lowQualScore : 1 444444
lowQualScore : 3 6 33 2 2 555555
lowQualScore : . . .. . . ......
lowQualScore : 7 0 11 5 5 999999
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGNTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAGG-GTTTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
Reference ( gi|1 ) : GGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAGTAATACGTTTGTATAAATGCGACGTGACTGATGCCGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAGGTGTTTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|2 : TATAGTAATACGTTTGTATAAATGCGACGTAACTGATGCTGAAGACGCCATTTTC--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTAATCACATTGAGGACTATCGGCAAAAATGAGGTG-TTTTTTTTCAGTCTTATTATT
gi|7 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CGTGATACTGATAGCTGGTCATCAGCTCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAGTTGTTGTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|3 : agtctttcttagtcctgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATTACTGCGACATGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGGTAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAGG---TTTTTTTTCAGACTTGCTATTAcggc
gi|8 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGCTGGTCATCAACTCATCAAATTGAGGACAATCTGTAAAAGTGAGTTG--TTTTTTTCAATCTTATTATTA
gi|5 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATGACTGCAACGTGACTGATGCTGAAGACGTCATTTTT--CCTAATACTGATAGCTGGTCATCAACTCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAGG----TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|4 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATGACTGCAACGTGACTGATGCTGAAGACGTCATTTTT--CCTAATACTGATAGCTGGTCATCAACTCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAGG----TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|6 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGGCGTGACTGACGCTGAAGACATCATTTTT--TCTAATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACGTTGTGGACAATCGGCAAAAGTGAG-----TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|11 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGTCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTTGTCACATTGAGGACAAACGGCAAAAGTGAGG-GTTTTTT
gi|9 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACATGAATGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGACAGCTGGTCATCAACTCGTCAAATTGAGGACAATCGGCGAAAGTGA---GTTTTTTTT----TCTTATTATTA
gi|10 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAAAACGTTTGTATAACTGTGACGTGACTGATGCTGAAAACAACATTTTT--CCTGATACTGGTAGGTTGGCATCAGCTTATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG-----TTAATTTCAGTCTTATTATTAcggc
gi|12 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTTTATCTGTGACGTGACTGATGATGAAGACACCATTTTT--TCTGATACTGATAGGTGGTCATGAGATCACCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG------TTTATTCAGTCTTATTATcggc
gi|13 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGAATAACTGCGACGAGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGCTGGTCATCTACTCATCA----------AATCGGCAAAAGTGAG-----TTTTTTTCAGTCTTATTATTAaacggc
gi|15 : ggtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACTTTTGTATAACTGCGACGTGGCTGGTGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGAAACTGATAGCTGGTCATCAATTCATCACATTGAGGACAAGCGGCAAAAGcggc
gi|16 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTTTGACTGCAACGTGACCGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAGCTCATCACATTGAGGACAATCG
gi|14 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGAAGTGGTTGATGCTGAAGACGCCATTTT---CCTAATACTGATAGGTAGTCATCAACTCA--------------ATCGGCAAAAGTGA-GT-TTTTTTTTTCAATCTTATTATTA
gi|17 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACATTTGTATAACTGGGACGTAACTGGTACTG
gi|18 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTAGTAATACCTTTGTATAACTGCCACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGCTGTTCATCATCTCATAACCTTGAGGACAATTGGCAAAAGTGAGTTG-TTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|19 : TTTGTATAACTGCGACGTGATTGATGCTGAAGACGCCATTTTTTTCTTAATACTGATCGCTGGTCATTAAATCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGA---GTTTTTTAT---GTCTTTTTATTA
gi|20 : ACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGAAAAAAGTGA----TTTTTca
Alignments
lowQualScore : 33333333
lowQualScore : 22 1 1 66666666
lowQualScore : .. . . ........
lowQualScore : 99 0 8 11111111
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG-G--TT-TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
Reference ( family-5183 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGNTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG-G-GTT-TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|1 : TGTAGTAATACGTTTGTATAAATGCGACGTGACTGATGCCGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG-GTGTT-TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|10 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAAAACGTTTGTATAACTGTGACGTGACTGATGCTGAAAACAACATTTTT--CCTGATACTGGTAGGTTGGCATCAGCTTATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG-------TTAATTTCAGTCTTATTATTA
gi|11 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGTCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTTGTCACATTGAGGACAAACGGCAAAAGTGAG-G-GTT-TTTTcggc
gi|12 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTTTATCTGTGACGTGACTGATGATGAAGACACCATTTTT--TCTGATACTGATAGGTGGTCATGAGATCACCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--------TTTATTCAGTCTTATTAT
gi|13 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGAATAACTGCGACGAGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGCTGGTCATCTACTCATCA----------AATCGGCAAAAGTGAG-------TTTTTTTCAGTCTTATTATTAaacggc
gi|14 : ggtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGAAGTGGTTGATGCTGAAGACGCCATTTT---CCTAATACTGATAGGTAGTCATCAACTCA--------------ATCGGCAAAAGTGA--G-TTT-TTTTTTTCAATCTTATTATTAcggc
gi|15 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACTTTTGTATAACTGCGACGTGGCTGGTGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGAAACTGATAGCTGGTCATCAATTCATCACATTGAGGACAAGCGGCAAAAG
gi|16 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTTTGACTGCAACGTGACCGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAGCTCATCACATTGAGGACAATCG
gi|17 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACATTTGTATAACTGGGACGTAACTGGTACTG
gi|18 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTAGTAATACCTTTGTATAACTGCCACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGCTGTTCATCATCTCATAACCTTGAGGACAATTGGCAAAAGTGAG-T-TGT-TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|19 : TTTGTATAACTGCGACGTGATTGATGCTGAAGACGCCATTTTTTTCTTAATACTGATCGCTGGTCATTAAATCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGA----GTT-TTTTAT---GTCTTTTTATTA
gi|2 : TATAGTAATACGTTTGTATAAATGCGACGTAACTGATGCTGAAGACGCCATTTTC--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTAATCACATTGAGGACTATCGGCAAAAATGAG-G-TGT-TTTTTTTCAGTCTTATTATTca
gi|20 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGAAAAAAGTGA-----TT-TTT
gi|3 : atTGTAGTAATACGTTTGTATTACTGCGACATGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGGTAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG-G---T-TTTTTTTCAGACTTGCTATTA
gi|4 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATGACTGCAACGTGACTGATGCTGAAGACGTCATTTTT--CCTAATACTGATAGCTGGTCATCAACTCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG-G-----TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|5 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATGACTGCAACGTGACTGATGCTGAAGACGTCATTTTT--CCTAATACTGATAGCTGGTCATCAACTCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG-G-----TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|6 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGGCGTGACTGACGCTGAAGACATCATTTTT--TCTAATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACGTTGTGGACAATCGGCAAAAGTGAG-------TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|7 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CGTGATACTGATAGCTGGTCATCAGCTCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAGTT-GTT-GTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|8 : agtctttcttagtcctgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGCTGGTCATCAACTCATCAAATTGAGGACAATCTGTAAAAGTGA----GTTGTTTTTTTCAATCTTATTATTAcggc
gi|9 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACATGAATGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGACAGCTGGTCATCAACTCGTCAAATTGAGGACAATCGGCGAAAGTGA----GTT-TTTTTT----TCTTATTATTA
Alignments
lowQualScore : 222222
lowQualScore : 22 1 1 666666
lowQualScore : .. . . ......
lowQualScore : 99 8 8 444444
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--GT-TTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
Reference ( family-5183 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--GT-TTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|1 : TGTAGTAATACGTTTGTATAAATGCGACGTGACTGATGCCGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAGGTGT-TTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|10 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAAAACGTTTGTATAACTGTGACGTGACTGATGCTGAAAACAACATTTTT--CCTGATACTGGTAGGTTGGCATCAGCTTATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG------TTAATTTCAGTCTTATTATTA
gi|11 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGTCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTTGTCACATTGAGGACAAACGGCAAAAGTGAG--GG-TTTTTTcggc
gi|12 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTTTATCTGTGACGTGACTGATGATGAAGACACCATTTTT--TCTGATACTGATAGGTGGTCATGAGATCACCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG-------TTTATTCAGTCTTATTAT
gi|13 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGAATAACTGCGACGAGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGCTGGTCATCTACTCATCA----------AATCGGCAAAAGTGAG------TTTTTTTCAGTCTTATTATTAaacggc
gi|14 : ggtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGAAGTGGTTGATGCTGAAGACGCCATTTT---CCTAATACTGATAGGTAGTCATCAACTCA--------------ATCGGCAAAAGTGAG--TT-TTTTTTTTCAATCTTATTATTAcggc
gi|15 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACTTTTGTATAACTGCGACGTGGCTGGTGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGAAACTGATAGCTGGTCATCAATTCATCACATTGAGGACAAGCGGCAAAAG
gi|16 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTTTGACTGCAACGTGACCGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAGCTCATCACATTGAGGACAATCG
gi|17 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACATTTGTATAACTGGGACGTAACTGGTACTG
gi|18 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTAGTAATACCTTTGTATAACTGCCACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGCTGTTCATCATCTCATAACCTTGAGGACAATTGGCAAAAGTGAG--TTGTTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|19 : TTTGTATAACTGCGACGTGATTGATGCTGAAGACGCCATTTTTTTCTTAATACTGATCGCTGGTCATTAAATCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGA---GT-TTTTTAT---GTCTTTTTATTA
gi|2 : TATAGTAATACGTTTGTATAAATGCGACGTAACTGATGCTGAAGACGCCATTTTC--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTAATCACATTGAGGACTATCGGCAAAAATGAG--GTGTTTTTTTTCAGTCTTATTATTca
gi|20 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGAAAAAAGTGA----T-TTTT
gi|3 : atTGTAGTAATACGTTTGTATTACTGCGACATGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGGTAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--G--TTTTTTTTCAGACTTGCTATTA
gi|4 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATGACTGCAACGTGACTGATGCTGAAGACGTCATTTTT--CCTAATACTGATAGCTGGTCATCAACTCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--G---TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|5 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATGACTGCAACGTGACTGATGCTGAAGACGTCATTTTT--CCTAATACTGATAGCTGGTCATCAACTCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--G---TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|6 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGGCGTGACTGACGCTGAAGACATCATTTTT--TCTAATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACGTTGTGGACAATCGGCAAAAGTGAG------TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|7 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CGTGATACTGATAGCTGGTCATCAGCTCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAGTTGT-TGTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|8 : agtctttcttagtcctgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGCTGGTCATCAACTCATCAAATTGAGGACAATCTGTAAAAGTGAG--TT-GTTTTTTTCAATCTTATTATTAcggc
gi|9 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACATGAATGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGACAGCTGGTCATCAACTCGTCAAATTGAGGACAATCGGCGAAAGTGA---GT-TTTTTTT----TCTTATTATTA
Alignments
lowQualScore : 222222
lowQualScore : 22 1 1 666666
lowQualScore : .. . . ......
lowQualScore : 99 8 8 444444
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--GT-TTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
Reference ( family-5183 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--GT-TTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|1 : TGTAGTAATACGTTTGTATAAATGCGACGTGACTGATGCCGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAGGTGT-TTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|10 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAAAACGTTTGTATAACTGTGACGTGACTGATGCTGAAAACAACATTTTT--CCTGATACTGGTAGGTTGGCATCAGCTTATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG------TTAATTTCAGTCTTATTATTA
gi|11 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGTCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTTGTCACATTGAGGACAAACGGCAAAAGTGAG--GG-TTTTTTcggc
gi|12 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTTTATCTGTGACGTGACTGATGATGAAGACACCATTTTT--TCTGATACTGATAGGTGGTCATGAGATCACCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG-------TTTATTCAGTCTTATTAT
gi|13 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGAATAACTGCGACGAGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGCTGGTCATCTACTCATCA----------AATCGGCAAAAGTGAG------TTTTTTTCAGTCTTATTATTAaacggc
gi|14 : ggtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGAAGTGGTTGATGCTGAAGACGCCATTTT---CCTAATACTGATAGGTAGTCATCAACTCA--------------ATCGGCAAAAGTGAG--TT-TTTTTTTTCAATCTTATTATTAcggc
gi|15 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACTTTTGTATAACTGCGACGTGGCTGGTGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGAAACTGATAGCTGGTCATCAATTCATCACATTGAGGACAAGCGGCAAAAG
gi|16 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTTTGACTGCAACGTGACCGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAGCTCATCACATTGAGGACAATCG
gi|17 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACATTTGTATAACTGGGACGTAACTGGTACTG
gi|18 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTAGTAATACCTTTGTATAACTGCCACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGCTGTTCATCATCTCATAACCTTGAGGACAATTGGCAAAAGTGAG--TTGTTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|19 : TTTGTATAACTGCGACGTGATTGATGCTGAAGACGCCATTTTTTTCTTAATACTGATCGCTGGTCATTAAATCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGA---GT-TTTTTAT---GTCTTTTTATTA
gi|2 : TATAGTAATACGTTTGTATAAATGCGACGTAACTGATGCTGAAGACGCCATTTTC--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTAATCACATTGAGGACTATCGGCAAAAATGAG--GTGTTTTTTTTCAGTCTTATTATTca
gi|20 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGAAAAAAGTGA----T-TTTT
gi|3 : atTGTAGTAATACGTTTGTATTACTGCGACATGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGGTAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--G--TTTTTTTTCAGACTTGCTATTA
gi|4 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATGACTGCAACGTGACTGATGCTGAAGACGTCATTTTT--CCTAATACTGATAGCTGGTCATCAACTCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--G---TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|5 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATGACTGCAACGTGACTGATGCTGAAGACGTCATTTTT--CCTAATACTGATAGCTGGTCATCAACTCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--G---TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|6 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGGCGTGACTGACGCTGAAGACATCATTTTT--TCTAATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACGTTGTGGACAATCGGCAAAAGTGAG------TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|7 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CGTGATACTGATAGCTGGTCATCAGCTCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAGTTGT-TGTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|8 : agtctttcttagtcctgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGCTGGTCATCAACTCATCAAATTGAGGACAATCTGTAAAAGTGAG--TT-GTTTTTTTCAATCTTATTATTAcggc
gi|9 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACATGAATGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGACAGCTGGTCATCAACTCGTCAAATTGAGGACAATCGGCGAAAGTGA---GT-TTTTTTT----TCTTATTATTA
blockSeqs : TT G C TTGTT
blockSeqs : . G C TTGT
blockSeqs : . G C GTGT
blockSeqs : . C C GGT
blockSeqs : . G C TTT
blockSeqs : . C C GTT
blockSeqs : . G A TTG
blockSeqs : . C C GTT
blockSeqs : . C C TT
blockSeqs : . G C GT
blockSeqs : . G A G
blockSeqs : . G A G
blockSeqs : . C C .
blockSeqs : . C A .
blockSeqs : . G A .
blockSeqs : . C A .
blockSeqs : . C .
blockSeqs : . C .
blockSeqCons : GTT***
originalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--GT-TTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
finalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAGGTT---TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
Alignments
lowQualScore : 222222
lowQualScore : 22 1 1 666666
lowQualScore : .. . . ......
lowQualScore : 99 8 8 444444
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--GT-TTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
Reference ( family-5183 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--GT-TTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|1 : TGTAGTAATACGTTTGTATAAATGCGACGTGACTGATGCCGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAGGTGT-TTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|10 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAAAACGTTTGTATAACTGTGACGTGACTGATGCTGAAAACAACATTTTT--CCTGATACTGGTAGGTTGGCATCAGCTTATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG------TTAATTTCAGTCTTATTATTA
gi|11 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGTCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTTGTCACATTGAGGACAAACGGCAAAAGTGAG--GG-TTTTTTcggc
gi|12 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTTTATCTGTGACGTGACTGATGATGAAGACACCATTTTT--TCTGATACTGATAGGTGGTCATGAGATCACCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG-------TTTATTCAGTCTTATTAT
gi|13 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGAATAACTGCGACGAGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGCTGGTCATCTACTCATCA----------AATCGGCAAAAGTGAG------TTTTTTTCAGTCTTATTATTAaacggc
gi|14 : ggtagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGAAGTGGTTGATGCTGAAGACGCCATTTT---CCTAATACTGATAGGTAGTCATCAACTCA--------------ATCGGCAAAAGTGAG--TT-TTTTTTTTCAATCTTATTATTAcggc
gi|15 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACTTTTGTATAACTGCGACGTGGCTGGTGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGAAACTGATAGCTGGTCATCAATTCATCACATTGAGGACAAGCGGCAAAAG
gi|16 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTTTGACTGCAACGTGACCGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAGCTCATCACATTGAGGACAATCG
gi|17 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACATTTGTATAACTGGGACGTAACTGGTACTG
gi|18 : ggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTAGTAATACCTTTGTATAACTGCCACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGCTGTTCATCATCTCATAACCTTGAGGACAATTGGCAAAAGTGAG--TTGTTTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|19 : TTTGTATAACTGCGACGTGATTGATGCTGAAGACGCCATTTTTTTCTTAATACTGATCGCTGGTCATTAAATCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGA---GT-TTTTTAT---GTCTTTTTATTA
gi|2 : TATAGTAATACGTTTGTATAAATGCGACGTAACTGATGCTGAAGACGCCATTTTC--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTAATCACATTGAGGACTATCGGCAAAAATGAG--GTGTTTTTTTTCAGTCTTATTATTca
gi|20 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGAAAAAAGTGA----T-TTTT
gi|3 : atTGTAGTAATACGTTTGTATTACTGCGACATGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGGTAGGTGGTCATCAACTCATCACATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--G--TTTTTTTTCAGACTTGCTATTA
gi|4 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATGACTGCAACGTGACTGATGCTGAAGACGTCATTTTT--CCTAATACTGATAGCTGGTCATCAACTCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--G---TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|5 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATGACTGCAACGTGACTGATGCTGAAGACGTCATTTTT--CCTAATACTGATAGCTGGTCATCAACTCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAG--G---TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|6 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGGCGTGACTGACGCTGAAGACATCATTTTT--TCTAATACTGATAGGTGGTCATCAACTCATCACGTTGTGGACAATCGGCAAAAGTGAG------TTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|7 : gnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CGTGATACTGATAGCTGGTCATCAGCTCATCAAATTGAGGACAATCGGCAAAAGTGAGTTGT-TGTTTTTTCAGTCTTATTATTA
gi|8 : agtctttcttagtcctgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACGTGACTGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGATAGCTGGTCATCAACTCATCAAATTGAGGACAATCTGTAAAAGTGAG--TT-GTTTTTTTCAATCTTATTATTAcggc
gi|9 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTAGTAATACGTTTGTATAACTGCGACATGAATGATGCTGAAGACGCCATTTTT--CCTGATACTGACAGCTGGTCATCAACTCGTCAAATTGAGGACAATCGGCGAAAGTGA---GT-TTTTTTT----TCTTATTATTA