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gi|1 : GGTG-G-TACAACGTGCAACGGATATTGCCCTAAAGT---GATAAGATTTT-----AC---C---AAAATT-CAGCATGACTTTTGTCAACAAGGTCAGTTCAAATCTAATTATCTTGTGT-T-TC-CTGTGACTAC-AACATGAACTTTCAATGT-GATTATTAA-----GTTAC----TAATGTG---CAAATAT--TTT-ACAAAATGGGAAATCACTCAAAACTACACTGGAATGATAAAACTTGCGA-T-TC--T--GTCAACCTTATCATT-TTATCACTGGGTGCCATGTGCACATTTTACT--CAACATC--GTTT---T---ATT-TTTGCCATG-TTGTGAAAATTCTGAATCGAA-----CAATTTAGTAAGTT-AGACACATAGAACAAGGTATGGTCAATTTCTGGGTAGTATCTAATGAAAAGGCTGAGAAAT---AGGACTAAAACAAAAATTGGCAGTGTACTGGG---GATTGAATTTGTTCTCATGAA-G--------GTGTACTGGGTATTGCATTGGGTTGTA--CTGAGGATTGTTAT-TTA--AAAATGTGATAATTGGTGTTTAATGTGCCATCGTTCTGCATTTCTTGGTCCTTGCAAGCACATTTCAATCCATTTATGGCTTT-AATATTTGCGCTTTGTACG-TGTAGACTTAAAAATGTAGATGTTTA----TGATTTATTATTTTCA-TTAT-GAAAACT-GTGTGCTATAATT-----AACTT------TTCGC----TTTAA------ATGTTTAGCTACAAATTAA-ATATTAAA---TATT-T--ATA------------T------------A------------T------GAGAATTTTACATTTACAGCAT--TTCATCCGACGCACATTTCTGTT-TGATTTGATG-GTTATA----GCG----AGCTAAACCAC-C--AAAATG-GGC--AATCAGTTATAATCC---ATTATAATAAAACAACAGATTGG-CACACAGTCATATTGCATGACTGACAGTCTATATA-ATCTTCGTCGCTTGAT-TTTCTG
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gi|17 : -TTAT-TAAAACA-GAGTGCTATAATTTAATTAACTACTAGTATTCGCCATATTTAATACCTTATGTTGCAATGCAAATAAA-TTATTTAA---TTTT-TAAATA------------T------------gaagca
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gi|19 : gtgGATG-G-TACAACGTACAGCGGATAATGCCCTA---T---TCT----TTTT-----TC---T---AAAGTT-CAGTATTACAGTTGTCtccctgcttttcatctg
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gi|2 : tgATATG-GGC--AGTCAGTTATATTCC---ATTATAATAAAACAGTATATT-GCCACAAAGTCATAGTGC----CTG-----------TCATCTTTGTCGCTTGAT-TTTCTtaattgatttaaaaacgtttctttgaatctatcttattttccgaatttctgtatatgggcagtcagttatattccattataataaaacagtatattgccacaaagtcatagtgcctgtcatctttgtcgcttgattttct
gi|3 : tgggtgcaacgtgcactggatattgccctaaagtgataagatttttttctctaaatttgatgacttttgtcaacaaggtaagttcaaacctaattatctagtgttttttgtgactacaacataagctgtctatgtgattatcaagacacgaatgtacaattgctctacagcacgggaaatcactcaaacctataacggaatgatggaacttgcgaatgtctgtcaaacatatcattttatcaccaggtgtcatgtgcacattttactaaatttcgtcttatttttgccatgttgtgaaaattctgaatagaaaaatttagtaaataagacacgtagaacgagtatgctaaatttaagggttgtatcttatgaaacggccgagaaataggactaaaacgaaaatcggcggtgtactggggattgaaattgttctcatgtagttgtactgggtattgcatttggttgtactgtggactgtgataaatagtgtttagtgtgacatcgttctacattttttggtctctgcaatcacatttcattccatatatgactcaatacttacgtgtagacttaaaagagtagatttttatgttttattattttcattatagaaaaaggatgttacaattgactattcgttttgtttcaatgcaaattaaatgttaaacatttaaatatgggtgcctttttataagaattttacgacacaacgtttcctcccgcgaacggttctgtatgatttgacgtaattgatttaaaaacgtttctttgaatctatcttattttccgaatttctgtT-ACGATACGTGAAATCACTCAAAACTATACTGTAATGATGAAACTTGCGG-T-TC--TCTGTCAACCATATCATT-TGGTTACCGGTTGCCATGTACACATTTTACT--CAATATT--GTCT---T---ATT-TTT-CCATA-TTATGAACATTATGAATCGAA-----CGATTTAATAAGTT-AGACACAGAGAACAA-GTATGACAAATTTCAGGGTTGTTTCTAATGTAATGGCCAAATAAT---AGGACTTAGACGATAATCGGCAGTGTACTGCA---GATTGAAAATGATCTCATAAA-G--------TTGTACAGGATGTTGCATTCGCTTGTA--CTGAGGATTGATAT-TTA--AAAATGTGATAATTAGTGTTTATTATGCCATCGATCTGCATTCCTAAATCCCAGCAATCACATTTCATT--------GA--TT-AAGAGTTGCGCATGTTACG-TGTAGACTTAAAAA-GTAATTCTTTA----TGATATATTATCTTCA-TTAT-CAAAAAGAGAATA--ATAATT-----AACTA------TTCGC----TTT----------GTTTCAATGCAAATTAA-ATATTAAA---CATT-TAAATA------------T------------AAATTATTATTTCT------AAGAATTTTACATTTACAGCATGATTC--------AAT--------T-TGAATTGACG-TTTTGAAAAT-CACTGTAAATACATCGTTCCGAAAAT
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gi|4 : aatgaaatttaagcagtattaattgccaaacattttaaaaaaacaatacgatacgtgaaatcactcaaaactatactgtaatgatgaaacttgcggttctctgtcaaccatatcatttggttaccggttgccatgtacacattttactcaatattgtcttatttttccatattatgaacattatgaatcgaacgatttaataagttagacacagagaacaagtatgacaaatttcagggttgtttctaatgtaatggccaaataataggacttagacgataatcggcagtgtactgcagattgaaaatgatctcataaagttgtacaggatgttgcattcgcttgtactgaggattgatatttaaaaatgtgataattagtgtttattatgccatcgatctgcattcctaaatcccagcaatcacatttcattgattaagagttgcgcatgttacgtgtagacttaaaaagtaattctttatgatatattatcttcattatcaaaaagagaataGGTG-G-TACAACGTACACCAGATTTTGCCCTAAAGT---GATAAGATTTT-----TT---CT--AAAATT-CAGCATGATTTTTGTCAACAAGGTAAGTTCAAATCTGATTATTTAGTGTGTGTT-TTGTGACTAC-AACATGAACTGTCTATGT-GATTATTAA-----GTAAC----TGATGTA---CAAATGC--TCT-ACAATACAGGGAATCGCTCAAAACTATACTGGAATGATGAAAATTGTGA-T-TCCCT--GTCAACCTTATCATT-TTATCACCGGCTGTCATGTGCACATTTCACT--CAATTTC--GTCT---T---GCT-TTTGCCATG-TTGTGAAAATTCTGAATCGAA-----CAATTTAGAAAGTT-AGACACA--GAACAA-GTATGCCAAATTTCAGACGTGTATCTAATGAAATGGCTGAGAAAT---AGAACTAAAATGAAAATCTGCGGTGTACTGAG---GATTGAAATTGTTCTCACAAA-G--------TTGTACTGGGTATTGCATTTGGTTGTA--CTGAGGATTGCCAT-TTA--AAATTGAGATAATTAGTGTTTAGTGTGCCAATATTCTGCATTTCCCGGTACCTGCAATCA-ATTTCATTTGATTTATGAC-TA-AATATTTGTGCATGTTACA-TGTAGACTTAAAAAAATAGAGTTTTA----TGTTTTATTATCTTCA-TTAT-AAAAAAtaaa
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gi|6 : atcgacggtgtactcgggatcgatagtggtctcataaaggtgtactgggtattgtatttggttgtaatgaggcttgtcatttaaacatgtgataattagtgtttagtgtgccatcgttctgcatttctcggtcctttcattccatttatgactttaatatttgcgcacgttacgtgtagacttaaaaatgtagtttcttatgttttattatcttcattttaaaaacggagtgttacaattaactattcgctttaaatgtttcaatacaaattaaatattaaatatttaaatatggctggcctttaatgagaatttaacgtttacagcgttttcttccacgcacttttccgtttgatttgacgtattgaaaattggtttaaatacgtctctctgaaactgtcgtatttTTTATT--CATTTTC--GTCT---T---ATT-TT-GCCATGAGTG-GAAAAATCTGA-TTTAA-----C--TTTTTGAAGTT-AGACATATGGCACAA-GTAAGCCAATTTTCAGGGTTGTATGTAATAAAATGGCCGCGAAAT---AGGACCAAAACGAAAAC---CGGTACACCTAG---TTTTGAAATTGTTCTCACAAA-AGTAATACTTTGTACTGGGCACTGTATTTCTCTGTA--CT-----TTG-CAT-TT
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus : NNGGTG-G-TACAACGTACACCGGATATTGCCCTAAAGT---GATAAGATTTT-----TT---C---AAAATT-CGGAATGACTTTTGTCAACAAGGTAAGTTCAAACCCAATTATCTANTGT-T-TT-TTGTGACTAC-AACATAAACNATCTATGT-GATTANTAA-----GTAAC----TGATGTG---CAAATGC--TCT-ACAACACGTGAAATCACTCAAAACTATACTGGAATGATGAAACTTGCGA-T-TC--T--GTCAACCTTATCATT-TTATCACCGGGTGCCATGTGCACATTTTACT--CAATNTC--GTCT---T---ATT-TTTGCCATG-TTGTGAAAATTCTGAATCGAA-----CGATTTANTAAGTT-AGACACATAGAACAA-GTATGCCAAATTTCAGGGTTGTATCTAATGAAATGGCCGAGAAAT---AGGACTAAAACGAAAATCGGCGGTGTACCGGG---GATTGAAATTGTTCTCACGAA-G--------TTGTACTGGGTATTGCATTTGGTTGTA--CTGAGGATTGCCAT-TTA--AAAATGTGATAATTAGTGTTTAGTGTGCCATCGTTCTGCATTTCTCGGTCCCTGCAATCACATTTCATTCCATTTATGAC-TN-AATATTTGCGCATGTTACGTGTAGACTTAAAAATGTAGATNTTTATGNTTTATTATCTTCA-TTAT-NAAAAAG-GAGTGCTACAATT-----AACTA------TTCGC----TT----------------------TAA------ATGTTTCAATACAAATTA-----------AATATTAAATATTTA-AATATGGNTGGCTTT---------TTATGAGAATTTTAC-GTT---TACAGCGTTTC-----CTCCCG-------CGAAC-TTTCTGTT-TGATTTGACG-GTTAGAAAATGCGAG-TAAATCGCTCAATATG-GGC--AATCAGTTATAATCC---ATTATAATAAAACAATANATT-G-CACANAGTCATATTGCATGACTGACAGTCT-TATNCATCTTCGTCGCTTGAT-TTTCTG
Reference ( family-1463 ) : NNGGTG-G-TACAACGTACACCGGATATTGCCCTAAAGT---GATAAGATTTT-----TT---C---AAAATT-CGGAATGACTTTTGTCAACAAGGTAAGTTCAAACCCAATTATCTANTGT-T-TT-TTGTGACTAC-AACATAAACNATCTATGT-GATTANTAA-----GTAAC----TGATGTG---CAAATGC--TCT-ACAACACGTGAAATCACTCAAAACTATACTGGAATGATGAAACTTGCGA-T-TC--T--GTCAACCTTATCATT-TTATCACCGGGTGCCATGTGCACATTTTACT--CAATNTC--GTCT---T---ATT-TTTGCCATG-TTGTGAAAATTCTGAATCGAA-----CGATTTANTAAGTT-AGACACATAGAACAA-GTATGCCAAATTTCAGGGTTGTATCTAATGAAATGGCCGAGAAAT---AGGACTAAAACGAAAATCGGCGGTGTACCGGG---GATTGAAATTGTTCTCACGAA-G--------TTGTACTGGGTATTGCATTTGGTTGTA--CTGAGGATTGCCAT-TTA--AAAATGTGATAATTAGTGTTTAGTGTGCCATCGTTCTGCATTTCTCGGTCCCTGCAATCACATTTCATTCCATTTATGAC-TA-AATATTCGCGCATGTTACGTGTAGACTTAAAAATGTAGATNTTTATGNTTTATTATCTTCA-TTAT-NAAAAAG-GAGTGCTACAATT-----AACTA------TTCGC----TT----------------------TAA------ATGTTTCAATGCAAATTA-----------AATATTAAACATTTA-AATATGGNTGNCTTT---------TTATGAGAATTTTAC-G-T---TACAGCGTTTC-----CTCCCG-------CGAAC-TTTCTG-T-TGATTTGACG-GTTAGAAAATGCGAGATAAATCGCTCAANATG-GGC--AATCAGTTATAATCC---ATTATAATAAAACAATANATT-G-CACANAGTCATATTGCATGACTGACAGTCT-TATNCATCTTCGTCGCTTGAT-TTTCTG
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gi|7 : tttattcattttcgtcttattttgccatgagtggaaaaatctgatttaactttttgaagttagacatatggcacaagtaagccaattttcagggttgtatgtaataaaatggccgcgaaataggaccaaaacgaaaaccggtacacctagttttgaaattgttctcacaaaagtaatactttgtactgggcactgtatttctctgtacGTGCG-TACAACGTACACCGGATATTGCTCTAAAAT---GATAAGATTAG-----TT---G---AAAATT-TGGAAT-------------AAGATA--------CCTAATTCACTATTGT-T-TG-TTATTAATAC-AGCATACACAATTCATGT-AACTAATAA-----CTAAC----TGGTGTGTTTCAA-TGC--TCT-AAACCTCGTTAAATGAACTAAACCTGCGCTGACAT-CTTAAACTT-CAC-C-TCA-T--GTCAGACTTA----C-TTACTACTTGGTGCTATGTG---GTGT--CG--AGATAGA--GTTT---TAGCATT-TTT-------TT-TTAAAATTCTGAATCGTA-----CGATTTTTTCAGTT--GACATATTT--CAA-ATGT-----ATTTCGGCACT--------CGAAATAGCTGAGAAATTGGAGGAATATAGC----ATCGG-GGTGTACCGTGTATTATTGA---TGTTATCACTAATG--------GTGTACTGTGGATTGCATT---TTGTATTCTGAATATTGCAATATTGATAAAATGTT-CAACTTGTGTCTAcgcaaggaattatatagaaatataagtctttgaattacgtaactactatatagttttcgccatatttaaaagatataatcttagtacaaattttatatttaaattttaaatatgggtgattgtttctgataatttttacatttgagattgtttcgtgatattttcaagtactattgcgatacaatt
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|9 ): TTACAGTGTTTCCTCCTGTGCGCGGTTCTGTGCTTTTGGTGTATTGAAATTAATTGTAAATACATTCTTTGAAACTGTCGAATTTGCCGAAGTTAGCACATGCGGTTTAAATCATTTCTCAGTATTAGTGTAAAGACAAAATAAGTTATATTCGGTAAACGCAAATTTGACACAGACCCATAGTATTTATCACCTTCGATGTTTGTTTTT
Unaligned ( gi|16 ): TATTTAAAAAGTTTTGTCTTAATAACAATTAAATATTGAATTTTTAAATATCTATTTCTGAGAATTTTGACATTTAAAATAGTTTTGTAATATTTTAAAGTACTATTGCGATACCATTA