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Reference ( gi|1 )            : GGATGTGTTGCTTTAAAGGTAATATACATGTATCAGGATT-TTG-AAAAGATTTTA-AATTGGCATAAA--ACA----TTATTT--CC---AATACAAAATGCCTGTATACACTCACTGACCCCACATTATCAAAAGGATATA-ATATATATATCTATTTAATCTTGACAAATT--TATATTA--------T--TAAAAAGAGCTTTTCTAA---CTTAGGCTACGCACCTAGGTGAGACTGAAATAGATTTCCCGCTTAAAAGTTCAACATATTTTATAACATATTAAATGTGTCACG---------TGATTTCATTTTGATTT---------------------AGTATTTCAGTT-AAAAGGGAGCGCAC-----------AACAAACAATTTGAACTGGTATACATGTTTTTCAGTAGGAATATAGTG-AATTCAAATTTTTTTTTAAAGAGTAGATCTTCCATTAAATTGTTTCATCTTAAAAAGAGTCCAAATGACGTCAAGCAGTATTTAAGAG--CTGTCT-----TAA-------------ATT------------TCAAGTTTACCTCT-CCAATTTATATATCG--ATTATAGTATA-ATGTCACATTTTGGAGGATCT--GACACCTCAAACCATTTGGATTTTATTT-CTTA-ATGATGA-GAAT--GATGCT-TTTTATCTATTTTAGAAATAACTATATT-TTTTAACACATTTATAG--CATTTTTTT-CTGATATAA
gi|7                          :      TATTGCTTTTATGGAGA-----ATATATCTGAATTGTTT-AAAT--TTTTA-AATTAAC-TAAA--ACACGTTTTTTTC--CC---TATATAGCATGCATATGTATACTCTATATCCCCATATTAATATAAGGA------------TAGCTATTCAAACATGCCAAAAT--AATA-TG--------T--TGGAAAGGGATTTCCT
gi|4                          :   gagacatGTTTTAAAGAGAAT-----T-TGTCAGGATT-TTTTCCAACATTTAA-AATTGAC-TAAATTACA----TTTTTTTCCC---AGTATATCACGACTGTATATACTCATTGACCCTGTATTGCCAAA----------TACATATAT--ATTTAATCCTGTCAAAATAATATATTAAACATATAT--TAAAAAGGGATTTCCTAA---CT------ACGCGCCGAGGTTAGACTAAAATAGATTCCCCGCTTAAACGTGCAGCATATTTTGTGACGTAGTGAATGAGTCACA---------TGATTTCATTTTGATTT---------------------
gi|8                          : atttggcaaattgtgagtcactgaatgATTTATCAGGATT-TTT-TAAA-ATTTCAGAATTGG-GTAAA--ACA----TTTTTT--TCCCGAAAATATCATGCTTATATATACTCACTGACCCCGTAGTGCTAAAATGATATA------------TAGTTGAACATGCCAAAAC---ATATTA--------TATTGAAAAGGGATTTCCTAA---CTTGGcaaactgatccgttatatacaggcgtggatccagg
gi|6                          :                                                                                                       aagggaTACCCCCGTCGACCCAAC--TACCGAAACGATATATATATATATATCT
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                     atttttaagggaatttatcaggTTCCGGCTTTATAGTACAACCTATTTTGTGACGTATCAAATTAGTTATAATTTCATTTTGATTTCAAATTGATCTGTTATACACACGGACGGATCCAGGATTTCAGTTTAGAAGGGA---CGC-----------AACACA-AATCTGAACGGG-A-ACACGTTTTTCAGTAGAAATATAGTGAAATTTAAcaaattgatccgttatgcacgtgggaggatccaggatttcagtttaaaggacgcaacgcttacgtagcaataattgtttcattgcctgatggcgtcaaacagtatttaagtgctctattttaagaaaggggatttcgtttcaagtctatcactccaattcaaatatcgattttgtcacgttttggcggatttgtcataccagactattcggatttgatttttcaatgatacggagatgatttttatgtattttaataattattttattttttaagaaatttatatagtttttttcctgat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                           cAATATATTTTGTGACGTATTAAATGAATCACG---------TGATTTCACTtcaaatatgggagtttaagggagggggcgtatgccaggtatttaaaaagagttgatttaaaagtgaagtaaaattatttcattttggaaagagcctaaatgacgtcaagcagtatttaagtgctgtctatttttagattggggatttcgtttcatgtttacctttccaatttaaatatcaattttgtcatgttttggttgacttaagataccaaaccatttggacctgttaatgataattaaatgctatttacccattttaaattttttttttttagatatttatagcatttttttcctgat
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                   cttccggctttatagtacaacctattttgtgacgtatcaaattagttataatttcattttgatttcaaattgatctgttatacacacggacggatccaggatttcagtttagaagggacgcaacacaaatctgaacgggaacacgtttttcagtagaaatatagtgaaatttaatcaaatatgggagtttaagggagggggcgtatgccaggtatttaaaaagagttgatttaaaagtgaagtaAATTGTTTCATT---------G-CCTGATGGCGTCAAACAGTATTTAAGTGCTCTATTT-----TAAGAAAGGGGATTTCGTT------------TCAAGTCTATCACT-CCAATTCAAATATCG--ATT-T--------TGTCACGTTTTGGCGGATTT--GTCATACCAGACTATTCGGATTTGATTT-TTCA-ATGATAC-GGA---GATGAT-TTTTATGTATTTTAATAATTATTTTATT-TTTTAAGAAATTTATAT--AGTTTTTTTCCTGAT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                atttttaagggaatttatcaggatttttttaatcttttaattaaaattgcctaaaacctttgaccaagcgcctatgttagactaaaatagtttacttgcttaaaattgcaaaatattttgtgacgtatttaatgagttatgttatttcaatttgatttcaaattgatccgttatgcacgtgggaggatccaggatttcagtttaaaggacgcaacgcttacgtagcaatAAGAG--CTTTCC-----TAA-----------------------------CACTTTTACCCCCGTCGACCCAACTACCGAAACGATA-TATATATAT-ATATCTTGGTGGATTT--GACATACCAAACCATTTGGATTTTATTT-CTTA-ATGATAATGA----GATGCT-TTTTATCTATTTTAAAAACAATTTTA-T-TTTAAAGACATTTATAG--CGTGTTTTC-CTGATATAA
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   attttTT------------TCAAATTTACAACT-CTGATTGAAA-ATCA--ACT------T---TGTCTTTCTTTGGTGGATTT--GATGTACAAAACTATTCGGATTTTATTTATTTAGATAATGA-------GATTTTATTTTATC-AATATAGAAATAATTCTATTATTTTAAGACGTTTTTAG--AATTTTGTT-tttctacct
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5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|12 ): ATTCAGACCATTCGTATTTTCTTTATTTATAGTTCGATGCTTTTTATTTTAAGACATTTATAGTTTTTTACCTTTGCAG
Unaligned ( gi|13 ): GTTATTCAGTAGAAACATAGTGAAGTTTAATAAAGTATTGAAGTTTAAGGGGGGTGTGTCAGGATT
Unaligned ( gi|17 ): TAGAAATATAGTGGATCTTAATGAAATATGGGACTTTCGTGTGTGTGG
Unaligned ( gi|18 ): TAATATAGTGGGTTTTAATAAAATATGAGCGTTTAGAGAGTGG






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Reference ( family-222 )      :                                                                                                                                                                                                                                          NNNNNTATTGCTTTNANGGGGATAT-----TATCAGGATTTTTN--AAA------ATTTNA-AATTGAC-TAAA--ACA----TTTTTT--CC---AATATATCACGCNTATATATACTCGTTGACCCCGTATTGCCAAAACGATATA-TACATATATCTATTTAANCNTGCCAAAAT--TATATTA--------T--TGAAAAGGGATTTCCTAA----CTT-GACCANGCGCCNANGTTAGACTAAAATAGNTTNCCCGCTTAAAAGTGCAACATATTTTGTGACGTATTAAATGAGTCACG---------TGATTTCANTTTGATTT---------------------AGGATTTCAGCTTNGGAGGGGGCGCG--CGTATAGGGCGTAACACAAGATCTGAACGGGCACACAT-TTTTTCAGTAGAAATATAGTGAATTTNAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAATTGTTTCATTTTGGAAAGAGCCCNGATGGCGTCAAGCAGTATTTAAGTGCTNTCT-----T-----AAA----------TT------------TCAAGTTTACCACTC--CGATTCAAATATCGA-------TTTT-------TGT-CATGTTTTGGTGGATTTGATATACCAAACCATTCGGATTTTATTTCTTAATGATAAGAATTAGATGCT-TTTTATCCATTTTAAAAATAATTTTATT-TTTTAAGACATTTATAG--CGTTTTTTTCCTGATATAA
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gCACAT-TTTTTCAGTAGAAATACGGTGAATTaaagtattgaagtttaaggggggtgtgtcaggatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agcagttgCTCAAATTTGTAATATATTTTGTGACGTATTAAATGAATCACG---------TGATTTCACTactaatatatggaagtttagggtta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATTTTATT-TTTTGAAACATTTATAGAACATTTTTT--CTGATATAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTCCGGCTTTATAGTACAACCTATTTTGTGACGTATCAAATTAGTTATAATTTCATTTTGATTTCAAATTGATCTGTTATACACACGGACGGATCCAGGATTTCAGTTTAGAAGGGA----------------CGCAACACAA-ATCTGAACGGGAACACGT-TTT-TCAGTAGAAATATAGTGAAATTTAATtccct
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cAAATTATTTCATTTTGGAAAGAGCCTAAATGACGTCAAGCAGTATTTAAGTGCTGTCTATTTTT-----AGA----------TTGGGGATTTCGTTTCATGTTTACCTTTC--CAATTTAAATATCAA-------TTTT--------GT-CATGTTTTGGTTGACTTAAGATACCAAACCATTTGG-----ACCTGTTAATGAT---AATTAAATGCT-ATTTACCCATTTTA-----AATTTTTTT-TTTTTAGATATTTATAG--CATTTTTTTCCTGATcaaatatgggagtttaagggagggggcgtatgccaggtatttaaaaagagttgatttaaaagtgaagtaaaattatttcattttggaaagagcctaaatgacgtcaagcagtatttaagtgctgtctatttttagattggggatttcgtttcatgtttacctttccaatttaaatatcaattttgtcatgttttggttgacttaagataccaaaccatttggacctgttaatgataattaaatgctatttacccattttaaattttttttttttagatatttatagcatttttttcctgat
gi|3                          : cttccggctttatagtacaacctattttgtgacgtatcaaattagttataatttcattttgatttcaaattgatctgttatacacacggacggatccaggatttcagtttagaagggacgcaacacaaatctgaacgggaacacgtttttcagtagaaatatagtgaaatttaatcaaatatgggagtttaagggagggggcgtatgccaggtatttaaaaagagttgatttaaaagtgaagtaTTTTAAGGGAAT-T-----TATCAGGATTTTTT--TAATCTTTTAATTAA-AATTGCC-TAAA--ACC----TTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atATTGCCTAAAACCTTT-GACCAAGCGCCTATGTTAGACTAAAATAGTTTACTTGCTTAAAATTGCAAAATATTTTGTGACGTATTTAATGAGTTATG---------TTATTTCAATTTGATTT---------------------gaccaagcgcctatgttagactaaaatagtttacttgcttaaaattgcaaaatattttgtgacgtatttaatgagttatgttatttcaatttgatttcaaattgatccgttatgcacgtgggaggatccaggatttcagtttaaaggacgcaacgcttacgtagcaataattgtttcattgcctgatggcgtcaaacagtatttaagtgctctattttaagaaaggggatttcgtttcaagtctatcactccaattcaaatatcgattttgtcacgttttggcggatttgtcataccagactattcggatttgatttttcaatgatacggagatgatttttatgtattttaataattattttattttttaagaaatttatatagtttttttcctgat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atttttaagggaatttatcaggatttttttaatcttttaattaaaGGATTTCAGTTTAAAGGACGCAACGCTTACGTAGCAATAATTGTTTCATT---------GCC-TGATGGCGTCAAACAGTATTTAAGTGCTCTAT-----TTTAAGAAAGGGGATTTCGTT------------TCAAGTCTATCACTC--CAATTCAAATATCGA--------TTT-------TGT-CACGTTTTGGCGGATTTGTCATACCAGACTATTCGGATTTGATTTTTCAATGATACGG---AGATGAT-TTTTATGTATTTTAATAATTATTTTATT-TTTTAAGAAATTTATAT--AGTTTTTTTCCTGATcaaattgatccgttatgcacgtgggaggatccaggatttcagtttaaaggacgcaacgcttacgtagcaataattgtttcattgcctgatggcgtcaaacagtatttaagtgctctattttaagaaaggggatttcgtttcaagtctatcactccaattcaaatatcgattttgtcacgttttggcggatttgtcataccagactattcggatttgatttttcaatgatacggagatgatttttatgtattttaataattattttattttttaagaaatttatatagtttttttcctgat
gi|4                          :                                                 atttttaagggaatttatcaggatttttttaatcttttaattaaaattgcctaaaacctttgaccaagcgcctatgttagactaaaatagtttacttgcttaaaattgcaaaatattttgtgacgtatttaatgagttatgttatttcaatttgatttcaaattgatccgttatgcacgtgggaggatccaATGGTTTTAAAGAGAAT-T-----TGTCAGGATTTTTTCCAAC------ATTTAA-AATTGAC-TAAATTACA----TTTTTTTCCC---AGTATATCACGACTGTATATACTCATTGACCCTGTATTGCCAAA---------TACATATAT--ATTTAATCCTGTCAAAATAATATATTAAACATATAT--TAAAAAGGGATTTCCTAA----CT------ACGCGCCGAGGTTAGACTAAAATAGATTCCCCGCTTAAACGTGCAGCATATTTTGTGACGTAGTGAATGAGTCACA---------TGATTTCATTTTGATTT---------------------
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atttggcaaattgtgagtcactga----------TT------------TCAAATTTACAACTC--TGATTGAAA-ATCAA-------CTTT--------GT-CTTTCTTTGGTGGATTTGATGTACAAAACTATTCGGATTTTATTTATTTA-GAT---AATGAGATTTTATTTTATCAA-TATAGAAATAATTCTATTATTTTAAGACGTTTTTAG--AATTTTGTTcaaactgatccgttatatacaggcgtggatccagg
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                          tatgaTATTGCTTTTATGGAGA-ATA----TATCTGAATTGTTT--AAA------TTTTTA-AATTAAC-TAAA--ACACGTTTTTTTC--CC---TATATAGCATGCATATGTATACTCTATATCCCCATATTA----------ATA-TAAGGATAGCTATTCAAACATGCCAAAAT--AATA-TG--------T--TGGAAAGGGATTTCCTttgtcctattatccttatttt
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Reference ( family-222 )      :                                                                                                                                                                                                                                          NNNNNTATTGCTTTNAAGGGAATATA----TATCAGGATTTTTT--AAA------ATTTNA-AATTGGC-TAAA--ACA----TTTTTT--CC---AATATANCATGCCTGTATATACTCACTGACCCCGTATTGCCAAAA-G-ATATA-TANATATATCTATTTAANCNTGCCAAAAT--TATAT--TA--------TTGAAAAGGGATTTCCTAA----CTT-GGCCACGCGCCTAGGTTAGACTAAAATAGATTTCCCGCTTAAAAGTGCAACATATTTTGTGACGTATTAAATGAGTCACG---------TGATTTCANTTTGATTT---------------------AGGATT--TCAGTTTAGAAGGGGGCGN--ACGT-T-AGGGCGCAACACAAAATCTGAACGGGNACACAT-TTTTTCAGTAGAAATATAGTGAATT-TTAATTTNNNNNNCGCGANNNNNNCNTNNNNNAAATTGTTTCATTTTGGAAAGAGCCCAAATGACGTCAAGCAGTATTTAAGNGCTNTCT-----T-----AAA----------TT------------TCAAGTTTACCACTC--CGATTTAAATATCGA-------TTTT-------TGT-CACGTTTTGGTGGATTTGACATACCAAACCATTCGGATTTTATTTNTTNATGAT---AATTAGATGCT-TTTTATCTATTTTAAAAATAATTTTATT-TTTTAAGACATTTATAG--CGTTTTTTTCCTGATATAA
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                               TGTTGCTTTAAAGGTAATATACATGTATCAGGATTTTGA--AAAG-----ATTTTA-AATTGGCATAAA--ACA----TTATTT--CC---AATACAAAATGCCTGTATACACTCACTGACCCCACATTATCAAAA-GGATATAATATATATATCTATTTAATCTTGACAAATT--TATAT--TA--------TTAAAAAGAGCTTTTCTAA----CTTAGGCTACGCACCTAGGTGAGACTGAAATAGATTTCCCGCTTAAAAGTTCAACATATTTTATAACATATTAAATGTGTCACG---------TGATTTCATTTTGATTT---------------------AGTATT--TCAGTT-AAAAGGGAGCGC--AC------------AACAAACAATTTGAACTGGTATACATGTTTTTCAGTAGGAATATAGTGAATT-CAAATTTTTTTTTAAAGAGTAGATCTTCCATTAAATTGTTTCATCTTAAAAAGAGTCCAAATGACGTCAAGCAGTATTTAAGAGCTGTCT-----T-----AAA----------TT------------TCAAGTTTACCTCTC--CAATTTATATATCGA-------TTATAGTATAATGT-CACATTTTGGAGGATCTGACACCTCAAACCATTTGGATTTTATTTCTTAATGATGAGAAT--GATGCT-TTTTATCTATTTTAGAAATAACTATATT-TTTTAACACATTTATAG--CATTTTTTT-CTGATATAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ggatgA----------TT------------TCAAGTTTACCAATC--CGATTTAAATATTGA-------TTTT--------GT-CATATTTTGGTGGATTTGATATATCAAAACATTCGTATTTTCTTTCTTTATGAC---AATTAGACGCT-TTTTATACA-TTTAAAAATAA--------TTTTGAGACATTTATAG-----TTTCTACCT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           attttGATCC---------------------AGGATT--TCAGTTTAGGGGGGGGGGGGGACAT-TTAGGGCGCAACACAAAGTCTGAACAGG-----------------AGAAATATTGTGGATT-TTAAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                caggggcaCAGACCATTCGTATTTTCTTTATTT---AT---AGTTCGATGCT-TTTTA------------------------TTTTAAGACATTTATA----GTTTTTTACCTataatatgggaatatagcg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            att-TTATTCAGTAGAAACATAGTGAAGT-TTAATttgcag
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gCACAT-TTTTTCAGTAGAAATACGGTGAATTACTAATaaagtattgaagtttaaggggggtgtgtcaggatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agcagttgCTCAAATTTGTAATATATTTTGTGACGTATTAAATGAATCACG---------TGATTTCACTatatggaagtttagggtta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATTTTATT-TTTTGAAACATTTATAGAACATTTTTT--CTGATATAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTCCGGCTTTATAGTACAACCTATTTTGTGACGTATCAAATTAGTTATAATTTCATTTTGATTTCAAATTGATCTGTTATACACACGGACGGATCCAGGATT--TCAGTTTAGAAGGGA-----------------CGCAACACAAA-TCTGAACGGGAACACGT-TTT-TCAGTAGAAATATAGTGAAAT-TTAATtccct
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cAAATTATTTCATTTTGGAAAGAGCCTAAATGACGTCAAGCAGTATTTAAGTGCTGTCTATTTTT-----AGA----------TTGGGGATTTCGTTTCATGTTTACCTTTC--CAATTTAAATATCAA-------TTTT--------GT-CATGTTTTGGTTGACTTAAGATACCAAACCATTTGGACCT-----GTTAATGAT---AATTAAATGCT-ATTTACCCATTTTAAA-----TTTTTTT-TTTTTAGATATTTATAG--CATTTTTTTCCTGATcaaatatgggagtttaagggagggggcgtatgccaggtatttaaaaagagttgatttaaaagtgaagtaaaattatttcattttggaaagagcctaaatgacgtcaagcagtatttaagtgctgtctatttttagattggggatttcgtttcatgtttacctttccaatttaaatatcaattttgtcatgttttggttgacttaagataccaaaccatttggacctgttaatgataattaaatgctatttacccattttaaattttttttttttagatatttatagcatttttttcctgat
gi|3                          : cttccggctttatagtacaacctattttgtgacgtatcaaattagttataatttcattttgatttcaaattgatctgttatacacacggacggatccaggatttcagtttagaagggacgcaacacaaatctgaacgggaacacgtttttcagtagaaatatagtgaaatttaatcaaatatgggagtttaagggagggggcgtatgccaggtatttaaaaagagttgatttaaaagtgaagtaTTTTAAGGGAAT-T-----TATCAGGATTTTTT--TAATCTTTTAATTAA-AATTGCC-TAAA--ACC----TTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atATTGCCTAAAACCTTT-GACCAAGCGCCTATGTTAGACTAAAATAGTTTACTTGCTTAAAATTGCAAAATATTTTGTGACGTATTTAATGAGTTATG---------TTATTTCAATTTGATTT---------------------CAAATTGATCCGTTgaccaagcgcctatgttagactaaaatagtttacttgcttaaaattgcaaaatattttgtgacgtatttaatgagttatgttatttcaatttgatttcaaattgatccgttatgcacgtgggaggatccaggatttcagtttaaaggacgcaacgcttacgtagcaataattgtttcattgcctgatggcgtcaaacagtatttaagtgctctattttaagaaaggggatttcgtttcaagtctatcactccaattcaaatatcgattttgtcacgttttggcggatttgtcataccagactattcggatttgatttttcaatgatacggagatgatttttatgtattttaataattattttattttttaagaaatttatatagtttttttcctgat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atttttaagggaatttatcaggatttttttaatcttttaattaaaGGATT-TCAGTTTAAAGGACGCAACGCTTACGTAGCAATAATTGTTTCATT---------GCCTGA-TGGCGTCAAACAGTATTTAAGTGCTCTAT-----TTTAAGAAAGGGGATTTCGTT------------TCAAGTCTATCACTC--CAATTCAAATATCGA--------TTT-------TGT-CACGTTTTGGCGGATTTGTCATACCAGACTATTCGGATTTGATTTTTCAATGAT---ACGGAGATGAT-TTTTATGTATTTTAATAATTATTTTATT-TTTTAAGAAATTTATAT--AGTTTTTTTCCTGATatgcacgtgggaggatccaggatttcagtttaaaggacgcaacgcttacgtagcaataattgtttcattgcctgatggcgtcaaacagtatttaagtgctctattttaagaaaggggatttcgtttcaagtctatcactccaattcaaatatcgattttgtcacgttttggcggatttgtcataccagactattcggatttgatttttcaatgatacggagatgatttttatgtattttaataattattttattttttaagaaatttatatagtttttttcctgat
gi|4                          :                                                 atttttaagggaatttatcaggatttttttaatcttttaattaaaattgcctaaaacctttgaccaagcgcctatgttagactaaaatagtttacttgcttaaaattgcaaaatattttgtgacgtatttaatgagttatgttatttcaatttgatttcaaattgatccgttatgcacgtgggaggatccaATGGTTTTAAAGAGAAT-T-----TGTCAGGATTTTTTCCAAC------ATTTAA-AATTGAC-TAAATTACA----TTTTTTTCCC---AGTATATCACGACTGTATATACTCATTGACCCTGTATTGCCAAA----------TACATATAT--ATTTAATCCTGTCAAAATAATATAT--TAAACATATATTAAAAAGGGATTTCCTAA----CT------ACGCGCCGAGGTTAGACTAAAATAGATTCCCCGCTTAAACGTGCAGCATATTTTGTGACGTAGTGAATGAGTCACA---------TGATTTCATTTTGATTT---------------------
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                          tatgaTATTGCTTTTATGGAGA-ATA----TATCTGAATTGTTT--AAA------TTTTTA-AATTAAC-TAAA--ACACGTTTTTTTC--CC---TATATAGCATGCATATGTATACTCTATATCCCCATATTA-----------ATA-TAAGGATAGCTATTCAAACATGCCAAAAT--AATA---TG--------TTGGAAAGGGATTTCCTttgtcctattatccttatttt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                  gagacatAAGGGAAT-T-----TATCAGGATTTTTT--AAA------ATTTCAGAATTGGG-TAAA--ACA----TTTTTT--TCCCGAAAATATCATGCTTATATATACTCACTGACCCCGTAGTGCTAAAATG-ATATA-TAG----------TTGAACATGCCAAAA---CATATTATA--------TTGAAAAGGGATTTCCTAA----CTT-GG
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TAGAAATATAGTGGATCTTAATGAAATATGGGACTTTCGTGTGTGTGG
Unaligned ( gi|18 ): TAATATAGTGGGTTTTAATAAAATATGAGCGTTTAGAGAGTGG






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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           attttGATCC---------------------AGGATT--TCAGTTTAGGGGGGGGGGGGGACAT-TTAGGGCGCAACACAAAGTCTGAACAGG-----------------AGAAATATTGTGGATT-TTAAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                caggggcaCAGACCATTCGTATTTTCTTTATTT---ATAGTTC-GATGCT-TTTTA------------------------TTTTAAGACATTTATA----GTTTTTTACCTataatatgggaatatagcg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            att-TTATTCAGTAGAAACATAGTGAAGT-TTAATttgcag
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gCACAT-TTTTTCAGTAGAAATACGGTGAATTACTAATaaagtattgaagtttaaggggggtgtgtcaggatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agcagttgCTCAAATTTGTAATATATTTTGTGACGTATTAAATGAATCACG---------TGATTTCACTatatggaagtttagggtta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATTTTATT-TTTTGAAACATTTATAGAACATTTTTT--CTGATATAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTCCGGCTTTATAGTACAACCTATTTTGTGACGTATCAAATTAGTTATAATTTCATTTTGATTTCAAATTGATCTGTTATACACACGGACGGATCCAGGATT--TCAGTTTAGAAGGGA-----------------CGCAACACAAA-TCTGAACGGGAACACGT-TTT-TCAGTAGAAATATAGTGAAAT-TTAATtccct
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cAAATTATTTCATTTTGGAAAGAGCCTAAATGACGTCAAGCAGTATTTAAGTGCTGTCTATTTTT-----AGA----------TTGGGGATTTCGTTTCATGTTTACCTTTC--CAATTTAAATATCAA-------TTTT--------GT-CATGTTTTGGTTGACTTAAGATACCAAACCATTTGGACCT-----GTTAATGATAATTA-AATGCT-ATTTACCCATTTTAAA-----TTTTTTT-TTTTTAGATATTTATAG--CATTTTTTTCCTGATcaaatatgggagtttaagggagggggcgtatgccaggtatttaaaaagagttgatttaaaagtgaagtaaaattatttcattttggaaagagcctaaatgacgtcaagcagtatttaagtgctgtctatttttagattggggatttcgtttcatgtttacctttccaatttaaatatcaattttgtcatgttttggttgacttaagataccaaaccatttggacctgttaatgataattaaatgctatttacccattttaaattttttttttttagatatttatagcatttttttcctgat
gi|3                          : cttccggctttatagtacaacctattttgtgacgtatcaaattagttataatttcattttgatttcaaattgatctgttatacacacggacggatccaggatttcagtttagaagggacgcaacacaaatctgaacgggaacacgtttttcagtagaaatatagtgaaatttaatcaaatatgggagtttaagggagggggcgtatgccaggtatttaaaaagagttgatttaaaagtgaagtaTTTTAAGGGAAT-T-----TATCAGGATTTTTT--TAATCTTTTAATTAA-AATTGCC-TAAA--ACC----TTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atATTGCCTAAAACCTTT-GACCAAGCGCCTATGTTAGACTAAAATAGTTTACTTGCTTAAAATTGCAAAATATTTTGTGACGTATTTAATGAGTTATG---------TTATTTCAATTTGATTT---------------------CAAATTGATCCGTTgaccaagcgcctatgttagactaaaatagtttacttgcttaaaattgcaaaatattttgtgacgtatttaatgagttatgttatttcaatttgatttcaaattgatccgttatgcacgtgggaggatccaggatttcagtttaaaggacgcaacgcttacgtagcaataattgtttcattgcctgatggcgtcaaacagtatttaagtgctctattttaagaaaggggatttcgtttcaagtctatcactccaattcaaatatcgattttgtcacgttttggcggatttgtcataccagactattcggatttgatttttcaatgatacggagatgatttttatgtattttaataattattttattttttaagaaatttatatagtttttttcctgat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atttttaagggaatttatcaggatttttttaatcttttaattaaaGGATT-TCAGTTTAAAGGACGCAACGCTTACGTAGCAATAATTGTTTCATT---------GCCTGA-TGGCGTCAAACAGTATTTAAGTGCTCTAT-----TTTAAGAAAGGGGATTTCGTT------------TCAAGTCTATCACTC--CAATTCAAATATCGA--------TTT-------TGT-CACGTTTTGGCGGATTTGTCATACCAGACTATTCGGATTTGATTTTTCAATGATACGGA-GATGAT-TTTTATGTATTTTAATAATTATTTTATT-TTTTAAGAAATTTATAT--AGTTTTTTTCCTGATatgcacgtgggaggatccaggatttcagtttaaaggacgcaacgcttacgtagcaataattgtttcattgcctgatggcgtcaaacagtatttaagtgctctattttaagaaaggggatttcgtttcaagtctatcactccaattcaaatatcgattttgtcacgttttggcggatttgtcataccagactattcggatttgatttttcaatgatacggagatgatttttatgtattttaataattattttattttttaagaaatttatatagtttttttcctgat
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TAGAAATATAGTGGATCTTAATGAAATATGGGACTTTCGTGTGTGTGG
Unaligned ( gi|18 ): TAATATAGTGGGTTTTAATAAAATATGAGCGTTTAGAGAGTGG






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Reference ( family-222 )      :                                                                                                                                                                                                                                          NNNNNTATTGCTTTNAAGGGAATATA----TATCAGGATTTTTT--AAA------ATTTNA-AATTGGC-TAAA--ACA----TTTTTT--CC---AATATANCATGCCTGTATATACTCACTGACCCCGTATTGCCAAAA-G-ATATA-TANATATATCTATTTAANCNTGCCAAAAT--TATAT--TA--------TTGAAAAGGGATTTCCTAA----CTT-GGCCACGCGCCTAGGTTAGACTAAAATAGATTTCCCGCTTAAAAGTGCAACATATTTTGTGACGTATTAAATGAGTCACG---------TGATTTCANTTTGATTT---------------------AGGATT--TCAGTTTAGAAGGGGGCGN--ACGT-T-AGGGCGCAACACAAAATCTGAACGGGNACACAT-TTTTTCAGTAGAAATATAGTGAATT-TTAATTTNNNNNNCGCGANNNNNNCNTNNNNNAAATTGTTTCATTTTGGAAAGAGCCTAAATGACGTCAAGCAGTATTTAAGNGCTNTCT-----T-----AAA----------TT------------TCAAGTTTACCACTC--CGATTTAAATATCGA-------TTTT-------TGT-CACGTTTTGGTGGATTTGACATACCAAACCATTCGGATTTTATTTNTTNATGATAATNA-GATGCT-TTTTATCTATTTTAAAAATAATTTTATT-TTTTAAGACATTTATAG--CGTTTTTTTCCTGATATAA
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            att-TTATTCAGTAGAAACATAGTGAAGT-TTAATttgcag
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gCACAT-TTTTTCAGTAGAAATACGGTGAATTACTAATaaagtattgaagtttaaggggggtgtgtcaggatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agcagttgCTCAAATTTGTAATATATTTTGTGACGTATTAAATGAATCACG---------TGATTTCACTatatggaagtttagggtta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATTTTATT-TTTTGAAACATTTATAGAACATTTTTT--CTGATATAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTCCGGCTTTATAGTACAACCTATTTTGTGACGTATCAAATTAGTTATAATTTCATTTTGATTTCAAATTGATCTGTTATACACACGGACGGATCCAGGATT--TCAGTTTAGAAGGGA-----------------CGCAACACAAA-TCTGAACGGGAACACGT-TTT-TCAGTAGAAATATAGTGAAAT-TTAATtccct
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cAAATTATTTCATTTTGGAAAGAGCCTAAATGACGTCAAGCAGTATTTAAGTGCTGTCTATTTTT-----AGA----------TTGGGGATTTCGTTTCATGTTTACCTTTC--CAATTTAAATATCAA-------TTTT--------GT-CATGTTTTGGTTGACTTAAGATACCAAACCATTTGGACCT-----GTTAATGATAATTA-AATGCT-ATTTACCCATTTTAAA-----TTTTTTT-TTTTTAGATATTTATAG--CATTTTTTTCCTGATcaaatatgggagtttaagggagggggcgtatgccaggtatttaaaaagagttgatttaaaagtgaagtaaaattatttcattttggaaagagcctaaatgacgtcaagcagtatttaagtgctgtctatttttagattggggatttcgtttcatgtttacctttccaatttaaatatcaattttgtcatgttttggttgacttaagataccaaaccatttggacctgttaatgataattaaatgctatttacccattttaaattttttttttttagatatttatagcatttttttcctgat
gi|3                          : cttccggctttatagtacaacctattttgtgacgtatcaaattagttataatttcattttgatttcaaattgatctgttatacacacggacggatccaggatttcagtttagaagggacgcaacacaaatctgaacgggaacacgtttttcagtagaaatatagtgaaatttaatcaaatatgggagtttaagggagggggcgtatgccaggtatttaaaaagagttgatttaaaagtgaagtaTTTTAAGGGAAT-T-----TATCAGGATTTTTT--TAATCTTTTAATTAA-AATTGCC-TAAA--ACC----TTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atATTGCCTAAAACCTTT-GACCAAGCGCCTATGTTAGACTAAAATAGTTTACTTGCTTAAAATTGCAAAATATTTTGTGACGTATTTAATGAGTTATG---------TTATTTCAATTTGATTT---------------------CAAATTGATCCGTTgaccaagcgcctatgttagactaaaatagtttacttgcttaaaattgcaaaatattttgtgacgtatttaatgagttatgttatttcaatttgatttcaaattgatccgttatgcacgtgggaggatccaggatttcagtttaaaggacgcaacgcttacgtagcaataattgtttcattgcctgatggcgtcaaacagtatttaagtgctctattttaagaaaggggatttcgtttcaagtctatcactccaattcaaatatcgattttgtcacgttttggcggatttgtcataccagactattcggatttgatttttcaatgatacggagatgatttttatgtattttaataattattttattttttaagaaatttatatagtttttttcctgat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atttttaagggaatttatcaggatttttttaatcttttaattaaaGGATT-TCAGTTTAAAGGACGCAACGCTTACGTAGCAATAATTGTTTCATT---------GCCTGA-TGGCGTCAAACAGTATTTAAGTGCTCTAT-----TTTAAGAAAGGGGATTTCGTT------------TCAAGTCTATCACTC--CAATTCAAATATCGA--------TTT-------TGT-CACGTTTTGGCGGATTTGTCATACCAGACTATTCGGATTTGATTTTTCAATGATACGGA-GATGAT-TTTTATGTATTTTAATAATTATTTTATT-TTTTAAGAAATTTATAT--AGTTTTTTTCCTGATatgcacgtgggaggatccaggatttcagtttaaaggacgcaacgcttacgtagcaataattgtttcattgcctgatggcgtcaaacagtatttaagtgctctattttaagaaaggggatttcgtttcaagtctatcactccaattcaaatatcgattttgtcacgttttggcggatttgtcataccagactattcggatttgatttttcaatgatacggagatgatttttatgtattttaataattattttattttttaagaaatttatatagtttttttcctgat
gi|4                          :                                                 atttttaagggaatttatcaggatttttttaatcttttaattaaaattgcctaaaacctttgaccaagcgcctatgttagactaaaatagtttacttgcttaaaattgcaaaatattttgtgacgtatttaatgagttatgttatttcaatttgatttcaaattgatccgttatgcacgtgggaggatccaATGGTTTTAAAGAGAAT-T-----TGTCAGGATTTTTTCCAAC------ATTTAA-AATTGAC-TAAATTACA----TTTTTTTCCC---AGTATATCACGACTGTATATACTCATTGACCCTGTATTGCCAAA----------TACATATAT--ATTTAATCCTGTCAAAATAATATAT--TAAACATATATTAAAAAGGGATTTCCTAA----CT------ACGCGCCGAGGTTAGACTAAAATAGATTCCCCGCTTAAACGTGCAGCATATTTTGTGACGTAGTGAATGAGTCACA---------TGATTTCATTTTGATTT---------------------
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atttggcaaattgtgagtcactga----------TT------------TCAAATTTACAACTC--TGATTGAAA-ATCAA-------CTTT--------GT-CTTTCTTTGGTGGATTTGATGTACAAAACTATTCGGATTTTATTTATTTA-GATAATGA-GATTTTATTTTATC-AATATAGAAATAATTCTATTATTTTAAGACGTTTTTAG--AATTTTGTTcaaactgatccgttatatacaggcgtggatccagg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cgggatttcgAAGAGCTTTCC-----T-----AA--------------------------CACTTTTACC-CCCGTCGACCCAACTACCGAAACGATATATA-------TATATATATCTTGGTGGATTTGACATACCAAACCATTTGGATTTTATTTCTTAATGATAATGA-GATGCT-TTTTATCTATTTTAAAAACAATTTTA-T-TTTAAAGACATTTATAG--CG-TGTTTTCCTGATATAAtacccttgaaatgttgacactttcttttttattttgatgaattgacagtagcgcagatatatcacatc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                          tatgaTATTGCTTTTATGGAGA-ATA----TATCTGAATTGTTT--AAA------TTTTTA-AATTAAC-TAAA--ACACGTTTTTTTC--CC---TATATAGCATGCATATGTATACTCTATATCCCCATATTA-----------ATA-TAAGGATAGCTATTCAAACATGCCAAAAT--AATA---TG--------TTGGAAAGGGATTTCCTttgtcctattatccttatttt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                  gagacatAAGGGAAT-T-----TATCAGGATTTTTT--AAA------ATTTCAGAATTGGG-TAAA--ACA----TTTTTT--TCCCGAAAATATCATGCTTATATATACTCACTGACCCCGTAGTGCTAAAATG-ATATA-TAG----------TTGAACATGCCAAAA---CATATTATA--------TTGAAAAGGGATTTCCTAA----CTT-GG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGATTC---------------------AGGATT--TCAGCTTAG-AGGGGGCGT--ACGTAT-AGGGCGTAACACAAGATCTGAACAGACACACA--TTTTTCAGTACAAATATAGTGAATT-TTAAT


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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  caggggcaCAGACCATTCGTATTTTCTTTATTT---ATAGTTC-GATGCT-TTTTA------------------------TTTTAAGACATTTATA----GTTTTTTACCTataatatgggaatatagcg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            attT--TAT-TCAGTAGAAACATAGTGAAGT-TTAATttgcag
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gCACAT--TTTTTCAGTAGAAATACGGTGAATTACTAATaaagtattgaagtttaaggggggtgtgtcaggatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agcagttgCTCAAATTTGTAATATATTTTGTGACGTATTAAATGAATCACG---------TGATTTCACTatatggaagtttagggtta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATTTTATT-TTTTGAAACATTTATAGAACATTTTTT--CTGATATAA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCCGGCTTTATAGTACAACCTATTTTGTGACGTATCAAATTAGTTATAATTTCATTTTGATTTCAAATTGATCTGTTATACACACGGACGGATCCAGGATT--TCAGTTTAGAAGGGA-----------------CGCAACACAAA-TCTGAACGGGAACACGT--TTT-TCAGTAGAAATATAGTGAAAT-TTAATtccct
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cAAATTATTTCATTTTGGAAAGAGCCTAAATGACGTCAAGCAGTATTTAAGTGCTGTCTATTTTT-----AGA----------TTGGGGATTTCGTTTCATGTTTACCTTTC--CAATTTAAATATCAA-------TT-T-------TGT-CATGTTTTGGTTGACTTAAGATACCAAACCATTTGG-----ACCTGTTAATGATAATTA-AATGCT-ATTTACCCATTTTA-----AATTTTTTT-TTTTTAGATATTTATAG--CATTTTTTTCCTGATcaaatatgggagtttaagggagggggcgtatgccaggtatttaaaaagagttgatttaaaagtgaagtaaaattatttcattttggaaagagcctaaatgacgtcaagcagtatttaagtgctgtctatttttagattggggatttcgtttcatgtttacctttccaatttaaatatcaattttgtcatgttttggttgacttaagataccaaaccatttggacctgttaatgataattaaatgctatttacccattttaaattttttttttttagatatttatagcatttttttcctgat
gi|3                          : cttccggctttatagtacaacctattttgtgacgtatcaaattagttataatttcattttgatttcaaattgatctgttatacacacggacggatccaggatttcagtttagaagggacgcaacacaaatctgaacgggaacacgtttttcagtagaaatatagtgaaatttaatcaaatatgggagtttaagggagggggcgtatgccaggtatttaaaaagagttgatttaaaagtgaagtaTTTTAAGG-GAAT-----T-TATCAGGATTTTTT--TAATCTTTTAATTAA-AATTGCC-TAAA--ACC----TTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atATTGCCTAAAACCTTT-GACCAAGCGCCTATGTTAGACTAAAATAGTTTACTTGCTTAAAATTGCAAAATATTTTGTGACGTATTTAATGAGTTATG---------TTATTTCAATTTGATTT---------------------CAAATTGATCCGTTgaccaagcgcctatgttagactaaaatagtttacttgcttaaaattgcaaaatattttgtgacgtatttaatgagttatgttatttcaatttgatttcaaattgatccgttatgcacgtgggaggatccaggatttcagtttaaaggacgcaacgcttacgtagcaataattgtttcattgcctgatggcgtcaaacagtatttaagtgctctattttaagaaaggggatttcgtttcaagtctatcactccaattcaaatatcgattttgtcacgttttggcggatttgtcataccagactattcggatttgatttttcaatgatacggagatgatttttatgtattttaataattattttattttttaagaaatttatatagtttttttcctgat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atttttaagggaatttatcaggatttttttaatcttttaattaaaGGATT-TCAGTTTAAAGGACGCAACGCTTACGTAGCAATAATTGTTTCATT---------GCCTGA-TGGCGTCAAACAGTATTTAAGTGCTCTAT-----TTTAAGAAAGGGGATTTCGTT------------TCAAGTCTATCACTC--CAATTCAAATATCGA-------TT-T-------TGT-CACGTTTTGGCGGATTTGTCATACCAGACTATTCGGATTTGATTTTTCAATGATACGGA-GATGAT-TTTTATGTATTTTAATAATTATTTTATT-TTTTAAGAAATTTATAT--AGTTTTTTTCCTGATatgcacgtgggaggatccaggatttcagtttaaaggacgcaacgcttacgtagcaataattgtttcattgcctgatggcgtcaaacagtatttaagtgctctattttaagaaaggggatttcgtttcaagtctatcactccaattcaaatatcgattttgtcacgttttggcggatttgtcataccagactattcggatttgatttttcaatgatacggagatgatttttatgtattttaataattattttattttttaagaaatttatatagtttttttcctgat
gi|4                          :                                                 atttttaagggaatttatcaggatttttttaatcttttaattaaaattgcctaaaacctttgaccaagcgcctatgttagactaaaatagtttacttgcttaaaattgcaaaatattttgtgacgtatttaatgagttatgttatttcaatttgatttcaaattgatccgttatgcacgtgggaggatccaATGGTTTTAAAGA-GAAT-----T-TGTCAGGATTTTTTCCAAC------ATTTAA-AATTGAC-TAAATTACA----TTTTTTTCCC---AGTATATCACGACTGTATATACTCATTGACCCTGTATTGCCAAA----------TACATATAT--ATTTAATCCTGTCAAAATAATATAT--TAAACATATATTAAAAAGGGATTTCCTAA----CT------ACGCGCCGAGGTTAGACTAAAATAGATTCCCCGCTTAAACGTGCAGCATATTTTGTGACGTAGTGAATGAGTCACA---------TGATTTCATTTTGATTT---------------------
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atttggcaaattgtgagtcactga----------TT------------TCAAATTTACAACTC--TGATTGAAA-ATCAA-------CT-T-------TGT-CTTTCTTTGGTGGATTTGATGTACAAAACTATTCGGATTTTATTTATTTA-GATAATGA-GATTTTATTTTATC-AATATAGAAATAATTCTATTATTTTAAGACGTTTTTAG--AATTTTGTTcaaactgatccgttatatacaggcgtggatccagg
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                          tatgaTATTGCTTTTATGGAGAAT-----A-TATCTGAATTGTTT--AAA------TTTTTA-AATTAAC-TAAA--ACACGTTTTTTTC--CC---TATATAGCATGCATATGTATACTCTATATCCCCATATTA-----------ATA-TAAGGATAGCTATTCAAACATGCCAAAAT--AATA---TG--------TTGGAAAGGGATTTCCTttgtcctattatccttatttt
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGATTC---------------------AGGATT--TCAGCTTAGA-GGGGGCGT--ACGTAT-AGGGCGTAACACAAGATCTGAACAGACACACAT--TTT-TCAGTACAAATATAGTGAATT-TTAAT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TAGAAATATAGTGGATCTTAATGAAATATGGGACTTTCGTGTGTGTGG
Unaligned ( gi|18 ): TAATATAGTGGGTTTTAATAAAATATGAGCGTTTAGAGAGTGG