lowQualScore                  :          1111              11                                                                                      22222222                             111111111                    111111111          2222222         11       2                            11              33333333       22222       3333333333333333333    2222                        3333333333333333      33333   22          444444444444          1      11                     555555555            22222222  1                   11            4444                             33333                                                1                                                       22                     11                                                         1                             1    11   1      333                                          22                      
lowQualScore                  :       1  1111     33333    00 222         1    0  6          33 00     1   5 444444  11   666    11                55555555   444    77    444     3  2 555555555                    111111111      1   1111111  8888   44    0  0     3   44    3       3    22    4   4     11111111  5    88888   4   3333333333333333333    8888 7   6   5 0  77        2222222222222222    2 00000   77    3     555555555555       4  3  4   55 8              8    888888888            11111111  6   7  1       7    77   3 2   4  2222   2 3  3       2  4      4  44444  2     2     2    2                            5                               6        66             33          3          55  2          4    2            4         4               5                     2       5 4  88   5      555   3     2   3               66   6   66  77       4           2  
lowQualScore                  :       .  ....     .....    .. ...         .    .  .          .. ..     .   . ......  ..   ...    ..                ........   ...    ..    ...     .  . .........                    .........      .   .......  ....   ..    .  .     .   ..    .       .    ..    .   .     ........  .    .....   .   ...................    .... .   .   . .  ..        ................    . .....   ..    .     ............       .  .  .   .. .              .    .........            ........  .   .  .       .    ..   . .   .  ....   . .  .       .  .      .  .....  .     .     .    .                            .                               .        ..             ..          .          ..  .          .    .            .         .               .                     .       . .  ..   .      ...   .     .   .               ..   .   ..  ..       .           .  
lowQualScore                  :       7  1111     88888    99 555         4    1  3          88 66     4   9 000000  99   222    88                99999999   777    11    777     0  7 555555555                    444444444      2   7777777  5555   77    6  7     2   99    9       2    66    7   9     33333333  7    66666   7   6666666666666666666    3333 8   7   4 2  22        8888888888888888    2 55555   55    2     333333333333       7  3  7   00 3              3    000000000            33333333  0   0  0       0    55   0 5   0  5555   5 0  0       5  0      0  00000  5     5     5    5                            0                               0        55             00          0          55  5          0    5            0         0               5                     5       0 0  00   0      000   0     5   0               55   0   55  55       0           5  
consensus                     :     GTTGTN---CTAAG-----GTTT-TT---AGTCCCTCC-GCCAGGTNATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGGTT------GG--CACN--ATAG--AGTGTGGACTGTAAAAGGT-T-T-AAT---TTTGAGATTT---TGATGNTT-TTG-NTGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCT---------AAAGTTCCTA-------AA-AC-TGT-GAAAAATA-GGATATACCC-GTCGGTTAATTTAACCT-CTAGTGGGTCTATCCTG-----NTA-TGCC-----GAGGTAAA---G---TGAT-A-T-G-TGTTG-A-ANCGG-CGTGGGACNTGCCGCCGTGTTTAT-CTAGA----TTCCCTATTGGTTGATGGTGTTGATT------GNNAT-GGGGTCGNTA-TANTATT-GTGTGTATGTTGTTGTAGTTG--TT-----TAAGTTTTGAGG--GTAAC-GA-GCTGGGGATTAGCACCGGCGGAGTNTNTGTNTTGAAGGTTNTNTANGGACGGTNTANCTTAGANTACCGTTGCGCTGTGNGTTGTNTGTGNTGTGTATGAGTCAAGGTGGATCGGGTAATGTCAGGGAGGGCGCTAGTTCTCTTGATTGCGGTGGTGTCTNNTTGGGTGGTCGTTNGTCGGAGGTTGNTGCTCTGTGGNNGGNTGTGCTGCGTNGTTCGTTGTCTAGAAGANGCCCGGCAGNACCTGTACCCCACACTTTAGGTGTGACGTATCTAGTANCCCCGGGCTNGTTGGGTCGTCTTCTTGTTGNTGGGTNTTCNGGTCACGGCGCCTGTNNATTGGTCNNTTTAGGCCTCGNTCAGTCGTCGTNCC
Reference ( gi|1 )            :     GTTGTA---CTAAG-----GTTT-AT---AGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGGCT------GG--CACA--ATAG--AGTGTGGACTGTAAAAAGA-T-T-AAT---TTTGGAATTT---TGATGTTT-TCG-CTAT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCT---------AAAGTTCCTA-------AA-AC-TGT-GAAAAATAGGGATATACCT-GTCGGTTAATTTAACCT-TTAGTTGGTTTATCCCG-----ATA-TGCC-----GAGTTAAG---G---TGAT-A-T-A-TGTTG-A-AGTGG-TGTTGGACATGCCGCCGTGTGGAT-CTAGA----TTCCTTG-TGTTTG--GGTGTTGATT------GAGAT-GGGGTCGATA-TAATATTAGAGTGTATGTTGTTGTTGTTG--TT-----TAAGTTTTGAGG--GTCACTGATGCTTGGAATTAGCAACGGTGGAGTATGTGTATT----GTTGTATATGGACGGTGTATCTTAGAATACTGTTGTGTTGTGCGTTGTGTGTGGTGTGTATGAGTCAAGGTGGATCGGGTAAGGTCAGGGAGGGCGCTAGTTCTCTTGATTGTGATGGTGTCTTCTTGGGTGGTCATTT-TCGGAGGTTGTTGCTCTGTGGTAGGCTGTGCTGCGTAGTTCGTTGTCTAGAAGATACCCGGCAGTACCTGTACCCCACACTTTAGGTGTGACGTATCTAGTACCCCCGGGCTTGTTGGATCGTCTTC---TTGATGGGTCTTCTGGTCACGGCGCCTGTGAATTAGTCAGTT--GGCCTCGATCAGTCGTCGTGCCGT
gi|2                          :     GTTGTA---CTAAG-----GATT-AT---AGTCCCTCC-GCCAGGATATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGGCT------GG--CACA--ATAG--AGTGTGG------------------AT---TTTGGAATTT---TGATGTTT-TCG-CTGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCT---------AAAGTTCCTA-------AA-TC-TGT-GAAAAATAGGGATATACCT-GTTGGTTAATTTAACCT-TTAGTTGGTTTATCCCG-----ATA-TGCC-----GAGTTAAG---G---TGAT-G-T-A-TGTTG-A-AGTGG-TGTTGGACATGCCGCCGTGTGAAT-CTAGA----TTCTTAA-TGTTTG--GGTGTTGATT------GAGAT-GGGGTCGATA-TAATATTAGAGTGTATGTTGTTGTTGTTG--TT-----TAAGTTTTGAGG--GTCACTGATGCTTGGAATTAGCAACGGTGGAGTATGTGTATT----GTTGTATATGGACGGTGTATCTTAGAATACCGTTGTTTTGTGCGTTGTGTGTGGTGTGTATGAGTCAAGGTGGATCGGGTAATGTCAGGGAGGGCGCTAGTTCTCTTGATTGTGGTGGTGTCTTATTGGGTGGTCATTT-TCGGAGGTTGTTGCTCTGTGGAAGGCTGTGCTGCGTAGTTCGTTGTTTAGAAGATACCCGGCAGAACCTGTACCCCACACTTTAGGTGTGACGTATCTAGTACCCCCGGGCTTGTTGGGTCGTCTTC---TTGATGGGTCTTCTGGTCACGGCGCCTGTGAATTGGTTAGTT--GGCCTCGATCAGTCGTCGTGCC
gi|6                          :   gtGTAGTT---CTGAG-----GTTT-TT---AGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCGGGGGC-TTGCC--------------------ACA--ATAG--AGTGTGGACTGTAAAAAGG-T-TTAAT---TTTGAAATTT---TGATGTTT-TTG-GTGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCT---------AAAGTTCCTA-------AA-AC-TGT-GAAA----------------GTCGGTTAACTTTACCT-TTAGTTGGTTTATCCTA-----TTA-TGCC-----GAGGTAAAAATG---TGCT-A-T-GTTGTT----ATTGG-TGTGGGACA-GCCGCCGTGTTTAT-CTGAG----TTCCCTATTGGTTGATAGTGTTGATT------TTTGTAGGGGTCGGGG-TATCACTTGTGTGTATGTTGCTGTAGTTA----------AAATATTGGGG--GTAGCAGAAGCTGGAGATTAACACCGG
gi|12                         : gtgtGTAGTA---CTAAG-----GTTT-TT---AGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCGGGGG--------------------------------------AGTGTGGACTGTAAAATGT-T-T-AAT---TTTGAATTTT---TTATGTTT-TTG-TTGT--TCCGCCGAAGAACTGTTTCT---------AAAGTTCCTA-------AA-AC-TGT-GAAAATTA-GGATATACCT-GTCGc
gi|17                         : gtgtGTGGTA---CTAAG-----GTTT-AT---AGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCAAGGGGC-TTGCCCCC-GGGCT------GG--CACA--ATAG--AGTGTGGACTcacctatacctccgtttatcaccatgc
gi|23                         :    tGTAGTT---CTAAG-----GTTT-TT---AGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCAGGGGC-TTGCCCCC-GGGTT------GG--TACA--ATAG--AGCG
gi|30                         :  tatGTTGTT---ATAAG-----GTTT-TT---AGTCCCTCC-GCCAGG------------C-TTGCCCCC-GGGTT------GG--CACA--ATAG--AGTGTGGACT
gi|32                         :   atGTAGTA---CTAAG-----GTTT-TT---AGTCCCTCC-GCCAGGTAGTCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGG
gi|37                         :  tgtGTTGTA---CTAAG-----GATT-AT---AGTCCCTCC-GCCAGGTt
gi|18                         : gtgtGTTATT---CGAAG-----TTTT-AT---AGTCACTCC-GTCAAATGA-CCCGGGGGT-TT--TCAC-ATGTT------GG--CTCT--ATAG--TGCCCGGACTGTAc
gi|4                          :      tTGTAATTCTAAG-----GTTT-TT---AGTATCTCC-GCCAGGTTATCCTGGGGGA-TTGCCC-------T------TG--CACA--ATAG--AGTGTAGACTGTAAAAGGT-A-A-AAT---TGTGAGATTT---TGATGTTT-TT---TAT--GCTGCCGCAGAACTGTTTCTATAATTTCT---------A-------AA-AC-TGT--ATAAATTAGGATATTCCT-TTCGGTTAATTTAACCT-CTAACTGGTCTATCCTA-----TCA-TGCT-----TAGGTAAA---G---AAATGG-T-A-TATTA-ATATTGG-TGTGAAACTTGCCACTGTACTTATATTAG-----TTCCCTATTGGTTGATAGTATTGATTTTGGTGGGAAT-GGGGACTTTACCGGTAT--GTGTGTATATTGTTGTAGTTGAATTTCCTATAAGATTGGAGGTAGCAA--GA-GCTGGGGATTAGCACCGGC--AGTCTTTGTTTTGAAGGTTTTCTAGAGATGGTTTAACTTAAATTA-----GCGCTGTAGGTTATTTGTGTTGTGTAT
gi|19                         :      gTGTAATTCTATG-----GTTT--T---AGTCCCTCC-ACCAGGTTGTCCCAGGGGC-TTGCCCCC-GGGTT------GG--CACA--TTAG--AGTG
gi|34                         :       TGTAATTCTAAG-----GTTT-TT---AGTCCCTTC-GCTGGGT--------------------------T------GG--CACA--ATAG--A--GTGGACTattgacc
gi|24                         :       gGTT---CTAAG-----GGTT-TT---AGTCCCTCC-GCCAAGTTATCTCGGGTGC-TTGCCCCC-GGGTT------GG--CATA--TTAG--AGTG
gi|25                         :  tatgcaGTT---CTAAG-----GTTT-TT---AGTCCC-------AGGTTATCCCCGGGAC-GTGCACCC-GATTT------AA--CACA--ATAG--AATGTGGAC
gi|26                         :  tgtataGTT---CTAAG-----GTTT-TA---AGTCCATCT-GCCAAACAATCCCTGGGAA---ACCCCC-ATGTT------GG--CCCT--ATAG--ACTGTGGACT
gi|10                         :          A---CTAAGTTCCTGTTTGATTTGAGTCCCTCC----ATGGAATCCCCGTGG--TAGCTCCT-TA-TT------GA--CACT--ATAA--AGTGAGGACTATAAAAGGG-T-TTAAC---CTCGAGAT-------ATCCTTATTG-TTATGATCCTCCACAGAACTATGTTT---------AACGTTTCTA-------AA-GG-TACAGAAAAAAAGATAAATACGTCGTCACTAGATT---CCT-TTA
gi|21                         :        gtc---CTAAG-----GTTT-TG---AGTCCCTCC-GCCAAGTTATCCCATGGGC-TTGCCCCCAGGGTT------GG--CACA--ATAG--AGTGTGG
gi|28                         :      taatt---CTAAA-----GTTT-TT---AGTCCATCT-GCCAAGTGATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-AGATT------GG--CACA--ATAG--AGTGTGtc
gi|35                         :          t---CTAAG-----GTTT-TT---AGTCCCTCC-GCCAAGTGATCCCGAGGG
gi|22                         :       tatt---CTAAG-----GTTT-AT---AGACCGTCC-GCAAAATATTCCCGGCGGT-TTTCACCC-GTTTT------GG--CACT--TTTG--ATTGTGGACTaa
gi|20                         :      tgatt---CTAAA-----GTTT-TA---AGTCCCTCC-GCAAAATAGTCCCTT---CATTACCCCT-GAGTTAACGTTGG--CACT--ATAG--AGTGTGGAC
gi|38                         :        agt---CTAAG-----GTGT-TT---AGTCCCTCC-GTCAAGTGATC
gi|31                         :     gtaatt---CTAAG-----ATTT-TT---AGTCCCTGC-ACCAAGGTATCCC
gi|33                         :  tgtgtgatt---CTAAG-----ATTT-TT---AGTCCCTCC-----------------------ACCCCC-GGTTT------GG--CACT--ATAG--ATTGTGtagttgacattatatagtgtagag
gi|29                         :      atgtgtgattAAG-----ATTA-AC---AGTCCCTCT-GCCATATCGTCCCGGGGGA-T----CCC-TGGTT------GA--TAC----TAGGCAGTGTGAACTGT
gi|5                          :                  G-----GCTT-TT---AGTCCCTCC-GCCAAGTGATC
gi|7                          :                          TT-A----AGTCCCTCC-GCCAAGTAGTCCAGGAGGC-TTGCC--------------------ACT--ATAC--AGTGGGGACTGTAAAAGGT-A-T-AAT---TTTGAGATTT---TGATGGTT-TTG-AAGT--TCCGCCGCAGAAC-ATTTCT---------AAAGTTCGTG-------AA-AC-TGT--ATAAATTAGGATAGATCC-GTTGGTTAATTTAACCC-CTAGTGGGTCTAT-CCA-----ATGTTGCC-----GAGGTAAA---GAAATGGT-A-T-aatgtggactgtaaaaggtataattttgagattttgatggttttgatgttccgccgcagaactgtttctaagttcctaaaactgtgtatattaggatatacccttcggttaatttaacctctagtggatctatcctatcatgccgaggtaaagaaatggtatgatattattggttgtgatacttgccgccgcacctatattatttccctgttggttgtgatacttgccaacgcacctaaattatttccctattggttgctagtattgatttgatggggattgggggtatcactttatgtgtgtgtatttttgttgttaaaatttcagataaaaatggaggtagcaaaagctggggagtag
gi|11                         :                            -AT---AGTTCCTTCTGCCAAATAGTCCCAGCGG----AACTCT-GGGTT------TG--CACT--ATAA--AGTTTGGACTAGAAAAGGT-T-T-ATT---TTTGAAATTTGATTAATATTG-ACG----T--TCCGCCACAGAACTAGATCT---------AAAGTTGCTA-------GA-TA-TAT-AGAAAATtatcctactggttgatatgcttgccgctgcacctgt
gi|8                          :                                                     TCCCGTG--C-TAACCTCC-AGGTT------GG--CACT--TTAG--AGTGTTGACTATAAACGGT-A-T-AAA---TATGAGATTT---CGTTGATT-TTG-TTGT--TCCACCGCAGAACTGTTTCT---------AAAGTTTCTACTTCTATAGTACATGT--AAAAGTA-AGATAGATCC-ATCG--TAATTTCACCCAGTAGTGGATAAAACCTGGTGTCATA-GGCCTACATAAGTTAAA---A---T-AT-ACT-G-TGTTGCA-AACGG-CGTTtaaaacagatgcaaacctataggtgtattaataacaacctattttagt
gi|9                          :                                            gcaaaacagTCCCGTG--C-TAACCTCC-AGGTT------GG--CACT--TTAG--AGTGTTGACTATAAACGGT-A-T-AAA---TATGAGATTT---CGTTGATT-TTG-TTGT--TCCACCGCAGAACTGTTTCT---------AAAGTTTCTACTTCTATAGTACATGT--AAAAGTA-AGATAGATCC-ATCG--TAATTTCACCCAGTAGTGGATAAAACCTGGTGTCATA-GGCCTACATAAGTTAAA---A---T-AT-ACT-G-TGTTGCA-AACGG-CGT
gi|27                         :                                                      gcaaaacag-TTACCCCC-AGGTT------GG--CACA--ATAG--AGTGTGGACTGTAAAATGT-T-A-AAT---TTTGAAATTT---TGATGTTT-T
gi|16                         :                                                                ccttCCCC-GGGTG------GGAACCCAGTATAG--AGTGTGGACTATAAAAGGGTT-T-AATTTGTTT---ATTT---TGATGTTT-------------CGCCACAGATCTATTTCT---------Agg
gi|14                         :                                               cagtgtagtgtcgagatagcctCTC-GGACT------GC--CGCA--ATAA--AGTGCGGACTATAAAATGA-T-TTAAT---TTTAAGACTT---TGTTAATT-CTG-ACAT--TCCGCCATAGAACTG
gi|13                         :                           tgtgtgtgattcgattctaaggatttgagttcattcgtcaaacaa-GGGTT------GG--CACT--ATAG--AGTGTAGGCTATAAAAAGT-TAT-AAT---TTTGAGATTT---AGTTGGTT-TTG-ATGT--CCCACCACAGAATTATTTCT---------ATAGTTTCT
gi|15                         :                                                                             T------GG--CACT--ATAG--AGTGTTGAC---------A-T----AT---TTTGAGATTT---CGTTGCTT-TAGATTA---TCCGCAACTAAATCAATTCT---------AAAGTTTCTA-------ttttgtttttcataaaatctaaagtttctaaatctgtataaaatagaataaattcgccggttaa
gi|5                          :                                                                                                 t--AATGTGGACTGTAAAAGGT-A-T-AAT---TTTGAGATTT---TGATGGTT-TTG-ATGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCT----------AAGTTCCTA-------AA-AC-TGT-GTATATTA-GGATATACCC-TTCGGTTAATTTAACCT-CTAGTGGATCTATCCTA-----TCA-TGCC-----GAGGTAAA---GAAATGGT-A-TGA-TATT----ATTGGTTGTGATACTTGCCGCCGC----AC-CTATATTATTTCCCTG----TTG--GTTG-TGATtagtttctgtatagttaaaaaaagatgattccgt
gi|13                         :                                                                                                                                                        ggcttttagtccctccgccaagtgatcTCT---------AAAGTTTCTA-------AA-TC-TGT-ATAAAATA-GAATAAATTC-GCCGGTTAAacttgccaacgcacctaaattatttccctattggttgctagtattgatttgatggggattgggggtatcactttatgtgtgtgtatttttgttgttaaaatttcagataaaaatggaggtagcaaaagctggggagtag
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gggttggcactatagagtgtaggctataaaaagttataattttgagatttagttggttttgatgtcccaccacagaattatttctatagtttctttttgtttttcataaaaTGCAGTGGTGTCTACTTGGATGGTCGTTGGTTGGAGGTTGGTGCTCTGTGGCTGGGTATGCTGCATTGTTTCTTGTCTAGAAGAAGCCCGACAGTACCTGTACCCCACAC-TTAGGTATGACGTATCTAGTAGCCCTGGG-TAGT--GAT-GTTTTCTTGTTGCTGGATGTTCGGGTCACGGCGTCTGTCTATTGGTCTTTTTAGGCCTCGTTCAGTCGTCGTTCC
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-1150 )     :                                                                                                                                                                                                                                                    GTTGTNCTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTNATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGGTT------GGCACN----ATAGAGTGTGGACTGTAAAA-GGTT-TAATTTTGAGATTTTGA-TGNTT-TTGNTGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGTGAAAAATA-GGATATACCCGTCGGTTAATTTAACCTC--TAGTGGGTCTATCC--TGNTAT-----GCC-----GAGGTAAA---G---TGAT-A-TG-T-GTTG-A-ANCGG-CGTGGGACNTGCCGCCGTGTTTAT-CTAGATT----CCCTATTGGTTGATGGTGTTGATT------GNNAT-GGGG-TC---GNTA-T-ANTA-TT-GTGTGTATGTTGTTGTAGTTG--TT-----TAAGTTT----------TGAGGGTAAC--GA-GCTGGGGATTAGCACCGGCGGAGTNTNTGTNTTGAAGGTTNTNTANGGACGGTNTANCTTAGANTACCGTTGCGCTGTGNGTTGTNTGTGNTGTGTATGAGTCAAGGTGGATCGGGTAATGTCAGGGAGGGCGCTAGTTCTCTTGATTGCGGTGGTGTCTNNTTGGGTGGTCGTTNGTCGGAGGTTGNTGCTCTGTGGNNGGNTGTGCTGCGTNGTTCGTTGTCTAGAAGANGCCCGGCAGNACCTGTACCCCACACTTTAGGTGTGACGTATCTAGTANCCCCGGGCTNGTTGGGTCGTCTTCTTGTTGNTGGGTNTTCNGGTCACGGCGCCTGTNNATTGGTCNNTTTAGGCCTCGNTCAGTCGTCGTNCC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                    GTTGTACTAAGGTTTATAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGGCT------GGCACA----ATAGAGTGTGGACTGTAAAA-AGAT-TAATTTTGGAATTTTGA-TGTTT-TCGCTAT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGTGAAAAATAGGGATATACCTGTCGGTTAATTTAACCTT--TAGTTGGTTTATCC--CGATAT-----GCC-----GAGTTAAG---G---TGAT-A-TA-T-GTTG-A-AGTGG-TGTTGGACATGCCGCCGTGTGGAT-CTAGATT----CCTTG-TGTTTG--GGTGTTGATT------GAGAT-GGGG-TC---GATA-T-AATA-TTAGAGTGTATGTTGTTGTTGTTG--TT-----TAAGTTT----------TGAGGGTCACT-GATGCTTGGAATTAGCAACGGTGGAGTATGTGTATT----GTTGTATATGGACGGTGTATCTTAGAATACTGTTGTGTTGTGCGTTGTGTGTGGTGTGTATGAGTCAAGGTGGATCGGGTAAGGTCAGGGAGGGCGCTAGTTCTCTTGATTGTGATGGTGTCTTCTTGGGTGGTCATTT-TCGGAGGTTGTTGCTCTGTGGTAGGCTGTGCTGCGTAGTTCGTTGTCTAGAAGATACCCGGCAGTACCTGTACCCCACACTTTAGGTGTGACGTATCTAGTACCCCCGGGCTTGTTGGATCGTCTTC---TTGATGGGTCTTCTGGTCACGGCGCCTGTGAATTAGTCAGTT--GGCCTCGATCAGTCGTCGTGCC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTGAGTCCCTCC----ATGGAATCCCCGTGG--TAGCTCCT-TA-TT------GACACT----ATAAAGTGAGGACTATAAAAGGGTT-TAACCTCGAGAT----A-TCCTTATTGTTATGATCCTCCACAGAACTATGTTTAACGTTTC-------------TA-------AA-G----------------G-TACAGAAAAAA-AGATAAATACGTCGgt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                gtcactaagttcctgtttgaTAGTTCCTTCTGCCAAATAGTCCCAGCGG----AACTCT-GGGTT------TGCACT----ATAAAGTTTGGACTAGAAAA-GGTT-TATTTTTGAAA-TTTGATTAATA-TTGACGT--TCCGCCACAGAACTAGATCTAAAGTTGC-------------TA-------GA-T----------------A-TATAGAAAATtcactagattccttta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                   aGTAGTACTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCGGGGG------------------------------------AGTGTGGACTGTAAAA-TGTT-TAATTTTGAATTTTTTA-TGTTT-TTGTTGT--TCCGCCGAAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGTGAAAATTA-GGATATACCTGTCGtaaaacagatgcaaacctataggtgtattaataacaacctattttagt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gtgt-GGGTT------GGCACT----ATAGAGTGTAGGCTATAAAA-AGTTATAATTTTGAGATTTAGT-TGGTT-TTGATGT--CCCACCACAGAATTATTTCTATAGTTTCTTTTTGTTTTTCATA-------AA-ATCTAAAGTTTCTAAATC-TGTATAAAATA-GAATAAATTCGCCGGTTAAcacctatacctccgtttatcaccatgc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                        TTCTAAGGATTTGAGTTCATTC-GTCAAACAA----------------CTC-GGACT------GCCGCA----ATAAAGTGCGGACTATAAAATGATT-TAATTTTAAGACTTTGT-TAATT-CTGACAT--TCCGCCATAGAACTG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgtgtgtgattcgaTT------GGCACT----ATAGAGTGTTGAC---------AT----ATTTTGAGATTTCGT-TGCTT-TAGATTA--TCCGCAACTAAATCAATTCTAAAGTTTC-------------TA-------
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCCC-GGGTG------GGAACCCAGTATAGAGTGTGGACTATAAAAGGGTT-TAATTT----GTTT------ATT-TTGATGT--TTCGCCACAGATCTATTTCTAtagtttctgtatagttaaaaaaagatgattccgt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                              cagtgtagtgtcgagatagcctGTGGTACTAAGGTTTATAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCAAGGGGC-TTGCCCCC-GGGCT------GGCACA----ATAGAGTGTGGACT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                   tGTTATTCGAAGTTTTATAGTCACTCC-GTCAAATGA-CCCGGGGGT-TT--TCAC-ATGTT------GGCTCT----ATAGTGCCCGGACTGTA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                       tTTCTATGGTTTT-AGTCCCTCC-ACCAGGTTGTCCCAGGGGC-TTGCCCCC-GGGTT------GGCACA----TTAGAGTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                               tgtaaGTTGTACTAAGGATTATAGTCCCTCC-GCCAGGATATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGGCT------GGCACA----ATAGAGTGTGG-----------------ATTTTGGAATTTTGA-TGTTT-TCGCTGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-T----------------C-TGTGAAAAATAGGGATATACCTGTTGGTTAATTTAACCTT--TAGTTGGTTTATCC--CGATAT-----GCC-----GAGTTAAG---G---TGAT-G-TA-T-GTTG-A-AGTGG-TGTTGGACATGCCGCCGTGTGAAT-CTAGATT-----CTTAATGTTTG--GGTGTTGATT------GAGAT-GGGG-TC---GATA-T-AATA-TTAGAGTGTATGTTGTTGTTGTTG--TT-----TAAGTTT----------TGAGGGTCACT-GATGCTTGGAATTAGCAACGGTGGAGTATGTGTATT----GTTGTATATGGACGGTGTATCTTAGAATACCGTTGTTTTGTGCGTTGTGTGTGGTGTGTATGAGTCAAGGTGGATCGGGTAATGTCAGGGAGGGCGCTAGTTCTCTTGATTGTGGTGGTGTCTTATTGGGTGGTCATTT-TCGGAGGTTGTTGCTCTGTGGAAGGCTGTGCTGCGTAGTTCGTTGTTTAGAAGATACCCGGCAGAACCTGTACCCCACACTTTAGGTGTGACGTATCTAGTACCCCCGGGCTTGTTGGGTCGTCTTC---TTGATGGGTCTTCTGGTCACGGCGCCTGTGAATTGGTTAGTT--GGCCTCGATCAGTCGTCGTGCCattgacc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                        gtCTAAAGTTTTAAGTCCCTCC-GCAAAATAGTCCCTT---CATTACCCCT-GAGTTAACGTTGGCACT----ATAGAGTGTGGAC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                     agtTTCTAAGGTTTTGAGTCCCTCC-GCCAAGTTATCCCATGGGC-TTGCCCCCAGGGTT------GGCACA----ATAGAGTGTGG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                     taaTTCTAAGGTTTATAGACCGTCC-GCAAAATATTCCCGGCGGT-TTTCACCC-GTTTT------GGCACT----TTTGATTGTGGACTtc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                 tgaGTAGTTCTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCAGGGGC-TTGCCCCC-GGGTT------GGTACA----ATAGAGCG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                    tatGTTCTAAGGGTTTTAGTCCCTCC-GCCAAGTTATCTCGGGTGC-TTGCCCCC-GGGTT------GGCATA----TTAGAGTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                 tatgcaGTTCTAAGGTTTTTAGTCCC-------AGGTTATCCCCGGGAC-GTGCACCC-GATTT------AACACA----ATAGAATGTGGAC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                 tgtataGTTCTAAGGTTTTAAGTCCATCT-GCCAAACAATCCCTGGGAA---ACCCCC-ATGTT------GGCCCT----ATAGACTGTGGACT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -TTACCCCC-AGGTT------GGCACA----ATAGAGTGTGGACTGTAAAA-TGTT-AAATTTTGAAATTTTGA-TGTTT-T
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                      ccttCTAAAGTTTTTAGTCCATCT-GCCAAGTGATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-AGATT------GGCACA----ATAGAGTGTGgg
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                    tAGTCCCTCT-GCCATATCGTCCCGGGGGA-T----CCC-TGGTT------GATACT----AGGCAGTGTGAACTGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aagattaacTGCAGTGGTGTCTACTTGGATGGTCGTTGGTTGGAGGTTGGTGCTCTGTGGCTGGGTATGCTGCATTGTTTCTTGTCTAGAAGAAGCCCGACAGTACCTGTACCCCACAC-TTAGGTATGACGTATCTAGTAGCCCTGGG-TAGT--GAT-GTTTTCTTGTTGCTGGATGTTCGGGTCACGGCGTCTGTCTATTGGTCTTTTTAGGCCTCGTTCAGTCGTCGTTCC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                    GTTGTTATAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGG------------C-TTGCCCCC-GGGTT------GGCACA----ATAGAGTGTGGACTcctcaggtccatgatactttaagacatcttggtgcaatgagcttttggtatttgttagtgagcttacggttttgttgcttacaaaaaatggcctgctttataggtatatcttgttgggcattgcctttagttaaatataatatataaaatatgtaataactaaatataatatataaaatatgtaataactaatactacgtttactagtaaatatatttacagtgttaagctacatttgttgtgcataccgcaatagttgcactagcactaaggtataccgctactaatttggttgtgtttcctgttttgataccaattgtgtaatatctctatctgtgtttattgtatctagttttgtgattgatgtgtatatgggttctttgacttgtatttttgtcacgttgtattttcgaagtaggtgttgtattttgtgggtgtatggtaatatttgttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                      atTTCTAAGATTTTTAGTCCCTGC-ACCAAGGTATCC------C-T---------AGTT------GACATT----ATATAGTGTAGA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                             tgtgtgaGTAGTACTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTAGTCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGGTg
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                     tgtTTCTAAGATTTTTAGTCCCTCC-----------------------ACCCCC-GGTTT------GGCACT----ATAGATTGTG
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                atgtgtgaTTCTAAGGTTTTTAGTCCCTTC-G-------------------------CT-GGGTT------GGCACA----ATAGA--GTGGACT
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                gtgtaaTATTCTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAAGTGATCCCGAGGG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                    GTTGTACTAAGGATTATAGTCCCTCC-GCCAGGTaa
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                    gtgtTTCTAAGGTGTTTAGTCCCTCC-GTCAAGTGATCc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                    gtaaTTCTAAGGTTTTTAGTATCTCC-GCCAGGTTATCCTGGGGGA-TTGCCC------TT------G-CACA----ATAGAGTGTAGACTGTAAAA-GGTA-AAATTGTGAGATTTTGA-TGTTT-TTTATG----CTGCCGCAGAACTGTTTCTATAATTTC-------------TA-------AA-A----------------C-TGTATAAATTA-GGATATTCCTTTCGGTTAATTTAACCTC--TAACTGGTCTATCC--TATCAT-----GCT-----TAGGTAAA---G---AAATGG-TA-T-ATTA-ATATTGG-TGTGAAACTTGCCACTGTACTTATATTAG-TT----CCCTATTGGTTGATAGTATTGATTTTGGTGGGAAT-GGGG-AC---TTTACC-GGTA--T-GTGTGTATATTGTTGTAGTTGAATTTCCTATAAGATT----------GGA-GGTAGCAAGA-GCTGGGGATTAGCACCGGC--AGTCTTTGTTTTGAAGGTTTTCTAGAGATGGTTTAACTTAAATTA-----GCGCTGTAGGTTATTTGTGTTGTGTAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                        gtgtaaGGCTTTTAGTCCCTCC-GCCAAGTGATC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AATGTGGACTGTAAAA-GGTA-TAATTTTGAGATTTTGA-TGGTT-TTGATGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCTAA-GTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGTGTATATTA-GGATATACCCTTCGGTTAATTTAACCTC--TAGTGGATCTATCC--TATCAT-----GCC-----GAGGTAAA---GAAATGGT-A-TGAT-ATT----ATTGGTTGTGATACTTGCCGCCGCACCTAT-ATTATTT----CCCTGTTGGTTGaatgtggactgtaaaaggtataattttgagattttgatggttttgatgttccgccgcagaactgtttctaagttcctaaaactgtgtatattaggatatacccttcggttaatttaacctctagtggatctatcctatcatgccgaggtaaagaaatggtatgatattattggttgtgatacttgccgccgcacctatattatttccctgttggttgtgatacttgccaacgcacctaaattatttccctattggttgctagtattgatttgatggggattgggggtatcactttatgtgtgtgtatttttgttgttaaaatttcagataaaaatggaggtagcaaaagctggggagtag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ggcttttagtccctccgccaagtgatcGTGATACTTGCCAACGC----AC-CTAAATTATTTCCCTATTGGTTGCTAGTATTGATT-------TGAT-GGGGATTGGGGGTA-TCACT--TT-ATGTGTGTG-TATTTTTGTTG--TT-----AAAATTTCAGATAAAAATGGAGGTAGCAAAA-GCTGGGGAGTAGtgatacttgccaacgcacctaaattatttccctattggttgctagtattgatttgatggggattgggggtatcactttatgtgtgtgtatttttgttgttaaaatttcagataaaaatggaggtagcaaaagctggggagtag
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Reference ( family-1150 )     :                                                                                                                                                                                                                                                    GTNGTTCTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTNATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGGTT------GGCACN----ATAGAGTGTGGACTGTAAAA-GG-TT-TAATTTTGAGATTTTGA-TGNTT-TTGNTGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-GNAAANTA-GG-ATANACCCGTCGGTTAATTTAACCTC--TAGTNGGTCTATCC--TGNTAT-----GCC-----GAGNTAAA---G---TGAT-A-TG-T-GTTG-A-ANCGG-CGTGGGA--CNTGCCGCCGCGCGTAT-CTAGATT----CCCTATTGGTTGATAGTGTTGATT------GNGAT-GGGG------TC---GGTAT-ANTATTAGTGTGTATGTTGTTGTTGTTG--TT-----TAAGTTT----------TGAGGGTAGCAA-GATGCTGGGGATTAGCANCGGCGGAGTATGTGTATT----GTTGTATATGGACGGTGTATCTTAGAATACCGTTGCGTTGTGCGTTGTGTGTGGTGTGTATGAGTCAAGGTGGATCGGGTAANGTCAGGGAGGGCGCTAGTTCTCTTGATTGCGGTGGTGTCTTCTTGGGTGGTCGTTT-TCGGAGGTTGTTGCTCTGTGGNAGGCTGTGCTGCGTAGTTCGTTGTCTAGAAGATACCCGGCAGTACCTGTACCCCACACTTTAGGTGTGACGTATCTAGTACCCCCGGGCTTGTTGGATCGTCTTC---TTGATGGGTCTTCTGGTCACGGCGCCTGTGAATTGGTCAGTT--GGCCTCGATCAGTCGTCGTGCC
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTGAGTCCCTCC----ATGGAATCCCCGTGG--TAGCTCCT-TA-TT------GACACT----ATAAAGTGAGGACTATAAAAGGG-TT-TAACCTCGAGAT----A-TCCTTATTGTTATGATCCTCCACAGAACTATGTTTAACGTTTC-------------TA-------AA-G----------------G-TAC-AGAAAAAA-AG-ATAAATACGTCGgt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                gtcactaagttcctgtttgaTAGTTCCTTCTGCCAAATAGTCCCAGCGG----AACTCT-GGGTT------TGCACT----ATAAAGTTTGGACTAGAAAA-GG-TT-TATTTTTGAAA-TTTGATTAATA-TTGACGT--TCCGCCACAGAACTAGATCTAAAGTTGC-------------TA-------GA-T----------------A-TATAGAAAATTA-AA-ACAGAtcactagattccttta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                   aGTAGTACTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCGGGGG------------------------------------AGTGTGGACTGTAAAA-TG-TT-TAATTTTGAATTTTTTA-TGTTT-TTGTTGT--TCCGCCGAAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-GAAAATTA-GG-ATATACCTGTCGtgcaaacctataggtgtattaataacaacctattttagt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gtgt-GGGTT------GGCACT----ATAGAGTGTAGGCTATAAAA-AG-TTATAATTTTGAGATTTAGT-TGGTT-TTGATGT--CCCACCACAGAATTATTTCTATAGTTTCTTTTTGTTTTTCATA-------AA-ATCTAAAGTTTCTAAATC-TGT-ATAAAATA-GA-ATAAATTCGCCGGTTAAcacctatacctccgtttatcaccatgc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                        TTCTAAGGATTTGAGTTCATTC-GTCAAACAA----------------CTC-GGACT------GCCGCA----ATAAAGTGCGGACTATAAAATGA-TT-TAATTTTAAGACTTTGT-TAATT-CTGACAT--TCCGCCATAGAACTG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tgtgtgtgattcgaTT------GGCACT----ATAGAGTGTTGAC---------A-T----ATTTTGAGATTTCGT-TGCTT-TAGATTA--TCCGCAACTAAATCAATTCTAAAGTTTC-------------TA-------
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCCC-GGGTG------GGAACCCAGTATAGAGTGTGGACTATAAAA-GGGTT-TAATTT----GTTT------ATT-TTGATGT--TTCGCCACAGATCTATTTCTAtagtttctgtatagttaaaaaaagatgattccgt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                              cagtgtagtgtcgagatagcctGTGGTACTAAGGTTTATAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCAAGGGGC-TTGCCCCC-GGGCT------GGCACA----ATAGAGTGTGGACT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                   tGTTATTCGAAGTTTTATAGTCACTCC-GTCAAATGA-CCCGGGGGT-TT--TCAC-ATGTT------GGCTCT----ATAGTGCCCGGACTGTA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                   tGTAATTCTATGGTTTT-AGTCCCTCC-ACCAGGTTGTCCCAGGGGC-TTGCCCCC-GGGTT------GGCACA----TTAGAGTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                   tGTTGTACTAAGGATTATAGTCCCTCC-GCCAGGATATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGGCT------GGCACA----ATAGAGTGTGG------------------ATTTTGGAATTTTGA-TGTTT-TCGCTGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-T----------------C-TGT-GAAAAATAGGG-ATATACCTGTTGGTTAATTTAACCTT--TAGTTGGTTTATCC--CGATAT-----GCC-----GAGTTAAG---G---TGAT-G-TA-T-GTTG-A-AGTGG-TGTTGGA--CATGCCGCCGTGTGAAT-CTAGATT-----CTTAATGTTTG--GGTGTTGATT------GAGAT-GGGG------TC---GATAT-AATATTAGAGTGTATGTTGTTGTTGTTG--TT-----TAAGTTT----------TGAGGGT--CACTGATGCTTGGAATTAGCAACGGTGGAGTATGTGTATT----GTTGTATATGGACGGTGTATCTTAGAATACCGTTGTTTTGTGCGTTGTGTGTGGTGTGTATGAGTCAAGGTGGATCGGGTAATGTCAGGGAGGGCGCTAGTTCTCTTGATTGTGGTGGTGTCTTATTGGGTGGTCATTT-TCGGAGGTTGTTGCTCTGTGGAAGGCTGTGCTGCGTAGTTCGTTGTTTAGAAGATACCCGGCAGAACCTGTACCCCACACTTTAGGTGTGACGTATCTAGTACCCCCGGGCTTGTTGGGTCGTCTTC---TTGATGGGTCTTCTGGTCACGGCGCCTGTGAATTGGTTAGTT--GGCCTCGATCAGTCGTCGTGCCattgacc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                       gtTCTAAAGTTTTAAGTCCCTCC-GCAAAATAGTCCCTT---CATTACCCCT-GAGTTAACGTTGGCACT----ATAGAGTGTGGAC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                   agTAATTCTAAGGTTTTGAGTCCCTCC-GCCAAGTTATCCCATGGGC-TTGCCCCCAGGGTT------GGCACA----ATAGAGTGTGG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                     TGATTCTAAGGTTTATAGACCGTCC-GCAAAATATTCCCGGCGGT-TTTCACCC-GTTTT------GGCACT----TTTGATTGTGGACTtc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                    GTAGTTCTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCAGGGGC-TTGCCCCC-GGGTT------GGTACA----ATAGAGCG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                 tatGCAGTTCTAAGGGTTTTAGTCCCTCC-GCCAAGTTATCTCGGGTGC-TTGCCCCC-GGGTT------GGCATA----TTAGAGTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                  tatTAGTTCTAAGGTTTTTAGTCCC-------AGGTTATCCCCGGGAC-GTGCACCC-GATTT------AACACA----ATAGAATGTGGAC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                   tgtaGTTCTAAGGTTTTAAGTCCATCT-GCCAAACAATCCCTGGGAA---ACCCCC-ATGTT------GGCCCT----ATAGACTGTGGACT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -TTACCCCC-AGGTT------GGCACA----ATAGAGTGTGGACTGTAAAA-TG-TT-AAATTTTGAAATTTTGA-TGTTT-T
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                     ccttTCTAAAGTTTTTAGTCCATCT-GCCAAGTGATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-AGATT------GGCACA----ATAGAGTGTGgg
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                     AGTCCCTCT-GCCATATCGTCCCGGGGGA-T----CCC-TGGTT------GATACT----AGGCAGTGTGAACTGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aagattaacTGCAGTGGTGTCTACTTGGATGGTCGTTGGTTGGAGGTTGGTGCTCTGTGGCTGGGTATGCTGCATTGTTTCTTGTCTAGAAGAAGCCCGACAGTACCTGTACCCCACAC-TTAGGTATGACGTATCTAGTAGCCCTGGG-TAGT--GAT-GTTTTCTTGTTGCTGGATGTTCGGGTCACGGCGTCTGTCTATTGGTCTTTTTAGGCCTCGTTCAGTCGTCGTTCC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                    GTTGTTATAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGG------------C-TTGCCCCC-GGGTT------GGCACA----ATAGAGTGTGGACTcctcaggtccatgatactttaagacatcttggtgcaatgagcttttggtatttgttagtgagcttacggttttgttgcttacaaaaaatggcctgctttataggtatatcttgttgggcattgcctttagttaaatataatatataaaatatgtaataactaaatataatatataaaatatgtaataactaatactacgtttactagtaaatatatttacagtgttaagctacatttgttgtgcataccgcaatagttgcactagcactaaggtataccgctactaatttggttgtgtttcctgttttgataccaattgtgtaatatctctatctgtgtttattgtatctagttttgtgattgatgtgtatatgggttctttgacttgtatttttgtcacgttgtattttcgaagtaggtgttgtattttgtgggtgtatggtaatatttgttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                  atGTGATTCTAAGATTTTTAGTCCCTGC-ACCAAGGTATCC------C-T---------AGTT------GACATT----ATATAGTGTAGA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                 tgtGTAGTACTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTAGTCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGGTg
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                 tgtGTGATTCTAAGATTTTTAGTCCCTCC-----------------------ACCCCC-GGTTT------GGCACT----ATAGATTGTG
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                atgtGTAATTCTAAGGTTTTTAGTCCCTTC-G-------------------------CT-GGGTT------GGCACA----ATAGA--GTGGACT
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                      gtTTCTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAAGTGATCCCGAGGG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                  taGTTGTACTAAGGATTATAGTCCCTCC-GCCAGGTaa
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                gtgtGTAATTCTAAGGTGTTTAGTCCCTCC-GTCAAGTGATCc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                    GTAATTCTAAGGTTTTTAGTATCTCC-GCCAGGTTATCCTGGGGGA-TTGCCC------TT------G-CACA----ATAGAGTGTAGACTGTAAAA-GG-TA-AAATTGTGAGATTTTGA-TGTTT-TTTATG----CTGCCGCAGAACTGTTTCTATAATTTC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-ATAAATTA-GG-ATATTCCTTTCGGTTAATTTAACCTC--TAACTGGTCTATCC--TATCAT-----GCT-----TAGGTAAA---G---AAATGG-TA-T-ATTA-ATATTGG-TGTGAAA--CTTGCCACTGTACTTATATTAG-TT----CCCTATTGGTTGATAGTATTGATTTTGGTGGGAAT-GGGGACTTTACC---GGTAT--------GTGTGTATATTGTTGTAGTTGAATTTCCTATAAGATT----------GGA-GGTAGCAA-GA-GCTGGGGATTAGCACCGGC--AGTCTTTGTTTTGAAGGTTTTCTAGAGATGGTTTAACTTAAATTA-----GCGCTGTAGGTTATTTGTGTTGTGTAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                            gtGGCTTTTAGTCCCTCC-GCCAAGTGATC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AATGTGGACTGTAAAA-GG-TA-TAATTTTGAGATTTTGA-TGGTT-TTGATGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCT-AAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-GTATATTA-GG-ATATACCCTTCGGTTAATTTAACCTC--TAGTGGATCTATCC--TATCAT-----GCC-----GAGGTAAA---GAAATGGT-A-TGAT-ATT----ATTGGTTGTGATA--CTTGCCGCCGCACCTAT-ATTATTT----CCCTGTTGGTTGaatgtggactgtaaaaggtataattttgagattttgatggttttgatgttccgccgcagaactgtttctaagttcctaaaactgtgtatattaggatatacccttcggttaatttaacctctagtggatctatcctatcatgccgaggtaaagaaatggtatgatattattggttgtgatacttgccgccgcacctatattatttccctgttggttgtgatacttgccaacgcacctaaattatttccctattggttgctagtattgatttgatggggattgggggtatcactttatgtgtgtgtatttttgttgttaaaatttcagataaaaatggaggtagcaaaagctggggagtag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ggcttttagtccctccgccaagtgatcGTGATA--CTTGCCAACGCAC-----CTAAATTATTTCCCTATTGGTTGCTAGTATTGATT-------TGAT-GGGGA-----TTGGGGGTATCACT-TTA-TGTGTGTG-TATTTTTGTTG--TT-----AAAATTTCAGATAAAAATGGAGGTAGCAA-AA-GCTGGGGAGTAGtgatacttgccaacgcacctaaattatttccctattggttgctagtattgatttgatggggattgggggtatcactttatgtgtgtgtatttttgttgttaaaatttcagataaaaatggaggtagcaaaagctggggagtag
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Reference ( family-1150 )     :                                                                                                                                                                                                                                               GTAGTTCTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTNATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGGTT------GGCACN----ATAGAGTGTGGACTGTAAAA-GGTT-TAATTTTGAGATTTTGA-TGNTT-TTGNTGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-GAAAANTA-GG-ATANACCCGTCGGTTAATTTAACCTC--TAGTNGGTCTATCC--TGNTAT-----GCC-----GAGNTAAA---G---TGAT-A-TG-T-GTTG-A-ANTGG-T-GTGGNA--CNTGCCGCCGCGCGTAT-CTAGATT----CCCTATTGGTTGATAGTGTTGATTGNGATGGGGATC---GGTA---T-ANTATTA-GTGTGTATGTTGTTGTTGTTG--TT-----TAAGTTT----------TGAGGGTAGCAATGATGCTGGGGATTAGCANCGGCGGAGTATGTGTATT----GTTGTATATGGACGGTGTATCTTAGAATACCGTTGCGTTGTGCGTTGTGTGTGGTGTGTATGAGTCAAGGTGGATCGGGTAANGTCAGGGAGGGCGCTAGTTCTCTTGATTGCGGTGGTGTCTTCTTGGGTGGTCGTTT-TCGGAGGTTGTTGCTCTGTGGNAGGCTGTGCTGCGTAGTTCGTTGTCTAGAAGATACCCGGCAGTACCTGTACCCCACACTTTAGGTGTGACGTATCTAGTACCCCCGGGCTTGTTGGATCGTCTTC---TTGATGGGTCTTCTGGTCACGGCGCCTGTGAATTGGTCAGTT--GGCCTCGATCAGTCGTCGTGCC
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                            TTTGAGTCCCTCC----ATGGAATCCCCGTGG--TAGCTCCT-TA-TT------GACACT----ATAAAGTGAGGACTATAAAAGGGTT-TAACCTCGAGAT----A-TCCTTATTGTTATGATCCTCCACAGAACTATGTTTAACGTTTC-------------TA-------AA-G----------------G-TAC-AGAAAAAA-AG-ATAAATACGTCGgt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                           gtcactaagttcctgtttgaTAGTTCCTTCTGCCAAATAGTCCCAGCGG----AACTCT-GGGTT------TGCACT----ATAAAGTTTGGACTAGAAAA-GGTT-TATTTTTGAAA-TTTGATTAATA-TTGACGT--TCCGCCACAGAACTAGATCTAAAGTTGC-------------TA-------GA-T----------------A-TATAGAAAATTA-AA-ACAGAtcactagattccttta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                              aGTAGTACTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCGGGGG------------------------------------AGTGTGGACTGTAAAA-TGTT-TAATTTTGAATTTTTTA-TGTTT-TTGTTGT--TCCGCCGAAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-GAAAATTA-GG-ATATACCTGTCGtgcaaacctataggtgtattaataacaacctattttagt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtgt-GGGTT------GGCACT----ATAGAGTGTAGGCTATAAAA-AGTTATAATTTTGAGATTTAGT-TGGTT-TTGATGT--CCCACCACAGAATTATTTCTATAGTTTCTTTTTGTTTTTCATA-------AA-ATCTAAAGTTTCTAAATC-TGT-ATAAAATA-GA-ATAAATTCGCCGGTTAAcacctatacctccgtttatcaccatgc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                   TTCTAAGGATTTGAGTTCATTC-GTCAAACAA----------------CTC-GGACT------GCCGCA----ATAAAGTGCGGACTATAAAATGATT-TAATTTTAAGACTTTGT-TAATT-CTGACAT--TCCGCCATAGAACTG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgtgtgtgattcgaTT------GGCACT----ATAGAGTGTTGAC---------AT----ATTTTGAGATTTCGT-TGCTT-TAGATTA--TCCGCAACTAAATCAATTCTAAAGTTTC-------------TA-------
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCCC-GGGTG------GGAACCCAGTATAGAGTGTGGACTATAAAAGGGTT-TAATTT----GTTT------ATT-TTGATGT--TTCGCCACAGATCTATTTCTAtagtttctgtatagttaaaaaaagatgattccgt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                         cagtgtagtgtcgagatagcctGTGGTACTAAGGTTTATAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCAAGGGGC-TTGCCCCC-GGGCT------GGCACA----ATAGAGTGTGGACT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                  tTTCGAAGTTTTATAGTCACTCC-GTCAAATGA-CCCGGGGGT-TT--TCAC-ATGTT------GGCTCT----ATAGTGCCCGGACTGTA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                          tgttaGTAATTCTATGGTTTT-AGTCCCTCC-ACCAGGTTGTCCCAGGGGC-TTGCCCCC-GGGTT------GGCACA----TTAGAGTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                              tGTTGTACTAAGGATTATAGTCCCTCC-GCCAGGATATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGGCT------GGCACA----ATAGAGTGTGG-----------------ATTTTGGAATTTTGA-TGTTT-TCGCTGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-T----------------C-TGT-GAAAAATAGGG-ATATACCTGTTGGTTAATTTAACCTT--TAGTTGGTTTATCC--CGATAT-----GCC-----GAGTTAAG---G---TGAT-G-TA-T-GTTG-A-AGTGG-T-GTTGGA--CATGCCGCCGTGTGAAT-CTAGATT-----CTTAATGTTTG--GGTGTTGATTGAGATGGGG-TC---GATA---T-AATATTA-GAGTGTATGTTGTTGTTGTTG--TT-----TAAGTTT----------TGAGGGT--CACTGATGCTTGGAATTAGCAACGGTGGAGTATGTGTATT----GTTGTATATGGACGGTGTATCTTAGAATACCGTTGTTTTGTGCGTTGTGTGTGGTGTGTATGAGTCAAGGTGGATCGGGTAATGTCAGGGAGGGCGCTAGTTCTCTTGATTGTGGTGGTGTCTTATTGGGTGGTCATTT-TCGGAGGTTGTTGCTCTGTGGAAGGCTGTGCTGCGTAGTTCGTTGTTTAGAAGATACCCGGCAGAACCTGTACCCCACACTTTAGGTGTGACGTATCTAGTACCCCCGGGCTTGTTGGGTCGTCTTC---TTGATGGGTCTTCTGGTCACGGCGCCTGTGAATTGGTTAGTT--GGCCTCGATCAGTCGTCGTGCCattgacc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                  gtTCTAAAGTTTTAAGTCCCTCC-GCAAAATAGTCCCTT---CATTACCCCT-GAGTTAACGTTGGCACT----ATAGAGTGTGGAC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                              agTAATTCTAAGGTTTTGAGTCCCTCC-GCCAAGTTATCCCATGGGC-TTGCCCCCAGGGTT------GGCACA----ATAGAGTGTGG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                   TTCTAAGGTTTATAGACCGTCC-GCAAAATATTCCCGGCGGT-TTTCACCC-GTTTT------GGCACT----TTTGATTGTGGACTtc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                            tgaGTAGTTCTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCAGGGGC-TTGCCCCC-GGGTT------GGTACA----ATAGAGCG
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gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                             tatTAGTTCTAAGGTTTTTAGTCCC-------AGGTTATCCCCGGGAC-GTGCACCC-GATTT------AACACA----ATAGAATGTGGAC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                              tgtaGTTCTAAGGTTTTAAGTCCATCT-GCCAAACAATCCCTGGGAA---ACCCCC-ATGTT------GGCCCT----ATAGACTGTGGACT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -TTACCCCC-AGGTT------GGCACA----ATAGAGTGTGGACTGTAAAA-TGTT-AAATTTTGAAATTTTGA-TGTTT-T
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                ccttTCTAAAGTTTTTAGTCCATCT-GCCAAGTGATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-AGATT------GGCACA----ATAGAGTGTGgg
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                AGTCCCTCT-GCCATATCGTCCCGGGGGA-T----CCC-TGGTT------GATACT----AGGCAGTGTGAACTGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aagattaacTGCAGTGGTGTCTACTTGGATGGTCGTTGGTTGGAGGTTGGTGCTCTGTGGCTGGGTATGCTGCATTGTTTCTTGTCTAGAAGAAGCCCGACAGTACCTGTACCCCACAC-TTAGGTATGACGTATCTAGTAGCCCTGGG-TAGT--GAT-GTTTTCTTGTTGCTGGATGTTCGGGTCACGGCGTCTGTCTATTGGTCTTTTTAGGCCTCGTTCAGTCGTCGTTCC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                               GTTGTTATAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGG------------C-TTGCCCCC-GGGTT------GGCACA----ATAGAGTGTGGACTcctcaggtccatgatactttaagacatcttggtgcaatgagcttttggtatttgttagtgagcttacggttttgttgcttacaaaaaatggcctgctttataggtatatcttgttgggcattgcctttagttaaatataatatataaaatatgtaataactaaatataatatataaaatatgtaataactaatactacgtttactagtaaatatatttacagtgttaagctacatttgttgtgcataccgcaatagttgcactagcactaaggtataccgctactaatttggttgtgtttcctgttttgataccaattgtgtaatatctctatctgtgtttattgtatctagttttgtgattgatgtgtatatgggttctttgacttgtatttttgtcacgttgtattttcgaagtaggtgttgtattttgtgggtgtatggtaatatttgttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                             atGTGATTCTAAGATTTTTAGTCCCTGC-ACCAAGGTATCC------C-T---------AGTT------GACATT----ATATAGTGTAGA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                            tgtGTAGTACTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTAGTCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGGTg
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                            tgtGTGATTCTAAGATTTTTAGTCCCTCC-----------------------ACCCCC-GGTTT------GGCACT----ATAGATTGTG
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                           atgtGTAATTCTAAGGTTTTTAGTCCCTTC-G-------------------------CT-GGGTT------GGCACA----ATAGA--GTGGACT
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                 gtTTCTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAAGTGATCCCGAGGG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                             taGTTGTACTAAGGATTATAGTCCCTCC-GCCAGGTaa
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                           gtgtGTAATTCTAAGGTGTTTAGTCCCTCC-GTCAAGTGATCc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                               GTAATTCTAAGGTTTTTAGTATCTCC-GCCAGGTTATCCTGGGGGA-TTGCCC------TT------G-CACA----ATAGAGTGTAGACTGTAAAA-GGTA-AAATTGTGAGATTTTGA-TGTTT-TTTATG----CTGCCGCAGAACTGTTTCTATAATTTC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-ATAAATTA-GG-ATATTCCTTTCGGTTAATTTAACCTC--TAACTGGTCTATCC--TATCAT-----GCT-----TAGGTAAA---G---AAATGG-TA-T-ATTA-ATATTGG-T-GTGAAA--CTTGCCACTGTACTTATATTAG-TT----CCCTATTGGTTGATAGTATTGATTTTGGTGGGAATG---GGGACTTT-ACCGGTATGTGTGTATATTGTTGTAGTTGAATTTCCTATAAGATT----------GGA-GGTAGCAA-GA-GCTGGGGATTAGCACCGGC--AGTCTTTGTTTTGAAGGTTTTCTAGAGATGGTTTAACTTAAATTA-----GCGCTGTAGGTTATTTGTGTTGTGTAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                       gtGGCTTTTAGTCCCTCC-GCCAAGTGATC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATGTGGACTGTAAAA-GGTA-TAATTTTGAGATTTTGA-TGGTT-TTGATGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCT-AAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-GTATATTA-GG-ATATACCCTTCGGTTAATTTAACCTC--TAGTGGATCTATCC--TATCAT-----GCC-----GAGGTAAA---GAAATGGT-A-TGAT-ATT----ATTGGTT-GTGATA--CTTGCCGCCGCACCTAT-ATTATTT----CCCTGTTGGTTGaatgtggactgtaaaaggtataattttgagattttgatggttttgatgttccgccgcagaactgtttctaagttcctaaaactgtgtatattaggatatacccttcggttaatttaacctctagtggatctatcctatcatgccgaggtaaagaaatggtatgatattattggttgtgatacttgccgccgcacctatattatttccctgttggttgtgatacttgccaacgcacctaaattatttccctattggttgctagtattgatttgatggggattgggggtatcactttatgtgtgtgtatttttgttgttaaaatttcagataaaaatggaggtagcaaaagctggggagtag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggcttttagtccctccgccaagtgatcTGG-TTGTGATA--CTTGCCAACGCAC-----CTAAATTATTTCCCTATTGGTTGCTAGTATTGATT-TGATGGGGATTGGGGGTA---TCACT-TTA--TGTGTGTG-TATTTTTGTTG--TT-----AAAATTTCAGATAAAAATGGAGGTAGCAA--AAGCTGGGGAGTAGtgatacttgccaacgcacctaaattatttccctattggttgctagtattgatttgatggggattgggggtatcactttatgtgtgtgtatttttgttgttaaaatttcagataaaaatggaggtagcaaaagctggggagtag
gi|6                          : ggcttttagtccctccgccaagtgatcaatgtggactgtaaaaggtataattttgagattttgatggttttgatgttccgccgcagaactgtttctaagttcctaaaactgtgtatattaggatatacccttcggttaatttaacctctagtggatctatcctatcatgccgaggtaaagaaatggtatgatattattggttgtgatacttgccgccgcacctatattatttccctgtGTAGTTCTGAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCGGGGGC-TTGCC------------------ACA----ATAGAGTGTGGACTGTAAAAAGGTT-TAATTTTGAAATTTTGA-TGTTT-TTGGTGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-GAAA----------------GTCGGTTAACTTTACCTT--TAGTTGGTTTATCC--TATTAT-----GCC-----GAGGTAAAAATG---TGCT-A-TG-TTGTT----ATTGG-T-GTGGGA--CA-GCCGCCGTGTTTAT-CTGAGTT----CCCTATTGGTTGATAGTGTTGATTTTTGTAGGGGTC---GGGG---T-ATCACTT-GTGTGTATGTTGCTGTAGTTA----------AAATAT----------TGGGGGTAGCA--GAAGCTGGAGATTAACACCGGC
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                            TTTGAGTCCCTCC----ATGGAATCCCCGTGG--TAGCTCCT-TA-TT------GACACT----ATAAAGTGAGGACTATAAAAGGGTT-TAACCTCGAGAT----A-TCCTTATTGTTATGATCCTCCACAGAACTATGTTTAACGTTTC-------------TA-------AA-G----------------G-TAC-AGAAAAAA-AG-ATAAATACGTCGgt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                           gtcactaagttcctgtttgaTAGTTCCTTCTGCCAAATAGTCCCAGCGG----AACTCT-GGGTT------TGCACT----ATAAAGTTTGGACTAGAAAA-GGTT-TATTTTTGAAA-TTTGATTAATA-TTGACGT--TCCGCCACAGAACTAGATCTAAAGTTGC-------------TA-------GA-T----------------A-TATAGAAAATTA-AA-ACAGAtcactagattccttta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                              aGTAGTACTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCGGGGG------------------------------------AGTGTGGACTGTAAAA-TGTT-TAATTTTGAATTTTTTA-TGTTT-TTGTTGT--TCCGCCGAAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-GAAAATTA-GG-ATATACCTGTCGtgcaaacctataggtgtattaataacaacctattttagt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gtgt-GGGTT------GGCACT----ATAGAGTGTAGGCTATAAAA-AGTTATAATTTTGAGATTTAGT-TGGTT-TTGATGT--CCCACCACAGAATTATTTCTATAGTTTCTTTTTGTTTTTCATA-------AA-ATCTAAAGTTTCTAAATC-TGT-ATAAAATA-GA-ATAAATTCGCCGGTTAAcacctatacctccgtttatcaccatgc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                   TTCTAAGGATTTGAGTTCATTC-GTCAAACAA----------------CTC-GGACT------GCCGCA----ATAAAGTGCGGACTATAAAATGATT-TAATTTTAAGACTTTGT-TAATT-CTGACAT--TCCGCCATAGAACTG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            tgtgtgtgattcgaTT------GGCACT----ATAGAGTGTTGAC---------AT----ATTTTGAGATTTCGT-TGCTT-TAGATTA--TCCGCAACTAAATCAATTCTAAAGTTTC-------------TA-------
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCCC-GGGTG------GGAACCCAGTATAGAGTGTGGACTATAAAAGGGTT-TAATTT----GTTT------ATT-TTGATGT--TTCGCCACAGATCTATTTCTAtagtttctgtatagttaaaaaaagatgattccgt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                         cagtgtagtgtcgagatagcctGTGGTACTAAGGTTTATAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCAAGGGGC-TTGCCCCC-GGGCT------GGCACA----ATAGAGTGTGGACT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                  tTTCGAAGTTTTATAGTCACTCC-GTCAAATGA-CCCGGGGGT-TT--TCAC-ATGTT------GGCTCT----ATAGTGCCCGGACTGTA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                          tgttaGTAATTCTATGGTTTT-AGTCCCTCC-ACCAGGTTGTCCCAGGGGC-TTGCCCCC-GGGTT------GGCACA----TTAGAGTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                              tGTTGTACTAAGGATTATAGTCCCTCC-GCCAGGATATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGGCT------GGCACA----ATAGAGTGTGG-----------------ATTTTGGAATTTTGA-TGTTT-TCGCTGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-T----------------C-TGT-GAAAAATAGGG-ATATACCTGTTGGTTAATTTAACCTT--TAGTTGGTTTATCC--CGATAT-----GCC-----GAGTTAAG---G---TGAT-G-TA-T-GTTG-A-AGTGG-T-GTTGGA--CATGCCGCCGTGTGAAT-CTAGATT-----CTTAATGTTTG--GGTGTTGATTGAGATGGGG-TC---GATA---T-AATATTA-GAGTGTATGTTGTTGTTGTTG--TT-----TAAGTTT----------TGAGGGT--CACTGATGCTTGGAATTAGCAACGGTGGAGTATGTGTATT----GTTGTATATGGACGGTGTATCTTAGAATACCGTTGTTTTGTGCGTTGTGTGTGGTGTGTATGAGTCAAGGTGGATCGGGTAATGTCAGGGAGGGCGCTAGTTCTCTTGATTGTGGTGGTGTCTTATTGGGTGGTCATTT-TCGGAGGTTGTTGCTCTGTGGAAGGCTGTGCTGCGTAGTTCGTTGTTTAGAAGATACCCGGCAGAACCTGTACCCCACACTTTAGGTGTGACGTATCTAGTACCCCCGGGCTTGTTGGGTCGTCTTC---TTGATGGGTCTTCTGGTCACGGCGCCTGTGAATTGGTTAGTT--GGCCTCGATCAGTCGTCGTGCCattgacc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                  gtTCTAAAGTTTTAAGTCCCTCC-GCAAAATAGTCCCTT---CATTACCCCT-GAGTTAACGTTGGCACT----ATAGAGTGTGGAC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                              agTAATTCTAAGGTTTTGAGTCCCTCC-GCCAAGTTATCCCATGGGC-TTGCCCCCAGGGTT------GGCACA----ATAGAGTGTGG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                   TTCTAAGGTTTATAGACCGTCC-GCAAAATATTCCCGGCGGT-TTTCACCC-GTTTT------GGCACT----TTTGATTGTGGACTtc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                            tgaGTAGTTCTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCAGGGGC-TTGCCCCC-GGGTT------GGTACA----ATAGAGCG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                            tatGCAGTTCTAAGGGTTTTAGTCCCTCC-GCCAAGTTATCTCGGGTGC-TTGCCCCC-GGGTT------GGCATA----TTAGAGTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                             tatTAGTTCTAAGGTTTTTAGTCCC-------AGGTTATCCCCGGGAC-GTGCACCC-GATTT------AACACA----ATAGAATGTGGAC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                              tgtaGTTCTAAGGTTTTAAGTCCATCT-GCCAAACAATCCCTGGGAA---ACCCCC-ATGTT------GGCCCT----ATAGACTGTGGACT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             -TTACCCCC-AGGTT------GGCACA----ATAGAGTGTGGACTGTAAAA-TGTT-AAATTTTGAAATTTTGA-TGTTT-T
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                ccttTCTAAAGTTTTTAGTCCATCT-GCCAAGTGATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-AGATT------GGCACA----ATAGAGTGTGgg
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                AGTCCCTCT-GCCATATCGTCCCGGGGGA-T----CCC-TGGTT------GATACT----AGGCAGTGTGAACTGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aagattaacTGCAGTGGTGTCTACTTGGATGGTCGTTGGTTGGAGGTTGGTGCTCTGTGGCTGGGTATGCTGCATTGTTTCTTGTCTAGAAGAAGCCCGACAGTACCTGTACCCCACAC-TTAGGTATGACGTATCTAGTAGCCCTGGG-TAGT--GAT-GTTTTCTTGTTGCTGGATGTTCGGGTCACGGCGTCTGTCTATTGGTCTTTTTAGGCCTCGTTCAGTCGTCGTTCC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                               GTTGTTATAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGG------------C-TTGCCCCC-GGGTT------GGCACA----ATAGAGTGTGGACTcctcaggtccatgatactttaagacatcttggtgcaatgagcttttggtatttgttagtgagcttacggttttgttgcttacaaaaaatggcctgctttataggtatatcttgttgggcattgcctttagttaaatataatatataaaatatgtaataactaaatataatatataaaatatgtaataactaatactacgtttactagtaaatatatttacagtgttaagctacatttgttgtgcataccgcaatagttgcactagcactaaggtataccgctactaatttggttgtgtttcctgttttgataccaattgtgtaatatctctatctgtgtttattgtatctagttttgtgattgatgtgtatatgggttctttgacttgtatttttgtcacgttgtattttcgaagtaggtgttgtattttgtgggtgtatggtaatatttgttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                             atGTGATTCTAAGATTTTTAGTCCCTGC-ACCAAGGTATCC------C-T---------AGTT------GACATT----ATATAGTGTAGA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                            tgtGTAGTACTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTAGTCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GGGTg
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                            tgtGTGATTCTAAGATTTTTAGTCCCTCC-----------------------ACCCCC-GGTTT------GGCACT----ATAGATTGTG
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                           atgtGTAATTCTAAGGTTTTTAGTCCCTTC-G-------------------------CT-GGGTT------GGCACA----ATAGA--GTGGACT
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                 gtTTCTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAAGTGATCCCGAGGG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                             taGTTGTACTAAGGATTATAGTCCCTCC-GCCAGGTaa
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                           gtgtGTAATTCTAAGGTGTTTAGTCCCTCC-GTCAAGTGATCc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                               GTAATTCTAAGGTTTTTAGTATCTCC-GCCAGGTTATCCTGGGGGA-TTGCCC------TT------G-CACA----ATAGAGTGTAGACTGTAAAA-GGTA-AAATTGTGAGATTTTGA-TGTTT-TTTATG----CTGCCGCAGAACTGTTTCTATAATTTC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-ATAAATTA-GG-ATATTCCTTTCGGTTAATTTAACCTC--TAACTGGTCTATCC--TATCAT-----GCT-----TAGGTAAA---G---AAATGG-TA-T-ATTA-ATATTGG-T-GTGAAA--CTTGCCACTGTACTTATATTAG-TT----CCCTATTGGTTGATAGTATTGATTTTGGTGGGAATG---GGGACTTT-ACCGGTATGTGTGTATATTGTTGTAGTTGAATTTCCTATAAGATT----------GGA-GGTAGCAA-GA-GCTGGGGATTAGCACCGGC--AGTCTTTGTTTTGAAGGTTTTCTAGAGATGGTTTAACTTAAATTA-----GCGCTGTAGGTTATTTGTGTTGTGTAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                       gtGGCTTTTAGTCCCTCC-GCCAAGTGATC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATGTGGACTGTAAAA-GGTA-TAATTTTGAGATTTTGA-TGGTT-TTGATGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCT-AAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-GTATATTA-GG-ATATACCCTTCGGTTAATTTAACCTC--TAGTGGATCTATCC--TATCAT-----GCC-----GAGGTAAA---GAAATGGT-A-TGAT-ATT----ATTGGTT-GTGATA--CTTGCCGCCGCACCTAT-ATTATTT----CCCTGTTGGTTGaatgtggactgtaaaaggtataattttgagattttgatggttttgatgttccgccgcagaactgtttctaagttcctaaaactgtgtatattaggatatacccttcggttaatttaacctctagtggatctatcctatcatgccgaggtaaagaaatggtatgatattattggttgtgatacttgccgccgcacctatattatttccctgttggttgtgatacttgccaacgcacctaaattatttccctattggttgctagtattgatttgatggggattgggggtatcactttatgtgtgtgtatttttgttgttaaaatttcagataaaaatggaggtagcaaaagctggggagtag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggcttttagtccctccgccaagtgatcTGG-TTGTGATA--CTTGCCAACGCAC-----CTAAATTATTTCCCTATTGGTTGCTAGTATTGATT-TGATGGGGATTGGGGGTA---TCACT-TTA--TGTGTGTG-TATTTTTGTTG--TT-----AAAATTTCAGATAAAAATGGAGGTAGCAA--AAGCTGGGGAGTAGtgatacttgccaacgcacctaaattatttccctattggttgctagtattgatttgatggggattgggggtatcactttatgtgtgtgtatttttgttgttaaaatttcagataaaaatggaggtagcaaaagctggggagtag
gi|6                          : ggcttttagtccctccgccaagtgatcaatgtggactgtaaaaggtataattttgagattttgatggttttgatgttccgccgcagaactgtttctaagttcctaaaactgtgtatattaggatatacccttcggttaatttaacctctagtggatctatcctatcatgccgaggtaaagaaatggtatgatattattggttgtgatacttgccgccgcacctatattatttccctgtGTAGTTCTGAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCGGGGGC-TTGCC------------------ACA----ATAGAGTGTGGACTGTAAAAAGGTT-TAATTTTGAAATTTTGA-TGTTT-TTGGTGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-GAAA----------------GTCGGTTAACTTTACCTT--TAGTTGGTTTATCC--TATTAT-----GCC-----GAGGTAAAAATG---TGCT-A-TG-TTGTT----ATTGG-T-GTGGGA--CA-GCCGCCGTGTTTAT-CTGAGTT----CCCTATTGGTTGATAGTGTTGATTTTTGTAGGGGTC---GGGG---T-ATCACTT-GTGTGTATGTTGCTGTAGTTA----------AAATAT----------TGGGGGTAGCA--GAAGCTGGAGATTAACACCGGC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                         gtgtTTAAGTCCCTCC-GCCAAGTAGTCCAGGAGGC-TTGCC------------------ACT----ATACAGTGGGGACTGTAAAA-GGTA-TAATTTTGAGATTTTGA-TGGTT-TTGAAGT--TCCGCCGCAGAAC-ATTTCTAAAGTTCG-------------TG-------AA-A----------------C-TGT-ATAAATTA-GG-ATAGATCCGTTGGTTAATTTAACCCC--TAGTGGGTCTATCCAATGT--T-----GCC-----GAGGTAAA---GAAATGGT-A-T--T-ATCC-T-ACTGG-T--TGATATGCTTGCCGCTGCAC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCCCGTG--C-TAACCTCC-AGGTT------GGCACT----TTAGAGTGTTGACTATAAAC-GGTA-TAAATATGAGATTTCGT-TGATT-TTGTTGT--TCCACCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTTC-------------TACTTCTATAGTA----------------CATGT--AAAAGTA-AG-ATAGATCCATCG--TAATTTCACC-CAGTAGTGGATAAAACC--TGGTGTCATAGGCCTACATAAGTTAAA---A---T-AT-ACTG-T-GTTGCA-AACGG-C-GTctgt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                          gcaaaacagTCCCGTG--C-TAACCTCC-AGGTT------GGCACT----TTAGAGTGTTGACTATAAAC-GGTA-TAAATATGAGATTTCGT-TGATT-TTGTTGT--TCCACCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTTC-------------TACTTCTATAGTA----------------CATGT--AAAAGTA-AG-ATAGATCCATCG--TAATTTCACC-CAGTAGTGGATAAAACC--TGGTGTCATAGGCCTACATAAGTTAAA---A---T-AT-ACTG-T-GTTGCA-AACGG-C-GTt


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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|36 ): TGAATATAATTTGAAGTCGTCCCTGAAATTGGTTTTGTTTCA
Unaligned ( gi|39 ): TGCGTTTTAGTACTTTGTAATTCTAAGGTTTTGA
Unaligned ( gi|40 ): TGTGGTGCATTCTCTGACATCCATGTTTTTT






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Reference ( family-1150 )     :                                                                                                                                                                                                                                            GTAGTTCTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTNATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GG------GTTGGCACN----ATAGAGTGTGGACTGTAAAA-GGTT-TAATTTTGAGATTTTGA-TGNTT-TTGNTGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-GAAAANTA-GG-ATANACCCGTCGGTTAATTTAACCTC--TAGTNGGTCTATCC--TGNTAT-----GCC-----GAGNTAAA---G---TGAT-A-TG-T-GTTG----AN-TGG-TGTGGNA--CNTGCCGCCGCGCGTAT-CTAGATT----CCCTATTGGTTGATAGTGTTGATTNTGATGGGGGTC---GGTA---T-ANTATTA-GTGTGTATGTTGTTGTTGTTG--TT-----TAAGTTT----------TGAGGGTAGCAGANGCTGGGGATTAGCANCGGCGGAGTATGTGTATT----GTTGTATATGGACGGTGTATCTTAGAATACCGTTGCGTTGTGCGTTGTGTGTGGTGTGTATGAGTCAAGGTGGATCGGGTAANGTCAGGGAGGGCGCTAGTTCTCTTGATTGCGGTGGTGTCTTCTTGGGTGGTCGTTT-TCGGAGGTTGTTGCTCTGTGGNAGGCTGTGCTGCGTAGTTCGTTGTCTAGAAGATACCCGGCAGTACCTGTACCCCACACTTTAGGTGTGACGTATCTAGTACCCCCGGGCTTGTTGGATCGTCTTC---TTGATGGGTCTTCTGGTCACGGCGCCTGTGAATTGGTCAGTT--GGCCTCGATCAGTCGTCGTGCC
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtgt-GG------GTTGGCACT----ATAGAGTGTAGGCTATAAAA-AGTTATAATTTTGAGATTTAGT-TGGTT-TTGATGT--CCCACCACAGAATTATTTCTATAGTTTCTTTTTGTTTTTCATA-------AA-ATCTAAAGTTTCTAAATC-TGT-ATAAAATA-GA-ATAAATTCGCCGGTTAAcacctatacctccgtttatcaccatgc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                TTCTAAGGATTTGAGTTCATTC-GTCAAACAA----------------CTC-GG------ACTGCCGCA----ATAAAGTGCGGACTATAAAATGATT-TAATTTTAAGACTTTGT-TAATT-CTGACAT--TCCGCCATAGAACTG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               tgtgtgtgattcgaTTGGCACT----ATAGAGTGTTGAC---------AT----ATTTTGAGATTTCGT-TGCTT-TAGATTA--TCCGCAACTAAATCAATTCTAAAGTTTC-------------TA-------
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCCC-GG------GTGGGAACCCAGTATAGAGTGTGGACTATAAAAGGGTT-TAATTT----GTTT------ATT-TTGATGT--TTCGCCACAGATCTATTTCTAtagtttctgtatagttaaaaaaagatgattccgt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                      cagtgtagtgtcgagatagcctGTGGTACTAAGGTTTATAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCAAGGGGC-TTGCCCCC-GG------GCTGGCACA----ATAGAGTGTGGACT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                               tTTCGAAGTTTTATAGTCACTCC-GTCAAATGA-CCCGGGGGT-TT--TCAC-AT------GTTGGCTCT----ATAGTGCCCGGACTGTA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                       tgttaGTAATTCTATGGTTTT-AGTCCCTCC-ACCAGGTTGTCCCAGGGGC-TTGCCCCC-GG------GTTGGCACA----TTAGAGTG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                           tGTTGTACTAAGGATTATAGTCCCTCC-GCCAGGATATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GG------GCTGGCACA----ATAGAGTGTGG-----------------ATTTTGGAATTTTGA-TGTTT-TCGCTGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-T----------------C-TGT-GAAAAATAGGG-ATATACCTGTTGGTTAATTTAACCTT--TAGTTGGTTTATCC--CGATAT-----GCC-----GAGTTAAG---G---TGAT-G-TA-T-GTTGA---AG-TGG-TGTTGGA--CATGCCGCCGTGTGAAT-CTAGATT-----CTTAATGTTTG--GGTGTTGATTGAGAT-GGGGTC---GATA---T-AATATTA-GAGTGTATGTTGTTGTTGTTG--TT-----TAAGTTT----------TGAGGGTCACTGATGCTTGGAATTAGCAACGGTGGAGTATGTGTATT----GTTGTATATGGACGGTGTATCTTAGAATACCGTTGTTTTGTGCGTTGTGTGTGGTGTGTATGAGTCAAGGTGGATCGGGTAATGTCAGGGAGGGCGCTAGTTCTCTTGATTGTGGTGGTGTCTTATTGGGTGGTCATTT-TCGGAGGTTGTTGCTCTGTGGAAGGCTGTGCTGCGTAGTTCGTTGTTTAGAAGATACCCGGCAGAACCTGTACCCCACACTTTAGGTGTGACGTATCTAGTACCCCCGGGCTTGTTGGGTCGTCTTC---TTGATGGGTCTTCTGGTCACGGCGCCTGTGAATTGGTTAGTT--GGCCTCGATCAGTCGTCGTGCCattgacc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                               gtTCTAAAGTTTTAAGTCCCTCC-GCAAAATAGTCCC---TTCATTACCCCT-GAGTTAACGTTGGCACT----ATAGAGTGTGGAC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                           agTAATTCTAAGGTTTTGAGTCCCTCC-GCCAAGTTATCCCATGGGC-TTGCCCCCAGG------GTTGGCACA----ATAGAGTGTGG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                TTCTAAGGTTTATAGACCGTCC-GCAAAATATTCCCGGCGGT-TTTCACCC-GT------TTTGGCACT----TTTGATTGTGGACTtc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                         tgaGTAGTTCTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCAGGGGC-TTGCCCCC-GG------GTTGGTACA----ATAGAGCG
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                         tatGCAGTTCTAAGGGTTTTAGTCCCTCC-GCCAAGTTATCTCGGGTGC-TTGCCCCC-GG------GTTGGCATA----TTAGAGTG
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                          tatTAGTTCTAAGGTTTTTAGTCCC-------AGGTTATCCCCGGGAC-GTGCACCC-GA------TTTAACACA----ATAGAATGTGGAC
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                           tgtaGTTCTAAGGTTTTAAGTCCATCT-GCCAAACAATCCCTGGGAA---ACCCCC-AT------GTTGGCCCT----ATAGACTGTGGACT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                          -TTACCCCC-AG------GTTGGCACA----ATAGAGTGTGGACTGTAAAA-TGTT-AAATTTTGAAATTTTGA-TGTTT-T
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                             ccttTCTAAAGTTTTTAGTCCATCT-GCCAAGTGATCCCGGGGGC-TTGCCCCC-AG------ATTGGCACA----ATAGAGTGTGgg
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                             AGTCCCTCT-GCCATATCGTCCCGGGGGA-T----CCC-TG------GTTGATACT----AGGCAGTGTGAACTGT
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aagattaacTGCAGTGGTGTCTACTTGGATGGTCGTTGGTTGGAGGTTGGTGCTCTGTGGCTGGGTATGCTGCATTGTTTCTTGTCTAGAAGAAGCCCGACAGTACCTGTACCCCACAC-TTAGGTATGACGTATCTAGTAGCCCTGGG-TAGT--GAT-GTTTTCTTGTTGCTGGATGTTCGGGTCACGGCGTCTGTCTATTGGTCTTTTTAGGCCTCGTTCAGTCGTCGTTCC
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                            GTTGTTATAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGG------------C-TTGCCCCC-GG------GTTGGCACA----ATAGAGTGTGGACTcctcaggtccatgatactttaagacatcttggtgcaatgagcttttggtatttgttagtgagcttacggttttgttgcttacaaaaaatggcctgctttataggtatatcttgttgggcattgcctttagttaaatataatatataaaatatgtaataactaaatataatatataaaatatgtaataactaatactacgtttactagtaaatatatttacagtgttaagctacatttgttgtgcataccgcaatagttgcactagcactaaggtataccgctactaatttggttgtgtttcctgttttgataccaattgtgtaatatctctatctgtgtttattgtatctagttttgtgattgatgtgtatatgggttctttgacttgtatttttgtcacgttgtattttcgaagtaggtgttgtattttgtgggtgtatggtaatatttgttt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                          atGTGATTCTAAGATTTTTAGTCCCTGC-ACCAAGGTATCC------C-T---------A------GTTGACATT----ATATAGTGTAGA
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                         tgtGTAGTACTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTAGTCCCGGGGGC-TTGCCCCC-GG------GTg
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                         tgtGTGATTCTAAGATTTTTAGTCCCTCC-----------------------ACCCCC-GG------TTTGGCACT----ATAGATTGTG
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                        atgtGTAATTCTAAGGTTTTTAGTCCCTTC-G-------------------------CT-GG------GTTGGCACA----ATAGA--GTGGACT
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                              gtTTCTAAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAAGTGATCCCGAGGG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                          taGTTGTACTAAGGATTATAGTCCCTCC-GCCAGGTaa
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                        gtgtGTAATTCTAAGGTGTTTAGTCCCTCC-GTCAAGTGATCc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                            GTAATTCTAAGGTTTTTAGTATCTCC-GCCAGGTTATCCTGGGGGA-TTGCCC------------TTG-CACA----ATAGAGTGTAGACTGTAAAA-GGTA-AAATTGTGAGATTTTGA-TGTTT-TTTATG----CTGCCGCAGAACTGTTTCTATAATTTC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-ATAAATTA-GG-ATATTCCTTTCGGTTAATTTAACCTC--TAACTGGTCTATCC--TATCAT-----GCT-----TAGGTAAA---G---AAATGG-TA-T-ATTAAT--AT-TGG-TGTGAAA--CTTGCCACTGTACTTATATTAG-TT----CCCTATTGGTTGATAGTATTGATTTTGGTGGGAATG---GGGACTTT-ACCGGTATGTGTGTATATTGTTGTAGTTGAATTTCCTATAAGATT----------GGA-GGTAGCAAGAGCTGGGGATTAGCACCGGC--AGTCTTTGTTTTGAAGGTTTTCTAGAGATGGTTTAACTTAAATTA-----GCGCTGTAGGTTATTTGTGTTGTGTAT
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                    gtGGCTTTTAGTCCCTCC-GCCAAGTGATC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATGTGGACTGTAAAA-GGTA-TAATTTTGAGATTTTGA-TGGTT-TTGATGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCT-AAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-GTATATTA-GG-ATATACCCTTCGGTTAATTTAACCTC--TAGTGGATCTATCC--TATCAT-----GCC-----GAGGTAAA---GAAATGGT-A-TGAT-ATT-----AT-TGGTTGTGATA--CTTGCCGCCGCACCTAT-ATTATTT----CCCTGTTGGTTGaatgtggactgtaaaaggtataattttgagattttgatggttttgatgttccgccgcagaactgtttctaagttcctaaaactgtgtatattaggatatacccttcggttaatttaacctctagtggatctatcctatcatgccgaggtaaagaaatggtatgatattattggttgtgatacttgccgccgcacctatattatttccctgttggttgtgatacttgccaacgcacctaaattatttccctattggttgctagtattgatttgatggggattgggggtatcactttatgtgtgtgtatttttgttgttaaaatttcagataaaaatggaggtagcaaaagctggggagtag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ggcttttagtccctccgccaagtgatc-T-GTTG--------GT-TGTGATA--CTTGCCAACGCAC-----CTAAATTATTTCCCTATTGGTTGCTAGTATTGATT-TGATGGGGATTGGGGGTA---TCACT-TTA--TGTGTGTG-TATTTTTGTTG--TT-----AAAATTTCAGATAAAAATGGAGGTAGCAAAAGCTGGGGAGTAGtgatacttgccaacgcacctaaattatttccctattggttgctagtattgatttgatggggattgggggtatcactttatgtgtgtgtatttttgttgttaaaatttcagataaaaatggaggtagcaaaagctggggagtag
gi|6                          : ggcttttagtccctccgccaagtgatcaatgtggactgtaaaaggtataattttgagattttgatggttttgatgttccgccgcagaactgtttctaagttcctaaaactgtgtatattaggatatacccttcggttaatttaacctctagtggatctatcctatcatgccgaggtaaagaaatggtatgatattattggttgtgatacttgccgccgcacctatattatttcccGTAGTTCTGAGGTTTTTAGTCCCTCC-GCCAGGTTATCCCGGGGGC-TTGCC------------------ACA----ATAGAGTGTGGACTGTAAAAAGGTT-TAATTTTGAAATTTTGA-TGTTT-TTGGTGT--TCCGCCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTCC-------------TA-------AA-A----------------C-TGT-GAAA----------------GTCGGTTAACTTTACCTT--TAGTTGGTTTATCC--TATTAT-----GCC-----GAGGTAAAAATG---TGCT-A-TG-TTGTT-----AT-TGG-TGTGGGA--CA-GCCGCCGTGTTTAT-CTGAGTT----CCCTATTGGTTGATAGTGTTGATTTTTGTAGGGGTC---GGGG---T-ATCACTT-GTGTGTATGTTGCTGTAGTTA----------AAATAT----------TGGGGGTAGCAGAAGCTGGAGATTAACACCGGC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                      gtgtTTAAGTCCCTCC-GCCAAGTAGTCCAGGAGGC-TTGCC------------------ACT----ATACAGTGGGGACTGTAAAA-GGTA-TAATTTTGAGATTTTGA-TGGTT-TTGAAGT--TCCGCCGCAGAAC-ATTTCTAAAGTTCG-------------TG-------AA-A----------------C-TGT-ATAAATTA-GG-ATAGATCCGTTGGTTAATTTAACCCC--TAGTGGGTCTATCCAATGT--T-----GCC-----GAGGTAAA---G---AAAT-G--G-T-ATTATCCTAC-TGG-T-TGATATGCTTGCCGCTGCAC
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                TCCCGTG--C-TAACCTCC-AG------GTTGGCACT----TTAGAGTGTTGACTATAAAC-GGTA-TAAATATGAGATTTCGT-TGATT-TTGTTGT--TCCACCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTTC-------------TACTTCTATAGTA----------------CATGT--AAAAGTA-AG-ATAGATCCATCG--TAATTTCACC-CAGTAGTGGATAAAACC--TGGTGTCATAGGCCTACATAAGTTAAA---A---T-AT-ACTG-T-GTTGCA--AA-CGG-CGTctgt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                       gcaaaacagTCCCGTG--C-TAACCTCC-AG------GTTGGCACT----TTAGAGTGTTGACTATAAAC-GGTA-TAAATATGAGATTTCGT-TGATT-TTGTTGT--TCCACCGCAGAACTGTTTCTAAAGTTTC-------------TACTTCTATAGTA----------------CATGT--AAAAGTA-AG-ATAGATCCATCG--TAATTTCACC-CAGTAGTGGATAAAACC--TGGTGTCATAGGCCTACATAAGTTAAA---A---T-AT-ACTG-T-GTTGCA--AA-CGG-CGTt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|36 ): TGAATATAATTTGAAGTCGTCCCTGAAATTGGTTTTGTTTCA
Unaligned ( gi|39 ): TGCGTTTTAGTACTTTGTAATTCTAAGGTTTTGA
Unaligned ( gi|40 ): TGTGGTGCATTCTCTGACATCCATGTTTTTT