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consensus                     :                                                      TCGACTCA-ATTGAATGTCATAAGACAATCGGCTACATAA-GTGCCATTGGCNATTTA-CAAAGCAAGTAATGTGAAAATACG--GCCATGGCATATAACAAATAATACACATTAACACAGAATTTACATAATTCATGAAGTG--TAA--C----CAAG-AATT-ACATAGAAGT-C-----GTAACACACATCAAAATAAACATAA-TTAAATCTAAT--TA-CGTTACATTTC-TATAATCGAATTTCTCAG---GAGA--GAG--AT-----TCTTTT-AT--A-T------AT-TTAG-CTAAATTAACCTGTACTTTTT--TATTTTTTTA------TTTTTTTANGACATAATAT-TTTTGAATTTTTGAATAGTTGCCCAAGCTTGA--TTGTGTATAT--------A--T--T--GTTCTAATAATTNTATATGCT-------------G-------------G------------AA-----ATG------ATATTCCGATTCTACTTGGTTTTGATTAC
Reference ( gi|2 )            :                                                      TCAACTCA-TTTGTATAATATAAGGCAATCGGGTACATAA-GTGCTATTGGCAATTTG-CAAACCAAGTAATGCGGAAACGAG--GCCTTGGCGTATAACAAACACTACACATTAACAGAGAATTTACATAATTCATGAAGTGAGTAATAC----CAAGGAATT-ATATAGAAGTCCTTG--ATAATACACATCAAAATAAACAGAA-C-AAATCTACTGGTA-TGTTATATT-C-TGTAATCGAACTTCTCAG--TGGGA--GAG--AT-----TGATTT-AT--A-T------AT-TAAG-CTAAATTAACATGTACTTTTTGCTGTTTTTTTGGGGGGGTTTTTTTAAGACATAATAT-TTTTGAATTTTTTAATAGTTGCCTAAGCTTGA--TTATATATAT--------A--T--T--GTTCTAATAATTCTATATGCT-------------G-------------G------------AA-----ATG------ATATTCTGACACTACTTGGTTTTAATTAC
gi|1                          :                                                      TCGACTCA-ATTCAATGTTATCAAACAATTAGTTACAAAA-GTGCCATTTGTG-TTTGACAAAGCGAGTAATGTGAAAATATT--GTCATACAATATAACAAACAATACACATTAACTAAGGATTTATATAATTCATGAAGTGTATAATACAAAACAAG--ATTAACATAAAA
gi|7                          :  tcacattgtcttattgtttatctatctcaatacattaattgtgttcaccaacTCAACTCA-ATTGTAT----TAAG-CGATCGGCTACATTA-GTGTTATTGACCTTTTA-CCAAACAAGTACCGTGAAGATT-T--GCCATGGCATACAACAACTAATACACATTGACAAAGAATTcatctaagctacatttctataatcgaatttctcagtgagaattttttattgatatttaactaattttacttttttattttttgaagacagaatataaacctgctggacaatcaagtaaaaaatgatattccgcttccacatggttttgattacaaaatatacattcactataatgtctataaatgttgtcaaaatgccctgcttcagtcgcttaattgtgagcagatgtacaaaaccagtacttgaccttttattctaattaaatcacatttaaccgtgttttaaacagattatactaaatctgttttggaacgctgtataaagactgtaaccattatt
gi|11                         : actttgttgcttttgtttatcaacatttgtaccgcaatgtagactattgtagcTCAACACAACTTGACTATCATAAGACAATCGGCAGCATAAAGTGCCATGGGCCATTAA-CAGAGCAAGTAATGTGAAAAaaagaaacaaatagcacacatcaaataaatataatcaaatcttaaatttttaaaatcaatatctcagagggacagagcaactgtttatatatctaggttaattaatttatacgttttattttttgacgacataatagttt
gi|10                         :                      tttacatgtttactttagtttggaatacgtaatgccaacccaccagctattatgtGACAAT-GGCTAAA-AA-GTGTCATTGGTAATTTA-CAAAGCAAGTAATTTGAAAAAAAGAAGCGGTGGCATATAACAAAAAATACACATTTACACAGAATTTACAtatgtccaagacaattaac
gi|4                          :                                                                                                    caactcaatgttttgAAGCATGTAATGTGAAAATACG--TCCATGACATATAACAGCTAATTCATGTTAACACAGAATTGACATAATTCATGAA----------------------TT-ACATA-------------TAA--CAAATCAAA-TAAACACAA-TTAAATATGAAGTTACTTTTTTATT-T-TAAAAT-AAATTTATCAG------A--GAG--AT-----TTTTTT-AC--AAT------AT-CTCG-CTAAATTTACCTGTACTTTTTG---------TA-------TTTTTTACAACATGATATGTTTT--ATTTTTTAAAAGTTGCCCAAGCATGA--AAGAGTATAT--------AACT--T--GTTCTAATAATTTTATATGCT-------------GGACAAACAAGTAAG------------AA-----ATG------ATATTCTGATTCTACTTGGTTTCGATTACccagtaggtacataatacacattaacacagaatttacaccagtcattaagtaca
gi|5                          :                                                                                                                     cCAAATAATGAGAATACATG--GCCATGGCATATTATAAATAATACACATGAACACAGAATTTACAT------------------------------AATT--TAT-GAAGTAC-----AAAATACACATCAAAATCAACATAA-T-A---CTTCT--TA-CATTACATTTC-TATAATCGAATTTCTCAG--GGAGA--GAG--AT-----TCTTTTCAA--A-T------AC-TAaaaatatacatactctattgttactattaacgtt
gi|10                         :                            tcacactttctttgtgttcaaagttatctccgggtcgatatctatatcattcaaacatgtatcattaacaactcagtccaactcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTACACATTAACACAGAATTTACACCAGTCATTAAGTtttctactattcaaatagtcgactgctatct
gi|16                         :                                                            caactcaatgttttggacaatggctaaaaagtgtcattggtaatttacaaagcaagtaatttgaaaaaaagaagcggtggcatataacaaaaaatacacatttacacagaatttacaccagtaggtacataaAAGTG--TAA--C----CAAGGAATT-ATATAGAAGTCCTTGGCGTAACACAaca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                          --ATAGCACACATCAAA-TAAATATAATC-AAATCT-----TA-AATT----T-T-TAAAATC-AATATCTCAG--AGGGACAGAGCAAC-----TG-TTT-AT--A-T------ATCTAGG-TT-AATTAATTTATAC--------GTTTT---------ATTTTTTGACGACATAATAG-TTT
gi|3                          :                                                                        actttgttgcttttgtttatcaacatttgtaccgcaatgtagactattgtagctcaactcaattgtattaagcgatcggctacattagtgttattgaccttttaccaaacaagtaccgtgaagatttgccatggcatacaacaactaatacacattgacaaagaattaaagaaacaaAAACAAACATAA-T-AAATCTA-----A--GTTACATTTC-TATAATCAATTTTTTCAG----GGA--GAG--AT-----TCTTTT-AT--A-TTTTTATAT-TTAGTCAAAATCAAC-TGTATTTTTT---------TTA------TTTTTTGAGGACATAATAT-TTTTGAA---------------------TCGA--TTGTGTGTGT--------A--T--TTGATTCTAATAATTATATATGCTGGACAAACAAGTAG-------------G------------AA-----AAG------GTATTCTGACA--ACTTGGTTTTGATTAC
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                           ATAAACATAA-TTGGATCTAATT-TA-AGTAACATT-CCTATAATCAAATTTCTCA----GAGA--GAG--AC-----AGATTaaactttgcaactatgttgtttctattaatgttgtgaaaatgccctgcttcattcgctaaattgtgagcaaatacgaatacgagtaattattattcgaagataatcacatttaacattatctaaatatggttcaaactcaaactgtttgaaacttaataatttagttttggtgaattatttaaaaactggaaccattc
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                       GCTACATTTC-TATAATCGAATTTCTCAG--TGAGA-------AT-----TT-TTT-ATTGA-T------AT-TTAA-CTAATTT------TACTTTTT--TATTTTTTctttt
gi|8                          :                                                            tcacattgtcttattgtttatctatctcaatacattaattgtgttcaccaactcgactcaattcaatgttatcaaacaattagttacaaaagtgccatttgtgtttgacaaagcgagtaatgtgaaaatattgtcatacaatataacaaacaatacacattaactaaggatttatataattcatgaagtgtataatacaaaacaagattaacataaaacatctaaTT-C-TATAATCGAATTTCTCAGAGTAAAA--GAG--ATAAACATCATTT-AT--A-T------AT-CTAG-CTAAATTTACCTATACTGTT--CTATTTTT--------G-------AAGACATAATAC-TTTTAAATTTTTGAATATTTGCTCTAGCTTGATGTTGTGTATAT--------A--TTGT--GTTCAAATAATTCTACATGCC-------------A-------------G------------AAAAAATACGTAAAATATATTCGGATTCTTCTCTGTTTTGATTACgaagacagaatataaacctgctggacaatcaagtaaaaaatgatattccgcttccacatggttttgattacaaaatatacattcactataatgtctataaatgttgtcaaaatgccctgcttcagtcgcttaattgtgagcagatgtacaaaaccagtacttgaccttttattctaattaaatcacatttaaccgtgttttaaacagattatactaaatctgttttggaacgctgtataaagactgtaaccattatt
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTTTT--GACATAATAT-TTTCGAATTTTTGAATAGTTGACCAAGCTTGA--TTGTGTACAT--------ATTT--T--ATTCTAATAATTGTGTATATT-------------G-------------G------------Aaaaatatgcattctcatttccatcaatgttgttgaaacgccctgct
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcaagtttatctataccttttta------------AA-----ATG------ATATTCCGCTTCCACATGGTTTTGATTACcaaaaaaatgtaagaaatgatatttcgtgattacaaaatatgcatactctgttgtttctatcagtgttgttaaaaagtccagcttcaatcgctaacttgtgggcgaaaacgagtaactttactctaagagcatttaatactatctaaatacgatttaaaataaacttatcattataattcagtttcggtgttgttaaatgtctgaaacca
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-2270 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCGACTCAA-TTGAATGTCATAAGACAATCGGCTACATAA-GTGCCATTGGCNATTTACAAAGCAAGTAATGTGAAAATACG--GCCATGGCATATAACAAATAATACACATTAACACAGAATTTACATAATTCATGAAGTG--TAA--CCAAG-AATTACATA------GAAGT------C----GTAACACACATCAAAATAAACATAATTAA-ATCTAAT--T-ACGTTACATTTCTAT-----AATCGAATTTCTCA-G-G---AGAG--AGAT-----T--CT-TTT---AT--A-T------ATTTAG-CTAAATTAACCTGTACTTTTT--TATTTTTTTA------TTTTTTTANGACATAA---TATTTTTGAATTTTTGAATAGTTGCCCAAGCTTGA--TTGTGTATAT--------A--T--T--GTTCTAATAATTNTATATGCT-------------G---------------G------------AA-----ATG------ATATTCCGATTCTACTTGGTTTTGATTAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCGACTCAA-TTCAATGTTATCAAACAATTAGTTACAAAA-GTGCCATTTGTGTTTGACAAAGCGAGTAATGTGAAAATATT--GTCATACAATATAACAAACAATACACATTAACTAAGGATTTATATAATTCATGAAGTG--TA-----------------------------------------TAATACAAAACAAGATTAACATAA--AACATCTAA-------GCTACATTTCTAT-----AATCGAATTTCTCA-GTG---AGA-----AT-----T---T-TTT---ATTGA-T------ATTTAA-CTAA--------------TTT--TACTTTTTTA------TTTTTTGAAGACAGAA---TAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcacattgtcttattgtttatctatctcaatacattaattgtgttcaccaac------------AA-----ATG------ATATTCCGCTTCCACATGGTTTTGATTACaaacctgctggacaatcaagtaaaaaatgatattccgcttccacatggttttgattacaaaatatacattcactataatgtctataaatgttgtcaaaatgccctgcttcagtcgcttaattgtgagcagatgtacaaaaccagtacttgaccttttattctaattaaatcacatttaaccgtgttttaaacagattatactaaatctgttttggaacgctgtataaagactgtaaccattatt
gi|10                         : tcacattgtcttattgtttatctatctcaatacattaattgtgttcaccaactcgactcaattcaatgttatcaaacaattagttacaaaagtgccatttgtgtttgacaaagcgagtaatgtgaaaatattgtcatacaatataacaaacaatacacattaactaaggatttatataattcatgaagtgtataatacaaaacaagattaacataaaacatctaagctacatttctataatcgaatttctcagtgagaattttttattgatatttaactaattttacttttttattttttgaagacagaatataaacctgctggacaatcaagtaaaCAA-CTCAATGTTTTG-GACAAT-GGCTAAA-AA-GTGTCATTGGTAATTTACAAAGCAAGTAATTTGAAAAAAAGAAGCGGTGGCATATAACAAAAAATACACATTTACACAGAATTTACAaaaatatacattcactataatgtctataaatgttgtcaaaatgccctgcttcagtcgcttaattgtgagcagatgtacaaaaccagtacttgaccttttattctaattaaatcacatttaaccgtgttttaaacagattatactaaatctgttttggaacgctgtataaagactgtaaccattatt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATAATACACATTAACACAGAATTTACACCAGTCATTAAGTccagtaggtacataatacacattaacacagaatttacaccagtcattaagtaca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                            caactcaatgttttggacaatggctaaaaagtgtcattggtaatttacaaagcaagtaatttgaaaaaaagaagcggtggcatataacaaaaaatacacatttacacagaatttacaccagtaggtacTCAACACAACTTGACTATCATAAGACAATCGGCAGCATAAAGTGCCATGGGCCATTAACAGAGCAAGTAATGTGAAAATATG--TCCAAGACAATTAACaca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tttacatgtttactttagtttggaatacgtaatgccaacccaccagctattatgt--TAG--CAAAG-GATTACATAACTCATGAAATA-----C----ATATTACACATC-AACTTAACAGAATTAA-GTC---T--T-AAGTTACA-----A------AAT--AACTTGTCA---G---AGAG--A
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATAAACATAATTGG-ATCTAAT--TTAAGTAACATTCCTAT-----AATCAAATTTCTCA-GAG---AGAGACAGAT-----T--CT-TTT---
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACTCAA-TT-----TTAAAAGACGATCGGCTACAAAA-GTGTCACTGGCCATTGACAAAGCAAGT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAGTG--TAA--CCAAGGAATTATATA------GAAGTCCTTGGC----GTAACACA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAACTCAT-TTGTATAATATAAGGCAATCGGGTACATAA-GTGCTATTGGCAATTTGCAAACCAAGTAATGCGGAAACGAG--GCCTTGGCGTATAACAAACACTACACATTAACAGAGAATTTACATAATTCATGAAGTGAGTAATACCAAGGAATTATATA------GAAGT------CCTTGATAATACACATCAAAATAAACAGAAC-AA-ATCTACTGGT-ATGTTATATT-CTGT-----AATCGAACTTCTCA-GTG---GGAG--AGAT-----T--GA-TTT---AT--A-T------ATTAAG-CTAAATTAACATGTACTTTTTGCTGTTTTTTTGGGGGGGTTTTTTTAAGACATAA---TATTTTTGAATTTTTTAATAGTTGCCTAAGCTTGA--TTATATATAT--------A--T--T--GTTCTAATAATTCTATATGCT-------------G---------------G------------AA-----ATG------ATATTCTGACACTACTTGGTTTTAATTAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAACAAACATAAT-AA-ATCTAA-------GTTACATTTCTAT-----AATCAATTTTTTCA-G-G----GAG--AGAT-----T--CT-TTT---AT--A-TTTTTATATTTAGTCAAAATCAAC-TGTATTTTTT--T-------TA------TTTTTTGAGGACATAA---TATTTTT--------GAA-------------TCGA--TTGTGTGTGT--------A--T--TTGATTCTAATAATTATATATGCTGGACAAACAAGTAG---------------G------------AA-----AAG------GTATTCTGA--CAACTTGGTTTTGATTAC
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cCAAATAATGAGAATACATG--GCCATGGCATATTATAAATAATACACATGAACACAGAATTTACATAATTTATGAAGTA--CAA-----------------------------------------AATACACATCAAAATCAACATAAT----A-CTTCT--T-ACATTACATTTCTAT-----AATCGAATTTCTCAGG-G---AGAG--AGAT-----T--CT-TTTCAAAT--ACT------ATTTaaaatatacatactctattgttactattaacgtt
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Reference ( family-2270 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAACTCAA-TTGAATGTTATAAGACGATCGGCTACATAA-GTGCCATTGGCNATTNACAAAGCAAGTAATGTGAAAATATG--GCCATGGCATATAACAAATAATACACATTAACACAGAATTTACATAATTCATGAAGTG--TAA--CCAAG--ATTACATAGAA-TC-----TAACACACATCAAAATAAACATAATTAA-ATCTAAT--T--A-GTTACATTTCTAT-----AATCGAATTTCTCA-G-G---AGAG--AGAT-----T--CT-TTT---AT--A-T------ATTTAGCTAAATTNACCTGTACTTTTT--TATTTTTTTA------TTTTTTGAAGACATAATATTTTTNAATTTTTGAATAGTTGCCCAAGCTTGA--TTGTGTATAT--------A--T--T--GTTCTAATAATTCTATATGCT-------------G---------------G------------AA-----ATG------ATATTCCGATTCTACTTGGTTTTGATTAC
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                            caactcaatgttttggacaatggctaaaaagtgtcattggtaatttacaaagcaagtaatttgaaaaaaagaagcggtggcatataacaaaaaatacacatttacacagaatttacaccagtaggtacTCAACACAACTTGACTATCATAAGACAATCGGCAGCATAAAGTGCCATGGGCCATTAACAGAGCAAGTAATGTGAAAATATG--TCCAAGACAATTAACaca
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAACTCAT-TTGTATAATATAAGGCAATCGGGTACATAA-GTGCTATTGGCAATTTGCAAACCAAGTAATGCGGAAACGAG--GCCTTGGCGTATAACAAACACTACACATTAACAGAGAATTTACATAATTCATGAAGTGAGTAATACCAAGGAATTATATAGAAGTCCTTGATAATACACATCAAAATAAACAGAAC-AA-ATCTACTGGT--ATGTTATATT-CTGT-----AATCGAACTTCTCA-GTG---GGAG--AGAT-----T--GA-TTT---AT--A-T------ATTAAGCTAAATTAACATGTACTTTTTGCTGTTTTTTTGGGGGGGTTTTTTTAAGACATAATATTTTTGAATTTTTTAATAGTTGCCTAAGCTTGA--TTATATATAT--------A--T--T--GTTCTAATAATTCTATATGCT-------------G---------------G------------AA-----ATG------ATATTCTGACACTACTTGGTTTTAATTAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAACAAACATAAT-AA-ATCTAA--------GTTACATTTCTAT-----AATCAATTTTTTCA-G-G----GAG--AGAT-----T--CT-TTT---AT--A-TTTTTATATTTAGTCAAAATCAACTGTATTTTTT--T-------TA------TTTTTTGAGGACATAATATTTTT--------GAA-------------TCGA--TTGTGTGTGT--------A--T--TTGATTCTAATAATTATATATGCTGGACAAACAAGTAG---------------G------------AA-----AAG------GTATTCTGA--CAACTTGGTTTTGATTAC
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tcacactttctttgtgttcaaagttatctccgggtcgatatctatatcattcaaacatgtatcattaacaactcagtccaactcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGTTTATCTATACCTTTT--TATTTTTT-----------------GACATAATATTTTCGAATTTTTGAATAGTTGACCAAGCTTGA--TTGTGTACAT--------ATTT--T--ATTCTAATAATTGTGTATATT-------------GGACAAAAAAATGTAAG------------AA-----ATG------ATATTTCGctactattcaaatagtcgactgctatct
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       actttgttgcttttgtttatcaacatttgtaccgcaatgtagactattgtagcTTTCTAT-----AATCGAATTTCTCA-G-AGTAAAAG--AGATAAACAT--CA-TTT---AT--A-T------ATCTAGCTAAATTTACCTATACTGTTC--TATTTT---------------TGAAGACATAATACTTTTAAATTTTTGAATATTTGCTCTAGCTTGATGTTGTGTATAT--------A--TTGT--GTTCAAATAATTCTACATGCC-------------A---------------G------------AAAAAATACGTAAAATATATTCGGATTCTTCTCTGTTTTGATTAC
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAACACAACTTGACTATCATAAGACAATCGGCAGCATAAAGTGCCATGGGCCATTAACAGAGCAAGTAATGTGAAAATATG--TCCAAGACAATTAAC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttacatgtttactttagtttggaatacgtaatgccaacccaccagctattatgtTAGCAAAGGATT-ACATAACTCATGAAAT-----ACA--------------------------TATTACACATC-AACTTAACAGAATTAA-GTC--T--T--A--A-GTTACA-----A------AAT--AACTTGTCA---G---AGAG--A
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATAAACATAATTGG-ATC--TAAT--TTAA-GTAACATTCCTAT-----AATCAAATTTCTCA-GAG---AGAGACAGAT-----T--CT-TTT---
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACTCAA-TT-----TTAAAAGACGATCGGCTACAAAA-GTGTCACTGGCCATTGACAAAGCAAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAACTCAT-TTGTATAATATAAGGCAATCGGGTACATAA-GTGCTATTGGCAATTTGCAAACCAAGTAATGCGGAAACGAG--GCCTTGGCGTATAACAAACACTACACATTAACAGAGAATTTACATAATTCATGAAGTGAGTAATACCAAGGAATTATATAGAAGTCCTTGATAATACACATCAAAATAAACAGAAC-AA-ATC--TACTGGT--ATGTTATATT-CTGT-----AATCGAACTTCTCA-GTG---GGAG--AGAT-----T--GA-TTT---AT--A-T------ATTAAGCTAAATTAACATGTACTTTTTGCTGTTTTTTTGGGGGGGTTTTTTTAAGACATAATATTTTTGAATTTTTTAATAGTTGCCTAAGCTTGA--TTATATATAT--------A--T--T--GTTCTAATAATTCTATATGCT-------------G---------------G------------AA-----ATG------ATATTCTGACACTACTTGGTTTTAATTAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAACAAACATAAT-AA-ATC--TAA--------GTTACATTTCTAT-----AATCAATTTTTTCA-G-G----GAG--AGAT-----T--CT-TTT---AT--A-TTTTTATATTTAGTCAAAATCAACTGTATTTTTT--T-------TA------TTTTTTGAGGACATAATATTTTT--------GAA-------------TCGA--TTGTGTGTGT--------A--T--TTGATTCTAATAATTATATATGCTGGACAAACAAGTAG---------------G------------AA-----AAG------GTATTCTGA--CAACTTGGTTTTGATTAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAGCATGTAATGTGAAAATACG--TCCATGACATATAACAGCTAATTCATGTTAACACAGAATTGACATAATTCATGAA------------------TTACATA-----------TAA--CAAATCAAA-TAAACACAATTAA-ATA--TGA------A-GTTACTTTTTTATTTTAAAAT-AAATTTATCA-G-------AG--AGAT-----T--TT-TTT---AC--AAT------ATCTCGCTAAATTTACCTGTACTTTTTG-TATTTTTT---------------ACAACATGATATGTTTTATTTTTTAAA-AGTTGCCCAAGCATGA--AAGAGTATAT--------AACT--T--GTTCTAATAATTTTATATGCT-------------GGACAAACAAGTAA--G------------AA-----ATG------ATATTCTGATTCTACTTGGTTTCGATTACaaactttgcaactatgttgtttctattaatgttgtgaaaatgccctgcttcattcgctaaattgtgagcaaatacgaatacgagtaattattattcgaagataatcacatttaacattatctaaatatggttcaaactcaaactgtttgaaacttaataatttagttttggtgaattatttaaaaactggaaccattc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cCAAATAATGAGAATACATG--GCCATGGCATATTATAAATAATACACATGAACACAGAATTTACATAATTTATGAAGT-----ACA-------A-------------------AATACACATCAAAATCAACATAA-TA----C--TTCT--T--ACATTACATTTCTAT-----AATCGAATTTCTCAGG-G---AGAG--AGAT-----T--CT-TTTCAAAT--ACT------ATTTaaaatatacatactctattgttactattaacgtt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcacactttctttgtgttcaaagttatctccgggtcgatatctatatcattcaaacatgtatcattaacaactcagtccaactcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGTTTATCTATACCTTTT--TATTTTTT-----------------GACATAATATTTTCGAATTTTTGAATAGTTGACCAAGCTTGA--TTGTGTACAT--------ATTT--T--ATTCTAATAATTGTGTATATT-------------GGACAAAAAAATGTAAG------------AA-----ATG------ATATTTCGctactattcaaatagtcgactgctatct
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcTCAACTCAA-TTGTAT----TAAG-CGATCGGCTACATTA-GTGTTATTGACCTTTTACCAAACAAGTACCGTGAAGAT-TT--GCCATGGCATACAACAACTAATACACATTGACAAAGAATT-----AA---A-GAA-------ACA-------A----ATAG----------CA---CACATCAAA-TAAATATAATCAA-ATC--T------------TAAATTTTTAA-----AATC-AATATCTCA-GAG---GGAC--AGAG-----CAACTGTTT---AT--A-T------ATCTAGGTTAATTAATTTATAC-----------GTTTTA------TTTTTTGACGACATAATAGTTTtgattacaaaatatgcatactctgttgtttctatcagtgttgttaaaaagtccagcttcaatcgctaacttgtgggcgaaaacgagtaactttactctaagagcatttaatactatctaaatacgatttaaaataaacttatcattataattcagtttcggtgttgttaaatgtctgaaacca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         actttgttgcttttgtttatcaacatttgtaccgcaatgtagactattgtagcTTTCTAT-----AATCGAATTTCTCA-G-AGTAAAAG--AGATAAACAT--CA-TTT---AT--A-T------ATCTAGCTAAATTTACCTATACTGTTC--TATTTT---------------TGAAGACATAATACTTTTAAATTTTTGAATATTTGCTCTAGCTTGATGTTGTGTATAT--------A--TTGT--GTTCAAATAATTCTACATGCC-------------A---------------G------------AAAAAATACGTAAAATATATTCGGATTCTTCTCTGTTTTGATTAC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---AT--A-T------ATTTAGCTAAATTAACATGT-------------TCTTTA------TTTGATAAAAATCT--T-TTTTTTAACTGTAGAATAGTTGCCCAAGCTTGA--TTGTATATATGCATGTAGA--T--T--GTTCTTATAATTCTATATACT-------------G---------------GACAAACAAGTGCAA-----ATG------ATATTCCGACTCTACTTAGTTTTGAATACaaaatatgcat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         : tcacattgtcttattgtttatctatctcaatacattaattgtgttcaccaactcgactcaattcaatgttatcaaacaattagttacaaaagtgccatttgtgtttgacaaagcgagtaatgtgaaaatattgtcatacaatataacaaacaatacacattaactaaggatttatataattcatgaagtgtataatacaaaacaagattaacataaaacatctaagctacatttctataatcgaatttctcagtgagaattttttattgatatttaactaattttacttttttattttttgaagacagaatataaacctgctggacaatcaagtaaaCAA-CTCAATGTTTTG-GACAAT-GGCTAAA-AA-GTGTCATTGGTAATTTACAAAGCAAGTAATTTGAAAAAAAGAAGCGGTGGCATATAACAAAAAATACACATTTACACAGAATTTACA----CCAGTAGG-------TAC------------------------ATAATACACATTAACACAGA-AT--TTAC-ACCAGTCAT--T--A-AGTACAaaaatatacattcactataatgtctataaatgttgtcaaaatgccctgcttcagtcgcttaattgtgagcagatgtacaaaaccagtacttgaccttttattctaattaaatcacatttaaccgtgttttaaacagattatactaaatctgttttggaacgctgtataaagactgtaaccattatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAACACAACTTGACTATCATAAGACAATCGGCAGCATAAAGTGCCATGGGCCATTAACAGAGCAAGTAATGTGAAAATATG--TCCAAGACAATTAAC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttacatgtttactttagtttggaatacgtaatgccaacccaccagctattatgtTAGCAAAGGATT-ACATAACTCATGAAA-------TAC-----------------AT-----AT--TACACATC-AACTTAACAGAATTAA-GTC--T--T--A--A-GTTACA-----A------AAT--AACTTGTCA---G---AGAG--A
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATAAACATAATTGG-ATC--TAAT--TTAA-GTAACATTCCTAT-----AATCAAATTTCTCA-GAG---AGAGACAGAT-----T--CT-TTT---
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACTCAA-TT-----TTAAAAGACGATCGGCTACAAAA-GTGTCACTGGCCATTGACAAAGCAAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAACTCAT-TTGTATAATATAAGGCAATCGGGTACATAA-GTGCTATTGGCAATTTGCAAACCAAGTAATGCGGAAACGAG--GCCTTGGCGTATAACAAACACTACACATTAACAGAGAATTTACATAATTCATGAAGTGAGTAATACCAAGGAATTATATAGAAGTCCTTGATAATACACATCAAAATAAACAGAAC-AA-ATC--TACTGGT--ATGTTATATT-CTGT-----AATCGAACTTCTCA-GTG---GGAG--AGAT-----T--GA-TTT---AT--A-T------ATTAAGCTAAATTAACATGTACTTTTTGCTGTTTTTTTGGGGGGGTTTTTTTAAGACATAATATTTTTGAATTTTTTAATAGTTGCCTAAGCTTGA--TTATATATAT--------A--T--T--GTTCTAATAATTCTATATGCT-------------G---------------G------------AA-----ATG------ATATTCTGACACTACTTGGTTTTAATTAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAACAAACATAAT-AA-ATC--TAA--------GTTACATTTCTAT-----AATCAATTTTTTCA-G-G----GAG--AGAT-----T--CT-TTT---AT--A-TTTTTATATTTAGTCAAAATCAACTGTATTTTTT--T-------TA------TTTTTTGAGGACATAATATTTTT--------GAA-------------TCGA--TTGTGTGTGT--------A--T--TTGATTCTAATAATTATATATGCTGGACAAACAAGTAG---------------G------------AA-----AAG------GTATTCTGA--CAACTTGGTTTTGATTAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAGCATGTAATGTGAAAATACG--TCCATGACATATAACAGCTAATTCATGTTAACACAGAATTGACATAATTCATGAAT-------TAC---------------A--T-----ATAA--CAAATCAAA-TAAACACAATTAA-ATA--TGA------A-GTTACTTTTTTATTTTAAAAT-AAATTTATCA-G-------AG--AGAT-----T--TT-TTT---AC--AAT------ATCTCGCTAAATTTACCTGTACTTTTTG-TATTTTTT---------------ACAACATGATATGTTTTATTTTTTAAA-AGTTGCCCAAGCATGA--AAGAGTATAT--------AACT--T--GTTCTAATAATTTTATATGCT-------------GGACAAACAAGTAA--G------------AA-----ATG------ATATTCTGATTCTACTTGGTTTCGATTACaaactttgcaactatgttgtttctattaatgttgtgaaaatgccctgcttcattcgctaaattgtgagcaaatacgaatacgagtaattattattcgaagataatcacatttaacattatctaaatatggttcaaactcaaactgtttgaaacttaataatttagttttggtgaattatttaaaaactggaaccattc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cCAAATAATGAGAATACATG--GCCATGGCATATTATAAATAATACACATGAACACAGAATTTACATAATTTATGAAG-------TAC---------------AA---------AATACACATCAAAATCAACATAA-TA----C--TTCT--T--ACATTACATTTCTAT-----AATCGAATTTCTCAGG-G---AGAG--AGAT-----T--CT-TTTCAAAT--ACT------ATTTaaaatatacatactctattgttactattaacgtt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcacactttctttgtgttcaaagttatctccgggtcgatatctatatcattcaaacatgtatcattaacaactcagtccaactcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGTTTATCTATACCTTTT--TATTTTTT-----------------GACATAATATTTTCGAATTTTTGAATAGTTGACCAAGCTTGA--TTGTGTACAT--------ATTT--T--ATTCTAATAATTGTGTATATT-------------GGACAAAAAAATGTAAG------------AA-----ATG------ATATTTCGctactattcaaatagtcgactgctatct
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcTCAACTCAA-TTGTAT----TAAG-CGATCGGCTACATTA-GTGTTATTGACCTTTTACCAAACAAGTACCGTGAAGAT-TT--GCCATGGCATACAACAACTAATACACATTGACAAAGAATT-----AA---A-GAA---------AC---------------AAAT-----A--GCACACATCAAA-TAAATATAATCAA-ATC--T------------TAAATTTTTAA-----AATC-AATATCTCA-GAG---GGAC--AGAG-----CAACTGTTT---AT--A-T------ATCTAGGTTAATTAATTTATACGTTTT-----------A------TTTTTTGACGACATAATAGTTTtgattacaaaatatgcatactctgttgtttctatcagtgttgttaaaaagtccagcttcaatcgctaacttgtgggcgaaaacgagtaactttactctaagagcatttaatactatctaaatacgatttaaaataaacttatcattataattcagtttcggtgttgttaaatgtctgaaacca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         actttgttgcttttgtttatcaacatttgtaccgcaatgtagactattgtagcTTTCTAT-----AATCGAATTTCTCA-G-AGTAAAAG--AGATAAACAT--CA-TTT---AT--A-T------ATCTAGCTAAATTTACCTATACTGTTC--TATTTT---------------TGAAGACATAATACTTTTAAATTTTTGAATATTTGCTCTAGCTTGATGTTGTGTATAT--------A--TTGT--GTTCAAATAATTCTACATGCC-------------A---------------G------------AAAAAATACGTAAAATATATTCGGATTCTTCTCTGTTTTGATTAC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---AT--A-T------ATTTAGCTAAATTAACATGT-------------TCTTTA------TTTGATAAAAATCT--T-TTTTTTAACTGTAGAATAGTTGCCCAAGCTTGA--TTGTATATATGCATGTAGA--T--T--GTTCTTATAATTCTATATACT-------------G---------------GACAAACAAGTGCAA-----ATG------ATATTCCGACTCTACTTAGTTTTGAATACaaaatatgcat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAACACAACTTGACTATCATAAGACAATCGGCAGCATAAAGTGCCATGGGCCATTAACAGAGCAAGTAATGTGAAAATATG--TCCAAGACAATTAAC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttacatgtttactttagtttggaatacgtaatgccaacccaccagctattatgtTAGCAAAGGATT-ACATAACTCATGAAAT-------AC---------------A--T-----AT--TACACATC-AACTTAACAGAATTAA-GTC--T--T--A--A-GTTACA-----A------AAT--AACTTGTCA---G---AGAG--A
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATAAACATAATTGG-ATC--TAAT--TTAA-GTAACATTCCTAT-----AATCAAATTTCTCA-GAG---AGAGACAGAT-----T--CT-TTT---
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACTCAA-TT-----TTAAAAGACGATCGGCTACAAAA-GTGTCACTGGCCATTGACAAAGCAAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAACTCAT-TTGTATAATATAAGGCAATCGGGTACATAA-GTGCTATTGGCAATTTGCAAACCAAGTAATGCGGAAACGAG--GCCTTGGCGTATAACAAACACTACACATTAACAGAGAATTTACATAATTCATGAAGTGAGTAATACCAAGGAATTATATAGAAGTCCTTGATAATACACATCAAAATAAACAGAAC-AA-ATC--TACTGGT--ATGTTATATT-CTGT-----AATCGAACTTCTCA-GTG---GGAG--AGAT-----T--GA-TTT---AT--A-T------ATTAAGCTAAATTAACATGTACTTTTTGCTGTTTTTTTGGGGGGGTTTTTTTAAGACATAATATTTTTGAATTTTTTAATAGTTGCCTAAGCTTGA--TTATATATAT--------A--T--T--GTTCTAATAATTCTATATGCT-------------G---------------G------------AA-----ATG------ATATTCTGACACTACTTGGTTTTAATTAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAACAAACATAAT-AA-ATC--TAA--------GTTACATTTCTAT-----AATCAATTTTTTCA-G-G----GAG--AGAT-----T--CT-TTT---AT--A-TTTTTATATTTAGTCAAAATCAACTGTATTTTTT--T-------TA------TTTTTTGAGGACATAATATTTTT--------GAA-------------TCGA--TTGTGTGTGT--------A--T--TTGATTCTAATAATTATATATGCTGGACAAACAAGTAG---------------G------------AA-----AAG------GTATTCTGA--CAACTTGGTTTTGATTAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAGCATGTAATGTGAAAATACG--TCCATGACATATAACAGCTAATTCATGTTAACACAGAATTGACATAATTCATGAATT-------AC---------------A--T-----ATAA--CAAATCAAA-TAAACACAATTAA-ATA--TGA------A-GTTACTTTTTTATTTTAAAAT-AAATTTATCA-G-------AG--AGAT-----T--TT-TTT---AC--AAT------ATCTCGCTAAATTTACCTGTACTTTTTG-TATTTTTT---------------ACAACATGATATGTTTTATTTTTTAAA-AGTTGCCCAAGCATGA--AAGAGTATAT--------AACT--T--GTTCTAATAATTTTATATGCT-------------GGACAAACAAGTAA--G------------AA-----ATG------ATATTCTGATTCTACTTGGTTTCGATTACaaactttgcaactatgttgtttctattaatgttgtgaaaatgccctgcttcattcgctaaattgtgagcaaatacgaatacgagtaattattattcgaagataatcacatttaacattatctaaatatggttcaaactcaaactgtttgaaacttaataatttagttttggtgaattatttaaaaactggaaccattc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cCAAATAATGAGAATACATG--GCCATGGCATATTATAAATAATACACATGAACACAGAATTTACATAATTTATGAAGT-------AC---------------AA---------AATACACATCAAAATCAACATAA-TA----C--TTCT--T--ACATTACATTTCTAT-----AATCGAATTTCTCAGG-G---AGAG--AGAT-----T--CT-TTTCAAAT--ACT------ATTTaaaatatacatactctattgttactattaacgtt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcacactttctttgtgttcaaagttatctccgggtcgatatctatatcattcaaacatgtatcattaacaactcagtccaactcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGTTTATCTATACCTTTT--TATTTTTT-----------------GACATAATATTTTCGAATTTTTGAATAGTTGACCAAGCTTGA--TTGTGTACAT--------ATTT--T--ATTCTAATAATTGTGTATATT-------------GGACAAAAAAATGTAAG------------AA-----ATG------ATATTTCGctactattcaaatagtcgactgctatct
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcTCAACTCAA-TTGTAT----TAAG-CGATCGGCTACATTA-GTGTTATTGACCTTTTACCAAACAAGTACCGTGAAGAT-TT--GCCATGGCATACAACAACTAATACACATTGACAAAGAATT-----AA---A-GAA---------AC---------------AA-------ATAGCACACATCAAA-TAAATATAATCAA-ATC--T------------TAAATTTTTAA-----AATC-AATATCTCA-GAG---GGAC--AGAG-----CAACTGTTT---AT--A-T------ATCTAGGTTAATTAATTTATACGTTTT-----------A------TTTTTTGACGACATAATAGTTTtgattacaaaatatgcatactctgttgtttctatcagtgttgttaaaaagtccagcttcaatcgctaacttgtgggcgaaaacgagtaactttactctaagagcatttaatactatctaaatacgatttaaaataaacttatcattataattcagtttcggtgttgttaaatgtctgaaacca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         actttgttgcttttgtttatcaacatttgtaccgcaatgtagactattgtagcTTTCTAT-----AATCGAATTTCTCA-G-AGTAAAAG--AGATAAACAT--CA-TTT---AT--A-T------ATCTAGCTAAATTTACCTATACTGTTC--TATTTT---------------TGAAGACATAATACTTTTAAATTTTTGAATATTTGCTCTAGCTTGATGTTGTGTATAT--------A--TTGT--GTTCAAATAATTCTACATGCC-------------A---------------G------------AAAAAATACGTAAAATATATTCGGATTCTTCTCTGTTTTGATTAC
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         : tcacattgtcttattgtttatctatctcaatacattaattgtgttcaccaactcgactcaattcaatgttatcaaacaattagttacaaaagtgccatttgtgtttgacaaagcgagtaatgtgaaaatattgtcatacaatataacaaacaatacacattaactaaggatttatataattcatgaagtgtataatacaaaacaagattaacataaaacatctaagctacatttctataatcgaatttctcagtgagaattttttattgatatttaactaattttacttttttattttttgaagacagaatataaacctgctggacaatcaagtaaaCAA-CTCAATGTTTTG-GACAAT-GGCTAAA-AA-GTGTCATTGGTAATTTACAAAGCAAGTAATTTGAAAAAAAGAAGCGGTGGCATATAACAAAAAATACACATTTACACAGAATTTACA----CCA-----GTA--GGTAC------------------------ATAATACACATTAACACAGA-AT--TTAC-ACCAGTCAT--T--A-AGTACAaaaatatacattcactataatgtctataaatgttgtcaaaatgccctgcttcagtcgcttaattgtgagcagatgtacaaaaccagtacttgaccttttattctaattaaatcacatttaaccgtgttttaaacagattatactaaatctgttttggaacgctgtataaagactgtaaccattatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAACACAACTTGACTATCATAAGACAATCGGCAGCATAAAGTGCCATGGGCCATTAACAGAGCAAGTAATGTGAAAATATG--TCCAAGACAATTAAC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttacatgtttactttagtttggaatacgtaatgccaacccaccagctattatgtTAGCAAAGGATT-ACATAACTCA-----TGA--AATAC------AT----------------AT--TACACATC-AACTTAACAGAATTAA-GTC--T--T--A--A-GTTACA-----A------AAT--AACTTGTCA---G---AGAG--A
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATAAACATAATTGG-ATC--TAAT--TTAA-GTAACATTCCTAT-----AATCAAATTTCTCA-GAG---AGAGACAGAT-----T--CT-TTT---
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACTCAA-TT-----TTAAAAGACGATCGGCTACAAAA-GTGTCACTGGCCATTGACAAAGCAAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAACTCAT-TTGTATAATATAAGGCAATCGGGTACATAA-GTGCTATTGGCAATTTGCAAACCAAGTAATGCGGAAACGAG--GCCTTGGCGTATAACAAACACTACACATTAACAGAGAATTTACATAATTCATGAAGTGAGTAATACCAAGGAATTATATAGAAGTCCTTGATAATACACATCAAAATAAACAGAAC-AA-ATC--TACTGGT--ATGTTATATT-CTGT-----AATCGAACTTCTCA-GTG---GGAG--AGAT-----T--GA-TTT---AT--A-T------ATTAAGCTAAATTAACATGTACTTTTTGCTGTTTTTTTGGGGGGGTTTTTTTAAGACATAATATTTTTGAATTTTTTAATAGTTGCCTAAGCTTGA--TTATATATAT--------A--T--T--GTTCTAATAATTCTATATGCT-------------G---------------G------------AA-----ATG------ATATTCTGACACTACTTGGTTTTAATTAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAACAAACATAAT-AA-ATC--TAA--------GTTACATTTCTAT-----AATCAATTTTTTCA-G-G----GAG--AGAT-----T--CT-TTT---AT--A-TTTTTATATTTAGTCAAAATCAACTGTATTTTTT--T-------TA------TTTTTTGAGGACATAATATTTTT--------GAA-------------TCGA--TTGTGTGTGT--------A--T--TTGATTCTAATAATTATATATGCTGGACAAACAAGTAG---------------G------------AA-----AAG------GTATTCTGA--CAACTTGGTTTTGATTAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAGCATGTAATGTGAAAATACG--TCCATGACATATAACAGCTAATTCATGTTAACACAGAATTGACATAATTCA-----TGA--ATTAC-----A-T----------------ATAA--CAAATCAAA-TAAACACAATTAA-ATA--TGA------A-GTTACTTTTTTATTTTAAAAT-AAATTTATCA-G-------AG--AGAT-----T--TT-TTT---AC--AAT------ATCTCGCTAAATTTACCTGTACTTTTTG-TATTTTTT---------------ACAACATGATATGTTTTATTTTTTAAA-AGTTGCCCAAGCATGA--AAGAGTATAT--------AACT--T--GTTCTAATAATTTTATATGCT-------------GGACAAACAAGTAA--G------------AA-----ATG------ATATTCTGATTCTACTTGGTTTCGATTACaaactttgcaactatgttgtttctattaatgttgtgaaaatgccctgcttcattcgctaaattgtgagcaaatacgaatacgagtaattattattcgaagataatcacatttaacattatctaaatatggttcaaactcaaactgtttgaaacttaataatttagttttggtgaattatttaaaaactggaaccattc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cCAAATAATGAGAATACATG--GCCATGGCATATTATAAATAATACACATGAACACAGAATTTACATAATTTA-----TGA--AGTAC-----AA-------------------AATACACATCAAAATCAACATAA-TA----C--TTCT--T--ACATTACATTTCTAT-----AATCGAATTTCTCAGG-G---AGAG--AGAT-----T--CT-TTTCAAAT--ACT------ATTTaaaatatacatactctattgttactattaacgtt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcacactttctttgtgttcaaagttatctccgggtcgatatctatatcattcaaacatgtatcattaacaactcagtccaactcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGTTTATCTATACCTTTT--TATTTTTT-----------------GACATAATATTTTCGAATTTTTGAATAGTTGACCAAGCTTGA--TTGTGTACAT--------ATTT--T--ATTCTAATAATTGTGTATATT-------------GGACAAAAAAATGTAAG------------AA-----ATG------ATATTTCGctactattcaaatagtcgactgctatct
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcTCAACTCAA-TTGTAT----TAAG-CGATCGGCTACATTA-GTGTTATTGACCTTTTACCAAACAAGTACCGTGAAGAT-TT--GCCATGGCATACAACAACTAATACACATTGACAAAGAATT-----AA---A------GA--A--AC-----AA-----------------ATAGCACACATCAAA-TAAATATAATCAA-ATC--T------------TAAATTTTTAA-----AATC-AATATCTCA-GAG---GGAC--AGAG-----CAACTGTTT---AT--A-T------ATCTAGGTTAATTAATTTATACGTTTT-----------A------TTTTTTGACGACATAATAGTTTtgattacaaaatatgcatactctgttgtttctatcagtgttgttaaaaagtccagcttcaatcgctaacttgtgggcgaaaacgagtaactttactctaagagcatttaatactatctaaatacgatttaaaataaacttatcattataattcagtttcggtgttgttaaatgtctgaaacca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         actttgttgcttttgtttatcaacatttgtaccgcaatgtagactattgtagcTTTCTAT-----AATCGAATTTCTCA-G-AGTAAAAG--AGATAAACAT--CA-TTT---AT--A-T------ATCTAGCTAAATTTACCTATACTGTTC--TATTTT---------------TGAAGACATAATACTTTTAAATTTTTGAATATTTGCTCTAGCTTGATGTTGTGTATAT--------A--TTGT--GTTCAAATAATTCTACATGCC-------------A---------------G------------AAAAAATACGTAAAATATATTCGGATTCTTCTCTGTTTTGATTAC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---AT--A-T------ATTTAGCTAAATTAACATGT-------------TCTTTA------TTTGATAAAAATCT--T-TTTTTTAACTGTAGAATAGTTGCCCAAGCTTGA--TTGTATATATGCATGTAGA--T--T--GTTCTTATAATTCTATATACT-------------G---------------GACAAACAAGTGCAA-----ATG------ATATTCCGACTCTACTTAGTTTTGAATACaaaatatgcat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         : tcacattgtcttattgtttatctatctcaatacattaattgtgttcaccaactcgactcaattcaatgttatcaaacaattagttacaaaagtgccatttgtgtttgacaaagcgagtaatgtgaaaatattgtcatacaatataacaaacaatacacattaactaaggatttatataattcatgaagtgtataatacaaaacaagattaacataaaacatctaagctacatttctataatcgaatttctcagtgagaattttttattgatatttaactaattttacttttttattttttgaagacagaatataaacctgctggacaatcaagtaaaCAA-CTCAATGTTTTG-GACAAT-GGCTAAA-AA-GTGTCATTGGTAATTTACAAAGCAAGTAATTTGAAAAAAAGAAGCGGTGGCATATAACAAAAAATACACATTTACACAGAATTTACA----CCA-----GTA--GGTAC------------------------ATAATACACATTAACACAGA-AT--TTAC-ACCAGTCAT--T--A-AGTACAaaaatatacattcactataatgtctataaatgttgtcaaaatgccctgcttcagtcgcttaattgtgagcagatgtacaaaaccagtacttgaccttttattctaattaaatcacatttaaccgtgttttaaacagattatactaaatctgttttggaacgctgtataaagactgtaaccattatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAACACAACTTGACTATCATAAGACAATCGGCAGCATAAAGTGCCATGGGCCATTAACAGAGCAAGTAATGTGAAAATATG--TCCAAGACAATTAAC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttacatgtttactttagtttggaatacgtaatgccaacccaccagctattatgtTAGCAAAGGATT-ACATAACTCA-----TGA--AATAC------AT----------------AT--TACACATC-AACTTAACAGAATTAA-GTC--T--T--A--A-GTTACA-----A------AAT--AACTTGTCA---G---AGAG--A
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATAAACATAATTGG-ATC--TAAT--TTAA-GTAACATTCCTAT-----AATCAAATTTCTCA-GAG---AGAGACAGAT-----T--CT-TTT---
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACTCAA-TT-----TTAAAAGACGATCGGCTACAAAA-GTGTCACTGGCCATTGACAAAGCAAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCAACTCAT-TTGTATAATATAAGGCAATCGGGTACATAA-GTGCTATTGGCAATTTGCAAACCAAGTAATGCGGAAACGAG--GCCTTGGCGTATAACAAACACTACACATTAACAGAGAATTTACATAATTCATGAAGTGAGTAATACCAAGGAATTATATAGAAGTCCTTGATAATACACATCAAAATAAACAGAAC-AA-ATC--TACTGGT--ATGTTATATT-CTGT-----AATCGAACTTCTCA-GTG---GGAG--AGAT-----T--GA-TTT---AT--A-T------ATTAAGCTAAATTAACATGTACTTTTTGCTGTTTTTTTGGGGGGGTTTTTTTAAGACATAATATTTTTGAATTTTTTAATAGTTGCCTAAGCTTGA--TTATATATAT--------A--T--T--GTTCTAATAATTCTATATGCT-------------G---------------G------------AA-----ATG------ATATTCTGACACTACTTGGTTTTAATTAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAACAAACATAAT-AA-ATC--TAA--------GTTACATTTCTAT-----AATCAATTTTTTCA-G-G----GAG--AGAT-----T--CT-TTT---AT--A-TTTTTATATTTAGTCAAAATCAACTGTATTTTTT--T-------TA------TTTTTTGAGGACATAATATTTTT--------GAA-------------TCGA--TTGTGTGTGT--------A--T--TTGATTCTAATAATTATATATGCTGGACAAACAAGTAG---------------G------------AA-----AAG------GTATTCTGA--CAACTTGGTTTTGATTAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAGCATGTAATGTGAAAATACG--TCCATGACATATAACAGCTAATTCATGTTAACACAGAATTGACATAATTCA-----TGA--ATTAC-----A-T----------------ATAA--CAAATCAAA-TAAACACAATTAA-ATA--TGA------A-GTTACTTTTTTATTTTAAAAT-AAATTTATCA-G-------AG--AGAT-----T--TT-TTT---AC--AAT------ATCTCGCTAAATTTACCTGTACTTTTTG-TATTTTTT---------------ACAACATGATATGTTTTATTTTTTAAA-AGTTGCCCAAGCATGA--AAGAGTATAT--------AACT--T--GTTCTAATAATTTTATATGCT-------------GGACAAACAAGTAA--G------------AA-----ATG------ATATTCTGATTCTACTTGGTTTCGATTACaaactttgcaactatgttgtttctattaatgttgtgaaaatgccctgcttcattcgctaaattgtgagcaaatacgaatacgagtaattattattcgaagataatcacatttaacattatctaaatatggttcaaactcaaactgtttgaaacttaataatttagttttggtgaattatttaaaaactggaaccattc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cCAAATAATGAGAATACATG--GCCATGGCATATTATAAATAATACACATGAACACAGAATTTACATAATTTA-----TGA--AGTAC-----AA-------------------AATACACATCAAAATCAACATAA-TA----C--TTCT--T--ACATTACATTTCTAT-----AATCGAATTTCTCAGG-G---AGAG--AGAT-----T--CT-TTTCAAAT--ACT------ATTTaaaatatacatactctattgttactattaacgtt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcacactttctttgtgttcaaagttatctccgggtcgatatctatatcattcaaacatgtatcattaacaactcagtccaactcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGTTTATCTATACCTTTT--TATTTTTT-----------------GACATAATATTTTCGAATTTTTGAATAGTTGACCAAGCTTGA--TTGTGTACAT--------ATTT--T--ATTCTAATAATTGTGTATATT-------------GGACAAAAAAATGTAAG------------AA-----ATG------ATATTTCGctactattcaaatagtcgactgctatct
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcTCAACTCAA-TTGTAT----TAAG-CGATCGGCTACATTA-GTGTTATTGACCTTTTACCAAACAAGTACCGTGAAGAT-TT--GCCATGGCATACAACAACTAATACACATTGACAAAGAATT-----AA---A------GA--A--AC-----AA-----------------ATAGCACACATCAAA-TAAATATAATCAA-ATC--T------------TAAATTTTTAA-----AATC-AATATCTCA-GAG---GGAC--AGAG-----CAACTGTTT---AT--A-T------ATCTAGGTTAATTAATTTATACGTTTT-----------A------TTTTTTGACGACATAATAGTTTtgattacaaaatatgcatactctgttgtttctatcagtgttgttaaaaagtccagcttcaatcgctaacttgtgggcgaaaacgagtaactttactctaagagcatttaatactatctaaatacgatttaaaataaacttatcattataattcagtttcggtgttgttaaatgtctgaaacca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         actttgttgcttttgtttatcaacatttgtaccgcaatgtagactattgtagcTTTCTAT-----AATCGAATTTCTCA-G-AGTAAAAG--AGATAAACAT--CA-TTT---AT--A-T------ATCTAGCTAAATTTACCTATACTGTTC--TATTTT---------------TGAAGACATAATACTTTTAAATTTTTGAATATTTGCTCTAGCTTGATGTTGTGTATAT--------A--TTGT--GTTCAAATAATTCTACATGCC-------------A---------------G------------AAAAAATACGTAAAATATATTCGGATTCTTCTCTGTTTTGATTAC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ---AT--A-T------ATTTAGCTAAATTAACATGT-------------TCTTTA------TTTGATAAAAATCT--T-TTTTTTAACTGTAGAATAGTTGCCCAAGCTTGA--TTGTATATATGCATGTAGA--T--T--GTTCTTATAATTCTATATACT-------------G---------------GACAAACAAGTGCAA-----ATG------ATATTCCGACTCTACTTAGTTTTGAATACaaaatatgcat


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Reference ( family-2270 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCAACTCAA-TTGAATGTTATAAGACGATCGGCTACATAA-GTGCCATTGGCNATTNACAAAGCAAGTAATGTGAAAATATG--GCCATGGCATATAACAAATAATACACATTAACANAGAATTTACATAATTCA-----TGA--AGTAC-----AAT----------------ATAATACACATCAAAATAAACATAATTA----A-ATC-T-----TAAGTTACATTTCTAT-----AATCGAATTTCTCA-G-G---AGAG--AGAT-----T--CT-TTT---AT--A-T------ATTTAGCTAAATTNACCTGTACTTTTT--TNTTTTTTTG-------------A-AGACATAATATTTTTNAATTTTTGAATAGTTGCCCAAGCTTGA--TTGTGTATAT--AT-T---TTGTTCTAATAATTCTATATGCT-GGACAAACAA--GTAAG-AAATGATATTCCGATTCTACTTGGTTTTGATTAC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcacattgtcttattgtttatctatctcaatacattaattgtgttcaccaacTGCT-GGACAATCAA--GTAAA-AAATGATATTCCGCTTCCACATGGTTTTGATTACaaacctgctggacaatcaagtaaaaaatgatattccgcttccacatggttttgattacaaaatatacattcactataatgtctataaatgttgtcaaaatgccctgcttcagtcgcttaattgtgagcagatgtacaaaaccagtacttgaccttttattctaattaaatcacatttaaccgtgttttaaacagattatactaaatctgttttggaacgctgtataaagactgtaaccattatt
gi|10                         : tcacattgtcttattgtttatctatctcaatacattaattgtgttcaccaactcgactcaattcaatgttatcaaacaattagttacaaaagtgccatttgtgtttgacaaagcgagtaatgtgaaaatattgtcatacaatataacaaacaatacacattaactaaggatttatataattcatgaagtgtataatacaaaacaagattaacataaaacatctaagctacatttctataatcgaatttctcagtgagaattttttattgatatttaactaattttacttttttattttttgaagacagaatataaaccCAA-CTCAATGTTTTG-GACAAT-GGCTAAA-AA-GTGTCATTGGTAATTTACAAAGCAAGTAATTTGAAAAAAAGAAGCGGTGGCATATAACAAAAAATACACATTTACACAGAATTTACA----CCA-----GTA--GGTAC------------------------ATAATACACATTAACACAGA-AT--TTACACCA-GTCAT-----TAAG-TACAaaaatatacattcactataatgtctataaatgttgtcaaaatgccctgcttcagtcgcttaattgtgagcagatgtacaaaaccagtacttgaccttttattctaattaaatcacatttaaccgtgttttaaacagattatactaaatctgttttggaacgctgtataaagactgtaaccattatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCAACACAACTTGACTATCATAAGACAATCGGCAGCATAAAGTGCCATGGGCCATTAACAGAGCAAGTAATGTGAAAATATG--TCCAAGACAATTAAC
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tttacatgtttactttagtttggaatacgtaatgccaacccaccagctattatgtTAGCAAAGGATT-ACATAACTCA-----TGA--AATAC-----A-T----------------AT--TACACATCAACTTAA-CAGAATTA----A-GTC-T-----TAAGTTACA-----A------AAT--AACTTGTCA---G---AGAG--A
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATAAACATAATTG----G-ATC-TAATT-TAAGTAACATTCCTAT-----AATCAAATTTCTCA-GAG---AGAGACAGAT-----T--CT-TTT---
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACTCAA-TT-----TTAAAAGACGATCGGCTACAAAA-GTGTCACTGGCCATTGACAAAGCAAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCAACTCAT-TTGTATAATATAAGGCAATCGGGTACATAA-GTGCTATTGGCAATTTGCAAACCAAGTAATGCGGAAACGAG--GCCTTGGCGTATAACAAACACTACACATTAACAGAGAATTTACATAATTCATGAAGTGAGTAATACCAAGGAATTATATAGAAGTCCTTGATAATACACATCAAAATAAACAGAAC-A----A-ATC-TACTGGTATGTTATATT-CTGT-----AATCGAACTTCTCA-GTG---GGAG--AGAT-----T--GA-TTT---AT--A-T------ATTAAGCTAAATTAACATGTACTTTTTGCTGTTTTTTTGGGGGGGTTTTTTTA-AGACATAATATTTTTGAATTTTTTAATAGTTGCCTAAGCTTGA--TTATATATAT--A------TTGTTCTAATAATTCTATATGCT-G---------------G-AAATGATATTCTGACACTACTTGGTTTTAATTAC
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAACAAACATAAT-A----A-ATC-T------AAGTTACATTTCTAT-----AATCAATTTTTTCA-G-G----GAG--AGAT-----T--CT-TTT---AT--A-TTTTTATATTTAGTCAAAATCAACTGTATTTTTT--TTATTTTTTG-------------A-GGACATAATATTTTT--------GAA-------------TCGA--TTGTGTGTGT--AT-T---TGATTCTAATAATTATATATGCT-GGACAAACAA--GTAGG-AAAAGGTATTCTGA--CAACTTGGTTTTGATTAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AAGCATGTAATGTGAAAATACG--TCCATGACATATAACAGCTAATTCATGTTAACACAGAATTGACATAATTCA-----TGA--ATTAC-----A-T----------------ATAA--CAAATCAAA-TAAACACAATTA----A-ATA-T-----GAAGTTACTTTTTTATTTTAAAAT-AAATTTATCA-G-------AG--AGAT-----T--TT-TTT---AC--AAT------ATCTCGCTAAATTTACCTGTACTTTTTG-TATTTTTT---------------A-CAACATGATATGTTTTATTTTTTAAA-AGTTGCCCAAGCATGA--AAGAGTATAT--AA-C---TTGTTCTAATAATTTTATATGCT-GGACAAACAA--GTAAG-AAATGATATTCTGATTCTACTTGGTTTCGATTACaaactttgcaactatgttgtttctattaatgttgtgaaaatgccctgcttcattcgctaaattgtgagcaaatacgaatacgagtaattattattcgaagataatcacatttaacattatctaaatatggttcaaactcaaactgtttgaaacttaataatttagttttggtgaattatttaaaaactggaaccattc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cCAAATAATGAGAATACATG--GCCATGGCATATTATAAATAATACACATGAACACAGAATTTACATAATTTA-----TGA--AGTAC-----AA-------------------AATACACATCAAAATCAACATAA-TA----C-TTC-T-----TACATTACATTTCTAT-----AATCGAATTTCTCAGG-G---AGAG--AGAT-----T--CT-TTTCAAAT--ACT------ATTTaaaatatacatactctattgttactattaacgtt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tcacactttctttgtgttcaaagttatctccgggtcgatatctatatcattcaaacatgtatcattaacaactcagtccaactcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAGTTTATCTATACCTTTT--TATTTTTT------------------GACATAATATTTTCGAATTTTTGAATAGTTGACCAAGCTTGA--TTGTGTACAT--AT-T---TTATTCTAATAATTGTGTATATT-GGACAAAAAAATGTAAG-AAATGATATTTCGctactattcaaatagtcgactgctatct
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tcTCAACTCAA-TTGTAT----TAAG-CGATCGGCTACATTA-GTGTTATTGACCTTTTACCAAACAAGTACCGTGAAGAT-TT--GCCATGGCATACAACAACTAATACACATTGACAAAGAATT-----AA---A------GA--A--AC-----AA-----------------ATAGCACACATCAAA-TAAATATAATCA----A-ATC-T-----TAA-----ATTTTTAA-----AATC-AATATCTCA-GAG---GGAC--AGAG-----CAACTGTTT---AT--A-T------ATCTAGGTTAATTAATTTATACGTTTT----ATTTTTTG-------------A-CGACATAATAGTTTtgattacaaaatatgcatactctgttgtttctatcagtgttgttaaaaagtccagcttcaatcgctaacttgtgggcgaaaacgagtaactttactctaagagcatttaatactatctaaatacgatttaaaataaacttatcattataattcagtttcggtgttgttaaatgtctgaaacca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       actttgttgcttttgtttatcaacatttgtaccgcaatgtagactattgtagcTTTCTAT-----AATCGAATTTCTCA-G-AGTAAAAG--AGATAAACAT--CA-TTT---AT--A-T------ATCTAGCTAAATTTACCTATACTGTTC--TATTTT--TG-------------A-AGACATAATACTTTTAAATTTTTGAATATTTGCTCTAGCTTGATGTTGTGTATAT--AT-T---GTGTTCAAATAATTCTACATGCCAGAAAAAATAC--GTA---AAAT-ATATTCGGATTCTTCTCTGTTTTGATTAC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ---AT--A-T------ATTTAGCTAAATTAACATGT---------TCTTTATTTG-------------ATAAAAATCTT-TTTTTTAACTGTAGAATAGTTGCCCAAGCTTGA--TTGTATATATGCATGTAGATTGTTCTTATAATTCTATATACT-GGACAAACAA--GT--GCAAATGATATTCCGACTCTACTTAGTTTTGAATACaaaatatgcat
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): TGTTAAATTGTATACGTAAACCAGTAACTTTGATTCTAAGATAATCGCATTTAACATAAGCTTAATACGATTCAATCTCAAACTGTGTTTTAGACATATTATGATATTTCAGTTTTGGCGAGATGTTTAAGGTCTACAA
Unaligned ( gi|16 ): AAGTGTAACCAAGGAATTATATAGAAGTCCTTGGCGTAACACA