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lowQualScore : 33333333333 666666666666666666666666666666666666666666666666 11 444444444444444444444444 77777777777777777777777777777777777 22 111 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111111 111 1111111111 1 333 11111 33333 33333333 111 222222222222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 1 11 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 1 111 11 1 1 5555555555555 11 1 55555555555555555555555555555 1 11 77777777 4444444 2222 111 1 55555555555 1 1 88888888888 44 111 11 1 555555555 555555555555555555555555555555555 2 1 1 8888 55 2222 1 1 33 00000000000000000000000000000000000000000000000000000 22 1 1 1 4 1 1 11
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lowQualScore : . ........... .. . . ... ................................................ . .. .. . . . ... . ........................ . ..... ................................... . . . .. ... . . .......................................................................................................... .... . ......... . ... .. .. . .......... . . ... . . ..... . . ..... .. ........ . . .. . ... . . .. ............ . ....................................................................................................................... . . . . .. . . . . . .. . ........................................................ . . . . . ... . .. . . . . . . . .. ............. . .. .... . .. . ............................. . .. ........ ....... . .... . ... . ........... . . ........... .. . ... . . .. . . . ......... . . ................................. . . . . . .. . .... .. . . .... . . . . .. . . ..................................................... . . .. . . . . . . . .. . . .
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consensus : CGAGGCCATCCCGCACTAAACCGTAC-A-----A---CGTA--TGATANTTATTTT---ACA---A-A---GTCATTATGACTTATG----AGCA-------A---AAC-AAG--AATA--TAAACAA-ACACA-TT-T---T-AT----G-A--TT-TTTTTTAAATATTCAATGGCGGAAATCAGTGTG-----ACT------------A-----T---T--TT---TN---CAA-TACTTATCAAATGA-A--AAA---AAATTCAAAA-TGA-G--A--------T--------GTTTTT-AC---AA----AA-------AA----AAA-G--ACT--T-----AT---NAG--------G-ACAGGAGAGAA---GAAATATCTCGAGTAAGCAT----TTGATAG---------TTACACATN--TGTTTT-A--AATA-TT-A-------AANATTTACTTGTA-AAAACAAAACAGCA----GATTTACCA-A-TAAT-NACTTTTT-TTAAG-AATTGTGTT-TTTC--CTTAATTCAAAANATTTAAATATATACATTGC-ANNATT-------T--TGCATAT-C--TCGTC-T-NAG-CTT-------T---C-----------------AG---NCT-------TAAACA-----------------TGC-TANNA-------TGTCTTAATA-------AAATAAGGT-T-TAATGTATTTTTTTCTTAAATCGTTATACATTTGACATTCAA-ACATAAAATGAAATTCATCTTCTAACACAGAACATA-----CAGTACATNNC--CTATTTTCNCTACCT-TT-TG-TG-GTTTT-C----CGACGACCCGCTTCGATTTCGAGACGATGTNAAGAAACCC---TNAGTNGTGTTAAGGCAACCCTAAATTTNCTTACGTTTACAATATTAAGATATGGT-------------TGAAATTTA-AAATCTAAAA-TACNACGATAAAAAGTT-CCCTACTT-A-T-ATTTAGACG-TCGTTTCGGTTTTGT--ACAA----ANT-TATCATTTAGGCGCTGTNTCGAAATNNNTNAGANANATTTTTT-TTACCGAGCGTTTGCTGATACAAGACGT-AT--TTATAACCTAGATC-AAATNATTNCNTNCGGACAAGCGNTNCCCGATCGGCTTTATTTGACATNANTTCCNAANCATTANATTGATAATCTNGTNCACAGTGNAGTNNTGTTTACGTTCACTNACATTTNGCAATTTNANCNNGATTTACATGGTATTTTCAATAATACTAATAAGTCAACGAGTTCTATAACTTAGTCTTCCAAGTGCTCCATAAACATGATAATATTGGCTTGTATTTCTAACTGTAACCATAGC-ACGATTAATTAAAGTGTAAGTTTACCATTT-TATATTGTTAGCTTGATAGAATTTCCAAATCTCGCTACCATGAT
Reference ( gi|1 ) : CGAGGCCATCCCACACTAAACCGTAC-A-----A---CGTA--TGATAATTATTTT---ACA---A-----GTCAGTATGACTTATG----TGCA-------A---AA--AAG--AATA--TAAACAA-ACACA-TT-T---T-AT----G-A--TT-TTTTTTAAATAATCAATGGCGGAAATCAGTGTG-----ACT------------A-----T---T--TT---TC---CAA-TACTTATCAAATGA-A--AAA---AAATTCAAAA-TGA-G--A--------T--------G------AA---AA----AA-------AAA---AAA-G--ACT--T-----AT---TAG--------G-ATAGTAGAGTA---AAAATATCTCGAGTAAGCAT----TTGATAG---------TTACACATT--TGTTTC-A--AATA-TC-A-------AACATTAACTTGTA-GAAACAAAACAACA----AACTTACCA-ATTAAT-AACTTTTT-TTAAA-AATTATGTT-TTTC--CTTAATTCAAAAGATTTAAACATATACATTGC-AATACT-------T--TACATAT-C--TCTTC-T-C---CTT-------T---A-----------------AG---TCT-------TAAACA-----------------TGC-TACTC-------TGTCTTAATG-------AAACAAGAT-T-TAATGCATTATTTTCTTAAATCGTTAAACATTTGACATTCTA-ACATAAAATGAAATTCATCTTCTAACACAGAACATA-----AAGTGCGTGTT--CTATTTTCCCTTCTTTTTTTGTTAGGTTTTGT---CCAACGACCCGCTTCAAGTTCGAGACGCTGTGAAGAAACCC---TAAGTGATGTTAAGACAACCCTTAATTTGCTTACATTGACAATATCAAAATATGGT-------------TGAAACTTA-AAATCCGAAA-TACGACGATAAAAAGTTGCCTTAATTGATTGATTTAGATGGTCGTTTCATTTTTGT--ACAATTTTTTT-TATCATTTTGGCGTTGTTTTGAAATTTTTTAAAAGAATTTATTATTGCCAACACTTTGCAGATACCAGACTTCATCATTGAAACCTAAATTTGAATAATTCTTTACGAACAAGCGATGACCAATTTGTTTGATTTGGCATTGGTTCCATATCATTAAAC--ATCATTCAGTACACAATGTAATATTATTTACGTTCACTTACATTTAGCTATTTCAACAAGAGTTA----GTATTT--AATGATATTAACTATTCTACGAGTTTTATCATTTTCTTTTTCAAGTTCACC---------GTAATTTTGCATTGTGTTTTTAAC----ACAA-AGTAAAGACTGAGCAAATTGTAAGTGTATCCTTTCTATATTTTTAGCTTGAAAGAATCCCCAAACCTCGCCACCATAAT
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gi|8 : attttatttccttgtaacatgtCACAAAACCGTAC-A------------------TAGTCATTTT---ACA---ACAA--GACATTATGACTTACG----AGCA-------A---AAC-AGG--AATA--TAAACAA-AAACA-TT-T---TTAT----G-G--AT-TTTATTAAATACTCAATGGCGGAAATCAGTGTG-----ACT------------A-----TAAAT--TT---TCTTACAA-TTTTTAACAAATGA-AACAAA---AAAATCAAAA-TGA-G--A--------ag
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gi|18 : -T---T-AT----G-G--AT-TTTTTTGAATACTCAGTAGCGAAAATCAGTGCG-----ACT------------AATTT-T---T--TT---TA---CAA-TATTTATCAAATAACAC-AAA---AAATTCAAAA-TGA-A--A--------T--------GTTTTT-AC---AA----CA-------A------------TCTGGT-----AA---TAG--------GAACAGGAGAGAA---GAAATACCTTGAG-AAGTAT----TTGACAG---------TTACACATG--TATTTC-A--AATA-TT-A-------AAatgtata
gi|16 : tg-TTGTTGAACTAGTCAATGGCTGAAATCAGTGTG-----ACT------------AAAATCT---T--CT---TA---CAAGTACTTATCAAATGA-AACAAA---AAATTCAAAA-CGA-GA-A--------T--------GTTTTTTAC---TA----A---------------------ACT--TTATCAAT---AAC--------G-CTAGGAGAAAA---AAAAAATCTCGAGTTAACAA----TTGATAGTAACAAAAATTAAATATTAATGTT---A--AATA-TT-A-------AAGATTTACTTGTT-AAAAC-AAACAGCA----a
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gi|9 : atctgagaaaaaatgtccacaacattttatatgactacaatttaccaG--------A-ATGG-AGAACA---GCAATATCTCTAATAAGCATATATTTAATAG---------TTAAACATA--TATTTTTA--AATA-TCCA-------AAAATTTACTTGTA---AACAAAATAGCA----GATTTACAA-AATTAT-TACTTTAC---AAG-CATTGT-TT-TTCC--CTTAATTCTTAAGATTTAAACATGTCCATTGCAAATG-T-------T--TGCATAT-A--TTGTT-T-G---CTT-------T---C-----------------AGACATATATATATATATACA-----------------TGA-TAAAT-------TGTCTT-ATA-------AAATAAGGTGTATAAGGC-TGAT--------ATCGTTTTACATTTGACATTTAA-ACACAAAAtatacactgtatgatattctatttt
gi|13 : caaaaaaatgaaaatgttttcaaaaaatttgacatagctaaaatttaccaataatAAGCAT----TTACTAG---------TTACACAT----GTTTA-A--CATA-TT-ATGTCAATAAGATTTACTAATA-CAAACAAAAGAGCA----GATTTACCA-AATAAT-TACTTTTT---AAG-AATAGTGTT-TTTC--CTTAAATCTAAAGATTTCGATATATACATTGC-ACGATT-------T--TGCGTAT-C--TCGTCGT-CAG-CTT-------T---C-----------------AG---ACT-------TAAACA-----------------ag
gi|8 : tcttcttacaatactccaaagtttcaaaatgaaaatggtttcacaattacatatattattattatttataaaaaagaataggggagaaAAATAAAACAGCA----TATTTACCA-A---AT-AATTTCTT-TTGAAGAAGTATGCT-TTTC--CGTATTACAAAATATTTAAATTTACACTTTGC-ACTATTAGGCATAT--TGCATAT-A--T--TC-T-CAGACTTAAACAATTGCAA-----------------AG---TTT-------TAAACA-----------------TGC-CATTA-------TGTCTTC-TA-------AAATAAGGT-T-TAATGTACT-TTTTCTTAGACAGTAATTCATTTAACATT-TACACATAAAATGGAATTTATCTTCTAGCACAGAACATA-----CAGAACATGCC--TTATTTattgtatagtttt
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Reference ( family-1706 ) : CGAGGCCATCCCGCACTAAACCGTAC-A-----A---CGTA--TGATANTTATTTTACAA--A----GTCATTATGACTTATGAGCA-------A---AA-C--AAG--AATATAAACAA-ACACA-TT-T---T-AT----G-A--TT-TTTTTTAAATATTCAATGGCGGAAATCAGTGTG-----AC---T------------A------T------T--T-T-TNCAA-TACT------TATCAAA-TGA-A--A--AA---AAATTCAAAA-TGA-G--A-TG-T-TT-TTACAA---A-AA---A--------A-----AAGACTT----------A----T---NAGGACAGGAGAGAA--GAAATATCTCGAGTAAGCAT----TTGATAGTTACA-----CATNTGTT----TT-A--A-ATA-TT-A-------AANATTTACTT--GTA-AAA-ACAAAACAGCAGAT----TTACCA-A-TAATNACTTTTT-TT-AAGAATTGTGTT-TTTC--CTTAATTCAAAANATTTAAATATATACATTGCANNAT-T-------T--------TGC-ATATCTCGTC-TNAG-CTT------TC----AGNC-T---------TA------------------AACA-----------------TGCTANNATGTCTTAATAAAATAAGGT-T-TAATGTATTTTTTTCTTAAATCGTTATACATTTGACATTCAAACATAAAATGAAATTCATCTTCTAACACAGAACATACAGTACATNNCC-TATTTTCNCTAC--CTTTTGT----GGT--------TT--T-C-C-GACGACCCGCTTCGATTTCGAGACGATGTNAAGAAACCC---TNAGTNGTGTTAAGGCAACCCTAAATTTNCTTACGTTTACAATATTAAGATATGG-------------TTGAAAT-T-TAAAATCTAAAA-TACNACGATAAAAAG-TT-CCCTACTT--AT--ATTTAGAC-G-TCGTTTCGGTTTTGTACAA----ANTTATCATTTAGGCGCTGTNTCGAAATNNNTNAGANANATTT-TTTTTACCGAGCGTTTGCTGATACAAGACGT-AT--TTATAACCTAGA-TCAAATNATTNCNTNCGGACAAGCGNTNCCCGATCGGCTTTATTTGACATNANTTCCNAANCATTANATTGATAATCTNGTNCACAGTGNAGTNNTGTTTACGTTCACTNACATTTNGCAATTTNANCNNGATTTACATGGTATTTTCAATAATACTAATAAGTCAACGAGTTCTATAACTTAGTCTTCCAAGTGCTCCATAAACATGATAATATTGGCTTGTATTTCTAACTGTAACCATAGC-ACGATTAATTAAAGTGTAAGTTTACCATTT-TATATTGTTAGCTTGATAGAATTTCCAAATCTCGCTACCATGAT
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Reference ( family-1706 ) : CGAGGCCATCCCGCACTAAACCGTAC-A-----A---CGTA--TGATANTTATTTTACAAC-A-GTCATT-ATGACTTATGAGCA-------A---AA-C--AAG--AATATAAACAA-ACACA-TT-T---T-AT----G-A--TT-TTTTTTAAATATTCAATGGCGGAAATCAGTGTG-----ACT------------A------T------T----CT-TACA-A-TACT------TATCAAA-TGA-A--A--AA---AAATTCAAAA-TGA-G--A-TG-T-TT-TTACAA---A-AA---A--------A-----AAGACTT----------A----TAANGACAGGAGAGAA--GAAATATCTCGAGTAAGCAT----TTGATAGTTACA-----CATGTGTT----TT-A--A-ATA-TT-A-------AANATTTACTT--GTA-AAA-ACAAAACAGCAGAT----TTACCA-A-T-AATNACTTTTT-TT-AAGAATTGTGTT-TTTC--CTTAATTCAAAAGATTTAAATATATACATTGCANNAT-T-------T--------TGC-ATAT---CTC-GTC--T--AGC--TTTCAGA--C-T---------TA------------------AACA-----------------TGCTACAATGTCTTAATAAAATAAGGT-T-TAATGTATTTTTTTCTTAAATCGTTATACATTTGACATTCAAACATAAAATGAAATTCATCTTCTAACACAGAACATACAGTACACGACC-TATTTTCTCTACCCTTT--GT----GGT--------TTT--C-C-GACGACCCGCTTCAATTTCGAGACGATGTGAAGAAACCC---TAAGTTGTGTTAAGGCAACCCTNAATTTNCTTACATTTACAATATTAAGATATGG-------------TTGAAAT-T-TAAAATCTGAAA-TACGACGATAAAAAGTTGCCCTACTTG-ATT-ATTTAGACGGTCGTTTCAGTTTTGTACAA----ANTTATCATTTAGGCGTTGTTTCGAAATATTTAAGAAAAATTTATTNTTGCCGANNNTTTGCNGATACNAGACNTCATCATTGNAACCTAAA-TTAAATAATTCCTTACGAACAAGCGATGCCCGATTTGTTTTATTTGACATCGNTTCCAAATCATTAAAT--ATAATCTAGTACACAATGTA--ATT--GTTTACGTTCACTTACATTTAGCAATTTNAACAAGANTTACATGGTATTTTCAATGATACTAACNANTCNACGAGTTCTATNACTTNNTCTTCCAAGTNCNCCATAAACATGGTAATNTTGNNTTGTGTTTCTAACTGTAACNATAGCAANGACTGANCAAANTGTAAGTNTACCNTTTCTATATTNTTAGCTTGANAGAATCCCCAAACCTCGCCACCATGAT
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Reference ( family-1706 ) : CGAGGCCATCCCGCACTAAACCGTAC-A-----A---CGTA--TGATANTTATTTTACAAC-A-GTCGTT-ATGACTTATGAGCA-------A------AA-C--AAG--AATATAAACAA-ACACA-TT-T---T-AT----G-A--TT-TTTTTTAAATATTCAATGGCGGAAATCAGTGTG-----ACT------------A------T------T--CT-TACA-A-TACT------TATCAAA-TGA-A--A--AA---AAATTCAAAA-TGA-G--A-TG-T-TT-TTACAA---A-AA---A--------A-----AAGACTT----------A----TAANGACAGGAGAGAA--GAAATATCTCGAGTAAGCAT----TTGATAGTTACA-----CATGTGTT----TT-A--A-ATA-TT-A-------AANATTTACTT--GTA-AAA-ACAAAACAGCAGAT----TTACCA-A-T-AATNACTTTTT-TT-AAGAATTGTGTT-TTTC--CTTAATTCAAAAGATTTAAATATATACATTGCANNAT-T-------T--------TGC-ATAT---CTC-GTC--T--AGC--TTTCAGA--C-T---------TA------------------AACA-----------------TGCTACAATGTCTTAATAAAATAAGGT-T-TAATGTATTTTTTTCTTAAATCGTTATACATTTGACATTCAAACATAAAATGAAATTCATCTTCTAACACAGAACATACAGTACACGACC-TATTTTCTCTACCCTTT--GT----GGT--------TTTG-C-CGACGACCCGCTTCAATTTCGAGACGATGTGAAGAAACCC---TAAGTTGTGTTAAGGCAACCCTNAATTTNCTTACATTTACAATATTAAGATATGG-------------TTGAAAT-T-TAAAATCTGAAA-TACGACGATAAAAAGTTGCCCTACTTG-ATT-ATTTAGACGGTCGTTTCAGTTTTGTACAA----ANTTATCATTTAGGCGTTGTTTCGAAATATTTAAAAAAAATTTATTNTTGCCGANNNTTTGCNGATACNAGACNTCATCATTGNAACCTAAA-TTAAATAATTCCTTACGAACAAGCGATGCCCGATTTGTTTTATTTGACATCGNTTCCAAATCATTAAAT--ATAATCTAGTACACAATGTA--ATT--GTTTACGTTCACTTACATTTAGCAATTTNAACAAGANTTACATGGTATTTTCAATGATACTAACNANTCNACGAGTTCTATNACTTNNTCTTCCAAGTNCNCCATAAACATGGTAATNTTGNNTTGTGTTTCTAACTGTAACNATAGCAANGACTGANCAAANTGTAAGTNTACCNTTTCTATATTNTTAGCTTGANAGAATCCCCAAACCTCGCCACCATGAT
gi|1 : CGAGGCCATCCCACACTAAACCGTAC-A-----A---CGTA--TGATAATTATTTTACAA----GTCAGT-ATGACTTATGTGCA-------A------AA----AAG--AATATAAACAA-ACACA-TT-T---T-AT----G-A--TT-TTTTTTAAATAATCAATGGCGGAAATCAGTGTG-----ACT------------A------T------T--TT-TCCA-A-TACT------TATCAAA-TGA-A--A--AA---AAATTCAAAA-TGA-G--A-TG-A------AAAA---A-AA---A--------A-----AAGACTT----------A----TTAGGATAGTAGAGTA--AAAATATCTCGAGTAAGCAT----TTGATAGTTACA-----CATTTGTT----TC-A--A-ATA-TC-A-------AACATTAACTT--GTA-GAA-ACAAAACAACAAAC----TTACCA-A-TTAATAACTTTTT-TT-AAAAATTATGTT-TTTC--CTTAATTCAAAAGATTTAAACATATACATTGCAATAC-T-------T--------TAC-ATAT---CTC-TTC--T--C-C--TTTAAGT--C-T---------TA------------------AACA-----------------TGCTACTCTGTCTTAATGAAACAAGAT-T-TAATGCATTATTTTCTTAAATCGTTAAACATTTGACATTCTAACATAAAATGAAATTCATCTTCTAACACAGAACATAAAGTGCGTGTTC-TATTTTCCCTTCTTTTTTTGTTA--GGT--------TTTGTC-CAACGACCCGCTTCAAGTTCGAGACGCTGTGAAGAAACCC---TAAGTGATGTTAAGACAACCCTTAATTTGCTTACATTGACAATATCAAAATATGG-------------TTGAAAC-T-TAAAATCCGAAA-TACGACGATAAAAAGTTGCCTTAATTG-ATTGATTTAGATGGTCGTTTCATTTTTGTACAATTTTTTTTATCATTTTGGCGTTGTTTTGAAATTTTTTAAAAGAATTTATTATTGCCAACACTTTGCAGATACCAGACTTCATCATTGAAACCTAAATTTGAATAATTCTTTACGAACAAGCGATGACCAATTTGTTTGATTTGGCATTGGTTCCATATCATTAAAC--ATCATTCAGTACACAATGTAATATT--ATTTACGTTCACTTACATTTAGCTATTTCAACAAGAGTTA----GTATTT--AATGATATTAACTATTCTACGAGTTTTATCATTTTCTTTTTCAAGTTCACC---------GTAATTTTGCATTGTGTTTTTAAC----ACAA-AGTAAAGACTGAGCAAATTGTAAGTGTATCCTTTCTATATTTTTAGCTTGAAAGAATCCCCAAACCTCGCCACCATAAT
gi|10 : GCCACTTCACATCAAACCGTAC-A-----A---GGTA--GGAGAATTATTTTACA---A-GTCATT-AT--------------------------AA-C--AAG--AATATAAACAC-ACACA-TG-T---T-AT----G-AACCT-TGTCATAAATATCCAATGGTGTAAATCAGTGGG-----CCTAATATTATTACAA------T------T--TTGTACA-A-TATT------TATTAAT-TGA-AT-T--AA---AATTTTAAAACTGA-G--A--A-T-TT-TTACTC---A-AA---ATGTT----ATGATTACAATTTACCA------A----TAAA-ACAGAAGATAAACAAAATATCTCGAGTAAG---------AATA--TATA-----CCTGTGTT----TT-ATCA-ATG-TC-A----------ATTTATTTTGGCA-AA
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Reference ( family-1706 ) : CGAGGCCATCCCGCACTAAACCGTAC-A-----A---CGTA--TGATANTTATTTTACAAC-A-GTCGTT-ATGACTTATGAGCA-------A------AA-C--AAG--AATATAAACAA-ACACA-TT-T---T-AT----G-A--TT-TTTTTTAAATATTCAATGGCGGAAATCAGTGTG-----ACT------------A------T------T--CT-TACA-A-TACT------TATCAAA-TGA-A--A--AA---AAATTCAAAA-TGA-G--A-TG-T-TT-TTACAA---A-AA---A--------A-----AAGACTT----------A----TAANGACAGGAGAGAA--GAAATATCTCGAGTAAGCAT----TTGATAGTTACA-----CATGTGTT----TT-A--A-ATA-TT-A-------AANATTTACTT--GTA-AAA-ACAAAACAGCAGAT----TTACCA-A-T-AATNACTTTTT-TT-AAGAATTGTGTT-TTTC--CTTAATTCAAAAGATTTAAATATATACATTGCANNAT-T-------T--------TGC-ATAT---CTC-GTC--T--AGC--TTTCAGA--C-T---------TA------------------AACA-----------------TGCTACAATGTCTTAATAAAATAAGGT-T-TAATGTATTTTTTTCTTAAATCGTTATACATTTGACATTCAAACATAAAATGAAATTCATCTTCTAACACAGAACATACAGTACACGACC-TATTTTCTCTACCCTTT--GT----GGT--------TTTN-C-CGACGACCCGCTTCAATTTCGAGACGATGTGAAGAAACCC---TAAGTTGTGTTAAGGCAACCCTNAATTTNCTTACATTTACAATATTAAGATATGG-------------TTGAAAT-T-TAAAATCTGAAA-TACGACGATAAAAAGTTGCCCTACTTG-ATT-ATTTAGACGGTCGTTTCAGTTTTGTACAA----ANTTATCATTTAGGCGTTGTTTCGAAATATTTAAAAAAAATTTATTNTTGCCGANNNTTTGCNGATACNAGACNTCATCATTGNAACCTAAA-TTAAATAATTCCTTACGAACAAGCGATGCCCGATTTGTTTTATTTGACATCGNTTCCAAATCATTAAAT--ATAATCTAGTACACAATGTA--ATT--GTTTACGTTCACTTACATTTAGCAATTTNAACAAGANTTACATGGTATTTTCAATGATACTAACNANTCNACGAGTTCTATNACTTNNTCTTCCAAGTNCNCCATAAACATGGTAATNTTGNNTTGTGTTTCTAACTGTAACNATAGCAANGACTGANCAAANTGTAAGTNTACCNTTTCTATATTNTTAGCTTGANAGAATCCCCAAACCTCGCCACCATGAT
gi|1 : CGAGGCCATCCCACACTAAACCGTAC-A-----A---CGTA--TGATAATTATTTTACAA----GTCAGT-ATGACTTATGTGCA-------A------AA----AAG--AATATAAACAA-ACACA-TT-T---T-AT----G-A--TT-TTTTTTAAATAATCAATGGCGGAAATCAGTGTG-----ACT------------A------T------T--TT-TCCA-A-TACT------TATCAAA-TGA-A--A--AA---AAATTCAAAA-TGA-G--A-TG-A------AAAA---A-AA---A--------A-----AAGACTT----------A----TTAGGATAGTAGAGTA--AAAATATCTCGAGTAAGCAT----TTGATAGTTACA-----CATTTGTT----TC-A--A-ATA-TC-A-------AACATTAACTT--GTA-GAA-ACAAAACAACAAAC----TTACCA-A-TTAATAACTTTTT-TT-AAAAATTATGTT-TTTC--CTTAATTCAAAAGATTTAAACATATACATTGCAATAC-T-------T--------TAC-ATAT---CTC-TTC--T--C-C--TTTAAGT--C-T---------TA------------------AACA-----------------TGCTACTCTGTCTTAATGAAACAAGAT-T-TAATGCATTATTTTCTTAAATCGTTAAACATTTGACATTCTAACATAAAATGAAATTCATCTTCTAACACAGAACATAAAGTGCGTGTTC-TATTTTCCCTTCTTTTTTTGTTA--GGT--------TTTGTC-CAACGACCCGCTTCAAGTTCGAGACGCTGTGAAGAAACCC---TAAGTGATGTTAAGACAACCCTTAATTTGCTTACATTGACAATATCAAAATATGG-------------TTGAAAC-T-TAAAATCCGAAA-TACGACGATAAAAAGTTGCCTTAATTG-ATTGATTTAGATGGTCGTTTCATTTTTGTACAATTTTTTTTATCATTTTGGCGTTGTTTTGAAATTTTTTAAAAGAATTTATTATTGCCAACACTTTGCAGATACCAGACTTCATCATTGAAACCTAAATTTGAATAATTCTTTACGAACAAGCGATGACCAATTTGTTTGATTTGGCATTGGTTCCATATCATTAAAC--ATCATTCAGTACACAATGTAATATT--ATTTACGTTCACTTACATTTAGCTATTTCAACAAGAGTTA----GTATTT--AATGATATTAACTATTCTACGAGTTTTATCATTTTCTTTTTCAAGTTCACC---------GTAATTTTGCATTGTGTTTTTAAC----ACAA-AGTAAAGACTGAGCAAATTGTAAGTGTATCCTTTCTATATTTTTAGCTTGAAAGAATCCCCAAACCTCGCCACCATAAT
gi|10 : GCCACTTCACATCAAACCGTAC-A-----A---GGTA--GGAGAATTATTTTACA---A-GTCATT-AT--------------------------AA-C--AAG--AATATAAACAC-ACACA-TG-T---T-AT----G-AACCT-TGTCATAAATATCCAATGGTGTAAATCAGTGGG-----CCTAATATTATTACAA------T------T--TTGTACA-A-TATT------TATTAAT-TGA-AT-T--AA---AATTTTAAAACTGA-G--A--A-T-TT-TTACTC---A-AA---ATGTT----ATGATTACAATTTACCA------A----TAAA-ACAGAAGATAAACAAAATATCTCGAGTAAG---------AATA--TATA-----CCTGTGTT----TT-ATCA-ATG-TC-A----------ATTTATTTTGGCA-AA
gi|11 : aaaggtgattttatttcctcgtaatatgtttaatGAGGGAATCCCATACTAAACCGTTC-ATAGTAA---C-TA--TGATACTTATTTTACAAC-ATGTTATT-ATAACAAATGACCAT------ATAATGTAA-T--AAG--AATGTAAACAA-ACACA-TTCT---T-AT----G-tttat
gi|12 : aatgacgtgtcgtttttactttttcaacatgtaatctaaaaatagtaatatttattgaaaataaaactgcattattattaaaaaaaaatgactttaaaacgacatattagaagtatactttcaaactatttttgcatggtgtccagttattgcttttccataatatttgagaagaagaaaatttaatatcctcgtaaaagatctagtcgggtaTTCTTTTCGTAAAGCGTTATACATTTTACATTCAAACATAAAATGAAATTCATCTTCTAACACAGAACATACTG---ACGACTGTATGTTTTCTATCC------------------------TC-C-TTACGACCCGCTTCGATTTTGAGACGATGTGAAGAAACCC---TTAGCTGTGTTAAGGCAACACT--ATTTTTTTACATTTACAAAATTAAGATATAGTAATTGTTGATATTTGATAT-T-TGAAATCTGCAA-AACTAAGATAAATAGTTGCTCTACTTC-ATTCATTTAGACGGTCGTTTCAGTTTTGTGCAA----ACTTATCATTTAGGCg
gi|13 : t------T------T--CT-TACA-A-TACTCCAAAGTTTCAAAATGA-A--A--AT---GGTTTCACAA-TTA-C--A-TA-TATTATTATTATTTATAA---A--------A-----AAGA-----------------------ATAGGGGAGAA----------------AAGCAT----TTACTAGTTACA-----CATGT-------TT-A--ACATA-TT-ATGTCAATAAGATTTACTA--ATA-CAA-ACAAAAGAGCAGAT----TTACCA-AAT-AATTACTTTT---T-AAGAATAGTGTT-TTTC--CTTAAATCTAAAGATTTCGATATATACATTGCACGAT-T-------T--------TGC-GTAT---CTC-GTCGTC--AGC--TTTCAGA--C-T---------TA------------------AACA-----------------
gi|14 : tcA-TT-T---T-ATAGAGG-G--TA-TTTTTTAA-TACTTAAAGGCGTAAATT----TG-------------------------------------CA-TACA-A-AACT------TATCAAA-TGA-ACCA--AA---CAATTCAAAT-TGA-A--AATG-T-AT-TCACAA---A-AATTTA--------T-----ATGGCTCGAATTAACAAA----TAATGACAGGAGAGAC--AACATATCTCTAATAGGCAT----TTAATAGTTACA-----TAT-TACT----TT-C--A-ATA-TT-A-------AAGATTTACCA--GCATAAA-ACAAAACATCAGATGAACGTACTA-A-T-A-----TTTTT-TT-ACGAATCGTGTT-TTTC--CTGAATTCAAAAGAT----ATGTATAattgtatagtttt
gi|15 : CAAGGCTATCTCACACTTAATCGTAT-A-----A---CGTA--TGAATCTTATTTTACAACTA-GTCAAT-ATGAATTATGAGCA-------A------AA-C--AGG--AATATAAACAA-AATCA-TT-C---A-A-------A--TC-ACTTTTAAATGTGCAATAGCCGAAATCAGTATGCCGAAATT------------A------TCTTATAT--CT-TATA-A-TACT------TATCAAA-TGA-A--A--CATCTAAATT
gi|16 : aaaaagaattgtttttctcgcagtaggttttggggc-TTGTTGAACTAGTCAATGGCTGAAATCAGTGTG-----ACT------------AAAATC-T------T--CT-TACA-AGTACT------TATCAAA-TGA-A--ACAAA---AAATTCAAAA-CGA-GA-A-TGTT-TT-TTACTA---A------------------------ACTTTATCA-----A----TAACGCTAGGAGAAAA--AAAAAATCTCGAGTTAACAA----TTGATAGTAACAAAAATTAAATATTAATGTT-A--A-ATA-TT-A-------AAGATTTACTT--GTT-AAA-AC-AAACAGCAtgatactaaaactt
gi|17 : ggaaGGTCATCCCACACTAAACCGTTC-A-----A---AATG--CGATACTTATTTTACAACAA-GTCATT-ATGTCATATGAGCA-------A------AA-C--AAT--AATTCAAACAA-ACACA-TT-TC--T-GTC---G-A---T-TCTAATAAATATACAATGGAGAAAACCAGTGTG-----AATAA----------A------C------TAACT-TACG-A-TAAT------TATCAAA-TTA-A--A--
gi|18 : gaaaaaatgagtcagattttctttccccgtcg-T---T-AT----G-G--AT-TTTTTTGAATACTCAGTAGCGAAAATCAGTGCG-----ACT------------AATTT--T------T--TT-TACA-A-TATT------TATCAAA-TAACAC-A--AA---AAATTCAAAA-TGA-A--A-TG-T-TT-TTACAA---C-AA---T--------C-----TGG--TA----------A----TAGGAACAGGAGAGAA--GAAATACCTTGAG-AAGTAT----TTGACAGTTACA-----CATGTATT----TC-A--A-ATA-TT-A-------AA
gi|19 : tg----------A----TAAAGACAGGAAAGAA--GAACTATCTCGAGTAAGCAT----TTG-----TAAG-----CATATGTG----TA-A--A-ACAGTT-A-------AATCTTa
gi|2 : atctgagaaaaaatgtccacaacattttatatgactacaatttaccaCATCTTCTAACACAAAACATACAGTACATTACC-TACTTTCACTAACTATT--TT----GATATATTTTTTTTC-C-TGTCGACCGGCTTCAATTTTGAGACGAAGTGAGGCAACTCCCTTAAGTGGTGTTAAGGCAACCTTAAATTTGCTTGCATTTACAATATTGAGATATGA-------------CTGAAAT-T-TTAACTATAAAAATATGA-GATAAAAA--------------------TTA--------TTTCGGTTTTGTTAAA----AATTGTCTTATATGATTTATTTCAAAATATATAAGAAATATTT-TTTTTACCGAGCGTTTGCTGATACAAGACGT-AT--TTATAATTTAAA-TTAAATAATTCCTTCCGAACAAGCGCTGCCCAATTTGCTTTATTTGACATCATTTCCCAATCATTAAAT--ATAATCTTGTTCACAGTATA--ATTATGTTTACGTTCACTAACATTTAGCA-TTTAACCATAATTTACATGGTATTTTCAATAATACTAATAAGTCAACGAGTTCTATAACTTAGTCTTCCAAGTGCTCCATAAACATGATAATATTGGCTTGTATTTCTAACTGTAACCATAGC-ACGATTAATTAAAGTGTAAGTTTACCATTT-TATATTGTTAGCTTGATAGAATTTCCAAATCTCGCTACCATGATatatacactgtatgatattctatttt
gi|20 : AAACA--AAAT----TCACTA-A-A-ATTAACTTTCA----AAGAATTGTGTT-TATT--CTTAATTCAAAATGTTTAACTATATACATTGCAAAAG-T-------C--------TGA-ATAT---CTC-GTC-----AAC--TTTCAGA--T-A---------TA------------------AA-A-----------------TG
gi|21 : tctattatCGAGACCATCCCGCACTAAACTTAAC-A-----AAAGCATATTTGATATTTAtatcg
gi|22 : cagtttatgaacctcgtcataggtctagtgagatCTTATGAGCA-------A------AATC--AAGTTAATATAAACAA-ACACA-TT-T---TTAT----GGA--TTATCTTCCAAATATTCAAAGGCAGAAAGCAGTGTG-----ACT------------A----------------------A-A-TAAT------TAT---A-TTA-A--A--Aaacagcgagatcgagtcgttttatttattactgaataa
gi|23 : TACATTGTAAGAT-T-------T--------TGC-ATAT---CTC-GTA--T---GC--TTTCCGA--C-T---------TA------------------AACA------------------GTTGTAATGTTTTA
gi|24 : GCCATCCCTCATTAAACCGTAC-A-----A---
gi|3 : attttatttccttgtaacatgtCGAAGTCATCCTGCACTAAACCTTAC-A-----AAAGCATA--T--TAAATATTTTACAAA-A-GGTGTTAATGACCCATAAGTATTTTTTTA------TA-CTGAAT--AAT-TTAACAACATACA-TT-----------------------------GTATTCAATGACGGACACCTGTGTG-----ACT------------A------T------A--CG-TATATA-TAag
gi|4 : ttaataaaaaatatctagtgataacccacaaccttcgttcatttaacagtatgttaatatcaactaaaaatatccttaccacaattgtagcttcatgcttatacttttcaaacgttactgcagttcgaatgttgtccgtggaaggtattgtaatgtcaatgtgtatctctacattcgttatcttttcatctatcaatatagaaagatcctatctgttagagtaatagtgttaattataattgaacatgttgatattgaacattctacgacaaacaatagcagatgaacttcaataaagtgggttaagactaattttaaataattatcaattttctttctacatattctctatattcatatgttatacttgccgaagaacgatggtttctctaatacaactgttgccatagaatagaatagtttattaacctcgttatagatagatttttgggtCAAAGTCATCCTGCACTAAACCTTACAA-----A---AGCA--TTTTAAATATTTTACAAA-A-GGTGTTAATGACCCATAAGTATTTTTTTA------TA-CTGAAT--AAT-TTAACAACATACA-TT-----------------------------GTATTCAATGACGGACACCTGTGTG-----ACT------------A------T------ta
gi|5 : attaataaaaaatatctagtgataacccgcaaccttcgttcatttaacattatgttaatatcaactgaaaatctccttaccacaattgtagcttcatgcttatacttttcaaacgttactgcagttcgaatgttgtccgtggaaggtattgtaatgtcaatgtgtatctctacattcgttatcttttcatctatcaatatagaaatatcctatctgttatagtaatagtgttaattataattgaacatgttgatattgaacattctacgacaaacaatagcagatgaacttcaataaagactaattctaaataattatcaattttctttctacatattctctatattcatatgttatacttgccgaagaacgatggtttctctaatacaactgttgccatagaatagaatagtttattaacctcgttatagatagattttagggtA-ACACA-TT-TGTTT-AT----GCA--TT-CTTT---AGTATTCAATGACAAAAGTCAGTGTG-----GCT------------A------TATTT--T--CT-TATG-A-T---------TATCAAC--------A--AA---AATTTCAAAA-TGATA--A-TG-T-TT-TCATAT---G-AA---T--------A-----AA-ATTT----------ACCAATAAGGACAGGAGAGAA--GAAATATCGCGAGTAAGCAT----TTGATGGTTACA-----TATTTGCT----TT-A--A-ATA-TT-T-------AATATTTACTT--GTG-AAACAC----CAGCAGAT----TTATCATA-T-TATTACTATTT-T-----GATTATATTGTTTCTGTTTAATTAAAAAGATTTAA--ATATACAATGCATTAT-T-------TCGTAAATGTGCAATAT----TC-GTC-----AGC--TTTCAGA--C-T---------TAAACAATTGTATAATTTTAAACA-----------------TGTTTCAATGTATT-ATAAAATAAGGT-T-TAATGTATTTATTTCTTAAATTATTATACATTTGACATTCAATCATAAAATGAAATTCATCTTCTACCACAGAACATACAGTACACTATC-TATTTTCa
gi|5 : TTTCAAGACGATGTTAAGAAACCC---TAAGTTGTGTAAAGGCAACCCTAAATTTTCTTACATTTACAATATTAAGATATCT-------------TTGAAATATATAAACTCTG-AA-TAAAACGATAaagacgatgttaagaaaccctaagttgtgtaaaggcaaccctaaattttcttacatttacaatattaagatatctttgaaatatataaactctgaataaaacgata
gi|6 : aacacatttgtttatgcattctttagtattcaatgacaaaagtcagtgtggctatattttcttatgattatcaacaaaaatttcaaaatgataatgttttcatatgaataaaatttaccaataaggacaggagagaagaaatatcgcgagtaagcatttgatggttacatatttgctttaaatatttaatatttacttgtgaaacaccagcagatttatcatattattactattttgattatattgtttctgtttaattaaaaagatttaaatatacaatgcattatttcgtaaatgtgcaatattcgtcagctttcagacttaaacaattgtataattttaaacatgtttcaatgtattataaaataaggtttaatgtatttatttcttaaattattatacatttgacattcaatcataaaatgaaattcatcttctaccacagaacatacagtacactatctatT-TTTC--CTTAATTCAAAATGTTTA--------CATTGCAGTAT-T-------T--------GG--ACAT---CTC-ATC--T---GC--TTTCAGA--C-G---------TA------------------AACAAATGTATAGTTTTAATATACTACAACATCTTATTAAA-TAAGGT-T-TAATGTATTTTTTCCCCAAATTATTATACATTTGACATTCAAATATAAAATGAAATTCATCTTCTAATACAGAACAAACAGTA------C-TATTTTCTATACCCTTT--GTGTTGGGT--------TTTA-CACAATGATCCGCTTCAATTTCGAGACGATGTTACGAAACAT---T-TGCTGTGTTAGGGCAATCCTTAACTTACTTTTGTTTACAATGTTACGATATGG-------------TTGAAAC-T-TAAAATCTAAAA-TACTACGATAAAACGTTTCCCTACTTGAATG-ATTAAGACGCTTGATACAGTTTTGTACAA----AATTATCATTTAGACGCTGTATTGAAATATTTAAACAAA
gi|6 : AACCTAGA-TCAAATTATTACGTATGGACAAGCGATTCCCGATCGGTTTTATTTGACATGAAT---AAAACATTATATTGATAA--TAGTATA-AATG-A--AGT--GT---CGTTCACTTATATTTTGCAATTTTAACCAGtaccaacctagatcaaattattacgtatggacaagcgattcccgatcggttttatttgacatgaataaaacattatattgataatagtataaatgaagtgtcgttcacttatattttgcaattttaaccag
gi|7 : ttttccttaattcaaaatgtttacattgcagtatttggacatctcatctgctttcagacgtaaacaaatgtatagttttaatatactacaacatcttattaaataaggtttaatgtattttttccccaaattattatacatttgacattcaaatataaaatgaaattcatcttctaatacagaacaaacagtactattttctataccctttgtgttgggttttacacaatgatccgcttcaatttcgagacgatgttacgaaacatttgctgtgttagggcaatccttaacttacttttgtttacaatgttacgatatggttgaaacttaaaatctaaaatactacgataaaacgtttccctacttgaatgattaagacgcttgatacagttttgtacaaaattatcatttagacgctgtattgaaatatttaaacaaataccGCCATGACACACTTAACCGTAC-A-----C---ATTC--TGATAATTATTTTA-----------TT-GTGACTTATGAGCA-------A------AA-C--AAG--AATATAAACAT-ATACATTT-T---T-ATG---G-A-----TTTTTTAAATATTCAATGGCGGAAATTCGTGTG-----ACA------------ATTGT--T------T--CT-TACA-A-TACT------TAACAAA-TGA-A--A--CAGT-AATTTCAAAA-TGA-GGAA-TT-T-TT-CT-CAG---A-CT---A--------A--------ACTTTATCA-----A----TAAAGACTGGAAAGAA--GAAATAAATCGAGTAAGCAT----TTATTAGTTACA-----TATATGTT----TT-G--A-ATA-TT-A-------AACATTTACTT--GT---------AAACAGCAGAT----TTACCA-----AATAATTTCTTGTT-AAGAATTGTGTT-TTAT--CTTAATTTAAAATATTTAGATATATTCATCGCAAGAT-T-------C--------TGC-ATAT---CAC-GTC--T---GC--TTTTACA--C-T---------TAAACAATTGTATAGTTTTAAACA-----------------TGCCACCATGTCT---TAAAATAAGAC-T-TTATGTAT
gi|8 : aaagtgagattggaaatatataattatattctataaatagattatttaaatgttgaaagtttacacaacaggtgggatcaatCACAAAACCGTAC-A------------------TAGTCATTTTACAAC-AAGACATT-ATGACTTACGAGCA-------A------AA-C--AGG--AATATAAACAA-AAACA-TT-T---TTAT----G-G--AT-TTTATTAAATACTCAATGGCGGAAATCAGTGTG-----ACT------------ATAAATTT------T--CT-TACA-A-TTTT------TAACAAA-TGA-AACA--AA---AAAATCAAAA-TGA-GA-A-TG-T-TT-TCATAA---A-AA---A--------a
gi|8 : -AAA-ATAAAACAGCATAT----TTACCA-A----ATAATTTCTT-TTGAAGAAGTATGCT-TTTC--CGTATTACAAAATATTTAAATTTACACTTTGCACTAT-TAGGCATAT--------TGC-ATATATTCTCAGAC--TTAAACAATTGCAAAGTT-T---------TA------------------AACA-----------------TGCCATTATGTCTTC-TAAAATAAGGT-T-TAATGTACTTTTT-CTTAGACAGTAATTCATTTAACATTTACACATAAAATGGAATTTATCTTCTAGCACAGAACATACAGAACATGCCT-TATTTctgatacgactaaaataaaacagcatatttaccaaataatttcttttgaagaagtatgcttttccgtattacaaaatatttaaatttacactttgcactattaggcatattgcatatattctcagacttaaacaattgcaaagttttaaacatgccattatgtcttctaaaataaggtttaatgtactttttcttagacagtaattcatttaacatttacacataaaatggaatttatcttctagcacagaacatacagaacatgccttatttaagtatgaaaaccaataa
gi|9 : cacaaaaccgtacatagtcattttacaacaagacattatgacttacgagcaaaacaggaatataaacaaaaacatttttatggattttattaaatactcaatggcggaaatcagtgtgactataaattttcttacaatttttaacaaatgaaacaaaaaaatcaaaatgagaatgttttcataaaaaactgatacgactAAAA-TGA-A--AATG-T-TT-T--CAA---A-AA---ATTTGACATAGCT--AAAATTT----------ACCAATAATGAATGGAGAACA--GCAATATCTCTAATAAGCATATATTTAATAGTTAAA-----CATATATT----TTTA--A-ATA-TCCA-------AAAATTTACTT--GTA-AA---CAAAATAGCAGAT----TTACAA-AAT-TATTACTTTAC----AAGCATTGT-TT-TTCC--CTTAATTCTTAAGATTTAAACATGTCCATTGCA-AATGT-------T--------TGC-ATAT---ATT-GTT--T---GC--TTTCAGA--CATATATATATATA------------------TACA-----------------TGATAAATTGTCTT-ATAAAATAAGGTGTATAAGG---------CTGATATCGTTTTACATTTGACATTTAAACACAAAAaagtatgaaaaccaataa
blockSeqs : A A TAGTAAC TT A CAT T A A A TATAATGT CTG TT A C T TTATAGAGGGTA A CCGAA AATATTATTACAATT G T G CCAAAG A C CC CA TCT T C GGA A T A A T AAAATTTGACATAGCTAAAATTTACCAA A ACA ATAT AAAAT G G AATG T TC C G C TGTCAAT G TG AT AC A GAAC AATAA T TGTT G TG G GA CG G TCGTAAATG A ATT A GTCA AA GT TTAAACAATTGTATAATTTTAAACA A AT G A T C T TACATTACC T ATTTTGATATATTTTT ACACA CCT T A T TAATTGTTGATAT A A C A T A G G C CATTC G G G . C . T GCG T A G . . T . CAT T TG TC C T . AT T A A T CATG TC A G A A AG G T ATAAACATG A GC TGTA C T . C T G T A . G T
blockSeqs : A . AAAGCA . C CTA T A A T TTTTTTTA CTG . G C . TGTTTATGCATT T . ATCTTATAT . . . . . . AC . GT T . GA A . . . T AAAATGTTATGATTACAATTTACCAA T A . . G A . . . . . . . G . A A A . TATTA A TTTG . . G AC AA . AGGCATAT . . . TTAA . . TTAAACAATTGTATAGTTTTAAACA A A . . T T T TACACTATC A TTTGTGTTGGGT CCTT . A A G . . . A . G C G T C GAATG G C T . A . GAA . . . . . . . . . T
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blockSeqs : T . AAA . A AA G G . C A C . A . . TTTATGGAT T . AATTTTT . . . . . . . . . A . C . . . . C TTTATAAAAAAGA G G . . T G . . . . . . . C . A . . . AA T A . . T A AG . T . . . T . . TTAAACA A
blockSeqs : G . AAG . A A A A . T A C . A . . TTATGGAT C . ATATTTT . . . . . . . . . T . A . . . . T AACTTTATCAA A G . . A G . . . . . . . A . . . . . AA . C . . T A CT . C . . . T . . TTAAACA
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