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Reference ( family-2779 ) : NGTGAG-TAATGTTAACTTT---TATAAGATATGTGTATATTTATTTT---TAGC--TGTGTTGTGTAACTTGCCAA-ATATGGTATTGA--AT---------------------ATTGGAAATNA-TG-TATTAA---T-CATGTTGATTGGTCAGTTACACTGGTC-TTCC-----G-----T-------AA-AATTTCATTGGTCG---------------AAAACAGTATAAATAGTAGANTTTAAATAGTAATTAGGCAGTCNA-NAGTGAA-ATTTCGAAGTGAATCACG-T---AGTAA--AATAAATAAGTGTTGATGTTGGATTTGGAA-ATTTGGGGT-GA-GTGCAAATTATA--TTTTT---ATTTTATA-AATGTT--ATAA-AGATGA--CAAATGTGAA-GTACATATCAAATT---GTT-----TTTATGTTATTATTCATTG---TTGCATGTAAGTGAAACAGAATGAATATT-----ACCG-AA-TNTGCGTTACTACTATTAGTT-TGTT-AATACGCTTGCATTGG---AAT---CA--TAAAGC----TTGGATAT---------TGTTT----------TAC----CA-----------------A-----------------T-A-AT-TGT-TGAATACGTTT-CA-TAG-A-AT-AT----ATGT--------AAATGT--GAGTTTT-AANATGTAT----GTGC--------GTCAGTACGTA-----T--ATC----TG------CGTAAATAACNATGTA---AT---T-ATT------AT------TGT--------------------------TGTG---------------------TG-------TT-----CA--------TGCGTCC--GCG------TATCT--GAAT----TTTAA---GACATTGATGGAAATCTGTGAGAAATATTCATAGAGTAAATATTTATATATTGTAAT-GT------TGTA-TTTCCATATAGAAT-TTATAAGGAAAATGTAGATTTGCTTTATATAT----GTA----CACGATGTACAAATATGAC--A--ATTGTTTCTTTTT--TNTTAT---ATATAGGATAAAGATCTAGTGTGTGTGTGAAAA--AGTTC-AAA--AC---A---GT---TCACCGTCATAGTACCA----TATACTTGTAAGTGACATGTAT----TC-TTTATTGCAATGTTTATCTTATTTATTGTACCACGCATTATTGCTCTTAGCTATAATGATGATTTAAATATAATAAAATGTTAAATT-T-----AGTGTAAAGAATTATAAGCAAAAGATGAACTCAG-TTTGAAATCAGCGTAATTTAT-TAAATCATAAG--AA-AAAA-GCAAGCTATTA----TTTAAATCATTGTAATGTTTATCATAATGTATTTTAAATG-TGTATTGTA-----TG-----TGTA--ATA-----TA---T-GTGA-------TAAAT-TG--TT-ANTCTGT-AT-T----TATGTAA-----TGTTA-TATGTATT-------------------TTCAGTG-AT-AAAAATGTGAC-G-ATAA---AA-----TATG-TG---ATGAATAAAAATGTA-----TAATGAAG--A---A-AG--TGT--A--A-A----GTTG--TNAATCAAATAACCAGTGGACTC---CA-TAA-AGAGAGTNA-----AACCCCGGTTAC
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Reference ( family-2779 ) : NGTGAG-TAATGTTAACTTT---TACAAGATATGTGTATATTTATTTT---TAGC--TGTGTTGTGTAACTTGCCAA-ATATGGTATTGA--ATA---------------------TTGGAAATNA-TG-TATTAA---T-CATGTTGATTGGTCAGTTACACTGGTCATTCCGTTATATTATA-AAAATTTC-ATTGGTCG---------------AAAACAGTATAAATAGTAAATTTTAAATAGTAATTAGGCAGTCNAN-AGTGAAATTTCGAAGTGAACCACG-T---AGTAA--AATAAATAAGTGTTGATGTTGGATTTGGAA-ATTTGGGGT-GA-GTGCAAATTATA-TTTTT--ATTTTATAAATGTTATAA-AGATGACAAATGTGAAGTACATATCAAATTGTTTCTATGTTATTATTCATTGTTGCATGTAAGTGA-AACAGA-ATGAA-----TAT--TACCGAATNTGTGTTATTAATCAGT----T-TGTTAA-TACACTTGCATTGGAATCATAAAGCTTGAATATTGTTTTACCATAATGTACTCTAC-AA----TAATTGTTGAATACGTTT-CA-TAGAAT-ATATGTAAATGTGAGTTTC-AANATGTATG------------------TGTGTCAGTACGTATATCTGTGTAA--------------ATAACNACGTA---AT---TATT------AT------TG---T--------------------------TGTG---------------------TG-------TT-----CA--------TGCGTCC--GCG------TATCT--GAAT----TTTAA---GACATTGATGGAAATCTGTGAGAAATATTCATAGAGTAAATATTTATATATTGTAAT-GT------TGTA-TTTCCATATAGAAT-TTATAAGGAAAATGTAGATTTGCTTTATATAT----GTA----CACGATGTACAAATATGAC--A--ATTGTTTCTTTTTTA--TTAT---ATATAGGATAAAGATCTAGTGTGTGTGTGAAAA--AGTTCAAA--A-C---A---GT---TCACCATCATAGTACCA----TATACTTGTAAGTGACATGTAT----TC-TTTATTGCAATGTTTATCTTATTTATTGTACCACGCATTATTGCTCTTAGCTATAATGATGATTTAAATATAATAAAATGTTAAATT--------GTGTAAAGAATTATAAGCAAAAGATGAACTCAG-TTTGAAATCAGCGTAATTTAT-TAAATCGTAAG---A--AAAA--GCAAGCTATTG----TTTAAATC---AT---TGTAATGTTTATCATAATGTATTTTAAATG-TGTATTGTA-----TG-----TGTA--ATA-----TA---T-GTGA-------TAAAT-TG--TT-ACTCTGT-AT-T----TATGTAA-----TGTTA-TATGTATTT-------------------TCAGTG-AT-AAAAATGTGAC-G-ATAA---AA-----TATG-TG---ATGAATAAAAATGTA-----TAATGAAG--A---A-A--G--TGT--AA-A----G--TT-TNAATCAAATAACCAGTGGACTC---CA-TAA-AGAGAGTCA-----AACCCCGGTTAC
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gi|24 : GTGTATTCAATTA---T-GA--TGTGTTGTATAACTT-CCAATTTAAGATGTTGA--ACA---------------------TTGatttgttcaaaattcaaatagaaaa
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gi|4 : ATGACAAATATGAAGTACATATCAAATTGTTCCAATGTTAT-A--CAATGTTGCATGTAAGTGA-AACAGA-ATGAA-----TGTTACCGAATT-----TGTGTTATTAATTTGT----TGTTTTAA-TACACTTGCATAGGAATCATAAAGCTTGAATATTGTTTCACCATAATGTACTTTACAACTGTTAATTGTTGAATACGTTT-CA-TAGTAT-ATATGTAAATGTGAGTTTT-AAAATGTATGTGTGTCAGTACGTATATCTGTGTAAATACATGTAACTACGTAATTATTATTGATATGATAA-AACACA---AA---TAAG------AC------AGAAATA-------------------------TGTG---------------------TG-------TT-----CG--------TGCGTCC--GCG------TA-----------------A---GACATTGATGGAAATCTGTGAGAAATATTCATAGAATAAATATTTATATATAGTAAT-GT------TGTA-TTTCCATATACAAT-TTATAAGGAAAATGTAGATTTGCTTTATATAT----ATA----CACGATGTACGAATATGAT--A--ATTGTTGATTTTT-A--TTAT---ATATAGGATAAAGATCTAGTGTGTGTG--AAAA--ATTACAAA--AAC---A---GT---TCAACATCATAGTACTA----TATACTTGTAAGTGACATATAT----TTATTTATTGCAATGTTTATCTTATTTACTGTACCCTGCATTATTGTTCTTAGCTAGAATGATGATTTAAATTTAATAAAATGTTTAATT--------GTGTAAAGAATTTTAAGCAAAAAATGAACTCAG-TTTGAAGTCAGCATAATT---TAT-TTAGTCATAAG---A--AAAA--GCAAGCTATTG----TTAAAAGC---A--T---TGTTATGTTTTTCATAATGTATTTCAAAT--TGTATTGTA-----TA-----TGTGATA-----TA---T-GTGA-------TAAAT-TG--TT-ACTCTGT-AT-T------------------------TGCATTT-------------------TCAGTA-AT-AAAAATGTGACAA-ATAA---AA------ATG-T----AT-------AATGTA-----TAATGAAGAAA---A-A--G--TGT--AA-AAAGGG--TT-TAAATC-AATTACCAGAGGACTCAA-CACCAA-AGAGAGCC------AACCCCGGTTA
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gi|24 : GTGTATTCAATTA---T-GA--TGTGTTGTATAACTT-CCAATTTAAGATGTTGA--ACA---------------------TTGatttgttcaaaattcaaatagaaaa
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gi|3 : gtggtagcgtgtattatgacacgTATAATGTTGTAA-AGATAACAAATATGAAGTACATATCAAATTGTTCCAATGTTAT-A--CAATGTTGAATGTAAGTGA-AACAGA-ATGAA-----TGTTACCGGATT-----TGTGTTATTAATTTGTGTTTT-TTTTAAATACACTTGCATATGAATCATAAAGCTTGAATATTGTTTTACCATAATGTACTTTACAACTATTAGTTGTTGAATACGTTT-CA-TGGTAT-ATATGTAAATGGGTGTTTT-AAAATGTATGTGTGTCAGTACGTATATCTGTGTAAATACATGTAACTACGTAATTATTATTGATATGATAA-AACACA---AA---TAAG------AC------AGAAATA-------------------------TGTG---------------------TG-------TT-----CG--------TGAGTCC--GCG------TA-----------------A---GACATTGATGGAAATCTGTGAGAAATATTCATAGAATAAATATTTATATATTGTAAT-GT------TGTA-TTTCCATATACA-T-TTATGAGGAAAATGTAGAT--GTTTTATATAT----ATATATACACGATGTACGAATATGAC--A--ATTGTTGATTTTTTA--TTAT---ATATAGGATAAAGATTTAGTGTGTGTG--AAAA--AGTACAAA--A-C---A---GT---TCAACATCATAGTACTA----TATACTTGTAAGTGACATACAT----TTATTTATTGCAATGTTTATCTTATTTACTGTACCCCGCATTATTGCTCTTAGCTCGAATGATGATTTAAATTTAATAAAATGTTAAATT--------GTGTAAAGAATTATAAGCAAAAATTGAACTCAG-TTTGAAGTCAGCATAATT---TAT-TTAATCATAAG---A--AAAA--GCAAGCTATTG----TTAAAAGC---A--T---TGTAATGTTTTTCATAATATATTTCAAAT--TGTATTGTA-----TA-----TGTGATA-----TA---T-GTGA-------TAAAT-TG--TT-ACTCTGT-AT-T----TATGTTA-----TGTTA-TATGCATTT-------------------TCAGTG-AT-AAAAATGTGAA-GAATAA---AA------ATG-T----AT-------AATTTA-----TAATGAAGAAA---A-A--G--TGT--AA-AGAGGG--TT-TAAATC-AATTACCAGAGGACTCAA-CA-TCATCGAGAGTC------AACCCCGGTTAC
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gi|6 : tgtggtagtgtgtatattgatacTGGATTTGGAA-ATTTGGGGT-GATATATACATT----TTTT--TATTGTATAATGTTATAA-AGTTGACACATGTGAAGTATATATCAAATTATTTCTATGTTATTTTTCATTGTTGCATGTAAGTG-------------------TATTACCGAATT-----TGCGCTGTTAATCAGT----T-TGTTAA-TTCACTTGCATTGGAATCATATAGCTTGGATATTTATTTACCATAATGTACTCTACAGCAATTAATTGTTGAATATGTTT-CA-TAGAAT-ATATGTAAATGTGAGTTTC-AAAATGTATG------------------TCTGTCAGTACGTATATCTGTGTAA--------------ATAGCTATATA---ATTATTATT------GA------TG---TGATAAAACACATATAGAACAGAAATATGTG---------------------TG-------TT-----CA--------TGCGACC--GCG------TATCT--GAAT----TTTAA---GACATTGATGGAAATCTGTGAGAAATA------GAGTAAATATTTATACATTGTAAT-GT------TGTA-TTTCCATATAGAAT-TTATAAGGAAAATATAGATTTGCTTTATAAAT----GTA----CACGATGTACAAATATGAC--A--ATTGTTTCTTTTTTA--TTAT---ATTTAGGATAAAGATTTAGTGT--GTGTGAAAA--AGTTTAAA--A-C---A---GT---TCACCGTCATATTACCA----TATATTTGTAAGTGACATGTAT----TC-TTTATTGTAATGTTTATCTTATTTATTGTACCATGGATTATTGCTCTTAACTATAATGATGATTTAAATATAATAAAATGTTAAATT--------GTGTAAAGCATTATAAGTAAAAGATGAACTCAG-TTTGGAATCAGGATAATT---TAT-TAAATCATAAG---A--AAAA--GCAAGCTATTG----TTTAAATC---A--T---TGTAATGTTCATCTTAATGTATTTTAAATG-TGT
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gi|10 : tttttactttcattaacattatattgatttgttcaatattcaaatagaaaataatgtatttattcatgttaattggtcagttgcactggtcattcagttataaacaatttcattgaccgtaggtgttcacctccaaagcagtatacatattagaatttaaacagtatttagtcagtcaaaagcgaaatttcgaagtgaatgcagtaaaatacatttgaaata--------------ATA--ATT---------------ACGTAAT----TAT-------------TATTGA---------TGTG---------------------
gi|10 : ---------TGTG---------------------TG-------TG-----CA--------TCCGTCC--GCG------CATCT--GAAT----TT-AA---AACATTTATGGAAATCTGTGAGAAATATTCATAGAGTGAATATT-ATATATT-CAATTGT------TTTG-TTTCCATATAGAAC-TTATAAGAAAAATATATATTTGCTTTATATGT----GTA----CACAATGTACAAATATGAC--A--ATTATTT-TTTTTTA--TTATTTTATATAGGATAAAGATCGAGTGT-T-TGTGAAAT--AGTTCAAA--A-C---A---GTAGTTCACCGTCATTTTACCA----TATACTTGTAAGTGACATGTAT----TC-TTTATTGCAATGTTTATATTATTTATTGTACCACGCATTATTGCTCTTAGCTATAATGATAA-TTAATTATAATTAAATGTTAAATT--------GTGTAAAG------AAGCAAAGGATAAACTCAC-TTTGAAAGCAGCGTAATT---TATGTGTATTGT-AT---A--TGTG--GTAA---ATTG----TT--ACTCTGTA--TTTATGTAATG-TTAT----ATGTATTTTCAGTGATGAATTA-A-----TTTAT-A--------T---------A-----ATGataaaacacatatcggacagaaatatgtgtgtgcatccgtccgcgcatctgaatttaaaacatttatggaaatctgtgagaaatattcatagagtgaatattatatattcaattgttttgtttccatatagaacttataagaaaaatatatatttgctttatatgtgtacacaatgtacaaatatgacaattatttttttttattattttatataggataaagatcgagtgtttgtgaaatagttcaaaacagtagttcaccgtcattttaccatatacttgtaagtgacatgtattctttattgcaatgtttatattatttattgtaccacgcattattgctcttagctataatgataattaattataattaaatgttaaattgtgtaaagaagcaaaggataaactcactttgaaagcagcgtaatttatgtgtattgtatatgtggtaaattgttactctgtatttatgtaatgttatatgtattttcagtgatgaattaatttatataatgaagaaaaggtgtaaaaggttttaatcaaataaccagtggactcgaaaacagagagtcaagcccagtta
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gi|22 : gtggtagtgtgtatattgacac---------------------TG-------TC-----TA--------TGCATCC--GCT------TATCT--AAAT----TACAA---CATATTCCTGTACATCTGTGAGGAATATTATTAGAGTTGATGCTTATGTATTGTAAT-GTTGTAGATGTA-TTTTAATATAGAATATTATAA
gi|23 : TGCTGATCTT---TACGAGATCTGTGTATATTTATTTT---CAGC--TGTGTTTGGTAACTTACCAA-ATACAATATTGA--ATA---------------------TTGttgattccatgtgtatac
gi|24 : GTGTATTCAATTA---T-GA--TGTGTTGTATAACTT-CCAATTTAAGATGTTGA--ACA---------------------TTGatttgttcaaaattcaaatagaaaa
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gi|3 : gtggtagcgtgtattatgacacgTATAATGTTGTAA-AGATAACAAATATGAAGTACATATCAAATTGTTCCAATGTTAT-A--CAATGTTGAATGTAAGTGA-AACAGA-ATGAA-----TGTTACCGGATT-----TGTGTTATTAATTTGTGTTTT-TTTTAAATACACTTGCATATGAATCATAAAGCTTGAATATTGTTTTACCATAATGTACTTTACAACTATTAGTTGTTGAATACGTTT-CA-TGGTAT-ATATGTAAATGGGTGTTTT-AAAATG------------TATGTGTGTCAGTACGTATATCTGTGTAAATACATGTAACTACG----TAATTATTATTGATATGATA--A-A---------------ACACAAA----TAA-------------GACAGAAATA-----TGTG---------------------TG-------TT-----CG--------TGAGTCC--GCG------TA-----------------A---GACATTGATGGAAATCTGTGAGAAATATTCATAGAATAAATATTTATATATTGTAAT-GT------TGTA-TTTCCATATACA-T-TTATGAGGAAAATGTAGAT--GTTTTATATAT----ATATATACACGATGTACGAATATGAC--A--ATTGTTGATTTTTTA--TTAT---ATATAGGATAAAGATTTAGTGTGTGTG--AAAA--AGTACAAA--A-C---A---GT---TCAACATCATAGTACTA----TATACTTGTAAGTGACATACAT----TTATTTATTGCAATGTTTATCTTATTTACTGTACCCCGCATTATTGCTCTTAGCTCGAATGATGATTTAAATTTAATAAAATGTTAAATT--------GTGTAAAGAATTATAAGCAAAAATTGAACTCAG-TTTGAAGTCAGCATAATT---TAT-TTAATCATAAG---A--AAAA--GCAAGCTATTG----TTAAAAGC---A--T---TGTAATGTTTTTCATAATATATTTCAAAT--TGTATTGTA-----TATGTGA--------T---------AT----ATGTGA---TAAAT-TG--TT-ACTCTGT-AT----T-TATGTTA-----TGTTA-TATGCATT-------------------TTCAGTG-AT-AAAAATGTGAA-GAATAA---AA------ATG-T----AT-------AATTTA-----TAATGAAGAAA---A-A--G--TGT--AA-AGAGGG--TT-TAAATC-AATTACCAGAGGACTCAA-CA-TCATCGAGAGTC------AACCCCGGTTAC
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gi|6 : tgtggtagtgtgtatattgatacTGGATTTGGAA-ATTTGGGGT-GATATATACATT----TTTT--TATTGTATAATGTTATAA-AGTTGACACATGTGAAGTATATATCAAATTATTTCTATGTTATTTTTCATTGTTGCATGTAAGTG-------------------TATTACCGAATT-----TGCGCTGTTAATCAGT----T-TGTTAA-TTCACTTGCATTGGAATCATATAGCTTGGATATTTATTTACCATAATGTACTCTACAGCAATTAATTGTTGAATATGTTT-CA-TAGAAT-ATATGTAAATGTGAGTTTC-AAAATGTATGTCTGTCAGTACGT------------------ATATCTGTGTAAATAGCTATA----TAA--------------TTATTATTG--------------ATGTGATAAAACACA------------TATAGAACAGAAATATGTG---------------------TG-------TT-----CA--------TGCGACC--GCG------TATCT--GAAT----TTTAA---GACATTGATGGAAATCTGTGAGAAATA------GAGTAAATATTTATACATTGTAAT-GT------TGTA-TTTCCATATAGAAT-TTATAAGGAAAATATAGATTTGCTTTATAAAT----GTA----CACGATGTACAAATATGAC--A--ATTGTTTCTTTTTTA--TTAT---ATTTAGGATAAAGATTTAGTGT--GTGTGAAAA--AGTTTAAA--A-C---A---GT---TCACCGTCATATTACCA----TATATTTGTAAGTGACATGTAT----TC-TTTATTGTAATGTTTATCTTATTTATTGTACCATGGATTATTGCTCTTAACTATAATGATGATTTAAATATAATAAAATGTTAAATT--------GTGTAAAGCATTATAAGTAAAAGATGAACTCAG-TTTGGAATCAGGATAATT---TAT-TAAATCATAAG---A--AAAA--GCAAGCTATTG----TTTAAATC---A--T---TGTAATGTTCATCTTAATGTATTTTAAATG-TGT
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