lowQualScore : 1 1111 11111 111 1111111111 111 11111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111 1111 1 222 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 1 333 4444
lowQualScore : 9 6 2 9 4444 22 99999 2 33 1 2 0 666 33 777777 888 2 0000000000 2 111 444 00000000000 33 2 2 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3 3 4 55 4 4 99999 1 5555 2 5 222 4 4 888 2 444444444444444444444444444444444444444444444444444444 00 3 88 444 1111
lowQualScore : . . . . .... .. ..... . .. . . . ... .. ...... ... . .......... . ... ... ........... .. . . ................................................................................................... . . . .. . . ..... . .... . . ... . . ... . ...................................................... .. . .. ... ....
lowQualScore : 0 7 4 6 9999 66 22222 5 11 2 5 4 555 22 222222 444 4 3333333333 4 999 111 99999999999 22 1 7 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 6 6 1 11 0 0 44444 4 4444 0 0 333 4 4 555 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33 3 66 000 0000
consensus : AGGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTGCCATAT---CTTGA-TT-TT--TT-GTTATAG-AAAATN--AT--CAAACTTGGCCATGT------ATG-N-TATATTGATGC-AG----------TTC-AAGTG--TAG---A-----A-----GT--AATTACGAGC-CTGCATATTTN---GTNA---AATGTGTG-CTTTAAA-----A-A--N--ACAA-----------------AAAANA--CACAAACACTTTCAGCACGATT-A-TTATTAC-TAT-TA-T---AAATGTAAAAT--GATTTCTGAAACCAGT-A-A-A-GTACCTCATACA--------TGA---TNG-TTACTG-CCAAGGA---AGCTT--TT-T---T----AAA-NAAA-CAATTTATT-AATGTACCATTTCTCC
Reference ( gi|4 ) : AGGTGAATGTTATGTCACAGCCTTCTTAGAATTCAGA-TGTCTTAAAATTGCCATAT---ATTGA-TTGTT--TT-GTTATAG-AAAATC--AT--CAAACTTGGCCATGT------ATG-A-TATATTGATGC-AG----------TTC-AAGTG--AAG---A-----A-----GT--AATTACGAGC-CGCCATATTTC---GTTA---AATATTTG-CTTTGAA-----A-A--C--ACAA-----------------AATACA--CACAAACACTTTCAGCATGAAT-A-TCATTAT-CAT-TA-T---AGATGTAAAAC--GATTTCTGAAACGAGT-G-A-A-GTACCCTGTATA--------TGA---TTG-TTACTG-TCCACAA---AGCTT--TT-T---T----AAA-TAAA-CAGTTTATTGAATGTAT-AGGTCTCCAATCTTATCTTTCTTTGA
gi|8 : AGGTGAATGTTATGTCACAGCCATCTTAGAATTGAGA-TTTCTTAAAATTGCCAAAT---CTTGA-TCGTT--TT-GTTATAG-AACATG--AT--CAAACTTGGCCATGT------ATG-A-TATATCGATGC-AG----------TTA-AAGTG--TAG---A-----A-----GT--AATTACGAGT-CTGCATATTTA---GTAA---AATGTGTG-CATC-AA-----A-A--T--ATAA-----------------AA-AAA--AAC--ACACTTTCAGCATACTT-A-TTAT
gi|2 : aAGGTGAATGTAATGT-ATAGCAATTTTAGCAATCAAA-TATCTTAAAATTGCCATAT---CTTG-----------------------------------ACTTGGCCATGT------ATG-C-TATTTTGATGC-AG----------TTC-AAGTG--TAA---A-----A-----GT--GATCACGAGT-CTGAATA----------G---AATGTGTG-TTTT-AA-----A-A--G--ACAA-----------------AAAAAT--CACAAAC--TTTCAGAAC-AAT-AATTATTAT-CAT-TA-TAACAAATATAAAAT--AATTTCAGCAACCAGT-A-A-A-A-ACACCGCATAGTTTTACGTGA---TGA-TTACTA-ACAAGGA---AGCTT--TT-TTCAT----AAA-AAAATCAATTTA---AATATATCATTTCTCC
gi|7 : cAAGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTCGAAGTCGG--TCTCTTAAAAATGCCATAT---CTT----T-TT--TT-GT-ATAG-AAAATG--AT--TAAACTTTGCCATGC------ATG-A-TATACTGGTGC-AG----------TTC-AAGTT--TGG---A-----A-----GT--AATAA---------CATATTAA---GCCA---AATTTGTG-CTCTAAAGAGATA-A--CCAAAAA-----------------AATTTA--CACAA--ACTTCCAGAATGATT-G-TTATTAC-TAT-AATT---AAATGTAAATT--TACCTCTGA------T-T-A-A-GTATCCCATACA--------TGA---ttgtacattacatgacccttttcattttataacataatttaatagttgtttacacatgctttaatagaattaaacatttcccaattatatcattttagcatatgtactcatatagtttatatatactacatgtatacggggatatacttaaatgagattgtaaccggtgcct
gi|1 : taAGGTGAATGTAATGTCATAGC-----------------TATCTTAAAATAACCGTATCTTATT---TTGAT--TT-GTCATAG-AAAATG--AT--CAAACTTGGACATTT------AAA-C-TGTATTAATGC-AG----------TTC-AAGTG--TAG---A-----A-----GT--AATTATCAGC-CAGCATATTAA---GTAT---AACGTCTG-CTTT-AA-----A-A--G--ATAA-----------------AA-ACA--CACA-----TT-----------------TTAC-TAC-TA-C---AAATGTTAAAA--AATTTCTGAAACCAAT-A-ATG-GTACCTCATACA--------TG------G-TTTCTG-CCAAGGG---AGCTTAATTAT---TGATAAAA-T-AA-CAATTTA---AATGCA
gi|9 : aAGGTGAATGTAATGT-ATAGCAATTTTAGCAATCAAA-TATCTTAAAATTGCCATAT---CTTG-----------------------------------ACTTGGCCATGT------ATG-C-TATTTTGATGC-AG----------TTC-AAGTG--TAA---A-----A-----GT--GATCACGAGT-CTGAATA----------G---AATGTGTG-TTTT-AA-----A-A--G--ACAA-----------------AAAAAT--CACAA--ACTTTCAGAAC-AATAA-TTATTAT-CAT-TA-TTACAAATATAAAAT--AATTTCccactttctgttgtatgtaacatgactcgtttcatatgataacattatttagagttgttttcatgtgctgaaatatgattaaatttgttccgattggctttatacatagccatgggccgaagtgcattatttgaatatatggtcatacaatagatatattttattgggccgtatatcaaaaagatattgtgaccggctgatgtagttttataccgttttatgtatataacgttagtaata
gi|16 : AGATGAATTTAATGCCACAGTCATTTTAGAATGCAGA-TTTCTTAAAATTGCAATAT---ATTCA-TTTAT--TT-ATT-T------ATT--AT--CAAACTTGGCCATGT------ATGCG-TA-ATTGATGC-AG----------ACC-AAGTGTTAAG---------------GT--ATTTACAAagc
gi|15 : taAGGCGAATATAATATCA--GTCATCTTAGAATTCAGA-AATCTTAAA---------T---CTTGA-TCTAT--TT-GTTCTAG-AAA-TG--AT--CAAACCTAGCCATGT------TTG-C-TATATTGATGC-AG----------TT----ATA--GAC---A-----ACTATTGT--AATTAGGAGC-C
gi|20 : tcaAGGTGAATGTAATGTCGCAGTCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAAATGGTAAAT---CTTGA-TTA-----T-ATTATTG-AAAACG--AT--C-AACTAGACCATGtgc
gi|22 : AGATGAATGTTATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGATTTTTTTAAAATT
gi|23 : AGGTGAATGTTATGTCGAAGCCATTTTAGAATTCACA-T
gi|10 : ttaTGAATTTTATGTCACAGCCATCTTAGAGTTCATA-TTTCTTAAAATTGCAATAT---CATGA-TTGTT--TTTGTTATAG-AAAATT--AT--CAAACTTGGCCATGT------ATG-A-TATATTGATGC-AG----------TTC-AAGTG--TAA---A-----A-----GT--AATTACAAGC-CTGCATATTTC---ATAA---GATATATG-CTTTGAA-----AGA--C---CAA-----------------AA
gi|3 : GAATGCAATGCCACAGCCGTCTTAGGATTCGGA-TGTCGTAAAAAAGCCGT-------TGA-GTTTTG-TT-GTTGTGG-AAAAT--------------GGC-----------ACA-ACTGTTTTGATGCTAG----------T-C-AAGGG--AAG---A-----T-----GT--AATTACAAGC-CTGCATATTTT---GT------------G-CTTTAAA-----A-GGGC--GCAA-----------------AAAATA--AAAAAAAA---TCAACAAGGTT-A-TTATTAC-TAT-TA-T---AAAAATAAAAT--GATTTCTGAAACCAGT-A-A-AAGTACCTTATACA--------CGAGAGTTG-TT--TGGTTTA---------TT--TT-T---T----ATA-TAAA-aa
gi|5 : acTGTAATGTCACAGCCATCTGACAAGTCAGA-TTTCTTTAAACTGCCATAT---ATTGA-TTTGT--TT-GTTATTG-AAATTT--AT--CGAACTTGGCCATGT------ATG-C-TTTATTGATG------------------AA--G--AAG---A-----A-----AA--AGTTACATGC-CTGCATA--------TTG---AGTAT-----TTTAAA-----A-G-------AA-----------------AAGAAA--CTCAATC---TTTAGCAAAATT-A-TAATTAC-CTT-TA-T---AAAT-TACAACTTGATTTCTGAAACCAGA-A-A-A-ATAaacatattcactttaaatgctcaatttccgttatatgtgtcaatttataacacaatctagagttgtttatatgtgcactgaaatataac
gi|18 : actgagttGCCACAGCCATCTTAGCTTTCAGA-TTTCTTTATATTGTCATAT---CTTGA-CT--T--TC-GATGTAGTAGGATTCGAT--CAAACTTGGCCATGT------ATG-A-TATACTTATGC-AG----------TTC-AAGTG--TAGTTAA-----A-----AT--AAttataaatgcaaaaagatttctgattccaataaaagtacctcatacgtgatatttactaa
gi|6 : CACAGCCATTTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTACCATAC---CTTGAATTTTT--TT-GTAATAG-CAAATG--ATACCAAACTTGGACATGT------ATG-G-TATATTGATAC-AG----------TTC-AAGTA--AAG---ATTCTGAC----GT--AAATACAAGCTTGCT-TATTTA---GTAA---ACTGTTT-------AA-----A-A--G--ACAA-----------------AA---------AATGACT------AT---T-G-TAACTGT-TAT-TA-T------TGTAGATT--GATTTCTGACACCAGT-GAA-A-GTACTACACACA--------TGA---TGG-TTACT----TACAATGGAAC----TT-T---T----AAA-AAAA-AAA---ATTGAAcaagtctg
gi|17 : cTTCAGG-TTTCTTAAAATTGGCATAT---CTTGA-TTTTTCTTT-GTTACAA-AAAATA--TT--CAAACTTGGCCATGT------ATA-A-TATACTGATGC-AG----------TTC-AAGTG--TAG---A-----C-----AT--AATTACATGT-CTGCACATTTA---GTAA---AATGTataaatttaat
gi|21 : TTCAGA-TGTCTTAACATTGCCATAT---CTTGA-TCGTT--TT------AG-A--------C--CAAACTTGCTCATGT------ATG-A-TATATTGATGT-CG----------TTC-ATGTG--TAG---A-----A-----AT--gt
gi|11 : TTAAAATTGTAATGT---CATGA-TT-TT--TT-GTTATAT-AGAATT--AT--CAAAC----CGATAA------ATG-C-TATATTGATGC-AGGGAGCATACTTTCTGAATG--AAC---A-----A------TCAAATTA-AATG-CACAATTTTCT---GTTATATAAAACATGAATTTAAA-----T-A--C--ACTA-----------------AGAACGTTCACATACATTTTCCGCATG
gi|19 : AATT--AT--CAAAACTGACCATGTACATGTATG-C-TATACTGATGC-AG---------------AATG--TAG---A-----A-----GT--AATTATGACC-CTGAATAATTTAAAGTTA---AAT
gi|14 : atcttgattATTGATGC-AG----------TTC-AATTG--TAA---A-----C-----AT--ATTTACAAGC-CTGCACTTTTC---ATTA---AATGTGTG-TTTTAAA-----A-A--A--ACAATACAAAAAACCCCAAACAACACT--CACAA--ACTTTCAGCAATACT-A-TCATTAA-CA
gi|13 : TACAAGC-CTGCATATTTA---GTAA---AATGTGTG-C-------------A--C--ACAA-----------------AA-AAATCCACAAAC--TTTCAACATGATT-A-TCGTTAC-TAA-TA-T---TAATGTAAATT--GATT--TGAAAGCAGT---A-A-ATATAGTGTATG--------AAA---ATA-TT-CTG-TC---------------TT-T---T----AAAGTAAA-CATTTTATTAAATATAaatcaattttaatataatattttc
gi|12 : GATT-A-TCAATATATATATA-T---AAATATAAA-T--GATTTCTGAAACCAGTAA-A-A-GTACCTCATACA--------TG----TTGAATATTG-CTAAGGA---AGCTT--TT-T---TTTTAAAA-GAAATCAATTTA---AATGTAC-A
gi|5 : AT-TA-T---AAATGCAAAAA--GATTTCTGATTCCAATAA-A-A-GTACCTCATACG--------TGA---TAT-TTACTcttttctgttgcataaaacatgacctataataaaagtaatttcattttattcaaa
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111 11111111111111111 111111111111 1 44444444444444444444444444444 1111 1 111111 11111111111111 22222222 1 33333 1111
lowQualScore : 0 2 2 0 9999999999999999 33 0 0 3 33 2 666666 33 2 00000000000000000 2 33 66666666 33 1 2 444 666666666666 0 0 2 4 6666 44 555 33333333333333333333333333333 0 2222 0 3 3 3 666 0 777 0 6 4 4 1 111111 33 5 33333333333333 77 5 66666666 5 5 66 1 5 99999 3333
lowQualScore : . . . . ................ .. . . . .. . ...... .. . ................. . .. ........ .. . . ... ............ . . . . .... .. ... ............................. . .... . . . . ... . ... . . . . . ...... .. . .............. .. . ........ . . .. . . ..... ....
lowQualScore : 3 2 1 2 5555555555555555 44 6 6 3 11 2 888888 44 2 44444444444444444 2 11 22222222 11 7 7 777 444444444444 6 1 1 0 5555 22 444 11111111111111111111111111111 4 5555 2 6 6 6 444 4 555 9 0 0 0 6 555555 00 0 22222222222222 99 7 99999999 7 7 77 4 7 33333 8888
consensus : AGGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTGCCATATCTTGA--TT--T-T---T---TGTTATAGAAAATGAT--CA-AACTTGGCCATGT------ATG-NTATATTGATGC-AG----------TT-----C-AAGTGTAG--A-----A-GT--AATTACGAGCCTGCAT-A---TTT--AG-----TAAAATGTGTGCTTTAAAAAGA----C--AA---AAAA---N-A--C-----ACAA-AC------ACTTTCAGCAC---GATTATTATTAC-TAT-TA-T---AAATGTAAAA--TGATTTCTGAAACCAGT-AA-A-GTACCTCA------TACATGATGGT-TACT--GNCAA-GGAAGCTT--TT-T---T----A-A-A-AAAA-CA-ATTTATT---AATGTAC-CA-TTTCTCC
Reference ( family-7330 ) : AGGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTGCCATATCTTGA--TT--T-T---T---TGTTATAGAAAATNAT--CA-AACTTGGCCATGT------ATG-NTATATTGATGC-AG----------TT-----C-AAGTGTAG--A-----A-GT--AATTACGAGCCTGCAT-A---TTT--NG-----TNAAATGTGTGCTTTAAAAANA----C--AA---AAAA---N-A--C-----ACAA-AC------ACTTTCAGCAC---GATTATTATTAC-TAT-TA-T---AAATGTAAAA--TGATTTCTGAAACCAGT-AA-A-GTACCTCA------TACATGATNGT-TACT--GCCAA-GGAAGCTT--TT-T---T----A-A-A-NAAA-CA-ATTTATT---AATGTAC-CA-TTTCTCC
gi|1 : AGGTGAATGTAATGTCATAGCTATCTTAAAAT--------------AA---CCGTATCTT-A--TT--T-TGATT---TGTCATAGAAAATGAT--CA-AACTTGGACATTT------AAA-CTGTATTAATGC-AG----------TT-----C-AAGTGTAG--A-----A-GT--AATTATCAGCCAGCAT-A---TTA--AG-----TATAACGTCTGCTTT-AAAAGA----T---A---AAAA---C-A--C-----ACA------------TT------------------TTAC-TAC-TA-C---AAATGTTAAA--AAATTTCTGAAACCAAT-AATG-GTACCTCA------TACATG---GT-TTCT--GCCAA-GGGAGCTTAATTATTGAT----A-A-A-ATAA-CA-ATTTA-----AATGCAC-CACTTTCT
gi|10 : aTGAATTTTATGTCACAGCCATCTTAGAGTTCATA-TTTCTTAAAATTGCAATATCATGA--TTGTT-T---T---TGTTATAGAAAATTAT--CA-AACTTGGCCATGT------ATG-ATATATTGATGC-AG----------TT-----C-AAGTGTAA--A-----A-GT--AATTACAAGCCTGCAT-A---TTT--CA-----TAAGATATATGCTTTGAAAGAC----C--AA---AAAA---gttgtatgtaacatgactcgtttcatatgataacattatttagagttgttttcatgtgctgaaatatgattaaatttgttccgattggctttatacatagccatgggccgaagtgcattatttgaatatatggtcatacaatagatatattttattgggccgtatatcaaaaagatattgtgaccggctgatgtagttttataccgttttatgtatataacgttagtaata
gi|11 : TTAAAATTGTAATGTCATGA--TT--T-T---T---TGTTATATAGAATTAT--CA-AAC----CGATAA------ATG-CTATATTGATGC-AGGGAGCATACTTT-----CTGAATGAAC--A-----A--TCAAATTA-AA---TGCAC-AATTTTC--TGTTATATAAAACATG-AATTTAAATACA----C--TA---AGAA---C-GTTC-----ACAT-AC------ATTTTCCGCAT---G
gi|12 : ---GATTATCAATATATATATA-T---AAATATAAA---TGATTTCTGAAACCAGT-AA-AAGTACCTCA------TACATGTTGAA-TATT--GCTAA-GGAAGCTT--TT-T---TTTTAA-A-A-GAAATCA-ATTTA-----AATGTACACT-TTTCT
gi|13 : TACAAGCCTGCAT-A---TTT--AG-----TAAAATGTGTGC-------ACA----C--AA---AAAA---ATC--C-----ACAA-AC--------TTTCAACAT---GATTATCGTTAC-TAA-TA-T---TAATGTAAAT--TGATT--TGAAAGCAGT-AA-A--TA--TAG------TGTATGAAAATATTCT--GTC-------------TT-T---T----A-A-AGTAAA-CA-TTTTATT---AAgttgcataaaacatgacctataataaaagtaatttcattttattcaaa
gi|14 : ATTGATGC-AG----------TT-----C-AATTGTAA--A-----C-AT--ATTTACAAGCCTGCAC-T---TTT--CA-----TTAAATGTGTGTTTTAAAAAAA----C--AATACAAAA---A-A--CCCCAAACAACACTCACAAACTTTCAGCAA---TACTATCATTAatata
gi|15 : AGGCGAATATAATATCA--GTCATCTTAGAATTCAGA-AATCTTAAA---------TCTTGA--TC--TAT---T---TGTTCTAGAAA-TGAT--CA-AACCTAGCCATGT------TTG-CTATATTGATGC-AG----------TTATAGAC-AACTAT----------T-GT--AATTAGGAGCCTGCacaaatcaattttaatataatattttc
gi|16 : tcaAGATGAATTTAATGCCACAGTCATTTTAGAATGCAGA-TTTCTTAAAATTGCAATATATTCA--TT--TAT---T---TATT-T-----ATTAT--CA-AACTTGGCCATGT------ATGCGTA-ATTGATGC-AG----------AC-----C-AAGTGTTA--A-----G-GT--ATTTACAA
gi|17 : taTTCAGG-TTTCTTAAAATTGGCATATCTTGA--TT--T-T---TCTTTGTTACAAAAAATATT--CA-AACTTGGCCATGT------ATA-ATATACTGATGC-AG----------TT-----C-AAGTGTAG--A-----C-AT--AATTACATGTCTGCAC-A---TTT--AG-----TAAAATGTGT
gi|18 : GCCACAGCCATCTTAGCTTTCAGA-TTTCTTTATATTGTCATATCTTGA--CT--T-T---CGA-TGTAGTAGGATTCGAT--CA-AACTTGGCCATGT------ATG-ATATACTTATGC-AG----------TT-----C-AAGTGTAGTTA-----A-----AATAACAAGTCTG
gi|19 : AATTAT--CA-AAACTGACCATGTACATGTATG-CTATACTGATGC-AG--------------------AATGTAG--A-----A-GT--AATTATGACCCTGAATAA---TTTAAAG-----TTAAAT
gi|2 : atcttgattAGGTGAATGTAATGT-ATAGCAATTTTAGCAATCAAA-TATCTTAAAATTGCCATATCTTGA---------------------------------------CTTGGCCATGT------ATG-CTATTTTGATGC-AG----------TT-----C-AAGTGTAA--A-----A-GT--GATCACGAGTCTGAAT-A-----------------GAATGTGTGTTTT-AAAAGA----C--AA---AAAA---A-T--C-----ACAA---------ACTTTCAGAAC---AATAATTATTAT-CAT-TA-TAACAAATATAAAA--TAATTTCAGCAACCAGTAAA-A-ACACCGCATAGTTTTACGTGATGAT-TACT--AACAA-GGAAGCTT--TT-TTCAT----A-A-A-AAAATCA-ATTTA-----AATATAT-CA-TTTCTCC
gi|20 : cAGGTGAATGTAATGTCGCAGTCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAAATGGTAAATCTTGA------T-T---A---TATTATTGAAAACGAT--C--AACTAGACCATGttgtacattacatgacccttttcattttataacataatttaatagttgtttacacatgctttaatagaattaaacatttcccaattatatcattttagcatatgtactcatatagtttatatatactacatgtatacggggatatacttaaatgagattgtaaccggtgcct
gi|21 : TTCAGA-TGTCTTAACATTGCCATATCTTGA--TC--G-T---T---T----TAGA------C--CA-AACTTGCTCATGT------ATG-ATATATTGATGT-CG----------TT-----C-ATGTGTAG--A-----A-AT--
gi|22 : AGATGAATGTTATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGATTTTTTTAAAATT
gi|23 : AGGTGAATGTTATGTCGAAGCCATTTTAGAATTCACA-T
gi|3 : ttaGAATGCAATGCCACAGCCGTCTTAGGATTCGGA-TGTCGTAAAAAAGCCGT----TGAG-TT--T-TG--T---TGTTGTGGAAAATGG---CACAACT-----------------G-TT---TTGATGCTAG----------T------C-AAGGGAAG--A-----T-GT--AATTACAAGCCTGCAT-A---TTT----------------TGTGCTTTAAAAGGG----CGCAA---AAAA---T-A--A-----AAAA-AA------A---TCAACAA---GGTTATTATTAC-TAT-TA-T---AAAAATAAAA--TGATTTCTGAAACCAGTAAA-A-GTACCTTA------TACACGAGAGT-TGTTTGGTTTA-------TT--TT-T---T----ATATA-AAAA-CATATTCACTTTAAATGCTC-AA-TTTC
gi|4 : acAGGTGAATGTTATGTCACAGCCTTCTTAGAATTCAGA-TGTCTTAAAATTGCCATATATTGA--TTG-T-T---T---TGTTATAGAAAATCAT--CA-AACTTGGCCATGT------ATG-ATATATTGATGC-AG----------TT-----C-AAGTGAAG--A-----A-GT--AATTACGAGCCGCCAT-A---TTT--CG-----TTAAATATTTGCTTTGAAAACA----C--AA---AATA---C-A--C-----ACAA-AC------ACTTTCAGCAT---GAATATCATTAT-CAT-TA-T---AGATGTAAAA--CGATTTCTGAAACGAGT-GA-A-GTACCCTG------TATATGATTGT-TACT--GTCCA-CAAAGCTT--TT-T---T----A-A-A-TAAA-CA-GTTTATTG--AATGTAcgttatatgtgtcaatttataacacaatctagagttgtttatatgtgcactgaaatataac
gi|5 : TGTAATGTCACAGCCATCTGACAAGTCAGA-TTTCTTTAAACTGCCATATATTGA--TT--TGT---T---TGTTATTGAAATTTAT--CG-AACTTGGCCATGT------ATG-CTTTATTGATGA-AG-------------------AAG---AA--A-----A-----AGTTACATGCCTGCAT-A---TTG--AG-----T---AT------TTTAAAAG---------AA---AAGA---A-A--C-----TCAA-TC---------TTTAGCAA---AATTATAATTAC-CTT-TA-T---AAAT-TACAACTTGATTTCTGAAACCAGA-AA-A-ATA--TTA------TAAATGtaggtctccaatcttatctttctttga
gi|5 : actgagtt-TAT-TA-T---AAATGCAAAA--AGATTTCTGATTCCAATAAA-A-GTACCTCA------TACGTGATATT-TACT--caaaaagatttctgattccaataaaagtacctcatacgtgatatttactaa
gi|6 : actgagtttgtaatgtcacagccatctgacaagtcagatttctttaaactgccatatattgatttgtttgttattgaaatttatcgaacttggccatgtatgctttattgatgaagaagaaaaagttacatgcctgcatattgagtattttaaaagaaaagaaactcaatctttagcaaaattataattacctttataaattacaacttgatttctgaaaccagaaaaaCACAGCCATTTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTACCATACCTTGAATTT--T-T---T---TGTAATAGCAAATGATACCA-AACTTGGACATGT------ATG-GTATATTGATAC-AG----------TT-----C-AAGTAAAG--ATTCTGACGT--AAATACAAGCTTGCTT-A---TTT--AG-----TAAACTGT----TT--AAAAGA----C--AA---AAAA---T-------------------------------------GACTATTGTAAC-TGT-TA-T---TATTGTAGAT--TGATTTCTGACACCAGTGAA-A-GTACTACA------CACATGATGGT-TACT--TACAATGGAA--CT--TT-T---A----A-A-A-AAAA-AA-ATTaa
gi|7 : cAAGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTCGAAGTCGG--TCTCTTAAAAATGCCATATCTT-----T--T-T---T---TGT-ATAGAAAATGAT--TA-AACTTTGCCATGC------ATG-ATATACTGGTGC-AG----------TT-----C-AAGTTTGG--A-----A-GT--AATAA--------CAT-A---TTA--AG-----CCAAATTTGTGCTCTAAAGAGATAACC--AA---AAAAATTT-A--C-----ACAA---------ACTTCCAGAAT---GATTGTTATTAC-TAT-AATT---AAATGTAAAT--TTACCTCTGA------T-TA-A-GTATCCCA------TACATGAgaaataaatttaat
gi|8 : taAGGTGAATGTTATGTCACAGCCATCTTAGAATTGAGA-TTTCTTAAAATTGCCAAATCTTGA--TCG-T-T---T---TGTTATAGAACATGAT--CA-AACTTGGCCATGT------ATG-ATATATCGATGC-AG----------TT-----A-AAGTGTAG--A-----A-GT--AATTACGAGTCTGCAT-A---TTT--AG-----TAAAATGTGTGCATC-AAAATA----T--AA---AAAA---A-A--------AC---AC------ACTTTCAGCAT---ACTTATTAT
gi|9 : aAGGTGAATGTAATGT-ATAGCAATTTTAGCAATCAAA-TATCTTAAAATTGCCATATCTTGA---------------------------------------CTTGGCCATGT------ATG-CTATTTTGATGC-AG----------TT-----C-AAGTGTAA--A-----A-GT--GATCACGAGTCTGAAT-A-----------------GAATGTGTGTTTT-AAAAGA----C--AA---AAAA---A-T--C-----ACAA---------ACTTTCAGAACAATAATTATTATCAT-TAT-TA-C---AAATATAAAA--TAATTTC
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222 1 444444444444444444444444444 1111 1 111111 2222222222 222 11 33333 1111
lowQualScore : 0 2 2 0 1111111111111111 22 1 1 2 33 2 33 2 55555 33 6666666 1 2 33 0 0 1 7777 44 555 555555555555555555555555555 1 3333 3 3 3 666 0 777 0 6 4 4 1 111111 5 66 1 5 2222222222 77 5 000 5 5 5 33 5 99999 3333
lowQualScore : . . . . ................ .. . . . .. . .. . ..... .. ....... . . .. . . . .... .. ... ........................... . .... . . . ... . ... . . . . . ...... . .. . . .......... .. . ... . . . .. . ..... ....
lowQualScore : 3 2 1 2 4444444444444444 22 4 9 0 11 2 44 2 99999 22 0000000 4 9 99 2 8 9 1111 66 888 333333333333333333333333333 4 0000 6 6 6 444 4 555 9 0 0 0 6 555555 0 99 0 1 3333333333 99 7 000 7 7 7 66 7 33333 8888
consensus : AGGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTGCCATATCTTGA--TT--T-T---T---TGTTATAGAAAATGAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-NTATATTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAG--A-----A-GTAATTACGAGCCTGCAT-ATTT--AGTAAAATGTGTGCTTTAAAAAGA----C--AA---AAAA---N-AC-----ACAA-AC------ACTTTCAGCAC---GATTATTATTAC-TAT-TA-T---AAATGTAAAA--TGATTTCTGAAACCAGT-AA-A-GTACCTCA------TACATGATGGT-TACT--GNCAA-GGAAGC---TT--TT-T---TA-A-AA-AAA--CA-ATTTATT---AATGTAC-CA-TTTCTCC
Reference ( family-7330 ) : AGGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTGCCATATCTTGA--TT--T-T---T---TGTTATAGAAAATGAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-NTATATTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAG--A-----A-GTAATTACGAGCCTGCAT-ATTT--AGTAAAATGTGTGCTTTAAAAAGA----C--AA---AAAA---N-AC-----ACAA-AC------ACTTTCAGCAC---GATTATTATTAC-TAT-TA-T---AAATGTAAAA--TGATTTCTGAAACCAGT-AA-A-GTACCTCA------TACATGATGGT-TACT--GNCAA-GGAAGC---TT--TT-T---TA-A-AA-AAA--CA-ATTTATT---AATGTAC-CA-TTTCTCC
gi|1 : AGGTGAATGTAATGTCATAGCTATCTTAAAAT--------------AA---CCGTATCTT-A--TT--T-TGATT---TGTCATAGAAAATGAT--CA-AACTTGGACATTTAAA-CTGTATTAATGC-AGTT-----CAAGTGTAG--A-----A-GTAATTATCAGCCAGCAT-ATTA--AGTATAACGTCTGCTTTAAAA-GA----T--AA---AAA----C-AC-----ACA-----------------------------TT-TTAC-TAC-TA-C---AAATGTTAAA--AAATTTCTGAAACCAAT-AATG-GTACCTCA------TAC---ATGGT-TTCT--GCCAA-GGGAGC---TTAATTATTGATA-A-AA-TAA--CA-ATTTA-----AATGCAC-CACTTTCT
gi|10 : aTGAATTTTATGTCACAGCCATCTTAGAGTTCATA-TTTCTTAAAATTGCAATATCATGA--TTGTT-T---T---TGTTATAGAAAATTAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-ATATATTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAA--A-----A-GTAATTACAAGCCTGCAT-ATTT--CATAAGATATATGCTTTGAAAGAC----C--AA---AAAA---gttgtatgtaacatgactcgtttcatatgataacattatttagagttgttttcatgtgctgaaatatgattaaatttgttccgattggctttatacatagccatgggccgaagtgcattatttgaatatatggtcatacaatagatatattttattgggccgtatatcaaaaagatattgtgaccggctgatgtagttttataccgttttatgtatataacgttagtaata
gi|11 : TTAAAATTGTAATGTCATGA--TT--T-T---T---TGTTATATAGAATTAT--CA-AAC----CGATAAATG-CTATATTGATGC-AG
gi|12 : ---GATTATCAATATATATATA-T---AAATATAAA---TGATTTCTGAAACCAGT-AA-AAGTACCTCA------TACATGTTGAA-TATT--GCTAA-GGAAGCTTTTT--TT-T---TA-A-AA-GAAATCA-ATTTA-----AATGTACACT-TTTCTggagcatactttctgaatgaacaatcaaattaaatgcacaattttctgttatataaaacatgaatttaaatacactaagaacgttcacatacattttccgcatg
gi|13 : TACAAGCCTGCAT-ATTT--AGTAAAATGTGTGC-------ACA----C--AA---AAAA---ATCC-----ACAA-AC--------TTTCAACAT---GATTATCGTTAC-TAA-TA-T---TAATGTAAAT--TGATT--TGAAAGCAGT-AA-A--TA--TAG------TGTATGAAAATATTCT--GTC----------------TT-T---TA-A-AGTAAA--CA-TTTTATT---AAgttgcataaaacatgacctataataaaagtaatttcattttattcaaa
gi|14 : ATTGATGC-AGTT-----CAATTGTAA--A-----C-ATATTTACAAGCCTGCAC-TTTT--CATTAAATGTGTGTTTTAAAAAAA----C--AATACAAAA---A-ACCCCAAACAACACTCACAAACTTTCAGCAA---TACTATCATTAatata
gi|15 : AGGCGAATATAATATCA--GTCATCTTAGAATTCAGA-AATCTTAAA---------TCTTGA--TC--TAT---T---TGTTCTAGAAA-TGAT--CA-AACCTAGCCATGTTTG-CTATATTGATGC-AGTTATAGACAACTAT----------T-GTAATTAGGAGCCTGCacaaatcaattttaatataatattttc
gi|16 : tcaAGATGAATTTAATGCCACAGTCATTTTAGAATGCAGA-TTTCTTAAAATTGCAATATATTCA--TT--TAT---T---TATT-T-----ATTAT--CA-AACTTGGCCATGTATGCGTA-ATTGATGC-AGAC-----CAAGTGTTA--A-----G-GTATTTACAA
gi|17 : taTTCAGG-TTTCTTAAAATTGGCATATCTTGA--TT--T-T---TCTTTGTTACAAAAAATATT--CA-AACTTGGCCATGTATA-ATATACTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAG--A-----C-ATAATTACATGTCTGCAC-ATTT--AGTAAAATGTGT
gi|18 : GCCACAGCCATCTTAGCTTTCAGA-TTTCTTTATATTGTCATATCTTGA--CT--T-T---CGA-TGTAGTAGGATTCGAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-ATATACTTATGC-AGTT-----CAAGTGTAGTTA-----A---AATAACAAGTCTG
gi|19 : ATCTTGA--TT--A----------ATTATCAAAACTGAC--CA-----TGTACATGTATG-CTATACTGATGC-AG---------AATGTAG--A-----A-GTAATTATGACCCTGAATAATTTAAAGTTAAAT
gi|2 : AGGTGAATGTAATGT-ATAGCAATTTTAGCAATCAAA-TATCTTAAAATTGCCATATCTTGA---------------------------------------CTTGGCCATGTATG-CTATTTTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAA--A-----A-GTGATCACGAGTCTG----------AATAGAATGTGTGTTTT-AAAAGA----C--AA---AAAA---A-TC-----ACAA---------ACTTTCAGAAC---AATAATTATTAT-CAT-TA-TAACAAATATAAAA--TAATTTCAGCAACCAGTAAA-A-ACACCGCATAGTTTTACGTGATGAT-TACT--AACAA-GGAAGC---TT--TT-TTCATA-A-AA-AAAT-CA-ATTTA-----AATATAT-CA-TTTCTCC
gi|20 : cAGGTGAATGTAATGTCGCAGTCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAAATGGTAAATCTTGA------T-T---A---TATTATTGAAAACGAT--C--AACTAGACCATGttgtacattacatgacccttttcattttataacataatttaatagttgtttacacatgctttaatagaattaaacatttcccaattatatcattttagcatatgtactcatatagtttatatatactacatgtatacggggatatacttaaatgagattgtaaccggtgcct
gi|21 : TTCAGA-TGTCTTAACATTGCCATATCTTGA--TC--G-T---T---T----TAGA------C--CA-AACTTGCTCATGTATG-ATATATTGATGT-CGTT-----CATGTGTAG--A-----A-AT
gi|22 : AGATGAATGTTATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGATTTTTTTAAAATT
gi|23 : AGGTGAATGTTATGTCGAAGCCATTTTAGAATTCACA-T
gi|3 : ttaGAATGCAATGCCACAGCCGTCTTAGGATTCGGA-TGTCGTAAAAAAGCCGT----TGAG-TT--T-TG--T---TGTTGTGGAAAATGG---CACAACT-----------G-TT---TTGATGCTAGT------CAAGGGAAG--A-----T-GTAATTACAAGCCTGCAT-ATTT-----------TGTGCTTTAAAAGGG----CGCAA---AAAA---T-AA-----AAAA-AA------A---TCAACAA---GGTTATTATTAC-TAT-TA-T---AAAAATAAAA--TGATTTCTGAAACCAGTAAA-A-GTACCTTA------TACACGAGAGT-TGTTTGGTTTA----------TT--TT-T---TATATAA-AAA--CATATTCACTTTAAATGCTC-AA-TTTC
gi|4 : acAGGTGAATGTTATGTCACAGCCTTCTTAGAATTCAGA-TGTCTTAAAATTGCCATATATTGA--TTG-T-T---T---TGTTATAGAAAATCAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-ATATATTGATGC-AGTT-----CAAGTGAAG--A-----A-GTAATTACGAGCCGCCAT-ATTT--CGTTAAATATTTGCTTTGAAAACA----C--AA---AATA---C-AC-----ACAA-AC------ACTTTCAGCAT---GAATATCATTAT-CAT-TA-T---AGATGTAAAA--CGATTTCTGAAACGAGT-GA-A-GTACCCTG------TATATGATTGT-TACT--GTCCA-CAAAGC---TT--TT-T---TA-A-AT-AAA--CA-GTTTATTG--AATGTAcgttatatgtgtcaatttataacacaatctagagttgtttatatgtgcactgaaatataac
gi|5 : TGTAATGTCACAGCCATCTGACAAGTCAGA-TTTCTTTAAACTGCCATATATTGA--TT--TGT---T---TGTTATTGAAATTTAT--CG-AACTTGGCCATGTATG-CTTTATTGATGA-AG--------AAG---AA--A-----A---AGTTACATGCCTGCAT-ATTG--AGTA----------TTTTAAAAG--------AA---AAGA---A-AC-----TCAA-TC---------TTTAGCAA---AATTATAATTAC-CTT-TA-T---AAAT-TACAACTTGATTTCTGAAACCAGA-AA-A-ATA--TTA------TAAATGtaggtctccaatcttatctttctttga
gi|5 : actgagtt-TAT-TA-T---AAATGCAAAA--AGATTTCTGATTCCAATAAA-A-GTACCTCA------TACGTGATATT-TACT--caaaaagatttctgattccaataaaagtacctcatacgtgatatttactaa
gi|6 : actgagtttgtaatgtcacagccatctgacaagtcagatttctttaaactgccatatattgatttgtttgttattgaaatttatcgaacttggccatgtatgctttattgatgaagaagaaaaagttacatgcctgcatattgagtattttaaaagaaaagaaactcaatctttagcaaaattataattacctttataaattacaacttgatttctgaaaccagaaaaaCACAGCCATTTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTACCATACCTTGAATTT--T-T---T---TGTAATAGCAAATGATACCA-AACTTGGACATGTATG-GTATATTGATAC-AGTT-----CAAGTAAAG--ATTCTGACGTAAATACAAGCTTGCTT-ATTT--AGTAAACTGT----TT--AAAAGA----C--AA---AAAA---T-----------------------------------GACTATTGTAAC-TGT-TA-T---TATTGTAGAT--TGATTTCTGACACCAGTGAA-A-GTACTACA------CACATGATGGT-TACT--TACAATGGAA-----CT--TT-T---AA-A-AA-AAA--AA-ATTaa
gi|7 : cAAGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTCGAAGTCGG--TCTCTTAAAAATGCCATATCTT-----T--T-T---T---TGT-ATAGAAAATGAT--TA-AACTTTGCCATGCATG-ATATACTGGTGC-AGTT-----CAAGTTTGG--A-----A-GTAATAA--------CAT-ATTA--AGCCAAATTTGTGCTCTAAAGAGATAACC--AA---AAAAATTT-AC-----ACAA---------ACTTCCAGAAT---GATTGTTATTAC-TAT-AATT---AAATGTAAAT--TTACCTCTGA------T-TA-A-GTATCCCA------TACATGAgaaataaatttaat
gi|8 : taAGGTGAATGTTATGTCACAGCCATCTTAGAATTGAGA-TTTCTTAAAATTGCCAAATCTTGA--TCG-T-T---T---TGTTATAGAACATGAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-ATATATCGATGC-AGTT-----AAAGTGTAG--A-----A-GTAATTACGAGTCTGCAT-ATTT--AGTAAAATGTGTGCATC-AAAATA----T--AA---AAAA---A-A------AC---AC------ACTTTCAGCAT---ACTTATTAT
gi|9 : aAGGTGAATGTAATGT-ATAGCAATTTTAGCAATCAAA-TATCTTAAAATTGCCATATCTTGA---------------------------------------CTTGGCCATGTATG-CTATTTTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAA--A-----A-GTGATCACGAGTCTG----------AATAGAATGTGTGTTTT-AAAAGA----C--AA---AAAA---A-TC-----ACAA---------ACTTTCAGAACAATAATTATTATCAT-TAT-TA-C---AAATATAAAA--TAATTTC
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222 1 444444444444444444444444444 1111 1 111111 2222222222 222 11 33333 1111
lowQualScore : 0 2 2 0 1111111111111111 22 1 1 2 33 2 33 2 55555 33 6666666 1 2 33 0 0 1 7777 44 555 555555555555555555555555555 1 3333 3 3 3 666 0 777 0 6 4 4 1 111111 5 66 1 5 2222222222 77 5 000 5 5 5 33 5 99999 3333
lowQualScore : . . . . ................ .. . . . .. . .. . ..... .. ....... . . .. . . . .... .. ... ........................... . .... . . . ... . ... . . . . . ...... . .. . . .......... .. . ... . . . .. . ..... ....
lowQualScore : 3 2 1 2 4444444444444444 22 4 9 0 11 2 44 2 99999 22 0000000 4 9 99 2 8 9 1111 66 888 333333333333333333333333333 4 0000 6 6 6 444 4 555 9 0 0 0 6 555555 0 99 0 1 3333333333 99 7 000 7 7 7 66 7 33333 8888
consensus : AGGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTGCCATATCTTGA--TT--T-T---T---TGTTATAGAAAATGAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-NTATATTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAG--A-----A-GTAATTACGAGCCTGCAT-ATTT--AGTAAAATGTGTGCTTTAAAAAGA----C--AA---AAAA---N-AC-----ACAA-AC------ACTTTCAGCAC---GATTATTATTAC-TAT-TA-T---AAATGTAAAA--TGATTTCTGAAACCAGT-AA-A-GTACCTCA------TACATGATGGT-TACT--GNCAA-GGAAGC---TT--TT-T---TA-A-AA-AAA--CA-ATTTATT---AATGTAC-CA-TTTCTCC
Reference ( family-7330 ) : AGGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTGCCATATCTTGA--TT--T-T---T---TGTTATAGAAAATGAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-NTATATTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAG--A-----A-GTAATTACGAGCCTGCAT-ATTT--AGTAAAATGTGTGCTTTAAAAAGA----C--AA---AAAA---N-AC-----ACAA-AC------ACTTTCAGCAC---GATTATTATTAC-TAT-TA-T---AAATGTAAAA--TGATTTCTGAAACCAGT-AA-A-GTACCTCA------TACATGATGGT-TACT--GNCAA-GGAAGC---TT--TT-T---TA-A-AA-AAA--CA-ATTTATT---AATGTAC-CA-TTTCTCC
gi|1 : AGGTGAATGTAATGTCATAGCTATCTTAAAAT--------------AA---CCGTATCTT-A--TT--T-TGATT---TGTCATAGAAAATGAT--CA-AACTTGGACATTTAAA-CTGTATTAATGC-AGTT-----CAAGTGTAG--A-----A-GTAATTATCAGCCAGCAT-ATTA--AGTATAACGTCTGCTTTAAAA-GA----T--AA---AAA----C-AC-----ACA-----------------------------TT-TTAC-TAC-TA-C---AAATGTTAAA--AAATTTCTGAAACCAAT-AATG-GTACCTCA------TAC---ATGGT-TTCT--GCCAA-GGGAGC---TTAATTATTGATA-A-AA-TAA--CA-ATTTA-----AATGCAC-CACTTTCT
gi|10 : aTGAATTTTATGTCACAGCCATCTTAGAGTTCATA-TTTCTTAAAATTGCAATATCATGA--TTGTT-T---T---TGTTATAGAAAATTAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-ATATATTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAA--A-----A-GTAATTACAAGCCTGCAT-ATTT--CATAAGATATATGCTTTGAAAGAC----C--AA---AAAA---gttgtatgtaacatgactcgtttcatatgataacattatttagagttgttttcatgtgctgaaatatgattaaatttgttccgattggctttatacatagccatgggccgaagtgcattatttgaatatatggtcatacaatagatatattttattgggccgtatatcaaaaagatattgtgaccggctgatgtagttttataccgttttatgtatataacgttagtaata
gi|11 : TTAAAATTGTAATGTCATGA--TT--T-T---T---TGTTATATAGAATTAT--CA-AAC----CGATAAATG-CTATATTGATGC-AG
gi|12 : ---GATTATCAATATATATATA-T---AAATATAAA---TGATTTCTGAAACCAGT-AA-AAGTACCTCA------TACATGTTGAA-TATT--GCTAA-GGAAGCTTTTT--TT-T---TA-A-AA-GAAATCA-ATTTA-----AATGTACACT-TTTCTggagcatactttctgaatgaacaatcaaattaaatgcacaattttctgttatataaaacatgaatttaaatacactaagaacgttcacatacattttccgcatg
gi|13 : TACAAGCCTGCAT-ATTT--AGTAAAATGTGTGC-------ACA----C--AA---AAAA---ATCC-----ACAA-AC--------TTTCAACAT---GATTATCGTTAC-TAA-TA-T---TAATGTAAAT--TGATT--TGAAAGCAGT-AA-A--TA--TAG------TGTATGAAAATATTCT--GTC----------------TT-T---TA-A-AGTAAA--CA-TTTTATT---AAgttgcataaaacatgacctataataaaagtaatttcattttattcaaa
gi|14 : ATTGATGC-AGTT-----CAATTGTAA--A-----C-ATATTTACAAGCCTGCAC-TTTT--CATTAAATGTGTGTTTTAAAAAAA----C--AATACAAAA---A-ACCCCAAACAACACTCACAAACTTTCAGCAA---TACTATCATTAatata
gi|15 : AGGCGAATATAATATCA--GTCATCTTAGAATTCAGA-AATCTTAAA---------TCTTGA--TC--TAT---T---TGTTCTAGAAA-TGAT--CA-AACCTAGCCATGTTTG-CTATATTGATGC-AGTTATAGACAACTAT----------T-GTAATTAGGAGCCTGCacaaatcaattttaatataatattttc
gi|16 : tcaAGATGAATTTAATGCCACAGTCATTTTAGAATGCAGA-TTTCTTAAAATTGCAATATATTCA--TT--TAT---T---TATT-T-----ATTAT--CA-AACTTGGCCATGTATGCGTA-ATTGATGC-AGAC-----CAAGTGTTA--A-----G-GTATTTACAA
gi|17 : taTTCAGG-TTTCTTAAAATTGGCATATCTTGA--TT--T-T---TCTTTGTTACAAAAAATATT--CA-AACTTGGCCATGTATA-ATATACTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAG--A-----C-ATAATTACATGTCTGCAC-ATTT--AGTAAAATGTGT
gi|18 : GCCACAGCCATCTTAGCTTTCAGA-TTTCTTTATATTGTCATATCTTGA--CT--T-T---CGA-TGTAGTAGGATTCGAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-ATATACTTATGC-AGTT-----CAAGTGTAGTTA-----A---AATAACAAGTCTG
gi|19 : ATCTTGA--TT--A----------ATTATCAAAACTGAC--CA-----TGTACATGTATG-CTATACTGATGC-AG---------AATGTAG--A-----A-GTAATTATGACCCTGAATAATTTAAAGTTAAAT
gi|2 : AGGTGAATGTAATGT-ATAGCAATTTTAGCAATCAAA-TATCTTAAAATTGCCATATCTTGA---------------------------------------CTTGGCCATGTATG-CTATTTTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAA--A-----A-GTGATCACGAGTCTG----------AATAGAATGTGTGTTTT-AAAAGA----C--AA---AAAA---A-TC-----ACAA---------ACTTTCAGAAC---AATAATTATTAT-CAT-TA-TAACAAATATAAAA--TAATTTCAGCAACCAGTAAA-A-ACACCGCATAGTTTTACGTGATGAT-TACT--AACAA-GGAAGC---TT--TT-TTCATA-A-AA-AAAT-CA-ATTTA-----AATATAT-CA-TTTCTCC
gi|20 : cAGGTGAATGTAATGTCGCAGTCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAAATGGTAAATCTTGA------T-T---A---TATTATTGAAAACGAT--C--AACTAGACCATGttgtacattacatgacccttttcattttataacataatttaatagttgtttacacatgctttaatagaattaaacatttcccaattatatcattttagcatatgtactcatatagtttatatatactacatgtatacggggatatacttaaatgagattgtaaccggtgcct
gi|21 : TTCAGA-TGTCTTAACATTGCCATATCTTGA--TC--G-T---T---T----TAGA------C--CA-AACTTGCTCATGTATG-ATATATTGATGT-CGTT-----CATGTGTAG--A-----A-AT
gi|22 : AGATGAATGTTATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGATTTTTTTAAAATT
gi|23 : AGGTGAATGTTATGTCGAAGCCATTTTAGAATTCACA-T
gi|3 : ttaGAATGCAATGCCACAGCCGTCTTAGGATTCGGA-TGTCGTAAAAAAGCCGT----TGAG-TT--T-TG--T---TGTTGTGGAAAATGG---CACAACT-----------G-TT---TTGATGCTAGT------CAAGGGAAG--A-----T-GTAATTACAAGCCTGCAT-ATTT-----------TGTGCTTTAAAAGGG----CGCAA---AAAA---T-AA-----AAAA-AA------A---TCAACAA---GGTTATTATTAC-TAT-TA-T---AAAAATAAAA--TGATTTCTGAAACCAGTAAA-A-GTACCTTA------TACACGAGAGT-TGTTTGGTTTA----------TT--TT-T---TATATAA-AAA--CATATTCACTTTAAATGCTC-AA-TTTC
gi|4 : acAGGTGAATGTTATGTCACAGCCTTCTTAGAATTCAGA-TGTCTTAAAATTGCCATATATTGA--TTG-T-T---T---TGTTATAGAAAATCAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-ATATATTGATGC-AGTT-----CAAGTGAAG--A-----A-GTAATTACGAGCCGCCAT-ATTT--CGTTAAATATTTGCTTTGAAAACA----C--AA---AATA---C-AC-----ACAA-AC------ACTTTCAGCAT---GAATATCATTAT-CAT-TA-T---AGATGTAAAA--CGATTTCTGAAACGAGT-GA-A-GTACCCTG------TATATGATTGT-TACT--GTCCA-CAAAGC---TT--TT-T---TA-A-AT-AAA--CA-GTTTATTG--AATGTAcgttatatgtgtcaatttataacacaatctagagttgtttatatgtgcactgaaatataac
gi|5 : TGTAATGTCACAGCCATCTGACAAGTCAGA-TTTCTTTAAACTGCCATATATTGA--TT--TGT---T---TGTTATTGAAATTTAT--CG-AACTTGGCCATGTATG-CTTTATTGATGA-AG--------AAG---AA--A-----A---AGTTACATGCCTGCAT-ATTG--AGTA----------TTTTAAAAG--------AA---AAGA---A-AC-----TCAA-TC---------TTTAGCAA---AATTATAATTAC-CTT-TA-T---AAAT-TACAACTTGATTTCTGAAACCAGA-AA-A-ATA--TTA------TAAATGtaggtctccaatcttatctttctttga
gi|5 : actgagtt-TAT-TA-T---AAATGCAAAA--AGATTTCTGATTCCAATAAA-A-GTACCTCA------TACGTGATATT-TACT--caaaaagatttctgattccaataaaagtacctcatacgtgatatttactaa
gi|6 : actgagtttgtaatgtcacagccatctgacaagtcagatttctttaaactgccatatattgatttgtttgttattgaaatttatcgaacttggccatgtatgctttattgatgaagaagaaaaagttacatgcctgcatattgagtattttaaaagaaaagaaactcaatctttagcaaaattataattacctttataaattacaacttgatttctgaaaccagaaaaaCACAGCCATTTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTACCATACCTTGAATTT--T-T---T---TGTAATAGCAAATGATACCA-AACTTGGACATGTATG-GTATATTGATAC-AGTT-----CAAGTAAAG--ATTCTGACGTAAATACAAGCTTGCTT-ATTT--AGTAAACTGT----TT--AAAAGA----C--AA---AAAA---T-----------------------------------GACTATTGTAAC-TGT-TA-T---TATTGTAGAT--TGATTTCTGACACCAGTGAA-A-GTACTACA------CACATGATGGT-TACT--TACAATGGAA-----CT--TT-T---AA-A-AA-AAA--AA-ATTaa
gi|7 : cAAGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTCGAAGTCGG--TCTCTTAAAAATGCCATATCTT-----T--T-T---T---TGT-ATAGAAAATGAT--TA-AACTTTGCCATGCATG-ATATACTGGTGC-AGTT-----CAAGTTTGG--A-----A-GTAATAA--------CAT-ATTA--AGCCAAATTTGTGCTCTAAAGAGATAACC--AA---AAAAATTT-AC-----ACAA---------ACTTCCAGAAT---GATTGTTATTAC-TAT-AATT---AAATGTAAAT--TTACCTCTGA------T-TA-A-GTATCCCA------TACATGAgaaataaatttaat
gi|8 : taAGGTGAATGTTATGTCACAGCCATCTTAGAATTGAGA-TTTCTTAAAATTGCCAAATCTTGA--TCG-T-T---T---TGTTATAGAACATGAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-ATATATCGATGC-AGTT-----AAAGTGTAG--A-----A-GTAATTACGAGTCTGCAT-ATTT--AGTAAAATGTGTGCATC-AAAATA----T--AA---AAAA---A-A------AC---AC------ACTTTCAGCAT---ACTTATTAT
gi|9 : aAGGTGAATGTAATGT-ATAGCAATTTTAGCAATCAAA-TATCTTAAAATTGCCATATCTTGA---------------------------------------CTTGGCCATGTATG-CTATTTTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAA--A-----A-GTGATCACGAGTCTG----------AATAGAATGTGTGTTTT-AAAAGA----C--AA---AAAA---A-TC-----ACAA---------ACTTTCAGAACAATAATTATTATCAT-TAT-TA-C---AAATATAAAA--TAATTTC
blockSeqs : T T TTTTTCTT TA A A T AC C CG T ATAGA TT TTCTGAC A A AA G TAAC GC TAC AACCCCAAACAACACTCACAAAC C CAAT A A T AAC ACT A . A C TAGTTT A TG C A GGAAGCTTT . . TCA T T T AT T CTTTA ACT
blockSeqs : . A TTGTTTT TA A A T . . A . . . A A . . A . . . ATTTACACAAAC C T . . . . T A . . C . . . T A GGAAGC . . . . . . T . TTG CA
blockSeqs : . T CTTTCGA TC A A G . . C . . . C A . . A . . . CACACAAACAC A A . . . . A A . . C . . . A T CAAAGC . . . . . . . . TT AA
blockSeqs : . T GTTTTGT TA A A T . . C . . . T G . . G . . . ATCCACAAAC C C . . . . A G . . C . . . T C TGGAA . . . . . . . . .
blockSeqs : . T ATTTTTT AG A T A . . A . . . G A . . T . . . TAAAAAAAAA C A . . . . A . . . C . . . T A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A TCTATT TA C C G . . A . . . C A . . A . . . ATCACAAAC C T . . . . A . . . C . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T TTTATT TA T A G . . C . . . A A . . . . . . AACTCAATC A A . . . . T . . . T . . .
blockSeqs : . G TTGTTT TG A A G . . C . . . A G . . . . . . ATCACAAAC C T . . . . T . . . . .
blockSeqs : . T TTTGTT TA G A G . . A . . . A G . . . . . . AAACACAC A T . . . . A . . . . .
blockSeqs : . G TCGTTT TA A T C . . T . . . A A . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . G TTTTT AA T A T . . A . . . T G . . . . . .
blockSeqs : . T TCGTT TA A A G . . C . . . A A . .
blockSeqs : . T TTTT T A A G . . G . . . A A . .
blockSeqs : . C TTA A A . G . . A . . . A G
blockSeqs : . T TTA . . . . . . A . . . A G
blockSeqs : . A . . . . . . . C . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqCons : TTTTT*********** ANCACAAAC****************** N*** GGAAGC**** ** ***
originalCons : AGGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTGCCATATCTTGA--TT--T-T---T---TGTTATAGAAAATGAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-NTATATTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAG--A-----A-GTAATTACGAGCCTGCAT-ATTT--AGTAAAATGTGTGCTTTAAAAAGA----C--AA---AAAA---N-AC-----ACAA-AC------ACTTTCAGCAC---GATTATTATTAC-TAT-TA-T---AAATGTAAAA--TGATTTCTGAAACCAGT-AA-A-GTACCTCA------TACATGATGGT-TACT--GNCAA-GGAAGC---TT--TT-T---TA-A-AA-AAA--CA-ATTTATT---AATGTAC-CA-TTTCTCC
finalCons : AGGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTGCCATATCTTGATTTTT-----------TGTTATAGAAAATGAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-NTATATTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAG--A-----A-GTAATTACGAGCCTGCAT-ATTT--AGTAAAATGTGTGCTTTAAAAAGA----C--AA---AAAAANCACAAAC------------------TTTCAGCAN---GATTATTATTAC-TAT-TA-T---AAATGTAAAA--TGATTTCTGAAACCAGT-AA-A-GTACCTCA------TACATGATGGT-TACT--GNCAAGGAAGC----TT--TT-T---TA-A-AA-AAA--CA-ATTTATT---AATGTAC-CA-TTTCTCC
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222 1 222222222222222 1 111111 2222222222 222 11 33333 1111
lowQualScore : 0 2 2 0 1111111111111111 22 1 1 2 33 2 33 2 55555 33 6666666 1 2 33 0 0 4 3 7777 3 555 999999999999999 3 55 7777 2 4 4 4 777 1 999 3 4 4 2 222222 5 0 77 1 5 2222222222 77 5 000 5 5 5 33 5 99999 3333
lowQualScore : . . . . ................ .. . . . .. . .. . ..... .. ....... . . .. . . . . .... . ... ............... . .. .... . . . . ... . ... . . . . ...... . . .. . . .......... .. . ... . . . .. . ..... ....
lowQualScore : 3 2 1 2 4444444444444444 22 4 9 0 11 2 44 2 99999 22 0000000 4 9 99 2 8 8 3 1111 3 888 000000000000000 6 00 7777 3 0 0 0 000 4 222 3 4 4 9 888888 7 6 99 0 1 3333333333 99 7 000 7 7 7 66 7 33333 8888
consensus : AGGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTGCCATATCTTGA--TT--T-T---T---TGTTATAGAAAATGAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-NTATATTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAG--A-----A-GTAATTACGAGCCTGCAT-ATTT--AGTAAAATGTGTGCTTT-AAA-AGA----CA-A---AAAAA--------------NC-ACAA--ACTTTCAG--C-ATGATTATTATTAC-TAT-TA-T---AAATGTAAAA--TGATTTCTGAAACCAGT-AA-A-GTACCTCA------TACATGATGGT-TACT--GNCAA-GGAAGC---TT--TT-T---TA-A-AA-AAA--CA-ATTTATT---AATGTAC-CA-TTTCTCC
Reference ( family-7330 ) : AGGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTGCCATATCTTGA--TT--T-T---T---TGTTATAGAAAATGAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-NTATATTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAG--A-----A-GTAATTACGAGCCTGCAT-ATTT--AGTAAAATGTGTGCTTTAAAA-AGA----CA-A---AAAAA--------------NC-ACAA--ACTTTCAG--C-ANGATTATTATTAC-TAT-TA-T---AAATGTAAAA--TGATTTCTGAAACCAGT-AA-A-GTACCTCA------TACATGATGGT-TACT--GNCAA-GGAAGC---TT--TT-T---TA-A-AA-AAA--CA-ATTTATT---AATGTAC-CA-TTTCTCC
gi|1 : AGGTGAATGTAATGTCATAGCTATCTTAAAAT--------------AA---CCGTATCTT-A--TT--T-TGATT---TGTCATAGAAAATGAT--CA-AACTTGGACATTTAAA-CTGTATTAATGC-AGTT-----CAAGTGTAG--A-----A-GTAATTATCAGCCAGCAT-ATTA--AGTATAACGTCTGCTTT-AAA-AGA----TA-A---AAA-----------------C-ACA--------------------CATT-TTAC-TAC-TA-C---AAATGTTAAA--AAATTTCTGAAACCAAT-AATG-GTACCTCA------TAC---ATGGT-TTCT--GCCAA-GGGAGC---TTAATTATTGATA-A-AA-TAA--CA-ATTTA-----AATGCAC-CACTTTCT
gi|10 : aTGAATTTTATGTCACAGCCATCTTAGAGTTCATA-TTTCTTAAAATTGCAATATCATGA--TTGTT-T---T---TGTTATAGAAAATTAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-ATATATTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAA--A-----A-GTAATTACAAGCCTGCAT-ATTT--CATAAGATATATGCTTT-GAA-AGA----CC-A---AAAAA--------------gttgtatgtaacatgactcgtttcatatgataacattatttagagttgttttcatgtgctgaaatatgattaaatttgttccgattggctttatacatagccatgggccgaagtgcattatttgaatatatggtcatacaatagatatattttattgggccgtatatcaaaaagatattgtgaccggctgatgtagttttataccgttttatgtatataacgttagtaata
gi|11 : TTAAAATTGTAATGTCATGA--TT--T-T---T---TGTTATATAGAATTAT--CA-AAC----CGATAAATG-CTATATTGATGC-AG
gi|12 : GATTATCAATATATATATA-T---AAATATAAA---TGATTTCTGAAACCAGT-AA-AAGTACCTCA------TACATGTTGAA-TATT--GCTAA-GGAAGCTTTTT--TT-T---TA-A-AA-GAAATCA-ATTTA-----AATGTACACT-TTTCTggagcatactttctgaatgaacaatcaaattaaatgcacaattttctgttatataaaacatgaatttaaatacactaagaacgttcacatacattttccgcatg
gi|13 : TACAAGCCTGCAT-ATTT--AGTAAAATGTGTGC--------ACA----CA-A---AAAAA--------------TCCACAA--ACTTTCAA--C-ATGATTATCGTTAC-TAA-TA-T---TAATGTAAAT--TGATT--TGAAAGCAGT-AA-A--TA--TAG------TGTATGAAAATATTCT--GTC----------------TT-T---TA-A-AGTAAA--CA-TTTTATT---AAgttgcataaaacatgacctataataaaagtaatttcattttattcaaa
gi|14 : ATTGATGC-AGTT-----CAATTGTAA--A-----C-ATATTTACAAGCCTGCAC-TTTT--CATTAAATGTGTGTTTTAAAA-AAA----CA-ATACAAAAAACCCCAAACAACACTC-ACAA--ACTTTCAG--C-AATACTATCATTAatata
gi|15 : AGGCGAATATAATATCA--GTCATCTTAGAATTCAGA-AATCTTAAA---------TCTTGA--TC--TAT---T---TGTTCTAGAAA-TGAT--CA-AACCTAGCCATGTTTG-CTATATTGATGC-AGTTATAGACAACTAT----------T-GTAATTAGGAGCCTGCacaaatcaattttaatataatattttc
gi|16 : tcaAGATGAATTTAATGCCACAGTCATTTTAGAATGCAGA-TTTCTTAAAATTGCAATATATTCA--TT--TAT---T---TATT-T-----ATTAT--CA-AACTTGGCCATGTATGCGTA-ATTGATGC-AGAC-----CAAGTGTTA--A-----G-GTATTTACAA
gi|17 : taTTCAGG-TTTCTTAAAATTGGCATATCTTGA--TT--T-T---TCTTTGTTACAAAAAATATT--CA-AACTTGGCCATGTATA-ATATACTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAG--A-----C-ATAATTACATGTCTGCAC-ATTT--AGTAAAATGTGT
gi|18 : GCCACAGCCATCTTAGCTTTCAGA-TTTCTTTATATTGTCATATCTTGA--CT--T-T---CGA-TGTAGTAGGATTCGAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-ATATACTTATGC-AGTT-----CAAGTGTAGTTA-----A---AATAACAAGTCTG
gi|19 : ATCTTGA--TT--A----------ATTATCAAAACTGAC--CA-----TGTACATGTATG-CTATACTGATGC-AG---------AATGTAG--A-----A-GTAATTATGACCCTGAATAATTTAAAGTTAAAT
gi|2 : AGGTGAATGTAATGT-ATAGCAATTTTAGCAATCAAA-TATCTTAAAATTGCCATATCTTGA---------------------------------------CTTGGCCATGTATG-CTATTTTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAA--A-----A-GTGATCACGAGTCTG----------AATAGAATGTGTGTTTT-AAA-AGA----CA-A---AAAAA--------------TC-ACAA--ACTTTCAG--A-ACAATAATTATTAT-CAT-TA-TAACAAATATAAAA--TAATTTCAGCAACCAGTAAA-A-ACACCGCATAGTTTTACGTGATGAT-TACT--AACAA-GGAAGC---TT--TT-TTCATA-A-AA-AAAT-CA-ATTTA-----AATATAT-CA-TTTCTCC
gi|20 : cAGGTGAATGTAATGTCGCAGTCATCTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAAATGGTAAATCTTGA------T-T---A---TATTATTGAAAACGAT--C--AACTAGACCATGttgtacattacatgacccttttcattttataacataatttaatagttgtttacacatgctttaatagaattaaacatttcccaattatatcattttagcatatgtactcatatagtttatatatactacatgtatacggggatatacttaaatgagattgtaaccggtgcct
gi|21 : TTCAGA-TGTCTTAACATTGCCATATCTTGA--TC--G-T---T---T----TAGA------C--CA-AACTTGCTCATGTATG-ATATATTGATGT-CGTT-----CATGTGTAG--A-----A-AT
gi|22 : AGATGAATGTTATGTCACAGCCATCTTAGAATTCAGATTTTTTTAAAATT
gi|23 : AGGTGAATGTTATGTCGAAGCCATTTTAGAATTCACA-T
gi|3 : ttaGAATGCAATGCCACAGCCGTCTTAGGATTCGGA-TGTCGTAAAAAAGCCGT----TGAG-TT--T-TG--T---TGTTGTGGAAAATGG---CACAACT-----------G-TT---TTGATGCTAGT------CAAGGGAAG--A-----T-GTAATTACAAGCCTGCAT-ATTT-----------TGTGCTTTAAAA-GGG----CGCA---AAAAA--------------TA-AAAA--AAAATCAA--C-AAGGTTATTATTAC-TAT-TA-T---AAAAATAAAA--TGATTTCTGAAACCAGTAAA-A-GTACCTTA------TACACGAGAGT-TGTTTGGTTTA----------TT--TT-T---TATATAA-AAA--CATATTCACTTTAAATGCTC-AA-TTTC
gi|4 : acAGGTGAATGTTATGTCACAGCCTTCTTAGAATTCAGA-TGTCTTAAAATTGCCATATATTGA--TTG-T-T---T---TGTTATAGAAAATCAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-ATATATTGATGC-AGTT-----CAAGTGAAG--A-----A-GTAATTACGAGCCGCCAT-ATTT--CGTTAAATATTTGCTTTGAAA-ACA----CA-A---AATAC--------------AC-ACAAACACTTTCAG--C-ATGAATATCATTAT-CAT-TA-T---AGATGTAAAA--CGATTTCTGAAACGAGT-GA-A-GTACCCTG------TATATGATTGT-TACT--GTCCA-CAAAGC---TT--TT-T---TA-A-AT-AAA--CA-GTTTATTG--AATGTAcgttatatgtgtcaatttataacacaatctagagttgtttatatgtgcactgaaatataac
gi|5 : TGTAATGTCACAGCCATCTGACAAGTCAGA-TTTCTTTAAACTGCCATATATTGA--TT--TGT---T---TGTTATTGAAATTTAT--CG-AACTTGGCCATGTATG-CTTTATTGATGA-AG--------AAG---AA--A-----A---AGTTACATGCCTGCAT-ATTG--AGTA----------TTTTAAA-AG------A-A---AAGAA--------------AC-TCAA--TCTTT-AG--C-AAAATTATAATTAC-CTT-TA-T---AAAT-TACAACTTGATTTCTGAAACCAGA-AA-A-ATA--TTA------TAAATGtaggtctccaatcttatctttctttga
gi|6 : actgagttCACAGCCATTTTAGAATTCAGA-TTTCTTAAAATTACCATACCTTGAATTT--T-T---T---TGTAATAGCAAATGATACCA-AACTTGGACATGTATG-GTATATTGATAC-AGTT-----CAAGTAAAG--ATTCTGACGTAAATACAAGCTTGCTT-ATTT--AGTAAACTGT----TT--AAA-AGA----CA-A---AAA-------------------------------------ATGACTATTGTAAC-TGT-TA-T---TATTGTAGAT--TGATTTCTGACACCAGTGAA-A-GTACTACA------CACATGATGGT-TACT--TACAATGGAA-----CT--TT-T---AA-A-AA-AAA--AA-ATTcaaaaagatttctgattccaataaaagtacctcatacgtgatatttactaa
gi|7 : cAAGTGAATGTAATGTCACAGCCATCTTCGAAGTCGG--TCTCTTAAAAATGCCATATCTT-----T--T-T---T---TGT-ATAGAAAATGAT--TA-AACTTTGCCATGCATG-ATATACTGGTGC-AGTT-----CAAGTTTGG--A-----A-GTAATAA--------CAT-ATTA--AGCCAAATTTGTGCTCTAAAG-AGATAACCA-A---AAAAATTT-----------AC-ACAA--ACTTCCAG--A-ATGATTGTTATTAC-TAT-AATT---AAATGTAAAT--TTACCTCTGA------T-TA-A-GTATCCCA------TACATGAgaaataaatttaat
gi|8 : taAGGTGAATGTTATGTCACAGCCATCTTAGAATTGAGA-TTTCTTAAAATTGCCAAATCTTGA--TCG-T-T---T---TGTTATAGAACATGAT--CA-AACTTGGCCATGTATG-ATATATCGATGC-AGTT-----AAAGTGTAG--A-----A-GTAATTACGAGTCTGCAT-ATTT--AGTAAAATGTGTGCATCAAAATATA-----A-A---AAAAA--------------AC-AC----ACTTTCAG--C-ATACTTATTAT
gi|9 : aAGGTGAATGTAATGT-ATAGCAATTTTAGCAATCAAA-TATCTTAAAATTGCCATATCTTGA---------------------------------------CTTGGCCATGTATG-CTATTTTGATGC-AGTT-----CAAGTGTAA--A-----A-GTGATCACGAGTCTG----------AATAGAATGTGTGTTTT-AAA-AGA----CA-A---AAAAA--------------TC-ACAA--ACTTTCAGAACAATAATTATTATCAT-TAT-TA-C---AAATATAAAA--TAATTTC