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Reference ( gi|1 )            :                                                                                TATTGGTTTTTTTCCATCGTCC-TTTTCTTTTTCTAACCTATGCACCGATACCCAAGTAGAA---AA--AAAA--AGAA------CTGTAAA-TGTTACCCGTGAAGA----TTTATTTAATCGTTCATTCAAAGTGTTT----ATGTAATAAACTCGTAGTCTTTGTTTGAATGTTGGAGGAAATAAATTTATATCACCCACTCCTTATGCT-AACAGCACGTAATAAAATCCTAATTTACA--TAATGTATATCTGACAAGCGAGGCCCAATAAGCAATATTTGTTGATTTTTCGATATCTTTTAACATTATTAGGTAAACATGATACATATA--TTTTCGATCGTAACTGTGTAATGCTTTGAACCAG-TATTTTATGAT--------TATATTCATTCGCATA-AT---------ATAATAACTTGTTCTTCCTAACTGGCTGTACATAAAGCCATTTTGTGTC-GATAATTT---CGC--TTAATAACGATTTGCAAAAT-TGTAAACGTACCCGTT--CT---------GTTCGA--------G-----T-AATGCCGCC----ATAT--------TTCGCTACCATAATTCAATATAGGTGTGACTATTTTACCATATAACTCTAGAGCATGTTTTGACGA---TATATAAACCAATT-TAAGTA---CGTATTAAAGTA-T--AATTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGTCGACCCACGATATTTTG-GCTTCGCTAAATGATCCACTCGTAGTGAAAACAAT--GCCTTA-GTACGAGCATTTACTGAC--TATTATCAG-TTTTGTATCAATAAAA----TC-AAACTTTATATGCTTCTCGTTACCATGCCGCCCCTTTTCTAAGG--TTCGTAACCTT-GGTTACTACTGTGTTTACTTTAAGTTTTCATCTATCGCAATATGCA---T-T-TAAAATATTAAATCCTTGTTGTCACTCTTCAGTATTAGGAGCGAAGATTATAATATCATCC---------ACATAC------TTTACTAACACTATTATA-CTACCCCGGCATTTCCTTTTTAAAATATGCATCT----TCTAAG-----TCATTAAGGTACGTTGAAAACAGAAATGGCGACAAATA-TTCACATTGCCTTGCCCAAAGATAACATTTAAAACTATCACTTAAAGTGTTAATTAT-T----TTTACCC-------TTCACCTTACATTGCTATACATTGA--TTTGATGA-TA--TAAAAAGTGTT----TCC----TCTTTTT-----------------TTCTCTAACAACAT-ATTCAAAAACTTTAGAAAAAGTTTTCCATGGCACAAAATTTGT--TGTGACCATTATTTAACAT
gi|11                         :                                                                                 ATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAACATAAGCGCAGATA
gi|10                         :                                             acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAACATACGCGCAGATAgtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgtgaggagttatttaatcattcattcaaattt
gi|7                          :                                                                      tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcCTATTTCTAAA-TATG-ACTGA-----AAATAAAACGTAA--TAAA--AGCA------CTGTAAAATGTTGTCCGTGAGGA----GTTATTTAATCGTTCATTCAAA---TTTGA--ATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATATTGAAAGAAATATATCAATTTCACCCACTCCTTGTGCTTAACTAAACATAATGAAATCCTAATTTACA--TAATGCATCTCTGACAAGCGAGGCCCAGTTAGGAATACTT-----TTTTTCTATATCTTTTAACATCA-TAAGTAgtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgagagtagttatttaatcattcattcaaattt
gi|11                         :                                                                                                                   cttaattttggaatgttcaAAGTAGAA---AA--A------GCC------CTGTAAAATGTTATCCGTGAGGA----GTTATTTAATCATTCATTCAAAcgagaatttaatgacgctgttca
gi|10                         : acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacataagcgcagatagtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagatttaAAGTAGAA---AA--A------GCC------CTGTAAAATGTTATCCGAGAGTA----GTTATTTAATCATTCATTCAAAttt
gi|4                          : tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacatacgcgcagatagtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagatttaAGTAGAA---AA--A------GCC------CTGTAAAATATTGCCCATGAGGAGTTATTTATTTAATCACTCATTCAAA-TGTTCA---ATATAACTACCACGCAGTCTTTGTTTGAATGTTGAAAGAAATATATTTATATTACCAACTCATTGTGCT-AACCAAACATAATAAAATCCTAACTTACA--TTAAGTATCTCTGACAAGCGAGGCCCAATTAGTAGTATTTG----------GAAATTTTTCAACATCATTAAGTAAACATGATGAATATATTTTTTCGATCGT----------TACTTTGAACCAGTTTTTTTATAATTATACATATATATACATGTATATATATTCACTTTGCATAGTAATTTGTTCTATCCAAC--GCTCTATAGATAGTCATTTTGTGTC-GATAATTTTA-CAC--CTAATAACGATTTGAAAAAT-GGTAAATGTACCCGTT--ATATTTGATGCGCTTGA--------A-----T-AA-ACTCCA----AAAC--------TTCGCTTGCATGATTTACTTTATGAGTGATTAATTTATCATATAACCCCAGAACATGTTTTGATGA---TACAT------ATG-TAAGTA---TTTTTT----TA----AACTTAAATATAGCTTTTTGGTCTTTGCAGGCCAAAGAT-TTTTGAACTTCGCTAAGTGATCCACCCGTAGTAAAAACATTCCCCCTAA-GTACGATAGTTTACTGA---TATGCCCAG-TTTTATATTATCAAAttt
gi|2                          :                                                                                                                                          gGAA---AATTAAAAGCAGAATAAACGCTGTAAAATGTTGCCCATAAGGA----GTAGTTTAATCGTTCATTCAAA---TTT-----TG-AACGATCTCGCAGTCTTTGTTTGAATGTAGAAAAAAAT--ACCTATATCTTCCATTATTTGTGCT-AACCACACATAACAAATACCTAATTTACATTTAATGTATCTCTGATAAGCAAGGCCCAATTAGTAACATTTGGTGATTTTTCTACATCTTATAACATTATTCAGTAAACATGATGAATACA--TTTTCGAT-GTTACTGTTCATTACTTTGAACAAA-TATTTTATAAT--------TATATTTATTCGTTTT-GT---------AAAATATTTTGTTCTTCCCCACTCGATGTAGATA----TATT---------ATAA-----------ATAATAACTATTTGAACAAT-TGTAAGCGTACCCATTAATTTGATGC---GCTTGA--------A-----TAAACGC--CC----ACAC--------TTCGCTTGCTTTATTCAATTTAGGTGTGACTAGTTTATAATATAAATCCAGAACAGGTTTTGGCCA---TATATTAA-CAATTGTGTGTATTTTTTATTTAAATATT--TACTTAAATATAGCTTTTTAGGATTGGCCGGTCAACGAT-TTTTGAGCTTTGCTAAATAATCCTTTCGTAGTGAAAATAAG--GTCTAA-GTAAGAGAATTT----AC--TATGTCCAGTTTTTATATCATTAAAA----TA-AAACTCCATA--CTTGTCGAAACCATGC---------TCTAAAG--ATCATAACCCTAGGTT-TTACTGATTTTAC
gi|17                         :                                                          tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactTTATCTAATCGTTCATTCA----GTTTCTGAATATAATTATCTCGTAGTaaataaaattagttctttagcattcttggcgaagcgtataatatgatcaggataaaaaaaatacgaattattttaatagtaaaatatctaacccggaacttccttttaaaaccattcatcttcttagtcatttagttacattgaaaacaatagtggcggcacattttcaccttgcctttaccctagataacatttaaaactatcacttaaacctcacattgttagacattgacttgatgatattgaaaaccttccttttaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                  TATCTAATCGTTCATTCA----GTTTCTGAATATAATTATCTCGTAGTTTt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GATCGTTACTGTTCAATATTTTTAACCAG-AATTTT-------------------C-TTTGTATA-AT-----------------TTGTTCTTCCTAATTCGCTGTATATAAAG---TTTTGTGTC-GATAATTT---CACACCTAATAACGATTTGCAAAAA-TGTTAATGTACCCGTT--CT---------ATTTGAT-------GCGCTCC-AATAACCCCAATAATATGGATAAACTTTGCTTTCATAGTTCAGTATAGTAGTGACTAGT----CATATAACTCCAGAACATGTTTTTGCGA---TATGTTAATAAATT-TA---------TATT---TTT-T--AACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGG
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atgGTTATTTCTAATTCACCATATATAAAGGTATTTTGTGTTTGA--ATTTGAACTC--CTAATCATTGCTTGCAAAAT-TGTAAATTAACTCGTT--CT---------ATctag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TACATAACGTTGTTTTG-----AATAATTTAA-CAC--CCAGTAACAGTTCGCAAAATATGTAAATATACACGTT--aacaacagcatttgaatggccccaa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttcaacaccttttaacctggtgtagttcttctgatttctcct-TGTGAAAGTATCCGTT--CT---------ATTTGGTGTGCTTGA-----T-AA-ACCTCT----TAAT--------TTCGCTCGTTTAATTTCGTATAGGAGTGACAAGTTT---ATATAACTCAAGAtgatgacgaacca
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           attacaatttatacgattatacgTGACAAGTTTATATAA-----CT-CAAGAA---C-----AATGTA-TGCAAATTCAATATAGCTTTTTTGCCTTGGACGGCAAAAGATTTTTTA-ACCTTGCTAAATGATTTACCC--AGTCAAAACAAT--G-CTTATGGAAGAGAAATGACTGAC--CATGTCCAG-TT---------TAAAA----TCGAAACC---CATGCTTTCGGATATCAT---GCCTTTTTTCTAAAGACTTC-TG--CTT-AGTTTTTGCTATGGTTGC-TTAAGTTTCCGTGTATCGCAATATGTA---TATATATAATATTacaatgtatgcaaattcaatatagcttttttgccttggacggcaaaagattttttaaccttgctaaatgatttacccagtcaaaacaatgcttatggaagagaaatgactgaccatgtccagtttaaaatcgaaacccatgctttcggatatcatgccttttttctaaagacttctgcttagtttttgctatggttgcttaagtttccgtgtatcgcaatatgtatatatataatatttggacatttctatttctgtatattctttacgattactgaaaagaaacgcaacaaacagtaggaatatttaagtagtcctaaatcggcatgtcatttccttttaaaatatattctaatttctaagctaaatcattgaagttcaatacaaacatgaacggcaacaatacttcaccttgccttcaccccagataaatccaaaactttcatattaagtattatttatttaagtttacccatgatcttttattttcattgctatacatttgttatattatatttaaaaaatcttcttatccctaatttatttaatgtataccaaatatattctcttacgacataattatatctatagaaaaatatgtaatggcataaatatcatatgaccattatttaacatatgacttataaataaaagttatctatcggttccatttttacctaaatctagcttgtgattagaaataaatataatattcttccgtccatttcttagatatgttattaaggatgctagtgaacaattttcctaacctactcagtaaaacctttgaaattttcagcatcacttaaactacctttttcaaggataagaataacataaccatcgctccagctatcaaggaaata
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             attacaatttatacgattatacgtgtgaaagtatccgttctatttggtgtgcttgataaacctcttaatttcgctcgtttaatttcgtataggag-GTACGAGAATTTAATGACGCTGTT--CAG-TTCTATATCATTAAAAAAAATA-AAAATCCAT--GCTTCT---TA--AAACC-------TTCTAAAG--ATCATAACCTT-GGTTTTTACAATGTTTACTTTAAGTTTCCATTTAACGTTATATTCAAAGT-T-TACAGTATtggacatttctatttctgtatattctttacgattactgaaaagaaacgcaacaaacagtaggaatatttaagtagtcctaaatcggcatgtcatttccttttaaaatatattctaatttctaagctaaatcattgaagttcaatacaaacatgaacggcaacaatacttcaccttgccttcaccccagataaatccaaaactttcatattaagtattatttatttaagtttacccatgatcttttattttcattgctatacatttgttatattatatttaaaaaatcttcttatccctaatttatttaatgtataccaaatatattctcttacgacataattatatctatagaaaaatatgtaatggcataaatatcatatgaccattatttaacatatgacttataaataaaagttatctatcggttccatttttacctaaatctagcttgtgattagaaataaatataatattcttccgtccatttcttagatatgttattaaggatgctagtgaacaattttcctaacctactcagtaaaacctttgaaattttcagcatcacttaaactacctttttcaaggataagaataacataaccatcgctccagctatcaaggaaata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCTTTAGCATTCTTGGCGAAGCGTATAATATGATCAGGATAAAAAAAATACGAATTATTT--TAATAGTAAAATATCTAACCCGGAACTTCCTTTTAAAACCATTCATCT----TCTTAG-----TCATTTAGTTACATTGAAAACAATAGTGGCGGCACATT-TTCACCTTGCCTTTACCCTAGATAACATTTAAAACTATCACTTAA-----------------------------------ACCTCACATTGTTAGACATTGA--CTTGATGA-TA--TTGAAAAC-CT----TCC----TTTT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                           tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaattaaaagcagaataaacgctgtaaaatgttgcccataaggagtagtttaatcgttcattcaaattttgaacgatctcgcagtctttgtttgaatgtagaaaaaaatacctatatcttccattatttgtgctaaccacacataacaaatacctaatttacatttaatgtatctctgataagcaaggcccaattagtaacatttggtgatttttctacatcttataacattattcagtaaacatgatgaatacattttcgatgttactgttcattactttgaacaaatattttataattatatttattcgttttgtaaaatattttgttcttccccactcgatgtagatatattataaataataactatttgaacaattgtaagcgtacccattaatttgatgcgcttgaataaacgcccacacttcgcttgctttattcaatttaggtgtgactagtttataatataaatccagaacaggttttggccatatattaacaattgtgtgtattttttatttaaatatttacttaaatatagctttttaggattggccggtcaacgatttttgagctttgctaaataatcctttcgtagtgaaaataaggtctaagtaagagaatttactatgtccagtttttatatcattaaaataaaactccatacttgtcgaaaccatgctctaaagatcataaccctaggttttactgattttacaaataaaattagtCATTTCCTTTT-AAAATATAT-TCTAATTTCTAAGCTAAATCATTGAAGTTCAATACAAACATGAACGGCAACAA-TACTTCACCTTGCCTTCACCCCAGATAA-ATCCAAAACTTTCATATTAAGTATTATTTAT-TTAAGTTTACCCATGATCTTTTATTTT-CATTGCTATACATTTG--TTATATTA-TATTTAAAAAATCTTCTTATCCCTAATTTATTTAATGTATACCAAATATATTCTCTTACGACATAATT--ATATCTATAGAAAAA-TATGTAATGGCATAAA---TATCATATGACCATTATTTAACATaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      attacaatttatacgattatacgtgtgaaagtatccgttctatttggtgtgcttgataaacctcttaatttcgctcgtttaatttcgtataggagtgacaagtttatataactcaagaacaatgtatgcaaattcaatatagcttttttgccttggacggcaaaagattttttaaccttgctaaatgatttacccagtcaaaacaatgcttatggaagagaaatgactgaccatgtccagtttaaaatcgaaacccatgctttcggatatcatgccttttttctaaagacttctgcttagtttttgctatggttgcttaagtttccgtgtatcgcaatatgtatatatataatatttggacatttctatttctgtatattctttacgattactgaaaagaaacgcaacaaacagtaggaatatttaagtagtcctaaatcggcatgtAACATTTAAAACTTTCACTT--AGTTTTTGTTTTAT----TTTACAC-------GTGACTGTACTTTGTTTTACATTTATTTTTTATGAGTA--TCAAAA-TAAT----TTC----TCTatgacttataaataaaagttatctatcggttccatttttacctaaatctagcttgtgattagaaataaatataatattcttccgtccatttcttagatatgttattaaggatgctagtgaacaattttcctaacctactcagtaaaacctttgaaattttcagcatcacttaaactacctttttcaaggataagaataacataaccatcgctccagctatcaaggaaata
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): ACATTGATTTTATTATATTTAATCAAAAGCTTTAAAATTATACTTTGGCATAAAACTATAATATTATCTTCAGTATACGGTTTATAATGCCATGGCAATATGATATAAAGCAACACCTTTTATATTCTGTAAATTACATCTTCTGTACTTACTTGTACTTAAATCCGGATTGTTATTCAACATAGATGCAATAATGTTCCGCTCAATTCGTTAAACTATTATTTAAACTGCTAGTGAAAACATTTTTTTATATACTCAATAATGTTAAACCTCTGCAATGGTCAACAATACTTAAACCAACATTTAATAGATCGGAATACTATATATATAACCATCACTCCGCTTATCTGAGAAATA
Unaligned ( gi|9 ): TTTCTAAATTTTGGAATGTTCACTATTTCTAAATATAACTGAAAATTAAAAGTAGAAAAATGTTGCCGGAAAAATGTTGCCGGTGAGGAACTATTTAATCGTTCATTCAAATTTTGAATAAAATTGTCTCGTAGTCTTTGTTTAAATGTTGAAAGAAATATATTCATATCACCCACTCCGTGCGCTAACCACACATGATAAAATCCTTATTTACATAGTGTATCTCTGACAAGCGAGGCCTAATTAGTA
Unaligned ( gi|15 ): ATTACAAATACTAGTAGACAATTTCCCTAACGTACTCAGCAAAGTGGTACCTCCGAAACAACACTTCAGCTATCAAGGA






Alignments
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Reference ( family-1044 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       NATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATACGCGCAGAT--A---AAGTAGAA---AAAAAAAGCCCTGTAAAATGTTGTCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAA-GTTTNTGAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATGTTGAAAGAAATATATCTATATCACCCACTCNTTGTGC-TAACCAAACATAATAAAATCCTAATTTACAT--AATGTATCTCTGACAAGCGAGGCCCAATTAGTAATATTTG----TT----TTTCTANATCTTTTAACATCATTAAGTAAACATGATGAATACATTTTTTCGATCGTTACTGT-TCA-TACTTTGAACCAGTATTTT-ATAATTATA-T---------CATTCGTATA-AT-A------------AGTA-TTTGTTCTTCCCAACTCGCCGTATATAAAGTTATTTTGTG-TCGATAATTT--A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAT-TGTAAATGTACCCGTT---CTTGAT----TTGAT-------A-----TAACACCCCC------------ANACTTCGCTTGCNTAATTCAGTNTAGGAGTGACTAGTTTATCATATAACTCCAGAACATGTTTTGGCGATATATTA--A--AATT-TAAGTATTTATTAN--T---ATA---ACTTAAATATAGCTTTTTGGNCTTGGCCGGCCAAAGAT-TTTTGAACTTCGCTAAATGATCCACCCGTAGTNAAAACAAT--GCCTAAGTANGAGAATTTACTGACTATGTCCAG-TTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA-GCTTNT-GATACCATGC--------TTCTAAAGA--TCATAACCTTGGTTTTTACT-ATGTTTACTTTAAGTTTCCGTNTANCGCNATATNCAAAGTATATACAGTATTNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTTAGCATTCTTGGCGAAGCGTATAATA-TGATCAGGA---TAA-AAAAAATACGAATTATTT--TAATAGTAAAATATCTAACCCGG-----NACTTCCTTTTAAAANCATNCATCTAATTTCTNAGCTAAATCATTNAGNTNCANTGNAAACANNAGCGGCGGCANATNCTTCACCTTGCCTTCACCCCAGATAACATTTAAAACTTTCAC-TTAA---GT----T--TT-TTT---TTTACC---T--------A-----CTTTA----CATTGTTATACATTTA--TTTTATGA-TATC--GAA--AAT-NTTCC---------T----------TTNTTTAATGTATACCAAATATATTCTCTTACGACATAATT--ATATCTATAGAAAAA-TATGTAATGGCATAAA---TATCATATGACCATTATTTAACAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATACGCGCAGAT--A---
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AAGTAGAA---AA----AGCCCTGTAAAATGTTATCCGAGAGTAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAA-TTTgtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgagagtagttatttaatcattcattcaaattt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                    tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacatacgcgcagatagtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagattATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATAAGCGCAGAT--A---
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AAGTAGAA---AA----AGCCCTGTAAAATGTTATCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAA-TTTgtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgtgaggagttatttaatcattcattcaaattt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacataagcgcagatagtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagattGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAG-TTCTATATCATTAAAAAAAAT-AAAAATCCAT--GCTTCT-TAAAAC---C--------TTCTAAAGA--TCATAACCTTGGTTTTTACA-ATGTTTACTTTAAGTTTCCATTTAACGTTATATTCAAAGT-T-TACAGTAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTTCTTCTGATTTCTCCTTACATAACGTTGTTTTG-----AATAATTT--AACACCCAGTAACAGTT-CGCAAAATATGTAAATATACACGT-----TTGAT----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttcaacaccttttaacctggtgtaGTTATTTCTAATTCACCATATATAAAGGTATTTTGTGTTTG--AATTTGAA-CTCCTAATCATTGCT-TGCAAAAT-TGTAAATTAACTCGTT---CTgacgaacca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATCTA----ATCGTTCATTCA---GTTTCTGAATATAATTATCTCGTAGTTTataacaacagcatttgaatggccccaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTATCTA----ATCGTTCATTCA---GTTTCTGAATATAATTATCTCGTAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --A---AAGCAGAA---TAAA----CGCTGTAAAATGTTGCCCATAAGGAGTAGTTTA----ATCGTTCATTCAAA---TTTTGAACG-----ATCTCGCAGTCTTTGTTTGAATGTAGAAAAAAATAC--CTATATCTTCCATTATTTGTGC-TAACCACACATAACAAATACCTAATTTACATTTAATGTATCTCTGATAAGCAAGGCCCAATTAGTAACATTTGGTGATT----TTTCTACATCTTATAACATTATTCAGTAAACATGATGAATACA--TTTTCGAT-GTTACTGT-TCATTACTTTGAACAAATATTTT-ATAATTATATT---------TATTCGTTTT-GTAA------------AATATTTTGTTCTTCCCCACTCGATGTAGATA----TATT---------ATAA-----A-----TAATAACTATT-TGAACAAT-TGTAAGCGTACCCATTAA-TTTGATGCGCTTGA--------A-----TAA-ACGCCC------------ACACTTCGCTTGCTTTATTCAATTTAGGTGTGACTAGTTTATAATATAAATCCAGAACAGGTTTTGGCCATATATTA--AC-AATTGTGTGTATTTTTTAT--TTAAATATTTACTTAAATATAGCTTTTTAGGATTGGCCGGTCAACGAT-TTTTGAGCTTTGCTAAATAATCCTTTCGTAGTGAAAATAAG--GTCTAAGTAAGAGAATTT----ACTATGTCCAGTTTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA--CTTGTCGAAACCATGC---------TCTAAAGA--TCATAACCCTAGGTTTTACTGAT-TTTACt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaattaTTTACAAATAAAATTAGTTCTTTAGCATTCTTGGCGAAGCGTATAATA-TGATCAGGA---TAA-AAAAAATACGAATTATTT--TAATAGTAAAATATCTAACCCGG-----AACTTCCTTTTAAAACCATTCATC----TTCTTAG-----TCATTTAGTTACATTGAAAACAATAGTGGCGGCACATT-TTCACCTTGCCTTTACCCTAGATAACATTTAAAACTATCAC-TTAA---------------------------------------A-----CCTCA----CATTGTTAGACATTGA--CTTGATGA-TATT--GAA--AAC-CTTCC---------T----------TTaaataaaattagttctttagcattcttggcgaagcgtataatatgatcaggataaaaaaaatacgaattattttaatagtaaaatatctaacccggaacttccttttaaaaccattcatcttcttagtcatttagttacattgaaaacaatagtggcggcacattttcaccttgcctttaccctagataacatttaaaactatcacttaaacctcacattgttagacattgacttgatgatattgaaaaccttccttttaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|3                          : tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaattaaaagcagaataaacgctgtaaaatgttgcccataaggagtagtttaatcgttcattcaaattttgaacgatctcgcagtctttgtttgaatgtagaaaaaaatacctatatcttccattatttgtgctaaccacacataacaaatacctaatttacatttaatgtatctctgataagcaaggcccaattagtaacatttggtgatttttctacatcttataacattattcagtaaacatgatgaatacattttcgatgttactgttcattactttgaacaaatattttataattatatttattcgttttgtaaaatattttgttcttccccactcgatgtagatatattataaataataactatttgaacaattgtaagcgtacccattaatttgatgcgcttgaataaacgcccacacttcgcttgctttattcaatttaggtgtgactagtttataatataaatccagaacaggttttggccatatattaacaattgtgtgtattttttatttaaatatttacttaaatatagctttttaggattggccggtcaacgatttttgagctttgctaaataatcctttcgtagtgaaaataaggtctaagtaagagaatttactatgtccagtttttatatcattaaaataaaactccatacttgtcgaaaccatgctctaaagatcataaccctaggttttactgatTT--A-CAATTTATA-CGATTATACG-----TGTGAAAGTATCCGTT---CT--AT----TTGGTGTGCTTGA-----TAA-ACCTCT------------TAATTTCGCTCGTTTAATTTCGTATAGGAGTGACAAGTTT---ATATAACTCAAGAACA----------ATGTATGC--A--AATT-CA------------------------------ATATAGCTTTTTTGCCTTGGACGGCAAAAGAT-TTTTTAACCTTGCTAAATGATTTACCC--AGTCAAAACAAT--GCTTATGGAAGAGAAATGACTGACCATGTCCAG-T---------TTAAAA----TCGAAAC-CCAT--GCTTTCGGATATCATGCCTTTT---TTCTAAAGACTTC-TG--CTTAGTTTTTGCT-ATGGTTGC-TTAAGTTTCCGTGTATCGCAATATGTA---TATATATAATATT--TGGACATTTCTATTTCTGTA-TATTCTTTACGA----T----TACTGAAAAGAAACGCAACAAACAGTAGGAA-TATTT--AAGTAGT------CCTAAATCGGCATGTCATTTCCTTTTAAAAT-ATAT-TCTAATTTCTAAGCTAAATCATTGAAGTTCAATACAAACATGAACGGCAACA-ATACTTCACCTTGCCTTCACCCCAGATAA-ATCCAAAACTTTCATATTAA---GTATTAT--TTATTTAAGTTTACC---C--------ATGATCTTTTATTTTCATTGCTATACATTTG--TTATATTA-TATTTAAAA--AAT-CTTCTTATCCCTAAT----------TTATTTAATGTATACCAAATATATTCTCTTACGACATAATT--ATATCTATAGAAAAA-TATGTAATGGCATAAA---TATCATATGACCATTATTTAACATtaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aAGTAGAA---AAA----GCCCTGTAAAATATTGCCCATGAGGAGTTATTTATTTAATCACTCATTCAAATGTTC---AATATAACTACCACGCAGTCTTTGTTTGAATGTTGAAAGAAATATATTTATATTACCAACTCATTGTGC-TAACCAAACATAATAAAATCCTAACTTACAT--TAAGTATCTCTGACAAGCGAGGCCCAATTAGTAGTATTTG----G----------AAATTTTTCAACATCATTAAGTAAACATGATGAATATATTTTTTCGATCGTTACT-----------TTGAACCAGTTTTTTTATAATTATA-CATATATATACAT--GTATATAT-ATTCACTTTGCATAGTAATTTGTTCTATCCAAC--GCTCTATAGATAGTCATTTTGTG-TCGATAATTTT-A-CACCTAATAACGATT-TGAAAAAT-GGTAAATGTACCCGTTATATTTGATGCGCTTGA--------A-----TAA-ACTCCA------------AAACTTCGCTTGCATGATTTACTTTATGAGTGATTAATTTATCATATAACCCCAGAACATGTTTTGATGATACAT--------ATG-TAAGTATTTTTT----T---A-A---ACTTAAATATAGCTTTTTGGTCTTTGCAGGCCAAAGAT-TTTTGAACTTCGCTAAGTGATCCACCCGTAGTAAAAACATTCCCCCTAAGTACGATAGTTTACTGA-TATGCCCAG-TTTTATATTATCAAAatgacttataaataaaagttatctatcggttccatttttacctaaatctagcttgtgattagaaataaatataatattcttccgtccatttcttagatatgttattaaggatgctagtgaacaattttcctaacctactcagtaaaacctttgaaattttcagcatcacttaaactacctttttcaaggataagaataacataaccatcgctccagctatcaaggaaata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gAACATTTAAAACTTTCAC-TT-A---GT----T--TT-TGT---TTTATT---TTACACGTGA-----CTGTA----CTTTGTTTTACATTTATTTTTTATGAGTATC--AAAATAAT-TTCTC---------TAACCTGTAACTTAATTAGTGTACACAAAATAATTTCTCGTACGTCAAAATTA-AAAGCTTTAAAAAAC-TCTACCATG------A---TATCAT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTATTTCTAA--ATATG-ACTGA-------AAATAAAACGTAATAAAAGCACTGTAAAATGTTGTCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAA----TTTGAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATATTGAAAGAAATATATCAATTTCACCCACTCCTTGTGCTTAACTAAACATAATGAAATCCTAATTTACAT--AATGCATCTCTGACAAGCGAGGCCCAGTTAGGAATACTT-----TT----TTTCTATATCTTTTAACATCA-TAAGTAtctttcatatattactaataataccacaaagagaataactattggctttcgttctcattttttacctaaatctagcttgtggcacattaatgtaatactcttctgcccacttcgtttacctgcttttaaggatcataaagaacaaatttcctaac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cttaattttggaatgttcaTAAGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAcgagaatttaatgacgctgttca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cttaattttggaatgttcactatttctaaatatgactgaaaataaaacgtaataaaagcactgtaaaatgttgtccgtgaggagttatttaatcgttcattcaaatttgaatataattatctcgtagtctttgtttgaatattgaaagaaatatatcaatttcacccactccttgtgcttaactaaacataatgaaatcctaatttacataatgcatctctgacaagcgaggcccagttaggaatactttttttctatatcttttaacatcaGATCGTTACTGT-TCAATATTTTTAACCAGAATTTT---------------------C-TTTGTATA-AT--------------------TTGTTCTTCCTAATTCGCTGTATATAAAGTT---TTGTG-TCGATAATTTC-A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAA-TGTTAATGTACCCGTT---CT--AT----TTGAT-------GCGCTCCAATAACCCCAATAATATGGATAAACTTTGCTTTCATAGTTCAGTATAGTAGTGACTAG----TCATATAACTCCAGAACATGTTTTTGCGATATGTTAATA--AATT-TA--TATTT-TT---------TA---ACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               atgCTATTTCTAAATATAACTGAAAATTAA---AAGTAGAA---AAATGTTGCCG-GAAAAATGTTGCCGGTGAGGAACTATTTA----ATCGTTCATTCAAA---TTTTGAATAAAATTGTCTCGTAGTCTTTGTTTAAATGTTGAAAGAAATATATTCATATCACCCACTCCGTGCGC-TAACCACACATGATAAAATCCTTATTTACAT--AGTGTATCTCTGACAAGCGAGGCCTAATTAGTAtag
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1044 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     NATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATANG--CGCAGAT--A---AAGTAGAAAAAAA--GCCCTGTAAAATGTTGCCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAAGTTTTTGAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATGTTGAAAGAAATATATTTATATCACCCACTCCTTGTGC-TAACCACACATAATAAAATCCTAATTTACAT--AATGTATCTCTGACAAGCGAGGCCCAATTAGTAATATTTG----TTTTTCTATATCTTTTAACATCATTAAGTAAACATGATGAATATATTTTTTCGATCGTTACTGT-TCA-T-ACTTTGAACCAGTATTTT-ATAATTATA-T---------C-ATTCGTATA-AT---------ATAATAATTTGTTCTTCCTAACTCGCCGTATATAAAGTTATTTTGTG-TCGATAATTT--A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAT-TGTAAACGTACCCGTT---CTTGAT----TTGAT-------A-----TAATACCCCC------------AAACTTCGCTTGCATAATTCAGTATAGGAGTGACTAGTTTATCATATAACTCCAGAACATGTTTTGGCGATATATNAA-C-AATT-TAAGTATTTTTTA---T----ATA---ACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGCCGGCCAANGAT-TTTTGAACTTCGCTAAATGATCCACCCGTAGTGAAAACAAT--GCCTAAGTACGAGAATTTACTGACTATGTCCAG-TTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA-GCTTCTCGANACCATGCC-CCC---TTCTAAAGA--TCGTAACCTTGGTTTTTACT-ATGTTTACTTTAAGTTTCCGTNTATCGCAATATGCA---T-T-TAN-AATATTACGNATANTTNTANT---TCTTTAGTATTCTTNGCGAAG--TATAATA-TGATCAGGA---CAA-AAAAAATACGAAT-ATTT--TAATAGTA--A--TACCTAACCCGG-----CATTTCCTTTTAAAA-NCATNC--ATCTTCTAAG-----TCATTNAGGTACGTTGAAAACANNAACGGCGAC-A-ATA-TTCACCTTGCCTTNACCCNAGATAACATTTAAAACTNTCAC-TTAA---GT----T--TT-TTT---TTTACC---CA-----C----CT-TA----CATTGCTATACATTNA--TTTNATGA-TATT--AAA--AAT-CTTCC---------T----------TTATTTAGTGTACA-C-AA--ATA--TTCTCTTACGACATAATT--AAANCTTTAGAAAAA-TNTNCCATGGCACAAA---TATCATGTGACCATTATTTAACAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATACG--CGCAGAT--A---
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AAGTAGAAAA--A--GCCCTGTAAAATGTTATCCGAGAGTAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAATTTgtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgagagtagttatttaatcattcattcaaattt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                  tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacatacgcgcagatagtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagattATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATAAG--CGCAGAT--A---
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AAGTAGAAAA--A--GCCCTGTAAAATGTTATCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAATTTgtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgtgaggagttatttaatcattcattcaaattt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacataagcgcagatagtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagattGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAG-TTCTATATCATTAAAAAAAAT-AAAAATCCAT--GCTTCTTAAAACC------------TTCTAAAGA--TCATAACCTTGGTTTTTACA-ATGTTTACTTTAAGTTTCCATTTAACGTTATATTCAAAGT-T-TAC-AGTAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTCTTCTGATTTCTCCTTACATAACGTTGTTTTG-----AATAATTT--AACACCCAGTAACAGTT-CGCAAAATATGTAAATATACACGT-----TTGAT----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttcaacaccttttaacctggtgtaGTTATTTCTAATTCACCATATATAAAGGTATTTTGTGTTTG--AATTTGAA-CTCCTAATCATTGCT-TGCAAAAT-TGTAAATTAACTCGTT---CTgacgaacca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATCTA----ATCGTTCATTCA--GTTTCTGAATATAATTATCTCGTAGTTTataacaacagcatttgaatggccccaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTATCTA----ATCGTTCATTCA--GTTTCTGAATATAATTATCTCGTAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --A---AAGCAGAATAAAC--GC--TGTAAAATGTTGCCCATAAGGAGTAGTTTA----ATCGTTCATTCAAA--TTTTGAACG-----ATCTCGCAGTCTTTGTTTGAATGTAGAAAAAAATAC--CTATATCTTCCATTATTTGTGC-TAACCACACATAACAAATACCTAATTTACATTTAATGTATCTCTGATAAGCAAGGCCCAATTAGTAACATTTGGTGATTTTTCTACATCTTATAACATTATTCAGTAAACATGATGAATACATTTT--CGAT-GTTACTGT-TCA-TTACTTTGAACAAATATTTT-ATAATTATA-T---------TTATTCGTTTT-GT---------AAAATATTTTGTTCTTCCCCACTCGATGTAGATA----TATT---------ATAA--------A--TAATAACTATT-TGAACAAT-TGTAAGCGTACCCATTAA-TTTGATGCGCTTGA--------A-----TAA-ACGCCC------------ACACTTCGCTTGCTTTATTCAATTTAGGTGTGACTAGTTTATAATATAAATCCAGAACAGGTTTTGGCCATATATTAA-C-AATTGTGTGTATTTTTTA---TTTAAATATTTACTTAAATATAGCTTTTTAGGATTGGCCGGTCAACGAT-TTTTGAGCTTTGCTAAATAATCCTTTCGTAGTGAAAATAAG--GTCTAAGTAAGAGAATTT----ACTATGTCCAGTTTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA--CTTGTCGAAACCATGC---------TCTAAAGA--TCATAACCCTAGGTTTTACTGAT-TTTACt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaatta---T-T-TACTGATTTTACAAATAAAATTAGT---TCTTTAGCATTCTTGGCGAAGCGTATAATA-TGATCAGGA---TAA-AAAAAATACGAATTATTT--TAATAGTA--AAATATCTAACCCGG-----AACTTCCTTTTAAAA-CCATTC--ATCTTCTTAG-----TCATTTAGTTACATTGAAAACAATAGTGGCGGC-ACATT-TTCACCTTGCCTTTACCCTAGATAACATTTAAAACTATCAC-TTAA-------------------------------A-----C----CT-CA----CATTGTTAGACATTGA--CTTGATGA-TATT--GAA--AAC-CTTCC---------T----------TTaaataaaattagttctttagcattcttggcgaagcgtataatatgatcaggataaaaaaaatacgaattattttaatagtaaaatatctaacccggaacttccttttaaaaccattcatcttcttagtcatttagttacattgaaaacaatagtggcggcacattttcaccttgcctttaccctagataacatttaaaactatcacttaaacctcacattgttagacattgacttgatgatattgaaaaccttccttttaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|3                          : tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaattaaaagcagaataaacgctgtaaaatgttgcccataaggagtagtttaatcgttcattcaaattttgaacgatctcgcagtctttgtttgaatgtagaaaaaaatacctatatcttccattatttgtgctaaccacacataacaaatacctaatttacatttaatgtatctctgataagcaaggcccaattagtaacatttggtgatttttctacatcttataacattattcagtaaacatgatgaatacattttcgatgttactgttcattactttgaacaaatattttataattatatttattcgttttgtaaaatattttgttcttccccactcgatgtagatatattataaataataactatttgaacaattgtaagcgtacccattaatttgatgcgcttgaataaacgcccacacttcgcttgctttattcaatttaggtgtgactagtttataatataaatccagaacaggttttggccatatattaacaattgtgtgtattttttatttaaatatttacttaaatatagctttttaggattggccggtcaacgatttttgagctttgctaaataatcctttcgtagtgaaaataaggtctaagtaagagaatttactatgtccagtttttatatcattaaaataaaactccatacttgtcgaaaccatgctctaaagatcataaccctaggtTT--A-CAATTTATA-CGATTATACG-----TGTGAAAGTATCCGTT---CT--AT----TTGGTGTGCTTGA-----TAA-ACCTCT------------TAATTTCGCTCGTTTAATTTCGTATAGGAGTGACAAGTTT---ATATAACTCAAGAACA----------ATGTATGCA---AATT-CAA-------------------------------TATAGCTTTTTTGCCTTGGACGGCAAAAGAT-TTTTTAACCTTGCTAAATGATTTACCC--AGTCAAAACAAT--GCTTATGGAAGAGAAATGACTGACCATGTCCAG-T---------TTAAAA----TCGAAAC-CCAT--GCTTTCGGATATCATGCCTTTT---TTCTAAAGACTTC-TG--CTTAGTTTTTGCT-ATGGTTGC-TTAAGTTTCCGTGTATCGCAATATGTA---TATATAT-AATATT-TGGACATTTCTATT---TCTGTA-TATTCTTTACGA----T----TACTGAAAAGAAACGCAACAAACAGTAGGAAT-ATTT--AAGTAGT--------CCTAAATCGGCATGTCATTTCCTTTTAAAATATATTCTAAT-TTCTAAGCTAAATCATTGAAGTTCAATACAAACATGAACGGCAAC-A-ATACTTCACCTTGCCTTCACCCCAGATAA-ATCCAAAACTTTCATATTAA---GTATTAT--TTATTTAAGTTTACC---CATGATCT----TT-TATTTTCATTGCTATACATTTG--TTATATTA-TATTTAAAA--AAT-CTTCTTATCCCTAAT----------TTATTTAATGTATACC-AAATATA--TTCTCTTACGACATAATT--ATATCTATAGAAAAA-TATGTAATGGCATAAA---TATCATATGACCATTATTTAACATtaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aAGTAGAAAAA----GCCCTGTAAAATATTGCCCATGAGGAGTTATTTATTTAATCACTCATTCAAA--TGTTCAATATAACTACCACGCAGTCTTTGTTTGAATGTTGAAAGAAATATATTTATATTACCAACTCATTGTGC-TAACCAAACATAATAAAATCCTAACTTACAT--TAAGTATCTCTGACAAGCGAGGCCCAATTAGTAGTATTTG----G------AAATTTTTCAACATCATTAAGTAAACATGATGAATATATTTTTTCGATCGTTACT------------TTGAACCAGTTTTTTTATAATTATA-CATATATATAC-ATGTATATATATTCACTTTGCATAGTAATTTGTTCTATCCAAC--GCTCTATAGATAGTCATTTTGTG-TCGATAATTTT-A-CACCTAATAACGATT-TGAAAAAT-GGTAAATGTACCCGTTATATTTGATGCGCTTGA--------A-----TAA-ACTCCA------------AAACTTCGCTTGCATGATTTACTTTATGAGTGATTAATTTATCATATAACCCCAGAACATGTTTTGATGATACAT-------ATG-TAAGTATTTTTT----T----A-A---ACTTAAATATAGCTTTTTGGTCTTTGCAGGCCAAAGAT-TTTTGAACTTCGCTAAGTGATCCACCCGTAGTAAAAACATTCCCCCTAAGTACGATAGTTTACTGA-TATGCCCAG-TTTTATATTATCAAAatgacttataaataaaagttatctatcggttccatttttacctaaatctagcttgtgattagaaataaatataatattcttccgtccatttcttagatatgttattaaggatgctagtgaacaattttcctaacctactcagtaaaacctttgaaattttcagcatcacttaaactacctttttcaaggataagaataacataaccatcgctccagctatcaaggaaata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gAACATTTAAAACTTTCAC-TT-A---GT----T--TT-TGT---TTTATTTTACA-----CGTGACTGTA----CTTTGTTTTACATTTATTTTTTATGAGTATC--AAAATAAT-TTCTC---------TAACCTGTAACTTAATTAGTGTACA-CAAA--ATAATTTCTCGTACGTCAAAATTA-AAAGCTTTAAAAAAC-TCTACCATG------A---TATCAT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTATTTCTAA--ATATGACTGAAAAT--A---AAACGTAATAAAA--GCACTGTAAAATGTTGTCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAA---TTTGAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATATTGAAAGAAATATATCAATTTCACCCACTCCTTGTGCTTAACTAAACATAATGAAATCCTAATTTACAT--AATGCATCTCTGACAAGCGAGGCCCAGTTAGGAATACTT-----TTTTTCTATATCTTTTAACATCA-TAAGTAtctttcatatattactaataataccacaaagagaataactattggctttcgttctcattttttacctaaatctagcttgtggcacattaatgtaatactcttctgcccacttcgtttacctgcttttaaggatcataaagaacaaatttcctaac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cttaattttggaatgttcaTAAGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAcgagaatttaatgacgctgttca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cttaattttggaatgttcactatttctaaatatgactgaaaataaaacgtaataaaagcactgtaaaatgttgtccgtgaggagttatttaatcgttcattcaaatttgaatataattatctcgtagtctttgtttgaatattgaaagaaatatatcaatttcacccactccttgtgcttaactaaacataatgaaatcctaatttacataatgcatctctgacaagcgaggcccagttaggaatactttttttctatatcttttaacatcaGATCGTTACTGT-TCAAT-ATTTTTAACCAGAATTTT---------------------C--TTTGTATA------------------ATTTGTTCTTCCTAATTCGCTGTATATAAAG---TTTTGTG-TCGATAATTTC-A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAA-TGTTAATGTACCCGTT---CT--AT----TTGAT-------GCGCTCCAATAACCCCAATAATATGGATAAACTTTGCTTTCATAGTTCAGTATAGTAGTGACTAG----TCATATAACTCCAGAACATGTTTTTGCGATATGTTAA-TAAATT-TA--TATTTTT-----------TA---ACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atgCTATTTCTAAATATAAC--TGAAAATTAA---AAGTAGAAAAATGTTGCCG-GAAAAATGTTGCCGGTGAGGAACTATTTA----ATCGTTCATTCAAA--TTTTGAATAAAATTGTCTCGTAGTCTTTGTTTAAATGTTGAAAGAAATATATTCATATCACCCACTCCGTGCGC-TAACCACACATGATAAAATCCTTATTTACAT--AGTGTATCTCTGACAAGCGAGGCCTAATTAGTAtag
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): ACATTGATTTTATTATATTTAATCAAAAGCTTTAAAATTATACTTTGGCATAAAACTATAATATTATCTTCAGTATACGGTTTATAATGCCATGGCAATATGATATAAAGCAACACCTTTTATATTCTGTAAATTACATCTTCTGTACTTACTTGTACTTAAATCCGGATTGTTATTCAACATAGATGCAATAATGTTCCGCTCAATTCGTTAAACTATTATTTAAACTGCTAGTGAAAACATTTTTTTATATACTCAATAATGTTAAACCTCTGCAATGGTCAACAATACTTAAACCAACATTTAATAGATCGGAATACTATATATATAACCATCACTCCGCTTATCTGAGAAATA
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Reference ( family-1044 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    NATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATANG--CGCAGAT--A---AAGTAGAAAAAAA--GC--CCTGTAAAATGTTGCCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAATT-TTTGAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATGTTGAAAGAAATATATTTATATCACCCACTCCTTGTGC-TAACCACACATAATAAAATCCTAATTTACA--TAATGTATCTCTGACAAGCGAGGCCCAATTAGTAATATTT-G-TGATTTTTCTATATCTTTTAACATCATTAAGTAAACATGATGAATATATTTTTTCGATCGTTACTGT-TCA-TACTTTGAACCAGTATTTT-ATAATTATA-T---------CATTCGTATA-AT---------ATAATAATTTGTTCTTCCTAACTCGCCGTATATAAAGTTATTTTGTG-TCGATAATTT--A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAT-TGTAAACGTACCCGTT---CTTGAT----TTGAT-------A-----TAATACCCCC------------AAACTTCGCTTGCATAATTCAGTATAGGAGTGACTAGTTTATCATATAACTCCAGAACATGTTTTGGCGATATATNAA-C-AATT-TAAGTATTTTTTA---T----ATA---ACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGCCGGCCAANGAT-TTTTGAGCTTCGCTAAATGATCCACCCGTAGTGAAAACAAT--GCCTAAGTACGAGAATTTACTGACTATGTCCAG-TTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA-GCTTCTCGANACCATGCC-CCC---TTCTAAAGA--TCGTAACCTTGGTTTTTACT-ATGTTTACTTTAAGTTTCCGTNTATCGCAATATGCA---T-T-TAC-AATATTACGAATANTTNTAGT---TCTTTAGTATTCTTNGCGAAG--TATAATA-TGATCAGGA---CAA-AAAAAATACGAAT-ATTT--TAATAGTA--A--TACCTAACCCGG-----CATTTCCTTTTAAAA-ATATTC--ATCTTCTAAG-----TCATTNAGGTACGTTGAAAACANNAACGGCGAC-A-ATA-TTCACCTTGCCTTNACCCNAGATAACATTTAAAACTNTCAC-TTAA---GT----T--TT-TTT---TTTACCC-T-CAC----C--T-TA----CATTGCTATACATTNA--TTTNATGA-TATT--AAA--AAT-CTTCC---------T----------TTATTTAGTGTACA-C-AA--ATA--TTCTCTTACGACATAATT--AAANCTTTAGAAAAA-TNTNCCATGGCACAAA---TATCATGTGACCATTATTTAACAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATACG--CGCAGAT--A---
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AAGTAGAAAA--A--GC--CCTGTAAAATGTTATCCGAGAGTAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAATT-Tgtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgagagtagttatttaatcattcattcaaattt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                 tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacatacgcgcagatagtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagattATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATAAG--CGCAGAT--A---
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AAGTAGAAAA--A--GC--CCTGTAAAATGTTATCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAATT-Tgtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgtgaggagttatttaatcattcattcaaattt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacataagcgcagatagtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagattGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAG-TTCTATATCATTAAAAAAAAT-AAAAATCCAT--GCTTCTTAAAACC------------TTCTAAAGA--TCATAACCTTGGTTTTTACA-ATGTTTACTTTAAGTTTCCATTTAACGTTATATTCAAAGT-T-TAC-AGTAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTCTTCTGATTTCTCCTTACATAACGTTGTTTTG-----AATAATTT--AACACCCAGTAACAGTT-CGCAAAATATGTAAATATACACGT-----TTGAT----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttcaacaccttttaacctggtgtaGTTATTTCTAATTCACCATATATAAAGGTATTTTGTGTTTG--AATTTGAA-CTCCTAATCATTGCT-TGCAAAAT-TGTAAATTAACTCGTT---CTgacgaacca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TATCTA----ATCGTTCATTCAG-TT-TCTGAATATAATTATCTCGTAGTTTataacaacagcatttgaatggccccaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTATCTA----ATCGTTCATTCAG-TT-TCTGAATATAATTATCTCGTAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         --A---AAGCAGAATAAAC--GC----TGTAAAATGTTGCCCATAAGGAGTAGTTTA----ATCGTTCATTCAAA-T-TTTGAACG-----ATCTCGCAGTCTTTGTTTGAATGTAGAAAAAA--ATACCTATATCTTCCATTATTTGTGC-TAACCACACATAACAAATACCTAATTTACATTTAATGTATCTCTGATAAGCAAGGCCCAATTAGTAACATTTGG-TGATTTTTCTACATCTTATAACATTATTCAGTAAACATGATGAATACA--TTTTCGAT-GTTACTGT-TCATTACTTTGAACAAATATTTT-ATAATTATATT---------TATTCGTTTT-GT---------AAAATATTTTGTTCTTCCCCACTCGATGTAGATA----TATT---------ATAA-----A-----TAATAACTATT-TGAACAAT-TGTAAGCGTACCCATTAA-TTTGATGCGCTTGA--------A-----TAA-ACGCCC------------ACACTTCGCTTGCTTTATTCAATTTAGGTGTGACTAGTTTATAATATAAATCCAGAACAGGTTTTGGCCATATATTAA-C-AATTGTGTGTATTTTTTA---TTTAAATATTTACTTAAATATAGCTTTTTAGGATTGGCCGGTCAACGAT-TTTTGAGCTTTGCTAAATAATCCTTTCGTAGTGAAAATAAG--GTCTAAGTAAGAGAATTT----ACTATGTCCAGTTTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA--CTTGTCGAAACCATGC---------TCTAAAGA--TCATAACCCTAGGTTTTACTGAT-TTTACt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaatta---T-T-TACTGATTTTACAAATAAAATTAGT---TCTTTAGCATTCTTGGCGAAGCGTATAATA-TGATCAGGA---TAA-AAAAAATACGAATTATTT--TAATAGTA--AAATATCTAACCCGG-----AACTTCCTTTTAAAA-CCATTC--ATCTTCTTAG-----TCATTTAGTTACATTGAAAACAATAGTGGCGGC-ACATT-TTCACCTTGCCTTTACCCTAGATAACATTTAAAACTATCAC-TTAA--------------------------------AC----C--T-CA----CATTGTTAGACATTGA--CTTGATGA-TATT--GAA--AAC-CTTCC---------T----------TTaaataaaattagttctttagcattcttggcgaagcgtataatatgatcaggataaaaaaaatacgaattattttaatagtaaaatatctaacccggaacttccttttaaaaccattcatcttcttagtcatttagttacattgaaaacaatagtggcggcacattttcaccttgcctttaccctagataacatttaaaactatcacttaaacctcacattgttagacattgacttgatgatattgaaaaccttccttttaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|3                          : tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaattaaaagcagaataaacgctgtaaaatgttgcccataaggagtagtttaatcgttcattcaaattttgaacgatctcgcagtctttgtttgaatgtagaaaaaaatacctatatcttccattatttgtgctaaccacacataacaaatacctaatttacatttaatgtatctctgataagcaaggcccaattagtaacatttggtgatttttctacatcttataacattattcagtaaacatgatgaatacattttcgatgttactgttcattactttgaacaaatattttataattatatttattcgttttgtaaaatattttgttcttccccactcgatgtagatatattataaataataactatttgaacaattgtaagcgtacccattaatttgatgcgcttgaataaacgcccacacttcgcttgctttattcaatttaggtgtgactagtttataatataaatccagaacaggttttggccatatattaacaattgtgtgtattttttatttaaatatttacttaaatatagctttttaggattggccggtcaacgatttttgagctttgctaaataatcctttcgtagtgaaaataaggtctaagtaagagaatttactatgtccagtttttatatcattaaaataaaactccatacttgtcgaaaccatgctctaaagatcataaccctaggtTT--A-CAATTTATA-CGATTATACG-----TGTGAAAGTATCCGTT---CT--AT----TTGGTGTGCTTGA-----TAA-ACCTCT------------TAATTTCGCTCGTTTAATTTCGTATAGGAGTGACAAGTTT---ATATAACTCAAGAACA----------ATGTATGCA---AATT-CAA-------------------------------TATAGCTTTTTTGCCTTGGACGGCAAAAGAT-TTTTTAACCTTGCTAAATGATTTACCC--AGTCAAAACAAT--GCTTATGGAAGAGAAATGACTGACCATGTCCAG-T---------TTAAAA----TCGAAAC-CCAT--GCTTTCGGATATCATGCCTTTT---TTCTAAAGACTTC-TG--CTTAGTTTTTGCT-ATGGTTGC-TTAAGTTTCCGTGTATCGCAATATGTA---TATATAT-AATATT-TGGACATTTCTATT---TCTGTA-TATTCTTTACGA----T----TACTGAAAAGAAACGCAACAAACAGTAGGAAT-ATTT--AAGTAGT--------CCTAAATCGGCATGTCATTTCCTTTTAAAATATATTCTAAT-TTCTAAGCTAAATCATTGAAGTTCAATACAAACATGAACGGCAAC-A-ATACTTCACCTTGCCTTCACCCCAGATAA-ATCCAAAACTTTCATATTAA---GTATTAT--TTATTTAAGTTTACCCAT-GAT----CTTT-TATTTTCATTGCTATACATTTG--TTATATTA-TATTTAAAA--AAT-CTTCTTATCCCTAAT----------TTATTTAATGTATACC-AAATATA--TTCTCTTACGACATAATT--ATATCTATAGAAAAA-TATGTAATGGCATAAA---TATCATATGACCATTATTTAACATtaaaccctaatttaataatttgacaccaa
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTATTTCTAA--ATATGACTGAAAAT--A---AAACGTAATAAAA--GC--ACTGTAAAATGTTGTCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAATT-T--GAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATATTGAAAGAAATATATCAATTTCACCCACTCCTTGTGCTTAACTAAACATAATGAAATCCTAATTTACA--TAATGCATCTCTGACAAGCGAGGCCCAGTTAGGAATACTT------TTTTTCTATATCTTTTAACATCA-TAAGTAtctttcatatattactaataataccacaaagagaataactattggctttcgttctcattttttacctaaatctagcttgtggcacattaatgtaatactcttctgcccacttcgtttacctgcttttaaggatcataaagaacaaatttcctaac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cttaattttggaatgttcaTAAGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAcgagaatttaatgacgctgttca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cttaattttggaatgttcactatttctaaatatgactgaaaataaaacgtaataaaagcactgtaaaatgttgtccgtgaggagttatttaatcgttcattcaaatttgaatataattatctcgtagtctttgtttgaatattgaaagaaatatatcaatttcacccactccttgtgcttaactaaacataatgaaatcctaatttacataatgcatctctgacaagcgaggcccagttaggaatactttttttctatatcttttaacatcaGATCGTTACTGT-TCAATATTTTTAACCAGAATTTT---------------------C-TTTGTATA------------------ATTTGTTCTTCCTAATTCGCTGTATATAAAG---TTTTGTG-TCGATAATTTC-A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAA-TGTTAATGTACCCGTT---CT--AT----TTGAT-------GCGCTCCAATAACCCCAATAATATGGATAAACTTTGCTTTCATAGTTCAGTATAGTAGTGACTAG----TCATATAACTCCAGAACATGTTTTTGCGATATGTTAA-TAAATT-TA--TATTTTT-----------TA---ACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atgCTATTTCTAAATATAAC--TGAAAATTAA---AAGTAG-AAAAAT--GTTGCCGGAAAAATGTTGCCGGTGAGGAACTATTTA----ATCGTTCATTCAAA-T-TTTGAATAAAATTGTCTCGTAGTCTTTGTTTAAATGTTGAAAGAAATATATTCATATCACCCACTCCGTGCGC-TAACCACACATGATAAAATCCTTATTTACA--TAGTGTATCTCTGACAAGCGAGGCCTAATTAGTAtag
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): ACATTGATTTTATTATATTTAATCAAAAGCTTTAAAATTATACTTTGGCATAAAACTATAATATTATCTTCAGTATACGGTTTATAATGCCATGGCAATATGATATAAAGCAACACCTTTTATATTCTGTAAATTACATCTTCTGTACTTACTTGTACTTAAATCCGGATTGTTATTCAACATAGATGCAATAATGTTCCGCTCAATTCGTTAAACTATTATTTAAACTGCTAGTGAAAACATTTTTTTATATACTCAATAATGTTAAACCTCTGCAATGGTCAACAATACTTAAACCAACATTTAATAGATCGGAATACTATATATATAACCATCACTCCGCTTATCTGAGAAATA
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Reference ( family-1044 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     NATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATANG--CGCAGAT--A---AAGTAGAAAAAAA--GC--CCTGTAAAATGTTGCCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAATT-TTTGAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATGTTGAAAGAAATATATTTATATCACCCACTCCTTGTGC-TAACCACACATAATAAAATCCTAATTTACAT--AATGTATCTCTGACAAGCGAGGCCCAATTAGTAATATTTG-T-GATTTTTCTATATCTTTTAACATCATTAAGTAAACATGATGAATATATTTT--CGATCGTTACTGT-TCA-TACTTTGAACCAGTATTTT-ATAATTATA--------TTCATTCGTATA-AT---------ATAATAATTTGTTCTTCCTAACTCGCCGTATATAAAGTTATTTTGTG-TCGATAATTT--A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAT-TGTAAACGTACCCGTT---CTTGAT----TTGAT-------AT-----AATACCCCCAA------------ACTTCGCTTGCATAATTCAGTATAGGAGTGACTAGTTTATCATATAACTCCAGAACATGTTTTGGCGATATATNAAC-AATT-TAAGTATTTTTTA---T----ATA---ACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGCCGGCCAANGAT-TTTTGAGCTTCGCTAAATGATCCACCCGTAGTGAAAACAAT--GCCTAAGTACGAGAATTTACTGACTATGTCCAG-TTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA-GCTTCTCGANACCATGCC--CCCTT--CTAAAGA--TCGTAACCTTGGTTTTTACT-ATGTTTACTTTAAGTTTCCGTNTATCGCAATATGCA---T-T-TAC-AATATTACGAATANTTNTAGT---TCTTTAGTATTCTTNGCGAAG--TATAATA-TGATCAGGA---CAA-AAAAAATACGAAT-ATTT--TAATAGTA--A--TACCTAACCCGG-----CATTTCCTTTTAAAA-ATATTC--ATCTTCTAAG-----TCATTNAGGTACGTTGAAAACANNAACGGCGAC-A-ATA-TTCACCTTGCCTTNACCCNAGATAACATTTAAAACTNTCAC-TTAA---GT----T--TT-TTT---TTTACCC-T-CAC----C--T-TA----CATTGCTATACATTNA--TTTNATGA-TATT--AAA--AAT-CTTCC---------T----------TTATTTAGTGTACA-C-AA--ATA--TTCTCTTACGACATAATT--AAANCTTTAGAAAAA-TNTNCCATGGCACAAA---TATCATGTGACCATTATTTAACAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATACG--CGCAGAT--A---
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AAGTAGAAAA--A--GC--CCTGTAAAATGTTATCCGAGAGTAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAATT-Tgtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgagagtagttatttaatcattcattcaaattt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                  tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacatacgcgcagatagtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagattATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATAAG--CGCAGAT--A---
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AAGTAGAAAA--A--GC--CCTGTAAAATGTTATCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAATT-Tgtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgtgaggagttatttaatcattcattcaaattt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacataagcgcagatagtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagattGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAG-TTCTATATCATTAAAAAAAAT-AAAAATCCAT--GCTTCTTAAAACC----------TT--CTAAAGA--TCATAACCTTGGTTTTTACA-ATGTTTACTTTAAGTTTCCATTTAACGTTATATTCAAAGT-T-TAC-AGTAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTCTTCTGATTTCTCCTTACATAACGTTGTTTTG-----AATAATTT--AACACCCAGTAACAGTT-CGCAAAATATGTAAATATACACGT-----TTGAT----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttcaacaccttttaacctggtgtaGTTATTTCTAATTCACCATATATAAAGGTATTTTGTGTTTG--AATTTGAA-CTCCTAATCATTGCT-TGCAAAAT-TGTAAATTAACTCGTT---CTgacgaacca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATCTA----ATCGTTCATTCAG-TT-TCTGAATATAATTATCTCGTAGTTTataacaacagcatttgaatggccccaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTATCTA----ATCGTTCATTCAG-TT-TCTGAATATAATTATCTCGTAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --A---AAGCAGAATAAAC--GC----TGTAAAATGTTGCCCATAAGGAGTAGTTTA----ATCGTTCATTCAAATT-TT-GAACG-----ATCTCGCAGTCTTTGTTTGAATGTAGAAAAAAATAC--CTATATCTTCCATTATTTGTGC-TAACCACACATAACAAATACCTAATTTACATTTAATGTATCTCTGATAAGCAAGGCCCAATTAGTAACATTTGGT-GATTTTTCTACATCTTATAACATTATTCAGTAAACATGATGAATACATTTT--CGAT-GTTACTGT-TCATTACTTTGAACAAATATTTT-ATAATTATA--------TTTATTCGTTTT-GT---------AAAATATTTTGTTCTTCCCCACTCGATGTAGATA----TATT---------ATAA-----A-----TAATAACTATT-TGAACAAT-TGTAAGCGTACCCATTAA-TTTGATGCGCTTGA--------AT-----AA-ACGCCCAC------------ACTTCGCTTGCTTTATTCAATTTAGGTGTGACTAGTTTATAATATAAATCCAGAACAGGTTTTGGCCATATATTAAC-AATTGTGTGTATTTTTTA---TTTAAATATTTACTTAAATATAGCTTTTTAGGATTGGCCGGTCAACGAT-TTTTGAGCTTTGCTAAATAATCCTTTCGTAGTGAAAATAAG--GTCTAAGTAAGAGAATTT----ACTATGTCCAGTTTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA--CTTGTCGAAACCATGC-------T--CTAAAGA--TCATAACCCTAGGTTTTACTGAT-TTTACt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaatta---T-T-TACTGATTTTACAAATAAAATTAGT---TCTTTAGCATTCTTGGCGAAGCGTATAATA-TGATCAGGA---TAA-AAAAAATACGAATTATTT--TAATAGTA--AAATATCTAACCCGG-----AACTTCCTTTTAAAA-CCATTC--ATCTTCTTAG-----TCATTTAGTTACATTGAAAACAATAGTGGCGGC-ACATT-TTCACCTTGCCTTTACCCTAGATAACATTTAAAACTATCAC-TTAA--------------------------------AC----C--T-CA----CATTGTTAGACATTGA--CTTGATGA-TATT--GAA--AAC-CTTCC---------T----------TTaaataaaattagttctttagcattcttggcgaagcgtataatatgatcaggataaaaaaaatacgaattattttaatagtaaaatatctaacccggaacttccttttaaaaccattcatcttcttagtcatttagttacattgaaaacaatagtggcggcacattttcaccttgcctttaccctagataacatttaaaactatcacttaaacctcacattgttagacattgacttgatgatattgaaaaccttccttttaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|3                          : tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaattaaaagcagaataaacgctgtaaaatgttgcccataaggagtagtttaatcgttcattcaaattttgaacgatctcgcagtctttgtttgaatgtagaaaaaaatacctatatcttccattatttgtgctaaccacacataacaaatacctaatttacatttaatgtatctctgataagcaaggcccaattagtaacatttggtgatttttctacatcttataacattattcagtaaacatgatgaatacattttcgatgttactgttcattactttgaacaaatattttataattatatttattcgttttgtaaaatattttgttcttccccactcgatgtagatatattataaataataactatttgaacaattgtaagcgtacccattaatttgatgcgcttgaataaacgcccacacttcgcttgctttattcaatttaggtgtgactagtttataatataaatccagaacaggttttggccatatattaacaattgtgtgtattttttatttaaatatttacttaaatatagctttttaggattggccggtcaacgatttttgagctttgctaaataatcctttcgtagtgaaaataaggtctaagtaagagaatttactatgtccagtttttatatcattaaaataaaactccatacttgtcgaaaccatgctctaaagatcataaccctaggtTT--A-CAATTTATA-CGATTATACG-----TGTGAAAGTATCCGTT---CT--AT----TTGGTGTGCTTGAT-----AA-ACCTCTTA------------ATTTCGCTCGTTTAATTTCGTATAGGAGTGACAAGTTT---ATATAACTCAAGAACA----------ATGTATGCA--AATT-CAA-------------------------------TATAGCTTTTTTGCCTTGGACGGCAAAAGAT-TTTTTAACCTTGCTAAATGATTTACCC--AGTCAAAACAAT--GCTTATGGAAGAGAAATGACTGACCATGTCCAG-T---------TTAAAA----TCGAAAC-CCAT--GCTTTCGGATATCATGCCT-TTTTT--CTAAAGACTTC-TG--CTTAGTTTTTGCT-ATGGTTGC-TTAAGTTTCCGTGTATCGCAATATGTA---TATATAT-AATATT-TGGACATTTCTATT---TCTGTA-TATTCTTTACGA----T----TACTGAAAAGAAACGCAACAAACAGTAGGAAT-ATTT--AAGTAGT--------CCTAAATCGGCATGTCATTTCCTTTTAAAATATATTCTAAT-TTCTAAGCTAAATCATTGAAGTTCAATACAAACATGAACGGCAAC-A-ATACTTCACCTTGCCTTCACCCCAGATAA-ATCCAAAACTTTCATATTAA---GTATTAT--TTATTTAAGTTTACCCAT-GAT----CTTT-TATTTTCATTGCTATACATTTG--TTATATTA-TATTTAAAA--AAT-CTTCTTATCCCTAAT----------TTATTTAATGTATACC-AAATATA--TTCTCTTACGACATAATT--ATATCTATAGAAAAA-TATGTAATGGCATAAA---TATCATATGACCATTATTTAACATtaaaccctaatttaataatttgacaccaa
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gAACATTTAAAACTTTCAC-TT-A---GT----T--TT-TGT---TTTATTT-TACACGTGAC--TGTA----CTTTGTTTTACATTTATTTTTTATGAGTATC--AAAATAAT-TTCTC---------TAACCTGTAACTTAATTAGTGTACA-CAAA--ATAATTTCTCGTACGTCAAAATTA-AAAGCTTTAAAAAAC-TCTACCATG------A---TATCAT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTATTTCTAA--ATATGACTGAAAAT--A---AAACGTAATAAAA--GC--ACTGTAAAATGTTGTCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAATT-T--GAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATATTGAAAGAAATATATCAATTTCACCCACTCCTTGTGCTTAACTAAACATAATGAAATCCTAATTTACAT--AATGCATCTCTGACAAGCGAGGCCCAGTTAGGAATACTT------TTTTTCTATATCTTTTAACATCA-TAAGTAtctttcatatattactaataataccacaaagagaataactattggctttcgttctcattttttacctaaatctagcttgtggcacattaatgtaatactcttctgcccacttcgtttacctgcttttaaggatcataaagaacaaatttcctaac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cttaattttggaatgttcaTAAGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAcgagaatttaatgacgctgttca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cttaattttggaatgttcactatttctaaatatgactgaaaataaaacgtaataaaagcactgtaaaatgttgtccgtgaggagttatttaatcgttcattcaaatttgaatataattatctcgtagtctttgtttgaatattgaaagaaatatatcaatttcacccactccttgtgcttaactaaacataatgaaatcctaatttacataatgcatctctgacaagcgaggcccagttaggaatactttttttctatatcttttaacatcaGATCGTTACTGT-TCAATATTTTTAACCAG---------AATT-----------TTC-TTTGTATA-AT-----------------TTGTTCTTCCTAATTCGCTGTATATAAAGTT---TTGTG-TCGATAATTTC-A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAA-TGTTAATGTACCCGTT---CT--AT----TTGAT-------GCGCTCCAATAACCCCAATAATATGGATAAACTTTGCTTTCATAGTTCAGTATAGTAGTGACTAGT----CATATAACTCCAGAACATGTTTTTGCGATATGTTAATAAATT-TA--TATTTTT-----------TA---ACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atgCTATTTCTAAATATAAC--TGAAAATTAA---AAGTAG-AAAAAT--GTTGCCGGAAAAATGTTGCCGGTGAGGAACTATTTA----ATCGTTCATTCAAA-T-TTTGAATAAAATTGTCTCGTAGTCTTTGTTTAAATGTTGAAAGAAATATATTCATATCACCCACTCCGTGCGC-TAACCACACATGATAAAATCCTTATTTACAT--AGTGTATCTCTGACAAGCGAGGCCTAATTAGTAtag
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): ACATTGATTTTATTATATTTAATCAAAAGCTTTAAAATTATACTTTGGCATAAAACTATAATATTATCTTCAGTATACGGTTTATAATGCCATGGCAATATGATATAAAGCAACACCTTTTATATTCTGTAAATTACATCTTCTGTACTTACTTGTACTTAAATCCGGATTGTTATTCAACATAGATGCAATAATGTTCCGCTCAATTCGTTAAACTATTATTTAAACTGCTAGTGAAAACATTTTTTTATATACTCAATAATGTTAAACCTCTGCAATGGTCAACAATACTTAAACCAACATTTAATAGATCGGAATACTATATATATAACCATCACTCCGCTTATCTGAGAAATA
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Reference ( family-1044 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      NATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATANG--CGCAGAT--A---AAGTAGAAAAAAA--GC--CCTGTAAAATGTTGCCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAATT-TTTGAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATGTTGAAAGAAATATATTTATATCACCCACTCCTTGTGC-TAACCACACATAATAAAATCCTAATTTACAT--AATGTATCTCTGACAAGCGAGGCCCAATTAGTAATATTTG-TGATTTTTCTATATCTTTTAACATCATTAAGTAAACATGATGAATATATTTT--CGATCGTTACTGT-TCA-TACTTTGAACCAGTATTTT-ATAATTATA--------TTCATTCGTATA-AT---------ATAATAATTTGTTCTTCCTAACTCGCCGTATATAAAGTTATTTTGTG-TCGATAATTT--A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAT-TGTAAACGTACCCGTT---CTTGAT----TTGAT-------AT-----AATACCCCCAA------------ACTTCGCTTGCATAATTCAGTATAGGAGTGACTAGTTTATCATATAACTCCAGAACATGTTTTGGCGATATATNAA-C-AATT-TAAGTATTTTTTA---T----ATA---ACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGCCGGCCAANGAT-TTTTGAGCTTCGCTAAATGATCCACCCGTAGTGAAAACAAT--GCCTAAGTACGAGAATTTACTGACTATGTCCAG-TTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA-GCTTCTCGANACCATGCC-CCC---TTCTAAAGA--TCGTAACCTTGGTTTTTACT-ATGTTTACTTTAAGTTTCCGTNTATCGCAATATGCA---T-T-TAC-AATATTACGAATANTTNTAGT---TCTTTAGTATTCTTNGCGAAG--TATAATA-TGATCAGGA---CAA-AAA-AG-TACGAAT-ATTT--TAATAGTA--A--TACCTAACCCGG-----CATTTCCTTTTAAAA-ATATTC--ATCTTCTAAG-----TCATTNAGGTACGTTGAAAACANNAACGGCGAC-A-ATA-TTCACCTTGCCTTNACCCNAGATAACATTTAAAACTNTCAC-TTAA---GT----T--TT-TTT---TTTACCC-T-CAC----C--T-TA----CATTGCTATACATTNA--TTTNATGA-TATT--AAA--AAT-CTTCC---------T----------TTATTTAGTGTACA-C-AA--ATA--TTCTCTTACGACATAATT--AAANCTTTAGAAAAA-TNTNCCATGGCACAAA---TATCATGTGACCATTATTTAACAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATACG--CGCAGAT--A---
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AAGTAGAAAA--A--GC--CCTGTAAAATGTTATCCGAGAGTAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAATT-Tgtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgagagtagttatttaatcattcattcaaattt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                   tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacatacgcgcagatagtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagattATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATAAG--CGCAGAT--A---
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AAGTAGAAAA--A--GC--CCTGTAAAATGTTATCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAATT-Tgtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgtgaggagttatttaatcattcattcaaattt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacataagcgcagatagtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagattGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAG-TTCTATATCATTAAAAAAAAT-AAAAATCCAT--GCTTCTTAAAACC------------TTCTAAAGA--TCATAACCTTGGTTTTTACA-ATGTTTACTTTAAGTTTCCATTTAACGTTATATTCAAAGT-T-TAC-AGTAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTCTTCTGATTTCTCCTTACATAACGTTGTTTTG-----AATAATTT--AACACCCAGTAACAGTT-CGCAAAATATGTAAATATACACGT-----TTGAT----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttcaacaccttttaacctggtgtaGTTATTTCTAATTCACCATATATAAAGGTATTTTGTGTTTG--AATTTGAA-CTCCTAATCATTGCT-TGCAAAAT-TGTAAATTAACTCGTT---CTgacgaacca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATCTA----ATCGTTCATTCAG-TT-TCTGAATATAATTATCTCGTAGTTTataacaacagcatttgaatggccccaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTATCTA----ATCGTTCATTCAG-TT-TCTGAATATAATTATCTCGTAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --A---AAGCAGAATAAAC--GC----TGTAAAATGTTGCCCATAAGGAGTAGTTTA----ATCGTTCATTCAAATT-TT-GAACG-----ATCTCGCAGTCTTTGTTTGAATGTAGAAAAAAATAC--CTATATCTTCCATTATTTGTGC-TAACCACACATAACAAATACCTAATTTACATTTAATGTATCTCTGATAAGCAAGGCCCAATTAGTAACATTTGGTGATTTTTCTACATCTTATAACATTATTCAGTAAACATGATGAATACATTTT--CGAT-GTTACTGT-TCATTACTTTGAACAAATATTTT-ATAATTATA--------TTTATTCGTTTT-GT---------AAAATATTTTGTTCTTCCCCACTCGATGTAGATA----TATT---------ATAA-----A-----TAATAACTATT-TGAACAAT-TGTAAGCGTACCCATTAA-TTTGATGCGCTTGA--------AT-----AA-ACGCCCAC------------ACTTCGCTTGCTTTATTCAATTTAGGTGTGACTAGTTTATAATATAAATCCAGAACAGGTTTTGGCCATATATTAA-C-AATTGTGTGTATTTTTTA---TTTAAATATTTACTTAAATATAGCTTTTTAGGATTGGCCGGTCAACGAT-TTTTGAGCTTTGCTAAATAATCCTTTCGTAGTGAAAATAAG--GTCTAAGTAAGAGAATTT----ACTATGTCCAGTTTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA--CTTGTCGAAACCATGC---------TCTAAAGA--TCATAACCCTAGGTTTTACTGAT-TTTACt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaatta---T-T-TACTGATTTTACAAATAAAATTAGT---TCTTTAGCATTCTTGGCGAAGCGTATAATA-TGATCAGGA---TAA-AAA-AAATACGAATTATTT--TAATAGTA--AAATATCTAACCCGG-----AACTTCCTTTTAAAA-CCATTC--ATCTTCTTAG-----TCATTTAGTTACATTGAAAACAATAGTGGCGGC-ACATT-TTCACCTTGCCTTTACCCTAGATAACATTTAAAACTATCAC-TTAA--------------------------------AC----C--T-CA----CATTGTTAGACATTGA--CTTGATGA-TATT--GAA--AAC-CTTCC---------T----------TTaaataaaattagttctttagcattcttggcgaagcgtataatatgatcaggataaaaaaaatacgaattattttaatagtaaaatatctaacccggaacttccttttaaaaccattcatcttcttagtcatttagttacattgaaaacaatagtggcggcacattttcaccttgcctttaccctagataacatttaaaactatcacttaaacctcacattgttagacattgacttgatgatattgaaaaccttccttttaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|3                          : tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaattaaaagcagaataaacgctgtaaaatgttgcccataaggagtagtttaatcgttcattcaaattttgaacgatctcgcagtctttgtttgaatgtagaaaaaaatacctatatcttccattatttgtgctaaccacacataacaaatacctaatttacatttaatgtatctctgataagcaaggcccaattagtaacatttggtgatttttctacatcttataacattattcagtaaacatgatgaatacattttcgatgttactgttcattactttgaacaaatattttataattatatttattcgttttgtaaaatattttgttcttccccactcgatgtagatatattataaataataactatttgaacaattgtaagcgtacccattaatttgatgcgcttgaataaacgcccacacttcgcttgctttattcaatttaggtgtgactagtttataatataaatccagaacaggttttggccatatattaacaattgtgtgtattttttatttaaatatttacttaaatatagctttttaggattggccggtcaacgatttttgagctttgctaaataatcctttcgtagtgaaaataaggtctaagtaagagaatttactatgtccagtttttatatcattaaaataaaactccatacttgtcgaaaccatgctctaaagatcataaccctaggtTT--A-CAATTTATA-CGATTATACG-----TGTGAAAGTATCCGTT---CT--AT----TTGGTGTGCTTGAT-----AA-ACCTCTTA------------ATTTCGCTCGTTTAATTTCGTATAGGAGTGACAAGTTT---ATATAACTCAAGAACA----------ATGTATGCA---AATT-CAA-------------------------------TATAGCTTTTTTGCCTTGGACGGCAAAAGAT-TTTTTAACCTTGCTAAATGATTTACCC--AGTCAAAACAAT--GCTTATGGAAGAGAAATGACTGACCATGTCCAG-T---------TTAAAA----TCGAAAC-CCAT--GCTTTCGGATATCATGCCTTTT---TTCTAAAGACTTC-TG--CTTAGTTTTTGCT-ATGGTTGC-TTAAGTTTCCGTGTATCGCAATATGTA---TATATAT-AATATT-TGGACATTTCTATT---TCTGTA-TATTCTTTACGA----T----TACTGAAAAGAAACGCAACAAACAG-TAGGAAT-ATTT--AAGTAGT--------CCTAAATCGGCATGTCATTTCCTTTTAAAATATATTCTAAT-TTCTAAGCTAAATCATTGAAGTTCAATACAAACATGAACGGCAAC-A-ATACTTCACCTTGCCTTCACCCCAGATAA-ATCCAAAACTTTCATATTAA---GTATTAT--TTATTTAAGTTTACCCAT-GAT----CTTT-TATTTTCATTGCTATACATTTG--TTATATTA-TATTTAAAA--AAT-CTTCTTATCCCTAAT----------TTATTTAATGTATACC-AAATATA--TTCTCTTACGACATAATT--ATATCTATAGAAAAA-TATGTAATGGCATAAA---TATCATATGACCATTATTTAACATtaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aAGTAGAAAAA----GC--CCTGTAAAATATTGCCCATGAGGAGTTATTTATTTAATCACTCATTCAAATG-TTC-AATATAACTACCACGCAGTCTTTGTTTGAATGTTGAAAGAAATATATTTATATTACCAACTCATTGTGC-TAACCAAACATAATAAAATCCTAACTTACAT--TAAGTATCTCTGACAAGCGAGGCCCAATTAGTAGTATTTG-GAA---------ATTTTTCAACATCATTAAGTAAACATGATGAATATATTTTTTCGATCGTTACT-----------TTGAACCAGTTTTTTTATAATTATACATATATATACATGTATATATATTCACTTTGCATAGTAATTTGTTCTATCCAAC--GCTCTATAGATAGTCATTTTGTG-TCGATAATTTT-A-CACCTAATAACGATT-TGAAAAAT-GGTAAATGTACCCGTTATATTTGATGCGCTTGA--------AT-----AA-ACTCCAAA------------ACTTCGCTTGCATGATTTACTTTATGAGTGATTAATTTATCATATAACCCCAGAACATGTTTTGATGATACAT-------ATG-TAAGTATTTTTT----T----A-A---ACTTAAATATAGCTTTTTGGTCTTTGCAGGCCAAAGAT-TTTTGAACTTCGCTAAGTGATCCACCCGTAGTAAAAACATTCCCCCTAAGTACGATAGTTTACTGA-TATGCCCAG-TTTTATATTATCAAAatgacttataaataaaagttatctatcggttccatttttacctaaatctagcttgtgattagaaataaatataatattcttccgtccatttcttagatatgttattaaggatgctagtgaacaattttcctaacctactcagtaaaacctttgaaattttcagcatcacttaaactacctttttcaaggataagaataacataaccatcgctccagctatcaaggaaata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gAACATTTAAAACTTTCAC-TT-A---GT----T--TT-TGT---TTTATTT-TACACGTGAC--TGTA----CTTTGTTTTACATTTATTTTTTATGAGTATC--AAAATAAT-TTCTC---------TAACCTGTAACTTAATTAGTGTACA-CAAA--ATAATTTCTCGTACGTCAAAATTA-AAAGCTTTAAAAAAC-TCTACCATG------A---TATCAT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTATTTCTAA--ATATGACTGAAAAT--A---AAACGTAATAAAA--GC--ACTGTAAAATGTTGTCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAATT-T--GAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATATTGAAAGAAATATATCAATTTCACCCACTCCTTGTGCTTAACTAAACATAATGAAATCCTAATTTACAT--AATGCATCTCTGACAAGCGAGGCCCAGTTAGGAATACTT-----TTTTTCTATATCTTTTAACATCA-TAAGTAtctttcatatattactaataataccacaaagagaataactattggctttcgttctcattttttacctaaatctagcttgtggcacattaatgtaatactcttctgcccacttcgtttacctgcttttaaggatcataaagaacaaatttcctaac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cttaattttggaatgttcaTAAGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAcgagaatttaatgacgctgttca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cttaattttggaatgttcactatttctaaatatgactgaaaataaaacgtaataaaagcactgtaaaatgttgtccgtgaggagttatttaatcgttcattcaaatttgaatataattatctcgtagtctttgtttgaatattgaaagaaatatatcaatttcacccactccttgtgcttaactaaacataatgaaatcctaatttacataatgcatctctgacaagcgaggcccagttaggaatactttttttctatatcttttaacatcaGATCGTTACTGT-TCAATATTTTTAACCAG---------AATT-----------TTC-TTTGTATA-AT-----------------TTGTTCTTCCTAATTCGCTGTATATAAAGTT---TTGTG-TCGATAATTTC-A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAA-TGTTAATGTACCCGTT---CT--AT----TTGAT-------GCGCTCCAATAACCCCAATAATATGGATAAACTTTGCTTTCATAGTTCAGTATAGTAGTGACTAGT----CATATAACTCCAGAACATGTTTTTGCGATATGTTAA-TAAATT-TA--TATTTTT-----------TA---ACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atgCTATTTCTAAATATAAC--TGAAAATTAA---AAGTAG-AAAAAT--GTTGCCGGAAAAATGTTGCCGGTGAGGAACTATTTA----ATCGTTCATTCAAA-T-TTTGAATAAAATTGTCTCGTAGTCTTTGTTTAAATGTTGAAAGAAATATATTCATATCACCCACTCCGTGCGC-TAACCACACATGATAAAATCCTTATTTACAT--AGTGTATCTCTGACAAGCGAGGCCTAATTAGTAtag
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1044 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      NATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATANG--CGCAGAT--A---AAGTAGAAAAAAA--GC--CCTGTAAAATGTTGCCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAATT-TTTGAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATGTTGAAAGAAATATATTTATATCACCCACTCCTTGTGC-TAACCACACATAATAAAATCCTAATTTACAT--AATGTATCTCTGACAAGCGAGGCCCAATTAGTAATATTTG-TGATTTTTCTATATCTTTTAACATCATTAAGTAAACATGATGAATATATTTT--CGATCGTTACTGT-TCA-TACTTTGAACCAGTATTTT-ATAATTATA--------TTCATTCGTATA-AT---------ATAATAATTTGTTCTTCCTAACTCGCCGTATATAAAGTTATTTTGTG-TCGATAATTT--A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAT-TGTAAACGTACCCGTT---CTTGAT----TTGAT-------AT-----AATACCCCCAA------------ACTTCGCTTGCATAATTCAGTATAGGAGTGACTAGTTTATCATATAACTCCAGAACATGTTTTGGCGATATATNAA-C-AATT-TAAGTATTTTTTA---T----ATA---ACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGCCGGCCAANGAT-TTTTGAGCTTCGCTAAATGATCCACCCGTAGTGAAAACAAT--GCCTAAGTACGAGAATTTACTGACTATGTCCAG-TTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA-GCTTCTCGANACCATGCC-CCC---TTCTAAAGA--TCGTAACCTTGGTTTTTACT-ATGTTTACTTTAAGTTTCCGTNTATCGCAATATGCA---T-T-TAC-AATATTACGAATANTTNTAGT---TCTTTAGTATTCTTNGCGAAG--TA-TAATATGATCAGNACAA-AAA-AG-TACGAAT-ATTT--TAATAGTA--A--TACCTAACCCGG-----CATTTCCTTTTAAAA-ATATTC--ATCTTCTAAG-----TCATTNAGGTACGTTGAAAACANNAACGGCGAC-A-ATA-TTCACCTTGCCTTNACCCNAGATAACATTTAAAACTNTCAC-TTAA---GT----T--TT-TTT---TTTACCC-T-CAC----C--T-TA----CATTGCTATACATTNA--TTTNATGA-TATT--AAA--AAT-CTTCC---------T----------TTATTTAGTGTACA-C-AA--ATA--TTCTCTTACGACATAATT--AAANCTTTAGAAAAA-TNTNCCATGGCACAAA---TATCATGTGACCATTATTTAACAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATACG--CGCAGAT--A---
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AAGTAGAAAA--A--GC--CCTGTAAAATGTTATCCGAGAGTAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAATT-Tgtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgagagtagttatttaatcattcattcaaattt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                   tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacatacgcgcagatagtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagattATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATAAG--CGCAGAT--A---
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AAGTAGAAAA--A--GC--CCTGTAAAATGTTATCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAATT-Tgtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgtgaggagttatttaatcattcattcaaattt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacataagcgcagatagtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagattGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAG-TTCTATATCATTAAAAAAAAT-AAAAATCCAT--GCTTCTTAAAACC------------TTCTAAAGA--TCATAACCTTGGTTTTTACA-ATGTTTACTTTAAGTTTCCATTTAACGTTATATTCAAAGT-T-TAC-AGTAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTCTTCTGATTTCTCCTTACATAACGTTGTTTTG-----AATAATTT--AACACCCAGTAACAGTT-CGCAAAATATGTAAATATACACGT-----TTGAT----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttcaacaccttttaacctggtgtaGTTATTTCTAATTCACCATATATAAAGGTATTTTGTGTTTG--AATTTGAA-CTCCTAATCATTGCT-TGCAAAAT-TGTAAATTAACTCGTT---CTgacgaacca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATCTA----ATCGTTCATTCAG-TT-TCTGAATATAATTATCTCGTAGTTTataacaacagcatttgaatggccccaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTATCTA----ATCGTTCATTCAG-TT-TCTGAATATAATTATCTCGTAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --A---AAGCAGAATAAAC--GC----TGTAAAATGTTGCCCATAAGGAGTAGTTTA----ATCGTTCATTCAAATT-TT-GAACG-----ATCTCGCAGTCTTTGTTTGAATGTAGAAAAAAATAC--CTATATCTTCCATTATTTGTGC-TAACCACACATAACAAATACCTAATTTACATTTAATGTATCTCTGATAAGCAAGGCCCAATTAGTAACATTTGGTGATTTTTCTACATCTTATAACATTATTCAGTAAACATGATGAATACATTTT--CGAT-GTTACTGT-TCATTACTTTGAACAAATATTTT-ATAATTATA--------TTTATTCGTTTT-GT---------AAAATATTTTGTTCTTCCCCACTCGATGTAGATA----TATT---------ATAA-----A-----TAATAACTATT-TGAACAAT-TGTAAGCGTACCCATTAA-TTTGATGCGCTTGA--------AT-----AA-ACGCCCAC------------ACTTCGCTTGCTTTATTCAATTTAGGTGTGACTAGTTTATAATATAAATCCAGAACAGGTTTTGGCCATATATTAA-C-AATTGTGTGTATTTTTTA---TTTAAATATTTACTTAAATATAGCTTTTTAGGATTGGCCGGTCAACGAT-TTTTGAGCTTTGCTAAATAATCCTTTCGTAGTGAAAATAAG--GTCTAAGTAAGAGAATTT----ACTATGTCCAGTTTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA--CTTGTCGAAACCATGC---------TCTAAAGA--TCATAACCCTAGGTTTTACTGAT-TTTACt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaatta---T-T-TACTGATTTTACAAATAAAATTAGT---TCTTTAGCATTCTTGGCGAAGCGTA-TAATATGATCAGGATAA-AAA-AAATACGAATTATTT--TAATAGTA--AAATATCTAACCCGG-----AACTTCCTTTTAAAA-CCATTC--ATCTTCTTAG-----TCATTTAGTTACATTGAAAACAATAGTGGCGGC-ACATT-TTCACCTTGCCTTTACCCTAGATAACATTTAAAACTATCAC-TTAA--------------------------------AC----C--T-CA----CATTGTTAGACATTGA--CTTGATGA-TATT--GAA--AAC-CTTCC---------T----------TTaaataaaattagttctttagcattcttggcgaagcgtataatatgatcaggataaaaaaaatacgaattattttaatagtaaaatatctaacccggaacttccttttaaaaccattcatcttcttagtcatttagttacattgaaaacaatagtggcggcacattttcaccttgcctttaccctagataacatttaaaactatcacttaaacctcacattgttagacattgacttgatgatattgaaaaccttccttttaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|3                          : tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaattaaaagcagaataaacgctgtaaaatgttgcccataaggagtagtttaatcgttcattcaaattttgaacgatctcgcagtctttgtttgaatgtagaaaaaaatacctatatcttccattatttgtgctaaccacacataacaaatacctaatttacatttaatgtatctctgataagcaaggcccaattagtaacatttggtgatttttctacatcttataacattattcagtaaacatgatgaatacattttcgatgttactgttcattactttgaacaaatattttataattatatttattcgttttgtaaaatattttgttcttccccactcgatgtagatatattataaataataactatttgaacaattgtaagcgtacccattaatttgatgcgcttgaataaacgcccacacttcgcttgctttattcaatttaggtgtgactagtttataatataaatccagaacaggttttggccatatattaacaattgtgtgtattttttatttaaatatttacttaaatatagctttttaggattggccggtcaacgatttttgagctttgctaaataatcctttcgtagtgaaaataaggtctaagtaagagaatttactatgtccagtttttatatcattaaaataaaactccatacttgtcgaaaccatgctctaaagatcataaccctaggtTT--A-CAATTTATA-CGATTATACG-----TGTGAAAGTATCCGTT---CT--AT----TTGGTGTGCTTGAT-----AA-ACCTCTTA------------ATTTCGCTCGTTTAATTTCGTATAGGAGTGACAAGTTT---ATATAACTCAAGAACA----------ATGTATGCA---AATT-CAA-------------------------------TATAGCTTTTTTGCCTTGGACGGCAAAAGAT-TTTTTAACCTTGCTAAATGATTTACCC--AGTCAAAACAAT--GCTTATGGAAGAGAAATGACTGACCATGTCCAG-T---------TTAAAA----TCGAAAC-CCAT--GCTTTCGGATATCATGCCTTTT---TTCTAAAGACTTC-TG--CTTAGTTTTTGCT-ATGGTTGC-TTAAGTTTCCGTGTATCGCAATATGTA---TATATAT-AATATT-TGGACATTTCTATT---TCTGTA-TATTCTTTACG-AT--TACTGAAAAGA--AACGCAACAAACAG-TAGGAAT-ATTT--AAGTAGT--------CCTAAATCGGCATGTCATTTCCTTTTAAAATATATTCTAAT-TTCTAAGCTAAATCATTGAAGTTCAATACAAACATGAACGGCAAC-A-ATACTTCACCTTGCCTTCACCCCAGATAA-ATCCAAAACTTTCATATTAA---GTATTAT--TTATTTAAGTTTACCCAT-GAT----CTTT-TATTTTCATTGCTATACATTTG--TTATATTA-TATTTAAAA--AAT-CTTCTTATCCCTAAT----------TTATTTAATGTATACC-AAATATA--TTCTCTTACGACATAATT--ATATCTATAGAAAAA-TATGTAATGGCATAAA---TATCATATGACCATTATTTAACATtaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aAGTAGAAAAA----GC--CCTGTAAAATATTGCCCATGAGGAGTTATTTATTTAATCACTCATTCAAATG-TTC-AATATAACTACCACGCAGTCTTTGTTTGAATGTTGAAAGAAATATATTTATATTACCAACTCATTGTGC-TAACCAAACATAATAAAATCCTAACTTACAT--TAAGTATCTCTGACAAGCGAGGCCCAATTAGTAGTATTTG-GAA---------ATTTTTCAACATCATTAAGTAAACATGATGAATATATTTTTTCGATCGTTACT-----------TTGAACCAGTTTTTTTATAATTATACATATATATACATGTATATATATTCACTTTGCATAGTAATTTGTTCTATCCAAC--GCTCTATAGATAGTCATTTTGTG-TCGATAATTTT-A-CACCTAATAACGATT-TGAAAAAT-GGTAAATGTACCCGTTATATTTGATGCGCTTGA--------AT-----AA-ACTCCAAA------------ACTTCGCTTGCATGATTTACTTTATGAGTGATTAATTTATCATATAACCCCAGAACATGTTTTGATGATACAT-------ATG-TAAGTATTTTTT----T----A-A---ACTTAAATATAGCTTTTTGGTCTTTGCAGGCCAAAGAT-TTTTGAACTTCGCTAAGTGATCCACCCGTAGTAAAAACATTCCCCCTAAGTACGATAGTTTACTGA-TATGCCCAG-TTTTATATTATCAAAatgacttataaataaaagttatctatcggttccatttttacctaaatctagcttgtgattagaaataaatataatattcttccgtccatttcttagatatgttattaaggatgctagtgaacaattttcctaacctactcagtaaaacctttgaaattttcagcatcacttaaactacctttttcaaggataagaataacataaccatcgctccagctatcaaggaaata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gAACATTTAAAACTTTCAC-TT-A---GT----T--TT-TGT---TTTATTT-TACACGTGAC--TGTA----CTTTGTTTTACATTTATTTTTTATGAGTATC--AAAATAAT-TTCTC---------TAACCTGTAACTTAATTAGTGTACA-CAAA--ATAATTTCTCGTACGTCAAAATTA-AAAGCTTTAAAAAAC-TCTACCATG------A---TATCAT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTATTTCTAA--ATATGACTGAAAAT--A---AAACGTAATAAAA--GC--ACTGTAAAATGTTGTCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAATT-T--GAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATATTGAAAGAAATATATCAATTTCACCCACTCCTTGTGCTTAACTAAACATAATGAAATCCTAATTTACAT--AATGCATCTCTGACAAGCGAGGCCCAGTTAGGAATACTT-----TTTTTCTATATCTTTTAACATCA-TAAGTAtctttcatatattactaataataccacaaagagaataactattggctttcgttctcattttttacctaaatctagcttgtggcacattaatgtaatactcttctgcccacttcgtttacctgcttttaaggatcataaagaacaaatttcctaac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cttaattttggaatgttcaTAAGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAcgagaatttaatgacgctgttca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cttaattttggaatgttcactatttctaaatatgactgaaaataaaacgtaataaaagcactgtaaaatgttgtccgtgaggagttatttaatcgttcattcaaatttgaatataattatctcgtagtctttgtttgaatattgaaagaaatatatcaatttcacccactccttgtgcttaactaaacataatgaaatcctaatttacataatgcatctctgacaagcgaggcccagttaggaatactttttttctatatcttttaacatcaGATCGTTACTGT-TCAATATTTTTAACCAG---------AATT-----------TTC-TTTGTATA-AT-----------------TTGTTCTTCCTAATTCGCTGTATATAAAGTT---TTGTG-TCGATAATTTC-A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAA-TGTTAATGTACCCGTT---CT--AT----TTGAT-------GCGCTCCAATAACCCCAATAATATGGATAAACTTTGCTTTCATAGTTCAGTATAGTAGTGACTAGT----CATATAACTCCAGAACATGTTTTTGCGATATGTTAA-TAAATT-TA--TATTTTT-----------TA---ACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atgCTATTTCTAAATATAAC--TGAAAATTAA---AAGTAG-AAAAAT--GTTGCCGGAAAAATGTTGCCGGTGAGGAACTATTTA----ATCGTTCATTCAAA-T-TTTGAATAAAATTGTCTCGTAGTCTTTGTTTAAATGTTGAAAGAAATATATTCATATCACCCACTCCGTGCGC-TAACCACACATGATAAAATCCTTATTTACAT--AGTGTATCTCTGACAAGCGAGGCCTAATTAGTAtag
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1044 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      NATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATANG--CGCAGAT--A---AAGTAGAAAAAAA--GC--CCTGTAAAATGTTGCCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAATT-TTTGAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATGTTGAAAGAAATATATTTATATCACCCACTCCTTGTGC-TAACCACACATAATAAAATCCTAATTTACAT--AATGTATCTCTGACAAGCGAGGCCCAATTAGTAATATTTG-TGATTTTTCTATATCTTTTAACATCATTAAGTAAACATGATGAATATATTTT--CGATCGTTACTGT-TCA-TACTTTGAACCAGTATTTT-ATAATTATA--------TTCATTCGTATA-AT---------ATAATAATTTGTTCTTCCTAACTCGCCGTATATAAAGTTATTTTGTG-TCGATAATTT--A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAT-TGTAAACGTACCCGTT---CTTGAT----TTGAT-------AT-----AATACCCCCAA------------ACTTCGCTTGCATAATTCAGTATAGGAGTGACTAGTTTATCATATAACTCCAGAACATGTTTTGGCGATATATNAA-C-AATT-TAAGTATTTTTTA---T----ATA---ACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGCCGGCCAANGAT-TTTTGAGCTTCGCTAAATGATCCACCCGTAGTGAAAACAAT--GCCTAAGTACGAGAATTTACTGACTATGTCCAG-TTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA-GCTTCTCGANACCATGCC-CCC---TTCTAAAGA--TCGTAACCTTGGTTTTTACT-ATGTTTACTTTAAGTTTCCGTNTATCGCAATATGCA---T-T-TAC-AATATTACGAATANTTNTAGT---TCTTTAGTATTCTTNGCGAAG--TA-TAATATGATCAGCGCAA-AAA-AG-TACGAAT-ATTT--TAATAGTA--A--TACCTAACCCGG-----CATTTCCTTTTAAAA-ATATTC--ATCTTCTAAG-----TCATTNAGGTACGTTGAAAACANNAACGGCGAC-A-ATA-TTCACCTTGCCTTNACCCNAGATAACATTTAAAACTNTCAC-TTAA---GT----T--TT-TTT---TTTACCC-T-CAC----C--T-TA----CATTGCTATACATTNA--TTTNATGA-TATT--AAA--AAT-CTTCC---------T----------TTATTTAGTGTACA-C-AA--ATA--TTCTCTTACGACATAATT--AAANCTTTAGAAAAA-TNTNCCATGGCACAAA---TATCATGTGACCATTATTTAACAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATACG--CGCAGAT--A---
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AAGTAGAAAA--A--GC--CCTGTAAAATGTTATCCGAGAGTAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAATT-Tgtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgagagtagttatttaatcattcattcaaattt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                   tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacatacgcgcagatagtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagattATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATAAG--CGCAGAT--A---
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AAGTAGAAAA--A--GC--CCTGTAAAATGTTATCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAATT-Tgtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgtgaggagttatttaatcattcattcaaattt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacataagcgcagatagtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagattGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAG-TTCTATATCATTAAAAAAAAT-AAAAATCCAT--GCTTCTTAAAACC------------TTCTAAAGA--TCATAACCTTGGTTTTTACA-ATGTTTACTTTAAGTTTCCATTTAACGTTATATTCAAAGT-T-TAC-AGTAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTCTTCTGATTTCTCCTTACATAACGTTGTTTTG-----AATAATTT--AACACCCAGTAACAGTT-CGCAAAATATGTAAATATACACGT-----TTGAT----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttcaacaccttttaacctggtgtaGTTATTTCTAATTCACCATATATAAAGGTATTTTGTGTTTG--AATTTGAA-CTCCTAATCATTGCT-TGCAAAAT-TGTAAATTAACTCGTT---CTgacgaacca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATCTA----ATCGTTCATTCAG-TT-TCTGAATATAATTATCTCGTAGTTTataacaacagcatttgaatggccccaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTATCTA----ATCGTTCATTCAG-TT-TCTGAATATAATTATCTCGTAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --A---AAGCAGAATAAAC--GC----TGTAAAATGTTGCCCATAAGGAGTAGTTTA----ATCGTTCATTCAAATT-TT-GAACG-----ATCTCGCAGTCTTTGTTTGAATGTAGAAAAAAATAC--CTATATCTTCCATTATTTGTGC-TAACCACACATAACAAATACCTAATTTACATTTAATGTATCTCTGATAAGCAAGGCCCAATTAGTAACATTTGGTGATTTTTCTACATCTTATAACATTATTCAGTAAACATGATGAATACATTTT--CGAT-GTTACTGT-TCATTACTTTGAACAAATATTTT-ATAATTATA--------TTTATTCGTTTT-GT---------AAAATATTTTGTTCTTCCCCACTCGATGTAGATA----TATT---------ATAA-----A-----TAATAACTATT-TGAACAAT-TGTAAGCGTACCCATTAA-TTTGATGCGCTTGA--------AT-----AA-ACGCCCAC------------ACTTCGCTTGCTTTATTCAATTTAGGTGTGACTAGTTTATAATATAAATCCAGAACAGGTTTTGGCCATATATTAA-C-AATTGTGTGTATTTTTTA---TTTAAATATTTACTTAAATATAGCTTTTTAGGATTGGCCGGTCAACGAT-TTTTGAGCTTTGCTAAATAATCCTTTCGTAGTGAAAATAAG--GTCTAAGTAAGAGAATTT----ACTATGTCCAGTTTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA--CTTGTCGAAACCATGC---------TCTAAAGA--TCATAACCCTAGGTTTTACTGAT-TTTACt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaatta---T-T-TACTGATTTTACAAATAAAATTAGT---TCTTTAGCATTCTTGGCGAAGCGTA-TAATATGATCAGGATAA-AAA-AAATACGAATTATTT--TAATAGTA--AAATATCTAACCCGG-----AACTTCCTTTTAAAA-CCATTC--ATCTTCTTAG-----TCATTTAGTTACATTGAAAACAATAGTGGCGGC-ACATT-TTCACCTTGCCTTTACCCTAGATAACATTTAAAACTATCAC-TTAA--------------------------------AC----C--T-CA----CATTGTTAGACATTGA--CTTGATGA-TATT--GAA--AAC-CTTCC---------T----------TTaaataaaattagttctttagcattcttggcgaagcgtataatatgatcaggataaaaaaaatacgaattattttaatagtaaaatatctaacccggaacttccttttaaaaccattcatcttcttagtcatttagttacattgaaaacaatagtggcggcacattttcaccttgcctttaccctagataacatttaaaactatcacttaaacctcacattgttagacattgacttgatgatattgaaaaccttccttttaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|3                          : tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaattaaaagcagaataaacgctgtaaaatgttgcccataaggagtagtttaatcgttcattcaaattttgaacgatctcgcagtctttgtttgaatgtagaaaaaaatacctatatcttccattatttgtgctaaccacacataacaaatacctaatttacatttaatgtatctctgataagcaaggcccaattagtaacatttggtgatttttctacatcttataacattattcagtaaacatgatgaatacattttcgatgttactgttcattactttgaacaaatattttataattatatttattcgttttgtaaaatattttgttcttccccactcgatgtagatatattataaataataactatttgaacaattgtaagcgtacccattaatttgatgcgcttgaataaacgcccacacttcgcttgctttattcaatttaggtgtgactagtttataatataaatccagaacaggttttggccatatattaacaattgtgtgtattttttatttaaatatttacttaaatatagctttttaggattggccggtcaacgatttttgagctttgctaaataatcctttcgtagtgaaaataaggtctaagtaagagaatttactatgtccagtttttatatcattaaaataaaactccatacttgtcgaaaccatgctctaaagatcataaccctaggtTT--A-CAATTTATA-CGATTATACG-----TGTGAAAGTATCCGTT---CT--AT----TTGGTGTGCTTGAT-----AA-ACCTCTTA------------ATTTCGCTCGTTTAATTTCGTATAGGAGTGACAAGTTT---ATATAACTCAAGAACA----------ATGTATGCA---AATT-CAA-------------------------------TATAGCTTTTTTGCCTTGGACGGCAAAAGAT-TTTTTAACCTTGCTAAATGATTTACCC--AGTCAAAACAAT--GCTTATGGAAGAGAAATGACTGACCATGTCCAG-T---------TTAAAA----TCGAAAC-CCAT--GCTTTCGGATATCATGCCTTTT---TTCTAAAGACTTC-TG--CTTAGTTTTTGCT-ATGGTTGC-TTAAGTTTCCGTGTATCGCAATATGTA---TATATAT-AATATT-TGGACATTTCTATT---TCTGTA-TATTCTTTACG-AT--TACTGAAAAGA--AACGCAACAAACAG-TAGGAAT-ATTT--AAGTAGT--------CCTAAATCGGCATGTCATTTCCTTTTAAAATATATTCTAAT-TTCTAAGCTAAATCATTGAAGTTCAATACAAACATGAACGGCAAC-A-ATACTTCACCTTGCCTTCACCCCAGATAA-ATCCAAAACTTTCATATTAA---GTATTAT--TTATTTAAGTTTACCCAT-GAT----CTTT-TATTTTCATTGCTATACATTTG--TTATATTA-TATTTAAAA--AAT-CTTCTTATCCCTAAT----------TTATTTAATGTATACC-AAATATA--TTCTCTTACGACATAATT--ATATCTATAGAAAAA-TATGTAATGGCATAAA---TATCATATGACCATTATTTAACATtaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aAGTAGAAAAA----GC--CCTGTAAAATATTGCCCATGAGGAGTTATTTATTTAATCACTCATTCAAATG-TTC-AATATAACTACCACGCAGTCTTTGTTTGAATGTTGAAAGAAATATATTTATATTACCAACTCATTGTGC-TAACCAAACATAATAAAATCCTAACTTACAT--TAAGTATCTCTGACAAGCGAGGCCCAATTAGTAGTATTTG-GAA---------ATTTTTCAACATCATTAAGTAAACATGATGAATATATTTTTTCGATCGTTACT-----------TTGAACCAGTTTTTTTATAATTATACATATATATACATGTATATATATTCACTTTGCATAGTAATTTGTTCTATCCAAC--GCTCTATAGATAGTCATTTTGTG-TCGATAATTTT-A-CACCTAATAACGATT-TGAAAAAT-GGTAAATGTACCCGTTATATTTGATGCGCTTGA--------AT-----AA-ACTCCAAA------------ACTTCGCTTGCATGATTTACTTTATGAGTGATTAATTTATCATATAACCCCAGAACATGTTTTGATGATACAT-------ATG-TAAGTATTTTTT----T----A-A---ACTTAAATATAGCTTTTTGGTCTTTGCAGGCCAAAGAT-TTTTGAACTTCGCTAAGTGATCCACCCGTAGTAAAAACATTCCCCCTAAGTACGATAGTTTACTGA-TATGCCCAG-TTTTATATTATCAAAatgacttataaataaaagttatctatcggttccatttttacctaaatctagcttgtgattagaaataaatataatattcttccgtccatttcttagatatgttattaaggatgctagtgaacaattttcctaacctactcagtaaaacctttgaaattttcagcatcacttaaactacctttttcaaggataagaataacataaccatcgctccagctatcaaggaaata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gAACATTTAAAACTTTCAC-TT-A---GT----T--TT-TGT---TTTATTT-TACACGTGAC--TGTA----CTTTGTTTTACATTTATTTTTTATGAGTATC--AAAATAAT-TTCTC---------TAACCTGTAACTTAATTAGTGTACA-CAAA--ATAATTTCTCGTACGTCAAAATTA-AAAGCTTTAAAAAAC-TCTACCATG------A---TATCAT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CTATTTCTAA--ATATGACTGAAAAT--A---AAACGTAATAAAA--GC--ACTGTAAAATGTTGTCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAATT-T--GAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATATTGAAAGAAATATATCAATTTCACCCACTCCTTGTGCTTAACTAAACATAATGAAATCCTAATTTACAT--AATGCATCTCTGACAAGCGAGGCCCAGTTAGGAATACTT-----TTTTTCTATATCTTTTAACATCA-TAAGTAtctttcatatattactaataataccacaaagagaataactattggctttcgttctcattttttacctaaatctagcttgtggcacattaatgtaatactcttctgcccacttcgtttacctgcttttaaggatcataaagaacaaatttcctaac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cttaattttggaatgttcaTAAGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAcgagaatttaatgacgctgttca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cttaattttggaatgttcactatttctaaatatgactgaaaataaaacgtaataaaagcactgtaaaatgttgtccgtgaggagttatttaatcgttcattcaaatttgaatataattatctcgtagtctttgtttgaatattgaaagaaatatatcaatttcacccactccttgtgcttaactaaacataatgaaatcctaatttacataatgcatctctgacaagcgaggcccagttaggaatactttttttctatatcttttaacatcaGATCGTTACTGT-TCAATATTTTTAACCAG---------AATT-----------TTC-TTTGTATA-AT-----------------TTGTTCTTCCTAATTCGCTGTATATAAAGTT---TTGTG-TCGATAATTTC-A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAA-TGTTAATGTACCCGTT---CT--AT----TTGAT-------GCGCTCCAATAACCCCAATAATATGGATAAACTTTGCTTTCATAGTTCAGTATAGTAGTGACTAGT----CATATAACTCCAGAACATGTTTTTGCGATATGTTAA-TAAATT-TA--TATTTTT-----------TA---ACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atgCTATTTCTAAATATAAC--TGAAAATTAA---AAGTAG-AAAAAT--GTTGCCGGAAAAATGTTGCCGGTGAGGAACTATTTA----ATCGTTCATTCAAA-T-TTTGAATAAAATTGTCTCGTAGTCTTTGTTTAAATGTTGAAAGAAATATATTCATATCACCCACTCCGTGCGC-TAACCACACATGATAAAATCCTTATTTACAT--AGTGTATCTCTGACAAGCGAGGCCTAATTAGTAtag


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Reference ( family-1044 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   NATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATANG--CGCAGAT--A---AA--GTAGAAAAAA---GC--CCTGTAAAATGTTGCCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAA---TTTTGAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATGTTGAAAGAAATATATTTATATCACCCACTCCTTGTGC-TAACCACACATAATAAAATCCTAATTTACAT--AATGTATCTCTGACAAGCGAGGCCCAATTAGTAATATTTG-TGATTTTTCTATATCTTTTAACATCATTAAGTAAACATGATGAATATATTTT--CGATCGTTACTGT-TCA-TACTTTGAACCAGTATTTT-ATAATTATA--------TTCATTCGTATA-AT---------ATAATAATTTGTTCTTCCTAACTCGCCGTATATAAAGTTATTTTGTG-TCGATAATTT--A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAT-TGTAAACGTACCCGTT---CTTGAT----TTGAT-------AT-----AATACCCCCAA------------ACTTCGCTTGCATAATTCAGTATAGGAGTGACTAGTT--T--CATATAACTCCAGAACATGTTTTGGCGATAT----AT--G---CAATT-TAAGTATTT-TT------T--A-----------ACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGCCGGCCAANGAT-TTTTGAGCTTCGCTAAATGATCCACCCGTAGTGAAAACAAT--GCCTAAGTACGAGAATTTACTGACTATGTCCAG-TTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA-GCTTCTCGANACCATGCC-CCC---TT-CTAAAGA--TCGTAACCTTGGTTTTTACT-ATGTTTACTTTAAGTTTCCGTNTATCGCAATATGCA---T-T-TAC-AATATTACGAATANTTNTAGT---TCTTTAGTATTCTTNGCGAAG--TA-TAATATGATCAGCGCAA-AAA-AG-TACGAAT-ATTT--TAATAGTA--A--TACCTAACCCGGCAT-----TTCCTTTTAAAA-ATATTC--ATCTTCTAAG-----TCATTNAGGTACGTTGAAAACANNAACGGCGAC-A-ATA-TTCACCTTGCCTTNACCCNAGATAACATTTAAAACTNTCAC-TTAA---GT----T--TT-TTT---TTTACCC-T-CAC----CT-T--A----CATTGCTATACATTNA--TTTNATGA-TATT--AAA--AAT-CTTCCT----------TTATTTAGTGTACAC--AA-ATA--TTCTCTTACGACATAATT--AAANCTTTAGAAAAA-TNTNCCATGGCACAAA---TATCATGTGACCATTATTTAACAT
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATACG--CGCAGAT--A---
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AA--GTAGAAAA-A---GC--CCTGTAAAATGTTATCCGAGAGTAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAA---TTTgtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgagagtagttatttaatcattcattcaaattt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                tacatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacatacgcgcagatagtgtttttaatgcttatcttaattttggaatgttgactggagattATTGTTTTTTTCCCATCGTCCTTTTTCTTTTTCTAA-CATAAG--CGCAGAT--A---
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcT--A---AA--GTAGAAAA-A---GC--CCTGTAAAATGTTATCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCATTCATTCAAA---TTTgtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagatttaaagtagaaaaagccctgtaaaatgttatccgtgaggagttatttaatcattcattcaaattt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acatattctgcattttctgttttctctaggagtgtcattgtttttttcccatcgtcctttttctttttctaacataagcgcagatagtgttgttaatgcttatctaaattttggaatgttgactggagattGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAG-TTCTATATCATTAAAAAAAAT-AAAAATCCAT--GCTTCTTAAAACC------------TT-CTAAAGA--TCATAACCTTGGTTTTTACA-ATGTTTACTTTAAGTTTCCATTTAACGTTATATTCAAAGT-T-TAC-AGTAT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTCTTCTGATTTCTCCTTACATAACGTTGTTTTG-----AATAATTT--AACACCCAGTAACAGTT-CGCAAAATATGTAAATATACACGT-----TTGAT----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttcaacaccttttaacctggtgtaGTTATTTCTAATTCACCATATATAAAGGTATTTTGTGTTTG--AATTTGAA-CTCCTAATCATTGCT-TGCAAAAT-TGTAAATTAACTCGTT---CTgacgaacca
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATCTA----ATCGTTCATTCAGT---TTCTGAATATAATTATCTCGTAGTTTataacaacagcatttgaatggccccaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTATCTA----ATCGTTCATTCAGT---TTCTGAATATAATTATCTCGTAGT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --A---AA--GCAGAATAAA----C--GCTGTAAAATGTTGCCCATAAGGAGTAGTTTA----ATCGTTCATTCAAA---TTTTGAACG-----ATCTCGCAGTCTTTGTTTGAATGTAGAAAAAAATAC--CTATATCTTCCATTATTTGTGC-TAACCACACATAACAAATACCTAATTTACATTTAATGTATCTCTGATAAGCAAGGCCCAATTAGTAACATTTGGTGATTTTTCTACATCTTATAACATTATTCAGTAAACATGATGAATACATTTT--CGAT-GTTACTGT-TCATTACTTTGAACAAATATTTT-ATAATTATA--------TTTATTCGTTTT-GT---------AAAATATTTTGTTCTTCCCCACTCGATGTAGATA----TATT---------ATAA-----A-----TAATAACTATT-TGAACAAT-TGTAAGCGTACCCATTAA-TTTGATGCGCTTGA--------AT-----AA-ACGCCCAC------------ACTTCGCTTGCTTTATTCAATTTAGGTGTGACTAGTTTAT--AATATAAATCCAGAACAGGTTTTGGCCATAT----ATTAA---CAATTGTGTGTATTT-TT------T--ATTTAAATATTTACTTAAATATAGCTTTTTAGGATTGGCCGGTCAACGAT-TTTTGAGCTTTGCTAAATAATCCTTTCGTAGTGAAAATAAG--GTCTAAGTAAGAGAATTT----ACTATGTCCAGTTTTTATATCATTAAAA----T-AAAACTCCATA--CTTGTCGAAACCATGC---------T-CTAAAGA--TCATAACCCTAGGTTTTACTGAT-TTTACt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaatta---T-T-TACTGATTTTACAAATAAAATTAGT---TCTTTAGCATTCTTGGCGAAGCGTA-TAATATGATCAGGATAA-AAA-AAATACGAATTATTT--TAATAGTA--AAATATCTAACCCGGAAC-----TTCCTTTTAAAA-CCATTC--ATCTTCTTAG-----TCATTTAGTTACATTGAAAACAATAGTGGCGGC-ACATT-TTCACCTTGCCTTTACCCTAGATAACATTTAAAACTATCAC-TTAA--------------------------------AC----CT-C--A----CATTGTTAGACATTGA--CTTGATGA-TATT--GAA--AAC-CTTCCT----------TTaaataaaattagttctttagcattcttggcgaagcgtataatatgatcaggataaaaaaaatacgaattattttaatagtaaaatatctaacccggaacttccttttaaaaccattcatcttcttagtcatttagttacattgaaaacaatagtggcggcacattttcaccttgcctttaccctagataacatttaaaactatcacttaaacctcacattgttagacattgacttgatgatattgaaaaccttccttttaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|3                          : tacatattctgcatttgtcgtttctctgtgagtttgtattgtattattttgtatcttcctgcctatgcacgtatactttaggtcttgttaacgcttttctaaatttttgaatattcattatttataaatgtgactgaaaattaaaagcagaataaacgctgtaaaatgttgcccataaggagtagtttaatcgttcattcaaattttgaacgatctcgcagtctttgtttgaatgtagaaaaaaatacctatatcttccattatttgtgctaaccacacataacaaatacctaatttacatttaatgtatctctgataagcaaggcccaattagtaacatttggtgatttttctacatcttataacattattcagtaaacatgatgaatacattttcgatgttactgttcattactttgaacaaatattttataattatatttattcgttttgtaaaatattttgttcttccccactcgatgtagatatattataaataataactatttgaacaattgtaagcgtacccattaatttgatgcgcttgaataaacgcccacacttcgcttgctttattcaatttaggtgtgactagtttataatataaatccagaacaggttttggccatatattaacaattgtgtgtattttttatttaaatatttacttaaatatagctttttaggattggccggtcaacgatttttgagctttgctaaataatcctttcgtagtgaaaataaggtctaagtaagagaatttactatgtccagtttttatatcattaaaataaaactccatacttgtcgaaaccatgctctaaagatcataaccctaggtTT--A-CAATTTATA-CGATTATACG-----TGTGAAAGTATCCGTT---CT--AT----TTGGTGTGCTTGAT-----AA-ACCTCTTA------------ATTTCGCTCGTTTAATTTCGTATAGGAGTGACAAGTT--T---ATATAACTCAAGAACA----------ATGT----AT--G---CAA--------ATTC-----------------------------AATATAGCTTTTTTGCCTTGGACGGCAAAAGAT-TTTTTAACCTTGCTAAATGATTTACCC--AGTCAAAACAAT--GCTTATGGAAGAGAAATGACTGACCATGTCCAG-TTT---------AAAA----TCGAAAC-CCAT--GCTTTCGGATATCATGCC-TTT---TTTCTAAAGACTTC-TG--CTTAGTTTTTGCT-ATGGTTGCTT-AAGTTTCCGTGTATCGCAATATGTA---TATATAT-AATATT-TGGACATTTCTATT---TCTGTA-TATTCTTTACGA-T--TACTGAAAAGA--AACGCAACAAACAG-TAGGAAT-ATTT--AAGTAGT--------CCTAAATCGGCATGTCATTTCCTTTTAAAATATATTCTAAT-TTCTAAGCTAAATCATTGAAGTTCAATACAAACATGAACGGCAAC-A-ATACTTCACCTTGCCTTCACCCCAGATAA-ATCCAAAACTTTCATATTAA---GTATTAT--TTATTTAAGTTTACCCAT-GAT----CT-TTTATTTTCATTGCTATACATTTG--TTATATTA-TATTTAAAA--AAT-CTTCTTATCCCTAAT-TTATTTAATGTATACCAAATATA--TTCTCTTACGACATAATT--ATATCTATAGAAAAA-TATGTAATGGCATAAA---TATCATATGACCATTATTTAACATtaaaccctaatttaataatttgacaccaa
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aA--GTAGAAAAA----GC--CCTGTAAAATATTGCCCATGAGGAGTTATTTATTTAATCACTCATTCAAA---TGTTCAATATAACTACCACGCAGTCTTTGTTTGAATGTTGAAAGAAATATATTTATATTACCAACTCATTGTGC-TAACCAAACATAATAAAATCCTAACTTACAT--TAAGTATCTCTGACAAGCGAGGCCCAATTAGTAGTATTTG-GAA---------ATTTTTCAACATCATTAAGTAAACATGATGAATATATTTTTTCGATCGTTACT-----------TTGAACCAGTTTTTTTATAATTATACATATATATACATGTATATATATTCACTTTGCATAGTAATTTGTTCTATCCAAC--GCTCTATAGATAGTCATTTTGTG-TCGATAATTTT-A-CACCTAATAACGATT-TGAAAAAT-GGTAAATGTACCCGTTATATTTGATGCGCTTGA--------AT-----AA-ACTCCAAA------------ACTTCGCTTGCATGATTTACTTTATGAGTGATTAATT--TATCATATAACCCCAGAACATGTTTTGATGATAC----AT--------ATG-TAAGTATTT-TT------TTAA-----------ACTTAAATATAGCTTTTTGGTCTTTGCAGGCCAAAGAT-TTTTGAACTTCGCTAAGTGATCCACCCGTAGTAAAAACATTCCCCCTAAGTACGATAGTTTACTGA-TATGCCCAG-TTTTATATTATCAAAatgacttataaataaaagttatctatcggttccatttttacctaaatctagcttgtgattagaaataaatataatattcttccgtccatttcttagatatgttattaaggatgctagtgaacaattttcctaacctactcagtaaaacctttgaaattttcagcatcacttaaactacctttttcaaggataagaataacataaccatcgctccagctatcaaggaaata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gAACATTTAAAACTTTCAC-TT-A---GT----T--TT-TGT---TTTATTT-TACACGTGACTGT--A----CTTTGTTTTACATTTATTTTTTATGAGTATC--AAAATAAT-TTCTCTAACCTGTAACTTAATTAGTGTACACA-AA-ATAATTTCTCGTACGTCAAAATTA-AAAGCTTTAAAAAAC-TCTACCATG------A---TATCAT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTATTTCTAA--ATATGACTGAAAAT--A---AAACGTA-ATAAAA---GC--ACTGTAAAATGTTGTCCGTGAGGAGTTATTTA----ATCGTTCATTCAAA---TTT-GAATATAATTATCTCGTAGTCTTTGTTTGAATATTGAAAGAAATATATCAATTTCACCCACTCCTTGTGCTTAACTAAACATAATGAAATCCTAATTTACAT--AATGCATCTCTGACAAGCGAGGCCCAGTTAGGAATACTT-----TTTTTCTATATCTTTTAACATCA-TAAGTAtctttcatatattactaataataccacaaagagaataactattggctttcgttctcattttttacctaaatctagcttgtggcacattaatgtaatactcttctgcccacttcgtttacctgcttttaaggatcataaagaacaaatttcctaac
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cttaattttggaatgttcaTAAGTACGAGAATTTAATGACGCTGTTCAcgagaatttaatgacgctgttca
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cttaattttggaatgttcactatttctaaatatgactgaaaataaaacgtaataaaagcactgtaaaatgttgtccgtgaggagttatttaatcgttcattcaaatttgaatataattatctcgtagtctttgtttgaatattgaaagaaatatatcaatttcacccactccttgtgcttaactaaacataatgaaatcctaatttacataatgcatctctgacaagcgaggcccagttaggaatactttttttctatatcttttaacatcaGATCGTTACTGT-TCAATATTTTTAACCAG---------AATT-----------TTC-TTTGTATA-AT-----------------TTGTTCTTCCTAATTCGCTGTATATAAAGTT---TTGTG-TCGATAATTTC-A-CACCTAATAACGATT-TGCAAAAA-TGTTAATGTACCCGTT---CT--AT----TTGAT-------GCGCTCCAATAACCCCAATAATATGGATAAACTTTGCTTTCATAGTTCAGTATAGTAGTGACTAGT------CATATAACTCCAGAACATGTTTTTGCGATATGTTAAT--A----AATT-TA--TATTT-TT------T--A-----------ACTTAAATATAGCTTTTTGGGCTTGGC
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atgCTATTTCTAAATATAAC--TGAAAATTAA---AA--GTAGAAAAAT---GTTGCCGGAAAAATGTTGCCGGTGAGGAACTATTTA----ATCGTTCATTCAAA---TTTTGAATAAAATTGTCTCGTAGTCTTTGTTTAAATGTTGAAAGAAATATATTCATATCACCCACTCCGTGCGC-TAACCACACATGATAAAATCCTTATTTACAT--AGTGTATCTCTGACAAGCGAGGCCTAATTAGTAtag
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): ACATTGATTTTATTATATTTAATCAAAAGCTTTAAAATTATACTTTGGCATAAAACTATAATATTATCTTCAGTATACGGTTTATAATGCCATGGCAATATGATATAAAGCAACACCTTTTATATTCTGTAAATTACATCTTCTGTACTTACTTGTACTTAAATCCGGATTGTTATTCAACATAGATGCAATAATGTTCCGCTCAATTCGTTAAACTATTATTTAAACTGCTAGTGAAAACATTTTTTTATATACTCAATAATGTTAAACCTCTGCAATGGTCAACAATACTTAAACCAACATTTAATAGATCGGAATACTATATATATAACCATCACTCCGCTTATCTGAGAAATA
Unaligned ( gi|15 ): ATTACAAATACTAGTAGACAATTTCCCTAACGTACTCAGCAAAGTGGTACCTCCGAAACAACACTTCAGCTATCAAGGA