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gi|10 : GTA-GTATTTATTT-T---GTAATTATTCGGTACAGGAAAC---CATCAGATGT-TTTTTCCCTTACCGACAAAATCTTGTTAGTCTCCCGACTGACTTTGTCAGTAACTGACGGTTACTTTGTCGGGTGTCAAACAAATATG----TTTGGT-----CACTATAAG-AATC---T----------G------------TGAGTTGGTTGGGATTCGGACA--ATTCCTTGTCAGGATGGGTATATAAA-----C-AGCCGATTTTATGTCACTTT--GACTTTTTAGA-ACTTT-G-------AGAAAC-----------TTCAGAT--ATTTG-AGAACTTTTGGAACT------TTT---GGAACTTT---------GACGACTTTTGGATTTTTGATTAAAACGGTT--AGGACT--TTTAGACATTTGGAGGA-------ACTTTTGAAG------------CGTATCACCGGATAGAGGTGCGATACGGGGTTTATTTATAGTTCA--TC-C------AACATACAAAAC-TAGCATAATCTATAT-CAAGAAACGTACTCACTAATTTAT-----TGAAAGTCCAGGAACATAGATCTATTACATTAACCTATTG-------TGTTTAT-ATTCTACTGAAGGAAAT-GGCAAGACAAGATA-----AATCATCTATAAT-CTGCAGCCTG-TGTTTTAGTTA-TTTT-AACCCTACGAGTATAAATTGATAAGCAGTATCATCCTGACAAACATTATTCTAACAGCACTGGATAATGGGACCCCTCGGTTGTAAtgt
gi|11 : ttgtaatgtaaacctaagttgcattgtttagacaaattattttagtaattctatcatagtttcactatgttaaatactgctctaagctacaagctcatgtgttttaaaggcattatttatacaGGAAAC---CATCGGATGC-TTTCTCCCTTACCGACAAAGTCTTGTT-GTTTTCC---------------CAAC---CG---ACTT-GTCGGGTGCCAAACAAACATT----TTTGGT-----CCCTATAAG-AATA---T----------G------------TCAGTTGGTTGGGATTCGGACA--AATCCTTGTCGGGATGGGTATATGAA-----C-AGCTGATTTTATGTCACTTG--GACTCTTTAGA-ACTTT-G-------AGAAAC-----------TTCAGAT--CTTTG-AGAAC-----G----------TTTT--GGAACTTTTCGATATTTGACGATTTTTGGAACTTTGATCAAAACGGTT--AGGACT--TTTAGATGTTTGGAGGA-------ACTTTTGAAG------------CGTATCACCGAATAAAAGTGCGATACGGG-TTTATTTATAGTTTA--TC-C------AACGTACAAAAC-AAGCATAATCTATAT-CAAGAAACGTATTCACTAATTTAT-----TAAAAGTCCAGGAACATAGATCTGTTACGTTTACCTATTG-------TGTCGAT-ATTCTACTGAAAGAAAT-TGCAAGACAAGATA-----AATCATTTATAAT-CTGCAGTCTG-TGTTTTAGTTA-TTTT-AACCCTACCAGTATAAATTCATTAGCAGTGGTATCCTGACAAATATTCTTCTAACAGCACTGGATAATCGGACCGCTCGGTTGTAAca
gi|7 : AACTGACAGATTCTT-GTAGGG-----ACCAAACATG----TTTGTTTGACACCCGACAAGTAACCGTTT----------GTTACTGGCAAACTCAGTTGG--GAGACT--AACAAGATT--TTGTCGGTAAGGG-AGA-AAA-----C-ATCCGATc
gi|1 : atgtaatgtgaaccctagttgcattgtttagacaatttattttagtaattctatcagtaattttatttccataaatattatttactgcttatgataacagttacagttgatgataaaggtcaccattacaacttggtggaaactttgatgcatttactcacatgtttatctgtctgtaattcatcttacatgttattaatcagctcattttgtctacatattgatgatatgtattgtagagaactgtatccattgattgttcattatcaagtcattttaaagcactgtattacttaaatttagtcatatttatcagagaaagcagacagcctgttttcagtttgcactataaataacctccttccaggagagctattttgtgtatttctatatttagattgtcacagttcaattcatcggacggttttcaccataaatagttttcacaatatataacattatttaattcttggaacattgtaagtcaatgtatgtatctgtttggtaattattcggtacaggaaaccCTT-GTAGGG-----ACCAAACATGTTTGTTTGGTA----CCCGACAAGTAACCG--TTAGTTACAAAG------------TCAGTTGG--GAGACT--AACAAGATT--TTGTCGGggttgggatttggacaattccttgtcgggatgggataataatggtgtgagtccttgacgacttttggaactttgatcaaaacgtttggaggacttttagacgtttggaggaacttttgaagcgtatcatcggatagaggtgcgatacggggtttatttatagttcatccaacgtacaaaacaagaataatctatatcaagaaacgtattcactaatttattgaaagtccaggaacatggatctattacatttatccattgtgtctatattctactgaaagaaattgaaagacaagataaatcatctataatctgcagcctgtgttttagttattttaaccctatcagtataaattgataagcagtgtcatcctgacgaacattattctaacagcactggataatcggacctctcggttgtaata
gi|12 : taatgtaaaccctagttgcattgtttagacaaattattttagtaattctatcatatcttcactttgttaaatactgctctaagctccaagctcatgtgttgtaaaggcattatttatacagtagtattttcgtttcataaatatcatttactgcttatgagaacagttacagttgatgataaaggtcaccgttacaacttggtggaaactttgatgcattttactcacatgtttatctgtctgtaattcatcttacttgttataaatcagctcattttgtctacttattgatgatatgtattgtagagaactttatccattgattgttcattatcaaaagtcattttaaggcactttatttcttaaatttagtcatatttatctgagaaagcagacagcctgttttcagtttgcaatataagtaatctccttccaggagagccagtttgtgtatttctatatttagattgtcacagttcaattcatcggacggttttcatcataaatagttttcacaatttataagattatttgttcttggaacattgtatgtcagtgtatttatttattttgtaattattcggtacaggaaagcatcggatgttttctcatttaACAAG-AACC---C----------G------------TCAGTCGGTTGGGACTTGAACA--ATTCCTTGTCGTGACGGGCATATACAATAAGC-AGCCGATTTTATGTCACTTG--GAC-TTTTAGAGACTTTCGGACGTTTTGGAACATTTAAAGACTTTTGGAT--CTTCA-GGAAC-----G----------TTC---GG-ACTTT---------GATAACTTTactctttcagttggttgggattcggacaattctttgtcgggatgagtatataaacagccgattttatgtcactaggactttttagaactttgagaaacttcagatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatataaacggttaggacctttagacgtttggaggaacttttgaagcgtatcaccggatagaggtgcgatacggggtctatttatagttcatccaacgtacaaaacaagcataatctatatcaagaaacgtattcactaatttttgaaagttcaggaacatagatctattacatttacctattgtgtctatattctactgaaagaaattgcaagactagataaatcatctataatctgcaatctgtgttttagttattttaaccctaccagtataaattgattagcagtgtcatcctgacaaacattaatctaacagcacgggatagtcgaaccgcttggttgtaaca
gi|7 : CCTT---------GACGACTTTTGGAACTTTGATCAAAACGTTTGGAGGACT--TTTAGACGTTTGGAGGA-------ACTTTTGAAG------------CGTATCATCGGATAGAGGTGCGATACGGGGTTTATTTATAGTTCA--TC-C------AACGTACAAAAC-AAGAATAATCTATAT-CAAGAAACGTATTCACTAATTTAT-----TGAAAGTCCAGGAACATGGATCTATTACATTTATCCATTG-------TGTCTAT-ATTCTACTGAAAGAAAT-TGAAAGACAAGATA-----AATCATCTATAAT-CTGCAGCCTG-TGTTTTAGTTA-TTTT-AACCCTATCAGTATAAATTGATAAGCAGTGTCATCCTGACGAACATTATTCTAACAGCACTGGATAATCGGACCTCTCGGTTGTAAcatcaaggacttatatagatatataattccttgctttcattatgtcatattcatcatataatcgtatcactggagagaggttctatgcgttttttagttcagttctcaaagtacaaaccaacataatagaaacttattatctgaaagtccaagaaaacgtataacttttacctattagatctactttttattagtctactgaaaacaatatacaagaaacgatatataaaccatctataatcttcagcttgtgttgttgttattcaataccagtataaacagtgtcatcctaacgaatattatcgacagcactaagaacagaccgcttggttggaat
gi|12 : atgtaatgtgaaccctagttgcattgtttagacaatttattttagtaattctatcagtaattttatttccataaatattatttactgcttatgataacagttacagttgatgataaaggtcaccattacaacttggtggaaactttgatgcatttactcacatgtttatctgtctgtaattcatcttacatgttattaatcagctcattttgtctacatattgatgatatgtattgtagagaactgtatccattgattgttcattatcaagtcattttaaagcactgtattacttaaatttagtcatatttatcagagaaagcagacagcctgttttcagtttgcactataaataacctccttccaggagagctattttgtgtatttctatatttagattgtcacagttcaattcatcggacggttttcaccataaatagttttcacaatatataacattatttaattcttggaacattgtaagtcaatgtatgtatctgtttggtaattattcggtacaggaaaccatcggatgttttctcccttaccgacaaaatcttgttagtctcccaactgagtttgccagtaacaaacggttacttgtcgggtgtcaaacaaacatgtttggtccctacaagaatctgtcagttggttgggatttggacaattccttgtcgggatgggataataatggtgtgagtAAT------------CGTATCACTGGAGAGAGGTTCTATGCG----TT-TTT-TAGTTCAGTTCTC------AAAGTAC-AAAC-CAACATAAT---------AGAAACTTATT-----ATCTG--------AAAGTCCAAGAA----AACGTATAACTTTTACCTATTAGATCTACTTTTTATTAGTCTACTGAAAACAATATACAAGAAACGATATATA-AACCATCTATAAT-CTTCAGCTTG-TGTTGTTGTTA-TTC--AA---TACCAGTATA--------AACAGTGTCATCCTAACGAATATTAT--CGACAGCACT-AAGAA-CAGACCGCTTGGTTGGAAta
gi|19 : acaagaacccgtcagtcggttgggacttgaacaattccttgtcgtgacgggcatatacaataagcagccgattttatgtcacttggacttttagagactttcggacgttttggaacatttaaagacttttggatcttcaggaacgttcggactttgataactttcatcaaggacttatatagatatataattccttgctttcattatgtcatattcatcatatAAGAAAT--ACAAGAAAAGATATATAAAATCAT-TCAAATACTCCAGCTTG-TGTT------A-TTT---ACTGTA-----ATAC--TGGTA--CAGTGTCATCCTGAC---CATTATTt
gi|18 : ttcaatttgtataaagatTACAACTTGGTGTTTTC-----TTTT-AACCCTACCAGTATAAATTGATTAGCAGTGTCATCCTGACAAATATTATTCTAACAGCACTGGATAATCAGGCCACTTCTTTGTAAgacactgcta
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): GACTGTGGTAGCCTATACCAAGGACTTATATAATTCTATATAATTCCTTGCCTGTATGAAGATGCATATAAATTTAGGATAAACAATGGAGACTGGAGAGATGTAGCTATTGCATTGTTTTCGTCAGGATTCATTGACAACATAAAGAAGTATTTAC
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Unaligned ( gi|22 ): TCAAGGACTTGTATAGATATATACTTCCTTGTCATGATG
Alignments
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lowQualScore : ...... ... . . .. . ..... . . .. . . . . . . ......... . . . . . . . . . . . . . . .... ..... .. . . . . . . . . . . ..... . .. . .. . .. . . . . ................ . .. ......... ... . . . .. .......... . ........ . .. . ...... . . ..... . . ..... ... . ..... . . . . . . ... .
lowQualScore : 666666 888 9 3 00 5 00000 0 0 55 4 1 6 4 4 0 000000000 0 5 0 2 0 0 6 6 7 9 4 1 6 4 8888 33333 00 2 6 5 1 6 4 3 4 7 8 77777 4 66 9 44 3 44 2 3 3 7 9999999999999999 3 66 333333333 444 3 8 1 00 9999999999 6 22222222 1 66 3 222222 3 3 77777 6 4 33333 888 1 22222 1 1 9 9 9 5 666 2
consensus : GTAATGTAAACCCTAGTTGCA------TTGTTTA---GACAAATTATTT-TAGTAATTCTATCA-TAGCTTCACTTTGTTAAATACTGCTCTAAGCTCCAAGCTCATGTGTTTTAAAGGCATTATTTATACAGTAGT--ATTTTCTTTT-----CATAAANATCATTTACTGCTTATGATA--ACAGTTACAGTTGATGATAAAGGTCACCGTTACAACTTGGTGGAAACTTTGATGCATTTTACTCACATGTTTATCTGTCTGTAATTCATCTNACTTGTTATAAATCAG-CTCATTTT-GTCTACATATTGATGATATGTAT-TGTAGAGAACT---------TTATCCATTGATTGTTCATTA-TCAAAAGTCATTTTAAGGCACTTTATTACTTAAATTTAGTCATATTTA-TCTGAGAAAGCAGACAGCCTGTTTTCAGTTTGCANTATA-AATAACCTCCTTCCAGGAGAGCTATTTTGTGTATTTCTATATTTAGATTGTCACAGTTCAATTCATCGGACGGTTTTCATCATAAACAGTTTTCACAATTTATAACATTATTTA-TTCTTGGAACATTGTAAGTCAATGTATGTATTTATTT-T---GTAATTATTCGGTACAGGAA--ACCATCGGATGT-TTTCTCCCTTACCGACAAAATCTTGTTAGTCTCCCAACCGACTTTGTCAGTAACTGACGGTTACTT-GTCGGGTGCCAAACAAACATGTTTGGTCCCTACAAGAATCTGTCAGTCGGTTGGGATTCGGACAATTCCTTGTCGGGATGGGTAT-----ATAAACAGCCGATTTTATGTCACTTG--GACTTTTTAGA-ACTTTGAGAAACTTCAGATC-TTTG-AGAAC-----G----------TTT-GGA--ACTTT---------GACGACTTTT---GGAACTTTGATCAAAACGGTT--AGG----------ACTTTTA-GACGTTTGG--------AGGAACTTTTGAAGCGTATCACCGGATAGAGGTGCGATACGGGGTTTATTTATAGTTCA--TC-C------AACGTACAAAAC-AAGCATAATCTATAT-CAAGAAACGTATTCACTAATTTAT-----TGAAAGTCCAGGAACATAGATCTATTACATTTACCTATTGTGTCTA-----TATT---CTACTGAAAGAAAT-TGCAAGACAAGATA-----AATCATCTATAAT-CTGCAGCCTG-TGTTTTAGTTA-TTTT-AACCCTACCAGTATAAATTGATAAGCAGTGTCATCCTGACAAACATTATTCTAACAGCACTGGATAATCGGACCGCTCGGTTGTAA
Reference ( family-1695 ) : GTAATGTAAACCCTAGTTGCA------TTGTTTA---GACAAATTATTTGTAGTAATTCTATCA-TAGCTTCACTTTGTTAAATACTGCTCTAAGCTCCAAGCTCATGTGTTTTAAAGGCATTATTTATACAGTAGT--ATTTTCTTTT-----CATAAANATCATTTACTGCTTGTGATA--ACAGTTACAGTTGATGATAAAGGTCACCGTTACAACTTGGTGGAAACTTTGATGCATTTTACTCACATGTTTATCTGTCTGTAATTCATCTAACTTGTTATAAATCAG-CTCATTTT-GTCTACATATTGATGATATGTAT-TGTAGAGAACT---------TTATCCATTGATTGTTCATTA-TCAAAAGTCATTTTAAGGCACTTTATTACTTAAATTTAGTCATATTTA-TCTGAGAAAGCAGACAGCCTGTTTTCAGTTTGCAGTATA-AATNACCTCCTTCCAGGAGAGCTATTTTGTGTATTTCTATATTTAGATTGTCACAGTTCAATTCATCGGACGGTTTTCATCATAAACAGTTTTCACAATTTATAACATTATTTA-TTCTTGGAACATTGTAAGTCAATGTATGTATTTATTT-T---GTAATTATTCGGTACAGGAA--ACCATCGGATGT-TTTCTCCCTTACCGACAAAATCTTGTTAGTCTCCCAACTGACTTTGTCAGTAACTGACGGTTACTT-GTCGGGTGCCAAACAAACATGTTTGGTCCCTACAAGAATCTGTCAGTCGGTTGGGATTCGGACAATTCCTTGTCGGGATGGGTAT-----ATAAACAGCCGATTTTATGTCACTTG--GACTTTTTAGA-ACTTTGNGAAACTTCAGATC-TTTG-AGAAC-----G----------TTT-GGA--ACTTT---------GACGACTTTT---GGAACTTTGATCAAAACGGTT--AGG----------ACTTTTA-GACGTTTGG--------AGGAACTTTTGAAGCGTATCACCGGATAGAGGTGCGATACGGGGTTTATTTATAGTTCA--TC-C------AACGTACAAAAC-AAGCATAATCTATAT-CAAGAAACGTATTCACTAATTTAT-----TGAAAGTCCAGGAACATAGATCTATTACATTTACCTATTGTGTCTA-----TATT---CTACTGAAAGAAAT-TGCAAGACAAGATA-----AATCATCTATAAT-CTGCAGCCTG-TGTTTTAGTTA-TTTT-AACCCTACCAGTATAAATTGATAAGCAGTGTCATCCTGACAAACATTATTCTAACAGCACTGGATAATCGGACCGCTCGGTTGTAA
gi|1 : TAATGTAAACCCTAGTTGCA------TTGTTTA---GACAAATTATTT-TAGTAATTCTATCA-TATCTTCACTTTGTTAAATACTGCTCTAAGCTCCAAGCTCATGTGTTGTAAAGGCATTATTTATACAGTAGT--ATTTTCGTTT-----CATAAATATCATTTACTGCTTATGAGA--ACAGTTACAGTTGATGATAAAGGTCACCGTTACAACTTGGTGGAAACTTTGATGCATTTTACTCACATGTTTATCTGTCTGTAATTCATCTTACTTGTTATAAATCAG-CTCATTTT-GTCTACTTATTGATGATATGTAT-TGTAGAGAACT---------TTATCCATTGATTGTTCATTA-TCAAAAGTCATTTTAAGGCACTTTATTTCTTAAATTTAGTCATATTTA-TCTGAGAAAGCAGACAGCCTGTTTTCAGTTTGCAATATA-AGTAATCTCCTTCCAGGAGAGCCAGTTTGTGTATTTCTATATTTAGATTGTCACAGTTCAATTCATCGGACGGTTTTCATCATAAATAGTTTTCACAATTTATAAGATTATTTG-TTCTTGGAACATTGTATGTCAGTGTATTTATTTATTT-T---GTAATTATTCGGTACAGGAA--AGCATCGGATGT-TTTCTCATTTACCGACAAAATCTTGTTAGTCTCCCAACTGACTTT----GTAACTAACGGTTACTT-GTCGGGTACCAAACAAACATGTTTGGTCCCTACAAGACTCTTTCAGTTGGTTGGGATTCGGACAATTCTTTGTCGGGATGAGTAT-----ATAAACAGCCGATTTTATGTCACTAG--GACTTTTTAGA-ACTTTGAGAAACTTCAGATC-NNNN-NNNNN-----N----------NNN-NNN--NNNNN---------NNNNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNGATATAAACGGTTAGGACCTTTAGACGTTTGGAGGAACTTTTGAAGCGTATCACCGGATAGAGGTGCGATACGGGGTCTATTTATAGTTCA--TC-C------AACGTACAAAAC-AAGCATAATCTATAT-CAAGAAACGTATTCACTAATTT-T-----TGAAAGTTCAGGAACATAGATCTATTACATTTACCTATTGTGTCTA-----TATT---CTACTGAAAGAAAT-TGCAAGACTAGATA-----AATCATCTATAAT-CTGCAATCTG-TGTTTTAGTTA-TTTT-AACCCTACCAGTATAAATTGATTAGCAGTGTCATCCTGACAAACATTAATCTAACAGCACGGGATAGTCGAACCGCTTGGTTGTAA
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gi|12 : ACAAGAACCCGTCAGTCGGTTGGGACTTGAACAATTCCTTGTCGTGACGGGCATATACAATAAGCAGCCGATTTTATGTCACTTG--GAC-TTTTAGAGACTTTCGGACGTTTTGGAACATTTA-AAGAC-----T----------TTT-GGA--TCTTC---------AGGAACGTTC---GG-ACTTTGATc
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gi|13 : acaagaacccgtcagtcggttgggacttgaacaattccttgtcgtgacgggcatatacaataagcagccgattttatgtcacttggacttttagagactttcggacgttttggaacatttaaagacttttggatcttcaggaacgttcggactttgataactttcatcaaggacttatatagatatataattccttgctttcattatgtcatattcatcatatGTAATGTAAACCCTTGTTGCA------TTGTTGA---AACAAATTATTT-CAGTAATTCTATCA-TAGCTTCACTTTGTTAAATACTGCTCTAAGCTCCAAACTCATGTGTTTTAAAGGCATTTTTTATACAGTAGT--ATTTTCTTTT-----CATAAAGATCACTTACTGCTTTTGATA--ACAGTTACAGTTGATGATAAAGGTCAC-----CAACTTTGTGGAAACTTTGATGCACTTTACTCACATGTATATTTGCCTGTt
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gi|17 : ATTGATTATCTGTCTCTGTATAGAAATCGTACATGGTTATCCAT-GTTTATATAATACTCAAAGGTCATTT-AAGTCACTTTATTTCTTTAATTTAG----ATTGACTCTGAGAAAATGGACAG-CTGATTTCACTTTCTAGAACA-AATTATTTTCCTC
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gi|7 : atgtaatgtgaaccctagttgcattgtttagacaatttattttagtaatCCTT---------GACGACTTTTGGAACTTTGATCAAAACGTTTGGAGG----------ACTTTTA-GACGTTTGG--------AGGAACTTTTGAAGCGTATCATCGGATAGAGGTGCGATACGGGGTTTATTTATAGTTCA--TC-C------AACGTACAAAAC-AAGAATAATCTATAT-CAAGAAACGTATTCACTAATTTAT-----TGAAAGTCCAGGAACATGGATCTATTACATTTATCCATTGTGTCTA-----TATT---CTACTGAAAGAAAT-TGAAAGACAAGATA-----AATCATCTATAAT-CTGCAGCCTG-TGTTTTAGTTA-TTTT-AACCCTATCAGTATAAATTGATAAGCAGTGTCATCCTGACGAACATTATTCTAACAGCACTGGATAATCGGACCTCTCGGTTGTAAtcggatagaggtgcgatacggggtttatttatagttcatccaacgtacaaaacaagaataatctatatcaagaaacgtattcactaatttattgaaagtccaggaacatggatctattacatttatccattgtgtctatattctactgaaagaaattgaaagacaagataaatcatctataatctgcagcctgtgttttagttattttaaccctatcagtataaattgataagcagtgtcatcctgacgaacattattctaacagcactggataatcggacctctcggttgtaata
gi|8 : atgtaatgtgaaccctagttgcattgtttagacaatttattttagtaattctatcagtaattttatttccataaatattatttactgcttatgataacagttacagttgatgataaaggtcaccattacaacttggtggaaactttgatgcatttactcacatgtttatctgtctgtaattcatcttacatgttattaatcagctcattttgtctacatattgatgatatgtattgtagagaactgtatccattgattgttcattatcaagtcattttaaagcactgtattacttaaatttagtcatatttatcagagaaagcagacagcctgttttcagtttgcactataaataacctccttccaggagagctattttgtgtatttctatatttagattgtcacagttcaattcatcggacggttttcaccataaatagttttcacaatatataacattatttaattcttggaacattgtaagtcaatgtatgtatctgtttggtaattattcggtacaggaaaccatcggatgttttctcccttaccgacaaaatcttgttagtctcccaactgagtttgccagtaacaaacggttacttgtcgggtgtcaaacaaacatgtttggtccctacaagaatctgtcagttggttgggatttggacaattccttgtcgggatgggataataatggtgtgagtATTTTACTCACATGTGTATCTGTCTGTAATCCATCTAACTTGTTATATATCAGGTTC--TCT-CTCTACAGATTGATTATATGTAT-TGTATAGAACT---------TTATCCAGTGATTGTTCATTA-TTGATATTCTTTTTAAGGCACTTTATTACTTAAAGTTAGTCATATTTA-TCTGAGAAAGCTGACAGTCTGTTTTCAGTTGGCAGTACG-AATTATCT------------GC---TTTGTGTATTTCTATATTTCGATTGTCACAGTTCAAT--------CGGTTTTCATCATGAAAAGCTTTTACAATTTAAAATAT--TTTA-T-----GAACATTGTAAGTCAATATATGTATTAATTT-T---GTAATTATTCGGTATAGGAA--AACATCGGATGT-TTTCATTCTTTCCGATATTATCTTGTAATTCTCCCAACCGA-TTTGTCAGTTACTGACAGTTACTT-GTCGAGTGCCAAATAAACGTATCTGGTCCCTACAAGAATATGTCTGTCGGTTGTGATGTTAACAATTCCTTGTCGGGATGGGTAT-ATA-----AACAGCCGA-ACTATGTCATTTG--AACTTTTT------------------TTTGTAACTTTGA--AAAAC-TT--------TTT---------------------------GAACTTT---------GACGTCGTTTGAGGCTT------------TT--AGG----------ACTTTTA-AACGTTTGG--------GAGAAC-TTTGAAGCGTATCCCCGGGTAGAGGTGCGATATTGGGTTTATGTTTAGTTCA--TC-TCGCGTAAACGTACAAAACAAAATATAGTCTATAT-CTAGAAACTTATTCACTAATGTATTAATCTAAAAGTACAGGAACATA----TA--ACATTCATCTATTATATCTA-----TATT---CTACTGAAAGAAAT-TACAAGACACGATA-----AACCCTATATAAT-CTCCAGTCTG-CGTTTTAGTTA-TTTTAAAGTCTACCAGTAAAAA---ATAAta
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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lowQualScore : ...... ... . .. . ..... . . .. . . . . . . ......... . . . . . . . . . . . . . . .... ..... .. . . . . . . . . . . . . ..... . .. ... .................. .. . . .... . ................ . ......... .. . . .. .......... . ........ . .. . ...... . . ..... . . ..... ... . ..... . . . . . . ... .
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Reference ( family-1695 ) : GTAATGTAAACCCTAGTTGCA------TTGTTTA---GACAAATTATTTTAGTAATTCTATCA-TAGCTTCACTTTGTTAAATACTGCTCTAAGCTCCAAGCTCATGTGTTTTAAAGGCATTATTTATACAGTAGT--ATTTTCTTTT-----CATAAANATCATTTACTGCTTATGATA--ACAGTTACAGTTGATGATAAAGGTCACCGTTACAACTTGGTGGAAACTTTGATGCATTTTACTCACATGTTTATCTGTCTGTAATTCATCTNACTTGTTATAAATCAG-CTCATTTT-GTCTACATATTGATGATATGTAT-TGTAGAGAACT---------TTATCCATTGATTGTTCATTA-TCAAAAGTCATTTTAAGGCACTTTATTACTTAAATTTAGTCATATTTA-TCTGAGAAAGCAGACAGCCTGTTTTCAGTTTGCANTATA-AATAACCTCCTTCCAGGAGAGCTATTTTGTGTATTTCTATATTTAGATTGTCACAGTTCAATTCATCGGACGGTTTTCATCATAAACAGTTTTCACAATTTATAACATTATTTA-TTCTTGGAACATTGTAAGTCAATGTATGTATTTATTT-T---GTAATTATTCGGTACAGGAA--ACCATCGGATGT-TTTCTCCCTTACCGACAAAATCTTGTTAGTCTCCCAACCGACTTTGTCAGTAACTGACGGTTACTT-GTCGGGTGCCAAACAAACATGTTTGGTCCCTACAAGAATCTGTCAGTCGGTTGGGATTCGGACAATTCCTTGTCGGGATGGGTAT-ATA-----AACAGCCGATTTTATGTCACTTG--GAC---TT------------------TTTGGAACTTTGA--GAAAC-TTCAGAT--CTTTGAGAAC-----G----------TTT-GGAACTTT---------GACGACTTTTGGAACTTTGATCAAAACGGTT--AGG----------ACTTTTA-GACGTTTGG--------AGGAACTTTTGAAGCGTATCACCGGATAGAGGTGCGATACGGGGTTTATTTATAGTTCA--TC-C------AACGTACAAAAC-AAGCATAATCTATAT-CAAGAAACGTATTCACTAATTTAT-----TGAAAGTCCAGGAACATAGATCTATTACATTTACCTATTGTGTCTA-----TATT---CTACTGAAAGAAAT-TGCAAGACAAGATA-----AATCATCTATAAT-CTGCAGCCTG-TGTTTTAGTTA-TTTT-AACCCTACCAGTATAAATTGATAAGCAGTGTCATCCTGACAAACATTATTCTAACAGCACTGGATAATCGGACCGCTCGGTTGTAA
gi|1 : TAATGTAAACCCTAGTTGCA------TTGTTTA---GACAAATTATTTTAGTAATTCTATCA-TATCTTCACTTTGTTAAATACTGCTCTAAGCTCCAAGCTCATGTGTTGTAAAGGCATTATTTATACAGTAGT--ATTTTCGTTT-----CATAAATATCATTTACTGCTTATGAGA--ACAGTTACAGTTGATGATAAAGGTCACCGTTACAACTTGGTGGAAACTTTGATGCATTTTACTCACATGTTTATCTGTCTGTAATTCATCTTACTTGTTATAAATCAG-CTCATTTT-GTCTACTTATTGATGATATGTAT-TGTAGAGAACT---------TTATCCATTGATTGTTCATTA-TCAAAAGTCATTTTAAGGCACTTTATTTCTTAAATTTAGTCATATTTA-TCTGAGAAAGCAGACAGCCTGTTTTCAGTTTGCAATATA-AGTAATCTCCTTCCAGGAGAGCCAGTTTGTGTATTTCTATATTTAGATTGTCACAGTTCAATTCATCGGACGGTTTTCATCATAAATAGTTTTCACAATTTATAAGATTATTTG-TTCTTGGAACATTGTATGTCAGTGTATTTATTTATTT-T---GTAATTATTCGGTACAGGAA--AGCATCGGATGT-TTTCTCATTTACCGACAAAATCTTGTTAGTCTCCCAACTGACTTT----GTAACTAACGGTTACTT-GTCGGGTACCAAACAAACATGTTTGGTCCCTACAAGACTCTTTCAGTTGGTTGGGATTCGGACAATTCTTTGTCGGGATGAGTAT-ATA-----AACAGCCGATTTTATGTCACTAG--GAC---TT------------------TTTAGAACTTTGA--GAAAC-TTCAGAT--CNNNNNNNNN-----N----------NNN-NNNNNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNGATATAAACGGTTAGGACCTTTAGACGTTTGGAGGAACTTTTGAAGCGTATCACCGGATAGAGGTGCGATACGGGGTCTATTTATAGTTCA--TC-C------AACGTACAAAAC-AAGCATAATCTATAT-CAAGAAACGTATTCACTAATTT-T-----TGAAAGTTCAGGAACATAGATCTATTACATTTACCTATTGTGTCTA-----TATT---CTACTGAAAGAAAT-TGCAAGACTAGATA-----AATCATCTATAAT-CTGCAATCTG-TGTTTTAGTTA-TTTT-AACCCTACCAGTATAAATTGATTAGCAGTGTCATCCTGACAAACATTAATCTAACAGCACGGGATAGTCGAACCGCTTGGTTGTAA
gi|10 : GTAATGTAAACCTAAGTTGCA------TTGTTTA---GACAAATTATTTTAGTAATTCTATCA-TAGTTTCACTATGTTAAATACTGCTCTAAGCTACAAGCTCATGTGTTTTAAAGGCATTATTTATACAGTAGT--ATTTATTTTca
gi|10 : ttGTA-GTATTTATTT-T---GTAATTATTCGGTACAGGAA--ACCATCAGATGT-TTTTTCCCTTACCGACAAAATCTTGTTAGTCTCCCGACTGACTTTGTCAGTAACTGACGGTTACTTTGTCGGGTGTCAAACAAATATGTTTGGTCACTATAAGAATCTGTGAGTTGGTTGGGATTCGGACAATTCCTTGTCAGGATGGGTAT-ATA-----AACAGCCGATTTTATGTCACTTT--GAC---TT------------------TTTAGAACTTTGA--GAAAC-TTCAGAT--ATTTGAGAACTTTTGGAACT------TTT-GGAACTTT---------GACGACTTTTGGATTTTTGATTAAAACGGTT--AGG----------ACTTTTA-GACATTTGG--------AGGAACTTTTGAAGCGTATCACCGGATAGAGGTGCGATACGGGGTTTATTTATAGTTCA--TC-C------AACATACAAAAC-TAGCATAATCTATAT-CAAGAAACGTACTCACTAATTTAT-----TGAAAGTCCAGGAACATAGATCTATTACATTAACCTATTGTGTTTA-----TATT---CTACTGAAGGAAAT-GGCAAGACAAGATA-----AATCATCTATAAT-CTGCAGCCTG-TGTTTTAGTTA-TTTT-AACCCTACGAGTATAAATTGATAAGCAGTATCATCCTGACAAACATTATTCTAACAGCACTGGATAATGGGACCCCTCGGTTGTAAgtaattattcggtacaggaaaccatcagatgttttttcccttaccgacaaaatcttgttagtctcccgactgactttgtcagtaactgacggttactttgtcgggtgtcaaacaaatatgtttggtcactataagaatctgtgagttggttgggattcggacaattccttgtcaggatgggtatataaacagccgattttatgtcactttgactttttagaactttgagaaacttcagatatttgagaacttttggaacttttggaactttgacgacttttggatttttgattaaaacggttaggacttttagacatttggaggaacttttgaagcgtatcaccggatagaggtgcgatacggggtttatttatagttcatccaacatacaaaactagcataatctatatcaagaaacgtactcactaatttattgaaagtccaggaacatagatctattacattaacctattgtgtttatattctactgaaggaaatggcaagacaagataaatcatctataatctgcagcctgtgttttagttattttaaccctacgagtataaattgataagcagtatcatcctgacaaacattattctaacagcactggataatgggacccctcggttgtaaca
gi|11 : ttgtaatgtaaacctaagttgcattgtttagacaaattattttagtaattctatcatagtttcactatgttaaatactgctctaagctacaagctcatgtgttttaaaggcattatttatacaGGAA--ACCATCGGATGC-TTTCTCCCTTACCGACAAAGTCTTGTTGTTTTCCCAACCGACTT-----------------------GTCGGGTGCCAAACAAACATTTTTGGTCCCTATAAGAATATGTCAGTTGGTTGGGATTCGGACAAATCCTTGTCGGGATGGGTAT-ATG-----AACAGCTGATTTTATGTCACTTG--GAC---TC------------------TTTAGAACTTTGA--GAAAC-TTCAGAT--CTTTGAGAAC-----G----------TTTTGGAACTTTTCGATATTTGACGATTTTTGGAACTTTGATCAAAACGGTT--AGG----------ACTTTTA-GATGTTTGG--------AGGAACTTTTGAAGCGTATCACCGAATAAAAGTGCGATACGGG-TTTATTTATAGTTTA--TC-C------AACGTACAAAAC-AAGCATAATCTATAT-CAAGAAACGTATTCACTAATTTAT-----TAAAAGTCCAGGAACATAGATCTGTTACGTTTACCTATTGTGTCGA-----TATT---CTACTGAAAGAAAT-TGCAAGACAAGATA-----AATCATTTATAAT-CTGCAGTCTG-TGTTTTAGTTA-TTTT-AACCCTACCAGTATAAATTCATTAGCAGTGGTATCCTGACAAATATTCTTCTAACAGCACTGGATAATCGGACCGCTCGGTTGTAAca
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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