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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTAGCTGGAAAATCATAAATATT-----CTTATTATATGCTATATAAATA-TG-TATACAAATGT-TTAAAT-GTGTCTT-TGAAACAT-AG--TGTTGACATTTTCTTACACATTAATATACCAAAAAATGTCATATGACGCTAAAGTATGTGGCTTTGTGCAGGCTGACGCTTTTGAAATTATTCATACACAATTTAGATTGAAAAAAAAACAACAAACTGCTACAT-----GTAAAGCAATCTTCTAAAAACTATTTCGTTTACGAGAAATTCGGAAGGGTAACATG--AAATCAAGACGATCACTTAGTCTAGCTAAAT----------AACAG-----TATAC-----------GTATCCAATAT-TAT----GTTT------GATAA-TAT-----ATAACCCCTGAGTTAATAATT-GGCAAAGTATGTTAAACTTATACTTATACACTTAAT--TTTTCACCAAATATGGTTGAACCAGGGTGTTGGTAATGTCAAACTGTTCGACATG-------TTTA------TAT-------TTCACGGTAAGTTCGTCCAGGAATGGAACACTAGACTTAC----AAACTTCACAGCAGCTAAA-TATATCTTTATTTACAAAATGTTTTTGAATTCCAACCATATTTATCTTTAATAAGAAGAAGTAAA-TTTTGacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtatgctatccactgtataatgaattacgtaaaaatatatatcaaacttttatataaaacaccaaagaatgctgaaatttattcaattagtttaaagtgaaaatgttagaactctatataacttgagtgtttccttttttttaatctttttaaaaaagaaatatatcaaaataattaaaccttctcccaggtatctttatataaatgtactgatgcatttgtgttattgctaagttccgttcgtctaatatttgaaattgttgaaatgtttataaacacgcaagcccatgtgggctttggtatacttgtcgcatattgatgatatgcacttaattgccgttacgtataataactgtgttgtcacatgtattgtattgaatatgttaagcctcatgaatcagattgatcatagggcaatataaataaacactaaacatga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gtttacaagcgcattcacggtcaccccaTCATATATGTCTTTAATAACAACACACCCAGC---GAAACTAATT-AAAATTTAA-CATAATTATACATAGTACTAGAAGTAGGTGGAAGGTCACGTGATAAAATCGATTTTGATTATAGACGTTGTGGAAGTTGCAA------AGAGGAGGAACAGCATTTTGTATTAT-----------TATA-CAAATTAT------ATATA----GAATTATTATATAAACCACCAAAGTATGCTTAAATTTATTCAATTA-TTAAAAGTGTCAA----TTC------TATTTAAAT-----GTTTA------------------AAG------AAAAGAAACGAAGAAATATATCAAAATAATTA-AACATGTTTATTCCCAa
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gTATGCTATCCACTGTATAATGAATTACGTAAAAATATATATCAAACTTTTATATAAAACACCAAAGAATGCTGAAATTTATTCAATTAGTTTAAAG--TGAAAATGTTAGAACTCTATATAACTTGAGTGTTTCCTTTT---------TTTTAATCTTTTTAAAA------AAGAAATATATCAAAATAATTA-AA----CCTTCTCCCAGGTATCTT----TAT--ATAAATGTACTGATGCATTTGTGT--TATTGCTAAGTTCCGTTCGTCTAATATTT-GAAATTGTTGAAATGTTTAT-AAACACGCAAGCCCATGTGGGCTTTGG--TATACT-TGTCGCAT------ATTGATGATATGCACTTAATTGCCGTTACGTATAATAACTGTGTTGTCACATGTATTGT---ATTGA-------ATATGTTAAG-CCTCATG-AAT---CAGATTGATCATAGGGCA--ATATAAATAA-ACA-CTAAA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 tattgtaatatttcatattattggtcctttggcaaggaaaacagaatgtacatattatgctggaagcaaattggatgctggaagcaaattggagataaatcataaacttacataccttgtaatagtgtttacaacagatgattcattttctgacacaatacataaaaaaatatatcaaactgttagttggaaaagtattaaaggtctcctatatgttatacaaatatttatacaaatttgtaaatgtgtttttaaaaacattatcatgttaatttgtatgatacattaatatctccaataccgtcatatgtagctgaagtatgggtctttgcacaggctaatgctattgaaagtattcatacacaaattcataaaaaactgttttgggttaagaaatctactcaaaatgattttacggggaattcgtacgggtaacatgcaaaaatacctttaaatattggtttacaatagtgcaatatagtgatgtaaaatacactaaatacatatacaagtttatgtttgctgattatggaaaataacccctgacgtaataattgggcaaaaatgttaaacttataccaatacactttggttttaacacagtatggttgaacgagggtgttggtgatgtcaaactgttcctgtccttatttaaacaaagtgttaaaagatattttcgccaaggaatggaacgctatacttacttaaaaactctccatgagccatattttatcgtcatctacaaaatgtttttgaattccaaccaaatctttgataaaaagtagtaaatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgATTGTATATTGAATTACGTAACACTATATATCGAAA-ATTATATAAACCACCAAAGTATGCTTGAATTTTCTCAATTAGATCAAAG--CGAAAATATTAGAACTCTATTCAACTCAAGTGATTACGTTTATAAATGTTTT--AAG------AAA-GAAACGAAGAAATATATTAAAACAATTA-AACAT-CCcatga
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATTAAA---GTGGAAATGTTAGAACCCTATTTAACTTAAGTGTTCACGTTT---------
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tacatgaTT---------TT--AAG------AAAAGAAATGAAGAAATGTATCAAAATAATCA-AATAT-CCTTCTCCCAGGTATA---------------ATGTACTGATGTATTTGTAT--TATTGCTAAGTTTAGTTTGTCTAATATTT-AAAATTGTTGAAATGTTTAT-GCACACACAAGCCCATATGG-CTTAGG--TATTCT-TGTTG------TATATTGATTATATGCACTTAATTGTAGTTATGTATAATAATTGTGTTGTCATGTTTATTGT---ATTGT-------ATATGTTAAG-CCTCTTA-AAT---CAGACTCATCTGAAGGCA--TTATAAATAA-ACA-ATAAAt
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aAATAGT-A-AATGT-TATACT----GGTATATCA-CAGAT--ATAAGTATATTGATGTAATCGTTT--TATTGATAGATTCGGTTCGCCTAATGTTT-ATAAATGTTGAA----ATGT-GTACACATA----CA--TAGGC----------CAA-TGTTACGTGCATTTA-----------------ACTGACCTCATGTTTAATGA-----CTGTCGTGTGTTTTGT---AGTGA-------ATACGCTAAGACATTATACGATACACAAA---AT---AAGGTATTATACGA-TAA-ACA-ATACAGTAAAtttaaacaaattacttatcttcacacatctaactaaaatat
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|16 ): GGGGGTGTGGATTTCAAACCGTTCCTGTCCTTATTTAAACGAAGAGTTAACGATACTT
Unaligned ( gi|18 ): TCAACTGTCTTACTTTTATTAAGAAATGGAACATCTGAAAATAAAACATT






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Reference ( family-2772 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATATATGAATCTTTTTTATATTGCTATACGCAAAGTTTGATATTGTNNTNTTATCTCNAAATCTCAAACGAACCTATTACAGAATGNNNTGAATGTNTTATATGAANACTNCCAAAAAGTGGAANCCTNCCGCGAGCACTNNAAAANCNAATGTTATGGTATTNCGTAAT-GGTGGTCGTTTGGCAAGAAANACAGAAN----------TGCTGGANGCANATTGGGCGCTGNANGCACGTTGGAGATAGNTCATAAACCTACNTACNTNGNAATAGTGTTTGCAACAGNTCGTTCATTTTNTGACACNATACATAAAGAAATATATCAAACCGTTAGCTGGAAAA------G-TATT-----CTTNNTATATGNTATATAAATAT-T-TATACAAATTTTTAAATGTGTT-TTNAAAA-CAT-AT--TGTCGAT-TTGTNTNATACATTAATATNCCNAANANCGTCATATGNNGCTGAAGTATGNGNCTTTGCGCAGGCTGACGCTNTTGAAANTATTCATACACAANTTAGATCGNAAAAAAAACAACAAACTGCTNCGTTTTGGGTNAAGNAATCTNCTNAAAACGATTTCGTTTACGGGGAATTCGNANGGGTAACATGCAAAATCAAGACGATCACTTAGTNCNNCTAAATATTGGTTTACAACAGTGCAATATANTGATGTAAAATGCACCNAATACATATACAAGTTTATGTTTGNTGATTATGGAAAATAACCCCTGANNTAATAATTGGGCAAAGTATGTTAAACTTATACCNATACACTTANTGGTTTTNACNNAGTATGGTTGAACNAGGGTGTTGGTGATGTCAAACTGTTCGACATGTCCTTATTTNAACAAAGTGTTAAAAGATTCACGGTAAGTTCGCCNAGGAATGGAACGCTANACTTACTTAAAAACTCCNCANNAGCCANATTNTATCNTCATCTACAAAATGTTTTTGAATTCCAACCATA-T-T-ATCTTTAATAANAAGA-----AGTAAA-TTTCGAAACTAATT-AAAATTTAA-CATAATTATACATAGTACTAGAAGTAGGTGGAAGGTCACGTGATAAAATCGATTTTGATTATAGACGTTGTGGAAGTTGCAA------AGAGGAGGAACAGCATTTTGTATTATGCTATCCACTGTATA-C-GAATTACGTAAAA-TATATATCGAANTATTATATAAACCACCAAAGTATGCTTAAATTTATTCAATTAGTTNAAAG-GTGAAAATGTTAGAACTCTATTTAACTTAAGTGTTTACGT---------TTTT--AAG------AAAAGAAACGAAGAAATGTATCAAAATAATTA-AATATCCTT-CTCCCAGGTATATTA-TATAT--ATAAATGTACTGATGTA-TT-GTGT--TATTGCTAAGTTCGGTTCGTCTAATATTTAAAACTGTTGAAATGTTTATGCACACACAAGCCCATGTGGGCTTTGG--TATNC---TTGTTGCAT---TATATTGATTAT--ATGCACTTA-ATTGCCGTTATGTATAATAACTNTGT-TGTCACGTGTA-TTGT---ATTGA-------ATATGTTAAG-CCTTATG-GAT---CAGACTGATCCG-AAGGCA--ATACAAAT---AAACA-ATA---AANTAAA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tatATTGTATA-TTGAATTACGTAACACTATATATCGAAA-ATTATATAAACCACCAAAGTATGCTTGAATTTTCTCAATTAGATCAAAG--CGAAAATATTAGAACTCTATTCAACTCAAGTGATTACGTTTATAAATGTTTT--AAG-------AAAGAAACGAAGAAATATATTAAAACAATTA-AACATCCta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --ATAAATATACTGATGTA-TT-CT-T--TATTGCTAGGTTCATTTCGCCTGATGTTTAAAACTGTTGAAATGTTTATACACCCACAAGTCCGTGTGGGCTTTGGCATATAC----TGTT---T---TACATTGATCA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GGGTGT--G-GATTTCAAACCGTTC--C-TGTCCTTATTTAAACGAAGAGTTAA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ggAAA-GTGGAAATGTTAGAACCCTATTTAACTTAAGTGTTCACGT---------TTTcgatactt
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TATGCTATCCACTGTATAAT-GAATTACGTAAAAATATATATCAAACTTTTATATAAAACACCAAAGAATGCTGAAATTTATTCAATTAGTTTAAAG--TGAAAATGTTAGAACTCTATATAACTTGAGTGTTTCCTT---------TTTTTTAATCTTTTTAAAA------AAGAAATATATCAAAATAATTA-AA---CCTT-CTCCCAGGTATCTT----TAT--ATAAATGTACTGATGCATTT-GTGT--TATTGCTAAGTTCCGTTCGTCTAATATTTGAAATTGTTGAAATGTTTATAAACACGCAAGCCCATGTGGGCTTTGG--TATAC---TTGTCGC------ATATTGATGAT--ATGCACTTA-ATTGCCGTTACGTATAATAACTGTGT-TGTCACATGTA-TTGT---ATTGA-------ATATGTTAAG-CCTCATG-AAT---CAGATTGATCAT-AGGGCA--ATATAAAT---AAACA-CTA---AAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtatgctatccactgtataatgaattacgtaaaaatatatatcaaacttttatataaaacaccaaagaatgctgaaatttattcaattagtttaaagtgaaaatgttagaactctatataacttgagtgtttccttttttttaatctttttaaaaaagaaatatatcaaaataattaaaccttctcccaggtatctttatataaatgtactgatgcatttgtgttattgctaagttccgttcgtctaatatttgaaattgttgaaatgtttataaacacgcaagcccatgtgggctttggtatacttgtcgcatattgatgatatgcacttaattgccgttacgtataataactgtgttgtcacatgtattgtattgaatatgttaagcctcatgaatcagattgatcatagggcaatataaataaacactaaacatga
gi|3                          : tattgtaatatttcatattattggtcctttggcaaggaaaacagaatgtacatattatgctggaagcaaattggatgctggaagcaaattggagataaatcataaacttacataccttgtaatagtgtttacaacagatgattcattttctgacacaatacataaaaaaatatatcaaactgttagttggaaaagtattaaaggtctcctatatgttatacaaatatttatacaaatttgtaaatgtgtttttaaaaacattatcatgttaatttgtatgatacattaatatctccaataccgtcatatgtagctgaagtatgggtctttgcacaggctaatgctattgaaagtattcatacacaaattcataaaaaactgttttgggttaagaaatctactcaaaatgattttacggggaattcgtacgggtaacatgcaaaaatacctttaaatattggtttacaatagtgcaatatagtgatgtaaaatacactaaatacatatacaagtttatgtttgctgattatggaaaataacccctgacgtaataattgggcaaaaatgttaaacttataccaatacactttggttttaacacagtatggttgaacgagggtgttggtgatgtcaaactgttcctgtccttatttaaacaaagtgttaaaagatattttcgccaaggaatggaacgctatacttacttaaaaactctccatgagccatattttatcgtcatctacaaaatgtttttgaattccaaccaaatctttgataaaaagtagtaaatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgCCATTAGCTGGAAAATCATAAA-TATT-----CTTATTATATGCTATATAAATAT-G-TATACAAATGTTTAAATGTGTC-TTTGAAA-CAT-AG--TGTTGACATTTTCTTACACATTAATATACCAAAAAATGTCATATGACGCTAAAGTATGTGGCTTTGTGCAGGCTGACGCTTTTGAAATTATTCATACACAATTTAGATTGAAAAAAAAACAACAAACTGCTACAT-----GTAAAGCAATCTTCTAAAAACTATTTCGTTTACGAGAAATTCGGAAGGGTAACATG--AAATCAAGACGATCACTTAGTCTAGCTAAAT----------AACAG-----TATAC-----------GTATCCAATA-----------TTATGTTTGATAA-TAT-----ATAACCCCTGAGTTAATAATT-GGCAAAGTATGTTAAACTTATACTTATACACTTAAT--TTTTCACCAAATATGGTTGAACCAGGGTGTTGGTAATGTCAAACTGTTCGACATGT--TTATAT------------------TTCACGGTAAGTTCGTCCAGGAATGGAACACTAGACTTAC----AAACTTCACAGCAGCTAAA-TATATCTTTATTTACAAAATGTTTTTGAATTCCAACCATATT-T-ATCTTTAATAAGAAGA-----AGTAAA-TTTTGAcatga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gtttacaagcgcattcacggtcacc--AAG------AAATGAAACGAA-AAATGTTTCAAAATAATTA-GATATTCTT-CTCCCAGGTATATTA--ATATCAATAAATAAACTGATGTA-T--GTGTAGTATTGCTAAGTTCAGTTCGTCTAATATTTAAAACTGTTGAAATGTTATTGCACACACAAGTCCATTTGGGCTTTGG--TATGC---TTGTTG------TATATTGATTAT--ATGCACCTA-ATTGCCGTTATGCATAATAACTTAGT-TTTCACGTGTA-TTGT---TTTGA-------ATATGTTAAG-CCCTATG-GAT---CAGACTGATTCG-AAGGCA--ATATAAAT---AAACA-AT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aTGTAT---TGTATTTATTATCTATGCA--TATATTGTAGTTAT-TAT-----CTATGTATGTATTGTATAATTGTTT-ATT----------TATATT--G-CCTT-CG-AAT---CAGTCTGATCCATAGGGCT--TAACATATTCAAAACA-ATA---tatacaatacatacatagataataactacaatatatgcatagataataaatacaatacacatataggtgataattc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaagaaatgaaacgaaaaatgtttcaaaataattagatattcttctcccaggtatattaatatcaataaataaactgatgtatgtgtagtattgctaagttcagttcgtctaatatttaaaactgttgaaatgttattgcacacacaagtccatttgggctttggtatgcttgttgtatattgattatatgcacctaattgccgttatgcataataacttagttttcacgtg--AAG------AAATGAAACGAA-AAATGTTTCAAAATAATTA-GATATTCTT-CTCCCAGGTATATTA--ATATCAATAAATAAACTGATGTA-T--GTGTAGTATTGCTAAGTTCAGTTCGTCTAATATTTAAAACTGTTGAAATGTTATTGCACACACAAGTCCATTTGGGCTTTGG--TATGC---TTGTTG------TATATTGATTAT--ATGCACCTA-ATTGCCGTTATGCATAATAACTTAGT-TTTCACGTGTA-TTGT---TTTGA-------ATATGTTAAG-CCCTATG-GAT---CAGACTGATTCG-AAGGCA--ATATAAAT---AAACA-ATcatataggtgataattc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aTGTAT---TGTATTTATTATCTATGCA--TATATTGTAGTTAT-TAT-----CTATGTATGTATTGTATAATTGTTT-ATT----------TATATT--G-CCTT-CG-AAT---CAGTCTGATCCATAGGGCT--TAACATATTCAAAACA-ATA---tatacaatacatacatagataataactacaatatatgcatagataataaatacaatacacatataggtgataattc
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aCATA-TAT-GTCTTTAATAACAACACACCCAG--------CGAAACTAATT-AAAATTTAA-CATAATTATACATAGTACTAGAAGTAGGTGGAAGGTCACGTGATAAAATCGATTTTGATTATAGACGTTGTGGAAGTTGCAA------AGAGGAGGAACAGCATTTTGTATTAT-----------TATA-C-AAATT-------A-TATATA--GAATTATTATATAAACCACCAAAGTATGCTTAAATTTATTCAATTA-TTAAAAG--------TGTC--AATTCTAT-----TTAAATGTTTA------------------AAG------AAAAGAAACGAAGAAATATATCAAAATAATTA-AACATGTTTATTCCCAttacttatcttcacacatctaactaaaatat
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): GGCAACAACTAAATAAACAATTATACAATACATACATAGATAATAACTACAATATATGCATAGATAATAACTACAATACACATA
Unaligned ( gi|18 ): TCAACTGTCTTACTTTTATTAAGAAATGGAACATCTGAAAATAAAACATT






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Reference ( family-2772 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGTATGNATCTTTTTTATATTATTATACGCAAA---TGATATTGTAATATT--TTCTAAATCTCAAATCGAC---TTACAGAATGGTTTAAATATATTATATGAATACTGTCAAAA-GTGAAATCCTGTCGTAAGCACTTCAAAAACAAATGTTATGGTATTTCGTAAT-GGTGGTCGTTTGGCAAGGAATACAGAAT-------------TGANA-CATATTGG--GCTG-AA-GCAAATTGGAGATAGTTCACAAATTTACATACNTTGGAATAGTGTTTACAACAGNTGGTTCATTTTCTGACACAAT---TAAAGA------TC----CGTTNGCTGG-AAAA------ATATTGAAGGCTTCTTATATGNTATACAAATAT-T-TATACANATTTNTAAATGTGTT-TTNAAAA-CAT-AT--TGTTGAT-TTGTNTGACACATTAATATATCNAATACCGTCATATGNCGCTAAAGTATGGGGCTTTGCGCAGGCTAACGCTATTGAAAGTATTCATACACAATTT----CGNAAAAAAA-----------C----T-CGTGTAAAGAAATCTACTAAAAACGATTTCGTTTACGGGGAATTCGGACGGGTAACAT-GAAAATCG-GACGATCA-TCAGTATCGTTAAATATTGGTTT-A-AATAGTGCAATATACTGATG-AAAA-ACACTCAATACATATACAAGTTTATGTTTGATAATTATGGAAAATAACCCCTGACTTAATAATTGGGCAAAACATGTTAAACTTATACTAATACACTTA-TGGTTTTAACGAAGTATGGTTGAACCAGGGTGTTGGTGATGTCAAACTGTTC--C-TGTCCTTATTTAAACGAAG-GTT--AACG-TANTTTCGTCCAGGAATGGAACGCTAGACTTAC----AAACTCTACANNAGCCAAATTTTATCGTCATCTACAAAATGTTTTTGAATTCCAACCATA-T-TATCTTTAATAAAAA-GNAGTAAA-TTTCGANACTAATTTAGAGTTTAATCACAATTATACANAGNACTAGAAGNAGGTGNNNGNTCACGTGATNNAATCGATTTCGATNACANACGNTGTGGAANNTGCAATGAATTAGNGGANGAACAGCATTTTGTATTATGCTG-CC-ACTGTATAACGAATTACGTAAAAATATATATCGAATTATTATATAAACCACCAAAGTATGCTTAAATTTATTCAATTAGTTNAAAG-GTGAAAATGTTAGAACTCTATTTAACTTAAGTGTTTACGT---------TTTT--AAG------AAAAGAAACGAAGAAATGTATCAAAATAATTA-AATATCCTT-CTCCCAGGTATATTA--ATATCAATAAATGTACTGATGTA-TT-GTGT--TATTGCTAAGTTCAGTTCGTCTAATATTTAAAACTGTTGAAATGTTTATGCACACACAAGCCCATGTGGGCTTTGG--TATGCTTGT----TGT-TATATTGATCATATGCACTTAATTGCCGTTATGTATAATAACTNTGTTGTCACGTGTATTGT---ATTGA-------ATATGTTAAG-CCTTATG-GAT---CAGACTGATCCGAAGGCANTACA-AA------TAAACA-ATA---AAGNAAA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tat-ATTGTATATTGAATTACGTAACACTATATATCGAAA-ATTATATAAACCACCAAAGTATGCTTGAATTTTCTCAATTAGATCAAA--GCGAAAATATTAGAACTCTATTCAACTCAAGTGATTACGTTTATAAATGTTTT--AAG-------AAAGAAACGAAGAAATATATTAAAACAATTA-AACATCCta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATAAATATACTGATGTA-TT-CT-T--TATTGCTAGGTTCATTTCGCCTGATGTTTAAAACTGTTGAAATGTTTATACACCCACAAGTCCGTGTGGGCTTTGGCATATAC-TGT----T-T-TACATTGATCA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGGTGT--G-GATTTCAAACCGTTC--C-TGTCCTTATTTAAACGAAGAGTT--AACGATACTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ggAAA-GTGGAAATGTTAGAACCCTATTTAACTTAAGTGTTCACGT---------TTT
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATGCTATCC-ACTGTATAATGAATTACGTAAAAATATATATCAAACTTTTATATAAAACACCAAAGAATGCTGAAATTTATTCAATTAGTTTAAAG--TGAAAATGTTAGAACTCTATATAACTTGAGTGTTTCCTT---------TTTTTTAATCTTTTTAAAA------AAGAAATATATCAAAATAATTA-AA---CCTT-CTCCCAGGTATCTT----TAT--ATAAATGTACTGATGCATTT-GTGT--TATTGCTAAGTTCCGTTCGTCTAATATTTGAAATTGTTGAAATGTTTATAAACACGCAAGCCCATGTGGGCTTTGG--TATACTTGT----CG--CATATTGATGATATGCACTTAATTGCCGTTACGTATAATAACTGTGTTGTCACATGTATTGT---ATTGA-------ATATGTTAAG-CCTCATG-AAT---CAGATTGATCATAGGGCAATATA-AA------TAAACA-CTA---AAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtatgctatccactgtataatgaattacgtaaaaatatatatcaaacttttatataaaacaccaaagaatgctgaaatttattcaattagtttaaagtgaaaatgttagaactctatataacttgagtgtttccttttttttaatctttttaaaaaagaaatatatcaaaataattaaaccttctcccaggtatctttatataaatgtactgatgcatttgtgttattgctaagttccgttcgtctaatatttgaaattgttgaaatgtttataaacacgcaagcccatgtgggctttggtatacttgtcgcatattgatgatatgcacttaattgccgttacgtataataactgtgttgtcacatgtattgtattgaatatgttaagcctcatgaatcagattgatcatagggcaatataaataaacactaaacatga
gi|3                          : tattgtaatatttcatattattggtcctttggcaaggaaaacagaatgtacatattatgctggaagcaaattggatgctggaagcaaattggagataaatcataaacttacataccttgtaatagtgtttacaacagatgattcattttctgacacaatacataaaaaaatatatcaaactgttagttggaaaagtattaaaggtctcctatatgttatacaaatatttatacaaatttgtaaatgtgtttttaaaaacattatcatgttaatttgtatgatacattaatatctccaataccgtcatatgtagctgaagtatgggtctttgcacaggctaatgctattgaaagtattcatacacaaattcataaaaaactgttttgggttaagaaatctactcaaaatgattttacggggaattcgtacgggtaacatgcaaaaatacctttaaatattggtttacaatagtgcaatatagtgatgtaaaatacactaaatacatatacaagtttatgtttgctgattatggaaaataacccctgacgtaataattgggcaaaaatgttaaacttataccaatacactttggttttaacacagtatggttgaacgagggtgttggtgatgtcaaactgttcctgtccttatttaaacaaagtgttaaaagatattttcgccaaggaatggaacgctatacttacttaaaaactctccatgagccatattttatcgtcatctacaaaatgtttttgaattccaaccaaatctttgataaaaagtagtaaatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgC----CATTAGCTGG-AAAATCATAAATATT-----CTTATTATATGCTATATAAATAT-G-TATACAAATGTTTAAATGTGTC-TTTGAAA-CAT-AG--TGTTGACATTTTCTTACACATTAATATACCAAAAAATGTCATATGACGCTAAAGTATGTGGCTTTGTGCAGGCTGACGCTTTTGAAATTATTCATACACAATTTAGATTGAAAAAAAAACAACAAACTGC----TACATGTAAAGCAATCTTCTAAAAACTATTTCGTTTACGAGAAATTCGGAAGGGTAACAT-GAAA-TCAAGACG---A-TCA----C--------TTAGTCT-A-GCTA----AATA--------------ACAGT--ATACGTATCCAATATTATGTTTGATAAT-AT-----ATAACCCCTGAGTTAATAATTGG-CAAAGTATGTTAAACTTATACTTATACACTTAAT--TTTTCACCAAATATGGTTGAACCAGGGTGTTGGTAATGTCAAACTGTTCGACATGTTTATATTT-CACG------------G-TAAGTTCGTCCAGGAATGGAACACTAGACTTAC----AAACTTCACAGCAGCTAAA-TATATCTTTATTTACAAAATGTTTTTGAATTCCAACCATATT-TATCTTTAATAAGAA-GAAGTAAA-TTTTGAcatga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtttacaagcgcattcacggtcacc--AAG------AAATGAAACGAA-AAATGTTTCAAAATAATTA-GATATTCTT-CTCCCAGGTATATTA--ATATCAATAAATAAACTGATGTA--T-GTGTAGTATTGCTAAGTTCAGTTCGTCTAATATTTAAAACTGTTGAAATGTTATTGCACACACAAGTCCATTTGGGCTTTGG--TATGCTTGT----TG--TATATTGATTATATGCACCTAATTGCCGTTATGCATAATAACTTAGTTTTCACGTGTATTGT---TTTGA-------ATATGTTAAG-CCCTATG-GAT---CAGACTGATTCGAAGGCAATATA-AA------TAAACA-AT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    a--AAG------AAATGAAACGAA-AAATGTTTCAAAATAATTA-GATATTCTT-CTCCCAGGTATATTA--ATATCAATAAATAAACTGATGTA--T-GTGTAGTATTGCTAAGTTCAGTTCGTCTAATATTTAAAACTGTTGAAATGTTATTGCACACACAAGTCCATTTGGGCTTTGG--TATGCTTGT----TG--TATATTGATTATATGCACCTAATTGCCGTTATGCATAATAACTTAGTTTTCACGTGTATTGT---TTTGA-------ATATGTTAAG-CCCTATG-GAT---CAGACTGATTCGAAGGCAATATA-AA------TAAACA-ATtatacaatacatacatagataataactacaatatatgcatagataataaatacaatacacatataggtgataattc
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): GGCAACAACTAAATAAACAATTATACAATACATACATAGATAATAACTACAATATATGCATAGATAATAACTACAATACACATA
Unaligned ( gi|18 ): TCAACTGTCTTACTTTTATTAAGAAATGGAACATCTGAAAATAAAACATT






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Reference ( family-2772 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGTATGNATCTTTTTTATATTATTATACGCAAA---TGATATTGTAATATT--TTCTAAATCTCAAATCGAC---TTACAGAATGGTTTAAATATATTATATGAATACTGTCAAAA-GTGAAATCCTGTCGTAAGCACTTCAAAAACAAATGTTATGGTATTTCGTAAT-GGTGGTCGTTTGGCAAGGAATACAGAAT-------------TGGNA-CATATTGG---CTG-AA-GCAAATTGGAGATAGTTCACAAATTTACATACNTTGGAATAGTGTTTACAACAGNTGGTTCATTTTCTGACACAAT---TAAAGA------TC----CGTTNGCTGG-AAAA------ATATTGAAGGCTTCTTATATGNTATACAAATAT-T-TATACANATTTNTAAATGTGTT-TTNAAAA-CAT-AT--TGTTGAT-TTGTNTGACACATTAATATATCNAATACCGTCATATGNCGCTAAAGTATGGGGCTTTGCGCAGGCTAACGCTATTGAAAGTATTCATACACAATTT----CGNAAAAAAA-----------C----T-CGTGTAAAGAAATCTACTAAAAACGATTTCGTTTACGGGGAATTCGGACGGGTAACAT-GAAAATCG-GACGA----TCAGTACC-TTAAATATTGGTTT-A-AATAGTGCAATATA-TGATG-AAAA-ACACT-AATACGTATACAAGTTTATGTTTGATAATTATGGAAAATAACCCCTGACTTAATAATTGGGCAAAACATGTTAAACTTATACTAATACACTTA-TGGTTTTAACGAAGTATGGTTGAACCAGGGTGTTGGTGATGTCAAACTGTTC--C-TGTCCTTATTTAAACGAAG-GTT--AACG-TACTTTCGTCCAGGAATGGAACACTAGACTTAC----AAACTCTACANNAGCCAAATTTTATCGTCATCTACAAAATGTTTTTGAATTCCAACCATATTTATCTTTAATAAAAAGTAGTAAA-TTT--CGANACTAATTTAGAGTTTAATCACAATTATACANAGNACTAGAAGNAGGTGNNNGNTCACGTGATNNAATCGATTTCGATNACANACGNTGTGGAANNTGCAATGAATTAGNGGANGAACAGCATTTTGTATTATGCTG-CC-ACTGTATAACGAATTACGTAAAAATATATATCGAATTATTATATAAACCACCAAAGTATGCTTAAATTTATTCAATTAGTTNAAAG-GTGAAAATGTTAGAACTCTATTTAACTTAAGTGTTTACGT---------TTTT--AAG------AAAAGAAACGAAGAAATGTATCAAAATAATTA-AATATCCTT-CTCCCAGGTATATTA--ATATCAATAAATGTACTGATGTA-TT-GTGT--TATTGCTAAGTTCAGTTCGTCTAATATTTAAAACTGTTGAAATGTTTATGCACACACAAGCCCATGTGGGCTTTGG--TATGCTTGT----TGT-TATATTGATCATATGCACTTAATTGCCGTTATGTATAATAACTNTGTTGTCACGTGTATTGT---ATTGA-------ATATGTTAAG-CCTTATG-GAT---CAGACTGATCCGAAGGCANTATA-AATAAACA-ATA---AAGCAAA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tat-ATTGTATATTGAATTACGTAACACTATATATCGAAA-ATTATATAAACCACCAAAGTATGCTTGAATTTTCTCAATTAGATCAAA--GCGAAAATATTAGAACTCTATTCAACTCAAGTGATTACGTTTATAAATGTTTT--AAG-------AAAGAAACGAAGAAATATATTAAAACAATTA-AACATCCta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATAAATATACTGATGTA-TT-CT-T--TATTGCTAGGTTCATTTCGCCTGATGTTTAAAACTGTTGAAATGTTTATACACCCACAAGTCCGTGTGGGCTTTGGCATATAC-TGT----T-T-TACATTGATCA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGGTGT--G-GATTTCAAACCGTTC--C-TGTCCTTATTTAAACGAAGAGTT--AACGATACTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ggAAA-GTGGAAATGTTAGAACCCTATTTAACTTAAGTGTTCACGT---------TTT
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATGCTATCC-ACTGTATAATGAATTACGTAAAAATATATATCAAACTTTTATATAAAACACCAAAGAATGCTGAAATTTATTCAATTAGTTTAAAG--TGAAAATGTTAGAACTCTATATAACTTGAGTGTTTCCTT---------TTTTTTAATCTTTTTAAAA------AAGAAATATATCAAAATAATTA-AA---CCTT-CTCCCAGGTATCTT----TAT--ATAAATGTACTGATGCATTT-GTGT--TATTGCTAAGTTCCGTTCGTCTAATATTTGAAATTGTTGAAATGTTTATAAACACGCAAGCCCATGTGGGCTTTGG--TATACTTGT----CG--CATATTGATGATATGCACTTAATTGCCGTTACGTATAATAACTGTGTTGTCACATGTATTGT---ATTGA-------ATATGTTAAG-CCTCATG-AAT---CAGATTGATCATAGGGCAATATA-AATAAACA-CTA---AAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtatgctatccactgtataatgaattacgtaaaaatatatatcaaacttttatataaaacaccaaagaatgctgaaatttattcaattagtttaaagtgaaaatgttagaactctatataacttgagtgtttccttttttttaatctttttaaaaaagaaatatatcaaaataattaaaccttctcccaggtatctttatataaatgtactgatgcatttgtgttattgctaagttccgttcgtctaatatttgaaattgttgaaatgtttataaacacgcaagcccatgtgggctttggtatacttgtcgcatattgatgatatgcacttaattgccgttacgtataataactgtgttgtcacatgtattgtattgaatatgttaagcctcatgaatcagattgatcatagggcaatataaataaacactaaacatga
gi|3                          : tattgtaatatttcatattattggtcctttggcaaggaaaacagaatgtacatattatgctggaagcaaattggatgctggaagcaaattggagataaatcataaacttacataccttgtaatagtgtttacaacagatgattcattttctgacacaatacataaaaaaatatatcaaactgttagttggaaaagtattaaaggtctcctatatgttatacaaatatttatacaaatttgtaaatgtgtttttaaaaacattatcatgttaatttgtatgatacattaatatctccaataccgtcatatgtagctgaagtatgggtctttgcacaggctaatgctattgaaagtattcatacacaaattcataaaaaactgttttgggttaagaaatctactcaaaatgattttacggggaattcgtacgggtaacatgcaaaaatacctttaaatattggtttacaatagtgcaatatagtgatgtaaaatacactaaatacatatacaagtttatgtttgctgattatggaaaataacccctgacgtaataattgggcaaaaatgttaaacttataccaatacactttggttttaacacagtatggttgaacgagggtgttggtgatgtcaaactgttcctgtccttatttaaacaaagtgttaaaagatattttcgccaaggaatggaacgctatacttacttaaaaactctccatgagccatattttatcgtcatctacaaaatgtttttgaattccaaccaaatctttgataaaaagtagtaaatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgC----CATTAGCTGG-AAAATCATAAATATT-----CTTATTATATGCTATATAAATAT-G-TATACAAATGTTTAAATGTGTC-TTTGAAA-CAT-AG--TGTTGACATTTTCTTACACATTAATATACCAAAAAATGTCATATGACGCTAAAGTATGTGGCTTTGTGCAGGCTGACGCTTTTGAAATTATTCATACACAATTTAGATTGAAAAAAAAACAACAAACTGC----TACATGTAAAGCAATCTTCTAAAAACTATTTCGTTTACGAGAAATTCGGAAGGGTAACAT-GAAA-TCAAGACGA----TCA----C-TTA-------GTCT-A-GCTA----AATA--------------ACAGT-A-TACGTATCCAATATTATGTTTGATAAT-AT-----ATAACCCCTGAGTTAATAATTGG-CAAAGTATGTTAAACTTATACTTATACACTTAAT--TTTTCACCAAATATGGTTGAACCAGGGTGTTGGTAATGTCAAACTGTTCGACATGTTTATATTT-CACG------------G-TAAGTTCGTCCAGGAATGGAACACTAGACTTAC----AAACTTCACAGCAGCTAAA-TATATCTTTATTTACAAAATGTTTTTGAATTCCAACCATATTTATCTTTAATAAGAAGAAGTAAA-TTT--TGAcatga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtttacaagcgcattcacggtcacc--AAG------AAATGAAACGAA-AAATGTTTCAAAATAATTA-GATATTCTT-CTCCCAGGTATATTA--ATATCAATAAATAAACTGATGTA--T-GTGTAGTATTGCTAAGTTCAGTTCGTCTAATATTTAAAACTGTTGAAATGTTATTGCACACACAAGTCCATTTGGGCTTTGG--TATGCTTGT----TG--TATATTGATTATATGCACCTAATTGCCGTTATGCATAATAACTTAGTTTTCACGTGTATTGT---TTTGA-------ATATGTTAAG-CCCTATG-GAT---CAGACTGATTCGAAGGCAATATA-AATAAACA-AT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    a--AAG------AAATGAAACGAA-AAATGTTTCAAAATAATTA-GATATTCTT-CTCCCAGGTATATTA--ATATCAATAAATAAACTGATGTA--T-GTGTAGTATTGCTAAGTTCAGTTCGTCTAATATTTAAAACTGTTGAAATGTTATTGCACACACAAGTCCATTTGGGCTTTGG--TATGCTTGT----TG--TATATTGATTATATGCACCTAATTGCCGTTATGCATAATAACTTAGTTTTCACGTGTATTGT---TTTGA-------ATATGTTAAG-CCCTATG-GAT---CAGACTGATTCGAAGGCAATATA-AATAAACA-ATtatacaatacatacatagataataactacaatatatgcatagataataaatacaatacacatataggtgataattc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aTATATTGCTATAC--AAAGTTTG-TATTGTATTTTTATTTCAAAAT----AATGAACCTATTACAAAATAGAATGAATATTTTATATGAATACTTCCAAAAAGTGGAATCTTGCCGCAAACACTAAAAAAACTAA-GTTATGGCATTCGGTAAAAGGTGGTCGTTTGGCACGAAATAGAGAAT-------------T--TA-CATAT--G---CTG-TATGCACGTTG----TAGT------ATCTATCTA-GTAGGAATAGTGTTTGCAACAGTTCGTTCATTTTATGACACTAT---TAAAG-------------CACTCGCTAG-GAAA------CTAT--A--------TATATGATATATGAATATATATATACACATTTGTAAATTAGTTCTTGAAAA-C-T-AT--TATCGAT-TTGTGTAATACAAAAATATtatacaatacatacatagataataactacaatatatgcatagataataaatacaatacacatataggtgataattc
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): GGCAACAACTAAATAAACAATTATACAATACATACATAGATAATAACTACAATATATGCATAGATAATAACTACAATACACATA
Unaligned ( gi|18 ): TCAACTGTCTTACTTTTATTAAGAAATGGAACATCTGAAAATAAAACATT






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Reference ( family-2772 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGTATGNATCTTTTTTATATTATTATACGCAAA---TGATATTGTAATATT--TTCTAAATCTCAAATCGAC---TTACAGAATGGTTTAAATATATTATATGAATACTGTCAAAA-GTGAAATCCTGTCGTAAGCACTTCAAAAACAAATGTTATGGTATTTCGTAAT-GGTGGTCGTTTGGCAAGGAATACAGAAT-------------TGGNA-CATATTGG---CTG-AA-GCAAATTGGAGATAGTTCACAAATTTACATACNTTGGAATAGTGTTTACAACAGNTGGTTCATTTTCTGACACAAT---TAAAGA------TC----CGTTNGCTGG-AAAA------ATATTGAAGGCTTCTTATATGNTATACAAATAT-T-TATACANATTTNTAAATGTGTT-TTNAAAA-CAT-AT--TGTTGAT-TTGTNTGACACATTAATATATCNAATACCGTCATATGNCGCTAAAGTATGGGGCTTTGCGCAGGCTAACGCTATTGAAAGTATTCATACACAATTT----CGNAAAAAAA-----------C----T-CGTGTAAAGAAATCTACTAAAAACGATTTCGTTTACGGGGAATTCGGACGGGTAACAT-GAAAATCG-GACGA----TCAGTACC-TTAAATATTGGTTT-A-AATAGTGCAATATA-TGATG-AAAA-ACACT-AATACGTATACAAGTTTATGTTTGATAATTATGGAAAATAACCCCTGACTTAATAATTGGGCAAAACATGTTAAACTTATACTAATACACTTA-TGGTTTTAACGAAGTATGGTTGAACCAGGGTGTTGGTGATGTCAAACTGTTC--C-TGTCCTTATTTAAACGAAG-GTT--AACG-TACTTTCGTCCAGGAATGGAACACTAGACTTAC----AAACTCTACANNAGCCAAATTTTATCGTCATCTACAAAATGTTTTTGAATTCCAACCATATTTATCTTTAATAAAAAGTAGTAAA-TTT--CGANACTAATTTAGAGTTTAATCACAATTATACANAGNACTAGAAGNAGGTGNNNGNTCACGTGATNNAATCGATTTCGATNACANACGNTGTGGAANNTGCAATGAATTAGNGGANGAACAGCATTTTGTATTATGCTG-CC-ACTGTATAACGAATTACGTAAAAATATATATCGAATTATTATATAAACCACCAAAGTATGCTTAAATTTATTCAATTAGTTNAAAG-GTGAAAATGTTAGAACTCTATTTAACTTAAGTGTTTACGT---------TTTT--AAG------AAAAGAAACGAAGAAATGTATCAAAATAATTA-AATATCCTT-CTCCCAGGTATATTA--ATATCAATAAATGTACTGATGTA-TT-GTGT--TATTGCTAAGTTCAGTTCGTCTAATATTTAAAACTGTTGAAATGTTTATGCACACACAAGCCCATGTGGGCTTTGG--TATGCTTGT----TGT-TATATTGATCATATGCACTTAATTGCCGTTATGTATAATAACTNTGTTGTCACGTGTATTGT---ATTGA-------ATATGTTAAG-CCTTATG-GAT---CAGACTGATCCGAAGGCANTATA-AATAAACA-ATA---AAGCAAA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tat-ATTGTATATTGAATTACGTAACACTATATATCGAAA-ATTATATAAACCACCAAAGTATGCTTGAATTTTCTCAATTAGATCAAA--GCGAAAATATTAGAACTCTATTCAACTCAAGTGATTACGTTTATAAATGTTTT--AAG-------AAAGAAACGAAGAAATATATTAAAACAATTA-AACATCCta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATAAATATACTGATGTA-TT-CT-T--TATTGCTAGGTTCATTTCGCCTGATGTTTAAAACTGTTGAAATGTTTATACACCCACAAGTCCGTGTGGGCTTTGGCATATAC-TGT----T-T-TACATTGATCA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGGTGT--G-GATTTCAAACCGTTC--C-TGTCCTTATTTAAACGAAGAGTT--AACGATACTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ggAAA-GTGGAAATGTTAGAACCCTATTTAACTTAAGTGTTCACGT---------TTT
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATGCTATCC-ACTGTATAATGAATTACGTAAAAATATATATCAAACTTTTATATAAAACACCAAAGAATGCTGAAATTTATTCAATTAGTTTAAAG--TGAAAATGTTAGAACTCTATATAACTTGAGTGTTTCCTT---------TTTTTTAATCTTTTTAAAA------AAGAAATATATCAAAATAATTA-AA---CCTT-CTCCCAGGTATCTT----TAT--ATAAATGTACTGATGCATTT-GTGT--TATTGCTAAGTTCCGTTCGTCTAATATTTGAAATTGTTGAAATGTTTATAAACACGCAAGCCCATGTGGGCTTTGG--TATACTTGT----CG--CATATTGATGATATGCACTTAATTGCCGTTACGTATAATAACTGTGTTGTCACATGTATTGT---ATTGA-------ATATGTTAAG-CCTCATG-AAT---CAGATTGATCATAGGGCAATATA-AATAAACA-CTA---AAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtatgctatccactgtataatgaattacgtaaaaatatatatcaaacttttatataaaacaccaaagaatgctgaaatttattcaattagtttaaagtgaaaatgttagaactctatataacttgagtgtttccttttttttaatctttttaaaaaagaaatatatcaaaataattaaaccttctcccaggtatctttatataaatgtactgatgcatttgtgttattgctaagttccgttcgtctaatatttgaaattgttgaaatgtttataaacacgcaagcccatgtgggctttggtatacttgtcgcatattgatgatatgcacttaattgccgttacgtataataactgtgttgtcacatgtattgtattgaatatgttaagcctcatgaatcagattgatcatagggcaatataaataaacactaaacatga
gi|3                          : tattgtaatatttcatattattggtcctttggcaaggaaaacagaatgtacatattatgctggaagcaaattggatgctggaagcaaattggagataaatcataaacttacataccttgtaatagtgtttacaacagatgattcattttctgacacaatacataaaaaaatatatcaaactgttagttggaaaagtattaaaggtctcctatatgttatacaaatatttatacaaatttgtaaatgtgtttttaaaaacattatcatgttaatttgtatgatacattaatatctccaataccgtcatatgtagctgaagtatgggtctttgcacaggctaatgctattgaaagtattcatacacaaattcataaaaaactgttttgggttaagaaatctactcaaaatgattttacggggaattcgtacgggtaacatgcaaaaatacctttaaatattggtttacaatagtgcaatatagtgatgtaaaatacactaaatacatatacaagtttatgtttgctgattatggaaaataacccctgacgtaataattgggcaaaaatgttaaacttataccaatacactttggttttaacacagtatggttgaacgagggtgttggtgatgtcaaactgttcctgtccttatttaaacaaagtgttaaaagatattttcgccaaggaatggaacgctatacttacttaaaaactctccatgagccatattttatcgtcatctacaaaatgtttttgaattccaaccaaatctttgataaaaagtagtaaatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgC----CATTAGCTGG-AAAATCATAAATATT-----CTTATTATATGCTATATAAATAT-G-TATACAAATGTTTAAATGTGTC-TTTGAAA-CAT-AG--TGTTGACATTTTCTTACACATTAATATACCAAAAAATGTCATATGACGCTAAAGTATGTGGCTTTGTGCAGGCTGACGCTTTTGAAATTATTCATACACAATTTAGATTGAAAAAAAAACAACAAACTGC----TACATGTAAAGCAATCTTCTAAAAACTATTTCGTTTACGAGAAATTCGGAAGGGTAACAT-GAAA-TCAAGACGA----TCA----C-TTA-------GTCT-A-GCTA----AATA--------------ACAGT-A-TACGTATCCAATATTATGTTTGATAAT-AT-----ATAACCCCTGAGTTAATAATTGG-CAAAGTATGTTAAACTTATACTTATACACTTAAT--TTTTCACCAAATATGGTTGAACCAGGGTGTTGGTAATGTCAAACTGTTCGACATGTTTATATTT-CACG------------G-TAAGTTCGTCCAGGAATGGAACACTAGACTTAC----AAACTTCACAGCAGCTAAA-TATATCTTTATTTACAAAATGTTTTTGAATTCCAACCATATTTATCTTTAATAAGAAGAAGTAAA-TTT--TGAcatga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtttacaagcgcattcacggtcacc--AAG------AAATGAAACGAA-AAATGTTTCAAAATAATTA-GATATTCTT-CTCCCAGGTATATTA--ATATCAATAAATAAACTGATGTA--T-GTGTAGTATTGCTAAGTTCAGTTCGTCTAATATTTAAAACTGTTGAAATGTTATTGCACACACAAGTCCATTTGGGCTTTGG--TATGCTTGT----TG--TATATTGATTATATGCACCTAATTGCCGTTATGCATAATAACTTAGTTTTCACGTGTATTGT---TTTGA-------ATATGTTAAG-CCCTATG-GAT---CAGACTGATTCGAAGGCAATATA-AATAAACA-AT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    a--AAG------AAATGAAACGAA-AAATGTTTCAAAATAATTA-GATATTCTT-CTCCCAGGTATATTA--ATATCAATAAATAAACTGATGTA--T-GTGTAGTATTGCTAAGTTCAGTTCGTCTAATATTTAAAACTGTTGAAATGTTATTGCACACACAAGTCCATTTGGGCTTTGG--TATGCTTGT----TG--TATATTGATTATATGCACCTAATTGCCGTTATGCATAATAACTTAGTTTTCACGTGTATTGT---TTTGA-------ATATGTTAAG-CCCTATG-GAT---CAGACTGATTCGAAGGCAATATA-AATAAACA-ATtatacaatacatacatagataataactacaatatatgcatagataataaatacaatacacatataggtgataattc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aTATATTGCTATAC--AAAGTTTG-TATTGTATTTTTATTTCAAAAT----AATGAACCTATTACAAAATAGAATGAATATTTTATATGAATACTTCCAAAAAGTGGAATCTTGCCGCAAACACTAAAAAAACTAA-GTTATGGCATTCGGTAAAAGGTGGTCGTTTGGCACGAAATAGAGAAT-------------T--TA-CATAT--G---CTG-TATGCACGTTG----TAGT------ATCTATCTA-GTAGGAATAGTGTTTGCAACAGTTCGTTCATTTTATGACACTAT---TAAAG-------------CACTCGCTAG-GAAA------CTAT--A--------TATATGATATATGAATATATATATACACATTTGTAAATTAGTTCTTGAAAA-C-T-AT--TATCGAT-TTGTGTAATACAAAAATATtatacaatacatacatagataataactacaatatatgcatagataataaatacaatacacatataggtgataattc
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Reference ( family-2772 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATGTGTATGNATCTTTTTTATATTATTATACGCAAA---TGATATTGTAATATT--TTCTAAATCTCAAATCGAC---TTACAGAATGGTTTAAATATATTATATGAATACTGTCAAAA-GTGAAATCCTGTCGTAAGCACTTCAAAAACAAATGTTATGGTATTTCGTAAT-GGTGGTCGTTTGGCAAGGAATACAGAAT-------------TGGNA-CATATTGG---CTG-AA-GCAAATTGGAGATAGTTCACAAATTTACATACNTTGGAATAGTGTTTACAACAGNTGGTTCATTTTCTGACACAAT---TAAAGA------TC----CGTTNGCTGG-AAAA------ATATTGAAGGCTTCTTATATGNTATACAAATAT-T-TATACANATTTNTAAATGTGTT-TTNAAAA-CAT-AT--TGTTGAT-TTGTNTGACACATTAATATATCNAATACCGTCATATGNCGCTAAAGTATGGGGCTTTGCGCAGGCTAACGCTATTGAAAGTATTCATACACAATTT----CGNAAAAAAA-----------C----T-CGTGTAAAGAAATCTACTAAAAACGATTTCGTTTACGGGGAATTCGGACGGGTAACAT-GAAAATCG-GACGA----TCAGTACC-TTAAATATTGGTTT-A-AATAGTGCAATATA-TGATG-AAAA-ACACT-AATACGTATACAAGTTTATGTTTGATAATTATGGAAAATAACCCCTGACTTAATAATTGGGCAAAACATGTTAAACTTATACTAATACACTTA-TGGTTTTAACGAAGTATGGTTGAACCAGGGTGTTGGTGATGTCAAACTGTTC--C-TGTCCTTATTTAAACGAAG-GTT--AACG-TACTTTCGTCCAGGAATGGAACACTAGACTTAC----AAACTCTACANNAGCCAAATTTTATCGTCATCTACAAAATGTTTTTGAATTCCAACCATATTTATCTTTAATAAAAAGTAGTAAA-TTT--CGANACTAATTTAGAGTTTAATCACAATTATACANAGNACTAGAAGNAGGTGNNNGNTCACGTGATNNAATCGATTTCGATNACANACGNTGTGGAANNTGCAATGAATTAGNGGANGAACAGCATTTTGTATTATGCTG-CC-ACTGTATAACGAATTACGTAAAAATATATATCGAATTATTATATAAACCACCAAAGTATGCTTAAATTTATTCAATTAGTTNAA--AGTGAAAATGTTAGAACTCTATTTAACTTAAGTGTTTACGT---------TTTT--AAG------AAAAGAAACGAAGAAATGTATCAAAATAATTA-AATATCCTT-CTCCCAGGTATATTA-ATAT----ATAAATGTACTGATGTA-TT-GTGT--TATTGCTAAGTTCAGTTCGTCTAATATTTAAAACTGTTGAAATGTTTATGCACACACAAGCCCATGTGGGCTTTGG--TATGCTTGT------TGTATATTGATCATATGCACTTAATTGCCGTTATGTATAATAACTNTGTTGTCACGTGTATTGT---ATTGA-------ATATGTTAAG-CCTTATG-GAT---CAGACTGATCCGAAGGCANTATA-AATAAACA-ATA---AAGCAAA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tat-ATTGTATATTGAATTACGTAACACTATATATCGAAA-ATTATATAAACCACCAAAGTATGCTTGAATTTTCTCAATTAGATCAA--AGCGAAAATATTAGAACTCTATTCAACTCAAGTGATTACGTTTATAAATGTTTT--AAG-------AAAGAAACGAAGAAATATATTAAAACAATTA-AACATCCta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ----ATAAATATACTGATGTA-TT-CT-T--TATTGCTAGGTTCATTTCGCCTGATGTTTAAAACTGTTGAAATGTTTATACACCCACAAGTCCGTGTGGGCTTTGGCATATAC-TGT------TTTACATTGATCA
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGGTGT--G-GATTTCAAACCGTTC--C-TGTCCTTATTTAAACGAAGAGTT--AACGATACTT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggTTAA--AGTGGAAATGTTAGAACCCTATTTAACTTAAGTGTTCACGT---------TTT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tacatgaaaTATTGTAATATTTCATATT-ATTGGTCCTTTGGCAAGGAAAACAGAATGTACATATTATGCTGGAAGCAAATTGGATGCTGGAA-GCAAATTGGAGATAAATCATAAACTTACATACCTTGTAATAGTGTTTACAACAGATGATTCATTTTCTGACACAATACATAAAAAAATATATCAAACTGTTAGTTGG-AAAA------GTATTAAAGGTCTCCTATATGTTATACAAATAT-T-TATACAAATTTGTAAATGTGTT-TTTAAAAACATTATCATGTTAAT-TTGTATGATACATTAATATCTCCAATACCGTCATATGTAGCTGAAGTATGGGTCTTTGCACAGGCTAATGCTATTGAAAGTATTCATACACAAATT----CAT-AAAAAA-----------CTGTTT-TGGGTTAAGAAATCTACTCAAAATGAT----TTTACGGGGAATTCGTACGGGTAACAT-GCAAA---------------AATACCTTTAAATATTGGTTT-ACAATAGTGCAATATAGTGATGTAAAATACACTAAATACATATACAAGTTTATGTTTGCTGATTATGGAAAATAACCCCTGACGTAATAATTGGGCAAAA-ATGTTAAACTTATACCAATACACTT--TGGTTTTAACACAGTATGGTTGAACGAGGGTGTTGGTGATGTCAAACTGTTC--C-TGTCCTTATTTAAACAAAGTGTTAAAAGA-TATTTTCGCCAAGGAATGGAACGCTATACTTACTTAAAAACTCTCCATGAGCCATATTTTATCGTCATCTACAAAATGTTTTTGAATTCCAACCA-A---ATCTTTGATAAAAAGTAGTAAA-TTT--CGA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATGCTATCC-ACTGTATAATGAATTACGTAAAAATATATATCAAACTTTTATATAAAACACCAAAGAATGCTGAAATTTATTCAATTAGTTTAA--AGTGAAAATGTTAGAACTCTATATAACTTGAGTGTTTCCTT---------TTTTTTAATCTTTTTAAAA------AAGAAATATATCAAAATAATTA-AA---CCTT-CTCCCAGGTATCTT---TAT----ATAAATGTACTGATGCATTT-GTGT--TATTGCTAAGTTCCGTTCGTCTAATATTTGAAATTGTTGAAATGTTTATAAACACGCAAGCCCATGTGGGCTTTGG--TATACTTGT------CGCATATTGATGATATGCACTTAATTGCCGTTACGTATAATAACTGTGTTGTCACATGTATTGT---ATTGA-------ATATGTTAAG-CCTCATG-AAT---CAGATTGATCATAGGGCAATATA-AATAAACA-CTA---AAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgtatgctatccactgtataatgaattacgtaaaaatatatatcaaacttttatataaaacaccaaagaatgctgaaatttattcaattagtttaaagtgaaaatgttagaactctatataacttgagtgtttccttttttttaatctttttaaaaaagaaatatatcaaaataattaaaccttctcccaggtatctttatataaatgtactgatgcatttgtgttattgctaagttccgttcgtctaatatttgaaattgttgaaatgtttataaacacgcaagcccatgtgggctttggtatacttgtcgcatattgatgatatgcacttaattgccgttacgtataataactgtgttgtcacatgtattgtattgaatatgttaagcctcatgaatcagattgatcatagggcaatataaataaacactaaacatga
gi|3                          : tattgtaatatttcatattattggtcctttggcaaggaaaacagaatgtacatattatgctggaagcaaattggatgctggaagcaaattggagataaatcataaacttacataccttgtaatagtgtttacaacagatgattcattttctgacacaatacataaaaaaatatatcaaactgttagttggaaaagtattaaaggtctcctatatgttatacaaatatttatacaaatttgtaaatgtgtttttaaaaacattatcatgttaatttgtatgatacattaatatctccaataccgtcatatgtagctgaagtatgggtctttgcacaggctaatgctattgaaagtattcatacacaaattcataaaaaactgttttgggttaagaaatctactcaaaatgattttacggggaattcgtacgggtaacatgcaaaaatacctttaaatattggtttacaatagtgcaatatagtgatgtaaaatacactaaatacatatacaagtttatgtttgctgattatggaaaataacccctgacgtaataattgggcaaaaatgttaaacttataccaatacactttggttttaacacagtatggttgaacgagggtgttggtgatgtcaaactgttcctgtccttatttaaacaaagtgttaaaagatattttcgccaaggaatggaacgctatacttacttaaaaactctccatgagccatattttatcgtcatctacaaaatgtttttgaattccaaccaaatctttgataaaaagtagtaaatttcgacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccgC----CATTAGCTGG-AAAATCATAAATATT-----CTTATTATATGCTATATAAATAT-G-TATACAAATGTTTAAATGTGTC-TTTGAAA-CAT-AG--TGTTGACATTTTCTTACACATTAATATACCAAAAAATGTCATATGACGCTAAAGTATGTGGCTTTGTGCAGGCTGACGCTTTTGAAATTATTCATACACAATTTAGATTGAAAAAAAAACAACAAACTGC----TACATGTAAAGCAATCTTCTAAAAACTATTTCGTTTACGAGAAATTCGGAAGGGTAACAT-GAAA-TCAAGACGA----TCA----C-TTA-------GTCT-A-GCTA----AATA--------------ACAGT-A-TACGTATCCAATATTATGTTTGATAAT-AT-----ATAACCCCTGAGTTAATAATTGG-CAAAGTATGTTAAACTTATACTTATACACTTAAT--TTTTCACCAAATATGGTTGAACCAGGGTGTTGGTAATGTCAAACTGTTCGACATGTTTATATTT-CACG------------G-TAAGTTCGTCCAGGAATGGAACACTAGACTTAC----AAACTTCACAGCAGCTAAA-TATATCTTTATTTACAAAATGTTTTTGAATTCCAACCATATTTATCTTTAATAAGAAGAAGTAAA-TTT--TGAcatga
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gtttacaagcgcattcacggtcacc--AAG------AAATGAAACGAA-AAATGTTTCAAAATAATTA-GATATTCTT-CTCCCAGGTATATTA-ATATCA--ATAAATAAACTGATGTA-T--GTGTAGTATTGCTAAGTTCAGTTCGTCTAATATTTAAAACTGTTGAAATGTTATTGCACACACAAGTCCATTTGGGCTTTGG--TATGCTTGT------TGTATATTGATTATATGCACCTAATTGCCGTTATGCATAATAACTTAGTTTTCACGTGTATTGT---TTTGA-------ATATGTTAAG-CCCTATG-GAT---CAGACTGATTCGAAGGCAATATA-AATAAACA-AT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    a--AAG------AAATGAAACGAA-AAATGTTTCAAAATAATTA-GATATTCTT-CTCCCAGGTATATTA-ATATCA--ATAAATAAACTGATGTA-T--GTGTAGTATTGCTAAGTTCAGTTCGTCTAATATTTAAAACTGTTGAAATGTTATTGCACACACAAGTCCATTTGGGCTTTGG--TATGCTTGT------TGTATATTGATTATATGCACCTAATTGCCGTTATGCATAATAACTTAGTTTTCACGTGTATTGT---TTTGA-------ATATGTTAAG-CCCTATG-GAT---CAGACTGATTCGAAGGCAATATA-AATAAACA-ATtatacaatacatacatagataataactacaatatatgcatagataataaatacaatacacatataggtgataattc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aTATATTGCTATAC--AAAGTTTG-TATTGTATTTTTATTTCAAAAT----AATGAACCTATTACAAAATAGAATGAATATTTTATATGAATACTTCCAAAAAGTGGAATCTTGCCGCAAACACTAAAAAAACTAA-GTTATGGCATTCGGTAAAAGGTGGTCGTTTGGCACGAAATAGAGAAT-------------T--TA-CATAT--G---CTG-TATGCACGTTG----TAGT------ATCTATCTA-GTAGGAATAGTGTTTGCAACAGTTCGTTCATTTTATGACACTAT---TAAAG-------------CACTCGCTAG-GAAA------CTAT--A--------TATATGATATATGAATATATATATACACATTTGTAAATTAGTTCTTGAAAA-C-T-AT--TATCGAT-TTGTGTAATACAAAAATATtatacaatacatacatagataataactacaatatatgcatagataataaatacaatacacatataggtgataattc
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Unaligned ( gi|18 ): TCAACTGTCTTACTTTTATTAAGAAATGGAACATCTGAAAATAAAACATT