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Reference ( family-140 ) : AGACCATAT-C--CTATACTTTA------A-----C------A----------C-----AT------AT----TTTGGT-T----AT-GG-----GTACATCTA-GGGAAGG----GGN-----TGT--GTCACAT-------A-C-CAAA--------------AC------TAGGTCANTGTGA-CCT---A-CATACT-GA------------CCTCTGAC-------------C------T------A-----------AG--A--AA--AAC-CTTG-T-C-GA-A--GC---ATATATTTCCTA----TAACTG-----T-ACCACT--AA-G----------A-CTT-G-----------G--ATGACCANATTCAGTTCATGGATGAATTT---TA-GGAA----G--TAGGTGTGTCTCCTTTACTGTAGGGATTATTTGTTTTGTTGTTGGACAGTTATCTTTTGTATAATCAACTCATGTCATATTCAAGCTTAAAACCAATGTGGTTTAAAATAACAT-ACATTCTTTATAACCTTCCCTAGATAACAGCGGTCAACCATTGCAATGTAGCAAGTTAGTCGCAACTTCCCCTTGAAATACAAATTAGTTTACATTAATTGTTCTACTGTTTTTTT--TTATTTCAGTATTGTACTGCGAAGATTTTATTTGGACAGAC---ATGAGATAAGGAATATTC
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gi|4 : ccAGACCATAT-C--CTATACTTTA------A-----C------A----------C-----AT------AT----TTTGGT-T----AT-AG-----ATATATCTA-GAGAAGG----GGC-----TGT--GTCACAT-------A-C-CAAA--------------AC------TAGGTAAATGTGA-TCC---A-TATACT-GA------------CTGCTGAC-------------C------C------A-----------AG--A--AA--AGC-CTTA-T-C-AA-A--GC---ATATATTTCCTA----TAACTA-----T-ACCACT--AA-G----------A-CTT-G-----------G--ATGGCCATATTCAGTTCATGGATGAATTT---TA-GGAA----G--TAGGTGCGTCTCC-----------GATTATTTGTTTTGTTGTTGGACAGTTATCTTTTGTATAATCAACTCATGTCATATTCAAGCTTAAAACCAATGTGGTTTAAAATAACAT-ACATTCTTTAATACCTTCCCTAGATGACAGCGGTCAACCATTGCAATGTAGCAAGTTAGTCGCAACTTCCCCTTGAAATACAAATTAGTTTACATTAATTGTTCTTCTGTTTTTTT--TTATTTCAGTATTGTACTGCGAAGATTTTATTTGGACAGAC---ATGAGATAAGGAATATTC
gi|5 : AGACCATAT-C--CTATACTTTA------A-----C------A----------C-----AT------AT----TTTGGT-T----AT-AG-----ATATATCTA-GAGAAGG----GGC-----TGT--GTCACAT-------A-C-CAAA--------------AC------TAGGTAAATGTGA-TCC---A-TATACT-GA------------CTGCTGAC-------------C------C------A-----------AG--A--AA--AGC-CTTA-T-C-AA-A--GC---ATATATTTCCTA----TAACTA-----T-ACCACT--AA-G----------A-CTT-G-----------G--ATGGCCATATTCAGTTCATGGATGAATTT---TA-GGAA----G--TAGGTGCGTCTCC-----------GATTATTTGTTTTGTTGTTGGACAGTTATCTTTTGTATAATCAACTCATGTCATATTCAAGCTTAAAACCAATGTGGTTTAAAATAACAT-ACATTCTTTAATACCTTCCCTAGATGACAGCGGTCAACCATTGCAATGTAGCAAGTTAGTCGCAACTTCCCCTTGAAATACAAATTAGTTTACATTAATTGTTCTTCTGTTTTTTT--TTATTTCAGTATTGTACTGCGAAGATTTTATTTGGACAGAC---ATGAGATAAGGAATATTC
gi|6 : TGGT-TT---AT-GG-----ATACATCTC-TGGAAGG------T-----AGT--GCAACAT-------A-C-CAAA--------------AT------TAGGCCAGTTTGA-CCA---A-TATACT-GA------------CTTCTTAC-------------T------TACATTAA-----------AG--A--AA--AAC-A-TG-T-C-TG-G--AT---A-AAATTTCCTA----T-ACTA-----TGAGCCCT------------------CT--------------G--ATGACCATATTCAGTTTAAAGGT-AATTC---TAGGGAA----T--TATTTGTGTC
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gi|6 : gattttgtctggagtgaatctcttattcattaatgcccaggatgactaaatggtttatggatacatctctggaaggtagtgcaacataccaaaattaggccagtttgaccaatatactgacttcttacttacattaaagaaaaacatgtctggataaaatttcctatactatgagccctctgatgacATAT-C--CTATGCTGTAGGGTCTA-----G------AATTGC-----C-----AA------AT----TTTGTT-T----TT-TG-----GTACATCTC-AAGAAGGCTATGTA-----TGT--GTCACAT-------A-C-CAAT--------------AG------TAAGTCACTGTGA-CCT---C-CATCTT-GA------------CCTCTGAC-------------T------T------ACATATC-----AG--T--AA--AAT-GTTG-TCC-GG-A--GC-----ATATTTCCacataccaatagtaagtcactgtgacctccatcttgacctctgacttacatatcagtaaaatgttgtccggagcatatttcc
gi|7 : gattttgtctggagtgaatctcttattcattaatgcccaggatgactaaatggtttatggatacatctctggaaggtagtgcaacataccaaaattaggccagtttgaccaatatactgacttcttacttacattaaagaaaaacatgtctggataaaatttcctatactatgagccctctgatgaccatattcagtttaaaggtaattctagggaattatttgtgtcacataccaaaataaggtcattgtgacctatatctttaccattgactgtcatacatgtaccagtaaacacacatctggaaaat------AT----TTTGGT-T----AT-AG-----ATATATCTA-GAGAAGG----GGC-----TGT--GTCACAT-------A-C-CAAA--------------AC------TAGGTAAATGTGA-TCC---A-TATACT-GA------------CTGCTGAC-------------C------A------A-----------AG--A--AA--AGC-CTTA-T-C-AA-A--GC---ATAT--TTCCTA----TAACTA-----T-ACCAC---AA-G----------A-CTT-G-----------G--ATGGCCATATTCAGTTCATGGATGAAATT---TA-GGAA----G--TAGGTGTGTCTCCTTTACTGTAGGGATTATTTGTTTTGTTGTTGGACAGTTATCTTTTGTATAATCAACTCATGTCATATTCAAGCTTAAAACTAATGTGGTTTAAAATAACAT-ACATTCTTTATAACCTTCCCTAGATAACAGCGGTCAGCCATTGCAATGTAGCAAGTTAGTCGCAACTTCCCCTTGAAATACAAATTAGTTTACATTAATTGTTCTACTGTTTTTTT--TTATTTCAGTATTGTACTGCGAAGATTTTATTTGGACAGAC---ATGAGATAAGGAATATTC
gi|8 : -T----AT-TG-----GTACTTTTA-CGGAAAG----ATG-----TAT--GTCATAT-------A-T-CAAA--------------AG------TAATTCACTGTGA-CCT---A-CATCTT-GA------------CAAATAAC-------------C------T------AT----------AT--ACCAG--GAC-CTTG-T-C-CA-G--ACCATATATATTT
gi|8 : ttgacctacataccagtaaaacattatacatatcgtctttattgcaagacacaggtttatcaaaaacggcgAGACCATAT------ATATTTTA------A-----TGTTGGAA----------C-----AA------AT----TTGGTT-T----AA-CG-----GTACATGTA-GAAAGGG----AAA-----TAT--GTCGTAT-------A-TAAAAA--------------AC------TGTTTCACTGTGA-TCT---A-CCTGCT-GA------------CTTTTAAC-------------C------T------ATATATT-----AG--A--AA--ACA-CTTG-TCC-GA-A--AC---ATATCTT--CT-----TTACTG------------T--AA-G----------G-CCT-G-----------GGAAT-ACCAAATTTAG----TGTATGAGTTT---Ttaatgttggaacaaatttggtttaacggtacatgtagaaagggaaatatgtcgtatataaaaaactgtttcactgtgatctacctgctgacttttaacctatatattagaaaacacttgtccgaaacatatcttctttactgtaaggcctgggaataccaaatttagtgtatgagtttttcccttataagcaacgtgccactaaccaaaaattggtcattatggcctaaatctt
gi|9 : ttgacctacataccagtaaaacattatacatatcgtctttattgcaagacacaggtttatcaaaaacggcgtattggtacttttacggaaagatgtatgtcatatatcaaaagtaattcactgtgacctacatcttgacaaataacctatataccaggaccttgtccT-C--CTATACCTTG------AATGACC------A----------T-----AT------AC-------AGTAT----AT-AG-----GTACATCTA-GGGAAGT----AGG-----TTT--GACATAT-------A-C-CAAA--------------AG------TAGGTAATTGTGA-CCT---A-CAT-------------------CTCTGAT-------------C------T------A-----------tcccttataagcaacgtgccactaaccaaaaattggtcattatggcctaaatctt
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gi|9 : acttagctcaaaacatgtttcctataccttgaatgaccatatacagtatataggtacatctagggaagtaggtttgacatataccaaaagtaggtaattgtgacctacatctctgatctatataccatagagtcctggatttactgaATCT-C--CTTTACTTTA------A-----A------ATCGGTATGAGC-----AA------AT----TTAGCT-T----AA-GA-----GTAATTATA-TGGAAGG----TAG-----TGT--GTCACAT-----------CAAA--------------AC------TAGATCACTGTGA-Cacatcaaaactagatcactgtgac
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blockSeqs : . . ATGCCTAGA . . T . . . . . GTGG . . . . . A C . . . AC . . TA CTACATACT T . . . TC . . . AT ATAACTATACCACTAAGA . . . T A GA . . . . G . .
blockSeqs : . . AATGACCAT . . T . . . . . CAGT . . . . . C G . . . AG . . CT CTACATGTA G . . . AT . . . AT TCACTGTACTATAAAGC . . . G T GA . . . . G
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blockSeqs : . G . . . . . TAGG . . . . . G A . . . CT . . TG CAA A . . . G . . . .
blockSeqs : G . . . . . GTGC . . . . . C C . . . GC . . AA CTA C . . . C . . . .
blockSeqs : C . . . . . GTAG . . . . . G C . . . CT . . TT TT . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . TGG . . . . . C T . . . A . . CT TA . . . . . . . .
blockSeqs : . GT . . . . . G C . . . . . . CT A .
blockSeqs : . A . . . . . G C . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . .
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Reference ( family-140 ) : AGACCATAT-C--CTATACTTTA------A-----C------A----------C-----AT------AT----TTTGGT-T----AT-GG-----GTACATCTA-GGGAAGG----GGN-----TGT--GTCACAT-------A-C-CAAA--------------AC------TAGGTCANTGTGA-CCT---A-CATACT-GA------------CCTCTGACC------T------A-----------AG--A--AA--AACCTTG-T-C-GA-A--GC---ATATATTTCCTA----TAA--CT-----AT-ACCACT--AA-G----------A-CTT-G-----------G--ATGACCANATTCAGTTCATGGATGAATTT---TA-GGAA----GTAGGTGTGTCTCCTTTACTGTAGGGATTATTTGTTTTGTTGTTGGACAGTTATCTTTTGTATAATCAACTCATGTCATATTCAAGCTTAAAACCAATGTGGTTTAAAATAACAT-ACATTCTTTATAACCTTCCCTAGATAACAGCGGTCAACCATTGCAATGTAGCAAGTTAGTCGCAACTTCCCCTTGAAATACAAATTAGTTTACATTAATTGTTCTACTGTTTTTTT--TTATTTCAGTATTGTACTGCGAAGATTTTATTTGGACAGAC---ATGAGATAAGGAATATTC
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gi|10 : aattggtttctgatgaatatcttggaaagagtctgtttattagtcctaaaactaggtcagtctgacctataatataatgacctgacctacaataaagtaaaaaaccttgtttggcgcatattttctatactgtgaggccctagatgaacatattcaattcatagatacatctagggaagtgtgtcacatatcaaaagaagttcactttcacctactttgtcctctgatctatgtgtacatgcaaataaaaccttgtcaggagcttagaattaccaaatttagttgatgcatacttctagggaagttgcatatttgtgtcacataaggattaccaaatttagtttatgcatacttctagggaagttgtatatgtgtgtcacataaggattaccaaatttagtttatgcatacaaaatgtaggttattttggcctacattttgacgtcatacctacataccagtaaaattttgtccagggcattttcttAA--------------AG------TAAGTCACTGTGG-TTT---A-CA-ACTTGA------------CTTTTGACT------T------GCATATC-----AG--T--AA--AACCTTG-T-CTGA-A--GC-----ATATCTCCT-----TTA--CT-----G-------T--AA-G----------A-CCTAG-----------G--ATTACCAAATTTCGTTTATGAGT--ACTTCTATA-GAAA----GT-GGTGTTTCCCactattgaaacttttccgaagcaaatatc
gi|10 : ctttccaaattttgtttatagatacttagaggCATAT-CTCCTTTACTGTA------A-----G------A----------CCTAGGATTACCAAAT----TTCGTT-T----AT-GA-----GTACTTCTA-TAGAAAG----TGG-----TGT--TTCCCAA-------A-C-CAAA--------------A-------TAGGTCACTGTGA-TCT---C-CATCTT-GA------------ATACTGACC------T------ACATACT-----AG--T--AA--AATCTTG-C-C-AA-AAGGC---ATGTA--TCCT-----TCA--CT-----GT-ACTATA--AA-G----------C-CTaaaccaaaataggtcactgtgatctccatcttgaatactgacctacatactagtaaaatcttgccaaaaggcatgtatccttcactgtactataaagcctagtttgtttagccttgttggccgtaagctagaaatactgaagctacagtgttacat
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