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Reference ( gi|1 )            : TAA-ATGGAATGTATGTGGGTAGAACTAAAACTATAGAAAAG---TTCTTCTAAGAACTATATACAGACATTCTGCATCTAGAGTT-------------ATTTGGAAAGATG--ATT-----TTTAAAA--T-C---ATCTA--AAA----AA-------TA---TTAAAACTGAATAGTCAAATTATATTTTATCTTAAG--GTTA-AT-TGAAACT---TG---------TTCATGAACCCACAAAAGAGT--G--CCAAACTTCAAGAACATTAATTTATC-TATTCATAAAAACTTT-AAAGAAACTATATCTCATGTAATCATCCCCAAAATAGTAGCTCTGAGTGATCATTTTCAAATATTTTGTTCACGTAAAATCAATTATAAAAATAAGAAAAAAATCCATCACGCTATAAAATACAGATCTTTCAAACAATTAAGTGAAGCCAATTTTCTAATAGATCTTCAAAATGCCCATTGATATG---TACACTCTATTCTTTGAATGATGTAAATGAAGGGCTTGACACCAGGATGTAATATATTGTCACGTGTAGTAGATAGGCATGTGCCACCTAGATTGCATCGAGTTGAAATATTACACCAACCTGATTGGTTAACACCAGAAATATTACACGCCATAAAAGACAGGGACAAATATAAAGCTCGGAATGATACTGACAATTAT--A------A--TGTACAAAAATGAAATATGCC----ATCTTATTAAGAAAT--A----------AT------ACTTATGAAATAAAAATTTAAGAAGTCAAATCTAA--CCCAGAATCAAT-CTGGAAACTTTTGA-TGCACCA------TCTACAAAAA---CACAAATAATTAATCTAATATTAATAACATTAATAAAGATGGTCTTGAATTAACGGAACGTAA-TGATATTGTAAACGAGTTTAATAAC-TTCTTAAGTTTGTTAACATAGCAGCAAATTTAGAACAGCAGAAC-A-TACCCGACTCAAGTTTAAATAAAATTAAAACAATTGTTGACACCAAAGT--------------------A-ACA--CCCCTCATTACAGAGAATAAAACAAAAGAAATGCTTTCTAATATAGATACATCAAAAGCCACAGATATTGACCAGATCGGACCAAAACTGTTAAAAATGTCAACTTGTGTATTTTCCAGTAGTTTAACACGTGATATAAATAGCAATATAAGAAATGGTGTTTTT--TCCGACTTCTGAAAATATGCTCAAGTAAGCCCTTTATTTAAAAGCGGTTCAACTGATGACTTAAAC---AATTA-----TTGA---CCTATA-TCAATACTATCGA---CACTG------TCTAAAT--TG-ATTGAA---AAACA-TGTTCATTTAC-ATTTTATTCTATTGTTAAGTCACTATTAAT-----TAG--TATTGTGTGAATTTCAAAGCGGGTTCAGAAAACAACATAGTTGTGAAACAGCTCTTGTTCATATGCTTGATG-A--ATGGCTCGCAGCACTAAATGAAGAAATATTTGTTGGTGCAATTAGTG-TAGATTTTAGAAAAGCTTTTGATTAAGTTGACCATGCAATATTTTTT-AACAT-TTAAAACTGTACAATTGCCTTGAAAACACAATAACATGGTTTAAATCGAACTTTACT-G-AACAAAACAGAAAATTATCATTATCATCATTGACGTTAAATCGAAAAACATCTATTGAACAAACTGTTAT-TAATGGGATACCATAAGACTCTGTATTAGGACCTATCTTGTTATTTCATATTTATAAATGATCTCCC-----TCTCAGTCAGGAGGGAATTGTATCAAATACAGATATGTATGCACATGATACAACAATA-TT-GACATAAACAAATCAAAAGCTTTTAT--AC-AAAAAGATCTTCAATCATCTTTAAAAAGTTAAAATGGACAGTGTTTAGAAAAAATGGAATGG-T-AT-AAA-CA----TAT-----CAAA------AACAAAAGTTGTA-CTTG--TTACTACACCACAACGGCGTGCTAG-GCT--TATTGATAA-AAGTATATCATTAACGT-ATAATGATATTTCATTGGAACT--GATATCTGGTGGTAAGGT-TCTTAGA-ATG--CATAT----AAATAATAACCTTAAGTGGGATACACATA-TCATGTTTATAAGGAAGAAAATGTCAACATAC-TTGTGGCTATTATCAAGACT
gi|2                          : TAACATTGAATGTTTATGGGTAGAAATTAAACCA-AGTAAACCCTTCCCTCTTGGTACTATTTACAGACATCCTGAATCTAGAGTTATTTGGAAAGATGATTTTGAAA-ATC--ATC-----TAGAAAAAGTAC---AATTA--AGA----AAAAAAACATACACTTATAATTGGAGATTTAAATCGTGACTAAT--TAAATAGTAATAT-TAAAACTGAATGGTCAGCTATTTCATGAACCGACGA--GAGTCCG--CCAATATTCAAGAACATTAATTGATCATATTTATAAATATTTT-ATAAA---TATTTCTCATGTAGCCATCCCTAAA---GTTGGTTTGAGTGAACATTTCCAG-TATTTT-TTTACGTAAAATCAAGTATAAAACTA----------------CG----AAAATA---ATCTTTCAAACATTTCAGTGAAGACAATTTTATAAAAGATCTTCAAAATGCTC-----TATGGCATATATTGTATTCTTCGAATGATGCAAATGAAGGGATTGACACATGGACGAAATAT-TTTTCAAGTGTAGAAAATAAGTATGTGCCAATTAGATTGCAT------------------CAACCTCACTGGTTAACTCCAGATATATTAGACGCCGTATAAGACAGAGACACATATAAAGCTTGGAATGATACTGCCAACTAT--A------AAATGTACAGCAATAAAGTATGCC----ATCTTATCAAGAATT--AGACAAAAAAAAT------TCTTAAGACGGAAAAATTGAATAAGGCAAATCTGA--CCCAAAATCAAT-CTGGAAACTTTTTAGTGAACAAGGTGCTTCTACAAAAAACCCACAAATAGTTCAACTAATATTAATAAAATTAATAAAGATGGTCTTGAAATAACAGAAACTAT-TT-TGTTGTTAATGAATTTATTAAC-TTCT---GT--GTTAACATAGCAGCAAATTTAAAAGAGC----C-AATACCCAACTCAAGTTTCGATGAAATGAAAACGTTTGTTGACACCAAAGTCGCAGAAAGAATGTTTTTTAATATA--CCCCTCATTACAGAGAATAAAACAAAAGAAAAACTTTCTAATTTAGATACATCAAAAGTCACAGGTATTGACCAAATCAGACCAAAACTGTTAAAAATGTCCACTAATGTAATTTCAAGTAGTTTAACACGTGTTATAAATAGCAGTTGAAGAAATGGTGTTTTTCCCCCGACATCTGGAAATATGCTGAAATAAGCCTTTTATTTAAAAGCGGTGCAACAGATGATCTTAAC---AATTA-----TCGA---CCTATA-TCAATACAACCGA---CACTGTGTGTTTTTCAAT--TG-ATTGGA---ATACA-TGTTCA-TGACAATTTTATTCTATTTTTAAATCACTATAAATCACTATAAATTATTGTGTGAATTTCAAAGCGGGTTCAGAAAACAACACAGTTGTGAAACAGCTCTAGTTCATATGATTGATATAATATGGTTGGCAGCACTAAATGAAGAAAAATTTGTTGGTGCAATTAAGA-TTGATTTTAGAAAAGCTTTTGATATAGTTGACCATGGAATACTTTGTAAAAATATTAAAACTGTATAAATGCAATGAAAACACAATAAAATTGTTTGCATTCGACCTTACTGG-AAGAAAACAGAAAG----------------TAACATTAAATGAAAAAGCATCTGTTGAACAAACTGTTGT---GTGGAGTACCGCAAGGCTCTATATTAGGAGCTCTCGTGTT-TTTGATATTTATAAATGATCTGCC-----TCTCAGTCATGAGGAAATTGTATCAAATACAGATATGTATGCAGATTATACAACAATATTT-GACATAAA-AAATCAAAGACTTTTAT--ACAAAAAAAATCTTCAATCATCTTTAGATACTTTAAATGGATGGTGTTT--GAAAAATGGAATGG-T--T-AAACCA----CAT-----CA-----------AAAAGTTCTA-CTTG--TAACTACACCACAACGGCGTGCTAG-GCT--TATTGATAA-AAATATATCATTTACGT-ATAATGATAATTCATTTGAACT--TACATCTGGTGATTTGAT-TCTTGGA-ATG--CATAT----AAATAATAACCTTAAGTGGGA-A-ATATA-TCATGTTCATAAGGAAGAAA
gi|3                          :                                           ---TCCTTCTTGGAACTATTTAAAGACATCCTGAATATATAGTT-------------ATTTGGAAAAGTACCATTGGAGATAT-AAA--T-CGTGACCTATTAAACAGTAA-------CA---TTAAAACTGAATGGTCAAGTTATATTTTATCTTATG--GTTT-ATCT--AACT---TG---------TTCATGAACACAC----GAGT--GTCCCAAAATTCAAGAACTCTAATTGATCATATTTATACAGATTTTAAAAGAAAATATATCTC-TA-AACCATCCCTAA---AGTAGGTCAGAGTTGTCATTTTCCAGTATTTT-TTCACGTCAAATCAATTATAAAAATAAGAACAAATTAAATCTCGCTATAACATACATATCTTTCAAACATTTCAGTGAAGACAATTTTATAA-AGATCTTTAAAATAC----------A---TACACTGTATTCTTTGAATGGTGCAAATGAAGGATTTGACACCTGGATGAAATAT-TTTTCA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aagtaaaacctGAAAAAATACACCAATCTGACTGGATAACTCCAGATATATTAGACGCCATAAAAGACATGGACAAATAGAAAGCTCGGAATGATACTGACAATTATAAA------A--TGTATAGAAATAAAGTATGCCTTATATCTTATTAAGAACTCGA----------ATAAAAAAATTTACGAAAGAAAAAAAGAAGAAGGCAAAGTTGA--CCAAAAATCAAT-CTAAAAACTTTT------------------TA-AAGGA---CACAAAC-----------CATTAATAAAATTAACACAGACGGTCTTGAAATAACAGAAAGTAA-TGATA-TGT-AATGAATTCAGTAACATTTTTAA-------AA-ATAGCAGCAAATTTAAAAGAGC----CAA-TAACCGACTCGTGTTCCAG-------AAAAAAGTTTTTAAT------------------------------ATA--CCCCTCATTTCAGAGAATAAAACAAAAGAAATGTTTTCTACTTTAGACACATCAAAAGTCACAGGTATTGACCTGATCTGACCAAAACTGTT-CAAATATCCACTACTGTAATTTTTAGTAGTTTAACagaaaaaatacaccaatctgactggataactccagatatattagacgccataaaagacatggacaaatagaaagctcggaatgatactgacaattataaaatgtatagaaataaagtatgccttatatcttattaagaactcgaataaaaaaatttacgaaagaaaaaaagaagaaggcaaagttgaccaaaaatcaatctaaaaactttttaaaggacacaaaccattaataaaattaacacagacggtcttgaaataacagaaagtaatgatatgtaatgaattcagtaacatttttaaaaatagcagcaaatttaaaagagccaataaccgactcgtgttccagaaaaaagtttttaatatacccctcatttcagagaataaaacaaaagaaatgttttctactttagacacatcaaaagtcacaggtattgacctgatctgaccaaaactgttcaaatatccactactgtaatttttagtagtttaaccccccccaccccgacttctgcaaatatgctaaagtaagccctttatttaaaaacggtgcaactgatgatctacacaattatcgaccaatatcaatactaccgacactgtctaaattgattgaaaaaaaatgttcatgaaaatcttattctatttttatatcactataaattatgtgagttttaaagcgggttaaaaaaacacagttatgaaacagctctagttcgtgattgataaatggctggcggcatatttgttgctgcaataatgatagattttagaaaagcttttgatttagttgaccatgtaaatgcagtgaaaaaaaataaaaaatttaatcctaccttactggaagaaaacagcaagtaactatcaatgaagaaacatctgttgaacaaactgttatgagtgggataccgcaaggctctaatttaggacctcttttgtttttaatattagtaaatgatcttcctctcagtattgaggcaattgtatcaaatacagacatgtatgcagataatacaacaatatttgacataaatacatctaaggctgttatagaaaaaaaaatctttaataatttttaaatggatggtgtttgaaaaatgttatggttataaacacaaagttctatttttttactacacggcaagcattattaacgtataatgatatttcattagaacttacatctggtgataaggtctttcggaatacatataaataataaccttaagtgggatacacatatgttcataaggaagaaactttcagcctacttgtggctattagcaagaataaaaacagacattccattaaattacagcattattttctatgaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                     aagtaaaaccttccttcttggaactatttaaagacatcctgaatatatagttatttggaaaagtaccattggagatataaatcgtgacctattaaacagtaacattaaaactgaatggtcaagttatattttatcttatggtttatctaacttgttcatgaacacacgagtgtcccaaaattcaagaactctaattgatcatatttatacagattttaaaagaaaatatatctctaaaccatccctaaagtaggtcagagttgtcattttccagtattttttcacgtcaaatcaattataaaaataagaacaaattaaatctcgctataacatacatatctttcaaacatttcagtgaagacaattttataaagatctttaaaatacatacactgtattctttgaatggtgcaaatgaaggatttgacacctggatgaaatatttttcaaGACTGGTTAACTCCAGATATATAAGACACCATAAAAGTCAGGGACAAATATAAAGCCCGGAATGATACTGACACTTAT--AAAATCCA--TGTACAGAAATAAAATATG-----------GTTAAAAA----A----------AT------GGTTTTGAAATAAcccccccaccccgacttctgcaaatatgctaaagtaagccctttatttaaaaacggtgcaactgatgatctacacaattatcgaccaatatcaatactaccgacactgtctaaattgattgaaaaaaaatgttcatgaaaatcttattctatttttatatcactataaattatgtgagttttaaagcgggttaaaaaaacacagttatgaaacagctctagttcgtgattgataaatggctggcggcatatttgttgctgcaataatgatagattttagaaaagcttttgatttagttgaccatgtaaatgcagtgaaaaaaaataaaaaatttaatcctaccttactggaagaaaacagcaagtaactatcaatgaagaaacatctgttgaacaaactgttatgagtgggataccgcaaggctctaatttaggacctcttttgtttttaatattagtaaatgatcttcctctcagtattgaggcaattgtatcaaatacagacatgtatgcagataatacaacaatatttgacataaatacatctaaggctgttatagaaaaaaaaatctttaataatttttaaatggatggtgtttgaaaaatgttatggttataaacacaaagttctatttttttactacacggcaagcattattaacgtataatgatatttcattagaacttacatctggtgataaggtctttcggaatacatataaataataaccttaagtgggatacacatatgttcataaggaagaaactttcagcctacttgtggctattagcaagaataaaaacagacattccattaaattacagcattattttctatgaa
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cttaTGATCTCCC-----TCTCAGTCTTGAGGGAATTTTATCAAATACAGGTATGTATGCAGATGATACAACAATA-TTTGACATAAATACATCAAACGCTGTTAT--AC-AAAATG-TCATGAATCATCTTTAAATATTTTAAATGGATGATGTTTG--AAAAATGGAATGA-TTAT-AAG-CA----CAT-----CAAA------AACTAAAGTTCTA-TTTA--TTACTACACCACAACGGCGTGCTAG-GCT--TATTGATAA-AAATGTATCATAAACAT-ATAATGATATTACATTAGAACT--TACATCTGGTGATAAGGT-TCTTGGA-ATG--CATAT----AAATAGTAACCTTAAGTGAGATACACATA-TCATGTTCATAAGGAAGAAAAGTTCAACCTAC-TTGTTGCTATTATCAAGAagaaataagattcaaagtgcgtgtgttattatcaagaataaaaacctacattccactaaatt
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gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tTCATCTTTTAATATTTTAAATGGATGGTGTTT--AAAAAATGGAATGGTT-AT-AAA-CA----CAC-----GAAA------AACTAAAGTTCTA-TTcttcaccacaacgacgtgctaggcatattgataaaaatatatcattaatgtgtaatgagattttattaaaacttacatcttgtgataaggttcttggaatgcatataaataataactttaagtgggatttacatatcatgttcatatggaagaaaatgtcaacctaattgtggctatgatcgagaataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAGTCTTTAGA-------GAATTG-T-CTCAAA-CACAGATATGAATGCAAATGATACAACAATATTTG-A-CATAAATAACTTCACCACAACGACGTGCTAG-GCA--TATTGATAA-AAATATATCATTAATGT-GTAATGAGATTTTATTAAAACT--TACATCTTGTGATAAGGT-TCTTGGA-ATG--CATAT----AAATAATAACTTTAAGTGGGATTTACATA-TCATGTTCATATGGAAGAAAATGTCAACCTAA-TTGTGGCTATGATCGAGAgg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ttct-CA----CAT-----CAAA------AACTGAAGTTCTA-TTTG--TTACTACACCACAATGGTGTGCTAG-GCC--TATTGATAA-AAATATATGATTAACTT-ATAATGAAATTTCATTAGAACT--TACATATGATGATACAGT-TCTTGGA-ATGCACATAT----AAATAATAAACTTAAGTGGGATACACATA-GC---------------AAAATTTCAACTTAC-TTATTGCTATTATCAAGAataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ACACCACAATGGCGTGCTGGCGTTAATATAGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATGATGATATTACATTAAGACataaaaacctacggtacattcttttaaattacagag
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAG-GCT--TATTGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATAATGATAGTTCATTAGGACT--TACATCTGGTGATAAGTT-TCTTGGA-ATG--CATAT----AAATAATAACCTTAAGTGGAACACACATA-TCATGTTTG---------------CAACCTAC-TTATGGCTATTATCAAAA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGATAA-AAATATATCATCAACATTATAATGATATTTCGTAAGAACTTGGATA--TGTTGGTTAGTT-TATTGAC-ATA--CATAT----AGATAATTACCTTAAGTGAAATACACATA-TAATGTTCATAATGAAG-AAAT-TCAACTAAC-TCATGGCTAGTGTAAAAACataaaacattatatttctttaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgcagacgctatgaagttaatagatgcactttccattgatcaaataatatttgcaccttcatatataacagatatgtttaatacccatgataacgttcgtataaatctacgttcaacaaatgaattaaaattgatcacaccaaaacccaacagggatttattcaaaggtagtttgtcctactctggaattttaatatcgtataccggttaatatcagaaaatgtactacagtcaaaagttttacttaacattgtgttaaattgttacaaacagaattaactacttcatatatcccgaagataataactgctatgacgtcatcctttgttctcgcagcactgtatatttaataca
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACATCTGGTGATAAGGT-TCTTGGA-ATG--CATATATATAAATAATAACTTTAAGTGGGATATACATA-TCATGTTCATAAGGAAGAAAATTTCAACCTAG-TTGTGGCTATTATCAAGAaaaacattcctgtaacttacagaatcattttcctaaaagattattctcaaccccccagttagatttttaataacctaattgtaagtactacaaaagataaacataacccgtctcttaatattacaaaaatgagcatgccgtattttctaagttgatcaaaattcaacatatgcagacgctatgaagttaataaatgcactttctattgatcaaagaatcttt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aagatttAGACATC--CGTAT-------TAATATCCATA-----GATA-ACATA-TCATGTTTATAAGGAAGAAAATTTCAATTTTCGTTGTGGCTATTATCATGAatattaacctacattccattaaattacagaattattttctataatgcctatattcaaccctttctacattattgcaatctagttttggttattacaaaaaagtaaaaacataaaccgtctcctaatattgcaaaagagagcatgccatatcatcttgggtagcttagatattcaacatttgcagacactatgaagttaataaatgtactttccattgatcaaagaatatttatcaaaaaagtaaaatttatgtacagagtataaaaaaacatacaccttcgtatataacacataacattcatagaagtcaacaaatgaattaaactttatcacaccaaaacccaacagggaattatatattcaaaggttacaaagtttgtcctactctggaactttaatatggaatagtatactggttaatatcagaatctgtactacagtcaaaaactttacaacaaattgtgttaataggttacaaacggaatgaactacttcataatatttggcaataattaaacaattattattgcaagttctacaaataagtaaccacctccaatgtacacacatatattattaactgtaaataattatacttgttcttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattttgttgttgtaacagatgtagtgatattcactttctttattaatttttaatatacaatgtatatatatatatttttttttattcaaagagactttcaaatgattgcttaaaaaaccttaaa
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     aacagaaataaAT----AAATAATAACCTTTAGC-GGATACACATACTCATGCTTATATGGATGAAAAacaaaaatctacattccattaaatttttaaacaatttatgtataaagcttattttcagccatattttataaaacagaatgtgtttaataccccttgataatgattgtaaaaatctacgttcaacaaatgaaataaattttattactctgaaacctaatggaattattcaaccatggtttgtcctactcaggaacttgaatctagtataa
24 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): GATCAAATATATACTCAATCGTATATCAAAAAGCAAATTGTATGTACAGATTTTCAAAAAACAATGCACTTTCGTATATAACAGATATGTTTTATACACATGCTAACGTTCGTAGAAATCTACGTTCAACAAATGAGTTAAACATTATCAAACCAAAATCCAACAGGGAATTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTCTGGAACTTTAATCTGGAATAGATCAGAAACTGTACTACAGTCAAAAGTATTACAACAAATTGTATTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTCATATGTCCCGAATATAATATTTAGTAATAATTTAACAATTATTATCGCAAGTGCTAAAAATAAACCACCACCTCCAATGTACACACATATATTGTTAACTGTACATAATAATTATTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCAGATGTAATGATATTCACTTTCTTAATTAATTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTTAATCAAAGAGACTTTCAATGGACTGATAAAAAACTTTAAAAAAATGACATTT
Unaligned ( gi|9 ): ATATTGCATAATAGAGCATGCCGTTTTATCTTAGGTGATCAATATTCAATATTTGCAGACGAAATTGATGAATGGACTTTTCATTGATCAAAGAATACTCTCAATATAGCTTAATGTATGTACAAAGTTTAAAAAACAATGCACATTCGTATATAACTGATATGATTAATACTCATGACAACATTCGTAGAAATCTACGTTCAATAAATATATTAAACTGCATTACTACAAAACTCAACAGTGAAGTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTTTGGAACTTTAATCTTGAATAGTTTACCGGTCAATATCAGAATCTGTACTACAGACAAATAATGAATCAAATTGTGTTAAATAGTTACAAACAGAATAAGCTACTTCATATTTTTTTAAATTTAATAATAAGTAATAATTAAAGATTTATTACCACAATTAATACAAATAAGCCACCACCTTCAATATACACACATATATTATTACCTGTACATAATTATACCTGTTGTATTGTTGTTGTTATTTTGTTGCTATAACAGTTACAATGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATATA
Unaligned ( gi|12 ): ACGTTCAACAAATGAATTAAATTGTATCACTCCTAAACCCATAAGGGAATCATTCAAAAGACATTTTTCCAACTGTGAAACTTAAGTCTGGAATAGTACACAATTAATATCGGAAACTCTATTGCTTTAAAACGTCTAGGCAACAAATTGTGTTAAATCGCTACAAACAGAATGGACTACATCATATGTGGAGAAAAAATATTATTTAGTAATGATAGACTCACTTATCGCAAGTGCTACCAATTATCCAACACATCTAATGTACGCATGTATTAATAGATGTACATTATTATAATGTTTGTGTTGTTGTAGTGTTATTTGTTGCTGTAACAGATGTAATGATATCTATTATTTTTTGTTATCGGTGGGACTTTCAAAGAATGCTTAAAAAATCTCAAAATTGATAGAGTTAATATCATTTTTCGTCTACAATCAATTTGCTTG
Unaligned ( gi|13 ): AACATTATACTTTTGTGAGAAACTGTACTCCAGTCAAACGTTTTACAACAAATTGTGTTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTTATATGTCCCGAACACAATATTTAGTAATAATTAAACAAATATTATAGCACATATAAGCCACCACCTCCAATGTACACACATATATTATTAGCTGTACATAATTATACTTGTTATATTGTTGCTGTTGTTTATAGTGTTCTTGTAACAGATGTAGTGAGTTTCTCTTTCTTGATTAATTTTTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGTTTCTTAAAAAAAAGATGATATACATATTCATTCTTATTATTGTTCACCATTGTTTTGTTAACAAATTGTATATATATATATATATATATATAACACATTCCATAGAATA
Unaligned ( gi|16 ): AGAAACTTTACTACAGTCAAAATTTTACAACAAATTGATTAAAATGGTAACAAATAGAATGAACTACTTCATATGTCCTGAATATAATAGTAGTAATAATTAAACAATTATTATCGCAGTTGCTACAAATAAACCACCACCTCCAATGTACATACATATATCATTAACTGTATATAATTATACTTGTTGTATTGTTGTTGTAACACATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTATGTTTATATTATATATATTTTTAAATCAAAGGGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAATCTAAATAATTGATTTACGTGTA
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Unaligned ( gi|19 ): GTACACACATACTTATACTTGTTGATATTGTTGGTGTTATTATTGTTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTATATATACATTTTTTTAATCAAAGAGACTGTCAAAAAAATCTAAAATATTGATATACATGTAGTTATCATTTATCATGTACATGTACAATCATTTTGCTTGCAATGCTTAAACTGTTGTTTTTTTGTTTTGCATTGGTATTTTGTGAATAACCTATAAATGTATCTTTAGATTTCTGAAAAG
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Unaligned ( gi|25 ): ACACACATATATTATTAACTGTAAATAATTATATTTGTTTTGAAGTTTTTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAACATATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGTTTGCTTAAAATGATATATA
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Alignments
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tACTTCACCACAACGACGTGCTAG-GCA--TATTGATAA-AAATATATCATTAATGT-GTAATGAGATTTTATTAAAACTTACATCTTGTGATAAGGT-TCTTGGAATG--CATAT----AAATAATAACTTTAAGTGGGATTTACATA-TCATGTTCATATGGAAGAAAATGTCAACCTAA-TTGTGGCTATGATCGAGAacttcaccacaacgacgtgctaggcatattgataaaaatatatcattaatgtgtaatgagattttattaaaacttacatcttgtgataaggttcttggaatgcatataaataataactttaagtgggatttacatatcatgttcatatggaagaaaatgtcaacctaattgtggctatgatcgagaataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttctcagtctttagagaattgtctcaaacacagatatgaatgcaaatgatacaacaatatttgacataaataAT----AAATAATAACCTTTAGC-GGATACACATACTCATGCTTATATGGATGAAAACTTataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taaATTGATAA-AAATATATCATCAACATTATAATGATATTTCGTAAGAACTTGGATATGTTGGTTAGTT-TATTGACATA--CATAT----AGATAATTACCTTAAGTGAAATACACATA-TAATGTTCATAATGAAGAAA--TTCAACTAAC-TCATGGCTAGTGTAAAAACagctatagcgttaataaaaaaataagcacctacattcaattaagttacaaaattaatttctttcttcaacctcattttgatcagtgtacatatcgtaatttttagataatacataaaaggtaagcacagacgctatctgaatattacagaagagggcatgtcgtataatcctggatgaccaatatgtgacataaattactaagtaaatagatcaaattatttttaaaagcaaaatcattgcacaaagtttcacaaaaatcgtctaccttcttataaagcgtatatgtccaatactcaccataacgtacagatctacgttcaacaaataaattaaaactcaacaggaaatcattcaaaggtaatttgtattactcaggaattttagttcgtattactataccag
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TATTGAACAAACTAGTATA-TG-ATATG-TATCGCATGACTCT-GT-C-GGGATCTG-T----TT-TTTTATATTTATAAATGATCTCCCCTCCCTCTCATTCTTGAAGGAATTTTATCAATTACAGGTATGTATACACATGATAAAACAATATTT-GATATAAATACGTCAAAA-CTGTTAT--AC-AAAAA--TCTACTGA--CAT--TGAACTATTTTAAATGAACGGTGTTT-GTATAA-TAGTATGATTATAAACAGATCATAA-CTAAAGTTCTA-TGTGTTACTAAACCACAACGGCGTGCTAG-GCC--TATTGATAAGAAATAaaaacattcctgtaacttacagaatcattttcctaaaagattattctcaaccccccagttagatttttaataacctaattgtaagtactacaaaagataaacataacccgtctcttaatattacaaaaatgagcatgccgtattttctaagttgatcaaaattcaacatatgcagacgctatgaagttaataaatgcactttctattgatcaaagaatcttt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cttaTAATATCCATA-----GATA-ACATA-TCATGTTTATAAGGAAGAAAATTTCAATTTTCGTTGTGGCTATTATCATGAagaaataagattcaaagtgcgtgtgttattatcaagaataaaaacctacattccactaaatt
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gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aagtaaaaccttccttcttggaactatttaaagacatcctgaatatatagttatttggaaaagtaccattggagatataaatcgtgacctattaaacagtaacattaaaactgaatggtcaagttatattttatcttatggtttatctaacttgttcatgaacacacgagtgtcccaaaattcaagaactctaattgatcatatttatacagattttaaaagaaaatatatctctaaaccatccctaaagtaggtcagagttgtcattttccagtatttTCATCTTTTAATATTTTAAATGGATGGTGTTT-A-AAAAATGGAATGGTTATAAACACACGAAAAACTAAAGTTCTA-TTataaaaacagacattccattaaattacagcattattttctatgaa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACACCACAATGGCGTGCTGGCGTTAATATAGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATGATGATATTACATTAAGACgg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATTTACATCTGGTGATAAGGT-TCTTGGAATG--CATATATATAAATAATAACTTTAAGTGGGATATACATA-TCATGTTCATAAGGAAGAAAATTTCAACCTAG-TTGTGGCTATTATCAAGA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aagTTTCAAAGCGGTGCAACTGATGATCTTAATAATTATCGACCTATATCAATACTACCGATACTG------TCTAAATTGATTGAAAAACA-TTTTAATGAACATTTTATTATATTTTTAATTCACTATAAATTAT-------TATTGTGTGCATTTCAAAGCGGGTTAAGAAATCAACTCAGTTGTGAAACAGTTCTTGTCCATATGATTGATA-A--ATGGTTGGCGGCACTAAATGAAGGAAAGTTAGTGAGTGAAATTATAG-TAGATTTTAGAAAAGCTTTTGATTTAGATGACCATatattaacctacattccattaaattacagaattattttctataatgcctatattcaaccctttctacattattgcaatctagttttggttattacaaaaaagtaaaaacataaaccgtctcctaatattgcaaaagagagcatgccatatcatcttgggtagcttagatattcaacatttgcagacactatgaagttaataaatgtactttccattgatcaaagaatatttatcaaaaaagtaaaatttatgtacagagtataaaaaaacatacaccttcgtatataacacataacattcatagaagtcaacaaatgaattaaactttatcacaccaaaacccaacagggaattatatattcaaaggttacaaagtttgtcctactctggaactttaatatggaatagtatactggttaatatcagaatctgtactacagtcaaaaactttacaacaaattgtgttaataggttacaaacggaatgaactacttcataatatttggcaataattaaacaattattattgcaagttctacaaataagtaaccacctccaatgtacacacatatattattaactgtaaataattatacttgttcttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattttgttgttgtaacagatgtagtgatattcactttctttattaatttttaatatacaatgtatatatatatatttttttttattcaaagagactttcaaatgattgcttaaaaaaccttaaa
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttcaaagcggtgcaactgatgatcttaataattatcgacctatatcaatactaccgatactgtctaaattgattgaaaaacattttaatgaacattttattatatttttaattcactataaattattattgtgtgcatttcaaagcgggttaagaaatcaactcagttgtgaaacagttcttgtccatatgattgataaatggttggcggcactaaatgaaggaaagttagtgagtgaaattatagtagattttagaaaagcttttgatttagatgaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAG-GCT--TATTGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATAATGATAGTTCATTAGGACTTACATCTGGTGATAAGTT-TCTTGGAATG--CATAT----AAATAATAACCTTAAGTGGAACACACATA-TCATGT---------------TTGCAACCTAC-TTATGGCTATTATCAAAAaaaaaaacttacattctattaacttacagaagtatttt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATAAAAGTCAGGGA---CAAATATAAAGCCCGGAAT-GATACTG-ACACTTAT-----AAAATCCA--------TGTACAGAAA---TA-----------------A----AATAT------GGTTAA-AAAAATGGTTTTGAAATAACAGAAAGTAAATGATATTGT-AA-------ATCAATTTC------T-TTGTTAACATAGCAGCAAATTTAAAAGAGC----C-AACACCCGATTCAAGTTTCGATAA---AA-TTAA--AACGTTTGTTGAC-CCCAAAGTCACGAAAATAATGTTTTTCA-ACATA--CCTCTCATTACAGAGAATAAAA------AAA-G-CTTTTTAATTTAGAAACATCAAAAGCCACAGGT-----------TCGGACCAAAACTGTTAAAA-TGTCTACTAATGTAATATCCAGTAGAT-ACCACGTGTTTTAAATAGTAGTATAAGAAATG----TTTTCCC---CCGACATCTGGAAATATGCTAAAGTAAGTCCTTTATTTAAAAGCGGGACAACTGGTGATATAAAataaaacattatatttctttaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgcagacgctatgaagttaatagatgcactttccattgatcaaataatatttgcaccttcatatataacagatatgtttaatacccatgataacgttcgtataaatctacgttcaacaaatgaattaaaattgatcacaccaaaacccaacagggatttattcaaaggtagtttgtcctactctggaattttaatatcgtataccggttaatatcagaaaatgtactacagtcaaaagttttacttaacattgtgttaaattgttacaaacagaattaactacttcatatatcccgaagataataactgctatgacgtcatcctttgttctcgcagcactgtatatttaataca
24 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): GATCAAATATATACTCAATCGTATATCAAAAAGCAAATTGTATGTACAGATTTTCAAAAAACAATGCACTTTCGTATATAACAGATATGTTTTATACACATGCTAACGTTCGTAGAAATCTACGTTCAACAAATGAGTTAAACATTATCAAACCAAAATCCAACAGGGAATTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTCTGGAACTTTAATCTGGAATAGATCAGAAACTGTACTACAGTCAAAAGTATTACAACAAATTGTATTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTCATATGTCCCGAATATAATATTTAGTAATAATTTAACAATTATTATCGCAAGTGCTAAAAATAAACCACCACCTCCAATGTACACACATATATTGTTAACTGTACATAATAATTATTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCAGATGTAATGATATTCACTTTCTTAATTAATTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTTAATCAAAGAGACTTTCAATGGACTGATAAAAAACTTTAAAAAAATGACATTT
Unaligned ( gi|9 ): ATATTGCATAATAGAGCATGCCGTTTTATCTTAGGTGATCAATATTCAATATTTGCAGACGAAATTGATGAATGGACTTTTCATTGATCAAAGAATACTCTCAATATAGCTTAATGTATGTACAAAGTTTAAAAAACAATGCACATTCGTATATAACTGATATGATTAATACTCATGACAACATTCGTAGAAATCTACGTTCAATAAATATATTAAACTGCATTACTACAAAACTCAACAGTGAAGTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTTTGGAACTTTAATCTTGAATAGTTTACCGGTCAATATCAGAATCTGTACTACAGACAAATAATGAATCAAATTGTGTTAAATAGTTACAAACAGAATAAGCTACTTCATATTTTTTTAAATTTAATAATAAGTAATAATTAAAGATTTATTACCACAATTAATACAAATAAGCCACCACCTTCAATATACACACATATATTATTACCTGTACATAATTATACCTGTTGTATTGTTGTTGTTATTTTGTTGCTATAACAGTTACAATGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATATA
Unaligned ( gi|12 ): ACGTTCAACAAATGAATTAAATTGTATCACTCCTAAACCCATAAGGGAATCATTCAAAAGACATTTTTCCAACTGTGAAACTTAAGTCTGGAATAGTACACAATTAATATCGGAAACTCTATTGCTTTAAAACGTCTAGGCAACAAATTGTGTTAAATCGCTACAAACAGAATGGACTACATCATATGTGGAGAAAAAATATTATTTAGTAATGATAGACTCACTTATCGCAAGTGCTACCAATTATCCAACACATCTAATGTACGCATGTATTAATAGATGTACATTATTATAATGTTTGTGTTGTTGTAGTGTTATTTGTTGCTGTAACAGATGTAATGATATCTATTATTTTTTGTTATCGGTGGGACTTTCAAAGAATGCTTAAAAAATCTCAAAATTGATAGAGTTAATATCATTTTTCGTCTACAATCAATTTGCTTG
Unaligned ( gi|13 ): AACATTATACTTTTGTGAGAAACTGTACTCCAGTCAAACGTTTTACAACAAATTGTGTTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTTATATGTCCCGAACACAATATTTAGTAATAATTAAACAAATATTATAGCACATATAAGCCACCACCTCCAATGTACACACATATATTATTAGCTGTACATAATTATACTTGTTATATTGTTGCTGTTGTTTATAGTGTTCTTGTAACAGATGTAGTGAGTTTCTCTTTCTTGATTAATTTTTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGTTTCTTAAAAAAAAGATGATATACATATTCATTCTTATTATTGTTCACCATTGTTTTGTTAACAAATTGTATATATATATATATATATATATAACACATTCCATAGAATA
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Alignments
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tACTTCACCACAACGACGTGCTAG-GCA--TATTGATAA-AAATATATCATTAATGT-GTAATGAGATTTTATTAAAACTTACATCTTGTGATAAGGT-TCTTGGAATG--CATAT----AAATAATAACTTTAAGTGGGATTTACATA-TCATGTTCATATGGAAGAAAATGTCAACCTAA-TTGTGGCTATGATCGAGAacttcaccacaacgacgtgctaggcatattgataaaaatatatcattaatgtgtaatgagattttattaaaacttacatcttgtgataaggttcttggaatgcatataaataataactttaagtgggatttacatatcatgttcatatggaagaaaatgtcaacctaattgtggctatgatcgagaataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttctcagtctttagagaattgtctcaaacacagatatgaatgcaaatgatacaacaatatttgacataaataAT----AAATAATAACCTTTAGC-GGATACACATACTCATGCTTATATGGATGAAAACTTataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taaATTGATAA-AAATATATCATCAACATTATAATGATATTTCGTAAGAACTTGGATATGTTGGTTAGTT-TATTGACATA--CATAT----AGATAATTACCTTAAGTGAAATACACATA-TAATGTTCATAATGAAGAAA--TTCAACTAAC-TCATGGCTAGTGTAAAAACagctatagcgttaataaaaaaataagcacctacattcaattaagttacaaaattaatttctttcttcaacctcattttgatcagtgtacatatcgtaatttttagataatacataaaaggtaagcacagacgctatctgaatattacagaagagggcatgtcgtataatcctggatgaccaatatgtgacataaattactaagtaaatagatcaaattatttttaaaagcaaaatcattgcacaaagtttcacaaaaatcgtctaccttcttataaagcgtatatgtccaatactcaccataacgtacagatctacgttcaacaaataaattaaaactcaacaggaaatcattcaaaggtaatttgtattactcaggaattttagttcgtattactataccag
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATTGAACAAACTAGTATA-TG-ATATG-TATCGCATGACTCTGT--CGGGATCTGT-----TT-TTTTATATTTATAAATGATCTCCCCTCCCTCTCATTCTTGAAGGAATTTTATCAATTACAGGTATGTATACACATGATAAAACAATATTTGATATAAATACGTCAAA-ACTGTTAT--AC-AAAA--ATCT--ACTGACATTGAACTATTTTAAATGAACGGTGTTT-GT-ATAATAGTATGATTATAAACAGATC-ATAACTAAAGTTCTA-TGTGTTACTAAACCACAACGGCGTGCTAG-GCC--TATTGATAAGAAATAaaaacattcctgtaacttacagaatcattttcctaaaagattattctcaaccccccagttagatttttaataacctaattgtaagtactacaaaagataaacataacccgtctcttaatattacaaaaatgagcatgccgtattttctaagttgatcaaaattcaacatatgcagacgctatgaagttaataaatgcactttctattgatcaaagaatcttt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cttaTAATATCCATA-----GATA-ACATA-TCATGTTTATAAGGAAGAAAATTTCAATTTTCGTTGTGGCTATTATCATGAagaaataagattcaaagtgcgtgtgttattatcaagaataaaaacctacattccactaaatt
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gi|3                          :                                                         A-AGTAAAACCTTCCTTCTTGGAACTATTTAAAGACATCCTGAATATATAGTTATTTGGAAAAGTACCATT-GGAGATAT-----AAATCGTGACCTA---TTAAACAGTAA--C----A-TTA-AAACTGAATGGTCAAGTTATATTTTATCTTATG--GTT-TATCTAA--CT---TG---------TTCATGAACACACGAG----TGT-CCCAAAATTCAAGAACTCTAATTGATCATATTTATACAGATTTTAAAAGAAAATATATCTC-TA-AACCATCCCTAAA---GTAGGTCAGAGTTGTCATTTTCCAG-TATTTT-TTCACGTCAAATCAATTATAAAAATAAGAACAAATTAAATCTC-----GCTATAACATACATATCTTTCAAACATTTCA-GTGAAGACAATTTTATAAA---GATC---TTTAAAAT-----------ACATACACTGTATTCTTTGAATG-----GTG----CAA----ATGAAGGATTT---GACACCTGGAT-GAAATAT-TTTTCAAG---AAAAAAT-A------CACCAATCTGAC---------TGGAT------AA----------------------------CTCCAGATATATTAGACGCCATAAAAGACATGGACAAATAGAAAGCTCGGAATGATACTGACAATTATAAA----ATGTATAGAAATAAAGTATGCCTTATATCTTATTAAGAACTCGA--------ATAAAAAAA------TTTACGAAAGAAAAAAAGAAG--AAGG-CAAAGTTGA--CCAAAAATCAAT-CTAAAAACTTT-------------------------T-TA-AAGGA---CACAAA--------C-----------CATTAATAAAATTAACACAGACGGTCTTGAAATAACAGAAAGTAA-TGATA-TGT-AA-TGAATTCAGTAACATTT-T-------TAAAAATAGCAGCAAATTTAAAAGAGC----CAATAACCGACTCGTGTTCCA--GAAA--------------------AAAGT----------------TTTT--AATATA--CCCCTCATTTCAGAGAATAAAACAAAAGAAATGTTTTCTACTTTAGACACATCAAAAGTCACAGGTATTGACCTGATCTGACCAAAACTGTT-CAAATATCCACTACTGTAATTTTTAGTAGTTTAACataaaaacctacggtacattcttttaaattacagag
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gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aagtaaaaccttccttcttggaactatttaaagacatcctgaatatatagttatttggaaaagtaccattggagatataaatcgtgacctattaaacagtaacattaaaactgaatggtcaagttatattttatcttatggtttatctaacttgttcatgaacacacgagtgtcccaaaattcaagaactctaattgatcatatttatacagattttaaaagaaaatatatctctaaaccatccctaaagtaggtcagagttgtcattttccagtatttTCATCTTTTAATATTTTAAATGGATGGTGTTT-A-AAAAATGGAATGGTTATAAACACACGAAAAACTAAAGTTCTA-TTataaaaacagacattccattaaattacagcattattttctatgaa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACACCACAATGGCGTGCTGGCGTTAATATAGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATGATGATATTACATTAAGACgg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATTTACATCTGGTGATAAGGT-TCTTGGAATG--CATATATATAAATAATAACTTTAAGTGGGATATACATA-TCATGTTCATAAGGAAGAAAATTTCAACCTAG-TTGTGGCTATTATCAAGA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aagTTTCAAAGCGGTGCAACTGATGATCTTAATAATTATCGACCTATATCAATACTACCGATACTG------TCTAAATTGATTGAAAAACA-TTTTAATGAACATTTTATTATATTTTTAATTCACTATAAATT-------ATTATTGTGTGCATTTCAAAGCGGGTTAAGAAATCAACTCAGTTGTGAAACAGTTCTTGTCCATATGATTGATA-A--ATGGTTGGCGGCACTAAATGAAGGAAAGTTAGTGAGTGAAATTATAG-TAGATTTTAGAAAAGCTTTTGATTTAGATGACCAT-atattaacctacattccattaaattacagaattattttctataatgcctatattcaaccctttctacattattgcaatctagttttggttattacaaaaaagtaaaaacataaaccgtctcctaatattgcaaaagagagcatgccatatcatcttgggtagcttagatattcaacatttgcagacactatgaagttaataaatgtactttccattgatcaaagaatatttatcaaaaaagtaaaatttatgtacagagtataaaaaaacatacaccttcgtatataacacataacattcatagaagtcaacaaatgaattaaactttatcacaccaaaacccaacagggaattatatattcaaaggttacaaagtttgtcctactctggaactttaatatggaatagtatactggttaatatcagaatctgtactacagtcaaaaactttacaacaaattgtgttaataggttacaaacggaatgaactacttcataatatttggcaataattaaacaattattattgcaagttctacaaataagtaaccacctccaatgtacacacatatattattaactgtaaataattatacttgttcttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattttgttgttgtaacagatgtagtgatattcactttctttattaatttttaatatacaatgtatatatatatatttttttttattcaaagagactttcaaatgattgcttaaaaaaccttaaa
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tttcaaagcggtgcaactgatgatcttaataattatcgacctatatcaatactaccgatactgtctaaattgattgaaaaacattttaatgaacattttattatatttttaattcactataaattattattgtgtgcatttcaaagcgggttaagaaatcaactcagttgtgaaacagttcttgtccatatgattgataaatggttggcggcactaaatgaaggaaagttagtgagtgaaattatagtagattttagaaaagcttttgatttagatgaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAG-GCT--TATTGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATAATGATAGTTCATTAGGACTTACATCTGGTGATAAGTT-TCTTGGAATG--CATAT----AAATAATAACCTTAAGTGGAACACACATA-TCATGT---------------TTGCAACCTAC-TTATGGCTATTATCAAAAaaaaaaacttacattctattaacttacagaagtatttt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GACTGGTTAACTCCAGATATATAAGACACCATAAAAGTCAGGGACAAATATAAAGCCCGGAATGATACTGACACTTATAAAATCCATGTACAGAAATAAAATATGataaaacattatatttctttaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgcagacgctatgaagttaatagatgcactttccattgatcaaataatatttgcaccttcatatataacagatatgtttaatacccatgataacgttcgtataaatctacgttcaacaaatgaattaaaattgatcacaccaaaacccaacagggatttattcaaaggtagtttgtcctactctggaattttaatatcgtataccggttaatatcagaaaatgtactacagtcaaaagttttacttaacattgtgttaaattgttacaaacagaattaactacttcatatatcccgaagataataactgctatgacgtcatcctttgttctcgcagcactgtatatttaataca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATAAAAGTCAGGGACAAATATAAAGCCCGGAAT-GATACTG-ACACTTAT----AA---AATCC-A--------TGTACAGAAA---TA-----------------AA----ATAT------GGTTAA-AAAAATGGTTTTGAAATAACAGAAAGTAAATGATATTGT-AA--------ATCAATTTCT-TT-----GTTAACATAGCAGCAAATTTAAAAGAGC----CAACACCCGATTCAAGTTTCGATAAAATTAAAACGTTTGTTGACCCCAAAGTCAC-GAAA-ATAATGTTTTTCAAC-ATA--CCTCTCATTACAGAGAATAAAA------AAA-GCTTTTTAATTTAGAAACATCAAAAGCCACAGGT----------TCGGACCAAAACTGTTAAAA-TGTCTACTAATGTAATATCCAGTAGAT-ACCACGTGTTTTAAATAGTAGTATAAGAAATG----TTTTCCC---CCGACATCTGGAAATATGCTAAAGTAAGTCCTTTATTTAAAAGCGGGACAACTGGTGATATAAAgttaaaaaaatggttttgaaataacagaaagtaaatgatattgtaaatcaatttctttgttaacatagcagcaaatttaaaagagccaacacccgattcaagtttcgataaaattaaaacgtttgttgaccccaaagtcacgaaaataatgtttttcaacatacctctcattacagagaataaaaaaagctttttaatttagaaacatcaaaagccacaggttcggaccaaaactgttaaaatgtctactaatgtaatatccagtagataccacgtgttttaaatagtagtataagaaatgttttcccccgacatctggaaatatgctaaagtaagtcctttatttaaaagcgggacaactggtgatataaatgcggattaatcgtctgaaactttgtgttcaataccatggagagcacttcgagataatgtaataaagttaaatttatttatttatttatttgtttccgtcaattt
24 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): GATCAAATATATACTCAATCGTATATCAAAAAGCAAATTGTATGTACAGATTTTCAAAAAACAATGCACTTTCGTATATAACAGATATGTTTTATACACATGCTAACGTTCGTAGAAATCTACGTTCAACAAATGAGTTAAACATTATCAAACCAAAATCCAACAGGGAATTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTCTGGAACTTTAATCTGGAATAGATCAGAAACTGTACTACAGTCAAAAGTATTACAACAAATTGTATTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTCATATGTCCCGAATATAATATTTAGTAATAATTTAACAATTATTATCGCAAGTGCTAAAAATAAACCACCACCTCCAATGTACACACATATATTGTTAACTGTACATAATAATTATTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCAGATGTAATGATATTCACTTTCTTAATTAATTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTTAATCAAAGAGACTTTCAATGGACTGATAAAAAACTTTAAAAAAATGACATTT
Unaligned ( gi|9 ): ATATTGCATAATAGAGCATGCCGTTTTATCTTAGGTGATCAATATTCAATATTTGCAGACGAAATTGATGAATGGACTTTTCATTGATCAAAGAATACTCTCAATATAGCTTAATGTATGTACAAAGTTTAAAAAACAATGCACATTCGTATATAACTGATATGATTAATACTCATGACAACATTCGTAGAAATCTACGTTCAATAAATATATTAAACTGCATTACTACAAAACTCAACAGTGAAGTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTTTGGAACTTTAATCTTGAATAGTTTACCGGTCAATATCAGAATCTGTACTACAGACAAATAATGAATCAAATTGTGTTAAATAGTTACAAACAGAATAAGCTACTTCATATTTTTTTAAATTTAATAATAAGTAATAATTAAAGATTTATTACCACAATTAATACAAATAAGCCACCACCTTCAATATACACACATATATTATTACCTGTACATAATTATACCTGTTGTATTGTTGTTGTTATTTTGTTGCTATAACAGTTACAATGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATATA
Unaligned ( gi|12 ): ACGTTCAACAAATGAATTAAATTGTATCACTCCTAAACCCATAAGGGAATCATTCAAAAGACATTTTTCCAACTGTGAAACTTAAGTCTGGAATAGTACACAATTAATATCGGAAACTCTATTGCTTTAAAACGTCTAGGCAACAAATTGTGTTAAATCGCTACAAACAGAATGGACTACATCATATGTGGAGAAAAAATATTATTTAGTAATGATAGACTCACTTATCGCAAGTGCTACCAATTATCCAACACATCTAATGTACGCATGTATTAATAGATGTACATTATTATAATGTTTGTGTTGTTGTAGTGTTATTTGTTGCTGTAACAGATGTAATGATATCTATTATTTTTTGTTATCGGTGGGACTTTCAAAGAATGCTTAAAAAATCTCAAAATTGATAGAGTTAATATCATTTTTCGTCTACAATCAATTTGCTTG
Unaligned ( gi|13 ): AACATTATACTTTTGTGAGAAACTGTACTCCAGTCAAACGTTTTACAACAAATTGTGTTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTTATATGTCCCGAACACAATATTTAGTAATAATTAAACAAATATTATAGCACATATAAGCCACCACCTCCAATGTACACACATATATTATTAGCTGTACATAATTATACTTGTTATATTGTTGCTGTTGTTTATAGTGTTCTTGTAACAGATGTAGTGAGTTTCTCTTTCTTGATTAATTTTTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGTTTCTTAAAAAAAAGATGATATACATATTCATTCTTATTATTGTTCACCATTGTTTTGTTAACAAATTGTATATATATATATATATATATATAACACATTCCATAGAATA
Unaligned ( gi|16 ): AGAAACTTTACTACAGTCAAAATTTTACAACAAATTGATTAAAATGGTAACAAATAGAATGAACTACTTCATATGTCCTGAATATAATAGTAGTAATAATTAAACAATTATTATCGCAGTTGCTACAAATAAACCACCACCTCCAATGTACATACATATATCATTAACTGTATATAATTATACTTGTTGTATTGTTGTTGTAACACATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTATGTTTATATTATATATATTTTTAAATCAAAGGGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAATCTAAATAATTGATTTACGTGTA
Unaligned ( gi|18 ): CTACAATCAAAAGCTTTACATCAAATTGTGTTAAATGGTTACAAACTGAATGAATTGCTTCGTATGTCCTGAAGATAATATTTGGTAATAATTAAACAATTATTTTCGCAAATGCTATAAATAAGCCACCACCTCCAATATACACACATGTTTTATTAACTGTAAAGAATTATACTTGTTTTTTTTGTTATTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATACATATTTTTTTTTAATCAAATAGACTTTCAAAGGATTACTTAAAAAAATAAAAAAATATATAT
Unaligned ( gi|19 ): GTACACACATACTTATACTTGTTGATATTGTTGGTGTTATTATTGTTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTATATATACATTTTTTTAATCAAAGAGACTGTCAAAAAAATCTAAAATATTGATATACATGTAGTTATCATTTATCATGTACATGTACAATCATTTTGCTTGCAATGCTTAAACTGTTGTTTTTTTGTTTTGCATTGGTATTTTGTGAATAACCTATAAATGTATCTTTAGATTTCTGAAAAG
Unaligned ( gi|20 ): TACTTCATATGTCTCGAATATAATATTTGGTTAAAATGCAAAAAAATACAAATAAGCAACCAACTCCATTGAACACACATATAGTATTACCTGTTCACAATTATACTTGTATTGTTGTTGTTGTTTTTTTAGTTGTTGTAACAGATATAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATTATATATACATAGCAGTATACTTTTTTATTCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAAAA
Unaligned ( gi|22 ): ATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATATATATAATTTTTAATCACAGAGACTTTCAAAGGAACACTTTAAACAATCTAAAAAATGGATATACATGTAGTTATCATGTACAATCATTTTGCTTGCAATGCTTAAAATGTTTTTATTTTATTTTGCTATTGTATTTTGTAAATAACTTGTAAATGTATCATTAGAGGGTCCCAAGGAAGA
Unaligned ( gi|23 ): TACAAATAAGCCACCACCTCCAATGCACACACATATATTATTAACTGTAAATAATTATACCTTTTTTTTTATTGTTGTTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAACAGATGTAGAGATTTTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATATATATATATTTGTATCTTTATATATAAATCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAACTAAATATTGA
Unaligned ( gi|24 ): CAGGGAATTAATCAAAGGTTACTAAGTTTGTTCTACTCTGGAACTTTATTATGGAATAGCAAACAAGTTAATATCAAAAACTGTACTACAGTCAAAAGCTTTACAACAAATTGTGTTAAATGGTTACAAACAGAATGAACTACTTCGTATGTCATGAAGATAATATTTGGTAATAATTAAACAATTGTTATCACAAGTGCTACAAATAAGC
Unaligned ( gi|25 ): ACACACATATATTATTAACTGTAAATAATTATATTTGTTTTGAAGTTTTTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAACATATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGTTTGCTTAAAATGATATATA
Unaligned ( gi|26 ): TAGTCCAAAGCTTAACAATAAATTATGTTAAATGTTACAAACAGAATAAACTACGCCATATGTCCCGAATATAATATATAGTAATAATTAAACGATTATTATCGCAAGTCACCACCTCAAATGTACACACATGTATTATTAACTGTACATAATACTTGTTTGTTTATTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAATATATGTAGTGATATT
Unaligned ( gi|27 ): GTTGTATTGTTGTTTTGTTATTTGTTGTAACAGATGTAGTAACATTCACTATTTAAACTTTTGTTTTCAATGAGACTTTCAAAGAATTCCTTTAAAAATCTCAAAATTAATATAGTTATCATTTTTCATGTAAAATCCATTTGCTTGTAATCCTTAGAACATTTTGTTCTGTTATTGT
Unaligned ( gi|28 ): TAATACTTATATTTGTTGTATTGTTGTTGTTATTTATTTTGTTGTTGTAACAGATGAAGTGATATTCACTTTCTTGATTATTATTTTTTTTTTAATCAAAGAGACTTTTAAAGGACTGCTTAAAAATCTGAACGTTTAATATTCATG
Unaligned ( gi|29 ): GTTGTTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTACATGTATTTGTATATATATATTTTTTTTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAATCTAAAAAAAATGCTACATATGT
Unaligned ( gi|30 ): TTTATCAATTCAATACCAAGTAAAGTTAAGCAATGCACTTTTCATTGATCAAAAAATGTTTCTCCAAAAAGCAGAATTTATGTAAAAAGTTTCAAAAAGCAATGCACCTTTGTATATAACA
Unaligned ( gi|31 ): CAGTCAAACATTTTACAACATATTGTGTTAAACGGTTACAAACATAATTAGCTACTTTATATGTCCCGAATATTAATGCAAGTGCTACAAATAAGCCAACATCTCCAATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTTACTGTTGAAACAGATGTAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATATATATATGTATA
Unaligned ( gi|35 ): ACACATATAAATATACATACGCAATCTTCCAATGTACACACACATTTTATTAACTGTACATAACTACAC
Unaligned ( gi|36 ): AAAGATAGTCTTTAAAAACTTTCAAAAAACAATGCACCTTCGTATATAACAGATATGTTTTAATACT
Unaligned ( gi|37 ): CACATATAAATATACATACGCAATCTTCCAATGTACACACATACATTATCAACTGTGCATAATTAT
Unaligned ( gi|38 ): TGTTGTTGCTTATGTTGTTGTTTTAACAGATGTAGTGATATGCACTTTTTTGATTAAT
Unaligned ( gi|39 ): TCAAAGAGACTTTCAAAAGATTGCTTAAAAAACCTAAAAAAATTATATTTATGT






Alignments
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tACTTCACCACAACGACGTGCTAG-GCA--TATTGATAA-AAATATATCATTAATGT-GTAATGAGATTTTATTAAAACTTACATCTTGTGATAAGGT-TCTTGGAATG--CATAT----AAATAATAACTTTAAGTGGGATTTACATA-TCATGTTCATATGGAAGAAAATGTCAACCTAA-TTGTGGCTATGATCGAGAacttcaccacaacgacgtgctaggcatattgataaaaatatatcattaatgtgtaatgagattttattaaaacttacatcttgtgataaggttcttggaatgcatataaataataactttaagtgggatttacatatcatgttcatatggaagaaaatgtcaacctaattgtggctatgatcgagaataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttctcagtctttagagaattgtctcaaacacagatatgaatgcaaatgatacaacaatatttgacataaataAT----AAATAATAACCTTTAGC-GGATACACATACTCATGCTTATATGGATGAAAACTTataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taaATTGATAA-AAATATATCATCAACATTATAATGATATTTCGTAAGAACTTGGATATGTTGGTTAGTT-TATTGACATA--CATAT----AGATAATTACCTTAAGTGAAATACACATA-TAATGTTCATAATGAAGAAA--TTCAACTAAC-TCATGGCTAGTGTAAAAACagctatagcgttaataaaaaaataagcacctacattcaattaagttacaaaattaatttctttcttcaacctcattttgatcagtgtacatatcgtaatttttagataatacataaaaggtaagcacagacgctatctgaatattacagaagagggcatgtcgtataatcctggatgaccaatatgtgacataaattactaagtaaatagatcaaattatttttaaaagcaaaatcattgcacaaagtttcacaaaaatcgtctaccttcttataaagcgtatatgtccaatactcaccataacgtacagatctacgttcaacaaataaattaaaactcaacaggaaatcattcaaaggtaatttgtattactcaggaattttagttcgtattactataccag
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATTGAACAAACTAGTATA-TG-ATATG-TATCGCATGACTCTGT--CGGGATCTGT-----TT-TTTTATATTTATAAATGATCTCCCCTCCCTCTCATTCTTGAAGGAATTTTATCAATTACAGGTATGTATACACATGATAAAACAATATTTGATATAAATACGTCAAA-ACTGTTAT--AC-AAAA--ATCT--ACTGACATTGAACTATTTTAAATGAACGGTGTTT-GT-ATAATAGTATGATTATAAACAGATC-ATAACTAAAGTTCTA-TGTGTTACTAAACCACAACGGCGTGCTAG-GCC--TATTGATAAGAAATAaaaacattcctgtaacttacagaatcattttcctaaaagattattctcaaccccccagttagatttttaataacctaattgtaagtactacaaaagataaacataacccgtctcttaatattacaaaaatgagcatgccgtattttctaagttgatcaaaattcaacatatgcagacgctatgaagttaataaatgcactttctattgatcaaagaatcttt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cttaTAATATCCATA-----GATA-ACATA-TCATGTTTATAAGGAAGAAAATTTCAATTTTCGTTGTGGCTATTATCATGAagaaataagattcaaagtgcgtgtgttattatcaagaataaaaacctacattccactaaatt
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CACATCAAAAACTGAAGTTCTA-TTTGTTACTACACCACAATGGTGTGCTAG-GCC--TATTGATAA-AAATATATGATTAACTT-ATAATGAAATTTCATTAGAACTTACATATGATGATACAGT-TCTTGGAATGCACATAT----AAATAATAAACTTAAGTGGGATACACATA-GC---------------AAAATTTCAACTTAC-TTATTGCTATTATCAAGA
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gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aagtaaaaccttccttcttggaactatttaaagacatcctgaatatatagttatttggaaaagtaccattggagatataaatcgtgacctattaaacagtaacattaaaactgaatggtcaagttatattttatcttatggtttatctaacttgttcatgaacacacgagtgtcccaaaattcaagaactctaattgatcatatttatacagattttaaaagaaaatatatctctaaaccatccctaaagtaggtcagagttgtcattttccagtatttTCATCTTTTAATATTTTAAATGGATGGTGTTT-A-AAAAATGGAATGGTTATAAACACACGAAAAACTAAAGTTCTA-TTataaaaacagacattccattaaattacagcattattttctatgaa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACACCACAATGGCGTGCTGGCGTTAATATAGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATGATGATATTACATTAAGACgg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATTTACATCTGGTGATAAGGT-TCTTGGAATG--CATATATATAAATAATAACTTTAAGTGGGATATACATA-TCATGTTCATAAGGAAGAAAATTTCAACCTAG-TTGTGGCTATTATCAAGA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aagTTTCAAAGCGGTGCAACTGATGATCTTAATAATTATCGACCTATATCAATACTACCGATACTG------TCTAAATTGATTGAAAAACA-TTTTAATGAACATTTTATTATATTTTTAATTCACTATAAATT-------ATTATTGTGTGCATTTCAAAGCGGGTTAAGAAATCAACTCAGTTGTGAAACAGTTCTTGTCCATATGATTGATA-A--ATGGTTGGCGGCACTAAATGAAGGAAAGTTAGTGAGTGAAATTATAG-TAGATTTTAGAAAAGCTTTTGATTTAGATGACCAT-atattaacctacattccattaaattacagaattattttctataatgcctatattcaaccctttctacattattgcaatctagttttggttattacaaaaaagtaaaaacataaaccgtctcctaatattgcaaaagagagcatgccatatcatcttgggtagcttagatattcaacatttgcagacactatgaagttaataaatgtactttccattgatcaaagaatatttatcaaaaaagtaaaatttatgtacagagtataaaaaaacatacaccttcgtatataacacataacattcatagaagtcaacaaatgaattaaactttatcacaccaaaacccaacagggaattatatattcaaaggttacaaagtttgtcctactctggaactttaatatggaatagtatactggttaatatcagaatctgtactacagtcaaaaactttacaacaaattgtgttaataggttacaaacggaatgaactacttcataatatttggcaataattaaacaattattattgcaagttctacaaataagtaaccacctccaatgtacacacatatattattaactgtaaataattatacttgttcttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattttgttgttgtaacagatgtagtgatattcactttctttattaatttttaatatacaatgtatatatatatatttttttttattcaaagagactttcaaatgattgcttaaaaaaccttaaa
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttcaaagcggtgcaactgatgatcttaataattatcgacctatatcaatactaccgatactgtctaaattgattgaaaaacattttaatgaacattttattatatttttaattcactataaattattattgtgtgcatttcaaagcgggttaagaaatcaactcagttgtgaaacagttcttgtccatatgattgataaatggttggcggcactaaatgaaggaaagttagtgagtgaaattatagtagattttagaaaagcttttgatttagatgaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAG-GCT--TATTGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATAATGATAGTTCATTAGGACTTACATCTGGTGATAAGTT-TCTTGGAATG--CATAT----AAATAATAACCTTAAGTGGAACACACATA-TCATGT---------------TTGCAACCTAC-TTATGGCTATTATCAAAAaaaaaaacttacattctattaacttacagaagtatttt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GACTGGTTAACTCCAGATATATAAGACACCATAAAAGTCAGGGACAAATATAAAGCCCGGAATGATACTGACACTTATAAAATCCATGTACAGAAATAAAATATGataaaacattatatttctttaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgcagacgctatgaagttaatagatgcactttccattgatcaaataatatttgcaccttcatatataacagatatgtttaatacccatgataacgttcgtataaatctacgttcaacaaatgaattaaaattgatcacaccaaaacccaacagggatttattcaaaggtagtttgtcctactctggaattttaatatcgtataccggttaatatcagaaaatgtactacagtcaaaagttttacttaacattgtgttaaattgttacaaacagaattaactacttcatatatcccgaagataataactgctatgacgtcatcctttgttctcgcagcactgtatatttaataca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATAAAAGTCAGGGACAAATATAAAGCCCGGAAT-GATACTG-ACACTTAT----AA---AATCC-A--------TGTACAGAAA---TA-----------------AA----ATAT------GGTTAA-AAAAATGGTTTTGAAATAACAGAAAGTAAATGATATTGT-AA---------ATCAATTTCT-TT-----GTTAACATAGCAGCAAATTTAAAAGAGC----CAACACCCGATTCAAGTTTCGATAA---AATTAAAACG--TT-TGTTGACCCCAAAGTCAC-GAAAATAATGTTTTTCAACATACCTCTCATTACAGAGAATAAAA-AAA------GCTTTTTAATTTAGAAACATCAAAAGCCACAGGT----------TCGGACCAAAACTGTT-AAAATGTCTACTAATGTAATATCCAGTAG-ATACCACGTGTTTTAAATAGTAGTATAAGAAATG----TTTTCCC---CCGACATCTGGAAATATGCTAAAGTAAGTCCTTTATTTAAAAGCGGGACAACTGGTGATATAAAgttaaaaaaatggttttgaaataacagaaagtaaatgatattgtaaatcaatttctttgttaacatagcagcaaatttaaaagagccaacacccgattcaagtttcgataaaattaaaacgtttgttgaccccaaagtcacgaaaataatgtttttcaacatacctctcattacagagaataaaaaaagctttttaatttagaaacatcaaaagccacaggttcggaccaaaactgttaaaatgtctactaatgtaatatccagtagataccacgtgttttaaatagtagtataagaaatgttttcccccgacatctggaaatatgctaaagtaagtcctttatttaaaagcgggacaactggtgatataaatgcggattaatcgtctgaaactttgtgttcaataccatggagagcacttcgagataatgtaataaagttaaatttatttatttatttatttgtttccgtcaattt
24 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): GATCAAATATATACTCAATCGTATATCAAAAAGCAAATTGTATGTACAGATTTTCAAAAAACAATGCACTTTCGTATATAACAGATATGTTTTATACACATGCTAACGTTCGTAGAAATCTACGTTCAACAAATGAGTTAAACATTATCAAACCAAAATCCAACAGGGAATTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTCTGGAACTTTAATCTGGAATAGATCAGAAACTGTACTACAGTCAAAAGTATTACAACAAATTGTATTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTCATATGTCCCGAATATAATATTTAGTAATAATTTAACAATTATTATCGCAAGTGCTAAAAATAAACCACCACCTCCAATGTACACACATATATTGTTAACTGTACATAATAATTATTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCAGATGTAATGATATTCACTTTCTTAATTAATTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTTAATCAAAGAGACTTTCAATGGACTGATAAAAAACTTTAAAAAAATGACATTT
Unaligned ( gi|9 ): ATATTGCATAATAGAGCATGCCGTTTTATCTTAGGTGATCAATATTCAATATTTGCAGACGAAATTGATGAATGGACTTTTCATTGATCAAAGAATACTCTCAATATAGCTTAATGTATGTACAAAGTTTAAAAAACAATGCACATTCGTATATAACTGATATGATTAATACTCATGACAACATTCGTAGAAATCTACGTTCAATAAATATATTAAACTGCATTACTACAAAACTCAACAGTGAAGTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTTTGGAACTTTAATCTTGAATAGTTTACCGGTCAATATCAGAATCTGTACTACAGACAAATAATGAATCAAATTGTGTTAAATAGTTACAAACAGAATAAGCTACTTCATATTTTTTTAAATTTAATAATAAGTAATAATTAAAGATTTATTACCACAATTAATACAAATAAGCCACCACCTTCAATATACACACATATATTATTACCTGTACATAATTATACCTGTTGTATTGTTGTTGTTATTTTGTTGCTATAACAGTTACAATGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATATA
Unaligned ( gi|12 ): ACGTTCAACAAATGAATTAAATTGTATCACTCCTAAACCCATAAGGGAATCATTCAAAAGACATTTTTCCAACTGTGAAACTTAAGTCTGGAATAGTACACAATTAATATCGGAAACTCTATTGCTTTAAAACGTCTAGGCAACAAATTGTGTTAAATCGCTACAAACAGAATGGACTACATCATATGTGGAGAAAAAATATTATTTAGTAATGATAGACTCACTTATCGCAAGTGCTACCAATTATCCAACACATCTAATGTACGCATGTATTAATAGATGTACATTATTATAATGTTTGTGTTGTTGTAGTGTTATTTGTTGCTGTAACAGATGTAATGATATCTATTATTTTTTGTTATCGGTGGGACTTTCAAAGAATGCTTAAAAAATCTCAAAATTGATAGAGTTAATATCATTTTTCGTCTACAATCAATTTGCTTG
Unaligned ( gi|13 ): AACATTATACTTTTGTGAGAAACTGTACTCCAGTCAAACGTTTTACAACAAATTGTGTTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTTATATGTCCCGAACACAATATTTAGTAATAATTAAACAAATATTATAGCACATATAAGCCACCACCTCCAATGTACACACATATATTATTAGCTGTACATAATTATACTTGTTATATTGTTGCTGTTGTTTATAGTGTTCTTGTAACAGATGTAGTGAGTTTCTCTTTCTTGATTAATTTTTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGTTTCTTAAAAAAAAGATGATATACATATTCATTCTTATTATTGTTCACCATTGTTTTGTTAACAAATTGTATATATATATATATATATATATAACACATTCCATAGAATA
Unaligned ( gi|16 ): AGAAACTTTACTACAGTCAAAATTTTACAACAAATTGATTAAAATGGTAACAAATAGAATGAACTACTTCATATGTCCTGAATATAATAGTAGTAATAATTAAACAATTATTATCGCAGTTGCTACAAATAAACCACCACCTCCAATGTACATACATATATCATTAACTGTATATAATTATACTTGTTGTATTGTTGTTGTAACACATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTATGTTTATATTATATATATTTTTAAATCAAAGGGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAATCTAAATAATTGATTTACGTGTA
Unaligned ( gi|18 ): CTACAATCAAAAGCTTTACATCAAATTGTGTTAAATGGTTACAAACTGAATGAATTGCTTCGTATGTCCTGAAGATAATATTTGGTAATAATTAAACAATTATTTTCGCAAATGCTATAAATAAGCCACCACCTCCAATATACACACATGTTTTATTAACTGTAAAGAATTATACTTGTTTTTTTTGTTATTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATACATATTTTTTTTTAATCAAATAGACTTTCAAAGGATTACTTAAAAAAATAAAAAAATATATAT
Unaligned ( gi|19 ): GTACACACATACTTATACTTGTTGATATTGTTGGTGTTATTATTGTTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTATATATACATTTTTTTAATCAAAGAGACTGTCAAAAAAATCTAAAATATTGATATACATGTAGTTATCATTTATCATGTACATGTACAATCATTTTGCTTGCAATGCTTAAACTGTTGTTTTTTTGTTTTGCATTGGTATTTTGTGAATAACCTATAAATGTATCTTTAGATTTCTGAAAAG
Unaligned ( gi|20 ): TACTTCATATGTCTCGAATATAATATTTGGTTAAAATGCAAAAAAATACAAATAAGCAACCAACTCCATTGAACACACATATAGTATTACCTGTTCACAATTATACTTGTATTGTTGTTGTTGTTTTTTTAGTTGTTGTAACAGATATAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATTATATATACATAGCAGTATACTTTTTTATTCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAAAA
Unaligned ( gi|22 ): ATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATATATATAATTTTTAATCACAGAGACTTTCAAAGGAACACTTTAAACAATCTAAAAAATGGATATACATGTAGTTATCATGTACAATCATTTTGCTTGCAATGCTTAAAATGTTTTTATTTTATTTTGCTATTGTATTTTGTAAATAACTTGTAAATGTATCATTAGAGGGTCCCAAGGAAGA
Unaligned ( gi|23 ): TACAAATAAGCCACCACCTCCAATGCACACACATATATTATTAACTGTAAATAATTATACCTTTTTTTTTATTGTTGTTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAACAGATGTAGAGATTTTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATATATATATATTTGTATCTTTATATATAAATCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAACTAAATATTGA
Unaligned ( gi|24 ): CAGGGAATTAATCAAAGGTTACTAAGTTTGTTCTACTCTGGAACTTTATTATGGAATAGCAAACAAGTTAATATCAAAAACTGTACTACAGTCAAAAGCTTTACAACAAATTGTGTTAAATGGTTACAAACAGAATGAACTACTTCGTATGTCATGAAGATAATATTTGGTAATAATTAAACAATTGTTATCACAAGTGCTACAAATAAGC
Unaligned ( gi|25 ): ACACACATATATTATTAACTGTAAATAATTATATTTGTTTTGAAGTTTTTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAACATATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGTTTGCTTAAAATGATATATA
Unaligned ( gi|26 ): TAGTCCAAAGCTTAACAATAAATTATGTTAAATGTTACAAACAGAATAAACTACGCCATATGTCCCGAATATAATATATAGTAATAATTAAACGATTATTATCGCAAGTCACCACCTCAAATGTACACACATGTATTATTAACTGTACATAATACTTGTTTGTTTATTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAATATATGTAGTGATATT
Unaligned ( gi|27 ): GTTGTATTGTTGTTTTGTTATTTGTTGTAACAGATGTAGTAACATTCACTATTTAAACTTTTGTTTTCAATGAGACTTTCAAAGAATTCCTTTAAAAATCTCAAAATTAATATAGTTATCATTTTTCATGTAAAATCCATTTGCTTGTAATCCTTAGAACATTTTGTTCTGTTATTGT
Unaligned ( gi|28 ): TAATACTTATATTTGTTGTATTGTTGTTGTTATTTATTTTGTTGTTGTAACAGATGAAGTGATATTCACTTTCTTGATTATTATTTTTTTTTTAATCAAAGAGACTTTTAAAGGACTGCTTAAAAATCTGAACGTTTAATATTCATG
Unaligned ( gi|29 ): GTTGTTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTACATGTATTTGTATATATATATTTTTTTTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAATCTAAAAAAAATGCTACATATGT
Unaligned ( gi|30 ): TTTATCAATTCAATACCAAGTAAAGTTAAGCAATGCACTTTTCATTGATCAAAAAATGTTTCTCCAAAAAGCAGAATTTATGTAAAAAGTTTCAAAAAGCAATGCACCTTTGTATATAACA
Unaligned ( gi|31 ): CAGTCAAACATTTTACAACATATTGTGTTAAACGGTTACAAACATAATTAGCTACTTTATATGTCCCGAATATTAATGCAAGTGCTACAAATAAGCCAACATCTCCAATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTTACTGTTGAAACAGATGTAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATATATATATGTATA
Unaligned ( gi|35 ): ACACATATAAATATACATACGCAATCTTCCAATGTACACACACATTTTATTAACTGTACATAACTACAC
Unaligned ( gi|36 ): AAAGATAGTCTTTAAAAACTTTCAAAAAACAATGCACCTTCGTATATAACAGATATGTTTTAATACT
Unaligned ( gi|37 ): CACATATAAATATACATACGCAATCTTCCAATGTACACACATACATTATCAACTGTGCATAATTAT
Unaligned ( gi|38 ): TGTTGTTGCTTATGTTGTTGTTTTAACAGATGTAGTGATATGCACTTTTTTGATTAAT
Unaligned ( gi|39 ): TCAAAGAGACTTTCAAAAGATTGCTTAAAAAACCTAAAAAAATTATATTTATGT






Alignments
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tACTTCACCACAACGACGTGCTAG-GCA--TATTGATAA-AAATATATCATTAATGT-GTAATGAGATTTTATTAAAACTTACATCTTGTGATAAGGT-TCTTGGAATG--CATAT----AAATAATAACTTTAAGTGGGATTTACATA-TCATGTTCATATGGAAGAAAATGTCAACCTAA-TTGTGGCTATGATCGAGAacttcaccacaacgacgtgctaggcatattgataaaaatatatcattaatgtgtaatgagattttattaaaacttacatcttgtgataaggttcttggaatgcatataaataataactttaagtgggatttacatatcatgttcatatggaagaaaatgtcaacctaattgtggctatgatcgagaataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttctcagtctttagagaattgtctcaaacacagatatgaatgcaaatgatacaacaatatttgacataaataAT----AAATAATAACCTTTAGC-GGATACACATACTCATGCTTATATGGATGAAAACTTataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taaATTGATAA-AAATATATCATCAACATTATAATGATATTTCGTAAGAACTTGGATATGTTGGTTAGTT-TATTGACATA--CATAT----AGATAATTACCTTAAGTGAAATACACATA-TAATGTTCATAATGAAGAAA--TTCAACTAAC-TCATGGCTAGTGTAAAAACagctatagcgttaataaaaaaataagcacctacattcaattaagttacaaaattaatttctttcttcaacctcattttgatcagtgtacatatcgtaatttttagataatacataaaaggtaagcacagacgctatctgaatattacagaagagggcatgtcgtataatcctggatgaccaatatgtgacataaattactaagtaaatagatcaaattatttttaaaagcaaaatcattgcacaaagtttcacaaaaatcgtctaccttcttataaagcgtatatgtccaatactcaccataacgtacagatctacgttcaacaaataaattaaaactcaacaggaaatcattcaaaggtaatttgtattactcaggaattttagttcgtattactataccag
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATTGAACAAACTAGTATA-TG-ATATG-TATCGCATGACTCTGT--CGGGATCTGT-----TT-TTTTATATTTATAAATGATCTCCCCTCCCTCTCATTCTTGAAGGAATTTTATCAATTACAGGTATGTATACACATGATAAAACAATATTTGATATAAATACGTCAAA-ACTGTTAT--AC-AAAA--ATCT--ACTGACATTGAACTATTTTAAATGAACGGTGTTT-GT-ATAATAGTATGATTATAAACAGATC-ATAACTAAAGTTCTA-TGTGTTACTAAACCACAACGGCGTGCTAG-GCC--TATTGATAAGAAATAaaaacattcctgtaacttacagaatcattttcctaaaagattattctcaaccccccagttagatttttaataacctaattgtaagtactacaaaagataaacataacccgtctcttaatattacaaaaatgagcatgccgtattttctaagttgatcaaaattcaacatatgcagacgctatgaagttaataaatgcactttctattgatcaaagaatcttt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cttaTAATATCCATA-----GATA-ACATA-TCATGTTTATAAGGAAGAAAATTTCAATTTTCGTTGTGGCTATTATCATGAagaaataagattcaaagtgcgtgtgttattatcaagaataaaaacctacattccactaaatt
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CACATCAAAAACTGAAGTTCTA-TTTGTTACTACACCACAATGGTGTGCTAG-GCC--TATTGATAA-AAATATATGATTAACTT-ATAATGAAATTTCATTAGAACTTACATATGATGATACAGT-TCTTGGAATGCACATAT----AAATAATAAACTTAAGTGGGATACACATA-GC---------------AAAATTTCAACTTAC-TTATTGCTATTATCAAGA
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gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aagtaaaaccttccttcttggaactatttaaagacatcctgaatatatagttatttggaaaagtaccattggagatataaatcgtgacctattaaacagtaacattaaaactgaatggtcaagttatattttatcttatggtttatctaacttgttcatgaacacacgagtgtcccaaaattcaagaactctaattgatcatatttatacagattttaaaagaaaatatatctctaaaccatccctaaagtaggtcagagttgtcattttccagtatttTCATCTTTTAATATTTTAAATGGATGGTGTTT-A-AAAAATGGAATGGTTATAAACACACGAAAAACTAAAGTTCTA-TTataaaaacagacattccattaaattacagcattattttctatgaa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACCACAATGGCGTGCTGGCGTTAATATAGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATGATGATATTACATTAAGACgg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTTACATCTGGTGATAAGGT-TCTTGGAATG--CATATATATAAATAATAACTTTAAGTGGGATATACATA-TCATGTTCATAAGGAAGAAAATTTCAACCTAG-TTGTGGCTATTATCAAGA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aagTTTCAAAGCGGTGCAACTGATGATCTTAATAATTATCGACCTATATCAATACTACCGATACTG------TCTAAATTGATTGAAAAACA-TTTTAATGAACATTTTATTATATTTTTAATTCACTATAAATT-------ATTATTGTGTGCATTTCAAAGCGGGTTAAGAAATCAACTCAGTTGTGAAACAGTTCTTGTCCATATGATTGATA-A--ATGGTTGGCGGCACTAAATGAAGGAAAGTTAGTGAGTGAAATTATAG-TAGATTTTAGAAAAGCTTTTGATTTAGATGACCAT-atattaacctacattccattaaattacagaattattttctataatgcctatattcaaccctttctacattattgcaatctagttttggttattacaaaaaagtaaaaacataaaccgtctcctaatattgcaaaagagagcatgccatatcatcttgggtagcttagatattcaacatttgcagacactatgaagttaataaatgtactttccattgatcaaagaatatttatcaaaaaagtaaaatttatgtacagagtataaaaaaacatacaccttcgtatataacacataacattcatagaagtcaacaaatgaattaaactttatcacaccaaaacccaacagggaattatatattcaaaggttacaaagtttgtcctactctggaactttaatatggaatagtatactggttaatatcagaatctgtactacagtcaaaaactttacaacaaattgtgttaataggttacaaacggaatgaactacttcataatatttggcaataattaaacaattattattgcaagttctacaaataagtaaccacctccaatgtacacacatatattattaactgtaaataattatacttgttcttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattttgttgttgtaacagatgtagtgatattcactttctttattaatttttaatatacaatgtatatatatatatttttttttattcaaagagactttcaaatgattgcttaaaaaaccttaaa
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tttcaaagcggtgcaactgatgatcttaataattatcgacctatatcaatactaccgatactgtctaaattgattgaaaaacattttaatgaacattttattatatttttaattcactataaattattattgtgtgcatttcaaagcgggttaagaaatcaactcagttgtgaaacagttcttgtccatatgattgataaatggttggcggcactaaatgaaggaaagttagtgagtgaaattatagtagattttagaaaagcttttgatttagatgaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAG-GCT--TATTGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATAATGATAGTTCATTAGGACTTACATCTGGTGATAAGTT-TCTTGGAATG--CATAT----AAATAATAACCTTAAGTGGAACACACATA-TCATGT---------------TTGCAACCTAC-TTATGGCTATTATCAAAAaaaaaaacttacattctattaacttacagaagtatttt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GACTGGTTAACTCCAGATATATAAGACACCATAAAAGTCAGGGACAAATATAAAGCCCGGAATGATACTGACACTTATAAAATCCATGTACAGAAATAAAATATGataaaacattatatttctttaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgcagacgctatgaagttaatagatgcactttccattgatcaaataatatttgcaccttcatatataacagatatgtttaatacccatgataacgttcgtataaatctacgttcaacaaatgaattaaaattgatcacaccaaaacccaacagggatttattcaaaggtagtttgtcctactctggaattttaatatcgtataccggttaatatcagaaaatgtactacagtcaaaagttttacttaacattgtgttaaattgttacaaacagaattaactacttcatatatcccgaagataataactgctatgacgtcatcctttgttctcgcagcactgtatatttaataca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATAAAAGTCAGGGACAAATATAAAGCCCGGAAT-GATACTG-ACACTTAT----AA---AATCC-A--------TGTACAGAAA---TA-----------------AA----ATAT------GGTTAA-AAAAATGGTTTTGAAATAACAGAAAGTAAATGATATTGT-AA--------ATCAATTTCT-TT-----GTTAACATAGCAGCAAATTTAAAAGAGC----CAACACCCGATTCAAGTTTCGATAA---AATTAAAACG--TT-TGTTGACCCCAAAGTCAC-GAAAATAATGTTTT-TCAACATACCTCTCATTACAGAGAATAAAA-AAA------GCTTTTTAATTTAGAAACATCAAAAGCCACAGGT----------TCGGACCAAAACTGTT-AAAATGTCTACTAATGTAATATCCAGTAG-ATACCACGTGTTTTAAATAGTAGTATAAGAAATG----TTTTCCC---CCGACATCTGGAAATATGCTAAAGTAAGTCCTTTATTTAAAAGCGGGACAACTGGTGATATAAAgttaaaaaaatggttttgaaataacagaaagtaaatgatattgtaaatcaatttctttgttaacatagcagcaaatttaaaagagccaacacccgattcaagtttcgataaaattaaaacgtttgttgaccccaaagtcacgaaaataatgtttttcaacatacctctcattacagagaataaaaaaagctttttaatttagaaacatcaaaagccacaggttcggaccaaaactgttaaaatgtctactaatgtaatatccagtagataccacgtgttttaaatagtagtataagaaatgttttcccccgacatctggaaatatgctaaagtaagtcctttatttaaaagcgggacaactggtgatataaatgcggattaatcgtctgaaactttgtgttcaataccatggagagcacttcgagataatgtaataaagttaaatttatttatttatttatttgtttccgtcaattt
24 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): GATCAAATATATACTCAATCGTATATCAAAAAGCAAATTGTATGTACAGATTTTCAAAAAACAATGCACTTTCGTATATAACAGATATGTTTTATACACATGCTAACGTTCGTAGAAATCTACGTTCAACAAATGAGTTAAACATTATCAAACCAAAATCCAACAGGGAATTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTCTGGAACTTTAATCTGGAATAGATCAGAAACTGTACTACAGTCAAAAGTATTACAACAAATTGTATTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTCATATGTCCCGAATATAATATTTAGTAATAATTTAACAATTATTATCGCAAGTGCTAAAAATAAACCACCACCTCCAATGTACACACATATATTGTTAACTGTACATAATAATTATTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCAGATGTAATGATATTCACTTTCTTAATTAATTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTTAATCAAAGAGACTTTCAATGGACTGATAAAAAACTTTAAAAAAATGACATTT
Unaligned ( gi|9 ): ATATTGCATAATAGAGCATGCCGTTTTATCTTAGGTGATCAATATTCAATATTTGCAGACGAAATTGATGAATGGACTTTTCATTGATCAAAGAATACTCTCAATATAGCTTAATGTATGTACAAAGTTTAAAAAACAATGCACATTCGTATATAACTGATATGATTAATACTCATGACAACATTCGTAGAAATCTACGTTCAATAAATATATTAAACTGCATTACTACAAAACTCAACAGTGAAGTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTTTGGAACTTTAATCTTGAATAGTTTACCGGTCAATATCAGAATCTGTACTACAGACAAATAATGAATCAAATTGTGTTAAATAGTTACAAACAGAATAAGCTACTTCATATTTTTTTAAATTTAATAATAAGTAATAATTAAAGATTTATTACCACAATTAATACAAATAAGCCACCACCTTCAATATACACACATATATTATTACCTGTACATAATTATACCTGTTGTATTGTTGTTGTTATTTTGTTGCTATAACAGTTACAATGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATATA
Unaligned ( gi|12 ): ACGTTCAACAAATGAATTAAATTGTATCACTCCTAAACCCATAAGGGAATCATTCAAAAGACATTTTTCCAACTGTGAAACTTAAGTCTGGAATAGTACACAATTAATATCGGAAACTCTATTGCTTTAAAACGTCTAGGCAACAAATTGTGTTAAATCGCTACAAACAGAATGGACTACATCATATGTGGAGAAAAAATATTATTTAGTAATGATAGACTCACTTATCGCAAGTGCTACCAATTATCCAACACATCTAATGTACGCATGTATTAATAGATGTACATTATTATAATGTTTGTGTTGTTGTAGTGTTATTTGTTGCTGTAACAGATGTAATGATATCTATTATTTTTTGTTATCGGTGGGACTTTCAAAGAATGCTTAAAAAATCTCAAAATTGATAGAGTTAATATCATTTTTCGTCTACAATCAATTTGCTTG
Unaligned ( gi|13 ): AACATTATACTTTTGTGAGAAACTGTACTCCAGTCAAACGTTTTACAACAAATTGTGTTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTTATATGTCCCGAACACAATATTTAGTAATAATTAAACAAATATTATAGCACATATAAGCCACCACCTCCAATGTACACACATATATTATTAGCTGTACATAATTATACTTGTTATATTGTTGCTGTTGTTTATAGTGTTCTTGTAACAGATGTAGTGAGTTTCTCTTTCTTGATTAATTTTTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGTTTCTTAAAAAAAAGATGATATACATATTCATTCTTATTATTGTTCACCATTGTTTTGTTAACAAATTGTATATATATATATATATATATATAACACATTCCATAGAATA
Unaligned ( gi|16 ): AGAAACTTTACTACAGTCAAAATTTTACAACAAATTGATTAAAATGGTAACAAATAGAATGAACTACTTCATATGTCCTGAATATAATAGTAGTAATAATTAAACAATTATTATCGCAGTTGCTACAAATAAACCACCACCTCCAATGTACATACATATATCATTAACTGTATATAATTATACTTGTTGTATTGTTGTTGTAACACATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTATGTTTATATTATATATATTTTTAAATCAAAGGGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAATCTAAATAATTGATTTACGTGTA
Unaligned ( gi|18 ): CTACAATCAAAAGCTTTACATCAAATTGTGTTAAATGGTTACAAACTGAATGAATTGCTTCGTATGTCCTGAAGATAATATTTGGTAATAATTAAACAATTATTTTCGCAAATGCTATAAATAAGCCACCACCTCCAATATACACACATGTTTTATTAACTGTAAAGAATTATACTTGTTTTTTTTGTTATTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATACATATTTTTTTTTAATCAAATAGACTTTCAAAGGATTACTTAAAAAAATAAAAAAATATATAT
Unaligned ( gi|19 ): GTACACACATACTTATACTTGTTGATATTGTTGGTGTTATTATTGTTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTATATATACATTTTTTTAATCAAAGAGACTGTCAAAAAAATCTAAAATATTGATATACATGTAGTTATCATTTATCATGTACATGTACAATCATTTTGCTTGCAATGCTTAAACTGTTGTTTTTTTGTTTTGCATTGGTATTTTGTGAATAACCTATAAATGTATCTTTAGATTTCTGAAAAG
Unaligned ( gi|20 ): TACTTCATATGTCTCGAATATAATATTTGGTTAAAATGCAAAAAAATACAAATAAGCAACCAACTCCATTGAACACACATATAGTATTACCTGTTCACAATTATACTTGTATTGTTGTTGTTGTTTTTTTAGTTGTTGTAACAGATATAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATTATATATACATAGCAGTATACTTTTTTATTCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAAAA
Unaligned ( gi|22 ): ATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATATATATAATTTTTAATCACAGAGACTTTCAAAGGAACACTTTAAACAATCTAAAAAATGGATATACATGTAGTTATCATGTACAATCATTTTGCTTGCAATGCTTAAAATGTTTTTATTTTATTTTGCTATTGTATTTTGTAAATAACTTGTAAATGTATCATTAGAGGGTCCCAAGGAAGA
Unaligned ( gi|23 ): TACAAATAAGCCACCACCTCCAATGCACACACATATATTATTAACTGTAAATAATTATACCTTTTTTTTTATTGTTGTTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAACAGATGTAGAGATTTTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATATATATATATTTGTATCTTTATATATAAATCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAACTAAATATTGA
Unaligned ( gi|24 ): CAGGGAATTAATCAAAGGTTACTAAGTTTGTTCTACTCTGGAACTTTATTATGGAATAGCAAACAAGTTAATATCAAAAACTGTACTACAGTCAAAAGCTTTACAACAAATTGTGTTAAATGGTTACAAACAGAATGAACTACTTCGTATGTCATGAAGATAATATTTGGTAATAATTAAACAATTGTTATCACAAGTGCTACAAATAAGC
Unaligned ( gi|25 ): ACACACATATATTATTAACTGTAAATAATTATATTTGTTTTGAAGTTTTTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAACATATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGTTTGCTTAAAATGATATATA
Unaligned ( gi|26 ): TAGTCCAAAGCTTAACAATAAATTATGTTAAATGTTACAAACAGAATAAACTACGCCATATGTCCCGAATATAATATATAGTAATAATTAAACGATTATTATCGCAAGTCACCACCTCAAATGTACACACATGTATTATTAACTGTACATAATACTTGTTTGTTTATTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAATATATGTAGTGATATT
Unaligned ( gi|27 ): GTTGTATTGTTGTTTTGTTATTTGTTGTAACAGATGTAGTAACATTCACTATTTAAACTTTTGTTTTCAATGAGACTTTCAAAGAATTCCTTTAAAAATCTCAAAATTAATATAGTTATCATTTTTCATGTAAAATCCATTTGCTTGTAATCCTTAGAACATTTTGTTCTGTTATTGT
Unaligned ( gi|28 ): TAATACTTATATTTGTTGTATTGTTGTTGTTATTTATTTTGTTGTTGTAACAGATGAAGTGATATTCACTTTCTTGATTATTATTTTTTTTTTAATCAAAGAGACTTTTAAAGGACTGCTTAAAAATCTGAACGTTTAATATTCATG
Unaligned ( gi|29 ): GTTGTTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTACATGTATTTGTATATATATATTTTTTTTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAATCTAAAAAAAATGCTACATATGT
Unaligned ( gi|30 ): TTTATCAATTCAATACCAAGTAAAGTTAAGCAATGCACTTTTCATTGATCAAAAAATGTTTCTCCAAAAAGCAGAATTTATGTAAAAAGTTTCAAAAAGCAATGCACCTTTGTATATAACA
Unaligned ( gi|31 ): CAGTCAAACATTTTACAACATATTGTGTTAAACGGTTACAAACATAATTAGCTACTTTATATGTCCCGAATATTAATGCAAGTGCTACAAATAAGCCAACATCTCCAATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTTACTGTTGAAACAGATGTAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATATATATATGTATA
Unaligned ( gi|35 ): ACACATATAAATATACATACGCAATCTTCCAATGTACACACACATTTTATTAACTGTACATAACTACAC
Unaligned ( gi|36 ): AAAGATAGTCTTTAAAAACTTTCAAAAAACAATGCACCTTCGTATATAACAGATATGTTTTAATACT
Unaligned ( gi|37 ): CACATATAAATATACATACGCAATCTTCCAATGTACACACATACATTATCAACTGTGCATAATTAT
Unaligned ( gi|38 ): TGTTGTTGCTTATGTTGTTGTTTTAACAGATGTAGTGATATGCACTTTTTTGATTAAT
Unaligned ( gi|39 ): TCAAAGAGACTTTCAAAAGATTGCTTAAAAAACCTAAAAAAATTATATTTATGT






Alignments
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tACTTCACCACAACGACGTGCTAG-GCA--TATTGATAA-AAATATATCATTAATGT-GTAATGAGATTTTATTAAAACTTACATCTTGTGATAAGGT-TCTTGGAATG--CATAT----AAATAATAACTTTAAGTGGGATTTACATA-TCATGTTCATATGGAAGAAAATGTCAACCTAA-TTGTGGCTATGATCGAGAacttcaccacaacgacgtgctaggcatattgataaaaatatatcattaatgtgtaatgagattttattaaaacttacatcttgtgataaggttcttggaatgcatataaataataactttaagtgggatttacatatcatgttcatatggaagaaaatgtcaacctaattgtggctatgatcgagaataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttctcagtctttagagaattgtctcaaacacagatatgaatgcaaatgatacaacaatatttgacataaataAT----AAATAATAACCTTTAGC-GGATACACATACTCATGCTTATATGGATGAAAACTTataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taaATTGATAA-AAATATATCATCAACATTATAATGATATTTCGTAAGAACTTGGATATGTTGGTTAGTT-TATTGACATA--CATAT----AGATAATTACCTTAAGTGAAATACACATA-TAATGTTCATAATGAAGAAA--TTCAACTAAC-TCATGGCTAGTGTAAAAACagctatagcgttaataaaaaaataagcacctacattcaattaagttacaaaattaatttctttcttcaacctcattttgatcagtgtacatatcgtaatttttagataatacataaaaggtaagcacagacgctatctgaatattacagaagagggcatgtcgtataatcctggatgaccaatatgtgacataaattactaagtaaatagatcaaattatttttaaaagcaaaatcattgcacaaagtttcacaaaaatcgtctaccttcttataaagcgtatatgtccaatactcaccataacgtacagatctacgttcaacaaataaattaaaactcaacaggaaatcattcaaaggtaatttgtattactcaggaattttagttcgtattactataccag
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATTGAACAAACTAGTATA-TG-ATATG-TATCGCATGACTCTGT--CGGGATCTGT-----TT-TTTTATATTTATAAATGATCTCCCCTCCCTCTCATTCTTGAAGGAATTTTATCAATTACAGGTATGTATACACATGATAAAACAATATTTGATATAAATACGTCAAA-ACTGTTAT--AC-AAAA--ATCT--ACTGACATTGAACTATTTTAAATGAACGGTGTTT-GT-ATAATAGTATGATTATAAACAGATC-ATAACTAAAGTTCTA-TGTGTTACTAAACCACAACGGCGTGCTAG-GCC--TATTGATAAGAAATAaaaacattcctgtaacttacagaatcattttcctaaaagattattctcaaccccccagttagatttttaataacctaattgtaagtactacaaaagataaacataacccgtctcttaatattacaaaaatgagcatgccgtattttctaagttgatcaaaattcaacatatgcagacgctatgaagttaataaatgcactttctattgatcaaagaatcttt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cttaTAATATCCATA-----GATA-ACATA-TCATGTTTATAAGGAAGAAAATTTCAATTTTCGTTGTGGCTATTATCATGAagaaataagattcaaagtgcgtgtgttattatcaagaataaaaacctacattccactaaatt
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CACATCAAAAACTGAAGTTCTA-TTTGTTACTACACCACAATGGTGTGCTAG-GCC--TATTGATAA-AAATATATGATTAACTT-ATAATGAAATTTCATTAGAACTTACATATGATGATACAGT-TCTTGGAATGCACATAT----AAATAATAAACTTAAGTGGGATACACATA-GC---------------AAAATTTCAACTTAC-TTATTGCTATTATCAAGA
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gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aagtaaaaccttccttcttggaactatttaaagacatcctgaatatatagttatttggaaaagtaccattggagatataaatcgtgacctattaaacagtaacattaaaactgaatggtcaagttatattttatcttatggtttatctaacttgttcatgaacacacgagtgtcccaaaattcaagaactctaattgatcatatttatacagattttaaaagaaaatatatctctaaaccatccctaaagtaggtcagagttgtcattttccagtatttTCATCTTTTAATATTTTAAATGGATGGTGTTT-A-AAAAATGGAATGGTTATAAACACACGAAAAACTAAAGTTCTA-TTataaaaacagacattccattaaattacagcattattttctatgaa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACCACAATGGCGTGCTGGCGTTAATATAGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATGATGATATTACATTAAGACgg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTTACATCTGGTGATAAGGT-TCTTGGAATG--CATATATATAAATAATAACTTTAAGTGGGATATACATA-TCATGTTCATAAGGAAGAAAATTTCAACCTAG-TTGTGGCTATTATCAAGA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aagTTTCAAAGCGGTGCAACTGATGATCTTAATAATTATCGACCTATATCAATACTACCGATACTG------TCTAAATTGATTGAAAAACA-TTTTAATGAACATTTTATTATATTTTTAATTCACTATAAATT-------ATTATTGTGTGCATTTCAAAGCGGGTTAAGAAATCAACTCAGTTGTGAAACAGTTCTTGTCCATATGATTGATA-A--ATGGTTGGCGGCACTAAATGAAGGAAAGTTAGTGAGTGAAATTATAG-TAGATTTTAGAAAAGCTTTTGATTTAGATGACCAT-atattaacctacattccattaaattacagaattattttctataatgcctatattcaaccctttctacattattgcaatctagttttggttattacaaaaaagtaaaaacataaaccgtctcctaatattgcaaaagagagcatgccatatcatcttgggtagcttagatattcaacatttgcagacactatgaagttaataaatgtactttccattgatcaaagaatatttatcaaaaaagtaaaatttatgtacagagtataaaaaaacatacaccttcgtatataacacataacattcatagaagtcaacaaatgaattaaactttatcacaccaaaacccaacagggaattatatattcaaaggttacaaagtttgtcctactctggaactttaatatggaatagtatactggttaatatcagaatctgtactacagtcaaaaactttacaacaaattgtgttaataggttacaaacggaatgaactacttcataatatttggcaataattaaacaattattattgcaagttctacaaataagtaaccacctccaatgtacacacatatattattaactgtaaataattatacttgttcttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattttgttgttgtaacagatgtagtgatattcactttctttattaatttttaatatacaatgtatatatatatatttttttttattcaaagagactttcaaatgattgcttaaaaaaccttaaa
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tttcaaagcggtgcaactgatgatcttaataattatcgacctatatcaatactaccgatactgtctaaattgattgaaaaacattttaatgaacattttattatatttttaattcactataaattattattgtgtgcatttcaaagcgggttaagaaatcaactcagttgtgaaacagttcttgtccatatgattgataaatggttggcggcactaaatgaaggaaagttagtgagtgaaattatagtagattttagaaaagcttttgatttagatgaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAG-GCT--TATTGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATAATGATAGTTCATTAGGACTTACATCTGGTGATAAGTT-TCTTGGAATG--CATAT----AAATAATAACCTTAAGTGGAACACACATA-TCATGT---------------TTGCAACCTAC-TTATGGCTATTATCAAAAaaaaaaacttacattctattaacttacagaagtatttt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GACTGGTTAACTCCAGATATATAAGACACCATAAAAGTCAGGGACAAATATAAAGCCCGGAATGATACTGACACTTATAAAATCCATGTACAGAAATAAAATATGataaaacattatatttctttaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgcagacgctatgaagttaatagatgcactttccattgatcaaataatatttgcaccttcatatataacagatatgtttaatacccatgataacgttcgtataaatctacgttcaacaaatgaattaaaattgatcacaccaaaacccaacagggatttattcaaaggtagtttgtcctactctggaattttaatatcgtataccggttaatatcagaaaatgtactacagtcaaaagttttacttaacattgtgttaaattgttacaaacagaattaactacttcatatatcccgaagataataactgctatgacgtcatcctttgttctcgcagcactgtatatttaataca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATAAAAGTCAGGGACAAATATAAAGCCCGGAAT-GATACTG-ACACTTAT----AA---AATCC-A--------TGTACAGAAA---TA-----------------AA----ATAT------GGTTAA-AAAAATGGTTTTGAAATAACAGAAAGTAAATGATATTGT-AA--------ATCAATTTCT-TT-----GTTAACATAGCAGCAAATTTAAAAGAGC----CAACACCCGATTCAAGTTTCGATAA---AATTAAAACG--TT-TGTTGACCCCAAAGTCAC-GAAAATAATGTTTT-TCAACATACCTCTCATTACAGAGAATAAAA-AAA------GCTTTTTAATTTAGAAACATCAAAAGCCACAGGT----------TCGGACCAAAACTGTT-AAAATGTCTACTAATGTAATATCCAGTAG-ATACCACGTGTTTTAAATAGTAGTATAAGAAATG----TTTTCCC---CCGACATCTGGAAATATGCTAAAGTAAGTCCTTTATTTAAAAGCGGGACAACTGGTGATATAAAgttaaaaaaatggttttgaaataacagaaagtaaatgatattgtaaatcaatttctttgttaacatagcagcaaatttaaaagagccaacacccgattcaagtttcgataaaattaaaacgtttgttgaccccaaagtcacgaaaataatgtttttcaacatacctctcattacagagaataaaaaaagctttttaatttagaaacatcaaaagccacaggttcggaccaaaactgttaaaatgtctactaatgtaatatccagtagataccacgtgttttaaatagtagtataagaaatgttttcccccgacatctggaaatatgctaaagtaagtcctttatttaaaagcgggacaactggtgatataaatgcggattaatcgtctgaaactttgtgttcaataccatggagagcacttcgagataatgtaataaagttaaatttatttatttatttatttgtttccgtcaattt
24 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): GATCAAATATATACTCAATCGTATATCAAAAAGCAAATTGTATGTACAGATTTTCAAAAAACAATGCACTTTCGTATATAACAGATATGTTTTATACACATGCTAACGTTCGTAGAAATCTACGTTCAACAAATGAGTTAAACATTATCAAACCAAAATCCAACAGGGAATTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTCTGGAACTTTAATCTGGAATAGATCAGAAACTGTACTACAGTCAAAAGTATTACAACAAATTGTATTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTCATATGTCCCGAATATAATATTTAGTAATAATTTAACAATTATTATCGCAAGTGCTAAAAATAAACCACCACCTCCAATGTACACACATATATTGTTAACTGTACATAATAATTATTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCAGATGTAATGATATTCACTTTCTTAATTAATTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTTAATCAAAGAGACTTTCAATGGACTGATAAAAAACTTTAAAAAAATGACATTT
Unaligned ( gi|9 ): ATATTGCATAATAGAGCATGCCGTTTTATCTTAGGTGATCAATATTCAATATTTGCAGACGAAATTGATGAATGGACTTTTCATTGATCAAAGAATACTCTCAATATAGCTTAATGTATGTACAAAGTTTAAAAAACAATGCACATTCGTATATAACTGATATGATTAATACTCATGACAACATTCGTAGAAATCTACGTTCAATAAATATATTAAACTGCATTACTACAAAACTCAACAGTGAAGTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTTTGGAACTTTAATCTTGAATAGTTTACCGGTCAATATCAGAATCTGTACTACAGACAAATAATGAATCAAATTGTGTTAAATAGTTACAAACAGAATAAGCTACTTCATATTTTTTTAAATTTAATAATAAGTAATAATTAAAGATTTATTACCACAATTAATACAAATAAGCCACCACCTTCAATATACACACATATATTATTACCTGTACATAATTATACCTGTTGTATTGTTGTTGTTATTTTGTTGCTATAACAGTTACAATGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATATA
Unaligned ( gi|12 ): ACGTTCAACAAATGAATTAAATTGTATCACTCCTAAACCCATAAGGGAATCATTCAAAAGACATTTTTCCAACTGTGAAACTTAAGTCTGGAATAGTACACAATTAATATCGGAAACTCTATTGCTTTAAAACGTCTAGGCAACAAATTGTGTTAAATCGCTACAAACAGAATGGACTACATCATATGTGGAGAAAAAATATTATTTAGTAATGATAGACTCACTTATCGCAAGTGCTACCAATTATCCAACACATCTAATGTACGCATGTATTAATAGATGTACATTATTATAATGTTTGTGTTGTTGTAGTGTTATTTGTTGCTGTAACAGATGTAATGATATCTATTATTTTTTGTTATCGGTGGGACTTTCAAAGAATGCTTAAAAAATCTCAAAATTGATAGAGTTAATATCATTTTTCGTCTACAATCAATTTGCTTG
Unaligned ( gi|13 ): AACATTATACTTTTGTGAGAAACTGTACTCCAGTCAAACGTTTTACAACAAATTGTGTTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTTATATGTCCCGAACACAATATTTAGTAATAATTAAACAAATATTATAGCACATATAAGCCACCACCTCCAATGTACACACATATATTATTAGCTGTACATAATTATACTTGTTATATTGTTGCTGTTGTTTATAGTGTTCTTGTAACAGATGTAGTGAGTTTCTCTTTCTTGATTAATTTTTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGTTTCTTAAAAAAAAGATGATATACATATTCATTCTTATTATTGTTCACCATTGTTTTGTTAACAAATTGTATATATATATATATATATATATAACACATTCCATAGAATA
Unaligned ( gi|16 ): AGAAACTTTACTACAGTCAAAATTTTACAACAAATTGATTAAAATGGTAACAAATAGAATGAACTACTTCATATGTCCTGAATATAATAGTAGTAATAATTAAACAATTATTATCGCAGTTGCTACAAATAAACCACCACCTCCAATGTACATACATATATCATTAACTGTATATAATTATACTTGTTGTATTGTTGTTGTAACACATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTATGTTTATATTATATATATTTTTAAATCAAAGGGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAATCTAAATAATTGATTTACGTGTA
Unaligned ( gi|18 ): CTACAATCAAAAGCTTTACATCAAATTGTGTTAAATGGTTACAAACTGAATGAATTGCTTCGTATGTCCTGAAGATAATATTTGGTAATAATTAAACAATTATTTTCGCAAATGCTATAAATAAGCCACCACCTCCAATATACACACATGTTTTATTAACTGTAAAGAATTATACTTGTTTTTTTTGTTATTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATACATATTTTTTTTTAATCAAATAGACTTTCAAAGGATTACTTAAAAAAATAAAAAAATATATAT
Unaligned ( gi|19 ): GTACACACATACTTATACTTGTTGATATTGTTGGTGTTATTATTGTTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTATATATACATTTTTTTAATCAAAGAGACTGTCAAAAAAATCTAAAATATTGATATACATGTAGTTATCATTTATCATGTACATGTACAATCATTTTGCTTGCAATGCTTAAACTGTTGTTTTTTTGTTTTGCATTGGTATTTTGTGAATAACCTATAAATGTATCTTTAGATTTCTGAAAAG
Unaligned ( gi|20 ): TACTTCATATGTCTCGAATATAATATTTGGTTAAAATGCAAAAAAATACAAATAAGCAACCAACTCCATTGAACACACATATAGTATTACCTGTTCACAATTATACTTGTATTGTTGTTGTTGTTTTTTTAGTTGTTGTAACAGATATAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATTATATATACATAGCAGTATACTTTTTTATTCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAAAA
Unaligned ( gi|22 ): ATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATATATATAATTTTTAATCACAGAGACTTTCAAAGGAACACTTTAAACAATCTAAAAAATGGATATACATGTAGTTATCATGTACAATCATTTTGCTTGCAATGCTTAAAATGTTTTTATTTTATTTTGCTATTGTATTTTGTAAATAACTTGTAAATGTATCATTAGAGGGTCCCAAGGAAGA
Unaligned ( gi|23 ): TACAAATAAGCCACCACCTCCAATGCACACACATATATTATTAACTGTAAATAATTATACCTTTTTTTTTATTGTTGTTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAACAGATGTAGAGATTTTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATATATATATATTTGTATCTTTATATATAAATCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAACTAAATATTGA
Unaligned ( gi|24 ): CAGGGAATTAATCAAAGGTTACTAAGTTTGTTCTACTCTGGAACTTTATTATGGAATAGCAAACAAGTTAATATCAAAAACTGTACTACAGTCAAAAGCTTTACAACAAATTGTGTTAAATGGTTACAAACAGAATGAACTACTTCGTATGTCATGAAGATAATATTTGGTAATAATTAAACAATTGTTATCACAAGTGCTACAAATAAGC
Unaligned ( gi|25 ): ACACACATATATTATTAACTGTAAATAATTATATTTGTTTTGAAGTTTTTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAACATATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGTTTGCTTAAAATGATATATA
Unaligned ( gi|26 ): TAGTCCAAAGCTTAACAATAAATTATGTTAAATGTTACAAACAGAATAAACTACGCCATATGTCCCGAATATAATATATAGTAATAATTAAACGATTATTATCGCAAGTCACCACCTCAAATGTACACACATGTATTATTAACTGTACATAATACTTGTTTGTTTATTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAATATATGTAGTGATATT
Unaligned ( gi|27 ): GTTGTATTGTTGTTTTGTTATTTGTTGTAACAGATGTAGTAACATTCACTATTTAAACTTTTGTTTTCAATGAGACTTTCAAAGAATTCCTTTAAAAATCTCAAAATTAATATAGTTATCATTTTTCATGTAAAATCCATTTGCTTGTAATCCTTAGAACATTTTGTTCTGTTATTGT
Unaligned ( gi|28 ): TAATACTTATATTTGTTGTATTGTTGTTGTTATTTATTTTGTTGTTGTAACAGATGAAGTGATATTCACTTTCTTGATTATTATTTTTTTTTTAATCAAAGAGACTTTTAAAGGACTGCTTAAAAATCTGAACGTTTAATATTCATG
Unaligned ( gi|29 ): GTTGTTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTACATGTATTTGTATATATATATTTTTTTTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAATCTAAAAAAAATGCTACATATGT
Unaligned ( gi|30 ): TTTATCAATTCAATACCAAGTAAAGTTAAGCAATGCACTTTTCATTGATCAAAAAATGTTTCTCCAAAAAGCAGAATTTATGTAAAAAGTTTCAAAAAGCAATGCACCTTTGTATATAACA
Unaligned ( gi|31 ): CAGTCAAACATTTTACAACATATTGTGTTAAACGGTTACAAACATAATTAGCTACTTTATATGTCCCGAATATTAATGCAAGTGCTACAAATAAGCCAACATCTCCAATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTTACTGTTGAAACAGATGTAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATATATATATGTATA
Unaligned ( gi|35 ): ACACATATAAATATACATACGCAATCTTCCAATGTACACACACATTTTATTAACTGTACATAACTACAC
Unaligned ( gi|36 ): AAAGATAGTCTTTAAAAACTTTCAAAAAACAATGCACCTTCGTATATAACAGATATGTTTTAATACT
Unaligned ( gi|37 ): CACATATAAATATACATACGCAATCTTCCAATGTACACACATACATTATCAACTGTGCATAATTAT
Unaligned ( gi|38 ): TGTTGTTGCTTATGTTGTTGTTTTAACAGATGTAGTGATATGCACTTTTTTGATTAAT
Unaligned ( gi|39 ): TCAAAGAGACTTTCAAAAGATTGCTTAAAAAACCTAAAAAAATTATATTTATGT






Alignments
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tACTTCACCACAACGACGTGCTAG-GCA--TATTGATAA-AAATATATCATTAATGT-GTAATGAGATTTTATTAAAACTTACATCTTGTGATAAGGT-TCTTGGAATG--CATAT----AAATAATAACTTTAAGTGGGATTTACATA-TCATGTTCATATGGAAGAAAATGTCAACCTAA-TTGTGGCTATGATCGAGAacttcaccacaacgacgtgctaggcatattgataaaaatatatcattaatgtgtaatgagattttattaaaacttacatcttgtgataaggttcttggaatgcatataaataataactttaagtgggatttacatatcatgttcatatggaagaaaatgtcaacctaattgtggctatgatcgagaataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttctcagtctttagagaattgtctcaaacacagatatgaatgcaaatgatacaacaatatttgacataaataAT----AAATAATAACCTTTAGC-GGATACACATACTCATGCTTATATGGATGAAAACTTataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taaATTGATAA-AAATATATCATCAACATTATAATGATATTTCGTAAGAACTTGGATATGTTGGTTAGTT-TATTGACATA--CATAT----AGATAATTACCTTAAGTGAAATACACATA-TAATGTTCATAATGAAGAAA--TTCAACTAAC-TCATGGCTAGTGTAAAAACagctatagcgttaataaaaaaataagcacctacattcaattaagttacaaaattaatttctttcttcaacctcattttgatcagtgtacatatcgtaatttttagataatacataaaaggtaagcacagacgctatctgaatattacagaagagggcatgtcgtataatcctggatgaccaatatgtgacataaattactaagtaaatagatcaaattatttttaaaagcaaaatcattgcacaaagtttcacaaaaatcgtctaccttcttataaagcgtatatgtccaatactcaccataacgtacagatctacgttcaacaaataaattaaaactcaacaggaaatcattcaaaggtaatttgtattactcaggaattttagttcgtattactataccag
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TATTGAACAAACTAGTATA-TG-ATATG-TATCGCATGACTCTGT--CGGGATCTGT-----TT-TTTTATATTTATAAATGATCTCCCCTCCCTCTCATTCTTGAAGGAATTTTATCAATTACAGGTATGTATACACATGATAAAACAATATTTGATATAAATACGTCAAA-ACTGTTAT--AC-AAAA--ATCT--ACTGACATTGAACTATTTTAAATGAACGGTGTTT-GT-ATAATAGTATGATTATAAACAGATC-ATAACTAAAGTTCTA-TGTGTTACTAAACCACAACGGCGTGCTAG-GCC--TATTGATAAGAAATAaaaacattcctgtaacttacagaatcattttcctaaaagattattctcaaccccccagttagatttttaataacctaattgtaagtactacaaaagataaacataacccgtctcttaatattacaaaaatgagcatgccgtattttctaagttgatcaaaattcaacatatgcagacgctatgaagttaataaatgcactttctattgatcaaagaatcttt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cttaTAATATCCATA-----GATA-ACATA-TCATGTTTATAAGGAAGAAAATTTCAATTTTCGTTGTGGCTATTATCATGAagaaataagattcaaagtgcgtgtgttattatcaagaataaaaacctacattccactaaatt
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gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CACATCAAAAACTGAAGTTCTA-TTTGTTACTACACCACAATGGTGTGCTAG-GCC--TATTGATAA-AAATATATGATTAACTT-ATAATGAAATTTCATTAGAACTTACATATGATGATACAGT-TCTTGGAATGCACATAT----AAATAATAAACTTAAGTGGGATACACATA-GC---------------AAAATTTCAACTTAC-TTATTGCTATTATCAAGA
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gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aagtaaaaccttccttcttggaactatttaaagacatcctgaatatatagttatttggaaaagtaccattggagatataaatcgtgacctattaaacagtaacattaaaactgaatggtcaagttatattttatcttatggtttatctaacttgttcatgaacacacgagtgtcccaaaattcaagaactctaattgatcatatttatacagattttaaaagaaaatatatctctaaaccatccctaaagtaggtcagagttgtcattttccagtatttTCATCTTTTAATATTTTAAATGGATGGTGTTT-A-AAAAATGGAATGGTTATAAACACACGAAAAACTAAAGTTCTA-TTataaaaacagacattccattaaattacagcattattttctatgaa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACACCACAATGGCGTGCTGGCGTTAATATAGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATGATGATATTACATTAAGACgg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATTTACATCTGGTGATAAGGT-TCTTGGAATG--CATATATATAAATAATAACTTTAAGTGGGATATACATA-TCATGTTCATAAGGAAGAAAATTTCAACCTAG-TTGTGGCTATTATCAAGA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aagTTTCAAAGCGGTGCAACTGATGATCTTAATAATTATCGACCTATATCAATACTACCGATACTG------TCTAAATTGATTGAAAAACA-TTTTAATGAACATTTTATTATATTTTTAATTCACTATAAATT-------ATTATTGTGTGCATTTCAAAGCGGGTTAAGAAATCAACTCAGTTGTGAAACAGTTCTTGTCCATATGATTGATA-A--ATGGTTGGCGGCACTAAATGAAGGAAAGTTAGTGAGTGAAATTATAG-TAGATTTTAGAAAAGCTTTTGATTTAGATGACCAT-atattaacctacattccattaaattacagaattattttctataatgcctatattcaaccctttctacattattgcaatctagttttggttattacaaaaaagtaaaaacataaaccgtctcctaatattgcaaaagagagcatgccatatcatcttgggtagcttagatattcaacatttgcagacactatgaagttaataaatgtactttccattgatcaaagaatatttatcaaaaaagtaaaatttatgtacagagtataaaaaaacatacaccttcgtatataacacataacattcatagaagtcaacaaatgaattaaactttatcacaccaaaacccaacagggaattatatattcaaaggttacaaagtttgtcctactctggaactttaatatggaatagtatactggttaatatcagaatctgtactacagtcaaaaactttacaacaaattgtgttaataggttacaaacggaatgaactacttcataatatttggcaataattaaacaattattattgcaagttctacaaataagtaaccacctccaatgtacacacatatattattaactgtaaataattatacttgttcttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattttgttgttgtaacagatgtagtgatattcactttctttattaatttttaatatacaatgtatatatatatatttttttttattcaaagagactttcaaatgattgcttaaaaaaccttaaa
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blockSeqs                     :                           C  T      T           A T      .      CC                                                        CC    GAGATAT        CTAG    AGTACAA    GAAAAAAAACATACACTTAT    A                        C     TA   AT   A  A  GAATGGTCAGCTAT                AGTCCG    C                        A          T        AG            A  T             .                        C  .      .                                AATTAAATCTCGCTATAACATACAT                       C      A            TAA    AAA  C     CTCGCTATA    A    T G           T TTTCAGTGAAGA   TTTT           TAA     A     T A     .     A  T T  A    G AGT  GT    A  A   GAAATATTTTTCAAGAAAAAATACAC                    T                                                                         AATCC                      TTAT               A  CAAAAAAAATT                           TT    TC    A    TC   AG            A   G       TTAGTGAACAAGGTGCTTCTACAAAAAACCCACAAATAGTTCAACTAA                               T                             A    GT   T  TGAATT   T       TGTG       T                     G   .                        AT  GCC  TGA     ACTCG    GACA       CGCAGAAAGAATGT    TT   T            A                     A               T                         A    A             AA           AA      T        TT           A A         T   G     GTGT       ACCC    A                                                       T                                    TGTGTT                    A          A                  A            ACTATAA  T                        C                             A      A         TAAT              T           A               T AG A                                   G AATACTTTGTAAAAATA        A      AAATGCAA          C       TT    G     G        G               .  ACTATCA                                         A  A  TGA      G                A         G CGT    .   T                    CTCCC                                           A                         T        G        AG  A    AAA   TC   G                              GT                           A T   T         T                             C  TAA         G                 T                                        C          CA     ATAT                       T     C                                G
blockSeqs                     :                                                          .      AC                                                        .     TGA            .       TA         ACAGTAACATTA            .                        .     .    T    T  .  TG                            TGT       .                        A          G        .             .  .             .                        .  .      .                                TA                                              .      A            A      .    T     GCTCTATG     A    C G           T ATG            .              .       C     . A     .     A  T G  A    . AGG  TT    A  T   TGGATAA                                       A                                                                         A                          TTAT               C  ATAAAAAAA                             AA    .     .    GT   .             .   A       TAAAATCCATGTACAGAAATAAAA                                                       C                             .    AT   .  TGAATT   G       TTTG       A                     G   .                        AA  .    TTA     TT       GACC       CACGAAAATAATGT    TC   T            T                     T               C                         T    T             C            AC      T        TT           T A         T   G     C          C       T                                                       A                                    .                         .          A                  A            .        T                        A                             A      A         A                 T           A               T AT .                                   . .                        .      AG                .       A     .     T        G               .  ACA                                             .  .  TG       A                T         C TTT    .   G                    .                                               C                         T        G        .   .    AAA   TT   C                              G                            A A   T         .                             .  A           .                 .                                        .          .      .                          C     .                                .
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finalCons                     :                        TAACATNGAATGTNTGTGGGTAGAANTNAAACCA-AGTAAANCCTTCCTTCTTGGAACTATTTACAGACATCCTGAATCTAGAGTTATTTGGAAAGATG--ATTT----T-A-AAATCGTCTAGAAAA--TA---TTAAG-AG-AA--------CA-TTA-AA-CTGAATAGTCAAATTATATTTTATCTTAAG--GTTATATTNAAACT---TG---------TTCATGAACCCACGAGAG--CGT-CC-AAAATTCAAGAACATTAATTGATCATATTTATAAANATTTTAAA-GAAAATATATCTCATGTAACCATCCCTAAA---GTAGGTCTGAGTGATCATTTTC-AG-TATTTT-TTCACGTAAAATCAATTATAAAAATAAGAAAAAA-----TCA-----CGCTATAA-A-TACA-ATCTTTCAAACATTTCA-GTGAAGNCAATTTTATAAA--AGATC---TTCAAAATGCTCGCT-ATGACGTACACTGTATTCTTCGAACG-----GTG----CAA----ATGAAGGGCTT---GACACNTGGAC-GAAATAT-TTTTCGAGTGTAGNAAAT-AAGNATGCGCCANCTAGAT---------TGCAT------GAAA-A--T-ACACCAACCTGACTGGTTAACTCCAGATATATTAGACGCCATAAAAGACAGGGACAAATATAAAGCTCGGAATGATACTGACAATTATAAA----ATGTACAGAAATAAAGTATGCCTTATATCTTATTAAGAACTCGA--------AT------A------CTTACGAAAGAAAAATAGAAG--AAGG-CAAATCTGA--CCCAAAATCAAT-CTGGAAACTTTT----GA---A---C-A--------T-TACAAAAA---CACAAA--------C---TAA----ATATTAATAAAATTAACAAAGACGGTCTTGAAATAACAGAAAGTAA-TGATATTGT-AATG-----TANTAACTTCT---------TTAACATAGCAGCAAATTTAAAAGAGC----CAATACCCGACTCAAGTTTCGATGA---AATTAAAACG--TT-TGTT----CCAAAGTGGAAAAAGT------TTTT--AATATACCCCTCATTACAGAGAATAAAACAAAAGAAATGCTTTCTAATTTAGACACATCAAAAGTCACAGGTATTGACCNGATCGGACCAAAACTGTT--AAATGTCCACTAATGTAATTTCCAGTAGTTTAACACGTGTTNTAAATAGCAGTNTAAGAAATGGTGTTTTTCCC---CCGACNTCTGGAAATATGCTAAAGTAAGCCCTTTATTTAAAAGCGGTGCAACTGATGATCTAAACAATTATCGACCTATATCAATACTACCGACACTG------TCTAAATTGATTGAAAAACA-TGTTCATGAANATTTTATTCTATTTTTAAATCACTATAAATT-------ATTATTGTGTGAATTTCAAAGCGGGTTCAGAAAACAACACAGTTGTGAAACAGCTCTNGTTCATATGATTGATA-A--ATGGCTGGCGGCACTAAATGAAGAAAAATTTGTTGGTGCAATTAANG-TAGATTTTAGAAAAGCTTTTGATTTAGTTGACCAT-G-AATA-CTTT-T--AA-AT-TTAAAACTGTAC-AA-TG-C-GTGAAAACACAATAAAATNGTTTGAATCCGACCTTACTGGAAGAAAACAGAAAG-TA--ACTATC-------ACGTTAAATGAAAAAACATCTGTTGAACAAACT-GT-TA-TG-GTGGGATACCGCAAGGCTCTGTATTAGGACCTNTC-T-GTT-TTTNATATTTATAAATGATCTCCC-----TCTCAGTCTTGAGGGAATTGTATCAAATACAGATATGTATGCAGATGATACAACAATATTTGACATAAATACATCAAAGGCTGTTAT--AC-AAAAAGATCTTCAATCATCTTTAAATATTTTAAATGGACGGTGTTTG--AAAAATGGAATGGTTATAAACACATCAAAAACTAAAGTTCTA-TTTGTTACTACACCACAACGGCGTGCTAG-GCT--TATTGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATAATGATATTTCATTAGAACTTACATCTGGTGATAAGGT-TCTTGGAATG--CATAT----AAATAATAACCTTAAGTGGGATACACATA-TCATGTTCATAAGGAAGAAAATTTCAACCTAC-TTGTGGCTATTATCAAGAC
24 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): GATCAAATATATACTCAATCGTATATCAAAAAGCAAATTGTATGTACAGATTTTCAAAAAACAATGCACTTTCGTATATAACAGATATGTTTTATACACATGCTAACGTTCGTAGAAATCTACGTTCAACAAATGAGTTAAACATTATCAAACCAAAATCCAACAGGGAATTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTCTGGAACTTTAATCTGGAATAGATCAGAAACTGTACTACAGTCAAAAGTATTACAACAAATTGTATTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTCATATGTCCCGAATATAATATTTAGTAATAATTTAACAATTATTATCGCAAGTGCTAAAAATAAACCACCACCTCCAATGTACACACATATATTGTTAACTGTACATAATAATTATTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCAGATGTAATGATATTCACTTTCTTAATTAATTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTTAATCAAAGAGACTTTCAATGGACTGATAAAAAACTTTAAAAAAATGACATTT
Unaligned ( gi|9 ): ATATTGCATAATAGAGCATGCCGTTTTATCTTAGGTGATCAATATTCAATATTTGCAGACGAAATTGATGAATGGACTTTTCATTGATCAAAGAATACTCTCAATATAGCTTAATGTATGTACAAAGTTTAAAAAACAATGCACATTCGTATATAACTGATATGATTAATACTCATGACAACATTCGTAGAAATCTACGTTCAATAAATATATTAAACTGCATTACTACAAAACTCAACAGTGAAGTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTTTGGAACTTTAATCTTGAATAGTTTACCGGTCAATATCAGAATCTGTACTACAGACAAATAATGAATCAAATTGTGTTAAATAGTTACAAACAGAATAAGCTACTTCATATTTTTTTAAATTTAATAATAAGTAATAATTAAAGATTTATTACCACAATTAATACAAATAAGCCACCACCTTCAATATACACACATATATTATTACCTGTACATAATTATACCTGTTGTATTGTTGTTGTTATTTTGTTGCTATAACAGTTACAATGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATATA
Unaligned ( gi|12 ): ACGTTCAACAAATGAATTAAATTGTATCACTCCTAAACCCATAAGGGAATCATTCAAAAGACATTTTTCCAACTGTGAAACTTAAGTCTGGAATAGTACACAATTAATATCGGAAACTCTATTGCTTTAAAACGTCTAGGCAACAAATTGTGTTAAATCGCTACAAACAGAATGGACTACATCATATGTGGAGAAAAAATATTATTTAGTAATGATAGACTCACTTATCGCAAGTGCTACCAATTATCCAACACATCTAATGTACGCATGTATTAATAGATGTACATTATTATAATGTTTGTGTTGTTGTAGTGTTATTTGTTGCTGTAACAGATGTAATGATATCTATTATTTTTTGTTATCGGTGGGACTTTCAAAGAATGCTTAAAAAATCTCAAAATTGATAGAGTTAATATCATTTTTCGTCTACAATCAATTTGCTTG
Unaligned ( gi|13 ): AACATTATACTTTTGTGAGAAACTGTACTCCAGTCAAACGTTTTACAACAAATTGTGTTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTTATATGTCCCGAACACAATATTTAGTAATAATTAAACAAATATTATAGCACATATAAGCCACCACCTCCAATGTACACACATATATTATTAGCTGTACATAATTATACTTGTTATATTGTTGCTGTTGTTTATAGTGTTCTTGTAACAGATGTAGTGAGTTTCTCTTTCTTGATTAATTTTTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGTTTCTTAAAAAAAAGATGATATACATATTCATTCTTATTATTGTTCACCATTGTTTTGTTAACAAATTGTATATATATATATATATATATATAACACATTCCATAGAATA
Unaligned ( gi|16 ): AGAAACTTTACTACAGTCAAAATTTTACAACAAATTGATTAAAATGGTAACAAATAGAATGAACTACTTCATATGTCCTGAATATAATAGTAGTAATAATTAAACAATTATTATCGCAGTTGCTACAAATAAACCACCACCTCCAATGTACATACATATATCATTAACTGTATATAATTATACTTGTTGTATTGTTGTTGTAACACATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTATGTTTATATTATATATATTTTTAAATCAAAGGGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAATCTAAATAATTGATTTACGTGTA
Unaligned ( gi|18 ): CTACAATCAAAAGCTTTACATCAAATTGTGTTAAATGGTTACAAACTGAATGAATTGCTTCGTATGTCCTGAAGATAATATTTGGTAATAATTAAACAATTATTTTCGCAAATGCTATAAATAAGCCACCACCTCCAATATACACACATGTTTTATTAACTGTAAAGAATTATACTTGTTTTTTTTGTTATTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATACATATTTTTTTTTAATCAAATAGACTTTCAAAGGATTACTTAAAAAAATAAAAAAATATATAT
Unaligned ( gi|19 ): GTACACACATACTTATACTTGTTGATATTGTTGGTGTTATTATTGTTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTATATATACATTTTTTTAATCAAAGAGACTGTCAAAAAAATCTAAAATATTGATATACATGTAGTTATCATTTATCATGTACATGTACAATCATTTTGCTTGCAATGCTTAAACTGTTGTTTTTTTGTTTTGCATTGGTATTTTGTGAATAACCTATAAATGTATCTTTAGATTTCTGAAAAG
Unaligned ( gi|20 ): TACTTCATATGTCTCGAATATAATATTTGGTTAAAATGCAAAAAAATACAAATAAGCAACCAACTCCATTGAACACACATATAGTATTACCTGTTCACAATTATACTTGTATTGTTGTTGTTGTTTTTTTAGTTGTTGTAACAGATATAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATTATATATACATAGCAGTATACTTTTTTATTCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAAAA
Unaligned ( gi|22 ): ATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATATATATAATTTTTAATCACAGAGACTTTCAAAGGAACACTTTAAACAATCTAAAAAATGGATATACATGTAGTTATCATGTACAATCATTTTGCTTGCAATGCTTAAAATGTTTTTATTTTATTTTGCTATTGTATTTTGTAAATAACTTGTAAATGTATCATTAGAGGGTCCCAAGGAAGA
Unaligned ( gi|23 ): TACAAATAAGCCACCACCTCCAATGCACACACATATATTATTAACTGTAAATAATTATACCTTTTTTTTTATTGTTGTTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAACAGATGTAGAGATTTTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATATATATATATTTGTATCTTTATATATAAATCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAACTAAATATTGA
Unaligned ( gi|24 ): CAGGGAATTAATCAAAGGTTACTAAGTTTGTTCTACTCTGGAACTTTATTATGGAATAGCAAACAAGTTAATATCAAAAACTGTACTACAGTCAAAAGCTTTACAACAAATTGTGTTAAATGGTTACAAACAGAATGAACTACTTCGTATGTCATGAAGATAATATTTGGTAATAATTAAACAATTGTTATCACAAGTGCTACAAATAAGC
Unaligned ( gi|25 ): ACACACATATATTATTAACTGTAAATAATTATATTTGTTTTGAAGTTTTTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAACATATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGTTTGCTTAAAATGATATATA
Unaligned ( gi|26 ): TAGTCCAAAGCTTAACAATAAATTATGTTAAATGTTACAAACAGAATAAACTACGCCATATGTCCCGAATATAATATATAGTAATAATTAAACGATTATTATCGCAAGTCACCACCTCAAATGTACACACATGTATTATTAACTGTACATAATACTTGTTTGTTTATTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAATATATGTAGTGATATT
Unaligned ( gi|27 ): GTTGTATTGTTGTTTTGTTATTTGTTGTAACAGATGTAGTAACATTCACTATTTAAACTTTTGTTTTCAATGAGACTTTCAAAGAATTCCTTTAAAAATCTCAAAATTAATATAGTTATCATTTTTCATGTAAAATCCATTTGCTTGTAATCCTTAGAACATTTTGTTCTGTTATTGT
Unaligned ( gi|28 ): TAATACTTATATTTGTTGTATTGTTGTTGTTATTTATTTTGTTGTTGTAACAGATGAAGTGATATTCACTTTCTTGATTATTATTTTTTTTTTAATCAAAGAGACTTTTAAAGGACTGCTTAAAAATCTGAACGTTTAATATTCATG
Unaligned ( gi|29 ): GTTGTTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTACATGTATTTGTATATATATATTTTTTTTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAATCTAAAAAAAATGCTACATATGT
Unaligned ( gi|30 ): TTTATCAATTCAATACCAAGTAAAGTTAAGCAATGCACTTTTCATTGATCAAAAAATGTTTCTCCAAAAAGCAGAATTTATGTAAAAAGTTTCAAAAAGCAATGCACCTTTGTATATAACA
Unaligned ( gi|31 ): CAGTCAAACATTTTACAACATATTGTGTTAAACGGTTACAAACATAATTAGCTACTTTATATGTCCCGAATATTAATGCAAGTGCTACAAATAAGCCAACATCTCCAATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTTACTGTTGAAACAGATGTAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATATATATATGTATA
Unaligned ( gi|35 ): ACACATATAAATATACATACGCAATCTTCCAATGTACACACACATTTTATTAACTGTACATAACTACAC
Unaligned ( gi|36 ): AAAGATAGTCTTTAAAAACTTTCAAAAAACAATGCACCTTCGTATATAACAGATATGTTTTAATACT
Unaligned ( gi|37 ): CACATATAAATATACATACGCAATCTTCCAATGTACACACATACATTATCAACTGTGCATAATTAT
Unaligned ( gi|38 ): TGTTGTTGCTTATGTTGTTGTTTTAACAGATGTAGTGATATGCACTTTTTTGATTAAT
Unaligned ( gi|39 ): TCAAAGAGACTTTCAAAAGATTGCTTAAAAAACCTAAAAAAATTATATTTATGT






Alignments
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tACTTCACCACAACGACGTGCTAG-GCA--TATTGATAA-AAATATATCATTAATGT-GTAATGAGATTTTATTAAAACTTACATCTTGTGATAAGGT-TCTTGGAATG--CATAT----AAATAATAACTTTAAGTGGGATTTACATA-TCATGTTCATATGGAAGAAAATGTCAACCTAA-TTGTGGCTATGATCGAGAacttcaccacaacgacgtgctaggcatattgataaaaatatatcattaatgtgtaatgagattttattaaaacttacatcttgtgataaggttcttggaatgcatataaataataactttaagtgggatttacatatcatgttcatatggaagaaaatgtcaacctaattgtggctatgatcgagaataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttctcagtctttagagaattgtctcaaacacagatatgaatgcaaatgatacaacaatatttgacataaataAT----AAATAATAACCTTTAGC-GGATACACATACTCATGCTTATATGGATGAAAACTTataaataccttcattccattaaattacagaattgttttctatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgccgaccgtatgaagtcgataaatacactttcctttgaccaaagaatatttctccaaaagcaaaatttaaaaaaacaatgcaatttcgtatgtaacagatatgttt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taaATTGATAA-AAATATATCATCAACATTATAATGATATTTCGTAAGAACTTGGATATGTTGGTTAGTT-TATTGACATA--CATAT----AGATAATTACCTTAAGTGAAATACACATA-TAATGTTCATAATGAAGAAA--TTCAACTAAC-TCATGGCTAGTGTAAAAACagctatagcgttaataaaaaaataagcacctacattcaattaagttacaaaattaatttctttcttcaacctcattttgatcagtgtacatatcgtaatttttagataatacataaaaggtaagcacagacgctatctgaatattacagaagagggcatgtcgtataatcctggatgaccaatatgtgacataaattactaagtaaatagatcaaattatttttaaaagcaaaatcattgcacaaagtttcacaaaaatcgtctaccttcttataaagcgtatatgtccaatactcaccataacgtacagatctacgttcaacaaataaattaaaactcaacaggaaatcattcaaaggtaatttgtattactcaggaattttagttcgtattactataccag
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATTGAACAAACTAGTATA-TG-ATATG-TATCGCATGACTCTGT--CGGGATCTGT-----TT-TTTTATATTTATAAATGATCTCCCCTCCCTCTCATTCTTGAAGGAATTTTATCAATTACAGGTATGTATACACATGATAAAACAATATTTGATATAAATACGTCAAA-ACTGTTAT--AC-AAAA--ATCT--ACTGACATTGAACTATTTTAAATGAACGGTGTTT--GTATAATAGTATGATTATAAACAGATC-ATAACTAAAGTTCTA-TGTGTTACTAAACCACAACGGCGTGCTAG-GCC--TATTGATAAGAAATAaaaacattcctgtaacttacagaatcattttcctaaaagattattctcaaccccccagttagatttttaataacctaattgtaagtactacaaaagataaacataacccgtctcttaatattacaaaaatgagcatgccgtattttctaagttgatcaaaattcaacatatgcagacgctatgaagttaataaatgcactttctattgatcaaagaatcttt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cttaTAATATCCATA-----GATA-ACATA-TCATGTTTATAAGGAAGAAAATTTCAATTTTCGTTGTGGCTATTATCATGAagaaataagattcaaagtgcgtgtgttattatcaagaataaaaacctacattccactaaatt
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gi|3                          :                                                         A-AGTAAAACCTTCCTTCTTGGAACTATTTAAAGACATCCTGAATATATAGTTATTTGGAAAAGTACCATTGGAGAT-ATAAATCGT----GACC--TA---TTAAACAGTAA--------CA-TTA-AAACTGAATGGTCAAGTTATATTTTATCTTATG--GTT-TATCTAA-CT---TG---------TTCATGAACACACGAG----TGT-CCCAAAATTCAAGAACTCTAATTGATCATATTTATACAGATTTTAAAAGAAAATATATCTC-TA-AACCATCCCTAAA---GTAGGTCAGAGTTGTCATTTTCCAG-TATTTT-TTCACGTCAAATCAATTATAAAAATAAGAACAAA-----TTAAATCTCGCTATAACA-TACATATCTTTCAAACATTTCA-GTGAAGACAATTTTATAAA---GATC---TTTAAAAT-----------ACATACACTGTATTCTTTGAATG-----GTG----CAA----ATGAAGGATTT---GACACCTGGAT-GAAATAT-TTTTCAAG---AAAAAAT-A------CACCAATCTGAC---------TGGAT------AA----------------------------CTCCAGATATATTAGACGCCATAAAAGACATGGACAAATAGAAAGCTCGGAATGATACTGACAATTATAAA----ATGTATAGAAATAAAGTATGCCTTATATCTTATTAAGAACTCGA--------ATAAAAAAA------TTTACGAAAGAAAAAAAGAAG--AAGG-CAAAGTTGA--CCAAAAATCAAT-CTAAAAACTTT-------------------------T-TA-AAGGA---CACAAA--------C-----------CATTAATAAAATTAACACAGACGGTCTTGAAATAACAGAAAGTAA-TGATA-TGT-AA-----TGAATTCAGTAACATTTT---T--------AAAAA-TAGCAGCAAATTTAAAAGAGC----CAATAACCGACTCG-----------------------TGTT----CCA-------GA-AAA-AA-G-----TTTTT-AATATACCCCTCATTTCAGAGAATAAAACAAAAGAAATGTTTTCTACTTTAGACACATCAAAAGTCACAGGTATTGACCTGATCTGACCAAAACTGTTC-AAA--TATCCACTACTGTAATTTTTAGTAGTTTAACataaaaacctacggtacattcttttaaattacagag
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gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aagtaaaaccttccttcttggaactatttaaagacatcctgaatatatagttatttggaaaagtaccattggagatataaatcgtgacctattaaacagtaacattaaaactgaatggtcaagttatattttatcttatggtttatctaacttgttcatgaacacacgagtgtcccaaaattcaagaactctaattgatcatatttatacagattttaaaagaaaatatatctctaaaccatccctaaagtaggtcagagttgtcattttccagtatttTCATCTTTTAATATTTTAAATGGATGGTGTTT--AAAAAATGGAATGGTTATAAACACACGAAAAACTAAAGTTCTA-TTataaaaacagacattccattaaattacagcattattttctatgaa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACACCACAATGGCGTGCTGGCGTTAATATAGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATGATGATATTACATTAAGACgg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ATTTACATCTGGTGATAAGGT-TCTTGGAATG--CATATATATAAATAATAACTTTAAGTGGGATATACATA-TCATGTTCATAAGGAAGAAAATTTCAACCTAG-TTGTGGCTATTATCAAGA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aagTTTCAAAGCGGTGCAACTGATGATCTTAATAATTATCGACCTATATCAATACTACCGATACTG------TCTAAATTGATTGAAAAACA-TTTTAATGAACATTTTATTATATTTTTAATTCACTATAAATT-------ATTATTGTGTGCATTTCAAAGCGGGTTAAGAAATCAACTCAGTTGTGAAACAGTTCTTGTCCATATGATTGATA-A--ATGGTTGGCGGCACTAAATGAAGGAAAGTTAGTGAGTGAAATTATAG-TAGATTTTAGAAAAGCTTTTGATTTAGATGACCAT-atattaacctacattccattaaattacagaattattttctataatgcctatattcaaccctttctacattattgcaatctagttttggttattacaaaaaagtaaaaacataaaccgtctcctaatattgcaaaagagagcatgccatatcatcttgggtagcttagatattcaacatttgcagacactatgaagttaataaatgtactttccattgatcaaagaatatttatcaaaaaagtaaaatttatgtacagagtataaaaaaacatacaccttcgtatataacacataacattcatagaagtcaacaaatgaattaaactttatcacaccaaaacccaacagggaattatatattcaaaggttacaaagtttgtcctactctggaactttaatatggaatagtatactggttaatatcagaatctgtactacagtcaaaaactttacaacaaattgtgttaataggttacaaacggaatgaactacttcataatatttggcaataattaaacaattattattgcaagttctacaaataagtaaccacctccaatgtacacacatatattattaactgtaaataattatacttgttcttctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntattttgttgttgtaacagatgtagtgatattcactttctttattaatttttaatatacaatgtatatatatatatttttttttattcaaagagactttcaaatgattgcttaaaaaaccttaaa
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tttcaaagcggtgcaactgatgatcttaataattatcgacctatatcaatactaccgatactgtctaaattgattgaaaaacattttaatgaacattttattatatttttaattcactataaattattattgtgtgcatttcaaagcgggttaagaaatcaactcagttgtgaaacagttcttgtccatatgattgataaatggttggcggcactaaatgaaggaaagttagtgagtgaaattatagtagattttagaaaagcttttgatttagatgaccatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTAG-GCT--TATTGATAA-AAATATATCATTAACGT-ATAATGATAGTTCATTAGGACTTACATCTGGTGATAAGTT-TCTTGGAATG--CATAT----AAATAATAACCTTAAGTGGAACACACATA-TCATGT---------------TTGCAACCTAC-TTATGGCTATTATCAAAAaaaaaaacttacattctattaacttacagaagtatttt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GACTGGTTAACTCCAGATATATAAGACACCATAAAAGTCAGGGACAAATATAAAGCCCGGAATGATACTGACACTTATAAAATCCATGTACAGAAATAAAATATGataaaacattatatttctttaattannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaacatttgcagacgctatgaagttaatagatgcactttccattgatcaaataatatttgcaccttcatatataacagatatgtttaatacccatgataacgttcgtataaatctacgttcaacaaatgaattaaaattgatcacaccaaaacccaacagggatttattcaaaggtagtttgtcctactctggaattttaatatcgtataccggttaatatcagaaaatgtactacagtcaaaagttttacttaacattgtgttaaattgttacaaacagaattaactacttcatatatcccgaagataataactgctatgacgtcatcctttgttctcgcagcactgtatatttaataca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ATAAAAGTCAGGGACAAATATAAAGCCCGGAAT-GATACTG-ACACTTAT----AA---AATCC-A--------TGTACAGAAA---TA-----------------AA----ATAT------GGTTAA-AAAAATGGTTTTGAAATAACAGAAAGTAAATGATATTGT-AA------------ATCAAT-TTCTTTGT--------TAACA-TAGCAGCAAATTTAAAAGAGC----CAACACCCGATTCAAGTTTCGATAAAATTAAAACGTTTGTTGACCCCAAAGTCACGA-AAATAATG-----TTTTTCAACATACCTCTCATTACAGAGAATAAAA-AAA------GCTTTTTAATTTAGAAACATCAAAAGCCACAGGT----------TCGGACCAAAACTGTTA-AAA--TGTCTACTAATGTAATATCCAGTAG-ATACCACGTGTTTTAAATAGTAGTATAAGAAATG----TTTTCCC---CCGACATCTGGAAATATGCTAAAGTAAGTCCTTTATTTAAAAGCGGGACAACTGGTGATATAAAgttaaaaaaatggttttgaaataacagaaagtaaatgatattgtaaatcaatttctttgttaacatagcagcaaatttaaaagagccaacacccgattcaagtttcgataaaattaaaacgtttgttgaccccaaagtcacgaaaataatgtttttcaacatacctctcattacagagaataaaaaaagctttttaatttagaaacatcaaaagccacaggttcggaccaaaactgttaaaatgtctactaatgtaatatccagtagataccacgtgttttaaatagtagtataagaaatgttttcccccgacatctggaaatatgctaaagtaagtcctttatttaaaagcgggacaactggtgatataaatgcggattaatcgtctgaaactttgtgttcaataccatggagagcacttcgagataatgtaataaagttaaatttatttatttatttatttgtttccgtcaattt
24 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|8 ): GATCAAATATATACTCAATCGTATATCAAAAAGCAAATTGTATGTACAGATTTTCAAAAAACAATGCACTTTCGTATATAACAGATATGTTTTATACACATGCTAACGTTCGTAGAAATCTACGTTCAACAAATGAGTTAAACATTATCAAACCAAAATCCAACAGGGAATTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTCTGGAACTTTAATCTGGAATAGATCAGAAACTGTACTACAGTCAAAAGTATTACAACAAATTGTATTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTCATATGTCCCGAATATAATATTTAGTAATAATTTAACAATTATTATCGCAAGTGCTAAAAATAAACCACCACCTCCAATGTACACACATATATTGTTAACTGTACATAATAATTATTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCAGATGTAATGATATTCACTTTCTTAATTAATTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTTAATCAAAGAGACTTTCAATGGACTGATAAAAAACTTTAAAAAAATGACATTT
Unaligned ( gi|9 ): ATATTGCATAATAGAGCATGCCGTTTTATCTTAGGTGATCAATATTCAATATTTGCAGACGAAATTGATGAATGGACTTTTCATTGATCAAAGAATACTCTCAATATAGCTTAATGTATGTACAAAGTTTAAAAAACAATGCACATTCGTATATAACTGATATGATTAATACTCATGACAACATTCGTAGAAATCTACGTTCAATAAATATATTAAACTGCATTACTACAAAACTCAACAGTGAAGTATTCAAAGGTAGTTTGTCCTACTTTGGAACTTTAATCTTGAATAGTTTACCGGTCAATATCAGAATCTGTACTACAGACAAATAATGAATCAAATTGTGTTAAATAGTTACAAACAGAATAAGCTACTTCATATTTTTTTAAATTTAATAATAAGTAATAATTAAAGATTTATTACCACAATTAATACAAATAAGCCACCACCTTCAATATACACACATATATTATTACCTGTACATAATTATACCTGTTGTATTGTTGTTGTTATTTTGTTGCTATAACAGTTACAATGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATATA
Unaligned ( gi|12 ): ACGTTCAACAAATGAATTAAATTGTATCACTCCTAAACCCATAAGGGAATCATTCAAAAGACATTTTTCCAACTGTGAAACTTAAGTCTGGAATAGTACACAATTAATATCGGAAACTCTATTGCTTTAAAACGTCTAGGCAACAAATTGTGTTAAATCGCTACAAACAGAATGGACTACATCATATGTGGAGAAAAAATATTATTTAGTAATGATAGACTCACTTATCGCAAGTGCTACCAATTATCCAACACATCTAATGTACGCATGTATTAATAGATGTACATTATTATAATGTTTGTGTTGTTGTAGTGTTATTTGTTGCTGTAACAGATGTAATGATATCTATTATTTTTTGTTATCGGTGGGACTTTCAAAGAATGCTTAAAAAATCTCAAAATTGATAGAGTTAATATCATTTTTCGTCTACAATCAATTTGCTTG
Unaligned ( gi|13 ): AACATTATACTTTTGTGAGAAACTGTACTCCAGTCAAACGTTTTACAACAAATTGTGTTAAATGGTAACAAACAGAATGAACTACTTTATATGTCCCGAACACAATATTTAGTAATAATTAAACAAATATTATAGCACATATAAGCCACCACCTCCAATGTACACACATATATTATTAGCTGTACATAATTATACTTGTTATATTGTTGCTGTTGTTTATAGTGTTCTTGTAACAGATGTAGTGAGTTTCTCTTTCTTGATTAATTTTTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGTTTCTTAAAAAAAAGATGATATACATATTCATTCTTATTATTGTTCACCATTGTTTTGTTAACAAATTGTATATATATATATATATATATATAACACATTCCATAGAATA
Unaligned ( gi|16 ): AGAAACTTTACTACAGTCAAAATTTTACAACAAATTGATTAAAATGGTAACAAATAGAATGAACTACTTCATATGTCCTGAATATAATAGTAGTAATAATTAAACAATTATTATCGCAGTTGCTACAAATAAACCACCACCTCCAATGTACATACATATATCATTAACTGTATATAATTATACTTGTTGTATTGTTGTTGTAACACATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTATGTTTATATTATATATATTTTTAAATCAAAGGGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAATCTAAATAATTGATTTACGTGTA
Unaligned ( gi|18 ): CTACAATCAAAAGCTTTACATCAAATTGTGTTAAATGGTTACAAACTGAATGAATTGCTTCGTATGTCCTGAAGATAATATTTGGTAATAATTAAACAATTATTTTCGCAAATGCTATAAATAAGCCACCACCTCCAATATACACACATGTTTTATTAACTGTAAAGAATTATACTTGTTTTTTTTGTTATTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATACATATTTTTTTTTAATCAAATAGACTTTCAAAGGATTACTTAAAAAAATAAAAAAATATATAT
Unaligned ( gi|19 ): GTACACACATACTTATACTTGTTGATATTGTTGGTGTTATTATTGTTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTATATATACATTTTTTTAATCAAAGAGACTGTCAAAAAAATCTAAAATATTGATATACATGTAGTTATCATTTATCATGTACATGTACAATCATTTTGCTTGCAATGCTTAAACTGTTGTTTTTTTGTTTTGCATTGGTATTTTGTGAATAACCTATAAATGTATCTTTAGATTTCTGAAAAG
Unaligned ( gi|20 ): TACTTCATATGTCTCGAATATAATATTTGGTTAAAATGCAAAAAAATACAAATAAGCAACCAACTCCATTGAACACACATATAGTATTACCTGTTCACAATTATACTTGTATTGTTGTTGTTGTTTTTTTAGTTGTTGTAACAGATATAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATTATATATACATAGCAGTATACTTTTTTATTCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAAAA
Unaligned ( gi|22 ): ATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTATATATATATAATTTTTAATCACAGAGACTTTCAAAGGAACACTTTAAACAATCTAAAAAATGGATATACATGTAGTTATCATGTACAATCATTTTGCTTGCAATGCTTAAAATGTTTTTATTTTATTTTGCTATTGTATTTTGTAAATAACTTGTAAATGTATCATTAGAGGGTCCCAAGGAAGA
Unaligned ( gi|23 ): TACAAATAAGCCACCACCTCCAATGCACACACATATATTATTAACTGTAAATAATTATACCTTTTTTTTTATTGTTGTTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAACAGATGTAGAGATTTTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATATATATATATTTGTATCTTTATATATAAATCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAAACTAAATATTGA
Unaligned ( gi|24 ): CAGGGAATTAATCAAAGGTTACTAAGTTTGTTCTACTCTGGAACTTTATTATGGAATAGCAAACAAGTTAATATCAAAAACTGTACTACAGTCAAAAGCTTTACAACAAATTGTGTTAAATGGTTACAAACAGAATGAACTACTTCGTATGTCATGAAGATAATATTTGGTAATAATTAAACAATTGTTATCACAAGTGCTACAAATAAGC
Unaligned ( gi|25 ): ACACACATATATTATTAACTGTAAATAATTATATTTGTTTTGAAGTTTTTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAACATATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGTTTGCTTAAAATGATATATA
Unaligned ( gi|26 ): TAGTCCAAAGCTTAACAATAAATTATGTTAAATGTTACAAACAGAATAAACTACGCCATATGTCCCGAATATAATATATAGTAATAATTAAACGATTATTATCGCAAGTCACCACCTCAAATGTACACACATGTATTATTAACTGTACATAATACTTGTTTGTTTATTGTTGTTGCTTATTTTGTTGTTGTAATATATGTAGTGATATT
Unaligned ( gi|27 ): GTTGTATTGTTGTTTTGTTATTTGTTGTAACAGATGTAGTAACATTCACTATTTAAACTTTTGTTTTCAATGAGACTTTCAAAGAATTCCTTTAAAAATCTCAAAATTAATATAGTTATCATTTTTCATGTAAAATCCATTTGCTTGTAATCCTTAGAACATTTTGTTCTGTTATTGT
Unaligned ( gi|28 ): TAATACTTATATTTGTTGTATTGTTGTTGTTATTTATTTTGTTGTTGTAACAGATGAAGTGATATTCACTTTCTTGATTATTATTTTTTTTTTAATCAAAGAGACTTTTAAAGGACTGCTTAAAAATCTGAACGTTTAATATTCATG
Unaligned ( gi|29 ): GTTGTTGTAACAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTACATGTATTTGTATATATATATTTTTTTTTAATCAAAGAGACTTTCAAAGGATTGCTTAAAAAATCTAAAAAAAATGCTACATATGT
Unaligned ( gi|30 ): TTTATCAATTCAATACCAAGTAAAGTTAAGCAATGCACTTTTCATTGATCAAAAAATGTTTCTCCAAAAAGCAGAATTTATGTAAAAAGTTTCAAAAAGCAATGCACCTTTGTATATAACA
Unaligned ( gi|31 ): CAGTCAAACATTTTACAACATATTGTGTTAAACGGTTACAAACATAATTAGCTACTTTATATGTCCCGAATATTAATGCAAGTGCTACAAATAAGCCAACATCTCCAATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTTACTGTTGAAACAGATGTAGATGTAGTGATATTCACTTTCTTGATTAATTTTGTATATATATATGTATA
Unaligned ( gi|35 ): ACACATATAAATATACATACGCAATCTTCCAATGTACACACACATTTTATTAACTGTACATAACTACAC
Unaligned ( gi|36 ): AAAGATAGTCTTTAAAAACTTTCAAAAAACAATGCACCTTCGTATATAACAGATATGTTTTAATACT
Unaligned ( gi|37 ): CACATATAAATATACATACGCAATCTTCCAATGTACACACATACATTATCAACTGTGCATAATTAT
Unaligned ( gi|38 ): TGTTGTTGCTTATGTTGTTGTTTTAACAGATGTAGTGATATGCACTTTTTTGATTAAT
Unaligned ( gi|39 ): TCAAAGAGACTTTCAAAAGATTGCTTAAAAAACCTAAAAAAATTATATTTATGT