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4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-2197 ) : GCAAAACAAG-AA-TTA-GCAGCTTAGTAAATNTTATAATTACTCCGTTTCCATGACAATAAC---------------C------ATCTTCTATAAGTTTCAGTATACATATA-TGAAATGTTCTTTTAT-TTGTTTTAGAATTAAGT-TAGCTACATTAATTA---AGTGT-GATTCGTTGCTCACGTATTCCGACGTATGAAAGGTCAAAAGAAGGTATTANATT----ATTT-TAAGACAAAATCGTAATT-GGAGTACTT--AT--A--AA--CTACCAAGTGTAGGGCATTCGAAATTGTAGGGATTCCGGTNCGGATTTGTTCGATGGCCCGGTTAGCT------------CAG--TGGGTAGAGCACCCTGGTA-GTGTTCGGAGATTC--GCTGGTTCGAAT-------------C-------------TGT-------ACC--------TGTAGGAGCAGGTTAGCTCCTGGAAAAANGAAGTGTATC-------GATTCCGGCGCGGGTTTGTTTTAAC--TCAGTGGTCAGAGCACCCTGCAAGTGTTCGAATATGTGCGGGTTTGAATCC------A-TATCGGGCGNCATTCCTCTCCACCCTT--TGGATTTCTACAATG---GT-AAAGAGGTTCACG--T-G------A---T-----TGTGCAGGTACTAT---AATGGCC-G-GTA--C---AAA-GAATAATC-A-ACG-CCGTGCATCGAACCTTCCGAGTCTTATACTTAGATTCAGACGTCAAATTATGATTT-TGATAACTTTTT-ATTCAAGTAGC-GTTATAATT---------G------T----GTT------ACTAAACGGAGTGGATTT-ATTCCAAGATGGATTTGAATGTGTGAATTAGAATATTTGCGTCTGGTTTAAAGACTAAGACTCAAAAGGTTGATAAAATA-AACCAAAATGTATCCATAGTAACGATACCAGTCTGATGATCTTCAAGCGTCGTCTTCTGTGCTATGCACGGGTAGCGTTAGCCTGGAATAAACATCCTCCGTCTGTCTGAA---------------TANACACACT---GT------AACA---TGTCCAA-GT-----TAC--GCT-TT-ACA--T-TC---GTCAC-TTTTA-------------A-------------AACGAAAGTTTTGATTTCCTATTACACAATTCG-TCT----TGCACACAAATT----GTCC--GCACGC----AATT-TTCTGTTTTCGCAA--ACGA-ATAAATTACACCACAAGTTCA------ACACACGTATTGTGCTATAAAGCAATCTGTCCATAAT----GTATTAAAACTATGCGT-C--CACGCACGC-------------G-TA---TGNAA---NNTAACGTNNA-T-TGTCCAC--GACGTA-ANTACTCGTACGCACGTTCACGCGTA
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consensus : GCAAAACAAG-AA-TTA-GCAGCTTAGTAAATNTTATAATTACTCCGTTTCCATGACAATAAC---------------C------ATCTTCTATAAGTTTCAGTATACATATA-TGAAATGTTCTTTTAT-TTGTTTTAGAATTAAGT-TAGCTACATTAATTA---AGTGT-GATTCGTTGCTCACGTATTCCGACGTATGAAAGGTCAAAAGAAGGTATTANATT----ATTT-TAAGACAAAATCGTAATT-GGAGTACTT--AT--A--AA--CTACCAAGTGTAGGGCATTCGAAATTGTAGGGATTCCGGTNCGGATTTGTTCGATGGCCC---GGTTAGCT------------CAG--TGGGTA-GA-CACCCTGGTA-GTATTCGGAGATTCGCTGGTTCGAAT-------------C-------------TGT-------ACC--------TGTAGGAGCAGGTTAGCTCCTGGAAAAANGAAGTGTATC-------GATTCCGGCGCGGGTTTGTTTTAAC--TC-GTGGTCAGAGCACCCTGCAAGTGTTCGAATATGTGCGGGTTTGAATCC------A-TATCGGGCGNCATTCCTCTCCACCCTT--TGGATTTCTACAATGGT-A---AAGAGGTTCACG--T-G------A---T-----TGTGCAGGTACT---AT---A------ATGGCCGTNTA-T-C--AAA-GAATAA-C-G-A-A-TCATGCACCGAACCTTCCGAGTCTTATACTTAGATTCAGACGTCAAATTATGATTT-TGATAACTTTTTA-TTCAAGTAGC-GTTATAATT---------G------T----GTT------ACTAAACGGAGTGGATTT-ATTCCAAGATGGATTTGAATGTGTGAATTAGAATATTTGCGTCTGGTTTAAAGACTAAGACTCAAAAGGTTGATAAAATA-AACCAAAATGTATCCATAGTAACGATACCAGTCTGATGATCTTCAAGCGTCGTCTTCTGTGCTATGCACGGGTAGCGTTAGCCTGGAATAAACATCCTCCGTCTGTCTGAA---------------TANACACACT---GT------AACA---TGTCCAA-GT-----TAC--GCT-TT-ACA--T-TC---GTCAC-TTTTA-------------GAACGAAAGTTTTGATTTCCTATTACACAATTCG-TCT----TGCACACAAATT----GTCC--GCACGC----AATT-TTCTGTTTTCGCAA--ACGA-ATAAATTACACCACAAGTTCA------ACACACGTATTGTGCTATAAAGCAATCTGTCCATAAT----GTATTAAAACTATGCGTC--CACGCACGC----------GTATTGTGCAATT---TAACGTAAA-T-TGTCCAC--AACGT-TATTACTCGTACACACGTTCGCGCGTA
Reference ( family-2197 ) : GCAAAACAAG-AA-TTA-GCAGCTTAGTAAATNTTATAATTACTCCGTTTCCATGACAATAAC---------------C------ATCTTCTATAAGTTTCAGTATACATATA-TGAAATGTTCTTTTAT-TTGTTTTAGAATTAAGT-TAGCTACATTAATTA---AGTGT-GATTCGTTGCTCACGTATTCCGACGTATGAAAGGTCAAAAGAAGGTATTANATT----ATTT-TAAGACAAAATCGTAATT-GGAGTACTT--AT--A--AA--CTACCAAGTGTAGGGCATTCGAAATTGTAGGGATTCCGGTNCGGATTTGTTCGATGGCCC---GGTTAGCT------------CAG--TGGGTA-GA-CACCCTGGTA-GTATTCGGAGATTCGCTGGTTCGAAT-------------C-------------TGT-------ACC--------TGTAGGAGCAGGTTAGCTCCTGGAAAAANGAAGTGTATC-------GATTCCGGCGCGGGTTTGTTTTAAC--TC-GTGGTCAGAGCACCCTGCAAGTGTTCGAATATGTGCGGGTTTGAATCC------A-TATCGGGCGNCATTCCTCTCCACCCTT--TGGATTTCTACAATGGT-A---AAGAGGTTCACG--T-G------A---T-----TGTGCAGGTACT---AT---A------ATGGCCGTNTA-T-C--AAA-GAATAATC-A-ACA-TCATGCACCGAACCTTCCGAGTCTTATACTTAGATTCAGACGTCAAATTATGATTT-TGATAACTTTTTA-TTCAAGTAGC-GTTATAATT---------G------T----GTT------ACTAAACGGAGTGGATTT-ATTCCAAGATGGATTTGAATGTGTGAATTAGAATATTTGCGTCTGGTTTAAAGACTAAGACTCAAAAGGTTGATAAAATA-AACCAAAATGTATCCATAGTAACGATACCAGTCTGATGATCTTCAAGCGTCGTCTTCTGTGCTATGCACGGGTAGCGTTAGCCTGGAATAAACATCCTCCGTCTGTCTGAA---------------TANACACACT---GT------AACA---TGTCCAA-GT-----TAC--GCT-TT-ACA--T-TC---GTCAC-TTTTA-------------GAACGAAAGTTTTGATTTCCTATTACACAATTCG-TCT----TGCACACAAATT----GTCC--GCACGC----AATT-TTCTGTTTTCGCAA--ACGA-ATAAATTACACCACAAGTTCA------ACACACGTATTGTGCTATAAAGCAATCTGTCCATAAT----GTATTAAAACTATGCGTC--CACGCACGC----------GTATTGTGCAATT---TAACGTAAA-T-TGTCCAC--AACGT-NATTACTCGTACACACGTTCGCGCGTA
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gi|1 : aGTAAGAGCACCCTGCAAATGTTCAAATATGTGCGAGTTTGAATCCTTAATGA-TATCGGGTGTTATAACTCTCTACACTT--TATATTTCTACAATAGTTA---AAGAGGATAACGCAT-GCAATTCG---T-----TGTACAAGCACT---ATTATA------ATGACTGTGTA-C-TGAAAA-GAATAATA-A-AAAATTATGCACCGAACCTTC-GAGTCTTATACTTAGATTCAGACGTCAAATTATGATTT-TGATAACGTTTTA-TTCAAATGAG-ATT-CAATTAG-------G------T----GTTTTTGCTACTAAATAAAGTGGATTT-ATTCCGAAATGAATTTGAATATGTCATTTAGA-TATTTGCGTCTGGTTTAAAGACTTAGACTCAAAAGGCTGATGAAATA-TGCCAAAGTATATCAATAGTAACGATACCAGTCTGATGATCTTCAACCGTCGTCTTATGTGCTGTGCACGGGTAGCGTTAGCCTGGAATAACTATCCTCCGTCTGTCTGAA---------------TATACACACTGTAGT------AACA---TATCCAAGGTACATGTAC--ACT-TT-ATA--T-T----GT--C-TTTTA-------------TA---------TGGAGTGCC-----CATAATGCG-TTA----TACACACAAATT----GTCC--GCACGC----AATT-TTTTCTTTTTGCAA--ATGA-ATAAATTA---CACAAGTTCA------ACACATGTATTGCGGTATAAAACAATGTGTCCATGAT----GCACTAAGCCCAGGCGTC--CACATACACACAACCACAAATAATGTGCATTT---TAACGTAAAGT-TGTCCACATAACGT-CATTACTGGTACACACGTTCATGCATAgtaagagcaccctgcaaatgttcaaatatgtgcgagtttgaatccttaatgatatcgggtgttataactctctacactttatatttctacaatagttaaagaggataacgcatgcaattcgttgtacaagcactattataatgactgtgtactgaaaagaataataaaaaattatgcaccgaaccttcgagtcttatacttagattcagacgtcaaattatgattttgataacgttttattcaaatgagattcaattaggtgtttttgctactaaataaagtggatttattccgaaatgaatttgaatatgtcatttagatatttgcgtctggtttaaagacttagactcaaaaggctgatgaaatatgccaaagtatatcaatagtaacgataccagtctgatgatcttcaaccgtcgtcttatgtgctgtgcacgggtagcgttagcctggaataactatcctccgtctgtctgaatatacacactgtagtaacatatccaaggtacatgtacactttatattgtcttttatatggagtgcccataatgcgttatacacacaaattgtccgcacgcaattttttctttttgcaaatgaataaattacacaagttcaacacatgtattgcggtataaaacaatgtgtccatgatgcactaagcccaggcgtccacatacacacaaccacaaataatgtgcattttaacgtaaagttgtccacataacgtcattactggtacacacgttcatgcataagccgctttttgtatttgatcgaatcaaatcgccagtatcttaaagtagacgagttcctaaaaacaaaactgaatattttcaaattgacgatttaagct
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus : GCAAAACAAG-AA-TTA-GCAGCTTAGTAAATNTTATAATTACTCCGTTTCCATGACAATAAC---------------C------ATCTTCTATAAGTTTCAGTATACATATA-TGAAATGTTCTTTTAT-TTGTTTTAGAATTAAGT-TAGCTACATTAATTA---AGTGT-GATTCGTTGCTCACGTATTCCGACGTATGAAAGGTCAAAAGAAGGTATTANATT----ATTT-TAAGACAAAATCGTAATT-GGAGTACTT--AT--A--AA--CTACCAAGTGTAGGGCATTCGAAATTGTAGGGATTCCGGTNCGGATTTGTTCGATGGCCC---GGTTAGCT------------CAG--TGGGTA-GA-CACCCTGGTA-GTATTCGGAGATTCGCTGGTTCGAAT-------------C-------------TGT-------ACC--------TGTAGGAGCAGGTTAGCTCCTGGAAAAANGAAGTGTATC-------GATTCCGGCGCGGGTTTGTTTTAAC--TC-GTGGTCAGAGCACCCTGCAAGTGTTCGAATATGTGCGGGTTTGAATCC------A-TATCGGGCGNCATTCCTCTCCACCCTT--TGGATTTCTACAATGGT-A---AAGAGGTTCACG--T-G------A---T-----TGTGCAGGTACTAN---AATGGCCGTGTA-T-C--AAA-GAATAATC-GA-A--TCATGCACCGAACCTTCCGAGTCTTATACTTAGATTCAGACGTCAAATTATGATTT-TGATAACTTTTTA-TTCAAGTAGC-GTTATAATT---------G------T----GTT------ACTAAACGGAGTGGATTT-ATTCCAAGATGGATTTGAATGTGTGAATTAGAATATTTGCGTCTGGTTTAAAGACTAAGACTCAAAAGGTTGATAAAATA-AACCAAAATGTATCCATAGTAACGATACCAGTCTGATGATCTTCAAGCGTCGTCTTCTGTGCTATGCACGGGTAGCGTTAGCCTGGAATAAACATCCTCCGTCTGTCTGAA---------------TANACACACT---GT------AACA---TGTCCAA-GT-----TAC--GCT-TT-ACA--T-TC---GTCAC-TTTTA-------------GAACGAAAGTTTTGATTTCCTATTACACAATTCG-TCT----TGCACACAAATT----GTCC--GCACGC----AATT-TTCTGTTTTCGCAA--ACGA-ATAAATTACACCACAAGTTCA------ACACACGTATTGTGCTATAAAGCAATCTGTCCATAAT----GTATTAAAACTATGCGTC--CACGCACGC----------GTATTGTGCAATT---TAACGTAAA-T-TGTCCAC--AACGT-TATTACTCGTACACACGTTCGCGCGTA
Reference ( family-2197 ) : GCAAAACAAG-AA-TTA-GCAGCTTAGTAAATNTTATAATTACTCCGTTTCCATGACAATAAC---------------C------ATCTTCTATAAGTTTCAGTATACATATA-TGAAATGTTCTTTTAT-TTGTTTTAGAATTAAGT-TAGCTACATTAATTA---AGTGT-GATTCGTTGCTCACGTATTCCGACGTATGAAAGGTCAAAAGAAGGTATTANATT----ATTT-TAAGACAAAATCGTAATT-GGAGTACTT--AT--A--AA--CTACCAAGTGTAGGGCATTCGAAATTGTAGGGATTCCGGTNCGGATTTGTTCGATGGCCC---GGTTAGCT------------CAG--TGGGTA-GA-CACCCTGGTA-GTATTCGGAGATTCGCTGGTTCGAAT-------------C-------------TGT-------ACC--------TGTAGGAGCAGGTTAGCTCCTGGAAAAANGAAGTGTATC-------GATTCCGGCGCGGGTTTGTTTTAAC--TC-GTGGTCAGAGCACCCTGCAAGTGTTCGAATATGTGCGGGTTTGAATCC------A-TATCGGGCGNCATTCCTCTCCACCCTT--TGGATTTCTACAATGGT-A---AAGAGGTTCACG--T-G------A---T-----TGTGCAGGTACTAN---AATGGCCGTGTA-T-C--AAA-GAATAATC-GA-A--TCATGCACCGAACCTTCCGAGTCTTATACTTAGATTCAGACGTCAAATTATGATTT-TGATAACTTTTTA-TTCAAGTAGC-GTTATAATT---------G------T----GTT------ACTAAACGGAGTGGATTT-ATTCCAAGATGGATTTGAATGTGTGAATTAGAATATTTGCGTCTGGTTTAAAGACTAAGACTCAAAAGGTTGATAAAATA-AACCAAAATGTATCCATAGTAACGATACCAGTCTGATGATCTTCAAGCGTCGTCTTCTGTGCTATGCACGGGTAGCGTTAGCCTGGAATAAACATCCTCCGTCTGTCTGAA---------------TANACACACT---GT------AACA---TGTCCAA-GT-----TAC--GCT-TT-ACA--T-TC---GTCAC-TTTTA-------------GAACGAAAGTTTTGATTTCCTATTACACAATTCG-TCT----TGCACACAAATT----GTCC--GCACGC----AATT-TTCTGTTTTCGCAA--ACGA-ATAAATTACACCACAAGTTCA------ACACACGTATTGTGCTATAAAGCAATCTGTCCATAAT----GTATTAAAACTATGCGTC--CACGCACGC----------GTATTGTGCAATT---TAACGTAAA-T-TGTCCAC--AACGT-TATTACTCGTACACACGTTCGCGCGTA
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gi|1 : aGTAAGAGCACCCTGCAAATGTTCAAATATGTGCGAGTTTGAATCCTTAATGA-TATCGGGTGTTATAACTCTCTACACTT--TATATTTCTACAATAGTTA---AAGAGGATAACGCAT-GCAATTCG---T-----TGTACAAGCACTATTATAATGACTGTGTA-C-TGAAAA-GAATAATA-AA-AAATTATGCACCGAACCTTC-GAGTCTTATACTTAGATTCAGACGTCAAATTATGATTT-TGATAACGTTTTA-TTCAAATGAG-ATT-CAATTAG-------G------T----GTTTTTGCTACTAAATAAAGTGGATTT-ATTCCGAAATGAATTTGAATATGTCATTTAGA-TATTTGCGTCTGGTTTAAAGACTTAGACTCAAAAGGCTGATGAAATA-TGCCAAAGTATATCAATAGTAACGATACCAGTCTGATGATCTTCAACCGTCGTCTTATGTGCTGTGCACGGGTAGCGTTAGCCTGGAATAACTATCCTCCGTCTGTCTGAA---------------TATACACACTGTAGT------AACA---TATCCAAGGTACATGTAC--ACT-TT-ATA--T-T----GT--C-TTTTA-------------TA---------TGGAGTGCC-----CATAATGCG-TTA----TACACACAAATT----GTCC--GCACGC----AATT-TTTTCTTTTTGCAA--ATGA-ATAAATTA---CACAAGTTCA------ACACATGTATTGCGGTATAAAACAATGTGTCCATGAT----GCACTAAGCCCAGGCGTC--CACATACACACAACCACAAATAATGTGCATTT---TAACGTAAAGT-TGTCCACATAACGT-CATTACTGGTACACACGTTCATGCATAgtaagagcaccctgcaaatgttcaaatatgtgcgagtttgaatccttaatgatatcgggtgttataactctctacactttatatttctacaatagttaaagaggataacgcatgcaattcgttgtacaagcactattataatgactgtgtactgaaaagaataataaaaaattatgcaccgaaccttcgagtcttatacttagattcagacgtcaaattatgattttgataacgttttattcaaatgagattcaattaggtgtttttgctactaaataaagtggatttattccgaaatgaatttgaatatgtcatttagatatttgcgtctggtttaaagacttagactcaaaaggctgatgaaatatgccaaagtatatcaatagtaacgataccagtctgatgatcttcaaccgtcgtcttatgtgctgtgcacgggtagcgttagcctggaataactatcctccgtctgtctgaatatacacactgtagtaacatatccaaggtacatgtacactttatattgtcttttatatggagtgcccataatgcgttatacacacaaattgtccgcacgcaattttttctttttgcaaatgaataaattacacaagttcaacacatgtattgcggtataaaacaatgtgtccatgatgcactaagcccaggcgtccacatacacacaaccacaaataatgtgcattttaacgtaaagttgtccacataacgtcattactggtacacacgttcatgcataagccgctttttgtatttgatcgaatcaaatcgccagtatcttaaagtagacgagttcctaaaaacaaaactgaatattttcaaattgacgatttaagct
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|17 : agcTGTAGTAATTACAGTACAGGTTTGTTCGTAGGCCC----GTCAGCT------------CAG--TGG-------CATCCTACTA-GTGTTCGAAa
gi|2 : ggtagCAGTATAAATATA-TGAAACGTTCTTATAT-TTGTTTTAGAA---------------TTAAGTA---AG-------------CT-AC--ATT---AAGTATGAAAGGTCAAAAGAAGGTCTTACTTT----ATTT-TGA-ACCAAATCATA-------GTATTT--AT--A--A---CTATACAGTGTAGAGCATTCTAAATGGTATGGATTCTAGTTGGGATTTGTTCAATAGCCC---GATTAGCTCAGCGGGTAGCTCAG--TGGGTAAGG-CATCCTGGTA-GTATTCAGAGATACGCTGGTTCGCAT-------------C-------------CGT-------AT---------TG--------GGTTAGCTGT-------ATGAAATGTATATAAATTAGATTCCGGCA--AATTTTATTTAAC--TCAGTCGTCAAAGCATCTTGAAAGTGTTCGA-T-TGTGCGGATTTGAATCC------A-TATCGGGCGGCACTCCTGTCAACCCTTATT---TTTCTACAATGGT-A---AAGAGTTTTATG--T-GGTAACAA---T-----TGTGCAGGTAATAG---AATCACCGTGTA-T-C------------------------------GAACCTTCCGAGTCTTATACTTATATTCTGACGTCAAATTATGATTT-TGATAATTTTTTG-TTCAAGTAGC-GTTATAACT---------G------T----GTT------ACTAAATGAAG--GATTT-ATTTTAACATGGATTCGATTGTGTGAATT-GAATATTTGCGTCTTGTTAAAAGACTAAGACTCAAAAGATTGATTAAATA-A-CCAAAATGTATCCATAGTAACGATACCGGTCTGATGATCTTCAAGCGTCGTCTTCTGTGCTATGCACGGGTAGCGTTAGCCTGGAATAAACATCCTCCGTCTGTCTGAA---------------TAGACACACT---GT------AACA---TTTCCAA-GT-----AAC--GTT-TT-ACA--T------GGAAC-ATCTA-------------TAGCGAAAGTTTTGATTTCTCATTACACAATTTG-TTT----TATACACAAATA----GTCC--GCACGC----AATT------CTTTC-CTA--ACGA-ATACGTTACACCATAATTTCAAT----ACACATGTACTGTCCTATAAAACAATTAGTCCATAAT-------TTA-----ATGCAT---AACACACAC----------ACATTGTGCAATT---TAACGTGAATT-TGTCCGC--AACGT-TATTACTTGTACAAACGTTCGTACATtcctatca
gi|3 : GCAAAACAAG-AA-CTAAGCAGCTTAGTAATTGTTATAATTACTCCGTTTTCATAGCAATAAC---------------T------ATCTTCTGTAAGTTTCAGCATACATTTAATGAAATGTTCTTATAT-TTGTTTTAGAATTAAGT-TAGCTACATTAATTATTAAGTGTTGATTCATTGCTCACTTATTCCGACGTATGAAAAGTCAAAAGAAGGTATTACATT----ATTT-TAAGACAAAATCGTAATT-GGAGTACTT--AT--A--AAAACTACCAAGTGTCAGGCATTCGAAATTGTAGGGATTCTGGTATAAATTTGTTCAATGGCCC---GGTTAGCT------------CAA--TTGGTA-GAGCGCCCTGGTA-GTGTTCGGATATTTGCTGGTTCGAAT-------------A-------------TGT-------ACC--------TGTAGGAGCAGGTCAGCTTCTGGGGAAAGGAAGTATATC-------GATTCCGGCACGGGTTTGTTTTAAC--TTAGTGGTCAGGGCACCATACAAGTGTTCGAGTATGTGCAGGTTTGAATCC------A-TATCCGGTGTCATTCCTCTCCAGCCTT--TAGCTTTCTACAATGTT-ATTAAAGAGGTTCGTG--T-G------A---T-----TGTGCAGGTACTGT---AATGGCCAAATA-TTC--AAATGAATAACCTGACA--TCATGCATCGAACCTTCCGAGTCTTATACTTAGATTCGGACGTCAAATTATAATTC-TGATAACTTTTTGGTTCAAGTAGC-ATTATAATT---------A------T----GTT------ATTAAACGCAGTGGAATT-ATTCCAATATGTAGT-GATTGTGTGAATTTGAA-ATTTGCGTCTGATTTAAAGACTAAGACTTAAAAGGTTGATATAATA-AACACAAATGTATCCATAGTAACGATACCAGTCTGATGGTCTTCAAGCGTCGTCTTCTGTGCTATGCACGGGTAG--------------AAACATCCTCCGTCTGTCTGAA---------------TATACACACT---GT------AACA---TGTCCAA-GT-----TAC--ACT-TT-ATA--T-T----GTCAC-TTTTA--------------AATGAAGCTTTTTATTTCTCAATACACAATTCG-TCT----TGCACACACATT----GTCC--GCACGC----AATTGTCCTTTTTTCACAA--ACGA-ATAAATTACACCACAAGTTCAATTAACACACACGTCTTGTGCAATTAAACAATTTGTCCATAAT----GTATGAAAACTATACGTC--CATGCACGC----------GTAcagcctttatttgcagttgaccgaaccaaatcaccaacatcttaaagtaggatgaaagtacctggaaacaaaaaagaatattttcaaaacaatatttactgtcaagtctagggtcgggtggtactggcagatacaggtgccccaggtgcaagcccccgcccaaaaatgttgtcagttatagtaaaactgactcaaatctagtatatgaaacgacatgcgaatcgtctaaaacagtaaaatatg
gi|3 : TANNNNNNNNNNTGTCCATAATCACGGTATAAAAACTATACGTC--CATGCACGC----------GTAnnnnnnnnnntgtccataatcacggtataaaaactatacgtccatgcacgcgta
gi|4 : gcaaaacaagaactaagcagcttagtaattgttataattactccgttttcatagcaataactatcttctgtaagtttcagcatacatttaatgaaatgttcttatatttgttttagaattaagttagctacattaattattaagtgttgattcattgctcacttattccgacgtatgaaaagtcaaaagaaggtattacattattttaagacaaaatcgtaattggagtacttataaaaactaccaagtgtcaggcattcgaaattgtagggattctggtataaatttgttcaatggcccggttagctcaattggtagagcgccctggtagtgttcggatatttgctggttcgaatatgtacctgtaggagcaggtcagcttctggggaaaggaagtatatcgattccggcacgggtttgttttaacttagtggtcagggcaccatacaagtgttcgagtatgtgcaggtttgaatccatatccggtgtcattcctctccagcctttagctttctacaatgttattaaagaggttcgtgtgattgtgcaggtactgtaatggccaaatattcaaatgaataacctgacatcatgcatcgaaccttccgagtcttatacttagattcggacgtcaaattataattctgataactttttggttcaagtagcattataattatgttattaaacgcagtggaattattccaatatgtagtgattgtgtgaatttgaaatttgcgtctgatttaaagactaagacttaaaaggttgatataataaacacaaatgtatccatagtaacgataccagtctgatggtcttcaagcgtcgtcttctgtgctatgcacgggtagaaacatcctccgtctgtctgaatatacacactgtaacatgtccaagttacactttatattgtcacttttaaatgaagctttttatttctcaatacacaattcgtcttgcacacacattgtccgcacgcaattgtccttttttcacaaacgaataaattacaccacaagttcaattaacacacacgtcttgtgcaattaaacaatttgtccataatgtatgaaaactatacgtccatgcacgcgGCAAAACA-------T--GCAGTTTAGTAAATATTATAAATCCTCCGTTTTCATGACAATAAC---------------C------ATCTTCTAAAAGTTTCAGTTTAAATATA-TGAAATGTTCTTTTAT-TTGTTTTAGAATT
gi|4 : aGTTTTAGA------ATTTGCAACACAAAATCGTAATT-GGAGTATTT--AT--A--G---CTATCAAGTTTAAAGCATTAAAAACCGTAGGG-TTCTGGTCGGGATTTGTTCGGTAG---------TA-TT------------CAG-------A-GA-TTCACTGGTACGTAT-----------CTGTATCGGAT-----------------------------T-------AGT--------TATAGGAACAGGTTTGTACCTGGAAAAA-GAAGTGTGTtgcaacacaaaatcgtaattggagtatttatagctatcaagtttaaagcattaaaaaccgtagggttctggtcgggatttgttcggtagtattcagagattcactggtacgtatctgtatcggattagttataggaacaggtttgtacctggaaaaagaagtgtgtgtctgtgtgtctgtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcatgcgtgcgtgcgtgaggtcagaacaccttgcaagtgttcggatttgaatccatatcaggcgatattcatttccatccttggagttttataacgattaagaggtccacgtgattgggcaagtactagaatcgccgtctatcgaaccttccgagtcttatacttatattcagacgtcaaattatgattttggtaactctttatttaagtaacgttataattgagttactaaacggaggatttattcccagatggatttgaatgtgtgaattaaatagttgcgtcttgtttacagactaagactcaaaatgttgataaaataaaccaaaatgtatccatagtaacgataccagtctgatgattgtcaagcgtcgtcttctgtgccatacacgggtagcgatagtctggaataaacatcctccgtttgtctgaataaacacactgttgaataaacacactgtctgaataatagactgttacatgtccaagttacgttttacatgcagcatctggaacgaaagttttgatttcctattacacaaatcgtttttgcacacaaattatccgcacgcaattttctgttttcgcaaacgaataaatttcaccacaagtattgtgctataaagcagtctgtacatactatattaaaactatgcttc
gi|4 : agcaaaacatgcagtttagtaaatattataaatcctccgttttcatgacaataaccatcttctaaaagtttcagtttaaatatatgaaatgttcttttatttGGTCAGAACACCTTGCAAGTGTTCG----------GATTTGAATCC------A-TATCAGGCGATATTCATTTCCATCCTT---GGAGTTTTATAACGAT-T---AAGAGGTCCACG--T-G------A---T-----TGGGCAAGTACTAG---AATCGCCGTCTA-T-C------------------------------GAACCTTCCGAGTCTTATACTTATATTCAGACGTCAAATTATGATTT-TGGTAACTCTTTA-TTTAAGTAAC-GTTATAATT---------G------A----GTT------ACTAAACGGAG--GATTT-ATTCCCAGATGGATTTGAATGTGTGAATTA-AATAGTTGCGTCTTGTTTACAGACTAAGACTCAAAATGTTGATAAAATA-AACCAAAATGTATCCATAGTAACGATACCAGTCTGATGATTGTCAAGCGTCGTCTTCTGTGCCATACACGGGTAGCGATAGTCTGGAATAAACATCCTCCGTTTGTCTGAA---------------TAAACACACT---GTTGAATAAACACACTGTCTGA-ATAA---TAG--ACTGTT-ACA--TGTCCAAGTTACGTTTTACATGCAGCATCTGGAACGAAAGTTTTGATTTCCTATTACACAAATCGTTTT----TGCACACAAATT----ATCC--GCACGC----AATT-TTCTGTTTTCGCAA--ACGA-ATAAATTTCACCACAA-----------------GTATTGTGCTATAAAGCAGTCTGTACATACT----ATATTAAAACTATGCTTC--gtctgtgtgtctgtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcatgcgtgcgtgcgtgaggtcagaacaccttgcaagtgttcggatttgaatccatatcaggcgatattcatttccatccttggagttttataacgattaagaggtccacgtgattgggcaagtactagaatcgccgtctatcgaaccttccgagtcttatacttatattcagacgtcaaattatgattttggtaactctttatttaagtaacgttataattgagttactaaacggaggatttattcccagatggatttgaatgtgtgaattaaatagttgcgtcttgtttacagactaagactcaaaatgttgataaaataaaccaaaatgtatccatagtaacgataccagtctgatgattgtcaagcgtcgtcttctgtgccatacacgggtagcgatagtctggaataaacatcctccgtttgtctgaataaacacactgttgaataaacacactgtctgaataatagactgttacatgtccaagttacgttttacatgcagcatctggaacgaaagttttgatttcctattacacaaatcgtttttgcacacaaattatccgcacgcaattttctgttttcgcaaacgaataaatttcaccacaagtattgtgctataaagcagtctgtacatactatattaaaactatgcttc
gi|5 : agcaaaacatgcagtttagtaaatattataaatcctccgttttcatgacaataaccatcttctaaaagtttcagtttaaatatatgaaatgttcttttatttgttttagaatttgcaacacaaaatcgtaattggagtatttatagctatcaagtttaaagcattaaaaaccgtagggttctggtcgggatttgttcggtagtattcagagattcactggtacgtatctgtatcggattagttataggaacaggtttgtacctggaaaaagaagtgtgtgtctgtgtgtctgtctgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgcatgcgtgcgtgcgtgaGCAAAACA-------T--GCAGTTTAGTAGATATTATAAATACTCCATTTCGATGACAATAAC---------------C------ATCTTCTAAAAGTTTCAGTTTAAATATA-TGAAATGTTCTTTTAT-TTGTTTTAGAATTAAGT-T
gi|5 : aATTAAGTTTTGAATTG-TAACACACAATCGTAATT-AGAGTATTT--AT--A--A---CTATCAAGTTTAGAGCATTCAAAACTGTAGGGGTTCTGGTCAGGATTCGTTTGATGGCC--------------------------------------------TGGTA-GTATTCAGAGATTCACTGGCACGTAT-------------C-------------TGT-------ATCGGATTGGCTGTAGGAACAGGTTTATACCTGGAAAA-TAAAGTGTGT---------------GTGTGTGTGTGTGT---------GTGGTCAGAGCACCTTGCAAGTGTTCG----------GATCTGAATCC------A-TATCGGACGATATTCCTTTCCATCCTT---GGATATCTATAAAGGT-G---AAGAGGT-CACG--T-G------A---T-----TGGGCAAGTACTAG---AATGGCCGTCTA-T-C------------------------------GAACCTTCCGAGTCTTATTCTTATATTCAAACGTCAAATTATGATTTATGA--ACTCTTTA-TTTAAGTAAC-GTTATAATT---------G------T----GTT------ACTAAACGGAG--GATTT-ATTCCAAGATGGATTTGAATGTGTGAATTA-AATAGTTGCGTCTTGCTTAAAGACTAAGACTCAAA-TGTTGATAAAATA-AACCAAAATGCATCCATAGTAACGATACAAGTCTGATGATTTTCAAGCGTCGTCTTCTGTGCCATGCACGGGTAGCGTTAGTCTGGAATAAACATCCTCCGTTTGTCTGAATAAACACTGTCTGAATAAACACACT---GTTGAATAAACACACTGTCTGA-AT-----AACAGACT-GTAACA--TGTCCAAGTTACATTTTAAATTCAGCATATGGAACGAAAGTTTTGATTTCCTATTACACAAATCG-TCT----TCCACACAAATT----ATCC--GCACGC----AATT-TTCTGTTTTCGCAA--ACGA-ATAAATTACACCACAAGT--A------A---------TGTGCTATAAAGCAATCTGTACATAAT----GTATTAAAACTATGCTTC--AACACACAC----------ttgaattgtaacacacaatcgtaattagagtatttataactatcaagtttagagcattcaaaactgtaggggttctggtcaggattcgtttgatggcctggtagtattcagagattcactggcacgtatctgtatcggattggctgtaggaacaggtttatacctggaaaataaagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtggtcagagcaccttgcaagtgttcggatctgaatccatatcggacgatattcctttccatccttggatatctataaaggtgaagaggtcacgtgattgggcaagtactagaatggccgtctatcgaaccttccgagtcttattcttatattcaaacgtcaaattatgatttatgaactctttatttaagtaacgttataattgtgttactaaacggaggatttattccaagatggatttgaatgtgtgaattaaatagttgcgtcttgcttaaagactaagactcaaatgttgataaaataaaccaaaatgcatccatagtaacgatacaagtctgatgattttcaagcgtcgtcttctgtgccatgcacgggtagcgttagtctggaataaacatcctccgtttgtctgaataaacactgtctgaataaacacactgttgaataaacacactgtctgaataacagactgtaacatgtccaagttacattttaaattcagcatatggaacgaaagttttgatttcctattacacaaatcgtcttccacacaaattatccgcacgcaattttctgttttcgcaaacgaataaattacaccacaagtaatgtgctataaagcaatctgtacataatgtattaaaactatgcttcaacacacac
gi|6 : agcaaaacatgcagtttagtagatattataaatactccatttcgatgacaataaccatcttctaaaagtttcagtttaaatatatgaaatgttcttttatttgttttagaACCTTGCAAATGTTCG----------GATCTGAATCT--------TGTCGGGCGATATTCCTTTCCATC-TT--TGGATTTCTATAACGGT-A---AAGAGGTCCACG--T-G------A---T-----TGGGCAAGTACTAG---AATGGCCGTCTA-T-C------------------------------GAACCTTCCGAGTCTTATACTTATATTCAGACGTCAAATTATGATTT-TATTAACTCTTAA-TTTAAGTAAC-GTTATTATT---------G------T----GTA------ACTAAACGGAG--GATTT-ATTCCAAGATGGATTTGAATGTGTGAATTA-AATAGTTGCGTCTGGTTTAAAGATTAAGACTCAAAAGGTTAATAAAATA-AACAAAAATGTATCCATAGTAACGATACCAGTCTGATGATCTTCAAGCGTCGTCTTCTGTGCTATGCACGGGTAGCGTTAGCCTGGAATAAACATCCTCCGTCTGTCTGAA---------------TAAACACACT---GT------TACA---TGTCCAA-GT-----TAC--GTT-TT-ACA--T------G-CAG-TATCAG------------GAACGAACGTTTTGATTTCCTATTACACAATTCG-TCT----TGCACACACATT----GTCC--GCACGC----AATT-TTCTGTTTTCGCAA--ACGA-ATAAATTACACCACAA-----------------GTATTGTGCTATAAAGCAATCTGTACATACT----GTATTAAAGCCATGCTTCAACACACACAC----------ATATTGTGAAATT---TAATGTAAA-T-TGTCCAC--AATGT-AACTACTCGTACACACGTTCACGCGTA
gi|7 : AAAACAAGCAA-TTA-GTAGCTTGATAAATTTTATAATTACTCCGTTTACTTGGCAATAACAGAA-----------CAGACCAATCTCCTATAAATTTCACTATACATATA-TG----------TTAG-CTAC------ATTAAGTGTTGCTTCATT----------------------GCTCACGTGTTCAGACGTATGAAAGGTCAAAAGATGATATTAAACT----GCTT-TAAAATATAAACGTAATA-GGAGTACTT--ATAAA--AA--CTACCAAGTGTAGGGTATTGGAAATTATAGGGATTCTAGTTCGGATTAGTTCAATGGCCC---GGTTAGCT------------CAG--TGGGTA-GA-CACCGTTGTA-TTATTCGGAGATTATCTGGTTCGAATTCATATTGGTTCGT-------------TGT-------ACC--------TGTAGGGGAAGGTCAGCTCTTGGAAAAAAGA--TTTAT----------TTCGGACTTGGGT------------------GTCGGAGCACCCTGCAAATGTTCGAATATGTGCGGGTTTCATTCC------A-TTTCGGGTGTCATTTCTCTCCACCCTT--TGTATTTCTACAATGGT-T---ATGAGGGTAATG--TAG------A---TATGGGTATACAGGGACTAT---AATGGCCGTGTAGT-CA-AAA-GAATAATCAGATA--TCATGCACCGAGCCTT-CGAGTCTTATACTTAGATTCAGACGTCAAATTACG---------AACGTTTTA-TTCAAGTAGC-ATTATAATTTAATTAA--GTGTTTTT----GTT------ACTATATAAAGTGAATTT-ATTCCAAAATTGATTTTAATATGTAAATTAG-ATATTTGCGTCTGGTTTAAAGAATAAGACTCAAAAGGCCGATAAAATA-AACCAAAATGTATCCATAGTAACGATACCAATCTGATGATCTTCAAGCGTCGTCTTCTGTGCTATGCACCGGTAGCGTTAGCCTGGAATACACATCCTCCATCTGTCTGAA---------------TATACACACT---GT------AACA---TGTCCAA-GT-----TAagcctttagaaccgaatcaccagcctcttaaggtagggaagtacctgaaaacaaaaatgaatatttttaaattaataatgacttaaattccagggtcggatgacactggcagatacataaccacatgggccagccccgcccaataacgttggtaagcatagttaaattgactgaaatctggtacaagacacaacatgcgaaccgactcaaacagtcaaatatatataacgcctctttaaaat
gi|8 : gaTA-GA-CACCATGGTA-GTATTCGAAGATTAGCTGGTTCGAAT-------------CCGTTTCGGTTCGTTGT-------ACC--------TGCAGAAGCAGGTCAGCTCTTGGTAAAAGGAAGTATATA-------GATCCCGG-----GTTTGTTTTAAC---------------------GCAAATGTTCGAGTATGTGAGGGTTTGAATCC------A-TATCGGGTGTCACTTCTCTCCACCCTT--TGGATTCTTACAATGGT-A---AAGAGGGTAATG--T-A------AATATGGG--TGTACAGGCACTAT---AATGGCCGTGTAGT-C--AAAAGAATAATCAGATA--TCATGCACCGAGCCTTC-GAGTCTTATACTTAGATTCAGACGTCAAATTATGA---------ACATTTTA-TTCAAGAAGC-ATTATAATTTAATTAGATG------TTTCTGTT------ACTATATAGTGTGGGTTTTATTCCAAAATGGATTTGAATATGTAAATTAGA-TATTTGCGTCTGGTTTAAAGACTAAGACTCAAAATGCTGATATAATA-AACCAG--TGTATCCATAGTAACGATACCAATCTGATGATCTTCAAGCGTCGTCTTCTGTGCTATGCATGGGTAGCGTTAGCCTGGAATACACATCCTCCGTCTGTCTGAA---------------TATACACACT---GT------AACA---TGTCCAA-GT-----TAC--ACT-TT-A
gi|9 : agtATTAAACAATTTG-TCCATAATGTATGAAAACTATACGTCCATGCACGCGTANNNNN-NNNNNTGTCCATAATCACGGTATAAA--A-ACTATACGTCCAT-----GCACGCGTATTGTGCAGCTAATCACTTTGTCCATAATCACGGTATGAAAACTATACGTC--CATACATGC----------GTATTGTGCAATTTAGTAACGTAAA-TGTGTCCAC--AACGTATTTTACTCGTACACACGTTTGCGCGt
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blockSeqs : AGCAATTA A T . TC . TA T ATT G C AT T C . . C . . . AA AC A CGGTTAGCT . GTAGACAC . T TCA A CCAATATCAGCGACACC G A C CTTGG G TTTTAAC A A AGTATGTGAG A A TG T TCC . . ATATGGG G C . . AAAAGAATAATCAGATATCATGCACC C G TGGT . . GT . TG . AA . A . G . . . . . . . . . GGAACATCTAT A A T . . . . . . G G . . C GTCCATGCACGC . G . G . . T . A
blockSeqs : T A C . TC . . . . . . A G . . C . . . A TG T CGGTTAGCT . CTGAAC . T TAT G CTGTATCGGATTGGC T G A CAA T TGTG A T ATTGTGCG A A TG G TCC . . AT G C . . . C T ATGA . . GT . TG . AA . A . T . . . . . . . . . TGTCACTTTTA A A T . . . . . . G G . . C GTAA . T . A .
blockSeqs : T T C . . . A A . . A . . . G AT T CGTCAGCT . AGATTC . T TAG T ATGTACC A G . . . . A T AATATGT A A TG A GTA . . AT G C . . . C T TATT . . AT . . . AA . A . A . . . . . . . . . GCAGTATCAGG A C T . . . . . . N A . . C . . T . A .
blockSeqs : . . . . A . . . . . . A CG T TTACCTG . CAT . T CT A CCGTAT G T . . T . A T G T GTA . . AT T G . . . C T T . . GA . . . GA . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . A .
blockSeqs : CA T CAGTAT . . . T . A TAGT . A . C . A T G A TC . . AT T G . . . C G . . . GT . . . GA . . . A . . . . . . . . . G .
blockSeqs : TC T TATT . . . . . . . G . . . GT . . . A . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . .
blockSeqCons : C********************* ** AA**** CGGTTAGCT*************** TAGACAC*** TCG CCGTATCGGGGTACC********************************* TTTTAACG***** ATATGTG*** A******* N**** ** AT************** G*** ****************************** GT******************* ****** *** ***** GGANNATCTNN******************** GTCAATCACC******* **********
originalCons : GCAAAACAAG-AA-TTA-GCAGCTTAGTAAATNTTATAATTACTCCGTTTCCATGACAATAAC---------------C------ATCTTCTATAAGTTTCAGTATACATATA-TGAAATGTTCTTTTAT-TTGTTTTAGAATTAAGT-TAGCTACATTAATTA---AGTGT-GATTCGTTGCTCACGTATTCCGACGTATGAAAGGTCAAAAGAAGGTATTANATT----ATTT-TAAGACAAAATCGTAATT-GGAGTACTT--AT--A--AA--CTACCAAGTGTAGGGCATTCGAAATTGTAGGGATTCCGGTNCGGATTTGTTCGATGGCCC---GGTTAGCT------------CAG--TGGGTA-GA-CACCCTGGTA-GTATTCGGAGATTCGCTGGTTCGAAT-------------C-------------TGT-------ACC--------TGTAGGAGCAGGTTAGCTCCTGGAAAAANGAAGTGTATC-------GATTCCGGCGCGGGTTTGTTTTAAC--TC-GTGGTCAGAGCACCCTGCAAGTGTTCGAATATGTGCGGGTTTGAATCC------A-TATCGGGCGNCATTCCTCTCCACCCTT--TGGATTTCTACAATGGT-A---AAGAGGTTCACG--T-G------A---T-----TGTGCAGGTACTAN---AATGGCCGTGTA-T-C--AAA-GAATAATC-GA-A--TCATGCACCGAACCTTCCGAGTCTTATACTTAGATTCAGACGTCAAATTATGATTT-TGATAACTTTTTA-TTCAAGTAGC-GTTATAATT---------G------T----GTT------ACTAAACGGAGTGGATTT-ATTCCAAGATGGATTTGAATGTGTGAATTAGAATATTTGCGTCTGGTTTAAAGACTAAGACTCAAAAGGTTGATAAAATA-AACCAAAATGTATCCATAGTAACGATACCAGTCTGATGATCTTCAAGCGTCGTCTTCTGTGCTATGCACGGGTAGCGTTAGCCTGGAATAAACATCCTCCGTCTGTCTGAA---------------TANACACACT---GT------AACA---TGTCCAA-GT-----TAC--GCT-TT-ACA--T-TC---GTCAC-TTTTA-------------GAACGAAAGTTTTGATTTCCTATTACACAATTCG-TCT----TGCACACAAATT----GTCC--GCACGC----AATT-TTCTGTTTTCGCAA--ACGA-ATAAATTACACCACAAGTTCA------ACACACGTATTGTGCTATAAAGCAATCTGTCCATAAT----GTATTAAAACTATGCGTC--CACGCACGC----------GTATTGTGCAATT---TAACGTAAA-T-TGTCCAC--AACGT-TATTACTCGTACACACGTTCGCGCGTA
finalCons : GCAAAACAAG-AA-TTA-GCAGCTTAGTAAATNTTATAATTACTCCGTTTCCATGACAATAACC---------------------ATCTTCTATAAGTTTCAGTATACATATA-TGAAATGTTCTTTTAT-TTGTTTTAGAATTAAGT-TAGCTACATTAATTA---AGTGT-GATTCGTTGCTCACGTATTCCGACGTATGAAAGGTCAAAAGAAGGTATTANATT----ATTT-TAAGACAAAATCGTAATT-GGAGTACTT--AT--AAA----CTACCAAGTGTAGGGCATTCGAAATTGTAGGGATTCCGGTNCGGATTTGTTCGATGGCCCGGTTAGCT---------------CAG--TGGTAGACAC---CCTGGTA-GTATTCGGAGATTCGCTGGTTCGAATCCGTATCGGGGTACC---------------------------------TGTAGGAGCAGGTTAGCTCCTGGAAAAANGAAGTGTATC-------GATTCCGGCGCGGGTTTGTTTTAACG-----TGGTCAGAGCACCCTGCAAGTGTTCGATATGTG---GGTTTGAATCCA-------TATCGGGCGNCATTCCTCTCCACCCTT--TGGATTTCTACAATGGTN----AAGAGGTTCACG--T-GAT--------------TGTGCAGGTACTAG---AATGGCCGTGTA-T-C------------------------------GAACCTTCCGAGTCTTATACTTAGATTCAGACGTCAAATTATGATTT-TGATAACTTTTTA-TTCAAGTAGC-GTTATAATTGT-------------------GTT------ACTAAACGGAGTGGATTT-ATTCCAAGATGGATTTGAATGTGTGAATTAGAATATTTGCGTCTGGTTTAAAGACTAAGACTCAAAAGGTTGATAAAATA-AACCAAAATGTATCCATAGTAACGATACCAGTCTGATGATCTTCAAGCGTCGTCTTCTGTGCTATGCACGGGTAGCGTTAGCCTGGAATAAACATCCTCCGTCTGTCTGAA---------------TANACACACT---GT------AACA---TGTCCAA-GT-----TAC--GCT-TT-ACA--TGGANNATCTNN--------------------AACGAAAGTTTTGATTTCCTATTACACAATTCG-TCT----TGCACACAAATT----GTCC--GCACGC----AATT-TTCTGTTTTCGCAA--ACGA-ATAAATTACACCACAAGTCAATCACC-------GTATTGTGCTATAAAGCAATCTGTCCATAAT----GTATTAAAACTATGCGTC--CACGCACGC----------GTATTGTGCAATT---TAACGTAAA-T-TGTCCAC--AACGT-TATTACTCGTACACACGTTCGCGCGTA
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): TGAAAACAAAAATAAATATTTTGAAATTAATAATGACTTTAAATTCCAGGGTCGGATGACACTGGCAGATACATAACCACAGGTGCCAACTCCGCCCAAAAACGTTGGTAAGTATAGTTAAATTGACTGCAATCTAGTACAAGAAACGGCATACGAACCGTCTAAAACAGTCAAATATATATTGCGCCTCTTTAAAAT
Unaligned ( gi|14 ): GGTCGGATGGCACTGGCAGATACAGGTGCCTCAGGAGCCAGCCTCTGACCCAGAACGTTGGCACATATAATTAAATGCACAAACACCTGGTACAAGAAACTGCATGTGAACCGTCTCAAACAGTCAGATATGTATAATTACGCCCTTTTA
Unaligned ( gi|16 ): CCCAAAAATAAATATAGTTAAGTTTATTGAAAATGTGGTGCAAGAACTGGCATATGAACTCCCCCCAACCCATAAAATGGGATAATATATATATTTCTCACTCCCTTAAAATT
Unaligned ( gi|18 ): TCGTTCAATGGACTTATGATCAGTTGTTAGAGCGCCCTGTGGTGTTCTGGTAGTCACAGGTTCAAGTTCTGTATC
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gi|8 : ga-TA-GA-CACCATGGTAGTATTCGAAGATTAGCTGGTTCGAATCCG-TTTCGGTTCGTTGTACCTGCAGAAGCAGGT-CAGCTCTTGGTAAAAGGAAGTATATAGATCCCGG-----GTTTGTTTTAAC---G-------------------CAAATGTTC-G-AGT-ATGT--GAGGGTTTGAATCC------A-TATCGGGTGTCACTTCTCTCCACCCTT--TGGATTCTTACAATG---G-TAAAGAGGGTAATG--T-A------AATATGGG--TGTACAGGCAC---TATAATGGCCGTGTAGTCAAAAGAATAATCAGATATCATGCA-CCG-------------AG--------------------------CCT-------------------T-----C-GAGTCTT--------ATACTTAGATTCAGACGTCAAATTATGA---------ACATTTT-ATTCAAGAAGC-ATTATAATTTAATTAGATG------TTTCTGT------TACTATATAGTGTGGGTTTTATTCCAAAATGGATTTGAATATGTAAATTAGA-TATTTGCGTCTGGTTTAAAGACTAAGACTCAAAATGCTGATATAATA-AACCAG--TGTATCCATAGTAACGATACCAATCTGATGATCTTCAAGCGTCGTCTTCTGTGCTATGCATGGGTAGCGTTAGCCTGGAATACACATCCTCCGT---------------CTGTCTGAATATACACACT---GT------AACA---TGTC-----------------------CAA----------GT-----TA-------------CACTTTA
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