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Reference ( gi|3 ) : TCTTCC--GT-GGCCGAGTGGTC-T-AAGGCG---C---CGTC-------TC-A------G-GAT--------CA-CT-TACC--TC-------TCA----C--CG---CTAA--GGTC-----GT-----AG--------GTTC--G--A-TC---C-----------C-A---A-T-CA--C-T----C-TAA----AAA-C-----TTA--ATGTGA-GAA-AGT-TT-G-CC---A-G-T-A-ACTT-----GC--GGAAGGACGGTGGTTCTA-------C-----TC-CGT-CTGACT------CAG----TCTGAGGT-CTT--C-CTCCA----------C---CAGTA--A--A---A--CTTG--ATAT-GC------C--A-------T-A-----TATAACCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATTGCGCT-AA----------ACCCCA----T-T---AAA-AAT
gi|14 : TCCTCC--AT-GGCCCAGTGGTC-T-AAGGCA---C---TGTC-------TC-A------A-GAT--------CA-CT-TACC--TC---------A----C--TG---CTAA--GGTC-----GT-----AG--------GTTC--G--AGTC---C-----------C-G---C-T-AG--C-A----C-CGA----AAA-C-----TTT--TTGTGA-GAA-AGT-GT---CC---A-A-T-T-ATTA-----GT--GGAAGGACAGTGGTTCTA-------C-----TC------------------AG----TTTG---T-CTT--C-CTCCA----------C---CAGTA--A--A---AAACTGG--ATAT-GC------C--A-------T-A-----TATAACCTT----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGCGTT-AA----------ACCCCA----T-T---TAA-
gi|35 : TCTTCC--GC-AGTCAGGTGGTC-C-AGGGCG---C---TGGC-------TC-A------G-GGT--------GA-CT-TACT--TT-------TTAGGAGC--CG-----AA----CC-----GT-----CA--------GTT-------------------------C-A---A-T-CA--C-------------------------------TGCG-------------G-C----A-G-T-T-ACTT-----GC--GGAAGGACCATGATTCTA-------------TC-CG
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24 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-466 ) : TCCTCCGTGGCCGAGTGGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCA-C--CGC---TGA----GGTC-----GT-----GGGTTC--G--A-----TC---CC------G-C-TCGNTC---C------AAA-----A---AC----T---TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACGG--TGG----------T-----TC---TACT------CAG---GATTCAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAATA-A-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---AAA-AAT
gi|1 : TGATCGAATGGTC-T-T-GAGCG---C---A---GCC------TC--G---A-----G---------AGC-A-CA-TACA--A-------CGCA-C--TGC---TCA----GGTC-----GT-----ATGTTCG-G--A-----TC---CA------A-C-TGGGTC---C------AAA-----A---AC----CTCATTATA-TAACAA---A-AGT-GT-G-CC---C-T----TT------A--CTTTTGAAAG------AACAG--TGG----------T-----GT---TGCT------CA----TATCCGT---------CTTGA-GT-CTT--C-TTGA---T---C----------CAATA-T-A---A---G-TG--A--TTGT-C------C--AGTC----T-GTCCAAGAG--CCTG----ATAT-C--TCCCG-----AATAAGGCATATT-AA----------CCTCCA----A-T---GAA-AA
gi|10 : tttcgtTCCACGGCAGAGTGGTC-C-A-AGCCA---T---T---GTC------TC--A---A-----G----------TC-AACT-TCCC--T-------CTCA-T--CGC---TGA----AGTT-----GT-----GGGTTT--G--AG----TC---TA------G-C-TAGGTC---T------AAC-----A----C----T---TTATG-TGA-GA---A-TTT-TT-G-AT---A-G-----T------A--AATATGGAAA------GGCTA--TAA----------T-----TC---T----------------ATTCAT---------TCTAATGT-CTT--C-GTCC---A---G----------CAATA-A-G---A---C-TG--G----ATGA------C--A-------T-AT---ACTA--CCTGTAGTACAT-GTATGTTA-----AAAAAAGG--TTT-TA----------ACCGCA----T-a
gi|11 : CGTGTCCGAGTGTTC-T-A-AGGCG---C---C---GCC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-GACC--T-------CTCA-C--CTC---TAA----TGTC-----GT-----AGGTTC--G--AG----TC---TT------G-C-TCGCTC---C------TAA-----A---TC----T---TTGTG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAA------GACGG--CGG----------T-----TC---TACT------CA----GATTCAT---------CCTGAGGT-CCT--T-CCCT---A---T----------CAGTA-A-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--G-------TAAC---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTA-----AAAATGGC--G-T-AA----------ACCCCA----gcta
gi|12 : TCCACGGCCGAGTGATC-T-A-AGACG---C---C---GTC------TC--A---A-----A---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCA-C--TGC---TAA----GGTC-----AT-----AGGTTT--A--AG----TC---GC------A-C-TCGCTC---C------AGT-----A---AC----T---TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCAGAAG------GACAA--TGG----------T-----TC---TACT------CA--------CAG---------TCTGAGGT-CTT--T-TTCC---A---C----------CAGTA-A-A---A---C-TG--A--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---AAatt
gi|13 : CCTCCGTGGCAAAATAGTC-T-T-AGGTG---C---C---GTC------TC--A---A-----A---------ATC-A-CT-TGCC--A-------CTCA-C--CAC---TAA----GTTT-----GT-----AGGTTC--G--AG----TC---CC------G-C-TCGCTCA--C------AAG-----A---GC-----------TA-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CA---A-G----TT------A--CCTGCGAAAG------GACGG--TGT----------T-----AT---TTCT------CAG---T-TTCAT---------TCTGAGAA-CTT--C-CTCC---A---C----------TAATA-A-A---A---C-TT--G--ATATACATGTATC--A-------C-AT---ATAT--CCTG----AATT-G--TGTCG-----AAAACGGT--GTT-A
gi|14 : TCCTCCATGGCCCAGTGGTC-T-A-AGGCA---C---T---GTC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------C--A-C--TGC---TAA----GGTC-----GT-----AGGTTC--G--AG----TC---CC------G-C-TAGCAC---C------GAA-----A---AC----T---TTTTG-TGA-GA---A-AGT-GT---CC---A-A----TT------A--TTAGTGGAAG------GACAG--TGG----------T-----TC---TACT------CAG-------------------TTTG---T-CTT--C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---AAA-C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTT----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---TAA-
gi|15 : CGTGACCCAGTGGTC---A-AGGCG---C---C---GTT------TC--A---C-----G---------ATC-A-TT-TACC--T-------TTCA-C--CGC---TAA----GCGC-----GT-----AGGTTC--G--GG----TC---CC------A-T-TCGCTC---A------AAA-----A---AC----T---TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-A-AC---A-G----GT------A--CTTGCGGATG------GACAA--TGG----------T-----TC---TACT------CA----GATTCAT---------TCCGACGC-CTT--C-CTCC---G---C----------CAATA-A-A---A---C-AC--G--ATATGC------C--A-------T-AT---GTAA--C---------AT------TT-------AAATAGC--GTT-AA----------TCTCCA----T-T---AAA-
gi|16 : gGAGTGGTC-T-A-AGGTG---C---T---GTTGTTTATTT--A---AT----G---------ATC-A-TT-GACC--A-------CCTA-C--CGC---TGA----AGTA-----AT-----AAGTTT--A--A-----AC---CC------A-C-ACAGAC---C------AAA-----A---CC----T---TTATG-TGA-AC---A-GGT-TT-T-CC---A-G----TT------A--TTTGTGGAAG------GTTGA--TGG----------T-----TC---TTC-------CAA---GATTCAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---A----------CAGTA-A-A---A---C-TG--G--ATGTGT------C---------------------------------AT-G--TGTTG-----AAAATGAT--GTT-AA----------ACCC
gi|17 : CCTCCATTGCCAAGTAATT-T-A-AGAAC---A---T---GTC------TT--A---A-----T---------AT--A----TATT--T-------CCAA-C--CAT---TGA----GATCTT---AT-----GTGTAT--G--ACTATGTG---CC------A-TGTCGTAA---T------AAGCAGGTA---AC----G---TTAGA-AAA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-C----TT------A--CTTCCTGA--------GGCAGTTTCA----------T-----TC---TACA------CA----GATTCAT---------TCCAAGAT-CTT--T-CTTC----------------------------------C-TG--G----ATGC------C--A-------T-AT---AAAA--Cggtgt
gi|18 : GTAGCTGAGTGATC-T-A-AGGTG---C---C---ATC------TC--A---A-----G---------ACC-A-CT-TACC--T-------TTCA-T--GGC---TAA----GGTC-----AT-----AGGTTC--G--AG----TC---TC------A-C-TCTGTC---C------AAA-----A---AC----T---TAATG-TAT-GA---A-AAT-TT-G-TC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------AACAG--TAG----------T-----TG---TACT------CAA---GAT----------------------CTT--T-CTAC---A---T----------CAGTA-A-A-------T-TG--G--ATATGC------C--A-------C-AT------------G----AAAT-G--TGATG-----AAAATGAC--ACT-GA----------Aaagctttatatttcacatt
gi|19 : aTTCGTGGCCGATTGGTC-T-A-AGGCG---T---C---GCC------AC--G---A-----G---------ATC-A-CT-TACC--aca
gi|19 : -TT-G-CC---G-G----TT------A--CTCGCAGAAA------GACTG--TGGCTCTGGGTTGT-----TC---TTCT------CAG----ATACAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CGCC---AACTCTTA-------CAATA-A-A---A---A--G--G--ATATGC------C--A-------T-TT---ATAA--CTTG----GTAT-G--TATTG-----AAACTGAC--GTT-AA----------ACTTCA----T-T---gtcatagttgccggttactcgcagaaagactgtggctctgggttgttcttctcagatacattctgaggtcttccgccaactcttacaataaaaaggatatgccatttataacttggtatgtattgaaactgacgttaaacttcattccaaa
gi|2 : ttcgtggccgattggtctaaggcgtcgccacgagatcacttaccgtcatagTC-A-TT-TACC--T-------T--A-C--AGC---TGA----GGTG-----GTTACTAAGGTTC--A--A-----GC---CTT-----G-C-TTGGTC---A------AAA-----A---AC----T---CCATG-TTA-GA---A-AGT-TT-G-TC---A-G----TT------A--TTTGCAGAAA------GGTAG--TGG----------T-----TC---TAAC------CA----AATTGA----------TCTTATGT-CTT--C-TTCC---A---C----------CAATA-A-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--ATAAAACTT-AT---ATAA--CCTG----AATT-G--TGTTC-----AAAATGG--------------------CCCCA----T-T---AAA-ccaaa
gi|20 : atcctctgtggtcttgttgaaggtgtataattgtcctgtaattAA-----A---GC----A---TTATG-TAA-GA---A-AGT-TT-T-CC---A-G----TC------A--CTTGCAG
gi|20 : cctctgttcgaact---CT------G-C-TCGAAC---T------AAA-----A----C----A---TTATG-TGA-GG---A-AAT-TT-T-CT---A-G----TC------A--Cctcggaccagtgacttaatttcatatgcctctgctcgaactaaaacattatgtgaggaaattttctagtcacgttctacacgttctacaattagatatgccatatatactctgtaatgggtagaaaaaggcgttaaatccaatt
gi|20 : cctctgttcgaactaaagcattatgtaagaaagttttccagtcacttgcagctcggaccagtgacttaatttcatatgcctTA-C-A---A---T-TA--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAC--TCTG----TAAT-G--GGTAG-----AAAAAGGC--GTT-AA----------ATCCAA----T-T---gttctacacgttctacaattagatatgccatatatactctgtaatgggtagaaaaaggcgttaaatccaatt
gi|21 : cctctgttcgaactaaagcattatgtaagaaagttttccagtcacttgcagctcggaccagtgacttaatttcatatgcctctgctcgaactaaaacattatgtgaggaaattttctagtcacgttctacacgttcCCGTAACCAAGTGTTC-T-A-AGGCG---C---T---GCT------TC--A---A-----A---------ATC-A-TT-TACC--T-------CTCA-C--CGC---TAA----GGTC-----GT-----AGGTTC--G--AG----TC---CC------G-C-TTGCTCG--T------AAA-----A---A----------TATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGTGGAAG------GACGG--T-G----------T-----TC---TACG------CA----GATTCAT---------TCTGCTGT-ATT--C-CTCC---G---A----------AAATA-A-A---A---C-TA--G--CTCTGC------C--A-------T-AT---
gi|22 : TC-A-CT-TACT--A-------TTCAGC--CAT---TCA----GGCC------T-----GGTTT-------------------------------GGTC---C------ATA-----A---AC----T---TCCTT-TGA-GA---A-AAT-TA-A-CA---A-G----CT------A--CTAGTGGTAT------GACAT--TGG----------T-----TC---TACT------T-G---GATTCAT---------ACTGAGTT-CTG--C-CTTC---A---C----------CAATC-A-A---A---C-TG--G----ATGC------C--A-------T-TT---ATAA--CTCA----CAAT-G--TGTTGGGGAAAAAATGGT--GTT-AA----------GCATCA----T-T---AAA-AAtcaata
gi|23 : T-----AGGTTC--G--AG----TC---TC------G-T-TCGCTC---C------GAA-----A---TT----T---CCATG-CGA-GA---A-AGC-T--G-CC---A-G----CT------ATACTTGCAGA----------TGG--TGG----------C-----TC---TACT------CAG----ATTAAT---------TCTGAGGT-TTT--C-CTCT---A---CAAAAATAACCCAA-A-A-ACAGA---C-TG--G--ATATGT------G--A-------T-AC---ATAA--CTTG----AAAT-A--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------TCCTCA----T-T---
gi|24 : TGACCGGGTTGTC-T-A-ATAGA---T---C---GTC------TC----------------------ACC-A-----ACA--T-------TTCA-C--CGA---CGA----GTTT-----AT-----GGATTC--A--A-----GC---CCA-----G-C-TCGca
gi|25 : tgtgctatagtaatgacacagaaaaagtgttttcaagtatatacatataatgtaacacaagtttacttcaaattttatggaaacattcttaaaA-GA---A-ACT-TTTG-CCCCGA-G----AC------A--CTTGCGGAAA------GACGG--TGG----------T-----TC---TACT------GTG-------------------TCTAAGGT-AT---C-CTCC---A---C----------AAATA-A-A---A---C-TT--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CATG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GAC-AA----------ACCCAA----T-T---CAATAATgcaca
gi|26 : gttcgagtttacagaatacgaaggctaaaTGGCCTAGTGGT----------G---C---T---TTC------TC--A---A-----G---------TTC-AGCC-AACC--T-------CTCC-C--TGC---TTA----GGTT-----GT-----GGG--------A-----AC---CA------G-C---GAT-----------------------------T---TAATC-TGA-GA---A-TGT-TG-G-CC---A-A----TT------A--TTTGTATAAA--------------------------------TT---TA---------AA---G---------------TCTAAAGT-CTT--C-CTCT---G-----------------TG-A-A---A---A-TG--G--A-A-GA------T--A-------T-AT---ATAA--CCTG----TAAT-A--TGTTG-----AAAaac
gi|27 : cTT-T-G-AGGCA---C---T---GTC------TC--A---A------------------------------T-------TTCA-C--GGA---TGA----TTTT-----GT-----GGGTTC--G--T-----GC---CA------C-C-TCAGGC---C------AAA-----T---AT----A---TGACG-TGA-GG---C-AGT-TT-A-CC---A-G----TT------C--CTTGCAGA
gi|27 : gtT-CTT--T-TTCT---A---T----------CAATA---A---A---C-TA--A--ATGT-C------C--A--------------ATCA--TCTG----TAAT-C--TGTTA-----AAAATGAC--ACT-AA----------ATCtctttttctatcaataaactaaatgtccaatcatctgtaatctgttaaaaatgacactaaatca
gi|28 : gttttgaggcactgtctcaatttcacggatgattttgtgggttcgtgccacctcaggccaaatatatgacgtgaggcagtttaccagttccttgcagaGTGGTC-C-A-TGTCG---A---C---ATA------TC--A---A-----A---------ATC-A-TT-TATA--T-------CTCA-C--TGTAG-TG-----GGTC-----CT-----AGGT----G--A-----AA---CA------G-T-GTGTTC---CTTTAAGAAG-----G---ACAATTT---TTCTACTCA-TATTTA-GGT-GT-G-TT---A-G----TT------A--CATTAGGAAG------GACAA--TGG----------T-----TC---TACT------CAa
gi|29 : tgtcttct---AC----T---TTATG-TAA-GA---A-ATT-GA-G-TC---A-GCT--TT------T--TTTGTGGAAG------GATGG--TGG----------T-----TC---TATT------CA----GATTAAT---------TACAAAAT-TGT--C-CTCC---A---C----------CTACC-A-A---A---C-TG--G--ATATAC--------------------------AG--CCTG----TAAT-A--TGTTG-----GAAATTAT--GTT-AA----------AC
gi|3 : tactgctgtattctagcTCTTCCGTGGCCGAGTGGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTC------TC--A---G-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCA-C--CGC---TAA----GGTC-----GT-----AGGTTC--G--A-----TC---CC------A-A-TCACTC---T------AAA-----A---AC----T---TAATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TA------A--CTTGCGGAAG------GACGG--TGG----------T-----TC---TACT------CCGTCTGACTCAG---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---A---C-TT--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATTGC--GCT-AA----------ACCCCA----T-T---AAA-AATaa
gi|31 : CCATAGCCGGGTGATC-T-A-GGGCA---T-------GTC------TC--A---A-----T---------ATC----T-CACC--T-------GTCA-C--CGC---TGA----GGTT-----GT-----GGGTTC--A--A------------------------GACC------------------A---GC----T---------TGA-GA---A-GGT-TT-A-CC----------TT-------------------------GACAG--TGG----------T-----TC---TGCT------C-T---GATTCG----------TCTGAGCT-TTTAAC-TTTC---A---C----------CA
gi|32 : GCTGAGTGAGC-T-A-AGGCA---C---C---ATC------TC--A---A-----G---------GTC-A-CT-TACC--T-------CTTA-A--TGC---TGA----GGTC-----AT-----GGGTTCA-A--A-----TC---CC------A-C-TCGATT---C------AAA-----A---AC----------AT---------------T-TT-A-CC---A-G----TC------A--CTTGCAGAAG------GGTAG--TGG----------T-----TC---TACT------C
gi|33 : aTTCTCTGTGGCAGAGCAGTT-A-A-AATTG---C---A---ATC------AC--A---T-----G---------ATC-A-CC-AATC--T-------CT-A-C--CAC---TGA----GAAT-----GT-----GGACAC--C--A-----AC---CT------G-T-TCA-----------------------------------TTA-----A-GG---A-AATATT-G-CC---A-G----TC------A--CTTTCGGGAA------GACGG---GA----------T-----TC---tga
gi|34 : aggaT------A--CTTGCAGA-G------AATGC--TGG----------T-----TC---TACT------CAC----ATTCAT---------TCTGAGGT-CTG--C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---A---C-TA--G--ATATGT------T--A-------A-GT---ATAA--CCTT----TTAT-G--TGTTG-----TAAATGAT--CTT-TA----------ACACCA----T-T---AAA-
gi|35 : gtgaC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACCA--TGA----------T-----TC---TA
gi|36 : gtcttccgcagtcaggtggtccagggcgctggctcagggtgacttactttttaggagccgaaccgtcagttcaatcactgcggCTGAGGT-TGT--C-CTCC---A---T----------CAAT----A---A---C-CG--A----ATGC------C--T-------T-AT---ATAA--TC-------AATGG--TGTTG-----CAAAtccg
gi|37 : gggagatgtcggtgatttggtttgattaaatttaaggGTGGTA-T-A-ATGCG---C---T---GTC------TTCTA---A-----T---------GTCCA-CT-GACC--T-------TCCG-C--CGC---TGA----AGTC-----TT-----GGATGT--G--A-----GCG--CA------G-C-TAGGTT---T------AAA-----A---ACAA--G---TTATG-TTATGA---A-Aaccttacaaaaaaaaccctca
gi|38 : ggttcctctacTTCACGGCCAAATGCTC-CCA-AGACA---A---T---GTC------TC--A---A-------------------------ACC--T-------CTCA-G--CAA---TGA----GGTT-----GT-----GAATTC--GAAA-----T----CT------G-G-TTGGTCAGTT------AAATC---A---A----------TATG-T---AA---A-AGT-TC-A-CT---T-G----TC------A--CTa
gi|39 : TGGTCAAGTGGTC-T-A-AGGCA---C---C---ATC------TC--A---ATTTCTGTATCTATTCACC-A-CTCCACC--A-------CTCA-C--TAC---TGA----GGTG-----GT-----CGGT
gi|4 : ggagttcttttTCCTCC-TGGCTGTGTGGTCGT-T-AGATA---C---T---GTG------TC--A---A-----A---------ATC-A-CT-TGCC--T-------CTTG-T--CG----TGACCAGGGTTTAATGGG-----GGGTTCAAG--G-----TCAGGCCA-----G-C-TGAGTG---T------AAA-----C---CT----T---TTTTA-TTG-GA---G-A----T-G-CC---A-GAGATTT------C--CTTAT--AAG------GACAG--TTA----------TAA---TCAGTTACTTTTATACAG-----TTC-T---------TCTCAGATGAAT--C-CTTC---A---C----------CACTA-T-A---A---C-TG--GTTATTTGC------C--A-------T-AT---A--------A----AAAT-AT-TGTTG-----AAAAaaaatctcaataagtttaaaa
gi|40 : gg------TC--A---A-----G---------GTC-A-CT-AACC--T-------CTCA-C--CGT---TAA----GGTT-----GT-----GTGTTC--G--A-----GC---CCA-----G-C-TTGGT
gi|40 : aTGC------C--A-------T-AT---ATAG--TCTG----AATT-G--TGTTG-----GAAATGAC--GTTAAA----------ACACCC----T-T---AAA-tgccatatatagtctgaattgtgttggaaatgacgttaaaacacccttaaaa
gi|41 : atcaaggtcactaacctctcaccgttaaggttgtgtgttcgagcccagcttggt--T-------CTTG-T--CAT---TGT----GGTG-----GT-----GAGTTC--G--AA----TC---CA------GAC-TGGTT-----------AAA-----A---AC----C---CG--G-TGA-GC---T-GGT-TT-G-CC---A-G----TT------T--CTTGTG
gi|42 : ctctttggcaaagcaacctaaggaattg-----TC---TATT------CAG---AAAT-AT---------ACTAAGGT-CTTA-C-CCCC---A---A----------CAATA-C-A---A---C-TA--G--ATA--C------A--A-------TGAT---AT------TG----TAAT-G--TGTTG-----ATGTTTGC--GTC-AA----------ata
gi|43 : gacG---C---A---GTC------TC--A---G-----G---------ATC-A-CT-TA-------------TCA-C--------TGA----GGTG-----GT-----GAGTTT--G--A-----GC---CC------AAC-TTGG-C---C------TAA-----A---AC----T---GT-TC-TGA-GA---A-AGG-TT-A-CC---A-G----TT------A--CTTGTGAAAG------AACtcgatatacaagtaaat
gi|44 : ctACA--T-------CTCA-AAACGC-----A----GTTC------T-----AAGTTC--G--AC----TC---TA------G-T-TAGGCC---C------AAA-----A---AC----T---TTATG-TGC-GA---A-AGT-TT-GCCC---A-G----TT------
gi|45 : tgCTCCGTGACCAAGGGGTC-T-A-AAGCG---C--------TC------TC--GTTTA-----GCC-------ATC-A----TATCAAT-------CTCA-C--CGCAATTGA-------C-----GT------GGTTC--A--A-----GC---Ctaaatagaaggatattcattc
gi|46 : TG-TGA-TA---ATAGT-T--G-CA---A-G----TT------A--CTTGCGTAAG------GACAA--GGA----------T-----TT---TAAT------CA----GATTGAT---------acacttagttggtaaag
gi|47 : tgttacagtatatttactcacTCCTCCTTGAACAAGTG----T-A-AGATG---C---T---GTT------TT--G---A-----GG--------ATT-A-CT-TGCC--C-------TTCA-C--CGC---TCT----GATC-----CT------GGTTC--A--A-----AC---CC------gacatatttcaccagt
gi|48 : CCGAGGT-CCT--C-TTCC---A---T----------CAATA-A-A---A---C-TG--A--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTT----AAAT-G--TGTT------AAAATGAT--GTT-AATGTTTTTTTTACCCCA----T-T---AAA-taaacattacactaaaga
gi|5 : TCCTTGGTCGAGAGATC-T-A-AGGCA---CTCCC---GTT------TG--A---T-----G---------GCC-A-CT-CATC--A-------CCCA-T--CGT---TGA----AGTC-----AG-----GGAGTC--G--A-----GC---ACA-----G-T-TCGGTC------------------A---A-----T---TTATG-TGT-GA---A-AGT-GA-G-CC---A-G----TT------T--TTCGCTGCAG------GACTG--TGT----------T-----TC---TACT------C-C---GATGTAT---------TCTGAGTG-CTT--C-CTC
gi|50 : agtatgtattgtacgaaatcaaaatagggtgtGTGAAAGACT---GACGA--T------------T-----TC---T--T------AAG---GATTTAT---------TC-GAGTT-GTT--C-CCCC---A---T----------CAATA-A-A---A---C-C------AAATGG------C--A-------T-A-----------------------A--TGTTG-----GAAGTGAC--ATT-AA----------ACattatgcatttgtcgaaagtgaataaatatattcaaactgaa
gi|51 : ----------T-----TG---TACT------CAT---GATTCATATCTATGGATCTGGGGT-CTC--C-TTCA---A---C----------CAATA-C-A---A---C-TG--A--AT-T-C------C--A-------T-A------------------AAAC-A--TGCTG-----AAAATTGA--GTT-
gi|52 : ttaCAT---------TTTGAGGT-CTT--T-CCCT---T---T----------CAGTA-ATA---A---C-TG--G--AT--GC------T--A-------T-A----ATA-----CG----AAAT-G--TGTTG-----GAAACGGA--GTT-TA----------TCCCCA----T-TCACAAA-
gi|53 : aTCCTCAATGGCAGAGTTATC-T-A-ATGCG---A---T---GTCCT----TT--A---AT----G---------ACC-A-CT-T-------------CTTA-C--CAC---TTA----TGTC-----GT-----GGTTTC--G--A-----GC---CC------
gi|54 : ggTCCTCCGTGCCCTAATAGTC-C-A-AGGCG---A---T---GCA------TC--A---A------------------------TAAC--A-------GTCA-T--CGC---TGA----GAAA-----GA-----AGGTTC--G--A-----AC---CCA-----G-C-TTGagc
gi|55 : acaga-C--TGC---TGA----GGTT-----CT-----GGTTTC--G--AA----GC---CT------G-C-TCA-----------------------------------TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CT---ATG----CT------A--TTTACAAAAG------GATTA--TGA----------T-----TT---TA
gi|56 : ---GATTGAT---------TCTGCAGT-CTT--CTCTCC---A---C----------CAAAA-A-A---AAACC-TG--G---T-TGC------C--A-------T-AT---ATAA--C--A----AAAC-G--TGTTG-----AAAAt
gi|57 : -------CTCA-T--TGT---TGA----GGTC-----AT-----GAGTTT--G--A-----GC---ACAAGTGAG-C-TCAGTC---C-------AA-----A---CC----A---TTATG-T-A-TA---A-AGT-TA-A-CC---A-G----TG------A--CTTGctgagtgaa
gi|58 : T--T-CTTC---A---C----------CAATA-A-C-------C-TG--T--GT-TAC------C--A-------T-AT---ATAA--CATG----ACGT-G--GATTG-----CCA-TGAT--GTT-AA----------ACCCCA----T-
gi|59 : CCTCTGTAGGAGAATGGTC-T-A-ACGCG---C---C---GTT------TC--G---G-----G---------ATC-A-TT-TACA--T-------CTCA-C--C------AA----AGTC-----AT-----AGGTTC--G--A-----aatacatgt
gi|6 : CCGAGTGGTC-T-A-AGACG---C---T---GTC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-AACA--T-------CTCA-C--TGC---AGA----AGTC-----GT-----AGGTTC--G--AG----TA---CC------A-C-TTTGTC---C------AAA-----A---AC----T---TTATG-TGA-AA---A-TGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACGT--TGG----------T-----TC---TGCT------C-G---GATACAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTTC---A---C----------CATTA-A-A---A---C-TG--G--ACATGC------CATA-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTCC-----AAAATGGT--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---TAA-atacc
gi|60 : ccc-----G---------ATC-A-CT-AACC--T-------GTTA-C--CAT---AGA----GGTC-----AC-----GAGTTT--A--A-----GC---CCA-----G-C-TCAGT
gi|61 : tcatcatgtA-GA---A-AAT-TT-G-TT---A-G----TTGTATGTA--CATGTAGATA------GACGA--TGG----------T-----TC---TACA------CGG---AATtatacatgcatgaat
gi|63 : ttcatagaaatatttCATGGCATAGTGGCA-T-AGAGGCA---T---T---GTC------TT--A---A-----G---------AGT-A-CT-T----------------------GC---TGA----GGTT-----GT-----GGGTTT--G--A-----GC---CCA-----G-C-Tcg
gi|64 : ACT--T-------CTCA-C--CGC---TGA----AGTT-----GT-----CGGTTC--A--A-----TC---TC-----------CGTTC---C------AGA-----ATGTAC----T---TTGTg
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7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus : TCCTCCGTGGCCGAGTGGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCA-C--CGC---TGA----GGTC-----GT-----GGGTTC-G-A------G-C-C-C------G--CTCGGTC---C------AAA--A---AC----T---TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACGG--TGG----------T-----TC---TACT------CAG---GATTCAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAATA-A-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---AAA-AAT
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7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-466 ) : TCCTCCGTGGCCGAGTGGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCAC--CGC---TGA----GGTC-----GT-----GGGTTCG-A------G-C-C-C------G--CTCGGTC---C------AAA--A---AC----T---TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACGG--TGG----------T-----TC---TACT------CAG---GATTCAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAATA-A-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---AAA-AAT
gi|1 : TGATCGAATGGTC-T-T-GAGCG---C---A---GCC------TC--G---A-----G---------AGC-A-CA-TACA--A-------CGCAC--TGC---TCA----GGTC-----GT-----ATGTTCG-G------A-T-C-CA-----A--CTGGGTC---C------AAA--A---AC----CTCATTATA-TAACAA---A-AGT-GT-G-CC---C-T----TT------A--CTTTTGAAAG------AACAG--TGG----------T-----GT---TGCT------CA----TATCCGT---------CTTGA-GT-CTT--C-TTGA---T---C----------CAATA-T-A---A---G-TG--A--TTGT-C------C--AGTC----T-GTCCAAGAG--CCTG----ATAT-C--TCCCG-----AATAAGGCATATT-AA----------CCTCCA----A-T---GAA-AA
gi|10 : tttcgtTCCACGGCAGAGTGGTC-C-A-AGCCA---T---T---GTC------TC--A---A-----G----------TC-AACT-TCCC--T-------CTCAT--CGC---TGA----AGTT-----GT-----GGGTTTG-A------G-T-C-TA-----G--CTAGGTC---T------AAC--A----C----T---TTATG-TGA-GA---A-TTT-TT-G-AT---A-G-----T------A--AATATGGAAA------GGCTA--TAA----------T-----TC---T----------------ATTCAT---------TCTAATGT-CTT--C-GTCC---A---G----------CAATA-A-G---A---C-TG--G----ATGA------C--A-------T-AT---ACTA--CCTGTAGTACAT-GTATGTTA-----AAAAAAGG--TTT-TA----------ACCGCA----T-a
gi|11 : CGTGTCCGAGTGTTC-T-A-AGGCG---C---C---GCC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-GACC--T-------CTCAC--CTC---TAA----TGTC-----GT-----AGGTTCG-A------G-T-C-TT-----G--CTCGCTC---C------TAA--A---TC----T---TTGTG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAA------GACGG--CGG----------T-----TC---TACT------CA----GATTCAT---------CCTGAGGT-CCT--T-CCCT---A---T----------CAGTA-A-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--G-------TAAC---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTA-----AAAATGGC--G-T-AA----------ACCCCA----gcta
gi|12 : TCCACGGCCGAGTGATC-T-A-AGACG---C---C---GTC------TC--A---A-----A---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCAC--TGC---TAA----GGTC-----AT-----AGGTTTA-A------G-T-CGC------A--CTCGCTC---C------AGT--A---AC----T---TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCAGAAG------GACAA--TGG----------T-----TC---TACT------CA--------CAG---------TCTGAGGT-CTT--T-TTCC---A---C----------CAGTA-A-A---A---C-TG--A--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---AAatt
gi|13 : CCTCCGTGGCAAAATAGTC-T-T-AGGTG---C---C---GTC------TC--A---A-----A---------ATC-A-CT-TGCC--A-------CTCAC--CAC---TAA----GTTT-----GT-----AGGTTCG-A------GTC-C-C------G--CTCGCTCA--C------AAG--A---GC-----------TA-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CA---A-G----TT------A--CCTGCGAAAG------GACGG--TGT----------T-----AT---TTCT------CAG---T-TTCAT---------TCTGAGAA-CTT--C-CTCC---A---C----------TAATA-A-A---A---C-TT--G--ATATACATGTATC--A-------C-AT---ATAT--CCTG----AATT-G--TGTCG-----AAAACGGT--GTT-A
gi|14 : TCCTCCATGGCCCAGTGGTC-T-A-AGGCA---C---T---GTC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------C--AC--TGC---TAA----GGTC-----GT-----AGGTTCG-A------GTC-C-C------G--CTAGCAC---C------GAA--A---AC----T---TTTTG-TGA-GA---A-AGT-GT---CC---A-A----TT------A--TTAGTGGAAG------GACAG--TGG----------T-----TC---TACT------CAG-------------------TTTG---T-CTT--C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---AAA-C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTT----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---TAA-
gi|15 : CGTGACCCAGTGGTC---A-AGGCG---C---C---GTT------TC--A---C-----G---------ATC-A-TT-TACC--T-------TTCAC--CGC---TAA----GCGC-----GT-----AGGTTCG-G------GTC-C-C------A--TTCGCTC---A------AAA--A---AC----T---TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-A-AC---A-G----GT------A--CTTGCGGATG------GACAA--TGG----------T-----TC---TACT------CA----GATTCAT---------TCCGACGC-CTT--C-CTCC---G---C----------CAATA-A-A---A---C-AC--G--ATATGC------C--A-------T-AT---GTAA--C---------AT------TT-------AAATAGC--GTT-AA----------TCTCCA----T-T---AAA-
gi|16 : gGAGTGGTC-T-A-AGGTG---C---T---GTTGTTTATTT--A---AT----G---------ATC-A-TT-GACC--A-------CCTAC--CGC---TGA----AGTA-----AT-----AAGTTTA-A------A-C-C-C------A--CACAGAC---C------AAA--A---CC----T---TTATG-TGA-AC---A-GGT-TT-T-CC---A-G----TT------A--TTTGTGGAAG------GTTGA--TGG----------T-----TC---TTC-------CAA---GATTCAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---A----------CAGTA-A-A---A---C-TG--G--ATGTGT------C---------------------------------AT-G--TGTTG-----AAAATGAT--GTT-AA----------ACCC
gi|17 : A-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-C----TT------A--CTTCCTGA--------GGCAGTTTCA----------T-----TC---TACA------CA----GATTCAT---------TCCAAGAT-CTT--T-CTTC----------------------------------C-TG--G----ATGC------C--A-------T-AT---AAAA--Cggtgt
gi|18 : cctccattgccaagtaatttaagaacatgtcttaatatatatttccaaccattgagatcttatgtgtatgactatgtgccatgtcgtaataagcaggtaacgttagaaaGTAGCTGAGTGATC-T-A-AGGTG---C---C---ATC------TC--A---A-----G---------ACC-A-CT-TACC--T-------TTCAT--GGC---TAA----GGTC-----AT-----AGGTTCG-A------G-T-CTC------A--CTCTGTC---C------AAA--A---AC----T---TAATG-TAT-GA---A-AAT-TT-G-TC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------AACAG--TAG----------T-----TG---TACT------CAA---GAT----------------------CTT--T-CTAC---A---T----------CAGTA-A-A-------T-TG--G--ATATGC------C--A-------C-AT------------G----AAAT-G--TGATG-----AAAATGAC--ACT-GA----------Aaagctttatatttcacatt
gi|19 : aTTCGTGGCCGATTGGTC-T-A-AGGCG---T---C---GCC------AC--G---A-----G---------ATC-A-CT-TACC--aca
gi|19 : -TT-G-CC---G-G----TT------A--CTCGCAGAAA------GACTG--TGGCTCTGGGTTGT-----TC---TTCT------CAG----ATACAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CGCC---AACTCTTA-------CAATA-A-A---A---A--G--G--ATATGC------C--A-------T-TT---ATAA--CTTG----GTAT-G--TATTG-----AAACTGAC--GTT-AA----------ACTTCA----T-T---gtcatagttgccggttactcgcagaaagactgtggctctgggttgttcttctcagatacattctgaggtcttccgccaactcttacaataaaaaggatatgccatttataacttggtatgtattgaaactgacgttaaacttcattccaaa
gi|2 : ttcgtggccgattggtctaaggcgtcgccacgagatcacttaccgtcatagTC-A-TT-TACC--T-------T--AC--AGC---TGA----GGTG-----GTTACTAAGGTTCA-A------G-C-C-TT-----G--CTTGGTC---A------AAA--A---AC----T---CCATG-TTA-GA---A-AGT-TT-G-TC---A-G----TT------A--TTTGCAGAAA------GGTAG--TGG----------T-----TC---TAAC------CA----AATTGA----------TCTTATGT-CTT--C-TTCC---A---C----------CAATA-A-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--ATAAAACTT-AT---ATAA--CCTG----AATT-G--TGTTC-----AAAATGG--------------------CCCCA----T-T---AAA-ccaaa
gi|20 : atcctctgtggtcttgttgaaggtgtataattgtcctgtaattAA--A---GC----A---TTATG-TAA-GA---A-AGT-TT-T-CC---A-G----TC------A--CTTGCAG
gi|20 : cctctgttcgaact-C-T------G--CTCGAAC---T------AAA--A----C----A---TTATG-TGA-GG---A-AAT-TT-T-CT---A-G----TC------A--Cctcggaccagtgacttaatttcatatgcctctgctcgaactaaaacattatgtgaggaaattttctagtcacgttctacacgttctacaattagatatgccatatatactctgtaatgggtagaaaaaggcgttaaatccaatt
gi|20 : cctctgttcgaactaaagcattatgtaagaaagttttccagtcacttgcagctcggaccagtgacttaatttcatatgcctTA-C-A---A---T-TA--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAC--TCTG----TAAT-G--GGTAG-----AAAAAGGC--GTT-AA----------ATCCAA----T-T---gttctacacgttctacaattagatatgccatatatactctgtaatgggtagaaaaaggcgttaaatccaatt
gi|21 : cctctgttcgaactaaagcattatgtaagaaagttttccagtcacttgcagctcggaccagtgacttaatttcatatgcctctgctcgaactaaaacattatgtgaggaaattttctagtcacgttctacacgttcCCGTAACCAAGTGTTC-T-A-AGGCG---C---T---GCT------TC--A---A-----A---------ATC-A-TT-TACC--T-------CTCAC--CGC---TAA----GGTC-----GT-----AGGTTCG-A------GTC-C-C------G--CTTGCTCG--T------AAA--A---A----------TATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGTGGAAG------GACGG--T-G----------T-----TC---TACG------CA----GATTCAT---------TCTGCTGT-ATT--C-CTCC---G---A----------AAATA-A-A---A---C-TA--G--CTCTGC------C--A-------T-AT---
gi|22 : TTCA-G------G-C-C-T------GG-TTTGGTC---C------ATA--A---AC----T---TCCTT-TGA-GA---A-AAT-TA-A-CA---A-G----CT------A--CTAGTGGTAT------GACAT--TGG----------T-----TC---TACT------T-G---GATTCAT---------ACTGAGTT-CTG--C-CTTC---A---C----------CAATC-A-A---A---C-TG--G----ATGC------C--A-------T-TT---ATAA--CTCA----CAAT-G--TGTTGGGGAAAAAATGGT--GTT-AA----------GCATCA----T-T---AAA-AAtcaata
gi|23 : tcacttactattcagccaT-----AGGTTCG-A------G-T-CTC------G--TTCGCTC---C------GAA--A---TT----T---CCATG-CGA-GA---A-AGC-T--G-CC---A-G----CT------ATACTTGCAGA----------TGG--TGG----------C-----TC---TACT------CAG----ATTAAT---------TCTGAGGT-TTT--C-CTCT---A---CAAAAATAACCCAA-A-A-ACAGA---C-TG--G--ATATGT------G--A-------T-AC---ATAA--CTTG----AAAT-A--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------TCCTCA----T-T---
gi|24 : TGACCGGGTTGTC-T-A-ATAGA---T---C---GTC------TC----------------------ACC-A-----ACA--T-------TTCAC--CGA---CGA----GTTT-----AT-----GGATTCA-A------G-C-C-CA-----G--CTCGGca
gi|25 : tgtgctatagtaatgacacagaaaaagtgttttcaagtatatacatataatgtaacacaagtttacttcaaattttatggaaacattcttaaaA-GA---A-ACT-TTTG-CCCCGA-G----AC------A--CTTGCGGAAA------GACGG--TGG----------T-----TC---TACT------GTG-------------------TCTAAGGT-AT---C-CTCC---A---C----------AAATA-A-A---A---C-TT--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CATG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GAC-AA----------ACCCAA----T-T---CAATAATcaca
gi|26 : gttcgagtttacagaatacgaaggctaaaTGGCCTAGTGGT----------G---C---T---TTC------TC--A---A-----G---------TTC-AGCC-AACC--T-------CTCCC--TGC---TTA----GGTT-----GT-----GGG-----A------A-C-C-A------G--C---------------------G---AT----T---TAATC-TGA-GA---A-TGT-TG-G-CC---A-A----TT------A--TTTGTATAAA--------------------------------TT---TA---------AA---G---------------TCTAAAGT-CTT--C-CTCT---G-----------------TG-A-A---A---A-TG--G--A-A-GA------T--A-------T-AT---ATAA--CCTG----TAAT-A--TGTTG-----AAAaac
gi|27 : cTT-T-G-AGGCA---C---T---GTC------TC--A---A------------------------------T-------TTCAC--GGA---TGA----TTTT-----GT-----GGGTTCG-T------G-C-C-A------C--CTCAGGC---C------AAA--T---AT----A---TGACG-TGA-GG---C-AGT-TT-A-CC---A-G----TT------C--CTTGCAGA
gi|27 : gtT-CTT--T-TTCT---A---T----------CAATA---A---A---C-TA--A--ATGT-C------C--A--------------ATCA--TCTG----TAAT-C--TGTTA-----AAAATGAC--ACT-AA----------ATCtctttttctatcaataaactaaatgtccaatcatctgtaatctgttaaaaatgacactaaatca
gi|28 : gttttgaggcactgtctcaatttcacggatgattttgtgggttcgtgccacctcaggccaaatatatgacgtgaggcagtttaccagttccttgcagaGTGGTC-C-A-TGTCG---A---C---ATA------TC--A---A-----A---------ATC-A-TT-TATA--T-------CTCAC--TGTAG-TG-----GGTC-----CT-----AGGT--G-A------A-A-C-A------G--TGTGTTC---CTTTAAGAAG--G---ACAATTT---TTCTACTCA-TATTTA-GGT-GT-G-TT---A-G----TT------A--CATTAGGAAG------GACAA--TGG----------T-----TC---TACT------CAa
gi|29 : tgtcttct---AC----T---TTATG-TAA-GA---A-ATT-GA-G-TC---A-GCT--TT------T--TTTGTGGAAG------GATGG--TGG----------T-----TC---TATT------CA----GATTAAT---------TACAAAAT-TGT--C-CTCC---A---C----------CTACC-A-A---A---C-TG--G--ATATAC--------------------------AG--CCTG----TAAT-A--TGTTG-----GAAATTAT--GTT-AA----------AC
gi|3 : tactgctgtattctagcTCTTCCGTGGCCGAGTGGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTC------TC--A---G-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCAC--CGC---TAA----GGTC-----GT-----AGGTTCG-A------T-C-C-C------A--ATCACTC---T------AAA--A---AC----T---TAATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TA------A--CTTGCGGAAG------GACGG--TGG----------T-----TC---TACT------CCGTCTGACTCAG---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---A---C-TT--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATTGC--GCT-AA----------ACCCCA----T-T---AAA-AATaa
gi|31 : CCATAGCCGGGTGATC-T-A-GGGCA---T-------GTC------TC--A---A-----T---------ATC----T-CACC--T-------GTCAC--CGC---TGA----GGTT-----GT-----GGGTTCA-A------G-A-C-C-------------------------------A---GC----T---------TGA-GA---A-GGT-TT-A-CC----------TT-------------------------GACAG--TGG----------T-----TC---TGCT------C-T---GATTCG----------TCTGAGCT-TTTAAC-TTTC---A---C----------CA
gi|32 : GCTGAGTGAGC-T-A-AGGCA---C---C---ATC------TC--A---A-----G---------GTC-A-CT-TACC--T-------CTTAA--TGC---TGA----GGTC-----AT-----GGGTTCA-A------ATC-C-C------A--CTCGATT---C------AAA--A---AC----------AT---------------T-TT-A-CC---A-G----TC------A--CTTGCAGAAG------GGTAG--TGG----------T-----TC---TACT------C
gi|33 : aTTCTCTGTGGCAGAGCAGTT-A-A-AATTG---C---A---ATC------AC--A---T-----G---------ATC-A-CC-AATC--T-------CT-AC--CAC---TGA----GAAT-----GT-----GGACACC-A------A-C-C-T------G--TTCA--------------------------------TTA-----A-GG---A-AATATT-G-CC---A-G----TC------A--CTTTCGGGAA------GACGG---GA----------T-----TC---tga
gi|34 : aggaT------A--CTTGCAGA-G------AATGC--TGG----------T-----TC---TACT------CAC----ATTCAT---------TCTGAGGT-CTG--C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---A---C-TA--G--ATATGT------T--A-------A-GT---ATAA--CCTT----TTAT-G--TGTTG-----TAAATGAT--CTT-TA----------ACACCA----T-T---AAA-
gi|35 : gtgaTCTTCCGCAGTCAGGTGGTC-C-A-GGGCG---C---T---GGC------TC--A---G-----G---------GTG-A-CT-TACT--T-------TTTA--------------------------------GGAGCCG-A------A-C-C--------G---TCAGTT---C------AAT--C---AC----T-------G-CGG------------------C---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACCA--TGA----------T-----TC---TA
gi|36 : gCTGAGGT-TGT--C-CTCC---A---T----------CAAT----A---A---C-CG--A----ATGC------C--T-------T-AT---ATAA--TC-------AATGG--TGTTG-----CAAAtccg
gi|37 : gggagatgtcggtgatttggtttgattaaatttaaggGTGGTA-T-A-ATGCG---C---T---GTC------TTCTA---A-----T---------GTCCA-CT-GACC--T-------TCCGC--CGC---TGA----AGTC-----TT-----GGATGTG-A------G-CGC-A------G--CTAGGTT---T------AAA--A---ACAA--G---TTATG-TTATGA---A-Aaccttacaaaaaaaaccctca
gi|38 : ggttcctctacTTCACGGCCAAATGCTC-CCA-AGACA---A---T---GTC------TC--A---A-------------------------ACC--T-------CTCAG--CAA---TGA----GGTT-----GT-----GAATTCGAA------A-T-C-T------G--GTTGGTCAGTT------AAATCA---A----------TATG-T---AA---A-AGT-TC-A-CT---T-G----TC------A--CTa
gi|39 : TGGTCAAGTGGTC-T-A-AGGCA---C---C---ATC------TC--A---ATTTCTGTATCTATTCACC-A-CTCCACC--A-------CTCAC--TAC---TGA----GGTG-----GT-----CGGT
gi|4 : ggagttcttttTCCTCC-TGGCTGTGTGGTCGT-T-AGATA---C---T---GTG------TC--A---A-----A---------ATC-A-CT-TGCC--T-------CTTGT--CG----TGACCAGGGTTTAATGGG-----GGGTTCA-AGGTCAGG-C-C-A------G--CTGAGTG---T------AAA--C---CT----T---TTTTA-TTG-GA---G-A----T-G-CC---A-GAGATTT------C--CTTAT--AAG------GACAG--TTA----------TAA---TCAGTTACTTTTATACAG-----TTC-T---------TCTCAGATGAAT--C-CTTC---A---C----------CACTA-T-A---A---C-TG--GTTATTTGC------C--A-------T-AT---A--------A----AAAT-AT-TGTTG-----AAAAaaaatctcaataagtttaaaa
gi|40 : gg------TC--A---A-----G---------GTC-A-CT-AACC--T-------CTCAC--CGT---TAA----GGTT-----GT-----GTGTTCG-A------G-C-C-CA-----G--CTTGGT
gi|40 : aTGC------C--A-------T-AT---ATAG--TCTG----AATT-G--TGTTG-----GAAATGAC--GTTAAA----------ACACCC----T-T---AAA-tgccatatatagtctgaattgtgttggaaatgacgttaaaacacccttaaaa
gi|41 : atcaaggtcactaacctctcaccgttaaggttgtgtgttcgagcccagcttggt--T-------CTTGT--CAT---TGT----GGTG-----GT-----GAGTTCG-A------A-T-C-C------AGACT-GGTT----------AAA--A---AC----C---CG--G-TGA-GC---T-GGT-TT-G-CC---A-G----TT------T--CTTGTG
gi|42 : ctctttggcaaagcaacctaaggaattg-----TC---TATT------CAG---AAAT-AT---------ACTAAGGT-CTTA-C-CCCC---A---A----------CAATA-C-A---A---C-TA--G--ATA--C------A--A-------TGAT---AT------TG----TAAT-G--TGTTG-----ATGTTTGC--GTC-AA----------ata
gi|43 : gacG---C---A---GTC------TC--A---G-----G---------ATC-A-CT-TA-------------TCAC--------TGA----GGTG-----GT-----GAGTTTG-A------G-C-C-C------AA-CTTGG-C---C------TAA--A---AC----T---GT-TC-TGA-GA---A-AGG-TT-A-CC---A-G----TT------A--CTTGTGAAAG------AACtcgatatacaagtaaat
gi|44 : ctACA--T-------CTCAAAACGC-----A----GTTC------T-----AAGTTCG-A--------C-T-CTA----G--TTAGGCC---C------AAA--A---AC----T---TTATG-TGC-GA---A-AGT-TT-GCCC---A-G----TT------
gi|45 : tgCTCCGTGACCAAGGGGTC-T-A-AAGCG---C--------TC------TC--GTTTA-----GCC-------ATC-A----TATCAAT-------CTCAC--CGCAATTGA-------C-----GT------GGTTCA-A------G-C-CAC------A--CTTAGTtaaatagaaggatattcattc
gi|46 : TG-TGA-TA---ATAGT-T--G-CA---A-G----TT------A--CTTGCGTAAG------GACAA--GGA----------T-----TT---TAAT------CA----GATTGAT---------tggtaaag
gi|47 : tgttacagtatatttactcacTCCTCCTTGAACAAGTG----T-A-AGATG---C---T---GTT------TT--G---A-----GG--------ATT-A-CT-TGCC--C-------TTCAC--CGC---TCT----GATC-----CT------GGTTCA-A------A-C-C-C------gacatatttcaccagt
gi|48 : CCGAGGT-CCT--C-TTCC---A---T----------CAATA-A-A---A---C-TG--A--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTT----AAAT-G--TGTT------AAAATGAT--GTT-AATGTTTTTTTTACCCCA----T-T---AAA-taaacattacactaaaga
gi|5 : TCCTTGGTCGAGAGATC-T-A-AGGCA---CTCCC---GTT------TG--A---T-----G---------GCC-A-CT-CATC--A-------CCCAT--CGT---TGA----AGTC-----AG-----GGAGTCG-A------G-C-A-CA-----G--TTCGGTC---------------A---A-----T---TTATG-TGT-GA---A-AGT-GA-G-CC---A-G----TT------T--TTCGCTGCAG------GACTG--TGT----------T-----TC---TACT------C-C---GATGTAT---------TCTGAGTG-CTT--C-CTC
gi|50 : agtatgtattgtacgaaatcaaaatagggtgtGTGAAAGACT---GACGA--T------------T-----TC---T--T------AAG---GATTTAT---------TC-GAGTT-GTT--C-CCCC---A---T----------CAATA-A-A---A---C-C------AAATGG------C--A-------T-A-----------------------A--TGTTG-----GAAGTGAC--ATT-AA----------ACattatgcatttgtcgaaagtgaataaatatattcaaactgaa
gi|51 : ----------T-----TG---TACT------CAT---GATTCATATCTATGGATCTGGGGT-CTC--C-TTCA---A---C----------CAATA-C-A---A---C-TG--A--AT-T-C------C--A-------T-A------------------AAAC-A--TGCTG-----AAAATTGA--GTT-
gi|52 : ttaCAT---------TTTGAGGT-CTT--T-CCCT---T---T----------CAGTA-ATA---A---C-TG--G--AT--GC------T--A-------T-A----ATA-----CG----AAAT-G--TGTTG-----GAAACGGA--GTT-TA----------TCCCCA----T-TCACAAA-
gi|53 : aTCCTCAATGGCAGAGTTATC-T-A-ATGCG---A---T---GTCCT----TT--A---AT----G---------ACC-A-CT-T-------------CTTAC--CAC---TTA----TGTC-----GT-----GGTTTCG-A------G-C-C-C------
gi|54 : ggTCCTCCGTGCCCTAATAGTC-C-A-AGGCG---A---T---GCA------TC--A---A------------------------TAAC--A-------GTCAT--CGC---TGA----GAAA-----GA-----AGGTTCG-A------A-C-C-CA-----G--CTTGagc
gi|55 : acagaC--TGC---TGA----GGTT-----CT-----GGTTTCG-AA-----G-C-C-T------G--CTCA--------------------------------TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CT---ATG----CT------A--TTTACAAAAG------GATTA--TGA----------T-----TT---TA
gi|56 : ---GATTGAT---------TCTGCAGT-CTT--CTCTCC---A---C----------CAAAA-A-A---AAACC-TG--G---T-TGC------C--A-------T-AT---ATAA--C--A----AAAC-G--TGTTG-----AAAAt
gi|57 : -------CTCAT--TGT---TGA----GGTC-----AT-----GAGTTTG-A------G-C-A-CAAGTGAG--CTCAGTC---C-------AA--A---CC----A---TTATG-T-A-TA---A-AGT-TA-A-CC---A-G----TG------A--CTTGctgagtgaa
gi|58 : T--T-CTTC---A---C----------CAATA-A-C-------C-TG--T--GT-TAC------C--A-------T-AT---ATAA--CATG----ACGT-G--GATTG-----CCA-TGAT--GTT-AA----------ACCCCA----T-
gi|59 : CCTCTGTAGGAGAATGGTC-T-A-ACGCG---C---C---GTT------TC--G---G-----G---------ATC-A-TT-TACA--T-------CTCAC--C------AA----AGTC-----AT-----AGGTTCG-A------aatacatgt
gi|6 : CCGAGTGGTC-T-A-AGACG---C---T---GTC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-AACA--T-------CTCAC--TGC---AGA----AGTC-----GT-----AGGTTCG-A------G-TAC-C------A--CTTTGTC---C------AAA--A---AC----T---TTATG-TGA-AA---A-TGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACGT--TGG----------T-----TC---TGCT------C-G---GATACAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTTC---A---C----------CATTA-A-A---A---C-TG--G--ACATGC------CATA-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTCC-----AAAATGGT--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---TAA-atacc
gi|60 : ccc-----G---------ATC-A-CT-AACC--T-------GTTAC--CAT---AGA----GGTC-----AC-----GAGTTTA-A------G-C-C-CA-----G--CTCAGT
gi|61 : tcatcatgtA-GA---A-AAT-TT-G-TT---A-G----TTGTATGTA--CATGTAGATA------GACGA--TGG----------T-----TC---TACA------CGG---AATtatacatgcatgaat
gi|63 : ttcatagaaatatttCATGGCATAGTGGCA-T-AGAGGCA---T---T---GTC------TT--A---A-----G---------AGT-A-CT-T---------------------GC---TGA----GGTT-----GT-----GGGTTTG-A------G-C-C-CA-----G--CTcg
gi|64 : ACT--T-------CTCAC--CGC---TGA----AGTT-----GT-----CGGTTCA-A------T-C-T-C-----------CGTTC---C------AGA--ATGTAC----T---TTGTg
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7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus : TCCTCCGTGGCCGAGTGGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCAC--CGC---TGA----GGTC-----GT-----GGGTTCG-A------G-C-C-C------G--CTCGGTC---C------AAA--A---AC----T---TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACGG--TGG----------T-----TC---TACT------CAG---GATTCAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAATA-A-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---AAA-AAT
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gi|28 : gttttgaggcactgtctcaatttcacggatgattttgtgggttcgtgccacctcaggccaaatatatgacgtgaggcagtttaccagttccttgcagaGTGGTC-C-A-TGTCG---A---C---ATA------TC--A---A-----A---------ATC-A-TT-TATA--T-------CTCAC--TGTAG-TG-----GGTC-----CT-----AGGT--G-A------A-A-C-A------G--TGTGTTC---CTTTAAGAAG--G---ACAATTT---TTCTACTCA-TATTTA-GGT-GT-G-TT---A-G----TT------A--CATTAGGAAG------GACAA--TGG----------T-----TC---TACT------CAa
gi|29 : tgtcttct---AC----T---TTATG-TAA-GA---A-ATT-GA-G-TC---A-GCT--TT------T--TTTGTGGAAG------GATGG--TGG----------T-----TC---TATT------CA----GATTAAT---------TACAAAAT-TGT--C-CTCC---A---C----------CTACC-A-A---A---C-TG--G--ATATAC--------------------------AG--CCTG----TAAT-A--TGTTG-----GAAATTAT--GTT-AA----------AC
gi|3 : tactgctgtattctagcTCTTCCGTGGCCGAGTGGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTC------TC--A---G-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCAC--CGC---TAA----GGTC-----GT-----AGGTTCG-A------T-C-C-C------A--ATCACTC---T------AAA--A---AC----T---TAATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TA------A--CTTGCGGAAG------GACGG--TGG----------T-----TC---TACT------CCGTCTGACTCAG---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---A---C-TT--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATTGC--GCT-AA----------ACCCCA----T-T---AAA-AATaa
gi|31 : CCATAGCCGGGTGATC-T-A-GGGCA---T-------GTC------TC--A---A-----T---------ATC----T-CACC--T-------GTCAC--CGC---TGA----GGTT-----GT-----GGGTTCA-A------G-A-C-C-------------------------------A---GC----T---------TGA-GA---A-GGT-TT-A-CC----------TT-------------------------GACAG--TGG----------T-----TC---TGCT------C-T---GATTCG----------TCTGAGCT-TTTAAC-TTTC---A---C----------CA
gi|32 : GCTGAGTGAGC-T-A-AGGCA---C---C---ATC------TC--A---A-----G---------GTC-A-CT-TACC--T-------CTTAA--TGC---TGA----GGTC-----AT-----GGGTTCA-A------ATC-C-C------A--CTCGATT---C------AAA--A---AC----------AT---------------T-TT-A-CC---A-G----TC------A--CTTGCAGAAG------GGTAG--TGG----------T-----TC---TACT------C
gi|33 : aTTCTCTGTGGCAGAGCAGTT-A-A-AATTG---C---A---ATC------AC--A---T-----G---------ATC-A-CC-AATC--T-------CT-AC--CAC---TGA----GAAT-----GT-----GGACACC-A------A-C-C-T------G--TTCA--------------------------------TTA-----A-GG---A-AATATT-G-CC---A-G----TC------A--CTTTCGGGAA------GACGG---GA----------T-----TC---tga
gi|34 : aggaT------A--CTTGCAGA-G------AATGC--TGG----------T-----TC---TACT------CAC----ATTCAT---------TCTGAGGT-CTG--C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---A---C-TA--G--ATATGT------T--A-------A-GT---ATAA--CCTT----TTAT-G--TGTTG-----TAAATGAT--CTT-TA----------ACACCA----T-T---AAA-
gi|35 : gtgaTCTTCCGCAGTCAGGTGGTC-C-A-GGGCG---C---T---GGC------TC--A---G-----G---------GTG-A-CT-TACT--T-------TTTA--------------------------------GGAGCCG-A------A-C-C--------G---TCAGTT---C------AAT--C---AC----T-------G-CGG------------------C---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACCA--TGA----------T-----TC---TA
gi|36 : gCTGAGGT-TGT--C-CTCC---A---T----------CAAT----A---A---C-CG--A----ATGC------C--T-------T-AT---ATAA--TC-------AATGG--TGTTG-----CAAAtccg
gi|37 : gggagatgtcggtgatttggtttgattaaatttaaggGTGGTA-T-A-ATGCG---C---T---GTC------TTCTA---A-----T---------GTCCA-CT-GACC--T-------TCCGC--CGC---TGA----AGTC-----TT-----GGATGTG-A------G-CGC-A------G--CTAGGTT---T------AAA--A---ACAA--G---TTATG-TTATGA---A-Aaccttacaaaaaaaaccctca
gi|38 : ggttcctctacTTCACGGCCAAATGCTC-CCA-AGACA---A---T---GTC------TC--A---A-------------------------ACC--T-------CTCAG--CAA---TGA----GGTT-----GT-----GAATTCGAA------A-T-C-T------G--GTTGGTCAGTT------AAATCA---A----------TATG-T---AA---A-AGT-TC-A-CT---T-G----TC------A--CTa
gi|39 : TGGTCAAGTGGTC-T-A-AGGCA---C---C---ATC------TC--A---ATTTCTGTATCTATTCACC-A-CTCCACC--A-------CTCAC--TAC---TGA----GGTG-----GT-----CGGT
gi|4 : ggagttcttttTCCTCC-TGGCTGTGTGGTCGT-T-AGATA---C---T---GTG------TC--A---A-----A---------ATC-A-CT-TGCC--T-------CTTGT--CG----TGACCAGGGTTTAATGGG-----GGGTTCA-AGGTCAGG-C-C-A------G--CTGAGTG---T------AAA--C---CT----T---TTTTA-TTG-GA---G-A----T-G-CC---A-GAGATTT------C--CTTAT--AAG------GACAG--TTA----------TAA---TCAGTTACTTTTATACAG-----TTC-T---------TCTCAGATGAAT--C-CTTC---A---C----------CACTA-T-A---A---C-TG--GTTATTTGC------C--A-------T-AT---A--------A----AAAT-AT-TGTTG-----AAAAaaaatctcaataagtttaaaa
gi|40 : gg------TC--A---A-----G---------GTC-A-CT-AACC--T-------CTCAC--CGT---TAA----GGTT-----GT-----GTGTTCG-A------G-C-C-CA-----G--CTTGGT
gi|40 : aTGC------C--A-------T-AT---ATAG--TCTG----AATT-G--TGTTG-----GAAATGAC--GTTAAA----------ACACCC----T-T---AAA-tgccatatatagtctgaattgtgttggaaatgacgttaaaacacccttaaaa
gi|41 : atcaaggtcactaacctctcaccgttaaggttgtgtgttcgagcccagcttggt--T-------CTTGT--CAT---TGT----GGTG-----GT-----GAGTTCG-A------A-T-C-C------AGACT-GGTT----------AAA--A---AC----C---CG--G-TGA-GC---T-GGT-TT-G-CC---A-G----TT------T--CTTGTG
gi|42 : ctctttggcaaagcaacctaaggaattg-----TC---TATT------CAG---AAAT-AT---------ACTAAGGT-CTTA-C-CCCC---A---A----------CAATA-C-A---A---C-TA--G--ATA--C------A--A-------TGAT---AT------TG----TAAT-G--TGTTG-----ATGTTTGC--GTC-AA----------ata
gi|43 : gacG---C---A---GTC------TC--A---G-----G---------ATC-A-CT-TA-------------TCAC--------TGA----GGTG-----GT-----GAGTTTG-A------G-C-C-C------AA-CTTGG-C---C------TAA--A---AC----T---GT-TC-TGA-GA---A-AGG-TT-A-CC---A-G----TT------A--CTTGTGAAAG------AACtcgatatacaagtaaat
gi|44 : ctACA--T-------CTCAAAACGC-----A----GTTC------T-----AAGTTCG-A--------C-T-CTA----G--TTAGGCC---C------AAA--A---AC----T---TTATG-TGC-GA---A-AGT-TT-GCCC---A-G----TT------
gi|45 : tgCTCCGTGACCAAGGGGTC-T-A-AAGCG---C--------TC------TC--GTTTA-----GCC-------ATC-A----TATCAAT-------CTCAC--CGCAATTGA-------C-----GT------GGTTCA-A------G-C-CAC------A--CTTAGTtaaatagaaggatattcattc
gi|46 : TG-TGA-TA---ATAGT-T--G-CA---A-G----TT------A--CTTGCGTAAG------GACAA--GGA----------T-----TT---TAAT------CA----GATTGAT---------tggtaaag
gi|47 : tgttacagtatatttactcacTCCTCCTTGAACAAGTG----T-A-AGATG---C---T---GTT------TT--G---A-----GG--------ATT-A-CT-TGCC--C-------TTCAC--CGC---TCT----GATC-----CT------GGTTCA-A------A-C-C-C------gacatatttcaccagt
gi|48 : CCGAGGT-CCT--C-TTCC---A---T----------CAATA-A-A---A---C-TG--A--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTT----AAAT-G--TGTT------AAAATGAT--GTT-AATGTTTTTTTTACCCCA----T-T---AAA-taaacattacactaaaga
gi|5 : TCCTTGGTCGAGAGATC-T-A-AGGCA---CTCCC---GTT------TG--A---T-----G---------GCC-A-CT-CATC--A-------CCCAT--CGT---TGA----AGTC-----AG-----GGAGTCG-A------G-C-A-CA-----G--TTCGGTC---------------A---A-----T---TTATG-TGT-GA---A-AGT-GA-G-CC---A-G----TT------T--TTCGCTGCAG------GACTG--TGT----------T-----TC---TACT------C-C---GATGTAT---------TCTGAGTG-CTT--C-CTC
gi|50 : agtatgtattgtacgaaatcaaaatagggtgtGTGAAAGACT---GACGA--T------------T-----TC---T--T------AAG---GATTTAT---------TC-GAGTT-GTT--C-CCCC---A---T----------CAATA-A-A---A---C-C------AAATGG------C--A-------T-A-----------------------A--TGTTG-----GAAGTGAC--ATT-AA----------ACattatgcatttgtcgaaagtgaataaatatattcaaactgaa
gi|51 : ----------T-----TG---TACT------CAT---GATTCATATCTATGGATCTGGGGT-CTC--C-TTCA---A---C----------CAATA-C-A---A---C-TG--A--AT-T-C------C--A-------T-A------------------AAAC-A--TGCTG-----AAAATTGA--GTT-
gi|52 : ttaCAT---------TTTGAGGT-CTT--T-CCCT---T---T----------CAGTA-ATA---A---C-TG--G--AT--GC------T--A-------T-A----ATA-----CG----AAAT-G--TGTTG-----GAAACGGA--GTT-TA----------TCCCCA----T-TCACAAA-
gi|53 : aTCCTCAATGGCAGAGTTATC-T-A-ATGCG---A---T---GTCCT----TT--A---AT----G---------ACC-A-CT-T-------------CTTAC--CAC---TTA----TGTC-----GT-----GGTTTCG-A------G-C-C-C------
gi|54 : ggTCCTCCGTGCCCTAATAGTC-C-A-AGGCG---A---T---GCA------TC--A---A------------------------TAAC--A-------GTCAT--CGC---TGA----GAAA-----GA-----AGGTTCG-A------A-C-C-CA-----G--CTTGagc
gi|55 : acagaC--TGC---TGA----GGTT-----CT-----GGTTTCG-AA-----G-C-C-T------G--CTCA--------------------------------TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CT---ATG----CT------A--TTTACAAAAG------GATTA--TGA----------T-----TT---TA
gi|56 : ---GATTGAT---------TCTGCAGT-CTT--CTCTCC---A---C----------CAAAA-A-A---AAACC-TG--G---T-TGC------C--A-------T-AT---ATAA--C--A----AAAC-G--TGTTG-----AAAAt
gi|57 : -------CTCAT--TGT---TGA----GGTC-----AT-----GAGTTTG-A------G-C-A-CAAGTGAG--CTCAGTC---C-------AA--A---CC----A---TTATG-T-A-TA---A-AGT-TA-A-CC---A-G----TG------A--CTTGctgagtgaa
gi|58 : T--T-CTTC---A---C----------CAATA-A-C-------C-TG--T--GT-TAC------C--A-------T-AT---ATAA--CATG----ACGT-G--GATTG-----CCA-TGAT--GTT-AA----------ACCCCA----T-
gi|59 : CCTCTGTAGGAGAATGGTC-T-A-ACGCG---C---C---GTT------TC--G---G-----G---------ATC-A-TT-TACA--T-------CTCAC--C------AA----AGTC-----AT-----AGGTTCG-A------aatacatgt
gi|6 : CCGAGTGGTC-T-A-AGACG---C---T---GTC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-AACA--T-------CTCAC--TGC---AGA----AGTC-----GT-----AGGTTCG-A------G-TAC-C------A--CTTTGTC---C------AAA--A---AC----T---TTATG-TGA-AA---A-TGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACGT--TGG----------T-----TC---TGCT------C-G---GATACAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTTC---A---C----------CATTA-A-A---A---C-TG--G--ACATGC------CATA-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTCC-----AAAATGGT--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---TAA-atacc
gi|60 : ccc-----G---------ATC-A-CT-AACC--T-------GTTAC--CAT---AGA----GGTC-----AC-----GAGTTTA-A------G-C-C-CA-----G--CTCAGT
gi|61 : tcatcatgtA-GA---A-AAT-TT-G-TT---A-G----TTGTATGTA--CATGTAGATA------GACGA--TGG----------T-----TC---TACA------CGG---AATtatacatgcatgaat
gi|63 : ttcatagaaatatttCATGGCATAGTGGCA-T-AGAGGCA---T---T---GTC------TT--A---A-----G---------AGT-A-CT-T---------------------GC---TGA----GGTT-----GT-----GGGTTTG-A------G-C-C-CA-----G--CTcg
gi|64 : ACT--T-------CTCAC--CGC---TGA----AGTT-----GT-----CGGTTCA-A------T-C-T-C-----------CGTTC---C------AGA--ATGTAC----T---TTGTg
gi|65 : cgaatgaacacaaCCTCTGTGGCCATGTGGTA-T-A--GGTG---T---C---AAC------TC--G---A-----A---------ATC-A-CA-TACC--T-------CTCAC--TGC---TGtt
gi|67 : gcGTGGCCGAGTGATC-T-A-ATGGG---C---T---TTC------TC--A---T-----G---------ATC-G-CA-TACA--T-------TGCAC--CA----TGA----GGtcagagtt
gi|69 : ggtctttctaTC------TC--A---G-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTAGT--TGC---TGA----GATT-----TT-----GGGTTCA-A------
gi|7 : CTCCTTGGCCAAGTGGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTT------T---A---A-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCAT--CGC---TTA----GGTC------T-----AA-TTCG-A------G-T-CTC------G--TTCGCTC---C------AAA--A----C----T---TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT---CC---A-G----TT------A--CTTGCGAAAG------GACAG--TGG----------T-----TC---TACT------CAGTCTGACTCAG---------TCTGAGGT--TT--C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---A---C-TG--G--ATATAC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAACGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---tgctgtctcaaagttgattca
gi|70 : TCTGGGGCCTAAGGGTT-T-A-AGGTT---C---T---GTC------TC--A---G-----T---------ATC-A-CT-TACT--T-------CTTTC--AGC---TGA----GATT-----Gta
gi|71 : TCTTCCGTGGCCGAGTTGTG-G-A-CGGCGCTTC---C---GTC-------C--A---GT----G---------ACA-A-CT-TACT--T-------CTCAC--
gi|72 : agaa----------CAGTA-A-A---A---CCTGATG--ACATAA------T--T-------T-AT---ATAA--TCTG----TAAT-G--GATTG-----AAAATTGC--ATT-AA----------AC
gi|73 : C-T-A-AGG-A---C---CTTGGT-------TC--A---A-----G---------GTC-A-CT-TGCC--T-------CTCTC--AGC---TGA----GGGC-----AT-----GGGTT
gi|74 : a------TC--A---A-----G---------ATC-A-TT-TACT--T-------CT--------------------TC-----AT-----GGG----------------C-C------A-----GATT---C------AAA--A---AC----T-------G-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----aaggtc
gi|75 : tCC---A---A----------TAATA-A-A---A---T-TG--G--ATG------------A-------C-AT---ATAA--T-TA----TAAT-C--TATTG-----AAAATGGT--GTT-AA----------ACC
gi|77 : caTT--C-CTCCGTCA---G----------CAATA-A-A---A---C-TG--G--AT--GC------C--A------------------------------GT-G--TGTTG-----AAAATGGT--TTT-AA----------ACC
gi|78 : gtTCCGTGGCCAAATG---------------------------------TC--A---A-----AC--------ATC-A-CC-AGGC--T-------CTCAC--TGC---TGA----GGCT-----GT-----GTGT
gi|79 : tG-CGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G-----T------A--CTTGCAAAAAAACAACAACAA--CAG----------T-----TC---TATT------CAG---c
gi|8 : CCGCGGCCAA-TAGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTC------TG--A---A-----G---------AAC-A-TT-TACC--T-------CTCAC--CGC---TAA----AGTT-----GC-----AGGTTCA-A------GTT-C-C------G--TTC-GCC---C------GAA--A---AC----T---TTATT-TGA-GA---A-ATG-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------ACCGG--TGG----------TACTTCTC---T-CT------CA----GATTCAT---------TCCGAGGT-CTT--T-CTCC---A---C----------CATTA-A-A---A---C-TG--G--ATATGT------C----------T--T---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG------AAATAGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-C---Aa
gi|80 : g----------T-----CC---TATT------CAG----ATTCAT---------TCTGAGGT-TTG--C-CTCG---G---C----------C---A-A-A---A---C-TA--G--GCATt
gi|81 : CATGGCTCAGTGGTC-----AGACA---T---T---GTT------TC--A---A-----G---------AGC-A-TT-TAtgttaa
gi|82 : catcagggtccga--A-------T-AC---ATAA--CCTG----TCAT-G--TGTTG-----AAAACGTC--TTT-AA----------TCCCCAGTGTT-T---AAA-
gi|83 : TC------GC--A---A-----G---------ATC-A-CT-CACC--TCCTATTGCTCAG--TGC---TGA----GGTC-----AT-----AGGTTCA-A------
gi|85 : AA--A---AC----T---TTGTG-TGA-GA---G-AAC-TT-T-CC---A-G----GT------A--CCTGTGGAAG------AACAG--T
gi|86 : ttcCTGAGAT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---G---C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----
gi|87 : -TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGAAGC------GGTAG--TGG----------T-----TT---TACA------CA
gi|88 : aaataACAG--TGA----------T-----TC---TACT------CAG----ATTAAT---------TCTGAGGT-CTT--T-CTCC---A---C----------CAATA-A-cagtc
gi|89 : ---AT----T---TTATA-TGA-GA---A-AGG-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCAGA
gi|9 : TCTGTAGGAGAATGGTC-T-A-ATGCG---C---C---GTC------TC--G---G-----G---------ATC-A-TT-TACC--T-------CTCTC--CA------A----AGTC-----AT-----AGGTTCG-A------G-TAC-C------G--CTTGCTC---C------AAA--A---AC----T-------G-TGA-GA---A-AGT-TT-G-TC---A-G----AT------A--CTTGCGGAAG------AACGG--TGA----------T-----TC---TATT------CAG----ATTCAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCT---A---C----------CAATA-C-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--GGTTG-----AACATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----TAC---AAA-AAccgattatgttt
gi|90 : ---------TCTGAGGT-CT---C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--
gi|91 : ag----------T-----TC----ACT------C-G---GATTCAC---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAATATA-A---A---
gi|92 : ---ATAATGCCTG----AAAT-G--TG--------GAAATGGT--GTT-AA----------ACC
gi|93 : aaaagtggTCCTCCATGGCTCAGTGGTC-----AGACA---T---T---GTT------TC--A---A-----G---------A
gi|94 : gT-CTT--T-TTCC---A---C----------AAAAG-A-A---A---C-CT--G--GT-TGC------C--A-------T-AT---ATAA--
gi|95 : -G--TGTTG-----AAAATGGT--GTT-AA----------ACACCA----T-T---AAA-AAT
gi|96 : agTCCTGCTTGGCCAAGTGGTC-T-A-AGG---------C---GTC------TT--A---A-----
gi|97 : GTTT-----AAAACGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---AAA-AAta
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blockSeqs : . CTTG CT . . GCC G . . . AG . . . GT A CAGA C AGTT . . AAG . . . CT . . ACT G . . AA . . GTCTG . A . . TTA . AA . . . . . G . . C A . T . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . TG . . . . . . . . GT A CTAG C AC . . T . . . . . . . A . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . C . . . G . . . . . . . . GT . TTG G C . . T . . . . . . . A . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . C . . . A . . . . . . . . G . TCG A C . . T . . . . . . . T . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . T C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . A . . . . . . . . G . CAG C C . . A . . . . . . . A . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . .
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originalCons : TCCTCCGTGGCCGAGTGGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCAC--CGC---TGA----GGTC-----GT-----GGGTTCG-A------G-C-C-C------G--CTCGGTC---C------AAA--A---AC----T---TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACGG--TGG----------T-----TC---TACT------CAG---GATTCAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAATA-A-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---AAA-AAT
finalCons : TCCTCCGTGGCCGAGTGGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCAC--CGC---TGA----GGTC-----GT-----GGGTTCG-A------G-C-CCAG--------CTCGGTC---C------AAA--A---ACT-------TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACGG--TGG----------T-----TC---TACT------CAG---GATTCAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAATA-A-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---AAA-AAT
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|66 ): ATAGGGTCATCTGTGTTCAAGTAGTTCAAGGCACTGTCTTAATGCCACTAACCCTCACTGGCTA
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consensus : TCCTCCGTGGCCGAGTGGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCAC--CGC---TGA----GGTC-----GT-----GGGTTCGAG--C---C-C-----A---GCTCGGTC--------C------AAA--A---AC----T---TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACGG--TGG----------T-----TC---TACT------CAG---GATTCAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAATA-A-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---AAA-AAT
Reference ( family-466 ) : TCCTCCGTGGCCGAGTGGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCAC--CGC---TGA----GGTC-----GT-----GGGTTCGAG--C---C-C-----A---GCTCGGTC--------C------AAA--A---AC----T---TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACGG--TGG----------T-----TC---TACT------CAG---GATTCAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAATA-A-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---AAA-AAT
gi|1 : TGATCGAATGGTC-T-T-GAGCG---C---A---GCC------TC--G---A-----G---------AGC-A-CA-TACA--A-------CGCAC--TGC---TCA----GGTC-----GT-----ATGTTCGGA--T---C-C-----A---ACTGGGTC--------C------AAA--A---AC----CTCATTATA-TAACAA---A-AGT-GT-G-CC---C-T----TT------A--CTTTTGAAAG------AACAG--TGG----------T-----GT---TGCT------CA----TATCCGT---------CTTGA-GT-CTT--C-TTGA---T---C----------CAATA-T-A---A---G-TG--A--TTGT-C------C--AGTC----T-GTCCAAGAG--CCTG----ATAT-C--TCCCG-----AATAAGGCATATT-AA----------CCTCCA----A-T---GAA-AA
gi|10 : tttcgtTCCACGGCAGAGTGGTC-C-A-AGCCA---T---T---GTC------TC--A---A-----G----------TCAA-CT-TCCC--T-------CTCAT--CGC---TGA----AGTT-----GT-----GGGTTTGAG--T---C-T-----A---GCTAGGTC--------T-------AA--C---AC----T---TTATG-TGA-GA---A-TTT-TT-G-AT---A-G-----T------A--AATATGGAAA------GGCTA--TAA----------T-----TC---T----------------ATTCAT---------TCTAATGT-CTT--C-GTCC---A---G----------CAATA-A-G---A---C-TG--G----ATGA------C--A-------T-AT---ACTA--CCTGTAGTACAT-GTATGTTA-----AAAAAAGG--TTT-TA----------ACCGCA----T-a
gi|11 : CGTGTCCGAGTGTTC-T-A-AGGCG---C---C---GCC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-GACC--T-------CTCAC--CTC---TAA----TGTC-----GT-----AGGTTCGAG--T---C-T-----T---GCTCGCTC--------C------TAA--A---TC----T---TTGTG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAA------GACGG--CGG----------T-----TC---TACT------CA----GATTCAT---------CCTGAGGT-CCT--T-CCCT---A---T----------CAGTA-A-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--G-------TAAC---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTA-----AAAATGGC--G-T-AA----------ACCCCA----gcta
gi|12 : TCCACGGCCGAGTGATC-T-A-AGACG---C---C---GTC------TC--A---A-----A---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCAC--TGC---TAA----GGTC-----AT-----AGGTTTAAG--T---CGC-----A----CTCGCTC--------C------AGT--A---AC----T---TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCAGAAG------GACAA--TGG----------T-----TC---TACT------CA--------CAG---------TCTGAGGT-CTT--T-TTCC---A---C----------CAGTA-A-A---A---C-TG--A--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---AAatt
gi|13 : CCTCCGTGGCAAAATAGTC-T-T-AGGTG---C---C---GTC------TC--A---A-----A---------ATC-A-CT-TGCC--A-------CTCAC--CAC---TAA----GTTT-----GT-----AGGTTCGAG--T---C-C-----C---GCTCGCTCA-------C------AAG--A---GC-----------TA-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CA---A-G----TT------A--CCTGCGAAAG------GACGG--TGT----------T-----AT---TTCT------CAG---T-TTCAT---------TCTGAGAA-CTT--C-CTCC---A---C----------TAATA-A-A---A---C-TT--G--ATATACATGTATC--A-------C-AT---ATAT--CCTG----AATT-G--TGTCG-----AAAACGGT--GTT-A
gi|14 : TCCTCCATGGCCCAGTGGTC-T-A-AGGCA---C---T---GTC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------C--AC--TGC---TAA----GGTC-----GT-----AGGTTCGAG--T---C-C-----C---GCTAGCAC--------C------GAA--A---AC----T---TTTTG-TGA-GA---A-AGT-GT---CC---A-A----TT------A--TTAGTGGAAG------GACAG--TGG----------T-----TC---TACT------CAG-------------------TTTG---T-CTT--C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---AAA-C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTT----AAAT-G--TGTTG-----AAAATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---TAA-
gi|15 : CGTGACCCAGTGGTC---A-AGGCG---C---C---GTT------TC--A---C-----G---------ATC-A-TT-TACC--T-------TTCAC--CGC---TAA----GCGC-----GT-----AGGTTCGGG--T---C-C-----C---ATTCGCTC--------A------AAA--A---AC----T---TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-A-AC---A-G----GT------A--CTTGCGGATG------GACAA--TGG----------T-----TC---TACT------CA----GATTCAT---------TCCGACGC-CTT--C-CTCC---G---C----------CAATA-A-A---A---C-AC--G--ATATGC------C--A-------T-AT---GTAA--C---------AT------TT-------AAATAGC--GTT-AA----------TCTCCA----T-T---AAA-
gi|16 : gGAGTGGTC-T-A-AGGTG---C---T---GTTGTTTATTT--A---AT----G---------ATC-A-TT-GACC--A-------CCTAC--CGC---TGA----AGTA-----AT-----AAGTTTAAA--C---C-C-----A----CACAGAC--------C------AAA--A---CC----T---TTATG-TGA-AC---A-GGT-TT-T-CC---A-G----TT------A--TTTGTGGAAG------GTTGA--TGG----------T-----TC---TTC-------CAA---GATTCAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---A----------CAGTA-A-A---A---C-TG--G--ATGTGT------C---------------------------------AT-G--TGTTG-----AAAATGAT--GTT-AA----------ACCC
gi|17 : CCTCCATTGCCAAGTAATT-T-A-AGAAC---A---T---GTC------TT--A---A-----T---------AT--A----TATT--T-------CCAAC--CAT---TGA----GATCTT---AT-----GTGTATGA-------C-T-----ATGTGCCATGTCGTAATAAGC------AGGT-A---AC----G---TTAGA-AAA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-C----TT------A--CTTCCTGA--------GGCAGTTTCA----------T-----TC---TACA------CA----GATTCAT---------TCCAAGAT-CTT--T-CTTC----------------------------------C-TG--G----ATGC------C--A-------T-AT---AAAA--Cggtgt
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gi|19 : -TT-G-CC---G-G----TT------A--CTCGCAGAAA------GACTG--TGGCTCTGGGTTGT-----TC---TTCT------CAG----ATACAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CGCC---AACTCTTA-------CAATA-A-A---A---A--G--G--ATATGC------C--A-------T-TT---ATAA--CTTG----GTAT-G--TATTG-----AAACTGAC--GTT-AA----------ACTTCA----T-T---gtcatagttgccggttactcgcagaaagactgtggctctgggttgttcttctcagatacattctgaggtcttccgccaactcttacaataaaaaggatatgccatttataacttggtatgtattgaaactgacgttaaacttcattccaaa
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gi|20 : cctctgttcgaactaaagcattatgtaagaaagttttccagtcacttgcagctcggaccagtgacttaatttcatatgcctctTA-C-A---A---T-TA--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAC--TCTG----TAAT-G--GGTAG-----AAAAAGGC--GTT-AA----------ATCCAA----T-T---gttctacacgttctacaattagatatgccatatatactctgtaatgggtagaaaaaggcgttaaatccaatt
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gi|22 : TTCAGG--C---C-T-----G---GTTTGGTC--------C------ATA--A---AC----T---TCCTT-TGA-GA---A-AAT-TA-A-CA---A-G----CT------A--CTAGTGGTAT------GACAT--TGG----------T-----TC---TACT------T-G---GATTCAT---------ACTGAGTT-CTG--C-CTTC---A---C----------CAATC-A-A---A---C-TG--G----ATGC------C--A-------T-TT---ATAA--CTCA----CAAT-G--TGTTGGGGAAAAAATGGT--GTT-AA----------GCATCA----T-T---AAA-AAtcaata
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gi|27 : cTT-T-G-AGGCA---C---T---GTC------TC--A---A------------------------------T-------TTCAC--GGA---TGA----TTTT-----GT-----GGGTTCGTG------C-C-----A---CCTCAGGC--------C------AAA--T---AT----A---TGACG-TGA-GG---C-AGT-TT-A-CC---A-G----TT------C--CTTGCAGA
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gi|28 : gttttgaggcactgtctcaatttcacggatgattttgtgggttcgtgccacctcaggccaaatatatgacgtgaggcagtttaccagttccttgcagaGTGGTC-C-A-TGTCG---A---C---ATA------TC--A---A-----A---------ATC-A-TT-TATA--T-------CTCAC--TGTAG-TG-----GGTC-----CT-----AGGT--GAA--A---C-------A---GTGTGTTC--------CTTTAAGAAG--G---ACAATTT---TTCTACTCA-TATTTA-GGT-GT-G-TT---A-G----TT------A--CATTAGGAAG------GACAA--TGG----------T-----TC---TACT------CAa
gi|29 : tgtcttct---AC----T---TTATG-TAA-GA---A-ATT-GA-G-TC---A-GCT--TT------T--TTTGTGGAAG------GATGG--TGG----------T-----TC---TATT------CA----GATTAAT---------TACAAAAT-TGT--C-CTCC---A---C----------CTACC-A-A---A---C-TG--G--ATATAC--------------------------AG--CCTG----TAAT-A--TGTTG-----GAAATTAT--GTT-AA----------AC
gi|3 : tactgctgtattctagcTCTTCCGTGGCCGAGTGGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTC------TC--A---G-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCAC--CGC---TAA----GGTC-----GT-----AGGTTCGAT--C---C-C-----A---A-TCACTC--------T------AAA--A---AC----T---TAATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----TA------A--CTTGCGGAAG------GACGG--TGG----------T-----TC---TACT------CCGTCTGACTCAG---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---A---C-TT--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAATTGC--GCT-AA----------ACCCCA----T-T---AAA-AATaa
gi|31 : CCATAGCCGGGTGATC-T-A-GGGCA---T-------GTC------TC--A---A-----T---------ATC----T-CACC--T-------GTCAC--CGC---TGA----GGTT-----GT-----GGGTTCAAG--A---C-C-----A---GCT---------------------------------------------TGA-GA---A-GGT-TT-A-CC----------TT-------------------------GACAG--TGG----------T-----TC---TGCT------C-T---GATTCG----------TCTGAGCT-TTTAAC-TTTC---A---C----------CA
gi|32 : GCTGAGTGAGC-T-A-AGGCA---C---C---ATC------TC--A---A-----G---------GTC-A-CT-TACC--T-------CTTAA--TGC---TGA----GGTC-----AT-----GGGTTCAAA--T---C-C-----C---ACTCGATT--------C------AAA--A---AC----------AT---------------T-TT-A-CC---A-G----TC------A--CTTGCAGAAG------GGTAG--TGG----------T-----TC---TACT------C
gi|33 : aTTCTCTGTGGCAGAGCAGTT-A-A-AATTG---C---A---ATC------AC--A---T-----G---------ATC-A-CC-AATC--T-------CT-AC--CAC---TGA----GAAT-----GT-----GG-----AC--A---C-C-----A---AC-CTGTT--------C------A------------------TTA-----A-GG---A-AATATT-G-CC---A-G----TC------A--CTTTCGGGAA------GACGG---GA----------T-----TC---tga
gi|34 : aggaT------A--CTTGCAGA-G------AATGC--TGG----------T-----TC---TACT------CAC----ATTCAT---------TCTGAGGT-CTG--C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---A---C-TA--G--ATATGT------T--A-------A-GT---ATAA--CCTT----TTAT-G--TGTTG-----TAAATGAT--CTT-TA----------ACACCA----T-T---AAA-
gi|35 : gtgaTCTTCCGCAGTCAGGTGGTC-C-A-GGGCG---C---T---GGC------TC--A---G-----G---------GTG-A-CT-TACT--T-------TTTA--------------------------------GGAGCCGAA--C---C-----------G-TCAGTT--------C------AAT--C---AC----T-------G-CGG------------------C---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACCA--TGA----------T-----TC---TA
gi|36 : gCTGAGGT-TGT--C-CTCC---A---T----------CAAT----A---A---C-CG--A----ATGC------C--T-------T-AT---ATAA--TC-------AATGG--TGTTG-----CAAAtccg
gi|37 : gggagatgtcggtgatttggtttgattaaatttaaggGTGGTA-T-A-ATGCG---C---T---GTC------TTCTA---A-----T---------GTCCA-CT-GACC--T-------TCCGC--CGC---TGA----AGTC-----TT-----GGATGTGAG--C---G-C-----A---GCTAGGTT--------T------AAA--A---ACAA--G---TTATG-TTATGA---A-Aaccttacaaaaaaaaccctca
gi|38 : ggttcctctacTTCACGGCCAAATGCTC-CCA-AGACA---A---T---GTC------TC--A---A-------------------------ACC--T-------CTCAG--CAA---TGA----GGTT-----GT-----GAATTCGAA--A---T-C-----T---GGTTGGTCAGT-----T------AAATCA---A----------TATG-T---AA---A-AGT-TC-A-CT---T-G----TC------A--CTa
gi|39 : TGGTCAAGTGGTC-T-A-AGGCA---C---C---ATC------TC--A---ATTTCTGTATCTATTCACC-A-CTCCACC--A-------CTCAC--TAC---TGA----GGTG-----GT-----CGGT
gi|4 : ggagttcttttTCCTCC-TGGCTGTGTGGTCGT-T-AGATA---C---T---GTG------TC--A---A-----A---------ATC-A-CT-TGCC--T-------CTTGT--CG----TGACCAGGGTTTAATGGG-----GGGTTCAAGGTCAGGC-C-----A---GCTGAGTG--------T------AAA--C---CT----T---TTTTA-TTG-GA---G-A----T-G-CC---A-GAGATTT------C--CTTAT--AAG------GACAG--TTA----------TAA---TCAGTTACTTTTATACAG-----TTC-T---------TCTCAGATGAAT--C-CTTC---A---C----------CACTA-T-A---A---C-TG--GTTATTTGC------C--A-------T-AT---A--------A----AAAT-AT-TGTTG-----AAAAaaaatctcaataagtttaaaa
gi|40 : gg------TC--A---A-----G---------GTC-A-CT-AACC--T-------CTCAC--CGT---TAA----GGTT-----GT-----GTGTTCGAG--C---C-C-----A---GCTTGGT
gi|40 : aTGC------C--A-------T-AT---ATAG--TCTG----AATT-G--TGTTG-----GAAATGAC--GTTAAA----------ACACCC----T-T---AAA-tgccatatatagtctgaattgtgttggaaatgacgttaaaacacccttaaaa
gi|41 : atcaaggtcactaacctctcaccgttaaggttgtgtgttcgagcccagcttggt--T-------CTTGT--CAT---TGT----GGTG-----GT-----GAGTTCGAA--T---C-C-----A---GACTGGTT---------------AAA--A---AC----C---CG--G-TGA-GC---T-GGT-TT-G-CC---A-G----TT------T--CTTGTG
gi|42 : ctctttggcaaagcaacctaaggaattg-----TC---TATT------CAG---AAAT-AT---------ACTAAGGT-CTTA-C-CCCC---A---A----------CAATA-C-A---A---C-TA--G--ATA--C------A--A-------TGAT---AT------TG----TAAT-G--TGTTG-----ATGTTTGC--GTC-AA----------ata
gi|43 : gacG---C---A---GTC------TC--A---G-----G---------ATC-A-CT-TA-------------TCAC--------TGA----GGTG-----GT-----GAGTTTGAG--C---C-C-----A---ACTTGG-C--------C------TAA--A---AC----T---GT-TC-TGA-GA---A-AGG-TT-A-CC---A-G----TT------A--CTTGTGAAAG------AACtcgatatacaagtaaat
gi|44 : ctACA--T-------CTCAAAACGC-----A----GTTC------T-----AAGTTCGAC--T---C-T-----A---GTTAGGCC--------C------AAA--A---AC----T---TTATG-TGC-GA---A-AGT-TT-GCCC---A-G----TT------
gi|45 : tgCTCCGTGACCAAGGGGTC-T-A-AAGCG---C--------TC------TC--GTTTA-----GCC-------ATC-A----TATCAAT-------CTCAC--CGCAATTGA-------C-----GT------GGTTCAAG--C---C-taaatagaaggatattcattc
gi|46 : TG-TGA-TA---ATAGT-T--G-CA---A-G----TT------A--CTTGCGTAAG------GACAA--GGA----------T-----TT---TAAT------CA----GATTGAT---------acacttagttggtaaag
gi|47 : tgttacagtatatttactcacTCCTCCTTGAACAAGTG----T-A-AGATG---C---T---GTT------TT--G---A-----GG--------ATT-A-CT-TGCC--C-------TTCAC--CGC---TCT----GATC-----CT------GGTTCAAA--C---C-C-----gacatatttcaccagt
gi|48 : CCGAGGT-CCT--C-TTCC---A---T----------CAATA-A-A---A---C-TG--A--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTT----AAAT-G--TGTT------AAAATGAT--GTT-AATGTTTTTTTTACCCCA----T-T---AAA-taaacattacactaaaga
gi|5 : TCCTTGGTCGAGAGATC-T-A-AGGCA---CTCCC---GTT------TG--A---T-----G---------GCC-A-CT-CATC--A-------CCCAT--CGT---TGA----AGTC-----AG-----GGAGTCGAG--C---A-C-----A---GTTCGGTC--------------------A---A-----T---TTATG-TGT-GA---A-AGT-GA-G-CC---A-G----TT------T--TTCGCTGCAG------GACTG--TGT----------T-----TC---TACT------C-C---GATGTAT---------TCTGAGTG-CTT--C-CTC
gi|50 : agtatgtattgtacgaaatcaaaatagggtgtGTGAAAGACT---GACGA--T------------T-----TC---T--T------AAG---GATTTAT---------TC-GAGTT-GTT--C-CCCC---A---T----------CAATA-A-A---A---C-C------AAATGG------C--A-------T-A-----------------------A--TGTTG-----GAAGTGAC--ATT-AA----------ACattatgcatttgtcgaaagtgaataaatatattcaaactgaa
gi|51 : ----------T-----TG---TACT------CAT---GATTCATATCTATGGATCTGGGGT-CTC--C-TTCA---A---C----------CAATA-C-A---A---C-TG--A--AT-T-C------C--A-------T-A------------------AAAC-A--TGCTG-----AAAATTGA--GTT-
gi|52 : ttaCAT---------TTTGAGGT-CTT--T-CCCT---T---T----------CAGTA-ATA---A---C-TG--G--AT--GC------T--A-------T-A----ATA-----CG----AAAT-G--TGTTG-----GAAACGGA--GTT-TA----------TCCCCA----T-TCACAAA-
gi|53 : aTCCTCAATGGCAGAGTTATC-T-A-ATGCG---A---T---GTCCT----TT--A---AT----G---------ACC-A-CT-T-------------CTTAC--CAC---TTA----TGTC-----GT-----GGTTTCGAG--C---C-C-----A---GC
gi|54 : ggTCCTCCGTGCCCTAATAGTC-C-A-AGGCG---A---T---GCA------TC--A---A-----T---------AAC-A-GT-----------------CAT--CGC---TGA----GAAA-----GA-----AGGTTCGAA--C---C-C-----A---GCTTG
gi|55 : acagaC--TGC---TGA----GGTT-----CT-----GGTTTCGAA--G---C-C-----T---GCTCA-------------------------------------TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CT---ATG----CT------A--TTTACAAAAG------GATTA--TGA----------T-----TT---TA
gi|56 : ---GATTGAT---------TCTGCAGT-CTT--CTCTCC---A---C----------CAAAA-A-A---AAACC-TG--G---T-TGC------C--A-------T-AT---ATAA--C--A----AAAC-G--TGTTG-----AAAAt
gi|57 : -------CTCAT--TGT---TGA----GGTC-----AT-----GAGTTTGAG--C---A-CAAGTGA---GCTCAGTC--------C-------AA--A---CC----A---TTATG-T-A-TA---A-AGT-TA-A-CC---A-G----TG------A--CTTGctgagtgaa
gi|58 : T--T-CTTC---A---C----------CAATA-A-C-------C-TG--T--GT-TAC------C--A-------T-AT---ATAA--CATG----ACGT-G--GATTG-----CCA-TGAT--GTT-AA----------ACCCCA----T-
gi|59 : CCTCTGTAGGAGAATGGTC-T-A-ACGCG---C---C---GTT------TC--G---G-----G---------ATC-A-TT-TACA--T-------CTCAC--C------AA----AGTC-----AT-----AGGTTCGAaatacatgt
gi|6 : CCGAGTGGTC-T-A-AGACG---C---T---GTC------TC--A---A-----G---------ATC-A-CT-AACA--T-------CTCAC--TGC---AGA----AGTC-----GT-----AGGTTCGAG--TA--C-C-----A----CTTTGTC--------C------AAA--A---AC----T---TTATG-TGA-AA---A-TGT-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------GACGT--TGG----------T-----TC---TGCT------C-G---GATACAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTTC---A---C----------CATTA-A-A---A---C-TG--G--ACATGC------CATA-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTCC-----AAAATGGT--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---TAA-atacc
gi|60 : ccc-----G---------ATC-A-CT-AACC--T-------GTTAC--CAT---AGA----GGTC-----AC-----GAGTTTAAG--C---C-C-----A---GCTCAGT
gi|61 : tcatcatgtA-GA---A-AAT-TT-G-TT---A-G----TTGTATGTA--CATGTAGATA------GACGA--TGG----------T-----TC---TACA------CGG---AATtatacatgcatgaat
gi|63 : ttcatagaaatatttCATGGCATAGTGGCA-T-AGAGGCA---T---T---GTC------TT--A---A-----G---------AGT-A-CT-T---------------------GC---TGA----GGTT-----GT-----GGGTTTGAG--C---C-C-----A---GCTcg
gi|64 : ACT--T-------CTCAC--CGC---TGA----AGTT-----GT-----CGGTTCAAT--C---T-C------------CGTTC--------C------AGA--ATGTAC----T---TTGTg
gi|65 : cgaatgaacacaaCCTCTGTGGCCATGTGGTA-T-A--GGTG---T---C---AAC------TC--G---A-----A---------ATC-A-CA-TACC--T-------CTCAC--TGC---TGtt
gi|67 : gcGTGGCCGAGTGATC-T-A-ATGGG---C---T---TTC------TC--A---T-----G---------ATC-G-CA-TACA--T-------TGCAC--CA----TGA----GGtcagagtt
gi|69 : ggtctttctaTC------TC--A---G-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTAGT--TGC---TGA----GATT-----TT-----GGGTTCAA
gi|7 : CTCCTTGGCCAAGTGGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTT------T---A---A-----G---------ATC-A-CT-TACC--T-------CTCAT--CGC---TTA----GGTC------T-----AA-TTCGAG--T---C-T-----C---GTTCGCTC--------C------AAA--A----C----T---TTATG-TGA-GA---A-AGT-TT---CC---A-G----TT------A--CTTGCGAAAG------GACAG--TGG----------T-----TC---TACT------CAGTCTGACTCAG---------TCTGAGGT--TT--C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---A---C-TG--G--ATATAC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG-----AAAACGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---tgctgtctcaaagttgattca
gi|70 : TCTGGGGCCTAAGGGTT-T-A-AGGTT---C---T---GTC------TC--A---G-----T---------ATC-A-CT-TACT--T-------CTTTC--AGC---TGA----GATT-----Gta
gi|71 : TCTTCCGTGGCCGAGTTGTG-G-A-CGGCGCTTC---C---GTC-------C--A---GT----G---------ACA-A-CT-TACT--T-------CTCAC--
gi|72 : agaa----------CAGTA-A-A---A---CCTGATG--ACATAA------T--T-------T-AT---ATAA--TCTG----TAAT-G--GATTG-----AAAATTGC--ATT-AA----------AC
gi|73 : C-T-A-AGG-A---C---CTTGGT-------TC--A---A-----G---------GTC-A-CT-TGCC--T-------CTCTC--AGC---TGA----GGGC-----AT-----GGGTT
gi|74 : a------TC--A---A-----G---------ATC-A-TT-TACT--T-------CT--------------------TC-----AT-----GGG------------C-C-----A---G----ATT--------C------AAA--A---AC----T-------G-TGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G----aaggtc
gi|75 : tCC---A---A----------TAATA-A-A---A---T-TG--G--ATG------------A-------C-AT---ATAA--T-TA----TAAT-C--TATTG-----AAAATGGT--GTT-AA----------ACC
gi|77 : caTT--C-CTCCGTCA---G----------CAATA-A-A---A---C-TG--G--AT--GC------C--A------------------------------GT-G--TGTTG-----AAAATGGT--TTT-AA----------ACC
gi|78 : gtTCCGTGGCCAAATG---------------------------------TC--A---A-----AC--------ATC-A-CC-AGGC--T-------CTCAC--TGC---TGA----GGCT-----GT-----GTGT
gi|79 : tG-CGA-GA---A-AGT-TT-G-CC---A-G-----T------A--CTTGCAAAAAAACAACAACAA--CAG----------T-----TC---TATT------CAG---c
gi|8 : CCGCGGCCAA-TAGTC-T-A-AGGCG---C---C---GTC------TG--A---A-----G---------AAC-A-TT-TACC--T-------CTCAC--CGC---TAA----AGTT-----GC-----AGGTTCAAG--T---T-C-----C---GTTC-GCC--------C------GAA--A---AC----T---TTATT-TGA-GA---A-ATG-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGGAAG------ACCGG--TGG----------TACTTCTC---T-CT------CA----GATTCAT---------TCCGAGGT-CTT--T-CTCC---A---C----------CATTA-A-A---A---C-TG--G--ATATGT------C----------T--T---ATAA--CCTG----AAAT-G--TGTTG------AAATAGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-C---Aa
gi|80 : g----------T-----CC---TATT------CAG----ATTCAT---------TCTGAGGT-TTG--C-CTCG---G---C----------C---A-A-A---A---C-TA--G--GCATt
gi|81 : CATGGCTCAGTGGTC-----AGACA---T---T---GTT------TC--A---A-----G---------AGC-A-TT-TAtgttaa
gi|82 : catcagggtccga--A-------T-AC---ATAA--CCTG----TCAT-G--TGTTG-----AAAACGTC--TTT-AA----------TCCCCAGTGTT-T---AAA-
gi|83 : TC------GC--A---A-----G---------ATC-A-CT-CACC--TCCTATTGCTCAG--TGC---TGA----GGTC-----AT-----AGGTTCAA
gi|85 : AA--A---AC----T---TTGTG-TGA-GA---G-AAC-TT-T-CC---A-G----GT------A--CCTGTGGAAG------AACAG--T
gi|86 : ttcCTGAGAT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---G---C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----
gi|87 : -TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCGAAGC------GGTAG--TGG----------T-----TT---TACA------CA
gi|88 : aaataACAG--TGA----------T-----TC---TACT------CAG----ATTAAT---------TCTGAGGT-CTT--T-CTCC---A---C----------CAATA-A-cagtc
gi|89 : ---AT----T---TTATA-TGA-GA---A-AGG-TT-G-CC---A-G----TT------A--CTTGCAGA
gi|9 : TCTGTAGGAGAATGGTC-T-A-ATGCG---C---C---GTC------TC--G---G-----G---------ATC-A-TT-TACC--T-------CTCTC--CA------A----AGTC-----AT-----AGGTTCGAG--T---A-C-----C---GCTTGCTC--------C------AAA--A---AC----T-------G-TGA-GA---A-AGT-TT-G-TC---A-G----AT------A--CTTGCGGAAG------AACGG--TGA----------T-----TC---TATT------CAG----ATTCAT---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCT---A---C----------CAATA-C-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--CCTG----AAAT-G--GGTTG-----AACATGGC--GTT-AA----------ACCCCA----TAC---AAA-AAccgattatgttt
gi|90 : ---------TCTGAGGT-CT---C-CTCC---A---C----------CAGTA-A-A---A---C-TG--G--ATATGC------C--A-------T-AT---ATAA--
gi|91 : ag----------T-----TC----ACT------C-G---GATTCAC---------TCTGAGGT-CTT--C-CTCC---A---C----------CAATATA-A---A---
gi|92 : ---ATAATGCCTG----AAAT-G--TG--------GAAATGGT--GTT-AA----------ACC
gi|93 : aaaagtggTCCTCCATGGCTCAGTGGTC-----AGACA---T---T---GTT------TC--A---A-----G---------A
gi|94 : gT-CTT--T-TTCC---A---C----------AAAAG-A-A---A---C-CT--G--GT-TGC------C--A-------T-AT---ATAA--
gi|95 : -G--TGTTG-----AAAATGGT--GTT-AA----------ACACCA----T-T---AAA-AAT
gi|96 : agTCCTGCTTGGCCAAGTGGTC-T-A-AGG---------C---GTC------TT--A---A-----
gi|97 : GTTT-----AAAACGGC--GTT-AA----------ACCCCA----T-T---AAA-AAta
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|30 ): TGTCTCAAGAGAAATAACATCTCAAACTCAGAGTCGAGTTGAAGCTTAAGATTCATTAAAAATGACAATAAGTGAAAATTCTGCTAATTACTAAGAACATTTTTTGAGATACGGTTTTCTTTCGTCATTTCAAAC
Unaligned ( gi|49 ): TCGTCCTCCTTGACTGAATGGTCTGAGGTGTTGATACACAGTCACTGACCTTTCACTAACAAGGTTGTGGGATTCAAACTCTTGACCACTC
Unaligned ( gi|62 ): TTTTCAATTGAGTCCTATGATACTGTCTCTAAATCACTGACCTCCCACTACTGCGGTTACGGGTTCAAGC
Unaligned ( gi|66 ): ATAGGGTCATCTGTGTTCAAGTAGTTCAAGGCACTGTCTTAATGCCACTAACCCTCACTGGCTA
Unaligned ( gi|68 ): TACAGAAGCTGAAATACTAAAACTGTTTCACTCGGAAACTTATGAATAAAAAAATGTTAATTTA
Unaligned ( gi|76 ): GCGCTATTATAATAGAAAAAGGGTTTTTAAATATAAATAGTATGTATATCTCTACTAC
Unaligned ( gi|84 ): GATCTTCCATGACTTAGTGGTATAAGATGCCATCTCAAAAACACTTGCC