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lowQualScore : 5 6 66 5 333 222 0 55 1 5 22 5 333333 77777 22222 99999999999999999999999999999999 3 333 777777777777777777777 333 0 22222 0 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 44444444 111 00 111 1111 22222222 1 1 4444 1111111111111111111111111111111111111111111111111111 333 888888888888888888888888888888888888 22 0 333 0 222 0 2222 44 111 00 22 55555 77777777777777777777777777777777 33333333 0 1 4 4444444444444444 1 11 3333 111 0 00 1111 44444444444444444444444444444444 3333 11111 333333 111 55555555 0 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 33333333 5555555555 11 11 22 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 1 0 11 3333333333333333333333333333333333333333 5555 88888888888 2 88 666 2222
lowQualScore : . . .. . ... ... . .. . . .. . ...... ..... ..... ................................ . ... ..................... ... . ..... . . .......................................................................... ........ ... .. ... .... ........ . . .... .................................................... ... .................................... .. . ... . ... . .... .. ... .. .. ..... ................................ ........ . . . ................ . .. .... ... . .. .... ................................ .... ..... ...... ... ........ . .................................................................................................. . ........ .......... .. .. .. . ................................................................ .. . . .. ........................................ .... ........... . .. ... ....
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consensus : NNTTCAGGAGATANAAAATTTTGAC--TATA--TGCTNTGTG--GCAACCCTTAGTGTAA------C-----AA-----A---A-CC----C-------------TN-----AGTG---T--AACA--------A------TT---GT-T-----A-CACT-A-----------A--G---G------G----T--------TG-----A----C-A-T---C----------G---CA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----A--------A--A--T----C------G---G---T-------T-TN------GT---TACACTA----AG---GGT--------T-G----A----C---A--C-CG---CA-A---CC-C----TTAG-TGT---A--AC--A-----A-A---TC------A------G---TTT-N---GT--------TACAC-T-AAGGGT-------TG-AC-A-C--CG---CA---A-CCCTTAG--T----G--T----C---A------A------CC-----C----T-----TAG------T---GTA--------A-C--------------------A---A------------A-------------------G-G---TT--G--------AC-A-C---------C--G---C-A--------A----------CC--C--T--TAGT-GTA-----A------C--A----A--------------------A-C-----------AA------TT--GT-TAC-ACT--AA----G-----------------GGT-T-------------T----T-----------TGTTACACTAAGGGTTGCCA-CAA-AGC-TGCGTCAAAATTTAT
Reference ( gi|6 ) : TATTCCGGAAATGGAAAATTTTGAC--TATA--TGCTATGTG--GCAACCCTTAGTGCAA------C-----AA-----A---A-CC----C-------------TA-----AATG---T--AACA--------A------TT---GT-T-----A-CACT-A-----------G--G---A------A----T--------TG-----A----C-A-T---C----------G---CA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----A--------A--G--T----C------A---G---T-------T-TA------GT---TACACTA----GG---AAT--------T-G----A----C---A--C-CG---CA-A---CC-C----TTAA-TGT---A--AC--A-----A-A---TC------A------G---TTT-A---GT--------TACAC-T-AGGAAT-------TG-AC-A-C--CG---CA---A-CCCTTAG--T----G--C----C---A------A------CC-----C----T-----TAG------T---GTA--------A-C--------------------A---A------------A-------------------G-G---TT--G--------AC-A-C---------C--G---C-A--------A----------CC--C--T--TAGT-GTA-----A------C--A----A--------------------A-C-----------AA------TT--GT-TAC-ACT--AA----A-----------------GGT-T-------------T----T-----------TGTTACACTAAGGGTTGCCA-CAA-AGC-TGTGT----ATTTATTAT
gi|4 : TTCAGGAGATATAAA-TTTTGA---TGCA--TGCTTTGTG--GCAACCCTTAATGTAA------C-----AA-----A-----------C-------------TC-----AATT---T---------------------TT---GT-T-----A-CACTAA-----------G--G---G------A----T--------TG-----A------A-C---C----------G---TA--------A---CC--CCT---AAT----GTA--------A-C-A----A--------A--AC-C----C------A---T---T-------T-TT------GT---TACACTA----AG---GGT--------T-G---------T---G--G-TGT--CA-A---CC-CT---TTGA-T-T---A--AC--A-----A-A----A------A------A---T-------GT--------TACAC-T-A
gi|5 : gtatttttgtttttaatttttaagttaaagtttattggacaacaaatgagaaatatgtaaataatATAAAAAAT----AC--TAAAA-TACTATATATTGCAACCCTAAGTGTAA------T-----AA-----A---A-TC----C-------------TT-----AGTG---A--AACA--------A------TT---AT-T-----A-CACT-A-----------A--GTGCA------A----TACAATCAATGTTTT-A----CAA-T---T----------G---TT--------A---CA--CTA---AGT----GTA--------G-T-A----A--------T--A--T----CCATTTGG---G---T-------T-TT------GT---TACACTA----AA---GTT--------T-G----A----G---G--T-GT---CA-A---CC-C----TTAG-AGT---A--AC--A-----A--------------------------T-G---GT--------TACAG-T-Aaacgtatgtttggtgcatgtattgacatttgattataaaacgggttcactaagtgtaacacttttttttcaactagaaattcatttatccctgcttt
gi|24 : atttataaattaacacactttaattgttacgagaagagacatcaatagcgtagatttttctttatcagtatatTTTAGAA--TACA--T----TGTG--GCAACCCTTAGTGTAA------CA----AA-----A---A-CC----T-------------TT-----AGTG---T--AACA--------A------CT---aacgtagttatttttatcaaataaaaattatttatttccgctttgaaataggggtatatattgtt
gi|1 : ctaattccttggaatcatggagcagatccatttttgcTTTGACAATATAATTGCTTTGTG--GCAGCCATTAGTGAAA------A-----AA-----A---A-AC----C-------------TT-----AGTG---T--AACT--------A------TT---AT-T-----A-CATT-A-----------A--G---T------G----T--------TG-----A----A-A-C---C----------G---TA--------A---CC--CTT---ATT----GT---------A-C-A----A--------A--A--T----C------AT--T---T-------T-TT------GT---AACACTA----AG---GGT--------T------A----T---GT-C-CA---CA-T---CC-C----TTGT-TAC------AC--A-----A-A---TG------G------A---TTTCAGT-GT--------TACAC-T-AAGGGT-------T--ACGG-T--TG---CG---A-CCCTTAG--T----G--TAA--C---AATTGCTA------CA-----C----T-----TAG------C---GTA--------a
gi|9 : aacagaaataacaaatataccaatttctcaagtagatcttataaATA--CGATATGT----------TTATTTTAA------C-----AA-----A---A-CC-------------------------AATT---T---------------------TT---GT-T----------T-A-----------A--G---G------G----T--------TG-----C----T-G-T---T----------G---TG--------G---CC--CCT---AGT----GTA--------A-C-A----A--------A--AAAT----G------A---T---T-------T-T-------GC---TACACTA----AT---GGT--------T-G----T----G---A--T-TT---CC-A---CC-C----TTAG-TGT---A--AC--T-----A-A-----------A------GGT-TTT-T---GT--------TACAC-T-AAGGGT-------TG-CC-A-CAATG---CA---A-tgtttggtacatatattgacattttattataaaacgggttcacttagtgtaacaattttttttcaactataaatgaatttgcccctgctatgaaatgggggaatatagtgttaa
gi|7 : aaggaaaacaacaccaccaatccatgtatgtATG--TGCTCTGTG--GCAACCCTTAGTGTAA------CA----AA-----A---A-CC----C-------------TT-----AGTG---T--A--------------------------------A-CACT------------------------------------------------------------------------G---CA--------A---CC--ATT---AAA----TTA--------A-CAA----A--------A--A--T----G------G---G---T-------T-TA------GT---TACACTA----TG---GGT--------T------A----CG--G--T-TA---CG-A---CC-A----TTAA-TGT---A--AC--A-----A------------------------TT------GT--------TACAC-T-AAGgttttatacatgtattgacaattgattataaaatgggttcacttggtgtaacaatttttttcagttagaaattcatttgtccctgctttgaaatgggagcatattgtgttac
gi|22 : caagatatagttattgttacagtaacttactactctcaagggaaacagtgaccgttacattggtacagcTATATG--ACAGCCAT-AGTGTAA------C-----AA-----A---AACC----T-------------TT-----AGTG---T--AACA--------A------TT---GT-T-----A-TATT-T-----------G--G---G------G----T--------T------------------------------G---CA--------A----T--CTT---CGT----GTA--------A---A----A--------A--A--T----C------A---T---T-------T-Tcgtttgtttggtacatgtattgacatttgattataaaacgggttctcttggtgaaacaattgtttcaactagaaattaatttatccttgttatgaaatggggtcatatagtgttac
gi|2 : tagttcgacatttcaatTGTG--GCAACCCTTAGTGTAA------C-----AA-----A---AACT----C-------------TT-----AGTG---T--AACA--------A------TT---GT-TTTGTTA-TACT-A-----------A--G---G------A----T--------TG-----T----G-A-T---G----------T---CA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----A--------A--AC-C----C------A---T---T-------T-TT------GT---TACACTA----AG---GGT--------T-A----T----G---G--T-TG---CA-G---CC-C----TTTG-TGT---A--AC--A------------------------------TTT-----GT--------TACAC-T-Attattaatctagg
gi|9 : tgtacctatacaaaagtcttcacataacctgaaacaaagaaaaacatctcttttctattgcaagatagtgagtttTGTG--GCAACCCTTAGTGTAA------C-----AA-----A---A-AC----C-------------T-----------------------------------TTA--GT-T-----A-CACT-A-----------A--G---G------G----T--------GG-----A----A-A-T---C----------A---CA--------A---CC--ATT---AGT----GTA--------G-C-A----A--------A--A--T----C------AT--T---T-------T-TT------GT---TACACTA----GG---GGC--------C------A----CA--A--C-AG---CA-A---CC-C----TTAA--AC---A--A---A-----A-A---TT------G------G---TTT-T---GT--------TAaatgtatgtttggtacatgtattgacatttgaatataaaacaggttcacttagtgttacattttttttcaaatagaaatttatttatcctgctatgaaatgggggcatatagtgttatc
gi|23 : aaggaaaacaacaccaccaatccatgtatgtttgcatTGTG--GTAACCCTTGGTGTAA------CA----AA-----A---A-CC----C-------------TT-----AGTG---T--AACA--------A------TT---G-----------------------------------------A----T--------T---------------C---C----------G---CA--------A---CT--CTT---AGC----GTA--------A-C-AT---A--------A--C--C----C------A---T---T-------T-TT------GC---TACACTA----AG---GGT--------T-G----C----C---A--C-aaataaacatatcgtatgttttatacatgtattgacaattgattataaaatgggttcacttggtgtaacaatttttttcagttagaaattcatttgtccctgctttgaaatgggagcatattgtgttac
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gi|23 : tttacatgaattcataaacgacatcgcatacgtcatctcatcatcttaggcgcGTG--GCAACCCTTAGTGTAG------C-----AA--------------------------------A-----AATGGGTT--A-------------------T---GT-T-----A-CGCT-A-----------A--G---A------G----T--------TG------------------C----------G---GA--------A---TC--A-----ATT----GTT--------A-C-ACT--A--------A--G--------------G---GT--T-------T-TT------GT---TACACCA----AG---GGT--------T-A----C----C---A--C-ttttttcaactagaaatgtatttatccctgctatgaaatgggggcatatagtgttac
gi|21 : aagtgcagtaacccctGTG--TCAACCCTTAATGTAA------C-----AA-----------------T-------------TA-----AGCG---T---ATG--------T------TT---GG-T-----A-CATT--------------------T------A----T--------TG-----A----C-A-T---
gi|28 : ttgttccactaagggttgcgGTG--TCAACCCTTAGTGTAA------C-----AA-----ttgattataaaacgggttcacttagtgcaacattttttttcaactagaaatgtaattatccc
gi|29 : tttttgtcctgttgcgGTG--TCAACCCTTAGTGTAA------C-----AC-----A---A-tt
gi|11 : TG--GCAACCCTGAGTGTAA------C-----AA-----A---AACC----C-------------TT-----AGTG---T--AACA--------A------TT---GT-T-----A-CACC-------------G--C---A------ACCCTT--------TT-----T----T-A-T---T----------G---TAATAAT---A---CA--CTT---AGG----GTA--------A-C-AACTGA--------A--A--C----CCTTATTG---A---T-------T-TT------GT---GACATAA----AG---GGT--------T------A----CG--G--T-TG---CG-A---CC-C----TTAG-TGT---A--AC--A-----A------------------------TT------GT--------TACAC-T-AAGattgattt
gi|15 : TG--GCAACCATTTGTGTAA------C-----AA-----A---A-AG----T-------------TA-----A---------AACC--------C------TT---GG-T-----G----T-A-----------G---------------------------TG-----G----T-G-T------------------CA--------A---AC--CTT---CGT----GTA--------A-C-A----A----------------------------------T-------T---------GT---TACACTA----AG---cgtatgttgtgaccatgtattgacatttgattataaaactgattcacttagtgtaaaaattattagaaatttatttgtccctgctatgaaatgggggaatacagg
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gi|3 : tttacatgaattcataaacgacatcgcatacgtcatctcatcatcttag--GCAACCCTTAGTGTAA------T-----AA-----A---A-A-------------------TA-----GAT----T---------------------TT---GT-T-----A-CACT-A-----------A--G---G------G----T--------TG-----C----G-G-T---G----------T---CA--------A---CC--CTT---AGT----CTA--------A-C-T----A----------------------------------T-------T---------GT---TACACTA----AG---GCT--------T-G----C----C---A--T-Cggttgtgacccctagtgtaacactaagcgtatgtttggtacatgtattaacatttgattataccaccggtacacttagtgtaataattttttcaactagaaatgtatttatccctgctatgaaatgggggcatatagtgttac
gi|13 : ttttaatattttgtgtgttagtcaaagcatacccttatcgagtcattcgcgtt--GCAGCCCTTAGTGTAA------C-----AC-----A---A-TC-------------------A-----AGT----T---------------------TT---GT-C-----A-CACT-A-----------G--G---G------A----TCA------TA-----A----C-------C----------G---CA--------A---CC--TTT---AGT----ggtgtcaacccttagtgtaacacaatttgattttttttattttgaggggtcgcaaccataacccttagttacactaagcgtatgtttagtacatgtattgacatttgattataaaacgggctcactcagtgttgttgttttttttcaaatataattttttatccctgctttgaaatggaggtatatagtgttacc
gi|5 : gttttgtcatactagggagcataaccCAAACTTTAGTGTAA------C-----AA-----A---A-CC----CAAATGGATATTACTACACTTAGTG---T--AACA--------A------TT---GT-A-----A-AAC----------------------------A----T--------TG-----ATTG-T-A-T---T----------G---CA----------------CTT---AGT----GTA--------A-T-A----A----------------------------------T-------T---------GT---TTCACTA----AG---GAT--------T-aagggccacgatactaagcgtatgttttgtacatgaactgacatttggctaatgaattggttcacttagtgttacaaattattttccaactagaaatgtgtttgtccctgctgtgaaatggcgaaatgtagtgttaca
gi|2 : atttataaattaacacactttaattgttacgagaagagacatcaatagcgtagatttttctttatcagtatatataaaaaatactaaaatactatatattgcaaccctaagtgtaataaAACCCTTAGTGTAA------C-----AA--------------------------------A-----AATGGGTT---------------------TT---GT-T-----A-CACT-A-----------A--G---G------G----T--------TG-----A----C-A-T---C----------A---CA--------A---TC--CTT---AGT----ATA--------A-C-A----A--------A--A-------C------A---A---T-------T---------GT---TACACTA----AG---AGT--------T-aggtgtcaacccttagagtaacaatggttacagtaaacgtagttatttttatcaaataaaaattatttatttccgctttgaaataggggtatatattgtt
gi|15 : tgtacctatacaaaagtcttcacataacctgaaacaaagaaaaacatctcttttctattgcaagatagtgagttttgtggcaacccttagtgtaacaaaAACCCTTGGTGTAGTGGTGTC-----AA-----A------C----C-------------TT-----CGTG---T--AACA--------A------TT---GT-T-----A-CACT-A-----------A--G---atggttgcagccctttgtgtaacatttgttacactaaatgtatgtttggtacatgtattgacatttgaatataaaacaggttcacttagtgttacattttttttcaaatagaaatttatttatcctgctatgaaatgggggcatatagtgttatc
gi|19 : tggcaaccatttgtgtaacaaaaagttaaACCCTTAGTGTAA------C-----AA-----A---A-TCT---C-------------TT-----AGTG---T--AACA--------A------TT---GT-T-----A-CACT-A-----------cctaggtttggtacgtatattgatatttgataataaaacagattcacttagtgtaacaatttttttttcaactagaaatttatttatccctgctatgaaataggggcatatagtgtt
gi|16 : ACCCTAAGTGGAA------CTTATGAT-----A---A-TC-------------------A-----AATG---T----CA--------A------TA---CA-T-----A-TACC-A-----------A----------------------------------A----C-A-T----------------------------A---CG--CTT---CGT----GTA--------A-C-A----A-----------------------------------------------------T---TACACTA----AG---GGT--------T-G----A----C---A--C-CA---CA-GC--CC-C----TTAG-TGT---A--AT--A-----A-A---aacgtatgtttggtacatgtattggcctttgattataaaacgggttcacttagtgtaacaatttttttcaactagaaatttatccctgctttgaaatggaggcatatagtgttact
gi|12 : tACGCTTAGTGTAA------C-----AATTGTCA---A-CC----C-------------TT-----AATG---T--A--A--------G------TT---GT-T-----A-CACT-A-----------aacaatgtttgttcaactagaaatgtatttatccctgctatggaatgggggaatatggtgtt
gi|14 : ttttaaatgtgagaataaaacaagctgttaaaagtgaaatattcctatattgattgagctaattgcataaaCCTTAGTGTAA------C------A-----A---A-CC----C-------------T------------------TA--------A------TT---GT-T-----A-CACT-A-----------A--G---G------G----C--------TA-----AGGGTC-A-TAGCC----------G---CA--------A----C--CTT---AAT----GTA--------A-C-A----A--------A--A--C----CCTT---A---A---T-------T---------GT---TACACTA----AG---GGC--------T-A----AGGGTCATAA--C-CG---CA-A----C-C----TTAG-TGC---AGTAA--A-----A-A---TG------G------G---TTT-T---AT--------TACAA-T-AAGGGT-------T-----A-C--GG---T---------------T----G--C----G---A------A-------C-----C----T-----CAG------T---GTA--------A-C--------------------A---A--------------------------------------TT--G--------TC-A-----------C--G---C-------------------------------------------------------------------------------------------------------T--GT-TAC-ACT--AA----G-----------------GGT-T-------------T----T-----------TGTTACACTAATGGTTATCA-Catatttggaacatgtattgacatttgattataaaacaggttcacttagtgaaacaaagtttgtttttttttattaaaaatttattgatccctgcaatgaaatgggggtatattgtgttaccc
gi|12 : TAGTGTAA------C-----AA-----CTT-A-CA----T-------------TA-----AGGG---TT-GACA--------A------TT---GT-T-----A-CACT-AAGCGTATATTTG--G---AACATGTA----T--------TG-----A----C-A-T---TTGATTATAAAA---CA--------GGTTCA--CTT---AGT----GAA--------A-C-A----A--------A--G--T----T------T---G---T-------T-TT------TT---TTTATTA----AA---AAT--------T-
gi|1 : ttttaaatgtgagaataaaacaagctgttaaaagtgaaatattcctatattgattgagctaattgcataaaTGTAC------C-----AA-----ACATA-CG----C-------------TA-----AGTG---T--AGCA--------A------TT---GT-T-----A-CACT-A-----------A--G---G------G----T--------CG-----C----A-A-C---C----------G---TA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-ACTG-A--------A--A--T----C------C---A---T-------T-TGT-----GT---AACA--A----GG---GATG-------TGG----A----C---A---------TA-A---CC-C----TTAG-TGTTACA--AA--A-----A-A---TG------A------T---TTT-G-------------TACAA-T-AAGGGT-------TA---------CG----------------G--T----T--T----C---A------A------CA-----C----T-----TAA------T---GTA--------A-T--------------------A---A------------T-------------------A-G---TT-----------AC-A-C---------tattgatccctgcaatgaaatgggggtatattgtgttaccc
gi|4 : aacagaaataacaaatataccaatttctcaagtagatcttataatttgacaatataattgctttgtggcagccattagtgaaaaaaaaaccttaTGCAC------C-----AA-----ACATA-CG----T-------------TT-----AGTG---T--AACA--------T------TTTTTGT-T-----A-ATCA-A-----------A--G---G------G----T--------TG-----A----C-A-C---C----------A---CA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-CAA----A--------A--A--T----G------G---G---T-------T-TT------GT---TACATTA----GG---GGT--------T------A----C---G--G-TT---CA-AT--CC-C----TTAG-TGT---A--AC--A-----A-AAATTG------A------G---TTT-----GT--------TACAT-T-AAGGGT-------TG-CC-A-C--tatattgacattttattataaaacgggttcacttagtgtaacaattttttttcaactataaatgaatttgcccctgctatgaaatgggggaatatagtgttaa
gi|10 : gtatttttgtttttaatttttaagttaaagtttattggacaacaaatgagaaatatgtaaataatttcaggagatataaattttgatgcatgctttCAA------C-----CA-----T---A-CT----C-------------TT-----AGTG---T--AACA--------A------CT---AT-T-----AACGCT-A-----------A--G---G------G----T--------CG-----C----A-A-C---C----------G---TA--------A---CC--TTT---ACT----GTA--------A-C-A----A--------A--A--C----C------C---A---T-------A-TT------GT---TACACTT----AG---GGT--------T------A----C---GG-T-TA---TG-A---CC-C----CTAG-CGT---A--GCCAA-----A-A---TG------A------T---TTT-----GA--------TACAC-T-AAGAAT-------TG-AT-G-T--TT---CA---A-CCCTTGG--T----tgtattgacatttgattataaaacgggttcactaagtgtaacacttttttttcaactagaaattcatttatccctgcttt
gi|11 : ggtagtcctgcatgtaacaaaaacccttagtatatA------C-----AA-----A-------------------------TA-----AATT---TCTAATA--------A------TT---TT-T-----A-CACT-A-----------A--G------------------------TG-----A------A-T---C------------------------A---GT--TTT---A-------TA--------ATC-A----A--------AT-G--T----C------A---A---T-------------------------AC------------AT--------G-G----T----C---A--C-AA---CATA---CG-C----TTAG-TGT---A--AC--A-----A-------------------------TT-----GT--------TACAC-T-AAGGGT-------CG-CA-A-C--CG---TA---A-CCCTTTA--T----G--T----C---A--------------------C----A-----AAA------T----CA--------A-T--------------------A---A------------G-------------------G-G---TT--T---------C-AGT---------T--G---T-T--------A----------CC--C--T--AAGT-GTATTATTA------C--A----ATAAAAAAGGGTTGCGGTGTAA-C-----------AA------TT--GT-TAC-ACT--AA----G-----------------GGT-T-------------T----T-----------TGTTACACTCAGGGTTGCCA-gtacatgtattgaccgttgtttataaaataggttttcaactagaaatgtatttgtctctgccatgaaatgtaggcatatag
gi|15 : A------C-----CA-----A---A-CCTAGGC-------------TT-----AGTG---T--AACA--------A------TT---GT-T-----A-CACG-A-----------A--G---G------T----T--------TG-----A----C-A-C---C----------A---CT--------A---Cccctgctatgaaatgggggaatacagg
gi|3 : tggcaaccatttgtgtaacaaaaagttaaaacccttggt-----A---A-GC----C-------------TT-----AGTG---T--AACA--------A------TA---GT-T-----A-GACT-A-----------A--G---G------G----T--------TG-----A----C-A-C---C----------G---CA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----A--------A--A--T----CT-----A---T---T-------T-TT------AT---TACACTA----AG---GGT--------T-G---------C---G--G-TGT--CA-A---CC-C----TTAG-TGT---A--AC--AC----A-A---TTTG----A------T---TTT-T---TT--------TATTT-TGAGGGGT-------CG-CA-A-C--CA---TA---A-CCCTTAG--T----acgtatattgatatttgataataaaacagattcacttagtgtaacaatttttttttcaactagaaatttatttatccctgctatgaaataggggcatatagtgtt
gi|22 : ttttaatattttgtgtgttagtcaaagcatacccttatcgagtcattcgcgttgatggc-----A---A-CC----C-------------CA-----AATA---T--AACA--------A------TT---GT-T-----A-CACT-A-----------tacactaagcgtatgtttagtacatgtattgacatttgattataaaacgggctcactcagtgttgttgttttttttcaaatataattttttatccctgctttgaaatggaggtatatagtgttacc
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gi|10 : C----C-------------TG-----CATG---T--AACA--------AAAACCCTTA--GTAT-----A-TACC-A-----------A--G---G------G----T--------TG-----AAA--C-A-T---C---------------A--------A---TT--CTT---AGT----GTA--------T-C-A----A--------A--A--T----C------A---T---T-------T-TG------GC---TACGCTA----GG---GGT--------C-A----T----A---A--C-CG---TA-A---CC-C----TAAG-TGT---A--AC--A-----ATA---TG------G------G---TTT-T---GT--------TACAG-T-AAAGGT-------T--ACGG-T--TG---CG---A-CCCTTAG--C----G--T----T---A------A------------------------TAGT-----T---GTT--------A-C--------------------A---aacaatgtttgttcagttagaaatgtatttatccctgctatggaattggggcatattgtgtt
gi|8 : ggtagt----C-------------TA-----GTTG---A--AAAA--------A------TT---AT-T-----A-CACT-A-----------A--G---T------G----TACCGG---TG-----G----T-A-T---A----------AT--CA--------A---AT--GTT---AATACATGTA--------C-C-A----A--------A----------C------ATACG---C-------T-TA------GTGT-TACACTA----GG---GGT--------C------A----CA--A--C-CG---TA-A---CC-C----TTAG-TGT---A--AC--A-----A-AAC-CC------A------T---TTT-T---GT--------TACAC-T-AA-----------TG---------CG----------------G--T----G--T----C---A------A------TCCG---C----T-----TAG------T---GTA--------A-C--------------------A--------------------------------------G---TT-----------AC-A-C---------ctaagagtatggttggtacatgtattgaccgttgtttataaaataggttttcaactagaaatgtatttgtctctgccatgaaatgtaggcatatag
gi|7 : tttacatgaattcataaacgacatcgcatacgtcatctcatcatcttaggcgcgtggcaacccttactgcaactaaaaccctta----C-------------TA-----GTTG---A--AACA--------A------TT---GT-T-----T-CACC-A-----------A--G---A------G-------------------------------------------------A--------A---CC--CGT---TTT----ATA--------ATC-A----A--------AT-G--T----C------A---A---T-------A-CA-----------TGTACCA----A----------------------A----C---A----------A-A---CG-C----TTAG-TGT---A--AC--A-----A-------------------------TT-----GT--------TACAT-T-A---AT-------GG------T--CG---TA---A-CC----G--T----------------A------A------CC-----C----A-----TAG------T---GTA--------A-C--------------------T---A------------A-----------------------------------------A-C---------C------C-A--------T----------TT--T--TGTTAAT-TTA-----A------T--G----GTT------------------G-C-----------AG------T---GT-TAC-ACT--AA----G-----------------GGT-T-------------T----T-----------TGTTACACTAAGGGTTGCCA-CAG-AGC-aaatgtatttatccctgctatgaaatgggggcatatagtgttac
gi|2 : caagatatagttattgttacagtaacttactactctcaagggaaacagtgaccgttacattggtacagcatgt-----AGTG---T--AACA--------A------AT---GT-T-----A-CACA-A-----------A--G---G------G----C--------TG-----C----A-A-C---C----------A---TA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----A--------A--AA-T----G------G---G---T-------T-TT------GT---TACACTA----AG---GGT--------T-G----A----C---A--T-CA---CA-A---TC-C----TTAG-TAT---A--AC--A-----A-A---AC------A------A---TT------GT--------TACAC-T-AAGAGT-------Taaattaatttatccttgttatgaaatggggtcatatagtgttac
gi|19 : tgtacctatacaaaagtcttcacataacctgaaacaaagaaaaacatctcttttctattgcaagatagtgagttttgtggcaacccttagtgtaacaaa-----AGTG---T--AACA--------A------TT---GT-T-----A-CACT-A-----------A--G---AG-----A----T--------Taaatgtatgtttggtacatgtattgacatttgaatataaaacaggttcacttagtgttacattttttttcaaatagaaatttatttatcctgctatgaaatgggggcatatagtgttatc
gi|5 : acccttagtgtaacaaTG---T--AACC--------A------TT---GT-T-----A-CTCT-A-----------A--G---G------G----T--------TG-----A----C-A-C---C----------T---CA--------A---AC--TTT---AGT----GTA--------A-C-A----A--------A--A--C----C---------------------------------------CA------------AAT--------G-G----A----T---A--T-TA---CT-A---CA-C----TTAG-TGT---A--AC--A-----A-aaacgtatgtttggtacatgtattggcctttgattataaaacgggttcacttagtgtaacaatttttttcaactagaaatttatccctgctttgaaatggaggcatatagtgttact
gi|21 : atttataaattaacacactttaattgttacgagaagagacatcaatagcgtagatttttctttatcagtatatataaaaaatactaaaatactatatattgcaaccctaagtgtaataaaatccttagtgaaacaattattacactaagtgcaatacaatcaatgttttacaaA--------A------TT---GT-T-----A-CATT-A-----------A--G---G------G----T--------TG-----A----C-A-C---C----------G---CA--------A---CC--CTT---AGT----GGA--------A-C-A----A--------gtaaacgtagttatttttatcaaataaaaattatttatttccgctttgaaataggggtatatattgtt
gi|28 : A--------A------TT---GT-T-----A-CACT-A-----------A--G---G------G----T--------TG-----A----C-A-C---C----------G---CA--------A---Caagcgtatgtttggtacatttattgacatttgattataaaacgggttcacttagtgcaacattttttttcaactagaaatgtaattatccc
gi|24 : tttttgtcct--------A------TT---TT-T-----G-CTTT-A-----------G------A------A----T---------------A----C-A-T---T----------GTGGCA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----A--------A--A--A----C----------C---T-------T-TA------GT---
gi|13 : ctaattccttggaatcatggagcagatcc------TT---GT-C-----A-TACT-A-----------G--G---G------A--------------------G----C-A-TAACC----------G---CA--------G---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----C--------A--A--T----CA-----A---G---T-------T-TT------GT---CACACTA----GG---GAT--------C-A----T----A---A--C-CG---CA-A---CC-T----TTA---GT---A--Agtaacaacta
gi|21 : gtt------TT---GT-T-----C-CACT-A-----------A--G---G------G----T--------TG-----C----G-G-T---G----------T---CA--------A---CC--CTT---AAT----GTA--------A-C-A----A--------gggccacgatactaagcgtatgttttgtacatgaactgacatttggctaatgaattggttcacttagtgttacaaattattttccaactagaaatgtgtttgtccctgctgtgaaatggcgaaatgtagtgttaca
gi|16 : ------TT---AT-T-----A-CACT-AA----------G--G---G------G----C--------TG-----T----G-G-T---G----------T---CA--------A---CC--CTT---AGT----GTAATTGTTACA-C-G----A--------AGCG--T----A------T---G---T-------T-TG------GTATATGTATTG----AC---ATT--------T-G----AT---T---A--T-CA---TA-AGTTCCAC----TTAG-GGT---A--AC--------A-A---T--------------G---TTT-----GT--------TCAAC-T-AGAAAT-------ttaagcgtatgtttggtacatttattgacatttgattataaaacgggttcacttagtgcaacattttttttcaactagaaatgtaattatccc
gi|8 : ttT---GT-T-----A-CACT-A-----------G--G---G------G----T--------C------A----C-AAC---C----------G---TA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----A--------A--A--C----CC-----A---T---T-------T-TT------GT---TACACTAATGCGG--------------T-G----T----C---AATC-CG---C--------------TTAG-TGT---A--AC--AGTTACA-C---TA------A------GGGTTTT-A---GT--------TGCAG-T-AAGGGT-------TG-CC-A-CG-CG---Cgtatttatccctgctatggaatgggggaatatggtgtt
gi|3 : tttacatgaattcataaacgacatcgcatacgtcatctcatcatcttagT---GT-T-----A-CACT-A-----------A--G---G------G----T--------TG-----A----C-A-C---C----------G---CA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-T-A----A--------A--A--A----T------A---GA--T-------T-TT------GT---TACACTA----AG---GGT--------T-G---------C---G--G-TGT--CA-A---CC-C----TTAG-TCT---A--AC--T-----A------------------------TT------GT--------TACAC-T-AAGGCT-------TG-CC-A-T--Cctaagcgtatgtttggtacatgtattaacatttgattataccaccggtacacttagtgtaataattttttcaactagaaatgtatttatccctgctatgaaatgggggcatatagtgttac
gi|20 : ttttaatattttgtgtgttagtcaaagcatacccttatcgagtcattcgcgttT-T-----A-CACT-A-----------A--G---G------G----T--------CGCAA--A----C-A-T-------------------A--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-caatttgattttttttattttgaggggtcgcaaccataacccttagttacactaagcgtatgtttagtacatgtattgacatttgattataaaacgggctcactcagtgttgttgttttttttcaaatataattttttatccctgctttgaaatggaggtatatagtgttacc
gi|20 : T-T-----A-CACT-A-----------A--G---G------G----T--------T------A----T-G-T---TT---------G---CG--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------AGC-A------------------------C------AT--G---T-------T-TT------G----TACAT-------G---TAT--------T-G----A----C---A--gcacatgttttgtacatgtattgacatttgattataaaacgggttcactaagtgtaacacttttttttaactagaaatgtattcatccctgctatgaaattggggtatatggtgttacc
gi|3 : ACT-A-----------A--G---G------G----T--------TA-----T----G-G-T---T----------G---CG--------A---CC--CCTCAAAAT----A-A--------A-A-A----A--------A--A--T----C------A---A---A-------T-TGT-----GT---TACACTA----AG---GGT--------T-G----A----C---A--C-CG---CA-A---CC-C----TTAG-TGT---A--AT--A-----A-AAA-TA------G------A---TTT-T---GT--------TACAC-T-AAGGGT-------TG--C-G-G--TGT--CA---A-CCCTTAG--T-------C----T---A------A------C-----------------TAT------T---GTT--------A-C--------------------ACT-A------------A-------------------G-GC--TT--G--------CC-A-T---------C--tttgattataaaacgggttcactaagtgtaacacttttttttaactagaaatgtattcatccctgctatgaaattggggtatatggtgttacc
gi|5 : ttttaatattttgtgtgttagtcaaagcatacccttatcgagtcattcgcgtt-----A----T-A-T---T----------G---CA--------A---CC--CTA---AGT----GTA--------A-T-A----A--------A--A--T----CCTT---A---G---TGAAACAAT-TA-------T---TACACTA----AGTGCAATACAATCAAT-GTTTTA----CA--A--T-TG---TT-A---CA-C----TAAG-TGT---A--GT--A-----ATA---TCCATTTGG------G---TTT-T---GT--------TACAC-T-AAAGTT-------TG-A------------------------GG--T----G--T----C---A------A------CC-----C----T-----TAG------A---GTA--------A-C--------------------A---A------------T-------------------G-G---TT-----------AC-A-tacactaagcgtatgtttagtacatgtattgacatttgattataaaacgggctcactcagtgttgttgttttttttcaaatataattttttatccctgctttgaaatggaggtatatagtgttacc
gi|3 : atttataaattaacacactttaattgttacgagaagagacatcaatagcgtagatttttctttatcagtatatataaaaaatactaaaatactat-A-T---G----------G---CA--------A---GC--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----A--------------------------------------------TA------GT---TAGACTA----AG---GGT--------T-G----A----C---A--C-CG---CA-A---CC-C----TTAG-TGT---A--ACA-A-----A-A---TCT-----A------T---TTT-T---AT--------TACAC-T-AAGGGT-------TG---------CG----------------G--T----G--T----C---A------A------CC-----C----T-----TAG------T---GTA--------A-C--------------------A---C------------A-------------------A-T---TT--G--------Agtaaacgtagttatttttatcaaataaaaattatttatttccgctttgaaataggggtatatattgtt
gi|2 : ttttaatattttgtgtgttagtcaaagcatacccttatcgagtcattcgcgttg----------G---CA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----AAAACTCTTA--G--TGTAAC------AATTG---T-------T-TT------GT---TATACTA----AG---GAT--------T-G----T----G---A--T-GT---CA-A---CC-C----TTAG-TGT---A--AC--A-----A-AAC-CC------A------T---TTT-T---GT--------TACAC-T-AAGGGT-------TA-TG-G-T--TG---CA---G-CCCTTTG--T----G--ttttttttattttgaggggtcgcaaccataacccttagttacactaagcgtatgtttagtacatgtattgacatttgattataaaacgggctcactcagtgttgttgttttttttcaaatataattttttatccctgctttgaaatggaggtatatagtgttacc
gi|4 : tgtacctatacaaaagtcttcacataacctgaaacaaagaaaaacatctcttttctattgcaagatagtgagttttgtg----------G---CA--------A---CC--CTT---AAT----GTA--------A-C-A----A--------A--C--T----C------A---A---T-------T-TTT-----GT---TACACTAA---GG---GAT--------T-G----A--------A--C-CG---TA-A---CC-C----CTAA-TGT---A--AC--A-----A-AAC-CC------A------T---TTT-T---GT--------TACAC-T-AAGGGT-------TG-------------------------TGG--T----G--T----C---A------A------CC-----C----T-----TTG------A---TTA--------A-C--------------------A---A------------A-------------------taacatttgttacactaaatgtatgtttggtacatgtattgacatttgaatataaaacaggttcacttagtgttacattttttttcaaatagaaatttatttatcctgctatgaaatgggggcatatagtgttatc
gi|9 : gtatttttgtttttaatttttaagttaaagtttattggacaacaaatgagaaatatgtaaataatttcaggagatataaattttgatgcatgctttgtg----------G---CA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----A--------A--A--A----C----------C---T-------T-TA------GT---TACACTA----AG---GGT--------G-G----A----A---A--T-CA---CA-A---CC-A----TTAG-TGT---A--GCA-A-----A-A---TC------AT-----T---TTT-T---GT--------TACAC-T-AGGG---------------G-C--CA---CA---A-C----AG---------------C---A------A------CC-----C----T-----TA-------------A--------A-C--------------------A---A------------A-------------------A-A---TT--G--------aaatgttacactaaacgtatgtttggtgcatgtattgacatttgattataaaacgggttcactaagtgtaacacttttttttcaactagaaattcatttatccctgcttt
gi|23 : aaggaaaacaacaccaccaatccatgtatgtttgcattgtg----------G---TA--------A---CC--CTT---GGT----GTA--------A-C-A----A--------A--A--A----C------C-------C-------T-TA------GTG--TA-AC-----------AAT--------T-G----A----T---T--C-CG---CA-A---CT-C----TTAG-CGT---A--AC--AT----A-AC--CC------A------T---TTT-T---GC--------TACAC-T-AAGGGT-------TG-CC-A-C--gttttgttaaaataaacatatcgtatgttttatacatgtattgacaattgattataaaatgggttcacttggtgtaacaatttttttcagttagaaattcatttgtccctgctttgaaatgggagcatattgtgttac
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gi|11 : aagtgcagtaacccct----------G---CA--------A---CC--CTG---AGT----GTA--------A-C-A----A--------A--A--A----C----------C---C-------T-TA------GTG--TA-AC-----------AAT--------T-GTT--A----C---A--C-CG---CA-A---CC-CTTTTTTAT-TGT---A--AT--A-----A------------------------------------------TACACTT-AGGG---------TA-ACAA-C--TG---AA---A-CCCTTAT--T----G-----------A--------------------T----T-----TTG------T---GAC--------A-T--------------------A---A------------A-------------------G-G---GT--T--------ACGG-T---------T--G---C-G--------A----------CC--C--T--TAGT-GT---------------------A--------------------A-C-----------AA------TT--GT-TAC-ACT--AA----G-----------------CGTAT-------------G----T-----------TGTGACcac
gi|7 : tg----------G---CA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----A--------A--A--A----C------C-------C-------T-TA------GT---------------G--------------T-A----A----C---A--C-TG---CA-A---CC-A----TTAA-ATT---A--AC--A-----A-AAA-TG------G------G---TTT-A---GT--------TACAC-T-ATGGGT-------T-----A-C--GG-------------TTA----------------C---G------A------CC-----A----T-----TAA------T---GTA--------A-C--------------------A---A------------T-------------------T-G---TT-----------AC-A-C---------catgtattgacatttgattataaaactgattcacttagtgtaaaaattattagaaatttatttgtccctgctatgaaatgggggaatacagg
gi|28 : caagatatagttattgttacagtaacttactactctcaagggaaacagtgaccgttacattggtacagcatgtgctctgtg---CA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----A--------taagcgtttgtttggtacatgtattgacatttgattataaaacgggttctcttggtgaaacaattgtttcaactagaaattaatttatccttgttatgaaatggggtcatatagtgttac
gi|29 : tttttgtcctgttgcggtgt---CA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-AC---A--------A--A--T----T------G---A---T-------T-Ttt
gi|1 : gtgtA--------A---AC--CTT---AGT----GTA--------A-C-T----A------------------------------------------T-TA-------T---TACATTA----AG---TGT--------T-G----A----A---A--C-CG---TA-A---CC-C----TTAT-TGT---A--CA--A-----A-A---TC------A------T---TTT-TT--GT--------AACAC-T-AAGGGT-------T--AT-GTC--CA---CA---T-CCCTTGT--T----A--CA---C---A------A------ATGGAT-T----T-----CAG------T---GTT--------A-C--------------------ACT-A------------A-------------------G-G---GT--T--------AC-GGT---------T--G---C-G--------A----------CC--C--T--TAGT-GT---------------------A--------------------A-C-----------AA------TT--GC-TAC-ACT--TA----G-----------------CGTATG------------T----T-----------TGGTACA
gi|14 : aacagaaataacaaatataccaatttctcaagtagatcttataatttgacaatataattgctttgtggcagccattagtgaaaaaaA--------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----G--------C--G--TGA--C------A---A---T-------T---------GT---TACACTG----AG---GTT--------C-G----C----A---A--C-CG---TA-A---CC-C----TTAT-TGT---A--AT--A-----A-AAC-CC------A------T---TTT-T---AC--------TGCAC-T-AAGGTTGCGGTTATG-AC---C--CT---TA---G-CCCTTAG--T----G--T--------A------A------CA-----A----T-----TAAGGGTTTT---GTT--------A-C--------------------ATT-A------------A-------------------G-G---TT--GCGGCTATGAC---C---------C--T---T-A--------G----------CC--C--T--TAGT-GTA-----A------C--A----A--------------------T-T-----------AAGGGT--TT--GT-TAC-ACT--AA----G-----------------Gtatattgacattttattataaaacgggttcacttagtgtaacaattttttttcaactataaatgaatttgcccctgctatgaaatgggggaatatagtgttaa
gi|1 : gtgataaccattagtgtaacaaa--------A---CG--CTA---AGT----GTA--------G-C-A----A------------------------------------------T-T-------GT---TACACTA----AG---GGT--------C-G----C----A---A--C-CG---TA-A---CC-C----TTAG-TGT---A--AC--ACTGA-A-A---TC------C------A---TTT-GT--GT--------AACA----AGGGATG------TGGAC-A-T--------A---A-CCCTTAG--T----G--TTA--C---A------A------AAAATGAT----T-----TTG------T---ACA--------A-T--------------------A---A------------G-------------------G-G---TT--------------A-C---------G--GTTTC-A--------A----------CA--C--T--TAAT-GTA-----A------T--A----A------------------------------------------TA--GT-TAC-ACT--AA----------------------GGT-T-------------T----T-----------TTTTTCACTAATGGCTGCCA-CAA-AGC-
gi|3 : aacagaaataacaaatataccaatttctcaagtagatcttataatttgacaatataatt--------A---CG--CTT---AGT----GTA--------A-C-T----A--------A--G--------------G---G---T-------TATG------GT---TGC--------------------------G----A----C---C--C-CT---CA-A-------------AA-TAA---A--AA--A-----A-A---TC------A------A---ATT-GT--GT--------TACAC-T-AAGGGT-------TG-AC-A-C--CG---CA---A-CCCTTAG--T----G-------T---A------A------------------TAAAAATAGATTT--T---GTT--------A-CACT-----------------A---A------------G-------------------G-G---TT--G---------C-G-G---------T--GT--C-A--------A----------CC--C--T--TAGT-CT---------------------A--------------------A-C-----------TA------TT--GT-TAC-ACT--AA----G-----------------GCT-T-------------atgtttggtacatatattgacattttattataaaacgggttcacttagtgtaacaattttttttcaactataaatgaatttgcccctgctatgaaatgggggaatatagtgttaa
gi|10 : ttttaatattttgtgtgttagtcaaagcatacccttatcgagtcattcgcgttgatggc--------A---CT--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----A------------------------------------------C-TA------TT---AACGCTA----AG---GGT--------C-G----C----A---A--C-CG---TA-A---CC-T----TTAC-TGT---A--AC--A-----A-AAC-CC------A------T---ATT-----GT--------TACAC-T-TAGGGT-------T-----A-C--GG-------------TTA---T----G------------------A------CC-----C----C-----TAG------C---GTA--------G-CCA------------------A---A------------A-------------------T-GATTTT--G--------AT-A-C---------A--C---T-A--------A----------GA--A--T--TGAT-GTT-----T------C--A----A--------------------C-C-----------CT------TG--GTATAT-ACT--AA----G-----------------GGT-T-------------T----T-----------TGTTACATGCAGGACTACCatgtttagtacatgtattgacatttgattataaaacgggctcactcagtgttgttgttttttttcaaatataattttttatccctgctttgaaatggaggtatatagtgttacc
gi|19 : --------A---CC--CTT---AGT----GTA--------A-C-A----A--------A--A--T----CTCTT--A---G---T-------G-TAACAATTGT---TACACTA----atggttggtacatgtattgaccgttgtttataaaataggttttcaactagaaatgtatttgtctctgccatgaaatgtaggcatatag
gi|15 : --CTT---AGT----GTA--------A-C-A----A------------------------------------------T-T-------GT---TACACGA----AG---GTT--------T-G----A----C---A--C-CA---CT-A---Caacgtatgtttggtacatgtattggcctttgattataaaacgggttcacttagtgtaacaatttttttcaactagaaatttatccctgctttgaaatggaggcatatagtgttact
gi|2 : tggcaaccatttgtgtaacaaaaagttaaaacccttggtTT---AGT----GTA--------A-C-A----A--------A-----------------------------------T-------GT---TACACAA----AG---GGC--------T-G----C----A---A--C-CA---TA-A---CC-C----TTAG-TGT---A--AC--A-----A-AAA-TG------G------G---TTT-T---GT--------TACAC-T-AAGGGT-------TG-AC-A-T--CA---CA---A-TCCTTAG--T----A-------T---A------A------C------------------AA------------A--------A-C--------------------A---A------------T-------------------T-G---TT-----------AC-A-C----------------T-A--------A--------------------GAGT-TT----------------------------------------------------------------TT--GT-TAC-ACT--AA----G-----------------GGT-T-------------cctaggtttggtacgtatattgatatttgataataaaacagattcacttagtgtaacaatttttttttcaactagaaatttatttatccctgctatgaaataggggcatatagtgtt
gi|4 : tgtacctatacaaaagtcttcacataacctgaaacaaagaaaaacatctcttttctattgcaagatagtgagttttgtggcTT---AGT----GTA--------A-C-A-------------------T----T--------------T-------T-TT------GT---TAATCAA----AG---GGT--------T-G----A----C---A--C-CA---CA-A---CC-C----TTAG-TGT---A--AC--A-----A-AAA-TG------G------G---TTT-T---GT--------TACAT-T-AGGGGT-------T--AC-G-G--TT---CA---ATCCC-------------------------------------------------T-----TAG------T---GTA--------A-C--------------------A---A------------A-------------------A-A---TT--G--------Aatgtatgtttggtacatgtattgacatttgaatataaaacaggttcacttagtgttacattttttttcaaatagaaatttatttatcctgctatgaaatgggggcatatagtgttatc
gi|5 : gtatttttgtttttaatttttaagttaaagtttattggacaacaaatgagaaatatgtaaataatttcaggagatataaattttgatgcatgctttgtggcaacccttaatgtaacaaacTT---ACT----GTA--------A-C--------------------------C------A---------------T-T-------GT---TACTCTA----AG---GGT--------T-G----A----C---A--C-CT---CA-A---AC-T----TTAG-TGT---A--AC--A-----A-A-----------------------------------------AC-C-C-A--AAT-------GG-AT-A-T--TA---CT---A-CACTTAG--T----G-------T---A------A------CA-----A----T-----T-G------T---AAA--------A-C--------------------A---T------------T-------------------G-A---TT--G---------T-A-T---------T--G---C-A-----------------------C--T--TAGT-GT---------------------A--------------------A-T-----------AA------TT--GT-TTC-ACT---A----A-----------------GGA-T-------------T----T-----------TATTACACTTAGGGTTGCacgtatgtttggtgcatgtattgacatttgattataaaacgggttcactaagtgtaacacttttttttcaactagaaattcatttatccctgcttt
gi|21 : atttataaattaacacactttaattgttacgagaagagacatcaatagcgtagatttttctttatcagtatatataaaaaatactaaaatactatatatt---AAT----GTA--------C-C-A----A--------A----------C------ATACG---C-------T-TAATT---GT---TACATTA----AG---GGT--------T-G----A----C---A--C-CG---CA-A---CC-C----TTAG-TGG---A--AC--A-----A-acgtagttatttttatcaaataaaaattatttatttccgctttgaaataggggtatatattgtt
gi|10 : T----GTA--------A-C-A----A--------A--A--A----C------C-------C-------T-TA------GTA--TATACCA----AG---GGT--------T-G----A----A---A--C-AT---CA-A---TT-C----TTAG-TGT---A--TC--A-----A-AA--TC------A------T---TTT-G---GC--------TACGC-T-AGGGGT------------------CA---TA---A-CC----G--T----------------A------A------CC-----C----T-----AAG------T---GTA--------A-CAATATGGGTTTTGTTACAGTA---A------------A-------------------G-G---TT-----------ACGG-T---------T--G---C-G--------A----------CC--C--T--TAGC-GT----------------T----A--------------------A-T-----------AG------TT--GT-TAC-ACT--AA----G-----------------AGT-A-------------TGG--T-----------TGGTACAtattgacatttgattataaaacgggttcacttagtgcaacattttttttcaactagaaatgtaattatccc
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gi|13 : ---G---T-------T-TT------GT---CATACTA----GG---GAG--------C-A----T----A---A--C-CG---CA-G---CC-C----TTAG-TGT---A--AC--AC----A-A---TC------AA-----G---TTT-T---GT--------CACAC-T-AGGGAT-------CA-TA-A-C--CG---CA---A-CCTTTAG--TAAGGG--C----C---ACG----A------TA-----C----T-----AAG------C---GTATGTTTTGTA-C--------------------A---T------------G-------------------A-A---CT--G--------AC-A-T---------TTGG---CTA--------ATGAATTGGTTCA--C--T--TAGT-GTT-----A------C--A----A--------------------A-T-----------TA------TT---T-TCCAACTAGAA----A-----------------TGT-G-------------T----T-----------TGT
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gi|28 : t------GT---TACACTA----AG---GGT--------T-G----A----C---A--C-CG---CA-A---Ccgtatgtttggtacatgtattgacatttgataataaaacaagttcacttagggtaacaatgtttgttcagttagaaatgtatttatccctgctatggaattggggcatattgtgtt
gi|4 : tttttgtcctG---CA-A---CC-C----TTAA-TGT---A--AC--A-----A-AC--TC------A------AT--TTT-T---GT--------TACAC-TAAGGGAT-------TG-A--A-C--CG---TA---A-CCCCTAA--T----G--TAA--CAA-A------A------CC-----CA---T-----TTT------T---GTT--------A-CACT-----------------A---A------------G-------------------G-G---TT--G---------T-G-G---------T--GT--C-A--------A----------CC--C--T--TTGA-TTA-----A------C--A----A--------------------A-A-----------AA-------T--GT-TAC-ACT--AA----A-----------------CGTATG------------T----T-----------TGGTGCAaatt
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gi|9 : ttttaatattttgtgtgttagtcaaagcatacccttatcgagtcattcgcgttgatgG---CA-A---CC-C----TTAG-TGT---A--AC--A-----A-AAA-CC-----------------TTT-A---GT--------TACAC-T-AAGGGT-------GG-AA-A-T--CA---CA---A-CCATTAG--T----G--TAG--C---A------AAAT---CA-----T----T-----TTT------T---GTT--------A-C--------------------ACT-A------------G-------------------G-G---GC--C--------ACAA-C---------A--G---C-A--------A----------CC--C--T--TA-----A-----A------C--A----A--------------------A-------------AA------TT--Gtgattttttttattttgaggggtcgcaaccataacccttagttacactaagcgtatgtttagtacatgtattgacatttgattataaaacgggctcactcagtgttgttgttttttttcaaatataattttttatccctgctttgaaatggaggtatatagtgttacc
gi|23 : aaggaaaacaacaccaccaatccatgtatgtttgcattgtgG---TA-A---CC-C----TTGG-TGT---A--AC--A-----A-AAA-CC-----------------CTT-A---GTG-------TA-AC------AAT-------TG-AT-T-C--CG---CA---A-CTCTTAG--C----G--TAACAT---A------A------CC-----CATTTT-----TGC------T---ACA--------C-T--------------------A---A------------G-------------------G-G---TT--G--------CC-A-C---------gttttgttaaaataaacatatcgtatgttttatacatgtattgacaattgattataaaatgggttcacttggtgtaacaatttttttcagttagaaattcatttgtccctgctttgaaatgggagcatattgtgttac
gi|7 : aagtgcagtaacccctgtgG---CA-A---CC-C----TTAG-TGT---A--AC--A-----A-AAA-CC-----------------CTT-A---GT------------------G----------TA-AC-A-C--TG---CA---A-CCATTAAATT----A--A----C---A------A------AAATGGGT----T-----TAG------T----TAC-------A-C--------------------T---A------------T-------------------G-G---GT--T--------AC-GGT---------T--A---C-G--------A----------CC--A--T--TAAT-GTA-----A------C--A----------------------------------------A------TT--GT-TAC-ACT--AA----G-----------------CGT-TTG-----------T----T-----------TGGTACA
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gi|12 : ctaattccttggaatcatggagcagatccatttttgctttagaatacattgtg---CA-A---CC-C----TTAA-TGT---A--------------------------A------G---TT------GT--------TACAC-T-Aaacctttagtgtaacaacta
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gi|15 : t-C----TTAG-TGT---A--AC--A-----A-------------------------TT-----GT--------TACAC-G-AAGGTT-------TG-AC-A-C--CA---CT---A-CACCAAG--G----GTTT----T---A------A------CT-----T----T-----TTG------T----TAC-------A-C--------------------A---A------------AT------------------G-G---TT--G--------CC-A-atgtttggtatatgtattgacatttgattatcataagttccacttagggtaacaatgtttgttcaactagaaatgtatttatccctgctatggaatgggggaatatggtgtt
gi|2 : ----TTAG-TGT---A--AC--A-----A-A---T--------------------------GT--------TACAC-A-AAGGGC-------TG-CA-A-C--CA---TA---A-CCCTTAG--T----G--TAA--C---A------A------AA-----A----T-----GGG------TTTTGTT--------A-C--------------------ACTAA------------G-------------------G-G---TT--G--------AC-A-T---------C--A---C-A--------A----------TC--C--T--TAGT-ATA-----A------C--A----A--------------------AAC-----------AA------TT--GT-TAC-ACT--AA----G-----------------AGT-T-------------T----T-----------TGTTACACTAAGGGTTGCCA-CAA-AAC-Tcctaggtttggtacgtatattgatatttgataataaaacagattcacttagtgtaacaatttttttttcaactagaaatttatttatccctgctatgaaataggggcatatagtgtt
gi|4 : tgtacctatacaaaagtcttcacataacctgaaacaaagaaaaacatctcttttctattgcaagatagtg----TTAG-TGT---A--AC--A-----------TT-----------------TTT-T---GT--------TAATC-A-AAGGGT-------TG-AC-A-C--CA---CA---A-CCC-------------------------------------------------T-----TAG------T---GTA--------A-C--------------------A---A------------AAATG---------------G-G---TTTTGTT------AC-A-TTAGGGGTTAC--GGTTC-A--------AT---------CC--C--T--TAGT-GTA-----A------C--A----A--------------------A-------------AA------TT--G-----------------A-----------------G-----------------T----T-----------TGTTACATTAAGGGTTGCCA-CAA-AGCATGCATCAAAATTTATatgtatgtttggtacatgtattgacatttgaatataaaacaggttcacttagtgttacattttttttcaaatagaaatttatttatcctgctatgaaatgggggcatatagtgttatc
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gi|8 : ttgttcA-TGT---A--CC--A-----A-A----C------ATAC---G---CTT-A---GTGT------TACAC-T-AGGGGT-------C--AC-AAC--CG---TA---A-CCCTTAG--T----G--TAA--CAA-A------A------CC-----CA---T-----TTT------T---GTT--------A-C--------------------A------------------------------------------CT--A--------AT-G-C---------G--GTGTC-A--------A----------TCCGC--T--TAGT-GTA-----A------C--A---------------------------------------------------GT-TAC-ACT--AA----G-----------------GGT-T-------------T----T-----------AGTTGCAGTAAGGGTTGCCA-Ctattgacatttgattataaaacgggttcacttagtgcaacattttttttcaactagaaatgtaattatccc
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gi|29 : tta--A-----A-A---TC------A------A---TTT-GT--GT--------TACAC-T-AAGGGT-------TG-AC-A-C--gtattgacatttgattataaaacgggttcactaagtgtaacacttttttttaactagaaatgtattcatccctgctatgaaattggggtatatggtgttacc
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gi|5 : aagtgcagtaacccctgtgG---CA---A-CCCTAAG--T----G--T----A---ATAAA--A------TC-----C----T-----TAG------T---GAA--------A-C--------------------A---A------------T-------------------T-A---TT-----------AC-A-CTAAG-----T--G---C-A--------A----------TA--CAAT--CAAT-GT-------------T--T----T--------------------A-C-----------AA------TT--GT-TAC-ACT--AA----GTGTAGTAATATCCATTTGGG-T-------------T----T-----------TGTTACACTAAAGTTTG
gi|13 : atttataaattaacacactttaattgttacgagaagagacatcaatagcgtagatttttctttatcagtatatataaaaaatactaaaatactatatatt---A-CGCTTAG--T----A--T----C---GTG----G------CC-----C----T-----TAC------T-------------------------------------A---A------------A-------------------G-G---TT--G--------CG-G-T---------T--A---T-G--------A----------TC--C--C--TAGT-GTG-----A------C--A----A--------------------A--------------------------------ACT--TG----A---------------------T-------------T----G-----------TGTTACACTAAGGGCTGCaggtgtcaacccttagagtaacaatggttacagtaaacgtagttatttttatcaaataaaaattatttatttccgctttgaaataggggtatatattgtt
gi|19 : gttttgtcatactagggagcataacc---A-CACTAAG--T----G-----------A------A------CC-----C----G-----TTT------T---ATA--------ATC--------------------A---A------------A-------------------G-G---CC--A--------AT-A-CA--------T--G---T-ACCAAACATA----------CG--T--T--TAGT-GTA-----A------C--A----A------------------------------------------TT--GT-TAC-ACT--AA----G-----------------AGA-T-------------T----T-----------TGTTACACTAAGGGTatgttttgtacatgaactgacatttggctaatgaattggttcacttagtgttacaaattattttccaactagaaatgtgtttgtccctgctgtgaaatggcgaaatgtagtgttaca
gi|19 : ---A-CCCTTAG--T----G--TAA--C---A------AAAT---CT-----C----T-----TAG------T---GTA--------A-C--------------------A---A------------T-------------------T-G---TT-----------AC-A-C---------aacaatttttttcaactagaaatttatccctgctttgaaatggaggcatatagtgttact
gi|3 : TTGA--T----G--G----C---A------A------GC-----C----T-----TAG------T---GTA--------A-C--------------------A---ATAGTTAGACTAAG-------------------G-G---TT--G--------AC-A-C---------C--G---C-A--------A----------CC--C--T--TAGT-GTA-----A------C--A----A--------------------A--------------A------T-----------CT--A-------------------------T-T-------------T----T-----------TATTACACTAAGGGTTGCtaaacgtatgtttggtacatgtattggcctttgattataaaacgggttcacttagtgtaacaatttttttcaactagaaatttatccctgctttgaaatggaggcatatagtgttact
gi|16 : ttttaatattttgtgtgttagtcaaagcatacccttatcgagtcattcgcgTGG--T----G--T----C---A------A------CC-----C----T-----TAG------T---GTA--------A-ggtgtcaacccttagtgtaacacaatttgattttttttattttgaggggtcgcaaccataacccttagttacactaagcgtatgtttagtacatgtattgacatttgattataaaacgggctcactcagtgttgttgttttttttcaaatataattttttatccctgctttgaaatggaggtatatagtgttacc
gi|9 : ttttattacactaaggggctgG--T----G--G----C---A------A------CC-----C----T-----TAG------T---GTA--------A-C--------------------A---A------------AAACCTTTAGTTACACTAAGG-G---TG--G--------AA-A-T---------C--A---C-A--------A----------CC--A--T--TAGT-GTA-----G------C--A----A----------------------------------AA------TC--AT------------------------------------T-T-------------T----T-----------TGTTACACTAGGG---GCCA-CAACAGC-ttgttacacgaagcgtatgtttggtatatgtattgacatttgattatcataagttccacttagggtaacaatgtttgttcaactagaaatgtatttatccctgctatggaatgggggaatatggtgtt
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gi|21 : ctaattccttggaatcatggagcagatccatttttgctttagaatacattG--T----G--T----C---A------A------CC-----C----T-----TAA------T---GTA--------A-C--------------------A---A------------cta
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gi|9 : ttttaaatgtgagaataaaacaagctgttaaaagtgaaatattcctatattgattgagctaattgcataaa------CC-----C----C-----TAG------T---GTA--------A-C--------------------A---A------------A-------------------A-A---AT--G--------AT-T-T---------T--G---C-T--------A----------CA--C--TAATGGTTGTG-----ATTT---C--C----A--------------------C-C-----------CT------TA--GTGTA--ACT--AA----A-----------------GGT-T-------------T----T-----------TGTTACACTAAGGGTTGCCA-CAA-TGC-atatttggaacatgtattgacatttgattataaaacaggttcacttagtgaaacaaagtttgtttttttttattaaaaatttattgatccctgcaatgaaatgggggtatattgtgttaccc
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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lowQualScore : . . . .. ..... .. . .. . . ..... ....... . .... . . . . ... . .............................................. .. ... . ..... .... ... . . ........................ .. .. ................................ .... .. .. ......................... ... . . .. .......... . . .. ....................................................................................... . ....
lowQualScore : 0 0 2 44 88888 99 0 22 7 7 55555 2222222 0 2222 6 5 4 2 777 9 7777777777777777777777777777777777777777777777 00 111 5 77777 1111 666 5 1 777777777777777777777777 66 00 22222222222222222222222222222222 2222 55 55 3333333333333333333333333 999 4 2 77 2222222222 9 4 99 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 0000
consensus : NNTTCNGGAGATAAAAAATTTTGAC--TATA--TGCTNTGTG--GCAA-CCCTTAGTGTAAC-AA-----A-------A-CC----CTTAGTGT-AACAAT---TGTTACACT-AAG---------------GG-T--TG---A----C-A-----C----C-G--CA---A-C---C-CTTAGT----G---TAAC-A-A----A-A-T-C------G---N--TT--TT-GTTACACTAAGGGTTGA----C---A-CC--G-C-AA----------CC----CTTAGTGTA--AC--A----A-A-TC--G---GTTT---T-GT---TACACT-AAGG--GTTGA------C-A-CCGCAACCCTTAGTG--T--CA------ACN-----CTTAG-T---GTA-ACA---AA-GG-TTG-CACCG---CAACCCT--T-AGTGTAACAA--G-CAATTGTTACACTAAGGGTTTTTGTTACACTAAGGGTTGCCACAAAGCTGTGT----ATTTAT
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|7 : taTGTACC-AA------------ACAAA-C---G----CTT----AGT-GTAA-CA--------ATTGT---T-----AC----ATTAAT--GG---------------TCGTAA-CCG--TA-A-CCCATAGTG---TAA-CTA-AA-C--C-C------A-TT-T--T-TGTTAATTTAAT-----GGT--TG----------------------------CAGTGTT-A-C--ACTA--AG--G-G---T--TTT---TGT---TA-CACT-AAGGGTTGC------C-A-CAG-AGCACATGCTG--T------------A-CC----A---------A-TGTA-A-C-------GG-T----------C-A-CTG--TT-TCCCT--TGAGAGTAGT--AA--G---T----TA-----CTGT--AACAATAAtat
gi|7 : caagatatagT----AGTTGAAA-CA--------ATTGT---T-----TC----ACCAAG--AG----------------------------A-A-CCCGTTTTA---TAATC-A-AATG--T-C------A-AT-A--CATGT---ACCAA-------------AC-A---------AA---CG-----C-TTAGTGTA-A-C--A--A-----------------T---TGT---TA-CATT-AATGGT--------------CGTAACC------G--T-----A------A-CCCAT-A---------G-TGTA-A-CT---AA-----------------A-CC---CA-TTTTTGTT-AATTTAAT--GGTTG---C----AG-----T-GT--TACACTAAGGGTT----TTT---------GT-T---ACACTAAGGGTT---GCCACAGAGCtgtattgacatttgattataaaacgggttctcttggtgaaacaattgtttcaactagaaattaatttatccttgttatgaaatggggtcatatagtgttac
gi|8 : caagatatagttattgttacagtaacttactactctcaagggaaacagtgaccgttacattggtacagcatgtGTG--GCAA-CCCTTACTGCAACTAA------------A---A-C---C----CTT----AGT-GTAA-C-----------TGT---T-----AC----ACTAAGCGGA---------------TTGACA-CCG--CA------TTAGTG---TAA-C-A-AA-AA-T-G------G-GT-T--T-TGTTACACTAAG-----GGT--T-ACGG-T-TG---TGA---CC-----C-CTAGTGTA-A-C--ACTA--AG--C-GTATG--TTT---GGTACATG-TATT-AACATTTGATTATACC-A-CCGGTACACTTAGTG--T--gaaattaatttatccttgttatgaaatggggtcatatagtgttac
gi|9 : tttacatgaattcataaacgacatcgcatacgtcatctcatcatcttaggcgc--TGCATTGTG--GCAA-CCCTTAGTGTAAC-AA------------A---A-A---C----CTT---------TA---------------GT---T-----AC----ACTAAG--GG---------------TGGAAA-TCA--CA-A-CCATTAGTG---TAG-C-A-AA-A--T-C------ATTT-T--T-TGTTACACTAGG-----GGC--C-ACAA-C-AG---CAA---CC-----C-TTA----A-A-CAAA--A--AT--T-G---G--TTT---TGT---TA-AAAT-AAaataattttttcaactagaaatgtatttatccctgctatgaaatgggggcatatagtgttac
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus : NNTTCNGGAGATANAAAATTTTGAC--TATA--TGCTNTGTG--GCAA-CCCTTAGTGTAAC-AA------------A---A-CC----CTT----AGT-GT-AA-CA--------ATTGT---T-----ACACTAAG-----GG-TTGACA-C-CG--CA---A-CCCTTAGTG---TAA-C-A-AA-A-T--C-A-NTT--T-TGTTACACTAAG-----GGT--TGAC-G-CCG-CAA---C---C----C-TTAGTGTA-A-CA---A-A---T-G---G-T---TT---TGTTAC----ACT---AAGGGTTGA------C-GCCGCGACCC---TTAGTG--T--C-----A------A---CCC-TT-A-G-TGTA-ACAAA-GG-TTG-C-G------ACCC-------TT-AGTGT---AACAAA---C----G-ATTGT--TACACTAAGGGTTTTTGTT---ACACTAAGGGTT---GCCACAAAGCTGTGTATTTAT
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gi|10 : aacagaaataacaaatataccaatttctcaagtagatcttataatttgacaatataattgctttgtggcagccattagtgaaaaaaaaaccttagtgtaactattattacattaG--GTAG-TCCTGCATGTAAC-AA------------A---AACC----CTT----AGT-AT-A---------------------------TACCAAG-----GG-TTGAAA-C-AT--CA---A-TTCTTAGTG---TAT-C-A-AA-A-T--C-A-TTT--T-GGCTACGCTAGG-----GGTCATAAC----CG-TAA---C---C----C-TAAGTGTA-A-CA---ATA---TGG---G-T---TT---TGTTAC----AGT---AAAGGTT-A------CGGTTGCGACCC---TTAGCG--T--T-----A------A--------T-A-GTTGTT-ACAtttcaactataaatgaatttgcccctgctatgaaatgggggaatatagtgttaa
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gi|13 : gtt-A-AA-A-T--A-A---T--T-TGTAACACTAAG----------TGA--A-CC---AA---T---T----CATTAGC------CA---A-A---T-GTCAG-T---TCA--TGT-AC----A-----AAACAT--A------C-GC-----------TTAGTA--T--C-----GTG----G---CCC-TT-A-C-T------AAA-GG-TTG-C-GGTTATGATCC-------CT-AGTGT---GACAAAACTT----G-ATTGTGTTACACTAAGGGCTGCGGTT---ATGCTaagggccacgatactaagcgtatgttttgtacatgaactgacatttggctaatgaattggttcacttagtgttacaaattattttccaactagaaatgtgtttgtccctgctgtgaaatggcgaaatgtagtgttaca
gi|14 : gttttgtcatactagggGTG--ATAA-CCATTAGTGTAAC-AA------------A---AACC----CTT----AGT-GT-AA-CAGCGTGACAATTGT---T-----ACACTGAG-----GT-TCGCAA-C-CG--TA---A-CCCTTATTG---TAA-T-A-AA-ACC--C-A-TTT--T-TACTGCACTAAGGTTGCGGTTATGAC---CCT-TAG---C---C----C-TTAGTGTA-A-CAATTA-A---G-G---G-T---TT---TGTTAC----ATT---AA-GGTTGC------G-GCTATGACCC---TTAG------------------------CCC-TT-A-G-TGTA-ACAAccaactagaaatgtgtttgtccctgctgtgaaatggcgaaatgtagtgttaca
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gi|19 : T---TGTTAC----ACT---AAG---TGA--------------ACCCGTTTTATAA--T--C-----A------AAGGCCA-AT-ACA-TGTA-CCAAA-CA-T------------ACGT-------TT-AGTGT---AACAA------------TTGT--TACACTAAGAGATTTTGTT---ACACTAAGGGTacgtatgtttggtacatgtattggcctttgattataaaacgggttcacttagtgtaacaatttttttcaactagaaatttatccctgctttgaaatggaggcatatagtgttact
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gi|7 : caagatatagttattgttacagtaacttactactctcaagggaaacagtgaccgttacattggtacagcT----AGTTGA-AA-CA--------ATTGT---T-----TCACCAAG-----AG---------------A---A-CCCGTTTTA---TAATC-A-AATG-T--C-A-ATA--CATGT---ACCAA-------------AC-A------AA---C---G----C-TTAGTGTA-A-CA---A------------------T---TGTTAC----ATT---AATGGT-------------CGTAACC---------G--T--------A------A---CCC-AT-A-G-TGTA-ACTAA-----------------ACCCATTTTTGTT-AATTT---AATGGT---T----GCAGTGT--TACACTAAGGGTTTTTGTT---ACACTAAGGGTT---GCCACAGAGCtgtttggtacatgtattgacatttgattataaaacgggttctcttggtgaaacaattgtttcaactagaaattaatttatccttgttatgaaatggggtcatatagtgttac
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus : NNTTCNGGAGATANAAAATTTTGAC--TATA--TGCTNTGTG--GCAA-CCCTTAGTGTAAC-AA------------A---A-C---C----CTT----AGT-GT-AA-CA--------ATTGT---T-----AC----ACTAAG-----GG-TTGACA-C-CG--CA---A-CCCTTAGTG---TAA-C-A-AA-A--T-C-A-NT-T--T-TGTTACACTAAG-----GGT--TGAC-G-CCG-CAA---C---C----C-TTAGTGTA-A-CA---A-A---T-G---G-T---TT---TGTTAC----ACT---AAGGGTTGA------C-GCCGCGACCC---TTAGTG--T--C-----A--A---CCC-TT-A-G-TGTA-ACAAA-GG-T---T------GC-------ACCC-------TT-AGTGT---AACAAA---T--ATTGT--TACACTAAGGGTTTTTGTT---ACACTAAGGGTTGCCACAAAGCTGTGTATTTAT
Reference ( family-735 ) : NNTTCNGGAGATANAAAATTTTGAC--TATA--TGCTNTGTG--GCAA-CCCTTAGTGTAAC-AA------------A---A-C---C----CTT----AGT-GT-AA-CA--------ATTGT---T-----AC----ACTAAG-----GG-TTGACA-C-CG--CA---A-CCCTTAGTG---TAA-C-A-AA-A--T-C-A-NT-T--T-TGTTACACTAAG-----GGT--TGAC-G-CCG-CAA---C---C----C-TTAGTGTA-A-CA---A-A---T-G---G-T---TT---TGTTAC----ACT---AAGGGTTGA------C-GCCGCGACCC---TTAGTG--T--C-----A--A---CCC-TT-A-G-TGTA-ACAAA-GG-T---T------GCG------ACCC-------TT-AGTGT---AACAAA---CG-ATTGT--TACACTAAGGGTTTTTGTT---ACACTAAGGGTTGCCACAAAGCTGTGTATTTAT
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|7 : caagatatagATG--TGCTCTGTG--GCAA-CCCTTAGTGTAAC-AA------------A---AAC---C----CTT----AGT-GT-AACA--------------------------------------------------------C-TGCA---A-CCATTAAAT---TAA-C-A-AA-AAT---G-G-GTT--T-AGTTACACTATG-----GG--T--T-ACGG-TTA-CGA---C---C----A-TTAATGTA-A-CA---A------------------T---TGTTAC----ACT---AAG-----CGTTtgtattgacatttgattataaaacgggttctcttggtgaaacaattgtttcaactagaaattaatttatccttgttatgaaatggggtcatatagtgttac
gi|7 : caagatatagttattgttacagtaacttactactctcaagggaaacagtgaccgttacattggtacagcT----AGTTGA-AACA--------AT--------TGTT-----TC----ACCAAG-----AG---------------A---A-CCCGTTTTA---TAATC-A-AATG-T---C-A-ATA--CATGT---ACCAA---------------AC-A------AA---C---G----C-TTAGTGTA-A-CA---A------------------T---TGTTAC----ATT---AAT-----GGTCGT------A-ACCGTAACCC---ATA-----GTG--TAACTA-A--ACCCATTTT-T-GT--TA-ATTTA---AT-GG-TTG-C-A-----------------GT------------------------GT--TAC-ACTAAGGGTTTTTGTTACACTAAGGGTTGCCACAGAGCtgtttggtacatgtattgacatttgattataaaacgggttctcttggtgaaacaattgtttcaactagaaattaatttatccttgttatgaaatggggtcatatagtgttac
gi|8 : caagatatagttattgttacagtaacttactactctcaagggaaacagtgaccgttacattggtacagcatgtGTG--GCAA-CCCTTACTGCAACTAA------------A---A-C---C----CTT----AGT-GT-AAC-------------------TGTT-----AC----ACTAAGCG---GA-T-TGAC-A-C-CGCA--------TTAGTG---TAA-C-A-AA-AAT---G-G-GTT--T-TGTTACACTAAG-----GG--T--T-ACGG-TTG-TGA---C---C----C-CTAGTGTA-A-CACT-A-A---G-C---G-TATGTT---TGGTACATGTATT---AAC-----ATTTGATTATACC-ACCGGTACAC---TTA-----GTG--T--gaaattaatttatccttgttatgaaatggggtcatatagtgttac
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Alignments
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consensus : NNTTCNGGAGATANAAAATTTTGAC--TATA--TGCTNTGTG--GCAA-CCCTTAGTGTAAC-AA------------A---A-CC----CTT----AGTGT-AACA--------AT--------TGTT-----ACACTAAG-----GG-T-TGAC-A-C-CGCA---A-CCCTTAGTG---TAAC-A-AA-A-T---C-A-TTT--T-TGTTA---CACTAAG-----GG--T--TGAC-G-CCG-CAA---C---CCTTAGTGTA-A-CA---A--------A---T----GG-T---T-----T---TGTTAC----ACT---AAG----GGTTGA------C-GTTGTG-AC-CTTA-----GTG--TC---GACATTT-A-NT-GTAAN--A---NA--GG-T-T--CA--------CTT-AGTGTA--------ACA-A--TA-TTGTTAC-ACTAAGGGTTTTTGTTACACTAAGGGTTGCCACAAAGCTGTGTATTTAT
Reference ( family-735 ) : NNTTCNGGAGATANAAAATTTTGAC--TATA--TGCTNTGTG--GCAA-CCCTTAGTGTAAC-AA------------A---A-CC----CTT----AGTGT-AACA--------AT--------TGTT-----ACACTAAG-----GG-T-TGAC-A-C-CGCA---A-CCCTTAGTG---TAAC-A-AA-A-T---C-A-NTT--T-TGTTA---CACTAAG-----GG--T--TGAC-G-CCG-CAA---C---CCTTAGTGTA-A-CA---A--------A---T----GG-T---T-----T---TGTTAC----ACT---AAG----GGTTGA------C-GCCGTG-ACCCTTA-----GTG--TC---GACCCTT-A-GT-GTAAC--A---AA--GG-T-TG-CA--------CTT-AGTGTA--------ACA-A--TA-TTGTTAC-ACTAAGGGTTTTTGTTACACTAAGGGTTGCCACAAAGCTGTGTATTTAT
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gi|16 : TT--T-TATTA---CACTAAG-----GGGCTG-TGGT-G-T---CAA---C---CCTTAGTGTA-A-------------------------------------T---TGTTAC----ACG---AAG----CGT--A------T-GTT-TG-G----TATAT--GTA--TT---GACATTT-G-AT--TATC--A---TA--AG-T-TC-CA--------CTT-AGGGTA--------ACA-A--TGTTTGTTCA-ACTAtgtattgacatttgattatcataagttccacttagggtaacaatgtttgttcaactagaaatgtatttatccctgctatggaatgggggaatatggtgtt
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gi|18 : -TGTTA---CACTAAG-----TG--T--CG-C-G-GTGTCAA---C---CCTTAATGTA-G-------------------------------------T---TGATAC----ACT---AAG----CGT--A------T-GTT-TG-GTACAT------GTA--TT---GACATTT-G-ATAATAAA--A---CA--AG-T-T--CA--------CTT-AGGGTA--------ACA-A--TGTTTGTTtgtattgacatttgataataaaacaagttcacttagggtaacaatgtttgttcagttagaaatgtatttatccctgctatggaattggggcatattgtgtt
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gi|6 : atttataaattaacacactttaattgttacgagaagagacatcaatagcgtagatttttctttatcagtatatTTCCGGAAATGGAAAATTTTGAC--TATA--TGCTATGTG--GCAA-CCCTTAGTGCAAC-AA------------A---A-CC----CTA----AATGT-AACA--------AT--------TGTT-----ACACTAGG-----AA-T-TGAC-A-T-CGCA---A-CCCTTAGTG---TAAC-A-AA-G-T---C-A-GTT--T-AGTTA---CACTAGG-----AA--T--TGAC-A-CCG-CAA---C---CCTTAATGTA-A-CA---A--------A---TC---AG-T---T-----T---AGTTAC----ACT---AGG----AATTGA------C-ACCGCA-ACCCTTA-----GTG--CC---AACCCTT-A-GT-GTAAC--A---AA--GG-T-TGACACCGCAACCCTT-AGTGTA--------ACA-AACAA-TTGTTAC-ACTAAAGGTTTTTGTTACACTAAGGGTTGCCACAAAGCTGTGTATTTATtcaaataaaaattatttatttccgctttgaaataggggtatatattgtt
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gi|7 : caagatatagATG--TGCTCTGTG--GCAA-CCCTTAGTGTAAC-AA------------A---AACC----CTT----AGTGT-AACA----------------------------------------------------C-TGCA---A-CCATTAAAT---TAAC-A-AA-AAT---G-G-GTT--T-AGTTA---CACTATG-----GG--T--T-ACGG-TTA-CGA---C---CATTAATGTA-A-CA---A------------------------------T---TGTTAC----ACT---AAG----CGTT--------T-GTT-TG-GTACAT------GTA--TT---GACATTTGA-TT-ATAAA--A---CG--GG-T-T--CT--------CTT-GGTGAA--------ACA-----A-TTGTTTCAACTAtgtattgacatttgattataaaacgggttctcttggtgaaacaattgtttcaactagaaattaatttatccttgttatgaaatggggtcatatagtgttac
gi|8 : caagatatagttattgttacagtaacttactactctcaagggaaacagtgaccgttacattggtacagcGTG--GCAA-CCCTTACTGCAACTAA------------A---A-CC----CTT----AGTGT-AAC-------------------TGTT-----ACACTAAGCG---GA-T-TGAC-A-C-CGCA--------TTAGTG---TAAC-A-AA-AAT---G-G-GTT--T-TGTTA---CACTAAG-----GG--T--T-ACGG-TTG-TGA---C---CCCTAGTGTA-A-CACT-A--------A---G----CG-TATGT-----T---TGGTACATGTATT---AAC----ATTTGATTATACC-ACCGGT-ACACTTA-----GTG--Tgaaattaatttatccttgttatgaaatggggtcatatagtgttac
gi|9 : tttacatgaattcataaacgacatcgcatacgtcatctcatcatcttaggcgc--TGCATTGTG--GCAA-CCCTTAGTGTAAC-AA------------A---A-AC----CTT--------T-A----------------------GTT-----ACACTAAG-----GG-T-GGAA-A-T-CACA---A-CCATTAGTG---TAGC-A-AA-A-T---C-ATTTT--T-TGTTA---CACTAGG-----GG--C--C-ACAA-CAG-CAA---C---CCTTA----A-A-CA---A--------AAATT----GG-T---T-----T---TGTTAA----AAT---AAA--------CA------T-ATCGTA-TGTTTTATACATGTA--TT---GACAATTGA-TT-ATAAA--A---TG--GG-T-T--CA--------CTT-GGTGTA--------ACA-A--TT-TTTTTaataattttttcaactagaaatgtatttatccctgctatgaaatgggggcatatagtgttac
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): CGGCTAGGGTTATGGATAATGTTGCGACTCTAAGTGCGCCTAAGAATATGTGTATGATGTGTACATGTATTGAAATTTGATTATAAAACCGGTTCAGTTAATGTTACAAGTATTTGCAACTAGAAATGTATTTTTCCCTGCTATGGAATGGGGGCATGAAGTGTTATC
Unaligned ( gi|25 ): TTTGATTATAAAACCGGTTCAATTAGTGTTACAAGTATTTTGCAACTAGAAATGTATTTTTCCCTGCTATGGAGTGGGGGGATGAAGTGTTAT
Unaligned ( gi|26 ): TTTGTTTGGTACTTGTATTGACATTTAATTGTAAAACGGGTTCACTTAGTGTTACATTTTTTTTCAACTAGAAATTTATTGATCCCTG
Alignments
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lowQualScore : . . . ... .. . . . .................. .... .... . . .. . ..... .. . . .......... . . . ... ... . .............. . ... .. ................... ... .. ............................... ... ......................................... . . . .. ........ . .... ...... . ........ ........ ....... ... . . . .....
lowQualScore : 0 0 5 000 22 0 9 2 777777777777777777 2222 2222 4 7 55 8 55555 55 8 8 5555555555 7 7 7 999 999 2 00000000000000 6 666 00 9999999999999999999 999 88 4444444444444444444444444444444 777 88888888888888888888888888888888888888888 1 5 7 33 00000000 2 8888 444444 8 66666666 66666666 7777777 777 9 4 5 00000
consensus : NNTTCNGGAGATGNAAAATTTTGAC--TATA--TGCTCTGTGGCAA-CCCTTAGTGTAAC-AA------------A---A-CC----CTT----AGTGTAACAATT-GTT-----ACACTAAG--GG-T-TGA----CA---CCG-CA-A-CCCTT---AGTG---TAACA-AAA-T---C--A-T---T-TTTGTTA---CACTAAGGG--T--TGAC-G-------CCG-CAAC---CCTTAGTGTA--A-C--A-A-----A---T----GG-TT-----T---TGTTACACTAAG----CGT-T-A---C-GT-T--GTG--A--C-NTTA-----GTATTGAC-ATT--TGA-NT-A-TAAAACG--GGTT------C-A--------CTTAGTGTA--------ACA-A--TN-TTGTTAC-ACTAAGGGTTT-TTGTTACACTAAGGGTTGCCACAAAGCTGTGTATTTAT
Reference ( family-735 ) : NNTTCNGGAGATANAAAATTTTGAC--TATA--TGCTNTGTGGCAA-CCCTTAGTGTAAC-AA------------A---A-CC----CTT----AGTGTAACAATT-GTT-----ACACTAAG--GG-T-TGA----CA---CCG-CA-A-CCCTT---AGTG---TAACA-AAA-T---C--A-T---T-TTTGTTA---CACTAAGGG--T--TGAC-G-------CCG-CAAC---CCTTAGTGTA--A-C--A-A-----A---T----GG-TT-----T---TGTTACACTAAG----GGT-TGA---C-GT-T--GTG--A--C-CTTA-----GTGTCGAC-ATT--T-A-NT-G-TAANANA--GGTT------C-A--------CTTAGTGTA--------ACA-A--TA-TTGTTAC-ACTAAGGGTTT-TTGTTACACTAAGGGTTGCCACAAAGCTGTGTATTTAT
gi|1 : TTTGACAATATAATTGCTTTGTGGCAG-CCATTAGTGAAAA-AA------------A---A-AC----CTT----AGTGTAACTATT-ATT-----ACATTAAG--TG-T-TGA----AA---CCG-TA-A-CCCTT---ATTG---T-ACA-AAA-T---C--ATT---T-TTTGTAA---CACTAAGGG--T--T-AT-GT------CCA-CATC---CCTT-GT-TAC-A-C--A-A-----A---T----GGATT-----TCAGTGTTACACTAAG----GGT-T-A---CGGT-T--GCG--AC-C-CTTA-----GTGT-AAC-AAT--T-G-CT-A--------------------C-A--------CTTAGCGTATGTTTGGTACATA--TA-TTG--AC-A--------TT-TTATTATAAAACGGGTT
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gi|10 : aacagaaataacaaatataccaatttctcaagtagatcttataatttgacaatataattgctttgtggcagccattagtgaaaaaaaaaccttagtgtaactattattacattaagtgttgaaaccgtaacccttattgtacaaaatcattttttgtaacactaagggttatgtccacatcccttgttacacaaatggatttcagtgttacactaagggttacggttgcgGGTAG-TCCTGCATGTAAC-AA------------A---AACC----CTT----AGTATA----------------TACCAAG--GG-T-TGA----AA---CAT-CA-A-TTCTT---AGTG---TATCA-AAA-T---C--A-T---T-TTGGCTA---CGCTAGGGG--TCATAA----------CCG-TAAC---CCTAAGTGTA--A-C--A-AT----A---TG---GG-TT-----T---TGTTACAGTAAA----GGT-T-A---CGGT-T--GCG--AC-C-CTTA-----GCGTTAAT-AGT--T-G-TT-taaatgaatttgcccctgctatgaaatgggggaatatagtgttaa
gi|10 : CAA-TTCTTAGTGTATC-AA------------A---A-TC----ATT--------------TTGGCT-----ACGCTAGG--GG-T-CAT----AA---CCG-TA-A-CCCTA---AGTG---TAACA-ATA-T---G--G-G---T-TTTGTTA---CAGTAAAGG--T--T-ACGG-------TTG-CGAC---CCTTAGCGT--------T-A-----A---T----AG--------T---TGTTACACTAAG----AGTATG------GT-T--GGT--A--C-AT-------GTATTGAC-CGT--T-GTTT-A-TAAAATA--GGTT------acactaagagtatggttggtacatgtattgaccgttgtttataaaataggttttcaactagaaatgtatttgtctctgccatgaaatgtaggcatatag
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gi|15 : G-CA-A-CCATT---TGTG---TAACA-AAA--------A----------GTTAAAACCCTTGGTG--TAGTGGT-G-------TC---AAA---CCTTCGTGTA--A-C--A-A------------------------T---TGTTACACTAAGCCTAGGT-T--------T-G--GTA-------CGTA------TATTGAT-ATT--T-G-AT-AATAAAACA--GATT------C-A--------CTTAGTGTA--------ACA-A--TT-TTTTT
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gi|16 : ---T-TTTATTA---CACTAAGGGGCTG-TGGT-G-------TC---AAC---CCTTAGTGTA--A-------------------------------T---TGTTACACGAAG----CGT---A---T-GT-T---TG--G--T-ATAT-----GTATTGAC-ATT--T-G-AT---TATCATA--AGTT------CCA--------CTTAGGGTA--------ACA-A--TGTTTGTTCA-ACTAtgtattgacatttgattatcataagttccacttagggtaacaatgtttgttcaactagaaatgtatttatccctgctatggaatgggggaatatggtgtt
gi|18 : TGTTA---CACTAAGTG--T--CG-C-G-------GTGTCAAC---CCTTAATGTA--G-------------------------------T---TGATACACTAAG----CGT---A---T-GT-TTGGT---A--C-AT-------GTATTGAC-ATT--T-G-AT-AATAAAACA--AGTT------C-A--------CTTAGGGTA--------ACA-A--TGTTTGTTgaaatgtatttatccctgctatggaatgggggaatatggtgtt
gi|19 : -----T---TGTTACACTAAG--------TGAACCC-GT-TTTATA--A--T-CAAA-----G-GCCAAT-AC-------AT-G-TACCAAA--CATA------C-G--------TTTAGTGTA--------ACA-A--T---TGTTAC-ACTAAGAGATT-TTGTTACACTAAGGGTcagttagaaatgtatttatccctgctatggaattggggcatattgtgtt
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gi|20 : tgtacctatacaaaagtcttcacataacctgaaacaaagaaaaacatctcttttctattgcaagatagtgaTTA---CACTAAGGG--T--T-AT-GT------TTG-CGAC---CCTTAGTGTA--AGC--A-C-----A---T-----G-TT-----T---TG-TACAT---------------------------------------------GTATTGAC-ATT--TGA-TT-A-TAAAACG--GGTT------C-A--------CTAAGTGTA--------ACA-C--TT-TTTTTTA-ACTAttttttttcaaatagaaatttatttatcctgctatgaaatgggggcatatagtgttatc
gi|21 : AATT-GTT-----ACATTAAG--GG-T-TGA----CA---CCG-CA-A-CCCTT---AGTG---GAACA-Agaaatgtattcatccctgctatgaaattggggtatatggtgttacc
gi|21 : TTGTTC---CACTAAGGG--T--TG-C-G-------GTGTCAAC---CCTTAATGTA--A-C--A------------------------------------ATTAAG----CGT---A---T-GT-T---TGGTA--C-ATT-------TATTGAC-ATT--TGA-TT-A-TAAAACG--GGTT------C-A--------CTTAGTGCA--------ACA-T--TT-TTTTTCA-ACTAaagcgtatgtttggtacatttattgacatttgattataaaacgggttcacttagtgcaacattttttttcaactagaaatgtaattatccc
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gi|7 : taATG--TGCTCTGTGGCAA-CCCTTAGTGTAAC-AA------------A---AACC----CTT----AGTGTAACA---------------------------------------CTG-CA-A-CCATT---AAAT---TAACA-AAA--------A-TGGGT-TTAGTTA---CACTATGGG--T--T-ACGG-------TTA-CGAC---CATTAATGTA--A-C--A-A------------------------T---TGTTACACTAAG----CGT-T-----T-GT-T---TGGTA--C-AT-------GTATTGAC-ATT--TGA-TT-A-TAAAACG--GGTT------C-T--------CTTGGTGAA--------ACA-----A-TTGTTTCAACTAtat
gi|8 : caagatatagttattgttacagtaacttactactctcaagggaaacagtgaccgttacattggtacagcGTGGCAA-CCCTTACTGCAACTAA------------A---A-CC----CTT----AGTGTAAC---T-GTT-----ACACTAAGCGGA-T-TGA----CA---CCG-CA------TT---AGTG---TAACA-AAA--------A-TGGGT-TTTGTTA---CACTAAGGG--T--T-ACGG-------TTG-TGAC---CCCTAGTGTA------------------------------------------ACACTAAG----CGT---A---T-GT-T---TGGTA--C-AT-------GTATTAAC-ATT--TGA-TT-A-TACCACC--GGTA------C-A--------CTTAGTGTA--------ATA-A--TT-TTTTCA--ACTAgaaattaatttatccttgttatgaaatggggtcatatagtgttac
gi|9 : tttacatgaattcataaacgacatcgcatacgtcatctcatcatcttaggcgc--TGCATTGTGGCAA-CCCTTAGTGTAAC-AA------------A---A-AC----CTT--------TA-------GTT-----ACACTAAG--GG-T-GGA----AA---TCA-CA-A-CCATT---AGTG---TAGCA-AAA-T---C--ATT---T-TTTGTTA---CACTAGGGG--C--C-ACAA-------CAG-CAAC---CCTTA----A--A-C--A-A-----AAATT----GG-TT-----T---TGTTAAAATAAA----CAT---AT--C-GTAT--GT--------TTTATACATGTATTGACAATT--G-A-TT-A-TAAAATG--GGTT------C-A--------CTTGGTGTA--------ACA-A--TT-TTTTTgaaatgtatttatccctgctatgaaatgggggcatatagtgttac
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|25 ): TTTGATTATAAAACCGGTTCAATTAGTGTTACAAGTATTTTGCAACTAGAAATGTATTTTTCCCTGCTATGGAGTGGGGGGATGAAGTGTTAT
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gi|5 : gtatttttgtttttaatttttaagttaaagtttattggacaacaaatgagaaatatgtaaataatTTACTGTAAC-------C-A-T---T------GTTA---CTCTAAGGG--T--TGAC-A-------CC-T-CAAA---CTTTAGTGTA--ACAAAACCCA-A-----A---T----GGATA-----T---T--------------ACTAC-AC--TTAGT----GT----A-ACAATT----GTA--A-----AAC------ATTGA---TTG--TAT---------TG--CA--------CTTAGTGTAAT-AA-----TTGTTTC-ACTAAGGA-TT-TTATTACACTTAGGGTTGCgaaattcatttatccctgcttt
gi|5 : atttataaattaacacactttaattgttacgagaagagacatcaatagcgtagatttttctttatcagtatatataaaaaatactaaaatactatatattATTTGA-TA-AA-AATAACTA--CG--------TTTACTGTAAC-CA--T---TGTTAC-TCTAAGGGTTacgtagttatttttatcaaataaaaattatttatttccgctttgaaataggggtatatattgtt
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