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Alignments
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gi|5 : tcattgcccctctgttgacatatttgttcccaacaagcatttttttaaatctggaaacaaataaaagtcactgggagcaaggtcaggactgtagggaggatagtgtagagtttcccgcgtgtaggtcttcaacaagtcctttgttttggtggcggtatgtgctggggcattatcgtgctgaagaacaacattcttcattctgagtctaggcctcagtttacacaaatttgcttttaattttggtaaaactacatcagaataataatttgcagtaactgtgcaaccttttggaacataatgtgtcaatacaacgcctttataatcccagaaaatgatggccataacttttccagcagaaggtgactgtttgaatttctttggggatgaaaaaccagttcatacccattgcttggactgcaccttggattcagactgagagtgatgaatccatgtctcatatcctgtcacaatatggtgcagatctccatctccctgtctcatgacgagccagaaggtttttaaaagtggtcttgcgaaccaatttttggtctgctgacaactgttttggcacccatctagcacttaccTAGTTTGCAGTAACTATGCGACCTTTTGGAACATAATTTGTCAATATAACGCTTTTATAATCCCATAAAATGATGGCCATAACTTTTCCAGCAGAA---GGTGACTGTTTGAATTTCTTTGGGGGCGGGGAACCAGCTCGTACCCATTGTTTGGACTGCACCTT-GATATCAGGCTCAGAGTGATACATCAATGTTTCGTCCCCTGTCACAA-ATGGTGCAGAAATCCATCTTATCCATCTCCCTGTCTCTTATGATGAGCCAGAAGGTATTTAGAAGTGGTCTTG-GCACCCATCTtc
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gi|6 : tagtttgcagtaactatgcgaccttttggaacataatttgtcaatataacgcttttataatcccataaaatgatggccataacttttccagcagaaggtgactgtttgaatttctttgggggcggggaaccagctcgtacccattgtttggactgcaccttgatatcaggctcagagtgatacatcaatgtttcgtcccctgtcacaaatggtgcagaaatccatcttatccatctccctgtctcttatgatgagccagaaggtatttagaagtgATTATAGTCACTGAGAGCAAGGACAACATTCTTCATTCTGAGTCTAGGCCCCAGTTTACATAAATTTTCTTTCAATTTTGGTAAAACTACATCAGA-TAATAATTTGTAGTAACTGTGCAACCTTTTGGAACAT---GTGTCAATACAATTCCTTTATAATCCAAGAAAATGAAGGCCATAACTTTTCCAGCAGAAA---GTGACTGTTGGAATCTCTTTCGGGGCGGGGAACCGGCTCGTACCCATGGTTTGGACTGCACCTTGGGT-TTAGGCTCAAAGTGATGAATCCATGTTTCGTCCCCTGTCATAATATGGTGAAGAAAT---------CCACCTCACTGTTTCTTATGACGAGCCAAAAGTTCTTTAGAAGTGGTCTTGCGAACCA-TTTTTGGTCTGCTGACAACTGTTTTGGCACCCATCTAGCACTTACCTTGCTCAAGCTAAGGTTGTCCCGTACGATCTTAAATACCGATCCCTTTGAGATACTCAATCTACAAGCAACTTCTTGCAAAGTGACTCGTCGATCTTTCATGATATCAGATTCGACA-TTTTTTAACATTTGTGGGGTAACT-ATGC--AAGCTG-GGTGG----CCCCTGCCA---CGTCTATAGTTAACGTCATTTCTACCATCACGAAAACGAGCTACCCAAGAATTAAA------CGCGCTAC----G-----TAACAAACATGAATTCCAAAA-CCTATTTTGAAGTCGATTCAAAATAAAAATT-GTTTTTTGCCCTTCTTCAAGAAGAAA-----TCactc
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Reference ( family-3076 ) : TATACGAGGGACGGTCATTGTCTAGGTGGACAACCCTCAGTGCTGATTTGTGGCTCATTAT-----TTT-T-AAATTTCGATTTTACTCCTTCTCAAAGTATTCTCCTTCTTTCATTATACACTTGTTCCAGCGGTGTGGGAGTTTCATGATTCCCGCAGTGAACCAACATTTAGGCCTATGTCGAAGGTACTGATTNACAGCCCC-AATCAATGCCCCTCTGTTGGCATATTTGTTCCCAGCAAGCATTTTTTTTAATTCTGGAAACAAATAAAAGTCACTGGGAGCAAGGTCAGGACTGTAGGGAGGATGGTGTAGAGTTTCCCGCGTGTAGGTCTTCAACAAGTCCTTTGTTTTGGTGGCGGTATGTGCTGGGG-CATTATCGT-GCTGA-----AGAACAACATTCTTCATTCTGAGTCTAGGCCTCAGTTTACACAAATTTGCTTTCAATTTTGGTAAAACTNCATCAGAATAATAATTTGCAGTAACTGTGCGACCTTTTGGAACATAATGTGTCAATACAACGCCTTTATAATCCCAGAAAATGACGGCCATAACTTTTCCAGCAGAAA-AGGTGACTGTTTGAATTTCTTTGGGGNCGGGGAACCAGCTCGTACCCATTGTTTGGACTGCACCTTGGAT-TCAGGCTNAGAGTGATGAATCCATGTTTCGTCCCCTGTCACAATATGGTGCAGAAAT--A----ATCCATCTCCCTGTCTCTTATGACGAGCCAGAAGGTCTTTAGAAGTGGTCTTGCGAACCAATTTTTGGTCTGCTGACAACTGTTTTGGCACCCATCTAGCACTTACCTTGCTCAAGCCAAGGTTGTCCCGTACGATCTTAAATACCGATCCCTTTGAGATGCTAAATCTATTAGCAACTTCTTGCAAAGTGACTCGTCGATCTTTCATGATATAAGAGTCGACA-TTTTTTACCATTTGCGGGGTCACT-ATGC--AAGCTG-GACGC----CCCCTGCCA---CGTCTATTGTTAACGTCGTTTCTACCATCACGAAAACGAGCTACCCAAGAATAAAA------CGCGCTAC----G-----TGACATACATGAATCCCTAAA-CCTATTTTGAAGTCGATTCAAAATAAAAACCGGTTTTTTGCCCTTCTTCAAGAAGAAA-----TCTTATTACGGCACGCTGTTCTTCA-------TA--------TGTTGAGTCCATATTACCATGTATACATGCAATGTATA--A-------GTGACCGATTTTGGTACAACGCATTGTCCGATTTTAAAAGTTATT-GTTGCATATCATCTGCTAAGGTCTAATCTACCCGTGCACATCGAGTTTTTCGATATGACTTATATATTATGCAATATTTTAACAAAAGTCCACCTAGATAATGACCGTCCC
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gi|5 : tcattgcccctctgttgacatatttgttcccaacaagcatttttttaaatctggaaacaaataaaagtcactgggagcaaggtcaggactgtagggaggatagtgtagagtttcccgcgtgtaggtcttcaacaagtcctttgttttggtggcggtatgtgctggggcattatcgtgctgaagaacaacattcttcattctgagtctaggcctcagtttacacaaatttgcttttaattttggtaaaactacatcagaataataatttgcagtaactgtgcaaccttttggaacataatgtgtcaatacaacgcctttataatcccagaaaatgatggccataacttttccagcagaaggtgactgtttgaatttctttggggatgaaaaaccagttcatacccattgcttggactgcaccttggattcagactgagagtgatgaatccatgtctcatatcctgtcacaatatggtgcagatctccatctccctgtctcatgacgagccagaaggtttttaaaagtggtcttgcgaaccaatttttggtctgctgacaactgttttggcacccatctagcacttaccTAGTTTGCAGTAACTATGCGACCTTTTGGAACATAATTTGTCAATATAACGCTTTTATAATCCCATAAAATGATGGCCATAACTTTTCCAGCAGAA---GGTGACTGTTTGAATTTCTTTGGGGGCGGGGAACCAGCTCGTACCCATTGTTTGGACTGCACCTT-GATATCAGGCTCAGAGTGATACATCAATGTTTCGTCCCCTGTCACAA-ATGGTGCAGAAATCCATCTTATCCATCTCCCTGTCTCTTATGATGAGCCAGAAGGTATTTAGAAGTGGTCTTG-GCACCCATCTtc
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gi|6 : tagtttgcagtaactatgcgaccttttggaacataatttgtcaatataacgcttttataatcccataaaatgatggccataacttttccagcagaaggtgactgtttgaatttctttgggggcggggaaccagctcgtacccattgtttggactgcaccttgatatcaggctcagagtgatacatcaatgtttcgtcccctgtcacaaatggtgcagaaatccatcttatccatctccctgtctcttatgatgagccagaaggtatttagaagtgATTATAGTCACTGAGAGCAAGGACAACATTCTTCATTCTGAGTCTAGGCCCCAGTTTACATAAATTTTCTTTCAATTTTGGTAAAACTACATCAGA-TAATAATTTGTAGTAACTGTGCAACCTTTTGGAACAT---GTGTCAATACAATTCCTTTATAATCCAAGAAAATGAAGGCCATAACTTTTCCAGCAGAAA---GTGACTGTTGGAATCTCTTTCGGGGCGGGGAACCGGCTCGTACCCATGGTTTGGACTGCACCTTGGGT-TTAGGCTCAAAGTGATGAATCCATGTTTCGTCCCCTGTCATAATATGGTGAAGAAAT---------CCACCTCACTGTTTCTTATGACGAGCCAAAAGTTCTTTAGAAGTGGTCTTGCGAACCA-TTTTTGGTCTGCTGACAACTGTTTTGGCACCCATCTAGCACTTACCTTGCTCAAGCTAAGGTTGTCCCGTACGATCTTAAATACCGATCCCTTTGAGATACTCAATCTACAAGCAACTTCTTGCAAAGTGACTCGTCGATCTTTCATGATATCAGATTCGACA-TTTTTTAACATTTGTGGGGTAACT-ATGC--AAGCTG-GGTGG----CCCCTGCCA---CGTCTATAGTTAACGTCATTTCTACCATCACGAAAACGAGCTACCCAAGAATTAAA------CGCGCTAC----G-----TAACAAACATGAATTCCAAAA-CCTATTTTGAAGTCGATTCAAAATAAAAATT-GTTTTTTGCCCTTCTTCAAGAAGAAA-----TCactc
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Reference ( family-3076 ) : TATACGAGGGACGGTCATTGTCTAGGTGGACAACCCTCAGTGCTGATTTGTGGCTCATTAT-----TTT-T-AAATTTCGATTTTACTCCTTCTCAAAGTATTCTCCTTCTTTCATTATACACTTGTTCCAGCGGTGTGGGAGTTTCATGATTCCCGCAGTGAACCAACATTTAGGCCTATGTCGAAGGTACTGATTNACAGCCCC-AATCAATGCCCCTCTGTTGGCATATTTGTTCCCAGCAAGCATTTTTTTTAATTCTGGAAACAAATAAAAGTCACTGGGAGCAAGGTCAGGACTGTAGGGAGGATGGTGTAGAGTTTCCCGCGTGTAGGTCTTCAACAAGTCCTTTGTTTTGGTGGCGGTATGTGCTGGGG-CATTATCGT-GCTGA-----AGAACAACATTCTTCATTCTGAGTCTAGGCCTCAGTTTACACAAATTTGCTTTCAATTTTGGTAAAACTNCATCAGAATAATAATTTGCAGTAACTGTGCGACCTTTTGGAACATAATGTGTCAATACAACGCCTTTATAATCCCAGAAAATGACGGCCATAACTTTTCCAGCAGAAA-AGGTGACTGTTTGAATTTCTTTGGGGNCGGGGAACCAGCTCGTACCCATTGTTTGGACTGCACCTTGGAT-TCAGGCTNAGAGTGATGAATCCATGTTTCGTCCCCTGTCACAATATGGTGCAGAAAT--A----ATCCATCTCCCTGTCTCTTATGACGAGCCAGAAGGTCTTTAGAAGTGGTCTTGCGAACCAATTTTTGGTCTGCTGACAACTGTTTTGGCACCCATCTAGCACTTACCTTGCTCAAGCCAAGGTTGTCCCGTACGATCTTAAATACCGATCCCTTTGAGATGCTAAATCTATTAGCAACTTCTTGCAAAGTGACTCGTCGATCTTTCATGATATAAGAGTCGACA-TTTTTTACCATTTGCGGGGTCACT-ATGC--AAGCTG-GACGC----CCCCTGCCA---CGTCTATTGTTAACGTCGTTTCTACCATCACGAAAACGAGCTACCCAAGAATAAAA------CGCGCTAC----G-----TGACATACATGAATCCCTAAA-CCTATTTTGAAGTCGATTCAAAATAAAAACCGGTTTTTTGCCCTTCTTCAAGAAGAAA-----TCTTATTACGGCACGCTGTTCTTCA-------TA--------TGTTGAGTCCATATTACCATGTATACATGCAATGTATA--A-------GTGACCGATTTTGGTACAACGCATTGTCCGATTTTAAAAGTTATT-GTTGCATATCATCTGCTAAGGTCTAATCTACCCGTGCACATCGAGTTTTTCGATATGACTTATATATTATGCAATATTTTAACAAAAGTCCACCTAGATAATGACCGTCCC
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