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Reference ( gi|4 ) : GCAGTGTATTGCCAGGACACTTCCGATACAATA---TG--T-ACTGT---GATA----CGG---GTA--GGC-CAATACGCAA----------TACAA---TATGATACTCTGCTTAACATTAGAAAA-CAATCTTACTTT----TGCTTTGTAGTTCTCATTGATTTGAAATACACAAGTATCAAGTGACAAAAAGTTTCGTATTTTGTCTGTAATGCAGAACAGTTTA-TTGTT--TG-TT-TATTATGTTTTTATTTGTTTCCAATT-TCCTTTTAT-TTTC--ATATGCAAATTAAAATTAAAG-T-T-G-AATGCCATTTGGAGTTT--TATTAACAC-AA-TTTAGAATTCAAATAC------GTATA-C--TGA-AATGCGAAGTCGGA--GCTCTAGAGACTAGTATCAGTACTAGCTCTACCTGATGTT---TATAAATAGACTATGTT-ACTGCATAA------CAGTTTATTGT--TTGT-T-TTAATT--TTTC--CAATTTTC-TT---CA-----TTTT---TTTTAAAATGCAAATTAAAATTTAAAGTTTAAATGTCA--AACAGGGT--TTTAT-TTACTTA-AATGTAGTATTTGTA--CACACATAAGTATTGAACA-TTTGAAATGCGGAAATC-AGG-TCTTTGGAACAAA----TACTAGCTCTACATGCAGGG------CTGA--AAAAAAAACCTAAAACGTCCCATTATTGCAAGAAACATAAACGGAACCACACTTTG---AAAAAAAGGTGCCGTCTTTTAATGCAACC-AATTTAAAATGTCAACATCCAGGCAGTTTGATAAAACAAAT----GACG-AAATGGTTATATATACATAAATAAACTATTTCAACTGTGTTTTCAAGCATTTA-TCGTATTATGTTTTCTTATAAGATGAATCATATTGAAACAGCCTTTAACACAAAATCTTTGTATTATTTACTTGCGAAGTGTCCTCGATATATTTTTTTATGGCAAATAGGTGCCTTTGGCGACCGACAGCAGAAGTAAG----T-CT-----ATTTGATTGATCTTTCAATA----ATC-GA-----------TCATTTGA------A-A-----GAT--TT---T--ATG---TTG------T--T-----TT----TC--GGC-TTT----ATTTT-AA-AG-G--CA-A--T--TGAATTATGCATAACCTACGACTGTAT-----TGT----GGTATG------GCCGAT----ACAG-AC-------------C-------------ATG-------------TAGAT-------------TGCTCAGAAACAAACCGCAATAAACCGAAATACCGGTATATCGGAACAGTCCTAGGA
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gi|11 : atatttttcaactgtttacaccataaatgtagttgattatgcacttgaagttatgtagtttaatattcagtcataatgcttgaagttgaacatatatttaatatttattattatgaactatggtttataggGCTGTGTATTGCCAGGACACTTCCGATACAATA---TG--T-ACCGC---GCTA----CGG---GAA--CAT-CGATACGCAA----------T--------ATGATACGCTGCTTAACATTAGAAAA-CAATCTTACTTT----TGCTTAGTAGCTCCCATTGAGTTGAAATACACAAGTATCAACTGACAAGTAGTTTCGTATTTTGTC---AATG----------TA-T----------------ATG-TTTTATTTGTTTCCGATT-TCCTTTTGT-TTTT--ATATGCAAATTAAAATTAAAGTT-T-G-AATGCCAAATGGAGTTTTGTATTAA----AA-GTTGGAGCTC------------------T--TGA-GA-----------------CTAGA-ACCAATAT------TAGCTCTACCTGATATT---TATAAATAgtcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatgttttatcgcaaattggtacctttagcaactgatagcgtcagccctgaagatttacgatttataaatagaatacggaagtaaggctttttctttcatctcttggtatttgatcaattgtatagatttgatgttgttttttggctttatttacaagaatgttgaattatgcataatccaccactgtatcgaggtatggccgataatcacaaaagctgtagatattgttaactttacgcat
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gi|6 : aacagtttattgtttttattcatttccacagaaattaaagtttgactaccaaacagagttttattaacgcaattttgtattcgtatactaacattgaaagagtcagagatctagaaccgatagtagccctacctaataattataaatagattacgtTTTTAT-T--C--ATTTCCACA--GAAATTAAAG-T-TTG-ACTACCAAACAGAGTTT--TATTAACGC-AA-TTTTGTATTCGTATAC------TAACA-T--TGA-AA----GAGTCAGA--GATCTAGA-------ACCGATAGTAGCCCTACCTAATAAT---TATAAATAGATTACGTT-ATTGCAAAA------CAGTTTATTGTTATTGT-T-----TT--TTTC--TTATTTCCTTT---CATTCTTTTTT---TTTTTAAATACAAATTGAAA-TTAAAGTTTGAATGTCA--AAC---GTAACTTAT-TTATGTA-AATTTAGTATTCGTA--TACACATA--T-CTGATAA-TTTGAAactttatgctgtgtttttgggctttattttaaaggacattgaattattcctaacctatgactatcatgttatggttgatacaatatgcatattgttaaaaaacgaaccgcaataaaccggtatatcagaacagcactag
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gi|13 : tggggacgtgcattgccgcgacaagtctgatatgatatattatgtgatttaggtagactgatacgcaatatgaaattcagcttttaactgctgatgtttgactctttaatgtcctctagttttctatgaaaactgcaacagtgatgtttattactttGTT-AACCCACAA------CAGTTTATTGT--TTAT-T-TTACTT--TT-----GATTTTT-TT---TA-----TTCT--------ATATGCAAATTAGAA-------TTTGAATGCCA--AACAAAA----TCATGTTAATGC-AATTTTGTATTCGAA--TACGCATAtaaaatgcgaagaacctacactggttacctggtttataaatagactacaataattccacaaagtaaaactggttggccatttgaaatttgataatttgaatggatttgctgctgttgtatcggctttattttaaagaatacatggagtcatgcacagcctgcatttgtaacatgatacagtcaatacggaaactgtccatataacatgcatatc
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gi|12 : aagctgtgtattgccaggacacttccgatacaatatgtaccgcgctacgggaacatcgatacgcaatatgatacgctgcttaacattagaaaacaatcttacttttgcttagtagctcccattgagttgaaatacacaagtatcaactgacaagtagtttcgtattttgtcaatgtataTATTCCTA--TACACATA----TTGAAAAATTTGAAATGC-----TCTAG---CTCTAGAACCAA----TACTAGCTCTACCTGaaagttggagctcttgagactagaaccaatattagctctacctgatatttataaata
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gi|20 : cagtgttcttgtaattgttatgaggtctcccaagtgtatatggattagggctgtgtattgccaggacactttccatacaataagtaccgcggtatgggtaggctgatacaaaatacgatacaatacgctgcttaacattagaaaacaatcttacttttgctttgtagttctcattgatttgacatacacaagtatcaagtgacaaaaagtttcatattttgtaggtaatgcggaacagtttattgtttgttttatatgtttttatttgtttccaatttccttttattttcatatgcaaattaaaatcaaagttttaatgccaaatggagtttcattaacgcaatttaggattcttatacatgtatgtatattgaaatacgaagtcgcagctctaaaaactagaaccgatactagctctacctgatgtgtatgaatatattgttttacagcaaaacggtttattgtttgtttttatttttttcaattttcttcatttttttttaaatgcaaattgaaagtttaaatgtaaaacggagttgtatttacttaactgtagtatttgtacacacataattatttaacatttgaaaagcggtagtcagacgtctagaacagaatgatactagctctacatgcagtgctgaaaaaaaacttttatttccgctgttgcaagaaacataaacagagccttactttgaaaaaaaaaaggtgctgacctttagtgcaactgatttatacagtcaacatcttggcagacaaaggaggaaatggttttatatacatacatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatttttttattgcaaattggtgcctttggcgacagacagcatgagtcctgcagatttatgatttataaatagaataT-AAAA-GAT-ACTGAATAATGCACAACTTATGGCTGTATCACGGTAT--GGACCATGC----C---C--------AT---ACAATACGCATTTTACTAGGAAATGAATCACAATAAACTGGTATACat
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gi|5 : tggggacgtgcattgccgcgacaagtctgatatgatatattatgtgatttaggtagactgatacgcaatatgaaattcagcttttaactgctgatgtttgactctttaatgtcctctagttttctatgaaaactgcaacagtgatgtttattactttAAGTAAAAC-----T-----GGTTGGCCATT-------------------TGAAA----TTTGATA-------A-TTTG--------AATGGATTTGCTGC----TGT--TGTATC--GGCTTTATTTT-AAAGAATACATGGAGTCATGCACAGCCTGCATTTGTAACATGATAC--AGTCAATACGGAAA---CT---GTCCAT---ATAACATGCATATcaataattccacaaagtaaaactggttggccatttgaaatttgataatttgaatggatttgctgctgttgtatcggctttattttaaagaatacatggagtcatgcacagcctgcatttgtaacatgatacagtcaatacggaaactgtccatataacatgcatatc
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Alignments
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Reference ( family-3073 ) : GCTGTGTATTGCCAGGACACTTCCGATACAATA---TGT-ACCGCGATACGGGTAGGCCGATACGCAA----------TACGATA--------TGATACGCTGCTTAACATTAGAAAA-CAATCTTACTTT----TGCTTTGTAGTTCTCATTGATTTGAAATACACAAGTATCGAGTGACAAATAG--TTT-CGTATTTTGTCGGTAACGCGGAACAGTTTA-TTGTTTG-TT-TAT-ATGTTTTTATTTGTTTCCAATT-TCCTTTTAT-TTTC--ATATGCAAATTAAAATTAAAGTTTGAATGCCAAACGGAGTTT--TATTAACGCAA-TTTAGNATTCGTATAC------GCATATTGAAA--TGCGAAGTCGGAGCTCT-AGA-ACTAGAACCGATACTAGCTCTACCTGATGTTTATAAATAGACTATGTTACTGCAAAACAGTTTATTGT--TTG-T-TTTATTTTTTCCAATTTTC-TTCA-----TTTTT---TTTTA-AATGCAAATTGAAATTTAAAGTTTAAATGTCAAACGGGGTTTTATTTACTTAAATGTAGTATTCGTACACACATAA-T--TT--GAACATTTGAAANGCGG-A-G-TCAGGCCTCTAGAAC----TGATACTAGCTCTACATGCAGGGC------TGA--AAAAAAACCCTAAAACGTCCCGTTATTGCAAGAAACATAAACGGAGCCGCACTTTG---AAAAAAAGGTGCCGACTTTTAATGCAACC-GATTTAGAAAGTCAACATCCTGGCAATTTGATGAAACAAAC----GANGAAATGGTTTTATATACGTAAATNAACTATTTTAACTGTNNTTTCAATCGTTCATCGGGTTATGTTTTCTTATAAGAATAATTATATTGAAACAGCCTTTNACCCGAAATCTTTGTTTTATTTACTTGCGAAATGTCCTTGATATATTTTTTTATCGCAAATNGGCGCCTTTGGCGACCGACAGCGGAAGTAAGGC-----T-ATTTGNTTGATCTCT-------------------CGATA----TTTGATC-------A-TT--------TGAATAGATTTGATGC----TGT--TTT-TC--GGCTTTATTTTAAAGG--ANATTGAATTATGCATAACCTACGACTGTATCGCGGTAT--GGCCGATACGGACCCTG-CC-ATACAATACGCATATTGCTCAGAAACGAACCGCAATAAACCGGTATACCGGTATATCGGAACAGCCCTAG
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gi|1 : atatttttcaactgtttacaccataaatgtagttgattatgcacttgaagttatgtagtttaatattcagtcataatgcttgaagttgaacatatatttaatatttattattatgaactatggtttataggTTTTATCGCAAATTGGTACCTTTAGCAACTGATAGCGgtcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatgttttatcgcaaattggtacctttagcaactgatagcgtcagccctgaagatttacgatttataaatagaatacggaagtaaggctttttctttcatctcttggtatttgatcaattgtatagatttgatgttgttttttggctttatttacaagaatgttgaattatgcataatccaccactgtatcgaggtatggccgataatcacaaaagctgtagatattgttaactttacgcat
gi|1 : atatttttcaactgtttacaccataaatgtagttgattatgcacttgaagttatgtagtttaatattcagtcataatgcttgaagttgaacatatatttaatatttattattatgaactatggtttatagggctgtgtattgccaggacacttttgatacaatatgtactgcgatacgggtaggctgatacccaaaacgatacgatacgatatgatacgctgcttaacatcagaaaaacaatcttactgttgctttgtagttctcattgatttgaaatacacaagtatcgagtgacaaatagtttcgtattttgtcggtaatgcggaacagtttattgtttgttatatatgtttatatttgtttccaatttccttttattttcatatatgcaaattaaaataagtttgaattccaaatggagtattattaatgccatttagaattcatatacacatattaaaatgcgaagtcagagctctagagactagaaccaatacttgctcttcctgatgtttataaatagactgtgactgcaaaccagtttattgtgttttttattttttccaattttattcagcatttttttaatgaaaattgaaattgaaagtttaaatatcaaacagggtttatttacttaaatgtagtatttgtacacacataattattgaaaggccctttagaactgatactagctctacaggcaggacagaaaaaaaaattaaaacatcccgttaatacaagaaacataaacggagccgcactttgaaaaaactgagcggatttttaatgcaatcaaatttagaaggtcaacatcctggcaatttgatgaaacaaaggcgtaaatggctttatagtcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatgCGGAAGTAAGGC-----T-TTTTCTTTCATCTCT-------------------TGGTA----TTTGATC-------A-AT--------TGTATAGATTTGATGT----TGT--TTT-TT--GGCTTTATTTACAAGA--ATGTTGAATTATGCATAATCCACCACTGTATCGAGGTAT--GGCCGATAtcagccctgaagatttacgatttataaatagaatacggaagtaaggctttttctttcatctcttggtatttgatcaattgtatagatttgatgttgttttttggctttatttacaagaatgttgaattatgcataatccaccactgtatcgaggtatggccgataatcacaaaagctgtagatattgttaactttacgcat
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gi|20 : cagtgttcttgtaattgttatgaggtctcccaagtgtatatggattagggctgtgtattgccaggacactttccatacaataagtaccgcggtatgggtaggctgatacaaaatacgatacaatacgctgcttaacattagaaaacaatcttacttttgctttgtagttctcattgatttgacatacacaagtatcaagtgacaaaaagtttcatattttgtaggtaatgcggaacagtttattgtttgttttatatgtttttatttgtttccaatttccttttattttcatatgcaaattaaaatcaaagttttaatgccaaatggagtttcattaacgcaatttaggattcttatacatgtatgtatattgaaatacgaagtcgcagctctaaaaactagaaccgatactagctctacctgatgtgtatgaatatattgttttacagcaaaacggtttattgtttgtttttatttttttcaattttcttcatttttttttaaatgcaaattgaaagtttaaatgtaaaacggagttgtatttacttaactgtagtatttgtacacacataattatttaacatttgaaaagcggtagtcagacgtctagaacagaatgatactagctctacatgcagtgctgaaaaaaaacttttatttccgctgttgcaagaaacataaacagagccttactttgaaaaaaaaaaggtgctgacctttagtgcaactgatttatacagtcaacatcttggcagacaaaggaggaaatggttttatatacatacatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatttttttattgcaaattggtgcctttggcgacagacagcatgagtcctgcagatttatgatttataaatagaataTAAAAG--ATACTGAATAATGCACAACTTATGGCTGTATCACGGTAT--GG---------ACCATG-CCCATACAATACGCATTTTACTAGGAAATGAATCACAATAAACTGGTATACat
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gi|8 : tattttaactgttatttcaatcgttcatcaggttatgttttcttataagaataattatattgaaacagccttttacccgaaatctttgttttatttacttgcgaaatgtccttgatatattttttatcgtaaataggcacctttggtgaacggcagcacgagccctgcagatttatgatttataaatagaataATTTTAACTGTTATTTCAATCGTTCATCAGGTTATGTTTTCTTATAAGAATAATTATATTGAAACAGCCTTTTACCCGAAATCTTTGTTTTATTTACTTGCGAAATGTCCTTGATATA-TTTTTTATCGTAAATAGGCACCTTTGGTGAACGGCAGCa
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Alignments
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Reference ( family-3073 ) : GCTGTGTATTGCCAGGACACTTCCGATACAATA---TGT-ACCGCGATACGGGTAGGCCGATACGCAA----------TACGATA--------TGATACGCTGCTTAACATTAGAAAA-CAATCTTACTTT----TGCTTTGTAGTTCTCATTGATTTGAAATACACAAGTATCGAGTGACAAATAG--TTT-CGTATTTTGTCGGTAACGCGGAACAGTTTA-TTGTTTG-TT-TAT-ATGTTTTTATTTGTTTCCAATT-TCCTTTTAT-TTTC--ATATGCAAATTAAAATTAAAGTTTGAATGCCAAACGGAGTTT--TATTAACGCAA-TTTAGNATTCGTATAC------GCATATTGAAA--TGCGAAGTCGGAGCTCT-AGA-ACTAGAACCGATACTAGCTCTACCTGATGTTTATAAATAGACTATGTTACTGCAAAACAGTTTATTGT--TTG-T-TTTATTTTTTCCAATTTTC-TTCA-----TTTTT---TTTTA-AATGCAAATTGAAATTTAAAGTTTAAATGTCAAACGGGGTTTTATTTACTTAAATGTAGTATTCGTACACACATAA-T--TT--GAACATTTGAAANGCGG-A-G-TCAGGCCTCTAGAAC----TGATACTAGCTCTACATGCAGGGC------TGA--AAAAAAACCCTAAAACGTCCCGTTATTGCAAGAAACATAAACGGAGCCGCACTTTG---AAAAAAAGGTGCCGACTTTTAATGCAACC-GATTTAGAAAGTCAACATCCTGGCAATTTGATG----AAACAAANGAGGAAATGGTTTTATATACGTAAATNAACTATTTTAACTGTNNTTTCAATCGTTCATCGGGTTATGTTTTCTTATAAGAATAATTATATTGAAACAGCCTTTNACCCGAAATCTTTGTTTTATTTACTTGCGAAATGTCCTTGATATATTTTTTTATCGCAAATNGGCGCCTTTGGCGACCGACAGCGGAAGTAAGGC-----T-ATTTGNTTGATCTCT-------------------CGATA----TTTGATC-------A-TT--------TGAATAGATTTGATGC----TGT--TTT-TC--GGCTTTATTTTAAAGGATA--TTGAAT----TATGCATAACCTACGACTGTATCGCGGTAT--GGCCG---AT-AC--GGACCCTGCCGATACAATACGCATATTGCTCAGAAACGAACCGCAATAAACCGGTATACCGGTATATCGGAACAGCCCTAG
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gi|21 : TA--TTGAAT----TATGCACAACCTACAACT-TATAAGGATATAAGG--G---AT-AT--GGACTCTGCCAATATAATACTTATGTAACTTGGAAACAAACCCCTATAAACTGGTATA----TA----GGAACAACTCTAtttttataattgtca
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Alignments
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Reference ( family-3073 ) : GCTGTGTATTGCCAGGACACTTCCGATACAATA---TGT-ACCGCGATACGGGTAGGCCGATACGCAA----------TACGATA--------TGATACGCTGCTTAACATTAGAAAA-CAATCTTACTTT----TGCTTTGTAGTTCTCATTGATTTGAAATACACAAGTATCGAGTGACAAATAG--TTT-CGTATTTTGTCGGTAACGCGGAACAGTTTA-TTGTTTG-TT-TAT-ATGTTTTTATTTGTTTCCAATT-TCCTTTTAT-TTTC--ATATGCAAATTAAAATTAAAGTTTGAATGCCAAACGGAGTTT--TATTAACGCAA-TTTAGNATTCGTATAC------GCATATTGAAA--TGCGAAGTCGGAGCTCT-AGA-ACTAGAACCGATACTAGCTCTACCTGATGTTTATAAATAGACTATGTTACTGCAAAACAGTTTATTGT--TTG-T-TTTATTTTTTCCAATTTTC-TTCA-----TTTTT---TTTTA-AATGCAAATTGAAATTTAAAGTTTAAATGTCAAACGGGGTTTTATTTACTTAAATGTAGTATTCGTACACACATAA-T--TT--GAACATTTGAAANGCGG-A-G-TCAGGCCTCTAGAAC----TGATACTAGCTCTACATGCAGGGC------TGA--AAAAAAACCCTAAAACGTCCCGTTATTGCAAGAAACATAAACGGAGCCGCACTTTG---AAAAAAAGGTGCCGACTTTTAATGCAACC-GATTTAGAAAGTCAACATCCTGGCAATTTGATG----AAACAAAGGAGGAAATGGTTTTATATACGTAAATNAACTATTTTAACTGTNNTTTCAATCGTTCATCGGGTTATGTTTTCTTATAAGAATAATTATATTGAAACAGCCTTTNACCCGAAATCTTTGTTTTATTTACTTGCGAAATGTCCTTGATATATTTTTTTATCGCAAATNGGCGCCTTTGGCGACCGACAGCGGAAGTAAGGC-----T-ATTTGNTTGATCTCT-------------------CGATA----TTTGATC-------A-TT--------TGAATAGATTTGATGC----TGT--TTT-TC--GGCTTTATTTTAAAGGATA--TTGAAT----TATGCATAACCTACGACTGTATCGCGGTAT--GGCCG---AT-AC--GGACCCTGCCGATACAATACGCATATTGCTCAGAAACGAACCGCAATAAACCGGTATACCGGTATATCGGAACAGCCCTAG
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gi|12 : aaATTCCTATAC------ACATATTGAAAAATTTGAAAT----GCTCT-AGC-TCTAGAACCAATACTAGCTCTACCTGA--TTTATAAATAGAATATG
gi|12 : tGAAAGTAAGGC-----T-ATTTG----ATCTCT-------------------TGATA----TTTGATC-------A-TT--------TGAAT----TTGATGC----TGT--TTT-TTTGGGCTTTATTTTTAAAGGTA--TTGAAT----TATGCATAACCT--GACTGTATCCCGGTAT--GGCCA---AT-AT--GGACCCTGCTGATACAATACGCATATTGCTTAGAAATGAACTGCAATCAACCAGTATACCGGTATATCGAAACAGCTCTAaaagtaaggctatttgatctcttgatatttgatcatttgaatttgatgctgtttttttgggctttatttttaaaggtattgaattatgcataacctgactgtatcccggtatggccaatatggaccctgctgatacaatacgcatattgcttagaaatgaactgcaatcaaccagtataccggtatatcgaaacagctcta
gi|13 : tattcctatacacatattgaaaaatttgaaatgctctagctctagaaccaatactagctctacctgatttataaatagaatatATAG--TTT-TGTATTTTGTCGTTAACCCACAACAGTTTA-TTGTTTA-TT-T-T-AC-TTTTGATTT-------------TTTTTAT-TCT---ATATGCAAATTAGAATT------TGAATGCCAAACAAAATCA--TGTTAATGCAA-TTTTGTATTCGAATAC------GCATATTAAAA------------AAGCT--------CTAGAACCGATACTAGATATTCCTGGTGT
gi|14 : ATT----TTTGATT-------AATT--------TGAATGGATTTGATGC----TAT--TTTGTC--AGCTTTAATTCAAAGCATA--TTGAAT----TGTGCACAATCTACAACTATATTGCGGAAT--GGCTA---AT-AA--AGACACTGCCAATACAATACATATATTGCTAAAAAGTTAACTGCGATAG----------CGGTATGTTGGAAAAGCCCTAG
gi|15 : a-------------------CGATA----TTTTATC-------A-T----------------ATCTGATGC----CGT--TTT-TC--AACTTAATTTTAAATGATA--TTGAAT----TATGCATAACCTACGTCTGTACCGCGGTAT--GGCCT---AT-AC--GGACCCTGCTGATACAATACACATATTGCTCAGAAAAGAACTGCAATAAACCTGTATACTGGTATATCGGAACAGCCCT
gi|16 : GCTGTGTATTGCCAGGTCACTTACAATACAATA---CAT-ACCGTGATATTGGTA----------CAG----------TATGATA--------GCATACGCTGCTTAACATTAGAAAA-CAATCTTACTTTAAATTGCTTTAAAGTTCACTTTGATATGAAATACACAAGTATTAAGTGACAAACAG--TTT-TCTGTTTTGTC
gi|17 : taggTATTTT-TCGGTAACACGGAACAGTTTA-TTGT-----------ATGTTTTTATTTGTTTCCAATT-AACTTTTAT-TTTC--ATATGCAAATTAAAATTAAAGTTTGAATGCCATTTGCAGTTT--TAGTAACACAA-TTTAGAATTCATATAT------GCATAATGAAA--TTCGAAATCTGAGCTCT-A
gi|18 : GGAAGTAAGGC-----T-AT----TTAATCTCT-------------------TGCTA----TCTGATt
gi|18 : ataaatattatTATCACGGTAC--AACCG---AT-AC--GGACCCTGTAGATACAATATGCATATTGCTCAAAAACGAACTGCAAGAAACGGATGTACCAGTATTTCAGAACAGCCCTgctgttttttctaggtttatcacggtacaaccgatacggaccctgtagatacaatatgcatattgctcaaaaacgaactgcaagaaacggatgtaccagtatttcagaacagccct
gi|19 : ataaatattatggaagtaaggctatttaatctcttgctatctgatgctgttttttctaggttGTATTGCCAGGACACCTCCGATACAATA---TTT-ACTGTGATA--------CTGACACACAGT---------TGTGATATAAATGTCTGATACGCTGGTTA
gi|2 : aaattccacaacctttaacctttcatgttcaaatgaatgtgtctatgctgtgtattaagttgggctaGCTGTGTATTGCCAGGACACTTTCCATACAATA---AGT-ACCGCGGTATGGGTAGGCTGATACAAAA----------TACGATA--------CAATACGCTGCTTAACATTAGAAAA-CAATCTTACTTT----TGCTTTGTAGTTCTCATTGATTTGACATACACAAGTATCAAGTGACAAAAAG--TTT-CATATTTTGTAGGTAATGCGGAACAGTTTA-TTGTTTGTTT-TAT-ATGTTTTTATTTGTTTCCAATT-TCCTTTTAT-TTTC--ATATGCAAATTAAAATCAAAGTTTTAATGCCAAATGGAGTTT--CATTAACGCAA-TTTAGGATTCTTATACATGTATGTATATTGAAA--TACGAAGTCGCAGCTCTAAAA-ACTAGAACCGATACTAGCTCTACCTGATGTGTATGAATATATTGTTTTACAGCAAAACGGTTTATTGT--TTGTT-TTTATTTTTTTCAATTTTC-TTCA-----TTTTT---TTTTA-AATGCAAATTG------AAAGTTTAAATGTAAAACGGAGTTGTATTTACTTAACTGTAGTATTTGTACACACATAA-TTATT--TAACATTTGAAAAGCGGTA-G-TCAGACGTCTAGAACAGAATGATACTAGCTCTACATGCAGTGC------TGA--AAAAAAACTTTTA---TTTCCGCTGTTGCAAGAAACATAAACAGAGCCTTACTTTGAAAAAAAAAAGGTGCTGACCTTTAGTGCAACT-GATTTATACAGTCAACATCTTGGC-------------AGACAAAGGAGGAAATGGTTTTATATACATACAT
gi|2 : cagtgttcttgtaattgttatgaggtctcccaagtgtatatggattaggTATTTTTTTATTGCAAATTGGTGCCTTTGGCGACAGACAGCATGAGTgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatttttttattgcaaattggtgcctttggcgacagacagcatgagtcctgcagatttatgatttataaatagaatacggaagtgtggctatttgtttgatctctcaatatttaatcatttgaatagatttaatgctgaattatgcataacctgttactgtatcgcagtatggccaatacagaccctgatgatacaatacgcatattgctcagaaatgaaccacaataaatcggtataccggtataacagccctaat
gi|2 : cagtgttcttgtaattgttatgaggtctcccaagtgtatatggattagggctgtgtattgccaggacactttccatacaataagtaccgcggtatgggtaggctgatacaaaatacgatacaatacgctgcttaacattagaaaacaatcttacttttgctttgtagttctcattgatttgacatacacaagtatcaagtgacaaaaagtttcatattttgtaggtaatgcggaacagtttattgtttgttttatatgtttttatttgtttccaatttccttttattttcatatgcaaattaaaatcaaagttttaatgccaaatggagtttcattaacgcaatttaggattcttatacatgtatgtatattgaaatacgaagtcgcagctctaaaaactagaaccgatactagctctacctgatgtgtatgaatatattgttttacagcaaaacggtttattgtttgtttttatttttttcaattttcttcatttttttttaaatgcaaattgaaagtttaaatgtaaaacggagttgtatttacttaactgtagtatttgtacacacataattatttaacatttgaaaagcggtagtcagacgtctagaacagaatgatactagctctacatgcagtgctgaaaaaaaacttttatttccgctgttgcaagaaacataaacagagccttactttgaaaaaaaaaaggtgctgacctttagtgcaactgatttatacagtcaacatcttggcagacaaaggaggaaatggttttatatacatacatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttCGGAAGTGTGGC-----T-ATTTGTTTGATCTCT-------------------CAATA----TTTAATC-------A-TT--------TGAATAGA---------------------------------TTTAA----TG--CTGAAT----TATGCATAACCTGTTACTGTATCGCAGTAT--GGCCA---AT-AC--AGACCCTGATGATACAATACGCATATTGCTCAGAAATGAACCACAATAAATCGGTATACCGGTAT-----AACAGCCCTAcctgcagatttatgatttataaatagaatacggaagtgtggctatttgtttgatctctcaatatttaatcatttgaatagatttaatgctgaattatgcataacctgttactgtatcgcagtatggccaatacagaccctgatgatacaatacgcatattgctcagaaatgaaccacaataaatcggtataccggtataacagccctaat
gi|20 : cagtgttcttgtaattgttatgaggtctcccaagtgtatatggattagggctgtgtattgccaggacactttccatacaataagtaccgcggtatgggtaggctgatacaaaatacgatacaatacgctgcttaacattagaaaacaatcttacttttgctttgtagttctcattgatttgacatacacaagtatcaagtgacaaaaagtttcatattttgtaggtaatgcggaacagtttattgtttgttttatatgtttttatttgtttccaatttccttttattttcatatgcaaattaaaatcaaagttttaatgccaaatggagtttcattaacgcaatttaggattcttatacatgtatgtatattgaaatacgaagtcgcagctctaaaaactagaaccgatactagctctacctgatgtgtatgaatatattgttttacagcaaaacggtttattgtttgtttttatttttttcaattttcttcatttttttttaaatgcaaattgaaagtttaaatgtaaaacggagttgtatttacttaactgtagtatttgtacacacataattatttaacatttgaaaagcggtagtcagacgtctagaacagaatgatactagctctacatgcagtgctgaaaaaaaacttttatttccgctgttgcaagaaacataaacagagccttactttgaaaaaaaaaaggtgctgacctttagtgcaactgatttatacagtcaacatcttggcagacaaaggaggaaatggttttatatacatacatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatttttttattgcaaattggtgcctttggcgacagacagcatgagtcctgcagatttatgatttataaatagaataTAAAAGATA--CTGAAT----AATGCACAACTTATGGCTGTATCACGGTAT--GG---------------ACCATGCCCATACAATACGCATTTTACTAGGAAATGAATCACAATAAACTGGTATACat
gi|21 : TA--TTGAAT----TATGCACAACCTACAACT-TATAAGGATATAAGG--G---AT-AT--GGACTCTGCCAATATAATACTTATGTAACTTGGAAACAAACCCCTATAAACTGGTATA----TA----GGAACAACTCTAtttttataattgtca
gi|3 : CTGTGTATTGCCAGGACATTTCCAATACAATA---CGT-ACCACGATAGAAGTAGG----TAGGC--------------CGATA--------CGATATGCTACTAAGCATTAGAAAA-TAATCTTTCTTT----TGCTTTGTAGTTCTCATTGATTTGAAATACACAAGTATTTAGAGACATACAG--TTT-CGTATTTTGTCGGCAACGCGGAACAGTCTA-TTGTTGT-TT-TAA-ATGTTTTTATTTGTTTCTAATT-TCCTTTTAT-TTTC--ATATGCAAATTAAAATTAAAGTTTGAAAGCCA---------------T--------TTTAGTATTCGTATAC------ACATATTGAAA--TGTGAAGTTGGAGCTCT-AGAGACTAGAACCAATACTAGCTCTACCTGATGTTTATAAATGGACTATGTTACTGCGGAACAGTTT---GT--TTG-TCTTTATTTTTTCAAACTTTC-TTCA-----GTTTTATATTCTAGAATGCAAATTGAAATTCAA-GTTTGAATGTCAAATGTGGTTTTATTTACTTAAATTTAGTATTCATACACACATTA-C--TTATGAACACCTAAAATGTGG-AAG-TCAGGCCTCCAGAAC----TGATACTACCGCTACATGCAGGGCCTACCCTGGCTGAAAAAACCCTAAAACATCTTGTTATTGCAAGAAACATAAACAGAGCCGCACTTCG---AAAA-AAGGTGCTGACTTTTAATTCAACC-AATTTAGAAAGTCAACATCTTGGCAATTTGATGAAACAAACAAAGGAAGAATTGGTTTTATATATGTAAATTAACTATTTTCACTTTGCTTTCAATCGTTTATTCGATGATGTGTTTTT---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTTATCGT-TATTGGCACCTTTGGCAACTGACAGTGTGGGT---CC-----TAATTTG--TGATTTATAAATAGAATATCGAAGTAACGATATTTGTTTGATCTCTCAATA-TTTGATAATTTGAATGGATTTGATGCAGTTTTT--TTT-TC--GGCTTTATTTTAAAGGATA--TTGAAT----TATGTATAACCTATGACTGTATTGCGTTAT--GGCTA---AT-AC--GGACCCTGCCGATACAATATGCATATTGTTCAGAAATGAACTGCAATAAATCGATATATAG---TATCAGAACAGACC
gi|4 : aggaGCAGTGTATTGCCAGGACACTTCCGATACAATA---TGT-ACTGTGATACGGGTAGGCCAATACGCAA----------TACAATA--------TGATACTCTGCTTAACATTAGAAAA-CAATCTTACTTT----TGCTTTGTAGTTCTCATTGATTTGAAATACACAAGTATCAAGTGACAAAAAG--TTT-CGTATTTTGTCTGTAATGCAGAACAGTTTA-TTGTTTG-TT-TATTATGTTTTTATTTGTTTCCAATT-TCCTTTTAT-TTTC--ATATGCAAATTAAAATTAAAGTT-GAATGCCATTTGGAGTTT--TATTAACACAA-TTTAGAATTCAAATAC------GTATACTGAAA--TGCGAAGTCGGAGCTCT-AGAGACTAGTATCAGTACTAGCTCTACCTGATGTTTATAAATAGACTATGTTACTGCATAACAGTTTATTGT--TTG-T-TTTAATTTTTCCAATTTTC-TTCA-----TTTTT---TTTAA-AATGCAAATTAAAATTTAAAGTTTAAATGTCAAACAGGGTTTTATTTACTTAAATGTAGTATTTGTACACACATAAGTA-TT--GAACATTTGAAATGCGG-A-AATCAGGTCTTTGGAAC----AAATACTAGCTCTACATGCAGGGC------TGA--AAAAAAAACCTAAAACGTCCCATTATTGCAAGAAACATAAACGGAACCACACTTTG---AAAAAAAGGTGCCGTCTTTTAATGCAACC-AATTTAAAATGTCAACATCCAGGCAGTTTGATA----AAACAAATGACGAAATGGTTATATATACATAAATAAACTATTTCAACTGTGTTTTCAAGCATTTATCGTATTATGTTTTCTTATAAGATGAATCATATTGAAACAGCCTTTAACACAAAATCTTTGTATTATTTACTTGCGAAGTGTCCTCGATATATTTTTTTATGGCAAATAGGTGCCTTTGGCGACCGACAGCAGAAGTAAGTC-----T-ATTTGATTGATCTTT-------------------CAATA----ATCGATC-------A-TT--------TGAA-AGATTTTATGT----TGT--TTT-TC--GGCTTTATTTTAAAGGCAA--TTGAAT----TATGCATAACCTACGACTGTATTGTGGTAT--GGCCG---AT-AC--AGACC-------------ATGTAGATTGCTCAGAAACAAACCGCAATAAACCGAAATACCGGTATATCGGAACAGTCCTAG
gi|5 : GTGCATTGCCGCGACAAGTCTGATATGATA---TAT-TATGTGATTTAGGTAGACTGATACGCAA----------TATGAAA--------Tga
gi|5 : tggggacTGTTGAGTG-TAAATAGACTTTGCCCATTATAT----AATGTAGA-CAGTTTA-TAGTTTG-TT-ATT-ATTTTTTTATCAACTTCCTTTTGTCTTTTTATATTTC--AT-TGCAAA---------AAGTGTGAATGCCAGGCAGAGTTT--TAATAATGCAAATTTAGTATTCGTATGT------ACACATTAAAA--TGCGA--------------------AGAACCTACACTGG--TTACCTG--GTTTATAAATAGACTAtcagcttttaactgctgatgtttgactctttaatgtcctctagttttctatgaaaactgcaacagtgatgtttattacttttgttgagtgtaaatagactttgcccattatataatgtagacagtttatagtttgttattatttttttatcaacttccttttgtctttttatatttcattgcaaaaagtgtgaatgccaggcagagttttaataatgcaaatttagtattcgtatgtacacattaaaatgcgaagaacctacactggttacctggtttataaatagactacaataattccacaaagtaaaactggttggccatttgaaatttgataatttgaatggatttgctgctgttgtatcggctttattttaaagaatacatggagtcatgcacagcctgcatttgtaacatgatacagtcaatacggaaactgtccatataacatgcatatc
gi|5 : tggggacgtgcattgccgcgacaagtctgatatgatatattatgtgatttaggtagactgatacgcaatatgaaattcagcttttaactgctgatgtttgactctttaatgtcctctagttttctatgaaaactgcaacagtgatgtttattactttAAGTAAAAC-----T-----GGTTGGCCATT-------------------TGAAA----TTTGATA-------A-TT--------TGAATGGATTTGCTGC----TGT--TGTATC--GGCTTTATTTTAAAGAATACATGGAGT----CATGCACAGCCTGCATTTGTAACATGATAC--AGTCA---AT-AC--GGAAACTGTCCATATAACATGCATATcaataattccacaaagtaaaactggttggccatttgaaatttgataatttgaatggatttgctgctgttgtatcggctttattttaaagaatacatggagtcatgcacagcctgcatttgtaacatgatacagtcaatacggaaactgtccatataacatgcatatc
gi|6 : tggggacgtgcattgccgcgacaagtctgatatgatatattatgtgatttaggtagactgatacgcaatatgaaattcagcttttaactgctgatgtttgactctttaatgtcctctagttttctatgaaaactgcaacagtgatgtttattacttttgttgagtgtaaatagactttgcccattatataatgtagacagtttatagtttgttattatttttttatcaacttccttttgtctttttatatttcattgcaaaaagtgtgaatgccaggcagagttttaataatgcaaatttagtattcgtatgtacacattaaaatgcgaagaacctacactggttacctggtttataaatagactacaataattccacaG-TT-TAT--TGTTTTTATTCATTTCCAc
gi|6 : aacaTTTTAT-T--C--ATTTCCACA--GAAATTAAAGTTTGACTACCAAACAGAGTTT--TATTAACGCAA-TTTTGTATTCGTATAC------TAACATTGAAA------GAGTCAGAGATCT-AG-------AACCGATAGTAGCCCTACCTAATAATTATAAATAGATTACGTTATTGCAAAACAGTTTATTGTTATTG-T-TTT-TTTCTT---ATTTCCTTTCATTCTTTTTTT---TTTTA-AATACAAATTGAAA-TTAAAGTTTGAATGTCAAACGTAA-CTTATTTATGTAAATTTAGTATTCGTATACACAT-A-T--CT--GATAATTTGAAcagaaattaaagtttgactaccaaacagagttttattaacgcaattttgtattcgtatactaacattgaaagagtcagagatctagaaccgatagtagccctacctaataattataaatagattacgttattgcaaaacagtttattgttattgtttttttcttatttcctttcattctttttttttttaaatacaaattgaaattaaagtttgaatgtcaaacgtaacttatttatgtaaatttagtattcgtatacacatatctgataatttgaagactttatgctgtgtttttgggctttattttaaaggacattgaattattcctaacctatgactatcatgttatggttgatacaatatgcatattgttaaaaaacgaaccgcaataaaccggtatatcagaacagcactag
gi|6 : aacagtttattgtATA----TCTGATA-------A-TT--------TGAA--GACTTTATGC----TGTGTTTT-TG--GGCTTTATTTTAAAGGACA--TTGAAT----TATTCCTAACCTATGAC--TATCATGTTAT--G---------------------GTTGATACAATATGCATATTGTTAAAAAACGAACCGCAATAA--------ACCGGTATATCAGAACAGCACTAGgactttatgctgtgtttttgggctttattttaaaggacattgaattattcctaacctatgactatcatgttatggttgatacaatatgcatattgttaaaaaacgaaccgcaataaaccggtatatcagaacagcactag
gi|7 : aacagtttattgtttttattcatttccacagaaattaaagtttgactaccaaacagagttttattaacgcaattttgtattcgtatactaacattgaaagagtcagagatctagaaccgatagtagccctacctaataattataaatagattacgttattgcaaaacagtttattgttattgtttttttcttatttcctttcattctttttttttttaaatacaaattgaaattaaagtttgaatgtcaaacgtaacttatttatgtaaatttagtattcgtatacacTATTTTAACTGTTATTTCAATCGTTCATCAGGTTATGTTTTCTTATAAGAATAATTATATTGAAACAGCCTTTTACCCGAAATCTTTGTTTTATTTACTTGCGAAATGTCCTTGATATA-TTTTTTATCGTAAATAGGCACCTTTGGTGAACGGCAGC
gi|7 : CGGAAGTAAGGC-----T-ATTTGCTTGATTTCT-------------------CAATA----TTCGAGT-------A-TT--------TAAATAGATTTGATGC----TGT--TTT-TC--AGATTAATTTTAAAGACAA--TTGAAT----TATGCATAACCTACGACTGTA------------GCTG---AT-AC--AGACCCTGCCCATACAATATGCATATTGCTCAGAAACGAACCGCAATAAACCGGTATAC--------CGGAACAGCCTTAacgagccctgcagatttatgatttataaatagaatacggaagtaaggctatttgcttgatttctcaatattcgagtatttaaatagatttgatgctgtttttcagattaattttaaagacaattgaattatgcataacctacgactgtagctgatacagaccctgcccatacaatatgcatattgctcagaaacgaaccgcaataaaccggtataccggaacagccttaa
gi|8 : tattttaactgttatttcaatcgttcatcaggttatgttttcttataagaataattatattgaaacagccttttacccgaaatctttgttttatttacttgcgaaatgtccttgatatattttttatcgtaaataggcacctttggtgaacggcagcacgagccctgcagatttatgatttataaatagaataATTTTAACTGTTATTTCAATCGTTCATCAGGTTATGTTTTCTTATAAGAATAATTATATTGAAACAGCCTTTTACCCGAAATCTTTGTTTTATTTACTTGCGAAATGTCCTTGATATA-TTTTTTATCGTAAATAGGCACCTTTGGTGAACGGCAGCa
gi|8 : CGGAAGTAAGGC-----T-ATTTGCTTGATTTCT-------------------CAATA----TTCGAGT-------A-TT--------TAAATAGATTTGATGC----TGT--TTT-TC--AGATTAATTTTAAAGACAA--TTGAAT----TATGCATAACCTACGACTGTA------------GCTG---AT-AC--AGACCCTGCCCATACAATATGCATATTGCTCAGAAACGAACCGCAATAAACCGGTATAC--------CGGAACAGCCTTAacgagccctgcagatttatgatttataaatagaatacggaagtaaggctatttgcttgatttctcaatattcgagtatttaaatagatttgatgctgtttttcagattaattttaaagacaattgaattatgcataacctacgactgtagctgatacagaccctgcccatacaatatgcatattgctcagaaacgaaccgcaataaaccggtataccggaacagccttaa
gi|9 : attttaactgttatttcaatcgttcatcaggttatgttttcttataagaataattatattgaaacagccttttacccgaaatctttgttttatttacttgcgaaatgtccttgatatattttttatcgtaaataggcacctttggtgaacggcagcacgagccctgcagatttatgatttataaatagaataGTTTCCTTATAAGA-------TATTGAGACAAACTTTAATCCGCAATCTTTGTTTTATTGACTTTCGAAATGTCCTTCA-----TTTTTTATTGCAAATTGGCGCCTGTGCCGACCGACAGCGAGAGTa
gi|9 : AAGTAAGGCCATACT-ATTTGTTTGATCTCT-------------------CGATA----TTTAATC-------A-T----------------ATTTGATGC----CGT--TTT-TA--GGCTTTATTTTAAAGAATA--TTGAAT----TATGCATAACCTACGTCTGTATCGCGGTAT--GGCCT---AT-AC------CCTGCTGAT-------------TGCTCAGAAACGAACTGCAATAAACCTGTATAATGGTATATCGGAACAGCTCTAGcctgcagatttatgatttatagatagaataccaaagtaaggccatactatttgtttgatctctcgatatttaatcatatttgatgccgtttttaggctttattttaaagaatattgaattatgcataacctacgtctgtatcgcggtatggcctataccctgctgattgctcagaaacgaactgcaataaacctgtataatggtatatcggaacagctctag
blockSeqs : CAT T T GGCC TTGTGATATAAATGTC . AAAT G AC G AA T A . T G A . T TA AAT TG T A A C ATGTATG TTCGAAATCTG A AGA A TA T C T T TTCTTT ATA G T C T A TTATT A A G TAG AGAA CTACCC CT CT A T AAA A T G A AA GAAAC A GT G TG A T T T CATAC A T AAATAGAATATCGAAGTAA TTTG TCTCAAT A TGATAATT TG AGTT GT G TG CA AGCA CT AA GTGT T G T C G
blockSeqs : . . C CATC TATGATA . . A . . GT . T . . . . . T TA AAC . C . T G A TACGAAGTCGC . AGA A . . . C . T . . T T T T CTTAT A T G AAG . . . CC A A . A T A A AG A TA A AT T T T T . . A . . . . . TA . . A . . . CC . A . A A T A
blockSeqs : . . T GGCT TACGATA . . A . . GG . . . . . . . T CA TTT . C . A A G TGTGAAGTTGG . CT G . . . C . G . . . T T A GTATT A T G AAA . . . AC . G . . C A T . . TA A AT T T . A . . G . . . . . TG . . . . . . GC . A . G C C T
blockSeqs : . . T GGCC TACAATA . . A . . GG . . . . . . . T TA AAT . C . G T G TGCGAAGTCGG . AA G . . . . . T . . . . . . TCT T . A . . A . . C . . . . . TG . . . . . . GC . T . G C C A
blockSeqs : . . G GACT TATGAAA . . T . . GG . . . . . . . T TA TTT . T . T G A AATTTGAAAT . . A . A . . C . . . . . TA . . . . . . AC . G . A C A A
blockSeqs : . . C CT CGATA . . A . . TG . . . . . . . T TA GGC . C . A A G GAGTCAG . . A T . . T . . . . . TA . . . . . . GC . A . G A C A
blockSeqs : . . T GG TA G . . . . . . . . . . . T AAC . . . T G A TGCGA . . T . . . . . . . . T . . . . . . AC . G . G T C A
blockSeqs : . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . T G T A . . G . . . . . . . . A . . . . . . AG . A . A C T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . G . G C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . GT . A . A A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . AT . G . A C . .
blockSeqs : . . . AT . G . . C
blockSeqs : . . GC . T . . C
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : TACGATA****************** ** TA A** NTATT*** G**
originalCons : GCTGTGTATTGCCAGGACACTTCCGATACAATA---TGT-ACCGCGATACGGGTAGGCCGATACGCAA----------TACGATA--------TGATACGCTGCTTAACATTAGAAAA-CAATCTTACTTT----TGCTTTGTAGTTCTCATTGATTTGAAATACACAAGTATCGAGTGACAAATAG--TTT-CGTATTTTGTCGGTAACGCGGAACAGTTTA-TTGTTTG-TT-TAT-ATGTTTTTATTTGTTTCCAATT-TCCTTTTAT-TTTC--ATATGCAAATTAAAATTAAAGTTTGAATGCCAAACGGAGTTT--TATTAACGCAA-TTTAGNATTCGTATAC------GCATATTGAAA--TGCGAAGTCGGAGCTCT-AGA-ACTAGAACCGATACTAGCTCTACCTGATGTTTATAAATAGACTATGTTACTGCAAAACAGTTTATTGT--TTG-T-TTTATTTTTTCCAATTTTC-TTCA-----TTTTT---TTTTA-AATGCAAATTGAAATTTAAAGTTTAAATGTCAAACGGGGTTTTATTTACTTAAATGTAGTATTCGTACACACATAA-T--TT--GAACATTTGAAANGCGG-A-G-TCAGGCCTCTAGAAC----TGATACTAGCTCTACATGCAGGGC------TGA--AAAAAAACCCTAAAACGTCCCGTTATTGCAAGAAACATAAACGGAGCCGCACTTTG---AAAAAAAGGTGCCGACTTTTAATGCAACC-GATTTAGAAAGTCAACATCCTGGCAATTTGATG----AAACAAAGGAGGAAATGGTTTTATATACGTAAATNAACTATTTTAACTGTNNTTTCAATCGTTCATCGGGTTATGTTTTCTTATAAGAATAATTATATTGAAACAGCCTTTNACCCGAAATCTTTGTTTTATTTACTTGCGAAATGTCCTTGATATATTTTTTTATCGCAAATNGGCGCCTTTGGCGACCGACAGCGGAAGTAAGGC-----T-ATTTGNTTGATCTCT-------------------CGATA----TTTGATC-------A-TT--------TGAATAGATTTGATGC----TGT--TTT-TC--GGCTTTATTTTAAAGGATA--TTGAAT----TATGCATAACCTACGACTGTATCGCGGTAT--GGCCG---AT-AC--GGACCCTGCCGATACAATACGCATATTGCTCAGAAACGAACCGCAATAAACCGGTATACCGGTATATCGGAACAGCCCTAG
finalCons : GCTGTGTATTGCCAGGACACTTCCGATACAATA---TGT-ACCGCGATACGGGTAGGCCGATACGCAATACGATA------------------TGATACGCTGCTTAACATTAGAAAA-CAATCTTACTTT----TGCTTTGTAGTTCTCATTGATTTGAAATACACAAGTATCGAGTGACAAATAG--TTT-CGTATTTTGTCGGTAACGCGGAACAGTTTA-TTGTTTG-TT-TAT-ATGTTTTTATTTGTTTCCAATT-TCCTTTTAT-TTTC--ATATGCAAATTAAAATTAAAGTTTGAATGCCAAACGGAGTTT--TATTAACGCAA-TTTAGNATTCGTATAC------GCATATTGAAA--TGCGAAGTCGGAGCTCT-AGA--CTAGAACCGATACTAGCTCTACCTGATGTTTATAAATAGACTATGTTACTGCAAAACAGTTTATTGT--TTG-T-TTTATTTTTTCCAATTTTC-TTCA-----TTTTT---TTTTA-AATGCAAATTGAAATTTAAAGTTTAAATGTCAAACGGGGTTTTATTTACTTAAATGTAGTATTCGTACACACATAANTATT---GAACATTTGAAANGCGG-A-G-TCAGGCCTCTAGAAC----TGATACTAGCTCTACATGCAGGGC------TGA--AAAAAAACCCTAAAACGTCCCGTTATTGCAAGAAACATAAACGGAGCCGCACTTTG---AAAAAAAGGTGCCGACTTTTAATGCAACC-GATTTAGAAAGTCAACATCCTGGCAATTTGATG----AAACAAAGGAGGAAATGGTTTTATATACGTAAATNAACTATTTTAACTGTNNTTTCAATCGTTCATCGGGTTATGTTTTCTTATAAGAATAATTATATTGAAACAGCCTTTNACCCGAAATCTTTGTTTTATTTACTTGCGAAATGTCCTTGATATATTTTTTTATCGCAAATNGGCGCCTTTGGCGACCGACAGCGGAAGTAAGGC-----T-ATTTGNTTGATCTCT-------------------CGATA----TTTGATC-------A-TT--------TGAATAGATTTGATGC----TGT--TTT-TC--GGCTTTATTTTAAAGGATA--TTGAAT----TATGCATAACCTACGACTGTATCGCGGTAT--GGCCG---AT-ACG--GACCCTGCCGATACAATACGCATATTGCTCAGAAACGAACCGCAATAAACCGGTATACCGGTATATCGGAACAGCCCTAG
Alignments
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lowQualScore : ... . . .... ......................... . .... . . .. . .. . . . . . . . .. . .. ... . .. . . . . ....... .......................... . . . .. . . . . . ...... ... . . .... . . .. . . . . .... . .... ...... .. ... . . . .... . .. . . .. ..... . . . .. . . .. . . . . . ..... . . ................... .... ....... . ........ .. .... .. . .. .. .... .. .. .... . ... . . . . .
lowQualScore : 888 4 4 0000 7777777777777777777777777 7 1111 1 1 11 4 00 4 0 0 9 0 0 4 11 9 66 777 0 11 7 4 0 8 9999999 33333333333333333333333333 7 8 8 00 0 0 8 2 0 666666 000 0 8 8888 8 8 66 0 0 0 5 2222 2 2222 888888 88 000 2 2 2 8888 2 00 2 2 00 55555 2 7 0 00 2 8 66 8 0 8 3 0 00000 0 2 2222222222222222222 5555 8888888 3 11111111 00 1111 66 7 66 77 7777 55 44 6666 5 777 5 2 2 4 5
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Reference ( family-3073 ) : GCTGTGTATTGCCAGGACACTTCCGATACAATA---TGT-ACCGCGATACGGGTAGGCCGATACGCAA----------TACGATA--------TGATACGCTGCTTAACATTAGAAAA-CAATCTTACTTT----TGCTTTGTAGTTCTCATTGATTTGAAATACACAAGTATCGAGTGACAAATAG--TTT-CGTATTTTGTCGGTAACGCGGAACAGTTTA-TTGTTTG-TT-TAT-ATGTTTTTATTTGTTTCCAATT-TCCTTTTAT-TTTCATAT--GCAAATTAAAATTAAAGTTTGAATGCCAAACGGAGTTT--TATTAACGCAA-TTTAGNATTCGTATAC------GCATATTGAAA--TGCGAAGTCGGAGCTCT--AGA--CTAGAACCGATACTAGCTCTACCTGATGTTTATAAATAGACTATGTTACTGCAAAACAGTTTATTGT--TTG-T-TTTATTTTTTCCAATTTTC-TTCA-----TTTTT---TTTTA-AATGCAAATTGAAATTTAAAGTTTAAATGTCAAACGGGGTTTTATTTACTTAAATGTAGTATTCGTACACACATAANTATTGAACATTTGAAANGCGG-AG-TCAGGCCTCTAGAAC----TGATACTAGCTCTACATGCAGGG------CTGA--AAAAAAACCCTAAAACGTCCCGTTATTGCAAGAAACATAAACGGAGCCGCACTTTG---AAAAAAAGGTGCCGACTTTTAATGCAACC-GATTTAGAAAGTCAACATCCTGGCAATTTGATG----AAACAAAGGAGGAAATGGTTTTATATACGTAAATNAACTATTTTAACTGTNNTTTCAATCGTTCATCGGGTTATGTTTTCTTATAAGAATAATTATATTGAAACAGCCTTTNACCCGAAATCTTTGTTTTATTTACTTGCGAAATGTCCTTGATATATTTTTTTATCGCAAATNGGCGCCTTTGGCGACCGACAGCGGAAGTAAGGC-----T-ATTTGNTTGATCTCT-------------------CGATA----TTTGATC-------A-TT--------TGAATAGATTTGATGC----TGT--TTT-TC--GGCTTTATTTTAAAGGAT--ATTGAAT----TATGCATAACCTACGACTGTATCGCGGTAT--GGCCG---AT-AC--GGACCCTGCCGATACAATACGCATATTGCTCAGAAACGAACCGCAATAAACCGGTATACCGGTATATCGGAACAGCCCTAG
gi|1 : GCTGTGTATTGCCAGGACACTTTTGATACAATA---TGT-ACTGCGATACGGGTAGGCTGATACCCAAAACGATACGATACGATA--------TGATACGCTGCTTAACATCAGAAAAACAATCTTACTGT----TGCTTTGTAGTTCTCATTGATTTGAAATACACAAGTATCGAGTGACAAATAG--TTT-CGTATTTTGTCGGTAATGCGGAACAGTTTA-TTGTTTG-TTATAT-ATGTTTATATTTGTTTCCAATT-TCCTTTTAT-TTTCATATATGCAAATTAAAAT--AAGTTTGAATTCCAAATGGAGTAT--TATTAATGCCA-TTTAGAATTCATATAC------ACATATTAAAA--TGCGAAGTCAGAGCTCT--AGAGACTAGAACCAATACTTGCTCTTCCTGATGTTTATAAATAGACTGTG--ACTGCAAACCAGTTTATTGT--GTT-T-TTTATTTTTTCCAATTTTA-TTCA-----GCATT---TTTTT-AATGAAAATTGAAATTGAAAGTTTAAATATCAAACAGGGTTT-ATTTACTTAAATGTAGTATTTGTACACACATAATTATTGAA--------AGGC-----------CCTTTAGAAC----TGATACTAGCTCTACAGGCAGGA------CAGA--AAAAAAAAT-TAAAACATCCCGTTAATACAAGAAACATAAACGGAGCCGCACTTTG---AAAAAACTGAGCGGATTTTTAATGCAATCAAATTTAGAAGGTCAACATCCTGGCAATTTGATG----AAACAAAGGCGTAAATGGCTTTATA
gi|1 : atatttttcaactgtttacaccataaatgtagttgattatgcacttgaagttatgtagtttaatattcagtcataatgcttgaagttgaacatatatttaatatttattattatgaactatggtttataggTTTTATCGCAAATTGGTACCTTTAGCAACTGATAGCGgtcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatgttttatcgcaaattggtacctttagcaactgatagcgtcagccctgaagatttacgatttataaatagaatacggaagtaaggctttttctttcatctcttggtatttgatcaattgtatagatttgatgttgttttttggctttatttacaagaatgttgaattatgcataatccaccactgtatcgaggtatggccgataatcacaaaagctgtagatattgttaactttacgcat
gi|1 : atatttttcaactgtttacaccataaatgtagttgattatgcacttgaagttatgtagtttaatattcagtcataatgcttgaagttgaacatatatttaatatttattattatgaactatggtttatagggctgtgtattgccaggacacttttgatacaatatgtactgcgatacgggtaggctgatacccaaaacgatacgatacgatatgatacgctgcttaacatcagaaaaacaatcttactgttgctttgtagttctcattgatttgaaatacacaagtatcgagtgacaaatagtttcgtattttgtcggtaatgcggaacagtttattgtttgttatatatgtttatatttgtttccaatttccttttattttcatatatgcaaattaaaataagtttgaattccaaatggagtattattaatgccatttagaattcatatacacatattaaaatgcgaagtcagagctctagagactagaaccaatacttgctcttcctgatgtttataaatagactgtgactgcaaaccagtttattgtgttttttattttttccaattttattcagcatttttttaatgaaaattgaaattgaaagtttaaatatcaaacagggtttatttacttaaatgtagtatttgtacacacataattattgaaaggccctttagaactgatactagctctacaggcaggacagaaaaaaaaattaaaacatcccgttaatacaagaaacataaacggagccgcactttgaaaaaactgagcggatttttaatgcaatcaaatttagaaggtcaacatcctggcaatttgatgaaacaaaggcgtaaatggctttatagtcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatgCGGAAGTAAGGC-----T-TTTTCTTTCATCTCT-------------------TGGTA----TTTGATC-------A-AT--------TGTATAGATTTGATGT----TGT--TTT-TT--GGCTTTATTTACAAGAAT--GTTGAAT----TATGCATAATCCACCACTGTATCGAGGTAT--GGCCG---AT-Atcagccctgaagatttacgatttataaatagaatacggaagtaaggctttttctttcatctcttggtatttgatcaattgtatagatttgatgttgttttttggctttatttacaagaatgttgaattatgcataatccaccactgtatcgaggtatggccgataatcacaaaagctgtagatattgttaactttacgcat
gi|10 : atatttttcaactgtttacaccataaatgtagttgattatgcacttgaagttatgtagtttaatattcagtcataatgcttgaagttgaacatatatttaatatttattattatgaactatggtttatagggctgtgtattgccaggacacttttgatacaatatgtactgcgatacgggtaggctgatacccaaaacgatacgatacgatatgatacgctgcttaacatcagaaaaacaatcttactgttgctttgtagttctcattgatttgaaatacacaagtatcgagtgacaaatagtttcgtattttgtcggtaatgcggaacagtttattgtttgttatatatgtttatatttgtttccaatttccttttattttcatatatgcaaattaaaataagtttgaattccaaatggagtattattaatgccatttagaattcatatacacatattaaaatgcgaagtcagagctctagagactagaaccaatacttgctcttcctgatgtttataaatagactgtgactgcaaaccagtttattgtgttttttattttttccaattttattcagcatttttttaatgaaaattgaaattgaaagtttaaatatcaaacagggtttatttacttaaatgtagtatttgtacacacataattattgaaaggccctttagaactgatactagctctacaggcaggacagaaaaaaaaattaaaacatcccgttaatacaagaaacataaacggagccgcactttgaaaaaactgagcggatttttaatgcaatcaaatttagaaggtcaacatcctggcaatttgatgaaacaaaggcgtaaatggctttatagtcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatgttttatcgcaaattggtacctttagcaactgatagcgtcagccctgaagatttacgatttataaatagaataT--AGTGAATAGCATATGCATAAC----GACTACATTCTACTAG--GGCTGTGTATTACCAGGACACTTCCGTTACAATAC----ATTGTT---------ACCGCGATAatcacaaaagctgtagatattgttaactttacgcat
gi|10 : acaagcaaaagccaccaagtaacaaaattcctaggtacctaaactgaacctttcattGCTGTGTATTACCAGGACACTTCCGTTACAATACATTGTTACCGCGATATGGGTAGGCCAATACGCAA----------TA-------------TGATACAATGCTTAACATTAGAAAA-CATTCTTACTTT----TGCTCTGTTGTTCTCATTGATTTGAAATACACAAGTTTCGAGTGACAAATAG--TTT-TATATTTTGTCAATAACGTGCAACAGTTTATTTGTTTGACT-TAT-ATGTTATTATTTGTTTCAAATtgggtaggccaatacgcaatatgatacaatgcttaacattagaaaacattcttacttttgctctgttgttctcattgatttgaaatacacaagtttcgagtgacaaatagttttatattttgtcaataacgtgcaacagtttatttgtttgacttatatgttattatttgtttcaaatg
gi|11 : acaagcaaaagccaccaagtaacaaaattcctaggtacctaaactgaacctttcatttagtgaatagcatatgcataacgactacattctactaggGCTGTGTATTGCCAGGACACTTCCGATACAATA---TGT-ACCGCGCTACGGGAACATCGATACGCAA----------TA-------------TGATACGCTGCTTAACATTAGAAAA-CAATCTTACTTT----TGCTTAGTAGCTCCCATTGAGTTGAAATACACAAGTATCAACTGACAAGTAG--TTT-CGTATTTTGTC---AATG------------------------TAT-ATG-TTTTATTTGTTTCCGATT-TCCTTTTGT-TTTTATAT--GCAAATTAAAATTAAAGTTTGAATGCCAAATGGAGTTTTGTATTAA---AA-GTTGGAGCTC-----------------TTGAGA-----------------CT--AG-------AACCAATATTAGCTCTACCTGATATTTATAAATAg
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gi|2 : cagtgttcttgtaattgttatgaggtctcccaagtgtatatggattagggctgtgtattgccaggacactttccatacaataagtaccgcggtatgggtaggctgatacaaaatacgatacaatacgctgcttaacattagaaaacaatcttacttttgctttgtagttctcattgatttgacatacacaagtatcaagtgacaaaaagtttcatattttgtaggtaatgcggaacagtttattgtttgttttatatgtttttatttgtttccaatttccttttattttcatatgcaaattaaaatcaaagttttaatgccaaatggagtttcattaacgcaatttaggattcttatacatgtatgtatattgaaatacgaagtcgcagctctaaaaactagaaccgatactagctctacctgatgtgtatgaatatattgttttacagcaaaacggtttattgtttgtttttatttttttcaattttcttcatttttttttaaatgcaaattgaaagtttaaatgtaaaacggagttgtatttacttaactgtagtatttgtacacacataattatttaacatttgaaaagcggtagtcagacgtctagaacagaatgatactagctctacatgcagtgctgaaaaaaaacttttatttccgctgttgcaagaaacataaacagagccttactttgaaaaaaaaaaggtgctgacctttagtgcaactgatttatacagtcaacatcttggcagacaaaggaggaaatggttttatatacatacatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttCGGAAGTGTGGC-----T-ATTTGTTTGATCTCT-------------------CAATA----TTTAATC-------A-TT--------TGAATAGA---------------------------------TTTAA----T--GCTGAAT----TATGCATAACCTGTTACTGTATCGCAGTAT--GGCCA---AT-AC--AGACCCTGATGATACAATACGCATATTGCTCAGAAATGAACCACAATAAATCGGTATACCGGTAT-----AACAGCCCTAcctgcagatttatgatttataaatagaatacggaagtgtggctatttgtttgatctctcaatatttaatcatttgaatagatttaatgctgaattatgcataacctgttactgtatcgcagtatggccaatacagaccctgatgatacaatacgcatattgctcagaaatgaaccacaataaatcggtataccggtataacagccctaat
gi|20 : cagtgttcttgtaattgttatgaggtctcccaagtgtatatggattagggctgtgtattgccaggacactttccatacaataagtaccgcggtatgggtaggctgatacaaaatacgatacaatacgctgcttaacattagaaaacaatcttacttttgctttgtagttctcattgatttgacatacacaagtatcaagtgacaaaaagtttcatattttgtaggtaatgcggaacagtttattgtttgttttatatgtttttatttgtttccaatttccttttattttcatatgcaaattaaaatcaaagttttaatgccaaatggagtttcattaacgcaatttaggattcttatacatgtatgtatattgaaatacgaagtcgcagctctaaaaactagaaccgatactagctctacctgatgtgtatgaatatattgttttacagcaaaacggtttattgtttgtttttatttttttcaattttcttcatttttttttaaatgcaaattgaaagtttaaatgtaaaacggagttgtatttacttaactgtagtatttgtacacacataattatttaacatttgaaaagcggtagtcagacgtctagaacagaatgatactagctctacatgcagtgctgaaaaaaaacttttatttccgctgttgcaagaaacataaacagagccttactttgaaaaaaaaaaggtgctgacctttagtgcaactgatttatacagtcaacatcttggcagacaaaggaggaaatggttttatatacatacatgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttatttttttattgcaaattggtgcctttggcgacagacagcatgagtcctgcagatttatgatttataaatagaataTAAAAGAT--ACTGAAT----AATGCACAACTTATGGCTGTATCACGGTAT--GG---------------ACCATGCCCATACAATACGCATTTTACTAGGAAATGAATCACAATAAACTGGTATACat
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