lowQualScore : 111 2222 11111111 1 11 22 111 22
lowQualScore : 666 2222 555 1 11111111 3 555 7 00 44 1 0 111 3 44 00 55
lowQualScore : ... .... ... . ........ . ... . .. .. . . ... . .. .. ..
lowQualScore : 222 4444 888 2 77777777 3 888 0 55 33 0 4 333 3 66 66 00
consensus : AGAN--GACACTTCAATGTTAAATTATTATTA---AATTA---TTGTTTTTATCAATGGCTTGCCGGGNAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGG-T---TTTGTCATTTATTTTTAGAACCATCGTGGGTCT--TTTT-T--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCTGA
Reference ( gi|1 ) : AGAG--GACACTTCAATGTTAAATTATTATTT---AATTA---TTGTTTTTATCAATGGCTTGCCAGGGAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGG-T---TTTGACATTTATTTTTGGAACCATCATGGGTCC--TTTT-T--GTTTGAATGCATATTACAT--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCTGA
gi|3 : AGAGTTGATGCTTCAATCATAAATTATTATTA---AATTA---TTGTTTTTATCAATGGCT--------------CATTTGTGATTGCTTAATAG-T---TTTGTCATTTATTAT-AGAACCATTGTGGGTATATTTTT-T--GTTTAAATGCAGGTTACAT--GACTGACCAATTCTTTCAATATACTCCTG
gi|5 : tgcAGAGTTGACACTTCGATGTTGAATTATTATT--------------------ACCGGTAACT-------GAAACTGCAATTGCCATTGCTT--T---T---TTTGTCATTTATTTT-AGAGCCATCATGGGTAT--TTTT-T--GTTTGAATACAGGTTACAT--GATGAATCAATTCCTTCAATATACTCCTG
gi|15 : cGAT--GACAATATAATGTTAAATCGTTATTA---AATTA---TTGTTTTTATCAACGGCTTGCTGGGCAAACTGCAATTGTCAgc
gi|17 : GAT--GACACTTAAATGTTAAATCATTATTA---AATTA---TTGTTTTTATCAACAGCTTGCTGGACAAACTGCAATT
gi|2 : --GACACTTCAATATTAAATTAATATCA---AATTA---TTGTTTTTATCAATGGCTTGCCAGGGAAACTGCAATTGCCATTGTTTAATGA-T---TTTGTCATTT-TTTCT--AACCAT-GTGAGTAT--TTTT-T--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACTAATTTATTCAATATACTCCTGA
gi|4 : gagtt--GACACTTCAATGTTAAATTG-------------A---T-GTTTTTATCAATGACTAGCCAGTAAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATAG-T---TTTGTCATTTATTTA-AGAACCATTATGGGTCT--TTTT-T--GTTTGAATGCAGGTTATAC--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCT
gi|6 : agtt--GACACTTAAATGTTAAATTATCATTA---AATTA---TTATTTTTATCAATGGCTAGCCAGACAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGGATAAATCAGTCATTTA-TTTTAGAATCATCGTGGGTCT--TTCT-T--GTTTGAATGTAGGTTACAT--TAT
gi|16 : agtt--GACACTTTAATGTGAAATCGTTATTA---AATTA---TTGTTTTTATCAACGGCTTGCTAGGCAAACTGCAATTGCC
gi|18 : tACAATTTAATGTTAAATCATTATTA---AATTA---TTGTTTTTATCAATGGCTTGCTGGGCAAACTGCAATTGTC
gi|14 : ACACTTCAATGTTGAAATATTATTTTTTAATTAGTATTGTTTT-ATCAATGG----------AAACTGCAATTGCTATTGGTTAATG
gi|8 : CTTCAATGTTAAATTATTATCA---AATTA---TTTTCTTTATCAATGGCTTGCCAGGGAAACTGCAATTGCTATTGCTTAACGG-T---TTTGTCATTTA-TTTTAGAACCATTGTGGGTCT--TTCC-T--GTTTGAAT
gi|7 : TGTTGCATTATTATTA---AATTA---TTATTTT-ATCAATGGCT---CAGGGAAACTGCAATTGC------TTAATGA-T---TTTGTGATTTATTTT-AGAACCATCGTTGGTCT--TTTT-TTAGTT--AATGCAGATTACAT--GATTGATCAATTCTTTCAATATACTCATG
gi|10 : AATTGCCATTGCT-AATGG-T---TAAGTCATTTATTTT-AGAACCATTGTGGGTCT--TTTT-T--GTTTGAATGCAGTTTACATCAGATTGGTCAATTTCTTAAATGTACTCATGA
gi|9 : TTAATGG-T---TTTGTCATTTATTGT-AGAATCACCATTGGTCA--TTTT-T--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACCAATTCCTCCAATATACTCCTGA
gi|13 : tgcacttcagtgttaaaTAATGG-T---TTTGTCATTT--TTTTAGAACCGTCGTTGGTCT--TTTT-T--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTAAACATTTCCGTTAATATTCTCCTGAc
gi|11 : AATGG-T---TTTGTCATTT-TGTTTAGAACCATCGTTGGTCT--TTTT-T--GTTTGAATACAGGTTACAT--GATTTACCATTTTCTTTAATATACTCCTGA
gi|12 : AATGG-T---TATGTCATTT---TTTAGCACCATCATTGTTTT--TTTTTT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTAACCATTTCCTTTAATATACTCCTGAc
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 88 6666 44 0 88888 33 3 555 88 3 44 3 44 44
lowQualScore : .. .... .. . ..... .. . ... .. . .. . .. ..
lowQualScore : 22 5555 22 4 66666 33 1 444 33 6 22 1 22 66
consensus : AGTTGACACTTCAATGTTAAATTATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCCGGGNAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGG-T---TTTGTCATTTATTTTTAGAACCATCGTGGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCTGA
Reference ( family-1879 ) : AGANGACACTTCAATGTTAAATTATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCCGGGNAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGG-T---TTTGTCATTTATTTTTAGAACCATCGTGGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCTGA
gi|1 : AGAGGACACTTCAATGTTAAATTATTATT----TA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCCAGGGAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGG-T---TTTGACATTTATTTTTGGAACCATCATGGGTCC--TTT-TT--GTTTGAATGCATATTACAT--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCTGA
gi|10 : AATTGCCATTGCT-AATGG-T---TAAGTCATTTATTTT-AGAACCATTGTGGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGTTTACATCAGATTGGTCAATTTCTTAAATGTACTCATGA
gi|11 : AATGG-T---TTTGTCATTT-TGTTTAGAACCATCGTTGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATACAGGTTACAT--GATTTACCATTTTCTTTAATATACTCCTGA
gi|12 : AATGG-T---TATGTCATTT---TTTAGCACCATCATTGTTTT--TTTTTT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTAACCATTTCCTTTAATATACTCCTGAc
gi|13 : TAATGG-T---TTTGTCATTT--TTTTAGAACCGTCGTTGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTAAACATTTCCGTTAATATTCTCCTGAc
gi|14 : ACACTTCAATGTTGAAATATTATTTTTTAATTAGTATTGTTTT-ATCAATGG----------AAACTGCAATTGCTATTGGTTAATG
gi|15 : GATGACAATATAATGTTAAATCGTTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAACGGCTTGCTGGGCAAACTGCAATTGTCA
gi|16 : GACACTTTAATGTGAAATCGTTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAACGGCTTGCTAGGCAAACTGCAATTGCC
gi|17 : tGATGACACTTAAATGTTAAATCATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAACAGCTTGCTGGACAAACTGCAATT
gi|18 : ACAATTTAATGTTAAATCATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCTGGGCAAACTGCAATTGTC
gi|2 : AGTTGACACTTCAATATTAAATTAATATC----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCCAGGGAAACTGCAATTGCCATTGTTTAATGA-T---TTTGTCATTT-TTTCT--AACCAT-GTGAGTAT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACTAATTTATTCAATATACTCCTGA
gi|3 : gAGTTGATGCTTCAATCATAAATTATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCT--------------CATTTGTGATTGCTTAATAG-T---TTTGTCATTTATTAT-AGAACCATTGTGGGTATATTTT-TT--GTTTAAATGCAGGTTACAT--GACTGACCAATTCTTTCAATATACTCCTG
gi|4 : tgcagAGTTGACACTTCAATGTTAAATTG----------------AT-GTTTTTATCAATGACTAGCCAGTAAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATAG-T---TTTGTCATTTATTTA-AGAACCATTATGGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTATAC--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCT
gi|5 : AGTTGACACTTCGATGTTGAATTATTATT----A----------------CCGGTAACT-------GAAACTGCAATTGCCATTGCTT--T---T---TTTGTCATTTATTTT-AGAGCCATCATGGGTAT--TTT-TT--GTTTGAATACAGGTTACAT--GATGAATCAATTCCTTCAATATACTCCTG
gi|6 : cagAGTTGACACTTAAATGTTAAATTATCATT----AA--ATTATTATTTTTATCAATGGCTAGCCAGACAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGGATAAATCAGTCATTTA-TTTTAGAATCATCGTGGGTCT--TTC-TT--GTTTGAATGTAGGTTACAT--TATgc
gi|7 : TGTTGCATTATTATT----AA--ATTATTATTTT-ATCAATGGCT---CAGGGAAACTGCAATTGC------TTAATGA-T---TTTGTGATTTATTTT-AGAACCATCGTTGGTCT--TTT-TTTAGTT--AATGCAGATTACAT--GATTGATCAATTCTTTCAATATACTCATG
gi|8 : CTTCAATGTTAAATTATTATC----AA--ATTATTTTCTTTATCAATGGCTTGCCAGGGAAACTGCAATTGCTATTGCTTAACGG-T---TTTGTCATTTA-TTTTAGAACCATTGTGGGTCT--TTC-CT--GTTTGAAT
gi|9 : TTAATGG-T---TTTGTCATTTATTGT-AGAATCACCATTGGTCA--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACCAATTCCTCCAATATACTCCTGA
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 6666 44 0 88888 33 3 555 88 3 44 3 44 44
lowQualScore : .... .. . ..... .. . ... .. . .. . .. ..
lowQualScore : 5555 22 4 66666 33 1 444 33 6 22 1 22 66
consensus : AGTTGACACTTCAATGTTAAATTATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCCGGGNAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGG-T---TTTGTCATTTATTTTTAGAACCATCGTGGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCTGA
Reference ( family-1879 ) : AGTTGACACTTCAATGTTAAATTATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCCGGGNAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGG-T---TTTGTCATTTATTTTTAGAACCATCGTGGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCTGA
gi|1 : GACACTTCAATGTTAAATTATTATT----TA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCCAGGGAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGG-T---TTTGACATTTATTTTTGGAACCATCATGGGTCC--TTT-TT--GTTTGAATGCATATTACAT--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCTGA
gi|10 : agagAATTGCCATTGCT-AATGG-T---TAAGTCATTTATTTT-AGAACCATTGTGGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGTTTACATCAGATTGGTCAATTTCTTAAATGTACTCATGA
gi|11 : AATGG-T---TTTGTCATTT-TGTTTAGAACCATCGTTGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATACAGGTTACAT--GATTTACCATTTTCTTTAATATACTCCTGA
gi|12 : AATGG-T---TATGTCATTT---TTTAGCACCATCATTGTTTT--TTTTTT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTAACCATTTCCTTTAATATACTCCTGAc
gi|13 : TAATGG-T---TTTGTCATTT--TTTTAGAACCGTCGTTGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTAAACATTTCCGTTAATATTCTCCTGAc
gi|14 : ACACTTCAATGTTGAAATATTATTTTTTAATTAGTATTGTTTT-ATCAATGG----------AAACTGCAATTGCTATTGGTTAATG
gi|15 : TGACAATATAATGTTAAATCGTTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAACGGCTTGCTGGGCAAACTGCAATTGTCA
gi|16 : gaTGACACTTTAATGTGAAATCGTTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAACGGCTTGCTAGGCAAACTGCAATTGCC
gi|17 : TGACACTTAAATGTTAAATCATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAACAGCTTGCTGGACAAACTGCAATT
gi|18 : gaACAATTTAATGTTAAATCATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCTGGGCAAACTGCAATTGTC
gi|2 : AGTTGACACTTCAATATTAAATTAATATC----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCCAGGGAAACTGCAATTGCCATTGTTTAATGA-T---TTTGTCATTT-TTTCT--AACCAT-GTGAGTAT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACTAATTTATTCAATATACTCCTGA
gi|3 : gAGTTGATGCTTCAATCATAAATTATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCT--------------CATTTGTGATTGCTTAATAG-T---TTTGTCATTTATTAT-AGAACCATTGTGGGTATATTTT-TT--GTTTAAATGCAGGTTACAT--GACTGACCAATTCTTTCAATATACTCCTG
gi|4 : tgcagAGTTGACACTTCAATGTTAAATTG----------------AT-GTTTTTATCAATGACTAGCCAGTAAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATAG-T---TTTGTCATTTATTTA-AGAACCATTATGGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTATAC--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCT
gi|5 : AGTTGACACTTCGATGTTGAATTATTATT----A----------------CCGGTAACT-------GAAACTGCAATTGCCATTGCTT--T---T---TTTGTCATTTATTTT-AGAGCCATCATGGGTAT--TTT-TT--GTTTGAATACAGGTTACAT--GATGAATCAATTCCTTCAATATACTCCTG
gi|6 : cagAGTTGACACTTAAATGTTAAATTATCATT----AA--ATTATTATTTTTATCAATGGCTAGCCAGACAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGGATAAATCAGTCATTTA-TTTTAGAATCATCGTGGGTCT--TTC-TT--GTTTGAATGTAGGTTACAT--TATgc
gi|7 : TGTTGCATTATTATT----AA--ATTATTATTTT-ATCAATGGCT---CAGGGAAACTGCAATTGC------TTAATGA-T---TTTGTGATTTATTTT-AGAACCATCGTTGGTCT--TTT-TTTAGTT--AATGCAGATTACAT--GATTGATCAATTCTTTCAATATACTCATG
gi|8 : CTTCAATGTTAAATTATTATC----AA--ATTATTTTCTTTATCAATGGCTTGCCAGGGAAACTGCAATTGCTATTGCTTAACGG-T---TTTGTCATTTA-TTTTAGAACCATTGTGGGTCT--TTC-CT--GTTTGAAT
gi|9 : TTAATGG-T---TTTGTCATTTATTGT-AGAATCACCATTGGTCA--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACCAATTCCTCCAATATACTCCTGA
blockSeqs : TTTT TT TGCTG GC A AAA AT T AT T TA CA
blockSeqs : . . TGCTA GC . . AT T . . . .
blockSeqs : . . TGCTG AC . . AT T . . . .
blockSeqs : . . TGCTG GC . . AT T . . . .
blockSeqs : . . TGCCA GG . . AT T . . . .
blockSeqs : . . AGCCA TA . . AT T . . . .
blockSeqs : . . AGCCA AC . . T . . . . .
blockSeqs : . . TGCCA GG . . T . . . . .
blockSeqs : . . CA GG . . A . . . . .
blockSeqs : . . . G . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AGTTGACACTTCAATGTTAAATTATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCCGGGNAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGG-T---TTTGTCATTTATTTTTAGAACCATCGTGGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCTGA
finalCons : AGTTGACACTTCAATGTTAAATTATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCCGGGNAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGG-T---TTTGTCATTTATTTTTAGAACCATCGTGGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCTGA
Alignments
lowQualScore : 1
lowQualScore : 6666 44 0 88888 33 3 555 88 3 44 3 44 44
lowQualScore : .... .. . ..... .. . ... .. . .. . .. ..
lowQualScore : 5555 22 4 66666 33 1 444 33 6 22 1 22 66
consensus : AGTTGACACTTCAATGTTAAATTATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCCGGGNAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGG-T---TTTGTCATTTATTTTTAGAACCATCGTGGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCTGA
Reference ( family-1879 ) : AGTTGACACTTCAATGTTAAATTATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCCGGGNAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGG-T---TTTGTCATTTATTTTTAGAACCATCGTGGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCTGA
gi|1 : GACACTTCAATGTTAAATTATTATT----TA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCCAGGGAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGG-T---TTTGACATTTATTTTTGGAACCATCATGGGTCC--TTT-TT--GTTTGAATGCATATTACAT--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCTGA
gi|10 : agagAATTGCCATTGCT-AATGG-T---TAAGTCATTTATTTT-AGAACCATTGTGGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGTTTACATCAGATTGGTCAATTTCTTAAATGTACTCATGA
gi|11 : AATGG-T---TTTGTCATTT-TGTTTAGAACCATCGTTGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATACAGGTTACAT--GATTTACCATTTTCTTTAATATACTCCTGA
gi|12 : AATGG-T---TATGTCATTT---TTTAGCACCATCATTGTTTT--TTTTTT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTAACCATTTCCTTTAATATACTCCTGAc
gi|13 : TAATGG-T---TTTGTCATTT--TTTTAGAACCGTCGTTGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTAAACATTTCCGTTAATATTCTCCTGAc
gi|14 : ACACTTCAATGTTGAAATATTATTTTTTAATTAGTATTGTTTT-ATCAATGG----------AAACTGCAATTGCTATTGGTTAATG
gi|15 : TGACAATATAATGTTAAATCGTTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAACGGCTTGCTGGGCAAACTGCAATTGTCA
gi|16 : gaTGACACTTTAATGTGAAATCGTTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAACGGCTTGCTAGGCAAACTGCAATTGCC
gi|17 : TGACACTTAAATGTTAAATCATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAACAGCTTGCTGGACAAACTGCAATT
gi|18 : gaACAATTTAATGTTAAATCATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCTGGGCAAACTGCAATTGTC
gi|2 : AGTTGACACTTCAATATTAAATTAATATC----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCTTGCCAGGGAAACTGCAATTGCCATTGTTTAATGA-T---TTTGTCATTT-TTTCT--AACCAT-GTGAGTAT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACTAATTTATTCAATATACTCCTGA
gi|3 : gAGTTGATGCTTCAATCATAAATTATTATT----AA--ATTATTGTTTTTATCAATGGCT--------------CATTTGTGATTGCTTAATAG-T---TTTGTCATTTATTAT-AGAACCATTGTGGGTATATTTT-TT--GTTTAAATGCAGGTTACAT--GACTGACCAATTCTTTCAATATACTCCTG
gi|4 : tgcagAGTTGACACTTCAATGTTAAATTG----------------AT-GTTTTTATCAATGACTAGCCAGTAAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATAG-T---TTTGTCATTTATTTA-AGAACCATTATGGGTCT--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTATAC--GATTGACCAATTCCTTCAATATACTCCT
gi|5 : AGTTGACACTTCGATGTTGAATTATTATT----A----------------CCGGTAACT-------GAAACTGCAATTGCCATTGCTT--T---T---TTTGTCATTTATTTT-AGAGCCATCATGGGTAT--TTT-TT--GTTTGAATACAGGTTACAT--GATGAATCAATTCCTTCAATATACTCCTG
gi|6 : cagAGTTGACACTTAAATGTTAAATTATCATT----AA--ATTATTATTTTTATCAATGGCTAGCCAGACAAACTGCAATTGCCATTGCTTAATGGATAAATCAGTCATTTA-TTTTAGAATCATCGTGGGTCT--TTC-TT--GTTTGAATGTAGGTTACAT--TATgc
gi|7 : TGTTGCATTATTATT----AA--ATTATTATTTT-ATCAATGGCT---CAGGGAAACTGCAATTGC------TTAATGA-T---TTTGTGATTTATTTT-AGAACCATCGTTGGTCT--TTT-TTTAGTT--AATGCAGATTACAT--GATTGATCAATTCTTTCAATATACTCATG
gi|8 : CTTCAATGTTAAATTATTATC----AA--ATTATTTTCTTTATCAATGGCTTGCCAGGGAAACTGCAATTGCTATTGCTTAACGG-T---TTTGTCATTTA-TTTTAGAACCATTGTGGGTCT--TTC-CT--GTTTGAAT
gi|9 : TTAATGG-T---TTTGTCATTTATTGT-AGAATCACCATTGGTCA--TTT-TT--GTTTGAATGCAGGTTACAT--GATTGACCAATTCCTCCAATATACTCCTGA