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gi|5                          : CAACCAGGTTGGATGACATATTTAACTCTCTTTTTTTTTCTTTCATAGGAGCATGC----TTAGT-AAGAACC-GAATTGATTATATAATGTAATAGAGTTAGAGATTGGGTTG-GATTATCAGTATATTCAATAACATCAAGTGAATAATTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTG-AATTTCTTGAAA-CATCTGTTCTTAATTGTGTCATGGCAAAT-CCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGT-ATACG-GGCGCTATAACCTCTGATATTAAATCAGGCATATTTGTATATA----------TATGATCTATAATATTAGAACTAGATTTACACATTCTAGATGGCGATTTGATCATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAAATAGTGTTATTCCAGCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCGATAAACAGTTGATATTGAAATTCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATTGACTTTATTG-AATATTAATTCA-AAAGACACGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTCTATA-TATGAAGTGTAGTAAAAACAGTTTACTATTTGGAGATTTTATTTCTATACATATTGATTCTATGTCATCACACTCTAAATCGCAACATCTTCGATATGGAATGTTAAACTTTATATGTACTAAAACACCTCCACCTCTTTTAATAACCCTGACCTTACGTTCGATTTGAAAATCGGGTATCTGTACGTTATTGTCTT----CAATACTTGGCGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATC--TTGATTTTCAtctcaaactttatattagatatttctcatttatgtaatactttaatatacaata
gi|2                          :  AGCCAGGTTGGGTGCCATATTTAACT------CTTTTTCTTTCATGGGAGCAGAC----TTAGT-AAGAACC-GAATTGATTACAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTG-GATTATCAATATATTCAATAACATCAAATGAATAATTGGCTGAGTAATTAAAAAAT--ACAGTTTAACTG-AATTTCTTGAAA-CATCTGTACTTAATTGTGTCATGGCATTTTCCTTTCGATTTTATACT------ACACATGTGCCATGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGTTGT-ATATG-GGCACTATAACCTCTGATATTAAATCAGGCATATTTGTATATA--------TATATGATCTATAATATTAGAACTGTATTTACATATTATAGTTGGTGATTTAATCATTTGTGTAAAACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCGATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATTGACTTTATCT-AATATTGATTCA-AAAGACATGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTAT---ATATGAAGTGTAGTAAAA-------A--ACTTG---ATTCTA----TGT-CAT----------------CGCACTCTAAATCGCACCGTCTTCGATATGGAATGTTAGACTTGATATATACTACAACACCTCCACCTCTTTTAATAACCCTGTCCTTACAGTCGATTTGAAAATTGGGTATCTGTACACTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAAAAATGTTTCAACAATTCCGAAGATATCAGTTGAGTTACATTGACTTAGATGGTATTTGATTTTATTTAGTTTTGGA-----AGT-GTATGCTGTATGTTTATATTAGCAATGTGTAATCCCTTAGTAGTATAATTAA---ACAAGTTTGATGTATGTAAA-------------------TGTGCATTTGAAGATGCACTATTATTATGTCTAGT---TATGAAATCAGCATAAT---------------CATCAGCATTAGTATTTGGGCTGATGGCTTCAT------------TATCGCTCTGTACCAGCCTA-TTCAATTTAACAGTATCTGATCCTG-CACATATATTGACTGGTATGGTTTTTATAGAAGTATTAATAGCGTTATTTTTCATATATTCATTTAAAGATGATAAACACACTACTGTACAAGATAACGAATCCATACATCAAT--TAAC-AACCgatgggatcaatatttagcttgctatgggtatatagattatttgtggtagaatggtga
gi|9                          :  AACCAGGTTGTGTGTCATATTTAACT-C----TTTTTTCTTTCATAGGAGCATGC----TTAGT-AAGAACC-GAATTGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTG-GATTATCAATATAGTCAATAACATCAAGTGAATAATTGGCTAAGTCATCCAAAAATGTATAGATTCACTG-AATTTCTTGAAA-CATCTGTACTTAATTGTGTCACGGCAATTTCCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGT-ATACA-GGTACTATAACCTCTGATATTAAATCAGGCATATTTGTATATA--------TATATGATCTATAATATTTGAACTTGATTTACATATTTTAGTTGGTGATTTAATCATATGTGTGAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAATATTAGTATTCAATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTTAGTGATCGATTTTATCTAAATATGGATTCA-AAAGACATGATCAATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTAT---ATATGAAGTGTAGTAAAAACGGTTTACAATTTGGATATTTTATTTCTATACATGTTAATTCTATGtcg
gi|8                          :  AACCAGGTTGGGTGTCATATCTAACT-C----TTTTTTCATTCATAGGTGCATGC----TTAGT-AAGAACT-GAATCGATTATAGAATTTAATAGAGTTAGAGATTGGTTTG-GATTATCAATGTATTCAATAACATCAAGT--------GGCGAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCATTGCAATTCTT--GAAGCATCAGTACTTAATTGTGTCATGACAATTTCCTTTCAATTTTATACT------ACCCATGCGCTGTGTTAAA-CAAACAGGATAGTGATTTCTAATGCTGT-ATATG-GGCACTATAACC--------------AGGCATATTTGTATATA----------TGTGATCTATAATAGTAGAACTGGATTTACATATTCTAGTTTGTGGTTTAATCATTTGTGTAGGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACGTAAGTATCCAGTAAACAGTTGTTATTGAAATCCCCAAACATACAGATTTCCAGATCTAAGTGATCA-------CT-AATATTGATTCA-AAAGACACGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTAT---ATATGAAGTGTAGTAAAAACGGTTTACTATTTGGATATTTTATTTCTATACATATTGATTATATGTCATCGCATTCTAAATTGCAACGTCTTCGATATGGAATGTTATACT
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gi|16                         :  AACCAGGTTGGATGTCAAATTTAACT-C----TTTTTTCTTTCATAGGAGCATGC----TTAGTAAAAAATT-AAATCGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGATTATTAATAT-AATA-ATTCAATAACATAAAGTGAATAATTGGCTAAGT
gi|7                          :                                                                                                                                                                  ATTCAATAAT--ATAGTTTCACTG-AATTTCTTGAAA-CATCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCCTTTCGCTATTATACT------ACCCATGCACCGTGTAAAAT--AACAGGATAGTGATTGCTAATGCTGT-ATAAG-GGCAATATAACCTCTGATATTAAATCAGGCATATTTGTATATA----------TATGATCTATAATATTAGAGCTGGATTTGGATATTCTAGTTGGTGATTTAATTATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATATTTTTCAACATTAGTATCCAATAAACATTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATCGACTTTATCT-AATATTGATTCA-AAAGACAC-ATTCATGATTGAATTTCTTTTGGCGCTCTAT---ATATGAAGTGTAGTATA--CGGTTTACTATTTGGATATTTTATTCCTATACATATTGATTCTATGTCATCGCACTCTTAATCGCACTGTCTTCGATACGGAATATCAGACTTTAAATATGCTAAAACACCTCCACC
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTG-ATGTATGCAAATGCACATTTGAAGATGCACCATTATCAAGTCCGGTAACTATTAAGTCAACATAAT---------------CATCAGCATTAATATTTGTACTGATGGTTCCATTTTCCACCGTATTATCATTATGTATCAGCCTA-TTCAATTTATAAGTATCTGAGCCTG-CAGATATATCGACTGGTATGGTTATTATCGAAGTATTA--AACGTTATTTTGCATATATTCATTTGAAGATGATAAACAAGATTCCCAACAA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cacaTTCG-TTGTATGTATTTATGAATTTGAACATGTAGTACTATCCGGTCCGGT---TATTAGATCATTATAATAGTAATAATAAATATCATTAGCATTAGTA------CTGATGGCTCGTTTTTCCACAACAATATCAGTTTGTATCAGTTT--TTTAATTTTATTGCATCTGA-CTTGACAGCTATGTTTACCGGTAttatcaacttcgcgtatgttttgacattcagtctatttgtgatctgtttttcgttaattagcaacattatatcagatgaattagtacttatattatctaatttgacatactcactttgatttgtaattgacctacattcctttgtaaacatgtatttaaggttgatttaaatttgttgtctgtacatgtacactatacacttttacaagtatagcaaaatagttaaaatatgcgatatctgtaactatatataagtgaaggggtgagtgttggttgttgttcccctgctggcgtcttgatagactacaatttgcaatcatatggttatagtgtccacagttctcacagtacgtctgtcttccaaatctagcttgactgccagccgacatggttttgtctcatagggtgtgttaagtttagcgcgataattgtttccgttgtgagttgcatc
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ACATCTTGGTGGTATACAATCTACAGTTGTATGGTTATAGTGGCAACAGTTCTCGTAGTACATCTGTCTTCCAAATCCAGTGTTACTGTTCTAGCCCACGTGATTTCGTCTCATAGAGTGTATTAAGTGCAGATTACTTCCGGTTTTGCGCTTCATCTGTCGGTGCAAAATTGTGGCAGCTGCTTTGCATTGGACTGTCT
Unaligned ( gi|18 ): GTTTGCTGTCCATCGGTCTGTGTGAAATCGTGGCAGCCACTTTGCATTGGATTATTTATGTGATGTCACTTTCAGTTTACTGTACATTTCTCTGAGGGAAATTTAGTTATCTTCACAGCATAGTATCA






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Reference ( family-271 )      :                                                                                                                               CAACCAGGTTGGGTGTCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGT-AAGAACCGAA-TTGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAACATCAAGTGAATAATTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTGAATTTCTTGAAA-CATCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATACGGGCACTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATAT---------T-ATGATCTATAATATTAGAACTGGATTTACATATTCTAGTTGGTGATTTAATCATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCAATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATCGACTTTATCT-AATATTGATTCA-AAAGACACGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTAT-T-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACGGTTTACTATTTGGATATTTTATTTCTATACATATTGATTCTATGTCATCGCACTCTAAATCGCAACGTCTTCGATATGGAATGTTAGACTTTATATATACTAAAACACCTCCACCTCTTTTAATAACCCTGNCCTTACGTTCGATTTGAAAATCGGGTATCTGTACGTTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATCAGTTGAGTTACATTGACTTAGNTGGTATTTGATTTCATCAAGTTTTGGAA-----GTNT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATGTGTAATCCCTTAGTAGTATAATTAA---CGTTTGATGTACGTAAA---TTTG-ATGTATGC--A--T--GCGCATTTGAAGATGCACTATTATCANGTCCGGT---TATNAAATCANCATAAT---------------CATCAGCATTAGTATTTGGGCTGATGGCTCCATTTTCCACCGTATTATCGTTCTGTATCAGCCTA-TTCAATTTAACAGTATCTGATCCTG-CAGATATATTGACCGGTATGGTTCTTATAGAAGTATT-A-TAGCGTTATTTTGCATATAT-TCATTTAAAGATGATAAACAAGATACCGNACAAGATAACGAATCCNTNCATCNAC---AATNACCAACC
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tGTAAGACCAAACTTCACAA-TAGTGTCATTTCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCAATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGGTTTCTAGATCTTAGTGATCCACTTTATCT-AATATTGATCCA-AAAGACATGATCCATAATTGAATTTCATTTGGTGCTCTATGTAA-TATGAAGTGTAGTAAAAACAGTTTACTATTTGGATATTTCATTTCTATACATATTGATTCTATGTCATCGCAATCTTAATCGCAATGTCTTGGATATGGAATGTTAGACTTTATA-ATACTAAAACACCTCCAC
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gi|3                          :                                                                                                                               CAACCAAGTTGGATATCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTT-CATAGGAACATA----TTTAGT-AAGAACAGAA-TTGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAACA--------ATATTTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTGAATTTCTTGATA-CAGCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCGTTTAGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAGAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATATTGGCA------------GATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATAT-----------ATGATCTAAAATTTTAGAACTGGATTTACGTATTCTAGTTGGTGATTTAATCATTTGTGTAAGACAAAATTTCACAA-TAGTGTCAT-CTATCTTTTT-------------CAACATTAGTATCAAATAAACAATTGATAGTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAGGTGATCGACTTTATCT-ATTATTGATTAA-AAAAACATGATCCAGGATTGAATTTCATTTGGCACTCTAT-T-A-T--GAAGTGTAGTAAAAACAGTTTACTATT-GTATATATTATTTCTATAAATATTGATTCTTTGTCATCGCACTCTAAATCGCAATGTCTTCGATATTGAATGTTAGACTTTAAATGTACTCAAACACCTCCTCCTCTTTTAATAACCCTGCCCTTACGTTCGATTTGAAAATTGGGTATCTGTACACTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATCAATTGAGTTA-ATTGACTTTGTTGGTATTTGATTTCATCAAGTTGTGGAACTATAATTT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATTTGTAATCCCTTAGTAGTATGATTAAACACGTTTGATGTATGTAAA---T--------------------GCACATTTGAAGATGCACTATTATCATGTCCAGT---TATGAAATCAACATAAT---------------CATCAGCATTAGTATTTGGGCTGATGGTTTCATTTTCCACCGTATTATCGTTCTGTATCAGCCTA-TTCCATTTAACAGTATCTGATCCTG-CAGATATATTGACTGGTATGGTTCTTAT-----TCTC-A--AACTTTATATTAGATATTTCTCATTTA
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Reference ( family-271 )      :                                                                                                                               CAACCAGGTTGGGTGTCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGT-AAGAACCGAA-TTGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAACATCAAGTGAATAATTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTGAATTTCTTGAAA-CATCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATACGGGCACTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATAT---------T-ATGATCTATAATATTAGAACTGGATTTACATATTCTAGTTGGTGATTTAATCATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCAATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATCGACTTTATCT-AATATTGATTCA-AAAGACACGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTAT-T-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACGGTTTACTATTTGGATATTTTATTTCTATACATATTGATTCTATGTCATCGCACTCTAAATCGCAACGTCTTCGATATGGAATGTTAGACTTTANATATACTAAAACACCTCCACCTCTTTTAATAACCCTGNCCTTACGTTCGATTTGAAAATCGGGTATCTGTACGTTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATCAGTTGAGTTACATTGACTTAGGTGGTATTTGATTTCATCAAGTTTTGGAA-----GTNT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATGTGTAATCCCTTAGTAGTATAATTAACGTTTGATG-ACGCAAA---TTTG-ATGTATGCAAATGCGCATTTGAAGATGCACTATTATCATGTCCGGT---TATGAAATCAACATA---------------ATCATCAGCATTAGTATTTGGGCTGATGGCTCCATTTTCCACCGTATTATCGTTCTGTATCGGCCTA-TTCAATTTAACAGTATCTGATCCTG-CAGATATATTGACCGGTATGGTTCTTATAGAAGTATTATTAGCGTTATTTTGCATATAT-TCATTTAAAGATGATAAACAAGATACTGAACAAGATAACGAATCCCTACATCCACAATTANCAACC
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gi|15                         : taagcagttaagattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgAACCAGGTTGGATGTCATATCTATCT-CT-----TTTTTCTTTCATATGAGAATG----CATAGT-AAGAACCGAAATTGGTGGTAGAATATGATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATTAAAAT----ATCCAATAACATCAAGTGAATCATTTGCTAAGTCGCTCAAA
gi|16                         :                                                                                                                                AACCAGGTTGGATGTCAAATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGTAAAAAATTAAA-TCGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGA-----TTGGATTATTAATATAATAATTCAATAACATAAAGTGAATAATTGGCTAAGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACAG-ACAGCGATCGCTAATACCATA-ACATGAAACATGAACTTC----ACT-AATGAGGCTAGGACATCTAT-TGTAT---------TCATGATATATGATAGAACAACTGGTTTTAGTTATACTTGCTGGTGTATTAATTATTTG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTATCCGTACGTTACTGTCTTAATTCAATACTTAGTGATAAAAATGTTTCAACAAT----------CCAGTTGAATTACATTGACTTA----------GATTTCATCAAGTTTTGGAA-----ATATAATGTTGTATGTTTATATTAAC
gi|2                          :                                                                                                                                AGCCAGGTTGGGTGCCATATTTAACT-CT-----TTT-TCTTTCATGGGAGCAGA----CTTAGT-AAGAACCGAA-TTGATTACAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAACATCAAATGAATAATTGGCTGAGTAATTAAAAAAT--ACAGTTTAACTGAATTTCTTGAAA-CATCTGTACTTAATTGTGTCATGGCATTTTCCTTTCGATTTTATACT------ACACATGTGCCATGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGTTGTATATGGGCACTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATATA--------T-ATGATCTATAATATTAGAACTGTATTTACATATTATAGTTGGTGATTTAATCATTTGTGTAAAACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCGATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATTGACTTTATCT-AATATTGATTCA-AAAGACATGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTA--T-A-TATGAAGTGTAGTAAAAA---------ACTTGA---------TTCTAT---------------GTCATCGCACTCTAAATCGCACCGTCTTCGATATGGAATGTTAGACTTGATATATACTACAACACCTCCACCTCTTTTAATAACCCTGTCCTTACAGTCGATTTGAAAATTGGGTATCTGTACACTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAAAAATGTTTCAACAATTCCGAAGATATCAGTTGAGTTACATTGACTTAGATGGTATTTGATTTTATTTAGTTTTGGAA-----GTGT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATGTGTAATCCCTTAGTAGTATAATTAA------------ACAAG---TTTG-ATGTATGTAAATGTGCATTTGAAGATGCACTATTATTATGTCTAGT---TATGAAATCAGCATA---------------ATCATCAGCATTAGTATTTGGGCTGATGGCTTC------------ATTATCGCTCTGTACCAGCCTA-TTCAATTTAACAGTATCTGATCCTG-CACATATATTGACTGGTATGGTTTTTATAGAAGTATTAATAGCGTTATTTTTCATATAT-TCATTTAAAGATGATAAACACACTACTGTACAAGATAACGAATCCATACAT---CAATTAACAACC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCCTT--GAATTTATACTTGTAGTACGGATGTACAGTGTAAAG-CA----GGATAGTGATCGCTAATGTTGTATACAGGCCCTAT-AA---CTGATTTTATATCAGGC----AAATTTGTtcg
gi|3                          :                                                                                                                               CAACCAAGTTGGATATCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTT-CATAGGAACATA----TTTAGT-AAGAACAGAA-TTGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAACA--------ATATTTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTGAATTTCTTGATA-CAGCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCGTTTAGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAGAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATATTGGCA------------GATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATAT-----------ATGATCTAAAATTTTAGAACTGGATTTACGTATTCTAGTTGGTGATTTAATCATTTGTGTAAGACAAAATTTCACAA-TAGTGTCAT-CTATCTTTTT-------------CAACATTAGTATCAAATAAACAATTGATAGTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAGGTGATCGACTTTATCT-ATTATTGATTAA-AAAAACATGATCCAGGATTGAATTTCATTTGGCACTCTAT-T-A-T--GAAGTGTAGTAAAAACAGTTTACTATT-GTATATATTATTTCTATAAATATTGATTCTTTGTCATCGCACTCTAAATCGCAATGTCTTCGATATTGAATGTTAGACTTTAAATGTACTCAAACACCTCCTCCTCTTTTAATAACCCTGCCCTTACGTTCGATTTGAAAATTGGGTATCTGTACACTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATCAATTGAGTTA-ATTGACTTTGTTGGTATTTGATTTCATCAAGTTGTGGAACTATAATTT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATTTGTAATCCCTTAGTAGTATGATTAA----------ACACG-----TTTG-ATGTATGTAAATGCACATTTGAAGATGCACTATTATCATGTCCAGT---TATGAAATCAACATA---------------ATCATCAGCATTAGTATTTGGGCTGATGGTTTCATTTTCCACCGTATTATCGTTCTGTATCAGCCTA-TTCCATTTAACAGTATCTGATCCTG-CAGATATATTGACTGGTATGGTTCTTAT-----TCTCA--AACTTTATATTAGATATTTCTCATTTA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATAGCACTATAAATCGCAATGTCTTCGATAAGGTATGTTAGACTTTATATATACTAAAACACCTTCATCTCTTTTAATAACCCTGACCTTACGTTCGATTTGAAAACCGGGTACCTGTACGTTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAATAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATCAGTTGAGTTACATTGACTTAGGTGGTATTTGATTTCATCAAGTTTTGGAA-----GTAT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATGTGTAATCCCATAGTAGTATAAATAA----------ACACA-----TTTG-ATGTATGCAAATGCACATTTGAAGATGCACTATTATCATGTCCTGT---TATGAAATCAACATA---------------ATCATCAGCATTAGTATTTGGGCTGACGGTTTCACTTTCCAACGTATTATCGTTCTGTATCGGCCTG-TTCAATTAAACAGTATCTGATCCT----GATATATTGACTGGTATGGTTCTTATAGAAGTATTATTAGCGTCATTTTGCATACA--TCATTTAAAGATGATAAACAAGATACTGGACAAGATAACGAATCCCTTCATTCACAATTATCAACCtgtaatactttaatatacaata
gi|5                          :                                                                                                                            atgCAACCAGGTTGGATGACATATTTAACT-CTCTTTTTTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGT-AAGAACCGAA-TTGATTATATAATGTAATAGAGTTAGAGATTGGGTTGGATTATCAGTAT----ATTCAATAACATCAAGTGAATAATTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTGAATTTCTTGAAA-CATCTGTTCTTAATTGTGTCATGGCAAAT-CCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATACGGGCGCTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATAT-----------ATGATCTATAATATTAGAACTAGATTTACACATTCTAGATGGCGATTTGATCATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAAATAGTGTTATTCCAGCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCGATAAACAGTTGATATTGAAATTCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATTGACTTTATTG-AATATTAATTCA-AAAGACACGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTCTAT-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACAGTTTACTATTTGGAGATTTTATTTCTATACATATTGATTCTATGTCATCACACTCTAAATCGCAACATCTTCGATATGGAATGTTAAACTTTATATGTACTAAAACACCTCCACCTCTTTTAATAACCCTGACCTTACGTTCGATTTGAAAATCGGGTATCTGTACGTTATTGTCTT----CAATACTTGGCGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATC--TTGATTTTCAttgcatgtgttttgacattcagtactatgtgtgatctgtttttcattaattagcaaactttttgttagatgaataagtacttacattatttaatttgacatactcactttgattcataaattgacccacattcttttgtaaacttgtatctaaggttgattcaaagtcattgtctttgcacgtacattctacactataacaattaaagcagatatagtttaaaatgtcatctgttactacatatcagggaatgtgagtgtttgtcgtcacttccctaccaacgtcttggtagtctacaatctgcaattgtatggttatagtgaccacaattctcacagtacaactgtcttccgaatccagctcgactgttccagtcgacgtggttttgtcttatagggtgttttatgtgcagatcacttccagtttgctctccatcagtcagtgtgaaatcgtggcagccactttgcattggattatct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CACA---TTTG-ATGTATGCAAATGCACATTTGAAGATGCACCATTATCAAGTCCGGTAACTATTAAGTCAACATA---------------ATCATCAGCATTAATATTTGTACTGATGGTTCCATTTTCCACCGTATTATCATTATGTATCAGCCTA-TTCAATTTATAAGTATCTGAGCCTG-CAGATATATCGACTGGTATGGTTATTATCGAAGTATTA--AACGTTATTTTGCATATAT-TCATTTGAAGATGATAAACAAGATTCCCAACAAgatgggatcaatatttagcttgctatgggtatatagattatttgtggtagaatggtga
gi|7                          :                                                                                                                                AACCAAGTTGGGTGTCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATGTATGCTTAGT-AAGAAACAAA-TTGATTATAGAATATAACAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAAT---------ATAGTT-------TCACTGAA----------TTTC-TTGAA---------A-CATCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCCTTTCGCTATTATACT------ACCCATGCACCGTGTAAAA-T-AACAGGATAGTGATTGCTAATGCTGTATAAGGGCAATAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATA----------T-ATGATCTATAATATTAGAGCTGGATTTGGATATTCTAGTTGGTGATTTAATTATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATATTTTTCAACATTAGTATCCAATAAACATTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATCGACTTTATCT-AATATTGATTCA-AAAGACAC-ATTCATGATTGAATTTCTTTTGGCGCTCTA--T-A-TATGAAGTGTAGT--ATACGGTTTACTATTTGGATATTTTATTCCTATACATATTGATTCTATGTCATCGCACTCTTAATCGCACTGTCTTCGATACGGAATATCAGACTTTAAATATGCTAAAACACCTCCACCttatcaacttcgcgtatgttttgacattcagtctatttgtgatctgtttttcgttaattagcaacattatatcagatgaattagtacttatattatctaatttgacatactcactttgatttgtaattgacctacattcctttgtaaacatgtatttaaggttgatttaaatttgttgtctgtacatgtacactatacacttttacaagtatagcaaaatagttaaaatatgcgatatctgtaactatatataagtgaaggggtgagtgttggttgttgttcccctgctggcgtcttgatagactacaatttgcaatcatatggttatagtgtccacagttctcacagtacgtctgtcttccaaatctagcttgactgccagccgacatggttttgtctcatagggtgtgttaagtttagcgcgataattgtttccgttgtgagttgcatc
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gi|9                          :                                                                                                                                AACCAGGTTGTGTGTCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGT-AAGAACCGAA-TTGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----AGTCAATAACATCAAGTGAATAATTGGCTAAGTCATCCAAAAATGTATAGATTCACTGAATTTCTTGAAA-CATCTGTACTTAATTGTGTCACGGCAATTTCCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATACAGGTACTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATATA--------T-ATGATCTATAATATTTGAACTTGATTTACATATTTTAGTTGGTGATTTAATCATATGTGTGAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAATATTAGTATTCAATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTTAGTGATCGATTTTATCTAAATATGGATTCA-AAAGACATGATCAATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTA--T-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACGGTTTACAATTTGGATATTTTATTTCTATACATGTTAATTCTATG
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Reference ( family-271 )      :                                                                                                                               CAACCAGGTTGGGTGTCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGT-AAGAACCGAA-TTGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAACATCAAGTGAATAATTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTGAATTTCTTGAAA-CATCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATACGGGCACTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATAT---------T-ATGATCTATAATATTAGAACTGGATTTACATATTCTAGTTGGTGATTTAATCATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCAATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATCGACTTTATCT-AATATTGATTCA-AAAGACACGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTAT-T-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACGGTTTACTATTTGGATATTTTATTTCTATACATATTGATTCTATGTCATCGCACTCTAAATCGCAACGTCTTCGATATGGAATGTTAGACTTTANATATACTAAAACACCTCCACCTCTTTTAATAACCCTGNCCTTACGTTCGATTTGAAAATCGGGTATCTGTACGTTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATCAGTTGAGTTACATTGACTTAGGTGGTATTTGATTTCATCAAGTTTTGGA-----AGTNT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATGTGTAATCCCTTAGTAGTATAATTA----------AACACAAA---TTTG-ATGTATGCAAATGCGCATTTGAAGATGCACTATTATCATGTCCGGT---TATGAAATCAACATA---------------ATCATCAGCATTAGTATTTGGGCTGATGGCTCCATTTTCCACCGTATTATCGTTCTGTATCGGCCTA-TTCAATTTAACAGTATCTGATCCTG-CAGATATATTGACCGGTATGGTTCTTATAGAAGTATTATTAGCGTTATTTTGCATATAT-TCATTTAAAGATGATAAACAAGATACTGAACAAGATAACGAATCCCTACATCCACAATTAACAACC
gi|1                          :                                                                                                                               CAACCAGGTTGGGTGTCATATTTAACTATT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATG----TTTAGT-AAGAACCAAA-TTGATTATAGAATATAAAGGAGTTAGAGATTGGTTTGGAATATCAATAT----ATTCAATAACATCAAGTAAATAATTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTGAATTTTTCGAAAACATCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAAACAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATACGGACATTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATACACATGTATAT-ATGATCTATAATATTAGAACTGGATTTACATATTCTAGTTGGTGATTTAATCATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCGTCTTTTTATACTTTAGTTTTCAACATTAGTTTCCAACAAACAGTTGATATTGAAATCTCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATCGACTTTATCT-AATATTGATTCA-AAAGACACGATCCATGATTTAATTTCATTTGGCGCTCTATAT-AATATGAAGTGTAGTAAAATCGGTTTACTATTTGGATATTTTATTTCTGTACATATTGATTCTATGTCATCGCATTCTAAATCGCAACGTCTTCTATATGGAATGTTAGACTTTAAATATACTAAAACACCTCCACCTCATTTAACAACCCTGTCCTTACGTTCGATTTGAAAATTGGGTATTTGTACGTTATTGTCTT----TAATACTTGATGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATCAGTTGAGTTACACTGACTTAAGTGGTGTTTGATTTCATCAAGTTTTGGA-----AGTTT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCATTGTGTAATCCCTTAGTAGTATAATTAACGTTTGATGAATGCAAATGCTTTG-ATGTATGCAAATGCGCATTTGAAAATGCACTATTTTCATGTCCAGT---TATGAAATCAACATA---------------ATCATCAGCATTAGTATTTGGGCTAATGGTTTCATTTTCCACCGTACTATTGTTCTGTATCGGCTTA-TTTAATTTAACAGTATCTGATCCTG-CAGATAAATTGACTGGTATGGTTCTTATAGAAGTATTATTAGCGTTATTTTGCATATAT-TCATATCAAGATGATAAACAAGATACTGAACAAGATAACGAATCCCTACATCCACAG-TAATAACC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATAGG-TAGTGATCGCTAATGCTGTATACAGGGACTAT-AACCTCTGATAATAAAGCATGC----ATGTTTGTATATAT-----------ATGATCAATAATAGAAAGGCTGGATTTCCTTATTCTAGTTGATGATTTAATTATTTGTTTAAGACCAAATTTCACAA-TAATGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATTCAATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAACCATATAGATTTCCAAATGTAAGTGATCTACATTATC----TATTGATTCAGAAAGACATGCTTCATGATTGAATTTCATTTGGAGATCT-T-T-A-TGTAAAGTGTAGTAAAAACGGTTTACCATTTGTTTATTTTATTTCTAAACATATTGATTTTATGTCaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tGTAAGACCAAACTTCACAA-TAGTGTCATTTCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCAATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGGTTTCTAGATCTTAGTGATCCACTTTATCT-AATATTGATCCA-AAAGACATGATCCATAATTGAATTTCATTTGGTGCTCTATGTAA-TATGAAGTGTAGTAAAAACAGTTTACTATTTGGATATTTCATTTCTATACATATTGATTCTATGTCATCGCAATCTTAATCGCAATGTCTTGGATATGGAATGTTAGACTTTATA-ATACTAAAACACCTCCAC
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---TTCG-TTGTATGTATTTATGAATTTGAACATGTAGTACTATCCGGTCCGGT---TATTAGATCATTATAATAGTAATAATAAATATCATTAGCATTAGTA------CTGATGGCTCGTTTTTCCACAACAATATCAGTTTGTATCAGTTT--TTTAATTTTATTGCATCTGA-CTTGACAGCTATGTTTACCGGTA
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gi|15                         : taagcagttaagattgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttcgAACCAGGTTGGATGTCATATCTATCT-CT-----TTTTTCTTTCATATGAGAATG----CATAGT-AAGAACCGAAATTGGTGGTAGAATATGATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATTAAAAT----ATCCAATAACATCAAGTGAATCATTTGCTAAGTCGCTCAAA
gi|16                         :                                                                                                                                AACCAGGTTGGATGTCAAATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGTAAAAAATTAAA-TCGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGA-----TTGGATTATTAATATAATAATTCAATAACATAAAGTGAATAATTGGCTAAGT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACAG-ACAGCGATCGCTAATACCATA-ACATGAAACATGAACTTC----ACT-AATGAGGCTAGGACATCTAT-TGTAT---------TCATGATATATGATAGAACAACTGGTTTTAGTTATACTTGCTGGTGTATTAATTATTTG
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTATCCGTACGTTACTGTCTTAATTCAATACTTAGTGATAAAAATGTTTCAACAAT----------CCAGTTGAATTACATTGACTTA----------GATTTCATCAAGTTTTGGA-----AATATAATGTTGTATGTTTATATTAAC
gi|2                          :                                                                                                                                AGCCAGGTTGGGTGCCATATTTAACT-CT-----TTT-TCTTTCATGGGAGCAGA----CTTAGT-AAGAACCGAA-TTGATTACAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAACATCAAATGAATAATTGGCTGAGTAATTAAAAAAT--ACAGTTTAACTGAATTTCTTGAAA-CATCTGTACTTAATTGTGTCATGGCATTTTCCTTTCGATTTTATACT------ACACATGTGCCATGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGTTGTATATGGGCACTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATATA--------T-ATGATCTATAATATTAGAACTGTATTTACATATTATAGTTGGTGATTTAATCATTTGTGTAAAACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCGATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATTGACTTTATCT-AATATTGATTCA-AAAGACATGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTA--T-A-TATGAAGTGTAGTAAAAA---------ACTTGA---------TTCTAT---------------GTCATCGCACTCTAAATCGCACCGTCTTCGATATGGAATGTTAGACTTGATATATACTACAACACCTCCACCTCTTTTAATAACCCTGTCCTTACAGTCGATTTGAAAATTGGGTATCTGTACACTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAAAAATGTTTCAACAATTCCGAAGATATCAGTTGAGTTACATTGACTTAGATGGTATTTGATTTTATTTAGTTTTGGA-----AGTGT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATGTGTAATCCCTTAGTAGTATAATTA----------A--ACAAG---TTTG-ATGTATGTAAATGTGCATTTGAAGATGCACTATTATTATGTCTAGT---TATGAAATCAGCATA---------------ATCATCAGCATTAGTATTTGGGCTGATGGCTTC------------ATTATCGCTCTGTACCAGCCTA-TTCAATTTAACAGTATCTGATCCTG-CACATATATTGACTGGTATGGTTTTTATAGAAGTATTAATAGCGTTATTTTTCATATAT-TCATTTAAAGATGATAAACACACTACTGTACAAGATAACGAATCCATACAT---CAATTAACAACC
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCCTT--GAATTTATACTTGTAGTACGGATGTACAGTGTAAAG-CA----GGATAGTGATCGCTAATGTTGTATACAGGCCCTAT-AA---CTGATTTTATATCAGGC----AAATTTGTtcg
gi|3                          :                                                                                                                               CAACCAAGTTGGATATCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTT-CATAGGAACATA----TTTAGT-AAGAACAGAA-TTGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAACA--------ATATTTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTGAATTTCTTGATA-CAGCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCGTTTAGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAGAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATATTGGCA------------GATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATAT-----------ATGATCTAAAATTTTAGAACTGGATTTACGTATTCTAGTTGGTGATTTAATCATTTGTGTAAGACAAAATTTCACAA-TAGTGTCAT-CTATCTTTTT-------------CAACATTAGTATCAAATAAACAATTGATAGTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAGGTGATCGACTTTATCT-ATTATTGATTAA-AAAAACATGATCCAGGATTGAATTTCATTTGGCACTCTAT-T-A-T--GAAGTGTAGTAAAAACAGTTTACTATT-GTATATATTATTTCTATAAATATTGATTCTTTGTCATCGCACTCTAAATCGCAATGTCTTCGATATTGAATGTTAGACTTTAAATGTACTCAAACACCTCCTCCTCTTTTAATAACCCTGCCCTTACGTTCGATTTGAAAATTGGGTATCTGTACACTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATCAATTGAGTTA-ATTGACTTTGTTGGTATTTGATTTCATCAAGTTGTGGAACTATAATTT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATTTGTAATCCCTTAGTAGTATGATTA----------AACAC--G---TTTG-ATGTATGTAAATGCACATTTGAAGATGCACTATTATCATGTCCAGT---TATGAAATCAACATA---------------ATCATCAGCATTAGTATTTGGGCTGATGGTTTCATTTTCCACCGTATTATCGTTCTGTATCAGCCTA-TTCCATTTAACAGTATCTGATCCTG-CAGATATATTGACTGGTATGGTTCTTAT-----TCTCA--AACTTTATATTAGATATTTCTCATTTA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATAGCACTATAAATCGCAATGTCTTCGATAAGGTATGTTAGACTTTATATATACTAAAACACCTTCATCTCTTTTAATAACCCTGACCTTACGTTCGATTTGAAAACCGGGTACCTGTACGTTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAATAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATCAGTTGAGTTACATTGACTTAGGTGGTATTTGATTTCATCAAGTTTTGGA-----AGTAT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATGTGTAATCCCATAGTAGTATAAATA----------AACAC--A---TTTG-ATGTATGCAAATGCACATTTGAAGATGCACTATTATCATGTCCTGT---TATGAAATCAACATA---------------ATCATCAGCATTAGTATTTGGGCTGACGGTTTCACTTTCCAACGTATTATCGTTCTGTATCGGCCTG-TTCAATTAAACAGTATCTGATCCT----GATATATTGACTGGTATGGTTCTTATAGAAGTATTATTAGCGTCATTTTGCATACA--TCATTTAAAGATGATAAACAAGATACTGGACAAGATAACGAATCCCTTCATTCACAATTATCAACCtgtaatactttaatatacaata
gi|5                          :                                                                                                                            atgCAACCAGGTTGGATGACATATTTAACT-CTCTTTTTTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGT-AAGAACCGAA-TTGATTATATAATGTAATAGAGTTAGAGATTGGGTTGGATTATCAGTAT----ATTCAATAACATCAAGTGAATAATTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTGAATTTCTTGAAA-CATCTGTTCTTAATTGTGTCATGGCAAAT-CCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATACGGGCGCTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATAT-----------ATGATCTATAATATTAGAACTAGATTTACACATTCTAGATGGCGATTTGATCATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAAATAGTGTTATTCCAGCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCGATAAACAGTTGATATTGAAATTCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATTGACTTTATTG-AATATTAATTCA-AAAGACACGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTCTAT-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACAGTTTACTATTTGGAGATTTTATTTCTATACATATTGATTCTATGTCATCACACTCTAAATCGCAACATCTTCGATATGGAATGTTAAACTTTATATGTACTAAAACACCTCCACCTCTTTTAATAACCCTGACCTTACGTTCGATTTGAAAATCGGGTATCTGTACGTTATTGTCTT----CAATACTTGGCGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATC--TTGATTTTCAttgcatgtgttttgacattcagtactatgtgtgatctgtttttcattaattagcaaactttttgttagatgaataagtacttacattatttaatttgacatactcactttgattcataaattgacccacattcttttgtaaacttgtatctaaggttgattcaaagtcattgtctttgcacgtacattctacactataacaattaaagcagatatagtttaaaatgtcatctgttactacatatcagggaatgtgagtgtttgtcgtcacttccctaccaacgtcttggtagtctacaatctgcaattgtatggttatagtgaccacaattctcacagtacaactgtcttccgaatccagctcgactgttccagtcgacgtggttttgtcttatagggtgttttatgtgcagatcacttccagtttgctctccatcagtcagtgtgaaatcgtggcagccactttgcattggattatct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CACA---TTTG-ATGTATGCAAATGCACATTTGAAGATGCACCATTATCAAGTCCGGTAACTATTAAGTCAACATA---------------ATCATCAGCATTAATATTTGTACTGATGGTTCCATTTTCCACCGTATTATCATTATGTATCAGCCTA-TTCAATTTATAAGTATCTGAGCCTG-CAGATATATCGACTGGTATGGTTATTATCGAAGTATTA--AACGTTATTTTGCATATAT-TCATTTGAAGATGATAAACAAGATTCCCAACAAgatgggatcaatatttagcttgctatgggtatatagattatttgtggtagaatggtga
gi|7                          :                                                                                                                                AACCAAGTTGGGTGTCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATGTATGCTTAGT-AAGAAACAAA-TTGATTATAGAATATAACAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAAT---------ATAGTT-------TCACTGAA----------TTTC-TTGAA---------A-CATCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCCTTTCGCTATTATACT------ACCCATGCACCGTGTAAAA-T-AACAGGATAGTGATTGCTAATGCTGTATAAGGGCAATAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATA----------T-ATGATCTATAATATTAGAGCTGGATTTGGATATTCTAGTTGGTGATTTAATTATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATATTTTTCAACATTAGTATCCAATAAACATTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATCGACTTTATCT-AATATTGATTCA-AAAGACAC-ATTCATGATTGAATTTCTTTTGGCGCTCTA--T-A-TATGAAGTGTAGT--ATACGGTTTACTATTTGGATATTTTATTCCTATACATATTGATTCTATGTCATCGCACTCTTAATCGCACTGTCTTCGATACGGAATATCAGACTTTAAATATGCTAAAACACCTCCACCttatcaacttcgcgtatgttttgacattcagtctatttgtgatctgtttttcgttaattagcaacattatatcagatgaattagtacttatattatctaatttgacatactcactttgatttgtaattgacctacattcctttgtaaacatgtatttaaggttgatttaaatttgttgtctgtacatgtacactatacacttttacaagtatagcaaaatagttaaaatatgcgatatctgtaactatatataagtgaaggggtgagtgttggttgttgttcccctgctggcgtcttgatagactacaatttgcaatcatatggttatagtgtccacagttctcacagtacgtctgtcttccaaatctagcttgactgccagccgacatggttttgtctcatagggtgtgttaagtttagcgcgataattgtttccgttgtgagttgcatc
gi|8                          :                                                                                                                                AACCAGGTTGGGTGTCATATCTAACT-CT-----TTTTTCATTCATAGGTGCATG----CTTAGT-AAGAACTGAA-TCGATTATAGAATTTAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATGT----ATTCAATAACATCAAGTG--------GCGAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCATTGCAATTCTTGAAG-CATCAGTACTTAATTGTGTCATGACAATTTCCTTTCAATTTTATACT------ACCCATGCGCTGTGTTAAA-CAAACAGGATAGTGATTTCTAATGCTGTATATGGGCACTAT-AACC--------------AGGC----ATATTTGTATATAT-----------GTGATCTATAATAGTAGAACTGGATTTACATATTCTAGTTTGTGGTTTAATCATTTGTGTAGGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACGTAAGTATCCAGTAAACAGTTGTTATTGAAATCCCCAAACATACAGATTTCCAGATCTAAGTGATCA-------CT-AATATTGATTCA-AAAGACACGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTA--T-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACGGTTTACTATTTGGATATTTTATTTCTATACATATTGATTATATGTCATCGCATTCTAAATTGCAACGTCTTCGATATGGAATGTTATACT
gi|9                          :                                                                                                                                AACCAGGTTGTGTGTCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGT-AAGAACCGAA-TTGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----AGTCAATAACATCAAGTGAATAATTGGCTAAGTCATCCAAAAATGTATAGATTCACTGAATTTCTTGAAA-CATCTGTACTTAATTGTGTCACGGCAATTTCCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATACAGGTACTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATATA--------T-ATGATCTATAATATTTGAACTTGATTTACATATTTTAGTTGGTGATTTAATCATATGTGTGAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAATATTAGTATTCAATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTTAGTGATCGATTTTATCTAAATATGGATTCA-AAAGACATGATCAATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTA--T-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACGGTTTACAATTTGGATATTTTATTTCTATACATGTTAATTCTATG
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ACATCTTGGTGGTATACAATCTACAGTTGTATGGTTATAGTGGCAACAGTTCTCGTAGTACATCTGTCTTCCAAATCCAGTGTTACTGTTCTAGCCCACGTGATTTCGTCTCATAGAGTGTATTAAGTGCAGATTACTTCCGGTTTTGCGCTTCATCTGTCGGTGCAAAATTGTGGCAGCTGCTTTGCATTGGACTGTCT
Unaligned ( gi|18 ): GTTTGCTGTCCATCGGTCTGTGTGAAATCGTGGCAGCCACTTTGCATTGGATTATTTATGTGATGTCACTTTCAGTTTACTGTACATTTCTCTGAGGGAAATTTAGTTATCTTCACAGCATAGTATCA






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Reference ( family-271 )      :                                                                                                                               CAACCAGGTTGGGTGTCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGT-AAGAACCGAA-TTGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAACATCAAGTGAATAATTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTGAATTTCTTGAAA-CATCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATACGGGCACTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATAT---------T-ATGATCTATAATATTAGAACTGGATTTACATATTCTAGTTGGTGATTTAATCATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCAATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATCGACTTTATCT-AATATTGATTCA-AAAGACACGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTAT-T-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACGGTTTACTATTTGGATATTTTATTTCTATACATATTGATTCTATGTCATCGCACTCTAAATCGCAACGTCTTCGATATGGAATGTTAGACTTTANATATACTAAAACACCTCCACCTCTTTTAATAACCCTGNCCTTACGTTCGATTTGAAAATCGGGTATCTGTACGTTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATCAGTTGAGTTACATTGACTTAGGTGGTATTTGATTTCATCAAGTTTTGGA-----AGTNT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATGTGTAATCCCTTAGTAGTATAATTA----------AACACAAA---TTTG-ATGTATGCAAATGCGCATTTGAAGATGCACTATTATCATGTCCGGT---TATGAAATCAACATA---------------ATCATCAGCATTAGTATTTGGGCTGATGGCTCCATTTTCCACCGTATTATCGTTCTGTATCGGCCTA-TTCAATTTAACAGTATCTGATCCTG-CAGATATATTGACCGGTATGGTTCTTATAGAAGTATTATTAGCGTTATTTTGCATATAT-TCATTTAAAGATGATAAACAAGATACTGAACAAGATAACGAATCCCTACATCCACAATTAACAACC
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tGTAAGACCAAACTTCACAA-TAGTGTCATTTCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCAATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGGTTTCTAGATCTTAGTGATCCACTTTATCT-AATATTGATCCA-AAAGACATGATCCATAATTGAATTTCATTTGGTGCTCTATGTAA-TATGAAGTGTAGTAAAAACAGTTTACTATTTGGATATTTCATTTCTATACATATTGATTCTATGTCATCGCAATCTTAATCGCAATGTCTTGGATATGGAATGTTAGACTTTATA-ATACTAAAACACCTCCAC
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACAG-ACAGCGATCGCTAATACCATA-ACATGAAACATGAACTTC----ACT-AATGAGGCTAGGACATCTAT-TGTAT---------TCATGATATATGATAGAACAACTGGTTTTAGTTATACTTGCTGGTGTATTAATTATTTG
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCCTT--GAATTTATACTTGTAGTACGGATGTACAGTGTAAAG-CA----GGATAGTGATCGCTAATGTTGTATACAGGCCCTAT-AA---CTGATTTTATATCAGGC----AAATTTGTtcg
gi|3                          :                                                                                                                               CAACCAAGTTGGATATCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTT-CATAGGAACATA----TTTAGT-AAGAACAGAA-TTGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAACA--------ATATTTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTGAATTTCTTGATA-CAGCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCGTTTAGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAGAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATATTGGCA------------GATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATAT-----------ATGATCTAAAATTTTAGAACTGGATTTACGTATTCTAGTTGGTGATTTAATCATTTGTGTAAGACAAAATTTCACAA-TAGTGTCAT-CTATCTTTTT-------------CAACATTAGTATCAAATAAACAATTGATAGTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAGGTGATCGACTTTATCT-ATTATTGATTAA-AAAAACATGATCCAGGATTGAATTTCATTTGGCACTCTAT-T-A-T--GAAGTGTAGTAAAAACAGTTTACTATT-GTATATATTATTTCTATAAATATTGATTCTTTGTCATCGCACTCTAAATCGCAATGTCTTCGATATTGAATGTTAGACTTTAAATGTACTCAAACACCTCCTCCTCTTTTAATAACCCTGCCCTTACGTTCGATTTGAAAATTGGGTATCTGTACACTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATCAATTGAGTTA-ATTGACTTTGTTGGTATTTGATTTCATCAAGTTGTGGAACTATAATTT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATTTGTAATCCCTTAGTAGTATGATTA----------AACAC--G---TTTG-ATGTATGTAAATGCACATTTGAAGATGCACTATTATCATGTCCAGT---TATGAAATCAACATA---------------ATCATCAGCATTAGTATTTGGGCTGATGGTTTCATTTTCCACCGTATTATCGTTCTGTATCAGCCTA-TTCCATTTAACAGTATCTGATCCTG-CAGATATATTGACTGGTATGGTTCTTAT-----TCTCA--AACTTTATATTAGATATTTCTCATTTA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATAGCACTATAAATCGCAATGTCTTCGATAAGGTATGTTAGACTTTATATATACTAAAACACCTTCATCTCTTTTAATAACCCTGACCTTACGTTCGATTTGAAAACCGGGTACCTGTACGTTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAATAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATCAGTTGAGTTACATTGACTTAGGTGGTATTTGATTTCATCAAGTTTTGGA-----AGTAT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATGTGTAATCCCATAGTAGTATAAATA----------AACAC--A---TTTG-ATGTATGCAAATGCACATTTGAAGATGCACTATTATCATGTCCTGT---TATGAAATCAACATA---------------ATCATCAGCATTAGTATTTGGGCTGACGGTTTCACTTTCCAACGTATTATCGTTCTGTATCGGCCTG-TTCAATTAAACAGTATCTGATCCT----GATATATTGACTGGTATGGTTCTTATAGAAGTATTATTAGCGTCATTTTGCATACA--TCATTTAAAGATGATAAACAAGATACTGGACAAGATAACGAATCCCTTCATTCACAATTATCAACCtgtaatactttaatatacaata
gi|5                          :                                                                                                                            atgCAACCAGGTTGGATGACATATTTAACT-CTCTTTTTTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGT-AAGAACCGAA-TTGATTATATAATGTAATAGAGTTAGAGATTGGGTTGGATTATCAGTAT----ATTCAATAACATCAAGTGAATAATTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTGAATTTCTTGAAA-CATCTGTTCTTAATTGTGTCATGGCAAAT-CCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATACGGGCGCTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATAT-----------ATGATCTATAATATTAGAACTAGATTTACACATTCTAGATGGCGATTTGATCATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAAATAGTGTTATTCCAGCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCGATAAACAGTTGATATTGAAATTCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATTGACTTTATTG-AATATTAATTCA-AAAGACACGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTCTAT-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACAGTTTACTATTTGGAGATTTTATTTCTATACATATTGATTCTATGTCATCACACTCTAAATCGCAACATCTTCGATATGGAATGTTAAACTTTATATGTACTAAAACACCTCCACCTCTTTTAATAACCCTGACCTTACGTTCGATTTGAAAATCGGGTATCTGTACGTTATTGTCTT----CAATACTTGGCGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATC--TTGATTTTCAttgcatgtgttttgacattcagtactatgtgtgatctgtttttcattaattagcaaactttttgttagatgaataagtacttacattatttaatttgacatactcactttgattcataaattgacccacattcttttgtaaacttgtatctaaggttgattcaaagtcattgtctttgcacgtacattctacactataacaattaaagcagatatagtttaaaatgtcatctgttactacatatcagggaatgtgagtgtttgtcgtcacttccctaccaacgtcttggtagtctacaatctgcaattgtatggttatagtgaccacaattctcacagtacaactgtcttccgaatccagctcgactgttccagtcgacgtggttttgtcttatagggtgttttatgtgcagatcacttccagtttgctctccatcagtcagtgtgaaatcgtggcagccactttgcattggattatct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CACA---TTTG-ATGTATGCAAATGCACATTTGAAGATGCACCATTATCAAGTCCGGTAACTATTAAGTCAACATA---------------ATCATCAGCATTAATATTTGTACTGATGGTTCCATTTTCCACCGTATTATCATTATGTATCAGCCTA-TTCAATTTATAAGTATCTGAGCCTG-CAGATATATCGACTGGTATGGTTATTATCGAAGTATTA--AACGTTATTTTGCATATAT-TCATTTGAAGATGATAAACAAGATTCCCAACAAgatgggatcaatatttagcttgctatgggtatatagattatttgtggtagaatggtga
gi|7                          :                                                                                                                                AACCAAGTTGGGTGTCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATGTATGCTTAGT-AAGAAACAAA-TTGATTATAGAATATAACAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAAT---------ATAGTT-------TCACTGAA----------TTTC-TTGAA---------A-CATCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCCTTTCGCTATTATACT------ACCCATGCACCGTGTAAAA-T-AACAGGATAGTGATTGCTAATGCTGTATAAGGGCAATAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATA----------T-ATGATCTATAATATTAGAGCTGGATTTGGATATTCTAGTTGGTGATTTAATTATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATATTTTTCAACATTAGTATCCAATAAACATTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATCGACTTTATCT-AATATTGATTCA-AAAGACAC-ATTCATGATTGAATTTCTTTTGGCGCTCTA--T-A-TATGAAGTGTAGT--ATACGGTTTACTATTTGGATATTTTATTCCTATACATATTGATTCTATGTCATCGCACTCTTAATCGCACTGTCTTCGATACGGAATATCAGACTTTAAATATGCTAAAACACCTCCACCttatcaacttcgcgtatgttttgacattcagtctatttgtgatctgtttttcgttaattagcaacattatatcagatgaattagtacttatattatctaatttgacatactcactttgatttgtaattgacctacattcctttgtaaacatgtatttaaggttgatttaaatttgttgtctgtacatgtacactatacacttttacaagtatagcaaaatagttaaaatatgcgatatctgtaactatatataagtgaaggggtgagtgttggttgttgttcccctgctggcgtcttgatagactacaatttgcaatcatatggttatagtgtccacagttctcacagtacgtctgtcttccaaatctagcttgactgccagccgacatggttttgtctcatagggtgtgttaagtttagcgcgataattgtttccgttgtgagttgcatc
gi|8                          :                                                                                                                                AACCAGGTTGGGTGTCATATCTAACT-CT-----TTTTTCATTCATAGGTGCATG----CTTAGT-AAGAACTGAA-TCGATTATAGAATTTAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATGT----ATTCAATAACATCAAGTG--------GCGAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCATTGCAATTCTTGAAG-CATCAGTACTTAATTGTGTCATGACAATTTCCTTTCAATTTTATACT------ACCCATGCGCTGTGTTAAA-CAAACAGGATAGTGATTTCTAATGCTGTATATGGGCACTAT-AACC--------------AGGC----ATATTTGTATATAT-----------GTGATCTATAATAGTAGAACTGGATTTACATATTCTAGTTTGTGGTTTAATCATTTGTGTAGGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACGTAAGTATCCAGTAAACAGTTGTTATTGAAATCCCCAAACATACAGATTTCCAGATCTAAGTGATCA-------CT-AATATTGATTCA-AAAGACACGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTA--T-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACGGTTTACTATTTGGATATTTTATTTCTATACATATTGATTATATGTCATCGCATTCTAAATTGCAACGTCTTCGATATGGAATGTTATACT
gi|9                          :                                                                                                                                AACCAGGTTGTGTGTCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGT-AAGAACCGAA-TTGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----AGTCAATAACATCAAGTGAATAATTGGCTAAGTCATCCAAAAATGTATAGATTCACTGAATTTCTTGAAA-CATCTGTACTTAATTGTGTCACGGCAATTTCCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATACAGGTACTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTGTATATATA--------T-ATGATCTATAATATTTGAACTTGATTTACATATTTTAGTTGGTGATTTAATCATATGTGTGAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAATATTAGTATTCAATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTTAGTGATCGATTTTATCTAAATATGGATTCA-AAAGACATGATCAATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTA--T-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACGGTTTACAATTTGGATATTTTATTTCTATACATGTTAATTCTATG


blockSeqs                     :                                                                                                                                                          .  CTTTT                     TATG      A          A                                                 AATA                  A      T                  GT              T         .                                               TGTAGT                   .                                     C   G                      TAGG              TC                                                                                      A                                                                                                                 A            G                                       TG A .                                                                                                                 T                                     T                                             AATT                                                               GA                           ACTAT   A A                                                 AACAAG                   T         T                            G       AAC               ATAGTAATAATAAAT                T                T                           A    AT                    T    A             C              A         AT                  TC                            T                      T     T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                          .  .                         .         .          .                                                 .                     A      G                  .               T         .                                               .                        .                                     A   .                      .                 AT                                                                                      .                                                                                                                 .            .                                       TA . .                                                                                                                 T                                     C                                             .                                                                  GT                           .       G .                                                 AACACG                   .         A                            G       .                 ATAGTAATAATAAAT                T                T                           A    A                     T    A             C              A         TT                  T                             G                      .     T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                          .  .                         .         .          .                                                 .                     A      G                  .               T         .                                               .                        .                                     C   .                      .                 AT                                                                                      .                                                                                                                 .            .                                       T  . .                                                                                                                 A                                     A                                             .                                                                  GG                           .       T .                                                 AACACA                   .         A                            T       .                 .                              T                A                           A    A                     T    .             T              C         .                   T                             A                             
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ACATCTTGGTGGTATACAATCTACAGTTGTATGGTTATAGTGGCAACAGTTCTCGTAGTACATCTGTCTTCCAAATCCAGTGTTACTGTTCTAGCCCACGTGATTTCGTCTCATAGAGTGTATTAAGTGCAGATTACTTCCGGTTTTGCGCTTCATCTGTCGGTGCAAAATTGTGGCAGCTGCTTTGCATTGGACTGTCT
Unaligned ( gi|18 ): GTTTGCTGTCCATCGGTCTGTGTGAAATCGTGGCAGCCACTTTGCATTGGATTATTTATGTGATGTCACTTTCAGTTTACTGTACATTTCTCTGAGGGAAATTTAGTTATCTTCACAGCATAGTATCA






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Reference ( family-271 )      :                                                                                                                               CAACCAGGTTGGGTGTCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGT-AAGAACCGAA-TTGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAACATCAAGTGAATAATTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTGAATTTCTTGAAA-CATCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATACGGGCACTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTG--TATA--TA----------T--ATGATCTATAATATTAGAACTGGATTTACATATTCTAGTTGGTGATTTAATCATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCAATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATCGACTTTATCT-AATATTGATTCA-AAAGACACGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTAT-T-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACGGTTTACTATTTGGATATTTTATTTCTATACATATTGATTCTATGTCATCGCACTCTAAATCGCAACGTCTTCGATATGGAATGTTAGACTTTANATATACTAAAACACCTCCACCTCTTTTAATAACCCTGNCCTTACGTTCGATTTGAAAATCGGGTATCTGTACGTTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATCAGTTGAGTTACATTGACTTAGGTGGTATTTGATTTCATCAAGTTTTGGA-----AGTNT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATGTGTAATCCCTTAGTAGTATAATTA----------AACACAAA---TTTG-ATGTATGCAAATGCGCATTTGAAGATGCACTATTATCATGTCCGGT---TATGAAATCAACATA---------------ATCATCAGCATTAGTATTTGGGCTGATGGCTCCATTTTCCACCGTATTATCGTTCTGTATCGGCCTA-TTCAATTTAACAGTATCTGATCCTG-CAGATATATTGACCGGTATGGTTCTTATAGAAGTATT-A-TAGCGTTATTTTGCATATAT-TCATTTAAAGATGATAAACAAGATACTGAACAAGATAACGAATCCCTACATCCACAATTAACAACC
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tGTAAGACCAAACTTCACAA-TAGTGTCATTTCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCAATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGGTTTCTAGATCTTAGTGATCCACTTTATCT-AATATTGATCCA-AAAGACATGATCCATAATTGAATTTCATTTGGTGCTCTATGTAA-TATGAAGTGTAGTAAAAACAGTTTACTATTTGGATATTTCATTTCTATACATATTGATTCTATGTCATCGCAATCTTAATCGCAATGTCTTGGATATGGAATGTTAGACTTTATA-ATACTAAAACACCTCCAC
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gi|16                         :                                                                                                                                AACCAGGTTGGATGTCAAATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGTAAAAAATTAAA-TCGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGA-----TTGGATTATTAATATAATAATTCAATAACATAAAGTGAATAATTGGCTAAGT
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gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCCTT--GAATTTATACTTGTAGTACGGATGTACAGTGTAAAG-CA----GGATAGTGATCGCTAATGTTGTATACAGGCCCTAT-AA---CTGATTTTATATCAGGC----AAATTTG--Ttcg
gi|3                          :                                                                                                                               CAACCAAGTTGGATATCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTT-CATAGGAACATA----TTTAGT-AAGAACAGAA-TTGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAACA--------ATATTTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTGAATTTCTTGATA-CAGCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCGTTTAGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAGAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATATTGGCA------------GATATTAAATCAGGC----ATATTTG--TATA--TA----------T--ATGATCTAAAATTTTAGAACTGGATTTACGTATTCTAGTTGGTGATTTAATCATTTGTGTAAGACAAAATTTCACAA-TAGTGTCAT-CTATCTTTTT-------------CAACATTAGTATCAAATAAACAATTGATAGTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAGGTGATCGACTTTATCT-ATTATTGATTAA-AAAAACATGATCCAGGATTGAATTTCATTTGGCACTCTAT-T-A-T--GAAGTGTAGTAAAAACAGTTTACTATT-GTATATATTATTTCTATAAATATTGATTCTTTGTCATCGCACTCTAAATCGCAATGTCTTCGATATTGAATGTTAGACTTTAAATGTACTCAAACACCTCCTCCTCTTTTAATAACCCTGCCCTTACGTTCGATTTGAAAATTGGGTATCTGTACACTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATCAATTGAGTTA-ATTGACTTTGTTGGTATTTGATTTCATCAAGTTGTGGAACTATAATTT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATTTGTAATCCCTTAGTAGTATGATTA----------AACAC--G---TTTG-ATGTATGTAAATGCACATTTGAAGATGCACTATTATCATGTCCAGT---TATGAAATCAACATA---------------ATCATCAGCATTAGTATTTGGGCTGATGGTTTCATTTTCCACCGTATTATCGTTCTGTATCAGCCTA-TTCCATTTAACAGTATCTGATCCTG-CAGATATATTGACTGGTATGGTTCTTAT-----TCTC-A--AACTTTATATTAGATATTTCTCATTTA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATAGCACTATAAATCGCAATGTCTTCGATAAGGTATGTTAGACTTTATATATACTAAAACACCTTCATCTCTTTTAATAACCCTGACCTTACGTTCGATTTGAAAACCGGGTACCTGTACGTTATTGTCTT----CAATACTTGGTGATAATAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATCAGTTGAGTTACATTGACTTAGGTGGTATTTGATTTCATCAAGTTTTGGA-----AGTAT-ATGCTGTATGTTTATATTAGCAATGTGTAATCCCATAGTAGTATAAATA----------AACAC--A---TTTG-ATGTATGCAAATGCACATTTGAAGATGCACTATTATCATGTCCTGT---TATGAAATCAACATA---------------ATCATCAGCATTAGTATTTGGGCTGACGGTTTCACTTTCCAACGTATTATCGTTCTGTATCGGCCTG-TTCAATTAAACAGTATCTGATCCT----GATATATTGACTGGTATGGTTCTTATAGAAGTATT-ATTAGCGTCATTTTGCATACA--TCATTTAAAGATGATAAACAAGATACTGGACAAGATAACGAATCCCTTCATTCACAATTATCAACCtgtaatactttaatatacaata
gi|5                          :                                                                                                                            atgCAACCAGGTTGGATGACATATTTAACT-CTCTTTTTTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGT-AAGAACCGAA-TTGATTATATAATGTAATAGAGTTAGAGATTGGGTTGGATTATCAGTAT----ATTCAATAACATCAAGTGAATAATTGGCTAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCACTGAATTTCTTGAAA-CATCTGTTCTTAATTGTGTCATGGCAAAT-CCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATACGGGCGCTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTG--TATA--TA----------T--ATGATCTATAATATTAGAACTAGATTTACACATTCTAGATGGCGATTTGATCATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAAATAGTGTTATTCCAGCTTTTTATACTATAGTTTTCAACATTAGTATCCGATAAACAGTTGATATTGAAATTCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATTGACTTTATTG-AATATTAATTCA-AAAGACACGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTCTAT-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACAGTTTACTATTTGGAGATTTTATTTCTATACATATTGATTCTATGTCATCACACTCTAAATCGCAACATCTTCGATATGGAATGTTAAACTTTATATGTACTAAAACACCTCCACCTCTTTTAATAACCCTGACCTTACGTTCGATTTGAAAATCGGGTATCTGTACGTTATTGTCTT----CAATACTTGGCGATAAAAATGTTTCAACAATTCCCAAGATATC--TTGATTTTCAttgcatgtgttttgacattcagtactatgtgtgatctgtttttcattaattagcaaactttttgttagatgaataagtacttacattatttaatttgacatactcactttgattcataaattgacccacattcttttgtaaacttgtatctaaggttgattcaaagtcattgtctttgcacgtacattctacactataacaattaaagcagatatagtttaaaatgtcatctgttactacatatcagggaatgtgagtgtttgtcgtcacttccctaccaacgtcttggtagtctacaatctgcaattgtatggttatagtgaccacaattctcacagtacaactgtcttccgaatccagctcgactgttccagtcgacgtggttttgtcttatagggtgttttatgtgcagatcacttccagtttgctctccatcagtcagtgtgaaatcgtggcagccactttgcattggattatct
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CACA---TTTG-ATGTATGCAAATGCACATTTGAAGATGCACCATTATCAAGTCCGGTAACTATTAAGTCAACATA---------------ATCATCAGCATTAATATTTGTACTGATGGTTCCATTTTCCACCGTATTATCATTATGTATCAGCCTA-TTCAATTTATAAGTATCTGAGCCTG-CAGATATATCGACTGGTATGGTTATTATCGAAGTATT-A--AACGTTATTTTGCATATAT-TCATTTGAAGATGATAAACAAGATTCCCAACAAgatgggatcaatatttagcttgctatgggtatatagattatttgtggtagaatggtga
gi|7                          :                                                                                                                                AACCAAGTTGGGTGTCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATGTATGCTTAGT-AAGAAACAAA-TTGATTATAGAATATAACAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----ATTCAATAAT---------ATAGTT-------TCACTGAA----------TTTC-TTGAA---------A-CATCTGTACTTAATTGTGTCATGGCAATTTCCTTTCGCTATTATACT------ACCCATGCACCGTGTAAAA-T-AACAGGATAGTGATTGCTAATGCTGTATAAGGGCAATAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTG--TATA--TA----------T--ATGATCTATAATATTAGAGCTGGATTTGGATATTCTAGTTGGTGATTTAATTATTTGTGTAAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATATTTTTCAACATTAGTATCCAATAAACATTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTAAGTGATCGACTTTATCT-AATATTGATTCA-AAAGACAC-ATTCATGATTGAATTTCTTTTGGCGCTCTA--T-A-TATGAAGTGTAGT--ATACGGTTTACTATTTGGATATTTTATTCCTATACATATTGATTCTATGTCATCGCACTCTTAATCGCACTGTCTTCGATACGGAATATCAGACTTTAAATATGCTAAAACACCTCCACCttatcaacttcgcgtatgttttgacattcagtctatttgtgatctgtttttcgttaattagcaacattatatcagatgaattagtacttatattatctaatttgacatactcactttgatttgtaattgacctacattcctttgtaaacatgtatttaaggttgatttaaatttgttgtctgtacatgtacactatacacttttacaagtatagcaaaatagttaaaatatgcgatatctgtaactatatataagtgaaggggtgagtgttggttgttgttcccctgctggcgtcttgatagactacaatttgcaatcatatggttatagtgtccacagttctcacagtacgtctgtcttccaaatctagcttgactgccagccgacatggttttgtctcatagggtgtgttaagtttagcgcgataattgtttccgttgtgagttgcatc
gi|8                          :                                                                                                                                AACCAGGTTGGGTGTCATATCTAACT-CT-----TTTTTCATTCATAGGTGCATG----CTTAGT-AAGAACTGAA-TCGATTATAGAATTTAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATGT----ATTCAATAACATCAAGTG--------GCGAAGTCATTCAAAAAT--ATAGTTTCATTGCAATTCTTGAAG-CATCAGTACTTAATTGTGTCATGACAATTTCCTTTCAATTTTATACT------ACCCATGCGCTGTGTTAAA-CAAACAGGATAGTGATTTCTAATGCTGTATATGGGCACTAT-AACC--------------AGGC----ATATTTG--TATA--TA----------T--GTGATCTATAATAGTAGAACTGGATTTACATATTCTAGTTTGTGGTTTAATCATTTGTGTAGGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAACGTAAGTATCCAGTAAACAGTTGTTATTGAAATCCCCAAACATACAGATTTCCAGATCTAAGTGATCA-------CT-AATATTGATTCA-AAAGACACGATCCATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTA--T-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACGGTTTACTATTTGGATATTTTATTTCTATACATATTGATTATATGTCATCGCATTCTAAATTGCAACGTCTTCGATATGGAATGTTATACT
gi|9                          :                                                                                                                                AACCAGGTTGTGTGTCATATTTAACT-CT-----TTTTTCTTTCATAGGAGCATG----CTTAGT-AAGAACCGAA-TTGATTATAGAATATAATAGAGTTAGAGATTGGTTTGGATTATCAATAT----AGTCAATAACATCAAGTGAATAATTGGCTAAGTCATCCAAAAATGTATAGATTCACTGAATTTCTTGAAA-CATCTGTACTTAATTGTGTCACGGCAATTTCCTTTCGATTTTATACT------ACCCATGCGCCGTGTAAAA-CAAACAGGATAGTGATCGCTAATGCTGTATACAGGTACTAT-AACCTCTGATATTAAATCAGGC----ATATTTG--TATATATA----------T--ATGATCTATAATATTTGAACTTGATTTACATATTTTAGTTGGTGATTTAATCATATGTGTGAGACCAAATTTCACAA-TAGTGTCATTCCATCTTTTTATACTATAGTTTTCAATATTAGTATTCAATAAACAGTTGATATTGAAATCCCCAAGCATATAGATTTCTAGATCTTAGTGATCGATTTTATCTAAATATGGATTCA-AAAGACATGATCAATGATTGAATTTCATTTGGCGCTCTA--T-A-TATGAAGTGTAGTAAAAACGGTTTACAATTTGGATATTTTATTTCTATACATGTTAATTCTATG
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): ACATCTTGGTGGTATACAATCTACAGTTGTATGGTTATAGTGGCAACAGTTCTCGTAGTACATCTGTCTTCCAAATCCAGTGTTACTGTTCTAGCCCACGTGATTTCGTCTCATAGAGTGTATTAAGTGCAGATTACTTCCGGTTTTGCGCTTCATCTGTCGGTGCAAAATTGTGGCAGCTGCTTTGCATTGGACTGTCT
Unaligned ( gi|18 ): GTTTGCTGTCCATCGGTCTGTGTGAAATCGTGGCAGCCACTTTGCATTGGATTATTTATGTGATGTCACTTTCAGTTTACTGTACATTTCTCTGAGGGAAATTTAGTTATCTTCACAGCATAGTATCA