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Reference ( gi|1 )            : AAATATTTAAGTTGCTCAAAATAA----AATGATTAGATTTATACACAGCTATGATTGTAGAGCTTCTTTGTCAGTGGCGGATTTTAAAGATCTTGGAATACTTCAAAGTGGAAGAAGAAACAGATGATTAAGATTTGAATCAAGTTCATAAGATTTTGAACAATTCATGCCCGTCTTATCTT----AAAACTTT-ACAAAGCTGTTTACTTCGCATCATCATGCAACTAGAGGAAGTACATTTAATTTTATTGGGTCATGTGTTAAAAGACAAACAACATCAACTTTCTTTTATAATGGCATTCTGGATTGGAATCAATTACCCCATTACTATTAAGGAAATT--AAAAACAAGCATA-ACTTGAAAAAAGAAGTGAATAAGTATCCATTCTTTCAAA---A-GGA--AA---G--T--AGAGGAATGTGAATTTATTGTTTATTTAGTTAT---T--T----A-----TT--T-------T------A----AA----A---A--AA-AACACACTTTTTTATTGTTACAAATGTGGA--T--AT-AGTTGGGATACATAT---TTTAAAT-ATACTTGATAAATAACA-AAGTATCATTTTTCCGATATGAAACTAACATAAA
gi|2                          :      TTAAAGTTGCTCAAAATAATCTTGATTAATAGATTTATACCCAGCTTTGATAGTAGAGCTTCTTTGTCCACGTCGGATTGTTAATATCTTGGAATTCTTAACATTGAAAGTAGAAAAAGTCAATCAGGATT-GAATCAAGTTCATAAGATTTTTAACAATTCATGCCCGCCTTATCTTCAACAAAAGTTTCAGAAAGCTGTCTAATTCTCCACATGATGCAACTAGAGGAAGT---------TCTATTGTGTCCTGTGTTGATAGTTCTACAACATTAACTTTCTTTTATAATGGCATTCTGGATTGGAACCAATTACCCCA-TACTGTTACGGGAATT--AAAAACAAGCATA-ACTTTAAATAAGAA-TGGAAAAATAACTATTCTTGCAAA---T-GGA--AA---A--TTAAGAGGAATGTGATTTTTTTTTTTATCAAATTAA---T--G----A-----TT--T-------T------A----AA----ACTTA--GA-A------TTTATTGATGTTATTAATGTGGATTT--AT-AGCAATGATATATTT---TTTAA---ATACTTGTTAAATAACA-ATGTATAATTTCTGTGGTATGA
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gi|22                         :                                                               GCTACTTTGTCTGCGTCATAATTTAAAGATCTTGGAATACTTaacattgcaaataga
gi|3                          :                                                                                   TTTTAAAGATCTTGGAATACTTAACATTGGAAGTAGAAATAGACAATTAAGATTgaca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                        ----AAAATTTT-ACAAAGCTATCTAATTCTCACCACCCTGaagaaaattttacaaagctatctaattctcaccaccctgtgttaatagtttaacaacattatctttcttttataatggcattcttgattgaatccagttacccaatactgttaagggaattaaaaacaagcacaactttaaaaaaaagtgaagaaatatctattcttgcaaagaaacatttaaaggaatgtgaatttattttttttattataactttatgattttaaaacttagaatgtatttatgttgttaatttggatttatagttatgatgcatatttttaaatacttgataaataacaaagtataatttctgtgatgt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                           ttttaaagatcttggaatacttaacattggaagtagaaatagacaattaagattaagTGTGTTAATAGTTTAACAACATTATCTTTCTTTTATAATGGCATTCTTGATTGAATCCAGTTACCCAA-TACTGTTAAGGGAATT--AAAAACAAGCACA-ACTTTAAAAAA-AAGTGAAGAAATATCTATTCTTGCAAA------GA--AACATT--T--AAAGGAATGTGAATTTATT-TTT-TTTA-TTATAACT--TTATGA-----TT--T-------T------A----AA----A---CTTAG-AATGTA--TTTATGTTGTT---AATTTGGATTT--AT-AGTTATGATGCATAT---TTTTAA--ATACTTGATAAATAACA-AAGTATAATTTCTGTGATGTtgttaatagtttaacaacattatctttcttttataatggcattcttgattgaatccagttacccaatactgttaagggaattaaaaacaagcacaactttaaaaaaaagtgaagaaatatctattcttgcaaagaaacatttaaaggaatgtgaatttattttttttattataactttatgattttaaaacttagaatgtatttatgttgttaatttggatttatagttatgatgcatatttttaaatacttgataaataacaaagtataatttctgtgatgt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                  ttttaaagatcttggaatacttaacattggaagtagaaatagacaattaagattaagaaaattttacaaagctatctaattctcaccacccCATTCTGGATTGGAATCAATTACCCCA-TACTATTAAGGAAATTAGAAAAAAAAGCATACATTTAAAAAAAATCG-GAAGAAATATCTTTTCGTGCAAA---T-GGA--AAAT-G--T--AGAGGAATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---N--N----N-----NN--N-------N------NNNTTAA----A---A--AA-AATAGAA-TTTTCATTGCTACTAATGTGGGTTT--AT-AGCTGTGATACATAT---TTTAAAT-ATACTCGATAAAT-ACA-AAATAGAATTTCTGTGATATGAAACCGACATGAA
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttGTGATAAAATATATATTCTTATAAATTTATGGA--AA---A--TTTAGAGGAATGTGAATTTATTTTTTATTAACTT-T---T--C----AAAGATTT--T-------T------A----GA----A----------------TTTATCATAATTATTAATGTGGA--TTTAT-AGCTGTGATACATAT---TTTTAA--ATGCTAGATAAATAACA-AAGTATAATTTCTATGATATGAACCTAAaaac
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Unaligned ( gi|12 ): CTACGATTATCAAAGCTTAGAATTGTGTAATGTAATTAAAGTCGATTTATAGCTGTGATATATCATTTTTAAATGATAGACAAATGACGTAAGTATAACTTCTCTCGTACATTGTATGCACCTAATAATAT
Unaligned ( gi|20 ): TAATTTCAATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

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Reference ( family-1102 )     : NNNNNTTAAAGTTGCTCAAAATAATCTTGATNANTAGATTTATACCCAGCTNTGGTNGTAGAGCTTCTTTGTCCGCGTCGGATTTTAAAGATCTTGGAATACTTAACATTGGAAGTAGAAANAGNCAATCAGGATT--GAATCAAGTTCATAAGATT-TTTAACAATTCATGCCCGCCTTATCTTCAACAAAANTTTCANAAAGCTGTCTAATTCTCNNCACGNTGCAACTAGAGGAAGT---------TCTATTGTGTCCTGTGTTGATAGTTCNACAACATTANCTTTCTTTTATAATGGCATTCTGGATTGGAACCAATTACCCCA-TACTGTTAAGGGAATTA--AAAACAAGCATAACTTTAAAAAAGAAGTGAAGAAATATCTATTCTTGCAAAT----GGAAAA--G--T-AGAGGAATGTGAATTTA--TTTTTTAT--TAANTTNT----T--TA----T---T-----T-------T------AAAA---AGAA------T----TT-TTTATTGTTATTAATGTGGATTTATAGCTGTGATACAT-A-T---TTTAAAT-ATACTTGATAAATAACA-AAGTATAATTTCTGTGATATGAAACTGACATGAA
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gi|2                          :      TTAAAGTTGCTCAAAATAATCTTGATTAATAGATTTATACCCAGCTTTGATAGTAGAGCTTCTTTGTCCACGTCGGATTGTTAATATCTTGGAATTCTTAACATTGAAAGTAGAAAAAGTCAATCAGGATT--GAATCAAGTTCATAAGATT-TTTAACAATTCATGCCCGCCTTATCTTCAACAAAAGTTTCAGAAAGCTGTCTAATTCTCCACATGATGCAACTAGAGGAAGT---------TCTATTGTGTCCTGTGTTGATAGTTCTACAACATTAACTTTCTTTTATAATGGCATTCTGGATTGGAACCAATTACCCCA-TACTGTTACGGGAATTA--AAAACAAGCATAACTTTAAATAAGAA-TGGAAAAATAACTATTCTTGCAAAT----GGAAAA--T--TAAGAGGAATGTGATTTTT--TTTTTTAT--CAAATTAA----T--GA----T---T-----T-------T------AAAACTTAGAA------T----TT-ATTGATGTTATTAATGTGGATTTATAGCAATGATATAT-T-T---TTTAA---ATACTTGTTAAATAACA-ATGTATAATTTCTGTGGTATGA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaag-T---TTCAAAT-ATACTTGATAAATAACA-AAGTATAATTTTTATGATATGAAACTGACcttaaaaacatga
gi|22                         :                                                            cacGCTACTTTGTCTGCGTCATAATTTAAAGATCTTGGAATACTTGACA
gi|3                          :                                                                                   TTTTAAAGATCTTGGAATACTTAACATTGGAAGTAGAAATAGACAATTAAGATTAAGAA--AATTTTACAAAGCTATCT---AATTC-TCACCACCCTGTGTT----AATAGTTTAACAACATTATCT--TTCT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                    CCTGTGTTAATAGTTTAACAACATTATCTTTCTTTTATAATGGCATTCTTGATTGAATCCAGTTACCCAA-TACTGTTAAGGGAATTA--AAAACAAGCACAACTTTAAAAAA-AAGTGAAGAAATATCTATTCTTGCAAA------GAAAC--ATTT-AAAGGAATGTGAATTTATTTTTTTTATTATAACTTTA----T--GA----T---T-----T-------T------AAAACTTAGAA------T----GTATTTA-TGTTGTTAATTTGGATTTATAGTTATGATGCAT-A-T---TTTTAA--ATACTTGATAAATAACA-AAGTATAATTTCTGTGATGTtttataatggcattcttgattgaatccagttacccaatactgttaagggaattaaaaacaagcacaactttaaaaaaaagtgaagaaatatctattcttgcaaagaaacatttaaaggaatgtgaatttattttttttattataactttatgattttaaaacttagaatgtatttatgttgttaatttggatttatagttatgatgcatatttttaaatacttgataaataacaaagtataatttctgtgatgt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                      ttttaaagatcttggaatacttaacattggaagtagaaatagacaattaagattaagaaaattttacaaagctatctaattctcaccacCATTCTGGATTGGAATCAATTACCCCA-TACTATTAAGGAAATTAGAAAAAAAAGCATACATTTAAAAAAAATCGGAAGAAATATCTTTTCGTGCAAAT----GGAAAAT-G--T-AGAGGAATGNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNNNNNNN----N--NN----N---NNNNNNT-------T------AAAA---AAAA------TAGAATT-TTCATTGCTACTAATGTGGGTTTATAGCTGTGATACAT-A-T---TTTAAAT-ATACTCGATAAAT-ACA-AAATAGAATTTCTGTGATATGAAACCGACATGAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATCAATTACCATA-TACTATTAAGGAAATTA--GAAAAAAGCATAAATTTAAAAAAGAAGTGAAGAATTATCTATTCGTGCAAAT----GGAAAAT-G--T-AGAGAAATGTGAATTCA--CTTTTTAT--TAAATTAT----TATTA----T---T-----T-------TTTTTTTAAA--------------TC---TT-TTTATTGTTATTAATGTGGATTTATAGCTGCGATACAT-A-T---TTTAAAT-ATATTTGATGAATAACA-AAGAATAATTT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGGAATTA--AAAACAAACATGTCTTTAAGAAAGAAGTGAAGAAATATTTATTCTCACAAAT----GAAAAAT-T--T-AGAGGA--CTGAATTTA--ATTTTTAA--TAAGCTTTACAAT--TA----T---T-----
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTGATAAAATATATATTCTTATAAATTTATGGAAAA--T--TTAGAGGAATGTGAATTTA--TTTTTTAT--TAACTTTT----C--AAAGATT---T-----T-------T-------------AGAA------T----TT-ATCATAATTATTAATGTGGATTTATAGCTGTGATACAT-A-T---TTTTAA--ATGCTAGATAAATAACA-AAGTATAATTTCTATGATATGAACCTAAaaac
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Unaligned ( gi|20 ): TAATTTCAATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

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Reference ( family-1102 )     : NNNNNTTNAAGTTGCTCAAAATAATCTTGATGATTAGATTTATACNCAGCTATGATTGTAGAGCTTCTTTGTCCGCGTCGGATTTTAAAGATCTTGGAATACTTAACATTGGAAGTAGAAANAGACGATTAAGATT--GAATCAAGTTCATAAGATT-TTTAACAATTCATGCCCGCCTTATCTT----AAAAGTTT-ACAAAGCTGTCTA-TTCTCNNCATNATGCAACTAGAGGAAGTACATTTAATTCT-ATTGNGTCCTGTGTTAATAGTTNAACAACATTAACTTTCTTTTATAATGGCATTCTGGATTGGAATCAATTACCCCA-TACTATTAAGGGAATT--AAAAACAAGCATAACTTTAAAAAAGAAGTGAAGAAATATCTATTCTTGCAAAT----GGAAAA--G--T-AGAGGAATGTGAATTTA--TTTTTTAT--TAANT--------T---T-T----T---TAT---T-TT-------AAAA-CTTAG-AA------T--T----------T-TTTATTGTTATTAA---TG-TGGATTTATAGCTGTGATACAT-A-T---TTTAAAT-ATACTTGATAAATAACA-AAGTATAATTTCTGTGATATGAAACTGACATGAA
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gi|3                          :                                                                                   TTTTAAAGATCTTGGAATACTTAACATTGGAAGTAGAAATAGACAATTAAGATTAAGAA--AATTTTACAAAGCTATCT---AATTC-TCACCACCCTGTGTT----AATAGTTTAACAACATTATCT--TTCT-TTTATAATG
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                       ttttaaagatcttggaatacttaacattggaagtagaaatagacaattaagattaagaaaattttacaaagctCATTCTGGATTGGAATCAATTACCCCA-TACTATTAAGGAAATTAGAAAAAAAAGCATACATTTAAAAAAAATCGGAAGAAATATCTTTTCGTGCAAAT----GGAAAAT-G--T-AGAGGAATGNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNNNN--------N---N-N----N---NNN---N-NNNNNTTAAAAAA-AATAG-AA---------T----------T-TTCATTGCTACTAA---TG-TGGGTTTATAGCTGTGATACAT-A-T---TTTAAAT-ATACTCGATAAAT-ACA-AAATAGAATTTCTGTGATATGAAACCGACATGAA
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Unaligned ( gi|20 ): TAATTTCAATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN

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Reference ( family-1102 )     : NNNNNTTNAAGTTGCTCAAAATAATCTTGATGATTAGATTTATACNCAGCTATGATTGTAGAGCTTCTTTGTCCGCGTCGGATTTTAAAGATCTTGGAATACTTAACATTGGAAGTAGAAANAGACGATTAAGATT--GAATCAAGTTCATAAGATT-TTTAACAATTCATGCCCGCCTTATCTT----AAAAGTTT-ACAAAGCTGTCTA-TTCTCNTCATNATGCAACTAGAGGAAGTACATCTAATTCT-ATCGCGTCCTGTGTTAATAGTTNAACAACATTAACTTTCTTTTATAATGGCATTCTGGATTGGAATCAATTACCCCA-TACTATTAAGGGAATT--AAAAACAAGCATAACTTTAAAAAAGAAGTGAAGAAATATCTATTCTTGCAAAT----GGAAAA--G--T-AGAGGAATGTGAATTTA--TTTTTTAT--TAANT--------T---T-T----T---TAT---T-TT-------AAAA-CTTAG-AA------T--T----------T-TTTATTGTTATTAA---TG-TGGATTTATAGCTGTGATACAT-A-T---TTTAAAT-ATACTTGATAAATAACA-AAGTATAATTTCTGTGATATGAAACTGACATGAA
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaataAAGT-ATGACAT-TCTATTCTTGCAAAT----GAAAAAATG--T-AGAGAAATGTGAATTTA--TTTTTTAT----GTT--------T---T-T----T---TATGATT-TT-------AAAT-CTTAG-AA------T--T----------T-TTTATTGTCATCAA---TG-TAGATTCATAGCTGTGATACAT-A-T---TTTAA---ATACTTGATAAATAACA-AAGTATAATTTCTGTGAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AAGT-ATGACAT-TCTATTCTTGCAAAT----GAAAAAATG--T-AGAGAAATGTGAATTTA--TTTTTTAT----GTT--------T---T-T----T---TATGATT-TT-------AAAT-CTTAG-AA------T--T----------T-TTTATTGTCATCAA---TG-TAGATTCATAGCTGTGATACAT-A-T---TTTAA---ATACTTGATAAATAACA-AAGTATAATTTCTGTGAT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AT---TATC-------AAAG-CTTAG-AA------T--T----------G-TGTAATGTAATTAA---AG-TCGATTTATAGCTGTGATATATCATT---TTTAAATGATA---GACAAATGACGTAAGTATAACTTCT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctacgT--------T---T-T----T---TTT---T-TT-------AAAA-AT-AT-AA------T--G----------T-T--ATTGTTATTAA---TG-TGGATTTATAGCTGTGATACAT-A-T---TTGAAAT-ATACTTGATCAATAACA-AAGAATAATTTCTGTGATATGAAACTGACActcgtacattgtatgcacctaataatat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cttAA-CTTAG-A-------C--T----------T-TTTATTGTTATTAG---TA-TGGATTTGTAGCTGTGATGCAT-A-T---TTTAAAT-ATACTTGATAAATAACA-AAGTATTATTTCTGTGATATTAAACTGACATGAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T--------T---T-A----T---TAT---T-TG-------AAAAGCTT-------------------------T-TTGATTGTTATTAA---TG-TGGATTTATAGCTGTGATACAT-A-T---TTTAAAT-ATACTTGATAAATAACA-AAGTGTAATTTc
gi|16                         :                            taATGATTAGATTTATATTCAGCTATGGTTGTAGAGCTTCTTTGTCCGCGTCGGATTTTAAAGATCTTAGAATACTTAACATTGCAAATAGA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aataaaA---TG-TGATTCTATAGCTGTGATAAAT-A-T---TTTAAAT-ATACTTAATAAATAACA-AAGTATAAATTCTGTGATATGAAAATGACATGAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --T----------T-TTTATTGTTATTAA---TG-TAAATTTATAGCTGCGATACAT-A-T---TTTAAAT-ATATTTGATGAATAACA-AAGTATAATTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tcATCAA---TG-TGTATTT-TAGCTGTGATATAT--------TTAAATGATA---GATAAATAACATAAATGTAATTTCTGTGATATGAA
gi|2                          :      TTAAAGTTGCTCAAAATAATCTTGATTAATAGATTTATACCCAGCTTTGATAGTAGAGCTTCTTTGTCCACGTCGGATTGTTAATATCTTGGAATTCTTAACATTGAAAGTAGAAAAAGTCAATCAGGATT--GAATCAAGTTCATAAGATT-TTTAACAATTCATGCCCGCCTTATCTTCAACAAAAGTTTCAGAAAGCTGTCTAATTCTCCACATGATGCAACTAGAGGAAGT---------TCT-ATTGTGTCCTGTGTTGATAGTTCTACAACATTAACTTTCTTTTATAATGGCATTCTGGATTGGAACCAATTACCCCA-TACTGTTACGGGAATT--AAAAACAAGCATAACTTTAAATAAGAA-TGGAAAAATAACTATTCTTGCAAAT----GGAAAA--T--TAAGAGGAATGTGATTTTT--TTTTTTAT--CAAAT--------T---A-A----T---GAT---T-TT-------AAAA-CTTAG-AA------T--T----------T-ATTGATGTTATTAA---TG-TGGATTTATAGCAATGATATAT-T-T---TTTAA---ATACTTGTTAAATAACA-ATGTATAATTTCTGTGGTATGA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaag-T---TTCAAAT-ATACTTGATAAATAACA-AAGTATAATTTTTATGATATGAAACTGACcttaaaaacatga
gi|22                         :                                                            cacGCTACTTTGTCTGCGTCATAATTTAAAGATCTTGGAATACTTGACA
gi|3                          :                                                                                   TTTTAAAGATCTTGGAATACTTAACATTGGAAGTAGAAATAGACAATTAAGATTAAGAA--AATTTTACAAAGCTATCT---AATTC-TCACCACCCTGTGTT----AATAGTTTAACAACATTATCT--TTCT-TTTATAATG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                   ATCTAATTCTCACCAC--CCTGTGTTAATAGTTTAACAACATTATCTTTCTTTTATAATGGCATTCTTGATTGAATCCAGTTACCCAA-TACTGTTAAGGGAATT--AAAAACAAGCACAACTTTAAAAAA-AAGTGAAGAAATATCTATTCTTGCAAA------GAAAC--ATTT-AAAGGAATGTGAATTTATTTTTTTTATTATAACT--------T---T-A----T---GAT---T-TT-------AAAA-CTTAG-AA------T--G----------TATTTA-TGTTGTTAA---TT-TGGATTTATAGTTATGATGCAT-A-T---TTTTAA--ATACTTGATAAATAACA-AAGTATAATTTCTGTGATGTgcattcttgattgaatccagttacccaatactgttaagggaattaaaaacaagcacaactttaaaaaaaagtgaagaaatatctattcttgcaaagaaacatttaaaggaatgtgaatttattttttttattataactttatgattttaaaacttagaatgtatttatgttgttaatttggatttatagttatgatgcatatttttaaatacttgataaataacaaagtataatttctgtgatgt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                       ttttaaagatcttggaatacttaacattggaagtagaaatagacaattaagattaagaaaattttacaaagctCATTCTGGATTGGAATCAATTACCCCA-TACTATTAAGGAAATTAGAAAAAAAAGCATACATTTAAAAAAAATCGGAAGAAATATCTTTTCGTGCAAAT----GGAAAAT-G--T-AGAGGAATGNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNNNN--------N---N-N----N---NNN---N-NNNNNTTAAAAAA-AATAG-AA---------T----------T-TTCATTGCTACTAA---TG-TGGGTTTATAGCTGTGATACAT-A-T---TTTAAAT-ATACTCGATAAAT-ACA-AAATAGAATTTCTGTGATATGAAACCGACATGAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATCAATTACCATA-TACTATTAAGGAAATT--AGAAAAAAGCATAAATTTAAAAAAGAAGTGAAGAATTATCTATTCGTGCAAAT----GGAAAAT-G--T-AGAGAAATGTGAATTCA--CTTTTTAT--TAAATTATTATTAT---T-T----T---TTT---T-TT-------AAAT-C----------------T----------T-TTTATTGTTATTAA---TG-TGGATTTATAGCTGCGATACAT-A-T---TTTAAAT-ATATTTGATGAATAACA-AAGAATAATTT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GGGAATT--AAAAACAAACATGTCTTTAAGAAAGAAGTGAAGAAATATTTATTCTCACAAAT----GAAAAAT-T--T-AGAGGA--CTGAATTTA--ATTTTTAA--TAAGC--------T---T-TACAAT---TAT---T-AC-------AATA-CATGGTAA------TGCTTCTGTATTCAT-TTTATT-TCATTGAGCTTGTTAAATTTTT--TTATGACACAT-A-------TATAT-ATA-TCAATATATA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTAAAAAAGAAATGAAAAACTATCTGTTCATGCAAAT----GGAGCA--T--TTAGATGATTGTGAATATA--TTTTTTAT--TAACT--------T---T-A----T---GAT---T-TT-------AAAA-CTTAG-AA------T--T----------T-ATTAATGTCATTAA---TG-TGGATTTATAGCTGTGATATAT-A-TATCTTTAA---ATACTTGATAAATAACA-AAGTATAATTTCTGTGATATGAACCTAAtatatcacaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTGATAAAATATATATTCTTATAAATTTATGGAAAA--T--TTAGAGGAATGTGAATTTA--TTTTTTAT--TAACT--------T---T-T----CAAAGAT---T-TT--------------TAG-AA------T--T----------T-ATCATAATTATTAA---TG-TGGATTTATAGCTGTGATACAT-A-T---TTTTAA--ATGCTAGATAAATAACA-AAGTATAATTTCTATGATATGAACCTAAaaac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTAAAAAAGAAGTGAAGATTTATCTATTCGTGCAAAT----GGAAAAT-G--T-AGAGAAATGTGAATTCA--CTTTTTAT--TAAAT--------TATTTAT----T---TAT---T-TT------------TTTAA-AT------C--T----------T-TTTATTGTTATTAA---TG-TGGATTTATAGCTGCTATACAT-A-T---TTTAAAT-ATATTTGATAAATAACA-AAGAATAATTTg


blockSeqs                     :        A                TCTT                 T                                                                           A              AA   T               A   A       A               CAAC        C            AA    CC    G                 .           C    TG                C                                                      .                AG                                                     TTAT      ATGT                    TT        TAT  T TATTATTATTT         AAA   GAT A  NNNTTAA   AGCT   T  TGCTTCTGTATTCA       A              GCT  T                      C T ATC     ATG                 T
blockSeqs                     :                                              C                                                                           T              .    .               .   .       .               .           A            .     T     A                             .    C                 T                                                      .                .                                                      .         ATGT                    .         C    T TTTACAA             .     GAT .  .         TCT    .  TT                   .              .    .                      . . .       ATG                 T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .                .                                                      .         ATTT                    .         N    A TATTTAT             .     .   .  .         TCT    .  TT                   .              .    .                      . . .       AT                  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .                .                                                      .         TTA                     .         T    C TTT                 .     .   .  .         GCT    .  TT                   .              .    .                      . . .       AT                  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .                                                      .         TGT                     .         T    N TTT                 .     .   .  .         AAT    .  TG                   .              .    .                      . . .       AT                  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .         TGT                     .         T    A TTT                 .     .   .  .         ACT    .  CT                   .              .    .                      . . .       AT                  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .         TTT                     .         T    G TTA                 .     .   .  .         ACT    .  TT                   .              .    .                      . . .       AT                  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .         TTT                     .         T    C TAA                 .     .   .  .         ACT    .  TG                   .              .    .                      . . .       AT                  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .         TTT                     .         .    C TTA                 .     .   .  .         AAA    .  TT                   .              .    .                      . . .       AT                  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .         TGT                     .         .    A NNN                 .     .   .  .         ACA    .  TT                   .              .    .                      . . .       AT                  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTA                 .     .   .  .         ACT    .  CT                   .              .    .                      . . .       AT                  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTT                 .     .   .  .         TC     .  T                    .              .    .                      . . .       AT                  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .   .  .         TT     .  T                    .              .    .                      . . .       A                   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .      .  .                    .              .    .                      . . .       A                   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .              .    .                      . . .       .                   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .    .                      . . .       .                   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .    .                      . . .       .                   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .       .                    


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gi|16                         :                            taATGATTAGATTTATATTCAGCTATGGTTGTAGAGCTTCTTTGTCCGCGTCGGATTTTAAAGATCTTAGAATACTTAACATTGCAAATAGA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aataaaA---TG-TGATTCTATAGCTGTGATAAAT-A-T---TTTAAAT-ATACTTAATAAATAACA-AAGTATAAATTCTGTGATATGAAAATGACATGAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --T----------T-TTTATTGTTATTAA---TG-TAAATTTATAGCTGCGATACAT-A-T---TTTAAAT-ATATTTGATGAATAACA-AAGTATAATTT
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tcATCAA---TG-TGTATTT-TAGCTGTGATATAT--------TTAAATGATA---GATAAATAACATAAATGTAATTTCTGTGATATGAA
gi|2                          :      TTAAAGTTGCTCAAAATAATCTTGATTAATAGATTTATACCCAGCTTTGATAGTAGAGCTTCTTTGTCCACGTCGGATTGTTAATATCTTGGAATTCTTAACATTGAAAGTAGAAAAAGTCAATCAGGATT--GAATCAAGTTCATAAGATT-TTTAACAATTCATGCCCGCCTTATCTTCAACAAAAGTTTCAGAAAGCTGTCTAA-TTCTCCACATGATGCAACTAGAGGAAG---------TTCT-ATTGTGTCCTGTGTTGATAGTTCTACAACATTAACTTTCTTTTATAATGGCATTCTGGATTGGAACCAATTACCCCA-TACTGTTACGGGAATT--AAAAACAAGCATAACTTTAAATAAGAA-TGGAAAAATAACTATTCTTGCAAAT----GGAAAA-TTAAGAGGAATGTGATTTTT--TTTTTTAT--CAAAT--------T-A---A----T---GAT---T-TT-------AAAA-CTTAG-AA------T--T----------T-ATTGATGTTATTAA---TG-TGGATTTATAGCAATGATATAT-T-T---TTTAA---ATACTTGTTAAATAACA-ATGTATAATTTCTGTGGTATGA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaag-T---TTCAAAT-ATACTTGATAAATAACA-AAGTATAATTTTTATGATATGAAACTGACcttaaaaacatga
gi|22                         :                                                            cacGCTACTTTGTCTGCGTCATAATTTAAAGATCTTGGAATACTTGACA
gi|3                          :                                                                                   TTTTAAAGATCTTGGAATACTTAACATTGGAAGTAGAAATAGACAATTAAGATTAAGAA--AATTTTACAAAGCTATCT---AATTC-TCACCACCCTGTGTT----AATAGTTTAACAACATTATCT---TTCT-TTTATAATG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                    ATCTAATTCTCACCAC--CCTGTGTTAATAGTTTAACAACATTATCTTTCTTTTATAATGGCATTCTTGATTGAATCCAGTTACCCAA-TACTGTTAAGGGAATT--AAAAACAAGCACAACTTTAAAAAA-AAGTGAAGAAATATCTATTCTTGCAAA-----GAAACA-TTTAAAGGAATGTGAATTTATTTTTTTTATTATAACT--------T-T---A----T---GAT---T-TT-------AAAA-CTTAG-AA------T--G----------TATTTA-TGTTGTTAA---TT-TGGATTTATAGTTATGATGCAT-A-T---TTTTAA--ATACTTGATAAATAACA-AAGTATAATTTCTGTGATGTgcattcttgattgaatccagttacccaatactgttaagggaattaaaaacaagcacaactttaaaaaaaagtgaagaaatatctattcttgcaaagaaacatttaaaggaatgtgaatttattttttttattataactttatgattttaaaacttagaatgtatttatgttgttaatttggatttatagttatgatgcatatttttaaatacttgataaataacaaagtataatttctgtgatgt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                        ttttaaagatcttggaatacttaacattggaagtagaaatagacaattaagattaagaaaattttacaaagctCATTCTGGATTGGAATCAATTACCCCA-TACTATTAAGGAAATTAGAAAAAAAAGCATACATTTAAAAAAAATCGGAAGAAATATCTTTTCGTGCAAAT----GGAAAA-TGTAGAGGAATGNNNNNNNN--NNNNNNNN--NNNNN--------N-N---N----N---NNN---N-NNNNNTTAAAAAA-AATAG-AA---------T----------T-TTCATTGCTACTAA---TG-TGGGTTTATAGCTGTGATACAT-A-T---TTTAAAT-ATACTCGATAAAT-ACA-AAATAGAATTTCTGTGATATGAAACCGACATGAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATCAATTACCATA-TACTATTAAGGAAATT--AGAAAAAAGCATAAATTTAAAAAAGAAGTGAAGAATTATCTATTCGTGCAAAT----GGAAAA-TGTAGAGAAATGTGAATTCA--CTTTTTAT--TAAATTATTATTAT-T---T----T---TTT---T-TT-------AAAT-C----------------T----------T-TTTATTGTTATTAA---TG-TGGATTTATAGCTGCGATACAT-A-T---TTTAAAT-ATATTTGATGAATAACA-AAGAATAATTT
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGGAATT--AAAAACAAACATGTCTTTAAGAAAGAAGTGAAGAAATATTTATTCTCACAAAT----GAAAAA-TTTAGAGGA--CTGAATTTA--ATTTTTAA--TAAGC--------T-T---TACAAT---TAT---T-AC-------AATA-CATGGTAA------TGCTTCTGTATTCAT-TTTATT-TCATTGAGCTTGTTAAATTTTT--TTATGACACAT-A-------TATAT-ATA-TCAATATATA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTAAAAAAGAAATGAAAAACTATCTGTTCATGCAAAT----GGAGCA-TTTAGATGATTGTGAATATA--TTTTTTAT--TAACT--------T-T---A----T---GAT---T-TT-------AAAA-CTTAG-AA------T--T----------T-ATTAATGTCATTAA---TG-TGGATTTATAGCTGTGATATAT-A-TATCTTTAA---ATACTTGATAAATAACA-AAGTATAATTTCTGTGATATGAACCTAAtatatcacaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTGATAAAATATATATTCTTATAAATTTATGGAAAA-TTTAGAGGAATGTGAATTTA--TTTTTTAT--TAACT--------T-T---T----CAAAGAT---T-T--------------TTAG-AA------T--T----------T-ATCATAATTATTAA---TG-TGGATTTATAGCTGTGATACAT-A-T---TTTTAA--ATGCTAGATAAATAACA-AAGTATAATTTCTATGATATGAACCTAAaaac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTAAAAAAGAAGTGAAGATTTATCTATTCGTGCAAAT----GGAAAA-TGTAGAGAAATGTGAATTCA--CTTTTTAT--TAAAT--------TATTTAT----T---TAT---T-TT------------TTTAA-AT------C--T----------T-TTTATTGTTATTAA---TG-TGGATTTATAGCTGCTATACAT-A-T---TTTAAAT-ATATTTGATAAATAACA-AAGAATAATTTg

Unaligned ( gi|20 ): TAATTTCAATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN