lowQualScore                  :                                        
lowQualScore                  :                                        
lowQualScore                  :                                        
consensus                     :       TTAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
Reference ( gi|5 )            :       TTAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|4                          :       TTAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|2                          :       TTAAGTCAATAATGTGTCCGACTGTCAATTCAA
gi|10                         :        TAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAAg
gi|9                          :        TAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|12                         :        TAAGTTTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|11                         :        TAAGTCTATAATGTATCTGACTGTCAATTCAA
gi|6                          :        TAAGTCTATAATGTATCTGACTGTCAATTCAA
gi|8                          :        TAAGTCTATAATGAGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|7                          :        TAAGTCTATAATGTATCTGACTGCCAATTCAA
gi|17                         :        TAATTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCA
gi|1                          :        TACGTCTATAATGTGTCTGATTGTCAATTCAA
gi|13                         : tgttaaaTAAGTCTACAATGTATCTGGCTGTCAATTCA
gi|3                          :        TAATTCTATAATGTATCTGACTGCCAATTCAA
gi|15                         :         AAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAAg
gi|14                         :         AAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|16                         :         AAGTCTATAATGTGTCCGACTGTCAATTCAA
gi|18                         :         AATTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCA
gi|19                         :          AGTCTATAATGTATCTGACTGTCAATTCAAt

lowQualScore                  :                                        
lowQualScore                  :                                        
lowQualScore                  :                                        
consensus                     :       TTAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
Reference ( family-2353 )     :       TTAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|1                          :        TACGTCTATAATGTGTCTGATTGTCAATTCAA
gi|10                         : tgttaaaTAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|11                         :        TAAGTCTATAATGTATCTGACTGTCAATTCAA
gi|12                         :        TAAGTTTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|13                         :        TAAGTCTACAATGTATCTGGCTGTCAATTCA
gi|14                         :         AAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|15                         :         AAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|16                         :         AAGTCTATAATGTGTCCGACTGTCAATTCAA
gi|17                         :        TAATTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCA
gi|18                         :         AATTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCA
gi|19                         :          AGTCTATAATGTATCTGACTGTCAATTCAAt
gi|2                          :       TTAAGTCAATAATGTGTCCGACTGTCAATTCAA
gi|3                          :        TAATTCTATAATGTATCTGACTGCCAATTCAAg
gi|4                          :       TTAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAAg
gi|5                          :       TTAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|6                          :        TAAGTCTATAATGTATCTGACTGTCAATTCAA
gi|7                          :        TAAGTCTATAATGTATCTGACTGCCAATTCAA
gi|8                          :        TAAGTCTATAATGAGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|9                          :        TAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA




blockSeqCons                  :       
originalCons                  :       TTAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
finalCons                     :       TTAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA

lowQualScore                  :                                        
lowQualScore                  :                                        
lowQualScore                  :                                        
consensus                     :       TTAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
Reference ( family-2353 )     :       TTAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|1                          :        TACGTCTATAATGTGTCTGATTGTCAATTCAA
gi|10                         : tgttaaaTAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|11                         :        TAAGTCTATAATGTATCTGACTGTCAATTCAA
gi|12                         :        TAAGTTTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|13                         :        TAAGTCTACAATGTATCTGGCTGTCAATTCA
gi|14                         :         AAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|15                         :         AAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|16                         :         AAGTCTATAATGTGTCCGACTGTCAATTCAA
gi|17                         :        TAATTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCA
gi|18                         :         AATTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCA
gi|19                         :          AGTCTATAATGTATCTGACTGTCAATTCAAt
gi|2                          :       TTAAGTCAATAATGTGTCCGACTGTCAATTCAA
gi|3                          :        TAATTCTATAATGTATCTGACTGCCAATTCAAg
gi|4                          :       TTAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAAg
gi|5                          :       TTAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|6                          :        TAAGTCTATAATGTATCTGACTGTCAATTCAA
gi|7                          :        TAAGTCTATAATGTATCTGACTGCCAATTCAA
gi|8                          :        TAAGTCTATAATGAGTCTGACTGTCAATTCAA
gi|9                          :        TAAGTCTATAATGTGTCTGACTGTCAATTCAA