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Alignments
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Reference ( family-315 ) : CTCTGTTTATAACAATATAAT----A--GAAGATTCTATTAA-TCTTGCNGTCGATACTGGTAT-CAAGGATATTATAATCACTGGTGACTTAAACTAT-AATATGCTAAG---T--AA---TGCTTCATC-TACGAAAATAG-ATAATATA--TATGTCAAC-AGCTAGGTCTATATCAGAC-TATTACCGAACCAACTCATTATACTGAGAAC-----TC--CNAATCTTTGATTGATATTTTAC---TTTTAAGCAACAAAAACAGTCTGAT--AACATG-------TGG-GGTGGCAGAACCTTTTTTAAACCAAGATAT-TAGATTTCACTGTCCGATATNCGGTGTNTTTAAATT-T-AATAAANCGAAA--CAA--TTT--A---CTTTTAAGAGACA------AG--TCTGGAAATAT---GAACGTGGCG-ATTATG--CTTCATT-CAAGAATGAA-----A----------TTNACGAA-ACAAACTGGAATGAAGTTATC-A--ACGACGA-CGTAAACGTGTATGCT---A--GCAAC-TTATCTG-C----AAAATTAAAGGAACTTT---CNAACAAATGTATTCCAAATAAAACCGTT-GTAATTAAACCACATGAGCCGAAATGGATTACC----A-GTGAAATAAAGCGCAATATTAGGGT-TAGAAAAAGA---TTATACAAAAA-AGCCAAGAGATCCAATNCAATTTANA----GCTGGAACAGGTTTAAGAAATATAGA----AATGACGTTGTCAAGC-TT-ATACGCGAAACTAAAAAGNTATACTACGAAAATTTAGCTTC---TAAACTAA----ATTC-ACC--G-TCTCTCT---TGCCAAAGGACTGGTGGAAAACATTAAAATCGTTTATCNNTTCAAATGACAA-A---CCA--G--CNGTCCCNCCAC---T------NAAC--GATAATG--GAAACATT--GTCTCCGA---CGA--C-GATACCAAA-GCNAACNTATTAAATAATT-TTTTCCAGGAAC------AGACAATTCTTAATGACGACAACATT-NTACCACCAAT-CATATTACCAAGTGAT-AACA----ATGATATCA--TAT-CAATTATTAGACTACCGCCTAACGATGTAAGTAGTA
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gi|1 : actctgtttatacaaatataatataagattctattaaccatgcagtcaatactggtataaaggttattataatcactggtgacttaaactataatatgctaagtaatacttcatctacaaaagtagatgatatatgtcaacagctagggttatatcagactattaccgaaccaactcattatactgagaactcccaatctttgattgatattttacttttaagcaacaaaaactgtttgataaTCTGAT--ATCATG-------TGG-GTTAGCAGAACCTTTTTTAAATCAAGATAT-TAGATTTCACTTTCCGATATTTGGAGTTTTTAAATT-T-AATAAATCGAAA--CAT--TTT--A---CTTTTAAAAGAAA------AG-----GGAAATAT---GAACGAGGCG-AATATG--CTTCATT-CAAGAATGAA-----A----------ATAACGAA-ACAAACTGGAATGAAGTTATC-A--ATGACGA-CATAAATGTGTATGCT---A--GCAAT-GTATCTA-C----AAAATTAAAGGAAATTT---CTAATAAATATATTCCAAATAAAACTGTT-GTAATTGAACCACATGAGCCGAAATGGATTACC----A-GTGA--TA---CGCAGTGTTAGGGT-TAGAAAAAGA---GTATACAAAAACAACCAAGAGATTCAATACAATTTAAA----GCTGGACC--GTTCCAGAAACATAGA----AATGACGTTTTCAAGA-TT-ATACGCGAAACTAAAAAGGTATATTACGAAATTTTAGCTTC---TCAACTAA----ATTC-ACC--G-TCTCTTT---TGCCAAAGAACTGGTGGAAAACATTAAAATCATTTATCAATTCAAATGATAA-A---CCA--G--CTGTCGCACCAC---T------TAAC--GATAAGG--GAAACATT--GTCTCTGA---CAA--C-AATACCGAA-GCAAACATATTAAAT-ATT-TTTTCAAGGAAC------GGACAATTCTTAATGATGACAAGATT-TTACCACCAAT-CATATTACCAAGTGAT-AACA----ATGACATCG--TAT-CAATTATTAGTCTACAGCATAAAGATGTAAATAGtatcatgtgggttagcagaaccttttttaaatcaagatattagatttcactttccgatatttggagtttttaaatttaataaatcgaaacattttacttttaaaagaaaagggaaatatgaacgaggcgaatatgcttcattcaagaatgaaaataacgaaacaaactggaatgaagttatcaatgacgacataaatgtgtatgctagcaatgtatctacaaaattaaaggaaatttctaataaatatattccaaataaaactgttgtaattgaaccacatgagccgaaatggattaccagtgatacgcagtgttagggttagaaaaagagtatacaaaaacaaccaagagattcaatacaatttaaagctggaccgttccagaaacatagaaatgacgttttcaagattatacgcgaaactaaaaaggtatattacgaaattttagcttctcaactaaattcaccgtctcttttgccaaagaactggtggaaaacattaaaatcatttatcaattcaaatgataaaccagctgtcgcaccacttaacgataagggaaacattgtctctgacaacaataccgaagcaaacatattaaatattttttcaaggaacggacaattcttaatgatgacaagattttaccaccaatcatattaccaagtgataacaatgacatcgtatcaattattagtctacagcataaagatgtaaatag
gi|10 : actctgtttatacaaatataatataagattctattaaccatgcagtcaatactggtataaaggttattataatcactggtgacttaaactataatatgctaagtaatacttcatctacaaaagtagatgatatatgtcaacagctagggttatatcagactattaccgaaccaactcattatactgagaactcccaatctttgattgatattttacttttaagcaacaaaaactgtttgataagtttaaaatgttctgctaacctacatgttaTAAAAC-AAA--TAA--TTT--A---CTTTTAA-----A------AG--TCTGGAAATGC---GGACGTAGCG-ATTTTG--ATTCATT-CAAGGATGAA-----T----------TTGATGAA-ACAAACTGGAATGAAATTATT-ATTATAA-GA-CATAAACGTGTATGCC---A--GCAAC-TTTTATG-T----AAAATGAAAGGAACTTT---CGAACAAATGTATTCCAAATATTACTGTT-GTAATAAAACCAAATGAACCGAAATGGATAATT----T-ATGAGATAAAACTCAATATTATAGG-TCGCAAAAGC---TTATACAAAAC-AGCTAAAACGTCCAATAAAATT---------CTAG---------AAGAAATATGGA----AATGACGTTGT
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