lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111111 11 1 22222222222222222 222222 1 1 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 222 1 111 2222222 555555555555555555555555555 4444444444444444444444444444444444444444444 111111 55555555555555555555555555555555 3 1 1 11111 11 1 1 111
lowQualScore : 0 5 3 2222222222 3 4444 888888 22 2 22 2 6 4 2 22 666666 4444 2 1 2 11111111111111111 666666 7777777 1 1 33 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 66 666666 2 66 2 222 2 2 888 0000000 444 444444444444444444444444444 2 333 77777777 6666666666666666666666666666666666666666666 55 777777 1 3 222 1 222 88888888888888888888888888888888 333 2 1 3 22 2 22 222 00000 5555555 44444 1 1 22 22 1 4 2 3 77 666 2 5
lowQualScore : . . . .......... . .... ...... .. . .. . . . . .. ...... .... . . . ................. ...... ....... . . .. .................................................................................................................. . .. ...... . .. . ... . . ... ....... ... ........................... . ... ........ ........................................... .. ...... . . ... . ... ................................ ... . . . .. . .. ... ..... ....... ..... . . .. .. . . . . .. ... . .
lowQualScore : 8 0 2 2222222222 1 5555 777777 44 0 66 8 5 8 1 99 111111 5555 1 5 1 88888888888888888 444444 2222222 4 8 11 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 33 111111 1 44 1 222 4 0 555 4444444 111 555555555555555555555555555 2 555 22222222 6666666666666666666666666666666666666666666 00 000000 8 6 333 7 999 22222222222222222222222222222222 999 0 6 0 22 3 22 999 22222 9999999 55555 8 8 55 22 9 1 1 7 88 444 4 3
consensus : GTCTCCATTCAAAA-TGCCGAAC-T------AA--C-AT----TTTG-GG-TATTTTCGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGAAGTTCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACG-AA-GT---------TG---ATAT----CCA-------ATCAGAACAGGTCATTT--TGA--CCA--T-GT------G-AN-------C-------A--------------AAN-GT-------A-----------CGA-A--------C---T-G--C--A----A-----TATTAAAATGCCGAACATA------CAAC-T-TT-TTN-AGGCTGAAATG-CCGAAG--TAATATCAAAATTGAGGAC---ATTTTTC---AT----TAAAAAG---N-----A----C-C-TGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGTTTCTACTACAA--ACTA----G----TACTC----T-GCTGT--NAAAA--T--G-A-T-A-CAATG--TAACG-TTG---GAAT---ACC---T---TTA-T--TT--TTT-CTA-AATACAAGT-TTTCAGGTCT-GTAATTA--TCA--AACTATTTG---AGAAA--ATTATAT-------T-----T-T-T--GTTCCTCCT-GAAAAGTTTGTATTTTGT-TAGTT-CGCCA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
Reference ( gi|8 ) : GTCTCCATTTAAAA-TGCCGAAC-T------AA--C-AT----TTTA-GG-CATTTTCCATATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGATGTCCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACAACG-AA-CT---------TA---ATAA----TCA-------ATCAGAACATGTCTTTT--TTT--CCC--T-GT------G-AT-------C-------A--------------AAG-GT-------A-----------CGA-G--------C---T-G--C--C----A-----TATTAAAATGCTAAACATA------CAAC-T-AT-TTG-AGGCTGAAATG-CAGAAG--AAATATCAAAATTGAGGAT---ATGTTTC---AT----TCAAAAG---G-----A----C-C-TGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGTTTGTACAACAA--ACTT----G----TAGTC----T-TCTAT--TAAAA--T--G-A-T-A-CAATG--TAATG-TTG---GAAT---GCC---T---TGA-T--GT--TTGACCA-AATACAAGT-TTTCAGG-CT-GTAAGTA--TAA--AACTATTTG---AGAAA--GTTATAT-------T-----T-T-T--GTTTTTCCT-GAAACGTTTGTATTTTGT-TACTT-TGCAA-TTTTGAATGGAG-A-CAAT
gi|4 : GTCTCCATTAAAAA-TGCCAAAC-TTTACTTAC--C-AC----TTTG-GG-TATTTTCAGTGCTAT-ACAT--TAAAATGTGCCGAATTGCA-TACAGT--ATCTG------C----GTG-CAAAATGACA-AA-GT---------CT---ATAT----CCA-------ATCAGAACAGGTCATTT--TGG--CCA--T-GT------G----------C-------A--------------AAATGTAAAA---A-----------TGA-AGAAC----C---T-G--C--A----A-----TATAAAAATGCCGAACATACAGTTTCAAT-T-TT-TTA-AGGCTGAAATGTCAGAAG--TAATATCAAAATTGAAGACA--ATG-TTC---AT----AAAAAAA---A-----AACG-C-T-TGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGTTTCTACTACAA--A-------A----TA-TCAAGGT-GCTG---TAAAA--T--GAA-T-A-CAATG--TTATG-TAG---GAAT---ACC---T---TTATT--TT--TTTTCTT-AATACAGAT-TTTCTGGTCT-GTAATTT--TCA--AACTAATT-----GAAA--ATTATAT-------T-----A-T-T--GTTGCTCGG-GAAAAGTATGTATTTTGC-TAGTT-TGCCA-TTTTGAATGGAG-
gi|5 : GTCTCCATTTAAAA-TGGCGAAC-T------AA--C-tccaatgatgtgttatgtattattttttttaatatacaaaataaatttaaaatgctttttcatttaatattttaatg
gi|9 : attttcggtattttacattaaaatttgggaaagttcacactgtggctgcttgaaaacaacgaagtgagtaccagaacaagaccttgtgaacatgttcaaagtgtaaaaactgcatattaaaatgacaaacatacaacttttttatgttgaaatgccgaagtaatataaaattgaggacatttttcatgaaaagcacctgaaattgcagaagcaatattttctactatacactattactctgctgtaaaataatacaatgaaaatctggaataatttcattttttctatatacaagttttcaggtctgtaattatcaaacttttagagaaaatcatattttcgttcctcctgaaagttttgtttgGTTTTCATTCAAAA-TGGCTA---T------AC--C-AT----ACTG-GT-TATTTTCCGTATTTT-TCAT--TAAAATGTGC------CAA-TACTGC--ATCTG------C----ATC-CAAAACAATA-AA-GT---------TG---ATAT----CCA-------ATCAGAACAGATTATTT--GTT--GACAAT-GTA-----G-ACATATGTGC-------A--------------AAATGTCAGACAGA-----------TGA-AA-------C---T-G--C--A----A-----CATTACAGTGCCGACCACA------CAAC-T-CT-TT--AGGTTGAAATG-CCAGAG--TAATATGATAATT------------TTTC---AT----AAAAAAG---T-----A----C-C-TGGAATTGCTGAG---GCAAC--------AGTTTATTCTACAA--AATA----T----TACTC----T-GTTGT--AAAGA--T--G-AAT-A-CAATG--TGATG-CTG---GAAT---TCT---T---TTA-T--ATATTTCTCTG-AATATAAGT-TTTCAGG-TTTGTAAGTA--TCA--AACTATTTG---AGGGA--ATTATAT-------T-----T-T-T--GTTCCTTCT-GAAAAGTTTGTATTTTGT-TAGTTCTCCAA--TTTGAAcaacaataagtatgattcagagataaacttgggaataactaatgcaaataaaaccaattaaagatgccaatgaatagcttagtaattattttatata
gi|12 : gGTCTCCATTTAAAA-TGGCGAAC-T------AA--C-Ac
gi|16 : cattttgggtatttttcagattttacattaaaatgtgcagaagtttgttctgagtgtaaaacgacgtaactgatatccaattagaacatgccatgttgatcatgtgagcacatgtaaaatgtacaaatgacatgactgcaatatttaaatgctgaacatacaactcatttttaggctgaaataccaaagtaatatcaaaattgagaacatttttcatgaaaatatattattctactgtaattttttaaatgaatacaatgaaaaatatatattttttttaaatacaagttttcaggtctgttattatcaaattacttaagaaaatgatatttttgttcctcctgaaaagtttatatgtGTGTCCATTCAAAA-TGCTGATC-TT-----AC--C-AT----TTTATGA-TATTTTCTGTATTTC-ACAT--TGAAATATGCAGAAGTTCA-TGCTAC--ATATA------C----GTGTCAA--TAACG-AA-GT---------TG---ATAT----TCA-------ATCAGAATAGATCGATT--TGA--CCA--T-GC------A-A----------------A--------------CAT-GT-------A-----------CAA-A--------A---T-G--TAAC----ATTCAGTATTAAAATGCCGGACATG------CGACTT-TT-TTT-AAGCTGAAGTA-CCGAAA--TAATATAAAAATAGAGGAC---AT-TTTC---TT----TAAAAAA---A-----A----CGCATGAAAATACCGAG---GCAAG--------AAATTCTACTACAA--ACTA----T----TACTC----T-GC-AT--TAAAA--T--G-------TCATG--TAAAG-TTG---GAAT---ACT---TGTGTAA-T--AT--TTT-----AATACAATA-TTTCAGGTCT-GTAATTA--TCA--AACTctgcaatggtatg
gi|10 : ttaGTCTCTATTCAAAA-TGCCAAAC-A------AA----------TTTG-GG-TATTTTCGGTATTTT-GTAT--TAACATGTGCTGA-ATTCA-TACTGC--ATCTGATCCTAT----GTG-CAAAACTACA-AAGCTGGTATCCACTACGCAAAACTGCTCATTTGACCATGAGAATATGTCTTAT--TT----------AT------A-AA-------A-------A--------------AAA-TG-------A-----------CGATA--------C---T-G--C--A----A-----TATTAAAATGCCGAT--TA------CAA------------GGCTGAAATG-CCAAAA--TGATATCAACATTTTTGAC---ATATTTT---AT------AAAAATTCG----------C-C-TGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AATTTCTTCAACAA----TA----GAT--TACCC----A-GCTAT---AAAA--T--G-AAT-A-CATTC--CAATG--------AA----------------A-C--GT--TGGAC----A-ACAATTATTTCAGGTCT-GTAATTA--TCA--AACTATATA---AGCTT--ATTATAT-------T-----T-T-T--GTTCCTCCA-GAAAAGATTGTATTct
gi|20 : tgGTCTCCATTCAAAA-TGGTGAAC-T------AG--C-Aatttagttatgttaactatgt
gi|14 : aaaagtatctgaaaatgccagagcaagtttctactacaaactaatacactgttgcaaaaatgaaaacaatgtaatgattgaaggaatatctttatttttctttaatacagttttcaggtctgtaattatcaaactatttaggaaaattatattaccagtattattcttcctgaaaaatttgtatttGTCGCCATTTAAAA-TGCTAAAT-T------AA--CCAT----TTTA-GG-TATATTCGG-ATTTTGATAT--TATAATGTGCGGAAGTTCA--ACT-------TG------G----G-G-TACAATGATG-AA-GT---------TG---ATAT----CCA-------GTCAGAACAGGTCATTT--TTG--CCA--T-GT------G-GT-------C-------ATGTGCAAAATATTAAAA-TT-------A-----------CGA-A--------T---T-T--A--C----AC----TATTAAAACGCCATACATA------CAAT-T-TTGTTT-AGTCTGAAA-------------ATA---------AGGAA---AT-TATC---AT-------AAA-------------------T-AAAGCACAGGA---GCAAC--------AGTTTCTACTATAA--AAGT----G----TACTC----T-GCTGT--TAAAA--TT-A-A-T-A-TTTTG--CAATA-CTT---GTATTGGGCCACGT---TTA-TACGTA-TTTTCTA-AAAACAAGA-TTTTAGGTCT-GTAATTAAATAATTAACTATTGA---AGAAA--Gctatgacacaaatgatatatagtcttgtttaaggcaagtaaattcacaatggtctgtaatgttttgttatatattttatat
gi|24 : GTTTCCATTTAAAA-CGACGAAC-T------TA--C-Aatccaaaaaagtttgtatt
gi|1 : atataactttttataaaatcgcgctggaaaatgccgaagcaatagtttctacactattactggggcgtgaaaattaatacactataacgttggaatacctttaatttatacaagttttcatgtctgttattattaaactatttgagaaaaatatctttttgttctctagaaaagtttatatttGTCTCCATTTAAAAATGGCGAAC-T------AA--C-Acaacgatatatacatgctactgaaaatgtatttataaa
gi|3 : tgtaatgttggaatacttttatgtcttcaaaatacaaaactgtcaaactttttgagaaatgtatgtttttcttcctcctgaaaagtgagtatttGTCTCCATTTAAAAATGGCGAAC-T------AA--C-Acagcgaaatgtgtttaaaagaaaagaacttattcaatatgaaaactatttattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaactgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattatttgttcccacgtgttcggtagacgtggactgagattgtgttaatattacaacgtacctgaaacgaagagatatgatactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgataattatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaagaaaacaccgaactctggcttcc
gi|2 : tgtaatgttggaatacttttttgtcttcaaaatacaaaactgtcaaactttttgagaaatgaatgtttttcttcctactgaaaagtgagtatttGTCTCCATTTAAAAATGGCGAAC-T------AA--C-Acagcgaaatgtgtttaaaagaacttattcaatatgaaaactattcattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaagtgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattattttttcccacgtgttcggtagatgtggactgagattgtgttaatatttcaacgtacctgaaacgaagagatattctactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgatacttatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaaggaaacacctaactctggcttc
gi|35 : tgtaatgttggaatacttttttgtcttcaaaatacaaaactgtcaaactttttgagaaatgaatgtttttcttcctactgaaaagtgagtatttGTCTCTATTCAAAA-TGCCGAACTT------AC--C-AT----TTTG-GG-TA-TTACGGTATTTA-ACAT--TTAAATGTGCcagcgaaatgtgtttaaaagaacttattcaatatgaaaactattcattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaagtgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattattttttcccacgtgttcggtagatgtggactgagattgtgttaatatttcaacgtacctgaaacgaagagatattctactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgatacttatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaaggaaacacctaactctggcttcc
gi|32 : GTCTCCATTCAAAA-TGGTGAAC-T------AA--C-A
gi|38 : cttttaagtttgttattatcaatataataattattgttccttttgaagattttgtatttGTCTCCATTCAAAC-TGCCAAAC-T------TG--C-AT----T---------TTTTCAGAATTTT-ACAT--TCAAATTTGCc
gi|7 : taCTCCATTCAAAA-TGCTTAGC-T------TC--CGAC----TTTT-GG-TATTTTCGGTTCATT-AACT--TGAAATGTGCGAAATTCTA-TACTGC--ATCTG------CCTGCGTG-CAAAACAATG-AA-AA---------TA---ATAT----CCG-------ATCAGAACAGGTTATTT--TGA--CCA--T-AT------G-AA-------C-------ATGTGCGA-------AAT-GT-------AAAAATGA----CGA-G--------CC--T-G--TG-C----A-----TTATAAAATGCCGAACATA------CAAC-T-AT-TTG-GGCCGGAAATG-CGGAAG--TACTATCCAAATTGAGGAG---ATTTTTC---AT----TAGAAAA---A-----AACT-C-C-TTTAAATGCCGAA---CCAAC--------AGTTT------------CTTC---T----TAGTA----C-TCTATTGTAAAA--CTAA-A-T-A-CAAAG--TAGCG-TTG---GGGT---ACC---T---T---T--TT--TT------AATACAAGT-TTTCAGGTCT-G--------------ACTTTATG---AGAAA--ATTATAT-------T-----T-T-T--GTCCCTCCT-GAATAGCTGGTATTTTCT-TAGTT-CATCC-TTTTGAATAGAG-ATCAA
gi|28 : CTCAATTCAAAG-TGCCGAAT-T------TA--C-CA----TTTA-GG-GAGTTTTGTTACTTT-GCAT--TAAAATGTGTGGGTATTTA-TACTGC--AACTG------T----GTG-TAAAACAACG-AA-GT---------TG---ATAT----CCA-------ATCAGATCAGGTCTTTT--T
gi|19 : TCCATTCAAAA-TGC-------------------AT----TTTG-GG-TATTACCGATATTTT-ACAT--T-AAACATGCGAAAGTTCA-TATTGCATATCTG------C----GTG-CGAAACGACA-AA-caaaatgtgaccatgtgcaaaatgtaactaagacagcacgctcaactattcaaata
gi|21 : CATTCAAAA-TGCTGAAC-T------TA--C-AT----TTTG-AG-TGTTTTACA-ATTTT-ACATATTAAAATGTGCAAATGTTGA-TATTAC--ATCTG------C----GTG-CAAAACAATG-AA-GT---------TG---ATAT----CCA-------ATCAGAACAGGTCATTT--TGA--CCA--T-GT------G-AA-------CATATGCTA--------------AAT-GTGAAAAAGA-----------AGA-A--------C---CAG--C--A----A-----CATTAAAATGCTGAATATA------CAAC-T-TT-TTA-Aactgcaatataaaatgccgaacacacaacttttataagctgaaatgccgaagtgaaaaaagaattgaggacatttttttttattataaagcgcctgaaaataccgaaacaacagtttcaataacatttgcttttactcttctgtaaaaatgaatccaatgaaatgttggaatatcgttatttttaataaagttttcaggtctgttattttcaaactacttgtgaaaattatatttttgttcccccagaaatgtttgtattttgtgtact
gi|15 : tTTCAAAA-TGCCGAAC-TT-----AC--C-AT----TTTG-GG-TATTTTTGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGAA-GTTCA-TATTAC--AAATG------T----GAG-CGAAACAACA-AA-GT---------TG---ATAT----CCA-------ATCAGAACAGGCCATTT--TGA--TCA--TAGT------G-AA-------C-------A--------------AAA-ATG------A-----------CGA-A--------A---TCG--A--A----A-----TATGAAAATGCTGAATACA------TAAC-T-TT-TTA---GTTTATTTG-CCAAAG--CAATATCAAAATTGAGGAC---ATTTTTC---AT----AAAAAAT---C-----A----T-C-CGAAAATGACAAT---GCAAC--------ATTTTCTACTACGA--ACTA----T----TATTC----A-GCTGT--TAAAA--T--GAA-T-A-CAATG--AAATaaattttactacatacaagtactctgcttttaaaaaatgattgcaatgtaatggtagaatgcttctattttttcta
gi|5 : TTGAAA-TGCCGAAG-T------AA--T-ATAAAATTGA-GGACATTTTTCATttcaggtctgttattatcaaactatttgagaaaactatatatatacatgtatgttcctcctgaaaagtgta
gi|6 : attttcggtattttacattaaaatttgggaaagttcacactgtggctgcttgaaaacaacgaagtgagtaccagaacaagaccttgtgaacatgttcaaagtgtaaaaactgcatattaaaatgacaaacatacaacttttttatgAAAA-TGCAGAACAT------AAACC-AT----TTTG-GA-AATTTTCAGCATTTT-ACAT--TAAAATGTGCAGAAGTTTA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACG--------T---------TG---ATAT----CCA-------ATCAAAAAAGGTCATTTAATTTGACCA--T-GTTAACTTGCAT-------A-------A--------------AAT-GT-------GAAAAAAAAAATCAA-C--------C---T-G--A--A----T-----TATTAAAATACCGAACATA------CACC-T-TT-TTTTAGTCTGAAATG-TTGAAG--TAATACCAAAACCGAG-ATTTTAT-TTTT---AT----TCAAAAA---GT----G----C-C-TGAAAATGCTGAA---GCAAC--------TGATTCTACCACAA--ACTA----G----TACTC----T-GCTGT--ACAAA--T--GAA-T-A-CCATG--AAACG-TTG---GGAT---ACC---T---TCT-T--TT--TTTTCCA-AATACAAGT-ATTCAGGTCT-GTAATAA--TCA--AGATATTTG---AAAAA--A--A----------------------------TCCT-GAAATATTTGTATTTTGT-AAGTT-TGCCA-TTTTGAATAGAG-A-gaaaagcacctgaaattgcagaagcaatattttctactatacactattactctgctgtaaaataatacaatgaaaatctggaataatttcattttttctatatacaagttttcaggtctgtaattatcaaacttttagagaaaatcatattttcgttcctcctgaaagttttgtttggttagttcgccattttaaatggagaccaacaataagtatgattcagagataaacttgggaataactaatgcaaataaaaccaattaaagatgccaatgaatagcttagtaattattttatata
gi|11 : attcaAAAA-TGCCAAAC-TT-----AC--C-AT----TTTG-GA-TAATTCCGGTATTTT-ACAT--TAAAATATGCAGGAGTTCA-TACCGT--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACG-AA-GT---------TG---TTAT----CCA-------ATCGGAACTGGTCATTC--TTA--CCA--C-GT------G-AA-------C-------A--------------------------------------------------------T----C--A----A-----TATGAAAATGCCGAGCGTA------CATC-T-TT-TTC-TAACTGAAACG-TCGAAG--TAATAACAAAATAGAGAAC---AGTTTTC---GT------AAAAA---ATATACA----C-C-TGAAAATGCCAAA---GCAAC--------AGTTTATTCTACAA--ACTA----G----CACTC----T-GTTGT--AAAGA--T--GAA-T-A-TAATG--TATCG-TTG---AAAT---ACC---T---TTA-C--TT--TTTATT--AATACAAAG-TTTCAGATCC-GAAATCA--TAA--AAATATTTGAATAAAAA--G-----T-------G-----T-T-T--GTTT-----------GTTTTTTTTTTGT-T--TT-GGC-A-TTTTGCATAGAG-A-
gi|17 : cAGA-TGCCGAAC-T------TA--C---------------CATTTTTGATATTTT-ATAC--TTAAATGTTCGGAAGTTCA-TACTGC--GTCTG------C-----TG-TAAAACCATA-GA-GT---------TG---ATAT----CTA-------ATCGGAACTGGTCATTT--TGA--CCA--T-GT------G----------C-------A--------------AA--AT-------A-----------TTA-A--------------G--T--T----A-----TATCAAAATtaaagaaaacatattttacga
gi|29 : agttccGCCGAAC-TT-----AC--C-AT----TTTG-GA-AATGTTG-GTATTTT-ACAT--TATAATGTGCAAAAGTTCA-CACTGC--ATCTG------C----ATA-CAAAACGACA-AA-GT---------TG---ATAT----CCA-------ATCAGATCAGGTCTTGT--TGA--CCA--T-GT------G-Atgaggatatttttcatagaaaaaaaaatgcctgaaaatgccaaagtaacagtttctactattctgctgtaaaaatgaatactatataactttggaatacttttattattttcttaatacaagttttcaggtctgtaagtttcaaacttttcgagaaatttattttcccctcttgaaaagttattttgttaggtggccattttgagtggagatcaacaaatttag
gi|12 : --C-AT----TTTG-GG-TATTTTTCAGATTTT-ACAT--TAAAATGTGCAGAAGTTTG-T--------TCTG------A----GTG-TAAAACGACGTAA-CT----------G---ATAT----CCA-------ATTAGAACATGCCATGT--TGA--TCA--T-GT------G-AG-------C-------ACATGTAA-------AAT-GT-------A-----------CAA-ATGACATGAC---T-G--C--A----A-----TATTTAAATGCTGAACATA------CAAC-TCAT-TTTTAGGCTGAAATA-CCAAAG--TAATATCAAAATTGAGAAC---ATTTTTC---AT------------------------------GAAAAT------------AT--------A--TTATTCTAC-------T----G----TAATT----T-TTTA------AA--T--G-AAT-A-CAATG--AAA----------AAT---ATA---T-----A-T--TT--TTT-TTA-AATACAAGT-TTTCAGGTCT-GTTATTA--TCA--AATTACTTA---AGAAA--ATGATAT-------T-----T-T-T--GTTCCTCCT-GAAAAGTTTATATGTTGT-TAGTT-CGCCA-TTTTAAATGGAG-A-ctgaacatgtgcaaa
gi|22 : T----TTTA----TATTTTCCGTATTTT-ACAT-----GCTTTTCATAAGTTTA-TAATGT--ATCTG------C----GTG-CAAAACGAC--AA-GT---------TG---ATAT----CCA-------ATCAGAA-ACG---------GT--CAG--T-AT------G-AG-------C-------A-------------------T-------G-----------CGA-A--------TATGT-G--CAAA----A-----TGTTAAAATGCCGAACATA------CGAC-T-AT-Tctgcaatggtatg
gi|5 : ttcattcaagatgtctttATTTTCGGTATTTT-ACAT--TAAAATTTGGGAAAGTTCA-CACTGT--GGCTG------C----TTG--AAAACAACG-AA-GT---------GA---GTA----------------CCAGAACAAGACCTTG--TGA--ACA--T-GT---------T-------C-------A--------------AAGTGT-------A-----------AAA-A--------C---T-G--C-------A-----TATTAAAATGACAAACATA------CAAC-T-TT-TTT-ATGTTGAAATG-CCGAAG--TAATAT-AAAATTGAGGAC---ATTTTTC---A-----TGAAAAG---C-----A----C-C-TGAAATTGCAGAA---GCAAT--------ATTTTCTACTATAC--ACTA----T----TACTC----T-GCTG---TAAAA--T--A-A-T-A-CAATG--AAAAT-CTG---GAAT---AAT---T---TCA-T--TT--TTT-CTA-TATACAAGT-TTTCAGGTCT-GTAATTA--TCA--AACTTTTAG---AGAAA--ATCATAT-------T-----T-T-C--GTTCCTCCT-GAAA-GTTT-TGTTTGGT-TAGTT-CGCCA-TTTTAAATGGAG-A-actctgcccaaggaactatagtggaagaggacctttcctctccaattccttgctctgctgtaagtaaataataatacaatgaactattggaatacctttatttttatct
gi|33 : T-ATAT--TAAAA-----AGAAATTCA-TATCCC--ATATG------C----ATG-CAAAGCGACG-AA-GA---------CG---ATAT----CCA-------GTCA----ACGTTATTT--TGA--CCA--C-GT------G-AT-------caacaataagtatgattcagagataaacttgggaataactaatgcaaataaaaccaattaaagatgccaatgaatagcttagtaattattttatata
gi|13 : --TAAAATGTGCAGAGGTTCAACACTGC--AGCTA------C----GTG-CAAAACGATG-AA-GT---------TG---ATAT----CCA-------ATCAGGACAGGTCATTT--TGA--CAA--T-GT------G----------C-------A--------------CAT-GTT------A-----------CAATG--------A---T-GAAC--CTCGAA-----TATCAAAATGCTGAACATA------CAAC-T-AT-TTG-AGTCTGAAATA-CCTAAG--TTAAATCAAAATTGAGGAC---ATTTTTT---ATAAAATAAAAAA---A-----AGCT-C-C-TGAAAATGCCGAA---CCAAC--------AGTTTCTTCTAGAA--ATTA----G----TACTC----T-GCTGT--AAAAA--A--GAA-T-A-CAATG--TAACT-TTC---AAAT---ACCA--T---T---T--TT--TCTTCTA-AACATCAAT-T-------CT-GTAATTA--TCA--AACTAATTA---ACAAA--ATAATAC-------T-----T-T-T--G-TCCTCCT-GAAAAGATTACATTTTAT-TTGTT-CACCA-TTTTGAATGGAG-A-
gi|19 : A-A--------C---T-G--C--A----A-----TAT-AAAATGCCGAACACA------CAAC-T--T-TTATAAGCTGAAATG-CCGAAGTGAAAAA--AGAATTGAGGAC---ATTTTTTTTTAT----TATAAAG---C-----G----C-C-TGAAAATACCGAA---ACAAC--------AGTTT---CAATAAC-ATTT----GCTTTTACTC----T-TCTGT--AAAAA--T--G-AAT-C-CAATG--AAATG-TTG---GAAT---ATC---G---TTA-T--TT--TT------AATA-AAGT-TTTCAGGTCT-GTTATTT--TCA--AACTACTTG---TGAAA--ATTATAT-------T-----T-T-T--GTTCCCCCA-GAAATGTTTGTATTTTGTGTACTca
gi|36 : tccattcaaaatgcattttgggtattaccgatattttacattaaacatgcgaaagttcatattgcatatctgcgtgcgaaacgacaa---T-G--C--A----A-----TATCAAAATGACGAACATA------CAAC------TTG--GGCTGATATA-CAGAAG--TAATATCGAA
gi|18 : aactTAAAGTGCTGAGCATA------CAAC-T--T-TTT-AGGCTGAAGTG-TTGAAG--TAATATCAAAATTGAAGAC---ATTTTTT---AT-----AAAAAG---C-----G----C-C-GGAAAAT-CAGAA---GCAAC--------AGTCTCCACTACTA--ACAA----T----TACTC----T-GCTGT--AAAAA--T--G-AAT-A-CAATG--TAATA-TTT---GAAT---GCC---T---TTA-T--TT--TTTTCTA-AATACAAA--TTTCAGGTCT-GTTATCA--TCA--AACTATTTT---AAAAAAGGTTGTAT-------T-----T-T-TTAGTTT
gi|23 : aacaagaatgacaaaacgtcatacagcagcaggtgAAAATGCAGAACATT------CAAC-T--T-TTATAGCCTGAAATG-TCGAGT--TAATATAAAAATTGAGGAC---ATTCTTC---AT----ACAAAAG--------------CGC-TGAAAA---------------------------TGTA-----G--ACT-----------ATTC----T-GCTAT---AAGA--TCGA-A-T-A-TAATACCTAAT---------AAT-------------T-A-T--GT--TTT-CTT-CATACAAGT-TATCAATTCT-GTAATTA--TCC--AACTATTTG---AGATA--ATTATAT-------T-----T-T-T--ATTCCTCCT-TAAAAGTTTGCATTTTTT-TAGTT-AACCA-ATTTGAATGGAA-A-gccattttacatataaaaaaaacaatagtttgcaaatttgaatttttttaatattattgatataaatgtggaactttaaattagaaaatgttgattttaa
gi|26 : caatggcAAAACGCTGAACATA------CAAC-T-GT-TTTTCGGTTCAAATC-CTAACG--TAATATCCAAAATGAGAAC------TTTT---TT----T------------------------------TGTC--A---GCAAC--------AATTTCTACTCCAA--ACT-----A----TAAC-----------T--TAAAAATT--A-A-T-G-CAATG--AAACG-TTA---GAAT---AAC---T---TTA-T--TT--TTTTCCA-TATAAAAGT-TTTTAGGTCT-GTAATTA--TAA--AACTATTTT---AGAAcaacga
gi|17 : agctggtatccaatcaggataggtcatactgacaatatgaacatgtgcacaacATATCAAAATTGAGGAT---ATTTTTC---AT----AGAAAAA---A-----AAATGC-C-TGAAAATGCCAAA---GTAAC--------AGTTTCTAC--------------------TATTC----T-GCTGT--AAAAA--T--GAA-T-A-CTATA--TAACT-TTG---GAAT---ACT---T---TTATT--AT--TTT-CTT-AATACAAGT-TTTCAGGTCT-GTAAGTT--TCA--AACTTTTCG---AGAAA---TT-TAT-------T-----T-T-----CCCCTCTT-GAAAAGT---TATTTTGT-TAGGT-GGCCA-TTTTGAGTGGAG-ATCAA
gi|20 : agttccagatgccgaacttaccatttttgatattttatacttaaatgttcggaagttcatactgcgtctgctgtaaaaccatagagttgatatctaatcggaactggtcattttgaccatgtgcaaaatattaagttAAAAG---T-----A----T-C-TGAAAATGCCAGA---GCAA----------GTTTCTACTACAA--ACTA----A----TACAC----T-GTTGC--AAAAA--T--G-A-A-AACAATG--TAATGATTGAAGGAAT---ATC---T---TTA-T--TT--TT--CTTTAATACA-GT-TTTCAGGTCT-GTAATTA--TCA--AACTATTTA---GGAAA--ATTATAT-------TACCAGTAT-T--ATTCTTCCT-GAAAAATTTGTATTTTGC-TAGTT-CACCA-TTTTGAATGGAG-A-caaatttag
gi|24 : GAAAATGCCGAA---GCAAT--------AGTTTCTACA-CTATTACTG----G------GGC---------GT--GAAAA--TT-A-A-T-A-CACTA--TAACG-TTG---GAAT---ACC---T---TTA----AT--TT-------ATACAAGT-TTTCATGTCT-GTTATTA--TTA--AACTATTTG---AGAAA--AATATCT-------T-----T-T-T--GTTCT--CTAGAAAAGTTTATATTTTGT-AAGTT-CGTCG-TTTTAAATGGAA-A-ctatgacacaaatgatatatagtcttgtttaaggcaagtaaattcacaatggtctgtaatgttttgttatatattttatat
gi|21 : atataactttttataaaatcgcgctgAAAATGCTGAATATACAACTTTTTAAAAATTT-TACTACAT--ACAA----G----TACTC----T-GCTTT--TAAAAAAT--G-A-TTG-CAATG--TAATG-GTA---GAAT---GCT---T---CTA-T--TT--TTcaacgatatatacatgctactgaaaatgtatttataaa
gi|25 : tcattcaaaatgctgaacttacattttgagtgttttacaattttacatattaaaatgtgcaaatgttgatattacatctgcgtgcaaaacaatgaagttgatatccaatcagaacaggtcattttgaccatgtgaacatatgctaaatgtgaaaaagaagaaccagcaacattACAA--AATTAGGAG----TATTC----TGTCT-T--TAATA--T--G-A-A-AACAATG--CAATG-TTG---GAATTATATT---T---T---T--TT--TT---TA-AATACAAGT-TTTTGGGTCT-GTAATTA--TCA--GACTTTTTG---AGAtcta
gi|22 : tcagaacttgtcattttgaccccatctgagcattgaacatgtgccaaatgttaaaaggcattcaacgtttttagactgaattactgaacaagatctggtacaaaaaacaacaacacatttttcacaaaaaagctcAA--T--A-A-T-A-CAATG--AACTA-TTG---GAAT---ACC---T---TTA-T--TT--TT
gi|1 : ttcattcaagatgtctttttttatattttccgtattttacatgcttttcataagtttataatgtatctgcgtgcaaaacgacaagttgatatccaatcagaaacggtcagtatgagcatgcgaatatgtgcaaaatgttaaaatgccgaacatacgactattactctgcccaaggaactatagtggaagaggacctttcctctccaattccttgctctgctgtaagtaaatTG--TAATG-TTG---GAAT---ACT---T---TTA-T--GT--CTT-CAA-AATACAA----------------AACTG--TCA--AACTTTTTG---AGAAA--TGTATGT-------T-----T-T-T--CTTCCTCCT-GAAAAGTGAGTATTTTGT-TAGTT-CGCCATTTTTAAATGGAG-A-atct
gi|3 : TG--TAATG-TTG---GAAT---ACT---T---TTT-T--GT--CTT-CAA-AATACAA----------------AACTG--TCA--AACTTTTTG---AGAAA--TGAATGT-------T-----T-T-T--CTTCCTACT-GAAAAGTGAGTATTTTGT-TAGTT-CGCCATTTTTAAATGGAG-A-cagcgaaatgtgtttaaaagaaaagaacttattcaatatgaaaactatttattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaactgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattatttgttcccacgtgttcggtagacgtggactgagattgtgttaatattacaacgtacctgaaacgaagagatatgatactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgataattatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaagaaaacaccgaactctggcttcc
gi|2 : TG--TAATG-TTG---GAAT---ACT---T---TTT-T--GT--CTT-CAA-AATACAA----------------AACTG--TCA--AACTTTTTG---AGAAA--TGAATGT-------T-----T-T-T--CTTCCTACT-GAAAAGTGAGTATTTTGT-TAGTT-CGCCATTTTTAAATGGAG-A-cagcgaaatgtgtttaaaagaacttattcaatatgaaaactattcattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaagtgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattattttttcccacgtgttcggtagatgtggactgagattgtgttaatatttcaacgtacctgaaacgaagagatattctactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgatacttatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaaggaaacacctaactctggcttc
gi|27 : ---T---TGA-T--AA--TTACTCA-TAAACA----TTTTAGGTCT-GCGGTTA--TTA--CA-TATTTG---AGGCA--ATTATGT-------T-----T-T-T--GTTTCTCCT-GAACATTTTGTATTTT-T-TAGTT-CGCTT-TTTTGGATGAAG-cagcgaaatgtgtttaaaagaacttattcaatatgaaaactattcattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaagtgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattattttttcccacgtgttcggtagatgtggactgagattgtgttaatatttcaacgtacctgaaacgaagagatattctactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgatacttatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaaggaaacacctaactctggcttcc
gi|31 : tGT-TTTCAGGTCT-GTAACTA--TCA--ACCTCTTTG---AGAAA--ATAATAT-------T--------------------T-GAAACTTGGGTATATTGT-T---------A-TTTTGAATGGAGAA-CAAgtcaacgacaggaaaatatacgatgtcgacaatggatctatgacacagttatccatgaattaatgttcccttactatgtattgttattg
gi|15 : -TTTCAGGTCT-GTTATTA--TCA--AACTATTTG---AGAAA--ACTATATATATACAT-----G-TAT--GTTCCTCCT-GAAAAGTcgata
gi|32 : ttcaaaatgccgaacttaccattttgggtatttttggtattttacattaaaatgtgcgaagttcatattacaaatgtgagcgaaacaacaaagttgatatccaatcagaacaggccattttgatcatagtgaacaaaaatgacgaaatcgaaatatgaaaatgctgaatacataactttttagtttatttgccaaagcaatatcaaaattgaggacatttttcataaaaaatcatccgaaaatgacaatgcaacattttctactacgaactattattcagctgttaaaatgaatacaatgaaaAT-------T-----A-T-T--GTTCCTTTT-GAAGATTTTGTATTTTGT-TAGTT-CACCA-TTTTGAATGGAG-A-gta
4 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): GTTTTACTTTATTTATTCTTTATGATACCATATCTTCATATTTCGATATTTTAATATTCGGTAGATAATATGTAATATATATTAGCTATAATAGTTTGAAATGTATC
Unaligned ( gi|34 ): TCATCCTGCGTCTCCTGTAACATACATGATGTCTAATCGCAACTTTAATGAAGATATGAAAAGTGTCAAGTTTATTA
Unaligned ( gi|37 ): CAGTATAAAAATTGGATAAGGATCATTCTCTATATAAACTCTACAAGACTAAAATTCAAA
Unaligned ( gi|39 ): ATATACTTATAAACAATTGTTCTAATTCTACA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 2222222222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111111111111 22222222222222222222222222222222 11111111111
lowQualScore : 2 1 4 7777777777 4 2 4 1 22 2 4 22 555555 4444 2 22 555 6666 22 1 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 44 22 44 555555 44 1 8888888888888888 2 2 77777777 2 4444 333 33333333333333333333333333333333 0 333 66666666 1 22 77777777 6 44444 44 5 55555555555 3333 0 55 1 222 1 0 33333 1 888888888888 1 3333 33 22 22 1 5555 44444 1 22 6 2 5
lowQualScore : . . . .......... . . . . .. . . .. ...... .... . .. ... .... .. . . .............................................................................. .. .. .. ...... .. . ................ . . ........ . .... ... ................................ . ... ........ . .. ........ . ..... .. . ........... .... . .. . ... . . ..... . ............ . .... .. .. .. . .... ..... . .. . . .
lowQualScore : 4 4 4 7777777777 2 1 0 9 55 2 0 88 888888 2222 0 66 000 7777 66 9 7 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 55 55 222222 33 8 6666666666666666 0 0 22222222 1 2222 555 44444444444444444444444444444444 1 222 66666666 8 55 33333333 1 33333 11 2 99999999999 3333 5 77 5 777 5 7 88888 5 666666666666 5 6666 77 00 00 6 2222 22222 7 55 3 2 0
consensus : GTCTCCATTCAAAA-TGCCGAAC-T------AC--C-ATTTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGAAGTTCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT----TGACC--AT-GTGAAC-------A----------------A--AT-GT-------A-----------CGA-A--------C---T-G-------C--AATA--T-TAAAATGCCGAACATA------CAACT--TT-TTT-A-------------GGCTG-AAATGCC-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AGGACATTTT----TC---AT----N-AA-AAA---GCG----C-C-------TGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTCTACTACAA--ACT----AG--TACTCTGCTGTAAA-----AA--T-G-A-T-A-----CAA----TGTAAC-G-TTG---GAAT-ACCT-----T-T---A--T---T-TTT-T-CTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCGCCA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
Reference ( family-4804 ) : GTCTCCATTCAAAA-TGCCGAAC-T------AA--C-ATTTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGAAGTTCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT----TGACC--AT-GTGANC-------A----------------A--AN-GT-------A-----------CGA-A--------C---T-G-------C--AATA--T-TAAAATGCCGAACATA------CAACT--TT-TTN-A-------------GGCTG-AAATGCC-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AGGACATTTT----TC---AT----T-AA-AAA---GNA----C-C-------TGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTCTACTACAA--ACT----AG--TACTCTGCTGTNAA-----AA--T-G-A-T-A-----CAA----TGTAAC-G-TTG---GAAT-ACCT-----T-T---A--T---T-TTT-T-CTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCGCCA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
gi|1 : ----TGTAAT-G-TTG---GAAT-ACTT-----T-T---A--T---G-TCT-T-CAAAATACAA--------------AACT--GTCA--AACTTTTTGAGAA-AT--G-TATGTT-----T-TTCTTCCTCCTGAAAAGTGA--GTATTTTGTTAGTTCGCCATTTTTAAATGGAG-A-
gi|10 : GTCTCTATTCAAAA-TGCCAAAC-A------AA------TTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-GTAT--TAACATGTGCTGAA-TTCA-TACTGC--ATCTGATCCTAT----GTG-CAAAACTACAAAGCTG--GTATCCACTACGCAAAACTGCTCATTT-----GACC--AT-GAGAAT-------ATGTCTTATTTATAAAAA--AA-ATG------A-----------CGATA--------C---T-G-------C--AATA--T-TAAAATGCCGAT--TA------CAA-------------------------GGCTG-AAATGCC-AAAATGATATC--------AACATTT-TTGACATATT----TT---AT----A-AA-AAT---TCG----C-C-------TGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AAT-TTCTTCAACAA----T----AGATTACCCAGCTAT-AA-----AA--T-GAA-T-ACATTCCAA----TGAAAC-G-TTG---GACA-AC------------------------------AATTA-----TTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATATAAGCT-TA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCAGAAAAGATT--GTATTAT-TTAGTTcagcgaaatgtgtttaaaagaaaagaacttattcaatatgaaaactatttattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaactgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattatttgttcccacgtgttcggtagacgtggactgagattgtgttaatattacaacgtacctgaaacgaagagatatgatactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgataattatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaagaaaacaccgaactctggcttcc
gi|11 : tgCAAAA-TGCCAAAC-TT-----AC--C-ATTTTG-GATAATTC-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATATGCAGGAGTTCA-TACCGT--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--TTATCCAAT---CGGAACTGGTCATTC----TTACC--AC-GTGAAC-------A-----------------------T----------------------------------------------C--AATA--T-GAAAATGCCGAGCGTA------CATCT--TT-TTC-T-------------AACTG-AAACGTC-GAAGTAATAAC--------AAAATAG-AGAACAGTTT----TC---GT----A-AA-AAATATACA----C-C-------TGAAAATGCCAAA---GCAAC--------AGT-TTATTCTACAA--ACT----AG--CACTCTGTTGTAAA-----GA--T-GAA-T-A-----TAA----TGTATC-G-TTG---AAAT-ACCT-----T-T---A--C---T-TTT-T-ATTAATACAAAGTTTCAGATCCGAAATC--ATAA--AAATATTTGAATA-AA-----AAGTG-----T-TTGTTT----------GTTT--TTTTTTTGT---TTTGGCA-TTTTGCATAGAG-A-atgttaactatgt
gi|12 : --C-ATTTTG-GGTATTTTTCAG-ATTTT-ACAT--TAAAATGTGCAGAAGTTTG-T--------TCTG------A----GTG-TAAAACGACGTAACTG--ATATCCAAT---TAGAACATGCCATGT----TGATC--AT-GTGAGC-------ACATGTAA---------A--AT-GT-------A-----------CAA-ATGACATGAC---T-G-------C--AATA--T-TTAAATGCTGAACATA------CAACTCATT-TTT-A-------------GGCTG-AAATACC-AAAGTAATATC--------AAAATTG-AGAACATTTT----TC---A---------------------------------TGAAAAT------------AT--------ATTATTCTACT--------------G--TAATTT----TTTA-----AA--T-GAA-T-A-----CAA----TGAAA-----------AAT-A--T-----A-T---A--T---T-TTT-T-TTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTTATT--ATCA--AATTACTTAAGAA-AA--T-GATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--ATATGTTGTTAGTTCGCCA-TTTTAAATGGAG-A-taaagaaaacatattttacga
gi|13 : --TAAAATGTGCAGAGGTTCAACACTGC--AGCTA------C----GTG-CAAAACGATGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGGACAGGTCATTT----TGACA--AT-GTGCAC-------ATGTTAC----------A--AT-G--------A-----------TGA-A--------C---C-T-------CG-AATA--T-CAAAATGCTGAACATA------CAACT--AT-TTG-A-------------GTCTG-AAATACC-TAAGTTAAATC--------AAAATTG-AGGACATTTT----TT---ATAAAAT-AA-AAA---AAAGCT-C-C-------TGAAAATGCCGAA---CCAAC--------AGT-TTCTTCTAGAA--ATT----AG--TACTCTGCTGTAAA-----AA--A-GAA-T-A-----CAA----TGTAAC-T-TTC---AAAT-ACCA-----T-T---T--T---T-TCT-T-CTAAACA-------TCAATTCTGTAATT--ATCA--AACTAATTAACAA-AA--T-AATACT-----T-TTG-TCCTCCTGAAAAGATT--ACATTTTATTTGTTCACCA-TTTTGAATGGAG-A-ctgcaatggtatg
gi|14 : GTCGCCATTTAAAA-TGCTAAAT-T------AA--CCATTTTA-GGTATATT-CGG-ATTTTGATAT--TATAATGTGCGGAAGTTCA--ACT-------TG------G----G-G-TACAATGATGAAGTTG--ATATCCAGT---CAGAACAGGTCATTT----TTGCC--AT-GTGGTC-------ATGTGCAAAATATTA--A--AA-TT-------A-----------CGA-A--------T---TTA-------C--ACTA--T-TAAAACGCCATACATA------CAATT--TTGTTT-A-------------GTCTG-AA-----------AATA------------------AGGAAA-TTA----TC---AT----A-AATAAA---GCA----C-----------A-------GGA---GCAAC--------AGT-TTCTACTATAA--AAG----TG--TACTCTGCTGTTAA-----AAT-T-A-A-T-ATTTTGCAATACTTGTA-----TTG---GGCC-ACGT-----T-T---A--TACGTATTT-T-CTAAAAACAAGATTTTAGGTCTGTAATTAAATAATTAACTATTGAAGAA-AG-----A------------------TCCAAAAAAGTTT--GTATTca
gi|15 : TTCAAAA-TGCCGAAC-TT-----AC--C-ATTTTG-GGTATTTT-TGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGCG-AAGTTCA-TATTAC--AAATG------T----GAG-CGAAACAACAAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGCCATTT----TGATC--ATAGTGAAC-------A----------------A--AA-ATG------A-----------CGA-A--------A---TCG-------A--AATA--T-GAAAATGCTGAATACA------TAACT--TT-TTA----------------GTTT-ATTTGCC-AAAGCAATATC--------AAAATTG-AGGACATTTT----TC---AT----A-AA-AAA---TCA----T-C-------CGAAAATGACAAT---GCAAC--------ATT-TTCTACTACGA--ACT----AT--TATTCAGCTGTTAA-----AA--T-GAA-T-A-----CAA----TGAAAT-T-TCA---GG------T-----C-T---G--T---TATTA-T-CAAACTA-----TTTGAGA--------------A--AACTAT------A-TA--TATACATG-----T-ATGTTCCTCCTGAAAAGT
gi|16 : GTGTCCATTCAAAA-TGCTGATC-TT-----AC--C-ATTTTATGATATTTT-CTGTATTTC-ACAT--TGAAATATGCAGAAGTTCA-TGCTAC--ATATA------C----GTGTCAATA--ACGAAGTTG--ATATTCAAT---CAGAATAGATCGATT----TGACC--AT-GCAAAC-------A--------------------T-GT-------A-----------CAA-A--------A---T-GTAACATTC--AGTA--T-TAAAATGCCGGACATG------CGACT--TT-TTTTA-------------AGCTG-AAGTACC-GAAATAATATA--------AAAATAG-AGGACATTTT-----C---TT----T-AA-AAA---AAA----CGCA------TGAAAATACCGAG---GCAAG--------AAA-TTCTACTACAA--ACT----AT--TACTCTGC-ATTAA-----AA--T-G-----------TCA----TGTAAA-G-TTG---GAAT-ACTT-----G-TGTAA--T---A-TTT-T----AATACAATATTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTgta
gi|17 : ttaTTCCAGA-TGCCGAAC-T------TA--C----------CATTTT-TGATATTTT-ATAC--TTAAATGTTCGGAAGTTCA-TACTGC--GTCTG------C-----TG-TAAAACCATAGAGTTG--ATATCTAAT---CGGAACTGGTCATTT----TGACC--AT-GTG--C-------A----------------A--AA--T-------A-----------TTA-A--------------G-------T--TATA--T-CAAAAT--TGAGGATA----------T--TT-TTC-ATAGAAAAAAAAATGCCTGAAAATGCC-AAAGTAACAct
gi|17 : agAAGTTATATC--------AAAATTG-AGGATATTTT----TC---AT----A-GA-AAA---AAAAATGC-C-------TGAAAATGCCAAA---GTAAC--------AGT-TTCTACTAT------------------TCTGCTGTAAA-----AA--T-G-AAT-A-----CTA----TATAAC-T-TTG---GAAT-ACTT-----T-T---A--T---TATTT-T-CTTAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAAGT--TTCA--AACTTTTCGAG-A-AA--T-T-TATT-----T-T--CCCCTCTTGAAAAGT-----TATTTTGTTAGGTGGCCA-TTTTGAGTGGAG-ATCAAgtttctactattctgctgtaaaaatgaatactatataactttggaatacttttattattttcttaatacaagttttcaggtctgtaagtttcaaacttttcgagaaatttattttcccctcttgaaaagttattttgttaggtggccattttgagtggagatcaacaaatttag
gi|18 : agttccagatgccgaacttaccatttttgatattttatacttaaatgttcggaagttcatactgcgtctgctgtaaaaccatagagttgatatctaatcggaactggtcattttgaccatgtgcaaaatattTGACA-------A----------------A--AC-GT-------------------CAT-A--------C---A-G-------C--AGCAGGTGTAAAGTGCTGAGCATA------CAACT--TT-TT--A-------------GGCTG-AAGTGTT-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AAGACATTTT----TT---AT------AA-AAA---GCG----C-C-------GGAAAAT-CAGAA---GCAAC--------AGT-CTCCACTACTA--ACA----AT--TACTCTGCTGTAAA-----AA--T-G-AAT-A-----CAA----TGTAAT-A-TTT---GAAT-GCCT-----T-T---AT-T---T-TTT-T-CTAAATACAAA-TTTCAGGTCTGTTATC--ATCA--AACTATTTTAAAA-AAGGT-TGTATT-----T-TTcaaatttag
gi|19 : aacaagaaTCCATTCAAAA-TGC-------------------ATTTTG-GGTATTAC-CGATATTTT-ACAT--T-AAACATGCGAAAGTTCA-TATTGCATATCTG------C----GTG-CGAAACGACAAAACTGCAATATAAAATG--CCGAACAtagtttgccattttacatataaaaaaaacaatagtttgcaaatttgaatttttttaatattattgatataaatgtggaactttaaattagaaaatgttgattttaa
gi|19 : A-A--------C---T-G-------C--AATA--T--AAAATGCCGAACACA------CAACT--TT-TAT-A-------------AGCTG-AAATGCC-GAAGTGAAAAA--------AGAATTG-AGGACATTTT----TTTTTAT----T-AT-AAA---GCG----C-C-------TGAAAATACCGAA---ACAAC--------AGT-TTCAATAACATTTGCT----TT--TACTCTTCTGTAAA-----AA--T-G-AAT-C-----CAA----TGAAAT-G-TTG---GAAT-ATCG-----T-T---A--T---T-TTT------AATA-AAGTTTTCAGGTCTGTTATT--TTCA--AACTACTTGTGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCCCCAGAAATGTTT--GTATTTTGTcacaacttttataagctgaaatgccgaagtgaaaaaagaattgaggacatttttttttattataaagcgcctgaaaataccgaaacaacagtttcaataacatttgcttttactcttctgtaaaaatgaatccaatgaaatgttggaatatcgttatttttaataaagttttcaggtctgttattttcaaactacttgtgaaaattatatttttgttcccccagaaatgtttgtattttgtgtact
gi|2 : tccattcaaaatgcattttgggtattaccgatattttacattaaacatgcgaaagttcatattgcatatctgcgtgcgaaacgacaa----TGTAAT-G-TTG---GAAT-ACTT-----T-T---T--T---G-TCT-T-CAAAATACAA--------------AACT--GTCA--AACTTTTTGAGAA-AT--G-AATGTT-----T-TTCTTCCTACTGAAAAGTGA--GTATTTTGTTAGTTCGCCATTTTTAAATGGAG-A-gtact
gi|20 : A-AAA---GTA----T-C-------TGAAAATGCCAGA---GCAA----------GT-TTCTACTACAA--ACT----AA--TACACTGTTGCAAA-----AA--T-G-A-A-AA----CAA----TGTAAT-GATTGAAGGAAT-ATCT-----T-T---A--T---T-TTT-C-TTTAATACA-GTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTAGGAA-AA--T-TATATTACCAGTATTATTCTTCCTGAAAAATTT--GTATTTTGCTAGTTCACCA-TTTTGAATGGAG-A-cagcgaaatgtgtttaaaagaacttattcaatatgaaaactattcattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaagtgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattattttttcccacgtgttcggtagatgtggactgagattgtgttaatatttcaacgtacctgaaacgaagagatattctactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgatacttatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaaggaaacacctaactctggcttcc
gi|21 : CATTCAAAA-TGCTGAAC-T------TA--C-ATTTTG-AGTGTTTTACA--ATTTT-ACATATTAAAATGTGCAAATGTTGA-TATTAC--ATCTG------C----GTG-CAAAACAATGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT----TGACC--AT-GTGAAC-------ATATGCTA---------A--AT-GTGAAAAAGA-----------AGA-A--------C---CAG-------C--AACA--T-TAAAATGCTGAATATA------CAACT--TT-TTA-A-------------ctatgacacaaatgatatatagtcttgtttaaggcaagtaaattcacaatggtctgtaatgttttgttatatattttatat
gi|21 : t-AA-GAA---GAA----C-CAGCAACATTAAAATGCTGAATATACAACTTTTTAAAAAT-TT-TACTACAT--ACA----AG--TACTCTGCTTTTAA-----AAAAT-G-A-TTG-----CAA----TGTAAT-G-GTA---GAAT-GCTT-----C-T---A--T---T-TTT-T-CTAaaattttactacatacaagtactctgcttttaaaaaatgattgcaatgtaatggtagaatgcttctattttttcta
gi|22 : tcattcaaaatgctgaacttacattttgagtgttttacaattttacatattaaaatgtgcaaatgttgatattacatctgcgtgcaaaacaatgaagttgatatccaatcagaacaggtcattttgaccatgtgaacatatgctaaatgtgaaaTTCATTCAAGA-TGTC-----T-------------TTTTT-TATATTTT-CCGTATTTT-ACAT-----GCTTTTCATAAGTTTA-TAATGT--ATCTG------C----GTG-CAAAACGAC-AAGTTG--ATATCCAAT---CAGAAACGGTCAGTA----TGAGC--AT-GCGAAT---------------------------AT-GT-------G-----------CAA---------------------------AATG--T-TAAAATGCCGAACATA------CGACT--AT-T
gi|22 : --TGCTCTGCTGTAAGTAAATAA--T-A-A-T-A-----CAA----TG-AACTA-TTG---GAAT-ACCT-----T-T---A--T---T-TTTAT-CTactctgcccaaggaactatagtggaagaggacctttcctctccaattccttgctctgctgtaagtaaataataatacaatgaactattggaatacctttatttttatct
gi|23 : ttcattcaagatgtctttttttatattttccgtattttacatgcttttcataagtttataatgtatctgcgtgcaaaacgacaagttgatatccaatcagaaacggtcagtatgagcatgcgaatatgtgcaaaatgttaaaatgccgaacatacgactattactctgcccaaggaactatagtggaagaggacctttcctctccaattcct-------C--AATG--G-CAAAATGCAGAACATT------CAACT--TT-TAT-A-------------GCCTG-AAATGTC-GAGTTAATATA--------AAAATTG-AGGACATTCT----TC---AT----A-CA-AAA---GCG----C---------TGAAAATGT---------------------------------AG--ACT----A-----TTCTGCTATAA------------G-A-T-C-----GAA----TATAA-------------T-ACCTAATAAT-T---A--T---G-TTT-T-CTTCATACAAGTTATCAATTCTGTAATT--ATCC--AACTATTTGAGAT-AA--T-TATATT-----T-TTATTCCTCCTTAAAAGTTT--GCATTTTTTTAGTTAACCA-ATTTGAATGGAA-A-
gi|24 : ACTTT----TT---AT----A-AA-ATC---GCG----C-T-------GGAAAATGCCGAA---GCAAT--------AGT-TTCTAC-------ACT----AT--TACTGGGGCGTGAA-----AA--TTA-A-T-A-----CAC----TATAAC-G-TTG---GAAT-ACCT-----T-T---A--A---T-TT--------ATACAAGTTTTCATGTCTGTTATT--ATTA--AACTATTTGAGAA-AA--A-TATCTT-----T-TTGTT-CTCTAGAAAAGTTT--ATATTTTGTAAGTTCGTCG-TTTTAAATGGAA-A-caacga
gi|25 : atataT---CAGAACTTGTCATTT----TGACCCCAT-CTGAGC-------A-----------------------T-------------------TGA-A--------CATGT-G-------CCAAATG--T-TAAAAGGC-----ATT------CAACG--TT-TTT-A-------------GACTG-AATTACT-GAA-CAAGATCTGGTACAAAAAACAACAACACATTTT----TC---AC----------------------------------AAAA-----AA---GC----------------TC----ACAA--AATTAGGAG--TATTCTGTCTTTAA-----TA--T-G-A-A-AA----CAA----TGCAAT-G-TTG---GAATTATAT-----T-T----------T-TTT-T-TTAAATACAAGTTTTTGGGTCTGTAATT--ATCA--GACTTTTTGAGAcaacgatatatacatgctactgaaaatgtatttataaa
gi|26 : AGCTG--GTATCCAAT---CAGGATAGGTCATAC----TGACA--AT-ATGAAC-------A----------------T--GT-GC-------A-----------C-A-A--------C-------------------------AAAACGCTGAACATA------CAACTG-TT-TTT-C-------------GGTTC-AAATCCT-AACGTAATATC--------CAAAATG-AGAAC-TTTT----T-----T----T---------------------------------TGTC--A---GCAAC--------AAT-TTCTACTCCAA--ACT----AT--AACT------TAAA-----AA--TTA-A-T-G-----CAA----TGAAAC-G-TTA---GAAT-AACT-----T-T---A--T---T-TTT-TTCCATATAAAAGTTTTTAGGTCTGTAATT--ATAA--AACTATTTTAGAA-
gi|27 : TTTTAGGTCTGCGGTT--ATTA--CA-TATTTGAGGC-AA--T-TATGTT-----T-TTGTTTCTCCTGAACATTTT--GTATTTT-TTAGTTCGCTT-TTTTGGATGAAG-
gi|28 : tttgataattactcataaacaCTCAATTCAAAG-TGCCGAAT-TT-----AC--C-ATTTAG-GG-AGTTT-TGTTACTTT-GCAT--TAAAATGTGTGGGTATTTA-TACTGC--AACTG------T----GTG-TAAAACAACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGATCAGGTCTTTT----TCAAA--AT-GTGACC---------------------------AT-GT-------G-----------CAA-A--------A---T-G-------T--AAgtcaacgacaggaaaatatacgatgtcgacaatggatctatgacacagttatccatgaattaatgttcccttactatgtattgttattg
gi|29 : GCCGAAC-TT-----AC--C-ATTTTG-GAAATGTT--GGTATTTT-ACAT--TATAATGTGCAAAAGTTCA-CACTGC--ATCTG------C----ATA-CAAAACGACAAAGTTG--ATATCCAAT---CAGATCAGGTCTTGT----TGACC--AT-GTGACT-------G----------------AACAT-GT-------G-----------CAA-A--------ctaagacagcacgctcaactattcaaata
gi|3 : ----TGTAAT-G-TTG---GAAT-ACTT-----T-T---T--T---G-TCT-T-CAAAATACAA--------------AACT--GTCA--AACTTTTTGAGAA-AT--G-AATGTT-----T-TTCTTCCTACTGAAAAGTGA--GTATTTTGTTAGTTCGCCATTTTTAAATGGAG-A-
gi|31 : GTTTTCAGGTCTGTAACT--ATCA--ACCTCTTTGAGAA-AA--T-AATATT-----------------TGAAA--CTTGGGTATATTGTT--------A-TTTTGAATGGAGAA-CAAcagcgaaatgtgtttaaaagaacttattcaatatgaaaactattcattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaagtgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattattttttcccacgtgttcggtagatgtggactgagattgtgttaatatttcaacgtacctgaaacgaagagatattctactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgatacttatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaaggaaacacctaactctggcttc
gi|32 : TTTTAAGTTTGTTATT--ATCA--A--TAT-----AATAA--T-TAT-----------TGTTCCTTTTGAAGATTTT--GTATTTTGTTAGTTCACCA-TTTTGAATGGAG-A-cgata
gi|33 : cT-ATAT--TAAAA-----AGAAATTCA-TATCCC--ATATG------C----ATG-CAAAGCGACGAAGACG--ATATCCAGT---C--AAC--GTTATTT----TGACC--AC-GTGAc
gi|35 : GTCTCTATTCAAAA-TGCCGAACTT------AC--C-ATTTTG-GGTA-TTA-CGGTATTTA-ACAT--TTAAATGTGCt
gi|36 : A-A--------C---TTG-------C--AATA--T-CAAAATGACGAACATA------CAACT--T------G-------------GGCTG-ATATACA-GAAGTAATATC--------GAA
gi|38 : GTCTCCATTCAAAC-TGCCAAAC-T------TG--C-ATT--------TTTT-CAGAATTTT-ACAT--TCAAATTTGC
gi|4 : taGTCTCCATTAAAAA-TGCCAAAC-TTTACTTAC--C-ACTTTG-GGTATTTT-CAGTGCTAT-ACAT--TAAAATGTGCCGAATTGCA-TACAGT--ATCTG------C----GTG-CAAAATGACAAAGTCT--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT----TGGCC--AT-GTG-CA-------A----------------A--AT-GTAAAA---A-----------TGA-AGAAC----C---T-G-------C--AATA--T-AAAAATGCCGAACATACAGTTTCAATT--TT-TTA-A-------------GGCTG-AAATGTCAGAAGTAATATC--------AAAATTG-AAGACAATGT----TC---AT----A-AA-AAA---AAAACG-C-T-------TGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTCTACTACAA--AAT----AT--CAAGGTGCTGT-AA-----AA--T-GAA-T-A-----CAA----TGTTAT-G-TAG---GAAT-ACCT-----T-T---ATTT---T-TTT-T-CTTAATACAGATTTTCTGGTCTGTAATT--TTCA--AACTAATT--GAA-AA--T-TATATT-----A-TTGTTGCTCGGGAAAAGTAT--GTATTTTGCTAGTTTGCCA-TTTTGAATGGAG-
gi|5 : ATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATTTGGGAAAGTTCA-CACTGT--GGCTG------C----TTG--AAAACAACGAAGTGA--GTACC--------AGAACAAGACCTTG----TGAAC--AT-GT--TC-------A----------------A--AGTGT-------A-----------AAA-A--------C---T-G-------C--A-TA--T-TAAAATGACAAACATA------CAACT--TT-TTT-A-------------TGTTG-AAATGCC-GAAGTAATAT---------AAAATTG-AGGACATTTT----TC---AT------GA-AAA---GCA----C-C-------TGAAATTGCAGAA---GCAAT--------ATT-TTCTACTATAC--ACT----AT--TACTCTGCTGT-AA-----AA--T-A-A-T-A-----CAA----TGAAAA-T-CTG---GAAT-AATT-----T-C---A--T---T-TTT-T-CTATATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTTTTAGAGAA-AA--T-CATATT-----T-TCGTTCCTCCTG-AAAGTTT---TGTTTGGTTAGTTCGCCA-TTTTAAATGGAG-A-tccaatgatgtgttatgtattattttttttaatatacaaaataaatttaaaatgctttttcatttaatattttaatg
gi|6 : ATTCAAAAATGCAGAACAT------AAACC-ATTTTG-GAAATTTT-CAGCATTTT-ACAT--TAAAATGTGCAGAAGTTTA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACG------TTG--ATATCCAAT---CAAAAAAGGTCATTTAATTTGACC--AT-GTTAACTTGCATAA----------------A--AT-GT-------GAAAAAAAAAATCAA-C--------C---T-G-------A--ATTA--T-TAAAATACCGAACATA------CACCT--TT-TTTTA-------------GTCTG-AAATGTT-GAAGTAATACC--------AAAACCG-AG---ATTTTATTTTT---AT----TCAA-AAA---GTG----C-C-------TGAAAATGCTGAA---GCAAC--------TGA-TTCTACCACAA--ACT----AG--TACTCTGCTGTACA-----AA--T-GAA-T-A-----CCA----TGAAAC-G-TTG---GGAT-ACCT-----TCT---T--T---T-TTT-T-CCAAATACAAGTATTCAGGTCTGTAATA--ATCA--AGATATTTGAAAA-AA-----A------------------TCCTGAAATATTT--GTATTTTGTAAGTTTGCCA-TTTTGAATAGAG-A-caacaataagtatgattcagagataaacttgggaataactaatgcaaataaaaccaattaaagatgccaatgaatagcttagtaattattttatata
gi|7 : CTCCATTCAAAA-TGCTTAGC-T------TC--CGACTTTT-GGTATTTT-CGGTTCATT-AACT--TGAAATGTGCGAAATTCTA-TACTGC--ATCTG------CCTGCGTG-CAAAACAATGAAAATA--ATATCCGAT---CAGAACAGGTTATTT----TGACC--AT-ATGAAC-------ATGTGCGA---------A--AT-GT-------AAAAATGA----CGA-G--------CCTGT-G-------C--ATTA--T--AAAATGCCGAACATA------CAACT--AT-TTG-G-------------GCCGG-AAATGCG-GAAGTACTATC--------CAAATTG-AGGAGATTTT----TC---AT----T-AG-AAA---AAAACT-C-C-------TTTAAATGCCGAA---CCAAC--------AGT-TTCTTCT--------T----AG--TACTCTATTGTAAA-----AC--TAA-A-T-A-----CAA----AGTAGC-G-TTG---GGGT-ACCT-----T-T------T---T-TT-------AATACAAGTTTTCAGGTCTG--------------ACTTTATGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTCCCTCCTGAATAGCTG--GTATTTTCTTAGTTCATCC-TTTTGAATAGAG-ATCAA
gi|8 : GTCTCCATTTAAAA-TGCCGAAC-T------AA--C-ATTTTA-GGCATTTT-CCATATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGATGTCCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACAACGAACTTA--ATAATCAAT---CAGAACATGTCTTTT----TTTCC--CT-GTGATC-------A----------------A--AG-GT-------A-----------CGA-G--------C---T-G-------C--CATA--T-TAAAATGCTAAACATA------CAACT--AT-TTG-A-------------GGCTG-AAATGCA-GAAGAAATATC--------AAAATTG-AGGATATGTT----TC---AT----T-CA-AAA---GGA----C-C-------TGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTGTACAACAA--ACT----TG--TAGTCTTCTATTAA-----AA--T-G-A-T-A-----CAA----TGTAAT-G-TTG---GAAT-GCCT-----T-G---A--T---G-TTT-GACCAAATACAAGTTTTCAGG-CTGTAAGT--ATAA--AACTATTTGAGAA-AG--T-TATATT-----T-TTGTTTTTCCTGAAACGTTT--GTATTTTGTTACTTTGCAA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
gi|9 : GTTTTCATTCAAAA-TGGCTA---T------AC--C-ATACTG-GTTATTTT-CCGTATTTT-TCAT--TAAAATGTGC-------CAATACTGC--ATCTG------C----ATC-CAAAACAATAAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGATTATTTGT--TGACA--AT-GTAGAC-------ATATGTGCAA-------A--AT-GTCAGACAGA-----------TGA-AA-------C---T-G-------C--AACA--T-TACAGTGCCGACCACA------CAACT--CT-TT--A-------------GGTTG-AAATGCC-AGAGTAATATG--------ATA----------ATTTT----TC---AT----A-AA-AAA---GTA----C-C-------TGGAATTGCTGAG---GCAAC--------AGT-TTATTCTACAA--AAT----AT--TACTCTGTTGTAAA-----GA--T-GAA-T-A-----CAA----TGTGAT-G-CTG---GAAT-TCTT-----T-T---A--TATAT-TTC-T-CTGAATATAAGTTTTCAGGTTTGTAAGT--ATCA--AACTATTTGAGGG-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTTCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCTCCA-ATTTGAAt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): GTTTTACTTTATTTATTCTTTATGATACCATATCTTCATATTTCGATATTTTAATATTCGGTAGATAATATGTAATATATATTAGCTATAATAGTTTGAAATGTATC
Unaligned ( gi|34 ): TCATCCTGCGTCTCCTGTAACATACATGATGTCTAATCGCAACTTTAATGAAGATATGAAAAGTGTCAAGTTTATTA
Unaligned ( gi|37 ): CAGTATAAAAATTGGATAAGGATCATTCTCTATATAAACTCTACAAGACTAAAATTCAAA
Unaligned ( gi|39 ): ATATACTTATAAACAATTGTTCTAATTCTACA
Alignments
lowQualScore : 222222222 11111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 222222222222 11111111111
lowQualScore : 2 1 4 444444444 2 2 4 1 22 4 4 22 555555 4444 2 22 555 33333333 22 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 555555 44 1 6666 99999999999 1 3 66666666 2 333 22 333 222222222222 1 333 1 1 0 333 66666666 1 22 77777777 1 222 44444 5 55555555555 3333 0 55 1 222 1 0 33333 1 888888888888 1 3333 33 22 22 1 5555 44444 1 22 6 2 5
lowQualScore : . . . ......... . . . . .. . . .. ...... .... . .. ... ........ .. . ................................................................................................. . ...... .. . .... ........... . . ........ . ... .. ... ............ . ... . . . ... ........ . .. ........ . ... ..... . ........... .... . .. . ... . . ..... . ............ . .... .. .. .. . .... ..... . .. . . .
lowQualScore : 4 4 4 444444444 1 1 0 9 55 7 0 88 888888 2222 0 66 000 00000000 55 8 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 000000 11 7 2222 00000000000 9 8 99999999 1 555 88 555 111111111111 9 333 3 0 1 222 66666666 8 55 33333333 7 888 33333 2 99999999999 3333 5 77 5 777 5 7 88888 5 666666666666 5 6666 77 00 00 6 2222 22222 7 55 3 2 0
consensus : GTCTCCATTCAAAA-TGCCGAAC-TT-----A--CC-ATTTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGAAGTTCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-----------AAC-------A------------------A--A-TGT-------A-----------CGA-A--------C---T-G-------C--AATATTAAAATGCCGAACATA------CAACT--TT-TT--T-AGG-----------CTG-AAATGCC-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TC---AT-------A----AA-AAA---GCGCCTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTCTACTACAA--ACT----AG--TACTCTGCTG-T--AAA-----AAT-GAA-T-A-----CAA----TGTAAC-G-TTG---GAAT-ACCT-----T-T---A--T---T-TTT-T-CTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCGCCA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
Reference ( family-4804 ) : GTCTCCATTCAAAA-TGCCGAAC-T------A--CC-ATTTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGAAGTTCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-----------AAC-------A------------------A--A-TGT-------A-----------CGA-A--------C---T-G-------C--AATATTAAAATGCCGAACATA------CAACT--TT-TT--T-AGG-----------CTG-AAATGCC-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TC---AT-------N----AA-AAA---GCGCCTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTCTACTACAA--ACT----AG--TACTCTGCTG-T--AAA-----AAT-G-A-T-A-----CAA----TGTAAC-G-TTG---GAAT-ACCT-----T-T---A--T---T-TTT-T-CTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCGCCA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
gi|1 : ----TGTAAT-G-TTG---GAAT-ACTT-----T-T---A--T---G-TCT-T-CAAAATACAA--------------AACT--GTCA--AACTTTTTGAGAA-AT--G-TATGTT-----T-TTCTTCCTCCTGAAAAGTGA--GTATTTTGTTAGTTCGCCATTTTTAAATGGAG-A-
gi|10 : GTCTCTATTCAAAA-TGCCAAAC-A------A-----ATTT-G-GGTATTTT-CGGTATTTT-GTAT--TAACATGTGCTGAA-TTCA-TACTGC--ATCTGATCCTAT----GTG-CAAAACTACAAAGCTG--GTATCCACTACGCAAAACTGCTCATTT---------GACC--AT-GAG-----------AAT-------ATGTCTTATTTATAAAAAAA--A-TG--------A-----------CGATA--------C---T-G-------C--AATATTAAAATGCCGAT--TA------CAA--------------GG-----------CTG-AAATGCC-AAAATGATATC--------AACATTT-TTGAC---ATATT--TT---AT-------A----AA-AAT---TCGCCTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AAT-TTCTTCAACAA----T----AGATTACCCAGCTA-T---AA-----AAT-GAA-T-ACATTCCAA----TGAAAC-G-TTG---GACA-AC------------------------------AATTA-----TTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATATAAGCT-TA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCAGAAAAGATT--GTATTAT-TTAGTTcagcgaaatgtgtttaaaagaaaagaacttattcaatatgaaaactatttattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaactgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattatttgttcccacgtgttcggtagacgtggactgagattgtgttaatattacaacgtacctgaaacgaagagatatgatactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgataattatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaagaaaacaccgaactctggcttcc
gi|11 : tgCAAAA-TGCCAAAC-TT-----A--CC-ATTTTG-GATAATTC-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATATGCAGGAGTTCA-TACCGT--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--TTATCCAAT---CGGAACTGGTCATTC--------TTACC--AC-GTG-----------AAC-----------------------------A-T------------------------------------------------C--AATATGAAAATGCCGAGCGTA------CATCT--TT-TT--C-TAA-----------CTG-AAACGTC-GAAGTAATAAC--------AAAATAG-AGAAC---AGTTT--TC---GT-------A----AA-AAATATACACCTGAAAATGCCAAA---GCAAC--------AGT-TTATTCTACAA--ACT----AG--CACTCTGTTG-T--AAA-----GAT-GAA-T-A-----TAA----TGTATC-G-TTG---AAAT-ACCT-----T-T---A--C---T-TTT-T-ATTAATACAAAGTTTCAGATCCGAAATC--ATAA--AAATATTTGAATA-AA-----AAGTG-----T-TTGTTT----------GTTT--TTTTTTTGT---TTTGGCA-TTTTGCATAGAG-A-atgttaactatgt
gi|12 : C-ATTTTG-GGTATTTTTCAG-ATTTT-ACAT--TAAAATGTGCAGAAGTTTG-T--------TCTG------A----GTG-TAAAACGACGTAACTG--ATATCCAAT---TAGAACATGCCATGT--------TGATC--AT-GTG-----------AGC-------ACATGTAA-----------A--A-TGT-------A-----------CAA-ATGACATGAC---T-G-------C--AATATTTAAATGCTGAACATA------CAACTCATT-TT--T-AGG-----------CTG-AAATACC-AAAGTAATATC--------AAAATTG-AGAAC---ATTTT--TC---A---------------------------TGAAAAT------------AT--------ATTATTCTACT--------------G--TAATTT--TT-T--AAA-------T-GAA-T-A-----CAA----TGAAA-----------AAT-A--T-----A-T---A--T---T-TTT-T-TTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTTATT--ATCA--AATTACTTAAGAA-AA--T-GATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--ATATGTTGTTAGTTCGCCA-TTTTAAATGGAG-A-taaagaaaacatattttacga
gi|13 : --TAAAATGTGCAGAGGTTCAACACTGC--AGCTA------C----GTG-CAAAACGATGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGGACAGGTCATTT--------TGACA--AT-GTG-----------CAC-------ATGTTAC------------A--A-TG--------A-----------TGA-A--------C---C-T-------CG-AATATCAAAATGCTGAACATA------CAACT--AT-TT--G-AGT-----------CTG-AAATACC-TAAGTTAAATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TT---ATAAAATAAA----AA-AAA---GCTCCTGAAAATGCCGAA---CCAAC--------AGT-TTCTTCTAGAA--ATT----AG--TACTCTGCTG-T--AAA-----AAA-GAA-T-A-----CAA----TGTAAC-T-TTC---AAAT-ACCA-----T-T---T--T---T-TCT-T-CTAAACA-------TCAATTCTGTAATT--ATCA--AACTAATTAACAA-AA--T-AATACT-----T-TTG-TCCTCCTGAAAAGATT--ACATTTTATTTGTTCACCA-TTTTGAATGGAG-A-ctgcaatggtatg
gi|14 : GTCGCCATTTAAAA-TGCTAAAT-T------AA-CC-ATTTTA-GGTATATT-CGG-ATTTTGATAT--TATAATGTGCGGAAGTTCA--ACT-------TG------G----G-G-TACAATGATGAAGTTG--ATATCCAGT---CAGAACAGGTCATTT--------TTGCC--AT-GTGGTCATGTGCAAAAT-------ATTAA--------------A--A-T-T-------A-----------CGA-A--------T---TTA-------C--ACTATTAAAACGCCATACATA------CAATT--TTGTT--T-AGT-----------CTG-AA-----------AATA------------------AGGAA---A-TTA--TC---AT-------A----AATAAA---GCAC---A-------GGA---GCAAC--------AGT-TTCTACTATAA--AAG----TG--TACTCTGCTGTT--AAA-----ATT-A-A-T-ATTTTGCAATACTTGTA-----TTG---GGCC-ACGT-----T-T---A--TACGTATTT-T-CTAAAAACAAGATTTTAGGTCTGTAATTAAATAATTAACTATTGAAGAA-AG-----A------------------TCCAAAAAAGTTT--GTATTca
gi|15 : TTCAAAA-TGCCGAAC-TT-----A--CC-ATTTTG-GGTATTTT-TGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGC-GAAGTTCA-TATTAC--AAATG------T----GAG-CGAAACAACAAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGCCATTT--------TGATC--ATAGTG-----------AACAA-----A------------------A--A-TG--------A-----------CGA-A--------A---TCG-------A--AATATGAAAATGCTGAATACA------TAACT--TT-TT-----AG-----------TTT-ATTTGCC-AAAGCAATATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TC---AT-------A----AA-AAA---TCATCCGAAAATGACAAT---GCAAC--------ATT-TTCTACTACGA--ACT----AT--TATTCAGCTG-T--TAA-----AAT-GAA-T-A-----CAA----TGAAAT-T-TCA---GG------T-----C-T---G--T---TATTA-T-CAAACTA-----TTTGAGA--------------A--AACTAT------A-TA--TATACATG-----T-ATGTTCCTCCTGAAAAGT
gi|16 : GTGTCCATTCAAAA-TGCTGATC-TT-----A--CC-ATTTTATGATATTTT-CTGTATTTC-ACAT--TGAAATATGCAGAAGTTCA-TGCTAC--ATATA------C----GTGTCAATA--ACGAAGTTG--ATATTCAAT---CAGAATAGATCGATT--------TGACC--AT-GCA-----------AAC-------A-----------------------TGT-------A-----------CAA-A--------A---T-GTAACATTC--AGTATTAAAATGCCGGACATG------CGACT--TT-TT--TTAAG-----------CTG-AAGTACC-GAAATAATATA--------AAAATAG-AGGAC---ATTTTCTTT---A--------A----AA-AAA---ACGCATGAAAATACCGAG---GCAAG--------AAA-TTCTACTACAA--ACT----AT--TACTCTGC-A-T--TAA-----AAT-G-----------TCA----TGTAAA-G-TTG---GAAT-ACTT-----G-TGTAA--T---A-TTT-T----AATACAATATTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTgta
gi|17 : ttaTTCCAGA-TGCCGAAC-TT-----A--CC-ATTTT-----------TGATATTTT-ATAC--TTAAATGTTCGGAAGTTCA-TACTGC--GTCTG------C-----TG-TAAAACCATAGAGTTG--ATATCTAAT---CGGAACTGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-------------C-------A------------------A--A--AT-------A-----------TTA-A--------------G-------T--TATATCAAAAT--TGAGGATA----------T--TT-TTCAT-AGAAAAAAAAATGCCTGAAAATGCC-AAAGTAACAct
gi|17 : agAAGTTATATC--------AAAATTG-AGGAT---ATTTT--TC---AT-------AGAAAAA-AAA---ATGCCTGAAAATGCCAAA---GTAAC--------AGT-TTCTACTAT------------------TCTGCTG-T--AAA-----AAT-G-AAT-A-----CTA----TATAAC-T-TTG---GAAT-ACTT-----T-T---A--T---TATTT-T-CTTAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAAGT--TTCA--AACTTTTCGAG-A-AA--T-T-TATT-----T-T--CCCCTCTTGAAAAGT-----TATTTTGTTAGGTGGCCA-TTTTGAGTGGAG-ATCAAgtttctactattctgctgtaaaaatgaatactatataactttggaatacttttattattttcttaatacaagttttcaggtctgtaagtttcaaacttttcgagaaatttattttcccctcttgaaaagttattttgttaggtggccattttgagtggagatcaacaaatttag
gi|18 : agttccagatgccgaacttaccatttttgatattttatacttaaatgttcggaagttcatactgcgtctgctgtaaaaccatagagttgatatctaatcggaactggtcattttgaccatgtgcaaaatattTAAAGTGCTGAGCATA------CAACT--TT-T---T-AGG-----------CTG-AAGTGTT-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AAGAC---ATTTT--TT---AT------------AA-AAA---GCGCCGGAAAAT-CAGAA---GCAAC--------AGT-CTCCACTACTA--ACA----AT--TACTCTGCTG-T--AAA-----AAT-GAA-T-A-----CAA----TGTAAT-A-TTT---GAAT-GCCT-----T-T---AT-T---T-TTT-T-CTAAATACAAA-TTTCAGGTCTGTTATC--ATCA--AACTATTTTAAAA-AAGGT-TGTATT-----T-TTcaaatttag
gi|19 : aacaagaatgacaaaacgtcatacagcagcaggtgTCCATTCAAAA-TGC-------------------ATTTTG-GGTATTAC-CGATATTTT-ACAT--T-AAACATGCGAAAGTTCA-TATTGCATATCTG------C----GTG-CGAAACGACAAAACTGCAATATAAAATG--CCGAACACACAACTT--------T-------T-ATA-----------AGCTG-----A------------------A--A-TGC-------------------CGA-A--------G---T-G-------A--AAAA--AGAATTGAGGACAT---------TTT--TT-TT--T-ATT-----------ATA-AAGCGCCTGAA--AATACC--------GAAAtagtttgccattttacatataaaaaaaacaatagtttgcaaatttgaatttttttaatattattgatataaatgtggaactttaaattagaaaatgttgattttaa
gi|19 : A-A--------C---T-G-------C--AATAT-AAAATGCCGAACACA------CAACT--TT-TA--T-AAG-----------CTG-AAATGCC-GAAGTGAAAAA--------AGAATTG-AGGAC---ATTTT--TTTTTAT-------T----AT-AAA---GCGCCTGAAAATACCGAA---ACAAC--------AGT-TTCAATAACATTTGCT----TT--TACTCTTCTG-T--AAA-----AAT-G-AAT-C-----CAA----TGAAAT-G-TTG---GAAT-ATCG-----T-T---A--T---T-TTT------AATA-AAGTTTTCAGGTCTGTTATT--TTCA--AACTACTTGTGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCCCCAGAAATGTTT--GTATTTTGTcaacagtttcaataacatttgcttttactcttctgtaaaaatgaatccaatgaaatgttggaatatcgttatttttaataaagttttcaggtctgttattttcaaactacttgtgaaaattatatttttgttcccccagaaatgtttgtattttgtgtact
gi|2 : tccattcaaaatgcattttgggtattaccgatattttacattaaacatgcgaaagttcatattgcatatctgcgtgcgaaacgacaa----TGTAAT-G-TTG---GAAT-ACTT-----T-T---T--T---G-TCT-T-CAAAATACAA--------------AACT--GTCA--AACTTTTTGAGAA-AT--G-AATGTT-----T-TTCTTCCTACTGAAAAGTGA--GTATTTTGTTAGTTCGCCATTTTTAAATGGAG-A-gtact
gi|20 : A-AAA---GTATCTGAAAATGCCAGA---GCAA----------GT-TTCTACTACAA--ACT----AA--TACACTGTTG-C--AAA-----AAT-G-A-A-AA----CAA----TGTAAT-GATTGAAGGAAT-ATCT-----T-T---A--T---T-TTT-C-TTTAATACA-GTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTAGGAA-AA--T-TATATTACCAGTATTATTCTTCCTGAAAAATTT--GTATTTTGCTAGTTCACCA-TTTTGAATGGAG-A-cagcgaaatgtgtttaaaagaacttattcaatatgaaaactattcattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaagtgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattattttttcccacgtgttcggtagatgtggactgagattgtgttaatatttcaacgtacctgaaacgaagagatattctactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgatacttatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaaggaaacacctaactctggcttcc
gi|21 : CATTCAAAA-TGCTGAAC-T------T--AC-ATTTTG-AGTGTTTTACA--ATTTT-ACATATTAAAATGTGCAAATGTTGA-TATTAC--ATCTG------C----GTG-CAAAACAATGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-----------AAC-------ATATGCTA-----------A--A-TGTGAAAAAGA-----------AGA-A--------C---CAG-------C--AACATTAAAATGCTGAATATA------CAACT--TT-TT--ctatgacacaaatgatatatagtcttgtttaaggcaagtaaattcacaatggtctgtaatgttttgttatatattttatat
gi|21 : tAAAATGCTGAATATACAACTTTTTAAAAAT-TT-TACTACAT--ACA----AG--TACTCTGCTT-TTAAAA-----AAT-G-A-TTG-----CAA----TGTAAT-G-GTA---GAAT-GCTT-----C-T---A--T---T-TTT-T-CTAaaaaattttactacatacaagtactctgcttttaaaaaatgattgcaatgtaatggtagaatgcttctattttttcta
gi|22 : tcattcaaaatgctgaacttacattttgagtgttttacaattttacatattaaaatgtgcaaatgttgatattacatctgcgtgcaaaacaatgaagttgatatccaatcagaacaggtcattttgaccatgtgaacatatgctaaatgtgaaaaagaagaaccagcaacattTTCATTCAAGA-TGTC-----T-------------TTTTT-TATATTTT-CCGTATTTT-ACAT-----GCTTTTCATAAGTTTA-TAATGT--ATCTG------C----GTG-CAAAACGAC-AAGTTG--ATATCCAAT---CAGAAACGGTCAGTA--------TGAGC--AT-GCG-----------AAT-----------------------------A-TGT-------G-----------CAA---------------------------AATGTTAAAATGCCGAACATA------CGACT--AT-T
gi|22 : --TGCTCTGCTG-T--AAGTAAATAAT-A-A-T-A-----CAA----TG-AACTA-TTG---GAAT-ACCT-----T-T---A--T---T-TTTAT-CTactctgcccaaggaactatagtggaagaggacctttcctctccaattccttgctctgctgtaagtaaataataatacaatgaactattggaatacctttatttttatct
gi|23 : ttcattcaagatgtctttttttatattttccgtattttacatgcttttcataagtttataatgtatctgcgtgcaaaacgacaagttgatatccaatcagaaacggtcagtatgagcatgcgaatatgtgcaaaatgttaaaatgccgaacatacgactattactctgcccaaggaactatagtggaagaggacctttcctctccaattcct-------C--AATGGCAAAATGCAGAACATT------CAACT--TT-TA--T-AGC-----------CTG-AAATGTC-GAGTTAATATA--------AAAATTG-AGGAC---ATTCT--TC---AT-------A----CA-AAA---GCGC-TGAAAATGT---------------------------------AG--ACT----A-----TTCTGCTA-T--AA----------G-A-T-C-----GAA----TATAA-------------T-ACCTAATAAT-T---A--T---G-TTT-T-CTTCATACAAGTTATCAATTCTGTAATT--ATCC--AACTATTTGAGAT-AA--T-TATATT-----T-TTATTCCTCCTTAAAAGTTT--GCATTTTTTTAGTTAACCA-ATTTGAATGGAA-A-
gi|24 : ---ACTTT--TT---AT-------A----AA-ATC---GCGCTGGAAAATGCCGAA---GCAAT--------AGT-TTCTAC-------ACT----AT--TACTGGGGCG-T--GAA-----AATTA-A-T-A-----CAC----TATAAC-G-TTG---GAAT-ACCT-----T-T---A--A---T-TT--------ATACAAGTTTTCATGTCTGTTATT--ATTA--AACTATTTGAGAA-AA--A-TATCTT-----T-TTGTT-CTCTAGAAAAGTTT--ATATTTTGTAAGTTCGTCG-TTTTAAATGGAA-A-caacga
gi|25 : atataT---CAGAACTTGTCATTT--------TGACCCCAT-CTG-----------AGC-------A-------------------------T-------------------TGA-A--------CATGT-G-------CCAAATGTTAAAAGGC-----ATT------CAACG--TT-TT--T-AGA-----------CTG-AATTACT-GAA-CAAGATCTGGTACAAAAAACAACAACAC---ATTTT--TC---AC-------A----AA-A---------------------AA---GC----------------TC----ACAA--AATTAGGAG--TATTCTGTCT-T--TAA-----TAT-G-A-A-AA----CAA----TGCAAT-G-TTG---GAATTATAT-----T-T----------T-TTT-T-TTAAATACAAGTTTTTGGGTCTGTAATT--ATCA--GACTTTTTGAGAcaacgatatatacatgctactgaaaatgtatttataaa
gi|26 : AGCTG--GTATCCAAT---CAGGATAGGTCATAC--------TGACA--AT-ATG-----------AAC-------A------------------T--G-TGC-------A-----------C-A-A--------C----------------------AAAACGCTGAACATA------CAACTG-TT-TT--T-CGG-----------TTC-AAATCCT-AACGTAATATC--------CAAAATG-AGAAC---TTTTT--TT-------------------------------------TGTC--A---GCAAC--------AAT-TTCTACTCCAA--ACT----AT--AACT-------T--AAA-----AATTA-A-T-G-----CAA----TGAAAC-G-TTA---GAAT-AACT-----T-T---A--T---T-TTT-TTCCATATAAAAGTTTTTAGGTCTGTAATT--ATAA--AACTATTTTAGAA-
gi|27 : TTTTAGGTCTGCGGTT--ATTA--CA-TATTTGAGGC-AA--T-TATGTT-----T-TTGTTTCTCCTGAACATTTT--GTATTTT-TTAGTTCGCTT-TTTTGGATGAAG-
gi|28 : tttgataattactcataaacaCTCAATTCAAAG-TGCCGAAT-TT-----A--CC-ATTTAG-GG-AGTTT-TGTTACTTT-GCAT--TAAAATGTGTGGGTATTTA-TACTGC--AACTG------T----GTG-TAAAACAACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGATCAGGTCTTTTTCAAAATGTGACC--AT-GTG-----------CA--------A------------------A--A-TGT-------A-----------gtcaacgacaggaaaatatacgatgtcgacaatggatctatgacacagttatccatgaattaatgttcccttactatgtattgttattg
gi|29 : GCCGAAC-TT-----A--CC-ATTTTG-GAAATGTT--GGTATTTT-ACAT--TATAATGTGCAAAAGTTCA-CACTGC--ATCTG------C----ATA-CAAAACGACAAAGTTG--ATATCCAAT---CAGATCAGGTCTTGT--------TGACC--AT-GTG-----------ACT-------G------------------AACA-TGT-------G-----------CAA-A--------actaagacagcacgctcaactattcaaata
gi|3 : ----TGTAAT-G-TTG---GAAT-ACTT-----T-T---T--T---G-TCT-T-CAAAATACAA--------------AACT--GTCA--AACTTTTTGAGAA-AT--G-AATGTT-----T-TTCTTCCTACTGAAAAGTGA--GTATTTTGTTAGTTCGCCATTTTTAAATGGAG-A-
gi|31 : GTTTTCAGGTCTGTAACT--ATCA--ACCTCTTTGAGAA-AA--T-AATATT-----------------TGAAA--CTTGGGTATATTGTT--------A-TTTTGAATGGAGAA-CAAcagcgaaatgtgtttaaaagaacttattcaatatgaaaactattcattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaagtgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattattttttcccacgtgttcggtagatgtggactgagattgtgttaatatttcaacgtacctgaaacgaagagatattctactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgatacttatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaaggaaacacctaactctggcttc
gi|32 : TTTTAAGTTTGTTATT--ATCA--A--TAT-----AATAA--T-TAT-----------TGTTCCTTTTGAAGATTTT--GTATTTTGTTAGTTCACCA-TTTTGAATGGAG-A-cgata
gi|33 : cT-ATAT--TAAAA-----AGAAATTCA-TATCCC--ATATG------C----ATG-CAAAGCGACGAAGACG--ATATCCAGT---C--AAC--GTTATTT--------TGACC--AC-GTG-----------Ac
gi|35 : GTCTCTATTCAAAA-TGCCGAACTT------A--CC-ATTTTG-GGTA-TTA-CGGTATTTA-ACAT--TTAAATGTGCt
gi|36 : A-A--------C---TTG-------C--AATATCAAAATGACGAACATA------CAAC-------T--T-GGG-----------CTG-ATATACA-GAAGTAATATC--------GAA
gi|38 : GTCTCCATTCAAAC-TGCCAAAC-T------T--GC-ATT--------TTTT-CAGAATTTT-ACAT--TCAAATTTGC
gi|4 : taGTCTCCATTAAAAA-TGCCAAAC-TTTACTTA--CC-ACTTTG-GGTATTTT-CAGTGCTAT-ACAT--TAAAATGTGCCGAATTGCA-TACAGT--ATCTG------C----GTG-CAAAATGACAAAGTCT--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGGCC--AT-GTG-----------CA--------A------------------A--A-TGTAAAA---A-----------TGA-AGAAC----C---T-G-------C--AATATAAAAATGCCGAACATACAGTTTCAATT--TT-TT--A-AGG-----------CTG-AAATGTCAGAAGTAATATC--------AAAATTG-AAGAC---AATGT--TC---ATAAA----A----AA-AAA---ACGCTTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTCTACTACAA--AAT----AT--CAAGGTGCTG-T---AA-----AAT-GAA-T-A-----CAA----TGTTAT-G-TAG---GAAT-ACCT-----T-T---ATTT---T-TTT-T-CTTAATACAGATTTTCTGGTCTGTAATT--TTCA--AACTAATT--GAA-AA--T-TATATT-----A-TTGTTGCTCGGGAAAAGTAT--GTATTTTGCTAGTTTGCCA-TTTTGAATGGAG-
gi|5 : ATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATTTGGGAAAGTTCA-CACTGT--GGCTG------C----TTG--AAAACAACGAAGTGA--GTACC--------AGAACAAGACCTTG--------TGAAC--AT-GTT-------------C-------A------------------A--AGTGT-------A-----------AAA-A--------C---T-G-------C--A-TATTAAAATGACAAACATA------CAACT--TT-TT--T-ATG-----------TTG-AAATGCC-GAAGTAATAT---------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TC---AT-------G----AA-AA----GCACCTGAAATTGCAGAA---GCAAT--------ATT-TTCTACTATAC--ACT----AT--TACTCTGCTG-T--AAA-----A-T-A-A-T-A-----CAA----TGAAAA-T-CTG---GAAT-AATT-----T-C---A--T---T-TTT-T-CTATATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTTTTAGAGAA-AA--T-CATATT-----T-TCGTTCCTCCTG-AAAGTTT---TGTTTGGTTAGTTCGCCA-TTTTAAATGGAG-A-tccaatgatgtgttatgtattattttttttaatatacaaaataaatttaaaatgctttttcatttaatattttaatg
gi|6 : ATTCAAAAATGCAGAACAT------AAACC-ATTTTG-GAAATTTT-CAGCATTTT-ACAT--TAAAATGTGCAGAAGTTTA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACG------TTG--ATATCCAAT---CAAAAAAGGTCATTTAATT----TGACC--AT-GTT-----------AACTTGCATAA------------------A--A-TGT-------GAAAAAAAAAATCAA-C--------C---T-G-------A--ATTATTAAAATACCGAACATA------CACCT--TT-TT--TTAGT-----------CTG-AAATGTT-GAAGTAATACC--------AAAACCG-AG-ATTTTATTTT--TA---TT-------C----AA-AAA---GTGCCTGAAAATGCTGAA---GCAAC--------TGA-TTCTACCACAA--ACT----AG--TACTCTGCTG-T--ACA-----AAT-GAA-T-A-----CCA----TGAAAC-G-TTG---GGAT-ACCT-----TCT---T--T---T-TTT-T-CCAAATACAAGTATTCAGGTCTGTAATA--ATCA--AGATATTTGAAAA-AA-----A------------------TCCTGAAATATTT--GTATTTTGTAAGTTTGCCA-TTTTGAATAGAG-A-caacaataagtatgattcagagataaacttgggaataactaatgcaaataaaaccaattaaagatgccaatgaatagcttagtaattattttatata
gi|7 : CTCCATTCAAAA-TGCTTAGC-T------T--CCGACTTTT-GGTATTTT-CGGTTCATT-AACT--TGAAATGTGCGAAATTCTA-TACTGC--ATCTG------CCTGCGTG-CAAAACAATGAAAATA--ATATCCGAT---CAGAACAGGTTATTT--------TGACC--AT-ATG-----------AAC-------ATGTGCGA-----------A--A-TGT-------AAAAATGA----CGA-G--------CCTGT-G-------C--ATTAT-AAAATGCCGAACATA------CAACT--AT-TT--G-GGC-----------CGG-AAATGCG-GAAGTACTATC--------CAAATTG-AGGAG---ATTTT--TC---ATTAG----A----AA-AAA---ACTCCTTTAAATGCCGAA---CCAAC--------AGT-TTCTTCT--------T----AG--TACTCTATTG-T--AAA-----ACTAA-A-T-A-----CAA----AGTAGC-G-TTG---GGGT-ACCT-----T-T------T---T-TT-------AATACAAGTTTTCAGGTCTG--------------ACTTTATGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTCCCTCCTGAATAGCTG--GTATTTTCTTAGTTCATCC-TTTTGAATAGAG-ATCAA
gi|8 : GTCTCCATTTAAAA-TGCCGAAC-T------A--AC-ATTTTA-GGCATTTT-CCATATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGATGTCCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACAACGAACTTA--ATAATCAAT---CAGAACATGTCTTTT--------TTTCC--CT-GTG-----------ATC-------A------------------A--A-GGT-------A-----------CGA-G--------C---T-G-------C--CATATTAAAATGCTAAACATA------CAACT--AT-TT--G-AGG-----------CTG-AAATGCA-GAAGAAATATC--------AAAATTG-AGGAT---ATGTT--TC---AT-------T----CA-AAA---GGACCTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTGTACAACAA--ACT----TG--TAGTCTTCTA-T--TAA-----AAT-G-A-T-A-----CAA----TGTAAT-G-TTG---GAAT-GCCT-----T-G---A--T---G-TTT-GACCAAATACAAGTTTTCAGG-CTGTAAGT--ATAA--AACTATTTGAGAA-AG--T-TATATT-----T-TTGTTTTTCCTGAAACGTTT--GTATTTTGTTACTTTGCAA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
gi|9 : GTTTTCATTCAAAA-TGGCTA---T------A--CC-ATACTG-GTTATTTT-CCGTATTTT-TCAT--TAAAATGTGC-------CAATACTGC--ATCTG------C----ATC-CAAAACAATAAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGATTATTTGT------TGACA--AT-GTA-----------GAC-------ATATGTGCAA---------A--A-TGTCAGACAGA-----------TGA-AA-------C---T-G-------C--AACATTACAGTGCCGACCACA------CAAC---TC-TT--T-AGG-----------TTG-AAATGCC-AGAGTAATATG--------ATA-------------ATTTT--TC---AT-------A----AA-AAA---GTACCTGGAATTGCTGAG---GCAAC--------AGT-TTATTCTACAA--AAT----AT--TACTCTGTTG-T--AAA-----GAT-GAA-T-A-----CAA----TGTGAT-G-CTG---GAAT-TCTT-----T-T---A--TATAT-TTC-T-CTGAATATAAGTTTTCAGGTTTGTAAGT--ATCA--AACTATTTGAGGG-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTTCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCTCCA-ATTTGAAt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): GTTTTACTTTATTTATTCTTTATGATACCATATCTTCATATTTCGATATTTTAATATTCGGTAGATAATATGTAATATATATTAGCTATAATAGTTTGAAATGTATC
Unaligned ( gi|34 ): TCATCCTGCGTCTCCTGTAACATACATGATGTCTAATCGCAACTTTAATGAAGATATGAAAAGTGTCAAGTTTATTA
Unaligned ( gi|37 ): CAGTATAAAAATTGGATAAGGATCATTCTCTATATAAACTCTACAAGACTAAAATTCAAA
Unaligned ( gi|39 ): ATATACTTATAAACAATTGTTCTAATTCTACA
Alignments
lowQualScore : 11111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
lowQualScore : 2 1 55555555 2 4 1 22 4 4 22 555555 4444 2 22 555 33333333 22 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 555555 44 1 999999999999999999 1 3 66666666 0 2 333 22 333 88888888 1 777777777777 1 1 0 333 66666666 1 22 77777777 444 22 22 88888 3333 1 33 1 222 1 2 1 888888888888 1 3333 33 22 22 1 5555 44444 1 22 6 2 5
lowQualScore : . . ........ . . . .. . . .. ...... .... . .. ... ........ .. . ................................................................................................. . ...... .. . .................. . . ........ . . ... .. ... ........ . ............ . . . ... ........ . .. ........ ... .. .. ..... .... . .. . ... . . . ............ . .... .. .. .. . .... ..... . .. . . .
lowQualScore : 4 4 88888888 1 0 9 55 7 0 88 888888 2222 0 66 000 00000000 55 8 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 000000 11 7 555555555555555555 9 8 99999999 5 0 333 66 333 33333333 9 999999999999 3 0 1 222 66666666 8 55 33333333 000 44 44 77777 3333 4 77 5 777 5 6 5 666666666666 5 6666 77 00 00 6 2222 22222 7 55 3 2 0
consensus : GTCTCCATTCAAAA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGAAGTTCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-----------AAC-------A------------------A--A-TGT-------A-----------CGA-A--------C---T-G-------C--AATATTAAAATGCCGAACATA------CAACT--TT-TT--T-AGG-----------CTG-AAATGCC-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TC---AT---A----AA-A-------AA---GCGCCTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTCTACTACAA--ACT----AG--TACTCTGCTGT--AA--AAATGA--ATA-----CAA----TGTAAC-G-TTG---GAAT-ACCTT-T---A--T---T-TTT-T-CTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCGCCA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
Reference ( family-4804 ) : GTCTCCATTCAAAA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGAAGTTCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-----------AAC-------A------------------A--A-TGT-------A-----------CGA-A--------C---T-G-------C--AATATTAAAATGCCGAACATA------CAACT--TT-TT--T-AGG-----------CTG-AAATGCC-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TC---AT---A----AA-A-------AA---GCGCCTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTCTACTACAA--ACT----AG--TACTCTGCTGT--AA--AAATGA--ATA-----CAA----TGTAAC-G-TTG---GAAT-ACCTT-T---A--T---T-TTT-T-CTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCGCCA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
gi|1 : ----TGTAAT-G-TTG---GAAT-ACTTT-T---A--T---G-TCT-T-CAAAATACAA--------------AACT--GTCA--AACTTTTTGAGAA-AT--G-TATGTT-----T-TTCTTCCTCCTGAAAAGTGA--GTATTTTGTTAGTTCGCCATTTTTAAATGGAG-A-
gi|10 : GTCTCTATTCAAAA-TGCCAAAC-------A----AATTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-GTAT--TAACATGTGCTGAA-TTCA-TACTGC--ATCTGATCCTAT----GTG-CAAAACTACAAAGCTG--GTATCCACTACGCAAAACTGCTCATTT---------GACC--AT-GAG-----------AAT-------ATGTCTTATTTATAAAAAAA--A-TG--------A-----------CGATA--------C---T-G-------C--AATATTAAAATGCCGAT--TA------CAA--------------GG-----------CTG-AAATGCC-AAAATGATATC--------AACATTT-TTGAC---ATATT--TT---AT---A----AA-A-------AT---TCGCCTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AAT-TTCTTCAACAA----T----AGATTACCCAGCTAT---A--AAATGA--ATACATTCCAA----TGAAAC-G-TTG---GACA-AC-------------------------AATTA-----TTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATATAAGCT-TA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCAGAAAAGATT--GTATTAT-TTAGTTcagcgaaatgtgtttaaaagaaaagaacttattcaatatgaaaactatttattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaactgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattatttgttcccacgtgttcggtagacgtggactgagattgtgttaatattacaacgtacctgaaacgaagagatatgatactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgataattatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaagaaaacaccgaactctggcttcc
gi|11 : tgCAAAA-TGCCAAACTT-----A--CCATTTTG-GATAATTC-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATATGCAGGAGTTCA-TACCGT--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--TTATCCAAT---CGGAACTGGTCATTC--------TTACC--AC-GTG-----------AAC-----------------------------A-T------------------------------------------------C--AATATGAAAATGCCGAGCGTA------CATCT--TT-TT--C-TAA-----------CTG-AAACGTC-GAAGTAATAAC--------AAAATAG-AGAAC---AGTTT--TC---GT---A----AA-A-------AATATACACCTGAAAATGCCAAA---GCAAC--------AGT-TTATTCTACAA--ACT----AG--CACTCTGTTGT--AA--AGATGA--ATA-----TAA----TGTATC-G-TTG---AAAT-ACCTT-T---A--C---T-TTT-T-ATTAATACAAAGTTTCAGATCCGAAATC--ATAA--AAATATTTGAATA-AA-----AAGTG-----T-TTGTTT----------GTTT--TTTTTTTGT---TTTGGCA-TTTTGCATAGAG-A-atgttaactatgt
gi|12 : CATTTTG-GGTATTTTTCAG-ATTTT-ACAT--TAAAATGTGCAGAAGTTTG-T--------TCTG------A----GTG-TAAAACGACGTAACTG--ATATCCAAT---TAGAACATGCCATGT--------TGATC--AT-GTG-----------AGC-------ACATGTAA-----------A--A-TGT-------A-----------CAA-ATGACATGAC---T-G-------C--AATATTTAAATGCTGAACATA------CAACTCATT-TT--T-AGG-----------CTG-AAATACC-AAAGTAATATC--------AAAATTG-AGAAC---ATTTT--TC---A------------------------------TGAAAAT------------AT--------ATTATTCTACT--------------G--TAATTT--TTT--AA----ATGA--ATA-----CAA----TGAAA-----------AAT-A--TA-T---A--T---T-TTT-T-TTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTTATT--ATCA--AATTACTTAAGAA-AA--T-GATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--ATATGTTGTTAGTTCGCCA-TTTTAAATGGAG-A-taaagaaaacatattttacga
gi|13 : --TAAAATGTGCAGAGGTTCAACACTGC--AGCTA------C----GTG-CAAAACGATGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGGACAGGTCATTT--------TGACA--AT-GTG-----------CAC-------ATGTTAC------------A--A-TG--------A-----------TGA-A--------C---C-T-------CG-AATATCAAAATGCTGAACATA------CAACT--AT-TT--G-AGT-----------CTG-AAATACC-TAAGTTAAATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TT---AT---A----AA-ATAAAAAAAA---GCTCCTGAAAATGCCGAA---CCAAC--------AGT-TTCTTCTAGAA--ATT----AG--TACTCTGCTGT--AA--AAAAGA--ATA-----CAA----TGTAAC-T-TTC---AAAT-ACCAT-T---T--T---T-TCT-T-CTAAACA-------TCAATTCTGTAATT--ATCA--AACTAATTAACAA-AA--T-AATACT-----T-TTG-TCCTCCTGAAAAGATT--ACATTTTATTTGTTCACCA-TTTTGAATGGAG-A-ctgcaatggtatg
gi|14 : GTCGCCATTTAAAA-TGCTAAATTA-----A--CCATTTTA-GGTATATT-CGG-ATTTTGATAT--TATAATGTGCGGAAGTTCA--ACT-------TG------G----G-G-TACAATGATGAAGTTG--ATATCCAGT---CAGAACAGGTCATTT--------TTGCC--AT-GTGGTCATGTGCAAAAT-------ATTAA--------------A--A-T-T-------A-----------CGA-A--------T---TTA-------C--ACTATTAAAACGCCATACATA------CAATT--TTGTT--T-AGT-----------CTG-AA-----------AATA------------------AGGAA---A-TTA--TC---AT---A----AATA-------AA---GCAC---A-------GGA---GCAAC--------AGT-TTCTACTATAA--AAG----TG--TACTCTGCTGT--TA--AAATTA--ATATTTTGCAATACTTGTA-----TTG---GGCC-ACGTT-T---A--TACGTATTT-T-CTAAAAACAAGATTTTAGGTCTGTAATTAAATAATTAACTATTGAAGAA-AG-----A------------------TCCAAAAAAGTTT--GTATTca
gi|15 : TTCAAAA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GGTATTTT-TGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGC-GAAGTTCA-TATTAC--AAATG------T----GAG-CGAAACAACAAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGCCATTT--------TGATC--ATAGTG-----------AACAA-----A------------------A--A-TG--------A-----------CGA-A--------A---TCG-------A--AATATGAAAATGCTGAATACA------TAACT--TT-TT-----AG-----------TTT-ATTTGCC-AAAGCAATATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TC---AT---A----AA-A-------AA---TCATCCGAAAATGACAAT---GCAAC--------ATT-TTCTACTACGA--ACT----AT--TATTCAGCTGT--TA--AAATGA--ATA-----CAA----TGAAAT-T-TCA---GG------TC-T---G--T---TATTA-T-CAAACTA-----TTTGAGA--------------A--AACTAT------A-TA--TATACATG-----T-ATGTTCCTCCTGAAAAGT
gi|16 : GTGTCCATTCAAAA-TGCTGATCTT-----A--CCATTTTATGATATTTT-CTGTATTTC-ACAT--TGAAATATGCAGAAGTTCA-TGCTAC--ATATA------C----GTGTCAATA--ACGAAGTTG--ATATTCAAT---CAGAATAGATCGATT--------TGACC--AT-GCA-----------AAC-------A-----------------------TGT-------A-----------CAA-A--------A---T-GTAACATTC--AGTATTAAAATGCCGGACATG------CGACT--TT-TT--TTAAG-----------CTG-AAGTACC-GAAATAATATA--------AAAATAG-AGGAC---ATTTTCTTT---A----A----AA-A-------AA---ACGCATGAAAATACCGAG---GCAAG--------AAA-TTCTACTACAA--ACT----AT--TACTCTGC-AT--TA--AAATG-----------TCA----TGTAAA-G-TTG---GAAT-ACTTG-TGTAA--T---A-TTT-T----AATACAATATTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTgta
gi|17 : ttaTTCCAGA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTT-----------TGATATTTT-ATAC--TTAAATGTTCGGAAGTTCA-TACTGC--GTCTG------C-----TG-TAAAACCATAGAGTTG--ATATCTAAT---CGGAACTGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-------------C-------A------------------A--A--AT-------A-----------TTA-A--------------G-------T--TATATCAAAAT--TGAGGATA----------T--TT-TTCAT-AGAAAAAAAAATGCCTGAAAATGCC-AAAGTAACAct
gi|17 : agAAGTTATATC--------AAAATTG-AGGAT---ATTTT--TC---AT---AGAAAAA-A-------AA---ATGCCTGAAAATGCCAAA---GTAAC--------AGT-TTCTACTAT------------------TCTGCTGT--AA--AAATGA--ATA-----CTA----TATAAC-T-TTG---GAAT-ACTTT-T---A--T---TATTT-T-CTTAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAAGT--TTCA--AACTTTTCGAG-A-AA--T-T-TATT-----T-T--CCCCTCTTGAAAAGT-----TATTTTGTTAGGTGGCCA-TTTTGAGTGGAG-ATCAAgtttctactattctgctgtaaaaatgaatactatataactttggaatacttttattattttcttaatacaagttttcaggtctgtaagtttcaaacttttcgagaaatttattttcccctcttgaaaagttattttgttaggtggccattttgagtggagatcaacaaatttag
gi|18 : agttccagatgccgaacttaccatttttgatattttatacttaaatgttcggaagttcatactgcgtctgctgtaaaaccatagagttgatatctaatcggaactggtcattttgaccatgtgcaaaatattTAAAGTGCTGAGCATA------CAACT--TT-TT----AGG-----------CTG-AAGTGTT-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AAGAC---ATTTT--TT---AT---A----AA-A-------A----GCGCCGGAAAAT-CAGAA---GCAAC--------AGT-CTCCACTACTA--ACA----AT--TACTCTGCTGT--AA--AAATGA--ATA-----CAA----TGTAAT-A-TTT---GAAT-GCCTT-T---AT-T---T-TTT-T-CTAAATACAAA-TTTCAGGTCTGTTATC--ATCA--AACTATTTTAAAA-AAGGT-TGTATT-----T-TTcaaatttag
gi|19 : aacaagaatgacaaaacgtcatacagcagcaggtgTCCATTCAAAA-TGC-----------------ATTTTG-GGTATTAC-CGATATTTT-ACAT--T-AAACATGCGAAAGTTCA-TATTGCATATCTG------C----GTG-CGAAACGACAAAACTGCAATATAAAATG--CCGAACACACAACTT--------T-------T-ATA-----------AGCTG-----A------------------A--A-TGC-------------------CGA-A--------G---T-G-------A--AAAA--AGAATTGAGGACAT---------TTT--TT-TT--T-ATT-----------ATA-AAGCGCCTGAA--AATACC--------GAAAC-----AAC---AGTTT--CA---AT---A----Atagtttgccattttacatataaaaaaaacaatagtttgcaaatttgaatttttttaatattattgatataaatgtggaactttaaattagaaaatgttgattttaa
gi|19 : A-A--------C---T-G-------C--AATAT-AAAATGCCGAACACA------CAACT--TT-TA--T-AAG-----------CTG-AAATGCC-GAAGTGAAAAA--------AGAATTG-AGGAC---ATTTT--TTTTTAT---T----AT-A-------AA---GCGCCTGAAAATACCGAA---ACAAC--------AGT-TTCAATAACATTTGCT----TT--TACTCTTCTGT--AA--AAATGA--ATC-----CAA----TGAAAT-G-TTG---GAAT-ATCGT-T---A--T---T-TTT------AATA-AAGTTTTCAGGTCTGTTATT--TTCA--AACTACTTGTGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCCCCAGAAATGTTT--GTATTTTGTcatttgcttttactcttctgtaaaaatgaatccaatgaaatgttggaatatcgttatttttaataaagttttcaggtctgttattttcaaactacttgtgaaaattatatttttgttcccccagaaatgtttgtattttgtgtact
gi|2 : tccattcaaaatgcattttgggtattaccgatattttacattaaacatgcgaaagttcatattgcatatctgcgtgcgaaacgacaa----TGTAAT-G-TTG---GAAT-ACTTT-T---T--T---G-TCT-T-CAAAATACAA--------------AACT--GTCA--AACTTTTTGAGAA-AT--G-AATGTT-----T-TTCTTCCTACTGAAAAGTGA--GTATTTTGTTAGTTCGCCATTTTTAAATGGAG-A-gtact
gi|20 : A-A-------AA---GTATCTGAAAATGCCAGA---GCAA----------GT-TTCTACTACAA--ACT----AA--TACACTGTTGC--AA--AAATGA--AAA-----CAA----TGTAAT-GATTGAAGGAAT-ATCTT-T---A--T---T-TTT-C-TTTAATACA-GTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTAGGAA-AA--T-TATATTACCAGTATTATTCTTCCTGAAAAATTT--GTATTTTGCTAGTTCACCA-TTTTGAATGGAG-A-cagcgaaatgtgtttaaaagaacttattcaatatgaaaactattcattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaagtgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattattttttcccacgtgttcggtagatgtggactgagattgtgttaatatttcaacgtacctgaaacgaagagatattctactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgatacttatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaaggaaacacctaactctggcttcc
gi|21 : CATTCAAAA-TGCTGAACTT-----A--C-ATTTTG-AGTGTTTTACA--ATTTT-ACATATTAAAATGTGCAAATGTTGA-TATTAC--ATCTG------C----GTG-CAAAACAATGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-----------AAC-------ATATGCTA-----------A--A-TGTGAAAAAGA-----------AGA-A--------C---CAG-------C--AACATTAAAATGCTGAATATA------CAACT--TT-TT--ctatgacacaaatgatatatagtcttgtttaaggcaagtaaattcacaatggtctgtaatgttttgttatatattttatat
gi|21 : tAAAATGCTGAATATACAACTTTTTAAAAAT-TT-TACTACAT--ACA----AG--TACTCTGCTTTTAAA--AAATGA--TTG-----CAA----TGTAAT-G-GTA---GAAT-GCTTC-T---A--T---T-TTT-T-CTAaaaaattttactacatacaagtactctgcttttaaaaaatgattgcaatgtaatggtagaatgcttctattttttcta
gi|22 : tcattcaaaatgctgaacttacattttgagtgttttacaattttacatattaaaatgtgcaaatgttgatattacatctgcgtgcaaaacaatgaagttgatatccaatcagaacaggtcattttgaccatgtgaacatatgctaaatgtgaaaaagaagaaccagcaacattTTCATTCAAGA-TGTC---TTT-----------TTTTA---TATTTT-CCGTATTTT-ACAT-----GCTTTTCATAAGTTTA-TAATGT--ATCTG------C----GTG-CAAAACGAC-AAGTTG--ATATCCAAT---CAGAAACGGTCAGTA--------TGAGC--AT-GCG-----------AAT-----------------------------A-TGT-------G-----------CAA---------------------------AATGTTAAAATGCCGAACATA------CGACT--AT-T
gi|22 : --TGCTCTGCTGT--AAGTAAATAATAATA-----CAA----TG-AACTA-TTG---GAAT-ACCTT-T---A--T---T-TTTAT-CTactctgcccaaggaactatagtggaagaggacctttcctctccaattccttgctctgctgtaagtaaataataatacaatgaactattggaatacctttatttttatct
gi|23 : ttcattcaagatgtctttttttatattttccgtattttacatgcttttcataagtttataatgtatctgcgtgcaaaacgacaagttgatatccaatcagaaacggtcagtatgagcatgcgaatatgtgcaaaatgttaaaatgccgaacatacgactattactctgcccaaggaactatagtggaagaggacctttcctctccaattcct-------C--AATGGCAAAATGCAGAACATT------CAACT--TT-TA--T-AGC-----------CTG-AAATGTC-GAGTTAATATA--------AAAATTG-AGGAC---ATTCT--TC---AT---A----CA-A-------AA---GCGC-TGAAAATGT---------------------------------AG--ACT----A-----TTCTGCTAT--AA--GATCGA--ATA-----TAA----T---AC-C-T------AAT-AA--T-T---A--T---G-TTT-T-CTTCATACAAGTTATCAATTCTGTAATT--ATCC--AACTATTTGAGAT-AA--T-TATATT-----T-TTATTCCTCCTTAAAAGTTT--GCATTTTTTTAGTTAACCA-ATTTGAATGGAA-A-
gi|24 : ---ACTTT--TT---AT---A----AA-A-------TC---GCGCTGGAAAATGCCGAA---GCAAT--------AGT-TTCTAC-------ACT----AT--TACTGGGGCGT--GA--AAATTA--ATA-----CAC----TATAAC-G-TTG---GAAT-ACCTT-T---A--A---T-TT--------ATACAAGTTTTCATGTCTGTTATT--ATTA--AACTATTTGAGAA-AA--A-TATCTT-----T-TTGTT-CTCTAGAAAAGTTT--ATATTTTGTAAGTTCGTCG-TTTTAAATGGAA-A-caacga
gi|25 : atataT---CAGAACTTGTCATTT--------TGACCCCAT-CTG-----------AGC-------A-------------------------T-------------------TGA-A--------CATGT-G-------CCAAATGTTAAAAGGC-----ATT------CAACG--TT-TT--T-AGA-----------CTG-AATTACT-GAA-CAAGATCTGGTACAAAAAACAACAACAC---ATTTT--TC---AC---A----AA-A----------------------------AA---GC----------------TC----ACAA--AATTAGGAG--TATTCTGTCTT--TA--ATATGA--AAA-----CAA----TGCAAT-G-TTG---GAATTATATT-T----------T-TTT-T-TTAAATACAAGTTTTTGGGTCTGTAATT--ATCA--GACTTTTTGAGAcaacgatatatacatgctactgaaaatgtatttataaa
gi|26 : AGCTG--GTATCCAAT---CAGGATAGGTCATAC--------TGACA--AT-ATG-----------AAC-------A------------------T--G-TGC-------A-----------C-A-A--------C----------------------AAAACGCTGAACATA------CAACTG-TT-TT--T-CGG-----------TTC-AAATCCT-AACGTAATATC--------CAAAATG-AGAAC---TTTTT--TT----------------------------------------TGTC--A---GCAAC--------AAT-TTCTACTCCAA--ACT----AT--AACT------T--AA--AAATTA--ATG-----CAA----TGAAAC-G-TTA---GAAT-AACTT-T---A--T---T-TTT-TTCCATATAAAAGTTTTTAGGTCTGTAATT--ATAA--AACTATTTTAGAA-
gi|27 : TTTTAGGTCTGCGGTT--ATTA--CA-TATTTGAGGC-AA--T-TATGTT-----T-TTGTTTCTCCTGAACATTTT--GTATTTT-TTAGTTCGCTT-TTTTGGATGAAG-
gi|28 : tttgataattactcataaacaCTCAATTCAAAG-TGCCGAATTT-----A--CCATTTAG-GG-AGTTT-TGTTACTTT-GCAT--TAAAATGTGTGGGTATTTA-TACTGC--AACTG------T----GTG-TAAAACAACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGATCAGGTCTTTTTCAAAATGTGACC--AT-GTG-----------CA--------A------------------A--A-TGT-------A-----------gtcaacgacaggaaaatatacgatgtcgacaatggatctatgacacagttatccatgaattaatgttcccttactatgtattgttattg
gi|29 : GCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GAAATGTT--GGTATTTT-ACAT--TATAATGTGCAAAAGTTCA-CACTGC--ATCTG------C----ATA-CAAAACGACAAAGTTG--ATATCCAAT---CAGATCAGGTCTTGT--------TGACC--AT-GTG-----------ACT-------G------------------AACA-TGT-------G-----------CAA-A--------actaagacagcacgctcaactattcaaata
gi|3 : ----TGTAAT-G-TTG---GAAT-ACTTT-T---T--T---G-TCT-T-CAAAATACAA--------------AACT--GTCA--AACTTTTTGAGAA-AT--G-AATGTT-----T-TTCTTCCTACTGAAAAGTGA--GTATTTTGTTAGTTCGCCATTTTTAAATGGAG-A-
gi|31 : GTTTTCAGGTCTGTAACT--ATCA--ACCTCTTTGAGAA-AA--T-AATATT-----------------TGAAA--CTTGGGTATATTGTT--------A-TTTTGAATGGAGAA-CAAcagcgaaatgtgtttaaaagaacttattcaatatgaaaactattcattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaagtgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattattttttcccacgtgttcggtagatgtggactgagattgtgttaatatttcaacgtacctgaaacgaagagatattctactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgatacttatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaaggaaacacctaactctggcttc
gi|32 : TTTTAAGTTTGTTATT--ATCA--A--TAT-----AATAA--T-TAT-----------TGTTCCTTTTGAAGATTTT--GTATTTTGTTAGTTCACCA-TTTTGAATGGAG-A-cgata
gi|33 : cT-ATAT--TAAAA-----AGAAATTCA-TATCCC--ATATG------C----ATG-CAAAGCGACGAAGACG--ATATCCAGT---C--AAC--GTTATTT--------TGACC--AC-GTG-----------Ac
gi|35 : GTCTCTATTCAAAA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GGTA-TTA-CGGTATTTA-ACAT--TTAAATGTGCt
gi|36 : A-A--------C---TTG-------C--AATATCAAAATGACGAACATA------CAAC-------T--T-GGG-----------CTG-ATATACA-GAAGTAATATC--------GAA
gi|38 : GTCTCCATTCAAAC-TGCCAAACTT-----G---CATT--------TTTT-CAGAATTTT-ACAT--TCAAATTTGC
gi|4 : taGTCTCCATTAAAAA-TGCCAAACTTTACTTA--CCACTTTG-GGTATTTT-CAGTGCTAT-ACAT--TAAAATGTGCCGAATTGCA-TACAGT--ATCTG------C----GTG-CAAAATGACAAAGTCT--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGGCC--AT-GTG-----------CA--------A------------------A--A-TGTAAAA---A-----------TGA-AGAAC----C---T-G-------C--AATATAAAAATGCCGAACATACAGTTTCAATT--TT-TT--A-AGG-----------CTG-AAATGTCAGAAGTAATATC--------AAAATTG-AAGAC---AATGT--TC---ATAAAA----AA-A-------AA---ACGCTTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTCTACTACAA--AAT----AT--CAAGGTGCTGT---A--AAATGA--ATA-----CAA----TGTTAT-G-TAG---GAAT-ACCTT-T---ATTT---T-TTT-T-CTTAATACAGATTTTCTGGTCTGTAATT--TTCA--AACTAATT--GAA-AA--T-TATATT-----A-TTGTTGCTCGGGAAAAGTAT--GTATTTTGCTAGTTTGCCA-TTTTGAATGGAG-
gi|5 : ATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATTTGGGAAAGTTCA-CACTGT--GGCTG------C----TTG--AAAACAACGAAGTGA--GTACC--------AGAACAAGACCTTG--------TGAAC--AT-GTT-------------C-------A------------------A--AGTGT-------A-----------AAA-A--------C---T-G-------C--A-TATTAAAATGACAAACATA------CAACT--TT-TT--T-ATG-----------TTG-AAATGCC-GAAGTAATAT---------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TC---AT---G----AA-A-------A----GCACCTGAAATTGCAGAA---GCAAT--------ATT-TTCTACTATAC--ACT----AT--TACTCTGCTGT--AA--AA-T-A--ATA-----CAA----TGAAAA-T-CTG---GAAT-AATTT-C---A--T---T-TTT-T-CTATATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTTTTAGAGAA-AA--T-CATATT-----T-TCGTTCCTCCTG-AAAGTTT---TGTTTGGTTAGTTCGCCA-TTTTAAATGGAG-A-tccaatgatgtgttatgtattattttttttaatatacaaaataaatttaaaatgctttttcatttaatattttaatg
gi|6 : ATTCAAAAATGCAGAACAT-----AAACCATTTTG-GAAATTTT-CAGCATTTT-ACAT--TAAAATGTGCAGAAGTTTA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACG------TTG--ATATCCAAT---CAAAAAAGGTCATTTAATT----TGACC--AT-GTT-----------AACTTGCATAA------------------A--A-TGT-------GAAAAAAAAAATCAA-C--------C---T-G-------A--ATTATTAAAATACCGAACATA------CACCT--TT-TT--TTAGT-----------CTG-AAATGTT-GAAGTAATACC--------AAAACCG-AG-ATTTTATTTT--TA---TT---C----AA-A-------AA---GTGCCTGAAAATGCTGAA---GCAAC--------TGA-TTCTACCACAA--ACT----AG--TACTCTGCTGT--AC--AAATGA--ATA-----CCA----TGAAAC-G-TTG---GGAT-ACCTTCT---T--T---T-TTT-T-CCAAATACAAGTATTCAGGTCTGTAATA--ATCA--AGATATTTGAAAA-AA-----A------------------TCCTGAAATATTT--GTATTTTGTAAGTTTGCCA-TTTTGAATAGAG-A-caacaataagtatgattcagagataaacttgggaataactaatgcaaataaaaccaattaaagatgccaatgaatagcttagtaattattttatata
gi|7 : CTCCATTCAAAA-TGCTTAGCTT-----C--CGACTTTT-GGTATTTT-CGGTTCATT-AACT--TGAAATGTGCGAAATTCTA-TACTGC--ATCTG------CCTGCGTG-CAAAACAATGAAAATA--ATATCCGAT---CAGAACAGGTTATTT--------TGACC--AT-ATG-----------AAC-------ATGTGCGA-----------A--A-TGT-------AAAAATGA----CGA-G--------CCTGT-G-------C--ATTAT-AAAATGCCGAACATA------CAACT--AT-TT--G-GGC-----------CGG-AAATGCG-GAAGTACTATC--------CAAATTG-AGGAG---ATTTT--TC---ATTAGA----AA-A-------AA---ACTCCTTTAAATGCCGAA---CCAAC--------AGT-TTCTTCT--------T----AG--TACTCTATTGT--AA--AACTAA--ATA-----CAA----AGTAGC-G-TTG---GGGT-ACCTT-T------T---T-TT-------AATACAAGTTTTCAGGTCTG--------------ACTTTATGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTCCCTCCTGAATAGCTG--GTATTTTCTTAGTTCATCC-TTTTGAATAGAG-ATCAA
gi|8 : GTCTCCATTTAAAA-TGCCGAACT------A--ACATTTTA-GGCATTTT-CCATATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGATGTCCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACAACGAACTTA--ATAATCAAT---CAGAACATGTCTTTT--------TTTCC--CT-GTG-----------ATC-------A------------------A--A-GGT-------A-----------CGA-G--------C---T-G-------C--CATATTAAAATGCTAAACATA------CAACT--AT-TT--G-AGG-----------CTG-AAATGCA-GAAGAAATATC--------AAAATTG-AGGAT---ATGTT--TC---AT---T----CA-A-------AA---GGACCTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTGTACAACAA--ACT----TG--TAGTCTTCTAT--TA--AAATG---ATA-----CAA----TGTAAT-G-TTG---GAAT-GCCTT-G---A--T---G-TTT-GACCAAATACAAGTTTTCAGG-CTGTAAGT--ATAA--AACTATTTGAGAA-AG--T-TATATT-----T-TTGTTTTTCCTGAAACGTTT--GTATTTTGTTACTTTGCAA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
gi|9 : GTTTTCATTCAAAA-TGGCTA---T-----A--CCATACTG-GTTATTTT-CCGTATTTT-TCAT--TAAAATGTGC-------CAATACTGC--ATCTG------C----ATC-CAAAACAATAAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGATTATTTGT------TGACA--AT-GTA-----------GAC-------ATATGTGCAA---------A--A-TGTCAGACAGA-----------TGA-AA-------C---T-G-------C--AACATTACAGTGCCGACCACA------CAAC---TC-TT--T-AGG-----------TTG-AAATGCC-AGAGTAATATG--------ATA-------------ATTTT--TC---AT---A----AA-A-------AA---GTACCTGGAATTGCTGAG---GCAAC--------AGT-TTATTCTACAA--AAT----AT--TACTCTGTTGT--AA--AGATGA--ATA-----CAA----TGTGAT-G-CTG---GAAT-TCTTT-T---A--TATAT-TTC-T-CTGAATATAAGTTTTCAGGTTTGTAAGT--ATCA--AACTATTTGAGGG-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTTCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCTCCA-ATTTGAAt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): GTTTTACTTTATTTATTCTTTATGATACCATATCTTCATATTTCGATATTTTAATATTCGGTAGATAATATGTAATATATATTAGCTATAATAGTTTGAAATGTATC
Unaligned ( gi|34 ): TCATCCTGCGTCTCCTGTAACATACATGATGTCTAATCGCAACTTTAATGAAGATATGAAAAGTGTCAAGTTTATTA
Unaligned ( gi|37 ): CAGTATAAAAATTGGATAAGGATCATTCTCTATATAAACTCTACAAGACTAAAATTCAAA
Unaligned ( gi|39 ): ATATACTTATAAACAATTGTTCTAATTCTACA
Alignments
lowQualScore : 11111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999
lowQualScore : 2 1 55555555 2 4 1 22 4 4 22 555555 4444 2 22 555 33333333 22 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 555555 44 1 999999999999999999 1 3 66666666 0 2 333 22 333 88888888 1 777777777777 1 1 0 333 66666666 1 22 77777777 444 22 22 88888 3333 1 33 1 222 1 2 1 888888888888 1 3333 33 22 22 1 5555 44444 1 22 6 2 5
lowQualScore : . . ........ . . . .. . . .. ...... .... . .. ... ........ .. . ................................................................................................. . ...... .. . .................. . . ........ . . ... .. ... ........ . ............ . . . ... ........ . .. ........ ... .. .. ..... .... . .. . ... . . . ............ . .... .. .. .. . .... ..... . .. . . .
lowQualScore : 4 4 88888888 1 0 9 55 7 0 88 888888 2222 0 66 000 00000000 55 8 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 000000 11 7 555555555555555555 9 8 99999999 5 0 333 66 333 33333333 9 999999999999 3 0 1 222 66666666 8 55 33333333 000 44 44 77777 3333 4 77 5 777 5 6 5 666666666666 5 6666 77 00 00 6 2222 22222 7 55 3 2 0
consensus : GTCTCCATTCAAAA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGAAGTTCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-----------AAC-------A------------------A--A-TGT-------A-----------CGA-A--------C---T-G-------C--AATATTAAAATGCCGAACATA------CAACT--TT-TT--T-AGG-----------CTG-AAATGCC-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TC---AT---A----AA-A-------AA---GCGCCTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTCTACTACAA--ACT----AG--TACTCTGCTGT--AA--AAATGA--ATA-----CAA----TGTAAC-G-TTG---GAAT-ACCTT-T---A--T---T-TTT-T-CTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCGCCA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
Reference ( family-4804 ) : GTCTCCATTCAAAA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGAAGTTCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-----------AAC-------A------------------A--A-TGT-------A-----------CGA-A--------C---T-G-------C--AATATTAAAATGCCGAACATA------CAACT--TT-TT--T-AGG-----------CTG-AAATGCC-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TC---AT---A----AA-A-------AA---GCGCCTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTCTACTACAA--ACT----AG--TACTCTGCTGT--AA--AAATGA--ATA-----CAA----TGTAAC-G-TTG---GAAT-ACCTT-T---A--T---T-TTT-T-CTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCGCCA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
gi|1 : ----TGTAAT-G-TTG---GAAT-ACTTT-T---A--T---G-TCT-T-CAAAATACAA--------------AACT--GTCA--AACTTTTTGAGAA-AT--G-TATGTT-----T-TTCTTCCTCCTGAAAAGTGA--GTATTTTGTTAGTTCGCCATTTTTAAATGGAG-A-
gi|10 : GTCTCTATTCAAAA-TGCCAAAC-------A----AATTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-GTAT--TAACATGTGCTGAA-TTCA-TACTGC--ATCTGATCCTAT----GTG-CAAAACTACAAAGCTG--GTATCCACTACGCAAAACTGCTCATTT---------GACC--AT-GAG-----------AAT-------ATGTCTTATTTATAAAAAAA--A-TG--------A-----------CGATA--------C---T-G-------C--AATATTAAAATGCCGAT--TA------CAA--------------GG-----------CTG-AAATGCC-AAAATGATATC--------AACATTT-TTGAC---ATATT--TT---AT---A----AA-A-------AT---TCGCCTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AAT-TTCTTCAACAA----T----AGATTACCCAGCTAT---A--AAATGA--ATACATTCCAA----TGAAAC-G-TTG---GACA-AC-------------------------AATTA-----TTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATATAAGCT-TA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCAGAAAAGATT--GTATTAT-TTAGTTcagcgaaatgtgtttaaaagaaaagaacttattcaatatgaaaactatttattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaactgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattatttgttcccacgtgttcggtagacgtggactgagattgtgttaatattacaacgtacctgaaacgaagagatatgatactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgataattatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaagaaaacaccgaactctggcttcc
gi|11 : tgCAAAA-TGCCAAACTT-----A--CCATTTTG-GATAATTC-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATATGCAGGAGTTCA-TACCGT--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--TTATCCAAT---CGGAACTGGTCATTC--------TTACC--AC-GTG-----------AAC-----------------------------A-T------------------------------------------------C--AATATGAAAATGCCGAGCGTA------CATCT--TT-TT--C-TAA-----------CTG-AAACGTC-GAAGTAATAAC--------AAAATAG-AGAAC---AGTTT--TC---GT---A----AA-A-------AATATACACCTGAAAATGCCAAA---GCAAC--------AGT-TTATTCTACAA--ACT----AG--CACTCTGTTGT--AA--AGATGA--ATA-----TAA----TGTATC-G-TTG---AAAT-ACCTT-T---A--C---T-TTT-T-ATTAATACAAAGTTTCAGATCCGAAATC--ATAA--AAATATTTGAATA-AA-----AAGTG-----T-TTGTTT----------GTTT--TTTTTTTGT---TTTGGCA-TTTTGCATAGAG-A-atgttaactatgt
gi|12 : CATTTTG-GGTATTTTTCAG-ATTTT-ACAT--TAAAATGTGCAGAAGTTTG-T--------TCTG------A----GTG-TAAAACGACGTAACTG--ATATCCAAT---TAGAACATGCCATGT--------TGATC--AT-GTG-----------AGC-------ACATGTAA-----------A--A-TGT-------A-----------CAA-ATGACATGAC---T-G-------C--AATATTTAAATGCTGAACATA------CAACTCATT-TT--T-AGG-----------CTG-AAATACC-AAAGTAATATC--------AAAATTG-AGAAC---ATTTT--TC---A------------------------------TGAAAAT------------AT--------ATTATTCTACT--------------G--TAATTT--TTT--AA----ATGA--ATA-----CAA----TGAAA-----------AAT-A--TA-T---A--T---T-TTT-T-TTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTTATT--ATCA--AATTACTTAAGAA-AA--T-GATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--ATATGTTGTTAGTTCGCCA-TTTTAAATGGAG-A-taaagaaaacatattttacga
gi|13 : --TAAAATGTGCAGAGGTTCAACACTGC--AGCTA------C----GTG-CAAAACGATGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGGACAGGTCATTT--------TGACA--AT-GTG-----------CAC-------ATGTTAC------------A--A-TG--------A-----------TGA-A--------C---C-T-------CG-AATATCAAAATGCTGAACATA------CAACT--AT-TT--G-AGT-----------CTG-AAATACC-TAAGTTAAATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TT---AT---A----AA-ATAAAAAAAA---GCTCCTGAAAATGCCGAA---CCAAC--------AGT-TTCTTCTAGAA--ATT----AG--TACTCTGCTGT--AA--AAAAGA--ATA-----CAA----TGTAAC-T-TTC---AAAT-ACCAT-T---T--T---T-TCT-T-CTAAACA-------TCAATTCTGTAATT--ATCA--AACTAATTAACAA-AA--T-AATACT-----T-TTG-TCCTCCTGAAAAGATT--ACATTTTATTTGTTCACCA-TTTTGAATGGAG-A-ctgcaatggtatg
gi|14 : GTCGCCATTTAAAA-TGCTAAATTA-----A--CCATTTTA-GGTATATT-CGG-ATTTTGATAT--TATAATGTGCGGAAGTTCA--ACT-------TG------G----G-G-TACAATGATGAAGTTG--ATATCCAGT---CAGAACAGGTCATTT--------TTGCC--AT-GTGGTCATGTGCAAAAT-------ATTAA--------------A--A-T-T-------A-----------CGA-A--------T---TTA-------C--ACTATTAAAACGCCATACATA------CAATT--TTGTT--T-AGT-----------CTG-AA-----------AATA------------------AGGAA---A-TTA--TC---AT---A----AATA-------AA---GCAC---A-------GGA---GCAAC--------AGT-TTCTACTATAA--AAG----TG--TACTCTGCTGT--TA--AAATTA--ATATTTTGCAATACTTGTA-----TTG---GGCC-ACGTT-T---A--TACGTATTT-T-CTAAAAACAAGATTTTAGGTCTGTAATTAAATAATTAACTATTGAAGAA-AG-----A------------------TCCAAAAAAGTTT--GTATTca
gi|15 : TTCAAAA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GGTATTTT-TGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGC-GAAGTTCA-TATTAC--AAATG------T----GAG-CGAAACAACAAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGCCATTT--------TGATC--ATAGTG-----------AACAA-----A------------------A--A-TG--------A-----------CGA-A--------A---TCG-------A--AATATGAAAATGCTGAATACA------TAACT--TT-TT-----AG-----------TTT-ATTTGCC-AAAGCAATATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TC---AT---A----AA-A-------AA---TCATCCGAAAATGACAAT---GCAAC--------ATT-TTCTACTACGA--ACT----AT--TATTCAGCTGT--TA--AAATGA--ATA-----CAA----TGAAAT-T-TCA---GG------TC-T---G--T---TATTA-T-CAAACTA-----TTTGAGA--------------A--AACTAT------A-TA--TATACATG-----T-ATGTTCCTCCTGAAAAGT
gi|16 : GTGTCCATTCAAAA-TGCTGATCTT-----A--CCATTTTATGATATTTT-CTGTATTTC-ACAT--TGAAATATGCAGAAGTTCA-TGCTAC--ATATA------C----GTGTCAATA--ACGAAGTTG--ATATTCAAT---CAGAATAGATCGATT--------TGACC--AT-GCA-----------AAC-------A-----------------------TGT-------A-----------CAA-A--------A---T-GTAACATTC--AGTATTAAAATGCCGGACATG------CGACT--TT-TT--TTAAG-----------CTG-AAGTACC-GAAATAATATA--------AAAATAG-AGGAC---ATTTTCTTT---A----A----AA-A-------AA---ACGCATGAAAATACCGAG---GCAAG--------AAA-TTCTACTACAA--ACT----AT--TACTCTGC-AT--TA--AAATG-----------TCA----TGTAAA-G-TTG---GAAT-ACTTG-TGTAA--T---A-TTT-T----AATACAATATTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTgta
gi|17 : ttaTTCCAGA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTT-----------TGATATTTT-ATAC--TTAAATGTTCGGAAGTTCA-TACTGC--GTCTG------C-----TG-TAAAACCATAGAGTTG--ATATCTAAT---CGGAACTGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-------------C-------A------------------A--A--AT-------A-----------TTA-A--------------G-------T--TATATCAAAAT--TGAGGATA----------T--TT-TTCAT-AGAAAAAAAAATGCCTGAAAATGCC-AAAGTAACAct
gi|17 : agAAGTTATATC--------AAAATTG-AGGAT---ATTTT--TC---AT---AGAAAAA-A-------AA---ATGCCTGAAAATGCCAAA---GTAAC--------AGT-TTCTACTAT------------------TCTGCTGT--AA--AAATGA--ATA-----CTA----TATAAC-T-TTG---GAAT-ACTTT-T---A--T---TATTT-T-CTTAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAAGT--TTCA--AACTTTTCGAG-A-AA--T-T-TATT-----T-T--CCCCTCTTGAAAAGT-----TATTTTGTTAGGTGGCCA-TTTTGAGTGGAG-ATCAAgtttctactattctgctgtaaaaatgaatactatataactttggaatacttttattattttcttaatacaagttttcaggtctgtaagtttcaaacttttcgagaaatttattttcccctcttgaaaagttattttgttaggtggccattttgagtggagatcaacaaatttag
gi|18 : agttccagatgccgaacttaccatttttgatattttatacttaaatgttcggaagttcatactgcgtctgctgtaaaaccatagagttgatatctaatcggaactggtcattttgaccatgtgcaaaatattTAAAGTGCTGAGCATA------CAACT--TT-TT----AGG-----------CTG-AAGTGTT-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AAGAC---ATTTT--TT---AT---A----AA-A-------A----GCGCCGGAAAAT-CAGAA---GCAAC--------AGT-CTCCACTACTA--ACA----AT--TACTCTGCTGT--AA--AAATGA--ATA-----CAA----TGTAAT-A-TTT---GAAT-GCCTT-T---AT-T---T-TTT-T-CTAAATACAAA-TTTCAGGTCTGTTATC--ATCA--AACTATTTTAAAA-AAGGT-TGTATT-----T-TTcaaatttag
gi|19 : aacaagaatgacaaaacgtcatacagcagcaggtgTCCATTCAAAA-TGC-----------------ATTTTG-GGTATTAC-CGATATTTT-ACAT--T-AAACATGCGAAAGTTCA-TATTGCATATCTG------C----GTG-CGAAACGACAAAACTGCAATATAAAATG--CCGAACACACAACTT--------T-------T-ATA-----------AGCTG-----A------------------A--A-TGC-------------------CGA-A--------G---T-G-------A--AAAA--AGAATTGAGGACAT---------TTT--TT-TT--T-ATT-----------ATA-AAGCGCCTGAA--AATACC--------GAAAC-----AAC---AGTTT--CA---AT---A----Atagtttgccattttacatataaaaaaaacaatagtttgcaaatttgaatttttttaatattattgatataaatgtggaactttaaattagaaaatgttgattttaa
gi|19 : A-A--------C---T-G-------C--AATAT-AAAATGCCGAACACA------CAACT--TT-TA--T-AAG-----------CTG-AAATGCC-GAAGTGAAAAA--------AGAATTG-AGGAC---ATTTT--TTTTTAT---T----AT-A-------AA---GCGCCTGAAAATACCGAA---ACAAC--------AGT-TTCAATAACATTTGCT----TT--TACTCTTCTGT--AA--AAATGA--ATC-----CAA----TGAAAT-G-TTG---GAAT-ATCGT-T---A--T---T-TTT------AATA-AAGTTTTCAGGTCTGTTATT--TTCA--AACTACTTGTGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCCCCAGAAATGTTT--GTATTTTGTcatttgcttttactcttctgtaaaaatgaatccaatgaaatgttggaatatcgttatttttaataaagttttcaggtctgttattttcaaactacttgtgaaaattatatttttgttcccccagaaatgtttgtattttgtgtact
gi|2 : tccattcaaaatgcattttgggtattaccgatattttacattaaacatgcgaaagttcatattgcatatctgcgtgcgaaacgacaa----TGTAAT-G-TTG---GAAT-ACTTT-T---T--T---G-TCT-T-CAAAATACAA--------------AACT--GTCA--AACTTTTTGAGAA-AT--G-AATGTT-----T-TTCTTCCTACTGAAAAGTGA--GTATTTTGTTAGTTCGCCATTTTTAAATGGAG-A-gtact
gi|20 : A-A-------AA---GTATCTGAAAATGCCAGA---GCAA----------GT-TTCTACTACAA--ACT----AA--TACACTGTTGC--AA--AAATGA--AAA-----CAA----TGTAAT-GATTGAAGGAAT-ATCTT-T---A--T---T-TTT-C-TTTAATACA-GTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTAGGAA-AA--T-TATATTACCAGTATTATTCTTCCTGAAAAATTT--GTATTTTGCTAGTTCACCA-TTTTGAATGGAG-A-cagcgaaatgtgtttaaaagaacttattcaatatgaaaactattcattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaagtgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattattttttcccacgtgttcggtagatgtggactgagattgtgttaatatttcaacgtacctgaaacgaagagatattctactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgatacttatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaaggaaacacctaactctggcttcc
gi|21 : CATTCAAAA-TGCTGAACTT-----A--C-ATTTTG-AGTGTTTTACA--ATTTT-ACATATTAAAATGTGCAAATGTTGA-TATTAC--ATCTG------C----GTG-CAAAACAATGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-----------AAC-------ATATGCTA-----------A--A-TGTGAAAAAGA-----------AGA-A--------C---CAG-------C--AACATTAAAATGCTGAATATA------CAACT--TT-TT--ctatgacacaaatgatatatagtcttgtttaaggcaagtaaattcacaatggtctgtaatgttttgttatatattttatat
gi|21 : tAAAATGCTGAATATACAACTTTTTAAAAAT-TT-TACTACAT--ACA----AG--TACTCTGCTTTTAAA--AAATGA--TTG-----CAA----TGTAAT-G-GTA---GAAT-GCTTC-T---A--T---T-TTT-T-CTAaaaaattttactacatacaagtactctgcttttaaaaaatgattgcaatgtaatggtagaatgcttctattttttcta
gi|22 : tcattcaaaatgctgaacttacattttgagtgttttacaattttacatattaaaatgtgcaaatgttgatattacatctgcgtgcaaaacaatgaagttgatatccaatcagaacaggtcattttgaccatgtgaacatatgctaaatgtgaaaaagaagaaccagcaacattTTCATTCAAGA-TGTC---TTT-----------TTTTA---TATTTT-CCGTATTTT-ACAT-----GCTTTTCATAAGTTTA-TAATGT--ATCTG------C----GTG-CAAAACGAC-AAGTTG--ATATCCAAT---CAGAAACGGTCAGTA--------TGAGC--AT-GCG-----------AAT-----------------------------A-TGT-------G-----------CAA---------------------------AATGTTAAAATGCCGAACATA------CGACT--AT-T
gi|22 : --TGCTCTGCTGT--AAGTAAATAATAATA-----CAA----TG-AACTA-TTG---GAAT-ACCTT-T---A--T---T-TTTAT-CTactctgcccaaggaactatagtggaagaggacctttcctctccaattccttgctctgctgtaagtaaataataatacaatgaactattggaatacctttatttttatct
gi|23 : ttcattcaagatgtctttttttatattttccgtattttacatgcttttcataagtttataatgtatctgcgtgcaaaacgacaagttgatatccaatcagaaacggtcagtatgagcatgcgaatatgtgcaaaatgttaaaatgccgaacatacgactattactctgcccaaggaactatagtggaagaggacctttcctctccaattcct-------C--AATGGCAAAATGCAGAACATT------CAACT--TT-TA--T-AGC-----------CTG-AAATGTC-GAGTTAATATA--------AAAATTG-AGGAC---ATTCT--TC---AT---A----CA-A-------AA---GCGC-TGAAAATGT---------------------------------AG--ACT----A-----TTCTGCTAT--AA--GATCGA--ATA-----TAA----T---AC-C-T------AAT-AA--T-T---A--T---G-TTT-T-CTTCATACAAGTTATCAATTCTGTAATT--ATCC--AACTATTTGAGAT-AA--T-TATATT-----T-TTATTCCTCCTTAAAAGTTT--GCATTTTTTTAGTTAACCA-ATTTGAATGGAA-A-
gi|24 : ---ACTTT--TT---AT---A----AA-A-------TC---GCGCTGGAAAATGCCGAA---GCAAT--------AGT-TTCTAC-------ACT----AT--TACTGGGGCGT--GA--AAATTA--ATA-----CAC----TATAAC-G-TTG---GAAT-ACCTT-T---A--A---T-TT--------ATACAAGTTTTCATGTCTGTTATT--ATTA--AACTATTTGAGAA-AA--A-TATCTT-----T-TTGTT-CTCTAGAAAAGTTT--ATATTTTGTAAGTTCGTCG-TTTTAAATGGAA-A-caacga
gi|25 : atataT---CAGAACTTGTCATTT--------TGACCCCAT-CTG-----------AGC-------A-------------------------T-------------------TGA-A--------CATGT-G-------CCAAATGTTAAAAGGC-----ATT------CAACG--TT-TT--T-AGA-----------CTG-AATTACT-GAA-CAAGATCTGGTACAAAAAACAACAACAC---ATTTT--TC---AC---A----AA-A----------------------------AA---GC----------------TC----ACAA--AATTAGGAG--TATTCTGTCTT--TA--ATATGA--AAA-----CAA----TGCAAT-G-TTG---GAATTATATT-T----------T-TTT-T-TTAAATACAAGTTTTTGGGTCTGTAATT--ATCA--GACTTTTTGAGAcaacgatatatacatgctactgaaaatgtatttataaa
gi|26 : AGCTG--GTATCCAAT---CAGGATAGGTCATAC--------TGACA--AT-ATG-----------AAC-------A------------------T--G-TGC-------A-----------C-A-A--------C----------------------AAAACGCTGAACATA------CAACTG-TT-TT--T-CGG-----------TTC-AAATCCT-AACGTAATATC--------CAAAATG-AGAAC---TTTTT--TT----------------------------------------TGTC--A---GCAAC--------AAT-TTCTACTCCAA--ACT----AT--AACT------T--AA--AAATTA--ATG-----CAA----TGAAAC-G-TTA---GAAT-AACTT-T---A--T---T-TTT-TTCCATATAAAAGTTTTTAGGTCTGTAATT--ATAA--AACTATTTTAGAA-
gi|27 : TTTTAGGTCTGCGGTT--ATTA--CA-TATTTGAGGC-AA--T-TATGTT-----T-TTGTTTCTCCTGAACATTTT--GTATTTT-TTAGTTCGCTT-TTTTGGATGAAG-
gi|28 : tttgataattactcataaacaCTCAATTCAAAG-TGCCGAATTT-----A--CCATTTAG-GG-AGTTT-TGTTACTTT-GCAT--TAAAATGTGTGGGTATTTA-TACTGC--AACTG------T----GTG-TAAAACAACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGATCAGGTCTTTTTCAAAATGTGACC--AT-GTG-----------CA--------A------------------A--A-TGT-------A-----------gtcaacgacaggaaaatatacgatgtcgacaatggatctatgacacagttatccatgaattaatgttcccttactatgtattgttattg
gi|29 : GCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GAAATGTT--GGTATTTT-ACAT--TATAATGTGCAAAAGTTCA-CACTGC--ATCTG------C----ATA-CAAAACGACAAAGTTG--ATATCCAAT---CAGATCAGGTCTTGT--------TGACC--AT-GTG-----------ACT-------G------------------AACA-TGT-------G-----------CAA-A--------actaagacagcacgctcaactattcaaata
gi|3 : ----TGTAAT-G-TTG---GAAT-ACTTT-T---T--T---G-TCT-T-CAAAATACAA--------------AACT--GTCA--AACTTTTTGAGAA-AT--G-AATGTT-----T-TTCTTCCTACTGAAAAGTGA--GTATTTTGTTAGTTCGCCATTTTTAAATGGAG-A-
gi|31 : GTTTTCAGGTCTGTAACT--ATCA--ACCTCTTTGAGAA-AA--T-AATATT-----------------TGAAA--CTTGGGTATATTGTT--------A-TTTTGAATGGAGAA-CAAcagcgaaatgtgtttaaaagaacttattcaatatgaaaactattcattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaagtgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattattttttcccacgtgttcggtagatgtggactgagattgtgttaatatttcaacgtacctgaaacgaagagatattctactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgatacttatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaaggaaacacctaactctggcttc
gi|32 : TTTTAAGTTTGTTATT--ATCA--A--TAT-----AATAA--T-TAT-----------TGTTCCTTTTGAAGATTTT--GTATTTTGTTAGTTCACCA-TTTTGAATGGAG-A-cgata
gi|33 : cT-ATAT--TAAAA-----AGAAATTCA-TATCCC--ATATG------C----ATG-CAAAGCGACGAAGACG--ATATCCAGT---C--AAC--GTTATTT--------TGACC--AC-GTG-----------Ac
gi|35 : GTCTCTATTCAAAA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GGTA-TTA-CGGTATTTA-ACAT--TTAAATGTGCt
gi|36 : A-A--------C---TTG-------C--AATATCAAAATGACGAACATA------CAAC-------T--T-GGG-----------CTG-ATATACA-GAAGTAATATC--------GAA
gi|38 : GTCTCCATTCAAAC-TGCCAAACTT-----G---CATT--------TTTT-CAGAATTTT-ACAT--TCAAATTTGC
gi|4 : taGTCTCCATTAAAAA-TGCCAAACTTTACTTA--CCACTTTG-GGTATTTT-CAGTGCTAT-ACAT--TAAAATGTGCCGAATTGCA-TACAGT--ATCTG------C----GTG-CAAAATGACAAAGTCT--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGGCC--AT-GTG-----------CA--------A------------------A--A-TGTAAAA---A-----------TGA-AGAAC----C---T-G-------C--AATATAAAAATGCCGAACATACAGTTTCAATT--TT-TT--A-AGG-----------CTG-AAATGTCAGAAGTAATATC--------AAAATTG-AAGAC---AATGT--TC---ATAAAA----AA-A-------AA---ACGCTTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTCTACTACAA--AAT----AT--CAAGGTGCTGT---A--AAATGA--ATA-----CAA----TGTTAT-G-TAG---GAAT-ACCTT-T---ATTT---T-TTT-T-CTTAATACAGATTTTCTGGTCTGTAATT--TTCA--AACTAATT--GAA-AA--T-TATATT-----A-TTGTTGCTCGGGAAAAGTAT--GTATTTTGCTAGTTTGCCA-TTTTGAATGGAG-
gi|5 : ATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATTTGGGAAAGTTCA-CACTGT--GGCTG------C----TTG--AAAACAACGAAGTGA--GTACC--------AGAACAAGACCTTG--------TGAAC--AT-GTT-------------C-------A------------------A--AGTGT-------A-----------AAA-A--------C---T-G-------C--A-TATTAAAATGACAAACATA------CAACT--TT-TT--T-ATG-----------TTG-AAATGCC-GAAGTAATAT---------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TC---AT---G----AA-A-------A----GCACCTGAAATTGCAGAA---GCAAT--------ATT-TTCTACTATAC--ACT----AT--TACTCTGCTGT--AA--AA-T-A--ATA-----CAA----TGAAAA-T-CTG---GAAT-AATTT-C---A--T---T-TTT-T-CTATATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTTTTAGAGAA-AA--T-CATATT-----T-TCGTTCCTCCTG-AAAGTTT---TGTTTGGTTAGTTCGCCA-TTTTAAATGGAG-A-tccaatgatgtgttatgtattattttttttaatatacaaaataaatttaaaatgctttttcatttaatattttaatg
gi|6 : ATTCAAAAATGCAGAACAT-----AAACCATTTTG-GAAATTTT-CAGCATTTT-ACAT--TAAAATGTGCAGAAGTTTA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACG------TTG--ATATCCAAT---CAAAAAAGGTCATTTAATT----TGACC--AT-GTT-----------AACTTGCATAA------------------A--A-TGT-------GAAAAAAAAAATCAA-C--------C---T-G-------A--ATTATTAAAATACCGAACATA------CACCT--TT-TT--TTAGT-----------CTG-AAATGTT-GAAGTAATACC--------AAAACCG-AG-ATTTTATTTT--TA---TT---C----AA-A-------AA---GTGCCTGAAAATGCTGAA---GCAAC--------TGA-TTCTACCACAA--ACT----AG--TACTCTGCTGT--AC--AAATGA--ATA-----CCA----TGAAAC-G-TTG---GGAT-ACCTTCT---T--T---T-TTT-T-CCAAATACAAGTATTCAGGTCTGTAATA--ATCA--AGATATTTGAAAA-AA-----A------------------TCCTGAAATATTT--GTATTTTGTAAGTTTGCCA-TTTTGAATAGAG-A-caacaataagtatgattcagagataaacttgggaataactaatgcaaataaaaccaattaaagatgccaatgaatagcttagtaattattttatata
gi|7 : CTCCATTCAAAA-TGCTTAGCTT-----C--CGACTTTT-GGTATTTT-CGGTTCATT-AACT--TGAAATGTGCGAAATTCTA-TACTGC--ATCTG------CCTGCGTG-CAAAACAATGAAAATA--ATATCCGAT---CAGAACAGGTTATTT--------TGACC--AT-ATG-----------AAC-------ATGTGCGA-----------A--A-TGT-------AAAAATGA----CGA-G--------CCTGT-G-------C--ATTAT-AAAATGCCGAACATA------CAACT--AT-TT--G-GGC-----------CGG-AAATGCG-GAAGTACTATC--------CAAATTG-AGGAG---ATTTT--TC---ATTAGA----AA-A-------AA---ACTCCTTTAAATGCCGAA---CCAAC--------AGT-TTCTTCT--------T----AG--TACTCTATTGT--AA--AACTAA--ATA-----CAA----AGTAGC-G-TTG---GGGT-ACCTT-T------T---T-TT-------AATACAAGTTTTCAGGTCTG--------------ACTTTATGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTCCCTCCTGAATAGCTG--GTATTTTCTTAGTTCATCC-TTTTGAATAGAG-ATCAA
gi|8 : GTCTCCATTTAAAA-TGCCGAACT------A--ACATTTTA-GGCATTTT-CCATATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGATGTCCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACAACGAACTTA--ATAATCAAT---CAGAACATGTCTTTT--------TTTCC--CT-GTG-----------ATC-------A------------------A--A-GGT-------A-----------CGA-G--------C---T-G-------C--CATATTAAAATGCTAAACATA------CAACT--AT-TT--G-AGG-----------CTG-AAATGCA-GAAGAAATATC--------AAAATTG-AGGAT---ATGTT--TC---AT---T----CA-A-------AA---GGACCTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTGTACAACAA--ACT----TG--TAGTCTTCTAT--TA--AAATG---ATA-----CAA----TGTAAT-G-TTG---GAAT-GCCTT-G---A--T---G-TTT-GACCAAATACAAGTTTTCAGG-CTGTAAGT--ATAA--AACTATTTGAGAA-AG--T-TATATT-----T-TTGTTTTTCCTGAAACGTTT--GTATTTTGTTACTTTGCAA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
gi|9 : GTTTTCATTCAAAA-TGGCTA---T-----A--CCATACTG-GTTATTTT-CCGTATTTT-TCAT--TAAAATGTGC-------CAATACTGC--ATCTG------C----ATC-CAAAACAATAAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGATTATTTGT------TGACA--AT-GTA-----------GAC-------ATATGTGCAA---------A--A-TGTCAGACAGA-----------TGA-AA-------C---T-G-------C--AACATTACAGTGCCGACCACA------CAAC---TC-TT--T-AGG-----------TTG-AAATGCC-AGAGTAATATG--------ATA-------------ATTTT--TC---AT---A----AA-A-------AA---GTACCTGGAATTGCTGAG---GCAAC--------AGT-TTATTCTACAA--AAT----AT--TACTCTGTTGT--AA--AGATGA--ATA-----CAA----TGTGAT-G-CTG---GAAT-TCTTT-T---A--TATAT-TTC-T-CTGAATATAAGTTTTCAGGTTTGTAAGT--ATCA--AACTATTTGAGGG-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTTCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCTCCA-ATTTGAAt
blockSeqs : A A TACTTA T T G AT A A AT . CTGC T CA G TCAAAATG CC A AACTTGCATAAAATGTGAAAAAAAAAATCAACCTGA G CAGTTT CA G CATAGAAAAAAAAATGC A T TGGTACAA C TTT CT TTT AGAAA T TAAAAAAAA A C TAT TTTTTAAA A TT TAGGAG TAA GT TA TTTTG TACT A CT A AAG T C C ATACGTA A TCCA AG AA TT T GGT ACCAG A GG T A T
blockSeqs : . A AAA . A . . A A . . . . . . AATT . . AACATGTGCGAAATGTAAAAATGACGAGCCTGTGC T . G . TTAAG . A . . . . . AAAA . AATAT T C . . . . AG A . . . . T C . . . C . GTAATA . ACCA GT . . . TA . . . T . T
blockSeqs : . G A . . . . A . . . . . . . GT . . GACATATGTGCAAAATGTCAGACAGATGAAACTGC C . . . TTAGT . . . . . . . TAGA . AA A C . . . . AG A . . . . A C . . . G . ATATAT . ATT GA . . . T . . . . . .
blockSeqs : . G A . . . . G . . . . . . . . . . AGCACATGTAAAATGTACAAATGACATGACTGC T . . . CTAA . . . . . . . A . AA A A . . . . TG A . . . . T C . . . T . ATTTT . TTA TA . . . T . . . . . .
blockSeqs : . G A . . . . A . . . . . . . . . . GTCATGTGCAAAATATTAAAATTACGAATTTAC G . . . TAGG . . . . . . . A . AA G C . . . . AT T . . . . T T . . . T . GTTA . CTA GT . . . T . . . . . .
blockSeqs : . G A . . . . G . . . . . . . . . . AACATATGCTAAATGTGAAAAAGAAGAACCAGC T . . . GAGT . . . . . . . A . AA G C . . . . AT T . . . . A A . . . C . ATTA . CTA GT . . . T . . . . . .
blockSeqs : . G A . . . . G . . . . . . . . . . CAAAATGTAAAAATGAAGAACCTGC C . . . TAGT . . . . . . . A . AA G C . . . . AT T . . . . T C . . . C . ATTT . CAA GT . . . T . . . . . .
blockSeqs : . G A . . . . A . . . . . . . . . . CACATGTTACAATGATGAACCTCG T . . . TATT . . . . . . . A . AA G C . . . . TT A . . . . T T . . . T . ACT . CTT GT . . . G . . . . . .
blockSeqs : . G A . . . . A . . . . . . . . . . AACATGTACAAAATGTAACATTC T . . . TAAG . . . . . . . A . AA A T . . . . AA A . . . . T T . . . C . ATT . CTA GT . . . T . . . . . .
blockSeqs : . A A . . . . G . . . . . . . . . . AACAAAAATGACGAAATCGA T . . . TAGC . . . . . . . A . TC G T . . . . AG A . . . . A T . . . T . TTT . CAA GT . . . T . . . . . .
blockSeqs : . A A . . . . A . . . . . . . . . . AGCTGAAATGCCGAAGTGA C . . . TAGA . . . . . . . T . AA G C . . . . AT A . . . . T T . . . C . ATT . TTT GT . . . A . . . . . .
blockSeqs : . G G . . . . A . . . . . . . . . . AGCATTGAACATGTGCCA T . . . TCGG . . . . . . . A . AA G C . . . . AT A . . . . T T . . . C . TTG . CTA GT . . . T . . . . . .
blockSeqs : . T C . . . . C . . . . . . . . . . ATCAAAGGTACGAGCTGC C . . . TGGG . . . . . . . A . AA A C . . . . AT A . . . . T C . . . A . ATT . CTT AT . . . G . . . . . .
blockSeqs : . G A . . . . G . . . . . . . . . . CAAAGTGTAAAAACTGC A . . . AAGG . . . . . . . A . AA G C . . . . AT G . . . . T C . . . C . ATT . TTA GT . . . T . . . . . .
blockSeqs : . T A . . . . A . . . . . . . . . . AACATGTGCACAAC T . . . TATG . . . . . . . G . AA T C . . . . AG T . . . . C T . . . T . ATT . CAA GT . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . CAAAATATTAAGT T . . . GGGC . . . . . . . C . A A . . . . . AG A . . . . A C . . . C . ATG . CTT GT . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . . . . . AATATGTGCAA T . . . GAGG . . . . . . . T . A A . . . . . TG A . . . . T T . . . T . AAT . CTA GT . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . AACATC T . . . TAGG . . . . . . . A . . . . . . . . AT A . . . . T T . . . C . ATT . CCA GT . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGG . . . . . . . . . . . . . . . . G A . . . . A A . . . C . TTG . CTG A . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . A T . . . . A C . . . C . ATT . A . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T C . . . T . TTT . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T T . . . . . ATG . . . . . . . . .
blockSeqs : . T T . . . . . TT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : ****** *** TAGG************** AN****** A** ***** GT
originalCons : GTCTCCATTCAAAA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGAAGTTCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-----------AAC-------A------------------A--A-TGT-------A-----------CGA-A--------C---T-G-------C--AATATTAAAATGCCGAACATA------CAACT--TT-TT--T-AGG-----------CTG-AAATGCC-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TC---AT---A----AA-A-------AA---GCGCCTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTCTACTACAA--ACT----AG--TACTCTGCTGT--AA--AAATGA--ATA-----CAA----TGTAAC-G-TTG---GAAT-ACCTT-T---A--T---T-TTT-T-CTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCGCCA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
finalCons : GTCTCCATTCAAAA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGAAGTTCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-----------AAC-------A------------------A--A-TGT-------A-----------CGA-A--------C---T-G-------C--AATATTAAAATGCCGAACATA------CAACT--TT-TTTAGG--------------CTG-AAATGCC-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--TC---AT---A----AA-A-------AA---GCGCCTGAAAATGCCGAA---GCAAC--------AGT-TTCTACTACAA--ACTAN------TACTCTGCTGTA--A--AAATGA--ATA-----CAA----TGTAAC-G-TTG---GAAT-ACCTT-T---A--T---T-TTT-T-CTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCGCCA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): GTTTTACTTTATTTATTCTTTATGATACCATATCTTCATATTTCGATATTTTAATATTCGGTAGATAATATGTAATATATATTAGCTATAATAGTTTGAAATGTATC
Unaligned ( gi|34 ): TCATCCTGCGTCTCCTGTAACATACATGATGTCTAATCGCAACTTTAATGAAGATATGAAAAGTGTCAAGTTTATTA
Unaligned ( gi|37 ): CAGTATAAAAATTGGATAAGGATCATTCTCTATATAAACTCTACAAGACTAAAATTCAAA
Unaligned ( gi|39 ): ATATACTTATAAACAATTGTTCTAATTCTACA
Alignments
lowQualScore : 11111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111111111111111
lowQualScore : 2 1 55555555 2 4 1 22 4 4 22 555555 4444 2 22 555 33333333 22 1 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5 1 555555 1 1 444444444444444444 1 3 777777777 0 2 333 22 4444444 77777777 1 7777777777777 1 22 333 3333 66666666 0 22 0 3333 1 444 777777 22 88888 3333 1 33 1 222 1 2 1 888888888888 1 3333 33 22 22 1 5555 44444 1 22 6 2 5
lowQualScore : . . ........ . . . .. . . .. ...... .... . .. ... ........ .. . ............................................................................................. . . ...... . . .................. . . ......... . . ... .. ....... ........ . ............. . .. ... .... ........ . .. . .... . ... ...... .. ..... .... . .. . ... . . . ............ . .... .. .. .. . .... ..... . .. . . .
lowQualScore : 4 4 88888888 1 0 9 55 7 0 88 888888 2222 0 66 000 00000000 55 8 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 7 000000 7 7 222222222222222222 9 8 666666666 5 0 333 66 4444444 99999999 9 8888888888888 3 55 222 9999 66666666 3 44 1 7777 6 000 444444 44 77777 3333 4 77 5 777 5 6 5 666666666666 5 6666 77 00 00 6 2222 22222 7 55 3 2 0
consensus : GTCTCCATTCAAAA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGAAGTTCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-----------AAC-------A------------------A--A-TGT-------A-----------CGA-A----C---T-G-------C--AATATTAAAATGCCG-AACATA------CAACT-TT-TT--T-AGG-----------CTG-AAATGCC-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--T---C---AT---A----AA-A-------AA---GCGCCTGAA--AATGCCGAA---GC----AAC--------AGTTTCTACTACAA--ACT----ATTACTCTGCTGT--AA------AAATGA--ATA-----CAA----TGTAAC-G-TTG---GAAT-ACCTT-T---A--T---T-TTT-T-CTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCGCCA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
Reference ( family-4804 ) : GTCTCCATTCAAAA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGAAGTTCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-----------AAC-------A------------------A--A-TGT-------A-----------CGA-A----C---T-G-------C--AATATTAAAATGCCG-AACATA------CAACT-TT-TT--T-AGG-----------CTG-AAATGCC-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--T---C---AT---A----AA-A-------AA---GCGCCTGAA--AATGCCGAA---GC----AAC--------AGTTTCTACTACAA--ACT----ANTACTCTGCTGT--AA------AAATGA--ATA-----CAA----TGTAAC-G-TTG---GAAT-ACCTT-T---A--T---T-TTT-T-CTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCGCCA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
gi|1 : ----TGTAAT-G-TTG---GAAT-ACTTT-T---A--T---G-TCT-T-CAAAATACAA--------------AACT--GTCA--AACTTTTTGAGAA-AT--G-TATGTT-----T-TTCTTCCTCCTGAAAAGTGA--GTATTTTGTTAGTTCGCCATTTTTAAATGGAG-A-
gi|10 : GTCTCTATTCAAAA-TGCCAAAC-------A----AATTTG-GGTATTTT-CGGTATTTT-GTAT--TAACATGTGCTGAA-TTCA-TACTGC--ATCTGATCCTAT----GTG-CAAAACTACAAAGCTG--GTATCCACTACGCAAAACTGCTCATTT---------GACC--AT-GAG-----------AAT-------ATGTCTTATTTATAAAAAAA--A-TG--------A-----------CGATA----C---T-G-------C--AATATTAAAATGCCG-AT--TA------CAA-------------GG-----------CTG-AAATGCC-AAAATGATATC--------AACATTT-TTGAC---ATATT--T---T---AT---A----AA-A-------AT---TCGCCTGAA--AATGCCGAA---GC----AAC--------AATTTCTTCAACAA--TAG----ATTACCCAGCTAT---A------AAATGA--ATACATTCCAA----TGAAAC-G-TTG---GACA-AC-------------------------AATTA-----TTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATATAAGCT-TA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTCCAGAAAAGATT--GTATTAT-TTAGTTcagcgaaatgtgtttaaaagaaaagaacttattcaatatgaaaactatttattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaactgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattatttgttcccacgtgttcggtagacgtggactgagattgtgttaatattacaacgtacctgaaacgaagagatatgatactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgataattatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaagaaaacaccgaactctggcttcc
gi|11 : tgCAAAA-TGCCAAACTT-----A--CCATTTTG-GATAATTC-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATATGCAGGAGTTCA-TACCGT--ATCTG------C----GTG-CAAAACGACGAAGTTG--TTATCCAAT---CGGAACTGGTCATTC--------TTACC--AC-GTG-----------AAC-----------------------------A-T--------------------------------------------C--AATATGAAAATGCCG-AGCGTA------CATCT-TT-TT--C-TAA-----------CTG-AAACGTC-GAAGTAATAAC--------AAAATAG-AGAAC---AGTTT--T---C---GT---A----AA-A-------AATATACACCTGAA--AATGCCAAA---GC----AAC--------AGTTTATTCTACAA--ACT----AGCACTCTGTTGT--AA------AGATGA--ATA-----TAA----TGTATC-G-TTG---AAAT-ACCTT-T---A--C---T-TTT-T-ATTAATACAAAGTTTCAGATCCGAAATC--ATAA--AAATATTTGAATA-AA-----AAGTG-----T-TTGTTT----------GTTT--TTTTTTTGT---TTTGGCA-TTTTGCATAGAG-A-atgttaactatgt
gi|12 : CATTTTG-GGTATTTTTCAG-ATTTT-ACAT--TAAAATGTGCAGAAGTTTG-T--------TCTG------A----GTG-TAAAACGACGTAACTG--ATATCCAAT---TAGAACATGCCATGT--------TGATC--AT-GTG-----------AGC-------A------------------C--A-TGT-------A-------------A-A----A---T-G------------TAC--AAATGACATGAC-TG------CAATA-TT-T-----------------------AAATGCT-GAAC--ATAC-----------AACT------C---ATTTT--TAGGC----T---G----AA-A-------TA-------CCAAAGTAATATCAAA---ATTGAGAAC--------ATTTTTCATGAAAA--TAT----ATTATTCTACTGT--AATTTTTTAAATGA--ATA-----CAA----TGAAA-----------AAT-A--TA-T---A--T---T-TTT-T-TTAAATACAAGTTTTCAGGTCTGTTATT--ATCA--AATTACTTAAGAA-AA--T-GATATT-----T-TTGTTCCTCCTGAAAAGTTT--ATATGTTGTTAGTTCGCCA-TTTTAAATGGAG-A-taaagaaaacatattttacga
gi|13 : --TAAAATGTGCAGAGGTTCAACACTGC--AGCTA------C----GTG-CAAAACGATGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGGACAGGTCATTT--------TGACA--AT-GTG-----------CAC-------ATGTTAC------------A--A-TG--------A-----------TGA-A----C---C-T-------CG-AATATCAAAATGCTG-AACATA------CAACT-AT-TT--G-AGT-----------CTG-AAATACC-TAAGTTAAATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--T---T---AT---A----AA-ATAAAAAAAA---GCTCCTGAA--AATGCCGAA---CC----AAC--------AGTTTCTTCTAGAA--ATT----AGTACTCTGCTGT--AA------AAAAGA--ATA-----CAA----TGTAAC-T-TTC---AAAT-ACCAT-T---T--T---T-TCT-T-CTAAACA-------TCAATTCTGTAATT--ATCA--AACTAATTAACAA-AA--T-AATACT-----T-TTG-TCCTCCTGAAAAGATT--ACATTTTATTTGTTCACCA-TTTTGAATGGAG-A-ctgcaatggtatg
gi|14 : GTCGCCATTTAAAA-TGCTAAATTA-----A--CCATTTTA-GGTATATT-CGG-ATTTTGATAT--TATAATGTGCGGAAGTTCA--ACT-------TG------G----G-G-TACAATGATGAAGTTG--ATATCCAGT---CAGAACAGGTCATTT--------TTGCC--AT-GTGGTCATGTGCAAAAT-------ATTAA--------------A--A-T-T-------A-----------CGA-A----T---TTA-------C--ACTATTAAAACGCCA-TACATA------CAATT-TTGTT--T-AGT-----------CTG-AA-----------AATA------------------AGGAA---A-TTA--T---C---AT---A----AATA-------AA---GCAC---A---------GGA---GC----AAC--------AGTTTCTACTATAA--AAG----TGTACTCTGCTGT--TA------AAATTA--ATATTTTGCAATACTTGTA-----TTG---GGCC-ACGTT-T---A--TACGTATTT-T-CTAAAAACAAGATTTTAGGTCTGTAATTAAATAATTAACTATTGAAGAA-AG-----A------------------TCCAAAAAAGTTT--GTATTca
gi|15 : TTCAAAA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GGTATTTT-TGGTATTTT-ACAT--TAAAATGTGC-GAAGTTCA-TATTAC--AAATG------T----GAG-CGAAACAACAAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGCCATTT--------TGATC--ATAGTG-----------AACAA-----A------------------A--A-TG--------A-----------CGA-A----A---TCG-------A--AATATGAAAATGCTG-AATACA------TAACT-TT-TT-----AG-----------TTT-ATTTGCC-AAAGCAATATC--------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--T---C---AT---A----AA-A-------AA---TCATCCGAA--AATGACAAT---GC----AAC--------ATTTTCTACTACGA--ACT----ATTATTCAGCTGT--TA------AAATGA--ATA-----CAA----TGAAAT-T-TCA---GG------TC-T---G--T---TATTA-T-CAAACTA-----TTTGAGA--------------A--AACTAT------A-TA--TATACATG-----T-ATGTTCCTCCTGAAAAGT
gi|16 : GTGTCCATTCAAAA-TGCTGATCTT-----A--CCATTTTATGATATTTT-CTGTATTTC-ACAT--TGAAATATGCAGAAGTTCA-TGCTAC--ATATA------C----GTGTCAATA--ACGAAGTTG--ATATTCAAT---CAGAATAGATCGATT--------TGACC--AT-GCA-----------AAC-------A-----------------------TGT-------A-----------CAA-A----A---T-GTAACATTC--AGTATTAAAATGCCG-GACATG------CGACT-TT-TT--TTAAG-----------CTG-AAGTACC-GAAATAATATA--------AAAATAG-AGGAC---ATTTTCTT---T---A----A----AA-A-------AA---ACGCATGAA--AATACCGAG---GC----AAG--------AAATTCTACTACAA--ACT----ATTACTCTGC-AT--TA------AAATG-----------TCA----TGTAAA-G-TTG---GAAT-ACTTG-TGTAA--T---A-TTT-T----AATACAATATTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTgta
gi|17 : ttaTTCCAGA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTT-----------TGATATTTT-ATAC--TTAAATGTTCGGAAGTTCA-TACTGC--GTCTG------C-----TG-TAAAACCATAGAGTTG--ATATCTAAT---CGGAACTGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-------------C-------A------------------A--A--AT-------A-----------TTA-A----------G-------T--TATATCAAAAT--TG-AGGATA----------T-TT-TTCAT-AGAAAAAAAAATGCCTGAAAATGCC-AAAGTAACAct
gi|17 : agAAGTTATATC--------AAAATTG-AGGAT---ATTTT--T---C---AT---AGAAAAA-A-------AA---ATGCCTGAA--AATGCCAAA---GT----AAC--------AGTTTCTACTAT----------------TCTGCTGT--AA------AAATGA--ATA-----CTA----TATAAC-T-TTG---GAAT-ACTTT-T---A--T---TATTT-T-CTTAATACAAGTTTTCAGGTCTGTAAGT--TTCA--AACTTTTCGAG-A-AA--T-T-TATT-----T-T--CCCCTCTTGAAAAGT-----TATTTTGTTAGGTGGCCA-TTTTGAGTGGAG-ATCAAgtttctactattctgctgtaaaaatgaatactatataactttggaatacttttattattttcttaatacaagttttcaggtctgtaagtttcaaacttttcgagaaatttattttcccctcttgaaaagttattttgttaggtggccattttgagtggagatcaacaaatttag
gi|18 : agttccagatgccgaacttaccatttttgatattttatacttaaatgttcggaagttcatactgcgtctgctgtaaaaccatagagttgatatctaatcggaactggtcattttgaccatgtgcaaaatattTAAAGTGCTG-AGCATA------CAACT-TT-TT----AGG-----------CTG-AAGTGTT-GAAGTAATATC--------AAAATTG-AAGAC---ATTTT--T---T---AT---A----AA-A-------A----GCGCCGGAA--AAT-CAGAA---GC----AAC--------AGTCTCCACTACTA--ACA----ATTACTCTGCTGT--AA------AAATGA--ATA-----CAA----TGTAAT-A-TTT---GAAT-GCCTT-T---AT-T---T-TTT-T-CTAAATACAAA-TTTCAGGTCTGTTATC--ATCA--AACTATTTTAAAA-AAGGT-TGTATT-----T-TTcaaatttag
gi|19 : aacaagaatgacaaaacgtcatacagcagcaggtgTCCATTCAAAA-TGC-----------------ATTTTG-GGTATTAC-CGATATTTT-ACAT--T-AAACATGCGAAAGTTCA-TATTGCATATCTG------C----GTG-CGAAACGACAAAACTGCAATATAAAATG--CCGAACACACAACTT--------T-------T-ATA-----------AGCTG-----A------------------A--A-TGC-------------------CGA-A----G---T-G-------A--AAAA--AGAATTGAG-GACAT---------TTT-TT-TT--T-ATT-----------ATA-AAGCGCCTGAA--AATACC--------GAAAC-----AAC---AGTTT--C---A---AT---A----Atagtttgccattttacatataaaaaaaacaatagtttgcaaatttgaatttttttaatattattgatataaatgtggaactttaaattagaaaatgttgattttaa
gi|19 : A-A----C---T-G-------C--AATAT-AAAATGCCG-AACACA------CAACT-TT-TA--T-AAG-----------CTG-AAATGCC-GAAGTGAAAAA--------AGAATTG-AGGAC---ATTTT--T---TTTTAT---T----AT-A-------AA---GCGCCTGAA--AATACCGAA---AC----AAC--------AGTTTCAATAACATTTGCT----TTTACTCTTCTGT--AA------AAATGA--ATC-----CAA----TGAAAT-G-TTG---GAAT-ATCGT-T---A--T---T-TTT------AATA-AAGTTTTCAGGTCTGTTATT--TTCA--AACTACTTGTGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCCCCAGAAATGTTT--GTATTTTGTcatttgcttttactcttctgtaaaaatgaatccaatgaaatgttggaatatcgttatttttaataaagttttcaggtctgttattttcaaactacttgtgaaaattatatttttgttcccccagaaatgtttgtattttgtgtact
gi|2 : tccattcaaaatgcattttgggtattaccgatattttacattaaacatgcgaaagttcatattgcatatctgcgtgcgaaacgacaa----TGTAAT-G-TTG---GAAT-ACTTT-T---T--T---G-TCT-T-CAAAATACAA--------------AACT--GTCA--AACTTTTTGAGAA-AT--G-AATGTT-----T-TTCTTCCTACTGAAAAGTGA--GTATTTTGTTAGTTCGCCATTTTTAAATGGAG-A-gtact
gi|20 : A-A-------AA---GTATCTGAA--AATGCCAGA---GC----AA----------GTTTCTACTACAA--ACT----AATACACTGTTGC--AA------AAATGA--AAA-----CAA----TGTAAT-GATTGAAGGAAT-ATCTT-T---A--T---T-TTT-C-TTTAATACA-GTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTATTTAGGAA-AA--T-TATATTACCAGTATTATTCTTCCTGAAAAATTT--GTATTTTGCTAGTTCACCA-TTTTGAATGGAG-A-cagcgaaatgtgtttaaaagaacttattcaatatgaaaactattcattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaagtgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattattttttcccacgtgttcggtagatgtggactgagattgtgttaatatttcaacgtacctgaaacgaagagatattctactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgatacttatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaaggaaacacctaactctggcttcc
gi|21 : CATTCAAAA-TGCTGAACTT-----A--C-ATTTTG-AGTGTTTTACA--ATTTT-ACATATTAAAATGTGCAAATGTTGA-TATTAC--ATCTG------C----GTG-CAAAACAATGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGACC--AT-GTG-----------AAC-------ATATGCTA-----------A--A-TGTGAAAAAGA-----------AGA-A----C---CAG-------C--AACATTAAAATGCTG-AATATA------CAACT-TT-TT--ctatgacacaaatgatatatagtcttgtttaaggcaagtaaattcacaatggtctgtaatgttttgttatatattttatat
gi|21 : tAA--AATGCTGAATATAC----AACTTTTTAAAAATTT-TACTACAT--ACA----AGTACTCTGCTTTTAAA------AAATGA--TTG-----CAA----TGTAAT-G-GTA---GAAT-GCTTC-T---A--T---T-TTT-T-CTAaaaaattttactacatacaagtactctgcttttaaaaaatgattgcaatgtaatggtagaatgcttctattttttcta
gi|22 : tcattcaaaatgctgaacttacattttgagtgttttacaattttacatattaaaatgtgcaaatgttgatattacatctgcgtgcaaaacaatgaagttgatatccaatcagaacaggtcattttgaccatgtgaacatatgctaaatgtgaaaaagaagaaccagcaacattTTCATTCAAGA-TGTC---TTT-----------TTTTA---TATTTT-CCGTATTTT-ACAT-----GCTTTTCATAAGTTTA-TAATGT--ATCTG------C----GTG-CAAAACGAC-AAGTTG--ATATCCAAT---CAGAAACGGTCAGTA--------TGAGC--AT-GCG-----------AAT-----------------------------A-TGT-------G-----------CAA-----------------------AATGTTAAAATGCCG-AACATA------CGACT-AT-T
gi|22 : TTTCCTCTCCAA--TTC----CTTGCTCTGCTGT--AAGT----AAATAATAATA-----CAA----TG-AACTA-TTG---GAAT-ACCTT-T---A--T---T-TTTAT-CTactctgcccaaggaactatagtggaagaggacctttcctctccaattccttgctctgctgtaagtaaataataatacaatgaactattggaatacctttatttttatct
gi|23 : ttcattcaagatgtctttttttatattttccgtattttacatgcttttcataagtttataatgtatctgcgtgcaaaacgacaagttgatatccaatcagaaacggtcagtatgagcatgcgaatatgtgcaaaatgttaaaatgccgaacatacgactattactctgcccaaggaactatagtggaagaggacc-------C--AATGGCAAAATGCAG-AACATT------CAACT-TT-TA--T-AGC-----------CTG-AAATGTC-GAGTTAATATA--------AAAATTG-AGGAC---ATTCT--T---C---AT---A----CA-A-------AA---GCGC-TGAA--AATGT------------------------------------AG--ACT----ATT---CTGCTAT--AA------GATCGA--ATA-----TAA----T---AC-C-T------AAT-AA--T-T---A--T---G-TTT-T-CTTCATACAAGTTATCAATTCTGTAATT--ATCC--AACTATTTGAGAT-AA--T-TATATT-----T-TTATTCCTCCTTAAAAGTTT--GCATTTTTTTAGTTAACCA-ATTTGAATGGAA-A-
gi|24 : ---ACTTT--T---T---AT---A----AA-A-------TC---GCGCTGGAA--AATGCCGAA---GC----AAT--------AGTTTCTAC-------ACT----ATTACTGGGGCGT--GA------AAATTA--ATA-----CAC----TATAAC-G-TTG---GAAT-ACCTT-T---A--A---T-TT--------ATACAAGTTTTCATGTCTGTTATT--ATTA--AACTATTTGAGAA-AA--A-TATCTT-----T-TTGTT-CTCTAGAAAAGTTT--ATATTTTGTAAGTTCGTCG-TTTTAAATGGAA-A-caacga
gi|25 : atataT---CAGAACTTGTCATTT--------TGACCCCAT-CTG-----------AGC-------A-------------------------T-------------------TGA-A----CATGT-G-------CCAAATGTTAAAAGGC------ATT------CAACG-TT-TT--T-AGA-----------CTG-AATTACT-GAA-CAAGATCTGGTACAAAAAACAACAACAC---ATTTT--T---C---AC---A----AA-A------------------------------AA---GC-------------------TC----ACAA--AATTAGGAGTATTCTGTCTT--TA------ATATGA--AAA-----CAA----TGCAAT-G-TTG---GAATTATATT-T----------T-TTT-T-TTAAATACAAGTTTTTGGGTCTGTAATT--ATCA--GACTTTTTGAGAcaacgatatatacatgctactgaaaatgtatttataaa
gi|26 : AGCTG--GTATCCAAT---CAGGATAGGTCATAC--------TGACA--AT-ATG-----------AAC-------A------------------T--G-TGC-------A-----------C-A-A----C----------------------AAAACGCTG-AACATA------CAACTGTT-TT--T-CGG-----------TTC-AAATCCT-AACGTAATATC--------CAAAATG-AGAAC---TTTTT--T---T------------------------------------------TGTC--A---GC----AAC--------AATTTCTACTCCAA--ACT----ATAACT------T--AA------AAATTA--ATG-----CAA----TGAAAC-G-TTA---GAAT-AACTT-T---A--T---T-TTT-TTCCATATAAAAGTTTTTAGGTCTGTAATT--ATAA--AACTATTTTAGAA-
gi|27 : TTTTAGGTCTGCGGTT--ATTA--CA-TATTTGAGGC-AA--T-TATGTT-----T-TTGTTTCTCCTGAACATTTT--GTATTTT-TTAGTTCGCTT-TTTTGGATGAAG-
gi|28 : tttgataattactcataaacaCTCAATTCAAAG-TGCCGAATTT-----A--CCATTTAG-GG-AGTTT-TGTTACTTT-GCAT--TAAAATGTGTGGGTATTTA-TACTGC--AACTG------T----GTG-TAAAACAACGAAGTTG--ATATCCAAT---CAGATCAGGTCTTTTTCAAAATGTGACC--AT-GTG-----------CA--------A------------------A--A-TGT-------A-----------gtcaacgacaggaaaatatacgatgtcgacaatggatctatgacacagttatccatgaattaatgttcccttactatgtattgttattg
gi|29 : GCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GAAATGTT--GGTATTTT-ACAT--TATAATGTGCAAAAGTTCA-CACTGC--ATCTG------C----ATA-CAAAACGACAAAGTTG--ATATCCAAT---CAGATCAGGTCTTGT--------TGACC--AT-GTG-----------ACT-------G------------------AACA-TGT-------G-----------CAA-A----actaagacagcacgctcaactattcaaata
gi|3 : ----TGTAAT-G-TTG---GAAT-ACTTT-T---T--T---G-TCT-T-CAAAATACAA--------------AACT--GTCA--AACTTTTTGAGAA-AT--G-AATGTT-----T-TTCTTCCTACTGAAAAGTGA--GTATTTTGTTAGTTCGCCATTTTTAAATGGAG-A-
gi|31 : GTTTTCAGGTCTGTAACT--ATCA--ACCTCTTTGAGAA-AA--T-AATATT-----------------TGAAA--CTTGGGTATATTGTT--------A-TTTTGAATGGAGAA-CAAcagcgaaatgtgtttaaaagaacttattcaatatgaaaactattcattgtagaataagaaacacagtgacctttcttcataacatgaacaaataatgtctgaccaaacatgcatcaatgcaatggcttaaataattatactataattttatcttgaagtgattcaagtgtcaaaatgacgtcacattattttttcccacgtgttcggtagatgtggactgagattgtgttaatatttcaacgtacctgaaacgaagagatattctactgcaataatgcagatatccgtgtttacaaaaacgctttaaagaacgtattttacgaatcataagaaaaaataatcgatacttatcgtgaaagctgattttcttgctagcttccaaacaaaacatcgtaacctggcttccaggcgtccacgcttccaaaggaaacacctaactctggcttc
gi|32 : TTTTAAGTTTGTTATT--ATCA--A--TAT-----AATAA--T-TAT-----------TGTTCCTTTTGAAGATTTT--GTATTTTGTTAGTTCACCA-TTTTGAATGGAG-A-cgata
gi|33 : cT-ATAT--TAAAA-----AGAAATTCA-TATCCC--ATATG------C----ATG-CAAAGCGACGAAGACG--ATATCCAGT---C--AAC--GTTATTT--------TGACC--AC-GTG-----------Ac
gi|35 : GTCTCTATTCAAAA-TGCCGAACTT-----A--CCATTTTG-GGTA-TTA-CGGTATTTA-ACAT--TTAAATGTGCt
gi|36 : A-A----C---TTG-------C--AATATCAAAATGACG-AACATA------CAAC------T--T-GGG-----------CTG-ATATACA-GAAGTAATATC--------GAA
gi|38 : GTCTCCATTCAAAC-TGCCAAACTT-----G---CATT--------TTTT-CAGAATTTT-ACAT--TCAAATTTGC
gi|4 : taGTCTCCATTAAAAA-TGCCAAACTTTACTTA--CCACTTTG-GGTATTTT-CAGTGCTAT-ACAT--TAAAATGTGCCGAATTGCA-TACAGT--ATCTG------C----GTG-CAAAATGACAAAGTCT--ATATCCAAT---CAGAACAGGTCATTT--------TGGCC--AT-GTG-----------CA--------A------------------A--A-TGTAAAA---A-----------TGA-AGAACC---T-G-------C--AATATAAAAATGCCG-AACATACAGTTTCAATT-TT-TT--A-AGG-----------CTG-AAATGTCAGAAGTAATATC--------AAAATTG-AAGAC---AATGT--T---C---ATAAAA----AA-A-------AA---ACGCTTGAA--AATGCCGAA---GC----AAC--------AGTTTCTACTACAA--AAT----ATCAAGGTGCTGT---A------AAATGA--ATA-----CAA----TGTTAT-G-TAG---GAAT-ACCTT-T---ATTT---T-TTT-T-CTTAATACAGATTTTCTGGTCTGTAATT--TTCA--AACTAATT--GAA-AA--T-TATATT-----A-TTGTTGCTCGGGAAAAGTAT--GTATTTTGCTAGTTTGCCA-TTTTGAATGGAG-
gi|5 : ATTTT-CGGTATTTT-ACAT--TAAAATTTGGGAAAGTTCA-CACTGT--GGCTG------C----TTG--AAAACAACGAAGTGA--GTACC--------AGAACAAGACCTTG--------TGAAC--AT-GTT-------------C-------A------------------A--AGTGT-------A-----------AAA-A----C---T-G-------C--A-TATTAAAATGACA-AACATA------CAACT-TT-TT--T-ATG-----------TTG-AAATGCC-GAAGTAATAT---------AAAATTG-AGGAC---ATTTT--T---C---AT---G----AA-A-------A----GCACCTGAA--ATTGCAGAA---GC----AAT--------ATTTTCTACTATAC--ACT----ATTACTCTGCTGT--AA------AA-T-A--ATA-----CAA----TGAAAA-T-CTG---GAAT-AATTT-C---A--T---T-TTT-T-CTATATACAAGTTTTCAGGTCTGTAATT--ATCA--AACTTTTAGAGAA-AA--T-CATATT-----T-TCGTTCCTCCTG-AAAGTTT---TGTTTGGTTAGTTCGCCA-TTTTAAATGGAG-A-tccaatgatgtgttatgtattattttttttaatatacaaaataaatttaaaatgctttttcatttaatattttaatg
gi|6 : ATTCAAAAATGCAGAACAT-----AAACCATTTTG-GAAATTTT-CAGCATTTT-ACAT--TAAAATGTGCAGAAGTTTA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACG------TTG--ATATCCAAT---CAAAAAAGGTCATTTAATT----TGACC--AT-GTT-----------AACTTGCATAA------------------A--A-TGT-------GAAAAAAAAAATCAA-C----C---T-G-------A--ATTATTAAAATACCG-AACATA------CACCT-TT-TT--TTAGT-----------CTG-AAATGTT-GAAGTAATACC--------AAAACCG-AG-ATTTTATTTT--T---A---TT---C----AA-A-------AA---GTGCCTGAA--AATGCTGAA---GC----AAC--------TGATTCTACCACAA--ACT----AGTACTCTGCTGT--AC------AAATGA--ATA-----CCA----TGAAAC-G-TTG---GGAT-ACCTTCT---T--T---T-TTT-T-CCAAATACAAGTATTCAGGTCTGTAATA--ATCA--AGATATTTGAAAA-AA-----A------------------TCCTGAAATATTT--GTATTTTGTAAGTTTGCCA-TTTTGAATAGAG-A-caacaataagtatgattcagagataaacttgggaataactaatgcaaataaaaccaattaaagatgccaatgaatagcttagtaattattttatata
gi|7 : CTCCATTCAAAA-TGCTTAGCTT-----C--CGACTTTT-GGTATTTT-CGGTTCATT-AACT--TGAAATGTGCGAAATTCTA-TACTGC--ATCTG------CCTGCGTG-CAAAACAATGAAAATA--ATATCCGAT---CAGAACAGGTTATTT--------TGACC--AT-ATG-----------AAC-------ATGTGCGA-----------A--A-TGT-------AAAAATGA----CGA-G----CCTGT-G-------C--ATTAT-AAAATGCCG-AACATA------CAACT-AT-TT--G-GGC-----------CGG-AAATGCG-GAAGTACTATC--------CAAATTG-AGGAG---ATTTT--T---C---ATTAGA----AA-A-------AA---ACTCCTTTA--AATGCCGAA---CC----AAC--------AGTTTCTTCT--------T----AGTACTCTATTGT--AA------AACTAA--ATA-----CAA----AGTAGC-G-TTG---GGGT-ACCTT-T------T---T-TT-------AATACAAGTTTTCAGGTCTG--------------ACTTTATGAGAA-AA--T-TATATT-----T-TTGTCCCTCCTGAATAGCTG--GTATTTTCTTAGTTCATCC-TTTTGAATAGAG-ATCAA
gi|8 : GTCTCCATTTAAAA-TGCCGAACT------A--ACATTTTA-GGCATTTT-CCATATTTT-ACAT--TAAAATGTGCGGATGTCCA-TACTGC--ATCTG------C----GTG-CAAAACAACGAACTTA--ATAATCAAT---CAGAACATGTCTTTT--------TTTCC--CT-GTG-----------ATC-------A------------------A--A-GGT-------A-----------CGA-G----C---T-G-------C--CATATTAAAATGCTA-AACATA------CAACT-AT-TT--G-AGG-----------CTG-AAATGCA-GAAGAAATATC--------AAAATTG-AGGAT---ATGTT--T---C---AT---T----CA-A-------AA---GGACCTGAA--AATGCCGAA---GC----AAC--------AGTTTGTACAACAA--ACT----TGTAGTCTTCTAT--TA------AAATG---ATA-----CAA----TGTAAT-G-TTG---GAAT-GCCTT-G---A--T---G-TTT-GACCAAATACAAGTTTTCAGG-CTGTAAGT--ATAA--AACTATTTGAGAA-AG--T-TATATT-----T-TTGTTTTTCCTGAAACGTTT--GTATTTTGTTACTTTGCAA-TTTTGAATGGAG-A-CAA
gi|9 : GTTTTCATTCAAAA-TGGCTA---T-----A--CCATACTG-GTTATTTT-CCGTATTTT-TCAT--TAAAATGTGC-------CAATACTGC--ATCTG------C----ATC-CAAAACAATAAAGTTG--ATATCCAAT---CAGAACAGATTATTTGT------TGACA--AT-GTA-----------GAC-------ATATGTGCAA---------A--A-TGTCAGACAGA-----------TGA-AA---C---T-G-------C--AACATTACAGTGCCG-ACCACA------CAAC--TC-TT--T-AGG-----------TTG-AAATGCC-AGAGTAATATG--------ATA-------------ATTTT--T---C---AT---A----AA-A-------AA---GTACCTGGA--ATTGCTGAG---GC----AAC--------AGTTTATTCTACAA--AAT----ATTACTCTGTTGT--AA------AGATGA--ATA-----CAA----TGTGAT-G-CTG---GAAT-TCTTT-T---A--TATAT-TTC-T-CTGAATATAAGTTTTCAGGTTTGTAAGT--ATCA--AACTATTTGAGGG-AA--T-TATATT-----T-TTGTTCCTTCTGAAAAGTTT--GTATTTTGTTAGTTCTCCA-ATTTGAAt
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): GTTTTACTTTATTTATTCTTTATGATACCATATCTTCATATTTCGATATTTTAATATTCGGTAGATAATATGTAATATATATTAGCTATAATAGTTTGAAATGTATC
Unaligned ( gi|34 ): TCATCCTGCGTCTCCTGTAACATACATGATGTCTAATCGCAACTTTAATGAAGATATGAAAAGTGTCAAGTTTATTA
Unaligned ( gi|37 ): CAGTATAAAAATTGGATAAGGATCATTCTCTATATAAACTCTACAAGACTAAAATTCAAA
Unaligned ( gi|39 ): ATATACTTATAAACAATTGTTCTAATTCTACA