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gi|4                          : ttgtaataattattagaagttaaaattagaatacaaactaaccatattatatggggaaataggaagaactccaaatacgaattatagatggtaaccttttgtttatatttgtttaaggtgttacactgtgatgaaattaaatatgccatataattttataacatgatgcttgcagacatggaaaaaattccaattaaaaactgttgggcttcatcagtttcatcaatattagaaaacttagggtttaataatctttggttgttccgatgagttggtgacgttaatatgttccttaatacttttaaataaatactaacagataattttattcagaaatgtaatgaaaatattcaaaactctaccagagcaaacgatttaaaattaatttcaaattttaatttcaaaacctatttgaacgagattgggataaaatatttatatatgcattgactagatttagagtgtcctcacatagacttgaagctggaagctggcacaaacctaatataataccagtagaagatgtcaaatatgtaatgttttagaaggtgaatttcattctattttggaatgtccattgtacaaagatttcagactaaggtataatagaaaatactactgaaaaagacccaatatgctgaaatttgttgaactattacaatcacgacatacacaaactgtaacacatattgctacatacacttataaaagctttgagaaacattatataataaataattgaatattctacttagattgataattgatcggtataacaaatgataaattgatatttgattgtgtgcaaatataattataatatttgataatggtggcgaaaggagttattaaattagtacagatatgtgtaagtgatattacatgatacttttgacatcatttttgtgttgagaaatgtggAATAATCAT-TACTGTTCACTTTGTATTATGTATTAAACTCGTTATTGATATTTTATGTATGATTGTATTGTAACATAAGTACTGATAGACCTTTTG--GTATT-Ttttttagtattgaataaagtt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atttccctttagtctagaatgcgcatttgacaaatatttcagacttagctttattagaaaatacttctggaaaagaccaaatatgctgaaatttattgaattattacaatcacgacatacacaatttgtacaacatcttgctaaatacctatataaaaactttgagaaaagaaacgaaacattatataatagataatcgaatattcttcttcaattgataaaagatataacaaaggataaattaatatttgattgtatgcaagtatgattataatatttgataaatgtggcgaaaggagttattaaattagttcagatatgtgttagtgatattacacgatacttttgacattatttttctgttaagtaaagtgaAATAATTAAATACTGTACACTTTGTATTATGTAATGAACTCGTCATTGACATTTTATGCATGACTGTATTGTAAC--GTGTACTGGTAGGCCTTTtgtattgaatcaaattatttctttgtgctaatgtatatatcagagtttattttacatcattctgtagctgtaattttttagtcccaatcgacttaatctaatttcga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctacattcgctagatacagacataaaactttgagaaatgagacgaaccattatataatagataatcgaatattcttcttaaattgataattgataggtctaacaaataataaattgacatctgattgtgtgcaaatagtattataatatttgataatggtggcgaaatgagttattaagttagtacagatatgttttagtgatattacatggtacttttgacattatttttgtgtggagaaaagaggAATAATTAT-TACTGTACAATTTGTATTATGTATTGAACTCATTCTTGACATCGTATAAATGCTTTTCTTGCAACATCGGTACTGATAGGGCTTTTG--GTCTT-Ttttggttctttgtattgaataaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttaaaatagttcaattaaagtatagttcacgacatacaaaaactgtaaaacatcttgctacatatctgcataaaagctttgagaaaaacaaagtgaatattatataacagataatctaacattcttcttaaatttatatttgatagaggtataagtaatgatgacagatatattaatattcaattgtgtacaatgtgttagttatattacatgataattttgacattattttgtgttagaaatggAATAATTAT-TACTGTACAATTTGTATTATGTATTGAACTCATTCTTGACATCGTATAAATGCTTTTCTTGCAACATCGGTACTGATAGGGCTTTTG--GTCTT-Ttgtattgaataaaagt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttaaaatagttcaattaaagtatagttcacgacatacaaaaactgtaaaacatcttgctacatatctgcataaaagctttgagaaaaacaaagtgaatattatataacagataatctaacattcttcttaaatttatatttgatagaggtataagtaatgatgacagatatattaatattcaattgtgtacaatgtgttagttatattacatgataattttgacattattttgtgttagaaatggAATATTTAA-TACGTTACAATACGTACTGTGTATTGACCTTGTCATTGACATCGGGTGTATGATTGTATTGTAGCATGTGTAATGTTGGACCTTtgtattgaataaaagt
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttgattataggtcaatcgaatattttcatgaattgatatttggtaactacatatttaatgatagattgatattagattgtttacaatgttactataacatttaaacattttggtgaatggggttatcaaattaattcacatatacgtaagagatgttgtatgaaatttttaacattacttttgtgtcgtaaaaatagATATTTAT-TACTGTACGATTTGTATTATGCACTGAACTCGTCATTGGCATCTTATTTATGATTGTACTGTAACATGTGTATTGATAGGCATTTCTAAGTCTT-TAT------AGCTATATACAATTCAAAATATAGTG---TAATATGAGCATTTACCG---AAATTGCTGTATGTCCATTTGAGACTCAAAGATTATCTTCTTGATAAGAGAATGCATTATTCAAAACACCCTGCTGTTCTACTTTACGAGGATGCTGATGTTAAAATCATCATTCATTATGCCATGACAGTTACTTTGTACGCCTCATTAGGCTTGGCAATTTGGTTTTAATTAATTTTATCAATTAATA-TTTTTTTTCTTATCTTTGTATGGTAGTTGAAGTTATACATAATGTGAACTTTCATGTGTACGCATAATTACTAGACATGCAGGGGATCAGTTATTTAAGTTTTGTTATTATTTTTAAATAACTGTAAACATGAATATTCTTTTATTTCAAATTCCATAGGCCATCTTTCTCTTGAGGGCAACATATTTACATGATGTACACACAGTCGCAAATGACCCCCAAGCACTATAATGCAAACCATATATACGCATTCAAAAAAAAGGAAGAGGTAGATATAT-TATAAACATGTTTACACAGAATGTTACGCGTCAGAAAAGAAGCACATAACATTTAAATACGTCTAAATATACCTTCTATTCAAT----TTATTT-------------AT--TTTA-----------CAAAAAAGGTATACATAATATGATATTTTAAGTACTTAGTCGCATTTCTATATGCCTAGAAGCAAACGTTTGCATGCAAATCCCTTAATATATATTTATTCACAATTTCTTAACGTCATTTTGAATTATGATGTCACCAATTCAAAAAATATTAGCATACATGATCTTACCCATTTATATTTGTCGATGTATTTTTCCTCATTTTTTTAAAAAATAAATTCATCGTTTAATTTGATAAATGTTACTCATGATCTTTCATGAAATGGAACACTGACAAATCCGTTTCATCTTCCAATTTCATTTTCAAATACGATGTTAGTTTAAATTCACCGCATATTTATTTATAAAATGGCTCTGAAGGATCCACATATCTTTGATCACCAGTTCTGATCAAACTTTCTCATAATCTTTGTTTAACAATAGATAAAAACATGTGCGTGTTTCACTTAAAACACACAGAAAAAGAAACAACAAATAGAATCCTATGGATGAGAACGTATTGCGTAACAAGCTTACTCTTTTTTGGCTCTTATATTTTAAACCAGTAGTTTATTATTCTAAAATATCTACCAACCAATACTGAGCATCATCCTAGCTCACCATGTACGAAAATCATTTTGTGTAGCTCGTTTAATATTGAACAACGTTTAGCAATATGCAATACGAATGGCACAATGAAATCTCCACACTTCATAC------CCAGTAAAGGTAAATATTTTTTTTGTCAAAACGGTCTAGTCCATGCTTGACACTTATGTCTATTCAATAATATATTTATTTAGTTTTTTAATTGCTTTATTAGATTGACCAGCCAAAGCTATTCGGGGTTCGTTAAATGACCCGACAGAAATAAATACAACACATGTACTTACAAATGGAAAATACGTTATAATTTTTAATTCTTCATATTTAAATGCAAAACGTAGGTTTATCGGTAGACAGTTTGTTTTTCTTTTGAATTTTCAAACAAAGTCTTCAACTTATTTGTCTCACAATAATCTAACAAAATATCCACACCTTTCCATAGCCATTTTCAGTTTCAAAGTGTAGAGATACATTGTCTGCATACAAGAGAAAATATTAAAAAATATATATATATATACTAATGTATAACATTActagtgttttgcattcaacaaagtatatacatt
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tatacctttgtaatgtctgtatcatagtgaaacgatacactgtatattagacaatggaatattcttcttcaattgataactgataggtataacaaatgatatattgatatctgattgtgtgcaaatattattattatatttgataatgcaggcgagataatttattagattgatacagatatgtgttagtgacattacatgatacattttgacattttttttgttttgagaaaagtggatAT-TATTGTACGGTTTGCATTATGCATTGAACTCGTCGTTGACAT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttatttcaattgaaacaaatacatgtattatatgtaagttagattacataatacttctgatattactgttgtattgacaatatgaagaaatattgcATATTCTTTTATTTCAAATCCAATAGGACATCTGGCCCTTGAGGACAATATA---GAACTATATACACCAAATCACAAATAACGCAAAAGCA-GATAAT-C----------TACGAATTCAAATAAA--GGAGAAGTTTATATATAAATAAA-ATATACAAACACAATGTCACACGTCAGAGAAGAAtgtgttgattaacgtgctaatatcttgcatatcaatttgtatt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gATATTCCTTTATTTCGAACCCAATAGCCCATCTGGCCATTAAGTACAACATTTATACATACAGTATATACA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 agtAACCTTTAAGTAGCATCTCTTCCTTAAGATC
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|10 ): CTAATATAATACCAGTAGAAGATAGAACATGTCAAATATATCACGTTTTATTTTAAAATGTCCATTTCACAAAGATTTCAGACTATGCTGTATTTTAAATCACAACTAGAAAATTTATTGAAATATTACAATTATGACATGTGAAAACCGAAAAGCATCCCTTTACATATATATAATTTTGACAACAGAAACGTACCGTTATATGACAGATTGTCGAATCGTCGTTTTCAATTGGTGTCTGATTTATTAGATATAACGAATTATAAATTAATTCTTTCATTGTGTACAAATATCATTATAACATTTGATAATAGTGGCGAAAGGAACAT
Unaligned ( gi|13 ): CTTTTGTAAAACTTCTGTGATTGCAAAGAGAAAAGAAGCGAAGCATCACATAAAATACAATCGAACCTTCTTCTTAACTTGATATTCGTTAGGTATAATTATTGATAAATTGATATTTGACTGTGTAGAACTATTATTATAACATTTGATAACGGTGGCAAAAGGTGTAATTAAATACGGCATATATGTGTTTGTGATATTACA
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Unaligned ( gi|18 ): CCATCGATATGTTTAGCAATTTAATAGTGATAGAAATCAT






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Reference ( family-3710 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATAATTAT-TACTGT-------ACANTTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCGTCATTGACATCTTATGTATGATTGTATTGTAACATGTGTACTGATAGGCC--TTTT--G--G--TCTT-----T---ATT-G-ATGAAGCTNTATACAATNCANNATG-TAGTGTATTAATATGAGCANTTACCGTCCAAATTGCTGTATGTCCATTTGAGACTCAAAGATTATCTTCTTGATAAGAGAATGCATTATTCAAAACACCCTGCTGTTCTACTTTACGAGGATGCTGATGTTAAAATCATCATTCATTATGCCATGACAGTTACTTTGTACGCCTCATTAGGCTTGGCAATTTGGTTTTAATTAATTTTATCAATTAATA-TTTTTTTTCTTATCTTTGTATGGTAGTTGAAGTTATACATAATGTGAACTTTCATGTGTACGCATAATTACTAGACATGCAGGGGATCAGTTATTTAAGTTTTGTTATTATTTTTAAATAACTGTAAACATGAATATTCTTTTATTTCGAATCCAATAGGCCATCTGGCCCTTGAGGACAACATA-T-T-ACATNATGTACACACAGTCGCAAATGACNCNNAAGCACNATAATGCAAACCATATATACGNATTCAAANAAAAGGGAGAGGTNNATATATANATAAACATGTNCANACANAATGTCACGCGTCAGAGAAGAAGCACATAACATTTAAATACGTCTAAATATACCTTCTATTCAAT----TTATTT-------------AT--TTTA-----------CAAAAAAGGTATACATAATATGATATTTTAAGTACTTAGTCGCATTTCTATATGCCTAGAAGCAAACGTTTGCATGCAAATCCCTTAATATATATTTATTCACAATTTCTTAACGTCATTTTGAATTATGATGTCACCAATTCAAAAAATATTAGCATACATGATCTTACCCATTTATATTTGTCGATGTATTTTTCCTCATTTTTTTAAAAAATAAATTCATCGTTTAATTTGATAAATGTTACTCATGATCTTTCATGAAATGGAACACTGACAAATCCGTTTCATCTTCCAATTTCATTTTCAAATACGATGTTAGTTTAAATTCACCGCATATTTATTTATAAAATGGCTCTGAAGGATCCACATATCTTTGATCACCAGTTCTGATCAAACTTTCTCATAATCTTTGTTTAACAATAGATAAAAACATGTGCGTGTTTCACTTAAAACACACAGAAAAAGAAACAACAAATAGAATCCTATGGATGAGAACGTATTGCGTAACAAGCTTACTCTTTTTTGGCTCTTATATTTTAAACCAGTAGTTTATTATTCTAAAATATCTACCAACCAATACTGAGCATCATCCTAGCTCACCATGTACGAAAATCATTTTGTGTAGCTCGTTTAATATTGAACAACGTTTAGCAATATGCAATACGAATGGCACAATGAAATCTCCACACTTCATAC------CCAGTAAAGGTAAATATTTTTTTTGTCAAAACGGTCTAGTCCATGCTTGACACTTATGTCTATTCAATAATATATTTATTTAGTTTTTTAATTGCTTTATTAGATTGACCAGCCAAAGCTATTCGGGGTTCGTTAAATGACCCGACAGAAATAAATACAACACATGTACTTACAAATGGAAAATACGTTATAATTTTTAATTCTTCATATTTAAATGCAAAACGTAGGTTTATCGGTAGACAGTTTGTTTTTCTTTTGAATTTTCAAACAAAGTCTTCAACTTATTTGTCTCACAATAATCTAACAAAATATCCACACCTTTCCATAGCCATTTTCAGTTTCAAAGTGTAGAGATACATTGTCTGCATACAAGAGAAAATATTAAAAAATATATATATATATACTAATGTATAACATTANAACCTTTAAGTAGCATCTCTTCCTTAAGATC
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gAT-TATTGT-------ACGGTTTG------CATTA-TGCATTGAAC----TCGTCGTTGACAT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tagtggtgttatataatacttttgacatacatttcgtgttgaacaaggggactaATATTCCTTTATTTCGAACCCAATAGCCCATCTGGCCATTAAGTACAACATT-TAT-ACATACAGTATATACA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agtAACCTTTAAGTAGCATCTCTTCCTTAAGATC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATATTTAT-TACTGT-------ACGATTTG------TATTA-TGCACTGAAC----TCGTCATTGGCATCTTATTTATGATTGTACTGTAACATGTGTATTGATAGGCA--TTTCTAA--G--TCTT-----T---AT--------AGCTATATACAATTCAAAATA-TAGTGTA---ATATGAGCATTTACCG---AAATTGCTGTATGTCCATTTGAGACTCAAAGATTATCTTCTTGATAAGAGAATGCATTATTCAAAACACCCTGCTGTTCTACTTTACGAGGATGCTGATGTTAAAATCATCATTCATTATGCCATGACAGTTACTTTGTACGCCTCATTAGGCTTGGCAATTTGGTTTTAATTAATTTTATCAATTAATA-TTTTTTTTCTTATCTTTGTATGGTAGTTGAAGTTATACATAATGTGAACTTTCATGTGTACGCATAATTACTAGACATGCAGGGGATCAGTTATTTAAGTTTTGTTATTATTTTTAAATAACTGTAAACATGAATATTCTTTTATTTCAAATTCCATAGGCCATCTTTCTCTTGAGGGCAACATATT-T-ACATGATGTACACACAGTCGCAAATGACCCCCAAGCACTATAATGCAAACCATATATACGCATTCAAAAAAAAGGAAGAGGTAGATATAT-TATAAACATGTTTACACAGAATGTTACGCGTCAGAAAAGAAGCACATAACATTTAAATACGTCTAAATATACCTTCTATTCAAT----TTATTT-------------AT--TTTA-----------CAAAAAAGGTATACATAATATGATATTTTAAGTACTTAGTCGCATTTCTATATGCCTAGAAGCAAACGTTTGCATGCAAATCCCTTAATATATATTTATTCACAATTTCTTAACGTCATTTTGAATTATGATGTCACCAATTCAAAAAATATTAGCATACATGATCTTACCCATTTATATTTGTCGATGTATTTTTCCTCATTTTTTTAAAAAATAAATTCATCGTTTAATTTGATAAATGTTACTCATGATCTTTCATGAAATGGAACACTGACAAATCCGTTTCATCTTCCAATTTCATTTTCAAATACGATGTTAGTTTAAATTCACCGCATATTTATTTATAAAATGGCTCTGAAGGATCCACATATCTTTGATCACCAGTTCTGATCAAACTTTCTCATAATCTTTGTTTAACAATAGATAAAAACATGTGCGTGTTTCACTTAAAACACACAGAAAAAGAAACAACAAATAGAATCCTATGGATGAGAACGTATTGCGTAACAAGCTTACTCTTTTTTGGCTCTTATATTTTAAACCAGTAGTTTATTATTCTAAAATATCTACCAACCAATACTGAGCATCATCCTAGCTCACCATGTACGAAAATCATTTTGTGTAGCTCGTTTAATATTGAACAACGTTTAGCAATATGCAATACGAATGGCACAATGAAATCTCCACACTTCATAC------CCAGTAAAGGTAAATATTTTTTTTGTCAAAACGGTCTAGTCCATGCTTGACACTTATGTCTATTCAATAATATATTTATTTAGTTTTTTAATTGCTTTATTAGATTGACCAGCCAAAGCTATTCGGGGTTCGTTAAATGACCCGACAGAAATAAATACAACACATGTACTTACAAATGGAAAATACGTTATAATTTTTAATTCTTCATATTTAAATGCAAAACGTAGGTTTATCGGTAGACAGTTTGTTTTTCTTTTGAATTTTCAAACAAAGTCTTCAACTTATTTGTCTCACAATAATCTAACAAAATATCCACACCTTTCCATAGCCATTTTCAGTTTCAAAGTGTAGAGATACATTGTCTGCATACAAGAGAAAATATTAAAAAATATATATATATATACTAATGTATAACATTAat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATAATTAT-TACTGT-------ACACTTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCGTCATTGACATCTTATGTATGATTGTATAGTAACATGTGTACTAATAGGCC--TTTT--C--T--TTTTTTTAGT---ATT-GAATAAAGTT
gi|4                          : ttgtaataattattagaagttaaaattagaatacaaactaaccatattatatggggaaataggaagaactccaaatacgaattatagatggtaaccttttgtttatatttgtttaaggtgttacactgtgatgaaattaaatatgccatataattttataacatgatgcttgcagacatggaaaaaattccaattaaaaactgttgggcttcatcagtttcatcaatattagaaaacttagggtttaataatctttggttgttccgatgagttggtgacgttaatatgttccttaatacttttaaataaatactaacagataattttattcagaaatgtaatgaaaatattcaaaactctaccagagcaaacgatttaaaattaatttcaaattttaatttcaaaacctatttgaacgagattgggataaaatatttatatatgcattgactagatttagagtgtcctcacatagacttgaagctggaagctggcacaaacctaatataataccagtagaagatgtcaaatatgtaatgttttagaaggtgaatttcattctattttggaatgtccattgtacaaagatttcagactaaggtataatagaaaatactactgaaaaagacccaatatgctgaaatttgttgaactattacaatcacgacatacacaaactgtaacacatattgctacatacacttataaaagctttgagaaacattatataataaataattgaatattctacttagattgataattgatcggtataacaaatgataaattgatatttgattgtgtgcaaatataattataatatttgataatggtggcgaaaggagttattaaattagtacagatatgtgtaagtgatattacatgatacttttgacatcatttttgtgttgagaaatgtggAATAATCAT-TACTGT-------TCACTTTG------TATTA-TGTATTAAAC----TCGTTATTGATATTTTATGTATGATTGTATTGTAACATAAGTACTGATAGACC--TTTT--G--G--TATTTTG--T---ATT-GAATCAAATTAT------TTCTTTGTGCTAATGTAT--ATATCAGAGTTTA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atttccctttagtctagaatgcgcatttgacaaatatttcagacttagctttattagaaaatacttctggaaaagaccaaatatgctgaaatttattgaattattacaatcacgacatacacaatttgtacaacatcttgctaaatacctatataaaaactttgagaaaagaaacgaaacattatataatagataatcgaatattcttcttcaattgataaaagatataacaaaggataaattaatatttgattgtatgcaagtatgattataatatttgataaatgtggcgaaaggagttattaaattagttcagatatgtgttagtgatattacacgatacttttgacattatttttctgttaagtaaagtgaTATTTAT-TACTGT-------ACACTTTA------TATTA-TGTATTGAAC----TCGCCATTGCTATCTTATGTATGATTGTATTGTACCATGTATACTGATAGGCA--TTTT--A--GTATCTTG----T---ATT-G-ATGAAGTTCTATAC-ATGTATCATG-TAATGTATTGA-------AGTTACCGTCCAAATttttacatcattctgtagctgtaattttttagtcccaatcgacttaatctaatttcga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatacctttgtaatgtctgtatcatagtgaaacgatacactgtatattagacaatggaatattcttcttcaattgataactgataggtataacaaatgatatattgatatctgattgtgtgcaaatattattattatatttgataatgcaggcgagataatttattagattgatacagatatgtgttagtgacattacatgatacattttgacattttttttgttttgagaaaagtggatAATAATTAT-TACTGT-------ACAATTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCATTCTTGACATCGTATAAATGCTTTTCTTGCAACATCGGTACTGATAGGGC--TTTT--G--G--TCTTTTG--T---ATT-G-A
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttaaaatagttcaattaaagtatagttcacgacatacaaaaactgtaaaacatcttgctacatatctgcataaaagctttgagaaaaacaaagtgaatattatataacagataatctaacattcttcttaaatttatatttgatagaggtataagtaatgatgacagatatattaatattcaattgtgtacaatgtgttagttatattacatgataattttgacattattttgtgttagaaatggAATAATTAT-TACTGT-------ACAATTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCATTCTTGACATCGTATAAATGCTTTTCTTGCAACATCGGTACTGATAGGGC--TTTT--G--G--TCTTTTG--T---ATT-G-Aataaaagt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttaaaatagttcaattaaagtatagttcacgacatacaaaaactgtaaaacatcttgctacatatctgcataaaagctttgagaaaaacaaagtgaatattatataacagataatctaacattcttcttaaatttatatttgatagaggtataagtaatgatgacagatatattaatattcaattgtgtacaatgtgttagttatattacatgataattttgacattattttgtgttagaaatggAATAATTAAATACTGT-------ACACTTTG------TATTA-TGTAATGAAC----TCGTCATTGACATTTTATGCATGACTGTATTGTAAC--GTGTACTGGTAGGCCTTTTTT--G--GT-TCTTTG---T---ATT-G-Aataaaagt
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): GATCAATGTCAAAACTTAGGTTTTAATCATGTTTGGTTGTTCTAAGGAGTTGGTAATGTTACTTTGTTCCTTGATACTTCAAACAAAGACTAACGGATACATTTATTCAGTACTGCTATTAACATATTCAAAACTCTACCGGAGCAAACATTTATTTATTGATATAAAATTGTAATTTCAAGACATATTTGGGCGAGTTTAGGATAAACATGTTTATATATGCATTTACTAGATTAAGAATGAAATTGAAGCTGGAAGATGTCGCAAACCTAATAGAATACCAGTAGAAAATAGAATGATGTCAAATATGTAATGTTTTGGAAGATGAATTTATTTTTATTTAAGAATGTCAATTAAACAAAGATCTGAGACTAAGCTGTATTACAAATACTTCTGGAAAAGATCCGATATGATGAAATTGATTGAATTATTACAATCATGCCATACAGACAACTGTAACACATCTTACTACATGCATAATTATATAAAAACTTTGAGAAAAGAAACGAACATTATATAAAAGAT
Unaligned ( gi|10 ): CTAATATAATACCAGTAGAAGATAGAACATGTCAAATATATCACGTTTTATTTTAAAATGTCCATTTCACAAAGATTTCAGACTATGCTGTATTTTAAATCACAACTAGAAAATTTATTGAAATATTACAATTATGACATGTGAAAACCGAAAAGCATCCCTTTACATATATATAATTTTGACAACAGAAACGTACCGTTATATGACAGATTGTCGAATCGTCGTTTTCAATTGGTGTCTGATTTATTAGATATAACGAATTATAAATTAATTCTTTCATTGTGTACAAATATCATTATAACATTTGATAATAGTGGCGAAAGGAACAT
Unaligned ( gi|13 ): CTTTTGTAAAACTTCTGTGATTGCAAAGAGAAAAGAAGCGAAGCATCACATAAAATACAATCGAACCTTCTTCTTAACTTGATATTCGTTAGGTATAATTATTGATAAATTGATATTTGACTGTGTAGAACTATTATTATAACATTTGATAACGGTGGCAAAAGGTGTAATTAAATACGGCATATATGTGTTTGTGATATTACA
Unaligned ( gi|17 ): TATTTTATTTTAGAATGTCCATTGTACAAAGATTTCAGACTAAGTTATATTAC
Unaligned ( gi|18 ): CCATCGATATGTTTAGCAATTTAATAGTGATAGAAATCAT






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Reference ( family-3710 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATANTTAT-TACTGT-------ACAATTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCGTCATTGACATCTTATGTATGATTGTATTGTAACATGTGTACTGATAGGCC--TTTT--G--GTCTTTT--GTATT-G-ATNAAGTTATATACAATTCATNATG-TAGTGTATATATGAGCATTTACCG---AAATTGCTGTNTGTCCATTTGAGANTCAAAGNTTATCTTCTTGANNAGAGAATGNATTATTCAAAACACCCTGCTGTTCTACTTTGCGAGGATGCTGATGTTGAAATCATCATTCATTATGCCATGACAGTTACTCTGTACGCCTCATTAGGCTTGGCAATTTGGTTTTAATTAATTTTATCAATTANTAATTTTTTTTCTTATCTTTGTATGGTAGTTGAAGTTATACATAATGTGAACTTTCATGTGTACGCATAATTACTAGACATGCAGGGNATCAGTTATTCAAGTTTTGTTATTATTTTTNAATAACTGTAAACATGAATATTCTTTTATTTCAAATCCNATAGGCCATCTNNCCCTTGAGGGCAACATAT-T-ACATGATGTACACACAGTCGCAAATGACCCNCAAGCACTATAATGCAAACCATATATACGCATTCAAAAAAA--GAAGAGGTAGATATAT-TATAAACATGTTTACACAGAATGTTACGCGTCAGAAAAGAANCACATAACATTTAAATACGTCTAAATATACCTTCTATTCAATAAATTTATTTTACAAATATTAACATGGTTTAAGCTGAGTTTTCGAAAAAGGTATACATAATATGATATTTTAAGTACTTAGTCGCATTTCTATATGCCTAGAAGCAAACGTTTGCATGCAAATCCCTTAATATATATTTATTCACAATTTCTTAACGTCATTTTGAATTATGATGTCACCAGTTCAAAAAATATTAGCATACATGATCTTACCCATTNATATTTGTCGATGTATTTTTCCTCATTTTTTTAAAAAATAAATTCATCGTTTAATTTGATAAATGTTACTCATGATCTTTCATGAAATGGAACACTGACAAATCCGTTTCATCTTCCAATTTCATTTTCAAATACGATGTTAGTTTAAATTCACCGCATATTTATTTATAAAATGGCTCTGAAGGATCCANANATCTTTGATCNCCAGTTCTGATCAAACTTTCTCATNATCTTTGTTTAACAATAGATAAAAACATGTGCGTGTTTCACTTAAAACACACAGAAAAAGAAACAACAAATAGAATCCTATGGATGAGAACGTATTGCGTAACAAGCTTACTCTTTNTTGGCTCTTNTATTTTAAACCAGTAGTTTATTATTCTAAAATATCTACCAACCAATACTGAGCATCATCCTGGCTCACCATGTACGAAAATCATTTTGTGTAGCTCGTTTAATATTGAACAACGTTTAGCAATATGCAATACGAATGGCACAATGAAATCTCCACACTTCATACCCTGATCCAGTAAAGGTAAATATTTTTTTTGTCAAAACGGTCTAGTCCATGCTTGACACTTATGTCTATTCAATAATATATTTATTTAGTTTTNTAATTGCTTTNTTAGATTGACCAGCCAAAGCNATTCGGGGTTCGTTAAATGACCCGACAGAAATAAATACAACACATGTACTTACAAATGGAAAATACGTTATAATTTTTANTTCTTCATATTTAAATGCAAAACGTAGGTTTATCGGTAGACAGTTTGTTTTTCTTTTGAATTTTCAAACAAAGTCTTCAACTTATTTGTCTCACAATAATCTAACAAAATATCCACACCTTTCCATAGCCATTTTCAGTTTCAAAGTGTAGAGATACATTNTCTGCATACAAGAGAAAATATTAAAAAATATATATATATATACTAATGTATAACATTAAAACCTTTAAGTAGCNTCTCTCCCTTAAGATC
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttatttcaattgaaacaaatacatgtattatatgtaagttagattacataatacttctgaATATTCTTTTATTTCAAATCCAATAGGACATCTGGCCCTTGAGGACAATATAG-A-AC-T-ATATACACCAAATCACAAATAACGCAAAAGCA-GATAAT-C----------TACGAATTCAAATAAA--GGAGAAGTTTATATATAAATAAA-ATATACAAACACAATGTCACACGTCAGAGAAGAAcgtgctaatatcttgcatatcaatttgtatt
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tagtggtgttatataatacttttgacatacatttcgtgttgaacaaggggactaATATTCCTTTATTTCGAACCCAATAGCCCATCTGGCCATTAAGTACAACATTTAT-ACATACAGTATATACA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agtAACCTTTAAGTAGCATCTCTTCCTTAAGATC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATATTTAT-TACTGT-------ACGATTTG------TATTA-TGCACTGAAC----TCGTCATTGGCATCTTATTTATGATTGTACTGTAACATGTGTATTGATAGGCA--TTTCTAA--GTCTTT-----------AT--AGCTATATACAATTCAAAATA-TAGTGTA-ATATGAGCATTTACCG---AAATTGCTGTATGTCCATTTGAGACTCAAAGATTATCTTCTTGATAAGAGAATGCATTATTCAAAACACCCTGCTGTTCTACTTTACGAGGATGCTGATGTTAAAATCATCATTCATTATGCCATGACAGTTACTTTGTACGCCTCATTAGGCTTGGCAATTTGGTTTTAATTAATTTTATCAATTAATA-TTTTTTTTCTTATCTTTGTATGGTAGTTGAAGTTATACATAATGTGAACTTTCATGTGTACGCATAATTACTAGACATGCAGGGGATCAGTTATTTAAGTTTTGTTATTATTTTTAAATAACTGTAAACATGAATATTCTTTTATTTCAAATTCCATAGGCCATCTTTCTCTTGAGGGCAACATAT-TTACATGATGTACACACAGTCGCAAATGACCCCCAAGCACTATAATGCAAACCATATATACGCATTCAAAAAAAAGGAAGAGGTAGATATAT-TATAAACATGTTTACACAGAATGTTACGCGTCAGAAAAGAAGCACATAACATTTAAATACGTCTAAATATACCTTCTATTCAAT----TTATTT-------------AT--TTTA-----------CAAAAAAGGTATACATAATATGATATTTTAAGTACTTAGTCGCATTTCTATATGCCTAGAAGCAAACGTTTGCATGCAAATCCCTTAATATATATTTATTCACAATTTCTTAACGTCATTTTGAATTATGATGTCACCAATTCAAAAAATATTAGCATACATGATCTTACCCATTTATATTTGTCGATGTATTTTTCCTCATTTTTTTAAAAAATAAATTCATCGTTTAATTTGATAAATGTTACTCATGATCTTTCATGAAATGGAACACTGACAAATCCGTTTCATCTTCCAATTTCATTTTCAAATACGATGTTAGTTTAAATTCACCGCATATTTATTTATAAAATGGCTCTGAAGGATCCACATATCTTTGATCACCAGTTCTGATCAAACTTTCTCATAATCTTTGTTTAACAATAGATAAAAACATGTGCGTGTTTCACTTAAAACACACAGAAAAAGAAACAACAAATAGAATCCTATGGATGAGAACGTATTGCGTAACAAGCTTACTCTTTTTTGGCTCTTATATTTTAAACCAGTAGTTTATTATTCTAAAATATCTACCAACCAATACTGAGCATCATCCTAGCTCACCATGTACGAAAATCATTTTGTGTAGCTCGTTTAATATTGAACAACGTTTAGCAATATGCAATACGAATGGCACAATGAAATCTCCACACTTCATAC------CCAGTAAAGGTAAATATTTTTTTTGTCAAAACGGTCTAGTCCATGCTTGACACTTATGTCTATTCAATAATATATTTATTTAGTTTTTTAATTGCTTTATTAGATTGACCAGCCAAAGCTATTCGGGGTTCGTTAAATGACCCGACAGAAATAAATACAACACATGTACTTACAAATGGAAAATACGTTATAATTTTTAATTCTTCATATTTAAATGCAAAACGTAGGTTTATCGGTAGACAGTTTGTTTTTCTTTTGAATTTTCAAACAAAGTCTTCAACTTATTTGTCTCACAATAATCTAACAAAATATCCACACCTTTCCATAGCCATTTTCAGTTTCAAAGTGTAGAGATACATTGTCTGCATACAAGAGAAAATATTAAAAAATATATATATATATACTAATGTATAACATTAat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATAATTAT-TACTGT-------ACACTTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCGTCATTGACATCTTATGTATGATTGTATAGTAACATGTGTACTAATAGGCC--TTTT--C--TTTTTTTTAGTATT-GAATAAAGTT
gi|4                          : ttgtaataattattagaagttaaaattagaatacaaactaaccatattatatggggaaataggaagaactccaaatacgaattatagatggtaaccttttgtttatatttgtttaaggtgttacactgtgatgaaattaaatatgccatataattttataacatgatgcttgcagacatggaaaaaattccaattaaaaactgttgggcttcatcagtttcatcaatattagaaaacttagggtttaataatctttggttgttccgatgagttggtgacgttaatatgttccttaatacttttaaataaatactaacagataattttattcagaaatgtaatgaaaatattcaaaactctaccagagcaaacgatttaaaattaatttcaaattttaatttcaaaacctatttgaacgagattgggataaaatatttatatatgcattgactagatttagagtgtcctcacatagacttgaagctggaagctggcacaaacctaatataataccagtagaagatgtcaaatatgtaatgttttagaaggtgaatttcattctattttggaatgtccattgtacaaagatttcagactaaggtataatagaaaatactactgaaaaagacccaatatgctgaaatttgttgaactattacaatcacgacatacacaaactgtaacacatattgctacatacacttataaaagctttgagaaacattatataataaataattgaatattctacttagattgataattgatcggtataacaaatgataaattgatatttgattgtgtgcaaatataattataatatttgataatggtggcgaaaggagttattaaattagtacagatatgtgtaagtgatattacatgatacttttgacatcatttttgtgttgagaaatgtggAATAATCAT-TACTGT-------TCACTTTG------TATTA-TGTATTAAAC----TCGTTATTGATATTTTATGTATGATTGTATTGTAACATAAGTACTGATAGACC--TTTT--G--GTATTTT--GTATT-GAATCAAATTAT------TTCTTTGTGCTAATGTATATATCAGAGTTTA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atttccctttagtctagaatgcgcatttgacaaatatttcagacttagctttattagaaaatacttctggaaaagaccaaatatgctgaaatttattgaattattacaatcacgacatacacaatttgtacaacatcttgctaaatacctatataaaaactttgagaaaagaaacgaaacattatataatagataatcgaatattcttcttcaattgataaaagatataacaaaggataaattaatatttgattgtatgcaagtatgattataatatttgataaatgtggcgaaaggagttattaaattagttcagatatgtgttagtgatattacacgatacttttgacattatttttctgttaagtaaagtgaTATTTAT-TACTGT-------ACACTTTA------TATTA-TGTATTGAAC----TCGCCATTGCTATCTTATGTATGATTGTATTGTACCATGTATACTGATAGGCA--TTTT--A--GTATCTT--GTATT-G-ATGAAGTTCTATAC-ATGTATCATG-TAATGTAT---TGA--AGTTACCGTCCAAATttttacatcattctgtagctgtaattttttagtcccaatcgacttaatctaatttcga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatacctttgtaatgtctgtatcatagtgaaacgatacactgtatattagacaatggaatattcttcttcaattgataactgataggtataacaaatgatatattgatatctgattgtgtgcaaatattattattatatttgataatgcaggcgagataatttattagattgatacagatatgtgttagtgacattacatgatacattttgacattttttttgttttgagaaaagtggatAATAATTAT-TACTGT-------ACAATTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCATTCTTGACATCGTATAAATGCTTTTCTTGCAACATCGGTACTGATAGGGC--TTTT--G--GTCTTTT--GTATT-GAATAAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttaaaatagttcaattaaagtatagttcacgacatacaaaaactgtaaaacatcttgctacatatctgcataaaagctttgagaaaaacaaagtgaatattatataacagataatctaacattcttcttaaatttatatttgatagaggtataagtaatgatgacagatatattaatattcaattgtgtacaatgtgttagttatattacatgataattttgacattattttgtgttagaaatggAATAATTAT-TACTGT-------ACAATTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCATTCTTGACATCGTATAAATGCTTTTCTTGCAACATCGGTACTGATAGGGC--TTTT--G--GTCTTTT--GTATT-GAATAAAagt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttaaaatagttcaattaaagtatagttcacgacatacaaaaactgtaaaacatcttgctacatatctgcataaaagctttgagaaaaacaaagtgaatattatataacagataatctaacattcttcttaaatttatatttgatagaggtataagtaatgatgacagatatattaatattcaattgtgtacaatgtgttagttatattacatgataattttgacattattttgtgttagaaatggAATAATTAAATACTGT-------ACACTTTG------TATTA-TGTAATGAAC----TCGTCATTGACATTTTATGCATGACTGTATTGTAAC--GTGTACTGGTAGGCCTTTTTT--G--GTTCTTT--GTATT-GAATAAAagt
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): GATCAATGTCAAAACTTAGGTTTTAATCATGTTTGGTTGTTCTAAGGAGTTGGTAATGTTACTTTGTTCCTTGATACTTCAAACAAAGACTAACGGATACATTTATTCAGTACTGCTATTAACATATTCAAAACTCTACCGGAGCAAACATTTATTTATTGATATAAAATTGTAATTTCAAGACATATTTGGGCGAGTTTAGGATAAACATGTTTATATATGCATTTACTAGATTAAGAATGAAATTGAAGCTGGAAGATGTCGCAAACCTAATAGAATACCAGTAGAAAATAGAATGATGTCAAATATGTAATGTTTTGGAAGATGAATTTATTTTTATTTAAGAATGTCAATTAAACAAAGATCTGAGACTAAGCTGTATTACAAATACTTCTGGAAAAGATCCGATATGATGAAATTGATTGAATTATTACAATCATGCCATACAGACAACTGTAACACATCTTACTACATGCATAATTATATAAAAACTTTGAGAAAAGAAACGAACATTATATAAAAGAT
Unaligned ( gi|10 ): CTAATATAATACCAGTAGAAGATAGAACATGTCAAATATATCACGTTTTATTTTAAAATGTCCATTTCACAAAGATTTCAGACTATGCTGTATTTTAAATCACAACTAGAAAATTTATTGAAATATTACAATTATGACATGTGAAAACCGAAAAGCATCCCTTTACATATATATAATTTTGACAACAGAAACGTACCGTTATATGACAGATTGTCGAATCGTCGTTTTCAATTGGTGTCTGATTTATTAGATATAACGAATTATAAATTAATTCTTTCATTGTGTACAAATATCATTATAACATTTGATAATAGTGGCGAAAGGAACAT
Unaligned ( gi|13 ): CTTTTGTAAAACTTCTGTGATTGCAAAGAGAAAAGAAGCGAAGCATCACATAAAATACAATCGAACCTTCTTCTTAACTTGATATTCGTTAGGTATAATTATTGATAAATTGATATTTGACTGTGTAGAACTATTATTATAACATTTGATAACGGTGGCAAAAGGTGTAATTAAATACGGCATATATGTGTTTGTGATATTACA
Unaligned ( gi|17 ): TATTTTATTTTAGAATGTCCATTGTACAAAGATTTCAGACTAAGTTATATTAC
Unaligned ( gi|18 ): CCATCGATATGTTTAGCAATTTAATAGTGATAGAAATCAT






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Reference ( family-3710 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATANTTAT-TACTGT-------ACAATTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCGTCATTGACATCTTATGTATGATTGTATTGTAACATGTGTACTGATAGGCC--TTTT--G--GTCTTTT--GTATTGAATAAAGTTATATACAATTCATNATG-TAGTGTATATATGAGCATTTACCG---AAATTGCTGTNTGTCCATTTGAGANTCAAAGNTTATCTTCTTGANNAGAGAATGNATTATTCAAAACACCCTGCTGTTCTACTTTGCGAGGATGCTGATGTTGAAATCATCATTCATTATGCCATGACAGTTACTCTGTACGCCTCATTAGGCTTGGCAATTTGGTTTTAATTAATTTTATCAATTANTAATTTTTTTTCTTATCTTTGTATGGTAGTTGAAGTTATACATAATGTGAACTTTCATGTGTACGCATAATTACTAGACATGCAGGGNATCAGTTATTCAAGTTTTGTTATTATTTTTNAATAACTGTAAACATGAATATTCTTTTATTTCAAATCCNATAGGCCATCTNNCCCTTGAGGGCAACATATTTACATGATGTACACACAGTCGCAAATGACCCNCAAGCACTATAATGCAAACCATATATACGCATTCAAAAAAA--GAAGAGGTAGATATAT-TATAAACATGTTTACACAGAATGTTACGCGTCAGAAAAGAANCACATAACATTTAAATACGTCTAAATATACCTTCTATTCAATAAATTTATTTTACAAATATTAACATGGTTTAAGCTGAGTTTTCGAAAAAGGTATACATAATATGATATTTTAAGTACTTAGTCGCATTTCTATATGCCTAGAAGCAAACGTTTGCATGCAAATCCCTTAATATATATTTATTCACAATTTCTTAACGTCATTTTGAATTATGATGTCACCAGTTCAAAAAATATTAGCATACATGATCTTACCCATTNATATTTGTCGATGTATTTTTCCTCATTTTTTTAAAAAATAAATTCATCGTTTAATTTGATAAATGTTACTCATGATCTTTCATGAAATGGAACACTGACAAATCCGTTTCATCTTCCAATTTCATTTTCAAATACGATGTTAGTTTAAATTCACCGCATATTTATTTATAAAATGGCTCTGAAGGATCCANANATCTTTGATCNCCAGTTCTGATCAAACTTTCTCATNATCTTTGTTTAACAATAGATAAAAACATGTGCGTGTTTCACTTAAAACACACAGAAAAAGAAACAACAAATAGAATCCTATGGATGAGAACGTATTGCGTAACAAGCTTACTCTTTNTTGGCTCTTNTATTTTAAACCAGTAGTTTATTATTCTAAAATATCTACCAACCAATACTGAGCATCATCCTGGCTCACCATGTACGAAAATCATTTTGTGTAGCTCGTTTAATATTGAACAACGTTTAGCAATATGCAATACGAATGGCACAATGAAATCTCCACACTTCATACCCTGATCCAGTAAAGGTAAATATTTTTTTTGTCAAAACGGTCTAGTCCATGCTTGACACTTATGTCTATTCAATAATATATTTATTTAGTTTTNTAATTGCTTTNTTAGATTGACCAGCCAAAGCNATTCGGGGTTCGTTAAATGACCCGACAGAAATAAATACAACACATGTACTTACAAATGGAAAATACGTTATAATTTTTANTTCTTCATATTTAAATGCAAAACGTAGGTTTATCGGTAGACAGTTTGTTTTTCTTTTGAATTTTCAAACAAAGTCTTCAACTTATTTGTCTCACAATAATCTAACAAAATATCCACACCTTTCCATAGCCATTTTCAGTTTCAAAGTGTAGAGATACATTNTCTGCATACAAGAGAAAATATTAAAAAATATATATATATATACTAATGTATAACATTAAAACCTTTAAGTAGCNTCTCTCCCTTAAGATC
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttatttcaattgaaacaaatacatgtattatatgtaagttagattacataatacttctgaATATTCTTTTATTTCAAATCCAATAGGACATCTGGCCCTTGAGGACAATATA---GAACTATATACACCAAATCACAAATAACGCAAAAGCA-GATAAT-C----------TACGAATTCAAATAAA--GGAGAAGTTTATATATAAATAAA-ATATACAAACACAATGTCACACGTCAGAGAAGAAgctaatatcttgcatatcaatttgtatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gAT-TATTGT-------ACGGTTTG------CATTA-TGCATTGAAC----TCGTCGTTGACAT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tagtggtgttatataatacttttgacatacatttcgtgttgaacaaggggactaATATTCCTTTATTTCGAACCCAATAGCCCATCTGGCCATTAAGTACAACATTTATACATACAGTATATACA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agtAACCTTTAAGTAGCATCTCTTCCTTAAGATC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATATTTAT-TACTGT-------ACGATTTG------TATTA-TGCACTGAAC----TCGTCATTGGCATCTTATTTATGATTGTACTGTAACATGTGTATTGATAGGCA--TTTCTAA--GTCTTT----------ATA--GCTATATACAATTCAAAATA-TAGTGTA-ATATGAGCATTTACCG---AAATTGCTGTATGTCCATTTGAGACTCAAAGATTATCTTCTTGATAAGAGAATGCATTATTCAAAACACCCTGCTGTTCTACTTTACGAGGATGCTGATGTTAAAATCATCATTCATTATGCCATGACAGTTACTTTGTACGCCTCATTAGGCTTGGCAATTTGGTTTTAATTAATTTTATCAATTAATA-TTTTTTTTCTTATCTTTGTATGGTAGTTGAAGTTATACATAATGTGAACTTTCATGTGTACGCATAATTACTAGACATGCAGGGGATCAGTTATTTAAGTTTTGTTATTATTTTTAAATAACTGTAAACATGAATATTCTTTTATTTCAAATTCCATAGGCCATCTTTCTCTTGAGGGCAACATATTTACATGATGTACACACAGTCGCAAATGACCCCCAAGCACTATAATGCAAACCATATATACGCATTCAAAAAAAAGGAAGAGGTAGATATAT-TATAAACATGTTTACACAGAATGTTACGCGTCAGAAAAGAAGCACATAACATTTAAATACGTCTAAATATACCTTCTATTCAAT----TTATTT-------------AT--TTTA-----------CAAAAAAGGTATACATAATATGATATTTTAAGTACTTAGTCGCATTTCTATATGCCTAGAAGCAAACGTTTGCATGCAAATCCCTTAATATATATTTATTCACAATTTCTTAACGTCATTTTGAATTATGATGTCACCAATTCAAAAAATATTAGCATACATGATCTTACCCATTTATATTTGTCGATGTATTTTTCCTCATTTTTTTAAAAAATAAATTCATCGTTTAATTTGATAAATGTTACTCATGATCTTTCATGAAATGGAACACTGACAAATCCGTTTCATCTTCCAATTTCATTTTCAAATACGATGTTAGTTTAAATTCACCGCATATTTATTTATAAAATGGCTCTGAAGGATCCACATATCTTTGATCACCAGTTCTGATCAAACTTTCTCATAATCTTTGTTTAACAATAGATAAAAACATGTGCGTGTTTCACTTAAAACACACAGAAAAAGAAACAACAAATAGAATCCTATGGATGAGAACGTATTGCGTAACAAGCTTACTCTTTTTTGGCTCTTATATTTTAAACCAGTAGTTTATTATTCTAAAATATCTACCAACCAATACTGAGCATCATCCTAGCTCACCATGTACGAAAATCATTTTGTGTAGCTCGTTTAATATTGAACAACGTTTAGCAATATGCAATACGAATGGCACAATGAAATCTCCACACTTCATAC------CCAGTAAAGGTAAATATTTTTTTTGTCAAAACGGTCTAGTCCATGCTTGACACTTATGTCTATTCAATAATATATTTATTTAGTTTTTTAATTGCTTTATTAGATTGACCAGCCAAAGCTATTCGGGGTTCGTTAAATGACCCGACAGAAATAAATACAACACATGTACTTACAAATGGAAAATACGTTATAATTTTTAATTCTTCATATTTAAATGCAAAACGTAGGTTTATCGGTAGACAGTTTGTTTTTCTTTTGAATTTTCAAACAAAGTCTTCAACTTATTTGTCTCACAATAATCTAACAAAATATCCACACCTTTCCATAGCCATTTTCAGTTTCAAAGTGTAGAGATACATTGTCTGCATACAAGAGAAAATATTAAAAAATATATATATATATACTAATGTATAACATTAat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATAATTAT-TACTGT-------ACACTTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCGTCATTGACATCTTATGTATGATTGTATAGTAACATGTGTACTAATAGGCC--TTTT--C--TTTTTTTTAGTATTGAATAAAGTT
gi|4                          : ttgtaataattattagaagttaaaattagaatacaaactaaccatattatatggggaaataggaagaactccaaatacgaattatagatggtaaccttttgtttatatttgtttaaggtgttacactgtgatgaaattaaatatgccatataattttataacatgatgcttgcagacatggaaaaaattccaattaaaaactgttgggcttcatcagtttcatcaatattagaaaacttagggtttaataatctttggttgttccgatgagttggtgacgttaatatgttccttaatacttttaaataaatactaacagataattttattcagaaatgtaatgaaaatattcaaaactctaccagagcaaacgatttaaaattaatttcaaattttaatttcaaaacctatttgaacgagattgggataaaatatttatatatgcattgactagatttagagtgtcctcacatagacttgaagctggaagctggcacaaacctaatataataccagtagaagatgtcaaatatgtaatgttttagaaggtgaatttcattctattttggaatgtccattgtacaaagatttcagactaaggtataatagaaaatactactgaaaaagacccaatatgctgaaatttgttgaactattacaatcacgacatacacaaactgtaacacatattgctacatacacttataaaagctttgagaaacattatataataaataattgaatattctacttagattgataattgatcggtataacaaatgataaattgatatttgattgtgtgcaaatataattataatatttgataatggtggcgaaaggagttattaaattagtacagatatgtgtaagtgatattacatgatacttttgacatcatttttgtgttgagaaatgtggAATAATCAT-TACTGT-------TCACTTTG------TATTA-TGTATTAAAC----TCGTTATTGATATTTTATGTATGATTGTATTGTAACATAAGTACTGATAGACC--TTTT--G--GTATTTT--GTATTGAATCAAATTAT------TTCTTTGTGCTAATGTATATATCAGAGTTTA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atttccctttagtctagaatgcgcatttgacaaatatttcagacttagctttattagaaaatacttctggaaaagaccaaatatgctgaaatttattgaattattacaatcacgacatacacaatttgtacaacatcttgctaaatacctatataaaaactttgagaaaagaaacgaaacattatataatagataatcgaatattcttcttcaattgataaaagatataacaaaggataaattaatatttgattgtatgcaagtatgattataatatttgataaatgtggcgaaaggagttattaaattagttcagatatgtgttagtgatattacacgatacttttgacattatttttctgttaagtaaagtgaTATTTAT-TACTGT-------ACACTTTA------TATTA-TGTATTGAAC----TCGCCATTGCTATCTTATGTATGATTGTATTGTACCATGTATACTGATAGGCA--TTTT--A--GTATCTT--GTATTG-ATGAAGTTCTATAC-ATGTATCATG-TAATGTAT---TGA--AGTTACCGTCCAAATttttacatcattctgtagctgtaattttttagtcccaatcgacttaatctaatttcga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatacctttgtaatgtctgtatcatagtgaaacgatacactgtatattagacaatggaatattcttcttcaattgataactgataggtataacaaatgatatattgatatctgattgtgtgcaaatattattattatatttgataatgcaggcgagataatttattagattgatacagatatgtgttagtgacattacatgatacattttgacattttttttgttttgagaaaagtggatAATAATTAT-TACTGT-------ACAATTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCATTCTTGACATCGTATAAATGCTTTTCTTGCAACATCGGTACTGATAGGGC--TTTT--G--GTCTTTT--GTATTGAATAAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttaaaatagttcaattaaagtatagttcacgacatacaaaaactgtaaaacatcttgctacatatctgcataaaagctttgagaaaaacaaagtgaatattatataacagataatctaacattcttcttaaatttatatttgatagaggtataagtaatgatgacagatatattaatattcaattgtgtacaatgtgttagttatattacatgataattttgacattattttgtgttagaaatggAATAATTAT-TACTGT-------ACAATTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCATTCTTGACATCGTATAAATGCTTTTCTTGCAACATCGGTACTGATAGGGC--TTTT--G--GTCTTTT--GTATTGAATAAAagt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttaaaatagttcaattaaagtatagttcacgacatacaaaaactgtaaaacatcttgctacatatctgcataaaagctttgagaaaaacaaagtgaatattatataacagataatctaacattcttcttaaatttatatttgatagaggtataagtaatgatgacagatatattaatattcaattgtgtacaatgtgttagttatattacatgataattttgacattattttgtgttagaaatggAATAATTAAATACTGT-------ACACTTTG------TATTA-TGTAATGAAC----TCGTCATTGACATTTTATGCATGACTGTATTGTAAC--GTGTACTGGTAGGCCTTTTTT--G--GTTCTTT--GTATTGAATAAAagt
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): GATCAATGTCAAAACTTAGGTTTTAATCATGTTTGGTTGTTCTAAGGAGTTGGTAATGTTACTTTGTTCCTTGATACTTCAAACAAAGACTAACGGATACATTTATTCAGTACTGCTATTAACATATTCAAAACTCTACCGGAGCAAACATTTATTTATTGATATAAAATTGTAATTTCAAGACATATTTGGGCGAGTTTAGGATAAACATGTTTATATATGCATTTACTAGATTAAGAATGAAATTGAAGCTGGAAGATGTCGCAAACCTAATAGAATACCAGTAGAAAATAGAATGATGTCAAATATGTAATGTTTTGGAAGATGAATTTATTTTTATTTAAGAATGTCAATTAAACAAAGATCTGAGACTAAGCTGTATTACAAATACTTCTGGAAAAGATCCGATATGATGAAATTGATTGAATTATTACAATCATGCCATACAGACAACTGTAACACATCTTACTACATGCATAATTATATAAAAACTTTGAGAAAAGAAACGAACATTATATAAAAGAT
Unaligned ( gi|10 ): CTAATATAATACCAGTAGAAGATAGAACATGTCAAATATATCACGTTTTATTTTAAAATGTCCATTTCACAAAGATTTCAGACTATGCTGTATTTTAAATCACAACTAGAAAATTTATTGAAATATTACAATTATGACATGTGAAAACCGAAAAGCATCCCTTTACATATATATAATTTTGACAACAGAAACGTACCGTTATATGACAGATTGTCGAATCGTCGTTTTCAATTGGTGTCTGATTTATTAGATATAACGAATTATAAATTAATTCTTTCATTGTGTACAAATATCATTATAACATTTGATAATAGTGGCGAAAGGAACAT
Unaligned ( gi|13 ): CTTTTGTAAAACTTCTGTGATTGCAAAGAGAAAAGAAGCGAAGCATCACATAAAATACAATCGAACCTTCTTCTTAACTTGATATTCGTTAGGTATAATTATTGATAAATTGATATTTGACTGTGTAGAACTATTATTATAACATTTGATAACGGTGGCAAAAGGTGTAATTAAATACGGCATATATGTGTTTGTGATATTACA
Unaligned ( gi|17 ): TATTTTATTTTAGAATGTCCATTGTACAAAGATTTCAGACTAAGTTATATTAC
Unaligned ( gi|18 ): CCATCGATATGTTTAGCAATTTAATAGTGATAGAAATCAT






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Reference ( family-3710 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATANTTAT-TACTGT-------ACAATTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCGTCATTGACATCTTATGTATGATTGTATTGTAACATGTGTACTGATAGGCC--TTTT--G--GTCTTTT--GTATTGAATAAAGTTATATACAATTCATNATG-TAGTGTATATATGAGCATTTACCG---AAATTGCTGTNTGTCCATTTGAGANTCAAAGNTTATCTTCTTGANNAGAGAATGNATTATTCAAAACACCCTGCTGTTCTACTTTGCGAGGATGCTGATGTTGAAATCATCATTCATTATGCCATGACAGTTACTCTGTACGCCTCATTAGGCTTGGCAATTTGGTTTTAATTAATTTTATCAATTANTAATTTTTTTTCTTATCTTTGTATGGTAGTTGAAGTTATACATAATGTGAACTTTCATGTGTACGCATAATTACTAGACATGCAGGGNATCAGTTATTCAAGTTTTGTTATTATTTTTNAATAACTGTAAACATGAATATTCTTTTATTTCAAATCCNATAGGCCATCTNNCCCTTGAGGGCAACATATTTACATGATGTACACACAGTCGCAAATGACCCNCAAGCACTATAATGCAAACCATATATACGCATTCAAAAAAA--GAAGAGGTAGATATAT-TATAAACATGTTTACACAGAATGTTACGCGTCAGAAAAGAANCACATAACATTTAAATACGTCTAAATATACCTTCTATTCAATAAATTTATTTTACAAATATTAACATGGTTTAAGCTGAGTTTTCGAAAAAGGTATACATAATATGATATTTTAAGTACTTAGTCGCATTTCTATATGCCTAGAAGCAAACGTTTGCATGCAAATCCCTTAATATATATTTATTCACAATTTCTTAACGTCATTTTGAATTATGATGTCACCAGTTCAAAAAATATTAGCATACATGATCTTACCCATTNATATTTGTCGATGTATTTTTCCTCATTTTTTTAAAAAATAAATTCATCGTTTAATTTGATAAATGTTACTCATGATCTTTCATGAAATGGAACACTGACAAATCCGTTTCATCTTCCAATTTCATTTTCAAATACGATGTTAGTTTAAATTCACCGCATATTTATTTATAAAATGGCTCTGAAGGATCCANANATCTTTGATCNCCAGTTCTGATCAAACTTTCTCATNATCTTTGTTTAACAATAGATAAAAACATGTGCGTGTTTCACTTAAAACACACAGAAAAAGAAACAACAAATAGAATCCTATGGATGAGAACGTATTGCGTAACAAGCTTACTCTTTNTTGGCTCTTNTATTTTAAACCAGTAGTTTATTATTCTAAAATATCTACCAACCAATACTGAGCATCATCCTGGCTCACCATGTACGAAAATCATTTTGTGTAGCTCGTTTAATATTGAACAACGTTTAGCAATATGCAATACGAATGGCACAATGAAATCTCCACACTTCATACCCTGATCCAGTAAAGGTAAATATTTTTTTTGTCAAAACGGTCTAGTCCATGCTTGACACTTATGTCTATTCAATAATATATTTATTTAGTTTTNTAATTGCTTTNTTAGATTGACCAGCCAAAGCNATTCGGGGTTCGTTAAATGACCCGACAGAAATAAATACAACACATGTACTTACAAATGGAAAATACGTTATAATTTTTANTTCTTCATATTTAAATGCAAAACGTAGGTTTATCGGTAGACAGTTTGTTTTTCTTTTGAATTTTCAAACAAAGTCTTCAACTTATTTGTCTCACAATAATCTAACAAAATATCCACACCTTTCCATAGCCATTTTCAGTTTCAAAGTGTAGAGATACATTNTCTGCATACAAGAGAAAATATTAAAAAATATATATATATATACTAATGTATAACATTAAAACCTTTAAGTAGCNTCTCTCCCTTAAGATC
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttatttcaattgaaacaaatacatgtattatatgtaagttagattacataatacttctgaATATTCTTTTATTTCAAATCCAATAGGACATCTGGCCCTTGAGGACAATATA---GAACTATATACACCAAATCACAAATAACGCAAAAGCA-GATAAT-C----------TACGAATTCAAATAAA--GGAGAAGTTTATATATAAATAAA-ATATACAAACACAATGTCACACGTCAGAGAAGAAgctaatatcttgcatatcaatttgtatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gAT-TATTGT-------ACGGTTTG------CATTA-TGCATTGAAC----TCGTCGTTGACAT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tagtggtgttatataatacttttgacatacatttcgtgttgaacaaggggactaATATTCCTTTATTTCGAACCCAATAGCCCATCTGGCCATTAAGTACAACATTTATACATACAGTATATACA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agtAACCTTTAAGTAGCATCTCTTCCTTAAGATC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATATTTAT-TACTGT-------ACGATTTG------TATTA-TGCACTGAAC----TCGTCATTGGCATCTTATTTATGATTGTACTGTAACATGTGTATTGATAGGCA--TTTCTAA--GTCTTT----------ATA--GCTATATACAATTCAAAATA-TAGTGTA-ATATGAGCATTTACCG---AAATTGCTGTATGTCCATTTGAGACTCAAAGATTATCTTCTTGATAAGAGAATGCATTATTCAAAACACCCTGCTGTTCTACTTTACGAGGATGCTGATGTTAAAATCATCATTCATTATGCCATGACAGTTACTTTGTACGCCTCATTAGGCTTGGCAATTTGGTTTTAATTAATTTTATCAATTAATA-TTTTTTTTCTTATCTTTGTATGGTAGTTGAAGTTATACATAATGTGAACTTTCATGTGTACGCATAATTACTAGACATGCAGGGGATCAGTTATTTAAGTTTTGTTATTATTTTTAAATAACTGTAAACATGAATATTCTTTTATTTCAAATTCCATAGGCCATCTTTCTCTTGAGGGCAACATATTTACATGATGTACACACAGTCGCAAATGACCCCCAAGCACTATAATGCAAACCATATATACGCATTCAAAAAAAAGGAAGAGGTAGATATAT-TATAAACATGTTTACACAGAATGTTACGCGTCAGAAAAGAAGCACATAACATTTAAATACGTCTAAATATACCTTCTATTCAAT----TTATTT-------------AT--TTTA-----------CAAAAAAGGTATACATAATATGATATTTTAAGTACTTAGTCGCATTTCTATATGCCTAGAAGCAAACGTTTGCATGCAAATCCCTTAATATATATTTATTCACAATTTCTTAACGTCATTTTGAATTATGATGTCACCAATTCAAAAAATATTAGCATACATGATCTTACCCATTTATATTTGTCGATGTATTTTTCCTCATTTTTTTAAAAAATAAATTCATCGTTTAATTTGATAAATGTTACTCATGATCTTTCATGAAATGGAACACTGACAAATCCGTTTCATCTTCCAATTTCATTTTCAAATACGATGTTAGTTTAAATTCACCGCATATTTATTTATAAAATGGCTCTGAAGGATCCACATATCTTTGATCACCAGTTCTGATCAAACTTTCTCATAATCTTTGTTTAACAATAGATAAAAACATGTGCGTGTTTCACTTAAAACACACAGAAAAAGAAACAACAAATAGAATCCTATGGATGAGAACGTATTGCGTAACAAGCTTACTCTTTTTTGGCTCTTATATTTTAAACCAGTAGTTTATTATTCTAAAATATCTACCAACCAATACTGAGCATCATCCTAGCTCACCATGTACGAAAATCATTTTGTGTAGCTCGTTTAATATTGAACAACGTTTAGCAATATGCAATACGAATGGCACAATGAAATCTCCACACTTCATAC------CCAGTAAAGGTAAATATTTTTTTTGTCAAAACGGTCTAGTCCATGCTTGACACTTATGTCTATTCAATAATATATTTATTTAGTTTTTTAATTGCTTTATTAGATTGACCAGCCAAAGCTATTCGGGGTTCGTTAAATGACCCGACAGAAATAAATACAACACATGTACTTACAAATGGAAAATACGTTATAATTTTTAATTCTTCATATTTAAATGCAAAACGTAGGTTTATCGGTAGACAGTTTGTTTTTCTTTTGAATTTTCAAACAAAGTCTTCAACTTATTTGTCTCACAATAATCTAACAAAATATCCACACCTTTCCATAGCCATTTTCAGTTTCAAAGTGTAGAGATACATTGTCTGCATACAAGAGAAAATATTAAAAAATATATATATATATACTAATGTATAACATTAat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATAATTAT-TACTGT-------ACACTTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCGTCATTGACATCTTATGTATGATTGTATAGTAACATGTGTACTAATAGGCC--TTTT--C--TTTTTTTTAGTATTGAATAAAGTT
gi|4                          : ttgtaataattattagaagttaaaattagaatacaaactaaccatattatatggggaaataggaagaactccaaatacgaattatagatggtaaccttttgtttatatttgtttaaggtgttacactgtgatgaaattaaatatgccatataattttataacatgatgcttgcagacatggaaaaaattccaattaaaaactgttgggcttcatcagtttcatcaatattagaaaacttagggtttaataatctttggttgttccgatgagttggtgacgttaatatgttccttaatacttttaaataaatactaacagataattttattcagaaatgtaatgaaaatattcaaaactctaccagagcaaacgatttaaaattaatttcaaattttaatttcaaaacctatttgaacgagattgggataaaatatttatatatgcattgactagatttagagtgtcctcacatagacttgaagctggaagctggcacaaacctaatataataccagtagaagatgtcaaatatgtaatgttttagaaggtgaatttcattctattttggaatgtccattgtacaaagatttcagactaaggtataatagaaaatactactgaaaaagacccaatatgctgaaatttgttgaactattacaatcacgacatacacaaactgtaacacatattgctacatacacttataaaagctttgagaaacattatataataaataattgaatattctacttagattgataattgatcggtataacaaatgataaattgatatttgattgtgtgcaaatataattataatatttgataatggtggcgaaaggagttattaaattagtacagatatgtgtaagtgatattacatgatacttttgacatcatttttgtgttgagaaatgtggAATAATCAT-TACTGT-------TCACTTTG------TATTA-TGTATTAAAC----TCGTTATTGATATTTTATGTATGATTGTATTGTAACATAAGTACTGATAGACC--TTTT--G--GTATTTT--GTATTGAATCAAATTAT------TTCTTTGTGCTAATGTATATATCAGAGTTTA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atttccctttagtctagaatgcgcatttgacaaatatttcagacttagctttattagaaaatacttctggaaaagaccaaatatgctgaaatttattgaattattacaatcacgacatacacaatttgtacaacatcttgctaaatacctatataaaaactttgagaaaagaaacgaaacattatataatagataatcgaatattcttcttcaattgataaaagatataacaaaggataaattaatatttgattgtatgcaagtatgattataatatttgataaatgtggcgaaaggagttattaaattagttcagatatgtgttagtgatattacacgatacttttgacattatttttctgttaagtaaagtgaTATTTAT-TACTGT-------ACACTTTA------TATTA-TGTATTGAAC----TCGCCATTGCTATCTTATGTATGATTGTATTGTACCATGTATACTGATAGGCA--TTTT--A--GTATCTT--GTATTG-ATGAAGTTCTATAC-ATGTATCATG-TAATGTAT---TGA--AGTTACCGTCCAAATttttacatcattctgtagctgtaattttttagtcccaatcgacttaatctaatttcga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatacctttgtaatgtctgtatcatagtgaaacgatacactgtatattagacaatggaatattcttcttcaattgataactgataggtataacaaatgatatattgatatctgattgtgtgcaaatattattattatatttgataatgcaggcgagataatttattagattgatacagatatgtgttagtgacattacatgatacattttgacattttttttgttttgagaaaagtggatAATAATTAT-TACTGT-------ACAATTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCATTCTTGACATCGTATAAATGCTTTTCTTGCAACATCGGTACTGATAGGGC--TTTT--G--GTCTTTT--GTATTGAATAAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttaaaatagttcaattaaagtatagttcacgacatacaaaaactgtaaaacatcttgctacatatctgcataaaagctttgagaaaaacaaagtgaatattatataacagataatctaacattcttcttaaatttatatttgatagaggtataagtaatgatgacagatatattaatattcaattgtgtacaatgtgttagttatattacatgataattttgacattattttgtgttagaaatggAATAATTAT-TACTGT-------ACAATTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCATTCTTGACATCGTATAAATGCTTTTCTTGCAACATCGGTACTGATAGGGC--TTTT--G--GTCTTTT--GTATTGAATAAAagt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttaaaatagttcaattaaagtatagttcacgacatacaaaaactgtaaaacatcttgctacatatctgcataaaagctttgagaaaaacaaagtgaatattatataacagataatctaacattcttcttaaatttatatttgatagaggtataagtaatgatgacagatatattaatattcaattgtgtacaatgtgttagttatattacatgataattttgacattattttgtgttagaaatggAATAATTAAATACTGT-------ACACTTTG------TATTA-TGTAATGAAC----TCGTCATTGACATTTTATGCATGACTGTATTGTAAC--GTGTACTGGTAGGCCTTTTTT--G--GTTCTTT--GTATTGAATAAAagt


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Unaligned ( gi|13 ): CTTTTGTAAAACTTCTGTGATTGCAAAGAGAAAAGAAGCGAAGCATCACATAAAATACAATCGAACCTTCTTCTTAACTTGATATTCGTTAGGTATAATTATTGATAAATTGATATTTGACTGTGTAGAACTATTATTATAACATTTGATAACGGTGGCAAAAGGTGTAATTAAATACGGCATATATGTGTTTGTGATATTACA
Unaligned ( gi|17 ): TATTTTATTTTAGAATGTCCATTGTACAAAGATTTCAGACTAAGTTATATTAC
Unaligned ( gi|18 ): CCATCGATATGTTTAGCAATTTAATAGTGATAGAAATCAT






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Reference ( family-3710 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATANTTAT-TACTGT-------ACAATTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCGTCATTGACATCTTATGTATGATTGTATTGTAACATGTGTACTGATAGGCC--TTTT--G--GTCTTTT--GTATTGAATAAAGTTATATACAATTCATNATG-TAGTGTATATATGAGCATTTACCG---AAATTGCTGTNTGTCCATTTGAGANTCAAAGNTTATCTTCTTGANNAGAGAATGNATTATTCAAAACACCCTGCTGTTCTACTTTGCGAGGATGCTGATGTTGAAATCATCATTCATTATGCCATGACAGTTACTCTGTACGCCTCATTAGGCTTGGCAATTTGGTTTTAATTAATTTTATCAATTANTAATTTTTTTTCTTATCTTTGTATGGTAGTTGAAGTTATACATAATGTGAACTTTCATGTGTACGCATAATTACTAGACATGCAGGGNATCAGTTATTCAAGTTTTGTTATTATTTTTNAATAACTGTAAACATGAATATTCTTTTATTTCAAATCCNATAGGCCATCTNNCCCTTGAGGGCAACATATTTACATGATGTACACACAGTCGCAAATGACCCNCAAGCACTATAATGCAAACCATATATACGCATTCAAAAAAA--GAAGAGGTAGATATAT-TATAAACATGTTTACACAGAATGTTACGCGTCAGAAAAGAANCACATAACATTTAAATACGTCTAAATATACCTTCTATTCAATAAATTTATTTTACAAATATTAACATGGTTTAAGCTGAGTTTTCGAAAAAGGTATACATAATATGATATTTTAAGTACTTAGTCGCATTTCTATATGCCTAGAAGCAAACGTTTGCATGCAAATCCCTTAATATATATTTATTCACAATTTCTTAACGTCATTTTGAATTATGATGTCACCAGTTCAAAAAATATTAGCATACATGATCTTACCCATTNATATTTGTCGATGTATTTTTCCTCATTTTTTTAAAAAATAAATTCATCGTTTAATTTGATAAATGTTACTCATGATCTTTCATGAAATGGAACACTGACAAATCCGTTTCATCTTCCAATTTCATTTTCAAATACGATGTTAGTTTAAATTCACCGCATATTTATTTATAAAATGGCTCTGAAGGATCCANANATCTTTGATCNCCAGTTCTGATCAAACTTTCTCATNATCTTTGTTTAACAATAGATAAAAACATGTGCGTGTTTCACTTAAAACACACAGAAAAAGAAACAACAAATAGAATCCTATGGATGAGAACGTATTGCGTAACAAGCTTACTCTTTNTTGGCTCTTNTATTTTAAACCAGTAGTTTATTATTCTAAAATATCTACCAACCAATACTGAGCATCATCCTGGCTCACCATGTACGAAAATCATTTTGTGTAGCTCGTTTAATATTGAACAACGTTTAGCAATATGCAATACGAATGGCACAATGAAATCTCCACACTTCATACCCTGATCCAGTAAAGGTAAATATTTTTTTTGTCAAAACGGTCTAGTCCATGCTTGACACTTATGTCTATTCAATAATATATTTATTTAGTTTTNTAATTGCTTTNTTAGATTGACCAGCCAAAGCNATTCGGGGTTCGTTAAATGACCCGACAGAAATAAATACAACACATGTACTTACAAATGGAAAATACGTTATAATTTTTANTTCTTCATATTTAAATGCAAAACGTAGGTTTATCGGTAGACAGTTTGTTTTTCTTTTGAATTTTCAAACAAAGTCTTCAACTTATTTGTCTCACAATAATCTAACAAAATATCCACACCTTTCCATAGCCATTTTCAGTTTCAAAGTGTAGAGATACATTNTCTGCATACAAGAGAAAATATTAAAAAATATATATATATATACTAATGTATAACATTAAAACCTTTAAGTAGCNTCTCTCCCTTAAGATC
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttatttcaattgaaacaaatacatgtattatatgtaagttagattacataatacttctgaATATTCTTTTATTTCAAATCCAATAGGACATCTGGCCCTTGAGGACAATATA---GAACTATATACACCAAATCACAAATAACGCAAAAGCA-GATAAT-C----------TACGAATTCAAATAAA--GGAGAAGTTTATATATAAATAAA-ATATACAAACACAATGTCACACGTCAGAGAAGAAgctaatatcttgcatatcaatttgtatt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gAT-TATTGT-------ACGGTTTG------CATTA-TGCATTGAAC----TCGTCGTTGACAT
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tagtggtgttatataatacttttgacatacatttcgtgttgaacaaggggactaATATTCCTTTATTTCGAACCCAATAGCCCATCTGGCCATTAAGTACAACATTTATACATACAGTATATACA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           agtAACCTTTAAGTAGCATCTCTTCCTTAAGATC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATATTTAT-TACTGT-------ACGATTTG------TATTA-TGCACTGAAC----TCGTCATTGGCATCTTATTTATGATTGTACTGTAACATGTGTATTGATAGGCA--TTTCTAA--GTCTTT----------ATA--GCTATATACAATTCAAAATA-TAGTGTA-ATATGAGCATTTACCG---AAATTGCTGTATGTCCATTTGAGACTCAAAGATTATCTTCTTGATAAGAGAATGCATTATTCAAAACACCCTGCTGTTCTACTTTACGAGGATGCTGATGTTAAAATCATCATTCATTATGCCATGACAGTTACTTTGTACGCCTCATTAGGCTTGGCAATTTGGTTTTAATTAATTTTATCAATTAATA-TTTTTTTTCTTATCTTTGTATGGTAGTTGAAGTTATACATAATGTGAACTTTCATGTGTACGCATAATTACTAGACATGCAGGGGATCAGTTATTTAAGTTTTGTTATTATTTTTAAATAACTGTAAACATGAATATTCTTTTATTTCAAATTCCATAGGCCATCTTTCTCTTGAGGGCAACATATTTACATGATGTACACACAGTCGCAAATGACCCCCAAGCACTATAATGCAAACCATATATACGCATTCAAAAAAAAGGAAGAGGTAGATATAT-TATAAACATGTTTACACAGAATGTTACGCGTCAGAAAAGAAGCACATAACATTTAAATACGTCTAAATATACCTTCTATTCAAT----TTATTT-------------AT--TTTA-----------CAAAAAAGGTATACATAATATGATATTTTAAGTACTTAGTCGCATTTCTATATGCCTAGAAGCAAACGTTTGCATGCAAATCCCTTAATATATATTTATTCACAATTTCTTAACGTCATTTTGAATTATGATGTCACCAATTCAAAAAATATTAGCATACATGATCTTACCCATTTATATTTGTCGATGTATTTTTCCTCATTTTTTTAAAAAATAAATTCATCGTTTAATTTGATAAATGTTACTCATGATCTTTCATGAAATGGAACACTGACAAATCCGTTTCATCTTCCAATTTCATTTTCAAATACGATGTTAGTTTAAATTCACCGCATATTTATTTATAAAATGGCTCTGAAGGATCCACATATCTTTGATCACCAGTTCTGATCAAACTTTCTCATAATCTTTGTTTAACAATAGATAAAAACATGTGCGTGTTTCACTTAAAACACACAGAAAAAGAAACAACAAATAGAATCCTATGGATGAGAACGTATTGCGTAACAAGCTTACTCTTTTTTGGCTCTTATATTTTAAACCAGTAGTTTATTATTCTAAAATATCTACCAACCAATACTGAGCATCATCCTAGCTCACCATGTACGAAAATCATTTTGTGTAGCTCGTTTAATATTGAACAACGTTTAGCAATATGCAATACGAATGGCACAATGAAATCTCCACACTTCATAC------CCAGTAAAGGTAAATATTTTTTTTGTCAAAACGGTCTAGTCCATGCTTGACACTTATGTCTATTCAATAATATATTTATTTAGTTTTTTAATTGCTTTATTAGATTGACCAGCCAAAGCTATTCGGGGTTCGTTAAATGACCCGACAGAAATAAATACAACACATGTACTTACAAATGGAAAATACGTTATAATTTTTAATTCTTCATATTTAAATGCAAAACGTAGGTTTATCGGTAGACAGTTTGTTTTTCTTTTGAATTTTCAAACAAAGTCTTCAACTTATTTGTCTCACAATAATCTAACAAAATATCCACACCTTTCCATAGCCATTTTCAGTTTCAAAGTGTAGAGATACATTGTCTGCATACAAGAGAAAATATTAAAAAATATATATATATATACTAATGTATAACATTAat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATAATTAT-TACTGT-------ACACTTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCGTCATTGACATCTTATGTATGATTGTATAGTAACATGTGTACTAATAGGCC--TTTT--C--TTTTTTTTAGTATTGAATAAAGTT
gi|4                          : ttgtaataattattagaagttaaaattagaatacaaactaaccatattatatggggaaataggaagaactccaaatacgaattatagatggtaaccttttgtttatatttgtttaaggtgttacactgtgatgaaattaaatatgccatataattttataacatgatgcttgcagacatggaaaaaattccaattaaaaactgttgggcttcatcagtttcatcaatattagaaaacttagggtttaataatctttggttgttccgatgagttggtgacgttaatatgttccttaatacttttaaataaatactaacagataattttattcagaaatgtaatgaaaatattcaaaactctaccagagcaaacgatttaaaattaatttcaaattttaatttcaaaacctatttgaacgagattgggataaaatatttatatatgcattgactagatttagagtgtcctcacatagacttgaagctggaagctggcacaaacctaatataataccagtagaagatgtcaaatatgtaatgttttagaaggtgaatttcattctattttggaatgtccattgtacaaagatttcagactaaggtataatagaaaatactactgaaaaagacccaatatgctgaaatttgttgaactattacaatcacgacatacacaaactgtaacacatattgctacatacacttataaaagctttgagaaacattatataataaataattgaatattctacttagattgataattgatcggtataacaaatgataaattgatatttgattgtgtgcaaatataattataatatttgataatggtggcgaaaggagttattaaattagtacagatatgtgtaagtgatattacatgatacttttgacatcatttttgtgttgagaaatgtggAATAATCAT-TACTGT-------TCACTTTG------TATTA-TGTATTAAAC----TCGTTATTGATATTTTATGTATGATTGTATTGTAACATAAGTACTGATAGACC--TTTT--G--GTATTTT--GTATTGAATCAAATTAT------TTCTTTGTGCTAATGTATATATCAGAGTTTA
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atttccctttagtctagaatgcgcatttgacaaatatttcagacttagctttattagaaaatacttctggaaaagaccaaatatgctgaaatttattgaattattacaatcacgacatacacaatttgtacaacatcttgctaaatacctatataaaaactttgagaaaagaaacgaaacattatataatagataatcgaatattcttcttcaattgataaaagatataacaaaggataaattaatatttgattgtatgcaagtatgattataatatttgataaatgtggcgaaaggagttattaaattagttcagatatgtgttagtgatattacacgatacttttgacattatttttctgttaagtaaagtgaTATTTAT-TACTGT-------ACACTTTA------TATTA-TGTATTGAAC----TCGCCATTGCTATCTTATGTATGATTGTATTGTACCATGTATACTGATAGGCA--TTTT--A--GTATCTT--GTATTG-ATGAAGTTCTATAC-ATGTATCATG-TAATGTAT---TGA--AGTTACCGTCCAAATttttacatcattctgtagctgtaattttttagtcccaatcgacttaatctaatttcga
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatacctttgtaatgtctgtatcatagtgaaacgatacactgtatattagacaatggaatattcttcttcaattgataactgataggtataacaaatgatatattgatatctgattgtgtgcaaatattattattatatttgataatgcaggcgagataatttattagattgatacagatatgtgttagtgacattacatgatacattttgacattttttttgttttgagaaaagtggatAATAATTAT-TACTGT-------ACAATTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCATTCTTGACATCGTATAAATGCTTTTCTTGCAACATCGGTACTGATAGGGC--TTTT--G--GTCTTTT--GTATTGAATAAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttaaaatagttcaattaaagtatagttcacgacatacaaaaactgtaaaacatcttgctacatatctgcataaaagctttgagaaaaacaaagtgaatattatataacagataatctaacattcttcttaaatttatatttgatagaggtataagtaatgatgacagatatattaatattcaattgtgtacaatgtgttagttatattacatgataattttgacattattttgtgttagaaatggAATAATTAT-TACTGT-------ACAATTTG------TATTA-TGTATTGAAC----TCATTCTTGACATCGTATAAATGCTTTTCTTGCAACATCGGTACTGATAGGGC--TTTT--G--GTCTTTT--GTATTGAATAAAagt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttaaaatagttcaattaaagtatagttcacgacatacaaaaactgtaaaacatcttgctacatatctgcataaaagctttgagaaaaacaaagtgaatattatataacagataatctaacattcttcttaaatttatatttgatagaggtataagtaatgatgacagatatattaatattcaattgtgtacaatgtgttagttatattacatgataattttgacattattttgtgttagaaatggAATAATTAAATACTGT-------ACACTTTG------TATTA-TGTAATGAAC----TCGTCATTGACATTTTATGCATGACTGTATTGTAAC--GTGTACTGGTAGGCCTTTTTT--G--GTTCTTT--GTATTGAATAAAagt
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): GATCAATGTCAAAACTTAGGTTTTAATCATGTTTGGTTGTTCTAAGGAGTTGGTAATGTTACTTTGTTCCTTGATACTTCAAACAAAGACTAACGGATACATTTATTCAGTACTGCTATTAACATATTCAAAACTCTACCGGAGCAAACATTTATTTATTGATATAAAATTGTAATTTCAAGACATATTTGGGCGAGTTTAGGATAAACATGTTTATATATGCATTTACTAGATTAAGAATGAAATTGAAGCTGGAAGATGTCGCAAACCTAATAGAATACCAGTAGAAAATAGAATGATGTCAAATATGTAATGTTTTGGAAGATGAATTTATTTTTATTTAAGAATGTCAATTAAACAAAGATCTGAGACTAAGCTGTATTACAAATACTTCTGGAAAAGATCCGATATGATGAAATTGATTGAATTATTACAATCATGCCATACAGACAACTGTAACACATCTTACTACATGCATAATTATATAAAAACTTTGAGAAAAGAAACGAACATTATATAAAAGAT
Unaligned ( gi|10 ): CTAATATAATACCAGTAGAAGATAGAACATGTCAAATATATCACGTTTTATTTTAAAATGTCCATTTCACAAAGATTTCAGACTATGCTGTATTTTAAATCACAACTAGAAAATTTATTGAAATATTACAATTATGACATGTGAAAACCGAAAAGCATCCCTTTACATATATATAATTTTGACAACAGAAACGTACCGTTATATGACAGATTGTCGAATCGTCGTTTTCAATTGGTGTCTGATTTATTAGATATAACGAATTATAAATTAATTCTTTCATTGTGTACAAATATCATTATAACATTTGATAATAGTGGCGAAAGGAACAT
Unaligned ( gi|13 ): CTTTTGTAAAACTTCTGTGATTGCAAAGAGAAAAGAAGCGAAGCATCACATAAAATACAATCGAACCTTCTTCTTAACTTGATATTCGTTAGGTATAATTATTGATAAATTGATATTTGACTGTGTAGAACTATTATTATAACATTTGATAACGGTGGCAAAAGGTGTAATTAAATACGGCATATATGTGTTTGTGATATTACA
Unaligned ( gi|17 ): TATTTTATTTTAGAATGTCCATTGTACAAAGATTTCAGACTAAGTTATATTAC
Unaligned ( gi|18 ): CCATCGATATGTTTAGCAATTTAATAGTGATAGAAATCAT