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Reference ( gi|10 ) : CCTAAATTAATTAATA------GTGTGGTTCCTG----TTA---CA-TGGAAA-TACAAAATA----G----GG----T----A----GGTA-----G---------------------GT-------------A----------------------A----------------------AT------------------TATTTAT------------------------TT------------------TG-CATTGTCGATAC--TA------TCCGTTTTCT-GCAAGTATA------TG----T----TATGTC-TGTAT----GTGAACA-----CACTTGTCATACATGATGGCGAGGCAGCTCTTGCTGGAGGCCGCCATGTTGCTGCTATCGTTACT----ATGAT--------------C--------------ACT--------------TCT--------------GGC-G------TTC--------A-------------GGTATAAAAGCTAAA-GGCCTACAATACAG-CAGAACCGTCGCCACCGGAAAC-GAAAATTGTGGACAC--TGCAG------ATACGGCCGAT-TT-T---T--T--------TA---------TATTTTATTTGA--------TT-TTT-TTTTTTAAGGGAATAAAT-GTTTAG---GGT-CGGCGGGAAG-----TAAAAGGGATGG-TCG---GGAAACC-GGAACCACAC-TATTAT
gi|6 : CCTAAATTAATTAAT---------GTG-TTCCTA----TTA---CA-TGGAAA-TACAAAATA----GCATAGG----T----A----GGTA-----AACTATTTATTTATT-------GT-------------A----------------------A----------------------AT------------------TATTTAT------------------------TT------------------TG-CGTTGTTGATAC--TA------TCTGTTTTCT-GCGAGTATA------TG----T----TATGTC-TGTAT----GTGGACA-----CACTTGTCATACACGATGGCGAGGCAGCTCTTGCTGGAGGCCGCCATGCTGCTGCCATCGTTACT----ATGAT--------------C--------------ACT--------------TCT--------------GGC-G------ATC--------A-------------GGTATAAAAGCTTAA-GGCCTACAATACAG-CCAAACGGTCACCACCGGGAAC-GAAAATTGTGGACAC--GACAG------ATACGGCCCAT-TT-C----------------------------TTTTATTTGA-------------T-TTTTTTAAAGGAATAAAT-GTTTAG---GGT-CGGCAGGAAA-----TAATAGGGAAGG-TCG---GGAAAAC-GGAACCACAC-TTTTAT
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gi|11 : tTAAATTAAATAATA------GTGTGGTTCTGA----TTA---Cttaattt
gi|13 : ctaaattaataaatagtatggttcctattacatggaaatacaagataggataggtaggtaggtaaattatttattgtaaattatttattttgcgttgtcaatactatctgttttacgttatgtctgtatgtgtacacacttgtcatacacgatggtgaggcagctcttgctggaggctgccatgttgctgctatagttactaagatctcttccggcggtgcacttccggcaattgggtataaagctaaaggcctacaatacagccgaaccgtcgccaccgggaacaaaaattgttgggttttttttgggtttttttaagggaataaatgtttagggtctgcaggaaataatagagacggttgaTAGATTAAATAATA------GTGTGGTTCCAG----TT
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gi|15 : ggcctaaattttttaatagtgtggttcctattagaacatggaaatacaaatagggtaagtaggtaaattatttattttgcattgtcgatactatccgttttctttgagaataagttatgtctgtatgtggacacacttgtcacacacgatggcaaggcagctc--------------GGT-G------ATC--------G-------------GGTATAAAAGCTAAA-GGCCTGCAATACAG-CTGAACCATTGCTAACGGGAAC-GATAATTGTGGAAAC--AACAG------ATACAGCTGAA-TT-T---T--TAAAAAAAATA---------AA--------AA--------TT----------TAAGGGAATAAAT-GTTTAG---GGT-CAGCGGGAAA-----TAATAGGGACGG-TTG---GGAAACC-AGAACCTCAT-TATTATaaaaaaaaaataaaaatttaagggaataaatgtttagggtcagcggcaaataatagggacggttgggaaaccagaacctcattattatttaattta
gi|25 : ggcctaaattttttaatacatgtagtgtggtgcctattagaacatggaaatacaaatagggtaggtaggtaaattatttattttgcattgtcgatactatccgttttctttgagaataagttatgtctgtatgtggacacacttgtcacacacgatggcaaggcagctc------ATACGGCCGAT-TT-T---T--T--------TA---------T------TTTGA--------TT-TT------TTAAGGGAATAAAT-GTTTAG---GGT-CGGTGGGAAA-----TAATAGGGACGG-TTG---AGAAACC-GGAACCACAC-TATTATttaattta
gi|27 : acaggaattgacggagtgtTATTTTT--------TT-TTT-ATTTTTAAGGGAACAG-----TTAG---AGT-CGGCCGGAAA-----TAATAGAGACGGATCG---GGAAACC-AGAACTACAC--ATTttaattta
gi|28 : --------TT-TTT-TCTTTTCGTGGAA-AAATAGGTTAG---GGT-CGGCGGGAAA-----AAATAGGGTCGG-TCG---GGTAACC-GGAAACGCACTTATTtttatttaatt
gi|30 : -TTTTTTAAGGGAACAAAT-GTTTAA---GGT-TGG----AAT-----TAAAAGGGACGG-TTG---GGAAACC-TGAACCACAC-TATTATtttttatttg
gi|16 : taTTTAAGGGAATAAAT-GTTTAG---GGT-CAGCGGCAAA-----TAATAGGGACGG-TTG---GGAAACC-AGAACCTCAT-TATTAT
gi|20 : ggcctaaattttttaatagtgtggttcctattagaacatggaaatacaaatagggtaagtaggtaaattatttattttgcattgtcgatactatccgttttctttgagaataagttatgtctgtatgtggacacacttgtcacacacgatggcaaggcagctcggtgatcgggtataaaagctaaaaggcctgcaatacagctgaaccattgctaacgggaacgataattgtggaaacaacagatacagctgaattttaaaaaaaaaataaaaaTTTAAGGGAATAAAT-GTTTAT---GGT-CGGCAGGAAA-----TAATAGGGACAG-TTG---GGAAACTGGGAACCACAC-TATTATttaattta
gi|29 : ccatgttgctgctatcgttactatgatcacttctggcgatcaggtataaaagctaaaggcctacaatacaggcgcacctttgccaccgggaacaaaaattgtggacacaacagaaacggccggtggggggggggggggggggggggggTTAAGGGAACAG-----TTAG---AGT-CGGTCGGAAA-----TAATATAGTCAA-TCG---GGAAACC-AGAACTACAC-TTTTATttgattt
gi|31 : AATAA----TTTAG---GGT-CGG-GGCCA-------AAAAGATAGGG-TT--------ACC-GGAACCACAG-TATTATttaattta
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|13 : TAGATTAAATAATA------GTGTGGTTCCttaatcta
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gi|15 : ggcctaaattttttaatacatgtagtgtggtgcctattagaacatggaaatacaaatagggtaggtaggtaaattatttattttgcattgtcgatactatccgttttctttgagaataagttatgtctgtatgtggacacacttgtcacacacgatggcaaggcagctTTTAAGGGAATAAAT-GTTTA-----G---GGT-CAGCGG--GAAATAATAGGGACGG-TTG---GGAAACC-AGAACCTCAT-TATTATaaaaaaaataaaaatttaagggaataaatgtttagggtcagcgggaaataatagggacggttgggaaaccagaacctcattattatttaattta
gi|16 : ggcctaaattttttaatacatgtagtgtggtgcctattagaacatggaaatacaaatagggtaggtaggtaaattatttattttgcattgtcgatactatccgttttctttgagaataagttatgtctgtatgtggacacacttgtcacacacgatggcaaggcagctcggtgatcgggtataaaagctaaaggcctgcaatacagctgaaccattgctaacgggaacgataattgtggaaacaacagatacagctgaatttttaaaaaaaataaaaaCCTAAATTTTTTAATA------GTGTGGTTCCTA----TTAGAACA-TGGAAA-TACAAA-TA----G----GG----T----A----AGTA-----G-----------------G------------------------T----------------------AA----------------------A--------T------------------TA------------------TT----------TATTT-TG-CATTGTCGATAC--TA------TCCGTTTTCT-TTGAGAATA------AG----T----TATGTC-TGTATGTG---------GACACACTTGTCACACACGATGGCAAGGCAGCTCttaattta
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|19 : ggACACAATGGCGAGGCAACTCTTGCTGGAGGCCGCCATGTTGCTGCTATTGTTACT----ATGATTACTTCCAGCGGTGC--------------A--------------C--------------TT--------------C--------------C--------------A--------------GC-----------G--------------ATCAGGTATAAAAGCTAAA-GGCCTACAATACAGCCAAA-TCATTGCCAGTGGGAAT-GAAAATTGTGGGCACG--ACAG------ATACGGTAGAT-TT-T-T---------------------------------------------------TTTTTTAAGGGAATAAAT--TTTA-----G---GGT-CAGCGG--GAAATAATAAGGACTG-TCA---GGAAAAC-GGAACCACAC-TATTGTat
gi|2 : CCTAAATTAATTAATA------GTGTAGTTCCTA----TAA---CA-TGGAAA-TACAAAATA----G----GG----T----A----GGTATGTACGTAAATTATTTATTTATTG------------------------T----------------------AA----------------------A--------T------------------TA------------------TT----------TATTT-TG-CAATGTCGATAC--TACATGTGTCTGTTTTCT-GCGAGTA-A------TGG---T----TATGTC-TGTATGCG---------GACACACTTGTCATACACAATGACGAGGCAGCTCTTGCTGGAGGCCACCATGTTGTTGCTATAATTTCT----ATGGT--------------C--------------A--------------C--------------TTTTGGCGCTGCACTTC--------------T--------------G--------------GC-----------G--------------ATCGGGTATAAAAGCTAAA-GGCTTACAATACAGCCGAA-TTGTCGCCACCGAGAAC-GAAAATTGTGGACACG--ACAG------ATATGGCCCAT-TTAT-T------T-TA--------T-T-TTT-TTT-A--------TTTTTTTATTT-TTTTTTAAGGGAATAAAT-GTTTA-----T---GGT-TGGTGG--GAAATAATAGGGATTG-CCACCTCGAAACC-AGAACCACAC-TATTATtcaatta
gi|20 : ggCCATGTTGCTGCTATCGTTACT----ATGAT--------------C--------------A--------------C--------------TT--------------C--------------T--------------G--------------GC-----------G--------------ATCAGGTATAAAAGCTAAA-GGCCTACAATACAGGCGCA-CCTTTGCCACCGGGAAC-AAAAATTGTGGACACA--ACAG------AAACGGCCGGT-ttaattt
gi|20 : TTTAAGGGAATAAAT-GTTTA-----T---GGT-CGGCAG--GAAATAATAGGGACAG-TTG---GGAAACTGGGAACCACAC-TATTATggggggggggggggggggggggggtttaagggaataaatgtttatggtcggcaggaaataatagggacagttgggaaactgggaaccacactattatttgattt
gi|20 : ccatgttgctgctatcgttactatgatcacttctggcgatcaggtataaaagctaaaggcctacaatacaggcgcacctttgccaccgggaacaaaaattgtggacacaacagaaacggccggtggggggggggggggggggggggggAAATCAAATAATA------GTGTGGTTCCCA----ttgattt
gi|21 : ccatgttgctgctatcgttactatgatcacttctggcgatcaggtataaaagctaaaggcctacaatacaggcgcacctttgccaccgggaacaaaaattgtggacacaacagaaacggccggtggggggggggggggggggggggggtttaagggaataaatgtttatggtcggcaggaaataatagggacagttgggaaacCCTAAATTAATTAATA------GCGTGATTCCTA----TTA---CA-TGGACA-TACAAACTA----G----GG----C----A----GGAA-----G-----------------G------------------------T----------------------AA----------------------A--------TTATTTATTTAACTGAAATTA------------------TT----------TATTT-TG-CATTGTCGATAC--TA------TCCGTTTTCT-TTGAATATA------TG----T----TGTGGT-TGTATGTG---------GACACACTTGTCATACACGATGGCGACGCAGCTCTTACCGGAGGCTGCCATATTGCTGTTAT
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gi|24 : ggcaCCTTAATTAATATATA------TTGTGGTTCCTA----TTA---CA-TGGGAA-TACAAAAAA----G----GG----TAGGGA----GGTA-----G-----------------G------------------------T----------------------AT----------------------A--------T------------------TAGTTATTTATTGTAAATTATT----------TATTT-TG-CATTGTCGAAACTATA------TCCATTTTCT-GCGAGTATG------T
gi|25 : ag------ATACGGCCGAT-TT-T-T------T-TA--------T-T-TT-----GA--------TT------TTT-T-----AAGGGAATAAAT-GTTTA-----G---GGT-CGGTGG--GAAATAATAGGGACGG-TTG---AGAAACC-GGAACCACAC-TATTATt
gi|25 : acaggaattgacggagtgtTAAATTAAATAATA------GTGTGGTTCCttaattta
gi|27 : acaggaattgacggagtgtatacggccgatttttttattttgattttttaagggaataaatgtttagggtcggtgggaaataatagggacggttgagaaacc-TA--------T-T-TTT--------------TT------TTT-ATTTTTAAGGGAACAG-----TTA-----G---AGT-CGGCCG--GAAATAATAGAGACGGATCG---GGAAACC-AGAACTACAC--ATT
gi|28 : --------TT------TTT-TCTTTTCGTGGAA-AAATAGGTTA-----G---GGT-CGGCGG--GAAAAAATAGGGTCGG-TCG---GGTAACC-GGAAACGCACTTATTtttatttaatt
gi|29 : TTAAGGGAACAG-----TTA-----G---AGT-CGGTCG--GAAATAATATAGTCAA-TCG---GGAAACC-AGAACTACAC-TTTTATtttttatttg
gi|3 : CCTAAATTAATTAATA------GTGTGATTCCTA----TTA---CA-TGGAAAATACAAAATA----G----GG----T----AAATAGGTA-----G-----------------G------------------------T----------------------AA----------------------ATTATTTATT------------------TA------------------TTGTAAATTAATTATTT-TG-TATTGTCGATAC--TT------TCCGTTTTCT-TCGATTATAATATTATG----T----TATGTC-TGTATGTG---------GACACACTTGTCATACACAATG-TGAGGCAGTTCTTGCTGGAAGCTGCCATGTTGCTGCTATCGTTACT----ATGAT--------------C--------------A--------------C--------------TT--------------C--------------TGGCAGTGCACTTCTG--------------GC-----------G--------------ATTGGGTATAAAAGCTGAA-GTCCTACAACCCAGCCGAA-CTGTCGCCATCGGGAAC-GACAATTGTGGACACG--ACAG------ATACGGCCAAT-TT-T-T------TGTT--------T-T-TGT-TTTG----------T------TGA-TTTTTTATGAGAATAAAT-GTTTA-----A---GGT-CGGCGG--GAAATAAAAGGGATGG-TCA---GGAAACT-GGAACTACAC-TATTATttaattta
gi|30 : gg-TTTTTTAAGGGAACAAAT-GTTTA-----A---GGT-TGG------AATTAAAAGGGACGG-TTG---GGAAACC-TGAACCACAC-TATTATttaattt
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gi|4 : ggCCTAAATTAATTAATA------GTGTGGTTCCTA----TTA---CA-TTGAAA-TACAAAATA----G----GG----T----A----GGTA-----G-----------------G------------------------T----------------------AGGTAAGGTAAATTTTTATTGTATA--------T------------------TA------------------TT----------TATTG-TG-CATTGTCGATAC--TA------ACTGTTTTCT-ACGAGTATC------TG----TGACTTATGTC-TGTATGTG---------GACACACTCGTCATACACGATGGAGCAGCAGCTCTTGCTGGTGGCTGCCATGTTGCTGCTATCATTACT----ATGAT--------------C--------------A--------------C--------------TT--------------C--------------C--------------G--------------ACTGTGCACTTCTG--------------ATTGGGTATAAAAGCTAAA-GGCCTACATAACAGACAAA-CCGTCACCACCGGGAAC-GAAAATTGTGGACACG--ACAG------ATACGGACGA-----T-T------T-TG--------T-T-GTT-GTTGA--------------------TTCTTTGAGGGAATAAAT-GTTAA-----G---AGT-CTGCGA--GAAATAATAGGGACGG-TCA---AGAAACC-GGAACCACAC-TTTCAT
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gi|5 : ggAAATTAAATAATA------GTGTGGTTCCGG----TTT---CC-TGGttaattt
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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