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Reference ( gi|1 ) : ATTTAAATGAAGAAAACATGTAATCAATTA----T---TA----AATTA-CACT----ATTAAGAAGAATTTCAAAA-TATTTGACAACTGATTT--AAT---TAAATACA---TTTCTAAAATG--CGTAAATTGCTTCCGTTTTTTTATAATTATGGTTGTATTCTCTGGGGGTAACGGTAATAAATCATACATTCTAAA--TATCT-AATTATA-TA-TAAATA--TCATTGCTAAATGGATTTGATAAAAAAACTATTGTTACCTCATCTTTGGAAGTTTAACAAGAACTTGGATGGTTATCTTTTAATGAAC---GATGCAAATGTCATACTGGATTGCTTGTTTACAAGG----CA----AT---T--T-T-GCATC------TTCTGAT---ATTA---ATA--ATTTGATAGTGTTATCTGAATATAAAATATA-C---AAA--TGACGAT--CAGCTGAAAATAAAGATATTGTACAC---ATTCAACCAA--AAA--CTTAAG-TTTTAAAACGTTCATTTACT---A-ATGTACGCATGGG---TG--------TT-------TG---------GA---AT---T----C--------------------T--------------------A-T------------------CATC--TA----C----------------TTTG-CA-TGCAT-TT-AAGAGTA-AT-TCT-TACA--TATATTT--GTT-T--A-CA------TCTAA--ATGTA---------AGAATCT-TAA--A-CAGGTGT------TTGCTC---TATT-----ATA--------ACATG--------T-------TATA-------C-------T----T----T---T----C------AATTGTT-----CAA-ATGTGCTT----ACCATTTCTTCCA-TATT-TGTATAATTTTAATGTTG-TTTAGAA-GGCCA------TATGGTAGATAAGTTTTAAACAGTTGTATGA---------------GTTTA--A-------------AA-ATAAAGATATTATTATT-ATAGAACCCATATGT
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gi|14 : tgggtcaaattacagaactgtttatacataagaaccttaacttatatgttgtgaaatcactgcaaattattggcaatatctaaagacagatgtcttaaattcaacTTAAATGG-GAAA---TCCAA--AACTA----TGTATA----AATTA-ACCTTTTCAGTAAGATGACTATCAAAC-TAATTTACAACTGATTTGAAAA---CAAAAAC----TTTCCATATTGCACGTA---TGCCTCAGCTGTT---TGATTATGGTCTTATCATTCGGAA--AACTGGAATAACTCATACATTAAAAAGGTTTCTCAAGTATA-----AAAGA--GCACTGCCACATAGACTTTGTCAA-----------TGCACCATATTCAGAAGTTTTA-AAGAGTTCAGATGGTTTTCGTTTAATAAAC---GTTGCAGATGtac
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gi|12 : aTAAAAATATTGTACAC---AATTAACCAA--AAAAACTGAAC-TTTTAAAACGTTCGTTTACT---T-ATATATGCATGTT---TG--------TT-------TG---------TG---AG---T----C--------------------T--------------------A-TTCCTGTACAATTA-----CGTT--TATCATC----------------TTTA-CA-TGCAT-TT-AAGAATA-AT-TAT-AGAA--TACATTT--GTT-T--AACA------GCTAA--ATGTT---------AGACTTT-TTTTTA-CAGATGT------TTGCCC---TATT-----ATA--------ACATG--------T--------ATAAACTTTTC-------T----T----T---T----C------CATTGTT-----AAA-ATATGCTTTAATATCATTTCTTCTA-TGGT-TTAACAAAGCAAATGTTG-ATTAGGA-AGCCA------TATGGTAGATGAGTTTTACACTGTTGTATGA---------------TCTT------------------A-AT----ATATTGTTATT-Aatatcattattataataaatgttcttaatttagtacaaaaccctgaagaggtctttacaatcgttttttgaaa
gi|16 : TACTGTACAC---ATTCACCCAA--GAA--GTGAAG-ATTTAAAAAGTCCATTTATT---T-GTGTGGGCATGAG---TG--------TT-------TG---------AT---AT---T----CTATTCCTGTACCTATACGTGT--------------------A-T------------------CACC--AA----T----------------TTTA-AATTGCAT-TT-AGTAGTATAT-TAA-GACAAGTATATTT--ATTAA--A-CA------GCTAA--ATGTA---------AAACTCT-GGA--A-CAGGTGT------TTGATT---TAatttatattaatttttttttaatattttttattat
gi|19 : cAA--CTGAAC-TTTTAAAAGGTTCATTGACT---T-ATATAGGCATGA----TG--------TT-------TT---------GG---AT---T----C--------------------T--------------------A-TTCCTGTACAAATATTTGTCACC--TT----C----------------CTTA-CA-AGCAT-TG-AAGAAAA-AT-TAT-AAAA--CGAATTT--GTT-TG-A-CA------ACTAA--ATGTA---------AA----T-TAA--A-TTGTTGT------TTACTCAATTATT-----ATA--------CCATatgttgtttagaaggtcatatggtagataagttttaaaccgttgtatggtctctataggttaccttctaaaaataaa
gi|2 : TCTAAAACTTATGTTTACT---T-ATGTAGGTATGGA---TT--------CTACTCCTGTA---------CA---AT---TATGCC--------------------T--------------------A-T------------------CATC--TT----C----------------TGTG-CA-CACAT-CT-TAGATTA-AT-TAA-AGAA--TGTATTT--GTT-T--AACA------ACTAA--ATGTA---------ATAATTT-CAA--A-CAGGTGT------TTGCTC---TATT-----ATA--------ACATG--------TGTTTGTATGTA-------CCTTTCATT----T----T---T----C------AATTGAT-----AAC-ATATGCTT----GCCATATATGCTA-TGTT-TGTATAATTGTAAGGTTG-TTAAGAA-GGCCA------TATGGTAAATAAGTTTTATACCATTATATGA---------------TCTTA--AT------------GT-GTTAATGTTTTATTATT-ATc
gi|21 : TA-AT-GTT-TAAA--TATTTTTTTGTT-TTTA-CA---------AATGATGTA---------ACATACT-TAA--A-CAGGGGT------TTGCTC---TATTTTGAAATGAATTGAGCACATG----------------TATT-------T-------T----T----TTCAT----C------AATTGTT-----AAT-ATGTGCTT----GCCA-----TCCA-GATT-TGCATAATTtattaaacatcagaatttattcttgtttcctgatttggttgttatgtgtgccaggtgtattggcagtagtcactgtctgaaaccgatcttgccggtgggtgataagtagtcttgggcgcgtgttgtgatacacggacgtcagtgataaagtagtcttgggcgcgtgttgtgatacatggacgtcagtgataaagtagtcttgggtgcgtattgtgctacatggacgtcaactacgtgacaaatcaccagtacgtcctctttggtgaaaagcgtccccacattgagcatagcaacagcttg
gi|27 : T------TTGCTA---TATT-----ATC--------A-ATG--------TA------TATA-------C-------C----T----T---TATTTC------TATTGTT-----TAC-ATGTGCTT----GCCTTTTTGTCTAACGTT-TGTATAATTATAGTATTG-TTTAGAA-GGTCA------TATGG
gi|16 : TTTAATGTTG-TTTAGAA-GGTCA------TATGGTAGATAAGTTTTAAACCGTTGTATG
gi|29 : ctactgtacacattcacccaagaagtgaagatttaaaaagtccatttatttgtgtgggcatgagtgtttgatattctattcctgtacctatacgtgtatcaccaattttaaattgcatttagtagtatattaagacaagtatatttattaaacagctaaatgtaaaactctggaacaggtgtttgaATGTTG-TTTGGA-----CA------TATATTAGAGAAGTTTTATACTGTTGTATGA---------------TCTTA--A-------------gtctctataggttaccttctaaaaataaa
15 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|4 ): AAAGAAATGTCCGGTTAATTTGATTGAGGTTATTTAAACGTAGGAAAAGATTTAATTCATGATTCCTGGTTCGGTTTTTCTGTGGACCGGGTTTATTAGCTGCCGTATTCGTCGTCGTCAGCAATCTATCCTGCAGGTGGATATAAATGGTATTGCGGTCTTTTGTCTGAGATGTGACACATGGAGAGAAAGACGCACAGCTGGAGGTCACAGTTTGTGTTGCGACGTCTTCGCTGAGCTTGGCAGCATTGAGCATATTGATTATGTCCATTACATAATTTGCAGAGTAATAATTGAAAATTAAATAATATCAAGTTTGAAAATCAAAAATACTTCATCGCACTTTGAGATACGAGTAATATCGGCAAGAAAGGACATAAATTTTACTGGTCATTGCAGCCACGTAGAATCAGGAGTTACACTTCATTTTCGCGACTTACCTGGCGATTTAAATGATTGATTCCCGATACATTGGATCAAGGTTGATTATATGTCATTCAGTAAGCATGTCACCGACATTAGATACCGAAAACTACCTAAGAGAATCGGACGTTTCTTTTTTTGTTTAGTATATATGTT
Unaligned ( gi|5 ): ACAAAAAAAAATGTCCCATAAATTTGAGTGAGGATATTTTTAAGATGGCATCAAATATAGGAATCTCTGGTTCCTGATTCGGTTGTTATGTGTACCGGACGCTGCATTAGTAGACAAGGTCAGAAACCATTCTATTCCTGCAGGTAGCTATTACTGATATAGTGGTCTTCACTGTTAGTTGGACCCCTCAGTATTTCATTATTACTGAAAAAGTGTTCTCAAACTTTTAATAACACAGCTGGAGACCTCAACAGATGTTGCAATATCTTATGTGGACATGCCTGCCATGCCTGTATTGAGCATATTGCTTACATTTTTTTAATTATTGGCTGTAATTCTTGAGAAAATTTTCAATAAATTCTGAAATTTTAAACTGTTTCCTTCACATTGACATGAAATAGAACCAATAATAATTATGGGAGTAAAGTACAAGGACTTACCTGGCTTTAGTGTGCAAGTCCAAATTTGGATTTACACTGCACCTGTTGTTATCTACATTCCAATCATTAATTTCCGACACCTTTCAGACATCCTGTATCAGGACAGATCA
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Unaligned ( gi|15 ): TTTTTATCAATATATTTTAACATTTATCTTTAATTTTTGGAGAGACAATGTTGTTTACTCAAATGACGGTATCATTATCATTATAAAACATGAATGTTGAAATTTATATCATTTATGTAATTTTGAACATAAAAAGAAATGTCAGATACATATGACTGATAATATTTTAAGATGTCATAAAACGTAGGTTTTTAATATACGGTTCCTGGTTTAGATGTTATGTACCAGGTGTATCGTCGCTGCCAGACCCGATCCGCAGGTGGGTTATGATATCAAC
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Unaligned ( gi|20 ): ATAAATGTACATGTATATTTATTATGTATCATAAACAAACAAACAAATGTCCAATATATTTGACTAAGGATATTCTAAAGATGTCATAATACACAGGAATTCGGTATATGGTCCCTAGTACATTGTTATATGTACAAGGTG
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Unaligned ( gi|25 ): ACTGATGATATGTTACAGATGTCGTAAAACTTAAGAATTTATGCTATGGTTGCTGATTCGATCCCAAGTGTGTTATATGCGACAGAAGTCTTTGTCAGAAACCATTGCCGAAGGTGGATACTGATAAAGTTG
Unaligned ( gi|26 ): AAACCGACAACATTCAAATAAATTCAACTGAGGATATTTTAAAGATGTCATATTAAAATGTATGAATTTCATTTTAATGGTTCCTGATTTGGTTGTTATGTGTATCAGGT
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gi|6 : ttatattcctgtataaatacgtattAAAATATA-CTTTAA---G----------TTAACTGAAGACAAATTTATTGTACAC---GTTCAACCAA--AAA--CTGAAG-TTTTAAGATGTTCATTTACTTGAAAT-TACGGAAGGA---TG--------TC-------TG---------GA----ATGCAATTCATGTGCAAATATGT----T---------T--------------------A---T------------------AATTT---------TT------GTTACG-CATATTAAAGAGTA--ATTATAG---AATACATTTGTTCA-ACAGC------GAAATGTA---------AGAA--TCT-CAA---AGATGTAATATATCGATC---AGTA-----ATAA--------CATGCAT-----T-------TAAA-------T-------TTCTAT----TT------CA---GGTGTTATATATGA-CTGTGCT----TGGC---TGTTGTA-C-TATGTATGA-------------TTAGAA-AACCA------TATAACAGAGGAGTATTATACTGTAGTATAATATTATTATGTTATCGTCTTGAAATAAAG--ATATTATTATTA-c
gi|7 : aATAACA--ATA--TAATTTTATT-AT-TTATGGGAGTACAGACTGCATC---AA---A---CAA-----CAG--------AAAG---TTATAAACTCGGTTTCACTGA--GAATACTGAAG-TTTTAAAACGTCCATTTACTT---ATGTAGACATGGA---TG--------TT-------TG---------GA----AT--------------------T----C---------TTTCCCTGTACATACAAATTTA---T------------------CATCT---------TC------TTTGCA-TGCATTTAAGAGTA--ATTATAG---GATATATATGTTTA-ACAGC------TAAATATA---------AGAA--TCT-TAAA-CA--TGTA-----TTGCTA---TATT-----ATAG--------CATGGGTAAACAT-------T-TC-------C-------T----T----TT------CA---ATTGTT-----CAA-ATGTA---------CATTTCTTCTA-AATTTGTATAATTTAAAAGTTGATTTAAAT-GGTTG------TATG--------GTCTTAAAATGTT-----ACCTT-CTA-------------AAATATA---ATATTATTATT----GA---CATATGTatatcattattataataaatgttcttaatttagtacaaaaccctgaagaggtctttacaatcgttttttgaaa
gi|8 : caagacaatatatcgtatgttcgATAACA--ATA--TAATTTTATT-AT-TTATGGGAGTACAGACTGCATC---AA---A---CAA-----CAG--------AAAG---TTATAAACTCGGTTTCACTGAGGATA--CTGAAG-TTTTAAAACGTCCATTTACTT---ATGTAGACATGGA---TG--------TT-------TG---------GA----AT--------------------T----C---------TTTCCCTGTACATACAAATTTA---T------------------CATCT---------TC------TT-GCA-TGCATTTAAGAGTA--ATTATAG---GATATATATGTTTA-ACAGC------TAAATATA---------AGAA--TCT-TAAA-CA--TGTA-----TTGCTA---TATT-----ATAG--------CATGGGTAAACAT-------T-TC-------C-------T----T----TT------CA---ATTGTT-----CAA-ATGTA---------CATTTCTTCTA-AATTTGTATAATTTAAAAGTTG-ATTAAAATGATTG------TATG--------GTCTTAAAATGTT-----ACCTT-CTA-------------AAATATA---ATATTATTATT----GA---TATATGTtacgtagcaaccgtatgtattctaaaactggtgcaaa
14 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|5 ): ACAAAAAAAAATGTCCCATAAATTTGAGTGAGGATATTTTTAAGATGGCATCAAATATAGGAATCTCTGGTTCCTGATTCGGTTGTTATGTGTACCGGACGCTGCATTAGTAGACAAGGTCAGAAACCATTCTATTCCTGCAGGTAGCTATTACTGATATAGTGGTCTTCACTGTTAGTTGGACCCCTCAGTATTTCATTATTACTGAAAAAGTGTTCTCAAACTTTTAATAACACAGCTGGAGACCTCAACAGATGTTGCAATATCTTATGTGGACATGCCTGCCATGCCTGTATTGAGCATATTGCTTACATTTTTTTAATTATTGGCTGTAATTCTTGAGAAAATTTTCAATAAATTCTGAAATTTTAAACTGTTTCCTTCACATTGACATGAAATAGAACCAATAATAATTATGGGAGTAAAGTACAAGGACTTACCTGGCTTTAGTGTGCAAGTCCAAATTTGGATTTACACTGCACCTGTTGTTATCTACATTCCAATCATTAATTTCCGACACCTTTCAGACATCCTGTATCAGGACAGATCA
Unaligned ( gi|9 ): CGGAATCTCGTACTTAAATTATTGATGAATTAAGGCCCAGATTTCTAACAGCACAGCTGGAGGCCCAAACAGCTCTCTTGTCAACATGCCTGTATTGAGAATACCAAGTGCTTGTTCCCTTTATTAAGCAGTGTAATTGTTGAGAAAACCAAACTACTCTTGCACTAATATGTAAGATAGGATAAAAATCTTGTTAAAACAGCACATGGATTTATTTGGTACAAGTCGGGGGGATTCACACTGTACCTATTGTTCGTTACATATCTGGCAGTTTAAATCACTGATTTCAGACAACTTTAGTCATGACAGATTATATGTGATTCATTAAATACAACAGAAAAAAAATTTGAATGGAAATTGGCCATTTCCTTTTTTGTTCAGTGCATACAATATTTATATAAATAATG
Unaligned ( gi|15 ): TTTTTATCAATATATTTTAACATTTATCTTTAATTTTTGGAGAGACAATGTTGTTTACTCAAATGACGGTATCATTATCATTATAAAACATGAATGTTGAAATTTATATCATTTATGTAATTTTGAACATAAAAAGAAATGTCAGATACATATGACTGATAATATTTTAAGATGTCATAAAACGTAGGTTTTTAATATACGGTTCCTGGTTTAGATGTTATGTACCAGGTGTATCGTCGCTGCCAGACCCGATCCGCAGGTGGGTTATGATATCAAC
Unaligned ( gi|18 ): CTTTAACAATATAGTAAGAATTTAGAATGTACAATTCAATATTTGATAATATTTTACTTTTTTACTGACGTATTTCAATTATAATGAAATATAGTGAATAATTTAGATCAATTTGCATTCTTCCAGAACATAAAAAGAACTGTTCAAAATAAATTTGATTGTAGATATTTTAAATTGTCATAAAACATCAGAATTTAATCTATGGTTTCATGTTTCGATTGTTACGTGTACCTG
Unaligned ( gi|20 ): ATAAATGTACATGTATATTTATTATGTATCATAAACAAACAAACAAATGTCCAATATATTTGACTAAGGATATTCTAAAGATGTCATAATACACAGGAATTCGGTATATGGTCCCTAGTACATTGTTATATGTACAAGGTG
Unaligned ( gi|22 ): AGATAAATATCCGATAAATCTGACTGAGGCTTTTTTAAATATCTCATAAAACGTAGGAATGTAGTAAAATGATTCCTTATTCGGTTGTTATATGAACAAGTGGATTTACTACAATAGAAGTCGCTGTCATAAAACA
Unaligned ( gi|23 ): TGTTGAGAAAATGAAATAAAATTTGAAATTTTAAGCTGTTTCTTTTTCATTGACCTGAAATAATGTAAGAAAGAATAAAAATCTCATTAAGAAAGAACATGTCTTTACCTGGCGCATGCATACATGGATTTACACT
Unaligned ( gi|24 ): AAAAAGAAATGTCCAATAAATTTTGATTGAGGATTTAAAGAAATTTAAATGTATGGTTCCTGATTTGGTGATGTCACAGTTGTATTAGCTACAGTAGTAGTTGCTTTCAGAAAGGTATCTGCATGTTTATAT
Unaligned ( gi|25 ): ACTGATGATATGTTACAGATGTCGTAAAACTTAAGAATTTATGCTATGGTTGCTGATTCGATCCCAAGTGTGTTATATGCGACAGAAGTCTTTGTCAGAAACCATTGCCGAAGGTGGATACTGATAAAGTTG
Unaligned ( gi|26 ): AAACCGACAACATTCAAATAAATTCAACTGAGGATATTTTAAAGATGTCATATTAAAATGTATGAATTTCATTTTAATGGTTCCTGATTTGGTTGTTATGTGTATCAGGT
Unaligned ( gi|28 ): TTCACGCTGCACCTATTGTTGTGTCTATTGTTTTCCTATCAATTAAATCACTAATTGCAGACACCTTGTGTTAAGGCTGATAAAATGTTATTAATTACATA
Unaligned ( gi|30 ): ATATCCAATGAATTTGATGGAGGACAATTTAAAGATGTCATAAACCATAGGAATTTAATTGATGGTTCTTAATTTGGTT
Unaligned ( gi|32 ): AATTCAGACTCAAATTATTGATGAATTAAGGCCC