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gi|11 : TTGAATCTATTTGAAGAC--TTTCACATT-----TGGAAGTACTCATATAAAATCAAAGTATGGATGTTCTCATTA----------TCATTTTATTGCCAATTTCTATTGAAATGTCCTTGAACATTCTTTAAGACCCTAAGAGATATAA-TT-TTTTTCGTAATAATACAGATCAGTGATATTAAATTTGTCTTAATTTGT---CTATCTTTCA-TGAAAATATGCCCAAAATCAACTCCTCTTTCCCTTGGGTGTGGAAGTACTCCTACAATTTTTAAAAACTTTT------------------AGTATGCTTGGTGCATAA-----AA-------T------TGAAT---ACAGCCATTGCGTAGTTTACTGTTGGGC-GGTGCGGTGCTCTT--TATCCTGTGTTGATTGCTATAATATTAAAA-------AAGACATTTCTTGTCTGA--AGTGACGGTGTTT------------GCTCATTTGTGTACATTTTTG-ATGACGTTGCAAA----G-----TTTCCTGACCG
gi|12 : TCG---------ATGTCACCTTAGTGACAGTTTTAATAGTGAGTGGAAAAGTGATAAAACCTCAATGATATCCATTTCATTT-------AAACAACAAATGTAGAAACTCGAACGACCAACAGATCCCATATATTCGGTGTAGCCTTATTAAGATACCATATCTACT----AAGGCTAACTGTGTGAGGCATGTTACAAT--CACACAGCCA-ACATTTTTAGGT---CGTACTC------GA----------ACGGCGTGTG-GTAC----CTGACAAAGTATGTTGTTACTTA---TGTT------GTCACCC------------A------G------TAAGCC-------GAACTTATTGGAAGCGTCGATATGGAACTGATAAATAACAAA
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gi|14 : cacgatGTACTC------GA----------ATGGCGTGTT-GTAC----CTGACACTGTATGTTATTACTTA---TGTT------CTCACCC------------A------T------TTAGCT-------GAACTTATTGGAAGCGTCGATATGGAACTGATAAATTACAAACATAATTCCCTTCGACA-----CTATTTGTCATTTAGCTGCATGC-TTTTGCATCACTTTGAAGACGCCTACACacaaa
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gi|17 : TTTCCCTGCATGGGCTCTGCTTCATTCTTGAAAACTCCCATGAAATAAACAAAACGTCCGCCAAAGATTCTCCAACAAAGTTTTCAAGTTCACTTT
gi|18 : -------GAACATTTTGGAAGCGTCGATATGGAACTGATGAATgtcat
gi|19 : GCGGTGTTTT-GGTTTGGTCAGCTTATTTGTGTACAATTTTG-ATGACGTTtatcgatagccaagtgtatcgtattgcggctaactgggtg
gi|2 : TGGTCTTCTTCCACCATCAACATTAAAATAATCAAACTAACGAAGGACTGTTGTATTATGAAGTTAATTTTTGATTTAATTGGAGAATGTTTGCTTTAATTGATTTAACCCTGTATGAGCTCTGCTTCATTCTTGAAAACTCCCATGAAATAAACAAAACATCCGCCAAAGATTCTCCAACCAGGTTTCCAA-TTGATTTTTGTTTTATGTAAATAGCGCATTCGTGTAGTATTCTGACATTGATACCACCGTACAACATCGATCCATAAAAGGAAGCAATGGTGTATGTTGTGAATATCTCTGTATATGCTGAAAAA-ATGCAATTAAAGCTTAATCAAGTCGTTTTTCTTCAGAC-ATCTTTGCATAACGCATG------ATATAAGGCGGGACATTTCTTTGGTTGTATCAGATAGGCCATTACGCGTGTCTGTGTTTGT--GTTTCAGTTGTTTCTTCATTTTGTCCATGCTTTAATGGATTTCAGAGATTCACTGGGTCAGTTAATATTCAGTTATAACGGTTTTATCATTTGAACTTTGTGTATTACTAATTAGTATTTTCTGTAAATGGTAGTTCCCGTGTAGTGCAC-ACAATAAC--CCAAAGTATTTCACATAAATTGACAGTGGCATGTTTCTTTTGAATTTGACTTCAGATTTATTATTAGTTTTACGTTCAGTGTTTCCGCTTTCCACTTTGTTCCAGCTT-AAAA-GGTGTCAAAGTCAGAAACTTCAGATTTCTATCCATTTTCGCTAT--------GTAAAATTTTCATAGGA-TTGGGGCATATATCAACAGAATTGACTGAAACTTCAATTTGTCCAATTTCATTTGATTCATTTCTGGCAAATAAAGAGCGTACAAAATTATGTTTAAATTGTTTTGATAATGGAAAAGCTCTGTATTAAGTTGATTTA----AATGTTGA--AGG---------CAA------------------TTTTT-TTCTTTTCTGGCTTTTTAGGAGTAAATGTGGTATTT-ACTTTAAAAATATTGTGTTTAGCCATTTTGTCAGTGCAGCATACTGATATTTCAATTTTTGAAGACTTTGCCTTTCTGTCTATGGAGGTTGCGGTTAGATATCAGT-TTTCTCATTGTCAACAGACTGAAACACATAAACAATTGACATAGGTTTATAATGAAAAACTCAAATATACACTAAACAGAAAATTTTTCTCTCAA-TCAGTAAACCATTAATTTTGTAGTTTCTATT-TTCTAAG--ATGTTCCCAAAAAAGTAACTGTTTTTTTTAATGTTCC-CTTTTAGTATTTTCTCAAACAAGGGCAGTAAAATTGGAGATTGGCTTATTAACATCCCCCCCAA-AAAACAGTAACATGGCATAAG--------ATTAGAGCAGCCATCCAATATACAAGGTCAACATTTTT--ATTGATCTC------------------------AATTAAC-AAGCGATTAACAGAAACTATG--------------------TCTGTCTTCAAA--G-GTTAGGCTATCTATTCCAATAGCATGCATTGTATACATGTATATTGCAGTGAAATTTTGGACAAAAATA-AAATGCTTATTT-TAGATTCACCAAGGAATTAATTACATGTATTTAATGTTGAATATCTACAGAACTCTTGCAATATCCTTTTAATAGTTATGCTTCTGATGGATTTTCCATGCATCGCCTATTTTTTG-AACTTCTTTTCATTATGTTTATTTAATCAAGT-TC--G--A--TAT--GTTAAAAGA----TAAGAAAAATTCCAAGTTAACTAGGAATACTATGGCATTTCACC-TTGAAATTAACAATTAGTCTGTGTTTTG---------ATGTCACCTTCATGACAGTTTTAATAGTGAGT-GAGAGGTGATAAAACCTCAATGATGTCCATTTCATTT-------CAACAACGAATGTAGAAACTTGAATGACCAACAGATCCCATATATTCGGTGTAGCCTTATTTAGATACCATATCTTCT----AAGGCTAACTGCGTGGGGCATGTTACAAC--CACACAGTCA-AAATATTTGGGT---CGTACTT------GA----------ATGGCGTATG-GCAC----CTGAAAAAGTATGTTGTTACTTA---TGTT------GTCACCC------------A------G------ATAGCC-------AATCCTATTGGAAG-------------CTGATAAATTGCAAACAGAATGCCCTTCGACA-----GTATATGTCATTAAGTTGCATGCTTTTTGCACCTCTTTGAAGACACCGACACATTCGATGTGGAAGTACTCATATAAAATCAGACTGTGGAAGTTCTCATTA----------TTATTTCATTCTCTGTTTCTATTGAAATGTCATTGGACATTCTTTAAGACACGAAAATATATCA-CT-TTTT-CATAATGATACAAGGCACTGATATTAGATTTTTCGTTATTTGT---CTTTATTTCA-TGAAAATATGCCCAAATTCTATTTCTCTTTCACTTGGGTGTTGAAGTACTCCTACAAATTTTTAAAACTTTT-TCCGTTTTCAGGAAAAAAGTAAGACAGGTGCATAA-----AA-------T------C---T---ACCACCGTTA---AGTTAACTGTTGGGCTGGTTTGGTGCATTT--TATCCCGCGTAGATTGTTATAATAATAAAAGAGAAACAAGACATTTCTTACCTGA--AGCGGTGGTGTTTTTAGTGTGGCCAGCTCATTTGTGTACATTTTTG-ATGATGTTACAAAGTTTG-----TTTCCTGACCGtgtcggttttcgaaatacct
gi|20 : CAGCTCATTTGTGTACAATTTTG-ATGACGTTGCAAAGTGTG-----TTTTCCGACCG
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gi|3 : TGGTCTTCTTTCACCATCAACATTAAACTGATCGAACTAACAAAGGACTGTTAGATAATGAACTTAACTTTTGATTCAATTGGAGAATATTTGCTTTAAGTGATTTTTCCCTGCATGAGATCTGCTTCACTCTTGAAAACTCCCATGAAATAAACAAAACGTCTGCCAAAA----------CAAGTTTCCAA-TTGATTTTTGTTTTATGTAAATAGCGCATTTGTGTAGTATTCTGACATTGATACCACCGTACAACATCAATCTGTAAAAGGAAGCAATGGTGGCTGTTGGCAATATCCCTGTTTATGCTG-AAAAAATGCAATTTACACTTCATCAAGTCGGTTTTCTTCAGACAATCTTTGTATATCGCATG------ATACTAGGCGTGACATTTCTTTGGTTGTATCAGATAGGCCGTTAAGCGTTTCTGTGTTT-TCAGTTTCAGTTGTTTATTCATTTTGTCCATGCTTTAATAGATTTCTGAGATTCACTGGGTCAGTTAATATTCAGTTATAACGGTTTTATCATTTGAACTTCGTGT-------ATGAGTATTTTCTGTAAATGGTAGTCCCCGTGTAGTGCACAATAATAAT--TCAAAGTATTCCACATTAACTGACAGTGG--------------------ATTCAGATTTATCATTAGTTTTACGTTCAATG--TCCGCCTTCTACTTCATTCCAGCTCAAAAA-GGTG---AAGTCAGAAACTTCAGATTCCTGTCCAGTTTCGCTGTGTATCTTAGTAAAATTCTCATAGAA-TTGGGGCATGTGTCAACAGAATTAACTGAAACTTCATTTGGTCCAATTTCATTCGAGTTGTTTCTGGCAAATAAAGAGTGTACAAAATTCTGTTCAAATTGTTTTGATAATTGAAAAGCTTGGTATAAAGTTGATCCA----AATGTTGA--TGG---------CGATTTAAACGGGGA-------TTTT-TTCTTTTCTGGCTTTTGAGGAGTAAATGTGATTTTTAACTATAAAAATGTTGCGTATAGCCATTTTGTCAGGGCAGCATATTGATGTTTCAATTTTTGAAGACTTTGCCGTTTTATCTATGGAGGTTGAGGTTAGATATCAGC-ATTCTCATTGTCTACAAACTGAAACACATAAATAATTGGAATAAGTTTAtcgtagtacagtgtacaatgaagactcgtctgggtgctggaactcaggccgaagagtgcttctcttttttctttttgatggtatttactaaatgtatgaagattgagatttgatggagatttataagaacattgatgtatcaatacgtctatctcgtgttttttcatttggagattacattgccgatcatgaagagatgatccattttcaaatcccaataagtcaacatcgccgaagcttttcgttagtccttgctttatcattttaccaccataagtcaaacaggctgtccgatgattgatattcttacttttgctttcaagtatatctaaatatatccctggtcttctttcaccatcaacattaaactgatcgaactaacaaaggactgttagataatgaacttaacttttgattcaattggagaatatttgctttaagtgatttttccctgcatgagatctgcttcactcttgaaaactcccatgaaataaacaaaacgtctgccaaaacaagtttccaattgatttttgttttatgtaaatagcgcatttgtgtagtattctgacattgataccaccgtacaacatcaatctgtaaaaggaagcaatggtggctgttggcaatatccctgtttatgctgaaaaaatgcaatttacacttcatcaagtcggttttcttcagacaatctttgtatatcgcatgatactaggcgtgacatttctttggttgtatcagataggccgttaagcgtttctgtgttttcagtttcagttgtttattcattttgtccatgctttaatagatttctgagattcactgggtcagttaatattcagttataacggttttatcatttgaacttcgtgtatgagtattttctgtaaatggtagtccccgtgtagtgcacaataataattcaaagtattccacattaactgacagtggattcagatttatcattagttttacgttcaatgtccgccttctacttcattccagctcaaaaaggtgaagtcagaaacttcagattcctgtccagtttcgctgtgtatcttagtaaaattctcatagaattggggcatgtgtcaacagaattaactgaaacttcatttggtccaatttcattcgagttgtttctggcaaataaagagtgtacaaaattctgttcaaattgttttgataattgaaaagcttggtataaagttgatccaaatgttgatggcgatttaaacggggattttttcttttctggcttttgaggagtaaatgtgatttttaactataaaaatgttgcgtatagccattttgtcagggcagcatattgatgtttcaatttttgaagactttgccgttttatctatggaggttgaggttagatatcagcattctcattgtctacaaactgaaacacataaataattggaataagtttaaa
gi|4 : gaaacaaactttgcaacgtcatcaaaaatgtacacaaatgagctgaccacaccaaaaacatcgccgcttcaggtaagaaatgtcttgtaacttttttattattataacccgcccaacagtaaacataacaacagtagtgttagatgttgtgcacctagcagacttttttctcgaaaatggaaacagtttttaaaaattgtaggagttattccacacccaagtgaaagagatgtagattttgtgcgtatttcatgaaataaagacaaatttaatatcagcaacctgtattattataaaaaaaatgatatattttcatgtcttaaagaatgtccgatgatatttcagtagaaacggagaatgaaatgatgagaacatccacactctaattttatatgagtacttccacacccaatgtgttggtgtcttcaaagagatgcaaaaagcatgcagctaaatgacatatacgtatatgtcgaagggcattctgtttactatttaacagttccatatcgacgcttccaaaatgttctatcgatagcgaagtatatcgtattatggctaactgggagacaacataagtaacaacatactttgtcaggtacctctcgcagtttgagtatgtcgtagtacagtgtacaatgaagactcgtctgggtgctggaactcaggccgaagagtgcttctcttttttctttttgatggtatttactaaatgtatgaagattgagatttgatggagatttataagaacattgatgtatcaatacgtctatctcgtgttttttcatttggagattacattgccgatcatgaagagatgatccattttcaaatcccaataagtcaacatcgccgaagcttttcgttagtccttgctttatcattttaccaccataagtcaaacaggctgtccgatgattgatattcttacttttgctttcaagtatatctaaatatatcccTGGATAATGAA---AACGTTTGATTTAATTGGAGAATGTTTGCTTTAAGTGACTTTTTCC-ACATGAGCTCTGCTTCATTCTTAAACATTCCCATGAAATAAACAAAACGTCCGACATGGATTCTCCAACCAAGTTTCCAA-TTGATTTTTGTTATATGTAAATAGTGCATTCGTGTAGTATTCTGATATTGATACCACTGTACAACATCGATCCGTAAAAGGAAGCAATGGTGGCTGTTGGGAATATCCCTGTAAATGCTG-AAAA-ATGCAATTAAAGCTTCA---AGTCGGTTTTCTTCAGACAATCTTTGCATAACGCATG------ATACTAGCCGTGACATTATTTTAGTTGTATCAGATTGGCCATTACGCGTTTCTGTGTTT-TCAGTTTCATTTGTTTCTTCATTTTGTCCATGCTTAAATGGATTTCTGAGATTCACCAGGTCAGTTAATATTCAGTTATAGCGGTATTATCATTTGAACTTTGTGA-------ATTAGTATTTTCTGTAAATGGTAATTCCCGTGTAGTGCACAATAATAAC--TTAAAGTATTTCACATAAACTGACAGTGGCGTGTTTCTTTTGAATTCGAATTCAGATTTATCATTTGTTTTACGTTCAGTGTTTCCGCCTTCTACTTCGTTCCAGCTCAAAAA-GGTG---TAGTCAGAATTTTCAGATTCCTGTCTAGTTTCGCTGTGTATCTTAGTAAAATTCTCAAAGGA-TTGGGGCATATGTCAACAGAATTGTTTGAAATTTCATTTGGTCCAATTTCATTCGAGTCCATTCTGGCAAATAAAGAGCGTACAAAATTCTGTTTAAATTGTTTTGATCATGGAAACGCTCGGTATAAAGTTGATCCA----AA--TTGAGTTGG---------CGATTTA------AACGGGGATTCTT-CTC-TTTCTGGCTTTTTAGAAGTAAATATGATTTTT-ACTATAAAAATGTTGTGTAAAGCCATTTTGTCAGGGCAGCATACTGATATTTCAATTTTTGAAGACTTTGCCTTTTTGTCTGTGGAGGTTGAGGTTGGATATCAGCTTTTCTCATTGTCAACAAACTAAAACACATAAACCATTGGAATATGTTTATAATGAAAAACTGAAATATACACTAAACAGAAATAATTTCTCTCAA-TCATTAAATCATTAATTTTGCAGTTTCTA-T-TT-CAAG--ATGTTCCCAAAATAGTAACCGTCTTATTTAATGTTCC-CTTTTAGTATTTCATTAAACAAGGGCAGTAAAATTTCAGATTCGCTTATTAACAT-T--CCCAACAAAACAGTAAAAGGGCATAAA--------ATTAGAGCAGCGATCAATTATACAAGGTCAACATT------TTAATCTC------------------------AATTAACAAAGGGATAAACAGAAACTATG--------------------TCCGTCTTCAAA--G-GTTAGGCTATCCATTCCAATAGTGTACATTGTATACACGTATATTGCATTGAAATTTTGGACAAAAAAATAAATGCTTATTT-TAGATTCACCAAGGAGTT-ATTACATGTATTTAATGTCGAATATCTACAGAACTCTTGCAATATCCTTTTGATAGTTGTGCTTCTGATAGATTTTCCATGCATCGCCCATTTTCGG-AACTTCTTTTCATTATGTTTATTTATTCGAGT-TCGAG--A--TAT--GCTGAAAGA----TTAAATAAACTCCAATTTATCTAAGAATGAaa
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Reference ( family-26 ) : TGGTCTTCTTTCACCATCAACATTAAAATGATCGAACTAACGAAGGACTGTTGGATAATGAAGTTAACTTTTGATTTAATTGGAGAATGTTTGCTTTAAGTGACTTTTCCCTGCATGAGCTCTGCTTCATTCTTGAAAACTCCCATGAAATAAACAAAACGTCCGCCAAAGATTCTCCAACCAAGTTTCCAA-TTGATTTTTGTTTTATGTAAATAGCGCATTCGTGTAGTATTCTGATATTGATACCACCGTACAACATCGATCCGTAAAAGGAAGCAATGGTGGCTGTTGGGAATATCCCTGTATATGCTG-AAAA-ATGCAATTAAAGCTTCATCAAGTCGGTTTTCTTCAGACAATCTTTGCATAACGCATG------ATACTAGGCGTGACATTTCTTTGGTTGTATCAGATAGGCCGTTACGCGTTTCTGTGTTT-TCAGTTTCAGTTGTTTCTTCATTTTGTCCATGCTTTAATGGATTTCTGAGATTCACTGGGTCAGTTAATATTCAGTTATAACGGTTTTATCATTTGAACTTCGTGT-------ATTAGTATTTTCTGTAAATGGTAGTTCCCGTGTAGTGCACAATAATAAC--TCAAAGTATTTCACATNAACTGACAGTGGCGTGTTTCTTTTGAATTCGAATTCAGATTTATCATTAGTTTTACGTTCAGTGTTTCCGCCTTCTACTTCGTTCCAGCTCAAAAA-GGTG---AAGTCAGAAACTTCAGATTCCTGTCCAGTTTCGCTGTGTATCTTAGTAAAATTCTCATAGGA-TTGGGGCATATGTCAACAGAATTGACTGAAACTTCATTTGGTCCAATTTCATTCGAGTCGTTTCTGGCAAATAAAGAGCGTACAAAATTCTGTTTAAATTGTTTTGATAATGGAAAAGCTCGGTATAAAGTTGATCCA----AATGTTGA--TGGCGATTTAAACGGGGATTTTTTTTCTTTTCTGGCTTTTTAGGAGTAAATGTGATTTTT-ACTATAAAAATGTTGTGTATAGCCATTTTGTCAGGGCAGCATACTGATATTTCAATTTTTGAAGACTTTGCCTTTTTGTCTATGGAGGTTGAGGTTAGATATCAGC-TTTCTCATTGTCAACAAACTGAAACACATAAACAATTGGAATANGTTTATAATGAAAAACTGAAATATACACTAAACAGAAATAATTTCTCTCAA-TCAGTAAACCATTAATTTTGCAGTTTCTA-T-TTCCAAGAT--GTTCCCAAAATAGTAACCGTTTTTTTTAATGTTCC-CTTTTAGTATTTCCTAAAACAAGGGCAGTAAAATTTGAGATTCGCTTATTAACAT-TCCCCCAA-AAAACAGTAACAGGGCATAAA--------ATTAGAGCAGCGATCCAATATACAAGGTCAACATTTTT--ATTGATCTC------------------------AATTAAC-AAGGGATTAACAGAAACTATG--------------------TCTGTCTTCAAA--G-GTTAGGCTATCCATTCCAATAGCGTACATTGTATACACGTATATTGCACTGAAATTTTGGACAAAAATA-AAATGCTTATTT-TAGATTCACCAAGGAATT-ATTACATGTATTAAATGTCGAATATCTACAGAACTCTTGCAATATCCTTTTAATAGTTGTGCTTCTGATGGATTTTCCATGCATCGCCTATTTTCGG-AA-TTCTTTTCATTATGTTTATTTATTCAAGT-TC--G--A--TAT--GCTAAAAGA----TTAGAAAAACTCCAAGTTATCTAAGAATAATAGGGCATTACA-C-TTGAAAATAACAATTATTCTGTGTTTTG---------ATGTCACCTTCGTGACAGTTTTAATAGTGAGCGGAGAGGTGATAAAACCTCAATGATGTCCATTTCATTT-------CAACAACGAATGTAGAAACTCGAACGACCAACAGATCCCATATATTCGGTGTAGCCTTATTTAGATACCATATCTACT----AAGGCTAACTGCGTGAGGCATGTTACAAC--CA-CACAGTCA-ANATTTTTGGGT---CGTACTC------GA----------ACGGCGTGTG-GTAC----CTGACAAAGTATGTTGTTACTTA---TGTT------GTCACCC------------A------G------TTAGCC-------GAACNTATTGGAAGCGTCGATATGGAACTGATAAATTGCAAACAGAATGCCCTTCGACA-----GTATATGTCATTTAGCTGCATGCTTTTTGCATCTCTTTGAAGACACCCACACATTGGGTGTGGAAGTACTCATATAAAATCAGAGTGTGGAAGTTCTCATTA----------TCATTTCATTCTCCGTTTCTACTGAAATATCATCGGACGTTCTTTAAGACACGAAAATATATCA-CT-TTTT-CATAATGATACAGGNCACTGATATTAGATTTTTCTTTATTTGT---CTTTATTTCA-TGAAAATACGCCCAAANTCTACTTCTCTTTCACTTGGGTGTGGAAGTACTCCTACAAATTTTTAAAAC-TTTTTCCGTTTTCGGGAAAAAAGTNTGCTAGGTGCATAAA-------ATCTAA-ACTACCGCCGTTA---AGTTAACTGTTGGGCGGGTACGGTGCTCTT--TATCCCGTGTCGATTGTTATAATAATAAAAAAGTNACAAGACATTTCTTACCTGA--AGCGGCGGTGTTTTTGGTGTGGTCAGCTCATTTGTGTACATTTTTG-ATGACGTTGCAAAGTTTG-----TTTCCCGACCG
gi|1 : ---CGTACTC------AA----------ACTGCGAGAG-GTAC----CTGACAAAGTATGTTGTTACTTA---TGTTGTCCCAGTTAGCCGTAATACGATATA------C------TTTGCTATCGAAAGAACATTTTGGAAGTGTCAATATGGAACTGATAAATTGCAAACAGAATGCCCTTCGACA-----GTAT--GTCATTTAGCTGCATGCTTTTTGCA--------------CCCACACATTGG-TGTTGAAGTACTCATATAAAATCAGAGTGTGGACGTTCTCATTA----------TCAATTCATTCTCCGTTTCTACTGAAATATCATCGGATGTTCTTTAACACACAAAAATGTATAA-TT-TGAT-CATAATAATACAGGTCGCTGATATTAAATCTGTCTTTATTTTT---CTTTATTTCA-TG-AAATACGCACAAAATCTACTTCTCTTTCGCTTGGGTGTGTAAGTACTCCTACAAATTTTTAAAACTTTTTTCCGTTTTCGAGAAAAAAGTGTGCCAGGTGCAAAAC-------ATCTAACACTACCGTTGTTA---A------TGTTGGGCGGGTACGGTGCTCTT--TATCCCGTGACGATTGTTATACTATTAAAAAAGTTACAAGACATTTCTTACCTGA--AGCGGCGATGTTTTTGGTGTGGTCAGTTCATTTGTGTACATTTTTT-ATGACGTTGCAAAACTTG-----TTTCCC
gi|1 : cggtggTGGTGTTCTTTCACCATCAACATAAAAATGATCGAACTAACGAAGGACTGTTGGATAATGAAGTTTACTTTTGATTTAATTGGAGAATGTTTGCTTTAAGTGACTATTCCCTGCATGACCTCTGCTTCATTTTTGAAAACTCCCATGAAATAAACAAAACGTCCGCCAAAGATCATCCAACCAAGTTCCCAG-TTGATTTTAGCTTTATGTAAATAGCGCATTCGTGTAGCATTCTGATATTGATACCAGCGTACAACATCGATTCGTAAAAGGAAGCAATGGTGGCTGTTGGGAATATCCCTGTATATGCTG-AAAA-ATGCAATTAAAGCTTAATCAAGTCGGGTTTCTTCCGACAATCTTTGCATAACGCATG------ATACTAGGCGTGACATTTCTTTAGTTGTATCAGACTGGCCGTTACGCGTTTCAGTGTTT-TGAGTTTCAATTGTTTCTTCATTTTGTCCATGCTTTAGTGGATTTCTGAGATTCACTGGGTCTGTTAATCATCAGTTATAACGGTTTAATCATTT-------GTGT-------ATTAGTATTTTCTGTAAATGGTAGTTCCCGTGCAGTGCACAATAATAATAATAAAAGTATTTCACATTAACTGACAGTAGCATTTATTTTTTTAATTCGAATTCAGATTTATCATTAGTTTTACGTTCAGTGTTTTCGCCTTCTACTTCGACCCAGTTCAAAAA-GGTG---AAGTCAGAAACTTCAGACTCCTGTCCAGTTTCGCTGTGTATCTTAGTAAAATTCTCATAGGATTTGGGGCATATGTTAACAGAATTGACTGAAACTTCATTTGATCCAGATTCATTCAAGTCGTTTCTGGCAAATAAAGAGCATACAAAATTCTGTTTAAATTGTTTTGATAATGGAAAATCTCGGTATAAAGTTGATCCA----AATGTTGA--TGGCGATTTAAACGGGGATTTTTTTTCTTTTTTGGCTTTTTAGAAGTAAATGTGATTTTT-ACTAT-AAAATGTTGTGTAAAGCCATTTTGTCAGGGCAGCATACTGATATTTCAATTTTTGAAGACTTTACCTTTTTGTCTACGGAGGTTGAGGTTAGATATCAGC-TTTCTCATTGTCAACAAACTGAAACACATAAACAATTGGAATATGTTTATAATG-AAAACTGAAATATACGCTGAACAGAAATAATTTCTCTCAA-TCAGTAAACCATTAATTTTGCAGTTTCTA-T-TT-CAAGGT--GTTCCCATAATAGTAACCG--TTTTTTAATGTTCC-ATTTTAGTATTTCCTAAAACAAGGGCATTAAAATTTGAGATTCGCTTATTGACAT-T-CCCAAA-AAAACTGTAACAGGACATA----------------------ATCAAATATACAAGGTCAACATTTTT--ATTGATCTC------------------------AATTAAC-AAGGGATTAATAGAAACTATA--------------------TCTATCTTCAAA--G-GTTAGGCTATCCATTCCAATAGCGTACATTGTATACACGTATATTGCACTGAAATTTTGGACAAAAATA-AAATGTTTATCT-TAGATTCACCAAGGAATT-GTTACATGTATTAAATATCGAATATCTACAGAA-------------CTTTTAATAGTTGTGCTTCTGGTTGATTTTTCATGCATCGCTCCTTTTTGGAAA-TTCTTTTCGTTATGTTTATTTATTCAAGT-TC--G--A--Tttgtagtgcggtgtacaatgacgactcgtctgggtgatggaacccaggccgaagagtgcttctctcttcttgatatattttactaaatgtataaagattgagatttgatgaacatttataagaacattgattatcaatacgtcatctcgtgttgttgtttttcatttggagattacaatgccaattctgaagcgatgatccattttcaaattccaccaagtcaacatcgcctgagtcaacatttcgttagtccttgctttatcatttacctccgtaggtcaaacaggctgtctgatgattgatattcttacttttgctttccagtatacctaaatatatccctggtgttctttcaccatcaacataaaaatgatcgaactaacgaaggactgttggataatgaagtttacttttgatttaattggagaatgtttgctttaagtgactattccctgcatgacctctgcttcatttttgaaaactcccatgaaataaacaaaacgtccgccaaagatcatccaaccaagttcccagttgattttagctttatgtaaatagcgcattcgtgtagcattctgatattgataccagcgtacaacatcgattcgtaaaaggaagcaatggtggctgttgggaatatccctgtatatgctgaaaaatgcaattaaagcttaatcaagtcgggtttcttccgacaatctttgcataacgcatgatactaggcgtgacatttctttagttgtatcagactggccgttacgcgtttcagtgttttgagtttcaattgtttcttcattttgtccatgctttagtggatttctgagattcactgggtctgttaatcatcagttataacggtttaatcatttgtgtattagtattttctgtaaatggtagttcccgtgcagtgcacaataataataataaaagtatttcacattaactgacagtagcatttatttttttaattcgaattcagatttatcattagttttacgttcagtgttttcgccttctacttcgacccagttcaaaaaggtgaagtcagaaacttcagactcctgtccagtttcgctgtgtatcttagtaaaattctcataggatttggggcatatgttaacagaattgactgaaacttcatttgatccagattcattcaagtcgtttctggcaaataaagagcatacaaaattctgtttaaattgttttgataatggaaaatctcggtataaagttgatccaaatgttgatggcgatttaaacggggattttttttcttttttggctttttagaagtaaatgtgatttttactataaaatgttgtgtaaagccattttgtcagggcagcatactgatatttcaatttttgaagactttacctttttgtctacggaggttgaggttagatatcagctttctcattgtcaacaaactgaaacacataaacaattggaatatgtttataatgaaaactgaaatatacgctgaacagaaataatttctctcaatcagtaaaccattaattttgcagtttctatttcaaggtgttcccataatagtaaccgttttttaatgttccattttagtatttcctaaaacaagggcattaaaatttgagattcgcttattgacattcccaaaaaaactgtaacaggacataatcaaatatacaaggtcaacatttttattgatctcaattaacaagggattaatagaaactatatctatcttcaaaggttaggctatccattccaatagcgtacattgtatacacgtatattgcactgaaattttggacaaaaataaaatgtttatcttagattcaccaaggaattgttacatgtattaaatatcgaatatctacagaacttttaatagttgtgcttctggttgatttttcatgcatcgctcctttttggaaattcttttcgttatgtttatttattcaagttcgat
gi|10 : cggtgggggaaacaagttttgcaacgtcataaaaaatgtacacaaatgaactgaccacaccaaaaacatcgccgcttcaggtaagaaatgtcttgtaacttttttaatagtataacaatcgtcacgggataaagagcaccgtacccgcccaacattaacaacggtagtgttagatgttttgcacctggcacacttttttctcgaaaacggaaaaaagttttaaaaatttgtaggagtacttacacacccaagcgaaagagaagtagattttgtgcgtatttcatgaaataaagaaaaataaagacagatttaatatcagcgacctgtattattatgatcaaattatacatttttgtgtgttaaagaacatccgatgatatttcagtagaaacggagaatgaattgataatgagaacgtccacactctgattttatatgagtacttcaacaccaatgtgtgggtgcaaaaagcatgcagctaaatgacatactgtcgaagggcattctgtttgcaatttatcagttccatattgacacttccaaaatgttctttcgatagcaaagtatatcgtattacggctaactgggacaacataagtaacaacatactttgtcaggtacctctcgcagtttgagtacgttgtagtgcggtgtacaatgacgactcgtctgggtgatggaacccaggccgaagagtgcttctctcttcttgatatattttactaaatgtataaagattgagatttgatgaacatttataagaacattgattatcaatacgtcatctcgtgttgttgtttttcatttggagattacaatgccaattctgaagcgatgatccattttcaaattccaccaagtcaacatcgcctgagtcaacatttcgttagtccttgctttatcatttacctccgtaggtcaaacaggctgtctgatgattgatattcttacttttgctttccagtatacctaaatatatcccATTTAGCTGCATGCTTTTTGCATCTCTTTGAAGACACCTACACATTGGGTTTGGAAGTAATCATATAAAATCAGAGTGTAGAAGTTCTCATTA----------TCATTTCATTCGCCGTTTCTACTGAAATATCATCGGGCGTTCTTTGAGACACGAAAATATATCA-CT-TTTT-CATAATGAAACAAGGCACTGATATTAGATTTTT-TTTATTTGT---CTTTATTTCA-TGAAAATACGCCCAAATTTTATTTCTTTTTCAACTGGATGTTGAAGTACTCTTACAAATTTTTAAAAC-TCTTTCTGTTTTCCGGAAAAAGGTATGCTATGTGCATACA-------ATCTAATACTACCGCCGTTA---AGTTAACTGTTGGGTGGGTACGGTGCTCTT--TATCCCGTGTCGATTGTTATCATAACAAAAAAGAAACAAGACATTTCTTACCTGA--AGCGGTGGGATTTTTGGTGTGGTCAGCTCATCTGTTTTCATTTTTG-ATGATGTTGCAAAGTTTG-----TTTCCCGGCCG
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gi|17 : TTTCCCTGCATGGGCTCTGCTTCATTCTTGAAAACTCCCATGAAATAAACAAAACGTCCGCCAAAGATTCTCCAACAAAGTTTTCAAGTTCACTTT
gi|18 : -------GAACATTTTGGAAGCGTCGATATGGAACTGATGAATgtcat
gi|19 : GCGGTGTTTT-GGTTTGGTCAGCTTATTTGTGTACAATTTTG-ATGACGTTtatcgatagccaagtgtatcgtattgcggctaactgggtg
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Reference ( family-26 ) : TGGTCTTCTTTCACCATCAACATTAAAATGATCGAACTAACGAAGGACTGTTGGATAATGAAGTTAACTTTTGATTTAATTGGAGAATGTTTGCTTTAAGTGACTTTTCCCTGCATGAGCTCTGCTTCATTCTTGAAAACTCCCATGAAATAAACAAAACGTCCGCCAAAGATTCTCCAACCAAGTTTCCAA-TTGATTTTTGTTTTATGTAAATAGCGCATTCGTGTAGTATTCTGATATTGATACCACCGTACAACATCGATCCGTAAAAGGAAGCAATGGTGGCTGTTGGGAATATCCCTGTATATGCTG-AAAA-ATGCAATTAAAGCTTCATCAAGTCGGTTTTCTTCAGACAATCTTTGCATAACGCATG------ATACTAGGCGTGACATTTCTTTGGTTGTATCAGATAGGCCGTTACGCGTTTCTGTGTTT-TCAGTTTCAGTTGTTTCTTCATTTTGTCCATGCTTTAATGGATTTCTGAGATTCACTGGGTCAGTTAATATTCAGTTATAACGGTTTTATCATTTGAACTTCGTGT-------ATTAGTATTTTCTGTAAATGGTAGTTCCCGTGTAGTGCACAATAATAAC--TCAAAGTATTTCACATNAACTGACAGTGGCGTGTTTCTTTTGAATTCGAATTCAGATTTATCATTAGTTTTACGTTCAGTGTTTCCGCCTTCTACTTCGTTCCAGCTCAAAAA-GGTG---AAGTCAGAAACTTCAGATTCCTGTCCAGTTTCGCTGTGTATCTTAGTAAAATTCTCATAGGA-TTGGGGCATATGTCAACAGAATTGACTGAAACTTCATTTGGTCCAATTTCATTCGAGTCGTTTCTGGCAAATAAAGAGCGTACAAAATTCTGTTTAAATTGTTTTGATAATGGAAAAGCTCGGTATAAAGTTGATCCA----AATGTTGA--TGGCGATTTAAACGGGGATTTTTTTTCTTTTCTGGCTTTTTAGGAGTAAATGTGATTTTT-ACTATAAAAATGTTGTGTATAGCCATTTTGTCAGGGCAGCATACTGATATTTCAATTTTTGAAGACTTTGCCTTTTTGTCTATGGAGGTTGAGGTTAGATATCAGC-TTTCTCATTGTCAACAAACTGAAACACATAAACAATTGGAATANGTTTATAATGAAAAACTGAAATATACACTAAACAGAAATAATTTCTCTCAA-TCAGTAAACCATTAATTTTGCAGTTTCTA-T-TTCCAAGAT--GTTCCCAAAATAGTAACCGTTTTTTTTAATGTTCCCTTTTAGTATTTCCTAAAACAAGGGCAGTAAAATTTGAGATTCGCTTATTAACAT-TCCCCCAA-AAAACAGTAACAGGGCATAAAATTAGAGCAGCGATCCAATATACAAGGTCAACATTTTTATTGATCTCAATTAAC-AAGGGATTAACAGAAACTATGTCTGTCTTCAAA--G-GTTAGGCTATCCATTCCAATAGCGTACATTGTATACACGTATATTGCACTGAAATTTTGGACAAAAATA-AAATGCTTATTT-TAGATTCACCAAGGAATT-ATTACATGTATTAAATGTCGAATATCTACAGAACTCTTGCAATATCCTTTTAATAGTTGTGCTTCTGATGGATTTTCCATGCATCGCCTATTTTCGG-AA-TTCTTTTCATTATGTTTATTTATTCAAGT-TC--G--AT--AT--GCTAAAAGATTA----GAAAAACTCCAAGTTATCTAAGAATAATAGGGCATTACA-C-TTGAAAATAACAATTATTCTGTGTTTTGATGT---------CACCTTCGTGACAGTTTTAATAGTGAGCGGAGAGGTGATAAAACCTCAATGATGTCCATTTCATTT-------CAACAACGAATGTAGAAACTCGAACGACCAACAGATCCCATATATTCGGTGTAGCCTTATTTAGATACCATATCTACTA----AGGCTAACTGCGTGAGGCATGTTACAACCA-CACA--GTCAANATTTTT-GGGTCG---TACTC------GA----------ACGGCGTGTG-GTAC----CTGACAAAGTATGTTGTTACTTA---TGTT------GTCACCC------------A------G------TTAGCC-------GAACNTATTGGAAGCGTCGATATGGAACTGATAAATTGCAAACAGAATGCCCTTCGACA-----GTATATGTCATTTAGCTGCATGCTTTTTGCATCTCTTTGAAGACACCCACACATTGGGTGTGGAAGTACTCATATAAAATCAGAGTGTGGAAGTTCTCATTA----------TCATTTCATTCTCCGTTTCTACTGAAATATCATCGGACGTTCTTTAAGACACGAAAATATATCA-CT-TTTT-CATAATGATACAGGNCACTGATATTAGATTTTTCTTTATTTGT---CTTTATTTCAT-GAAAATACGCCCAAANTCTACTTCTCTTTCACTTGGGTGTGGAAGTACTCCTACAAATTTTTAAAAC-TTTTTCCGTTTTCGGGAAAAAAGTNTGCTAGGTGCATAAA-ATCTAATA------CTACCGCCGTTA---AGTTNACTGTTGGGCGGGTACGGTGCTCTT--TATCCCGTGTCGATTGTTATAATAATAAAAAAGTNACAAGACATTTCTTACCTGA--AGCGGCGGTGTTTTTGGTGTGGTCAGCTCATTTGTGTACATTTTTG-ATGACGTTGCAAAGTTTG-----TTTCCCGACCG
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Reference ( family-26 ) : TGGTCTTCTTTCACCATCAACATTAAAATGATCGAACTAACGAAGGACTGTTGGATAATGAAGTTAACTTTTGATTTAATTGGAGAATGTTTGCTTTAAGTGACTTTTCCCTGCATGAGCTCTGCTTCATTCTTGAAAACTCCCATGAAATAAACAAAACGTCCGCCAAAGATTCTCCAACCAAGTTTCCAA-TTGATTTTTGTTTTATGTAAATAGCGCATTCGTGTAGTATTCTGATATTGATACCACCGTACAACATCGATCCGTAAAAGGAAGCAATGGTGGCTGTTGGGAATATCCCTGTATATGCTG-AAAA-ATGCAATTAAAGCTTCATCAAGTCGGTTTTCTTCAGACAATCTTTGCATAACGCATG------ATACTAGGCGTGACATTTCTTTGGTTGTATCAGATAGGCCGTTACGCGTTTCTGTGTTT-TCAGTTTCAGTTGTTTCTTCATTTTGTCCATGCTTTAATGGATTTCTGAGATTCACTGGGTCAGTTAATATTCAGTTATAACGGTTTTATCATTTGAACTTCGTGT-------ATTAGTATTTTCTGTAAATGGTAGTTCCCGTGTAGTGCACAATAATAAC--TCAAAGTATTTCACATNAACTGACAGTGGCGTGTTTCTTTTGAATTCGAATTCAGATTTATCATTAGTTTTACGTTCAGTGTTTCCGCCTTCTACTTCGTTCCAGCTCAAAAA-GGTG---AAGTCAGAAACTTCAGATTCCTGTCCAGTTTCGCTGTGTATCTTAGTAAAATTCTCATAGGA-TTGGGGCATATGTCAACAGAATTGACTGAAACTTCATTTGGTCCAATTTCATTCGAGTCGTTTCTGGCAAATAAAGAGCGTACAAAATTCTGTTTAAATTGTTTTGATAATGGAAAAGCTCGGTATAAAGTTGATCCA----AATGTTGA--TGGCGATTTAAACGGGGATTTTTTTTCTTTTCTGGCTTTTTAGGAGTAAATGTGATTTTT-ACTATAAAAATGTTGTGTATAGCCATTTTGTCAGGGCAGCATACTGATATTTCAATTTTTGAAGACTTTGCCTTTTTGTCTATGGAGGTTGAGGTTAGATATCAGC-TTTCTCATTGTCAACAAACTGAAACACATAAACAATTGGAATANGTTTATAATGAAAAACTGAAATATACACTAAACAGAAATAATTTCTCTCAA-TCAGTAAACCATTAATTTTGCAGTTT-CTA-T-TTC----CAAGAT--GTTCCCAAAAT-AGTAACCGTTTTTTTTAATGTTCCCTT-TTAGTATTTCCT-AAAAC---AA--GGGCAGTA---AAATTTG--AGATTCGC---TTA----------TTAACAT-TTC---------CCCAA-AAAACAGTAACAGGGCATAAAATTAGAGCAGCGATCCAATATACAAGGT--CAACATTTTTATTGATCTCAATTAAC-AAGGGATTAACAGAAACTATGTCTGTCTTCAAA--G-GTTAGGCTATCCATTCCAATAGCGTACATTGTATACACGTATATTGCACTGAAATTTTGGACAAAAATA-AAATGCTTATTT-TAGATTCACCAAGGAATT-ATTACATGTATTAAATGTCGAATATCTACAGAACTCTTGCAATATCCTTTTAATAGTTGTGCTTCTGATGGATTTTCCATGCATCGCCTATTTTCGG-AA-TTCTTTTCATTATGTTTATTTATTCAAGT-TC--G--AT--AT--GCTAAAAGATTA----GAAAAACTCCAAGTTATCTAAGAATAATAGGGCATTACA-C-TTGAAAATAACAATTATTCTGTGTTTTGATGT---------CACCTTCGTGACAGTTTTAATAGTGAGCGGAGAGGTGATAAAACCTCAATGATGTCCATTTCATTT-------CAACAACGAATGTAGAAACTCGAACGACCAACAGATCCCATATATTCGGTGTAGCCTTATTTAGATACCATATCTACTA----AGGCTAACTGCGTGAGGCATGTTACAACCA-CACA--GTCAANATTTTT-GGGTCG---TACTC------GA----------ACGGCGTGTG-GTAC----CTGACAAAGTATGTTGTTACTTA---TGTT------GTCACCC------------A------G------TTAGCC-------GAACNTATTGGAAGCGTCGATATGGAACTGATAAATTGCAAACAGAATGCCCTTCGACA-----GTATATGTCATTTAGCTGCATGCTTTTTGCATCTCTTTGAAGACACCCACACATTGGGTGTGGAAGTACTCATATAAAATCAGAGTGTGGAAGTTCTCATTA----------TCATTTCATTCTCCGTTTCTACTGAAATATCATCGGACGTTCTTTAAGACACGAAAATATATCA-CT-TTTT-CATAATGATACAGGNCACTGATATTAGATTTTTCTTTATTTGT---CTTTATTTCAT-GAAAATACGCCCAAANTCTACTTCTCTTTCACTTGGGTGTGGAAGTACTCCTACAAATTTTTAAAAC-TTTTTCCGTTTTCGGGAAAAAAGTNTGCTAGGTGCATAAA-ATCTAATA------CTACCGCCGTTA---AGTTNACTGTTGGGCGGGTACGGTGCTCTT--TATCCCGTGTCGATTGTTATAATAATAAAAAAGTNACAAGACATTTCTTACCTGA--AGCGGCGGTGTTTTTGGTGTGGTCAGCTCATTTGTGTACATTTTTG-ATGACGTTGCAAAGTTTG-----TTTCCCGACCG
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Reference ( family-26 ) : TGGTCTTCTTTCACCATCAACATTAAAATGATCGAACTAACGAAGGACTGTTGGATAATGAAGTTAACTTTTGATTTAATTGGAGAATGTTTGCTTTAAGTGACTTTTCCCTGCATGAGCTCTGCTTCATTCTTGAAAACTCCCATGAAATAAACAAAACGTCCGCCAAAGATTCTCCAACCAAGTTTCCAA-TTGATTTTTGTTTTATGTAAATAGCGCATTCGTGTAGTATTCTGATATTGATACCACCGTACAACATCGATCCGTAAAAGGAAGCAATGGTGGCTGTTGGGAATATCCCTGTATATGCTG-AAAA-ATGCAATTAAAGCTTCATCAAGTCGGTTTTCTTCAGACAATCTTTGCATAACGCATG------ATACTAGGCGTGACATTTCTTTGGTTGTATCAGATAGGCCGTTACGCGTTTCTGTGTTT-TCAGTTTCAGTTGTTTCTTCATTTTGTCCATGCTTTAATGGATTTCTGAGATTCACTGGGTCAGTTAATATTCAGTTATAACGGTTTTATCATTTGAACTTCGTGT-------ATTAGTATTTTCTGTAAATGGTAGTTCCCGTGTAGTGCACAATAATAAC--TCAAAGTATTTCACATNAACTGACAGTGGCGTGTTTCTTTTGAATTCGAATTCAGATTTATCATTAGTTTTACGTTCAGTGTTTCCGCCTTCTACTTCGTTCCAGCTCAAAAA-GGTG---AAGTCAGAAACTTCAGATTCCTGTCCAGTTTCGCTGTGTATCTTAGTAAAATTCTCATAGGA-TTGGGGCATATGTCAACAGAATTGACTGAAACTTCATTTGGTCCAATTTCATTCGAGTCGTTTCTGGCAAATAAAGAGCGTACAAAATTCTGTTTAAATTGTTTTGATAATGGAAAAGCTCGGTATAAAGTTGATCCA----AATGTTGA--TGGCGATTTAAACGGGGATTTTTTTTCTTTTCTGGCTTTTTAGGAGTAAATGTGATTTTT-ACTATAAAAATGTTGTGTATAGCCATTTTGTCAGGGCAGCATACTGATATTTCAATTTTTGAAGACTTTGCCTTTTTGTCTATGGAGGTTGAGGTTAGATATCAGC-TTTCTCATTGTCAACAAACTGAAACACATAAACAATTGGAATANGTTTATAATGAAAAACTGAAATATACACTAAACAGAAATAATTTCTCTCAA-TCAGTAAACCATTAATTTTGCAGTTT-CTA-T-TTC----CAAGAT--GTTCCCAAAAT-AGTAACCGTTTTTTTTAATGTTCCCTT-TTAGTATTTCCT-AAAAC---AA--GGGCAGTA---AAATTTG--AGATTCGC---TTA----------TTAACAT-TTC---------CCCAA-AAAACAGTAACAGGGCATAAAATTAGAGCAGCGATCCAATATACAAGGT--CAACATTTTTATTGATCTCAATTAAC-AAGGGATTAACAGAAACTATGTCTGTCTTCAAA--G-GTTAGGCTATCCATTCCAATAGCGTACATTGTATACACGTATATTGCACTGAAATTTTGGACAAAAATA-AAATGCTTATTT-TAGATTCACCAAGGAATT-ATTACATGTATTAAATGTCGAATATCTACAGAACTCTTGCAATATCCTTTTAATAGTTGTGCTTCTGATGGATTTTCCATGCATCGCCTATTTTCGG-AA-TTCTTTTCATTATGTTTATTTATTCAAGT-TC--G--AT--AT--GCTAAAAGATTA----GAAAAACTCCAAGTTATCTAAGAATAATAGGGCATTACA-C-TTGAAAATAACAATTATTCTGTGTTTTGATGT---------CACCTTCGTGACAGTTTTAATAGTGAGCGGAGAGGTGATAAAACCTCAATGATGTCCATTTCATTT-------CAACAACGAATGTAGAAACTCGAACGACCAACAGATCCCATATATTCGGTGTAGCCTTATTTAGATACCATATCTACTA----AGGCTAACTGCGTGAGGCATGTTACAACCA-CACA--GTCAANATTTTT-GGGTCG---TACTC------GA----------ACGGCGTGTG-GTAC----CTGACAAAGTATGTTGTTACTTA---TGTT------GTCACCC------------A------G------TTAGCC-------GAACNTATTGGAAGCGTCGATATGGAACTGATAAATTGCAAACAGAATGCCCTTCGACA-----GTATATGTCATTTAGCTGCATGCTTTTTGCATCTCTTTGAAGACACCCACACATTGGGTGTGGAAGTACTCATATAAAATCAGAGTGTGGAAGTTCTCATTA----------TCATTTCATTCTCCGTTTCTACTGAAATATCATCGGACGTTCTTTAAGACACGAAAATATATCA-CT-TTTT-CATAATGATACAGGNCACTGATATTAGATTTTTCTTTATTTGT---CTTTATTTCAT-GAAAATACGCCCAAANTCTACTTCTCTTTCACTTGGGTGTGGAAGTACTCCTACAAATTTTTAAAAC-TTTTTCCGTTTTCGGGAAAAAAGTNTGCTAGGTGCATAAA-ATCTAATA------CTACCGCCGTTA---AGTTNACTGTTGGGCGGGTACGGTGCTCTT--TATCCCGTGTCGATTGTTATAATAATAAAAAAGTNACAAGACATTTCTTACCTGA--AGCGGCGGTGTTTTTGGTGTGGTCAGCTCATTTGTGTACATTTTTG-ATGACGTTGCAAAGTTTG-----TTTCCCGACCG
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Alignments
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gi|20 : CAGCTCATTTGTGTACAATTTTG-ATGACGTTGCAAAGTGTG-----TTTTCCGACCG
gi|3 : CA---TACTC------AA----------ACTGCGAGAG-GTAC----CTGACAAAGTATGTTGTTACTTATGTTGTCTCCCA-GTTAGCC------------ATAATACGATATACTTCGCTATCGATAGAACATTTTGGAAGCGTCGATATGGAACTGTTAAATAGTAAACAGAATGCCCTTCGACATATACGTATATGTCATTTAGCTGCATGCTTTTTGCATCTCTTTGAAGACACCAACACATTGGGTGTGGAAGTACTCATATAAAATTAGAGTGTGGATGTTCTC---A----------TCATTTCATTCTCCGTTTCTACTGAAATATCATCGGACATTCTTTAAGACATGAAAATATATCATTT-TTTT-TATAATAATACAGGTTGCTGATATTAA----------ATTTGT---CTTTATTTCAT-G-AAATACGCACAAAATCTACATCTCTTTCACTTGGGTGTGGAATAACTCCTACAATTTTTAAAAAC-TGTTTCCATTTTCGAGAAAAAAGTCTGCTAGGTGCACAAC-ATCTAACA------CTACTGTTGTTA---TGTTTACTGTTGGGCGGG-----------T--TAT---------A-----ATAA---TAAAAAAGTTACAAGACATTTCTTACCTGA--AGCGGCGATGTTTTTGGTGTGGTCAGCTCATTTGTGTACATTTTTG-ATGACGTTGCAAAGTTTG-----TTTCt
gi|3 : TGGTCTTCTTTCACCATCAACATTAAACTGATCGAACTAACAAAGGACTGTTAGATAATGAACTTAACTTTTGATTCAATTGGAGAATATTTGCTTTAAGTGATTTTTCCCTGCATGAGATCTGCTTCACTCTTGAAAACTCCCATGAAATAAACAAAACGTCTGCCAAAA----------CAAGTTTCCAA-TTGATTTTTGTTTTATGTAAATAGCGCATTTGTGTAGTATTCTGACATTGATACCACCGTACAACATCAATCTGTAAAAGGAAGCAATGGTGGCTGTTGGCAATATCCCTGTTTATGCTG-AAAAAATGCAATTTACACTTCATCAAGTCGGTTTTCTTCAGACAATCTTTGTATATCGCATG------ATACTAGGCGTGACATTTCTTTGGTTGTATCAGATAGGCCGTTAAGCGTTTCTGTGTTT-TCAGTTTCAGTTGTTTATTCATTTTGTCCATGCTTTAATAGATTTCTGAGATTCACTGGGTCAGTTAATATTCAGTTATAACGGTTTTATCATTTGAACTTCGTGT-------ATGAGTATTTTCTGTAAATGGTAGTCCCCGTGTAGTGCACAATAATAAT--TCAAAGTATTCCACATTAACTGACAGTGG--------------------ATTCAGATTTATCATTAGTTTTACGTTCAATG--TCCGCCTTCTACTTCATTCCAGCTCAAAAA-GGTG---AAGTCAGAAACTTCAGATTCCTGTCCAGTTTCGCTGTGTATCTTAGTAAAATTCTCATAGAA-TTGGGGCATGTGTCAACAGAATTAACTGAAACTTCATTTGGTCCAATTTCATTCGAGTTGTTTCTGGCAAATAAAGAGTGTACAAAATTCTGTTCAAATTGTTTTGATAATTGAAAAGCTTGGTATAAAGTTGATCCA----AATGTTGA--TGGCGATTTAAACGGGGA--TTTTTTCTTTTCTGGCTTTTGAGGAGTAAATGTGATTTTTAACTATAAAAATGTTGCGTATAGCCATTTTGTCAGGGCAGCATATTGATGTTTCAATTTTTGAAGACTTTGCCGTTTTATCTATGGAGGTTGAGGTTAGATATCAGC-ATTCTCATTGTCTACAAACTGAAACACATAAATAATTGGAATAAGTTTAtcgtagtacagtgtacaatgaagactcgtctgggtgctggaactcaggccgaagagtgcttctcttttttctttttgatggtatttactaaatgtatgaagattgagatttgatggagatttataagaacattgatgtatcaatacgtctatctcgtgttttttcatttggagattacattgccgatcatgaagagatgatccattttcaaatcccaataagtcaacatcgccgaagcttttcgttagtccttgctttatcattttaccaccataagtcaaacaggctgtccgatgattgatattcttacttttgctttcaagtatatctaaatatatccctggtcttctttcaccatcaacattaaactgatcgaactaacaaaggactgttagataatgaacttaacttttgattcaattggagaatatttgctttaagtgatttttccctgcatgagatctgcttcactcttgaaaactcccatgaaataaacaaaacgtctgccaaaacaagtttccaattgatttttgttttatgtaaatagcgcatttgtgtagtattctgacattgataccaccgtacaacatcaatctgtaaaaggaagcaatggtggctgttggcaatatccctgtttatgctgaaaaaatgcaatttacacttcatcaagtcggttttcttcagacaatctttgtatatcgcatgatactaggcgtgacatttctttggttgtatcagataggccgttaagcgtttctgtgttttcagtttcagttgtttattcattttgtccatgctttaatagatttctgagattcactgggtcagttaatattcagttataacggttttatcatttgaacttcgtgtatgagtattttctgtaaatggtagtccccgtgtagtgcacaataataattcaaagtattccacattaactgacagtggattcagatttatcattagttttacgttcaatgtccgccttctacttcattccagctcaaaaaggtgaagtcagaaacttcagattcctgtccagtttcgctgtgtatcttagtaaaattctcatagaattggggcatgtgtcaacagaattaactgaaacttcatttggtccaatttcattcgagttgtttctggcaaataaagagtgtacaaaattctgttcaaattgttttgataattgaaaagcttggtataaagttgatccaaatgttgatggcgatttaaacggggattttttcttttctggcttttgaggagtaaatgtgatttttaactataaaaatgttgcgtatagccattttgtcagggcagcatattgatgtttcaatttttgaagactttgccgttttatctatggaggttgaggttagatatcagcattctcattgtctacaaactgaaacacataaataattggaataagtttaaa
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