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finalCons : CAATGGCGGATCTACTCT-TT----A-A-A---AAA--C--CT-GGCGCA--CGCC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): CGGATCCGTTCTTTAAAAGACCCCCCCCCCCCCCCCCACTCTCACCC
Unaligned ( gi|36 ): TACATTGTCGGGTCTACTCTTTAACCGCCGCCCCACCCATCA
Unaligned ( gi|56 ): TTGATTTCGATGGCGGATCTAAACACAAAGGGTGAATC
Alignments
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lowQualScore : . .... . . ... ........ ..
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consensus : CAATGGCGGATCTACTCT-TT----A-A-A---AAA--C--CT-GGCGCA--CGCC
Reference ( family-1914 ) : CAATGGCGGATCTACTCT-TT----A-A-A---AAA--C--CT-GGCGCA--CGCC
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gi|14 : cATGGCTGATCTACTC--TT----A-A-A---AAA--C-----GGCGTA--TGttgacccaacc
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gi|23 : cCAATGGCGGATATACTCT-TT----A-A-A---AAA--C--CT-GGCGCA--CACCtccc
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gi|46 : aacCAATGGCGGATCTACTTT-TT----G-A-A---AAA--T--CT-GGCGCA--TACCca
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gi|54 : CAATGGCGGATATACTCT-CT----A-A-A---AAA--C--CT--GCGTA--CCCC
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gi|59 : tatgCAATGGCAGATCAACTCT-TT----A-A-A---ACA--A--AT-GGCATA--
gi|6 : acAATGGCGGATCTACTCT-TTAAA-A-A-A---AAA--C--CC-GGC
gi|60 : gcctCAATGGCCGATCCACTCT-TT----A-A-A---AAA--G--CT-GGTGTA--ccccccccccccccccccccccc
gi|61 : AATAGCGGATCTACTAT-TT----G-A-A---AAA--G--C--AGCGCA--a
gi|62 : CAATGGCAGGTTTACGCT-TT----A-A-AC--AAAC-C--CT-GGCGtcac
gi|63 : tAATGGCGGATCTACTCT-TT----A-A-A---GGA--C--C--GGCGTA--GGCCt
gi|64 : CAGTGGCGGATCTACTCT-TT----A-A-A---AAA--C--CT-GGCGCA--
gi|65 : CAATGGCAGATCTTCTCT-TT----A-A-A---AAA-----TT-GGCATA--CG
gi|66 : CAATGACGGATCTACTCT-TT----A-A-A---CAA--C--CA-GGCTCA--
gi|67 : CAATGGTGGATCTACTCT-TT----A-A-A---AAA--
gi|7 : agCAATAGCAGATCTATTCT-TT----A-A-A---AAA--C--CTCAACGCA--CGCCaaggcgc
gi|8 : ccattcgCAATGGCGGGTCAACTCT-TT----A-ACA---AAA--C--CT--GCGCATCCGCCcccatcccct
gi|9 : cacacctatacATGGCGGATCTACCCT-TT----A-A-A---AGA--C--CT-GG-GAA--CACCaac
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): CGGATCCGTTCTTTAAAAGACCCCCCCCCCCCCCCCCACTCTCACCC
Unaligned ( gi|36 ): TACATTGTCGGGTCTACTCTTTAACCGCCGCCCCACCCATCA
Unaligned ( gi|56 ): TTGATTTCGATGGCGGATCTAAACACAAAGGGTGAATC