lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 333333333333333333333 111111111 1 333333333 4444444444444444444444444444 1 555555555555555555555 1 22 1 1 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111 11 222 11111 111 1 1111 1 555555 1 444444444444
lowQualScore : 77777777 999999 8 444444 3333 333 3333 888888888888888888888 5555 222 0 22 666666666 1 666666666 1 3333 888 5 4 3 99999 1 1 1 4 1 222222222 4 2 333 1111111111111111111111111111 2 2 444 2 5555 0 2 1 2 6 2 000000000000000000000 2 33 33 6 44 4 6 5 66 6 0 777 8888 3 1 4 0 33 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 3 6 7 1 44444 3 66 55 0 000 6 11111 333 0 99999 4 5 2 5 6 5555 0 2 9 7 000000 7 1 2 1 888 444444444444 55
lowQualScore : ........ ...... . ...... .... ... .... ..................... .... ... . .. ......... . ......... . .... ... . . . ..... . . . . . ......... . . ... ............................ . . ... . .... . . . . . . ..................... . .. .. . .. . . . .. . . ... .... . . . . .. . ......................................................... . . . . . ..... . .. .. . ... . ..... ... . ..... . . . . . .... . . . . ...... . . . . ... ............ ..
lowQualScore : 22222222 555555 5 666666 7777 000 7777 888888888888888888888 6666 999 4 33 777777777 0 333333333 7 7777 555 0 6 7 22222 7 8 7 4 8 888888888 2 1 777 6666666666666666666666666666 4 4 111 4 0000 5 5 1 5 7 1 777777777777777777777 9 99 99 0 22 2 0 0 99 8 9 000 5555 1 6 4 8 77 7 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 8 0 7 7 33333 6 44 55 2 666 0 44444 888 7 00000 4 4 4 7 0 9999 4 1 0 1 666666 0 9 2 1 888 444444444444 22
consensus : TGTCAG--------AAAG------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CTTA---CCT----A---------------C--C--ATAA--AT---ATTG--T---------AATTGAAA---------AT-A----CA---TGTGNATCANA----CATATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTT-AGTATAAAAGTACT-AA--GTT-TTTTTA-TT-GTAC---TGT---------TG---T---C---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTGGGTCTT-TCCCAATA-ATATTTATTTATA---T-AT---A--T-------TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACTTATCAAGTTTGATACAATTTAAATAAGGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTAAAA-GACTGCGCGTGTTGACT-----------------CAGT-----------------T------------------TTGAATAAANTGATCACTAATNCGTTGTTTTA-----CTGTTAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTTGATGTAGCCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---AAAAGATTTT-TCAACAAAGAAACCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACCTCTAAATCAGTTAAA--AGCATATTATAAACAATTCTNATGTATTTTTGAATC--GTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAG--ATAGTC-TGCCAAATTCACCATGTACAAAATCATTCTGCGTT
Reference ( gi|2 ) : TGTCAG--------AAAG------CAAATACAAT-----GCAACATGAT----CTTA---CCT----A---------------T--A--ATGA--AT---ATTG--T---------AATTGAAA---------AT-A----CA---TGCGAATCATA----TATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCATTT-AGTATAAAAGTACT-AAG-GTTGTTTTTA-TT-GTAC---TGC---------TG---T---C---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTTGGTCTT-TCCCAATA-ATACTTATTTATA---C-A----A--T-------TTTTC-TC--AGATCGGA--ACATA--GCACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACCTACCACGTTATATACTATTTAAATAAGGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTTAAA-GACTGTGCGTGTTGACT-----------------CAGT-----------------T------------------TTGAATAAATTTATCACTAATACGTTGTTTTA-----CTGTTAAAATGAATATTTCCGCTAATCCGGCACCTTGATGCAGCCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---AAAAGATTTT-TCAATAAAAAAACCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACTTCTAAATCAGTTAAA--ACCATATTATAAACAATTCTAATGTATTTTTGAAAT--G-TTGCATTCTGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAG--TTAGTC-TG-CAAATTCACCATGTACAAAATCATTTTGCGTT
gi|5 : TGTCAG--------AAAG------CAAATAGAAT-----GCAACATGAT----CTTA---CCT----A---------------C--C--ATAA--AT---ATTG--T---------AATTGAAA---------AT-A----CA---TGTGAATCATA----CACATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTT-AGAATAAAAGT--T---------TTTTTA-TT-GTAC---TGT---------TGATTT---C---T----GAATTTAAA-AAATTG-AT---TAAC-TTAG----GCATGTTGGGTCTT-TCACAATA-ATATTTATTTATA---T-AT---AC-T-------TTTTC-TC--AGATCAGA--ATATACCGCAC
gi|4 : TGTCAG--------AAAA------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CTAA---CCT----A---------------TCTAGCATAA--AC---ATCG--T---------AATTGAAA---------AT-A----TA---TGAGAATCATAATTATATATGTG-GCTATATTTTTTCATTTGAAATGCTTTT-AGTTTAAAAGTGCT-AAG-GTTTTTTTTA-TT-GTAT---TGT---------TG---T---CGTCT----GAATTTAAC-ACATTG-AT---AAAC-TTAG----GTGTGTTAGGTCTT-TCTCAATG-ATATTTATTTATA---TAA----A--C-------TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgatacaatttagataaggctgcaatctaaaattaataatactattgtaaaagactgcacaagctgacttagttgaatgccagttttcaataaattgatcactaatgcattgttttactgttaaaataaatagttacggtgatccgtaatgtagccacacatcattaaagactaaaattaaagatttatctataaagaaacccaagtagtgttatttggatacctctatatcagttaaaagcatattata
gi|8 : aTGTCAG--------AAAG------CAAATAAAAT-----GCAACATGAT----CTTA---CCT----A---------------C--C--ATAA--AT---TTTG--T---------AATTGATA---------AC-A----CA---TGTGAATC--A----TACATATG-GCTATATTTTCT-TTATGAAAAGCTTTT-AGTATAAAAGTTCT-AA--ATT-TTTTCA-TT-GTAC---TGT---------TGTTTT---C---T----GAATTTAAC-AAACTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTGGGTTTT-TCCCAATA-ATATTTATTTATA---T-ATTATA--T-------TTTTC-TC--AAATCGGA--ATATA--GCATAcattttataataaattggtattcattctttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgatacgatttaaacaaggctgagtttttaatttattgaccactaatacttgttttactgtcaaaataaatagttccggtgatccggcacgttgatgtagccatacatcattaaagcctaaatttgattaaaagatttttcgataaagaaatccaagtagtcttatttggatatacctctaaatctgttaaaaacatattattaacaattctaatgtattttgaatcgtttgcattcagtatttt
gi|3 : aTGTTAG--------AAAA------CTAATATAATCAAATGAAACATAATACAACTTA---TCT----AGTTA-----------T--ATTATGA--ACTAGAATA--T---------AAATAAAAGCAAAACAAAA-A----CAAGATGCGTATCAGC----TATATATG-GTTATGTTTCTA-ATATCAAAAGCTTTT-AATATAAAAGTACT-TAG---TATTTTTA-TT-GTTC---TGTCAT------TT---T---C---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---ACAC-TTTG----GCATGTTCGATATT-TTCCAATA-A---TTATTGATAATGT-AT---G--T-------TTTTC-GT--AAATCGGA--ATATA--GCACAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaacttatcaagtttgatacaagttaaacaaaggagaaatctaaatttaataatattgttgtaaaagaa
gi|15 : caTGTCAGAAAAAATAAAAG------CAAATATAAT-----ACAACATTAT----CTTA---CCT----AGT-------------T-----------AT---ACTG--TAAAAAAGCAAATCAAAA---------ACAA----AA---TGTGTATCAGA----CACATATG-GCTCTGTTTCTG-ATTTGAAAAGCTTTT-AATATAAAAGTACT-AA--GTT-TTTTTA-TT-GTACTTTTAT---------TT---T---T---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTGGTTTTT-TTCCATTA-ATATTTATTAATA---T-AT---G--T-------TTTTCGTT--A-ATCGGA--ATATA--cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgattcaatttaaataaggctgaatctaaaatcaataatatgattgtaaaacaactgtgccgatttggataaattgatcagtagttcgttattttatggttagaataaattgttgcggtgatccggcatcttgtagccacacatcattaaaactttaatttgataaaaaaagaaattcaacaaagaaatccaagaattttattcggatatatctctatatcagttaaaagcatattatttttttatgtattttgaatcctttgcaatcagtattttaaccaatattcaataatgttgacataccgttgacaaataagaga
gi|21 : cTGTCAT--------AAAG------CAAATATAAT-----GCAATGTAAT----TCTA---CCT----A---------------C--T--ATAA--AT---ATTG--T---------TATTGAAA---------CT-A----CA---TGCGTATCAAA----CATATCCA-GCTATATTTCTT-ATTTAAAAAACTTTT-AGTGTAAAAGTATT------TTTTTTTTA-TT-GAAC---TGT---------TGTTTT---C---T----GAATTAAAT-AAATTGAAA---AAAA-ATAG----GCATGTTGGGTTT
gi|14 : TGTCAG--------AAAGAAAAAACAAATATAAT-----ACAACATGAT----CTTAGAACTT----AGTTA-----------T--ACTATAA--AT---AGAGAAC---------AAATAAAAGCAAAACCAAA-A----CAAGATGTGTATCAGA----CATATATT-GCTATGTTTCTG-ATTTGAAAAGCTTTT-AATATA--------------TT-TTTATA-TT-GTAC---TGT---------TT---TTTTC---C----GAATTTAAC-AAATTG-AA---AAAC-ATAG----GTATGTT---TTTT-CCCCAATA-ATATTTATTTATA---T-AT---G--T-------TTTGC-GT--AAATCAGA--A
gi|32 : caTGTCAG--------AAAG------AAAATATAAT-----CCAACATGAT----CCTC---CCT----A---------------C--C--ATAT--AT---ATTG--T---------AACTGAAA---------AA-AAACCCA---GGTGAATCATA----CATGTATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTT-A-TATAAAtgt
gi|34 : TGTCAG--------AAAG------CAAATATGAT-----CTAACCTG-C----CATA---A------A---------------T--A--ATGT--AC---AT-G--T---------AATTCGAA---------AT-A----CA---TGTGAATCATA----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTT-AGTTCAAAAGTAt
gi|35 : aTGTCAG--------AAAG------CAAATATGAT-----CTAACCTG-C----CATA---A------A---------------T--A--ATGT--AC---AT-G--T---------AATTCGAA---------AT-A----CA---TGTGAATCATA----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTT-AG
gi|20 : aTGTCAG--------CAAA------CAATTTTAAT-----ATAGCATGAT----ACTA---CCTCCTTA---------------T--A---TAA--CT---A--G--A---------GAT---AA---------AT-A----CA---CGTGTGTCAGA---------ATG---------------TTTAAAAAGCATTT-AATAGAAAGGTACT-AA--GTTTTTTTTA-TT-GTAC---TGT---------TG---T---CTTAT----GAACTGAAT-AAATCA-AC---ACAC-TTTG----GCATATTGGGTCTA-TTCTAATA-CTGCTTATTAATA---T-A----
gi|37 : caTGTCAG--------AAAAA-----CAAATATAAT-----ACAACGTAAT----CTTA---CCT----AG--------------T--A--AT-ACTAT---AGTG--T---------AATGGAAtat
gi|17 : gttaGTCAG--------AAAC------CAAATAAAAT-----GCAACGTGAT----CTTA---CCT----A---------------C--C--ATAA--AT---ATTG--T---------AATTTGAA---------AT-A----CA---AGTGTATCAGT----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTA-AGTATAAAAGTAGT-AAG-TTTGTC-----TT-GTAC---TCT---------TGT--T---T---T----GAATTTAAC-AAAT-----------C-TTAG----GCATGTTTTGTCTT-TTCCAATA-ATATTTATTTATA---T-AT---A--C-------TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCcagaacaaaaaccagatgtgtatcagac
gi|29 : GTCAG--------AAAG------CAAATA---------------TGAT----TTTA---TCT----A---------------C--C--ATAA--AA---ATTG--T---------AATTGAAA---------AT-A----CA---TGTGAATCATA----CATATATG-GCTATATTT-TT-ATTTGAAAAACTTTT-AGTATAAAAGTACT-AAGTTTTTTTTTTA-TT-GTAC---TGT---------TG---T---T---TTCA-GAATATA
gi|6 : GTCAG--------TAAGAT----CAT-TATGAT-----ATAAACTGGT----GTTG---CCT----A---------------C--T--TTAA--AA---ACTA--T---------CATTGAAA---------AT-A----CA---TTTATATCAGA----CCAATATG-GCTATATTTCTG-ATTTGAAAAG-ATTTAAATATAAAAGTATT-AA----TGCCTTTAGTG-GTAG---TGT---------TA---T---T---TTCTAAAATTTAACAAAATTA-ATTGAAAACTTTAG----ACATATTGAGCCTA-TGTCAATA-ACATTTATT---------A----A--TTTTTTGATTTTC-TT--TGATCAGA--ATATG--TCACA
gi|9 : aTCAG--------AAAG------CAGATATAAT-----GTAACATGAT----CTTA---TCT----A---------------C--C--ATAC--AT---ATTG--T---------AATTGAAA---------AT-A----CT---AGTGAATCATA----CATATATG-GCTATATTTCTT-AATTGAAAAGCTTTT-AGTATAAAAGTACT-AA--GTTG-GTTTA-TT-GTAC---TGT---------TGTTTT---C---T----AAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TAAG----GCATGTTTGGTCTT-TCCCAATA-ATATTTATTTATA---T-A----AACT-------TTTTC-TC--AAATCGGA--ATAAA--GCACATcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaacttataaagctaaatacagtttaaataaggctgaactctaaattcaacagttatattataaaaataggacatgctgactcagttaaccgactatgccagttttgaatcaaatgattacggattcggtgttcaacagtttcggcaccttgatttagctacacatcgttaaaaattatatttgataat
gi|19 : CAG--------AA-G------TAAATATAAT-----ACAACATGAT----CTTA---CCT----A---------------C--T--ATAA--AA---ATTG--T---------AATTGAGA---------TT-G----CA---TGTGTACCATA----CACATATG-GTTATACTTATT-GTTTGAAAAGCTTTG-AGTATGAAAGTAC--AAA-GTT-TTTCTA-AT-GTTT---TGT---------TGTTTT---C---T----GAATTTAAT-AAATTG-AG---TAAC-TTAG----G--------------------TA-ATA------TATA---C-----------------TTTTC-TC--AGATCGGA--ATGTA--ACactagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacctatcaagtttgattcaatttaaataaggctgaa
gi|31 : gaCAG--------AAAG------CAAATACAGT-----GCAACATGAT----CTTA---CCT----A---------------C--C--ATAG--AT---ATTG--T---------AATTGAAA---------AT-A----CA---TGTGAATCATA----CATATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAA
gi|24 : cAG--------AAAA-------AAATAAAA-------CAACATGAT----CTTA---CCT----AGTTATACTACAAATAT--A--ATGA--A----AGTA--T---------AAGCAAAACA-------AC-A----CAGA-TGTGTATCAGA----CATATATG-GCTATGTTTCTG-ATTTGAAAAGCTTTC-CATATAAAAGTACT-A----TTTATTTTA-TT-GTAC---TGT---------Tagtcatgtcagaaagaaaatata
gi|38 : catgtcagagaaactaatat--------AAAA------CAAATATGAT-----GAAACACGAT----CTTA---CC---------------------T--C--ACAA--AT---A--G--T-----------TT--AA---------AT-G----CA---TGTGTATCAGA----CATATATGAGTTATA---CAT-ATTTtt
gi|39 : gaAAG------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CTTA---CCT----A---------------C--C--ATAC--AT---ATTG--T---------AATTGAAA---------AT-A----CA---TTTGAATCATA----CATATATG-GCTcagat
gi|1 : ------CAAATATAAT-----GCAATGCGAT----CTTA---CCT----A---------------C--C--ATAA--AT---ATTG--T---------AATTTGAA---------AT-A----CA---AGTGTATCAGT----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTA-AGTATAAAAGTAGT-AAG-TTTG-----ACTT-GTAC---TCT---------TGT--T---T---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---TATC-TTAG----GCATGTTTTGTCTT-TTCCAATA-ATATTTATTTATA---T-AT---A--C-------TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACGTgatt
gi|10 : ATGAT----CTTA---CCT----G---------------T--C--ATAA--AT---ATTG--T---------AATTGAAA---------AT-A----CA---TGTGAATCAAA----CATATATG-GCTGTATTTCTT--------------TT-AGTATAAAAGTACTTAA----T-TTCTTA-TT-GTAC---TGTAAAAGTAGTTT---T---T---T----GAATTCAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCAAGTTGGGTCTT-TCGAAATA-ATATTTATATATA---C-----------------TTTTC-TC--AGATCGTAATATATA--GCACAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagttttatacaatttaaattagactgaaatctaaaattaatactactattgcaacagacagcacgtgttgactcagttaaacgactacgccagtttttgataaaattgtcacttatccgtagttttactgtgaaaaaaattgttctggtgatctggcaccttgatgtagccagacattaataaagcctaaatttaataaaacaaaaaatacccaactagtcttatttggatataactctaaatcagttaaacgcatgttataaacaattctaatgtattataaatcgtttgcattcagtattcttaaccaatatttaatatttatatattgttgacaaataagatatggtctgccaaatttaccataacaaaatcattctgcgttgtttttataacacctattactctttttaaaagctgtaaatgtattctttcaacaagtaaaccgttatcaaatccccagacttcactcccgtaattcacaatttggctgtaattaaattgtcgaaaatatcta
gi|25 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna--AT---ATTA--T---------A--TCAAT---------TT-A----CT---TGTGTATTATA----CATATACG-GCTATAAGTCTT-AATTGAAA-GC-TTC-AGTACATAAGAACT-----GTTGCTTT----------------------------------C---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTAAAACTC-TTTTGATATATAC-TA-TTATA---cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaactgatcaagtttgatcacatttaaataag
gi|16 : cagatatatatT-ATT---AAAGCTTTT-AATATAAAAAAAAT-ACG-GTT-TTTTTA-TT-GTAC---TGT---------TA---TTTTC---T----GAATTTAGT-AAGTTG-AT---CAAC-TTAGTTAGACATGTTGGGTCTT-TTCCAATA-ATATTTATTAATA---A-AT---G--T-------TTTTT-TCGGAGATCGAA--ATATA--atgactataatattag
gi|28 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtcataccagaaaaactaatatgataaaaccaaataTGAAAACTATAT-AATATA----T-CT-----GTTATTTTTC-TTTATAT---T--------------------C---T----GAATATAAC-AAATCT-AT---AAAC-TTAG----GCAC-TTTGGTTTTATTTCATTG-ATGTTTATTAATA---A-AC---A--C-------TTGCC-TC--AGATCAGA--ATATA--
gi|1 : GAACTTATCAAGTTTTATACAATTTAAATTAGACTGAAATCTAAA---ATTAA----TACTACTATTGCAACA-GACAGCACGTGTTGACT-----------------CAGT-----------------TAAACGACTACGCCAGTTTTTGA-TAAAATTGTCACTTATCCGTAGTTTTA-----CTGTGAAAA-AAATTGTTCTGGTGATCTGGCACCTTGATGTAGCCAGACATTAATAAAGCCTA----AATTTAAT---AAAA--------CAA--AAAATACCCAACTAG-TCTTATTTGGATATAACTCTAAATCAGTTAAA--CGCATGTTATAAACAATTCTAATGTATTAT--AAATC-GTTTGCATTCAGTATTCTTAACCAATATT---TAATATTTATAT---ATTGTTGACAAATAAGAT--ATGGTC-TGCCAAATTTACCATA-ACAAAATCATTCTGCGTTatattcatttaatagttaatgatagtcatcctctaat
gi|9 : caaatataatgcaatgcgatcttacctaccataaatattgtaatttgaaatacaagtgtatcagtcatatatggttatatttcttatttgaaaagctttaagtataaaagtagtaagtttgacttgtactcttgttttgaatttaacaaattgattatcttaggcatgttttgtcttttccaataatatttatttatatatacttttctcagatcggaatatagcacgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAACCTATCAAGTTTGATTCAATTTAAATAAGGCTGAAgtttttataacacctattactctttttaaaagctgtaaatgtattctttcaacaagtaaaccgttatcaaatccccagacttcactcccgtaattcacaatttggctgtaattaaattgtcgaaaatatcta
gi|5 : tcagaaagcagatataatgtaacatgatcttatctaccatacatattgtaattgaaaatactagtgaatcatacatatatggctatatttcttaattgaaaagcttttagtataaaagtactaagttggtttattgtactgttgttttctaaatttaacaaattgataaactaaggcatgtttggtctttcccaataatatttatttatataaactttttctcaaatcggaataaagcacatactagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAACTTATCAAGTTTGATACAATTTAGATAAGGCTGCAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTAAAA-GACTGCACAAGCTGACTTAGTTGAATGC------CAGT-----------------T------------------TTCAATAAATTGATCACTAATGCATTGTTTTA-----CTGTTAAAATAAATAGTTACGGTGATCCG------TAATGTAGCCACACATCATTAAAGACTA----AA----AT---TAAAGATTTA-TCTATAAAGAAACCCAAGTAG-TGTTATTTGG--ATACCTCTATATCAGTTAAA--AGCATATTATA
gi|4 : tgtcagaaagcaaatagaatgcaacatgatcttacctaccataaatattgtaattgaaaatacatgtgaatcatacacatatggctatatttcttatttgaaaagcttttagaataaaagtttttttattgtactgttgatttctgaatttaaaaaattgattaacttaggcatgttgggtctttcacaataatatttatttatatatactttttctcagatcagaatataccgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAACTTATCAAGTTTGATACGATTTAAACAAGGCTGAGTTTTTAATTTATTGACCACTAATAC--TTGTT
gi|8 : atgtcagaaaacaaatataatgcaacatgatctaacctatctagcataaacatcgtaattgaaaatatatgagaatcataattatatatgtggctatattttttcatttgaaatgcttttagtttaaaagtgctaaggttttttttattgtattgttgtcgtctgaatttaacacattgataaacttaggtgtgttaggtctttctcaatgatatttatttatataaacttttctcagatcggaatatagcacacattttataataaattggtattcattctttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAACTTATCAAGTTTGATACAAGTTAAACAAAGGAGAAATCTAAA---TTTAA----TAATATTGTTGTAAAA-GAttactgtcaaaataaatagttccggtgatccggcacgttgatgtagccatacatcattaaagcctaaatttgattaaaagatttttcgataaagaaatccaagtagtcttatttggatatacctctaaatctgttaaaaacatattattaacaattctaatgtattttgaatcgtttgcattcagtatttt
gi|3 : atgtcagaaagcaaataaaatgcaacatgatcttacctaccataaattttgtaattgataacacatgtgaatcatacatatggctatattttctttatgaaaagcttttagtataaaagttctaaattttttcattgtactgttgttttctgaatttaacaaactgataaacttaggcatgttgggtttttcccaataatatttatttatatattatatttttctcaaatcggaatatagcatacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGAACTTATCAAGTTTGATTCAATTTAAATAAGGCTGAA-TCTAAA---ATCAA----TAATATGATTGTAAAACAACTGTGC----CGA----------------------------------------T------------------TTGGATAAATTGATCAGTAGTTCGTTATTTTA-----TGGTTAGAATAAATTGTTGCGGTGATCCGGCATCT---TGTAGCCACACATCATTAAAACTTT----AATTTGATAAAAAAAGA-AAT-TCAACAAAGAAATCCAAG-AA-TTTTATTCGGATATATCTCTATATCAGTTAAA--AGCATATTAT-----TTTTTTATGTATTTT--GAATCCT-TTGCAATCAGTA-TTTTAACCAATATTCAATAATGTTGACAT---ACCGTTGACAAATAAGAG--a
gi|30 : catgttagaaaactaatataatcaaatgaaacataatacaacttatctagttatattatgaactagaatataaataaaagcaaaacaaaaacaagatgcgtatcagctatatatggttatgtttctaatatcaaaagcttttaatataaaagtacttagtatttttattgttctgtcattttctgaatttaacaaattgatacactttggcatgttcgatattttccaataattattgataatgtatgtttttcgtaaatcggaatatagcacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAACTAATCAAGTTTGATACAATTTAAATAAGGCCAAAATCTAAA---ATTAA----CAATACTATTGTAAAA-GACTGCGCGTGTTGACT-----------------CA-------------------T------------------TTAAACGA--TTATGACa
gi|6 : GAACTTATAAAGCTAAATACAGTTTAAATAAGGCTGAACTCTAAA---TTCAA----CAGTTATATTA-TAAA-AATAGGACATGCTGACTCAGTTAACCGACTATGCCAGT-----------------T------------------TTGAATCAAATGATTACGGATTCGGTGTTCAA-----CAGT---------------------TTCGGCACCTTGATTTAGCTACACATCGTTAAAAATTA----TATTTGAT---AAagtttattgatatttgaaataaaaact
gi|40 : agtcagtaagatcattatgatataaactggtgttgcctactttaaaaactatcattgaaaatacatttatatcagaccaatatggctatatttctgatttgaaaagatttaaatataaaagtattaatgcctttagtggtagtgttattttctaaaatttaacaaaattaattgaaaactttagacatattgagcctatgtcaataacatttattaattttttgattttctttgatcagaatatgtcacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttAACTAATCAAGTTTAATACAATTTAAATAAAGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATGCTATTGTGAAA-GACTGt
gi|7 : ATATAAATAAGGCTAAAATTTAAA---ATTAA----T-ATATGACTGTAAAA-GACTGT
gi|12 : AAGGCTGAAATCTAAA---ACTTA----TAATATGATTGTAAAA-CACAGCACGTGTTGACT-----------------CAGTCAAACGACTGTGCCAATT------------------TTGGATGAAATGATCACTAATTTGTTGTTCTA-----CTGTTAGAATAAATAGTTCGG-TGATCCGGCACCTTCATGTAGGCATACATCATTAAAGCCTT----AATTTAAT---GAAAGATATT-TCAACAAAGATACCCAAG-AGTTTTTATTTGGATATACCTCTTAATCAGTTAAA--AGCATATTATAAACATTTTTTATGTA-TTTTGAATT--GTTTGCATTCAATATTTTTAACCAATATTTAATAATGTTTACAT---ATTGCTGACAAATAAGAG--AAAGTCTTC-CAAGTTCACCATtaaaatgaatagttctggttatcagacacattgatgtagccatacagcatttaaaccttgtgtaatatgataaaatattattcaacacataaatccaagaagtcttgcttggatatatctttaaaccagttaaaagcttattgtaaacaactttaatgtttatcgactcgtttgcattcagtattttaacaaatatttaataatatttatatatcatcattgacaaataagagaacttttgccaaatacaccatacaaaacaaccaagatttggtaattatttttaaaaactataaatatactctttcaacaggtcagctgttgttaaatccccatacgttattcctgtaattcacaattggtgtaattaactttaatatacactgtgctttggcaatatgaatgcaaattgatataaatatctattcattttaaaaaacacattttttgcttgatctttagagtgtaaatggcttcagcaacagaaccacggatt
gi|4 : GGCT-----------------GAGT-----------------T------------------TTTAATTTATTGACCACTAATAC-TTGTTTTA-----CTGTCAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACGTTGATGTAGCCATACATCATTAAAGCCTA----AATTTGATT--AAAAGATTTT-TCGATAAAGAAATCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACCTCTAAATCTGTTAAA--AACATATTATTAACAATTCTAATGTA-TTTTGAATC--GTTTGCATTCAGTATTTT
gi|7 : atgtcagaaaacaaatataatgcaacatgatctaacctatctagcataaacatcgtaattgaaaatatatgagaatcataattatatatgtggctatattttttcatttgaaatgcttttagtttaaaagtgctaaggttttttttattgtattgttgtcgtctgaatttaacacattgataaacttaggtgtgttaggtctttctcaatgatatttatttatataaacttttctcagatcggaatatagcacacattttataataaattggtattcattctttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgatacgatttaaacaaAAATTTAAAATTAATATATGACTGTAAAAGACTGTTAAAATGAATAGTTCTGGTTATCAGACACATTGATGTAGCCATACAGCATTTAAACCTTGTGTAATATGAT---AAAATATTAT-TCAACACATAAATCCAAGAAG-TCTTGCTTGGATATATCTTTAAACCAGTTAAA--AGCTTATTGTAAACAACTTTAATGT-TTATCGACTC--GTTTGCATTCAGTA-TTTTAACAAATATTTAATAATATTTATATATCATCATTGACAAATAAGAGAACT--TT-TGCCAAATACACCA--TACAAAA
gi|23 : atataaataaggctaAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTTGATGTAGTCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---ATAAGTTTTTTTCAATAAAGAAACCCAAGAAG-TCTTATTTGGATATACCTTTAAATCAGTTAAA--AGCATATTGTAAACAATTCTTATGTA-TTTTGCATC--GTTTGCATTCAGTATTTTcaaccaagatttggtaattatttttaaaaactataaatatactctttcaacaggtcagctgttgttaaatccccatacgttattcctgtaattcacaattggtgtaattaactttaatatacactgtgctttggcaatatgaatgcaaattgatataaatatctattcattttaaaaaacacattttttgcttgatctttagagtgtaaatggcttcagcaacagaaccacggatt
gi|11 : aTTAAATAAGCATATTATAAACAATTCTAATGTA-TTTTGAATC--GTTTGCGTTCAGTATTTTTAACCAATATTAAATAATATCTGTTT---ATCATTGACAAATAAGAG--AATGTC-TGCCAAATTCACCA
gi|22 : atGTATTTT-AACCAATATTTAATAGCATTTGTAA---ATCGTTGAC----------------------AAATTCACCATGTACAAAATCAGTCTGTATTcacccacctgttattcttctttttaaaaactttaaatgtactcttctaacgggtaaatcattattaaatccccagatttcactcccgtaattcaaaattggtgtaattaacgaaaagacataccctgtgcttcggcgatatgaaagtaaatttatataaatgtctattcattttaaaaatagctttttgtgcttcacctgataacgtgttaatgacttcagtaaaaagaaccaccgactgtta
gi|18 : TATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAG--ATAGTC-TGCCAAATTCACCATGTACAAAATCATTTTGCGgattttttaacacctattattcttttgaaaaactgttaatgtactctttcaacgggtaaaccagatttcactcccgtaattcaaaattggcgtaattaatttgtcgaaaagat
gi|13 : ATATTTAATAATATTTTTAT---ATCGTTGACAAATAAGAG--ATAGTC-TGCCAAACTCACCCTACACAAAATCATTTTGCGTTataatttttaacacctattattcttattaaaaactgtagatgtacgctttcaacgggtaaacaatcattatatccccagacttcactcccgtaattcaaaattggtgtaattaacttgtcgaaaagatctaccttgt
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|26 ): ACACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACTTATCAAGTTTGATA
Unaligned ( gi|27 ): GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACTTATCAAGTTTT
Unaligned ( gi|33 ): TATTCTTTTTAAAAACTGTAAATGTACTCTTTAAACGGGTAAACCATCATTAAATTCCCAGACTTCACTCCCGTAATTCCAAATTGGTGCAATTAACTTGTCGAAAAGATTTACCCTGTG
Unaligned ( gi|36 ): TATTCTTTTTAAGAACTGGATACACCATCATTATATCCCTAGACGTCACTCCCGTAATTCAAAATTGGTGTAATTAACTTGTCGAAAAGATCTACCCTG
Unaligned ( gi|41 ): AAGCAAGGGTGAAAGTGGAGAAGGTGGTATGCATTACAGTAATAATATACAAAAGTCAT
Unaligned ( gi|42 ): AAAAATAGAATACAAAAACAAGATGTGTATCAGACATATATGGCTATAT
Alignments
lowQualScore : 111111 111111111111 111111111 11111111 222222222222222222222222222 1111 1111 9999999999999999999999999999999999999999999999999 111 2
lowQualScore : 999999 44444 3333 3333 222 444444 3333 222 555555555555 22 666666666 222 6666666 555555555 3333 222 999 1 1 3333 1 1 00000000 2 2 2 4 333 777777777777777777777777777 2 2 333 2 4444 2 33 2 33 1 888 5555 2 33 33 33 3 666 7777 2222 4 5 9999 0000 1111111111111111111111111111111111111111111111111 1 1 2 0 1 0 1 9999 222 111 5 5 9 5 66 1 1 0 1 777 55 1
lowQualScore : ...... ..... .... .... ... ...... .... ... ............ .. ......... ... ....... ......... .... ... ... . . .... . . ........ . . . . ... ........................... . . ... . .... . .. . .. . ... .... . .. .. .. . ... .... .... . . .... .... ................................................. . . . . . . . .... ... ... . . . . .. . . . . ... .. .
lowQualScore : 111111 33333 5555 5555 999 444444 4444 888 111111111111 22 444444444 888 8888888 000000000 4444 777 000 0 0 3333 6 7 88888888 0 0 0 0 555 444444444444444444444444444 2 2 999 2 7777 9 11 5 22 5 222 1111 7 77 77 99 3 444 7777 5555 4 7 0000 6666 0000000000000000000000000000000000000000000000000 4 0 8 1 0 2 9 4444 222 111 0 0 8 0 11 0 6 8 0 888 99 7
consensus : TGTCAGAAAG------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGNATCANA----CATATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAGTATAAAAGTACT-A-AG---TT-T-TTTT-A-TTGTACTG---T---------TG---T---C---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTGGG--TCTTTCCCAATAATATTTAT--TTATA---TATA-T--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACTTATCAAGTTTGATACA-ATTTAAATAAGGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTAAAA----GAC-TGC-GCGT--GTT----GACT-----------CA-----------------GT-----------------TTTGAATAAANTGATCACTAATNCGTTGTTTTACTGTTAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTTGATGTAGCCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---AAAAGATTTTT-CAACAAAGAA-ACCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACCTCTAAATCAGTTAAA--AGCATATTATAAACAATTCTAATGTATTTTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGANAGTCTGCCAAATTCACCATGTACAAAATCATTTTGCGTT
Reference ( family-4767 ) : TGTCAGAAAG------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGNATCANA----CATATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAGTATAAAAGTACT-A-AG---TT-T-TTTT-A-TTGTACTG---T---------TG---T---C---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTGGG--TCTTTCCCAATAATATTTAT--TTATA---TATA-T--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACTTATCAAGTTTGATACA-ATTTAAATAAGGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTAAAA----GAC-TGC-GCGT--GTT----GACT-----------CA-----------------GT-----------------TTTGAATAAANTGATCACTAATNCGTTGTTTTACTGTTAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTTGATGTAGCCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---AAAAGATTTTT-CAACAAAGAA-ACCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACCTCTAAATCAGTTAAA--AGCATATTATAAACAATTCTNATGTATTTTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAATTCACCATGTACAAAATCATTCTGCGTT
gi|1 : ------CAAATATAAT-----GCAATGCGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---TG-------AA---------ATA----C---A---AGTGTATCAGT----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTAAGTATAAAAGTAGT-A-AG--------TTTG-ACTTGTACTC---T---------TGT--T---T---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---TATC-TTAG----GCATGTTTTG--TCTTTTCCAATAATATTTAT--TTATA---TATA-C--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACGT
gi|1 : GAACTTATCAAGTTTTATACA-ATTTAAATTAGACTGAAATCTAAA---ATTAA----TACTACTATTGCAACA----GAC-AGC-ACGT--GTT----GACT-----------CAGTTAAACGACTACGCCAGT-----------------TTTTGATAAAATTGTCACTTATCCGTAGTTTTACTGTGAAAA-AAATTGTTCTGGTGATCTGGCACCTTGATGTAGCCAGACATTAATAAAGCCTA----AATTTAAT---AAAA-----------CAAAAAATACCCAACTAG-TCTTATTTGGATATAACTCTAAATCAGTTAAA--CGCATGTTATAAACAATTCTAATGTA-TTATAAATCGTTTGCATTCAGTATTCTTAACCAATATT---TAATATTTATAT---ATTGTTGACAAATAAGATATGGTCTGCCAAATTTACCATA-ACAAAATCATTCTGCGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagttttatacaatttaaattagactgaaatctaaaattaatactactattgcaacagacagcacgtgttgactcagttaaacgactacgccagtttttgataaaattgtcacttatccgtagttttactgtgaaaaaaattgttctggtgatctggcaccttgatgtagccagacattaataaagcctaaatttaataaaacaaaaaatacccaactagtcttatttggatataactctaaatcagttaaacgcatgttataaacaattctaatgtattataaatcgtttgcattcagtattcttaaccaatatttaatatttatatattgttgacaaataagatatggtctgccaaatttaccataacaaaatcattctgcgttgtttttataacacctattactctttttaaaagctgtaaatgtattctttcaacaagtaaaccgttatcaaatccccagacttcactcccgtaattcacaatttggctgtaattaaattgtcgaaaatatcta
gi|10 : caaatataatgcaatgcgatcttacctaccataaatattgtaatttgaaatacaagtgtatcagtcatatatggttatatttcttatttgaaaagctttaagtataaaagtagtaagtttgacttgtactcttgttttgaatttaacaaattgattatcttaggcatgttttgtcttttccaataatatttatttatatatacttttctcagatcggaatatagcacgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGAT----CT----TA---CCTG------TCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCAAA----CATATATG-GCTGTATTTCTT--------------TTAGTATAAAAGTACTTA-A-----T-T-TCTT-A-TTGTACTG---TAAAAGTAGTTT---T---T---T----GAATTCAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCAAGTTGGG--TCTTTCGAAATAA----TAT--TTATA---TATA-C--TTTTC-TC--AGATCGTAATATATA--GCACAgtttttataacacctattactctttttaaaagctgtaaatgtattctttcaacaagtaaaccgttatcaaatccccagacttcactcccgtaattcacaatttggctgtaattaaattgtcgaaaatatcta
gi|10 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGAACTGATCAAGTTTGAT-CACATTTAAATAAGcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaactgatcaagtttgatcacatttaaataag
gi|11 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgatcttacctgtcataaatattgtaattgaaaatacatgtgaatcaaacatatatggctgtatttcttttagtataaaagtacttaatttcttattgtactgtaaaagtagttttttgaattcaacaaattgataaacttaggcaagttgggtctttcgaaataatatttatatatacttttctcagatcgtaatatatagcacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTAAATAAGCATATTATAAACAATTCTAATGTATTTT-GAATCGTTTGCGTTCAGTATTTTTAACCAATATTAAATAATATCTGTTT---ATCATTGACAAATAAGAGAATGTCTGCCAAATTCACCA
gi|12 : atAAGGCTGAAATCTAAA---ACTTA----TAATATGATTGTAAAA----CAC-AGC-ACGT--GTT----GACT-----------CA-----------------GTCAAACGACTGTGCCAATTTTGGATGAAATGATCACTAATTTGTTGTTCTACTGTTAGAATAAATAGTTC-GGTGATCCGGCACCTTCATGTAGGCATACATCATTAAAGCCTT----AATTTAAT---GAAAGATATTT-CAACAAAGAT-ACCCAAG-AGTTTTTATTTGGATATACCTCTTAATCAGTTAAA--AGCATATTATAAACATTTTTTATGTA-TTTTGAATTGTTTGCATTCAATATTTTTAACCAATATTTAATAATGTTTACAT---ATTGCTGACAAATAAGAGAAAGTCTTCCAAGTTCACCATcacccacctgttattcttctttttaaaaactttaaatgtactcttctaacgggtaaatcattattaaatccccagatttcactcccgtaattcaaaattggtgtaattaacgaaaagacataccctgtgcttcggcgatatgaaagtaaatttatataaatgtctattcattttaaaaatagctttttgtgcttcacctgataacgtgttaatgacttcagtaaaaagaaccaccgactgtta
gi|13 : ATATTTAATAATATTTTTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAACTCACCCTACACAAAATCATTTTGCGTT
gi|14 : TGTCAGAAAGAAAAAACAAATATAAT-----ACAACATGAT----CT----TAGAACTTAGTTATACTATAA----AT---A---G--------AGAACAA---------AT---AA-------AAGCAAAACCAAAA----C---AAGATGTGTATCAGA----CATATATT-GCTATGTTTCTG-ATTTGAAAAGCTTTTAATATA----------------TT-T-TTAT-A-TTGTACTGTTTT---------TT---T---C---C----GAATTTAAC-AAATTG-AA---AAAC-ATAG----GTATGTT-----TTTTCCCCAATAATATTTAT--TTATA---TATG-T--TTTGC-GT--AAATCAGA--ATGTtgtttgttaacaccttttattgttcttgcaacccgttaaccatcattaaatctccagacatcacttccgtaattaaaaattggtgtaattaacttgcaaagatctaccctgtgcttcgacgatatgaaagtaaatttatatcagtatttatttatttcaaaaataaccttttgtgcttgacctgatagagtgtaaatggc
gi|15 : caAAAG------CAAATATAAT-----ACAACATTAT----CT----TA---CCTA------GT-TA------T---A---C--------TG--TAAAAAAGCAAATC---AA-------AA---------ACA----A---AA--TGTGTATCAGA----CACATATG-GCTCTGTTTCTG-ATTTGAAAAGCTTTTAATATAAAAGTACT-A-AG---TT-T-TTTT-A-TTGTACTT---T---------TA---T---T---TTTT-GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTGGT--TTTTTTCCATTAATATTTAT--TAATA---TATG-T--TTTTCGTT--A-ATCGGA--ATATA--
gi|16 : ctgtcagaaaaaataT-ATT---AAAGCTTTTAATATAAAAAAAAT-ACGG---TT-T-TTTT-A-TTGTACTG---T---------TA---TTTTC---T----GAATTTAGT-AAGTTG-AT---CAAC-TTAGTTAGACATGTTGGG--TCTTTTCCAATAATATTTAT--TAATA---AATG-T--TTTTT-TCGGAGATCGAA--ATATA--
gi|17 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtcataccagaaaaactaatatgataaaaccaaataGTCAGAAAC------CAAATAAAAT-----GCAACGTGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---TG-------AA---------ATA----C---A---AGTGTATCAGT----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTAAGTATAAAAGTAGT-A-AG---TT-T-GTC----TTGTACTC---T---------TGT--T---T---T----GAATTTAAC-AAAT-----------C-TTAG----GCATGTTTTG--TCTTTTCCAATAATATTTAT--TTATA---TATA-C--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GC
gi|18 : TATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAATTCACCATGTACAAAATCATTTTGCG
gi|19 : CAGAA-G------TAAATATAAT-----ACAACATGAT----CT----TA---CCTA------CTATAA----AA---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------GA---------TTG----C---A---TGTGTACCATA----CACATATG-GTTATACTTATT-GTTTGAAAAGCTTTGAGTATGAAAGTACA-A-AG---TT-T-TTCT-A-ATGTTTTG---T---------TGTTTT---C---T----GAATTTAAT-AAATTG-AG---TAAC-TTAG----G---------------------TAATA---------------TATA-C--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATGTA--ACataatttttaacacctattattcttattaaaaactgtagatgtacgctttcaacgggtaaacaatcattatatccccagacttcactcccgtaattcaaaattggtgtaattaacttgtcgaaaagatctaccttgt
gi|2 : gaTGTCAGAAAG------CAAATACAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------TAATGA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGCGAATCATA----TATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCATTTAGTATAAAAGTACT-A-AGG--TTGT-TTTT-A-TTGTACTG---C---------TG---T---C---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTTGG--TCTTTCCCAATAATACTTAT--TTATA---CA-A-T--TTTTC-TC--AGATCGGA--ACATA--GCACAT
gi|2 : GAACCTACCACGTTATATACT-ATTTAAATAAGGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTTAAA----GAC-TGT-GCGT--GTT----GACT-----------CA-----------------GT-----------------TTTGAATAAATTTATCACTAATACGTTGTTTTACTGTTAAAATGAATATTTCCGCTAATCCGGCACCTTGATGCAGCCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---AAAAGATTTTT-CAATAAAAAA-ACCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACTTCTAAATCAGTTAAA--ACCATATTATAAACAATTCTAATGTATTTTTGAAATGTT-GCATTCTGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGTTAGTCTG-CAAATTCACCATGTACAAAATCATTTTGCGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacctaccacgttatatactatttaaataaggctgaaatctaaaattaataatactattgttaaagactgtgcgtgttgactcagttttgaataaatttatcactaatacgttgttttactgttaaaatgaatatttccgctaatccggcaccttgatgcagccacacatcattaaagcctaaatttgataaaagatttttcaataaaaaaacccaagtagtcttatttggatatacttctaaatcagttaaaaccatattataaacaattctaatgtatttttgaaatgttgcattctgtatttttaaccaatatttaataatatttgtatatcgttgacaaataagagttagtctgcaaattcaccatgtacaaaatcattttgcgtt
gi|20 : tgtcagaaagcaaatacaatgcaacatgatcttacctataatgaatattgtaattgaaaatacatgcgaatcatatatatatggttatatttcttatttgaaaagcatttagtataaaagtactaaggttgtttttattgtactgctgtctgaatttaacaaattgataaacttaggcatgtttggtctttcccaataatacttatttatacaatttttctcagatcggaacatagcacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTCAGCAAA------CAATTTTAAT-----ATAGCATGAT----AC----TA---CCT-------CCTTA-----------------------TA--TAA---------CTAGAGAT------AA---------ATA----C---A---CGTGTGTCAGA---------ATG---------------TTTAAAAAGCATTTAATAGAAAGGTACT-A-AG---TT-T-TTTTTA-TTGTACTG---T---------TG---T---C---TTAT-GAACTGAAT-AAATCA-AC---ACAC-TTTG----GCATATTGGG--TCTATTCTAATACTGCTTAT--TAATA---TATA-T--
gi|21 : caTGTCATAAAG------CAAATATAAT-----GCAATGTAAT----TC----TA---CCTA------CTATAA----AT---A---T--------TG--TTA---------TT---GA-------AA---------CTA----C---A---TGCGTATCAAA----CATATCCA-GCTATATTTCTT-ATTTAAAAAACTTTTAGTGTAAAAGTATT----T---TT-T-TTTT-A-TTGAACTG---T---------TGTTTT---C---T----GAATTAAAT-AAATTGAAA---AAAA-ATAG----GCATGTTGGG--TTT
gi|22 : GTATTTT-AACCAATATTTAATAGCATTTGTAA---ATCGTTGA-------------------CAAATTCACCATGTACAAAATCAGTCTGTATT
gi|23 : AAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTTGATGTAGTCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---ATAAGTTTTTTTCAATAAAGAA-ACCCAAGAAG-TCTTATTTGGATATACCTTTAAATCAGTTAAA--AGCATATTGTAAACAATTCTTATGTA-TTTTGCATCGTTTGCATTCAGTATTTTgattttttaacacctattattcttttgaaaaactgttaatgtactctttcaacgggtaaaccagatttcactcccgtaattcaaaattggcgtaattaatttgtcgaaaagat
gi|24 : AGAAAA-------AAATAAAA-------CAACATGAT----CT----TA---CCTAGTTATACTACAA----AT---A---TAATGAAAGTA--TAA---------GC---AA-------AACA-------ACA----C---AGA-TGTGTATCAGA----CATATATG-GCTATGTTTCTG-ATTTGAAAAGCTTTCCATATAAAAGTACT-A------TT-TATTTT-A-TTGTACTG---T---------T
gi|25 : catgtcagagaaactaatatATAT----AT---A---T--------TA--TA-----------T---CA-------AT---------TTA----C---T---TGTGTATTATA----CATATACG-GCTATAAGTCTT-AATTGAAA-GCTTC-AGTACATAAGAACT----------------------GT--TG---C---------TT---T---C---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTAAAACTCTTT-----TGATATATACTATTATA---tt
gi|26 : cagatatGAACTTATCAAGTTTGATAatgactataatattag
gi|28 : acacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---TT-T-TTCT---TTATATT-----------------------C---T----GAATATAAC-AAATCT-AT---AAAC-TTAG----GCACTTTGGT--TTTATTTCATTGATGTTTAT--TAATA---AACA-C--TTGCC-TC--AGATCAGA--ATATA--
gi|29 : tgaaaactatataatatatctgttaGTCAGAAAG------CAAATAT---------------GAT----TT----TA---TCTA------CCATAA----AA---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCATA----CATATATG-GCTATATTT-TT-ATTTGAAAAACTTTTAGTATAAAAGTACT-A-AGTTTTT-T-TTTT-A-TTGTACTG---T---------TG---T---T---TTCA-GAATATAatattcatttaatagttaatgatagtcatcctctaat
gi|3 : TGTTAGAAAA------CTAATATAATCAAATGAAACATAATACAACT----TA---TCTAGTTATATTATGA----ACTAGA---A--------TA--TAA---------AT---AA-------AAGCAAAACAAAAA----C---AAGATGCGTATCAGC----TATATATG-GTTATGTTTCTA-ATATCAAAAGCTTTTAATATAAAAGTACT-T-AG---TA-T-TTTT-A-TTGTTCTG---TCAT------TT---T---C---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---ACAC-TTTG----GCATGTTCGA--TATTTTCCAATAA---TTAT--TGATAATGTATG-T--TTTTC-GT--AAATCGGA--ATATA--GCACA
gi|3 : caGAACTTATCAAGTTTGATTCA-ATTTAAATAAGGCTGAA-TCTAAA---ATCAA----TAATATGATTGTAAAAC---AAC-TGT-GC------C----GA---------------------------------------------------TTTGGATAAATTGATCAGTAGTTCGTTATTTTATGGTTAGAATAAATTGTTGCGGTGATCCGGCATCT---TGTAGCCACACATCATTAAAACTTT----AATTTGATAAAAAAAGA-AATT-CAACAAAGAA-ATCCAAG-AA-TTTTATTCGGATATATCTCTATATCAGTTAAA--AGCATATTAT-----TTTTTTATGTA-TTTTGAATCCTTTGCAATCAGTA-TTTTAACCAATATTCAATAATGTTGACAT---ACCGTTGACAAATAAGAGAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgattcaatttaaataaggctgaatctaaaatcaataatatgattgtaaaacaactgtgccgatttggataaattgatcagtagttcgttattttatggttagaataaattgttgcggtgatccggcatcttgtagccacacatcattaaaactttaatttgataaaaaaagaaattcaacaaagaaatccaagaattttattcggatatatctctatatcagttaaaagcatattatttttttatgtattttgaatcctttgcaatcagtattttaaccaatattcaataatgttgacataccgttgacaaataagaga
gi|30 : catgttagaaaactaatataatcaaatgaaacataatacaacttatctagttatattatgaactagaatataaataaaagcaaaacaaaaacaagatgcgtatcagctatatatggttatgtttctaatatcaaaagcttttaatataaaagtacttagtatttttattgttctgtcattttctgaatttaacaaattgatacactttggcatgttcgatattttccaataattattgataatgtatgtttttcgtaaatcggaatatagcacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAACTAATCAAGTTTGATACA-ATTTAAATAAGGCCAAAATCTAAA---ATTAA----CAATACTATTGTAAAA----GAC-TGC-GCGT--GTT----GACT-----------CA------------------------------------TTTAAACGA--TTATGAC-AGTTTATTGATAT----TTGAAATAAA
gi|31 : CAGAAAG------CAAATACAGT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAG----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCATA----CATATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAaact
gi|32 : cTGTCAGAAAG------AAAATATAAT-----CCAACATGAT----CC----TC---CCTA------CCATAT----AT---A---T--------TG--TAA---------CT---GA-------AA---------AAAAACCC---A---GGTGAATCATA----CATGTATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTA-TATAAAagtcatgtcagaaagaaaatata
gi|34 : TGTCAGAAAG------CAAATAT---------------GAT----CT----AA---CCTG------CCATAA----AT---AATGTACA-----TG--TAA---------TT---CG-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCATA----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAGTTCAAAAGTAt
gi|35 : aTGTCAGAAAG------CAAATAT---------------GAT----CT----AA---CCTG------CCATAA----AT---AATGTACA-----TG--TAA---------TT---CG-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCATA----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAG
gi|37 : aTGTCAGAAAAA-----CAAATATAAT-----ACAACGTAAT----CT----TA---CCTA--------GTAATACTAT---A---G--------TG--TAA---------TG---GAACAGAACAA---------AAA----CCAGA---TGTGTATCAGA----C
gi|38 : gttaAAAA------CAAATATGAT-----GAAACACGAT----CT----TA---CCT--------CACAA----AT---A-------------G--T-----------TT------------AA---------ATG----C---A---TGTGTATCAGA----CATATATGAGTTATA---CAT-ATTT
gi|39 : gaAAG------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAC----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TTTGAATCATA----CATATATG-GCTcagat
gi|4 : TGTCAGAAAA------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CTAACCTA---TCTA------GCATAA----AC---A---T--------CG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----T---A---TGAGAATCATAATTATATATGTG-GCTATATTTTTTCATTTGAAATGCTTTTAGTTTAAAAGTGCT-A-AGGT-TT-T-TTTT-A-TTGTATTG---T---------TG---T---CGTCT----GAATTTAAC-ACATTG-AT---AAAC-TTAG----GTGTGTTAGG--TCTTTCTCAATGATATTTAT--TTATA---TAAA-C--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACAgatt
gi|4 : aGAACTTATCAAGTTTGATACG-ATTTAAACAAGGCTGAGTTTTTAATTTATTGACCACTAATACTcattttataataaattggtattcattctttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgatacgatttaaacaaggctgagtttttaatttattgaccactaatacttgttttactgtcaaaataaatagttccggtgatccggcacgttgatgtagccatacatcattaaagcctaaatttgattaaaagatttttcgataaagaaatccaagtagtcttatttggatatacctctaaatctgttaaaaacatattattaacaattctaatgtattttgaatcgtttgcattcagtatttt
gi|4 : atgtcagaaaacaaatataatgcaacatgatctaacctatctagcataaacatcgtaattgaaaatatatgagaatcataattatatatgtggctatattttttcatttgaaatgcttttagtttaaaagtgctaaggttttttttattgtattgttgtcgtctgaatttaacacattgataaacttaggtgtgttaggtctttctcaatgatatttatttatataaacttttctcagatcggaatatagcacacattttataataaattggtattcattctttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----GGCT-----------GA-----------------GT-----------------TTTTAATTTATTGACCACTAATAC-TTGTTTTACTGTCAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACGTTGATGTAGCCATACATCATTAAAGCCTA----AATTTGATT--AAAAGATTTTT-CGATAAAGAA-ATCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACCTCTAAATCTGTTAAA--AACATATTATTAACAATTCTAATGTA-TTTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTtgttttactgtcaaaataaatagttccggtgatccggcacgttgatgtagccatacatcattaaagcctaaatttgattaaaagatttttcgataaagaaatccaagtagtcttatttggatatacctctaaatctgttaaaaacatattattaacaattctaatgtattttgaatcgtttgcattcagtatttt
gi|40 : atgtcagaaaacaaatataatgcaacatgatctaacctatctagcataaacatcgtaattgaaaatatatgagaatcataattatatatgtggctatattttttcatttgaaatgcttttagtttaaaagtgctaaggttttttttattgtattgttgtcgtctgaatttaacacattgataaacttaggtgtgttaggtctttctcaatgatatttatttatataaacttttctcagatcggaatatagcacacattttataataaattggtattcattctttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgatacgatttaaacaaAACTAATCAAGTTTAATACA-ATTTAAATAAAGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATGCTATTGTGAAA----GAC-TG
gi|42 : ---A---TGTGTATCAGA----CATATATG-GCTATAT
gi|5 : aaaaatagaatacaaaaacaagTGTCAGAAAG------CAAATAGAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCATA----CACATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAGAATAA--------A-AG---TT-T-TTTT-A-TTGTACTG---T---------TGATTT---C---T----GAATTTAAA-AAATTG-AT---TAAC-TTAG----GCATGTTGGG--TCTTTCACAATAATATTTAT--TTATA---TATACT--TTTTC-TC--AGATCAGA--ATATACCGCAC
gi|5 : GAACTTATCAAGTTTGATACA-ATTTAGATAAGGCTGCAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTAAAA----GAC-TGC-ACAA--GCT----GACTTAGTTGAATGCCA-----------------GT-----------------TTTCAATAAATTGATCACTAATGCATTGTTTTACTGTTAAAATAAATAGTTACGGTGATCCG------TAATGTAGCCACACATCATTAAAGACTA----AA----AT---TAAAGATTTAT-CTATAAAGAA-ACCCAAGTAG-TGTTATTTGG--ATACCTCTATATCAGTTAAA--AGCATATTATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgatacaatttagataaggctgcaatctaaaattaataatactattgtaaaagactgcacaagctgacttagttgaatgccagttttcaataaattgatcactaatgcattgttttactgttaaaataaatagttacggtgatccgtaatgtagccacacatcattaaagactaaaattaaagatttatctataaagaaacccaagtagtgttatttggatacctctatatcagttaaaagcatattata
gi|6 : tgtcagaaagcaaatagaatgcaacatgatcttacctaccataaatattgtaattgaaaatacatgtgaatcatacacatatggctatatttcttatttgaaaagcttttagaataaaagtttttttattgtactgttgatttctgaatttaaaaaattgattaacttaggcatgttgggtctttcacaataatatttatttatatatactttttctcagatcagaatataccgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTCAGTAAGAT----CAT-TATGAT-----ATAAACTGGT----GT----TG---CCTA------CTTTAA----AA---A---C--------TA--TCA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TTTATATCAGA----CCAATATG-GCTATATTTCTG-ATTTGAAAAGATTTAAATATAAAAGTATT-A-A----TG-C-CTTT-AGTGGTAGTG---T---------TA---T---T---TTCTAAAATTTAACAAAATTA-ATTGAAAACTTTAG----ACATATTGAG--CCTATGTCAATAACATTTAT--TAAT----TTTT-TGATTTTC-TT--TGATCAGA--ATATG--TCACA
gi|6 : aGAACTTATAAAGCTAAATACA-GTTTAAATAAGGCTGAACTCTAAA---TTCAA----CAGTTATATTATAAAAATAGGACATGCTGACTCAGTTAACCGACTATGC-------CA-----------------GT-----------------TTTGAATCAAATGATTACGGATTCGGTGTTC-------------AACAGT--------TTCGGCACCTTGATTTAGCTACACATCGTTAAAAATTA----TATTTGAT---AAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaacttataaagctaaatacagtttaaataaggctgaactctaaattcaacagttatattataaaaataggacatgctgactcagttaaccgactatgccagttttgaatcaaatgattacggattcggtgttcaacagtttcggcaccttgatttagctacacatcgttaaaaattatatttgataat
gi|7 : agtcagtaagatcattatgatataaactggtgttgcctactttaaaaactatcattgaaaatacatttatatcagaccaatatggctatatttctgatttgaaaagatttaaatataaaagtattaatgcctttagtggtagtgttattttctaaaatttaacaaaattaattgaaaactttagacatattgagcctatgtcaataacatttattaattttttgattttctttgatcagaatatgtcacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntt-ATATAAATAAGGCTAAAATTTAAA---ATTAA----T-ATATGACTGTAAAA----GAC-TGt
gi|7 : ACTGTTAAAATGAATAGTTCTGGTTATCAGACACATTGATGTAGCCATACAGCATTTAAACCTTGTGTAATATGAT---AAAATATTATT-CAACACATAA-ATCCAAGAAG-TCTTGCTTGGATATATCTTTAAACCAGTTAAA--AGCTTATTGTAAACAACTTTAATGT-TTATCGACTCGTTTGCATTCAGTA-TTTTAACAAATATTTAATAATATTTATATATCATCATTGACAAATAAGAGAACTTTTGCCAAATACACCA--TACAAAAttaaaatgaatagttctggttatcagacacattgatgtagccatacagcatttaaaccttgtgtaatatgataaaatattattcaacacataaatccaagaagtcttgcttggatatatctttaaaccagttaaaagcttattgtaaacaactttaatgtttatcgactcgtttgcattcagtattttaacaaatatttaataatatttatatatcatcattgacaaataagagaacttttgccaaatacaccatacaaaacaaccaagatttggtaattatttttaaaaactataaatatactctttcaacaggtcagctgttgttaaatccccatacgttattcctgtaattcacaattggtgtaattaactttaatatacactgtgctttggcaatatgaatgcaaattgatataaatatctattcattttaaaaaacacattttttgcttgatctttagagtgtaaatggcttcagcaacagaaccacggatt
gi|8 : atataaataaggctaaaatttaaaattaatatatgactgtaaaagTGTCAGAAAG------CAAATAAAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---T---T--------TG--TAA---------TT---GA-------TA---------ACA----C---A---TGTGAATCATA----C--ATATG-GCTATATTTTCT-TTATGAAAAGCTTTTAGTATAAAAGTTCT-A-AA---TT-T-TTTC-A-TTGTACTG---T---------TGTTTT---C---T----GAATTTAAC-AAACTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTGGG--TTTTTCCCAATAATATTTAT--TTATATATTATA-T--TTTTC-TC--AAATCGGA--ATATA--GCATAcaaccaagatttggtaattatttttaaaaactataaatatactctttcaacaggtcagctgttgttaaatccccatacgttattcctgtaattcacaattggtgtaattaactttaatatacactgtgctttggcaatatgaatgcaaattgatataaatatctattcattttaaaaaacacattttttgcttgatctttagagtgtaaatggcttcagcaacagaaccacggatt
gi|8 : aGAACTTATCAAGTTTGATACA-AGTTAAACAAAGGAGAAATCTAAA---TTTAA----TAATATTGTTGTAAAA----GAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaacttatcaagtttgatacaagttaaacaaaggagaaatctaaatttaataatattgttgtaaaagaa
gi|9 : atgtcagaaagcaaataaaatgcaacatgatcttacctaccataaattttgtaattgataacacatgtgaatcatacatatggctatattttctttatgaaaagcttttagtataaaagttctaaattttttcattgtactgttgttttctgaatttaacaaactgataaacttaggcatgttgggtttttcccaataatatttatttatatattatatttttctcaaatcggaatatagcatacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTCAGAAAG------CAGATATAAT-----GTAACATGAT----CT----TA---TCTA------CCATAC----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---T---AGTGAATCATA----CATATATG-GCTATATTTCTT-AATTGAAAAGCTTTTAGTATAAAAGTACT-A-AG---TT-G-GTTT-A-TTGTACTG---T---------TGTTTT---C---T----AAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TAAG----GCATGTTTGG--TCTTTCCCAATAATATTTAT--TTATA---TAAACT--TTTTC-TC--AAATCGGA--ATAAA--GCACATa
gi|9 : GAACCTATCAAGTTTGATTCA-ATTTAAATAAGGCTGAAactagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacctatcaagtttgattcaatttaaataaggctgaa
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACTTATCAAGTTTT
Unaligned ( gi|33 ): TATTCTTTTTAAAAACTGTAAATGTACTCTTTAAACGGGTAAACCATCATTAAATTCCCAGACTTCACTCCCGTAATTCCAAATTGGTGCAATTAACTTGTCGAAAAGATTTACCCTGTG
Unaligned ( gi|36 ): TATTCTTTTTAAGAACTGGATACACCATCATTATATCCCTAGACGTCACTCCCGTAATTCAAAATTGGTGTAATTAACTTGTCGAAAAGATCTACCCTG
Unaligned ( gi|41 ): AAGCAAGGGTGAAAGTGGAGAAGGTGGTATGCATTACAGTAATAATATACAAAAGTCAT
Alignments
lowQualScore : 111111 111111111111 111111111 11111111 222222222222222222222222222 1111 1111 9999999999999999999999999999999999999999999999999 111 2
lowQualScore : 999999 44444 3333 3333 222 444444 3333 222 555555555555 22 666666666 222 6666666 555555555 3333 222 999 1 1 3333 1 1 00000000 2 2 2 4 333 777777777777777777777777777 2 2 333 2 4444 2 33 2 33 1 888 5555 2 33 33 33 3 666 7777 2222 4 5 9999 0000 1111111111111111111111111111111111111111111111111 1 1 2 0 1 0 1 9999 222 111 5 5 9 5 66 0 1 0 1 777 44 1
lowQualScore : ...... ..... .... .... ... ...... .... ... ............ .. ......... ... ....... ......... .... ... ... . . .... . . ........ . . . . ... ........................... . . ... . .... . .. . .. . ... .... . .. .. .. . ... .... .... . . .... .... ................................................. . . . . . . . .... ... ... . . . . .. . . . . ... .. .
lowQualScore : 111111 33333 5555 5555 999 444444 4444 888 111111111111 22 444444444 888 8888888 000000000 4444 777 000 0 0 3333 6 7 88888888 0 0 0 0 555 444444444444444444444444444 2 2 999 2 7777 9 11 5 22 5 222 1111 7 77 77 99 3 444 7777 5555 4 7 0000 6666 0000000000000000000000000000000000000000000000000 4 0 8 1 0 2 9 4444 222 111 0 0 8 0 11 8 6 8 0 888 99 7
consensus : TGTCAGAAAG------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGNATCANA----CATATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAGTATAAAAGTACT-A-AG---TT-T-TTTT-A-TTGTACTG---T---------TG---T---C---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTGGG--TCTTTCCCAATAATATTTAT--TTATA---TATA-T--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACTTATCAAGTTTGATACA-ATTTAAATAAGGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTAAAA----GAC-TGC-GCGT--GTT----GACT-----------CA-----------------GT-----------------TTTGAATAAANTGATCACTAATNCGTTGTTTTACTGTTAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTTGATGTAGCCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---AAAAGATTTTT-CAACAAAGAA-ACCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACCTCTAAATCAGTTAAA--AGCATATTATAAACAATTCTAATGTATTTTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGANAGTCTGCCAAATTCACCATGTACAAAATCATTTTGCGTT
Reference ( family-4767 ) : TGTCAGAAAG------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGNATCANA----CATATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAGTATAAAAGTACT-A-AG---TT-T-TTTT-A-TTGTACTG---T---------TG---T---C---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTGGG--TCTTTCCCAATAATATTTAT--TTATA---TATA-T--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACTTATCAAGTTTGATACA-ATTTAAATAAGGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTAAAA----GAC-TGC-GCGT--GTT----GACT-----------CA-----------------GT-----------------TTTGAATAAANTGATCACTAATNCGTTGTTTTACTGTTAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTTGATGTAGCCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---AAAAGATTTTT-CAACAAAGAA-ACCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACCTCTAAATCAGTTAAA--AGCATATTATAAACAATTCTAATGTATTTTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGANAGTCTGCCAAATTCACCATGTACAAAATCATTTTGCGTT
gi|1 : ------CAAATATAAT-----GCAATGCGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---TG-------AA---------ATA----C---A---AGTGTATCAGT----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTAAGTATAAAAGTAGT-A-AG--------TTTG-ACTTGTACTC---T---------TGT--T---T---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---TATC-TTAG----GCATGTTTTG--TCTTTTCCAATAATATTTAT--TTATA---TATA-C--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACGT
gi|1 : GAACTTATCAAGTTTTATACA-ATTTAAATTAGACTGAAATCTAAA---ATTAA----TACTACTATTGCAACA----GAC-AGC-ACGT--GTT----GACT-----------CAGTTAAACGACTACGCCAGT-----------------TTTTGATAAAATTGTCACTTATCCGTAGTTTTACTGTGAAAA-AAATTGTTCTGGTGATCTGGCACCTTGATGTAGCCAGACATTAATAAAGCCTA----AATTTAAT---AAAA-----------CAAAAAATACCCAACTAG-TCTTATTTGGATATAACTCTAAATCAGTTAAA--CGCATGTTATAAACAATTCTAATGTA-TTATAAATCGTTTGCATTCAGTATTCTTAACCAATATT---TAATATTTATAT---ATTGTTGACAAATAAGATATGGTCTGCCAAATTTACCATA-ACAAAATCATTCTGCGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagttttatacaatttaaattagactgaaatctaaaattaatactactattgcaacagacagcacgtgttgactcagttaaacgactacgccagtttttgataaaattgtcacttatccgtagttttactgtgaaaaaaattgttctggtgatctggcaccttgatgtagccagacattaataaagcctaaatttaataaaacaaaaaatacccaactagtcttatttggatataactctaaatcagttaaacgcatgttataaacaattctaatgtattataaatcgtttgcattcagtattcttaaccaatatttaatatttatatattgttgacaaataagatatggtctgccaaatttaccataacaaaatcattctgcgttgtttttataacacctattactctttttaaaagctgtaaatgtattctttcaacaagtaaaccgttatcaaatccccagacttcactcccgtaattcacaatttggctgtaattaaattgtcgaaaatatcta
gi|10 : caaatataatgcaatgcgatcttacctaccataaatattgtaatttgaaatacaagtgtatcagtcatatatggttatatttcttatttgaaaagctttaagtataaaagtagtaagtttgacttgtactcttgttttgaatttaacaaattgattatcttaggcatgttttgtcttttccaataatatttatttatatatacttttctcagatcggaatatagcacgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGAT----CT----TA---CCTG------TCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCAAA----CATATATG-GCTGTATTTCTT--------------TTAGTATAAAAGTACTTA-A-----T-T-TCTT-A-TTGTACTG---TAAAAGTAGTTT---T---T---T----GAATTCAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCAAGTTGGG--TCTTTCGAAATAA----TAT--TTATA---TATA-C--TTTTC-TC--AGATCGTAATATATA--GCACAgtttttataacacctattactctttttaaaagctgtaaatgtattctttcaacaagtaaaccgttatcaaatccccagacttcactcccgtaattcacaatttggctgtaattaaattgtcgaaaatatcta
gi|10 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGAACTGATCAAGTTTGAT-CACATTTAAATAAGcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaactgatcaagtttgatcacatttaaataag
gi|11 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgatcttacctgtcataaatattgtaattgaaaatacatgtgaatcaaacatatatggctgtatttcttttagtataaaagtacttaatttcttattgtactgtaaaagtagttttttgaattcaacaaattgataaacttaggcaagttgggtctttcgaaataatatttatatatacttttctcagatcgtaatatatagcacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTAAATAAGCATATTATAAACAATTCTAATGTATTTT-GAATCGTTTGCGTTCAGTATTTTTAACCAATATTAAATAATATCTGTTT---ATCATTGACAAATAAGAGAATGTCTGCCAAATTCACCA
gi|12 : atAAGGCTGAAATCTAAA---ACTTA----TAATATGATTGTAAAA----CAC-AGC-ACGT--GTT----GACT-----------CA-----------------GTCAAACGACTGTGCCAATTTTGGATGAAATGATCACTAATTTGTTGTTCTACTGTTAGAATAAATAGTTC-GGTGATCCGGCACCTTCATGTAGGCATACATCATTAAAGCCTT----AATTTAAT---GAAAGATATTT-CAACAAAGAT-ACCCAAG-AGTTTTTATTTGGATATACCTCTTAATCAGTTAAA--AGCATATTATAAACATTTTTTATGTA-TTTTGAATTGTTTGCATTCAATATTTTTAACCAATATTTAATAATGTTTACAT---ATTGCTGACAAATAAGAGAAAGTCTTCCAAGTTCACCATcacccacctgttattcttctttttaaaaactttaaatgtactcttctaacgggtaaatcattattaaatccccagatttcactcccgtaattcaaaattggtgtaattaacgaaaagacataccctgtgcttcggcgatatgaaagtaaatttatataaatgtctattcattttaaaaatagctttttgtgcttcacctgataacgtgttaatgacttcagtaaaaagaaccaccgactgtta
gi|13 : ATATTTAATAATATTTTTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAACTCACCCTACACAAAATCATTTTGCGTT
gi|14 : TGTCAGAAAGAAAAAACAAATATAAT-----ACAACATGAT----CT----TAGAACTTAGTTATACTATAA----AT---A---G--------AGAACAA---------AT---AA-------AAGCAAAACCAAAA----C---AAGATGTGTATCAGA----CATATATT-GCTATGTTTCTG-ATTTGAAAAGCTTTTAATATA----------------TT-T-TTAT-A-TTGTACTGTTTT---------TT---T---C---C----GAATTTAAC-AAATTG-AA---AAAC-ATAG----GTATGTT-----TTTTCCCCAATAATATTTAT--TTATA---TATG-T--TTTGC-GT--AAATCAGA--ATGTtgtttgttaacaccttttattgttcttgcaacccgttaaccatcattaaatctccagacatcacttccgtaattaaaaattggtgtaattaacttgcaaagatctaccctgtgcttcgacgatatgaaagtaaatttatatcagtatttatttatttcaaaaataaccttttgtgcttgacctgatagagtgtaaatggc
gi|15 : caAAAG------CAAATATAAT-----ACAACATTAT----CT----TA---CCTA------GT-TA------T---A---C--------TG--TAAAAAAGCAAATC---AA-------AA---------ACA----A---AA--TGTGTATCAGA----CACATATG-GCTCTGTTTCTG-ATTTGAAAAGCTTTTAATATAAAAGTACT-A-AG---TT-T-TTTT-A-TTGTACTT---T---------TA---T---T---TTTT-GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTGGT--TTTTTTCCATTAATATTTAT--TAATA---TATG-T--TTTTCGTT--A-ATCGGA--ATATA--
gi|16 : ctgtcagaaaaaataT-ATT---AAAGCTTTTAATATAAAAAAAAT-ACGG---TT-T-TTTT-A-TTGTACTG---T---------TA---TTTTC---T----GAATTTAGT-AAGTTG-AT---CAAC-TTAGTTAGACATGTTGGG--TCTTTTCCAATAATATTTAT--TAATA---AATG-T--TTTTT-TCGGAGATCGAA--ATATA--
gi|17 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtcataccagaaaaactaatatgataaaaccaaataGTCAGAAAC------CAAATAAAAT-----GCAACGTGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---TG-------AA---------ATA----C---A---AGTGTATCAGT----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTAAGTATAAAAGTAGT-A-AG---TT-T-GTC----TTGTACTC---T---------TGT--T---T---T----GAATTTAAC-AAAT-----------C-TTAG----GCATGTTTTG--TCTTTTCCAATAATATTTAT--TTATA---TATA-C--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GC
gi|18 : TATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAATTCACCATGTACAAAATCATTTTGCG
gi|19 : CAGAA-G------TAAATATAAT-----ACAACATGAT----CT----TA---CCTA------CTATAA----AA---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------GA---------TTG----C---A---TGTGTACCATA----CACATATG-GTTATACTTATT-GTTTGAAAAGCTTTGAGTATGAAAGTACA-A-AG---TT-T-TTCT-A-ATGTTTTG---T---------TGTTTT---C---T----GAATTTAAT-AAATTG-AG---TAAC-TTAG----G---------------------TAATA---------------TATA-C--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATGTA--ACataatttttaacacctattattcttattaaaaactgtagatgtacgctttcaacgggtaaacaatcattatatccccagacttcactcccgtaattcaaaattggtgtaattaacttgtcgaaaagatctaccttgt
gi|2 : gaTGTCAGAAAG------CAAATACAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------TAATGA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGCGAATCATA----TATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCATTTAGTATAAAAGTACT-A-AGG--TTGT-TTTT-A-TTGTACTG---C---------TG---T---C---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTTGG--TCTTTCCCAATAATACTTAT--TTATA---CA-A-T--TTTTC-TC--AGATCGGA--ACATA--GCACAT
gi|2 : GAACCTACCACGTTATATACT-ATTTAAATAAGGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTTAAA----GAC-TGT-GCGT--GTT----GACT-----------CA-----------------GT-----------------TTTGAATAAATTTATCACTAATACGTTGTTTTACTGTTAAAATGAATATTTCCGCTAATCCGGCACCTTGATGCAGCCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---AAAAGATTTTT-CAATAAAAAA-ACCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACTTCTAAATCAGTTAAA--ACCATATTATAAACAATTCTAATGTATTTTTGAAATGTT-GCATTCTGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGTTAGTCTG-CAAATTCACCATGTACAAAATCATTTTGCGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacctaccacgttatatactatttaaataaggctgaaatctaaaattaataatactattgttaaagactgtgcgtgttgactcagttttgaataaatttatcactaatacgttgttttactgttaaaatgaatatttccgctaatccggcaccttgatgcagccacacatcattaaagcctaaatttgataaaagatttttcaataaaaaaacccaagtagtcttatttggatatacttctaaatcagttaaaaccatattataaacaattctaatgtatttttgaaatgttgcattctgtatttttaaccaatatttaataatatttgtatatcgttgacaaataagagttagtctgcaaattcaccatgtacaaaatcattttgcgtt
gi|20 : tgtcagaaagcaaatacaatgcaacatgatcttacctataatgaatattgtaattgaaaatacatgcgaatcatatatatatggttatatttcttatttgaaaagcatttagtataaaagtactaaggttgtttttattgtactgctgtctgaatttaacaaattgataaacttaggcatgtttggtctttcccaataatacttatttatacaatttttctcagatcggaacatagcacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTCAGCAAA------CAATTTTAAT-----ATAGCATGAT----AC----TA---CCT-------CCTTA-----------------------TA--TAA---------CTAGAGAT------AA---------ATA----C---A---CGTGTGTCAGA---------ATG---------------TTTAAAAAGCATTTAATAGAAAGGTACT-A-AG---TT-T-TTTTTA-TTGTACTG---T---------TG---T---C---TTAT-GAACTGAAT-AAATCA-AC---ACAC-TTTG----GCATATTGGG--TCTATTCTAATACTGCTTAT--TAATA---TATA-T--
gi|21 : caTGTCATAAAG------CAAATATAAT-----GCAATGTAAT----TC----TA---CCTA------CTATAA----AT---A---T--------TG--TTA---------TT---GA-------AA---------CTA----C---A---TGCGTATCAAA----CATATCCA-GCTATATTTCTT-ATTTAAAAAACTTTTAGTGTAAAAGTATT----T---TT-T-TTTT-A-TTGAACTG---T---------TGTTTT---C---T----GAATTAAAT-AAATTGAAA---AAAA-ATAG----GCATGTTGGG--TTT
gi|22 : GTATTTT-AACCAATATTTAATAGCATTTGTAA---ATCGTTGA-------------------CAAATTCACCATGTACAAAATCAGTCTGTATT
gi|23 : AAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTTGATGTAGTCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---ATAAGTTTTTTTCAATAAAGAA-ACCCAAGAAG-TCTTATTTGGATATACCTTTAAATCAGTTAAA--AGCATATTGTAAACAATTCTTATGTA-TTTTGCATCGTTTGCATTCAGTATTTTgattttttaacacctattattcttttgaaaaactgttaatgtactctttcaacgggtaaaccagatttcactcccgtaattcaaaattggcgtaattaatttgtcgaaaagat
gi|24 : AGAAAA-------AAATAAAA-------CAACATGAT----CT----TA---CCTAGTTATACTACAA----AT---A---TAATGAAAGTA--TAA---------GC---AA-------AACA-------ACA----C---AGA-TGTGTATCAGA----CATATATG-GCTATGTTTCTG-ATTTGAAAAGCTTTCCATATAAAAGTACT-A------TT-TATTTT-A-TTGTACTG---T---------T
gi|25 : catgtcagagaaactaatatATAT----AT---A---T--------TA--TA-----------T---CA-------AT---------TTA----C---T---TGTGTATTATA----CATATACG-GCTATAAGTCTT-AATTGAAA-GCTTC-AGTACATAAGAACT----------------------GT--TG---C---------TT---T---C---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTAAAACTCTTT-----TGATATATACTATTATA---tt
gi|26 : cagatatGAACTTATCAAGTTTGATAatgactataatattag
gi|28 : acacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---TT-T-TTCT---TTATATT-----------------------C---T----GAATATAAC-AAATCT-AT---AAAC-TTAG----GCACTTTGGT--TTTATTTCATTGATGTTTAT--TAATA---AACA-C--TTGCC-TC--AGATCAGA--ATATA--
gi|29 : tgaaaactatataatatatctgttaGTCAGAAAG------CAAATAT---------------GAT----TT----TA---TCTA------CCATAA----AA---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCATA----CATATATG-GCTATATTT-TT-ATTTGAAAAACTTTTAGTATAAAAGTACT-A-AGTTTTT-T-TTTT-A-TTGTACTG---T---------TG---T---T---TTCA-GAATATAatattcatttaatagttaatgatagtcatcctctaat
gi|3 : TGTTAGAAAA------CTAATATAATCAAATGAAACATAATACAACT----TA---TCTAGTTATATTATGA----ACTAGA---A--------TA--TAA---------AT---AA-------AAGCAAAACAAAAA----C---AAGATGCGTATCAGC----TATATATG-GTTATGTTTCTA-ATATCAAAAGCTTTTAATATAAAAGTACT-T-AG---TA-T-TTTT-A-TTGTTCTG---TCAT------TT---T---C---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---ACAC-TTTG----GCATGTTCGA--TATTTTCCAATAA---TTAT--TGATAATGTATG-T--TTTTC-GT--AAATCGGA--ATATA--GCACA
gi|3 : caGAACTTATCAAGTTTGATTCA-ATTTAAATAAGGCTGAA-TCTAAA---ATCAA----TAATATGATTGTAAAAC---AAC-TGT-GC------C----GA---------------------------------------------------TTTGGATAAATTGATCAGTAGTTCGTTATTTTATGGTTAGAATAAATTGTTGCGGTGATCCGGCATCT---TGTAGCCACACATCATTAAAACTTT----AATTTGATAAAAAAAGA-AATT-CAACAAAGAA-ATCCAAG-AA-TTTTATTCGGATATATCTCTATATCAGTTAAA--AGCATATTAT-----TTTTTTATGTA-TTTTGAATCCTTTGCAATCAGTA-TTTTAACCAATATTCAATAATGTTGACAT---ACCGTTGACAAATAAGAGAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgattcaatttaaataaggctgaatctaaaatcaataatatgattgtaaaacaactgtgccgatttggataaattgatcagtagttcgttattttatggttagaataaattgttgcggtgatccggcatcttgtagccacacatcattaaaactttaatttgataaaaaaagaaattcaacaaagaaatccaagaattttattcggatatatctctatatcagttaaaagcatattatttttttatgtattttgaatcctttgcaatcagtattttaaccaatattcaataatgttgacataccgttgacaaataagaga
gi|30 : catgttagaaaactaatataatcaaatgaaacataatacaacttatctagttatattatgaactagaatataaataaaagcaaaacaaaaacaagatgcgtatcagctatatatggttatgtttctaatatcaaaagcttttaatataaaagtacttagtatttttattgttctgtcattttctgaatttaacaaattgatacactttggcatgttcgatattttccaataattattgataatgtatgtttttcgtaaatcggaatatagcacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAACTAATCAAGTTTGATACA-ATTTAAATAAGGCCAAAATCTAAA---ATTAA----CAATACTATTGTAAAA----GAC-TGC-GCGT--GTT----GACT-----------CA------------------------------------TTTAAACGA--TTATGAC-AGTTTATTGATAT----TTGAAATAAA
gi|31 : CAGAAAG------CAAATACAGT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAG----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCATA----CATATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAaact
gi|32 : cTGTCAGAAAG------AAAATATAAT-----CCAACATGAT----CC----TC---CCTA------CCATAT----AT---A---T--------TG--TAA---------CT---GA-------AA---------AAAAACCC---A---GGTGAATCATA----CATGTATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTA-TATAAAagtcatgtcagaaagaaaatata
gi|34 : TGTCAGAAAG------CAAATAT---------------GAT----CT----AA---CCTG------CCATAA----AT---AATGTACA-----TG--TAA---------TT---CG-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCATA----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAGTTCAAAAGTAt
gi|35 : aTGTCAGAAAG------CAAATAT---------------GAT----CT----AA---CCTG------CCATAA----AT---AATGTACA-----TG--TAA---------TT---CG-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCATA----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAG
gi|37 : aTGTCAGAAAAA-----CAAATATAAT-----ACAACGTAAT----CT----TA---CCTA--------GTAATACTAT---A---G--------TG--TAA---------TG---GAACAGAACAA---------AAA----CCAGA---TGTGTATCAGA----C
gi|38 : gttaAAAA------CAAATATGAT-----GAAACACGAT----CT----TA---CCT--------CACAA----AT---A-------------G--T-----------TT------------AA---------ATG----C---A---TGTGTATCAGA----CATATATGAGTTATA---CAT-ATTT
gi|39 : gaAAG------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAC----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TTTGAATCATA----CATATATG-GCTcagat
gi|4 : TGTCAGAAAA------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CTAACCTA---TCTA------GCATAA----AC---A---T--------CG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----T---A---TGAGAATCATAATTATATATGTG-GCTATATTTTTTCATTTGAAATGCTTTTAGTTTAAAAGTGCT-A-AGGT-TT-T-TTTT-A-TTGTATTG---T---------TG---T---CGTCT----GAATTTAAC-ACATTG-AT---AAAC-TTAG----GTGTGTTAGG--TCTTTCTCAATGATATTTAT--TTATA---TAAA-C--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACAgatt
gi|4 : aGAACTTATCAAGTTTGATACG-ATTTAAACAAGGCTGAGTTTTTAATTTATTGACCACTAATACTcattttataataaattggtattcattctttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgatacgatttaaacaaggctgagtttttaatttattgaccactaatacttgttttactgtcaaaataaatagttccggtgatccggcacgttgatgtagccatacatcattaaagcctaaatttgattaaaagatttttcgataaagaaatccaagtagtcttatttggatatacctctaaatctgttaaaaacatattattaacaattctaatgtattttgaatcgtttgcattcagtatttt
gi|4 : atgtcagaaaacaaatataatgcaacatgatctaacctatctagcataaacatcgtaattgaaaatatatgagaatcataattatatatgtggctatattttttcatttgaaatgcttttagtttaaaagtgctaaggttttttttattgtattgttgtcgtctgaatttaacacattgataaacttaggtgtgttaggtctttctcaatgatatttatttatataaacttttctcagatcggaatatagcacacattttataataaattggtattcattctttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----GGCT-----------GA-----------------GT-----------------TTTTAATTTATTGACCACTAATAC-TTGTTTTACTGTCAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACGTTGATGTAGCCATACATCATTAAAGCCTA----AATTTGATT--AAAAGATTTTT-CGATAAAGAA-ATCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACCTCTAAATCTGTTAAA--AACATATTATTAACAATTCTAATGTA-TTTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTtgttttactgtcaaaataaatagttccggtgatccggcacgttgatgtagccatacatcattaaagcctaaatttgattaaaagatttttcgataaagaaatccaagtagtcttatttggatatacctctaaatctgttaaaaacatattattaacaattctaatgtattttgaatcgtttgcattcagtatttt
gi|40 : atgtcagaaaacaaatataatgcaacatgatctaacctatctagcataaacatcgtaattgaaaatatatgagaatcataattatatatgtggctatattttttcatttgaaatgcttttagtttaaaagtgctaaggttttttttattgtattgttgtcgtctgaatttaacacattgataaacttaggtgtgttaggtctttctcaatgatatttatttatataaacttttctcagatcggaatatagcacacattttataataaattggtattcattctttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgatacgatttaaacaaAACTAATCAAGTTTAATACA-ATTTAAATAAAGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATGCTATTGTGAAA----GAC-TG
gi|42 : ---A---TGTGTATCAGA----CATATATG-GCTATAT
gi|5 : aaaaatagaatacaaaaacaagTGTCAGAAAG------CAAATAGAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCATA----CACATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAGAATAA--------A-AG---TT-T-TTTT-A-TTGTACTG---T---------TGATTT---C---T----GAATTTAAA-AAATTG-AT---TAAC-TTAG----GCATGTTGGG--TCTTTCACAATAATATTTAT--TTATA---TATACT--TTTTC-TC--AGATCAGA--ATATACCGCAC
gi|5 : GAACTTATCAAGTTTGATACA-ATTTAGATAAGGCTGCAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTAAAA----GAC-TGC-ACAA--GCT----GACTTAGTTGAATGCCA-----------------GT-----------------TTTCAATAAATTGATCACTAATGCATTGTTTTACTGTTAAAATAAATAGTTACGGTGATCCG------TAATGTAGCCACACATCATTAAAGACTA----AA----AT---TAAAGATTTAT-CTATAAAGAA-ACCCAAGTAG-TGTTATTTGG--ATACCTCTATATCAGTTAAA--AGCATATTATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgatacaatttagataaggctgcaatctaaaattaataatactattgtaaaagactgcacaagctgacttagttgaatgccagttttcaataaattgatcactaatgcattgttttactgttaaaataaatagttacggtgatccgtaatgtagccacacatcattaaagactaaaattaaagatttatctataaagaaacccaagtagtgttatttggatacctctatatcagttaaaagcatattata
gi|6 : tgtcagaaagcaaatagaatgcaacatgatcttacctaccataaatattgtaattgaaaatacatgtgaatcatacacatatggctatatttcttatttgaaaagcttttagaataaaagtttttttattgtactgttgatttctgaatttaaaaaattgattaacttaggcatgttgggtctttcacaataatatttatttatatatactttttctcagatcagaatataccgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTCAGTAAGAT----CAT-TATGAT-----ATAAACTGGT----GT----TG---CCTA------CTTTAA----AA---A---C--------TA--TCA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TTTATATCAGA----CCAATATG-GCTATATTTCTG-ATTTGAAAAGATTTAAATATAAAAGTATT-A-A----TG-C-CTTT-AGTGGTAGTG---T---------TA---T---T---TTCTAAAATTTAACAAAATTA-ATTGAAAACTTTAG----ACATATTGAG--CCTATGTCAATAACATTTAT--TAAT----TTTT-TGATTTTC-TT--TGATCAGA--ATATG--TCACA
gi|6 : aGAACTTATAAAGCTAAATACA-GTTTAAATAAGGCTGAACTCTAAA---TTCAA----CAGTTATATTATAAAAATAGGACATGCTGACTCAGTTAACCGACTATGC-------CA-----------------GT-----------------TTTGAATCAAATGATTACGGATTCGGTGTTC-------------AACAGT--------TTCGGCACCTTGATTTAGCTACACATCGTTAAAAATTA----TATTTGAT---AAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaacttataaagctaaatacagtttaaataaggctgaactctaaattcaacagttatattataaaaataggacatgctgactcagttaaccgactatgccagttttgaatcaaatgattacggattcggtgttcaacagtttcggcaccttgatttagctacacatcgttaaaaattatatttgataat
gi|7 : agtcagtaagatcattatgatataaactggtgttgcctactttaaaaactatcattgaaaatacatttatatcagaccaatatggctatatttctgatttgaaaagatttaaatataaaagtattaatgcctttagtggtagtgttattttctaaaatttaacaaaattaattgaaaactttagacatattgagcctatgtcaataacatttattaattttttgattttctttgatcagaatatgtcacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntt-ATATAAATAAGGCTAAAATTTAAA---ATTAA----T-ATATGACTGTAAAA----GAC-TGt
gi|7 : ACTGTTAAAATGAATAGTTCTGGTTATCAGACACATTGATGTAGCCATACAGCATTTAAACCTTGTGTAATATGAT---AAAATATTATT-CAACACATAA-ATCCAAGAAG-TCTTGCTTGGATATATCTTTAAACCAGTTAAA--AGCTTATTGTAAACAACTTTAATGT-TTATCGACTCGTTTGCATTCAGTA-TTTTAACAAATATTTAATAATATTTATATATCATCATTGACAAATAAGAGAACTTTTGCCAAATACACCA--TACAAAAttaaaatgaatagttctggttatcagacacattgatgtagccatacagcatttaaaccttgtgtaatatgataaaatattattcaacacataaatccaagaagtcttgcttggatatatctttaaaccagttaaaagcttattgtaaacaactttaatgtttatcgactcgtttgcattcagtattttaacaaatatttaataatatttatatatcatcattgacaaataagagaacttttgccaaatacaccatacaaaacaaccaagatttggtaattatttttaaaaactataaatatactctttcaacaggtcagctgttgttaaatccccatacgttattcctgtaattcacaattggtgtaattaactttaatatacactgtgctttggcaatatgaatgcaaattgatataaatatctattcattttaaaaaacacattttttgcttgatctttagagtgtaaatggcttcagcaacagaaccacggatt
gi|8 : atataaataaggctaaaatttaaaattaatatatgactgtaaaagTGTCAGAAAG------CAAATAAAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---T---T--------TG--TAA---------TT---GA-------TA---------ACA----C---A---TGTGAATCATA----C--ATATG-GCTATATTTTCT-TTATGAAAAGCTTTTAGTATAAAAGTTCT-A-AA---TT-T-TTTC-A-TTGTACTG---T---------TGTTTT---C---T----GAATTTAAC-AAACTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTGGG--TTTTTCCCAATAATATTTAT--TTATATATTATA-T--TTTTC-TC--AAATCGGA--ATATA--GCATAcaaccaagatttggtaattatttttaaaaactataaatatactctttcaacaggtcagctgttgttaaatccccatacgttattcctgtaattcacaattggtgtaattaactttaatatacactgtgctttggcaatatgaatgcaaattgatataaatatctattcattttaaaaaacacattttttgcttgatctttagagtgtaaatggcttcagcaacagaaccacggatt
gi|8 : aGAACTTATCAAGTTTGATACA-AGTTAAACAAAGGAGAAATCTAAA---TTTAA----TAATATTGTTGTAAAA----GAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaacttatcaagtttgatacaagttaaacaaaggagaaatctaaatttaataatattgttgtaaaagaa
gi|9 : atgtcagaaagcaaataaaatgcaacatgatcttacctaccataaattttgtaattgataacacatgtgaatcatacatatggctatattttctttatgaaaagcttttagtataaaagttctaaattttttcattgtactgttgttttctgaatttaacaaactgataaacttaggcatgttgggtttttcccaataatatttatttatatattatatttttctcaaatcggaatatagcatacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTCAGAAAG------CAGATATAAT-----GTAACATGAT----CT----TA---TCTA------CCATAC----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---T---AGTGAATCATA----CATATATG-GCTATATTTCTT-AATTGAAAAGCTTTTAGTATAAAAGTACT-A-AG---TT-G-GTTT-A-TTGTACTG---T---------TGTTTT---C---T----AAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TAAG----GCATGTTTGG--TCTTTCCCAATAATATTTAT--TTATA---TAAACT--TTTTC-TC--AAATCGGA--ATAAA--GCACATa
gi|9 : GAACCTATCAAGTTTGATTCA-ATTTAAATAAGGCTGAAactagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacctatcaagtttgattcaatttaaataaggctgaa
blockSeqs : AAAAAA CAAAT ACAA AACC GAA GTTATA TACT TAG TAATGAAAG AA AAAAGCAAA AGA ACAGAAC GCAAAACCA AACC CAG AGA A A ATTA A C AAGTTT G A T G TTT AAAAGTAGTTTTTT A A TGA T TTAG G AC C TA T ATG TGA G GG AT CC C TTT CCAC ATAG A T CTCA AACC CAGTCAAACGACTGTGCCAAT G G A T C GTGT AAA TAT T . T T TA T A ATC AT C
blockSeqs : AT . . . . GTTATA . . ATGTACA . . . T GCAAAACAA . . AGA T G . . . AAGGT . . . . . TATTTTCTA . . . . . G . C . T TAT CT . . . . . . . C . . GT . TAGTTGAATGCCAGT G A T A C . T TTT . . A . . T T . AA T
blockSeqs : A . . . . GTTATA . . ATGTACA . . . . CA . . GA T G . . . ACGG . . . . . TATTTTTT . . . . . G . T . A . CT . . . . . . . . . . GT . ATGCCAGT G A T T C . . TTT . . T . . T T . TA T
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . A T G . . . AAGG . . . . . TATTTTCT . . . . . T . T . A . C . . . . . . . . . . GT . CAGT A G T T C . . TTT . . T . . . T . TA T
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . . . . T T . . . TAA . . . . . TGTTTTCT . . . . . T . T . T . T . . . . . . . . . . AA . GAGT T T T A C . . TTT . . A . . . T . TA T
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . . . . A T . . . AAG . . . . . TGTCTTAT . . . . . G . C . T . T . . . . . . . . . . . . CA C A A G T . . TTA . . . . . . T . AC
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . T G . . . AAG . . . . . TGTTTTCT . . . . . G . T . A . T . . . . . . . . . . . G C . T . . . AA . . . . . . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . T A . . . AAG . . . . . TGTTTTCA . . . . . A . T . T . C . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . T G . . . AAG . . . . . CATTTTCT . . . . . G . T . A . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . T T . . . TAG . . . . . TGTCGTCT . . . . . C . C . G . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . A T . . . AAG . . . . . TGATTTCT . . . . . A . C . T . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . T G . . . AAA . . . . . TGTTTTCT . . . . . G . G . T . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . . . A T . . . AAG . . . . . TGTTTTCT . . . . . G . C . A . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . A T . . . AA . . . . . TGTTTT . . . . . G . C . T . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . A T . . . T . . . . . TTTCC . . . . . T . . . T . T
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . . . . . A T . . . A . . . . . TGTCT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . T G . . . . . . . . . TTTCT . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . T G . . . . . . . . . CT
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . A T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . . . . A T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . T G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . A T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A T . .
blockSeqs : . . A T .
blockSeqCons : TGTTTTCT******************* CAGT********************************************* TTT
originalCons : TGTCAGAAAG------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGNATCANA----CATATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAGTATAAAAGTACT-A-AG---TT-T-TTTT-A-TTGTACTG---T---------TG---T---C---T----GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTGGG--TCTTTCCCAATAATATTTAT--TTATA---TATA-T--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACTTATCAAGTTTGATACA-ATTTAAATAAGGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTAAAA----GAC-TGC-GCGT--GTT----GACT-----------CA-----------------GT-----------------TTTGAATAAANTGATCACTAATNCGTTGTTTTACTGTTAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTTGATGTAGCCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---AAAAGATTTTT-CAACAAAGAA-ACCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACCTCTAAATCAGTTAAA--AGCATATTATAAACAATTCTAATGTATTTTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGANAGTCTGCCAAATTCACCATGTACAAAATCATTTTGCGTT
finalCons : TGTCAGAAAG------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGNATCANA----CATATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAGTATAAAAGTACT-A-AG---TT-T-TTTT-A-TTGTACTG---TTGTTTTCT-------------------GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC-TTAG----GCATGTTGGG--TCTTTCCCAATAATATTTAT--TTATA---TATA-T--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACTTATCAAGTTTGATACA-ATTTAAATAAGGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTAAAA----GAC-TGC-GCGT--GTT----GACTCAGT---------------------------------------------TTTGAATAAANTGATCACTAATNCGTTGTTTTACTGTTAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTTGATGTAGCCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---AAAAGATTTTT-CAACAAAGAA-ACCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACCTCTAAATCAGTTAAA--AGCATATTATAAACAATTCTAATGTATTTTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGANAGTCTGCCAAATTCACCATGTACAAAATCATTTTGCGTT
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACTTATCAAGTTTT
Unaligned ( gi|33 ): TATTCTTTTTAAAAACTGTAAATGTACTCTTTAAACGGGTAAACCATCATTAAATTCCCAGACTTCACTCCCGTAATTCCAAATTGGTGCAATTAACTTGTCGAAAAGATTTACCCTGTG
Unaligned ( gi|36 ): TATTCTTTTTAAGAACTGGATACACCATCATTATATCCCTAGACGTCACTCCCGTAATTCAAAATTGGTGTAATTAACTTGTCGAAAAGATCTACCCTG
Unaligned ( gi|41 ): AAGCAAGGGTGAAAGTGGAGAAGGTGGTATGCATTACAGTAATAATATACAAAAGTCAT
Alignments
lowQualScore : 111111 111111111111 111111111 1111 1111 9999999999999999999999999999999999999999999999999 111 2
lowQualScore : 999999 44444 3333 3333 222 444444 3333 222 555555555555 22 666666666 222 6666666 555555555 3333 222 999 1 1 3333 1 1 2 2 8888 2 2 2 4 55555 2 2 2 2 333 6666 2 33 2 33 1 888 5555 2 33 33 33 3 666 7777 2222 4 5 9999 0000 1111111111111111111111111111111111111111111111111 1 1 2 0 1 0 1 9999 222 111 5 5 9 5 66 0 1 0 1 777 44 1
lowQualScore : ...... ..... .... .... ... ...... .... ... ............ .. ......... ... ....... ......... .... ... ... . . .... . . . . .... . . . . ..... . . . . ... .... . .. . .. . ... .... . .. .. .. . ... .... .... . . .... .... ................................................. . . . . . . . .... ... ... . . . . .. . . . . ... .. .
lowQualScore : 111111 33333 5555 5555 999 444444 4444 888 111111111111 22 444444444 888 8888888 000000000 4444 777 000 0 0 3333 6 7 1 1 7777 1 1 1 0 00000 0 1 2 2 999 9999 9 11 5 22 5 222 1111 7 77 77 99 3 444 7777 5555 4 7 0000 6666 0000000000000000000000000000000000000000000000000 4 0 8 1 0 2 9 4444 222 111 0 0 8 0 11 8 6 8 0 888 99 7
consensus : TGTCAGAAAG------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGNATCANA----CATATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAGTATAAAAGTACT-A-AG---TT-T-T-TTTA-TTGTACTGT-----T-GTTTTCT-GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC----TTAGGCATGTTGGG--TCTTTCCCAATAATATTTAT--TTATA---TATA-T--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACTTATCAAGTTTGATACA-ATTTAAATAAGGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTAAAA----GAC-TGC-GCGT--GTT----GACT-----------CA-----------------GT-----------------TTTGAATAAANTGATCACTAATNCGTTGTTTTACTGTTAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTTGATGTAGCCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---AAAAGATTTTT-CAACAAAGAA-ACCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACCTCTAAATCAGTTAAA--AGCATATTATAAACAATTCTAATGTATTTTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGANAGTCTGCCAAATTCACCATGTACAAAATCATTTTGCGTT
Reference ( family-4767 ) : TGTCAGAAAG------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGNATCANA----CATATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAGTATAAAAGTACT-A-AG---TT-T-T-TTTA-TTGTACTGT-----T-GTTTTCT-GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC----TTAGGCATGTTGGG--TCTTTCCCAATAATATTTAT--TTATA---TATA-T--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACTTATCAAGTTTGATACA-ATTTAAATAAGGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTAAAA----GAC-TGC-GCGT--GTT----GACT-----------CA-----------------GT-----------------TTTGAATAAANTGATCACTAATNCGTTGTTTTACTGTTAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTTGATGTAGCCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---AAAAGATTTTT-CAACAAAGAA-ACCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACCTCTAAATCAGTTAAA--AGCATATTATAAACAATTCTAATGTATTTTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGANAGTCTGCCAAATTCACCATGTACAAAATCATTTTGCGTT
gi|1 : ------CAAATATAAT-----GCAATGCGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---TG-------AA---------ATA----C---A---AGTGTATCAGT----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTAAGTATAAAAGTAGT-A-AG--------T-TTGACTTGTACTCT-----T-GTTT--T-GAATTTAAC-AAATTG-AT---TATC----TTAGGCATGTTTTG--TCTTTTCCAATAATATTTAT--TTATA---TATA-C--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACGT
gi|1 : GAACTTATCAAGTTTTATACA-ATTTAAATTAGACTGAAATCTAAA---ATTAA----TACTACTATTGCAACA----GAC-AGC-ACGT--GTT----GACT-----------CAGTTAAACGACTACGCCAGT-----------------TTTTGATAAAATTGTCACTTATCCGTAGTTTTACTGTGAAAA-AAATTGTTCTGGTGATCTGGCACCTTGATGTAGCCAGACATTAATAAAGCCTA----AATTTAAT---AAAA-----------CAAAAAATACCCAACTAG-TCTTATTTGGATATAACTCTAAATCAGTTAAA--CGCATGTTATAAACAATTCTAATGTA-TTATAAATCGTTTGCATTCAGTATTCTTAACCAATATT---TAATATTTATAT---ATTGTTGACAAATAAGATATGGTCTGCCAAATTTACCATA-ACAAAATCATTCTGCGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagttttatacaatttaaattagactgaaatctaaaattaatactactattgcaacagacagcacgtgttgactcagttaaacgactacgccagtttttgataaaattgtcacttatccgtagttttactgtgaaaaaaattgttctggtgatctggcaccttgatgtagccagacattaataaagcctaaatttaataaaacaaaaaatacccaactagtcttatttggatataactctaaatcagttaaacgcatgttataaacaattctaatgtattataaatcgtttgcattcagtattcttaaccaatatttaatatttatatattgttgacaaataagatatggtctgccaaatttaccataacaaaatcattctgcgttgtttttataacacctattactctttttaaaagctgtaaatgtattctttcaacaagtaaaccgttatcaaatccccagacttcactcccgtaattcacaatttggctgtaattaaattgtcgaaaatatcta
gi|10 : caaatataatgcaatgcgatcttacctaccataaatattgtaatttgaaatacaagtgtatcagtcatatatggttatatttcttatttgaaaagctttaagtataaaagtagtaagtttgacttgtactcttgttttgaatttaacaaattgattatcttaggcatgttttgtcttttccaataatatttatttatatatacttttctcagatcggaatatagcacgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATGAT----CT----TA---CCTG------TCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCAAA----CATATATG-GCTGTATTTCTT--------------TTAGTATAAAAGTACTTA-A-----T-T-T-CTTA-TTGTACTGTAAAAGTAGTTTTTT-GAATTCAAC-AAATTG-AT---AAAC----TTAGGCAAGTTGGG--TCTTTCGAAATAA----TAT--TTATA---TATA-C--TTTTC-TC--AGATCGTAATATATA--GCACAgtttttataacacctattactctttttaaaagctgtaaatgtattctttcaacaagtaaaccgttatcaaatccccagacttcactcccgtaattcacaatttggctgtaattaaattgtcgaaaatatcta
gi|10 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaGAACTGATCAAGTTTGAT-CACATTTAAATAAGcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaactgatcaagtttgatcacatttaaataag
gi|11 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaatgatcttacctgtcataaatattgtaattgaaaatacatgtgaatcaaacatatatggctgtatttcttttagtataaaagtacttaatttcttattgtactgtaaaagtagttttttgaattcaacaaattgataaacttaggcaagttgggtctttcgaaataatatttatatatacttttctcagatcgtaatatatagcacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTAAATAAGCATATTATAAACAATTCTAATGTATTTT-GAATCGTTTGCGTTCAGTATTTTTAACCAATATTAAATAATATCTGTTT---ATCATTGACAAATAAGAGAATGTCTGCCAAATTCACCA
gi|12 : atAAGGCTGAAATCTAAA---ACTTA----TAATATGATTGTAAAA----CAC-AGC-ACGT--GTT----GACT-----------CA-----------------GTCAAACGACTGTGCCAATTTTGGATGAAATGATCACTAATTTGTTGTTCTACTGTTAGAATAAATAGTTC-GGTGATCCGGCACCTTCATGTAGGCATACATCATTAAAGCCTT----AATTTAAT---GAAAGATATTT-CAACAAAGAT-ACCCAAG-AGTTTTTATTTGGATATACCTCTTAATCAGTTAAA--AGCATATTATAAACATTTTTTATGTA-TTTTGAATTGTTTGCATTCAATATTTTTAACCAATATTTAATAATGTTTACAT---ATTGCTGACAAATAAGAGAAAGTCTTCCAAGTTCACCATcacccacctgttattcttctttttaaaaactttaaatgtactcttctaacgggtaaatcattattaaatccccagatttcactcccgtaattcaaaattggtgtaattaacgaaaagacataccctgtgcttcggcgatatgaaagtaaatttatataaatgtctattcattttaaaaatagctttttgtgcttcacctgataacgtgttaatgacttcagtaaaaagaaccaccgactgtta
gi|13 : ATATTTAATAATATTTTTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAACTCACCCTACACAAAATCATTTTGCGTT
gi|14 : TGTCAGAAAGAAAAAACAAATATAAT-----ACAACATGAT----CT----TAGAACTTAGTTATACTATAA----AT---A---G--------AGAACAA---------AT---AA-------AAGCAAAACCAAAA----C---AAGATGTGTATCAGA----CATATATT-GCTATGTTTCTG-ATTTGAAAAGCTTTTAATATA----------------TT-T-T-TATA-TTGTACTGT-----T-TTTTTCC-GAATTTAAC-AAATTG-AA---AAAC----ATAGGTATGTT-----TTTTCCCCAATAATATTTAT--TTATA---TATG-T--TTTGC-GT--AAATCAGA--ATGTtgtttgttaacaccttttattgttcttgcaacccgttaaccatcattaaatctccagacatcacttccgtaattaaaaattggtgtaattaacttgcaaagatctaccctgtgcttcgacgatatgaaagtaaatttatatcagtatttatttatttcaaaaataaccttttgtgcttgacctgatagagtgtaaatggc
gi|15 : caAAAG------CAAATATAAT-----ACAACATTAT----CT----TA---CCTA------GT-TA------T---A---C--------TG--TAAAAAAGCAAATC---AA-------AA---------ACA----A---AA--TGTGTATCAGA----CACATATG-GCTCTGTTTCTG-ATTTGAAAAGCTTTTAATATAAAAGTACT-A-AG---TT-T-T-TTTA-TTGTACTTT-----T-ATTTTTT-GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC----TTAGGCATGTTGGT--TTTTTTCCATTAATATTTAT--TAATA---TATG-T--TTTTCGTT--A-ATCGGA--ATATA--
gi|16 : ctgtcagaaaaaataT-ATT---AAAGCTTTTAATATAAAAAAAAT-ACGG---TT-T-T-TTTA-TTGTACTGT-----T-ATTTTCT-GAATTTAGT-AAGTTG-AT---CAACTTAGTTAGACATGTTGGG--TCTTTTCCAATAATATTTAT--TAATA---AATG-T--TTTTT-TCGGAGATCGAA--ATATA--
gi|17 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtcataccagaaaaactaatatgataaaaccaaataGTCAGAAAC------CAAATAAAAT-----GCAACGTGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---TG-------AA---------ATA----C---A---AGTGTATCAGT----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTAAGTATAAAAGTAGT-A-AG---TT-T-G-TC---TTGTACTCT-----T-GTTT--T-GAATTTAAC-AAAT-----------C----TTAGGCATGTTTTG--TCTTTTCCAATAATATTTAT--TTATA---TATA-C--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GC
gi|18 : TATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGATAGTCTGCCAAATTCACCATGTACAAAATCATTTTGCG
gi|19 : CAGAA-G------TAAATATAAT-----ACAACATGAT----CT----TA---CCTA------CTATAA----AA---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------GA---------TTG----C---A---TGTGTACCATA----CACATATG-GTTATACTTATT-GTTTGAAAAGCTTTGAGTATGAAAGTACA-A-AG---TT-T-T-TCTA-ATGTTTTGT-----T-GTTTTCT-GAATTTAAT-AAATTG-AG---TAAC----TTAGG---------------------TAATA---------------TATA-C--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATGTA--ACataatttttaacacctattattcttattaaaaactgtagatgtacgctttcaacgggtaaacaatcattatatccccagacttcactcccgtaattcaaaattggtgtaattaacttgtcgaaaagatctaccttgt
gi|2 : gaTGTCAGAAAG------CAAATACAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------TAATGA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGCGAATCATA----TATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCATTTAGTATAAAAGTACT-A-AGG--TTGT-T-TTTA-TTGTACTGC-----T-GT---CT-GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC----TTAGGCATGTTTGG--TCTTTCCCAATAATACTTAT--TTATA---CA-A-T--TTTTC-TC--AGATCGGA--ACATA--GCACAT
gi|2 : GAACCTACCACGTTATATACT-ATTTAAATAAGGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTTAAA----GAC-TGT-GCGT--GTT----GACT-----------CA-----------------GT-----------------TTTGAATAAATTTATCACTAATACGTTGTTTTACTGTTAAAATGAATATTTCCGCTAATCCGGCACCTTGATGCAGCCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---AAAAGATTTTT-CAATAAAAAA-ACCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACTTCTAAATCAGTTAAA--ACCATATTATAAACAATTCTAATGTATTTTTGAAATGTT-GCATTCTGTATTTTTAACCAATATTTAATAATATTTGTAT---ATCGTTGACAAATAAGAGTTAGTCTG-CAAATTCACCATGTACAAAATCATTTTGCGTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacctaccacgttatatactatttaaataaggctgaaatctaaaattaataatactattgttaaagactgtgcgtgttgactcagttttgaataaatttatcactaatacgttgttttactgttaaaatgaatatttccgctaatccggcaccttgatgcagccacacatcattaaagcctaaatttgataaaagatttttcaataaaaaaacccaagtagtcttatttggatatacttctaaatcagttaaaaccatattataaacaattctaatgtatttttgaaatgttgcattctgtatttttaaccaatatttaataatatttgtatatcgttgacaaataagagttagtctgcaaattcaccatgtacaaaatcattttgcgtt
gi|20 : tgtcagaaagcaaatacaatgcaacatgatcttacctataatgaatattgtaattgaaaatacatgcgaatcatatatatatggttatatttcttatttgaaaagcatttagtataaaagtactaaggttgtttttattgtactgctgtctgaatttaacaaattgataaacttaggcatgtttggtctttcccaataatacttatttatacaatttttctcagatcggaacatagcacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTCAGCAAA------CAATTTTAAT-----ATAGCATGAT----AC----TA---CCT-------CCTTA-----------------------TA--TAA---------CTAGAGAT------AA---------ATA----C---A---CGTGTGTCAGA---------ATG---------------TTTAAAAAGCATTTAATAGAAAGGTACT-A-AG---TT-T-TTTTTA-TTGTACTGT-----T-GTCTTAT-GAACTGAAT-AAATCA-AC---ACAC----TTTGGCATATTGGG--TCTATTCTAATACTGCTTAT--TAATA---TATA-T--
gi|21 : caTGTCATAAAG------CAAATATAAT-----GCAATGTAAT----TC----TA---CCTA------CTATAA----AT---A---T--------TG--TTA---------TT---GA-------AA---------CTA----C---A---TGCGTATCAAA----CATATCCA-GCTATATTTCTT-ATTTAAAAAACTTTTAGTGTAAAAGTATT----T---TT-T-T-TTTA-TTGAACTGT-----T-GTTTTCT-GAATTAAAT-AAATTGAAA---AAAA----ATAGGCATGTTGGG--TTT
gi|22 : GTATTTT-AACCAATATTTAATAGCATTTGTAA---ATCGTTGA-------------------CAAATTCACCATGTACAAAATCAGTCTGTATT
gi|23 : AAATAGTTCCGGTGATCCGGCACCTTGATGTAGTCACACATCATTAAAGCCTA----AATTTGAT---ATAAGTTTTTTTCAATAAAGAA-ACCCAAGAAG-TCTTATTTGGATATACCTTTAAATCAGTTAAA--AGCATATTGTAAACAATTCTTATGTA-TTTTGCATCGTTTGCATTCAGTATTTTgattttttaacacctattattcttttgaaaaactgttaatgtactctttcaacgggtaaaccagatttcactcccgtaattcaaaattggcgtaattaatttgtcgaaaagat
gi|24 : AGAAAA-------AAATAAAA-------CAACATGAT----CT----TA---CCTAGTTATACTACAA----AT---A---TAATGAAAGTA--TAA---------GC---AA-------AACA-------ACA----C---AGA-TGTGTATCAGA----CATATATG-GCTATGTTTCTG-ATTTGAAAAGCTTTCCATATAAAAGTACT-A------TT-TAT-TTTA-TTGTACTGT-----T-
gi|25 : catgtcagagaaactaatatATAT----AT---A---T--------TA--TA-----------T---CA-------AT---------TTA----C---T---TGTGTATTATA----CATATACG-GCTATAAGTCTT-AATTGAAA-GCTTC-AGTACA-------T-A-AG-------------A-----ACTGT-----T-GCTTTCT-GAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC----TTAGGCATGTTAAAACTCTTT-----TGATATATACTATTATA---tt
gi|26 : cagatatGAACTTATCAAGTTTGATAatgactataatattag
gi|28 : acacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTA-TTTTTCT-T-----T-ATATTCT-GAATATAAC-AAATCT-AT---AAAC----TTAGGCACTTTGGT--TTTATTTCATTGATGTTTAT--TAATA---AACA-C--TTGCC-TC--AGATCAGA--ATATA--
gi|29 : tgaaaactatataatatatctgGTCAGAAAG------CAAATAT---------------GAT----TT----TA---TCTA------CCATAA----AA---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCATA----CATATATG-GCTATATTT-TT-ATTTGAAAAACTTTTAGTATAAAAGTACT-A-AGTTTTT-T-T-TTTA-TTGTACTGT-----T-GTTTTCA-GAATATAatattcatttaatagttaatgatagtcatcctctaat
gi|3 : TGTTAGAAAA------CTAATATAATCAAATGAAACATAATACAACT----TA---TCTAGTTATATTATGA----ACTAGA---A--------TA--TAA---------AT---AA-------AAGCAAAACAAAAA----C---AAGATGCGTATCAGC----TATATATG-GTTATGTTTCTA-ATATCAAAAGCTTTTAATATAAAAGTACT-T-AG---TA-T-T-TTTA-TTGTTCTGT-----C-ATTTTCT-GAATTTAAC-AAATTG-AT---ACAC----TTTGGCATGTTCGA--TATTTTCCAATAA---TTAT--TGATAATGTATG-T--TTTTC-GT--AAATCGGA--ATATA--GCACA
gi|3 : caGAACTTATCAAGTTTGATTCA-ATTTAAATAAGGCTGAA-TCTAAA---ATCAA----TAATATGATTGTAAAAC---AAC-TGT-GC------C----GA---------------------------------------------------TTTGGATAAATTGATCAGTAGTTCGTTATTTTATGGTTAGAATAAATTGTTGCGGTGATCCGGCATCT---TGTAGCCACACATCATTAAAACTTT----AATTTGATAAAAAAAGA-AATT-CAACAAAGAA-ATCCAAG-AA-TTTTATTCGGATATATCTCTATATCAGTTAAA--AGCATATTAT-----TTTTTTATGTA-TTTTGAATCCTTTGCAATCAGTA-TTTTAACCAATATTCAATAATGTTGACAT---ACCGTTGACAAATAAGAGAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgattcaatttaaataaggctgaatctaaaatcaataatatgattgtaaaacaactgtgccgatttggataaattgatcagtagttcgttattttatggttagaataaattgttgcggtgatccggcatcttgtagccacacatcattaaaactttaatttgataaaaaaagaaattcaacaaagaaatccaagaattttattcggatatatctctatatcagttaaaagcatattatttttttatgtattttgaatcctttgcaatcagtattttaaccaatattcaataatgttgacataccgttgacaaataagaga
gi|30 : catgttagaaaactaatataatcaaatgaaacataatacaacttatctagttatattatgaactagaatataaataaaagcaaaacaaaaacaagatgcgtatcagctatatatggttatgtttctaatatcaaaagcttttaatataaaagtacttagtatttttattgttctgtcattttctgaatttaacaaattgatacactttggcatgttcgatattttccaataattattgataatgtatgtttttcgtaaatcggaatatagcacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAACTAATCAAGTTTGATACA-ATTTAAATAAGGCCAAAATCTAAA---ATTAA----CAATACTATTGTAAAA----GAC-TGC-GCGT--GTT----GACT-----------CA------------------------------------TTTAAACGA--TTATGAC-AGTTTATTGATAT----TTGAAATAAA
gi|31 : CAGAAAG------CAAATACAGT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAG----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCATA----CATATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAaact
gi|32 : cTGTCAGAAAG------AAAATATAAT-----CCAACATGAT----CC----TC---CCTA------CCATAT----AT---A---T--------TG--TAA---------CT---GA-------AA---------AAAAACCC---A---GGTGAATCATA----CATGTATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTA-TATAAAagtcatgtcagaaagaaaatata
gi|34 : TGTCAGAAAG------CAAATAT---------------GAT----CT----AA---CCTG------CCATAA----AT---AATGTACA-----TG--TAA---------TT---CG-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCATA----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAGTTCAAAAGTAt
gi|35 : aTGTCAGAAAG------CAAATAT---------------GAT----CT----AA---CCTG------CCATAA----AT---AATGTACA-----TG--TAA---------TT---CG-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCATA----CATATATG-GTTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAG
gi|37 : aTGTCAGAAAAA-----CAAATATAAT-----ACAACGTAAT----CT----TA---CCTA--------GTAATACTAT---A---G--------TG--TAA---------TG---GAACAGAACAA---------AAA----CCAGA---TGTGTATCAGA----C
gi|38 : gttaAAAA------CAAATATGAT-----GAAACACGAT----CT----TA---CCT--------CACAA----AT---A-------------G--T-----------TT------------AA---------ATG----C---A---TGTGTATCAGA----CATATATGAGTTATA---CAT-ATTT
gi|39 : gaAAG------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAC----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TTTGAATCATA----CATATATG-GCTcagat
gi|4 : TGTCAGAAAA------CAAATATAAT-----GCAACATGAT----CTAACCTA---TCTA------GCATAA----AC---A---T--------CG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----T---A---TGAGAATCATAATTATATATGTG-GCTATATTTTTTCATTTGAAATGCTTTTAGTTTAAAAGTGCT-A-AGGT-TT-T-T-TTTA-TTGTATTGT-----T-GTCGTCT-GAATTTAAC-ACATTG-AT---AAAC----TTAGGTGTGTTAGG--TCTTTCTCAATGATATTTAT--TTATA---TAAA-C--TTTTC-TC--AGATCGGA--ATATA--GCACAgatt
gi|4 : aGAACTTATCAAGTTTGATACG-ATTTAAACAAGGCTGAGTTTTTAATTTATTGACCACTAATACTcattttataataaattggtattcattctttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgatacgatttaaacaaggctgagtttttaatttattgaccactaatacttgttttactgtcaaaataaatagttccggtgatccggcacgttgatgtagccatacatcattaaagcctaaatttgattaaaagatttttcgataaagaaatccaagtagtcttatttggatatacctctaaatctgttaaaaacatattattaacaattctaatgtattttgaatcgtttgcattcagtatttt
gi|4 : atgtcagaaaacaaatataatgcaacatgatctaacctatctagcataaacatcgtaattgaaaatatatgagaatcataattatatatgtggctatattttttcatttgaaatgcttttagtttaaaagtgctaaggttttttttattgtattgttgtcgtctgaatttaacacattgataaacttaggtgtgttaggtctttctcaatgatatttatttatataaacttttctcagatcggaatatagcacacattttataataaattggtattcattctttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----GGCT-----------GA-----------------GT-----------------TTTTAATTTATTGACCACTAATAC-TTGTTTTACTGTCAAAATAAATAGTTCCGGTGATCCGGCACGTTGATGTAGCCATACATCATTAAAGCCTA----AATTTGATT--AAAAGATTTTT-CGATAAAGAA-ATCCAAGTAG-TCTTATTTGGATATACCTCTAAATCTGTTAAA--AACATATTATTAACAATTCTAATGTA-TTTTGAATCGTTTGCATTCAGTATTTTtgttttactgtcaaaataaatagttccggtgatccggcacgttgatgtagccatacatcattaaagcctaaatttgattaaaagatttttcgataaagaaatccaagtagtcttatttggatatacctctaaatctgttaaaaacatattattaacaattctaatgtattttgaatcgtttgcattcagtatttt
gi|40 : atgtcagaaaacaaatataatgcaacatgatctaacctatctagcataaacatcgtaattgaaaatatatgagaatcataattatatatgtggctatattttttcatttgaaatgcttttagtttaaaagtgctaaggttttttttattgtattgttgtcgtctgaatttaacacattgataaacttaggtgtgttaggtctttctcaatgatatttatttatataaacttttctcagatcggaatatagcacacattttataataaattggtattcattctttcattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgatacgatttaaacaaAACTAATCAAGTTTAATACA-ATTTAAATAAAGCTGAAATCTAAA---ATTAA----TAATGCTATTGTGAAA----GAC-TG
gi|42 : ---A---TGTGTATCAGA----CATATATG-GCTATAT
gi|5 : aaaaatagaatacaaaaacaagTGTCAGAAAG------CAAATAGAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TGTGAATCATA----CACATATG-GCTATATTTCTT-ATTTGAAAAGCTTTTAGAATAA--------A-AG---TT-T-T-TTTA-TTGTACTGT-----T-GATTTCT-GAATTTAAA-AAATTG-AT---TAAC----TTAGGCATGTTGGG--TCTTTCACAATAATATTTAT--TTATA---TATACT--TTTTC-TC--AGATCAGA--ATATACCGCAC
gi|5 : GAACTTATCAAGTTTGATACA-ATTTAGATAAGGCTGCAATCTAAA---ATTAA----TAATACTATTGTAAAA----GAC-TGC-ACAA--GCT----GACTTAGTTGAATGCCA-----------------GT-----------------TTTCAATAAATTGATCACTAATGCATTGTTTTACTGTTAAAATAAATAGTTACGGTGATCCG------TAATGTAGCCACACATCATTAAAGACTA----AA----AT---TAAAGATTTAT-CTATAAAGAA-ACCCAAGTAG-TGTTATTTGG--ATACCTCTATATCAGTTAAA--AGCATATTATAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacttatcaagtttgatacaatttagataaggctgcaatctaaaattaataatactattgtaaaagactgcacaagctgacttagttgaatgccagttttcaataaattgatcactaatgcattgttttactgttaaaataaatagttacggtgatccgtaatgtagccacacatcattaaagactaaaattaaagatttatctataaagaaacccaagtagtgttatttggatacctctatatcagttaaaagcatattata
gi|6 : tgtcagaaagcaaatagaatgcaacatgatcttacctaccataaatattgtaattgaaaatacatgtgaatcatacacatatggctatatttcttatttgaaaagcttttagaataaaagtttttttattgtactgttgatttctgaatttaaaaaattgattaacttaggcatgttgggtctttcacaataatatttatttatatatactttttctcagatcagaatataccgcacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTCAGTAAGAT----CAT-TATGAT-----ATAAACTGGT----GT----TG---CCTA------CTTTAA----AA---A---C--------TA--TCA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---A---TTTATATCAGA----CCAATATG-GCTATATTTCTG-ATTTGAAAAGATTTAAATATAAAAGTATT-A-A----TG-C-C-TTTAGTGGTAGTGT-----T-ATTTTCTAAAATTTAACAAAATTA-ATTGAAAACT---TTAGACATATTGAG--CCTATGTCAATAACATTTAT--TAAT----TTTT-TGATTTTC-TT--TGATCAGA--ATATG--TCACA
gi|6 : aGAACTTATAAAGCTAAATACA-GTTTAAATAAGGCTGAACTCTAAA---TTCAA----CAGTTATATTATAAAAATAGGACATGCTGACTCAGTTAACCGACTATGC-------CA-----------------GT-----------------TTTGAATCAAATGATTACGGATTCGGTGTTC-------------AACAGT--------TTCGGCACCTTGATTTAGCTACACATCGTTAAAAATTA----TATTTGAT---AAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaacttataaagctaaatacagtttaaataaggctgaactctaaattcaacagttatattataaaaataggacatgctgactcagttaaccgactatgccagttttgaatcaaatgattacggattcggtgttcaacagtttcggcaccttgatttagctacacatcgttaaaaattatatttgataat
gi|7 : agtcagtaagatcattatgatataaactggtgttgcctactttaaaaactatcattgaaaatacatttatatcagaccaatatggctatatttctgatttgaaaagatttaaatataaaagtattaatgcctttagtggtagtgttattttctaaaatttaacaaaattaattgaaaactttagacatattgagcctatgtcaataacatttattaattttttgattttctttgatcagaatatgtcacacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntt-ATATAAATAAGGCTAAAATTTAAA---ATTAA----T-ATATGACTGTAAAA----GAC-TGt
gi|7 : ACTGTTAAAATGAATAGTTCTGGTTATCAGACACATTGATGTAGCCATACAGCATTTAAACCTTGTGTAATATGAT---AAAATATTATT-CAACACATAA-ATCCAAGAAG-TCTTGCTTGGATATATCTTTAAACCAGTTAAA--AGCTTATTGTAAACAACTTTAATGT-TTATCGACTCGTTTGCATTCAGTA-TTTTAACAAATATTTAATAATATTTATATATCATCATTGACAAATAAGAGAACTTTTGCCAAATACACCA--TACAAAAttaaaatgaatagttctggttatcagacacattgatgtagccatacagcatttaaaccttgtgtaatatgataaaatattattcaacacataaatccaagaagtcttgcttggatatatctttaaaccagttaaaagcttattgtaaacaactttaatgtttatcgactcgtttgcattcagtattttaacaaatatttaataatatttatatatcatcattgacaaataagagaacttttgccaaatacaccatacaaaacaaccaagatttggtaattatttttaaaaactataaatatactctttcaacaggtcagctgttgttaaatccccatacgttattcctgtaattcacaattggtgtaattaactttaatatacactgtgctttggcaatatgaatgcaaattgatataaatatctattcattttaaaaaacacattttttgcttgatctttagagtgtaaatggcttcagcaacagaaccacggatt
gi|8 : atataaataaggctaaaatttaaaattaatatatgactgtaaaagTGTCAGAAAG------CAAATAAAAT-----GCAACATGAT----CT----TA---CCTA------CCATAA----AT---T---T--------TG--TAA---------TT---GA-------TA---------ACA----C---A---TGTGAATCATA----CATAT--G-GCTATATTTTCT-TTATGAAAAGCTTTTAGTATAAAAGTTCT-A-AA---TT-T-T-TTCA-TTGTACTGT-----T-GTTTTCT-GAATTTAAC-AAACTG-AT---AAAC----TTAGGCATGTTGGG--TTTTTCCCAATAATATTTAT--TTATATATTATA-T--TTTTC-TC--AAATCGGA--ATATA--GCATAcaaccaagatttggtaattatttttaaaaactataaatatactctttcaacaggtcagctgttgttaaatccccatacgttattcctgtaattcacaattggtgtaattaactttaatatacactgtgctttggcaatatgaatgcaaattgatataaatatctattcattttaaaaaacacattttttgcttgatctttagagtgtaaatggcttcagcaacagaaccacggatt
gi|8 : aGAACTTATCAAGTTTGATACA-AGTTAAACAAAGGAGAAATCTAAA---TTTAA----TAATATTGTTGTAAAA----GAcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagaacttatcaagtttgatacaagttaaacaaaggagaaatctaaatttaataatattgttgtaaaagaa
gi|9 : atgtcagaaagcaaataaaatgcaacatgatcttacctaccataaattttgtaattgataacacatgtgaatcatacatatggctatattttctttatgaaaagcttttagtataaaagttctaaattttttcattgtactgttgttttctgaatttaacaaactgataaacttaggcatgttgggtttttcccaataatatttatttatatattatatttttctcaaatcggaatatagcatacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTCAGAAAG------CAGATATAAT-----GTAACATGAT----CT----TA---TCTA------CCATAC----AT---A---T--------TG--TAA---------TT---GA-------AA---------ATA----C---T---AGTGAATCATA----CATATATG-GCTATATTTCTT-AATTGAAAAGCTTTTAGTATAAAAGTACT-A-AG---TT-G-G-TTTA-TTGTACTGT-----T-GTTTTCT-AAATTTAAC-AAATTG-AT---AAAC----TAAGGCATGTTTGG--TCTTTCCCAATAATATTTAT--TTATA---TAAACT--TTTTC-TC--AAATCGGA--ATAAA--GCACATa
gi|9 : GAACCTATCAAGTTTGATTCA-ATTTAAATAAGGCTGAAactagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaacctatcaagtttgattcaatttaaataaggctgaa
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): GTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACTTATCAAGTTTT
Unaligned ( gi|33 ): TATTCTTTTTAAAAACTGTAAATGTACTCTTTAAACGGGTAAACCATCATTAAATTCCCAGACTTCACTCCCGTAATTCCAAATTGGTGCAATTAACTTGTCGAAAAGATTTACCCTGTG
Unaligned ( gi|36 ): TATTCTTTTTAAGAACTGGATACACCATCATTATATCCCTAGACGTCACTCCCGTAATTCAAAATTGGTGTAATTAACTTGTCGAAAAGATCTACCCTG
Unaligned ( gi|41 ): AAGCAAGGGTGAAAGTGGAGAAGGTGGTATGCATTACAGTAATAATATACAAAAGTCAT