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Alignments
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gi|9 : TAATTCTCAGTTATTCAGCAA---TTCAG-TACCATGGAACTTTGATTATAATTTGTAATAAAAATAAAGCTTATTTGACATGTTTGTTGTGTTAATACTTTTAGATATGATTTGAATGAATAGTAAAGATAGTTTTATGGAGACATGGTCAGAAAGAAAAAAATAACAACATTTTTAAATTGAAAAAT-GCCAGTTTTGACAGGGTCCATTTTGGGACATTTTACCATCAGTATA------TACAATAAAGTTGTATTGTTACTTTCCGATGGATTATAAAGTCATTATTTATGGTAACTGTAAAACCATAAATAAAATTAAAATATAAGCATCTCTAAAAGACTAAAATGCCGATAAAAAGTTGATTTTAATAGAAATTAAATTCTGCGTATGGACGTTATGGTGTCGGTCAATTTTTGTATGAAACTC-TGGCATCTATTTTTAGACAATACAAGCATGGACAATATCATTTGCATGT-GGGGGTGTTAGGTTGTTTGTTTAAAGTTACCTTGTAAAGTAGAGTGATATACAGGATTTCACAATAAAAAAATATCACCGAACTTTCCTCAATGTATAAATGTCGGTCAATTTGTAATGTCCAAAACGAATCGTCGTAAATTATCAATTTTATGATAATATCATATCTAACACCCCTCAATGGATAAATAAACGTGTCCAAAA-CGCGTCATCAGTTTGTGTGTACAAAACTCTACCACCAGCAGGGAGAATATAGAGGTAAGTGTTGTCGGTCAATCAAAAAGTCAGAGTAACGTCCAGAACATTTCATCACTCTATTGATAAAACCTCTAAAGTGAAACCATGTACTATTGTGATGATTGCAAACAATAAAA-AATGAATGTTAATCGAAAGAAAAGACGGAAATTGCCGTATTGACGCAGCTAGCAGTCCGTGTTATG----------AAATGAGTATATGGACGTTATACCTTGACATTTTATCGTGTTTTGGATGTTGCTATTTGACATGGTCAACTTGTCTATACCAAATGTCCTACACTTTAATGTAATTAATAACCATTATGTATACCCCAGTATTTGATATCATACCATTTTCTCTGTAAATGAACACAACAATTCTAGTTTGTCTATTCTGTCACCAAATATCTCCTTCGTCGTGCTTTGAATGTTAC-GTTTGCGGACGTTA-GGTAATGTTGTGGATGTGACATTGACATTAGTTTCTACTTGAATGTGTAACATCCAAAACTGATTTTATATTATCTCTAACTGAAATAATATGAGAGACAAGAAGATTAAC---AATTAATTATCC-TT-TTTTGGTAGAAATTGAGTTGACCTAAGTATGAGTTTGCCAGTACTCCCGATAAATAAGAAATATTATCAATACATGGATTTTTTCTTTGTTATGGATGTTACATTTGACACAAGAATTTTGGAACAAACAATTATGATTTAA----AGTCTGAAACATAAATTACTAATTAATTGATCTAAGTTTACAAAATATCCTTTAGAATGTTATTCTCATGTTAACAGTTTAA-TTTTTAAAAAATTAATTGTAAATAATAA----TGCTTAGTACCAGTATTAATGATATAAA-----ATATATATAT-ATTAAAAACAATAACTACAAACGATACTAATTTT-GTTCTCTTAATTAC-TTTAAGAAAATCTCATGCCCATAATTATGTTGCATTATCATTTAATTTA--AATAA--ATA--CAGACATAAAATAAC
Alignments
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lowQualScore : 5 5 444444 2 4 1 4 0 9 0 0 5 3333333333 4 2 4 2 444 4 8 0 0000 5 1 9999 00000 4 4 4 55 11 55 5 8 66 66 5 0000 5 66 5 66 1 0 5 0 0 3 9 9 3 3 888 2 5 7777777777777 8888 99 6 1 5
lowQualScore : . . ...... . . . . . . . . . .......... . . . . ... . . . .... . . .... ..... . . . .. .. .. . . .. .. . .... . .. . .. . . . . . . . . . . ... . . ............. .... .. . . .
lowQualScore : 0 0 444444 3 4 0 4 8 4 8 8 0 8888888888 4 9 4 3 000 0 0 8 6666 0 3 4444 66666 4 4 4 55 00 55 1 9 99 99 0 6666 0 99 0 99 0 1 0 1 1 1 4 4 2 2 888 5 0 5555555555555 3333 22 7 8 7
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Reference ( family-1035 ) : GGTAGTTCTCAGTTATTCAGCAATTCAGTACCATGGAACTTTGATTATAATTTGTAATAAAAATAAAGCTTATTTGACATGTTTGTTGTGTTAATACTTTTAGATATGATC-TGAATGAATAGTAAAGATAGTTTTATGGAGACATGGTCAGAAAGAAAAAAATTACAACATTTTTAAATTGAAAAAT-GCCAGTTTTGACAGGGTCCATTTTGGGACATTTTACCATCAGTATA------TACAATAAAGTTGTATTGTTACTTTCCGATGGATTATAAAGTCATTATTTATGGTAACTGTAAAACCATAAATAAAATTAAAATATAAGCATCTCTAAAAGACTAAAATGCCGATAAAAAGTTGATTTTAATAGAAATTAAATTCTGCGTATGGACGTTACGGTGTCGGTCAATTTTTGTATGAAACTC-TGGCATCTATTTTTAGACANTACAAGCATGGACAACATCATTTGCATGT-GGGGGTGTTAGGTTGTTTGTTTAAAGTTACCTTGTAAAGTAGAGTGATATACAGGATTTCACAATAAAAAAATATCACCGAACTTTCCTCAATGTATAAATGTCGGTCAATTTGTAACGTCCAAAACGAATCGTCGTAAATTATCAATTTTATGATCGTATCATATCTAACACCCCTCAATGGATAAATAAACGTGTCCAAAAACGCGTCATCAGTTTGTGTGTACACAACTCTACCACCAGCAGGGAGAATATAGAGGTAAGTGTTGTCGGTCAATCAAAAAGTCAGAGTAACGTCCAGAACATTTCATCACTCTATTGATAAAACATCTAAAGTGAATCCATGTACTATTGTGATGATTGCAAACAATAAAA-AATGAATGTTAATCGAAAGAAAAGACGGAAATTGCCGTATTGACGCAGCTAGCGGTCCGTGTTATG----------AAATGAGTATACGGACGTTATACCTTGACATTTTATCGTGTTTTGGATGTTACTATTTGACATGGTCAACTTGTCTATACCAAATGTCCTACGCTTTAATGTAATTAATAACCATGATGTATACCCCAGTATTTGATATCATACCATTTTCTCTGTAAATGAACACAACAATTCTAGTTTGTCTATTCTGTCACCAAATATCTCCTTCGTCGTGTTTTGGACGTTAC-GTTTGCGGACGTTA-GGTAATGTTGTGGATGTGACATTGACATTTGTTTCTACTTGAATGTGTAACATCCAAAACTGATTTTATATTATCTCTAATTGAAATAATATGAGAGGCAAGAAGATTAAC---AATTAATTATCC-TT-TTTTGGTAGAAATTGAGTTGACCTAAGTATGAGTTTGCCAGTACTCCCGATAAATAAGAAATATTATCAATTCATGGATGTTTTCTTTGTTATGGATGTTACATTTGACACAAGAATTTTGGAACAAACAATTATGTGTTAA----AGTCTGAAACATAAATTACTAATTAATTGATCTAAGTTTACAAAATATCCTTTAGAATGTTATTCTCATGTTAACAGTTTAA-TTTTTAAAAATTTAATTGTAAATAATAA----TGCTTAGTACCAGTATTAATGATATAAA-----ATATATATAT-ATTAAAAACAATAACTACAAACGATACTAATTTT-GTTCTCTTAATTAC-TTTAAGAAAATCTCATGCCCATAATTATGTTGCTTTATCATTTAATTTA--AATAA--ATA--CAGACAAAAAATAACTACAAATTTATCAAGAAACATTTTTTTATGTCC-AGGTTGATCAATGGCCATGGGTTTGTTA--ATTAAAACCATTTCCTCGAGCGTGGAGATCTTTGGCAGCTCTAGGAGACCAGGCACA--GTGATCTTTGAGGATATTGTGAGTGTTATCTCCTCTCCAG-ATT----TGGCTACGAGTGGGCTTAGGAGA-TTCTTCTATGTATTCAAAGGTAAGAACAGTGCCAATACAATTTAATATCAGTTTAGATAAAATAAAAGTAAATTGCCTTCTT--ACTCTCTCCCAATAGGATTAATATA-CTAATTATTTACTTTTATAGCGCTATAACTTTGTTATATGTGTACAAATAAACTTTTTGACTGTATAAAATACTTAATA--ATAATATNAAAACTTTCATTTGTGTATTTTCAGACCTTTGAGATGTCTCAGGAAGTTGTGAAGATGCCATTTTAATAGCAACAAAAGATTCTTTAGGGATCAAA-AGAAGAAAAAACTTTGAAATATTATTCACTGACATATATGGATATAGTTTATTATTCTTCCAATAAATTTTAATTGCCATTTGTCAGAAGAGACTTGTATACTTTGTCAATACCTTTTTCTGGTTGGGGGTCTCATTTATATACTGTAGATATACTAAGTGCTGCTAGT---CTAGTTCACAAAGTTTTGG-AAAGCACTGTAATAATACAGTGAGCAGATAGT-------------GGCTTTAAGTGATTTTCTATACTAGTTGGTTGGTGGGGCTCATAAACTTTATCTATAGTATATACTACTAGCAGCCTAGTACACAGATGTTGGGAAATCCTTCTTATAATACAGTTAGCACATGTAGATAAATACTAGAAGTAAGACAACATAATTTATTTATTTCAATATTACTAATATAACCCTTTAATATTACTAGTAGTT----GTTCAGTAGTTAGCAGTGAAACGAGTTCAAACCACTAAAGTACAAGTTTAAATATGTATACTAGGATAAAATGTTATAACACATGGCCAAGTGTGATGAGATGTACACTATTAACAACAATATAACAACAATTATAAAACA--ATACAGAAGTAATCTTGTAATTTGTGTATGTTGTGGACGTTATTTTTAAGTTGTGGACGTTACATATTTGCATATTTGTCAATTGTCAAAGAGTAACGTCCATATGAATTGTGACAAACTATTCTGATATATGTATGTCAG-TTTGAAGTTAAAATGAAAAATCACAAGGATATGTTCTCTAATTGAAAGTTTTGAGTACTATTTCAGTTTGTTCGGATATAGATAGCAACACGCTGAACTTTTATCATATAAATTTTGAGTAACATCCACAACTACAAAATATATATAATTACTTTCGTTCTGGTTATATTTGATTTTTTCTATGATTATTATTTCATAGGTATTCTCCAGTCTTATCTAATAATCATAAGTTATTGTATTGAAATCACCCATTAAATGCATAAACTATTGTCAATAAATAAAATGTAACGTCCAAAACCTTGAGGTTACCATACATAAATTTTGATTTACATGATTTTCTTGTCACAAACTATCTTTTTATTATTAAAATCATACAGAGGAATGTTTAAACTACATTTTAACACCAAAATATTTACTC-TAAGTTATAATTTAATAAATCCATCATTGTGTCTGGAAATTTGCTGAATAACTGAGAACTACC
gi|1 : GGTAGTTCTCAGTTATTCAGCAATTCAGTACCATGTAACTTTGATTATAATTTGTAATAAAAATAAAGCTTATTTGACATGTTTGTTGTGTTAATACTTTTAGATATGATC-TGAATGAATAGTAAAGATAGTTTTATGGAGATATTGTCAGAAAGAAAAAAATTACAACATTTTTAAATTGAAAAAT-GCCAGTTTCGACAGGGTCCATTTTGGGACATTTTACCATCAGTATA------TACAATTAAGTTGTATTGTTACTTTCCGATGGATTATAAAGTCATTATTTACGGTAACTGTAAAACCATAAATAAAATTAAAATATAAGCATCTCTAAAAGACTAAAATGCCGATAAAAAGTTGATTTTAATAGAAATTAAATTCTGCGTATGGACGTTACGGTGTCGGTCAATTTTTGTATGAAACTC-TGGCATCTATTTTTAGACACTACAAGCATGGACAACATCATTTGCATGT-GGGGGTGTTAGGTTGTTTGTTTAAAGTTACCTTGTAAAGTAGAGTGATATACAGGATTTCACAATAAAAAAATATCACCGAACTTTCCTCAATGTATAAATGTCGGTCAATTTGTAACGTCCAAAACGAATCGTCGTAAATTATCAATTTTATGATCGTATCATATCTAACACCCCTCAATGGATAAATAAACGTGTCCAAAAACGCGTCATCAGTTTGTGTGTACACAACTCTACCACCAGCAGGGAGAATATAGAGGTAAGTGTTGTCGGTCAATCAAAAAGTCAGAGTAACGTCCAGAACATTTCATCACTCTATTGATAAAACATCTAAAGTGAATCAATGTACTATTGTGATGATTGCAAACAATAAAA-AACGAATGTTAATCGAAAGAAAAGACGGAAATTGCCGTATTGACGCAGCTAGCGGTCCGTGTTATGTCTGTAAATCAAATGCGTATATGGACGTTATACCTTGACATTTTATCGTGTTTTGGATGTTATTATTTGACATGGTCAACTTGTCTATACCAAATGTCCTACGCTTTAAAGTAATTAATAACCATGATGTATACCCCAGTATTTGATATCATACCATTTTCTCTGTAAATGAACACAGCAATTCTAGTTTGTCTATTCTGTCACCAAATATCTCCTTCGTCGTGTTTTGGACGTTAC-GTTTGCGGACGTTA-GGTAATGTTGTGGATGTGACATTGACATTTGTTTCTACTTGAATGTGTAACATCCAAAACTGATTTTATATTATCTCTAATTGAAATAATATGAGAGACAAGAAGATTAAC---AATTAATTACCC-TT-TTTTGGTAGAAATTGAGTTGACCTAAGTATGAGTTTGCCAGTACTCCTGATAAATAAGAAATATTACCAATTCATGGATGTTTTCTTTGTTATGGATGTTACATTTGACACAAGAATTTTGGAACAAACAATTATGTGTTAA----AGTCTGAAACATAAATTACTAATTAATTGATCTAAGTTTACAAAATATCCTTTAGAATGTTATTCTCATGTTAACAGTTTAA-TTTTTAAAAATTTAATTGTAAATAATAA----TGCTTAGTATCAGTATTAATGATATAAA-----ATTTATATAT-ATTAAAAACAATAACTACAAACGATACTAATTTT-CTTCTCTTAATTACTTTTAAGAAAATCTCACGCTCATAATTATGTTGCTTTATCATTTAATTTA--AATAA--ATA--CAGACAAAAAATAACTACACATTTATCAAAAAACATTTTTTTATGTCC-AGGTTGATCAATGGCCATGGGTTTGTTA--ATTAAAACCATTTCCTCGAGTGTGGAGATCTTTGGCAGCTCTAGGAGACCAGGCACA--GTGATCTTTGAGGATATTGTGAGTGTTAT---CTCTCCAG-ATT----TGGCTACGAGTGGACTTAGGAGA-TTCTTCTATGTATTCAAAGGTAAGAACAGTGCCAATACAATTT-ATATCAGTTTAGATAAAATAAAAGTAAATTGCCTTCTT--ACTCTCTCCCAGTAGGATTAATATA-CTAATTATTTATTTTTATAGCGCTATAATTTTGTTATATGTGTACAAATAAACTTTTTGACTGTATAAAATACTTAATA--ATAATATAAAAACTTTCATTTGTGTATTTTCAGACCTTTGAGATGTCTCAGGAAGTTGTGAAGATGCCATTTTAATAGCAACAAAAGATTCTTTAGGGATCAAA-AGAAGAAAAAACTT--ATATATTATTCACTGACATATATGGATATAGTTGATTATTCTTCCAATAAATTTTAATTGCCATTTGTCAGA--AGACTTGTATACTTTGTCAATACCTTTTTCTGGTTGGGGGTCTCATTTATATACTGGAGATATACTAAGTGCTGCTAGT---CTAGTTCACAAAGTTTTGG-AAAGCACTGTAATAATACAGTGAGCAGATGGT-------------GGCTTTAAGTGATTTTCTATACTAGTTGGTTGGTGGGGCTCATAAACTTTATTTATAGTATATACTACTAGCAGCCTAGTACACAGATGTTGGGAAATCCTTCTTATAATACAGTTAGCACATGTAGATAAATACTAGAA-------AACATAATTTATTTATTTCAATATTACTAATATAACCCTTTAATATTACTAGTAGTT----GTTCAGTAGTTAGCAGTGAAACGAGTTCAAACCACTAAAGTACAAGTTTAAATATGTATACTAGGATAAAATGTTATAAAACATGGCCAAGTGTGATGAGATGTACACTATTAACAACAATATAACAACAATTATAAAACA--ATACAGAAGTAATCTTGTAATTTGTGTATGTTGTGGACGTTATTTTTAAGTTGTGGACGTTACATATTTGCATATTTGTCAATTGTCAAAGAGTAACGTCCATATGAATTGTGACAAACTATTCTGATATATGTATGTCAGTTTTGAAGTTAATATGAAAAATCACAAGGATATGTTCTCTAATTGAAAGTTTTGAGTACTATTTCAGTTTGTTCGGATATAGATAGCAACACGCTGAACTTTTATCATATAAATTTTGAGTAACATCCACAACTACAAAATATATATAATAACTTTCGTTCTGGTTATATTTGATTTTTTCTATAATTATTATTTCATAGGTATTCTCCAGTCTTATCTAATAATCATAAGTTATTGTATTGAAATCACCCATTAAATGCATAAACTATTGTCAATAAATAAAATGTAACGTCCAAAACCTTGAGGTTACCATACATAAATTTTGATTTACATGATTTACTTGTCACAAACTATCTTTTTATTATTAAAATCATACAGAGGAATGTTTAAACTACATTTTAACACCAAAATATTTACTC-TAAGTTATAATTTAATAAATCCATCATTGTGTCTGGAAATTTGCTGAATAACTGAGAACTACC
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gi|8 : CCATAATTATGTTGCTTTATCATTTA-TTTA--AATTA--ATA--CAGACAAAAAATAACTACAAATTTATCAAGAAACATTTTTTTATGTCC-AGGTTGATCAATGGCCATGGGTTTGTTA--ATTAAAACAATTTCCTCGAGTGTGGAGATCTTTGGCAGCTCTAGGAGACCAGGCACA--GTGATCTTTGAGGATATTGTGAGTGTTATCTCCTCTCCAG-ATT----TGGCTATGAGTGGACTTAGGAGA-TTCTTCTATGTATTCAAAGGTAAGAACAGTGCCAATACAATTTAATATCAGTTTAGATAAAATAAAAGTAAATTGCCTTCTT--ACTCTCTCCCAGTAGGATTAATATA-CTAATTATTTACTTTTATAGCGCTATAACTTTGTTATATGTGTACAAATAAACTTTTTGACTGTATAAATTACTTAATATAATAATATAAAAACTTTCATTTGTGTATTTTCAGACCTTTGAGATGTCTCAGGAAGTTGTGAAGATGCCATTTTAATAGCAACAAAAGATTTTTTAGAGATCAAA-AGAAGAAAAAAATTTGAAATATTATTCACTGACATATATGGATATAGTTTATTATTCTTCCAATAAATTTTAATTGCCATTTGTCAGAAGAGACTTGTATACTTTGTCAATACCTTTT-CTGGTTGGG--TCTCATTTATATACTGCAGATATACTAAGTGCTGCTAGT---CTAGTTCACAAAGTTTTGG-AAAGCACTGTAATAATACAGTGAGCAGATAGT-------------GGCTTTAAGTGATTTTCTATACTAGTTGGTTGGTGGGGCTCATAAACTTTATTTGTAGTATATACTACTAGCAGCCTAGTACACAGATGTTGGGAAATCCTTCTTATAATACAGTTAGCACATGTAGATAAATACTAGAAGTAAGACAACATAATTTATTTACTTCAATATTACTAATATAACCCTTTAACATTACTAGTAGTT----GTTCAGTAGTTAGCAGTGAAACGAGTTCAAACCACTAAAGTACAAGTTTAAATATGTATACTAGGATAAAATGTTATAACACATGGCCAAGTGTGATGAGATGTACACTATTAACAACAATATAACAACAATTATAAAACA--ATACAGAAGTAATCTTGTAATTTGTGTATGTTGTGGACGTTATTTTTAAGTTGTGGACGTTACATATTTGCATATTTGTCAATTGTCAAAGAGTAACGTCCATGTGAATTGTGACAAACTATTCTAATATATGTAAGTCAG-TTTGAAGTTAAAATGAAAAATCACAAGGATATGTTCTCTAATTGAAAGTTTTGAGTACTATTTCAGTTTGTTCGGATATAGATAGCAACACGCTGAACTTTTATCATATAAATTTTGAGTAACATCCACAACTACAAAATATATATAATTACTTTCGTTCTGGTTATATTTGATTTTTTCTATAATTATTATTTCATAGGTATTCTCCAGTCTTATCTAATAATCATAAGTTATTGTATTGAAATCACCCATTAAATGCATAAACTATTGTCAATAAATAAAATGTAACGTCCAAAACCTTGAGGTTACCATACATAAATTTTGATTTACATGATTTTCTTGTCACATACTATCTTTTTATTATTAAAATCATACAGAGGAATGTTTAAACTACATTTTAACACCAAAATATTTACTC-TAAGTTATAATTTAATAAATCCATCATTGTGTCTGGAAATTTGCTGAATAACTGAGAACTACC
gi|9 : TAATTCTCAGTTATTCAGCAATTCAGTACCATGGAACTTTGATTATAATTTGTAATAAAAATAAAGCTTATTTGACATGTTTGTTGTGTTAATACTTTTAGATATGATT-TGAATGAATAGTAAAGATAGTTTTATGGAGACATGGTCAGAAAGAAAAAAATAACAACATTTTTAAATTGAAAAAT-GCCAGTTTTGACAGGGTCCATTTTGGGACATTTTACCATCAGTATA------TACAATAAAGTTGTATTGTTACTTTCCGATGGATTATAAAGTCATTATTTATGGTAACTGTAAAACCATAAATAAAATTAAAATATAAGCATCTCTAAAAGACTAAAATGCCGATAAAAAGTTGATTTTAATAGAAATTAAATTCTGCGTATGGACGTTATGGTGTCGGTCAATTTTTGTATGAAACTC-TGGCATCTATTTTTAGACAATACAAGCATGGACAATATCATTTGCATGT-GGGGGTGTTAGGTTGTTTGTTTAAAGTTACCTTGTAAAGTAGAGTGATATACAGGATTTCACAATAAAAAAATATCACCGAACTTTCCTCAATGTATAAATGTCGGTCAATTTGTAATGTCCAAAACGAATCGTCGTAAATTATCAATTTTATGATAATATCATATCTAACACCCCTCAATGGATAAATAAACGTGTCCAAAA-CGCGTCATCAGTTTGTGTGTACAAAACTCTACCACCAGCAGGGAGAATATAGAGGTAAGTGTTGTCGGTCAATCAAAAAGTCAGAGTAACGTCCAGAACATTTCATCACTCTATTGATAAAACCTCTAAAGTGAAACCATGTACTATTGTGATGATTGCAAACAATAAAA-AATGAATGTTAATCGAAAGAAAAGACGGAAATTGCCGTATTGACGCAGCTAGCAGTCCGTGTTATG----------AAATGAGTATATGGACGTTATACCTTGACATTTTATCGTGTTTTGGATGTTGCTATTTGACATGGTCAACTTGTCTATACCAAATGTCCTACACTTTAATGTAATTAATAACCATTATGTATACCCCAGTATTTGATATCATACCATTTTCTCTGTAAATGAACACAACAATTCTAGTTTGTCTATTCTGTCACCAAATATCTCCTTCGTCGTGCTTTGAATGTTAC-GTTTGCGGACGTTA-GGTAATGTTGTGGATGTGACATTGACATTAGTTTCTACTTGAATGTGTAACATCCAAAACTGATTTTATATTATCTCTAACTGAAATAATATGAGAGACAAGAAGATTAAC---AATTAATTATCC-TT-TTTTGGTAGAAATTGAGTTGACCTAAGTATGAGTTTGCCAGTACTCCCGATAAATAAGAAATATTATCAATACATGGATTTTTTCTTTGTTATGGATGTTACATTTGACACAAGAATTTTGGAACAAACAATTATGATTTAA----AGTCTGAAACATAAATTACTAATTAATTGATCTAAGTTTACAAAATATCCTTTAGAATGTTATTCTCATGTTAACAGTTTAA-TTTTTAAAAAATTAATTGTAAATAATAA----TGCTTAGTACCAGTATTAATGATATAAA-----ATATATATAT-ATTAAAAACAATAACTACAAACGATACTAATTTT-GTTCTCTTAATTAC-TTTAAGAAAATCTCATGCCCATAATTATGTTGCATTATCATTTAATTTA--AATAA--ATA--CAGACATAAAATAAC
Alignments
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lowQualScore : . . ...... . . . . . . . . . .......... . . . . ... . . . .... . . .... ..... . . . .. .. .. . . .. .. . .... . .. . .. . . . . . . . . . . ... . . ............. .... .. . . .
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Reference ( family-1035 ) : GGTAGTTCTCAGTTATTCAGCAATTCAGTACCATGGAACTTTGATTATAATTTGTAATAAAAATAAAGCTTATTTGACATGTTTGTTGTGTTAATACTTTTAGATATGATC-TGAATGAATAGTAAAGATAGTTTTATGGAGACATGGTCAGAAAGAAAAAAATTACAACATTTTTAAATTGAAAAAT-GCCAGTTTTGACAGGGTCCATTTTGGGACATTTTACCATCAGTATA------TACAATAAAGTTGTATTGTTACTTTCCGATGGATTATAAAGTCATTATTTATGGTAACTGTAAAACCATAAATAAAATTAAAATATAAGCATCTCTAAAAGACTAAAATGCCGATAAAAAGTTGATTTTAATAGAAATTAAATTCTGCGTATGGACGTTACGGTGTCGGTCAATTTTTGTATGAAACTC-TGGCATCTATTTTTAGACANTACAAGCATGGACAACATCATTTGCATGT-GGGGGTGTTAGGTTGTTTGTTTAAAGTTACCTTGTAAAGTAGAGTGATATACAGGATTTCACAATAAAAAAATATCACCGAACTTTCCTCAATGTATAAATGTCGGTCAATTTGTAACGTCCAAAACGAATCGTCGTAAATTATCAATTTTATGATCGTATCATATCTAACACCCCTCAATGGATAAATAAACGTGTCCAAAAACGCGTCATCAGTTTGTGTGTACACAACTCTACCACCAGCAGGGAGAATATAGAGGTAAGTGTTGTCGGTCAATCAAAAAGTCAGAGTAACGTCCAGAACATTTCATCACTCTATTGATAAAACATCTAAAGTGAATCCATGTACTATTGTGATGATTGCAAACAATAAAA-AATGAATGTTAATCGAAAGAAAAGACGGAAATTGCCGTATTGACGCAGCTAGCGGTCCGTGTTATG----------AAATGAGTATACGGACGTTATACCTTGACATTTTATCGTGTTTTGGATGTTACTATTTGACATGGTCAACTTGTCTATACCAAATGTCCTACGCTTTAATGTAATTAATAACCATGATGTATACCCCAGTATTTGATATCATACCATTTTCTCTGTAAATGAACACAACAATTCTAGTTTGTCTATTCTGTCACCAAATATCTCCTTCGTCGTGTTTTGGACGTTAC-GTTTGCGGACGTTA-GGTAATGTTGTGGATGTGACATTGACATTTGTTTCTACTTGAATGTGTAACATCCAAAACTGATTTTATATTATCTCTAATTGAAATAATATGAGAGGCAAGAAGATTAAC---AATTAATTATCC-TT-TTTTGGTAGAAATTGAGTTGACCTAAGTATGAGTTTGCCAGTACTCCCGATAAATAAGAAATATTATCAATTCATGGATGTTTTCTTTGTTATGGATGTTACATTTGACACAAGAATTTTGGAACAAACAATTATGTGTTAA----AGTCTGAAACATAAATTACTAATTAATTGATCTAAGTTTACAAAATATCCTTTAGAATGTTATTCTCATGTTAACAGTTTAA-TTTTTAAAAATTTAATTGTAAATAATAA----TGCTTAGTACCAGTATTAATGATATAAA-----ATATATATAT-ATTAAAAACAATAACTACAAACGATACTAATTTT-GTTCTCTTAATTAC-TTTAAGAAAATCTCATGCCCATAATTATGTTGCTTTATCATTTAATTTA--AATAA--ATA--CAGACAAAAAATAACTACAAATTTATCAAGAAACATTTTTTTATGTCC-AGGTTGATCAATGGCCATGGGTTTGTTA--ATTAAAACCATTTCCTCGAGCGTGGAGATCTTTGGCAGCTCTAGGAGACCAGGCACA--GTGATCTTTGAGGATATTGTGAGTGTTATCTCCTCTCCAG-ATT----TGGCTACGAGTGGGCTTAGGAGA-TTCTTCTATGTATTCAAAGGTAAGAACAGTGCCAATACAATTTAATATCAGTTTAGATAAAATAAAAGTAAATTGCCTTCTT--ACTCTCTCCCAATAGGATTAATATA-CTAATTATTTACTTTTATAGCGCTATAACTTTGTTATATGTGTACAAATAAACTTTTTGACTGTATAAAATACTTAATA--ATAATATNAAAACTTTCATTTGTGTATTTTCAGACCTTTGAGATGTCTCAGGAAGTTGTGAAGATGCCATTTTAATAGCAACAAAAGATTCTTTAGGGATCAAA-AGAAGAAAAAACTTTGAAATATTATTCACTGACATATATGGATATAGTTTATTATTCTTCCAATAAATTTTAATTGCCATTTGTCAGAAGAGACTTGTATACTTTGTCAATACCTTTTTCTGGTTGGGGGTCTCATTTATATACTGTAGATATACTAAGTGCTGCTAGT---CTAGTTCACAAAGTTTTGG-AAAGCACTGTAATAATACAGTGAGCAGATAGT-------------GGCTTTAAGTGATTTTCTATACTAGTTGGTTGGTGGGGCTCATAAACTTTATCTATAGTATATACTACTAGCAGCCTAGTACACAGATGTTGGGAAATCCTTCTTATAATACAGTTAGCACATGTAGATAAATACTAGAAGTAAGACAACATAATTTATTTATTTCAATATTACTAATATAACCCTTTAATATTACTAGTAGTT----GTTCAGTAGTTAGCAGTGAAACGAGTTCAAACCACTAAAGTACAAGTTTAAATATGTATACTAGGATAAAATGTTATAACACATGGCCAAGTGTGATGAGATGTACACTATTAACAACAATATAACAACAATTATAAAACA--ATACAGAAGTAATCTTGTAATTTGTGTATGTTGTGGACGTTATTTTTAAGTTGTGGACGTTACATATTTGCATATTTGTCAATTGTCAAAGAGTAACGTCCATATGAATTGTGACAAACTATTCTGATATATGTATGTCAG-TTTGAAGTTAAAATGAAAAATCACAAGGATATGTTCTCTAATTGAAAGTTTTGAGTACTATTTCAGTTTGTTCGGATATAGATAGCAACACGCTGAACTTTTATCATATAAATTTTGAGTAACATCCACAACTACAAAATATATATAATTACTTTCGTTCTGGTTATATTTGATTTTTTCTATGATTATTATTTCATAGGTATTCTCCAGTCTTATCTAATAATCATAAGTTATTGTATTGAAATCACCCATTAAATGCATAAACTATTGTCAATAAATAAAATGTAACGTCCAAAACCTTGAGGTTACCATACATAAATTTTGATTTACATGATTTTCTTGTCACAAACTATCTTTTTATTATTAAAATCATACAGAGGAATGTTTAAACTACATTTTAACACCAAAATATTTACTC-TAAGTTATAATTTAATAAATCCATCATTGTGTCTGGAAATTTGCTGAATAACTGAGAACTACC
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