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Reference ( gi|5 ) : CCGTAATATGATACTGGT-AATTAAAAACAGTG-TAAAAT--CCAACACACTCACAGGTGGT-------CTCAAGAAGGCATTGACTTTTGGTTGGAAAT----------ATTTGACTGCTCTGC-TGGAGCAACTAACCTGAATTCATACT--AGTCATGAA-AGCTGATAATACCCATATATATTATAAGGTCTTCAAATCATCATTAATTAAAGTTCATGAAATTATCTTATGATTGATACTAAGCACTTTGTAGCAGATTAAAGAAATATAACACAAGACAATCAACTATAGCTGTTCTCCAATTACACCTGCTGTGCAGTTTTTCCCACTAGTAGTTGTAATAAAAGAAAAAGATGGGCATTGAGAATAGGATA-ATACAAGAGCTATCACAGATTAGTATGCTTGACTATATA---A----CAATTTCA--TTGAGTACAATATCATTTGTGGGCACCAGAAAATTGAAAGGTGCACTGAAATGATTTAATAAGCCTCATCAAG--TAA-GTCCA--ATAG-----TAGGGGGCATACCTTG-ATGAAAG-AT-AAAAGTAGATT------AATGTGAAACCAACA-GGAACCAT---CA-CAAAGACAT-----CCAAGCAC--A---------AGACA-AATACA-AGTAAC-TGTAAACCATGTTATATAACCAGTG---TCCTCTTCCTCCATATTGGAGCTTGCCATGTGACATTCAGGATATACTT-GGTTGAA-ATATGTAGGTACAATTGAAATGTAGGTTTT-----GAACTTTTAAAATAATCA-ATCAATTAGCCAATCAACCAATCACTATATTCTACTTAAAGGGCAACAGAGCATTTC---TGAATAGTCATGCGTAACATGAGTTAAGCCTGAACTTGGTGAAATTTACAAATTGTGATTGAAT-CACATGT
gi|9 : CCGTTATATATTACTGGT-AATAAAAAACAACAACAAAACAGCAAACGCACTCACAGATGGTATGAATATTCAGGGAGCCATTGAATTTCAGTTGGCAATGGGGATAAAAATTTGACTGCTCCGC-CGGA-TAATCAACTTGAAGTTATGCT--AATAACAAA-AGCTGATAATGGC--TATGTATTATAATGTCTTCAGATAATCAATTTTTAAAGTTTATGAAACTAAATTTTGATTAATATTAAGTACTTTGAAGCAGATTTA--AAATATAACACAAGGTA--CA---------------CAATT--ACCTATTGTGTAG-CTTTGCAACCTGTA----CAATAAAAGAA---------CATTGA-AACAACTCAGATACTAAACCTATCATAGTATAGAATACTATACAACAT----A----CAATTTCAGCTTCAATACAATATCAACTGTAGACATCTAAACCTTTAAAGTTGCACTGAAATGACTTAACGGG----A-AAAG--TAG-GTCC---ATAA-----T------------TTG-ATGAAAT-ATAAAAAATAAACA------AATATGA
gi|6 : ggatatagcaccgcatatattatgcatgtgttgatcctattcttattaaactagttacatgtggtatttagatggaggtcgtttacaatgaacttaggtcagcaatggtagagcctgcaaacgactgacctCCGTAATATGATACTGGT-AATTAAAAA-------------------ACG---ACGGTTGGTA------TTCCGGAAGACATTGACTTTCGGTTAGCAATGGGGATCAAAATCTGATCGCCCCGCATGGA--AACTCATCTAAA---ACACTTTAATCATGAA-GATCGATAATGCTCATATAT-TT-TAATATCTTCAAATCATCATTATTTAA-GTTCATGAAATTATCCTTCAAATGATACTAAGCACTTTGTAGCAGACT
gi|2 : caacaaggctattatggacggtacttgggtatcggcgaagtacttcttacggatctgtgtaagatatttgcctttcaatggtcgtttacttctgagtcagtgattctatttattatcgtatattggtgagaaagtgatcggtagttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaccacagagtccctctaaatgttataacaattactcgatgctaataatggttcgttgcattggtggtggaggaaaatcctggattaacttccgatctgtagatttttaatatttatgttaatgaatccacaatttagaagacctggatttgatttccggtcacgatgtatacaggaaattttgaaagtctacttgttttactacatgtatatagtacttccaaggagccgtgcataggtgctttacactatgaagaagggatgtagtactgcatatatgtttcctcgtgctgatcctatattttaaaactagttacatgtagtagcagatgctagtcgtttacagttaactgagatcaacactcgtacagcctgcgaaagggtggcacCCGTTATATGATACTGGT-AATTAGAAATA---------T-----ACACACCCATAGGTGGTA------TTCGAGAAGACGTTGGATTTCAGGTGTAG----------------------TC------------CTAATATGAATTCACGCT--AGTCATAAACAACTGATAATGCCCATGTAT--TACAATGTATTCAAATCATCATTAGTTA------------TTATCTTTTGATTAATATTAAGCACATTTCAGCAGATTAAAAA
gi|8 : tttcatgcatcttaaaccaggtttttaaactgagtgttgaccgttccagcagtactctgtgagtgtcttgtgcgtagatgtctgtgttttgtgtcctggtcctgtgtgtaaatgtttcatgtcggtttcatattatttacagtaaacatcttcttgtagaatacaaaaggctcaaccctacagacaccgataatgctattatgtacggatactggtagtagctggattttacttattacgagtctttatggtagcattttcaatgttcatttcgttataacccggtgattctacgtgtaatttattatcgtatattggtgggacagagattgacaaaacaccagtatggctgtttgctctggaggtggtggagttaattttgcgtccgatgtatctgcagattttgatctagtatttatgttaatagacccacattgaagaagaccttggttcattaccggtcatgataatgcgcattttgaaaaatcctatttgttttaccatatatttcttgttgagtctaccaggaagtcgtgcgtcgatgctttatatatactaattatgtgaaactagaaatatagtactacttatattatgttgtcacgtgctgatcctatatttttaaatattgtagctgtcggtcccttacagtgaactggggtcaccgctggaatggagctcagttacagcctacggaaggttgaccgATAAGATACTGGTAAATAAAAAATGGCA-TAA-------AAGACACGCACAAGTGAT-------GTTCAGGAGACATTGAATTTCGGTTGG
gi|7 : ataaagaaatgctcaagcttacatacaccgacaaggctattatggactgttattggtataagcgacatttcacctcttgtggtgctttatcttcgccttacaatgttcatttaatttttagttggtggtttatttattactgaatatttattcgttctaattagtgaaatagtggttgccagttggcagagacggatcttaaccacttgggtcacagaaacgctctaattatttcgttaaatattaatatagtttcgttgcactggcggtggatgaaactcacaatttattttgacttccggcggatgtgtagattttggtctagtgtttgtgttaactgatccgcaacacagaagacctggcttcgattatcggccacaataccgggaatgctgaaagacctatttgttttacccaaacagtgctcgttggacctttcagggagtcgtgcatcgaggctgtgcaatatgtgaaaaaagagtgtagtactacatatattatgttgtcacgtgctgatcctatgaaactagtgaggtagctgatgtcagtcgtttactgtgaactgatgtcagcacaaaattacccgaaaaactgacttccATACCAAGCACTTTGTATCAGTTCAGAGAAATATAACGCAAGGCAGTCATCT---------CCTCAATAGTACCTGTTGTGGAGTTTGTCTTACTTGTA----CATTAAACGAAAAAG-TAAACATTGAGAATA---------------------CGGA-----ACGCTTGGCTATACA---ATGAACACTTTCA--TTAAATA--ATATGATTTGTGGAGACTCGATAATTAAAAGGTACACTCAAG-GCTTTTCTTATCCT--TGAAACATAT-GTCCA--A---------AAGGGATTTACTTTG-ATGGAAC-AT-AAAAGTAAACA------AATGTAAACCCAACA-GGAAACAA---CA-TGCAGACAT-----CCAAGCAC--G---------AGGTA-AACACA-AGCAA-------ACTACAGTATATAACCAGAG---TCCTCTTCCTCCATATTGGAGGTTGCAATGTGACGCTCAGGGCATACTT-AGTTAAA-CTGTGTAGGT-CAATTGAAATGTAGGTTTT-----GAACTTTTAAAATAAGCA-ACCAATCAGCCAATCAACTAATCACTGTTTTCTATTTAAATGGCAACAGAACATTTC---TGAGTAGCCATGCGTTAAATGAGCTA----T--ACTTGGTGAAAATTGCGAATAGTAGCTGAAT--ACACGTtatagtggatc
gi|11 : TGCAGCTTTTCCCACTTGTA----CAAATAAAGAAACAGATTCACATTAATAATATGATA-ATACAAAA-CTATCAAGGAC-AGTACCCTTGACTAAACACCAA----CGATTTCA--TTGAAAACAATATCATGTTTGGACACCCAAAAATT-AAAGGTATACTGAAATGATTTAATTAACCT----AAA--AAA-GTCCA--A-A-------AGGGGGCATTCTTTG-ATGAAAG-AT-AAAAGTAAATA------AATGTAACACTACCA-AGAAACAA---CA-CAAAGACAC-----CCAAGCGC--A---------AGACA-GATACA-AG-A------AAACAACATTATATAACCAGAGTACTCCTCTTTGCCCATATTTGAG---GC----------TTAGTAAATACTTAGGTAGAG-CT-------TACAACTGAAATGTAGGTTTT-----GAACTTTTAGAATTAACA-ACCAATCAGTCAATTAACCAATCACAATATCCTACTT--AGAGCAGTGGAGCATTTTTAATGAATAGCCATGCGTAACATGAGCTAcacatagtgctaccgcacaattcaatcaataatgattgcgggcttcgagaggacagacaatatgtggtcacctaataagaataacaggtcggtgattaagtaggtgggtcattttcctacttgtcaaaacgggaagtatgaggtacatttgatgaggtagtcacaatgttacagacggtcatttacttcatactaactaattac
gi|10 : tttTGCAGCTTTTCCCACTTGTA----CAAATAAAGAAACAGATTCACATTAATAATATGATA-ATACAAAA-CTATCAAGGAC-AGTACCCTTGACTAAACACCAA----CGATTTCA--TTGAAAACAATATCATGTTTGGACACCCAAAAATT-AAAGGTATACTGAAATGATTTAATTAACCT----AAA--AAA-GTCCA--A-A-------AGGGGGCATTCTTTG-ATGAAAG-AT-AAAAGTAAATA------AATGTAACACTACCA-AGAAACAA---CA-CAAAGACAC-----CCAAGCGC--A---------AGACA-GATACA-AG-A------AAACAACATTATATAACCAGAGTACTCCTCTTTGCCCATATTTGAG---GC----------TTAGTAAATACTTAGGTAGAG-CT-------TACAACTGAAATGTAGGTTTT-----GAACTTTTAGAATTAACA-ACCAATCAGTCAATTAACCAATCACAATATCCTACTT--AGAGCAGTGGAGCATTTTTAATGAATAGCCATGCGTAACATGAGCTAt
gi|14 : tttCAAG--TACCGTCCATAATAGCCTTGTTGGGGGTCTTCTTCA-A--AAAG-AC-AAAAATAAA--------AATATGAAACCAACA-TGAATAATGAACA-CAAGGGCCTGGGAACAAAACAC--AGACACCCACAGACATAACACA-A-TCACAAGCAAACAA---TATATAACCAGAG---Tt
gi|17 : aggatccatggttcttacttttaagaggagggaaaatgaggtttggttcacctcaatcaatgtttcatatcacctgttacccatccggcaagtttatttaatgtttttggtgtcttttcTTGTATGAAAGGAT-TATAGTAGTTTTTCTTAAATATGAAACAAACT-GGAAACAT---CAACACATAGAA-----CCATACAC--A---------AGACA-CACTCACAG------GCAAACAAT---ATATAACCAGAG---TCggtatcggcgaagtacttcttacggatctgtgtaagatatttgcctttcaatggtcgtttacttctgagtcagtgattctatttattatcgtatattggtgagaaagtgatcggtagtt
gi|1 : attatctcctgcaagccaattcactgtttgtgatgcatttttATT------AATG--AAACCAACATGAAACCA-----A-C--AGACAG-----TCACGCACCTG---------ACACA-AACACA-AGCA----------CATTATATATAACCAGAG---Ttaaccaaagagagctcaaacctacaaccaaaagcaatgctattgtcatcggcgattattcataaagatctgtgttagatcttcgtctttcagtcgt
gi|20 : tgtaattgacatttttgaccttttagaaattgaccctggtcatgatttaacatccgaaaaatgcccttggtcattatttgacgttttaaaatgacacccggttacaaattggtgtaagaataactaaaccacatgcgtaaaaaagtgaccctctataaagaatgactcgtattttcaacttatgtctctcatacgtcatagaagatttgcattcttttaagttaggtcgtccgtccgtctgattgtctagtagtcataaaacatgtcatatcagaggaagaattagtttgactctcgtgctgcaaatatgacgacttttcagcttgtatttgtgatggaagagccaaggttcttcgggaattctttgcaggtacgaggggagcacccggataaacatgaacataatgtattatgtgatgtcttccaagcagtaaaaaatattcgtttttgagagttcgagtcctatgtacattggataatgatatacaaggacatttcatggcaatttctaattttaagaggaaggtaaaagtgggtttggtgcatgttaaacatggttttaaattgcaagttgccattttgcaaatgacaattccaaagcagttagcctccctctttagttattgaagtgtattttctATACTT-GGTTAAACAT-TGTAGGTATAAATGATATGTAGATTTT-----AAACCTTTATACTAATCG-ATC----AGTCAATGAATTAATtgttttggaggaaggccccaaaagcctctcctggtagaatatatagggaggtaactctgtatacaccgactaggtttgtatggacggttataggtataagcatgatttgacttttaacgtttctgtgatagattttcgcttttcaatattcgtcgggggttctatttattatcgtatatttgtgagctagtagttgatagttggcagagagaaatattgtaaccacatggtcaca
gi|12 : aggcaTAAA-ATGTGTACGTACA--T-AAATGTAGGCTTTTTTTAAAACTTTTACAATAA-CACATC--TT---TAAT--ACCAAT------ATTCTGCTTAAAAGGCAACCGGGCAATAC---TGAATGGT----CGTTACATGGGATA----T--ACATGGTGGAATATACGAATAGTAATTGAAT-ttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaattctacccaaagggcaacaaagcattaccgaaaggtcatgcgtaacatgagaatagtaattgaatacacctggtatag
gi|22 : AATGTAGGCTTT-----AAACTTATACAATAATCA------TT-----------CAATCA--ATATTCTACTTTAATAACAACTAAGCATTAC---TGAATAAACAAGCGTGTCA----TTAA--CTGTACTTGGTGAGACTTACAAAAGATAATTAAATACACacccctcataaaatgataccacacatgaaataaacacatacagacgggcggacgaacagacagaccaaaagacaagcagacgggaagattgacgggcggacatatgtgatcatatttcattaattacgtactgagatgactggtgattaagaagccttttagaaggagtcattttccgaaaaagttaaaatggggagtcaacattttatgaggggatcataattttaacagacggcagtcattttccgacaccaaataataaccgaagtcattatccaacagaagtcaaatatttacgttacaacggcactacc
gi|20 : gttacaatgggtaaatatATTCTACCCAAAGGGCAACAAAGCATTAC---CGAAAGGTCATGCGTAACATGAGctcacatagtgctacaac
13 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|3 ): TGTAAAAAATACCGGTGTAACGGACAATTTTGACCACCTTAGATTTTTTCCCCGTCAATAAATGACCCCCGGTATTTATTTGACGTTTGAAAATGACCCCCGGTCACAAATTGTAAAAATGACGACACTCCACTCGTAAAAGAATGACCTTTCCTATAAAAAATGAAACCCTATAAAGAAATGGCCCCTACTTGCAAGTCATGTCTATCACACATCATAGAATATTGTTTATATTTACTGTTGTAAGTTAGCTCATCCGTCCATTCGTCTATCTGAATGTCTAGTAGTCATAACACATGTCTTCTAAGAAGTCTAAGACTTTTCCACTTGTATTGGTGATGGAAATTGTTCTCCAGGAATTGTTTGCAGGTACGAGAGGGCACATGGAAAAACACGGACATTTGTAAACCTGCGTGATAGCTTATTAACGGTAAAAGGTGTTCGTTATGTGAAACTCGAGCTTTATGTGTAGTGTTCAGTGGTTTATAAAGAGATTATGACATTTTTTTTAATTTTAAAAGCGAGGTGGGGCATCTTTAACAGGATTCAAATCCCACGCAATTGATCCCTCTGGCCAGCTTATTTTGTTTTTGAGGTGTTTTGTTACTCTGGTTGTATATTGTTTGTTTGTGAATGTATCTTATGTTTTGTGCTCAGTGACTTGGGTTAACGATTCCAGTTTTTATATTTTTAATTTATCTTGGAGGAAAGCTCCCACAAGGTTATAATGGACGGTTATGAGTATTAGCGGAATTTGATTTCTGACGGATCTGTGTTAGATATTTTCTTTTCAATATTAGTTTAGTTTAGAGTCGGTGATTCTATTTCTTATTGTATATTGGTATGGGCAGGTTGA
Unaligned ( gi|4 ): ATTGTATCAGCACGCCGGTCTAACGTAGATTTTTGACCCCACTCTCCTCCTTTAGAAATCGACTTCCCGGTTATCATTACACTTACAGAAAGCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCGGTCACAAATTACTATAAAAATAAGGACACCACCGCGTAAAATGTGAAACCTCCTGTGAAAAGGTGCCCCCCACCCCCCAAAAAATAATGACCTCTTATTGCAATCCAGTTCCGTCCGTTGTCATATAGTCATAAAACATCTTGTCAGAGAAAGAATTGGTTAGCCTTCCATGTTACAAATAAGACGATTTGTTATGCTTGTCTTTGGAAGAGCAATACCTTCCAGGGAATTGTTTGCAGCTATGAGAGTCCACCCGGAATAAAACACGGGCATATTTCAAAGCAGAGGGAAGCTTTCTGACTGAAAAAAAGTATTTGTTCTGCGGAAGCTCGAGCCTATATACAGCGTGGTTGACAAAGACAATATACATGGATGACAATTTTTAATGGTGGTTAAATTGGGGTTTTGTACCTCTTATACCAGGTTTTGAATTCTTAGACACCGTTTGGCATTGGCCGTTCCAAGACGGTAACCGATTGTTTGCGTGTGAGTGTATCTGTGTGTCTGTGTTTTTGAGCTCTGTCCAGTGTGTAAAATGTTTCCTGTTGGTTTCATATATTTTATCTATATTTTGGAGGAATGTTCTTATAAGTCTCTCTTTATTACATAAAAAGTGCTAAAGTCAACATACACCAACAATTATGGACGGAGACCGGTAATGGCGGGATTTGACTTCTTACGGGTCTGTATCAGATCTTGGTCCTTTCACTGTTTGTTTAGTTTTGAATCGGTGATATTCCA
Unaligned ( gi|13 ): GTTACATCATCCGTTTGTTTGTCCGTCCGATTGTCATGTAGACATAACATATGTGTTATCAGAGGAAGAATTGGTTGCCATATTATAGACAACTTCTTGCTTGTAGTTGCATAGGAAGAACCAGTGCTCCCATGGATATACGGACATATTGTCAGGGCACCCAGAGATTTTTTGTAGGTTCGAGAGTGCAGCCGACATTGGAAGCTGAAGACACTATTCGTTCGGTGGACACTCGAGCACTTTATACAGCTTTGTTCACAAATGACTTCGTTTGACAATTTTTGGTTTTAAGAGGATGGTTAAGATTCGGTTCATCTTATACCAGGTTCGAAATCCTCAGTCGCCGTTTGGCAATTGGCCGTTCCAAGGTGGTACCTGATTGTTTGCATGTGAGTGTGTGTTGTGGTGGTTGGTTT
Unaligned ( gi|15 ): AAAAAAGTGACCACACCTGTGAAAAAGTGACCGCTATTCGCAGTTCATGTCTACCACACATCAGAGAAGATGTCTATTGTTTTAAGTTAAGTTGTCCGTGTGTTCGCCCGTCTGATTGTCTAGTAGTCATAAAACATGTCTTCTAGGAGGAAGAATTGTGTTACAAATATGACGACTTTTAGCTTGTATTTGTGATGGAAGAGCCATGGCTCTCCGGGAATTGGTTGCAGGCAAAAGAGGGCACCCGGATAAAAACACATATTCTAAACCTGCGTGATAGCTTCTTGACAGAAAAAGTGTTCGTTATGTGAGAGCTCGAGCCGTATGTACTGTTTGTAGTGGTTTATAAAGATATTATATGG
Unaligned ( gi|16 ): TCACTAATTTCCGTCAGAAAATGACCACCGGTCATTATTTGACGTTTGAAAATGACCCCCGGTCACAAATTACGATAACGACAACTGTAAGAAGGCGTAAAAGTGACACCTCCCGGGAAAACGTGACCCCCGATCACAATCATGTTTATCACAGCCCTTTATAGAAGATGTGTATTGGTTTAAGTTAGGATGTCCGTCTGTACGTCTTTCTGATTGCAAGGTAGTCATAAAACATGTCTTTTCAGAGGAAGCATTGGTAGTCTCTTGTGATCGTGTGGGAGTGCATTGAAAACCTTTACATCTTTTATTTTCATGAAA
Unaligned ( gi|18 ): GTAATGTACATTTTTGATCACTCTCAGAAATAGACTTCCGGGTCATTTTTTCACGATAGAAAATTACCCACGATCACAAATTGCTGTAAAAATGACGACACGCTACGCTTAAAAAAGTGACCCCTTCTGTTAAAAAGTGACCTCCAGTAAAATAATGACCCCTGTTCGCAATTCATGTCTATCACACATCATAGAAGATGTATATTGTTTTAAGTCAGGTTGTCTGTCTGTTTGT
Unaligned ( gi|19 ): TGTATGAACACGCCGGTGTAAAGGAAATATTTTACCCCCGTCAGAAATTGATCCTCGGTCAATATTTCCCGTCAGAAAATGACCCACGATCATAATTTGACGTTTGAAAATGACCTAATCAGAAATAGCTGTAAAAAACGACACTGTACGCGTAAAAATGTGATCTCCCCTGTTAAAAAGTGACCCACTAAAATATAATGACCCCA
Unaligned ( gi|21 ): TTGAGTCGGCGAAACTATTTATTACTGTATATTGGTGAGATAATAATTGGCAGTTGATAAAGAGAAATCTATACCATTTGGTCACAGATGTCCACTTAATACTAATCATTGCACTGGTGGTGGTGACGGATCTGTCCATTTCTAGTATTTATGTTAATGGGTCCACAA
Unaligned ( gi|23 ): AGAAGTGCCGTGTGACGTAAATAATTGACCCCCTCTCAGAAATTGACCCGGTCAATTATTTCCGCAAGTTAGAAAGTGACTCGGTCATTATTTGACGTTTGAAAATGACCCCATCCCCAGGTCACAAATTG
Unaligned ( gi|24 ): ACATAAAAGTGACCTCTCTTTCGAAAAAGTGACCGCTAATTAAATATGACCCCATATTCACAATTCATGTCTATCGCACCCAATAGAAGATGCCCATTGTTTTAAATTAGGTAGTCCGTTTGTTCGTC
Unaligned ( gi|25 ): AAGCTGTTATGGACGGTAAAACATGTAATTATTGGTATTAGAAGAGTTCGATTTCTTGTGGATCTGTGTTATATTTTTGCCCGTTCAATGTTCGTATTGTTTGTGTCGGTGA
Unaligned ( gi|26 ): AAGCTGTTATGGACGGTTATACATGTAATTATTGGTATTAGAGGAGTTCGATTTCCTGTGGATCTGTGTTATATTTTTGCCTGTTCAATGTTCGTATTGTTTGAGTCAGTG
Unaligned ( gi|27 ): GGTACTTTACACTGTAAAGAAGTGATTTAGTACTACTAATTGTATGTTGTCCCGTGCAGATACATTTTTTTTTAAAGCTAGTTACATGTGAT
Alignments
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12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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finalCons : CCGTNATATGATACTGGTAATTAAAAACGGCACAAAA---------------CACACNCACAGGTGGTAT------TCGAGAAGACATTGAATTTC-GGTTGGCAATGG-GGAT-AAAA-TTTGACCGCTCCGC-CGGA--AACTAACCTGAANTCACGCTAGTCATGAA-AGCTGATAATGCCCATGTAT-TTATAATGTCTTCAAATCATC-ATTATTTAA-GTTCATGAAATTATCTTTCGATTGATACTAAGCACTTTGTAGCAGATTAAAGAAATATAACGCAAGGCAGTCA----------CTCCCCAAT-GTACCTGTTGTGCAGCTTTTCCCACTTGTA----CAATAAAAGAAANAGATNNACATTGANAATA--TGATAATAC-AAAA-CTATCACGG-AC-AGTACGCTTGACTATACAAC-A-ACGATTTCA--TTGAATACAATATCATNTGTGGACACCCGAAAA---TT-AAA-GGTACACTGAAATGATTTAAT--TAACCT----AA-GTAN-GTCCA--ATA------TA-------GG---GGGCNTTCTTTG--------ATGAAAG-AT-AAAAGTAAAT------AAATGTGAAACCAACA----------------------GGAAACA------ACACANA-GACACCCA-AG-CAC--AAG--ACA---GAC--ACAAGCAAA-------CAA-CATTA--TATAACCAGAG---TCCTCTTCGCCCATATTNGAG-TTGC-A-TGTGACGCTCAGGAAATACTTAGGTTGAACTGTGTAGGTACAACTGAAATGTAGGTTTT-----GAACTTTTANAATAANCAACCAATCAGTCAATTAACCAATCACAATATTCTACTTAAAGGGCAACGGAGCATTNC---TGAATAGCCATGCGTAACATGAGCTA----T--ACTTGGTGAAATTTACGAATAGTAATTGAAT-ACACGT
12 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|27 ): GGTACTTTACACTGTAAAGAAGTGATTTAGTACTACTAATTGTATGTTGTCCCGTGCAGATACATTTTTTTTTAAAGCTAGTTACATGTGAT
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gi|20 : tttcatgcatcttaaaccaggtttttaaactgagtgttgaccgttccagcagtactctgtgagtgtcttgtgcgtagatgtctgtgttttgtgtcctggtcctgtgtgtaaatgtttcatgtcggtttcatattatttacagtaaacatcttcttgtagaatacaaaaggctcaaccctacagacaccgataatgctattatgtacggatactggtagtagctggattttacttattacgagtctttatggtagcattttcaatgttcatttcgttataacccggtgattctacgtgtaatttattatcgtatattggtgggacagagattgacaaaacaccagtatggctgtttgctctggaggtggtggagttaattttgcgtccgatgtatctgcagattttgatctagtatttatgttaatagacccacattgaagaagaccttggttcattaccggtcatgataatgcgcattttgaaaaatcctatttgttttaccatatatttcttgttgagtctaccaggaagtcgtgcgtcgatgctttatatatactaattatgtgaaactagaaatatagtactacttatattatgttgtcacgtgctgatcctatatttttaaatattgtagctgtcggtcccttacagtgaactggggtcaccgctggaatggagctcagttacagcctacggaaggttgaccgccgttatatgatactggtaattagaaatatacacacccataggtggtattcgagaagacgttggatttcaggtgtagtcAGGCAATACTT-GGTTAAACATTGTAGGTATAAATGATATGTAGATTTT-----AAACCTTTATACTAATCGATCAGTCAATGAATTAA
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Unaligned ( gi|18 ): GTAATGTACATTTTTGATCACTCTCAGAAATAGACTTCCGGGTCATTTTTTCACGATAGAAAATTACCCACGATCACAAATTGCTGTAAAAATGACGACACGCTACGCTTAAAAAAGTGACCCCTTCTGTTAAAAAGTGACCTCCAGTAAAATAATGACCCCTGTTCGCAATTCATGTCTATCACACATCATAGAAGATGTATATTGTTTTAAGTCAGGTTGTCTGTCTGTTTGT
Unaligned ( gi|19 ): TGTATGAACACGCCGGTGTAAAGGAAATATTTTACCCCCGTCAGAAATTGATCCTCGGTCAATATTTCCCGTCAGAAAATGACCCACGATCATAATTTGACGTTTGAAAATGACCTAATCAGAAATAGCTGTAAAAAACGACACTGTACGCGTAAAAATGTGATCTCCCCTGTTAAAAAGTGACCCACTAAAATATAATGACCCCA
Unaligned ( gi|21 ): TTGAGTCGGCGAAACTATTTATTACTGTATATTGGTGAGATAATAATTGGCAGTTGATAAAGAGAAATCTATACCATTTGGTCACAGATGTCCACTTAATACTAATCATTGCACTGGTGGTGGTGACGGATCTGTCCATTTCTAGTATTTATGTTAATGGGTCCACAA
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