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Reference ( gi|2 )            : CGATAATTGTTACAAGACGAAA-A-TCGATA------ACCCGCCTA-----------GAT-----------A---TTT-TG--TTGAA--TACTT--TACTTT---TCGGT---AAT--------TG-TTATG--GT--CGATCAT--CTC--G--AA---GT-AAAC-AATGATTTCTCAGGTACGTTATA-CTTC-G-AT--ACGATTGGAAATCAA-AATCA-TTGC------GTAC-----A----TG---GAGATT-CTTT-TA-GAGTA--T---TAATGTAC--T-TG--ATTTTTAAAA-CAA--ATGCGT----A-CT-TGATAATTTTTGTTTGCG----TATTTACGCA--AA---TACG-----CACCT-----TA--TCT------AGAG-TGCTG
gi|1                          : CGGTAATTGTTACAAGATGAAACA-TTGATA------ACCAGCCTA-----------GATC----------A---TTT-TG--TTGAA--TACTT--TACTTT---TCTGT---AAT--------TG-TTACG--GT--CAATCAT--CTCTCG--AA---GT-AAAC-AATGAATTCTCAGTTACGGTATT-TTTC-G-AT--ACGATTGGAAATCAA-AATCA-TTGC------ATAC-----A----TG---GAGATT-CTTA-TA-GAGTA--T---TTATACAC--T-TT--ATTTTCAAAA-C-A--ATGTGT----A-CT-TGATCATTTTTGTTTGTG----TATTTACGAA--AA---TACG-----CACAT-----TA--TCT------AGAG-TGCTG
gi|17                         : CGACAATTGTTACAAGACGAAA-AATCGATA------ACCTGCCTA-----------GATC----------A---TTT-TG--TTGAA--TACTT--TACTTTTGCTCTGC---AATTAGGCCACTG-TTATG--G---CAATC
gi|3                          :              AAGATGAAA-AATTGATACATGTAACCAGCCTACATAGCTAT--GAT-----------ACA-TTT-TGGATTGGA--TATTG--TACTTT---TTGGT---A-----------G-TTATG--GC--CAAGCA-------------------AAAC-GATAA---ATCAAGTTTGTT-TATCTCC-G-AT--GCGCCTTTAAATAAA-AAACA-GAGT------GTAC-----C----TG---GAGTTT-CTTT-GA-GTGTA--T---TTATATGC--T-CG--ATTTTCAAAA-TAA--GGGAGTTGAAA-CTATCATCATATTTGTTAGAA----TACTTACGCA--AA---TAAA-----CACC------TA--TCC------TGAGTTGCT
gi|18                         :                GAAGAAA-ACTTGATA------ATCAGCCTACAGAGCTTTCTGAT-----------ACATTTTATA--TTGAA--TATAG--TACTTT---T-GGC---AAT--------TA-TTATG--GT--TGAaat
gi|4                          :                     ct-A-TCGATA------TCTCACCTA-----------GTTCGCTCTTGTGCA---TTT-TGGTTTAAA--TACTC--TG-TTT---TCGGT---AAT--------TA-TTATGCAGTTACGATC----CTT--G--AT---TT-ACATGAATCAAATCTCAGCTCTGTTAAA-CCAC-T-AT--ACGCCTGGAAAG-AA-AATCA-TTGC------GTGCTCA--A----TG---T---TT-CATT-GA-GAGTT--T---T--TATACCTT-TG--AATTTTACAA-CAA---TGGCT----A-TT-TGATAATTTTTGTTTGCG----TGTTGGTGCA--AA---TACT-----CACCA-----TG--TCT------AGTGTTGCTgtaaaacaata
gi|11                         :                                          GCTTA-----------CAT-----------A---GCT-T----TGAA--TTCTG--TACATT---TCGGT---A----------TGATTATG--TG--CGATCATTATTT--T--AA---GTAAAAT-AGTGAAATCTCTGCTTTTTTA-A-TTTC------------TGAAAA-CAA-AACCA-GAGC------GTAT-----A----TA---GAGTTTACTTT-CA-----------------CGC--T-TG--ATTTTCAAAC-TA-------------A-CT-TGACCATTTGTGTACGTG----CATTaa
gi|6                          :                                                        tcaAC-----------A---TTT-TGGATTGAA--TATATAGTACTTT---TTGAT---AAT--------TAATTATA----------CAT------------------AAAC-AAT-----CTCAGCTTTGTT-TGTCTCC-A-AT--ACACCTATAAATCAA-AACCA-GAGC------ATAC-----A----TG---GAGTTT-CTTT-GA-GAGTAATT---CTATACAC--T-TG--ATTTTCAAAA-TAA--A-ACAT----T-CT-TGATTACTTTTGTTCACA----CATTTATACA--AA---AAAT-----CACC------TA--TTT------AGAA-AGCTG
gi|8                          :                                              tacataactttgatT-----------A---TTT-TG--TTTTAGCTGCTG--TAGTTT---TCGGTTGCAATCACGC---TC-TTGTC--AT--CGGGCAT--TTC--ATTAA---AC-AAAT-AATGGAATCTCAGTTTAGTAA-A-CTCC-G-ATGTACA--TGGAAATCAA-AACCA-CTGC------GTAT-----C----TG-------TT-TGTT-TG-GA-------------------------AGTTTT-AAA-TAA--AGGCGT----A--------------TGTTTGCG----TAT-----CA--AA---TACA-----CA-CT-----TAAGTCTTTACAAAGAG-TGCTGctaat
gi|5                          :                                                                         ---TTT-TGGATTGGA--TATTG--TACTTT---TCGAT---AAT--------AAATTACG--GC--CAAGTAT--GT------------T-TAAC-GATAAAATCTCAGCTTCGTT-TA-TTTC-GGAT--GCGCCTATAAATCAA-AACCA-GTGC------GTAC-----A----TA---GAGTTT-CTTT-AA-GAGTA--T---T----TAT--T-TG-----CTCAAAA-TAA--GGATGT----T-CT-TGATCATATTTGTTTGTG----TATTAACGCA--AG---TAAT-----CACC------TA--TTT------TGAG-TATTG
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                 TTGGAAATCAGTGACTG-TTGT------ATAC-----A----TG---GTCTTT-CTTTGTA--AGCA--TCTATAATACGC--T-TG--ATTTTTTAAA---A--A-GTAT----A-CT-GGGTCATTAT-GTTGGCA----TATTCACACACAAA---TACA-----CATGC-----TA--CCT------ATAG-TGCTGt
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Alignments
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Reference ( family-1740 )     : CGGCAATTGTTACAAGACGAAAAATCGATA------ACCAGCCTA-----------GAT----------CATTTTG-G-TT-------GAA-TAC-T-GTACTTTTCGGT---A--AT--------T-----G---T-TA--CGGT--CGATC----ATTT-------AA-----GTAAA-CAATGAAATCTCAGCTTTGTT-ATA-CTTC-GATACGCCTGGAAATCAA-AACCA-NTGCGTAC-----A----T---GGAGTTT-CTTTGA-GAGTA--TTT---ATACGCTTGATTTTCAAAA-T-AA-A-G-CGT----AC-T-TGAT--CATTTTTGTTTGCG----TATT--TACGCAAA---TACG-----CACCT-----TA--TCT------AGAG-TGCTG
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gi|3                          :          aattAAGATGAAAAATTGATACATGTAACCAGCCTACATAGCTAT--GATA---------CATTTTG-GATT-------GGA-TAT-T-GTACTTTTTGGT---A------------------G---T-TA--TGGC--CAAGC----A-------------------AAA-CGATAAA---TCAAGTTTGTTTAT--CTCC-GATGCGCCTTTAAATAAA-AAACA-GAGTGTAC-----C----T---GGAGTTT-CTTTGA-GTGTA--TTT---ATATGCTCGATTTTCAAAA-T-AAGG-G-AGTTGAAAC-TATCAT--CATATTTGTTAGAA----TACT--TACGCAAA---TAAA-----CACC------TA--TCC------TGAGTTGCTt
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gi|5                          :                              A------ACCGACCTA-----------CGT----------AACTTTG-G-TTTTGGATTGGA-TAT-T-GTACTTTTCGAT---A--AT--------A-----AA--T-TA--CGGC--CAAGT----ATGT---------------TTAA-CGATAAAATCTCAGCTTCGTT--TA-TTTCGGATGCGCCTATAAATCAA-AACCA-GTGCGTAC-----A----T---AGAGTTT-CTTTAA-GAGTA--TTT---AT----TTG---CTCAAAA-T-AA-G-GATGT----TC-T-TGAT--CATATTTGTTTGTG----TATT--AACGCAAG---TAAT-----CACC------TA--TTT------TGAG-TATTGaa
gi|6                          :                                              -----------GATA---------CATTTTG-GATT-------GAA-TATATAGTACTTTTTGAT---A--AT--------T-----A-----------------ATT----AT---------AC-----ATAAA-CAAT-----CTCAGCTTTGTT--TGTCTCC-AATACACCTATAAATCAA-AACCA-GAGCATAC-----A----T---GGAGTTT-CTTTGA-GAGTAATTCT---ATACACTTGATTTTCAAAA-T-AA-A-A-CAT----TC-T-TGAT--TACTTTTGTTCACA----CATT--TATACAAA---AAAT-----CACC------TA--TTT------AGAA-AGCTGcta
gi|7                          :                                                                 tacataactttG-G-TT-------TAA-AAC-T-GTGCACTTCAGT---T--AT--------TCTGATGCTCT-TA--GGTT--CAGTC----ATTTTTTTTAAAA-----GCAAG-CAATACAATTT----------------TCC-AGAAGGCTTGGAAATCAGTGACTG-TTGTATAC-----A----T---GGTCTTT-CTTTGT-AAGCA--TCTATAATACGCTTGATTTTTTAA----AA-A-G-TAT----AC-T-GGGT--CA-TTATGTTGGCA----TATTCACACACAAA---TACA-----CATGC-----TA--CCT------ATAG-TGCTGctaat
gi|8                          :                                                                       ATTTTG-T-TT-------TAGCTGC-T-GTAGTTTTCGGTTGCA--ATCACGCTCTT-----G---T-CA-----T--CGGGC----ATTTCATT---AA-----ACAAA-TAATGGAATCTCAG-TTTAGT-AAA-CTCC-GATGTACATGGAAATCAA-AACCA-CTGCGTAT-----C----T------GTTT-GTTTGG-AAGT---TTT-------------------AAA-T-AA-AGG-CGT----A----------------TGTTTGCG----TAT-------CAAA---TACA-----CA-CT-----TAAGTCTTTACAAAGAG-TGCTGa
gi|9                          :                                                                                                            tGT---A--GT--------T-----G---C-TG--TGGT--TGGTC----G-------------------AAA-CAGTGAAAACTCCGCTTTGTT--TA-TCTCAGATACGCCTGAAAATCAT-AACCAGCTGCACGCTGGTTA----TGAAGGAGTTT-TTTTTATGAGCA--TTT---ATAACCACGATTATCAAAA---AA-A-G-GATG---AC-T-TGATTCCA--TCTGTTTGTG----TA





Alignments
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gi|3                          :          aattAAGATGAAAAATTGATACATGTAACCAGCCTACATAGCTAT--G---------ATA-C----ATTTTG-GAT-T-GGA-TA---T-T-G-TACTTTTTGGT---A------------------G---T-TATG--GC--CAAGC----A-------------------AAA-CGATAAA---TCAAGTTTGTTTAT--CTCC-GATGCGCCTTTAAATAAA-AAACA-GAGTGTAC-----C----T---GGAGTTT-CTTTGA-GTGTA--TTT---ATATGCTCGATTTTCAAAA-T-AAGG-G-AGTTGAAAC-TATCAT--CATATTTGTTAGAA----TACT--TACGCAAA---TAAA-----CACC------TA--TCC------TGAGTTGCTt
gi|4                          :                        ATCGATA------TCTCACCTA-----------GTTCGCTCTTGTG-C----ATTTTG-G-T-TTAAA-TA---C-T-C-TG-TTTTCGGT---A--AT--------T-----A---T-TATGCAGTTACGATCCTTGATTT-------AC-----ATGAA----TCAAATCTCAGCTCTGTT-AAA-CCAC-TATACGCCTGGAAAG-AA-AATCA-TTGCGTGC-----T----C---AATGTTT-CATTGA-GAGTT--TTT---ATACCTTTGAATTTTACAA-C-AATG-G-C-T----AT-T-TGAT--AATTTTTGTTTGCG----TGTT--GGTGCAAA---TACT-----CACCA-----TG--TCT------AGTGTTGCTaat
gi|5                          :                              A------ACCGACCTA-----------C---------GTAACTTTGGTTTTG-GAT-T-GGA-TA---T-T-G-TACTTTTCGAT---A--AT--------A-----AA--T-TACG--GC--CAAGT----ATGT---------------TTAA-CGATAAAATCTCAGCTTCGTT--TA-TTTCGGATGCGCCTATAAATCAA-AACCA-GTGCGTAC-----A----T---AGAGTTT-CTTTAA-GAGTA--TTT---ATTTGC-------TCAAAA-T-AA-G-GATGT----TC-T-TGAT--CATATTTGTTTGTG----TATT--AACGCAAG---TAAT-----CACC------TA--TTT------TGAG-TATTGaa
gi|6                          :                                              -----------G---------ATA-C----ATTTTG-GAT-T-GAA-TA---TATAG-TACTTTTTGAT---A--AT--------T-----A-----------------ATT----AT---------AC-----ATAAA-CAAT-----CTCAGCTTTGTT--TGTCTCC-AATACACCTATAAATCAA-AACCA-GAGCATAC-----A----T---GGAGTTT-CTTTGA-GAGTAATTCT---ATACACTTGATTTTCAAAA-T-AA-A-A-CAT----TC-T-TGAT--TACTTTTGTTCACA----CATT--TATACAAA---AAAT-----CACC------TA--TTT------AGAA-AGCTGcta
gi|7                          :                                                                      tacataactttG-G-T-T-TAA-AA---C-T-G-TGCACTTCAGT---T--AT--------TCTGATGCTCT-TAGG--TT--CAGTC----ATTTTTTTTAAAA-----GCAAG-CAATACAATTT----------------TCC-AGAAGGCTTGGAAATCAGTGACTG-TTGTATAC-----A----T---GGTCTTT-CTTTGT-AAGCA--TCTATAATACGCTTGATTTTTTAA----AA-A-G-TAT----AC-T-GGGT--CA-TTATGTTGGCA----TATTCACACACAAA---TACA-----CATGC-----TA--CCT------ATAG-TGCTGctaat
gi|8                          :                                                                        ----ATTTTG-T-T-T-TAGCTG---C-T-G-TAGTTTTCGGTTGCA--ATCACGCTCTT-----G---T-CA-----T--CGGGC----ATTTCATT---AA-----ACAAA-TAATGGAATCTCAG-TTTAGT-AAA-CTCC-GATGTACATGGAAATCAA-AACCA-CTGCGTAT-----C----T------GTTT-GTTTGG-AAGT---TTT-------------------AAA-TAAA-G-G-CGT----A----------------TGTTTGCG----TAT-------CAAA---TACA-----CA-CT-----TAAGTCTTTACAAAGAG-TGCTGa
gi|9                          :                                     tCCAGTCTA-----------C---------ATA-G----ATTT-G-A-TAT-AAT-TAGGGT-T-GATACT-----GT---A--GT--------T-----G---C-TGTG--GT--TGGTC----G-------------------AAA-CAGTGAAAACTCCGCTTTGTT--TA-TCTCAGATACGCCTGAAAATCAT-AACCAGCTGCACGCTGGTTA----TGAAGGAGTTT-TTTTTATGAGCA--TTT---ATAACCACGATTATCAAAA-A-AA-G-G-ATG----AC-T-TGATTCCA--TCTGTTTGTG----TA





Alignments
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Reference ( family-1740 )     : CGATAATTGTTACAAGACGAAAAATCGATA------ACCNGCCTA-----------G---------ATA-C----ATTTTG-G-T-T-GAA-TA---C-T-G-TACTTTTCGGT---A--AT--------T-----G---T-TACG--GT--CGATC----ATTT-------AA-----GTAAA-CAATGAAATCTCAGCTTTGTT-ATA-CTTC-GATACGCCTGGAAATCAA-AACCA-NTGCGTAC-----A----T---GGAGTTT-CTTTGA-GAGTA--TTT---ATACGCTCGATTTTCAAAA-T-AA-G-G-CGT----AC-T-TGAT--CATTTTTGTTTGCG----TATT--TACGCAAA---TACG-----CACCT-----TA--TCT------AGAG-TGCTG
gi|1                          : CGGTAATTGTTACAAGATGAAACATTGATA------ACCAGCCTA-----------G---------AT--C----ATTTTG---T-T-GAA-TA---C-T-T-TACTTTTCTGT---A--AT--------T-----G---T-TACG--GT--CAATC----ATCTCTCG---AA-----GTAAA-CAATGAATTCTCAGTTACGGT-ATT-TTTC-GATACGATTGGAAATCAA-AATCA-TTGCATAC-----A----T---GGAGATT-CTTATA-GAGTA--TTT---ATACACTTTATTTTCAAAA-C-AA-T-G-TGT----AC-T-TGAT--CATTTTTGTTTGTG----TATT--TACGAAAA---TACG-----CACAT-----TA--TCT------AGAG-TGCTG
gi|10                         :                                                                                              A---C-T-G-TACTTTTAGGT---A--AT--------T-----A---T-TACA---C--CGGTC----ATTT-------AAAAAAAGTAAC-CAATAAAATTTCAGCCATGTTTAT--CTTC-GATACAAGTAGAAATCAA-AACAA-ATGCATAC-----T----T---AATGTTT-CTTTGG-AAAAA--ATT---AAACACTTAATTTCCACAA-C-AA-----------------------CA-TTTTGTTTGCC----TGTT--TACATAAA---TATT-----TGTCT-----TG--CCT------GGAG-TGCTG
gi|11                         :                                                                                   c-T-T-GAA-TT---C-T-G-TACATTTCGGT---ATGAT--------T-----A---TGTGCG--AT--C-ATT----ATTTT------AA-----GTAAAATAGTGAAATCTCTGCTTTTTT-A-A-TTTC---------TGAAAA-CAA-AACCA-GAGCGTAT-----A----T---AGAGTTTACTTT-----------------CACGCTTGATTTTCAAAC-T-A-------------AC-T-TGAC--CATTTGTGTACGTG----CATT--
gi|12                         :                                                                                                                                                                        tcagcttacatagctAA-CAATGAAATCTCATTTCTGTT-GAG-CTAT-TATATGCATGGTCACCAA-AACCC-ATGCATAC-----AATAAT---GGAGTTT-CTT-------------------------GATTTTCAAAAAT-AA-CTG-CAT----AC-C-TGAC--CATTTTTGTTTGCG----TATT--TTTGTAAAT--TATG-----CACCT-----TA--TCT------AGAG-TGCTG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                A-CTG-GTAC-----A----T---CATGTTT-GTTTGT-GAGTA--TTT---ATACACCTAATTTTCAAAT-TAAA-A-G-TGTA---ACAT-AGA----AATTTTGTTTGCATAATTATT--CATGCAAAT--TAGG-----CATCT-----TA--CCT------AAAG-TGTTt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                           aattattgcttATCAA-AACCA-GGGCATAC-----A----T---GTAGCTT-CTTTGA-GAGTA--TTT---ATATGCTAGATTTTCAAAA-G-A----G-CGT----TC-T-TGAT--TATTTTTGTTCACA----TATT--TATGCAAC---TAGG-----CAACTAACTATA--TCT------AGAA-TGCTG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                    AAATCAA-A-CCA-GAGCGTAC-----A----T---GGCGTTC-CTTTGA-GAGTA--TTT---AGACTTTCCATTTTCAAAA-T-AA-G-GACAA----AG-T-TGAT--CATTT---TTTGCA----CATT--TACACAAA---TATA-----CACCT-----TA--TCT------AGAG-TACTG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                             ACCA-GCACGTAC-----A----T---GGAGTTT-CTTTAT-GAGTA--TTT---ATACACTCAATGTTCAAAA-T-AA-G-G--GT----AT-----AT----TTTTTGTTTGCA----CATT--TGAGTAAAATTTCCA-----AACCT-----TA--TTT------GGAG-TGCTcta
gi|17                         : CGACAATTGTTACAAGACGAAAAATCGATA------ACCTGCCTA-----------G---------AT--C----ATTTT--G-T-T-GAA-TA---C-T-T-TACTTTTc
gi|18                         :                GAAGAAAACTTGATA------ATCAGCCTACAGAGCTTTCTG---------ATA-C----ATTTTATA-T-T-GAA-TA---T-A-G-TACTTTT-GGC---A--AT--------T-----A---T-TATG--GT--TGAgctctgcaattaggccactgttatggcaatc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctAGTA--TTT---ATACAACTGATTTT----A---AG-G-G-CAT----AC-T-TGAC--AATATCTGTTAGAG----AATC--TACACAAA---TACG-----CATCT-----TA--TCT------TGAA-TGTTGgtaaaacaata
gi|2                          : CGATAATTGTTACAAGACGAAAA-TCGATA------ACCCGCCTA-----------G---------ATA-------TTTTG---T-T-GAA-TA---C-T-T-TACTTTTCGGT---A--AT--------T-----G---T-TATG--GT--CGATC----ATCTCG-----AA-----GTAAA-CAATGATTTCTCAGGTACGTT-ATA-CTTC-GATACGATTGGAAATCAA-AATCA-TTGCGTAC-----A----T---GGAGATT-CTTTTA-GAGTA--TTA---ATGTACTTGATTTTTAAAA-C-AA-ATG-CGT----AC-T-TGAT--AATTTTTGTTTGCG----TATT--TACGCAAA---TACG-----CACCT-----TA--TCT------AGAG-TGCTGtttgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GT----AC-T-AGAC--TAGTTTTGTTTGCA----TATT--TATGCAAA---TATATTCACCACCT-----TA--TCT------AAGG-TATTG
gi|3                          :          aattAAGATGAAAAATTGATACATGTAACCAGCCTACATAGCTAT--G---------ATA-C----ATTTTG-GAT-T-GGA-TA---T-T-G-TACTTTTTGGT---A------------------G---T-TATG--GC--CAAGC----A-------------------AAA-CGATAAA---TCAAGTTTGTTTAT--CTCC-GATGCGCCTTTAAATAAA-AAACA-GAGTGTAC-----C----T---GGAGTTT-CTTTGA-GTGTA--TTT---ATATGCTCGATTTTCAAAA-T-AAGG-G-AGTTGAAAC-TATCAT--CATATTTGTTAGAA----TACT--TACGCAAA---TAAA-----CACC------TA--TCC------TGAGTTGCTt
gi|4                          :                        ATCGATA------TCTCACCTA-----------GTTCGCTCTTGTG-C----ATTTTG-G-T-TTAAA-TA---C-T-C-TG-TTTTCGGT---A--AT--------T-----A---T-TATGCAGTTACGATCCTTGATTT-------AC-----ATGAA----TCAAATCTCAGCTCTGTT-AAA-CCAC-TATACGCCTGGAAAG-AA-AATCA-TTGCGTGC-----T----C---AATGTTT-CATTGA-GAGTT--TTT---ATACCTTTGAATTTTACAA-C-AATG-G-C-T----AT-T-TGAT--AATTTTTGTTTGCG----TGTT--GGTGCAAA---TACT-----CACCA-----TG--TCT------AGTGTTGCTaat
gi|5                          :                              A------ACCGACCTA-----------C---------GTAACTTTGGTTTTG-GAT-T-GGA-TA---T-T-G-TACTTTTCGAT---A--AT--------A-----AA--T-TACG--GC--CAAGT----ATGT---------------TTAA-CGATAAAATCTCAGCTTCGTT--TA-TTTCGGATGCGCCTATAAATCAA-AACCA-GTGCGTAC-----A----T---AGAGTTT-CTTTAA-GAGTA--TTT---ATTTGC-------TCAAAA-T-AA-G-GATGT----TC-T-TGAT--CATATTTGTTTGTG----TATT--AACGCAAG---TAAT-----CACC------TA--TTT------TGAG-TATTGaa
gi|6                          :                                              -----------G---------ATA-C----ATTTTG-GAT-T-GAA-TA---TATAG-TACTTTTTGAT---A--AT--------T-----A-----------------ATT----AT---------AC-----ATAAA-CAAT-----CTCAGCTTTGTT--TGTCTCC-AATACACCTATAAATCAA-AACCA-GAGCATAC-----A----T---GGAGTTT-CTTTGA-GAGTAATTCT---ATACACTTGATTTTCAAAA-T-AA-A-A-CAT----TC-T-TGAT--TACTTTTGTTCACA----CATT--TATACAAA---AAAT-----CACC------TA--TTT------AGAA-AGCTGcta
gi|7                          :                                                                      tacataactttG-G-T-T-TAA-AA---C-T-G-TGCACTTCAGT---T--AT--------TCTGATGCTCT-TAGG--TT--CAGTC----ATTTTTTTTAAAA-----GCAAG-CAATACAATTT----------------TCC-AGAAGGCTTGGAAATCAGTGACTG-TTGTATAC-----A----T---GGTCTTT-CTTTGT-AAGCA--TCTATAATACGCTTGATTTTTTAA----AA-A-G-TAT----AC-T-GGGT--CA-TTATGTTGGCA----TATTCACACACAAA---TACA-----CATGC-----TA--CCT------ATAG-TGCTGctaat
gi|8                          :                                                                        ----ATTTTG-T-T-T-TAGCTG---C-T-G-TAGTTTTCGGTTGCA--ATCACGCTCTT-----G---T-CA-----T--CGGGC----ATTTCATT---AA-----ACAAA-TAATGGAATCTCAG-TTTAGT-AAA-CTCC-GATGTACATGGAAATCAA-AACCA-CTGCGTAT-----C----T------GTTT-GTTTGG-AAGT---TTT-------------------AAA-TAAA-G-G-CGT----A----------------TGTTTGCG----TAT-------CAAA---TACA-----CA-CT-----TAAGTCTTTACAAAGAG-TGCTGa
gi|9                          :                                     tCCAGTCTA-----------C---------ATA-G----ATTT-G-A-TAT-AAT-TAGGGT-T-GATACT-----GT---A--GT--------T-----G---C-TGTG--GT--TGGTC----G-------------------AAA-CAGTGAAAACTCCGCTTTGTT--TA-TCTCAGATACGCCTGAAAATCAT-AACCAGCTGCACGCTGGTTA----TGAAGGAGTTT-TTTTTATGAGCA--TTT---ATAACCACGATTATCAAAA-A-AA-G-G-ATG----AC-T-TGATTCCA--TCTGTTTGTG----TA


blockSeqs                     :                  C     A      CATGTA   T     CAGAGCTTTCTGATAC                    TA  A T   C  GGG A AG        A   TGC TG  TCTGATGCTCTTAGGTTCAGTCATTTTTTTTAAAAG                          A    A  A      C A    TAT      GG      G          T     GC       TGGTTA     GAA       A    TAT     AT   ATA    ACTT           AT   GGGAGTTGAA    A A    TCC T           TAAT    CA        ATT  TATTCAC    TAACTA  AG   TTACAA    T
blockSeqs                     :                  A     C      .        A     CATAGCTATGATAC                      GA  . .   .  .   . GA        C   .   .   CACGCTCTTGTCATCGGGCATTTCATTAAA                                .    G  A      C T    GAG      AG      A          .     A        AATAA      .         .    GG      .    .      GCTT           TA   CTGCAT        . .    C   T           .       .         T    TT         T       .    .         T
blockSeqs                     :                  C     A      .        C     GTTCGCTCTTGTGC                      GA  . .   .  .   . G         C   .   .   TATTATGCAGTTACGATCCTTGATTTACA                                 .    G  A      T C    ATA      G       T          .     G        T          .         .    GT      .    .      ACCT           TA   AGTGTA        . .    C   A           .       .         T    TG         T       .    .         .
blockSeqs                     :                  T     A      .        A     CGTAACTTTG                          GA  . .   .  .   . G         T   .   .   TATTACACCGGTCATTTAAAAAAAG                                     .    G  T      G A    TAT      T       C          .     A        A          .         .    GA      .    .      GCTA           C    GGACAA        . .    C   T           .       .         .    GG         T       .    .         .
blockSeqs                     :                        .      .        C     GATAC                               G   . .   .  .   . T         C   .   .   TGTTATGGTCGATCATCTCGAAG                                       .    A  A      G T    AAA      G       C          .     C        A          .         .    GA      .    .      TTTC           T    ATGCGT        . .    T   T           .       .         .    GG         T       .    .         .
blockSeqs                     :                               .        G     CATAG                               G   . .   .  .   . G         C   .   .   TATGTGCGATCATTATTTTAAG                                        .    C  A      C C    TGT      G       C          .     G        A          .         .    AT      .    .      ACTC           G    GGATGT        . .    C   T           .       .         .    TA         T       .    .         .
blockSeqs                     :                                        A     GATC                                G   . .   .  .   . T         T   .   .   AAATTACGGCCAAGTATGT                                           .    A  A      C T    AAA      T       C          .     G        A          .         .    TA      .    .      AACT           T    GGCAT         . .    A   T           .       .         .    CA         T       .    .         .
blockSeqs                     :                                              GATA                                T   . .   .  .   . G         C   .   .   TGCTGTGGTTGGTCG                                               .    A  A      C T    AA       A       T          .     G        A          .         .    GA      .    .      ACTT           T    TGGCT         . .    A   T           .       .         .    CG         T       .    .         .
blockSeqs                     :                                                                                  A   . .   .  .   . C         C   .   .   GTTATGGCCAAGCA                                                .    G  A      C T    TA       A       A          .     T        A          .         .    GA      .    .      GCTC           C    AACAT         . .    T   G           .       .         .    CG         T       .    .         .
blockSeqs                     :                                                                                  .   . .   .  .   . G         .   .   .   TAATTATACA                                                    .    G  .      . T    TA       G       C          .     G        C          .         .    AA      .    .      CTTT           T    AGTAT         . .    C   T           .       .         .    AA         A       .    .         .
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blockSeqCons                  :                                              CTAGCTTGATAC******************      GA*
originalCons                  : CGATAATTGTTACAAGACGAAAAATCGATA------ACCNGCCTA-----------G---------ATA-C----ATTTTG-G-T-T-GAA-TA---C-T-G-TACTTTTCGGT---A--AT--------T-----G---T-TACG--GT--CGATC----ATTT-------AA-----GTAAA-CAATGAAATCTCAGCTTTGTT-ATA-CTTC-GATACGCCTGGAAATCAA-AACCA-NTGCGTAC-----A----T---GGAGTTT-CTTTGA-GAGTA--TTT---ATACGCTCGATTTTCAAAA-T-AA-G-G-CGT----AC-T-TGAT--CATTTTTGTTTGCG----TATT--TACGCAAA---TACG-----CACCT-----TA--TCT------AGAG-TGCTG
finalCons                     : CGATAATTGTTACAAGACGAAAAATCGATA------ACCNGCCTACTAGCTTGATAC------------------ATTTTGGA-T-T-GAA-TA---C-T-G-TACTTTTCGGT---A--AT--------T-----G---T-TACG--GT--CGATC----ATTT-------AA-----GTAAA-CAATGAAATCTCAGCTTTGTT-ATA-CTTC-GATACGCCTGGAAATCAA-AACCA-NTGCGTAC-----A----T---GGAGTTT-CTTTGA-GAGTA--TTT---ATACGCTCGATTTTCAAAA-T-AA-G-G-CGT----AC-T-TGAT--CATTTTTGTTTGCG----TATT--TACGCAAA---TACG-----CACCT-----TA--TCT------AGAG-TGCTG





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Reference ( family-1740 )     :                  CGATAATTGTTACAAGACGAAAAATCGATA------ACCNGCCTA-----C-TAG-CT-T---GATACATTTTGGATTGAATAC-T-GTACTTTTCGGT---A--AT--------TG-T-TACG--GT--CGATC----ATTT----AA-----GTAAA-CAATGAAATCTCAGCTTTGTT-ATA-CTTC-GATACGCCTGGAAATCAA-AACCA-NTGCGTAC-----A----T---GGAGTTT-CTTTGA-GAGTA--TTT---ATACGCTCGATTTTCAAAA-T-AA-G-G-CGT----AC-T-TGAT--CATTTTTGTTTGCG----TATT--TACGCAAA---TACG-----CACCT-----TA--TCT------AGAG-TGCTG
gi|1                          :                  CGGTAATTGTTACAAGATGAAACATTGATA------ACCAGCCTA------------------GAT-CATTTTG--TTGAATAC-T-TTACTTTTCTGT---A--AT--------TG-T-TACG--GT--CAATC----ATCTCTCGAA-----GTAAA-CAATGAATTCTCAGTTACGGT-ATT-TTTC-GATACGATTGGAAATCAA-AATCA-TTGCATAC-----A----T---GGAGATT-CTTATA-GAGTA--TTT---ATACACTTTATTTTCAAAA-C-AA-T-G-TGT----AC-T-TGAT--CATTTTTGTTTGTG----TATT--TACGAAAA---TACG-----CACAT-----TA--TCT------AGAG-TGCTG
gi|10                         :                                                                                                    AC-T-GTACTTTTAGGT---A--AT--------TA-T-TACA---C--CGGTC----ATTT----AAAAAAAGTAAC-CAATAAAATTTCAGCCATGTTTAT--CTTC-GATACAAGTAGAAATCAA-AACAA-ATGCATAC-----T----T---AATGTTT-CTTTGG-AAAAA--ATT---AAACACTTAATTTCCACAA-C-AA-----------------------CA-TTTTGTTTGCC----TGTT--TACATAAA---TATT-----TGTCT-----TG--CCT------GGAG-TGCTG
gi|11                         :                                                                                             cTTGAATTC-T-GTACATTTCGGT---ATGAT--------TA-TGTGCG--AT--C-ATT----ATTTT---AA-----GTAAAATAGTGAAATCTCTGCTTTTTT-A-A-TTTC---------TGAAAA-CAA-AACCA-GAGCGTAT-----A----T---AGAGTTTACTTT-----------------CACGCTTGATTTTCAAAC-T-A-------------AC-T-TGAC--CATTTGTGTACGTG----CATT--
gi|12                         :                                                                                                                                                                tcagcttacatagctAA-CAATGAAATCTCATTTCTGTT-GAG-CTAT-TATATGCATGGTCACCAA-AACCC-ATGCATAC-----AATAAT---GGAGTTT-CTT-------------------------GATTTTCAAAAAT-AA-CTG-CAT----AC-C-TGAC--CATTTTTGTTTGCG----TATT--TTTGTAAAT--TATG-----CACCT-----TA--TCT------AGAG-TGCTG
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                        A-CTG-GTAC-----A----T---CATGTTT-GTTTGT-GAGTA--TTT---ATACACCTAATTTTCAAAT-TAAA-A-G-TGTA---ACAT-AGA----AATTTTGTTTGCATAATTATT--CATGCAAAT--TAGG-----CATCT-----TA--CCT------AAAG-TGTTt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                   aattattgcttATCAA-AACCA-GGGCATAC-----A----T---GTAGCTT-CTTTGA-GAGTA--TTT---ATATGCTAGATTTTCAAAA-G-A----G-CGT----TC-T-TGAT--TATTTTTGTTCACA----TATT--TATGCAAC---TAGG-----CAACTAACTATA--TCT------AGAA-TGCTG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                            AAATCAA-A-CCA-GAGCGTAC-----A----T---GGCGTTC-CTTTGA-GAGTA--TTT---AGACTTTCCATTTTCAAAA-T-AA-G-GACAA----AG-T-TGAT--CATTT---TTTGCA----CATT--TACACAAA---TATA-----CACCT-----TA--TCT------AGAG-TACTG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                     ACCA-GCACGTAC-----A----T---GGAGTTT-CTTTAT-GAGTA--TTT---ATACACTCAATGTTCAAAA-T-AA-G-G--GT----AT-----AT----TTTTTGTTTGCA----CATT--TGAGTAAAATTTCCA-----AACCT-----TA--TTT------GGAG-TGCTcta
gi|17                         :                  CGACAATTGTTACAAGACGAAAAATCGATA------ACCTGCCTA------------------GAT-CATTTTG--TTGAATAC-T-TTACTTTTc
gi|18                         :                                 GAAGAAAACTTGATA------ATCAGCCTA-----CAGAG-CT-TTCTGATACATTTTATATTGAATAT-A-GTACTTTT-GGC---A--AT--------TA-T-TATG--GT--TGAgctctgcaattaggccactgttatggcaatc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                              ctAGTA--TTT---ATACAACTGATTTT----A---AG-G-G-CAT----AC-T-TGAC--AATATCTGTTAGAG----AATC--TACACAAA---TACG-----CATCT-----TA--TCT------TGAA-TGTTGgtaaaacaata
gi|2                          :                  CGATAATTGTTACAAGACGAAAA-TCGATA------ACCCGCCTA------------------GATA--TTTTG--TTGAATAC-T-TTACTTTTCGGT---A--AT--------TG-T-TATG--GT--CGATC----ATCTCG--AA-----GTAAA-CAATGATTTCTCAGGTACGTT-ATA-CTTC-GATACGATTGGAAATCAA-AATCA-TTGCGTAC-----A----T---GGAGATT-CTTTTA-GAGTA--TTA---ATGTACTTGATTTTTAAAA-C-AA-ATG-CGT----AC-T-TGAT--AATTTTTGTTTGCG----TATT--TACGCAAA---TACG-----CACCT-----TA--TCT------AGAG-TGCTGtttgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GT----AC-T-AGAC--TAGTTTTGTTTGCA----TATT--TATGCAAA---TATATTCACCACCT-----TA--TCT------AAGG-TATTG
gi|3                          :                           aattAAGATGAAAAATTGATACATGTAACCAGCCTA-----CATAG-CTAT---GATACATTTTGGATTGGATAT-T-GTACTTTTTGGT---A-------------G-T-TATG--GC--CAAGC----A----------------AAA-CGATAAA---TCAAGTTTGTTTAT--CTCC-GATGCGCCTTTAAATAAA-AAACA-GAGTGTAC-----C----T---GGAGTTT-CTTTGA-GTGTA--TTT---ATATGCTCGATTTTCAAAA-T-AAGG-G-AGTTGAAAC-TATCAT--CATATTTGTTAGAA----TACT--TACGCAAA---TAAA-----CACC------TA--TCC------TGAGTTGCTt
gi|4                          :                                         ATCGATA------TCTCACCTAGTTCGC-T---CT-T---G-TGCATTTTGGTTTAAATAC-T-CTG-TTTTCGGT---A--AT--------TA-T-TATGCAGTTACGATCCTTGATTT----AC-----ATGAA----TCAAATCTCAGCTCTGTT-AAA-CCAC-TATACGCCTGGAAAG-AA-AATCA-TTGCGTGC-----T----C---AATGTTT-CATTGA-GAGTT--TTT---ATACCTTTGAATTTTACAA-C-AATG-G-C-T----AT-T-TGAT--AATTTTTGTTTGCG----TGTT--GGTGCAAA---TACT-----CACCA-----TG--TCT------AGTGTTGCTaat
gi|5                          :                                               A------ACCGACCTA-----CGTAA-CT-T-----TG-GTTTTGGATTGGATAT-T-GTACTTTTCGAT---A--AT--------AAAT-TACG--GC--CAAGT----ATGT------------TTAA-CGATAAAATCTCAGCTTCGTT--TA-TTTCGGATGCGCCTATAAATCAA-AACCA-GTGCGTAC-----A----T---AGAGTTT-CTTTAA-GAGTA--TTT---ATTTGC-------TCAAAA-T-AA-G-GATGT----TC-T-TGAT--CATATTTGTTTGTG----TATT--AACGCAAG---TAAT-----CACC------TA--TTT------TGAG-TATTGaa
gi|6                          :                                                                           T-T---GATACATTTTGGATTGAATATATAGTACTTTTTGAT---A--AT--------TA---------------ATT----AT------AC-----ATAAA-CAAT-----CTCAGCTTTGTT--TGTCTCC-AATACACCTATAAATCAA-AACCA-GAGCATAC-----A----T---GGAGTTT-CTTTGA-GAGTAATTCT---ATACACTTGATTTTCAAAA-T-AA-A-A-CAT----TC-T-TGAT--TACTTTTGTTCACA----CATT--TATACAAA---AAAT-----CACC------TA--TTT------AGAA-AGCTGcta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                             tacataactGCTTGGAAATCAGTGACTG-TTGTATAC-----A----T---GGTCTTT-CTTTGT-AAGCA--TCTATAATACGCTTGATTTTTTAA----AA-A-G-TAT----AC-T-GGGT--CA-TTATGTTGGCA----TATTCACACACAAA---TACA-----CATGC-----TA--CCT------ATAG-TGCTGctaat
gi|8                          : ggtttaaaactgtgcacttcagttattctgatgctcttaggttcagtcattttttttaaaagcaagcaatacaattttccagaagATTTTGTTTTAGCTGC-T-GTAGTTTTCGGTTGCA--ATCACGCTCTTG-T-CA-----T--CGGGC----ATTTCATTAA-----ACAAA-TAATGGAATCTCAG-TTTAGT-AAA-CTCC-GATGTACATGGAAATCAA-AACCA-CTGCGTAT-----C----T------GTTT-GTTTGG-AAGT---TTT-------------------AAA-TAAA-G-G-CGT----A----------------TGTTTGCG----TAT-------CAAA---TACA-----CA-CT-----TAAGTCTTTACAAAGAG-TGCTGa
gi|9                          :                                                      tCCAGTCTA-----CATAGATT-T---GATATAATTAGGGTTGA--------TACT-----GT---A--GT--------TG-C-TGTG--GT--TGGTC----G----------------AAA-CAGTGAAAACTCCGCTTTGTT--TA-TCTCAGATACGCCTGAAAATCAT-AACCAGCTGCACGCTGGTTA----TGAAGGAGTTT-TTTTTATGAGCA--TTT---ATAACCACGATTATCAAAA-A-AA-G-G-ATG----AC-T-TGATTCCA--TCTGTTTGTG----TA