lowQualScore : 3 1 111 11111111111 11111111111111 33333333333333333333333333 1111111 111 1
lowQualScore : 4 555 99 3 0 3 333 7 6 55 2 555 44 33 6 3 3 33333333333 3 4 55555555555555 22222222222222222222222222 8888 0 1 44 77 77 333 9999999 66 33 2 222 0 3 6666 0 2 3
lowQualScore : . ... .. . . . ... . . .. . ... .. .. . . . ........... . . .............. .......................... .... . . .. .. .. ... ....... .. .. . ... . . .... . . .
lowQualScore : 3 555 55 6 8 6 777 5 3 00 8 999 00 88 7 3 3 99999999999 1 0 66666666666666 55555555555555555555555555 0000 2 8 22 11 22 999 6666666 88 66 9 555 5 7 1111 1 9 1
consensus : CTGTTGCACAGTAAATGGGCCAATCATGT--TAGCAT-CNAA-GT--CAGAAAATAAAGTTTAAGCTATTC--ATNTG-T-TTT-TGT-TT-TTTT-C-TGAT------ACG--TT-TATGTTTCAAGTA--T-----------GTA----------AG--------------ACAAT---CGAAGAAGAGATA--A-NTTTCGGC-T-TAAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCN--AGGCTGGTAGACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
Reference ( gi|4 ) : CTGTTGCACAGTAA-TGGGCCAATTATGT--TAGCAT-CTAA-GT--AAAAAAAAAAAGTTTAAGATATTC--ATTTG-T-TTT-TGT-TT-TTTT-C-TAAT------ACA--TT-TATGTTTTAAGTA--T-----------GTA----------AG--------------ACAAC---CGAAGAAGAGATA--A-GTTTCAAC-T-TAAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCT--AGGCAGGTAGGCA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
gi|11 : CTGTTGCACAGTAAATGGGCCAATTATGT--TAGCAT-CTAA-GT--AAAAAAAAAAAGTTTAAGATATTC--ATTTG-C-TTT-TGT-TT-TTTTCC-TAAT------ACA--TT-TATGTTTTAAGTA--T-----------GTA----------AG--------------ACAAC---CGAAGAAGAGATA--A-GTTTCAAC-T-TAAA----------------------------TTCTCT--AGGCAGGTAGACA----AGGGAACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATG
gi|7 : cCTGTTGCACAGTAAATGGACCAAATATGT--TAGCAT-CAGA-GT--CAAAAAAAGAAGTTTAAGATATTC--ACTTG-T-TGT-TGT-TT-TTTC-C-TGAT------AGG--TT-TATGTTTCGAGTA-----------------------------------------------------AAGAGGAGATA--A-CTTTTGGC-A-TAAATTT--T---AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCT--AGACTGGTAAACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCGTCA-TGAGTTATGT
gi|5 : cCTGTTGAACAGTAAATTGACCA--CAT-----AG-AT-TCAACGT--CAGAAAGTAAAGTTTAGGCTATTC--ATATA-C-AT---GT-ATATTTT-C-TGATTT----ACG--TT-TATGTTTCAAGTA--TATATATACATTGTG----------AA--------------ACAAT---CAAAGAAGTGATA--A-ATCT-GGC-T-TAAATTT--TAA-AAAAAA--A-GCT-T---TTTTTCTGAAGGTGGGTAAACA----AGGAGACGGAT-GTTACAtgatat
gi|6 : gcTGTTGCACAGTAAGTAGGCCAATTATGT--TAGCAT-CTAA-GT---AAAAAAAAAAGTTTAAGATATTC--ATTTG-T-TTT-TGT-TT-TTTT-C-TAAT------ACA--TT-TATGTTTTAAGTA--T-----------GTA----------AG--------------ACAAC---CGAAGAAGAGATA--A-GTTTCAAC-T-TAAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCT--AGGCAGGTAGGCA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTAtattc
gi|12 : GTTGAACTGTAAATAGGTCAGT-ATGTAATAGCAT-CAAC-TT--TAGAAAATAATATTTAAGCTATTC--ATATA-T-TTT-TGTGTTATTTT-CATAAT-----------TT-TATG---TATATACCT-----------GTA----------TG--------------ACAAT---TAAAGAAGTGATACCA-AT---GAC-T-TTAATTT--A-A-AAAAAG--A-TCT-
gi|8 : GCACAGTAAATGGGCCAATCATGT--TAGCAT-CTAA-GT--AAAAAAAAAAAGTTTAAGATATTT--ATTTG-T-TTT-TGA-TT-TTTT-C-TAAT------ACA--TT-TATGTTTTAAGTA--T-----------GTA----------AG--------------ACAAC---CGAAGAAGAGATA--A-GTTTCAAC-T-TAAATTT--T---AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCT--AGGCAGGTAGGCA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATggtcaacttacagcttcatga
gi|2 : A-TGGGCCGTACACGT--TAGCAT-CAAT-GT--CAGAAAATAAACTTTAAGCTATACGTATTCA-C-CTC-T---TC-TTTT-C-TAAT------ATAAGTT-TATGTATCAAGTA--T-----------ATA----------
gi|9 : tgcatattgacctgtGCCTATTGTATG-TAGCAAACGGA-CC--AAATAAATAAAGTTTAAGCTATTC--ATTTG-T-TTCGTTT-TT-TTTT-C-TGATAGGATAACA--TTCCATGTACC-GGTA--T-----------GTA----------AA--------------ACAAA---TGAACAAGAG--A--A-CTTTTGGCTT-TAAATTT------AAAAAA--A-TCT-TATATTAC-----AAAATGGTAGACA----AGGGGATGGAC-TTTACAGCTTTG-TTAGTTATGTtttaatatatatatatatatcagaatattttatatgatttaaaccaaatgttattatttcttcgattgttatatatatatatataaaatattcttatgttttccaaggttggttaacagtgaagggg
gi|1 : tTGT--TAGCAT-C-AA-TTTCAGAAAAATAAA--TTAAACTATTC--ATATG-C-ATG-TAC-TT-TTCT-G-TTAT------AAG--TT-TATGTTTCAAGTA--T-----------ATATATATGCGTCAA--------------ACAAT---CGAAGAAGTGACA--A-TATTTGGC-T-TAAATTTAAT-A-AAAAAA--AGTCT-TATAGTTCTCA--AAACTGGCAAACA----AAGGGACAGAC-GTTACCACTTCA-TGAtgata
gi|10 : tgtctgttgaacagcaaatggcccatatagcttagcatcagtgactttattgtccctT--TAGCAC-CAAC-GT--CAGGAAATAAAGTTTAATCTATTC--ATATGAG-TTT-TGT---------C-TGAT------AGA--GA-TGTGTTTCAAATA--A-----------ATA----------AA--------------ACAAT---CGAAGAAGTGATA--ACGTTT-AGC----ATATTT--T-T-AAAAAA--A-GCT-GAT-TGTCGCA--AGGTTGGAAAACA----AAGGGACGGAA-GTTGTTACTTCA-TG
gi|3 : attgaaataataaatgcggaaagaatGCAT-CAAC-GT--CAGTAAATAAAGTTTAAGCTATAC--GTATA-TATTT-TGT-AC-TGTT-C-TAAT------ATAGGTT-TATGTTTCAAGTA--T-----------ATAAT--------AGTATTTAATATATATACAACGATCGAAGAAGTGATA--T-TATTTGGT-T-TACATTA--T-ATAAAATA--G-TCT-TACGTTT-TCA--AGGTTGATGAACAGTGGAGGGGGCAGAC-ATTACAGCTT-A-TGA
gi|13 : gcctgttgatcagtaagt-TTTT-C-TGAT------ACG--TT-TATGTATCAAGTA--T-----------GTA----------AA--------------ACAAT---C----AAGAGATA--A-CTTTTGAC-A-TCAATTT--A-A-AAAAAA--A------ATAATTCTGA--AGGCTGGTAGACA----CGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTA
gi|14 : tcaggcaattgcaaaatgcctgttgtgAT------ACA--TT-TA-ATCT---GTA--T-----------GTA----------AA--------------TCTAT---CAAAGAAGAGATA--A-CATTTGAC-T-TAATTTT--T-A-AAAAAA--A-CCCATATATTTCTC---A-------AGACA----AGGGT-CGGACAGTAACA----CATTGGGTTGTGa
gi|15 : ttaccatttacTA--T-GTTTCAAG-TCTAAATT-----A-AAAAAGT-A-TCA-TATATTTCTCA--AGGTTGGCCGACA----AATGGACAGAT-GTAACAGCTTCA-TGAGTTct
gi|16 : ttaaataatcatttgttttgttttctgataggttC-T-TAAATT-------AAAATACCA-TTT-TGTATTTCTCA--AGGCTTATAAACA----ATGGGGCAGAC-GTTAAAGCTTAA-
gi|17 : gg--AGGCTGGTAGACA----AGGAT-CGGAC-ATTACAGCTTCA-TCAGTTATG
Alignments
lowQualScore : 44444444444444444444444444444444 11111111111111 3333333333333333333333333333333 1111111
lowQualScore : 22222222222222222222222222222222 55 1 4 0 77 3 1 333 33 2 2 2 33 33 999 777777 33333333333333 1111111111111111111111111111111 1 44 1 3 2 2 6666666 66 22 2 2 1 5555 2 2
lowQualScore : ................................ .. . . . .. . . ... .. . . . .. .. ... ...... .............. ............................... . .. . . . . ....... .. .. . . . .... . .
lowQualScore : 99999999999999999999999999999999 55 0 5 5 11 5 0 666 99 6 9 9 77 77 555 777777 99999999999999 7777777777777777777777777777777 0 22 0 4 7 7 5555555 33 77 7 0 1 7777 7 9
consensus : CTGTTGCACAGTAAATGGGCCA-----------ATCA-----------------TGT--TAGCATCAANGTCAGAAAA-TAAAGTTTAAGCTATTCATNTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTG--AT--AC--GTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAATCGAAGAAGAGATA--ANTTTCG-GCTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCAAGGCTGGTAGACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
Reference ( family-2338 ) : CTGTTGCACAGTAAATGGGCCA-----------ATCA-----------------TGT--TAGCATCNAAGTCAGAAAA-TAAAGTTTAAGCTATTCATNTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTG--AT--AC--GTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAATCGAAGAAGAGATA--ANTTTCG-GCTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCNAGGCTGGTAGACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
gi|1 : CTGTTGAACAGCAAATGGCCCATATAGCTTAGCATCAGTGACTTTATTGTCCCTTGT--TAGCATCAATTTCAGAAAAATAAA--TTAAACTATTCATATG-C-AT---GTAC-TTTT-CTGTTAT--AA--GTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------ATATATATGCGTCA-------------------AACAATCGAAGAAGTGACA--ATATTTG-GCTT-AAATTTAAT-A-AAAAAA--AGTCT-TATAGTTCTCAAAACTGGCAAACA----AAGGGACAGAC-GTTACCACTTCA-TGA
gi|10 : tgtATAATAAATGCGGAA-----------AGAA-----------------T-T--TAGCACCAACGTCAGGAAA-TAAAGTTTAATCTATTCATATGAG-TTT-TGT--------CTG--AT--AG--AGATGTGTTTCA------AATA--A-----------ATA----------A-------------------AACAATCGAAGAAGTGATA--ACGTTTA-GC---ATATTT--T-T-AAAAAA--A-GCT-GAT-TGTCGCAAGGTTGGAAAACA----AAGGGACGGAA-GTTGTTACTTCA-TG
gi|11 : attgaaCTGTTGCACAGTAAATGGGCCA-----------ATTA-----------------TGT--TAGCATCTAAGTAAAAAAA-AAAAGTTTAAGATATTCATTTG-C-TTT-TGTTT-TTTTCCTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAA----------------------------TTCTCTAGGCAGGTAGACA----AGGGAACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATG
gi|12 : cGTTGAACTGTAAATAGGTCA-----------GT-A-----------------TGTAATAGCATCAACTTTAGAAAA-TAATATTTAAGCTATTCATATA-T-TTT-TGTGT-TATT-TTC--AT--AA--TTTTATGT---A------TATACCT-----------GTA----------T-------------------GACAATTAAAGAAGTGATACCAAT---G-ACTT-TAATTT--A-A-AAAAAG--A-TCT-
gi|13 : -TTTT-CTG--AT--AC--GTTTATGTATCA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAATC----AAGAGATA--ACTTTTG-ACAT-CAATTT--A-A-AAAAAA--A------ATAATTCTGAAGGCTGGTAGACA----CGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTAggtcaacttacagcttcatga
gi|14 : tcaggcaattgcaaaatgcctgttgtg--AT--AC--ATTTA-ATCT---------GTA--T-----------GTA----------A-------------------ATCTATCAAAGAAGAGATA--ACATTTG-ACTT-AATTTT--T-A-AAAAAA--A-CCCATATATTTCTCA--------AGACA----AGGGT-CGGACAGTAACA----CATTGGGTTGTGa
gi|15 : ttaccatttacTTAAA-TAATCATTTG-T-TTT--GTTT-T----CTG--AT--AG--GTTTATGTTTCA------AGTct
gi|15 : TTTCAAGTCT-AAATT-----A-AAAAAGT-A-TCA-TATATTTCTCAAGGTTGGCCGACA----AATGGACAGAT-GTAACAGCTTCA-TGAGTTctaaattaaaaaagtatcatatatttctcaaggttggccgacaaatggacagatgtaacagcttcatgagtt
gi|16 : ttaaataatcatttgttttgttttctgataggtttatgG-GCTT-AAATT-------AAAATACCA-TTT-TGTATTTCTCAAGGCTTATAAACA----ATGGGGCAGAC-GTTAAAGCTTAA-
gi|17 : AGGCTGGTAGACA----AGGAT-CGGAC-ATTACAGCTTCA-TCAGTTATG
gi|2 : ATGGGCCG-----------TACA-----------------CGT--TAGCATCAATGTCAGAAAA-TAAACTTTAAGCTATACGTATT-C-ACC-TCTTC-TTTT-CTA--AT--ATAAGTTTATGTATCA------AGTA--T-----------ATA----------
gi|3 : tgcatattgacctgtGCATCAACGTCAGTAAA-TAAAGTTTAAGCTATACGTATA-TATTT-TGTAC-TGTT-CTA--AT--ATAGGTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------ATA----------ATAGTATTTAATATATATACAACGATCGAAGAAGTGATA--TTATTTG-GTTT-ACATTA--T-ATAAAATA--G-TCT-TACGTTT-TCAAGGTTGATGAACAGTGGAGGGGGCAGAC-ATTACAGCTT-A-TGAtttaatatatatatatatatcagaatattttatatgatttaaaccaaatgttattatttcttcgattgttatatatatatatataaaatattcttatgttttccaaggttggttaacagtgaagggg
gi|4 : gcctgttgatcagtaagtCTGTTGCACAGTAA-TGGGCCA-----------ATTA-----------------TGT--TAGCATCTAAGTAAAAAAA-AAAAGTTTAAGATATTCATTTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGGCAGGTAGGCA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
gi|5 : CTGTTGAACAGTAAATTGACCA-------------CA-----------------T-----AGATTCAACGTCAGAAAG-TAAAGTTTAGGCTATTCATATA-C-AT---GTATATTTT-CTG--ATTTAC--GTTTATGTTTCA------AGTA--TATATATACATTGTG----------A-------------------AACAATCAAAGAAGTGATA--AATCT-G-GCTT-AAATTT--TAA-AAAAAA--A-GCT-T-TTTTTCTGAAGGTGGGTAAACA----AGGAGACGGAT-GTTACA
gi|6 : gcTGTTGCACAGTAAGTAGGCCA-----------ATTA-----------------TGT--TAGCATCTAAGTAAAAAAA--AAAGTTTAAGATATTCATTTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGGCAGGTAGGCA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTAtattc
gi|7 : CTGTTGCACAGTAAATGGACCA-----------AATA-----------------TGT--TAGCATCAGAGTCAAAAAA-AGAAGTTTAAGATATTCACTTG-T-TGT-TGTTT-TTTC-CTG--AT--AG--GTTTATGTTTCG------AGTA-------------------------------------------------------AAGAGGAGATA--ACTTTTG-GCAT-AAATTT--T---AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGACTGGTAAACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCGTCA-TGAGTTATGT
gi|8 : cGCACAGTAAATGGGCCA-----------ATCA-----------------TGT--TAGCATCTAAGTAAAAAAA-AAAAGTTTAAGATATTTATTTG-T-TTT-TGATT-TTTT-CTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAATTT--T---AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGGCAGGTAGGCA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATtgatat
gi|9 : AAA-TAAAGTTTAAGCTATTCATTTG-T-TTCGTTTTT-TTTT-CTG--AT--AG--GATAACATTCCATGTACCGGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAAATGAACAAGAGA----ACTTTTG-GCTTTAAATTT------AAAAAA--A-TCT-TATATTAC---AAAATGGTAGACA----AGGGGATGGAC-TTTACAGCTTTG-TTAGTTATGT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333 11111111111111 333333333333333333333333333333 1111111
lowQualScore : 88888888888888888888888888888888 0 88 1 44 3 77 3 1 333 33 2 2 2 33 33 999 777777 33333333333333 111111111111111111111111111111 1 44 1 3 2 2 6666666 66 22 2 0 1 5555 2 2
lowQualScore : ................................ . .. . .. . .. . . ... .. . . . .. .. ... ...... .............. .............................. . .. . . . . ....... .. .. . . . .... . .
lowQualScore : 55555555555555555555555555555555 5 66 0 66 3 11 5 0 666 99 6 9 9 77 77 555 777777 99999999999999 222222222222222222222222222222 0 22 0 4 7 7 5555555 33 77 7 3 1 7777 7 9
consensus : CTGTTGCACAGTAAATGGGCCA-----------ATCA-----------------TGT--TAGCATCAACG--TCAGA-AAA-TAAAGTTTAAGCTATTCATNTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTG--AT--AC--GTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAATCGAAGAAGAGATA--ANTTTCG-GCTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCAAGGCTGGTAGACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
Reference ( family-2338 ) : CTGTTGCACAGTAAATGGGCCA-----------ATCA-----------------TGT--TAGCATCAANG--TCAGA-AAA-TAAAGTTTAAGCTATTCATNTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTG--AT--AC--GTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAATCGAAGAAGAGATA--ANTTTCG-GCTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCAAGGCTGGTAGACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
gi|1 : CTGTTGAACAGCAAATGGCCCATATAGCTTAGCATCAGTGACTTTATTGTCCCTTGT--TAGCATCAATT--TCAGA-AAAATAAA--TTAAACTATTCATATG-C-AT---GTAC-TTTT-CTGTTAT--AA--GTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------ATATATATGCGTCA-------------------AACAATCGAAGAAGTGACA--ATATTTG-GCTT-AAATTTAAT-A-AAAAAA--AGTCT-TATAGTTCTCAAAACTGGCAAACA----AAGGGACAGAC-GTTACCACTTCA-TGA
gi|10 : tgtATAATAAATGCGGAA-----------AGAA-----------------T-T--TAGCACCAACG--TCAGG-AAA-TAAAGTTTAATCTATTCATATGAG-TTT-TGT--------CTG--AT--AG--AGATGTGTTTCA------AATA--A-----------ATA----------A-------------------AACAATCGAAGAAGTGATA--ACGTTTA-GC---ATATTT--T-T-AAAAAA--A-GCT-GAT-TGTCGCAAGGTTGGAAAACA----AAGGGACGGAA-GTTGTTACTTCA-TG
gi|11 : attgaaCTGTTGCACAGTAAATGGGCCA-----------ATTA-----------------TGT--TAGCATCTAAG--TAAAA-AAA-AAAAGTTTAAGATATTCATTTG-C-TTT-TGTTT-TTTTCCTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAA----------------------------TTCTCTAGGCAGGTAGACA----AGGGAACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATG
gi|12 : cGTTGAACTGTAAATAGGTCA-----------GT-A-----------------TGTAATAGCATCAACT--TTAGA-AAA-TAATATTTAAGCTATTCATATA-T-TTT-TGTGT-TATT-TTC--AT--AA--TTTTATGT---A------TATACCT-----------GTA----------T-------------------GACAATTAAAGAAGTGATACCAAT---G-ACTT-TAATTT--A-A-AAAAAG--A-TCT-
gi|13 : -TTTT-CTG--AT--AC--GTTTATGTATCA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAATC----AAGAGATA--ACTTTTG-ACAT-CAATTT--A-A-AAAAAA--A------ATAATTCTGAAGGCTGGTAGACA----CGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTAggtcaacttacagcttcatga
gi|14 : tcaggcaattgcaaaatgcctgttgtg--AT--AC--ATTTA-ATCT---------GTA--T-----------GTA----------A-------------------ATCTATCAAAGAAGAGATA--ACATTTG-ACTT-AATTTT--T-A-AAAAAA--A-CCCATATATTTCTCA--------AGACA----AGGGT-CGGACAGTAACA----CATTGGGTTGTGa
gi|15 : ttaccatttacTTAAA-TAATCATTTG-T-TTT--GTTT-T----CTG--AT--AG--GTTTATGTTTCA------AGTct
gi|15 : TTTCAAGTCT-AAATT-----A-AAAAAGT-A-TCA-TATATTTCTCAAGGTTGGCCGACA----AATGGACAGAT-GTAACAGCTTCA-TGAGTTctaaattaaaaaagtatcatatatttctcaaggttggccgacaaatggacagatgtaacagcttcatgagtt
gi|16 : ttaaataatcatttgttttgttttctgataggtttatgG-GCTT-AAATT-------AAAATACCA-TTT-TGTATTTCTCAAGGCTTATAAACA----ATGGGGCAGAC-GTTAAAGCTTAA-
gi|17 : AGGCTGGTAGACA----AGGAT-CGGAC-ATTACAGCTTCA-TCAGTTATG
gi|2 : ATGGGCCG-----------TACA-----------------CGT--TAGCATCAATG--TCAGA-AAA-TAAACTTTAAGCTATACGTATT-C-ACC-TCTTC-TTTT-CTA--AT--ATAAGTTTATGTATCA------AGTA--T-----------ATA----------
gi|3 : tgcatattgacctgtGCATCAACG--TCAGT-AAA-TAAAGTTTAAGCTATACGTATA-TATTT-TGTAC-TGTT-CTA--AT--ATAGGTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------ATA----------ATAGTATTTAATATATATACAACGATCGAAGAAGTGATA--TTATTTG-GTTT-ACATTA--T-ATAAAATA--G-TCT-TACGTTT-TCAAGGTTGATGAACAGTGGAGGGGGCAGAC-ATTACAGCTT-A-TGAtttaatatatatatatatatcagaatattttatatgatttaaaccaaatgttattatttcttcgattgttatatatatatatataaaatattcttatgttttccaaggttggttaacagtgaagggg
gi|4 : gcctgttgatcagtaagtCTGTTGCACAGTAA-TGGGCCA-----------ATTA-----------------TGT--TAGCATCTAAG--TAAAA-AAA-AAAAGTTTAAGATATTCATTTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGGCAGGTAGGCA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
gi|5 : CTGTTGAACAGTAAATTGACCA-------------CA-----------------T-----AGATTCAACG--TCAGA-AAG-TAAAGTTTAGGCTATTCATATA-C-AT---GTATATTTT-CTG--ATTTAC--GTTTATGTTTCA------AGTA--TATATATACATTGTG----------A-------------------AACAATCAAAGAAGTGATA--AATCT-G-GCTT-AAATTT--TAA-AAAAAA--A-GCT-T-TTTTTCTGAAGGTGGGTAAACA----AGGAGACGGAT-GTTACA
gi|6 : gcTGTTGCACAGTAAGTAGGCCA-----------ATTA-----------------TGT--TAGCATCTAAG--TAAAA-AAA--AAAGTTTAAGATATTCATTTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGGCAGGTAGGCA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTAtattc
gi|7 : CTGTTGCACAGTAAATGGACCA-----------AATA-----------------TGT--TAGCATCAGAG--TCAAA-AAA-AGAAGTTTAAGATATTCACTTG-T-TGT-TGTTT-TTTC-CTG--AT--AG--GTTTATGTTTCG------AGTA-------------------------------------------------------AAGAGGAGATA--ACTTTTG-GCAT-AAATTT--T---AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGACTGGTAAACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCGTCA-TGAGTTATGT
gi|8 : cGCACAGTAAATGGGCCA-----------ATCA-----------------TGT--TAGCATCTAAG--TAAAA-AAA-AAAAGTTTAAGATATTTATTTG-T-TTT-TGATT-TTTT-CTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAATTT--T---AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGGCAGGTAGGCA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATtgatat
gi|9 : GCCT-----------ATTG-----------------TATG-TAGCA--AACGGACCAAATAAA-TAAAGTTTAAGCTATTCATTTG-T-TTCGTTTTT-TTTT-CTG--AT--AG--GATAACATTCCATGTACCGGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAAATGAACAAGAGA----ACTTTTG-GCTTTAAATTT------AAAAAA--A-TCT-TATATTACAAAA---TGGTAGACA----AGGGGATGGAC-TTTACAGCTTTG-TTAGTTATGT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333 11111111111111 333333333333333333333333333333 1111111
lowQualScore : 88888888888888888888888888888888 0 88 3 44 3 77 3 1 333 33 2 2 2 33 33 999 777777 33333333333333 111111111111111111111111111111 1 44 1 3 2 2 6666666 66 22 2 0 1 5555 2 2
lowQualScore : ................................ . .. . .. . .. . . ... .. . . . .. .. ... ...... .............. .............................. . .. . . . . ....... .. .. . . . .... . .
lowQualScore : 55555555555555555555555555555555 5 66 1 66 3 11 5 0 666 99 6 9 9 77 77 555 777777 99999999999999 222222222222222222222222222222 0 22 0 4 7 7 5555555 33 77 7 3 1 7777 7 9
consensus : CTGTTGCACAGTAAATGGGCCA-----------ATCA-----------------TGT--TAGCATCAACG--TCAGA-AAA-TAAAGTTTAAGCTATTCATNTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTG--AT--AC--GTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAATCGAAGAAGAGATA--ANTTTCG-GCTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCAAGGCTGGTAGACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
Reference ( family-2338 ) : CTGTTGCACAGTAAATGGGCCA-----------ATCA-----------------TGT--TAGCATCAACG--TCAGA-AAA-TAAAGTTTAAGCTATTCATNTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTG--AT--AC--GTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAATCGAAGAAGAGATA--ANTTTCG-GCTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCAAGGCTGGTAGACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
gi|1 : CTGTTGAACAGCAAATGGCCCATATAGCTTAGCATCAGTGACTTTATTGTCCCTTGT--TAGCATCAATT--TCAGA-AAAATAAA--TTAAACTATTCATATG-C-AT---GTAC-TTTT-CTGTTAT--AA--GTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------ATATATATGCGTCA-------------------AACAATCGAAGAAGTGACA--ATATTTG-GCTT-AAATTTAAT-A-AAAAAA--AGTCT-TATAGTTCTCAAAACTGGCAAACA----AAGGGACAGAC-GTTACCACTTCA-TGA
gi|10 : tgtATAATAAATGCGGAA-----------AGAA-----------------T-T--TAGCACCAACG--TCAGG-AAA-TAAAGTTTAATCTATTCATATGAG-TTT-TGT--------CTG--AT--AG--AGATGTGTTTCA------AATA--A-----------ATA----------A-------------------AACAATCGAAGAAGTGATA--ACGTTTA-GC---ATATTT--T-T-AAAAAA--A-GCT-GAT-TGTCGCAAGGTTGGAAAACA----AAGGGACGGAA-GTTGTTACTTCA-TG
gi|11 : attgaaCTGTTGCACAGTAAATGGGCCA-----------ATTA-----------------TGT--TAGCATCTAAG--TAAAA-AAA-AAAAGTTTAAGATATTCATTTG-C-TTT-TGTTT-TTTTCCTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAA----------------------------TTCTCTAGGCAGGTAGACA----AGGGAACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATG
gi|12 : cGTTGAACTGTAAATAGGTCA-----------GT-A-----------------TGTAATAGCATCAACT--TTAGA-AAA-TAATATTTAAGCTATTCATATA-T-TTT-TGTGT-TATT-TTC--AT--AA--TTTTATGT---A------TATACCT-----------GTA----------T-------------------GACAATTAAAGAAGTGATACCAAT---G-ACTT-TAATTT--A-A-AAAAAG--A-TCT-
gi|13 : -TTTT-CTG--AT--AC--GTTTATGTATCA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAATC----AAGAGATA--ACTTTTG-ACAT-CAATTT--A-A-AAAAAA--A------ATAATTCTGAAGGCTGGTAGACA----CGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTAggtcaacttacagcttcatga
gi|14 : tcaggcaattgcaaaatgcctgttgtg--AT--AC--ATTTA-ATCT---------GTA--T-----------GTA----------A-------------------ATCTATCAAAGAAGAGATA--ACATTTG-ACTT-AATTTT--T-A-AAAAAA--A-CCCATATATTTCTCA--------AGACA----AGGGT-CGGACAGTAACA----CATTGGGTTGTGa
gi|15 : ttaccatttacTTAAA-TAATCATTTG-T-TTT--GTTT-T----CTG--AT--AG--GTTTATGTTTCA------AGTct
gi|15 : TTTCAAGTCT-AAATT-----A-AAAAAGT-A-TCA-TATATTTCTCAAGGTTGGCCGACA----AATGGACAGAT-GTAACAGCTTCA-TGAGTTctaaattaaaaaagtatcatatatttctcaaggttggccgacaaatggacagatgtaacagcttcatgagtt
gi|16 : ttaaataatcatttgttttgttttctgataggtttatgG-GCTT-AAATT-------AAAATACCA-TTT-TGTATTTCTCAAGGCTTATAAACA----ATGGGGCAGAC-GTTAAAGCTTAA-
gi|17 : AGGCTGGTAGACA----AGGAT-CGGAC-ATTACAGCTTCA-TCAGTTATG
gi|2 : ATGGGCCG-----------TACA-----------------CGT--TAGCATCAATG--TCAGA-AAA-TAAACTTTAAGCTATACGTATT-C-ACC-TCTTC-TTTT-CTA--AT--ATAAGTTTATGTATCA------AGTA--T-----------ATA----------
gi|3 : tgcatattgacctgtGCATCAACG--TCAGT-AAA-TAAAGTTTAAGCTATACGTATA-TATTT-TGTAC-TGTT-CTA--AT--ATAGGTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------ATA----------ATAGTATTTAATATATATACAACGATCGAAGAAGTGATA--TTATTTG-GTTT-ACATTA--T-ATAAAATA--G-TCT-TACGTTT-TCAAGGTTGATGAACAGTGGAGGGGGCAGAC-ATTACAGCTT-A-TGAtttaatatatatatatatatcagaatattttatatgatttaaaccaaatgttattatttcttcgattgttatatatatatatataaaatattcttatgttttccaaggttggttaacagtgaagggg
gi|4 : gcctgttgatcagtaagtCTGTTGCACAGTAA-TGGGCCA-----------ATTA-----------------TGT--TAGCATCTAAG--TAAAA-AAA-AAAAGTTTAAGATATTCATTTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGGCAGGTAGGCA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
gi|5 : CTGTTGAACAGTAAATTGACCA-------------CA-----------------T-----AGATTCAACG--TCAGA-AAG-TAAAGTTTAGGCTATTCATATA-C-AT---GTATATTTT-CTG--ATTTAC--GTTTATGTTTCA------AGTA--TATATATACATTGTG----------A-------------------AACAATCAAAGAAGTGATA--AATCT-G-GCTT-AAATTT--TAA-AAAAAA--A-GCT-T-TTTTTCTGAAGGTGGGTAAACA----AGGAGACGGAT-GTTACA
gi|6 : gcTGTTGCACAGTAAGTAGGCCA-----------ATTA-----------------TGT--TAGCATCTAAG--TAAAA-AAA--AAAGTTTAAGATATTCATTTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGGCAGGTAGGCA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTAtattc
gi|7 : CTGTTGCACAGTAAATGGACCA-----------AATA-----------------TGT--TAGCATCAGAG--TCAAA-AAA-AGAAGTTTAAGATATTCACTTG-T-TGT-TGTTT-TTTC-CTG--AT--AG--GTTTATGTTTCG------AGTA-------------------------------------------------------AAGAGGAGATA--ACTTTTG-GCAT-AAATTT--T---AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGACTGGTAAACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCGTCA-TGAGTTATGT
gi|8 : cGCACAGTAAATGGGCCA-----------ATCA-----------------TGT--TAGCATCTAAG--TAAAA-AAA-AAAAGTTTAAGATATTTATTTG-T-TTT-TGATT-TTTT-CTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAATTT--T---AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGGCAGGTAGGCA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATtgatat
gi|9 : GCCT-----------ATTG-----------------TATG-TAGCA--AACGGACCAAATAAA-TAAAGTTTAAGCTATTCATTTG-T-TTCGTTTTT-TTTT-CTG--AT--AG--GATAACATTCCATGTACCGGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAAATGAACAAGAGA----ACTTTTG-GCTTTAAATTT------AAAAAA--A-TCT-TATATTACAAAA---TGGTAGACA----AGGGGATGGAC-TTTACAGCTTTG-TTAGTTATGT
blockSeqs : AGAA AA C GA T T C A AG CG T A C . TT TAA TGTACC TATATATACATT ATAGTATTTAATATATATAC T CC C T A T ATAT CC G A T GTGG A T
blockSeqs : ATTA G A . . A A T TA T G . . . . TAG . CCT A A . G C . . TTAA T T . A . . .
blockSeqs : TACA . C . . T C A C T T . . . . G . A A T . A T . . TTT . C . T . . .
blockSeqs : ATTA . T . . T C T T T T . . . . C . T T A . C T . . TAA . T . T . . .
blockSeqs : ATTA . C . . T C A T T A . . . . A . T A A . C C . . TAA . T . T . . .
blockSeqs : AATA . A . . A A A C C T . . . . C . T A T . T T . . TTA . T . T . . .
blockSeqs : ATCA . C . . T C T T T A . . . . C . T A A . G C . . TTA . T . T . . .
blockSeqs : ATTG . A . . A A A C T T . . . . G . T A T . A C . . TTA . G . A . . .
blockSeqs : GTA . A . . A A T T T T . . . . C . T A A . G T . . TT . T . G . . .
blockSeqs : CA . A . . T A T T T T . . . . C . T A A . C C . . TT . T . A . . .
blockSeqs : C . . . C T T T T . . . . C . T A A . G T . . A . T . T . . .
blockSeqs : . T T . . . . . . G . T . A . C . . . T . T . A . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . . .
blockSeqCons : ATTA**************************** T* T* ** A***************************** TTA**** T*
originalCons : CTGTTGCACAGTAAATGGGCCA-----------ATCA-----------------TGT--TAGCATCAACG--TCAGA-AAA-TAAAGTTTAAGCTATTCATNTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTG--AT--AC--GTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAATCGAAGAAGAGATA--ANTTTCG-GCTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCAAGGCTGGTAGACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
finalCons : CTGTTGCACAGTAAATGGGCCAATTA----------------------------TGT--TAGCATCAACG--TCAGA-AAAT-AAAGTTTAAGCTATTCATNTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTG--AT--AC--GTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------GTAA-----------------------------AACAATCGAAGAAGAGATA--ANTTTCG-GCTT-AAATTTTA----AAAAAA--AT-CT-TATATTTCTCAAGGCTGGTAGACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111 333333333333333333333333333333 1111111
lowQualScore : 777 555 77 3 44 3 77 3 1 333 33 2 2 2 33 33 999 777777 33333333333333 111111111111111111111111111111 1 44 1 3 2 2 6666666 66 22 2 0 1 5555 2 2
lowQualScore : ... ... .. . .. . .. . . ... .. . . . .. .. ... ...... .............. .............................. . .. . . . . ....... .. .. . . . .... . .
lowQualScore : 888 666 99 1 66 3 11 5 0 666 99 6 9 9 77 77 555 777777 99999999999999 222222222222222222222222222222 0 22 0 4 7 7 5555555 33 77 7 3 1 7777 7 9
consensus : CTGTTGCACAGTAAATGGGCCAATTATG--T--TAGCATCAACG--TCAGA-AAA-TAAAGTTTAAGCTATTCATNTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTG--AT--AC--GTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAATCGAAGAAGAGATA--ANTTTCG-GCTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCAAGGCTGGTAGACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
Reference ( family-2338 ) : CTGTTGCACAGTAAATGGGCCAATTATG--T--TAGCATCAACG--TCAGA-AAA-TAAAGTTTAAGCTATTCATNTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTG--AT--AC--GTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAATCGAAGAAGAGATA--ANTTTCG-GCTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCAAGGCTGGTAGACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
gi|1 : CTGTTGAACAGCAAATGGCCCA--TATAGCT--TAGCATCA
gi|1 : tgtTG--T--TAGCATCAATT--TCAGA-AAAATAAA--TTAAACTATTCATATG-C-AT---GTAC-TTTT-CTGTTAT--AA--GTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------ATATATATGCGTCA-------------------AACAATCGAAGAAGTGACA--ATATTTG-GCTT-AAATTTAAT-A-AAAAAA--AGTCT-TATAGTTCTCAAAACTGGCAAACA----AAGGGACAGAC-GTTACCACTTCA-TGAgtgactttattgtcccttgttagcatcaatttcagaaaaataaattaaactattcatatgcatgtacttttctgttataagtttatgtttcaagtatatatatatgcgtcaaacaatcgaagaagtgacaatatttggcttaaatttaataaaaaaaagtcttatagttctcaaaactggcaaacaaagggacagacgttaccacttcatga
gi|10 : tgtctgttgaacagcaaatggcccatatagcttagcatcagtgactttattgtccctATAATAAATGCGGAAAGAAT---T--TAGCACCAACG--TCAGG-AAA-TAAAGTTTAATCTATTCATATGAG-TTT-TGT--------CTG--AT--AG--AGATGTGTTTCA------AATA--A-----------ATA----------A-------------------AACAATCGAAGAAGTGATA--ACGTTTA-GC---ATATTT--T-T-AAAAAA--A-GCT-GAT-TGTCGCAAGGTTGGAAAACA----AAGGGACGGAA-GTTGTTACTTCA-TG
gi|11 : attgaaCTGTTGCACAGTAAATGGGCCAATTATG--T--TAGCATCTAAG--TAAAA-AAA-AAAAGTTTAAGATATTCATTTG-C-TTT-TGTTT-TTTTCCTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAA----------------------------TTCTCTAGGCAGGTAGACA----AGGGAACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATG
gi|12 : cGTTGAACTGTAAATAGGTCAGT-ATG--TAATAGCATCAACT--TTAGA-AAA-TAATATTTAAGCTATTCATATA-T-TTT-TGTGT-TATT-TTC--AT--AA--TTTTATGT---A------TATACCT-----------GTA----------T-------------------GACAATTAAAGAAGTGATACCAAT---G-ACTT-TAATTT--A-A-AAAAAG--A-TCT-
gi|13 : -TTTT-CTG--AT--AC--GTTTATGTATCA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAATC----AAGAGATA--ACTTTTG-ACAT-CAATTT--A-A-AAAAAA--A------ATAATTCTGAAGGCTGGTAGACA----CGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTAggtcaacttacagcttcatga
gi|14 : tcaggcaattgcaaaatgcctgttgtg--AT--AC--ATTTA-ATCT---------GTA--T-----------GTA----------A-------------------ATCTATCAAAGAAGAGATA--ACATTTG-ACTT-AATTTT--T-A-AAAAAA--A-CCCATATATTTCTCA--------AGACA----AGGGT-CGGACAGTAACA----CATTGGGTTGTGa
gi|15 : ttaccatttacTTAAA-TAATCATTTG-T-TTT--GTTT-T----CTG--AT--AG--GTTTATGTTTCA------AGTct
gi|15 : TTTCAAGTCT-AAATT-----A-AAAAAGT-A-TCA-TATATTTCTCAAGGTTGGCCGACA----AATGGACAGAT-GTAACAGCTTCA-TGAGTTctaaattaaaaaagtatcatatatttctcaaggttggccgacaaatggacagatgtaacagcttcatgagtt
gi|16 : ttaaataatcatttgttttgttttctgataggtttatgG-GCTT-AAATT-------AAAATACCA-TTT-TGTATTTCTCAAGGCTTATAAACA----ATGGGGCAGAC-GTTAAAGCTTAA-
gi|17 : AGGCTGGTAGACA----AGGAT-CGGAC-ATTACAGCTTCA-TCAGTTATG
gi|2 : ATGGGCCGTACACG--T--TAGCATCAATG--TCAGA-AAA-TAAACTTTAAGCTATACGTATT-C-ACC-TCTTC-TTTT-CTA--AT--ATAAGTTTATGTATCA------AGTA--T-----------ATA----------
gi|3 : tgcatattgacctgtGCATCAACG--TCAGT-AAA-TAAAGTTTAAGCTATACGTATA-TATTT-TGTAC-TGTT-CTA--AT--ATAGGTTTATGTTTCA------AGTA--T-----------ATA----------ATAGTATTTAATATATATACAACGATCGAAGAAGTGATA--TTATTTG-GTTT-ACATTA--T-ATAAAATA--G-TCT-TACGTTT-TCAAGGTTGATGAACAGTGGAGGGGGCAGAC-ATTACAGCTT-A-TGAtttaatatatatatatatatcagaatattttatatgatttaaaccaaatgttattatttcttcgattgttatatatatatatataaaatattcttatgttttccaaggttggttaacagtgaagggg
gi|4 : gcctgttgatcagtaagtCTGTTGCACAGTAA-TGGGCCAATTATG--T--TAGCATCTAAG--TAAAA-AAA-AAAAGTTTAAGATATTCATTTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGGCAGGTAGGCA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATGT
gi|5 : CTGTTGAACAGTAAATTGACCA--CAT-------AGATTCAACG--TCAGA-AAG-TAAAGTTTAGGCTATTCATATA-C-AT---GTATATTTT-CTG--ATTTAC--GTTTATGTTTCA------AGTA--TATATATACATTGTG----------A-------------------AACAATCAAAGAAGTGATA--AATCT-G-GCTT-AAATTT--TAA-AAAAAA--A-GCT-T-TTTTTCTGAAGGTGGGTAAACA----AGGAGACGGAT-GTTACA
gi|6 : gcTGTTGCACAGTAAGTAGGCCAATTATG--T--TAGCATCTAAG--TAAAA-AAA--AAAGTTTAAGATATTCATTTG-T-TTT-TGTTT-TTTT-CTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAATTT--T-A-AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGGCAGGTAGGCA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTAtattc
gi|7 : CTGTTGCACAGTAAATGGACCAAATATG--T--TAGCATCAGAG--TCAAA-AAA-AGAAGTTTAAGATATTCACTTG-T-TGT-TGTTT-TTTC-CTG--AT--AG--GTTTATGTTTCG------AGTA-------------------------------------------------------AAGAGGAGATA--ACTTTTG-GCAT-AAATTT--T---AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGACTGGTAAACA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCGTCA-TGAGTTATGT
gi|8 : cGCACAGTAAATGGGCCAATCATG--T--TAGCATCTAAG--TAAAA-AAA-AAAAGTTTAAGATATTTATTTG-T-TTT-TGATT-TTTT-CTA--AT--AC--ATTTATGTTTTA------AGTA--T-----------GTA----------A-------------------GACAACCGAAGAAGAGATA--AGTTTCA-ACTT-AAATTT--T---AAAAAA--A-TCT-TATATTTCTCTAGGCAGGTAGGCA----AGGGGACGGAC-GTTACAGCTTCA-TGAGTTATtgatat
gi|9 : GCCTATTGTA--TG-TAGCA--AACGGACCAAATAAA-TAAAGTTTAAGCTATTCATTTG-T-TTCGTTTTT-TTTT-CTG--AT--AG--GATAACATTCCATGTACCGGTA--T-----------GTA----------A-------------------AACAAATGAACAAGAGA----ACTTTTG-GCTTTAAATTT------AAAAAA--A-TCT-TATATTACAAAA---TGGTAGACA----AGGGGATGGAC-TTTACAGCTTTG-TTAGTTATGT