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Reference ( family-5371 ) : TGAAAATGTTGCGGAAGATGAATTCCATTTTATCATTGAATGTAAAGCTTA--TAG--TNCTATAAGAGAGAAATAT--ATT----AAAAAA-TACTATACAAACAGAAGNAGC-----T-----A-A-TTTTT-AAAGTTAT--TGAAATCATCA-AAA--AAG-A--------AT--GTTAAATCTTTGTNAATTCATCGCAGAGGCATCTAAANTTAAAGAAANG----CAATACCGCTGAATAATGCACTTTGATTTCATCCTCAAACT-AAGAGT-AAATATTTAATTAAATATGTT-TTTGCTTCAATTCAT--ATATGACTTTT-ANATAAGAAACCTTACTGTAACATAACATAA---GACAACGATGTAAAGATTATA-TTGTTTGAAA-ACACCTATCAC--ATGTATTTG--TATAT----------GTATGTAATTTGTATTTGT--ATCTGATGAG-AAACTGTATACA-------GT-TTAA------------GTCAATAAAATTATGTT-CTGTTCTGTTC
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Reference ( family-5371 ) : TGAAAATGTTGTGGAAGATGAATTCCATTTTNTCATTGAATGTAAAGCTTA--TAG--TACTATAAGAGAGAAATAT--ATT----AAAAAA-TACTATACAAACAGAAGTAGCATGTTTA-A-TTTTT-AAAGTTATTGAAATCATCA-AA------AA--AGAATATGTTAAATCTTTGTAAATTCATCGCAGAGGCATCTAAAAT-TAAAGAAATG-----CAATACCGCTGAATAATGCACTTTGATTTCATCCTCAAACT-AAGAGT-AAATATTTAATTAAATATGTT-TTTGCTTCAATTCAT--ATATGACTTTT-ANATAAGAAACCTTACTGTAACATAACATAA---GACAACGATGTAAAGATTATA-TTGTTTGAAA-ACACCTATCAC--ATGTATTTG--TATAT----------GTATGTAATTTGTATTTGT--ATCTGATGAG-AAACTGTATACA-------GT-TTAA------------GTCAATAAAATTATGTT-CTGTTCTGTTC
gi|1 : TGAAAATATTTGGGAAAATAAATTACATTTTATCTTTGCATGTAAA---TAAGTAGACTACTATGAGAGAACAATATTTATT----AAAAAAATACTAAATGAACAGAAGTAGCATTTTTA-A-TTTTTTAAAATTATTGCTTTCAACA-AA------AA--AGAATATGTCAAATCTTTGTAAATTCATCGCAGAGACATCTAAACT---ACGAAAGG-----CAATACCGCTGAGTAATGCA------TTTCATCCTCAAACT-GAGAGTCAAATATTTAATTAAATATGTC-ATAGTTTCACTTCAT--ATGTGACTTTT-AAATAAAATACCTTACTGTGACAAAATATAA---GACAACGATGCTTATATTATA-TAGTTTTAGA--CAC-----AT--ATGGATTTG--TATAT----------GTATGTTATTTGTACTTGT--GTCTGATAAG-AATCTGTATACA-------GC-TTAA------------GTCAATGAAATTTTGTT-CTGTTCTG
gi|10 : gttttttgatatcggaattaagcataaattattgtgatcaaaatattaaaacaccttttggttatgaattgtttaaaaatgttataactacaaaaagaagcatatactgtttaactaagattcatatttactctcatcatttcaaataaagaaaaaaagatgctacacagagactagagagactttgaatatagtgggaATTTAATCCTCAAACT-AAGAGT-AAATATCTAATTAGGTATGTT-TTTGCTTTAATTCGTTTATGTGACTTTTTAGATAAGAAGCCTTTTTTTCACATAACATAA---TACAACGATGTAAAGATTATA-TTATTTGAAA-CC-CCTATCAC--ATGTATGTG--TATAT----------GTATGCAATTTGTATTTGT--ATCGGAAAAG-AATCTGTATACA-------GT-TAAA------------GTCAATAAAAGTATCTT-TTATTC
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gi|4 : tataaacTGAAAATGTTGTGAAAGGTTAATTCCATTTTCTCATTGAATATAAAGCGTA--CAG--CACTCTTAGAGATAA-TGT--ATT----ACAAA--TACTATACAAACAGATGTTGCATGTTTA-AATTTGT-AAAGCTATTGAAATCCTCA-AA------AACAAGAAT--GACAAATCTTTGTCAATTCATCGCAGAGGCATCTAAAAT-
gi|5 : tacaaaaatatcaaaaatacattttggttatgaaaattatttaaatgttattactacaaaaagttataacgtttaacttcgattcgtgttttcgctcataatttgaaaacagaaacaaaaatatatactagacagagactagagagaaaagatggacattgtgtacttcgcgaAATTCCATTTTATCATTGGATGTAAAGTTTA--TAG--TTCTATAAGAGTTAATTAT--ATT----TAAAAA-TACTTTACAAACAGAAGTAACATGTTTATA-TGTTT-AAAGTAATTGAAATCATAA-AA------AA--TGTATATGTTAAATCTTTGTAAATTCATCTTAGAGGCATCTAAAAT-T--AGAAACG-----CAATACCGCTGAATAATGCACTTTGATTTCATCCTCAAGCT-TAGAGT-AAATATATATTTAAATAT-TT-TTTGATTCAATTCAT--ATATGACTTTT-AAATAAGAAACCTTACAG-----TAACATAA---GACAACGATGTAAAGATTATA-TTa
gi|6 : CAGAAATAGTTTGCTTA-A-ATTT----A--TATTGAAATCCCCC-CA------AA--ATAGT---TTAAATCTTTGTAATTTAATCACAATGTTATCCGA--TGTAAAAACATA-----CAATGCTGCTTAATAA-GTACTTTGTTTTCATTCTAAATTT-AAGAGT-AAATATTTAGTTATGT-TGCT-TTTGCTTCAATTCGT--TTAGGAa
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gi|8 : cttGCTAAATAATGCAATTTGATTTCATCCTTAAACT-AAGAGT-AAATATTTAATTAATTATGTT-TTTGCTTCAATTCAT------GATTTTT-AAAAAAGAAACCTAACCGTAACATAACATAA---GTCAACGATGTAAAATCTATA-TTGTCTACAT-ACACCCATCAC--ATGTATTTG--TCTAT----------TTATATCATTTGTATTTGA--ATCTGATGAG-AAAATATAAATA-------GT-TTAA------------ATCTATATACTTATGTT-TTGTTTTG
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