lowQualScore : 111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 2 1 888888 11 999999999999999999 1 1 2 1 1111 3333333333 2222 1 22 11 2 2 33333333333 11 1 1 3333 333333333333 111 11 11111 1 111 1 2222222 11 1 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 1 4 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 111 222222222222 1 2 222 111 11 1111 6666666666666666666 00000 111111 1 11 11 1 1 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 1 111 1 11 111 22222222 6666666
lowQualScore : 5 8 5 000000 88 777777777777777777 5 6 6 11 6 5 7 3 5 9 6 6 66 3 8888 8 7777777777 5555 7 11 2 33 4 3 0 2 6 4 0 1 0 1 1 0 3 88888888888 00 5 6 6 7 0000 3 99 8 66 3 777 444444444444 1 444 22 88 66666 5 8 2 6 222 8 2 0 7 4444444 33 4 6 2 1 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 4 666 4 66666666 0 0 6 6 3 55 7 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 99 55 2 777 111 999999999999 3 2 6 0 3 7 333 6 777 4 0 2 99 6 8888 99 2222222222222222222 11111 999999 0 7 1 11 88 888 5 4 7 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 2 5 2 66666 99 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 8 88 3 111 6 1 1 6 4 6 55 99 000 3 11111111 5 6 5 2222222 2
lowQualScore : . . . ...... .. .................. . . . .. . . . . . . . . .. . .... . .......... .... . .. . .. . . . . . . . . . . . . . ........... .. . . . . .... . .. . .. . ... ............ . ... .. .. ..... . . . . ... . . . . ....... .. . . . . ..................................................................................................... . . ... . ........ . . . . . .. . ........................................................... .. .. . ... ... ............ . . . . . . ... . ... . . . .. . .... .. ................... ..... ...... . . . .. .. ... . . . ............................................................................ . . . . ..... .. ................................................................................... . . .. . ... . . . . . . .. .. ... . ........ . . . ....... .
lowQualScore : 5 5 0 000000 00 000000000000000000 0 0 7 33 7 0 3 7 0 7 0 0 77 7 3333 3 7777777777 3333 0 55 5 88 0 3 2 5 0 0 8 0 0 4 0 8 2 00000000000 22 0 0 0 0 2222 3 77 9 11 6 888 222222222222 1 222 11 00 00000 0 8 5 0 555 0 0 7 8 5555555 55 8 5 3 2 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 8 9 444 5 11111111 2 0 0 0 8 77 6 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22 22 5 777 777 333333333333 7 8 0 0 8 8 888 0 555 0 8 2 00 0 0000 22 3333333333333333333 00000 222222 7 0 0 00 33 777 0 7 0 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 2 0 2 77777 22 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 3 33 3 666 0 0 0 5 0 7 88 22 000 7 77777777 7 0 9 2222222 5
consensus : GATATAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATATAGTTATATA------ATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGCTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCTATATATCGAAACTTTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTTTT-AAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCGAACAGAAACTTCTCAATTATTCCCGAAAGCTATTTGTAANATTACTACTGGTTACACTTGAACAGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTNA--ATCATGTCCATACCGTCCCNCTATCTTACACACACAAAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGNTGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTCGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAG-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGNTTTTCAACAAGTAGTCAN-AG-TAATT--AAAAAATAGAATTGG---T-----------AATGGCTA-T-GCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATA--TTTT-TTTGTACTTGACAAGATATTGAGTTAA-G-TCGAGTTCTT----C--AATTA--TTATCTCAAGCGCTCAACTTGTTATGT-CCAGCCCTCAGC-------TTAT-T--TT---ATC-T-CA----ATATTG----T-----C---TT-ATAT----------CAN--GTT-----------ATNTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATTA--------TCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTATAATTTATTATTTCGAGCTCTCGACTTATTATCTCGAG--CGTTAGACT-TG---T----TAAG----ATT----------------------GT--ACTTATTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATA-CGGACTA---ATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTC-AAACTCCTCACTTNATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTACAATACCACATAATAAT---TATTATATNCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCAA--TTT--TTTTAAATTA-TCTT-TT-TA--GAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T-T-TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTAGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCGAAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATNAGAGTAATAAATG-------CTG------------AT------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACAAGCAGACTTTTATGATATCACCGATACGATAC-----AATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGCTGACAATCTATTAAATGCATTACTGGCCGCCCGAAGAAATTATTGA--CCGA-GACTTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTNACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTATT------TGG-TTCTNATATACATAGAGTCTAATATT---AAAAAATCCTAAAACATTAACAATAAAA
Reference ( gi|1 ) : GATATAAAAAAAAAGAAATAAAGAAATATATTTATATATATGTAATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAA---------------GTTCAATACGTGTTGTTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTGTCAATGAAACATGTGTAAATAATAATTGTTTTTTTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTCCCAAATAGAAACTTTTCAATTATTCCTGAAAGTTATCCGTAAGATTACTACTTGTAACACTTGAACTGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CTGTCTTTATAATTGTATGCTTCATTCCTTCAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACACAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTTAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCAACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCAGTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCCAGTAGTCTGGTACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATATAATGCATACTTCAACAAGTAGCCAA-AG-TAATT--AAAAAATAGAATTGG---T-----------AATGGCTA-T-GCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATA--TTTT-TTTATACTTGACAAGATATTAAGTTAA-G-TCGAGTTATT----C--AATTA--TTATCTCAAGCGTTCAACGTGTTATGT-C----------C-------TTAT-T--TC---ATC-T-CA----ATATTG----T-----C---TT-ATAT----------CAT--GTT-----------ATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGCATTA--------TCTCCACTTGATATCTAAATATTTTTAATTATCT-CATATCTCGACTTACTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCCTATAATTTATTATTTCAAGCTCTCGATTTATTATCTTGAG--CGTTAGACT-TG---T----TAAG----ATT----------------------GT--ACTTATTTCAATATCACACACTGTTACCACTTGACA-CAGACTA---ATTATGATGAGCTCCTGACTTATAATGTT-ATACACCTCACTTTATACGTCTAGGGCTCAACATATTATATTTTGCCATCAAAACATATGTCTATTTGATATGTTGAATACCACATGATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAATTGTGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGCGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATC-A--TTT--TTTTAAAATAGTCTT-TT-TA-GGAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATATATATATAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTTAAATCTGTCTCGCATGTGAAATGTCATGTCATG--TCAAACTCAGGCCGAATTATAGCAAATACTAAAATAAGAGTAATTAATG-------ATG------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATTTCACTGATACAATAC-----AATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGCCGCCCAAAGAAATAATTGA--CCGA-GACTTTTATGATGTGTATGTCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATTCATGCAATTTGTTACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAGTTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTATT------TTG-TTTTAATATACATAGAGTCTAATATTTAAAAAAAATCCTAAAACATTAACAATAAAA
gi|2 : GATATAAAAAAAAAAAAA-GAAGAAATATAGTTATATACATGTGATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAACATAAAAATGATAATACGTTAAAGTTCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCATATATCAAAACTTTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGCTTTTT-AAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGTCAAAAAGAAACTTCTCAATTATTCCCGAAAGCTATCTGTAAAATAACTAATGATTACACTTGAACTGTAAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTTC-TCAAATGTTAGTTTATGATTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAACCTTTGGAAGCATGTCATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCAATTGCAATACCTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCATAGCTTTTTGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGGTTTTCAACAAGTAGTCAT-AG-TAATT--AAAAAATAGAATTGG---T-----------TATGGCTA-T-GCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACAAACATA--TTTT-TTTGTACTTGACAAGATATTGATTGAA-G-TCGAGTTCTT----C--AATTA--GTATCTCAAGCGCTCAACTTGTTATGT-CCAGCCCTCAGC-------TTAT-T--TT---ATC-T-CA----ATATTG----T-----T---TT-ATAT-----------ATAAGTT-----------ATTTATTATGTTGAACCC---TTGACGTATTA--------TCTCCACTTGATATATAGATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTATAATTTATTATTTCAAGCTCTCAACTTATTATCTTGAG--TGTTAGACT-TG---TAATGTCAA----ATTCTTTACTTATTATCTCAAGATTGT--ACTTATTTCAATATTTCGCACTGTAACCACTTGATC-CAGACTA---ATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTC-ATACTCTTAACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTTCAACACTACACAATAAT---TATTAAATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAATTGAGCTTTCAACATCTTATGGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATC-ATTTTT--TTTTAAATTA-TCTT-TTATA--GAACAAATCATGACCAGTTCTCTTTATATAT-T---TAGGTTTTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGCAGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCACAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAATTTAGAGTTATAAATG-------CTG------------ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGATAC-----AATTGTATGGCTTAGGCGTGGG--AAAAATAAAATATTCTTCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGCCACCCGGAGAAATTATTGA--CCGA-
gi|7 : GATATAAAAATAAAAAAA-AAAGAAATATAGTTATATA------ATTATTATTGT--CTTCATGATTTTGATAAAATAAGA------------------TCAAGACGTGTTATTCAAAGCATAGTTCAAGTCTTAGCCTT--ACATTCTATATATCGAAGCCTTCAATGGACCATGTGTAAATAATAATTGTTTTTT-AAAGAGAATTACACCACAACTTATTCTGCCGAACATAAACTTCACAGTTATTCCTAAAAGCTATTTGTAAGATTACTACTGGTTACACATGAACAGACAAATTTATAATT----ACCAACTAAACT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCTATACCGTCCCTCTATCTTACACACACA-AGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGTTGTTATATTGTTTGAATACAGCCATTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCATGATACCTCACTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGTGACCTTTACAGTAGAACCCCCAAAAGATGTCCTTAT-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAATTAACACTGTAACTGGCTAGCAGACTGGCACCTTGGAATATCACCTCTGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCTCTTTTCAACAAAATTCTAATAG-TAATT--AAAAAATAGAATTGGAAATTGGAAATTGGAAATGGCTA-T-GCACCTTGTGTAAGTGTATTTAGGACACACACATA--TT
gi|18 : gGATATAAAAAAAA-GAAAAACAGAAATATAGTTATATA------ATTATTATTGT--CTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATAGCTTA
gi|12 : gATATAAAAAAAA-GAAAAAAAGAAATATAGTTATATA------ATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAAAGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGCTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCTGTAAATCAAAACTGTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTTTTTGTAACATTACTACTGGTTACACTGGAACAGTCAAATTTATAATTACTAAC----TAAGCTCACAGTCTACATAATTGTATGCTTCATTCCTTT-AAGCAGTTAA--ATcag
gi|9 : TCTATATAATTGTATGCTTCTTTCCTTT-AAGCAGTTAAAGATCATGTTC
gi|5 : CAAAGAACATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGTTGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTCGGGAGCATGTGAGTGTAT---AGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACGGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCT-GCACCTTGGAATATTACCTTTGGTATCTGAAAGTGTAAAGATGAAATGTGTTTTTCAACAAGTAGTTAT-AG-TAGT----AAAAACAGAATTAG---T-----------AATGGCTA-A-TCACCTAATATAAGTGTATTTAGGACACACACATG--TTTTGTTTGTACTTGACAAGATATTGAGTTAT-G-TCAAGTTCTT----T--AATTA--TTATCTCAAGCGATCAACTTGTTATGT-CCAGTCCTCAGC-------TTAT-T--TT---ATT-T-CA----ATA-----------------TT-ATA------------A---GTT-----------ATTTATTATGTTGAGCTC---TTGATGTATTA--------TCTCCACTTGATATCTAAATATGTTGAATTATCTCCATATCACGACTTATTTTCTCTAGACCTTGACTTGCTGTTTTGGACTCTCAACTTATAATTTATTATTTCAAGCTCTCAACTTATTACCTTGAG--CGTTGGACT-TG---TAATGTCAA----ATTCTTTACTTATTATCTCAAGATTGT--ACTTATTTCAATATCTAACACTGTTACCACTTGATA-CGGACTA---GTTATGATGAGCTCCTGACTTATTTTTTC-AAACTCCTCACTTAATACGCCAAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCCATTTAATATATctcaaatgttagtttatgactcaagagtcaatgttatattgtttgaatacagcctttggaatcatgtgattgtattttagttattgtccctgatttgtcattgcaataactgcagtagatttcactcattcttttggaggcttttacagaaggatgtccttaattttggaatgtaacagcactgtttgctttcaaataacactgcaactggctagtagtctggcaccttggaatatcccatatggtatctgaaagtgttaagataaaataaaattttcaacaagtagtgatagtaattaaaaaatagaattggtaattgctgtgaaccatatgtaagtgtatttaggacacacatatatttttttttgtaattgacaagatattgagttaagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaaattgttatgcccaactctcagcttatttcattttaatattgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacatattatctccacttgatatctaaatattttgaattaactccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactgtctttggctctcagcttataatttttatttcaagctctcgactgat
gi|9 : gAGATCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGTCAATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAATCATGTGATTGTATTTTAGTTATTGTC-------CCTGATTTGT----CATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAC-TCATTCTTTTGGAGGCTTTTACAGAAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGCAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCCCATATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATAAAATTTTCAACAAGTAGTGAT-AG-TAATT--AAAAAATAGAATTGG---T-----------AATTGCTG-T-GAACCATATGTAAGTGTATTTAGGACACACATATATTTTTT-TTTGTAATTGACAAGATATTGAGTTAA-G-TCGAGTTCTT----C--AATTA--TTATCTCAAGCGCTCAAATTGTTATGC-CCAACTCTCAGC-------TTAT-T--TC---ATT-T-TA----ATATTG----A-----C---TT-ATAT----------CAA--GTT-----------ATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACATATTA--------TCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTAACTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTTGGCTCTCAGCTTATAATTT-TTATTTCAAGCTCTCGACTGATa
gi|10 : tctatataattgtatgcttctttcctttaagcagttaaATACAACCTAAAGAAGCATGTGATTGTATTTAAGTAATTGTCCATGAAACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGTTTTCAAATAATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAA-----------GATGTCCTTAG-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTAGAATAACACTGTAACTGATTAGTAGTCCGGCACCTTAGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTTTTAAGATAAAATGCGTTTTTAAACAAGTAGTCAT-AG-TAATT--AAAAAAT-GAATTGG---T-----------TATGGCTA-T-GCACTTTATGTAAGTGTATTTAGGACAAACATATT--TTTT-TTTGTATTTGAAAAGATATTGAGTTAA-G-TCGAGTTCTT----C--AATTA--CTATCTCAAGCGCTCAACTTGTTATAT-CCAGTCCTCAGC-------TTAT-T--TT---ATC-T-CA----ATATTG----A-----C---CT-ATAT----------CAA--GTT-----------ATTCA-TATGCTGAGCCCTATTTGA-GCCCTA--------TCCCCACTTGATTTCTAAATATTTTTAATTATCTCCATATCTAGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTAC
gi|3 : TGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTCAC-AG-TAATT--AAAAAATAGAATTGG---T-----------AATGGCTA-T-GCACCTTATGTGAGTGTATTTAGGACACACACATA--TTTT-TTTGTACTTGACAAGATATTGAGTTGA-G-TCGAGTTCTT----C--AATTA--TTATCTCAAGCGCTCAACTTGTTATGT-CCAGCCCTCAGC-------TTAT-T--TT---ATC-T-CA----ATGTTG----A-----C---TT-ATAT----------CAA--GTT-----------ATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATCA--------TCTCTACTTGGTATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGGCTTGGGCTCTCAGCTTATAACTTATTATCTTGAGCATTAGACTTATAATGTCAAATTCTTTA-ATTATGATCT----CAAG----ATT----------------------GT--ACTTATTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATA-CGGACTA---ATTATGATGAGCTCCTGACTTGTTATTTC-AAACTCCTCACTTAATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATGTGTCTATTTAATATGTACAATACTACATAATAAT---TATTATATACATATTATGTTAAGCACTTGAGATAATTTATTTAGACAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTACAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCAA--TTTTATTTTAAATTA-TCTT-TTATA--GAACAAATCATGACTGATTCTCTTTATATAT-T---TAGGTTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAA
gi|2 : AA-AGATAATT--TAAAAA-AAAAT-GA---T---------------GCTAAG-GTACC--ATG---GTATGTTAAGAATATACAC-------TT-CTT---CCC-ATAAGATGTTGA---AA-GCTCAATTTATTAT--CTAAATTAA-TTATCTCAAGTGCTCAACATAATATGA-A----------T-------TTAA-TAATT---ATTGTGTA----GTGTTGAACAT-----A---TT-AAATAGACA-----TAT--GTTGTGATGGCAAGATATAATATGTTGAGCCC---TCGACGTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaagcagacttttatgatatcaccgatacgatacaactttatggcttaggtgtgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattacttgccgcccaaagaaattattgaccgagaagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataacttttacagtgtgtatgccttcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgaatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagagttatgacccatgaattgtcaaaactctaacatgtatccatgtatatgggagtttgctcaatacaacactgaactcaattatctctttccattatgtgatgatcttcatattgtatttggttctaatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaccattaacaat
gi|3 : gatataaaaaaaaaaaaagaagaaatatagttatatacatgtgattattattgtgtcttcatgattttgataacataaaaatgataatacgttaaagttcaagacgtgttattcaaagcatggttcaagtcttagtcttctacattccatatatcaaaactttcaatgaaccatgtgtaaataataattgctttttaaagagaattacaccataacttattctgtcaaaaagaaacttctcaattattcccgaaagctatctgtaaaataactaatgattacacttgaactgtaaaatttataattactaagctcagtctatataattgtatgcttcattcctttaaagcagttcaatcatgtccataccgtcccactatcttacacacacaaagaccatgttctcaaatgttagtttatgattcaagagacgatgttatattgtttgaatacaacctttggaagcatgtcattgtattttagtaattgtccacgatacgtcattggttatcaattgcaatacctgcagtagatttcaagtcattttcctggaggcctttacagtaggatgtccatagctttttgaatgtaacagcactgtttgctttcaaataacactgtaactggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcggttttcaacaagtagtcatagtaattaaaaaatagaattggttatggctatgcaccttatgtaagtgtatttaggacacaaacatatttttttgtacttgacaagatattgattgaagtcgagttcttcaattagtatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatattgttttatatataagttatttattatgttgaacccttgacgtattatctccacttgatatatagatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactgtcttgggctctcagcttataatttattatttcaagctctcaacttattatcttgagtgttagacttgtaatgtcaaattctttacttattatctcaagattgtacttatttcaatatttcgcactgtaaccacttgatccagactaattatgatgagctcctgacttattatttcatactcttaactttAA-AGATAATT--TAAAA-TAAAATTGA---T---------------GCTAAG-GTACC--ATG---GTATGTTAAGAATATACAC-------TT-CTT---CCTG-TAAGATGTTGA---AA-GCTCAACTTATTGTC-T--AAATAAATTATCTCAAGTGCTTAACATAATATGT-A----------TATAATAATTAT-T-------ATG-T--A----GTATTG----TA----CATATT-AAATAGACA-----CAT--GTTGTGATGGCAAGATATAATATGTTGAGCCC---TCGACGTATTA--------tatagaacaaatcatgaccagttctctttatatatttaggttttgcttcatgacttataatatactgcaatagcagactagttaaaatctgtctcgcatgcacaatgtcatgtcatgtcaaacccaggccgaattatagcaaagactaaatttagagttataaatgctgatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgatacaattgtatggcttaggcgtgggaaaaataaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattactggccacccggagaaattattgaccga
gi|4 : tggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcgtttttcaacaagtagtcacagtaattaaaaaatagaattggtaatggctatgcaccttatgtgagtgtatttaggacacacacatatttttttgtacttgacaagatattgagttgagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatgttgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacgtatcatctctacttggtatctaaatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactggcttgggctctcagcttataacttattatcttgagcattagacttataatgtcaaattctttaattatgatctcaagattgtacttatttcaatatctcacactgttaccacttgatacggactaattatgatgagctcctgacttgttatttcaaactcctcactAA-GA-TAATTTTAAAAAA----ATTGA---T---------------GCTA-CAGTACC--ATG---GTATGTTAAGAATATACAC-------TT-CTT---CCT-ATAAGATGTTGA---AA-GCTCAACTTATTATCTT--AATTAA-TTATCTCAAGTGCTCAACATAATATGTAT----------A-------TTATAT--TT---ATTAT-TATGTGGTATT-----T-----T---TC-ATATTAAATAGACATAT--GTTGTGATGGCAAGATATAATATGTTGAGCCC---TCGATGTATtatagaacaaatcatgactgattctctttatatatttaggttgtgcttcatgacttataatatactgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaagcagacttttatgatatcaccgatacgatacaactttatggcttaggtgtgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattacttgccgcccaaagaaattattgaccgagaagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataacttttacagtgtgtatgccttcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgaatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagagttatgacccatgaattgtcaaaactctaacatgtatccatgtatatgggagtttgctcaatacaacactgaactcaattatctctttccattatgtgatgatcttcatattgtatttggttctaatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaccattaacaat
gi|4 : tcttgtgcgttagactaataacgtcaaattctttacttattatctcaagattatacttatttcaatatctcacactgttacaacttgatacagactaattatgatcagctcctgacttattagttcaaactcctcactttTAACG-TCAAATTCTT----T--ACTTA--TTATCTCAAG----------ATTATA-------------C-------TTAT-T--TCAATATC-T-C-----ACACTG----TTACAAC---TTGATA-----------CAG--ACT-----------A---ATTATGATCAGCTC---CTGACTTATTAGTTCAAACTCCTCACTTTATAatatagaataaatcatgaccggttctctttatatatttagattatgcttcatgacttataataattatatactgcaatagtaaactagttaaaatctgtcccacatgtgaaatgtcatgggttcaaacccattatagcaaagactaaaatgagagtaataaatactgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattttatggcttaggtgtggggaaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattactggtcgcccgaagaaattattgaccgagaagcgaacagcatagaatgtgaacatattgcaacagaatttttatgtgtccacacacaaaatacaaaagtatcccaatatatataacaagatatggtagcaaggtttaattcagtctgataacttatacagtgtgtatgcctgtagttttcatttggtcttcatgtaagacatgattataatgaaccaaattagatacatgcaatttgtaacagagttatgactcttaaattgtcaaaactcttaacatttatccatgtatatgggcgtttgctcaatacaacaatgaactcaattatctctttccattatgtaatgatggtcataaagtattaaatttttggttcttatatacataagtctaatattataaaacattaacaataaaaa
gi|8 : tcttgtgcgttagactaaTAATG-TCAAATTCTT----T--ACTTA--TTATCTCAAG-AT-----------TGT-A----------C-------TTAT-T--TCAATACC-T-CACG--ATGTTA----C-----CATTTT-TTA-----------CAG--ACT-----------A---ATTATATTGAGCTC---CTGACTTATTA--------TTTCcatcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatatgtctatttaatatgaaaaataccacataataataaatataatatacatattatgttgagcacttgagataattaattaagataataagttgagctttcaacatcttataggaagaagtgtatattcttaacataccatggtactgtagcatcaatttttttaaaattatcttatatagaataaatcatgaccggttctctttatatatttagattatgcttcatgacttataataattatatactgcaatagtaaactagttaaaatctgtcccacatgtgaaatgtcatgggttcaaacccattatagcaaagactaaaatgagagtaataaatactgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattttatggcttaggtgtggggaaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattactggtcgcccgaagaaattattgaccgagaagcgaacagcatagaatgtgaacatattgcaacagaatttttatgtgtccacacacaaaatacaaaagtatcccaatatatataacaagatatggtagcaaggtttaattcagtctgataacttatacagtgtgtatgcctgtagttttcatttggtcttcatgtaagacatgattataatgaaccaaattagatacatgcaatttgtaacagagttatgactcttaaattgtcaaaactcttaacatttatccatgtatatgggcgtttgctcaatacaacaatgaactcaattatctctttccattatgtaatgatggtcataaagtattaaatttttggttcttatatacataagtctaatattataaaacattaacaataaaaa
gi|5 : gttacacttg-----------ATATAATATGTTGAGCCC---TTGGCGTATTA--------aaatgcctcactttatacgttgatggctcaacatattatatcttgccatcacaataccacataataaatattatattaatatcatgttgagcacttgagataatcaatttagataataagttcaacatcttatagggagaagtgtatattgtttacataccatggtaccttagcatcatttttttatagaacaaatcatgactggttctctttatatatttagattgtgcttcgtgacttataatacactgcaatagtggactatttaaaatctgtctcgaatgcgaaatgtcatgttatgtcaaacctaggccgaattatagcaaagactaaaataagagtaataaatgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattttatggcttagatatgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgacaatctattaaatccattactggcggcccgaagaatttattgaccgaga
gi|8 : gcaaagaacatgttcctcaaatgttagtttatgactcaagagacgttgttatattgtttgaatacagccttcgggagcatgtgagtgtatagtaattgtccacgatacgtcattggttatccattgcaataactgcagtagatttcaagtcattttcctggaggcctttacggtaggatgtccttaattttggaatgtaacagcactgtttgctttcaaataacactgtaactggctagtagtctgcaccttggaatattacctttggtatctgaaagtgtaaagatgaaatgtgtttttcaacaagtagttatagtagtaaaaacagaattagtaatggctaatcacctaatataagtgtatttaggacacacacatgttttgtttgtacttgacaagatattgagttatgtcaagttctttaattattatctcaagcgatcaacttgttatgtccagtcctcagcttattttatttcaatattataagttatttattatgttgagctcttgatgtattatctccacttgatatctaaatatgttgaattatctccatatcacgacttattttctctagaccttgacttgctgttttggactctcaacttataatttattatttcaagctctcaacttattaccttgagcgttggacttgtaatgtcaaattctttacttattatctcaagattgtacttatttcaatatctaacactgttaccacttgatacggactagttatgatgagctcctgacttattttttcaaactcctcactACTTGTAATGTCAAATTCTTTACTTATTATCTC--------------------------AAG----ATT----------------------GT--ACTTATTTCAATACCTCACGATGTTACCATTTTTTA-CAGACTA---ATTATATTGAGCTCCTGACTTATTATTTC-AAATGCCTCACTTTATACGTTGATGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCA----------C--------------AATACCACATAATAAA---TATTATATTAATATCATGTTGAGCACTTGAGATAATCAATTTAGATAATAAGTT-------CAACATCTTATAGGGAGAAGTGTATATTGTTTACATACCATGGTACCTTAGCATC-A--TTT--TTTTA--------------TA-G-AACAAATCATGACTGGTTCTCTTTATATAT---T-TAGATTGTGCTTCGTGACTTATA------ATACACTGCAATAGTGGACTATTTAAAATCTGTCTCGAATGCGAAATGTCATGTTATG--TCAAACCTAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCTNNNNNNNN------------NN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACAATACAATTTTATGGCTTAGATATGGG--AAAAATCAAATATTCTTCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGACAATCTATTAAATCCATTACTGGCGGCCCGAAGAATTTATTGA--CCGA-GActtgccatcacaacatatgtccatttaatatata
gi|9 : gttacTCGAGTTCTTCAATTATTATCTCAAG--CGCTCAAAT-TG---T----TATGCCCAACT----------------------CTCAGCTTATTTC-ATTTTA-ATATTG-----ACTT-ATATCAAGTTATTTATTATGTTGAGCCCTTGAC-----ATATT-AT---CTCCACTTGATA--TCTA
gi|4 : tctatataattgtatgcttctttcctttaagcagttaaagatcatgttcctcaaatgttagtttatgactcaagagtcaatgttatattgtttgaatacagcctttggaatcatgtgattgtattttagttattgtccctgatttgtcattgcaataactgcagtagatttcactcattcttttggaggcttttacagaaggatgtccttaattttggaatgtaacagcactgtttgctttcaaataacactgcaactggctagtagtctggcaccttggaatatcccatatggtatctgaaagtgttaagataaaataaaattttcaacaagtagtgatagtaattaaaaaatagaattggtaattgctgtgaaccatatgtaagtgtatttaggacacacatatatttttttttgtaattgacaagatattgagttaagTCAAATTCTTTACTTATTATCTC--------------------------AAG----ATT----------------------AT--ACTTATTTCAATATCTCACACTGTTACAACTTGATA-CAGACTA---ATTATGATCAGCTCCTGACTTATTA-GTTCAAACTCCTCACTTTATACATCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGAAAAATACCACATAATAATAAATATAATATACATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTAAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACTGTAGCATCAA--TTT--TTTTAAAATTATCTTATA-TA--GAATAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTATGCTTCATGACTTATAATAATTATATACTGCAATAGTAAACTAGTTAAAATCTGTCCCACATGTGAAATGTCATG----GGTTCAAACCC-------ATTATAGCAAAGACTAAAATGAGAGTAATAAATA-------CTGCNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACAATAC-----AATTTTATGGCTTAGGTGTGGGGAAAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGTCGCCCGAAGAAATTATTGA--CCGA-GAaatattttgaattaactccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactgtctttggctctcagcttataatttttatttcaagctctcgactgat
gi|2 : tcttgtgcgttagactaataacgATACGTCAAGGGTTCAACATAATAAATagcgaacagcatagaatgtgaacatattgcaacagaatttttatgtgtccacacacaaaatacaaaagtatcccaatatatataacaagatatggtagcaaggtttaattcagtctgataacttatacagtgtgtatgcctgtagttttcatttggtcttcatgtaagacatgattataatgaaccaaattagatacatgcaatttgtaacagagttatgactcttaaattgtcaaaactcttaacatttatccatgtatatgggcgtttgctcaatacaacaatgaactcaattatctctttccattatgtaatgatggtcataaagtattaaatttttggttcttatatacataagtctaatattataaaacattaacaataaaaa
gi|3 : gatataaaaaaaaaaaaagaagaaatatagttatatacatgtgattattattgtgtcttcatgattttgataacataaaaatgataatacgttaaagttcaagacgtgttattcaaagcatggttcaagtcttagtcttctacattccatatatcaaaactttcaatgaaccatgtgtaaataataattgctttttaaagagaattacaccataacttattctgtcaaaaagaaacttctcaattattcccgaaagctatctgtaaaataactaatgattacacttgaactgtaaaatttataattactaagctcagtctatataattgtatgcttcattcctttaaagcagttcaatcatgtccataccgtcccactatcttacacacacaaagaccatgttctcaaatgttagtttatgattcaagagacgatgttatattgtttgaatacaacctttggaagcatgtcattgtattttagtaattgtccacgatacgtcattggttatcaattgcaatacctgcagtagatttcaagtcattttcctggaggcctttacagtaggatgtccatagctttttgaatgtaacagcactgtttgctttcaaataacactgtaactggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcggttttcaacaagtagtcatagtaattaaaaaatagaattggttatggctatgcaccttatgtaagtgtatttaggacacaaacatatttttttgtacttgacaagatattgattgaagtcgagttcttcaattagtatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatattgttttatatataagttATACGTCAAGGGCTCAACATAATAAATtatctccacttgatatatagatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactgtcttgggctctcagcttataatttattatttcaagctctcaacttattatcttgagtgttagacttgtaatgtcaaattctttacttattatctcaagattgtacttatttcaatatttcgcactgtaaccacttgatccagactaattatgatgagctcctgacttattatttcatactcttaactttatacgtcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatatgtctatttaatatgttcaacactacacaataattattaaattcatattatgttgagcacttgagataattaatttagataataaattgagctttcaacatcttatgggaagaagtgtatattcttaacataccatggtaccttagcatcatttttttttaaattatcttttatagaacaaatcatgaccagttctctttatatatttaggttttgcttcatgacttataatatactgcaatagcagactagttaaaatctgtctcgcatgcacaatgtcatgtcatgtcaaacccaggccgaattatagcaaagactaaatttagagttataaatgctgatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatgatacaattgtatggcttaggcgtgggaaaaataaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattactggccacccggagaaattattgaccga
gi|3 : tggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcgtttttcaacaagtagtcacagtaattaaaaaatagaattggtaatggctatgcaccttatgtgagtgtatttaggacacacacatatttttttgtacttgacaagatattgagttgagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatgttgacttatatcaagttCATAACAAGTTGAGCGCTTGAGATAA-TAATTcatctctacttggtatctaaatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactggcttgggctctcagcttataacttattatcttgagcattagacttataatgtcaaattctttaattatgatctcaagattgtacttatttcaatatctcacactgttaccacttgatacggactaattatgatgagctcctgacttgttatttcaaactcctcacttaatacgtcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatgtgtctatttaatatgtacaatactacataataattattatatacatattatgttaagcacttgagataatttatttagacaataagttgagctttcaacatcttacaggaagaagtgtatattcttaacataccatggtaccttagcatcaattttattttaaattatcttttatagaacaaatcatgactgattctctttatatatttaggttgtgcttcatgacttataatatactgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaagcagacttttatgatatcaccgatacgatacaactttatggcttaggtgtgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattacttgccgcccaaagaaattattgaccgagaagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataacttttacagtgtgtatgccttcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgaatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagagttatgacccatgaattgtcaaaactctaacatgtatccatgtatatgggagtttgctcaatacaacactgaactcaattatctctttccattatgtgatgatcttcatattgtatttggttctaatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaccattaacaat
gi|11 : tggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcgtttttcaacaagtagtcacagtaattaaaaaatagaattggtaatggctatgcaccttatgtgagtgtatttaggacacacacatatttttttgtacttgacaagatattgagttgagtcgagttcttcGTATATTCTTAACATACCAGGGTGACTTAGCATC-A--ATT--TTTT-------TTTT-TT-TA-------AATCATGACCAGTTCTCTTTATATAT---T-TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAtccagccctcagcttattttatctcaatgttgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacgtatcatctctacttggtatctaaatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactggcttgggctctcagcttataacttattatcttgagcattagacttataatgtcaaattctttaattatgatctcaagattgtacttatttcaatatctcacactgttaccacttgatacggactaattatgatgagctcctgacttgttatttcaaactcctcacttaatacgtcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatgtgtctatttaatatgtacaatactacataataattattatatacatattatgttaagcacttgagataatttatttagacaataagttgagctttcaacatcttacaggaagaagtgtatattcttaacataccatggtaccttagcatcaattttattttaaattatcttttatagaacaaatcatgactgattctctttatatatttaggttgtgcttcatgacttataatatactgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaagcagacttttatgatatcaccgatacgatacaactttatggcttaggtgtgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattacttgccgcccaaagaaattattgaccgagaagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataacttttacagtgtgtatgccttcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgaatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagagttatgacccatgaattgtcaaaactctaacatgtatccatgtatatgggagtttgctcaatacaacactgaactcaattatctctttccattatgtgatgatcttcatattgtatttggttctaatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaccattaacaat
gi|6 : tT--TTTTAAATTA--CCT-TT-TATAGAACAAATCATGACCGGTTTTCTTTATATAT---T-TAGATTGTGCTTCATGACTTGTA------ATATACTGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacagtgcaattttatggcttaggtgtgggaaaaaccaaatattcttcgtgtccatatcatggatgaaacaatgattgagtcttgttttgaggccatcaggttgagcatgggatcaaacatgctgacaatctattaaatgcataactggccacccgaagaaattattgaccgagaagcaaacagcattgagtgtgaacatattgcaaca
gi|3 : AACAAGCAGACTTTTATGATATCACCGATACGATAC-----AACTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTAAATGCATTACTTGCCGCCCAAAGAAATTATTGA--CCGA-GAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattctatgacttaggtgtgggaaaaatcaaatatttttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaaatgcattagtgaccgcccaaagaaattactgtttgagaagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataacctttacagtgtatatgcctgcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgtatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagacttacgacccttgaattgtcaaaactgtaacatttatccatgtatataggagtttgctcaatacaacattgaactcaattatctcattccattatgtgatgatggtcataatgtatttggttcttatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaacattaacaataaaa
gi|6 : tggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcgtttttcaacaagtagtcacagtaattaaaaaatagaattggtaatggctatgcaccttatgtgagtgtatttaggacacacacatatttttttgtacttgacaagatattgagttgagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatgttgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacgtatcatctctacttggtatctaaatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactggcttgggctctcagcttataacttattatcttgagcattagacttataatgtcaaattctttaattatgatctcaagattgtacttatttcaatatctcacactgttaccacttgatacggactaattatgatgagctcctgacttgttatttcaaactcctcacttaatacgtcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatgtgtctatttaatatgtacaatactacataataattattatatacatattatgttaagcacttgagataatttatttagacaataagttgagctttcaacatcttacaggaagaagtgtatattcttaacataccatggtaccttagcatcaattttattttaaattatcttttatagaacaaatcatgactgattctctttatatatttaggttgtgcttcatgacttataatatactgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTACAATAC-----AATTCTATGACTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTTTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAAATGCATTAGTGACCGCCCAAAGAAATTACTGT--TTGA-GAagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataacttttacagtgtgtatgccttcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgaatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagagttatgacccatgaattgtcaaaactctaacatgtatccatgtatatgggagtttgctcaatacaacactgaactcaattatctctttccattatgtgatgatcttcatattgtatttggttctaatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaccattaacaat
gi|11 : tttttaaattaccttttatagaacaaatcatgaccggttttctttatatatttagattgtgcttcatgacttgtaatatactgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTACAGTGC-----AATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAACCAAATATTCTTCGT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGCTGACAATCTATTAAATGCATAACTGGCCACCCGAAGAAATTATTGA--CCGA-GAagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataacctttacagtgtatatgcctgcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgtatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagacttacgacccttgaattgtcaaaactgtaacatttatccatgtatataggagtttgctcaatacaacattgaactcaattatctcattccattatgtgatgatggtcataatgtatttggttcttatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaacattaacaataaaa
gi|3 : tgtatattcttaacataccagggtgacttagcatcaatttttttttttttaaatcatgaccagttctctttatatatttagattgtgcttcatgacttataatatactgcaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAATTCAGTCTGATAACTTTTACAGTGTGTATGCCTTCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTAACAGAGTTATGACCCATGAATTGTCAAAACT-CT-AA--CATGTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACACTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATCTTCATATTGTATT------TGG-TTCTAATATACATAGAGTCTAATATT---AAAAAATCCTAAACCATTAACAATagcaaacagcattgagtgtgaacatattgcaaca
gi|4 : tggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcgtttttcaacaagtagtcacagtaattaaaaaatagaattggtaatggctatgcaccttatgtgagtgtatttaggacacacacatatttttttgtacttgacaagatattgagttgagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatgttgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacgtatcatctctacttggtatctaaatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactggcttgggctctcagcttataacttattatcttgagcattagacttataatgtcaaattctttaattatgatctcaagattgtacttatttcaatatctcacactgttaccacttgatacggactaattatgatgagctcctgacttgttatttcaaactcctcacttaatacgtcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatgtgtctatttaatatgtacaatactacataataattattatatacatattatgttaagcacttgagataatttatttagacaataagttgagctttcaacatcttacaggaagaagtgtatattcttaacataccatggtaccttagcatcaattttattttaaattatcttttatagaacaaatcatgactgattctctttatatatttaggttgtgcttcatgacttataatatactgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaagcagacttttatgatatcaccgatacgatacaactttatggcttaggtgtgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattacttgccgcccaaagaaattattgaccgagaagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggttTAATTCAGTCTGATAACTTATACAGTGTGTATGCCTGTAGTTTTCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTAT-AATGAACCAAATTAGATACATGCAATTTGTAACAGAGTTATGACTCTTAAATTGTCAAAACT-CTTAA--CATTTATCCATGTA---TATGGGCGTTTGCTCAATACAACAATGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTAATGATGGTCATAAAGTATTAAATTTTTGGTTCTTATATACATA-AGTCTAATATT--------AT---AAAACATTAACAATAAAA
gi|6 : tcttgtgcgttagactaataacgtcaaattctttacttattatctcaagattatacttatttcaatatctcacactgttacaacttgatacagactaattatgatcagctcctgacttattagttcaaactcctcactttatacatcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatatgtctatttaatatgaaaaataccacataataataaatataatatacatattatgttgagcacttgagataattaattaagataataagttgagctttcaacatcttataggaagaagtgtatattcttaacataccatggtactgtagcatcaatttttttaaaattatcttatatagaataaatcatgaccggttctctttatatatttagattatgcttcatgacttataataattatatactgcaatagtaaactagttaaaatctgtcccacatgtgaaatgtcatgggttcaaacccattatagcaaagactaaaatgagagtaataaatactgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattttatggcttaggtgtggggaaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattactggtcgcccgaagaaattattgaccgagaagcgaacagcatagaatgtgaacatattgcaacagaatttttatgtgtccacacacaaaatacaaaagtatcccaatatatataacaagatatggtagcaaggttAATTAAGTCTGATAACCTTTACAGTGTATATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGTATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTAACAGACTTACGACCCTTGAATTGTCAAAACTGT--AA--CATTTATCCATGTA---TATAGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCATTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTATT------TGG-TTCTTATATACATAGAGTCTAATATT---AAAAAATCCTAAAACATTAACAATAAAAa
gi|14 : tttttaaattaccttttatagaacaaatcatgaccggttttctttatatatttagattgtgcttcatgacttgtaatatactgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattctatgacttaggtgtgggaaaaatcaaatatttttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaaatgcattagtgaccgcccaaagaaattactgtttgagaagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaTTTTACGGTGAGTATCCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATAAACCAAATTGGATACATACAATTTGTTACAGAATAATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAGTTATCTCTTTCCATTATGTGATGATTGTCATAATGTATT------TAG-TTCTAATATACATAGAGTCTAATATT--AAAATAATCCTAAAACATTAACAATAAAA
gi|15 : TTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATATAAGTCATGATAATGAATGAACCAAATTGGACTTATGCAATTTGTTACAGAA--------CTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAATTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTATT------TAG-TTCTTATATACATGGAGTa
gi|13 : aTAAAT-AACTAAATTGAAT------AATGTGTTATAGGGTTATTACCATTGCATTTTCAAAAC--C--AAATCAATTATCCATGTACAGTATAGGAGTT-GTTCAAAACAACATTAAACCTGATTATCGGTGTC-ATTATGTGATGATGGTCATAATGTATA------CGA-TCCTTATATA-ATAAA---TGATAC--------AATACTGGAAAATTAACATTGAAA
gi|16 : gtagcatagaatgatttagaacaataatagtattatgcaatgaatattctcaatgcagttatcactggttcttcatcaaacgtgcccagtaattgtaaaaccacaagacaatatacaaagtcgA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTATT------TGG-TTCTAATATACATAGAGTTTAATATT--AAACAAATCCTAAAACATTTACAATAAAAgt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): AAGCATATTTAGGACATACTTGTTTCTCTTTCTTTAAAGATCTCAAAATCTCTTGATTTGTTTTGTCGAACTCTCTTGACTTATTATCTGAAGAAGTCGATTTTGTTATGCCCAGCTATTGGCTTA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 444444 11 222222222222222 1 2222222222 11 1 11 33333333333 222222222222222 1111 111 111 111 555555555555555555555 111111 00000000000000000000000000000000 55555555555555555555 111 11 1 3333 111111 11 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 1111111 111111111
lowQualScore : 0 00 666666 00 0 222222222222222 1 2 2 3 0 2 0 2 1 4 3333333333 33 0 1 11 1 0 1 4 1 11111111111 88 1 77 1 888888888888888 5 77 2222 000 77 000 77 5 55 6 1 1 111 1 666666666666666666666 999999 6 0 5 1 1 00000000000000000000000000000000 99 44444444444444444444 0 1 444 1 0 1 44 77 66666666 5 7 5 6666 666666 33 33 3 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 1 77 5 5 1 5 33 77 888 6666666 1 333333333
lowQualScore : . .. ...... .. . ............... . . . . . . . . . . .......... .. . . .. . . . . . ........... .. . .. . ............... . .. .... ... .. ... .. . .. . . . ... . ..................... ...... . . . . . ................................ .. .................... . . ... . . . .. .. ........ . . . .... ...... .. .. . . ............................................................................. . . .. . . . . .. .. ... ....... . .........
lowQualScore : 8 88 000000 66 8 888888888888888 4 5 0 0 0 0 2 0 0 0 5555555555 88 6 0 00 0 8 0 8 0 77777777777 88 0 99 0 111111111111111 7 99 1111 000 99 000 99 7 00 7 0 0 777 0 777777777777777777777 222222 7 8 7 4 7 33333333333333333333333333333333 22 22222222222222222222 7 0 000 0 8 0 00 99 00000000 7 1 7 0000 444444 55 88 2 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 4 99 7 7 0 7 66 99 888 2222222 0 000000000
consensus : GATATAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATATAGTTATATA-ATGT-ATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTNTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTATCTGTAAGATTACTACTGGTTACACTTGAACNGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG---T-----------AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGNCTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTAT---------------------CTCCATATCTCGACTTATTAT------CTCTAGACCT-TGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTATAATTTATTATTTCGAGCTCTCGACTTATTATCTCGAG--C-TTA-ACT-TG---T----TA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAACTCCTCACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTACAATACCACATAATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTT--TTTT-AAATTA-TCTT-TTATA-GAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATA----TTTAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCGAAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATNTCACCGATACGATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATTACTGGCCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGACTTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTNACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTNATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
Reference ( family-2139 ) : GATATAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATATAGTTATATA------ATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGCTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCTATATATCGAAACTTTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCGAACAGAAACTTCTCAATTATTCCCGAAAGCTATTTGTAANATTACTACTGGTTACACTTGAACAGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTNA--ATCATGTCCATACCGTCCCNCTATCTTACACACACAAAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGNTGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTCGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAG-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGNTTTTCAACAAGTAGTC--ANAGTAATTAAAAAATAGAATTGG---T-----------AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGTCTTATAT-CANGTTATNTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTAT---------------------CTCCATATCTCGACTTATTAT------CTCTAGACCT-TGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTATAATTTATTATTTCGAGCTCTCGACTTATTATCTCGAG--CGTTAGACT-TG---T----TA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAACTCCTCACTTNATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTACAATACCACATAATAAT---TATTATATNCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTT--TTTT-AAATTA-TCTT-TT-TA-GAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT---TTTAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTAGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCGAAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATNAGAGTAATAAATGCT------------G------------AT------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACAAGCAGACTTTTATGATATCACCGATACGATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATTACTGGCCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGACTTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTNACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTNATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
gi|1 : GATATAAAAAAAAAGAAATAAAGAAATATATTTATATATATGTAATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAA---------------GTTCAATACGTGTTGTTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTGTCAATGAAACATGTGTAAATAATAATTGTTTTTTTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTCCCAAATAGAAACTTTTCAATTATTCCTGAAAGTTATCCGTAAGATTACTACTTGTAACACTTGAACTGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CTGTCTTTATAATTGTATGCTTCATTCCTTCAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACACAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTTAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCAACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCAGTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCCAGTAGTCTGGTACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATATAATGCATACTTCAACAAGTAGCC--AAAGTAATTAAAAAATAGAATTGG---T-----------AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--ATACTT----GA---CAAGATAT--TAA---GTTAAGTCGAGTTAT--TCAATTATTATCTCAAGCGTTCAACGT-GTTATGTC----------CTTATTTCATCTCAATATTGTCTTATAT-CATGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGCATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTTAATTAT---------------------CT-CATATCTCGACTTACTAT------CTCTAGACCT-TGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCCTATAATTTATTATTTCAAGCTCTCGATTTATTATCTTGAG--CGTTAGACT-TG---T----TA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCACACACTGTTACCACTTGACACAGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATAATGTTATACACCTCACTTTATACGTCTAGGGCTCAACATATTATATTTTGCCATCAAAACATATGTCTATTTGATATGTTGAATACCACATGATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAATTGTGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGCGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATC--ATTT--TTTT-AAAATAGTCTT-TT-TAGGAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATATATATATAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTTAAATCTGTCTCGCATGTGAAATGTCATGTCATG--TCAAACTCAGGCCGAATTATAGCAAATACTAAAATAAGAGTAATTAATGAT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATTTCACTGATACAATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGCCGCCCAAAGAAATAATTGACCGAGACTTTTATGATGTGTATGTCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATTCATGCAATTTGTTACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAGTTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTTGTTTTAATATACATAGAGTCTAATATTTAAAAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
gi|10 : ATACAACCTAAAGAAGCATGTGATTGTATTTAAGTAATTGTCCATGAAACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGTTTTCAAATAATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAA-----------GATGTCCTTAG-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTAGAATAACACTGTAACTGATTAGTAGTCCGGCACCTTAGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTTTTAAGATAAAATGCGTTTTTAAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAAT-GAATTGG---T-----------TATGGCTATGCACTTTATGTAAGTGTATTTAGGACAAACATATTTTTT-TTT--GTATTT----GA---AAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTACTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATATCCAGTCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGACCTATAT-CAAGTTATTCA-TATGCTGAGCCCTATTTGA-GCCCTATCCCCACTTGATTTCTAAATATTTTTAATTAT---------------------CTCCATATCTAGACTTATTAT------CTCTAGACCT-TGACTTAC
gi|11 : TGTATATTCTTAACATACCAGGGTGACTTAGCATCA-ATTT--TTTT----------TT-TT-T-----TAAATCATGACCAGTTCTCTTTATATAT---TT-AGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATA
gi|11 : TACAGTGCAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAACCAAATATTCTTCGT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATAACTGGCCACCCGAAGAAATTATTGACCGAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacagtgcaattttatggcttaggtgtgggaaaaaccaaatattcttcgtgtccatatcatggatgaaacaatgattgagtcttgttttgaggccatcaggttgagcatgggatcaaacatgctgacaatctattaaatgcataactggccacccgaagaaattattgaccgagaagcaaacagcattgagtgtgaacatattgcaaca
gi|12 : tgtatattcttaacataccagggtgacttagcatcaatttttttttttttaaatcatgaccagttctctttatatatttagattgtgcttcatgacttataatatactgcaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATATAAAA-AAAAGAAAAAAAGAAATATAGTTATATA------ATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAAAGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGCTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCTGTAAATCAAAACTGTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTTTTTGTAACATTACTACTGGTTACACTGGAACAGTCAAATTTATAATTACTAAC----TAAGCTCACAGTCTACATAATTGTATGCTTCATTCCTTT-AAGCAGTTAA--ATagcaaacagcattgagtgtgaacatattgcaaca
gi|13 : TAAAT-AACTAAATTGAATA-ATG-----TGTTATAGGGTTATTACCATTGCATTTTCAAAAC--C--AAATCAATTATCCATGTACAGTATAGGAGTT-GTTCAAAACAACATTAAACCTGATTATCGGTGTC-ATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TACGATCCTTATATA-ATAAA---TGATAC----------AATACTGGAAAATTAACATTGAAA
gi|14 : gtagcatagaatgatttagaacaataatagtattatgcaatgaatattctcaatgcagttatcactggttcttcatcaaacgtgcccagtaattgtaaaaccacaagacaatatacaaagtcgTTTTACGGTGAGTATCCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATAAACCAAATTGGATACATACAATTTGTTACAGAATAATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAGTTATCTCTTTCCATTATGTGATGATTGTCATAATGTA-------TTTAGTTCTAATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-ATAATCCTAAAACATTAACAATAAAAgt
gi|15 : TTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATATAAGTCATGATAATGAATGAACCAAATTGGACTTATGCAATTTGTTACAGAA--------CTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAATTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTAGTTCTTATATACATGGAGTa
gi|16 : aA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTAATATACATAGAGTTTAATATT---AAACA-AATCCTAAAACATTTACAATAAAA
gi|17 : AAGCATATTTAGGACATACTTGTTTCTC-TTT-----CTTTAAAGATCTCAAAATCTCTTGATTTGTTTTGTCGAACTCTCTTGACTTATTATCTGAAGAAGTCGATTTTGTTATGCCCAGCTATTGGCTTAa
gi|18 : GATATAAAAAAAA-GAAAAACAGAAATATAGTTATATA------ATTATTATTGT--CTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATAGCTTA
gi|2 : gGATATAAAAAAAAA-AAAAGAAGAAATATAGTTATATACATGTGATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAACATAAAAATGATAATACGTTAAAGTTCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCATATATCAAAACTTTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGCTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGTCAAAAAGAAACTTCTCAATTATTCCCGAAAGCTATCTGTAAAATAACTAATGATTACACTTGAACTGTAAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTT-CTCAAATGTTAGTTTATGATTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAACCTTTGGAAGCATGTCATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCAATTGCAATACCTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCATAGCTTTTTGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGGTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG---T-----------TATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACAAACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---TTGAAGTCGAGTTCT--TCAATTAGTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGTTTTATATATAAGTTATTTATTATGTTGAACCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATATAGATATTTTGAATTAT---------------------CTCCATATCTCGACTTATTAT------CTCTAGACCT-TGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTATAATTTATTATTTCAAGCTCTCAACTTATTATCTTGAG--TGTTAGACT-TG---TAATGTC-----AAATTCTTTACTTATTATCTCAAGATTGTACTTATTTCAATATTTCGCACTGTAACCACTTGATCCAGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCATACTCTTAACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTTCAACACTACACAATAAT---TATTAAATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAATTGAGCTTTCAACATCTTATGGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCATTTTT--TTTT-AAATTA-TCTT-TTATA-GAACAAATCATGACCAGTTCTCTTTATATA----TTTAGGTTTTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGCAGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCACAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAATTTAGAGTTATAAATGCT------------G------------ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGATACAATTGTATGGCTTAGGCGTGGG--AAAAATAAAATATTCTTCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGCCACCCGGAGAAATTATTGACCGAcag
gi|3 : TGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ACAGTAATTAAAAAATAGAATTGG---T-----------AATGGCTATGCACCTTATGTGAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTGAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATGTTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATCATCTCTACTTGGTATCTAAATATTTTGAATTAT---------------------CTCCATATCTCGACTTATTAT------CTCTAGACCT-TGACTTACTGGCTTGGGCTCTCAGCTTATAACTTATTATCTTGAGCATTAGACTTATAATGTCAAATTCTTTA-ATTATGATCT----CA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTGTTATTTCAAACTCCTCACTTAATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATGTGTCTATTTAATATGTACAATACTACATAATAAT---TATTATATACATATTATGTTAAGCACTTGAGATAATTTATTTAGACAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTACAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTTTATTTT-AAATTA-TCTT-TTATA-GAACAAATCATGACTGATTCTCTTTATATA----TTTAGGTTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAA
gi|3 : AACAAGCAGACTTTTATGATATCACCGATACGATACAACTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTTGCCGCCCAAAGAAATTATTGACCGAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaagcagacttttatgatatcaccgatacgatacaactttatggcttaggtgtgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattacttgccgcccaaagaaattattgaccgagaagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataacttttacagtgtgtatgccttcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgaatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagagttatgacccatgaattgtcaaaactctaacatgtatccatgtatatgggagtttgctcaatacaacactgaactcaattatctctttccattatgtgatgatcttcatattgtatttggttctaatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaccattaacaat
gi|3 : tggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcgtttttcaacaagtagtcacagtaattaaaaaatagaattggtaatggctatgcaccttatgtgagtgtatttaggacacacacatatttttttgtacttgacaagatattgagttgagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatgttgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacgtatcatctctacttggtatctaaatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactggcttgggctctcagcttataacttattatcttgagcattagacttataatgtcaaattctttaattatgatctcaagattgtacttatttcaatatctcacactgttaccacttgatacggactaattatgatgagctcctgacttgttatttcaaactcctcacttaatacgtcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatgtgtctatttaatatgtacaatactacataataattattatatacatattatgttaagcacttgagataatttatttagacaataagttgagctttcaacatcttacaggaagaagtgtatattcttaacataccatggtaccttagcatcaattttattttaaattatcttttatagaacaaatcatgactgattctctttatatatttaggttgtgcttcatgacttataatatactgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTTTTACAGTGTGTATGCCTTCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTAACAGAGTTATGACCCATGAATTGTCAAAACT-CT-AA--CATGTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACACTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATCTTCATATTGTA-------TTTGGTTCTAATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAACCATTAACAATagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataacttttacagtgtgtatgccttcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgaatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagagttatgacccatgaattgtcaaaactctaacatgtatccatgtatatgggagtttgctcaatacaacactgaactcaattatctctttccattatgtgatgatcttcatattgtatttggttctaatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaccattaacaat
gi|4 : tggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcgtttttcaacaagtagtcacagtaattaaaaaatagaattggtaatggctatgcaccttatgtgagtgtatttaggacacacacatatttttttgtacttgacaagatattgagttgagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatgttgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacgtatcatctctacttggtatctaaatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactggcttgggctctcagcttataacttattatcttgagcattagacttataatgtcaaattctttaattatgatctcaagattgtacttatttcaatatctcacactgttaccacttgatacggactaattatgatgagctcctgacttgttatttcaaactcctcacttaatacgtcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatgtgtctatttaatatgtacaatactacataataattattatatacatattatgttaagcacttgagataatttatttagacaataagttgagctttcaacatcttacaggaagaagtgtatattcttaacataccatggtaccttagcatcaattttattttaaattatcttttatagaacaaatcatgactgattctctttatatatttaggttgtgcttcatgacttataatatactgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaagcagacttttatgatatcaccgatacgatacaactttatggcttaggtgtgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattacttgccgcccaaagaaattattgaccgagaagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataTCAAATTCTTTACTTATTATCTC--------------------------A-----AGAT--TATACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACAACTTGATACAGACTAATTATGATCAGCTCCTGACTTATTAGTTCAAACTCCTCACTTTATACATCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGAAAAATACCACATAATAATAAATATAATATACATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTAAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACTGTAGCATCA-ATTT--TTTTAAAATTA-TCTTATA-TA-GAATAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATA----TTTAGATTATGCTTCATGACTTATAATAATTATATACTGCAATAGTAAACTAGTTAAAATCTGTCCCACATGTGAAATGTCATG----GGTTCAAACCC-------ATTATAGCAAAGACTAAAATGAGAGTAATAAATACT------------GCNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACAATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGGGAAAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGTCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGA
gi|4 : tcttgtgcgttagactaataacgACTTATACAGTGTGTATGCCTGTAGTTTTCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTAT-AATGAACCAAATTAGATACATGCAATTTGTAACAGAGTTATGACTCTTAAATTGTCAAAACT-CTTAA--CATTTATCCATGTA---TATGGGCGTTTGCTCAATACAACAATGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTAATGATGGTCATAAAGTATTAAATTTTTGGTTCTTATATACATA-AGTCTAATATT---A----------TAAAACATTAACAATAAAAagcgaacagcatagaatgtgaacatattgcaacagaatttttatgtgtccacacacaaaatacaaaagtatcccaatatatataacaagatatggtagcaaggtttaattcagtctgataacttatacagtgtgtatgcctgtagttttcatttggtcttcatgtaagacatgattataatgaaccaaattagatacatgcaatttgtaacagagttatgactcttaaattgtcaaaactcttaacatttatccatgtatatgggcgtttgctcaatacaacaatgaactcaattatctctttccattatgtaatgatggtcataaagtattaaatttttggttcttatatacataagtctaatattataaaacattaacaataaaaa
gi|5 : tcttgtgcgttagactaataacgtcaaattctttacttattatctcaagattatacttatttcaatatctcacactgttacaacttgatacagactaattatgatcagctcctgacttattagttcaaactcctcactttatacatcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatatgtctatttaatatgaaaaataccacataataataaatataatatacatattatgttgagcacttgagataattaattaagataataagttgagctttcaacatcttataggaagaagtgtatattcttaacataccatggtactgtagcatcaatttttttaaaattatcttatatagaataaatcatgaccggttctctttatatatttagattatgcttcatgacttataataattatatactgcaatagtaaactagttaaaatctgtcccacatgtgaaatgtcatgggttcaaacccattatagcaaagactaaaatgagagtaataaatactgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattttatggcttaggtgtggggaaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattactggtcgcccgaagaaattattgaccgagaagcgaacagcatagaatgtgaacatattgcaacagaatttttatgtgtccacacacaaaatacaaaagtatcccaatatatataacaagatatggtagcaaggtttaattcagtctgataCAAAGAACATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGTTGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTCGGGAGCATGTGAGTGTAT---AGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACGGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTG-CACCTTGGAATATTACCTTTGGTATCTGAAAGTGTAAAGATGAAATGTGTTTTTCAACAAGTAGTT--ATAGTAGT--AAAAACAGAATTAG---T-----------AATGGCTAATCACCTAATATAAGTGTATTTAGGACACACACATGTTTTGTTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTATGTCAAGTTCT--TTAATTATTATCTCAAGCGATCAACTT-GTTATGTCCAGTCCTCAGCTTATTTTATTTCAATATTAT---------AAGTTATTTATTATGTTGAGCTC---TTGATGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATGTTGAATTATCTCCATATCACGACTTATTTTCTCTAGACCTTGACTTGCTGTTTTGGACTCTCAACTTATAATTTATTATTTCAAGCTCTCAACTTAT-------TACCTTGAGCGTTGGACTTGTAATGTCAAATTCTTTA--CT-TA---T----TATCTCAAGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTAACACTGTTACCACTTGATACGGACTAGTTATGATGAGCTCCTGACTTATTTTTTCAAACTCCTCACTTAATACGCCAAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCCATTTAATATATAa
gi|6 : gT--TTTT-AAATTA-CCTT-TTATA-GAACAAATCATGACCGGTTTTCTTTATATA----TTTAGATTGTGCTTCATGACTTGTA------ATATACTGC
gi|6 : TACAATACAATTCTATGACTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTTTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNAGTAAATGCATTAGTGACCGCCCAAAGAAATTACTGTTTGAGAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattctatgacttaggtgtgggaaaaatcaaatatttttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaaatgcattagtgaccgcccaaagaaattactgtttgagaagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataacctttacagtgtatatgcctgcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgtatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagacttacgacccttgaattgtcaaaactgtaacatttatccatgtatataggagtttgctcaatacaacattgaactcaattatctcattccattatgtgatgatggtcataatgtatttggttcttatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaacattaacaataaaa
gi|6 : tttttaaattaccttttatagaacaaatcatgaccggttttctttatatatttagattgtgcttcatgacttgtaatatactgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCTTTACAGTGTATATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGTATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTAACAGACTTACGACCCTTGAATTGTCAAAACTGT--AA--CATTTATCCATGTA---TATAGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCATTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTTATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAAagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataacctttacagtgtatatgcctgcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgtatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagacttacgacccttgaattgtcaaaactgtaacatttatccatgtatataggagtttgctcaatacaacattgaactcaattatctcattccattatgtgatgatggtcataatgtatttggttcttatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaacattaacaataaaa
gi|7 : tttttaaattaccttttatagaacaaatcatgaccggttttctttatatatttagattgtgcttcatgacttgtaatatactgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattctatgacttaggtgtgggaaaaatcaaatatttttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaaatgcattagtgaccgcccaaagaaattactgtttgagaagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataGATATAAAAATAAA-AAAAAAAGAAATATAGTTATATA------ATTATTATTGT--CTTCATGATTTTGATAAAATAA------------------GATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATAGTTCAAGTCTTAGCCTT--ACATTCTATATATCGAAGCCTTCAATGGACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCACAACTTATTCTGCCGAACATAAACTTCACAGTTATTCCTAAAAGCTATTTGTAAGATTACTACTGGTTACACATGAACAGACAAATTTATAATT----ACCAACTAAACT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCTATACCGTCCCTCTATCTTACACACACAA-GACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGTTGTTATATTGTTTGAATACAGCCATTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCATGATACCTCACTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGTGACCTTTACAGTAGAACCCCCAAAAGATGTCCTTAT-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAATTAACACTGTAACTGGCTAGCAGACTGGCACCTTGGAATATCACCTCTGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCTCTTTTCAACAAA-ATTCTAATAGTAATTAAAAAATAGAATTGGAAATTGGAAATTGGAAATGGCTATGCACCTTGTGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATT
gi|8 : gACTTGTAATGTCAAATTCTTTACTTATTATCTC--------------------------A-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATACCTCACGATGTTACCATTTTTTACAGACTAATTATATTGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAATGCCTCACTTTATACGTTGATGGCTCAACATATTATATCTTGCCATC------------------------ACAATACCACATAATAAA---TATTATATTAATATCATGTTGAGCACTTGAGATAATCAATTTAGATAATAAG-------TTCAACATCTTATAGGGAGAAGTGTATATTGTTTACATACCATGGTACCTTAGCATC--ATTT--TTTT-A--------------TA-GAACAAATCATGACTGGTTCTCTTTATATA----TTTAGATTGTGCTTCGTGACTTATA------ATACACTGCAATAGTGGACTATTTAAAATCTGTCTCGAATGCGAAATGTCATGTTATG--TCAAACCTAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCTNNNNNNNNNNNNN------------NN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACAATACAATTTTATGGCTTAGATATGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGACAATCTATTAAATCCATTACTGGCGGCCCGAAGAATTTATTGACCGAGA
gi|9 : gttacTCTATATAATTGTATGCTTCTTTCCTTT-AAGCAGTTAAAGATCATGTTC
gi|9 : AAAGATCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGTCAATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAATCATGTGATTGTATTTTAGTTATTGTCCCTGAT------TTG-----TCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAC-TCATTCTTTTGGAGGCTTTTACAGAAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGCAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCCCATATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATAAAATTTTCAACAAGTAGTG--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG---T-----------AATTGCTGTGAACCATATGTAAGTGTATTTAGGACACACATATATTTT-TTTTTGTAATT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAAATT-GTTATGCCCAACTCTCAGCTTATTTCATTTTAATATTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACATATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTAA---------------------CTCCATATCTCGACTTATTAT------CTCTAGACCT-TGACTTACTGTCTTTGGCTCTCAGCTTATAATTT-TTATTTCAAGCTCTCGACTGATctcaaatgttagtttatgactcaagagtcaatgttatattgtttgaatacagcctttggaatcatgtgattgtattttagttattgtccctgatttgtcattgcaataactgcagtagatttcactcattcttttggaggcttttacagaaggatgtccttaattttggaatgtaacagcactgtttgctttcaaataacactgcaactggctagtagtctggcaccttggaatatcccatatggtatctgaaagtgttaagataaaataaaattttcaacaagtagtgatagtaattaaaaaatagaattggtaattgctgtgaaccatatgtaagtgtatttaggacacacatatatttttttttgtaattgacaagatattgagttaagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaaattgttatgcccaactctcagcttatttcattttaatattgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacatattatctccacttgatatctaaatattttgaattaactccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactgtctttggctctcagcttataatttttatttcaagctctcgactgat
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22 1 555555 11 222222222222222 1 2222222222 11 1 11 33333333333 222222222222222 1111 111 111 111 4444444444444444444444444 111111111111111111111111111111111 55555555555555555555 111 11 111 111111 11 333333333333333333333333333333333333333 11 1111111 111111111
lowQualScore : 00 6 222222 00 0 222222222222222 1 2 1 0 0 0 1 3333333333 33 0 11 0 1 1 11111111111 77 0 77 888888888888888 5 77 2222 000 77 000 77 5 3 77 111 1 0000000000000000000000000 1 1 1 000000000000000000000000000000000 99 44444444444444444444 0 444 1 0 1 44 77 77 1 5 5 5 000 666666 33 33 3 1 888888888888888888888888888888888888888 1 1 77 5 5 1 5 33 77 888 6666666 1 333333333
lowQualScore : .. . ...... .. . ............... . . . . . . . .......... .. . .. . . . ........... .. . .. ............... . .. .... ... .. ... .. . . .. ... . ......................... . . . ................................. .. .................... . ... . . . .. .. .. . . . . ... ...... .. .. . . ....................................... . . .. . . . . .. .. ... ....... . .........
lowQualScore : 66 0 222222 66 8 888888888888888 4 5 0 0 2 2 0 5555555555 88 6 00 8 4 0 77777777777 00 3 99 111111111111111 7 99 1111 000 99 000 99 7 3 77 777 0 0000000000000000000000000 7 4 7 888888888888888888888888888888888 22 22222222222222222222 7 000 4 8 0 00 99 11 6 7 7 7 000 444444 55 88 2 2 555555555555555555555555555555555555555 0 4 99 7 7 0 7 66 99 888 2222222 0 000000000
consensus : GATATAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATATAGTTATATA-ATGT-A-TTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTNTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTATCTGTAAGATTACTACTGGTTACACTTGAACNGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGC----------TTAT-----------AACTTATTATTTCGAGCTCTCGACTTATTATCTCGAG---C-TTA-ACT-TG---T----TA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAACTCCTCACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTACAATACCACATAATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTT--TTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCGAAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATNTCACCGATACGATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATTACTGGCCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGACTTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTNACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTNATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
Reference ( family-2139 ) : GATATAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATATAGTTATATA-ATGT-A-TTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTNTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTATCTGTAAGATTACTACTGGTTACACTTGAACNGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGNCTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGC----------TTAT-----------AATTTATTATTTCGAGCTCTCGACTTATTATCTCGAG---C-TTA-ACT-TG---T----TA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAACTCCTCACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTACAATACCACATAATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTT--TTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCGAAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATNTCACCGATACGATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATTACTGGCCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGACTTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTNACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTNATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
gi|1 : GATATAAAAAAAAAGAAATAAAGAAATATATTTATATATATGT-AATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAA---------------GTTCAATACGTGTTGTTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTGTCAATGAAACATGTGTAAATAATAATTGTTTTTTTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTCCCAAATAGAAACTTTTCAATTATTCCTGAAAGTTATCCGTAAGATTACTACTTGTAACACTTGAACTGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CTGTCTTTATAATTGTATGCTTCATTCCTTCAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACACAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTTAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCAACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCAGTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCCAGTAGTCTGGTACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATATAATGCATACTTCAACAAGTAGCC--AAAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--ATACTT----GA---CAAGATAT--TAA---GTTAAGTCGAGTTAT--TCAATTATTATCTCAAGCGTTCAACGT-GTTATGTC----------CTTATTTCATCTCAATATTGTCTTATAT-CATGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGCATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTTAATTATCT-CATATCTCGACTTACTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGC----------CTAT-----------AATTTATTATTTCAAGCTCTCGATTTATTATCTTGAG---CGTTAGACT-TG---T----TA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCACACACTGTTACCACTTGACACAGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATAATGTTATACACCTCACTTTATACGTCTAGGGCTCAACATATTATATTTTGCCATCAAAACATATGTCTATTTGATATGTTGAATACCACATGATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAATTGTGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGCGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATC--ATTT--TTTT-AAAATAGTCTTTT-TAGGAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATATATATATAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTTAAATCTGTCTCGCATGTGAAATGTCATGTCATG--TCAAACTCAGGCCGAATTATAGCAAATACTAAAATAAGAGTAATTAATGAT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATTTCACTGATACAATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGCCGCCCAAAGAAATAATTGACCGAGACTTTTATGATGTGTATGTCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATTCATGCAATTTGTTACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAGTTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTTGTTTTAATATACATAGAGTCTAATATTTAAAAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
gi|10 : ATACAACCTAAAGAAGCATGTGATTGTATTTAAGTAATTGTCCATGAAACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGTTTTCAAATAATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAA-----------GATGTCCTTAG-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTAGAATAACACTGTAACTGATTAGTAGTCCGGCACCTTAGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTTTTAAGATAAAATGCGTTTTTAAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAAT-GAATTGG-----------T---TATGGCTATGCACTTTATGTAAGTGTATTTAGGACAAACATATTTTTT-TTT--GTATTT----GA---AAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTACTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATATCCAGTCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGACCTATAT-CAAGTTATTCA-TATGCTGAGCCCTATTTGA-GCCCTATCCCCACTTGATTTCTAAATATTTTTAATTATCTCCATATCTAGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTAC
gi|11 : TGTATATTCTTAACATACCAGGGTGACTTAGCATCA-ATTT--TTTT--------TTTTTTA--------AATCATGACCAGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATA
gi|11 : TACAGTGCAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAACCAAATATTCTTCGT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATAACTGGCCACCCGAAGAAATTATTGACCGAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacagtgcaattttatggcttaggtgtgggaaaaaccaaatattcttcgtgtccatatcatggatgaaacaatgattgagtcttgttttgaggccatcaggttgagcatgggatcaaacatgctgacaatctattaaatgcataactggccacccgaagaaattattgaccgagaagcaaacagcattgagtgtgaacatattgcaaca
gi|12 : tgtatattcttaacataccagggtgacttagcatcaatttttttttttttaaatcatgaccagttctctttatatatttagattgtgcttcatgacttataatatactgcaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATATAAAAAAAA-GAAAAAAAGAAATATAGTTATATA-AT------TATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAAAGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGCTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCTGTAAATCAAAACTGTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTTTTTGTAACATTACTACTGGTTACACTGGAACAGTCAAATTTATAATTACTAAC----TAAGCTCACAGTCTACATAATTGTATGCTTCATTCCTTT-AAGCAGTTAA--ATagcaaacagcattgagtgtgaacatattgcaaca
gi|13 : TAAAT-AACTAAATTGAATA-ATG-----TGTTATAGGGTTATTACCATTGCATTTTCAAAAC--C--AAATCAATTATCCATGTACAGTATAGGAGTT-GTTCAAAACAACATTAAACCTGATTATCGGTGTC-ATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TACGATCCTTATATA-ATAAA---TGATAC----------AATACTGGAAAATTAACATTGAAA
gi|14 : gtagcatagaatgatttagaacaataatagtattatgcaatgaatattctcaatgcagttatcactggttcttcatcaaacgtgcccagtaattgtaaaaccacaagacaatatacaaagtcgTTTTACGGTGAGTATCCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATAAACCAAATTGGATACATACAATTTGTTACAGAATAATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAGTTATCTCTTTCCATTATGTGATGATTGTCATAATGTA-------TTTAGTTCTAATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-ATAATCCTAAAACATTAACAATAAAAgt
gi|15 : TTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATATAAGTCATGATAATGAATGAACCAAATTGGACTTATGCAATTTGTTACAGAA--------CTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAATTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTAGTTCTTATATACATGGAGTa
gi|16 : aA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTAATATACATAGAGTTTAATATT---AAACA-AATCCTAAAACATTTACAATAAAA
gi|17 : AAGCATATTTAGGACATACTTGTTTCTC-TTT-----CTTTAAAGATCTCAAAATCTCTTGATTTGTTTTGTCGAACTCTCTTGACTTATTATCTGAAGAAGTCGATTTTGTTATGCCCAGCTATTGGCTTAa
gi|18 : GATATAAAAAAAA-GAAAAACAGAAATATAGTTATATA-AT------TATTATTGT--CTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATAGCTTA
gi|2 : gGATATAAAAAAAAA-AAAAGAAGAAATATAGTTATATACATGTGA-TTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAACATAAAAATGATAATACGTTAAAGTTCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCATATATCAAAACTTTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGCTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGTCAAAAAGAAACTTCTCAATTATTCCCGAAAGCTATCTGTAAAATAACTAATGATTACACTTGAACTGTAAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTT-CTCAAATGTTAGTTTATGATTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAACCTTTGGAAGCATGTCATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCAATTGCAATACCTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCATAGCTTTTTGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGGTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---TATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACAAACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---TTGAAGTCGAGTTCT--TCAATTAGTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGTTTTATATATAAGTTATTTATTATGTTGAACCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATATAGATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGC----------TTAT-----------AATTTATTATTTCAAGCTCTCAACTTATTATCTTGAG---TGTTAGACT-TG---TAATGTC-----AAATTCTTTACTTATTATCTCAAGATTGTACTTATTTCAATATTTCGCACTGTAACCACTTGATCCAGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCATACTCTTAACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTTCAACACTACACAATAAT---TATTAAATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAATTGAGCTTTCAACATCTTATGGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCATTTTT--TTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACCAGTTCTCTTTATATAT-T---TAGGTTTTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGCAGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCACAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAATTTAGAGTTATAAATGCT------------G------------ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGATACAATTGTATGGCTTAGGCGTGGG--AAAAATAAAATATTCTTCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGCCACCCGGAGAAATTATTGACCGAcag
gi|3 : TGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ACAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTGAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTGAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATGTTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATCATCTCTACTTGGTATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGGCTTGGGCTCTCAGC----------TTAT-----------AACTTATTATCTTGAGCATTAGACTTATAATGTCAAATTCT-TTA-ATTATGATCT----CA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTGTTATTTCAAACTCCTCACTTAATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATGTGTCTATTTAATATGTACAATACTACATAATAAT---TATTATATACATATTATGTTAAGCACTTGAGATAATTTATTTAGACAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTACAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTTTATTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACTGATTCTCTTTATATAT-T---TAGGTTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAA
gi|3 : AACAAGCAGACTTTTATGATATCACCGATACGATACAACTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTTGCCGCCCAAAGAAATTATTGACCGAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaagcagacttttatgatatcaccgatacgatacaactttatggcttaggtgtgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattacttgccgcccaaagaaattattgaccgagaagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataacttttacagtgtgtatgccttcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgaatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagagttatgacccatgaattgtcaaaactctaacatgtatccatgtatatgggagtttgctcaatacaacactgaactcaattatctctttccattatgtgatgatcttcatattgtatttggttctaatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaccattaacaat
gi|3 : tggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcgtttttcaacaagtagtcacagtaattaaaaaatagaattggtaatggctatgcaccttatgtgagtgtatttaggacacacacatatttttttgtacttgacaagatattgagttgagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatgttgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacgtatcatctctacttggtatctaaatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactggcttgggctctcagcttataacttattatcttgagcattagacttataatgtcaaattctttaattatgatctcaagattgtacttatttcaatatctcacactgttaccacttgatacggactaattatgatgagctcctgacttgttatttcaaactcctcacttaatacgtcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatgtgtctatttaatatgtacaatactacataataattattatatacatattatgttaagcacttgagataatttatttagacaataagttgagctttcaacatcttacaggaagaagtgtatattcttaacataccatggtaccttagcatcaattttattttaaattatcttttatagaacaaatcatgactgattctctttatatatttaggttgtgcttcatgacttataatatactgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTTTTACAGTGTGTATGCCTTCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTAACAGAGTTATGACCCATGAATTGTCAAAACT-CT-AA--CATGTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACACTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATCTTCATATTGTA-------TTTGGTTCTAATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAACCATTAACAATagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataacttttacagtgtgtatgccttcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgaatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagagttatgacccatgaattgtcaaaactctaacatgtatccatgtatatgggagtttgctcaatacaacactgaactcaattatctctttccattatgtgatgatcttcatattgtatttggttctaatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaccattaacaat
gi|4 : tggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcgtttttcaacaagtagtcacagtaattaaaaaatagaattggtaatggctatgcaccttatgtgagtgtatttaggacacacacatatttttttgtacttgacaagatattgagttgagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatgttgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacgtatcatctctacttggtatctaaatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactggcttgggctctcagcttataacttattatcttgagcattagacttataatgtcaaattctttaattatgatctcaagattgtacttatttcaatatctcacactgttaccacttgatacggactaattatgatgagctcctgacttgttatttcaaactcctcacttaatacgtcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatgtgtctatttaatatgtacaatactacataataattattatatacatattatgttaagcacttgagataatttatttagacaataagttgagctttcaacatcttacaggaagaagtgtatattcttaacataccatggtaccttagcatcaattttattttaaattatcttttatagaacaaatcatgactgattctctttatatatttaggttgtgcttcatgacttataatatactgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaagcagacttttatgatatcaccgatacgatacaactttatggcttaggtgtgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattacttgccgcccaaagaaattattgaccgagaagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataTCAAATTCTTTACTTATTATCTC---------------------------A-----AGAT--TATACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACAACTTGATACAGACTAATTATGATCAGCTCCTGACTTATTAGTTCAAACTCCTCACTTTATACATCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGAAAAATACCACATAATAATAAATATAATATACATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTAAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACTGTAGCATCA-ATTT--TTTTAAAATTA-TCTTATATA-GAATAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTATGCTTCATGACTTATAATAATTATATACTGCAATAGTAAACTAGTTAAAATCTGTCCCACATGTGAAATGTCATG----GGTTCAAACCC-------ATTATAGCAAAGACTAAAATGAGAGTAATAAATACT------------GCNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACAATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGGGAAAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGTCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGA
gi|4 : tcttgtgcgttagactaataacgACTTATACAGTGTGTATGCCTGTAGTTTTCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTAT-AATGAACCAAATTAGATACATGCAATTTGTAACAGAGTTATGACTCTTAAATTGTCAAAACT-CTTAA--CATTTATCCATGTA---TATGGGCGTTTGCTCAATACAACAATGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTAATGATGGTCATAAAGTATTAAATTTTTGGTTCTTATATACATA-AGTCTAATATT---A----------TAAAACATTAACAATAAAAagcgaacagcatagaatgtgaacatattgcaacagaatttttatgtgtccacacacaaaatacaaaagtatcccaatatatataacaagatatggtagcaaggtttaattcagtctgataacttatacagtgtgtatgcctgtagttttcatttggtcttcatgtaagacatgattataatgaaccaaattagatacatgcaatttgtaacagagttatgactcttaaattgtcaaaactcttaacatttatccatgtatatgggcgtttgctcaatacaacaatgaactcaattatctctttccattatgtaatgatggtcataaagtattaaatttttggttcttatatacataagtctaatattataaaacattaacaataaaaa
gi|5 : tcttgtgcgttagactaataacgtcaaattctttacttattatctcaagattatacttatttcaatatctcacactgttacaacttgatacagactaattatgatcagctcctgacttattagttcaaactcctcactttatacatcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatatgtctatttaatatgaaaaataccacataataataaatataatatacatattatgttgagcacttgagataattaattaagataataagttgagctttcaacatcttataggaagaagtgtatattcttaacataccatggtactgtagcatcaatttttttaaaattatcttatatagaataaatcatgaccggttctctttatatatttagattatgcttcatgacttataataattatatactgcaatagtaaactagttaaaatctgtcccacatgtgaaatgtcatgggttcaaacccattatagcaaagactaaaatgagagtaataaatactgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattttatggcttaggtgtggggaaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattactggtcgcccgaagaaattattgaccgagaagcgaacagcatagaatgtgaacatattgcaacagaatttttatgtgtccacacacaaaatacaaaagtatcccaatatatataacaagatatggtagcaaggtttaattcagtctgataCAAAGAACATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGTTGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTCGGGAGCATGTGAGTGTAT---AGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACGGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTG-CACCTTGGAATATTACCTTTGGTATCTGAAAGTGTAAAGATGAAATGTGTTTTTCAACAAGTAGTT--ATAGTAGT--AAAAACAGAATTAG-----------T---AATGGCTAATCACCTAATATAAGTGTATTTAGGACACACACATGTTTTGTTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTATGTCAAGTTCT--TTAATTATTATCTCAAGCGATCAACTT-GTTATGTCCAGTCCTCAGCTTATTTTATTTCAATATT-------AT--AAGTTATTTATTATGTTGAGCTC---TTGATGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATGTTGAATTATCTCCATATCACGACTTATTTTCTCTAGACCTTGACTTGCTGTTTTGGACTCTCAACTTATAATTTATTATTTCAAGCTCTCAACTTATTACCTTGAGCGTTGGACTTGTAATGTCAAATT-C-TTT-ACT-TA---T----TATCTCAAGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTAACACTGTTACCACTTGATACGGACTAGTTATGATGAGCTCCTGACTTATTTTTTCAAACTCCTCACTTAATACGCCAAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCCATTTAATATATAa
gi|6 : gT--TTTT-AAATTA-CCTTTTATA-GAACAAATCATGACCGGTTTTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTGTA------ATATACTGC
gi|6 : TACAATACAATTCTATGACTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTTTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNAGTAAATGCATTAGTGACCGCCCAAAGAAATTACTGTTTGAGAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattctatgacttaggtgtgggaaaaatcaaatatttttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaaatgcattagtgaccgcccaaagaaattactgtttgagaagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataacctttacagtgtatatgcctgcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgtatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagacttacgacccttgaattgtcaaaactgtaacatttatccatgtatataggagtttgctcaatacaacattgaactcaattatctcattccattatgtgatgatggtcataatgtatttggttcttatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaacattaacaataaaa
gi|6 : tttttaaattaccttttatagaacaaatcatgaccggttttctttatatatttagattgtgcttcatgacttgtaatatactgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCTTTACAGTGTATATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGTATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTAACAGACTTACGACCCTTGAATTGTCAAAACTGT--AA--CATTTATCCATGTA---TATAGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCATTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTTATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAAagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataacctttacagtgtatatgcctgcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgtatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagacttacgacccttgaattgtcaaaactgtaacatttatccatgtatataggagtttgctcaatacaacattgaactcaattatctcattccattatgtgatgatggtcataatgtatttggttcttatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaacattaacaataaaa
gi|7 : tttttaaattaccttttatagaacaaatcatgaccggttttctttatatatttagattgtgcttcatgacttgtaatatactgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattctatgacttaggtgtgggaaaaatcaaatatttttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaaatgcattagtgaccgcccaaagaaattactgtttgagaagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataGATATAAAAATAAA-AAAAAAAGAAATATAGTTATATA-AT------TATTATTGT--CTTCATGATTTTGATAAAATAA------------------GATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATAGTTCAAGTCTTAGCCTT--ACATTCTATATATCGAAGCCTTCAATGGACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCACAACTTATTCTGCCGAACATAAACTTCACAGTTATTCCTAAAAGCTATTTGTAAGATTACTACTGGTTACACATGAACAGACAAATTTATAATT----ACCAACTAAACT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCTATACCGTCCCTCTATCTTACACACACAA-GACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGTTGTTATATTGTTTGAATACAGCCATTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCATGATACCTCACTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGTGACCTTTACAGTAGAACCCCCAAAAGATGTCCTTAT-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAATTAACACTGTAACTGGCTAGCAGACTGGCACCTTGGAATATCACCTCTGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCTCTTTTCAACAAA-ATTCTAATAGTAATTAAAAAATAGAATTGGAAATTGGAAATTGGAAATGGCTATGCACCTTGTGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATT
gi|8 : gACTTGTAATGTCAAATTCTTTACTTATTATCTC---------------------------A-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATACCTCACGATGTTACCATTTTTTACAGACTAATTATATTGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAATGCCTCACTTTATACGTTGATGGCTCAACATATTATATCTTGCCATC------------------------ACAATACCACATAATAAA---TATTATATTAATATCATGTTGAGCACTTGAGATAATCAATTTAGATAATAAG-------TTCAACATCTTATAGGGAGAAGTGTATATTGTTTACATACCATGGTACCTTAGCATC--ATTT----------------TTTTATA-GAACAAATCATGACTGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCGTGACTTATA------ATACACTGCAATAGTGGACTATTTAAAATCTGTCTCGAATGCGAAATGTCATGTTATG--TCAAACCTAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCTNNNNNNNNNNNNN------------NN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACAATACAATTTTATGGCTTAGATATGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGACAATCTATTAAATCCATTACTGGCGGCCCGAAGAATTTATTGACCGAGA
gi|9 : gttacTCTATATAATTGTATGCTTCTTTCCTTT-AAGCAGTTAAAGATCATGTTC
gi|9 : AAAGATCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGTCAATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAATCATGTGATTGTATTTTAGTTATTGTCCCTGAT------TTG-----TCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAC-TCATTCTTTTGGAGGCTTTTACAGAAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGCAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCCCATATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATAAAATTTTCAACAAGTAGTG--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATTGCTGTGAACCATATGTAAGTGTATTTAGGACACACATATATTTT-TTTTTGTAATT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAAATT-GTTATGCCCAACTCTCAGCTTATTTCATTTTAATATTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACATATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTAACTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTTGGCTCTCAGC----------TTAT-----------AATTT-TTATTTCAAGCTCTCGACTGATctcaaatgttagtttatgactcaagagtcaatgttatattgtttgaatacagcctttggaatcatgtgattgtattttagttattgtccctgatttgtcattgcaataactgcagtagatttcactcattcttttggaggcttttacagaaggatgtccttaattttggaatgtaacagcactgtttgctttcaaataacactgcaactggctagtagtctggcaccttggaatatcccatatggtatctgaaagtgttaagataaaataaaattttcaacaagtagtgatagtaattaaaaaatagaattggtaattgctgtgaaccatatgtaagtgtatttaggacacacatatatttttttttgtaattgacaagatattgagttaagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaaattgttatgcccaactctcagcttatttcattttaatattgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacatattatctccacttgatatctaaatattttgaattaactccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactgtctttggctctcagcttataatttttatttcaagctctcgactgat
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22 1 555555 11 222222222222222 1 2222222222 11 1 11 33333333333 222222222222222 1111 111 111 111 666666666666666666666 111111111111111111111111111111111 55555555555555555555 111 11 111 111111 11 333333333333333333333333333333333333333 11 1111111 111111111
lowQualScore : 00 6 222222 00 0 222222222222222 1 2 1 0 0 0 1 3333333333 33 0 11 0 1 1 11111111111 77 0 77 888888888888888 5 77 2222 000 77 000 77 5 3 77 111 1 888888888888888888888 1 1 1 000000000000000000000000000000000 99 44444444444444444444 0 444 1 0 1 44 77 77 1 5 5 5 000 666666 33 33 3 1 888888888888888888888888888888888888888 1 1 77 5 5 1 5 33 77 888 6666666 1 333333333
lowQualScore : .. . ...... .. . ............... . . . . . . . .......... .. . .. . . . ........... .. . .. ............... . .. .... ... .. ... .. . . .. ... . ..................... . . . ................................. .. .................... . ... . . . .. .. .. . . . . ... ...... .. .. . . ....................................... . . .. . . . . .. .. ... ....... . .........
lowQualScore : 66 0 222222 66 8 888888888888888 4 5 0 0 2 2 0 5555555555 88 6 00 8 4 0 77777777777 00 3 99 111111111111111 7 99 1111 000 99 000 99 7 7 77 777 0 000000000000000000000 7 4 7 888888888888888888888888888888888 22 22222222222222222222 7 000 4 8 0 00 99 11 6 7 7 7 000 444444 55 88 2 2 555555555555555555555555555555555555555 0 4 99 7 7 0 7 66 99 888 2222222 0 000000000
consensus : GATATAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATATAGTTATATA-ATGT-A-TTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTNTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTATCTGTAAGATTACTACTGGTTACACTTGAACNGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTAT---------------------AACTTATTATTTCGAGCTCTCGACTTATTATCTCGAG---C-TTA-ACT-TG---T----TA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAACTCCTCACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTACAATACCACATAATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTT--TTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCGAAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATNTCACCGATACGATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATTACTGGCCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGACTTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTNACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTNATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
Reference ( family-2139 ) : GATATAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATATAGTTATATA-ATGT-A-TTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTNTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTATCTGTAAGATTACTACTGGTTACACTTGAACNGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTAT---------------------AACTTATTATTTCGAGCTCTCGACTTATTATCTCGAG---C-TTA-ACT-TG---T----TA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAACTCCTCACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTACAATACCACATAATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTT--TTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCGAAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATNTCACCGATACGATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATTACTGGCCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGACTTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTNACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTNATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
gi|1 : GATATAAAAAAAAAGAAATAAAGAAATATATTTATATATATGT-AATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAA---------------GTTCAATACGTGTTGTTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTGTCAATGAAACATGTGTAAATAATAATTGTTTTTTTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTCCCAAATAGAAACTTTTCAATTATTCCTGAAAGTTATCCGTAAGATTACTACTTGTAACACTTGAACTGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CTGTCTTTATAATTGTATGCTTCATTCCTTCAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACACAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTTAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCAACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCAGTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCCAGTAGTCTGGTACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATATAATGCATACTTCAACAAGTAGCC--AAAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--ATACTT----GA---CAAGATAT--TAA---GTTAAGTCGAGTTAT--TCAATTATTATCTCAAGCGTTCAACGT-GTTATGTC----------CTTATTTCATCTCAATATTGTCTTATAT-CATGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGCATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTTAATTATCT-CATATCTCGACTTACTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCCTAT---------------------AATTTATTATTTCAAGCTCTCGATTTATTATCTTGAG---CGTTAGACT-TG---T----TA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCACACACTGTTACCACTTGACACAGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATAATGTTATACACCTCACTTTATACGTCTAGGGCTCAACATATTATATTTTGCCATCAAAACATATGTCTATTTGATATGTTGAATACCACATGATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAATTGTGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGCGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATC--ATTT--TTTT-AAAATAGTCTTTT-TAGGAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATATATATATAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTTAAATCTGTCTCGCATGTGAAATGTCATGTCATG--TCAAACTCAGGCCGAATTATAGCAAATACTAAAATAAGAGTAATTAATGAT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATTTCACTGATACAATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGCCGCCCAAAGAAATAATTGACCGAGACTTTTATGATGTGTATGTCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATTCATGCAATTTGTTACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAGTTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTTGTTTTAATATACATAGAGTCTAATATTTAAAAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
gi|10 : ATACAACCTAAAGAAGCATGTGATTGTATTTAAGTAATTGTCCATGAAACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGTTTTCAAATAATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAA-----------GATGTCCTTAG-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTAGAATAACACTGTAACTGATTAGTAGTCCGGCACCTTAGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTTTTAAGATAAAATGCGTTTTTAAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAAT-GAATTGG-----------T---TATGGCTATGCACTTTATGTAAGTGTATTTAGGACAAACATATTTTTT-TTT--GTATTT----GA---AAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTACTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATATCCAGTCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGACCTATAT-CAAGTTATTCA-TATGCTGAGCCCTATTTGA-GCCCTATCCCCACTTGATTTCTAAATATTTTTAATTATCTCCATATCTAGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTAC
gi|11 : TGTATATTCTTAACATACCAGGGTGACTTAGCATCA-ATTT--TTTT--------TTTTTTA--------AATCATGACCAGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATA
gi|11 : TACAGTGCAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAACCAAATATTCTTCGT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATAACTGGCCACCCGAAGAAATTATTGACCGAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacagtgcaattttatggcttaggtgtgggaaaaaccaaatattcttcgtgtccatatcatggatgaaacaatgattgagtcttgttttgaggccatcaggttgagcatgggatcaaacatgctgacaatctattaaatgcataactggccacccgaagaaattattgaccgagaagcaaacagcattgagtgtgaacatattgcaaca
gi|12 : tgtatattcttaacataccagggtgacttagcatcaatttttttttttttaaatcatgaccagttctctttatatatttagattgtgcttcatgacttataatatactgcaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATATAAAAAAAA-GAAAAAAAGAAATATAGTTATATA-AT------TATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAAAGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGCTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCTGTAAATCAAAACTGTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTTTTTGTAACATTACTACTGGTTACACTGGAACAGTCAAATTTATAATTACTAAC----TAAGCTCACAGTCTACATAATTGTATGCTTCATTCCTTT-AAGCAGTTAA--ATagcaaacagcattgagtgtgaacatattgcaaca
gi|13 : TAAAT-AACTAAATTGAATA-ATG-----TGTTATAGGGTTATTACCATTGCATTTTCAAAAC--C--AAATCAATTATCCATGTACAGTATAGGAGTT-GTTCAAAACAACATTAAACCTGATTATCGGTGTC-ATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TACGATCCTTATATA-ATAAA---TGATAC----------AATACTGGAAAATTAACATTGAAA
gi|14 : gtagcatagaatgatttagaacaataatagtattatgcaatgaatattctcaatgcagttatcactggttcttcatcaaacgtgcccagtaattgtaaaaccacaagacaatatacaaagtcgTTTTACGGTGAGTATCCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATAAACCAAATTGGATACATACAATTTGTTACAGAATAATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAGTTATCTCTTTCCATTATGTGATGATTGTCATAATGTA-------TTTAGTTCTAATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-ATAATCCTAAAACATTAACAATAAAAgt
gi|15 : TTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATATAAGTCATGATAATGAATGAACCAAATTGGACTTATGCAATTTGTTACAGAA--------CTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAATTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTAGTTCTTATATACATGGAGTa
gi|16 : aA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTAATATACATAGAGTTTAATATT---AAACA-AATCCTAAAACATTTACAATAAAA
gi|17 : AAGCATATTTAGGACATACTTGTTTCTC-TTT-----CTTTAAAGATCTCAAAATCTCTTGATTTGTTTTGTCGAACTCTCTTGACTTATTATCTGAAGAAGTCGATTTTGTTATGCCCAGCTATTGGCTTAa
gi|18 : GATATAAAAAAAA-GAAAAACAGAAATATAGTTATATA-AT------TATTATTGT--CTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATAGCTTA
gi|2 : gGATATAAAAAAAAA-AAAAGAAGAAATATAGTTATATACATGTGA-TTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAACATAAAAATGATAATACGTTAAAGTTCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCATATATCAAAACTTTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGCTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGTCAAAAAGAAACTTCTCAATTATTCCCGAAAGCTATCTGTAAAATAACTAATGATTACACTTGAACTGTAAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTT-CTCAAATGTTAGTTTATGATTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAACCTTTGGAAGCATGTCATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCAATTGCAATACCTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCATAGCTTTTTGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGGTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---TATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACAAACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---TTGAAGTCGAGTTCT--TCAATTAGTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGTTTTATATATAAGTTATTTATTATGTTGAACCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATATAGATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTAT---------------------AATTTATTATTTCAAGCTCTCAACTTATTATCTTGAG---TGTTAGACT-TG---TAATGTC-----AAATTCTTTACTTATTATCTCAAGATTGTACTTATTTCAATATTTCGCACTGTAACCACTTGATCCAGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCATACTCTTAACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTTCAACACTACACAATAAT---TATTAAATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAATTGAGCTTTCAACATCTTATGGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCATTTTT--TTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACCAGTTCTCTTTATATAT-T---TAGGTTTTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGCAGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCACAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAATTTAGAGTTATAAATGCT------------G------------ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGATACAATTGTATGGCTTAGGCGTGGG--AAAAATAAAATATTCTTCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGCCACCCGGAGAAATTATTGACCGAcag
gi|3 : TGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ACAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTGAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTGAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATGTTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATCATCTCTACTTGGTATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGGCTTGGGCTCTCAGCTTAT---------------------AACTTATTATCTTGAGCATTAGACTTATAATGTCAAATTCT-TTA-ATTATGATCT----CA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTGTTATTTCAAACTCCTCACTTAATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATGTGTCTATTTAATATGTACAATACTACATAATAAT---TATTATATACATATTATGTTAAGCACTTGAGATAATTTATTTAGACAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTACAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTTTATTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACTGATTCTCTTTATATAT-T---TAGGTTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAA
gi|3 : AACAAGCAGACTTTTATGATATCACCGATACGATACAACTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTTGCCGCCCAAAGAAATTATTGACCGAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaagcagacttttatgatatcaccgatacgatacaactttatggcttaggtgtgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattacttgccgcccaaagaaattattgaccgagaagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataacttttacagtgtgtatgccttcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgaatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagagttatgacccatgaattgtcaaaactctaacatgtatccatgtatatgggagtttgctcaatacaacactgaactcaattatctctttccattatgtgatgatcttcatattgtatttggttctaatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaccattaacaat
gi|3 : tggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcgtttttcaacaagtagtcacagtaattaaaaaatagaattggtaatggctatgcaccttatgtgagtgtatttaggacacacacatatttttttgtacttgacaagatattgagttgagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatgttgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacgtatcatctctacttggtatctaaatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactggcttgggctctcagcttataacttattatcttgagcattagacttataatgtcaaattctttaattatgatctcaagattgtacttatttcaatatctcacactgttaccacttgatacggactaattatgatgagctcctgacttgttatttcaaactcctcacttaatacgtcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatgtgtctatttaatatgtacaatactacataataattattatatacatattatgttaagcacttgagataatttatttagacaataagttgagctttcaacatcttacaggaagaagtgtatattcttaacataccatggtaccttagcatcaattttattttaaattatcttttatagaacaaatcatgactgattctctttatatatttaggttgtgcttcatgacttataatatactgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTTTTACAGTGTGTATGCCTTCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTAACAGAGTTATGACCCATGAATTGTCAAAACT-CT-AA--CATGTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACACTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATCTTCATATTGTA-------TTTGGTTCTAATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAACCATTAACAATagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataacttttacagtgtgtatgccttcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgaatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagagttatgacccatgaattgtcaaaactctaacatgtatccatgtatatgggagtttgctcaatacaacactgaactcaattatctctttccattatgtgatgatcttcatattgtatttggttctaatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaccattaacaat
gi|4 : tggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcgtttttcaacaagtagtcacagtaattaaaaaatagaattggtaatggctatgcaccttatgtgagtgtatttaggacacacacatatttttttgtacttgacaagatattgagttgagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatgttgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacgtatcatctctacttggtatctaaatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactggcttgggctctcagcttataacttattatcttgagcattagacttataatgtcaaattctttaattatgatctcaagattgtacttatttcaatatctcacactgttaccacttgatacggactaattatgatgagctcctgacttgttatttcaaactcctcacttaatacgtcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatgtgtctatttaatatgtacaatactacataataattattatatacatattatgttaagcacttgagataatttatttagacaataagttgagctttcaacatcttacaggaagaagtgtatattcttaacataccatggtaccttagcatcaattttattttaaattatcttttatagaacaaatcatgactgattctctttatatatttaggttgtgcttcatgacttataatatactgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaagcagacttttatgatatcaccgatacgatacaactttatggcttaggtgtgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattacttgccgcccaaagaaattattgaccgagaagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataTCAAATTCTTTACTTATTATCTC---------------------------A-----AGAT--TATACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACAACTTGATACAGACTAATTATGATCAGCTCCTGACTTATTAGTTCAAACTCCTCACTTTATACATCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGAAAAATACCACATAATAATAAATATAATATACATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTAAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACTGTAGCATCA-ATTT--TTTTAAAATTA-TCTTATATA-GAATAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTATGCTTCATGACTTATAATAATTATATACTGCAATAGTAAACTAGTTAAAATCTGTCCCACATGTGAAATGTCATG----GGTTCAAACCC-------ATTATAGCAAAGACTAAAATGAGAGTAATAAATACT------------GCNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACAATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGGGAAAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGTCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGA
gi|4 : tcttgtgcgttagactaataacgACTTATACAGTGTGTATGCCTGTAGTTTTCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTAT-AATGAACCAAATTAGATACATGCAATTTGTAACAGAGTTATGACTCTTAAATTGTCAAAACT-CTTAA--CATTTATCCATGTA---TATGGGCGTTTGCTCAATACAACAATGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTAATGATGGTCATAAAGTATTAAATTTTTGGTTCTTATATACATA-AGTCTAATATT---A----------TAAAACATTAACAATAAAAagcgaacagcatagaatgtgaacatattgcaacagaatttttatgtgtccacacacaaaatacaaaagtatcccaatatatataacaagatatggtagcaaggtttaattcagtctgataacttatacagtgtgtatgcctgtagttttcatttggtcttcatgtaagacatgattataatgaaccaaattagatacatgcaatttgtaacagagttatgactcttaaattgtcaaaactcttaacatttatccatgtatatgggcgtttgctcaatacaacaatgaactcaattatctctttccattatgtaatgatggtcataaagtattaaatttttggttcttatatacataagtctaatattataaaacattaacaataaaaa
gi|5 : tcttgtgcgttagactaataacgtcaaattctttacttattatctcaagattatacttatttcaatatctcacactgttacaacttgatacagactaattatgatcagctcctgacttattagttcaaactcctcactttatacatcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatatgtctatttaatatgaaaaataccacataataataaatataatatacatattatgttgagcacttgagataattaattaagataataagttgagctttcaacatcttataggaagaagtgtatattcttaacataccatggtactgtagcatcaatttttttaaaattatcttatatagaataaatcatgaccggttctctttatatatttagattatgcttcatgacttataataattatatactgcaatagtaaactagttaaaatctgtcccacatgtgaaatgtcatgggttcaaacccattatagcaaagactaaaatgagagtaataaatactgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattttatggcttaggtgtggggaaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattactggtcgcccgaagaaattattgaccgagaagcgaacagcatagaatgtgaacatattgcaacagaatttttatgtgtccacacacaaaatacaaaagtatcccaatatatataacaagatatggtagcaaggtttaattcagtctgataCAAAGAACATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGTTGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTCGGGAGCATGTGAGTGTAT---AGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACGGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTG-CACCTTGGAATATTACCTTTGGTATCTGAAAGTGTAAAGATGAAATGTGTTTTTCAACAAGTAGTT--ATAGTAGT--AAAAACAGAATTAG-----------T---AATGGCTAATCACCTAATATAAGTGTATTTAGGACACACACATGTTTTGTTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTATGTCAAGTTCT--TTAATTATTATCTCAAGCGATCAACTT-GTTATGTCCAGTCCTCAGCTTATTTTATTTCAATATT-------AT--AAGTTATTTATTATGTTGAGCTC---TTGATGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATGTTGAATTATCTCCATATCACGACTTATTTTCTCTAGACCTTGACTTGCTGTTTTGGACTCTCAACTTATAATTTATTATTTCAAGCTCTCAACTTATTACCTTGAGCGTTGGACTTGTAATGTCAAATT-C-TTT-ACT-TA---T----TATCTCAAGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTAACACTGTTACCACTTGATACGGACTAGTTATGATGAGCTCCTGACTTATTTTTTCAAACTCCTCACTTAATACGCCAAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCCATTTAATATATAa
gi|6 : gT--TTTT-AAATTA-CCTTTTATA-GAACAAATCATGACCGGTTTTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTGTA------ATATACTGC
gi|6 : TACAATACAATTCTATGACTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTTTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNAGTAAATGCATTAGTGACCGCCCAAAGAAATTACTGTTTGAGAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattctatgacttaggtgtgggaaaaatcaaatatttttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaaatgcattagtgaccgcccaaagaaattactgtttgagaagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataacctttacagtgtatatgcctgcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgtatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagacttacgacccttgaattgtcaaaactgtaacatttatccatgtatataggagtttgctcaatacaacattgaactcaattatctcattccattatgtgatgatggtcataatgtatttggttcttatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaacattaacaataaaa
gi|6 : tttttaaattaccttttatagaacaaatcatgaccggttttctttatatatttagattgtgcttcatgacttgtaatatactgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCTTTACAGTGTATATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGTATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTAACAGACTTACGACCCTTGAATTGTCAAAACTGT--AA--CATTTATCCATGTA---TATAGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCATTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTTATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAAagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataacctttacagtgtatatgcctgcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgtatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagacttacgacccttgaattgtcaaaactgtaacatttatccatgtatataggagtttgctcaatacaacattgaactcaattatctcattccattatgtgatgatggtcataatgtatttggttcttatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaacattaacaataaaa
gi|7 : tttttaaattaccttttatagaacaaatcatgaccggttttctttatatatttagattgtgcttcatgacttgtaatatactgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattctatgacttaggtgtgggaaaaatcaaatatttttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaaatgcattagtgaccgcccaaagaaattactgtttgagaagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataGATATAAAAATAAA-AAAAAAAGAAATATAGTTATATA-AT------TATTATTGT--CTTCATGATTTTGATAAAATAA------------------GATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATAGTTCAAGTCTTAGCCTT--ACATTCTATATATCGAAGCCTTCAATGGACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCACAACTTATTCTGCCGAACATAAACTTCACAGTTATTCCTAAAAGCTATTTGTAAGATTACTACTGGTTACACATGAACAGACAAATTTATAATT----ACCAACTAAACT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCTATACCGTCCCTCTATCTTACACACACAA-GACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGTTGTTATATTGTTTGAATACAGCCATTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCATGATACCTCACTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGTGACCTTTACAGTAGAACCCCCAAAAGATGTCCTTAT-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAATTAACACTGTAACTGGCTAGCAGACTGGCACCTTGGAATATCACCTCTGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCTCTTTTCAACAAA-ATTCTAATAGTAATTAAAAAATAGAATTGGAAATTGGAAATTGGAAATGGCTATGCACCTTGTGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATT
gi|8 : gACTTGTAATGTCAAATTCTTTACTTATTATCTC---------------------------A-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATACCTCACGATGTTACCATTTTTTACAGACTAATTATATTGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAATGCCTCACTTTATACGTTGATGGCTCAACATATTATATCTTGCCATC------------------------ACAATACCACATAATAAA---TATTATATTAATATCATGTTGAGCACTTGAGATAATCAATTTAGATAATAAG-------TTCAACATCTTATAGGGAGAAGTGTATATTGTTTACATACCATGGTACCTTAGCATC--ATTT----------------TTTTATA-GAACAAATCATGACTGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCGTGACTTATA------ATACACTGCAATAGTGGACTATTTAAAATCTGTCTCGAATGCGAAATGTCATGTTATG--TCAAACCTAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCTNNNNNNNNNNNNN------------NN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACAATACAATTTTATGGCTTAGATATGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGACAATCTATTAAATCCATTACTGGCGGCCCGAAGAATTTATTGACCGAGA
gi|9 : gttacTCTATATAATTGTATGCTTCTTTCCTTT-AAGCAGTTAAAGATCATGTTC
gi|9 : AAAGATCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGTCAATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAATCATGTGATTGTATTTTAGTTATTGTCCCTGAT------TTG-----TCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAC-TCATTCTTTTGGAGGCTTTTACAGAAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGCAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCCCATATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATAAAATTTTCAACAAGTAGTG--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATTGCTGTGAACCATATGTAAGTGTATTTAGGACACACATATATTTT-TTTTTGTAATT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAAATT-GTTATGCCCAACTCTCAGCTTATTTCATTTTAATATTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACATATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTAACTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTTGGCTCTCAGCTTAT---------------------AATTT-TTATTTCAAGCTCTCGACTGATctcaaatgttagtttatgactcaagagtcaatgttatattgtttgaatacagcctttggaatcatgtgattgtattttagttattgtccctgatttgtcattgcaataactgcagtagatttcactcattcttttggaggcttttacagaaggatgtccttaattttggaatgtaacagcactgtttgctttcaaataacactgcaactggctagtagtctggcaccttggaatatcccatatggtatctgaaagtgttaagataaaataaaattttcaacaagtagtgatagtaattaaaaaatagaattggtaattgctgtgaaccatatgtaagtgtatttaggacacacatatatttttttttgtaattgacaagatattgagttaagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaaattgttatgcccaactctcagcttatttcattttaatattgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacatattatctccacttgatatctaaatattttgaattaactccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactgtctttggctctcagcttataatttttatttcaagctctcgactgat
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22 1 555555 11 222222222222222 1 2222222222 11 1 11 33333333333 222222222222222 1111 111 111 111 666666666666666666666 111111111111111111111111111111111 55555555555555555555 111 11 111 111111 11 333333333333333333333333333333333333333 11 1111111 111111111
lowQualScore : 00 6 222222 00 0 222222222222222 1 2 1 0 0 0 1 3333333333 33 0 11 0 1 1 11111111111 77 0 77 888888888888888 5 77 2222 000 77 000 77 5 3 77 111 1 888888888888888888888 1 1 1 000000000000000000000000000000000 99 44444444444444444444 0 444 1 0 1 44 77 77 1 5 5 5 000 666666 33 33 3 1 888888888888888888888888888888888888888 1 1 77 5 5 1 5 33 77 888 6666666 1 333333333
lowQualScore : .. . ...... .. . ............... . . . . . . . .......... .. . .. . . . ........... .. . .. ............... . .. .... ... .. ... .. . . .. ... . ..................... . . . ................................. .. .................... . ... . . . .. .. .. . . . . ... ...... .. .. . . ....................................... . . .. . . . . .. .. ... ....... . .........
lowQualScore : 66 0 222222 66 8 888888888888888 4 5 0 0 2 2 0 5555555555 88 6 00 8 4 0 77777777777 00 3 99 111111111111111 7 99 1111 000 99 000 99 7 7 77 777 0 000000000000000000000 7 4 7 888888888888888888888888888888888 22 22222222222222222222 7 000 4 8 0 00 99 11 6 7 7 7 000 444444 55 88 2 2 555555555555555555555555555555555555555 0 4 99 7 7 0 7 66 99 888 2222222 0 000000000
consensus : GATATAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATATAGTTATATA-ATGT-A-TTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTNTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTATCTGTAAGATTACTACTGGTTACACTTGAACNGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTAT---------------------AACTTATTATTTCGAGCTCTCGACTTATTATCTCGAG---C-TTA-ACT-TG---T----TA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAACTCCTCACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTACAATACCACATAATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTT--TTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCGAAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATNTCACCGATACGATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATTACTGGCCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGACTTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTNACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTNATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
Reference ( family-2139 ) : GATATAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATATAGTTATATA-ATGT-A-TTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTNTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTATCTGTAAGATTACTACTGGTTACACTTGAACNGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTAT---------------------AACTTATTATTTCGAGCTCTCGACTTATTATCTCGAG---C-TTA-ACT-TG---T----TA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAACTCCTCACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTACAATACCACATAATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTT--TTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCGAAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATNTCACCGATACGATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATTACTGGCCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGACTTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTNACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTNATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
gi|1 : GATATAAAAAAAAAGAAATAAAGAAATATATTTATATATATGT-AATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAA---------------GTTCAATACGTGTTGTTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTGTCAATGAAACATGTGTAAATAATAATTGTTTTTTTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTCCCAAATAGAAACTTTTCAATTATTCCTGAAAGTTATCCGTAAGATTACTACTTGTAACACTTGAACTGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CTGTCTTTATAATTGTATGCTTCATTCCTTCAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACACAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTTAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCAACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCAGTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCCAGTAGTCTGGTACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATATAATGCATACTTCAACAAGTAGCC--AAAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--ATACTT----GA---CAAGATAT--TAA---GTTAAGTCGAGTTAT--TCAATTATTATCTCAAGCGTTCAACGT-GTTATGTC----------CTTATTTCATCTCAATATTGTCTTATAT-CATGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGCATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTTAATTATCT-CATATCTCGACTTACTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCCTAT---------------------AATTTATTATTTCAAGCTCTCGATTTATTATCTTGAG---CGTTAGACT-TG---T----TA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCACACACTGTTACCACTTGACACAGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATAATGTTATACACCTCACTTTATACGTCTAGGGCTCAACATATTATATTTTGCCATCAAAACATATGTCTATTTGATATGTTGAATACCACATGATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAATTGTGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGCGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATC--ATTT--TTTT-AAAATAGTCTTTT-TAGGAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATATATATATAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTTAAATCTGTCTCGCATGTGAAATGTCATGTCATG--TCAAACTCAGGCCGAATTATAGCAAATACTAAAATAAGAGTAATTAATGAT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATTTCACTGATACAATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGCCGCCCAAAGAAATAATTGACCGAGACTTTTATGATGTGTATGTCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATTCATGCAATTTGTTACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAGTTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTTGTTTTAATATACATAGAGTCTAATATTTAAAAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
gi|10 : ATACAACCTAAAGAAGCATGTGATTGTATTTAAGTAATTGTCCATGAAACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGTTTTCAAATAATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAA-----------GATGTCCTTAG-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTAGAATAACACTGTAACTGATTAGTAGTCCGGCACCTTAGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTTTTAAGATAAAATGCGTTTTTAAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAAT-GAATTGG-----------T---TATGGCTATGCACTTTATGTAAGTGTATTTAGGACAAACATATTTTTT-TTT--GTATTT----GA---AAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTACTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATATCCAGTCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGACCTATAT-CAAGTTATTCA-TATGCTGAGCCCTATTTGA-GCCCTATCCCCACTTGATTTCTAAATATTTTTAATTATCTCCATATCTAGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTAC
gi|11 : TGTATATTCTTAACATACCAGGGTGACTTAGCATCA-ATTT--TTTT--------TTTTTTA--------AATCATGACCAGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATA
gi|11 : TACAGTGCAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAACCAAATATTCTTCGT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATAACTGGCCACCCGAAGAAATTATTGACCGAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacagtgcaattttatggcttaggtgtgggaaaaaccaaatattcttcgtgtccatatcatggatgaaacaatgattgagtcttgttttgaggccatcaggttgagcatgggatcaaacatgctgacaatctattaaatgcataactggccacccgaagaaattattgaccgagaagcaaacagcattgagtgtgaacatattgcaaca
gi|12 : tgtatattcttaacataccagggtgacttagcatcaatttttttttttttaaatcatgaccagttctctttatatatttagattgtgcttcatgacttataatatactgcaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATATAAAAAAAA-GAAAAAAAGAAATATAGTTATATA-AT------TATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAAAGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGCTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCTGTAAATCAAAACTGTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTTTTTGTAACATTACTACTGGTTACACTGGAACAGTCAAATTTATAATTACTAAC----TAAGCTCACAGTCTACATAATTGTATGCTTCATTCCTTT-AAGCAGTTAA--ATagcaaacagcattgagtgtgaacatattgcaaca
gi|13 : TAAAT-AACTAAATTGAATA-ATG-----TGTTATAGGGTTATTACCATTGCATTTTCAAAAC--C--AAATCAATTATCCATGTACAGTATAGGAGTT-GTTCAAAACAACATTAAACCTGATTATCGGTGTC-ATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TACGATCCTTATATA-ATAAA---TGATAC----------AATACTGGAAAATTAACATTGAAA
gi|14 : gtagcatagaatgatttagaacaataatagtattatgcaatgaatattctcaatgcagttatcactggttcttcatcaaacgtgcccagtaattgtaaaaccacaagacaatatacaaagtcgTTTTACGGTGAGTATCCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATAAACCAAATTGGATACATACAATTTGTTACAGAATAATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAGTTATCTCTTTCCATTATGTGATGATTGTCATAATGTA-------TTTAGTTCTAATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-ATAATCCTAAAACATTAACAATAAAAgt
gi|15 : TTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATATAAGTCATGATAATGAATGAACCAAATTGGACTTATGCAATTTGTTACAGAA--------CTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAATTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTAGTTCTTATATACATGGAGTa
gi|16 : aA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTAATATACATAGAGTTTAATATT---AAACA-AATCCTAAAACATTTACAATAAAA
gi|17 : AAGCATATTTAGGACATACTTGTTTCTC-TTT-----CTTTAAAGATCTCAAAATCTCTTGATTTGTTTTGTCGAACTCTCTTGACTTATTATCTGAAGAAGTCGATTTTGTTATGCCCAGCTATTGGCTTAa
gi|18 : GATATAAAAAAAA-GAAAAACAGAAATATAGTTATATA-AT------TATTATTGT--CTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATAGCTTA
gi|2 : gGATATAAAAAAAAA-AAAAGAAGAAATATAGTTATATACATGTGA-TTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAACATAAAAATGATAATACGTTAAAGTTCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCATATATCAAAACTTTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGCTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGTCAAAAAGAAACTTCTCAATTATTCCCGAAAGCTATCTGTAAAATAACTAATGATTACACTTGAACTGTAAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTT-CTCAAATGTTAGTTTATGATTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAACCTTTGGAAGCATGTCATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCAATTGCAATACCTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCATAGCTTTTTGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGGTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---TATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACAAACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---TTGAAGTCGAGTTCT--TCAATTAGTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGTTTTATATATAAGTTATTTATTATGTTGAACCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATATAGATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTAT---------------------AATTTATTATTTCAAGCTCTCAACTTATTATCTTGAG---TGTTAGACT-TG---TAATGTC-----AAATTCTTTACTTATTATCTCAAGATTGTACTTATTTCAATATTTCGCACTGTAACCACTTGATCCAGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCATACTCTTAACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTTCAACACTACACAATAAT---TATTAAATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAATTGAGCTTTCAACATCTTATGGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCATTTTT--TTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACCAGTTCTCTTTATATAT-T---TAGGTTTTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGCAGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCACAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAATTTAGAGTTATAAATGCT------------G------------ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGATACAATTGTATGGCTTAGGCGTGGG--AAAAATAAAATATTCTTCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGCCACCCGGAGAAATTATTGACCGAcag
gi|3 : TGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ACAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTGAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTGAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATGTTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATCATCTCTACTTGGTATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGGCTTGGGCTCTCAGCTTAT---------------------AACTTATTATCTTGAGCATTAGACTTATAATGTCAAATTCT-TTA-ATTATGATCT----CA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTGTTATTTCAAACTCCTCACTTAATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATGTGTCTATTTAATATGTACAATACTACATAATAAT---TATTATATACATATTATGTTAAGCACTTGAGATAATTTATTTAGACAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTACAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTTTATTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACTGATTCTCTTTATATAT-T---TAGGTTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAA
gi|3 : AACAAGCAGACTTTTATGATATCACCGATACGATACAACTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTTGCCGCCCAAAGAAATTATTGACCGAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaagcagacttttatgatatcaccgatacgatacaactttatggcttaggtgtgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattacttgccgcccaaagaaattattgaccgagaagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataacttttacagtgtgtatgccttcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgaatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagagttatgacccatgaattgtcaaaactctaacatgtatccatgtatatgggagtttgctcaatacaacactgaactcaattatctctttccattatgtgatgatcttcatattgtatttggttctaatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaccattaacaat
gi|3 : tggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcgtttttcaacaagtagtcacagtaattaaaaaatagaattggtaatggctatgcaccttatgtgagtgtatttaggacacacacatatttttttgtacttgacaagatattgagttgagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatgttgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacgtatcatctctacttggtatctaaatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactggcttgggctctcagcttataacttattatcttgagcattagacttataatgtcaaattctttaattatgatctcaagattgtacttatttcaatatctcacactgttaccacttgatacggactaattatgatgagctcctgacttgttatttcaaactcctcacttaatacgtcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatgtgtctatttaatatgtacaatactacataataattattatatacatattatgttaagcacttgagataatttatttagacaataagttgagctttcaacatcttacaggaagaagtgtatattcttaacataccatggtaccttagcatcaattttattttaaattatcttttatagaacaaatcatgactgattctctttatatatttaggttgtgcttcatgacttataatatactgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTTTTACAGTGTGTATGCCTTCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTAACAGAGTTATGACCCATGAATTGTCAAAACT-CT-AA--CATGTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACACTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATCTTCATATTGTA-------TTTGGTTCTAATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAACCATTAACAATagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataacttttacagtgtgtatgccttcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgaatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagagttatgacccatgaattgtcaaaactctaacatgtatccatgtatatgggagtttgctcaatacaacactgaactcaattatctctttccattatgtgatgatcttcatattgtatttggttctaatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaccattaacaat
gi|4 : tggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcgtttttcaacaagtagtcacagtaattaaaaaatagaattggtaatggctatgcaccttatgtgagtgtatttaggacacacacatatttttttgtacttgacaagatattgagttgagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatgttgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacgtatcatctctacttggtatctaaatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactggcttgggctctcagcttataacttattatcttgagcattagacttataatgtcaaattctttaattatgatctcaagattgtacttatttcaatatctcacactgttaccacttgatacggactaattatgatgagctcctgacttgttatttcaaactcctcacttaatacgtcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatgtgtctatttaatatgtacaatactacataataattattatatacatattatgttaagcacttgagataatttatttagacaataagttgagctttcaacatcttacaggaagaagtgtatattcttaacataccatggtaccttagcatcaattttattttaaattatcttttatagaacaaatcatgactgattctctttatatatttaggttgtgcttcatgacttataatatactgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaagcagacttttatgatatcaccgatacgatacaactttatggcttaggtgtgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattacttgccgcccaaagaaattattgaccgagaagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataTCAAATTCTTTACTTATTATCTC---------------------------A-----AGAT--TATACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACAACTTGATACAGACTAATTATGATCAGCTCCTGACTTATTAGTTCAAACTCCTCACTTTATACATCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGAAAAATACCACATAATAATAAATATAATATACATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTAAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACTGTAGCATCA-ATTT--TTTTAAAATTA-TCTTATATA-GAATAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTATGCTTCATGACTTATAATAATTATATACTGCAATAGTAAACTAGTTAAAATCTGTCCCACATGTGAAATGTCATG----GGTTCAAACCC-------ATTATAGCAAAGACTAAAATGAGAGTAATAAATACT------------GCNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACAATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGGGAAAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGTCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGA
gi|4 : tcttgtgcgttagactaataacgACTTATACAGTGTGTATGCCTGTAGTTTTCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTAT-AATGAACCAAATTAGATACATGCAATTTGTAACAGAGTTATGACTCTTAAATTGTCAAAACT-CTTAA--CATTTATCCATGTA---TATGGGCGTTTGCTCAATACAACAATGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTAATGATGGTCATAAAGTATTAAATTTTTGGTTCTTATATACATA-AGTCTAATATT---A----------TAAAACATTAACAATAAAAagcgaacagcatagaatgtgaacatattgcaacagaatttttatgtgtccacacacaaaatacaaaagtatcccaatatatataacaagatatggtagcaaggtttaattcagtctgataacttatacagtgtgtatgcctgtagttttcatttggtcttcatgtaagacatgattataatgaaccaaattagatacatgcaatttgtaacagagttatgactcttaaattgtcaaaactcttaacatttatccatgtatatgggcgtttgctcaatacaacaatgaactcaattatctctttccattatgtaatgatggtcataaagtattaaatttttggttcttatatacataagtctaatattataaaacattaacaataaaaa
gi|5 : tcttgtgcgttagactaataacgtcaaattctttacttattatctcaagattatacttatttcaatatctcacactgttacaacttgatacagactaattatgatcagctcctgacttattagttcaaactcctcactttatacatcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatatgtctatttaatatgaaaaataccacataataataaatataatatacatattatgttgagcacttgagataattaattaagataataagttgagctttcaacatcttataggaagaagtgtatattcttaacataccatggtactgtagcatcaatttttttaaaattatcttatatagaataaatcatgaccggttctctttatatatttagattatgcttcatgacttataataattatatactgcaatagtaaactagttaaaatctgtcccacatgtgaaatgtcatgggttcaaacccattatagcaaagactaaaatgagagtaataaatactgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattttatggcttaggtgtggggaaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattactggtcgcccgaagaaattattgaccgagaagcgaacagcatagaatgtgaacatattgcaacagaatttttatgtgtccacacacaaaatacaaaagtatcccaatatatataacaagatatggtagcaaggtttaattcagtctgataCAAAGAACATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGTTGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTCGGGAGCATGTGAGTGTAT---AGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACGGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTG-CACCTTGGAATATTACCTTTGGTATCTGAAAGTGTAAAGATGAAATGTGTTTTTCAACAAGTAGTT--ATAGTAGT--AAAAACAGAATTAG-----------T---AATGGCTAATCACCTAATATAAGTGTATTTAGGACACACACATGTTTTGTTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTATGTCAAGTTCT--TTAATTATTATCTCAAGCGATCAACTT-GTTATGTCCAGTCCTCAGCTTATTTTATTTCAATATT-------AT--AAGTTATTTATTATGTTGAGCTC---TTGATGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATGTTGAATTATCTCCATATCACGACTTATTTTCTCTAGACCTTGACTTGCTGTTTTGGACTCTCAACTTATAATTTATTATTTCAAGCTCTCAACTTATTACCTTGAGCGTTGGACTTGTAATGTCAAATT-C-TTT-ACT-TA---T----TATCTCAAGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTAACACTGTTACCACTTGATACGGACTAGTTATGATGAGCTCCTGACTTATTTTTTCAAACTCCTCACTTAATACGCCAAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCCATTTAATATATAa
gi|6 : gT--TTTT-AAATTA-CCTTTTATA-GAACAAATCATGACCGGTTTTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTGTA------ATATACTGC
gi|6 : TACAATACAATTCTATGACTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTTTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNAGTAAATGCATTAGTGACCGCCCAAAGAAATTACTGTTTGAGAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattctatgacttaggtgtgggaaaaatcaaatatttttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaaatgcattagtgaccgcccaaagaaattactgtttgagaagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataacctttacagtgtatatgcctgcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgtatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagacttacgacccttgaattgtcaaaactgtaacatttatccatgtatataggagtttgctcaatacaacattgaactcaattatctcattccattatgtgatgatggtcataatgtatttggttcttatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaacattaacaataaaa
gi|6 : tttttaaattaccttttatagaacaaatcatgaccggttttctttatatatttagattgtgcttcatgacttgtaatatactgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCTTTACAGTGTATATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGTATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTAACAGACTTACGACCCTTGAATTGTCAAAACTGT--AA--CATTTATCCATGTA---TATAGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCATTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTTATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAAagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataacctttacagtgtatatgcctgcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgtatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagacttacgacccttgaattgtcaaaactgtaacatttatccatgtatataggagtttgctcaatacaacattgaactcaattatctcattccattatgtgatgatggtcataatgtatttggttcttatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaacattaacaataaaa
gi|7 : tttttaaattaccttttatagaacaaatcatgaccggttttctttatatatttagattgtgcttcatgacttgtaatatactgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattctatgacttaggtgtgggaaaaatcaaatatttttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaaatgcattagtgaccgcccaaagaaattactgtttgagaagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataGATATAAAAATAAA-AAAAAAAGAAATATAGTTATATA-AT------TATTATTGT--CTTCATGATTTTGATAAAATAA------------------GATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATAGTTCAAGTCTTAGCCTT--ACATTCTATATATCGAAGCCTTCAATGGACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCACAACTTATTCTGCCGAACATAAACTTCACAGTTATTCCTAAAAGCTATTTGTAAGATTACTACTGGTTACACATGAACAGACAAATTTATAATT----ACCAACTAAACT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCTATACCGTCCCTCTATCTTACACACACAA-GACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGTTGTTATATTGTTTGAATACAGCCATTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCATGATACCTCACTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGTGACCTTTACAGTAGAACCCCCAAAAGATGTCCTTAT-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAATTAACACTGTAACTGGCTAGCAGACTGGCACCTTGGAATATCACCTCTGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCTCTTTTCAACAAA-ATTCTAATAGTAATTAAAAAATAGAATTGGAAATTGGAAATTGGAAATGGCTATGCACCTTGTGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATT
gi|8 : gACTTGTAATGTCAAATTCTTTACTTATTATCTC---------------------------A-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATACCTCACGATGTTACCATTTTTTACAGACTAATTATATTGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAATGCCTCACTTTATACGTTGATGGCTCAACATATTATATCTTGCCATC------------------------ACAATACCACATAATAAA---TATTATATTAATATCATGTTGAGCACTTGAGATAATCAATTTAGATAATAAG-------TTCAACATCTTATAGGGAGAAGTGTATATTGTTTACATACCATGGTACCTTAGCATC--ATTT----------------TTTTATA-GAACAAATCATGACTGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCGTGACTTATA------ATACACTGCAATAGTGGACTATTTAAAATCTGTCTCGAATGCGAAATGTCATGTTATG--TCAAACCTAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCTNNNNNNNNNNNNN------------NN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACAATACAATTTTATGGCTTAGATATGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGACAATCTATTAAATCCATTACTGGCGGCCCGAAGAATTTATTGACCGAGA
gi|9 : gttacTCTATATAATTGTATGCTTCTTTCCTTT-AAGCAGTTAAAGATCATGTTC
gi|9 : AAAGATCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGTCAATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAATCATGTGATTGTATTTTAGTTATTGTCCCTGAT------TTG-----TCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAC-TCATTCTTTTGGAGGCTTTTACAGAAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGCAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCCCATATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATAAAATTTTCAACAAGTAGTG--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATTGCTGTGAACCATATGTAAGTGTATTTAGGACACACATATATTTT-TTTTTGTAATT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAAATT-GTTATGCCCAACTCTCAGCTTATTTCATTTTAATATTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACATATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTAACTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTTGGCTCTCAGCTTAT---------------------AATTT-TTATTTCAAGCTCTCGACTGATctcaaatgttagtttatgactcaagagtcaatgttatattgtttgaatacagcctttggaatcatgtgattgtattttagttattgtccctgatttgtcattgcaataactgcagtagatttcactcattcttttggaggcttttacagaaggatgtccttaattttggaatgtaacagcactgtttgctttcaaataacactgcaactggctagtagtctggcaccttggaatatcccatatggtatctgaaagtgttaagataaaataaaattttcaacaagtagtgatagtaattaaaaaatagaattggtaattgctgtgaaccatatgtaagtgtatttaggacacacatatatttttttttgtaattgacaagatattgagttaagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaaattgttatgcccaactctcagcttatttcattttaatattgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacatattatctccacttgatatctaaatattttgaattaactccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactgtctttggctctcagcttataatttttatttcaagctctcgactgat
blockSeqs : G C GTGAT GT AGATAATACTTTAAA A C G . A ACTAAC CA A AG A A AACCCCCAAAA GC TA AAATTGGAAATTGGA G TT TAAA TCT CT TTT CT T A AT TAT C AATTTATTATTTCAAGCTCTC A A C AAATTCTTTAATTATGATCTCA TC TTATCTCAAGATTGTACTTA AAA T A AT TA AA T . . . . ATAATT TC GT A T GATATNNNNNNNNNN N A GA N T T G TT AT CAG TTAAATT T AAAAT
blockSeqs : G . . GT TGATAATACTTTAAA A C T . T ACCAAC . A . T G . G . T . . . . . . . . T C . C . A G A AAATTCTTTACTTATTATCTCA . . . A A A . A T . . . . . TT . A G GCNNNNNNNNNNNNN A G . . . T . T . . . A AAACA
blockSeqs : A . . . TGATAATACGTTAAA T . T . A AC . . . T G . A . T . . . . . . . . A C . T . A A T GAGTGTTAGACTTGTAATGTC . . . A A A . A T . . . . . . . . A NNNNNNNNNNNNNNN N G . . . T . . . . . T AAAA
blockSeqs : A . . . . A . . A G . T . T . . . . . . . . A C . C . G G G A . . . T . A . A T . . . . . N A . . . A . . . . . A AAAA
blockSeqs : . . A . T . . . . . . . . . . . . . A T A . . . . . . . . . . . A . . . A . . . . . A A
blockSeqs : . T . . . . . . . . A C . . . . . . . . A . . . A . . . . . T .
blockSeqs : . . T
blockSeqCons : G* ****** TGATAATACTTTAAA GAGTCTATTGTGATTCA**************** A* *** AAAA*****
originalCons : GATATAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAATATAGTTATATA-ATGT-A-TTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTNTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTATCTGTAAGATTACTACTGGTTACACTTGAACNGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTAT---------------------AACTTATTATTTCGAGCTCTCGACTTATTATCTCGAG---C-TTA-ACT-TG---T----TA-----AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAACTCCTCACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTACAATACCACATAATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTT--TTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCGAAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATNTCACCGATACGATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATTACTGGCCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGACTTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTNACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTNATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
finalCons : GATATAAAAAAAAG-AAAAAAAGAAATATAGTTATATA-AT------TATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTNTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTATCTGTAAGATTACTACTGGTTACACTTGAACNGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTAT---------------------AACTTATTATTTCGAGCTCTCGACTTATTATCTCGAGTCTATTGTGATTCA----------------AGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAACTCCTCACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTACAATACCACATAATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTT--TTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCGAAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATNTCACCGATACGATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATTACTGGCCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGACTTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTNACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTNATATACATAGAGTCTAATATTAAAA-----AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 444444 11 222222222222222 1 2222222222 11 1 11 33333333333 222222222222222 1111 111 111 111 666666666666666666666 33333333333333333333333333 55555555555555555555 111 11 111 111111 11 333333333333333333333333333333333333333 11 1111111 111111111
lowQualScore : 8 666666 00 0 222222222222222 1 2 1 0 0 0 1 3333333333 33 0 11 0 1 1 11111111111 77 0 77 888888888888888 5 77 2222 000 77 000 77 5 3 77 111 1 888888888888888888888 1 1 1 88888888888888888888888888 1 99 44444444444444444444 0 444 1 0 1 44 77 77 1 5 5 5 000 666666 33 33 3 1 888888888888888888888888888888888888888 1 1 77 5 5 1 5 33 77 888 6666666 1 333333333
lowQualScore : . ...... .. . ............... . . . . . . . .......... .. . .. . . . ........... .. . .. ............... . .. .... ... .. ... .. . . .. ... . ..................... . . . .......................... . .. .................... . ... . . . .. .. .. . . . . ... ...... .. .. . . ....................................... . . .. . . . . .. .. ... ....... . .........
lowQualScore : 0 000000 66 8 888888888888888 4 5 0 0 2 2 0 5555555555 88 6 00 8 4 0 77777777777 00 3 99 111111111111111 7 99 1111 000 99 000 99 7 7 77 777 0 000000000000000000000 7 4 7 00000000000000000000000000 0 22 22222222222222222222 7 000 4 8 0 00 99 11 6 7 7 7 000 444444 55 88 2 2 555555555555555555555555555555555555555 0 4 99 7 7 0 7 66 99 888 2222222 0 000000000
consensus : GATATAAAAAAAA-GAAAAAAAGAAATATAGTTATATA-ATGT-ATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTNTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTATCTGTAAGATTACTACTGGTTACACTTGAACNGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTAT---------------------AACTTATTATTTCGAGCTCTCGACTTATTATCTCGAG-T-T---T---A---TTGT-AT-TCAAGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAACTCCTCACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTACAATACCACATAATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTT--TTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCGAAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATNTCACCGATACGATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATTACTGGCCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGACTTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTNACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTNATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
Reference ( family-2139 ) : GATATAAAAAAAA-GAAAAAAAGAAATATAGTTATATA------ATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTNTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTATCTGTAAGATTACTACTGGTTACACTTGAACNGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTAT---------------------AACTTATTATTTCGAGCTCTCGACTTATTATCTCGAG-T-C---T---A---TTGTGAT-TCAAGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAACTCCTCACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTACAATACCACATAATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTT--TTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCGAAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATNTCACCGATACGATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATTACTGGCCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGACTTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTNACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTNATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
gi|1 : GATATAAAAAAAAAGAAATAAAGAAATATATTTATATATATGTAATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAA---------------GTTCAATACGTGTTGTTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCGTATATCAAAACTGTCAATGAAACATGTGTAAATAATAATTGTTTTTTTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTCCCAAATAGAAACTTTTCAATTATTCCTGAAAGTTATCCGTAAGATTACTACTTGTAACACTTGAACTGTCAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CTGTCTTTATAATTGTATGCTTCATTCCTTCAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACACAGACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTTAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCAACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCAGTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCCAGTAGTCTGGTACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATATAATGCATACTTCAACAAGTAGCC--AAAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--ATACTT----GA---CAAGATAT--TAA---GTTAAGTCGAGTTAT--TCAATTATTATCTCAAGCGTTCAACGT-GTTATGTC----------CTTATTTCATCTCAATATTGTCTTATAT-CATGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGCATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTTAATTATCT-CATATCTCGACTTACTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCCTAT---------------------AATTTATTATTTCAAGCTCTCGATTTATTATCTTGAG-CGT---T---AGACTTG-----TTAAGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCACACACTGTTACCACTTGACACAGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATAATGTTATACACCTCACTTTATACGTCTAGGGCTCAACATATTATATTTTGCCATCAAAACATATGTCTATTTGATATGTTGAATACCACATGATAAT---TATTATATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAATTGTGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGCGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATC--ATTT--TTTT-AAAATAGTCTTTT-TAGGAACAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATATATATATAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGTGGACTAGTTTAAATCTGTCTCGCATGTGAAATGTCATGTCATG--TCAAACTCAGGCCGAATTATAGCAAATACTAAAATAAGAGTAATTAATGAT------------G------------AT------------GGGGTATAATGCTGTATGTATTACAGTGTGGAAACGTTAGCAAGCAGACCTTTGTGATTTCACTGATACAATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGCCGCCCAAAGAAATAATTGACCGAGACTTTTATGATGTGTATGTCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATTCATGCAATTTGTTACAGAGTTATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAGTTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTTGTTTTAATATACATAGAGTCTAATATTTAAAAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAA
gi|10 : ATACAACCTAAAGAAGCATGTGATTGTATTTAAGTAATTGTCCATGAAACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGTTTTCAAATAATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAA-----------GATGTCCTTAG-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTAGAATAACACTGTAACTGATTAGTAGTCCGGCACCTTAGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTTTTAAGATAAAATGCGTTTTTAAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAAT-GAATTGG-----------T---TATGGCTATGCACTTTATGTAAGTGTATTTAGGACAAACATATTTTTT-TTT--GTATTT----GA---AAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTACTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATATCCAGTCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGACCTATAT-CAAGTTATTCA-TATGCTGAGCCCTATTTGA-GCCCTATCCCCACTTGATTTCTAAATATTTTTAATTATCTCCATATCTAGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTAC
gi|11 : TGTATATTCTTAACATACCAGGGTGACTTAGCATCA-ATTT--TTTT--------TTTTTTA--------AATCATGACCAGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATA
gi|11 : TACAGTGCAATTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAACCAAATATTCTTCGT-GTCCATATCATGGATGAAACAATGATTGAGTCTTGTTTTGAGGCCATCAGGTTGAGCATGGGATCAAACATGC-TGACAATCTATTAAATGCATAACTGGCCACCCGAAGAAATTATTGACCGAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacagtgcaattttatggcttaggtgtgggaaaaaccaaatattcttcgtgtccatatcatggatgaaacaatgattgagtcttgttttgaggccatcaggttgagcatgggatcaaacatgctgacaatctattaaatgcataactggccacccgaagaaattattgaccgagaagcaaacagcattgagtgtgaacatattgcaaca
gi|12 : tgtatattcttaacataccagggtgacttagcatcaatttttttttttttaaatcatgaccagttctctttatatatttagattgtgcttcatgacttataatatactgcaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATATAAAAAAAA-GAAAAAAAGAAATATAGTTATATA------ATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAAAATAAAAAAGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGCTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCTGTAAATCAAAACTGTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGCCAAACAGAAACTTCTCAATTATTCCTGAAAGCTTTTTGTAACATTACTACTGGTTACACTGGAACAGTCAAATTTATAATTACTAAC----TAAGCTCACAGTCTACATAATTGTATGCTTCATTCCTTT-AAGCAGTTAA--ATagcaaacagcattgagtgtgaacatattgcaaca
gi|13 : TAAAT-AACTAAATTGAATA-ATG-----TGTTATAGGGTTATTACCATTGCATTTTCAAAAC--C--AAATCAATTATCCATGTACAGTATAGGAGTT-GTTCAAAACAACATTAAACCTGATTATCGGTGTC-ATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TACGATCCTTATATA-ATAAA---TGATAC----------AATACTGGAAAATTAACATTGAAA
gi|14 : gtagcatagaatgatttagaacaataatagtattatgcaatgaatattctcaatgcagttatcactggttcttcatcaaacgtgcccagtaattgtaaaaccacaagacaatatacaaagtcgTTTTACGGTGAGTATCCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATAAACCAAATTGGATACATACAATTTGTTACAGAATAATGACCCTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAGTTATCTCTTTCCATTATGTGATGATTGTCATAATGTA-------TTTAGTTCTAATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-ATAATCCTAAAACATTAACAATAAAAgt
gi|15 : TTTTACGGTGTGTATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATATAAGTCATGATAATGAATGAACCAAATTGGACTTATGCAATTTGTTACAGAA--------CTTGAATTGTCAAAACT-C--AA--CATTTATCCATGTA---TATGGGAATTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTAGTTCTTATATACATGGAGTa
gi|16 : aA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTAATATACATAGAGTTTAATATT---AAACA-AATCCTAAAACATTTACAATAAAA
gi|17 : AAGCATATTTAGGACATACTTGTTTCTC-TTT-----CTTTAAAGATCTCAAAATCTCTTGATTTGTTTTGTCGAACTCTCTTGACTTATTATCTGAAGAAGTCGATTTTGTTATGCCCAGCTATTGGCTTAa
gi|18 : GATATAAAAAAAA-GAAAAACAGAAATATAGTTATATA------ATTATTATTGT--CTTCATGATTTTGATAAAATAAAAATGATAATACTTTAAAGATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATAGCTTA
gi|2 : gGATATAAAAAAAA-AAAAAGAAGAAATATAGTTATATACATGTGATTATTATTGTGTCTTCATGATTTTGATAACATAAAAATGATAATACGTTAAAGTTCAAGACGTGTTATTCAAAGCATGGTTCAAGTCTTAGTCTTCTACATTCCATATATCAAAACTTTCAATGAACCATGTGTAAATAATAATTGCTTT-TTAAAGAGAATTACACCATAACTTATTCTGTCAAAAAGAAACTTCTCAATTATTCCCGAAAGCTATCTGTAAAATAACTAATGATTACACTTGAACTGTAAAATTTATAATT----AC----TAAGCT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCCATACCGTCCCACTATCTTACACACACAAAGACCATGTT-CTCAAATGTTAGTTTATGATTCAAGAGACGATGTTATATTGTTTGAATACAACCTTTGGAAGCATGTCATTGTATTTTAGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCAATTGCAATACCTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACAGTAG-----------GATGTCCATAGCTTTTTGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGGTTTTCAACAAGTAGTC--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---TATGGCTATGCACCTTATGTAAGTGTATTTAGGACACAAACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---TTGAAGTCGAGTTCT--TCAATTAGTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATATTGTTTTATATATAAGTTATTTATTATGTTGAACCC---TTGACGTATTATCTCCACTTGATATATAGATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTGGGCTCTCAGCTTAT---------------------AATTTATTATTTCAAGCTCTCAACTTATTATCTTGAG-TGT---T---AGACTTGTAATGTCAA-ATTCTTTACTTATTATCTCAAGATTGTACTTATTTCAATATTTCGCACTGTAACCACTTGATCCAGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTATTATTTCATACTCTTAACTTTATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGTTCAACACTACACAATAAT---TATTAAATTCATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTTAGATAATAAATTGAGCTTTCAACATCTTATGGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCATTTTT--TTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACCAGTTCTCTTTATATAT-T---TAGGTTTTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAATAGCAGACTAGTTAAAATCTGTCTCGCATGCACAATGTCATGTCATG--TCAAACCCAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAATTTAGAGTTATAAATGCT------------G------------ATATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATGATACAATTGTATGGCTTAGGCGTGGG--AAAAATAAAATATTCTTCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGCCACCCGGAGAAATTATTGACCGAcag
gi|3 : TGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCACCTATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCGTTTTTCAACAAGTAGTC--ACAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATGGCTATGCACCTTATGTGAGTGTATTTAGGACACACACATATTTT-TTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTGAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAACTT-GTTATGTCCAGCCCTCAGCTTATTTTATCTCAATGTTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACGTATCATCTCTACTTGGTATCTAAATATTTTGAATTATCTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGGCTTGGGCTCTCAGCTTAT---------------------AACTTATTATCTTGAGCATTAGACTTATAATGTCAAATT-C---TTTAA---TTATGATCTCAAGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACCACTTGATACGGACTAATTATGATGAGCTCCTGACTTGTTATTTCAAACTCCTCACTTAATACGTCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATGTGTCTATTTAATATGTACAATACTACATAATAAT---TATTATATACATATTATGTTAAGCACTTGAGATAATTTATTTAGACAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTACAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACCTTAGCATCA-ATTTTATTTT-AAATTA-TCTTTTATA-GAACAAATCATGACTGATTCTCTTTATATAT-T---TAGGTTGTGCTTCATGACTTATA------ATATACTGCAA
gi|3 : AACAAGCAGACTTTTATGATATCACCGATACGATACAACTTTATGGCTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTTGCCGCCCAAAGAAATTATTGACCGAGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaagcagacttttatgatatcaccgatacgatacaactttatggcttaggtgtgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattacttgccgcccaaagaaattattgaccgagaagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataacttttacagtgtgtatgccttcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgaatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagagttatgacccatgaattgtcaaaactctaacatgtatccatgtatatgggagtttgctcaatacaacactgaactcaattatctctttccattatgtgatgatcttcatattgtatttggttctaatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaccattaacaat
gi|3 : tggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcgtttttcaacaagtagtcacagtaattaaaaaatagaattggtaatggctatgcaccttatgtgagtgtatttaggacacacacatatttttttgtacttgacaagatattgagttgagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatgttgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacgtatcatctctacttggtatctaaatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactggcttgggctctcagcttataacttattatcttgagcattagacttataatgtcaaattctttaattatgatctcaagattgtacttatttcaatatctcacactgttaccacttgatacggactaattatgatgagctcctgacttgttatttcaaactcctcacttaatacgtcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatgtgtctatttaatatgtacaatactacataataattattatatacatattatgttaagcacttgagataatttatttagacaataagttgagctttcaacatcttacaggaagaagtgtatattcttaacataccatggtaccttagcatcaattttattttaaattatcttttatagaacaaatcatgactgattctctttatatatttaggttgtgcttcatgacttataatatactgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTTTTACAGTGTGTATGCCTTCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGAATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTAACAGAGTTATGACCCATGAATTGTCAAAACT-CT-AA--CATGTATCCATGTA---TATGGGAGTTTGCTCAATACAACACTGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTGATGATCTTCATATTGTA-------TTTGGTTCTAATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAACCATTAACAATagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataacttttacagtgtgtatgccttcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgaatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagagttatgacccatgaattgtcaaaactctaacatgtatccatgtatatgggagtttgctcaatacaacactgaactcaattatctctttccattatgtgatgatcttcatattgtatttggttctaatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaccattaacaat
gi|4 : tggctagtagtctggcaccttggaatatcacctatggtatctgaaagtgttaagataaaatgcgtttttcaacaagtagtcacagtaattaaaaaatagaattggtaatggctatgcaccttatgtgagtgtatttaggacacacacatatttttttgtacttgacaagatattgagttgagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaacttgttatgtccagccctcagcttattttatctcaatgttgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacgtatcatctctacttggtatctaaatattttgaattatctccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactggcttgggctctcagcttataacttattatcttgagcattagacttataatgtcaaattctttaattatgatctcaagattgtacttatttcaatatctcacactgttaccacttgatacggactaattatgatgagctcctgacttgttatttcaaactcctcacttaatacgtcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatgtgtctatttaatatgtacaatactacataataattattatatacatattatgttaagcacttgagataatttatttagacaataagttgagctttcaacatcttacaggaagaagtgtatattcttaacataccatggtaccttagcatcaattttattttaaattatcttttatagaacaaatcatgactgattctctttatatatttaggttgtgcttcatgacttataatatactgcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaacaagcagacttttatgatatcaccgatacgatacaactttatggcttaggtgtgggaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattacttgccgcccaaagaaattattgaccgagaagcaaacagcatagagtgtgaacatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacaaaagtaacccaatatatataacaagatatagtagcaaggtttaattcagtctgataTCAAATTCTTTACTTATTATCTC----------------------------AAGAT--TATACTTA--------------------TTTCAATATCTCACACTGTTACAACTTGATACAGACTAATTATGATCAGCTCCTGACTTATTAGTTCAAACTCCTCACTTTATACATCGAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCTATTTAATATGAAAAATACCACATAATAATAAATATAATATACATATTATGTTGAGCACTTGAGATAATTAATTAAGATAATAAGTTGAGCTTTCAACATCTTATAGGAAGAAGTGTATATTCTTAACATACCATGGTACTGTAGCATCA-ATTT--TTTTAAAATTA-TCTTATATA-GAATAAATCATGACCGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTATGCTTCATGACTTATAATAATTATATACTGCAATAGTAAACTAGTTAAAATCTGTCCCACATGTGAAATGTCATG----GGTTCAAACCC-------ATTATAGCAAAGACTAAAATGAGAGTAATAAATACT------------GCNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACAATACAATTTTATGGCTTAGGTGTGGGGAAAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNATTAAATGCATTACTGGTCGCCCGAAGAAATTATTGACCGAGA
gi|4 : tcttgtgcgttagactaataacgACTTATACAGTGTGTATGCCTGTAGTTTTCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTAT-AATGAACCAAATTAGATACATGCAATTTGTAACAGAGTTATGACTCTTAAATTGTCAAAACT-CTTAA--CATTTATCCATGTA---TATGGGCGTTTGCTCAATACAACAATGAACTCAATTATCTCTTTCCATTATGTAATGATGGTCATAAAGTATTAAATTTTTGGTTCTTATATACATA-AGTCTAATATT---A----------TAAAACATTAACAATAAAAagcgaacagcatagaatgtgaacatattgcaacagaatttttatgtgtccacacacaaaatacaaaagtatcccaatatatataacaagatatggtagcaaggtttaattcagtctgataacttatacagtgtgtatgcctgtagttttcatttggtcttcatgtaagacatgattataatgaaccaaattagatacatgcaatttgtaacagagttatgactcttaaattgtcaaaactcttaacatttatccatgtatatgggcgtttgctcaatacaacaatgaactcaattatctctttccattatgtaatgatggtcataaagtattaaatttttggttcttatatacataagtctaatattataaaacattaacaataaaaa
gi|5 : tcttgtgcgttagactaataacgtcaaattctttacttattatctcaagattatacttatttcaatatctcacactgttacaacttgatacagactaattatgatcagctcctgacttattagttcaaactcctcactttatacatcgagggctcaacatattatatcttgccatcacaacatatgtctatttaatatgaaaaataccacataataataaatataatatacatattatgttgagcacttgagataattaattaagataataagttgagctttcaacatcttataggaagaagtgtatattcttaacataccatggtactgtagcatcaatttttttaaaattatcttatatagaataaatcatgaccggttctctttatatatttagattatgcttcatgacttataataattatatactgcaatagtaaactagttaaaatctgtcccacatgtgaaatgtcatgggttcaaacccattatagcaaagactaaaatgagagtaataaatactgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattttatggcttaggtgtggggaaaaaatcaaatattcttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattaaatgcattactggtcgcccgaagaaattattgaccgagaagcgaacagcatagaatgtgaacatattgcaacagaatttttatgtgtccacacacaaaatacaaaagtatcccaatatatataacaagatatggtagcaaggtttaattcagtctgataCAAAGAACATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGTTGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTCGGGAGCATGTGAGTGTAT---AGTAATTGTCCACGATACGTCATTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGAGGCCTTTACGGTAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGTAACTGGCTAGTAGTCTG-CACCTTGGAATATTACCTTTGGTATCTGAAAGTGTAAAGATGAAATGTGTTTTTCAACAAGTAGTT--ATAGTAGT--AAAAACAGAATTAG-----------T---AATGGCTAATCACCTAATATAAGTGTATTTAGGACACACACATGTTTTGTTT--GTACTT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTATGTCAAGTTCT--TTAATTATTATCTCAAGCGATCAACTT-GTTATGTCCAGTCCTCAGCTTATTTTATTTCAATATT-------AT--AAGTTATTTATTATGTTGAGCTC---TTGATGTATTATCTCCACTTGATATCTAAATATGTTGAATTATCTCCATATCACGACTTATTTTCTCTAGACCTTGACTTGCTGTTTTGGACTCTCAACTTATAATTTATTATTTCAAGCTCTCAACTTATTACCTTGAGCGTTGGACTTGTAATGTCAAA-T-TCTTT---AC--TTATTATCTCAAGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATATCTAACACTGTTACCACTTGATACGGACTAGTTATGATGAGCTCCTGACTTATTTTTTCAAACTCCTCACTTAATACGCCAAGGGCTCAACATATTATATCTTGCCATCACAACATATGTCCATTTAATATATAa
gi|6 : gT--TTTT-AAATTA-CCTTTTATA-GAACAAATCATGACCGGTTTTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCATGACTTGTA------ATATACTGC
gi|6 : TACAATACAATTCTATGACTTAGGTGTGGG--AAAAATCAAATATTTTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNAGTAAATGCATTAGTGACCGCCCAAAGAAATTACTGTTTGAGAcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattctatgacttaggtgtgggaaaaatcaaatatttttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaaatgcattagtgaccgcccaaagaaattactgtttgagaagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataacctttacagtgtatatgcctgcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgtatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagacttacgacccttgaattgtcaaaactgtaacatttatccatgtatataggagtttgctcaatacaacattgaactcaattatctcattccattatgtgatgatggtcataatgtatttggttcttatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaacattaacaataaaa
gi|6 : tttttaaattaccttttatagaacaaatcatgaccggttttctttatatatttagattgtgcttcatgacttgtaatatactgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCTTTACAGTGTATATGCCTGCAGTTATCATTTGGTCTTCATGTAAGACATGATTATGTATGAACCAAATTGGATACATGCAATTTGTAACAGACTTACGACCCTTGAATTGTCAAAACTGT--AA--CATTTATCCATGTA---TATAGGAGTTTGCTCAATACAACATTGAACTCAATTATCTCATTCCATTATGTGATGATGGTCATAATGTA-------TTTGGTTCTTATATACATAGAGTCTAATATT---AAA-A-AATCCTAAAACATTAACAATAAAAagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataacctttacagtgtatatgcctgcagttatcatttggtcttcatgtaagacatgattatgtatgaaccaaattggatacatgcaatttgtaacagacttacgacccttgaattgtcaaaactgtaacatttatccatgtatataggagtttgctcaatacaacattgaactcaattatctcattccattatgtgatgatggtcataatgtatttggttcttatatacatagagtctaatattaaaaaatcctaaaacattaacaataaaa
gi|7 : tttttaaattaccttttatagaacaaatcatgaccggttttctttatatatttagattgtgcttcatgacttgtaatatactgccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntacaatacaattctatgacttaggtgtgggaaaaatcaaatatttttcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaaatgcattagtgaccgcccaaagaaattactgtttgagaagcgaacagcatagattgtgaccatattgcaacagtatttttatgtgtccacacacaaaaaacagaagtatcccaacagaaataacaagctatggtagcggtagcaaggttaaattaagtctgataGATATAAAAATAA-AAAAAAAAGAAATATAGTTATATA------ATTATTATTGT--CTTCATGATTTTGATAAAATAA------------------GATCAAGACGTGTTATTCAAAGCATAGTTCAAGTCTTAGCCTT--ACATTCTATATATCGAAGCCTTCAATGGACCATGTGTAAATAATAATTGTTTT-TTAAAGAGAATTACACCACAACTTATTCTGCCGAACATAAACTTCACAGTTATTCCTAAAAGCTATTTGTAAGATTACTACTGGTTACACATGAACAGACAAATTTATAATT----ACCAACTAAACT--CAGTCTATATAATTGTATGCTTCATTCCTTTAAAGCAGTTCA--ATCATGTCTATACCGTCCCTCTATCTTACACACACAA-GACCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGACGTTGTTATATTGTTTGAATACAGCCATTGGAAGCATGTGATTGTATTTTAGTAATTGTCCATGATACCTCACTGGTTATCCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAAGTCATTTTCCTGGTGACCTTTACAGTAGAACCCCCAAAAGATGTCCTTAT-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAATTAACACTGTAACTGGCTAGCAGACTGGCACCTTGGAATATCACCTCTGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATGCTCTTTTCAACAAA-ATTCTAATAGTAATTAAAAAATAGAATTGGAAATTGGAAATTGGAAATGGCTATGCACCTTGTGTAAGTGTATTTAGGACACACACATATT
gi|8 : gACTTGTAATGTCAAATTCTTTACTTATTATCTC----------------------------AAGAT--TGTACTTA--------------------TTTCAATACCTCACGATGTTACCATTTTTTACAGACTAATTATATTGAGCTCCTGACTTATTATTTCAAATGCCTCACTTTATACGTTGATGGCTCAACATATTATATCTTGCCATC------------------------ACAATACCACATAATAAA---TATTATATTAATATCATGTTGAGCACTTGAGATAATCAATTTAGATAATAAG-------TTCAACATCTTATAGGGAGAAGTGTATATTGTTTACATACCATGGTACCTTAGCATC--ATTT----------------TTTTATA-GAACAAATCATGACTGGTTCTCTTTATATAT-T---TAGATTGTGCTTCGTGACTTATA------ATACACTGCAATAGTGGACTATTTAAAATCTGTCTCGAATGCGAAATGTCATGTTATG--TCAAACCTAGGCCGAATTATAGCAAAGACTAAAATAAGAGTAATAAATGCTNNNNNNNNNNNNN------------NN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACAATACAATTTTATGGCTTAGATATGGG--AAAAATCAAATATTCTTCAT-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGACAATCTATTAAATCCATTACTGGCGGCCCGAAGAATTTATTGACCGAGA
gi|9 : gttacTCTATATAATTGTATGCTTCTTTCCTTT-AAGCAGTTAAAGATCATGTTC
gi|9 : AAAGATCATGTTCCTCAAATGTTAGTTTATGACTCAAGAGTCAATGTTATATTGTTTGAATACAGCCTTTGGAATCATGTGATTGTATTTTAGTTATTGTCCCTGAT------TTG-----TCATTGCAATAACTGCAGTAGATTTCAC-TCATTCTTTTGGAGGCTTTTACAGAAG-----------GATGTCCTTAA-TTTTGGAATGTAACAGCACTGTTTGCTTTCAAATAACACTGCAACTGGCTAGTAGTCTGGCACCTTGGAATATCCCATATGGTATCTGAAAGTGTTAAGATAAAATAAAATTTTCAACAAGTAGTG--ATAGTAATTAAAAAATAGAATTGG-----------T---AATTGCTGTGAACCATATGTAAGTGTATTTAGGACACACATATATTTT-TTTTTGTAATT----GA---CAAGATAT--TGA---GTTAAGTCGAGTTCT--TCAATTATTATCTCAAGCGCTCAAATT-GTTATGCCCAACTCTCAGCTTATTTCATTTTAATATTGACTTATAT-CAAGTTATTTATTATGTTGAGCCC---TTGACATATTATCTCCACTTGATATCTAAATATTTTGAATTAACTCCATATCTCGACTTATTATCTCTAGACCTTGACTTACTGTCTTTGGCTCTCAGCTTAT---------------------AATTT-TTATTTCAAGCTCTCGACTGATctcaaatgttagtttatgactcaagagtcaatgttatattgtttgaatacagcctttggaatcatgtgattgtattttagttattgtccctgatttgtcattgcaataactgcagtagatttcactcattcttttggaggcttttacagaaggatgtccttaattttggaatgtaacagcactgtttgctttcaaataacactgcaactggctagtagtctggcaccttggaatatcccatatggtatctgaaagtgttaagataaaataaaattttcaacaagtagtgatagtaattaaaaaatagaattggtaattgctgtgaaccatatgtaagtgtatttaggacacacatatatttttttttgtaattgacaagatattgagttaagtcgagttcttcaattattatctcaagcgctcaaattgttatgcccaactctcagcttatttcattttaatattgacttatatcaagttatttattatgttgagcccttgacatattatctccacttgatatctaaatattttgaattaactccatatctcgacttattatctctagaccttgacttactgtctttggctctcagcttataatttttatttcaagctctcgactgat