATGGATTTTAATA-ANACTTGCTACAAATGNT-CAACATAA-CATGATGACGTGTCGCGAATAAGAC--CCANATCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCAC-ACT-----TTGAG---GTTTGACAACA------CTT------TGAGTCC-TG-AGATGTT--C-GTGTCCGGCCCGTAACTTTGTCATGCACGGATGGATTTTGTTGA--ACTTGNTACAAATGATCAACATAACATGACGACGTGTCGTAAGTAANACCC------GTAC-----CTCAAAGGTCAAGGTCAC---------------------ACTTTGA----GTTTG-----------------TGCGAGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTATAAAT-AC---TT-GCTACAAATGATCAACATAACACGAC---G---TGTCGCGCGTAAGACCCAGACCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTAANTTTGTTTGACATCTCTTT-AGTNTATCCGANATTTCGTGTCCGGTCCGTAACTTTGTCATNCATAGATGGAT-TTTA--A--AA--ACTT-AC----------CAA-----CATGACATGACGACNTGTCACG-NGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTT------T--GTTTGACAACACTTTGANTCTGTNTGAGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCGTGCATNGATGGA-TTTCATAAATACTT-GTTCGA------TTTNTC------TGATCTGTAACTTTGTC-TACAT----GGAT----TTCAAAA-CA-CTTGNCTCAATTGATCAACATGNCACGATGATG--------ACATGACAATGTGTCGCGCGCAAGACCCAGATCT-GTAC---CTCAAAGGTCAAGGTCACANTTTGAGTTTG--TTT-------CG-CAACNATTTGAATATG-TTTGAGATTTT-TTT--CCTGTCTGTAACT-T--TGTCATACATGGATAAATTTCAAAAACACCTGTC--------TCAATTGATTAACATGACATGACGACTTCTTGCGCGTACGACCATGAACTGNACATCAAGGTCAAGGTCACACTTTCAGTTTGT----------------------TTGAGATTTCGTGTCTNGTCTGTAACT-T--TGTCTTACATGGAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGACATGACGACGTNTCATCTGCATTTA-----TG----AA-TACCCA-GACC-TNTACATCA-A-TGTCA-AGGTCAAGGTCACACAAAAGTCAAGGTCACGCTTTAANGTGAAAAAACA---------TGAAATTGCANGTCTAGTCGGAAAC-TCAGTCCATTGATC-TT-ATATTCATGGATACATCGCTACCTATTATAA---AA-CA--TATNGTTA-TTTTCAC-AGACCATT------T-GGG---G-G-C--ATGCGACACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTNT-AG-AATA-AAAA---ACGT-ATT----AAAATCGGTTTGCTTATAA-A-GTTCATTATTATAT-TCATAT--TTTCTCCATGATATAAACAAAAATTTGAGGAAANNANTAGGAAAGAANAAATTGCCTACCTGCNTANCCTTTTTTGTATTGTTGGTCAGTAACCCTAAACACAGGTATTATTTTTTCT
gi|1                          :                                                                                                   GGTCACACTTTGGGTTTGTTTGATAT-CACTTTGAGTCTGTG--AGATTTTGTGTCCGGCCTGTAA-TTTGTCATGCATGAATGGATTTTGTTAATACTTGCAACAAATGATCAACATAACATGACGATGTGTTGCGAGTAAGACCCACATCTGCACCTCAAAGGTCAAGGTCACACT------TTGAGTTTGCATGA---------CAATACT--TTG-AGT-CTGTGTGAGA---------TTTCGTGTCAGGCCTGTAACTTTGTTATTCAT-ACATGGATTTTGTTA-ATATTTGCTACAAATGAT-CAACATAA-CATGACTATGTGTCACAAGTAAGAC--CCACACCCGTACCACAAAGGTCAAGTTCAC-ACT-----TTGAGTTTGTTTGACATCA------CTT------TGAGT-C-TG-AGAT-TT--C-GTGTCCGGTCTGTAACTTTGTCATGCATGAATGGATTTTGTT-A--ATTTGCTACAAATGATCAACATAAAATGACGACGTGTTGTAAGAAAGACCC------ATAC-----CTCAAAGGTCAAGGTCAC---------------------ACTTTGA----GTTTG-----------------TGTGAGATTTCATGTCTGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTATAAAT-AC---CT-GCTACAAATGATCAACACAACATGAC---A---TGTCACACTTAACATCCAGACTCCCACTTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTAACTTTGTTTGACATCTCTTTCAGTCTATTTGAGATTTCGTGTCCAGTCTGTAACTTTGTCACCTATAGATAAAT-TTCA--A--AA--ACTT-AC----------CAG-----CATGACATGACTACATGTCACG-TGTAAGACCCACACCCATACCTTAAAGGTCAAGGTCACACTT------T--GTTTGACTACATTTTGATGCTGTATGAGATTTCGTGTCTAGTCTGTAACTTTGTCGTGCATAGAT-GA-TTTCTTTGATAT----TTCG---------TGTC------TGATCTGTAACTTTGTC-T-----------T----TT-------A-CTTGGCTCATTTGATCAAGATGACATGACGATG--------ACATGACAATGTGTCGCATGTAAGACCCAGATCT-GTAC---CTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTGAGTTTG--TTC-------CA-CAACACTTTGAGTATG--TTGAGATTTCAAGT--CCAGTCTGTAAGT-T--TATCATGCATGGATGAATTTCAAAAACACTTGGCTTGATTTATCAATTTATCAACATGACATGACAAAGTGTCGC-TTTAC---------CTGA-----AAGGTTAAGGTCACACTTTCAGTTTG-----------------------------TTTCATGTCTGGTC--TAATT-T--TGTTTTACATGGAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGTATGTGATGATGATGTGTCATCTGCATTTACC---TGTAGAAA-TACCCA-CACCTTTTACATCAGA-TGTTA-AGGTCAAGGTTACACAAAAGTCAAGGTCACCCTTTAATGTGAAAAAACA---------TGAAATTGCATGTCTAGTCGTAAACTTCAGTCCATGGATC-TTGATATTCATGGATACATCGCTACCTATTATAA---AA-TA--TATCGTTA-TTTTCAC-AGACCATT------T-GGG---G-G-C--ATGCAACACTTTCC------A------GTGACATTTCTTGTTAT-AG-AATA-AAAA---ACAT-GTT----AAATTCAGTTTGCTTATAATA-GTTCATTATTATATATTATAT--TTTCTCCATGATATAAACAAAAA---GAAGAAACAAATAGAAAAGAACAAATTGTCTACCTGCCTAACCTTTTTTGTATT-TTGGTCAATAACTCTAAACACAGGTATTATTTTTTCT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aannnnnnnnnnTCACAGAAAATTCACGGTCACACTTTAAGATAAAAAAA---------------ATTGTGTTTCT-GTTGG-----------TATTGATC-TT-AC--TCTT---TATATC-CCA--TATTTTAA---AA-CG--TATCGTTT-TTATCAA-CGACCACTTCTGGAT-GGGGTTG-G-C--ATGTGAGATTTACC------AGTCACTGTGGCATTTATCGTTCTGAGTAATA-TAAA---GCGTAATT----AA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -AG-AACAGAAAA---ACAA-ATT----AAAATCAATTTGCTTATAA-AAGTTCATCATTATG----ATAT--TTTCTCCATGA----AATAAAAATTTGAGAAAAATATTAGGAAAGAAAAAATTGCCTACCTACATACCCTTTT---TATTGTTG---AGTAACCCTAAACACAGGTATTATTTTTTCTtcacccgtgagttgaca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttaaCATCTGTTT--GTCCATCCTGTATTTCGTGTCCGGCCTGTAACGTTGTCATGCATAGATGGAT-TTTGTTA--AA--ACTT-gc
gi|13                         :                                                                                       atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagCTGT-----ATTTCGTGTCCGGCCTGTAACGTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTAAAACTTGATACAAATGATCAAgatacaaatgatcaatgaacaaaga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagcatctgtttgtccatcATGCATTAGA-GGATTTTAATATAAACTAG-TACAAATGTT-CACCACAC-CAAGATGAtgaacaaaga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cccgcgtcacattaacgaagggtgataaagtaatactcacagttcagttgtcctatttttccacaattttccaccattcttatTCATGTTTGGTTCGTAACTTTGTCATCCATAGAGAGAGATTTA--A--AATGACTTCACA---------CAAACTGGCATGACTTGGTGACCTGACATGTTGCAAG--CTACATCCAt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTGCATATTATA-----------TATTAACA-TTTTCAC-AGATCATT------T-GTG---G-G-TGAATGCGGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTcttccgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatatatatagattactcattttatGCAAAAACAAGGTAT-GTCC---CTCACAGGTAAAGGTCACACATTGGCGTTGAATTTATAAAAAAA-CAATAATTTG-ATATGAACCAATATTTT-TTT--tg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TT--C-GTTTCTGGCCTGTATCTTTGTCATGCACAGATGGATTTTGTTGAT-ACTTGGTACAAATGATCAACATAACATGATGATTTGTCATGAGTAAAACCCACACCCGTAT-----CTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGAATACACTTTGA----GTCTG-----------------TGCGAAACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTAATGAT-AC---TT-GCTACAAATGATCAACATAACACGAC---GACATGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTATTTGAGTTTGTTTGACAACACTTCGAGTTTGTATGAGATTTTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACATAGATGGAT-TTTA--ATGAT--ACTT-GCTACAATTGATCAA-----CATAACATGAGGATGTGTCGCG-AGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCACAATT------TGAGTTTGACAACACTTTGAGTCTGTGTGATATTCTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATACTT-GTTgtat
gi|2                          :                                     atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGA-ATACACTTTGAGTCTGTGCGAAACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTAATGATACTTGCTACAAATGATCAACATAACACGACGACATGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTAT------TTGAGTTTGTTTGA---------CAACACT--TCG-AGT-TTGTATGAGA---------TTTTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACAT-AGATGGATTTTAATG-ATACTTGCTACAATTGAT-CAACATAA-CATGAGGATGTGTCGCGAGTAAGAC--CCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCAC-AAT-----TTGA----GTTTGACAACA------CTT------TGAGTCTGTG-TGATATT--CTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATACTTGTTATAAATGATCAACATAACATGATGACGTTTTGCACTTAATACCC------AAACTCCCACTTAAAGGTCAAGGTCAC---------------------AATTTAACTTTGTTTGACAACACTTTCAGTCATTTTGACATTTCTTGTCCGGTC--TAATCT--------ATGGATAAATTTTA-AAATCAC---TTGGCT-CAGTTGATCAACATGACATAATTAAG---TGTCGCATGTAAGACCCAGAACCTTTCCTCAAAGATCCAGGTCACACTTTCAATTTGTTTGATAT---------TGT------------GTGTCTGGTCTGTGACTTTGCC-TTTA-ACTTGGCT-C---------A--ATTT-AT----------CAA-----GATGAAATGACGACTTGTCATA-AGTAAGACCTAGACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTTTTAGTAT--GTATGACAACACTTTGAATCTGTTTGAGATTTCAAGACCGGCCTTTAACTTTATCATACATGGATGGA-TTTCAAAAATACTTGGTTCAA------TTTATCAACAATTGATCTGTAACTTTGTCTTACATTTAGGGAT----TTTAAAA-TAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGGTGATGTTTCAGCAGCATT-TAAT-TGT----TGAAATACCCAGACCA-TTAC---ATCAAATGTCAAGGTCAAAGTTataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaattgatctgtaactttgtcttacatttagggattttaaaatagcttgacacaagtgatcagcatgtcatggtgatgtttcagcagcatttaattgttgaaatacccagaccattacatcaaatgtcaaggtcaaagttacacaaaggtcaaggtcacgctttaatgtaaaaaaacatgaaattgcaagtctagtctgaaacatcagtccattactctttatattcatggatacagcgctacctattataacataattatatagttatttttcaatgaccatttgggggacatgcgccatttaccagtaacattttttgttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaTGATCTGTAACT-T--TGTCTTACATTTAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGGTGATGTTTCAGCAGCATTTAATTGTTG----AAATACCCA-GACC-ATTACATCA-AATGTCA-AGGTCAAAGTTACACAAAGGTCAAGGTCACGCTTTAATGTAAAAAAACA---------TGAAATTGCAAGTCTAGTCTGAAACATCAGTCCATTACTCTTT-ATATTCATGGATACAGCGCTACCTATTATAACATAATTA--TATAGTTATTTTTCAA-TGACCATT------T-GGG---G-GAC--ATGCGCCATTTACC------A------GTAACATTTTTTGTTacacaaaggtcaaggtcacgctttaatgtaaaaaaacatgaaattgcaagtctagtctgaaacatcagtccattactctttatattcatggatacagcgctacctattataacataattatatagttatttttcaatgaccatttgggggacatgcgccatttaccagtaacattttttgttta
gi|20                         :                                                                                                                                                       atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaggtcacaatttgagtttgtttgaatacactttgagtctgtgcgaaacttcgtgtccggcctgtaactttgtcatgcatagatggattttaatgatacttgctacaaatgatcaacataacacgacgacatgttgcgagtaagacccacacctgtaactcaaaggtcaaggtcactatttgagtttgtttgacaacacttcgagtttgtatgagattttgtgtccggcctgcaactttgtcatacatagatggattttaatgatacttgctacaattgatcaacataacatgaggatgtgtcgcgagtaagacccacacccatacctcaaagttcaaggtcacaatttgagtttgacaacactttgagtctgtgtgatattctgtgtccggcctgcaactttgtcatgcattgatggatttttataaatacttgttataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaatCACCATAATG--------A---GGCAATGTTTGGCACACAAGGTCCAGATCT-GTAG---GTCAAAGGTCATAGTCATACTTAAAGGTTA--Tta
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taatacacaaattattTA-TATTCAC-AGACAATT------T-GGGC--G-G-C--ATGTGACAC----C------G------ATGACATTTCTTGTTTT-----CTA-AAAG---GAAT-ATTTTTAAAAATCAGATTat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aCCAGCCTATAACTTTGCCATGCTAAGATGGATTTTATAAAC-ACAGATG-GTTACAAA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GG---G-G-C--ATGAGATATTTACC------A------ATGACATTTCTTGTTatggatacttcatatcca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaATA-ACA-TTGC-ACAAATGTT-CACCATAATCA-GCTGATGTGTTGTGCACAAGAC--CGAGATCTGtgtttttttatgcccatgaacaaattttgtaatat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -TTTGCAC-AGACCATT------T-GGG---GAG-C--GTGTTGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTGT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -GGG---G-G-C--ATGTGACACTTGCCAGCCTGA------GTGACATTTCTTGTTCT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTTTTAAAA-A--TTGGCA-AAATAATCAACATGACATTACAATGTATCGTC-------A-----T-----AA-GACCCA-GACC-CA-GTAT-A-A-GCTCAGAGGTCAAGGTCACACttatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATG--------ACATTACAATGTATCGT-CATAAGACCCAGACCCAGTATAAGCTCAGAGGTCAAGGTCACACTTTT-TTTTG--TTT-------GG-CAACCATTTAAATATG-TTTGAGATTTT-TTTTTCTTATCTGTAACT-A--TGTCATACATGGATAAATTTCAAAAACACCTATC--------TCAATTGATTAACATGGCATGATGACTTGTTGTGCGTATGACCATGAACTGTACATCAAGGTCAAGGTCACACTTTCAGTTTGTTTTGGCAACCATTTGAATCTGTTTGAGATTTT-TTTCTTGCCTGTAACTATAATGTCATACATGGATAGACTTCAAAAACACCTGTCTCAATTGATTAACATGACATGACAACTTCT----TGCGTGTA-----TG----A-----CCATGAAC-TGCACATCA-A-GGTCA-AGGTCAttttttttgtttggcaaccatttaaatatgtttgagatttttttttcttatctgtaactatgtcatacatggataaatttcaaaaacacctatctcaattgattaacatggcatgatgacttgttgtgcgtatgaccatgaactgtacatcaaggtcaaggtcacactttcagtttgttttggcaaccatttgaatctgtttgagatttttttcttgcctgtaactataatgtcatacatggatagacttcaaaaacacctgtctcaattgattaacatgacatgacaacttcttgcgtgtatgaccatgaactgcacatcaaggtcaaggtcacattttcagcttgtttgagattttgtgtcttctctgttattgtctcacaaggagggattgtagaataacttgacacaaatgtctgacaaaatgtcacctgcaataaccaggcctgtacatcacatgtcaacgtcaaggtcatacaaagtcaaggtcacactttaaggggaaaaaaaagaattctcttgaaatttaaatctcaacagaataagtatattattttaaggtcacttaatagaccacttagggtcacttggactggaccacttagggcgatgggacactttccagtgacatttcttgccatggtgagagtttacgtgatgtaaactggtttgttgttaatcaatattatattcatctggtttgtcca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttttaaaaattggcaaaataatcaacTAAATA--T-GTTTGAGATTTTTTTTTC------TTATCTGTAACTATGTCATACAT----GGATAAATTTCAAAAACA-CCTATCTCAATTGATTAACATGGCA---TGATG--------AC-------T-TGTTGTGCGTATGACCATGAACT-GTAC---ATCAA-GGTCAAGGTCACACTTTCAGTTTG--TTT-------TGGCAACCATTTGAATCTG-TTTGAGATTTT-TTT--CTTGCCTGTAACTATAATGTCATACATGGATAGACTTCAAAAACACCTGTC--------TCAATTGATTAACATGACATGACAACTTCTTGCGTGTATGACCATGAACTGCACATCAAGGTCAAGGTCACATTTTCAGCTTGT----------------------TTGAGATTTTGTGTCTTCTCTGTTA---T--TGTCTCACAAGGAGGGATTGTAGAATAACTTGACACAAATG-TC---------TGACAAAATGTCACCTGC----------------AA-TAACCA-GGCC-TGTACATCACA-TGTCA-ACGTCAAGGTCATAC-AAAGTCAAGGTCACACTTTAAGGGGAAAAAAAAGAATTCTCTTGAAATT-TAAATCTCAACAGAA---TAAGT------ATA-TT-AT-TTTAAGG-----TC---ACTTA--ATAG---AC-CACTTAGGGTCA-CTTGGACTGGACCACT------T-AGG---G-C-G--ATGGGACACTTTCC------A------GTGACATTTCTTGCCAT-GG---TG-AGAGTTTACGTGATG----TAAACTGGTTTG-TTGTTA-A---TCAATATTATAT-TCATCTGGTTTGTCCAcattttcagcttgtttgagattttgtgtcttctctgttattgtctcacaaggagggattgtagaataacttgacacaaatgtctgacaaaatgtcacctgcaataaccaggcctgtacatcacatgtcaacgtcaaggtcatacaaagtcaaggtcacactttaaggggaaaaaaaagaattctcttgaaatttaaatctcaacagaataagtatattattttaaggtcacttaatagaccacttagggtcacttggactggaccacttagggcgatgggacactttccagtgacatttcttgccatggtgagagtttacgtgatgtaaactggtttgttgttaatcaatattatattcatctggtttgtcca
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttttaaaaattggcaaaataatcaacatgacattacaatgtatcgtcataagacccagacccagtataagctcagaggtcaaggtcacacttttttttgtttggcaaccattTTTCAT-AGACCATT------TTGGG---G-G-C--GTGCAACATTTACC------T------GTGAGATTT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CACCATAAT----------CA-GACAATGTTTTGTGTGCAAGACCCAGGTC
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tt-C--ATGTGACACTTACC------A------GTGACTTTTCTTGTTa
gi|4                          :                                                                                                                                                 ATTTCGTTTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTGAAACTTGCAACAAATGATCAACAGAACATGACATAGTGTTGCGAGTAAGACCCACACCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACAAT------TTCCGTTTGTTTGA---------CAACACT--TTG-AGT-TTATGTGAAA---------TTTCGTTTCTGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATTAATTTTAATG-ATACTTGCTACAAATGAA-CAACATAA-CATCATGACATGTTGt
gi|5                          : gtctgtctgtccgggcaaacaaatgggtagttaagtgtctagggttatagtttttatggacagttgaaaagcagttaaaaaataattacgtggctgtttctagccacttaaaaaacagcatttaagtggctttttttctcttacgtggctaaaattatctaaaatttagccacacaagtaataagattgacgcaaagaagccacttaaatacccattcgtgagaacttccgtccgtccttccgtccggtCTGTATCTCAAGGGTCAAGGTCACACAAGAGCATTGAATTTAT--GAAAAAAAAAACAACACTATTTATAATATTAT---AGAACATACTGTTTTCGTGTC--------AACTTTTACATGCAT-GAAAGGATTTT---------TTTTTAAAAAAGC----ACCTA----TAATCACA-----CCAATAAG----CCAGATCAGTATCCCAAAGGTCAAGGTCACAACTAAATGTTGAA---GTT--ATAACATAATCTCTTTTAATATGAATCC-CATAAATGTTTAC-ATGTCCGGTCCATAACCTTCATATGCAgggggcatgtgacacttaacagtgacatttcttgtttccttctttc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaaaggtGGATTTTAATA-TAAGTAGGTACAAGTTTTACAACATAA-AGT--TGATGTG-CA-GAATGAAACAATCATGTCTGTAACTCTGATGTCAAGGTCAG-ACT-----TGGGC---GTTgaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): GCACACGAATGGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTAATAATTTTTATGGACGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTGGCTGTTTCTAGAAACTTAAAAACAGCTTTGATGTGACTTTTTTACTTTTATGTGGCTAAACTTTAACCACACAAGTAATAAGCTTGGCGCAAAGCTGCCACTTAAATACCCATTCCTAGGAACGTCCATCCGTACGTCCGTACGCCCGTCCGTCCGTTCTTCTG
Unaligned ( gi|7 ): TCTGTCCGGGCACACGAATAGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTAAGGGTTAGTAATTGTTATGGGCGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTTGCTGTTTCTAGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTGGCTTTTTTTTCTTTTAGCCACACAAGTAATAAGCTTGACGCAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTCGTAGAACGTCCGTCCGTCCGCCCGACGTCCCTCTGTCAGTCCGTCTGG
Unaligned ( gi|9 ): GAACTGTTCGTCCACATACACGAATGGGGAATTAAGTGTCTTGGGTTCAGGGTTAGTATTTGTTGTGGACGGTTTGAAAACAGTTGAAAAAAAATATGTCGCTGTTTCTGGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTAGCTTACTTATGTGGCTAAGATTTAAACACACAAGTAACAGGCTGGGCGCAAAGAAGCCTCTTAACTACCCATTTGTG
Unaligned ( gi|11 ): CACACAAATGGGTATTTAAGTGTCTAGGTTTTTTTAGCAAGTTGAAAAACAGTTGAATAAAAATTATGTGGCTGTTTCTAAGACACTTAAAAATACTTTTATGTGGCTATAAATCTGTTATGTGGCTAAAATATAGCCACACAAGCAATCAGCTAGGCGCAAAGAAGCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|15 ): AAGATTTTAATGTAACTTTGTACATGTGTTCAGAACATACATGTAATAATATGCAGGACACACGTGACAGCAAACCGTTCTGAAACTCTAGGATAAGGTCAGTAGTAGGGGTTGAAGTTATA
Unaligned ( gi|19 ): CTGTTTGAAAAACAGTTGGAAAAAAAAAAGTAGCTGTACCTGAATACGCTAAAATACACAAATAATCAGCTGGGCTCATAGAATCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|21 ): GCATCTCAGAGGTCAAAGTTAAATCTGAGAGTTGAAAATATATAAAAAAAACAAACTTTCATATCAGATGTATGTATATAACATTTTGTTT
Unaligned ( gi|27 ): TCTGTCTGTAAATAGGTATTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTTGTAATTTGTT
Unaligned ( gi|29 ): TTTTAATGCCCCCCGCCCCCTCCCCCAATTTTTGGGGTGGCATAGTAAT
Unaligned ( gi|32 ): TTCAGCATAATGAGGTGATGTTTCGCATGCAAGGCCCTGA
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Unaligned ( gi|34 ): CAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTTGTGAGAAC






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Reference ( family-279 )      :                                                                                       NNNNNNNNNNNNGGTCACANTTTGGGTTTGTTTGATATACACTTTGAGTCTGTG--AGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTGANACTTGCNACAAATGATCAACATAACACGACGACGTGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACANT------TTGAGTTTGTTTGA---------CAACACT--TTG-AGT-TTGTGTGAGA---------TTTCGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATGGATTTTAATA-ANACTTGCTACAAATGNT-CAACATAA-CATGATGACGTGTCGCGAATAAGAC--CCANATCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCAC-ACT-----TTGA---NGTTTGACAACA------CTT------TGAGTCC-CG-AGATGTT--C-GTGTCCGGCCCGTAACTTTGTCATGCACGGATGGATTTTGTTGA--ACTTGNTACAAATGATCAACATAACATGACGACGTGTCGTAAGTAANACCC------GTAC-----CTCAAAGGTCAAGGTCAC---------------------ACTTTGA----GTTTG-----------------TGCGANATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTATAAAT-AC---TT-GCTACAAATGATCAACATAACACGAC---G---TGTCGCGCGTAAGACCCAGACCCNTACCTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTNANTTTGTTTGACATCTCTTT-AGTCTATNCGAGATTTCGTGTCCGGTCTGTAACTTTGTCATNCATAGATGGAT-TTTA--A--AA--ACTT-AC----------CAA-----CATGACATGACGACNTGTCACG-NGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTT------T--GTTTGACAACACTTTGANTCTGTNTGAGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCGTGCATNGATGGA-TTTCATAAATACTT-GTTCGA------TTTNTC------TGATCTGTAACTTTGTC-TACAT----GGAT----TTCAAAA-CA-CTTGNCTCAATTGATCAACATGNCACGATGATG--------ACATGACAATGTGTCGCGCGCAAGACCCAGATCT-GTACN---TCAAAGGTCAAGGTCACACTTTNAGTTTG--TTT-------CG-CAACNATTTGAATATG-TTCGAGATTTT-TTT--CTTGTCTGTAACT-T--TGTCATACATGGATAAATTTCAAAAACACCTGTC--------TCAATTGATTAACATGACATGACGACTTGTCGCGCGTACGACCATGAACTGNACATCAAGGTCAAGGTCACACTTTCAGTTTGT----------------------TTGAGATTTCGTGTCTNGTCTGTAACT-T--TGTCTTACATGGAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGNCATGACGACGTNTCATCTGCGTTTA-----TG----AA-TACCCA-GACC-C-GTACATCA-A-TGTCA-AGGTCAAGGTCACACAAAAGTCAAGGTCACGCTTTAANGTGAAAAAACA---------TGAAATTGCANGTCTAGTCGGAAAC-TCAGTCCATTGATC-TT-ATATTCATGGATACATCGCTACCTATTATAA---AA-CA--TATNGTTA-TTTTCAC-AGACCATTT-------GGG--G-G-C--ATGCGACACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTNT-AG-AATA-AAAA---ACGT-ATT----AAAATCGGTTTGCTTATAA-A-GTTCATTATTATAT-TCATAT--TTTCTCCATGATATAAACAAAAATTTGAGGAAANNANTAGGAAAGAANAAATTGCCTACCTGCNTANCCTTTTTTGTATTGTTGGTCAGTAACCCTAAACACAGGTATTATTTTTTCT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aannnnnnnnnnTCACAGAAAATTCACGGTCACACTTTAAGATAAAAAAA---------------ATTGTGTTTCT-GTTGG-----------TATTGATC-TT-AC--TCTT---TATATC-CCA--TATTTTAA---AA-CG--TATCGTTT-TTATCAA-CGACCACTTCTGGATGGGGTTG-G-C--ATGTGAGATTTACC------AGTCACTGTGGCATTTATCGTTCTGAGTAATA-TAAA---GCGTAATT----AA
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gi|13                         :                                                                                       atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagCTGT-----ATTTCGTGTCCGGCCTGTAACGTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTAAAACTTGATACAAATGATCAAgatacaaatgatcaatgaacaaaga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagcatctgtttgtccatcATGCATTAGA-GGATTTTAATATAAACTAG-TACAAATGTT-CACCACAC-CAAGATGAtgaacaaaga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cccgcgtcacattaacgaagggtgataaagtaatactcacagttcagttgtcctatttttccacaattttccaccattcttatTCATGTTTGGTTCGTAACTTTGTCATCCATAGAGAGAGATTTA--A--AATGACTTCACA---------CAAACTGGCATGACTTGGTGACCTGACATGTTGCAAG--CTACATCCAt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTGCATATTATA-----------TATTAACA-TTTTCAC-AGATCATTT-------GTG--G-G-TGAATGCGGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTcttccgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatatatatagattactcattttatGCAAAAACAAGGTAT-GTCCC---TCACAGGTAAAGGTCACACATTGGCGTTGAATTTATAAAAAAA-CAATAATTTG-ATATGAACCAATATTTT-TTT--tg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTCCCTCACAGGTAAAGGTCAC-ACA-----TTGG---CGTTgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcaaaaacaaggtatC-CG-GTAT-TT--C-GTTTCTGGCCTGTATCTTTGTCATGCACAGATGGATTTTGTTGAT-ACTTGGTACAAATGATCAACATAACATGATGATTTGTCATGAGTAAAACCCACACCCGTAT-----CTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGAATACACTTTGA----GTCTG-----------------TGCGAAACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTAATGAT-AC---TT-GCTACAAATGATCAACATAACACGAC---GACATGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTATTTGAGTTTGTTTGACAACACTTCGAGTTTGTATGAGATTTTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACATAGATGGAT-TTTA--ATGAT--ACTT-GCTACAATTGATCAA-----CATAACATGAGGATGTGTCGCG-AGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCACAATT------TGAGTTTGACAACACTTTGAGTCTGTGTGATATTCTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATACTT-GTTgaatttataaaaaaacaataatttgatatgaaccaatatttttttgtat
gi|2                          :                                            atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGA-ATACACTTTGAGTCTGTGCGAAACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTAATGATACTTGCTACAAATGATCAACATAACACGACGACATGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTAT------TTGAGTTTGTTTGA---------CAACACT--TCG-AGT-TTGTATGAGA---------TTTTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACAT-AGATGGATTTTAATG-ATACTTGCTACAATTGAT-CAACATAA-CATGAGGATGTGTCGCGAGTAAGAC--CCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCAC-AAT-----TTGA----GTTTGACAACA------CTT------TGAGTCTGTG-TGATATT--CTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATACTTGTTATAAATGATCAACATAACATGATGACGTTTTGCACTTAATACCC------AAACTCCCACTTAAAGGTCAAGGTCAC---------------------AATTTAACTTTGTTTGACAACACTTTCAGTCATTTTGACATTTCTTGTCCGGTC--TAATCT--------ATGGATAAATTTTA-AAATCAC---TTGGCT-CAGTTGATCAACATGACATAATTAAG---TGTCGCATGTAAGACCCAGAACCTTTCCTCAAAGATCCAGGTCACACTTTCAATTTGTTTGATATT-------GT--------------GTGTCTGGTCTGTGACTTTGCC-TTTA-ACTTGGCT-C---------A--ATTT-AT----------CAA-----GATGAAATGACGACTTGTCATA-AGTAAGACCTAGACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTTTTAGTAT--GTATGACAACACTTTGAATCTGTTTGAGATTTCAAGACCGGCCTTTAACTTTATCATACATGGATGGA-TTTCAAAAATACTTGGTTCAA------TTTATCAACAATTGATCTGTAACTTTGTCTTACATTTAGGGAT----TTTAAAA-TAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGGTGATGTTTCAGCAGCATT-TAAT-TGT----TGAAATACCCAGACCA-TTACA---TCAAATGTCAAGGTCAataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaattgatctgtaactttgtcttacatttagggattttaaaatagcttgacacaagtgatcagcatgtcatggtgatgtttcagcagcatttaattgttgaaatacccagaccattacatcaaatgtcaaggtcaaagttacacaaaggtcaaggtcacgctttaatgtaaaaaaacatgaaattgcaagtctagtctgaaacatcagtccattactctttatattcatggatacagcgctacctattataacataattatatagttatttttcaatgaccatttgggggacatgcgccatttaccagtaacattttttgttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaTGATCTGTAACT-T--TGTCTTACATTTAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGGTGATGTTTCAGCAGCATTTAATTGTTG----AAATACCCA-GACC-A-TTACATCA-AATGTCA-AGGTCAAAGTTACACAAAGGTCAAGGTCACGCTTTAATGTAAAAAAACA---------TGAAATTGCAAGTCTAGTCTGAAACATCAGTCCATTACTCTTT-ATATTCATGGATACAGCGCTACCTATTATAACATAATTA--TATAGTTATTTTTCAA-TGACCATTT-------GGG--G-GAC--ATGCGCCATTTACC------A------GTAACATTTTTTGTTaagttacacaaaggtcaaggtcacgctttaatgtaaaaaaacatgaaattgcaagtctagtctgaaacatcagtccattactctttatattcatggatacagcgctacctattataacataattatatagttatttttcaatgaccatttgggggacatgcgccatttaccagtaacattttttgttta
gi|20                         :                                                                                                                                                       atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaggtcacaatttgagtttgtttgaatacactttgagtctgtgcgaaacttcgtgtccggcctgtaactttgtcatgcatagatggattttaatgatacttgctacaaatgatcaacataacacgacgacatgttgcgagtaagacccacacctgtaactcaaaggtcaaggtcactatttgagtttgtttgacaacacttcgagtttgtatgagattttgtgtccggcctgcaactttgtcatacatagatggattttaatgatacttgctacaattgatcaacataacatgaggatgtgtcgcgagtaagacccacacccatacctcaaagttcaaggtcacaatttgagtttgacaacactttgagtctgtgtgatattctgtgtccggcctgcaactttgtcatgcattgatggatttttataaatacttgttataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaatCACCATAATG--------A---GGCAATGTTTGGCACACAAGGTCCAGATCT-GTAGG---TCAAAGGTCATAGTCATACTTAAAGGTTA--Tta
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taatacacaaattattTA-TATTCAC-AGACAATTT-------GGGC-G-G-C--ATGTGACAC----C------G------ATGACATTTCTTGTTTT-----CTA-AAAG---GAAT-ATTTTTAAAAATCAGATTat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aCCAGCCTATAACTTTGCCATGCTAAGATGGATTTTATAAAC-ACAGATG-GTTACAAA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GG--G-G-C--ATGAGATATTTACC------A------ATGACATTTCTTGTTatggatacttcatatcca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaATA-ACA-TTGC-ACAAATGTT-CACCATAATCA-GCTGATGTGTTGTGCACAAGAC--CGAGATCTGtgtttttttatgcccatgaacaaattttgtaatat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -TTTGCAC-AGACCATTT-------GGG--GAG-C--GTGTTGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTGT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -------GGG--G-G-C--ATGTGACACTTGCCAGCCTGA------GTGACATTTCTTGTTCT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTTTTAAAA-A--TTGGCA-AAATAATCAACATGACATTACAATGTATCGTC-------A-----T-----AA-GACCCA-GACC-CAGTATA----A-GCTCAGAGGTCAAGGTCACACttatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATG--------ACATTACAATGTATCGT-CATAAGACCCAGACCCAGTATAAGCTCAGAGGTCAAGGTCACACTTTT-TTTTG--TTT-------GG-CAACCATTTAAATATG-TTTGAGATTTT-TTTTTCTTATCTGTAACT-A--TGTCATACATGGATAAATTTCAAAAACACCTATC--------TCAATTGATTAACATGGCATGATGACTTGTTGTGCGTATGACCATGAACTGTACATCAAGGTCAAGGTCACACTTTCAGTTTGTTTTGGCAACCATTTGAATCTGTTTGAGATTTT-TTTCTTGCCTGTAACTATAATGTCATACATGGATAGACTTCAAAAACACCTGTCTCAATTGATTAACATGACATGACAACTTCT----TGCGTGTA-----TG----A-----CCATGAAC-T-GCACATCA-A-GGTCA-AGGTCAttttttttgtttggcaaccatttaaatatgtttgagatttttttttcttatctgtaactatgtcatacatggataaatttcaaaaacacctatctcaattgattaacatggcatgatgacttgttgtgcgtatgaccatgaactgtacatcaaggtcaaggtcacactttcagtttgttttggcaaccatttgaatctgtttgagatttttttcttgcctgtaactataatgtcatacatggatagacttcaaaaacacctgtctcaattgattaacatgacatgacaacttcttgcgtgtatgaccatgaactgcacatcaaggtcaaggtcacattttcagcttgtttgagattttgtgtcttctctgttattgtctcacaaggagggattgtagaataacttgacacaaatgtctgacaaaatgtcacctgcaataaccaggcctgtacatcacatgtcaacgtcaaggtcatacaaagtcaaggtcacactttaaggggaaaaaaaagaattctcttgaaatttaaatctcaacagaataagtatattattttaaggtcacttaatagaccacttagggtcacttggactggaccacttagggcgatgggacactttccagtgacatttcttgccatggtgagagtttacgtgatgtaaactggtttgttgttaatcaatattatattcatctggtttgtcca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttttaaaaattggcaaaataatcaacTAAATA--T-GTTTGAGATTTTTTTTTC------TTATCTGTAACTATGTCATACAT----GGATAAATTTCAAAAACA-CCTATCTCAATTGATTAACATGGCA---TGATG--------AC-------T-TGTTGTGCGTATGACCATGAACT-GTACA---TCAA-GGTCAAGGTCACACTTTCAGTTTG--TTT-------TGGCAACCATTTGAATCTG-TTTGAGATTTT-TTT--CTTGCCTGTAACTATAATGTCATACATGGATAGACTTCAAAAACACCTGTC--------TCAATTGATTAACATGACATGACAACTTCTTGCGTGTATGACCATGAACTGCACATCAAGGTCAAGGTCACATTTTCAGCTTGT----------------------TTGAGATTTTGTGTCTTCTCTGTTA---T--TGTCTCACAAGGAGGGATTGTAGAATAACTTGACACAA---------ATGTC-TGACAAAATGTCACCTGC----------------AA-TAACCA-GGCC-T-GTACATCACA-TGTCA-ACGTCAAGGTCATAC-AAAGTCAAGGTCACACTTTAAGGGGAAAAAAAAGAATTCTCTTGAAATT-TAAATCTCAACAGAA---TAAGT------ATA-TT-AT-TTTAAGG-----TC---ACTTA--ATAG---AC-CACTTAGGGTCA-CTTGGACTGGACCACTT-------AGG--G-C-G--ATGGGACACTTTCC------A------GTGACATTTCTTGCCAT-GG---TG-AGAGTTTACGTGATG----TAAACTGGTTTG-TTGTTA-A---TCAATATTATAT-TCATCTGGTTTGTCCAcattttcagcttgtttgagattttgtgtcttctctgttattgtctcacaaggagggattgtagaataacttgacacaaatgtctgacaaaatgtcacctgcaataaccaggcctgtacatcacatgtcaacgtcaaggtcatacaaagtcaaggtcacactttaaggggaaaaaaaagaattctcttgaaatttaaatctcaacagaataagtatattattttaaggtcacttaatagaccacttagggtcacttggactggaccacttagggcgatgggacactttccagtgacatttcttgccatggtgagagtttacgtgatgtaaactggtttgttgttaatcaatattatattcatctggtttgtcca
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttttaaaaattggcaaaataatcaacatgacattacaatgtatcgtcataagacccagacccagtataagctcagaggtcaaggtcacacttttttttgtttggcaaccattTTTCAT-AGACCATTTT------GGG--G-G-C--GTGCAACATTTACC------T------GTGAGATTT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CACCATAAT----------CA-GACAATGTTTTGTGTGCAAGACCCAGGTC
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tt-C--ATGTGACACTTACC------A------GTGACTTTTCTTGTTa
gi|4                          :                                                                                                                                                 ATTTCGTTTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTGAAACTTGCAACAAATGATCAACAGAACATGACATAGTGTTGCGAGTAAGACCCACACCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACAAT------TTCCGTTTGTTTGA---------CAACACT--TTG-AGT-TTATGTGAAA---------TTTCGTTTCTGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATTAATTTTAATG-ATACTTGCTACAAATGAA-CAACATAA-CATCATGACATGTTGt
gi|5                          : gtctgtctgtccgggcaaacaaatgggtagttaagtgtctagggttatagtttttatggacagttgaaaagcagttaaaaaataattacgtggctgtttctagccacttaaaaaacagcatttaagtggctttttttctcttacgtggctaaaattatctaaaatttagccacacaagtaataagattgacgcaaagaagccacttaaatacccattcgtgagaacttccgtccgtccttccgtccggtCTGTATCTCAAGGGTCAAGGTCACACAAGAGCATTGAATTTAT--GAAAAAAAAAACAACACTATTTATAATATTAT---AGAACATACTGTTTTCGTGTC--------AACTTTTACATGCAT-GAAAGGATTTT---------TTTTTAAAAAAGC----ACCTA----TAATCACA-----CCAATAAG----CCAGATCAGTATCCCAAAGGTCAAGGTCACAACTAAATGTTGA---AGTT--ATAACATAATCTCTTTTAATATGAATCC-CATAAATGTTTAC-ATGTCCGGTCCATAACCTTCATATGCAgggggcatgtgacacttaacagtgacatttcttgtttccttctttc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaaaggtGGATTTTAATA-TAAGTAGGTACAAGTTTTACAACATAA-AGT--TGATGTG-CA-GAATGAAACAATCATGTCTGTAACTCTGATGTCAAGGTCAG-ACT-----TGGG---CGTTgaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): GCACACGAATGGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTAATAATTTTTATGGACGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTGGCTGTTTCTAGAAACTTAAAAACAGCTTTGATGTGACTTTTTTACTTTTATGTGGCTAAACTTTAACCACACAAGTAATAAGCTTGGCGCAAAGCTGCCACTTAAATACCCATTCCTAGGAACGTCCATCCGTACGTCCGTACGCCCGTCCGTCCGTTCTTCTG
Unaligned ( gi|7 ): TCTGTCCGGGCACACGAATAGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTAAGGGTTAGTAATTGTTATGGGCGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTTGCTGTTTCTAGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTGGCTTTTTTTTCTTTTAGCCACACAAGTAATAAGCTTGACGCAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTCGTAGAACGTCCGTCCGTCCGCCCGACGTCCCTCTGTCAGTCCGTCTGG
Unaligned ( gi|9 ): GAACTGTTCGTCCACATACACGAATGGGGAATTAAGTGTCTTGGGTTCAGGGTTAGTATTTGTTGTGGACGGTTTGAAAACAGTTGAAAAAAAATATGTCGCTGTTTCTGGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTAGCTTACTTATGTGGCTAAGATTTAAACACACAAGTAACAGGCTGGGCGCAAAGAAGCCTCTTAACTACCCATTTGTG
Unaligned ( gi|11 ): CACACAAATGGGTATTTAAGTGTCTAGGTTTTTTTAGCAAGTTGAAAAACAGTTGAATAAAAATTATGTGGCTGTTTCTAAGACACTTAAAAATACTTTTATGTGGCTATAAATCTGTTATGTGGCTAAAATATAGCCACACAAGCAATCAGCTAGGCGCAAAGAAGCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|15 ): AAGATTTTAATGTAACTTTGTACATGTGTTCAGAACATACATGTAATAATATGCAGGACACACGTGACAGCAAACCGTTCTGAAACTCTAGGATAAGGTCAGTAGTAGGGGTTGAAGTTATA
Unaligned ( gi|19 ): CTGTTTGAAAAACAGTTGGAAAAAAAAAAGTAGCTGTACCTGAATACGCTAAAATACACAAATAATCAGCTGGGCTCATAGAATCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|21 ): GCATCTCAGAGGTCAAAGTTAAATCTGAGAGTTGAAAATATATAAAAAAAACAAACTTTCATATCAGATGTATGTATATAACATTTTGTTT
Unaligned ( gi|27 ): TCTGTCTGTAAATAGGTATTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTTGTAATTTGTT
Unaligned ( gi|29 ): TTTTAATGCCCCCCGCCCCCTCCCCCAATTTTTGGGGTGGCATAGTAAT
Unaligned ( gi|32 ): TTCAGCATAATGAGGTGATGTTTCGCATGCAAGGCCCTGA
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Unaligned ( gi|34 ): CAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTTGTGAGAAC






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Reference ( family-279 )      :                                                                                       NNNNNNNNNNNNGGTCACANTTTGGGTTTGTTTGATATACACTTTGAGTCTGTG--AGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTGANACTTGCNACAAATGATCAACATAACACGACGACGTGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACANT------TTGAGTTTGTTTGA---------CAACACT--TTG-AGT-TTGTGTGAGA---------TTTCGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATGGATTTTAATA-ANACTTGCTACAAATGNT-CAACATAA-CATGATGACGTGTCGCGAATAAGAC--CCANATCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCAC-ACT-----TTGA---CGTTTGACAACA------CTT------TGAGTCC-CG-AGATGTT--C-GTGTCCGGCCCGTAACTTTGTCATGCACGGATGGATTTTGTTGA--ACTTGNTACAAATGATCAACATAACATGACGACGTGTCGTAAGTAANACCC------GTAC-----CTCAAAGGTCAAGGTCAC---------------------ACTTTGA----GTTTG-----------------TGCGANATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTATAAAT-AC---TT-GCTACAAATGATCAACATAACACGAC---G---TGTCGCGCGTAAGACCCAGACCCNTACCTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTNANTTTGTTTGACATCTCTTT-AGTCTATNCGAGATTTCGTGTCCGGTCTGTAACTTTGTCATNCATAGATGGAT-TTTA--A--AA--ACTT-AC----------CAA-----CATGACATGACGACNTGTCACG-NGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTT------T--GTTTGACAACACTTTGANTCTGTNTGAGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCGTGCATNGATGGA-TTTCATAAATACTT-GTTCGA------TTTNTC------TGATCTGTAACTTTGTC-TACAT----GGAT----TTCAAAA-CA-CTTGNCTCAATTGATCAACATGNCACGATGATG--------ACATGACAATGTGTCGCGCGCAAGACCCAGATCT-GTACA---TCAAAGGTCAAGGTCACACTTTNAGTTTG--TTT-------CG-CAACNATTTGAATATG-TTCGAGATTTT-TTT--CTTGTCTGTAACT-T--TGTCATACATGGATAAATTTCAAAAACACCTGTC--------TCAATTGATTAACATGACATGACGACTTGTCGCGCGTACGACCATGAACTGNACATCAAGGTCAAGGTCACACTTTCAGTTTGT----------------------TTGAGATTTCGTGTCTNGTCTGTAACT-T--TGTCTTACATGGAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGACGACGTNTCATCTGCGTTTA-----TG----AA-TACCCA-GACC-T-GTACATCA-A-TGTCA-AGGTCAAGGTCACACAAAAGTCAAGGTCACGCTTTAANGTGAAAAAACA---------TGAAATTGCANGTCTAGTCGGAAAC-TCAGTCCATTGATC-TT-ATATTCATGGATACATCGCTACCTATTATAA---AA-CA--TATNGTTA-TTTTCAC-AGACCATTT-------GGG--G-G-C--ATGCGACACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTNT-AG-AATA-AAAA---ACGT-ATT----AAAATCGGTTTGCTTATAA-A-GTTCATTATTATAT-TCATAT--TTTCTCCATGATATAAACAAAAATTTGAGGAAANNANTAGGAAAGAANAAATTGCCTACCTGCNTANCCTTTTTTGTATTGTTGGTCAGTAACCCTAAACACAGGTATTATTTTTTCT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aannnnnnnnnnTCACAGAAAATTCACGGTCACACTTTAAGATAAAAAAA---------------ATTGTGTTTCT-GTTGG-----------TATTGATC-TT-AC--TCTT---TATATC-CCA--TATTTTAA---AA-CG--TATCGTTT-TTATCAA-CGACCACTTCTGGATGGGGTTG-G-C--ATGTGAGATTTACC------AGTCACTGTGGCATTTATCGTTCTGAGTAATA-TAAA---GCGTAATT----AA
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gi|13                         :                                                                                       atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagCTGT-----ATTTCGTGTCCGGCCTGTAACGTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTAAAACTTGATACAAATGATCAAgatacaaatgatcaatgaacaaaga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagcatctgtttgtccatcATGCATTAGA-GGATTTTAATATAAACTAG-TACAAATGTT-CACCACAC-CAAGATGAtgaacaaaga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cccgcgtcacattaacgaagggtgataaagtaatactcacagttcagttgtcctatttttccacaattttccaccattcttatTCATGTTTGGTTCGTAACTTTGTCATCCATAGAGAGAGATTTA--A--AATGACTTCACA---------CAAACTGGCATGACTTGGTGACCTGACATGTTGCAAG--CTACATCCAt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTGCATATTATA-----------TATTAACA-TTTTCAC-AGATCATTT-------GTG--G-G-TGAATGCGGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTcttccgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatatatatagattactcattttatGCAAAAACAAGGTAT-GTCCC---TCACAGGTAAAGGTCACACATTGGCGTTGAATTTATAAAAAAA-CAATAATTTG-ATATGAACCAATATTTT-TTT--tg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTCCCTCACAGGTAAAGGTCAC-ACA-----TTGG---CGTTgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcaaaaacaaggtatC-CG-GTAT-TT--C-GTTTCTGGCCTGTATCTTTGTCATGCACAGATGGATTTTGTTGAT-ACTTGGTACAAATGATCAACATAACATGATGATTTGTCATGAGTAAAACCCACACCCGTAT-----CTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGAATACACTTTGA----GTCTG-----------------TGCGAAACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTAATGAT-AC---TT-GCTACAAATGATCAACATAACACGAC---GACATGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTATTTGAGTTTGTTTGACAACACTTCGAGTTTGTATGAGATTTTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACATAGATGGAT-TTTA--ATGAT--ACTT-GCTACAATTGATCAA-----CATAACATGAGGATGTGTCGCG-AGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCACAATT------TGAGTTTGACAACACTTTGAGTCTGTGTGATATTCTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATACTT-GTTgaatttataaaaaaacaataatttgatatgaaccaatatttttttgtat
gi|2                          :                                            atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGA-ATACACTTTGAGTCTGTGCGAAACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTAATGATACTTGCTACAAATGATCAACATAACACGACGACATGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTAT------TTGAGTTTGTTTGA---------CAACACT--TCG-AGT-TTGTATGAGA---------TTTTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACAT-AGATGGATTTTAATG-ATACTTGCTACAATTGAT-CAACATAA-CATGAGGATGTGTCGCGAGTAAGAC--CCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCAC-AAT-----TTGA----GTTTGACAACA------CTT------TGAGTCTGTG-TGATATT--CTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATACTTGTTATAAATGATCAACATAACATGATGACGTTTTGCACTTAATACCC------AAACTCCCACTTAAAGGTCAAGGTCAC---------------------AATTTAACTTTGTTTGACAACACTTTCAGTCATTTTGACATTTCTTGTCCGGTC--TAATCT--------ATGGATAAATTTTA-AAATCAC---TTGGCT-CAGTTGATCAACATGACATAATTAAG---TGTCGCATGTAAGACCCAGAACCTTTCCTCAAAGATCCAGGTCACACTTTCAATTTGTTTGATATT-------GT--------------GTGTCTGGTCTGTGACTTTGCC-TTTA-ACTTGGCT-C---------A--ATTT-AT----------CAA-----GATGAAATGACGACTTGTCATA-AGTAAGACCTAGACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTTTTAGTAT--GTATGACAACACTTTGAATCTGTTTGAGATTTCAAGACCGGCCTTTAACTTTATCATACATGGATGGA-TTTCAAAAATACTTGGTTCAA------TTTATCAACAATTGATCTGTAACTTTGTCTTACATTTAGGGAT----TTTAAAA-TAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGGTGATGTTTCAGCAGCATT-TAAT-TGT----TGAAATACCCAGACCA-TTACA---TCAAATGTCAAGGTCAataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaattgatctgtaactttgtcttacatttagggattttaaaatagcttgacacaagtgatcagcatgtcatggtgatgtttcagcagcatttaattgttgaaatacccagaccattacatcaaatgtcaaggtcaaagttacacaaaggtcaaggtcacgctttaatgtaaaaaaacatgaaattgcaagtctagtctgaaacatcagtccattactctttatattcatggatacagcgctacctattataacataattatatagttatttttcaatgaccatttgggggacatgcgccatttaccagtaacattttttgttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaTGATCTGTAACT-T--TGTCTTACATTTAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGGTGATGTTTCAGCAGCATTTAATTGTTG----AAATACCCA-GACC-A-TTACATCA-AATGTCA-AGGTCAAAGTTACACAAAGGTCAAGGTCACGCTTTAATGTAAAAAAACA---------TGAAATTGCAAGTCTAGTCTGAAACATCAGTCCATTACTCTTT-ATATTCATGGATACAGCGCTACCTATTATAACATAATTA--TATAGTTATTTTTCAA-TGACCATTT-------GGG--G-GAC--ATGCGCCATTTACC------A------GTAACATTTTTTGTTaagttacacaaaggtcaaggtcacgctttaatgtaaaaaaacatgaaattgcaagtctagtctgaaacatcagtccattactctttatattcatggatacagcgctacctattataacataattatatagttatttttcaatgaccatttgggggacatgcgccatttaccagtaacattttttgttta
gi|20                         :                                                                                                                                                       atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaggtcacaatttgagtttgtttgaatacactttgagtctgtgcgaaacttcgtgtccggcctgtaactttgtcatgcatagatggattttaatgatacttgctacaaatgatcaacataacacgacgacatgttgcgagtaagacccacacctgtaactcaaaggtcaaggtcactatttgagtttgtttgacaacacttcgagtttgtatgagattttgtgtccggcctgcaactttgtcatacatagatggattttaatgatacttgctacaattgatcaacataacatgaggatgtgtcgcgagtaagacccacacccatacctcaaagttcaaggtcacaatttgagtttgacaacactttgagtctgtgtgatattctgtgtccggcctgcaactttgtcatgcattgatggatttttataaatacttgttataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaatCACCATAATG--------A---GGCAATGTTTGGCACACAAGGTCCAGATCT-GTAGG---TCAAAGGTCATAGTCATACTTAAAGGTTA--Tta
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taatacacaaattattTA-TATTCAC-AGACAATTT-------GGGC-G-G-C--ATGTGACAC----C------G------ATGACATTTCTTGTTTT-----CTA-AAAG---GAAT-ATTTTTAAAAATCAGATTat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aCCAGCCTATAACTTTGCCATGCTAAGATGGATTTTATAAAC-ACAGATG-GTTACAAA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GG--G-G-C--ATGAGATATTTACC------A------ATGACATTTCTTGTTatggatacttcatatcca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaATA-ACA-TTGC-ACAAATGTT-CACCATAATCA-GCTGATGTGTTGTGCACAAGAC--CGAGATCTGtgtttttttatgcccatgaacaaattttgtaatat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -TTTGCAC-AGACCATTT-------GGG--GAG-C--GTGTTGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTGT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -------GGG--G-G-C--ATGTGACACTTGCCAGCCTGA------GTGACATTTCTTGTTCT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gTTTTAAAA-A--TTGGCA-AAATAATCAACATGACATTACAATGTATCGTC-------A-----T-----AA-GACCCA-GACC-CAGTATA----A-GCTCAGAGGTCAAGGTCACACttatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATG--------ACATTACAATGTATCGT-CATAAGACCCAGACCCAGTATAAGCTCAGAGGTCAAGGTCACACTTTT-TTTTG--TTT-------GG-CAACCATTTAAATATG-TTTGAGATTTT-TTTTTCTTATCTGTAACT-A--TGTCATACATGGATAAATTTCAAAAACACCTATC--------TCAATTGATTAACATGGCATGATGACTTGTTGTGCGTATGACCATGAACTGTACATCAAGGTCAAGGTCACACTTTCAGTTTGTTTTGGCAACCATTTGAATCTGTTTGAGATTTT-TTTCTTGCCTGTAACTATAATGTCATACATGGATAGACTTCAAAAACACCTGTCTCAATTGATTAACATGACATGACAACTTCT----TGCGTGTA-----TG----A-----CCATGAAC-T-GCACATCA-A-GGTCA-AGGTCAttttttttgtttggcaaccatttaaatatgtttgagatttttttttcttatctgtaactatgtcatacatggataaatttcaaaaacacctatctcaattgattaacatggcatgatgacttgttgtgcgtatgaccatgaactgtacatcaaggtcaaggtcacactttcagtttgttttggcaaccatttgaatctgtttgagatttttttcttgcctgtaactataatgtcatacatggatagacttcaaaaacacctgtctcaattgattaacatgacatgacaacttcttgcgtgtatgaccatgaactgcacatcaaggtcaaggtcacattttcagcttgtttgagattttgtgtcttctctgttattgtctcacaaggagggattgtagaataacttgacacaaatgtctgacaaaatgtcacctgcaataaccaggcctgtacatcacatgtcaacgtcaaggtcatacaaagtcaaggtcacactttaaggggaaaaaaaagaattctcttgaaatttaaatctcaacagaataagtatattattttaaggtcacttaatagaccacttagggtcacttggactggaccacttagggcgatgggacactttccagtgacatttcttgccatggtgagagtttacgtgatgtaaactggtttgttgttaatcaatattatattcatctggtttgtcca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttttaaaaattggcaaaataatcaacTAAATA--T-GTTTGAGATTTTTTTTTC------TTATCTGTAACTATGTCATACAT----GGATAAATTTCAAAAACA-CCTATCTCAATTGATTAACATGGCA---TGATG--------AC-------T-TGTTGTGCGTATGACCATGAACT-GTACA---TCAA-GGTCAAGGTCACACTTTCAGTTTG--TTT-------TGGCAACCATTTGAATCTG-TTTGAGATTTT-TTT--CTTGCCTGTAACTATAATGTCATACATGGATAGACTTCAAAAACACCTGTC--------TCAATTGATTAACATGACATGACAACTTCTTGCGTGTATGACCATGAACTGCACATCAAGGTCAAGGTCACATTTTCAGCTTGT----------------------TTGAGATTTTGTGTCTTCTCTGTTA---T--TGTCTCACAAGGAGGGATTGTAGAATAACTTGACACAA---------ATGTC-TGACAAAATGTCACCTGC----------------AA-TAACCA-GGCC-T-GTACATCACA-TGTCA-ACGTCAAGGTCATAC-AAAGTCAAGGTCACACTTTAAGGGGAAAAAAAAGAATTCTCTTGAAATT-TAAATCTCAACAGAA---TAAGT------ATA-TT-AT-TTTAAGG-----TC---ACTTA--ATAG---AC-CACTTAGGGTCA-CTTGGACTGGACCACTT-------AGG--G-C-G--ATGGGACACTTTCC------A------GTGACATTTCTTGCCAT-GG---TG-AGAGTTTACGTGATG----TAAACTGGTTTG-TTGTTA-A---TCAATATTATAT-TCATCTGGTTTGTCCAcattttcagcttgtttgagattttgtgtcttctctgttattgtctcacaaggagggattgtagaataacttgacacaaatgtctgacaaaatgtcacctgcaataaccaggcctgtacatcacatgtcaacgtcaaggtcatacaaagtcaaggtcacactttaaggggaaaaaaaagaattctcttgaaatttaaatctcaacagaataagtatattattttaaggtcacttaatagaccacttagggtcacttggactggaccacttagggcgatgggacactttccagtgacatttcttgccatggtgagagtttacgtgatgtaaactggtttgttgttaatcaatattatattcatctggtttgtcca
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ttttaaaaattggcaaaataatcaacatgacattacaatgtatcgtcataagacccagacccagtataagctcagaggtcaaggtcacacttttttttgtttggcaaccattTTTCAT-AGACCATTTT------GGG--G-G-C--GTGCAACATTTACC------T------GTGAGATTT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CACCATAAT----------CA-GACAATGTTTTGTGTGCAAGACCCAGGTC
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tt-C--ATGTGACACTTACC------A------GTGACTTTTCTTGTTa
gi|4                          :                                                                                                                                                 ATTTCGTTTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTGAAACTTGCAACAAATGATCAACAGAACATGACATAGTGTTGCGAGTAAGACCCACACCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACAAT------TTCCGTTTGTTTGA---------CAACACT--TTG-AGT-TTATGTGAAA---------TTTCGTTTCTGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATTAATTTTAATG-ATACTTGCTACAAATGAA-CAACATAA-CATCATGACATGTTGt
gi|5                          : gtctgtctgtccgggcaaacaaatgggtagttaagtgtctagggttatagtttttatggacagttgaaaagcagttaaaaaataattacgtggctgtttctagccacttaaaaaacagcatttaagtggctttttttctcttacgtggctaaaattatctaaaatttagccacacaagtaataagattgacgcaaagaagccacttaaatacccattcgtgagaacttccgtccgtccttccgtccggtCTGTATCTCAAGGGTCAAGGTCACACAAGAGCATTGAATTTAT--GAAAAAAAAAACAACACTATTTATAATATTAT---AGAACATACTGTTTTCGTGTC--------AACTTTTACATGCAT-GAAAGGATTTT---------TTTTTAAAAAAGC----ACCTA----TAATCACA-----CCAATAAG----CCAGATCAGTATCCCAAAGGTCAAGGTCACAACTAAATGTTGA---AGTT--ATAACATAATCTCTTTTAATATGAATCC-CATAAATGTTTAC-ATGTCCGGTCCATAACCTTCATATGCAgggggcatgtgacacttaacagtgacatttcttgtttccttctttc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaaaggtGGATTTTAATA-TAAGTAGGTACAAGTTTTACAACATAA-AGT--TGATGTG-CA-GAATGAAACAATCATGTCTGTAACTCTGATGTCAAGGTCAG-ACT-----TGGG---CGTTgaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa


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originalCons                  :                                                                                       NNNNNNNNNNNNGGTCACANTTTGGGTTTGTTTGATATACACTTTGAGTCTGTG--AGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTGANACTTGCNACAAATGATCAACATAACACGACGACGTGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACANT------TTGAGTTTGTTTGA---------CAACACT--TTG-AGT-TTGTGTGAGA---------TTTCGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATGGATTTTAATA-ANACTTGCTACAAATGNT-CAACATAA-CATGATGACGTGTCGCGAATAAGAC--CCANATCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCAC-ACT-----TTGA---CGTTTGACAACA------CTT------TGAGTCC-CG-AGATGTT--C-GTGTCCGGCCCGTAACTTTGTCATGCACGGATGGATTTTGTTGA--ACTTGNTACAAATGATCAACATAACATGACGACGTGTCGTAAGTAANACCC------GTAC-----CTCAAAGGTCAAGGTCAC---------------------ACTTTGA----GTTTG-----------------TGCGANATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTATAAAT-AC---TT-GCTACAAATGATCAACATAACACGAC---G---TGTCGCGCGTAAGACCCAGACCCNTACCTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTNANTTTGTTTGACATCTCTTT-AGTCTATNCGAGATTTCGTGTCCGGTCTGTAACTTTGTCATNCATAGATGGAT-TTTA--A--AA--ACTT-AC----------CAA-----CATGACATGACGACNTGTCACG-NGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTT------T--GTTTGACAACACTTTGANTCTGTNTGAGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCGTGCATNGATGGA-TTTCATAAATACTT-GTTCGA------TTTNTC------TGATCTGTAACTTTGTC-TACAT----GGAT----TTCAAAA-CA-CTTGNCTCAATTGATCAACATGNCACGATGATG--------ACATGACAATGTGTCGCGCGCAAGACCCAGATCT-GTACA---TCAAAGGTCAAGGTCACACTTTNAGTTTG--TTT-------CG-CAACNATTTGAATATG-TTCGAGATTTT-TTT--CTTGTCTGTAACT-T--TGTCATACATGGATAAATTTCAAAAACACCTGTC--------TCAATTGATTAACATGACATGACGACTTGTCGCGCGTACGACCATGAACTGNACATCAAGGTCAAGGTCACACTTTCAGTTTGT----------------------TTGAGATTTCGTGTCTNGTCTGTAACT-T--TGTCTTACATGGAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGACGACGTNTCATCTGCGTTTA-----TG----AA-TACCCA-GACC-T-GTACATCA-A-TGTCA-AGGTCAAGGTCACACAAAAGTCAAGGTCACGCTTTAANGTGAAAAAACA---------TGAAATTGCANGTCTAGTCGGAAAC-TCAGTCCATTGATC-TT-ATATTCATGGATACATCGCTACCTATTATAA---AA-CA--TATNGTTA-TTTTCAC-AGACCATTT-------GGG--G-G-C--ATGCGACACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTNT-AG-AATA-AAAA---ACGT-ATT----AAAATCGGTTTGCTTATAA-A-GTTCATTATTATAT-TCATAT--TTTCTCCATGATATAAACAAAAATTTGAGGAAANNANTAGGAAAGAANAAATTGCCTACCTGCNTANCCTTTTTTGTATTGTTGGTCAGTAACCCTAAACACAGGTATTATTTTTTCT
finalCons                     :                                                                                       NNNNNNNNNNNNGGTCACANTTTGGGTTTGTTTGATATACACTTTGAGTCTGTG--AGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTGANACTTGCNACAAATGATCAACATAACACGACGACGTGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACANT------TTGAGTTTGTTTGA---------CAACACT--TTG-AGT-TTGTGTGAGA---------TTTCGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATGGATTTTAATA-ANACTTGCTACAAATGNT-CAACATAA-CATGATGACGTGTCGCGAATAAGAC--CCANATCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCAC-ACT-----TTGAC---GTTTGACAACA------CTT------TGAGTCC-CG-AGATGTT--C-GTGTCCGGCCCGTAACTTTGTCATGCACGGATGGATTTTGTTGA--ACTTGNTACAAATGATCAACATAACATGACGACGTGTCGTAAGTAANACCC------GTAC-----CTCAAAGGTCAAGGTCAC---------------------ACTTTGA----GTTTG-----------------TGCGANATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTATAAAT-AC---TT-GCTACAAATGATCAACATAACACGAC---G---TGTCGCGCGTAAGACCCAGACCCNTACCTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTNANTTTGTTTGACATCTCTTT-AGTCTATNCGAGATTTCGTGTCCGGTCTGTAACTTTGTCATNCATAGATGGATNTTTGAA-------ACTT-AC----------CAA-----CATGACATGACGACNTGTCACG-NGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTT------T--GTTTGACAACACTTTGANTCTGTNTGAGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCGTGCATNGATGGA-TTTCATAAATACTT-GTTCGA------TTTNTC------TGATCTGTAACTTTGTC-TACAT----GGAT----TTCAAAA-CA-CTTGNCTCAATTGATCAACATGNCACGATGATGACAG----------CAATGTGTCGCGCGCAAGACCCAGATCT-GTACA---TCAAAGGTCAAGGTCACACTTTNAGTTTG--TTT-------CG-CAACNATTTGAATATG-TTCGAGATTTT-TTT--CTTGTCTGTAACT-T--TGTCATACATGGATAAATTTCAAAAACACCTGTC--------TCAATTGATTAACATGACATGACGACTTGTCGCGCGTACGACCATGAACTGNACATCAAGGTCAAGGTCACACTTTCAGTTTGT----------------------TTGAGATTTCGTGTCTNGTCTGTAACT-T--TGTCTTACATGGAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGACGACGTNTCATCTGCATGAT---------------ACCCA-GACCT--GTACATCA-A-TGTCA-AGGTCAAGGTCACACAAAAGTCAAGGTCACGCTTTAANGTGAAAAAACA---------TGAAATTGCANGTCTAGTCGGAAAC-TCAGTCCATTGATC-TT-ATATTCATGGATACATCGCTACCTATTATAGAAC-------TATNGTTA-TTTTCAC-AGACCATTT-------GGG--G-G-C--ATGCGACACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTNT-AG-AATA-AAAA---ACGT-ATT----AAAATCGGTTTGCTTATAA-A-GTTCATTATTATAT-TCATAT--TTTCTCCATGATATAAACAAAAATTTGAGGAAANNANTAGGAAAGAANAAATTGCCTACCTGCNTANCCTTTTTTGTATTGTTGGTCAGTAACCCTAAACACAGGTATTATTTTTTCT
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): GCACACGAATGGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTAATAATTTTTATGGACGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTGGCTGTTTCTAGAAACTTAAAAACAGCTTTGATGTGACTTTTTTACTTTTATGTGGCTAAACTTTAACCACACAAGTAATAAGCTTGGCGCAAAGCTGCCACTTAAATACCCATTCCTAGGAACGTCCATCCGTACGTCCGTACGCCCGTCCGTCCGTTCTTCTG
Unaligned ( gi|7 ): TCTGTCCGGGCACACGAATAGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTAAGGGTTAGTAATTGTTATGGGCGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTTGCTGTTTCTAGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTGGCTTTTTTTTCTTTTAGCCACACAAGTAATAAGCTTGACGCAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTCGTAGAACGTCCGTCCGTCCGCCCGACGTCCCTCTGTCAGTCCGTCTGG
Unaligned ( gi|9 ): GAACTGTTCGTCCACATACACGAATGGGGAATTAAGTGTCTTGGGTTCAGGGTTAGTATTTGTTGTGGACGGTTTGAAAACAGTTGAAAAAAAATATGTCGCTGTTTCTGGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTAGCTTACTTATGTGGCTAAGATTTAAACACACAAGTAACAGGCTGGGCGCAAAGAAGCCTCTTAACTACCCATTTGTG
Unaligned ( gi|11 ): CACACAAATGGGTATTTAAGTGTCTAGGTTTTTTTAGCAAGTTGAAAAACAGTTGAATAAAAATTATGTGGCTGTTTCTAAGACACTTAAAAATACTTTTATGTGGCTATAAATCTGTTATGTGGCTAAAATATAGCCACACAAGCAATCAGCTAGGCGCAAAGAAGCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|15 ): AAGATTTTAATGTAACTTTGTACATGTGTTCAGAACATACATGTAATAATATGCAGGACACACGTGACAGCAAACCGTTCTGAAACTCTAGGATAAGGTCAGTAGTAGGGGTTGAAGTTATA
Unaligned ( gi|19 ): CTGTTTGAAAAACAGTTGGAAAAAAAAAAGTAGCTGTACCTGAATACGCTAAAATACACAAATAATCAGCTGGGCTCATAGAATCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|21 ): GCATCTCAGAGGTCAAAGTTAAATCTGAGAGTTGAAAATATATAAAAAAAACAAACTTTCATATCAGATGTATGTATATAACATTTTGTTT
Unaligned ( gi|27 ): TCTGTCTGTAAATAGGTATTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTTGTAATTTGTT
Unaligned ( gi|29 ): TTTTAATGCCCCCCGCCCCCTCCCCCAATTTTTGGGGTGGCATAGTAAT
Unaligned ( gi|32 ): TTCAGCATAATGAGGTGATGTTTCGCATGCAAGGCCCTGA
Unaligned ( gi|33 ): AATAACATTGCACAAATATTCACCATAATCAGATGA
Unaligned ( gi|34 ): CAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTTGTGAGAAC






Alignments
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Reference ( family-279 )      :                                                                                       NNNNNNNNNNNNGGTCACANTTTGGGTTTGTTTGATATACACTTTGAGTCTGTG--AGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTGANACTTGCNACAAATGATCAACATAACACGACGACGTGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACANT------TTGAGTTTGTTTGA---------CAACACT--TTG-AGT-TTGTGTGAGA---------TTTCGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATGGATTTTAATA-ANACTTGCTACAAATGNT-CAACATAA-CATGATGACGTGTCGCGAATAAGAC--CCANATCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCAC-ACT-----TTGA---CGTTTGACAACA------CTT------TGAGTCC-CG-AGATGTT--C-GTGTCCGGCCCGTAACTTTGTCATGCACGGATGGATTTTGTTGA--ACTTGNTACAAATGATCAACATAACATGACGACGTGTCGTAAGTAANACCC------GTAC-----CTCAAAGGTCAAGGTCAC---------------------ACTTTGA----GTTTG-----------------TGCGANATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTATAAAT-AC---TT-GCTACAAATGATCAACATAACACGAC---G---TGTCGCGCGTAAGACCCAGACCCNTACCTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTNANTTTGTTTGACATCTCTTT-AGTCTATNCGAGATTTCGTGTCCGGTCTGTAACTTTGTCATNCATAGATGGATNT--T--TGAA---ACTT-AC----------CAA-----CATGACATGACGACNTGTCACG-NGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTT------T--GTTTGACAACACTTTGANTCTGTNTGAGATTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCGTGCATNGATGGA-TTTCATAAATACTT-GTTCGA------TTTNTC------TGATCTGTAACTTTGTC-TACAT----GGAT----TTCAAAA-CA-CTTGNCTCAATTGATCAACATGNCACGATGATG-----ACA--G-C----AATGTGTCGCGCGCAAGACCCAGATCT-GTACA---TCAAAGGTCAAGGTCACACTTTNAGTTTG--TTT-------CG-CAACNATTTGAATATG-TTCGAGATTTT-TTT--CTTGTCTGTAACT-T--TGTCATACATGGATAAATTTCAAAAACACCTGTC--------TCAATTGATTAACATGACATGACGACTTGTCGCGCGTACGACCATGAACTGNACATCAAGGTCAAGGTCACACTTTCAGTTTGT----------------------TTGAGATTTCGTGTCTNGTCTGTAACT-T--TGTCTTACATGGAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGACGACGTNTCATCTGCAT-----------GATACCCA-GACC-TGTACATCA-A-TGTCAAGGTCAAGGTCACACAAAAGTCAAGGTCACGCTTTAANGTGAAAAAACA---------TGAAATTGCANGTCTAGTCGGAAAC-TCAGTCCATTGATC-TT-ATATTCATGGATACATCGCTACCTATTATAG---A--AC--TATNGTTA-TTTTCAC-AGACCATTT-------GGG--G-G-C--ATGCGACACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTNT-AG-AATA-AAAA---ACGT-ATT----AAAATCGGTTTGCTTATAA-A-GTTCATTATTATAT-TCATAT--TTTCTCCATGATATAAACAAAAATTTGAGGAAANNANTAGGAAAGAANAAATTGCCTACCTGCNTANCCTTTTTTGTATTGTTGGTCAGTAACCCTAAACACAGGTATTATTTTTTCT
gi|1                          :                                                                                                   GGTCACACTTTGGGTTTGTTTGATAT-CACTTTGAGTCTGTG--AGATTTTGTGTCCGGCCTGTAA-TTTGTCATGCATGAATGGATTTTGTTAATACTTGCAACAAATGATCAACATAACATGACGATGTGTTGCGAGTAAGACCCACATCTGCACCTCAAAGGTCAAGGTCACACT------TTGAGTTTGCATGA---------CAATACT--TTG-AGT-CTGTGTGAGA---------TTTCGTGTCAGGCCTGTAACTTTGTTATTCAT-ACATGGATTTTGTTA-ATATTTGCTACAAATGAT-CAACATAA-CATGACTATGTGTCACAAGTAAGAC--CCACACCCGTACCACAAAGGTCAAGTTCAC-ACT-----TTGAGTTTGTTTGACATCA------CTT------TGAGT-C-TG-AGAT-TT--C-GTGTCCGGTCTGTAACTTTGTCATGCATGAATGGATTTTGTT-A--ATTTGCTACAAATGATCAACATAAAATGACGACGTGTTGTAAGAAAGACCC------ATAC-----CTCAAAGGTCAAGGTCAC---------------------ACTTTGA----GTTTG-----------------TGTGAGATTTCATGTCTGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTATAAAT-AC---CT-GCTACAAATGATCAACACAACATGAC---A---TGTCACACTTAACATCCAGACTCCCACTTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTAACTTTGTTTGACATCTCTTTCAGTCTATTTGAGATTTCGTGTCCAGTCTGTAACTTTGTCACCTATAGATAAATTT--C--AAAA---ACTT-AC----------CAG-----CATGACATGACTACATGTCACG-TGTAAGACCCACACCCATACCTTAAAGGTCAAGGTCACACTT------T--GTTTGACTACATTTTGATGCTGTATGAGATTTCGTGTCTAGTCTGTAACTTTGTCGTGCATAGAT-GA-TTTCTTTGATAT----TTCG---------TGTC------TGATCTGTAACTTTGTC-T-----------T----TT-------A-CTTGGCTCATTTGATCAAGATGACATGACGATG-----ACATGA-C----AATGTGTCGCATGTAAGACCCAGATCT-GTACC---TCAAAGGTCAAGGTCACAATTTGAGTTTG--TTC-------CA-CAACACTTTGAGTATG-TT-GAGATTTCAAGT--CCAGTCTGTAAGT-T--TATCATGCATGGATGAATTTCAAAAACACTTGGCTTGATTTATCAATTTATCAACATGACATGACAAAGTGTCGC-TTTAC---------CTGA-----AAGGTTAAGGTCACACTTTCAGTTTG-----------------------------TTTCATGTCTGGTC--TAATT-T--TGTTTTACATGGAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGTATGTGATGATGATGTGTCATCTGCATTTACCTGTAGAAATACCCA-CACCTTTTACATCAGA-TGTTAAGGTCAAGGTTACACAAAAGTCAAGGTCACCCTTTAATGTGAAAAAACA---------TGAAATTGCATGTCTAGTCGTAAACTTCAGTCCATGGATC-TTGATATTCATGGATACATCGCTACCTATTATAA---A--ATA-TATCGTTA-TTTTCAC-AGACCATTT-------GGG--G-G-C--ATGCAACACTTTCC------A------GTGACATTTCTTGTTAT-AG-AATA-AAAA---ACAT-GTT----AAATTCAGTTTGCTTATAATA-GTTCATTATTATATATTATAT--TTTCTCCATGATATAAACAAAAA---GAAGAAACAAATAGAAAAGAACAAATTGTCTACCTGCCTAACCTTTTTTGTATT-TTGGTCAATAACTCTAAACACAGGTATTATTTTTTCT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aannnnnnnnnnTCACAGAAAATTCACGGTCACACTTTAAGATAAAAAAA---------------ATTGTGTTTCT-GTTGG-----------TATTGATC-TT-AC--TCTT---TATATC-CCA--TATTTTAA---A--ACG-TATCGTTT-TTATCAA-CGACCACTTCTGGATGGGGTTG-G-C--ATGTGAGATTTACC------AGTCACTGTGGCATTTATCGTTCTGAGTAATA-TAAA---GCGTAATT----AA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -AG-AACAGAAAA---ACAA-ATT----AAAATCAATTTGCTTATAA-AAGTTCATCATTATG----ATAT--TTTCTCCATGA----AATAAAAATTTGAGAAAAATATTAGGAAAGAAAAAATTGCCTACCTACATACCCTTTT---TATTGTTG---AGTAACCCTAAACACAGGTATTATTTTTTCTtcacccgtgagttgaca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttaaCATCTGTTT--GTCCATCCTGTATTTCGTGTCCGGCCTGTAACGTTGTCATGCATAGATGGATTTTGT--TAAA---ACTT-gc
gi|13                         :                                                                                       atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagCTGT-----ATTTCGTGTCCGGCCTGTAACGTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTAAAACTTGATACAAATGATCAAgatacaaatgatcaatgaacaaaga
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atttttatccccccgacatccaatttttggggtggcacagtaatcgcagcatctgtttgtccatcATGCATTAGA-GGATTTTAATATAAACTAG-TACAAATGTT-CACCACAC-CAAGATGAtgaacaaaga
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cccgcgtcacattaacgaagggtgataaagtaatactcacagttcagttgtcctatttttccacaattttccaccattcttatTCATGTTTGGTTCGTAACTTTGTCATCCATAGAGAGAGAT--T--TAAAATGACTTCACA---------CAAACTGGCATGACTTGGTGACCTGACATGTTGCAAG--CTACATCCAt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTGCATATTATA-----------TATTAACA-TTTTCAC-AGATCATTT-------GTG--G-G-TGAATGCGGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTcttccgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tatatatatagattactcattttatGCAAAAACAAGGTAT-GTCCC---TCACAGGTAAAGGTCACACATTGGCGTTGAATTTATAAAAAAA-CAATAATTTG-ATATGAACCAATATTTT-TTT--tg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTCCCTCACAGGTAAAGGTCAC-ACA-----TTGG---CGTTgtat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gcaaaaacaaggtatC-CG-GTAT-TT--C-GTTTCTGGCCTGTATCTTTGTCATGCACAGATGGATTTTGTTGAT-ACTTGGTACAAATGATCAACATAACATGATGATTTGTCATGAGTAAAACCCACACCCGTAT-----CTCAAAGGTCAAGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGAATACACTTTGA----GTCTG-----------------TGCGAAACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTAATGAT-AC---TT-GCTACAAATGATCAACATAACACGAC---GACATGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTATTTGAGTTTGTTTGACAACACTTCGAGTTTGTATGAGATTTTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACATAGATGGATTT--TAATGAT---ACTT-GCTACAATTGATCAA-----CATAACATGAGGATGTGTCGCG-AGTAAGACCCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCACAATT------TGAGTTTGACAACACTTTGAGTCTGTGTGATATTCTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATACTT-GTTgaatttataaaaaaacaataatttgatatgaaccaatatttttttgtat
gi|2                          :                                            atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatGGTCACAATTTGAGTTTGTTTGA-ATACACTTTGAGTCTGTGCGAAACTTCGTGTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTAATGATACTTGCTACAAATGATCAACATAACACGACGACATGTTGCGAGTAAGACCCACACCTGTAACTCAAAGGTCAAGGTCACTAT------TTGAGTTTGTTTGA---------CAACACT--TCG-AGT-TTGTATGAGA---------TTTTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATACAT-AGATGGATTTTAATG-ATACTTGCTACAATTGAT-CAACATAA-CATGAGGATGTGTCGCGAGTAAGAC--CCACACCCATACCTCAAAGTTCAAGGTCAC-AAT-----TTGA----GTTTGACAACA------CTT------TGAGTCTGTG-TGATATT--CTGTGTCCGGCCTGCAACTTTGTCATGCATTGATGGATTTTTATAAATACTTGTTATAAATGATCAACATAACATGATGACGTTTTGCACTTAATACCC------AAACTCCCACTTAAAGGTCAAGGTCAC---------------------AATTTAACTTTGTTTGACAACACTTTCAGTCATTTTGACATTTCTTGTCCGGTC--TAATCT--------ATGGATAAATTTTA-AAATCAC---TTGGCT-CAGTTGATCAACATGACATAATTAAG---TGTCGCATGTAAGACCCAGAACCTTTCCTCAAAGATCCAGGTCACACTTTCAATTTGTTTGATATT-------GT--------------GTGTCTGGTCTGTGACTTTGCC-TTTA-ACTTGGCTC---------A---ATTT-AT----------CAA-----GATGAAATGACGACTTGTCATA-AGTAAGACCTAGACCCATACCTCAAAGGTCAAGGTCACACTTTTAGTAT--GTATGACAACACTTTGAATCTGTTTGAGATTTCAAGACCGGCCTTTAACTTTATCATACATGGATGGA-TTTCAAAAATACTTGGTTCAA------TTTATCAACAATTGATCTGTAACTTTGTCTTACATTTAGGGAT----TTTAAAA-TAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGGTGATGTTTCAGCA--G-CATTTAAT-TGT----TGAAATACCCAGACCA-TTACA---TCAAATGTCAAGGTCAataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaattgatctgtaactttgtcttacatttagggattttaaaatagcttgacacaagtgatcagcatgtcatggtgatgtttcagcagcatttaattgttgaaatacccagaccattacatcaaatgtcaaggtcaaagttacacaaaggtcaaggtcacgctttaatgtaaaaaaacatgaaattgcaagtctagtctgaaacatcagtccattactctttatattcatggatacagcgctacctattataacataattatatagttatttttcaatgaccatttgggggacatgcgccatttaccagtaacattttttgttta
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaTGATCTGTAACT-T--TGTCTTACATTTAGGGATTTTAAAATAGCTTGACACAAGTGATCAGCATGTCATGGTGATGTTTCAGCAGCATTTAATTGTTGAAATACCCA-GACC-ATTACATCA-AATGTCAAGGTCAAAGTTACACAAAGGTCAAGGTCACGCTTTAATGTAAAAAAACA---------TGAAATTGCAAGTCTAGTCTGAAACATCAGTCCATTACTCTTT-ATATTCATGGATACAGCGCTACCTATTATAACATA--ATTATATAGTTATTTTTCAA-TGACCATTT-------GGG--G-GAC--ATGCGCCATTTACC------A------GTAACATTTTTTGTTaagttacacaaaggtcaaggtcacgctttaatgtaaaaaaacatgaaattgcaagtctagtctgaaacatcagtccattactctttatattcatggatacagcgctacctattataacataattatatagttatttttcaatgaccatttgggggacatgcgccatttaccagtaacattttttgttta
gi|20                         :                                                                                                                                                       atttttatgccccccctcccaaatttttggggtggcatatagtaatcgcgtccatccggtatttcgtttctggcctgtatctttgtcatgcacagatggattttgttgatacttggtacaaatgatcaacataacatgatgatttgtcatgagtaaaacccacacccgtatctcaaaggtcaaggtcacaatttgagtttgtttgaatacactttgagtctgtgcgaaacttcgtgtccggcctgtaactttgtcatgcatagatggattttaatgatacttgctacaaatgatcaacataacacgacgacatgttgcgagtaagacccacacctgtaactcaaaggtcaaggtcactatttgagtttgtttgacaacacttcgagtttgtatgagattttgtgtccggcctgcaactttgtcatacatagatggattttaatgatacttgctacaattgatcaacataacatgaggatgtgtcgcgagtaagacccacacccatacctcaaagttcaaggtcacaatttgagtttgacaacactttgagtctgtgtgatattctgtgtccggcctgcaactttgtcatgcattgatggatttttataaatacttgttataaatgatcaacataacatgatgacgttttgcacttaatacccaaactcccacttaaaggtcaaggtcacaatttaactttgtttgacaacactttcagtcattttgacatttcttgtccggtctaatctatggataaattttaaaatcacttggctcagttgatcaacatgacataattaagtgtcgcatgtaagacccagaacctttcctcaaagatccaggtcacactttcaatttgtttgatattgtgtgtctggtctgtgactttgcctttaacttggctcaatttatcaagatgaaatgacgacttgtcataagtaagacctagacccatacctcaaaggtcaaggtcacacttttagtatgtatgacaacactttgaatctgtttgagatttcaagaccggcctttaactttatcatacatggatggatttcaaaaatacttggttcaatttatcaacaatCACCATAATG-----A-G--G-C----AATGTTTGGCACACAAGGTCCAGATCT-GTAGG---TCAAAGGTCATAGTCATACTTAAAGGTTA--Tta
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taatacacaaattattTA-TATTCAC-AGACAATTT-------GGGC-G-G-C--ATGTGACAC----C------G------ATGACATTTCTTGTTTT-----CTA-AAAG---GAAT-ATTTTTAAAAATCAGATTat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aCCAGCCTATAACTTTGCCATGCTAAGATGGATTTTATAAAC-ACAGATG-GTTACAAA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GG--G-G-C--ATGAGATATTTACC------A------ATGACATTTCTTGTTatggatacttcatatcca
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaATA-ACA-TTGC-ACAAATGTT-CACCATAATCA-GCTGATGTGTTGTGCACAAGAC--CGAGATCTGtgtttttttatgcccatgaacaaattttgtaatat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -TTTGCAC-AGACCATTT-------GGG--GAG-C--GTGTTGCACTTACC------A------GTGACATTTCTTGTTGT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -------GGG--G-G-C--ATGTGACACTTGCCAGCCTGA------GTGACATTTCTTGTTCT-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gT----TTTAAAA--A--TTGGCAAAAT-AATCAACATGACATTA-----------------C----AATGTATCGT-CATAAGACCCAGACCCAGTATAAGCTCAGAGGTCAAGGTCACACTTTT-TTTTG--TTT-------GG-CAACCATTTAAATATG-TTTGAGATTTT-TTTTTCTTATCTGTAACT-A--TGTCATACATGGATAAATTTCAAAAACACCTATC--------TCAATTGATTAACATGGCATGATGACTTGTTGTGCGTATGACCATGAACTGTACATCAAGGTCAAGGTCACACTTTCAGTTTGTTTTGGCAACCATTTGAATCTGTTTGAGATTTT-TTTCTTGCCTGTAACTATAATGTCATACATGGATAGACTTCAAAAACACCTGTCTCAATTGATTAACATGACATGACAACTTCTTGCGTGTAT-----------GA---CCATGAAC-TGCACATCA-A-GGTCAAGGTCAttatg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAAATA--T-GTTTGAGATTTTTTTTTC------TTATCTGTAACTATGTCATACAT----GGATAAATTTCAAAAACA-CCTATCTCAATTGATTAACATGGCA---TGATG-----AC------------T-TGTTGTGCGTATGACCATGAACT-GTACA---TCAA-GGTCAAGGTCACACTTTCAGTTTG--TTT-------TGGCAACCATTTGAATCTG-TTTGAGATTTT-TTT--CTTGCCTGTAACTATAATGTCATACATGGATAGACTTCAAAAACACCTGTC--------TCAATTGATTAACATGACATGACAACTTCTTGCGTGTATGACCATGAACTGCACATCAAGGTCAAGGTCACATTTTCAGCTTGT----------------------TTGAGATTTTGTGTCTTCTCTGTTA---T--TGTCTCACAAGGAGGGATTGTAGAATAACTTGACACAA---------ATGTC-TGACAAAATGTCACCTGCA-------------ATAACCA-GGCC-TGTACATCACA-TGTCAACGTCAAGGTCATAC-AAAGTCAAGGTCACACTTTAAGGGGAAAAAAAAGAATTCTCTTGAAATT-TAAATCTCAACAGAA---TAAGT------ATA-TT-AT-TTTAAGG-----TC---ACTTA--ATAG---ACCACT-TAGGGTCA-CTTGGACTGGACCACTT-------AGG--G-C-G--ATGGGACACTTTCC------A------GTGACATTTCTTGCCAT-GG---TG-AGAGTTTACGTGATG----TAAACTGGTTTG-TTGTTA-A---TCAATATTATAT-TCATCTGGTTTGTCCAcattttcagcttgtttgagattttgtgtcttctctgttattgtctcacaaggagggattgtagaataacttgacacaaatgtctgacaaaatgtcacctgcaataaccaggcctgtacatcacatgtcaacgtcaaggtcatacaaagtcaaggtcacactttaaggggaaaaaaaagaattctcttgaaatttaaatctcaacagaataagtatattattttaaggtcacttaatagaccacttagggtcacttggactggaccacttagggcgatgggacactttccagtgacatttcttgccatggtgagagtttacgtgatgtaaactggtttgttgttaatcaatattatattcatctggtttgtcca
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttttaaaaattggcaaaataatcaacatgacattacaatgtatcgtcataagacccagacccagtataagctcagaggtcaaggtcacacttttttttgtttggcaaccattTTTCAT-AGACCATTTT------GGG--G-G-C--GTGCAACATTTACC------T------GTGAGATTT
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CACCATAAT-------CA--GAC----AATGTTTTGTGTGCAAGACCCAGGTC
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tt-C--ATGTGACACTTACC------A------GTGACTTTTCTTGTTa
gi|4                          :                                                                                                                                                 ATTTCGTTTCCGGCCTGTAACTTTGTCATGCATAGATGGATTTTGTTGAAACTTGCAACAAATGATCAACAGAACATGACATAGTGTTGCGAGTAAGACCCACACCCGTACCTCAAAGGTCAAGGTCACAAT------TTCCGTTTGTTTGA---------CAACACT--TTG-AGT-TTATGTGAAA---------TTTCGTTTCTGGCCTGCAACTTTGTCATGCAT-AGATTAATTTTAATG-ATACTTGCTACAAATGAA-CAACATAA-CATCATGACATGTTGt
gi|5                          : gtctgtctgtccgggcaaacaaatgggtagttaagtgtctagggttatagtttttatggacagttgaaaagcagttaaaaaataattacgtggctgtttctagccacttaaaaaacagcatttaagtggctttttttctcttacgtggctaaaattatctaaaatttagccacacaagtaataagattgacgcaaagaagccacttaaatacccattcgtgagaacttccgtccgtccttccgtccggtCTGTATCTCAAGGGTCAAGGTCACACAAGAGCATTGAATTTAT--GAAAAAAAAAACAACACTATTTATAATATTAT---AGAACATACTGTTTTCGTGTC--------AACTTTTACATGCAT-GAAAGGATTTT---------TTTTTAAAAAAGC----ACCTA----TAATCACA-----CCAATAAG----CCAGATCAGTATCCCAAAGGTCAAGGTCACAACTAAATGTTGA---AGTT--ATAACATAATCTCTTTTAATATGAATCC-CATAAATGTTTAC-ATGTCCGGTCCATAACCTTCATATGCAgggggcatgtgacacttaacagtgacatttcttgtttccttctttc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaaaggtGGATTTTAATA-TAAGTAGGTACAAGTTTTACAACATAA-AGT--TGATGTG-CA-GAATGAAACAATCATGTCTGTAACTCTGATGTCAAGGTCAG-ACT-----TGGG---CGTTgaatataatataactacataaagatgacgtgacgtgtagaactaaaaaaa
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): GCACACGAATGGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTAATAATTTTTATGGACGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTGGCTGTTTCTAGAAACTTAAAAACAGCTTTGATGTGACTTTTTTACTTTTATGTGGCTAAACTTTAACCACACAAGTAATAAGCTTGGCGCAAAGCTGCCACTTAAATACCCATTCCTAGGAACGTCCATCCGTACGTCCGTACGCCCGTCCGTCCGTTCTTCTG
Unaligned ( gi|7 ): TCTGTCCGGGCACACGAATAGGTAGTTAAGTGTCTAGGGTTAAGGGTTAGTAATTGTTATGGGCGGTTGAAAAGCAGTTGAAAAATAATTATGTTGCTGTTTCTAGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTGGCTTTTTTTTCTTTTAGCCACACAAGTAATAAGCTTGACGCAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTCGTAGAACGTCCGTCCGTCCGCCCGACGTCCCTCTGTCAGTCCGTCTGG
Unaligned ( gi|9 ): GAACTGTTCGTCCACATACACGAATGGGGAATTAAGTGTCTTGGGTTCAGGGTTAGTATTTGTTGTGGACGGTTTGAAAACAGTTGAAAAAAAATATGTCGCTGTTTCTGGACACTTAAAAACAGCTTTTATGTAGCTTACTTATGTGGCTAAGATTTAAACACACAAGTAACAGGCTGGGCGCAAAGAAGCCTCTTAACTACCCATTTGTG
Unaligned ( gi|11 ): CACACAAATGGGTATTTAAGTGTCTAGGTTTTTTTAGCAAGTTGAAAAACAGTTGAATAAAAATTATGTGGCTGTTTCTAAGACACTTAAAAATACTTTTATGTGGCTATAAATCTGTTATGTGGCTAAAATATAGCCACACAAGCAATCAGCTAGGCGCAAAGAAGCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|15 ): AAGATTTTAATGTAACTTTGTACATGTGTTCAGAACATACATGTAATAATATGCAGGACACACGTGACAGCAAACCGTTCTGAAACTCTAGGATAAGGTCAGTAGTAGGGGTTGAAGTTATA
Unaligned ( gi|19 ): CTGTTTGAAAAACAGTTGGAAAAAAAAAAGTAGCTGTACCTGAATACGCTAAAATACACAAATAATCAGCTGGGCTCATAGAATCCACTTAAATAC
Unaligned ( gi|21 ): GCATCTCAGAGGTCAAAGTTAAATCTGAGAGTTGAAAATATATAAAAAAAACAAACTTTCATATCAGATGTATGTATATAACATTTTGTTT
Unaligned ( gi|27 ): TCTGTCTGTAAATAGGTATTTAAGTGTCTAGGGTTTAGGGTTTGTAATTTGTT
Unaligned ( gi|29 ): TTTTAATGCCCCCCGCCCCCTCCCCCAATTTTTGGGGTGGCATAGTAAT
Unaligned ( gi|32 ): TTCAGCATAATGAGGTGATGTTTCGCATGCAAGGCCCTGA
Unaligned ( gi|33 ): AATAACATTGCACAAATATTCACCATAATCAGATGA
Unaligned ( gi|34 ): CAAAGAAGCCACTTAAATACCCATTTGTGAGAAC