lowQualScore : 1
lowQualScore : 1 6 2 222 999999999999999999999 2 3333 555 1 5555 11 1 222
lowQualScore : . . . ... ..................... . .... ... . .... .. . ...
lowQualScore : 3 8 4 111 666666666666666666666 4 8888 555 2 2222 77 2 444
consensus : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----C-G-----T--------TT-TT----T---T-C----AAAA--A-GACG---AGCTAA
Reference ( gi|21 ) : CAGGGTC-ATGTCAATAGCTC-T---T----C-G-----T--------TT-TT----T---T-C----AAAA--A-GACA---AGCTAA
gi|28 : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC------------G-----T--------TT-TT----T---T-C----AAAA--A-GACA---AGCTAA
gi|26 : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----C-G-----T--------TT-TT----TTC-T-C----AAAA--A-TACA---AGC
gi|10 : CAGAGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----C-G-----C--------TC-TTA---G---T-C----AAAA--A-GACA---AGCTAA
gi|12 : acCAAGGTC-ATAACAATAGCTC-T---T----C-G-----T--------TT-TTTTTCT---T-C----AAAA--A-GACA---ATCTAAa
gi|22 : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----C-GTT---T--------TT-TT----T---T-T----AAAA--A-GATG---AGC
gi|9 : cCAGGGTC-ATGACAATACCTC-T---T----C-A-----T--------TT-TT----TTA-T-A----AAAA--A-GACA---AGCTA
gi|2 : cCAGGGTT-ATGACAATAGCTC-T---TTCTTC-G-----T--------TT-TT----T---T-C----ATAA--A-GATG---AGCTAAga
gi|19 : gcCAGGGTA-ATGACAATAGCTC-T---A----T-G-----T--------TT-TT----T---T-G----AAAA--A-GACG---AGCTAaa
gi|24 : acCAGGTTC-ATAGAAATAGTTC-T---T----C-G-----T--------TT-TT----T---T-C----AAAA--A-GACT---AGCT
gi|4 : tCAGGGTC-ATGACAATAGCCCAT---T----C-G-----TGATT----TT-TT----TCTCT-C----AAAA--A-GACA---AGCTt
gi|27 : CAGGGTC-ATGACATTAGCTC-T---T----T-------T--------TT-TT----C---T-C----AAAA--A-GACG---AGCta
gi|25 : cCAGGGTC-ATGGCA-TAGTTC-A---T----C-A-----T--------TT-TT----C---T-C----AAAA--A-GACG---AGCT
gi|8 : CAGGGTC-A-GACAATAACTC-T---T----C-A-----T--------TTCTT----T---T-C----AAGA--A-GATG---AGCTAAtaa
gi|32 : acCAGGGTC-ATAACAATAGCTC-T---T----C-GAT---T--------TT-TT----T---T-C----AAAA--A-ag
gi|13 : acCAGGGTC-ATGACAATAGCTT-T---T----C-C-----T--------GT-TT----T---T-C----AAGA--A-GAC
gi|17 : ggCAGGGTC-ATGACAATAGATC-T---T----C-A-----T--------TT-TT----T---T-T----ATAA--A-GATG---AGATAtgattaaaa
gi|18 : acCAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----A-G-----C--------TT-AA----T---T-C----AAAA--G-GATG---AGCTGA
gi|6 : CAAGG---ATGACAATAGCTC-T---T----C-GGGGTTT--------TT-TT----T---T-C----GAGA--A-GACG---AGCTAAa
gi|5 : aCAAGATCCATGGCAATAGCTC-T---T----CCG-----T--------TT-TT----T---TTC----TAAA--C-GACA---AGCTAAa
gi|11 : CAGGGTC-ATAACAATAACTC-TTTGT----C-A-----T--------TT-TT----T---T-C----AAGA--A-GAGG---AACTAtaa
gi|14 : gcCAGGGTC-ATGACAAAAGCTC-T---T----T-G-----T--------TT-TT----T---C-TTTGAAAAA--A-GATG---AG
gi|3 : cCAGGGCC-ATGACAATAGCTC-T---T----T-G-----TTGTTGTTGTT-TT----T---T-T----AAAA--ATGATG---AGCTatc
gi|7 : cCAGGGTC-TTGACAATAGCTC-C---TAA--T-T-----T--------TT-TT----T---T-T----AAAAATA-GGCG---AGCT
gi|23 : cacCAGGGTC-TTGACA-TAGCTCTT---T----C-T-----T--------CT-TT----T---T-C----GTAA--A-GATG---AAC
gi|16 : cAGGTTC-ATGACAATAGCTC-T---T----G-G-----T--------TTATT----T---T-C----GAAA--A-GACA---GGCTAAaa
gi|31 : AGGGTC-ATGACAATAACTC-T---T----C-G--------------TT-TG----T---T-C----AAAA--G-GACG---AGa
gi|30 : tAAGGAC-ATGACAATAGCTC-T---T------------------------TT----T---T-C----AAAA--A-GACA---AACTAA
gi|29 : AGAGTC-ATGACAATAGCTT-C---T----C-G-----A--------TT-TT----T---T-TGTGAAAAA--A-Gaa
gi|33 : gctGGGTC-ATGACAACAGTTC-T---T----C-A-----T--------TT-TT----T---T-C----
gi|20 : TC-ATGATAATAACTC-T---T----C-A-----T--------TT-TT----T---T-C----AAAA--A-CATA---AGCTAAtcaaa
gi|1 : ccagtcC-ATGATGATAGCTC-T---T----C-A-----T--------TT-TT----T---C-T----CAAA--A-GACA---AGCTA
gi|19 : gacaacaacgctggaacTAGCTC------------G-----T--------CT-TT----T---T-C----AAAA--A-AACATAGAGCTAgaatt
gi|15 : accagggtaatgacaaCTC-T---T----C-A-----T--------TT-TT----T----------AAAA--A-GACA---AGCTAA
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): CAGTGTTGTGATATTGACTTTTTTAAAAAAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 1 2 222 99999999999999999999 2 3333 66666 5555 11 1
lowQualScore : . . ... .................... . .... ..... .... .. .
lowQualScore : 2 4 111 11111111111111111111 4 8888 44444 2222 77 2
consensus : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACGAGCTAA
Reference ( family-754 ) : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACGAGCTAA
gi|1 : C-ATGATGATAGCTC-T---T----CA-----T--------TT-TT----T-----CT----CAAA--A-GACAAGCTA
gi|10 : gacaacaacgctggaacCAGAGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CG-----C--------TC-TTA---G-----TC----AAAA--A-GACAAGCTAAgaatt
gi|11 : acCAGGGTC-ATAACAATAACTC-TTTGT----CA-----T--------TT-TT----T-----TC----AAGA--A-GAGGAACTAa
gi|12 : gcCAAGGTC-ATAACAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TTTTTCT-----TC----AAAA--A-GACAATCTAA
gi|13 : CAGGGTC-ATGACAATAGCTT-T---T----CC-----T--------GT-TT----T-----TC----AAGA--A-GAC
gi|14 : ggCAGGGTC-ATGACAAAAGCTC-T---T----TG-----T--------TT-TT----T-----CTTTGAAAAA--A-GATGAGtgattaaaa
gi|15 : cCAGGAAC-ATTATAACTCCTC-T---T----CA-----T--------TT-TT----T-----------AAAA--A-GACAAGCTAAatc
gi|16 : AGGTTC-ATGACAATAGCTC-T---T----GG-----T--------TTATT----T-----TC----GAAA--A-GACAGGCTAAcaag
gi|17 : CAGGGTC-ATGACAATAGATC-T---T----CA-----T--------TT-TT----T-----TT----ATAA--A-GATGAGATAa
gi|18 : acCAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----AG-----C--------TT-AA----T-----TC----AAAA--G-GATGAGCTGA
gi|19 : CAGGGTA-ATGACAATAGCTC-T---A----TG-----T--------TT-TT----T-----TG----AAAA--A-GACGAGCTAa
gi|2 : acCAGGGTT-ATGACAATAGCTC-T---TTCTTCG-----T--------TT-TT----T-----TC----ATAA--A-GATGAGCTAA
gi|20 : gcTC-ATGATAATAACTC-T---T----CA-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-CATAAGCTAAaa
gi|21 : ccagtcCAGGGTC-ATGTCAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACAAGCTAA
gi|22 : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CGTT---T--------TT-TT----T-----TT----AAAA--A-GATGAGC
gi|23 : cCAGGGTC-TTGAC-ATAGCTCTT---T----CT-----T--------CT-TT----T-----TC----GTAA--A-GATGAAC
gi|24 : cCAGGTTC-ATAGAAATAGTTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACTAGCTaa
gi|25 : tCAGGGTC-ATGGCA-TAGTTC-A---T----CA-----T--------TT-TT----C-----TC----AAAA--A-GACGAGCTt
gi|26 : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----TTC---TC----AAAA--A-TACAAGCtaa
gi|27 : CAGGGTC-ATGACATTAGCTC-T---T----T------T--------TT-TT----C-----TC----AAAA--A-GACGAGC
gi|28 : cCAGGGTC-ATGACAATAGCTC-----------G-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACAAGCTAA
gi|29 : AGAGTC-ATGACAATAGCTT-C---T----CG-----A--------TT-TT----T-----TTGTGAAAAA--A-
gi|3 : gctCAGGGCC-ATGACAATAGCTC-T---T----TG-----TTGTTGTTGTT-TT----T-----TT----AAAA--ATGATGAGCT
gi|30 : cAAGGAC-ATGACAATAGCTC-T---T-----------------------TT----T-----TC----AAAA--A-GACAAACTAA
gi|31 : AGGGTC-ATGACAATAACTC-T---T----CG--------------TT-TG----T-----TC----AAAA--G-GACGAGaa
gi|32 : tCAGGGTC-ATAACAATAGCTC-T---T----CGAT---T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-
gi|33 : acGGGTC-ATGACAACAGTTC-T---T----CA-----T--------TT-TT----T-----TC----
gi|4 : CAGGGTC-ATGACAATAGCCCAT---T----CG-----TGA------TT-TT----TTTCTCTC----AAAA--A-GACAAGCTtcaaa
gi|5 : CAAGATCCATGGCAATAGCTC-T---TC---CGT----T--------TT-TT----T-----TC----TAAA--C-GACAAGCTAAta
gi|6 : CAAGG---ATGACAATAGCTC-T---T----CGGGGTTT--------TT-TT----T-----TC----GAGA--A-GACGAGCTAAtaa
gi|7 : aCAGGGTC-TTGACAATAGCTC-C---TAA--TT-----T--------TT-TT----T-----TT----AAAAATA-GGCGAGCTa
gi|8 : cacCAGGGTC-A-GACAATAACTC-T---T----CA-----T--------TTCTT----T-----TC----AAGA--A-GATGAGCTAA
gi|9 : acCAGGGTC-ATGACAATACCTC-T---T----CA-----T--------TT-TT----TTA---TA----AAAA--A-GACAAGCTAag
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): CAGTGTTGTGATATTGACTTTTTTAAAAAAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 1 2 222 99999999999999999999 2 3333 66666 5555 11 1
lowQualScore : . . ... .................... . .... ..... .... .. .
lowQualScore : 2 4 111 11111111111111111111 4 8888 44444 2222 77 2
consensus : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACGAGCTAA
Reference ( family-754 ) : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACGAGCTAA
gi|1 : C-ATGATGATAGCTC-T---T----CA-----T--------TT-TT----T-----CT----CAAA--A-GACAAGCTA
gi|10 : gacaacaacgctggaacCAGAGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CG-----C--------TC-TTA---G-----TC----AAAA--A-GACAAGCTAAgaatt
gi|11 : acCAGGGTC-ATAACAATAACTC-TTTGT----CA-----T--------TT-TT----T-----TC----AAGA--A-GAGGAACTAa
gi|12 : gcCAAGGTC-ATAACAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TTTTTCT-----TC----AAAA--A-GACAATCTAA
gi|13 : CAGGGTC-ATGACAATAGCTT-T---T----CC-----T--------GT-TT----T-----TC----AAGA--A-GAC
gi|14 : ggCAGGGTC-ATGACAAAAGCTC-T---T----TG-----T--------TT-TT----T-----CTTTGAAAAA--A-GATGAGtgattaaaa
gi|15 : cCAGGAAC-ATTATAACTCCTC-T---T----CA-----T--------TT-TT----T-----------AAAA--A-GACAAGCTAAatc
gi|16 : AGGTTC-ATGACAATAGCTC-T---T----GG-----T--------TTATT----T-----TC----GAAA--A-GACAGGCTAAcaag
gi|17 : CAGGGTC-ATGACAATAGATC-T---T----CA-----T--------TT-TT----T-----TT----ATAA--A-GATGAGATAa
gi|18 : acCAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----AG-----C--------TT-AA----T-----TC----AAAA--G-GATGAGCTGA
gi|19 : CAGGGTA-ATGACAATAGCTC-T---A----TG-----T--------TT-TT----T-----TG----AAAA--A-GACGAGCTAa
gi|2 : acCAGGGTT-ATGACAATAGCTC-T---TTCTTCG-----T--------TT-TT----T-----TC----ATAA--A-GATGAGCTAA
gi|20 : gcTC-ATGATAATAACTC-T---T----CA-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-CATAAGCTAAaa
gi|21 : ccagtcCAGGGTC-ATGTCAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACAAGCTAA
gi|22 : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CGTT---T--------TT-TT----T-----TT----AAAA--A-GATGAGC
gi|23 : cCAGGGTC-TTGAC-ATAGCTCTT---T----CT-----T--------CT-TT----T-----TC----GTAA--A-GATGAAC
gi|24 : cCAGGTTC-ATAGAAATAGTTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACTAGCTaa
gi|25 : tCAGGGTC-ATGGCA-TAGTTC-A---T----CA-----T--------TT-TT----C-----TC----AAAA--A-GACGAGCTt
gi|26 : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----TTC---TC----AAAA--A-TACAAGCtaa
gi|27 : CAGGGTC-ATGACATTAGCTC-T---T----T------T--------TT-TT----C-----TC----AAAA--A-GACGAGC
gi|28 : cCAGGGTC-ATGACAATAGCTC-----------G-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACAAGCTAA
gi|29 : AGAGTC-ATGACAATAGCTT-C---T----CG-----A--------TT-TT----T-----TTGTGAAAAA--A-
gi|3 : gctCAGGGCC-ATGACAATAGCTC-T---T----TG-----TTGTTGTTGTT-TT----T-----TT----AAAA--ATGATGAGCT
gi|30 : cAAGGAC-ATGACAATAGCTC-T---T-----------------------TT----T-----TC----AAAA--A-GACAAACTAA
gi|31 : AGGGTC-ATGACAATAACTC-T---T----CG--------------TT-TG----T-----TC----AAAA--G-GACGAGaa
gi|32 : tCAGGGTC-ATAACAATAGCTC-T---T----CGAT---T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-
gi|33 : acGGGTC-ATGACAACAGTTC-T---T----CA-----T--------TT-TT----T-----TC----
gi|4 : CAGGGTC-ATGACAATAGCCCAT---T----CG-----TGA------TT-TT----TTTCTCTC----AAAA--A-GACAAGCTtcaaa
gi|5 : CAAGATCCATGGCAATAGCTC-T---TC---CGT----T--------TT-TT----T-----TC----TAAA--C-GACAAGCTAAta
gi|6 : CAAGG---ATGACAATAGCTC-T---T----CGGGGTTT--------TT-TT----T-----TC----GAGA--A-GACGAGCTAAtaa
gi|7 : aCAGGGTC-TTGACAATAGCTC-C---TAA--TT-----T--------TT-TT----T-----TT----AAAAATA-GGCGAGCTa
gi|8 : cacCAGGGTC-A-GACAATAACTC-T---T----CA-----T--------TTCTT----T-----TC----AAGA--A-GATGAGCTAA
gi|9 : acCAGGGTC-ATGACAATACCTC-T---T----CA-----T--------TT-TT----TTA---TA----AAAA--A-GACAAGCTAag
blockSeqs : C T TTG TGTTGTTGTTG A TTTC TTCTC TTGA AT T
blockSeqs : . A . CGGGGTTT C A TC GTGA . .
blockSeqs : . . . TCTTCGT . . TA . . .
blockSeqs : . . . CGTTT . . . . . .
blockSeqs : . . . CGATT . . . . . .
blockSeqs : . . . CGTGA . . . . . .
blockSeqs : . . . CCGTT . . . . . .
blockSeqs : . . . AATTT . . . . . .
blockSeqs : . . . CGC . . . . . .
blockSeqs : . . . CAT . . . . . .
blockSeqs : . . . CGT . . . . . .
blockSeqs : . . . CCT . . . . . .
blockSeqs : . . . TGT . . . . . .
blockSeqs : . . . CAT . . . . . .
blockSeqs : . . . GGT . . . . . .
blockSeqs : . . . CAT . . . . . .
blockSeqs : . . . AGC . . . . . .
blockSeqs : . . . TGT . . . . . .
blockSeqs : . . . CAT . . . . . .
blockSeqs : . . . CGT . . . . . .
blockSeqs : . . . CTT . . . . . .
blockSeqs : . . . CGT . . . . . .
blockSeqs : . . . CAT . . . . . .
blockSeqs : . . . CGT . . . . . .
blockSeqs : . . . CGA . . . . . .
blockSeqs : . . . CAT . . . . . .
blockSeqs : . . . CAT . . . . . .
blockSeqs : . . . CAT . . . . . .
blockSeqs : . . . TT . . . . . .
blockSeqs : . . . GT . . . . . .
blockSeqs : . . . CG . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACGAGCTAA
finalCons : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACGAGCTAA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): CAGTGTTGTGATATTGACTTTTTTAAAAAAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 1 2 222 99999999999999999999 2 3333 66666 5555 11 1
lowQualScore : . . ... .................... . .... ..... .... .. .
lowQualScore : 2 4 111 11111111111111111111 4 8888 44444 2222 77 2
consensus : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACGAGCTAA
Reference ( family-754 ) : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACGAGCTAA
gi|1 : C-ATGATGATAGCTC-T---T----CA-----T--------TT-TT----T-----CT----CAAA--A-GACAAGCTA
gi|10 : gacaacaacgctggaacCAGAGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CG-----C--------TC-TTA---G-----TC----AAAA--A-GACAAGCTAAgaatt
gi|11 : acCAGGGTC-ATAACAATAACTC-TTTGT----CA-----T--------TT-TT----T-----TC----AAGA--A-GAGGAACTAa
gi|12 : gcCAAGGTC-ATAACAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TTTTTCT-----TC----AAAA--A-GACAATCTAA
gi|13 : CAGGGTC-ATGACAATAGCTT-T---T----CC-----T--------GT-TT----T-----TC----AAGA--A-GAC
gi|14 : ggCAGGGTC-ATGACAAAAGCTC-T---T----TG-----T--------TT-TT----T-----CTTTGAAAAA--A-GATGAGtgattaaaa
gi|15 : cCAGGAAC-ATTATAACTCCTC-T---T----CA-----T--------TT-TT----T-----------AAAA--A-GACAAGCTAAatc
gi|16 : AGGTTC-ATGACAATAGCTC-T---T----GG-----T--------TTATT----T-----TC----GAAA--A-GACAGGCTAAcaag
gi|17 : CAGGGTC-ATGACAATAGATC-T---T----CA-----T--------TT-TT----T-----TT----ATAA--A-GATGAGATAa
gi|18 : acCAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----AG-----C--------TT-AA----T-----TC----AAAA--G-GATGAGCTGA
gi|19 : CAGGGTA-ATGACAATAGCTC-T---A----TG-----T--------TT-TT----T-----TG----AAAA--A-GACGAGCTAa
gi|2 : acCAGGGTT-ATGACAATAGCTC-T---TTCTTCG-----T--------TT-TT----T-----TC----ATAA--A-GATGAGCTAA
gi|20 : gcTC-ATGATAATAACTC-T---T----CA-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-CATAAGCTAAaa
gi|21 : ccagtcCAGGGTC-ATGTCAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACAAGCTAA
gi|22 : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CGTT---T--------TT-TT----T-----TT----AAAA--A-GATGAGC
gi|23 : cCAGGGTC-TTGAC-ATAGCTCTT---T----CT-----T--------CT-TT----T-----TC----GTAA--A-GATGAAC
gi|24 : cCAGGTTC-ATAGAAATAGTTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACTAGCTaa
gi|25 : tCAGGGTC-ATGGCA-TAGTTC-A---T----CA-----T--------TT-TT----C-----TC----AAAA--A-GACGAGCTt
gi|26 : CAGGGTC-ATGACAATAGCTC-T---T----CG-----T--------TT-TT----TTC---TC----AAAA--A-TACAAGCtaa
gi|27 : CAGGGTC-ATGACATTAGCTC-T---T----T------T--------TT-TT----C-----TC----AAAA--A-GACGAGC
gi|28 : cCAGGGTC-ATGACAATAGCTC-----------G-----T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-GACAAGCTAA
gi|29 : AGAGTC-ATGACAATAGCTT-C---T----CG-----A--------TT-TT----T-----TTGTGAAAAA--A-
gi|3 : gctCAGGGCC-ATGACAATAGCTC-T---T----TG-----TTGTTGTTGTT-TT----T-----TT----AAAA--ATGATGAGCT
gi|30 : cAAGGAC-ATGACAATAGCTC-T---T-----------------------TT----T-----TC----AAAA--A-GACAAACTAA
gi|31 : AGGGTC-ATGACAATAACTC-T---T----CG--------------TT-TG----T-----TC----AAAA--G-GACGAGaa
gi|32 : tCAGGGTC-ATAACAATAGCTC-T---T----CGAT---T--------TT-TT----T-----TC----AAAA--A-
gi|33 : acGGGTC-ATGACAACAGTTC-T---T----CA-----T--------TT-TT----T-----TC----
gi|4 : CAGGGTC-ATGACAATAGCCCAT---T----CG-----TGA------TT-TT----TTTCTCTC----AAAA--A-GACAAGCTtcaaa
gi|5 : CAAGATCCATGGCAATAGCTC-T---TC---CGT----T--------TT-TT----T-----TC----TAAA--C-GACAAGCTAAta
gi|6 : CAAGG---ATGACAATAGCTC-T---T----CGGGGTTT--------TT-TT----T-----TC----GAGA--A-GACGAGCTAAtaa
gi|7 : aCAGGGTC-TTGACAATAGCTC-C---TAA--TT-----T--------TT-TT----T-----TT----AAAAATA-GGCGAGCTa
gi|8 : cacCAGGGTC-A-GACAATAACTC-T---T----CA-----T--------TTCTT----T-----TC----AAGA--A-GATGAGCTAA
gi|9 : acCAGGGTC-ATGACAATACCTC-T---T----CA-----T--------TT-TT----TTA---TA----AAAA--A-GACAAGCTAag
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): CAGTGTTGTGATATTGACTTTTTTAAAAAAAAAAA