lowQualScore : 1 22222222222222 1 77777777777777777777 222222222 55555555555555555555 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111111 111 11 444
lowQualScore : 3 44 3 6 3 33333333333333 55 4 1 88888888888888888888 3 77 99 2 2 6666 3 333333333 88 44 44 999 66666666666666666666 2 3 2 0 4 55 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 8888888 2 000 6 5 33 888 6
lowQualScore : . .. . . . .............. .. . . .................... . .. .. . . .... . ......... .. .. .. ... .................... . . . . . .. ............................................................................. . ....... . ... . . .. ... .
lowQualScore : 5 44 2 0 1 66666666666666 55 0 6 66666666666666666666 1 77 88 8 3 5555 1 555555555 55 22 66 333 44444444444444444444 7 6 6 9 0 55 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 9 6666666 5 333 7 0 88 000 0
consensus : TACGCTTACAGAACANGATAATATCACTTTATTCA----A---------TCAC--GTTCA-GAATTTCA-TTAA-GGANACCAAA--A-TT-TGATAATT-AATGCGTAGTTTGTT----A-T-----G---CA--T--A--GACACTTGCCAGACT-T----TG--TA---CCCTTC-CGTTGATCGTACCCC-TC--TCC----TT-T---ATCAAATAT--T--TC-TTA-CATNGTT--TATT-ACTTCA--A-TNTNTTAAATGTA--TT-T--AATTC-------ATCTCGA-TNA-ATATTTG--TACA--AATACTTTG
Reference ( gi|5 ) : TACGTTTACAGAACATAATTACATCACTTTATTCA----A---------TCAT--GTTCA-GAATATCA-TTAA-GAGCACCAAG-GA-TT-TGATAATT-AATGCGTAGCTTGTT----A-T-----C---CA--T--A--GACGCCTGCCAAACT-T----TG--TA---CCTTTC-CGTTGATCGTACCTC-TC--TCC----TTAT---ATCAAATAT--T--TC-TTA-TATAGTT--TATT-ACTTCA--AGTTTGTTCAATGTA--TTGA--AATTC-------ATCTCGA-CAA-ATATGTG--TACGATAACATTTTG
gi|14 : TACGCTTACAGAACATGATGATATCATTATATTTA----T---------TCAT--ATTCA-GAA--------------CCCC-----------GATCAAT-AATGCGTAGCTTATT----A-T-----G---CA--C--A--GACACTTGTAAAACT-TA---TG--T
gi|2 : tatttgagaaagaTATGCTTATAGAACAAAATAATATCACTGTATTTATCGTA---------TATT--GTTTA-AAATATCA-TTAA-GGAGACAAAA-GAGTT-TGATGATT-AATTAGCAATTTGTT----G-T-----G---CA--T--
gi|1 : gttaatattttttgttggcaaataTACGCTTACAGAATAAAATAATATCACTGTATTTATC--A---------TTATAAGTGTATAAATATCA-TTAA-GAAGACAAAA-TAGTT-TGCTTATT-AATAAATAATTTGTTTTGCA-T-----C---CA--A--C--TACTCCC-CCA-----T----TC--TAACCCCTTTA-CGTTGATTGCATGCA-TC--CCC------------TCAATTTT--T--AC-TTG-TGCCG-T--TATTGGCTTTA----CTTTTTC-ATG-A--TT------TTC-------ATCtccaattctcccctatttaactcatttaggttgattgcatccatccccttaatttatactagtgtcgttattgtcttactttttcatgattttcaccaaaaaactcttacataattaattacttcaaatatggtaaatataccttaattcatctcgatcactatttgtatatttttgtttaagaatgccctttgttttgcttgtaaaataaaaaacaacaacatatgttta
gi|11 : cttaatgttgatgttgtttttttttacgaagaCGCTTACAGATCATGATAATATCATTTTAGTCA----A---------TCAC--ATTCA-GAATTTCA------------------A-TT-TCATAATTTAATG-GTCGTTTGTT----A-T-----G---CA--T--A--GACACTTGCC-----------------------TTC-CGTTGATCGTACCTC-TC--TCaaattactctttcataatttattacttcaaatatggtaaatataccttcattcatctcgatcactattggtatattgatatatttgttttagaacggcctttgttttggaaacaataacatatgtttaaacttctcagct
gi|12 : aaggttcaaaaagttattaaaagcgtatGCTTACAGAACATGATGATATCACTTGAGTCA----A---------TCGC--ATTCA-GAATTTCA------------------A-TT-TGATAAT----------GTTTGTT----A-T-----G---CA--T--A--GACACTTGCCAGACA-T----TAATTAAA-CACTTC-CGTTGATCGTATCTC-TC--TCCTAATTTATTTCATCAAATA
gi|13 : TTT-CAGAATAAGGTTATGTCACTTTA---A----A---------TAAT--GTTTT-GAATTTCG-TTAA-TGATATCAAA-AA-TT-TGATAATC-AATGTGTAGTTTGTT----A-T-----G---CAGGC--A--GACACTTGACTGACT-T----TG--T
gi|15 : cTTATAGAACAAAATAATATCATTTTATTCT----A---------TCAT--GTCCA-GAATTTCA-TTAAGGAAAACCAAACGG-TT-TGA
gi|6 : agtgttaattcagttttatttttcgccaaggtaaacACATGATAATATCACTTTAGTTA----A---------TCAA--ATTCA-GAATTTCA------------------A-TT-TGATAAT----------GTTTGTT----A-T-----G---CA--T--A--AACACTTGCCAGACA-T----TAATTAAA-CACTTC-CGTTGATCGTACCTC-AC--TCC----TTA----AT----TAT--T--TCATCA-AATAATT--C-TT-TCTAAA--AGTATGTTAAAAGTA--TTTT--AATTC-------ATCTTGATCAACATTTGTA--TACA--AATACTTTG
gi|4 : TTATTTTATTCA----AGAAATTATTTCAC--GTTCA-GAATTTCAGTTAG-GA-CACAAAG-CA-GTATGATAATT-GATATGCAATTTGTT----A-T-----G---CA--TACA--GACACTCGCCTGATTCT----TG---A---CCCTTC-CGTAGATAGTACCCC-AC---CC----TT------TCAAG-AT--T--GCAATA-TTTTGTT--TGCT-TCTTCGTTACTTTCATCAA---A--T-----AATTCTGACATAATTACTA-CAA-ATATGTtcgggacgggccacaattaatgttggtacaacttgt
gi|8 : cttagtgcttatgcagtttttatttatcttacgatacgttacttgaattgaaaaatcTCACTTTATTCA----A---------TGAT--GTTCA-TAATTTCG-TTAG-GGACACCAAG--------------C-AATGTATATTTTCCT----T-T-----A---CAGTT--G--GAGACTTGCTGGATT-T----TC--GA---CTCTTC-CGTCGGTCGTTCCCA-TC--TCC----C-------TCAGAT-T--T--AC-TGA-T---GTTAATATT-GTCTCA--Ataa
gi|16 : aaaatgctat-GA-TT-TGATAATT-AATGCGTATCTTCTT----A-T-----T---CA--T--A--GACGCTTGACAGACT-T----TG--GA---CCCTTT-CGTTGATCGTACcattattttgctttcatcaaata
gi|9 : cacacA-TT-TGATAAT-------G-AGTTTGTT----A-TGTATACAGACA--T--ACAGACACTTGCCTGACT-TGGATTG--GA---CCCCTCACCTTAAT---ACTTCATCGTTAC----TTTC---ATCAAATAG--T--TC-TTA-CAT---------T-ATTT-A--A-----TTAAATGTA--TTAT--ATTTC-------ATCTTGA-TCA-ACATTTG--TAC-ATA
gi|3 : -TT-TGATAATT-AATGTGTAGCTTGTT----AGT-----A---TA--T--G--GAC---------------------------CCTTT--TGTTGACTGTACTCC-TC--CCC----TT-T---ATt
gi|10 : gTAAGT-AATGTGAAGTTTGTT----A-T-----G---CA--T--A--GA-----GACACACC-TGGAGTA--GA---CCCTTT-CATCGTTTGTTCCCC-TC--TCT----TT-T---A--AAATATACTGATG-TCATTATTGTC--TTTTAACTTC------TTCTTTACTGTA--TTAATTAATT--------ATTGC-A-TAA-ATATttatacttatgtcattatagtctctcttctatgttattttcatcaaaaaatttaataattcttacttaagtaattacttcaaatatattaaacaatacatcatgatcagtattatttcttttcattttagggccataatcgatgttgattttttccagatttgtgacctgacccttttgcttatttataaaataaaaagcaacacttgtgtctataatgtttga
gi|7 : CTTTC-C-TTCATTG--------C--TGC----TTTC---ATCAAACAA--T--TC-TTA-CATATTT--AATT-ATTTCA--AATATGTTAAATGTAT-TTGT--ATTTC-------TTCTTGA-TCA-GTATTTGCATACA--AATATTTTGttaca
gi|2 : t---ACCAAAAAA--C--TC-TTA-CATAATT--AATT-ACTTCA--AATATGGTAAATATACCTT----AATTC-------ATCTCGA-TCA-CTATTTG--TAttgggaagggccttaatggtttcagacgttatggtccgacagtaatctataacatatagagcaataaaatag
Alignments
lowQualScore : 22222222222222 4444444444444444444444 222222222222222 33333333333333333333333333 2222222222222222 111111 2222 22222222 11
lowQualScore : 1 2 00000000000000 777 3 9999999999999999999999 2 3 8 1 77 33 000000000000000 44444444444444444444444444 7 1 4 55 1111111111111111 3 222222 6666 3 777 66 7777 555 77 0000 2 1 2 55555555 4 5 1 0 88 99 0
lowQualScore : . . .............. ... . ...................... . . . . .. .. ............... .......................... . . . .. ................ . ...... .... . ... .. .... ... .. .... . . . ........ . . . . .. .. .
lowQualScore : 0 0 66666666666666 555 6 9999999999999999999999 9 6 2 9 99 99 555555555555555 88888888888888888888888888 3 2 0 55 4444444444444444 3 999999 1111 6 333 44 7777 888 66 5555 4 0 0 22222222 4 0 0 8 33 22 7
consensus : TACGCTTACAGAACANGATAATATCACTTTATTCA----A---------TCAC--GTTCA-GAATTTCATTAAGG-ANACCAA--A--A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGTTTGTTATGCA--T--A----------G----ACACTTGCCAGAC-T---T----TG--N--A--CCCTTC-CGTTGATCGTACCCC-TC--TCC--------TT-C----ATCA-AATAN--T--T--C-TTA-C--ATAGT----T--TATT-ACTTC-AA-TATGTTAAATGTA-T-T--T-AATTCATC-TCG-ATCAATATTTG--TACA--AATATTTTG
Reference ( family-1617 ) : TACGCTTACAGAACANGATAATATCACTTTATTCA----A---------TCAC--GTTCA-GAATTTCATTAAGG-ANACCAA--A--A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGTTTGTTATGCA--T--A----------G----ACACTTGCCAGAC-T---T----TG--T--A--CCCTTC-CGTTGATCGTACCCC-TC--TCC--------TT-T----ATCA-AATAT--T--T--C-TTA-C--ATNGT----T--TATT-ACTTC-AA-TNTNTTAAATGTA-T-T--T-AATTCATC-TCG-ATNAATATTTG--TACA--AATACTTTG
gi|1 : TACGCTTACAGAATAAAATAATATCACTGTATTTATC--A---------TTATAAGTGTATAAATATCATTAAGA-AGACAAAATA--G-TTTGCTTA-TTAATAAATAATTTGTTTTGCA--TCCA----------A----CTACTCCCC---C-A---T----TC--T--AACCCCTTTACGTTGATTGCATGCA-TC--CCC-----------------TCA-A------T--T--T-TTA-C---TTGTGCCGT--TATTGGCTTT-AC-TTTTTC--ATG-A-T-T------TTCATC-
gi|1 : cttaatgttgatgttgtttttttttacgaaga--------TT-C----ATCA-AATTA--C--T--C-TTT-C--ATAAT----T--TATT-ACTTCAAA-TATGGTAAATATACC-T--T-CATTCATC-TCG-ATCACTATTGG--TATA--aaattactctttcataatttattacttcaaatatggtaaatataccttcattcatctcgatcactattggtatattgatatatttgttttagaacggcctttgttttggaaacaataacatatgtttaaacttctcagct
gi|10 : cttaatgttgatgttgtttttttttacgaagatacgcttacagaataaaataatatcactgtatttatcattataagtgtataaatatcattaagaagacaaaatagtttgcttattaataaataatttgttttgcatccaactactcccccattctaacccctttacgttgattgcatgcatcccctcaatttttacttgtgccgttattggctttactttttcatgattTAA-GTAATGTGAAGTTTGTTATGCA--T--A----------GAGACACACCTG---GA------------G--TAGA--CCCTTT-CATCGTTTGTTCCCC-TC--TCT--------TT-T----A--A-AATATACTGAT--G-TCATT--ATTGT----C--TTTTAACTTC-----TTCTTTACTGTA---T--T-AATTAATTATTGCATAAATATTTttgatatatttgttttagaacggcctttgttttggaaacaataacatatgtttaaacttctcagct
gi|11 : CGCTTACAGATCATGATAATATCATTTTAGTCA----A---------TCAC--ATTCA-GAATTTC-----------------A--A-TTTCATAATTTAATG-GTCGTTTGTTATGCA--T--A----------G----ACACTTG---------------------------CCTTC-CGTTGATCGTACCTC-TC--TCaca
gi|12 : aaggttcaaaaagttattaaaagcgtatGCTTACAGAACATGATGATATCACTTGAGTCA----A---------TCGC--ATTCA-GAATTTCA-------------------A-TTTGATAA-T---------GTTTGTTATGCA--T--A----------G----ACACTTGCCAGACATTAAT----TA--A--A--CACTTC-CGTTGATCGTATCTC-TC--TCCTAATTTATTT-C----ATCA-AATA
gi|13 : CTTTCAGAATAAGGTTATGTCACTTTA---A----A---------TAAT--GTTTT-GAATTTCGTTAATG-ATATCAA--A--AATTTGATAA-TCAATGTGTAGTTTGTTATGCAGGC--A----------G----ACACTTGACTGAC-T---T----TG--T--
gi|14 : TACGCTTACAGAACATGATGATATCATTATATTTA----T---------TCAT--ATTCA-GAACCCC---------GATCAA-----------------TAATGCGTAGCTTATTATGCA--C--A----------G----ACACTTGTAAAAC-T---TA---TG--T--
gi|15 : tatttgagaaagaCTTATAGAACAAAATAATATCATTTTATTCT----A---------TCAT--GTCCA-GAATTTCATTAAGGAAAACCAA--ACGG-TTTGA
gi|16 : agtgttaattcagttttatttttcgccaaggtaaa--A-TTTGATAA-TTAATGCGTATCTTCTTATTCA--T--A----------G----ACGCTTGACAGAC-T---T----TG--G--A--CCCTTT-CGTTGATCGTAC
gi|2 : cacacgTATGCTTATAGAACAAAATAATATCACTGTATTTATCGTA---------TATT--GTTTA-AAATATCATTAAGG-AGACAAAAGA--G-TTTGATGA-TTAATTAGCAATTTGTTGTGCA--T--
gi|2 : gttaatattttttgttggcaaata--------TT-C----ACCA-AAAAA--C--T--C-TTA-C--ATAAT----T--AATT-ACTTC-AAATATGGTAAATATA-CCT--T-AATTCATC-TCG-ATCACTATTTG--TATA--tccaattctcccctatttaactcatttaggttgattgcatccatccccttaatttatactagtgtcgttattgtcttactttttcatgattttcaccaaaaaactcttacataattaattacttcaaatatggtaaatataccttaattcatctcgatcactatttgtatatttttgtttaagaatgccctttgttttgcttgtaaaataaaaaacaacaacatatgttta
gi|3 : gttaatattttttgttggcaaatatatgcttatagaacaaaataatatcactgtatttatcgtatattgtttaaaatatcattaaggagacaaaagagtttgatgattaattagcaatttgttgtgcattccaattctcccctatttaactcatttaggttgattgcatccatccccttaatttatactagtgtcgttattgtcttactttttcatgatt-TTTGATAA-TTAATGTGTAGCTTGTTA-GTA--T--A--------------------------------------TG--G--A--CCCTTT-TGTTGACTGTACTCC-TC--CCC--------TT-T----ATtttttgtttaagaatgccctttgttttgcttgtaaaataaaaaacaacaacatatgttta
gi|3 : g-AATAA--T--T--C-TTA-C--TTAAG----T--AATT-ACTTCAAA-TATATTAAA----------C-AATACATC-ATG-ATCAGTATTttatacttatgtcattatagtctctcttctatgttattttcatcaaaaaatttaataattcttacttaagtaattacttcaaatatattaaacaatacatcatgatcagtattatttcttttcattttagggccataatcgatgttgattttttccagatttgtgacctgacccttttgcttatttataaaataaaaagcaacacttgtgtctataatgtttga
gi|4 : gtttgataattaatgtgtagcttgttagtatatggacccttttgttgactgtactcctcccctttatttatacttatgtcattatagtctctcttctatgttattttcatcaaaaaatttAATCTTATTTTATTCA----AGAAATTATTTCAC--GTTCA-GAATTTCAGTTAGG-ACACAAAGCA--G-TATGATAA-TTGATATGCAATTTGTTATGCA--T--ACA--------G----ACACTCGCCTGAT-TC--T----TG-----A--CCCTTC-CGTAGATAGTACCCC-AC---CC--------TT-TCAAGATTGCAATAT--T--TTGT-TTG-C---TTCT----T--CGTT-ACTTatttcttttcattttagggccataatcgatgttgattttttccagatttgtgacctgacccttttgcttatttataaaataaaaagcaacacttgtgtctataatgtttga
gi|5 : cttagtgcttatgcagtttttatttatcttacgatacgttacttgaattgaaaTACGTTTACAGAACATAATTACATCACTTTATTCA----A---------TCAT--GTTCA-GAATATCATTAAGA-GCACCAA--GG-A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGCTTGTTATCCA--T--A----------G----ACGCCTGCCAAAC-T---T----TG--T--A--CCTTTC-CGTTGATCGTACCTC-TC--TCC--------TTAT----ATCA-AATAT--T--T--C-TTA-T--ATAGT----T--TATT-ACTTC-AAGTTTGTTCAATGTA-T-T--GAAATTCATC-TCG-ACAAATATGTG--TACGATAACATTTTGtcatcaaataattctgacataattactacaaatatgttaa
gi|6 : ACATGATAATATCACTTTAGTTA----A---------TCAA--ATTCA-GAATTTCA-------------------A-TTTGATAA-T---------GTTTGTTATGCA--T--A----------A----ACACTTGCCAGAC-A---T----TAATT--AAACACTTC-CGTTGATCGTACCTC-AC--TCC--------TT-A----AT-----TAT--T--T--CATCA-A--ATAAT----T--CTTT--CTAA-AAGTATGTTAAAAGTA-T-T--TTAATTCATC-TTG-ATCAACATTTGTATACA--AATACTTTG
gi|7 : CT--------TT-C----ATCA-AACAA--T--T--C-TTA-C--ATATT----T--AATT-ATTTCAAA-TATGTTAAATGTA-T-TTGT-ATTTCTTC-TTG-ATCAGTATTTGCATACA--AATATTTTGtcgggacgggccacaattaatgttggtacaacttgt
gi|8 : tctttccttcattgctgTCACTTTATTCA----A---------TGAT--GTTCA-TAATTTCGTTAGGG-ACACCAA--G--------------CAATGTATATTTTCCTTTACAGTT--G----------G----AGACTTGCTGGAT-T---T----TC--G--A--CTCTTC-CGTCGGTCGTTCCCA-TC--TCC--------C--------TCA-GAT------------TTA-CTGAT-GT----TAATATT-GTCTC-AA-CATttgggaagggccttaatggtttcagacgttatggtccgacagtaatctataacatatagagcaataaaatag
gi|9 : aaaatgctat--A-TTTGATAA-T------G-AGTTTGTTATGTA--T--ACAGACATACAG----ACACTTGCCTGAC-T---TGGATTG--G--A--CCCCTCACCTTAAT---ACTTCATCGTTAC--------TT-TC---ATCA-AATAG--T--T--C-TTA-C--ATTAT----T--TA---------------ATTAAATGTA-T-TA-T-ATTTCATC-TTG-ATCAACATTTG--TACA--TATtattttgctttcatcaaata
Alignments
lowQualScore : 22222222222222 4444444444444444444444 2222222222222222 22222222222222222222 222222222222222 111111111111111111111111111 11111111 111 22222 2222222 111111111
lowQualScore : 1 2 00000000000000 777 3 9999999999999999999999 2 3 8 1 2 0000000000000000 6666 11111111111111111111 44 3 44 6 44 000000000000000 3 55 3 999999999999999999999999999 44444444 5 777 4 555 2 4 88888 0 5555555 1 3 777777777 6
lowQualScore : . . .............. ... . ...................... . . . . . ................ .... .................... .. . .. . .. ............... . .. . ........................... ........ . ... . ... . . ..... . ....... . . ......... .
lowQualScore : 0 0 66666666666666 555 6 9999999999999999999999 9 6 2 9 9 1111111111111111 1111 55555555555555555555 88 3 66 7 99 888888888888888 6 00 1 111111111111111111111111111 55555555 3 888 4 333 3 4 22222 4 6666666 1 8 666666666 7
consensus : TACGCTTACAGAACANGATAATATCACTTTATTCA----A---------TCAC--GTTCA-GAATTTCATTAAGG-ANACCAA--A--A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------G----ACACTT--GCCNGAC--T---T----TGGAC-CC--TTC-CGTTGATC-GTAC---------------CCC-TC--T-CC--------T---------T--------CATCAAA--------TAATTCTTA---CA-TA--ATTTATT-ACTTCAAA--TATGTTAAATGTA-TT--T-AATTCATCTCGATCANTATTTG--TACA--AATAT-TTTG
Reference ( family-1617 ) : TACGCTTACAGAACANGATAATATCACTTTATTCA----A---------TCAC--GTTCA-GAATTTCATTAAGG-ANACCAA--A--A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------G----ACACTT--GCCAGAC--T---T----TGNAC-CC--TTC-CGTTGATC-GTAC---------------CCC-TC--T-CC--------T---------T--------CATCAAA--------TANTTCTTA---CA-TA--GTTTATT-ACTTC-AA--TATGTTAAATGTA-TT--T-AATTCATCTCGATCAATATTTG--TACA--AATAT-TTTG
gi|1 : TACGCTTACAGAATAAAATAATATCACTGTATTTATC--A---------TTATAAGTGTATAAATATCATTAAGA-AGACAAAATA--G-TTTGCTTA-TTAATAAATAATTTGTTT-TGCA--TCCA----------A----CTACTC---CCCCAT--T---C----TAACC-CC--TTTACGTTGATT-GCAT---------------GCA-TC--C-CC--------T---------
gi|1 : cttaatgttgatgttgtttttttttacgaaga--------T---------T--------CATCAAA--------TTACTCTTT---CA-TA--ATTTATT-ACTTCAAA--TATGGTAAATATACCT--T-CATTCATCTCGATCACTATTGG--TATATTGATATATTTGcaatttttacttgtgccgttattggctttactttttcatgattttcatcaaattactctttcataatttattacttcaaatatggtaaatataccttcattcatctcgatcactattggtatattgatatatttgttttagaacggcctttgttttggaaacaataacatatgtttaaacttctcagct
gi|10 : cttaatgttgatgttgtttttttttacgaagatacgcttacagaataaaataatatcactgtatttatcattataagtgtataaatatcattaagaagacaaaatagtttgcttattaataaataatttgttttgcatccaactactcccccattctaacccctttacgttgattgcatgcatcccctcaatttttacttgtgccgttattggctttactttttcatgattTAA-GTAATGTGAAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GAGACACACCT--G---GA-------G----TAGAC-CC--TTT-CATCGTTT-GTTC---------------CCC-TC--T-CT--------T---------T--------TA--AAA--------TA-TACTGATGTCATTATTGTCTTTTAACTTC-----T-TCTTTACTGTA--T--T-AATTAAT---------TA-TTG--CATA--AATAT-TTttttagaacggcctttgttttggaaacaataacatatgtttaaacttctcagct
gi|11 : CGCTTACAGATCATGATAATATCATTTTAGTCA----A---------TCAC--ATTCA-GAATTTC-----------------A--A-TTTCATAATTTAATG-GTCGTTTGTTA-TGCA--T--A----------G----ACACTT--G-----------------------CC--TTC-CGTTGATC-GTAC---------------CTC-TC--T-Caca
gi|12 : aaggttcaaaaagttattaaaagcgtatGCTTACAGAACATGATGATATCACTTGAGTCA----A---------TCGC--ATTCA-GAATTTCA-------------------A-TTTGATAA-T---------GTTTGTTA-TGCA--T--A----------G----ACACTT--GCCAGACA-TTAAT----TAAAC-AC--TTC-CGTTGATC-GTAT---------------CTC-TC--T-CCTAATTTATT---------T--------CATCAAA--------TA
gi|13 : CTTTCAGAATAAGGTTATGTCACTTTA---A----A---------TAAT--GTTTT-GAATTTCGTTAATG-ATATCAA--A--AATTTGATAA-TCAATGTGTAGTTTGTTA-TGCAGGC--A----------G----ACACTT--GACTGAC--T---T----TG
gi|14 : TACGCTTACAGAACATGATGATATCATTATATTTA----T---------TCAT--ATTCA-GAACCCC---------GATCAA-----------------TAATGCGTAGCTTATTA-TGCA--C--A----------G----ACACTT--GTAAAAC--T---T----t
gi|15 : tatttgagaaagaCTTATAGAACAAAATAATATCATTTTATTCT----A---------TCAT--GTCCA-GAATTTCATTAAGGAAAACCAA--ACGG-TTTGAatgt
gi|16 : agtgttaattcagttttatttttcgccaaggtaaa--A-TTTGATAA-TTAATGCGTATCTTCTTA-TTCA--T--A----------G----ACGCTT--GACAGAC--T---T----TGGAC-CC--TTT-CGTTGATC-GTAC---------------
gi|2 : cacacgTATGCTTATAGAACAAAATAATATCACTGTATTTATCGTA---------TATT--GTTTA-AAATATCATTAAGG-AGACAAAAGA--G-TTTGATGA-TTAATTAGCAATTTGTTG-TGCA--TTCC----------A----ATTCTC---CC---C--TA--T----TTAAC-TCATTTA-GGTTGATT-GCAT---------------CCA-TC--C-CC--------T---------T--------AAT
gi|2 : gttaatattttttgttggcaaata--------T---------T--------CACCAAA--------AAACTCTTA---CA-TA--ATTAATT-ACTTCAAA--TATGGTAAATATACCT--T-AATTCATCTCGATCACTATTTG--T------ATAT-TTTttatactagtgtcgttattgtcttactttttcatgattttcaccaaaaaactcttacataattaattacttcaaatatggtaaatataccttaattcatctcgatcactatttgtatatttttgtttaagaatgccctttgttttgcttgtaaaataaaaaacaacaacatatgttta
gi|3 : gttaatattttttgttggcaaatatatgcttatagaacaaaataatatcactgtatttatcgtatattgtttaaaatatcattaaggagacaaaagagtttgatgattaattagcaatttgttgtgcattccaattctcccctatttaactcatttaggttgattgcatccatccccttaatttatactagtgtcgttattgtcttactttttcatgatt-TTTGATAA-TTAATGTGTAGCTTGTTAGTATA--T--G----------G----ACCCTTTTGTT-GAC--T---------GTACTCC--TCC-CCTTTATTTATACTTATGTCATTATAGTCTC-TC--T-TC--------TATGTTATTTT--------CATCAAAAAATTTAATAATTCTTA---CT-TA--AGTAATT-ACTTCAAA--TATATTAAA---------C-AATACATCATGATCAGTATTtgtttaagaatgccctttgttttgcttgtaaaataaaaaacaacaacatatgttta
gi|4 : gAATCTTATTTTATTCA----AGAAATTATTTCAC--GTTCA-GAATTTCAGTTAGG-ACACAAAGCA--G-TATGATAA-TTGATATGCAATTTGTTA-TGCA--T--ACA--------G----ACACTC--GCCTGAT--T---C----TTGAC-CC--TTC-CGTAGATA-GTAC---------------CCC-AC--C-CT--------T---------T--------CAatttcttttcattttagggccataatcgatgttgattttttccagatttgtgacctgacccttttgcttatttataaaataaaaagcaacacttgtgtctataatgtttga
gi|4 : cttagtgcttatgcagtttttatttatcttacgatacgttacttgaattgaaa-CT--------T---------T--------CATCAAA--------TAATTCTGA---CA-TA------ATT-ACTACAAA--TATGTTAAagattgcaatattttgtttgcttcttcgttactttcatcaaataattctgacataattactacaaatatgttaa
gi|5 : cttagtgcttatgcagtttttatttatcttacgatacgttacttgaattgaaaaatcttattttattcaagaaattatttcacgttcagaatttcagttaggacacaaagcagtatgataattgatatgcaatttgttatgcatacagacactcgcctgattcttgacccttccgtagatagtaccccaccctttcaagattgcaatattttgtttgcttcttcgttaTACGTTTACAGAACATAATTACATCACTTTATTCA----A---------TCAT--GTTCA-GAATATCATTAAGA-GCACCAA--GG-A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGCTTGTTA-TCCA--T--A----------G----ACGCCT--GCCAAAC--T---T----TGTAC-CT--TTC-CGTTGATC-GTAC---------------CTC-TC--T-CC--------T---------TA-------TATCAAA--------TATTTCTTA---TA-TA--GTTTATT-ACTTC-AAG-TTTGTTCAATGTA-TT--GAAATTCATCTCGACAAATATGTG--TACGATAACAT-TTTG
gi|6 : ACATGATAATATCACTTTAGTTA----A---------TCAA--ATTCA-GAATTTCA-------------------A-TTTGATAA-T---------GTTTGTTA-TGCA--T--A----------A----ACACTT--GCCAGACATTAA-T----TAAAC-AC--TTC-CGTTGATC-GTAC---------------CTC-AC--T-CC--------T---------TAATTATTTCATCAAA--------TAATTCTT------------TCTA---------AAAGTATGTTAAAAGTA-TT--TTAATTCATCTTGATCAACATTTGTATACA--AATAC-TTTG
gi|7 : -CT--------T---------T--------CATCAAA--------CAATTCTTA---CA-TA--TTTAATT-ATTTCAAA--TATGTTAAATGTA-TTTGT-ATTTCTTCTTGATCAGTATTTGCATACA--AATAT-TTTGtcgggacgggccacaattaatgttggtacaacttgt
gi|8 : tctttccttcattgctgTCACTTTATTCA----A---------TGAT--GTTCA-TAATTTCGTTAGGG-ACACCAA--G--------------CAATGTATATTTTCCTT-TACAGTT--G----------G----AGACTT--GCTGGAT--T---T----TCGAC-TC--TTC-CGTCGGTC-GTTC---------------CCA-TC--T-CC--------C---------T--------CAttgggaagggccttaatggtttcagacgttatggtccgacagtaatctataacatatagagcaataaaatag
gi|9 : aaaatgctat--A-TTTGATAA-T------G-AGTTTGTTA-TGTA--T--ACAGACATACAG----ACACTT--GCCTGAC--T---TGGATTGGAC-CC--CTCACCTTAAT----AC---------------TTCATCGTTACT--------T---------T--------CATCAAA--------TAGTTCTTA---CA-------TTATT-----------TA-ATTAAATGTA-TTA-T-ATTTCATCTTGATCAACATTTG--TACA--TATgatttactgatgttaatattgtctcaacattattttgctttcatcaaata
Alignments
lowQualScore : 22222222222222 4444444444444444444444 2222222222222222 22222222222222 222222222222222222222 222222222222222222222222222 11111111 2222222 111111111
lowQualScore : 1 2 00000000000000 777 3 9999999999999999999999 2 3 8 1 2 0000000000000000 33 2 11111111111111 3 44 6 44 111111111111111111111 3 55 3 000000000000000000000000000 44444444 1 777 22 99 777 2 0 5555555 1 2 1 777777777 6
lowQualScore : . . .............. ... . ...................... . . . . . ................ .. . .............. . .. . .. ..................... . .. . ........................... ........ . ... .. .. ... . . ....... . . . ......... .
lowQualScore : 0 0 66666666666666 555 6 9999999999999999999999 9 6 2 9 9 1111111111111111 99 0 00000000000000 3 66 7 99 888888888888888888888 6 00 3 888888888888888888888888888 55555555 0 888 88 44 888 0 4 6666666 1 8 4 666666666 7
consensus : TACGCTTACAGAACANGATAATATCACTTTATTCA----A---------TCAC--GTTCA-GAATTTCATTAAGG-ANACCAA--A--A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTC--GCCNGAC--T---T----TGGAC-CC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CCC-TC--T-CC--------T---------T--------CATCAAA--------TAATTCTTA---CATAATT-NATT---ACTTCAAATATGTTAAATGTA-TT--T-AATTCATCTCGATCANTATTTG--TACA--AATAT-TTTG
Reference ( family-1617 ) : TACGCTTACAGAACANGATAATATCACTTTATTCA----A---------TCAC--GTTCA-GAATTTCATTAAGG-ANACCAA--A--A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTT--GCCNGAC--T---T----TGGAC-CC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CCC-TC--T-CC--------T---------T--------CATCAAA--------TAATTCTTA---CATAATT-TATT---ACTTCAAATATGTTAAATGTA-TT--T-AATTCATCTCGATCANTATTTG--TACA--AATAT-TTTG
gi|1 : TACGCTTACAGAATAAAATAATATCACTGTATTTATC--A---------TTATAAGTGTATAAATATCATTAAGA-AGACAAAATA--G-TTTGCTTA-TTAATAAATAATTTGTTT-TGCA--TCCA----------ACTACTC---CCCCAT--T---C----TAACC-CC--TTTACGTTGATT-GCATGCATC---------------CCC-TC--
gi|1 : cttaatgttgatgttgtttttttttacgaaga--------T---------T--------CATCAAA--------TTACTCTTT---CATAATT-TATT---ACTTCAAATATGGTAAATATACCT--T-CATTCATCTCGATCACTATTGG--TATATTGATATATTTGaatttttacttgtgccgttattggctttactttttcatgattttcatcaaattactctttcataatttattacttcaaatatggtaaatataccttcattcatctcgatcactattggtatattgatatatttgttttagaacggcctttgttttggaaacaataacatatgtttaaacttctcagct
gi|10 : cttaatgttgatgttgtttttttttacgaagatacgcttacagaataaaataatatcactgtatttatcattataagtgtataaatatcattaagaagacaaaatagtttgcttattaataaataatttgttttgcatccaactactcccccattctaacccctttacgttgattgcatgcatcccctcaatttttacttgtgccgttattggctttactttttcatgattTAA-GTAATGTGAAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GAGACAC--ACCTGGA--G---T-----AGAC-CC--TTT-CATCGTTT-GTT-----C---------------CCC-TC--T-CT--------T---------T--------TA--AAA--------TA-TACTGATGTCATTATTGTCTTTTAACTTC---T-TCTTTACTGTA-TT----AATTAAT---------TATT-G--CATA--AATAT-TTttttagaacggcctttgttttggaaacaataacatatgtttaaacttctcagct
gi|11 : CGCTTACAGATCATGATAATATCATTTTAGTCA----A---------TCAC--ATTCA-GAATTTC-----------------A--A-TTTCATAATTTAATG-GTCGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTT--G-----------------------CC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CTC-TC--T-Caca
gi|12 : aaggttcaaaaagttattaaaagcgtatGCTTACAGAACATGATGATATCACTTGAGTCA----A---------TCGC--ATTCA-GAATTTCA-------------------A-TTTGATAA-T---------GTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTT--GCCAGACA-TTAAT----TAAAC-AC--TTC-CGTTGATC-GTA-----T---------------CTC-TC--T-CCTAATTTATT---------T--------CATCAAA--------TA
gi|13 : CTTTCAGAATAAGGTTATGTCACTTTA---A----A---------TAAT--GTTTT-GAATTTCGTTAATG-ATATCAA--A--AATTTGATAA-TCAATGTGTAGTTTGTTA-TGCAGGC--A----------GACACTT--GACTGAC--T---T----TG
gi|14 : TACGCTTACAGAACATGATGATATCATTATATTTA----T---------TCAT--ATTCA-GAACCCC---------GATCAA-----------------TAATGCGTAGCTTATTA-TGCA--C--A----------GACACTT--GTAAAAC--T---T----t
gi|15 : tatttgagaaagaCTTATAGAACAAAATAATATCATTTTATTCT----A---------TCAT--GTCCA-GAATTTCATTAAGGAAAACCAA--ACGG-TTTGAatgt
gi|16 : agtgttaattcagttttatttttcgccaaggtaaa--A-TTTGATAA-TTAATGCGTATCTTCTTA-TTCA--T--A----------GACGCTT--GACAGAC--T---T----TGGAC-CC--TTT-CGTTGATC-GTA-----C---------------
gi|2 : cacacgTATGCTTATAGAACAAAATAATATCACTGTATTTATCGTA---------TATT--GTTTA-AAATATCATTAAGG-AGACAAAAGA--G-TTTGATGA-TTAATTAGCAATTTGTTG-TGCA--TTCC----------AATTCTC---CCCTAT--T---T------AAC-TCATTTA-GGTTGATT-GCA-----T---------------CCA-TC--C-CC--------T---------T--------AAT
gi|2 : gttaatattttttgttggcaaata--------T---------T--------CACCAAA--------AAACTCTTA---CATAATT-AATT---ACTTCAAATATGGTAAATATACCT--T-AATTCATCTCGATCACTATTTG--T------ATAT-TTTttatactagtgtcgttattgtcttactttttcatgattttcaccaaaaaactcttacataattaattacttcaaatatggtaaatataccttaattcatctcgatcactatttgtatatttttgtttaagaatgccctttgttttgcttgtaaaataaaaaacaacaacatatgttta
gi|3 : gttaatattttttgttggcaaatatatgcttatagaacaaaataatatcactgtatttatcgtatattgtttaaaatatcattaaggagacaaaagagtttgatgattaattagcaatttgttgtgcattccaattctcccctatttaactcatttaggttgattgcatccatccccttaatttatactagtgtcgttattgtcttactttttcatgatt-TTTGATAA-TTAATGTGTAGCTTGTTAGTATA--T--G----------GACCCTTTTGT-TGAC--T---------GTACTCC--TCC-CCTTTATTTATA-----CTTATGTCATTATAGTCTC-TC--T-TC--------TATGTTATTTT--------CATCAAAAAATTTAATAATTCTTA---CTTAAGT-AATT---ACTTCAAATATATTAAA---------C-AATACATCATGATCAGTATTtgtttaagaatgccctttgttttgcttgtaaaataaaaaacaacaacatatgttta
gi|4 : gAATCTTATTTTATTCA----AGAAATTATTTCAC--GTTCA-GAATTTCAGTTAGG-ACACAAAGCA--G-TATGATAA-TTGATATGCAATTTGTTA-TGCA--T--ACA--------GACACTC--GCCTGAT--T---C----TTGAC-CC--TTC-CGTAGATA-GTA-----C---------------CCC-AC--C-CT--------T---------T--------CAatttcttttcattttagggccataatcgatgttgattttttccagatttgtgacctgacccttttgcttatttataaaataaaaagcaacacttgtgtctataatgtttga
gi|4 : cttagtgcttatgcagtttttatttatcttacgatacgttacttgaattgaaa-CT--------T---------T--------CATCAAA--------TAATTCTGA---CATA-----ATT---ACTACAAATATGTTAAagattgcaatattttgtttgcttcttcgttactttcatcaaataattctgacataattactacaaatatgttaa
gi|5 : cttagtgcttatgcagtttttatttatcttacgatacgttacttgaattgaaaaatcttattttattcaagaaattatttcacgttcagaatttcagttaggacacaaagcagtatgataattgatatgcaatttgttatgcatacagacactcgcctgattcttgacccttccgtagatagtaccccaccctttcaagattgcaatattttgtttgcttcttcgttaTACGTTTACAGAACATAATTACATCACTTTATTCA----A---------TCAT--GTTCA-GAATATCATTAAGA-GCACCAA--GG-A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGCTTGTTA-TCCA--T--A----------GACGCCT--GCCAAAC--T---T----TGTAC-CT--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CTC-TC--T-CC--------T---------TA-------TATCAAA--------TATTTCTTA---TATAGTT-TATT---ACTTCAAGTTTGTTCAATGTA-TT--GAAATTCATCTCGACAAATATGTG--TACGATAACAT-TTTG
gi|6 : ACATGATAATATCACTTTAGTTA----A---------TCAA--ATTCA-GAATTTCA-------------------A-TTTGATAA-T---------GTTTGTTA-TGCA--T--A----------AACACTT--GCCAGACATTAA-T----TAAAC-AC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CTC-AC--T-CC--------T---------TAATTATTTCATCAAA--------TAATTCTTT---C-TAA---------------AAGTATGTTAAAAGTA-TT--TTAATTCATCTTGATCAACATTTGTATACA--AATAC-TTTG
gi|7 : -CT--------T---------T--------CATCAAA--------CAATTCTTA---CATATTT-AATT---ATTTCAAATATGTTAAATGTA-TTTGT-ATTTCTTCTTGATCAGTATTTGCATACA--AATAT-TTTGtcgggacgggccacaattaatgttggtacaacttgt
gi|8 : tctttccttcattgctgTCACTTTATTCA----A---------TGAT--GTTCA-TAATTTCGTTAGGG-ACACCAA--G--------------CAATGTATATTTTCCTT-TACAGTT--G----------GAGACTT--GCTGGAT--T---T----TCGAC-TC--TTC-CGTCGGTC-GTT-----C---------------CCA-TC--T-CC--------C---------T--------CAttgggaagggccttaatggtttcagacgttatggtccgacagtaatctataacatatagagcaataaaatag
gi|9 : aaaatgctat--A-TTTGATAA-T------G-AGTTTGTTA-TGTA--T--ACAGACATACAGACACTT--GCCTGAC--T---TGGATTGGAC-CC--CTCACCTTAAT----A-----C---------------TTCATCGTTACT--------T---------T--------CATCAAA--------TAGTTCTTA---CATTATT-TA----------------ATTAAATGTA-TTA-T-ATTTCATCTTGATCAACATTTG--TACA--TATgatttactgatgttaatattgtctcaacattattttgctttcatcaaata
Alignments
lowQualScore : 22222222222222 4444444444444444444444 2222222222222222 22222222222222 222222222222222222222 222222222222222222 11111111 2222222222222 1111111111 22222222 2222222 111111111
lowQualScore : 1 2 00000000000000 777 3 9999999999999999999999 2 3 8 1 2 0000000000000000 555 2 11111111111111 3 44 6 44 111111111111111111111 3 55 3 999999999999999999 3 7777 44444444 3 4444444444444 8888888888 11111111 4 777 0 5555555 1 2 1 777777777 6
lowQualScore : . . .............. ... . ...................... . . . . . ................ ... . .............. . .. . .. ..................... . .. . .................. . .... ........ . ............. .......... ........ . ... . ....... . . . ......... .
lowQualScore : 0 0 66666666666666 555 6 9999999999999999999999 9 6 2 9 9 1111111111111111 444 0 00000000000000 3 66 7 99 888888888888888888888 6 00 6 888888888888888888 3 1111 55555555 9 4444444444444 8888888888 33333333 4 888 4 6666666 1 8 4 666666666 7
consensus : TACGCTTACAGAACANGATAATATCACTTTATTCA----A---------TCAC--GTTCA-GAATTTCATTAAGG-ANACCAA--A--A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTC--GCCNGAC--T---T----TGGAC-CC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CCC-TC--T-CC--------T---------T-CA----TCAAA--------TAATTC-------------TTAC---------ATAATT-------NATTA-CTTCAAATATGTTA---AATGTA-TT--T-AATTCATCTCGATCANTATTTG--TACA--AATAT-TTTG
Reference ( family-1617 ) : TACGCTTACAGAACANGATAATATCACTTTATTCA----A---------TCAC--GTTCA-GAATTTCATTAAGG-ANACCAA--A--A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTC--GCCNGAC--T---T----TGGAC-CC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CCC-TC--T-CC--------T---------T-CA----TCAAA--------TAATTC-------------TTAC---------ATAATT-------NATTA-CTTCAAATATGTTA---AATGTA-TT--T-AATTCATCTCGATCANTATTTG--TACA--AATAT-TTTG
gi|1 : TACGCTTACAGAATAAAATAATATCACTGTATTTATC--A---------TTATAAGTGTATAAATATCATTAAGA-AGACAAAATA--G-TTTGCTTA-TTAATAAATAATTTGTTT-TGCA--TCCA----------ACTACTC---CCCCAT--T---C----TAACC-CC--TTTACGTTGATT-GCATGCATC---------------CCC-TC--
gi|1 : cttaatgttgatgttgtttttttttacgaaga--------T---------T-CA----TCAAA--------TTACTC-------------TTTC---------ATAATT-------TATTA-CTTCAAATATGGTA---AATATACCT--T-CATTCATCTCGATCACTATTGG--TATATTGATATATTTGaatttttacttgtgccgttattggctttactttttcatgattttcatcaaattactctttcataatttattacttcaaatatggtaaatataccttcattcatctcgatcactattggtatattgatatatttgttttagaacggcctttgttttggaaacaataacatatgtttaaacttctcagct
gi|10 : cttaatgttgatgttgtttttttttacgaagatacgcttacagaataaaataatatcactgtatttatcattataagtgtataaatatcattaagaagacaaaatagtttgcttattaataaataatttgttttgcatccaactactcccccattctaacccctttacgttgattgcatgcatcccctcaatttttacttgtgccgttattggctttactttttcatgattTAA-GTAATGTGAAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GAGACAC--ACCTGGA--G---T-----AGAC-CC--TTT-CATCGTTT-GTT-----C---------------CCC-TC--T-CT--------T---------T-TA------AAA--------TA-TAC-------------TGAT---------GTCATT--------ATTGTCTTTTAACTTCTTCTTTACTGTA-TT----AATTAAT---------TATT-G--CATA--AATAT-TTttttagaacggcctttgttttggaaacaataacatatgtttaaacttctcagct
gi|11 : CGCTTACAGATCATGATAATATCATTTTAGTCA----A---------TCAC--ATTCA-GAATTTC-----------------A--A-TTTCATAATTTAATG-GTCGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTT--G-----------------------CC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CTC-TC--T-Caca
gi|12 : aaggttcaaaaagttattaaaagcgtatGCTTACAGAACATGATGATATCACTTGAGTCA----A---------TCGC--ATTCA-GAATTTCA-------------------A-TTTGATAA-T---------GTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTT--GCCAGACA-TTAAT----TAAAC-AC--TTC-CGTTGATC-GTA-----T---------------CTC-TC--T-CCTAATTTATT---------T-CA----TCAAA--------TA
gi|13 : CTTTCAGAATAAGGTTATGTCACTTTA---A----A---------TAAT--GTTTT-GAATTTCGTTAATG-ATATCAA--A--AATTTGATAA-TCAATGTGTAGTTTGTTA-TGCAGGC--A----------GACACTT--GACTGAC--T---T----TG
gi|14 : TACGCTTACAGAACATGATGATATCATTATATTTA----T---------TCAT--ATTCA-GAACCCC---------GATCAA-----------------TAATGCGTAGCTTATTA-TGCA--C--A----------GACACTT--GTAAAAC--T---T----t
gi|15 : tatttgagaaagaCTTATAGAACAAAATAATATCATTTTATTCT----A---------TCAT--GTCCA-GAATTTCATTAAGGAAAACCAA--ACGG-TTTGAatgt
gi|16 : agtgttaattcagttttatttttcgccaaggtaaa--A-TTTGATAA-TTAATGCGTATCTTCTTA-TTCA--T--A----------GACGCTT--GACAGAC--T---T----TGGAC-CC--TTT-CGTTGATC-GTA-----C---------------
gi|2 : cacacgTATGCTTATAGAACAAAATAATATCACTGTATTTATCGTA---------TATT--GTTTA-AAATATCATTAAGG-AGACAAAAGA--G-TTTGATGA-TTAATTAGCAATTTGTTG-TGCA--TTCC----------AATTCTC---CCCTAT--T---T------AAC-TCATTTA-GGTTGATT-GCA-----T---------------CCA-TC--C-CC--------T---------T-AA----T
gi|2 : gttaatattttttgttggcaaata--------T---------T-CA----CCAAA--------AAACTC-------------TTAC---------ATAATT-------AATTA-CTTCAAATATGGTA---AATATACCT--T-AATTCATCTCGATCACTATTTG--T------ATAT-TTTttatactagtgtcgttattgtcttactttttcatgattttcaccaaaaaactcttacataattaattacttcaaatatggtaaatataccttaattcatctcgatcactatttgtatatttttgtttaagaatgccctttgttttgcttgtaaaataaaaaacaacaacatatgttta
gi|3 : gttaatattttttgttggcaaatatatgcttatagaacaaaataatatcactgtatttatcgtatattgtttaaaatatcattaaggagacaaaagagtttgatgattaattagcaatttgttgtgcattccaattctcccctatttaactcatttaggttgattgcatccatccccttaatttatactagtgtcgttattgtcttactttttcatgatt-TTTGATAA-TTAATGTGTAGCTTGTTAGTATA--T--G----------GACCCTTTTGT-TGAC--T---------GTACTCC--TCC-CCTTTATTTATA-----CTTATGTCATTATAGTCTC-TC--T-TC--------TATGTTATTTT-CA----TCAAAAAATTTAATAATTC-------------TTAC---------TTAAGT-------AATTA-CTTCAAATATATTA---AA---------C-AATACATCATGATCAGTATTtgtttaagaatgccctttgttttgcttgtaaaataaaaaacaacaacatatgttta
gi|4 : gAATCTTATTTTATTCA----AGAAATTATTTCAC--GTTCA-GAATTTCAGTTAGG-ACACAAAGCA--G-TATGATAA-TTGATATGCAATTTGTTA-TGCA--T--ACA--------GACACTC--GCCTGAT--T---C----TTGAC-CC--TTC-CGTAGATA-GTA-----C---------------CCC-AC--C-CT--------T---------T-CAAGATTGCAA--------TATTTTGTTTGCTTCTTCGTTACTTTCATCAAATAATTCTGACATAATTA-CTACAAATATGTTA---Aatttcttttcattttagggccataatcgatgttgattttttccagatttgtgacctgacccttttgcttatttataaaataaaaagcaacacttgtgtctataatgtttga
gi|5 : cttagtgcttatgcagtttttatttatcttacgatacgttacttgaattgaaaTACGTTTACAGAACATAATTACATCACTTTATTCA----A---------TCAT--GTTCA-GAATATCATTAAGA-GCACCAA--GG-A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGCTTGTTA-TCCA--T--A----------GACGCCT--GCCAAAC--T---T----TGTAC-CT--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CTC-TC--T-CC--------T---------TATA----TCAAA--------TATTTC-------------TTAT---------ATAGTT-------TATTA-CTTCAAGTTTGTTC---AATGTA-TT--GAAATTCATCTCGACAAATATGTG--TACGATAACAT-TTTG
gi|6 : ACATGATAATATCACTTTAGTTA----A---------TCAA--ATTCA-GAATTTCA-------------------A-TTTGATAA-T---------GTTTGTTA-TGCA--T--A----------AACACTT--GCCAGACATTAA-T----TAAAC-AC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CTC-AC--T-CCTTAATTATT---------T-CA----TCAAA--------TAATTC-------------TTTC----------TAA-------------------AAGTATGTTA---AAAGTATTT--T-AATTCATCTTGATCAACATTTGTATACA--AATAC-TTTG
gi|7 : -CT--------T---------T-CA----TCAAA--------CAATTC-------------TTAC---------ATATTT-------AATTA-TTTCAAATATGTTA---AATGTA-TTTGT-ATTTCTTCTTGATCAGTATTTGCATACA--AATAT-TTTGtcgggacgggccacaattaatgttggtacaacttgt
gi|8 : tctttccttcattgctgTCACTTTATTCA----A---------TGAT--GTTCA-TAATTTCGTTAGGG-ACACCAA--G--------------CAATGTATATTTTCCTT-TACAGTT--G----------GAGACTT--GCTGGAT--T---T----TCGAC-TC--TTC-CGTCGGTC-GTT-----C---------------CCA-TC--T-CC--------C---------T-CA----ttgggaagggccttaatggtttcagacgttatggtccgacagtaatctataacatatagagcaataaaatag
gi|9 : aaaatgctat--A-TTTGATAA-T------G-AGTTTGTTA-TGTA--T--ACAGACATACAGACACTT--GCCTGAC--T---TGGATTGGAC-CC--CTCACCTTAAT----A-----C---------------TTCATCGTTACT--------T---------T-CA----TCAAA--------TAGTTC-------------TTAC---------ATTATT-------TA--------------ATTA---AATGTA-TTA-T-ATTTCATCTTGATCAACATTTG--TACA--TATgatttactgatgttaatattgtctcaacattattttgctttcatcaaata
Alignments
lowQualScore : 22222222222222 4444444444444444444444 2222222222222222 22222222222222 222222222222222222222 222222222222222222 11111111 2222222222222 1111111111 22222222 2222222 111111111
lowQualScore : 1 2 00000000000000 777 3 9999999999999999999999 2 3 8 1 2 0000000000000000 555 2 11111111111111 3 44 6 44 111111111111111111111 3 55 3 999999999999999999 3 7777 44444444 3 4444444444444 8888888888 11111111 4 777 0 5555555 1 2 1 777777777 6
lowQualScore : . . .............. ... . ...................... . . . . . ................ ... . .............. . .. . .. ..................... . .. . .................. . .... ........ . ............. .......... ........ . ... . ....... . . . ......... .
lowQualScore : 0 0 66666666666666 555 6 9999999999999999999999 9 6 2 9 9 1111111111111111 444 0 00000000000000 3 66 7 99 888888888888888888888 6 00 6 888888888888888888 3 1111 55555555 9 4444444444444 8888888888 33333333 4 888 4 6666666 1 8 4 666666666 7
consensus : TACGCTTACAGAACANGATAATATCACTTTATTCA----A---------TCAC--GTTCA-GAATTTCATTAAGG-ANACCAA--A--A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTC--GCCNGAC--T---T----TGGAC-CC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CCC-TC--T-CC--------T---------T-CA----TCAAA--------TAATTC-------------TTAC---------ATAATT-------NATTA-CTTCAAATATGTTA---AATGTA-TT--T-AATTCATCTCGATCANTATTTG--TACA--AATAT-TTTG
Reference ( family-1617 ) : TACGCTTACAGAACANGATAATATCACTTTATTCA----A---------TCAC--GTTCA-GAATTTCATTAAGG-ANACCAA--A--A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTC--GCCNGAC--T---T----TGGAC-CC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CCC-TC--T-CC--------T---------T-CA----TCAAA--------TAATTC-------------TTAC---------ATAATT-------NATTA-CTTCAAATATGTTA---AATGTA-TT--T-AATTCATCTCGATCANTATTTG--TACA--AATAT-TTTG
gi|1 : TACGCTTACAGAATAAAATAATATCACTGTATTTATC--A---------TTATAAGTGTATAAATATCATTAAGA-AGACAAAATA--G-TTTGCTTA-TTAATAAATAATTTGTTT-TGCA--TCCA----------ACTACTC---CCCCAT--T---C----TAACC-CC--TTTACGTTGATT-GCATGCATC---------------CCC-TC--
gi|1 : cttaatgttgatgttgtttttttttacgaaga--------T---------T-CA----TCAAA--------TTACTC-------------TTTC---------ATAATT-------TATTA-CTTCAAATATGGTA---AATATACCT--T-CATTCATCTCGATCACTATTGG--TATATTGATATATTTGaatttttacttgtgccgttattggctttactttttcatgattttcatcaaattactctttcataatttattacttcaaatatggtaaatataccttcattcatctcgatcactattggtatattgatatatttgttttagaacggcctttgttttggaaacaataacatatgtttaaacttctcagct
gi|10 : cttaatgttgatgttgtttttttttacgaagatacgcttacagaataaaataatatcactgtatttatcattataagtgtataaatatcattaagaagacaaaatagtttgcttattaataaataatttgttttgcatccaactactcccccattctaacccctttacgttgattgcatgcatcccctcaatttttacttgtgccgttattggctttactttttcatgattTAA-GTAATGTGAAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GAGACAC--ACCTGGA--G---T-----AGAC-CC--TTT-CATCGTTT-GTT-----C---------------CCC-TC--T-CT--------T---------T-TA------AAA--------TA-TAC-------------TGAT---------GTCATT--------ATTGTCTTTTAACTTCTTCTTTACTGTA-TT----AATTAAT---------TATT-G--CATA--AATAT-TTttttagaacggcctttgttttggaaacaataacatatgtttaaacttctcagct
gi|11 : CGCTTACAGATCATGATAATATCATTTTAGTCA----A---------TCAC--ATTCA-GAATTTC-----------------A--A-TTTCATAATTTAATG-GTCGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTT--G-----------------------CC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CTC-TC--T-Caca
gi|12 : aaggttcaaaaagttattaaaagcgtatGCTTACAGAACATGATGATATCACTTGAGTCA----A---------TCGC--ATTCA-GAATTTCA-------------------A-TTTGATAA-T---------GTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTT--GCCAGACA-TTAAT----TAAAC-AC--TTC-CGTTGATC-GTA-----T---------------CTC-TC--T-CCTAATTTATT---------T-CA----TCAAA--------TA
gi|13 : CTTTCAGAATAAGGTTATGTCACTTTA---A----A---------TAAT--GTTTT-GAATTTCGTTAATG-ATATCAA--A--AATTTGATAA-TCAATGTGTAGTTTGTTA-TGCAGGC--A----------GACACTT--GACTGAC--T---T----TG
gi|14 : TACGCTTACAGAACATGATGATATCATTATATTTA----T---------TCAT--ATTCA-GAACCCC---------GATCAA-----------------TAATGCGTAGCTTATTA-TGCA--C--A----------GACACTT--GTAAAAC--T---T----t
gi|15 : tatttgagaaagaCTTATAGAACAAAATAATATCATTTTATTCT----A---------TCAT--GTCCA-GAATTTCATTAAGGAAAACCAA--ACGG-TTTGAatgt
gi|16 : agtgttaattcagttttatttttcgccaaggtaaa--A-TTTGATAA-TTAATGCGTATCTTCTTA-TTCA--T--A----------GACGCTT--GACAGAC--T---T----TGGAC-CC--TTT-CGTTGATC-GTA-----C---------------
gi|2 : cacacgTATGCTTATAGAACAAAATAATATCACTGTATTTATCGTA---------TATT--GTTTA-AAATATCATTAAGG-AGACAAAAGA--G-TTTGATGA-TTAATTAGCAATTTGTTG-TGCA--TTCC----------AATTCTC---CCCTAT--T---T------AAC-TCATTTA-GGTTGATT-GCA-----T---------------CCA-TC--C-CC--------T---------T-AA----T
gi|2 : gttaatattttttgttggcaaata--------T---------T-CA----CCAAA--------AAACTC-------------TTAC---------ATAATT-------AATTA-CTTCAAATATGGTA---AATATACCT--T-AATTCATCTCGATCACTATTTG--T------ATAT-TTTttatactagtgtcgttattgtcttactttttcatgattttcaccaaaaaactcttacataattaattacttcaaatatggtaaatataccttaattcatctcgatcactatttgtatatttttgtttaagaatgccctttgttttgcttgtaaaataaaaaacaacaacatatgttta
gi|3 : gttaatattttttgttggcaaatatatgcttatagaacaaaataatatcactgtatttatcgtatattgtttaaaatatcattaaggagacaaaagagtttgatgattaattagcaatttgttgtgcattccaattctcccctatttaactcatttaggttgattgcatccatccccttaatttatactagtgtcgttattgtcttactttttcatgatt-TTTGATAA-TTAATGTGTAGCTTGTTAGTATA--T--G----------GACCCTTTTGT-TGAC--T---------GTACTCC--TCC-CCTTTATTTATA-----CTTATGTCATTATAGTCTC-TC--T-TC--------TATGTTATTTT-CA----TCAAAAAATTTAATAATTC-------------TTAC---------TTAAGT-------AATTA-CTTCAAATATATTA---AA---------C-AATACATCATGATCAGTATTtgtttaagaatgccctttgttttgcttgtaaaataaaaaacaacaacatatgttta
gi|4 : gAATCTTATTTTATTCA----AGAAATTATTTCAC--GTTCA-GAATTTCAGTTAGG-ACACAAAGCA--G-TATGATAA-TTGATATGCAATTTGTTA-TGCA--T--ACA--------GACACTC--GCCTGAT--T---C----TTGAC-CC--TTC-CGTAGATA-GTA-----C---------------CCC-AC--C-CT--------T---------T-CAAGATTGCAA--------TATTTTGTTTGCTTCTTCGTTACTTTCATCAAATAATTCTGACATAATTA-CTACAAATATGTTA---Aatttcttttcattttagggccataatcgatgttgattttttccagatttgtgacctgacccttttgcttatttataaaataaaaagcaacacttgtgtctataatgtttga
gi|5 : cttagtgcttatgcagtttttatttatcttacgatacgttacttgaattgaaaTACGTTTACAGAACATAATTACATCACTTTATTCA----A---------TCAT--GTTCA-GAATATCATTAAGA-GCACCAA--GG-A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGCTTGTTA-TCCA--T--A----------GACGCCT--GCCAAAC--T---T----TGTAC-CT--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CTC-TC--T-CC--------T---------TATA----TCAAA--------TATTTC-------------TTAT---------ATAGTT-------TATTA-CTTCAAGTTTGTTC---AATGTA-TT--GAAATTCATCTCGACAAATATGTG--TACGATAACAT-TTTG
gi|6 : ACATGATAATATCACTTTAGTTA----A---------TCAA--ATTCA-GAATTTCA-------------------A-TTTGATAA-T---------GTTTGTTA-TGCA--T--A----------AACACTT--GCCAGACATTAA-T----TAAAC-AC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CTC-AC--T-CCTTAATTATT---------T-CA----TCAAA--------TAATTC-------------TTTC----------TAA-------------------AAGTATGTTA---AAAGTATTT--T-AATTCATCTTGATCAACATTTGTATACA--AATAC-TTTG
gi|7 : -CT--------T---------T-CA----TCAAA--------CAATTC-------------TTAC---------ATATTT-------AATTA-TTTCAAATATGTTA---AATGTA-TTTGT-ATTTCTTCTTGATCAGTATTTGCATACA--AATAT-TTTGtcgggacgggccacaattaatgttggtacaacttgt
gi|8 : tctttccttcattgctgTCACTTTATTCA----A---------TGAT--GTTCA-TAATTTCGTTAGGG-ACACCAA--G--------------CAATGTATATTTTCCTT-TACAGTT--G----------GAGACTT--GCTGGAT--T---T----TCGAC-TC--TTC-CGTCGGTC-GTT-----C---------------CCA-TC--T-CC--------C---------T-CA----ttgggaagggccttaatggtttcagacgttatggtccgacagtaatctataacatatagagcaataaaatag
gi|9 : aaaatgctat--A-TTTGATAA-T------G-AGTTTGTTA-TGTA--T--ACAGACATACAGACACTT--GCCTGAC--T---TGGATTGGAC-CC--CTCACCTTAAT----A-----C---------------TTCATCGTTACT--------T---------T-CA----TCAAA--------TAGTTC-------------TTAC---------ATTATT-------TA--------------ATTA---AATGTA-TTA-T-ATTTCATCTTGATCAACATTTG--TACA--TATgatttactgatgttaatattgtctcaacattattttgctttcatcaaata
blockSeqs : T G AGAAATTATT C . ATTAAGGAAAACCAAACGG T T T A G TACAGACATACA TTT T ATTAATTAA T AT A TT CTTATGTCATTATAGT A GT A TATGTTATTT A AGAT AAATTTAA A GTTTGCTTCTTCG TTTCATCAAA CTGACATA T TTT TTTGT C C T TACGATA .
blockSeqs : T G TCGTA C . ATTAAGGAGACAAAAGAG . T T T . GGCA C A ATTAATTAA . . . T C . . . TAATTTATT . . . A . G A . . CCTT T G T TATACAA .
blockSeqs : A T A T . AGTTAGGACACAAAGCAG . C C T . TTCC T T TTGGATTGG . . . C C . . . TTAATTATT . . . T . A A . . TTGA C A T CATACAA .
blockSeqs : T T A T . GTTAATGATATCAAAAA . T C T . TACA T A TTTGG . . . C T . . . T . . . T . T T . . TTTT T A T CATAA .
blockSeqs : A T A T . ATTAAGAGCACCAAGGA . T A T . GTTG T A TCTTG . . . C C . . . T . . . A . A A . . TTAT T G T TACAT .
blockSeqs : A T T T . GTTAGGGACACCAAG . T T C . TA T C TTTGT . . . T T . . . T . . . A . A T . . TT T A . T
blockSeqs : T T A C . GATCAA . T T T . TA T T TTTCG . . . A C . . . T . . . G . A . . . C . .
blockSeqs : T G A T . AA . T C C . TA C T GTAG . . . C C . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : T A A . AA . T T T . CA C A TTA . . . C C . . . T . . .
blockSeqs : . A T . AA . C . T . TA T A TGT . . . C C . . . C . .
blockSeqs : . . . . . TG T G . . . . . C T . .
blockSeqs : . . . . . TA T T
blockSeqs : . . . . . TA T .
blockSeqCons : A************* T** ATTAAGGACACAAAA******* TA************** C********************
originalCons : TACGCTTACAGAACANGATAATATCACTTTATTCA----A---------TCAC--GTTCA-GAATTTCATTAAGG-ANACCAA--A--A-TTTGATAA-TTAATGCGTAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTC--GCCNGAC--T---T----TGGAC-CC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CCC-TC--T-CC--------T---------T-CA----TCAAA--------TAATTC-------------TTAC---------ATAATT-------NATTA-CTTCAAATATGTTA---AATGTA-TT--T-AATTCATCTCGATCANTATTTG--TACA--AATAT-TTTG
finalCons : TACGCTTACAGAACANGATAATATCACTTTATTCAA-------------TCAT--GTTCA-GAATTTCATTAAGGACACAAAA-------TTTGATAA-TTAATGCGTAGTTTGTTA-TGCATA--------------GACACTC--GCCNGAC--T---T----TGGAC-CC--TTC-CGTTGATC-GTAC--------------------CCC-TC--T-CC--------T---------T-CA----TCAAA--------TAATTC-------------TTAC---------ATAATT-------NATTA-CTTCAAATATGTTA---AATGTA-TT--T-AATTCATCTCGATCANTATTTG--TACA--AATAT-TTTG
Alignments
lowQualScore : 22222222222222 555555555555555555555555 2222222222222222 1111111111111 222222222222222222222 222222222222222222 11111111 2222222222222 1111111111 22222222 2222222 111111111
lowQualScore : 1 2 00000000000000 55 3 222222222222222222222222 2 4 8 1 2 0000000000000000 66666666 8888888888888 3 44 6 44 111111111111111111111 3 55 3 999999999999999999 3 7777 44444444 4444444444444 8888888888 11111111 4 9999 2 0 5555555 1 2 777777777 6
lowQualScore : . . .............. .. . ........................ . . . . . ................ ........ ............. . .. . .. ..................... . .. . .................. . .... ........ ............. .......... ........ . .... . . ....... . . ......... .
lowQualScore : 0 0 66666666666666 00 6 222222222222222222222222 9 3 2 9 9 1111111111111111 22222222 9999999999999 3 66 7 99 888888888888888888888 6 00 6 888888888888888888 3 1111 55555555 4444444444444 8888888888 33333333 4 4444 0 4 6666666 1 8 666666666 7
consensus : TACGCTTACAGAACANGATAATATCACTTTATTCA----A---------TCAC--GTTCA-GAATTTCATTAAGGACA--C--AAA--A---TTTGATAA-TTAATGCGTAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTC--GCC-NGAC-T---T----TGGAC-CC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CCC-TC--T-CC--------T---------T-CA----TCAAA--------TAATTC-------------TTAC---------ATAATT-------NATTA-CTTCAAA----TATGTTAAATGTA-TT--T-AATTCATCTCGATCANTATTTG--TACA--AATAT-TTTG
Reference ( family-1617 ) : TACGCTTACAGAACANGATAATATCACTTTATTCA----A---------TCAT--GTTCA-GAATTTCATTAAGGACA--C--AAA--A---TTTGATAA-TTAATGCGTAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTC--GCC-NGAC-T---T----TGGAC-CC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CCC-TC--T-CC--------T---------T-CA----TCAAA--------TAATTC-------------TTAC---------ATAATT-------NATTA-CTTCAAA----TATGTTAAATGTA-TT--T-AATTCATCTCGATCANTATTTG--TACA--AATAT-TTTG
gi|1 : TACGCTTACAGAATAAAATAATATCACTGTATTTATC--A---------TTATAAGTGTATAAATATCATTAAGAAGA--C--AAA--ATAGTTTGCTTA-TTAATAAATAATTTGTTT-TGCA--TCCA----------ACTACTC---CC-CCAT-T---C----TAACC-CC--TTTACGTTGATT-GCATGCATC---------------CCC-TC--
gi|1 : cttaatgttgatgttgtttttttttacgaaga--------T---------T-CA----TCAAA--------TTACTC-------------TTTC---------ATAATT-------TATTA-CTTCAAA----TATGGTAAATATACCT--T-CATTCATCTCGATCACTATTGG--TATATTGATATATTTGaatttttacttgtgccgttattggctttactttttcatgattttcatcaaattactctttcataatttattacttcaaatatggtaaatataccttcattcatctcgatcactattggtatattgatatatttgttttagaacggcctttgttttggaaacaataacatatgtttaaacttctcagct
gi|10 : cttaatgttgatgttgtttttttttacgaagatacgcttacagaataaaataatatcactgtatttatcattataagtgtataaatatcattaagaagacaaaatagtttgcttattaataaataatttgttttgcatccaactactcccccattctaacccctttacgttgattgcatgcatcccctcaatttttacttgtgccgttattggctttactttttcatgattTAA-GTAATGTGAAGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GAGACAC--ACCTGGA------G----TAGAC-CC--TTT-CATCGTTT-GTT-----C---------------CCC-TC--T-CT--------T---------T-TA------AAA--------T-ATAC-------------TGAT---------GTCATT--------ATTGTCTTTTAACTTCT-TCTTTACTGTA--T--T-AATTAAT---------TA-TTG--CATA--AATAT-TTttttagaacggcctttgttttggaaacaataacatatgtttaaacttctcagct
gi|11 : CGCTTACAGATCATGATAATATCATTTTAGTCA----A---------TCAC--ATTCA-GAATTTC-----------------A--A---TTTCATAATTTAATG-GTCGTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTT--G-----------------------CC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CTC-TC--T-Caca
gi|12 : aaggttcaaaaagttattaaaagcgtatGCTTACAGAACATGATGATATCACTTGAGTCA----A---------TCGC--ATTCA-GAATTTCA-------------------A---TTTGATAA-T---------GTTTGTTA-TGCA--T--A----------GACACTT--GCC-AGACATTAAT----TAAAC-AC--TTC-CGTTGATC-GTA-----T---------------CTC-TC--T-CCTAATTTATT---------T-CA----TCAAA--------TA
gi|13 : CTTTCAGAATAAGGTTATGTCACTTTA---A----A---------TAAT--GTTTT-GAATTTCGTTAATGATA--TCAAAA--A---TTTGATAA-TCAATGTGTAGTTTGTTA-TGCAGGC--A----------GACACTT--GAC-TGAC-T---T----TG
gi|14 : TACGCTTACAGAACATGATGATATCATTATATTTA----T---------TCAT--ATTCA-GAACCCC---------------------------GATCA-ATAATGCGTAGCTTATTA-TGCA--C--A----------GACACTT--GTA-AAAC-T---T----t
gi|15 : tatttgagaaagaCTTATAGAACAAAATAATATCATTTTATTCT----A---------TCAT--GTCCA-GAATTTCATTAAGGAAAACC--AAACGG---TTTGAatgt
gi|16 : agtgttaattcagttttatttttcgccaaggtaaaCA--C--ACG--A---TTTGATAA-TTAATGCGTATCTTCTTA-TTCA--T--A----------GACGCTT--GAC-AGAC-T---T----TGGAC-CC--TTT-CGTTGATC-GTA-----C---------------
gi|2 : TATGCTTATAGAACAAAATAATATCACTGTATTTATCGTA---------TATT--GTTTA-AAATATCATTAAGGAGA--C--AAA--AGAGTTTGATGA-TTAATTAGCAATTTGTTG-TGCA--TTCC----------AATTCTC---CC-CTAT-T---T------AAC-TCATTTA-GGTTGATT-GCA-----T---------------CCA-TC--C-CC--------T---------T-AA----T
gi|2 : gttaatattttttgttggcaaata--------T---------T-CA----CCAAA--------AAACTC-------------TTAC---------ATAATT-------AATTA-CTTCAAA----TATGGTAAATATACCT--T-AATTCATCTCGATCACTATTTG--T------ATAT-TTTttatactagtgtcgttattgtcttactttttcatgattttcaccaaaaaactcttacataattaattacttcaaatatggtaaatataccttaattcatctcgatcactatttgtatatttttgtttaagaatgccctttgttttgcttgtaaaataaaaaacaacaacatatgttta
gi|3 : gttaatattttttgttggcaaatatatgcttatagaacaaaataatatcactgtatttatcgtatattgtttaaaatatcattaaggagacaaaagagtttgatgattaattagcaatttgttgtgcattccaattctcccctatttaactcatttaggttgattgcatccatccccttaatttatactagtgtcgttattgtcttactttttcatgatt---TTTGATAA-TTAATGTGTAGCTTGTTAGTATA--T--G----------GACCCTTTTGT--TGAC-T---------GTACTCC--TCC-CCTTTATTTATA-----CTTATGTCATTATAGTCTC-TC--T-TC--------TATGTTATTTT-CA----TCAAAAAATTTAATAATTC-------------TTAC---------TTAAGT-------AATTA-CTTCAAA----TATATTAAA---------C-AATACATCATGATCAGTATTtgtttaagaatgccctttgttttgcttgtaaaataaaaaacaacaacatatgttta
gi|4 : gAATCTTATTTTATTCA----AGAAATTATTTCAC--GTTCA-GAATTTCAGTTAGGACA--C--AAA--GCAGTATGATAA-TTGATATGCAATTTGTTA-TGCA--T--ACA--------GACACTC--GCC-TGAT-T---C----TTGAC-CC--TTC-CGTAGATA-GTA-----C---------------CCC-AC--C-CT--------T---------T-CAAGATTGCAA--------TATTTTGTTTGCTTCTTCGTTACTTTCATCAAATAATTCTGACATAATTA-CTACAAA----TATGTTAAatttcttttcattttagggccataatcgatgttgattttttccagatttgtgacctgacccttttgcttatttataaaataaaaagcaacacttgtgtctataatgtttga
gi|5 : cttagtgcttatgcagtttttatttatcttacgatacgttacttgaattgaaaTACGTTTACAGAACATAATTACATCACTTTATTCA----A---------TCAT--GTTCA-GAATATCATTAAGAGCA--C--CAAGGA---TTTGATAA-TTAATGCGTAGCTTGTTA-TCCA--T--A----------GACGCCT--GCC-AAAC-T---T----TGTAC-CT--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CTC-TC--T-CC--------T---------TATA----TCAAA--------TATTTC-------------TTAT---------ATAGTT-------TATTA-CTTCAAG----TTTGTTCAATGTA-TT--GAAATTCATCTCGACAAATATGTG--TACGATAACAT-TTTG
gi|6 : ACATGATAATATCACTTTAGTTA----A---------TCAA--ATTCA-GAATTTCA-------------------A---TTTGATAA-T---------GTTTGTTA-TGCA--T--A----------AACACTT--GCC-AGACATTAAT----TAAAC-AC--TTC-CGTTGATC-GTA-----C---------------CTC-AC--T-CCTTAATTATT---------T-CA----TCAAA--------TAATTC-------------TTTC----------TAA-------------------AAG----TATGTTAAAAGTATTT--T-AATTCATCTTGATCAACATTTGTATACA--AATAC-TTTG
gi|7 : -CT--------T---------T-CA----TCAAA--------CAATTC-------------TTAC---------ATATTT-------AATTA-TTTCAAA----TATGTTAAATGTA-TTTGT-ATTTCTTCTTGATCAGTATTTGCATACA--AATAT-TTTGtcgggacgggccacaattaatgttggtacaacttgt
gi|8 : tctttccttcattgctgTCACTTTATTCA----A---------TGAT--GTTCA-TAATTTCGTTAGGGACA--C--CAA--G---C----------AATGTATATTTTCCTT-TACAGTT--G----------GAGACTT--GCT-GGAT-T---T----TCGAC-TC--TTC-CGTCGGTC-GTT-----C---------------CCA-TC--T-CC--------C---------T-CA----ttgggaagggccttaatggtttcagacgttatggtccgacagtaatctataacatatagagcaataaaatag
gi|9 : aaaatgctat--A---TTTGATAA-T------G-AGTTTGTTA-TGTA--T--ACAGACATACAGACACTT--GCC-TGAC-T---TGGATTGGAC-CC--CTCACCTTAAT----A-----C---------------TTCATCGTTACT--------T---------T-CA----TCAAA--------TAGTTC-------------TTAC---------ATTATT-------TA------------------ATTAAATGTA-TTA-T-ATTTCATCTTGATCAACATTTG--TACA--TATgatttactgatgttaatattgtctcaacattattttgctttcatcaaata