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10 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Alignments
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lowQualScore : ... . ... . ... . ... . . . ... ..... . .. .. . ... . . . .... . . . ........ .... . . . . . .. . . . . ............................. . . . . .. ... . . . . . ..................... . . .. . . . . ....... . . . . . . .... ..... .. ... ... .... .
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gi|1 : tatatatatatatatatatatgatgttgcgtcagatgttggcgaacagtacgtaacacgatgtaacattattttatgtgtcgattttgttttatattaacaagaaacatttattgaattgaatactgtttctttttcttttactttttatctaatttcatgcattttcataaattatgtgtgaaaagcatttcatataacaattcattttgaatggctgtttatgtgtgatttaattttaacggtgttctgatcgccgtgtttcaccgctgtgcttatgtaacatatcacaacccattaggtgaatgccttccattttttaataaatgtgtatttgtgtctgttttccccctacacgtaccactgtattggatctatgaggagttgctaggtattctctaaatttttattttgatgtgtaatacacgttctcatttttatggttacaattaacttttacgttctttctgtttcatttttttcttctctctttaaaaaatttagtcttttcagaagctgaagcaaaggccatatgaaaattaaccctgtttgataattatatcgtttaaatacagccacataagaatatatatggattaatatataataatatggataaattggttgcctgattattgactaattgaaACAAACATATTCTTCAATTATTTCAATTTTTTTCAATTATTT----TATAGATGTAACACTGTCGCTAGATATTAAATTTCACTTGGTATAGATAGAAACTCCATTTTTTT-CTTCTCTAAAATAGATTTTCATTAAAGTGATATAAAGAACTCTTTTTATTGAGAAAA-CAGAGTAAAAAGAATATCACAGAAGACATTTTGAATATGATTTTTATATAGCGAGATGATGAAAGAAAAAAAC---------AACTTATGT----TTT-ATTCTATATCGTGTCTTTTGCTTCTTGTTTATCttatttcaatttttttcaattattttatagatgtaacactgtcgctagatattaaatttcacttggtatagatagaaactccatttttttcttctctaaaatagattttcattaaagtgatataaagaactctttttattgagaaaacagagtaaaaagaatatcacagaagacattttgaatatgatttttatatagcgagatgatgaaagaaaaaaacaacttatgttttattctatatcgtgtcttttgcttcttgtttatc
gi|11 : tatatatatatatatatatatgatgttgcgtcagatgttggcgaacagtacgtaacacgatgtaacattattttatgtgtcgattttgttttatattaacaagaaacatttattgaattgaatactgtttctttttcttttactttttatctaatttcatgcattttcataaattatgtgtgaaaagcatttcatataacaattcattttgaatggctgtttatgtgtgatttaattttaacggtgttctgatcgccgtgtttcaccgctgtgcttatgtaacatatcacaacccattaggtgaatgccttccattttttaataaatgtgtatttgtgtctgttttccccctacacgtaccactgtattggatctatgaggagttgctaggtattctctaaatttttattttgatgtgtaatacacgttctcatttttatggttacaattaacttttacgttctttctgtttcatttttttcttctctctttaaaaaatttagtcttttcagaagctgaagcaaaggccatatgaaaattaaccctgtttgataattatatcgtttaaatacagccacataagaatatatatggattaatatataataatatggataaattggttgcctgattattgactaattgaatcattgtatggtatggtataattgtatgtagaagacagactagattaaaacattgatatggtgaaagtattactatcgacgaatttataataaacaatgatctcctataattgcactttaaatgtccgtcgaaaatgaacttaacgatacttgattttacgctgttacattatggctagatatagggaaaaaaaacaccaaaatcatatcggactacatatgttgtatatTCATTGTATGGTTTGGTATAA---TAGTATGTAGAAAAC----TAGATTTGAACATTGACATAGGGAAAGTATTTCTATCAACAAA---ATAAAC-----AATGATCTCTAATTA---TTGCTCTTTAATTGCCCGTCGAAAATGACGTTAACGTTACTTGAGTTTACGGTGTT---ACAATATGGCTAGACAT--CAGA-AAAAATAAT--ACCAAAATCATATAGGACGACAAACGTTGTATATATAAACATCTTTTTCAACAA-CTAAACTAGAACTTTTGAACCGATATATAAATTAACAATTAACAACATTGTGAAACTGT-C---AAAAAATACGACAAAC-T-TTGTTAAA--ATTT--ATTTTTGTCAAATATTC----TATAGATGTT
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gi|2 : atatatataggcagctagtaacatacaacgttgcgtcagatgttggcacctattaacatatatagaaataataaaactttttttatattacaagaaacctttattgaatggggtattgtttcttgttctttcaatctgtatttttacttcttatttatttcatgcattttcatatttaaaatgtaaaagcatttcatataacaacaacccatttcaaacggctgtttaatagtgattaaattttaacgttgttctgatcccgtgttacatcgctgtgcttatgtaacatactgcaaccccataggcgattgccttccgttttttaataaatgtgtaattgtttacagttttcgctgacacatactaatatatccgcataccactgtaccgaatctatgaggagtggctaaattttctttttttgacgtgtaatacacgccctcaagtgtatggttacaattaaagttaccttctttctctttcattttattctctttataaaatttagccttttcggaggctgaagcaaacgccatatgaacattaaccccgtttgataattatatcgttaaaagaatattcaatatgttgattaagtggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatggtatcgtataataatagtatgtagaagacagactagattaAAAAATTACAACAAAC-T-TTGTTA-----------TTTTTGTCAAATATTT----TATAGATGTTACATCGCGGCTAGACATTTAATTTCACTTGATATAGATAGAAACTTCATTCTTTTACTTCTCTAAAAT-GATTTTTATTAAAATGATATAAAGAACTTTTTTTATTAAGTAAA-CAGATTAAATAGAATAT-ACAGAAGATAATTGAAATATGATCTTTACATAGTGAGTTGATGAAAG-AAAAAA----------A--CAACTTAC--ATTATCTCTATATCGAGTCTTTCGCTTCTTGTTTGTCctttgttatttttgtcaaatattttatagatgttacatcgcggctagacatttaatttcacttgatatagatagaaacttcattcttttacttctctaaaatgatttttattaaaatgatataaagaactttttttattaagtaaacagattaaatagaatatacagaagataattgaaatatgatctttacatagtgagttgatgaaagaaaaaaacaacttacattatctctatatcgagtctttcgcttcttgtttgtc
gi|20 : atatatataggcagctagtaacatacaacgttgcgtcagatgttggcacctattaacatatatagaaataataaaactttttttatattacaagaaacctttattgaatggggtattgtttcttgttctttcaatctgtatttttacttcttatttatttcatgcattttcatatttaaaatgtaaaagcatttcatataacaacaacccatttcaaacggctgtttaatagtgattaaattttaacgttgttctgatcccgtgttacatcgctgtgcttatgtaacatactgcaaccccataggcgattgccttccgttttttaataaatgtgtaattgtttacagttttcgctgacacatactaatatatccgcataccactgtaccgaatctatgaggagtggctaaattttctttttttgacgtgtaatacacgccctcaagtgtatggttacaattaaagttaccttctttctctttcattttattctctttataaaatttagccttttcggaggctgaagcaaacgccatatgaacattaaccccgtttgataattatatcgttaaaagaatattcaatatgttgattaagtggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatggtatcgtataataatagtatgtagaagacagactagattaaaacattgatatctaataattacactttaaatgacattaacgttacttgattttacggtgttacattatggctagacatccgTTTT-T--GCAAATTATAAAGAAAAAT-CTTTAA-C--A----T-TTTT---TTTA-TT----ATTTAAAAAGGGTAAAAG--ACT-GTATATAATAATA----TATGTTTAAAATCTCTATTTA-A-TTTTT--T---CGATAAATAACGATATTTTAAAATTGACGAAAAGTACGAG----A-TAATTGTAATGTATGCCATCATCTGA
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Reference ( family-1136 ) : TCATTGTATGGTATGGTATAA---TAGTATGTAGAAGACAGACTAGATTAAAACATTGACATGGCGAAAGTATTACTATCGACGAA---ATAAACAAAC-AATGATCTCTNATAA---TTGCACTTTAAATGCCCGTCGAAAATGACGTTAACGTTACTTGATTTTACGGTGTT---ACATTATGGCTAGACAT-CNG-AAAAATAAC--ACCAAAATCATATAGGACGACATACGTTGTATATATAAACATCTTCTTCAACAA-A-AAANTAGAACTTTTAAACCGGTATATAAATTAACAATTAACAACATTGAGAAACTGTAAAA---AAAATACGACAAAC-T-TTGTTAAA--ATTT--ATTTTTGTCAAATATTTTATAGATGTTACATCGCGGCTAGACATTTAATTTCACTTGATATAGATAGAAACTCCATTCTTTTATTTCTCTAAAATAGATTTTCATTAAAATGATATAAAGAACTCTTTTTATTGAG-AAAACGGAGTAAGTAGAATAT-ACAGAAGACATTTTAAATATGATTTTTACATAGCGAGTTGATGAAAGAAAAAAACA-ACTT-----ATGTT----TT-AT-TCTATATCGAGTCTTTCGCTTCTTGTTTATCACCTGTACTGATTTCCGATTTGAAATTGTTACGTCGCTTAGAACTCTCGACAACACGTCAAATAACGGATTTTGGGCGAGAAATCATAGCACGGAATCATTATTCATGCGTTTT--TCATCATCGGATTTA-C-TTTTTT-GTTACATCTTACGGTGACGTT---------TTTTTGACGTTT--------CGTGACATTTTTT-T--GTNTATTATAAAAACATATTCTTTAA-ATAA----T-TTTTATT-TTTATTTTGTATTTAAAAAGAGTAAAAATAACT-GAATGTGATGGTA----TATATTTAAAATCTCTATTCA-T-TTTTT--T---CGATAAATGACGATATTTTAAAATTGAC---AAGTACGAG----ATTTTTTGCAATGTACGCCAACATCTGA
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