lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111
lowQualScore : 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 1 55 4 4 777 4 2 4 222222 0 3 0 99999999 44 0
lowQualScore : . .......................................................... . . .. . . ... . . . ...... . . . ........ .. .
lowQualScore : 0 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 1 55 0 0 000 0 9 0 888888 2 6 5 99999999 55 3
consensus : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA---AA-A------A---------G-TTTTCCAATT------------GTC--------GGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATANTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTNA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTCGATCCAGCGATGAAAAACAGGCTANNCTAATGTCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
Reference ( gi|4 ) : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGAAAAATTATTGAA---AA-A------A---------G---------TT------------GTC--------GGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTTGATTCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|1 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA---AA-A------AAGTTTTCCAG---------TT------------GTC--------GGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGTTTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATTTTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|2 : tTTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA---AA-A------A---------AGTTTTCCAATT------------GTC--------GGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTATGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTTAAAAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|3 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA---AA-A------A---------AGTTTTCCAATT------------GTC--------GGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGTGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAATTAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGATAATG
gi|5 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAACTATTGAA---AA-A------A---------AGTTTTCCAATT------------GTC--------GGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAAATAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAA-------------AACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAAAGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTATATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGAGAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAAAAAGACTAGAGAATG
gi|7 : tCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTGAAATTATTGAA---CACA------A---------G---------TT------------TTCCAATTGTGAGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACAGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATATTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATTATTAATGTACATTGTAA-GTTAA-ATGTAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACATATTGTTAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCTTACCGGTATATTAGTAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTCGATCCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGT
gi|8 : CTCTTCATACCTGTATGTGTTTGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAACACAA-GTTTTCCA---------G---------TT------------GTG--------AGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACAGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATATTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---CTGAACTATCATAATTCATGTACATTGTAA-GTTAA-ATGTAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACATATTGTTAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAGTAAATTTTGTG
gi|6 : TCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCGGTAAAGAGAGTGTAAAATTATTGAAT--AC-A------A---------G---------TTTACCAATT----GTG--------GGTTTATTCAAGTTTGCTT-AAAGGCGACAGTTTAATTTTTAAAAAAAATTAATATTTCAAAGCAAACATTTTTAAAGCTAGAATTACTCTAAAACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAGCTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTAA-ATGTA-CTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTGCATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTTAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTGGAGTTTGATCCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGTCTGAACTAGACTAGAGAATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgaagt
gi|13 : AAATAGTGTACAAATATTGAA---AA-A------AA--------G---------TTTGCCAATTCAATGTT--------GGTTTATTCAAGTCTGCTT-ATGGGTGACAGTTTAAATTTTACAAAT--TTAATATTTAAAAGCAAACA-TTTTGAAGCT
gi|9 : AAGAGTGTAAATTTATTGAA---TA-A------A---------GATTTTCCAATT------------GTC--------GGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCAACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGGAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAATGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACCTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGGAATGAGGATAGTGAAAAATGTT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTTGACCCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGTCTGAACTAGACTAGAGAATG
gi|11 : AATTATTGAA---AACA------A---------G---------TT------------TTCCAATTGTGGGTTTATTAACGTTTGCTTTCATGGCGACAGTATAATTTTTACAAAA--TTGATATTTAA--GTTAACAGTTTTAAAGCTAGAATTACTATAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTAA-ATGTAG
gi|10 : TAAGACACGGAAGACGTTGTGCTATTGTAATTATTGTA---TGTAGTGTTCATCTGTAGCTTCACAATGCATCCTTGTAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTGAGATGGAAGGTGTTGGTTCAATCCCAACTAAGAATAATTGTTGGAGGCTTCTTACTTCACAATGCAAATCTGTTTTAAATTAATGAAATGAG
gi|12 : tAAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|15 : TTA-TAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCCGGAATATAAGCATGATTTTGA------TCCCGCAATGAAAAACAGACTACTCTTATGTCTGATGTCTGAACTAGAATAGA
gi|14 : TAAGTAAG-ATTGTGTTTATTTCAGGAACATTAGCATGATTTTGA------TCCCGCAATGAAAAACAGGCTACTCTTATGTCTGATGTCTGAGCTAGACTAGAAAAT
gi|16 : AGTTAAATGTAGCAATGAAAGACAGGCTACTCTAATGCCTGATGTCTGAACTGGACTAAAGAATG
Alignments
lowQualScore : 2 111111
lowQualScore : 3 1 7 3 7777 0 3 55 1 3 666 3 1 3 111111 0 3 66666 22
lowQualScore : . . . . .... . . .. . . ... . . . ...... . . ..... ..
lowQualScore : 6 8 3 6 7777 5 6 00 0 6 444 6 0 6 555555 1 3 22222 00
consensus : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AA-AA-G-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATANTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTNA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTCGATCCAGCGATGAAAAACAGGCTAGNCTAATGTCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
Reference ( family-176 ) : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AA-AA-G-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATANTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTNA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTCGATCCAGCGATGAAAAACAGGCTANNCTAATGTCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|1 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AAAAA-G-TTTTCCAGTT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGTTTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATTTTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|10 : tTAAGACACGGAAGACGTTGTGCTATTGTAATTATTGTA---TGTAGTGTTCATCTGTAGCTTCACAATGCATCCTTGTAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTGAGATGGAAGGTGTTGGTTCAATCCCAACTAAGAATAATTGTTGGAGGCTTCTTACTTCACAATGCAAATCTGTTTTAAATTAATGAAATGAG
gi|11 : tAATTATTGAA-AACAA-G-TTTTCCAATT----GTGGGTTTATTAACGTTTGCTTTCATGGCGACAGTATAATTTTTACAAAA--TTGATATTTAA--GTTAACAGTTTTAAAGCTAGAATTACTATAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTAA-ATGTAG
gi|12 : AAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|13 : AAATAGTGTACAAATATTGAA-AA-AAAG-TTTGCCAATTCAATGTTGGTTTATTCAAGTCTGCTT-ATGGGTGACAGTTTAAATTTTACAAAT--TTAATATTTAAAAGCAAACA-TTTTGAAGCT
gi|14 : TAAGTAAG-ATTGTGTTTATTTCAGGAACATTAGCATGATTTTGA------TCCCGCAATGAAAAACAGGCTACTCTTATGTCTGATGTCTGAGCTAGACTAGAAAAT
gi|15 : TTA-TAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCCGGAATATAAGCATGATTTTGA------TCCCGCAATGAAAAACAGACTACTCTTATGTCTGATGTCTGAACTAGAATAGA
gi|16 : AGTTAAATGTAGCAATGAAAGACAGGCTACTCTAATGCCTGATGTCTGAACTGGACTAAAGAATG
gi|2 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AAAAA-G-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTATGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTTAAAAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|3 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AAAAA-G-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGTGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAATTAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGATAATG
gi|4 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGAAAAATTATTGAA-AA-AA-G-TT------------GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTTGATTCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|5 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAACTATTGAA-AA-AAAG-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAAATAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAA-------------AACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAAAGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTATATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGAGAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAAAAAGACTAGAGAATG
gi|6 : tTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCGGTAAAGAGAGTGTAAAATTATTGAATAC-AA-G-TTTACCAATT----GTGGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AAAGGCGACAGTTTAATTTTTAAAAAAAATTAATATTTCAAAGCAAACATTTTTAAAGCTAGAATTACTCTAAAACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAGCTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTAA-ATGTA-CTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTGCATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTTAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTGGAGTTTGATCCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGTCTGAACTAGACTAGAGAAT
gi|7 : CTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTGAAATTATTGAA-CACAA-G-TTTTCCAATT----GTGAGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACAGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATATTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATTATTAATGTACATTGTAA-GTTAA-ATGTAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACATATTGTTAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCTTACCGGTATATTAGTAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTCGATCCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGT
gi|8 : CTCTTCATACCTGTATGTGTTTGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-CACAA-G-TTTTCCAGTT----GTGAGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACAGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATATTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---CTGAACTATCATAATTCATGTACATTGTAA-GTTAA-ATGTAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACATATTGTTAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAGTAAATTTTGTG
gi|9 : AAGAGTGTAAATTTATTGAA-TA-AA-GATTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCAACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGGAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAATGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACCTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGGAATGAGGATAGTGAAAAATGTT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTTGACCCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGTCTGAACTAGACTAGAGAATGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgaagt
Alignments
lowQualScore : 2 111111
lowQualScore : 3 1 7 3 7777 0 3 55 1 3 666 3 1 3 111111 0 3 66666 11
lowQualScore : . . . . .... . . .. . . ... . . . ...... . . ..... ..
lowQualScore : 6 8 3 6 7777 5 6 00 0 6 444 6 0 6 555555 1 3 22222 88
consensus : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AA-AA-G-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATANTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTNA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTCGATCCAGCGATGAAAAACAGGCTAGNCTAATGTCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
Reference ( family-176 ) : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AA-AA-G-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATANTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTNA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTCGATCCAGCGATGAAAAACAGGCTAGNCTAATGTCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|1 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AAAAA-G-TTTTCCAGTT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGTTTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATTTTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|10 : tTAAGACACGGAAGACGTTGTGCTATTGTAATTATTGTA---TGTAGTGTTCATCTGTAGCTTCACAATGCATCCTTGTAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTGAGATGGAAGGTGTTGGTTCAATCCCAACTAAGAATAATTGTTGGAGGCTTCTTACTTCACAATGCAAATCTGTTTTAAATTAATGAAATGAG
gi|11 : tAATTATTGAA-AACAA-G-TTTTCCAATT----GTGGGTTTATTAACGTTTGCTTTCATGGCGACAGTATAATTTTTACAAAA--TTGATATTTAA--GTTAACAGTTTTAAAGCTAGAATTACTATAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTAA-ATGTAG
gi|12 : AAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|13 : AAATAGTGTACAAATATTGAA-AA-AAAG-TTTGCCAATTCAATGTTGGTTTATTCAAGTCTGCTT-ATGGGTGACAGTTTAAATTTTACAAAT--TTAATATTTAAAAGCAAACA-TTTTGAAGCT
gi|14 : TAAGTAAG-ATTGTGTTTATTTCAGGAACATTAGCATGATTTTGA------TCCCGCAATGAAAAACAGGCTACTCTTATGTCTGATGTCTGAGCTAGACTAGAAAAT
gi|15 : TTA-TAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCCGGAATATAAGCATGATTTTGA------TCCCGCAATGAAAAACAGACTACTCTTATGTCTGATGTCTGAACTAGAATAGA
gi|16 : AGTTAAATGTAGCAATGAAAGACAGGCTACTCTAATGCCTGATGTCTGAACTGGACTAAAGAATG
gi|2 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AAAAA-G-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTATGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTTAAAAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|3 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AAAAA-G-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGTGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAATTAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGATAATG
gi|4 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGAAAAATTATTGAA-AA-AA-G-TT------------GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTTGATTCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|5 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAACTATTGAA-AA-AAAG-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAAATAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAA-------------AACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAAAGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTATATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGAGAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAAAAAGACTAGAGAATG
gi|6 : tTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCGGTAAAGAGAGTGTAAAATTATTGAATAC-AA-G-TTTACCAATT----GTGGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AAAGGCGACAGTTTAATTTTTAAAAAAAATTAATATTTCAAAGCAAACATTTTTAAAGCTAGAATTACTCTAAAACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAGCTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTAA-ATGTA-CTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTGCATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTTAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTGGAGTTTGATCCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGTCTGAACTAGACTAGAGAAT
gi|7 : CTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTGAAATTATTGAA-CACAA-G-TTTTCCAATT----GTGAGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACAGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATATTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATTATTAATGTACATTGTAA-GTTAA-ATGTAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACATATTGTTAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCTTACCGGTATATTAGTAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTCGATCCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGT
gi|8 : CTCTTCATACCTGTATGTGTTTGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-CACAA-G-TTTTCCAGTT----GTGAGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACAGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATATTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---CTGAACTATCATAATTCATGTACATTGTAA-GTTAA-ATGTAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACATATTGTTAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAGTAAATTTTGTG
gi|9 : AAGAGTGTAAATTTATTGAA-TA-AA-GATTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCAACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGGAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAATGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACCTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGGAATGAGGATAGTGAAAAATGTT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTTGACCCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGTCTGAACTAGACTAGAGAATGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgaagt
blockSeqs : T C A A CAAT T AA T C ACG T C T TACCGG T NNNNN NN
blockSeqs : . A A . . . . T . . . A . . . GTTAA CT
blockSeqs : . A . . . . . A . . . T . . . NNNNN CT
blockSeqs : . C . . . . . A . . . T . . . NNNNN CT
blockSeqs : . C . . . . . A . . . T . . . GTTTG NN
blockSeqs : . . . . . . . A . . . T . . . NNNNN NN
blockSeqs : . . . . . . . T . . . A . . . GTTTG GA
blockSeqs : . . . . . . . T . . . A . . . GTTCG NN
blockSeqs : . . . . . . . T . . . A . . . GTTTG GA
blockSeqs : . . . . . . . A . . . T . . . GA
blockSeqs : . . GA
blockSeqCons :
originalCons : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AA-AA-G-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATANTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTNA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTCGATCCAGCGATGAAAAACAGGCTAGNCTAATGTCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
finalCons : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AA-AA-G-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATANTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTNA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTCGATCCAGCGATGAAAAACAGGCTAGNCTAATGTCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
Alignments
lowQualScore : 2 111111
lowQualScore : 3 1 7 3 7777 0 3 55 1 3 666 3 1 3 111111 0 3 66666 11
lowQualScore : . . . . .... . . .. . . ... . . . ...... . . ..... ..
lowQualScore : 6 8 3 6 7777 5 6 00 0 6 444 6 0 6 555555 1 3 22222 88
consensus : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AA-AA-G-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATANTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTNA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTCGATCCAGCGATGAAAAACAGGCTAGNCTAATGTCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
Reference ( family-176 ) : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AA-AA-G-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATANTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTNA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTCGATCCAGCGATGAAAAACAGGCTAGNCTAATGTCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|1 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AAAAA-G-TTTTCCAGTT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGTTTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATTTTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|10 : tTAAGACACGGAAGACGTTGTGCTATTGTAATTATTGTA---TGTAGTGTTCATCTGTAGCTTCACAATGCATCCTTGTAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTGAGATGGAAGGTGTTGGTTCAATCCCAACTAAGAATAATTGTTGGAGGCTTCTTACTTCACAATGCAAATCTGTTTTAAATTAATGAAATGAG
gi|11 : tAATTATTGAA-AACAA-G-TTTTCCAATT----GTGGGTTTATTAACGTTTGCTTTCATGGCGACAGTATAATTTTTACAAAA--TTGATATTTAA--GTTAACAGTTTTAAAGCTAGAATTACTATAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTAA-ATGTAG
gi|12 : AAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|13 : AAATAGTGTACAAATATTGAA-AA-AAAG-TTTGCCAATTCAATGTTGGTTTATTCAAGTCTGCTT-ATGGGTGACAGTTTAAATTTTACAAAT--TTAATATTTAAAAGCAAACA-TTTTGAAGCT
gi|14 : TAAGTAAG-ATTGTGTTTATTTCAGGAACATTAGCATGATTTTGA------TCCCGCAATGAAAAACAGGCTACTCTTATGTCTGATGTCTGAGCTAGACTAGAAAAT
gi|15 : TTA-TAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCCGGAATATAAGCATGATTTTGA------TCCCGCAATGAAAAACAGACTACTCTTATGTCTGATGTCTGAACTAGAATAGA
gi|16 : AGTTAAATGTAGCAATGAAAGACAGGCTACTCTAATGCCTGATGTCTGAACTGGACTAAAGAATG
gi|2 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AAAAA-G-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTATGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTTAAAAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|3 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-AAAAA-G-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGTGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAATTAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAACTAGACTAGATAATG
gi|4 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGAAAAATTATTGAA-AA-AA-G-TT------------GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTTGATTCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGTCCGAACTAGACTAGAGAATG
gi|5 : TTACTTCTCTTACCTATGTACCTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAACTATTGAA-AA-AAAG-TTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAAATAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAA-------------AACA-GGAAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAAAGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTATATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGAGAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTGAAGTCCGAAAAAGACTAGAGAATG
gi|6 : tTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCGGTAAAGAGAGTGTAAAATTATTGAATAC-AA-G-TTTACCAATT----GTGGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AAAGGCGACAGTTTAATTTTTAAAAAAAATTAATATTTCAAAGCAAACATTTTTAAAGCTAGAATTACTCTAAAACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAGCTATCATAATTAATGTACAGTGTAA-GTTAA-ATGTA-CTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTGCATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACGTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTTAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTGGAGTTTGATCCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGTCTGAACTAGACTAGAGAAT
gi|7 : CTCTTCATACCTGTATGTGTATGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTGAAATTATTGAA-CACAA-G-TTTTCCAATT----GTGAGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACAGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATATTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---TTGAACTATCATTATTAATGTACATTGTAA-GTTAA-ATGTAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACATATTGTTAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCTTACCGGTATATTAGTAAGTAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTCGATCCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGT
gi|8 : CTCTTCATACCTGTATGTGTTTGTGTGTCGCTGTAAAAAGAGTGTAAAATTATTGAA-CACAA-G-TTTTCCAGTT----GTGAGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCGACAGTTTAATTTTTACAAAA--TTGATATTTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGAAT---CTGAACTATCATAATTCATGTACATTGTAA-GTTAA-ATGTAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACATATTGTTAATCAGTTTTGAATTTATGAAATGAGGATAGTGAAAAATGCT------TATATTAGTAAGTAAATTTTGTG
gi|9 : AAGAGTGTAAATTTATTGAA-TA-AA-GATTTTCCAATT----GTCGGTTTATTCAAGTTTGCTT-AATGGCAACGATTTAATTTTTACAAAA--TTGATAATTAAAAGCAAACATTTTTAAAGCTTGAATTACTGTAAGACTTAAAAATAAAACA-GGGAT---TTGAACTATCATAATTAATGTACAATGTAA-GTTTA-ATGCAGCTTCAAAATGCATCCTTATAGTACAATGAAGTACATCTGTCTTTAAGATGGAAGATGTTGGTTCAATCCCAACTAAGGATATCTGTTGGAGGCTTCATACTACCTATTGTAAATCAGTTTTGAATTTATGGAATGAGGATAGTGAAAAATGTT------TATATTAGTAAATAAG-TTTGTGTTTATTTCAGGAATGGTAGCATAATTTTGAGTTTGACCCAGTGATGAAAAACAGGCTAGATTAATGTCTGAAGTCTGAACTAGACTAGAGAATGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgaagt