lowQualScore : 11111 11111111111111111111111111111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 4 1 00000 00000000000000000000000000000000000000 111111 1111111111111 11111111111111111 1111111111111111 11 11111 111111 444 1111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1 11111111111
lowQualScore : 0 7 6 00000 2 99999999999999999999999999999999999999 666666 5 3 3 5555555555555 66666666666666666 4 1 3333333333333333 2 4 2 33 66 2 00000 55 8888 222222 333 3 2 2 3 2 2 8888888 2 2 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 33 888 2 2 6666 4 2 0000 444 2 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 6 33 00000000000 33
lowQualScore : . . . ..... . ...................................... ...... . . . ............. ................. . . ................ . . . .. .. . ..... .. .... ...... ... . . . . . . ....... . . ..................................................................................................................... .. ... . . .... . . .... ... . ................................................................ . . .. ........... ..
lowQualScore : 0 0 0 00000 2 77777777777777777777777777777777777777 111111 0 6 6 2222222222222 22222222222222222 7 6 4444444444444444 4 5 0 77 55 7 33333 22 9999 666666 666 2 9 5 1 9 9 3333333 9 9 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 22 555 2 9 1111 8 7 3333 777 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 5 8 11 66666666666 11
consensus : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCC-ATATCAAAGC-----CACGGGCGTAGACACGGGTACGGCAT-G-------GTGC-GG----------TAT--------CAN-----TAA-T-TTA---T---------ATT-------GGTN--CG--GCAT-GCCGCACCAATAATTTC----AAA--A---C-TT-TTCTACA--T--T-TT-----AGCTN-AT----TTC-AAAACTTTT-A-TTACATTTATTTTGTATGC-CGCACC-AATAATTT-C-CC---A--T-TT-TTCTTGC--TA-AATCG-A---TTTGTAAAA-TA----ACTATTAA------T-----ANTAGT-ACTTAT-TTCGCAN--AAC--TTGTA-TAATCT--C--GGCATTC----TGTA-GACTGCCACC---ACTGGTG-C----TGCTCGT-TTT----AA---AGTCT--------AC------A-------CA--------A----T--------T--------T------GTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
Reference ( gi|2 ) : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGGAGAGGGTGTAGCAATATAAATAGAAAGTTTTGTAAATAATAAATTGAATGTTTATTCGCTCCCTATATCTAAACTGACACATGGACGTAGACACGGGTGCGGCAG-G-------ATGC-GG----------T----------CAA-----TGA-T-TTA---T---------ATT-------GGTT--CG--GCAT-GCCACACCAATAATTTT----AAA--A---C-TT-TTCTACA--TG-T-TT-----AGCTA-AT----TTC-AAAACTTTTAACTTACATTTATTTTGTATGC-CACACC-AATAATTT-C-CA---A--T-TT-TTCTTGCGCTAAAATCG-A---TTTGTAAAAGTA----ACTATTAA------T-----AGTAGTTACTTATATTCATAA--AAC--TTATA-TAATCT--CGGGACATTC---CTGTACGACTGCCACC---ACTAGTG-C----TGCTCGT-TTT----AA---AGTCT--------AC------A-------CA--------A----T--------T--------T------GTAAAAGATTAAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATCT
gi|1 : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTT
gi|3 : tCTCCC-ATATCAAAGC-----CACGGGCGTAGACACGGGTACGGCAT-G-------GTGC-GG----------TATAGCCGCAGCAG-----TAA-C-TAA---T---------ATT-------GGTG--CG--ACAT-GCCTCGCCAGTATTTTC----AAA--A---C-TC-TTCTCCA--TGTT-TT-----AGCTA-AT----TTC-AAAACTTTTTA--TACATTTATTTTGTATGC-CGCACT-AGTAATGT-C-CC---A--T-TTGTTCTTGTTTTATAATC--A---TTT-TAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgctccctatatctaaactgacacatggacgtagacacgggtgcggcaggatgcggtcaatgatttatattggttcggcatgccacaccaataattttaaaacttttctacatgtttagctaatttcaaaacttttaacttacatttattttgtatgccacaccaataatttccaatttttcttgcgctaaaatcgatttgtaaaagtaactattaatagtagttacttatattcataaaacttatataatctcgggacattcctgtacgactgccaccactagtgctgctcgttttaaagtctacacaatttgtaaaagattaagccgcaccaatatcaaattcgtgtctatct
gi|4 : ataataaagttttaaccaaataCACGGACGTAGGTACGGGTGCGTCAT-G-------GTGC-GG----------TATAACCTCACCAA-----TAAATATTA---TTGGTGAGGCATT-------GGTG--TG--GCAT-AACGCACCAATAATTTA----AAA--AAAAC-TT-TTCTCCC--CT-T-TTTTTATAGCTA-AT----TTC-CAAACTTTT---TTACATCTAGTTTGTATAC-CGCACC-AATAATTT-C-CA---C--T-TT-TT-----------ATTG-----TTT-TA----TA----ATTAT-----------------------CTTAAATTCGGAC--GACGATCGTA-TAATTT--TT---CATTT---TTG----ATT-----C---GTTGGTG-C----TGCTCTTATTT----GA---AGTCT--------A----------------A--------A----T--------T--------TTTTTTTGTAAATAAT-AAGCCTCA--CA-----------GATATCA--AATCCGTGTCTActcggacagtgatgacatttatcattcctgtcatcactggtgctgcttgttttaaagtctacaaaattacaagttttgtaaaatgtttacacgcatttcataacatattcgtgtctaca
gi|11 : tCATGAGCACAGACACGGGTACGGCAATGCTTCACCATGC-CG----------TAC--------CAA-----TAA-T-TAA---T---------ATT-------A--T--CGAGGCAA-GCAGCACCAAAAATTTC----AAA--A---C-TT-TTCTACA--TT-T-TT-----AGCTT-AT----TTC-CGATTTTTTcg
gi|12 : ATGGGCGTAGGCACGGGTGCGGCAT-G-------GTAT-GGCATTGCTGCAC----------CAT-----TAA-T-TAA---T---------ACT-------GGTG--AA--GCAT-TCCGAAC---TTTTTTT---------A---C-TT-TT-TACA--TA-T-AT-----AGCTT-AT----TTC-CATACTTTT---TTACATTT-TTT--TATGC-CGCA---AATAATTC-C-CC---A--TACT-TTCTttttgttattgaggttgcactaaaaaaagtaatagtaactagcaaaacatacagtaatgatttattttcgcacaactgatatactctctgggcattcctgtagga
gi|6 : CATAGACACGGGTACTGCAT-A-------ATATTGG----------T----------CAAAACTTTTT-T-TTA---T---------ATT-------TTTT--------AT-TCCA----AATG--TTT----GAC--A---T-TTATTTTGTA--TG-C-TC-----A-CTG-AT----CT---ATA-TTATAA-TTAGGTC-ACTG-GCATGC-CACATC-AATAATTT-T-CC---ATTT-TT-TTCTTGTTTTATAATT--A---TCT-TAAAggtttctataattatcgttttctacatttattttgtatgacgcaccgataagttcccat
gi|6 : g-------ATGC-------------T----------CAC-----TGA-T-CTA---T---------ATTATAATTAGGTCACTG--GCAT-GCCACATCAATAATTTT----CCA--------TT-TTTTTCT--TG-T-TT-----ttctaggactgccaccactaatgctgctagttttaaagtctacaaaatcacacgttttgtaaaatatttagccgcaccaatatcaaatttgtgtctacg
gi|1 : gcatagacacgggtactgcataatattggtcaaaacttttttttatattttttattccaaatgtttgacatttattttgt-----TAA-C-TTA---C---------ATT-------TATT--TT--GTAT-GCCACACCAATAATTTC-----CA--A---T-TT-TTCTtataattatcttaaattctaggactgccaccactaatgctgctagttttaaagtctacaaaatcacacgttttgtaaaatatttagccgcaccaatatcaaatttgtgtctacg
gi|13 : tggtcaccaaccccgggtagtgtgtgtgtgtgggtgggtggggggggggggggggggggaggcgcgcgggggggggggggatcaaacgcactatatacacttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgctccctatatctaaactgacacatggacgtagacacgggtgcggcaggatgcggtcaatgatttatattggttcggcatgccacaccaataattttaaaacttttctacatgtttagctaatttcaaaacttt-T-TTA---C---------ATT-------TATT--CT--GTAT-GCCGCACCAATAATTTC----CAATTA---T-TT-TTCTtgcgctaaaatcgatttgtaaaagtaactattaatagtagttacttatattcataaaacttatataatctcgggacattcctgtacgactgccaccactagtgctgctcgttttaaagtctacacaatttgtaaaagattaagccgcaccaatatcaaattcgtgtctatct
gi|4 : ttcaaactct-T-TTAAATT---------ATT-------GGTG--CG--TTAT-GCCACACCAATtgcacttaaagcgatttgtaaacgtaaatattaatagtaacacttgtatactctccggactgccaccgctggtgttactcgttttaaagtctacaaaattacaaattttgacaaatatttagccaatatcaaattcgagttcacg
gi|5 : tcacggacgtaggtacgggtgcgtcatggtgcggtataacctcaccaataaatattattggtgaggc-T-TTA---C---------GTT-------TATT--TT--GTAT-GCCGCACCAATAATaaaaacttttctcccctttttttatagctaatttccaaacttttttacatctagtttgtataccgcaccaataatttccactttttattgttttataattatcttaaattcggacgacgatcgtataatttttcatttttgattcgttggtgctgctcttatttgaagtctaaatttttttttgtaaataataagcctcacagatatcaaatccgtgtctacg
gi|9 : atgtgcgtacacatggtgcgggataatgcgacatgacgcaataattactacatttgttacaatttccaaactcg-T-TTA---C---------ATT-------CATT--TG---TAT-GCCACACCAATAATTTC----CCA--------TT-TTTTTCT--TG-T-TT-----gtctagtttttgcgctaaagtctatatgtaaacctaaatattaacattaatgacttttttacacacatctggtatacgttcaagctactaccaccactgttgctgctcgttttaaagtctacacaagtacaagatttgtaaaatatatagcctcaccgatgtcgattttgcgtctacg
gi|1 : atgcataaatgattttataactttgatacaaattttagctaatttccaaggttttt---T---------ATT-------GGTG--TG--GCAT-GCCGAACCAATAtacaatgaccttaaattctgacgatgtatttgtagacttcatcacttgtgctgcttgttttaaaaaaagtctacaaaattaccagtttagtaaaatatttagccgcaccaaggccataaaaatatcaaattcgtgtctacat
gi|7 : tggtcaccaaccccgggtagtgtgtgtgtgtgggtgggtggggggggggggggggggggaggcgcgcgggggggggggggatcaaacgcactatatacacttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgctccctatatctaaactgacacatggacgtagacacgggtgcggcaggatgcggtcaatgatttaT-------GGTA--TG--GCATCGTCGCATCAATAATTAA----AAA--A---A-AT-CTTAATA--T--T-TT-----GGCTT-AC----TTC-A-----TTTATTTTACATTTATTTTGTATGC-CGCGTT-ATTAATTT-C-CT---A--T-TT-C------------ATC-------TTGT---------------TTTA------T-----ACTGGT--CTTAAATTC-TGA--CA-------A-TGAT-------GACATT-----TGTG-GAAAATCACC---ACTGATG-C----TGCTCGT-TTA----AA---AGTCTCCAAAACTAC------A-------CG--------T----T--------T--------A------GTAAATTATTTAGCTGTA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAattttaaaacttttctacatgtttagctaatttcaaaacttttaacttacatttattttgtatgccacaccaataatttccaatttttcttgcgctaaaatcgatttgtaaaagtaactattaatagtagttacttatattcataaaacttatataatctcgggacattcctgtacgactgccaccactagtgctgctcgttttaaagtctacacaatttgtaaaagattaagccgcaccaatatcaaattcgtgtctatct
gi|10 : gggcgtagatatggatgcgtcaGTTG-CG--GCATTGCCGCACCAATAATATC----AAA--A---C-TT-TT-------------T-----AGCTA-AT-----------ATTTTTAA-----ATATATTTTGTATGT-CGAACC-AATCATTTCC-CAT--A--T-TT-TTCATG
gi|5 : --CG--ACAT-G--ACGC-AATAATT-----------A---C-T------ACA--TT-TGTT-----A--CA-AT----TTC-CAAACTCGT---TTACGTTTATTTTGTATGC-CGCACC-AATAATGT-C-TA---G--T-TT----TTGCGCTAAAGTCT-A---TATGTAAACCTA----AATATTAA------C-----ATTAATGACTTTTTTACACAC--ATC--TGGTA-T-----------ACGTTC---AAG--CTACTACCACC---ACTGTTG-C----TGCTCGT-TTT----AA---AGTCT--------AC------A-------CAAGTACAAGA----T--------T--------T------GTAAAATATATAGCCTCA--CC-----------GATGTCG--ATTTTGCGTCTAtttcataaatttcttaaaatctgacgatgatgacatttgtcattattgatgcattttcaatcaaatcaacatcattttagaattgattacaagttttgtaaaatatttagccgcacccctaccattaattcgt
gi|15 : atgtgcgtacacatggtgcgggataatgAT-GCCGCAACAATAATTTC----AAA--A---T-AT-TTCTACA--T--T-TTGA---AGCTT-GTG---TTC--AAACTTTTTACATGCA--TATTTTGCATGT-CGCACCTACTAATTT-C-CC---A--T-TT-CTcg
gi|8 : T-GCCGCATCAATGATTTT----AAA--A---CGTT-TTCTACA--TT-T-TT-----AGCTACATGTGATTT-AAAA-----AA---AAATTAGTTTTTTATGC-CGCACC-AATTATTT-C-TC---A--T-TT-TT-----------ATCT-G---TTT-TACAATTA----TCT-TAAA------T-----A--AGT------------TAA--AAC--TTTTT-TAACGT--T----TATT----TTGTATG-CTG-CACCAAAAATATTC-CATTTTTCTTGT-TTT----AT---AAT-G--------AC------A----------------------------------------T------GTATAATATT-ATCCGCG--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCacaaaattacaagtttgccaaatatttattcgtaccaatatcaaattcgtgtctac
gi|16 : caggcgtatacacggtCCGCATCAATAATTAA----ATA--A---T-TT-CATTACA--T----TT-----AGTTA--T----TTC-CAAACGTTT---TGACATTTATTTTGTATGC-CTCACC-AATGACTT-T-CC---A--T-TT-T------AACAAAATTGCAAGTTTTGTAAAAc
gi|9 : AATGATTTT----ATA--A---C-TT-TGATACAAAT--T-TT-----AGCTA-AT----TTCCAAGGTTTTT--TTTACATTCATTT-GTATGC-CACACC-AATAATTT-C-CC---ATTT-TT-TTCTTGTTTTACAAT-G-A---CCT-TAAAtatatagccacagcaataccatgtctacgcc
gi|6 : atgcataATAATATTGGTCAAA--A---C-TT-TTTTTTA--TA-T-TT-------TTT-AT----TCC-AAA--TGTT---TGACATTTATTTTGTATGCTCACttctgacgatgtatttgtagacttcatcacttgtgctgcttgttttaaaaaaagtctacaaaattaccagtttagtaaaatatttagccgcaccaaggccataaaaatatcaaattcgtgtctacat
gi|13 : gcatagacacgggtactgc----TTC-AAA-CTCTT---TTACATTTATTCTGTATGC-CGCACC-AATAATTT-C-CAATTA--T-TT-TTCTTGCACTTAAAGCG-A---TTTGTAAACGTA----AATATTAA------T-----AGTA---AC---------------AC--TTGTA-TACTCT--CCG----------------GACTGCCACC---GCTGGTG-T----TACTCGT-TTT----AA---AGTCT--------ACAAAATTA-------CA--------AAT--T--------T--------T------GACAAATATTTAG-------CC-----------AATATCA--AATTCGAGTtgatctatattataattaggtcactggcatgccacatcaataattttccatttttttcttgttttataattatcttaaattctaggactgccaccactaatgctgctagttttaaagtctacaaaatcacacgttttgtaaaatatttagccgcaccaatatcaaatttgtgtctacg
gi|1 : TGATTTATATTGGTTCGGCATGC-CACACC-AATAATTT-TAAA---A--C-TT-TTCTtcacg
gi|9 : tggtcaccaaccccgggtagtgtgtgtgtgtgggtgggtggggggggggggggggggggaggcgcgcgggggggggggggatcaaacgcactatatacacttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgctccctatatctaaactgacacatggacgtagacacgggtgcggcaggatgcggtcaaTAATTT-C-CA---AGGT-TT-TTTTTAC------ATTC-A---TTTGTA----TGCCACACCAATAA------TTTCCCATTTTTTTCTTGT-TTTACAATGACC--TTAAA-T--TCTGACGATGTATT-----TGTA-GACT-TCATC---ACTTGTG-C----TGCTTGT-TTTAAAAAA---AGTCT--------AC------AAAATTACCA--------G----T--------T--------TA-----GTAAAATATTTAGCCGCA--CCAAGGCCATAAAAATATCA--AATTCGTGTCTAacatgtttagctaatttcaaaacttttaacttacatttattttgtatgccacaccaataatttccaatttttcttgcgctaaaatcgatttgtaaaagtaactattaatagtagttacttatattcataaaacttatataatctcgggacattcctgtacgactgccaccactagtgctgctcgttttaaagtctacacaatttgtaaaagattaagccgcaccaatatcaaattcgtgtctatct
gi|11 : atgcataaatgattttataactttgatacaaattttagcGTAATAGTA----ACTAGCAAAACATAC-----AGTAATGATTTATTTTCGCAC--AAC--TGATA-TACTCT--CTGGGCATTC---CTGTAGGAcat
gi|6 : catgagcacagacacgggtacggcaatgcttcaccatgccgtaccaataattaatattatcgaggcaagcagcaccaaaaatttcaaaacttttctacatttttagcttatttccgattttttttttgttattgaggttgcactaaaaaaa--TTATAATTATCT--T---AAATTC------TAGGACTGCCACC---ACTAATG-C----TGCTAGT-TTT----AA---AGTCT--------AC------A-------AA--------A----TCACACGTTT--------T------GTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTTGTGTCTA
gi|14 : gcatagacacgggtactgcataatattggtcaaaacttttttttatattttttattccaaatgtttgacatttattttgtatgctcactgatctatattataattaggtcactggcatgccacatcaataattttccatttttttcttgttGGCATT-----TGTG-GAGTGCCGTC---ACTGATG-C----TGATCGT-TTT----AA---AGTCT--------AC------A-------AA--------ATTGTT--------T--------T------GTGAAATATTTCACCGGA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTcg
gi|16 : tttgtaccaataatttccacaatttttttttcttgttttataactatcttaaattcggacgatggtGACATTTATTTTGTA----TGCC-TC---ACCAATGAC----TTTCCAT-TTT----AACAAAAT-T--------GC------A-------AG--------T----T--------T--------T------GTAAAATATATAGCCACA--GC-----------AATACCA--------TGTCTA
gi|3 : ccgcatcaataattaaataatttcattacatttagttatttccaaacgttttCTGTCATC---ACTGGTG-C----TGCTTGT-TTT----AA---AGTCT--------ACAAAATTA-------CA--------AGT--T--------T--------T------GTAAAATGTTTACACGCATTTC------------ATAACA--TATTCGTGTCTAcgcc
gi|18 : ataataaagttttaaccaaatactcccatatcaaagccacgggcgtagacacgggtacggcatggtgcggtatagccgcagcagtaactaatattggtgcgacatgcctcgccagtattttcaaaactcttctccatgttttagctaatttcaaaactttttatacatttattttgtatgccgcactagtaatgtcccatttgttcttgttttataatcattttaaactcggacagtgatgacatttatcattcGCCACC---ACGGGTG-A----T--------TT----AA---ATTCC--------CC------A-------CA--------A----T--------TACAAGAGTT------GTAAATTATTTAGCCACA--CC-----------AATATCA--AATca
gi|17 : CACA---ACTGGTG-C----T---CGT-TTT----AA---AGTTTTAAA----AT------AA------CA--------AGT--T--------T--------T------GTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
gi|15 : CACCT--ACTAAT-------TTCCCAT-TTCTAC-AA---AAT-T--------AC------A--------A--------G----T--------T--------T------GCCAAATATTTATTCGTA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAg
gi|19 : atgccgcaacaataatttcaaaatatttctacattttgaagcttgtgttcaaactttttacatgcatattttgcatgtcgGTG-C----TACTCGT-TTA----AA---AGCCT--------ACAAAAGTA-------CA--------AGT--T--------T--------T------GTAAAATATTTAGCCG--------------------------AATTCGTGTCTc
gi|10 : TCAT-TTT----AG---AATTG--------ATT-----A-------CA--------AGT--T--------T--------T------GTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------CCTACCATTAATTCGTgcg
gi|22 : gttgcggcattgccgcaccaataatatcaaaactttttagctaatatttttaaatatattttgtatgtcgaaccaatcatttcccatatttttcatgtttcataaatttcttaaaatctgacgatgatgacatttgtcattattgatgcattttcaatcaaatcaaca----T--------T--------T------GTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
gi|23 : agt----T--------T--------T------GTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCATGTCTATg
gi|20 : gtGCCGCA--CC-----------AATATTA--AATTTGTGGCTAg
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): GGTGTAGACACAGGTGCAACATGTTGCGGCATTGCTGTACCAGTAATTAA
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 2 44444 11111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 11111 222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11111111111
lowQualScore : 6 8 0 00000 0 1 4 55555555 33333333333333333333333333333333333333333333333333 77 3 4 2222 0 2 2 3 44444 888888888 777777 444 2 2 666666 555 33 33 2 2 888888 2 2 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 44 555 11111111 1 2 5555 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 33 00000000000 33
lowQualScore : . . . ..... . . . ........ .................................................. .. . . .... . . . . ..... ......... ...... ... . . ...... ... .. .. . . ...... . . ................................................................................................................................................. .. ... ........ . . .... ........................................................... . .. ........... ..
lowQualScore : 7 3 7 00000 7 6 0 33333333 00000000000000000000000000000000000000000000000000 99 1 3 3333 9 7 7 2 33333 999999999 777777 777 5 4 444444 222 22 22 4 2 999999 4 4 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 66 666 22222222 2 7 7777 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 11 66666666666 11
consensus : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCCTATATCTAAACTGACACACGGGCGTAGACACGGGTGCGGCA-TG-------GTGCG--------GTA-----T--------CANTAAT-----T-AT---------ATTGGTGCGGCAT-GCCGCACCAATAATTT---CAAA-AC-TTTTCTACA--T--TT------T--AGC------TN--AT-T-TC-AAAACTTTT---TT--ACATT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T-T-C----T---TGC---TAA---A-T--CGA-T-TT-GTAA---A-A-TAACT----------ATTA------ATANTAGT--ACTT-A--T-TT-CG-ACGAC--TTGT---ATAAT---CTC--GG--CATT-C-TGTA-G--ACTG--CCA--------CCACTGGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTCT--------AC------A-------CA--------A-T----T--------T--------T-GTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
Reference ( family-6105 ) : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCC-ATATCAAAGC-----CACGGGCGTAGACACGGGTACGGCA-TG-------GTGCG--------GTA-----T--------CANTAAT-----TTAT---------ATTGGTNCGGCAT-GCCGCACCAATAATTT---CAAA-AC-TTTTCTACA--T--TT------T--AGC------TN--AT-T-TC-AAAACTTTTA--TT--ACATT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T-T-C----T---TGC---TAA---A-T--CGA-T-TT-GTAA---A-A-TAACT----------ATTA------ATANTAGT--ACTT-A--T-TT-CGCANAAC--TTGT---ATAAT---CTC--GG--CATT-C-TGTA-G--ACTG--CCA--------CCACTGGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTCT--------AC------A-------CA--------A------T--------T--------T-GTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
gi|1 : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTT
gi|1 : tCTCCCTATATCTAAACTGACACATGGACGTAGACACGGGTGCGGCA-GG-------ATGCG--------GT---------------CAATGAT-----TTAT---------ATTGGTTCGGCAT-GCCACACCAATAATTT---TAAA-AC-TTTTCTACA--TG-TT------T--AGC------TA--AT-T-TC-AAAACTTTTAACTT--ACATT--TATT-TTGTATGCCACACC-AATAATTTCC---A--A-T-TT-T-T-C----T---TGCGC-TAA---AAT--CGA-T-TT-GTAA---A-AGTAACT----------ATTA------ATAGTAGTT-ACTT-A--TATT-CATAAAAC--TTAT---ATAAT---CTC--GGGACATT-CCTGTACG--ACTG--CCA--------CCACTAGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTCT--------AC------A-------CA--------A------T--------T--------T-GTAAAAGATTAAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgctccctatatctaaactgacacatggacgtagacacgggtgcggcaggatgcggtcaatgatttatattggttcggcatgccacaccaataattttaaaacttttctacatgtttagctaatttcaaaacttttaacttacatttattttgtatgccacaccaataatttccaatttttcttgcgctaaaatcgatttgtaaaagtaactattaatagtagttacttatattcataaaacttatataatctcgggacattcctgtacgactgccaccactagtgctgctcgttttaaagtctacacaatttgtaaaagattaagccgcaccaatatcaaattcgtgtctatct
gi|10 : tggtcaccaaccccgggtagtgtgtgtgtgtgggtgggtggggggggggggggggggggaggcgcgcgggggggggggggatcaaacgcactatatacacttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgTGCGGCATTGCCGCACCAATAATAT---CAAA-AC-TTTT------------------T--AGC------TA--AT---------ATTTTTA------A-ATA--TATT-TTGTATGTCGAACC-AATCATTTCC---CATA-T-TT-T-T-C----A---TGT---TTC---A-T--AAA-T-TTCTTAA---A-A-Tct
gi|10 : gtTCAT-TTTAGA----ATTG--------ATT-----A-------CA--------AGT----T--------T--------T-GTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------CCTACCATTAATTCGTctgacgatgatgacatttgtcattattgatgcattttcaatcaaatcaacatcattttagaattgattacaagttttgtaaaatatttagccgcacccctaccattaattcgt
gi|11 : gttgcggcattgccgcaccaataatatcaaaactttttagctaatatttttaaatatattttgtatgtcgaaccaatcatttcccatatttttcatgtttcataaatttcttaaaatctgacgatgatgacatttgtcattattgatgcattttcaatcaaatcaaca-----CATGAGCACAGACACGGGTACGGCAATGCTTCACCATGCC--------GTA-----C--------CAATAAT-----TAAT---------ATTATCGAGGCAA-GCAGCACCAAAAATTT---CAAA-AC-TTTTCTACAT-T--TT------T--AGC------TT--AT-T-TC-CGA--TTTTT--TT-----TT--TGTTATTG-AGGTTGCACT-AA-AA--------------------------------------AA---A-------------GTAAT--A-G-TAACT----------AGCAAAACATACAGTAATG-ATTT-AT-T-TT-CGCACAAC--TGAT---ATACT---CTCTGGG--CATTCC-TGTA-G--
gi|12 : ATGGGCGTAGGCACGGGTGCGGCA-TG-------GTATG--------GCA-----TTGCTGCACCATTAAT-----TAAT---------ACTGGTGAAGCAT-TCCGAACT--TTTTTT--------AC-TTTT-TACA--TA-TA------T--AGC------TT--AT-T-TC-CATACTTTT---TT--ACATT--T-TT-T--TATGCCGCA---AATAATTCCC---C--A-TACT-T-T-C----T---ga
gi|12 : AT-GCCGCA--AATAATTC---CCCATAC-TTT-CTGGT--T--TC------T--A--------TA--AT-TATC-G----TTTT---CT--ACATT--TATT-TTGTATGACGCACC-GATAAGTTCC---C--A-T-ggtttctataattatcgttttctacatttattttgtatgacgcaccgataagttcccat
gi|13 : atgggcgtaggcacgggtgcggcatggtatggcattgctgcaccattaattaatactggtgaagcattccgaactttttttactttttacatatatagcttatttccatacttttttacattttttt-T-TC-AAA-CTCTT---TT--ACATT--TATT-CTGTATGCCGCACC-AATAATTTCCAATT--A-T-TT-T-T-C----T---TGCACTTAA---A-G--CGA-T-TT-GTAA---ACG-TAAAT----------ATTA------ATAGTA----AC-----------------AC--TTGT---ATACT---CTC--CG--------------G--ACTG--CCA--------CCGCTGGTGTTACTCGT-TTTAAA----GTCT--------ACAAAATTA-------CA--------AAT----T--------T--------T-GACAAATATTTAG-------CC-----------AATATCA--AATTCGAGT
gi|14 : GTACC-AATAATTTCCA--C--AAT-TT-T-T-T----T---TTC---T----------TGT-T-TT----------A-TAACT----------AT-------------------CTT-A------------AAT--TCGG---ACGAT---GGT--GG--CATT---TGTG-G--AGTG--CCG--------TCACTGATGCTGATCGT-TTTAAA----GTCT--------AC------A-------AA--------ATTGT--T--------T--------T-GTGAAATATTTCACCGGA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTtcacg
gi|15 : tttAT-GCCGCAACAATAATTT---CAAA-AT-ATTTCTACA--T--TT------TGAAGC------TT--GTGT-TC--AAACTTT----TT--ACATGCATATT-TTGCATGTCGCACCTACTAATTTCC---C--A-T-TT----------C---TAC---AAA---A-TTACAAGT-TT-GCCA---A-A-TATTT----------ATTC------GTACCAAT--ATCA-A--A-TT-CG
gi|16 : CCGCATCAATAATTA---AATA-AT-TTCATTACA--T--TT---------AG-------TT--AT-T-TC-CAAACGTTT---TG--ACATT--TATT-TTGTATGCCTCACC-AATGACTTTC---C--A-T-TT-TAA-CAAAAT---TGC----AA---G-T------T-TT-GTAA---A-A-TAtgtctac
gi|17 : CA--------CAACTGGTGCT---CGT-TTTAAA----GTTTTAAA----AT------AA------CA--------AGT----T--------T--------T-GTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATtatagccacagcaataccatgtctacgcc
gi|18 : G--CCA--------CCACGGGTGAT--------TTAAA----TTCC--------CC------A-------CA--------A------T--------TACAAGAGTT-GTAAATTATTTAGCCACA--CC-----------AATATCA--AATg
gi|19 : GTGCTACTCGT-TTAAAA----GCCT--------AC------AAAAGTA-CA--------AGT----T--------T--------T-GTAAAATATTTAGCCG--------------------------AATTCGTGTCT
gi|2 : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTgcg
gi|2 : CTCCCTATATCTAAACTGACACATGGACGTAGACACGGGTGCGGCA-GG-------ATGCG--------GT---------------CAATGAT-----TTAT---------ATTGGTTCGGCAT-GCCACACCAATAATTT---TAAA-AC-TTTTCTACA--TG-TT------T--AGC------TA--AT-T-TC-AAAACTTTTAACTT--ACATT--TATT-TTGTATGCCACACC-AATAATTTCC---A--A-T-TT-T-T-C----T---TGCGC-TAA---AAT--CGA-T-TT-GTAA---A-AGTAACT----------ATTA------ATAGTAGTT-ACTT-A--TATT-CATAAAAC--TTAT---ATAAT---CTC--GGGACATT-CCTGTACG--ACTG--CCA--------CCACTAGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTCT--------AC------A-------CA--------A------T--------T--------T-GTAAAAGATTAAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgctccctatatctaaactgacacatggacgtagacacgggtgcggcaggatgcggtcaatgatttatattggttcggcatgccacaccaataattttaaaacttttctacatgtttagctaatttcaaaacttttaacttacatttattttgtatgccacaccaataatttccaatttttcttgcgctaaaatcgatttgtaaaagtaactattaatagtagttacttatattcataaaacttatataatctcgggacattcctgtacgactgccaccactagtgctgctcgttttaaagtctacacaatttgtaaaagattaagccgcaccaatatcaaattcgtgtctatct
gi|20 : ggtcaccaaccccgggtagtgtgtgtgtgtgggtgggtggggggggggggggggggggaggcgcgcgggggggggggggatcaaacgcactatatacacttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgAATCCTCGGCCGCA--CC-----------AATATTA--AATTTGTGGCTAct
gi|21 : aggacgtacacgcatactatattGGTGTAGACACAGGTGCAACA-TG-------TTGCGGCATTGCTGTA-----C--------CAGTAAT-----T
gi|22 : ------T--------T--------T-GTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATaa
gi|23 : agt------T--------T--------T-GTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCATGTCTATg
gi|3 : gtCTCCC-ATATCAAAGC-----CACGGGCGTAGACACGGGTACGGCA-TG-------GTGCG--------GTA-----TAGCCGCAGCAGTAAC-----TAAT---------ATTGGTGCGACAT-GCCTCGCCAGTATTTT---CAAA-AC-TCTTCTCCA--TGTTT------T--AGC------TA--AT-T-TC-AAAACTTTTT--AT--ACATT--TATT-TTGTATGCCGCACT-AGTAATGTCC---C--A-T-TTGT-T-C----T---TG-------------------T-TT--TAT---A-A-TCATT-----------TTA------A-ACTCGG--AC---A--G-T---G-ATGAC--ATTT---AT---------------CATT-C----------CTG--TCA--------TCACTGGTGCTGCTTGT-TTTAAA----GTCT--------ACAAAATTA-------CA--------AGT----T--------T--------T-GTAAAATGTTTACACGCATTTC------------ATAACA--TATTCGTGTCTAg
gi|4 : ataataaagttttaaccaaata-----CACGGACGTAGGTACGGGTGCGTCA-TG-------GTGCG--------GTATAACCT--------CACCAATAAATATTATTGGTGAGGCATTGGTGTGGCAT-AACGCACCAATAATTTAAAAAAA-AC-TTTTCTCCC--C--TTTTTTTAT--AGC------TA--AT-T-TC-CAAACTTTT---TT--ACATC--TAGT-TTGTATACCGCACC-AATAATTTCC---A--C-T-TT-T-T-A----T---TGT---T--------------T-T-----------A-TAATT----------AT-------------------CTTAA--A-TT-CGGACGACGATCGT---ATAAT---TTT---T--CATT-T-T-T--G--ATT---------------CGTTGGTGCTGCTCTTATTTGAA----GTCT--------A----------------A--------ATTTTTTT--------T--------T-GT-AAATAATAAGCCTCA--CA-----------GATATCA--AATCCGTGTCTAca
gi|5 : tGTACA-CA-TG-------GTGCG--------GGA-----T------------AAT------------------------GCGACAT-GACGCA---ATAATT---------AC-T-----ACA--T--TT----------GT------TACAAT-T-TC-CAAACTCGT---TT--ACGTT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATGTCT---A--G-T-TT-T-TGC---------GC---TAA---AGT--CTA-T-AT-GTAA---ACC-TAAAT----------ATTA------ACATTAATG-ACTT-T--T-TTACACACATC--TGGT---ATA--------------CGTT-C---AA-GCTACTA--CCA--------CCACTGTTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTCT--------AC------A-------CAAGTACAAGA------T--------T--------T-GTAAAATATATAGCCTCA--CC-----------GATGTCG--ATTTTGCGTCTAcg
gi|6 : atgtgcGCATAGACACGGGTACTGCA-TA---------------------------------------------------AT---------ATTGGT---------------CAA-AACTT-----------TTTTTTATA--T--TT------T-----------TT--AT-T-CC-AAA--TGTT---TG--ACATT--TATT-TTGTATGCT-CACT-GATcg
gi|6 : -TC-AAAACTTTTT--TT-----TA--TATT-TTTTATTCCA-----AATG-TTTGA---C--A-T-TTAT-T-T----TGTATGC---TCACTGA-T--CTA-TATT-ATAATTAG-G-TCACTGGCATGCCACATCA------ATAATTTTCCATTT-T--T-TT-C---------TTGTTTTATAATTATCTT--AA---ATT-C-TA-G-G--ACTG--CCA--------CCACTAATGCTGCTAGT-TTTAAA----GTCT--------AC------A-------AA--------A------TCACACGTTT--------T-GTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTTGTGTCTActatattataattaggtcactggcatgccacatcaataattttccatttttttcttgttttataattatcttaaattctaggactgccaccactaatgctgctagttttaaagtctacaaaatcacacgttttgtaaaatatttagccgcaccaatatcaaatttgtgtctacg
gi|7 : gcatagacacgggtactgcataatattggGGGCGTAGATATGGATGCGTCA-TG-------GTATG--------GCA-----T--------C--------------------------------------GTCGCATCAATAATTA---AAAA-AA-ATCTTAATA--T--TT------T--GGC------TT--AC-T-TC-A-----TTTA--TTTTACATT--TATT-TTGTATGCCGCGTT-ATTAATTTCC---T--A-T-TT-C------------------------A-T--C-----TT-GT-------------------------TTT------ATACTGGT---CTT-AAAT-TC-TG-ACAA-----------TGAT--------GA--CATT---TGTG-G--AAAA--TCA--------CCACTGATGCTGCTCGT-TTAAAA----GTCTCCAAAACTAC------A-------CG--------T------T--------T--------A-GTAAATTATTTAGCTGTA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAcg
gi|8 : T-GCCGCATCAATGATTT---TAAA-ACGTTTTCTACAT-T--TT------T--AGCTACATGTG--AT-T-TA-AAAA-----A------AAATT--AGTT-TTTTATGCCGCACC-AATTATTTCT---C--A-T-TT-T-T----------------------A-T--CTG-T-TT--TAC---A-A-TTA-T----------CTTA------A-ATAAGT-----------------TAAAAC--TTTT---TTAAC---GTT------TATT-T-TGTA-T--GCTGCACCAAAAATATTCCATT----TTTCTTGT-TTTATA----AT-G--------AC------A------------------------------------------T-GTATAATA-TTATCCGCG--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTC
gi|9 : caggcgtatacacggtGCATAAATGATTT---TATA-AC-TTTGATACAAAT--TT------T--AGC------TA--AT-T-TCCAAGGTTTTTT--TT--ACATT--CATT-T-GTATGCCACACC-AATAATTTCC---C--A-T----T-T-T----T---TTC-----------T--TG--T-TT--TAC---A-A-TGACC-----------TTA------A--------------A--T-TC-TG-ACGA----TGT---AT--------------------T-TGTA-G--ACT---TCA--------TCACTTGTGCTGCTTGT-TTTAAAAAAAGTCT--------AC------AAAATTACCA--------G------T--------T--------TAGTAAAATATTTAGCCGCA--CCAAGGCCATAAAAATATCA--AATTCGTGTCTAc
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1111111 77777777777777777777777777777777777777777777 11111 111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111 55555555555555555555555555555555555555555 11111111111
lowQualScore : 7 7 0 777 4 4444444 66666666666666666666666666666666666666666666 0 3 3 6666 2 444 2 3 33 44444 111111 777777 444 2 2 8888888 2 888 2 55 2 2 888888 2 2 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 44 555 11111111 1 2 5555 444 8888888 33333333333333333333333333333333333333333 55555 33 00000000000 33
lowQualScore : . . . ... . ....... ............................................ . . . .... . ... . . .. ..... ...... ...... ... . . ....... . ... . .. . . ...... . . ...................................................................................................................................................... .. ... ........ . . .... ... ....... ......................................... ..... .. ........... ..
lowQualScore : 3 3 7 888 4 4444444 66666666666666666666666666666666666666666666 1 1 7 7777 7 777 7 2 77 33333 333333 777777 777 5 4 7777777 4 222 4 66 4 2 999999 4 4 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 66 666 22222222 2 7 7777 777 7777777 77777777777777777777777777777777777777777 99999 11 66666666666 11
consensus : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCCTATATCTAAACTGACACACGGGCGTAGACACGGGTGCG---GCA-TG-------GTGCG--------GTAT--------CAATAA---TT-A-T---------ATTGGTGCGGCAT-GCCGCACCAATAATT--TCAAA-A---C-TTTTCT--ACA--T--TTT------AGC------TN--AT-T-TCAAAA--CTT-TT---T-TACATT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T-T--C----T---T--GC---T-AA---A-T--C-A-T-TT-GTAA---A-A-TAACT----------ATTA------ATA--NTAG-T--ACTTA--T-TT-CG-ACGAC--TTGT---ATAAT---CTC--GG--CATT-CTGTA-G--ACTG--CCA--------CCACTGGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AA-------T-------T-------TT-----GTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
Reference ( family-6105 ) : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCCTATATCTAAACTGACACACGGGCGTAGACACGGGTGCG---GCA-TG-------GTGCG--------GTAT--------CANTAA---TT-A-T---------ATTGGTGCGGCAT-GCCGCACCAATAATT--TCAAA-A---C-TTTTCT--ACA--T--TTT------AGC------TN--AT-T-TCAAAA--CTT-TT---T-TACATT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T-T--C----T---T--GC---T-AA---A-T--CGA-T-TT-GTAA---A-A-TAACT----------ATTA------ATA--NTAG-T--ACTTA--T-TT-CG-ACGAC--TTGT---ATAAT---CTC--GG--CATT-CTGTA-G--ACTG--CCA--------CCACTGGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AA-------T-------T-------TT-----GTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
gi|1 : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTT
gi|1 : tCTCCCTATATCTAAACTGACACATGGACGTAGACACGGGTGCG---GCA-GG-------ATGCG--------G--T--------CAATGAT--TT-A-T---------ATTGGTTCGGCAT-GCCACACCAATAATT--TTAAA-A---C-TTTTCT--ACA--TG-TTT------AGC------TA--AT-T-TCAAAA--CTT-TTAACT-TACATT--TATT-TTGTATGCCACACC-AATAATTTCC---A--A-T-TT-T-T--C----T---TGCGC---TAAA---A-T--CGA-T-TT-GTAA---A-AGTAACT----------ATTA------ATA--GTAGTT--ACTTA--TATT-CATAAAAC--TTAT---ATAAT---CTC--GGGACATTCCTGTACG--ACTG--CCA--------CCACTAGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AA---------------T-------TT-----GTAAAAGATTAAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgctccctatatctaaactgacacatggacgtagacacgggtgcggcaggatgcggtcaatgatttatattggttcggcatgccacaccaataattttaaaacttttctacatgtttagctaatttcaaaacttttaacttacatttattttgtatgccacaccaataatttccaatttttcttgcgctaaaatcgatttgtaaaagtaactattaatagtagttacttatattcataaaacttatataatctcgggacattcctgtacgactgccaccactagtgctgctcgttttaaagtctacacaatttgtaaaagattaagccgcaccaatatcaaattcgtgtctatct
gi|10 : tggtcaccaaccccgggtagtgtgtgtgtgtgggtgggtggggggggggggggggggggaggcgcgcgggggggggggggatcaaacgcactatatacacttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgTGCGGCATTGCCGCACCAATAATA--TCAAA-A---C-TTTT--------------T------AGC------TA--AT--------A----T-TT---T-TAAATA--TATT-TTGTATGTCGAACC-AATCATTTCC---CATA-T-TT-T-T--C----A---T--GT---T-TC---A-T--AAA-T-TTCTTAA---A-A-Tct
gi|10 : gtTCAT-TTTAGA----ATTGATT-------AC------A---------AG-------T-------T-------TT-----GTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------CCTACCATTAATTCGTctgacgatgatgacatttgtcattattgatgcattttcaatcaaatcaacatcattttagaattgattacaagttttgtaaaatatttagccgcacccctaccattaattcgt
gi|11 : gttgcggcattgccgcaccaataatatcaaaactttttagctaatatttttaaatatattttgtatgtcgaaccaatcatttcccatatttttcatgtttcataaatttcttaaaatctgacgatgatgacatttgtcattattgatgcattttcaatcaaatcaacaCATGAGCACAGACACGGGTACG---GCAATGCTTCACCATGCC--------GTAC--------CAATAA---TT-AAT---------ATTATCGAGGCAA-GCAGCACCAAAAATT--TCAAA-A---C-TTTTCT--ACAT-T--TTT------AGC------TT--AT-T-TC-CGA--TTT-TT---T-T---TT--TGTTATTG-AGGTTGCACT-AA-AA------------------------------------------AA---A-------------GTAAT--A-G-TAACT----------AGCAAAACATACA--GTAA-TG-ATTTAT-T-TT-CGCACAAC--TGAT---ATACT---CTCTGGG--CATTCCTGTA-G--
gi|12 : ATGGGCGTAGGCACGGGTGCG---GCA-TG-------GTATG--------GCATTGCTGCACCATTAA---TTAA-T---------ACTGGTGAAGCAT-TCCGAACT--TTTTT--T-----A---C-TTTT-T--ACA--TA-TAT------AGC------TT--AT-T-TCCATA--CTT-TT---T-TACATT--T-TT-T--TATGCCGCA---AATAATTCCC---C--A-TACT-T-T--C----T---ga
gi|12 : AT-GCCGCA--AATAATT--CCCCATA---C-TTT-CT--GGT--T--TCT------A--------TA--AT-TATCG------TT-TT---C-TACATT--TATT-TTGTATGACGCACC-GATAAGTTCC---C--A-T-ggtttctataattatcgttttctacatttattttgtatgacgcaccgataagttcccat
gi|13 : atgggcgtaggcacgggtgcggcatggtatggcattgctgcaccattaattaatactggtgaagcattccgaactttttttactttttacatatatagcttatttccatacttttttacattttttt-T-TCAAA---CTC-TT---T-TACATT--TATT-CTGTATGCCGCACC-AATAATTTCCAATT--A-T-TT-T-T--C----T---T--GCACTT-AA---A-G--CGA-T-TT-GTAA---ACG-TAAAT----------ATTA------ATA--GTA--------------------AC-AC--TTGT---ATACT---CTC--CG-------------G--ACTG--CCA--------CCGCTGGTGTTACTCGT-TTTAAA----GTC---T-------ACAAAATTA-------CAAA-------T-------T-------TT-----GACAAATATTTAG-------CC-----------AATATCA--AATTCGAGT
gi|14 : GTACC-AATAATTTCCA--C--AAT-TT-T-T--T----T---T--TC---T-----------TGT-T-TT----------A-TAACT----------AT----------------------CTTAAAT-TC-GG-ACGA---TGGT----------------GG--CATT--TGTG-G--AGTG--CCG--------TCACTGATGCTGATCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------A-AA-------T-------TGTT----TT-----GTGAAATATTTCACCGGA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTtcacg
gi|15 : tttAT-GCCGCAACAATAATT--TCAAA-A---T-ATTTCT--ACA--T--TTTGA----AGC------TT--GTGT-TCAAA----CT-TT---T-TACATGCATATT-TTGCATGTCGCACCTACTAATTTCC---C--A-T-TT-----------C---T--AC---A-AA---A-TTACAAGT-TT-GCCA---A-A-TATTT----------ATTC------GTA--CCAA-T--ATCAA--A-TT-CG-
gi|16 : CCGCATCAATAATT--AAATA-A---T-TTCATT--ACA--T--TT-------AG-------TT--AT-T-TCCAAA--CGT-TT---T-GACATT--TATT-TTGTATGCCTCACC-AATGACTTTC---C--A-T-TT-TAA--CAAAAT---T--GC-----AA---G-T------T-TT-GTAA---A-A-TAtgtctac
gi|17 : CA--------CAACTGGTGCT---CGT-TTTAAA----GTT---TTAAAATAAC------A---------AG-------T-------T-------TT-----GTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATtatagccacagcaataccatgtctacgcc
gi|18 : G--CCA--------CCACGGGTGAT--------TTAAA----TTC---C-------CC------A-------C-AA-------T-------TACAAGAGTT-----GTAAATTATTTAGCCACA--CC-----------AATATCA--AATg
gi|19 : GTGCTACTCGT-TTAAAA----GCC---T-------AC------AAAAGTA-C-AAG------T-------T-------TT-----GTAAAATATTTAGCCG--------------------------AATTCGTGTCT
gi|2 : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTgcg
gi|2 : CTCCCTATATCTAAACTGACACATGGACGTAGACACGGGTGCG---GCA-GG-------ATGCG--------G--T--------CAATGAT--TT-A-T---------ATTGGTTCGGCAT-GCCACACCAATAATT--TTAAA-A---C-TTTTCT--ACA--TG-TTT------AGC------TA--AT-T-TCAAAA--CTT-TTAACT-TACATT--TATT-TTGTATGCCACACC-AATAATTTCC---A--A-T-TT-T-T--C----T---TGCGC---TAAA---A-T--CGA-T-TT-GTAA---A-AGTAACT----------ATTA------ATA--GTAGTT--ACTTA--TATT-CATAAAAC--TTAT---ATAAT---CTC--GGGACATTCCTGTACG--ACTG--CCA--------CCACTAGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AA---------------T-------TT-----GTAAAAGATTAAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgctccctatatctaaactgacacatggacgtagacacgggtgcggcaggatgcggtcaatgatttatattggttcggcatgccacaccaataattttaaaacttttctacatgtttagctaatttcaaaacttttaacttacatttattttgtatgccacaccaataatttccaatttttcttgcgctaaaatcgatttgtaaaagtaactattaatagtagttacttatattcataaaacttatataatctcgggacattcctgtacgactgccaccactagtgctgctcgttttaaagtctacacaatttgtaaaagattaagccgcaccaatatcaaattcgtgtctatct
gi|20 : ggtcaccaaccccgggtagtgtgtgtgtgtgggtgggtggggggggggggggggggggaggcgcgcgggggggggggggatcaaacgcactatatacacttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgAATCCTCGGCCGCA--CC-----------AATATTA--AATTTGTGGCTAct
gi|21 : aggacgtacacgcatactatattGGTGTAGACACAGGTGCA---ACA-TG-------TTGCGGCATTGCTGTAC--------CAGTAA---TT-A-
gi|22 : -AG-------T-------T-------TT-----GTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATa
gi|23 : -------T-------T-------TT-----GTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCATGTCTATg
gi|3 : gCTCCC-ATATCAAAGC-----CACGGGCGTAGACACGGGTACG---GCA-TG-------GTGCG--------GTATAGCCGCAGCAGTAA---CT-AAT---------ATTGGTGCGACAT-GCCTCGCCAGTATTT--TCAAA-A---C-TCTTCT--CCA--TGTTTT------AGC------TA--AT-T-TCAAAA--CTT-TT---TATACATT--TATT-TTGTATGCCGCACT-AGTAATGTCC---C--A-T-TTGT-T--C----T---T--G--------------------T-TT--TAT---A-A-TCATT-----------TTA------A-A--CTCG-G--AC--A--G-T---G-ATGAC--ATTT---AT---------------CATT-C---------CTG--TCA--------TCACTGGTGCTGCTTGT-TTTAAA----GTC---T-------ACAAAATTA-------C-AAG------T-------T-------TT-----GTAAAATGTTTACACGCATTTC------------ATAACA--TATTCGTGTCTAg
gi|4 : ataataaagttttaaccaaataCACGGACGTAGGTACGGGTGCG---TCA-TG-------GTGCG--------GTATAACCTCACCAATAAATATT-A-TTGGTGAGGCATTGGTGTGGCAT-AACGCACCAATAATT--TAAAA-AAAAC-TTTTCT--CCC--C--TTTTTTTATAGC------TA--AT-T-TCCAAA--CTT-TT---T-TACATC--TAGT-TTGTATACCGCACC-AATAATTTCC---A--C-T-TT-T-T--A----T---T--GT---T-----------------TT----------A-TAATT----------AT----------------------CTTAAAT-TC-GG-ACGACGATCGT---ATAAT---TTT--T---CATT-TT-T--G--ATT---------------CGTTGGTGCTGCTCTTATTTGAA----GTC---T-------A-----------------AA-------T-------T-------TTTTTTTGTAAA-TAATAAGCCTCA--CA-----------GATATCA--AATCCGTGTCTAca
gi|5 : tGTGCGTACACA-TG-------GTGCG--------GGAT------------AA---T--------------------GCGACAT-GACGCA---ATAATT--------A---C-T-------ACA--T--TT--------GT------TACAAT-T-TCCAAA--CTC-GT---T-TACGTT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATGTCT---A--G-T-TT-T-TG-C-----------GC---T-AA---AGT--CTA-T-AT-GTAA---ACC-TAAAT----------ATTA------ACA--TTAA-TG-ACTTT--T-TTACACACATC--TGGT---ATA--------------CGTT-C--AA-GCTACTA--CCA--------CCACTGTTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AAG------TACAAGA-T-------TT-----GTAAAATATATAGCCTCA--CC-----------GATGTCG--ATTTTGCGTCTAcg
gi|6 : atT-ACTGCAT-AATA-TTGGTCAAA-A---C-TTTTTTTTATA--T--TTT---------------TT--AT-T-CCAAA----TG-TT---T-GACATT--TATT-TTGTATGCT-CACT-GATcg
gi|6 : gcatagacacggg-TCAAAA--CTT-TT---T-T---TTA-TATT-TTTTATTCCA-----AATG-TTTGA---C--A-T-TTAT-T--T----TGTAT--GC---T-CACTGA-T--CTA-TATT-ATAATTAG-G-TCACTGGCATGCCACATCA------ATA--ATTT-TCCATTTT--T-TT-C---------TTGTTTTATAATTATCTT--AA---ATT-CTA-G-G--ACTG--CCA--------CCACTAATGCTGCTAGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------A-AA-------TCACACGTT-------TT-----GTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTTGTGTCTActatattataattaggtcactggcatgccacatcaataattttccatttttttcttgttttataattatcttaaattctaggactgccaccactaatgctgctagttttaaagtctacaaaatcacacgttttgtaaaatatttagccgcaccaatatcaaatttgtgtctacg
gi|7 : gcatagacacgggtactgcataatattggGGGCGTAGATATGGATGCG---TCA-TG-------GTATG--------GCAT--------C-------------------------------------GTCGCATCAATAATT--AAAAA-A---A-ATCTTA--ATA--T--TTT------GGC------TT--AC-T-TCA-----TTTATT---T-TACATT--TATT-TTGTATGCCGCGTT-ATTAATTTCC---T--A-T-TT-C----------------------------A-T--C-----TT-GT-------------------------TTT------ATA--CTGG-T---CTTAAAT-TC-TG-ACAA-----------TGAT--------GA--CATT--TGTG-G--AAAA--TCA--------CCACTGATGCTGCTCGT-TTAAAA----GTC---T-------CC------A-------A-AACTACACGT-------T-------TA-----GTAAATTATTTAGCTGTA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAcg
gi|8 : T-GCCGCATCAATGATT--TTAAA-A---CGTTTTCT--ACAT-T--TTT------AGCTACATGTG--AT-T-TAAAAA--A-----------AAATT--AGTT-TTTTATGCCGCACC-AATTATTTCT---C--A-T-TT-T-T--------------------------A-T--CTG-T-TT--TAC---A-A-TTATC----------TTAA------ATAAGTTAA-A--ACTT---T-TT-TA-ACG----TT----------------------TATT-TTGTA-T--GCTGCACCAAAAATATTCCATT----TTTCTTGT-TTTATA----AT----G-------AC------A-----------------------------------T-----GTATAATA-TTATCCGCG--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTC
gi|9 : caggcgtatacacggtGCATAAATGATT--TTATA-A---C-TTTGAT--ACAAAT--TTT------AGC------TA--AT-T-TCCAAGGTTTT-TT---T-TACATT--CATT-T-GTATGCCACACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T-TTTC----T---T--G--------------------T-TT--TAC---A-A-TGACC-----------TTA------A----------------A--T-TC-TG-ACGA----TGT---AT--------------------TTGTA-G--ACT---TCA--------TCACTTGTGCTGCTTGT-TTTAAAAAAAGTC---T-------AC------AAAATTACC-AG-------T-------T-------TA-----GTAAAATATTTAGCCGCA--CCAAGGCCATAAAAATATCA--AATTCGTGTCTAc
Alignments
lowQualScore : 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1111111 77777777777777777777777777777777777777777777 11111 111111 1111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111 55555555555555555555555555555555555555555 11111111111
lowQualScore : 7 7 0 777 4 4444444 44444444444444444444444444444444444444444444 0 3 3 6666 2 444 2 3 33 44444 111111 777777 444 2 2 2222222 2 888 2 33 2 2 999999 2 2 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 44 555 11111111 1 2 5555 444 8888888 99999999999999999999999999999999999999999 33 00000000000 33
lowQualScore : . . . ... . ....... ............................................ . . . .... . ... . . .. ..... ...... ...... ... . . ....... . ... . .. . . ...... . . . ......................................................................................................................................... .. ... ........ . . .... ... ....... ......................................... .. ........... ..
lowQualScore : 3 3 7 888 4 4444444 00000000000000000000000000000000000000000000 1 1 7 7777 7 777 7 2 77 33333 333333 777777 777 5 5 1111111 5 888 5 44 5 4 999999 4 4 5 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 66 666 22222222 2 7 7777 777 7777777 55555555555555555555555555555555555555555 11 66666666666 11
consensus : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCCTATATCTAAACTGACACACGGGCGTAGACACGGGTGCG---GCA-TG-------GTGCG--------GTAT--------CAATAA---TT-A-T---------ATTGGTGCGGCAT-GCCGCACCAATAATT--TCAAA-A---C-TTTTCT--ACA--T--TTT------AGC------TN--AT-T-TCAAAA--CTT-TT---T-TACATT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T--T--C----T-T--G---C----T-A-AA-TC-A----TTTGTAA-A-A-TAAC-TATTA------ATANTAG-T--ACTT--A--T-TT-CG-ACGAC--TTGT---ATAAT---CTC--GG--CATT-CTGTA-G--ACTG--CCA--------CCACTGGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AA-------T-------T-------TTGTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
Reference ( family-6105 ) : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCCTATATCTAAACTGACACACGGGCGTAGACACGGGTGCG---GCA-TG-------GTGCG--------GTAT--------CAATAA---TT-A-T---------ATTGGTGCGGCAT-GCCGCACCAATAATT--TCAAA-A---C-TTTTCT--ACA--T--TTT------AGC------TN--AT-T-TCAAAA--CTT-TT---T-TACATT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T--T--C----T-T--G---C----T-A-AA-TC-A----TTTGTAA-A-A-TAAC-TATTA------ATANTAG-T--ACTT--A--T-TT-CG-ACGAC--TTGT---ATAAT---CTC--GG--CATT-CTGTA-G--ACTG--CCA--------CCACTGGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AA-------T-------T-------TTGTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
gi|1 : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTT
gi|1 : tCTCCCTATATCTAAACTGACACATGGACGTAGACACGGGTGCG---GCA-GG-------ATGCG--------G--T--------CAATGAT--TT-A-T---------ATTGGTTCGGCAT-GCCACACCAATAATT--TTAAA-A---C-TTTTCT--ACA--TG-TTT------AGC------TA--AT-T-TCAAAA--CTT-TTAACT-TACATT--TATT-TTGTATGCCACACC-AATAATTTCC---A--A-T-TT-T--T--C----T-TGCG---C----TAA-AA-TCGA----TTTGTAA-A-AGTAAC-TATTA------ATAGTAGTT--ACTT--A--TATT-CATAAAAC--TTAT---ATAAT---CTC--GGGACATTCCTGTACG--ACTG--CCA--------CCACTAGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AA---------------T-------TTGTAAAAGATTAAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgctccctatatctaaactgacacatggacgtagacacgggtgcggcaggatgcggtcaatgatttatattggttcggcatgccacaccaataattttaaaacttttctacatgtttagctaatttcaaaacttttaacttacatttattttgtatgccacaccaataatttccaatttttcttgcgctaaaatcgatttgtaaaagtaactattaatagtagttacttatattcataaaacttatataatctcgggacattcctgtacgactgccaccactagtgctgctcgttttaaagtctacacaatttgtaaaagattaagccgcaccaatatcaaattcgtgtctatct
gi|10 : tggtcaccaaccccgggtagtgtgtgtgtgtgggtgggtggggggggggggggggggggaggcgcgcgggggggggggggatcaaacgcactatatacacttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgTGCGGCATTGCCGCACCAATAATA--TCAAA-A---C-TTTT--------------T------AGC------TA--AT--------A----T-TT---T-TAAATA--TATT-TTGTATGTCGAACC-AATCATTTCC---CATA-T-TT-T--T--C----A-T--G---TTTCAT-A-AA-T-------TTCTTAA-A-A-Tct
gi|10 : gtTCAT-TTTAGA----ATTGATT-------AC------A---------AG-------T-------T-------TTGTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------CCTACCATTAATTCGTctgacgatgatgacatttgtcattattgatgcattttcaatcaaatcaacatcattttagaattgattacaagttttgtaaaatatttagccgcacccctaccattaattcgt
gi|11 : gttgcggcattgccgcaccaataatatcaaaactttttagctaatatttttaaatatattttgtatgtcgaaccaatcatttcccatatttttcatgtttcataaatttcttaaaatctgacgatgatgacatttgtcattattgatgcattttcaatcaaatcaacaCATGAGCACAGACACGGGTACG---GCAATGCTTCACCATGCC--------GTAC--------CAATAA---TT-AAT---------ATTATCGAGGCAA-GCAGCACCAAAAATT--TCAAA-A---C-TTTTCT--ACAT-T--TTT------AGC------TT--AT-T-TC-CGA--TTT-TT---T-T---TT--TGTTATTG-AGGTTGCACT-AA-AA---------------------------------------------A-AA------------GTAATA-G-TAAC-TAGCAAAACATACAGTAA-TG-ATTT--AT-T-TT-CGCACAAC--TGAT---ATACT---CTCTGGG--CATTCCTGTA-G--
gi|12 : ATGGGCGTAGGCACGGGTGCG---GCA-TG-------GTATG--------GCATTGCTGCACCATTAA---TTAA-T---------ACTGGTGAAGCAT-TCCGAACT--TTTTT--T-----A---C-TTTT-T--ACA--TA-TAT------AGC------TT--AT-T-TCCATA--CTT-TT---T-TACATT--T-TT-T--TATGCCGCA---AATAATTCCC---C--A-TACT-T--T--C----T-G--GTTTC----T-ATAA-TT-A----Tga
gi|12 : AT-GCCGCA--AATAATT--CCCCATA---C-TTT-CT--GGT--T--TCT------A--------TA--AT-TATCG------TT-TT---C-TACATT--TATT-TTGTATGACGCACC-GATAAGTTCC---C--A-T-cgttttctacatttattttgtatgacgcaccgataagttcccat
gi|13 : atgggcgtaggcacgggtgcggcatggtatggcattgctgcaccattaattaatactggtgaagcattccgaactttttttactttttacatatatagcttatttccatacttttttacattttttt-T-TCAAA---CTC-TT---T-TACATT--TATT-CTGTATGCCGCACC-AATAATTTCCAATT--A-T-TT-T--T--C----T-T--G---CACT-T-A-AA-GCGA----TTTGTAA-ACG-TAAA-TATTA------ATAGTA----------------------AC-AC--TTGT---ATACT---CTC--CG-------------G--ACTG--CCA--------CCGCTGGTGTTACTCGT-TTTAAA----GTC---T-------ACAAAATTA-------CAAA-------T-------T-------TTGACAAATATTTAG-------CC-----------AATATCA--AATTCGAGT
gi|14 : GTACC-AATAATTTCCA--C--AAT-TT-T--T--T----T-T--T---C----T-------T-G----TTT-TA------TAAC-TAT--------------------CTT--AAAT-TC-GG-ACGA---TGGT----------------GG--CATT--TGTG-G--AGTG--CCG--------TCACTGATGCTGATCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------A-AA-------T-------TGTT----TTGTGAAATATTTCACCGGA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTtcacg
gi|15 : tttAT-GCCGCAACAATAATT--TCAAA-A---T-ATTTCT--ACA--T--TTTGA----AGC------TT--GTGT-TCAAA----CT-TT---T-TACATGCATATT-TTGCATGTCGCACCTACTAATTTCC---C--A-T-TT------------C-T--A---C----A-A-AA-TT-ACAAGTTTGCCA-A-A-TATT-TATTC------GTACCAA-T--ATCA--A--A-TT-CG-
gi|16 : CCGCATCAATAATT--AAATA-A---T-TTCATT--ACA--T--TT-------AG-------TT--AT-T-TCCAAA--CGT-TT---T-GACATT--TATT-TTGTATGCCTCACC-AATGACTTTC---C--A-T-TT-TA-A--CAAAAT-T--G---C------A-AG-T-------TTTGTAA-A-A-TAtgtctac
gi|17 : CA--------CAACTGGTGCT---CGT-TTTAAA----GTT---TTAAAATAAC------A---------AG-------T-------T-------TTGTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATtatagccacagcaataccatgtctacgcc
gi|18 : G--CCA--------CCACGGGTGAT--------TTAAA----TTC---C-------CC------A-------C-AA-------T-------TACAAGAGTTGTAAATTATTTAGCCACA--CC-----------AATATCA--AATg
gi|19 : GTGCTACTCGT-TTAAAA----GCC---T-------AC------AAAAGTA-C-AAG------T-------T-------TTGTAAAATATTTAGCCG--------------------------AATTCGTGTCT
gi|2 : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTgcg
gi|2 : CTCCCTATATCTAAACTGACACATGGACGTAGACACGGGTGCG---GCA-GG-------ATGCG--------G--T--------CAATGAT--TT-A-T---------ATTGGTTCGGCAT-GCCACACCAATAATT--TTAAA-A---C-TTTTCT--ACA--TG-TTT------AGC------TA--AT-T-TCAAAA--CTT-TTAACT-TACATT--TATT-TTGTATGCCACACC-AATAATTTCC---A--A-T-TT-T--T--C----T-TGCG---C----TAA-AA-TCGA----TTTGTAA-A-AGTAAC-TATTA------ATAGTAGTT--ACTT--A--TATT-CATAAAAC--TTAT---ATAAT---CTC--GGGACATTCCTGTACG--ACTG--CCA--------CCACTAGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AA---------------T-------TTGTAAAAGATTAAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgctccctatatctaaactgacacatggacgtagacacgggtgcggcaggatgcggtcaatgatttatattggttcggcatgccacaccaataattttaaaacttttctacatgtttagctaatttcaaaacttttaacttacatttattttgtatgccacaccaataatttccaatttttcttgcgctaaaatcgatttgtaaaagtaactattaatagtagttacttatattcataaaacttatataatctcgggacattcctgtacgactgccaccactagtgctgctcgttttaaagtctacacaatttgtaaaagattaagccgcaccaatatcaaattcgtgtctatct
gi|20 : ggtcaccaaccccgggtagtgtgtgtgtgtgggtgggtggggggggggggggggggggaggcgcgcgggggggggggggatcaaacgcactatatacacttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgAATCCTCGGCCGCA--CC-----------AATATTA--AATTTGTGGCTAct
gi|21 : aggacgtacacgcatactatattGGTGTAGACACAGGTGCA---ACA-TG-------TTGCGGCATTGCTGTAC--------CAGTAA---TT-A-
gi|22 : -AG-------T-------T-------TTGTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATa
gi|23 : -------T-------T-------TTGTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCATGTCTATg
gi|3 : gCTCCC-ATATCAAAGC-----CACGGGCGTAGACACGGGTACG---GCA-TG-------GTGCG--------GTATAGCCGCAGCAGTAA---CT-AAT---------ATTGGTGCGACAT-GCCTCGCCAGTATTT--TCAAA-A---C-TCTTCT--CCA--TGTTTT------AGC------TA--AT-T-TCAAAA--CTT-TT---TATACATT--TATT-TTGTATGCCGCACT-AGTAATGTCC---C--A-T-TTGT--T--C----T-T--G-----------------------TTT-TAT-A-A-TCAT-T-TTA------A-ACTCG-G--AC----A--G-T---G-ATGAC--ATTT---AT---------------CATT-C---------CTG--TCA--------TCACTGGTGCTGCTTGT-TTTAAA----GTC---T-------ACAAAATTA-------C-AAG------T-------T-------TTGTAAAATGTTTACACGCATTTC------------ATAACA--TATTCGTGTCTAg
gi|4 : ataataaagttttaaccaaataCACGGACGTAGGTACGGGTGCG---TCA-TG-------GTGCG--------GTATAACCTCACCAATAAATATT-A-TTGGTGAGGCATTGGTGTGGCAT-AACGCACCAATAATT--TAAAA-AAAAC-TTTTCT--CCC--C--TTTTTTTATAGC------TA--AT-T-TCCAAA--CTT-TT---T-TACATC--TAGT-TTGTATACCGCACC-AATAATTTCC---A--C-T-TT-T--T--A----T-T--G---T----T--------------TT--------A-TAAT-TAT--------------------CTTAAA--T-TC-GG-ACGACGATCGT---ATAAT---TTT---T--CATT-TT-T--G--ATT---------------CGTTGGTGCTGCTCTTATTTGAA----GTC---T-------A-----------------AATTTTT--T-------T-------TTGT-AAATAATAAGCCTCA--CA-----------GATATCA--AATCCGTGTCTAca
gi|5 : tGTGCGTACACA-TG-------GTGCG--------G------------GATAA---T--------------------GCGACAT-GACGCA---ATAATT--------A---C-T-------ACA--T--TT--------GT------TACAAT-T-TCCAAA--CTC-GT---T-TACGTT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATGTCT---A--G-T-TT-T--TG-C---------G---C----T-A-AAGTCTA----TATGTAA-ACC-TAAA-TATTA------ACATTAA-TG-ACTT--T--T-TTACACACATC--TGGT---ATA--------------CGTT-C--AA-GCTACTA--CCA--------CCACTGTTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AAG------TACAAGA-T-------TTGTAAAATATATAGCCTCA--CC-----------GATGTCG--ATTTTGCGTCTAcg
gi|6 : atT-ACTGCAT-AATA-TTGGTCAAA-A---C-TTTTTTTTATA--T--TTT---------------TT--AT-T-CCAAA----TG-TT---T-GACATT--TATT-TTGTATGCT-CACT-GAT------C---T--A-T-AT-T-----A----T-A--A---T----T-A-GG-TC-A----CTGGCA------TGCCACATCA------ATAATTT-TCCATTT--T--T-TT-C---------TTGTTTTATAATTATCTT--AA---ATT-CTA-G-G--ACTG--CCA--------CCACTAATGCTGCTAGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------A-AA-------TCACACGTT-------TTGTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTTGTGTCTAcg
gi|7 : gcatagacacgggGGGCGTAGATATGGATGCG---TCA-TG-------GTATG--------GCAT--------C-------------------------------------GTCGCATCAATAATT--AAAAA-A---A-ATCTTA--ATA--T--TTT------GGC------TT--AC-T-TCA-----TTTATT---T-TACATT--TATT-TTGTATGCCGCGTT-ATTAATTTCC---T--A-T-TT-C-----------------------------A-TC-------TTGT--------------TTT------ATACTGG-T---CTT--AAAT-TC-TG-ACAA-----------TGAT--------GA--CATT--TGTG-G--AAAA--TCA--------CCACTGATGCTGCTCGT-TTAAAA----GTC---T-------CC------A-------A-AACTACACGT-------T-------TAGTAAATTATTTAGCTGTA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAcg
gi|8 : T-GCCGCATCAATGATT--TTAAA-A---CGTTTTCT--ACAT-T--TTT------AGCTACATGTG--AT-T-TAAAAA--A-----------AAATT--AGTT-TTTTATGCCGCACC-AATTATTTCT---C--A-T-TT-TTAT--C----TGT--T---T----T-ACAA-TT-A----TCT-T-A-A-A-TAA---GTTA------A-A--------ACTT-----T-TT-TA-ACG----TT----------------------TATT-TTGTA-T--GCTGCACCAAAAATATTCCATT----TTTCTTGT-TTTATA----AT----G-------AC------A-----------------------------------TGTATAATA-TTATCCGCG--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTC
gi|9 : caggcgtatacacggtGCATAAATGATT--TTATA-A---C-TTTGAT--ACAAAT--TTT------AGC------TA--AT-T-TCCAAGGTTTT-TT---T-TACATT--CATT-T-GTATGCCACACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T--TTTC----T-T--G-----------------------TTT-TAC-A-A-TGAC-C-TTA------A----------------A--T-TC-TG-ACGA----TGT---AT--------------------TTGTA-G--ACT---TCA--------TCACTTGTGCTGCTTGT-TTTAAAAAAAGTC---T-------AC------AAAATTACC-AG-------T-------T-------TAGTAAAATATTTAGCCGCA--CCAAGGCCATAAAAATATCA--AATTCGTGTCTAc
Alignments
lowQualScore : 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1111111 77777777777777777777777777777777777777777777 11111 111111 1111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111 55555555555555555555555555555555555555555 11111111111
lowQualScore : 7 7 0 777 4 4444444 44444444444444444444444444444444444444444444 0 3 3 6666 2 444 2 3 33 44444 111111 777777 444 2 2 2222222 2 888 2 33 2 2 999999 2 2 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 44 555 11111111 1 2 5555 444 8888888 99999999999999999999999999999999999999999 33 00000000000 33
lowQualScore : . . . ... . ....... ............................................ . . . .... . ... . . .. ..... ...... ...... ... . . ....... . ... . .. . . ...... . . . ......................................................................................................................................... .. ... ........ . . .... ... ....... ......................................... .. ........... ..
lowQualScore : 3 3 7 888 4 4444444 00000000000000000000000000000000000000000000 1 1 7 7777 7 777 7 2 77 33333 333333 777777 777 5 5 1111111 5 888 5 44 5 4 999999 4 4 5 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 66 666 22222222 2 7 7777 777 7777777 55555555555555555555555555555555555555555 11 66666666666 11
consensus : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCCTATATCTAAACTGACACACGGGCGTAGACACGGGTGCG---GCA-TG-------GTGCG--------GTAT--------CAATAA---TT-A-T---------ATTGGTGCGGCAT-GCCGCACCAATAATT--TCAAA-A---C-TTTTCT--ACA--T--TTT------AGC------TN--AT-T-TCAAAA--CTT-TT---T-TACATT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T--T--C----T-T--G---C----T-A-AA-TC-A----TTTGTAA-A-A-TAAC-TATTA------ATANTAG-T--ACTT--A--T-TT-CG-ACGAC--TTGT---ATAAT---CTC--GG--CATT-CTGTA-G--ACTG--CCA--------CCACTGGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AA-------T-------T-------TTGTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
Reference ( family-6105 ) : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCCTATATCTAAACTGACACACGGGCGTAGACACGGGTGCG---GCA-TG-------GTGCG--------GTAT--------CAATAA---TT-A-T---------ATTGGTGCGGCAT-GCCGCACCAATAATT--TCAAA-A---C-TTTTCT--ACA--T--TTT------AGC------TN--AT-T-TCAAAA--CTT-TT---T-TACATT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T--T--C----T-T--G---C----T-A-AA-TC-A----TTTGTAA-A-A-TAAC-TATTA------ATANTAG-T--ACTT--A--T-TT-CG-ACGAC--TTGT---ATAAT---CTC--GG--CATT-CTGTA-G--ACTG--CCA--------CCACTGGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AA-------T-------T-------TTGTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
gi|1 : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTT
gi|1 : tCTCCCTATATCTAAACTGACACATGGACGTAGACACGGGTGCG---GCA-GG-------ATGCG--------G--T--------CAATGAT--TT-A-T---------ATTGGTTCGGCAT-GCCACACCAATAATT--TTAAA-A---C-TTTTCT--ACA--TG-TTT------AGC------TA--AT-T-TCAAAA--CTT-TTAACT-TACATT--TATT-TTGTATGCCACACC-AATAATTTCC---A--A-T-TT-T--T--C----T-TGCG---C----TAA-AA-TCGA----TTTGTAA-A-AGTAAC-TATTA------ATAGTAGTT--ACTT--A--TATT-CATAAAAC--TTAT---ATAAT---CTC--GGGACATTCCTGTACG--ACTG--CCA--------CCACTAGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AA---------------T-------TTGTAAAAGATTAAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgctccctatatctaaactgacacatggacgtagacacgggtgcggcaggatgcggtcaatgatttatattggttcggcatgccacaccaataattttaaaacttttctacatgtttagctaatttcaaaacttttaacttacatttattttgtatgccacaccaataatttccaatttttcttgcgctaaaatcgatttgtaaaagtaactattaatagtagttacttatattcataaaacttatataatctcgggacattcctgtacgactgccaccactagtgctgctcgttttaaagtctacacaatttgtaaaagattaagccgcaccaatatcaaattcgtgtctatct
gi|10 : tggtcaccaaccccgggtagtgtgtgtgtgtgggtgggtggggggggggggggggggggaggcgcgcgggggggggggggatcaaacgcactatatacacttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgTGCGGCATTGCCGCACCAATAATA--TCAAA-A---C-TTTT--------------T------AGC------TA--AT--------A----T-TT---T-TAAATA--TATT-TTGTATGTCGAACC-AATCATTTCC---CATA-T-TT-T--T--C----A-T--G---TTTCAT-A-AA-T-------TTCTTAA-A-A-Tct
gi|10 : gtTCAT-TTTAGA----ATTGATT-------AC------A---------AG-------T-------T-------TTGTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------CCTACCATTAATTCGTctgacgatgatgacatttgtcattattgatgcattttcaatcaaatcaacatcattttagaattgattacaagttttgtaaaatatttagccgcacccctaccattaattcgt
gi|11 : gttgcggcattgccgcaccaataatatcaaaactttttagctaatatttttaaatatattttgtatgtcgaaccaatcatttcccatatttttcatgtttcataaatttcttaaaatctgacgatgatgacatttgtcattattgatgcattttcaatcaaatcaacaCATGAGCACAGACACGGGTACG---GCAATGCTTCACCATGCC--------GTAC--------CAATAA---TT-AAT---------ATTATCGAGGCAA-GCAGCACCAAAAATT--TCAAA-A---C-TTTTCT--ACAT-T--TTT------AGC------TT--AT-T-TC-CGA--TTT-TT---T-T---TT--TGTTATTG-AGGTTGCACT-AA-AA---------------------------------------------A-AA------------GTAATA-G-TAAC-TAGCAAAACATACAGTAA-TG-ATTT--AT-T-TT-CGCACAAC--TGAT---ATACT---CTCTGGG--CATTCCTGTA-G--
gi|12 : ATGGGCGTAGGCACGGGTGCG---GCA-TG-------GTATG--------GCATTGCTGCACCATTAA---TTAA-T---------ACTGGTGAAGCAT-TCCGAACT--TTTTT--T-----A---C-TTTT-T--ACA--TA-TAT------AGC------TT--AT-T-TCCATA--CTT-TT---T-TACATT--T-TT-T--TATGCCGCA---AATAATTCCC---C--A-TACT-T--T--C----T-G--GTTTC----T-ATAA-TT-A----Tga
gi|12 : AT-GCCGCA--AATAATT--CCCCATA---C-TTT-CT--GGT--T--TCT------A--------TA--AT-TATCG------TT-TT---C-TACATT--TATT-TTGTATGACGCACC-GATAAGTTCC---C--A-T-cgttttctacatttattttgtatgacgcaccgataagttcccat
gi|13 : atgggcgtaggcacgggtgcggcatggtatggcattgctgcaccattaattaatactggtgaagcattccgaactttttttactttttacatatatagcttatttccatacttttttacattttttt-T-TCAAA---CTC-TT---T-TACATT--TATT-CTGTATGCCGCACC-AATAATTTCCAATT--A-T-TT-T--T--C----T-T--G---CACT-T-A-AA-GCGA----TTTGTAA-ACG-TAAA-TATTA------ATAGTA----------------------AC-AC--TTGT---ATACT---CTC--CG-------------G--ACTG--CCA--------CCGCTGGTGTTACTCGT-TTTAAA----GTC---T-------ACAAAATTA-------CAAA-------T-------T-------TTGACAAATATTTAG-------CC-----------AATATCA--AATTCGAGT
gi|14 : GTACC-AATAATTTCCA--C--AAT-TT-T--T--T----T-T--T---C----T-------T-G----TTT-TA------TAAC-TAT--------------------CTT--AAAT-TC-GG-ACGA---TGGT----------------GG--CATT--TGTG-G--AGTG--CCG--------TCACTGATGCTGATCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------A-AA-------T-------TGTT----TTGTGAAATATTTCACCGGA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTtcacg
gi|15 : tttAT-GCCGCAACAATAATT--TCAAA-A---T-ATTTCT--ACA--T--TTTGA----AGC------TT--GTGT-TCAAA----CT-TT---T-TACATGCATATT-TTGCATGTCGCACCTACTAATTTCC---C--A-T-TT------------C-T--A---C----A-A-AA-TT-ACAAGTTTGCCA-A-A-TATT-TATTC------GTACCAA-T--ATCA--A--A-TT-CG-
gi|16 : CCGCATCAATAATT--AAATA-A---T-TTCATT--ACA--T--TT-------AG-------TT--AT-T-TCCAAA--CGT-TT---T-GACATT--TATT-TTGTATGCCTCACC-AATGACTTTC---C--A-T-TT-TA-A--CAAAAT-T--G---C------A-AG-T-------TTTGTAA-A-A-TAtgtctac
gi|17 : CA--------CAACTGGTGCT---CGT-TTTAAA----GTT---TTAAAATAAC------A---------AG-------T-------T-------TTGTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATtatagccacagcaataccatgtctacgcc
gi|18 : G--CCA--------CCACGGGTGAT--------TTAAA----TTC---C-------CC------A-------C-AA-------T-------TACAAGAGTTGTAAATTATTTAGCCACA--CC-----------AATATCA--AATg
gi|19 : GTGCTACTCGT-TTAAAA----GCC---T-------AC------AAAAGTA-C-AAG------T-------T-------TTGTAAAATATTTAGCCG--------------------------AATTCGTGTCT
gi|2 : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTgcg
gi|2 : CTCCCTATATCTAAACTGACACATGGACGTAGACACGGGTGCG---GCA-GG-------ATGCG--------G--T--------CAATGAT--TT-A-T---------ATTGGTTCGGCAT-GCCACACCAATAATT--TTAAA-A---C-TTTTCT--ACA--TG-TTT------AGC------TA--AT-T-TCAAAA--CTT-TTAACT-TACATT--TATT-TTGTATGCCACACC-AATAATTTCC---A--A-T-TT-T--T--C----T-TGCG---C----TAA-AA-TCGA----TTTGTAA-A-AGTAAC-TATTA------ATAGTAGTT--ACTT--A--TATT-CATAAAAC--TTAT---ATAAT---CTC--GGGACATTCCTGTACG--ACTG--CCA--------CCACTAGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AA---------------T-------TTGTAAAAGATTAAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgctccctatatctaaactgacacatggacgtagacacgggtgcggcaggatgcggtcaatgatttatattggttcggcatgccacaccaataattttaaaacttttctacatgtttagctaatttcaaaacttttaacttacatttattttgtatgccacaccaataatttccaatttttcttgcgctaaaatcgatttgtaaaagtaactattaatagtagttacttatattcataaaacttatataatctcgggacattcctgtacgactgccaccactagtgctgctcgttttaaagtctacacaatttgtaaaagattaagccgcaccaatatcaaattcgtgtctatct
gi|20 : ggtcaccaaccccgggtagtgtgtgtgtgtgggtgggtggggggggggggggggggggaggcgcgcgggggggggggggatcaaacgcactatatacacttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgAATCCTCGGCCGCA--CC-----------AATATTA--AATTTGTGGCTAct
gi|21 : aggacgtacacgcatactatattGGTGTAGACACAGGTGCA---ACA-TG-------TTGCGGCATTGCTGTAC--------CAGTAA---TT-A-
gi|22 : -AG-------T-------T-------TTGTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATa
gi|23 : -------T-------T-------TTGTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCATGTCTATg
gi|3 : gCTCCC-ATATCAAAGC-----CACGGGCGTAGACACGGGTACG---GCA-TG-------GTGCG--------GTATAGCCGCAGCAGTAA---CT-AAT---------ATTGGTGCGACAT-GCCTCGCCAGTATTT--TCAAA-A---C-TCTTCT--CCA--TGTTTT------AGC------TA--AT-T-TCAAAA--CTT-TT---TATACATT--TATT-TTGTATGCCGCACT-AGTAATGTCC---C--A-T-TTGT--T--C----T-T--G-----------------------TTT-TAT-A-A-TCAT-T-TTA------A-ACTCG-G--AC----A--G-T---G-ATGAC--ATTT---AT---------------CATT-C---------CTG--TCA--------TCACTGGTGCTGCTTGT-TTTAAA----GTC---T-------ACAAAATTA-------C-AAG------T-------T-------TTGTAAAATGTTTACACGCATTTC------------ATAACA--TATTCGTGTCTAg
gi|4 : ataataaagttttaaccaaataCACGGACGTAGGTACGGGTGCG---TCA-TG-------GTGCG--------GTATAACCTCACCAATAAATATT-A-TTGGTGAGGCATTGGTGTGGCAT-AACGCACCAATAATT--TAAAA-AAAAC-TTTTCT--CCC--C--TTTTTTTATAGC------TA--AT-T-TCCAAA--CTT-TT---T-TACATC--TAGT-TTGTATACCGCACC-AATAATTTCC---A--C-T-TT-T--T--A----T-T--G---T----T--------------TT--------A-TAAT-TAT--------------------CTTAAA--T-TC-GG-ACGACGATCGT---ATAAT---TTT---T--CATT-TT-T--G--ATT---------------CGTTGGTGCTGCTCTTATTTGAA----GTC---T-------A-----------------AATTTTT--T-------T-------TTGT-AAATAATAAGCCTCA--CA-----------GATATCA--AATCCGTGTCTAca
gi|5 : tGTGCGTACACA-TG-------GTGCG--------G------------GATAA---T--------------------GCGACAT-GACGCA---ATAATT--------A---C-T-------ACA--T--TT--------GT------TACAAT-T-TCCAAA--CTC-GT---T-TACGTT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATGTCT---A--G-T-TT-T--TG-C---------G---C----T-A-AAGTCTA----TATGTAA-ACC-TAAA-TATTA------ACATTAA-TG-ACTT--T--T-TTACACACATC--TGGT---ATA--------------CGTT-C--AA-GCTACTA--CCA--------CCACTGTTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AAG------TACAAGA-T-------TTGTAAAATATATAGCCTCA--CC-----------GATGTCG--ATTTTGCGTCTAcg
gi|6 : atT-ACTGCAT-AATA-TTGGTCAAA-A---C-TTTTTTTTATA--T--TTT---------------TT--AT-T-CCAAA----TG-TT---T-GACATT--TATT-TTGTATGCT-CACT-GAT------C---T--A-T-AT-T-----A----T-A--A---T----T-A-GG-TC-A----CTGGCA------TGCCACATCA------ATAATTT-TCCATTT--T--T-TT-C---------TTGTTTTATAATTATCTT--AA---ATT-CTA-G-G--ACTG--CCA--------CCACTAATGCTGCTAGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------A-AA-------TCACACGTT-------TTGTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTTGTGTCTAcg
gi|7 : gcatagacacgggGGGCGTAGATATGGATGCG---TCA-TG-------GTATG--------GCAT--------C-------------------------------------GTCGCATCAATAATT--AAAAA-A---A-ATCTTA--ATA--T--TTT------GGC------TT--AC-T-TCA-----TTTATT---T-TACATT--TATT-TTGTATGCCGCGTT-ATTAATTTCC---T--A-T-TT-C-----------------------------A-TC-------TTGT--------------TTT------ATACTGG-T---CTT--AAAT-TC-TG-ACAA-----------TGAT--------GA--CATT--TGTG-G--AAAA--TCA--------CCACTGATGCTGCTCGT-TTAAAA----GTC---T-------CC------A-------A-AACTACACGT-------T-------TAGTAAATTATTTAGCTGTA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAcg
gi|8 : T-GCCGCATCAATGATT--TTAAA-A---CGTTTTCT--ACAT-T--TTT------AGCTACATGTG--AT-T-TAAAAA--A-----------AAATT--AGTT-TTTTATGCCGCACC-AATTATTTCT---C--A-T-TT-TTAT--C----TGT--T---T----T-ACAA-TT-A----TCT-T-A-A-A-TAA---GTTA------A-A--------ACTT-----T-TT-TA-ACG----TT----------------------TATT-TTGTA-T--GCTGCACCAAAAATATTCCATT----TTTCTTGT-TTTATA----AT----G-------AC------A-----------------------------------TGTATAATA-TTATCCGCG--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTC
gi|9 : caggcgtatacacggtGCATAAATGATT--TTATA-A---C-TTTGAT--ACAAAT--TTT------AGC------TA--AT-T-TCCAAGGTTTT-TT---T-TACATT--CATT-T-GTATGCCACACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T--TTTC----T-T--G-----------------------TTT-TAC-A-A-TGAC-C-TTA------A----------------A--T-TC-TG-ACGA----TGT---AT--------------------TTGTA-G--ACT---TCA--------TCACTTGTGCTGCTTGT-TTTAAAAAAAGTC---T-------AC------AAAATTACC-AG-------T-------T-------TAGTAAAATATTTAGCCGCA--CCAAGGCCATAAAAATATCA--AATTCGTGTCTAc
blockSeqs : T T TAC A CTTCACC GTATAACCTCACCAATAAATATTATTGGTGAGGC T C GGTC T AAA G C TT TGT TTTTAT TACATG ACA G A CAAGGTT A AAC A CA A T AATT A A G TCTTGCGCTAAAATCGATTTGTAAAAGTAACTATTAATAGTAGTTACTTATATTCATAAAACTTATATAATCTCGGGACATTCCTGTAC CT GCA AAAATATT A A AAAA GAT TAAAATA AAAATTACAAATT TT AAGGCCATAAA TT
blockSeqs : . . . . . GCATTGCTGCACCATTAATTAAT . C TC . . . C . AAT GA . A . . CATAC . . . . . . CAT . . . AAAGTAATAGTAACTAGCAAAACATACAGTAATGATTTATTTTCGCACAACTGATATACTCTCTGGGCATTCCTGTA . G . G . . . . ACAATTACAAGAG . . .
blockSeqs : . . . GTATAGCCGCAGCAGTAACTAAT . C TC . . . C . TT . . T . . CAAAC . . . . . . AC . . . ATAATTAGGTCACTGGCATGCCACATCAATAATTTTCCATTTTTTTCTTGTTTTATAATTATCTTAAATTCTAG . G . A . . . . AAAAGTACAAGTT . . .
blockSeqs : . . . GTACCAATAATTAAT . A CC . . . T . TA . . T . . AAAAC . . . . . . C . . . TGCGCTAAAGTCTATATGTAAACCTAAATATTAACATTAATGACTTTTTTACACACATCTGGTATACGTTCAA . G . G . . . . AAAATTACAAGTT . . .
blockSeqs : . . . GTCAATGATTTAT . T TC . . . C . TG . . A . . AAAAC . . . . . . C . . . TCTTGCACTTAAAGCGATTTGTAAACGTAAATATTAATAGTAACACTTGTATACTCTCCG . G . G . . . . ACAAGTACAAGAT . . .
blockSeqs : . . . GGATAAT . C AA . . . C . TT . . T . . CAAAC . . . . . . C . . . TATCTGTTTTACAATTATCTTAAATAAGTTAAAACTTTTTTAACGTTTATTTTGTA . G . G . . . . AAAATCACACGTT . . .
blockSeqs : . . . GCATC . C TT . . . C . T . . T . . CAAAC . . . . . . C . . . TATTGTTTTATAATTATCTTAAATTCGGACGACGATCGTATAATTTTTCATTTTT . A . G . . . . AAAACTACACGTT . . .
blockSeqs : . . . . C TC . . . T . T . . A . . AAAAA . . . . . . A . . . TTTTTCTTGTTTTATAACTATCTTAAATTCGGACGATGGTGGCATTTGTG . G . G . . . . AAAATTACCAGTT . . .
blockSeqs : . T TA . . . T . T . . A . . CGAT . . . . . . C . . . TCTTGTTTTATAATCATTTTAAACTCGGACAGTGATGACATTTATCATTC . A . G . . . . AAAATTGTT . . .
blockSeqs : . T AA . . . C . C . . A . . AAAC . . . . . . A . . . ATCTTGTTTTATACTGGTCTTAAATTCTGACAATGATGACATTTGTG . . . T . . . . AATTTTTTT . . .
blockSeqs : . T TT . . . A . T . . T . . AAA . . . . . . A . . . TTTCTTGTTTTACAATGACCTTAAATTCTGACGATGTATTTGTA . . . G . . . . AAGTT . . .
blockSeqs : . T TT . . . . . T . . T . . AAA . . . . . . T . . . . . . . . . AAGTT . . .
blockSeqs : . T . . . . . T . . G . . AT . . . . . . T . . . . . . . . ACAAT . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . C . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : GTACCATAATTAAT****************************** T**** *** AAAATTACAAGTT****************************
originalCons : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCCTATATCTAAACTGACACACGGGCGTAGACACGGGTGCG---GCA-TG-------GTGCG--------GTAT--------CAATAA---TT-A-T---------ATTGGTGCGGCAT-GCCGCACCAATAATT--TCAAA-A---C-TTTTCT--ACA--T--TTT------AGC------TN--AT-T-TCAAAA--CTT-TT---T-TACATT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T--T--C----T-T--G---C----T-A-AA-TC-A----TTTGTAA-A-A-TAAC-TATTA------ATANTAG-T--ACTT--A--T-TT-CG-ACGAC--TTGT---ATAAT---CTC--GG--CATT-CTGTA-G--ACTG--CCA--------CCACTGGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------AC------A-------C-AA-------T-------T-------TTGTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
finalCons : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCCTATATCTAAACTGACACACGGGCGTAGACACGGGTGCG---GCA-TG-------GTGCGGTACCATAATTAAT------------------------------ATTGGTGCGGCAT-GCCGCACCAATAATT--TCAAA-A---C-TTTTCT--ACAT----TTT------AGC------TN--AT-T-TCAAAA--CTT-TT---T-TACATT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T--T--C----T-T--G---C----T-A-AA-TC-A----TTTGTAA-A-A-TAAC-TATTA------ATANTAG-T--ACTT--A--T-TT-CG-ACGAC--TTGT---ATAAT---CTC--GG--CATT-CTGTA-G--ACTG--CCA--------CCACTGGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTC---T-------ACAAAATTACAAGTT----------------------------TTGTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
Alignments
lowQualScore : 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 6666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111111 1111111 1111 1111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111 11111111111
lowQualScore : 7 7 0 777 4 9999999999999999999999999999999999999999999999999999 3 2 0 1 6666666 6666 2 1111111 0 2 2 1 33 4444 888888888 777777 444 2 2 2222222 2 888 2 33 2 2 999999 2 2 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 44 555 11111111 1 2 5555 3 22 0 33 00000000000 33
lowQualScore : . . . ... . .................................................... . . . . ....... .... . ....... . . . . .. .... ......... ...... ... . . ....... . ... . .. . . ...... . . . ......................................................................................................................................... .. ... ........ . . .... . .. . .. ........... ..
lowQualScore : 3 3 7 888 4 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 7 1 1 1 2222222 1111 0 3333333 9 7 7 5 77 3333 999999999 777777 777 5 5 1111111 5 888 5 44 5 4 999999 4 4 5 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 66 666 22222222 2 7 7777 9 99 1 11 66666666666 11
consensus : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCCTATATCTAAACTGACACACGGGCGTAGACACGGGTGCG---GCA-TG-------G--------TGCG--------GT---A---CC------A------TAATTAATATTGGTGCGGCAT-------GC----CGCACCAATAATT--T---CAAA-AC-TTTTCT--ACA--T-TT------T--AGC------T--NAT-T-TCAAAA--CTT-TT---T-TACATT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T--T--C----T-T--G---C----T-A-AA-TC-A----TTTGTAA-A-A-TAAC-TATTA------ATANTAG-T--ACTT--A--T-TT-CG-ACGAC--TTGT---ATAAT---CTC--GG--CATT-CTGTA-G--ACTG--CCA--------CCACTGGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTCTACAAAATTACAAGTTTTGTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
Reference ( family-6105 ) : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCCTATATCTAAACTGACACACGGGCGTAGACACGGGTGCG---GCA-TG-------G--------TGCG--------GT---A---CC------A------TAATTAATATTGGTGCGGCAT-------GC----CGCACCAATAATT--T---CAAA-AC-TTTTCT--ACA--T-TT------T--AGC------T--NAT-T-TCAAAA--CTT-TT---T-TACATT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T--T--C----T-T--G---C----T-A-AA-TC-A----TTTGTAA-A-A-TAAC-TATTA------ATANTAG-T--ACTT--A--T-TT-CG-ACGAC--TTGT---ATAAT---CTC--GG--CATT-CTGTA-G--ACTG--CCA--------CCACTGGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTCTACAAAATTACAAGTTTTGTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
gi|1 : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTT
gi|1 : tCTCCCTATATCTAAACTGACACATGGACGTAGACACGGGTGCG---GCA-GG-------A--------TGCG--------GT-------CA------A------TGATTTATATTGGTTCGGCAT-------GC----CACACCAATAATT--T---TAAA-AC-TTTTCT--ACA--TGTT------T--AGC------T--AAT-T-TCAAAA--CTT-TTAACT-TACATT--TATT-TTGTATGCCACACC-AATAATTTCC---A--A-T-TT-T--T--C----T-TGCG---C----TAA-AA-TCGA----TTTGTAA-A-AGTAAC-TATTA------ATAGTAGTT--ACTT--A--TATT-CATAAAAC--TTAT---ATAAT---CTC--GGGACATTCCTGTACG--ACTG--CCA--------CCACTAGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTCTAC------ACAA--TTTGTAAAAGATTAAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgctccctatatctaaactgacacatggacgtagacacgggtgcggcaggatgcggtcaatgatttatattggttcggcatgccacaccaataattttaaaacttttctacatgtttagctaatttcaaaacttttaacttacatttattttgtatgccacaccaataatttccaatttttcttgcgctaaaatcgatttgtaaaagtaactattaatagtagttacttatattcataaaacttatataatctcgggacattcctgtacgactgccaccactagtgctgctcgttttaaagtctacacaatttgtaaaagattaagccgcaccaatatcaaattcgtgtctatct
gi|10 : tggtcaccaaccccgggtagtgtgtgtgtgtgggtgggtggggggggggggggggggggaggcgcgcgggggggggggggatcaaacgcactatatacacttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgTGCGGCATT------GC----CGCACCAATAATA--T---CAAA-AC-TTTT-------------------T--AGC------T--AAT--------A----T-TT---T-TAAATA--TATT-TTGTATGTCGAACC-AATCATTTCC---CATA-T-TT-T--T--C----A-T--G---TTTCAT-A-AA-T-------TTCTTAA-A-A-Tct
gi|10 : gtTCAT-TTTAGA----ATT-----GATTACAAGTTTTGTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------CCTACCATTAATTCGTctgacgatgatgacatttgtcattattgatgcattttcaatcaaatcaacatcattttagaattgattacaagttttgtaaaatatttagccgcacccctaccattaattcgt
gi|11 : gttgcggcattgccgcaccaataatatcaaaactttttagctaatatttttaaatatattttgtatgtcgaaccaatcatttcccatatttttcatgtttcataaatttcttaaaatctgacgatgatgacatttgtcattattgatgcattttcaatcaaatcaacaCATGAGCACAGACACGGGTACG---GCAATGCTTCACCA--------TGCC--------GT---A---CC------AA-----TAATTAATATTATCGAGGCAA-------GC----AGCACCAAAAATT--T---CAAA-AC-TTTTCT--ACAT-T-TT------T--AGC------T--TAT-T-TC-CGA--TTT-TT---T-T---TT--TGTTATTG-AGGTTGCACT-AA-AA---------------------------------------------A-AA------------GTAATA-G-TAAC-TAGCAAAACATACAGTAA-TG-ATTT--AT-T-TT-CGCACAAC--TGAT---ATACT---CTCTGGG--CATTCCTGTA-G--
gi|12 : ATGGGCGTAGGCACGGGTGCG---GCA-TG-------GTATGGCATTGCT--------GC---A---CC------AT-----TAATTAATACTGGTGAAGCAT-------TC----CGAACT--TTTTT--T--------AC-TTTT-T--ACA--TATA------T--AGC------T--TAT-T-TCCATA--CTT-TT---T-TACATT--T-TT-T--TATGCCGCA---AATAATTCCC---C--A-TACT-T--T--C----T-G--GTTTC----T-ATAA-TT-A----Tga
gi|12 : AT-------GC----CGCA--AATAATT--C---CCCATAC-TTT-CT--GGT--T-TC------T--A--------T--AAT-TATCG------TT-TT---C-TACATT--TATT-TTGTATGACGCACC-GATAAGTTCC---C--A-T-cgttttctacatttattttgtatgacgcaccgataagttcccat
gi|13 : atgggcgtaggcacgggtgcggcatggtatggcattgctgcaccattaattaatactggtgaagcattccgaactttttttactttttacatatatagcttatttccatacttttttacattttttt-T-TCAAA---CTC-TT---T-TACATT--TATT-CTGTATGCCGCACC-AATAATTTCCAATT--A-T-TT-T--T--C----T-T--G---CACT-T-A-AA-GCGA----TTTGTAA-ACG-TAAA-TATTA------ATAGTA----------------------AC-AC--TTGT---ATACT---CTC--CG-------------G--ACTG--CCA--------CCGCTGGTGTTACTCGT-TTTAAA----GTCTACAAAATTACAAATTTTGACAAATATTTAG-------CC-----------AATATCA--AATTCGAGT
gi|14 : GTACC-AATAATTTCCA--C--AAT-TT-T--T--T----T-T--T---C----T-------T-G----TTT-TA------TAAC-TAT--------------------CTT--AAAT-TC-GG-ACGA---TGGT----------------GG--CATT--TGTG-G--AGTG--CCG--------TCACTGATGCTGATCGT-TTTAAA----GTCTACAAAATT----GTTTTGTGAAATATTTCACCGGA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTtcacg
gi|15 : tttAT-------GC----CGCAACAATAATT--T---CAAA-AT-ATTTCT--ACA--T-TT------TGAAGC------T--TGTGT-TCAAA----CT-TT---T-TACATGCATATT-TTGCATGTCGCACCTACTAATTTCC---C--A-T-TT------------C-T--A---C----A-A-AA-TT-ACAAGTTTGCCA-A-A-TATT-TATTC------GTACCAA-T--ATCA--A--A-TT-CG-
gi|16 : C----CGCATCAATAATT--A---AATA-AT-TTCATT--ACA--T-TT---------AG-------T--TAT-T-TCCAAA--CGT-TT---T-GACATT--TATT-TTGTATGCCTCACC-AATGACTTTC---C--A-T-TT-TA-A--CAAAAT-T--G---C------A-AG-T-------TTTGTAA-A-A-TAtgtctac
gi|17 : CA--------CAACTGGTGCT---CGT-TTTAAA----GTTT-TAAAATAACAAGTTTTGTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATtatagccacagcaataccatgtctacgcc
gi|18 : G--CCA--------CCACGGGTGAT--------TTAAA----TTCCCCACAATTACAAGAGTTGTAAATTATTTAGCCACA--CC-----------AATATCA--AATg
gi|19 : GTGCTACTCGT-TTAAAA----GCCTACAAAAGTACAAGTTTTGTAAAATATTTAGCCG--------------------------AATTCGTGTCT
gi|2 : GGTCACCAACCCCGGGTAGTGTGTGTGTGTGGGTGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGCGCGGGGGGGGGGGGGATCAAACGCACTATATACACTTTTgcg
gi|2 : CTCCCTATATCTAAACTGACACATGGACGTAGACACGGGTGCG---GCA-GG-------A--------TGCG--------GT-------CA------A------TGATTTATATTGGTTCGGCAT-------GC----CACACCAATAATT--T---TAAA-AC-TTTTCT--ACA--TGTT------T--AGC------T--AAT-T-TCAAAA--CTT-TTAACT-TACATT--TATT-TTGTATGCCACACC-AATAATTTCC---A--A-T-TT-T--T--C----T-TGCG---C----TAA-AA-TCGA----TTTGTAA-A-AGTAAC-TATTA------ATAGTAGTT--ACTT--A--TATT-CATAAAAC--TTAT---ATAAT---CTC--GGGACATTCCTGTACG--ACTG--CCA--------CCACTAGTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTCTAC------ACAA--TTTGTAAAAGATTAAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgctccctatatctaaactgacacatggacgtagacacgggtgcggcaggatgcggtcaatgatttatattggttcggcatgccacaccaataattttaaaacttttctacatgtttagctaatttcaaaacttttaacttacatttattttgtatgccacaccaataatttccaatttttcttgcgctaaaatcgatttgtaaaagtaactattaatagtagttacttatattcataaaacttatataatctcgggacattcctgtacgactgccaccactagtgctgctcgttttaaagtctacacaatttgtaaaagattaagccgcaccaatatcaaattcgtgtctatct
gi|20 : ggtcaccaaccccgggtagtgtgtgtgtgtgggtgggtggggggggggggggggggggaggcgcgcgggggggggggggatcaaacgcactatatacacttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctggagagggtgtagcaatataaatagaaagttttgtaaataataaattgaatgtttattcgAATCCTCGGCCGCA--CC-----------AATATTA--AATTTGTGGCTAct
gi|21 : aggacgtacacgcatactatattGGTGTAGACACAGGTGCA---ACA-TG-------T--------TGCGGCATTGCTGT---A---CC------AG-----TAATTAA
gi|22 : AGTTTTGTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAT
gi|23 : GTTTTGTAAAATATTTAGCTGCA--CC-----------AATATCA--AATTCATGTCTATg
gi|3 : CTCCC-ATATCAAAGC-----CACGGGCGTAGACACGGGTACG---GCA-TG-------G--------TGCG--------GT---ATAGCC------GCAGCAGTAACTAATATTGGTGCGACAT-------GC----CTCGCCAGTATTT--T---CAAA-AC-TCTTCT--CCATGT-TT------T--AGC------T--AAT-T-TCAAAA--CTT-TT---TATACATT--TATT-TTGTATGCCGCACT-AGTAATGTCC---C--A-T-TTGT--T--C----T-T--G-----------------------TTT-TAT-A-A-TCAT-T-TTA------A-ACTCG-G--AC----A--G-T---G-ATGAC--ATTT---AT---------------CATT-C---------CTG--TCA--------TCACTGGTGCTGCTTGT-TTTAAA----GTCTACAAAATTACAAGTTTTGTAAAATGTTTACACGCATTTC------------ATAACA--TATTCGTGTCTAg
gi|4 : ataataaagttttaaccaaataCACGGACGTAGGTACGGGTGCG---TCA-TG-------G--------TGCG--------GTATAA---CCTCACCAA------TAAATATTATTGGTGAGGCATTGGTGTGGCATAACGCACCAATAATT--TAAAAAAA-AC-TTTTCT--CCC--C-TTTTTTTAT--AGC------T--AAT-T-TCCAAA--CTT-TT---T-TACATC--TAGT-TTGTATACCGCACC-AATAATTTCC---A--C-T-TT-T--T--A----T-T--G---T----T--------------TT--------A-TAAT-TAT--------------------CTTAAA--T-TC-GG-ACGACGATCGT---ATAAT---TTT---T--CATT-TT-T--G--ATT---------------CGTTGGTGCTGCTCTTATTTGAA----GTCT---AAATTTT--TTTTTGT-AAATAATAAGCCTCA--CA-----------GATATCA--AATCCGTGTCTAca
gi|5 : tGTGCGTACACA-TG-------G--------TGCG--------G---------G------A------TAA----------TGCGACAT-------GA----CG---CAATAATT-------A----------CT--ACA--T-TT----------GT------TACAAT-T-TCCAAA--CTC-GT---T-TACGTT--TATT-TTGTATGCCGCACC-AATAATGTCT---A--G-T-TT-T--TG-C---------G---C----T-A-AAGTCTA----TATGTAA-ACC-TAAA-TATTA------ACATTAA-TG-ACTT--T--T-TTACACACATC--TGGT---ATA--------------CGTT-C--AA-GCTACTA--CCA--------CCACTGTTGCTGCTCGT-TTTAAA----GTCTACACAAGTACAAGATTTGTAAAATATATAGCCTCA--CC-----------GATGTCG--ATTTTGCGTCTAcg
gi|6 : atT-------AC----TGCAT-AATA-TTGGT---CAAA-AC-TTTTTTTTATA--T-TT------T-----------T--TAT-T-CCAAA----TG-TT---T-GACATT--TATT-TTGTATGCT-CACT-GAT------C---T--A-T-AT-T-----A----T-A--A---T----T-A-GG-TC-A----CTGGCA------TGCCACATCA------ATAATTT-TCCATTT--T--T-TT-C---------TTGTTTTATAATTATCTT--AA---ATT-CTA-G-G--ACTG--CCA--------CCACTAATGCTGCTAGT-TTTAAA----GTCTACAAAATCACACGTTTTGTAAAATATTTAGCCGCA--CC-----------AATATCA--AATTTGTGTCTAcg
gi|7 : gcatagacacgggGGGCGTAGATATGGATGCG---TCA-TG-------G--------T-------------------------------------------AT------GGCATC------GT----CGCATCAATAATT--A---AAAA-AA-ATCTTA--ATA--T-TT------T--GGC------T--TAC-T-TCA-----TTTATT---T-TACATT--TATT-TTGTATGCCGCGTT-ATTAATTTCC---T--A-T-TT-C-----------------------------A-TC-------TTGT--------------TTT------ATACTGG-T---CTT--AAAT-TC-TG-ACAA-----------TGAT--------GA--CATT--TGTG-G--AAAA--TCA--------CCACTGATGCTGCTCGT-TTAAAA----GTCTCCAAAACTACACGTTTAGTAAATTATTTAGCTGTA--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTCTAcg
gi|8 : T-------GC----CGCATCAATGATT--T---TAAA-ACGTTTTCT--ACAT-T-TT------T--AGCTACATGT--GAT-T-TAAAAA--A-----------AAATT--AGTT-TTTTATGCCGCACC-AATTATTTCT---C--A-T-TT-TTAT--C----TGT--T---T----T-ACAA-TT-A----TCT-T-A-A-A-TAA---GTTA------A-A--------ACTT-----T-TT-TA-ACG----TT----------------------TATT-TTGTA-T--GCTGCACCAAAAATATTCCATT----TTTCTTGT-TTTA-------T------AATGACA-----TGTATAATA-TTATCCGCG--CC-----------AATATCA--AATTCGTGTC
gi|9 : caggcgtatacacggtGCATAAATGATT--T---TATA-AC-TTTGAT--ACAAAT-TT------T--AGC------T--AAT-T-TCCAAGGTTTT-TT---T-TACATT--CATT-T-GTATGCCACACC-AATAATTTCC---C--A-T-TT-T--TTTC----T-T--G-----------------------TTT-TAC-A-A-TGAC-C-TTA------A----------------A--T-TC-TG-ACGA----TGT---AT--------------------TTGTA-G--ACT---TCA--------TCACTTGTGCTGCTTGT-TTTAAAAAAAGTCTACAAAATTACCAGTTTAGTAAAATATTTAGCCGCA--CCAAGGCCATAAAAATATCA--AATTCGTGTCTAc