lowQualScore : 1 1 1 111 1 11 3 1 11111111111111111111 1111111111 22222 1111111 1 11 11 1 1 1 11
lowQualScore : 8 2 33 6 2 0 0 33 2 333 8 1 1 2 3 22 2 2 2 2 2 7777 5 2 22 333 2 66 22 8 0 2 7 2 777777 777777 4444 7 2 2 33 0 33333333333333333333 7 2 777777 444 5555555555 6666 6 22222 1 99999 5555555 44 2 2 0 88 88 11 6 6 3 99 99 3 5 5 7 5 88 6
lowQualScore : . . .. . . . . .. . ... . . . . . .. . . . . . .... . . .. ... . .. .. . . . . . ...... ...... .... . . . .. . .................... . . ...... ... .......... .... . ..... . ..... ....... .. . . . .. .. .. . . . .. .. . . . . . .. .
lowQualScore : 0 4 22 5 2 6 4 11 2 777 1 7 5 6 7 99 1 1 1 1 1 7777 3 1 99 666 1 55 88 2 1 7 3 7 777777 777777 3333 0 5 5 44 7 99999999999999999999 5 7 777777 777 4444444444 1111 2 22222 2 33333 4444444 66 6 0 0 11 66 88 0 8 5 22 22 3 5 3 0 0 33 0
consensus : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCT--GGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATATAAGGCA--AATCAAGTTAA-AAAT-T-G-C-CA--T-ANAT-GCTTATATC--ACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCC--ACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGA-TCG-TTTTGGGAATAT------CA------CAGTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGTGAAAAATAGA-AAGG-AAATGA--AATATTTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCNAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGNCATATATATATATATTCTTAAAATTGGGGNATAATTTAAGAAAATGTGTCGTNAATGTTCAAAATAGCAAACTAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATTACTTTATTTCACTCTGGACATTTTCATTAAT--TTCACTTAGATTTTTT
Reference ( gi|2 ) : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTCGCGT-AACGCT--GGACGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGT---TTTCGATACAAATACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATTAAATAGGCTCATATAATGCA--AATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-CA--T-ACAT-GCTTATATC--ACACGAGACGCATCGATTGTATCAAAACATCC--ACATGGAAGGTCCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGA-T-G-TTTTGGGAATAT------CA------CAGTGCT--T-TGTCTTTAATACTAAAGTGAAAAATAGA-AAGG-AAATGA--AATATTTG---------T---------TTTATTTAAACTGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCTAGGGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATAACTTAATGTCATATATATATATATTCACAAAATTGGGACATAATTCAAGAAAATGTGTCGTAAATGTTCAAAATAGCAAACTAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTTTTCTTTTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACAACTGACCGTTTAAATTACTTTATTTCAATCTGGACATTTTCATTAAT--TTCACTTAAACTTTTTAA
gi|3 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCT--GGAGGGTGATGGATTTACT-AAAAGCC-TTTTTT--T-ATTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCTAGTATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTTATATAAGGCA--AATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-CA--T-ACAT-GCTTATATC--ACACAAGACATATCGATTTTATCAAAACGTCC--ACACGGACGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGA-TCGCTTTTGGAAATAT------CA------CTGTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGTGAAACATAGA-AATG-AAATGA--AATATTTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-A-------GCAACATG---TA----------T----TT-TTCCGGAGCGCAGGTCACGAATAGGTGACATGGTC----GTTAC-------TGGCTATCCTTCCGGGGCCGTAATGTGAAACTTAATGTCA-A-ATATATATATTCATAAAATTGGGGCATAATTTAAGAAAATGTGCCGTAAATGTTCAAAATAGCAAGCTAGT
gi|1 : TGGTGGAGCTTTTTGAAAGTTGCGT-AACGCT--GGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTTGTT-GTTGT---TTTCGATACAAACATGTGTCTGCTCAATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCAAATAAGGCA--AATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-CA--C-ACAT-GCTTATATC--ACACGAAACATATCGATTTTTTCAAAACATCC--ACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGATA-TCG-TTTTTGGAACAT------CG------CATTGCT--T-TGTCTTTAATGCTATAGTGAAAAATAGA-AAGG-AAATGA--AATATTTG---------T---------TTTATTTAAACGGTGAATTAA-AA------GCAACACG---CA----------T----TT-TGCCCGAGCGCATGTCACGAATAGGTGCCGTGGTC----GTTAA-------TGACTATCTTTTCGGTGCCGTAATGTATAACTTAATGTC----ATATATATATTCAAAAAATTGGGGCATAATTTAAGAAATTTTTTCGTAAATGGTCAAAATATAAAACTAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctattttttagtagttaataagttagacgttacggtcgaacaatcacaactgaccgtttaaattactttatttcactctggacattttcattaattttacttaaacttttttatg
gi|5 : TGGTGGGGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCT--GGAGAATGGTGGATTTACT-TTAAGCCATTTT-T--T-GTTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAACAGGCTCACATAAGACA--AATCAAGTTAA-AAA--T-G-C-CT--T-TAAT-GCTTATATC--ACACGAGA--CATCGATTTTATCAAAACATCC--ACACAGAAAATTCTCAATATGTTATGTATATATTGAGA-TCG-TTTTAGGAATAT------CA------TAGTGCT--T-TGTCTTTAATACTTTAGTGAAAAATAAA-GAGG-AAATGA--AGTAAATG---------T---------TTTATTTAAACGTCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TCCCAT-GCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGATC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCTGCAATGCAGGACTTAATGCCATATATATA-ATATTTTTAAAATTAAGGAATAATTTAAGAAAATGTGTCGTTAATGTTCAAAATAGCAAACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatcaaatattgggtatttaactataaaagctatttttagaagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacaactgaccgtttaagttactttatttcactctggacattttcattaatttcacttagatttttttatgcc
gi|6 : TGGTGGAGCTGTTTTAAAGTTGCGT-AACGCT--GGAGGATGGTGGATTAACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGA---TATCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATGACACTATGTTACGACGATGAATTAGGCTCATATAAGGCA--AATCAAGTTAA-AAAT-T-G-T-CA--T-AAAT-GCTTATATC--GCACGAGACATGTCGATTTTATCAAAACATCC--ACACGGAAAATTCTCAGTATGTTATGTATGAATTGAGA-TCG-TTTTGGGAATAT------CA------CAGAGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGTAAAAAATAGA-AAAG-AAATGA--AGTATTTG---------T---------TTTATTTAAGCGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CG----------T----TT-TTTCCATGCGCAGGTCACGAATAGGTCCCATGATC----GTTAC-------TTACCATCCTTCCGGTGCCATAATGTAGGACTTAATGACATATATAT-CATATTTTTAAAATTAGAGAATAATTgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctatttttagaagttaataagttagacgttaagatcgaacaatcacgactgaccgttgaaataactttatttcactcttga
gi|9 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCT--GGAGGATGGTGGATTTACT-AAAACCCATTTTTG--T-TTTGT---TTTCGATACAAACACGAGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAA-ATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATATAAGGCA--AATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-AT--T-ACAT-GCTAATATC--ACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCC--ACACGGCAG-TTTTCAATATGTTATGTATGTATTGAGA-TCG-TTTTGGGAATAT------CA------CAGTGCT--T-TGTCTCTAATACTATAGTGAAAATTGGA-AAGG-AAATGA--AATATTTT---------T---------TTTATTTAAACGACGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCACGAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCTTTGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAA
gi|8 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCT--GGAGGATGGTGGATTTACT-TAAAGCCATTTTTG--T-GTTGT---TT-CGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGACTCACATAAGACA--AATCAAGTTAA-AAAA-T-G-A-CT--T-AAAT-GCTTATATC--ACACGAGA--CAACGATTTTATCAAAACAACC--ACACGGAAAATTCTCAATGTGTTATGTATATATTGAGA-TCG-TTTAAGGAATAT------CA------TAGTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGTGAAAAATAGA-GAGG-AAATGA--AGTAAATG---------T---------TTTATTTAAACGTCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TCCCAT-GCGCAGGTAACGAATAGGTGCCATGATC-----TTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCTGTAATGTAGGACTTAATGCCAAATATAT
gi|12 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCT--GGAGGATGGTAGATTTACT-AAAAGCCATTT-------------------------------TGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTTAAACTATTACAATATGTTACGATGATGAAATAGGCTCATATAAGGCA--AATCCAATTAA-AAAT-T-G-C-CA--T-ACAT-GCTTATATC--ACACGAAACATATCGATTTTATCAAAACATAC--ACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGA-TCG-TTTTGGGAATAT------TA------CAGTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGTGAAAAATAGA-AAGG-AAAGGA--AATATTTG---------T---------TTTATCT-ATCGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CAT---------T----TT-TTTCCGAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----ATTAC-------TGACTATTCTTCCGGTGCCGTA
gi|21 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCAT-AACGCT--GGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--TTGTTGT---TTTAGATACAAA--CGTGTCTGCACGATGGCCAATATATTGTAAAACTATTACAATATGTTATGTTGATGAAATAGGCTCATATAAGGCA--AATCAAATAAA-AAAT-T-G-C-CA--T-ACAT-GCTTATATC--A
gi|22 : TGGTGGAGCTATTTTCAAGATGCAT-AAAGTA--TGACGAT---------------AA---ATATTTT--T-A--GT---TTTCGAAACAAACATATGTCTGCTAGGTTGTCACTGTAATGTACAGTAATTACAATATACTTCGACTTTTAAATAGATTCCTTT--TGCGTTAATCATATC-A-AATT-T-A-A-CA----ACAC-ATTCACATCGAACATGA
gi|16 : GGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCT--GGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTT-T--T-GTTGT---TTGCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGTCAATTTAATATAAAACTATTGCAATATGTTATGACGATTAAATAGGCTCATATAAGGCA--AAACAAATAAA-AAAA-T-G-C-CA--T-ACAT-GCTTATATC--ACACAAGACATATCGATTTTATCAAAACATCC--ACACGGAAGGTTCTCAATAAGTTATGTATGTATTGAGATT-G-TTTTGGAAATAT------TA------CAGTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGTGGAAAATAGA-AAGG-AAATGA--AATATTTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATA---C
gi|17 : GGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCT--GGA---TGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGC---TTTCGATACAAACGTGTGTCTGCTCAATTGCCAATAAAATGTAAAACTATTACAAAATGTTACGGAGATGAAATAGGCTCATATAAGGCA--AATCAAATTAA-AACT-T-G-C-CA--T-ACAT-GCTTATATC--ACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCC---TAGCGAAGG---------TGTTATGTATGTATTGAGA-TCG-TTTTGGGAATAT------CA------CGGTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGTGAAAAATAGG-AAGG-AAATGA--AATATTTG---------T---------TTAATTTAAACTGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----
gi|11 : GGTGGAGCTATTTGAAAAATGTGT-AACGCT--TAAGGGTGGTGGATTTTCTTAAAAGCCTGTTTTC--T-ATAGT---TTATGACACAGACAAGTTTCAGTCAGATTATCAAACTTATGTACATCTATTACAACATGTTGCGACGATGAAATATGCTCATATACGGTT--AATTAAGTTAA-AAAT-T-G-CGCA--TTAAAT-TCTTATATC--ATACAAGACATATTGCTTTCACCAAAAC---------------GTTCTTAATATGTGCTGTATGTGTTGAGC-TCG-TTTTGGGAATAT------CAAACACATAGTATT--A-TGTTTTCAATACTGTATTGAAAAATAGA-AAGG-AAACTA--ATTAT------------T---------TTTATTTCAGCGGTGAATTAA-TA------GCAACATGAAAAA----------TGGGGGT-TTCCCCAGTGCAGGTCATGAATTGGTGCCATAATA----GTTACGGCATGGTGTCTATCCTTC
gi|10 : GGTGAAGCTGGTTGATGGT-GCGT-AACGCTTGGGA--ATGGTGG---CATC-AA-------------------------TTTAAGACAAAT----GTCTGCTCGGTTGGCAATCTAGTGCAAATCTATATCAAAAGGTTGCGGTGATGAAACATATTCCTATAAGGTC--AATCAAATTGATCAAT-G-A-C-CAT-T-AAAT-TGTTAGATC--ACATGGGACATA---ATT-TATC-TAACCTCC--AGGCAGAAAGTTCTCAATATGTTCTG---GTA--GAGA-TCG-TTCT-GGAATATCGAGCACA------CAGTGTT--A-TGGCGCTAATGATGTAATGAAAAATATA-AAGG-AAAGGT--AA---------------T---------TTTACTTGAAATGCACATTAATAATAAACTACAAAATG---TG----------T----TG-TTTTATAGCACAGGTCACAAATAGGTGTCAC-GTCGATAGTTACAGA----TGTCTATCCTTCTTGTGCCGTAATATATG-------GT-ATATATATAT
gi|15 : GGTGGAGCTATTTAAGAAATGCGT-TACGCT--TGAGGATGGTTGATTTTCT-AAAAGC--TTTTTT--T-CCTATATTTTTCGATACAAACAAGTGTCTGCTCGATTACCTATCTAATTCAAAACTATTCCAATATGTTGCGACGATGCACTATACTTCTATAAGTTT--AATTAAGTTAA-ACAT-TGG-T-CAT-T-AAAT-TCTTACAT------------ATATC--CTTTATCAAAATATCC--AC--------------ATATGTTCTGTATGTGATGAGA-TCG-TTTAGGGAAAAT------tt
gi|19 : GTGGAGCTGTTTGAAAGATGCGT-AACGCT--GGAGGATGATTAATTTTTT-TAAAGCCATTTTTC--T-ATAGT---TTTCGATACAAACAAGTGTTTACTGGATTGCCAATCTAATGTAAAACTATCACAATATGTTACGACGATAAAATAGGCCCCTGTTAGGCA--AATCACGTT-A-AAAT-A-GAC-TA--TAAAAT-GCTTATATC--ACACGAGACATATCGCCTGTATCAAACTATCC--ACACGGAagacaagaaaataagtgtttttatttgaacggcgaattaaaagcaacatgcaaaatgtgttgttttttccagcactggtcacaaatcggtgccatgctagttacggcatgatttctatac
gi|4 : GAAGCTGTTTCAAAGTTGCGT-AACGCT--GGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAACC-TTTTGT--T-GTTGT---ATTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCA-TATAATGTACAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATGTAAGGCA--AATCAAGTTAA-AAAT-T-G-C-CA--T-AAAT-GCTTATATC--ACGCGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCC--ACACGGACTGTTCTCAATATGTTACGTATGTATTGAGG-TCG-TTTTGGGAATAT------CA------CAGTGCT--T-TGTCTTTATTACTATAGTG-AAAATAGA-AAGG-AAATGA--AGTATTTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCATGCGCAGGTCACGGATAGGCGCCATGTTT----GTTAT-------TTACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGTCATATATATATATTTTTA-AAATTTGGGA-ATAATTTAAGAAAATGTGTCGTTAATGTTCAAAATAGCAAACTAG
gi|7 : CTGTTTGAAACATGCATTAACACT--GGAAGAAGGTGCATTATCT-AAAGGCCATTTTTC--T-ATAGT---TTTTGATACAAACAAGTGTCCGCTGGATTGCCAATCTAATGTAAAACTATAACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCCTGTAAGGCA--AATCAAGATAA-AATA-G-G-C-CA--C-ATATCGCCTGTATC-------------------------AAAATATCCCAACA--GAAGGTACTCAATATGGTCTGTATGTGTTGGGA-TCG-TTTTGGAATTAT------CA------CAGTGCT--A-TGTCTTTAATACTGTACTGGATATT-----------CTGT--AATATCTATAATAGATTT---------TTTATTTAAACTGCGAATTAA-AA-------CAACATC---CA----------T----TTCTTCCATA--GCAGGTCACGAATAGGTACCATGATA-------AA-------TGACTA----TCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGGCATA-------AAGTTCTTTAAATAGGGGTATATTTTAAGAACATGTAAAGTCACTGTTCAAAATAGCAAACTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatccaatattgggtatatataactatataagctatgtttttagtagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacgactgaccgttgaaattactctatttcactctgga
gi|24 : GGATTTACT-AAAAGCCATGTTTT----GTTGT---TTT-GATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATA
gi|20 : GT---TTTCGGTACAAAAAAGTGTCTGCTGGATTGCCAGTCTAATGTAAAACTATTACAATATGCTACGACGATGAAATAGGCTCCTGTAAGGCA--AATCAAGTTAC-AGATAG-G-C-CATTT-A-AT-TCTTATATC--ACACGAGACATGTCGCCTGTATCAAAATATCC--AC--CGAAAGTTCTCAACATGTTTTGTTTGTGTT
gi|13 : tataCCGCTGGATTGCCAATCTAATGTAAAACTATAACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCCTGTAAGGCA--AATCAAGATAA-AA-----------------------TAGGCC--ACAT-------ATCGCCTGTATCAAAATATCCCAACA--GAAGGTACTCAATATGGTCTGTATGTGTTGGGA-TCG-TTTTGGAATTAT------CA------CAGTGCT--A-TGTCTTTAATACTGTACTGGATATTC-----------TGT--AATATCTA---------TAATAGATTTTTTATTTAAACTGCGAATTAA-AA-------CAACATC---CA----------T----TTCTTCCATAG--CAGGTCACGAATAGGTACCATGATA-------AA-------TGACTATCC----GGTGCCGTAATGTATGACTTAATGGCATA-------AAGTTCTTTAAATAGGGGTATATTTTAAGAACATGTAAAGTCACTGTTCAAAATAGCAAACT
gi|25 : ------CAGTGCTGTTATGTCTTTAATAGTGTAGTGGAAAATAGA-AAGGAAAATAAGTAATAGTAT---------T---------TTTATATAGGGTACGAAt
gi|15 : GGAAAATAGACAAGA-AAAT-A--AGTGTTT---------------------TTATTTGAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CAAAATGTGTTGT----TT-TTTCC-AGCACTGGTCACAAATCGGTGCCATGCTA----GTTAC-------
gi|18 : ggtggagctatttaagaaatgcgttacgcttgaggatggttgattttctaaaagctttttttcctatatttttcgatacaaacaagtgtctgctcgattacctatctaattcaaaactattccaatatgttgcgacgatgcactatacttctataagtttaattaagttaaacattggtcattaaattcttacatatatcctttatcaaaatatccacatatgttctgtatgtgatgagatcgtttagTATTTTTAAAATTAAGGAATAATTTAAGAAAATGTGTCGTTAATGTTCAAAATAGCAAACggcatgatttctatac
gi|14 : AAAATTGGGGCATACTTTAAGAAAATGTGTCGTAAATGTTCAAAATAGCAAACTAGTgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctatttgtagtagttaataagttagacgttaagatcgaacaatcacgaatgaccgttgaaattactttatttcactcttga
gi|1 : TGTTTTTCTTCTATC--AAATATTGGGTATTTA--ACTATAAAAGCTAT-TTTT-AGAAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACAACTGACCGTTTAAGTTACTTTATTTCACTCTGGACATTTTCATTAAT--TTCACTTAGATTTTTTgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctttccaatattgggtatataactataaaagctttttttagtagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacgactgaccgtttaaattactttatttcactccgaacattttcattaatttcacttttttcta
gi|4 : tggtggagctttttgaaagttgcgtaacgctggaggatggtggatttactaaaagccattttttgttgttgttttcgatacaaacatgtgtctgctcaattgccaatataatgtaaaactattacaatatgttacgacgatgaaataggctcaaataaggcaaatcaaattaaaaattgccacacatgcttatatcacacgaaacatatcgattttttcaaaacatccacacggaaggttctcaatatgttatgtatgtattgatatcgtttttggaacatcgcattgctttgtctttaatgctatagtgaaaaatagaaaggaaatgaaatatttgttttatttaaacggtgaattaaaagcaacacgcattttgcccgagcgcatgtcacgaataggtgccgtggtcgttaatgactatcttttcggtgccgtaatgtataacttaatgtcatatatatattcaaaaaattggggcataatttaagaaattttttcgtaaatggtcaaaatataaaactagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATATAACTATATAAGCTATGTTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATTACTCTATTTCACTCTGGAtatgcc
gi|5 : gaagctgtttcaaagttgcgtaacgctggaggatggtggatttactaaaaaccttttgttgttgtattcgatacaaacacgtgtctgctcgattgccatataatgtacaactattacaatatgttacgacgatgaaataggctcatgtaaggcaaatcaagttaaaaattgccataaatgcttatatcacgcgagacatatcgattttatcaaaacatccacacggactgttctcaatatgttacgtatgtattgaggtcgttttgggaatatcacagtgctttgtctttattactatagtgaaaatagaaaggaaatgaagtatttgttttatttaaacggcgaattaaaagcaacatgcatttttcccatgcgcaggtcacggataggcgccatgtttgttatttactatccttccggtgccgtaatgtatgacttaatgtcatatatatatatttttaaaatttgggaataatttaagaaaatgtgtcgttaatgttcaaaatagcaaactagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTTT-AGAAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGATCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATAACTTTATTTCACTCTTGA
gi|14 : tggtggggctgtttgaaagttgcgtaacgctggagaatggtggatttactttaagccattttttgttgttttcgatacaaacacgtgtctgctcgattgccaatataatgtaaaactattacaatatgttacgacgatgaaacaggctcacataagacaaatcaagttaaaaatgcctttaatgcttatatcacacgagacatcgattttatcaaaacatccacacagaaaattctcaatatgttatgtatatattgagatcgttttaggaatatcatagtgctttgtctttaatactttagtgaaaaataaagaggaaatgaagtaaatgttttatttaaacgtcgaattaaaagcaacatgcattttcccatgcgcaggtcacgaataggtgccatgatcgttactgactatccttccggtgctgcaatgcaggacttaatgccatatatataatatttttaaaattaaggaataatttaagaaaatgtgtcgttaatgttcaaaatagcaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTTTTCTTCTTTC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCT-T-TTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTTAAATTACTTTATTTCACTCCGAACATTTTCATTAAT--TTCACTT
gi|18 : aaaattggggcatactttaagaaaatgtgtcgtaaatgttcaaaatagcaaactagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTGT-AGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGATCGAACAATCACGAATGACCGTTGAAATTACTTTATTTCACTCTTGAttttcta
gi|23 : tatttttaaaattaaggaataatttaagaaaatgtgtcgttaatgttcaaaatagcaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGCTTTTCTTTTATCTTCAAT--TGAGTATACA--TCTATAGAAGCTATATTTGTAGTAGTTTATAAATTAGACATGAAGATCGAACAATCACTACTGACTGCTGAACTT-CGTTATTTCACTCTGGACATTTTTATTAATTATTTACTTAA
Alignments
lowQualScore : 111111 11111111111111111111 111111111111111 1111111 1 1 11 111
lowQualScore : 2 2 1 3333 333 2 1 2 444 2 2 8 2 1 0 2 777777 2 7777777 2 33 2 4444 0 2 2 2 33 33 2 00000000000000000000 2 777777 444 777777777777777 5 3 0 77777 4444444 3 1 44 5 55 1 1 99 99 3 5 88 222
lowQualScore : . . . .... ... . . . ... . . . . . . . ...... . ....... . .. . .... . . . . .. .. . .................... . ...... ... ............... . . . ..... ....... . . .. . .. . . .. .. . . .. ...
lowQualScore : 2 1 3 7777 555 4 0 1 222 1 1 4 1 0 5 5 666666 4 2222222 2 11 2 7777 6 2 2 2 11 11 2 22222222222222222222 5 222222 444 555555555555555 7 8 4 99999 3333333 2 0 11 8 22 0 0 22 22 3 5 33 888
consensus : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAGTTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ANATGCTTATATCACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCNAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGNCATATATATATATATTCTTAAAATTGGGGNATAATTTAAGAAAATGTGTCGTNAATGTTCAAAATAGCAAACTAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATTACTTTATTTCACTCTGGACATTTTCATTAAT--TTCACTTAGATTTTCT
Reference ( family-2015 ) : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAGTTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ANATGCTTATATCACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCNAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGNCATATATATATATATTCTTAAAATTGGGGNATAATTTAAGAAAATGTGTCGTNAATGTTCAAAATAGCAAACTAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATTACTTTATTTCACTCTGGACATTTTCATTAAT--TTCACTTAGATTTTTT
gi|1 : TGGTGGAGCTTTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTTGTT-GTTGT---TTTCGATACAAACATGTGTCTGCTCAATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCAAATAAGGCAAATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-CA-C-ACATGCTTATATCACACGAAACATATCGATTTTTTCAAAACATCCACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGATATCG-TTTTTGGAACAT------C-G-------CA-TTGCT--T-TGTCTTTAATGCTATAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGTGAATTAA-AA------GCAACACG---CA----------T----TT-TGCCCGAGCGCATGTCACGAATAGGTGCCGTGGTC----GTTAA-------TGACTATCTTTTCGGTGCCGTAATGTATAACTTAATGTC----ATATATATATTCAAAAAATTGGGGCATAATTTAAGAAATTTTTTCGTAAATGGTCAAAATATAAAACTAGT
gi|1 : TGTTTTTCTTCTATC--AAATATTGGGTATTTA--ACTATAAAAGCTAT-TTTT-AGAAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACAACTGACCGTTTAAGTTACTTTATTTCACTCTGGACATTTTCATTAAT--TTCACTTAGATTTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatcaaatattgggtatttaactataaaagctatttttagaagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacaactgaccgtttaagttactttatttcactctggacattttcattaatttcacttagatttttttatgcc
gi|10 : tggtggagctttttgaaagttgcgtaacgctggaggatggtggatttactaaaagccattttttgttgttgttttcgatacaaacatgtgtctgctcaattgccaatataatgtaaaactattacaatatgttacgacgatgaaataggctcaaataaggcaaatcaaattaaaaattgccacacatgcttatatcacacgaaacatatcgattttttcaaaacatccacacggaaggttctcaatatgttatgtatgtattgatatcgtttttggaacatcgcattgctttgtctttaatgctatagtgaaaaatagaaaggaaatgaaatatttgttttatttaaacggtgaattaaaagcaacacgcattttgcccgagcgcatgtcacgaataggtgccgtggtcgttaatgactatcttttcggtgccgtaatgtataacttaatgtcatatatatattcaaaaaattggggcataatttaagaaattttttcgtaaatggtcaaaatataaaactagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTGAAGCTGGTTGATGGT-GCGT-AACGCTTGGGAATGGTGG---CATC-AA-------------------------TTTAAGACAAA----TGTCTGCTCGGTTGGCAATCTAGTGCAAATCTATATCAAAAGGTTGCGGTGATGAAACATATTCCTATAAGGTCAATCAAATTGATCAAT-G-A-C-CATT-AAATTGTTAGATCACATGGGACATA---A-TTTATC-TAACCTCCAGGCAGAAAGTTCTCAATATGTTCTG---GTA--GAGATCG-TTCT-GGAATATCGAGCAC-A-------CA-GTGTT--A-TGGCGCTAATGATGTAAT----GAAAAATATA-AAGG-AA-AGG--T--AA----------------T---------TTTACTTGAAATGCACATTAATAATAAACTACAAAATG---TG----------T----TG-TTTTATAGCACAGGTCACAAATAGGTGTCAC-GTCGATAGTTACAGA----TGTCTATCCTTCTTGTGCCGTAATAT--------ATGGTATATATATATtatgcc
gi|11 : GGTGGAGCTATTTGAAAAATGTGT-AACGCTTAAGGGTGGTGGATTTTCTTAAAAGCCTGTTTTC--T-ATAGT---TTATGACACAGACAAGTTTCAGTCAGATTATCAAACTTATGTACATCTATTACAACATGTTGCGACGATGAAATATGCTCATATACGGTTAATTAAGTTAA-AAAT-T-G-CGCATT-AAATTCTTATATCATACAAGACATATTGCTTTCACCAAAAC-------------GTTCTTAATATGTGCTGTATGTGTTGAGCTCG-TTTTGGGAATATCAAACAC-A-------TA-GTATT--A-TGTTTTCAATACTGTATT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ACT--A--ATTAT-------------T---------TTTATTTCAGCGGTGAATTAA-TA------GCAACATGAAAAA----------TGGGGGT-TTCCCCAGTGCAGGTCATGAATTGGTGCCATAATA----GTTACGGCATGGTGTCTATCCTTCtt
gi|12 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTAGATTTACT-AAAAGCCATTTT-------------------------------GTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTTAAACTATTACAATATGTTACGATGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCCAATTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCACACGAAACATATCGATTTTATCAAAACATACACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------T-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-AGG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATCT-ATCGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CAT---------T----TT-TTTCCGAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----ATTAC-------TGACTATTCTTCCGGTGCCGTA
gi|13 : CCGCTGGATTGCCAATCTAATGTAAAACTATAACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCCTGTAAGGCAAATCAAGATAA-AA------------T-AG--GCC-------------ACATATCGCCTGTATCAAAATATCCCAACAGAAGGTACTCAATATGGTCTGTATGTGTTGGGATCG-TTTTGGAATTAT------C-A-------CA-GTGCT--A-TGTCTTTAATACTGTACT----GGATATTC------------TG--T--AATAT-CTA---------TAATAGATTTTTTATTTAAACTGCGAATTAA-AA-------CAACATC---CA----------T----TTCTTCCATAGC--AGGTCACGAATAGGTACCATGATA-------AA-------TGACTATCC----GGTGCCGTAATGTATGACTTAATGGCATAAA-------GTTCTTTAAATAGGGGTATATTTTAAGAACATGTAAAGTCACTGTTCAAAATAGCAAACT
gi|14 : AAAATTGGGGCATACTTTAAGAAAATGTGTCGTAAATGTTCAAAATAGCAAACTAGTt
gi|14 : TGTTTTTCTTCTTTC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCT-T-TTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTTAAATTACTTTATTTCACTCCGAACATTTTCATTAAT--TTCACTT---TTTTCTgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctttccaatattgggtatataactataaaagctttttttagtagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacgactgaccgtttaaattactttatttcactccgaacattttcattaatttcacttttttcta
gi|15 : aaaattggggcatactttaagaaaatgtgtcgtaaatgttcaaaatagcaaactagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTGGAGCTATTTAAGAAATGCGT-TACGCTTGAGGATGGTTGATTTTCT-AAAAGC--TTTTTT--T-CCTATATTTTTCGATACAAACAAGTGTCTGCTCGATTACCTATCTAATTCAAAACTATTCCAATATGTTGCGACGATGCACTATACTTCTATAAGTTTAATTAAGTTAA-ACAT-TGG-T-CATT-AAATTCTTACAT----------ATATC--CTTTATCAAAATATCCAC--------------ATATGTTCTGTATGTGATGAGATCG-TTTAGGGAAAATAGA---C-AAGAAAATAA-GTGTT--T-T-TATTTGA----ACGGC----G---AATTAA-AAGC-AACATGCAA--AATGTGTTG---------T---------TTTa
gi|15 : AATAT------CCA-------CATATGTT--C-TGTATGTGATGAGATCGTTTAGGGAAAATAGACAAGA-AA-AT---A--AGTGT-TT---------------------TTATTTGAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CAAAATGTGTTGT----TT-TTTCC-AGCACTGGTCACAAATCGGTGCCATGCTA----GTTAC-------ttccagcactggtcacaaatcggtgccatgctagttacggcatgatttctatac
gi|16 : ggtggagctatttaagaaatgcgttacgcttgaggatggttgattttctaaaagctttttttcctatatttttcgatacaaacaagtgtctgctcgattacctatctaattcaaaactattccaatatgttgcgacgatgcactatacttctataagtttaattaagttaaacattggtcattaaattcttacatatatcctttatcaaGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTT-T--T-GTTGT---TTGCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGTCAATTTAATATAAAACTATTGCAATATGTTATGACGATTAAATAGGCTCATATAAGGCAAAACAAATAAA-AAAA-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCACACAAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGAAGGTTCTCAATAAGTTATGTATGTATTGAGATTG-TTTTGGAAATAT------T-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GGAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATA---Cggcatgatttctatac
gi|17 : GGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGA---TGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGC---TTTCGATACAAACGTGTGTCTGCTCAATTGCCAATAAAATGTAAAACTATTACAAAATGTTACGGAGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAATTAA-AACT-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCC-TAGCGAAGG---------TGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CG-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGG-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTAATTTAAACTGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----
gi|18 : TATTTTTAAAATTAAGGAATAATTTAAGAAAATGTGTCGTTAATGTTCAAAATAGCAAAC
gi|18 : GTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTGT-AGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGATCGAACAATCACGAATGACCGTTGAAATTACTTTATTTCACTCTTGAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctatttgtagtagttaataagttagacgttaagatcgaacaatcacgaatgaccgttgaaattactttatttcactcttga
gi|19 : tatttttaaaattaaggaataatttaagaaaatgtgtcgttaatgttcaaaatagcaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTGGAGCTGTTTGAAAGATGCGT-AACGCTGGAGGATGATTAATTTTTT-TAAAGCCATTTTTC--T-ATAGT---TTTCGATACAAACAAGTGTTTACTGGATTGCCAATCTAATGTAAAACTATCACAATATGTTACGACGATAAAATAGGCCCCTGTTAGGCAAATCACGTT-A-AAAT-A-GAC-TA-TAAAATGCTTATATCACACGAGACATATCGCCTGTATCAAACTATCCACACGGA
gi|2 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTCGCGT-AACGCTGGACGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGT---TTTCGATACAAATACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATTAAATAGGCTCATATAATGCAAATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCACACGAGACGCATCGATTGTATCAAAACATCCACATGGAAGGTCCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGAT-G-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTAAAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACTGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCTAGGGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATAACTTAATGTCATATATATATATATTCACAAAATTGGGACATAATTCAAGAAAATGTGTCGTAAATGTTCAAAATAGCAAACTAGT
gi|20 : GT---TTTCGGTACAAAAAAGTGTCTGCTGGATTGCCAGTCTAATGTAAAACTATTACAATATGCTACGACGATGAAATAGGCTCCTGTAAGGCAAATCAAGTTAC-AGATAG-G-C-CATT-TAATTCTTATATCACACGAGACATGTCGCCTGTATCAAAATATCCAC-C-GAAAGTTCTCAACATGTTTTGTTTGTGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttttatccaatattgggtatataactataaaagctattttttagtagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacaactgaccgtttaaattactttatttcaatctggacattttcattaatttcacttaaactttttaa
gi|21 : tataTGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCAT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--TTGTTGT---TTTAGATACAAAC--GTGTCTGCACGATGGCCAATATATTGTAAAACTATTACAATATGTTATGTTGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAATAAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCA
gi|22 : TGGTGGAGCTATTTTCAAGATGCAT-AA------AGTATGACGA------T-AAA-----TATTTT--T-A--GT---TTTCGAAACAAACATATGTCTGCTAGGTTGTCACTGTAATGTACAGTAATTACAATATACTTCGACTTTTAAATAGATTC
gi|23 : GCTTTTCTTTTATCTTCAAT--TGAGTATACA--TCTATAGAAGCTATATTTGTAGTAGTTTATAAATTAGACATGAAGATCGAACAATCACTACTGACTGCTGAACTT-CGTTATTTCACTCTGGACATTTTTATTAATTATTTACTTActtttgcgttaatcatatcaaatttaacaacacattcacatcgaacatga
gi|24 : GGATTTACT-AAAAGCCATGTTTT----GTTGT---TTT-GATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATAaca
gi|25 : -------CA-GTGCTGTTATGTCTTTAATAGTGTAGT----GGAAAATAGA-AAGGAAA-ATA--AGTAATAG-TAT---------T---------TTTATATA
gi|3 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGGTGATGGATTTACT-AAAAGCC-TTTTTT--T-ATTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCTAGTATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTTATATAAGGCAAATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCACACAAGACATATCGATTTTATCAAAACGTCCACACGGACGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCGCTTTTGGAAATAT------C-A-------CT-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAACATAGA-AATG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATT-A-AA------GCAACATG---TA----------T----TT-TTCCGGAGCGCAGGTCACGAATAGGTGACATGGTC----GTTAC-------TGGCTATCCTTCCGGGGCCGTAATGTGAAACTTAATGTCA-A-ATATATATATTCATAAAATTGGGGCATAATTTAAGAAAATGTGCCGTAAATGTTCAAAATAGCAAGCTAGTgggtacgaa
gi|4 : GAAGCTGTTTCAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAACC-TTTTGT--T-GTTGT---ATTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCA-TATAATGTACAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATGTAAGGCAAATCAAGTTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-AAATGCTTATATCACGCGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGACTGTTCTCAATATGTTACGTATGTATTGAGGTCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTATTACTATAGT----G-AAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AGTAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCATGCGCAGGTCACGGATAGGCGCCATGTTT----GTTAT-------TTACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGTC--ATATATATATATTTTTAAAATTTGGGAATAATTTAAGAAAATGTGTCGTTAATGTTCAAAATAGCAAACTAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctattttttagtagttaataagttagacgttacggtcgaacaatcacaactgaccgtttaaattactttatttcactctggacattttcattaattttacttaaacttttttatg
gi|4 : TGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATATAACTATATAAGCTATGTTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATTACTCTATTTCACTCTGGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatccaatattgggtatatataactatataagctatgtttttagtagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacgactgaccgttgaaattactctatttcactctgga
gi|5 : gaagctgtttcaaagttgcgtaacgctggaggatggtggatttactaaaaaccttttgttgttgtattcgatacaaacacgtgtctgctcgattgccatataatgtacaactattacaatatgttacgacgatgaaataggctcatgtaaggcaaatcaagttaaaaattgccataaatgcttatatcacgcgagacatatcgattttatcaaaacatccacacggactgttctcaatatgttacgtatgtattgaggtcgttttgggaatatcacagtgctttgtctttattactatagtgaaaatagaaaggaaatgaagtatttgttttatttaaacggcgaattaaaagcaacatgcatttttcccatgcgcaggtcacggataggcgccatgtttgttatttactatccttccggtgccgtaatgtatgacttaatgtcatatatatatatttttaaaatttgggaataatttaagaaaatgtgtcgttaatgttcaaaatagcaaactagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGGTGGGGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGAATGGTGGATTTACT-TTAAGCCATTTTTT----GTTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAACAGGCTCACATAAGACAAATCAAGTTAA-AAAT---G-C-CT-T-TAATGCTTATATCACACGAGACAT--CGATTTTATCAAAACATCCACACAGAAAATTCTCAATATGTTATGTATATATTGAGATCG-TTTTAGGAATAT------C-A-------TA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTTTAGT----GAAAAATAAA-GAGG-AA-ATG--A--AGTAA-ATG---------T---------TTTATTTAAACGTCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA---------------TT-TTCCCATGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGATC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCTGCAATGCAGGACTTAATGCCATATATATA-ATATTTTTAAAATTAAGGAATAATTTAAGAAAATGTGTCGTTAATGTTCAAAATAGCAAAC
gi|5 : TGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTTT-AGAAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGATCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATAACTTTATTTCACTCTTGAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctatttttagaagttaataagttagacgttaagatcgaacaatcacgactgaccgttgaaataactttatttcactcttga
gi|6 : tggtggggctgtttgaaagttgcgtaacgctggagaatggtggatttactttaagccattttttgttgttttcgatacaaacacgtgtctgctcgattgccaatataatgtaaaactattacaatatgttacgacgatgaaacaggctcacataagacaaatcaagttaaaaatgcctttaatgcttatatcacacgagacatcgattttatcaaaacatccacacagaaaattctcaatatgttatgtatatattgagatcgttttaggaatatcatagtgctttgtctttaatactttagtgaaaaataaagaggaaatgaagtaaatgttttatttaaacgtcgaattaaaagcaacatgcattttcccatgcgcaggtcacgaataggtgccatgatcgttactgactatccttccggtgctgcaatgcaggacttaatgccatatatataatatttttaaaattaaggaataatttaagaaaatgtgtcgttaatgttcaaaatagcaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGGTGGAGCTGTTTTAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTAACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGA---TATCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATGACACTATGTTACGACGATGAATTAGGCTCATATAAGGCAAATCAAGTTAA-AAAT-T-G-T-CA-T-AAATGCTTATATCGCACGAGACATGTCGATTTTATCAAAACATCCACACGGAAAATTCTCAGTATGTTATGTATGAATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GAGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----AAAAAATAGA-AAAG-AA-ATG--A--AGTAT-TTG---------T---------TTTATTTAAGCGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CG----------T----TT-TTTCCATGCGCAGGTCACGAATAGGTCCCATGATC----GTTAC-------TTACCATCCTTCCGGTGCCATAATGTAGGACTTAATGACATATATAT-CATATTTTTAAAATTAGAGAATAATT
gi|7 : CTGTTTGAAACATGCATTAACACTGGAAGAAGGTGCATTATCT-AAAGGCCATTTTTC--T-ATAGT---TTTTGATACAAACAAGTGTCCGCTGGATTGCCAATCTAATGTAAAACTATAACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCCTGTAAGGCAAATCAAGATAA-A-----------A-T-AG--GCC-------------ACATATCGCCTGTATCAAAATATCCCAACAGAAGGTACTCAATATGGTCTGTATGTGTTGGGATCG-TTTTGGAATTAT------C-A-------CA-GTGCT--A-TGTCTTTAATACTGTACT----GGATATT------------CTG--T--AATAT-CTATAATAGATTT---------TTTATTTAAACTGCGAATTAA-AA-------CAACATC---CA----------T----TTCTTCCATA--GCAGGTCACGAATAGGTACCATGATA-------AA-------TGACTA----TCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGGCATA-------AAGTTCTTTAAATAGGGGTATATTTTAAGAACATGTAAAGTCACTGTTCAAAATAGCAAACT
gi|8 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-TAAAGCCATTTTTG--T-GTTGT---TT-CGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGACTCACATAAGACAAATCAAGTTAA-AAAA-T-G-A-CT-T-AAATGCTTATATCACACGAGACA-A-CGATTTTATCAAAACAACCACACGGAAAATTCTCAATGTGTTATGTATATATTGAGATCG-TTTAAGGAATAT------C-A-------TA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGA-GAGG-AA-ATG--A--AGTAA-ATG---------T---------TTTATTTAAACGTCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA---------------TT-TTCCCATGCGCAGGTAACGAATAGGTGCCATGATC-----TTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCTGTAATGTAGGACTTAATGCCAAATATAT
gi|9 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAACCCATTTTTG--T-TTTGT---TTTCGATACAAACACGAGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAA-ATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-AT-T-ACATGCTAATATCACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGCAG-TTTTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTCTAATACTATAGT----GAAAATTGGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTT---------T---------TTTATTTAAACGACGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCACGAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCTTTGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAA
Alignments
lowQualScore : 111111 11111111111111111111 111111111111111 1111111 1 1 11 111
lowQualScore : 2 2 1 3333 333 2 1 2 444 2 2 8 2 1 0 2 777777 2 7777777 2 33 2 4444 0 2 2 2 33 33 2 00000000000000000000 2 777777 444 777777777777777 5 3 0 77777 4444444 3 1 44 5 55 1 1 99 99 3 5 88 222
lowQualScore : . . . .... ... . . . ... . . . . . . . ...... . ....... . .. . .... . . . . .. .. . .................... . ...... ... ............... . . . ..... ....... . . .. . .. . . .. .. . . .. ...
lowQualScore : 2 1 3 7777 555 4 0 1 222 1 1 4 1 0 5 5 666666 4 2222222 2 11 2 7777 6 2 2 2 11 11 2 22222222222222222222 5 222222 444 555555555555555 7 8 4 99999 3333333 2 0 11 8 22 0 0 22 22 3 5 33 888
consensus : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAGTTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ANATGCTTATATCACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCNAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGNCATATATATATATATTCTTAAAATTGGGGNATAATTTAAGAAAATGTGTCGTNAATGTTCAAAATAGCAAACTAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATTACTTTATTTCACTCTGGACATTTTCATTAAT--TTCACTTAGATTTTCT
Reference ( family-2015 ) : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAGTTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ANATGCTTATATCACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCNAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGNCATATATATATATATTCTTAAAATTGGGGNATAATTTAAGAAAATGTGTCGTNAATGTTCAAAATAGCAAACTAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATTACTTTATTTCACTCTGGACATTTTCATTAAT--TTCACTTAGATTTTCT
gi|1 : TGGTGGAGCTTTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTTGTT-GTTGT---TTTCGATACAAACATGTGTCTGCTCAATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCAAATAAGGCAAATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-CA-C-ACATGCTTATATCACACGAAACATATCGATTTTTTCAAAACATCCACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGATATCG-TTTTTGGAACAT------C-G-------CA-TTGCT--T-TGTCTTTAATGCTATAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGTGAATTAA-AA------GCAACACG---CA----------T----TT-TGCCCGAGCGCATGTCACGAATAGGTGCCGTGGTC----GTTAA-------TGACTATCTTTTCGGTGCCGTAATGTATAACTTAATGTC----ATATATATATTCAAAAAATTGGGGCATAATTTAAGAAATTTTTTCGTAAATGGTCAAAATATAAAACTAGT
gi|1 : TGTTTTTCTTCTATC--AAATATTGGGTATTTA--ACTATAAAAGCTAT-TTTT-AGAAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACAACTGACCGTTTAAGTTACTTTATTTCACTCTGGACATTTTCATTAAT--TTCACTTAGATTTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatcaaatattgggtatttaactataaaagctatttttagaagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacaactgaccgtttaagttactttatttcactctggacattttcattaatttcacttagatttttttatgcc
gi|10 : tggtggagctttttgaaagttgcgtaacgctggaggatggtggatttactaaaagccattttttgttgttgttttcgatacaaacatgtgtctgctcaattgccaatataatgtaaaactattacaatatgttacgacgatgaaataggctcaaataaggcaaatcaaattaaaaattgccacacatgcttatatcacacgaaacatatcgattttttcaaaacatccacacggaaggttctcaatatgttatgtatgtattgatatcgtttttggaacatcgcattgctttgtctttaatgctatagtgaaaaatagaaaggaaatgaaatatttgttttatttaaacggtgaattaaaagcaacacgcattttgcccgagcgcatgtcacgaataggtgccgtggtcgttaatgactatcttttcggtgccgtaatgtataacttaatgtcatatatatattcaaaaaattggggcataatttaagaaattttttcgtaaatggtcaaaatataaaactagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTGAAGCTGGTTGATGGT-GCGT-AACGCTTGGGAATGGTGG---CATC-AA-------------------------TTTAAGACAAA----TGTCTGCTCGGTTGGCAATCTAGTGCAAATCTATATCAAAAGGTTGCGGTGATGAAACATATTCCTATAAGGTCAATCAAATTGATCAAT-G-A-C-CATT-AAATTGTTAGATCACATGGGACATA---A-TTTATC-TAACCTCCAGGCAGAAAGTTCTCAATATGTTCTG---GTA--GAGATCG-TTCT-GGAATATCGAGCAC-A-------CA-GTGTT--A-TGGCGCTAATGATGTAAT----GAAAAATATA-AAGG-AA-AGG--T--AA----------------T---------TTTACTTGAAATGCACATTAATAATAAACTACAAAATG---TG----------T----TG-TTTTATAGCACAGGTCACAAATAGGTGTCAC-GTCGATAGTTACAGA----TGTCTATCCTTCTTGTGCCGTAATAT--------ATGGTATATATATATtatgcc
gi|11 : GGTGGAGCTATTTGAAAAATGTGT-AACGCTTAAGGGTGGTGGATTTTCTTAAAAGCCTGTTTTC--T-ATAGT---TTATGACACAGACAAGTTTCAGTCAGATTATCAAACTTATGTACATCTATTACAACATGTTGCGACGATGAAATATGCTCATATACGGTTAATTAAGTTAA-AAAT-T-G-CGCATT-AAATTCTTATATCATACAAGACATATTGCTTTCACCAAAAC-------------GTTCTTAATATGTGCTGTATGTGTTGAGCTCG-TTTTGGGAATATCAAACAC-A-------TA-GTATT--A-TGTTTTCAATACTGTATT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ACT--A--ATTAT-------------T---------TTTATTTCAGCGGTGAATTAA-TA------GCAACATGAAAAA----------TGGGGGT-TTCCCCAGTGCAGGTCATGAATTGGTGCCATAATA----GTTACGGCATGGTGTCTATCCTTCtt
gi|12 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTAGATTTACT-AAAAGCCATTTT-------------------------------GTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTTAAACTATTACAATATGTTACGATGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCCAATTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCACACGAAACATATCGATTTTATCAAAACATACACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------T-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-AGG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATCT-ATCGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CAT---------T----TT-TTTCCGAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----ATTAC-------TGACTATTCTTCCGGTGCCGTA
gi|13 : CCGCTGGATTGCCAATCTAATGTAAAACTATAACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCCTGTAAGGCAAATCAAGATAA-AA------------T-AG--GCC-------------ACATATCGCCTGTATCAAAATATCCCAACAGAAGGTACTCAATATGGTCTGTATGTGTTGGGATCG-TTTTGGAATTAT------C-A-------CA-GTGCT--A-TGTCTTTAATACTGTACT----GGATATTC------------TG--T--AATAT-CTA---------TAATAGATTTTTTATTTAAACTGCGAATTAA-AA-------CAACATC---CA----------T----TTCTTCCATAGC--AGGTCACGAATAGGTACCATGATA-------AA-------TGACTATCC----GGTGCCGTAATGTATGACTTAATGGCATAAA-------GTTCTTTAAATAGGGGTATATTTTAAGAACATGTAAAGTCACTGTTCAAAATAGCAAACT
gi|14 : AAAATTGGGGCATACTTTAAGAAAATGTGTCGTAAATGTTCAAAATAGCAAACTAGTt
gi|14 : TGTTTTTCTTCTTTC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCT-T-TTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTTAAATTACTTTATTTCACTCCGAACATTTTCATTAAT--TTCACTT---TTTTCTgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctttccaatattgggtatataactataaaagctttttttagtagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacgactgaccgtttaaattactttatttcactccgaacattttcattaatttcacttttttcta
gi|15 : aaaattggggcatactttaagaaaatgtgtcgtaaatgttcaaaatagcaaactagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTGGAGCTATTTAAGAAATGCGT-TACGCTTGAGGATGGTTGATTTTCT-AAAAGC--TTTTTT--T-CCTATATTTTTCGATACAAACAAGTGTCTGCTCGATTACCTATCTAATTCAAAACTATTCCAATATGTTGCGACGATGCACTATACTTCTATAAGTTTAATTAAGTTAA-ACAT-TGG-T-CATT-AAATTCTTACAT----------ATATC--CTTTATCAAAATATCCAC--------------ATATGTTCTGTATGTGATGAGATCG-TTTAGGGAAAATAGA---C-AAGAAAATAA-GTGTT--T-T-TATTTGA----ACGGC----G---AATTAA-AAGC-AACATGCAA--AATGTGTTG---------T---------TTTa
gi|15 : AATAT------CCA-------CATATGTT--C-TGTATGTGATGAGATCGTTTAGGGAAAATAGACAAGA-AA-AT---A--AGTGT-TT---------------------TTATTTGAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CAAAATGTGTTGT----TT-TTTCC-AGCACTGGTCACAAATCGGTGCCATGCTA----GTTAC-------ttccagcactggtcacaaatcggtgccatgctagttacggcatgatttctatac
gi|16 : ggtggagctatttaagaaatgcgttacgcttgaggatggttgattttctaaaagctttttttcctatatttttcgatacaaacaagtgtctgctcgattacctatctaattcaaaactattccaatatgttgcgacgatgcactatacttctataagtttaattaagttaaacattggtcattaaattcttacatatatcctttatcaaGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTT-T--T-GTTGT---TTGCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGTCAATTTAATATAAAACTATTGCAATATGTTATGACGATTAAATAGGCTCATATAAGGCAAAACAAATAAA-AAAA-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCACACAAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGAAGGTTCTCAATAAGTTATGTATGTATTGAGATTG-TTTTGGAAATAT------T-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GGAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATA---Cggcatgatttctatac
gi|17 : GGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGA---TGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGC---TTTCGATACAAACGTGTGTCTGCTCAATTGCCAATAAAATGTAAAACTATTACAAAATGTTACGGAGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAATTAA-AACT-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCC-TAGCGAAGG---------TGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CG-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGG-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTAATTTAAACTGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----
gi|18 : TATTTTTAAAATTAAGGAATAATTTAAGAAAATGTGTCGTTAATGTTCAAAATAGCAAAC
gi|18 : GTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTGT-AGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGATCGAACAATCACGAATGACCGTTGAAATTACTTTATTTCACTCTTGAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctatttgtagtagttaataagttagacgttaagatcgaacaatcacgaatgaccgttgaaattactttatttcactcttga
gi|19 : tatttttaaaattaaggaataatttaagaaaatgtgtcgttaatgttcaaaatagcaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTGGAGCTGTTTGAAAGATGCGT-AACGCTGGAGGATGATTAATTTTTT-TAAAGCCATTTTTC--T-ATAGT---TTTCGATACAAACAAGTGTTTACTGGATTGCCAATCTAATGTAAAACTATCACAATATGTTACGACGATAAAATAGGCCCCTGTTAGGCAAATCACGTT-A-AAAT-A-GAC-TA-TAAAATGCTTATATCACACGAGACATATCGCCTGTATCAAACTATCCACACGGA
gi|2 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTCGCGT-AACGCTGGACGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGT---TTTCGATACAAATACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATTAAATAGGCTCATATAATGCAAATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCACACGAGACGCATCGATTGTATCAAAACATCCACATGGAAGGTCCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGAT-G-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTAAAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACTGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCTAGGGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATAACTTAATGTCATATATATATATATTCACAAAATTGGGACATAATTCAAGAAAATGTGTCGTAAATGTTCAAAATAGCAAACTAGT
gi|20 : GT---TTTCGGTACAAAAAAGTGTCTGCTGGATTGCCAGTCTAATGTAAAACTATTACAATATGCTACGACGATGAAATAGGCTCCTGTAAGGCAAATCAAGTTAC-AGATAG-G-C-CATT-TAATTCTTATATCACACGAGACATGTCGCCTGTATCAAAATATCCAC-C-GAAAGTTCTCAACATGTTTTGTTTGTGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttttatccaatattgggtatataactataaaagctattttttagtagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacaactgaccgtttaaattactttatttcaatctggacattttcattaatttcacttaaactttttaa
gi|21 : tataTGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCAT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--TTGTTGT---TTTAGATACAAAC--GTGTCTGCACGATGGCCAATATATTGTAAAACTATTACAATATGTTATGTTGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAATAAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCA
gi|22 : TGGTGGAGCTATTTTCAAGATGCAT-AA------AGTATGACGA------T-AAA-----TATTTT--T-A--GT---TTTCGAAACAAACATATGTCTGCTAGGTTGTCACTGTAATGTACAGTAATTACAATATACTTCGACTTTTAAATAGATTC
gi|23 : GCTTTTCTTTTATCTTCAAT--TGAGTATACA--TCTATAGAAGCTATATTTGTAGTAGTTTATAAATTAGACATGAAGATCGAACAATCACTACTGACTGCTGAACTT-CGTTATTTCACTCTGGACATTTTTATTAATTATTTACTTActtttgcgttaatcatatcaaatttaacaacacattcacatcgaacatga
gi|24 : GGATTTACT-AAAAGCCATGTTTT----GTTGT---TTT-GATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATAaca
gi|25 : -------CA-GTGCTGTTATGTCTTTAATAGTGTAGT----GGAAAATAGA-AAGGAAA-ATA--AGTAATAG-TAT---------T---------TTTATATA
gi|3 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGGTGATGGATTTACT-AAAAGCC-TTTTTT--T-ATTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCTAGTATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTTATATAAGGCAAATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCACACAAGACATATCGATTTTATCAAAACGTCCACACGGACGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCGCTTTTGGAAATAT------C-A-------CT-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAACATAGA-AATG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATT-A-AA------GCAACATG---TA----------T----TT-TTCCGGAGCGCAGGTCACGAATAGGTGACATGGTC----GTTAC-------TGGCTATCCTTCCGGGGCCGTAATGTGAAACTTAATGTCA-A-ATATATATATTCATAAAATTGGGGCATAATTTAAGAAAATGTGCCGTAAATGTTCAAAATAGCAAGCTAGTgggtacgaa
gi|4 : GAAGCTGTTTCAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAACC-TTTTGT--T-GTTGT---ATTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCA-TATAATGTACAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATGTAAGGCAAATCAAGTTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-AAATGCTTATATCACGCGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGACTGTTCTCAATATGTTACGTATGTATTGAGGTCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTATTACTATAGT----G-AAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AGTAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCATGCGCAGGTCACGGATAGGCGCCATGTTT----GTTAT-------TTACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGTC--ATATATATATATTTTTAAAATTTGGGAATAATTTAAGAAAATGTGTCGTTAATGTTCAAAATAGCAAACTAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctattttttagtagttaataagttagacgttacggtcgaacaatcacaactgaccgtttaaattactttatttcactctggacattttcattaattttacttaaacttttttatg
gi|4 : TGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATATAACTATATAAGCTATGTTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATTACTCTATTTCACTCTGGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatccaatattgggtatatataactatataagctatgtttttagtagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacgactgaccgttgaaattactctatttcactctgga
gi|5 : gaagctgtttcaaagttgcgtaacgctggaggatggtggatttactaaaaaccttttgttgttgtattcgatacaaacacgtgtctgctcgattgccatataatgtacaactattacaatatgttacgacgatgaaataggctcatgtaaggcaaatcaagttaaaaattgccataaatgcttatatcacgcgagacatatcgattttatcaaaacatccacacggactgttctcaatatgttacgtatgtattgaggtcgttttgggaatatcacagtgctttgtctttattactatagtgaaaatagaaaggaaatgaagtatttgttttatttaaacggcgaattaaaagcaacatgcatttttcccatgcgcaggtcacggataggcgccatgtttgttatttactatccttccggtgccgtaatgtatgacttaatgtcatatatatatatttttaaaatttgggaataatttaagaaaatgtgtcgttaatgttcaaaatagcaaactagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGGTGGGGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGAATGGTGGATTTACT-TTAAGCCATTTTTT----GTTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAACAGGCTCACATAAGACAAATCAAGTTAA-AAAT---G-C-CT-T-TAATGCTTATATCACACGAGACAT--CGATTTTATCAAAACATCCACACAGAAAATTCTCAATATGTTATGTATATATTGAGATCG-TTTTAGGAATAT------C-A-------TA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTTTAGT----GAAAAATAAA-GAGG-AA-ATG--A--AGTAA-ATG---------T---------TTTATTTAAACGTCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA---------------TT-TTCCCATGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGATC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCTGCAATGCAGGACTTAATGCCATATATATA-ATATTTTTAAAATTAAGGAATAATTTAAGAAAATGTGTCGTTAATGTTCAAAATAGCAAAC
gi|5 : TGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTTT-AGAAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGATCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATAACTTTATTTCACTCTTGAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctatttttagaagttaataagttagacgttaagatcgaacaatcacgactgaccgttgaaataactttatttcactcttga
gi|6 : tggtggggctgtttgaaagttgcgtaacgctggagaatggtggatttactttaagccattttttgttgttttcgatacaaacacgtgtctgctcgattgccaatataatgtaaaactattacaatatgttacgacgatgaaacaggctcacataagacaaatcaagttaaaaatgcctttaatgcttatatcacacgagacatcgattttatcaaaacatccacacagaaaattctcaatatgttatgtatatattgagatcgttttaggaatatcatagtgctttgtctttaatactttagtgaaaaataaagaggaaatgaagtaaatgttttatttaaacgtcgaattaaaagcaacatgcattttcccatgcgcaggtcacgaataggtgccatgatcgttactgactatccttccggtgctgcaatgcaggacttaatgccatatatataatatttttaaaattaaggaataatttaagaaaatgtgtcgttaatgttcaaaatagcaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGGTGGAGCTGTTTTAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTAACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGA---TATCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATGACACTATGTTACGACGATGAATTAGGCTCATATAAGGCAAATCAAGTTAA-AAAT-T-G-T-CA-T-AAATGCTTATATCGCACGAGACATGTCGATTTTATCAAAACATCCACACGGAAAATTCTCAGTATGTTATGTATGAATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GAGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----AAAAAATAGA-AAAG-AA-ATG--A--AGTAT-TTG---------T---------TTTATTTAAGCGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CG----------T----TT-TTTCCATGCGCAGGTCACGAATAGGTCCCATGATC----GTTAC-------TTACCATCCTTCCGGTGCCATAATGTAGGACTTAATGACATATATAT-CATATTTTTAAAATTAGAGAATAATT
gi|7 : CTGTTTGAAACATGCATTAACACTGGAAGAAGGTGCATTATCT-AAAGGCCATTTTTC--T-ATAGT---TTTTGATACAAACAAGTGTCCGCTGGATTGCCAATCTAATGTAAAACTATAACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCCTGTAAGGCAAATCAAGATAA-A-----------A-T-AG--GCC-------------ACATATCGCCTGTATCAAAATATCCCAACAGAAGGTACTCAATATGGTCTGTATGTGTTGGGATCG-TTTTGGAATTAT------C-A-------CA-GTGCT--A-TGTCTTTAATACTGTACT----GGATATT------------CTG--T--AATAT-CTATAATAGATTT---------TTTATTTAAACTGCGAATTAA-AA-------CAACATC---CA----------T----TTCTTCCATA--GCAGGTCACGAATAGGTACCATGATA-------AA-------TGACTA----TCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGGCATA-------AAGTTCTTTAAATAGGGGTATATTTTAAGAACATGTAAAGTCACTGTTCAAAATAGCAAACT
gi|8 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-TAAAGCCATTTTTG--T-GTTGT---TT-CGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGACTCACATAAGACAAATCAAGTTAA-AAAA-T-G-A-CT-T-AAATGCTTATATCACACGAGACA-A-CGATTTTATCAAAACAACCACACGGAAAATTCTCAATGTGTTATGTATATATTGAGATCG-TTTAAGGAATAT------C-A-------TA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGA-GAGG-AA-ATG--A--AGTAA-ATG---------T---------TTTATTTAAACGTCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA---------------TT-TTCCCATGCGCAGGTAACGAATAGGTGCCATGATC-----TTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCTGTAATGTAGGACTTAATGCCAAATATAT
gi|9 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAACCCATTTTTG--T-TTTGT---TTTCGATACAAACACGAGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAA-ATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-AT-T-ACATGCTAATATCACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGCAG-TTTTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTCTAATACTATAGT----GAAAATTGGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTT---------T---------TTTATTTAAACGACGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCACGAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCTTTGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAA
blockSeqs : T T T TT ATT A T TG A G T A A C CGAGCA C AGAAAAT T GT A TTAG C A C CA GT G ATAATAGATTT T TAAACT AAA AAATGTGTTGT C T GATAG GGCATGG T G AT T AT T C TT TA A T TA .
blockSeqs : . . A T . A . AG . . T . A . CAAACA . . . . . . . . . . . . ATAATAGATTT . . . TGGGG C C G AGA T G AT A AT C A . . G T .
blockSeqs : . . A T . C . G . . T . C . AGA . . . . . . . . . . . . GT . . . TT . G A . A T AT T AT A T . . . T
blockSeqs : . . A T . T . T . . T . G . . . . . . . . . . . . . . GT . . . T . T G . T T AT T AT C A . . . .
blockSeqs : . . A T . A . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . GT . . . T . T G . G T AT T A C A . . . .
blockSeqs : . . A T . C . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . GT . . . T . G G . G C AT T C A T
blockSeqs : . . A T . A . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . GT . . . T . A G . T A AA T . A T
blockSeqs : . . A T . T . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TT . . . T . A G . G G A . . A C
blockSeqs : . . A T . C . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . GT . . . T . A G . . C . . T
blockSeqs : . . A T . C . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . GT . . . T . T G .
blockSeqs : . . A T . C . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . GT . . . T . A . .
blockSeqs : . . A T . C . T . . . . C . . . . . . . . . . . . . . GT . . . T . G . .
blockSeqs : . . A T . C . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . A . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . TT . . . .
blockSeqs : . . . . . C . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . C
blockSeqs : . .
blockSeqCons : T*** AT
originalCons : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAGTTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ANATGCTTATATCACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCNAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGNCATATATATATATATTCTTAAAATTGGGGNATAATTTAAGAAAATGTGTCGTNAATGTTCAAAATAGCAAACTAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATTACTTTATTTCACTCTGGACATTTTCATTAAT--TTCACTTAGATTTTCT
finalCons : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTTT---GTTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAGTTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ANATGCTTATATCACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCNAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGNCATATATATATATATTCTTAAAATTGGGGNATAATTTAAGAAAATGTGTCGTNAATGTTCAAAATAGCAAACTAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATTACTTTATTTCACTCTGGACATTTTCATTAAT--TTCACTTAGATTTTCT
Alignments
lowQualScore : 111111 11111111111111111111 111111111111111 1111111 1 1 11 111
lowQualScore : 2 2 1 3333 333 2 1 2 444 2 2 8 2 1 0 2 777777 2 7777777 2 33 2 4444 0 2 2 2 33 33 2 00000000000000000000 2 777777 444 777777777777777 5 3 0 77777 4444444 3 1 44 5 55 1 1 99 99 3 5 88 222
lowQualScore : . . . .... ... . . . ... . . . . . . . ...... . ....... . .. . .... . . . . .. .. . .................... . ...... ... ............... . . . ..... ....... . . .. . .. . . .. .. . . .. ...
lowQualScore : 2 1 3 7777 555 4 0 1 222 1 1 4 1 0 5 5 666666 4 2222222 2 11 2 7777 6 2 2 2 11 11 2 22222222222222222222 5 222222 444 555555555555555 7 8 4 99999 3333333 2 0 11 8 22 0 0 22 22 3 5 33 888
consensus : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAGTTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ANATGCTTATATCACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCNAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGNCATATATATATATATTCTTAAAATTGGGGNATAATTTAAGAAAATGTGTCGTNAATGTTCAAAATAGCAAACTAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATTACTTTATTTCACTCTGGACATTTTCATTAAT--TTCACTTAGATTTTCT
Reference ( family-2015 ) : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAGTTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ANATGCTTATATCACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCNAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGNCATATATATATATATTCTTAAAATTGGGGNATAATTTAAGAAAATGTGTCGTNAATGTTCAAAATAGCAAACTAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATTACTTTATTTCACTCTGGACATTTTCATTAAT--TTCACTTAGATTTTCT
gi|1 : TGGTGGAGCTTTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTTGTT-GTTGT---TTTCGATACAAACATGTGTCTGCTCAATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCAAATAAGGCAAATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-CA-C-ACATGCTTATATCACACGAAACATATCGATTTTTTCAAAACATCCACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGATATCG-TTTTTGGAACAT------C-G-------CA-TTGCT--T-TGTCTTTAATGCTATAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGTGAATTAA-AA------GCAACACG---CA----------T----TT-TGCCCGAGCGCATGTCACGAATAGGTGCCGTGGTC----GTTAA-------TGACTATCTTTTCGGTGCCGTAATGTATAACTTAATGTC----ATATATATATTCAAAAAATTGGGGCATAATTTAAGAAATTTTTTCGTAAATGGTCAAAATATAAAACTAGT
gi|1 : TGTTTTTCTTCTATC--AAATATTGGGTATTTA--ACTATAAAAGCTAT-TTTT-AGAAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACAACTGACCGTTTAAGTTACTTTATTTCACTCTGGACATTTTCATTAAT--TTCACTTAGATTTTTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatcaaatattgggtatttaactataaaagctatttttagaagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacaactgaccgtttaagttactttatttcactctggacattttcattaatttcacttagatttttttatgcc
gi|10 : tggtggagctttttgaaagttgcgtaacgctggaggatggtggatttactaaaagccattttttgttgttgttttcgatacaaacatgtgtctgctcaattgccaatataatgtaaaactattacaatatgttacgacgatgaaataggctcaaataaggcaaatcaaattaaaaattgccacacatgcttatatcacacgaaacatatcgattttttcaaaacatccacacggaaggttctcaatatgttatgtatgtattgatatcgtttttggaacatcgcattgctttgtctttaatgctatagtgaaaaatagaaaggaaatgaaatatttgttttatttaaacggtgaattaaaagcaacacgcattttgcccgagcgcatgtcacgaataggtgccgtggtcgttaatgactatcttttcggtgccgtaatgtataacttaatgtcatatatatattcaaaaaattggggcataatttaagaaattttttcgtaaatggtcaaaatataaaactagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTGAAGCTGGTTGATGGT-GCGT-AACGCTTGGGAATGGTGG---CATC-AA-------------------------TTTAAGACAAA----TGTCTGCTCGGTTGGCAATCTAGTGCAAATCTATATCAAAAGGTTGCGGTGATGAAACATATTCCTATAAGGTCAATCAAATTGATCAAT-G-A-C-CATT-AAATTGTTAGATCACATGGGACATA---A-TTTATC-TAACCTCCAGGCAGAAAGTTCTCAATATGTTCTG---GTA--GAGATCG-TTCT-GGAATATCGAGCAC-A-------CA-GTGTT--A-TGGCGCTAATGATGTAAT----GAAAAATATA-AAGG-AA-AGG--T--AA----------------T---------TTTACTTGAAATGCACATTAATAATAAACTACAAAATG---TG----------T----TG-TTTTATAGCACAGGTCACAAATAGGTGTCAC-GTCGATAGTTACAGA----TGTCTATCCTTCTTGTGCCGTAATAT--------ATGGTATATATATATtatgcc
gi|11 : GGTGGAGCTATTTGAAAAATGTGT-AACGCTTAAGGGTGGTGGATTTTCTTAAAAGCCTGTTTTC--T-ATAGT---TTATGACACAGACAAGTTTCAGTCAGATTATCAAACTTATGTACATCTATTACAACATGTTGCGACGATGAAATATGCTCATATACGGTTAATTAAGTTAA-AAAT-T-G-CGCATT-AAATTCTTATATCATACAAGACATATTGCTTTCACCAAAAC-------------GTTCTTAATATGTGCTGTATGTGTTGAGCTCG-TTTTGGGAATATCAAACAC-A-------TA-GTATT--A-TGTTTTCAATACTGTATT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ACT--A--ATTAT-------------T---------TTTATTTCAGCGGTGAATTAA-TA------GCAACATGAAAAA----------TGGGGGT-TTCCCCAGTGCAGGTCATGAATTGGTGCCATAATA----GTTACGGCATGGTGTCTATCCTTCtt
gi|12 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTAGATTTACT-AAAAGCCATTTT-------------------------------GTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTTAAACTATTACAATATGTTACGATGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCCAATTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCACACGAAACATATCGATTTTATCAAAACATACACACGGAAGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------T-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-AGG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATCT-ATCGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CAT---------T----TT-TTTCCGAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----ATTAC-------TGACTATTCTTCCGGTGCCGTA
gi|13 : CCGCTGGATTGCCAATCTAATGTAAAACTATAACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCCTGTAAGGCAAATCAAGATAA-AA------------T-AG--GCC-------------ACATATCGCCTGTATCAAAATATCCCAACAGAAGGTACTCAATATGGTCTGTATGTGTTGGGATCG-TTTTGGAATTAT------C-A-------CA-GTGCT--A-TGTCTTTAATACTGTACT----GGATATTC------------TG--T--AATAT-CTA---------TAATAGATTTTTTATTTAAACTGCGAATTAA-AA-------CAACATC---CA----------T----TTCTTCCATAGC--AGGTCACGAATAGGTACCATGATA-------AA-------TGACTATCC----GGTGCCGTAATGTATGACTTAATGGCATAAA-------GTTCTTTAAATAGGGGTATATTTTAAGAACATGTAAAGTCACTGTTCAAAATAGCAAACT
gi|14 : AAAATTGGGGCATACTTTAAGAAAATGTGTCGTAAATGTTCAAAATAGCAAACTAGTt
gi|14 : TGTTTTTCTTCTTTC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCT-T-TTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTTAAATTACTTTATTTCACTCCGAACATTTTCATTAAT--TTCACTT---TTTTCTgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctttccaatattgggtatataactataaaagctttttttagtagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacgactgaccgtttaaattactttatttcactccgaacattttcattaatttcacttttttcta
gi|15 : aaaattggggcatactttaagaaaatgtgtcgtaaatgttcaaaatagcaaactagtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGTGGAGCTATTTAAGAAATGCGT-TACGCTTGAGGATGGTTGATTTTCT-AAAAGC--TTTTTT--T-CCTATATTTTTCGATACAAACAAGTGTCTGCTCGATTACCTATCTAATTCAAAACTATTCCAATATGTTGCGACGATGCACTATACTTCTATAAGTTTAATTAAGTTAA-ACAT-TGG-T-CATT-AAATTCTTACAT----------ATATC--CTTTATCAAAATATCCAC--------------ATATGTTCTGTATGTGATGAGATCG-TTTAGGGAAAATAGA---C-AAGAAAATAA-GTGTT--T-T-TATTTGA----ACGGC----G---AATTAA-AAGC-AACATGCAA--AATGTGTTG---------T---------TTTa
gi|15 : AATAT------CCA-------CATATGTT--C-TGTATGTGATGAGATCGTTTAGGGAAAATAGACAAGA-AA-AT---A--AGTGT-TT---------------------TTATTTGAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CAAAATGTGTTGT----TT-TTTCC-AGCACTGGTCACAAATCGGTGCCATGCTA----GTTAC-------ttccagcactggtcacaaatcggtgccatgctagttacggcatgatttctatac
gi|16 : ggtggagctatttaagaaatgcgttacgcttgaggatggttgattttctaaaagctttttttcctatatttttcgatacaaacaagtgtctgctcgattacctatctaattcaaaactattccaatatgttgcgacgatgcactatacttctataagtttaattaagttaaacattggtcattaaattcttacatatatcctttatcaaGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTT-T--T-GTTGT---TTGCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGTCAATTTAATATAAAACTATTGCAATATGTTATGACGATTAAATAGGCTCATATAAGGCAAAACAAATAAA-AAAA-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCACACAAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGAAGGTTCTCAATAAGTTATGTATGTATTGAGATTG-TTTTGGAAATAT------T-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GGAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATA---Cggcatgatttctatac
gi|17 : GGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGA---TGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGC---TTTCGATACAAACGTGTGTCTGCTCAATTGCCAATAAAATGTAAAACTATTACAAAATGTTACGGAGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAATTAA-AACT-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCC-TAGCGAAGG---------TGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CG-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGG-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTAATTTAAACTGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----
gi|18 : TATTTTTAAAATTAAGGAATAATTTAAGAAAATGTGTCGTTAATGTTCAAAATAGCAAAC
gi|18 : GTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTGT-AGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGATCGAACAATCACGAATGACCGTTGAAATTACTTTATTTCACTCTTGAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctatttgtagtagttaataagttagacgttaagatcgaacaatcacgaatgaccgttgaaattactttatttcactcttga
gi|19 : tatttttaaaattaaggaataatttaagaaaatgtgtcgttaatgttcaaaatagcaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTGGAGCTGTTTGAAAGATGCGT-AACGCTGGAGGATGATTAATTTTTT-TAAAGCCATTTTTC--T-ATAGT---TTTCGATACAAACAAGTGTTTACTGGATTGCCAATCTAATGTAAAACTATCACAATATGTTACGACGATAAAATAGGCCCCTGTTAGGCAAATCACGTT-A-AAAT-A-GAC-TA-TAAAATGCTTATATCACACGAGACATATCGCCTGTATCAAACTATCCACACGGA
gi|2 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTCGCGT-AACGCTGGACGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGT---TTTCGATACAAATACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATTAAATAGGCTCATATAATGCAAATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCACACGAGACGCATCGATTGTATCAAAACATCCACATGGAAGGTCCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGAT-G-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTAAAGT----GAAAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACTGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCTAGGGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATAACTTAATGTCATATATATATATATTCACAAAATTGGGACATAATTCAAGAAAATGTGTCGTAAATGTTCAAAATAGCAAACTAGT
gi|20 : GT---TTTCGGTACAAAAAAGTGTCTGCTGGATTGCCAGTCTAATGTAAAACTATTACAATATGCTACGACGATGAAATAGGCTCCTGTAAGGCAAATCAAGTTAC-AGATAG-G-C-CATT-TAATTCTTATATCACACGAGACATGTCGCCTGTATCAAAATATCCAC-C-GAAAGTTCTCAACATGTTTTGTTTGTGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttttatccaatattgggtatataactataaaagctattttttagtagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacaactgaccgtttaaattactttatttcaatctggacattttcattaatttcacttaaactttttaa
gi|21 : tataTGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCAT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAGCCATTTTTT--TTGTTGT---TTTAGATACAAAC--GTGTCTGCACGATGGCCAATATATTGTAAAACTATTACAATATGTTATGTTGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAATAAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCA
gi|22 : TGGTGGAGCTATTTTCAAGATGCAT-AA------AGTATGACGA------T-AAA-----TATTTT--T-A--GT---TTTCGAAACAAACATATGTCTGCTAGGTTGTCACTGTAATGTACAGTAATTACAATATACTTCGACTTTTAAATAGATTC
gi|23 : GCTTTTCTTTTATCTTCAAT--TGAGTATACA--TCTATAGAAGCTATATTTGTAGTAGTTTATAAATTAGACATGAAGATCGAACAATCACTACTGACTGCTGAACTT-CGTTATTTCACTCTGGACATTTTTATTAATTATTTACTTActtttgcgttaatcatatcaaatttaacaacacattcacatcgaacatga
gi|24 : GGATTTACT-AAAAGCCATGTTTT----GTTGT---TTT-GATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATAaca
gi|25 : -------CA-GTGCTGTTATGTCTTTAATAGTGTAGT----GGAAAATAGA-AAGGAAA-ATA--AGTAATAG-TAT---------T---------TTTATATA
gi|3 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGGTGATGGATTTACT-AAAAGCC-TTTTTT--T-ATTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCTAGTATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTTATATAAGGCAAATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-ACATGCTTATATCACACAAGACATATCGATTTTATCAAAACGTCCACACGGACGGTTCTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCGCTTTTGGAAATAT------C-A-------CT-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAACATAGA-AATG-AA-ATG--A--AATAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATT-A-AA------GCAACATG---TA----------T----TT-TTCCGGAGCGCAGGTCACGAATAGGTGACATGGTC----GTTAC-------TGGCTATCCTTCCGGGGCCGTAATGTGAAACTTAATGTCA-A-ATATATATATTCATAAAATTGGGGCATAATTTAAGAAAATGTGCCGTAAATGTTCAAAATAGCAAGCTAGTgggtacgaa
gi|4 : GAAGCTGTTTCAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAAACC-TTTTGT--T-GTTGT---ATTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCA-TATAATGTACAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATGTAAGGCAAATCAAGTTAA-AAAT-T-G-C-CA-T-AAATGCTTATATCACGCGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGACTGTTCTCAATATGTTACGTATGTATTGAGGTCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTTTATTACTATAGT----G-AAAATAGA-AAGG-AA-ATG--A--AGTAT-TTG---------T---------TTTATTTAAACGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCCCATGCGCAGGTCACGGATAGGCGCCATGTTT----GTTAT-------TTACTATCCTTCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGTC--ATATATATATATTTTTAAAATTTGGGAATAATTTAAGAAAATGTGTCGTTAATGTTCAAAATAGCAAACTAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctattttttagtagttaataagttagacgttacggtcgaacaatcacaactgaccgtttaaattactttatttcactctggacattttcattaattttacttaaacttttttatg
gi|4 : TGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATATAACTATATAAGCTATGTTTTTAGTAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGGTCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATTACTCTATTTCACTCTGGAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatccaatattgggtatatataactatataagctatgtttttagtagttaataagttagacgttaaggtcgaacaatcacgactgaccgttgaaattactctatttcactctgga
gi|5 : gaagctgtttcaaagttgcgtaacgctggaggatggtggatttactaaaaaccttttgttgttgtattcgatacaaacacgtgtctgctcgattgccatataatgtacaactattacaatatgttacgacgatgaaataggctcatgtaaggcaaatcaagttaaaaattgccataaatgcttatatcacgcgagacatatcgattttatcaaaacatccacacggactgttctcaatatgttacgtatgtattgaggtcgttttgggaatatcacagtgctttgtctttattactatagtgaaaatagaaaggaaatgaagtatttgttttatttaaacggcgaattaaaagcaacatgcatttttcccatgcgcaggtcacggataggcgccatgtttgttatttactatccttccggtgccgtaatgtatgacttaatgtcatatatatatatttttaaaatttgggaataatttaagaaaatgtgtcgttaatgttcaaaatagcaaactagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGGTGGGGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGAATGGTGGATTTACT-TTAAGCCATTTTTT----GTTGT---TTTCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAACAGGCTCACATAAGACAAATCAAGTTAA-AAAT---G-C-CT-T-TAATGCTTATATCACACGAGACAT--CGATTTTATCAAAACATCCACACAGAAAATTCTCAATATGTTATGTATATATTGAGATCG-TTTTAGGAATAT------C-A-------TA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTTTAGT----GAAAAATAAA-GAGG-AA-ATG--A--AGTAA-ATG---------T---------TTTATTTAAACGTCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA---------------TT-TTCCCATGCGCAGGTCACGAATAGGTGCCATGATC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCTGCAATGCAGGACTTAATGCCATATATATA-ATATTTTTAAAATTAAGGAATAATTTAAGAAAATGTGTCGTTAATGTTCAAAATAGCAAAC
gi|5 : TGTTTTTCTTCTATC--CAATATTGGGTATATA--ACTATAAAAGCTAT-TTTT-AGAAGTTAATAAGTTAGACGTTAAGATCGAACAATCACGACTGACCGTTGAAATAACTTTATTTCACTCTTGAgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtttttcttctatccaatattgggtatataactataaaagctatttttagaagttaataagttagacgttaagatcgaacaatcacgactgaccgttgaaataactttatttcactcttga
gi|6 : tggtggggctgtttgaaagttgcgtaacgctggagaatggtggatttactttaagccattttttgttgttttcgatacaaacacgtgtctgctcgattgccaatataatgtaaaactattacaatatgttacgacgatgaaacaggctcacataagacaaatcaagttaaaaatgcctttaatgcttatatcacacgagacatcgattttatcaaaacatccacacagaaaattctcaatatgttatgtatatattgagatcgttttaggaatatcatagtgctttgtctttaatactttagtgaaaaataaagaggaaatgaagtaaatgttttatttaaacgtcgaattaaaagcaacatgcattttcccatgcgcaggtcacgaataggtgccatgatcgttactgactatccttccggtgctgcaatgcaggacttaatgccatatatataatatttttaaaattaaggaataatttaagaaaatgtgtcgttaatgttcaaaatagcaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGGTGGAGCTGTTTTAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTAACT-AAAAGCCATTTTTT--T-GTTGA---TATCGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATGACACTATGTTACGACGATGAATTAGGCTCATATAAGGCAAATCAAGTTAA-AAAT-T-G-T-CA-T-AAATGCTTATATCGCACGAGACATGTCGATTTTATCAAAACATCCACACGGAAAATTCTCAGTATGTTATGTATGAATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GAGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----AAAAAATAGA-AAAG-AA-ATG--A--AGTAT-TTG---------T---------TTTATTTAAGCGGCGAATTAA-AA------GCAACATG---CG----------T----TT-TTTCCATGCGCAGGTCACGAATAGGTCCCATGATC----GTTAC-------TTACCATCCTTCCGGTGCCATAATGTAGGACTTAATGACATATATAT-CATATTTTTAAAATTAGAGAATAATT
gi|7 : CTGTTTGAAACATGCATTAACACTGGAAGAAGGTGCATTATCT-AAAGGCCATTTTTC--T-ATAGT---TTTTGATACAAACAAGTGTCCGCTGGATTGCCAATCTAATGTAAAACTATAACAATATGTTACGACGATGAAATAGGCTCCTGTAAGGCAAATCAAGATAA-A-----------A-T-AG--GCC-------------ACATATCGCCTGTATCAAAATATCCCAACAGAAGGTACTCAATATGGTCTGTATGTGTTGGGATCG-TTTTGGAATTAT------C-A-------CA-GTGCT--A-TGTCTTTAATACTGTACT----GGATATT------------CTG--T--AATAT-CTATAATAGATTT---------TTTATTTAAACTGCGAATTAA-AA-------CAACATC---CA----------T----TTCTTCCATA--GCAGGTCACGAATAGGTACCATGATA-------AA-------TGACTA----TCCGGTGCCGTAATGTATGACTTAATGGCATA-------AAGTTCTTTAAATAGGGGTATATTTTAAGAACATGTAAAGTCACTGTTCAAAATAGCAAACT
gi|8 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-TAAAGCCATTTTTG--T-GTTGT---TT-CGATACAAACACGTGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAATATGTTACGACGATGAAATAGACTCACATAAGACAAATCAAGTTAA-AAAA-T-G-A-CT-T-AAATGCTTATATCACACGAGACA-A-CGATTTTATCAAAACAACCACACGGAAAATTCTCAATGTGTTATGTATATATTGAGATCG-TTTAAGGAATAT------C-A-------TA-GTGCT--T-TGTCTTTAATACTATAGT----GAAAAATAGA-GAGG-AA-ATG--A--AGTAA-ATG---------T---------TTTATTTAAACGTCGAATTAA-AA------GCAACATG---CA---------------TT-TTCCCATGCGCAGGTAACGAATAGGTGCCATGATC-----TTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCTGTAATGTAGGACTTAATGCCAAATATAT
gi|9 : TGGTGGAGCTGTTTGAAAGTTGCGT-AACGCTGGAGGATGGTGGATTTACT-AAAACCCATTTTTG--T-TTTGT---TTTCGATACAAACACGAGTCTGCTCGATTGCCAATATAATGTAAAACTATTACAA-ATGTTACGACGATGAAATAGGCTCATATAAGGCAAATCAAATTAA-AAAT-T-G-C-AT-T-ACATGCTAATATCACACGAGACATATCGATTTTATCAAAACATCCACACGGCAG-TTTTCAATATGTTATGTATGTATTGAGATCG-TTTTGGGAATAT------C-A-------CA-GTGCT--T-TGTCTCTAATACTATAGT----GAAAATTGGA-AAGG-AA-ATG--A--AATAT-TTT---------T---------TTTATTTAAACGACGAATTAA-AA------GCAACATG---CA----------T----TT-TTCACGAGCGCAGGTCACGAATAGGTGCTTTGGTC----GTTAC-------TGACTATCCTTCCGGTGCCGTAA