lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 44444 11 11111111 222222 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 22222222222222222222222222222 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 22222222222222222222222222222 111 111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111
lowQualScore : 6 5 22222 88888 66 55555555 4 111111 22 555 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 11111 22 11 111 0 1 777777 0 4 22 111 4444 0 0 4444 0 0 111 00000000000000000000000000000 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 1 333 0 55 555 66666666666666666666666666666 111 111111 11 1 222 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 44444444 555555 99999 1 222 4 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 77777777 0 6666 1111 1111111 11 11 1 11 11 666666 33 222 111 222 1 00000000000000 111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 88888 2
lowQualScore : . . ..... ..... .. ........ . ...... .. ... ................................................................................................. . ..... .. .. ... . . ...... . . .. ... .... . . .... . . ... ............................. ......................................................................... . . ... . .. ... ............................. ... ...... .. . ... ........................................................................... .. ........ ...... ..... . ... . ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................... ........ . .... .... ....... .. .. . .. .. ...... .. ... ... ... . .............. ... ................................................................................ . ..... .
lowQualScore : 0 0 77777 00000 11 44444444 6 888888 99 333 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 44444 22 33 666 9 7 777777 9 8 11 666 7777 9 9 2222 9 9 666 11111111111111111111111111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 0 222 3 99 888 66666666666666666666666666666 666 666666 88 3 333 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 88 55555555 111111 66666 2 222 9 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222222 9 0000 8888 9999999 22 22 7 11 22 222222 33 888 666 888 0 44444444444444 888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 44444 9
consensus : GGCTATTAAA-C-GTATTATTCG---AGTTATTGAGCGG-A-TGTTGANTAAAA--C-GTAATTTTACGNTAAATAAA----G----GG-----A-CNT-NA-C-TN--AT-GTA---ACA--T------T--A--C----A-T----G----TG-A----G----AG--CTG-AAATT-C--AA--TCC---CAT-G-CAA-----GGT-CTAG--TGA---TA----AG-CA-ACCT--TG-TG-T---A-T-A-N--A-TTT----A----A------AAAGAAT---C----A---G-----A-C---A-----A----T-G-----T-------T---N---A------G---A-GTT-ATTGAGCGG---ATGTT-GAT--TAAAATG-C------A-ATTT--TATGG--T--AAA--TAAAGN-GG--C--A-T---AAC--TC-NN--GT--AAA---A-T----------------T-A---GA------C--A----TGC---GAGN----C--TG--------AA---A--T---N-C-AAT---CCCATGCAA--G--G--T-----CT--T-G--TGAT-A----AGCAA-NC-TN--G-T-GT-A-CA-AA-TT-T-TAAA--A---A---A--A-ATC-A--G----NA--AA-T-ATT--T------GTT-AN--AGT-NN-----TTG-A-GCA-N--TGT-TGAATA-AA-ATGTN-AT------TT--TAAAATGC--A--------A--TAA--A---A---GG--G------A-C--ATAACTCAT-G--T-A-A-A--T-------TA------AT-ACG-TG----C--GG-----A--G--C--TGAA-------NT-TC---A----ATCC---C---A--T--G-CAAG--GT--CT--T---G--TGA---T---A---AGCA-AC-C--T--------T---GTG----N--A--NAAA--TTT--GA-AAAGAAT--CAG-G-N-AANG-----A----T-TGTTCAA----GTT---T-----ATTG-AG----CGGATGTTG-ATTAAAATGCATT
Reference ( gi|2 ) : GACTAGTAAATCTGTATTATTCA---AGGCATTGAGCAA-A-TGATGATTAAAA--C-ATAATTTTATGGTAACTAAA----G----GG-----A-CTT-TA-T-TA--AT-GTA---ACA--T------T--A--C----A-T----G----TG-A----G----AGA-CTG-AGATA-C--AA--TCC---CAT-G-CAA-----AGT-CTAG--TGA---TA----AG-CA-ACCT--TG-TG-T---A-T-A-C--A-TTC----A----A------AAAGAAT---C----A---A-----A-C---A-----A----T-G-----T-------T---A---A------G---A-ATT-ATTGAGTGG---ATATT-CAT--TAAAGTG-C------A-ATTC--TATGG--C--AAA--TAAAGT-GG--C--A-T---AAG--TC-TG--GT--AAA---A-T----------------T-A---GA------C--A----TGC---AAGC----C--TG--------AA---A--T---A-C-AAT---CCCAAGCAA--T--G--T-----AT--T-A--TGAT-A----AGCAG-AC-TA--G-T-AT-A-CA-AA-TT-T-TAAA--A---A---A--A-GTC-A--C----CA--AA-T-ATT--T------GTT-AT--AGT-GT-----TTG-A-GCA-C--TGT-TGAATT-AA-ATGCT-AT------TT--TAAAATGC--A--------A--TAA--A---A---GA--G------A-C--ATAACTCAA-G--T-A-A-A--T-------TA------AT-ACA-TA----C--AC-----A--G--C--TGAA-------TT-TT---A----ATCC---C---A--T--G-CAAG--GT--CT--T---G--TGA---T---A---AGCA-AT-C--T--------T---GTG----A--A--AAGG--TTT--AA-AAAGGAT--CAG-G-A-AAGG-----A----T-TACTCAT----GTTA--TA----ATTG-AT----CAGATGTTG-ATTAAAATGCATTC
gi|7 : GGCTATTAAA---G-ATTATTTG---AGTTATTGAGCGG-C-CCACAAATAAAA--C-ATAATTTTACATTATATAAA----ATGACAG-----A-CCC-TA-TGTA--AA-G-A---A-----------T--A--C----A-A----G----C--A----G----AG--TTG-AATTT-C--AA--TCC---CAT-G-CAA-----GGT-CTGG--ATT---TA----AG-CC-ACC---TG-TG-A---A-C-A-A--A-TAT----ATG--A------AAAGAAT---A----G---G-----G-C---T-----A----T-A-----T-------T---T---ATTG---G---A-GTT-ACTGTGTAG---ACATC-GAA--CAATATG-TAAAAAAA-ATTTAGTCTG------AAA---AGAG--GG--A--A-T---AAC--TC-AT--GC--AAC---A-T----------------T-C---TA------T--A----TGC---AGAT----T--TG--------AA---A--T---A-C-AAT---CACATACAA--G--G--TCTAGAAT--T-A--TTTA-A----AGCA--ACATT--G-T-GT-T-CA-AA-TT-T-GAAAT-A---A---C--T-GT--A--C----AA--AA-T-CTG--TGCAA--GTT-AT----T-GA-----CTG-A-A------TGT-TGAA
gi|21 : acTATTAAAAC-ATATT-TTAA---AATTATTGAGCAA-A-TGTTGATTAAAA--T-GCAATTTAATGATAAATAAA----G----GGGTATAA-CTCATG-T-TA--AT-ATATGTATA--TCATG--T--A--T----A-T----ATACCTG-C----A----AGC-CTG-AAATA-C--AA--TCC---CAT-G-TGA-----GGT-GTTG--AAA---TA----AG-CA-GCTT--TG-TG-A---A-T-A----A-TTT----A----C------AAAGAGT---C----A---C-----G-C---A-----G----T-A-----TTTA----T---A---A------G---A-GTT-ATTGAACAG---ATATT-GAA--TAAAATA-T------A-ATT
gi|1 : agttgcaaatttaacaATTCGTGTTAT-------GGAGTTGAGT--------TGAATAAAA-----TAATTTTAC---AATTAA-------------------CTT-AA-T-----AT-GCA---GGA------------A--C----A-T----A----T-----------------TG----TG-C--AAGATCC---CAT-G-CAA-----GGT-CTTA--TGA---TG----AG-CA-ACC-------------A-C-A-A--A-CTT----------------AAATAAT---C----A---A-----A-C---A-----AAGTTT-G-----T-------TC--A---A------G------TT-CTGTAGCGG---ATGTT-GAT--TAAAATA-C------A-ATTT--TATGG--T--AAA--TAAAGG-GG--C--A-CATAAAG------G--GT--CAA---A-T----------------T-A---GA------C--A----TGC---CAGC----C--TG--------AA---A--T-----C-AAT---CCCATGCAA--A--G--T-----CT--G-G--TGTT-A----GTCAA-CC-T-----T-GT-T-CA-AA-CT-T-t
gi|3 : ggcaaaccaaaaagggacattactcacacagaattttattatggtgttaaattcaaacccatgcaagatcttgtgatatacaaccaaccttgtgtgtcattttgaaaaaaatcaggtagcacatATTGTTCG---ATTTATTGAGCAG-A-TGTTGATTAAAA--T-GTAGTTTTAGCTTAA--AAA----T----GG-----CTCCT-AA-C-TG--AT-GTA---AAG--T------G--AAAC----A-T----G----C--A----G----AG--CTG-AATTT-C--TA--TCA---CAT-G-GAA-----GGTACT-G--TAA---TA----AG-CA-ACCT--TG-TG-T---A-T---C--A-ATCG---A----A------AAAAAAT---C----A---G-----A-A---A-----A----T-GATTGTT-------C---A---A------G------TT-ATTGGGCAA---ATGTT-AATA-AAAAGTA-C------A----------GG--T--TAA---AAAGG-GGC-C--A-T---AAC--TC-AT--GT--AAA---A-T----------------T-T---TA------G--A----TGT---A-----------G--------A---------------GAT---CCCATGCAA--G--C--T-----CT--T-G--TGAT-A----AG--G-AG-TA--A-T-GTGA-TT-CA-TT-T-TAAA--T---GTTCA--A-GTT-A--C----TG--AG-C-AGA--T------GTA-AC--A-T-GT-----GGG-ATGCA-C---AT-TGA--T-GA-A-----AT------TT--CAAAAgagatacggagttgaattttaatccaatgcaagatttgtgataagtggcaatgtatggcaatttaaaataagtagggctttatttgttcaagaaaatctgtggatgttacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|15 : aaaggggcataactcacattaaagtttagtgcggtgttgaaattaaatgccatgcaaggtctagcaaccatgtgtttgatttattaaaaaatcaagaaacaATTATTCG---AGGTATTTAGCGA-A-AGTTGATTAAAA--T-GCA--TTTAAGTTAAATAAA----AT---AG-----C-CAT-AA-C-TC--AC-GT----ACAATT------T--A-------A-T----G----TGCA----G----TG--TTA-AATTT-C--AA--TAC---CAT-G-TAA-----GGT-TT-G--TCA---TA----AG-GA-ACAC--TG-TG-T---G-C-A-A--A-TTT----A----A------AATGAAT---acccatctattcataaaatag
gi|11 : aataatcgagcaatgTTATTCACTGAGTTATTGAGCAA-A---ACAA--AAAA----------TTATGTTAATAAAA----G----GC-----A-GTA-AAAT-TC--AT-ATA---ACA--T------T--A--C----A-T----A----TG-T----A----TGC-CTG-AAATA-C--TA--TCC---CAT-G-CAA-----GGT-CTAA--TGA---GA----AT-CA-ACCT--TG-TG-C---A-T-A-A--A-TTT----G----A------TAAGAAT---C----A---T-----G-C---A-----A----C-A-----T-------T------------------T-GTT-ATTAAGTGG-----ACT-CAG--TGGAGTG-gggccagggtttgtttgagtggtctggcaaatgttacattttgggcgtcgacgccgacgaatatgtcattccaaaagcagctcaactatccatagaatagt
gi|20 : acacataaaaaggggacacatctagttcaaaatttgatgtgcggtgctgaaattcaattccatgtaaagtctagggttgagcatccttgtgtactattttaaaaagaatcacaaatatTTATTTT---AGTTATTTGGCAATA-T--TGATAAAAA------AAT---ATGATAAATAAA----G----GG-----G-CAT-AA-C-TC--GT-GTT---ACA--T---------A--C----C-T----A----TG-A----G----T---CTG-AAATG-C--AA--TCCGCCCAT-G-CAA-----AGC-CTAA--TGA----A----AG-AA-ACAT--TG-TG-T---A-C-A-C--A-TTT----G----A------AAgata
gi|6 : taaaaaaaagagccataaacgttgtattcggtgttaaaattccatcccatacaaggtgtagttaaaaatcaaccttgtgtaccattttaaaaaagaatcgggcaacgtTTGTTAG---AGTTATTAAGCGA-A-TGTTAATCAAAA--T-GCAATTTTATTGTAAATAAT----G----G
gi|45 : attatatggcatgcagtgtctagtgacaaacatccttgtgtacaacgtTTGTTAG---AGTTATTGAGCA--------GATTAAAA--T-GCAATTTTATGGTAA---------------------------------A--ATAGTG---GCA--T------G--A--C----A------------G-A----GGT--AAA-CT---TACA-C--AA--TCC---CAT-G-CAA-----AGC-CTAG--Ttgcataacttacataaaaatttgtgtaaaaagaatctggcaatggtcattaactgagtggatgttgatcagtgataaataaaacaagggccataactcatgtaaaattggagatgtggagtttaatttcagtcctaagcaaactcgtgtgatacagagtaatgtgtaccaatctaaaatgaataaggcaacatctgtttaagttaatgaatagataatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|29 : TTGTTTG---AGTTATTGAGCAG-A-TGTTAAATAAAA------------A-GGTAAATAG--------------------------T-TC--AT-GTA---A-A--T------A--AA-T----A-T----GC---TA-G----G----AGG--TG-AAATT-C--AA--TTT---CAT-G-CAA-----GGT-CAAA--TAA---TA----AG-CA-ACTG--TG-TG-T---A-C-A-A--A-TTT----G----A------AATGATT---C----A---
gi|23 : aaaatcagctaatatTTATTCA---AGTCATTGAGCAG-A-TGggttatatttgtt
gi|22 : atgataaaacctttttttttgaagagacataacttatgatgtggagttgagttttaatccctgacaagcttttgtgataggtggattaatgaggatgaatttgaaaagaattaaagcaacatTTATTCA---AGTCATTGAGCAG-A-TGctatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|24 : atgataaaacctttttttttgaagagacataacttatgatgtggagttgagttttaatccctgacaagcttttgtgataggtggattaatgaggatgaatttgaaaagaattaaagcaacatATTTA---AGTTCTTGAGTGG-A-TGTTGAATAAAA--C-AAAATTTTACAATAAA-GAG----G----GG-----G-CAT-AA-C-TC--AT-GTT---ACA--C------T--A--C----A-C----A-----------------AGA-CTG-AAATA-C--AA--TCC---TGT-G-CAA-----GCT-CTAA--TGA---TC----AG-CA-ACCT--TG-TG-T---A-C-A-A--A-Tctatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|8 : taccatgcaagatctagtgataaacaaccttgtatgctgttttaaaaagaataaggtaacactaTTTG---AGCTATTGAGCAG-A-TACTGAATAAAA--T-GTAATTTCATGATGAATAA----------GG-----A--TT-CA-T-TGCTAT-GTA---ATA--T------T--A--T----A-C----A----CA-ATTTCT----AGT-CTG-AAATA-C--AA--TTC---CAT---------------------TTG---TA----AG-CA-ACAT--TACTG-C---A-T-G-C--A---C----A----A----------TAT---T--------------A-C---ATTT--T----T-G-----T-------T---T---A------G-----GTT-ATTGAACAG---ATGTT-AAA--TAAAAT--T------A-ATTT--TATGcttata
gi|10 : taaaagaagtggcataatccatataattttttaagtggtgttgaaattcattccaaagcaagaagtattgataagtaaccttgtatagcagtttgaaaagaatcaagcaacttttggCA---AGTTGTTGAGTGG-C-TATCGATAAAAA--T--TCATTTTTTGTTAAAAAAA----G----GG-----C-CAT-AA-C-TC--AC-GTA---AAA--T------TTGA--G----A-T----G----TG------G----AG--TTG-AACTT-C--AA--TCC---CAT-A-CAA-----GCC-TTAG--TGA---TA----AG-GA-GTAA--TG-TGTT---C-T-A----A-TTT----A----A------AACGAA---------A---ATGTCTA-C---------A----T-G-----TATC----C---A---A------G------TT-ATTGAGCAG---ATGTtttaaaacaaat
gi|27 : gaatttcaatctcaggctaggtacagtattaagcaacattgtgtatatatttcataataaccaagaaatgactgacATTGAGCGG-A-TGTTATTTAAAATGC-ATA--TTTGCGGTAAACAAA----G----TG-------CAT-AA-G-TC--TT-GTA---AAA--T------T--A--CGCACA-C----G----CG-CCT--G----A-A-CTG-AATTA-CT-AA--TTC---GGT-G-CTA-----AGC-ATTG--TGA---TA----AG-CA-ACAT--CG-TG-------T-A-C--A-TTaacatgccggacggcaattaatggagcattataaaagctcacctactcaaaga
gi|19 : gcactttgtcattcataatgataaacaacagtgttgacacaatATTGAGGTG-A-TGTTGAAAAAAA--T-GCACTTTTGCAGTAAA-AAA----G----GG-----G-CC--------A--AA-AAA---ACA--TG-----T--A--A----AAT----A----TG-A----GGTGCAGAGTTG-AAATT-T--AA--TCC---TAT-G-CAA-----ACA-CTTG--TTA---TA----AG-GT-GTAT--TG-TG-C---A-T-G-A--A-TTC----A----A------AATGAATAGGC----A---A-----A-tttat
gi|16 : tTAAGCAA-AATTATGTTCAAAT--CTATAA----ATGATGAAAAAA----T----GT-----A-TTT-TA-T-T------GTA---ATA--T------T--A--A----A-T----T----TC-A----G----ATG-TGG-AATTT-C--AA--TGC---CAT-G-CAA-----GTT-CTTG--TAA---TA----AG-GA-A-----TG-TG-T---G-T-A-CTAA-TTA----AAAATA------AAAGGGT---A----A---A-----A-T---------T----T-G-----C-------T---C---A----------A-ATT-ATTGAGTGG---ATATTACAT--acatttgttccattaacaaaattaatattacagttgtgtgggatgccgacaccactgaatggggtattacaaaaactcaactattcatagaataatc
gi|9 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgaAGTGG-A-TGTTAAATAAAA--C-ATAAACTTAGGTTAAAAAAA----G----CA-----A-ATC-TT-T-TA--A----A---AC----------------------------------G-A----GTA--AAG-CTG--TATATC--AA--TCA---CAT-G-CAA-----TGA-TTAA--TGA---TA----AG-CA-ACCT--TA-TG-T---A-C-A-G--A-TTT----T----G------AAATATA---C----A---G-----G-C---A-----A----T-GAC---TG------T---C---C------G---A-GTA-ATTGAGCAG---ATGTT-gtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|6 : TGATAAATAAAACAAG----GG-----C-CAT-AA-C-TC--AT-GTA---AAA--T------TGGA--G----A-T----G----TG------G----AGT-TTA-ATTT--C--AG--TCC---TAA-G-CAA-----ACT-CGTG--TGA---TACAG-AG-TA-A-----TG-TG-T---A-C-C-A--A-TCT----A----A------AATGAAT---A----A---G-----G-C---A-----ACATCT-G-----T-------TT--A---A------G------TT-AATGAATAG---ATAATACATGTTGGACTC-C------A-A--C--ATTGA--C--AAA--TAAgtttttgttatttgtatttataaaagggggtatgaaacaactacattttccagtttctagttataagcaatcgtttgtaaaagtaaaaataatcatgcgaagactgttcttgttattgatatcggatgctgatgtaaatgcccttttagt
gi|1 : attatatggcatgcagtgtctagtgacaaacatccttgtgtacaacgtttgttagagttattaagcgaatgttaatcaaaatgcaattttattgtaaataatggtgcataacttacataaaaatttgtgtaaaaagaatctggcaatggtcattaactgagtggatgttgatcagAAA----G----GG-----A-CAT-TA-C-TC--AC-ACA---GAA--T------T--T--T----A-TTATGG----TG----------------TT-AAATT-C--AA--ACC---CAT-G-CAA-----GAT-CTTG--TGA---TATACAAC-CA-ACCT--TG-TG-T---G-T---C--A-TTTT---G----A------AAAAAAT---C----AGGTA-----G-C---AC----A----T-A-----T-------T---C----------G---T-GTT-ATGGAGTTG---A-GTT-GAA--TAAAAT---------A-ATTT--TA-----C--AAT--TAACTT-AA--T--A-T---G-----C-AG--GA--ACAT--A-T----------------T-G-------------------TGC---AAG-----------------------------------AT---CCCATGCAA--G--G--T-----CT--T-A--TGAT-G----AGCA--AC-CA-----------CA-AA-CT-T----A--A---A---T--A-ATC-A--AA---CA--AA---GTT--T------GTT-CA--AGT--T-----CTGTA-GCG-GA-TGT-TGATTA-AA-ATACA-AT------TT--TATGGTA---A--------A--TAA--A---G---GG--GC-----A-C--ATAA---AG-GGTC-A-A-A--T-------TA------G--ACA-TG----C---C-----A--G--CC-TGAA-------AT-C----A----ATCC---C---A--T--G-CAAA--GT--CT--G---G--TGT---T---A---GTCA-AC-C--T--------T---GTgatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|11 : ggcaaaccaaAAG----G----GG-----A-CAC--A-TCTA--GT-TCA---AAA--T------T--T--G----A-T----G----TG-C----G----GTG-CTG-AAATT-C--AA--TTC---CAT-G-TAA-----AGT-CTAG--GGT---TG----AG-CA-TCCT--TG-TG-T---ACT-A-T----TTT----A----A------AAAGAAT---C----A---C-----A-----A-----A----T-A-----T-------T---T---ATTCACTG---A-GTT-ATTGAGCAA---A-A---CA----AAA-----------A-ATT----ATGT--T--AA---TAAAA--GG--C--AGT---AAAATTC-AT--AT--AAC---A-T----------------T-A---CA------T--A----TGT---ATGC----C--TG--------AA---A--T---A-C-TAT---CCCATGCAA--G--G--T-----CT--A-A--TGAG-A----ATCAA-CC-TT--G-T-GC-A-TA-AA-TT-T-GATA--A---G---A--A--TC-A--T----GC--AA-C-ATT--T------GTT-ATTAAGT-Gtcaaacttgagatacggagttgaattttaatccaatgcaagatttgtgataagtggcaatgtatggcaatttaaaataagtagggctttatttgttcaagaaaatctgtggatgttacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|34 : acacataaaAAA----T----GG-----G-TTT-TA-C-TA--AT-GTA---ACA--TGTTTTGT--G--C------T----G----TG---------------TTG-AAATT-C--AT--TCC---CTT-G-GAA-----GGT-CTAG--TGA---CA----AG--A-GTAT--TG-TG-T---A---A-CA-A-TTT----A----A------AATGAAT------------ATGGCTA-C---AT----G----T-G-----T-------T-------T------G---A-GTT-ATTTAGTAG---ATATTACAT--gactcagtggagtggata
gi|18 : aaAAA----G----GA-----A-CAT-AA-C-TC--AT-G-A---AAA--T------T--AA-C----A-G----A----TGCA----G----AG--CTG-A---------A--TTT---CAT-------------T-CCCG--AGA---TT----AG-CA-ACCT--TG-TA-T---A-T-A-C--A-TTgtggg
gi|40 : taaaa-----A-CTC-TA-C-TA--AT-TTA---A-A------------A--C----A-G----G----T--A----G----AG--CTG-AATTT-C--AA--CCA---TAT-G-CAAGGTCTAGT-CTAG--TGA---AA----AG-CA-ACCT--TG-TG-T---A-C-A-A--A-TCTGA--A----A------AAAGGAT---C----A---tcttttagttaaaaaaaaaagggacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|12 : tttagatttaaaaattaccata-T-TA--AT-ATA---A-A--TG-----T--C--T----A-T----G----TG-C----G----GAG-CTG-AACTG-C--AA--GCC---AAT-A-CAC-----AGT-GTAG--TGA---TT----TG-CA-ATCA--TG-TG-T---------------------A----G------AAAGAAT---C----G---G-----A-C---A-----A----T-A-----T-------G---ACTTC------G---A-ATA-AATGAGCGG---gc
gi|4 : aggcataactcgtgtaaaattaaacatgtggagctgaaatgcaatccgatgcatagtctagtgatacacaacgttgtctccattaactatttgtacgagttactgaaaggaagtcgtataaaacataaactgagtgatac--AT-CTA---A-A--T------T--GT-C----A-T----G----TG------G----AGT-TTGTAAATT-C--AA--TTC---AAT-G-CAA-----TGT-GATG--TGA---T--------CA-AC-------TG-T---A-T-A-C--G-TTT----A----ATTTTGAAGAGAAT---T----G---C-----G-C---A-----A----T-G-----T-------T---A---GTTT---G---A-GTT-ACCGAGCAG---ATATT-AAA--AAATGTG-C--------TTTT--TACGA--T--AAA---AAAGG-GA--T--A-T---AAC--TC-AT--GT--AAT---A-T----------------T-A---TC------C--G----TGA---AAGC----CCTTC--------AA---A--T---A-T-AAT---CCTACACGA-----G--T-----CC--TAA--TGTT-G----AGCA--AC-CG--GAT-AA-A-CA-AACTC-T-TAAAT-A---A---A--A-ATC-G--C----AC--AA-T-ATC--T------GTT-AA--AAT-TA-----TTA-A-ACAGC--TGC-TGAATA-AA-ACGGA-AG------TT--C---ATGT--T--------T--TAA--A---A---AA--G------T-T--GCA--TC------------A--T-------TA------CT-ACG-TT----T--GG-----A--A--C--TGAA-------AT-TC---A----GCCT---C---A--T--G-CGAA--GA--C----------AGG---T---A---A--A-AT-T--T--------C---GT-------------------------AAATGAG--CAG-G-C-AACG-----T----T-TGTTTGC----GTTA--TA----A--A-AA----CA-ATGTTG-ATTAAAATGCAtctgtccgccagcccgtacaaactgcgataaaata
gi|12 : tataaaaagaagggagacaactcT-GTA---AAA--T------T--AAAC----A-T----G----TG------G----AG--CTG-AAATG-C--AA--TCC---GAT-G-CAT-----AGT-CTAG--TGA---TA----CA-CA-ACGT--TG-Tgttttaccagtaaat
gi|38 : aggcataactcg-GTA---ACA--T------T--T--CG---A-G----A----TG-C----G----ATG-TTG-AATTT-C--AA--TTT---CAT-G-CAA-----TGT-CTTG--TGA---TA----AA-AA-GCTT--TG-TG-T---G-C---C--A-ATT----A----A------AATTAAT---A----G---G-----A-C---A-----AGGTTT-G-----T-------T---T---A----------A-TTT-ATTGAGCGG---ATATctccattaactatttgtacgagttactgaaaggaagtcgtataaaacataaactgagtgatacttaatataaatgtctatgtgcggagctgaactgcaagccaatacacagtgtagtgatttgcaatcatgtgtagaaagaatcggacaatatgacttcgaataaatgagcggtctgtccgccagcccgtacaaactgcgataaaata
gi|23 : TA---AC---T------T--A--TG---A-T----G----TG------G----AG--TTG-AGTTT-T--AA--TCC---C-T-GACAA-----GCT-TTTG--TGA---TA----GG-TG-GATTAATG-AG-G---A-T-G-A--A-TTT----G----A------AAAGAAT---T----A---A-----AGC---A-----A----C-A-----T-------T---T---ATTC---A---A-GTC-ATTGAGCAG---ATcacatagtgaacgactga
gi|22 : atgataaaacctttttttttgaagagacaTA---AC---T------T--A--TG---A-T----G----TG------G----AG--TTG-AGTTT-T--AA--TCC---C-T-GACAA-----GCT-TTTG--TGA---TA----GG-TG-GATTAATG-AG-G---A-T-G-A--A-TTT----G----A------AAAGAAT---T----A---A-----AGC---A-----A----C-A-----T-------T---T---ATTC---A---A-GTC-ATTGAGCAG---ATgctatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|17 : atgataaaacctttttttttgaagagaca--A--C----A-C----G----TG-T----G----AAG-TCA-AACTT-C--AA--TCA---AAT-G-AAA-----GGT-CTTT--TGA---CA----AG-CA-AACT--TG-TG-T---A-T-C-A--A-TTT---------A------AGAGGAT---C----AGGCA-----G-C---A-----AT---T-G-----T-------TC--A---A------G------TA-ACAGAGTGG---ACGCT-GAT--TAAAATG-C------A-ATgctatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|5 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaaaagtaaataa-A----G----AG--TTG-AAACG-C--CA--TCC---TAC-A-CAA-----CGT-CTGG--TAA---TT----AG-CA-ACCT--TG-TA-T---A-T-A-T--A-TTT----G----AC-----AAAGAGTTG-C----A---G-----A-A---A-----T----T-GATTGCT-------T---A---A------G------TT-ACTGAGCAG---ATGTT-GA-----------C------A-------TGTTG--C---------------G--C--A-T---GAC--TC-TT--GT--AAA---AGT----------------C-A---G-------C--GT---TTT---GAG-----C--TG--------AA---A--T---A-C-AAA---TCCATACAA--A--G---------T--T-AACTGAT-A----AGCaaggagacacaactcaagatggggttttgtttcaatccgatgcaaggtgttgtgaaaggatacacaatggacttatttaaaataaggtcaatgtttgtt
gi|33 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggc----G----AAA-C---AGACA-CTAAA--TTC---CAT-A-CAA-----GCT-CTAGACGGG---TA----AG-CA-ATTA--TG-TG-T---A-A-A-A--A-TCT----G----A------AAAGAAT---C----G---G-----A-A---A-----A----T-G-----TTTATTTGT---A---C------G---A-GCA-ATTGAGCGG---ACATTATAT--TAAA-CG-T------A-ATTT--TAAGT--T--TTA--TAAAATGGG--C--A-T---Atacgtccagaattacattaaacgcacgaaatggagcatagttcatgtaaaatgtgttgtgcggagttaagatgcaatctcaaacaagatgtagcaacattttgtggaagattgaaaaaggtaggacaatacttgttcgtataactgagaagacatcgaagatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|25 : A-CAG-AGTTT-C--AA--TCT---CAT-A-TAC-----TGT-CTAGA-TG----TA----AG-CA-ATC-------A-T---A-T-A-C--A-TAC----A----AT-----AAATACT---C----A---G-----A-C---A-----G----T-AATACTT-------T---A---A----------A-GTT-ATTAAACGG---GTGCT-AAT--TAATATA-T------A-ATT---TATAG--TTAAAA--TA---T-GC--C--A-T---AAC--TC-AT--GC--ACA---A-T----------------T-T---AA------T--A----TGT---GAAA----T--TGAATTTTTAAA---A--C---G-C-AAT---CACATGCAA-----G--T-----A
gi|3 : gaTG-AAATT-A--AA--TGC---CAT-G-CAA-----GGT-CTAG-----------------CA-ACCA--TG-TG-TTTGA-T-T-T--A-TT-----------------AAAAAAT---C----A---AGAA--A-C---A-----A----TTG-----T-------T---C----------G---A-TTT-ATTGAGCAG---ATGTT-GAT--TAAAATG-T------A-GTTT--TA--G--C--TTA---AAAAT-GG--CTCC-T---AA----C-TGATGT--AAA---G-T----------------G-A---AA------C--A----TGC---AGAG----C--TG--------AA---T--T---T-C-TAT---CACATGGAA--G--G--T-----AC--T-G--TAAT-A----AGCAA-CC-TT--G-T-GT-ATCA-A---T-C-GAAA--A---A---A--A-ATC-A--G----AA--AA-T-GAT--T------GTT-CA--AGT-TA-----TTG-G-GC----------------AA-ATGTT-AA------TA--AAAAGTAC--A--------GGTTAA--A---AAG-GG--G------C-C--ATAACTCAT-G--T-A-A-A--A-------TT------TT-AGA-TG----T--AG-----A--G-----------------------------ATCC---C---A--T--G-CAAG--CT--CT--T---G--TGA---T---A---AGGA-GT-A--A--------T---GTG----A--g
gi|20 : aaaggggcataactcacattaaagtttagtgcggtgtTA-AAATT-C--CA--TCC---CAT-A-CAA-----GGT-GTAG--TTA---AA----AATCA-ACCT--TG-TG-T---A-C---C--A-TTTTA--A----A------AAAGAAT---C----G---G-----G-C---A-----A----C-G-----T-------T---T---A------TTTTA-GTT-ATT---TGGCA-ATATT-GAT--AAAAA----------A-AT-----ATGA--T--AAA--TAAAGG-GG--C--A-T---AAC--TC-GT--GT--TAC---A-T-----------------------A------C--C----TAT---GAGT----C--TG--------AA---A--T---G-C-AATCCGCCCATGCAA--A--G--C-----CT--A-A--TGA--A----AG-AA-ACATT--G-T-GT-A-CA-CA-TT-T-GAAA--ttcattttaaatgttcaagttactgagcagatgtaacatgtgggatgcacattgatgaaatttcaaaaacccatctattcataaaatag
gi|8 : taaaaaaaagagccataaacgttgtattcggtgtTG-AAATT-C--AT--TCC---AAA-G-CAAGA---AGT-AT----TGA---TA----AG-TA-ACCT--TG-TA-T---A---G-C--AGTTT----G----A------AAAGAAT---C----A---A-----G-C---A-----AC---T-T-----T-------T---G---GTTT---G---A-GCT-ATTGAGCAG---ATACT-GAA--TAAAATG-T------A-ATTT--CATGA--T--GAA--TAAGGA-TT--C--A-T---TGC--TA-T---GT--AAT---A-T----------------T-A---TA------C--ACAATTTC---TAGT----C--TG--------AA---A--T---A-C-AAT---TCC--------------------AT--T----TG-T-A----AGCAACAT-TACTG-C-AT-G-CACAA-TA-T-TA-------------------C--------------A-T-TTT--T------GTT--T--AG--GTTA---TTG-A-ACAGA--TGT-TAAATA-AA-AT--TAAT------TT--TA
gi|26 : taaaagaagtggcataatccatataattttttaagtggtgtTG-AGTTT-C--AA--TCC---TAT-A-CAA-----GG-----G---GA---TA----AG-CA-ACCA--TG-TG-T---A-TCA-A--A-TT-----------------AGAGAA----C----A---AC----A-C---AGCAACA----T-G-----T-------TTTCG---A------G---G---T-ATTGAGTGA---ATGTT-tgtttaaaacaaat
gi|41 : ttatgtttgaaaatggggacataacttaattatttaataaatttaaagG-AAATT-C--AA--TCT---CGT-G--AA-----AGT-T--G--TGAATACA----AG-CA-ATTT--TG-TG-T---A-C---C--A-TTgaacaaaaagaaagtttagacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|6 : tcagggcagataaaacctggcgcagtacattgattttttatacactgtgttaaa-AAATG-C--AA--TTT---TATTG-TAA-----A----TAA--TGG---T------G-CATAACT--TA-CA-T---A-A-A-A--A-TTTGTGTA----A------AAAGAAT---C----T---G-----G-C---A-----A----T-G-----G-------T------------------C-ATTAACTGAGTGG---ATGTT-GAT--C--AGTGAT------A-A------ATA------AAA--CAAGG--GC--C--A-T---AAC--TC-AT--GT--AAA---A-T----------------T-G---GA------G--A----TGTG--GAGT----T--T---------AA---T--T---T-C-AGT---CCTAAGCAA--A--C--T-----CG--T-G--TGAT-A------CAG-AG-TAATG-T-GT-A-CC-AA-TC-T-AAAATGA---AT--A--A-GGC-------------AA-C-ATC--T------GTT-ttgaaata
gi|14 : attatatggcatgcagtgtctagtgacaaacatccttgtgtacaacgtttgttagagttattaagcgaatgttaatcaATA-A--AA--TCC---CAT-G-TGA-----TGT-TTAC--TAT---TA----AA-CA-ACCT--GA-TG-T---A-C-A-T--A-TAT----G----A------AAATAAT---T----A---G-----G-A---A-----A----C-G-----T-------T---------------------TG-ATTGAGCAG---ATACT-AAT--TAAAATG-T------A---TT--TGTTGTTT--AAAATTAAAAA-AGACC--A-T---GAC--TCATG------AAA---A-T----------------T-T---GA------CCAA----TA----GAG-----T--TG--------AA---A--T---A-C-Ataagttaatgaatagataatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|10 : -C--AA--TCT---CAG-G-CTA-----GGT-ACAG--TAT---TA----AG-CA-ACAT--TG-TG-T---A-T-A-T--A-TTT----C----A------TAATAAC---C----A---A-----G-A---A-----A----T-GA----C-------T---G---ACC----A---A-GTT-GTTGAGTGG---CTATC-GAT--AAAAATT-C--------ATTT--TTTGT--T--AAA--AAAAGG-GC--C--A-T---AAC--TC-AC--GT--AAA---A-T----------------T-T---GA------G--A----TGT---GGAG----T--TG--------AA---C--T---T-C-AAT---CCCATACAA-----G--C-----CT--T-AG-TGAT-A----AG--G-AG-TAATG-T-GT-T-CT-AA-TT-T-AAAACGA---A---A--ATGTC-T--A----CA--TG-T-ATC--CAA----GTT-A--------------TTG-A-GCA-tctttttgcatggtcctgggataaggaacttacaacaaatatgaaaatgttcgattcattgagcgaatgttacatgtggcattccaatgtggacaaagctcacatgttcatagattaa
gi|30 : gaattt-C--AA--TTC---AAT-G-CAA-----GGT--------GA---CA----AG-CA-GCCT--TA-TG-T---A-T-T-T--A-T-------------------AAGAAT---CGGAGA---A-----A-C---A-----A----TTG-----T-------T---C---A----------A-ATT-ATTGTGCAG---ATGCT-GAT--AAAA-----------A-CTTG--T-TGG--A--AAA---AAAGC-AA--C--------AAC--TT-TG---------------------------------A---GA------T--A----TG-----AAC----T--T-----------------------C-AGT---CCAATGCAA--G--C--T-----CT--T-G--TGAT-A----AGgatgtaacatgccggacggcaattaatggagcattataaaagctcacctactcaaaga
gi|37 : t--AA--TCT---AAT-G-CAA-----GTT-GTAG--TGA---TA----AG-CA-G------G-CG-T---A-T-A-CT-ATTTT----G----G------AAAGAAT---C----A---G-----C-C---A-----A----T-ATGTGTT-------T---A---A------G------TT-ATTAAG
gi|32 : catataaaaagggggataacccaaaaataattgatatacggtgttgaaattccaa--AA--TCC---CAT-A-C--------GT-CTTG--TGG---TATT--AG-GA-ATGC--TG-TG-T---A-T-C-A--A-TTT----A----A------AATGAAA---T----T---G-----G-C---A-----A----T-G-----T-------T---T---C------T---T-GTT-ATTGAAC-A---ATATTACAT--Tgaa
gi|24 : C---CAT-G-CAA-----GAT-CTAG--TGA---TA----AA-CA-ACCT-----TG-T---A-T-G-CTGT-TTT----A----A------AAAGAAT---A----AGGTA-----A-CACTA-----A----T-------T-------T---A---A------G------TT-CTTGAGTGG---ATGTT-GAA--TAAAACA-A------A-ATTT--TACAA--T--AAA---GAGGG-GG--C--A-T---AAC--TCATG--TT--ACA---C-T-----------------------A------C--A------C---AAGA----C--TG--------AA---A--T---A-C-AAT---CCTGTGCAA--G--C--T-----CT--A-A--TGAT-C----AGCAA-CC-TT--G-T-GT-A-CA-AA-TC-T-TAtgtgatgccaatgttaacaaattagtaatttcaaaagttcaccaattcataggatagccga
gi|6 : ta---CAT-G-CAG-----TGT-CTAG--TGA---CA----AA-CA-TCCT--TG-TG-T---A-C-AAC--G-TT-----------------------------------------------------------T-G-----T-------T---A----------G---A-GTT-ATTAAGCGA---ATGTT-AAT--CAAAATG-C------A-ATTT--TATTG--T--AAA--TAATGG-TG--C--A-T---AAta
gi|46 : attatatggT-G-TAA-----GGT-CAAG--TGA---TA----CG-CA-ACGT--TG-TA-C---T-G-A-A--A-TTT----G----A------AAAGATT---C----cttacataaaaatttgtgtaaaaagaatctggcaatggtcattaactgagtggatgttgatcagtgataaataaaacaagggccataactcatgtaaaattggagatgtggagtttaatttcagtcctaagcaaactcgtgtgatacagagtaatgtgtaccaatctaaaatgaataaggcaacatctgtttaagttaatgaatagataatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|27 : -ACTT--TG-T------------C--A-TTC----A----T------AATGA-----T----A---A-----A-C---A-----ACAG-T-G-----T-------T---G---A------C---ACAAT-ATTGAGCGG---ATGTT-ATT--TAAAATG-C------ATATT---TGCGG--T--AAA--CAAAGT--G--C--A-T---AAG--TC-TT--GT--AAA---A-T----------------T-A---CG------C--A----CAC---GCGC----C--TG--------AACTGAATT---A-CTAAT---TCGGTGCTA--A--G--C-----AT--T-G--TGAT-A----AGCA--ACATC--G-T-GT-A-C---A-TT-T-Tggagtta
gi|15 : gcAATAAT---C----G---A-----G-C---A-----A----T-GA----T-------T---ATT-C------G---A-GGT-ATTTAGCGA---AAGTT-GAT--TAAAATG-C------A---TT--TAAGT--T--AAA--TAAAAT-AGC-C--A-T---AAC--TC-AC--GT--ACA---A-T----------------T-T---AA------T--G----TGC---AGTG----T--TA--------AA---T--T---T-C-AAT---ACCATGTAA--G--G--T------T--T-G--TCAT-A----AGGAACAC-T---G-T-GT-G-CA-AA--T-T-TAAA--A---tat
gi|21 : ----A---A-----A-C---AT----A----T-T-----T-------T---A---A----------A-ATT-ATTGAGCAA---ATGTT-GAT--TAAAATG-C------A-ATTT--AATGA--T--AAA--TAAAGG-GG--T--A-T---AAC--TCATG--TT--AAT---A-TATGTATATCATGTATAT-A---TA------C--C----TGC---AAGC----C--TG--------AA---A--T---A-C-AAT---CCCATGTGA--G--G--T-----GT--T-G--AAAT-A----AGCAG-CT-TT--G-T-GA-A-TA-A---T-T-TACA--A---A---G--A-GTC-A--C----GC--AG-T-ATT--T------ATA-AG--AGT-TA-----TTG-A-ACAGA--TAT-TGAATA-AA-ATATA-AT------TT--tgaatgggccagggtttgtttgagtggtctggcaaatgttacattttgggcgtcgacgccgacgaatatgtcattccaaaagcagctcaactatccatagaatagt
gi|45 : agttgcaaatttaacatatta----T-G-----T-------T---A----------G---A-GTT-ATTGAGCAG---AT---------TAAAATG-C------A-ATTT--TATGG--T--AAA---ATAGT-GG--C--A-T---GAC--AG-AG--GT--AAA---C-T----------------T-A---CACAATCCC--A----TGCA--AAGC----C--T
gi|7 : t------G---A-GTT-ATTGAGCGGCCCACA----AA--TAAAACA-T------A-ATTT--TACAT--T--ATA--TAAAAT-GA--C--A-----GAC--CC-TAT-GT--AAA----------------------------GA---------A----TAC---AAGCAGAGT--TG--------AA---T--T---T-C-AAT---CCCATGCAA--G--G--TCTGG-AT--T-------T-A----AGCCA-CC-T---G-T-GA-A-CA-AA-TA-TATGAA--A---A---G--A-ATA-GGGC----TA-----T-ATT--TATTGGAGTT-AC--TGT-GTAGACATCG-A-ACA-A--TATGTAAAAA-AA-AT-TT-AG------TC--TGAAA-------------------A--G---A---GG--G------A----ATAACTCAT-G--C-A-ACA--T-------T-------CT-ATA-TG----C--AG-----A--T--T--TGAA-------AT-AC---A----ATCA---C---A--T--A-CAAG--GT--CT--A---GAATTA---TTTAA---AGCA-AC-A--T--------T---GTGTTC-A--A--A-----TTT--GA-AAagt
gi|9 : acggctattaaagattatttAGTGG---ATGTT-AAA--TAAAACA-T------A-AACT--TAGGT--T--AAA--AAAAGC--------------AAA--TC-TT--TT--AAA---A-C----------------------GA---------------GT---AAAG----C--TG--------TA------T---ATC-AAT---CACATGCAA--T--G--------AT--T-AA-TGAT-A----AGCAA-CC-TT--A-T-GT-A-CA-GA-TT-T-TGAA--ATATA---C--A-GGC-A------------A-T-GAC--T------GTC-CG--AGT-AA-----TTG-A-GCA-GA-TGT-TGTTTT-----TGTT-AT------TT--------GT--ATTT-----A--TAA--A---A---GG--G------G--------------G--T-A------T-------GA------A---------------AC-----A--A--C--TACA-------TT-TT-----------C---C---A-------------GTTTCT--A---G--TTA---T---A---AGCA-AT-CGTT--------T---GT-----A--A--AAG-----T--AA-AAATAAT--CAT-G-C-GAAG-----A----C-TGTTCTT----GTTAT-TG----AT---AT----CGGATGCTG-ATGTAAATGCtaactgtacaaaatctgtgcaagttattgactgaatgttgaa
gi|8 : --AAA--AGAAGT-GG--C--A-T---AA---TC-CA---T--ATA---A-T----------------T-T-------------------TTT---AAGTGGTGT--TG--------AA---A--T---T-C-ATT---CCAAAGCAA--GAAG--T-----AT--T-----GAT-A----AGTAA-CC-TT--G-T-AT-AGCA-G---T-T-TGAA--A---A---G--A-ATCAA--G----CA--AC-T-TTT--G------GTT-TG--AGC-TA-----TTG-A-GCAGA--TAC-TGAATA-AA-ATGTA-AT------TT--CATGATG---A--------A--T-A--A---G---GA--T------T-C--ATTGCT-AT-G--T-A-ATA--T-------T-------AT-ACA-CAATTTC---T-----A--GT-C--TGAA-------AT-AC---A----ATTC---C---ATTT--G-TAAG--ccttttagt
gi|18 : t--AAA--AAAAGG-GA--C--A-T---AAC--TT-GG--GT--AAA---A-T----------------T-T---GA------G--A----TGA---GGAG----T--TG--------AA---T--T---T-C-AAT---CCCATGCAA--G--G--T-----CT--C-T--CGA--A----AG-AG-GC-TA--caacattactgcatgcacaatattacatttttgtttaggttattgaacagatgttaaataaaattaattttatgtttaaaacaaat
gi|3 : taaaaaaaggaacataactcatgaaaattaacagatgcagagctgaatttcattcccgagattagcaaccttgtatatacatttcttttagttaaaAAAGG-GG--C--A-T---AAC--TCACA--TT--AAA---G-T----------------TTA---G---------------TGC---GGTG----T--TG--------AA---A--T---T-A-AAT---GCCATGCAA--G--G--T-----CT-----------------AGCA--AC-CAT-G-T-GT-T-TG-AT-TTAT-TAAA--A---A---A-----TC-A--A----GA--AA-C-AAT--T------GTT-CG--ATT-TA-----TTG-A-GCA-GA-TGT-TGATTA-AA-ATGTA-GT------TT--TA----GC--T-----------TAA--A---A---AT--G------G-CTCCTAACTGAT-G--T-A-A-A--G-------TG------AA-ACA-TG----C--AG-----A--G--C--TGAA-------TT-TC---T----ATCA---C---A--T--G-GAAG--GT--AC--T---G--TAA---T---A---AGCA-AC-C--T--------T---GTG----T--ATCAA----TCG--AA-AAAAAAT--CAG-A-A-AATG-----A----T-TGTTCAA----GTT---------ATTG-GG----CAAATGTTA-ATAAAAAcacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|11 : AAAGG-GGA-C--A-C---A----TC-TA--GTTCAAA---A-T----------------T-T---GA------T--G----TGC---GGTG----C--TG--------AA---A--T---T-C-AAT---TCCATGTAA--A--G--T------C--T-A--GGGTTG----AGCAT-CC-TT--G-T-GT-A-CT-A--TT-T-TAAA--A---A---G--A-ATC-A--C-----A--AA-T-ATT--T------ATTCACTGAGT-TA-----TTG-A-GCA---------AAACA-AA-AAATT-ATG-----TTAATAAAAGGC--A--------G--TAA--A---A---TT--C------A-T--ATAAC--------------A--T-------TAC-----AT-ATG-TA----T--GC-----------C--TGAA-------AT-AC---T----ATCC---C---A--T--G-CAAG--GT--CT--A---A--TGA---G---A---ATCA-AC-C--T--------T---GTG----C--A--TAAA--TTT--GA-TAAGAAT--CAgtacaggttaaaaaggggccataactcatgtaaaattttagatgtagagatcccatgcaagctcttgtgataaggagtaatgtgattcattttaaatgttcaagttactgagcagatgtaacatgtgggatgcacattgatgaaatttcaaaaacccatctattcataaaatag
gi|37 : acacataaAAAGG-GG--G--A-T---AAC--CC---------AAA---A-A----------------T-AATTGA------T--A----TAC---GGTG----T--TG--------AA---A--TTCCA-A-AAT---CTAATGCAAGTT--G--T-----A-----G--TGAT-A----AGCAG-GC-----G-T-AT-A-C--TA-TT-T-TGGA--A---A---G--A-ATC-A--G----CC--AA-T-ATG--T------GTT-tgcaacatttgttattaagtggactcagtggagtggata
gi|12 : catataa-GG--C--A-T---AAC--TC-GT--GT--AAA---A-T----------------T-A---AA------C--A----TGT---GGAG----C--TG--------AA---A--T---G-C-AAT---C-----CGA--T--G--C-----AT--------------------AG-TC-TA--G-TGAT-A-CACAA-CG-T-T------------------GTC-T--C----CATTAACT-ATT--T------G-T-AC---GA-GT-----T-------A-C--TG---AAAGG-AA-GTCGT-A-----------TAAAAC-------------A--TAA--A---CT--GA--G------T-G--AT-ACTTAATA--T-A-A-A--T-------GT------CT-ATG-TG----C--GG-----A--G--C--TGAA-------CT-GC---A----AGCC---A---A--T--A-CACA--GT--GT--A---G--TGA---T---T---TGCA-AT-C--A--------T---GTG------------------T--AG-AAAGAAT--C-G-G-A-CAAT-----A----T-GACTtaagttattaaggaa
gi|16 : a--TT-TG--GT--AAATAAA-T----------------T-A---G-----------------------GC----C--TA--------AA---A--T---A-C-A-T---CTCATGCAA--A--A--C-----CT--A-G--TGAT-A----AGCAA-AA-TT--A-T-GT-T-CA-AA-TC-TATAAA--tcgaataaatgagcggtctgtccgccagcccgtacaaactgcgataaaata
gi|17 : tgattaaaatgttattt--GT--AAA----------------------T-A---AA------C--A----CGTGTGAAGT----C------------AA---AC-T---T-C-AAT---CAAATGAAA--G--G--T-----CT--T-T--TGAC-A----AGCAA-AC-TT--G-T-GT-A-TC-AA-TT-T-AAGA--G---G---ATCA-GGC-A--G----CA--A------T--T------GTT-CA--AGT------------A-ACA---------GAGT--GG-ACGCTGAT------T----AAAATGC--A--------A--TAA--G-------GA--G------A-C--ACAACTCAA-G-----------------------------------A----T--GG-----G--G--T--TTTG-------TT-TC---A----ATCC---G---A--T--G-CAAG--GT--GT--T---G--TGA-------A---AGtgatgaaaaaatgtattttattgtaatattaaatttcagatgtggaatttcaatgccatgcaagttcttgtaataaggaatgtgtgtactaattaaaaataaaagggtaaaatttgctcaaattattgagtggatattacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|20 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaaaa--TA--------AA---A--T---T-C-CAT---CCCATACAAGGT--G--T-----AG--T----TAAA-A----ATCAA-CC-TT--G-T-GT-A-CC-A--TT-T-TAAA--A---A---AG-A-ATC-G--G----GC--AA-C-GTT--T------ATT-TT--AGTTAT-----TTG---GCA-A--TAT-TGA--T-AA-A------------------AAAATAT--G--------A--TAA--ATAAA---GG--G------G-C--ATAACTC---G--T-G------T-------TAC-----AT-ACC-TA----T--G------A--GT-C--TGAA-------AT-GC---A----ATCCGCCC---A--T--G-CAAA--GC--CT--A---A--TGA-------A---AGAA-AC-A--T--------T---GTG----T--A--CACA--TTT--GA-AAgatacacaatggacttatttaaaataaggtcaatgtttgtt
gi|10 : taaaaaaaagagccataaacgttgtattcggtgtG--------AA---T--T---T-C-AAT---CTCAGGCTA--G--G--T-----ACAGT-A--T--T-A----AGCA--ACATT--G-T-GT-A-TA-TA-TT-T-CATA--A---T---A--A--CC-A--A----GA--AA-TGACT--G------ACC-A---AGT-TG-----TTG-A-GTGGC--TAT-CGA--T-AA-AAATTCAT------TT--TT---TGTT-A--------A--AAA--A---A---GG--G------C-C--ATAACTCAC-G--T-A-A-AATT-------TG---------AGA-TG----T--GG-----A--G--T--TGAA-------CT-TC---A----ATCC---C---A--T--A-CAA---GC--CT--TA--G--TGA---T---A---AGGA-GT-A--A--------T---GTGTTCTA--A--------TTT--AA-AA-------C-G-A-A-AATGTCTACA----TGTATCCAA----GTT---------ATTG-AG----CAGATGT
gi|1 : --------AA---A--T---T-C-AAA---CCCATGCAA--G--A--T-----CT--T-G--TGAT-ATACAACCAA-CC-TT--G-T-GT-GTCA----TT-T-TGAA--A---A---A--A-ATC-A--GGTAGCA--CA-T-ATTCGT------GTT-AT--GGA-GT-----T-G-A-G--------T-TGAATA-AA-ATA---AT------TT--TA-----C--A--------A--T-----------------------------TAACTTAA---------------------TA-------T-GCA-GG----A--AC-----A--------T--A-------TT-GT---GCAAGATCC---C---A--T--G-CAAG--GT--CT--T---A--TGA---T---G---AGCA-AC-C-------------------------A--CAAA--CTT--AA-ATA--AT--CAA-A-C-AAAG-----T----T-TGTTCAA----GTT----------CTGTAG----CGGATGTTG-ATTAAAATACAaacatgccggacggcaattaatggagcattataaaagctcacctactcaaaga
gi|14 : ggcaaaccaaaaagggacattactcacacagaattttattatggtgtt---A--T---A-A-AAT---CCCATGTGA--T--GTTT-----AC--T-A--T--T-A----AACAA-CC-TG--A-T-GT-A-CA-TA-TA-T-GAAA--A---T---A--A--TT-A--G----GA--AA-C-GTT--T------G---A--------------TTG-A-GCAGA--TAC-T-AATTAAA-ATG-T-ATTTGTTGTT--TAAAAT----------------TAA--A---A---AA--G------ACC--ATGACTCAT-G--A-A-A-A--T-------T--------TGACC-AA----T--AG-----A--G--T--TGAAATACATCTT-TT----------------------T--G-CATG--GT--CC--T---G--GGA---T---A---AGGA-AC-T--TACAACAAAT---ATG----A--A--AATG--TTattttatggtaaataaaggggcacataaagggtcaaattagacatgccagcctgaaatcaatcccatgcaaagtctggtgttagtcaaccttgttcaaacttgagatacggagttgaattttaatccaatgcaagatttgtgataagtggcaatgtatggcaatttaaaataagtagggctttatttgttcaagaaaatctgtggatgttacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|24 : CCATGCAA--G--A--T-----CT--A-G--TGAT-A----AACAA-CC-TT--G-T-AT-G-CT-G--TT-T-TAAA--A---A---G--A-ATA-A--G----GT--AA-C-ACT--A------ATT-TA--AGT-TC-----TTG-A-GTG-GA-TGT-TGAATA-AA-ACAAA-AT------TT--TA-----C--A--------A--TAAAGA---G---GG--G------G-C--ATAACTCAT-G--T-------------------------T-ACACTA----C--AC-----AAGA--C--TGAA-------AT-AC---A----ATCC---T---G--T--G-CAAG--CT--CT--A---A--TGA---T---C---AGCA-AC-C--T--------T---GTG----cgattcattgagcgaatgttacatgtggcattccaatgtggacaaagctcacatgttcatagattaa
gi|21 : taA--G-T--T-G-CA-AA-TT-T----A--A---C---A--T-ATT-A--------A--AA-C-ATA--T------TTT-AA--AAT-TA-----TTG-A-GCA-AA-TGT-TGATTA-AA-ATGCA-AT------TT-----AATG------------A--TAA--ATAAA---GG--G------G-T--ATAACTCAT-G--T-T-A-A--TATATGTATATCATGTAT-ATA-TA----CCTGC-----A--AGCC--TGAA-------AT-AC---A----ATCC---C---A--T--G-TGAG--GT--GT--T---G--AAA---T---A---AGCA-GC-T--T--------T---GTG----A--AT-AA----TTT--AC-AAAGAGT--CAC-G-C-AG--------------TATTTATAAGAGTT---------ATTG-AA----CAGATATTG-AATAAAATtacaaatcttata
gi|29 : ---A---A--A-ATC-A--G----CT--AA-T-ATT--T------GTT-TG--AGT-TA-----TTG-A-GCA-----GA-TG--TT-AA-ATA----------------AAAAGGT--A--------A-------------------------------ATAGTTCAT-G--T-A-A-A--T-------AA------AT-ATGCTA----G--G------A--G--G--TGAA-------AT-TC---A----ATTT---C---A--T--G-CAAG--GT--CA--A---A--TAA---T---A---AGCA-AC-T--G--------T---GTG----T--A--CAAA--TTT--GA-AATGATT--CAG-G-ataattt
gi|45 : T--T------GTT-AG--AGT-TA-----TTG-A-GCA---------GATTA-AA-ATGCA-AT------TT--T---ATG------------G--TAA--A---A---TAGTG------G-C--ATGACAGAG-G--T-A-A-A--C-------T--------------TA----C--AC---------------------------------A----ATCC---C---A--T--G-CAAA--GC--CT--A---G--Tttatatttgtt
gi|27 : -AC--AGT-GT-----T-G-A--CA-CAATAT-TGAGC--GG-ATGTT-AT------TT---AAAATGC--ATATTTGCGG--TAA--AC--A---AA--GT-----G-C--ATAAGTCTT-G--T-A-A-A--A-------TT------AC-GCA-CA----C--GCGCCTGA--A--C--TGAA-------TTACT---A----ATTC---G---G--T--G-CTAA--GC--AT--T---G--TGA---T---A---AGCA-AC-A--T--------C---GTG----
gi|42 : gcactttgtcattcataatgataaaca--TGT-TGA-TT-AAGATGTT-AT------TT--TA---CGCTTG--------A--TCA--A-------GA--A------A-C--ATAACTCAT-G--A-A-A-A--T-------TA------AT-ACG-TG----T--GG-----A--G--C--CGAA-------TT-TC---A----ATCtacatttttat
gi|19 : --TGT-TGAAAA-AA-ATGC--AC------TT--T----TGC--A--------G--TAA--A---A---AA--GGGGCCAA-A--AAAAC--AT-G--T-A-A-A--A-------TA------TG-AGG-TG----C--AG-----A--G--T--TGAA-------AT-TT---A----ATCC---T---A--T--G-CAAA--CA--CT--T---G--TTA---T---A---AGGT-GT-A--T--------T---GTG----C--A--TGAA--TTC--AA-AATGAAT---AG-GCA-AAAC-----A----T-Tatttggacaatccattaataatca
gi|15 : tattgaggtgaGT-TGATTA-AA-ATGC--AT------TT----AAGTTA--A--------A--TAA--A---A---TA--G------C-C--ATAACTCAC-G--T-ACA-AT-T-------TA------AT---G-TG----C--AG-----T--G--T--TAAA-------TT-TC---A----ATAC---C---A--T--G-TAAG--GT---T--T---G--TCA---T---A---AGGA-ACAC--TG-------T---GTG----C--A--AA----TTT--AA-AATGAAT---GG-G-C-CAGG-----G----T-T-----T----GTT---TG----AGTG-GTCTGGCAAATGTTtgttccattaacaaaattaatattacagttgtgtgggatgccgacaccactgaatggggtattacaaaaactcaactattcatagaataatc
gi|7 : aataatcgagcaatgattattcgaggtatttagcgaaaAATA-AA-ACATA-AT------TT--TACATTAT--A-----------TAA--A---A---T---G------A-C--AGACCCTAT-G--T-A-A-A--G--------A------AT-ACA-AG----C--AG-----A--G--T--TGAA-------TT-TC---A----ATCC---C---A--T--G-CAAG--GT--C---T---G---GATT-T---A---AGCC-A--C--C--------T---GTG----AACA--AATA--TAT--GA-AAAGAAT---AG-G-acattttgggcgtcgacgccgacgaatatgtcattccaaaagcagctcaactatccatagaatagt
gi|26 : acggctattaaagattatttgagttattgagcggcccacaT-GT------TT--GAAAATG----------------------------GG--G------A-C--ATAACTTAA-T--T-A-T----T-------TA------AT-AAA-TT----T--AA-----A--G-----TGAG-------TT-TC---A----ATCC---T---A--T--A-CAAG--G-----------G---GA---T---A---AGCA-AC-C--A--------T---GTG----gctatatttattggagttactgtgtagacatcgaacaatatgtaaaaaaaatttagtctgaaaagagggaataactcatgcaacattctatatgcagatttgaaatacaatcacatacaaggtctagaattatttaaagcaacattgtgttcaaatttgaaataactgtacaaaatctgtgcaagttattgactgaatgttgaa
gi|18 : ttaT--TAAAA-----A--------A---AA--A---A---GG--G------A-C--ATAACTTGG-G--T-A-A-AATT-------TG---------AGA-TG----A--GG-----A--G--T--TGAA-------TT-TC---A----ATCC---C---A--T--G-CAAG--GT--CT--tatcaaattagagaacaacacagcaacatgttttcgaggtattgagtgaatgttgaacaaaaagaaagtttagacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|31 : taaaaaaaggaacataactcatgaaaattaacagatgcagagctgaatttcattcccgagattagcaaccttgtatatacatttcttttagAATG------------A--TAA--A---A---AA--GGA----A-C--ATAACCCAT-G--T-T-A-A--T-------GA------AT-TCG-TG----TG-AC--------G--C--TGAA-------AT-TC---A----ATAC---C---A--T--T-CACG--GT--TT--A---A--CGA---T---A---ACCA-AC-T--T--------T---Gctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|6 : tgtgtaccatttgaaatgaatcaggttttatttgtgttatttgacaatgatcgggaagtt--A--------A--TAA--A---ACAAGG--G------C-C--ATAACTCAT-G--TAA-A-A--T-------TG------G--AGA-TG----T--GG-----A--G--T--TTAA-------TT-TC---A----GTCC---T---A--A--G-CAAA--CT--CG--T---G--TGA---T---ACAGAGTA-A--------------T---GTG----T--A--CCAA--TCT--AA-AATGAAT--AAG-G-C-AActta
gi|18 : attatatggcatgcagtgtctagtgacaaacatccttgtgtacaacgtttgttagagttattaagcgaatgttaatcaaaatgcaattttattgtaaataatggtgcataacttacataaaaatttgtgtaaaaagaatctggcaatggtcattaactgagtggatgttgatcagtgata--A--------A--AAA--A---A---GG--A------A-C--ATAACTCAT-G--A-A-A-A--T-------TA------AC-AGA-TG----C--AG-----A--G--C--TGAA-------TT-TC---A----TTCC---CGAGA--TTAG-CAA----C--CT--T---G--T-A---T---A---TACATTT-C--T--------TTTAGTT----A--A--AAA--------AA-AAAGGcatctgtttaagttaatgaatagataatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|37 : tAA--A---A---GG--G------G-G--ATAACCCAA------A-A-A--T--------A------AT-TGA-TA----T--AC-----G--G--TGTTGAA-------AT-TCCAAA----ATCT---A---A--T--G-CAAG--TT--GT--A---G--TGA---T---A---AGCA-GG-C--G--------T---AT--------A--CTAT--TTT--GG-AAAGAAT--CAG-gacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|23 : catata--A---A---GA--G------A-C--ATAACTTAT-G--------------------------------A-TG----T--GG-----A--G--T--TGAG-------TT-TT---A----ATCC---C------T--GACAAG--CT--TT--T---G--TGA---T---A---GGTG-GA-T--T--------A---ATG----A--G--GATGAATTT--GA-AAAGAAT--T-----A-AAGC-----AACATT-TATTCAA----GTC---------ATTG-AG----CAGATGCTccaatatgtgtttaagttattaaggaa
gi|22 : atgataaaacctttttttttg--A---A---GA--G------A-C--ATAACTTAT-G--------------------------------A-TG----T--GG-----A--G--T--TGAG-------TT-TT---A----ATCC---C------T--GACAAG--CT--TT--T---G--TGA---T---A---GGTG-GA-T--T--------A---ATG----A--G--GATGAATTT--GA-AAAGAAT--T-----A-AAGC-----AACATT-TATTCAA----GTC---------ATTG-AG----CAGATGCTatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|12 : atgataaaacctttttttttgA--G------G-C--ATAACTCGT-G--TAA-A-A--T-------TA------A--ACA-TG----T--GG-----A--G--C--TGAA-------AT-GC---A----ATCC---G---A--T--G-CATA--GT--CT--A---G--TGA---T---A---CACA-AC-G--T--------T---GTatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|40 : -C--ATAACTCTA-C--T-A-A-T--T-------TA------AA-ACA-GG----T--AG-----A--G--C--TGAA-------TT-TC---A----ACCA---T---A--T--G-CAAG--GT--CTAGTCTAG--TGA---A---A---AGCA-AC-C--T--------T---GTG----T--A--CAAA--TCTGAAA-AAAGGAT--CAG-ctccattaactatttgtacgagttactgaaaggaagtcgtataaaacataaactgagtgatacttaatataaatgtctatgtgcggagctgaactgcaagccaatacacagtgtagtgatttgcaatcatgtgtagaaagaatcggacaatatgacttcgaataaatgagcggtctgtccgccagcccgtacaaactgcgataaaata
gi|17 : tttagatttaaaaattacAA-G--T-A-A-A--T-------AA------AC-ACG-TG----T--GA-----A--G--T--CAAA-------CT-TC---A----ATCA---A---A--T--G-AAAG--GT--CT--T---T--TGA---C---A---AGCA-AA-C--T--------T---GTG----T--ATCAA----TTT---A-AGAGGAT--CAG-G-C-AGCA-----A----T-TGTTCAA----G-----TA----ACAG-AG----TGGACGCTG-ATTAAAATGCAc
gi|20 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaa--G--T--TAAA-------AT-TC---C----ATCC---C---A--T--A-CAAG--GT--GT--A---GT-TAA---A---A---ATCA-AC-C--T--------T---GTG----T--A--CCAT--TTTA-AA-AAAGAAT--CGG-G-C-AACG-----T----T-TATTTTA----GTTA--T------TTG-G-----CA-ATATTG-ATAAAAAataaggagacacaactcaagatggggttttgtttcaatccgatgcaaggtgttgtgaaaggatacacaatggacttatttaaaataaggtcaatgtttgtt
gi|8 : taaaaaaaagagccataaacgttgtattcggt--G--T--TGAA-------AT-TC---A----TTCC---A---A--A--G-CAAGAAGT--AT--T---G----A---T---A---AGTA-AC-C--T--------T---GTA----T--A--GCAG--TTT--GA-AAAGAAT--CAA-G-C-A----------------ACTTTT----GGTT--TGAGCTATTG-AG----CAGATACTG-AATAAAATGTAaatatgataaataaaggggcataactcgtgttacatacctatgagtctgaaatgcaatccgcccatgcaaagcctaatgaaagaaacattgtgtacacatttgaaa
gi|34 : taaaagaagtggcataatccatataattttttaagtggt--G--T--TGAA-------AT-TC---A----TTCC---C---T--T--G-GAAG--GT--CT--A---G--TGA---C---A---AG-A-GT-A--T--------T---GTG----T--A--ACAA--TTT--AA-AATGAAT--atttcatgatgaataaggattcattgctatgtaatattatacacaatttctagtctgaaatacaattccatttgtaagcaacattactgcatgcacaatattacatttttgtttaggttattgaacagatgttaaataaaattaattttatgtttaaaacaaat
gi|38 : aaaaatgggttttactaatgtaacatgttttgtgctgt--G--T--TGAA-------TT-TC---A----ATTT---C---A--T--G-CAAT--GT--CT--T---G--TGA---T---A---AAAA-GC-T--T--------T---GTGTGCCA--A---------TT--AA-AATTAAT---AG-G-ACAAGG-----T----T-TGTTTAA----TTT---------ATTG-AG----CGGATATatggctacatgtgtttgagttatttagtagatattacatgtggg
gi|30 : gtaacatttcgagatgcgat--TGAA-------CT-TC---A----GTCC---A---A--T--G-CAAG--CT--CT--T---G--TGA---T---A---AGcacatagtgaacgactga
gi|39 : tcaattcaatgcaaggtgacaagcagccttatgtatttataagaatcggagaaacaattgttcaaattattgtgcagatgctgataaaaacttgttggaaaaaaagcaacaactttgagata--TGAA-------TT-TC---A----ATCC-------A--T--G-CAAG--TT--CT--T---T--TGA---T---AGG-AGTA-AT-
gi|16 : tgaGAA-------TT-TC---A----ATGC---C---A--T--G-CAAG--TT--CT--T---G--TAA---T---A---AGGA-AT----G--------T---GTG----T--ACTAA-----TT--AA-AAATAAA--AGG-G-T-AAAA-----T----T-TGCTCAA----ATT---------ATTG-AG----TGGATATTgtgcaacatattacaatgattactaaaggtaacaattgttattgcacggatgtaacatgtgcaacaccaacaaatgggccaatacacgag
gi|41 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattatgttcaaatctataaatgatgaaaaaatgtattttattgtaatattaaatttcagatgtgGAA-------AT-TC---A----ATCT---C---G--T--G-AAAG-------T--T---G--TGAATAC---A---AGCA-AT-T--T--------T---GTG----acatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|28 : tcagggcagataaaacctggcgcagtacattgattttttatacactgtgttaaaT-TT---A----ATTC---A---A--G--T-CAAG--GA--CT--T---G--TGA---T---A---AGtaccattttgaaata
gi|30 : aaaaaggggaataagccatacaaaatatattatgtgtgacg-TC---A----ATTC---A---A--T--G-CAAG--------------G--TGA---C---A---AGCA-GC-C--T--------T---ATG----T--A--------TTT---A-TAAGAAT--CGGAG-A-AACA-----A----T-TGTTCAA----ATT---------ATTG-TG----CAGATGCTG-ATAAAAAgagcggaatgtactaaaataactagggcaaagtttgcttgagatatcaagaggatggtacagggacgacgaatggatagtcatagaaactcacctattcatagaataaa
gi|33 : ---A----ATTC---C---A--T--A-CAAG--CT--CT--A---GACGGG---T---A---AGCA-AT-T--A--------T---GTG----T--A--AAAA--TCT--GA-AAAGAAT--CGG-A-A-AATG-----T----T-TATTTGT----ACGAG-CA----ATTG-AG----CGGACATTATATTAAActtgttggaaaaaaagcaacaactttgagatatgaacttcagtccaatgcaagctcttgtgataag
gi|14 : gaaacagacacta---A----ATCC---C---A--T--G-TGAT--GT--TT--A---C--TAT---T---A---AACA-AC-C--T--------G---ATG----T--A--CATA--TAT--GA-AAATAAT--TAG-G-A-AA--------------------C----GTT---TG----ATTG-AG----CAGATACTA-ATTAAAATGTATTcgtaattttaagttttataaaatgggcata
gi|5 : ataa----ATCC---T---A--C--A-CAAC--GT--CT--G---G--TAA---T---T---AGCA-AC-C--T--------T---GTA----T--A--TATA--TTT--GACAAAGAGTTGCAG-A-A-ATTG-----A----T-TGCTTAA----GTTA--C-------TG-AG----CAGATGTTG-tgttgtttaaaattaaaaaagaccatgactcatgaaaatttgaccaatagagttgaaatacatctttttgcatggtcctgggataaggaacttacaacaaatatgaaaatgttcgattcattgagcgaatgttacatgtggcattccaatgtggacaaagctcacatgttcatagattaa
gi|24 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggcagagttgaaacgccC---C---A--T--G-CAAG--AT--CT--A---G--TGA---T---A---AACA-AC-C--T--------T---GTA----T--G--CTGT--TTT--AA-AAAGAAT--AAG-G-T-AA--------------CACTAAT-----TTAAGTT----CTTG-AG----TGGATGTTG-AATAAAAcatgttgcgcatgactcttgtaaaagtcagcgttttgagctgaaatacaaatccatacaaagttaactgataagctacgtccagaattacattaaacgcacgaaatggagcatagttcatgtaaaatgtgttgtgcggagttaagatgcaatctcaaacaagatgtagcaacattttgtggaagattgaaaaaggtaggacaatacttgttcgtataactgagaagacatcgaagatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|36 : ta-CAAG--GT--TT--T---G--TGA---T---A---AGTA-Acaaaattttacaataaagagggggcataactcatgttacactacacaagactgaaatacaatcctgtgcaagctctaatgatcagcaaccttgtgtacaaatcttata
gi|43 : AT--CAA-G-C-AAGG-----A----A-TGTTTGA----GTTA--T-------TG-AA----CGGATGTTG-ATT--GATGCATTcaatatgtatcaatttcaagttatggagcaatgtttgttttagatttttgagcggattttacatgtgtgacggcgacggataggtgattgcaaaggctcacctactcatagaatatt
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|13 ): AAGTCATTGAACAGATGTTCATAAAATGGTGGGTGTGGCGAGGGTTAAAAAAGGCCATTACTCGTGTAATATTGAGATGCTGACTTCATTTCAATCCAGTGTAAACTCTAGTAATAAGGGCTAATGTGTACCAAATTTGAAATGAATAGGGAAACATTTGTTCCAGTTATTGATGGGATGTTACATGTGAGATTCTGATAACAAAAGTACATCTATGTACAGAATAGTCTGGAAAACTAAAAAATGTTAATGATTTGTTAAATATAAAGTTCCAGACTAAA
Unaligned ( gi|35 ): TAAGGTTTTGCGATAGTGAACATTTTGTACAAGTTTAAAATGCATAGAGCAACGTTTGAATTATTGAACGAATGATATAATTTATGTTTGACGTCGACACCAGCGAATGGGTTATTACAAAAACACACATAGTCATACAT
Unaligned ( gi|44 ): TGTGTACTAATTCAAAATGAATAGGGCATCGTCATTGATGTTACATGCGGAGTGCCAACGGATGTGTGTACAAAACCTCACCTATCAAAACTAGTT
Unaligned ( gi|47 ): TGGGATGCCAACAAATGGGTAAAACGAAAACTCACCTATTCATAAAATAA
Unaligned ( gi|48 ): AGCTAAATTGTATTGTATATTATCTTTTAAAATATAAA
Unaligned ( gi|49 ): CTGAGTTATAAAGTGGGAATAACTCGTGCACAAATT
Alignments
lowQualScore : 222222 11111111111111111 11111111111 33333333333333333333333333333333333333333 1111111111 33333333333333333333333333333333333333333 111111111 111111 11111111 11111 222222 6666666666666666666666666666 11111111111111111 11111 1111111 22222222 22222222222222
lowQualScore : 3 444444 3 1 0 1 33 1 1 77 5 1 6 0 1 1 1 4 1 3 666 88888888888888888 0 88 2 2 2 1 1 44 6666 1 1 2 5555 66666666666 3 1 22 88888888888888888888888888888888888888888 1 1 1 1111111111 88888 22 999 3333 555555 33 44 3333 1 00000000000000000000000000000000000000000 55555555 3333 1 555 222 22 222 2 2 55 22 222 222 222 1 555555555 1 666666 666666666 1 3333 77777777 22 2 66666 44 22 2 111111 2 3 9999999999999999999999999999 22 2 555 22 0 1 222 99999999999999999 444 2 1 3 0 777777 22 222 66666 88888888888 99999 222 22 0000000 1 1 1 00000000 22 22 55555555555555 22 1
lowQualScore : . ...... . . . . .. . . .. . . . . . . . . . . ... ................. . .. . . . . . .. .... . . . .... ........... . . .. ......................................... . . . .......... ..... .. ... .... ...... .. .. .... . ......................................... ........ .... . ... ... .. ... . . .. .. ... ... ... . ......... . ...... ......... . .... ........ .. . ..... .. .. . ...... . . ............................ .. . ... .. . . ... ................. ... . . . . ...... .. ... ..... ........... ..... ... .. ....... . . . ........ .. .. .............. .. .
lowQualScore : 0 555555 8 0 6 0 22 7 0 33 7 0 9 7 0 0 4 9 3 6 444 44444444444444444 3 55 5 4 2 8 3 11 1111 7 7 4 6666 55555555555 3 6 11 66666666666666666666666666666666666666666 4 4 6 3333333333 66666 11 888 1111 111111 44 11 8888 4 55555555555555555555555555555555555555555 44444444 1111 5 000 666 00 666 1 2 22 11 888 888 888 7 777777777 7 555555 666666666 9 5555 55555555 88 0 55555 77 66 0 999999 1 5 5555555555555555555555555555 88 0 777 66 2 9 888 22222222222222222 888 6 6 1 8 444444 11 777 55555 00000000000 55555 999 22 8888888 7 6 8 77777777 55 55 33333333333333 99 7
consensus : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGTTATTGAGCGGATGTTGAATAAAACGTAATTTTA-CGNTAAANAAAGGGACATNACTCACGT-A---ACA--TTA-CGT-GTGA-GAG-TT-G-AAATT-CAATCCCAT-GCAAGGTCTAG--TGATA----AG-CA-ACCTTGTGTACA-NATTT----A------A-AAAGAAT--CGG----G-CA----A-----T-G----T-TTA-------G---A-GTTA-TTGAGCGGATGTTG-ATTAAAATGC-----AA-TTTTACGG--T--AAA--TAAA----G-GGG--C--ATAACTCATG-T--AAAA-T----------------TAG--AC--A----TGC-GGGNC--TG--------A----AA-T--NC---AA--T---CCCATGCAAGGTCTN-G--TGA---T---A---AGCA-A----CCT-TGTGTA-CAA-A-TTT--------TAAA-A--AGAAT--CAGNA-AATA--TT-TGTT-NA--AGTTATTG--AG-C--A-A-TG-TTGAATAAAATG-TA-ATTTTAAAATGC--GA----TAAAA--G-GG-A-C--ATAACTC-ATG--TAA-A--TT-A-AT-A---CGTGC--GGAGCTGAANTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGATA--AG---CAACCT--TGTGTA-N-AA----ATTT-G--AA---AA-GAAT-C-----A-GGCA-ACG----N-TTG--T--TC-----GAG--T-T-ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
Reference ( family-148 ) : GGCTATTAAAC--GTATTATTCGAGTTATTGAGCGGATGTTGANTAAAACGTAATTTTA-CGNTAAATAAAGGGACNTNACTNATGT-A---ACA--TTA-CAT-GTGA-GAG-CT-G-AAATT-CAATCCCAT-GCAAGGTCTAG--TGATA----AG-CA-ACCTTGTGTATA-NATTT----A------A-AAAGAAT--CAG----A-CA----A-----T-G----T-TNA-------G---A-GTTA-TTGAGCGGATGTTG-ATTAAAATGC-----AA-TTTTATGG--T--AAA--TAAA----G-NGG--C--ATAACTCNNG-T--AAAA-T----------------TAG--AC--A----TGC-GAGNC--TG--------A----AA-T--NC---AA--T---CCCATGCAAGGTCTT-G--TGA---T---A---AGCA-A----NCT-NGTGTA-CAA-A-TTT--------TAAA-A--AAAAT--CAGNA-AATA--TT-TGTT-AN--AGTNNTTG--AG-C--A-N-TG-TTGAATAAAATG-TN-ATTTTAAAATGC--AA----TAAAA--G-GG-A-C--ATAACTC-ATG--TAA-A--TT-A-AT-A---CGTGC--GGAGCTGAANTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGATA--AG---CAACCT--TGTGNA-N-AA----ATTT-G--AA---AA-GAAT-C-----A-GGNA-ANG----A-TTG--T--TC-----AAGT-T-T-ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
gi|1 : AAAGGGACATTACTCACAC-A---GAA--TTT-TATTATG--GTG-TT---AAATT-CAAACCCAT-GCAAGATCTTG--TGATATACAAC-CA-ACCTTGTGTGTC-ATTTT----G------A-AAAAAAT--CAG----G-TAGCACA-----T-A----T-TC--------G---T-GTTA-TGGAGTTGA-GTTG-AATAAAAT-------AA-TTTTAC--------AA--T------------------TAACT-----T--AATA-TG---------------CAGGAAC--A----T------AT--TG----------------T--GC---AAGAT---CCCATGCAAGGTCTT-A--TGA---T---G---AGCA-A----CC-------A-CAA-A-CTT-----------A-A--ATAAT--CAAAC-AAAG--TT-TGTT-CA--AGTTCTGT--AG-C--G-GATG-TTGATTAAAATA-CA-ATTTTATGGTA---AA----TAAAG--G-GGCA-C--ATAA----AGGGTCAA-A--TT-A-G--A---CATGC--CAGCCTGAAAT-CAATCCCATG-CAAAGTCT----G-GTGTTA--GT---CAACCT--TGTT---C-AA----ACTT-G--AG---A
gi|1 : ggcaaaccaaTATTCGTGTTATGGAGTTGA-GTTGAATAAAA--TAATTTTA-CAAT---TAA-----CTTAA--TATGC-AGGAACA--T-A-T-T-GTGC-AAG--------------ATCCCAT-GCAAGGTCTTA--TGATG----AG-CA-ACC------ACA-AACTT----A------A-A--TAAT--CAA----A-CA----AAGTT-T-G----T-TCA-----------A-GTTC-TGTAGCGGATGTTG-ATTAAAATAC-----AA-TTTTATGG--T--AAA--TAAA----G-GGGCAC--ATAA--AGGG-T--CAAA-T----------------TAG--AC--A----TGC-CAGCC--TG--------A----AA-T---C---AA--T---CCCATGCAAAGTCTG-G--TGT---T---A---GTCA-A----CCT---TGTT-CAA-A-CTT--------tacggagttgaattttaatccaatgcaagatttgtgataagtggcaatgtatggcaatttaaaataagtagggctttatttgttcaagaaaatctgtggatgttacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|1 : ggcaaaccaaaaagggacattactcacacagaattttattatggtgttaaattcaaacccatgcaagatcttgtgatatacaaccaaccttgtgtgtcattttgaaaaaaatcaggtagcacaTAC--GGAGTTGAATTTTAATCCAATG-CAAGAT-T----T-GTGATA--AG---TGGCAA--TGTATG-G-CA----ATTT----AA---AA-TAAG-T-----A-GGGC-TTT----ATTTG--T--TC-----AAGgagatacggagttgaattttaatccaatgcaagatttgtgataagtggcaatgtatggcaatttaaaataagtagggctttatttgttcaagaaaatctgtggatgttacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|10 : ggcaaaccaaaaagggacattactcacacagaattttattatggtgttaaattcaaacccatgcaagatcttgtgatatacaaccaaccttgtgtgtcattttgaaaaaaatcaggtagcacatattcgtgttatggagttgagttgaataaaataattttacaattaacttaatatgcaggaacatattgtgcaagatcccatgcaaggtcttatgatgagcaaccacaaacttaaataatcaaacaaagtttgttcaagttctgtagcggatgttgattaaaatacaattttatggtaaataaaggggcacataaagggtcaaattagacatgccagcctgaaatcaatcccatgcaaagtctggtgttagtcaaccttgttcaaacttgaga-G-AATTT-CAATCTCAG-GCTAGGTACAG--TATTA----AG-CA-ACATTGTGTATA-TATTT----C------A-TAATAAC--CAA----G-AA----A-----T-GA---C-TGACC-----A---A-GTTG-TTGAGTGGCTATCG-ATAAAAATTC-----AT-TTTT-TGT--T--AAA--AAAA----G-GGC--C--ATAACTCACG-T--AAAA-T----------------TTG--AG--A----TGT-GGAGT--TG--------A----AC-T--TC---AA--T---CCCATACAA-GCCTTAG--TGA---T---A---AGGA-G----TAA-TGTGTT-CTA-A--TT--------TAAA-ACGAAAAT----GTC-TACA--TG-TATC-CA--AGTTATTG--AG-C--AGA-TG-Taaaatctgtggatgttacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|11 : --T--AAA---AAG----G-GGA--C--ACA--TCTAG-TTCAAAA-T----------------TTG--AT--G----TGC-GGTGC--TG--------A----AA-T--TC---AA--T---TCCATGTAAAGTCTA-G--GGT---T---G---AGCA-T----CCT-TGTGTA-CTA---TTT--------TAAA-A--AGAAT--CA-CA-AATA--TT-TATTCACTGAGTTATTG--AG-C--A-A-------AACAAAAAA-TT-ATGTTAA-------------TAAAA--G-GC-AGT--AAAATTC-ATA--TAACA--TT-ACAT-A---TGTAT--GC--CTGAAATACTATCCCATG-CAAGGTCT----A-ATGAGA--AT---CAACCT--TGTGCA-T-AA----ATTT-G--AT---AA-GAAT-C-----A-TGCA-ACA----T-TTG--TTATT-----AAGT-G-G-ACTC--AGTGGA-GTGGATaacatgccggacggcaattaatggagcattataaaagctcacctactcaaaga
gi|12 : acacaGG--C--ATAACTCGTG-T--AAAA-T----------------TAA--AC--A----TGT-GGAGC--TG--------A----AA-T--GC---AA--T---CCGATGCATAGTCTA-G--TGA---T---A---CACA-A----CGT-TGTCTC-CA------T--------TAA------------C-------TA--TT-TGTA-CG--AGTTACTGAAAG-G--A-A--G-TCGTATAAAACA--------TAAACTG-------------A--G-TG------ATACTTA-ATA--TAA-A--TG-T-CT-A---TGTGC--GGAGCTGAACTGCAAGCCAATA-CACAGTGT----A-GTGATT--TG---CAATCA--TGTGTA-G----------------A---AA-GAAT-C-----G-GACA-ATA-------TGACT--TC-----GAA--T-A-AATG--AGCGGa
gi|13 : a--AGTCATTG--AA-C--A-GATG-TTCA-TAAAATGGTG-GGTGTG----GC--GAGGGTTAAAA--AAGG-C-C--ATTACTC-GTG--TAATA--TT-G-AG-A-----TGC--TGA-CTTCATTTCAATCCAGTG-TAAACTCT----A-GTAATA--AGGGCTAA-----TGTGTA-CCAA----ATTT-G--AA---AT-GAAT-A-----G-GGAA-ACA----T-TTG--T--TC-----CAG--T-T-ATTG--ATGGGATGTTtctgtccgccagcccgtacaaactgcgataaaata
gi|14 : aAATCCCAT-GTGATGTTTAC--TATTA----AA-CA-ACCTGATGTACA-TATAT----G------A-AAATAAT--TAG----G-AA----A-----C-G----T-T----------------TGA-TTGAGCAGATACTA-ATTAAAATGT-----A---TTTGTTGTTT--AAAATTAAA----A-AAGACC--ATGACTCATG----AAAA-T----------------TTG--ACCAA----TA--GAGT---TG--------A----AA-T--AC---AT--C---TTTTTGCATGGTCCT-G--GGA---T---A---AGGA-A----C------------------T--------TACA-A--CAAAT--ATGAA-AATG--TT-CG-------ATTCATTG--AG-CG-A-A-TG-TTacatgtgagattctgataacaaaagtacatctatgtacagaatagtctggaaaactaaaaaatgttaatgatttgttaaatataaagttccagactaaa
gi|15 : ataaAATAAT--CGA----G-CA----A-----T-G----A-TTATTC----G---A-GGTA-TTTAGCGAAAGTTG-ATTAAAATGC-----A---TTTAAGT--T--AAA--TAAA----A-TAG--CC-ATAACTCACG-T--ACAA-T----------------TTA--AT--G----TGC--AGTG--TT--------A----AATT--TC---AA--T---ACCATGTAAGGT-TT-G--TCA---T---A---AGGA-A----CAC-TGTGTG-CAA-A--TT--------TAAA-A--TGAAT--GGGCC-AGGG--TT-TGTT-TG--AGTGGTCT--GG-CA-A-A-TG-TTacatgtggcattccaatgtggacaaagctcacatgttcatagattaa
gi|16 : TG-ATTAAAATGT-----TA-TTTTTTGG--T--AAA--TAA--------------------------------A-T----------------TAG-----------------GCC--TA--------A----AA-T--AC---A---T---CTCATGCAA---------------------------A-A----CCT-AGTG-------------------------------AT--AAGCA-AA-A--TTATGTT-CA--AATCTATA--A-------A-TG-ATGAA-AAAATG-T--ATTTTAT--TGT--AA----TA------------------------T---TAA-A--TTTC-AG-A---TGTG---------GAATTTCAATGCCATG-CAAGTTCT----T-GTAATA--AG---GAA-TG--TGTGTA-C-TA----A-TT-A--AA---AA-TAAA-A-----G-GGTA-AAA----T-TTG--C--TC-----AAA--T-T-ATTG--AGTGGATATTacattttgggcgtcgacgccgacgaatatgtcattccaaaagcagctcaactatccatagaatagt
gi|16 : A-TGATGAAAAAATGTATTTTATT---GT-A---ATA--TTA-AAT-TTCA-GAT-GT-G-GAATTTCAATGCCAT-GCAAGTTCTTG--TAATA----AG-GA-A---TGTGTGTACTAATT----A------A-AAATAAA--AGG----G-TA----AAATT-T-G----C-TCA-----------A-ATTA-TTGAGTGGATATTacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|17 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattatgttcaaatctataaG--TAA-A--TA-A-AC-A---CGTGT--GAAGTCAAACTTCAATCAAATG-AAAGGTCT----T-TTGACA--AG---CAAACT--TGTGTA-T-CA----ATTT----AA---GA-GGAT-C-----A-GGCA-GCA----A-TTG--T--TC-----AAG--T-A-ACAG--AGTGGACGCTGATTAAAATGCAacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|17 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaaaaA-CGT-GTGA--AG-TC-A-AACTT-CAATCAAAT-GAAAGGTCTTT--TGACA----AG-CA-AACTTGTGTATC-AATTT-----------A-AGAGGAT--CAG----G-CA----GCAAT-T-G----T-TCA-----------A-GTAA-CAGAGTGGACGCTG-ATTAAAATGC----------------------AA--TAAG----G-AGA--C--ACAACTCAAG-----------------------------------A----TGG-GGTTT--TG--------------T-T--TC---AA--T---CCGATGCAAGGTGTT-G--TGA-------A---AGGATA----CAC-AATGGA-CTT-A-TTT--------AAAA-T--AAGGT--C-----AATG--TT-TGTT-ataaggagacacaactcaagatggggttttgtttcaatccgatgcaaggtgttgtgaaaggatacacaatggacttatttaaaataaggtcaatgtttgtt
gi|18 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaaaagtaaataaac--T--AAA--AAAA----G-GAA--C--ATAACTCATG----AAAA-T----------------TA---AC--AGA--TGC-AGAGC--TG--------A----AT-T--TC---AT--T---CCC-------------G--AGA---T---T---AGCA-A----CCT-TGTATA-TAC-A-TTTCTTTTAGTTAAA-A--AAAAA--AGGGA-CATAACTT-GGGT-AA--AAT--TTG--AG-
gi|18 : --AA----AAAAA--G-GA-A-C--ATAACTC-ATG--AAA-A--TT-A-AC-A---GATGC--AGAGCTGAATTTCATTCCC------------------GAGATT--AG---CAACCT--TGTATA-T-AC----ATTT-atgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|18 : tTTAAAA-----AA-----AAAA--G-GG-A-C--ATAACTT-GGG--TAA-AATTT-G-AG-A-----TGA--GGAGTTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----cttttagttaaaaaaaaaagggacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|19 : taaaaaaaggaacataactcatgaaaattaacagatgcagagctgaatttcattcccgagattagcaaccttgtatatacatttcttttagTTG--AGGT--G-A-TG-TTGAAAAAAATG--C-ACTTT----TGC--AG----TAAAAAAG-GG-G-CCAAAAAAAC-ATG--TAA-A--AT-A-TG-A---GGTGC--AGAGTTGAAATTTAATCCTATG-CAAACACT----T-GTTATA--AG---GTGTAT--TGTGCA-T-GA----ATTC-A--AA---AT-GAAT-------A-GGCA-AAAC---ATTTG--T--TC-----ctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|2 : taGACTAGTAAATCTGTATTATTCAAGGCATTGAGCAAATGATGATTAAAACATAATTTTA-TGGTAACTAAAGGGACTTTATTAATGT-A---ACA--TTA-CAT-GTGA-GAGACT-G-AGATA-CAATCCCAT-GCAAAGTCTAG--TGATA----AG-CA-ACCTTGTGTATA-CATTC----A------A-AAAGAAT--CAA----A-CA----A-----T-G----T-TAA-------G---A-ATTA-TTGAGTGGATATTC-ATTAAAGTGC-----AA-TTCTATGG--C--AAA--TAAA----G-TGG--C--ATAAGTCTGG-T--AAAA-T----------------TAG--AC--A----TGC-AAGCC--TG--------A----AA-T--AC---AA--T---CCCAAGCAATGTATT-A--TGA---T---A---AGCA-G----ACT-AGTATA-CAA-A-TTT--------TAAA-A--AAAGT--CACCA-AATA--TT-TGTT-AT--AGTGTTTG--AG-C--A-C-TG-TTGAATTAAATG-CT-ATTTTAAAATGC--AA----TAAAA--G-AG-A-C--ATAACTC-AAG--TAA-A--TT-A-AT-A---CATAC--ACAGCTGAATTTTAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGATA--AG---CAATCT--TGTGAA-A-AG----GTTT-A--AA---AA-GGAT-C-----A-GGAA-AGG----A-TTA--C--TC-----ATGT-TATAATTG--ATCAGATGTTGATTAAAATGCATTcattaacaaaattaatattacagttgtgtgggatgccgacaccactgaatggggtattacaaaaactcaactattcatagaataatc
gi|20 : -A---ACG--TTG-TAT-TCG--GTG-TT-A-AAATT-CCATCCCAT-ACAAGGTGTAG--TTAAA----AATCA-ACCTTGTGTAC--CATTTTA--A------A-AAAGAAT--CGG----G-CA----A-----C-G----T-TTA-------TTTTA-GTTA-TTTGGCA-ATATTG-ATAAAAA--------AA-T---ATGA--T--AAA--TAAA----G-GGG--C--ATAACTCGTG-T--TACA-T---------------------AC--C----TAT-GAGTC--TG--------A----AA-T--GC---AA--TCCGCCCATGCAAAGCCTA-A--TGA-------A---AGAA-A----CAT-TGTGTA-CAC-A-TTT--------GAAA-c
gi|21 : taaaaaaaagagccataA-AATTT----A------A-CA-TATT--AAA----A-CAT---A-----T------T-TTA-------A---A-ATTA-TTGAGCAAATGTTG-ATTAAAATGC-----AA-TTTAATGA--T--AAA--TAAA----G-GGG--T--ATAACTCATGTT--AATA-TATGTATATCATGTATATAT--AC--C----TGC-AAGCC--TG--------A----AA-T--AC---AA--T---CCCATGTGAGGTGTT-G--AAA---T---A---AGCA-G----CTT-TGTGAA-TAA----TT--------TACA-A--AGAGT--CACGC-AGTA--TT-TATA-AG--AGTTATTG--AA-C--AGA-TA-TTGAATAAAATA-TA-ATTT
gi|22 : agttgcAA--G-AG-A-C--ATAACTT-ATG----------------------ATGT--GGAGTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT----T-GTGATA--GG---TGGATTAATGAGGA-T-GA----ATTT-G--AA---AA-GAAT-TA----A-AGCA-ACA----T-TTA--T--TC-----AAG--T-C-ATTG--AGCAGATGCT
gi|23 : atgataaaacctttttttttgAA--G-AG-A-C--ATAACTT-ATG----------------------ATGT--GGAGTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT----T-GTGATA--GG---TGGATTAATGAGGA-T-GA----ATTT-G--AA---AA-GAAT-TA----A-AGCA-ACA----T-TTA--T--TC-----AAG--T-C-ATTG--AGCAGATGCTatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|24 : atgataaaacctttttttttgCCAT-GCAAGATCTAG--TGATA----AA-CA-ACCTTGTATGCT-GTTTT----A------A-AAAGAAT--AAG----G-TA----A-----C-A----C-TAATTT----A---A-GTTC-TTGAGTGGATGTTG-AATAAAACAA-----AA-TTTTACAA--T--AAA---GAG----G-GGG--C--ATAACTCATG-T--TACA-C----------------TAC--AC--A---------AGAC--TG--------A----AA-T--AC---AA--T---CCTGTGCAAGCTCTA-A--TGA---T---C---AGCA-A----CCT-TGTGTA-CAA-A-TCT--------TAatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|25 : ta-GAA-CA-G-AGTTT-CAATCTCAT-ATACTGTCTAGA-TG-TA----AG-CA-ATC----ATATA-CATAC----A------ATAAATACT--CAG----A-CA----G-----T-AATACT-TTA-------A---A-GTTA-TTAAACGGGTGCTA-ATTAATATAT-----AA--TTTATAG--TTAAAA--TA--------TGC--C--ATAACTCATG-C--ACAA-T----------------TTA--AT--A----TGT-GAAAT--TGAATTTTTAA----AA-C--GC---AA--T---CACATGCAAGta
gi|26 : TTTGAAAATG----------------G-GG-A-C--ATAACTT-A-A--TTA-T--TT-A-AT-A---AATTT--AAAG-TGAGTTTCAATCCTATA-CAAGG---------G-GATA--AG---CAACCA--TGTGTATC-AA----ATTA-G--AG---AA-CAACAC-----A-GCAACATG------TT---T--TC-----GAG--G-T-ATTG--AGTGAATGTTGAACAAAAtag
gi|26 : ttatgAAC--ATGTT-TTCGAGGTATTGAGTGAATGTTGAACAAAAAGAAAGTTTA-agaaagtttagacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|27 : ttatgtttgaaaatggggacataacttaattatttaataaatttaaagtgagtttcaatcctatacaaggggataagcaaccatgtgtatcaaattagagaacaacacagc----A-CA----G-----T-G----T-TGA-------C---ACAATA-TTGAGCGGATGTTA-TTTAAAATGC-----AT-ATTTGCGG--T--AAA--CAAA----G-T-G--C--ATAAGTCTTG-T--AAAA-T----------------TAC--GC--A----CAC-GCGCC--TG--------AACTGAA-TTACT---AA--T---TCGGTGCTAAGCATT-G--TGA---T---A---AGCA-A----CAT-CGTGTA-C---A-TTT--------Tgacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|28 : gcactttgtcattcataatgataaacaAAAA--G-GG-G-A--ATAAGCC-ATA--CAA-A--AT-ATATTA---TGTG--------TGACGTTTAATTCAAGT-CAAGGACT----T-GTGATA--AG---GAGC-----G-GAA-T-GT----ACT-----AA---AA-TAAC-T-----AGGGCA-AAG----T-TTG--C--TT-----GAG--A-T-ATCA--AGAGGATGtat
gi|29 : a--AAAAT--CAGCT-AATA--TT-TGTT-TG--AGTTATTG--AG-C--A-GATG-TTAAATAAAA------------------------------A--G-GT-A-A--ATAGTTC-ATG--TAA-A--TA-A-AT-A-----TGCTAGGAGGTGAAATTCAATTTCATG-CAAGGTCA----A-ATAATA--AG---CAACTG--TGTGTA-C-AA----ATTT-G--AA---AT-GATT-C-----A-GGTT-ATA----T-TTG--T--Tgtacagggacgacgaatggatagtcatagaaactcacctattcatagaataaa
gi|3 : AAAGGGGCATAACTCACAT-T---AAAGTTTA--GT-GCG--GTG-TT-G-AAATT-AAATGCCAT-GCAAGGTCTAG--------------CA-ACCATGTGTTT--GATTT----ATT----A-AAA-AAT--CAAGAA-A-CA----A-----TTG----T-TC--------G---A-TTTA-TTGAGCAGATGTTG-ATTAAAATGT-----AG-TTTTA-GC--T--TAA----AA----A-TGG--CTCCTAACTGATG-T--AAAG-T----------------GAA--AC--A----TGC-AGAGC--TG--------A----AT-T--TC---TA--T---CACATGGAAGGTACT-G--TAA---T---A---AGCA-A----CCT-TGTGTATCAA----TC--------GAAA-A--AAAAT--CAGAA-AATG--AT-TGTT-CA--AGTTATTG--GG-C--A-AATG-TT-AATAAAAAG-TACAGGTTAAAA--------------AG--G-GG-C-C--ATAACTC-ATG--TAA-A--AT-T-TT-A---GATGT--AGAG----------ATCCCATG-CAAGCTCT----T-GTGATA--AG---GAGTAA--TGTG-A-T-TC----ATTT-T--AA---A------------------------------TG--T--TC-----AAG--T-T-ACTG--AGCAGATGT
gi|30 : T-CAATTCAAT-GCAAG-----G--TGACA----AG-CA-GCCTTATGTATT-TAT----------------AAGAAT--CGGAGAAA-CA----AT----T-G----T-TCA-----------A-ATTA-TTGTGCAGATGCTG-ATAAAAA------------CTTGTTG--G--AAA--AAAA----G-CAA--C----AACTTTG----------------------------AG--AT--A---------------TG--------A----AC-T--TC---AG--T---CCAATGCAAGCTCTT-G--TGA---T---A---AGaacatgtgggatgcacattgatgaaatttcaaaaacccatctattcataaaatag
gi|31 : GTGTA-CCA----TT--------TGAA-A--TGAAT--CAGGT-TTTA--TT-TGT-------GTTATTT--GA-C--A-A-TGATCGGG--AAGT--TA-ATGATAAAA--------------AA--G-GA-A-C--ATAACCC-ATG--TTA-A--TG-A-AT-T---CGTGT--GACGCTGAAATTCAATACCATT-CACGGTTT----A-ACGATA--AC---CAACTT--TG
gi|32 : tAATCCCAT-AC---GTCTTG--TGGTATT--AG-GA-ATGCTGTGTATC-AATTT----A------A-AATGAAA--TTG----G-CA----A-----T-G----T-TTC-------T---T-GTTA-TTGAACctta
gi|33 : -G-ACACT-AAATTCCAT-ACAAGCTCTAGACGGGTA----AG-CA-ATTATGTGTAAA-AATCT----G------A-AAAGAAT--CGG----A-AA----A-----T-G----T-TTATTTGTACG---A-GCAA-TTGAGCGGACATTATATT-AAACGT-----AA-TTTTAAGT--T--TTA--TAAA----ATGGG--C--ATAaatattacatttgtgatgccaatgttaacaaattagtaatttcaaaagttcaccaattcataggatagccga
gi|34 : gaaacaAAATGGGTTTTACTAATGT-A---ACA--TGT-TTT-GTGCTGTG-TT-G-AAATT-CATTCCCTT-GGAAGGTCTAG--TGACA----AG--A-GTATTGTGTAAC-AATTT----A------A-AATGAAT--ATGGCT-A-CAT---G-----T-G----T-TT--------G---A-GTTA-TTTAGTAGATATT
gi|35 : aaAAGGTTTTG--CGATA----GT-GA-ACATTTTGTACA-AGTTT----A------A-AATGCAT---AG----AGCA----A-----C-G----T-TT--------G---A-ATTA-TTGAACGAATGacatgtggg
gi|36 : t-CAAGGTTT----T-GTGATA--AG---TAACAA--TATGTA-T-CA----ATTT-C--AAGTTAT-GGA-----------GCA-ATG----T-TTG--T--TT-----TAGA-T-T-TTTG--AGCGGATTTTatataatttatgtttgacgtcgacaccagcgaatgggttattacaaaaacacacatagtcatacat
gi|37 : AAA----G-GGG--G--ATAACCCAAA-A--ATAA-T----------------T-G--AT--A----TAC-GGTGT--TG--------A----AA-T--TCCAAAA--T---CTAATGCAAGTTGTA-G--TGA---T---A---AGCA-G----GC---GTATA-C-T-A-TTT--------TGGA-A--AGAAT--CAGCC-AATA--TG-TGTT-TA--AGTTATTA--AG-acatgtgtgacggcgacggataggtgattgcaaaggctcacctactcatagaatatt
gi|38 : catataaTGC--GATGTTGAATTTCAATTTCATG-CAATGTCT----T-GTGATA--AA---AAGCTT--TGTGTG-C-CA----ATT-----AA---AATTAAT-A-----G-GACA-AGG----T-TTG--T--TT-----AA-T-T-T-ATTG--AGCGGATATgaa
gi|39 : gtaacatttcgagaTGAATTTCAATCC-ATG-CAAGTTCT----T-TTGATAGGAG---TAA-----TGTGCA-A-CAT---ATT-----AC---AA-TGAT-TACTAAA-GGTA-ACA----A-TTG-----------------T-T-ATTG--CACGGATGTcacatagtgaacgactga
gi|4 : tgaAAAAGAAGGGAGACAACTCATCT-A---A-A--TTGTCAT-GTG--GAG-TTTGTAAATT-CAATTCAAT-GCAATGTGATG--TGAT--------CA-AC----TGTATA-CGTTT----AATTTTGA-AGAGAAT--TGC----G-CA----A-----T-G----T-TAGTTT----G---A-GTTA-CCGAGCAGATATTA-A--AAAATGT-----GCTTTTTACGA--T--AAA---AAA----G-GGA--T--ATAACTCATG-T--AATA-T----------------TAT--CC--G----TGA-AAGCCCTTC--------A----AA-T--AT---AA--T---CCTACACGAGTCCTA-A--TGT---T---G---AGCA-A----CCG-GATAAA-CAA-ACTCT--------TAAATA--AAAAT--C-GCACAATA--TC-TGTT-AA--AATTATTA--AA-C--AGC-TG-CTGAATAAAACG-GA-AGTTC---ATGT--TT----TAAAA--A-AG-T-T--GCA--TC----------A--TT-A-CT-A---CGTTT--GGAACTGAAATTCAGCCTCATG-CGAA------------GACA--GG---TA---------------AA----ATTTCG--TA---AA-TGAG-C-----A-GGCA-ACG----T-TTG--T--TT-----GCG--T-T-ATAA--AAACAATGTTGATTAAAATGCAaacatgtgcaacaccaacaaatgggccaatacacgag
gi|4 : tataAAC--GT-TTGTTTGCGTTATAAAAACAATGTTGATTAAAATGCAGTTTTACCAGTAAATgttttaccagtaaat
gi|40 : tataaaaagaagggagacaactcatctaaattgtcatgtggagtttgtaaattcaattcaatgcaatgtgatgtgatcaactgtatacgtttaattttgaagagaattgcgcaatgttagtttgagttaccgagcagatattaaaaaatgtgctttttacgataaaaaagggatataactcatgtaatattatccgtgaaagcccttcaaatataatcctacacgagtcctaatgttgagcaaccggataaacaaactcttaaataaaaatcgcacaatatctgttaaaattattaaacagctgctgaataaaacggaagttcatgttttaaaaaagttgcatcattactacgtttggaactgaaattcagcctcatgcgaagacaggtaaaatttcgtaaatgagcaggc-C--ATAACTCTAC---TAA-T--TT-A-AA-A---CAGGT--AGAGCTGAATTTCAACCATATG-CAAGGTCTAGTCTAGTGAAA--AG---CAACCT--TGTGTA-C-AA----ATCT-GAAAA---AA-GGAT-C-----A-G
gi|41 : tttagatttaaaaattacG--------A----AA-T--TC---AA--T---CTCGTGAAAG---TT-G--TGAATAC---A---AGCA-A----TTT-TGTGTA-C-C-A-TTT--------TGAA-A--c
gi|42 : tcagggcagataaaacctggcgcagtacattgattttttatacactgtgttaaa-TG-TTGATTAAGATG-TT-ATTTTA---CGCTTGA----TCAA---G-AA-A-C--ATAACTC-ATG--AAA-A--TT-A-AT-A---CGTGT--GGAGCCGAATTTCAATCta
gi|43 : AAT-C-----A-AGCA-AGG----A-ATG--T--TT-----GAGT-T---ATTG--AACGGATGTTGATT--GATGCATTatttggacaatccattaataatca
gi|43 : atAAT--CAA----G-CA----AGGAA-T-G----T-TT--------G---A-GTTA-TTGAACGGATGTTG-ATT--GATGC------A-TTTTAC-T--T--AA----AAA----A-TGG--C------CTTAAA-T--GAAA-T----------------ttacttaaaaaatggccttaaatgaaatatttgagatacaacattaa
gi|45 : at-----T-G----T-T-A-------G---A-GTTA-TTGAGCAGAT-------TAAAATGC-----AA-TTTTATGG--T--AAA---ATA----G-TGG--C--ATGACAGAGG-T--AAAC-T----------------T----AC--A-------------------------------------C---AA--T---CCCATGCAAAGCCTA-G--Tatttgagatacaacattaa
gi|46 : tTG-TAAGGTCA----A-GTGATA--CG---CAACGT--TGTACT-G-AA----ATTT-G--AA---AA-GATT-C-----G-G
gi|5 : AA-T----------------TGG--AC--G----GGCAGAGT---TG--------A----AA-C--GC---CA--T---CCTACACAACGTCTG-G--TAA---T---T---AGCA-A----CCT-TGTATA-TAT-A-TTT--------GACA-A--AGAGTTGCAGAA-ATTG--AT-TGCT-TA--AGTTACTG--AG-C--A-GATG-TTGAC----ATG-T-----------TGC--G-------------------C--ATGACTC-TTG--TAA-AAGTC-A-G------CGTTT--TGAGCTGAAATACAAATCCATA-CAAAGTTA----A-CTGATA--AG---CTAC-----GTCCA-G-AATTACATT-----AA---AC-G----C-----A-CGAA-ATGGAGCA-TAG--T--TCATGTAAAAT-G-T-GTTG--TGCGGA-----GTTAAGATGCAagtta
gi|5 : taatgttgtaagaagaatgA-GAG-TT-G-AAACG-CCATCCTAC-ACAACGTCTGG--TAATT----AG-CA-ACCTTGTATATA-TATTT----G------ACAAAGAGTTGCAG----A--A----ATTGATT-G----C-TTA-----------A-GTTA-CTGAGCAGATGTTG-AC----ATG---------TT------------------------G-C-G--C--ATGACTCTTG-T--AAAAGT----------------CAG---C--GT---TTT-GAG-C--TG--------A----AA-T--AC---AA--A---TCCATACAAAGTTAA-C--TGA---T---A---AGCatctcaaacaagatgtagcaacattttgtggaagattgaaaaaggtaggacaatacttgttcgtataactgagaagacatcgaagatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|5 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggcAAACGC--AC----GAAAT--G-GA-G-C--ATAGTTC-ATG--TAA-------A-AT-GTGTTGTGC--GGAGTTAAGATGCAATCTCAAA-CAAGA-------T-GT------AG---CAACAT--TTTGTG-G-AA----GATT-G--AA---AA-AGGT-A-----G-GACA-ATA----C-TTG--T--TC-------GTAT-A-ACTG--AGAAGACATCGAtacgtccagaattacattaaacgcacgaaatggagcatagttcatgtaaaatgtgttgtgcggagttaagatgcaatctcaaacaagatgtagcaacattttgtggaagattgaaaaaggtaggacaatacttgttcgtataactgagaagacatcgaagatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggcagagttgaaacgccatcctacacaacgtctggtaattagcaaccttgtatatatatttgacaaagagttgcagaaattgattgcttaagttactgagcagatgttgacatgttgcgcatgactcttgtaaaagtcagcgttttgagctgaaatacaaatccatacaaagttaactgataagctacgtccagaattacattCAT-GCAGTGTCTAG--TGACA----AA-CA-TCCTTGTGTACA-ACGTT-------------------------------------------T-G----T-T-A-------G---A-GTTA-TTAAGCGAATGTTA-ATCAAAATGC-----AA-TTTTATTG--T--AAA--TAAT----G-GTG--C--ATAACTTACA-T--AAAA-agatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : attatatgg-AAATG-CAATTTTATTGTAAA---TAA--TGGT------G-CATAACTTACATAAA-AATTTGTGTA------A-AAAGAAT--CTG----G-CA----A-----T-G----G-TCA--------------TTAACTGAGTGGATGTTG-ATCAG------------------TGA--T--AAA--TAAAACAAG-GGC--C--ATAACTCATG-T--AAAA-T----------------TGG--AG--A----TGT-GGAGT--TT--------A----AT-T--TC---AG--T---CCTAAGCAAACTCGT-G--TGA---T---ACAGAGTA-A--------TGTGTA-CCA-A--TC--------TAAA-A--TGAAT--AAGGC-AACA--TC-TGTT-TA--AGTTAATG--Aatttgtgtaaaaagaatctggcaatggtcattaactgagtggatgttgatcagtgataaataaaacaagggccataactcatgtaaaattggagatgtggagtttaatttcagtcctaagcaaactcgtgtgatacagagtaatgtgtaccaatctaaaatgaataaggcaacatctgtttaagttaatgaatagataatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|7 : attatatggcatgcagtgtctagtgacaaacatccttgtgtacaacgtttgttagagttattaagcgaatgttaatcaGGCTATTAAA---G-ATTATTTGAGTTATTGAGCGGCCCACAAATAAAACATAATTTTA-CATTATATAAAATGACAGACCCTATGTAA---AGA--ATA-CAA-GC-A-GAG-TT-G-AATTT-CAATCCCAT-GCAAGGTCTGG--ATTTA----AG-CC-ACC-TGTGAACA-AATAT----ATG----A-AAAGAAT--AGG----G-CT----A-----T-A----T-TTATTG----G---A-GTTA-CTGTGTAGACATCG-AACAATATGTAAAAAAA-ATTTAGTC--T--GAA---AAG----A-GGG--A--ATAACTCATG-C--AACA-T----------------TCT--AT--A----TGC-AGATT--TG--------A----AA-T--AC---AA--T---CACATACAAGGTCTA-GAATTA---TTTAA---AGCA-A----CAT-TGTGTT-CAA-A-TTT--------GAAA-T--AA-----CTGTACAAAA--TC-TGTG-CA--AGTTATTG--A--CTGA-A-TG-TTGAAatagataatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|8 : acTAAAAGAAGTGGCATAATCCATAT-A---ATT--TTT-TAA-GTG--GTG-TT-G-AAATT-CATTCCAAA-GCAAGAAGTAT--TGATA----AG-TA-ACCTTGTATAGC-AGTTT----G------A-AAAGAAT--CAA----G-CA----ACTTT-T-G----G-TTT-------G---A-GCTA-TTGAGCAGATACTG-AATAAAATGT-----AA-TTTCATGA--T--GAA--TAAG----G-ATT--C--ATTGCT-ATG-T--AATA-T----------------TAT--AC--ACAATTTC-TAGTC--TG--------A----AA-T--AC---AA--T---TCCAT--------TT-G--------T---A---AGCA-ACATTACTGCATGCA-CAATA-TT----------------------------A-CATT--TT-TGTT-TA--GGTTATTG--AA-C--AGA-TG-TTAAATAAAAT--TA-ATTTTA
gi|9 : AGTGGATGTTAAATAAAACATAAACTTA-GGTTAAA-AAAAGCAAATCTTTTA----A---A------A-CGA-GTAA--AG-CT-G-TATAT-CAATCACAT-GCAATGATTAA--TGATA----AG-CA-ACCTTATGTACA-GATTT----T------G-AAATATA--CAG----G-CA----A-----T-GAC--TGTCC-------G---A-GTAA-TTGAGCAGATGTTG-TTTtgtttaaaacaaat
gi|9 : TCT----A-GTTATA--AG---CAATCG--TTTGTA-A-AA----G--T-A--AA---AA-TAAT-C-----A-TGCG-AAG----A-CTG--T--TC-----TTG--T-T-ATTGATATCGGATGCTGATGTAAATGCttgttatttgtatttataaaagggggtatgaaacaactacattttccagtttctagttataagcaatcgtttgtaaaagtaaaaataatcatgcgaagactgttcttgttattgatatcggatgctgatgtaaatgcccttttagt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|44 ): TGTGTACTAATTCAAAATGAATAGGGCATCGTCATTGATGTTACATGCGGAGTGCCAACGGATGTGTGTACAAAACCTCACCTATCAAAACTAGTT
Unaligned ( gi|47 ): TGGGATGCCAACAAATGGGTAAAACGAAAACTCACCTATTCATAAAATAA
Unaligned ( gi|48 ): AGCTAAATTGTATTGTATATTATCTTTTAAAATATAAA
Unaligned ( gi|49 ): CTGAGTTATAAAGTGGGAATAACTCGTGCACAAATT
Alignments
lowQualScore : 33333 222222222222222222222 11111111 1111111 33333333333333333333333333333 11111 1111 111111111111111111111111111 111111111111111 222222222222222222222222 1 77777777777777777777777777777777777777 222222222222222222 11111 111 1111111
lowQualScore : 1 33333 7 3 1 9 1 4 1 66 1 0 1 1 88 5 4 777777777777777777777 3 444 0 2 44 4444 1 1 0 00000000 5555555 3 1 22 333 3333 99999999999999999999999999999 1 1 00 66666666 22222 555 3333 555555 0 33 0 9999999999999999 1 1 888888888888888888888888888 55555555 33 444 222 1 1 2 22 222 222 1 888888 1 777777777777777 2 444 55555 888888888888888888888888 3 22 888888888 22 1 66 6 3 44444 1 333 77777777777777777777777777777777777777 555 1 3 2 0 444 111111111111111111 444 2 1 3 777777 222 44 3333 22222 000 1 5555 333 1 1111111 1 555 22 3 2 333 22 3
lowQualScore : . ..... . . . . . . . .. . . . . .. . . ..................... . ... . . .. .... . . . ........ ....... . . .. ... .... ............................. . . .. ........ ..... ... .... ...... . .. . ................ . . ........................... ........ .. ... ... . . . .. ... ... . ...... . ............... . ... ..... ........................ . .. ......... .. . .. . . ..... . ... ...................................... ... . . . . ... .................. ... . . . ...... ... .. .... ..... ... . .... ... . ....... . ... .. . . ... .. .
lowQualScore : 0 00000 0 0 4 6 0 6 0 99 0 7 0 4 11 5 0 666666666666666666666 1 000 5 0 55 0000 9 9 4 44444444 0000000 8 0 77 222 9999 44444444444444444444444444444 5 7 77 44444444 22222 000 0000 000000 7 55 5 5555555555555555 4 5 999999999999999999999999999 66666666 66 111 666 2 8 1 11 888 888 6 333333 5 555555555555555 8 666 22222 222222222222222222222222 9 33 111111111 44 7 11 4 5 55555 8 111 11111111111111111111111111111111111111 000 9 6 0 3 555 222222222222222222 444 5 6 1 777777 666 11 0000 11111 333 7 7777 000 9 6666666 8 666 66 1 0 555 88 5
consensus : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGNTATTGAGCGGATGTTAAATAAAACATAATTTTACGTT--AAAAAAAGGGACATNACTC-ACGT-AANA--TT--A-CGTGTGA-GA-G-TT-G-AAATTCAATCCCAT-GCAAGGTCTAG--TGATA----AG-CA-ACCTTGTGTA-C----ANATTT----A--A-AAAGAATCG-GG---CA----A-----TG----TT---TA-------G---AGTTA-TTGAGCGGATGTTG-ATTAAAATGC-----AATTTT-ACGGT---AAAT---AAA----G-GGGC--ATAACTCATGTAAA----------------A-T-TA--G-AC--A----TGCG---GAGC--TG--------AAATN-C---AAT---CCCATGCAAGGTCTNG--TGAT---A---AGCA-ACNT---TGTGTA-CA-AA-TT--------TTAAA---A--A-GAA------------T--CG-G--NA-AATA--TTTGTT----CG---AGTTATTG--A-GC--AGA-T-----G-TTGAA--TAAAATG-T--A-----ATTTT----AA-ATGC--GA----TAAAAG---GG-A-CATAACTC-ATG--TAA-A--TTA-AT--A---CGTGC--GGAGCTGAANTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTG---ATA--AG---CAACCT--TGTGTAN-AA-ATTTG--AA---AA-GAAT-C-----A-GGCAACGTTTG--TTCGAG-TT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
Reference ( family-148 ) : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGTTATTGAGCGGATGTTGAATAAAACGTAATTTTACGNT--AAANAAAGGGACATNACTC-ACGT-AACA--TT--A-CGTGTGA-GA-G-TT-G-AAATTCAATCCCAT-GCAAGGTCTAG--TGATA----AG-CA-ACCTTGTGTA-C----ANATTT----A--A-AAAGAATCG-GG---CA----A-----TG----TT---TA-------G---AGTTA-TTGAGCGGATGTTG-ATTAAAATGC-----AATTTT-ACGGT---AAAT---AAA----G-GGGC--ATAACTCATGTAAA----------------A-T-TA--G-AC--A----TGCG---GGNC--TG--------AAATN-C---AAT---CCCATGCAAGGTCTNG--TGAT---A---AGCA-ACCT---TGTGTA-CA-AA-TT--------TTAAA---A--A-GAA------------T--CA-G--NA-AATA--TTTGTT----NA---AGTTATTG--A-GC--A-A-T-----G-TTGAA--TAAAATG-T--A-----ATTTT----AAAATGC--GA----TAAAAG---GG-A-CATAACTC-ATG--TAA-A--TTA-AT--A---CGTGC--GGAGCTGAANTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTG---ATA--AG---CAACCT--TGTGTAN-AA-ATTTG--AA---AA-GAAT-C-----A-GGCAACGNTTG--TTCGAG-TT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
gi|1 : AAAAAGGGACATTACTC-ACAC-AGAA--TTTTA-T-TATG--GT-G-TT---AAATTCAAACCCAT-GCAAGATCTTG--TGATATACAAC-CA-ACCTTGTGTGTC----AT-TTT----G--A-AAAAAATCA-GG---TAGCACA-----TA----TT---C--------G---TGTTA-TGGAGTTGA-GTTG-AATAAAAT-------AATTTT-AC-------AAT---TAA---------C--TTAAT--ATGCAGG----------------A---------AC--A----TATT---G-----TG--------CAA-------GAT---CCCATGCAAGGTCTTA--TGAT---G---AGCA-ACC---------A-CA-AA-CT--------T---A---A--A-TAA------------T--CA-A--AC-AAAG--TTTGTT----CA---AGTTCTGT--A-GC--GGA-T-----G-TTGAT--TAAAATA-C--A-----ATTTT----ATGGTA---AA----TAAAGG---GGCA-CATAA----AGGGTCAA-A--TTA-G---A---CATGC--CAGCCTGAAAT-CAATCCCATG-CAAAGTCT----G-GTG---TTA--GT---CAACCT--TGT-T-C-AA-ACTTG--AG---A
gi|1 : ggcaaaccTAC--GGAGTTGAATTTTAATCCAATG-CAAGAT-T----T-GTG---ATA--AG---TGGCAA--TGTATGG-CA-ATTTA--AA---AT-AAGT-A-----G-GGCTTTATTTG--TTCAAG-AA---AATC--TGTGGATGTTtacggagttgaattttaatccaatgcaagatttgtgataagtggcaatgtatggcaatttaaaataagtagggctttatttgttcaagaaaatctgtggatgttacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|10 : ggcaaaccaaaaagggacattactcacacagaattttattatggtgttaaattcaaacccatgcaagatcttgtgatatacaaccaaccttgtgtgtcattttgaaaaaaatcaggtagcacatattcgtgttatggagttgagttgaataaaataattttacaattaacttaatatgcaggaacatattgtgcaagatcccatgcaaggtcttatgatgagcaaccacaaacttaaataatcaaacaaagtttgttcaagttctgtagcggatgttgattaaaatacaattttatggtaaataaaggggcacataaagggtcaaattagacatgccagcctgaaatcaatcccatgcaaagtctggtgttagtcaaccttgttcaaacttgaga-G-AATTTCAATCTCAG-GCTAGGTACAG--TATTA----AG-CA-ACATTGTGTA-T----ATATTT----C--A-TAATAACCA-AG---AA----A-----TG----AC---TG-------ACCAAGTTG-TTGAGTGGCTATCG-ATAAAAATTC-----ATTTTT--TGTT---AAAA---AAA----G-GGCC--ATAACTCACGTAAA----------------A-T-TT--G-AG--A----TGTG---GAGT--TG--------AACTT-C---AAT---CCCATACAAGCCTTAG--TGAT---A---AGGA-GTAA---TGTGTT-CT-AA--T--------TTAAA---ACGA-AAA------------T-----G--TC-TACA--TGTATC----CA---AGTTATTG--A-GC--AGA-T-----G-Tacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|11 : T---AAA----AAG----G-GGAC--ACATCTAGTTCAAA----------------A-T-TT--G-AT--G----TGCG---GTGC--TG--------AAATT-C---AAT---TCCATGTAAAGTCTAG--GGTT---G---AGCA-TCCT---TGTGTA-CT-A--TT--------TTAAA---A--A-GAA------------T--CA----CA-AATA--TTTATT----CACTGAGTTATTG--A-GC--A-A------------AA--CAAAA------A-----ATT---------ATGTT-AA----TAAAAG---GC-AGTAAAATTC-ATA--TAACA--TTACAT--A---TGTAT--GC--CTGAAATACTATCCCATG-CAAGGTCT----A-ATG---AGA--AT---CAACCT--TGTGCAT-AA-ATTTG--AT---AA-GAAT-C-----A-TGCAACATTT--------G-TT---ATTA--AGTGGAaacatgccggacggcaattaatggagcattataaaagctcacctactcaaaga
gi|12 : acacaGGC--ATAACTCGTGTAAA----------------A-T-TA--A-AC--A----TGTG---GAGC--TG--------AAATG-C---AAT---CCGATGCATAGTCTAG--TGAT---A---CACA-ACGT---TGTCTC-CA--------------TTAA---------------------------C----------TA--TTTGTA----CG---AGTTACTGAAA-GG--A-A-------G-TCGTA--TAAAACA-T--A-----AACTG----A----GT--GA----T-----------A-CTTA-----ATA--TAA-A--TGT-CT--A---TGTGC--GGAGCTGAACTGCAAGCCAATA-CACAGTGT----A-GTG---ATT--TG---CAATCA--TGTGTAG------------A---AA-GAAT-C-----G-GACAATA--TGACTTCGAA-TA---AATG--AGCGGctcagtggagtggata
gi|13 : aA---AGTCATTG--A-AC--AGA-T-----G-TTCA---TAAAATGGT--G-----GGTGT----G----GC--GAGGGTTAAAAAA--GG-C-CATTACTC-GTG--TAATA--TTG-AG--A-----TGC--TGA-CTTCATTTCAATCCAGTG-TAAACTCT----A-GTA---ATA--AGGGCTAA-----TGTGTACCAA-ATTTG--AA---AT-GAAT-A-----G-GGAAACATTTG--TTCCAG-TT---ATTG--ATGGGATGTTtctgtccgccagcccgtacaaactgcgataaaata
gi|14 : AATCCCAT-GTGATGTTTAC--TATTA----AA-CA-ACCTGATGTA-C----ATATAT----G--A-AAATAATTA-GG---AA----A-----CG----TT---TG---------------A-TTGAGCAGATACTA-ATTAAAATGT-----A--TTT-GTTGTTTAAAATTAAAAA----A-GACC--ATGACTCATG-AAA----------------A-T-TT--G-ACCAA----T--A---GAGT--TG--------AAATA-C---ATC---TTTTTGCATGGTCCTG--GGAT---A---AGGA-A-CT---TACA-A-CA-AA-T------------------------A------------T-----G--AA-AA------TGTT----CG---ATTCATTG--A-GCG-A-A-T-----G-TTacatgtgagattctgataacaaaagtacatctatgtacagaatagtctggaaaactaaaaaatgttaatgatttgttaaatataaagttccagactaaa
gi|15 : ataaAATAATCG-AG---CA----A-----TG----AT---TATTC----G---AGGTA-TTTAGCGAAAGTTG-ATTAAAATGC-----A--TTT-AAGTT---AAAT---AAA----A-TAGCC-ATAACTCACGTACA----------------A-T-TT--A-AT--G----TGCA---GTGT--TA--------AATTT-C---AAT---ACCATGTAAGGT-TTG--TCAT---A---AGGA-ACAC---TGTGTG-CA-AA--T--------TTAAA---A--T-GAA------------T--GG-G--CC-AGGG--TTTGTT----TG---AGTGGTCT--G-GCA-A-A-T-----G-TTacatgtggcattccaatgtggacaaagctcacatgttcatagattaa
gi|16 : TG-ATTAAAATGT-----TATTTT-TTGGT---AAAT---AA-------------------------------------------A-T-TA--G------------------GCC--TA--------AAATA-C---A-T---CTCATGCAAAACCTAG--TGAT---A---AGCA-AAAT---TATGTT-CA-AA--T--------CTATA---A--A-TGA------------T-----G--AA-AAAA--TGTATT-----------TTATT-----GT--A-A-T-----A-TTAAATTTCAGATG-TGGA-----ATTTC------AATGC--CA----TGCAAG---acattttgggcgtcgacgccgacgaatatgtcattccaaaagcagctcaactatccatagaatagt
gi|16 : ATGAT--GAAAAAATGTATTTTATT----GT-AATA--TT--A-AATTTCA-GATG-TG-G-AATTTCAATGCCAT-GCAAGTTCTTG--TAATA----AG-GA-A-TGTGTGTA-C-----TAATT----A--A-AAATAAAAG-GG---TA----AAATT-TG----CT---CA-----------AATTA-TTGAGTGGATATTttcttgtaataaggaatgtgtgtactaattaaaaataaaagggtaaaatttgctcaaattattgagtggatattacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|16 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattatgttcaaatctataaTGTAAT----------------A-T-TA--A-AT-------TTCA---GATG--TG--------GAATTTC---AAT---GCCATGCAAGTTCTTG--TAAT---A---AGGA-A-TG---TGTGTA-CT-AA-----------TTAAA---A--ATAAA------------A--GG-G--TA-AA-A--TTTGCT----CA---AATTATTG--A-Gacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|17 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattatgttcaaatctataaatgatgaaaaaatgtattttatG--TAA-A--TAA-AC--A---CGTGT--GAAGTCAAACTTCAATCAAATG-AAAGGTCT----T-TTG---ACA--AG---CAAACT--TGTGTAT-CA-ATTT---AA---GA-GGAT-C-----A-GGCAGCAATTG--TTCAAG-TA---ACAG--AGTGGACGCTGATTAAAATGCAtggatattacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|17 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaaaa--A-CGTGTGA--A-G-TC-A-AACTTCAATCAAAT-GAAAGGTCTTT--TGACA----AG-CA-AACTTGTGTA-T----CAATTT-------A-AGAGGATCA-GG---CA----GCAAT-TG----TT---CA-----------AGTAA-CAGAGTGGACGCTG-ATTAAAATGC---------------------AAT---AAG----G-AGAC--ACAACTCA---------------------------A--G-----A----TGGG---GTTT--TG----------TTT-C---AAT---CCGATGCAAGGTGTTG--TGA----A---AGGATACAC---AATGGA-CT-TA-TT--------T--AA---A--A-TAA----------------G-G--TC-AATG--TTTGTT----ataaggagacacaactcaagatggggttttgtttcaatccgatgcaaggtgttgtgaaaggatacacaatggacttatttaaaataaggtcaatgtttgtt
gi|18 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaaaagtaaataaacT---AAAA---AAA----G-GAAC--ATAACTCATG-AAA----------------A-T-TA----AC--AGA--TGCA---GAGC--TG--------AATTT-C---ATT---CCC------------G--AGAT---T---AGCA-ACCT---TGTATA-TA-CA-TTTCTTTTAGTTAAA---A--A-AAA------------A--AG-G--GA-CATAACTTGGGT----AA---AAT--TTG--A-G-----A-TGAGGAG-TTGAA--T
gi|18 : AAAAG---GA-A-CATAACTC-ATG--AAA-A--TTA-AC--A---GATGC--AGAGCTGAATTTCATTCCC------------------GAG---ATT--AG---CAACCT--TGTATAT-AC-ATTTttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|18 : taaaTT----AAAA------A----AAAAAG---GG-A-CATAACTT-GGG--TAA-AATTTG-AG--A-----TGA--GGAGTTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT--------------------------CT--CG-----------------A---AA-G----------A-GGCTACACTTG--TTTGAG-TT---ATTG--AGcttttagttaaaaaaaaaagggacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|19 : taaaaaaaggaacataactcatgaaaattaacagatgcagagctgaatttcattcccgagattagcaaccttgtatatacatttcttttagTA-TTGAGGTGATGTTG-AAAAAAATGC-----ACTTTT-GCAGT---AAA----AAA----G-GGGCCAAAAAAACATGTAAA----------------A-T-AT--G-AG--G----TGCA---GAGT--TG--------AAATT-T---AAT---CCTATGCAAACACTTG--TTAT---A---AGGT-GTAT---TGTGCA-TG-AA--T--------TCAAA---A--T-GAA------------T---A-GGCAA-AACA--TTTGTT----acattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|2 : GACTAGTAAATCTGTATTATTCAAGGCATTGAGCAAATGATGATTAAAACATAATTTTATGGT--AACTAAAGGGACTTTATTA-ATGT-AACA--TT--A-CATGTGA-GA-GACT-G-AGATACAATCCCAT-GCAAAGTCTAG--TGATA----AG-CA-ACCTTGTGTA-T----ACATTC----A--A-AAAGAATCA-AA---CA----A-----TG----TT---AA-------G---AATTA-TTGAGTGGATATTC-ATTAAAGTGC-----AATTCT-ATGGC---AAAT---AAA----G-TGGC--ATAAGTCTGGTAAA----------------A-T-TA--G-AC--A----TGCA---AGCC--TG--------AAATA-C---AAT---CCCAAGCAATGTATTA--TGAT---A---AGCA-GACT---AGTATA-CA-AA-TT--------TTAAA---A--A-AAG------------T--CA-C--CA-AATA--TTTGTT----AT---AGTGTTTG--A-GC--A-C-T-----G-TTGAA--TTAAATG-C--T-----ATTTT----AAAATGC--AA----TAAAAG---AG-A-CATAACTC-AAG--TAA-A--TTA-AT--A---CATAC--ACAGCTGAATTTTAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTG---ATA--AG---CAATCT--TGTGAAA-AG-GTTTA--AA---AA-GGAT-C-----A-GGAAAGGATTA--CTCATG-TTATAATTG--ATCAGATGTTGATTAAAATGCATTccattaacaaaattaatattacagttgtgtgggatgccgacaccactgaatggggtattacaaaaactcaactattcatagaataatc
gi|20 : --AAAAAAAGAGCCATAA----ACGT-TGTA--TT----CG-GTG-------TT-A-AAATTCCATCCCAT-ACAAGGTGTAG--TTAAA----AATCA-ACCTTGTGTA-C-----CATTTTA--A--A-AAAGAATCG-GG---CA----A-----CG----TT---TA-------TTTTAGTTA-TTTGGCA-ATATTG-ATAAAAA--------AAT----ATGAT---AAAT---AAA----G-GGGC--ATAACTCGTGTTAC----------------A-T-------AC--C----TATG---AGTC--TG--------AAATG-C---AATCCGCCCATGCAAAGCCTAA--TGA----A---AGAA-ACAT---TGTGTA-CA-CA-TT--------TGAAA---c
gi|21 : ta----TT---TA-------A---AATTA-TTGAGCAAATGTTG-ATTAAAATGC-----AATTTA-ATGAT---AAAT---AAA----G-GGGT--ATAACTCATGTTAATATATGTATATCATGTA-TATA--T-AC--C----TGCA---AGCC--TG--------AAATA-C---AAT---CCCATGTGAGGTGTTG--AAAT---A---AGCA-GCTT---TGTGAA-TA-A---T--------TTACA---A--A-GAG------------T--CA-C--GC-AGTA--TTTATA----AG---AGTTATTG--A-AC--AGA-T-----A-TTGAA--TAAAATA-T--A-----ATTT
gi|22 : agttgcaaatttaacatattaaaacatatAAG---AG-A-CATAACTT-ATG----------------------ATGT--GGAGTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT----T-GTG---ATA--GG---TGGATTAATGAGGAT-GA-ATTTG--AA---AA-GAAT-TA----A-AGCAACATTTA--TTCAAG-TC---ATTG--AGCAGATGCT
gi|23 : atgataaaacctttttttttgAAG---AG-A-CATAACTT-ATG----------------------ATGT--GGAGTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT----T-GTG---ATA--GG---TGGATTAATGAGGAT-GA-ATTTG--AA---AA-GAAT-TA----A-AGCAACATTTA--TTCAAG-TC---ATTG--AGCAGATGCTatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|24 : atgataaaacctttttttttgCCAT-GCAAGATCTAG--TGATA----AA-CA-ACCTTGTATG-C----TGTTTT----A--A-AAAGAATAA-GG---TA----A-----CACTAATT---TA-----------AGTTC-TTGAGTGGATGTTG-AATAAAACAA-----AATTTT-ACAAT---AAA----GAG----G-GGGC--ATAACTCATGTTAC----------------A-C-TA--C-AC--A-----------AGAC--TG--------AAATA-C---AAT---CCTGTGCAAGCTCTAA--TGAT---C---AGCA-ACCT---TGTGTA-CA-AA-TC--------TTAatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|25 : taA-GA-G-TT-------TCAATCTCAT-ATACTGTCTAGA-TG-TA----AG-CA-ATC--ATATA-C----ATAC------A--ATAAATACTCA-GA---CA----G-----TAATACTT---TA-------A---AGTTA-TTAAACGGGTGCTA-ATTAATATAT-----AA-TTT-ATAGTTA-AAAT---A--------TGCC--ATAACTCATGCACA----------------A-T-TT--A-AT--A----TGTG---AAAT--TGAATTTTTAAAACG-C---AAT---CACATGCAAGta
gi|26 : gaacTTTG----AAAATG--------------G---GG-A-CATAACTT-A-A--TTA-T--TTA-AT--A---AATTT--AAAG-TGAGTTTCAATCCTATA-CAAGG---------G-G---ATA--AG---CAACCA--TGTGTATCAA-ATTAG--AG---AA-CAACAC-----A-G-CAACATGTT--TTCGAG-GT---ATTG--AGTGAATGTTGAACAAAAtag
gi|26 : ttatgAAC--ATGTT-TTCGAGGTATTGAGTGAATGTTGAACAAAAAGAAAGTTTAagaaagtttagacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|27 : ttatgtttgaaaatggggacataacttaattatttaataaatttaaagtgagtttcaatcctatacaaggggataagcaaccatgtgtatcaaattagagaacaacacagcTA-TTGAGCGGATGTTA-TTTAAAATGC-----ATATTT-GCGGT---AAAC---AAA------GTGC--ATAAGTCTTGTAAA----------------A-T-TAC-GCAC--A----CGCGCCTGAAC--TG--------AATTA-CT--AAT---TCGGTGCTAAGCATTG--TGAT---A---AGCA-ACAT---CGTGTA-C---A-TT--------TTgacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|28 : gcactttgtcattcataatgataaacaacagtgttgacacaaAAAAG---GG-G-AATAAGCC-ATA--CAA-A--ATATATT-A---TGTG--------TGACGTTTAATTCAAGT-CAAGGACT----T-GTG---ATA--AG---GAGCGG--AATGTAC-----T-----AA---AA-TAAC-T-----AGGGCAAAGTTTG--CTTGAG-AT---ATCA--AGAGGATGtat
gi|29 : a--A-AAA------------T--CA-G--CT-AATA--TTTGTT----TG---AGTTATTG--A-GC--AGA-T-----G-TTAAA--TAAAA----------------------------------------AG---GT-A-AATAGTTC-ATG--TAA-A--TAA-AT--A-----TGCTAGGAGGTGAAATTCAATTTCATG-CAAGGTCA----A-ATA---ATA--AG---CAACTG--TGTGTAC-AA-ATTTG--AA---AT-GATT-C-----A-GGTTATATTTG--TTgtacagggacgacgaatggatagtcatagaaactcacctattcatagaataaa
gi|3 : AAAGGGGCATAACTC-ACAT-TAAAGTTT--A--GTGCG--GT-G-TT-G-AAATTAAATGCCAT-GCAAGGTCTAG--------------CA-ACCATGTGTT-T-----GATTT----ATTA-AAA-AATCA-AGAAACA----A-----TT----GT---TC-------G---ATTTA-TTGAGCAGATGTTG-ATTAAAATGT-----AGTTTT-AGCTT---AAA----AAT----G-GCTC--CTAACTGATGTAAA----------------G-T-GA--A-AC--A----TGCA---GAGC--TG--------AATTT-C---TAT---CACATGGAAGGTACTG--TAAT---A---AGCA-ACCT---TGTGTATCA-A---T--------CGAAA---A--A-AAA------------T--CA-G--AA-AATG--ATTGTT----CA---AGTTATTG--G-GC--A-AAT-----G-TT-AA--TAAAAAG-T--AC----AGGTT----AAAA--------------AGG---GG-C-CATAACTC-ATG--TAA-A--ATT-TT--A---GATGT--AGAG----------ATCCCATG-CAAGCTCT----T-GTG---ATA--AG---GAGTAA--TGTG-AT-TC-ATTTT--AA---A------------------------TG--TTCAAG-TT---ACTG--AGCAGATGT
gi|30 : -C---AAT---TCAATGCAAG-----G--TGAC---A---AGCA-GCCT---TATGT------A-TT--------T--AT---A--A-GAA------------T--CG-GA-GA-AACA--ATTGTT----CA---AATTATTG--T-GC--AGA-T-----G-CTG-A--TAAAA------A-----CTTGT--------TG---GA----AAAAAA---GC-A--ACAACT--------------TTG-A---------------GATATGAACTTCAGTCCAATG-CAAGCTCT----T-GTG---ATA--AG---aacatgtgggatgcacattgatgaaatttcaaaaacccatctattcataaaatag
gi|31 : t---TGTGTA-CC-A---T--------TTGAA---A--T-GAA------------T--CA-G--GT-TTTA--TTTGT-----------GTTATTT--G-AC--A-A-T-----GATCGG----GAAGT--T--A-----ATGAT----AA--------------AAAAG---GA-A-CATAACCC-ATG--TTA-A--TGA-AT--T---CGTGT--GACGCTGAAATTCAATACCATT-CACGGTTT----A-ACG---ATA--AC---CAACTT--TG
gi|32 : AATCCCATA-C---GTCT----T-GTG---GTATTAG---GAATGC--TGTGTAT-CA-ATTTA--AA---AT-GAAA-T-----T-GGCAATGTTTC--TT---G-TT---ATTG--AACctta
gi|33 : -G-ACACTAAATTCCAT-ACAAGCTCTAGACGGGTA----AG-CA-ATTATGTGTA-A----AAATCT----G--A-AAAGAATCG-GA---AA----A-----TG----TT---TATTTGTACG---AGCAA-TTGAGCGGACATTATATT-AAACGT-----AATTTT-AAGTT---TTAT---AAA----ATGGGC--ATAaatattacatttgtgatgccaatgttaacaaattagtaatttcaaaagttcaccaattcataggatagccga
gi|34 : gaaacaAAAAATGGGTTTTACTA-ATGT-AACA--TG--T-TTTGTGCTGT-G-TT-G-AAATTCATTCCCTT-GGAAGGTCTAG--TGACA----AG--A-GTATTGTGTA-A----CAATTT----A--A-AATGAATAT-GG---CT----ACATG-TG----TT---T--------G---AGTTA-TTTAGTAGATATT
gi|35 : AAGGTTTTG--CGATA----GT-GA-ACATTTTGTA-C----AAGTTT----A--A-AATGCATAG-AG---CA----A-----CG----TT---T--------G---AATTA-TTGAACGAATGacatgtggg
gi|36 : t-CAAGGTTT----T-GTG---ATA--AG---TAACAA--TATGTAT-CA-ATTTC--AAGTTAT-GGA-----------GCAATGTTTG--TTTTAGATT---TTTG--AGCGGATTTTatataatttatgtttgacgtcgacaccagcgaatgggttattacaaaaacacacatagtcatacat
gi|37 : ---AAA----G-GGGG--ATAACCCA---AAA----------------A-T-AATTG-AT--A----TACG---GTGT--TG--------AAATT-CCAAAAT---CTAATGCAAGTTGTAG--TGAT---A---AGCA-GGC-----GTATA-CT-A--TT--------TTGGA---A--A-GAA------------T--CA-G--CC-AATA--TGTGTT----TA---AGTTATTA--A-GG--A-A-acatgtgtgacggcgacggataggtgattgcaaaggctcacctactcatagaatatt
gi|38 : catataaTGC--GATGTTGAATTTCAATTTCATG-CAATGTCT----T-GTG---ATA--AA---AAGCTT--TGTGTGC-CA-ATT----AA---AATTAAT-A-----G-GACAAGGTTTG--TTTAAT-TT---ATTG--AGCGGATAT
gi|39 : gtaacatttcgagaTGAATTTCAATCC-ATG-CAAGTTCT----T-TTG---ATAGGAG---TAA-----TGTGCAA-CATATT----AC---AA-TGAT-TACTAAA-GGTAACAATT--------G-TT---ATTG--CACGGATGTcacatagtgaacgactga
gi|4 : tga--AAAAGAAGGGAGACAACTC-ATCT-AA-A--TT--GTCATGTG--GA-G-TTTGTAAATTCAATTCAAT-GCAATGTGATG--TGAT--------CA-AC--TGTATA-CGTTTAATTTT----G--A-AGAGAATTG-CG---CA----A-----TG----TTAGTTT-------G---AGTTA-CCGAGCAGATATTA-A--AAAATGT-----GCTTTTTACGAT---AAA----AAA----G-GGAT--ATAACTCATGTAAT----------------A-T-TA--T-CC--G----TGAA---AGCCCTTC--------AAATA-T---AAT---CCTACACGAGTCCTAA--TGTT---G---AGCA-ACCG---GATAAA-CA-AACTC--------TTAAAT--A--A-AAA------------T--C--G--CACAATA--TCTGTT----AA---AATTATTA--A-AC--A-GCT-----G-CTGAA--TAAAACG-G--A-----AGTTC-------ATGT--TT----TAAAAA---AG-T-TGCA--TC----------A--TTA-CT--A---CGTTT--GGAACTGAAATTCAGCCTCATG-CGAAGAC------------------AG--------------GTAA-AA-TTTCG--TA---AA-TGAG-C-----A-GGCAACGTTTG--TTTGCG-TT---ATAA--AAACAATGTTGATTAAAATGCAaacatgtgcaacaccaacaaatgggccaatacacgag
gi|40 : tata-CATAACTCTAC---TAA-T--TTA-AA--A---CAGGT--AGAGCTGAATTTCAACCATATG-CAAGGTCTAGTCTAGTG---AAA--AG---CAACCT--TGTGTAC-AA-ATCTGAAAA---AA-GGAT-C-----A-Ggttttaccagtaaat
gi|41 : tttagatttaaaaattacGAAATTCAATCTCGTG-AAAG---T----T-GTGAATACA--AG---CAATTT--TGTGTAC-CA-TTTTG--AA---Ac
gi|42 : tcagggcagataaaacctggcgcagtacattgattttttatacactgtgttaaa-T-----G-TTGAT--TAAGATG-T--T-----ATTTT----A---CGCTTGA----TCAA-G---AA-A-CATAACTC-ATG--AAA-A--TTA-AT--A---CGTGT--GGAGCCGAATTTCAATCta
gi|43 : AAT-C-----A-AGCAAGGAATG--TTTGAG-TT---ATTG--AACGGATGTTGATT--GATGCATTatttggacaatccattaataatca
gi|43 : atAATCA-AG---CA----AGGAA-TG----TT---T--------G---AGTTA-TTGAACGGATGTTG-ATT--GATGC------ATTTT-AC-TT---AAA----AAA----T-GGCC--TTAA---ATGAAAT----------------A-T-TT--G-AG--A----TACttacttaaaaaatggccttaaatgaaatatttgagatacaacattaa
gi|45 : atT---TA-------G---AGTTA-TTGAGCAGAT-------TAAAATGC-----AATTTT-ATGGT---AAA----ATA----G-TGGC--ATGACAGAGGTAAA----------------C-T-T-----AC--A---------------------------------C---AAT---CCCATGCAAAGCCTAG--Taacattaa
gi|46 : ttgT-GTAAGGTCAAG--TGATA----CG-CA-ACGT--TGTA-CTG--AAATTT----G--A-AAAGATTCG-G
gi|5 : A----------------A-T-TG--G-AC--G----GGCA---GAGT--TG--------AAACG-C---CAT---CCTACACAACGTCTGG--TAAT---T---AGCA-ACCT---TGTATA-TA-TA-TT--------TGACA---A--A-GAG------------TTGCA-G--AA-ATTG--ATTGCT----TA---AGTTACTG--A-GC--AGA-T-----G-TTG------ACATG-T---------------------TGC--G-------------------CATGACTC-TTG--TAA-A----A-GTCAG---CGTTT--TGAGCTGAAATACAAATCCATA-CAAAGTTA----A-CTG---ATA--AG---CTACagtta
gi|5 : taatgttgtaagaagaatgA-GA-G-TT-G-AAACGCCATCCTAC-ACAACGTCTGG--TAATT----AG-CA-ACCTTGTATA-T----ATATTT----G--ACAAAGAGTTGCAG---AA----ATTGATTG----CT---TA-----------AGTTA-CTGAGCAGATGTTG-AC----ATG----------TT-GC------------------------GC--ATGACTCTTGTAAA----------------AGT-CA--G--C--G----TTTT---GAGC--TG--------AAATA-C---AAA---TCCATACAAAGTTAAC--TGAT---A---AGCT-AC--------GTC-CAGAA-TTACA-----TTAAACGCA--C-GAAATGGAGCATAGTT--CATG--TA-AA-A--TGTGTTGTGCGG---AGTTA-AG--ATGC--A-A-T-----C-TCAAA--CAAGATG-T--AGCAACATTTTGTGGAAGAT-T--GA-----AAAAGGTAGG-A-CAgtccagaattacattaaacgcacgaaatggagcatagttcatgtaaaatgtgttgtgcggagttaagatgcaatctcaaacaagatgtagcaacattttgtggaagattgaaaaaggtaggacaatacttgttcgtataactgagaagacatcgaagatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|5 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggcAAACGC---A----CGAAAT---GG-AGCATAGTTC-ATG--TAA------A-AT--GTGTTGTGC--GGAGTTAAGATGCAATCTCAAA-CAAGA-------T-GT---------AG---CAACAT--TTTGTGG-AA-GATTG--AA---AA-AGGT-A-----G-GACAATACTTG--TTCGTA-TA---ACTG--AGAAGACATCGAatacttgttcgtataactgagaagacatcgaagatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggcagagttgaaacgccatcctacacaacgtctggtaattagcaaccttgtatatatatttgacaaagagttgcagaaattgattgcttaagttactgagcagatgttgacatgttgcgcatgactcttgtaaaagtcagcgttttgagctgaaatacaaatccatacaaagttaactgataagctacgtccagaattacattCAT-GCAGTGTCTAG--TGACA----AA-CA-TCCTTGTGTA-C----AACGTT------------------------------------TG----TT----A-------G---AGTTA-TTAAGCGAATGTTA-ATCAAAATGC-----AATTTT-ATTGT---AAAT---AAT----G-GTGC--ATAACTTACATAAA----------------A-agatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : attatatgg-AAATGCAATTTTATTGTAAA---TAA--TGGT------G-CATAACTTACATA-A----AAATTTGTGTA--A-AAAGAATCT-GG---CA----A-----TG----GT---CA-------------TTAACTGAGTGGATGTTG-AT-------C-----AGT------GAT---AAAT---AAAACAAG-GGCC--ATAACTCATGTAAA----------------A-T-TG--G-AG--A----TGTG---GAGT--TT--------AATTT-C---AGT---CCTAAGCAAACTCGTG--TGAT---ACAGAGTA-A------TGTGTA-CC-AA--T--------CTAAA---A--T-GAA------------T--AA-G--GC-AACA--TCTGTT----TA---AGTTAATG--A-AT--AGA-T----------AA--T-ACATG-TTGG-----ACTCC----AACAT-T--GA----CAAATA---AG-A-TATAACatttgtgtaaaaagaatctggcaatggtcattaactgagtggatgttgatcagtgataaataaaacaagggccataactcatgtaaaattggagatgtggagtttaatttcagtcctaagcaaactcgtgtgatacagagtaatgtgtaccaatctaaaatgaataaggcaacatctgtttaagttaatgaatagataatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|7 : attatatggcatgcagtgtctagtgacaaacatccttgtgtacaacgtttgttagagttattaagcgaatgttaatcaGGCTATTAAA---G-ATTATTTGAGTTATTGAGCGGCCCACAAATAAAACATAATTTTACATT--ATATAAAATGACA-GACCCTATGTAAAGA--AT--A-CAAGC-A-GA-G-TT-G-AATTTCAATCCCAT-GCAAGGTCTGG--ATTTA----AG-CC-ACC-TGTGAA-C----AAATAT----ATGA-AAAGAATAG-GG---CT----A-----TA----TT---TATTG----G---AGTTA-CTGTGTAGACATCG-AACAATATGTAAAAAAAATTT-AGTCT---GAA----AAG----A-GGGA--ATAACTCATGCAAC----------------A-T-TC--T-AT--A----TGCA---GATT--TG--------AAATA-C---AAT---CACATACAAGGTCTAGAATTATTTAA---AGCA-ACAT---TGTGTT-CA-AA-TT--------T--GA---A--A-TAA---------------CT-G--TACAAAA--TCTGTG----CA---AGTTATTG--A--CTGA-A-T-----G-TTGAA--aaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|8 : acT--AAAAGAAGTGGCATAATCC-ATAT-AATT--TT--T-TAAGTG--GT-G-TT-G-AAATTCATTCCAAA-GCAAGAAGTAT--TGATA----AG-TA-ACCTTGTATAGC----AG-TTT----G--A-AAAGAATCA-AG---CA----ACTTT-TG----GT---TT-------G---AGCTA-TTGAGCAGATACTG-AATAAAATGT-----AATTTC-ATGAT---GAAT---AAG----G-ATTC--ATTGCT-ATGTAAT----------------A-T-TA--T-AC--ACAATTTCT---AGTC--TG--------AAATA-C---AAT---TCCAT--------TTG-----T---A---AGCA-ACATTACTGCATG-CACAA-TA--------TTA----------------------------C---------ATT--TTTGTT----TA---GGTTATTG--A-AC--AGA-T-----G-TTAAA--TAAAAT--T--A-----ATTTT----A
gi|8 : TTGTTTAGGTTATTGAACAGATGTTAAATAAAAT-TAATTTTATGTTTAAAACAAAtgtttaaaacaaat
gi|9 : taaaagaagtggcataatccatataattttttaagtggtgttgaaattcattccaaagcaagaagtattgataagtaaccttgtatagcagtttgaaaagaatcaagcaacttttggtttgagctattgagcagatactgaataaaatgtaatttcatgatgaataaggattcattgctatgtaatattatacacaatttctagtctgaaatacaattccatttgtaagcaacattactgcatgcacaatattacatttAGTGGATGTTAAATAAAACATAAACTTAGGTT--AAAAAAAGCAA-ATCTTTT-A----AA--------A-CGAGTAA--A-G-CT-G-TATATCAATCACAT-GCAATGATTAA--TGATA----AG-CA-ACCTTATGTA-C----AGATTT----T--G-AAATATACA-GG---CA----A-----TG----AC---TGTCC----G---AGTAA-TTGAGCAGATGTTG-TTTt
gi|9 : TCT----A-GTT---ATA--AG---CAATCG--TTTGTAA-AA-GT--A--AA---AA-TAAT-C-----A-TGCGAAGACTG--TTCTTG-TT---ATTGATATCGGATGCTGATGTAAATGCttgttatttgtatttataaaagggggtatgaaacaactacattttccagtttctagttataagcaatcgtttgtaaaagtaaaaataatcatgcgaagactgttcttgttattgatatcggatgctgatgtaaatgcccttttagt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|44 ): TGTGTACTAATTCAAAATGAATAGGGCATCGTCATTGATGTTACATGCGGAGTGCCAACGGATGTGTGTACAAAACCTCACCTATCAAAACTAGTT
Unaligned ( gi|47 ): TGGGATGCCAACAAATGGGTAAAACGAAAACTCACCTATTCATAAAATAA
Unaligned ( gi|48 ): AGCTAAATTGTATTGTATATTATCTTTTAAAATATAAA
Unaligned ( gi|49 ): CTGAGTTATAAAGTGGGAATAACTCGTGCACAAATT
Alignments
lowQualScore : 33333 222222222222222222 111111111 1111111 3333333333333333333333333 11111 111111 11111111111111 1111111111111111111 111111111 6666666666666666666666666666666666 111111111111111 11111 111 11111111
lowQualScore : 1 33333 7 1 4 3 3 2 1 66 1 4 11 4 5 444444444444444444 3 666 2 2 4444 2 2 000000000 6666666 4 0 33 333 4444 5555555555555555555555555 1 11 77777777 11111 555 777777 55555 0 33 0 8888888888888888 1 1 22222222222222 3333 444444 55555555 33 333 222 0 4 2 33 222 222 1 77777 1 1 3333333333333333333 444 55555 666666666 55555 4444444 44444 444444 1 44444 0 2222222222222222222222222222222222 22 1 22 1 2 444444 888888888888888 5555 1 2 1 3 888888 222 44 3333 44444 111 1 6666 333 2 22222222 1 44 22 44 2 333 22 3
lowQualScore : . ..... . . . . . . . .. . . .. . . .................. . ... . . .... . . ......... ....... . . .. ... .... ......................... . .. ........ ..... ... ...... ..... . .. . ................ . . .............. .... ...... ........ .. ... ... . . . .. ... ... . ..... . . ................... ... ..... ......... ..... ....... ..... ...... . ..... . .................................. .. . .. . . ...... ............... .... . . . . ...... ... .. .... ..... ... . .... ... . ........ . .. .. .. . ... .. .
lowQualScore : 0 00000 3 0 0 5 7 9 3 11 9 4 66 4 3 777777777777777777 3 111 2 1 5555 1 1 444444444 7777777 2 8 99 555 2222 4444444444444444444444444 7 55 33333333 88888 000 555555 33333 7 55 1 8888888888888888 3 4 33333333333333 8888 222222 22222222 44 777 333 3 9 4 88 555 555 4 22222 4 4 3333333333333333333 111 99999 666666666 33333 8888888 11111 666666 6 44444 1 6666666666666666666666666666666666 55 8 55 8 0 555555 000000000000000 1111 8 3 6 2 444444 777 22 9999 33333 222 7 9999 222 0 11111111 9 22 88 11 1 777 99 5
consensus : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGGTATTGAGCGGATGNTGAATAAAACATAANTTTACGTTAAAAAAAGGGGCATNACTC-ACGT-AANA--TT--A-CGTGTGA-GAG-TT-G-AAATTCAATCCCAT-GCAAGGTCTAG-TGATA----AG-CA-ACCTTGTGTA-C----ANATTT----A--A-AAAGAATCG-GG---CA----A-----TG----TT---TA---G---AGTTA-TTGAGCGGATGTTGATTAAAATGC-----AATTTT-ACGGT---AAAT-----AAA----GGGGC--ATAACTCATGTAAA----------------A-T-TN--G-AC--G----TGCG---GAGC---TG--------AAATN-C---AAT---CCCATGCAAGGTCTNG--TGAT---A---AGCA-ACNT---TGTGT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--A-GAATCG--G-N-NAAT----ATTTG-------TTC---GAGT------TATTGAGCGGATG-TTGAA--TAAAATG-T---A-ATTT-T-AA-ATGC--G---A----TAAAA--G-GG-A-CATAACTC-AT-G--TAA-A--TTA-AT--ACGTGC--GGA-GCTGAANTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTG---ATA--AG---CAACCT--TGTGTAC-NA-ATTTG--AA---AA-GAAT-C-----A-GGCAACGTTTG--TTCGAG-TT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
Reference ( family-148 ) : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGNTATTGAGCGGATGTTAAATAAAACATAATTTTACGTTAAAAAAAGGGACATNACTC-ACGT-AANA--TT--A-CGTGTGA-GAG-TT-G-AAATTCAATCCCAT-GCAAGGTCTAG-TGATA----AG-CA-ACCTTGTGTA-C----ANATTT----A--A-AAAGAATCG-GG---CA----A-----TG----TT---TA---G---AGTTA-TTGAGCGGATGTTGATTAAAATGC-----AATTTT-ACGGT---AAAT-----AAA----GGGGC--ATAACTCATGTAAA----------------A-T-TA--G-AC--A----TGCG---GAGC---TG--------AAATN-C---AAT---CCCATGCAAGGTCTNG--TGAT---A---AGCA-ACNT---TGTGT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--A-GAATCG--G-N-AAAT----ATTTG-------TTC---GAGT------TATTGAGCAGATG-TTGAA--TAAAATG-T---A-ATTT-T-AA-ATGC--G---A----TAAAA--G-GG-A-CATAACTC-AT-G--TAA-A--TTA-AT--ACGTGC--GGA-GCTGAANTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTG---ATA--AG---CAACCT--TGTGTAN-AA-ATTTG--AA---AA-GAAT-C-----A-GGCAACGTTTG--TTCGAG-TT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
gi|1 : AAAAAGGGACATTACTC-ACAC-AGAA--TTTTA-T-TATG--GTG-TT---AAATTCAAACCCAT-GCAAGATCTTG-TGATATACAAC-CA-ACCTTGTGTGTC----AT-TTT----G--A-AAAAAATCA-GG---TAGCACA-----TA----TT---C----G---TGTTA-TGGAGTTGA-GTTGAATAAAAT-------AATTTT-AC-------AAT-----TAA--------C--TTAAT--ATGCAGG----------------A---------AC--A----TATT---G------TG--------CAA-------GAT---CCCATGCAAGGTCTTA--TGAT---G---AGCA-ACC----------A-CA-A-ACT---T-----------A---A--A-TAATCA--A-A-CAAA----GTTTG-------TTC---AAGT------TCTGTAGCGGATG-TTGAT--TAAAATA-C---A-ATTT-T----ATG---GTAAA----TAAAG--G-GGCA-CATAA----AG-GGTCAA-A--TTA-G---ACATGC--CAG-CCTGAAA-TCAATCCCATG-CAAAGTCT----G-GTG---TTA--GT---CAACCT--TGT-T-C-AA-ACTTG--AG---A
gi|1 : ggcaaaccAA----------------A-C-TT--G-AG--A----TACG---GAGT---TG--------AATTT-T---AAT---CCAATGCAAGAT-TTG--TGAT---A---AGTG-GCAA---TGTATGG-CA-A---T---T--------TAAA---A--T-AAGTAG--G-G-CTTT----ATTTG-------TTC---AAGtacggagttgaattttaatccaatgcaagatttgtgataagtggcaatgtatggcaatttaaaataagtagggctttatttgttcaagaaaatctgtggatgttacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|10 : ggcaaaccaaaaagggacattactcacacagaattttattatggtgttaaattcaaacccatgcaagatcttgtgatatacaaccaaccttgtgtgtcattttgaaaaaaatcaggtagcacatattcgtgttatggagttgagttgaataaaataattttacaattaacttaatatgcaggaacatattgtgcaagatcccatgcaaggtcttatgatgagcaaccacaaacttaaataatcaaacaaagtttgttcaagttctgtagcggatgttgattaaaatacaattttatggtaaataaaggggcacataaagggtcaaattagacatgccagcctgaaatcaatcccatgcaaagtctggtgttagtcaaccttgttc-G-AATTTCAATCTCAG-GCTAGGTACAG-TATTA----AG-CA-ACATTGTGTA-T----ATATTT----C--A-TAATAACCA-AG---AA----A-----TG----AC---TG---ACCAAGTTG-TTGAGTGGCTATCGATAAAAATTC-----ATTTTT--TGTT---AAAA-----AAA----GGGCC--ATAACTCACGTAAA----------------A-T-TT--G-AG--A----TGTG---GAGT---TG--------AACTT-C---AAT---CCCATACAAGCCTTAG--TGAT---A---AGGA-GTAA---TGTGT-T-CT-A-A-T---T--------TAAA---ACGA-AAAT----G-T-CTAC----ATGTA-------TCC---AAGT------TATTGAGCAGATG-Taaaatctgtggatgttacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|11 : T---AAA------AAG----GGGAC--ACATCTAGTTCAAA----------------A-T-TT--G-AT--G----TGCG---GTGC---TG--------AAATT-C---AAT---TCCATGTAAAGTCTAG--GGTT---G---AGCA-TCCT---TGTGT-A-CT-A--TT---T--------TAAA---A--A-GAATCA----C-AAAT----ATTTA-------TTCACTGAGT------TATTGAGCAAA-------A--CAAAA-------A-ATT-------ATGTT-A---A----TAAAA--G-GC-AGTAAAATTC-AT-A--TAACA--TTACAT--ATGTAT--GC---CTGAAATACTATCCCATG-CAAGGTCT----A-ATG---AGA--AT---CAACCT--TGTGCAT-AA-ATTTG--AT---AA-GAAT-C-----A-TGCAACATTT--------G-TT---ATTA--AGTGGAaacatgccggacggcaattaatggagcattataaaagctcacctactcaaaga
gi|12 : acacaGGC--ATAACTCGTGTAAA----------------A-T-TA--A-AC--A----TGTG---GAGC---TG--------AAATG-C---AAT---CCGATGCATAGTCTAG--TGAT---A---CACA-ACGT---TGTCT-C-CA---------T--------TAA-------------C----------T----ATTTG-------TAC---GAGT------TACTGAAAGGAAG-TCGTA--TAAAACA-T---A-AACT-G-A----GT--G---A----T-----------A-CTTA-----AT-A--TAA-A--TGT-CT--ATGTGC--GGA-GCTGAACTGCAAGCCAATA-CACAGTGT----A-GTG---ATT--TG---CAATCA--TGTGTAG------------A---AA-GAAT-C-----G-GACAA--TATGACTTCGAA-TA---AATG--AGCGGctcagtggagtggata
gi|13 : aAGT------CATTGAACAGATG-TTCA---TAAAATGGT---G-GGTG-T-G----GC--G---AGGGTTAAAA--AAGG-C-CATTACTC-GT-G--TAATA--TTG-AG--A--TGC--TGA--CTTCATTTCAATCCAGTG-TAAACTCT----A-GTA---ATA--AGGGCTAA-----TGTGTACCAA-ATTTG--AA---AT-GAAT-A-----G-GGAAACATTTG--TTCCAG-TT---ATTG--ATGGGATGTTtctgtccgccagcccgtacaaactgcgataaaata
gi|14 : aAATCCCAT-GTGATGTTTAC-TATTA----AA-CA-ACCTGATGTA-C----ATATAT----G--A-AAATAATTA-GG---AA----A-----CG----TT---TG-----------A-TTGAGCAGATACTAATTAAAATGT-----A--TTT-GTTGTTTAAAATTAA--AAA----AGACC--ATGACTCATG-AAA----------------A-T-TT--G-ACCAA----T--A---GAGT---TG--------AAATA-C---ATC---TTTTTGCATGGTCCTG--GGAT---A---AGGA-AC-T---TACA--A-CA-A-AT---------------------------AT----G-A-AAA--------TG-------TTC---GATT------CATTGAGCGAATG-TTacatgtgagattctgataacaaaagtacatctatgtacagaatagtctggaaaactaaaaaatgttaatgatttgttaaatataaagttccagactaaa
gi|15 : ataaAATAATCG-AG---CA----A-----TG----AT---TATTCG---AGGTA-TTTAGCGAAAGTTGATTAAAATGC-----A--TTT-AAGTT---AAAT-----AAA----ATAGCC-ATAACTCACGTACA----------------A-T-TT--A-AT--G----TGCA---GTGT---TA--------AATTT-C---AAT---ACCATGTAAGGT-TTG--TCAT---A---AGGA-ACAC---TGTGT-G-CA-A-A-T---T--------TAAA---A--T-GAATGG--G-C-CAGG----GTTTG-------TTT---GAGT------GGTCTGGCAAATG-TTacatgtggcattccaatgtggacaaagctcacatgttcatagattaa
gi|16 : TGATTAAAATGT-----TATTTT-TTGGT---AAAT-----AAA-------------------------------------------T-TA--G-GC-----------------C---TA--------AAATA-C---A-T---CTCATGCAAAACCTAG--TGAT---A---AGCA-AAAT---TATGT-T-CA-A-A-T---C--------TATA---A--A-TGAT----G-A-AAAA----ATGTA-------TT-------T------TATT--GTA-ATA-TTAAATTTCAGATG-TGG-A-ATTT-C--A-ATGC--C---A----TGCAA--G-acattttgggcgtcgacgccgacgaatatgtcattccaaaagcagctcaactatccatagaatagt
gi|16 : ATG-TTCAA-ATCTAT-AA-ATG-------A----TGAAA--A-A--A-TGTATTTT-ATTG--TAATA--TTA-A---ATTT-C--AGATGTGGAATTTCAATGCCATG-CAAGTTCT----T-GTA---ATA--AG---GAA-TG--TGTGTAC-TA-A-TTA--AA---AA-TAAA-A-----G-GGTAAAATTTG--CTCAAA-TT---ATTG--AGTGGATATTttcttgtaataaggaatgtgtgtactaattaaaaataaaagggtaaaatttgctcaaattattgagtggatattacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|16 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattTGTAAT----------------A-T-TA--A-AT-------TTCA---GATG---TG--------GAATTTC---AAT---GCCATGCAAGTTCTTG--TAAT---A---AGGA-ATGT----GTGT-A-CT-A-ATT-------------AAA---A--ATAAAAGG--G-T-AAA-----ATTTG-------CTC---AAAT------TATTGAGTGGATA-TTacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|17 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattatgttcaaatctataaatgatgaaaaaatgtattttat-G--TAA-A--TAA-AC--ACGTGT--GAA-GTCAAACTTCAATCAAATG-AAAGGTCT----T-TTG---ACA--AG---CAAACT--TGTGTAT-CA-ATTT---AA---GA-GGAT-C-----A-GGCAGCAATTG--TTCAAG-TA---ACAG--AGTGGACGCTGATTAAAATGCAacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|17 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaaaa--A-CGTGTGA--AG-TC-A-AACTTCAATCAAAT-GAAAGGTCTTT-TGACA----AG-CA-AACTTGTGTA-T----CAATTT-------A-AGAGGATCA-GG---CA----GCAAT-TG----TT---CA-------AGTAA-CAGAGTGGACGCTGATTAAAATGC---------------------AAT-----AAG----GAGAC--ACAACTCA---------------------------A--G-----A----TGGG---GTTT---TG----------TTT-C---AAT---CCGATGCAAGGTGTTG--TGA----A---AGGATACAC---AATGG-A-CT-T-ATT---T----------AA---A--A-TAA--G--G-T-CAAT----GTTTG-------TTataaggagacacaactcaagatggggttttgtttcaatccgatgcaaggtgttgtgaaaggatacacaatggacttatttaaaataaggtcaatgtttgtt
gi|18 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaaaagtaaataaacT---AAAA-----AAA----GGAAC--ATAACTCATG-AAA----------------A-T-TA----AC--AGA--TGCA---GAGC---TG--------AATTT-C---ATT---CCC------------G--AGAT---T---AGCA-ACCT---TGTAT-A-TA-C-ATT---TCTTTTAGTTAAA---A--A-AAAAAG--G-G-ACATA---ACTTGGGTAAAATTT---GAG--------A-TGAG--GA-G-TTGAA--T
gi|18 : AAAA--G-GA-A-CATAACTC-AT-G--AAA-A--TTA-AC--AGATGC--AGA-GCTGAATTTCATTCCC------------------GAG---ATT--AG---CAACCT--TGTATAT-AC-ATTTttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|18 : taaaAAAA--G-GG-A-CATAACTT-GG-G--TAA-AATTTG-AG--A--TGA--GGA-GTTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT--------------------------CT--CG-----------------A---AA-G----------A-GGCTACACTTG--TTTGAG-TT---ATTG--AGcttttagttaaaaaaaaaagggacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|19 : taaaaaaaggaacataactcatgaaaattaacagatgcagagctgaatttcattcccgagattagcaaccttgtatatacatttcttttagttaaaaaaTA-TTGAGGTGATGTTGAAAAAAATGC-----ACTTTT-GCAGT---AAA------AAA----GGGGCCAAAAAAACATGTAAA----------------A-T-AT--G-AG--G----TGCA---GAGT---TG--------AAATT-T---AAT---CCTATGCAAACACTTG--TTAT---A---AGGT-GTAT---TGTGC-A-TG-A-A-T---T--------CAAA---A--T-GAATAG--GCA-AAAC----ATTTG-------TTC---acattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|2 : GACTAGTAAATCTGTATTATTCAAGGCATTGAGCAAATGATGATTAAAACATAATTTTATGGTAACTAAAGGGACTTTATTA-ATGT-AACA--TT--A-CATGTGA-GAGACT-G-AGATACAATCCCAT-GCAAAGTCTAG-TGATA----AG-CA-ACCTTGTGTA-T----ACATTC----A--A-AAAGAATCA-AA---CA----A-----TG----TT---AA---G---AATTA-TTGAGTGGATATTCATTAAAGTGC-----AATTCT-ATGGC---AAAT-----AAA----GTGGC--ATAAGTCTGGTAAA----------------A-T-TA--G-AC--A----TGCA---AGCC---TG--------AAATA-C---AAT---CCCAAGCAATGTATTA--TGAT---A---AGCA-GACT---AGTAT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--A-AAGTCA--C-C-AAAT----ATTTG-------TTA---TAGT------GTTTGAGCA-CTG-TTGAA--TTAAATG-C---T-ATTT-TAAA-ATGC--A---A----TAAAA--G-AG-A-CATAACTC-AA-G--TAA-A--TTA-AT--ACATAC--ACA-GCTGAATTTTAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTG---ATA--AG---CAATCT--TGTGAAA-AG-GTTTA--AA---AA-GGAT-C-----A-GGAAAGGATTA--CTCATG-TTATAATTG--ATCAGATGTTGATTAAAATGCATTcattaacaaaattaatattacagttgtgtgggatgccgacaccactgaatggggtattacaaaaactcaactattcatagaataatc
gi|20 : AAAAAAAGAGCCATAA----ACGT-TGTA--TT----CG-GTG------TT-A-AAATTCCATCCCAT-ACAAGGTGTAG-TTAAA----AATCA-ACCTTGTGTA-C-----CATTTTA--A--A-AAAGAATCG-GG---CA----A-----CG----TT---TA---TTTTAGTTA-TTTGGCA-ATATTGATAAAAA--------AAT----ATGAT---AAAT-----AAA----GGGGC--ATAACTCGTGTTAC----------------A-T-------AC--C----TATG---AGTC---TG--------AAATG-C---AATCCGCCCATGCAAAGCCTAA--TGA----A---AGAA-ACAT---TGTGT-A-CA-C-ATT---T--------GAAA---c
gi|21 : ta----TT---TA---A---AATTA-TTGAGCAAATGTTGATTAAAATGC-----AATTTA-ATGAT---AAAT-----AAA----GGGGT--ATAACTCATGTTAATATATGTATATCATGTA-TATA--T-AC--C----TGCA---AGCC---TG--------AAATA-C---AAT---CCCATGTGAGGTGTTG--AAAT---A---AGCA-GCTT---TGTGA-A-TA-A---T---T--------TACA---A--A-GAGTCA--C-G-CAGT----ATTTA-------TAA---GAGT------TATTGAACAGATA-TTGAA--TAAAATA-T---A-ATTT-
gi|22 : agttgcaaatttaacatattaaaacatatAA--G-AG-A-CATAACTT-AT-G-------------------ATGT--GGA-GTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT----T-GTG---ATA--GG---TGGATTAATGAGGAT-GA-ATTTG--AA---AA-GAAT-TA----A-AGCAACATTTA--TTCAAG-TC---ATTG--AGCAGATGCT
gi|23 : atgataaaacctttttttttgAA--G-AG-A-CATAACTT-AT-G-------------------ATGT--GGA-GTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT----T-GTG---ATA--GG---TGGATTAATGAGGAT-GA-ATTTG--AA---AA-GAAT-TA----A-AGCAACATTTA--TTCAAG-TC---ATTG--AGCAGATGCTatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|24 : atgataaaacctttttttttgCCAT-GCAAGATCTAG-TGATA----AA-CA-ACCTTGTATG-C----TGTTTT----A--A-AAAGAATAA-GG---TA----A-----CACTAATT---TA-------AGTTC-TTGAGTGGATGTTGAATAAAACAA-----AATTTT-ACAAT---AAA------GAG----GGGGC--ATAACTCATGTTAC----------------A-C-TA--C-AC--A-------A---GA-C---TG--------AAATA-C---AAT---CCTGTGCAAGCTCTAA--TGAT---C---AGCA-ACCT---TGTGT-A-CA-A-ATC---T--------TAatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|25 : taA-GAG-TT-------TCAATCTCAT-ATACTGTCTAGATG-TA----AG-CA-ATC--ATATA-C----ATAC------A--ATAAATACTCA-GA---CA----G-----TAATACTT---TA---A---AGTTA-TTAAACGGGTGCTAATTAATATAT-----AA-TTT-ATAGTTA-AAAT-----A-------TGCC--ATAACTCATGCACA----------------A-T-TT--A-AT--A----TGTG---AAAT---TGAATTTTTAAAACG-C---AAT---CACATGCAAGta
gi|26 : gaacAAAATGG-GG-A-CATAACTT-A--A--TTA-T--TTA-AT--AAATTT--AAA-G-TGAGTTTCAATCCTATA-CAAGG---------G-G---ATA--AG---CAACCA--TGTGTATCAA-ATTAG--AG---AA-CAACAC-----A-G-CAACATGTT--TTCGAG-GT---ATTG--AGTGAATGTTGAACAAAAtag
gi|26 : ttatgtttgAAC--ATGTT-TTCGAGGTATTGAGTGAATGTTGAACAAAAAGAAAGTTTAagaaagtttagacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|27 : ttatgtttgaaaatggggacataacttaattatttaataaatttaaagtgagtttcaatcctatacaaggggataagcaaccatgtgtatcaaattagagaacaacacagcTA-TTGAGCGGATGTTATTTAAAATGC-----ATATTT-GCGGT---AAAC-----AAA-----GTGC--ATAAGTCTTGTAAA----------------A-T-TAC-GCAC--A----CGCGCCTGAAC---TG--------AATTA-CT--AAT---TCGGTGCTAAGCATTG--TGAT---A---AGCA-ACAT---CGTGT-A-C----ATT---T--------Tgacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|28 : gcactttgtcattcataatgataaacaacagtgttgacacaaAAAA--G-GG-G-AATAAGCC-AT-A--CAA-A--ATATATT-ATGTG---------TGACGTTTAATTCAAGT-CAAGGACT----T-GTG---ATA--AG---GAGCGG--AATGTAC-----T-----AA---AA-TAAC-T-----AGGGCAAAGTTTG--CTTGAG-AT---ATCA--AGAGGATGtat
gi|29 : a--A-AAATCA--G-C-TAAT----ATTTG-------TTT---GAGT------TATTGAGCAGATG-TTAAA--TAAAA--------------------------------------A--G-GT-A-AATAGTTC-AT-G--TAA-A--TAA-AT--A--TGCTAGGA-GGTGAAATTCAATTTCATG-CAAGGTCA----A-ATA---ATA--AG---CAACTG--TGTGTAC-AA-ATTTG--AA---AT-GATT-C-----A-GGTTATATTTG--TTgtacagggacgacgaatggatagtcatagaaactcacctattcatagaataaa
gi|3 : AAAGGGGCATAACTC-ACAT-TAAAGTTT--A--GTGCG--GTG-TT-G-AAATTAAATGCCAT-GCAAGGTCTAG-------------CA-ACCATGTGTT-T-----GATTT----ATTA-AAA-AATCA-AGAAACA----A-----TT----GT---TC---G---ATTTA-TTGAGCAGATGTTGATTAAAATGT-----AGTTTT-AGCTT---AAA------AAT----GGCTC--CTAACTGATGTAAA----------------G-T-GA--A-AC--A----TGCA---GAGC---TG--------AATTT-C---TAT---CACATGGAAGGTACTG--TAAT---A---AGCA-ACCT---TGTGT-ATCA-A---T---C--------GAAA---A--A-AAATCA--G-A-AAAT----GATTG-------TTC---AAGT------TATTGGGCAAATG-TT-AA--TAAAAAG-T---ACAGGT-T-AA-----------------AAAG--G-GG-C-CATAACTC-AT-G--TAA-A--ATT-TT--AGATGT--AGA-G----------ATCCCATG-CAAGCTCT----T-GTG---ATA--AG---GAGTAA--TGTG-AT-TC-ATTTT--AA---A------------------------TG--TTCAAG-TT---ACTG--AGCAGATGT
gi|30 : -C---AAT---TCAATGCAAGGT-------GAC---A---AGCA-GCCT---TATGT-A--------T---T--------TATA---A----GAATCG--G-AGAAAC----AATTG-------TTC---AAAT------TATTGTGCAGATG-CTG-A--TAAAA-------A-CTTG-T-----TG---G---A----AAAAA--A-GC-A--ACAACT---------------TTG-A------------GA-TATGAACTTCAGTCCAATG-CAAGCTCT----T-GTG---ATA--AG---aacatgtgggatgcacattgatgaaatttcaaaaacccatctattcataaaatag
gi|31 : t---TGTGT-A-CC-A---T---T--------TGAA---A--T-GAATCA--G-G-TTTT----ATTTG-------T-------GT------TATTTGACA-ATGATCGG----GAAGT--T---A-ATGA-T-AA-----------------AAAA--G-GA-A-CATAACCC-AT-G--TTA-A--TGA-AT--TCGTGT--GAC-GCTGAAATTCAATACCATT-CACGGTTT----A-ACG---ATA--AC---CAACTT--TG
gi|32 : AATCCCATA-C---GTCT----T-GTG---GTATTAG---GAATGC--TGTGTAT-CA-ATTTA--AA---AT-GAAA-T-----T-GGCAATGTTTC--TT---G-TT---ATTG--AACctta
gi|33 : ---AAT---TCCATACAAGCTCTAGACGGGT---A---AGCA-ATTA---TGTGT-A-AA-A-ATC---T---------GAA---A--A-GAATCG--G-A-AAATGTTTATTTG-------TAC---GAGC------AATTGAGCGGACA-TTATA--TTAAACG-T---A-ATTT-T-AA-GTTT--T---A----TAAAA--T-GG-G-CATAaatattacatttgtgatgccaatgttaacaaattagtaatttcaaaagttcaccaattcataggatagccga
gi|34 : gaaacagacactaAAAAATGGGTTTTACTA-ATGT-AACA--TG--T-TTTGTGCTGTG-TT-G-AAATTCATTCCCTT-GGAAGGTCTAG-TGACA----AG--A-GTATTGTGTA-A----CAATTT----A--A-AATGAATAT-GG---CT----ACATG-TG----TT---T----G---AGTTA-TTTAGTAGATATT
gi|35 : AAGGTTTTG-CGATA----GT-GA-ACATTTTGTA-C----AAGTTT----A--A-AATGCATAG-AG---CA----A-----CG----TT---T----G---AATTA-TTGAACGAATGacatgtggg
gi|36 : t-CAAGGTTT----T-GTG---ATA--AG---TAACAA--TATGTAT-CA-ATTTC--AAGTTAT-GGA-----------GCAATGTTTG--TTTTAGATT---TTTG--AGCGGATTTTatataatttatgtttgacgtcgacaccagcgaatgggttattacaaaaacacacatagtcatacat
gi|37 : -----AAA----GGGGG--ATAACCCA---AAA----------------A-T-AATTG-AT--A----TACG---GTGT---TG--------AAATT-CCAAAAT---CTAATGCAAGTTGTAG--TGAT---A---AGCA-G-------GCGT-A-TA-CTATT---T--------TGGA---A--A-GAATCA--G-C-CAAT----ATGTG-------TTT---AAGT------TATTAAGacatgtgtgacggcgacggataggtgattgcaaaggctcacctactcatagaatatt
gi|38 : catataaTGC--GAT-GTTGAATTTCAATTTCATG-CAATGTCT----T-GTG---ATA--AA---AAGCTT--TGTGTGC-CA-ATT----AA---AATTAAT-A-----G-GACAAGGTTTG--TTTAAT-TT---ATTG--AGCGGATATgaa
gi|39 : gtaacatttcgagaTGAATTTCAATCC-ATG-CAAGTTCT----T-TTG---ATAGGAG---TAA-----TGTGCAA-CATATT----AC---AA-TGAT-TACTAAA-GGTAACAATT--------G-TT---ATTG--CACGGATGTcacatagtgaacgactga
gi|4 : tgaAAAAGAAGGGAGACAACTC-ATCT-AA-A--TT--GTCATGTG--GAG-TTTGTAAATTCAATTCAAT-GCAATGTGATG-TGAT--------CA-AC--TGTATA-CGTTTAATTTT----G--A-AGAGAATTG-CG---CA----A-----TG----TTAGTTT---G---AGTTA-CCGAGCAGATATTAA--AAAATGT-----GCTTTTTACGAT---AAA------AAA----GGGAT--ATAACTCATGTAAT----------------A-T-TA--T-CC--G----TG-A---AAGCCCTTC--------AAATA-T---AAT---CCTACACGAGTCCTAA--TGTT---G---AGCA-ACCG---GATAA-A-CA-A-ACTC--T--------TAAAT--A--A-AAATCG--C-A-CAAT----ATCTG-------TTA---AAAT------TATTAAACAGCTG-CTGAA--TAAAACG-G---A-AGTT-C----ATGT--T---T----TAAAA--A-AG-T-TGCA--TC-----------A--TTA-CT--ACGTTT--GGA-ACTGAAATTCAGCCTCATG-CGAAGAC------------------AG--------------GTAA-AA-TTTCG--TA---AA-TGAG-C-----A-GGCAACGTTTG--TTTGCG-TT---ATAA--AAACAATGTTGATTAAAATGCAaacatgtgcaacaccaacaaatgggccaatacacgag
gi|40 : tata-CATAACTCTAC----TAA-T--TTA-AA--ACAGGT--AGA-GCTGAATTTCAACCATATG-CAAGGTCTAGTCTAGTG---AAA--AG---CAACCT--TGTGTAC-AA-ATCTGAAAA---AA-GGAT-C-----A-Ggttttaccagtaaat
gi|41 : tttagatttaaaaattacGAAATTCAATCTCGTG-AAAG---T----T-GTGAATACA--AG---CAATTT--TGTGTAC-CA-TTTTG--AA---Ac
gi|42 : tcagggcagataaaacctggcgcagtacattgattttttatacactgtgttaaaTG-TTGAT--TAAGATG-T---T-ATTT-T-A---CGCTTG---A----TCAA---G-AA-A-CATAACTC-AT-G--AAA-A--TTA-AT--ACGTGT--GGA-GCCGAATTTCAATCta
gi|43 : AAT-C-----A-AGCAAGGAATG--TTTGAG-TT---ATTG--AACGGATGTTGATT--GATGCATTatttggacaatccattaataatca
gi|43 : atAATCA-AG---CA----AGGAA-TG----TT---T----G---AGTTA-TTGAACGGATGTTGATT--GATGC------ATTTT-AC-TT---AAA------AAA----TGGCC--TTAA---ATGAAAT----------------A-T-TT--G-AG--A----TACttacttaaaaaatggccttaaatgaaatatttgagatacaacattaa
gi|45 : atT---TA---G---AGTTA-TTGAGCAGAT------TAAAATGC-----AATTTT-ATGGT---AAA------ATA----GTGGC--ATGACAGAGGTAAA----------------C-T-T-----AC--A----------------------------------C---AAT---CCCATGCAAAGCCTAG--Taacattaa
gi|46 : ttgT-GTAAGGTCAAG-TGATA----CG-CA-ACGT--TGTA-CTG--AAATTT----G--A-AAAGATTCG-G
gi|5 : A----------------A-T-TG--G-AC--G----GGCA---GAGT---TG--------AAACG-C---CAT---CCTACACAACGTCTGG--TAAT---T---AGCA-ACCT---TGTAT-A-TA-T-ATT---T--------GACA---A--A-GAGTTGCAG-A-AATT----GATTG-------CTT---AAGT------TACTGAGCAGATG-TTG------ACATG-T----------------TGC--G----------------------CATGACTC-TT-G--TAA-A----A-GTCAGCGTTT--TGA-GCTGAAATACAAATCCATA-CAAAGTTA----A-CTG---ATA--AG---CTACagtta
gi|5 : taatgttgtaagaagaatgA-GAG-TT-G-AAACGCCATCCTAC-ACAACGTCTGG-TAATT----AG-CA-ACCTTGTATA-T----ATATTT----G--ACAAAGAGTTGCAG---AA----ATTGATTG----CT---TA-------AGTTA-CTGAGCAGATGTTGAC----ATG----------TT-GC-------------------------GC--ATGACTCTTGTAAA----------------AGT-CA--G--C--G----TTTT---GAGC---TG--------AAATA-C---AAA---TCCATACAAAGTTAAC--TGAT---A---AGCT-AC--------GT-C-CAGA-ATTACAT--------TAAACGCA--C-GAAATG--G-A-GCAT----A---G-------TTC---ATGTAAAATGTGTTGTGCGGA-G-T------TAAGATG-C---A-ATCT-C-AA-ACAA--G---A----Tgtccagaattacattaaacgcacgaaatggagcatagttcatgtaaaatgtgttgtgcggagttaagatgcaatctcaaacaagatgtagcaacattttgtggaagattgaaaaaggtaggacaatacttgttcgtataactgagaagacatcgaagatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|5 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggcTT-ACATT---AAACGCACGAAAT---GGAGC--ATAGTTCATGTAAA----------------A-T-GT--G-TT--G----TGCG---GAGT---TA--------AGATG-C---AAT---CTCAAACAAGAT---G--T----------AGCA-ACAT---TTTGT-G-GA-A-GAT---T--------GAAA---A--A-G-GTAG--G-A-CAAT----ACTTG-------TTC---GTAT------AACTGAGAAGACA-TCGAA--gtagcaacattttgtggaagattgaaaaaggtaggacaatacttgttcgtataactgagaagacatcgaagatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggcagagttgaaacgccatcctacacaacgtctggtaattagcaaccttgtatatatatttgacaaagagttgcagaaattgattgcttaagttactgagcagatgttgacatgttgcgcatgactcttgtaaaagtcagcgttttgagctgaaatacaaatccatacaaagttaactgataagctacgtccagaaCAT-GCAGTGTCTAG-TGACA----AA-CA-TCCTTGTGTA-C----AACGTT------------------------------------TG----TT----A---G---AGTTA-TTAAGCGAATGTTAATCAAAATGC-----AATTTT-ATTGT---AAAT-----AAT----GGTGC--ATAACTTACATAAA----------------A-gatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : attatatgg-AAATGCAATTTTATTGTAAA---TAA-TGGT------G-CATAACTTACATA-A----AAATTTGTGTA--A-AAAGAATCT-GG---CA----A-----TG----GT---CA---------TTAACTGAGTGGATGTTGAT-------C-----AGT------GAT---AAAT-----AAAACAAGGGCC--ATAACTCATGTAAA----------------A-T-TG--G-AG--A----TGTG---GAGT---TT--------AATTT-C---AGT---CCTAAGCAAACTCGTG--TGAT---ACAGAGTA-A------TGTGT-A-CC-A-A-T---C--------TAAA---A--T-GAATAA--G-G-CAAC----ATCTG-------TTT---AAGT------TAATGAATAGAT-----AA--T-ACATG-TTG-G-ACTC-C-AACAT-T--G---A----CAAAT--A-AG-A-TATAACatttgtgtaaaaagaatctggcaatggtcattaactgagtggatgttgatcagtgataaataaaacaagggccataactcatgtaaaattggagatgtggagtttaatttcagtcctaagcaaactcgtgtgatacagagtaatgtgtaccaatctaaaatgaataaggcaacatctgtttaagttaatgaatagataatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|7 : attatatggcatgcagtgtctagtgacaaacatccttgtgtacaacgtttgttagagttattaagcgaatgttaatcaGGCTATTAAA---G-ATTATTTGAGTTATTGAGCGGCCCACAAATAAAACATAATTTTACATTATATAAAATGACA-GACCCTATGTAAAGA--AT--A-CAAGC-A-GAG-TT-G-AATTTCAATCCCAT-GCAAGGTCTGG-ATTTA----AG-CC-ACC-TGTGAA-C----AAATAT----ATGA-AAAGAATAG-GG---CT----A-----TA----TT---TATTGG---AGTTA-CTGTGTAGACATCGAACAATATGTAAAAAAAATTT-AGTCT---GAA------AAG----AGGGA--ATAACTCATGCAAC----------------A-T-TC--T-AT--A----TGCA---GATT---TG--------AAATA-C---AAT---CACATACAAGGTCTAGAATTATTTAA---AGCA-ACAT---TGTGT-T-CA-A-ATT---T----------GA---A--A-TAACTG--T-A-CAAA----ATCTG-------TGC---AAGT------TATTGACTGAATG-TTGAA--aaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|8 : acTAAAAGAAGTGGCATAATCC-ATAT-AATT--TT--T-TAAGTG--GTG-TT-G-AAATTCATTCCAAA-GCAAGAAGTAT-TGATA----AG-TA-ACCTTGTATAGC----AG-TTT----G--A-AAAGAATCA-AG---CA----ACTTT-TG----GT---TT---G---AGCTA-TTGAGCAGATACTGAATAAAATGT-----AATTTC-ATGAT---GAAT-----AAG----GATTC--ATTGCT-ATGTAAT----------------A-T-TA--T-AC--ACAATTTCT---AGTC---TG--------AAATA-C---AAT---TCCAT--------TTG-----T---A---AGCA-ACATTACTGCAT-G-CACA-ATA---T--------TA--------------C---------AT----TTTTG-------TTT---AGGT------TATTGAACAGATG-TTAAA--TAAAAT--T---A-ATTT-T-A
gi|9 : AGTGGATGTTAAATAAAACATAAACTTAGGTTAAAAAAAG---CA--AATC-TTTT-AAAA--------CGAGTAA--AG-CT-G-TATATCAATCACAT-GCAATGATTAA-TGATA----AG-CA-ACCTTATGTA-C----AGATTT----T--G-AAATATACA-GG---CA----A-----TG----AC---TGTCCG---AGTAA-TTGAGCAGATGTTGTTTtgtttaaaacaaat
gi|9 : TCT----A-GTT---ATA--AG---CAATCG--TTTGTAA-AA-GT--A--AA---AA-TAAT-C-----A-TGCGAAGACTG--TTCTTG-TT---ATTGATATCGGATGCTGATGTAAATGCttgttatttgtatttataaaagggggtatgaaacaactacattttccagtttctagttataagcaatcgtttgtaaaagtaaaaataatcatgcgaagactgttcttgttattgatatcggatgctgatgtaaatgcccttttagt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|44 ): TGTGTACTAATTCAAAATGAATAGGGCATCGTCATTGATGTTACATGCGGAGTGCCAACGGATGTGTGTACAAAACCTCACCTATCAAAACTAGTT
Unaligned ( gi|47 ): TGGGATGCCAACAAATGGGTAAAACGAAAACTCACCTATTCATAAAATAA
Unaligned ( gi|48 ): AGCTAAATTGTATTGTATATTATCTTTTAAAATATAAA
Unaligned ( gi|49 ): CTGAGTTATAAAGTGGGAATAACTCGTGCACAAATT
Alignments
lowQualScore : 33333 3333333333333333333 111111111 1111111 3333333333333333333333333 111111 11111111111 11111111111111111 111111 666666666666666666666666666666666666 2222222222222222222222 11111 1111111
lowQualScore : 1 33333 7 1 1 3 2 2 66 1 4 11 6666666666666666666 2 3 666 2 0 2 0 4444 2 2 000000000 5555555 4 1 33 333 4444 2222222222222222222222222 1 22 666666 3 99999 555 888888 55555 0 33 1 9999999999999999 33 11111111111 33333 33333 55555555 22 333 222 2 3 2 33 222 222 77777 222 2 11111111111111111 444 3333 333333 3333 22 4444 444444 222 1 1 0 22 111111111111111111111111111111111111 22 1 1 1 2 3333333333333333333333 555 1 3 1 3 2 777777 222 44 3333 1 55555 66666 1 99999 222 1 1111111 1 1 3 22 44 2 333 22 3
lowQualScore : . ..... . . . . . . .. . . .. ................... . . ... . . . . .... . . ......... ....... . . .. ... .... ......................... . .. ...... . ..... ... ...... ..... . .. . ................ .. ........... ..... ..... ........ .. ... ... . . . .. ... ... ..... ... . ................. ... .... ...... .... .. .... ...... ... . . . .. .................................... .. . . . . ...................... ... . . . . . ...... ... .. .... . ..... ..... . ..... ... . ....... . . . .. .. . ... .. .
lowQualScore : 0 00000 3 0 0 7 9 7 11 9 4 66 5555555555555555555 6 6 111 4 1 2 2 7777 2 2 333333333 4444444 4 4 88 777 5555 8888888888888888888888888 7 44 000000 0 66666 000 555555 33333 7 55 4 1111111111111111 33 77777777777 88888 00000 22222222 99 777 333 0 2 5 99 666 666 22222 222 9 44444444444444444 222 8888 222222 3333 11 7777 444444 777 3 5 2 66 111111111111111111111111111111111111 55 8 9 8 0 4444444444444444444444 555 8 0 6 2 0 444444 777 22 5555 6 66666 44444 6 11111 999 8 7777777 7 8 1 66 11 1 777 99 5
consensus : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGGTATTGAGCGGATGNTGAATAAAACATAANTTTACGTTAAAAAAAGGGGCATNACTC-ACGTAAN-A--TT--A-CGTGTGA-GAG-TT-G-AAATTCAATCCCAT-GCAAGGTCTAG-TGATA----AG-CA-ACCTTGTGTA-C----ANATTT----A--A-AAAGAATCG-GG---CA----A-----TG----TT---TA---G---AGTTA-TTGAGCGGATGTTGATTAAAATGC-----AATTTT-ACGGT---AAAT-----AAA----GGGGC--ATAACTCATGT-AAA----------------AT--T-NG-ACG----TGCG---GAGC---TG--------AAATN-C---AAT---CCCATGCAAGGTCTNG--TGAT---A---AGCAACNT---TGTGT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--AGAATCGG-GCAAT----A--TTTGTTC---GAGT------TATTGA---GCGGATG-TTGAA--TAAAATG-T---A-ATTT-T-AA-ATGC--G---A----TAAAA--G-GG-A-CATAACTC-AT-G--TAA-A--TTA-AT-ACGTGC--GGA-GCTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGA---TA--AG---CA-ACCT--TGTGTA-CNA-A-TTT-G--AA---AA-GAAT-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTCGAG-TT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
Reference ( family-148 ) : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGGTATTGAGCGGATGNTGAATAAAACATAANTTTACGTTAAAAAAAGGGGCATNACTC-ACGTAAN-A--TT--A-CGTGTGA-GAG-TT-G-AAATTCAATCCCAT-GCAAGGTCTAG-TGATA----AG-CA-ACCTTGTGTA-C----ANATTT----A--A-AAAGAATCG-GG---CA----A-----TG----TT---TA---G---AGTTA-TTGAGCGGATGTTGATTAAAATGC-----AATTTT-ACGGT---AAAT-----AAA----GGGGC--ATAACTCATGT-AAA----------------AT--T-NG-ACG----TGCG---GAGC---TG--------AAATN-C---AAT---CCCATGCAAGGTCTNG--TGAT---A---AGCAACNT---TGTGT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--AGAATCGG-NNAAT----A--TTTGTTC---GAGT------TATTGA---GCGGATG-TTGAA--TAAAATG-T---A-ATTT-T-AA-ATGC--G---A----TAAAA--G-GG-A-CATAACTC-AT-G--TAA-A--TTA-AT-ACGTGC--GGA-GCTGAANTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGA---TA--AG---CA-ACCT--TGTGTA-CNA-A-TTT-G--AA---AA-GAAT-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTCGAG-TT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
gi|1 : AAAAAGGGACATTACTC-ACACAGA-A--TTTTA-T-TATG--GTG-TT---AAATTCAAACCCAT-GCAAGATCTTG-TGATATACAAC-CA-ACCTTGTGTGTC----AT-TTT----G--A-AAAAAATCA-GG---TAGCACA-----TA----TT---C----G---TGTTA-TGGAGTTGA-GTTGAATAAAAT-------AATTTT-AC-------AAT-----TAA--------C--TTAAT--ATGC-AGG----------------A--------ACA----TATT---G------TG--------CAA-------GAT---CCCATGCAAGGTCTTA--TGAT---G---AGCAACC----------A-CA-A-ACT---T-----------A---A--ATAATCAA-ACAAA----G--TTTGTTC---AAGT------TCTGTA---GCGGATG-TTGAT--TAAAATA-C---A-ATTT-T----ATG---GTAAA----TAAAG--G-GGCA-CATAA----AG-GGTCAA-A--TTA-G--ACATGC--CAG-CCTGAAA-TCAATCCCATG-CAAAGTCT----G-GTGT---TA--GT---CA-ACCT--TGT-T--CAA-A-CTT-G--AG---A
gi|1 : ggcaaaccAA----------------AC--T-TG-AGA----TACG---GAGT---TG--------AATTT-T---AAT---CCAATGCAAGAT-TTG--TGAT---A---AGTGGCAA---TGTATGG-CA-A---T---T--------TAAA---A--TAAGTAGG-GCTTT----A--TTTGTTC---AAGA------AAATCT---GTGGATG-TTtacggagttgaattttaatccaatgcaagatttgtgataagtggcaatgtatggcaatttaaaataagtagggctttatttgttcaagaaaatctgtggatgttacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|10 : ggcaaaccaaaaagggacattactcacacagaattttattatggtgttaaattcaaacccatgcaagatcttgtgatatacaaccaaccttgtgtgtcattttgaaaaaaatcaggtagcacatattcgtgttatggagttgagttgaataaaataattttacaattaacttaatatgcaggaacatattgtgcaagatcccatgcaaggtcttatgatgagcaaccacaaacttaaataatcaaacaaagtttgttcaagttctgtagcggatgttgattaaaatacaattttatggtaaataaaggggcacataaagggtcaaattagacatgccagcctgaaatcaatcccatgcaaagtctggtgttagtcaaccttgttc-G-AATTTCAATCTCAG-GCTAGGTACAG-TATTA----AG-CA-ACATTGTGTA-T----ATATTT----C--A-TAATAACCA-AG---AA----A-----TG----AC---TG---ACCAAGTTG-TTGAGTGGCTATCGATAAAAATTC-----ATTTTT--TGTT---AAAA-----AAA----GGGCC--ATAACTCACGT-AAA----------------AT--T-TG-AGA----TGTG---GAGT---TG--------AACTT-C---AAT---CCCATACAAGCCTTAG--TGAT---A---AGGAGTAA---TGTGT-T-CT-A-A-T---T--------TAAA---ACGAAAAT--G-TCTAC----A--TGTATCC---AAGT------TATTGA---GCAGATG-Tacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|11 : T---AAA------AAG----GGGAC--ACATCTAGTTC-AAA----------------AT--T-TG-ATG----TGCG---GTGC---TG--------AAATT-C---AAT---TCCATGTAAAGTCTAG--GGTT---G---AGCATCCT---TGTGT-A-CT-A--TT---T--------TAAA---A--AGAATCA--CAAAT----A--TTTATTCACTGAGT------TATTGA---GCAAA-------A--CAAAA-------A-ATT-------ATGTT-A---A----TAAAA--G-GC-AGTAAAATTC-AT-A--TAACA--TTACAT-ATGTAT--GC---CTGAAATACTATCCCATG-CAAGGTCT----A-ATGA---GA--AT---CA-ACCT--TGTGCA-TAA-A-TTT-G--AT---AA-GAAT-C-----A-TG-CAACATTT--------G-TT---ATTA--AGTGGAaacatgccggacggcaattaatggagcattataaaagctcacctactcaaaga
gi|12 : acacaGGC--ATAACTCGTGT-AAA----------------AT--T-AA-ACA----TGTG---GAGC---TG--------AAATG-C---AAT---CCGATGCATAGTCTAG--TGAT---A---CACAACGT---TGTCT-C-CA---------T--------TAA------------C-------T----A--TTTGTAC---GAGT------TACTGA---AAGGAAG-TCGTA--TAAAACA-T---A-AACT-G-A----GT--G---A----T-----------A-CTTA-----AT-A--TAA-A--TGT-CT-ATGTGC--GGA-GCTGAACTGCAAGCCAATA-CACAGTGT----A-GTGA---TT--TG---CA-ATCA--TGTGTA--------------GA---AA-GAAT-C-----G-GA-CAA--TATGACTTCGAA-TA---AATG--AGCGGctcagtggagtggata
gi|13 : aAGT------CATTGA---ACAGATG-TTCA---TAAAATGGT---G-GGTG-T-G----GC--G---AGGGTTAAAA--AAGG-C-CATTACTC-GT-G--TAATA--TTG-AG-A--TGC--TGA--CTTCATTTCAATCCAGTG-TAAACTCT----A-GTAA---TA--AGGGCTA-A-----TGTGTA-CCA-AATTT-G--AA---AT-GAAT-A-----G-GG-AAACATTTG--TTCCAG-TT---ATTG--ATGGGATGTTtctgtccgccagcccgtacaaactgcgataaaata
gi|14 : aAATCCCAT-GTGATGTTTAC-TATTA----AA-CA-ACCTGATGTA-C----ATATAT----G--A-AAATAATTA-GG---AA----A-----CG----TT---TG-----------A-TTGAGCAGATACTAATTAAAATGT-----A--TTT-GTTGTTTAAAATTAA--AAA----AGACC--ATGACTCATG--AAA----------------AT--T-TG-ACC----AATA---GAGT---TG--------AAATA-C---ATC---TTTTTGCATGGTCCTG--GGAT---A---AGGAAC-T---TACA--A-CA-A-ATA---T--------GAAA---A-------------------------TGTTC---GATT------CATTGA---GCGAATG-TTacatgtgagattctgataacaaaagtacatctatgtacagaatagtctggaaaactaaaaaatgttaatgatttgttaaatataaagttccagactaaa
gi|15 : ataaAATAATCG-AG---CA----A-----TG----AT---TATTCG---AGGTA-TTTAGCGAAAGTTGATTAAAATGC-----A--TTT-AAGTT---AAAT-----AAA----ATAGCC-ATAACTCACGT-ACA----------------AT--T-TA-ATG----TGCA---GTGT---TA--------AATTT-C---AAT---ACCATGTAAGGT-TTG--TCAT---A---AGGAACAC---TGTGT-G-CA-A-A-T---T--------TAAA---A--TGAATGGG-CCAGG----G--TTTGTTT---GAGT------GGTCTG---GCAAATG-TTacatgtggcattccaatgtggacaaagctcacatgttcatagattaa
gi|16 : TGATTAAAATGT-----TATTTT-TTGGT---AAAT-----AAA-------------------------------------------T--T-AG-GC---------------C---TA--------AAATA-C---A-T---CTCATGCAAAACCTAG--TGAT---A---AGCAAAAT---TATGT-T-CA-A-A-T---C--------TATA---A--ATGAT--G-AAAAA----A--TGTATT-------T------TATTG------TAATA-TTAAATTTCAGATG-TGG-A-ATTT-C--A-ATGC--C---A----TGCAA--G-acattttgggcgtcgacgccgacgaatatgtcattccaaaagcagctcaactatccatagaatagt
gi|16 : ATG-TTCAA-ATCTAT-AA-ATG-------A----TGAAA--A-A--A-TGTATTTT-ATTG--TAATA--TTA-A--ATTT-C--AGATGTGGAATTTCAATGCCATG-CAAGTTCT----T-GTAA---TA--AG---GA-A-TG--TGTGTA-CTA-A--TT-A--AA---AA-TAAA-A-----G-GG-TAAAATTTG--CTCAAA-TT---ATTG--AGTGGATATTttcttgtaataaggaatgtgtgtactaattaaaaataaaagggtaaaatttgctcaaattattgagtggatattacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|16 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattTGT-AAT----------------AT--T-AA-ATT----T-CA---GATG---TG--------GAATTTC---AAT---GCCATGCAAGTTCTTG--TAAT---A---AGGAATGT----GTGT-A-CT-A-ATT-------------AAA---A--ATAAAAGG-GTAAA----A--TTTGCTC---AAAT------TATTGA---GTGGATA-TTacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|17 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattatgttcaaatctataaatgatgaaaaaatgtattttat-G--TAA-A--TAA-AC-ACGTGT--GAA-GTCAAACTTCAATCAAATG-AAAGGTCT----T-TTGA---CA--AG---CA-AACT--TGTGTA-TCA-A-TTT----AA---GA-GGAT-C-----A-GG-CAGCAATTG--TTCAAG-TA---ACAG--AGTGGACGCTGATTAAAATGCAacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|17 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaaaa-ACG----TGTG---AAGT---CA--------AACTT-C---AAT---CAAATGAAAGGTCTTT--TGAC---A---AGCAAACT---TGTGT-A-TC-A-ATT---T----------AA---G--AGGATCAG-GCAGC----A--ATTGTTC---AAGT------AACAGA---GTGGACG-CTGAT--TAAAATG-C---A-AT-------------------------AAG--G-AG-A-CACAACTC-A------AG-A--T--------------GGG-GTTTTGTTTCAATCCGATG-CAAGGTGT----T-GTGA----A--AG---GATACAC--AATGGA-CTT-A-TTT----------A-AAAT-A-----A-GGTCAATGTTTG--TTataaggagacacaactcaagatggggttttgtttcaatccgatgcaaggtgttgtgaaaggatacacaatggacttatttaaaataaggtcaatgtttgtt
gi|18 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaaaagtaaataaacT---AAAA-----AAA----GGAAC--ATAACTCATG--AAA----------------AT--T-A--ACAGA--TGCA---GAGC---TG--------AATTT-C---ATT---CCC------------G--AGAT---T---AGCAACCT---TGTAT-A-TA-C-ATT---TCTTTTAGTTAAA---A--AAAAAAGG-GACAT----AACTTGGGTA---AAAT--------TTGAGATGAGGA-G-TTGAA--T
gi|18 : AAAA--G-GA-A-CATAACTC-AT-G--AAA-A--TTA-AC-AGATGC--AGA-GCTGAATTTCATTCCC------------------GAGA---TT--AG---CA-ACCT--TGTATA-TAC-A-TTT-ttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|18 : taaa---AAAA-----AAA----GGGAC--ATAACTTGGGT-AAA----------------AT--T-TG-AGA----TGAG---GAGT---TG--------AATTT-C---AAT---CCCATGCAAGGTCTcttttagttaaaaaaaaaagggacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|18 : taaaaaaaggaacataactcatgaaaattaacagatgcagagctgaatttcattcccgagattagcaaccttgtatatacatttcttttagttaaaAAAA--G-GG-A-CATAACTT-GG-G--TAA-AATTTG-AG-A--TGA--GGA-GTTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT---------------------------CT--CG-------------------A---AA-G----------A-GG-CTACACTTG--TTTGAG-TT---ATTG--AGctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|19 : taaaaaaaggaacataactcatgaaaattaacagatgcagagctgaatttcattcccgagattagcaaccttgtatatacatttcttttagttaaaaaaTA-TTGAGGTGATGTTGAAAAAAATGC-----ACTTTT-GCAGT---AAA------AAA----GGGGCCAAAAAAACATGT-AAA----------------AT--A-TG-AGG----TGCA---GAGT---TG--------AAATT-T---AAT---CCTATGCAAACACTTG--TTAT---A---AGGTGTAT---TGTGC-A-TG-A-A-T---T--------CAAA---A--TGAATAGGCAAAAC----A--TTTGTTC---acattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|2 : GACTAGTAAATCTGTATTATTCAAGGCATTGAGCAAATGATGATTAAAACATAATTTTATGGTAACTAAAGGGACTTTATTA-ATGTAAC-A--TT--A-CATGTGA-GAGACT-G-AGATACAATCCCAT-GCAAAGTCTAG-TGATA----AG-CA-ACCTTGTGTA-T----ACATTC----A--A-AAAGAATCA-AA---CA----A-----TG----TT---AA---G---AATTA-TTGAGTGGATATTCATTAAAGTGC-----AATTCT-ATGGC---AAAT-----AAA----GTGGC--ATAAGTCTGGT-AAA----------------AT--T-AG-ACA----TGCA---AGCC---TG--------AAATA-C---AAT---CCCAAGCAATGTATTA--TGAT---A---AGCAGACT---AGTAT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--AAAGTCAC-CAAAT----A--TTTGTTA---TAGT------GTTTGA---GC-ACTG-TTGAA--TTAAATG-C---T-ATTT-TAAA-ATGC--A---A----TAAAA--G-AG-A-CATAACTC-AA-G--TAA-A--TTA-AT-ACATAC--ACA-GCTGAATTTTAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGA---TA--AG---CA-ATCT--TGTGAA-AAG-G-TTT-A--AA---AA-GGAT-C-----A-GG-AAAGGATTA--CTCATG-TTATAATTG--ATCAGATGTTGATTAAAATGCATTcattaacaaaattaatattacagttgtgtgggatgccgacaccactgaatggggtattacaaaaactcaactattcatagaataatc
gi|20 : AAAAAAAGAGCCATAA----ACGTTGT-A--TT----CG-GTG------TT-A-AAATTCCATCCCAT-ACAAGGTGTAG-TTAAA----AATCA-ACCTTGTGTA-C-----CATTTTA--A--A-AAAGAATCG-GG---CA----A-----CG----TT---TA---TTTTAGTTA-TTTGGCA-ATATTGATAAAAA--------AAT----ATGAT---AAAT-----AAA----GGGGC--ATAACTCGTGT-TAC----------------AT-------ACC----TATG---AGTC---TG--------AAATG-C---AATCCGCCCATGCAAAGCCTAA--TGA----A---AGAAACAT---TGTGT-A-CA-C-ATT---T--------GAAA---c
gi|21 : ta----TT---TA---A---AATTA-TTGAGCAAATGTTGATTAAAATGC-----AATTTA-ATGAT---AAAT-----AAA----GGGGT--ATAACTCATGT-TAATATATGTATATCATGTATA-T-AT-ACC----TGCA---AGCC---TG--------AAATA-C---AAT---CCCATGTGAGGTGTTG--AAAT---A---AGCAGCTT---TGTGA-A-TA-A---T---T--------TACA---A--AGAGTCAC-GCAGT----A--TTTATAA---GAGT------TATTGA---ACAGATA-TTGAA--TAAAATA-T---A-ATTT-
gi|22 : agttgcaaatttaacatattaaaacatatAA--G-AG-A-CATAACTT-AT-G------------------ATGT--GGA-GTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT----T-GTGA---TA--GG---TG-GATTAATGAGGA-TGA-A-TTT-G--AA---AA-GAAT-TA----A-AG-CAACATTTA--TTCAAG-TC---ATTG--AGCAGATGCT
gi|23 : atgataaaacctttttttttgAA--G-AG-A-CATAACTT-AT-G------------------ATGT--GGA-GTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT----T-GTGA---TA--GG---TG-GATTAATGAGGA-TGA-A-TTT-G--AA---AA-GAAT-TA----A-AG-CAACATTTA--TTCAAG-TC---ATTG--AGCAGATGCTatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|24 : atgataaaacctttttttttgCCAT-GCAAGATCTAG-TGATA----AA-CA-ACCTTGTATG-C----TGTTTT----A--A-AAAGAATAA-GG---TA----A-----CACTAATT---TA-------AGTTC-TTGAGTGGATGTTGAATAAAACAA-----AATTTT-ACAAT---AAA------GAG----GGGGC--ATAACTCATGT-TAC----------------AC--T-AC-ACA-------A---GA-C---TG--------AAATA-C---AAT---CCTGTGCAAGCTCTAA--TGAT---C---AGCAACCT---TGTGT-A-CA-A-ATC---T--------TAatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|25 : taA-GAG-TT-------TCAATCTCAT-ATACTGTCTAGATG-TA----AG-CA-ATC--ATATA-C----ATAC------A--ATAAATACTCA-GA---CA----G-----TAATACTT---TA---A---AGTTA-TTAAACGGGTGCTAATTAATATAT-----AA-TTT-ATAGTTA-AAAT-----A-------TGCC--ATAACTCATGC-ACA----------------AT--T-TA-ATA----TGTG---AAAT---TGAATTTTTAAAACG-C---AAT---CACATGCAAGta
gi|26 : gaacAAAATGG-GG-A-CATAACTT-A--A--TTA-T--TTA-AT-AAATTT--AAA-G-TGAGTTTCAATCCTATA-CAAGG---------G-GA---TA--AG---CA-ACCA--TGTGTATCAA-A-TTA-G--AG---AA-CAACAC-----A-G--CAACATGTT--TTCGAG-GT---ATTG--AGTGAATGTTGAACAAAAtag
gi|26 : ttatgtttgAAC--ATGTT-TTCGAGGTATTGAGTGAATGTTGAACAAAAAGAAAGTTTAagaaagtttagacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|27 : ttatgtttgaaaatggggacataacttaattatttaataaatttaaagtgagtttcaatcctatacaaggggataagcaaccatgtgtatcaaattagagaacaacacagcTA-TTGAGCGGATGTTATTTAAAATGC-----ATATTT-GCGGT---AAAC-----AAA-----GTGC--ATAAGTCTTGT-AAA----------------AT--TACGCACA----CGCGCCTGAAC---TG--------AATTA-CT--AAT---TCGGTGCTAAGCATTG--TGAT---A---AGCAACAT---CGTGT-A-C----ATT---T--------Tgacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|28 : gcactttgtcattcataatgataaacaacagtgttgacacaaAAAA--G-GG-G-AATAAGCC-AT-A--CAA-A--ATATATTATGTG---------TGACGTTTAATTCAAGT-CAAGGACT----T-GTGA---TA--AG---GA-GCGG--AATGTA-CT-----------AA---AA-TAAC-T-----AGGG-CAAAGTTTG--CTTGAG-AT---ATCA--AGAGGATGtat
gi|29 : a--AAAATCAG-CTAAT----A--TTTGTTT---GAGT------TATTGA---GCAGATG-TTAAA--TAAAA--------------------------------------A--G-GT-A-AATAGTTC-AT-G--TAA-A--TAA-AT-A--TGCTAGGA-GGTGAAATTCAATTTCATG-CAAGGTCA----A-ATAA---TA--AG---CA-ACTG--TGTGTA-CAA-A-TTT-G--AA---AT-GATT-C-----A-GG-TTATATTTG--TTgtacagggacgacgaatggatagtcatagaaactcacctattcatagaataaa
gi|3 : AAAGGGGCATAACTC-ACATTAA-AGTTT--A--GTGCG--GTG-TT-G-AAATTAAATGCCAT-GCAAGGTCTAG-------------CA-ACCATGTGTT-T-----GATTT----ATTA-AAA-AATCA-AGAAACA----A-----TT----GT---TC---G---ATTTA-TTGAGCAGATGTTGATTAAAATGT-----AGTTTT-AGCTT---AAA------AAT----GGCTC--CTAACTGATGT-AAA----------------GT--G-AA-ACA----TGCA---GAGC---TG--------AATTT-C---TAT---CACATGGAAGGTACTG--TAAT---A---AGCAACCT---TGTGT-ATCA-A---T---C--------GAAA---A--AAAATCAG-AAAAT----G--ATTGTTC---AAGT------TATTGG---GCAAATG-TT-AA--TAAAAAG-T---ACAGGT-T-AA-A----------------AAG--G-GG-C-CATAACTC-AT-G--TAA-A--ATT-TT-AGATGT--AGA-G----------ATCCCATG-CAAGCTCT----T-GTGA---TA--AG---GA-GTAA--TGTG-A-TTC-A-TTT-T--AA---A-------------------------TG--TTCAAG-TT---ACTG--AGCAGATGT
gi|30 : -C---AAT---TCAATGCAAG-----G--TGAC---A---AGCAGCCT---TATGT--------ATT---T----------AT---A--AGAATCGGAGAAAC----A--ATTGTTC---AAAT------TATTGT---GCAGATG-CTG-A--TAAAA-------A-CTTG-T-----TG---G---A----AAAAA--A-GC-A--ACAACT---------------TTG-A-----------GA-TATGAACTTCAGTCCAATG-CAAGCTCT----T-GTGA---TA--AG---aacatgtgggatgcacattgatgaaatttcaaaaacccatctattcataaaatag
gi|31 : t---TGTGT-A-CC-A---T---T--------TGAA---A--TGAATCAG-GTTTT----A--TTTGT-------GT------TATTTG---ACA-ATGATCGGG----AAGT--T---A-ATGA-T-AA-A----------------AAA--G-GA-A-CATAACCC-AT-G--TTA-A--TGA-AT-TCGTGT--GAC-GCTGAAATTCAATACCATT-CACGGTTT----A-ACGA---TA--AC---CA-ACTT--TG
gi|32 : AATCCCATA-C---GTCT----T-GTGG---TATTAG---GA-ATGC--TGTGTA-TCA-A-TTT-A--AA---AT-GAAA-T-----T-GG-CAATGTTTC--TT---G-TT---ATTG--AACctta
gi|33 : ---AAT---TCCATACAAGCTCTAGACGGGT---A---AGCAATTA---TGTGT-A-AA-A-ATC---T---------GAA---A--AGAATCGG-AAAATGTTTA--TTTGTAC---GAGC------AATTGA---GCGGACA-TTATA--TTAAACG-T---A-ATTT-T-AA-GTTT--T---A----TAAAA--T-GG-G-CATAaatattacatttgtgatgccaatgttaacaaattagtaatttcaaaagttcaccaattcataggatagccga
gi|34 : gaaacagacactaAAAAATGGGTTTTACTA-ATGTAAC-A--TG--T-TTTGTGCTGTG-TT-G-AAATTCATTCCCTT-GGAAGGTCTAG-TGACA----AG--A-GTATTGTGTA-A----CAATTT----A--A-AATGAATAT-GG---CT----ACATG-TG----TT---T----G---AGTTA-TTTAGTAGATATT
gi|35 : AAGGTTTTG-CGATA----GT-GA-ACATTTTGTA-C----AAGTTT----A--A-AATGCATAG-AG---CA----A-----CG----TT---T----G---AATTA-TTGAACGAATGacatgtggg
gi|36 : t-CAAGGTTT----T-GTGA---TA--AG---TA-ACAA--TATGTA-TCA-A-TTT-C--AAGTTAT-GGA-----------G-CAATGTTTG--TTTTAGATT---TTTG--AGCGGATTTTatataatttatgtttgacgtcgacaccagcgaatgggttattacaaaaacacacatagtcatacat
gi|37 : -----AAA----GGGGG--ATAACCCA----AAA----------------ATAAT-TG-ATA----TACG---GTGT---TG--------AAATT-CCAAAAT---CTAATGCAAGTTGTAG--TGAT---A---AGCAG-------GCGT-A-TA-CTATT---T--------TGGA---A--AGAATCAG-CCAAT----A--TGTGTTT---AAGT------TATTAA---Gacatgtgtgacggcgacggataggtgattgcaaaggctcacctactcatagaatatt
gi|38 : catataaTGC--GAT-GTTGAATTTCAATTTCATG-CAATGTCT----T-GTGA---TA--AA---AA-GCTT--TGTGTG-CCA-A-TT-----AA---AATTAAT-A-----G-GA-CAAGGTTTG--TTTAAT-TT---ATTG--AGCGGATATgaa
gi|39 : gtaacatttcgagaTGAATTTCAATCC-ATG-CAAGTTCT----T-TTGA---TAGGAG---TA-A-----TGTGCA-ACATA-TT-----AC---AA-TGAT-TACTAAA-GG-TAACAATT--------G-TT---ATTG--CACGGATGTcacatagtgaacgactga
gi|4 : tgaAAAAGAAGGGAGACAACTC-ATCTAA--A--TT--GTCATGTG--GAG-TTTGTAAATTCAATTCAAT-GCAATGTGATG-TGAT--------CA-AC--TGTATA-CGTTTAATTTT----G--A-AGAGAATTG-CG---CA----A-----TG----TTAGTTT---G---AGTTA-CCGAGCAGATATTAA--AAAATGT-----GCTTTTTACGAT---AAA------AAA----GGGAT--ATAACTCATGT-AAT----------------AT--T-AT-CCG----TG-A---AAGCCCTTC--------AAATA-T---AAT---CCTACACGAGTCCTAA--TGTT---G---AGCAACCG---GATAA-A-CA-A-ACTC--T--------TAAAT--A--AAAATCGC-ACAAT----A--TCTGTTA---AAAT------TATTAA---ACAGCTG-CTGAA--TAAAACG-G---A-AGTT-C----ATGT--T---T----TAAAA--A-AG-T-TGCA--TC-----------A--TTA-CT-ACGTTT--GGA-ACTGAAATTCAGCCTCATG-CGAA------------GA---CA--GG---TA-A--------------A-A-TTTCG--TA---AA-TGAG-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTTGCG-TT---ATAA--AAACAATGTTGATTAAAATGCAaacatgtgcaacaccaacaaatgggccaatacacgag
gi|40 : tata-CATAACTCTAC----TAA-T--TTA-AA-ACAGGT--AGA-GCTGAATTTCAACCATATG-CAAGGTCTAGTCTAGTGA---AA--AG---CA-ACCT--TGTGTA-CAA-A-TCT-GAAAA---AA-GGAT-C-----A-Ggttttaccagtaaat
gi|41 : tttagatttaaaaattacGAAATTCAATCTCGTG-AAAG---T----T-GTGAATACA--AG---CA-ATTT--TGTGTA-CCA-T-TTT-G--AA---Ac
gi|42 : tcagggcagataaaacctggcgcagtacattgattttttatacactgtgttaaaTG-TTGAT--TAAGATG-T---T-ATTT-T-A---CGCTTG---A----TCAA---G-AA-A-CATAACTC-AT-G--AAA-A--TTA-AT-ACGTGT--GGA-GCCGAATTTCAATCta
gi|43 : AAT-C-----A-AG-CAAGGAATG--TTTGAG-TT---ATTG--AACGGATGTTGATT--GATGCATTatttggacaatccattaataatca
gi|43 : atAATCA-AG---CA----AGGAA-TG----TT---T----G---AGTTA-TTGAACGGATGTTGATT--GATGC------ATTTT-AC-TT---AAA------AAA----TGGCC--TTAA---ATGA-AAT----------------AT--T-TG-Attacttaaaaaatggccttaaatgaaatatttgagatacaacattaa
gi|44 : at--TGTGTA-CTA-A-TTC-A--AA---AT-GAAT-A-----G-GG-CATCGTgatacaacattaa
gi|45 : T---TA---G---AGTTA-TTGAGCAGAT------TAAAATGC-----AATTTT-ATGGT---AAA------ATA----GTGGC--ATGACAGAGGT-AAA----------------CT--T-------------------------------------ACA-C---AAT---CCCATGCAAAGCCTAG--Tcattgatgttacatgcggagtgccaacggatgtgtgtacaaaacctcacctatcaaaactagtt
gi|46 : ttgT-GTAAGGTCAAG-TGATA----CG-CA-ACGT--TGTA-CTG--AAATTT----G--A-AAAGATTCG-G
gi|5 : A-GAG-TT-G-AAACGCCATCCTAC-ACAACGTCTGG-TAATT----AG-CA-ACCTTGTATA-T----ATATTT----G--ACAAAGAGTTGCAG---AA----ATTGATTG----CT---TA-------AGTTA-CTGAGCAGATGTTGAC----ATG----------TT-GC-------------------------GC--ATGACTCTTGT-AAA----------------AG--T-CA-GCG----TTTT---GAGC---TG--------AAATA-C---AAA---TCCATACAAAGTTAAC--TGAT---A---AGCTAC--------GT-C-CAGA-ATTACAT--------TAAACGCA--CGAAATGG-AGCAT----A-----GTTC---ATGTAAAATGTGTTGT---GCGGA-G-T------TAAGATG-C---A-ATCT-C-AA-ACAA--G---A----Tagtta
gi|5 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggcTT-ACATT---AAACGCACGAAAT---GGAGC--ATAGTTCATGT-AAA----------------AT--G-TG-TTG----TGCG---GAGT---TA--------AGATG-C---AAT---CTCAAACAAGAT---G--T----------AGCAACAT---TTTGT-G-GA-A-GAT---T--------GAAA---A--AG-GTAGG-ACAAT----A--CTTGTTC---GTAT------AACTGA---GAAGACA-TCGAA--gtagcaacattttgtggaagattgaaaaaggtaggacaatacttgttcgtataactgagaagacatcgaagatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggcagagttgaaacgccatcctacacaacgtctggtaattagcaaccttgtatatatatttgacaaagagttgcagaaattgattgcttaagttactgagcagatgttgacatgttgcgcatgactcttgtaaaagtcagcgttttgagctgaaatacaaatccatacaaagttaactgataagctacgtccagaaCAT-GCAGTGTCTAG-TGACA----AA-CA-TCCTTGTGTA-C----AACGTT------------------------------------TG----TT----A---G---AGTTA-TTAAGCGAATGTTAATCAAAATGC-----AATTTT-ATTGT---AAAT-----AAT----GGTGC--ATAACTTACATAAAA----------------AT--T-TG-gatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : attatatgg-AAATGCAATTTTATTGTAAA---TAA-TGGT------G-CATAACTTACATA-A----AAATTTGTGTA--A-AAAGAATCT-GG---CA----A-----TG----GT---CA---------TTAACTGAGTGGATGTTGAT-------C-----AGT------GAT---AAAT-----AAAACAAGGGCC--ATAACTCATGT-AAA----------------AT--T-GG-AGA----TGTG---GAGT---TT--------AATTT-C---AGT---CCTAAGCAAACTCGTG--TGAT---ACAGAGTAA------TGTGT-A-CC-A-A-T---C--------TAAA---A--TGAATAAG-GCAAC----A--TCTGTTT---AAGT------TAATGA---ATAGAT-----AA--T-ACATG-TTG-G-ACTC-C-AACAT-T--G---A----CAAAT--A-AG-A-TATAACtgtaaaaagaatctggcaatggtcattaactgagtggatgttgatcagtgataaataaaacaagggccataactcatgtaaaattggagatgtggagtttaatttcagtcctaagcaaactcgtgtgatacagagtaatgtgtaccaatctaaaatgaataaggcaacatctgtttaagttaatgaatagataatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|7 : attatatggcatgcagtgtctagtgacaaacatccttgtgtacaacgtttgttagagttattaagcgaatgttaatcaGGCTATTAAA---G-ATTATTTGAGTTATTGAGCGGCCCACAAATAAAACATAATTTTACATTATATAAAATGACA-GACCCTATGTAAAGA--AT--A-CAAGC-A-GAG-TT-G-AATTTCAATCCCAT-GCAAGGTCTGG-ATTTA----AG-CC-ACC-TGTGAA-C----AAATAT----ATGA-AAAGAATAG-GG---CT----A-----TA----TT---TATTGG---AGTTA-CTGTGTAGACATCGAACAATATGTAAAAAAAATTT-AGTCT---GAA------AAG----AGGGA--ATAACTCATGC-AAC----------------AT--T-CT-ATA----TGCA---GATT---TG--------AAATA-C---AAT---CACATACAAGGTCTAGAATTATTTAA---AGCAACAT---TGTGT-T-CA-A-ATT---T----------GA---A--ATAACTGT-ACAAA----A--TCTGTGC---AAGT------TATTGA---CTGAATG-TTGAA--aaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|8 : acTAAAAGAAGTGGCATAATCC-ATATAAT-T--TT--T-TAAGTG--GTG-TT-G-AAATTCATTCCAAA-GCAAGAAGTAT-TGATA----AG-TA-ACCTTGTATAGC----AG-TTT----G--A-AAAGAATCA-AG---CA----ACTTT-TG----GT---TT---G---AGCTA-TTGAGCAGATACTGAATAAAATGT-----AATTTC-ATGAT---GAAT-----AAG----GATTC--ATTGCT-ATGT-AAT----------------AT--T-AT-ACACAATTTCT---AGTC---TG--------AAATA-C---AAT---TCCAT--------TTG-----T---A---AGCAACATTACTGCAT-G-CACA-ATA---T--------TA-------------C------AT----T--TTTGTTT---AGGT------TATTGA---ACAGATG-TTAAA--TAAAAT--T---A-ATTT-T-A
gi|9 : AGTGGATGTTAAATAAAACATAAACTTAGGTTAAAAAAAG---CA--AATC-TTTTAAA-A--------CGAGTAA--AG-CT-G-TATATCAATCACAT-GCAATGATTAA-TGATA----AG-CA-ACCTTATGTA-C----AGATTT----T--G-AAATATACA-GG---CA----A-----TG----AC---TGTCCG---AGTAA-TTGAGCAGATGTTGTTTtgtttaaaacaaat
gi|9 : TCT----A-GTTA---TA--AG---CA-ATCG--TTTGTA-AAA-G-T---A--AA---AA-TAAT-C-----A-TG-CGAAGACTG--TTCTTG-TT---ATTGATATCGGATGCTGATGTAAATGCttgttatttgtatttataaaagggggtatgaaacaactacattttccagtttctagttataagcaatcgtttgtaaaagtaaaaataatcatgcgaagactgttcttgttattgatatcggatgctgatgtaaatgcccttttagt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|47 ): TGGGATGCCAACAAATGGGTAAAACGAAAACTCACCTATTCATAAAATAA
Unaligned ( gi|48 ): AGCTAAATTGTATTGTATATTATCTTTTAAAATATAAA
Unaligned ( gi|49 ): CTGAGTTATAAAGTGGGAATAACTCGTGCACAAATT
Alignments
lowQualScore : 33333 333333333333333333 1111111 1111111 2222222222222222222222222 111111 11111111111111 11111111111111111111 11111111 6666666666666666666666666666666666 333333333333333333333 11111 1111111
lowQualScore : 1 33333 7 1 1 3 4 4 77 3 5 2 555555555555555555 1 4 777 2 0 0 2 0 5555 2 2 4 0000000 6666666 4 1 33 333 4444 9999999999999999999999999 1 0 22 666666 2 1 999 555 999999 55555 33 2 9999999999999999999 44444444444444 555555555555 44444444 22 333 222 0 2 2 33 222 222 77777 222 11111111111111111111 555 66666 33333333 555555 3333 1 444444 0 1 22 0000000000000000000000000000000000 22 2 2 2 2 333333333333333333333 333 2 2 0 3 4 999999 333 55 4444 1 77777 1 777 1 1 77777 22 3333333 2 33 444 444 444 33 6
lowQualScore : . ..... . . . . . . .. . . . .................. . . ... . . . . . .... . . . ....... ....... . . .. ... .... ......................... . . .. ...... . . ... ... ...... ..... .. . ................... .............. ............ ........ .. ... ... . . . .. ... ... ..... ... .................... ... ..... ........ ...... .... . ...... . . .. .................................. .. . . . . ..................... ... . . . . . ...... ... .. .... . ..... . ... . . ..... .. ....... . .. ... ... ... .. .
lowQualScore : 0 00000 3 0 0 7 5 2 99 4 0 2 444444444444444444 2 0 555 5 7 2 4 8 0000 4 4 4 9999999 2222222 4 4 33 777 5555 2222222222222222222222222 7 2 11 555555 5 7 222 000 000000 11111 33 7 0000000000000000000 99999999999999 333333333333 88888888 88 444 222 9 9 3 44 333 333 00000 888 77777777777777777777 999 66666 88888888 666666 5555 5 333333 9 3 99 8888888888888888888888888888888888 88 0 1 0 2 111111111111111111111 666 1 9 9 8 3 222222 222 00 1111 9 44444 2 000 8 8 22222 22 0000000 1 33 111 333 444 44 0
consensus : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGGTATTGAGCGGATGNTGAATAAAACATAANTTTACGTTAAAAAAAGGGACATAACTC-ACGTAAA-A--TT--A-CGNGTGAGAG-TT-G-AAATTCAATCCCAT-GCAAGGTCTAG-TGATA----AG-CA-ACCTTGTGTA-C----ANATTT----G--A-AAAGAATCG-GG---CA----A-----TG----TT---TA---G---AGTTA-TTGAGCGGATGTTGATTAAAATGC-----AATTTT-ACGGT---AAAT-----AAA----GGGGC--ATAACTCATGT-AA--A----------------AT--T-NG-ACG----TGCG---GAGC---TG--------AAATN-C---AAT---CCCATGCAAGGTCTNG--TGAT---A---AGCAACNT---TGTGT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--AG-AATCGG-GC--AA-T----ATTTGTTC---GAG-T------TATTGAGCGGATGTTGAA--TAAAATG-T---A-ATTT-T-AA-ATGC--G---A----TAAAA--G-GG-A-CATAACTC-AT-G--TAA-A--TTA-ATA-ATGC--GGA-GCTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT--T---GTGA---TA--AG---CA-ACCT--TGTGTA-CNA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-C-----AGG-CAACGTTTG--TTCGAGTT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
Reference ( family-148 ) : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGGTATTGAGCGGATGNTGAATAAAACATAANTTTACGTTAAAAAAAGGGGCATNACTC-ACGTAAN-A--TT--A-CGTGTGAGAG-TT-G-AAATTCAATCCCAT-GCAAGGTCTAG-TGATA----AG-CA-ACCTTGTGTA-C----ANATTT----A--A-AAAGAATCG-GG---CA----A-----TG----TT---TA---G---AGTTA-TTGAGCGGATGTTGATTAAAATGC-----AATTTT-ACGGT---AAAT-----AAA----GGGGC--ATAACTCATGT-AA--A----------------AT--T-NG-ACG----TGCG---GAGC---TG--------AAATN-C---AAT---CCCATGCAAGGTCTNG--TGAT---A---AGCAACNT---TGTGT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--AG-AATCGG-GC--AA-T----ATTTGTTC---GAG-T------TATTGAGCGGATGTTGAA--TAAAATG-T---A-ATTT-T-AA-ATGC--G---A----TAAAA--G-GG-A-CATAACTC-AT-G--TAA-A--TTA-ATACGTGC--GGA-GCTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT--T---GTGA---TA--AG---CA-ACCT--TGTGTA-CNA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-C-----AGG-CAACGTTTG--TTCGAGTT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
gi|1 : AAAAAGGGACATTACTC-ACACAGA-A--TTTTA-T-TATG-GTG-TT---AAATTCAAACCCAT-GCAAGATCTTG-TGATATACAAC-CA-ACCTTGTGTGTC----AT-TTT----G--A-AAAAAATCA-GG---TAGCACA-----TA----TT---C----G---TGTTA-TGGAGTTGA-GTTGAATAAAAT-------AATTTT-AC-------AAT-----TAA--------C--TTAAT--ATGC-AG--G----------------A--------ACA----TATT---G------TG--------CAA-------GAT---CCCATGCAAGGTCTTA--TGAT---G---AGCAACC----------A-CA-A-ACT---T-----------A---A--AT-AATCAA-AC--AA-A----GTTTGTTC---AAG-T------TCTGTAGCGGATGTTGAT--TAAAATA-C---A-ATTT-T----ATG---GTAAA----TAAAG--G-GGCA-CATAA----AG-GGTCAA-A--TTA-G-ACATGC--CAG-CCTGAA-ATCAATCCCATG-CAAAGTCT--G---GTGT---TA--GT---CA-ACCT--TGT-T--CAA-A-CTT-G--AGA
gi|1 : ggcaaaccA--A----------------AC--T-TG-AGA----TACG---GAGT---TG--------AATTT-T---AAT---CCAATGCAAGAT-TTG--TGAT---A---AGTGGCAA---TGTATGG-CA-A---T---T--------TAAA---A--TA-AGTAGG-GC--TT-T----ATTTGTTC---AAG-A------AAATCTGTGGATGTTtacggagttgaattttaatccaatgcaagatttgtgataagtggcaatgtatggcaatttaaaataagtagggctttatttgttcaagaaaatctgtggatgttacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|10 : ggcaaaccaaaaagggacattactcacacagaattttattatggtgttaaattcaaacccatgcaagatcttgtgatatacaaccaaccttgtgtgtcattttgaaaaaaatcaggtagcacatattcgtgttatggagttgagttgaataaaataattttacaattaacttaatatgcaggaacatattgtgcaagatcccatgcaaggtcttatgatgagcaaccacaaacttaaataatcaaacaaagtttgttcaagttctgtagcggatgttgattaaaatacaattttatggtaaataaaggggcacataaagggtcaaattagacatgccagcctgaaatcaatcccatgcaaagtctggtgttagtcaaccttgttc-G-AATTTCAATCTCAG-GCTAGGTACAG-TATTA----AG-CA-ACATTGTGTA-T----ATATTT----C--A-TAATAACCA-AG---AA----A-----TG----AC---TG---ACCAAGTTG-TTGAGTGGCTATCGATAAAAATTC-----ATTTTT--TGTT---AAAA-----AAA----GGGCC--ATAACTCACGT-AA--A----------------AT--T-TG-AGA----TGTG---GAGT---TG--------AACTT-C---AAT---CCCATACAAGCCTTAG--TGAT---A---AGGAGTAA---TGTGT-T-CT-A-A-T---T--------TAAA---ACGAA-AAT--G-TC--TA-C----ATGTATCC---AAG-T------TATTGAGCAGATGTacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|11 : T---AAA------AAG----GGGAC--ACATCTAGTTC-AA--A----------------AT--T-TG-ATG----TGCG---GTGC---TG--------AAATT-C---AAT---TCCATGTAAAGTCTAG--GGTT---G---AGCATCCT---TGTGT-A-CT-A--TT---T--------TAAA---A--AG-AATCA---C--AAAT----ATTTATTCACTGAG-T------TATTGAGCAAA------A--CAAAA-------A-ATT-------ATGTT-A---A----TAAAA--G-GC-AGTAAAATTC-AT-A--TAACA--TTACATATGTAT--GC---CTGAAATACTATCCCATG-CAAGGTCT--A---ATGA---GA--AT---CA-ACCT--TGTGCA-TAA-A-TTT-G--ATAA-GAAT-C-----ATG-CAACATTT--------GTT---ATTA--AGTGGAaacatgccggacggcaattaatggagcattataaaagctcacctactcaaaga
gi|12 : acacaGGC--ATAACTCGTGT-AA--A----------------AT--T-AA-ACA----TGTG---GAGC---TG--------AAATG-C---AAT---CCGATGCATAGTCTAG--TGAT---A---CACAACGT---TGTCT-C-CA---------T--------TAA-------------C----------T----ATTTGTAC---GAG-T------TACTGAAAGGAAGTCGTA--TAAAACA-T---A-AACT-G-A----GT--G---A----T-----------A-CTTA-----AT-A--TAA-A--TGT-CTATGTGC--GGA-GCTGAACTGCAAGCCAATA-CACAGTGT--A---GTGA---TT--TG---CA-ATCA--TGTGTA--------------GAAA-GAAT-C-----GGA-CAA--TATGACTTCGAATA---AATG--AGCGGctcagtggagtggata
gi|13 : aAG-T------CATTGAACAGATGTTCA---TAAAATGGT---G-GGTG-T-G----GC--G---AGGGTTAAAA--AAGG-C-CATTACTC-GT-G--TAATA--TTG-AGA--TGC--TGA--CTTCATTTCAATCCAGTG-TAAACTCT--A---GTAA---TA--AGGGCTA-A-----TGTGTA-CCA-AATTT-G--AAAT-GAAT-A-----GGG-AAACATTTG--TTCCAGTT---ATTG--ATGGGATGTTtctgtccgccagcccgtacaaactgcgataaaata
gi|14 : aAATCCCAT-GTGATGTTTAC-TATTA----AA-CA-ACCTGATGTA-C----ATATAT----G--A-AAATAATTA-GG---AA----A-----CG----TT---TG-----------A-TTGAGCAGATACTAATTAAAATGT-----A--TTT-GTTGTTTAAAATTAA--AAA----AGACC--ATGACTCATG--AA--A----------------AT--T-TG-ACC----AATA---GAGT---TG--------AAATA-C---ATC---TTTTTGCATGGTCCTG--GGAT---A---AGGAAC-T---TACA--A-CA-A-ATA---T--------GAAA---A---------------------------TGTTC---GAT-T------CATTGAGCGAATGTTacatgtgagattctgataacaaaagtacatctatgtacagaatagtctggaaaactaaaaaatgttaatgatttgttaaatataaagttccagactaaa
gi|15 : ataaAATAATCG-AG---CA----A-----TG----AT---TATTCG---AGGTA-TTTAGCGAAAGTTGATTAAAATGC-----A--TTT-AAGTT---AAAT-----AAA----ATAGCC-ATAACTCACGT-AC--A----------------AT--T-TA-ATG----TGCA---GTGT---TA--------AATTT-C---AAT---ACCATGTAAGGT-TTG--TCAT---A---AGGAACAC---TGTGT-G-CA-A-A-T---T--------TAAA---A--TG-AATGGG-CC--AG-G----GTTTGTTT---GAG-T------GGTCTGGCAAATGTTacatgtggcattccaatgtggacaaagctcacatgttcatagattaa
gi|16 : TGATTAAAATGT-----TATTTT-TTGGT---AAAT-----AAA---------------------------------------------T--T-AG-GC---------------C---TA--------AAATA-C---A-T---CTCATGCAAAACCTAG--TGAT---A---AGCAAAAT---TATGT-T-CA-A-ATC---TA-------TAAATG-A--TG-AA---------AA-A----ATGTATT--------T------TATTG---TAATATTAAATTTCAGATG-TGG-A-ATTT-C--A-ATGC--C---A----TGCAA--G-acattttgggcgtcgacgccgacgaatatgtcattccaaaagcagctcaactatccatagaatagt
gi|16 : ATG-TTCAA-ATCTAT-AA-ATG-------A----TGAAA--A-A--A-TGTATTTT-ATTG--TAATA--TTA-A-ATTT-C--AGATGTGGAATTTCAATGCCATG-CAAGTTCT--T---GTAA---TA--AG---GA-A-TG--TGTGTA-CTA-A--TT-A--AAAA-TAAA-A-----GGG-TAAAATTTG--CTCAAATT---ATTG--AGTGGATATTttcttgtaataaggaatgtgtgtactaattaaaaataaaagggtaaaatttgctcaaattattgagtggatattacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|16 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattTGT-AA--T----------------AT--T-AA-ATT----T-CA---GATG---TG--------GAATTTC---AAT---GCCATGCAAGTTCTTG--TAAT---A---AGGAATGT----GTGT-A-CT-A-ATT-------------AAA---A--AT-AAAAGG-GT--AA-A----ATTTGCTC---AAA-T------TATTGAGTGGATATTacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|17 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattatgttcaaatctataaatgatgaaaaaatgtattttat-ACG----TGTG---AAGT---CA--------AACTT-C---AAT---CAAATGAAAGGTCTTT--TGAC---A---AGCAAACT---TGTGT-A-TC-A-ATT---T----------AA---G--AG-GATCAG-GC--AG-C----AATTGTTC---AAG-T------AACAGAGTGGACGCTGAT--TAAAATG-C---A-AT-------------------------AAG--G-AG-A-CACAACTC-A------AG-A--T-------------GGG-GTTTTGTTTCAATCCGATG-CAAGGTGT--T---GTGA----A--AG---GATACAC--AATGGA-CTT-A-TTT-------A-AAAT-A-----AGGTCAATGTTTG--TTacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|18 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaaaagtaaataaacT---AAAA-----AAA----GGAAC--ATAACTCATG--AA--A----------------AT--T-A--ACAGA--TGCA---GAGC---TG--------AATTT-C---ATT---CCC------------G--AGAT---T---AGCAACCT---TGTAT-A-TA-C-ATT---TCTTTTAGTTAAA---A--AA-AA
gi|18 : AAAA--G-GA-A-CATAACTC-AT-G--AAA-A--TTA-ACAGATGC--AGA-GCTGAATTTCATTCCC------------------GAGA---TT--AG---CA-ACCT--TGTATA-TAC-A-TTT-aagggacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|18 : taaaAAAA--G-GG-A-CATAACTT-GG-G--TAA-AATTTG-AGA--TGA--GGA-GTTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT---------------------------CT--CG-------------------AAA-G----------AGG-CTACACTTG--TTTGAGTT---ATTG--AGcttttagttaaaaaaaaaagggacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|19 : taaaaaaaggaacataactcatgaaaattaacagatgcagagctgaatttcattcccgagattagcaaccttgtatatacatttcttttagttaaaaaaTA-TTGAGGTGATGTTGAAAAAAATGC-----ACTTTT-GCAGT---AAA------AAA----GGGGCCAAAAAAACATGT-AA--A----------------AT--A-TG-AGG----TGCA---GAGT---TG--------AAATT-T---AAT---CCTATGCAAACACTTG--TTAT---A---AGGTGTAT---TGTGC-A-TG-A-A-T---T--------CAAA---A--TG-AAT-AG-GCAAAA-C----ATTTGTTC---acattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|2 : GACTAGTAAATCTGTATTATTCAAGGCATTGAGCAAATGATGATTAAAACATAATTTTATGGTAACTAAAGGGACTTTATTA-ATGTAAC-A--TT--A-CATGTGAGAGACT-G-AGATACAATCCCAT-GCAAAGTCTAG-TGATA----AG-CA-ACCTTGTGTA-T----ACATTC----A--A-AAAGAATCA-AA---CA----A-----TG----TT---AA---G---AATTA-TTGAGTGGATATTCATTAAAGTGC-----AATTCT-ATGGC---AAAT-----AAA----GTGGC--ATAAGTCTGGT-AA--A----------------AT--T-AG-ACA----TGCA---AGCC---TG--------AAATA-C---AAT---CCCAAGCAATGTATTA--TGAT---A---AGCAGACT---AGTAT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--AA-AGTCAC-CA--AA-T----ATTTGTTA---TAG-T------GTTTGAGC-ACTGTTGAA--TTAAATG-C---T-ATTT-TAAA-ATGC--A---A----TAAAA--G-AG-A-CATAACTC-AA-G--TAA-A--TTA-ATACATAC--ACA-GCTGAATTTTAATCCCATG-CAAGGTCT--T---GTGA---TA--AG---CA-ATCT--TGTGAA-AAG-G-TTT-A--AAAA-GGAT-C-----AGG-AAAGGATTA--CTCATGTTATAATTG--ATCAGATGTTGATTAAAATGCATTcattaacaaaattaatattacagttgtgtgggatgccgacaccactgaatggggtattacaaaaactcaactattcatagaataatc
gi|20 : AAAAAAAGAGCCATAA----ACGTTGT-A--TT----CG-GTG-----TT-A-AAATTCCATCCCAT-ACAAGGTGTAG-TTAAA----AATCA-ACCTTGTGTA-C-----CATTTTA--A--A-AAAGAATCG-GG---CA----A-----CG----TT---TA---TTTTAGTTA-TTTGGCA-ATATTGATAAAAA--------AAT----ATGAT---AAAT-----AAA----GGGGC--ATAACTCGTGT-TA--C----------------AT-------ACC----TATG---AGTC---TG--------AAATG-C---AATCCGCCCATGCAAAGCCTAA--TGA----A---AGAAACAT---TGTGT-A-CA-C-ATT---T--------GAAA---c
gi|21 : ta----TT---TA---A---AATTA-TTGAGCAAATGTTGATTAAAATGC-----AATTTA-ATGAT---AAAT-----AAA----GGGGT--ATAACTCATGT-TA--ATATATGTATATCATGTATA-T-AT-ACC----TGCA---AGCC---TG--------AAATA-C---AAT---CCCATGTGAGGTGTTG--AAAT---A---AGCAGCTT---TGTGA-A-TA-A---T---T--------TACA---A--AG-AGTCAC-GC--AG-T----ATTTATAA---GAG-T------TATTGAACAGATATTGAA--TAAAATA-T---A-ATTT-
gi|22 : agttgcaaatttaacatattaaaacatatAA--G-AG-A-CATAACTT-AT-G-----------------ATGT--GGA-GTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT--T---GTGA---TA--GG---TG-GATTAATGAGGA-TGA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-TA----AAG-CAACATTTA--TTCAAGTC---ATTG--AGCAGATGCT
gi|23 : atgataaaacctttttttttgAA--G-AG-A-CATAACTT-AT-G-----------------ATGT--GGA-GTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT--T---GTGA---TA--GG---TG-GATTAATGAGGA-TGA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-TA----AAG-CAACATTTA--TTCAAGTC---ATTG--AGCAGATGCTatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|24 : atgataaaacctttttttttgCCAT-GCAAGATCTAG-TGATA----AA-CA-ACCTTGTATG-C----TGTTTT----A--A-AAAGAATAA-GG---TA----A-----CACTAATT---TA-------AGTTC-TTGAGTGGATGTTGAATAAAACAA-----AATTTT-ACAAT---AAA------GAG----GGGGC--ATAACTCATGT-TA--C----------------AC--T-AC-ACA-------A---GA-C---TG--------AAATA-C---AAT---CCTGTGCAAGCTCTAA--TGAT---C---AGCAACCT---TGTGT-A-CA-A-ATC---T--------TAatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|25 : taAGAG-TT-------TCAATCTCAT-ATACTGTCTAGATG-TA----AG-CA-ATC--ATATA-C----ATAC------A--ATAAATACTCA-GA---CA----G-----TAATACTT---TA---A---AGTTA-TTAAACGGGTGCTAATTAATATAT-----AA-TTT-ATAGTTA-AAAT-----A-------TGCC--ATAACTCATGC-AC--A----------------AT--T-TA-ATA----TGTG---AAAT---TGAATTTTTAAAACG-C---AAT---CACATGCAAGta
gi|26 : gaacAAAATGG-GG-A-CATAACTT-A--A--TTA-T--TTA-ATAAATTT--AAA-G-TGAGTTTCAATCCTATA-CAAGG---------G-GA---TA--AG---CA-ACCA--TGTGTATCAA-A-TTA-G--AGAA-CAACAC-----AG--CAACATGTT--TTCGAGGT---ATTG--AGTGAATGTTGAACAAAAtag
gi|26 : ttatgtttgAAC--ATGTT-TTCGAGGTATTGAGTGAATGTTGAACAAAAAGAAAGTTTAagaaagtttagacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|27 : ttatgtttgaaaatggggacataacttaattatttaataaatttaaagtgagtttcaatcctatacaaggggataagcaaccatgtgtatcaaattagagaacaacacagcTA-TTGAGCGGATGTTATTTAAAATGC-----ATATTT-GCGGT---AAAC-----AAA-----GTGC--ATAAGTCTTGT-AA--A----------------AT--TACGCACA----CGCGCCTGAAC---TG--------AATTA-CT--AAT---TCGGTGCTAAGCATTG--TGAT---A---AGCAACAT---CGTGT-A-C----ATT---T--------Tgacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|28 : gcactttgtcattcataatgataaacaacagtgttgacacaa-----AAA----GGGGA--ATAAGCCATAC-AA--A----------------AT--A-TA-TTA----TGTG----------TG--------ACGTT-T---AAT---TCAAGTCAAGGACTTG--TGAT---A---AGGAGCGG---AATGT-A-C-------------------TAAA---A--TA-ACTAGG-GC--AA-A----GTTTGCTT---GAG-A------TATCAAGAGGATGtat
gi|29 : aa--AA-AATCAG-CT--AA-T----ATTTGTTT---GAG-T------TATTGAGCAGATGTTAAA--TAAAA--------------------------------------A--G-GT-A-AATAGTTC-AT-G--TAA-A--TAA-ATA--TGCTAGGA-GGTGAAATTCAATTTCATG-CAAGGTCA--A---ATAA---TA--AG---CA-ACTG--TGTGTA-CAA-A-TTT-G--AAAT-GATT-C-----AGG-TTATATTTG--TTgtacagggacgacgaatggatagtcatagaaactcacctattcatagaataaa
gi|3 : AAAGGGGCATAACTC-ACATTAA-AGTTT--A--GTGCG-GTG-TT-G-AAATTAAATGCCAT-GCAAGGTCTAG-------------CA-ACCATGTGTT-T-----GATTT----ATTA-AAA-AATCA-AGAAACA----A-----TT----GT---TC---G---ATTTA-TTGAGCAGATGTTGATTAAAATGT-----AGTTTT-AGCTT---AAA------AAT----GGCTC--CTAACTGATGT-AA--A----------------GT--G-AA-ACA----TGCA---GAGC---TG--------AATTT-C---TAT---CACATGGAAGGTACTG--TAAT---A---AGCAACCT---TGTGT-ATCA-A---T---C--------GAAA---A--AA-AATCAG-AA--AA-T----GATTGTTC---AAG-T------TATTGGGCAAATGTT-AA--TAAAAAG-T---ACAGGT-T-AA-----------------AAAG--G-GG-C-CATAACTC-AT-G--TAA-A--ATT-TTAGATGT--AGA-G----------ATCCCATG-CAAGCTCT--T---GTGA---TA--AG---GA-GTAA--TGTG-A-TTC-A-TTT-T--AAA------------------------TG--TTCAAGTT---ACTG--AGCAGATGT
gi|30 : -C---AAT---TCAATGCAAG-----G--TGAC---A---AGCAGCCT---TATGT--------ATT---T----------AT---A--AG-AATCGGAGA--AA-C----AATTGTTC---AAA-T------TATTGTGCAGATGCTG-A--TAAAA-------A-CTTG-T-----TG---G---A----AAAAA--A-GC-A--ACAACT---------------TTG-A----------GA-TATGAACTTCAGTCCAATG-CAAGCTCT--T---GTGA---TA--AG---aacatgtgggatgcacattgatgaaatttcaaaaacccatctattcataaaatag
gi|31 : tTGTGTA-C-----CATTT----G--A-AATGAATCA-GG---TT----T-----TA----TT---T----G---TGTTA-TTT----GACAATGATCG----GG-----AAGTTA-ATGAT---AAA------AAA----GGAAC--ATAACCCATGTTAATGA----------------AT--T-----CG----TGTG---ACGC---TG--------AAATT-C---AAT---ACCATTCACGGTTTAA--CGAT---A---ACCAACTT---TG
gi|32 : AATCCCATA-C---GTCT--T---GTGG---TATTAG---GA-ATGC--TGTGTA-TCA-A-TTT-A--AAAT-GAAA-T-----TGG-CAATGTTTC--TT---GTT---ATTG--AACctta
gi|33 : ---AAT---TCCATACAAGCTCTAGACGGGT---A---AGCAATTA---TGTGT-A-AA-A-ATC---T---------GAA---A--AG-AATCGG-AA--AA-TGTTTATTTGTAC---GAG-C------AATTGAGCGGACATTATA--TTAAACG-T---A-ATTT-T-AA-GTTT--T---A----TAAAA--T-GG-G-CATAaatattacatttgtgatgccaatgttaacaaattagtaatttcaaaagttcaccaattcataggatagccga
gi|34 : gaaacagacacta-----AAA----TGGGT--TTTACTAATGT-AA--C----------------AT--G-TT-TTG----TGCT---GTGT---TG--------AAATT-C---ATT---CCCTTGGAAGGTCTAG--TGAC---A---AG-AGTAT---TGTGT-AACA-A---T---T--------TAAA---A--TG-AATATG-GC--TA-C----ATGTGTTT---GAG-T------TATTTAGTAGATATT
gi|35 : aaAAGGTTTTG-CGATA----GT-GA-ACATTTTGTA-C----AAGTTT----A--A-AATGCATAG-AG---CA----A-----CG----TT---T----G---AATTA-TTGAACGAATGacatgtggg
gi|36 : tCAAGGTTTTG--TGAT---A---AGTAACAA---TATGT-A-TC-A-ATT---T--------C------A--AGTTATGGA-GC--AA-T----GTTTGTTT---TAGAT------TTTTGAGCGGATTTTatataatttatgtttgacgtcgacaccagcgaatgggttattacaaaaacacacatagtcatacat
gi|37 : -----AAA----GGGGG--ATAACCCA----AA--A----------------ATAAT-TG-ATA----TACG---GTGT---TG--------AAATT-CCAAAAT---CTAATGCAAGTTGTAG--TGAT---A---AGCAG-------GCGT-A-TA-CTATT---T--------TGGA---A--AG-AATCAG-CC--AA-T----ATGTGTTT---AAG-T------TATTAAGacatgtgtgacggcgacggataggtgattgcaaaggctcacctactcatagaatatt
gi|38 : catataaTGC--GAT-GTTGAATTTCAATTTCATG-CAATGTCT--T---GTGA---TA--AA---AA-GCTT--TGTGTG-CCA-A-TT-----AAAATTAAT-A-----GGA-CAAGGTTTG--TTTAATTT---ATTG--AGCGGATATgaa
gi|39 : gtaacatttcgagaTGAATTTCAATCC-ATG-CAAGTTCT--T---TTGA---TAGGAG---TA-A-----TGTGCA-ACATA-TT-----ACAA-TGAT-TACTAAAGG-TAACAATT--------GTT---ATTG--CACGGATGTcacatagtgaacgactga
gi|4 : tgaAAAAGAAGGGAGACAACTC-ATCTAA--A--TT--GTCATGTG-GAG-TTTGTAAATTCAATTCAAT-GCAATGTGATG-TGAT--------CA-AC--TGTATA-CGTTTAATTTT----G--A-AGAGAATTG-CG---CA----A-----TG----TTAGTTT---G---AGTTA-CCGAGCAGATATTAA--AAAATGT-----GCTTTTTACGAT---AAA------AAA----GGGAT--ATAACTCATGT-AA--T----------------AT--T-AT-CCG----TG-A---AAGCCCTTC--------AAATA-T---AAT---CCTACACGAGTCCTAA--TGTT---G---AGCAACCG---GATAA-A-CA-A-ACTC--T--------TAAAT--A--AA-AATCGC-AC--AA-T----ATCTGTTA---AAA-T------TATTAAACAGCTGCTGAA--TAAAACG-G---A-AGTT-C----ATGT--T---T----TAAAA--A-AG-T-TGCA--TC-----------A--TTA-CTACGTTT--GGA-ACTGAAATTCAGCCTCATG-CGAA------------GA---CA--GG---TA-A--------------A-A-TTTCG--TAAA-TGAG-C-----AGG-CAACGTTTG--TTTGCGTT---ATAA--AAACAATGTTGATTAAAATGCAaacatgtgcaacaccaacaaatgggccaatacacgag
gi|40 : tata-CATAACTCTAC----TAA-T--TTA-AAACAGGT--AGA-GCTGAATTTCAACCATATG-CAAGGTCTAGTCTAGTGA---AA--AG---CA-ACCT--TGTGTA-CAA-A-TCT-GAAAAAA-GGAT-C-----AGgttttaccagtaaat
gi|41 : tttagatttaaaaattacGAAATTCAATCTCGTG-AAAG---T--T---GTGAATACA--AG---CA-ATTT--TGTGTA-CCA-T-TTT-G--AAAc
gi|42 : tcagggcagataaaacctggcgcagtacattgattttttatacactgtgttaaaTGTTGAT--TAAGATG-T---T-ATTT-T-A---CGCTTG---A----TCAA---G-AA-A-CATAACTC-AT-G--AAA-A--TTA-ATACGTGT--GGA-GCCGAATTTCAATCta
gi|43 : AAT-C-----AAG-CAAGGAATG--TTTGAGTT---ATTG--AACGGATGTTGATT--GATGCATTatttggacaatccattaataatca
gi|43 : atAATCA-AG---CA----AGGAA-TG----TT---T----G---AGTTA-TTGAACGGATGTTGATT--GATGC------ATTTT-AC-TT---AAA------AAA----TGGCC--TTAA---ATGA-AA--T----------------AT--T-TG-Attacttaaaaaatggccttaaatgaaatatttgagatacaacattaa
gi|44 : at--TGTGTA-CTA-A-TTC-A--AAAT-GAAT-A-----GGG-CATCGTgatacaacattaa
gi|45 : T---TA---G---AGTTA-TTGAGCAGAT------TAAAATGC-----AATTTT-ATGGT---AAA------ATA----GTGGC--ATGACAGAGGT-AA--A----------------CT--T-------------------------------------ACA-C---AAT---CCCATGCAAAGCCTAG--Tcattgatgttacatgcggagtgccaacggatgtgtgtacaaaacctcacctatcaaaactagtt
gi|46 : ttgT-GTAAGGTCAAG-TGATA----CG-CA-ACGT--TGTA-CTG--AAATTT----G--A-AAAGATTCG-G
gi|5 : AGAG-TT-G-AAACGCCATCCTAC-ACAACGTCTGG-TAATT----AG-CA-ACCTTGTATA-T----ATATTT----G--ACAAAGAGTTGCAG---AA----ATTGATTG----CT---TA-------AGTTA-CTGAGCAGATGTTGAC----ATG----------TT-GC-------------------------GC--ATGACTCTTGT-AA--A----------------AG--T-CA-GCG----TTTT---GAGC---TG--------AAATA-C---AAA---TCCATACAAAGTTAAC--TGAT---A---AGCTAC--------GT-C-CAGA-ATTACAT--------TAAACGCA--CGAAATGGA-GC---A-T----A---GTTC---ATG-TAAAATGTGTTGTGCGGA-GT------TAAGATG-C---A-ATCT-C-AA-ACAA--G---A----Tagtta
gi|5 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggcTT-ACATT---AAACGCACGAAAT---GGAGC--ATAGTTCATGT-AA--A----------------AT--G-TG-TTG----TGCG---GAGT---TA--------AGATG-C---AAT---CTCAAACAAGAT---G--T----------AGCAACAT---TTTGT-G-GA-A-GAT---T--------GAAA---A--AG--GTAGG-AC--AA-T----ACTTGTTC---GTA-T------AACTGAGAAGACATCGAA--gtagcaacattttgtggaagattgaaaaaggtaggacaatacttgttcgtataactgagaagacatcgaagatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggcagagttgaaacgccatcctacacaacgtctggtaattagcaaccttgtatatatatttgacaaagagttgcagaaattgattgcttaagttactgagcagatgttgacatgttgcgcatgactcttgtaaaagtcagcgttttgagctgaaatacaaatccatacaaagttaactgataagctacgtccagaaCAT-GCAGTGTCTAG-TGACA----AA-CA-TCCTTGTGTA-C----AACGTT------------------------------------TG----TT----A---G---AGTTA-TTAAGCGAATGTTAATCAAAATGC-----AATTTT-ATTGT---AAAT-----AAT----GGTGC--ATAACTTACATAAA--A----------------AT--T-TG-gatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : attatatgg-AAATGCAATTTTATTGTAAA---TAA-TGGT------G-CATAACTTACATA-A----AAATTTGTGTA--A-AAAGAATCT-GG---CA----A-----TG----GT---CA---------TTAACTGAGTGGATGTTGAT-------C-----AGT------GAT---AAAT-----AAAACAAGGGCC--ATAACTCATGT-AA--A----------------AT--T-GG-AGA----TGTG---GAGT---TT--------AATTT-C---AGT---CCTAAGCAAACTCGTG--TGAT---ACAGAGTAA------TGTGT-A-CC-A-A-T---C--------TAAA---A--TG-AATAAG-GC--AA-C----ATCTGTTT---AAG-T------TAATGAATAGAT----AA--T-ACATG-TTG-G-ACTC-C-AACAT-T--G---A----CAAAT--A-AG-A-TATAACtgtaaaaagaatctggcaatggtcattaactgagtggatgttgatcagtgataaataaaacaagggccataactcatgtaaaattggagatgtggagtttaatttcagtcctaagcaaactcgtgtgatacagagtaatgtgtaccaatctaaaatgaataaggcaacatctgtttaagttaatgaatagataatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|7 : attatatggcatgcagtgtctagtgacaaacatccttgtgtacaacgtttgttagagttattaagcgaatgttaatcaGGCTATTAAA---G-ATTATTTGAGTTATTGAGCGGCCCACAAATAAAACATAATTTTACATTATATAAAATGACA-GACCCTATGTAAAGA--AT--A-CAAGC-AGAG-TT-G-AATTTCAATCCCAT-GCAAGGTCTGG-ATTTA----AG-CC-ACC-TGTGAA-C----AAATAT----ATGA-AAAGAATAG-GG---CT----A-----TA----TT---TATTGG---AGTTA-CTGTGTAGACATCGAACAATATGTAAAAAAAATTT-AGTCT---GAA------AAG----AGGGA--ATAACTCATGC-AA--C----------------AT--T-CT-ATA----TGCA---GATT---TG--------AAATA-C---AAT---CACATACAAGGTCTAGAATTATTTAA---AGCAACAT---TGTGT-T-CA-A-ATT---T----------GA---A--AT-AACTGT-AC--AA-A----ATCTGTGC---AAG-T------TATTGACTGAATGTTGAA--aaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|8 : acTAAAAGAAGTGGCATAATCC-ATATAAT-T--TT--T-TAAGTG-GTG-TT-G-AAATTCATTCCAAA-GCAAGAAGTAT-TGATA----AG-TA-ACCTTGTATAGC----AG-TTT----G--A-AAAGAATCA-AG---CA----ACTTT-TG----GT---TT---G---AGCTA-TTGAGCAGATACTGAATAAAATGT-----AATTTC-ATGAT---GAAT-----AAG----GATTC--ATTGCT-ATGT-AA--T----------------AT--T-AT-ACACAATTTCT---AGTC---TG--------AAATA-C---AAT---TCCAT--------TTG-----T---A---AGCAACATTACTGCAT-G-CACA-ATA---T--------TA--------------C--------A-T----TTTTGTTT---AGG-T------TATTGAACAGATGTTAAA--TAAAAT--T---A-ATTT-T-A
gi|9 : AGTGGATGTTAAATAAAACATAAACTTAGGTTAAAAAAAG---CA--AATC-TTTTAAA-A--------CGAGTAA-AG-CT-G-TATATCAATCACAT-GCAATGATTAA-TGATA----AG-CA-ACCTTATGTA-C----AGATTT----T--G-AAATATACA-GG---CA----A-----TG----AC---TGTCCG---AGTAA-TTGAGCAGATGTTGTTTtgtttaaaacaaat
gi|9 : TCT--A---GTTA---TA--AG---CA-ATCG--TTTGTA-AAA-G-T---A--AAAA-TAAT-C-----ATG-CGAAGACTG--TTCTTGTT---ATTGATATCGGATGCTGATGTAAATGCttgttatttgtatttataaaagggggtatgaaacaactacattttccagtttctagttataagcaatcgtttgtaaaagtaaaaataatcatgcgaagactgttcttgttattgatatcggatgctgatgtaaatgcccttttagt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|47 ): TGGGATGCCAACAAATGGGTAAAACGAAAACTCACCTATTCATAAAATAA
Unaligned ( gi|48 ): AGCTAAATTGTATTGTATATTATCTTTTAAAATATAAA
Unaligned ( gi|49 ): CTGAGTTATAAAGTGGGAATAACTCGTGCACAAATT
Alignments
lowQualScore : 33333 33333333333333333 11111111 3333333333333333333333333 222222 11111111111 11111111 66666666666666666666666666666666 4444444444444444444444444 11111 1111111
lowQualScore : 1 33333 7 1 1 3 4 0 3 2 66666666666666666 1 4 777 0 1 2 1 5555 2 444 5 33333333 2 4444 2 0 33 444 5555 2222222222222222222222222 1 11 999999 2 1 999999 444 000000 22 0 33 33 9999999999999999999 33 55555555555 4444 333333 44444444 22 333 222 1 333 2 33 222 222 77777 222 33333 9999999999999 555 55555 55555555 3333 44444 1 444444 0 0 22 44444444444444444444444444444444 22 22 1 2 1 33 1111111111111111111111111 3333 444 1 3 3 777777 222 777 5555 1 88888 55555 1 77777 22 2222222 1 1 2 444 44 333 22 6
lowQualScore : . ..... . . . . . . . . ................. . . ... . . . . .... . ... . ........ . .... . . .. ... .... ......................... . .. ...... . . ...... ... ...... .. . .. .. ................... .. ........... .... ...... ........ .. ... ... . ... . .. ... ... ..... ... ..... ............. ... ..... ........ .... ..... . ...... . . .. ................................ .. .. . . . .. ......................... .... ... . . . ...... ... ... .... . ..... ..... . ..... .. ....... . . . ... .. ... .. .
lowQualScore : 0 00000 3 0 0 7 5 8 4 2 55555555555555555 2 0 888 3 1 7 1 7777 7 444 0 99999999 5 0000 5 7 44 111 0000 5555555555555555555555555 4 33 999999 0 7 888888 888 000000 66 5 33 00 9999999999999999999 11 11111111111 0000 111111 77777777 77 333 111 2 888 3 44 333 333 55555 888 00000 5555555555555 999 11111 66666666 1111 88888 5 333333 3 3 99 33333333333333333333333333333333 99 66 9 0 9 55 4444444444444444444444444 6666 666 5 5 5 000000 888 222 1111 7 88888 22222 6 33333 11 8888888 7 8 4 444 11 777 99 0
consensus : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGGTATTGAGCGGATGNTGAATAAAACATAANTTTACGTTAAAAAAAGGGACATAACTCACGTAAA-A--TT--A-CGNGCGAGAG-TT-G-AAATTCAATCCCATGCAAGGTCTAG-TGATA----AG-CAACCTTGTGT---A-C----AN-AT-T-T--GA-AAAGAATCG-GG---CA----A-----TG----TT---TA---G---AGTTATTGAGCGGATGTTGATTAAAATGC-----AATTTT-ACG---GT---AAAT-----AAA-GGGGC--ATAACTCATGT-AA--A----------------AT--T-NG-ACG----TGCG---GAGC---TG--------AAATN-C---AAT---CCCAT-GCAAGGTCTNG--TGAT---AAG---CAACNT---TGTGT-A-CA-A-ATT--------T---TAAA---A--AG-AATCGG-GC--AAT----ATTTGTTC---GAG-T------TATTGAGCGGATGTTGAA--TAAAATG-T---A-ATTT-T-AAATG--G---A----TA--AAA--G-GG-A-CATAACTC-AT-G--TAA-A---TTA-ATA---A-TGC--GGA-GCTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGA---TA---AG---CA-ACCT--TGTGTA-CNA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTCGAGTT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
Reference ( family-148 ) : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGGTATTGAGCGGATGNTGAATAAAACATAANTTTACGTTAAAAAAAGGGACATAACTCACGTAAA-A--TT--A-CGNGTGAGAG-TT-G-AAATTCAATCCCATGCAAGGTCTAG-TGATA----AG-CAACCTTGTGT---A-C----AN-AT-T-T--GA-AAAGAATCG-GG---CA----A-----TG----TT---TA---G---AGTTATTGAGCGGATGTTGATTAAAATGC-----AATTTT-ACG---GT---AAAT-----AAA-GGGGC--ATAACTCATGT-AA--A----------------AT--T-NG-ACG----TGCG---GAGC---TG--------AAATN-C---AAT---CCCAT-GCAAGGTCTNG--TGAT---AAG---CAACNT---TGTGT-A-CA-A-ATT--------T---TAAA---A--AG-AATCGG-GC--AAT----ATTTGTTC---GAG-T------TATTGAGCGGATGTTGAA--TAAAATG-T---A-ATTT-T-AAATG-CG---A----TA--AAA--G-GG-A-CATAACTC-AT-G--TAA-A---TTA-ATA---A-TGC--GGA-GCTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGA---TA---AG---CA-ACCT--TGTGTA-CNA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTCGAGTT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
gi|1 : AAAAAGGGACATTACTCACACAGA-A--TTTTA-T-TATG-GTG-TT---AAATTCAAACCCATGCAAGATCTTG-TGATATACAAC-CAACCTTGTGT---GTC----AT--T-T-T--GA-AAAAAATCA-GG---TAGCACA-----TA----TT---C----G---TGTTATGGAGTTGA-GTTGAATAAAAT-------AATTTT-AC----------AAT-----TAA-----C--TTAAT--ATGC-AG--G----------------A--------ACA----TATT---G------TG--------CAA-------GAT---CCCAT-GCAAGGTCTTA--TGAT---GAG---CAACC----------A-CA-A-ACT--------T------A---A--AT-AATCAA-AC--AAA----GTTTGTTC---AAG-T------TCTGTAGCGGATGTTGAT--TAAAATA-C---A-ATTT-T---ATG--GTAAA----TA--AAG--G-GGCA-CATAA----AG-GGTCAA-A---TTA-GAC---A-TGC--CAG-CCTGAA-ATCAATCCCATG-CAAAGTCT----G-GTGT---TA---GT---CA-ACCT--TGT-T--CAA-A-CTT-G--AGA
gi|1 : ggcaaaccA--A----------------AC--T-TG-AGA----TACG---GAGT---TG--------AATTT-T---AAT---CCAAT-GCAAGAT-TTG--TGAT---AAG---TGGCAA---TGTATGG-CA-A---T--------T---TAAA---A--TA-AGTAGG-GC--TTT----ATTTGTTC---AAG-A------AAATCTGTGGATGTTtacggagttgaattttaatccaatgcaagatttgtgataagtggcaatgtatggcaatttaaaataagtagggctttatttgttcaagaaaatctgtggatgttacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|10 : ggcaaaccaaaaagggacattactcacacagaattttattatggtgttaaattcaaacccatgcaagatcttgtgatatacaaccaaccttgtgtgtcattttgaaaaaaatcaggtagcacatattcgtgttatggagttgagttgaataaaataattttacaattaacttaatatgcaggaacatattgtgcaagatcccatgcaaggtcttatgatgagcaaccacaaacttaaataatcaaacaaagtttgttcaagttctgtagcggatgttgattaaaatacaattttatggtaaataaaggggcacataaagggtcaaattagacatgccagcctgaaatcaatcccatgcaaagtctggtgttagtcaaccttgttc-G-AATTTCAATCTCAGGCTAGGTACAG-TATTA----AG-CAACATTGTGT---A-T----AT-AT-T-T--CA-TAATAACCA-AG---AA----A-----TG----AC---TG---ACCAAGTTGTTGAGTGGCTATCGATAAAAATTC-----ATTTTT--TG---TT---AAAA-----AAA-GGGCC--ATAACTCACGT-AA--A----------------AT--T-TG-AGA----TGTG---GAGT---TG--------AACTT-C---AAT---CCCAT-ACAAGCCTTAG--TGAT---AAG---GAGTAA---TGTGT-T-CT-A-A-T--------T---TAAA---ACGAA-AAT--G-TC--TAC----ATGTATCC---AAG-T------TATTGAGCAGATGTacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|11 : T---AAA------AAG-GGGAC--ACATCTAGTTC-AA--A----------------AT--T-TG-ATG----TGCG---GTGC---TG--------AAATT-C---AAT---TCCAT-GTAAAGTCTAG--GGTT---GAG---CATCCT---TGTGT-A-C--T-ATT--------T---TAAA---A--AG-AATC---ACA-AAT----ATTTATTCACTGAG-T------TATTGAGCA------AAA--CAAAA-------A-ATT------ATGTTA---A----TA--AAA--G-GC-AGTAAAATTC-AT-A--TAACA---TTACATATGTA-TGC-------CTGAAATACTATCCCATG-CAAGGTCT----A-ATGA---GA---AT---CA-ACCT--TGTGCA-TAA-A-TTT-G--ATAA-GAAT-C-----A-TG-CAACATTT--------GTT---ATTA--AGTGGAaacatgccggacggcaattaatggagcattataaaagctcacctactcaaaga
gi|12 : acacaGGC--ATAACTCGTGT-AA--A----------------AT--T-AA-ACA----TGTG---GAGC---TG--------AAATG-C---AAT---CCGAT-GCATAGTCTAG--TGAT---ACA---CAACGT---TGTCT-C-CA--------------T---TAA-------------C---------T----ATTTGTAC---GAG-T------TACTGAAAGGAAGTCGTA--TAAAACA-T---A-AACT-G-A---G-TG---A----T-------------A-CTTA-----AT-A--TAA-A---TGT-CTAT--G-TGC--GGA-GCTGAACTGCAAGCCAATA-CACAGTGT----A-GTGA---TT---TG---CA-ATCA--TGTGTA--------------GAAA-GAAT-C-----G-GA-CAA--TATGACTTCGAATA---AATG--AGCGGctcagtggagtggata
gi|13 : aAG-T------CATTGAACAGATGTTCA---TAAAATGGT---G-GGTG-T-G---G-CG---AGGGTTA--AAA--AAGG-C-CATTACTC-GT-G--TAATA---TTG-A-G---A-TGC--TGA--CTTCATTTCAATCCAGTG-TAAACTCT----A-GTAA---TA---AGGGCTA-A-----TGTGTA-CCA-AATTT-G--AAAT-GAAT-A-----G-GG-AAACATTTG--TTCCAGTT---ATTG--ATGGGATGTTtctgtccgccagcccgtacaaactgcgataaaata
gi|13 : a---AGTCATTGAACAGATGTTCAT-AAAATGGTG---GGTGTG-GCGAGGGT---TAA------AAA-AGGCC--ATTACTCGTGT-AA--T----------------AT--T--G-AGA----TGCT---GA-C---TT--------CATTT-C---AAT---CCAGT-GTAAACTCTAG--TAAT---AAGGGCTAA------TGTGT-A-CC-A-AAT--------T---TGAA---A--TG-AATAGG-GA--AAC----ATTTGTTC---CAG-T------TATTGATGGGATGTTACA--T---GTG-A---G-ATTC-T--------G---A----TAACAAA--A-GT-A-CAT--CT--AT-G--TAC-A----GA-ATA---G-TCT--GGA-acatgtgagattctgataacaaaagtacatctatgtacagaatagtctggaaaactaaaaaatgttaatgatttgttaaatataaagttccagactaaa
gi|14 : aAATCCCATGTGATGTTTAC-TATTA----AA-CAACCTGATGT---A-C----AT-AT-A-T--GA-AAATAATTA-GG---AA----A-----CG----TT---TG-----------ATTGAGCAGATACTAATTAAAATGT-----A--TTT-GTT---GTTTAAAATTAA--AAA-AGACC--ATGACTCATG--AA--A----------------AT--T-TG-ACC----AATA---GAGT---TG--------AAATA-C---ATC---TTTTT-GCATGGTCCTG--GGAT---AAG---GAAC-T---TACA--A-CA-A-ATA--------T---GAAA---A--------------------------TGTTC---GAT-T------CATTGAGCGAATGTTaaactaaaaaatgttaatgatttgttaaatataaagttccagactaaa
gi|15 : ataaAATAATCG-AG---CA----A-----TG----AT---TATTCG---AGGTATTTAGCGAAAGTTGATTAAAATGC-----A--TTT-AAG---TT---AAAT-----AAA-ATAGCC-ATAACTCACGT-AC--A----------------AT--T-TA-ATG----TGCA---GTGT---TA--------AATTT-C---AAT---ACCAT-GTAAGGT-TTG--TCAT---AAG---GAACAC---TGTGT-G-CA-A-A-T--------T---TAAA---A--TG-AATGGG-CC--AGG----GTTTGTTT---GAG-T------GGTCTGGCAAATGTTacatgtggcattccaatgtggacaaagctcacatgttcatagattaa
gi|16 : TGATTAAAATGT-----TATTTT-TTG---GT---AAAT-----AAA------------------------------------------T--T-AG-GC---------------C---TA--------AAATA-C---A-T---CTCAT-GCAAAACCTAG--TGAT---AAG---CAAAAT---TATGT-T-CA-A-ATC--------TA--TAAATG-A--TG-AA---------AAA----ATGTATT--------T------TATTG---TAATATTAAATTTCAGATG-TGG-A-ATTT-C--AATG-CC---A----TG--CAA--G-acattttgggcgtcgacgccgacgaatatgtcattccaaaagcagctcaactatccatagaatagt
gi|16 : ATG-TTCAA-ATCTAT-AAATG------A----TG--AAA--A-A--A-TGTATTTT-ATTG--TAATA---TTA-A-A---T-TTC--AGATGTGGAATTTCAATGCCATG-CAAGTTCT----T-GTAA---TA---AG---GA-A-TG--TGTGTA-CTA-A--TT-A--AAAA-TAAA-A-----G-GG-TAAAATTTG--CTCAAATT---ATTG--AGTGGATATTttcttgtaataaggaatgtgtgtactaattaaaaataaaagggtaaaatttgctcaaattattgagtggatattacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|16 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattTGT-AA--T----------------AT--T-AA-ATT----T-CA---GATG---TG--------GAATTTC---AAT---GCCAT-GCAAGTTCTTG--TAAT---AAG---GAATGT----GTGT-A-CT-A-ATT-------------AAA---A--AT-AAAAGG-GT--AAA----ATTTGCTC---AAA-T------TATTGAGTGGATATTacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|17 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattatgttcaaatctataaatgatgaaaaaatgtattttat-ACG----TGTG---AAGT---CA--------AACTT-C---AAT---CAAAT-GAAAGGTCTTT--TGAC---AAG---CAAACT---TGTGT-A-TC-A-ATT--------T-----AA---G--AG-GATCAG-GC--AGC----AATTGTTC---AAG-T------AACAGAGTGGACGCTGAT--TAAAATG-C---A-AT-------------------------AAG--G-AG-A-CACAACTC-A------AG-A---T----------------GGG-GTTTTGTTTCAATCCGATG-CAAGGTGT----T-GTGA----A---AG---GATACAC--AATGGA-CTT-A-TTT-------A-AAAT-A-----A-GGTCAATGTTTG--TTacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|18 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaaaagtaaataaacT---AAAA-----AAA-GGAAC--ATAACTCATG--AA--A----------------AT--T-A--ACAGA--TGCA---GAGC---TG--------AATTT-C---ATT---CCC-------------G--AGAT---TAG---CAACCT---TGTAT-A-TA-C-ATTTCTTTTAGT---TAAA---A--AA-AA
gi|18 : A--AAA--G-GA-A-CATAACTC-AT-G--AAA-A---TTA-ACAG--A-TGC--AGA-GCTGAATTTCATTCCC------------------GAGA---TT---AG---CA-ACCT--TGTATA-TAC-A-TTT-aagggacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|18 : taaaA--AAA--G-GG-A-CATAACTT-GG-G--TAA-AAT-TTG-A-G---A-TGA--GGA-GTTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----------------------------CT--CG-------------------AAA-G----------A-GG-CTACACTTG--TTTGAGTT---ATTG--AGcttttagttaaaaaaaaaagggacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|19 : taaaaaaaggaacataactcatgaaaattaacagatgcagagctgaatttcattcccgagattagcaaccttgtatatacatttcttttagttaaaaaaTATTGAGGTGATGTTGAAAAAAATGC-----ACTTTT-GCA---GT---AAA------AAA-GGGGCCAAAAAAACATGT-AA--A----------------AT--A-TG-AGG----TGCA---GAGT---TG--------AAATT-T---AAT---CCTAT-GCAAACACTTG--TTAT---AAG---GTGTAT---TGTGC-A-TG-A-A-T--------T---CAAA---A--TG-AAT-AG-GCAAAAC----ATTTGTTC---acattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|2 : GACTAGTAAATCTGTATTATTCAAGGCATTGAGCAAATGATGATTAAAACATAATTTTATGGTAACTAAAGGGACTTTATTAATGTAAC-A--TT--A-CATGTGAGAGACT-G-AGATACAATCCCATGCAAAGTCTAG-TGATA----AG-CAACCTTGTGT---A-T----AC-AT-T-C--AA-AAAGAATCA-AA---CA----A-----TG----TT---AA---G---AATTATTGAGTGGATATTCATTAAAGTGC-----AATTCT-ATG---GC---AAAT-----AAA-GTGGC--ATAAGTCTGGT-AA--A----------------AT--T-AG-ACA----TGCA---AGCC---TG--------AAATA-C---AAT---CCCAA-GCAATGTATTA--TGAT---AAG---CAGACT---AGTAT-A-CA-A-ATT--------T---TAAA---A--AA-AGTCAC-CA--AAT----ATTTGTTA---TAG-T------GTTTGAGC-ACTGTTGAA--TTAAATG-C---T-ATTT-TAAAATG-CA---A----TA--AAA--G-AG-A-CATAACTC-AA-G--TAA-A---TTA-ATAC--A-TAC--ACA-GCTGAATTTTAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGA---TA---AG---CA-ATCT--TGTGAA-AAG-G-TTT-A--AAAA-GGAT-C-----A-GG-AAAGGATTA--CTCATGTTATAATTG--ATCAGATGTTGATTAAAATGCATTcattaacaaaattaatattacagttgtgtgggatgccgacaccactgaatggggtattacaaaaactcaactattcatagaataatc
gi|20 : AAAAAAAGAGCCATAA---ACGTTGT-A--TT----CG-GTG-----TT-A-AAATTCCATCCCATACAAGGTGTAG-TTAAA----AATCAACCTTGTGT---A-C-----C-AT-T-TTAAA-AAAGAATCG-GG---CA----A-----CG----TT---TA---TTTTAGTTATTTGGCA-ATATTGATAAAAA--------AAT----ATG---AT---AAAT-----AAA-GGGGC--ATAACTCGTGT-TA--C----------------AT-------ACC----TATG---AGTC---TG--------AAATG-C---AATCCGCCCAT-GCAAAGCCTAA--TGA----AAG---AAACAT---TGTGT-A-CA-C-ATT--------T---GAAA---c
gi|21 : ta----TT---TA---A---AATTATTGAGCAAATGTTGATTAAAATGC-----AATTTA-ATG---AT---AAAT-----AAA-GGGGT--ATAACTCATGT-TA--ATATATGTATATCATGTATA-T-AT-ACC----TGCA---AGCC---TG--------AAATA-C---AAT---CCCAT-GTGAGGTGTTG--AAAT---AAG---CAGCTT---TGTGA-A-TA-A---T--------T---TACA---A--AG-AGTCAC-GC--AGT----ATTTATAA---GAG-T------TATTGAACAGATATTGAA--TAAAATA-T---A-ATTT-
gi|22 : agttgcaaatttaacatattaaaacatatAA--G-AG-A-CATAACTT-AT-G--------------------A-TGT--GGA-GTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT----T-GTGA---TA---GG---TG-GATTAATGAGGA-TGA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-TA----A-AG-CAACATTTA--TTCAAGTC---ATTG--AGCAGATGCT
gi|23 : atgataaaacctttttttttgAA--G-AG-A-CATAACTT-AT-G--------------------A-TGT--GGA-GTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT----T-GTGA---TA---GG---TG-GATTAATGAGGA-TGA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-TA----A-AG-CAACATTTA--TTCAAGTC---ATTG--AGCAGATGCTatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|24 : atgataaaacctttttttttgCCATGCAAGATCTAG-TGATA----AA-CAACCTTGTAT---G-C----TG-TT-T-T--AA-AAAGAATAA-GG---TA----A-----CACTAATT---TA-------AGTTCTTGAGTGGATGTTGAATAAAACAA-----AATTTT-ACA---AT---AAA------GAG-GGGGC--ATAACTCATGT-TA--C----------------AC--T-AC-ACA-------A---GA-C---TG--------AAATA-C---AAT---CCTGT-GCAAGCTCTAA--TGAT---CAG---CAACCT---TGTGT-A-CA-A-ATC--------T---TAatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|25 : taAGAG-TT-------TCAATCTCATATACTGTCTAGATG-TA----AG-CAATCATATAC---A-T----AC-AA-T-------AAATACTCA-GA---CA----G-----TAATACTT---TA---A---AGTTATTAAACGGGTGCTAATTAATATAT-----AA-TTT-ATA---GTTA-AAAT-----A----TGCC--ATAACTCATGC-AC--A----------------AT--T-TA-ATA----TGTG---AAAT---TGAATTTTTAAAACG-C---AAT---CACAT-GCAAGta
gi|26 : gaacA--AAATGG-GG-A-CATAACTT-A--A--TTA-T---TTA-ATA---AATTT--AAA-G-TGAGTTTCAATCCTATA-CAAGG---------G-GA---TA---AG---CA-ACCA--TGTGTATCAA-A-TTA-G--AGAA-CAACAC-----A-G--CAACATGTT--TTCGAGGT---ATTG--AGTGAATGTTGAACAAAAtag
gi|26 : ttatgtttgAAC--ATGTT-TTCGAGGTATTGAGTGAATGTTGAACAAAAAGAAAGTTTAagaaagtttagacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|27 : ttatgtttgaaaatggggacataacttaattatttaataaatttaaagtgagtttcaatcctatacaaggggataagcaaccatgtgtatcaaattagagaacaacacagcTATTGAGCGGATGTTATTTAAAATGC-----ATATTT-GCG---GT---AAAC-----AAA--GTGC--ATAAGTCTTGT-AA--A----------------AT--TACGCACA----CGCGCCTGAAC---TG--------AATTA-CT--AAT---TCGGT-GCTAAGCATTG--TGAT---AAG---CAACAT---CGTGT-A-C----ATT--------T---Tgacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|28 : gcactttgtcattcataatgataaacaacagtgttgacacaaA--AAA--G-GG-G-AATAAGCC-AT-A--CAA-A---ATATATT---A-TGT--G-----TGACGTTTAATTCAAGT-CAAGGACT----T-GTGA---TA---AG---GA-GCGG--AATGTA-CT-----------AAAA-TAAC-T-----AGGG-CAAAGTTTG--CTTGAGAT---ATCA--AGAGGATGtat
gi|29 : a--AA-AATCAG-CT--AAT----ATTTGTTT---GAG-T------TATTGAGCAGATGTTAAA--TAAAA--------------------------------------A--G-GT-A-AATAGTTC-AT-G--TAA-A---TAA-ATA-----TGCTAGGA-GGTGAAATTCAATTTCATG-CAAGGTCA----A-ATAA---TA---AG---CA-ACTG--TGTGTA-CAA-A-TTT-G--AAAT-GATT-C-----A-GG-TTATATTTG--TTgtacagggacgacgaatggatagtcatagaaactcacctattcatagaataaa
gi|3 : AAAGGGGCATAACTCACATTAA-AGTTT--A--GTGCG-GTG-TT-G-AAATTAAATGCCATGCAAGGTCTAG-------------CAACCATGTGTTTGA-T----TT-AT-T-------AAAAAATCA-AGAAACA----A-----TT----GT---TC---G---ATTTATTGAGCAGATGTTGATTAAAATGT-----AGTTTT-AGC---TT---AAA------AAT-GGCTC--CTAACTGATGT-AA--A----------------GT--G-AA-ACA----TGCA---GAGC---TG--------AATTT-C---TAT---CACAT-GGAAGGTACTG--TAAT---AAG---CAACCT---TGTGT-ATCA-A---T--------C---GAAA---A--AA-AATCAG-AA--AAT----GATTGTTC---AAG-T------TATTGGGCAAATGTT-AA--TAAAAAG-T---ACAGGT-T-AA---------------A--AAG--G-GG-C-CATAACTC-AT-G--TAA-AATTTTA---G---A-TGT--AGA-G----------ATCCCATG-CAAGCTCT----T-GTGA---TA---AG---GA-GTAA--TGTG-A-TTC-A-TTT-T--AAA-------------------------TG--TTCAAGTT---ACTG--AGCAGATGT
gi|30 : -C---AAT---TCAAT-GCAAG-----G--TGAC---AAG---CAGCCT---TATGT--------ATT--------T-----AT---A--AG-AATCGGAGA--AAC----AATTGTTC---AAA-T------TATTGTGCAGATGCTG-A--TAAAA-------A-CTTG-T----TG--G---A----AA--AAA--A-GC-A--ACAACT----------------TTG-A-------------GA-TATGAACTTCAGTCCAATG-CAAGCTCT----T-GTGA---TA---AG---aacatgtgggatgcacattgatgaaatttcaaaaacccatctattcataaaatag
gi|31 : tTGTGT---A-C-----C-AT-T-T--GA-AATGAATCA-GG---TT----T-----TA----TT---T----G---TGTTATTT----GACAATGATCG----GG-----AAGTTA-ATG---AT---AAA------AAA-GGAAC--ATAACCCATGTTAATGA----------------AT--T-----CG----TGTG---ACGC---TG--------AAATT-C---AAT---ACCAT-TCACGGTTTAA--CGAT---AAC---CAACTT---TG
gi|32 : AATCCCATA-C---GTCT----T-GTGG---TATT-AG---GA-ATGC--TGTGTA-TCA-A-TTT-A--AAAT-GAAA-T-----T-GG-CAATGTTTC--TT---GTT---ATTG--AACctta
gi|33 : ---AAT---TCCAT-ACAAGCTCTAGACGGGT---AAG---CAATTA---TGTGT-A-AA-A-ATC--------T----GAA---A--AG-AATCGG-AA--AATGTTTATTTGTAC---GAG-C------AATTGAGCGGACATTATA--TTAAACG-T---A-ATTT-T-AAGTT-TT---A----TA--AAA--T-GG-G-CATAaatattacatttgtgatgccaatgttaacaaattagtaatttcaaaagttcaccaattcataggatagccga
gi|34 : gaaacagacacta-----AAA-TGGGT--TTTACTAATGT-AA--C----------------AT--G-TT-TTG----TGCT---GTGT---TG--------AAATT-C---ATT---CCCTT-GGAAGGTCTAG--TGAC---AAG----AGTAT---TGTGTAA-CA-A---T--------T---TAAA---A--TG-AATATG-GC--TAC----ATGTGTTT---GAG-T------TATTTAGTAGATATT
gi|35 : aaAAGGTTT----T-GCGA---TA---GT---GA-ACAT--TTTGTA-CAA-G-TTT-A--AAAT-GCAT-A-----G-AG-CAACGTTT------GAATT---ATTG--AACGAATGacatgtggg
gi|36 : tCAAGGTTTTG--TGAT---AAG---TAACAA---TATGT-A-TC-A-ATT--------T---C------A--AGTTATGGA-GC--AAT----GTTTGTTT---TAGAT------TTTTGAGCGGATTTTatataatttatgtttgacgtcgacaccagcgaatgggttattacaaaaacacacatagtcatacat
gi|37 : -----AAA-GGGGG--ATAACCCA----AA--A----------------ATAAT-TG-ATA----TACG---GTGT---TG--------AAATT-CCAAAAT---CTAAT-GCAAGTTGTAG--TGAT---AAG---CAG-------GCGT-A-TA-CTATT--------T---TGGA---A--AG-AATCAG-CC--AAT----ATGTGTTT---AAG-T------TATTAAGacatgtgtgacggcgacggataggtgattgcaaaggctcacctactcatagaatatt
gi|38 : catataa---A-TGC--GAT-GTTGAATTTCAATTTCATG-CAATGTCT----T-GTGA---TA---AA---AA-GCTT--TGTGTG-CCA-A-TT-----AAAATTAAT-A-----G-GA-CAAGGTTTG--TTTAATTT---ATTG--AGCGGATATgaa
gi|39 : gtaacatttcgagTGAATTTCAATCC-ATG-CAAGTTCT----T-TTGA---TAGG-AG---TA-A-----TGTGCA-ACATA-TT-----ACAA-TGAT-TACTAAA-GG-TAACAATT--------GTT---ATTG--CACGGATGTcacatagtgaacgactga
gi|4 : tgaAAAAGAAGGGAGACAACTCATCTAAA----TT--GTCATGTG-GAG-TTTGTAAATTCAATTCAATGCAATGTGATG-TGAT--------CAAC--TGTAT---A-CGTTTAA-TT-T-T--GA-AGAGAATTG-CG---CA----A-----TG----TTAGTTT---G---AGTTACCGAGCAGATATTAA--AAAATGT-----GCTTTTTACG---AT---AAA------AAA-GGGAT--ATAACTCATGT-AA--T----------------AT--T-AT-CCG----TG-A---AAGCCCTTC--------AAATA-T---AAT---CCTAC-ACGAGTCCTAA--TGTT---GAG---CAACCG---GATAA-A-CA-A-ACTC-------T---TAAAT--A--AA-AATCGC-AC--AAT----ATCTGTTA---AAA-T------TATTAAACAGCTGCTGAA--TAAAACG-G---A-AGTT-C---ATG-TT---T----TA--AAA--A-AG-T-TGCA--TC-----------A---TTA-CTAC--G-TTT--GGA-ACTGAAATTCAGCCTCATG-CGAA------------GA---CA---GG---TA-A--------------A-A-TTTCG--TAAA-TGAG-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTTGCGTT---ATAA--AAACAATGTTGATTAAAATGCAaacatgtgcaacaccaacaaatgggccaatacacgag
gi|40 : tata-CATAACTCTAC----TAA-T---TTA-AAAC--A-GGT--AGA-GCTGAATTTCAACCATATG-CAAGGTCTAGTCTAGTGA---AA---AG---CA-ACCT--TGTGTA-CAA-A-TCT-GAAAAAA-GGAT-C-----A-Ggttttaccagtaaat
gi|41 : tttagatttaaaaattacGAAATTCAATCTCGTG-AAAG---T----T-GTGAATACA---AG---CA-ATTT--TGTGTA-CCA-T-TTT-G--AAAc
gi|42 : tcagggcagataaaacctggcgcagtacattgattttttatacactgtgttaaaTGTTGATTAAGATGT-----TATTTT-ACG---CT---TGAT-----CAA-GAAAC--ATAACTCATG--AA--A----------------AT--T-AATACG----TGTG---GAGC---CG--------AATTT-C---AAT---Cta
gi|43 : AAT-C-----A-AG-CAAGGAATG--TTTGAGTT---ATTG--AACGGATGTTGATT--GATGCATTatttggacaatccattaataatca
gi|43 : atAATCA-AG---CA----AGGAA-TG----TT---T----G---AGTTATTGAACGGATGTTGATT--GATGC------ATTTT-AC----TT---AAA------AAA-TGGCC--TTAA---ATGA-AA--T----------------AT--T-TG-Attacttaaaaaatggccttaaatgaaatatttgagatacaacattaa
gi|44 : at--TGTGTA-CTA-A-TTC-A--AAAT-GAAT-A-----G-GG-CATCGTgatacaacattaa
gi|45 : T---TA---G---AGTTATTGAGCAGAT------TAAAATGC-----AATTTT-ATG---GT---AAA------ATA-GTGGC--ATGACAGAGGT-AA--A----------------CT--T-------------------------------------ACA-C---AAT---CCCAT-GCAAAGCCTAG--Tcattgatgttacatgcggagtgccaacggatgtgtgtacaaaacctcacctatcaaaactagtt
gi|46 : ttgTGTAAGGTCAAG-TGATA----CG-CAACGTTGT-----A-CTG--AA-AT-T-T--GA-AAAGATTCG-G
gi|5 : A-A--TTGGA-CGGGC-AGAG-TT-G-AAACGCCATCCTACACAACGTCTGG-TAATT----AG-CAACCTTGTAT---A-T----AT-AT-T-T--GACAAAGAGTTGCAG---AA----ATTGATTG----CT---TA-------AGTTACTGAGCAGATGTTGAC----ATG----------TT-GC-------------------------GC--ATGACTCTTGT-AA--A----------------AG--T-CA-GCG----TTTT---GAGC---TG--------AAATA-C---AAA---TCCAT-ACAAAGTTAAC--TGAT---AAG---CTAC--------GT-C-CAGA-ATTACA-----T---TAAACGCA--CGAAATGGA-GC---AT----A---GTTC---ATG-TAAAATGTGTTGTGCGGA-GT------TAAGATG-C---A-ATCT-C-AAACA-AG---A----Tagtta
gi|5 : taatgttgtaagaagaatgTT-ACA---TT---AAACGCACGAAATGGAGC--ATAGTTCATGT-AA--A----------------AT--G-TG-TTG----TGCG---GAGT---TA--------AGATG-C---AAT---CTCAA-ACAAGAT---G--T-------AG---CAACAT---TTTGT-G-GA-A-GAT--------T---GAAA---A--AG--GTAGG-AC--AAT----ACTTGTTC---GTA-T------AACTGAGAAGACATCGAA--gtagcaacattttgtggaagattgaaaaaggtaggacaatacttgttcgtataactgagaagacatcgaagatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggcagagttgaaacgccatcctacacaacgtctggtaattagcaaccttgtatatatatttgacaaagagttgcagaaattgattgcttaagttactgagcagatgttgacatgttgcgcatgactcttgtaaaagtcagcgttttgagctgaaatacaaatccatacaaagttaactgataagctacgtccagaaCATGCAGTGTCTAG-TGACA----AA-CATCCTTGTGT---A-C----AACGT-T-T--G------------------------------------T---TA---G---AGTTATTAAGCGAATGTTAATCAAAATGC-----AATTTT-ATT---GT---AAAT-----AAT-GGTGC--ATAACTTACATAAA--A----------------AT--T-TG-gatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : attatatgg--------AAATG-C---AAT---TTTATTGTAAA---TAA--TGGT---GCA---TAAC-T---TACAT-A-AA-A-ATT--------TGTGTAAA---A--AG-AATCTG-GC--AAT----GGTCATT-----A----------ACTGAGTGGATGTTGAT--CA----G-T---G-AT-----AAATA------A----AA--CAA--G-GG-C-CATAACTC-AT-G--TAA-AA--TTG-GAG---A-TGT--GGA-GTTTAATTTCAGTCCTAAG-CAAACTCG----T-GTGA---TACAGAG---TA-A-----TGTGTA-CCA-A-TCT-A--AAAT-GAAT-A-----A-GG-CAACATCTG--TTTAAGTT---AATG--AATAGATtgtaaaaagaatctggcaatggtcattaactgagtggatgttgatcagtgataaataaaacaagggccataactcatgtaaaattggagatgtggagtttaatttcagtcctaagcaaactcgtgtgatacagagtaatgtgtaccaatctaaaatgaataaggcaacatctgtttaagttaatgaatagataatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|7 : attatatggcatgcagtgtctagtgacaaacatccttgtgtacaacgtttgttagagttattaagcgaatgttaatcaGGCTATTAAA---G-ATTATTTGAGTTATTGAGCGGCCCACAAATAAAACATAATTTTACATTATATAAAATGACAGACCCTATGTAAAGA--AT--A-CAAGC-AGAG-TT-G-AATTTCAATCCCATGCAAGGTCTGG-ATTTA----AG-CCACC-TGTGA---A-C----AA-ATATAT--GA-AAAGAATAG-GG---CT----A-----TA----TT---TATTGG---AGTTACTGTGTAGACATCGAACAATATGTAAAAAAAATTT-AGT---CT---GAA------AAG-AGGGA--ATAACTCATGC-AA--C----------------AT--T-CT-ATA----TGCA---GATT---TG--------AAATA-C---AAT---CACAT-ACAAGGTCTAGAATTATTTAAAG---CAACAT---TGTGT-T-CA-A-ATT--------T-----GA---A--AT-AACTGT-AC--AAA----ATCTGTGC---AAG-T------TATTGACTGAATGTTGAA--aatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|8 : acTAAAAGAAGTGGCATAATCCATATAAT-T--TT--T-TAAGTG-GTG-TT-G-AAATTCATTCCAAAGCAAGAAGTAT-TGATA----AG-TAACCTTGTAT---AGC----AG--T-T-T--GA-AAAGAATCA-AG---CA----ACTTT-TG----GT---TT---G---AGCTATTGAGCAGATACTGAATAAAATGT-----AATTTC-ATG---AT---GAAT-----AAG-GATTC--ATTGCT-ATGT-AA--T----------------AT--T-AT-ACACAATTTCT---AGTC---TG--------AAATA-C---AAT---TCCAT---------TTG-----T---AAG---CAACATTACTGCAT-G-CACA-ATA--------T---TA--------------C--------AT----TTTTGTTT---AGG-T------TATTGAACAGATGTTAAA--TAAAAT--T---A-ATTT-T-A
gi|9 : AGTGGATGTTAAATAAAACATAAACTTAGGTTAAAAAAAG-----CAAATCTTTTAAA-A--------CGAGTAA-AG-CT-G-TATATCAATCACATGCAATGATTAA-TGATA----AG-CAACCTTATGT---A-C----AG-AT-T-T--TG-AAATATACA-GG---CA----A-----TG----AC---TGTCCG---AGTAATTGAGCAGATGTTGTTTtgtttaaaacaaat
gi|9 : TCT----A-GTTA---TA---AG---CA-ATCG--TTTGTA-AAA-G-T---A--AAAA-TAAT-C-----A-TG-CGAAGACTG--TTCTTGTT---ATTGATATCGGATGCTGATGTAAATGCttgttatttgtatttataaaagggggtatgaaacaactacattttccagtttctagttataagcaatcgtttgtaaaagtaaaaataatcatgcgaagactgttcttgttattgatatcggatgctgatgtaaatgcccttttagt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|47 ): TGGGATGCCAACAAATGGGTAAAACGAAAACTCACCTATTCATAAAATAA
Unaligned ( gi|48 ): AGCTAAATTGTATTGTATATTATCTTTTAAAATATAAA
Unaligned ( gi|49 ): CTGAGTTATAAAGTGGGAATAACTCGTGCACAAATT
Alignments
lowQualScore : 33333 55555555555555555555 11111111 3333333333333333333333333 222222 11111111111 111111111 11111111 666666666666666666666666666666666666666 4444444444444444444444444 11111 1111111
lowQualScore : 1 33333 7 1 1 3 4 0 3 2 22222222222222222222 1 4 777 1 2 0 5555 2 444 4 22222222 2 2 44444 1 33 333 4444 2222222222222222222222222 22 333 1 1 0 999999 1 1 999999 444 000000 22 0 33 33 9999999999999999999 33 55555555555 4444 333333 44444444 22 333 222 1 333 2 33 222 222 77777 222 2 444 333 222222222 333 55555 11111111 444444 4444 1 444444 444 888888888888888888888888888888888888888 22 22 1 2222 44 0000000000000000000000000 3333 444 0 3 3 777777 222 777 5555 1 88888 55555 1 77777 22 2222222 1 1 2 444 44 333 22 6
lowQualScore : . ..... . . . . . . . . .................... . . ... . . . .... . ... . ........ . . ..... . .. ... .... ......................... .. ... . . . ...... . . ...... ... ...... .. . .. .. ................... .. ........... .... ...... ........ .. ... ... . ... . .. ... ... ..... ... . ... ... ......... ... ..... ........ ...... .... . ...... ... ....................................... .. .. . .... .. ......................... .... ... . . . ...... ... ... .... . ..... ..... . ..... .. ....... . . . ... .. ... .. .
lowQualScore : 0 00000 3 0 0 7 5 8 4 2 99999999999999999999 4 0 777 4 5 4 3333 5 111 7 11111111 4 4 44444 5 55 999 7777 4444444444444444444444444 44 000 6 6 8 111111 5 7 888888 888 000000 66 5 33 00 9999999999999999999 11 11111111111 0000 111111 77777777 77 333 111 2 888 3 44 333 333 55555 888 7 444 777 777777777 999 00000 88888888 111111 4444 5 444444 222 333333333333333333333333333333333333333 88 55 9 9999 00 5555555555555555555555555 6666 666 5 5 5 000000 888 222 1111 7 88888 22222 6 33333 11 8888888 7 8 4 444 11 777 99 0
consensus : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGGTATTGAGCGGATGNTGAATAAAACATAANTTTACGTTAAAAAAAGGGACATAACTCACGTAAA--A--TT-----ACGNGCGAGAG-TT-G-AAATTCAATCCCATGCAAGGTCTAG-TGATA----AG-CAACCTTGTGT---A-C----AN-AT-T-T--GA-AAAGAATCG-GG---CA----A-----TG----TT---TA---G---AGT--TATTGAG---CGGATGTTG-ATTAAAATGC-----AATTTT-ACG---GT---AAAT-----AAA-GGGGC--ATAACTCATGT-AA--A----------------AT--T-NG-ACG----TGCG---GAGC---TG--------AAATN-C---AAT---CCCAT-GCAAGGTCTNG--TGAT---AAG---CAACNT---TGTGT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--AG-AATCGG-GC--AA-T----ATTTGTTC---GAG-T------TATTGAGCGGATGTTGAATAAAATG-T---A--A-------TTT-T-AA--A-TG-G---ATA--AAA--G-GG-A-CATAACTC-AT-G--TAA-A---TTA-ATA---A-TGC--GGA-GCTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGA---TA---AG---CA-ACCT--TGTGTA-CNA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTCGAGTT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
Reference ( family-148 ) : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGGTATTGAGCGGATGNTGAATAAAACATAANTTTACGTTAAAAAAAGGGACATAACTCACGTAAA--A--TT-----ACGNGCGAGAG-TT-G-AAATTCAATCCCATGCAAGGTCTAG-TGATA----AG-CAACCTTGTGT---A-C----AN-AT-T-T--GA-AAAGAATCG-GG---CA----A-----TG----TT---TA---G---AGT--TATTGAG---CGGATGTTG-ATTAAAATGC-----AATTTT-ACG---GT---AAAT-----AAA-GGGGC--ATAACTCATGT-AA--A----------------AT--T-NG-ACG----TGCG---GAGC---TG--------AAATN-C---AAT---CCCAT-GCAAGGTCTNG--TGAT---AAG---CAACNT---TGTGT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--AG-AATCGG-GC--AA-T----ATTTGTTC---GAG-T------TATTGAGCGGATGTTGAATAAAATG-T---A--A-------TTT-T-AA--A-TG-G---ATA--AAA--G-GG-A-CATAACTC-AT-G--TAA-A---TTA-ATA---A-TGC--GGA-GCTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGA---TA---AG---CA-ACCT--TGTGTA-CNA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTCGAGTT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
gi|1 : AAAAAGGGACATTACTCACACAGA--A--TTTTATTATG-----GTG-TT---AAATTCAAACCCATGCAAGATCTTG-TGATATACAAC-CAACCTTGTGT---GTC----AT--T-T-T--GA-AAAAAATCA-GG---TAGCACA-----TA----TT---C----G---TGT--TATGGAG---TTGA-GTTG-AATAAAAT-------AATTTT-AC----------AAT-----TAA-----C--TTAAT--ATGC-AG--G----------------A--------ACA----TATT---G------TG--------CAA-------GAT---CCCAT-GCAAGGTCTTA--TGAT---GAG---CAACC----------A-CA-A-ACT---T-----------A---A--AT-AATCAA-AC--AA-A----GTTTGTTC---AAG-T------TCTGTAGCGGATGTTGATTAAAATA-C---A--A-------TTT-T-A-----TG-GTAAATA--AAG--G-GGCA-CATAA----AG-GGTCAA-A---TTA-GAC---A-TGC--CAG-CCTGAAAT-CAATCCCATG-CAAAGTCT----G-GTGT---TA---GT---CA-ACCT--TGT-T--CAA-A-CTT-G--AGA
gi|1 : ggcaaaccA--A----------------AC--T-TG-AGA----TACG---GAGT---TG--------AATTT-T---AAT---CCAAT-GCAAGAT-TTG--TGAT---AAG---TGGCAA---TGTATGG-CA-A---T---T--------TAAA---A--TA-AGTAGG-GC--TT-T----ATTTGTTC---AAG-A------AAATCTGTGGATGTTtacggagttgaattttaatccaatgcaagatttgtgataagtggcaatgtatggcaatttaaaataagtagggctttatttgttcaagaaaatctgtggatgttacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|10 : ggcaaaccaaaaagggacattactcacacagaattttattatggtgttaaattcaaacccatgcaagatcttgtgatatacaaccaaccttgtgtgtcattttgaaaaaaatcaggtagcacatattcgtgttatggagttgagttgaataaaataattttacaattaacttaatatgcaggaacatattgtgcaagatcccatgcaaggtcttatgatgagcaaccacaaacttaaataatcaaacaaagtttgttcaagttctgtagcggatgttgattaaaatacaattttatggtaaataaaggggcacataaagggtcaaattagacatgccagcctgaaatcaatcccatgcaaagtctggtgttagtcaaccttgttc-G-AATTTCAATCTCAGGCTAGGTACAG-TATTA----AG-CAACATTGTGT---A-T----AT-AT-T-T--CA-TAATAACCA-AG---AA----A-----TG----AC---TG---ACCAAGT--TGTTGAG---TGGCTATCG-ATAAAAATTC-----ATTTTT--TG---TT---AAAA-----AAA-GGGCC--ATAACTCACGT-AA--A----------------AT--T-TG-AGA----TGTG---GAGT---TG--------AACTT-C---AAT---CCCAT-ACAAGCCTTAG--TGAT---AAG---GAGTAA---TGTGT-T-CT-A-A-T---T--------TAAA---ACGAA-AAT--G-TC--TA-C----ATGTATCC---AAG-T------TATTGAGCAGATGTacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|11 : T---AAA------AAG-GGGAC--ACATCTAGTTC-AA--A----------------AT--T-TG-ATG----TGCG---GTGC---TG--------AAATT-C---AAT---TCCAT-GTAAAGTCTAG--GGTT---GAG---CATCCT---TGTGT-A-CT-A--TT---T--------TAAA---A--AG-AATCA---C--AAAT----ATTTATTCACTGAG-T------TATTGAGCAAA------ACAAAAAA-T---T--A-------TGT-T-AA------------TA--AAA--G-GC-AGTAAAATTC-AT-A--TAACA---TTACATATGTA-TGC-------CTGAAATACTATCCCATG-CAAGGTCT----A-ATGA---GA---AT---CA-ACCT--TGTGCA-TAA-A-TTT-G--ATAA-GAAT-C-----A-TG-CAACATTT--------GTT---ATTA--AGTGGAaacatgccggacggcaattaatggagcattataaaagctcacctactcaaaga
gi|12 : acacaGGC--ATAACTCGTGT-AA--A----------------AT--T-AA-ACA----TGTG---GAGC---TG--------AAATG-C---AAT---CCGAT-GCATAGTCTAG--TGAT---ACA---CAACGT---TGTCT-C-CA---------T--------TAA-------------C----------T----ATTTGTAC---GAG-T------TACTGAAAGGAAGTCGTATAAAACA-T---A----------------AA--C-TG------------A--G-TG----ATACTTA-AT-A--TAA-A---TGT-CTAT--G-TGC--GGA-GCTGAACTGCAAGCCAATA-CACAGTGT----A-GTGA---TT---TG---CA-ATCA--TGTGTA--------------GAAA-GAAT-C-----G-GA-CAA--TATGACTTCGAATA---AATG--AGCGGctcagtggagtggata
gi|13 : aAG-T------CATTGAACAGATGTTCA-TAAAATGGT---G--G-------GTG-T-GGCGA-GG-G---TTA--AAA--AAGG-C-CATTACTC-GT-G--TAATA---TTG-A-G---A-TGC--TGA--CTTCATTTCAATCCAGTG-TAAACTCT----A-GTAA---TA---AGGGCTA-A-----TGTGTA-CCA-AATTT-G--AAAT-GAAT-A-----G-GG-AAACATTTG--TTCCAGTT---ATTG--ATGGGATGTTtctgtccgccagcccgtacaaactgcgataaaata
gi|13 : a---AGT--CATTGAA---CAGATGTTC-AT-AAAATGGTG---GGTGTG-GCGAGGGT---TAA------AAA-AGGCC--ATTACTCGTGT-AA--T----------------AT--T--G-AGA----TGCT---GA-C---TT--------CATTT-C---AAT---CCAGT-GTAAACTCTAG--TAAT---AAGGGCTAA------TGTGT-A-CC-A-AAT---T--------TGAA---A--TG-AATAGG-GA--AA-C----ATTTGTTC---CAG-T------TATTGATGGGATGTTACAT---GTG-A---G--A-------TTC-T----------G---ATAACAAA--A-GT-A-CAT--CT--AT-G--TAC-A----GA-ATA---G-TCT--GGA-acatgtgagattctgataacaaaagtacatctatgtacagaatagtctggaaaactaaaaaatgttaatgatttgttaaatataaagttccagactaaa
gi|14 : aAATCCCATGTGATGTTTAC-TATTA----AA-CAACCTGATGT---A-C----AT-AT-A-T--GA-AAATAATTA-GG---AA----A-----CG----TT---TG-------------ATTGAG---CAGATACTA-ATTAAAATGT-----A--TTT-GTT---GTTTAAAATTAA--AAA-AGACC--ATGACTCATG--AA--A----------------AT--T-TG-ACC----AATA---GAGT---TG--------AAATA-C---ATC---TTTTT-GCATGGTCCTG--GGAT---AAG---GAAC-T---TACA--A-CA-A-ATA---T--------GAAA---A---------------------------TGTTC---GAT-T------CATTGAGCGAATGTT-----ACATG-T---GGCA-------TTC-C-AAT-G-TG-G---ACA--AAG--C-TC-A-CAT-GTTC-A-----TAG-A---TTA-Aaaactaaaaaatgttaatgatttgttaaatataaagttccagactaaa
gi|15 : ataaAATAATCG-AG---CA----A-----TG----AT---TATTCG---AGG--TATTTAG---CGAAAGTTG-ATTAAAATGC-----A--TTT-AAG---TT---AAAT-----AAA-ATAGCC-ATAACTCACGT-AC--A----------------AT--T-TA-ATG----TGCA---GTGT---TA--------AATTT-C---AAT---ACCAT-GTAAGGT-TTG--TCAT---AAG---GAACAC---TGTGT-G-CA-A-A-T---T--------TAAA---A--TG-AATGGG-CC--AG-G----GTTTGTTT---GAG-T------GGTCTGGCAAATGTT
gi|16 : TG-ATTAAAATGT-----TATTTT-TTG---GT---AAAT-----AAA------------------------------------------T--T-AG-GC---------------C---TA--------AAATA-C---A-T---CTCAT-GCAAAACCTAG--TGAT---AAG---CAAAAT---TATGT-T-CA-A-ATC---TA-------TAAA---acattttgggcgtcgacgccgacgaatatgtcattccaaaagcagctcaactatccatagaatagt
gi|16 : T-A-AAATACA-TCTCATGCAAAACCTAG-TGATA----AG-CAAAATTATGT---T-C----AA-AT-C-T--AT-AAATGATGA-AA---AA----A-----TGTAT-TT---TA---T---TGTAATATTAAATTTCAGATGTGGAATTTCAATGC-----CATtgatgaaaaaatgtattttattgtaatattaaatttcagatgtggaatttcaatgccatgcaagttcttgtaataaggaatgtgtgtactaattaaaaataaaagggtaaaatttgctcaaattattgagtggatattacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|16 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggccATG-TTCAA--A-------TCTAT-AA--A-TG-----ATG--AAA--A-A--A-TGTATTTT-ATTG--TAATA---TTA-A-A---T-TTC--AGATGTGGAATTTCAATGCCATG-CAAGTTCT----T-GTAA---TA---AG---GA-A-TG--TGTGTA-CTA-A--TT-A--AAAA-TAAA-A-----G-GG-TAAAATTTG--CTCAAATT---ATTG--AGTGGATATTgcaagttcttgtaataaggaatgtgtgtactaattaaaaataaaagggtaaaatttgctcaaattattgagtggatattacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|16 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattTGT-AA--T----------------AT--T-AA-ATT----T-CA---GATG---TG--------GAATTTC---AAT---GCCAT-GCAAGTTCTTG--TAAT---AAG---GAATGT----GTGT-A-CT-A-ATT-------------AAA---A--AT-AAAAGG-GT--AA-A----ATTTGCTC---AAA-T------TATTGAGTGGATATTacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|17 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattatgttcaaatctataaatgatgaaaaaatgtattttat-ACG----TGTG---AAGT---CA--------AACTT-C---AAT---CAAAT-GAAAGGTCTTT--TGAC---AAG---CAAACT---TGTGT-A-TC-A-ATT---T----------AA---G--AG-GATCAG-GC--AG-C----AATTGTTC---AAG-T------AACAGAGTGGACGCTGATTAAAATG-C---A--A-------T-----------------------AAG--G-AG-A-CACAACTC-A------AG-A---T----------------GGG-GTTTTGTTTCAATCCGATG-CAAGGTGT----T-GTGA----A---AG---GATACAC--AATGGA-CTT-A-TTT-------A-AAAT-A-----A-GGTCAATGTTTG--TTacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|18 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaaaagtaaataaacT---AAAA-----AAA-GGAAC--ATAACTCATG--AA--A----------------AT--T-A--ACAGA--TGCA---GAGC---TG--------AATTT-C---ATT---CCC-------------G--AGAT---TAG---CAACCT---TGTAT-A-TA-C-ATT---TCTTTTAGTTAAA---A--AA-AA
gi|18 : A--AAA--G-GA-A-CATAACTC-AT-G--AAA-A---TTA-ACAG--A-TGC--AGA-GCTGAATTTCATTCCC------------------GAGA---TT---AG---CA-ACCT--TGTATA-TAC-A-TTT-aagggacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|18 : taaaT-T-AA--A----A---AAA--AAA--G-GG-A-CATAACTT-GG-G--TAA-AAT-TTG-A-G---A-TGA--GGA-GTTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----------------------------CT--CG-------------------AAA-G----------A-GG-CTACACTTG--TTTGAGTT---ATTG--AGcttttagttaaaaaaaaaagggacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|19 : taaaaaaaggaacataactcatgaaaattaacagatgcagagctgaatttcattcccgagattagcaaccttgtatatacatttcttttag--TATTGAG---GTGATGTTG-AAAAAAATGC-----ACTTTT-GCA---GT---AAA------AAA-GGGGCCAAAAAAACATGT-AA--A----------------AT--A-TG-AGG----TGCA---GAGT---TG--------AAATT-T---AAT---CCTAT-GCAAACACTTG--TTAT---AAG---GTGTAT---TGTGC-A-TG-A-A-T---T--------CAAA---A--TG-AAT-AG-GCAAAA-C----ATTTGTTC---acattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|2 : GACTAGTAAATCTGTATTATTCAAGGCATTGAGCAAATGATGATTAAAACATAATTTTATGGTAACTAAAGGGACTTTATTAATGTAAC--A--TT-----ACATGTGAGAGACT-G-AGATACAATCCCATGCAAAGTCTAG-TGATA----AG-CAACCTTGTGT---A-T----AC-AT-T-C--AA-AAAGAATCA-AA---CA----A-----TG----TT---AA---G---AAT--TATTGAG---TGGATATTC-ATTAAAGTGC-----AATTCT-ATG---GC---AAAT-----AAA-GTGGC--ATAAGTCTGGT-AA--A----------------AT--T-AG-ACA----TGCA---AGCC---TG--------AAATA-C---AAT---CCCAA-GCAATGTATTA--TGAT---AAG---CAGACT---AGTAT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--AA-AGTCAC-CA--AA-T----ATTTGTTA---TAG-T------GTTTGAGC-ACTGTTGAATTAAATG-C---T--A-------TTT-TAAA--A-TGCA---ATA--AAA--G-AG-A-CATAACTC-AA-G--TAA-A---TTA-ATAC--A-TAC--ACA-GCTGAATTTTAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGA---TA---AG---CA-ATCT--TGTGAA-AAG-G-TTT-A--AAAA-GGAT-C-----A-GG-AAAGGATTA--CTCATGTTATAATTG--ATCAGATGTTGATTAAAATGCATTcattaacaaaattaatattacagttgtgtgggatgccgacaccactgaatggggtattacaaaaactcaactattcatagaataatc
gi|20 : AAAAAAAGAGCCATAA---ACGTTGT--A--TT----------CG-GTG-TT-A-AAATTCCATCCCATACAAGGTGTAG-TTAAA----AATCAACCTTGTGT---A-C-----C-AT-T-TTAAA-AAAGAATCG-GG---CA----A-----CG----TT---TA---TTTTAGT--TATTTGG---CA-ATATTG-ATAAAAA--------AAT----ATG---AT---AAAT-----AAA-GGGGC--ATAACTCGTGT-TA--C----------------AT-------ACC----TATG---AGTC---TG--------AAATG-C---AATCCGCCCAT-GCAAAGCCTAA--TGA----AAG---AAACAT---TGTGT-A-CA-C-ATT---T--------GAAA---c
gi|21 : ta----TT---TA---A---AAT--TATTGAG---CAAATGTTG-ATTAAAATGC-----AATTTA-ATG---AT---AAAT-----AAA-GGGGT--ATAACTCATGT-TA--ATATATGTATATCATGTATA-T-AT-ACC----TGCA---AGCC---TG--------AAATA-C---AAT---CCCAT-GTGAGGTGTTG--AAAT---AAG---CAGCTT---TGTGA-A-TA-A---T---T--------TACA---A--AG-AGTCAC-GC--AG-T----ATTTATAA---GAG-T------TATTGAACAGATATTGAATAAAATA-T---A--A-------TTT-
gi|22 : agttgcaaatttaacatattaaaacatatAA--G-AG-A-CATAACTT-AT-G--------------------A-TGT--GGA-GTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT----T-GTGA---TA---GG---TG-GATTAATGAGGA-TGA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-TA----A-AG-CAACATTTA--TTCAAGTC---ATTG--AGCAGATGCT
gi|23 : atgataaaacctttttttttgAA--G-AG-A-CATAACTT-AT-G--------------------A-TGT--GGA-GTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT----T-GTGA---TA---GG---TG-GATTAATGAGGA-TGA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-TA----A-AG-CAACATTTA--TTCAAGTC---ATTG--AGCAGATGCTatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|24 : atgataaaacctttttttttgCCATGCAAGATCTAG-TGATA----AA-CAACCTTGTAT---G-C----TG-TT-T-T--AA-AAAGAATAA-GG---TA----A-----CACTAATT---TA-------AGT--TCTTGAG---TGGATGTTG-AATAAAACAA-----AATTTT-ACA---AT---AAA------GAG-GGGGC--ATAACTCATGT-TA--C----------------AC--T-AC-ACA-------A---GA-C---TG--------AAATA-C---AAT---CCTGT-GCAAGCTCTAA--TGAT---CAG---CAACCT---TGTGT-A-CA-A-ATC---T--------TAatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|25 : taAGAG-TT-------TCAATCTCATATACTGTCTAGATG-TA----AG-CAATCATATAC---A-T----AC-AA-T-------AAATACTCA-GA---CA----G-----TAATACTT---TA---A---AGT--TATTAAA---CGGGTGCTA-ATTAATATAT-----AA-TTT-ATA---GTTA-AAAT-----A----TGCC--ATAACTCATGC-AC--A----------------AT--T-TA-ATA----TGTG---AAAT---TGAATTTTTAAAACG-C---AAT---CACAT-GCAAGta
gi|26 : gaacA--AAATGG-GG-A-CATAACTT-A--A--TTA-T---TTA-ATA---AATTT--AAA-G-TGAGTTTCAATCCTATA-CAAGG---------G-GA---TA---AG---CA-ACCA--TGTGTATCAA-A-TTA-G--AGAA-CAACAC-----A-G--CAACATGTT--TTCGAGGT---ATTG--AGTGAATGTTGAACAAAAtag
gi|26 : ttatgtttgAAC--ATGTT-TTCGAGGTATTGAGTGAATGTTGAACAAAAAGAAAGTTTAagaaagtttagacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|27 : ttatgtttgaaaatggggacataacttaattatttaataaatttaaagtgagtttcaatcctatacaaggggataagcaaccatgtgtatcaaattagagaacaacacagc--TATTGAG---CGGATGTTA-TTTAAAATGC-----ATATTT-GCG---GT---AAAC-----AAA--GTGC--ATAAGTCTTGT-AA--A----------------AT--TACGCACA----CGCGCCTGAAC---TG--------AATTA-CT--AAT---TCGGT-GCTAAGCATTG--TGAT---AAG---CAACAT---CGTGT-A-C----ATT---T--------Tgacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|28 : gcactttgtcattcataatgataaacaacagtgttgacacaaA--AAA--G-GG-G-AATAAGCC-AT-A--CAA-A---ATATATT---A-TGT--G-----TGACGTTTAATTCAAGT-CAAGGACT----T-GTGA---TA---AG---GA-GCGG--AATGTA-CT-----------AAAA-TAAC-T-----AGGG-CAAAGTTTG--CTTGAGAT---ATCA--AGAGGATGtat
gi|29 : a--AA-AATCAG-CT--AA-T----ATTTGTTT---GAG-T------TATTGAGCAGATGTTAAATAAAA--------------------------------------------A--G-GT-A-AATAGTTC-AT-G--TAA-A---TAA-ATA-----TGCTAGGA-GGTGAAATTCAATTTCATG-CAAGGTCA----A-ATAA---TA---AG---CA-ACTG--TGTGTA-CAA-A-TTT-G--AAAT-GATT-C-----A-GG-TTATATTTG--TTgtacagggacgacgaatggatagtcatagaaactcacctattcatagaataaa
gi|3 : AAAGGGGCATAACTCACATTAA--AGTTT-----A-GTGCG-GTG-TT-G-AAATTAAATGCCATGCAAGGTCTAG-------------CAACCATGTGTTTGA-T----TT-AT-T-------AAAAAATCA-AGAAACA----A-----TT----GT---TC---G---ATT--TATTGAG---CAGATGTTG-ATTAAAATGT-----AGTTTT-AGC---TT---AAA------AAT-GGCTC--CTAACTGATGT-AA--A----------------GT--G-AA-ACA----TGCA---GAGC---TG--------AATTT-C---TAT---CACAT-GGAAGGTACTG--TAAT---AAG---CAACCT---TGTGT-ATCA-A---T---C--------GAAA---A--AA-AATCAG-AA--AA-T----GATTGTTC---AAG-T------TATTGGGCAAATGTT-AATAAAAAG-T---AC-A-------GGT-T-AA-------------A--AAG--G-GG-C-CATAACTC-AT-G--TAA-AATTTTA---G---A-TGT--AGA-G----------ATCCCATG-CAAGCTCT----T-GTGA---TA---AG---GA-GTAA--TGTG-A-TTC-A-TTT-T--AAA-------------------------TG--TTCAAGTT---ACTG--AGCAGATGT
gi|30 : -C---AAT---TCAAT-GCAAG-----G--TGAC---AAG---CAGCCT---TATGT--------ATT---T----------AT---A--AG-AATCGGAGA--AA-C----AATTGTTC---AAA-T------TATTGTGCAGATGCTG-ATAAAA-------A--C-------TTG-T-------TG-G---AAA--AAA--A-GC-A--ACAACT----------------TTG-A-------------GA-TATGAACTTCAGTCCAATG-CAAGCTCT----T-GTGA---TA---AG---aacatgtgggatgcacattgatgaaatttcaaaaacccatctattcataaaatag
gi|31 : tTGTGT---A-C-----C-AT-T-T--GA-AATGAATCA-GG---TT----T-----TA----TT---T----G---TGT--TATTT-------GACAATG-ATCG----GG-----AAGTTA-ATG---AT---AAA------AAA-GGAAC--ATAACCCATGTTAATGA----------------AT--T-----CG----TGTG---ACGC---TG--------AAATT-C---AAT---ACCAT-TCACGGTTTAA--CGAT---AAC---CAACTT---TG
gi|32 : AATCCCATA-C---GTCT----T-GTGG---TATT-AG---GA-ATGC--TGTGTA-TCA-A-TTT-A--AAAT-GAAA-T-----T-GG-CAATGTTTC--TT---GTT---ATTG--AACctta
gi|33 : ---AAT---TCCAT-ACAAGCTCTAGACGGGT---AAG---CAATTA---TGTGT-A-AA-A-ATC---T---------GAA---A--AG-AATCGG-AA--AA-TGTTTATTTGTAC---GAG-C------AATTGAGCGGACATTATATTAAACG-T---A--A-------TTT-T-AA--GTTT-T---ATA--AAA--T-GG-G-CATAaatattacatttgtgatgccaatgttaacaaattagtaatttcaaaagttcaccaattcataggatagccga
gi|34 : gaaacagacacta-----AAA-TGGGT--TTTACTAATGT-AA--C----------------AT--G-TT-TTG----TGCT---GTGT---TG--------AAATT-C---ATT---CCCTT-GGAAGGTCTAG--TGAC---AAG----AGTAT---TGTGTAA-CA-A---T---T--------TAAA---A--TG-AATATG-GC--TA-C----ATGTGTTT---GAG-T------TATTTAGTAGATATT
gi|35 : aaAAGGTTT----T-GCGA---TA---GT---GA-ACAT--TTTGTA-CAA-G-TTT-A--AAAT-GCAT-A-----G-AG-CAACGTTT------GAATT---ATTG--AACGAATGacatgtggg
gi|36 : tCAAGGTTTTG--TGAT---AAG---TAACAA---TATGT-A-TC-A-ATT---T--------C------A--AGTTATGGA-GC--AA-T----GTTTGTTT---TAGAT------TTTTGAGCGGATTTTatataatttatgtttgacgtcgacaccagcgaatgggttattacaaaaacacacatagtcatacat
gi|37 : -----AAA-GGGGG--ATAACCCA----AA--A----------------ATAAT-TG-ATA----TACG---GTGT---TG--------AAATT-CCAAAAT---CTAAT-GCAAGTTGTAG--TGAT---AAG---CAG-------GCGT-A-TA-CTATT---T--------TGGA---A--AG-AATCAG-CC--AA-T----ATGTGTTT---AAG-T------TATTAAGacatgtgtgacggcgacggataggtgattgcaaaggctcacctactcatagaatatt
gi|38 : catataa---A-TGC--GAT-GTTGAATTTCAATTTCATG-CAATGTCT----T-GTGA---TA---AA---AA-GCTT--TGTGTG-CCA-A-TT-----AAAATTAAT-A-----G-GA-CAAGGTTTG--TTTAATTT---ATTG--AGCGGATATgaa
gi|39 : gtaacatttcgagTGAATTTCAATCC-ATG-CAAGTTCT----T-TTGA---TAGG-AG---TA-A-----TGTGCA-ACATA-TT-----ACAA-TGAT-TACTAAA-GG-TAACAATT--------GTT---ATTG--CACGGATGTcacatagtgaacgactga
gi|4 : tgaAAAAGAAGGGAGACAACTCATCTAAATTG--TC-----ATGTG---GAG-TTTGTAAATTCAATTCAATGCAATGTGATG-TGAT--------CAAC--TGTAT---A-CGTTTAA-TT-T-T--GA-AGAGAATTG-CG---CA----A-----TG----TTAGTTT---G---AGT--TACCGAG---CAGATATTA-A--AAAATGT-----GCTTTTTACG---AT---AAA------AAA-GGGAT--ATAACTCATGT-AA--T----------------AT--T-AT-CCG----TG-A---AAGCCCTTC--------AAATA-T---AAT---CCTAC-ACGAGTCCTAA--TGTT---GAG---CAACCG---GATAA-A-CA-A-ACTC--T--------TAAAT--A--AA-AATCGC-AC--AA-T----ATCTGTTA---AAA-T------TATTAAACAGCTGCTGAATAAAACG-G---A--AGTTCATGTTT-T-AA-------------A--AAA--G-TT-G-CAT--C-------------A---TTA-CTAC--G-TTT--GGA-ACTGAAATTCAGCCTCATG-CGAA------------GA---CA---GG---TA-A--------------A-A-TTTCG--TAAA-TGAG-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTTGCGTT---ATAA--AAACAATGTTGATTAAAATGCAaacatgtgcaacaccaacaaatgggccaatacacgag
gi|40 : tata-CATAACTCTAC----TAA-T---TTA-AAAC--A-GGT--AGA-GCTGAATTTCAACCATATG-CAAGGTCTAGTCTAGTGA---AA---AG---CA-ACCT--TGTGTA-CAA-A-TCT-GAAAAAA-GGAT-C-----A-Ggttttaccagtaaat
gi|41 : tttagatttaaaaattacGAAATTCAATCTCGTG-AAAG---T----T-GTGAATACA---AG---CA-ATTT--TGTGTA-CCA-T-TTT-G--AAAc
gi|42 : tcagggcagataaaacctggcgcagtacattgattttttatacactgtgttaaaTGTTG-ATTAAGATGT-----TATTTT-ACG---CT---TGAT-----CAA-GAAAC--ATAACTCATG--AA--A----------------AT--T-AATACG----TGTG---GAGC---CG--------AATTT-C---AAT---Cta
gi|43 : AAT-C-----A-AG-CAAGGAATG--TTTGAGTT---ATTG--AACGGATGTTGATT--GATGCATTatttggacaatccattaataatca
gi|43 : atAATCA-AG---CA----AGGAA-TG----TT---T----G---AGT--TATTGAA---CGGATGTTG-ATT--GATGC------ATTTT-AC----TT---AAA------AAA-TGGCC--TTAA---ATGA-AA--T----------------AT--T-TG-Attacttaaaaaatggccttaaatgaaatatttgagatacaacattaa
gi|44 : at--TGTGTA-CTA-A-TTC-A--AAAT-GAAT-A-----G-GG-CATCGTgatacaacattaa
gi|45 : T---TA---G---AGT--TATTGAG---CAGAT-------TAAAATGC-----AATTTT-ATG---GT---AAA------ATA-GTGGC--ATGACAGAGGT-AA--A----------------CT--T-------------------------------------ACA-C---AAT---CCCAT-GCAAAGCCTAG--Tcattgatgttacatgcggagtgccaacggatgtgtgtacaaaacctcacctatcaaaactagtt
gi|46 : ttgTGTAAGGTCAAG-TGATA----CG-CAACGTTGT-----A-CTG--AA-AT-T-T--GA-AAAGATTCG-G
gi|5 : A--A--TTGG---ACGGGC-AGAG-TT-G-AAACGCCATCCTACACAACGTCTGG-TAATT----AG-CAACCTTGTAT---A-T----AT-AT-T-T--GACAAAGAGTTGCAG---AA----ATTGATTG----CT---TA-------AGT--TACTGAG---CAGATGTTG-AC----ATG----------TT-GC-------------------------GC--ATGACTCTTGT-AA--A----------------AG--T-CA-GCG----TTTT---GAGC---TG--------AAATA-C---AAA---TCCAT-ACAAAGTTAAC--TGAT---AAG---CTAC--------GT-C-CAGA-ATTACAT--------TAAACGCA--CGAAATGGA-GC---A-T----A---GTTC---ATG-TAAAATGTGTTGTGCGGA-GT----TAAGATG-C---A--A-------TCT-C-AA--A-agtta
gi|5 : taatgttgtaagaagaatgTT-ACA---TT---AAACGCACGAAATGGAGC--ATAGTTCATGT-AA--A----------------AT--G-TG-TTG----TGCG---GAGT---TA--------AGATG-C---AAT---CTCAA-ACAAGAT---G--T-------AG---CAACAT---TTTGT-G-GA-A-GAT---T--------GAAA---A--AG--GTAGG-AC--AA-T----ACTTGTTC---GTA-T------AACTGAGAAGACATCGAAcaagatgtagcaacattttgtggaagattgaaaaaggtaggacaatacttgttcgtataactgagaagacatcgaagatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggcagagttgaaacgccatcctacacaacgtctggtaattagcaaccttgtatatatatttgacaaagagttgcagaaattgattgcttaagttactgagcagatgttgacatgttgcgcatgactcttgtaaaagtcagcgttttgagctgaaatacaaatccatacaaagttaactgataagctacgtccagaaCATGCAGTGTCTAG-TGACA----AA-CATCCTTGTGT---A-C----AACGT-T-T--G------------------------------------T---TA---G---AGT--TATTAAG---CGAATGTTA-ATCAAAATGC-----AATTTT-ATT---GT---AAAT-----AAT-GGTGC--ATAACTTACATAAA--A----------------AT--T-TG-gatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : attatatgg--------AAATG-C---AAT---TTTATTGTAAA---TAA--TGGT---GCA---TAAC-T---TACAT-A-AA-A-ATT---TGTG-----TAAA---A--AG-AATCTG-GC--AA-T----GGTCATT-----A----------ACTGAGTGGATGTTGATCA----G-T---G--A-------T-----AA--A-TA-A---A-A--CAA--G-GG-C-CATAACTC-AT-G--TAA-AA--TTG-GAG---A-TGT--GGA-GTTTAATTTCAGTCCTAAG-CAAACTCG----T-GTGA---TACAGAG---TA-A-----TGTGTA-CCA-A-TCT-A--AAAT-GAAT-A-----A-GG-CAACATCTG--TTTAAGTT---AATG--AATAGATtgtaaaaagaatctggcaatggtcattaactgagtggatgttgatcagtgataaataaaacaagggccataactcatgtaaaattggagatgtggagtttaatttcagtcctaagcaaactcgtgtgatacagagtaatgtgtaccaatctaaaatgaataaggcaacatctgtttaagttaatgaatagataatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|7 : attatatggcatgcagtgtctagtgacaaacatccttgtgtacaacgtttgttagagttattaagcgaatgttaatcaGGCTATTAAA---G-ATTATTTGAGTTATTGAGCGGCCCACAAATAAAACATAATTTTACATTATATAAAATGACAGACCCTATGTAAAG-A--AT-----ACAAGC-AGAG-TT-G-AATTTCAATCCCATGCAAGGTCTGG-ATTTA----AG-CCACC-TGTGA---A-C----AA-ATATAT--GA-AAAGAATAG-GG---CT----A-----TA----TT---TATTGG---AGT--TACTGTG---TAGACATCG-AACAATATGTAAAAAAAATTT-AGT---CT---GAA------AAG-AGGGA--ATAACTCATGC-AA--C----------------AT--T-CT-ATA----TGCA---GATT---TG--------AAATA-C---AAT---CACAT-ACAAGGTCTAGAATTATTTAAAG---CAACAT---TGTGT-T-CA-A-ATT---T----------GA---A--AT-AACTGT-AC--AA-A----ATCTGTGC---AAG-T------TATTGACTGAATGTTGAAaatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|8 : acTAAAAGAAGTGGCATAATCCATATAAT--T--TT-----TTAAGTG-GTG-TT-G-AAATTCATTCCAAAGCAAGAAGTAT-TGATA----AG-TAACCTTGTAT---AGC----AG--T-T-T--GA-AAAGAATCA-AG---CA----ACTTT-TG----GT---TT---G---AGC--TATTGAG---CAGATACTG-AATAAAATGT-----AATTTC-ATG---AT---GAAT-----AAG-GATTC--ATTGCT-ATGT-AA--T----------------AT--T-AT-ACACAATTTCT---AGTC---TG--------AAATA-C---AAT---TCCAT---------TTG-----T---AAG---CAACATTACTGCAT-G-CACA-ATA---T--------TA--------------C--------A-T----TTTTGTTT---AGG-T------TATTGAACAGATGTTAAATAAAAT--T---A--A-------TTT-T-----A-TG-T---TTA--AAA--
gi|9 : AGTGGATGTTAAATAAAACATAAACTTAGGTTAAAAAAAG-----CAAATCTTTTAAA--A----------CGAGTAA-AG-CT-G-TATATCAATCACATGCAATGATTAA-TGATA----AG-CAACCTTATGT---A-C----AG-AT-T-T--TG-AAATATACA-GG---CA----A-----TG----AC---TGTCCG---AGT--AATTGAG---CAGATGTTG-TTTcaaat
gi|9 : TCT----A-GTTA---TA---AG---CA-ATCG--TTTGTA-AAA-G-T---A--AAAA-TAAT-C-----A-TG-CGAAGACTG--TTCTTGTT---ATTGATATCGGATGCTGATGTAAATGCttgttatttgtatttataaaagggggtatgaaacaactacattttccagtttctagttataagcaatcgtttgtaaaagtaaaaataatcatgcgaagactgttcttgttattgatatcggatgctgatgtaaatgcccttttagt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|47 ): TGGGATGCCAACAAATGGGTAAAACGAAAACTCACCTATTCATAAAATAA
Unaligned ( gi|48 ): AGCTAAATTGTATTGTATATTATCTTTTAAAATATAAA
Unaligned ( gi|49 ): CTGAGTTATAAAGTGGGAATAACTCGTGCACAAATT
Alignments
lowQualScore : 33333 55555555555555555555 11111111 3333333333333333333333333 222222 11111111111 111111111 11111111 666666666666666666666666666666666666666 4444444444444444444444444 11111 1111111
lowQualScore : 1 33333 7 1 1 3 4 0 3 2 22222222222222222222 1 4 777 1 2 0 5555 2 444 4 22222222 2 2 44444 1 33 333 4444 2222222222222222222222222 22 333 1 1 0 999999 1 1 999999 444 000000 22 0 33 33 9999999999999999999 33 55555555555 4444 333333 44444444 22 333 222 1 333 2 33 222 222 77777 222 2 444 333 222222222 333 55555 11111111 444444 4444 1 444444 444 888888888888888888888888888888888888888 22 22 1 2222 44 0000000000000000000000000 3333 444 0 3 3 777777 222 777 5555 1 88888 55555 1 77777 22 2222222 1 1 2 444 44 333 22 6
lowQualScore : . ..... . . . . . . . . .................... . . ... . . . .... . ... . ........ . . ..... . .. ... .... ......................... .. ... . . . ...... . . ...... ... ...... .. . .. .. ................... .. ........... .... ...... ........ .. ... ... . ... . .. ... ... ..... ... . ... ... ......... ... ..... ........ ...... .... . ...... ... ....................................... .. .. . .... .. ......................... .... ... . . . ...... ... ... .... . ..... ..... . ..... .. ....... . . . ... .. ... .. .
lowQualScore : 0 00000 3 0 0 7 5 8 4 2 99999999999999999999 4 0 777 4 5 4 3333 5 111 7 11111111 4 4 44444 5 55 999 7777 4444444444444444444444444 44 000 6 6 8 111111 5 7 888888 888 000000 66 5 33 00 9999999999999999999 11 11111111111 0000 111111 77777777 77 333 111 2 888 3 44 333 333 55555 888 7 444 777 777777777 999 00000 88888888 111111 4444 5 444444 222 333333333333333333333333333333333333333 88 55 9 9999 00 5555555555555555555555555 6666 666 5 5 5 000000 888 222 1111 7 88888 22222 6 33333 11 8888888 7 8 4 444 11 777 99 0
consensus : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGGTATTGAGCGGATGNTGAATAAAACATAANTTTACGTTAAAAAAAGGGACATAACTCACGTAAA--A--TT-----ACGNGCGAGAG-TT-G-AAATTCAATCCCATGCAAGGTCTAG-TGATA----AG-CAACCTTGTGT---A-C----AN-AT-T-T--GA-AAAGAATCG-GG---CA----A-----TG----TT---TA---G---AGT--TATTGAG---CGGATGTTG-ATTAAAATGC-----AATTTT-ACG---GT---AAAT-----AAA-GGGGC--ATAACTCATGT-AA--A----------------AT--T-NG-ACG----TGCG---GAGC---TG--------AAATN-C---AAT---CCCAT-GCAAGGTCTNG--TGAT---AAG---CAACNT---TGTGT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--AG-AATCGG-GC--AA-T----ATTTGTTC---GAG-T------TATTGAGCGGATGTTGAATAAAATG-T---A--A-------TTT-T-AA--A-TG-G---ATA--AAA--G-GG-A-CATAACTC-AT-G--TAA-A---TTA-ATA---A-TGC--GGA-GCTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGA---TA---AG---CA-ACCT--TGTGTA-CNA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTCGAGTT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
Reference ( family-148 ) : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGGTATTGAGCGGATGNTGAATAAAACATAANTTTACGTTAAAAAAAGGGACATAACTCACGTAAA--A--TT-----ACGNGCGAGAG-TT-G-AAATTCAATCCCATGCAAGGTCTAG-TGATA----AG-CAACCTTGTGT---A-C----AN-AT-T-T--GA-AAAGAATCG-GG---CA----A-----TG----TT---TA---G---AGT--TATTGAG---CGGATGTTG-ATTAAAATGC-----AATTTT-ACG---GT---AAAT-----AAA-GGGGC--ATAACTCATGT-AA--A----------------AT--T-NG-ACG----TGCG---GAGC---TG--------AAATN-C---AAT---CCCAT-GCAAGGTCTNG--TGAT---AAG---CAACNT---TGTGT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--AG-AATCGG-GC--AA-T----ATTTGTTC---GAG-T------TATTGAGCGGATGTTGAATAAAATG-T---A--A-------TTT-T-AA--A-TG-G---ATA--AAA--G-GG-A-CATAACTC-AT-G--TAA-A---TTA-ATA---A-TGC--GGA-GCTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGA---TA---AG---CA-ACCT--TGTGTA-CNA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTCGAGTT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
gi|1 : AAAAAGGGACATTACTCACACAGA--A--TTTTATTATG-----GTG-TT---AAATTCAAACCCATGCAAGATCTTG-TGATATACAAC-CAACCTTGTGT---GTC----AT--T-T-T--GA-AAAAAATCA-GG---TAGCACA-----TA----TT---C----G---TGT--TATGGAG---TTGA-GTTG-AATAAAAT-------AATTTT-AC----------AAT-----TAA-----C--TTAAT--ATGC-AG--G----------------A--------ACA----TATT---G------TG--------CAA-------GAT---CCCAT-GCAAGGTCTTA--TGAT---GAG---CAACC----------A-CA-A-ACT---T-----------A---A--AT-AATCAA-AC--AA-A----GTTTGTTC---AAG-T------TCTGTAGCGGATGTTGATTAAAATA-C---A--A-------TTT-T-A-----TG-GTAAATA--AAG--G-GGCA-CATAA----AG-GGTCAA-A---TTA-GAC---A-TGC--CAG-CCTGAAAT-CAATCCCATG-CAAAGTCT----G-GTGT---TA---GT---CA-ACCT--TGT-T--CAA-A-CTT-G--AGA
gi|1 : ggcaaaccA--A----------------AC--T-TG-AGA----TACG---GAGT---TG--------AATTT-T---AAT---CCAAT-GCAAGAT-TTG--TGAT---AAG---TGGCAA---TGTATGG-CA-A---T---T--------TAAA---A--TA-AGTAGG-GC--TT-T----ATTTGTTC---AAG-A------AAATCTGTGGATGTTtacggagttgaattttaatccaatgcaagatttgtgataagtggcaatgtatggcaatttaaaataagtagggctttatttgttcaagaaaatctgtggatgttacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|10 : ggcaaaccaaaaagggacattactcacacagaattttattatggtgttaaattcaaacccatgcaagatcttgtgatatacaaccaaccttgtgtgtcattttgaaaaaaatcaggtagcacatattcgtgttatggagttgagttgaataaaataattttacaattaacttaatatgcaggaacatattgtgcaagatcccatgcaaggtcttatgatgagcaaccacaaacttaaataatcaaacaaagtttgttcaagttctgtagcggatgttgattaaaatacaattttatggtaaataaaggggcacataaagggtcaaattagacatgccagcctgaaatcaatcccatgcaaagtctggtgttagtcaaccttgttc-G-AATTTCAATCTCAGGCTAGGTACAG-TATTA----AG-CAACATTGTGT---A-T----AT-AT-T-T--CA-TAATAACCA-AG---AA----A-----TG----AC---TG---ACCAAGT--TGTTGAG---TGGCTATCG-ATAAAAATTC-----ATTTTT--TG---TT---AAAA-----AAA-GGGCC--ATAACTCACGT-AA--A----------------AT--T-TG-AGA----TGTG---GAGT---TG--------AACTT-C---AAT---CCCAT-ACAAGCCTTAG--TGAT---AAG---GAGTAA---TGTGT-T-CT-A-A-T---T--------TAAA---ACGAA-AAT--G-TC--TA-C----ATGTATCC---AAG-T------TATTGAGCAGATGTacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|11 : T---AAA------AAG-GGGAC--ACATCTAGTTC-AA--A----------------AT--T-TG-ATG----TGCG---GTGC---TG--------AAATT-C---AAT---TCCAT-GTAAAGTCTAG--GGTT---GAG---CATCCT---TGTGT-A-CT-A--TT---T--------TAAA---A--AG-AATCA---C--AAAT----ATTTATTCACTGAG-T------TATTGAGCAAA------ACAAAAAA-T---T--A-------TGT-T-AA------------TA--AAA--G-GC-AGTAAAATTC-AT-A--TAACA---TTACATATGTA-TGC-------CTGAAATACTATCCCATG-CAAGGTCT----A-ATGA---GA---AT---CA-ACCT--TGTGCA-TAA-A-TTT-G--ATAA-GAAT-C-----A-TG-CAACATTT--------GTT---ATTA--AGTGGAaacatgccggacggcaattaatggagcattataaaagctcacctactcaaaga
gi|12 : acacaGGC--ATAACTCGTGT-AA--A----------------AT--T-AA-ACA----TGTG---GAGC---TG--------AAATG-C---AAT---CCGAT-GCATAGTCTAG--TGAT---ACA---CAACGT---TGTCT-C-CA---------T--------TAA-------------C----------T----ATTTGTAC---GAG-T------TACTGAAAGGAAGTCGTATAAAACA-T---A----------------AA--C-TG------------A--G-TG----ATACTTA-AT-A--TAA-A---TGT-CTAT--G-TGC--GGA-GCTGAACTGCAAGCCAATA-CACAGTGT----A-GTGA---TT---TG---CA-ATCA--TGTGTA--------------GAAA-GAAT-C-----G-GA-CAA--TATGACTTCGAATA---AATG--AGCGGctcagtggagtggata
gi|13 : aAG-T------CATTGAACAGATGTTCA-TAAAATGGT---G--G-------GTG-T-GGCGA-GG-G---TTA--AAA--AAGG-C-CATTACTC-GT-G--TAATA---TTG-A-G---A-TGC--TGA--CTTCATTTCAATCCAGTG-TAAACTCT----A-GTAA---TA---AGGGCTA-A-----TGTGTA-CCA-AATTT-G--AAAT-GAAT-A-----G-GG-AAACATTTG--TTCCAGTT---ATTG--ATGGGATGTTtctgtccgccagcccgtacaaactgcgataaaata
gi|13 : a---AGT--CATTGAA---CAGATGTTC-AT-AAAATGGTG---GGTGTG-GCGAGGGT---TAA------AAA-AGGCC--ATTACTCGTGT-AA--T----------------AT--T--G-AGA----TGCT---GA-C---TT--------CATTT-C---AAT---CCAGT-GTAAACTCTAG--TAAT---AAGGGCTAA------TGTGT-A-CC-A-AAT---T--------TGAA---A--TG-AATAGG-GA--AA-C----ATTTGTTC---CAG-T------TATTGATGGGATGTTACAT---GTG-A---G--A-------TTC-T----------G---ATAACAAA--A-GT-A-CAT--CT--AT-G--TAC-A----GA-ATA---G-TCT--GGA-acatgtgagattctgataacaaaagtacatctatgtacagaatagtctggaaaactaaaaaatgttaatgatttgttaaatataaagttccagactaaa
gi|14 : aAATCCCATGTGATGTTTAC-TATTA----AA-CAACCTGATGT---A-C----AT-AT-A-T--GA-AAATAATTA-GG---AA----A-----CG----TT---TG-------------ATTGAG---CAGATACTA-ATTAAAATGT-----A--TTT-GTT---GTTTAAAATTAA--AAA-AGACC--ATGACTCATG--AA--A----------------AT--T-TG-ACC----AATA---GAGT---TG--------AAATA-C---ATC---TTTTT-GCATGGTCCTG--GGAT---AAG---GAAC-T---TACA--A-CA-A-ATA---T--------GAAA---A---------------------------TGTTC---GAT-T------CATTGAGCGAATGTT-----ACATG-T---GGCA-------TTC-C-AAT-G-TG-G---ACA--AAG--C-TC-A-CAT-GTTC-A-----TAG-A---TTA-Aaaactaaaaaatgttaatgatttgttaaatataaagttccagactaaa
gi|15 : ataaAATAATCG-AG---CA----A-----TG----AT---TATTCG---AGG--TATTTAG---CGAAAGTTG-ATTAAAATGC-----A--TTT-AAG---TT---AAAT-----AAA-ATAGCC-ATAACTCACGT-AC--A----------------AT--T-TA-ATG----TGCA---GTGT---TA--------AATTT-C---AAT---ACCAT-GTAAGGT-TTG--TCAT---AAG---GAACAC---TGTGT-G-CA-A-A-T---T--------TAAA---A--TG-AATGGG-CC--AG-G----GTTTGTTT---GAG-T------GGTCTGGCAAATGTT
gi|16 : TG-ATTAAAATGT-----TATTTT-TTG---GT---AAAT-----AAA------------------------------------------T--T-AG-GC---------------C---TA--------AAATA-C---A-T---CTCAT-GCAAAACCTAG--TGAT---AAG---CAAAAT---TATGT-T-CA-A-ATC---TA-------TAAA---acattttgggcgtcgacgccgacgaatatgtcattccaaaagcagctcaactatccatagaatagt
gi|16 : T-A-AAATACA-TCTCATGCAAAACCTAG-TGATA----AG-CAAAATTATGT---T-C----AA-AT-C-T--AT-AAATGATGA-AA---AA----A-----TGTAT-TT---TA---T---TGTAATATTAAATTTCAGATGTGGAATTTCAATGC-----CATtgatgaaaaaatgtattttattgtaatattaaatttcagatgtggaatttcaatgccatgcaagttcttgtaataaggaatgtgtgtactaattaaaaataaaagggtaaaatttgctcaaattattgagtggatattacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|16 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggccATG-TTCAA--A-------TCTAT-AA--A-TG-----ATG--AAA--A-A--A-TGTATTTT-ATTG--TAATA---TTA-A-A---T-TTC--AGATGTGGAATTTCAATGCCATG-CAAGTTCT----T-GTAA---TA---AG---GA-A-TG--TGTGTA-CTA-A--TT-A--AAAA-TAAA-A-----G-GG-TAAAATTTG--CTCAAATT---ATTG--AGTGGATATTgcaagttcttgtaataaggaatgtgtgtactaattaaaaataaaagggtaaaatttgctcaaattattgagtggatattacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|16 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattTGT-AA--T----------------AT--T-AA-ATT----T-CA---GATG---TG--------GAATTTC---AAT---GCCAT-GCAAGTTCTTG--TAAT---AAG---GAATGT----GTGT-A-CT-A-ATT-------------AAA---A--AT-AAAAGG-GT--AA-A----ATTTGCTC---AAA-T------TATTGAGTGGATATTacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|17 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataagcaaaattatgttcaaatctataaatgatgaaaaaatgtattttat-ACG----TGTG---AAGT---CA--------AACTT-C---AAT---CAAAT-GAAAGGTCTTT--TGAC---AAG---CAAACT---TGTGT-A-TC-A-ATT---T----------AA---G--AG-GATCAG-GC--AG-C----AATTGTTC---AAG-T------AACAGAGTGGACGCTGATTAAAATG-C---A--A-------T-----------------------AAG--G-AG-A-CACAACTC-A------AG-A---T----------------GGG-GTTTTGTTTCAATCCGATG-CAAGGTGT----T-GTGA----A---AG---GATACAC--AATGGA-CTT-A-TTT-------A-AAAT-A-----A-GGTCAATGTTTG--TTacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|18 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaaaagtaaataaacT---AAAA-----AAA-GGAAC--ATAACTCATG--AA--A----------------AT--T-A--ACAGA--TGCA---GAGC---TG--------AATTT-C---ATT---CCC-------------G--AGAT---TAG---CAACCT---TGTAT-A-TA-C-ATT---TCTTTTAGTTAAA---A--AA-AA
gi|18 : A--AAA--G-GA-A-CATAACTC-AT-G--AAA-A---TTA-ACAG--A-TGC--AGA-GCTGAATTTCATTCCC------------------GAGA---TT---AG---CA-ACCT--TGTATA-TAC-A-TTT-aagggacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|18 : taaaT-T-AA--A----A---AAA--AAA--G-GG-A-CATAACTT-GG-G--TAA-AAT-TTG-A-G---A-TGA--GGA-GTTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----------------------------CT--CG-------------------AAA-G----------A-GG-CTACACTTG--TTTGAGTT---ATTG--AGcttttagttaaaaaaaaaagggacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|19 : taaaaaaaggaacataactcatgaaaattaacagatgcagagctgaatttcattcccgagattagcaaccttgtatatacatttcttttag--TATTGAG---GTGATGTTG-AAAAAAATGC-----ACTTTT-GCA---GT---AAA------AAA-GGGGCCAAAAAAACATGT-AA--A----------------AT--A-TG-AGG----TGCA---GAGT---TG--------AAATT-T---AAT---CCTAT-GCAAACACTTG--TTAT---AAG---GTGTAT---TGTGC-A-TG-A-A-T---T--------CAAA---A--TG-AAT-AG-GCAAAA-C----ATTTGTTC---acattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|2 : GACTAGTAAATCTGTATTATTCAAGGCATTGAGCAAATGATGATTAAAACATAATTTTATGGTAACTAAAGGGACTTTATTAATGTAAC--A--TT-----ACATGTGAGAGACT-G-AGATACAATCCCATGCAAAGTCTAG-TGATA----AG-CAACCTTGTGT---A-T----AC-AT-T-C--AA-AAAGAATCA-AA---CA----A-----TG----TT---AA---G---AAT--TATTGAG---TGGATATTC-ATTAAAGTGC-----AATTCT-ATG---GC---AAAT-----AAA-GTGGC--ATAAGTCTGGT-AA--A----------------AT--T-AG-ACA----TGCA---AGCC---TG--------AAATA-C---AAT---CCCAA-GCAATGTATTA--TGAT---AAG---CAGACT---AGTAT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--AA-AGTCAC-CA--AA-T----ATTTGTTA---TAG-T------GTTTGAGC-ACTGTTGAATTAAATG-C---T--A-------TTT-TAAA--A-TGCA---ATA--AAA--G-AG-A-CATAACTC-AA-G--TAA-A---TTA-ATAC--A-TAC--ACA-GCTGAATTTTAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGA---TA---AG---CA-ATCT--TGTGAA-AAG-G-TTT-A--AAAA-GGAT-C-----A-GG-AAAGGATTA--CTCATGTTATAATTG--ATCAGATGTTGATTAAAATGCATTcattaacaaaattaatattacagttgtgtgggatgccgacaccactgaatggggtattacaaaaactcaactattcatagaataatc
gi|20 : AAAAAAAGAGCCATAA---ACGTTGT--A--TT----------CG-GTG-TT-A-AAATTCCATCCCATACAAGGTGTAG-TTAAA----AATCAACCTTGTGT---A-C-----C-AT-T-TTAAA-AAAGAATCG-GG---CA----A-----CG----TT---TA---TTTTAGT--TATTTGG---CA-ATATTG-ATAAAAA--------AAT----ATG---AT---AAAT-----AAA-GGGGC--ATAACTCGTGT-TA--C----------------AT-------ACC----TATG---AGTC---TG--------AAATG-C---AATCCGCCCAT-GCAAAGCCTAA--TGA----AAG---AAACAT---TGTGT-A-CA-C-ATT---T--------GAAA---c
gi|21 : ta----TT---TA---A---AAT--TATTGAG---CAAATGTTG-ATTAAAATGC-----AATTTA-ATG---AT---AAAT-----AAA-GGGGT--ATAACTCATGT-TA--ATATATGTATATCATGTATA-T-AT-ACC----TGCA---AGCC---TG--------AAATA-C---AAT---CCCAT-GTGAGGTGTTG--AAAT---AAG---CAGCTT---TGTGA-A-TA-A---T---T--------TACA---A--AG-AGTCAC-GC--AG-T----ATTTATAA---GAG-T------TATTGAACAGATATTGAATAAAATA-T---A--A-------TTT-
gi|22 : agttgcaaatttaacatattaaaacatatAA--G-AG-A-CATAACTT-AT-G--------------------A-TGT--GGA-GTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT----T-GTGA---TA---GG---TG-GATTAATGAGGA-TGA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-TA----A-AG-CAACATTTA--TTCAAGTC---ATTG--AGCAGATGCT
gi|23 : atgataaaacctttttttttgAA--G-AG-A-CATAACTT-AT-G--------------------A-TGT--GGA-GTTGAGTTTTAATCCC-TGACAAGCTTT----T-GTGA---TA---GG---TG-GATTAATGAGGA-TGA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-TA----A-AG-CAACATTTA--TTCAAGTC---ATTG--AGCAGATGCTatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|24 : atgataaaacctttttttttgCCATGCAAGATCTAG-TGATA----AA-CAACCTTGTAT---G-C----TG-TT-T-T--AA-AAAGAATAA-GG---TA----A-----CACTAATT---TA-------AGT--TCTTGAG---TGGATGTTG-AATAAAACAA-----AATTTT-ACA---AT---AAA------GAG-GGGGC--ATAACTCATGT-TA--C----------------AC--T-AC-ACA-------A---GA-C---TG--------AAATA-C---AAT---CCTGT-GCAAGCTCTAA--TGAT---CAG---CAACCT---TGTGT-A-CA-A-ATC---T--------TAatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|25 : taAGAG-TT-------TCAATCTCATATACTGTCTAGATG-TA----AG-CAATCATATAC---A-T----AC-AA-T-------AAATACTCA-GA---CA----G-----TAATACTT---TA---A---AGT--TATTAAA---CGGGTGCTA-ATTAATATAT-----AA-TTT-ATA---GTTA-AAAT-----A----TGCC--ATAACTCATGC-AC--A----------------AT--T-TA-ATA----TGTG---AAAT---TGAATTTTTAAAACG-C---AAT---CACAT-GCAAGta
gi|26 : gaacA--AAATGG-GG-A-CATAACTT-A--A--TTA-T---TTA-ATA---AATTT--AAA-G-TGAGTTTCAATCCTATA-CAAGG---------G-GA---TA---AG---CA-ACCA--TGTGTATCAA-A-TTA-G--AGAA-CAACAC-----A-G--CAACATGTT--TTCGAGGT---ATTG--AGTGAATGTTGAACAAAAtag
gi|26 : ttatgtttgAAC--ATGTT-TTCGAGGTATTGAGTGAATGTTGAACAAAAAGAAAGTTTAagaaagtttagacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|27 : ttatgtttgaaaatggggacataacttaattatttaataaatttaaagtgagtttcaatcctatacaaggggataagcaaccatgtgtatcaaattagagaacaacacagc--TATTGAG---CGGATGTTA-TTTAAAATGC-----ATATTT-GCG---GT---AAAC-----AAA--GTGC--ATAAGTCTTGT-AA--A----------------AT--TACGCACA----CGCGCCTGAAC---TG--------AATTA-CT--AAT---TCGGT-GCTAAGCATTG--TGAT---AAG---CAACAT---CGTGT-A-C----ATT---T--------Tgacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|28 : gcactttgtcattcataatgataaacaacagtgttgacacaaA--AAA--G-GG-G-AATAAGCC-AT-A--CAA-A---ATATATT---A-TGT--G-----TGACGTTTAATTCAAGT-CAAGGACT----T-GTGA---TA---AG---GA-GCGG--AATGTA-CT-----------AAAA-TAAC-T-----AGGG-CAAAGTTTG--CTTGAGAT---ATCA--AGAGGATGtat
gi|29 : a--AA-AATCAG-CT--AA-T----ATTTGTTT---GAG-T------TATTGAGCAGATGTTAAATAAAA--------------------------------------------A--G-GT-A-AATAGTTC-AT-G--TAA-A---TAA-ATA-----TGCTAGGA-GGTGAAATTCAATTTCATG-CAAGGTCA----A-ATAA---TA---AG---CA-ACTG--TGTGTA-CAA-A-TTT-G--AAAT-GATT-C-----A-GG-TTATATTTG--TTgtacagggacgacgaatggatagtcatagaaactcacctattcatagaataaa
gi|3 : AAAGGGGCATAACTCACATTAA--AGTTT-----A-GTGCG-GTG-TT-G-AAATTAAATGCCATGCAAGGTCTAG-------------CAACCATGTGTTTGA-T----TT-AT-T-------AAAAAATCA-AGAAACA----A-----TT----GT---TC---G---ATT--TATTGAG---CAGATGTTG-ATTAAAATGT-----AGTTTT-AGC---TT---AAA------AAT-GGCTC--CTAACTGATGT-AA--A----------------GT--G-AA-ACA----TGCA---GAGC---TG--------AATTT-C---TAT---CACAT-GGAAGGTACTG--TAAT---AAG---CAACCT---TGTGT-ATCA-A---T---C--------GAAA---A--AA-AATCAG-AA--AA-T----GATTGTTC---AAG-T------TATTGGGCAAATGTT-AATAAAAAG-T---AC-A-------GGT-T-AA-------------A--AAG--G-GG-C-CATAACTC-AT-G--TAA-AATTTTA---G---A-TGT--AGA-G----------ATCCCATG-CAAGCTCT----T-GTGA---TA---AG---GA-GTAA--TGTG-A-TTC-A-TTT-T--AAA-------------------------TG--TTCAAGTT---ACTG--AGCAGATGT
gi|30 : -C---AAT---TCAAT-GCAAG-----G--TGAC---AAG---CAGCCT---TATGT--------ATT---T----------AT---A--AG-AATCGGAGA--AA-C----AATTGTTC---AAA-T------TATTGTGCAGATGCTG-ATAAAA-------A--C-------TTG-T-------TG-G---AAA--AAA--A-GC-A--ACAACT----------------TTG-A-------------GA-TATGAACTTCAGTCCAATG-CAAGCTCT----T-GTGA---TA---AG---aacatgtgggatgcacattgatgaaatttcaaaaacccatctattcataaaatag
gi|31 : tTGTGT---A-C-----C-AT-T-T--GA-AATGAATCA-GG---TT----T-----TA----TT---T----G---TGT--TATTT-------GACAATG-ATCG----GG-----AAGTTA-ATG---AT---AAA------AAA-GGAAC--ATAACCCATGTTAATGA----------------AT--T-----CG----TGTG---ACGC---TG--------AAATT-C---AAT---ACCAT-TCACGGTTTAA--CGAT---AAC---CAACTT---TG
gi|32 : AATCCCATA-C---GTCT----T-GTGG---TATT-AG---GA-ATGC--TGTGTA-TCA-A-TTT-A--AAAT-GAAA-T-----T-GG-CAATGTTTC--TT---GTT---ATTG--AACctta
gi|33 : ---AAT---TCCAT-ACAAGCTCTAGACGGGT---AAG---CAATTA---TGTGT-A-AA-A-ATC---T---------GAA---A--AG-AATCGG-AA--AA-TGTTTATTTGTAC---GAG-C------AATTGAGCGGACATTATATTAAACG-T---A--A-------TTT-T-AA--GTTT-T---ATA--AAA--T-GG-G-CATAaatattacatttgtgatgccaatgttaacaaattagtaatttcaaaagttcaccaattcataggatagccga
gi|34 : gaaacagacacta-----AAA-TGGGT--TTTACTAATGT-AA--C----------------AT--G-TT-TTG----TGCT---GTGT---TG--------AAATT-C---ATT---CCCTT-GGAAGGTCTAG--TGAC---AAG----AGTAT---TGTGTAA-CA-A---T---T--------TAAA---A--TG-AATATG-GC--TA-C----ATGTGTTT---GAG-T------TATTTAGTAGATATT
gi|35 : aaAAGGTTT----T-GCGA---TA---GT---GA-ACAT--TTTGTA-CAA-G-TTT-A--AAAT-GCAT-A-----G-AG-CAACGTTT------GAATT---ATTG--AACGAATGacatgtggg
gi|36 : tCAAGGTTTTG--TGAT---AAG---TAACAA---TATGT-A-TC-A-ATT---T--------C------A--AGTTATGGA-GC--AA-T----GTTTGTTT---TAGAT------TTTTGAGCGGATTTTatataatttatgtttgacgtcgacaccagcgaatgggttattacaaaaacacacatagtcatacat
gi|37 : -----AAA-GGGGG--ATAACCCA----AA--A----------------ATAAT-TG-ATA----TACG---GTGT---TG--------AAATT-CCAAAAT---CTAAT-GCAAGTTGTAG--TGAT---AAG---CAG-------GCGT-A-TA-CTATT---T--------TGGA---A--AG-AATCAG-CC--AA-T----ATGTGTTT---AAG-T------TATTAAGacatgtgtgacggcgacggataggtgattgcaaaggctcacctactcatagaatatt
gi|38 : catataa---A-TGC--GAT-GTTGAATTTCAATTTCATG-CAATGTCT----T-GTGA---TA---AA---AA-GCTT--TGTGTG-CCA-A-TT-----AAAATTAAT-A-----G-GA-CAAGGTTTG--TTTAATTT---ATTG--AGCGGATATgaa
gi|39 : gtaacatttcgagTGAATTTCAATCC-ATG-CAAGTTCT----T-TTGA---TAGG-AG---TA-A-----TGTGCA-ACATA-TT-----ACAA-TGAT-TACTAAA-GG-TAACAATT--------GTT---ATTG--CACGGATGTcacatagtgaacgactga
gi|4 : tgaAAAAGAAGGGAGACAACTCATCTAAATTG--TC-----ATGTG---GAG-TTTGTAAATTCAATTCAATGCAATGTGATG-TGAT--------CAAC--TGTAT---A-CGTTTAA-TT-T-T--GA-AGAGAATTG-CG---CA----A-----TG----TTAGTTT---G---AGT--TACCGAG---CAGATATTA-A--AAAATGT-----GCTTTTTACG---AT---AAA------AAA-GGGAT--ATAACTCATGT-AA--T----------------AT--T-AT-CCG----TG-A---AAGCCCTTC--------AAATA-T---AAT---CCTAC-ACGAGTCCTAA--TGTT---GAG---CAACCG---GATAA-A-CA-A-ACTC--T--------TAAAT--A--AA-AATCGC-AC--AA-T----ATCTGTTA---AAA-T------TATTAAACAGCTGCTGAATAAAACG-G---A--AGTTCATGTTT-T-AA-------------A--AAA--G-TT-G-CAT--C-------------A---TTA-CTAC--G-TTT--GGA-ACTGAAATTCAGCCTCATG-CGAA------------GA---CA---GG---TA-A--------------A-A-TTTCG--TAAA-TGAG-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTTGCGTT---ATAA--AAACAATGTTGATTAAAATGCAaacatgtgcaacaccaacaaatgggccaatacacgag
gi|40 : tata-CATAACTCTAC----TAA-T---TTA-AAAC--A-GGT--AGA-GCTGAATTTCAACCATATG-CAAGGTCTAGTCTAGTGA---AA---AG---CA-ACCT--TGTGTA-CAA-A-TCT-GAAAAAA-GGAT-C-----A-Ggttttaccagtaaat
gi|41 : tttagatttaaaaattacGAAATTCAATCTCGTG-AAAG---T----T-GTGAATACA---AG---CA-ATTT--TGTGTA-CCA-T-TTT-G--AAAc
gi|42 : tcagggcagataaaacctggcgcagtacattgattttttatacactgtgttaaaTGTTG-ATTAAGATGT-----TATTTT-ACG---CT---TGAT-----CAA-GAAAC--ATAACTCATG--AA--A----------------AT--T-AATACG----TGTG---GAGC---CG--------AATTT-C---AAT---Cta
gi|43 : AAT-C-----A-AG-CAAGGAATG--TTTGAGTT---ATTG--AACGGATGTTGATT--GATGCATTatttggacaatccattaataatca
gi|43 : atAATCA-AG---CA----AGGAA-TG----TT---T----G---AGT--TATTGAA---CGGATGTTG-ATT--GATGC------ATTTT-AC----TT---AAA------AAA-TGGCC--TTAA---ATGA-AA--T----------------AT--T-TG-Attacttaaaaaatggccttaaatgaaatatttgagatacaacattaa
gi|44 : at--TGTGTA-CTA-A-TTC-A--AAAT-GAAT-A-----G-GG-CATCGTgatacaacattaa
gi|45 : T---TA---G---AGT--TATTGAG---CAGAT-------TAAAATGC-----AATTTT-ATG---GT---AAA------ATA-GTGGC--ATGACAGAGGT-AA--A----------------CT--T-------------------------------------ACA-C---AAT---CCCAT-GCAAAGCCTAG--Tcattgatgttacatgcggagtgccaacggatgtgtgtacaaaacctcacctatcaaaactagtt
gi|46 : ttgTGTAAGGTCAAG-TGATA----CG-CAACGTTGT-----A-CTG--AA-AT-T-T--GA-AAAGATTCG-G
gi|5 : A--A--TTGG---ACGGGC-AGAG-TT-G-AAACGCCATCCTACACAACGTCTGG-TAATT----AG-CAACCTTGTAT---A-T----AT-AT-T-T--GACAAAGAGTTGCAG---AA----ATTGATTG----CT---TA-------AGT--TACTGAG---CAGATGTTG-AC----ATG----------TT-GC-------------------------GC--ATGACTCTTGT-AA--A----------------AG--T-CA-GCG----TTTT---GAGC---TG--------AAATA-C---AAA---TCCAT-ACAAAGTTAAC--TGAT---AAG---CTAC--------GT-C-CAGA-ATTACAT--------TAAACGCA--CGAAATGGA-GC---A-T----A---GTTC---ATG-TAAAATGTGTTGTGCGGA-GT----TAAGATG-C---A--A-------TCT-C-AA--A-agtta
gi|5 : taatgttgtaagaagaatgTT-ACA---TT---AAACGCACGAAATGGAGC--ATAGTTCATGT-AA--A----------------AT--G-TG-TTG----TGCG---GAGT---TA--------AGATG-C---AAT---CTCAA-ACAAGAT---G--T-------AG---CAACAT---TTTGT-G-GA-A-GAT---T--------GAAA---A--AG--GTAGG-AC--AA-T----ACTTGTTC---GTA-T------AACTGAGAAGACATCGAAcaagatgtagcaacattttgtggaagattgaaaaaggtaggacaatacttgttcgtataactgagaagacatcgaagatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggcagagttgaaacgccatcctacacaacgtctggtaattagcaaccttgtatatatatttgacaaagagttgcagaaattgattgcttaagttactgagcagatgttgacatgttgcgcatgactcttgtaaaagtcagcgttttgagctgaaatacaaatccatacaaagttaactgataagctacgtccagaaCATGCAGTGTCTAG-TGACA----AA-CATCCTTGTGT---A-C----AACGT-T-T--G------------------------------------T---TA---G---AGT--TATTAAG---CGAATGTTA-ATCAAAATGC-----AATTTT-ATT---GT---AAAT-----AAT-GGTGC--ATAACTTACATAAA--A----------------AT--T-TG-gatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : attatatgg--------AAATG-C---AAT---TTTATTGTAAA---TAA--TGGT---GCA---TAAC-T---TACAT-A-AA-A-ATT---TGTG-----TAAA---A--AG-AATCTG-GC--AA-T----GGTCATT-----A----------ACTGAGTGGATGTTGATCA----G-T---G--A-------T-----AA--A-TA-A---A-A--CAA--G-GG-C-CATAACTC-AT-G--TAA-AA--TTG-GAG---A-TGT--GGA-GTTTAATTTCAGTCCTAAG-CAAACTCG----T-GTGA---TACAGAG---TA-A-----TGTGTA-CCA-A-TCT-A--AAAT-GAAT-A-----A-GG-CAACATCTG--TTTAAGTT---AATG--AATAGATtgtaaaaagaatctggcaatggtcattaactgagtggatgttgatcagtgataaataaaacaagggccataactcatgtaaaattggagatgtggagtttaatttcagtcctaagcaaactcgtgtgatacagagtaatgtgtaccaatctaaaatgaataaggcaacatctgtttaagttaatgaatagataatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|7 : attatatggcatgcagtgtctagtgacaaacatccttgtgtacaacgtttgttagagttattaagcgaatgttaatcaGGCTATTAAA---G-ATTATTTGAGTTATTGAGCGGCCCACAAATAAAACATAATTTTACATTATATAAAATGACAGACCCTATGTAAAG-A--AT-----ACAAGC-AGAG-TT-G-AATTTCAATCCCATGCAAGGTCTGG-ATTTA----AG-CCACC-TGTGA---A-C----AA-ATATAT--GA-AAAGAATAG-GG---CT----A-----TA----TT---TATTGG---AGT--TACTGTG---TAGACATCG-AACAATATGTAAAAAAAATTT-AGT---CT---GAA------AAG-AGGGA--ATAACTCATGC-AA--C----------------AT--T-CT-ATA----TGCA---GATT---TG--------AAATA-C---AAT---CACAT-ACAAGGTCTAGAATTATTTAAAG---CAACAT---TGTGT-T-CA-A-ATT---T----------GA---A--AT-AACTGT-AC--AA-A----ATCTGTGC---AAG-T------TATTGACTGAATGTTGAAaatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|8 : acTAAAAGAAGTGGCATAATCCATATAAT--T--TT-----TTAAGTG-GTG-TT-G-AAATTCATTCCAAAGCAAGAAGTAT-TGATA----AG-TAACCTTGTAT---AGC----AG--T-T-T--GA-AAAGAATCA-AG---CA----ACTTT-TG----GT---TT---G---AGC--TATTGAG---CAGATACTG-AATAAAATGT-----AATTTC-ATG---AT---GAAT-----AAG-GATTC--ATTGCT-ATGT-AA--T----------------AT--T-AT-ACACAATTTCT---AGTC---TG--------AAATA-C---AAT---TCCAT---------TTG-----T---AAG---CAACATTACTGCAT-G-CACA-ATA---T--------TA--------------C--------A-T----TTTTGTTT---AGG-T------TATTGAACAGATGTTAAATAAAAT--T---A--A-------TTT-T-----A-TG-T---TTA--AAA--
gi|9 : AGTGGATGTTAAATAAAACATAAACTTAGGTTAAAAAAAG-----CAAATCTTTTAAA--A----------CGAGTAA-AG-CT-G-TATATCAATCACATGCAATGATTAA-TGATA----AG-CAACCTTATGT---A-C----AG-AT-T-T--TG-AAATATACA-GG---CA----A-----TG----AC---TGTCCG---AGT--AATTGAG---CAGATGTTG-TTTcaaat
gi|9 : TCT----A-GTTA---TA---AG---CA-ATCG--TTTGTA-AAA-G-T---A--AAAA-TAAT-C-----A-TG-CGAAGACTG--TTCTTGTT---ATTGATATCGGATGCTGATGTAAATGCttgttatttgtatttataaaagggggtatgaaacaactacattttccagtttctagttataagcaatcgtttgtaaaagtaaaaataatcatgcgaagactgttcttgttattgatatcggatgctgatgtaaatgcccttttagt
blockSeqs : T CAT A T G C G T G ATTGGACGGGCA A A TGT G A . T TTG G GTTTAAT A A TAAA T GC AAA . TAATACTTTAA AA TTT G A TAAAAA T T CGAGGG TTA CGCACG TG CA TT ATATATGTATATCATGT AA ATACACAAT GCCT AGCCCT AATTTTTA TT CAA CCG T CCT T AC TTA GGC ATTAC GG G TAT ACA CTTTTAGTT CGC CGAA AGGCAA TGTTT ACTG A AAAATG GTA TGGTGGGTGTGGCGAGGGTT AC TG A CAG CT TATAACATTACATATGTA CTAG TGT A G AGTCTA ATA CAG GGCT T ATTAA TCAA A TGAA AT TACTAA G T C GAC CG ATA AT A
blockSeqs : G . A T G A C G ATTACATGTGA T . G T . . . . . TGAAA . . GAC T A . . TTGATTGCTTA . . A . GTG G . TGT TA TTAA G C TA TGA A ACGCACA G AGT . T T . . GTC A AA . . AA AT C AA C GTGT T AGT CGGAGA AT A . . ACA TGTGGCATTCCAATGTGGAC . . . GC C TATAAATGTCTATG CG GC A G A . TT C . ATTAA ACAT . TCG A TA . . A G CC . . A
blockSeqs : T A G C A AGTTTAGTGCG A . A A . . . . . AACG . . CA T A . . CTTTTGGTTTG . . A . C A . TTG . A G . T A . AACAGA G AGT . T . . . GTC A . . . AA AA . AT . AT . CGA AGGGC T A . . GAT TGTTCAAATCTATAAATGAT . . . TA A TTGTAATATTAAAT CT GT . C A . GG C . CCT TAA . TG T TA . . T G CA . . T
blockSeqs : G C C GAATACAAGCA T . G A . . . . . ATA . . GA T G . . TGACTGACCA . . G . T A . AGT . T A . C A . AATACG G TGC . T . . . CTC A . . . CT T . AT . T . TA AGGGA C G . . GAA TGCTATTTTAAAATGCAAT . . . CA C TGAAAATTAACAGA TG GC . T A . . G . TCA CCA . TG A AC . . C G TG . . .
blockSeqs : T T G TTGTCATGTG A . A G . . . . . ATA . . AT G A . . TGATTATTCG . . A . C C . TGG . T A . T A . TGAGA G AGC . G . . . GTC A . . . GT A . AT . T . AG GGGCC T C . . GAA CGTAATTTTAAGTTTTAT . . . GA C GGTAAAATTTGAGA CA GT . G T . . G . CAC CTA . TA A C . . G G CA . .
blockSeqs : T A A TTTTTAAGTG A . G G . . . . . AAA . . AA G A . . TGTATTTTAT . . T . T A . CAG . A A . T A . TGAGA T AGT . T . . . ACC T . . . AC C . AT . T . TG AGGGT C G . . AAA CGGAAGTTCATGTTTTAA . . . AA T AGTAAATTAATACA CA GC . G T . . C . CCT CTT . TA A A . . C A CA . .
blockSeqs : . . T ACGAGTAA A . G T . . . . . ACA . . AA G G . . CGTTTATTTT . . G . C A . TGG . T G . T T . TGATG A TGT . A . . . TTC T . . . AT A . AT . T . TG CAGGC G G . . ATA TTAATTTTATGTTT . . . GA C TACAAAATATATTA AG GT . G T . . C . TCT TAC . TG A A . . C A CA . .
blockSeqs : ATTCG T . G G . . . . . TGT . . GA T A . . CACTAATTTA . . A . C A . TGA . T G . T A . AAACA A ATG . T . . . GTC A . . . GT A . AT . T . AT CACCA A A . . GAA AATTATGTTAAT . . . GA C TGTAAAATTTTAGA CA GT . C T . . T . CCA AAG . TG A A . . C A CG . .
blockSeqs : A . G T . . . . . ACA . . GA A A . . TGTTAGTTTG . . A . C A . TGA . T G . T A . TGACC A AGT . A . . . CAC T . . . CT G . AT . G . AG CACGC C A . . GAA TGAGATTCTGAT . . . GA T TGTAAAATTGGAGA TG GG . C T . . T . CGG TGA . AG A C . . A T TG . .
blockSeqs : G G . . . . . TTA . . GA G A . . GGAATGTTTG . . G . C A . CAA . T G . T T . TAATG G AGC . T . . . GTA T . . . CT T . AT . T . AA CAGCT C T . . GAT AGTACAGGTTAA . . . GA C TGTAATATTGAGA TG TA . G T . . C . CTG TGA . TG A T . . T G CA . .
blockSeqs : . C . . . . . ATA . . GA G A . . TATTTATTGG . . G . A T . TAG . C G . T A . AAATT A AGT . T . . . GCC T . . . AT A . AT . C . TG CAGAA T G . . GAA GTGATAAATAAA . . . GA T ATTATTTAATAAA TA GT . G A . . G . TAA CAA . TT A C . . T G TA . .
blockSeqs : T . . . . . AAA . . GA G G . . TGACTGTCCG . . G . T G . CGG . T G . T A . TGAGG A GCC . T . . . GTG T . . . CT A . AT . T . AA CGGAA T G . . AAA ACTTGTTGGAA . . . GG T CTAATTTAAAACA TG AC . G T . . C . TGC TTC . TA T T . . C G TG . .
blockSeqs : G . . . . . AGA . . TG G A . . TGTTAAG . . A . C A . GCT . T G . T A . AGACA A GTC . A . . . CTC A . . . AT A . AT . G . AG ATGGC T A . . CA CATAAACTG . . . TA T TGTACAGAATAG TA GC . C T . . G . CAT TCA . TA T A . . G C TG . .
blockSeqs : G . . . . . CA . . G G G . . TTGTTCG . . A . T C . TGA . T G . C C . ATACC G GCC . G . . . GCA T . . . TT A . AT . T . AA GGAGC T A . . AA TGCAAT . . . GC C TGTAAATAAATA CG GT . C T . . G . CTT CAA . TG T A . . C G TA . .
blockSeqs : T . . . . . CA . . . G G . . CGTTTG . . G . G A . CGA . . T . T C . ACACA A AAT . A . . . GTA A . . . CT A . AC . T . AA CAGCC C G . . GA . . . . CA C ATTACTACG TG C . G T . . G . CCT CCA . CA A C . . C G CT . .
blockSeqs : . . AG . . . T A . . TATTTG . . A . T A . CGC . . G . T A . TAATA A AAC . A . . . GTT T . . . AT A . AT . T . AG CGCAC C G . . A . . . GG C AGAT TA C . G T . . A . TTT CAA . TA A C . . G G G . .
blockSeqs : . A . . TTAG . . A . T A . TGG . . G . T A . AAACA G AGC . G . . . CTC T . . . CT A . GA . G . AG GGAGC T T . . . . . . TG C TTGA TG G . G T . . T . TCG CCA . T A C . . C G . . .
blockSeqs : . . . G . C A . CAT . . G . T A . TTTTG A CGC . A . . . GTC A . . . CT A . AT . T . TG AGGAC T A . . . . . . GC . TGA C G . T T . . T . TG CTA . A T A . . C G . . .
blockSeqs : . . A . C A . TTG . . T . A C . TGATA G TGT . T . . . GTT A . . . TT A . AT . C . AG CTGGC T A . . . . . G . TGA G . . G T . . C . CT CCA . . T A . . A .
blockSeqs : . . A . C A . GTC . . G . T A . ATCCG T TGT . T . . . TTG A . . . TA A . AT . T . AA TGTAC T A . . . . A . . . C A . . C . . AAA . . A C . . . .
blockSeqs : . . A . T . . TGA . . G . T T . CAGCG G AGC . T . . . TCC T . . . AT A . A . T . AG GTC T G . . . . . . . . T . . CT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . CT . . A . T A . TGTTG A AGC . T . . . GCC A . . . AA A . T . T . AG CAC T A . . . . . . . C . . A . . . .
blockSeqs : . . . . C . . G . C T . CTATA G AGT . A . . . GTT A . . . CG A . A . G . AT C A A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T A . GAGA T ATT . T . . . GTC A . . . AT C . A . T . . C T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . AGGC G GTC . A . . . AT A . . . AT G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . ACC A AC . A . . . GT A . . . T A . . . . . .
blockSeqs : . . . A . CG T AC . G . . . AT A . . . T T . . . . .
blockSeqs : . . C . . . C . G . . . . T . . . . G . . . .
blockSeqs : . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : G** **** ANA***** **** TGNTTGTTCG*************** C***** CGG*** G* NGACG****** AGC*** N* NT*** T******** TGTAATTTTAAGTTAT*********************** GA** C* TGTAAAATTTAGA************ G** CG
originalCons : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGGTATTGAGCGGATGNTGAATAAAACATAANTTTACGTTAAAAAAAGGGACATAACTCACGTAAA--A--TT-----ACGNGCGAGAG-TT-G-AAATTCAATCCCATGCAAGGTCTAG-TGATA----AG-CAACCTTGTGT---A-C----AN-AT-T-T--GA-AAAGAATCG-GG---CA----A-----TG----TT---TA---G---AGT--TATTGAG---CGGATGTTG-ATTAAAATGC-----AATTTT-ACG---GT---AAAT-----AAA-GGGGC--ATAACTCATGT-AA--A----------------AT--T-NG-ACG----TGCG---GAGC---TG--------AAATN-C---AAT---CCCAT-GCAAGGTCTNG--TGAT---AAG---CAACNT---TGTGT-A-CA-A-ATT---T--------TAAA---A--AG-AATCGG-GC--AA-T----ATTTGTTC---GAG-T------TATTGAGCGGATGTTGAATAAAATG-T---A--A-------TTT-T-AA--A-TG-G---ATA--AAA--G-GG-A-CATAACTC-AT-G--TAA-A---TTA-ATA---A-TGC--GGA-GCTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGA---TA---AG---CA-ACCT--TGTGTA-CNA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTCGAGTT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
finalCons : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGGTATTGAGCGGATGNTGAATAAAACATAANTTTACGTTAAAAAAAGGGACATAACTCACGTAAA--A--TT-----ACGNGCGAGAG-TTG--AAATTCAATCCCATGCAAGGTCTAG-TGATA----AG-CAACCTTGTGT---A-CANA-----T-T-T--GA-AAAGAATCG-GG---CA----ATGNTTGTTCG---------------AGT--TATTGAG---CGGATGTTG-ATTAAAATGC-----AATTTT-ACGG---T---AAAT-----AAAG-GGGC--ATAACTCATGT-AA--A----------------AT--TNGACG------TGCG---GAGC---TG--------AAATN-C---AAT---CCCAT-GCAAGGTCTNG--TGAT---AAG---CAACNT---TGTGT-A-CA-A-ATT---TT--------AAA---A--AG-AATCGG-GC--AA-T----ATTTGTTC---GAG-T------TATTGAGCGGATGTTGAATAAAATGTAATTTTAAGTTAT-----------------------A--AAA--G-GGA--CATAACTC-ATGTAAAATTTAGA------------TGC--GGA-GCTGAATTTCAATCCCATG-CAAGGTCT----T-GTGA---TA---AG---CA-ACCT--TGTGTA-CNA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTCGAGTT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|47 ): TGGGATGCCAACAAATGGGTAAAACGAAAACTCACCTATTCATAAAATAA
Unaligned ( gi|48 ): AGCTAAATTGTATTGTATATTATCTTTTAAAATATAAA
Unaligned ( gi|49 ): CTGAGTTATAAAGTGGGAATAACTCGTGCACAAATT
Alignments
lowQualScore : 33333 55555555555555555555 111111111 111111 111111 11111111111111 111111111 11111 222222222222222222222222222 2222222222222222222222 11111 1111111
lowQualScore : 1 33333 7 1 1 3 4 0 3 2 55555555555555555555 1 4 3 3 0 5555 2 444 666666666 2 2 333 2 0 22 0 2 1 2 3 0 22 99999999 1 111111 222 999999 44444444 11 22 9999999999999999999 44444444444444 55555 11 222 1 2 333 222 1 0 3 2 44 222 66666 2 555 111 333 333333333 444 55555 11111 22 222 333333 1 3333 1 666666 1 1 777777777777777777777777777 22 44444 44444 7777777777777777777777 55 22 88888888 0 55555555 1 3 4 1 666666 222 666 5555 1 99999 555 1 1 6666 222 3333333 1 1 22 444 55 333 22
lowQualScore : . ..... . . . . . . . . .................... . . . . . .... . ... ......... . . ... . . .. . . . . . . .. ........ . ...... ... ...... ........ .. .. ................... .............. ..... .. ... . . ... ... . . . . .. ... ..... . ... ... ... ......... ... ..... ..... .. ... ...... . .... . ...... . . ........................... .. ..... ..... ...................... .. .. ........ . ........ . . . . ...... ... ... .... . ..... ... . . .... ... ....... . . .. ... .. ... ..
lowQualScore : 0 00000 3 0 0 7 5 8 4 2 11111111111111111111 4 0 6 6 5 7777 7 444 555555555 5 5 777 5 2 55 2 4 0 2 2 7 33 11111111 7 222222 777 111111 66666666 99 99 4444444444444444444 99999999999999 11111 22 555 4 8 555 333 3 7 1 4 88 333 33333 8 222 888 888 444444444 111 88888 11111 11 777 555555 5 4444 5 000000 0 2 999999999999999999999999999 44 88888 88888 6666666666666666666666 99 44 33333333 2 88888888 5 1 1 5 444444 777 999 2222 6 00000 555 5 5 9999 999 9999999 7 8 00 999 00 555 88
consensus : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGGTATTGAGCGGATGNTGAATAAAACATAANTTTACGTTAAAAAAAGGGACATAACTCACGTAAA--A--TT-----ACGNGCGAGAG-TT-G-AAATTCAATCCCATGCAAGGTCTAGTGATA----AG-CAACCTTGTGT---A-C----ANAT-T-T--GA-AAAGAATCG-GGCAA-CGNTT-GTTCGAGTTATTGAGCGGATGTTGATTAAAATGC-----AATTTT-A---CGNT---AAAT-----AAA-G-GG--GC--ATAACTCATGT-AA--A----------------AT--T-NG-ACG----TGCG---GAGC---TGAA-ATNC---AAT---CCCAT-GCAAGGTCTAG--TGAT---AAGCAACNT---TGTGTA-CA---A-ATT---T--------TAAA---A--AG-AATCGG-GC--A---A-T----ATT-TGTTC---GAG-T------TATTGAGCGGATGTTGAATAAAATG-TAATTTTAN-----G--TT--A-TAAAA--GGG-A-C-ATAACTC-----A----TGTAA--A-A-TT--T--AG--AT--GC--GGAGCTGAATTT--------CAATCCCATG-CAAGGT-CT----T-GTGA---TA---AG---CA-ACCN--TGTGTA-CNA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-N-----A-GG-CAACGTTTG--TTCGAGTT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
Reference ( family-148 ) : GGCTANTAAAC--GTATTATTCGAGGTATTGAGCGGATGNTGAATAAAACATAANTTTACGTTAAAAAAAGGGACATAACTCACGTAAA--A--TT-----ACGNGCGAGAG-TT-G-AAATTCAATCCCATGCAAGGTCTAGTGATA----AG-CAACCTTGTGT---A-C----ANAT-T-T--GA-AAAGAATCG-GGCAA-TGNTT-GTTCGAGTTATTGAGCGGATGTTGATTAAAATGC-----AATTTT-A---CGGT---AAAT-----AAA-G-GG--GC--ATAACTCATGT-AA--A----------------AT--T-NG-ACG----TGCG---GAGC---TGAA-ATNC---AAT---CCCAT-GCAAGGTCTNG--TGAT---AAGCAACNT---TGTGTA-CA---A-ATT---T--------TAAA---A--AG-AATCGG-GC--A---A-T----ATT-TGTTC---GAG-T------TATTGAGCGGATGTTGAATAAAATG-TAATTTTAA-----G--TT--A-TAAAA--GGG-A-C-ATAACTC-----A----TGTAA--A-A-TT--T--AG--AT--GC--GGAGCTGAATTT--------CAATCCCATG-CAAGGT-CT----T-GTGA---TA---AG---CA-ACCT--TGTGTA-CNA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTCGAGTT---ATTG--AGCGGATGTTGATTAAAATGCATT
gi|1 : AAAAAGGGACATTACTCACACAGA--A--TTTTATTATG-----GTG-TT---AAATTCAAACCCATGCAAGATCTTGTGATATACAAC-CAACCTTGTGT---GTC----AT-T-T-T--GA-AAAAAATCA-GGTAG-CACAT-ATTCGTGTTATGGAGTTGA-GTTGAATAAAAT-------AATTTT-A---C-------AAT-----TAA--------C--TTAAT--ATGC-AG--G----------------A--------ACA----TATT---G------TGCA-A------GAT---CCCAT-GCAAGGTCTTA--TGAT---GAGCAACC---------A-CA---A-ACT---T-----------A---A--AT-AATCAA-AC--A---A-A----GTT-TGTTC---AAG-T------TCTGTAGCGGATGTTGATTAAAATA-CAATTTTAT-----G--GTAAA-TAAAG--GGGCA-C-ATAA--A-----G----GGTCA--A-A--T--T--AGACAT--GC--CAGCCTGAA-AT--------CAATCCCATG-CAAAGT-CT----G-GTGT---TA---GT---CA-ACCT--TGT-T--CAA-A-CTT-G--AGA
gi|1 : ggcaaaccAA--A-C-TT--G--AG--AT--AC--GGAGTTGAATTT--------TAATCCAATG-CAAGAT--T----T-GTGA---TA---AG---TG-GCAA--TGTATG-GCA-A-TTT-A--AAAT-AAGT-A-----G-GG-CTTTATTTG--TTCAAGAA---AATC--TGTGGATGTTtacggagttgaattttaatccaatgcaagatttgtgataagtggcaatgtatggcaatttaaaataagtagggctttatttgttcaagaaaatctgtggatgttacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|1 : ggcaaaccaaaaagggacattactcacacagaattttattatggtgttaaattcaaacccatgcaagatcttgtgatatacaaccaaccttgtgtgtcattttgaaaaaaatcaggtagcacatattcgtgttatggagttgagttgaataaaataattttacaattaacttaatatgcaggaacatattgtgcaagatcccatgcaaggtcttatgatgagcaaccacaaacttaaataatcaaacaaagtttgttcaagttctgtagcggatgttgattaaaatacaattttatggtaaataaaggggcacataaagggtcaaattagacatgccagcctgaaatcaatcccatgcaaagtctggtgttagtcaaccttgttcGAG-TT-G-AATTTTAATCCAATGCAAGATTT-GTGATA----AG-TGGCAATGTAT---G-G----CAAT-T-T--AA-AATAAGTAG-GGCTT-TATTT-GTTCAAGAAAATCTGTGGATGTT-----ACATG--------TTGG-AGGTCGAT---AAAT-----AAT-T-GATTAC--A-AATTCATAT-AA--A----------------AG--T-TG-Aacatgttggaggtcgataaataattgattacaaattcatataaaagttga
gi|10 : ggcaaaccaaaaagggacattactcacacagaattttattatggtgttaaattcaaacccatgcaagatcttgtgatatacaaccaaccttgtgtgtcattttgaaaaaaatcaggtagcacatattcgtgttatggagttgagttgaataaaataattttacaattaacttaatatgcaggaacatattgtgcaagatcccatgcaaggtcttatgatgagcaaccacaaacttaaataatcaaacaaagtttgttcaagttctgtagcggatgttgattaaaatacaattttatggtaaataaaggggcacataaagggtcaaattagacatgccagcctgaaatcaatcccatgcaaagtctggtgttagtcaaccttgttcaaacttgagatacg-G-AATTTCAATCTCAGGCTAGGTACAGTATTA----AG-CAACATTGTGT---A-T----ATAT-T-T--CA-TAATAACCA-AGAAA-TGACT-GACCAAGTTGTTGAGTGGCTATCGATAAAAATTC-----ATTTTT-----TGTT---AAAA-----AAA-G-GG--CC--ATAACTCACGT-AA--A----------------AT--T-TG-AGA----TGTG---GAGT---TGAA-CTTC---AAT---CCCAT-ACAAGCCTTAG--TGAT---AAGGAGTAA---TGTGTT-CT---A-A-T---T--------TAAA---ACGAA-AAT--G-TC--T---A-C----ATG-TATCC---AAG-T------TATTGAGCAGATGT
gi|11 : T---AAA------AAG-G-GG--AC--ACATCTAGTTC-AA--A----------------AT--T-TG-ATG----TGCG---GTGC---TGAA-ATTC---AAT---TCCAT-GTAAAGTCTAG--GGTT---GAGCATCCT---TGTGTA-CT---A--TT---T--------TAAA---A--AG-AATCA---C--A---AAT----ATT-TATTCACTGAG-T------TATTGAGCAAA------ACAAAA----AATTAT-------G--TT--AATAAAA--GGC-AGT-AAAATTC-----A----TATAA--C-A-TTA-C--AT--AT--GT--ATGCCTGAAATA--------CTATCCCATG-CAAGGT-CT----A-ATGA---GA---AT---CA-ACCT--TGTGCA-TAA-A-TTT-G--ATAA-GAAT-C-----A-TG-CAACATTT--------GTT---ATTA--AGTGGAaacatgccggacggcaattaatggagcattataaaagctcacctactcaaaga
gi|12 : acacaG--GC--ATAACTCGTGT-AA--A----------------AT--T-AA-ACA----TGTG---GAGC---TGAA-ATGC---AAT---CCGAT-GCATAGTCTAG--TGAT---ACACAACGT---TGTCTC-CA-----------T--------TAA-------------C-------------T----ATT-TGTAC---GAG-T------TACTGAAAGGAAGTCGTATAAAACA-TAA-ACTGA-----G--TG--A-T----------A-C-TTA---------A----TATAA--ATG-TC--T--AT--GT--GC--GGAGCTGAACTG--------CAAGCCAATA-CACAGT-GT----A-GTGA---TT---TG---CA-ATCA--TGTGTA--------------GAAA-GAAT-C-----G-GA-CAA--TATGACTTCGAATA---AATG--AGCGGctcagtggagtggata
gi|13 : aAG-T------CATTGAACAGATGTTCA-TAAAATGGTGGGTGTGGCGAGGG--TT--A--AAAA--AGG-C-C-ATTACTC-----G----TGTAA--T-A-TT--G--AG--AT--GC--TGA-CTTCATTT--------CAATCCAGTG-TAAACT-CT----A-GTAA---TA---AGGGCTA-A-----TGTGTA-CCA-AATTT-G--AAAT-GAAT-A-----G-GG-AAACATTTG--TTCCAGTT---ATTG--ATGGGATGTTtctgtccgccagcccgtacaaactgcgataaaata
gi|14 : aAATCCCATGTGATGTTTACTATTA----AA-CAACCTGATGT---A-C----ATAT-A-T--GA-AAATAATTA-GGAAA-CGTTT-G--------ATTGAGCAGATACTAATTAAAATGT-----A--TTT-G---TTGTTTAAAATTAA--AAA-A-GA--CC--ATGACTCATG--AA--A----------------AT--T-TG-ACC----AATA---GAGT---TGAA-ATAC---ATC---TTTTT-GCATGGTCCTG--GGAT---AAGGAAC-T---TACA-A-CA---A-ATA---T--------GAAA---A-------------------------------TGTTC---GAT-T------CATTGAGCGAATGTTacatgtgagattctgataacaaaagtacatctatgtacagaatagtctggaaaactaaaaaatgttaatgatttgttaaatataaagttccagactaaa
gi|15 : ataaAATAATCG-AGCAA-TGATT-ATTCGAGGTATTTAGCGAAAGTTGATTAAAATGC-----A--TTT-A---AGTT---AAAT-----AAA-ATAG--CC--ATAACTCACGT-AC--A----------------AT--T-TA-ATG----TGCA---GTGT---TAAA-TTTC---AAT---ACCAT-GTAAGGT-TTG--TCAT---AAGGAACAC---TGTGTG-CA---A-A-T---T--------TAAA---A--TG-AATGGG-CC--A---G-G----GTT-TGTTT---GAG-T------GGTCTGGCAAATGTTacatgtggcattccaatgtggacaaagctcacatgttcatagattaa
gi|16 : TGATTAAAATGT-----TATTTT-T---TGGT---AAAT-----AAA---------------------------------------------T--T-AG-GC---------------C---TAAA-ATAC---A-T---CTCAT-GCAAAACCTAG--TGAT---AAGCAAAAT---TATGTT-CA---A-ATC---TA-------TAAA---acattttgggcgtcgacgccgacgaatatgtcattccaaaagcagctcaactatccatagaatagt
gi|16 : -GC--A---A-A----ATTATGTTC---AAA-TC-----TAT-----AAATGATGAA-AAAATG-TA-TTTTA---------TT--G-TAA------------------T-----A----T-TAA--A-T-TT--C--AG--AT--GT--GGA-----ATTT--------CAATGCCATG-CAAGTT-CT----T-GTAA---TA---AG---GA-A-TG--TGTGTA-CTA-A--TT-A--AAAA-TAAA-A-----G-GG-TAAAATTTG--CTCAAATT---ATTG--AGTGGATATTtgatgaaaaaatgtattttattgtaatattaaatttcagatgtggaatttcaatgccatgcaagttcttgtaataaggaatgtgtgtactaattaaaaataaaagggtaaaatttgctcaaattattgagtggatattacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|17 : tgattaaaatgttattttttggtaaataaattaggcctaaaatacatctcatgcaaaacctagtgataa-ACG----TGTG---AAGT---CAAA-CTTC---AAT---CAAAT-GAAAGGTCTTT--TGAC---AAGCAAACT---TGTGTA-TC---A-ATT---T----------AA---G--AG-GATCAG-GC--A---G-C----AAT-TGTTC---AAG-T------AACAGAGTGGACGCTGATTAAAATG-CAAT---------------------AAG--GAG-A-C-ACAACTC-----A----------------------AG--AT--GG--GGTTTTG--TTT--------CAATCCGATG-CAAGGT-GT----T-GTGA----A---AG---GATACAC--AATGGA-CTT-A-TTT-------A-AAAT-A-----A-GGTCAATGTTTG--TTacatgtgggctgccaacaccaaagccaatg
gi|18 : agcttaatgcaagcaggctcaacaaaaaagtaaataaacT---AAAA-----AAA-G-GA--AC--ATAACTCATG--AA--A----------------AT--T-A--ACAGA--TGCA---GAGC---TGAA-TTTC---ATT---CCC-------------G--AGAT---TAGCAACCT---TGTATA-TA---C-ATT---TCTTTTAGTTAAA---A--AA-AA
gi|18 : AAAA--GGA-A-C-ATAACTC-----A----TG-AA--A-A-TTAAC--AG--AT--GC--AGAGCTGAATTT--------CATTCCC-------------------GAGA---TT---AG---CA-ACCT--TGTATA-TAC-A-TTT-aagggacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|18 : taaaAAAA--GGG-A-C-ATAACTT-----G----GGTAA--A-A-TT--TG-AG--AT--GA--GGAGTTGAATTT--------CAATCCCATG-CAAGGT-CT----------------------------CT--CG-------------------AAA-G----------A-GG-CTACACTTG--TTTGAGTT---ATTG--AGcttttagttaaaaaaaaaagggacataacttgggtaaaatttgagatgaggagttgaatttcaatcccatgcaaggtctctcgaaagaggctacacttgtttgagttattgagacattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|19 : taaaaaaaggaacataactcatgaaaattaacagatgcagagctgaatttcattcccgagattagcaaccttgtatatacatttcttttagttaaaaaaTATTGAGGTGATGTTGAAAAAAATGC-----ACTTTT-G---CAGT---AAA------AAA-G-GG--GCCAAAAAAACATGT-AA--A----------------AT--A-TG-AGG----TGCA---GAGT---TGAA-ATTT---AAT---CCTAT-GCAAACACTTG--TTAT---AAGGTGTAT---TGTGCA-TG---A-A-T---T--------CAAA---A--TG-AAT-AG-GCAAA---A-C----ATT-TGTTC---acattgctacatgtgggatgcaaatgaatgggtgattccaatgcatagaata
gi|2 : GACTAGTAAATCTGTATTATTCAAGGCATTGAGCAAATGATGATTAAAACATAATTTTATGGTAACTAAAGGGACTTTATTAATGTAAC--A--TT-----ACATGTGAGAGACT-G-AGATACAATCCCATGCAAAGTCTAGTGATA----AG-CAACCTTGTGT---A-T----ACAT-T-C--AA-AAAGAATCA-AACAA-TGTTA-A---GAATTATTGAGTGGATATTCATTAAAGTGC-----AATTCT-A---TGGC---AAAT-----AAA-G-TG--GC--ATAAGTCTGGT-AA--A----------------AT--T-AG-ACA----TGCA---AGCC---TGAA-ATAC---AAT---CCCAA-GCAATGTATTA--TGAT---AAGCAGACT---AGTATA-CA---A-ATT---T--------TAAA---A--AA-AGTCAC-CA--A---A-T----ATT-TGTTA---TAG-T------GTTTGAGC-ACTGTTGAATTAAATG-CTATTTTAAAAT--G--CA--A-TAAAA--GAG-A-C-ATAACTC-----A----AGT-A--A-A-TTAAT--AC--AT--AC--ACAGCTGAATTT--------TAATCCCATG-CAAGGT-CT----T-GTGA---TA---AG---CA-ATCT--TGTGAA-AAG-G-TTT-A--AAAA-GGAT-C-----A-GG-AAAGGATTA--CTCATGTTATAATTG--ATCAGATGTTGATTAAAATGCATTcattaacaaaattaatattacagttgtgtgggatgccgacaccactgaatggggtattacaaaaactcaactattcatagaataatc
gi|20 : AAAAAAAGAGCCATAA---ACGTTGT--A--TT----------CG-GTG-TT-A-AAATTCCATCCCATACAAGGTGTAGTTAAA----AATCAACCTTGTGT---A-C-----CAT-T-TTAAA-AAAGAATCG-GGCAA-CGTTT-ATTTTAGTTATTTGGCA-ATATTGATAAAAA--------AAT----A---TGAT---AAAT-----AAA-G-GG--GC--ATAACTCGTGT-TA--C----------------AT-------ACC----TATG---AGTC---TGAA-ATGC---AATCCGCCCAT-GCAAAGCCTAA--TGA----AAGAAACAT---TGTGTA-CA---C-ATT---T--------GAAA---c
gi|21 : taAACATATT--TTAAAATT---ATTG--AGCAAATGTTGATTAAAATGCA
gi|21 : agttgcaaatttaacatattaaAATTATTGAGCAAATGTTGATTAAAATGC-----AATTTA-A---TGAT---AAAT-----AAA-G-GG--GT--ATAACTCATGT-TA--ATATATGTATATCATGTATA-T-AT-ACC----TGCA---AGCC---TGAA-ATAC---AAT---CCCAT-GTGAGGTGTTG--AAAT---AAGCAGCTT---TGTGAA-TA---A---T---T--------TACA---A--AG-AGTCAC-GC--A---G-T----ATT-TATAA---GAG-T------TATTGAACAGATATTGAATAAAATA-TAATTTatttaatgataaataaaggggtataactcatgttaatatatgtatatcatgtatatatacctgcaagcctgaaatacaatcccatgtgaggtgttgaaataagcagctttgtgaataatttacaaagagtcacgcagtatttataagagttattgaacagatattgaataaaatataattt
gi|22 : agttgcaaatttaacatattaaaacatattttaaAA--GAG-A-C-ATAACTT-----A----T------------------G--AT--GT--GGAGTTGAGTTT--------TAATCCC-TGACAAGCT-TT----T-GTGA---TA---GG---TG-GATTAATGAGGA-TGA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-TA----A-AG-CAACATTTA--TTCAAGTC---ATTG--AGCAGATGCT
gi|23 : atgataaaacctttttttttgAA--GAG-A-C-ATAACTT-----A----T------------------G--AT--GT--GGAGTTGAGTTT--------TAATCCC-TGACAAGCT-TT----T-GTGA---TA---GG---TG-GATTAATGAGGA-TGA-A-TTT-G--AAAA-GAAT-TA----A-AG-CAACATTTA--TTCAAGTC---ATTG--AGCAGATGCTatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|24 : atgataaaacctttttttttgCCATGCAAGATCTAGTGATA----AA-CAACCTTGTAT---G-C----TGTT-T-T--AA-AAAGAATAA-GGTAA-CACTA-ATTTAAGTTCTTGAGTGGATGTTGAATAAAACAA-----AATTTT-A---CAAT---AAA------GAG-G-GG--GC--ATAACTCATGT-TA--C----------------AC--T-AC-ACA-------A---GA-C---TGAA-ATAC---AAT---CCTGT-GCAAGCTCTAA--TGAT---CAGCAACCT---TGTGTA-CA---A-ATC---T--------TAatatatggtatgctgacagatagggtattacaaaagctcgcctacacatagtgaagctaaatgaa
gi|25 : ta---GAAC---AGAG-TTTC---AAT---CTCAT-ATACTGTCTAGA-TG-T---AAGCAA--T---CATATA-CATACA-AT----------------A---A--AT-ACTCAG-AC--AGTAA-T----ACT-T--TA---AAG-T------TATTAAACGGGTGCTAATTAATATA-TAATTTATA-----G--TT--A--AAAT--ATG-C-C-ATAACTC-----A----TGCAC--A-A-TT--T--AAT-AT--GT--GAAATTGAATTTTTAAAACGCAATCACATG-CAAGta
gi|26 : TTAT-----G--TT--T-GAAAATGGGG-A-C-ATAACTT-----AATTATTTAATAA-A-TT--T--AA--A----------G-TGAGTTT--------CAATCCTATA-CAAGG----------G-GA---TA---AG---CA-ACCA--TGTGTATCAA-A-TTA-G--AGAA-CAACAC-----A-G--CAACATGTT--TTCGAGGT---ATTG--AGTGAATGTTGAACAAAAtag
gi|26 : AAC--ATGTT-TTCGAGGTATTGAGTGAATGTTGAACAAAAAGAAAGTTTAagaaagtttagacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|27 : ttatgtttgaaaatggggacataacttaattatttaataaatttaaagtgagtttcaatcctatacaaggggataagcaaccatgtgtatcaaattagagaacaacacagcTATTGAGCGGATGTTATTTAAAATGC-----ATATTT-G---CGGT---AAAC-----AAA---GT--GC--ATAAGTCTTGT-AA--A----------------AT--TACGCACA----CGCGCCTGAAC---TGAA-TTACT--AAT---TCGGT-GCTAAGCATTG--TGAT---AAGCAACAT---CGTGTA-C------ATT---T--------Tgacatctaccttaaaatgatgcaaagta
gi|28 : gcactttgtcattcataatgataaacaacagtgttgacacaaAAAA--GGG-G-A-ATAAGCC-----A----TACAA--A-A-TA--T--ATT-AT--GT--G----TGACGTT--------TAATTCAAGT-CAAGGA-CT----T-GTGA---TA---AG---GA-GCGG--AATGTA-CT-----------AAAA-TAAC-T-----AGGG-CAAAGTTTG--CTTGAGAT---ATCA--AGAGGATGtat
gi|29 : a--AA-AATCAG-CT--A---A-T----ATT-TGTTT---GAG-T------TATTGAGCAGATGTTAAATAAAA------------------------------A--GGT-A-A-ATAGTTC-----A----TGTAA--A-------T--AA--ATATGCTAGGAGGTGAAATT--------CAATTTCATG-CAAGGT-CA----A-ATAA---TA---AG---CA-ACTG--TGTGTA-CAA-A-TTT-G--AAAT-GATT-C-----A-GG-TTATATTTG--TTgtacagggacgacgaatggatagtcatagaaactcacctattcatagaataaa
gi|3 : AAAGGGGCATAACTCACATTAA--AGTTT-----A-GTGCG-GTG-TT-G-AAATTAAATGCCATGCAAGGTCTAG------------CAACCATGTGTTTGA-T----TTAT-T-------AAAAAATCA-AGAAA-CAATT-GTTCGATTTATTGAGCAGATGTTGATTAAAATGT-----AGTTTT-A---GCTT---AAA------AAT-G-GC--TC--CTAACTGATGT-AA--A----------------GT--G-AA-ACA----TGCA---GAGC---TGAA-TTTC---TAT---CACAT-GGAAGGTACTG--TAAT---AAGCAACCT---TGTGTATCA---A---T---C--------GAAA---A--AA-AATCAG-AA--A---A-T----GAT-TGTTC---AAG-T------TATTGGGCAAATGTT-AATAAAAAG-TA----CAG-----G--TT--A-AAAAG--GGG-C-C-ATAACTC-----A----TGTAA--A-ATTT--T--AG--AT--GT--AGAG------------------ATCCCATG-CAAGCT-CT----T-GTGA---TA---AG---GA-GTAA--TGTG-A-TTC-A-TTT-T--AAA-------------------------TG--TTCAAGTT---ACTG--AGCAGATGT
gi|30 : C---AAT---TCAAT-GCAAG-----G--TGAC---AAGCAGCCT---TATGT---------ATT---T----------AT---A--AG-AATCGGAGA--A---A-C----AAT-TGTTC---AAA-T------TATTGTGCAGATGCTG-ATAAA-----AACTT--------G--TT--G-GAAAA--AAA-G-CAACAACT----------------------TT--G--AG--AT--A--------TGAACTT--------CAGTCCAATG-CAAGCT-CT----T-GTGA---TA---AG---aacatgtgggatgcacattgatgaaatttcaaaaacccatctattcataaaatag
gi|31 : tTGTGT---A-C-----CAT-T-T--GA-AATGAATCA-GGT-----TTT-ATTTGTGTTATTT----GACAATGATCG----GG-----AAGTTA-A---TGAT---AAA------AAA-G-GA--AC--ATAACCCATGTTAATGA----------------AT--T-----CG----TGTG---ACGC---TGAA-ATTC---AAT---ACCAT-TCACGGTTTAA--CGAT---AACCAACTT---TG
gi|32 : AATCCCATA-C---GT-CT----T-GTGG---TATT-AG---GA-ATGC--TGTGTA-TCA-A-TTT-A--AAAT-GAAA-T-----T-GG-CAATGTTTC--TT---GTT---ATTG--AACctta
gi|33 : ---AAT---TCCAT-ACAAGCTCTAGACGGGT---AAGCAATTA---TGTGTA-AA---A-ATC---T---------GAA---A--AG-AATCGG-AA--A---A-TGTTTATT-TGTAC---GAG-C------AATTGAGCGGACATTATATTAAACG-TAATTTTAA-----GTTTT--A-TAAAA--TGG-G-C-ATAaatattacatttgtgatgccaatgttaacaaattagtaatttcaaaagttcaccaattcataggatagccga
gi|34 : gaaacagacacta-----AAA-T-GG--GT--TTTACTAATGT-AA--C----------------AT--G-TT-TTG----TGCT---GTGT---TGAA-ATTC---ATT---CCCTT-GGAAGGTCTAG--TGAC---AAG-AGTAT---TGTGTAACA---A---T---T--------TAAA---A--TG-AATATG-GC--T---A-C----ATG-TGTTT---GAG-T------TATTTAGTAGATATT
gi|35 : aaAAGGT-TT----T-GCGA---TA---GT---GA-ACAT--TTTGTA-CAA-G-TTT-A--AAAT-GCAT-A-----G-AG-CAACGTTT------GAATT---ATTG--AACGAATGacatgtggg
gi|36 : tCAAGGTTTTG--TGAT---AAGTAACAA---TATGTA-TC---A-ATT---T--------C------A--AGTTATGGA-GC--A---A-T----GTT-TGTTT---TAGAT------TTTTGAGCGGATTTTatataatttatgtttgacgtcgacaccagcgaatgggttattacaaaaacacacatagtcatacat
gi|37 : -----AAA-G-GG--GG--ATAACCCA----AA--A----------------ATAAT-TG-ATA----TACG---GTGT---TGAA-ATTCCAAAAT---CTAAT-GCAAGTTGTAG--TGAT---AAGCAG-------GCGTA-TA---CTATT---T--------TGGA---A--AG-AATCAG-CC--A---A-T----ATG-TGTTT---AAG-T------TATTAAGacatgtgtgacggcgacggataggtgattgcaaaggctcacctactcatagaatatt
gi|38 : catataaGTAA--C-A-TT--TCGAG--AT--GC--GATGTTGAATTT--------CAATTTCATG-CAATGT-CT----T-GTGA---TA---AA---AA-GCTT--TGTGTG-CCA-A-TT-----AAAATTAAT-A-----G-GA-CAAGGTTTG--TTTAATTT---ATTG--AGCGGATATgaa
gi|39 : TGAATTT--------CAATCC-ATG-CAAGTT-CT----T-TTGA---TAGG-AG---TA-A-----TGTGCA-ACATA-TT-----ACAA-TGAT-TACTAAA-GG-TAACAATT--------GTT---ATTG--CACGGATGTcacatagtgaacgactga
gi|4 : tgaAAAAGAAGGGAGACAACTCATCTAAATTG--TC-----ATGTG---GAG-TTTGTAAATTCAATTCAATGCAATGTGATGTGAT--------CAAC--TGTAT---A-CGTTTAATT-T-T--GA-AGAGAATTG-CGCAA-TGTTA-GTTTGAGTTACCGAGCAGATATTAA--AAAATGT-----GCTTTTTA---CGAT---AAA------AAA-G-GG--AT--ATAACTCATGT-AA--T----------------AT--T-AT-CCG----TG-A---AAGCCCTTCAA-ATAT---AAT---CCTAC-ACGAGTCCTAA--TGTT---GAGCAACCG---GATAAA-CA---A-ACTC--T--------TAAAT--A--AA-AATCGC-AC--A---A-T----ATC-TGTTA---AAA-T------TATTAAACAGCTGCTGAATAAAACG-GAAGTTCAT-----G--TT--T-TAAAA--AAG-T-T-GCA--TC-----A----T-TA--------C--T--AC--GT--TT--GGAACTGAAATT--------CAGCCTCATG-CGAA-------------GA---CA---GG---TA-A--------------A-A-TTTCG--TAAA-TGAG-C-----A-GG-CAACGTTTG--TTTGCGTT---ATAA--AAACAATGTTGATTAAAATGCAaacatgtgcaacaccaacaaatgggccaatacacgag
gi|40 : tataTTTAG-----A--TT----TAAAA--ATT-A-CCATAACTCTACTAA----TTTAA--A-A-C------AG------GT--AGAGCTGAATTT--------CAACCATATG-CAAGGT-CTAGTCTAGTGA---AA---AG---CA-ACCT--TGTGTA-CAA-A-TCT-GAAAAAA-GGAT-C-----A-Ggttttaccagtaaat
gi|41 : GAAATT--------CAATCTCGTG-AAAG----T----T-GTGAATACA---AG---CA-ATTT--TGTGTA-CCA-T-TTT-G--AAAc
gi|42 : tcagggcagataaaacctggcgcagtacattgattttttatacactgtgttaaaTGTTGATTAAGATGT-----TATTTT-A---CGCT---TGAT-----CAA-G-AA--AC--ATAACTCATG--AA--A----------------AT--T-AATACG----TGTG---GAGC---CGAA-TTTC---AAT---Cta
gi|43 : AATCA-AGCAA-GGAAT-GTTTGAGTTATTGAACGGATGTTGATT--GATGC------ATTTT-A---C-TT---AAA------AAA-T-GG--CC--TTAA---ATGA-AA--T----------------AT--T-TG-Aatttggacaatccattaataatca
gi|44 : at--TGTGTA-CTA-A-TTC-A--AAAT-GAAT-A-----G-GG-CATCGTgatacaacattaa
gi|45 : TT-GTTAGAGTTATTGAGCAGAT------TAAAATGC-----AATTTT-A---TGGT---AAA------ATA-G-TG--GC--ATGACAGAGGT-AA--A----------------CT--T------------------------------ACAC---AAT---CCCAT-GCAAAGCCTAG--Tcattgatgttacatgcggagtgccaacggatgtgtgtacaaaacctcacctatcaaaactagtt
gi|46 : TGTAAGGTCAAGTGATA----CG-CAACGTTGT-----A-CTG--AAAT-T-T--GA-AAAGATTCG-G
gi|5 : A--A--TTGG---ACGGGC-AGAG-TT-G-AAACGCCATCCTACACAACGTCTGGTAATT----AG-CAACCTTGTAT---A-T----ATAT-T-T--GACAAAGAGTTGCAGAAATTGATT-GCTTAAGTTACTGAGCAGATGTTGAC----ATG----------TT-G---C-------------------------GC--ATGACTCTTGT-AA--A----------------AG--T-CA-GCG----TTTT---GAGC---TGAA-ATAC---AAA---TCCAT-ACAAAGTTAAC--TGAT---AAGCTAC--------GTC-CAG--A-ATTACAT--------TAAACGCA--CGAAATGGA-GC------A-T----A----GTTC---ATG-TAAAATGTGTTGTGCGGA-GT----TAAGATG-CAATCTCAA-----agtta
gi|5 : taatgttgtaagaagaatgTT-A---CATT---AAACGCACGAAATG-GA--GC--ATAGTTCATGT-AA--A----------------AT--G-TG-TTG----TGCG---GAGT---TAAG-ATGC---AAT---CTCAA-ACAAGAT---G--T-------AGCAACAT---TTTGTG-GA---A-GAT---T--------GAAA---A--AG--GTAGG-AC--A---A-T----ACT-TGTTC---GTA-T------AACTGAGAAGACATCGAAacaagatgtagcaacattttgtggaagattgaaaaaggtaggacaatacttgttcgtataactgagaagacatcgaagatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : taatgttgtaagaagaatgaattggacgggcagagttgaaacgccatcctacacaacgtctggtaattagcaaccttgtatatatatttgacaaagagttgcagaaattgattgcttaagttactgagcagatgttgacatgttgcgcatgactcttgtaaaagtcagcgttttgagctgaaatacaaatccatacaaagttaactgataagctacgtccagaaCATGCAGTGTCTAGTGACA----AA-CATCCTTGTGT---A-C----A--------------------------A-CGTTT-GTTAGAGTTATTAAGCGAATGTTAATCAAAATGC-----AATTTT-A---TTGT---AAAT-----AAT-G-GT--GC--ATAACTTACATAAA--A----------------AT--T-TG-gatctgcctgcacaatctgcgtgaatatagta
gi|6 : attatatggAA-ATGC---AAT---TTTATTGTAAA---TAA--TGGT---GCATAAC-T---TACATA-AA---A-ATT---TGTG-----TAAA---A--AG-AATCTG-GC--A---A-T----GGT-CATT-----A----------ACTGAGTGGATGTTGATCA----G-TGAT---AA-----A--TA--A-AACAA--GGG-C-C-ATAACTC-----A----TGTAA--A-A-TT--GG-AG--AT--GT--GGAGTTTAATTT--------CAGTCCTAAG-CAAACT-CG----T-GTGA---TACAGAG---TA-A-----TGTGTA-CCA-A-TCT-A--AAAT-GAAT-A-----A-GG-CAACATCTG--TTTAAGTT---AATG--AATAGATtgtaaaaagaatctggcaatggtcattaactgagtggatgttgatcagtgataaataaaacaagggccataactcatgtaaaattggagatgtggagtttaatttcagtcctaagcaaactcgtgtgatacagagtaatgtgtaccaatctaaaatgaataaggcaacatctgtttaagttaatgaatagataatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|7 : attatatggcatgcagtgtctagtgacaaacatccttgtgtacaacgtttgttagagttattaagcgaatgttaatcaGGCTATTAAA---G-ATTATTTGAGTTATTGAGCGGCCCACAAATAAAACATAATTTTACATTATATAAAATGACAGACCCTATGTAAAG-A--AT-----ACAAGC-AGAG-TT-G-AATTTCAATCCCATGCAAGGTCTGGATTTA----AG-CCACC-TGTGA---A-C----AAATATAT--GA-AAAGAATAG-GGCTA-TATTT-ATTGGAGTTACTGTGTAGACATCGAACAATATGTAAAAAAAATTT-A---GTCT---GAA------AAG-A-GG--GA--ATAACTCATGC-AA--C----------------AT--T-CT-ATA----TGCA---GATT---TGAA-ATAC---AAT---CACAT-ACAAGGTCTAGAATTATTTAAAGCAACAT---TGTGTT-CA---A-ATT---T----------GA---A--AT-AACTGT-AC--A---A-A----ATC-TGTGC---AAG-T------TATTGACTGAATGTTGAAaatacatgttggactccaacattgacaaataagatataacaaaagctcatcctatccatggagcagtcga
gi|8 : acTAAAAGAAGTGGCATAATCCATATAAT--T--TT-----TTAAGTG-GTG-TT-G-AAATTCATTCCAAAGCAAGAAGTATTGATA----AG-TAACCTTGTAT---AGC----AG-T-T-T--GA-AAAGAATCA-AGCAA-CTTTTGGTTTGAGCTATTGAGCAGATACTGAATAAAATGT-----AATTTC-A---TGAT---GAAT-----AAG-G-AT--TC--ATTGCT-ATGT-AA--T----------------AT--T-AT-ACACAATTTCT---AGTC---TGAA-ATAC---AAT---TCCAT---------TTG-----T---AAGCAACATTACTGCATG-CAC--A-ATA---T--------TA--------------C-----------A-T----TTT-TGTTT---AGG-T------TATTGAACAGATGTTAAATAAAAT--TAATTTTAT-----G--TT----TAAAA--
gi|9 : AGTGGATGTTAAATAAAACATAAACTTAGGTTAAAAAAAG-----CAAATCTTTTAAA--A----------CGAGTAA-AG-CT-G-TATATCAATCACATGCAATGATTAATGATA----AG-CAACCTTATGT---A-C----AGAT-T-T--TG-AAATATACA-GGCAA-TGACT-GTCCGAGTAATTGAGCAGATGTTGTTTcaaat
gi|9 : AGTGGATGTTAAATAAAACAT-----AAACTT-A---GGTT---AAAA-----AAA-G----------CAAATCTTTT-AA--A----------------A---------CG----AGTA---AAGC---TGTATAT-C---AAT---CACAT-GCAATGATTAA--TGAT---AAGCAACCT---TATGTA-CA---G-ATT---T--------TGAA---AT-AT-A--CAG-GC--A---A-T----GAC-TGTCC---GAG-T------AATTGAGCAGATGTTGTTT---TTG-TTATTTGTA-----T--TT--A-TAAAA--GGG-G---------------G----TATGA--A-A-C--------------------AACTACATTT-----------TCC-------AGTTTCT----A-GTTA---TA---AG---CA-ATCG--TTTGTA-AAA-G---T-A--AAAA-TAAT-C-----A-TG-CGAAGACTG--TTCTTGTT---ATTGATATCGGATGCTGATGTAAATGCttgttatttgtatttataaaagggggtatgaaacaactacattttccagtttctagttataagcaatcgtttgtaaaagtaaaaataatcatgcgaagactgttcttgttattgatatcggatgctgatgtaaatgcccttttagt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|47 ): TGGGATGCCAACAAATGGGTAAAACGAAAACTCACCTATTCATAAAATAA
Unaligned ( gi|48 ): AGCTAAATTGTATTGTATATTATCTTTTAAAATATAAA
Unaligned ( gi|49 ): CTGAGTTATAAAGTGGGAATAACTCGTGCACAAATT