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gi|1 : TTTAACGTCTACGAAAATATATTT-AA-AACTT-GA-G--TTTGCTGTA--GGAAACCGT----TAAAG--AA--AGAT--GG------ATGTTACGT-----CAGAAT----A-ATG--ACG-TCA-AT--GT-------AT---A----TATTT-ATGACGTCTTGCTTACC----T-TCA-----------A---G-AACAG--GGCCAGG-AT-A-A-A-A----A-A-A-TAT---TT-TGAAGTA--C---ATTATTT---AAATAAA-TAC-TGTGC-GA---GAG-----AT--------ACATCGTTGT------AATT--TCTGG----TAC---------ATA---CTTTTGGTACTAAACTTAAGTTTGTACA--TG--TAC-TTTAAAATGCCCGTTT
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gi|12 : atTTTCACATCTACAAATACAT-TTTTAA-AACTG-GA-T--TTTGTTATA--GGAAACTGT----GCAAA--AG--AGAT--AG------ACTTTATGT-----CAAAAT----A-ATG--ATG-AAA-ACATGT-------AT---ACATGTATTA-ATGACGTCGTGCCGACC----TAACAGGATCAGGTACA---G-AAAAG--GATCAGG-GT-A-A-A-A----T-T-A-TA----TT-TGTAGTG--A---ATTATTT---AAACAAA-CAA-TGTGCGCA---GAG-----ATT--A----ACA--GGTGT------ta
gi|13 : tTACGAAAATAT-T---AACAACTT-GA-T--TTTAATGTA--GGAAACAGT----AAATA--AG--TGAC--AG------ACTTTCAGTG----AAGAAT----A-ATG--ACG-TCA-AC--GT-------AT---G----T-TTT-A-AAC-TCTCGCTT-CC----T-ACG-----------T---G-AACAG--GACCAGG-GT-A-A-------------------------ACGTG--AGC-ATTATCT---AAACAAA-CAA-TGT-CCAA---GAGGCCGCATT--A----ACA--GGTAT------ACTT--TCTGG----TAC---------ATGGATCTACTCGT-------------------A--TG--T
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gi|15 : acaTTTCATCCCAACGAAAATAT-ATT-AA-AACTT-GA-T--TTTGTTGTA--GGAAACTAT----AAA----------------------------TGT-----CAGAATTATAA-ATG--CTG-TCA-AC--GT-------AT---A----TATTT-ATGACGTC--G---A------T-ACA-----------A---G-AACAA--GGTCCAG-GT-A----------------TA----TT-TGAAGTG--A---TTTATTT---AAAC-----AA-TGTGCGGA---GAG-----ATT--A----ACA--GGTGT------AATT--TCTGT----TAC---------ATA---CTTTTAGT-------------------A--TT--TAC-TTTAAAAAGTCCAc
gi|16 : catCTCCGAAAATAT-TTC-AA-AACTT-GA-T--TTTGTCGTA--GGAAACCGT----AAAAA---G--AGAT--GG------ACGTTACGT-----CAGAAT----A-ATG--ACG-TCA-AC--GT-------AT---------------------CTGGCTTACC----T-ACA-----------A---G-AAAAA--GGTAAAG-AA-A-A-A-A----A-A-A-TA----TT-TGAAGTA--A---ATTATTT---AAAC-----AA-TGTGCGGA---GTG-----ATT--A----ACA--CATGT------AATT--TCTGG----TAC---------ATA---CTT----T-------------------A--TG--TAT-TTTAAAATGTCCATTT
gi|17 : TTTCACGTCCACTTAAATAT-TTT-AA-AACTT-GA-T--TTTGTTGTA--GTAAACTGT----TAAGA--AG--AGGT--AG------ACATT---T-----------------------CG-TCA-AC--GT-------AT---A----TATTT-ATGCCGTCTTGCTTACC----T-ACA-----------A---G-AACAG--GGTCAGG-GT-A-A-C-A--------A-TG----CG-CGGAGAG------ATT--------AACAG-------GTGT--------A-----ATT-------CCT--GGTAT------ATTTAGTATGA-----AC---------GTA---CTT---GT-------------------T--TG--TAC-TTTGAAATGTTCATTCT
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gi|22 : tTTCATGTATACGAAACTAT-TTC-G-----TT-GT-A--TTAGCCATA--AAAAA-TGT----AAAAA--AG--AGAT--AG------AAGTCATGT-----CAGAAT----A-ATG--ACG-TCA-AA--GT-------AT---A----TATTT-AAACCGTCTTGCTTACC----T-ACA-----------A---A-AACAA------AGG-CC-A-A-C-A----T-T-A-CA----TT-TCAAGTG--A---ATCATTT---AAACAAA-CAA-TGTGC
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Reference ( family-946 ) : TTTCACGTCTACGAAAATAT-TTT-AA-AACTT-GA-T--TTTGTTGTA--GGAAACCGT----AAAAA--AG--AGAT--AG------ACGTTACGT-----CAGAAT----A-ATG--ACG-TCA-AC--GT-------AT---A----TATTT-ATGACGTCTTGCTTACC----T-ACG-----------A---G-AACAG--GGTCAGG-GT-A-A-A-A----T-T-A-TA----TT-TGAAGTG--A---ATTATTT---AAACAAA-CAA-TGTGCGGA---GAG-----ATT--A----ACA--GGTGT------AATT--TCTGG----TAC---------ATA---CTTTTAGT-------------------A--TG--TAC-TTTAAAATGTCCATTTT
gi|1 : TTTAACGTCTACGAAAATATATTT-AA-AACTT-GA-G--TTTGCTGTA--GGAAACCGT----TAAAG--AA--AGAT--GG------ATGTTACGT-----CAGAAT----A-ATG--ACG-TCA-AT--GT-------AT---A----TATTT-ATGACGTCTTGCTTACC----T-TCA-----------A---G-AACAG--GGCCAGG-AT-A-A-A-A----A-A-A-TAT---TT-TGAAGTA--C---ATTATTT---AAATAAA-TAC-TGTGC-GA---GAG-----AT--------ACATCGTTGT------AATT--TCTGG----TAC---------ATA---CTTTTGGTACTAAACTTAAGTTTGTACA--TG--TAC-TTTAAAATGCCCGTTT
gi|10 : tTTTCACGTCTAAAGAAATAT-TTT-AA-AACTT-GA-T--TTTGCCGTA--GGAAAATGT----AAAAA--AA--AGAT--AG------AC-TTACGT-----CAGACT----A-ATG--ACG-TCA-AC--AT-------AT---A----TATTT-ATAACGTCTTGC--ACA----T-ACA-----------A---GAAAAAA--AGTCAGA-GT-A-A-ATA----T-T-A-TA----TA-TGAAGTG--A---ATCATTT---AAA-AAA--AA-TGTGCGGA---GAG-----ATG--A----TCA--GGTGT------AATT--TCTGG----AAC---------ATA---CTTTTAGT-------------------A--T
gi|11 : atTCTCATGCCTAC-AAAATAT-TTC-AC-AACTT-GA-TACTTTGTTGCA--GGAAAC-------------------AAT--A--------TGTTACAT-----CAGAAT----A-ATG--ATG-TCA---------------T---A----CTTTT-ATGATGTCTTTCTTACC----T-ATG-----------A---G-AACAA--AGTTGGG-GT-A-A-A-AA---T-C-A-TA----TT-TGAACTG--T---ATCATTT---AAACAAAATAA-TGAGTGGG---GAG-----ATT--A----ACA--GTGGT------AATT--CCTGG----TAC---------ATA---TTGTCAGT-------------------A--TG--AGC-TTTAA
gi|12 : atTTTCACATCTACAAATACAT-TTTTAA-AACTG-GA-T--TTTGTTATA--GGAAACTGT----GCAAA--AG--AGAT--AG------ACTTTATGT-----CAAAAT----A-ATG--ATG-AAA-ACATGT-------AT---ACATGTATTA-ATGACGTCGTGCCGACC----TAACAGGATCAGGTACA---G-AAAAG--GATCAGG-GT-A-A-A-A----T-T-A-TA----TT-TGTAGTG--A---ATTATTT---AAACAAA-CAA-TGTGCGCA---GAG-----ATT--A----ACA--GGTGT------ta
gi|13 : tTACGAAAATAT-T---AACAACTT-GA-T--TTTAATGTA--GGAAACAGT----AAATA--AG--TGAC--AG------ACTTTCAGTG----AAGAAT----A-ATG--ACG-TCA-AC--GT-------AT---G----T-TTT-A-AAC-TCTCGCTT-CC----T-ACG-----------T---G-AACAG--GACCAGG-GT-A-A-------------------------ACGTG--AGC-ATTATCT---AAACAAA-CAA-TGT-CCAA---GAGGCCGCATT--A----ACA--GGTAT------ACTT--TCTGG----TAC---------ATGGATCTACTCGT-------------------A--TG--T
gi|14 : cacaTACGAAAATAT-T---AACAACTT-GA-T--TTTAATGTA--GGAAACAGT----AAATA--AG--TGAC--AG------ACTTTCAGTG----AAGAAT----A-AAG--ACG-TCA-AC--GT-------AT---G----T-TTT-A-AAC-TCTCGCTT-CC----T-ACG-----------T---G-AACAG--GACCAGG-GT-A-A-------------------------ACGTG--AGC-ATTATCT---AAACAAA-CAA-TGT-CCGA---GAGACCGCATT--A----ACA--GGTGT------ACTT--TCTGG----TAC---------ATGGATCTACTCGT-------------------A--TG--Tct
gi|15 : acaTTTCATCCCAACGAAAATAT-ATT-AA-AACTT-GA-T--TTTGTTGTA--GGAAACTAT----AAA----------------------------TGT-----CAGAATTATAA-ATG--CTG-TCA-AC--GT-------AT---A----TATTT-ATGACGTC--G---A------T-ACA-----------A---G-AACAA--GGTCCAG-GT-A----------------TA----TT-TGAAGTG--A---TTTATTT---AAAC-----AA-TGTGCGGA---GAG-----ATT--A----ACA--GGTGT------AATT--TCTGT----TAC---------ATA---CTTTTAGT-------------------A--TT--TAC-TTTAAAAAGTCCAc
gi|16 : catCTCCGAAAATAT-TTC-AA-AACTT-GA-T--TTTGTCGTA--GGAAACCGT----AAAAA---G--AGAT--GG------ACGTTACGT-----CAGAAT----A-ATG--ACG-TCA-AC--GT-------AT---------------------CTGGCTTACC----T-ACA-----------A---G-AAAAA--GGTAAAG-AA-A-A-A-A----A-A-A-TA----TT-TGAAGTA--A---ATTATTT---AAAC-----AA-TGTGCGGA---GTG-----ATT--A----ACA--CATGT------AATT--TCTGG----TAC---------ATA---CTT----T-------------------A--TG--TAT-TTTAAAATGTCCATTT
gi|17 : TTTCACGTCCACTTAAATAT-TTT-AA-AACTT-GA-T--TTTGTTGTA--GTAAACTGT----TAAGA--AG--AGGT--AG------ACATT---T-----------------------CG-TCA-AC--GT-------AT---A----TATTT-ATGCCGTCTTGCTTACC----T-ACA-----------A---G-AACAG--GGTCAGG-GT-A-A-C-A--------A-TG----CG-CGGAGAG------ATT--------AACAG-------GTGT--------A-----ATT-------CCT--GGTAT------ATTTAGTATGA-----AC---------GTA---CTT---GT-------------------T--TG--TAC-TTTGAAATGTTCATTCT
gi|18 : atA-AACGT-GA-T--TTCGTTGTA--GGAAACCAT----AAAAA--AC--AAAT--GG------ACGTTACAG-----TAGAGT----A-ATG--ACG-TAA-AC--AT-------AT---A----TATTT-ATGACGTCTTGGTTACC----T-ACG-----------A---G-AACAG--GGTCAGG-GTAA-A-A-A----T-T-A-CA----TT-TGAAGTG--A---ATTATTGGA-AAAAAAA-CAC-AGTGCAGG---GAT-----ATT--A----ACT--AGTGT------AATT--T-TGG----TGC---------ATA---CT----GT-------------------A--TG--TAC--TGAAAAT
gi|19 : cTTTTATGCCTATTAATATAT-TTC-AA-AACTTGGA-T--TTTGGTGTA--GGAAAAGGT-----AAAG--AG--AGTC--TG------ATGTTTTAT-----CAAAGT----A-ATG--ATG-TCA-GC--TT-------AT---T----CTTCT-ATTATGTCTCACTTACC----T-GTC-----------T---A-AACAG--GCTCAGG-GT-GCG-C-A----T-T-A-TAT---TT-TAAAGTG--CTTTTTTTTTT---AAA-AAA-CAA-ATTGTGGG---AAA-----ATT--G----GTG--GGTGT------AA
gi|2 : atTTTCACATCCACGAAAATAT-TAT-AC-AACTT-GA-T--TTTATTGCA--GGAAGCCGT----AAAAA--A---AGAA--AG------ATGTTACATTACATCAGAAT----A-ATA--ATG-CCA-AC--GT-------AT---A----TATTT-GTGGTGTTTTGCTTACC----T-ACA-----------A---G-AACAG--AGTCAGA-GT-A-A-A-A----A-T-AATA----TT-TGAAGTG--A---ATTATAT---AAACCAA-CAT-TGTGTGTA---GAG-----ATT--A----ACA--GGTCT------GATT--TCTGG----TAC---------ATT---CTTA-AGT-------------------A--TG--TAC-TTTAAAATGTCCAT
gi|20 : tTTTCACATCTACAAAAATAC-TTT-AC-AACTT-GA-T--TTTGTTATA--GAAAACGGT----AAAAA--AAGCAGAG--CA------ACCTTACAT-----CAGAAT----A-ATG--ACG-TCA------C-------AT---A----TATTTGATGACGTCTTGACTA-C----T-GCA-----------G---G-GTCAGCAGGTCAGA-GT-G-ATA-A----T-T-A-AA----TT-TGAAGTGTAG---ATTATTT---AAAC-AA-TAA-GGTG-------AAG-----GTT---------A--TGTGT------AATC--TC
gi|21 : atACTA-GA-T--TCTGTTGCA--GGTAACAGTTAAAAAAAG--AG--AGAC--AG------ACATTATGT-----CAGAAT----A-ATG--ACG-TCA-GT--GT-------AA---A----TATTT-ATGACATCTTGCTTACA----T-GGG-----------A---G-ATCAT--GGTTAGG-GT-A-A-A-AAAATT-T-A-CA----TT-TGAAATG--A---ATCATG-----------------GTGTGGG---GAA-----ATT--A----ACA--AGTGT------AAAC--TCTGG----TAC---------A---------TAGT-------------------A--TG--TAC-TTTGATAT
gi|22 : tTTCATGTATACGAAACTAT-TTC-G-----TT-GT-A--TTAGCCATA--AAAAA-TGT----AAAAA--AG--AGAT--AG------AAGTCATGT-----CAGAAT----A-ATG--ACG-TCA-AA--GT-------AT---A----TATTT-AAACCGTCTTGCTTACC----T-ACA-----------A---A-AACAA------AGG-CC-A-A-C-A----T-T-A-CA----TT-TCAAGTG--A---ATCATTT---AAACAAA-CAA-TGTGC
gi|22 : ----TAC----------TA---CTTTTAGT-------------------A--TG--TAT-TTTCTAATGTatactacttttagtatgtattttctaatgt
gi|23 : ttcatgtatacgaaactatttcgttgtattagccataaaaaatgtaaaaaagagatagaagtcatgtcagaataatgacgtcaaagtatatatttaaaccgtcttgcttacctacaaaaacaaaggccaacattacatttcaagtgaatcatttaaacaaacaatgtgcaTTTCACGTCTACGAAAATAT-TTT-AA-AACTT-GA-T--TTTGTCGTA--GGAAACCGT----AAAAA--AG--ATAT--AG------ACGATACGT-----CAGAAT----A-ATG--CCG-TCA-GC--GT-------AT---T----TATTG-ATGACCTATTGCTAACC----T-ACA-----------A---G-GAAAA--AG-------------A-G----T-T-A-TA----TT-TGAAGTG--A---ATTATTT---AAACAAA-CAA-TGTGCGGA---GAG-----ATT--A----GTA--GGT
gi|24 : TGT-TTT-AC-AACTT-TA-T--TTTGTTTGA--AGAATCTGT----AAAAA--AG--AGCT--TGTTATTTATGTTACGT-----CAGAATTT--ACATG--ATGATCA-----GT-------ATCAAA----TTTTTTATGACATCTTGTTTACC----C-ATG-----------T---G-TACAG--GGTCAGGAAT-A-G-C-A----T-T-A-TAG---TT-TGAAAAG--T---AATATTT---CAACAAA-CAag
gi|25 : ttgttttcacactC----T-ACA-----------AAATG-AACAG--GACTAGT-A--A-A-A-A----T-T-A-TACAATTTATGATATG--A---ATTATTT---TAACAAG-CAA-TCTGCGGA---AAG-----ATT--A----A-A--AGTGT------AATT--TTTGA----TAA---------ATA---CCTCTAGC-------------------G--TG--TAC-TTTAAAATGTCCATTTt
gi|26 : aagtatttttaaaattagattttgtcgaggaaactataaaatatatagacaT----AAAAATAAG--AGAT--AG------ACGTTACGT-----CAGAAT----A-CTG--ACG-TCA-AC--GT-------TT---A----TATAT-ATGACTTCTTGCTTACT----T-A-G-----------A---G-AAAAA--TGTCAGA-GTAA-A-A-A----A-T-A-CA----TT-TGAAGTG--A---ATTATTT-------AAA-CAA-TGTGCGGA---GAG-----ATT--A----ACA--GGTGT------AATA--TCTGG----TAC---------ATA---CTTTT-GT-------------------A--TG--TAC-TTAACAATct
gi|27 : TAT-TTA-AA-AACTT-G--T--TTTGTCTTA--GGAAAGTGT----AAAAA--AG--AGAT--AG------ACGTTAGGT-----CAGAAT----A-ATG--ACT-TCA-AC--GT-------AT---A----TGTTT-ATGACATCTTGCTTACC----T-TCA-----------A---G-AAAAA--TGTCA---ATAA-A-A-A----T-T-A-TA----TT-TGAAGTG--A---ATT-TTT--------------------------GAG-----ATT--A----ACA--GGTAT------AATT--T--------------------------CTTTTAGT-------------------A--TG----C-TTT
gi|28 : gT----ATAAA--AG--AGAT--A--------TGTTACGT-----CAGAAT----A-ATG--ACG-TCA-AC--GTTGGGCCTAT---A----CATTT-ATGATGTCTTGCTAACC----T-ACA-----------A---G-AAAAA--GTTCCAG--T-A-G-A-A----T-TTA-TA----TT-TGAACTA--A---ATTATTT---AAACAAA-CAA-TGTGCGGA---GAG-----AT----------------------------------------------------TA---CTTTTAGT-------------------A--GA--TAC-TTTAAAATGTCCATt
gi|29 : aTTTCACGCTTACGAAAATAT-TTT-AA-AACTT-GA-C--TTTTTTGTA--GGAAACCGT----AAAAA--AG--A--T--AG------GCGTTACGT-----CAGAAT----A-ATG--ACG-TCA-AC--GT-------AT---A----TATTT-ATGACGTCGTGTCTATC----A-ACG-----------A---A-ATTAG--GCTTCGA-GA-A-A-A-A----TAC-A-TA----TT-TGAAGTA--A---ATTATTT---AAAC
gi|3 : tGTCTACGAAAATAT-TTT-AA-AATTT-GA-T--TTTGTTATAAAGTAGACCGT----TAAGA--AA--AGAT--CG------ACGTTGCGT-----CATAAG----A-AAGT-ACG-TCA-AT--GT-------AT---A----TAATT-ATG---TCTTGGTTACC----A-ATA-----------A---G-AACAG--GGTCAGA-GT-A-A-A---------------------CAAAAC---A---ATTATTTTATAAACAAA-CAA-------------AG-----ATT--A----CCA--GGTGT------TATT--TCTCT----TAC---------ATA---GTTTTAAT-------------------A--TG--TAC-
gi|30 : ttaaTTCACATCTTCAAAAATAT-TTT-AT-TACTT-GA-T--ATTTTTGTA--GAAAACCCT----TAAAC--AG---GATA-AG------ACGT---GT-----CAGAAT----T-ATGTCATT-TTACAT--GT-------AT---A----TTTTT-ATGACATCTTGC-AAGC----T-ATG-----------A---G-AACAA--GGTCAGG-GTAA-A-A-A----T-T-T-TA----TT-TGATGTG--T---ATTATTT---Aacgtatttttagtatctacttcgaaatgttcatttc
gi|31 : A--AA--AGAT--AA------ATGTTACGT-----CAGAGT----A-ATG--ACC-TCA-AC--AT--------T---A----TTTTC-ATAACGTTTGGCT--CCATGGT-ATA-----------A---C-AGCAG--TGTCAGG-GT-A-AGA-A----T-T-A-
gi|32 : ccacactgaattatagcatacctagttttatgcttacgccaacgaaaacatcttt---A----CATTT-ATGACATCATGCTTACC----T-ACA-----------A---G-AACAG--GGTC-GG-GT-A-G-A-A----T-T-A-TA----TT-TGAAGTG--A---ATTATTT---AAACAAA-CAT-TATGCGCG---GAG-----ATT--A----ACA--GGTCT------ATTT--TCTGG----TAT---------ATT---CT
gi|33 : TTTCACGCCAATGGAAATAT-TTT-AC-AACTT-TA-T--TTTGTTTTA--GAACACAGT----AAAAA--AA--AGAT--AG------ACGTTACGT-----TAGGAA----A-ATG--ATG-TCA-TT--GT-------AT---A----TTTTT-ATGACATCTTGCTTACC----T-ggattgtaa
gi|34 : atTTGCACGCCTACGAACA------------ACAT-GA-T--TTTGTTATA--CTAA--CGT----AAAAAT-AG--TAA---AG------A-GTTACGT-----TATAGT----A-ATG--ACG-TCA-----GT-------AG---T----TGATT-ATGACGTATTGTTTACT----C-ATG-----------C---G-AAAAG--GGttggga
gi|35 : tat-AACAG--GGCCCCGTAT-A-A-A-AA---T-T-A-TA----TT-TGATGCA--T---ATAATTT---AATCAAA----------------------------------ACA--GGTGT------AATT--TCTGG----TACATAATTCTTATA---CTTTTAGTATAC---------------A--TG--TACTTTTCAAATGTCata
gi|36 : TCAGA-GT-A-A-A-AG---T-T-A-TA----TT-TTAAGTG--A---ATTAGTT---AATCAAA-CAA-TGTGCTGA---GAG-----ATT--A----ACA--GGTGT------AATT--TCTGGTACATAC---------ATA---CTTTTAAT-------------------A--TG--TAC-at
gi|37 : a-GT-ACA-A-A----C-T-A-AA----TT-TGAAGTG--A---ATTATTT---AAACAAA-AAAATGTGTGGA---GAG-----ATA--A----ACA--GGTGG------AATT--TCTGG----TAC---------ATA---CCT
gi|38 : TTTCACGACTATGAAAATAT-TTT-TA-AACTT-AT-T--TCTGTTGTA--GAAAACCG
gi|39 : atA-TGTGAGAACATAAA-----ATT--A----ACA--GGTGT------AATT--TCTGG----TAC---------ATA---Cagaattaaa
gi|4 : acacgtaataatgtatTTTCAAGTCTACGAAAATAT-TTT-TA-AACTT-GA-T--TTTGTTGAA--GGAAACCAT----AAAAA--TG--AGAA--AG------ACATTACAT-----CAGAAA----A-ATG--ACA-TCA-AT--GT-------AT---A----TGTTT-ATGGTGTCTCGCTTACC----T-TCA-----------A---G-AATAG--GGTCAGG-GT-A-A-A-T----T-T-A-TA----TT-TGAAGTG--A---ATTATTT---AAAGAAA-CAA-TGTGTGGA---GAG-----ATT--A----ACA--GGTGT------ATTT--TCTGG----TAC---------ATA---CATTTAGT-------------------A--TG--TAC-TTTAAAATGCCCATTTT
gi|40 : TTTCACATCTACGAAAATAT-TTA-AA-AAC---AACT--TTTGTCGTA--GGAAACCGT----AAAAA--
gi|41 : atTTTCACACCTACGAATATAT-TTC-AC-AACTT-TA-A--TTTGTTATA--GGAATCCAT----A
gi|5 : tatTTCCACATCTACGAAAATAG-TAT-AC-AACTT-GA-T--TTTGTTGTA--GGAAACAGT----TAAAA--AG--AGAT--AG------ATGTTTCGT-----CAGAAT----A-ATG--ACG-TCA-AT--TT-------AT---A----CTTTT-ATGACGGCTTGCTCACT----T-ACA-----------A---G-AACA----GTCATG-GT-A-A-A-A----T-T-A-TA----TT-TGAAGTG--A---ATTATCT---AAACAAA-CAA-TATGAGGA---GAT-----ATC--A----ACA--GTTGT------CATT--TCTGG----TAT---------ACA---CTTTCAGT-------------------A--TA--AAC-TTTTAAATGCCGATTT
gi|6 : tTTTCATGTTTACGAAA-TAT-TTT-AT-AACTT-GA-T--TTTGTTGTG--GGAATCTGT-----AATT--AG--AGAT--AG------ATAATACGT-----CAGAA-----A-A----------A-AC--AT-------AT---A----TTTTT-ATGCCATCTTCCATATC----C-ATA-----------A---G-AACGT--GGTCAGG-GCAA-A-A-A----T-G-A-TAT---TT-TGAAGTG--T---AATATTT---AAATAGA-CAC-AGTGCAGG---AAG-----GTTTGAAAATACA--GGTGTAACGAAAATT--TCTGG----TAC---------AGT---CT----GT-------------------ATTTGTTTAC-TTGAAAAc
gi|7 : atTTCATGTCTACGAAAATAT-TTC-AA-AACTT-GA-T--TTTGTCATA--GGTAACTGT----AAC-----------------------CTTTACGT-----CAGAAT----A-ATG--AAG-TGT-AC--GA-------AT---A----TATTC-ATGACATCTTGCTTACC----T-AAA-----------T---G-AAAAA--TGTCAGA-GT-A-ACA-A----A-T-A-TA----TC-TGAAGTG--A---ATTATTT---AAACAAA-CAA-TGTGCGAA---AAG-----ATT--A----ACA--GGTGT------AATT--TCTGG----TAC---------ATA---CTTTTAGT-------------------A--TG--TAC-TTTAAAAAATCCATTT
gi|8 : aTTTACACCTAGGGAAATAT-TTTTAA-AACTT-AG-T--TTTGTTGTA--GATAACCGT----GAAAA--TG--AGAT--AG------ACGTTACGT-----CAGAAT----A-ATT--GCA-TCA-AC--GT-------AT---A----TTTTT-ACGACGTCTTGCTTACT----T-GCA-----------A---C-AGCAG--GATTAGG-AT-A-A-A-AA---T-G-A-TA----AT-TGAAGTC--A---ATTATTT---AAATAA------TGTGCGGA---GAG-----AGT--A----ATT--GATAT------AAAT--TCTGG-----AC---------ATA---C----------------------------------A---TTAAAATGTCCATTTc
gi|9 : atc-AA-AACTT-GA-T--TTTGTTGTA--TGAAATTGT----AAAAA--AA--AAATTAAG------ACATTACGT-----CAGAAT----A-ATG--A-G-TTT-AT--GT-------AT---A----TATTT-ATGATGTCTTGCTTACC----T-ATG-----------A---G-AACAG--GGCCAGG-GT-A-A-A-AA---T-T-A-TA----TT-TGAAGTG--A---ACTATTT---AAACAAA-CAA-TGTGTGTG---GAG-----ATT--A----ACA--GGTGT------AATT--TCTGG----TAC---------ATA---CTTGTAGT-------------------A--TG--TAC-TTTAAAATATTAATTc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|42 ): TACGTAGTCTGGAAGCATTGAAACAAAAAACAAATCGA