lowQualScore : 11111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 1 1 444444444 1111 11 11 1 1 44444444444 222 1111 1 1 1 1 222222 7777777777 1111 11 1 1111 1 333333 333333333333 1111 1111 11 1111 222 1 1 1 1 1 22222 111 111 1 33333333333 111111 111 4444444 11 1 1 1 1 1 22222 1 222222222 1111111 1 1 1 1111 22 1 77777777777777777777777 111 6666666666666666666666666666 1 2222222 1 2222222 1111 22222222222 1111 111 11111111 1111 222222 333 444 11 55555555 11111 1111 55555555 11 11
lowQualScore : 33 5 9 5 0 4 6 1 3 2 6 7 444444444 1 2222 1 0 6 99 55 3 1 1 5 77777777777 1 222 9 5555 3 5 5 1 5 333333 0 7 999 5 9999999999 99 6 66 1111 88 3 5 6666 7 2 7 2 6 6 000000 666666666666 2222 5 2222 4 33 0 77 5555 66 9 888 77 7 77 5 7 5 5 5 0 3 77 6 4 6 0 66666 111 666 1 1 1 6 1 3 1 1 55555555555 99 6 555555 111 0 5 1111111 22 6 6 3 6 1 1 7 2 5 7 2 1 5 33333 0 6 3 222222222 8888888 77 1 5 1 3 0 7 0 5 2 7 5 8888 5 1 55 5 1 77 5 6 55555555555555555555555 888 0 1 888 1 5 8888888888888888888888888888 4 1 3 1 4444444 0 2222222 77 2222 55555555555 2 66 8 66 0000 3 0 1 5 555 5 22222222 0000 111111 888 2 777 9 6 6 444 44 00000000 5 66666 1 4444 00000000 6 3 7 99 22
lowQualScore : .. . . . . . . . . . . . ......... . .... . . . .. .. . . . . ........... . ... . .... . . . . . ...... . . ... . .......... .. . .. .... .. . . .... . . . . . . ...... ............ .... . .... . .. . .. .... .. . ... .. . .. . . . . . . . .. . . . . ..... ... ... . . . . . . . . ........... .. . ...... ... . . ....... .. . . . . . . . . . . . . . ..... . . . ......... ....... .. . . . . . . . . . . . .... . . .. . . .. . . ....................... ... . . ... . . ............................ . . . . ....... . ....... .. .... ........... . .. . .. .... . . . . ... . ........ .... ...... ... . ... . . . ... .. ........ . ..... . .... ........ . . . .. ..
lowQualScore : 00 0 2 3 7 8 7 0 0 1 0 9 111111111 3 1111 9 7 0 77 00 7 4 1 7 00000000000 0 777 0 5555 3 0 0 4 0 000000 8 8 444 6 2222222222 22 7 77 0000 22 7 0 0000 3 2 5 0 0 7 888888 333333333333 1111 7 1111 3 99 2 44 9999 00 3 999 99 3 99 0 0 3 0 7 1 0 66 0 8 7 7 00000 777 222 0 0 0 7 7 2 4 4 66666666666 22 7 888888 777 4 7 4444444 00 7 7 3 7 7 0 0 7 7 0 7 3 3 77777 9 0 7 999999999 6666666 99 4 7 4 7 1 3 7 0 1 0 7 3333 7 4 66 7 4 99 7 0 00000000000000000000000 111 1 4 999 3 7 3333333333333333333333333333 6 4 7 7 9999999 1 3333333 99 1111 11111111111 1 99 6 99 6666 2 2 0 0 222 0 99999999 2222 666666 888 5 222 0 7 7 333 55 00000000 0 77777 0 2222 88888888 7 2 7 22 22
consensus : CCTGTGTCGTATACCAACATATCTCCAGAGCGCTTTACAAATGGATTACCCATCGCTTCCA-TAGTCACACAGAGGTCATTTACTTCNGGCCTTAATTTAACACGTTAAAATTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTTTTTATTTATTTTCCAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCC-CATCTC----CCG----AATACCATCCATATGAGAAGTTAGGTCAAC-ATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTTTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGGTACTCAAGAAAA------TAATGATGTGTT-TATCGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTGTTTTGTTTGCTATCTCGTCCACCA--AAATC-ATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCAACAAGAG-ACATTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGGAACTTCAAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA-----A----N-AA----A-A----CGTTTACTGCTGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATANGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAANGTGTACTTTTATGTG-GATG--GCCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGCCACCCCAATGTGAAGCTTTCCAAACGATACTGACTAC---TAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAG-TTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGT--------TTACTGAC--TGACGAACAGA--CTGAAC---AGATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATAT-TG--G---TGTGACAAAACGACTATGATTATTGTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATAAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT-AA-CTGGTAGTTTTGAGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGCTGTATTTATCTTTNGAGTTTTGATACTTGTATTGCATA-GAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAACC-GGCATTATTAGTATTT--T-TTACATTTTAAACCAATATATACGATA-ATACAATA-CTAT--TAT--TTTTTCATATCACTCA-CTTAAATACTATT-AC---ATATCAC-TTTTTTTN--A------AATCTAATTATGAACCTTTAATACATTTC------GTTAAATT------NA--CA----GGGTAAAGTACGCTAAATAAT--GTAAATATAAGGTCACAT--CAGTACTTA----TATACATTTAATAT-TGATTTACCC-CACCCACNNTATTTTG---CATATA-A----ATAC---AATGTTTTGCTCTATATCATTAGAAACTTTATT-TT-TA-ATATGTTTANAAAG--TG--T-AACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATG----AAAA--TTGGGCAAA-ATTANAATAGAATATTCAAATTATAGAAATCGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
Reference ( gi|1 ) : CCTGTGTCAAATACCAACATCTCTCCCGAGTGTTTTACAAATAGATTACCCATCGCTCCCA-TAGTCACACAGACGTCATTTACTTCAGGCCCTACTTTAACATATTAAAGTTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCCCTATGTTATTTCTTTATTTATTTTCCAGTATCGTCTCAAAGTCATTAACTGCTTTCTC-CATCTC----TAA----AATACCATCCATTTAAGAAGTCAGGTCAAC-ATTCCTCCATCTCATTTTACAAGCATGTTATTGTATTCATGTGGTTGGTCTGTTGGTAATCAAGAAAA------TAACGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTTTTTTATTTACTATCTTGTCCACCA--AAATC-ATGTTATAAATGTCAACAAGAAAGCAAAGTAAAAGTTTAACAAAAA-ACATTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGGCCTGACGGAACTTCGAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA-----A----G-AA----A-A----TGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATACGTATGTGAAATGCACAAGCAGTCACCTGATAGGCCAAACGTGTTCTTTTATGTG-G-TG--GCCTTGGGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACAGTATCTGCCTATTCAAGCGCAC-TAATGCAGTCATAACCTTTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTTAAAGAAGCCGTCCCAATGTGAAGGTTTCCAAACGATATTCAATAC---TAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCTG-TTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGAGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCAGTGATGT--------TGACTAAC--TGACGAACAGA--CAGAAC---AGATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATAT-T---G---TGTGACAAAACAGCTATGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAGAAAGTTTATCATGAAACTATTGAAGCTTTTG-AATTCAAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT-TA-CTGATAATTTTGAGACACCAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATACATGTATATATACATGTGTCCGCTGTATTCATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTTTTGCATA-GACATAATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAA-C-GGCATTATAAGTATTT--T-TTACATTTTGAACCAATATA-----------------------TAT--TTTTTCATATCACTCA-CGTAAATACTATT-AC-TTATATCAC-TTTTTTTG--A------AATTTAATTATGAACCTTAAACACATTTC------TTTCAATT------AA--CA----GGGTAAAATACGCTTAATAAT--GTAAATATGAGGTCACAT--CAGTATTTA----TATACATTTAATAT-TGAATAACCC-CACCTACACTATTTTG---TATATA-A----ATAC---AATGTTTTGCTCTATACTTTTAGAAACTTCATT-TT-TATCTATGTTTATTAAGACTG--T-AACTATTATTT-----TATAAAATATCTATG----AAA----TGGTCAAA-ATTAAAATAGAATATACAAATTATAGAAATGGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|3 : CCTGTATCAAATACCAACATATCTCCAGATTGTTTTACAAATAGATTACCCATCACTACCAGTAGTCACATAGAGGTCATTTACCT-AGGACTTACTTTAACAAGTTAAAATTTTGATGTGTT-----GTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTAGTT-TTTATTTATTTTCCAGTATCGGCTAAAAGTTATTAACTGCTTTCTC-CATCGC----CCG----AATATCATCAATAAAAGAAGTTAGGTCAAC-ATCCCTACATTTCATTTTACAAGCGTGTTATT-TATTCATGTGGTTGACCTGTTGGTACTCAAGAAAC------T---GTTTTGCTATCTCATCCACCAAAATCATGTCAT----AAA------------------TGT-CACCAAGAAACCAAAGTTA-AAGT-TCAACAAGAA-------------------------ACATTTGTTAAGCTGAAATTGCCTTCTTACAGTGACCTGACAGAACTTCAAT-GTAACAGATCAG--TTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA-----A----C-AAAAATA-A----TGTTTACTGTGGCCATCATCTGTA-TTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTCACATATGTATG
gi|8 : gCCTGTGTTGTATACCAACATATCTCCAGAGTGCTTTACAAATGGATTACCCATTACTTC-A-T-GTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTCAATTTAACACATT-------TGACCTGTT----TGTGTTGTTGAACATTTGCTCCTTTTTTCTACGTTATTTTTTTATTTATTTTCGAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCC-CATCTC----CCG----AATGCCATCCAT---ATGAGTTAGGCCAAC-ATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTGCTTTATTCATGTGTTTGTTCTGTTGGTACTCATCAAAATACATGTAATAATGTGTT-TATTGTTCATTACAATTTTGTCATTTGCAAACTGC----TTTGCTATCTTGTCCACCC--AAATC-ATGCCATATTTGTCAACATGGAACCAAAGTAAAAGGTCAATAAGAGTAT-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGAAACTT-AAGTGTAATAGATCA--TTTAAAAATTATGCGGTGATGCAAACA-----A----T-AA----ATA----TGTTTACTGCTGCAGTTATCTGTATTTTGGTTTCCTTATCCAAAATCATTTTACACAAGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCAGATAGGCGAAAA----------ATGTGAA-TG--ACCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATAAGCCTTTTCTAGAGCACAAAATACAGTCATTACTTCTAAGCCAGatacttgttcttttatgtgggtggccttgaggaatgacctggtcctctgatacattatctgccctttccagagcactaatgcagtcataacctctaagccagttgccaagattgttcaaagaagtcatcccaatgtgatggtttccaaacaatactcaataatagtatcatcaaatgtacctggtcagttttactgaatttgttagaggctggtcacaggcaataaaggtagtttgcttgagattgaaaaggtttacaaatgcccagtgatgtaactgactgacaaactgattgaggtagaagggcgcatttgtcaatgattgaatatgtagctgatccttccaacatattagcgtacgacaaaatgactatgattattctgcattctgttaaaaaagtttatcatgaaactaatgatgcttttgaattctaaatttatgaaataatgaataagcaacaacttgtaactgatggtttttagacaacaaacacagttaacaccaacccccctaatttatacatttatatatacatgtgcctgctgtatttatcttttgagttttgatacttgtattgcatagaaattatatgaatcagtacagcaaagcattaaaacaataaaaacataccggctttaaaagaattttttacattttaaaccaatatatatattttcatatactattacatctcacatttctttaaaatgtaattatgaacctttaacacatttcgttaaatttacagggtaaatatgaggtcacatcagtatttatatacatttaatactgatttacccaccccacaatataaaaacaatgttttgatctatatcattaaaaacttaattattttgtgtttataaagtgcataactattattttattaaatatctatgaaaaaattgggcaaaattataatagaatattccaattatagaaattgttgctattttctaagatttt
gi|11 : gCCTGTGTCTTGTACCAACATATCTCCAGAGCGCTCAACAAATGGATTTTCCATTGCTTCCA-CAGCCACAAAGAGGTCATTTACTTCTGTACTTGATTTAATCTGC-ACACGTGTGTCCTGTT----TGTGAT--------TCT-CTACTTTTCTCTATGCT-TTTTTTTATTTTTTTACCAGTGACGTCTAAATTTCATTAACTGCTTTCAC-CATCTCAGGTTCA----AATACCACCAATATGAGAAG----------------TTCATCTCATATTCCAAGCTTGTTATTTTAatt
gi|7 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaCTGTGTCAAATACCAACATATCTCCAGATCGTTTTACAAATTGAATACCCATCGCTCCCA-TAGTCACACAGAGGGCATTTACTTCAGGCCTTACTTTAACACATTAAAATTTTACCCTGTT----TGTGATGTTGAACATGTGCTCCTTTTATCTATGTTATTT-TTTATATATTTTCCAGCGATATTTACAATTCATTAACTGCTTTCCC-CATCTC-----AC----CTTACCATCTATATAAGCAGTTAGGTCAAC-ATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCGTGTTATTGTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGCTACTCAAGAAAA------TAATGATGTGTT--------CACTACAATTTTGCCATTTGAAAACTGTTTTG----CTATCTTGTCCACCA--AAATC-ATG--ATA---------------------TAAATGTC-AACAAGAA-AC-----------CAAAGTTGCCTTCTTACAGTGACCTGACG-----TCAAG-GTAACAGATC--TGTAAAAAAATCTGCGGTGATGCAAACA-----ACAAGA-AA----A-A----TGTGTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATACATATGTAAAATGCAGAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAATGTGTTCTTTTATGTG-GATG--GTCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGC--T----------------GTTGTCAAGAGTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGGTTTCCAAACAAT-----GTAC---TTGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAG-TTTTATTTAATTTGTTCGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGAGACTG-AAAAGGTTTAC
gi|13 : CTGTGTCGTATACCAACATATCTCCACAGTGCTTTACAAATGGACCATCCATTGCTTCCA-TAGTAACAAAGAGGTTATATACTTCAGGCCTTAATTTAACACA-------TTTGACCTGTT----TGTGTTGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTA-TTATTTATTTTCCCGTGTCGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCC-CATTTC----CCG----AATGCCATCCATATGAGAAGTAAGGTCAACTAT--CTCAATCTCA-TTTACAAGC
gi|12 : CTGTGTCTTATACAAACATATTTCA-GAGTGTTCAACAAATGGCTTTCCCTTTTTTTCCA-TAGTAACACAGAGTTCATTTACTTCTGGCCTTAGTTTAACACATT-------TGATATGTTCAAGTGTGCTTTTGAACATTTGTTTCTTTTCTCTTTGCTATTTTTTTCTTTATTTTTCAGTGACGTTTAAAATTCATTAACTGCTTTCTC-CATCTC----AGATCCGAATACCACCCATATGAGAAGTTAGGTCAAC-A-TCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTtt
gi|2 : CANNNNNNNNNNATTTACTTCTAGCCTTGATTTAA--TCGGAACATTTTGACCAGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTTTCTATGTTAT------------TTTCCAGTTACGTCTTCAATTCATTAACTG-TATATCAGATCC-------A----AATACCATt
gi|2 : cgAAGTTTGTTATTTCATCTATGTGCTTGGTCTCTTGGTACTCAAGAAAA------TAATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCATACTGTTTTA----CTATCTCGTCCAGCA--AAATA-ATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCATCAAGAG-TCATTTGTTAAGCTGAAGTTGTCTTCGTACA------TAATA-AACTTCAAG-GTAACAGAACAGTT--AAAAAT-CTGCGGTAATGCAAACACCAAAAT---G-AA----A-A----CGTGTACTGCTGTCATAATCTGTATTTTGGTA-CTTAATCAAATATCATTTAACATATCTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCATCTAATAGACGAAAGGTGTACGTTGATGTG-G--GAAGCCTAGAG--ATCCGATCTGACCCTCTGATACATAACTTGCATTTTCCACAGAAT-TAATGCAGTCAGTACCCCCAAACCAGTTACCAAGATTGTTCAAAGAAGCCCTTCCAATGTGGAGCCCTCCAAATAATACT---TACGTTTTGTATCTTCGAATGTACACGG-CTATTTTTATTGATTTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTTGTTTTCTCGGGATTGAAAAAAGTTTACACATGCCCTGTGATGTTTACTTTATGACTAATCATGAC-ATCAAA--CTGAAC---AGATTGAGACAGAAGGGCGAATTTGACAGTGATTAAATATGCAGCTGATCCTTTCAACATAT-TG--G---CGTGACAGAACGACAATGATT-TTGTGCATTCTG-TT-AAAAACATTTGTCATGAAACTAATGATATTTTTG-AATCCTAAATTTATGAAACAATTAATAAGCAATAACTTGA-AA-TAGATGGTTTCAAGACAACAAACAC---------AATTAGCA-------TCATCA-T-CCC-TTAACTGATATGTGTATATAAAC---------------TTATATTTAGAGTTTTGATACTTGTATTTCATA-CAAATGATATGAATCAGTACAGCAAACCATTAAAACAGT-ACAAACATAA-CTGGCATTATTAGTATTT--TCTTA-ATTTAAAACCAATATACATGTT-----------------TAT--CTTTTCAAATCAC-CATCTTCAATACTGTCAAA-TCATAC--C-TTTTTTTT--A------AATCTAATTATAAACCTTCAATACATTTCATTGCATTTGGATT------AA--TA----GAATAAAGAACACTAAGTAAT--GTAAATATAAGGTCACAT--CAGTACGTA----GATACATTTTATAT-TGATTTACCC-CACTAATCTTA-ATTG---CATATA-G----ATAC---AATAATTTGgtgcgaagtttgttatttcatctatgtgcttggtctcttggtactcaagaaaataatgatgtgtttattgttcactacaattttgccatttgcatactgttttactatctcgtccagcaaaataatgtcataaatgtcaacaagaaaccaaagtaaaagttcatcaagagtcatttgttaagctgaagttgtcttcgtacataataaacttcaaggtaacagaacagttaaaaatctgcggtaatgcaaacaccaaaatgaaaacgtgtactgctgtcataatctgtattttggtacttaatcaaatatcatttaacatatctatgtgaaatgcgcaagcagtcatctaatagacgaaaggtgtacgttgatgtgggaagcctagagatccgatctgaccctctgatacataacttgcattttccacagaattaatgcagtcagtacccccaaaccagttaccaagattgttcaaagaagcccttccaatgtggagccctccaaataatacttacgttttgtatcttcgaatgtacacggctatttttattgattttgttggaggctggtcacaagcaataaaggttgttttctcgggattgaaaaaagtttacacatgccctgtgatgtttactttatgactaatcatgacatcaaactgaacagattgagacagaagggcgaatttgacagtgattaaatatgcagctgatcctttcaacatattggcgtgacagaacgacaatgattttgtgcattctgttaaaaacatttgtcatgaaactaatgatatttttgaatcctaaatttatgaaacaattaataagcaataacttgaaatagatggtttcaagacaacaaacacaattagcatcatcatcccttaactgatatgtgtatataaacttatatttagagttttgatacttgtatttcatacaaatgatatgaatcagtacagcaaaccattaaaacagtacaaacataactggcattattagtattttcttaatttaaaaccaatatacatgtttatcttttcaaatcaccatcttcaatactgtcaaatcataccttttttttaaatctaattataaaccttcaatacatttcattgcatttggattaatagaataaagaacactaagtaatgtaaatataaggtcacatcagtacgtagatacattttatattgatttaccccactaatcttaattgcatatagatacaataatttgtaaatattcaaattacagaaattggtgctatgttttaagatctaaatagcatatatatacattaatttgctttatataatgcattattttaatataaaaataatgtttgatgtgcttataaagtgttaactgttattctgtaaattattcatgaaaatgttgagcaaaatagtagaatattcaaattacagaaagctatgttttaagattttaag
gi|4 : cgcannnnnnnnnnatttacttctagccttgatttaatcggaacattttgaccagtttgtgatgttgaacatttgctccttttttctatgttattttccagttacgtcttcaattcattaactgtatatcagatccaaataccatgtgcgATTCATGTG-TTGATCTTTTGGTACTTAAGAAAA------TAATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAGTTTTGCCATGTGCAAACTG----GTTTGCTATCTCGTCCACCA--AAATC-ATGTCATAAA-GTCAACAAAGAACCAAAGTAAATGTTAAACAAGTG-TCATTTGTTAAGCTGAAGTTCCCTTCTTACAGCGACTTGACGAAACTTCAAG-GTAACAGATC--TGTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAATG-----G----GAAA----A-A----CGTTTACTGCTGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATAAATATGTGAAATGCATAAGCATTCAACTGATAGCCGAAAAGTTTACTTTTATTTG-GATG--GCCTTGAGGAAA--GACCTGGCCCTGTGATACATTATCTGCCTTTACCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCAAAGAGTGTTCAAAGAAGCCACCCCAATGTGGAGCTTTCCAAACAATACTGACTAC---TAGAATCTTCGTATGTACCTTGTCAG-TTGTATTTAATTTGTTTGAGGCTGGTAACAAGCAAAAAAGGTAATTTGTTCGGGATCG-TAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGT--------TTACTGAC--TGACGAACACA--CTGAAC---ATATTGAGGTAGAAGGGTGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTTC-ACATAT-TGGCG---TTTGACAAAACGACTATGATTATTGTGCATT-TG-TTAAAAAAAGTTAATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATATATAAAATAATGAATACGCAAAAACTTGT-AA-CTGGTAGTTTTGAGACATCAAATAA---------AA-TAACA-------TCA--A-CTCCC-GTAACTTATGTATGTATATATACATGTGTCTGTTGTATTTATCTTTTGAATTTTGATACTTATATTGCATATGAGTTA--ATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAATAAAAAACATAACC-GGCATTATTGATATTT--T-TTACATTTTAAACCAATATATACGATATATACAATAACTATTTTAT--TTTTTCACGTTACTCA-TTTAAAAACTATT-AC-----ATC---------TA--AAAAAATAATATAATTATGAACCTTTGATACATTTC------GTTAGATT------TA--CA----AGGTAAAGTAAGCTAAATAAT--GTAAATAAAAGGTCACGT--CAGTACTTA----TATACATGTGATAT-TGATTTACCC-CACC--CACCGTTTTT---TACATA-T----ACACTAAAATGTTTTGCTCTATATCATTAGAAACTTTATT-CTATATGTATATAAAGTAAAA-------AACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAAA----AGGGCAAA-ATTACAGTAGAATATTCAAATGATAGAAATCATTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGTtaaatattcaaattacagaaattggtgctatgttttaagatctaaatagcatatatatacattaatttgctttatataatgcattattttaatataaaaataatgtttgatgtgcttataaagtgttaactgttattctgtaaattattcatgaaaatgttgagcaaaatagtagaatattcaaattacagaaagctatgttttaagattttaag
gi|3 : TTTGCTATCTCATCCACCA--AAATC-ATGTCATAAATGTCACCAAGAAACCAAAGTTAAAGTTCAACAAGAA-ACATTTGTTAAGCTGAAATTGCCTTCTTACAGTGACCTGACAGAACTTCAAT-GTAACAGATCAGTT--AAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA-----A----C-AA----A-AATAATGTTTACTGTGGCCATCATCTGTATTT-GGTTTCTTAATCCAAAATCATTTCACAT-----------ATGTA------------TGATA-------CTTGTTCTTTTATGTG-GGTG--GCCTTGAGGAAT--GACCTGGTCCTCTGATACATTATCTGCCCTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATAACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGTCATCCCAATGTGATGGTTTCCAAACAATACTCAATAA---TAGTATCATCAAATGTACCTGGTCAG-TTTTACTGAATTTGTTAGAGGCTGGTCACAGGCAATAAAGGTAGTTTGCTTGAGATTG-AAAAGGTTTACAAATGCCCAGTGATG-------------TAAC--TGACTGACA-------AAC---TGATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATAT-TAGCG---TACGACAAAATGACTATGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT-AA-CTGATGGTTTTTAGACAACAAACAC---------AGTTAACA-------CCA--ACC-CCC-CTAATTTATACATTTATATATACATGTGCCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATA-GAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAC-C-GGCTTTAAAAGAATTT--T-TTACATTTTAAACCAATATA-----------------------TAT--ATTTTCAT--------------ATACTATT-AC---ATCTCACATTTCTTTA--A------AATGTAATTATGAACCTTTAACACATTTC------GTTAAATT------TA--CA----GGGT---------------------AAATATGAGGTCACAT--CAGTATTTA----TATACATTTAATAC-TGATTTACCC-ACCCCACA------------ATATA-A----AAAC---AATGTTTTGATCTATATCATTAAAAACTTAATTATT-T---TGTGTTTATAAAG--TGCAT-AACTATTATTT-----TATTAAATATCTATG----AAAAAATTGGGCAAA-ATTATAATAGAATATTCCAATTATAGAAATTGTTGCTATTTTCTAAGATTTTc
gi|6 : gcctgtatcaaataccaacatatctccagattgttttacaaatagattacccatcactaccagtagtcacatagaggtcatttacctaggacttactttaacaagttaaaattttgatgtgttgtgatgttgaacatttgctccttttctctatgttagtttttatttattttccagtatcggctaaaagttattaactgctttctccatcgcccgaatatcatcaataaaagaagttaggtcaacatccctacatttcattttacaagcgtgttatttattcatgtggttgacctgttggtactcaagaaactgtA-----A----A-AC----A-A----CGTTTACTGCTGCCATGATCTGTATTTTGGTTTCTTAATATAAAATCATTTTACATA-----------------AGTAGTCACTTGAT--------TGTGTACTTTTATGTG-AATG--GCCTTGAGGA-C--GACCTAGCCCTCTGATACATGATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACATCTAAGCAAGTTGCAAATATTGTTCAAAGAAGCCATCCCAGTGTGAAGCTTTCCAAACGATACTGACTAC---TAGTATCTTCGAATGTACCGGGTCAG-TTTTATTAAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-CAAAAGT-------------GTGATGT--------TTACTGAC--TGACCAACAGA--CTGAAC---AGATTAAGATAGAAGGGCGCATTTGTCAATGCTTGAATATGCAGTTGATTCTTCCAACGTATAT---G---TGTGACAAAAGGAATATGATTATTGTGCATT-TGTTT-AAAAAA---CATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATATAATAATGAGTAAGCAATAACTTG---------TAGCTTTGAGACAACAAACACAGTTAACCAAATTAACA-------TCA--ACC-CCC-TTAACTTATATATGTCTATATACATTTGTCTGCCCTATCTATCTTAAGAGTTTTGATACTTATATTGCATA-GCAATTATATTAATTAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATA-------ATTATTAGTATTT--T-TTACTTTTAAAATCAATATA-----------------------TAT--TGTTTCATATCATTCA-CTTAAATACTATT-AC---ATCTTAC-ATTATTTA--A------AATTTAATTATGAACCATGAATACTATTC------ATTAAATTTGGCTAAA--CA----GAGTAAAGTACATTAAATAAT--ATAAATATAAGGTCACAT--CAGTACTTA----TATAC-----ACAT-TTAATTACCC-CACCCACCTTAATTTG---CATATACG----ATAC---AAT
gi|7 : aaCATTTTACATATGTATGTAAAATGaagtt
gi|5 : ctgtgtcaaataccaacatatctccagatcgttttacaaattgaatacccatcgctcccatagtcacacagagggcatttacttcaggccttactttaacacattaaaattttaccctgtttgtgatgttgaacatgtgctccttttatctatgttattttttatatattttccagcgatatttacaattcattaactgctttccccatctcaccttaccatctatataagcagttaggtcaacatccctccatctcattttacaagcgtgttattgtattcatgtgtttggtctgttgctactcaagaaaataatgatgtgttcactacaattttgccatttgaaaactgttttgctatcttgtccaccaaaatcatgatataaatgtcaacaagaaaccaaagttgccttcttacagtgacctgacgtcaaggtaacagatctgtaaaaaaatctgcggtgatgcaaacaacaagaaaaatgtgtactgcggccatcatctgtattttggtttcttaatccaaaatCATTTTACATAAGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTACTTTTATGTG-GATG--GCCTTGTGGAAT--GACCTGACCCTCTGGTACATTGTCTGTCTTTTCCAGAGTAC-TTATGCGGTCGTTACCTCAAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGTCACCCCAATGTGAAGCTTTTCAAACGATACTGACTAC---CAGTATATTGGAATGTTTCTGGTCAT-TTTTATTGAATCTGTTGGCGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGTTTGGGATTG-AAAATGTCTACAGACGCCCTGTGATGT--------TTGTTGAC--TGACGAAGAGA--CTAAAT---AGATTGAGGTAGAAGTGCGCATTTGCCAATGATTAAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATAT-TG--G---TGTGAcagaagcagtcacctgataggcgaaatgtgttcttttatgtggatggtcttgaggaatgacctggccctctgatacattatctgccttttccagagcactaatgctgttgtcaagagtgttcaaagaagccgccccaatgtgaaggtttccaaacaatgtacttgtatcttcgaatgtacctggtcagttttatttaatttgttcgaggctggtcacaagcaataaaggtagtttgctcgagactgaaaaggtttac
gi|10 : AGC--TGAAGAACAGATTCAAAATTTGAGATTGAGGTAGGAGGGCACATGTGTCAATGACTAATCATGTATCTGATCCTTGCAACATAA-T---GGCGTGTGACAAAACGACTGTGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAACAATGCATTTG-AATATTAAATACATTAAATAAAGAATAAGCAA-AA-------A-CTGATAGTTCTGAGGCAACAGACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCCCTTAACTGACATAGGCATATATACATGTGTGTGCTCTATTTATCCTTAGTGCTTTGATACTTGTATTGCATA-AATAATATATGAATCAGTACAGAAAAGCATTAAAACAAT-A------TC--C-TGCATTATTAGTATTTATT-TTTCATTTTAAACAAATATA-----------------------TATGATTTTTCTTATTACTAA-CTTCAATACTATT-ACAATATAT-AT-TTT-------A------TATCTAATTACGAACTTTAAATAC----T------TTTCAATA------AATTCGGCTTGAATAAAGTACACTAATTAAT--GTAAATAttttgaattctaaattaataaaataatgaatacgcaacaacttgtgtaactggtagttttgagacaacagacacaattaacaattaacatcaacccccttaacttatatatgtatatatacatgtgtctgttgtattcatattttgagttttgatacttgtattgcataaagattatattaattagtacagcaaagcattaaaacaataagaacataaccggcattatgagtatgtttcacattataaaccaatatatacgatatatacaatatctatcgtatgttttcatatcactcacttagatactattacatctcacaatttttcaaatttaattatgaacctttaatatatttcgttaaatgtacaaggttatgtaaatataatatcacatcagtctttatatacatttaatattgatttaccccacccaccattttttgcataaaatgatacaatattttgctctttatcatagaagctttattttttatatgtttaaaaagtttgtaaccgttattttgtaaaatatctattaaaaatttgggcaaaattataatagaatattaaaattacagaagttattgctatttttcaagaattaaagg
gi|9 : tttgGATTGAGGTAGAATGGTGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTTCAACATAC-T---GGCGTATGACAAAACGACTATGATTATTGAGCATTCTGGTT-AA-AAAGTTTATCATGAAACTAATGAAGCTTTTCCAATTCTAAATTTATAAAATAATGAATACACAACAACTTGT-AA-CTGGTAGTTTTGCGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTTTATGTGTATATATACGTGTGTCTGCTGTATTAATCTTTTGAGTTTTGATACCTGCATTGCATA-GAAAGTATAAAAATCAGTAGAGCAAAGAATTAAAAC----AAAGATATAACC-GGCA--------------T-TTACATGTTAAACCAATATATATGATACATACAATATCTATTGTAT--TTTTTCATATCACTCA-TTTAAATACTATT-ACGTCATA-CA---TTTTTTGCTA------AACCTAATCATGAACATTTAATACATTTC------GTTTAATT------TA--CA----GGGTAAAATACGCTAAATAAT--GTAAATATATGGTAATTT--CTGTATTTA----TATACATATAATAT-TGATTTCCCC-CACCCACCGTATTTTG---CAT---------ATAC---AATGTTTTACTATATATCATTAGAAACTTTATA-TT-TA--TATGTTTACAAAG--TG--------------------TATAACACATCTATG----AAA----AAGTTAAAGAATAAAATAGAATATTGAAACTATAGAAATTGTTG
gi|5 : TTTTG-AATTCTAAATTAATAAAATAATGAATACGCAACAACTTGTGTAACTGGTAGTTTTGAGACAACAGACAC---------AATTAACAATTAACATCA--A-C-CCCCTTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGTTGTATTCATATTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATA-AAGATTATATTAATTAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAGAACATAACC-GGCATTATGAGTATGT--T-TCACATTATAAACCAATATATACGATATATACAATATCTATCGTAT--GTTTTCATATCACTCA-CTTAGATACTATT-AC---ATCTCAC-AATTTTTC--A------AATTTAATTATGAACCTTTAATATATTTC------GTTAAATG------TA--CA----AGGT----T----------AT--GTAAATATAATATCACAT--CAGTCTTTA----TATACATTTAATAT-TGATTTACCC-CACC--CACCATTTTT---TGCATA-AAATGATAC---AATATTTTGCTCTTTA-TCATAGAAGCTTTATT-TT-T-TATATGTTTAAAAAGTTTG--T-AACCGTTATTT-----TGTAAAATATCTATT----AAAAATTTGGGCAAA-ATTATAATAGAATATTAAAATTACAGAAGTTATTGCTATTTTTCAAGAATTAAAG
gi|2 : cattttacataagtatgtgaaatgcgcaagcagtcacctgataggcgaaacgtgtacttttatgtggatggccttgtggaatgacctgaccctctggtacattgtctgtcttttccagagtacttatgcggtcgttacctcaaagccagttgccaagattgttcaaagaagtcaccccaatgtgaagcttttcaaacgatactgactaccagtatattggaatgtttctggtcatttttattgaatctgttggcggctggtcacaagcaataaaggtagtttgtttgggattgaaaatgtctacagacgccctgtgatgtttgttgactgacgaagagactaaatagattgaggtagaagtgcgcatttgccaatgattaaatatgtagctgatccttccaacatattggtgtgaAATAATTTGTAAATAT----TCAAATTACAGAAATTGGTGCTATGT-TTTAAGATCTAAATAGCATATATATACATTAATTTGCTTTATATA-A-----TGC---ATTATTTTA----ATA----TAAAAA--TAATG-TT-TG-ATGTGCTTATAAAG--TG--TTAACTGTTATTC-----TGTAAATTATTCATG----AAAATGTTGAGCAAA-AT---AGTAGAATATTCAAATTACAGAAA-----GCTATGTTTTAAGATTTTAAGg
gi|15 : cgcannnnnnnnnnatttacttctagccttgatttaatcggaacattttgaccagtttgtgatgttgaacatttgctccttttttctatgttattttccagttacgtcttcaattcattaactgtatatcagatccaaataccatgtgcgaagtttgttatttcatctatgtgcttggtctcttggtactcaagaaaataatgatgtgtttattgttcactacaattttgccatttgcatactgttttactatctcgtccagcaaaataatgtcataaatgtcaacaagaaaccaaagtaaaagttcatcaagagtcatttgttaagctgaagttgtcttcgtacataataaacttcaaggtaacagaacagttaaaaatctgcggtaatgcaaacaccaaaatgaaaacgtgtactgctgtcataatctgtattttggtacttaatcaaatatcatttaacatatctatgtgaaatgcgcaagcagtcatctaatagacgaaaggtgtacgttgatgtgggaagcctagagatccgatctgaccctctgatacataacttgcattttccacagaattaatgcagtcagtacccccaaaccagttaccaagattgttcaaagaagcccttccaatgtggagccctccaaataatacttacgttttgtatcttcgaatgtacacggctatttttattgattttgttggaggctggtcacaagcaataaaggttgttttctcgggattgaaaaaagtttacacatgccctgtgatgtttactttatgactaatcatgacatcaaactgaacagattgagacagaagggcgaatttgacagtgattaaatatgcagctgatcctttcaacatattggcgtgacagaacgacaatgattttgtgcattctgttaaaaacatttgtcatgaaactaatgatatttttgaatcctaaatttatgaaacaattaataagcaataacttgaaatagatggtttcaagacaacaaacacaattagcatcatcatcccttaactgatatgtgtatataaacttatatttagagttttgatacttgtatttcatacaaatgatatgaatcagtacagcaaaccattaaaacagtacaaacataactggcattattagtattttcttaatttaaaaccaatatacatgtttatcttttcaaatcaccatcttcaatactgtcaaatcataccttttttttaaatctaattataaaccttcaatacatttcattgcatttggattaatagaataaagaacactaagtaatgtaaatataaggtcacatcagtacgtagatacattttatattgatttaccccactaatcttaattgcatatagatacTCAAAT--CAGTATTTA----TATACATTTGATAT-TGATTTACCC-CATCTACCGTATTTTG---CATATACA----ATAC---AATGATTTGCTCTATATCATTAGAAACTTTATT-TT-TA--TACGTTTTTAAAGTGTG--T-TACTGTTTTTTTTTTGTGTAAAATATCTATG----AA-----------------AAAACAAGACA---AAGTTATAGTAATG
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): CATAATTGTTATATTTAATATCTAAGCTAAAATATAGTTTTCATATCACTCACTTGTTTAACACTAGCTTACAACAAAATAATTTAATGATAACTTTAAATGTATTTGATCAAAATGGAATATTTCGAATCCCATTAGTACATTAAATAATGTAAATATAATAATGTCACATCAGGAGATTTTCATATCGATTTACCTAACCCACCTTAATTTGCAAATACATATTACATTGATAAGTTCTT
Unaligned ( gi|16 ): ATGCTATATATAAAATGAATATGAGAAAACTGTATGCAACAATGGTCATTTGGAGGCATGGAACAAAATAATATCACAGTCCCG
Unaligned ( gi|17 ): TATAGATGAAATTAAATACATTCTCTTTCCTTGACAAAT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 3333333 1111 2222 1 111111 444444444 2222 11111 22222222222 1 1111 111111 11111 11 222222222 1111111 1 1 33333333333333333333333333333 22222222222222222 111111 1111111 22222222222222 1111 11111111 2222222222 1111 22 1111111111111 11111 22 222
lowQualScore : 66 1 5 1 1 444444 5555555 0000 0 0 33 00 0 6666 0 0 0 0 0 3 1 3 3 999999 6 4 3 444444444 0 77 5 1 1 4 1 1 1 99 5 0 55 5 2222 1 66 11111 33333333333 3 2 0 33 1 1 3 0 66 5 0 0 4 0 1 1 2222 5 666666 4 3 22222 1 66 66 33 0 4 5 5 5 3 777 000000000 6666666 66 0 5 0 1 0 5 3 33 3 6666 2 55555555555555555555555555555 0 4 8888 66 66 99999999999999999 1 9999 6 66 66 4 222222 5555555 66 0 33333333333333 2 0 777 4 66 66 4 8888 0 33333333 66 1111111111 0000 777 22 1 6666666666666 44444 33 333 3 6
lowQualScore : .. . . . . ...... ....... .... . . .. .. . .... . . . . . . . . . ...... . . . ......... . .. . . . . . . . .. . . .. . .... . .. ..... ........... . . . .. . . . . .. . . . . . . . .... . ...... . . ..... . .. .. .. . . . . . . ... ......... ....... .. . . . . . . . .. . .... . ............................. . . .... .. .. ................. . .... . .. .. . ...... ....... .. . .............. . . ... . .. .. . .... . ........ .. .......... .... ... .. . ............. ..... .. ... . .
lowQualScore : 11 4 7 0 9 444444 5555555 6666 5 9 22 22 8 2222 1 4 1 8 2 6 3 0 2 222222 7 8 2 333333333 4 99 7 7 4 3 6 6 3 33 7 4 77 7 4444 7 99 66666 99999999999 0 6 1 66 4 0 8 9 99 0 5 7 3 7 4 0 1111 7 444444 3 0 55555 4 99 99 88 7 3 7 7 0 4 111 000000000 2222222 99 0 0 0 0 2 0 1 44 5 9999 2 11111111111111111111111111111 7 4 4444 11 11 22222222222222222 0 4444 4 11 11 0 888888 3333333 11 9 66666666666666 7 9 888 4 11 33 9 9999 8 44444444 99 9999999999 6666 222 55 0 1111111111111 33333 66 999 0 3
consensus : CCTGTGTCGNATACCAACATATCTCCAGAGCGCTTTACAAATGGATTACCCATCGCTTCCA-TAGTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTTANTTTA------ACACGTTAAAATTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTTTTTATTTATTTTCCAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTCA---CCGAATACCATCCATATGAGAAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTTTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGGTACTCAAGAAAA------TAATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTGTTTTGTTTGCTATCTCGTCCACCA--AAATC-ATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCAACAAGAGACA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGGAACTTCAAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----NAA----A-A----CGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATANGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTNCTTTTATGTGGATGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGCTTTCCAAACGATACTNACTACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACAGACTGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGG--CG--T--GACAAAACGACTATGATTATTGTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAACCGGCATTATTAGTATTT--T-TTACATTTTAAACCAATATATACGATA-A---AAT-A------T--T--ATTTTTTCATATCACTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--A-T-NT-CA---C-TTTTTTTNA----AATCTAATT--ATGA--ACCTTNAATACATTTCG------TTAAATT------NA--CAGGGTA-----------A--AGTACGCTAAATAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCNTATTTTGCATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAT----C---ATT--A----------GAAACT----TTAT-T-TTT--ATATGTTTATAAAG--T--G--T-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAA--TTGGGCAAAATTANAGTAGAATATTCAAATTATAGAAATCGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
Reference ( family-579 ) : CCTGTGTCGTATACCAACATATCTCCAGAGCGCTTTACAAATGGATTACCCATCGCTTCCA-TAGTCACACAGAGGTCATTTACTTCNGGCCTTAATTTA------ACACGTTAAAATTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTTTTTATTTATTTTCCAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC----CCGAATACCATCCATATGAGAAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTTTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGGTACTCAAGAAAA------TAATGATGTGTT-TATCGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTGTTTTGTTTGCTATCTCGTCCACCA--AAATC-ATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCAACAAGAGACA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGGAACTTCAAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----NAA----A-A----CGTTTACTGCTGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATANGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAANGTGTACTTTTATGTGGATGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGCCACCCCAATGTGAAGCTTTCCAAACGATACTGACTACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACAGACTGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGG--TG--T--GACAAAACGACTATGATTATTGTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATAAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGCTGTATTTATCTTTNGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAACCGGCATTATTAGTATTT--T-TTACATTTTAAACCAATATATACGATA-ATACAAT-A-CTA--T--T--ATTTTTTCATATCACTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--A-T-AT-CA---C-TTTTTTTNA----AATCTAATT--ATGA--ACCTTTAATACATTTCG------TTAAATT------NA--CAGGGTA-----------A--AGTACGCTAAATAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTACTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACNNTATTTTGCATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAT----C---ATT--A----------GAAACT----TTAT-T-TTTA-ATATGTTTANAAAG--T--G--T-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATG--AAAA--TTGGGCAAAATTANAATAGAATATTCAAATTATAGAAATCGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|1 : CCTGTGTCAAATACCAACATCTCTCCCGAGTGTTTTACAAATAGATTACCCATCGCTCCCA-TAGTCACACAGACGTCATTTACTTCAGGCCCTACTTTA------ACATATTAAAGTTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCCCTATGTTATTTCTTTATTTATTTTCCAGTATCGTCTCAAAGTCATTAACTGCTTTCTCCATCTC----TAAAATACCATCCATTTAAGAAGTCAGGTCAACATTCCTCCATCTCATTTTACAAGCATGTTATTGTATTCATGTGGTTGGTCTGTTGGTAATCAAGAAAA------TAACGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTTTTTTATTTACTATCTTGTCCACCA--AAATC-ATGTTATAAATGTCAACAAGAAAGCAAAGTAAAAGTTTAACAAAAAACA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGGCCTGACGGAACTTCGAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----GAA----A-A----TGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATACGTATGTGAAATGCACAAGCAGTCACCTGATAGGCCAAACGTGTTCTTTTATGTGG-TGGCCTTGGGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACAGTATCTGCCTATTCAAGCGCAC-TAATGCAGTCATAACCTTTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTTAAAGAAGCCGTCCCAATGTGAAGGTTTCCAAACGATATTCAATACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCTGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGAGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCAGTGATGTTGAC----TAA-C------TGACGAACAGACAGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATT-G--TG--T--GACAAAACAGCTATGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAGAAAGTTTATCATGAAACTATTGAAGCTTTTG-AATTCAAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--TACTGATAATTTTGAGACACCAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATACATGTATATATACATGTGTCCGCTGTATTCATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTTTTGCATAGACATAATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAA-CGGCATTATAAGTATTT--T-TTACATTTTGAACCAATATA--------------------------T--ATTTTTTCATATCACTCA-CGTA---AATACTA--TTACTTA-T-AT-CA---C-TTTTTTTGA----AATTTAATT--ATGA--ACCTTAAACACATTTCT------TTCAATT------AA--CAGGGTA-----------A--AATACGCTTAATAATGTAAAT---ATGAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGAATAACCCCACCTACACTATTTTGTATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAC----T---TTT--A----------GAAACT----TCAT-T-TTTATCTATGTTTATTAAGACT--G--T-A--ACTATTATTT-----TATAAAATATCTATG--AAA----TGGTCAAAATTAAAATAGAATATACAAATTATAGAAATGGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|10 : ----TGAGC------TGAAGAACAGATTCAAAATTTGAGATTGAGGTAGGAGGGCACATGTGTCAATGACTAATCATGTATCTGATCCTTGCAACATAATGGCGTG--T--GACAAAACGACTGTGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAACAATGCATTTG-AATATTAAATACATTAAATAAAGAATAAGCAA--A-------AACTGATAGTTCTGAGGCAACAGACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCCCTTAACTGACATAGGCATATATACATGTGTGTGCTCTATTTATCCTTAGTGCTTTGATACTTGTATTGCATAAATAATATATGAATCAGTACAGAAAAGCATTAAAACAAT-A------T--CCTGCATTATTAGTATTTATT-TTTCATTTTAAACAAATATATATGAT--------------------------TTTTCTTATTACTAA-CTTC---AATACTA--TTAC--AAT-AT--A-------TATTTTA----TATCTAATT--ACGA--ACTTTAAATACTTTTCA------ATAAATT------CGGCTTGAATA-----------A--AGTACACTAATTAATGTAAAT---A
gi|11 : ttCCTGTGTCTTGTACCAACATATCTCCAGAGCGCTCAACAAATGGATTTTCCATTGCTTCCA-CAGCCACAAAGAGGTCATTTACTTCTGTACTTGATTTAATCTGCACACG-------TGTGTCCTGTT----TGTGAT--------TCT-CTACTTTTCTCTATGCT-TTTTTTTATTTTTTTACCAGTGACGTCTAAATTTCATTAACTGCTTTCACCATCTCAGGTTCAAATACCACCAATATGAGAAGTT---------------CATCTCATATTCCAAGCTTGTTATTTTA
gi|12 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaCTGTGTCTTATACAAACATATTTC-AGAGTGTTCAACAAATGGCTTTCCCTTTTTTTCCA-TAGTAACACAGAGTTCATTTACTTCTGGCCTTAGTTTA------ACACATT-------TGATATGTTCAAGTGTGCTTTTGAACATTTGTTTCTTTTCTCTTTGCTATTTTTTTCTTTATTTTTCAGTGACGTTTAAAATTCATTAACTGCTTTCTCCATCTCAGATCCGAATACCACCCATATGAGAAGTTAGGTCAACAT-CCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTT
gi|13 : CTGTGTCGTATACCAACATATCTCCACAGTGCTTTACAAATGGACCATCCATTGCTTCCA-TAGTAACAAAGAGGTTATATACTTCAGGCCTTAATTTA------ACACA-------TTTGACCTGTT----TGTGTTGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTA-TTTATTATTTATTTTCCCGTGTCGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATTTC----CCGAATGCCATCCATATGAGAAGTAAGGTCAAC-TATCTCAATCTCA-TTTACAAGCTT
gi|14 : TAATT--G-TTATATTT------AATATCTAAGCTA-A---AAT-A---------T--AGTTTT-CATATCACTCA-CTTGTTTAACACTAGCTTAC--A-------A---C--------AA----AAT--AATTTAATGATAACTTTAAATGTATTTGA------TCAAA---------A--TGGAATATTTCGAATCCCATTAGTACATTAAATAATGTAAATATAATAATGTCACATCAGGA--GAT-------TTTCATATCGATTTACCTAACCCACCTTAATTTGCAAATA-C--ATA
gi|15 : caTCAAATCAGTATTTATAT--ACATTTGATATTGATTTACCCCATCTACCGTATTTTGCATATACA--ATACAATGATTTGCTCTATAT----C---ATT--A----------GAAACT----TTAT-T-TTT--ATACGTTTTTAAAG--T--G--T-GTTACTGTTTTTTTTTTGTGTAAAATATCTATGAAAAAA--CAAGACAAAGTTATAGTAttacattgataagttctt
gi|2 : CANNNNNNNNNNATTTACTTCTAGCCTTGATTTA------AT-CGG-AACATTTTGACCAGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTTTCTATG------------TTATTTTCCAGTTACGTCTTCAATTCATTAACTGTATATCAGAT-------CCAAATA----CCATGTGCGAAGTTTGTT----AT---TTCATCT-ATGT-----GCTTG--------------------GTCTCTTGGTACTCAAGAAAA------TAATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCATACTGT----TTTACTATCTCGTCCAGCA--AAATA-ATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCATCAAGAGTCA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGTCTTCGTACA------TAAT-AAACTTCAAG-GTAACAGAACAG--TTAAAAA-TCTGCGGTAATGCAAACACCAAAATGAA----A-A----CGTGTACTGCTGTCATAATCTGTATTTTGG-TACTTAATCAAATATCATTTAACATATCTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCATCTAATAGACGAAAGGTGTACGTTGATGTGGGAAGCCTAGAG--ATCCGATCTGACCCTCTGATACATAACTTGCATTTTCCACAGAAT-TAATGCAGTCAGTACCCCCAAACCAGTTACCAAGATTGTTCAAAGAAGCCCTTCCAATGTGGAGCCCTCCAAATAATACTTACGTTTTGTATCTTCGAATGTACACGGCTATTTTTATTGATTTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTTGTTTTCTCGGGATTGAAAAAAGTTTACACATGCCCTGTGATGTTTACTTTATGA-CTAATCATGAC-ATCAAACTGAACA-----GATTGAGACAGAAGGGCGAATTTGACAGTGATTAAATATGCAGCTGATCCTTTCAACATATTGG--CG--T--GACAGAACGACAATGATT-TTGTGCATTCTG-TT-AAAAACATTTGTCATGAAACTAATGATATTTTTG-AATCCTAAATTTATGAAACAATTAATAAGCAATAACTTGA--AATAGATGGTTTCAAGACAACAAACAC---------AATTAGCA-------TCATCA-T-CCC-TTAACTGATATGTGTATATAAAC---------------TTATATTTAGAGTTTTGATACTTGTATTTCATACAAATGATATGAATCAGTACAGCAAACCATTAAAACAGT-ACAAACATAACTGGCATTATTAGTATTT--TCTTA-ATTTAAAACCAATATACATG-T-----------------T--T--ATCTTTTCAAATCAC-CATCTTC---AATACTG--T--C--A-A-AT-CATACC-TTTTTTTTA----AATCTAATT--ATAA--ACCTTCAATACATTTCATTGCATTTGGATT------AA--TAGAATA-----------A--AGAACACTAAGTAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTACGTAGAT--ACATTTTATATTGATTTACCCCACTAATCTTA-ATTGCATATA-G--ATACAATAATTTG-TAAATAT----TCAAATTACA----------GAAATTGGTGCTATGT-TTTA-AGATatgctatagatagtgtaaa
gi|2 : cgGCATATA-T--ATACATTAATTTGCTTTATATAATGC---ATT--ATTTTAATATAAAAA------TAAT-G-TTTG-ATGTGCTTATAAAG--T--G--TTA--ACTGTTATTC-----TGTAAATTATTCATG--AAAATGTTGAGCAAAAT---AGTAGAATATTCAAATTACAGAAA-----GCTATGTTTTAAGATTTTAAGctaaatagcatatatatacattaatttgctttatataatgcattattttaatataaaaataatgtttgatgtgcttataaagtgttaactgttattctgtaaattattcatgaaaatgttgagcaaaatagtagaatattcaaattacagaaagctatgttttaagattttaag
gi|3 : cgcannnnnnnnnnatttacttctagccttgatttaatcggaacattttgaccagtttgtgatgttgaacatttgctccttttttctatgttattttccagttacgtcttcaattcattaactgtatatcagatccaaataccatgtgcgaagtttgttatttcatctatgtgcttggtctcttggtactcaagaaaataatgatgtgtttattgttcactacaattttgccatttgcatactgttttactatctcgtccagcaaaataatgtcataaatgtcaacaagaaaccaaagtaaaagttcatcaagagtcatttgttaagctgaagttgtcttcgtacataataaacttcaaggtaacagaacagttaaaaatctgcggtaatgcaaacaccaaaatgaaaacgtgtactgctgtcataatctgtattttggtacttaatcaaatatcatttaacatatctatgtgaaatgcgcaagcagtcatctaatagacgaaaggtgtacgttgatgtgggaagcctagagatccgatctgaccctctgatacataacttgcattttccacagaattaatgcagtcagtacccccaaaccagttaccaagattgttcaaagaagcccttccaatgtggagccctccaaataatacttacgttttgtatcttcgaatgtacacggctatttttattgattttgttggaggctggtcacaagcaataaaggttgttttctcgggattgaaaaaagtttacacatgccctgtgatgtttactttatgactaatcatgacatcaaactgaacagattgagacagaagggcgaatttgacagtgattaaatatgcagctgatcctttcaacatattggcgtgacagaacgacaatgattttgtgcattctgttaaaaacatttgtcatgaaactaatgatatttttgaatcctaaatttatgaaacaattaataagcaataacttgaaatagatggtttcaagacaacaaacacaattagcatcatcatcccttaactgatatgtgtatataaacttatatttagagttttgatacttgtatttcatacaaatgatatgaatcagtacagcaaaccattaaaacagtacaaacataactggcattattagtattttcttaatttaaaaccaatatacatgtttatcttttcaaatcaccatcttcaatactgtcaaatcataccttttttttaaatctaattataaaccttcaatacatttcattgcatttggattaatagaataaagaacactaagtaatgtaaatataaggtcacatcagtacgtagatacattttatattgatttaccccactaatcttaattgcatatagatacaataatttgtaaatattcaaattacagaaattggtgctatgttttaagatctaaataCCTGTATCAAATACCAACATATCTCCAGATTGTTTTACAAATAGATTACCCATCACTACCAGTAGTCACATAGAGGTCATTTACCT-AGGACTTACTTTA------ACAAGTTAAAATTTTGATGTGTT-----GTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTAGTTTT-TATTTATTTTCCAGTATCGGCTAAAAGTTATTAACTGCTTTCTCCATCGC----CCGAATATCATCAATAAAAGAAGTTAGGTCAACATCCCTACATTTCATTTTACAAGCGTGTTA-TTTATTCATGTGGTTGACCTGTTGGTACTCAAGAA---------ACTGTTTTGCTATCTCATCCACCAAAATCATGTCAT----AAA-TGT------------------CACCAAGAAACCAAAGT--TAAAGTTCAACAAGAAA------------------------CA-TTTGTTAAGCTGAAATTGCCTTCTTACAGTGACCTGACAGAACTTCAAT-GTAACAGATCAG--TTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----CAAAAATA-A----TGTTTACTGTGGCCATCATCTGTA-TTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTCACATATGTATG
gi|3 : gAAACTGTTTTG----CTATCTCATCCACCA--AAATC-ATGTCATAAATGTCACCAAGAAACCAAAGTTAAAGTTCAACAAGAAACA-TTTGTTAAGCTGAAATTGCCTTCTTACAGTGACCTGACAGAACTTCAAT-GTAACAGATCAGTT--AAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----CAA----A-AATAATGTTTACTGTGGCCATCATCTGTATTT-GGTTTCTTAATCCAAAATCATTTCACAT----ATGTA-------------------TGATA-------CTTGTTCTTTTATGTGGGTGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGTCCTCTGATACATTATCTGCCCTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATAACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGTCATCCCAATGTGATGGTTTCCAAACAATACTCAATAATAGTATCATCAAATGTACCTGGTCAGTTTTACTGAATTTGTTAGAGGCTGGTCACAGGCAATAAAGGTAGTTTGCTTGAGATTG-AAAAGGTTTACAAATGCCCAGTGATG-TAAC----TGA-C------TG----ACAAACT----------GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTAG--CG--TACGACAAAATGACTATGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGATGGTTTTTAGACAACAAACAC---------AGTTAACA-------CCA--ACC-CCC-CTAATTTATACATTTATATATACATGTGCCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACAT-ACCGGCTTTAAAAGAATTT--T-TTACATTTTAAACCAATATAT---ATA-------------------------TTTTCAT-----------------ATACTA--TTAC--A-T-CT-CA---CATTTCTTTAA----AATGTAATT--ATGA--ACCTTTAACACATTTCG------TTAAATT------TA--CAGG--------------------------------GTAAAT---ATGAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATACTGATTTACCCACCCCACA---------ATATA-A--AAACAATGTTTTGATCTATAT----C---ATT--A----------AAAACT----TAAT-TATTT---TGTGTTTATAAAG--T--GCAT-A--ACTATTATTT-----TATTAAATATCTATGAAAAAA--TTGGGCAAAATTATAATAGAATATTCCAATTATAGAAATTGTTGCTATTTTCTAAGATTTTatacttgttcttttatgtgggtggccttgaggaatgacctggtcctctgatacattatctgccctttccagagcactaatgcagtcataacctctaagccagttgccaagattgttcaaagaagtcatcccaatgtgatggtttccaaacaatactcaataatagtatcatcaaatgtacctggtcagttttactgaatttgttagaggctggtcacaggcaataaaggtagtttgcttgagattgaaaaggtttacaaatgcccagtgatgtaactgactgacaaactgattgaggtagaagggcgcatttgtcaatgattgaatatgtagctgatccttccaacatattagcgtacgacaaaatgactatgattattctgcattctgttaaaaaagtttatcatgaaactaatgatgcttttgaattctaaatttatgaaataatgaataagcaacaacttgtaactgatggtttttagacaacaaacacagttaacaccaacccccctaatttatacatttatatatacatgtgcctgctgtatttatcttttgagttttgatacttgtattgcatagaaattatatgaatcagtacagcaaagcattaaaacaataaaaacataccggctttaaaagaattttttacattttaaaccaatatatatattttcatatactattacatctcacatttctttaaaatgtaattatgaacctttaacacatttcgttaaatttacagggtaaatatgaggtcacatcagtatttatatacatttaatactgatttacccaccccacaatataaaaacaatgttttgatctatatcattaaaaacttaattattttgtgtttataaagtgcataactattattttattaaatatctatgaaaaaattgggcaaaattataatagaatattccaattatagaaattgttgctattttctaagatttt
gi|4 : gcctgtatcaaataccaacatatctccagattgttttacaaatagattacccatcactaccagtagtcacatagaggtcatttacctaggacttactttaacaagttaaaattttgatgtgttgtgatgttgaacatttgctccttttctctatgttagtttttatttattttccagtatcggctaaaagttattaactgctttctccatcgcccgaatatcatcaataaaagaagttaggtcaacatccctacatttcattttacaagcgtgttatttattcatgtggttgacctgttggtactcaagATTCATGTGTT-GATCTTTTGGTACTTAAGAAAA------TAATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAGTTTTGCCATGTGCAAACTG----GTTTGCTATCTCGTCCACCA--AAATC-ATGTCATAAA-GTCAACAAAGAACCAAAGTAAATGTTAAACAAGTGTCA-TTTGTTAAGCTGAAGTTCCCTTCTTACAGCGACTTGACGAAACTTCAAG-GTAACAGATC--TGTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAATG--G----GAA----A-AA---CGTTTACTGCTGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATAAATATGTGAAATGCATAAGCATTCAACTGATAGCCGAAAAGTTTACTTTTATTTGGATGGCCTTGAGGAAA--GACCTGGCCCTGTGATACATTATCTGCCTTTACCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCAAAGAGTGTTCAAAGAAGCCACCCCAATGTGGAGCTTTCCAAACAATACTGACTACTAGAATCTTCGTATGTACCTTGTCAGTTGTATTTAATTTGTTTGAGGCTGGTAACAAGCAAAAAAGGTAATTTGTTCGGGATCG-TAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACACACTGAACA-----TATTGAGGTAGAAGGGTGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTTC-ACATATTGG--CGTTT--GACAAAACGACTATGATTATTGTGCATT-TG-TTAAAAAAAGTTAATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATATATAAAATAATGAATACGCAAAAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACATCAAATAA---------AA-TAACA-------TCA--A-CTCCC-GTAACTTATGTATGTATATATACATGTGTCTGTTGTATTTATCTTTTGAATTTTGATACTTATATTGCATATGAGTTA-ATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAATAAAAAACATAACCGGCATTATTGATATTT--T-TTACATTTTAAACCAATATATACGATATATACAATAA-CTATTT--T--ATTTTTTCACGTTACTCA-TTTA---AAAACTA--TTAC--A-T-CT-AA------------AAAAATAATATAATT--ATGA--ACCTTTGATACATTTCG------TTAGATT------TA--CAAGGTA-----------A--AGTAAGCTAAATAATGTAAAT---AAAAGGTCACGTCAGTACTTATAT--ACATGTGATATTGATTTACCCCACCCACCGTTTTTTACATATACA--CTAAAATGTTTTGCTCTATAT----C---ATT--A----------GAAACT----TTAT-T-CT---ATATGTATATAAAG--TAAA--A-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAA--AAGGGCAAAATTACAGTAGAATATTCAAATGATAGAAATCATTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|5 : CATTTTACATAAGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTACTTTTATGTGGATGGCCTTGTGGAAT--GACCTGACCCTCTGGTACATTGTCTGTCTTTTCCAGAGTAC-TTATGCGGTCGTTACCTCAAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGTCACCCCAATGTGAAGCTTTTCAAACGATACTGACTACCAGTATATTGGAATGTTTCTGGTCATTTTTATTGAATCTGTTGGCGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGTTTGGGATTG-AAAATGTCTACAGACGCCCTGTGATGTTTGT----TGA-C------TGACGAAGAGACTAAATA-----GATTGAGGTAGAAGTGCGCATTTGCCAATGATTAAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGG--TG--T--GAc
gi|5 : TGATTTTG-AATTCTAAATTAATAAAATAATGAATACGCAACAACTTGTGTAACTGGTAGTTTTGAGACAACAGACAC---------AATTAACAATTAACATCA--A-C-CCCCTTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGTTGTATTCATATTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAAAGATTATATTAATTAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAGAACATAACCGGCATTATGAGTATGT--T-TCACATTATAAACCAATATATACGATATATACAAT-ATCTA--TCGT--ATGTTTTCATATCACTCA-CTTA---GATACTA--TTAC--A-T-CT-CA---C-AATTTTTCA----AATTTAATT--ATGA--ACCTTTAATATATTTCG------TTAAATG------TA--CAAGGT-----------------T----------ATGTAAAT---ATAATATCACATCAGTCTTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCATTTTTTGCATAAA-ATGATACAATATTTTGCTCTTTAT----C---A-T--A----------GAAGCT----TTAT-T-TTTT-ATATGTTTAAAAAGTTT--G--T-A--ACCGTTATTT-----TGTAAAATATCTATT--AAAAATTTGGGCAAAATTATAATAGAATATTAAAATTACAGAAGTTATTGCTATTTTTCAAGAATTAAAGttttgaattctaaattaataaaataatgaatacgcaacaacttgtgtaactggtagttttgagacaacagacacaattaacaattaacatcaacccccttaacttatatatgtatatatacatgtgtctgttgtattcatattttgagttttgatacttgtattgcataaagattatattaattagtacagcaaagcattaaaacaataagaacataaccggcattatgagtatgtttcacattataaaccaatatatacgatatatacaatatctatcgtatgttttcatatcactcacttagatactattacatctcacaatttttcaaatttaattatgaacctttaatatatttcgttaaatgtacaaggttatgtaaatataatatcacatcagtctttatatacatttaatattgatttaccccacccaccattttttgcataaaatgatacaatattttgctctttatcatagaagctttattttttatatgtttaaaaagtttgtaaccgttattttgtaaaatatctattaaaaatttgggcaaaattataatagaatattaaaattacagaagttattgctatttttcaagaattaaagg
gi|6 : cattttacataagtatgtgaaatgcgcaagcagtcacctgataggcgaaacgtgtacttttatgtggatggccttgtggaatgacctgaccctctggtacattgtctgtcttttccagagtacttatgcggtcgttacctcaaagccagttgccaagattgttcaaagaagtcaccccaatgtgaagcttttcaaacgatactgactaccagtatattggaatgtttctggtcatttttattgaatctgttggcggctggtcacaagcaataaaggtagtttgtttgggattgaaaatgtctacagacgccctgtgatgtttgttgactgacgaagagactaaatagattgaggtagaagtgcgcatttgccaatgattaaatatgtagctgatccttccaacatattggtgA--A----AAC----A-A----CGTTTACTGCTGCCATGATCTGTATTTTGGTTTCTTAATATAAAATCATTTTACATAAGTA-----------------GTCACTTGAT--------TGTGTACTTTTATGTGAATGGCCTTGAGGA-C--GACCTAGCCCTCTGATACATGATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACATCTAAGCAAGTTGCAAATATTGTTCAAAGAAGCCATCCCAGTGTGAAGCTTTCCAAACGATACTGACTACTAGTATCTTCGAATGTACCGGGTCAGTTTTATTAAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTGCAAAAG--------------TGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACCAACAGACTGAACA-----GATTAAGATAGAAGGGCGCATTTGTCAATGCTTGAATATGCAGTTGATTCTTCCAACGTATATG--TG--T--GACAAAAGGAATATGATTATTGTGCATT-TGTTT-AAAAAA---CATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATATAATAATGAGTAAGCAATAACTT---------GTAGCTTTGAGACAACAAACACAGTTAACCAAATTAACA-------TCA--ACC-CCC-TTAACTTATATATGTCTATATACATTTGTCTGCCCTATCTATCTTAAGAGTTTTGATACTTATATTGCATAGCAATTATATTAATTAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATA------ATTATTAGTATTT--T-TTACTTTTAAAATCAATATA--------------------------T--ATTGTTTCATATCATTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--A-T-CT-TA---C-ATTATTTAA----AATTTAATT--ATGA--ACCATGAATACTATTCA------TTAAATTTGGCTAAA--CAGAGTA-----------A--AGTACATTAAATAATATAAAT---ATAAGGTCACATCAGTACTTATATACACATTTAA-------TTACCCCACCCACCTTAATTTGCATATACG--ATACAATg
gi|7 : aaCTGTGTCAAATACCAACATATCTCCAGATCGTTTTACAAATTGAATACCCATCGCTCCCA-TAGTCACACAGAGGGCATTTACTTCAGGCCTTACTTTA------ACACATTAAAATTTTACCCTGTT----TGTGATGTTGAACATGTGCTCCTTTTATCTATGTTATTTTTT-ATATATTTTCCAGCGATATTTACAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTCA---CCT--TACCATCTATATAAGCAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCGTGTTATTGTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGCTACTCAAGAAAA------TAATGATGTGTT--------CACTACAATTTTGCCATTTGAAAACTGTTTTG----CTATCTTGTCCACCA--AAATC-ATGATATAAATGT------------------------CAACAAGAAAC------------CAAAGTTGCCTTCTTACAGTGACCTGACG-----TCAAG-GTAACAGATC--TGTAAAAAAATCTGCGGTGATGCAAACA--A----CAAGAAAA-A----TGTGTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATACATATGTAAAATGCAGAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAATGTGTTCTTTTATGTGGATGGTCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGC--T----------------GTTGTCAAGAGTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGGTTTCCAAACAATG-----TACTTGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTTAATTTGTTCGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGAGACTG-AAAAGGTTTACaagtt
gi|8 : CCTGTGTTGTATACCAACATATCTCCAGAGTGCTTTACAAATGGATTACCCATTACTTC-A-T-GTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTCAATTTA------ACACATT-------TGACCTGTT----TGTGTTGTTGAACATTTGCTCCTTTTTTCTACGTTATTTTTTTATTTATTTTCGAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC----CCGAATGCCATCCATATG---AGTTAGGCCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTGCTTTATTCATGTGTTTGTTCTGTTGGTACTCATCAAAATACATGTAATAATGTGTT-TATTGTTCATTACAATTTTGTCATTTGCAAACTGC----TTTGCTATCTTGTCCACCC--AAATC-ATGCCATATTTGTCAACATGGAACCAAAGTAAAAGGTCAATAAGAG-TATTTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGAAACTT-AAGTGTAATAGATCA--TTTAAAAATTATGCGGTGATGCAAACA--A----TAA----ATA----TGTTTACTGCTGCAGTTATCTGTATTTTGGTTTCCTTATCCAAAATCATTTTACACAAGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCAGATAGGCGAAAA----------ATGTGAATGACCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATAAGCCTTTTCTAGAGCACAAAATACAGTCATTACTTCTAAGCCAG
gi|9 : g-----GATTGAGGTAGAATGGTGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTTCAACATACTGG--CG--TATGACAAAACGACTATGATTATTGAGCATTCTG-GT-TAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGAAGCTTTTCCAATTCTAAATTTATAAAATAATGAATACACAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGCGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTTTATGTGTATATATACGTGTGTCTGCTGTATTAATCTTTTGAGTTTTGATACCTGCATTGCATAGAAAGTATAAAAATCAGTAGAGCAAAGAATTAAAACAA----AGATATAACCGGCATT---------------TACATGTTAAACCAATATATATGATACATACAAT-ATCTA--T--TGTATTTTTTCATATCACTCA-TTTA---AATACTA--TTAC--G-TCATACA---T-TTTTTGCTA----AACCTAATC--ATGA--ACATTTAATACATTTCG------TTTAATT------TA--CAGGGTA-----------A--AATACGCTAAATAATGTAAAT---ATATGGTAATTTCTGTATTTATAT--ACATATAATATTGATTTCCCCCACCCACCGTATTTTGCAT-------ATACAATGTTTTACTATATAT----C---ATT--A----------GAAACT----TTAT-A-TTT--ATATGTTTACAAAG--T--G--T-A-------------------TAACACATCTATG--AAAAAGTTA---AAGAATAAAATAGAATATTGAAACTATAGAAATTGTTGatt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): ATGCTATATATAAAATGAATATGAGAAAACTGTATGCAACAATGGTCATTTGGAGGCATGGAACAAAATAATATCACAGTCCCG
Unaligned ( gi|17 ): TATAGATGAAATTAAATACATTCTCTTTCCTTGACAAAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 3333333 1111 44444 1 111111 444444444 2222 11111 22222222222 1 1111 111111 11111 11 222222222 1111111 1 1 2222222222222222222222222222222 11 2222222 111111 1111111 22222222222222 1111 1111 2222222222 1111111111111 11111
lowQualScore : 55 1 5 0 1 444444 5555555 0000 0 0 33 6 0 2 00000 0 0 0 0 0 3 1 3 3 999999 6 3 444444444 0 77 5 1 1 4 1 1 1 888 5 0 55 5 2222 1 66 11111 33333333333 2 2 0 33 1 3 2 0 66 5 0 2 0 3 0 1 1 2222 5 666666 4 3 22222 1 66 33 66 0 4 5 5 5 1 3 777 000000000 6666666 66 0 5 0 0 0 55 33 3 66 4 2 1111111111111111111111111111111 4 8888 66 00 888 2222222 777 9999 6 66 66 1 222222 5555555 66 0 33333333333333 2 0 777 1 66 1 1 7 8888 0 2222 5555555555 0 5 8888 6666666666666 44444 22 3 6
lowQualScore : .. . . . . ...... ....... .... . . .. . . . ..... . . . . . . . . . ...... . . ......... . .. . . . . . . . ... . . .. . .... . .. ..... ........... . . . .. . . . . .. . . . . . . . . .... . ...... . . ..... . .. .. .. . . . . . . . ... ......... ....... .. . . . . . .. .. . .. . . ............................... . .... .. .. ... ....... ... .... . .. .. . ...... ....... .. . .............. . . ... . .. . . . .... . .... .......... . . .... ............. ..... .. . .
lowQualScore : 00 4 7 8 0 444444 5555555 6666 5 9 22 2 8 2 66666 1 4 1 8 2 6 3 0 2 222222 7 2 333333333 4 99 7 7 4 3 6 6 3 000 0 4 77 7 4444 7 99 66666 99999999999 5 6 1 66 4 4 8 9 99 0 5 7 7 0 7 4 0 1111 7 444444 3 0 55555 4 99 88 99 7 3 7 7 0 1 4 111 000000000 2222222 99 0 0 0 8 2 11 44 5 11 4 2 9999999999999999999999999999999 4 4444 11 66 444 4444444 111 4444 4 11 11 0 888888 3333333 11 9 66666666666666 7 9 888 4 11 9 0 7 9999 8 1111 0000000000 6 7 3333 1111111111111 33333 77 0 3
consensus : CCTGTGTCGNATACCAACATATCTCCAGAGCGCTTTACAAATGGATTACCCATCGCTTCCA-TAGTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTTANTTTA------ACACGTTAAAATTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTTTTTATTTATTTTCCAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC-AG-TCCGAATACCATCCATATGAGAAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTTTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGGTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTGTTTTGTTT-CTATCTCGTCCACCA--AAATC-ATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCAACAAGAG-ACATTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGGAACTTCAAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----NAA----A-A----CGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATANGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTNCTTTTATGTGGATGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGCTTTCCAAACGATACTNACTACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACAGACTGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGCG--T--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAACCGGCATTATTAGTATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATA---A---AATA------T------TATTTTTTCATATCACTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTCA-C--TTTTTTN--A----AATCTAATT--ATGA--ACCTTNAATACATTTCG------TTAAATT------NA--CAGGGTA-----------A--AGTACGCTAAATAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCNTATTTTGCATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TATGTTTATAAAG--T--G--T-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTANAGTAGAATATTCAAATTACAGAAATTGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
Reference ( family-579 ) : CCTGTGTCGNATACCAACATATCTCCAGAGCGCTTTACAAATGGATTACCCATCGCTTCCA-TAGTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTTANTTTA------ACACGTTAAAATTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTTTTTATTTATTTTCCAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC-A---CCGAATACCATCCATATGAGAAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTTTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGGTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTGTTTTGTTTGCTATCTCGTCCACCA--AAATC-ATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCAACAAGAG-ACATTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGGAACTTCAAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----NAA----A-A----CGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATANGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTNCTTTTATGTGGATGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGCTTTCCAAACGATACTNACTACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACAGACTGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGCG--T--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAACCGGCATTATTAGTATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATA---A---AATA------T------TATTTTTTCATATCACTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATNTCA-C-TTTTTTTN--A----AATCTAATT--ATGA--ACCTTNAATACATTTCG------TTAAATT------NA--CAGGGTA-----------A--AGTACGCTAAATAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCNTATTTTGCATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TATGTTTATAAAG--T--G--T-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTANAGTAGAATATTCAAATTATAGAAATCGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|1 : CCTGTGTCAAATACCAACATCTCTCCCGAGTGTTTTACAAATAGATTACCCATCGCTCCCA-TAGTCACACAGACGTCATTTACTTCAGGCCCTACTTTA------ACATATTAAAGTTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCCCTATGTTATTTCTTTATTTATTTTCCAGTATCGTCTCAAAGTCATTAACTGCTTTCTCCATCTCTA-----AAATACCATCCATTTAAGAAGTCAGGTCAACATTCCTCCATCTCATTTTACAAGCATGTTATTGTATTCATGTGGTTGGTCTGTTGGTAATCAAGAAAATA------ACGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTTTTTTATTTACTATCTTGTCCACCA--AAATC-ATGTTATAAATGTCAACAAGAAAGCAAAGTAAAAGTTTAACAAAAA-ACATTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGGCCTGACGGAACTTCGAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----GAA----A-A----TGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATACGTATGTGAAATGCACAAGCAGTCACCTGATAGGCCAAACGTGTTCTTTTATGTGG-TGGCCTTGGGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACAGTATCTGCCTATTCAAGCGCAC-TAATGCAGTCATAACCTTTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTTAAAGAAGCCGTCCCAATGTGAAGGTTTCCAAACGATATTCAATACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCTGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGAGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCAGTGATGTTGAC----TAA-C------TGACGAACAGACAGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATT-GTG--T--G--ACAAAACAGCTATGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAGAAAGTTTATCATGAAACTATTGAAGCTTTTG-AATTCAAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--TACTGATAATTTTGAGACACCAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATACATGTATATATACATGTGTCCGCTGTATTCATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTTTTGCATAGACATAATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAA-CGGCATTATAAGTATT--TT-TTACATTTTGAACCAATATA-------------------------------TATTTTTTCATATCACTCA-CGTA---AATACTA--TTACTTATATCA-C-TTTTTTTG--A----AATTTAATT--ATGA--ACCTTAAACACATTTCT------TTCAATT------AA--CAGGGTA-----------A--AATACGCTTAATAATGTAAAT---ATGAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGAATAACCCCACCTACACTATTTTGTATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAC----TTTTA----------GAAACTTCA-TTTTT-ATCTATGTTTATTAAGACT--G--T-A--ACTATTATTT-----TATAAAATATCTATGAAA----TGGTCAAAATTAAAATAGAATATACAAATTATAGAAATGGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|10 : ----TGAGC------TGAAGAACAGATTCAAAATTTGAGATTGAGGTAGGAGGGCACATGTGTCAATGACTAATCATGTATCTGATCCTTGCAACATAATGGCG--T--GTGACAAAACGACTGTGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAACAATGCATTTG-AATATTAAATACATTAAATAAAGAATAAGCAA--A-------AACTGATAGTTCTGAGGCAACAGACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCCCTTAACTGACATAGGCATATATACATGTGTGTGCTCTATTTATCCTTAGTGCTTTGATACTTGTATTGCATAAATAATATATGAATCAGTACAGAAAAGCATTAAAACAAT-------AT--CCTGCATTATTAGTATTTATT-TTTCATTTTAAACAAATATATATGA-----------------------------TTTTTCTTATTACTAA-CTTC---AATACTA--TTACA-ATAT-A-----TATTTT--A----TATCTAATT--ACGA--ACTTTAAATACTTTTCA------ATAAATT------CGGCTTGAATA-----------A--AGTACACTAATTAATGTAAAT---A
gi|11 : ttCCTGTGTCTTGTACCAACATATCTCCAGAGCGCTCAACAAATGGATTTTCCATTGCTTCCA-CAGCCACAAAGAGGTCATTTACTTCTGTACTTGATTTAATCTGCACACG-------TGTGTCCTGTT----TGTGAT--------TCT-CTACTTTTCTCTATGCT-TTTTTTTATTTTTTTACCAGTGACGTCTAAATTTCATTAACTGCTTTCACCATCTC-AGGTTCAAATACCACCAATATGAGAAGTT---------------CATCTCATATTCCAAGCTTGTTATTTTA
gi|12 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaCTGTGTCTTATACAAACATATTTC-AGAGTGTTCAACAAATGGCTTTCCCTTTTTTTCCA-TAGTAACACAGAGTTCATTTACTTCTGGCCTTAGTTTA------ACACATT-------TGATATGTTCAAGTGTGCTTTTGAACATTTGTTTCTTTTCTCTTTGCTATTTTTTTCTTTATTTTTCAGTGACGTTTAAAATTCATTAACTGCTTTCTCCATCTC-AGATCCGAATACCACCCATATGAGAAGTTAGGTCAACAT-CCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTT
gi|13 : CTGTGTCGTATACCAACATATCTCCACAGTGCTTTACAAATGGACCATCCATTGCTTCCA-TAGTAACAAAGAGGTTATATACTTCAGGCCTTAATTTA------ACACA-------TTTGACCTGTT----TGTGTTGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTA-TTTATTATTTATTTTCCCGTGTCGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATTTC-----CCGAATGCCATCCATATGAGAAGTAAGGTCAAC-TATCTCAATCTCA-TTTACAAGCTT
gi|14 : TAAT--TG-TTATATTT------AATATCTAAGCTA---A---AATA------T------AGTTTT--CATATCACTCA-CTTGTTTAACACTAGCTTAC--A----A-C--------A--A----AAT--AATTTAATGATAACTTTAAATGTATTTGA------TCAAA---------A--TGGAATATTTCGAATCCCATTAGTACATTAAATAATGTAAATATAATAATGTCACATCAGGA--GAT-------TTTCATATCGATTTACCTAACCCACCTTAATTTGCAAATA-C--ATA
gi|15 : caTCAAATCAGTATTTATAT--ACATTTGATATTGATTTACCCCATCTACCGTATTTTGCATATACA--ATACAATGATTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TACGTTTTTAAAG--T--G--T-GTTACTGTTTTTTTTTTGTGTAAAATATCTATGAAAAAACAAGACAAAGTTATAGTAttacattgataagttctt
gi|2 : CANNNNNNNNNNATTTACTTCTAGCCTTGATTTA------AT-CGG-AACATTTTGACCAGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTTTCTATG------------TTATTTTCCAGTTACGTCTTCAATTCATTAACTG-------TATATC-AGATCCAAATA----CCATGTGCGAAGTTTGTT----AT---TTCATCT-ATGT-----GCTTG--------------------GTCTCTTGGTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCATACTGT----TTTACTATCTCGTCCAGCA--AAATA-ATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCATCAAGAG-TCATTTGTTAAGCTGAAGTTGTCTTCGTACA------TAAT-AAACTTCAAG-GTAACAGAACAG--TTAAAAA-TCTGCGGTAATGCAAACACCAAAATGAA----A-A----CGTGTACTGCTGTCATAATCTGTATTTTGG-TACTTAATCAAATATCATTTAACATATCTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCATCTAATAGACGAAAGGTGTACGTTGATGTGGGAAGCCTAGAG--ATCCGATCTGACCCTCTGATACATAACTTGCATTTTCCACAGAAT-TAATGCAGTCAGTACCCCCAAACCAGTTACCAAGATTGTTCAAAGAAGCCCTTCCAATGTGGAGCCCTCCAAATAATACTTACGTTTTGTATCTTCGAATGTACACGGCTATTTTTATTGATTTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTTGTTTTCTCGGGATTGAAAAAAGTTTACACATGCCCTGTGATGTTTACTTTATGA-CTAATCATGAC-ATCAAACTGAACA-----GATTGAGACAGAAGGGCGAATTTGACAGTGATTAAATATGCAGCTGATCCTTTCAACATATTGGCG--T--G--ACAGAACGACAATGATT-TTGTGCATTCTG-TT-AAAAACATTTGTCATGAAACTAATGATATTTTTG-AATCCTAAATTTATGAAACAATTAATAAGCAATAACTTGA--AATAGATGGTTTCAAGACAACAAACAC---------AATTAGCA-------TCATCA-T-CCC-TTAACTGATATGTGTATATAAAC---------------TTATATTTAGAGTTTTGATACTTGTATTTCATACAAATGATATGAATCAGTACAGCAAACCATTAAAACAGT-ACAAACATAACTGGCATTATTAGTATT--TTCTTA-ATTTAAAACCAATATACATG-T------------------T------TATCTTTTCAAATCAC-CATCTTC---AATACTG--TCAA--ATCATACC-TTTTTTTT--A----AATCTAATT--ATAA--ACCTTCAATACATTTCATTGCATTTGGATT------AA--TAGAATA-----------A--AGAACACTAAGTAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTACGTAGAT--ACATTTTATATTGATTTACCCCACTAATCTTA-ATTGCATATA-G--ATACAATAATTTGatgctatagatagtgtaaa
gi|2 : cgGTA-AATATTCAAATTACAGAAATTGGTGCTATGTTTTAAGATCTAAAtaaatattcaaattacagaaattggtgctatgttttaagatctaaatagcatatatatacattaatttgctttatataatgcattattttaatataaaaataatgtttgatgtgcttataaagtgttaactgttattctgtaaattattcatgaaaatgttgagcaaaatagtagaatattcaaattacagaaagctatgttttaagattttaag
gi|2 : cgcannnnnnnnnnatttacttctagccttgatttaatcggaacattttgaccagtttgtgatgttgaacatttgctccttttttctatgttattttccagttacgtcttcaattcattaactgtatatcagatccaaataccatgtgcgaagtttgttatttcatctatgtgcttggtctcttggtactcaagaaaataatgatgtgtttattgttcactacaattttgccatttgcatactgttttactatctcgtccagcaaaataatgtcataaatgtcaacaagaaaccaaagtaaaagttcatcaagagtcatttgttaagctgaagttgtcttcgtacataataaacttcaaggtaacagaacagttaaaaatctgcggtaatgcaaacaccaaaatgaaaacgtgtactgctgtcataatctgtattttggtacttaatcaaatatcatttaacatatctatgtgaaatgcgcaagcagtcatctaatagacgaaaggtgtacgttgatgtgggaagcctagagatccgatctgaccctctgatacataacttgcattttccacagaattaatgcagtcagtacccccaaaccagttaccaagattgttcaaagaagcccttccaatgtggagccctccaaataatacttacgttttgtatcttcgaatgtacacggctatttttattgattttgttggaggctggtcacaagcaataaaggttgttttctcgggattgaaaaaagtttacacatgccctgtgatgtttactttatgactaatcatgacatcaaactgaacagattgagacagaagggcgaatttgacagtgattaaatatgcagctgatcctttcaacatattggcgtgacagaacgacaatgattttgtgcattctgttaaaaacatttgtcatgaaactaatgatatttttgaatcctaaatttatgaaacaattaataagcaataacttgaaatagatggtttcaagacaacaaacacaattagcatcatcatcccttaactgatatgtgtatataaacttatatttagagttttgatacttgtatttcatacaaatgatatgaatcagtacagcaaaccattaaaacagtacaaacataactggcattattagtattttcttaatttaaaaccaatatacatgtttatcttttcaaatcaccatcttcaatactgtcaaatcataccttttttttaaatctaattataaaccttcaatacatttcattgcatttggattaatagaataaagaacactaagtaatgtaaatataaggtcacatcagtacgtagatacattttatattgatttaccccactaatcttaattgcatatagatacaataatttGCATATA-T--ATACATTAATTTGCTTTATATAATGCATTATTTTAATATAAAAA--TAA-TGTTTGA--TGTGCTTATAAAG--T--G--TTA--ACTGTTATTC-----TGTAAATTATTCATGAAAATGTTGAGCAAAAT---AGTAGAATATTCAAATTACAGAAA-----GCTATGTTTTAAGATTTTAAGtagcatatatatacattaatttgctttatataatgcattattttaatataaaaataatgtttgatgtgcttataaagtgttaactgttattctgtaaattattcatgaaaatgttgagcaaaatagtagaatattcaaattacagaaagctatgttttaagattttaag
gi|3 : cgcannnnnnnnnnatttacttctagccttgatttaatcggaacattttgaccagtttgtgatgttgaacatttgctccttttttctatgttattttccagttacgtcttcaattcattaactgtatatcagatccaaataccatgtgcgaagtttgttatttcatctatgtgcttggtctcttggtactcaagaaaataatgatgtgtttattgttcactacaattttgccatttgcatactgttttactatctcgtccagcaaaataatgtcataaatgtcaacaagaaaccaaagtaaaagttcatcaagagtcatttgttaagctgaagttgtcttcgtacataataaacttcaaggtaacagaacagttaaaaatctgcggtaatgcaaacaccaaaatgaaaacgtgtactgctgtcataatctgtattttggtacttaatcaaatatcatttaacatatctatgtgaaatgcgcaagcagtcatctaatagacgaaaggtgtacgttgatgtgggaagcctagagatccgatctgaccctctgatacataacttgcattttccacagaattaatgcagtcagtacccccaaaccagttaccaagattgttcaaagaagcccttccaatgtggagccctccaaataatacttacgttttgtatcttcgaatgtacacggctatttttattgattttgttggaggctggtcacaagcaataaaggttgttttctcgggattgaaaaaagtttacacatgccctgtgatgtttactttatgactaatcatgacatcaaactgaacagattgagacagaagggcgaatttgacagtgattaaatatgcagctgatcctttcaacatattggcgtgacagaacgacaatgattttgtgcattctgttaaaaacatttgtcatgaaactaatgatatttttgaatcctaaatttatgaaacaattaataagcaataacttgaaatagatggtttcaagacaacaaacacaattagcatcatcatcccttaactgatatgtgtatataaacttatatttagagttttgatacttgtatttcatacaaatgatatgaatcagtacagcaaaccattaaaacagtacaaacataactggcattattagtattttcttaatttaaaaccaatatacatgtttatcttttcaaatcaccatcttcaatactgtcaaatcataccttttttttaaatctaattataaaccttcaatacatttcattgcatttggattaatagaataaagaacactaagtaatgtaaatataaggtcacatcagtacgtagatacattttatattgatttaccccactaatcttaattgcatatagatacaataatttgtaaatattcaaattacagaaattggtgctatgttttaagatctaaataCCTGTATCAAATACCAACATATCTCCAGATTGTTTTACAAATAGATTACCCATCACTACCAGTAGTCACATAGAGGTCATTTACCT-AGGACTTACTTTA------ACAAGTTAAAATTTTGATGTGTT-----GTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTAGTTTTT-ATTTATTTTCCAGTATCGGCTAAAAGTTATTAACTGCTTTCTCCATCGC-----CCGAATATCATCAATAAAAGAAGTTAGGTCAACATCCCTACATTTCATTTTACAAGCGTGTTA-TTTATTCATGTGGTTGACCTGTTGGTACTCAAGAA---A------CTGTTTTGCTATCTCATCCACCAAAATCATGTCAT----AAA-TGT------------------CACCAAGAAACCAAAGT--TAAAGTTCAACAAGAAA-------------------------CATTTGTTAAGCTGAAATTGCCTTCTTACAGTGACCTGACAGAACTTCAAT-GTAACAGATCAG--TTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----CAAAAATA-A----TGTTTACTGTGGCCATCATCTGTA-TTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTCACATATGTATG
gi|3 : gAAACTGTTTTG----CTATCTCATCCACCA--AAATC-ATGTCATAAATGTCACCAAGAAACCAAAGTTAAAGTTCAACAAGAA-ACATTTGTTAAGCTGAAATTGCCTTCTTACAGTGACCTGACAGAACTTCAAT-GTAACAGATCAGTT--AAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----CAA----A-AATAATGTTTACTGTGGCCATCATCTGTATTT-GGTTTCTTAATCCAAAATCATTTCACAT----ATGTA-------------------TGATA-------CTTGTTCTTTTATGTGGGTGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGTCCTCTGATACATTATCTGCCCTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATAACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGTCATCCCAATGTGATGGTTTCCAAACAATACTCAATAATAGTATCATCAAATGTACCTGGTCAGTTTTACTGAATTTGTTAGAGGCTGGTCACAGGCAATAAAGGTAGTTTGCTTGAGATTG-AAAAGGTTTACAAATGCCCAGTGATG-TAAC----TGA-C------TG----ACAAACT----------GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTAGCG--TACG--ACAAAATGACTATGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGATGGTTTTTAGACAACAAACAC---------AGTTAACA-------CCA--ACC-CCC-CTAATTTATACATTTATATATACATGTGCCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACAT-ACCGGCTTTAAAAGAATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATAT---ATA----------------------------TTTTCAT-----------------ATACTA--TTAC--ATCTCA-CATTTCTTTA--A----AATGTAATT--ATGA--ACCTTTAACACATTTCG------TTAAATT------TA--CAGG--------------------------------GTAAAT---ATGAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATACTGATTTA-CCCACC--CCACA------ATATA-A--AAACAATGTTTTGATCTATAT----CATTA----------AAAACTTAA-TTATT-T--TGTGTTTATAAAG--T--GCAT-A--ACTATTATTT-----TATTAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTATAATAGAATATTCCAATTATAGAAATTGTTGCTATTTTCTAAGATTTTatacttgttcttttatgtgggtggccttgaggaatgacctggtcctctgatacattatctgccctttccagagcactaatgcagtcataacctctaagccagttgccaagattgttcaaagaagtcatcccaatgtgatggtttccaaacaatactcaataatagtatcatcaaatgtacctggtcagttttactgaatttgttagaggctggtcacaggcaataaaggtagtttgcttgagattgaaaaggtttacaaatgcccagtgatgtaactgactgacaaactgattgaggtagaagggcgcatttgtcaatgattgaatatgtagctgatccttccaacatattagcgtacgacaaaatgactatgattattctgcattctgttaaaaaagtttatcatgaaactaatgatgcttttgaattctaaatttatgaaataatgaataagcaacaacttgtaactgatggtttttagacaacaaacacagttaacaccaacccccctaatttatacatttatatatacatgtgcctgctgtatttatcttttgagttttgatacttgtattgcatagaaattatatgaatcagtacagcaaagcattaaaacaataaaaacataccggctttaaaagaattttttacattttaaaccaatatatatattttcatatactattacatctcacatttctttaaaatgtaattatgaacctttaacacatttcgttaaatttacagggtaaatatgaggtcacatcagtatttatatacatttaatactgatttacccaccccacaatataaaaacaatgttttgatctatatcattaaaaacttaattattttgtgtttataaagtgcataactattattttattaaatatctatgaaaaaattgggcaaaattataatagaatattccaattatagaaattgttgctattttctaagatttt
gi|4 : gcctgtatcaaataccaacatatctccagattgttttacaaatagattacccatcactaccagtagtcacatagaggtcatttacctaggacttactttaacaagttaaaattttgatgtgttgtgatgttgaacatttgctccttttctctatgttagtttttatttattttccagtatcggctaaaagttattaactgctttctccatcgcccgaatatcatcaataaaagaagttaggtcaacatccctacatttcattttacaagcgtgttatttattcatgtggttgacctgttggtactcaagATTCATGTGTT-GATCTTTTGGTACTTAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAGTTTTGCCATGTGCAAACTG----GTTTGCTATCTCGTCCACCA--AAATC-ATGTCATAAA-GTCAACAAAGAACCAAAGTAAATGTTAAACAAGTG-TCATTTGTTAAGCTGAAGTTCCCTTCTTACAGCGACTTGACGAAACTTCAAG-GTAACAGATC--TGTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAATG--G----GAA----A-AA---CGTTTACTGCTGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATAAATATGTGAAATGCATAAGCATTCAACTGATAGCCGAAAAGTTTACTTTTATTTGGATGGCCTTGAGGAAA--GACCTGGCCCTGTGATACATTATCTGCCTTTACCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCAAAGAGTGTTCAAAGAAGCCACCCCAATGTGGAGCTTTCCAAACAATACTGACTACTAGAATCTTCGTATGTACCTTGTCAGTTGTATTTAATTTGTTTGAGGCTGGTAACAAGCAAAAAAGGTAATTTGTTCGGGATCG-TAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACACACTGAACA-----TATTGAGGTAGAAGGGTGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTTC-ACATATTGGCGTTT--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATT-TG-TTAAAAAAAGTTAATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATATATAAAATAATGAATACGCAAAAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACATCAAATAA---------AA-TAACA-------TCA--A-CTCCC-GTAACTTATGTATGTATATATACATGTGTCTGTTGTATTTATCTTTTGAATTTTGATACTTATATTGCATATGAGTTA-ATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAATAAAAAACATAACCGGCATTATTGATATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATAT--ATACAATAACTATTT------TATTTTTTCACGTTACTCA-TTTA---AAAACTA--TTAC--ATCTAA----------A--AAAATAATATAATT--ATGA--ACCTTTGATACATTTCG------TTAGATT------TA--CAAGGTA-----------A--AGTAAGCTAAATAATGTAAAT---AAAAGGTCACGTCAGTACTTATAT--ACATGTGATATTGATTTACCCCACCCACCGTTTTTTACATATACA--CTAAAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA--TTCT-A--TATGTATATAAAG--TAAA--A-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAAAAGGGCAAAATTACAGTAGAATATTCAAATGATAGAAATCATTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|5 : CATTTTACATAAGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTACTTTTATGTGGATGGCCTTGTGGAAT--GACCTGACCCTCTGGTACATTGTCTGTCTTTTCCAGAGTAC-TTATGCGGTCGTTACCTCAAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGTCACCCCAATGTGAAGCTTTTCAAACGATACTGACTACCAGTATATTGGAATGTTTCTGGTCATTTTTATTGAATCTGTTGGCGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGTTTGGGATTG-AAAATGTCTACAGACGCCCTGTGATGTTTGT----TGA-C------TGACGAAGAGACTAAATA-----GATTGAGGTAGAAGTGCGCATTTGCCAATGATTAAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGTG--T--G--Ac
gi|5 : TGATTTTG-AATTCTAAATTAATAAAATAATGAATACGCAACAACTTGTGTAACTGGTAGTTTTGAGACAACAGACAC---------AATTAACAATTAACATCA--A-C-CCCCTTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGTTGTATTCATATTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAAAGATTATATTAATTAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAGAACATAACCGGCATTATGAGTATG--TT-TCACATTATAAACCAATATATACGATAT--ATACAATA------TCTATCGTATGTTTTCATATCACTCA-CTTA---GATACTA--TTAC--ATCTCA-C-AATTTTTC--A----AATTTAATT--ATGA--ACCTTTAATATATTTCG------TTAAATG------TA--CAAGGT-----------------T----------ATGTAAAT---ATAATATCACATCAGTCTTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCATTTTTTGCATAAA-ATGATACAATATTTTGCTCTTTAT----CA-TA----------GAAGCTTTATTTTTT-A--TATGTTTAAAAAGTTT--G--T-A--ACCGTTATTT-----TGTAAAATATCTATTAAAAATTTGGGCAAAATTATAATAGAATATTAAAATTACAGAAGTTATTGCTATTTTTCAAGAATTAAAGttttgaattctaaattaataaaataatgaatacgcaacaacttgtgtaactggtagttttgagacaacagacacaattaacaattaacatcaacccccttaacttatatatgtatatatacatgtgtctgttgtattcatattttgagttttgatacttgtattgcataaagattatattaattagtacagcaaagcattaaaacaataagaacataaccggcattatgagtatgtttcacattataaaccaatatatacgatatatacaatatctatcgtatgttttcatatcactcacttagatactattacatctcacaatttttcaaatttaattatgaacctttaatatatttcgttaaatgtacaaggttatgtaaatataatatcacatcagtctttatatacatttaatattgatttaccccacccaccattttttgcataaaatgatacaatattttgctctttatcatagaagctttattttttatatgtttaaaaagtttgtaaccgttattttgtaaaatatctattaaaaatttgggcaaaattataatagaatattaaaattacagaagttattgctatttttcaagaattaaagg
gi|6 : cattttacataagtatgtgaaatgcgcaagcagtcacctgataggcgaaacgtgtacttttatgtggatggccttgtggaatgacctgaccctctggtacattgtctgtcttttccagagtacttatgcggtcgttacctcaaagccagttgccaagattgttcaaagaagtcaccccaatgtgaagcttttcaaacgatactgactaccagtatattggaatgtttctggtcatttttattgaatctgttggcggctggtcacaagcaataaaggtagtttgtttgggattgaaaatgtctacagacgccctgtgatgtttgttgactgacgaagagactaaatagattgaggtagaagtgcgcatttgccaatgattaaatatgtagctgatccttccaacatattggtgA--A----AAC----A-A----CGTTTACTGCTGCCATGATCTGTATTTTGGTTTCTTAATATAAAATCATTTTACATAAGTA-----------------GTCACTTGAT--------TGTGTACTTTTATGTGAATGGCCTTGAGGA-C--GACCTAGCCCTCTGATACATGATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACATCTAAGCAAGTTGCAAATATTGTTCAAAGAAGCCATCCCAGTGTGAAGCTTTCCAAACGATACTGACTACTAGTATCTTCGAATGTACCGGGTCAGTTTTATTAAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTGCAAAAG--------------TGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACCAACAGACTGAACA-----GATTAAGATAGAAGGGCGCATTTGTCAATGCTTGAATATGCAGTTGATTCTTCCAACGTATATGTG--T--G--ACAAAAGGAATATGATTATTGTGCATT-TGTTT-AAAAAA---CATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATATAATAATGAGTAAGCAATAACTT---------GTAGCTTTGAGACAACAAACACAGTTAACCAAATTAACA-------TCA--ACC-CCC-TTAACTTATATATGTCTATATACATTTGTCTGCCCTATCTATCTTAAGAGTTTTGATACTTATATTGCATAGCAATTATATTAATTAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATA------ATTATTAGTATT--TT-TTACTTTTAAAATCAATATA-------------------------------TATTGTTTCATATCATTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTTA-C-ATTATTTA--A----AATTTAATT--ATGA--ACCATGAATACTATTCA------TTAAATTTGGCTAAA--CAGAGTA-----------A--AGTACATTAAATAATATAAAT---ATAAGGTCACATCAGTACTTATATACACATTTAA-------TTACCCCACCCACCTTAATTTGCATATACG--ATACAATg
gi|7 : aaCTGTGTCAAATACCAACATATCTCCAGATCGTTTTACAAATTGAATACCCATCGCTCCCA-TAGTCACACAGAGGGCATTTACTTCAGGCCTTACTTTA------ACACATTAAAATTTTACCCTGTT----TGTGATGTTGAACATGTGCTCCTTTTATCTATGTTATTTTTT-ATATATTTTCCAGCGATATTTACAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC-A---CCT--TACCATCTATATAAGCAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCGTGTTATTGTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGCTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT--------CACTACAATTTTGCCATTTGAAAACTGTTTTG----CTATCTTGTCCACCA--AAATC-ATGATATAAATGT------------------------CAACAAGAA-AC-----------CAAAGTTGCCTTCTTACAGTGACCTGACG-----TCAAG-GTAACAGATC--TGTAAAAAAATCTGCGGTGATGCAAACA--A----CAAGAAAA-A----TGTGTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATACATATGTAAAATGCAGAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAATGTGTTCTTTTATGTGGATGGTCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGC--T----------------GTTGTCAAGAGTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGGTTTCCAAACAATG-----TACTTGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTTAATTTGTTCGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGAGACTG-AAAAGGTTTACaagtt
gi|8 : CCTGTGTTGTATACCAACATATCTCCAGAGTGCTTTACAAATGGATTACCCATTACTTC-A-T-GTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTCAATTTA------ACACATT-------TGACCTGTT----TGTGTTGTTGAACATTTGCTCCTTTTTTCTACGTTATTTTTTTATTTATTTTCGAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC-----CCGAATGCCATCCATATGAG---TTAGGCCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTGCTTTATTCATGTGTTTGTTCTGTTGGTACTCATCAAAATACATGTAATAATGTGTT-TATTGTTCATTACAATTTTGTCATTTGCAAACTGCTTTG----CTATCTTGTCCACCC--AAATC-ATGCCATATTTGTCAACATGGAACCAAAGTAAAAGGTCAATAAGAGTAT-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGAAACTT-AAGTGTAATAGATCA--TTTAAAAATTATGCGGTGATGCAAACA--A----TAA----ATA----TGTTTACTGCTGCAGTTATCTGTATTTTGGTTTCCTTATCCAAAATCATTTTACACAAGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCAGATAGGCGAAAA----------ATGTGAATGACCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATAAGCCTTTTCTAGAGCACAAAATACAGTCATTACTTCTAAGCCAG
gi|9 : g-----GATTGAGGTAGAATGGTGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTTCAACATACTGGCG--TATG--ACAAAACGACTATGATTATTGAGCATTCTG-GT-TAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGAAGCTTTTCCAATTCTAAATTTATAAAATAATGAATACACAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGCGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTTTATGTGTATATATACGTGTGTCTGCTGTATTAATCTTTTGAGTTTTGATACCTGCATTGCATAGAAAGTATAAAAATCAGTAGAGCAAAGAATTAAAACAA----AGATATAACCGGCATT---------------TACATGTTAAACCAATATATATGATACATAC--AATA------TCTATTGTATTTTTTCATATCACTCA-TTTA---AATACTA--TTAC--GTCATA-C-ATTTTTTGCTA----AACCTAATC--ATGA--ACATTTAATACATTTCG------TTTAATT------TA--CAGGGTA-----------A--AATACGCTAAATAATGTAAAT---ATATGGTAATTTCTGTATTTATAT--ACATATAATATTGATTTCCCCCACCCACCGTATTTTGCAT-------ATACAATGTTTTACTATATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TATTT-A--TATGTTTACAAAG--T--G--T-A-------------------TAACACATCTATGAAAAAGTTA---AAGAATAAAATAGAATATTGAAACTATAGAAATTGTTGatt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): ATGCTATATATAAAATGAATATGAGAAAACTGTATGCAACAATGGTCATTTGGAGGCATGGAACAAAATAATATCACAGTCCCG
Unaligned ( gi|17 ): TATAGATGAAATTAAATACATTCTCTTTCCTTGACAAAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 3333333 1111 333333 1 111111 5555 2222 11111 22222222222 1 1111 111111 11111 11 222222222 1111111 1 1 2222222222222222222222222222222 11 33333333333333333 111111 1111111 22222222222222 1111 1111 2222222222 1111111111111 11111
lowQualScore : 55 1 5 0 1 444444 5555555 0000 0 0 33 6 0 2 888888 0 0 0 0 0 0 3 1 3 3 999999 6 3 8888 0 77 5 1 1 4 1 1 1 99 5 0 55 5 2222 1 66 11111 33333333333 2 2 0 33 1 3 2 0 66 5 0 2 0 3 0 1 1 2222 5 666666 4 3 22222 1 66 33 66 0 4 5 5 5 1 3 777 000000000 6666666 66 0 5 0 0 0 55 33 3 66 4 2 1111111111111111111111111111111 4 8888 66 00 66 33333333333333333 2 1 222222 5555555 66 0 33333333333333 2 0 777 1 66 1 1 7 8888 0 2222 5555555555 0 5 8888 6666666666666 44444 22 3
lowQualScore : .. . . . . ...... ....... .... . . .. . . . ...... . . . . . . . . . . ...... . . .... . .. . . . . . . . .. . . .. . .... . .. ..... ........... . . . .. . . . . .. . . . . . . . . .... . ...... . . ..... . .. .. .. . . . . . . . ... ......... ....... .. . . . . . .. .. . .. . . ............................... . .... .. .. .. ................. . . ...... ....... .. . .............. . . ... . .. . . . .... . .... .......... . . .... ............. ..... .. .
lowQualScore : 00 4 7 8 0 444444 5555555 6666 5 9 22 2 8 2 888888 2 1 4 1 8 2 6 3 0 2 222222 7 2 3333 4 99 7 7 4 3 6 6 3 33 7 4 77 7 4444 7 99 66666 99999999999 5 6 1 66 4 4 8 9 99 0 5 7 7 0 7 4 0 1111 7 444444 3 0 55555 4 99 88 99 7 3 7 7 0 1 4 111 000000000 2222222 99 0 0 0 8 2 11 44 5 11 4 2 9999999999999999999999999999999 4 4444 11 66 00 22222222222222222 7 0 888888 3333333 11 9 66666666666666 7 9 888 4 11 9 0 7 9999 8 1111 0000000000 6 7 3333 1111111111111 33333 77 0
consensus : CCTGTGTCGNATACCAACATATCTCCAGAGCGCTTTACAAATGGATTACCCATCGCTTCCA-TAGTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTTANTTTA------ACACGTTAAAATTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTTTTTATTTATTTTCCAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC-A-G-TCCGAATACCATCCATATGAGAAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTTTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGGTACTCAAGAAAA------TAATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTGTTTTG----CTATCTCGTCCACCA--AAATC-ATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCAACAAGAGACA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGGAACTTCAAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----NAA----A-A----CGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATANGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTNCTTTTATGTGGATGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGCTTTCCAAACGATACTNACTACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACAGACTGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGCG--T--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAACCGGCATTATTAGTATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATA---A---AATA------T------TATTTTTTCATATCACTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTCACA-TTTTTTN--A----AATCTAATTATGAACCTTNAATACATTTCG------TTAAATT------NA--CAGGGTA-----A--------AGTACGCTAAATAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCNTATTTTGCATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TATGTTTATAAAG--T--G--T-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTANAGTAGAATATTCAAATTACAGAAATTGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
Reference ( family-579 ) : CCTGTGTCGNATACCAACATATCTCCAGAGCGCTTTACAAATGGATTACCCATCGCTTCCA-TAGTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTTANTTTA------ACACGTTAAAATTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTTTTTATTTATTTTCCAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC-A-G-TCCGAATACCATCCATATGAGAAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTTTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGGTACTCAAGAAAA------TAATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTGTTTTGTTT-CTATCTCGTCCACCA--AAATC-ATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCAACAAGAGACA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGGAACTTCAAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----NAA----A-A----CGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATANGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTNCTTTTATGTGGATGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGCTTTCCAAACGATACTNACTACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACAGACTGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGCG--T--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAACCGGCATTATTAGTATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATA---A---AATA------T------TATTTTTTCATATCACTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTCAC--TTTTTTN--A----AATCTAATTATGAACCTTNAATACATTTCG------TTAAATT------NA--CAGGGTA-----A--------AGTACGCTAAATAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCNTATTTTGCATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TATGTTTATAAAG--T--G--T-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTANAGTAGAATATTCAAATTACAGAAATTGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|1 : CCTGTGTCAAATACCAACATCTCTCCCGAGTGTTTTACAAATAGATTACCCATCGCTCCCA-TAGTCACACAGACGTCATTTACTTCAGGCCCTACTTTA------ACATATTAAAGTTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCCCTATGTTATTTCTTTATTTATTTTCCAGTATCGTCTCAAAGTCATTAACTGCTTTCTCCATCTCTA-A-----AATACCATCCATTTAAGAAGTCAGGTCAACATTCCTCCATCTCATTTTACAAGCATGTTATTGTATTCATGTGGTTGGTCTGTTGGTAATCAAGAAAA------TAACGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTTTTTTATTTACTATCTTGTCCACCA--AAATC-ATGTTATAAATGTCAACAAGAAAGCAAAGTAAAAGTTTAACAAAAAACA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGGCCTGACGGAACTTCGAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----GAA----A-A----TGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATACGTATGTGAAATGCACAAGCAGTCACCTGATAGGCCAAACGTGTTCTTTTATGTGG-TGGCCTTGGGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACAGTATCTGCCTATTCAAGCGCAC-TAATGCAGTCATAACCTTTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTTAAAGAAGCCGTCCCAATGTGAAGGTTTCCAAACGATATTCAATACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCTGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGAGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCAGTGATGTTGAC----TAA-C------TGACGAACAGACAGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATT-GTG--T--G--ACAAAACAGCTATGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAGAAAGTTTATCATGAAACTATTGAAGCTTTTG-AATTCAAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--TACTGATAATTTTGAGACACCAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATACATGTATATATACATGTGTCCGCTGTATTCATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTTTTGCATAGACATAATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAA-CGGCATTATAAGTATT--TT-TTACATTTTGAACCAATATA-------------------------------TATTTTTTCATATCACTCA-CGTA---AATACTA--TTACTTATATCACT-TTTTTTG--A----AATTTAATTATGAACCTTAAACACATTTCT------TTCAATT------AA--CAGGGTA-----A--------AATACGCTTAATAATGTAAAT---ATGAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGAATAACCCCACCTACACTATTTTGTATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAC----TTTTA----------GAAACTTCA-TTTTT-ATCTATGTTTATTAAGACT--G--T-A--ACTATTATTT-----TATAAAATATCTATGAAA----TGGTCAAAATTAAAATAGAATATACAAATTATAGAAATGGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|10 : ----TGAGC------TGAAGAACAGATTCAAAATTTGAGATTGAGGTAGGAGGGCACATGTGTCAATGACTAATCATGTATCTGATCCTTGCAACATAATGGCG--T--GTGACAAAACGACTGTGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAACAATGCATTTG-AATATTAAATACATTAAATAAAGAATAAGCAA--A-------AACTGATAGTTCTGAGGCAACAGACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCCCTTAACTGACATAGGCATATATACATGTGTGTGCTCTATTTATCCTTAGTGCTTTGATACTTGTATTGCATAAATAATATATGAATCAGTACAGAAAAGCATTAAAACAAT-------AT--CCTGCATTATTAGTATTTATT-TTTCATTTTAAACAAATATATATGA-----------------------------TTTTTCTTATTACTAA-CTTC---AATACTA--TTACA-AT---AT--ATATTTT--A----TATCTAATTACGAACTTTAAATACTTTTCA------ATAAATT------CGGCTTGAATA-----A--------AGTACACTAATTAATGTAAAT---A
gi|11 : ttCCTGTGTCTTGTACCAACATATCTCCAGAGCGCTCAACAAATGGATTTTCCATTGCTTCCA-CAGCCACAAAGAGGTCATTTACTTCTGTACTTGATTTAATCTGCACACG-------TGTGTCCTGTT----TGTGAT--------TCT-CTACTTTTCTCTATGCT-TTTTTTTATTTTTTTACCAGTGACGTCTAAATTTCATTAACTGCTTTCACCATCTC-AGG-TTCAAATACCACCAATATGAGAAGTT---------------CATCTCATATTCCAAGCTTGTTATTTTA
gi|12 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaCTGTGTCTTATACAAACATATTTC-AGAGTGTTCAACAAATGGCTTTCCCTTTTTTTCCA-TAGTAACACAGAGTTCATTTACTTCTGGCCTTAGTTTA------ACACATT-------TGATATGTTCAAGTGTGCTTTTGAACATTTGTTTCTTTTCTCTTTGCTATTTTTTTCTTTATTTTTCAGTGACGTTTAAAATTCATTAACTGCTTTCTCCATCTC-A-GATCCGAATACCACCCATATGAGAAGTTAGGTCAACAT-CCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTT
gi|13 : CTGTGTCGTATACCAACATATCTCCACAGTGCTTTACAAATGGACCATCCATTGCTTCCA-TAGTAACAAAGAGGTTATATACTTCAGGCCTTAATTTA------ACACA-------TTTGACCTGTT----TGTGTTGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTA-TTTATTATTTATTTTCCCGTGTCGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATTTC------CCGAATGCCATCCATATGAGAAGTAAGGTCAAC-TATCTCAATCTCA-TTTACAAGCTT
gi|14 : TAAT--TG-TTATATTT------AATATCTAAGCTA---A---AATA------T------AGTTTT--CATATCACTCA-CTTGTTTAACACTAGCTTAC--AACAAAA--T-------------AATTTAATGAT-AACTTTAAATGTATTTGA------TCAAA---------A--TGGAATATTTCGAATCCCATTAGTACATTAAATAATGTAAATATAATAATGTCACATCAGGA--GAT-------TTTCATATCGATTTACCTAACCCACCTTAATTTGCAAATA-C--ATA
gi|15 : caTCAAATCAGTATTTATAT--ACATTTGATATTGATTTACCCCATCTACCGTATTTTGCATATACA--ATACAATGATTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TACGTTTTTAAAG--T--G--T-GTTACTGTTTTTTTTTTGTGTAAAATATCTATGAAAAAACAAGACAAAGTTATAGTAttacattgataagttctt
gi|2 : CANNNNNNNNNNATTTACTTCTAGCCTTGATTTA------AT-CGG-AACATTTTGACCAGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTTTCTATG------------TTATTTTCCAGTTACGTCTTCAATTCATTAACTG-------TATATC-A-GATCCAAATA----CCATGTGCGAAGTTTGTT----AT---TTCATCT-ATGT-----GCTTG--------------------GTCTCTTGGTACTCAAGAAAA------TAATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCATACTGTTTTA----CTATCTCGTCCAGCA--AAATA-ATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCATCAAGAGTCA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGTCTTCGTACA------TAAT-AAACTTCAAG-GTAACAGAACAG--TTAAAAA-TCTGCGGTAATGCAAACACCAAAATGAA----A-A----CGTGTACTGCTGTCATAATCTGTATTTTGG-TACTTAATCAAATATCATTTAACATATCTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCATCTAATAGACGAAAGGTGTACGTTGATGTGGGAAGCCTAGAG--ATCCGATCTGACCCTCTGATACATAACTTGCATTTTCCACAGAAT-TAATGCAGTCAGTACCCCCAAACCAGTTACCAAGATTGTTCAAAGAAGCCCTTCCAATGTGGAGCCCTCCAAATAATACTTACGTTTTGTATCTTCGAATGTACACGGCTATTTTTATTGATTTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTTGTTTTCTCGGGATTGAAAAAAGTTTACACATGCCCTGTGATGTTTACTTTATGA-CTAATCATGAC-ATCAAACTGAACA-----GATTGAGACAGAAGGGCGAATTTGACAGTGATTAAATATGCAGCTGATCCTTTCAACATATTGGCG--T--G--ACAGAACGACAATGATT-TTGTGCATTCTG-TT-AAAAACATTTGTCATGAAACTAATGATATTTTTG-AATCCTAAATTTATGAAACAATTAATAAGCAATAACTTGA--AATAGATGGTTTCAAGACAACAAACAC---------AATTAGCA-------TCATCA-T-CCC-TTAACTGATATGTGTATATAAAC---------------TTATATTTAGAGTTTTGATACTTGTATTTCATACAAATGATATGAATCAGTACAGCAAACCATTAAAACAGT-ACAAACATAACTGGCATTATTAGTATT--TTCTTA-ATTTAAAACCAATATACATG-T------------------T------TATCTTTTCAAATCAC-CATCTTC---AATACTG--TCAA--ATCATACCTTTTTTTT--A----AATCTAATTATAAACCTTCAATACATTTCATTGCATTTGGATT------AA--TAGAATA-----A--------AGAACACTAAGTAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTACGTAGAT--ACATTTTATATTGATTTACCCCACTAATCTTA-ATTGCATATA-G--ATACAATAATTTGatgctatagatagtgtaaa
gi|2 : cgGTA-AATATTCAAATTACAGAAATTGGTGCTATGTTTTAAGATCTAAAtaaatattcaaattacagaaattggtgctatgttttaagatctaaatagcatatatatacattaatttgctttatataatgcattattttaatataaaaataatgtttgatgtgcttataaagtgttaactgttattctgtaaattattcatgaaaatgttgagcaaaatagtagaatattcaaattacagaaagctatgttttaagattttaag
gi|2 : cgcannnnnnnnnnatttacttctagccttgatttaatcggaacattttgaccagtttgtgatgttgaacatttgctccttttttctatgttattttccagttacgtcttcaattcattaactgtatatcagatccaaataccatgtgcgaagtttgttatttcatctatgtgcttggtctcttggtactcaagaaaataatgatgtgtttattgttcactacaattttgccatttgcatactgttttactatctcgtccagcaaaataatgtcataaatgtcaacaagaaaccaaagtaaaagttcatcaagagtcatttgttaagctgaagttgtcttcgtacataataaacttcaaggtaacagaacagttaaaaatctgcggtaatgcaaacaccaaaatgaaaacgtgtactgctgtcataatctgtattttggtacttaatcaaatatcatttaacatatctatgtgaaatgcgcaagcagtcatctaatagacgaaaggtgtacgttgatgtgggaagcctagagatccgatctgaccctctgatacataacttgcattttccacagaattaatgcagtcagtacccccaaaccagttaccaagattgttcaaagaagcccttccaatgtggagccctccaaataatacttacgttttgtatcttcgaatgtacacggctatttttattgattttgttggaggctggtcacaagcaataaaggttgttttctcgggattgaaaaaagtttacacatgccctgtgatgtttactttatgactaatcatgacatcaaactgaacagattgagacagaagggcgaatttgacagtgattaaatatgcagctgatcctttcaacatattggcgtgacagaacgacaatgattttgtgcattctgttaaaaacatttgtcatgaaactaatgatatttttgaatcctaaatttatgaaacaattaataagcaataacttgaaatagatggtttcaagacaacaaacacaattagcatcatcatcccttaactgatatgtgtatataaacttatatttagagttttgatacttgtatttcatacaaatgatatgaatcagtacagcaaaccattaaaacagtacaaacataactggcattattagtattttcttaatttaaaaccaatatacatgtttatcttttcaaatcaccatcttcaatactgtcaaatcataccttttttttaaatctaattataaaccttcaatacatttcattgcatttggattaatagaataaagaacactaagtaatgtaaatataaggtcacatcagtacgtagatacattttatattgatttaccccactaatcttaattgcatatagatacaataatttGCATATA-T--ATACATTAATTTGCTTTATATAATGCATTATTTTAATATAAAAA--TAA-TGTTTGA--TGTGCTTATAAAG--T--G--TTA--ACTGTTATTC-----TGTAAATTATTCATGAAAATGTTGAGCAAAAT---AGTAGAATATTCAAATTACAGAAA-----GCTATGTTTTAAGATTTTAAGtagcatatatatacattaatttgctttatataatgcattattttaatataaaaataatgtttgatgtgcttataaagtgttaactgttattctgtaaattattcatgaaaatgttgagcaaaatagtagaatattcaaattacagaaagctatgttttaagattttaag
gi|3 : cgcannnnnnnnnnatttacttctagccttgatttaatcggaacattttgaccagtttgtgatgttgaacatttgctccttttttctatgttattttccagttacgtcttcaattcattaactgtatatcagatccaaataccatgtgcgaagtttgttatttcatctatgtgcttggtctcttggtactcaagaaaataatgatgtgtttattgttcactacaattttgccatttgcatactgttttactatctcgtccagcaaaataatgtcataaatgtcaacaagaaaccaaagtaaaagttcatcaagagtcatttgttaagctgaagttgtcttcgtacataataaacttcaaggtaacagaacagttaaaaatctgcggtaatgcaaacaccaaaatgaaaacgtgtactgctgtcataatctgtattttggtacttaatcaaatatcatttaacatatctatgtgaaatgcgcaagcagtcatctaatagacgaaaggtgtacgttgatgtgggaagcctagagatccgatctgaccctctgatacataacttgcattttccacagaattaatgcagtcagtacccccaaaccagttaccaagattgttcaaagaagcccttccaatgtggagccctccaaataatacttacgttttgtatcttcgaatgtacacggctatttttattgattttgttggaggctggtcacaagcaataaaggttgttttctcgggattgaaaaaagtttacacatgccctgtgatgtttactttatgactaatcatgacatcaaactgaacagattgagacagaagggcgaatttgacagtgattaaatatgcagctgatcctttcaacatattggcgtgacagaacgacaatgattttgtgcattctgttaaaaacatttgtcatgaaactaatgatatttttgaatcctaaatttatgaaacaattaataagcaataacttgaaatagatggtttcaagacaacaaacacaattagcatcatcatcccttaactgatatgtgtatataaacttatatttagagttttgatacttgtatttcatacaaatgatatgaatcagtacagcaaaccattaaaacagtacaaacataactggcattattagtattttcttaatttaaaaccaatatacatgtttatcttttcaaatcaccatcttcaatactgtcaaatcataccttttttttaaatctaattataaaccttcaatacatttcattgcatttggattaatagaataaagaacactaagtaatgtaaatataaggtcacatcagtacgtagatacattttatattgatttaccccactaatcttaattgcatatagatacaataatttgtaaatattcaaattacagaaattggtgctatgttttaagatctaaataCCTGTATCAAATACCAACATATCTCCAGATTGTTTTACAAATAGATTACCCATCACTACCAGTAGTCACATAGAGGTCATTTACCT-AGGACTTACTTTA------ACAAGTTAAAATTTTGATGTGTT-----GTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTAGTTTTT-ATTTATTTTCCAGTATCGGCTAAAAGTTATTAACTGCTTTCTCCATC-----G-CCCGAATATCATCAATAAAAGAAGTTAGGTCAACATCCCTACATTTCATTTTACAAGCGTGTTA-TTTATTCATGTGGTTGACCTGTTGGTACTCAAGAA---------ACTGTTTTGCTATCTCATCCACCAAAATCATGTCAT----AAA-TGT------------------CACCAAGAAACCAAAGT--TAAAGTTCAACAAGAAA------------------------CA-TTTGTTAAGCTGAAATTGCCTTCTTACAGTGACCTGACAGAACTTCAAT-GTAACAGATCAG--TTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----CAAAAATA-A----TGTTTACTGTGGCCATCATCTGTA-TTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTCACATATGTATG
gi|3 : gAAACTGTTTTG----CTATCTCATCCACCA--AAATC-ATGTCATAAATGTCACCAAGAAACCAAAGTTAAAGTTCAACAAGAAACA-TTTGTTAAGCTGAAATTGCCTTCTTACAGTGACCTGACAGAACTTCAAT-GTAACAGATCAGTT--AAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----CAA----A-AATAATGTTTACTGTGGCCATCATCTGTATTT-GGTTTCTTAATCCAAAATCATTTCACAT----ATGTA-------------------TGATA-------CTTGTTCTTTTATGTGGGTGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGTCCTCTGATACATTATCTGCCCTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATAACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGTCATCCCAATGTGATGGTTTCCAAACAATACTCAATAATAGTATCATCAAATGTACCTGGTCAGTTTTACTGAATTTGTTAGAGGCTGGTCACAGGCAATAAAGGTAGTTTGCTTGAGATTG-AAAAGGTTTACAAATGCCCAGTGATG-TAAC----TGA-C------TG----ACAAACT----------GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTAGCG--TACG--ACAAAATGACTATGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGATGGTTTTTAGACAACAAACAC---------AGTTAACA-------CCA--ACC-CCC-CTAATTTATACATTTATATATACATGTGCCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACAT-ACCGGCTTTAAAAGAATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATAT---ATA----------------------------TTTTCAT-----------------ATACTA--TTAC--ATCTCACATTTCTTTA--A----AATGTAATTATGAACCTTTAACACATTTCG------TTAAATT------TA--CAGG--------------------------------GTAAAT---ATGAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATACTGATTTA-CCCACC--CCACA------ATATA-A--AAACAATGTTTTGATCTATAT----CATTA----------AAAACTTAA-TTATT-T--TGTGTTTATAAAG--T--GCAT-A--ACTATTATTT-----TATTAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTATAATAGAATATTCCAATTATAGAAATTGTTGCTATTTTCTAAGATTTTatacttgttcttttatgtgggtggccttgaggaatgacctggtcctctgatacattatctgccctttccagagcactaatgcagtcataacctctaagccagttgccaagattgttcaaagaagtcatcccaatgtgatggtttccaaacaatactcaataatagtatcatcaaatgtacctggtcagttttactgaatttgttagaggctggtcacaggcaataaaggtagtttgcttgagattgaaaaggtttacaaatgcccagtgatgtaactgactgacaaactgattgaggtagaagggcgcatttgtcaatgattgaatatgtagctgatccttccaacatattagcgtacgacaaaatgactatgattattctgcattctgttaaaaaagtttatcatgaaactaatgatgcttttgaattctaaatttatgaaataatgaataagcaacaacttgtaactgatggtttttagacaacaaacacagttaacaccaacccccctaatttatacatttatatatacatgtgcctgctgtatttatcttttgagttttgatacttgtattgcatagaaattatatgaatcagtacagcaaagcattaaaacaataaaaacataccggctttaaaagaattttttacattttaaaccaatatatatattttcatatactattacatctcacatttctttaaaatgtaattatgaacctttaacacatttcgttaaatttacagggtaaatatgaggtcacatcagtatttatatacatttaatactgatttacccaccccacaatataaaaacaatgttttgatctatatcattaaaaacttaattattttgtgtttataaagtgcataactattattttattaaatatctatgaaaaaattgggcaaaattataatagaatattccaattatagaaattgttgctattttctaagatttt
gi|4 : gcctgtatcaaataccaacatatctccagattgttttacaaatagattacccatcactaccagtagtcacatagaggtcatttacctaggacttactttaacaagttaaaattttgatgtgttgtgatgttgaacatttgctccttttctctatgttagtttttatttattttccagtatcggctaaaagttattaactgctttctccatcgcccgaatatcatcaataaaagaagttaggtcaacatccctacatttcattttacaagcgtgttatttattcatgtggttgacctgttggtactcaagATTCATGTGTT-GATCTTTTGGTACTTAAGAAAA------TAATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAGTTTTGCCATGTGCAAACTGGTTTG----CTATCTCGTCCACCA--AAATC-ATGTCATAAA-GTCAACAAAGAACCAAAGTAAATGTTAAACAAGTGTCA-TTTGTTAAGCTGAAGTTCCCTTCTTACAGCGACTTGACGAAACTTCAAG-GTAACAGATC--TGTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAATG--G----GAA----A-AA---CGTTTACTGCTGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATAAATATGTGAAATGCATAAGCATTCAACTGATAGCCGAAAAGTTTACTTTTATTTGGATGGCCTTGAGGAAA--GACCTGGCCCTGTGATACATTATCTGCCTTTACCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCAAAGAGTGTTCAAAGAAGCCACCCCAATGTGGAGCTTTCCAAACAATACTGACTACTAGAATCTTCGTATGTACCTTGTCAGTTGTATTTAATTTGTTTGAGGCTGGTAACAAGCAAAAAAGGTAATTTGTTCGGGATCG-TAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACACACTGAACA-----TATTGAGGTAGAAGGGTGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTTC-ACATATTGGCGTTT--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATT-TG-TTAAAAAAAGTTAATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATATATAAAATAATGAATACGCAAAAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACATCAAATAA---------AA-TAACA-------TCA--A-CTCCC-GTAACTTATGTATGTATATATACATGTGTCTGTTGTATTTATCTTTTGAATTTTGATACTTATATTGCATATGAGTTA-ATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAATAAAAAACATAACCGGCATTATTGATATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATAT--ATACAATAACTATTT------TATTTTTTCACGTTACTCA-TTTA---AAAACTA--TTAC--ATCTAA---------A--AAAATAATATAATTATGAACCTTTGATACATTTCG------TTAGATT------TA--CAAGGTA-----A--------AGTAAGCTAAATAATGTAAAT---AAAAGGTCACGTCAGTACTTATAT--ACATGTGATATTGATTTACCCCACCCACCGTTTTTTACATATACA--CTAAAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA--TTCT-A--TATGTATATAAAG--TAAA--A-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAAAAGGGCAAAATTACAGTAGAATATTCAAATGATAGAAATCATTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|5 : CATTTTACATAAGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTACTTTTATGTGGATGGCCTTGTGGAAT--GACCTGACCCTCTGGTACATTGTCTGTCTTTTCCAGAGTAC-TTATGCGGTCGTTACCTCAAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGTCACCCCAATGTGAAGCTTTTCAAACGATACTGACTACCAGTATATTGGAATGTTTCTGGTCATTTTTATTGAATCTGTTGGCGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGTTTGGGATTG-AAAATGTCTACAGACGCCCTGTGATGTTTGT----TGA-C------TGACGAAGAGACTAAATA-----GATTGAGGTAGAAGTGCGCATTTGCCAATGATTAAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGTG--T--G--Ac
gi|5 : TGATTTTG-AATTCTAAATTAATAAAATAATGAATACGCAACAACTTGTGTAACTGGTAGTTTTGAGACAACAGACAC---------AATTAACAATTAACATCA--A-C-CCCCTTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGTTGTATTCATATTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAAAGATTATATTAATTAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAGAACATAACCGGCATTATGAGTATG--TT-TCACATTATAAACCAATATATACGATAT--ATACAATA------TCTATCGTATGTTTTCATATCACTCA-CTTA---GATACTA--TTAC--ATCTCACA-ATTTTTC--A----AATTTAATTATGAACCTTTAATATATTTCG------TTAAATG------TA--CAAGGT-----------------T----------ATGTAAAT---ATAATATCACATCAGTCTTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCATTTTTTGCATAAA-ATGATACAATATTTTGCTCTTTAT----CA-TA----------GAAGCTTTATTTTTT-A--TATGTTTAAAAAGTTT--G--T-A--ACCGTTATTT-----TGTAAAATATCTATTAAAAATTTGGGCAAAATTATAATAGAATATTAAAATTACAGAAGTTATTGCTATTTTTCAAGAATTAAAGttttgaattctaaattaataaaataatgaatacgcaacaacttgtgtaactggtagttttgagacaacagacacaattaacaattaacatcaacccccttaacttatatatgtatatatacatgtgtctgttgtattcatattttgagttttgatacttgtattgcataaagattatattaattagtacagcaaagcattaaaacaataagaacataaccggcattatgagtatgtttcacattataaaccaatatatacgatatatacaatatctatcgtatgttttcatatcactcacttagatactattacatctcacaatttttcaaatttaattatgaacctttaatatatttcgttaaatgtacaaggttatgtaaatataatatcacatcagtctttatatacatttaatattgatttaccccacccaccattttttgcataaaatgatacaatattttgctctttatcatagaagctttattttttatatgtttaaaaagtttgtaaccgttattttgtaaaatatctattaaaaatttgggcaaaattataatagaatattaaaattacagaagttattgctatttttcaagaattaaagg
gi|6 : cattttacataagtatgtgaaatgcgcaagcagtcacctgataggcgaaacgtgtacttttatgtggatggccttgtggaatgacctgaccctctggtacattgtctgtcttttccagagtacttatgcggtcgttacctcaaagccagttgccaagattgttcaaagaagtcaccccaatgtgaagcttttcaaacgatactgactaccagtatattggaatgtttctggtcatttttattgaatctgttggcggctggtcacaagcaataaaggtagtttgtttgggattgaaaatgtctacagacgccctgtgatgtttgttgactgacgaagagactaaatagattgaggtagaagtgcgcatttgccaatgattaaatatgtagctgatccttccaacatattggtgA--A----AAC----A-A----CGTTTACTGCTGCCATGATCTGTATTTTGGTTTCTTAATATAAAATCATTTTACATAAGTA-----------------GTCACTTGAT--------TGTGTACTTTTATGTGAATGGCCTTGAGGA-C--GACCTAGCCCTCTGATACATGATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACATCTAAGCAAGTTGCAAATATTGTTCAAAGAAGCCATCCCAGTGTGAAGCTTTCCAAACGATACTGACTACTAGTATCTTCGAATGTACCGGGTCAGTTTTATTAAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTGCAAAAG--------------TGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACCAACAGACTGAACA-----GATTAAGATAGAAGGGCGCATTTGTCAATGCTTGAATATGCAGTTGATTCTTCCAACGTATATGTG--T--G--ACAAAAGGAATATGATTATTGTGCATT-TGTTT-AAAAAA---CATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATATAATAATGAGTAAGCAATAACTT---------GTAGCTTTGAGACAACAAACACAGTTAACCAAATTAACA-------TCA--ACC-CCC-TTAACTTATATATGTCTATATACATTTGTCTGCCCTATCTATCTTAAGAGTTTTGATACTTATATTGCATAGCAATTATATTAATTAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATA------ATTATTAGTATT--TT-TTACTTTTAAAATCAATATA-------------------------------TATTGTTTCATATCATTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTTACA-TTATTTA--A----AATTTAATTATGAACCATGAATACTATTCA------TTAAATTTGGCTAAA--CAGAGTA-----A--------AGTACATTAAATAATATAAAT---ATAAGGTCACATCAGTACTTATATACACATTTAA-------TTACCCCACCCACCTTAATTTGCATATACG--ATACAATg
gi|7 : aaCTGTGTCAAATACCAACATATCTCCAGATCGTTTTACAAATTGAATACCCATCGCTCCCA-TAGTCACACAGAGGGCATTTACTTCAGGCCTTACTTTA------ACACATTAAAATTTTACCCTGTT----TGTGATGTTGAACATGTGCTCCTTTTATCTATGTTATTTTTT-ATATATTTTCCAGCGATATTTACAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC-A----CCT--TACCATCTATATAAGCAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCGTGTTATTGTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGCTACTCAAGAAAA------TAATGATGTGTT--------CACTACAATTTTGCCATTTGAAAACTGTTTTG----CTATCTTGTCCACCA--AAATC-ATGATATAAATGT------------------------CAACAAGAAAC------------CAAAGTTGCCTTCTTACAGTGACCTGACG-----TCAAG-GTAACAGATC--TGTAAAAAAATCTGCGGTGATGCAAACA--A----CAAGAAAA-A----TGTGTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATACATATGTAAAATGCAGAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAATGTGTTCTTTTATGTGGATGGTCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGC--T----------------GTTGTCAAGAGTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGGTTTCCAAACAATG-----TACTTGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTTAATTTGTTCGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGAGACTG-AAAAGGTTTACaagtt
gi|8 : CCTGTGTTGTATACCAACATATCTCCAGAGTGCTTTACAAATGGATTACCCATTACTTC-A-T-GTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTCAATTTA------ACACATT-------TGACCTGTT----TGTGTTGTTGAACATTTGCTCCTTTTTTCTACGTTATTTTTTTATTTATTTTCGAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC------CCGAATGCCATCCATATG---AGTTAGGCCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTGCTTTATTCATGTGTTTGTTCTGTTGGTACTCATCAAAATACATGTAATAATGTGTT-TATTGTTCATTACAATTTTGTCATTTGCAAACTGCTTTG----CTATCTTGTCCACCC--AAATC-ATGCCATATTTGTCAACATGGAACCAAAGTAAAAGGTCAATAAGAG-TATTTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGAAACTT-AAGTGTAATAGATCA--TTTAAAAATTATGCGGTGATGCAAACA--A----TAA----ATA----TGTTTACTGCTGCAGTTATCTGTATTTTGGTTTCCTTATCCAAAATCATTTTACACAAGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCAGATAGGCGAAAA----------ATGTGAATGACCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATAAGCCTTTTCTAGAGCACAAAATACAGTCATTACTTCTAAGCCAG
gi|9 : g-----GATTGAGGTAGAATGGTGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTTCAACATACTGGCG--TATG--ACAAAACGACTATGATTATTGAGCATTCTG-GT-TAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGAAGCTTTTCCAATTCTAAATTTATAAAATAATGAATACACAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGCGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTTTATGTGTATATATACGTGTGTCTGCTGTATTAATCTTTTGAGTTTTGATACCTGCATTGCATAGAAAGTATAAAAATCAGTAGAGCAAAGAATTAAAACAA----AGATATAACCGGCATT---------------TACATGTTAAACCAATATATATGATACATAC--AATA------TCTATTGTATTTTTTCATATCACTCA-TTTA---AATACTA--TTAC--GTCATACA-TTTTTTGCTA----AACCTAATCATGAACATTTAATACATTTCG------TTTAATT------TA--CAGGGTA-----A--------AATACGCTAAATAATGTAAAT---ATATGGTAATTTCTGTATTTATAT--ACATATAATATTGATTTCCCCCACCCACCGTATTTTGCAT-------ATACAATGTTTTACTATATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TATTT-A--TATGTTTACAAAG--T--G--T-A-------------------TAACACATCTATGAAAAAGTTA---AAGAATAAAATAGAATATTGAAACTATAGAAATTGTTGatt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): ATGCTATATATAAAATGAATATGAGAAAACTGTATGCAACAATGGTCATTTGGAGGCATGGAACAAAATAATATCACAGTCCCG
Unaligned ( gi|17 ): TATAGATGAAATTAAATACATTCTCTTTCCTTGACAAAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 3333333 1111 33333 1 111111 1111 2222 11111 22222222222 1 1111 111111 11111 11 222222222 1111111 1 1 2222222222222222222222222222222 111111 11 111111 1111111 22222222222222 1111 1111 2222222222 1111111111111 11111
lowQualScore : 55 1 5 0 1 444444 5555555 0000 0 0 33 6 0 2 77777 0 0 0 0 0 3 1 3 3 999999 6 3 2222 0 0 1 0 3 5 1 1 5 5 0 55 5 2222 1 66 11111 33333333333 2 2 0 33 1 3 2 0 66 5 0 2 0 3 0 1 1 2222 5 666666 4 3 22222 1 66 33 66 0 4 5 5 5 1 3 777 000000000 6666666 66 0 5 0 0 0 55 33 3 66 4 2 1111111111111111111111111111111 4 8888 66 66 6666 666666 777 22 2 1 222222 5555555 66 0 33333333333333 2 0 777 1 66 1 1 7 8888 0 2222 5555555555 0 5 8888 6666666666666 44444 22 3
lowQualScore : .. . . . . ...... ....... .... . . .. . . . ..... . . . . . . . . . ...... . . .... . . . . . . . . . . . .. . .... . .. ..... ........... . . . .. . . . . .. . . . . . . . . .... . ...... . . ..... . .. .. .. . . . . . . . ... ......... ....... .. . . . . . .. .. . .. . . ............................... . .... .. .. .... ...... ... .. . . ...... ....... .. . .............. . . ... . .. . . . .... . .... .......... . . .... ............. ..... .. .
lowQualScore : 00 4 7 8 0 444444 5555555 6666 5 9 22 2 8 2 99999 1 4 1 8 2 6 3 0 2 222222 7 2 1111 4 3 4 7 0 1 6 3 4 7 4 77 7 4444 7 99 66666 99999999999 5 6 1 66 4 4 8 9 99 0 5 7 7 0 7 4 0 1111 7 444444 3 0 55555 4 99 88 99 7 3 7 7 0 1 4 111 000000000 2222222 99 0 0 0 8 2 11 44 5 11 4 2 9999999999999999999999999999999 4 4444 11 11 0000 666666 111 22 7 0 888888 3333333 11 9 66666666666666 7 9 888 4 11 9 0 7 9999 8 1111 0000000000 6 7 3333 1111111111111 33333 77 0
consensus : CCTGTGTCGNATACCAACATATCTCCAGAGCGCTTTACAAATGGATTACCCATCGCTTCCA-TAGTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTTANTTTA------ACACGTTAAAATTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTTTTTATTTATTTTCCAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTCA-G-TCCGAATACCATCCATATGAGAAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTTTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGGTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTGT----TTTGCTATCTCGTCCACCAAAATCATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCAACAAGAGACA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGGAACTTCAAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----NAA----A-A----CGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATANGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTNCTTTTATGTGGATGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGCTTTCCAAACGATACTNACTACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACAGACTGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGCG--T--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAACCGGCATTATTAGTATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATA---A---AATA------T------TATTTTTTCATATCACTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTCACA-T-TT-TTTN--A--AATCTAATTATGAACCTTNAATACATTTCG------TTAAATT------NA--CAGGGTA-----A--------AGTACGCTAAATAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCNTATTTTGCATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TATGTTTATAAAG--T--G--T-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTANAGTAGAATATTCAAATTACAGAAATTGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
Reference ( family-579 ) : CCTGTGTCGNATACCAACATATCTCCAGAGCGCTTTACAAATGGATTACCCATCGCTTCCA-TAGTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTTANTTTA------ACACGTTAAAATTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTTTTTATTTATTTTCCAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTCA-G-TCCGAATACCATCCATATGAGAAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTTTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGGTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTGT----TTTGCTATCTCGTCCACCAAAATCATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCAACAAGAGACA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGGAACTTCAAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----NAA----A-A----CGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATANGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTNCTTTTATGTGGATGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGCTTTCCAAACGATACTNACTACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACAGACTGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGCG--T--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAACCGGCATTATTAGTATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATA---A---AATA------T------TATTTTTTCATATCACTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTCACA-T-TT-TTTN--A--AATCTAATTATGAACCTTNAATACATTTCG------TTAAATT------NA--CAGGGTA-----A--------AGTACGCTAAATAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCNTATTTTGCATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TATGTTTATAAAG--T--G--T-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTANAGTAGAATATTCAAATTACAGAAATTGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|1 : CCTGTGTCAAATACCAACATCTCTCCCGAGTGTTTTACAAATAGATTACCCATCGCTCCCA-TAGTCACACAGACGTCATTTACTTCAGGCCCTACTTTA------ACATATTAAAGTTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCCCTATGTTATTTCTTTATTTATTTTCCAGTATCGTCTCAAAGTCATTAACTGCTTTCTCCATCTC-----TAAAATACCATCCATTTAAGAAGTCAGGTCAACATTCCTCCATCTCATTTTACAAGCATGTTATTGTATTCATGTGGTTGGTCTGTTGGTAATCAAGAAAATA------ACGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTTTTTTATTTACTATCTTGTCCACCAAAATCATGTTATAAATGTCAACAAGAAAGCAAAGTAAAAGTTTAACAAAAAACA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGGCCTGACGGAACTTCGAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----GAA----A-A----TGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATACGTATGTGAAATGCACAAGCAGTCACCTGATAGGCCAAACGTGTTCTTTTATGTGG-TGGCCTTGGGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACAGTATCTGCCTATTCAAGCGCAC-TAATGCAGTCATAACCTTTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTTAAAGAAGCCGTCCCAATGTGAAGGTTTCCAAACGATATTCAATACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCTGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGAGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCAGTGATGTTGAC----TAA-C------TGACGAACAGACAGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATT-GTG--T--G--ACAAAACAGCTATGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAGAAAGTTTATCATGAAACTATTGAAGCTTTTG-AATTCAAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--TACTGATAATTTTGAGACACCAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATACATGTATATATACATGTGTCCGCTGTATTCATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTTTTGCATAGACATAATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAA-CGGCATTATAAGTATT--TT-TTACATTTTGAACCAATATA-------------------------------TATTTTTTCATATCACTCA-CGTA---AATACTA--TTACTTATATCACT-T-TT-TTTG--A--AATTTAATTATGAACCTTAAACACATTTCT------TTCAATT------AA--CAGGGTA-----A--------AATACGCTTAATAATGTAAAT---ATGAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGAATAACCCCACCTACACTATTTTGTATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAC----TTTTA----------GAAACTTCA-TTTTT-ATCTATGTTTATTAAGACT--G--T-A--ACTATTATTT-----TATAAAATATCTATGAAA----TGGTCAAAATTAAAATAGAATATACAAATTATAGAAATGGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|10 : ----TGAGC------TGAAGAACAGATTCAAAATTTGAGATTGAGGTAGGAGGGCACATGTGTCAATGACTAATCATGTATCTGATCCTTGCAACATAATGGCG--T--GTGACAAAACGACTGTGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAACAATGCATTTG-AATATTAAATACATTAAATAAAGAATAAGCAA--A-------AACTGATAGTTCTGAGGCAACAGACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCCCTTAACTGACATAGGCATATATACATGTGTGTGCTCTATTTATCCTTAGTGCTTTGATACTTGTATTGCATAAATAATATATGAATCAGTACAGAAAAGCATTAAAACAAT-------AT--CCTGCATTATTAGTATTTATT-TTTCATTTTAAACAAATATATATGA-----------------------------TTTTTCTTATTACTAA-CTTC---AATACTA--TTAC--A----ATA-TATA-TTTT--A--TATCTAATTACGAACTTTAAATACTTTTCA------ATAAATT------CGGCTTGAATA-----A--------AGTACACTAATTAATGTAAAT---A
gi|11 : ttCCTGTGTCTTGTACCAACATATCTCCAGAGCGCTCAACAAATGGATTTTCCATTGCTTCCA-CAGCCACAAAGAGGTCATTTACTTCTGTACTTGATTTAATCTGCACACG-------TGTGTCCTGTT----TGTGAT--------TCT-CTACTTTTCTCTATGCT-TTTTTTTATTTTTTTACCAGTGACGTCTAAATTTCATTAACTGCTTTCACCATCTCAGG-TTCAAATACCACCAATATGAGAAGTT---------------CATCTCATATTCCAAGCTTGTTATTTTA
gi|12 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaCTGTGTCTTATACAAACATATTTC-AGAGTGTTCAACAAATGGCTTTCCCTTTTTTTCCA-TAGTAACACAGAGTTCATTTACTTCTGGCCTTAGTTTA------ACACATT-------TGATATGTTCAAGTGTGCTTTTGAACATTTGTTTCTTTTCTCTTTGCTATTTTTTTCTTTATTTTTCAGTGACGTTTAAAATTCATTAACTGCTTTCTCCATCTCA-GATCCGAATACCACCCATATGAGAAGTTAGGTCAACAT-CCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTT
gi|13 : CTGTGTCGTATACCAACATATCTCCACAGTGCTTTACAAATGGACCATCCATTGCTTCCA-TAGTAACAAAGAGGTTATATACTTCAGGCCTTAATTTA------ACACA-------TTTGACCTGTT----TGTGTTGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTA-TTTATTATTTATTTTCCCGTGTCGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATTTC-----CCGAATGCCATCCATATGAGAAGTAAGGTCAAC-TATCTCAATCTCA-TTTACAAGCTT
gi|14 : TAAT--TG-TTATATTT------AATATCTAAGCTA---A---AATA------T------AGTTTT--CATATCACTCA-CTTGTTTAACACTAGCTTAC--A----ACA---------A--AATAATTTAATGAT-AACTTTAAATGTATTTGA------TCAAA---------A--TGGAATATTTCGAATCCCATTAGTACATTAAATAATGTAAATATAATAATGTCACATCAGGA--GAT-------TTTCATATCGATTTACCTAACCCACCTTAATTTGCAAATA-C--ATA
gi|15 : caTCAAATCAGTATTTATAT--ACATTTGATATTGATTTACCCCATCTACCGTATTTTGCATATACA--ATACAATGATTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TACGTTTTTAAAG--T--G--T-GTTACTGTTTTTTTTTTGTGTAAAATATCTATGAAAAAACAAGACAAAGTTATAGTAttacattgataagttctt
gi|2 : CANNNNNNNNNNATTTACTTCTAGCCTTGATTTA------AT-CGG-AACATTTTGACCAGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTTTCTATG------------TTATTTTCCAGTTACGTCTTCAATTCATTAACTG-------TATATCA-GATCCAAATA----CCATGTGCGAAGTTTGTT----AT---TTCATCT-ATGT-----GCTTG--------------------GTCTCTTGGTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCATACTGT----TTTACTATCTCGTCCAGCAAAATAATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCATCAAGAGTCA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGTCTTCGTACA------TAAT-AAACTTCAAG-GTAACAGAACAG--TTAAAAA-TCTGCGGTAATGCAAACACCAAAATGAA----A-A----CGTGTACTGCTGTCATAATCTGTATTTTGG-TACTTAATCAAATATCATTTAACATATCTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCATCTAATAGACGAAAGGTGTACGTTGATGTGGGAAGCCTAGAG--ATCCGATCTGACCCTCTGATACATAACTTGCATTTTCCACAGAAT-TAATGCAGTCAGTACCCCCAAACCAGTTACCAAGATTGTTCAAAGAAGCCCTTCCAATGTGGAGCCCTCCAAATAATACTTACGTTTTGTATCTTCGAATGTACACGGCTATTTTTATTGATTTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTTGTTTTCTCGGGATTGAAAAAAGTTTACACATGCCCTGTGATGTTTACTTTATGA-CTAATCATGAC-ATCAAACTGAACA-----GATTGAGACAGAAGGGCGAATTTGACAGTGATTAAATATGCAGCTGATCCTTTCAACATATTGGCG--T--G--ACAGAACGACAATGATT-TTGTGCATTCTG-TT-AAAAACATTTGTCATGAAACTAATGATATTTTTG-AATCCTAAATTTATGAAACAATTAATAAGCAATAACTTGA--AATAGATGGTTTCAAGACAACAAACAC---------AATTAGCA-------TCATCA-T-CCC-TTAACTGATATGTGTATATAAAC---------------TTATATTTAGAGTTTTGATACTTGTATTTCATACAAATGATATGAATCAGTACAGCAAACCATTAAAACAGT-ACAAACATAACTGGCATTATTAGTATT--TTCTTA-ATTTAAAACCAATATACATG-T------------------T------TATCTTTTCAAATCAC-CATCTTC---AATACTG--TCAA--ATCATACCTT-TT-TTTT--A--AATCTAATTATAAACCTTCAATACATTTCATTGCATTTGGATT------AA--TAGAATA-----A--------AGAACACTAAGTAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTACGTAGAT--ACATTTTATATTGATTTACCCCACTAATCTTA-ATTGCATATA-G--ATACAATAATTTGatgctatagatagtgtaaa
gi|2 : cgGTA-AATATTCAAATTACAGAAATTGGTGCTATGTTTTAAGATCTAAAtaaatattcaaattacagaaattggtgctatgttttaagatctaaatagcatatatatacattaatttgctttatataatgcattattttaatataaaaataatgtttgatgtgcttataaagtgttaactgttattctgtaaattattcatgaaaatgttgagcaaaatagtagaatattcaaattacagaaagctatgttttaagattttaag
gi|2 : cgcannnnnnnnnnatttacttctagccttgatttaatcggaacattttgaccagtttgtgatgttgaacatttgctccttttttctatgttattttccagttacgtcttcaattcattaactgtatatcagatccaaataccatgtgcgaagtttgttatttcatctatgtgcttggtctcttggtactcaagaaaataatgatgtgtttattgttcactacaattttgccatttgcatactgttttactatctcgtccagcaaaataatgtcataaatgtcaacaagaaaccaaagtaaaagttcatcaagagtcatttgttaagctgaagttgtcttcgtacataataaacttcaaggtaacagaacagttaaaaatctgcggtaatgcaaacaccaaaatgaaaacgtgtactgctgtcataatctgtattttggtacttaatcaaatatcatttaacatatctatgtgaaatgcgcaagcagtcatctaatagacgaaaggtgtacgttgatgtgggaagcctagagatccgatctgaccctctgatacataacttgcattttccacagaattaatgcagtcagtacccccaaaccagttaccaagattgttcaaagaagcccttccaatgtggagccctccaaataatacttacgttttgtatcttcgaatgtacacggctatttttattgattttgttggaggctggtcacaagcaataaaggttgttttctcgggattgaaaaaagtttacacatgccctgtgatgtttactttatgactaatcatgacatcaaactgaacagattgagacagaagggcgaatttgacagtgattaaatatgcagctgatcctttcaacatattggcgtgacagaacgacaatgattttgtgcattctgttaaaaacatttgtcatgaaactaatgatatttttgaatcctaaatttatgaaacaattaataagcaataacttgaaatagatggtttcaagacaacaaacacaattagcatcatcatcccttaactgatatgtgtatataaacttatatttagagttttgatacttgtatttcatacaaatgatatgaatcagtacagcaaaccattaaaacagtacaaacataactggcattattagtattttcttaatttaaaaccaatatacatgtttatcttttcaaatcaccatcttcaatactgtcaaatcataccttttttttaaatctaattataaaccttcaatacatttcattgcatttggattaatagaataaagaacactaagtaatgtaaatataaggtcacatcagtacgtagatacattttatattgatttaccccactaatcttaattgcatatagatacaataatttGCATATA-T--ATACATTAATTTGCTTTATATAATGCATTATTTTAATATAAAAA--TAA-TGTTTGA--TGTGCTTATAAAG--T--G--TTA--ACTGTTATTC-----TGTAAATTATTCATGAAAATGTTGAGCAAAAT---AGTAGAATATTCAAATTACAGAAA-----GCTATGTTTTAAGATTTTAAGtagcatatatatacattaatttgctttatataatgcattattttaatataaaaataatgtttgatgtgcttataaagtgttaactgttattctgtaaattattcatgaaaatgttgagcaaaatagtagaatattcaaattacagaaagctatgttttaagattttaag
gi|3 : cgcannnnnnnnnnatttacttctagccttgatttaatcggaacattttgaccagtttgtgatgttgaacatttgctccttttttctatgttattttccagttacgtcttcaattcattaactgtatatcagatccaaataccatgtgcgaagtttgttatttcatctatgtgcttggtctcttggtactcaagaaaataatgatgtgtttattgttcactacaattttgccatttgcatactgttttactatctcgtccagcaaaataatgtcataaatgtcaacaagaaaccaaagtaaaagttcatcaagagtcatttgttaagctgaagttgtcttcgtacataataaacttcaaggtaacagaacagttaaaaatctgcggtaatgcaaacaccaaaatgaaaacgtgtactgctgtcataatctgtattttggtacttaatcaaatatcatttaacatatctatgtgaaatgcgcaagcagtcatctaatagacgaaaggtgtacgttgatgtgggaagcctagagatccgatctgaccctctgatacataacttgcattttccacagaattaatgcagtcagtacccccaaaccagttaccaagattgttcaaagaagcccttccaatgtggagccctccaaataatacttacgttttgtatcttcgaatgtacacggctatttttattgattttgttggaggctggtcacaagcaataaaggttgttttctcgggattgaaaaaagtttacacatgccctgtgatgtttactttatgactaatcatgacatcaaactgaacagattgagacagaagggcgaatttgacagtgattaaatatgcagctgatcctttcaacatattggcgtgacagaacgacaatgattttgtgcattctgttaaaaacatttgtcatgaaactaatgatatttttgaatcctaaatttatgaaacaattaataagcaataacttgaaatagatggtttcaagacaacaaacacaattagcatcatcatcccttaactgatatgtgtatataaacttatatttagagttttgatacttgtatttcatacaaatgatatgaatcagtacagcaaaccattaaaacagtacaaacataactggcattattagtattttcttaatttaaaaccaatatacatgtttatcttttcaaatcaccatcttcaatactgtcaaatcataccttttttttaaatctaattataaaccttcaatacatttcattgcatttggattaatagaataaagaacactaagtaatgtaaatataaggtcacatcagtacgtagatacattttatattgatttaccccactaatcttaattgcatatagatacaataatttgtaaatattcaaattacagaaattggtgctatgttttaagatctaaataCCTGTATCAAATACCAACATATCTCCAGATTGTTTTACAAATAGATTACCCATCACTACCAGTAGTCACATAGAGGTCATTTACCT-AGGACTTACTTTA------ACAAGTTAAAATTTTGATGTGTT-----GTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTAGTTTTT-ATTTATTTTCCAGTATCGGCTAAAAGTTATTAACTGCTTTCTCCATC----G-CCCGAATATCATCAATAAAAGAAGTTAGGTCAACATCCCTACATTTCATTTTACAAGCGTGTTA-TTTATTCATGTGGTTGACCTGTTGGTACTCAAGAA---A------CTGTTTTGCTATCTCATCCACCAAAATCATGTCAT----AAA-TGT------------------CACCAAGA----------------AACCA-AAGTTAAAGT------TCAACAAGAAACA-TTTGTTAAGCTGAAATTGCCTTCTTACAGTGACCTGACAGAACTTCAAT-GTAACAGATCAG--TTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----CAAAAATA-A----TGTTTACTGTGGCCATCATCTGTA-TTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTCACATATGTATG
gi|3 : gAAACTGT----TTTGCTATCTCATCCACCAAAATCATGTCATAAATGTCACCAAGAAACCAAAGTTAAAGTTCAACAAGAAACA-TTTGTTAAGCTGAAATTGCCTTCTTACAGTGACCTGACAGAACTTCAAT-GTAACAGATCAGTT--AAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----CAA----A-AATAATGTTTACTGTGGCCATCATCTGTATTT-GGTTTCTTAATCCAAAATCATTTCACAT----ATGTA-------------------TGATA-------CTTGTTCTTTTATGTGGGTGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGTCCTCTGATACATTATCTGCCCTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATAACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGTCATCCCAATGTGATGGTTTCCAAACAATACTCAATAATAGTATCATCAAATGTACCTGGTCAGTTTTACTGAATTTGTTAGAGGCTGGTCACAGGCAATAAAGGTAGTTTGCTTGAGATTG-AAAAGGTTTACAAATGCCCAGTGATG-TAAC----TGA-C------TG----ACAAACT----------GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTAGCG--TACG--ACAAAATGACTATGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGATGGTTTTTAGACAACAAACAC---------AGTTAACA-------CCA--ACC-CCC-CTAATTTATACATTTATATATACATGTGCCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACAT-ACCGGCTTTAAAAGAATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATAT---ATA----------------------------TTTTCAT-----------------ATACTA--TTAC--ATCTCACA-T-TTCTTTA--A--AATGTAATTATGAACCTTTAACACATTTCG------TTAAATT------TA--CAGG--------------------------------GTAAAT---ATGAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATACTGATTTA-CCCACC--CCACA------ATATA-A--AAACAATGTTTTGATCTATAT----CATTA----------AAAACTTAA-TTATT-T--TGTGTTTATAAAG--T--GCAT-A--ACTATTATTT-----TATTAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTATAATAGAATATTCCAATTATAGAAATTGTTGCTATTTTCTAAGATTTTatacttgttcttttatgtgggtggccttgaggaatgacctggtcctctgatacattatctgccctttccagagcactaatgcagtcataacctctaagccagttgccaagattgttcaaagaagtcatcccaatgtgatggtttccaaacaatactcaataatagtatcatcaaatgtacctggtcagttttactgaatttgttagaggctggtcacaggcaataaaggtagtttgcttgagattgaaaaggtttacaaatgcccagtgatgtaactgactgacaaactgattgaggtagaagggcgcatttgtcaatgattgaatatgtagctgatccttccaacatattagcgtacgacaaaatgactatgattattctgcattctgttaaaaaagtttatcatgaaactaatgatgcttttgaattctaaatttatgaaataatgaataagcaacaacttgtaactgatggtttttagacaacaaacacagttaacaccaacccccctaatttatacatttatatatacatgtgcctgctgtatttatcttttgagttttgatacttgtattgcatagaaattatatgaatcagtacagcaaagcattaaaacaataaaaacataccggctttaaaagaattttttacattttaaaccaatatatatattttcatatactattacatctcacatttctttaaaatgtaattatgaacctttaacacatttcgttaaatttacagggtaaatatgaggtcacatcagtatttatatacatttaatactgatttacccaccccacaatataaaaacaatgttttgatctatatcattaaaaacttaattattttgtgtttataaagtgcataactattattttattaaatatctatgaaaaaattgggcaaaattataatagaatattccaattatagaaattgttgctattttctaagatttt
gi|4 : gcctgtatcaaataccaacatatctccagattgttttacaaatagattacccatcactaccagtagtcacatagaggtcatttacctaggacttactttaacaagttaaaattttgatgtgttgtgatgttgaacatttgctccttttctctatgttagtttttatttattttccagtatcggctaaaagttattaactgctttctccatcgcccgaatatcatcaataaaagaagttaggtcaacatccctacatttcattttacaagcgtgttatttattcatgtggttgacctgttggtactcaagATTCATGTGTT-GATCTTTTGGTACTTAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAGTTTTGCCATGTGCAAACTGG----TTTGCTATCTCGTCCACCAAAATCATGTCATAAA-GTCAACAAAGAACCAAAGTAAATGTTAAACAAGTGTCA-TTTGTTAAGCTGAAGTTCCCTTCTTACAGCGACTTGACGAAACTTCAAG-GTAACAGATC--TGTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAATG--G----GAA----A-AA---CGTTTACTGCTGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATAAATATGTGAAATGCATAAGCATTCAACTGATAGCCGAAAAGTTTACTTTTATTTGGATGGCCTTGAGGAAA--GACCTGGCCCTGTGATACATTATCTGCCTTTACCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCAAAGAGTGTTCAAAGAAGCCACCCCAATGTGGAGCTTTCCAAACAATACTGACTACTAGAATCTTCGTATGTACCTTGTCAGTTGTATTTAATTTGTTTGAGGCTGGTAACAAGCAAAAAAGGTAATTTGTTCGGGATCG-TAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACACACTGAACA-----TATTGAGGTAGAAGGGTGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTTC-ACATATTGGCGTTT--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATT-TG-TTAAAAAAAGTTAATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATATATAAAATAATGAATACGCAAAAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACATCAAATAA---------AA-TAACA-------TCA--A-CTCCC-GTAACTTATGTATGTATATATACATGTGTCTGTTGTATTTATCTTTTGAATTTTGATACTTATATTGCATATGAGTTA-ATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAATAAAAAACATAACCGGCATTATTGATATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATAT--ATACAATAACTATTT------TATTTTTTCACGTTACTCA-TTTA---AAAACTA--TTAC--ATCTAAAA---------A--AATAATATAATTATGAACCTTTGATACATTTCG------TTAGATT------TA--CAAGGTA-----A--------AGTAAGCTAAATAATGTAAAT---AAAAGGTCACGTCAGTACTTATAT--ACATGTGATATTGATTTACCCCACCCACCGTTTTTTACATATACA--CTAAAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA--TTCT-A--TATGTATATAAAG--TAAA--A-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAAAAGGGCAAAATTACAGTAGAATATTCAAATGATAGAAATCATTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|5 : CATTTTACATAAGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTACTTTTATGTGGATGGCCTTGTGGAAT--GACCTGACCCTCTGGTACATTGTCTGTCTTTTCCAGAGTAC-TTATGCGGTCGTTACCTCAAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGTCACCCCAATGTGAAGCTTTTCAAACGATACTGACTACCAGTATATTGGAATGTTTCTGGTCATTTTTATTGAATCTGTTGGCGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGTTTGGGATTG-AAAATGTCTACAGACGCCCTGTGATGTTTGT----TGA-C------TGACGAAGAGACTAAATA-----GATTGAGGTAGAAGTGCGCATTTGCCAATGATTAAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGTG--T--G--Ac
gi|5 : TGATTTTG-AATTCTAAATTAATAAAATAATGAATACGCAACAACTTGTGTAACTGGTAGTTTTGAGACAACAGACAC---------AATTAACAATTAACATCA--A-C-CCCCTTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGTTGTATTCATATTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAAAGATTATATTAATTAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAGAACATAACCGGCATTATGAGTATG--TT-TCACATTATAAACCAATATATACGATAT--ATACAATA------TCTATCGTATGTTTTCATATCACTCA-CTTA---GATACTA--TTAC--ATCTCACA-A-TT-TTTC--A--AATTTAATTATGAACCTTTAATATATTTCG------TTAAATG------TA--CAAGGT-----------------T----------ATGTAAAT---ATAATATCACATCAGTCTTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCATTTTTTGCATAAA-ATGATACAATATTTTGCTCTTTAT----CA-TA----------GAAGCTTTATTTTTT-A--TATGTTTAAAAAGTTT--G--T-A--ACCGTTATTT-----TGTAAAATATCTATTAAAAATTTGGGCAAAATTATAATAGAATATTAAAATTACAGAAGTTATTGCTATTTTTCAAGAATTAAAGttttgaattctaaattaataaaataatgaatacgcaacaacttgtgtaactggtagttttgagacaacagacacaattaacaattaacatcaacccccttaacttatatatgtatatatacatgtgtctgttgtattcatattttgagttttgatacttgtattgcataaagattatattaattagtacagcaaagcattaaaacaataagaacataaccggcattatgagtatgtttcacattataaaccaatatatacgatatatacaatatctatcgtatgttttcatatcactcacttagatactattacatctcacaatttttcaaatttaattatgaacctttaatatatttcgttaaatgtacaaggttatgtaaatataatatcacatcagtctttatatacatttaatattgatttaccccacccaccattttttgcataaaatgatacaatattttgctctttatcatagaagctttattttttatatgtttaaaaagtttgtaaccgttattttgtaaaatatctattaaaaatttgggcaaaattataatagaatattaaaattacagaagttattgctatttttcaagaattaaagg
gi|6 : cattttacataagtatgtgaaatgcgcaagcagtcacctgataggcgaaacgtgtacttttatgtggatggccttgtggaatgacctgaccctctggtacattgtctgtcttttccagagtacttatgcggtcgttacctcaaagccagttgccaagattgttcaaagaagtcaccccaatgtgaagcttttcaaacgatactgactaccagtatattggaatgtttctggtcatttttattgaatctgttggcggctggtcacaagcaataaaggtagtttgtttgggattgaaaatgtctacagacgccctgtgatgtttgttgactgacgaagagactaaatagattgaggtagaagtgcgcatttgccaatgattaaatatgtagctgatccttccaacatattggtgA--A----AAC----A-A----CGTTTACTGCTGCCATGATCTGTATTTTGGTTTCTTAATATAAAATCATTTTACATAAGTA-----------------GTCACTTGAT--------TGTGTACTTTTATGTGAATGGCCTTGAGGA-C--GACCTAGCCCTCTGATACATGATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACATCTAAGCAAGTTGCAAATATTGTTCAAAGAAGCCATCCCAGTGTGAAGCTTTCCAAACGATACTGACTACTAGTATCTTCGAATGTACCGGGTCAGTTTTATTAAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTGCAAAAG--------------TGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACCAACAGACTGAACA-----GATTAAGATAGAAGGGCGCATTTGTCAATGCTTGAATATGCAGTTGATTCTTCCAACGTATATGTG--T--G--ACAAAAGGAATATGATTATTGTGCATT-TGTTT-AAAAAA---CATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATATAATAATGAGTAAGCAATAACTT---------GTAGCTTTGAGACAACAAACACAGTTAACCAAATTAACA-------TCA--ACC-CCC-TTAACTTATATATGTCTATATACATTTGTCTGCCCTATCTATCTTAAGAGTTTTGATACTTATATTGCATAGCAATTATATTAATTAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATA------ATTATTAGTATT--TT-TTACTTTTAAAATCAATATA-------------------------------TATTGTTTCATATCATTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTTACA-T-TA-TTTA--A--AATTTAATTATGAACCATGAATACTATTCA------TTAAATTTGGCTAAA--CAGAGTA-----A--------AGTACATTAAATAATATAAAT---ATAAGGTCACATCAGTACTTATATACACATTTAA-------TTACCCCACCCACCTTAATTTGCATATACG--ATACAATg
gi|7 : aaCTGTGTCAAATACCAACATATCTCCAGATCGTTTTACAAATTGAATACCCATCGCTCCCA-TAGTCACACAGAGGGCATTTACTTCAGGCCTTACTTTA------ACACATTAAAATTTTACCCTGTT----TGTGATGTTGAACATGTGCTCCTTTTATCTATGTTATTTTTT-ATATATTTTCCAGCGATATTTACAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTCA----CCT--TACCATCTATATAAGCAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCGTGTTATTGTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGCTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT--------CACTACAATTTTGCCATTTGAAAACTGT----TTTGCTATCTTGTCCACCAAAATCATGATATAAATGT------------------------CAACAAGAAAC------------CAAAGTTGCCTTCTTACAGTGACCTGACG-----TCAAG-GTAACAGATC--TGTAAAAAAATCTGCGGTGATGCAAACA--A----CAAGAAAA-A----TGTGTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATACATATGTAAAATGCAGAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAATGTGTTCTTTTATGTGGATGGTCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGC--T----------------GTTGTCAAGAGTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGGTTTCCAAACAATG-----TACTTGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTTAATTTGTTCGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGAGACTG-AAAAGGTTTACaagtt
gi|8 : CCTGTGTTGTATACCAACATATCTCCAGAGTGCTTTACAAATGGATTACCCATTACTTC-A-T-GTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTCAATTTA------ACACATT-------TGACCTGTT----TGTGTTGTTGAACATTTGCTCCTTTTTTCTACGTTATTTTTTTATTTATTTTCGAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC-----CCGAATGCCATCCATATGAG---TTAGGCCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTGCTTTATTCATGTGTTTGTTCTGTTGGTACTCATCAAAATACATGTAATAATGTGTT-TATTGTTCATTACAATTTTGTCATTTGCAAACTGC----TTTGCTATCTTGTCCACCCAAATCATGCCATATTTGTCAACATGGAACCAAAGTAAAAGGTCAATAAGAG-TATTTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGAAACTT-AAGTGTAATAGATCA--TTTAAAAATTATGCGGTGATGCAAACA--A----TAA----ATA----TGTTTACTGCTGCAGTTATCTGTATTTTGGTTTCCTTATCCAAAATCATTTTACACAAGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCAGATAGGCGAAAA----------ATGTGAATGACCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATAAGCCTTTTCTAGAGCACAAAATACAGTCATTACTTCTAAGCCAG
gi|9 : g-----GATTGAGGTAGAATGGTGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTTCAACATACTGGCG--TATG--ACAAAACGACTATGATTATTGAGCATTCTG-GT-TAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGAAGCTTTTCCAATTCTAAATTTATAAAATAATGAATACACAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGCGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTTTATGTGTATATATACGTGTGTCTGCTGTATTAATCTTTTGAGTTTTGATACCTGCATTGCATAGAAAGTATAAAAATCAGTAGAGCAAAGAATTAAAACAA----AGATATAACCGGCATT---------------TACATGTTAAACCAATATATATGATACATAC--AATA------TCTATTGTATTTTTTCATATCACTCA-TTTA---AATACTA--TTAC--GTCATACA-T-TT-TTTGCTA--AACCTAATCATGAACATTTAATACATTTCG------TTTAATT------TA--CAGGGTA-----A--------AATACGCTAAATAATGTAAAT---ATATGGTAATTTCTGTATTTATAT--ACATATAATATTGATTTCCCCCACCCACCGTATTTTGCAT-------ATACAATGTTTTACTATATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TATTT-A--TATGTTTACAAAG--T--G--T-A-------------------TAACACATCTATGAAAAAGTTA---AAGAATAAAATAGAATATTGAAACTATAGAAATTGTTGatt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): ATGCTATATATAAAATGAATATGAGAAAACTGTATGCAACAATGGTCATTTGGAGGCATGGAACAAAATAATATCACAGTCCCG
Unaligned ( gi|17 ): TATAGATGAAATTAAATACATTCTCTTTCCTTGACAAAT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 3333333 1111 33333 1 111111 1111 2222 11111 22222222222 1 1111 111111 11111 11 222222222 1111111 1 1 2222222222222222222222222222222 111111 11 111111 1111111 22222222222222 1111 1111 2222222222 1111111111111 11111
lowQualScore : 55 1 5 0 1 444444 5555555 0000 0 0 33 6 0 2 77777 0 0 0 0 0 3 1 3 3 999999 6 3 2222 0 0 1 0 3 5 1 1 5 5 0 55 5 2222 1 66 11111 33333333333 2 2 0 33 1 3 2 0 66 5 0 2 0 3 0 1 1 2222 5 666666 4 3 22222 1 66 33 66 0 4 5 5 5 1 3 777 000000000 6666666 66 0 5 0 0 0 55 33 3 66 4 2 1111111111111111111111111111111 4 8888 66 66 6666 666666 777 22 2 1 222222 5555555 66 0 33333333333333 2 0 777 1 66 1 1 7 8888 0 2222 5555555555 0 5 8888 6666666666666 44444 22 3
lowQualScore : .. . . . . ...... ....... .... . . .. . . . ..... . . . . . . . . . ...... . . .... . . . . . . . . . . . .. . .... . .. ..... ........... . . . .. . . . . .. . . . . . . . . .... . ...... . . ..... . .. .. .. . . . . . . . ... ......... ....... .. . . . . . .. .. . .. . . ............................... . .... .. .. .... ...... ... .. . . ...... ....... .. . .............. . . ... . .. . . . .... . .... .......... . . .... ............. ..... .. .
lowQualScore : 00 4 7 8 0 444444 5555555 6666 5 9 22 2 8 2 99999 1 4 1 8 2 6 3 0 2 222222 7 2 1111 4 3 4 7 0 1 6 3 4 7 4 77 7 4444 7 99 66666 99999999999 5 6 1 66 4 4 8 9 99 0 5 7 7 0 7 4 0 1111 7 444444 3 0 55555 4 99 88 99 7 3 7 7 0 1 4 111 000000000 2222222 99 0 0 0 8 2 11 44 5 11 4 2 9999999999999999999999999999999 4 4444 11 11 0000 666666 111 22 7 0 888888 3333333 11 9 66666666666666 7 9 888 4 11 9 0 7 9999 8 1111 0000000000 6 7 3333 1111111111111 33333 77 0
consensus : CCTGTGTCGNATACCAACATATCTCCAGAGCGCTTTACAAATGGATTACCCATCGCTTCCA-TAGTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTTANTTTA------ACACGTTAAAATTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTTTTTATTTATTTTCCAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTCA-G-TCCGAATACCATCCATATGAGAAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTTTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGGTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTGT----TTTGCTATCTCGTCCACCAAAATCATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCAACAAGAGACA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGGAACTTCAAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----NAA----A-A----CGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATANGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTNCTTTTATGTGGATGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGCTTTCCAAACGATACTNACTACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACAGACTGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGCG--T--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAACCGGCATTATTAGTATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATA---A---AATA------T------TATTTTTTCATATCACTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTCACA-T-TT-TTTN--A--AATCTAATTATGAACCTTNAATACATTTCG------TTAAATT------NA--CAGGGTA-----A--------AGTACGCTAAATAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCNTATTTTGCATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TATGTTTATAAAG--T--G--T-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTANAGTAGAATATTCAAATTACAGAAATTGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
Reference ( family-579 ) : CCTGTGTCGNATACCAACATATCTCCAGAGCGCTTTACAAATGGATTACCCATCGCTTCCA-TAGTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTTANTTTA------ACACGTTAAAATTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTTTTTATTTATTTTCCAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTCA-G-TCCGAATACCATCCATATGAGAAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTTTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGGTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTGT----TTTGCTATCTCGTCCACCAAAATCATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCAACAAGAGACA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGGAACTTCAAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----NAA----A-A----CGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATANGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTNCTTTTATGTGGATGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGCTTTCCAAACGATACTNACTACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACAGACTGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGCG--T--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAACCGGCATTATTAGTATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATA---A---AATA------T------TATTTTTTCATATCACTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTCACA-T-TT-TTTN--A--AATCTAATTATGAACCTTNAATACATTTCG------TTAAATT------NA--CAGGGTA-----A--------AGTACGCTAAATAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCNTATTTTGCATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TATGTTTATAAAG--T--G--T-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTANAGTAGAATATTCAAATTACAGAAATTGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|1 : CCTGTGTCAAATACCAACATCTCTCCCGAGTGTTTTACAAATAGATTACCCATCGCTCCCA-TAGTCACACAGACGTCATTTACTTCAGGCCCTACTTTA------ACATATTAAAGTTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCCCTATGTTATTTCTTTATTTATTTTCCAGTATCGTCTCAAAGTCATTAACTGCTTTCTCCATCTC-----TAAAATACCATCCATTTAAGAAGTCAGGTCAACATTCCTCCATCTCATTTTACAAGCATGTTATTGTATTCATGTGGTTGGTCTGTTGGTAATCAAGAAAATA------ACGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTTTTTTATTTACTATCTTGTCCACCAAAATCATGTTATAAATGTCAACAAGAAAGCAAAGTAAAAGTTTAACAAAAAACA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGGCCTGACGGAACTTCGAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----GAA----A-A----TGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATACGTATGTGAAATGCACAAGCAGTCACCTGATAGGCCAAACGTGTTCTTTTATGTGG-TGGCCTTGGGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACAGTATCTGCCTATTCAAGCGCAC-TAATGCAGTCATAACCTTTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTTAAAGAAGCCGTCCCAATGTGAAGGTTTCCAAACGATATTCAATACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCTGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGAGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCAGTGATGTTGAC----TAA-C------TGACGAACAGACAGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATT-GTG--T--G--ACAAAACAGCTATGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAGAAAGTTTATCATGAAACTATTGAAGCTTTTG-AATTCAAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--TACTGATAATTTTGAGACACCAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATACATGTATATATACATGTGTCCGCTGTATTCATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTTTTGCATAGACATAATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAA-CGGCATTATAAGTATT--TT-TTACATTTTGAACCAATATA-------------------------------TATTTTTTCATATCACTCA-CGTA---AATACTA--TTACTTATATCACT-T-TT-TTTG--A--AATTTAATTATGAACCTTAAACACATTTCT------TTCAATT------AA--CAGGGTA-----A--------AATACGCTTAATAATGTAAAT---ATGAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGAATAACCCCACCTACACTATTTTGTATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAC----TTTTA----------GAAACTTCA-TTTTT-ATCTATGTTTATTAAGACT--G--T-A--ACTATTATTT-----TATAAAATATCTATGAAA----TGGTCAAAATTAAAATAGAATATACAAATTATAGAAATGGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|10 : ----TGAGC------TGAAGAACAGATTCAAAATTTGAGATTGAGGTAGGAGGGCACATGTGTCAATGACTAATCATGTATCTGATCCTTGCAACATAATGGCG--T--GTGACAAAACGACTGTGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAACAATGCATTTG-AATATTAAATACATTAAATAAAGAATAAGCAA--A-------AACTGATAGTTCTGAGGCAACAGACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCCCTTAACTGACATAGGCATATATACATGTGTGTGCTCTATTTATCCTTAGTGCTTTGATACTTGTATTGCATAAATAATATATGAATCAGTACAGAAAAGCATTAAAACAAT-------AT--CCTGCATTATTAGTATTTATT-TTTCATTTTAAACAAATATATATGA-----------------------------TTTTTCTTATTACTAA-CTTC---AATACTA--TTAC--A----ATA-TATA-TTTT--A--TATCTAATTACGAACTTTAAATACTTTTCA------ATAAATT------CGGCTTGAATA-----A--------AGTACACTAATTAATGTAAAT---A
gi|11 : ttCCTGTGTCTTGTACCAACATATCTCCAGAGCGCTCAACAAATGGATTTTCCATTGCTTCCA-CAGCCACAAAGAGGTCATTTACTTCTGTACTTGATTTAATCTGCACACG-------TGTGTCCTGTT----TGTGAT--------TCT-CTACTTTTCTCTATGCT-TTTTTTTATTTTTTTACCAGTGACGTCTAAATTTCATTAACTGCTTTCACCATCTCAGG-TTCAAATACCACCAATATGAGAAGTT---------------CATCTCATATTCCAAGCTTGTTATTTTA
gi|12 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaCTGTGTCTTATACAAACATATTTC-AGAGTGTTCAACAAATGGCTTTCCCTTTTTTTCCA-TAGTAACACAGAGTTCATTTACTTCTGGCCTTAGTTTA------ACACATT-------TGATATGTTCAAGTGTGCTTTTGAACATTTGTTTCTTTTCTCTTTGCTATTTTTTTCTTTATTTTTCAGTGACGTTTAAAATTCATTAACTGCTTTCTCCATCTCA-GATCCGAATACCACCCATATGAGAAGTTAGGTCAACAT-CCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTT
gi|13 : CTGTGTCGTATACCAACATATCTCCACAGTGCTTTACAAATGGACCATCCATTGCTTCCA-TAGTAACAAAGAGGTTATATACTTCAGGCCTTAATTTA------ACACA-------TTTGACCTGTT----TGTGTTGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTA-TTTATTATTTATTTTCCCGTGTCGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATTTC-----CCGAATGCCATCCATATGAGAAGTAAGGTCAAC-TATCTCAATCTCA-TTTACAAGCTT
gi|14 : TAAT--TG-TTATATTT------AATATCTAAGCTA---A---AATA------T------AGTTTT--CATATCACTCA-CTTGTTTAACACTAGCTTAC--A----ACA---------A--AATAATTTAATGAT-AACTTTAAATGTATTTGA------TCAAA---------A--TGGAATATTTCGAATCCCATTAGTACATTAAATAATGTAAATATAATAATGTCACATCAGGA--GAT-------TTTCATATCGATTTACCTAACCCACCTTAATTTGCAAATA-C--ATA
gi|15 : caTCAAATCAGTATTTATAT--ACATTTGATATTGATTTACCCCATCTACCGTATTTTGCATATACA--ATACAATGATTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TACGTTTTTAAAG--T--G--T-GTTACTGTTTTTTTTTTGTGTAAAATATCTATGAAAAAACAAGACAAAGTTATAGTAttacattgataagttctt
gi|2 : CANNNNNNNNNNATTTACTTCTAGCCTTGATTTA------AT-CGG-AACATTTTGACCAGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTTTCTATG------------TTATTTTCCAGTTACGTCTTCAATTCATTAACTG-------TATATCA-GATCCAAATA----CCATGTGCGAAGTTTGTT----AT---TTCATCT-ATGT-----GCTTG--------------------GTCTCTTGGTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCATACTGT----TTTACTATCTCGTCCAGCAAAATAATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCATCAAGAGTCA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGTCTTCGTACA------TAAT-AAACTTCAAG-GTAACAGAACAG--TTAAAAA-TCTGCGGTAATGCAAACACCAAAATGAA----A-A----CGTGTACTGCTGTCATAATCTGTATTTTGG-TACTTAATCAAATATCATTTAACATATCTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCATCTAATAGACGAAAGGTGTACGTTGATGTGGGAAGCCTAGAG--ATCCGATCTGACCCTCTGATACATAACTTGCATTTTCCACAGAAT-TAATGCAGTCAGTACCCCCAAACCAGTTACCAAGATTGTTCAAAGAAGCCCTTCCAATGTGGAGCCCTCCAAATAATACTTACGTTTTGTATCTTCGAATGTACACGGCTATTTTTATTGATTTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTTGTTTTCTCGGGATTGAAAAAAGTTTACACATGCCCTGTGATGTTTACTTTATGA-CTAATCATGAC-ATCAAACTGAACA-----GATTGAGACAGAAGGGCGAATTTGACAGTGATTAAATATGCAGCTGATCCTTTCAACATATTGGCG--T--G--ACAGAACGACAATGATT-TTGTGCATTCTG-TT-AAAAACATTTGTCATGAAACTAATGATATTTTTG-AATCCTAAATTTATGAAACAATTAATAAGCAATAACTTGA--AATAGATGGTTTCAAGACAACAAACAC---------AATTAGCA-------TCATCA-T-CCC-TTAACTGATATGTGTATATAAAC---------------TTATATTTAGAGTTTTGATACTTGTATTTCATACAAATGATATGAATCAGTACAGCAAACCATTAAAACAGT-ACAAACATAACTGGCATTATTAGTATT--TTCTTA-ATTTAAAACCAATATACATG-T------------------T------TATCTTTTCAAATCAC-CATCTTC---AATACTG--TCAA--ATCATACCTT-TT-TTTT--A--AATCTAATTATAAACCTTCAATACATTTCATTGCATTTGGATT------AA--TAGAATA-----A--------AGAACACTAAGTAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTACGTAGAT--ACATTTTATATTGATTTACCCCACTAATCTTA-ATTGCATATA-G--ATACAATAATTTGatgctatagatagtgtaaa
gi|2 : cgGTA-AATATTCAAATTACAGAAATTGGTGCTATGTTTTAAGATCTAAAtaaatattcaaattacagaaattggtgctatgttttaagatctaaatagcatatatatacattaatttgctttatataatgcattattttaatataaaaataatgtttgatgtgcttataaagtgttaactgttattctgtaaattattcatgaaaatgttgagcaaaatagtagaatattcaaattacagaaagctatgttttaagattttaag
gi|2 : cgcannnnnnnnnnatttacttctagccttgatttaatcggaacattttgaccagtttgtgatgttgaacatttgctccttttttctatgttattttccagttacgtcttcaattcattaactgtatatcagatccaaataccatgtgcgaagtttgttatttcatctatgtgcttggtctcttggtactcaagaaaataatgatgtgtttattgttcactacaattttgccatttgcatactgttttactatctcgtccagcaaaataatgtcataaatgtcaacaagaaaccaaagtaaaagttcatcaagagtcatttgttaagctgaagttgtcttcgtacataataaacttcaaggtaacagaacagttaaaaatctgcggtaatgcaaacaccaaaatgaaaacgtgtactgctgtcataatctgtattttggtacttaatcaaatatcatttaacatatctatgtgaaatgcgcaagcagtcatctaatagacgaaaggtgtacgttgatgtgggaagcctagagatccgatctgaccctctgatacataacttgcattttccacagaattaatgcagtcagtacccccaaaccagttaccaagattgttcaaagaagcccttccaatgtggagccctccaaataatacttacgttttgtatcttcgaatgtacacggctatttttattgattttgttggaggctggtcacaagcaataaaggttgttttctcgggattgaaaaaagtttacacatgccctgtgatgtttactttatgactaatcatgacatcaaactgaacagattgagacagaagggcgaatttgacagtgattaaatatgcagctgatcctttcaacatattggcgtgacagaacgacaatgattttgtgcattctgttaaaaacatttgtcatgaaactaatgatatttttgaatcctaaatttatgaaacaattaataagcaataacttgaaatagatggtttcaagacaacaaacacaattagcatcatcatcccttaactgatatgtgtatataaacttatatttagagttttgatacttgtatttcatacaaatgatatgaatcagtacagcaaaccattaaaacagtacaaacataactggcattattagtattttcttaatttaaaaccaatatacatgtttatcttttcaaatcaccatcttcaatactgtcaaatcataccttttttttaaatctaattataaaccttcaatacatttcattgcatttggattaatagaataaagaacactaagtaatgtaaatataaggtcacatcagtacgtagatacattttatattgatttaccccactaatcttaattgcatatagatacaataatttGCATATA-T--ATACATTAATTTGCTTTATATAATGCATTATTTTAATATAAAAA--TAA-TGTTTGA--TGTGCTTATAAAG--T--G--TTA--ACTGTTATTC-----TGTAAATTATTCATGAAAATGTTGAGCAAAAT---AGTAGAATATTCAAATTACAGAAA-----GCTATGTTTTAAGATTTTAAGtagcatatatatacattaatttgctttatataatgcattattttaatataaaaataatgtttgatgtgcttataaagtgttaactgttattctgtaaattattcatgaaaatgttgagcaaaatagtagaatattcaaattacagaaagctatgttttaagattttaag
gi|3 : cgcannnnnnnnnnatttacttctagccttgatttaatcggaacattttgaccagtttgtgatgttgaacatttgctccttttttctatgttattttccagttacgtcttcaattcattaactgtatatcagatccaaataccatgtgcgaagtttgttatttcatctatgtgcttggtctcttggtactcaagaaaataatgatgtgtttattgttcactacaattttgccatttgcatactgttttactatctcgtccagcaaaataatgtcataaatgtcaacaagaaaccaaagtaaaagttcatcaagagtcatttgttaagctgaagttgtcttcgtacataataaacttcaaggtaacagaacagttaaaaatctgcggtaatgcaaacaccaaaatgaaaacgtgtactgctgtcataatctgtattttggtacttaatcaaatatcatttaacatatctatgtgaaatgcgcaagcagtcatctaatagacgaaaggtgtacgttgatgtgggaagcctagagatccgatctgaccctctgatacataacttgcattttccacagaattaatgcagtcagtacccccaaaccagttaccaagattgttcaaagaagcccttccaatgtggagccctccaaataatacttacgttttgtatcttcgaatgtacacggctatttttattgattttgttggaggctggtcacaagcaataaaggttgttttctcgggattgaaaaaagtttacacatgccctgtgatgtttactttatgactaatcatgacatcaaactgaacagattgagacagaagggcgaatttgacagtgattaaatatgcagctgatcctttcaacatattggcgtgacagaacgacaatgattttgtgcattctgttaaaaacatttgtcatgaaactaatgatatttttgaatcctaaatttatgaaacaattaataagcaataacttgaaatagatggtttcaagacaacaaacacaattagcatcatcatcccttaactgatatgtgtatataaacttatatttagagttttgatacttgtatttcatacaaatgatatgaatcagtacagcaaaccattaaaacagtacaaacataactggcattattagtattttcttaatttaaaaccaatatacatgtttatcttttcaaatcaccatcttcaatactgtcaaatcataccttttttttaaatctaattataaaccttcaatacatttcattgcatttggattaatagaataaagaacactaagtaatgtaaatataaggtcacatcagtacgtagatacattttatattgatttaccccactaatcttaattgcatatagatacaataatttgtaaatattcaaattacagaaattggtgctatgttttaagatctaaataCCTGTATCAAATACCAACATATCTCCAGATTGTTTTACAAATAGATTACCCATCACTACCAGTAGTCACATAGAGGTCATTTACCT-AGGACTTACTTTA------ACAAGTTAAAATTTTGATGTGTT-----GTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTAGTTTTT-ATTTATTTTCCAGTATCGGCTAAAAGTTATTAACTGCTTTCTCCATC----G-CCCGAATATCATCAATAAAAGAAGTTAGGTCAACATCCCTACATTTCATTTTACAAGCGTGTTA-TTTATTCATGTGGTTGACCTGTTGGTACTCAAGAA---A------CTGTTTTGCTATCTCATCCACCAAAATCATGTCAT----AAA-TGT------------------CACCAAGA----------------AACCA-AAGTTAAAGT------TCAACAAGAAACA-TTTGTTAAGCTGAAATTGCCTTCTTACAGTGACCTGACAGAACTTCAAT-GTAACAGATCAG--TTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----CAAAAATA-A----TGTTTACTGTGGCCATCATCTGTA-TTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTCACATATGTATG
gi|3 : gAAACTGT----TTTGCTATCTCATCCACCAAAATCATGTCATAAATGTCACCAAGAAACCAAAGTTAAAGTTCAACAAGAAACA-TTTGTTAAGCTGAAATTGCCTTCTTACAGTGACCTGACAGAACTTCAAT-GTAACAGATCAGTT--AAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----CAA----A-AATAATGTTTACTGTGGCCATCATCTGTATTT-GGTTTCTTAATCCAAAATCATTTCACAT----ATGTA-------------------TGATA-------CTTGTTCTTTTATGTGGGTGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGTCCTCTGATACATTATCTGCCCTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATAACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGTCATCCCAATGTGATGGTTTCCAAACAATACTCAATAATAGTATCATCAAATGTACCTGGTCAGTTTTACTGAATTTGTTAGAGGCTGGTCACAGGCAATAAAGGTAGTTTGCTTGAGATTG-AAAAGGTTTACAAATGCCCAGTGATG-TAAC----TGA-C------TG----ACAAACT----------GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTAGCG--TACG--ACAAAATGACTATGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGATGGTTTTTAGACAACAAACAC---------AGTTAACA-------CCA--ACC-CCC-CTAATTTATACATTTATATATACATGTGCCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACAT-ACCGGCTTTAAAAGAATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATAT---ATA----------------------------TTTTCAT-----------------ATACTA--TTAC--ATCTCACA-T-TTCTTTA--A--AATGTAATTATGAACCTTTAACACATTTCG------TTAAATT------TA--CAGG--------------------------------GTAAAT---ATGAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATACTGATTTA-CCCACC--CCACA------ATATA-A--AAACAATGTTTTGATCTATAT----CATTA----------AAAACTTAA-TTATT-T--TGTGTTTATAAAG--T--GCAT-A--ACTATTATTT-----TATTAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTATAATAGAATATTCCAATTATAGAAATTGTTGCTATTTTCTAAGATTTTatacttgttcttttatgtgggtggccttgaggaatgacctggtcctctgatacattatctgccctttccagagcactaatgcagtcataacctctaagccagttgccaagattgttcaaagaagtcatcccaatgtgatggtttccaaacaatactcaataatagtatcatcaaatgtacctggtcagttttactgaatttgttagaggctggtcacaggcaataaaggtagtttgcttgagattgaaaaggtttacaaatgcccagtgatgtaactgactgacaaactgattgaggtagaagggcgcatttgtcaatgattgaatatgtagctgatccttccaacatattagcgtacgacaaaatgactatgattattctgcattctgttaaaaaagtttatcatgaaactaatgatgcttttgaattctaaatttatgaaataatgaataagcaacaacttgtaactgatggtttttagacaacaaacacagttaacaccaacccccctaatttatacatttatatatacatgtgcctgctgtatttatcttttgagttttgatacttgtattgcatagaaattatatgaatcagtacagcaaagcattaaaacaataaaaacataccggctttaaaagaattttttacattttaaaccaatatatatattttcatatactattacatctcacatttctttaaaatgtaattatgaacctttaacacatttcgttaaatttacagggtaaatatgaggtcacatcagtatttatatacatttaatactgatttacccaccccacaatataaaaacaatgttttgatctatatcattaaaaacttaattattttgtgtttataaagtgcataactattattttattaaatatctatgaaaaaattgggcaaaattataatagaatattccaattatagaaattgttgctattttctaagatttt
gi|4 : gcctgtatcaaataccaacatatctccagattgttttacaaatagattacccatcactaccagtagtcacatagaggtcatttacctaggacttactttaacaagttaaaattttgatgtgttgtgatgttgaacatttgctccttttctctatgttagtttttatttattttccagtatcggctaaaagttattaactgctttctccatcgcccgaatatcatcaataaaagaagttaggtcaacatccctacatttcattttacaagcgtgttatttattcatgtggttgacctgttggtactcaagATTCATGTGTT-GATCTTTTGGTACTTAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAGTTTTGCCATGTGCAAACTGG----TTTGCTATCTCGTCCACCAAAATCATGTCATAAA-GTCAACAAAGAACCAAAGTAAATGTTAAACAAGTGTCA-TTTGTTAAGCTGAAGTTCCCTTCTTACAGCGACTTGACGAAACTTCAAG-GTAACAGATC--TGTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAATG--G----GAA----A-AA---CGTTTACTGCTGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATAAATATGTGAAATGCATAAGCATTCAACTGATAGCCGAAAAGTTTACTTTTATTTGGATGGCCTTGAGGAAA--GACCTGGCCCTGTGATACATTATCTGCCTTTACCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCAAAGAGTGTTCAAAGAAGCCACCCCAATGTGGAGCTTTCCAAACAATACTGACTACTAGAATCTTCGTATGTACCTTGTCAGTTGTATTTAATTTGTTTGAGGCTGGTAACAAGCAAAAAAGGTAATTTGTTCGGGATCG-TAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACACACTGAACA-----TATTGAGGTAGAAGGGTGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTTC-ACATATTGGCGTTT--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATT-TG-TTAAAAAAAGTTAATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATATATAAAATAATGAATACGCAAAAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACATCAAATAA---------AA-TAACA-------TCA--A-CTCCC-GTAACTTATGTATGTATATATACATGTGTCTGTTGTATTTATCTTTTGAATTTTGATACTTATATTGCATATGAGTTA-ATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAATAAAAAACATAACCGGCATTATTGATATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATAT--ATACAATAACTATTT------TATTTTTTCACGTTACTCA-TTTA---AAAACTA--TTAC--ATCTAAAA---------A--AATAATATAATTATGAACCTTTGATACATTTCG------TTAGATT------TA--CAAGGTA-----A--------AGTAAGCTAAATAATGTAAAT---AAAAGGTCACGTCAGTACTTATAT--ACATGTGATATTGATTTACCCCACCCACCGTTTTTTACATATACA--CTAAAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA--TTCT-A--TATGTATATAAAG--TAAA--A-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAAAAGGGCAAAATTACAGTAGAATATTCAAATGATAGAAATCATTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|5 : CATTTTACATAAGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTACTTTTATGTGGATGGCCTTGTGGAAT--GACCTGACCCTCTGGTACATTGTCTGTCTTTTCCAGAGTAC-TTATGCGGTCGTTACCTCAAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGTCACCCCAATGTGAAGCTTTTCAAACGATACTGACTACCAGTATATTGGAATGTTTCTGGTCATTTTTATTGAATCTGTTGGCGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGTTTGGGATTG-AAAATGTCTACAGACGCCCTGTGATGTTTGT----TGA-C------TGACGAAGAGACTAAATA-----GATTGAGGTAGAAGTGCGCATTTGCCAATGATTAAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGTG--T--G--Ac
gi|5 : TGATTTTG-AATTCTAAATTAATAAAATAATGAATACGCAACAACTTGTGTAACTGGTAGTTTTGAGACAACAGACAC---------AATTAACAATTAACATCA--A-C-CCCCTTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGTTGTATTCATATTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAAAGATTATATTAATTAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAGAACATAACCGGCATTATGAGTATG--TT-TCACATTATAAACCAATATATACGATAT--ATACAATA------TCTATCGTATGTTTTCATATCACTCA-CTTA---GATACTA--TTAC--ATCTCACA-A-TT-TTTC--A--AATTTAATTATGAACCTTTAATATATTTCG------TTAAATG------TA--CAAGGT-----------------T----------ATGTAAAT---ATAATATCACATCAGTCTTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCATTTTTTGCATAAA-ATGATACAATATTTTGCTCTTTAT----CA-TA----------GAAGCTTTATTTTTT-A--TATGTTTAAAAAGTTT--G--T-A--ACCGTTATTT-----TGTAAAATATCTATTAAAAATTTGGGCAAAATTATAATAGAATATTAAAATTACAGAAGTTATTGCTATTTTTCAAGAATTAAAGttttgaattctaaattaataaaataatgaatacgcaacaacttgtgtaactggtagttttgagacaacagacacaattaacaattaacatcaacccccttaacttatatatgtatatatacatgtgtctgttgtattcatattttgagttttgatacttgtattgcataaagattatattaattagtacagcaaagcattaaaacaataagaacataaccggcattatgagtatgtttcacattataaaccaatatatacgatatatacaatatctatcgtatgttttcatatcactcacttagatactattacatctcacaatttttcaaatttaattatgaacctttaatatatttcgttaaatgtacaaggttatgtaaatataatatcacatcagtctttatatacatttaatattgatttaccccacccaccattttttgcataaaatgatacaatattttgctctttatcatagaagctttattttttatatgtttaaaaagtttgtaaccgttattttgtaaaatatctattaaaaatttgggcaaaattataatagaatattaaaattacagaagttattgctatttttcaagaattaaagg
gi|6 : cattttacataagtatgtgaaatgcgcaagcagtcacctgataggcgaaacgtgtacttttatgtggatggccttgtggaatgacctgaccctctggtacattgtctgtcttttccagagtacttatgcggtcgttacctcaaagccagttgccaagattgttcaaagaagtcaccccaatgtgaagcttttcaaacgatactgactaccagtatattggaatgtttctggtcatttttattgaatctgttggcggctggtcacaagcaataaaggtagtttgtttgggattgaaaatgtctacagacgccctgtgatgtttgttgactgacgaagagactaaatagattgaggtagaagtgcgcatttgccaatgattaaatatgtagctgatccttccaacatattggtgA--A----AAC----A-A----CGTTTACTGCTGCCATGATCTGTATTTTGGTTTCTTAATATAAAATCATTTTACATAAGTA-----------------GTCACTTGAT--------TGTGTACTTTTATGTGAATGGCCTTGAGGA-C--GACCTAGCCCTCTGATACATGATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACATCTAAGCAAGTTGCAAATATTGTTCAAAGAAGCCATCCCAGTGTGAAGCTTTCCAAACGATACTGACTACTAGTATCTTCGAATGTACCGGGTCAGTTTTATTAAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTGCAAAAG--------------TGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACCAACAGACTGAACA-----GATTAAGATAGAAGGGCGCATTTGTCAATGCTTGAATATGCAGTTGATTCTTCCAACGTATATGTG--T--G--ACAAAAGGAATATGATTATTGTGCATT-TGTTT-AAAAAA---CATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATATAATAATGAGTAAGCAATAACTT---------GTAGCTTTGAGACAACAAACACAGTTAACCAAATTAACA-------TCA--ACC-CCC-TTAACTTATATATGTCTATATACATTTGTCTGCCCTATCTATCTTAAGAGTTTTGATACTTATATTGCATAGCAATTATATTAATTAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATA------ATTATTAGTATT--TT-TTACTTTTAAAATCAATATA-------------------------------TATTGTTTCATATCATTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTTACA-T-TA-TTTA--A--AATTTAATTATGAACCATGAATACTATTCA------TTAAATTTGGCTAAA--CAGAGTA-----A--------AGTACATTAAATAATATAAAT---ATAAGGTCACATCAGTACTTATATACACATTTAA-------TTACCCCACCCACCTTAATTTGCATATACG--ATACAATg
gi|7 : aaCTGTGTCAAATACCAACATATCTCCAGATCGTTTTACAAATTGAATACCCATCGCTCCCA-TAGTCACACAGAGGGCATTTACTTCAGGCCTTACTTTA------ACACATTAAAATTTTACCCTGTT----TGTGATGTTGAACATGTGCTCCTTTTATCTATGTTATTTTTT-ATATATTTTCCAGCGATATTTACAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTCA----CCT--TACCATCTATATAAGCAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCGTGTTATTGTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGCTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT--------CACTACAATTTTGCCATTTGAAAACTGT----TTTGCTATCTTGTCCACCAAAATCATGATATAAATGT------------------------CAACAAGAAAC------------CAAAGTTGCCTTCTTACAGTGACCTGACG-----TCAAG-GTAACAGATC--TGTAAAAAAATCTGCGGTGATGCAAACA--A----CAAGAAAA-A----TGTGTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATACATATGTAAAATGCAGAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAATGTGTTCTTTTATGTGGATGGTCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGC--T----------------GTTGTCAAGAGTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGGTTTCCAAACAATG-----TACTTGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTTAATTTGTTCGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGAGACTG-AAAAGGTTTACaagtt
gi|8 : CCTGTGTTGTATACCAACATATCTCCAGAGTGCTTTACAAATGGATTACCCATTACTTC-A-T-GTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTCAATTTA------ACACATT-------TGACCTGTT----TGTGTTGTTGAACATTTGCTCCTTTTTTCTACGTTATTTTTTTATTTATTTTCGAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC-----CCGAATGCCATCCATATGAG---TTAGGCCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTGCTTTATTCATGTGTTTGTTCTGTTGGTACTCATCAAAATACATGTAATAATGTGTT-TATTGTTCATTACAATTTTGTCATTTGCAAACTGC----TTTGCTATCTTGTCCACCCAAATCATGCCATATTTGTCAACATGGAACCAAAGTAAAAGGTCAATAAGAG-TATTTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGAAACTT-AAGTGTAATAGATCA--TTTAAAAATTATGCGGTGATGCAAACA--A----TAA----ATA----TGTTTACTGCTGCAGTTATCTGTATTTTGGTTTCCTTATCCAAAATCATTTTACACAAGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCAGATAGGCGAAAA----------ATGTGAATGACCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATAAGCCTTTTCTAGAGCACAAAATACAGTCATTACTTCTAAGCCAG
gi|9 : g-----GATTGAGGTAGAATGGTGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTTCAACATACTGGCG--TATG--ACAAAACGACTATGATTATTGAGCATTCTG-GT-TAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGAAGCTTTTCCAATTCTAAATTTATAAAATAATGAATACACAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGCGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTTTATGTGTATATATACGTGTGTCTGCTGTATTAATCTTTTGAGTTTTGATACCTGCATTGCATAGAAAGTATAAAAATCAGTAGAGCAAAGAATTAAAACAA----AGATATAACCGGCATT---------------TACATGTTAAACCAATATATATGATACATAC--AATA------TCTATTGTATTTTTTCATATCACTCA-TTTA---AATACTA--TTAC--GTCATACA-T-TT-TTTGCTA--AACCTAATCATGAACATTTAATACATTTCG------TTTAATT------TA--CAGGGTA-----A--------AATACGCTAAATAATGTAAAT---ATATGGTAATTTCTGTATTTATAT--ACATATAATATTGATTTCCCCCACCCACCGTATTTTGCAT-------ATACAATGTTTTACTATATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TATTT-A--TATGTTTACAAAG--T--G--T-A-------------------TAACACATCTATGAAAAAGTTA---AAGAATAAAATAGAATATTGAAACTATAGAAATTGTTGatt
blockSeqs : TT C G A ATCTGC TTAAAAT CAAG AT T A AGGT A T T G T CATGTA A T . T G A A T T T AG T AGTT T CC AAATG AAATAA T T GC A G A CC A C T A C TTTA G TAATCA G C TTTGA G TT AC TG C T A C T T TGT AGTTAACCA ATTAACA TC C T C AA AA T TA C T TACGATATATACAATAACTATTT T GTTT GC . TCAT TATA GCT AT C A TTGCAT TGGCTAA GC TTTCGAATCCCATT A ATA T AC C T A ATG AATG TTTTAATATA T GA TGTGTT TTTTG AC T
blockSeqs : TT T . G . TTAAAAT . AG T T AGAT C T T T T . . G . T G T A T A . AG . AG T . C AAATAA G T AT C C T . . A C C A . . . G G . G . AT . C . . . G C A . . . C . C A AA T . . A TACGATATATACAATATCTATCG . C . . TCTC TTTT T AT T A . C . A A . C . T G T CA . . . A TGCATA . GT T
blockSeqs : GT T . A . GAACAT . AT T C AGAT C T T T T . . T . T A A T T A . GA . AG T . C GAAAAA G A GC G A A . . A G . G . . . G G . A . . . C . . . G A T . . . . . . A AA A . . T TATGATACATACAATATCTATTG . C . . TCTA TTTC A . C C . A . A A . T . A T T CA . . . T TAAAAA . AT C
blockSeqs : AA T . A . TT . AT T T GC C C G T . . . T . T G A A G T . GA . TG A . G AAA T A AG G C A . . A G . G . . . C A . G . . . C . . . A C T . . . . . . A AA T . . T TAAGCTAAAATAT . A . . TCTC ATT T . G T . T . A G . C . C A T CG . . . A TTTGTA . AA T
blockSeqs : AA C . C . TT . T . C A . . T . . . . . . . . . . . A . A . TG T . A ATA T A GC G T A . . A G . . . . . . G . G . . . . . . . A T T . . . . . . A A G . . T CATGTT . A . . TCTT TTA A . A T . T . A A . T . C G A C . . . A TGTTA . TT A
blockSeqs : GT T . C . . . A . C . . . . . . . . . . . . G . AT . . C AA G C . . T T . . G . . . . . . . . T . . . . . . . A C . . . . . . . . A T . . A TATGA . A . . TCAT TTT A . T T . T . A G . C . C A T G . . . A TGTA . GT .
blockSeqs : A . . . . . . . . . T AA T A . . A . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . T TATA . A . . . . C . T G . T . . . . T . C T . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . C T . . . . . . . . . G . A
blockSeqs : .
blockSeqCons : AT*** **** AG** AAA******** TACGATAAATAT******************* ** TTT*** A*** AT
originalCons : CCTGTGTCGNATACCAACATATCTCCAGAGCGCTTTACAAATGGATTACCCATCGCTTCCA-TAGTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTTANTTTA------ACACGTTAAAATTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTTTTTATTTATTTTCCAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTCA-G-TCCGAATACCATCCATATGAGAAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTTTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGGTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTGT----TTTGCTATCTCGTCCACCAAAATCATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCAACAAGAGACA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGGAACTTCAAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----NAA----A-A----CGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATANGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTNCTTTTATGTGGATGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGCTTTCCAAACGATACTNACTACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACAGACTGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGCG--T--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAACCGGCATTATTAGTATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATA---A---AATA------T------TATTTTTTCATATCACTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTCACA-T-TT-TTTN--A--AATCTAATTATGAACCTTNAATACATTTCG------TTAAATT------NA--CAGGGTA-----A--------AGTACGCTAAATAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCNTATTTTGCATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TATGTTTATAAAG--T--G--T-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTANAGTAGAATATTCAAATTACAGAAATTGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
finalCons : CCTGTGTCGNATACCAACATATCTCCAGAGCGCTTTACAAATGGATTACCCATCGCTTCCA-TAGTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTTANTTTA------ACACGTTAAAATTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTTTTTATTTATTTTCCAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTCAT---CCGAATACCATCCATATGAGAAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTTTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGGTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTGT----TTTGCTATCTCGTCCACCAAAATCATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCAACAAGAGACA-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGGAACTTCAAG-GTAACAGATCAG--TTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAACA--A----NAAAAA--------CGTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATANGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTNCTTTTATGTGGATGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGCTTTCCAAACGATACTNACTACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACAGACTGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGCG--T--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAACCGGCATTATTAGTATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATAAATAT-------------------TATTTTTTCATATCACTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTCACATTT---TTTN--A--AATCTAATTATGAACCTTNAATACATTTCG------TTAAATT------NA--CAGGGTA-----A--------AGTACGCTAAATAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCNTATTTTGCATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTTA---TATGTTTATAAAG--T--G--T-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTANAGTAGAATATTCAAATTACAGAAATTGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): ATGCTATATATAAAATGAATATGAGAAAACTGTATGCAACAATGGTCATTTGGAGGCATGGAACAAAATAATATCACAGTCCCG
Unaligned ( gi|17 ): TATAGATGAAATTAAATACATTCTCTTTCCTTGACAAAT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 3333333 1111 333333 1 111111 1111 11111 1111111 1 1111 111111 11111 11 222222222 1111111 1 1 111111111111111111111111111111 111111 111111 1111111 22222222222222 1111 1111 2222222222 1111111111111 11111
lowQualScore : 55 1 5 0 1 444444 5555555 0000 0 0 33 6 0 2 666666 2 0 0 0 0 0 3 1 3 3 999999 6 3 2222 0 0 1 0 3 5 1 1 5 5 0 55 5 77 1 22222 1 1111111 888 2 2 0 33 1 3 2 0 66 5 0 2 0 3 0 1 1 2222 5 666666 4 3 22222 1 66 33 66 0 4 5 5 5 1 3 777 000000000 6666666 66 0 5 0 0 0 55 33 3 66 4 2 888888888888888888888888888888 4 8888 66 66 6666 666666 777 66 66 2 1 222222 5555555 66 0 33333333333333 2 0 777 1 66 1 1 7 8888 0 2222 5555555555 0 5 8888 6666666666666 44444 22 3
lowQualScore : .. . . . . ...... ....... .... . . .. . . . ...... . . . . . . . . . . ...... . . .... . . . . . . . . . . . .. . .. . ..... . ....... ... . . . .. . . . . .. . . . . . . . . .... . ...... . . ..... . .. .. .. . . . . . . . ... ......... ....... .. . . . . . .. .. . .. . . .............................. . .... .. .. .... ...... ... .. .. . . ...... ....... .. . .............. . . ... . .. . . . .... . .... .......... . . .... ............. ..... .. .
lowQualScore : 00 4 7 8 0 444444 5555555 6666 5 9 22 2 8 2 111111 2 1 4 1 8 2 6 3 0 2 222222 7 2 1111 4 3 4 7 0 1 6 3 7 0 4 77 7 99 7 55555 0 5555555 888 5 6 1 66 4 4 8 9 99 0 5 7 7 0 7 4 0 1111 7 444444 3 0 55555 4 99 88 99 7 3 7 7 0 1 4 111 000000000 2222222 99 0 0 0 8 2 11 44 5 11 4 2 777777777777777777777777777777 4 4444 11 11 0000 666666 111 11 11 7 0 888888 3333333 11 9 66666666666666 7 9 888 4 11 9 0 7 9999 8 1111 0000000000 6 7 3333 1111111111111 33333 77 0
consensus : CCTGTGTCGNATACCAACATATCTCCAGAGCGCTTTACAAATGGATTACCCATCGCTTCCA-TAGTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTTANTTTA------ACACGTTAAAATTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTTTTTATTTATTTTCCAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC--A--TCCGAATACCATCCATATGAGAAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTTTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGGTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTGTTTTG----CTATCTCGTCCACCAAAATCATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCAACAAGAG-ACATTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGGAACTTCAAG-GTAACAGATCAG--TTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAAC-----AANAA---A---AAC---GTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATANGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTNCTTTTATGTGGATGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGCTTTCCAAACGATACTNACTACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACAGACTGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGCG--T--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAACCGGCATTATTAGTATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATA-----AA-TA------T------TATTTTTTCATATCACTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTCACA-T-TT-TTTN--A--A--ATCTAATTATGAACCTTNAATACATTTCG------TTAAATT------NA--CAGGGTA-----------A--AGTACGCTAAATAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCNTATTTTGCATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TATGTTTATAAAG--T--G--T-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTANAGTAGAATATTCAAATTACAGAAATTGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
Reference ( family-579 ) : CCTGTGTCGNATACCAACATATCTCCAGAGCGCTTTACAAATGGATTACCCATCGCTTCCA-TAGTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTTANTTTA------ACACGTTAAAATTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTATTTTTTTATTTATTTTCCAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC--A--TCCGAATACCATCCATATGAGAAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTTTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGGTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTGTTTTG----CTATCTCGTCCACCAAAATCATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCAACAAGAG-ACATTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGGAACTTCAAG-GTAACAGATCAG--TTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAAC-----AANAA---A---AAC---GTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATANGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTNCTTTTATGTGGATGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGCTTTCCAAACGATACTNACTACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACAGACTGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGCG--T--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAACCGGCATTATTAGTATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATA-----AA-TA------T------TATTTTTTCATATCACTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTCACA-T-TT-TTTN--A--A--ATCTAATTATGAACCTTNAATACATTTCG------TTAAATT------NA--CAGGGTA-----------A--AGTACGCTAAATAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCNTATTTTGCATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TATGTTTATAAAG--T--G--T-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTANAGTAGAATATTCAAATTACAGAAATTGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|1 : CCTGTGTCAAATACCAACATCTCTCCCGAGTGTTTTACAAATAGATTACCCATCGCTCCCA-TAGTCACACAGACGTCATTTACTTCAGGCCCTACTTTA------ACATATTAAAGTTTTGACCTGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCCCTATGTTATTTCTTTATTTATTTTCCAGTATCGTCTCAAAGTCATTAACTGCTTTCTCCATCTCT-A-----AAATACCATCCATTTAAGAAGTCAGGTCAACATTCCTCCATCTCATTTTACAAGCATGTTATTGTATTCATGTGGTTGGTCTGTTGGTAATCAAGAAAATA------ACGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCAAACTTTTTTATTTACTATCTTGTCCACCAAAATCATGTTATAAATGTCAACAAGAAAGCAAAGTAAAAGTTTAACAAAAA-ACATTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGGCCTGACGGAACTTCGAG-GTAACAGATCAGTTTTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAAC-----AAG-A---A---AAT---GTTTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATACGTATGTGAAATGCACAAGCAGTCACCTGATAGGCCAAACGTGTTCTTTTATGTGG-TGGCCTTGGGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACAGTATCTGCCTATTCAAGCGCAC-TAATGCAGTCATAACCTTTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTTAAAGAAGCCGTCCCAATGTGAAGGTTTCCAAACGATATTCAATACTAGTATCTTCGAATGTACCTGGTCTGTTTTATTGAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGAGATTG-AAAAGGTTTACAGACGCCCAGTGATGTTGAC----TAA-C------TGACGAACAGACAGAACA-----GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATT-GTG--T--G--ACAAAACAGCTATGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAGAAAGTTTATCATGAAACTATTGAAGCTTTTG-AATTCAAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--TACTGATAATTTTGAGACACCAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTATACATGTATATATACATGTGTCCGCTGTATTCATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTTTTGCATAGACATAATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATAA-CGGCATTATAAGTATT--TT-TTACATTTTGAACCAATATA------------------------------TATTTTTTCATATCACTCA-CGTA---AATACTA--TTACTTATATCACT-T-TT-TTTG--A--A--ATTTAATTATGAACCTTAAACACATTTCT------TTCAATT------AA--CAGGGTA-----------A--AATACGCTTAATAATGTAAAT---ATGAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATATTGAATAACCCCACCTACACTATTTTGTATATA-A--ATACAATGTTTTGCTCTATAC----TTTTA----------GAAACTTCA-TTTTT-ATCTATGTTTATTAAGACT--G--T-A--ACTATTATTT-----TATAAAATATCTATGAAA----TGGTCAAAATTAAAATAGAATATACAAATTATAGAAATGGTTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|10 : ----TGAGC------TGAAGAACAGATTCAAAATTTGAGATTGAGGTAGGAGGGCACATGTGTCAATGACTAATCATGTATCTGATCCTTGCAACATAATGGCG--T--GTGACAAAACGACTGTGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAACAATGCATTTG-AATATTAAATACATTAAATAAAGAATAAGCAA--A-------AACTGATAGTTCTGAGGCAACAGACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCCCTTAACTGACATAGGCATATATACATGTGTGTGCTCTATTTATCCTTAGTGCTTTGATACTTGTATTGCATAAATAATATATGAATCAGTACAGAAAAGCATTAAAACAAT-------AT--CCTGCATTATTAGTATTTATT-TTTCATTTTAAACAAATATATATGA----------------------------TTTTTCTTATTACTAA-CTTC---AATACTA--TTAC--A----ATA-TATA-TTTT--A--T--ATCTAATTACGAACTTTAAATACTTTTCA------ATAAATT------CGGCTTGAATA-----------A--AGTACACTAATTAATGTAAAT---A
gi|11 : ttCCTGTGTCTTGTACCAACATATCTCCAGAGCGCTCAACAAATGGATTTTCCATTGCTTCCA-CAGCCACAAAGAGGTCATTTACTTCTGTACTTGATTTAATCTGCACACG-------TGTGTCCTGTT----TGTGAT--------TCT-CTACTTTTCTCTATGCT-TTTTTTTATTTTTTTACCAGTGACGTCTAAATTTCATTAACTGCTTTCACCATCTC--AGGTTCAAATACCACCAATATGAGAAGTT---------------CATCTCATATTCCAAGCTTGTTATTTTA
gi|12 : nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaCTGTGTCTTATACAAACATATTTC-AGAGTGTTCAACAAATGGCTTTCCCTTTTTTTCCA-TAGTAACACAGAGTTCATTTACTTCTGGCCTTAGTTTA------ACACATT-------TGATATGTTCAAGTGTGCTTTTGAACATTTGTTTCTTTTCTCTTTGCTATTTTTTTCTTTATTTTTCAGTGACGTTTAAAATTCATTAACTGCTTTCTCCATCTCAGA--TCCGAATACCACCCATATGAGAAGTTAGGTCAACAT-CCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTATTT
gi|13 : CTGTGTCGTATACCAACATATCTCCACAGTGCTTTACAAATGGACCATCCATTGCTTCCA-TAGTAACAAAGAGGTTATATACTTCAGGCCTTAATTTA------ACACA-------TTTGACCTGTT----TGTGTTGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTA-TTTATTATTTATTTTCCCGTGTCGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATTTC------CCGAATGCCATCCATATGAGAAGTAAGGTCAAC-TATCTCAATCTCA-TTTACAAGCTT
gi|14 : TAAT--TG-TTATATTT------AATATCTAAGCTA-----AAATA------T------AGTTTT--CATATCACTCA-CTTGTTTAACACTAGCTTAC--A----ACA---------A--A--ATAATTTAATGAT-AACTTTAAATGTATTTGA------TCAAA---------A--TGGAATATTTCGAATCCCATTAGTACATTAAATAATGTAAATATAATAATGTCACATCAGGA--GAT-------TTTCATATCGATTTACCTAACCCACCTTAATTTGCAAATA-C--ATA
gi|15 : caTCAAATCAGTATTTATAT--ACATTTGATATTGATTTACCCCATCTACCGTATTTTGCATATACA--ATACAATGATTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TTTTT-A--TACGTTTTTAAAG--T--G--T-GTTACTGTTTTTTTTTTGTGTAAAATATCTATGAAAAAACAAGACAAAGTTATAGTAttacattgataagttctt
gi|2 : CANNNNNNNNNNATTTACTTCTAGCCTTGATTTA------AT-CGG-AACATTTTGACCAGTT----TGTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTTTCTATG------------TTATTTTCCAGTTACGTCTTCAATTCATTAACTGTAT-----ATCAG--A--TCCAAATA----CCATGTGCGAAGTTTGTT----AT---TTCATCT-ATGT-----GCTTG--------------------GTCTCTTGGTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAATTTTGCCATTTGCATACTGTTTTA----CTATCTCGTCCAGCAAAATAATGTCATAAATGTCAACAAGAAACCAAAGTAAAAGTTCATCAAGAG-TCATTTGTTAAGCTGAAGTTGTCTTCGTACA------TAAT-AAACTTCAAG-GTAACAGAACAG--TTAAAAA-TCTGCGGTAATGCAAACACCAAAATGA---A---AAC---GTGTACTGCTGTCATAATCTGTATTTTGG-TACTTAATCAAATATCATTTAACATATCTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCATCTAATAGACGAAAGGTGTACGTTGATGTGGGAAGCCTAGAG--ATCCGATCTGACCCTCTGATACATAACTTGCATTTTCCACAGAAT-TAATGCAGTCAGTACCCCCAAACCAGTTACCAAGATTGTTCAAAGAAGCCCTTCCAATGTGGAGCCCTCCAAATAATACTTACGTTTTGTATCTTCGAATGTACACGGCTATTTTTATTGATTTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTTGTTTTCTCGGGATTGAAAAAAGTTTACACATGCCCTGTGATGTTTACTTTATGA-CTAATCATGAC-ATCAAACTGAACA-----GATTGAGACAGAAGGGCGAATTTGACAGTGATTAAATATGCAGCTGATCCTTTCAACATATTGGCG--T--G--ACAGAACGACAATGATT-TTGTGCATTCTG-TT-AAAAACATTTGTCATGAAACTAATGATATTTTTG-AATCCTAAATTTATGAAACAATTAATAAGCAATAACTTGA--AATAGATGGTTTCAAGACAACAAACAC---------AATTAGCA-------TCATCA-T-CCC-TTAACTGATATGTGTATATAAAC---------------TTATATTTAGAGTTTTGATACTTGTATTTCATACAAATGATATGAATCAGTACAGCAAACCATTAAAACAGT-ACAAACATAACTGGCATTATTAGTATT--TTCTTA-ATTTAAAACCAATATACATG-T-----------------T------TATCTTTTCAAATCAC-CATCTTC---AATACTG--TCAA--ATCATACCTT-TT-TTTT--A--A--ATCTAATTATAAACCTTCAATACATTTCATTGCATTTGGATT------AA--TAGAATA-----------A--AGAACACTAAGTAATGTAAAT---ATAAGGTCACATCAGTACGTAGAT--ACATTTTATATTGATTTACCCCACTAATCTTA-ATTGCATATA-G--ATACAATAATTTGatgctatagatagtgtaaa
gi|2 : cgGTA-AATATTCAAATTACAGAAATTGGTGCTATGTTTTAAGATCTAAAtaaatattcaaattacagaaattggtgctatgttttaagatctaaatagcatatatatacattaatttgctttatataatgcattattttaatataaaaataatgtttgatgtgcttataaagtgttaactgttattctgtaaattattcatgaaaatgttgagcaaaatagtagaatattcaaattacagaaagctatgttttaagattttaag
gi|2 : cgcannnnnnnnnnatttacttctagccttgatttaatcggaacattttgaccagtttgtgatgttgaacatttgctccttttttctatgttattttccagttacgtcttcaattcattaactgtatatcagatccaaataccatgtgcgaagtttgttatttcatctatgtgcttggtctcttggtactcaagaaaataatgatgtgtttattgttcactacaattttgccatttgcatactgttttactatctcgtccagcaaaataatgtcataaatgtcaacaagaaaccaaagtaaaagttcatcaagagtcatttgttaagctgaagttgtcttcgtacataataaacttcaaggtaacagaacagttaaaaatctgcggtaatgcaaacaccaaaatgaaaacgtgtactgctgtcataatctgtattttggtacttaatcaaatatcatttaacatatctatgtgaaatgcgcaagcagtcatctaatagacgaaaggtgtacgttgatgtgggaagcctagagatccgatctgaccctctgatacataacttgcattttccacagaattaatgcagtcagtacccccaaaccagttaccaagattgttcaaagaagcccttccaatgtggagccctccaaataatacttacgttttgtatcttcgaatgtacacggctatttttattgattttgttggaggctggtcacaagcaataaaggttgttttctcgggattgaaaaaagtttacacatgccctgtgatgtttactttatgactaatcatgacatcaaactgaacagattgagacagaagggcgaatttgacagtgattaaatatgcagctgatcctttcaacatattggcgtgacagaacgacaatgattttgtgcattctgttaaaaacatttgtcatgaaactaatgatatttttgaatcctaaatttatgaaacaattaataagcaataacttgaaatagatggtttcaagacaacaaacacaattagcatcatcatcccttaactgatatgtgtatataaacttatatttagagttttgatacttgtatttcatacaaatgatatgaatcagtacagcaaaccattaaaacagtacaaacataactggcattattagtattttcttaatttaaaaccaatatacatgtttatcttttcaaatcaccatcttcaatactgtcaaatcataccttttttttaaatctaattataaaccttcaatacatttcattgcatttggattaatagaataaagaacactaagtaatgtaaatataaggtcacatcagtacgtagatacattttatattgatttaccccactaatcttaattgcatatagatacaataatttGCATATA-T--ATACATTAATTTGCTTTATATAATGCATTATTTTAATATAAAAA--TAA-TGTTTGA--TGTGCTTATAAAG--T--G--TTA--ACTGTTATTC-----TGTAAATTATTCATGAAAATGTTGAGCAAAAT---AGTAGAATATTCAAATTACAGAAA-----GCTATGTTTTAAGATTTTAAGtagcatatatatacattaatttgctttatataatgcattattttaatataaaaataatgtttgatgtgcttataaagtgttaactgttattctgtaaattattcatgaaaatgttgagcaaaatagtagaatattcaaattacagaaagctatgttttaagattttaag
gi|3 : cgcannnnnnnnnnatttacttctagccttgatttaatcggaacattttgaccagtttgtgatgttgaacatttgctccttttttctatgttattttccagttacgtcttcaattcattaactgtatatcagatccaaataccatgtgcgaagtttgttatttcatctatgtgcttggtctcttggtactcaagaaaataatgatgtgtttattgttcactacaattttgccatttgcatactgttttactatctcgtccagcaaaataatgtcataaatgtcaacaagaaaccaaagtaaaagttcatcaagagtcatttgttaagctgaagttgtcttcgtacataataaacttcaaggtaacagaacagttaaaaatctgcggtaatgcaaacaccaaaatgaaaacgtgtactgctgtcataatctgtattttggtacttaatcaaatatcatttaacatatctatgtgaaatgcgcaagcagtcatctaatagacgaaaggtgtacgttgatgtgggaagcctagagatccgatctgaccctctgatacataacttgcattttccacagaattaatgcagtcagtacccccaaaccagttaccaagattgttcaaagaagcccttccaatgtggagccctccaaataatacttacgttttgtatcttcgaatgtacacggctatttttattgattttgttggaggctggtcacaagcaataaaggttgttttctcgggattgaaaaaagtttacacatgccctgtgatgtttactttatgactaatcatgacatcaaactgaacagattgagacagaagggcgaatttgacagtgattaaatatgcagctgatcctttcaacatattggcgtgacagaacgacaatgattttgtgcattctgttaaaaacatttgtcatgaaactaatgatatttttgaatcctaaatttatgaaacaattaataagcaataacttgaaatagatggtttcaagacaacaaacacaattagcatcatcatcccttaactgatatgtgtatataaacttatatttagagttttgatacttgtatttcatacaaatgatatgaatcagtacagcaaaccattaaaacagtacaaacataactggcattattagtattttcttaatttaaaaccaatatacatgtttatcttttcaaatcaccatcttcaatactgtcaaatcataccttttttttaaatctaattataaaccttcaatacatttcattgcatttggattaatagaataaagaacactaagtaatgtaaatataaggtcacatcagtacgtagatacattttatattgatttaccccactaatcttaattgcatatagatacaataatttgtaaatattcaaattacagaaattggtgctatgttttaagatctaaataCCTGTATCAAATACCAACATATCTCCAGATTGTTTTACAAATAGATTACCCATCACTACCAGTAGTCACATAGAGGTCATTTACCT-AGGACTTACTTTA------ACAAGTTAAAATTTTGATGTGTT-----GTGATGTTGAACATTTGCTCCTTTTCTCTATGTTAGTTTTT-ATTTATTTTCCAGTATCGGCTAAAAGTTATTAACTGCTTTCTCCATCGC------CCGAATATCATCAATAAAAGAAGTTAGGTCAACATCCCTACATTTCATTTTACAAGCGTGTTA-TTTATTCATGTGGTTGACCTGTTGGTACTCAAGAA---A------CTGTTTTGCTATCTCATCCACCAAAATCATGTCAT----AAA-TGT------------------CACCAAGA----------------AACCA-AAGTTAAAGT------TCAACAAGAA-ACATTTGTTAAGCTGAAATTGCCTTCTTACAGTGACCTGACAGAACTTCAAT-GTAACAGATCAG--TTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAAC-----AACAA---AAATAAT---GTTTACTGTGGCCATCATCTGTA-TTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTCACATATGTATG
gi|3 : gAAACTGTTTTG----CTATCTCATCCACCAAAATCATGTCATAAATGTCACCAAGAAACCAAAGTTAAAGTTCAACAAGAA-ACATTTGTTAAGCTGAAATTGCCTTCTTACAGTGACCTGACAGAACTTCAAT-GTAACAGATCAG--TTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAAC-----AACAA---A---AATAATGTTTACTGTGGCCATCATCTGTATTT-GGTTTCTTAATCCAAAATCATTTCACAT----ATGTA-------------------TGATA-------CTTGTTCTTTTATGTGGGTGGCCTTGAGGAAT--GACCTGGTCCTCTGATACATTATCTGCCCTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATAACCTCTAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGTCATCCCAATGTGATGGTTTCCAAACAATACTCAATAATAGTATCATCAAATGTACCTGGTCAGTTTTACTGAATTTGTTAGAGGCTGGTCACAGGCAATAAAGGTAGTTTGCTTGAGATTG-AAAAGGTTTACAAATGCCCAGTGATG-TAAC----TGA-C------TG----ACAAACT----------GATTGAGGTAGAAGGGCGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTAGCG--TACG--ACAAAATGACTATGATTATTCTGCATTCTG-TT-AAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATGAAATAATGAATAAGCAACAACTTGT--AACTGATGGTTTTTAGACAACAAACAC---------AGTTAACA-------CCA--ACC-CCC-CTAATTTATACATTTATATATACATGTGCCTGCTGTATTTATCTTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAGAAATTATATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACAT-ACCGGCTTTAAAAGAATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATAT---ATA---------------------------TTTTCAT-----------------ATACTA--TTAC--ATCTCACA-T-TTCTTTA--A--A--ATGTAATTATGAACCTTTAACACATTTCG------TTAAATT------TA--CAGG--------------------------------GTAAAT---ATGAGGTCACATCAGTATTTATAT--ACATTTAATACTGATTTA-CCCACC--CCACA------ATATA-A--AAACAATGTTTTGATCTATAT----CATTA----------AAAACTTAA-TTATT-T--TGTGTTTATAAAG--T--GCAT-A--ACTATTATTT-----TATTAAATATCTATGAAAAAATTGGGCAAAATTATAATAGAATATTCCAATTATAGAAATTGTTGCTATTTTCTAAGATTTTatacttgttcttttatgtgggtggccttgaggaatgacctggtcctctgatacattatctgccctttccagagcactaatgcagtcataacctctaagccagttgccaagattgttcaaagaagtcatcccaatgtgatggtttccaaacaatactcaataatagtatcatcaaatgtacctggtcagttttactgaatttgttagaggctggtcacaggcaataaaggtagtttgcttgagattgaaaaggtttacaaatgcccagtgatgtaactgactgacaaactgattgaggtagaagggcgcatttgtcaatgattgaatatgtagctgatccttccaacatattagcgtacgacaaaatgactatgattattctgcattctgttaaaaaagtttatcatgaaactaatgatgcttttgaattctaaatttatgaaataatgaataagcaacaacttgtaactgatggtttttagacaacaaacacagttaacaccaacccccctaatttatacatttatatatacatgtgcctgctgtatttatcttttgagttttgatacttgtattgcatagaaattatatgaatcagtacagcaaagcattaaaacaataaaaacataccggctttaaaagaattttttacattttaaaccaatatatatattttcatatactattacatctcacatttctttaaaatgtaattatgaacctttaacacatttcgttaaatttacagggtaaatatgaggtcacatcagtatttatatacatttaatactgatttacccaccccacaatataaaaacaatgttttgatctatatcattaaaaacttaattattttgtgtttataaagtgcataactattattttattaaatatctatgaaaaaattgggcaaaattataatagaatattccaattatagaaattgttgctattttctaagatttt
gi|4 : gcctgtatcaaataccaacatatctccagattgttttacaaatagattacccatcactaccagtagtcacatagaggtcatttacctaggacttactttaacaagttaaaattttgatgtgttgtgatgttgaacatttgctccttttctctatgttagtttttatttattttccagtatcggctaaaagttattaactgctttctccatcgcccgaatatcatcaataaaagaagttaggtcaacatccctacatttcattttacaagcgtgttatttattcatgtggttgacctgttggtactcaagATTCATGTGTT-GATCTTTTGGTACTTAAGAAAATA------ATGATGTGTT-TATTGTTCACTACAGTTTTGCCATGTGCAAACTGGTTTG----CTATCTCGTCCACCAAAATCATGTCATAAA-GTCAACAAAGAACCAAAGTAAATGTTAAACAAGTG-TCATTTGTTAAGCTGAAGTTCCCTTCTTACAGCGACTTGACGAAACTTCAAG-GTAACAGATCTG--TTAAAAATTCTGCGGTGATGCAAAT-----GGGAA---A---AAC---GTTTACTGCTGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATAAATATGTGAAATGCATAAGCATTCAACTGATAGCCGAAAAGTTTACTTTTATTTGGATGGCCTTGAGGAAA--GACCTGGCCCTGTGATACATTATCTGCCTTTACCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACCTCTAAGCCAGTTGCAAAGAGTGTTCAAAGAAGCCACCCCAATGTGGAGCTTTCCAAACAATACTGACTACTAGAATCTTCGTATGTACCTTGTCAGTTGTATTTAATTTGTTTGAGGCTGGTAACAAGCAAAAAAGGTAATTTGTTCGGGATCG-TAAAGGTTTACAGACGCCCTGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACGAACACACTGAACA-----TATTGAGGTAGAAGGGTGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTTC-ACATATTGGCGTTT--G--ACAAAACGACTATGATTATTGTGCATT-TG-TTAAAAAAAGTTAATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATATATAAAATAATGAATACGCAAAAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGAGACATCAAATAA---------AA-TAACA-------TCA--A-CTCCC-GTAACTTATGTATGTATATATACATGTGTCTGTTGTATTTATCTTTTGAATTTTGATACTTATATTGCATATGAGTTA-ATGAATCAGTACAGCAAAGCATTAAAACAATAAAAAACATAACCGGCATTATTGATATT--TT-TTACATTTTAAACCAATATATACGATATATACAA-TAACTATTT------TATTTTTTCACGTTACTCA-TTTA---AAAACTA--TTAC--ATCTAAAA---------A--AATA--ATATAATTATGAACCTTTGATACATTTCG------TTAGATT------TA--CAAGGTA-----------A--AGTAAGCTAAATAATGTAAAT---AAAAGGTCACGTCAGTACTTATAT--ACATGTGATATTGATTTACCCCACCCACCGTTTTTTACATATACA--CTAAAATGTTTTGCTCTATAT----CATTA----------GAAACTTTA--TTCT-A--TATGTATATAAAG--TAAA--A-A--ACTGTTATTT-----TGTAAAATATCTATGAAAAAAAAGGGCAAAATTACAGTAGAATATTCAAATGATAGAAATCATTGCTATTTTTTAAGATTTTAAGT
gi|5 : CATTTTACATAAGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAACGTGTACTTTTATGTGGATGGCCTTGTGGAAT--GACCTGACCCTCTGGTACATTGTCTGTCTTTTCCAGAGTAC-TTATGCGGTCGTTACCTCAAAGCCAGTTGCCAAGATTGTTCAAAGAAGTCACCCCAATGTGAAGCTTTTCAAACGATACTGACTACCAGTATATTGGAATGTTTCTGGTCATTTTTATTGAATCTGTTGGCGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGTTTGGGATTG-AAAATGTCTACAGACGCCCTGTGATGTTTGT----TGA-C------TGACGAAGAGACTAAATA-----GATTGAGGTAGAAGTGCGCATTTGCCAATGATTAAATATGTAGCTGATCCTTCCAACATATTGGTG--T--G--Ac
gi|5 : TGATTTTG-AATTCTAAATTAATAAAATAATGAATACGCAACAACTTGTGTAACTGGTAGTTTTGAGACAACAGACAC---------AATTAACAATTAACATCA--A-C-CCCCTTAACTTATATATGTATATATACATGTGTCTGTTGTATTCATATTTTGAGTTTTGATACTTGTATTGCATAAAGATTATATTAATTAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAGAACATAACCGGCATTATGAGTATG--TT-TCACATTATAAACCAATATATACGATATATACAA-TA------TCTATCGTATGTTTTCATATCACTCA-CTTA---GATACTA--TTAC--ATCTCACA-A-TT-TTTC--A--A--ATTTAATTATGAACCTTTAATATATTTCG------TTAAATG------TA--CAAGGT-----------------T----------ATGTAAAT---ATAATATCACATCAGTCTTTATAT--ACATTTAATATTGATTTACCCCACCCACCATTTTTTGCATAAA-ATGATACAATATTTTGCTCTTTAT----CA-TA----------GAAGCTTTATTTTTT-A--TATGTTTAAAAAGTTT--G--T-A--ACCGTTATTT-----TGTAAAATATCTATTAAAAATTTGGGCAAAATTATAATAGAATATTAAAATTACAGAAGTTATTGCTATTTTTCAAGAATTAAAGttttgaattctaaattaataaaataatgaatacgcaacaacttgtgtaactggtagttttgagacaacagacacaattaacaattaacatcaacccccttaacttatatatgtatatatacatgtgtctgttgtattcatattttgagttttgatacttgtattgcataaagattatattaattagtacagcaaagcattaaaacaataagaacataaccggcattatgagtatgtttcacattataaaccaatatatacgatatatacaatatctatcgtatgttttcatatcactcacttagatactattacatctcacaatttttcaaatttaattatgaacctttaatatatttcgttaaatgtacaaggttatgtaaatataatatcacatcagtctttatatacatttaatattgatttaccccacccaccattttttgcataaaatgatacaatattttgctctttatcatagaagctttattttttatatgtttaaaaagtttgtaaccgttattttgtaaaatatctattaaaaatttgggcaaaattataatagaatattaaaattacagaagttattgctatttttcaagaattaaagg
gi|6 : cattttacataagtatgtgaaatgcgcaagcagtcacctgataggcgaaacgtgtacttttatgtggatggccttgtggaatgacctgaccctctggtacattgtctgtcttttccagagtacttatgcggtcgttacctcaaagccagttgccaagattgttcaaagaagtcaccccaatgtgaagcttttcaaacgatactgactaccagtatattggaatgtttctggtcatttttattgaatctgttggcggctggtcacaagcaataaaggtagtttgtttgggattgaaaatgtctacagacgccctgtgatgtttgttgactgacgaagagactaaatagattgaggtagaagtgcgcatttgccaatgattaaatatgtagctgatccttccaacatattggtg-----AAAAA---C---AAC---GTTTACTGCTGCCATGATCTGTATTTTGGTTTCTTAATATAAAATCATTTTACATAAGTA-----------------GTCACTTGAT--------TGTGTACTTTTATGTGAATGGCCTTGAGGA-C--GACCTAGCCCTCTGATACATGATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGCAGTCATTACATCTAAGCAAGTTGCAAATATTGTTCAAAGAAGCCATCCCAGTGTGAAGCTTTCCAAACGATACTGACTACTAGTATCTTCGAATGTACCGGGTCAGTTTTATTAAATTTGTTGGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGGGATTGCAAAAG--------------TGTGATGTTTAC----TGA-C------TGACCAACAGACTGAACA-----GATTAAGATAGAAGGGCGCATTTGTCAATGCTTGAATATGCAGTTGATTCTTCCAACGTATATGTG--T--G--ACAAAAGGAATATGATTATTGTGCATT-TGTTT-AAAAAA---CATCATGAAACTAATGATGCTTTTG-AATTCTAAATTTATATAATAATGAGTAAGCAATAACTT---------GTAGCTTTGAGACAACAAACACAGTTAACCAAATTAACA-------TCA--ACC-CCC-TTAACTTATATATGTCTATATACATTTGTCTGCCCTATCTATCTTAAGAGTTTTGATACTTATATTGCATAGCAATTATATTAATTAGTACAGCAAAGCATTAAAACAAT-AAAAACATA------ATTATTAGTATT--TT-TTACTTTTAAAATCAATATA------------------------------TATTGTTTCATATCATTCA-CTTA---AATACTA--TTAC--ATCTTACA-T-TA-TTTA--A--A--ATTTAATTATGAACCATGAATACTATTCA------TTAAATTTGGCTAAA--CAGAGTA-----------A--AGTACATTAAATAATATAAAT---ATAAGGTCACATCAGTACTTATATACACATTTAA-------TTACCCCACCCACCTTAATTTGCATATACG--ATACAATg
gi|7 : aCTGTGTCAAATACCAACATATCTCCAGATCGTTTTACAAATTGAATACCCATCGCTCCCA-TAGTCACACAGAGGGCATTTACTTCAGGCCTTACTTTA------ACACATTAAAATTTTACCCTGTT----TGTGATGTTGAACATGTGCTCCTTTTATCTATGTTATTTTTT-ATATATTTTCCAGCGATATTTACAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC--A--CCT---TACCATCTATATAAGCAGTTAGGTCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCGTGTTATTGTATTCATGTGTTTGGTCTGTTGCTACTCAAGAAAATA------ATGATGTGTT--------CACTACAATTTTGCCATTTGAAAACTGTTTTG----CTATCTTGTCCACCAAAATCATGATATAAATGT------------------------CAACAAGAA-AC-----------CAAAGTTGCCTTCTTACAGTGACCTGACG-----TCAAG-GTAACAGATCTG--TAAAAAAATCTGCGGTGATGCAAAC-----AACAAGAAA---AAT---GTGTACTGCGGCCATCATCTGTATTTTGGTTTCTTAATCCAAAATCATTTTACATACATATGTAAAATGCAGAAGCAGTCACCTGATAGGCGAAATGTGTTCTTTTATGTGGATGGTCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATCTGCCTTTTCCAGAGCAC-TAATGC--T----------------GTTGTCAAGAGTGTTCAAAGAAGCCGCCCCAATGTGAAGGTTTCCAAACAATG-----TACTTGTATCTTCGAATGTACCTGGTCAGTTTTATTTAATTTGTTCGAGGCTGGTCACAAGCAATAAAGGTAGTTTGCTCGAGACTG-AAAAGGTTTACaagtt
gi|8 : CCTGTGTTGTATACCAACATATCTCCAGAGTGCTTTACAAATGGATTACCCATTACTTC-A-T-GTCACACAGAGGTCATTTACTTCAGGCCTCAATTTA------ACACATT-------TGACCTGTT----TGTGTTGTTGAACATTTGCTCCTTTTTTCTACGTTATTTTTTTATTTATTTTCGAGTGACGTCTAAAATTCATTAACTGCTTTCCCCATCTC------CCGAATGCCATCCATATGAG---TTAGGCCAACATCCCTCCATCTCATTTTACAAGCTTGTTGCTTTATTCATGTGTTTGTTCTGTTGGTACTCATCAAAATACATGTAATAATGTGTT-TATTGTTCATTACAATTTTGTCATTTGCAAACTGCTTTG----CTATCTTGTCCACCCAAATCATGCCATATTTGTCAACATGGAACCAAAGTAAAAGGTCAATAAGAGTAT-TTTGTTAAGCTGAAGTTGCCTTCTTACAGCGACCTGACGAAACTT-AAGTGTAATAGATCAT--TTAAAAATTATGCGGTGATGCAAAC-----AATAA---A---TAT---GTTTACTGCTGCAGTTATCTGTATTTTGGTTTCCTTATCCAAAATCATTTTACACAAGTATGTGAAATGCGCAAGCAGTCACCAGATAGGCGAAAA----------ATGTGAATGACCTTGAGGAAT--GACCTGGCCCTCTGATACATTATAAGCCTTTTCTAGAGCACAAAATACAGTCATTACTTCTAAGCCAG
gi|9 : g-----GATTGAGGTAGAATGGTGCATTTGTCAATGATTGAATATGTAGCTGATCCTTTCAACATACTGGCG--TATG--ACAAAACGACTATGATTATTGAGCATTCTG-GT-TAAAAAGTTTATCATGAAACTAATGAAGCTTTTCCAATTCTAAATTTATAAAATAATGAATACACAACAACTTGT--AACTGGTAGTTTTGCGACAACAAACAC---------AATTAACA-------TCA--A-C-CCC-TTAACTTTTATGTGTATATATACGTGTGTCTGCTGTATTAATCTTTTGAGTTTTGATACCTGCATTGCATAGAAAGTATAAAAATCAGTAGAGCAAAGAATTAAAACAA----AGATATAACCGGCATT---------------TACATGTTAAACCAATATATATGATACATACAA-TA------TCTATTGTATTTTTTCATATCACTCA-TTTA---AATACTA--TTAC--GTCATACA-T-TT-TTTGCTA--A--ACCTAATCATGAACATTTAATACATTTCG------TTTAATT------TA--CAGGGTA-----------A--AATACGCTAAATAATGTAAAT---ATATGGTAATTTCTGTATTTATAT--ACATATAATATTGATTTCCCCCACCCACCGTATTTTGCAT-------ATACAATGTTTTACTATATAT----CATTA----------GAAACTTTA-TATTT-A--TATGTTTACAAAG--T--G--T-A-------------------TAACACATCTATGAAAAAGTTA---AAGAATAAAATAGAATATTGAAACTATAGAAATTGTTGatt
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): ATGCTATATATAAAATGAATATGAGAAAACTGTATGCAACAATGGTCATTTGGAGGCATGGAACAAAATAATATCACAGTCCCG
Unaligned ( gi|17 ): TATAGATGAAATTAAATACATTCTCTTTCCTTGACAAAT