lowQualScore : 111111111111111 2222222222222222222222222222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 333333 222222222222222 111 22 4444444444444444444444444444 2 1111 9999999999 222 444444444444 1111 1111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222222 22222222222 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 444444444444444444444444444444 1 111111 11111111111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 222 1111 7777777777777777777777777777777777777777777777777 1111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3333333333
lowQualScore : 777777 6 222222222222222 888 6 33 6 6 3333333333333333333333333333 6 0 6 6666 55 6 0000000000 999 0 5 000000000000 66 5555 9 0000 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 6 11 111111111111 7 33 33333333333 33 0 999999999 1 8888888 8888888 33 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 22 2 333 1 4 1 5555555 1 44 444444444444444444444444444444 1 0 1 1 000000 1 88888888 0 22 7777 2 11111111111111 2 666666 333 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 66666 4 2 11 0 33 33 222 4444 9999999999999999999999999999999999999999999999999 444 66666 555 3333 22 33 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 777 777 1 1 777 1 2 6666666666 77 0
lowQualScore : ...... . ............... ... . .. . . ............................ . . . .... .. . .......... ... . . ............ .. .... . .... ..................................................... . . .. ............ . .. ........... .. . ......... . ....... ....... .. . ................................................................................ . .. . ... . . . ....... . .. .............................. . . . . ...... . ........ . .. .... . .............. . ...... ... ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . ..... . . .. . .. .. ... .... ................................................. ... ..... ... .... .. .. ................................................................................................................... ... ... . . ... . . .......... .. .
lowQualScore : 000000 0 000000000000000 000 0 00 0 0 0000000000000000000000000000 0 0 5 9999 77 0 9999999999 666 2 0 555555555555 11 6666 5 0000 33333333333333333333333333333333333333333333333333333 9 2 99 777777777777 2 44 11111111111 44 3 999999999 6 1111111 7777777 77 9 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 99 0 555 9 8 9 9999999 8 33 333333333333333333333333333333 7 3 7 7 000000 7 77777777 1 44 4444 1 44444444444444 0 111111 777 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 9 44444 4 7 22 3 77 44 555 1111 8888888888888888888888888888888888888888888888888 777 77777 000 2222 99 99 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 888 888 9 9 888 9 2 0000000000 99 7
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTTTTACTAAGAGA-----TG-AAAATATGAACTTCGAACTAGTACTTGCTTACAAATTCGACCATA--------------TTAGGAGCA-GTT-CTAACAACATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCACGGAATTAAATGTCTCG-CT---TCTATATCGCTTTATCACAAAGTGAGGCTATGAAGAAG-TCAAN---A--G--TTA--TCC----ATTACACAACTATGGACAAAATTTGG--TGACTCTT-G--GGC-AAA-C--------A----GTTTC--AA---A-GAAA---CG---G-AGCTTAACACAAAA--AC--A----ACATTTTGTAG--G---CTA---AGTT--AATTATCCGT----AGAG------GTCAAGGTCA-------TC--CGAAA--------A-------A-----A------A-----T-------G-----NTT-T---A-G---G-G-----GTA----GTA-CTAC--CCATA-A---CACA-ACTAT-G-------GAC-C--AA-ATTTGG--T-GAC-----T---CTNGGNCA-AACAG-T-TT--N---AA-AG--------AAACGGAGC--TNAACACAAA------AAAAT-T-A-AC------ATTTT---G------T--------A------G--------TT--A--A-------TC----A--TT--C-----GTA-GAGGTCAAGGTCAT--------NCG--------AAA-A------A------A--------A---G----------T----N---------TCA----G--T---AGTAATA-----C-----T--AC------CC---ATA------------A--------------A-C---------------T----TGGT----G-AC------T--TG--------A-GACA--AAACA-TTTCNG--------A------G-----G------A--G--C----------C--------AAA-A----C-------T----G------T---T-T---GTAG--GCCA---AGTT--AATTA--TC----CGT----A------GAGGTCAAG---GTCA---T---CTG-AAA--AA-A-AT---C-TGCT-T-CGT-T--T--T----TTNAGT-AGT---ACTACCCATAAC-ACAACTATGGAC--C--A---TTTGG--TGAC-----TC---T---G-T---CAA-ACAGTTT---CT-----A-----G-AAA---C-----GG---AGCT---NAACGCAAA--AA-------------CTT--------AAC-----A----T-A--G-----T-----GT--AG-GTC------AAGGTCA--------C-CAGAA----A-----------AAA-NGCT---GC---ATGGTTTT---GATTAGTACTATCCA-T-A-ACACA--ACTATGGACCAAGT
Reference ( gi|1 ) : ATATCATCATGGTCTATTTGTTCAATAATAAGTAGAATTTGTATTGTACCTTGAAATGTGCCAGTCTACACGAAGGCCCCTGTTTTGACTAGTGACACTAGTAGTACTAGAAAAAGACAATTTGCAAAACA-GAACTTCGAACTGACACTTACTAGCAAGTTTGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGGATATTGCTGACAA-ATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCATGGAATTAAATGTTTCGACTACATGTATATCGCTTTATCACAAACTTAGGCTATGAAGAAG-TCAAA---A--G--TTA--TCC----ATTACAAAACTATGAACAAAATTTTG--TGACTCTTGG--GGT-AAA-C--------A----GTATC--AA---A-GATA---CC---G-AGCTTAACACAAAA--AC--A----ACATTCTGTAG--G---CTA---GGTT--AATTATTTGT----AAAG------GTCAAGGTCA-------TC--TAAAA--------A-------A-----A------A-----T-------A-----ATT-T---AAG---G-G-----GTA----GCA-CTAC--CCATA-A---CACA-ATTAT-G-------GAC-C--AG-GTTCTG--T-GGC-----A---CTAGGTCA-AAAAG-T-TT--A---AA-AG--------AAACAGAGC--TTAGCACAAA------AAAAT-T-A-AC------ATTTT---G------T--------A------G--------TT--A--A-------TC----A--TT--G-----GTA-GAGGTCAAGATCAT--------ACA--------AAA-A------G------A--------A---G----------T----A---------TCA----G--T---AGTAGTA-----C-----T--AC------CC---ATA------------A--------------A-C---------------T----TGAT----A-AC------T--TG--------A-GACA--AAACA-TTTCGG--------A------G-----G------A--G--C----------C--------AGA-A----C-------T----G------T---T-T---GCAG--GCCA---AGTT--AATTA--TT----CAT----A------GAGGTTAAG---ACCA---T---CTG-AAA--AA-A-AT---T-TGCT-T-TTT-T--T--T----TTTAGT-AAT---ACTACCCACAAC-ACAGTTATGAAC--C--A---TTTTG--TGAC-----AC---T---G-T---CAA-ATAGTTT---C------A-----T-AAA---C-----AG---AGCT---GAATGCAAA--AA-------------TCT--------AAC-----A----T-A--G-----T-----GT--AG-GTT------AAGGTTA--------C-CAGAA----A-----------AAA-AAAT---GC---ATGGTTTT---GATTAGTACTATCGA-T-A-A-GCA--ACTATGGACCAGGT
gi|22 : AGTAGTTTTACTAAGAGA-----TG-AAAATATGAACTTCGAACTAGTACTTGCTTACAAATTCGACCATA--------------TTAGGAGCA-GTT-CTAACAACATTTACAATT
gi|19 : tttcaatttgcgaaA-ATTTCTAAATT--ATAGGAGAATTCCACAGAATCAAATGTCT---CT---TCTATATCCCATTATCATAAA
gi|10 : atatggTTCACAAT-A--ACAAGAAAATTCCCCAGAATTCAATGTCT------CATCTATATTGCTTGACCACAAAGAGAGACCATGAAG-AG-TC--T---A--G--TTA--Taaatgaagctattgtaaatgatgaaactattcaatgtcaaagatgcacagatcacatcaaatagatatatgcaataccattatca
gi|12 : tctaaatgaaatttcattgtagtTTA-AATTATCATAAAAGAGTTCTACGGAATTGAATGTCT-AACT-----TAAATCGCTTTATCACTAAGTGAGGCTATAAAGAAG-TT--T---A--G--TTA--TTTTA--GTTACACAACTATAAACACAATTAGA--TGACTCTT-G--AGC-AAG-C--------A----GCTTC--AA---A-TAAA---CG---G-ATCTTAATACAAAATCAT--A----ACATTTTGTAG--G---CTA---TGTT--AATTATgaaggagagacaaagacttgacaagttacatcactacagatgcaagaccatatcatgatatttgtctatcaattttcaattaaggatatttctacacatttataaaagaagtttacattgtgttagggtcaa
gi|5 : ctaactacaaattttattaaggAATGA--ACATGAGAATTCCATGGAATTAAATGTCTAGCC------TATATCCCTTTATCACATAATGAGGCTATGAAGAAG-ACAAGT--A--GATCTA--CCC----ATTACACAACTATGAAAAAAA-----------------------AAA-T--------A----GT-TT--AA---A-GAAA---TG---G-AGCGTAAAACAAA-------A----TCATTTTATAG--T---TCA---GGCT--AA--A---AT----AGAG------ATTAA----------------TGGAA--------A-------A-----C------A-----T--------------TT-T-----------------GTA----A-G-CTAC--CCTTA-A---CACA-GCTAT-G-------AAT-C--A--AT------T-GGT-------------GCCA-AACAG-T-TT--T---TG-AG--------AAAAGGTGT--TAAACACAAA------AACA--T-A-AT------GTTGC---A------TAGACTA--A------G--------TT--A--T-------AC----A--TC--C-----AAA-GAGGCCAAGGTCAC--------TCA--------AAG-A------A------ATGCT----ACATG----------T----T---------TTA----G------GGTAATA-----T-----T--AC------CCCTTACACAACAATGGACCA--------------A-C---------------TTTGGTGAT----T-AT------T--TG------------CA--AAACAGTTTCTG--------A------G-----A------A--A--CAATCTGTACGC--------AAA-AAATTC-------A----A------T---T-TTGCGTAG--GCTT---AGCT--TTTCA--TC----TAT----A------GAGGTTAGG---GTCAAGGTAAACTG-AAA--AA-A-A------TGCT-G-CAC-T--G--T----TTTAATCAGT---ATTACCCATTAC-ACAACTTTAAAC--CAAA---TTTGG--TG-------AT---T---G----------TAG-GT---C------A-----A-AAA---C-----AG---AGCT---CAACACAAA--AA-------------cattgaagacttgatagtct
gi|2 : aacagtctgtaaataaacaaaaaagtgtaAGAGAATACCACATAATTAA-TGTCTC-ACT-----TATATCGCTTTACCACAAAGTGAAGCTATGAGGAGGTTCAGA----------TA--T-C----ATTACAAAataagtcttacgaaccagtcttacgaaccaacaccaagaaagtatcatgtatttctctgattttcgtttgaaaagccaagacaaaaatgtgtacagtatatcaaatagtgtttgatgcatgttacaatg
gi|20 : ttGACAATTGCACTGTATTAAATGTCTCACCTATATG------GCTTTATCACAAAAAGAGGCTATGAACAAG-TCAAgtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcataagcaaagctaatacatacacacatattgtgtaagggtcaaggttaattaattatccatagagaactatgtcaaggctatccaaaataaaactgcttgatttggagtagtcttacctataacacaactatgagtcaaatgtggtgactgtggaacaaacagtttcaaagaaatgaagctaaacaaaaaaaattttttttttaccatatctgtagaagtcaaagtcagccaaaacaaaaggctgaatggctttcagtagttgtacctaattattaatgattataaagctagaaaccatattttgtatctctaaggcaaacagtttcaaaagatcaggagctacatgcaaaacttaatatcttgtagctaagttaattatccataaaggtcaaggtcatcaaaaaaatgctgcctggttttgagtcatgttacccattacaatagcataaacagaatttggtgaatctgggacaaacaattgaagcaacagtgctaaaaataaaacttaaaaaacaaagctaattatacataggtcaaggccatccaataaaaatgctgcattgttttgagttgttctatccagtacacaactatgaaaaaaaattggtttctcttaagcaaaaagtttaaaagaaaatgagtgtaaca
gi|3 : tgtaaccaagaataagttAAATGTCTCG------TCTATACTGTTTTATCCCAAAATGAAGCTATGAAGAA-----AA---ACCG--TTAATTCTGCCGATTACACAACTGAGAACAAAATTTGG--GGACTTTT-G--GAC-AGA-C--------A----GTCCT--AA---A-GA-A---TC---GCAGCTCAAAACAAAA--ACTTA----ACATTTTGTAA--GC--CTA-----TT--AATTAATTGT----AGAG------TTCAAGGCCA-------TC--T---------------------------------------T-------G-----CT--------------------GCA-----CA-TTACTACCATA-A---CAAT-ATCAT-ACTGATATGAC-CCAAA-GTTTAC--T-GGC-----T---ATCAGTCA-AACAG-T-TT--A---AA-AG--------AAACAAAGC--TAAACACAAA------ACATG-A-A-AT------ATTTT---G------T--------A------AAC------TA--A--A-------ACAACAA--TA--A-----GTA-CAGGTCAAGGTTAT--------CTA--------AAA-A------A------A--------C---G----------T----gtggttccagtagtatctacctattatgcaatta
gi|26 : ctacGCTTTATCACAAATAGAGGCTAT-AAAAAG-TCAActgcatcatttttaactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcatacacctataacacgctaccaactttggttaaacagtttctgaaaaacagaggaaaacacagaatctgttgtaggccaagttaactattcgtaaaggtcaaggtcaaggtcatctgaaaataaaatgacctgcttttcagtcgtgctacccataacacactttgaacaatttgatgactccaggtcaactcgtttttgaaaaacggagcttaacactagaactaaacattgtgtaggctaccccgaaaaaaagctgcatgattttgattattatcatctatataacaactgcggacctccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|9 : tctcgtttattcaTTTATCACAATGTGAGGCTACAAATAAT-TCTAATACA--G--CTA--TCA----ACTACACAACTGCTGACGACATTTGA--TGACTTTTGA----C-AAA-C--------AATTTGT-TT--AA---G-GAAA---TT---G-ATCTTTACCCAAAA--ACTTA----TCATCTTGTAA--G---TCA---A-CA--AATCATTTGT----AATG------GTCAAGATGA-------T---TGAAA--------A-------C-----TTTCT--A-----T-------A-----GTT-T-----T---T-G-----GTA----TTA-CTAC--CCATA-A---TACA-ATCAT-G-------GAC-C--AA-G-TCGG--TAGGC-----T---CTGGG--A-AAAAA-CATT--A---AA-AG--------AAACCGAGC--TAGACAC------------AC-C-A-AC------ATGTT---A------TTAATA---A------G--------TT--A--A-------TT----A--TT--T-----GTA-AAGGTTGAAGTAAT--------Ag
gi|4 : TA--CCT----ATAACAAAATTATGGACAAAGTTTAG--TGACTCT--G--GGT-AAA-TTGATTAAAA----GAAT---AA---A-AATA---ATTAAA-AGATAAACATAAACC-AT--A----GAATTTTATAG--G---TTA---AGTT--AATTATTCAT----AGAG------GTCAAGTTCA-------TC--TGAAG--------A-------A-----A------G-----TCTGCATCA-----TTT-T---GAT---T-G-----GTA----ATA-C--C--CCATA-A---CACA-AATAA-A-------GAT-CA-AA-GT------T-GGT-----A---TTAAACTATAGACA-T-TT--A---AC-AGTTTCTGATAAACAAAGG--TCAATGC-AA------AAACT-T-C-AC------ATTTTTAGG------TCA------A------G--------TA--A--A-------TT----A--TT--C-----GTT-GAGACCAAG-TTGT--------GCA--------------------------T--------T---G----------T----T---------TTG-----------AGTATTA-----C-----T--AC------AC---ATA------------AC-------------A-CAGCTATGAAGCTT--T----TGAT----G-AC------T--AA--------A-GACA--ATTTT-TTTTTG--------A------GAAACAG------A--G--C----------TTAACGCAAAAA-A----CTAAA---T----A------T---TGT---GTAGT-ATTA---AGTT---ATTC--TTACGGCAT-------------GGTCAAA---TTCA-------CCG-AAA--AA-A------T-TGCT-G-CAT-G--G--T----TATAAT-ACC---AATA-CCAGAAC-ATA--------------A---GTTGG--TGGC------T---TCAGG-C---CAA-ACAGTTT---CT-----AAC---C-AAA---C-----AAGCCAACTAAGGAAT-CAAA--TG-------------TTTTCTAGGTCAAA-----A----T-A--GCCATAT-----GTCAAG-GTTAAGGGCAAGGTTA--------CTCAAAA----A-----------AAA-TGCT---AC---ATTGTTTT---GATT-TTACTATTCA-G-A-ACACA--ACTATGGACCAttttacaatgttggcatcattatgagtagttgtacacctaactcaactatgg
gi|7 : aaacacacaagagttttgtacTA--TCC----ATTACATGACTATGGCCAGTATTTGG--TGACACT-GG--GGC-CAA-C--------A----GTTTC--AA---A-GAAA---TG---G-AGCTTAATGCAAAA--ATTGA----ACATTTTGTAG--A-------------------ATTTGT----AGAA------TT---------------TC--GAAAA--------A-------ATGCCCA------A-----C-------A-----GTTAT---AAGTACA-T-----GTA----G---TTAC--AT-TG-AGTTCACA-ACCAC-A-------GAC-T--AA-A---TG--T-GGC-----GACTCTGGGGCA-AACAG-T-TT--C---AA-AG--------AAATACAGC--Tatcactttttgagaaatcgtgctaaactaaaaaactgagcattgtgtaaagttattcacccatagaaatcatggtcacctgaaaaaagctgcatggttttgagaagtatatggaca
gi|11 : aattgtaattatccacagagatcaagggcattcagaaaaatgctgcattgttgattattacA--TTT----ATTACACACTCATAGATAACGTTTAG--TTTCTCT--G--GGA-AAATC--------A----GTCTC--AACAGA-GATA----------AGC--------AAA--GC--ATTTAATATTTTGTAG--G---CTA---AGT-------GTCTCG----AACG--------CATGGCCA-------TT--TGAAA--------T-------A-----GTGCTT-A-----T-------G-----TTT-T-----G---GTA-----GTA----ACA--TAG--CCATT-A---CTCA-AATAT-T-------GAC-C--AA-GTTTAA--T-GAC-----T---CTGGTTTA-CAAAA-T-GT--A---AA-CG--------AAAGAGAGC--TAAACACAAA------ATAG--T-A-AT------ATAGT---G------T--------AT-----G--------CT--A--A-------aaatattttataggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttaattatcacttgaattcaatgccattcaaagaaaatactgcatggttttgagcagaactatccatcaaccaatcattacaaacagtctcttagaaatgcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|24 : CC----ATCACACAGCTATGGATCAAATTCTG-----------G--GTT-AAA-A--------A----GTGTC--TA---A-GAAA---CG---G-AGCTAAAACCAAAA--AC--ATTACACACTATGTGG--
gi|13 : ACAGAAATA-GAACAAA---CTGATTGACTCGTAACTGGTCAAA-T--------G----GTTTC--TG---A-GAAA---CA---G-AGCTTAACGCAAAA--AC--atttaa
gi|15 : catacagtttctaaaaacatagtcttaacactgggtgggccatttagttattcatccataaaggtaaaggtcaccattaaaatgctgcatggattaattagagaagaacaacccctacAACTATGGACCAAATTTGG--TGGTTCTTTA--C-T-AAA-T--------T----GTTTTT-GA---A-GAAA---C------AG----ACATAAAT--TA--A----ACATTCAGTAG--G---CAA---AATT--ATTCATCATT----AGAT------GTCAAGGTCA-------TC--CAAAA--------AGTGCTGCA-----A------A-----T-------------CTT-C---A-------------GTA----GGA-ATAC--CCACA-A---CACA-AGTAT-G-------AAC-C--AA-ATTTT---T---C-----A---TTGG-----AATAA-T-TC--A---GACAA--------AAACA---C--TTAAAATAAGGAGGATAAAAT-T-A-tttacactgaattgttgacgcagatgcaaccatcgtaacca
gi|16 : gAATTTGG--TGACTCTTGA--A-C-AAA-C--------A----GT-TC--AA---ATGAAA---TG---G-AGCTTAACACAAAA--AC--A-------TTTTGCAGCAGT--CTA---ATTT--A-TTATCAGT----AGAG------GTCAAGGTC------------TAGAA--------A-------ATGCTGC------A-----T-------A-----TTT-T---------G-G-----GTA----GTG-CTAC--CCATA-A---CACA-ATTAT-G-------GAC-T--AA-GTTTAG--T-GAT-----G---CT-TGCCA-AGTAG-T-TT--A---AA-AG--------AAACGAAGC--TAAATGCAAA------AA
gi|6 : catttAATTTTA--TGGCTCT--G--GATCAAA-T--------A----GTTTA--AA---A----A---CCA--G-AGGT--ACACAAAA--ACGCA----ACATTTTGAAG--G---CTC---AGCTGAAATCAAATTT----AGAG------GTCAAAGTCA-------TC--TGCAA--------A-------A------------------T-------A-----ATT-CTGCATG---G-GATCGAGTA----ATA-CAAC--CCATA-A---CACA-GCTAT-G-------AAC-C--A---TTTGG--T-GCC-----T---CCATGACA-AACAA-T-TT--T---TG-AG--------AAACGGAGC--TTA--AGATA------AAAAC-T-A-A-------ATGTT---G------TGTGGATCAA------G--------TT--A--T-------TC----A--TC---------CA-AAGATCAAGGTCAta
gi|8 : gttgacc-AAA-C--------A----GTTTCTAAA---A-AATAGTGCT---A-AGCTTA---TAATG--TT--T----ACATGTT-TAG--G---C-A---AATG--AATTTATCAT----AAAG------GTCAAGGTCAGTGTCATTC--CAAAA--------A-------A-----A------G-----T-------GTATGGGTT-T---AAG---A-A-----TTA----GTA-CTA-----GTT-A---CACG-AT-ATAG-------GTT-C--AA-ATTCGG--T-GAC-----T---CCTGGACA-AAACA-T-TT--C---TG-AT--------AAAAAGAAT--TTAACACAAA------AAC-C-T-A-AC------GCTTT---A------TTAT-----AC-----G--------CC--A--A-------G-----A--TTAAG-----GTC-GAGGTCAgtaaacaaatactgcatggttttgaattgaactactcataacacaattgtagaccaagtttggtgactcttttgtcaacagtttctgataaatggagctaaatgcgaaatgtttttttttaaaataaagctaattgaaaaacttaatgttatgtgagcaaatttattcatttggtgatttgaagccaagtgaaaaactttacgttgtgtattccaagttattcataaaggtcaaggtgaacaatttctgagaaaatagctcaatgcaaaaacttaaaattgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|2 : c-AGCT-AATACATAC--AC--AC---ATATTGTGTAA--GGGTCAA---GGTT--AATTAATTATCCATAGAGAACTATGTCAAGGCTA-------TC--CAAAAT-------A-------A-----A------ACTGCTT-------G-----ATT-T-----G---G-A-----GTA----GTC-TTAC--CTATA-A---CACA-ACTAT-G-------AGT-C--AA-ATGTGG--T-GAC-----T---GTGGAACA-AACAG-T-TT--C---AA-AG--------AAATGAAGC--TAAACA-AAA------AAAAT-T------------TTTT---T------T------------------------TT--ACCA-------T-----A--TC--T-----GTA-GAAGTCAAAGTCAG--------CCA--------AAACA------A------A--------A---GGCTGAATGGCT----T---------TCA----G--T---AGTTGTA-----CCTAATT--ATTAATGATT---ATA------------A--------------AGC---------------T----AGA-----A-ACCATATTT--TGTATCTCTAA-GGC---AAACAGTTTCAAAAGATC--A------G-----G------A--G--CTACATG----C--------AAA-A----C-------TTA--A------TATCT-T---GTA---GCTA---AGTT--AATTA--TC----CAT----A------AAGGTCAAG---GTCA---T---C---AAA--AA-A-A------TGCTGC-CTG-G--T--T----TTGAGT-CAT---GTTACCCATTACAATAG-CATAAACAGA--A---TTTGG--TGAA-----TC---T---G-GGA-CAA-ACAATTG---A------A-----G-CAA---C-----AG---TGCT---AAAAATAAA--A---------------CTTAAAA---AAC-----AAAGCT-A--A-----TTATACAT--AG-GTC------AAGGCCAT-------C-CAATA----A-----------AAA-TGCT---GC---ATTGTTTT---GAGTTGTTCTATCCAGT-A-C-ACA--ACTATGAAcccaagttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactactgagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaaattatgtaccaattttagtgactctgttcgaaaagtatttaaaagaaatggagctaaacgcaagaaggtattatatttcaacaaacgct
gi|18 : ttagagaataccacataattaatgtctcacttatatcgctttaccacaaagtgaagctatgaggaggttcagatatcattacaaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcataagcaaTCAACGCAAAA--AC--A----ACGCGTTGT--------CT-------T--AATTATTTGA----AAAG------GTCAACTTTA-------TT--TAAAA--------C--------------------------T-------CC----ATT-------G---G-A-----AAA----GTA-CTAC--CTATA-A---CACAGATT-C-G-------GAC-C--AG-TTACTG------------A---CTCAGTCA-AACCG-T-TT--C---AG-AG--------AAACCAGGC--TGAACACAAaaaaaattggtttctcttaagcaaaaagtttaaaagaaaatgagtgtaaca
gi|13 : --A----ACACTGGGTGG--G---CCATTTAGTT--ATTCATCCAT----AAAG------GTAAAGGTCA-------CCATTAAAATGCTGCATG-------G-----A------T-----T-------A-----ATT------AG---A-G-----A-A----GAA-CAAC--CCCTACA---CAGA-A--AT-A-------GAA-C--AA-A--CTGATT-GACTCGTAA---CT-GGTCA-AATGG-T-TT--C---TG-AG--------AAACAGAGC--TTAACGCAAA------AAtatagatattg
gi|14 : catacagtttctaaaaacatagtcttCATTAAGTAG--A---TCA---AGTT--TAATATC---------AG------TTCAAGGTCA-------TC--CCGAA--------A-------A-----A------------T-------G-----TTG-T---ATG---G-T-----GTATAGAGTA-TT-------TA-A---CGTA-ACTAT-A-------AAC-C--AA-ATTTGG--T-GAA-----T---CTAG-CCA-AACAT-T-TTCTA---AA-AGAA------AAACAGTGC--TAAATGC-AA------ATACT-T-A-AG------ACGTT---G---------------A------G--------AT--A--AAGTGTATTA----A--CT--GTATATGTC-AAGGTGAAGGTCAT--------TCG--------AAA-A------ctttacactgaattgttgacgcagatgcaaccatcgtaacca
gi|7 : aacttatT--AATTATCCAC----AGAG------ATCAAGGGCA-------TT--CAGAA--------A-------A-----ATGCTGCA-----T-------T-----GTT-----------G-A-----TTA----TTA-CTAT--CCATT-A---CATG-ACTAT-G-------G-C-C--AGTATTTGG--T-GAC-----A---CTGGGGCC-AACAG-T-TT--C---AA-AG--------AAATGGAGC--TTAATGC--A------AAAAT-TGA-AC------ATTTT---G------T--------A------G------------A--A-------T--------TT--------GTA-GAattgctacatgtatt
gi|9 : aattg-------A-----A------A-----T-------A-----ATTCT---AA-------------TA-----CAGCTAT--CAACT-A---CACA-ACTGC-T-------GAC-G--AC-ATTTGA--T-GAC-----T---TTTGA-CA-AACAA-T-TT--GTTTAA-GG--------AAATTGATC--TTTACCCAAA------AAC-T-T-A-TC------ATCTT---G------T--------AA-----G--------TC--A--ACAAA---TC----A--TT--T-----GTA-ATGGTCAAGATGAT---------TG--------AAA-ACTTTCTA------T--------A---G----------T----T---------TT--------T---GGTATTA-----C-----T--AC------CC---ATA------------AT-------------A-CAATCATGGACCAAG-T----CGGT----AGGC------TC-TG--------G-GAAA--AAACA--TTAAA--------A------GAAACCG------A--G--C----------T--------AGACA----CACCAACAT----G------T---T-A---TTAA----TA---AGTT--AATTA--TT----TGT----A------AAGGTTGAatttcgaaaaaatgcccaacagttataagtacatgtagttacattgagttcacaaccacagactaaatgtggcgactctggggcaaacagtttcaaagaaatacagctaaatattttataggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttaattatcacttgaattcaatgccattcaaagaaaatactgcatggttttgagcagaactatccatcaaccaatcattacaaacagtctcttagaaatgcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|4 : tttatcacaatgtgaggctac----GTA-CTAC--CTATA-A---CAAA-ATTAT-G-------GAC-A--AA-GTTTAG--T-GAC-----T---CTGGGT-A-AATTG-A-TT--A---AA-AG--------AATAAAAATAATTAAAAGATA------AACAT-A-A-ACCATAGAATTTT---A------T--------A------GGTTAAG--TT--A--A-------TT----A--TT--C-----ATA-GAGGTCAAGTTCAT--------CTG--------AAG-A-------------A--------A---G----------TCTGCA---------TCATTTTGATT---GGTAATA-----C---------C------CC---ATA------------AC-------------A-CAAATAAAGATCAAAGT----TGGTATTAA-AC------T--AT--------A-GACATTTAACAGTTTCTGATAAACAAA------G-----GTC----AATG--C----------A--------AAA-A----C-------TTCACA------T---T-T---TTAG--GTCA---AGTA--AATTA--TT----C----------------GTTGAG---ACC------------------A-A-GT---TGTGC----ATT-G--T--T----TTGAGT-ATT---ACTACACATAAC-ACAGCTATGAAG--C------TTTTGA-TGAC----------------T---AAAGACAATTT---TTTTTTGA-----G-AAA---C-----AG---AGCT---TAACGCAAA--AA-------------ACT--------AA------A----T-ATTG-----T-----GT--AGTATT------AA-GTTA--------agtaatattttacaatgttggcatcattatgagtagttgtacacctaactcaactatgg
gi|3 : aaacacacaagagtttt-CTGC--CGATT-A---CACA-ACTGA-G-------AAC-A--AA-ATTTGG--G-GAC-----T---TTTGGACA-GACAG-T-CC--T---AA-AG--------AATCGCAGC--TCAAAACAAA-------AACT-T-A-AC------ATTTT---G------T--------AAGCCT-A--------TT--A--A-------TT----A--AT--T-----GTA-GAGTTCAAGGCCATCTTGCTGCACATTACTACCATA-A------C------A--------A--------------T----A---------TCA-------T---ACTGATA-----T-----G--AC------CC---A-A------------A--------------G-T---------------T----TACT----G-GC------TA-TC--------A-GTC---AAACA-GTTTAA--------A------A-----GAAACAAA--G--CTAAACA----C--------AAA-A----CA------T----GAAATATT---T-T---GTAA--ACTA---AAAC--AACAA--TA----AGT----A------CAGGTCAAG---GTTA---T---CTA-AAA--AA-ACGT---C-TGCA-T-CAT-T--T--T----Tttcttacggcatggtcaaattcaccgaaaaaattgctgcatggttataataccaataccagaacataagttggtggcttcaggccaaacagtttctaaccaaacaagccaactaaggaatcaaatgttttctaggtcaaaatagccatatgtcaaggttaagggcaaggttactcaaaaaaaatgctacattgttttgattttactattcagaacacaactatggaccaatcactttttgagaaatcgtgctaaactaaaaaactgagcattgtgtaaagttattcacccatagaaatcatggtcacctgaaaaaagctgcatggttttgagaagtatatggaca
gi|24 : ctacaaatgtctcgtctatactgttttatcccaaaatgaagctatgaagaaaaaccgttaatt--CCATC-A---CACA-GCTAT-G-------GAT-C--AA-ATTCTG-------------------GGTTA-AAAAG-T-GT--C---TA-AG--------AAACGGAGC--TAAAACCAAA------AACAT-T-ACAC------ACTAT---G------T--------G------GAT------TT--A--A-------aactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcatacacctataacacgctaccaactttggttaaacagtttctgaaaaacagaggaaaacacagaatctgttgtaggccaagttaactattcgtaaaggtcaaggtcaaggtcatctgaaaataaaatgacctgcttttcagtcgtgctacccataacacactttgaacaatttgatgactccaggtcaactcgtttttgaaaaacggagcttaacactagaactaaacattgtgtaggctaccccgaaaaaaagctgcatgattttgattattatcatctatataacaactgcggacctccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|12 : -A---CACA-ACTAT-A-------AACAC--AA--TTAGA--T-GAC-----T---CTTGAGCA-AGCAG-C-TT--C---AA-AT--------AAACGGATC--TTAATACAAA------ATCAT---A-AC------ATTTT---G------T--------AGGCTATG--------TT--A--A-------TT----A--T
gi|15 : ctaactacaaattttattaaggttaaattatcataaaagagttctacggaattgaatgtctaacttaaatcgctttatcactaagtgaggctataaagaagtttagttattttagttA-ACTAT-G-------GAC-C--AA-ATTTGG--T-GGT-----T---CTTTACTA-AATTGTT-TT--T---GA-AG--------AAACAGA--------CAT----------AAAT-TAA-AC------ATTCA---G------T--------A------GGCAAAA--TT--A--T-------TC----A--TC--A-----TTA-GATGTCAAGGTCAT--------CCA--------AAA-A------GTGCTGCA--------A-------------------A---------TCT----T--C---AGTAGGA-----A-----T--AC------CC---ACA------------A--------------cattgaagacttgatagtct
gi|6 : g-------GAC-C--AA--TTTTA--T-GGC-----T---CTGGATCA-AATAG-T-TT--A---AA-A----------ACCAGAG------GTACACA------AAAACGC-A-AC------ATTTT---GAAGGCTC--------A------G--------CTGAA--A-------TC----AAATT---------TA-GAGGTCAAAGTCATCT------GCA--------AAA-T------A------ATTCTGCATG---G----------G----A---------TCG-----------AGTAATA-----C-----A--AC------CC---ATA------------ACACAGCTATGAACCA-T---------------T----TGGT----G-CC------T--CC--------ATGACA--AACAA-TTTTTG--------A------GAAACGG------A--G--C----------TTAAGATA-AAA-A----C-------TAAATG------T---TGT---GTGG--ATCA---AGTT--ATTCA--TC----CAA----A------GA--TCAAG---GTCA---------GTAAA--CA-A-ATA--C-TGCA-T-GGT-T--T--T--------G--AATTGAACTACTCATAAC-ACAATTGTAGAC--C--AAG-TTTGG--TGAC-----TCTTTT---G-T---C-A-ACAGTTT---CTG----A-----T-AAA---T-----GG---AGCT---AAATGCGAA--Acacaagtatgaaccaaatttttcattggaataattcagacaaaaacacttaaaataaggaggataaaatta
gi|16 : gttG--T-GAC-----T---CTTGAACA-AACAG-T-TC--A---AA-TG--------AAATGGAGC--TTAACACAAA--------------A-AC------ATTTT---G------C--------A------GCAGTCTAATT--T--A-------TT----A--TC--A-----GTA-GAGGTCAAGGTC-T--------AGA--------AAA-T------G------C--------T---G----------C----A---------T-A----T--TTTGGGTAGTG-----C-----T--AC------CC---ATA------------A--------------tgtttttttttaaaataaagctaattgaaaaacttaatgttatgtgagcaaatttattcatttggtgatttgaagccaagtgaaaaactttacgttgtgtattccaagttattcataaaggtcaaggtgaacaatttctgagaaaatagctcaatgcaaaaacttaaaattgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|17 : catttaatttg------AAATT-T-A-AT------ATTTT---G------T--------A------GGA------TA--A--A-------TT----A--TT--C-----ATATGAGTTCAA--------------ATG--------AAA-A------T------A--------T---G----------T----TGCGTGTGTTTTA----G--T---AGTAATATACAAC-----TGGAT------CC---A-----------------------------A-T---------------T----TGGT----G-AC------TC-TG--------A-GACA--AG-------CAA--------A------G-----G------A--A--CATAAATA---C--------ATA-A----C-------T----G------T---T-A---GTAC--ATAA---AGTT--TATTA--TC----TAA----A------GAGGTCAAcacaattatggactaagtttagtgatgcttgccaagtagtttaaaagaaacgaagctaaatgcaaaaata
gi|16 : ------------A--------------A-T---------------T----TGGT----G-AC------TCTTG--------A--ACA--AA-CA-GTTCAA--------ATGAAATG-----G------A--G--C----------TTAACACA-AAA-A----C-------A----T------T---T-T---GCAGCAGTCT---AATT--TATTA--TC----AGT----A------GAGGTCAAG---G------T---CTA-GAA--AA----------TGCT-G-CAT-A--T--T----TTGGGT-AGT---GCTACCCATAAC-ACAATTATGGAC--T--AAG-TTTAG--TGAT-----GCT--T---G-C---CAA-GTAGTTTAA-A------A-----G-AAA---C-----GA---AGCT---AAATGCAAA--AA-------------Tatgtatccaaagtaatattgcaatgc
gi|3 : catttA--AAACA------G--------A------G-----G------A--AAACA---------C--------AGA-AT---C-------T----G------T---T-----GTAG--GCCA---AGTT--AACTA--TT----CGT----AAAGGTCAAGGTCAAG---GTCA---T---CTG-AAAATAA-A-ATGACC-TGC-----------T--T----TTCAGT-CGT---GCTACCCATAAC-ACACTT-TGAAC--A--A---TTTGA--TGAC-----TC---CAG-G-T---CAA-CTCGTTT---TTG----A-----A-AAA---C-----GG---AGCT---TAACACTAG--AA-------------CTA--------AAC-----A----T-T--G-----T-----GT--AG-GCT------A-----C--------C-CCGAA----A-----------AAA-AGCT---GC---ATGATTTT---GATTATTATCATCTA-T-ATA-ACA--ACTGCGGACCa
gi|6 : ctacaaatgtctcgtctatactgttttatcccaaaatgaagctatgaagaaaaaccgttaattctgccgattacacaactgagaacaaaatttggggacttttggacagacagtcctaaagaatcgcagctcaaaacaaaaacttaacattttgtaagcctattaattaattgtagagttcaaggccatcttgctgcacattactaccataacaatatcatactgatatgacccaaagtttactggctatcagtcaaacagtttaaaagaaacaaagctaaacacaaaacatgaaatattttgtaaactaaaacaacaataagtacaggtcaaggttatctaaaaaaacgtctgcatcatttttaactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcatacacctataacacgctaccaactttggttaaacagtttctga------T---T-T---GAAG--GCTC---AGCTGAAATCAAATT------T----A------GAGGTCAAA---GTCA---T---CTG-CAA--AATA-AT---TCTGCA-T------------GGGATCGAGT-AAT---ACAACCCATAAC-ACAGCTATGAAC--C--A---TTTGG--TGCC-----TCCA-T---G-A---CAA-ACAATTT---TTG----A-----G-AAA---C-----GG---AGCT---TAAGATAAA--AA-------------CTA--------AAT-----G----T-T--G-----T-----GT--GG-ATC------AAG-TTATTCAT---C-CAAAG----ATCAAGGTCAGTAAACAAATACTGC---ATGGTTTT---GAATTGAACTACTCA-T-A-ACACA--ATTGTAGACCAAGTtccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|9 : gttgaccaattttatggctctggatcaaatagtttaaaaaccagaggtacacaaaaacgcaacat---T-T---GTAA--GTCA---A-CA--AATCA--TT----TGT----A------ATGGTCAAG---ATGA---T----TG-AAA--A-------------CT-T-TCTATAGT--T----TTTGGT-ATT---ACTACCCATAAT-ACAATCATGGAC--C--A---ttggtgactcttttgtcaacagtttctgataaatggagctaaatgcgaaatgtttttttttaaaataaagctaattgaaaaacttaatgttatgtgagcaaatttattcatttggtgatttgaagccaagtgaaaaactttacgttgtgtattccaagttattcataaaggtcaaggtgaacaatttctgagaaaatagctcaatgcaaaaacttaaaattgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|15 : tttatcacaatgtgaggctacaaataattctaatacagctatcaactacacaactgctgacgacatttgatgacttttgacaaacaatttgtttaaggaaattgatctttacccaaaaacttatcatc---GTAG--GC-A---A-----AATTA--TT----CATCATTA------GATGTCAAG---GTCA---T---CCA-AAA--AG----------TGCT-G-CAA-A--T--C----TTCAGT-AGG---AATACCCACAAC-ACAAGTATGAAC--C--AAATTTTT------C-----AT---T---G------GA-ATAATTCAGAC------A-----A-AAA---C-----Aagtcggtaggctctgggaaaaaacattaaaagaaaccgagctagacacaccaacatgttattaataagttaattatttgtaaaggttgaagtaatattttacaatgttggcatcattatgagtagttgtacacctaactcaactatgg
gi|13 : gaactatggaccaaatttggtggttctttactaaattgtttttgaagaaacagacataaattaaacattcaG--GCCATTTAGTT--ATTCA--TC----CAT----A------AAGGTAAAGGTCACCA---T---T--------AA-A-ATG--C-TGCA-T-GGA-T--TAAT----TAGAGA-AGA---ACAACCC-CTAC-ACAGAAATAGAA--C--A---AACTGATTGACTCGTAAC---T---GGT---CAA-ATGGTTT---CTG----A-----G-AAA---C-----AG---AGCT---TAACGCAAA--AA-------------CTT--------TAC-----A----cttaaaataaggaggataaaatta
gi|7 : catacagtttctaaaaacatagtcttaacactgggtgT--AATTA--TC----CAC----A------GAGATCAAG---GGCA---T----TC-AGA--AA-A-ATG--C-TGCA-T-TGT-T--G----------ATT-ATT---ACTATCCATTAC-ATGACTATGG-C--C--AGTATTTGG--TGAC-----AC---T---G-GGG-CCA-ACAGTTT---C------AAA---G-AAA---T-----GG---AGCT---TAATGCAAA--AA-------------TTG--------AAC-----A----T-T--T-----T-----GT--AG----------AA--TTT--------G-TAGAATTTCG-----------AAA-AAAT---GCCCAACAGTT------ATAAGTACctgaattgttgacgcagatgcaaccatcgtaacca
gi|11 : aattgG---GCCA---T---TTG-AAA--TA-G--------TGCT-TATGT-T--T--T----GGTAGT-AAC---A-TAGCCATTAC-TCAAATATTGAC--C--AAG-TTTAA--TGAC-----TC---T---G------------GTTTA--C------AAAATGT-AAA---CGAAAGAG---AGCT---AAACACAAA--AT-------------AGT--------AAT-----A----T-A--G-----T-----GT--AT-GCT------AAatgtagttacattgagttcacaaccacagactaaatgtggcgactctggggcaaacagtttcaaagaaatacagctaaatattttataggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttaattatcacttgaattcaatgccattcaaagaaaatactgcatggttttgagcagaactatccatcaaccaatcattacaaacagtctcttagaaatgcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|18 : atttattacacactcatagataacgtttagtttctctgggaaaatcagtctcaacagagataagcaaagcatttaatattttgtaggctaagtgtctcgaacgcat-AGT---ACTACCTATAAC-ACAGATTCGGAC--C--A---GTTAC--TGAC-----TC---A---G-T---CAA-ACCGTTT---C------A-----G-AGAAACC-----AG----GCT---GAACACAA
gi|14 : tcaacgcaaaaacaacgcgttgtcttaattatttgaaaaggtcaactttatttaaaactccattggaaaAAC-GTAACTATAAAC--C--AAA-TTTGG--TGAA-----TC---TA--G-C---CAA-ACATTTT---CTAAAAGA-----A-AAA---C-----AG---TGCT---AAATGCAAA--TA-------------CTT--------AAtatagatattg
gi|16 : aacttatcattaagtagatcaagtttaatatcagttcaaggtcatcccgaaaaatgttgtatggtgtatagagtattt--A---TTTGG--TGAC-----TC---T-----TGAACAA-ACAGTT----C------AAA---TGAAA---T-----GG---AGCT---TAACACAAA--AACATTTTGCAGCAGTCT--------AATTTATTA----TCA--G-----T-----AG--AG-GTC------AAGGT----------C-TAGAA----A-----------ATG-C--T---GC---ATA-TTTT---GGGTAGTGCTACCCA-T-A-ACACA--ATTATGGACTAAGTgacgttgagataaagtgtattaactgtatatgtcaaggtgaaggtcattcgaaaaattgctacatgtatt
gi|8 : catttaGCAAATGAA-------------TTT--------ATC-----A----T-A--A---------------AG-GTC------AAGGTCAGTGTCATTC-CA-------A-----------AAA-AAGT---GT---ATGGGTTTAAGAATTAGTACTAttagtgatgcttgccaagtagtttaaaagaaacgaagctaaatgcaaaaata
gi|7 : caaacagtttctaaaaaatagtgctaagcttataatgtttacatgtttag--AG-ATC------AAGGGCA--------TTCAGAA----A-----------AAT-GC-T---GC---ATTGTT-----GATTATTACTATCCA-T-T-A--CATGACTATGG-CCAGgttacacgatataggttcaaattcggtgactcctggacaaaacatttctgataaaaagaatttaacacaaaaacctaacgctttattatacgccaagattaaggtcgaggtcacccaagttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactactgagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaaattatgtaccaattttagtgactctgttcgaaaagtatttaaaagaaatggagctaaacgcaagaaggtattatatttcaacaaacgct
gi|7 : aattgtaattatccacag-CAAAG----A-----------AAA-TACT---GC---ATGGTTTT---GAGCAGAACTATCCA-TCA-A-CCA--ATCATtatttggtgacactggggccaacagtttcaaagaaatggagcttaatgcaaaaattgaacattttgtagaatttgtagaatttcgaaaaaatgcccaacagttataagtacatgtagttacattgagttcacaaccacagactaaatgtggcgactctggggcaaacagtttcaaagaaatacagctaaatattttataggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttaattatcacttgaattcaatgccattcaaagaaaatactgcatggttttgagcagaactatccatcaaccaatcattacaaacagtctcttagaaatgcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): AGAAACAGAAAATAAAACGTGAAAACTTAAAGCGTGGGCCAGGTTATTCATCTATAGAGCTCACGGTCATTAAAAAAATGTTGCATTGTTAATAGAAATACCCAAAAGTCAGCAGCTGTA
Unaligned ( gi|23 ): CCAAATACCATTTGAGAAACGGTACAACACGCAAATACTAAACATTATTTTATAAGTTATACATTCATAGAGGTCAATGTCACATGAAAAAA
Unaligned ( gi|25 ): TATCTGTGAATGTTGAGGTCATTCCAAAAATATGCTAGATGGTACTGAGTTATGTTACC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 55555555 1 11111111111111 2 2 1 111 2222222222 1111111 111111111111 11 2222222 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111111 555555555555555555555555555555555555555 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 111111 33333333333 333333333333333333 44444444444444444444444444444444444444 222 11111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111 1
lowQualScore : 4 66 11111111 5 4 77777777777777 2 0 0 5 2 3 111 0 9999999999 4 55 1 666 0 3333333 55 33 9999 2 333333333333 2 1 2 444 11 44 444 4 777 44 2 1 22 5 22 333 2222222 666666 333 2 22 888888 55555 1 777 555555 22 1 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 77777777 333 4 2 2 333 2 333 4444 1 4444 2 888 6666 8888 33 2 333 22 22 1 22 1 3 6 444444444 5555 666666666 333333333333333333333333333333333333333 33 33 777777777 555 555 2 77 3 3 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 666 4 5 0 000000 000000 777 00000000000 55 333333333333333333 2 5 55 4 3 2 44444444444444444444444444444444444444 333 666 5 3 1 33333333 1 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 444444 0 5 0 3 0 5 5 1 4 5 00
lowQualScore : . .. ........ . . .............. . . . . . . ... . .......... . .. . ... . ....... .. .. .... . ............ . . . ... .. .. ... . ... .. . . .. . .. ... ....... ...... ... . .. ...... ..... . ... ...... .. . ....................................................................... . ........ ... . . . ... . ... .... . .... . ... .... .... .. . ... .. .. . .. . . . ......... .... ......... ....................................... .. .. ......... ... ... . .. . . ............................................................................................................................................................................................................................................................................... . ... . . . ...... ...... ... ........... .. .................. . . .. . . . ...................................... ... ... . . . ........ . ......................................................................................... ...... . . . . . . . . . . ..
lowQualScore : 0 55 00000000 5 0 55555555555555 5 0 0 0 5 2 888 4 1111111111 4 55 4 444 9 5555555 55 77 3333 7 777777777777 7 6 5 444 99 00 111 7 444 99 4 3 99 3 99 777 9999999 111111 777 0 88 000000 00000 9 666 555555 66 9 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 88888888 555 0 0 2 555 0 555 2222 9 3333 0 666 6666 7777 11 1 777 99 99 0 88 0 7 3 888888888 0000 888888888 444444444444444444444444444444444444444 99 99 999999999 000 666 9 33 3 3 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6 444 0 5 2 555555 555555 000 55555555555 55 222222222222222222 6 0 11 0 8 3 22222222222222222222222222222222222222 222 222 6 6 0 66666666 5 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 444444 4 0 0 6 4 9 0 7 9 7 99
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTNCTANNAAGAGACAATTTGCAAAACATGAACTTCGAACTGGCACTTGCTNGCAAGTTCGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGNATGTTGCTGACAACATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCACGGAATTAAATGTCTCG-CT---TCTATATC-GCTTTATCAC--AAAGTGAG---GCTATGAAGAAGTC--A-A-NAG--TTA--TCC----ATTACA-C------------AACTAT-GGACAAAATTTGGT-GACT---CT-TGGG-CA---AA-CAGT---TTC-AAA-GAAACGGAGC--TTAAC--ACAAAA--AC--A----AC------ATT---TTGT-A--G--G-CCAAG-----TTAA-TTATCCGTAGAG------GTCAAG--GT-CA-------TCC-G-AAA----A-------AA------A-----T-----GCT-------TTA-----G--G-G-T---A----GT---A-C-TACC---CA-TAA---CA----CA-AC---TAT-GGACCAA-A-TTTGGT----GACTC-TGGG-NC-A---AACAGT--T--TNAAAG--AAACGGAGCTAAACGCAAAAAA--NTT-A--A----CATT----T----T---G------T------A-G--TT--A--A-T--C----A--TTCGT--A-G----A---GGTCAAG--GT-CATCCGAAA-AA-A--------A---G----------TN---------T-CA----GT--A---G-------TAA-T--------A-----C--------T--AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGGTG---ACT-TGA-GGCAAAACAGTTT-----CNG------AG-----G-----AG--C----------C--------AA----------AA----C----T----G-T---T-T---GTAG-GCCA---AGTTANTCATCCGTAAA------GGT------CAAGGT---CA------TCCG-AAAA--AAATG--CTGCTTCGTT-T--TTTGAGTNGTACTACCCATA-AC-ACAACTATGAAC--C--A--TTTGGT-GACTC-----T--G-T--CAAACAGTTTC-TGAG--AAACGGAG-CTNAAC---G----CAAA--------A--------------ACTT----AA---------C-A----T------AG-----T-----GT-A----------------AGGT------CAAGGTCA-C-CAGAAAAAANGCTG-CATGGTTTTGATTAGTACTATCCAT-AACACAACTATGGACCAAGT
Reference ( family-260 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTTTTACTAAGAGA-----TG-AAAATATGAACTTCGAACTAGTACTTGCTTACAAATTCGACCATA--------------TTAGGAGCA-GTT-CTAACAACATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCACGGAATTAAATGTCTCG-CT---TCTATATC-GCTTTATCAC--AAAGTGAG---GCTATGAAGAAGTC--A-A-NAG--TTA--TCC----ATTACA-C------------AACTAT-GGACAAAATTTGGT-GACT---CT-TGGG-CA---AA-CAGT---TTC-AAA-GAAACGGAGC--TTAAC--ACAAAA--AC--A----AC------ATT---TTGT-A--G--G-CTAAG-----TTAA-TTATCCGTAGAG------GTCAAG--GT-CA-------TCC-G-AAA----A-------AA------A-----T-----GNT-------TTA--G--G--G-G-T---A----GT---A-C-TACC---CA-TAA---CA----CA-AC---TAT-GGACCAA-A-TTTGGT----GACTC-TNGG-NC-A---AACAGT--T--TNAAAG--AAACGGAGCTNAACACAAAAAA--ATT-A--A----CATT----T----T---G------T------A-G--TT--A--A-T--C----A--TTCGT--A-G----A---GGTCAAG--GT-CATNCGAAA-AA-A--------A---G----------TN---------T-CA----GT--A---G-------TAA-T--------A-----C--------T--AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGGTG---ACT-TGA-GACAAAACA-TTT-----CNG------AG-----G-----AG--C----------C--------AA----------AA----C----T----G-T---T-T---GTAG-GCCA---AGTTAATTATCCGTAGA------GGT------CAAGGT---CA------TCTG-AAAA--AAAT---CTGCTTCGTT-T--TTTNAGTAGTACTACCCATA-AC-ACAACTATGGAC--C--A--TTTGGT-GACTC-----T--G-T--CAAACAGTTTC-T-AG--AAACGGAG-CTNAAC---G----CAAA--------A--------------ACTT----AA---------C-A----T------AG-----T-----GT------------------AGGT------CAAGGTCA-C-CAGAAAAAANGCTG-CATGGTTTTGATTAGTACTATCCAT-AACACAACTATGGACCAAGT
gi|1 : AGTAGTACTAGAAAAAGACAATTTGCAAAACA-GAACTTCGAACTGACACTTACTAGCAAGTTTGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGGATATTGCTGACAA-ATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCATGGAATTAAATGTTTCGACTACATGTATATC-GCTTTATCAC--AAACTTAG---GCTATGAAGAAGTC--A-A-AAG--TTA--TCC----ATTACA-A------------AACTAT-GAACAAAATTTTGT-GACT---CT-TGGGGTA---AA-CAGT---ATC-AAA-GATACCGAGC--TTAAC--ACAAAA--AC--A----AC------ATT---CTGT-A--G--G-CTAGG-----TTAA-TTATTTGTAAAG------GTCAAG--GT-CA-------TCT-A-AAA----A-------AA------A-----T-----AAT-------TTAA-G--G--G-G-T---A----GC---A-C-TACC---CA-TAA---CA----CA-AT---TAT-GGACCAG-G-TTCTGT----GGCAC-TAGG-TC-A---AAAAGT--T--TAAAAG--AAACAGAGCTTAGCACAAAAAA--ATT-A--A----CATT----T----T---G------T------A-G--TT--A--A-T--C----A--TTGGT--A-G----A---GGTCAAG--AT-CATACAAAA-AG-A--------A---G----------TA---------T-CA----GT--A---G-------TAG-T--------A-----C--------T--AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGATA---ACT-TGA-GACAAAACA-TTT-----CGG------AG-----G-----AG--C----------C--------AG----------AA----C----T----G-T---T-T---GCAG-GCCA---AGTTAATTATTCATAGA------GGT------TAAGAC---CA------TCTG-AAAA--AAAT---TTGCTTTTTT-T--TTTTAGTAATACTACCCACA-AC-ACAGTTATGAAC--C--A--TTTTGT-GACAC-----T--G-T--CAAATAGTTTC---AT--AAACAGAG-CTGAAT---G----CAAA--------A--------------ATCT----AA---------C-A----T------AG-----T-----GT------------------AGGT------TAAGGTTA-C-CAGAAAAAAAAATG-CATGGTTTTGATTAGTACTATCGAT-AA-GCAACTATGGACCAGGT
gi|10 : atatcatcatggtctatttgttcaataataagtagaatttgtattgtaccttgaaatgtgccagtctacacgaaggcccctgttttgactagtgacactTTCACAAT-A--ACAAGAAAATTCCCCAGAATTCAATGTCTCA------TCTATATT-GCTTGACCAC--AAAGAGAG---ACCATGAAG-AGTC------TAG--TTA--T
gi|11 : tctaaatgaaatttcattgtagtA--TTT----ATTACA-C------------ACTCAT-AGATAACGTTTAGT-TTCT---CT--GGG-AA---AATCAGT---CTC-AA------CAGAGA--TAAGC--A---AA--GC--ATTTAAT------ATT---TTGT-A--G--G-CTAAG-----T------GTC--TCGAA------CGCATG--GC-CA-------TTT-G-AAA----T-------AGTGCTT-A-----T-----GTT-------TT---------G-G-T---A----GT---AACATAGC---CA-TTA---CT----CA-AA---TAT-TGACCAA-G-TTTAAT----GACTC-TGGT-TT-A---CAAAAT--G--TAAACG--AAAGAGAGCTAAACACAAAATA--G-T-A--A----TATA----G----T---G------T------ATG--CT--A--A-gaaggagagacaaagacttgacaagttacatcactacagatgcaagaccatatcatgatatttgtctatcaattttcaattaaggatatttctacacatttataaaagaagtttacattgtgttagggtcaa
gi|12 : TTA-AATTATCATAAAAGAGTTCTACGGAATTGAATGTCTAA-CT---T--AAATC-GCTTTATCAC--TAAGTGAG---GCTATAAAGAAGTT------TAG--TTA--TTTTA--GTTACA-C------------AACTAT-AAACACAATTAGAT-GACT---CT-TGAG-CA---AG-CAGC---TTC-AAA-TAAACGGATC--TTAAT--ACAAAATCAT--A----AC------ATT---TTGT-A--G--G-CTATG-----TTAA-TTATC
gi|13 : ctaactacaaattttattaagg--CATACAGTTTC-T-AA--AAACATAGTCTTAAC---A----CTGG--------GTGGGCC--------ATTT----AGTTATTCATCC-A----T------AA-------------------------------AGGT------AAAGGTCA-C-CAT-TAAAATGCTG-CATGG-ATTAATTAGattgaagacttgatagtct
gi|13 : ---GTGG-GCCATTTAGTTATTCATCCATAAA------GGT------AAAGGT---CA------CC---ATTA--AAATG--CTGCATGGAT-TAATTAGAGAAGAACAACCCCTACAC-AGAAATA-GAAC--A--A--ACTGATTGACTCGTAACT--GGT--CAAATGGTTTC-TGAG--AAACAGAG-CTTAAC---G----CAAA--------A--------------ACTT----TA---------C-A----agaagaacaacccctacacagaaatagaacaaactgattgactcgtaactggtcaaatggtttctgagaaacagagcttaacgcaaaaactttacactgaattgttgacgcagatgcaaccatcgtaacca
gi|14 : catacagtttctaaaaacatagtcttaacactggC------ATT---AAGT-A--G--A-TCAAG-----TTTA-ATATCAGT-----------TCAAG--GT-CA-------TCCCG-AAA----A-------A-------------T-----GTT-------GTA--T--G--GTG-T---ATAGAGT---A-T-T---------TAA---CG----TA-AC---TAT-AAACCAA-A-TTTGGT----GAATC-TA-G-CC-A---AACATT--TTCTAAAAGAAAAACAGTGCTAAATGC-AAATA--CTT-AAGA----CGTTGAGATAAAGT---G------T------A----TT--A--A-CTGT----A--TATGT--C-A----A---GGTGAAG--GT-CATTCGAAA-AA-ctgaattgttgacgcagatgcaaccatcgtaacca
gi|15 : aacttat------------AACTAT-GGACCAAATTTGGT-GGTT---CT-TTAC-TA---AA-TTGT---TTTTGAA-GAAACAGA--------C--ATAAAT--TA--A----AC------ATT---CAGT-A--G--G-CAAAA-----TTAT-TCATCATTAGAT------GTCAAG--GT-CA-------TCC-A-AAA----AGTGCTGCAA------A-----T------CT-------TCA----------G-T---A----GG---A-A-TACC---CA-CAA---CA----CA-AG---TAT-GAACCAA-A-TTTttgctacatgtatt
gi|16 : gAATTTGGT-GACT---CT-TGAA-CA---AA-CAG----TTC-AAATGAAATGGAGC--TTAAC--ACAAA-------A----AC------ATT---TTGC-A--GCAGTCTAAT-----TT-A-TTATCAGTAGAG------GTCAAG--GT-C--------T------AG----A-------AA------A-----T-----GCTGCATA--TTT--T--G--G-G-T---A----GT---G-C-TACC---CA-TAA---CA----CA-AT---TAT-GGACTAA-G-TTTAGT----GATGC-TT-G-CC-A---AGTAGT--T--TAAAAG--AAACGAAGCTAAATGCAAAAAttcattggaataattcagacaaaaacacttaaaataaggaggataaaatta
gi|17 : catttAAA--TTT-A--A----TATT----T----T---G------T------A-GGATA--A--A-T--T----A--TTCAT--ATG----A---GTTCAA-------AT--GAAA-AT-A--------T---G----------TTGCGTGTGTTT-TA----GT--A---G-------TAA-T--------ATACAAC--------TGGAT----C----C-----------A-----------------AT-------------T-----TGGTG---ACTCTGA-GACAAG------------CAA------AG-----G-----AA--CATAAATA---C--------AT----------AA----C----T----G-T---T-A---GTAC-ATAA---AGTTTATTATCTAAAGA------GGT------CAAta
gi|18 : --TCAAC--GCAAAA--AC--A----AC------GCG---TTGT---------CT---------TAA-TTATTTGAAAAG------GTCAAC--TT-TA-------TTT-----A----A-------AA------C-----T-----CCA-------TT---G--G--A-A-A---A----GT---A-C-TACC---TA-TAA---CA----CA-GA---TTC-GGACCAG----TTACT----GACTC---AG-TC-A---AACCGT--T--TCAGAG--AAACCAGGCTGAACACAAatgtatccaaagtaatattgcaatgc
gi|19 : AATTA---TAGGAGAATTCCACAGAATCAAATGTCT---CT---TCTATATC-CCATTATCATAAAAAATGAA---GCTATtatagatattg
gi|2 : atatggaatttctaAGAGAATACCACATAATTAA-TGTCTCA-CT---T--ATATC-GCTTTACCAC--AAAGTGAA---GCTATGAGGAGGTT--C-A-GA----TA--T-C----ATTACA-tgtaaatgatgaaactattcaatgtcaaagatgcacagatcacatcaaatagatatatgcaataccattatca
gi|2 : ttAAGCAAAGC--T-AAT--ACATAC--AC--AC---AT------ATT---GTGT-AAGG--G-TCAAGGTTAATTAA-TTATCCATAGAGAACTATGTCAAG--GC-TA-------TCC-A-AAAT---A-------AA------ACTGCTT-----GAT-------TT---G--G--A-G-T---A----GT---C-T-TACC---TA-TAA---CA----CA-AC---TAT-GAGTCAA-A-TGTGGT----GACTG-TGGA-AC-A---AACAGT--T--TCAAAG--AAATGAAGCTAAACA-AAAAAA--ATT-----------TT----T----T---T------T-----------TT--ACCA-T-------A--TCTGT--A-G----A---AGTCAAA--GT-CAGCCAAAACAA-A--------A---GGCTGAATGGCTT---------T-CA----GT--A---GTTGTACCTAA-TTATTAATGA-----T--------T--ATAAAGC----T-----------AGAA--------------ACCATAT--------T-----TTGTA---TCTCTAA-GGC-AAACAGTTT-----CAAAAGATCAG-----G-----AG--CTACATG----C--------AA----------AA----C----TTA--A-TATCT-T---GTA--GCTA---AGTTAATTATCCATAAA------GGT------CAAGGT---CA------TC---AAAA--AAATG--CTGCCTGG---T--TTTGAGTCATGTTACCCATT-ACAATAGC-ATAAACAGA--A--TTTGGT-GAATC-----T--G-GGACAAACAATTGA---AG--CAACAGTG-CTAAAA---A----T-AA--------A--------------ACTTAAAAAA---------C-AAAGCT------AA-----TTATACAT------------------AGGT------CAAGGCCATC-CAATAAAAATGCTG-CATTGTTTTGAGTTGTTCTATCCAG-TACACAACTATGAAaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcataagcaaagctaatacatacacacatattgtgtaagggtcaaggttaattaattatccatagagaactatgtcaaggctatccaaaataaaactgcttgatttggagtagtcttacctataacacaactatgagtcaaatgtggtgactgtggaacaaacagtttcaaagaaatgaagctaaacaaaaaaaattttttttttaccatatctgtagaagtcaaagtcagccaaaacaaaaggctgaatggctttcagtagttgtacctaattattaatgattataaagctagaaaccatattttgtatctctaaggcaaacagtttcaaaagatcaggagctacatgcaaaacttaatatcttgtagctaagttaattatccataaaggtcaaggtcatcaaaaaaatgctgcctggttttgagtcatgttacccattacaatagcataaacagaatttggtgaatctgggacaaacaattgaagcaacagtgctaaaaataaaacttaaaaaacaaagctaattatacataggtcaaggccatccaataaaaatgctgcattgttttgagttgttctatccagtacacaactatgaaaaaaaattggtttctcttaagcaaaaagtttaaaagaaaatgagtgtaaca
gi|2 : ttagagaataccacataattaatgtctcacttatatcgctttaccacaaagtgaagctatgaggaggttcagatatcattacaaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcatG--TTA--CCC----ATTACAAT------------AGC-AT-AAACAGAATTTGGT-GAAT---CT-GGGA-CA---AA-CAAT---T---GAA-GCAACAGTGC--T--------AAAA--AT--A----AA------ACT---TAAA-A--A--A-CAAAG-----CTAA-TTATACAT--AG------GTCAAG--GC-CA-------TCC-A-ATA----A-------AA------A-----T-----GCTGCATTG-TTT--T--G--A-G-T---T----GT---T-C-TATC---CA-GTA---CA----CA-AC---TAT-GAAAAAA-A-ATTGGT----TTCTC-TTAA-GC-A---AAAAGT--T--TAAAAG--AAAATGAGTGTAACAaaaaaattggtttctcttaagcaaaaagtttaaaagaaaatgagtgtaaca
gi|20 : ttagagaataccacataattaatgtctcacttatatcgctttaccacaaagtgaagctatgaggaggttcagatatcattacaaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcataagcaaagctaatacatacacacatattgtgtaagggtcaaggttaattaattatccatagagaactatgtcaaggctatccaaaataaaactgcttgatttggagtagtcttacctataacacaactatgagtcaaatgtggtgactgtggaacaaacagtttcaaagaaatgaagctaaacaaaaaaaattttttttttaccatatctgtagaagtcaaagtcagccaaaacaaaaggctgaatggctttcagtagttgtacctaattattaatgattataaagctagaaaccatattttgtatctctaaggcaaacagtttcaaaagatcaggagctacatgcaaaacttaatatcttgtagctaagttaattatccataaaggtcaaggtcatcaaaaaaatgctgcctggttttgagtcatGACAATTGCACTGTATTAAATGTCTCA-C-----CTATATG-GCTTTATCAC--AAAAAGAG---GCTATGAACAAGTC--A-A-GTG--GT---TCC----AGTA
gi|21 : tgtaaccaagaataagttGT-G--G--G-CCAGG-----TTAT-TCATCTATAGAG------CTCACG--GT-CA-------TT----AAA----A-------AA------A-----T-----GTT-------gtatctacctattatgcaatta
gi|22 : agaaacagaaaataaaacgtgaaaacttaaagcAGTAGTTTTACTAAGAGA-----TG-AAAATATGAACTTCGAACTAGTACTTGCTTACAAATTCGACCATA--------------TTAGGAGCA-GTT-CTAACAACATTTACAATTgcattgttaatagaaatacccaaaagtcagcagctgta
gi|23 : tttcaatttgcgaaAG--AAACGGTAC--AACACGCAAAT--ACT-A--AACATTATT----T----T---A------T------AAG--TT--A--T-A--C----A--TTCAT--A-G----A---GGTCAAT--GT-CACATGAAA-AA-A--------
gi|24 : ccaaataccatttgC---CA-TCA---CA----CA-GC---TAT-GGATCAA-A-TT------------C-TGGG-TT-A---AAAAGT--G--TCTAAG--AAACGGAGCTAAAACCAAAAAC--ATT-AC-A----CACT----A----T---G------T------G-GATTT--A--A-
gi|25 : TATCTGTGAAT------GTTGAG--GT-CA-------TTC-C-AAA----A-------AT------A-----T-----GCT---------------A--G-A-T---G----GT---A-C-T
gi|26 : TCTCG-TT---T--AT-TCAGCTTTATCAC--AAATAGAG---GCTAT-AAAAAGTC--A-A-gagttatgttacc
gi|3 : AAATGTCTCG------TCTATACT-GTTTTATCCC--AAAATGAA---GCTATGAAGAAA----A-A-CCG--TTAATTCTGCCGATTACA-C------------AACTGA-GAACAAAATTTGGG-GACT---TT-TGGA-CA---GA-CAGT---CCT-AAA-GAATCGCAGC--TCAAA--ACAAAA--ACTTA----AC------ATT---TTGT-A--A--GCCTA-------TTAA-TTAATTGTAGAG------TTCAAG--GC-CA-------TCT--------------------------------T-----GCT---------------G--C-A-C---A----TT---A-C-TA-C---CA-TAA---CAATATCATACTGATAT-GACCCAA-AGTTTACT----GGCTA-TCAG-TC-A---AACAGT--T--TAAAAG--AAACAAAGCTAAACACAAAACA--TGA-A--A----TATT----T----T---G------T------A-AACTA--A--A-A--CAACAA--TAAGT--A-C----A---GGTCAAG--GT-TATCTAAAA-AA-A--------C---G----------TC---------T-g
gi|3 : ctacTAC-ACCTATA-AC-ACG-CTA----C--C--A----------ACTT-----T--GGT--TAAACAGTTTC-TGAA--AAACAGAG-GAAAAC---A----CAGA--------ATCTGTTGTAGGCCAAGTT----AA---------CTA----TTCGTAAAG-----------GTCA----------------AGGT------CAAGGTCA-T-CTGAAAATAAAATGACCTGCTTTTCAGTCGTGCTACCCAT-AACAC-ACTTTGAACgcatcatttttaactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcatacacctataacacgctaccaactttggttaaacagtttctgaaaaacagaggaaaacacagaatctgttgtaggccaagttaactattcgtaaaggtcaaggtcaaggtcatctgaaaataaaatgacctgcttttcagtcgtgctacccataacacactttgaacaatttgatgactccaggtcaactcgtttttgaaaaacggagcttaacactagaactaaacattgtgtaggctaccccgaaaaaaagctgcatgattttgattattatcatctatataacaactgcggacctccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|3 : ctacaaatgtctcgtctatactgttttatcccaaaatgaagctatgaagaaaaaccgttaattctgccgattacacaactgagaacaaaatttggggacttttggacagacagtcctaaagaatcgcagctcaaaacaaaaacttaacattttgtaagcctattaattaattgtagagttcaaggccatcttgctgcacattactaccataacaatatcatactgatatgacccaaagtttactggctatcagtcaaacagtttaaaagaaacaaagctaaacacaaaacatgaaatattttgtaaactaaaacaacaataagtacaggtcaaggttatctaaaaaaacgtctgcatcatttttaactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcaAAAACA-----------G------AG-----G-----AAAACA---------C--------AG----------AAT---C----T----G-T---T-----GTAG-GCCA---AGTTAACTATTCGTAAA------GGT------CAAGGT---CAAGGTCATCTG-AAAATAAAATGACCTGCTT---------TTCAGTCGTGCTACCCATA-AC-ACA-CTTTGAAC--A--A--TTTGAT-GACTC-----CAGG-T--CAACTCGTTTT-TGAA--AAACGGAG-CTTAAC---A----CTAG--------A--------------ACTA----AA---------C-A----T------TG-----T-----GT------------------AGGC------TA----CC-C-C-GAAAAAAAGCTG-CATGATTTTGATTATTATCATCTAT-ATAACAACTGCGGACCaatttgatgactccaggtcaactcgtttttgaaaaacggagcttaacactagaactaaacattgtgtaggctaccccgaaaaaaagctgcatgattttgattattatcatctatataacaactgcggacctccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|4 : ctacaaatgtctcgtctatactgttttatcccaaaatgaagctatgaagaaaaaccgttaattctgccgattacacaactgagaacaaaatttggggacttttggacagacagtcctaaagaatcgcagctcaaaacaaaaacttaacattttgtaagcctattaattaattgtagagttcaaggccatcttgctgcacattactaccataacaatatcatactgatatgacccaaagtttactggctatcagtcaaacagtttaaaagaaacaaagctaaacacaaaacatgaaatattttgtaaactaaaacaacaataagtacaggtcaaggttatctaaaaaaacgtctgcatcatttttaactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcatacacctataacacgctaccaactttggttaaacagtttctgaTTTGTACTACCTAT-AACAAAATTATGGACAAAGTtccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|4 : aaacacacaagagtTA--CCT----ATAACA-A------------AATTAT-GGACAAAGTTTAGT-GACT---CT--GGG-TA---AA-TTGA---TTA-AAA-GAATAAAAATAATTAAA--AGATAA--AC--ATAA-ACCATAGAATT---TTAT-A--G--G-TTAAG-----TTAA-TTATTCATAGAG------GTCAAG--TT-CA-------TCT-G-AAG----A-------AAGTCTGCA-----T-----CAT-------TTT--G--ATTG-G-T---A----AT---A-C---CC---CA-TAA---CA----CA-AA---TAA-AGATCAA-A-GTTGGTATTAAACTA-TA-G-AC-ATTTAACAGT--T--TCTGAT--AAACAAAGGTCAATGC-AAAAA--CTT-C--A----CATT----T----TTAGG------TCA----A-G--TA--A--A-T--T----A--TTCGT--T-G----A---GACCAAGTTGTGCATT----------------------G----------TT---------T-TG--------A---G-------TAT-T--------A-----C--------T--AC----A----C-----------ATAAC-------------ACAGCTATGAAGCTTT-----TGATG---ACT-AAA-GACAATTTT-TTT-----TTG------AGAAACAG-----AG--C----------TTAACGCAAAA----------AA----CTAAAT----A-T---TGT---GTAGTATTA---AGTTATTCTTACGGCAT------GGT------CAAATT---CA-------CCG-AAAA--AA-----TTGCTGCAT---------GGTTATAATACCAATA-CC-AGAAC-ATA--------A--GTTGGT-GGCTT-----CAGG-C--CAAACAGTTTC-T-AACCAAAC-AAG-C-CAACTAAGGAATCAAATGTTTTCTA--------------GGTC----AA---------A-A----T------AGCCATAT-----GTCA----------------AGGTTAAGGGCAAGGTTA-CTCAAAAAAAATGCTA-CATTGTTTTGATT-TTACTATTCAG-AACACAACTATGGACCAAttagtgactctgggtaaattgattaaaagaataaaaataattaaaagataaacataaaccatagaattttataggttaagttaattattcatagaggtcaagttcatctgaagaaagtctgcatcattttgattggtaataccccataacacaaataaagatcaaagttggtattaaactatagacatttaacagtttctgataaacaaaggtcaatgcaaaaacttcacatttttaggtcaagtaaattattcgttgagaccaagttgtgcattgttttgagtattactacacataacacagctatgaagcttttgatgactaaagacaatttttttttgagaaacagagcttaacgcaaaaaactaaatattgtgtagtattaagttattcttacggcatggtcaaattcaccgaaaaaattgctgcatggttataataccaataccagaacataagttggtggcttcaggccaaacagtttctaaccaaacaagccaactaaggaatcaaatgttttctaggtcaaaatagccatatgtcaaggttaagggcaaggttactcaaaaaaaatgctacattgttttgattttactattcagaacacaactatggaccaatcactttttgagaaatcgtgctaaactaaaaaactgagcattgtgtaaagttattcacccatagaaatcatggtcacctgaaaaaagctgcatggttttgagaagtatatggaca
gi|4 : aaacacacaagagttttgtacCC----ATAACA-C------------AAATAA-AGATCAAAGTTGGT--ATTAAACTATAGA-CATTTAA-CAGT---TTC-TGA-TAAACAAAGG--TCAAT--GCAAAA--ACTTC----AC------ATT---TT-T-A--G--G-TCAAG-----TAAA-TTATTCGTTGAG------ACCAAGTTGTGCA-------T----------------------------------T-----GTT-------TT------G--A-G-T---A----TT---A-C-TACA---CA-TAA---CA----CA-GC---TAT-GAAGCT----TTTGAT----GACTA--AAG-AC-A---ATTTTT--T--TTTGAG--AAACAGAGCTTAACGCAAAAAA--CTA-A--A----TATT----G----T---G------T------A-GTATT--A--AGT--T----A--TTCTT--ACG----GCATGGTCAAA--TT-CA-CCGAAA-AA-AT-------T---G----------CT---------G-CATG--GT--T---A-------TAA-T--------A-----CCAA-----T--AC----CAGAAC-----------ATAA--------------G--------------T-----TGGTG---GCT-TCA-GGCCAAACAGTTTCTAACCAA------AC-----A-----AG--C----------C--------AACTAAGGAATCAA----A----T----GTT---T-T---CTAG-GTCA---AAATAGCCATATGTCAA------GGTTAAGGGCAAGGT---TA------CTCA-AAAA--AAA-----TGCTACATT-G--TTTTGATTTTACTATTCAGA-AC-ACAACTATGGAC--C--A------AT-CACT---------------------TTTT-G-AG--AAATCGTG-CTAAAC---T----AAAA--------A--------------ACTG----AG---------C-A----T------TG-----T-----GTAAAGTTATTCACCCATAGAAAT------CATGGTCA-C-CTGAAAAAA-GCTG-CATGGTTTTGAGAAGTA-TATtcactttttgagaaatcgtgctaaactaaaaaactgagcattgtgtaaagttattcacccatagaaatcatggtcacctgaaaaaagctgcatggttttgagaagtatatggaca
gi|5 : aaacacacaagagttttgtactacctataacaaaattatggacaaagtttagtgactctgggtaaattgattaaaagaataaaaataattaaaagataaacataaaccatagaattttataggttaagttaattattcatagaggtcaagttcatctgaagaaagtctgcatcattttgattggtaataccAATGA--ACATGAGAATTCCATGGAATTAAATGTCTAG-C-----CTATATC-CCTTTATCAC--ATAATGAG---GCTATGAAGAAGAC--A-AGTAGATCTA--CCC----ATTACA-C------------AACTAT-GAAAAAAA-----------------------A---AA-TAGT---TT--AAA-GAAATGGAGC--GTAAA--ACAAA-------A----TC------ATT---TTAT-A--G--T-TCAGG-----CTAA---A---ATAGAG------ATTAA-----------------T-G-GAA----A-------AC------A-----T-------T-------TT-----------G-T---A----A----G-C-TACC---CT-TAA---CA----CA-GC---TAT-GAATCAA----TTGGT-------------G-CC-A---AACAGT--T--TTTGAG--AAAAGGTGTTAAACACAAAAAC--A-T-A--A----TGTT----G----C---A------TAGACTAA-G--TT--A--T-A--C----A--TCCAA--A-G----A---GGCCAAG--GT-CACTCAAAG-AA-ATGCT----ACATG----------TT---------T-TA----G---G---G-------TAA-T--------A-----T--------T--AC----C----CCTTACACAACAATGG--------------ACCAACT--------T-----TGGTGATTATT-TG----CAAAACAGTTT-----CTG------AG-----A-----AA--CAATCTGTACGC--------AA----------AAAATTC----A----A-T---T-TTGCGTAG-GCTT---AGCTTTTCATCTATAGAGGTTAGGGT------CAAGGT---AA------ACTG-AAAA--AAA-----TGCTGCACTGT--TTTAATCAGTATTACCCATT-AC-ACAACTTTAAAC--CAAA--TTTGGT-GATTG-----TAGG-T--CAA---------------AAACAGAG-CTCAAC---A----CAAA--------A--------------Aggaca
gi|6 : aacagtctgtaaataaacaaaaaagtgtaGACCAA---TTTTAT----GGCTC-TGGA-TC-A---AATAGT--T--TAAAA----ACCAGAGGT--ACACAAAAAC--GC--A--A----CATT----T----T---GAAGGCTC------A-G--CTGAA--A-T--C----AAATT--T--A-G----A---GGTCAAA--GT-CATCTGCAA-AATA--------A---T----------TC---------TGCATGGGATCGA---G-------TAA-T--------A-----C--------A--AC----C----C-----------ATAACACAGCTATGAACCAT-------------T-----TGGTG---CCT-CCATGACAAACAA-TTT-----TTG------AGAAACGG-----AG--C----------TTAAGATA-AA----------AA----C----TAAATG-T---TGT---GTGG-ATCA---AGTTATTCATCC--AAA------GAT------CAAGGT---CA---------GTAAAC--AAATA--CTGCATGGTT-T--T--GAATTGAACTACTCATA-AC-ACAATTGTAGAC--C--AAGTTTGGT-GACTCTTT--T--G-T--C-AACAGTTTC-TGAT--AAATGGAG-CTAAAT---G----CGAA--------A--------------ataagtcttacgaaccagtcttacgaaccaacaccaagaaagtatcatgtatttctctgattttcgtttgaaaagccaagacaaaaatgtgtacagtatatcaaatagtgtttgatgcatgttacaatg
gi|6 : gttA--CCC----ATAACA-C------------AGCTAT-GAACCA--TTTGGT-GCCT---CC-ATGA-CA---AA-CAAT---TTT-TGA-GAAACGGAGC--TTAAG--ATAAAA--ACTAA----AT------GTT---GTGT-G--G--A-TCAAG-----TTAT-TCATCC--AAAG------ATCAAG--GT-CA-----------GTAAA----C-------AA------A-----T-----ACT-------GCA--T--G--G-T-TTTGA----ATTGAA-C-TACT---CA-TAA---CA----CA-AT---TGT-AGACCAA-G-TTTGGT----GACTCTTTTG-TC-----AACAGT--T--TCTGAT--AAATGGAGCTAAATGCGAAATG--TTT-----------TT----T----T----------------------TT--A-----------------------------A---AATAAAG--CT-AATT-GAAA-AA-CTT------A---A----------TG---------T-TAT---GTG-A---G-------CAA-A--------T-----T--------T--AT----T----C-----------AT-------------------------------T-----TGGTG---ATT-TGA-AGCCAAG------------TG------A------------------------------------AA----------AA----C----TTTACG-T---TGT---GTAT-TCCA---AG----TTATTCATAAA------GGT------CAAGGTGAACAATT---TCTG-AGAA--AAtgtttttttttaaaataaagctaattgaaaaacttaatgttatgtgagcaaatttattcatttggtgatttgaagccaagtgaaaaactttacgttgtgtattccaagttattcataaaggtcaaggtgaacaatttctgagaaaatagctcaatgcaaaaacttaaaattgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|6 : gttgaccaattttatggctctggatcaaatagtttaaaaaccagaggtacacaaaaacgcaacattttgaaggctcagctgaaatcaaatttagaggtcaaagtcatctgcaaaataattctgcatgggatcgagtaatacaAACAATTTC-TGAG--AAA-ATAG-CTCAAT---G----CAAA--------A--------------ACTT----AA---------A-A----T------tagctcaatgcaaaaacttaaaattgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|7 : gttgaccaattttatggctctggatcaaatagtttaaaaaccagaggtacacaaaaacgcaacattttgaaggctcagctgaaatcaaatttagaggtcaaagtcatctgcaaaataattctgcatgggatcgagtaatacaacccataacacagctatgaaccatttggtgcctccatgacaaacaatttttgagaaacggagcttaagataaaaactaaatgttgtgtggatcaagttattcatccaaagatcaaggtcagtaaacaaatactgcatggttttgaattgaactactcataacacaattgtagaccaagtttggtgactcttttgtcaacagtttctgataaatggagctaaatgcgaaatgtttttttttaaaataaagctaattgaaaaacttaatgttatgtgagcaaatttattcatttggtgatttgaagccaagtgaaaaactttacgttgtgtattccaagttattcataaaggtcaaggtgTAA-TTATCCACAGAG------ATCAAG--GG-CA-------TTC---AGA----A-------AA------A-----T-----GCT-------GCATTGTTG--A-T-T---A----TT---A-C-TATC---CA-TTA---CA----TG-AC---TAT-GG-CCAGTA-TTTGGT----GACAC-TGGG-GC-C---AACAGT--T--TCAAAG--AAATGGAGCTTAATGC--AAAA--ATTGA--A----CATT----T----T---G------T------A-G------A------------A--TTTGT--A-G----A----AT-----------TTCGAAA-AA-ATGCCCAACA---GT---------TA---------T-AA----GT--ACATG-------TAGTT--------A-----CATTGAGTTC--ACAA--C----C-----------ACAG--------------AC-------------TAAATGTGGCG---ACTCTGG-GGC-AAACAGTTT-----CAA------AG-----AAATACAG--C----------T--------AA----------AT----A----T------T---T-T---ATAG-GCtgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|7 : aattgTA--TCC----ATTACA-T------------GACTAT-GGCCAGTATTTGGT-GACA---CT-GGGG-CC---AA-CAGT---TTC-AAA-GAAATGGAGC--TTAAT--GCAAAA--ATTGA----AC------ATT---TTGT-A--G----------------AA-TT---TGTAGA-------AT------------------TTC-G--AA----A-------AA------A-----T-----GCCCAACAG-TTA--T--A--A-G-T---ACAT-GT---AGT-TA-----CATTGAGTTCA----CA-AC---CAC-AGACTAA-A-TGTGGC----GACTC-TGGG-GC-A---AACAGT--T--TCAAAG--AAATACAGCTAAATAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttaattatcacttgaattcaatgccattcaaagaaaatactgcatggttttgagcagaactatccatcaaccaatcattacaaacagtctcttagaaatgcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|7 : aattgtaattatccacagagatcaagggcattcagaaaaatgctgcattgttgattattac---AGTTAATTATCACTTGA------ATT------CAATGC---CA------TTCA-AAGA--AAATA--CTGCATGG---T--TTTGAGCAGAACTATCCAT------CAACCA---AT--C--A--TT------A----------------CAAACAGTCTCTT-AG--AAATGttttataggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttaattatcacttgaattcaatgccattcaaagaaaatactgcatggttttgagcagaactatccatcaaccaatcattacaaacagtctcttagaaatgcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|7 : aattgtaattatccacagagatcaagggcattcagaaaaatgctgcattgttgattattactatccattacatgactatggccagtatttggtgacactggggccaacagtttcaaagaaatggagcttaatgcaaaaattgaacattttgtagaatttgtagaatttcgaaaaaatgcccaacagttataagtacatgtagttacattgagttcacaaccacagactaaatgtggcgactctggggcaaacagtttcaaagaaatacagctaaatattttataggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT------CAATGCCA-TTCAAAGAAAATACTG-CATGGTTTTGAGCAGAACTATCCATCAAC-CAATCATcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|8 : aattgtaattatccacagagatcaagggcattcagaaaaatgctgcattgttgattattactatccattacatgactatggccagtatttggtgacactggggccaacagtttcaaagaaatggagcttaatgcaaaaattgaacattttgtagaatttgtagaatttcgaaaaaatgcccaacagttataagtacatgtagttacattgagttcacaaccacagactaaatgtggcgactctggggcaaacagtttcaaagaaatacagctaaatattttataggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttaattatcacttgaat-CA---AA-CAGT---TTC-TAA-AAAATAGTGC--TAAGCTTATAATG--TT--T----AC------ATG---TT-T-A--G--G-C-AAA-----TGAATTTAT-CATAAAG------GTCAAG--GT-CAGTGTCATTCC-A-AAA----A-------AA------G-----TGTATGGGT-------TTA--A--G--A-ATT---A----GT---A-C-TA------G-TTA---CA----CG-A----TATAGGTTCAA-A-TTCGGT----GACTC-CTGG-ACAA---AACA-T--T--TCTGAT--AAAAAGAATTTAACAC-AAAAA--CCT-A--A----CGCT----T----T-----------------------------A-T--T----A--TACGCCAA-GATTAA---GGTCGAG--GT-CACCCAAtacaaacagtctcttagaaatgcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|8 : TTACA-C------------GA-TATAGGTTCAAATTCGGT-GACT---CC-TGGA-CA---AAACA-T---TTC-TGA-TAAAAAGAAT--TTAAC--ACAAAA--ACCTA----AC------GCTTTATTAT-A--C--G-CCAAG--------A-TTA-------AG------GTCGAG--GT-CA-------CCC----AA----G-------TT------A-----T-----GCT-------GCA--T--G--G-T-TTTAA----GT---A-A-CACCAAGCA-TTA---CA----CT-AC---Tgttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactactgagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaaattatgtaccaattttagtgactctgttcgaaaagtatttaaaagaaatggagctaaacgcaagaaggtattatatttcaacaaacgct
gi|8 : caaacagtttctaaaaaatagtgctaagcttataatgtttacatgtttaggcaaatgaatttatcataaaggtcaaggtcagtgtcattccaaaaaaagtgtatgggtttaagaattagtactagTGAGAATGCTAAGAATAA-----A-A-TAA--TTA--TTG----GTTACG-CTTAAACGTTAAAAATTAT-GTACCAATTTTAGT-GACT---CT--GTT-CG---AA-AAGTAT-TTA-AAA-GAAATGGAGC--TAAAC--GCAAGA--Agagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaaattatgtaccaattttagtgactctgttcgaaaagtatttaaaagaaatggagctaaacgcaagaaggtattatatttcaacaaacgct
gi|8 : caaacagtttctaaaaaatagtgctaagcttataatgtttacatgtttaggcaaatgaatttatcataaaggtcaaggtcagtgtcattccaaaaaaagtgtatgggtttaagaattagtactagttacacgatataggttcaaattcggtgactcctggacaaaacatttctgataaaaagaatttaacacaaaaacctaacgctttattatacgccaagattaaggtcgaggtcacccaagttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactacA-AT---TAT-GTACCAA-T-TTTAGT----GACTC-T-GT-TC-G---AAAAGTATT--TAAAAG--AAATGGAGCTAAACGCAAGAAGGTATT----A----TATT----T----ggtattatatttcaacaaacgct
gi|9 : caaacagtttctaaaaaatagtgctaagcttataatgtttacatgtttaggcaaatgaatttatcataaaggtcaaggtcagtgtcattccaaaaaaagtgtatgggtttaagaattagtactagttacacgatataggttcaaattcggtgactcctggacaaaacatttctgataaaaagaatttaacacaaaaacctaacgctttattatacgccaagattaaggtcgaggtcacccaagttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactactgagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaTTTATCAC--AATGTGAG---GCTACAAATAATTCTAATA-CAG--CTA--TCA----ACTACA-C------------AACTGC-TGACGACATTTGAT-GACT---TT-T-GA-CA---AA-CAATTTGTTT-AAG-GAAATTGATC--TTTAC--CCAAAA--ACTTA----TC------ATC---TTGT-A--A--G-TCAA------CAAA-TCATTTGTAATG------GTCAAG--AT-GA-------T-T-G-AAA----ACTTTCT-AT------A-----------GTT-------TT------T--G-G-T---A----TT---A-C-TACC---CA-TAA---TA----CA-AT---CAT-GGACCAA-G--TCGGTA---GGCTC-TGGGAAA-A---AACA----T--TAAAAG--AAACCGAGCTAGACAC--------ACC-A--A----CATG----T----T---A------TTAATA-A-G--TT--A--A-T--T----A--TTTGT--A-A----A---GGTTGAA--GT-AATcaacaaacgct
gi|9 : TA--CCC----ATAATA-C------------AATCAT-GGACCAAGTC-GGTAGGCT---CT--GGG-AA---AA-AACA---TTA-AAA-GAAACCGAGC--TAGAC--ACAC-----C--A----AC------ATG---TTATTA--A-----TAAG-----TTAA-TTATTTGTAAAG------GTTGAA--GT-AA-------T-------ATTTTA-------CA------A-----T-----GTTGGCATCATTA--T--G--A-G-T---A----GT---T-G-TACA---CC-TAA---CT----CA-AC---TAT-GGattttacaatgttggcatcattatgagtagttgtacacctaactcaactatgg
Alignments
lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222 1 1 55555555555555 1 1 1 111 2222222222 1111111 111111111111 11 222222222222 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111111 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 111111 111111 33333333333 4444444444444 5555555555555555555555555555555555 11111111 11111111 11111 0000000000000000000000000000000000000000
lowQualScore : 1 22 77777 5 5 1 22222222222222 1 5 5 5 2 3 111 0 9999999999 4 55 1 666 0 3333333 66 33 9999 333333333333 2 1 2 444 00 55 444 4 33 99999 2 1 22 2 22 333333333333 666666 333 2 22 7777 888888 0 2 777 2 555555 22 2 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 333 2 555 1 333 333 333 4444 1 4444 2 888 6666 6666 33 2 333 0 22 22 1 22 0 1 3 44444444 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 555 2 66 22 44 1 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 666 1 666 000000 000000 666 33333333333 55 55 0000000000000 444 1 55 4 77 0000000000000000000000000000000000 5 4 55 5 1 55555555 1 66666666 22222 1 6666666666666666666666666666666666666666 1 8 8 99 8 7 1 1 0 5
lowQualScore : . .. ..... . . . .............. . . . . . . ... . .......... . .. . ... . ....... .. .. .... ............ . . . ... .. .. ... . .. ..... . . .. . .. ............ ...... ... . .. .... ...... . . ... . ...... .. . .................................................................................... ... . ... . ... ... ... .... . .... . ... .... .... .. . ... . .. .. . .. . . . ........ .................................................................. ... . .. .. .. . . ............................................................................................................................................................................................................................................................... . ... . ... ...... ...... ... ........... .. .. ............. ... . .. . .. .................................. . . .. . . ........ . ........ ..... . ........................................ . . . .. . . . . . .
lowQualScore : 0 00 00000 0 5 0 55555555555555 0 5 0 0 5 2 888 4 1111111111 4 55 4 444 9 5555555 11 77 3333 777777777777 7 6 5 444 44 22 111 7 22 11111 4 8 99 7 99 333333333333 111111 777 1 99 1111 333333 8 0 444 0 888888 88 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 555 0 555 4 555 555 555 2222 9 3333 0 777 6666 8888 11 1 777 1 99 99 7 88 5 5 4 22222222 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 000 9 88 99 22 2 6 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 6 444 0 666 555555 555555 444 55555555555 00 55 7777777777777 666 4 11 4 44 0000000000000000000000000000000000 8 0 66 5 0 33333333 0 11111111 44444 4 8888888888888888888888888888888888888888 0 0 0 00 8 8 0 4 6 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTNCTANNAAGAGACAATTTGCAAAACATGAACTTCGAACTGGCACTTGCTNGCAAGTTCGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGNATGTTGCTGACAACATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCACGGAATTAAATGTCTCG-CT---TCTATATC-GCTTTATCAC--AAAGTGAG---GCTATGAAGAAGTC--A-A-NAG--TTA--TCC----ATTACAC------------AACTAT-GGACAAAATTTGGT-GACT---CT-TGGG-CA---AA-CAGT--TT---C-AAA-GAAACGGAGC--TTAAC--ACAAAA--AC--A----AC------ATT---TTGT-A--G--GCCAAG-----TTAA-TTATCCGTA-GAG------GTCAAG--GT-CA-------T-CCG-AAA----A-------AA--------A--TGC------T-------T----TA--G-----GG--T------AGT---A-C---TACC---CA---TAA---CA----CA-AC---TAT-GGACCAA-A-TTTGGT----GACTC-TGGG-NC-A---AACAGT--T--TNAAAG--AAACGGAGCTAAACGCAAAAAANT-TA--ACATT----T----T---G------T------A-G--TT--AA-T--C----A--T-TC-GT--A-G----A---G-GTCAAG--GT-CAT-CCGAAA-AA----A----A---G----------TNT-CAT---GT--AG-------TAAT--------AC---T------AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGGTG---ACT-TNAGGCCAAACAGTTT-----CNG------AG-----G-----A----GC-----------C--------AA----------AA----C----T----G-T---T-T---GTAG-GCCA---AGTTANTCATC-CGTA------AAGGT------CAAGGT---CA------TCCG-AAAA--AAATG--CTGCATGGTTT--TTTGAGTNGTACTACCCATA-AC-ACAACTATGAAC--C--A--TTTGGT-GACTC-----C---G-T--CAAACAGTTTCTG-A-GAAACGGAGCTNAAC---G----CAAA--------AACTT----AACATAGC-A--TGT-A---AGG-----------------T------CAAGGTTA-C-CA-GAAAAAANGCTGCATGGTTTTGATTAGTACTATCCATAACACAACTATGGACCAAGT
Reference ( family-260 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTNCTANNAAGAGACAATTTGCAAAACATGAACTTCGAACTGGCACTTGCTNGCAAGTTCGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGNATGTTGCTGACAACATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCACGGAATTAAATGTCTCG-CT---TCTATATC-GCTTTATCAC--AAAGTGAG---GCTATGAAGAAGTC--A-A-NAG--TTA--TCC----ATTACAC------------AACTAT-GGACAAAATTTGGT-GACT---CT-TGGG-CA---AA-CAGT--TT---C-AAA-GAAACGGAGC--TTAAC--ACAAAA--AC--A----AC------ATT---TTGT-A--G--GCCAAG-----TTAA-TTATCCGTA-GAG------GTCAAG--GT-CA-------T-CCG-AAA----A-------AA--------A--TGC------T-------T----TA--G-----GG--T------AGT---A-C---TACC---CA---TAA---CA----CA-AC---TAT-GGACCAA-A-TTTGGT----GACTC-TGGG-NC-A---AACAGT--T--TNAAAG--AAACGGAGCTAAACGCAAAAAANT-TA--ACATT----T----T---G------T------A-G--TT--AA-T--C----A--T-TC-GT--A-G----A---G-GTCAAG--GT-CAT-CCGAAA-AA----A----A---G----------TNT-CA----GT--AG-------TAAT--------AC---T------AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGGTG---ACT-TGAGGCAAAACAGTTT-----CNG------AG-----G-----A----GC-----------C--------AA----------AA----C----T----G-T---T-T---GTAG-GCCA---AGTTANTCATC-CGTA------AAGGT------CAAGGT---CA------TCCG-AAAA--AAATG--CTGCTTCGTTT--TTTGAGTNGTACTACCCATA-AC-ACAACTATGAAC--C--A--TTTGGT-GACTC-----T---G-T--CAAACAGTTTCTG-A-GAAACGGAGCTNAAC---G----CAAA--------AACTT----AACATAG-----TGT-A---AGG-----------------T------CAAGGTCA-C-CA-GAAAAAANGCTGCATGGTTTTGATTAGTACTATCCATAACACAACTATGGACCAAGT
gi|1 : AGTAGTACTAGAAAAAGACAATTTGCAAAACA-GAACTTCGAACTGACACTTACTAGCAAGTTTGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGGATATTGCTGACAA-ATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCATGGAATTAAATGTTTCGACTACATGTATATC-GCTTTATCAC--AAACTTAG---GCTATGAAGAAGTC--A-A-AAG--TTA--TCC----ATTACAA------------AACTAT-GAACAAAATTTTGT-GACT---CT-TGGGGTA---AA-CAGT--AT---C-AAA-GATACCGAGC--TTAAC--ACAAAA--AC--A----AC------ATT---CTGT-A--G--GCTAGG-----TTAA-TTATTTGTA-AAG------GTCAAG--GT-CA-------T-CTA-AAA----A-------AA--------A--TAA------T-------T----TAAGG-----GG--T------AGC---A-C---TACC---CA---TAA---CA----CA-AT---TAT-GGACCAG-G-TTCTGT----GGCAC-TAGG-TC-A---AAAAGT--T--TAAAAG--AAACAGAGCTTAGCACAAAAAAAT-TA--ACATT----T----T---G------T------A-G--TT--AA-T--C----A--T-TG-GT--A-G----A---G-GTCAAG--AT-CAT-ACAAAA-AG----A----A---G----------TAT-CA----GT--AG-------TAGT--------AC---T------AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGATA---ACT-TGAGACAAAACA-TTT-----CGG------AG-----G-----A----GC-----------C--------AG----------AA----C----T----G-T---T-T---GCAG-GCCA---AGTTAATTATT-CATA------GAGGT------TAAGAC---CA------TCTG-AAAA--AAAT---TTGCTTTTTTT--TTTTAGTAATACTACCCACA-AC-ACAGTTATGAAC--C--A--TTTTGT-GACAC-----T---G-T--CAAATAGTTTC---A-TAAACAGAGCTGAAT---G----CAAA--------AATCT----AACATAG-----TGT-----AGG-----------------T------TAAGGTTA-C-CA-GAAAAAAAAATGCATGGTTTTGATTAGTACTATCGATAA-GCAACTATGGACCAGGT
gi|10 : atatcatcatggtctatttgttcaataataagtagaatttgtattgtaccttgaaatgtgccagtctacacgaaggcccctgttttgactagtgacactTTCACAAT-A--ACAAGAAAATTCCCCAGAATTCAATGTCTCA------TCTATATT-GCTTGACCAC--AAAGAGAG---ACCATGAAG-AGTC------TAG--TTA--T
gi|11 : tctaaatgaaatttcattgtagtA--TTT----ATTACAC------------ACTCAT-AGATAACGTTTAGT-TTCT---CT--GGG-AA---AATCAGT--CT---C-AA------CAGAGA--TAAGC--A---AA--GC--ATTTAAT------ATT---TTGT-A--G--GCTAAG-----T------GTC--TC-GAA------CGCATG--GC-CA-------T-TTG-AAA----T-------AGTGCTT---A--TGT------T-------T----T---------GG--T------AGT---AACA--TAGC---CA---TTA---CT----CA-AA---TAT-TGACCAA-G-TTTAAT----GACTC-TGGT-TT-A---CAAAAT--G--TAAACG--AAAGAGAGCTAAACACAAAATAG--TA--ATATA----G----T---G------T------ATG--CT--AA-gaaggagagacaaagacttgacaagttacatcactacagatgcaagaccatatcatgatatttgtctatcaattttcaattaaggatatttctacacatttataaaagaagtttacattgtgttagggtcaa
gi|12 : TTA-AATTATCATAAAAGAGTTCTACGGAATTGAATGTCTAA-CT---T--AAATC-GCTTTATCAC--TAAGTGAG---GCTATAAAGAAGTT------TAG--TTA--TTTTA--GTTACAC------------AACTAT-AAACACAATTAGAT-GACT---CT-TGAG-CA---AG-CAGC--TT---C-AAA-TAAACGGATC--TTAAT--ACAAAATCAT--A----AC------ATT---TTGT-A--G--GCTATG-----TTAA-TTATC
gi|13 : ctaactacaaattttattaaggACAGTTT-----CTA------AA-----A-----ACATAGT-----------CTT------AA----------CA----C----T----G-G---------GTGG-GCCATTTAGTTATTCATC-CATA------AAGGT------AAAGGT---CA------CC---ATTA--AAATG--CTGCATGGATTAATTAGAGAAGAACAACCCCTACAC-AGAAATA-GAAC--A--A--ACTGATTGACTCGTAACT---GGT--CAAATGGTTTCTG-A-GAAACAGAGCTTAAC---G----CAAA--------AACTT----TACAattgaagacttgatagtct
gi|14 : catC------ATT---AAGT-A--G--ATCAAG-----TTTA-ATATCAGT------------TCAAG--GT-CA-------TCCCG---A----A-------AA--------A--TGT------T-------G----TA--T-----GG--TGTATAGAGT---A-T---T-----------TAA---CG----TA-AC---TAT-AAACCAA-A-TTTGGT----GAATC-T-AG-CC-A---AACATT--TTCTAAAAGAAAAACAGTGCTAAATGC-AAATACT-TAAGACGTTGAGATAAAGT---G------T------A----TT--AA-CTGT----A--T-AT-GT--C-A----A---G-GTGAAG--GT-CAT-TCGAAA-AA----ctgaattgttgacgcagatgcaaccatcgtaacca
gi|15 : aacttat------------AACTAT-GGACCAAATTTGGT-GGTT---CT-TTAC-TA---AA-TTGT--TT---TTGAA-GAAACAGA--------C--ATAAAT--TA--A----AC------ATT---CAGT-A--G--GCAAAA-----TTAT-TCATCATTA-GAT------GTCAAG--GT-CA-------T-CCA-AAA----AGTGCTGCAA--------A--T-C------T-------T----CA---------G--T------AGG---A-A---TACC---CA---CAA---CA----CA-AG---TAT-GAACCAA-A-TTTttgctacatgtatt
gi|16 : gAATTTGGT-GACT---CT-TGAA-CA---AA-CAG---TT---C-AAATGAAATGGAGC--TTAAC--ACAAA-------A----AC------ATT---TTGC-A--GCAGTCTAA-----TTTA-TTATCAGTA-GAG------GTCAAG--GT-C--------T------AG----A-------AA--------A--TGCTGCATAT-------T----TT--G-----GG--T------AGT---G-C---TACC---CA---TAA---CA----CA-AT---TAT-GGACTAA-G-TTTAGT----GATGC-T-TG-CC-A---AGTAGT--T--TAAAAG--AAACGAAGCTAAATGCAAAAAttcattggaataattcagacaaaaacacttaaaataaggaggataaaatta
gi|17 : cattt--A----AT------ATT---TTGT-A--G--GATAA---------A-TTATTCATATGAG------TTCAA-------A-------T---G-AAA----A-------TATGTTGCGTG--TGT------T-------T----TA--G---------T------AGT---A-------------A---TA----TA----CA-AC---T---GGATCCA-A-TTTGGT----GACTC-TGAG-AC-A---AGC----------AAAG--GAACA----TAAATACATAACTGT-TAGTACA-----------T---A------A------A-G--TT--TA-T--T----A--T-CT-AA--A-G----A---G-GTCAAAT-GT--AT-CCAAAta
gi|18 : aaattt--TCAAC--GCAAAA--AC--A----AC------GCG---TTGT---------C--------TTAA-TTATTTGAA-AAG------GTCAAC--TT-TA-------T-TT----A----A-------AA--------C--TCC------A-------T----TG--G-----AA--A------AGT---A-C---TACC---TA---TAA---CA----CA-GA---TTC-GGACCAG----TTACT----GACTC---AG-TC-A---AACCGT--T--TCAGAG--AAACCAGGCTGAACACAAgtaatattgcaatgc
gi|19 : AATTA---TAGGAGAATTCCACAGAATCAAATGTCT---CT---TCTATATC-CCATTATCATAAAAAATGAA---GCTATtatagatattg
gi|2 : atatggaatttctaAGAGAATACCACATAATTAA-TGTCTCA-CT---T--ATATC-GCTTTACCAC--AAAGTGAA---GCTATGAGGAGGTT--C-A-GA----TA--T-C----ATTACAtgtaaatgatgaaactattcaatgtcaaagatgcacagatcacatcaaatagatatatgcaataccattatca
gi|2 : ttAAGCAAAGC--T-AAT--ACATAC--AC--AC---AT------ATT---GTGT-AAGG--GTCAAGGTTAATTAA-TTATCCATA-GAGAACTATGTCAAG--GC-TA-------T-CCA-AAAT---A-------AA--------AC-TGC------T-------TGATTTG--G-----AG--T------AGT---C-T---TACC---TA---TAA---CA----CA-AC---TAT-GAGTCAA-A-TGTGGT----GACTG-TGGA-AC-A---AACAGT--T--TCAAAG--AAATGAAGCTAAACAAAAAAAATT-T------TT----T----T----------------------TT--TA-C--C----A--TATCTGT--A-G----A---A-GTCAAA--GT-CAG-CCAAAACAA----A----A---GGCTGAATGGCTTT-CA----GT--AGTTGTACCTAATTATTAATGAT---T------ATAAAGC----T-----------AGAA--------------ACCATAT--------T-----TTGTA---TCTCTAAGGC-AAACAGTTT-----CAAAAGATCAG-----G-----A----GCTACATG-----C--------AA----------AA----C----TTA--A-TATCT-T---GTA--GCTA---AGTTAATTATC-CATA------AAGGT------CAAGGT---CA------TC---AAAA--AAATG--CTGCCTGG--T--TTTGAGTCATGTTACCCATT-ACAATAGC-ATAAACAGA--A--TTTGGT-GAATC-----T---G-GGACAAACAAT---TGAA-GCAACAGTGCTAAAA---A----T-AA--------AACTTAAAAAACAAAGCTAATTAT-ACATAGG-----------------T------CAAGGCCATC-CA-ATAAAAATGCTGCATTGTTTTGAGTTGTTCTATCCAGTACACAACTATGAAaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcataagcaaagctaatacatacacacatattgtgtaagggtcaaggttaattaattatccatagagaactatgtcaaggctatccaaaataaaactgcttgatttggagtagtcttacctataacacaactatgagtcaaatgtggtgactgtggaacaaacagtttcaaagaaatgaagctaaacaaaaaaaattttttttttaccatatctgtagaagtcaaagtcagccaaaacaaaaggctgaatggctttcagtagttgtacctaattattaatgattataaagctagaaaccatattttgtatctctaaggcaaacagtttcaaaagatcaggagctacatgcaaaacttaatatcttgtagctaagttaattatccataaaggtcaaggtcatcaaaaaaatgctgcctggttttgagtcatgttacccattacaatagcataaacagaatttggtgaatctgggacaaacaattgaagcaacagtgctaaaaataaaacttaaaaaacaaagctaattatacataggtcaaggccatccaataaaaatgctgcattgttttgagttgttctatccagtacacaactatgaaaaaaaattggtttctcttaagcaaaaagtttaaaagaaaatgagtgtaaca
gi|2 : ttagagaataccacataattaatgtctcacttatatcgctttaccacaaagtgaagctatgaggaggttcagatatcattacaaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcatTA--TCC----AGTACAC------------AACTAT-GAAAAAAAATTGGT-TTCT---CT-TAAG-CA---AA-AAGT--TT---A-AAA-GAAAATGAGT--GTAAC--Aaaaaaattggtttctcttaagcaaaaagtttaaaagaaaatgagtgtaaca
gi|20 : ttagagaataccacataattaatgtctcacttatatcgctttaccacaaagtgaagctatgaggaggttcagatatcattacaaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcataagcaaagctaatacatacacacatattgtgtaagggtcaaggttaattaattatccatagagaactatgtcaaggctatccaaaataaaactgcttgatttggagtagtcttacctataacacaactatgagtcaaatgtggtgactgtggaacaaacagtttcaaagaaatgaagctaaacaaaaaaaattttttttttaccatatctgtagaagtcaaagtcagccaaaacaaaaggctgaatggctttcagtagttgtacctaattattaatgattataaagctagaaaccatattttgtatctctaaggcaaacagtttcaaaagatcaggagctacatgcaaaacttaatatcttgtagctaagttaattatccataaaggtcaaggtcatcaaaaaaatgctgcctggttttgagtcatgttacccattacaatagcataaacagaatttggtgaatctgggacaaacaattgaagcaacagtgctaaaaataaaacttaaaaaacaaagctaattatacataggtcaaggccatccaataaaaatgctgcattgttttgagttgttcGACAATTGCACTGTATTAAATGTCTCA-C-----CTATATG-GCTTTATCAC--AAAAAGAG---GCTATGAACAAGTC--A-A-GTG--GT---TCC----AGTA
gi|21 : tgtaaccaagaataagtt---GTGG-GCCA---GGTTATTCATC-TATA------GAGCT------CACGGT---CA------TT---AAAA--AAATG--TTGCATTGTT-------AATAGAAATACCCAAA-Agtatctacctattatgcaatta
gi|22 : agaaacagaaaataaaacgtgaaaacttaaagcAGTAGTTTTACTAAGAGA-----TG-AAAATATGAACTTCGAACTAGTACTTGCTTACAAATTCGACCATA--------------TTAGGAGCA-GTT-CTAACAACATTTACAATTgtcagcagctgta
gi|23 : tttcaatttgcgaaAG--AAACGGTACAACACGCAAATA-CT-AA--ACATTATT-T----T---A------T------AAG--TT--AT-A--C----A--T-TC-AT--A-G----A---G-GTCAAT--GT-CAC-ATGAAA-AA----A----
gi|24 : ccaaataccatttgC---CA---TCA---CA----CA-GC---TAT-GGATCAA-A-TT------------C-TGGG-TT-A---AAAAGT--G--TCTAAG--AAACGGAGCTAAAACCAAAAACAT-TAC-ACACT----A----T---G------T------G-GATTT--AA-
gi|25 : TATCTGTG-AAT------GTTGAG--GT-CA-------T-TCC-AAA----A-------AT--------A--TGC------T----------------A-----GA--T------GGT---A-C---T
gi|26 : TCTCG-TT---T--AT-TCAGCTTTATCAC--AAATAGAG---GCTAT-AAAAAGTC--A-A-gagttatgttacc
gi|3 : AAATGTCTCG------TCTATACT-GTTTTATCCC--AAAATGAA---GCTATGAAGAAA----A-A-CCG--TTAATTCTGCCGATTACAC------------AACTGA-GAACAAAATTTGGG-GACT---TT-TGGA-CA---GA-CAGT--CC---T-AAA-GAATCGCAGC--TCAAA--ACAAAA--ACTTA----AC------ATT---TTGT-A--A--GCCTA------TTAA-TTAATTGTA-GAG------TTCAAG--GC-CA-------T-CT------------------------------TGC------T----------------G-----CA--C------ATT---A-C---TA-C---CA---TAA---CAATATCATACTGATAT-GACCCAA-AGTTTACT----GGCTA-TCAG-TC-A---AACAGT--T--TAAAAG--AAACAAAGCTAAACACAAAACATG-AA--ATATT----T----T---G------T------A-AACTA--AA-A--CAACAA--T-AA-GT--A-C----A---G-GTCAAG--GT-TAT-CTAAAA-AA----A----C---G----------TCT-g
gi|3 : ctacAT--------AC----------AC----C----T-----------ATAAC-------------ACG------------C-----TACCA---ACT-TT-GGTTAAACAGTTT-----CTG------AA-----A-----A----ACAGAGGAAAACAC--------AG----------AAT---C----T----G-T---T-----GTAG-GCCA---AGTTAACTATT-CGTA------AAGGT------CAAGGT---CAAGGTCATCTG-AAAATAAAATGACCTGCTT--------TTCAGTCGTGCTACCCATA-AC-ACA-CTTTGAAC--A--A--TTTGAT-GACTC-----CAG-G-T--CAACTCGTTTTTG-A-AAAACGGAGCTTAAC---A----CTAG--------AACTA----AACATTG-----TGT-A---------------------------------GGCTA-C-CCCGAAAAAAAGCTGCATGATTTTGATTATTATCATCTATATAACAACTGCGGACCgcatcatttttaactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcatacacctataacacgctaccaactttggttaaacagtttctgaaaaacagaggaaaacacagaatctgttgtaggccaagttaactattcgtaaaggtcaaggtcaaggtcatctgaaaataaaatgacctgcttttcagtcgtgctacccataacacactttgaacaatttgatgactccaggtcaactcgtttttgaaaaacggagcttaacactagaactaaacattgtgtaggctaccccgaaaaaaagctgcatgattttgattattatcatctatataacaactgcggacctccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|4 : ctacaaatgtctcgtctatactgttttatcccaaaatgaagctatgaagaaaaaccgttaattctgccgattacacaactgagaacaaaatttggggacttttggacagacagtcctaaagaatcgcagctcaaaacaaaaacttaacattttgtaagcctattaattaattgtagagttcaaggccatcttgctgcacattactaccataacaatatcatactgatatgacccaaagtttactggctatcagtcaaacagtttaaaagaaacaaagctaaacacaaaacatgaaatattttgtaaactaaaacaacaataagtacaggtcaaggttatctaaaaaaacgtctgcatcatttttaactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcTTTGTACTACCTATAACAAAATTATGGACAAAGTtccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|4 : aaacacacaagagtTA--CCT----ATAACAA------------AATTAT-GGACAAAGTTTAGT-GACT---CT--GGG-TA---AA-TTGA--TT---A-AAA-GAATAAAAATAATTAAA--AGATAA--AC--ATAA-ACCATAGAATT---TTAT-A--G--GTTAAG-----TTAA-TTATTCATA-GAG------GTCAAG--TT-CA-------T-CTG-AAG----A-------AA--------GTCTGCATCA--T-------T----TT--GATT--GG--T------AAT---A-C-----CC---CA---TAA---CA----CA-AA---TAA-AGATCAA-A-GTTGGTATTAAACTA-T-AG-AC-ATTTAACAGT--T--TCTGAT--AAACAAAGGTCAATGC-AAAAACT-TC--ACATT----T----TTAGG------TCA----A-G--TA--AA-T--T----A--T-TC-GT--T-G----A---G-ACCAAGTTGTGCAT-T---------------------G----------TTT-TG--------AG-------TATT--------AC---T------AC----A----C-----------ATAAC-------------ACAGCTATGAAGCTTT-----TGATG---ACT-AAAGAC-AATTTTTTT-----TTG------AGAAACAG-----A----GC-----------TTAACGCAAAA----------AA----CTAAAT----A-T---TGT---GTAGTATTA---AGTTATTCTTA-CGGC------ATGGT------CAAATT---CA-------CCG-AAAA--AATTG--CTGCATGGTT-----------ATAATACCAATA-CC-AGAAC-ATAAG----------TTGGT-GGCTT-----CAG-G-C--CAAACAGTTTCTA-ACCAAAC-AAGC-CAACTAAGGAATCAAATGTTTTCTAGGTC----AAAATAGCCATATGTCA---AGG-----------------TTAAGGGCAAGGTTA-CTCA-AAAAAAATGCTACATTGTTTTGATT-TTACTATTCAGAACACAACTATGGACCAAttagtgactctgggtaaattgattaaaagaataaaaataattaaaagataaacataaaccatagaattttataggttaagttaattattcatagaggtcaagttcatctgaagaaagtctgcatcattttgattggtaataccccataacacaaataaagatcaaagttggtattaaactatagacatttaacagtttctgataaacaaaggtcaatgcaaaaacttcacatttttaggtcaagtaaattattcgttgagaccaagttgtgcattgttttgagtattactacacataacacagctatgaagcttttgatgactaaagacaatttttttttgagaaacagagcttaacgcaaaaaactaaatattgtgtagtattaagttattcttacggcatggtcaaattcaccgaaaaaattgctgcatggttataataccaataccagaacataagttggtggcttcaggccaaacagtttctaaccaaacaagccaactaaggaatcaaatgttttctaggtcaaaatagccatatgtcaaggttaagggcaaggttactcaaaaaaaatgctacattgttttgattttactattcagaacacaactatggaccaatcactttttgagaaatcgtgctaaactaaaaaactgagcattgtgtaaagttattcacccatagaaatcatggtcacctgaaaaaagctgcatggttttgagaagtatatggaca
gi|4 : aaacacacaagagttttgtacCC----ATAACAC------------AAATAA-AGATCAAAGTTGGT--ATTAAACTATAGA-CATTTAA-CAGT--TT---C-TGA-TAAACAAAGG--TCAAT--GCAAAA--ACTTC----AC------ATT---TT-T-A--G--GTCAAG-----TAAA-TTATTCGTT-GAG------ACCAAGTTGTGCA-------T---------------------------------TGT------T-------T----T---G-----AG--T------ATT---A-C---TACA---CA---TAA---CA----CA-GC---TAT-GAAGC---T-TTTGAT----GACTA--AAG-AC-A---ATTTTT--T--TTTGAG--AAACAGAGCTTAACGCAAAAAACT-AA--ATATT----G----T---G------T------A-GTATT--AAGT--T----A--T-TC-TT--ACG----GCATG-GTCAAA--TT-CA--CCGAAA-AA----AT---T---G----------CTG-CATG--GT--TA-------TAAT--------ACCAAT------AC----CAGAAC-----------ATAA--------------G--------------T-----TGGTG---GCT-TCAGGCCAAACAGTTTCTAACCAA------AC-----A-----A----GC-----------C--------AACTAAGGAATCAA----A----T----GTT---T-T---CTAG-GTCA---AAATAGCCATA-TGTC------AAGGTTAAGGGCAAGGT---TA------CTCA-AAAA--AAATG--CTACATTG--T--TTTGA-TTTTACTATTCAGA-AC-ACAACTATGGAC----------------------------------CAATCACTTTTTG-A-GAAATCGTGCTAAAC---T----AAAA--------AACTG----AGCATTG-----TGT-A---AAGTTATTCACCCATAGAAAT------CATGGTCA-C-CT-GAAAAAA-GCTGCATGGTTTTGAGAAGTA-TATtcactttttgagaaatcgtgctaaactaaaaaactgagcattgtgtaaagttattcacccatagaaatcatggtcacctgaaaaaagctgcatggttttgagaagtatatggaca
gi|5 : aaacacacaagagttttgtactacctataacaaaattatggacaaagtttagtgactctgggtaaattgattaaaagaataaaaataattaaaagataaacataaaccatagaattttataggttaagttaattattcatagaggtcaagttcatctgaagaaagtctgcatcattttgattggtaataccAATGA--ACATGAGAATTCCATGGAATTAAATGTCTAG-C-----CTATATC-CCTTTATCAC--ATAATGAG---GCTATGAAGAAGAC--A-AGTAGATCTA--CCC----ATTACAC------------AACTAT-GAAAAAAA-----------------------A---AA-TAGT--TT-----AAA-GAAATGGAGC--GTAAA--ACAAA-------A----TC------ATT---TTAT-A--G--TTCAGG-----CTAA---A---ATA-GAG------ATTAA------------------TG-GAA----A-------AC--------A--T--------T-------T----T----------G--T------AA----G-C---TACC---CT---TAA---CA----CA-GC---TAT-GAATCAA----TTGGT-------------G-CC-A---AACAGT--T--TTTGAG--AAAAGGTGTTAAACACAAAAACA--TA--ATGTT----G----C---A------TAGACTAA-G--TT--AT-A--C----A--T-CC-AA--A-G----A---G-GCCAAG--GT-CAC-TCAAAG-AA----ATGCTACATG----------TTT-TA----G---GG-------TAAT--------AT---T------AC----C----CCTTACACAACAATGG--------------ACCAACT--------T-----TGGTGATTATT-T---GCAAAACAGTTT-----CTG------AG-----A-----A----ACAATCTGTACG-C--------AA----------AAAATTC----A----A-T---T-TTGCGTAG-GCTT---AGCTTTTCATC-TATAGAGGTTAGGGT------CAAGGT---AA------ACTG-AAAA--AAATG--CTGCACTG--T--TTTAATCAGTATTACCCATT-AC-ACAACTTTAAAC--CAAA--TTTGGT-GATTG-----TAG-G-T--CAA--------------AAACAGAGCTCAAC---A----CAAA--------AAggaca
gi|6 : aacagtctgtaaataaacaaaaaagtgtaGACCAA---TTTTAT----GGCTC-TGGA-TC-A---AATAGT--T--TAAAA----ACCAGAGGTACAC---AAAAACG-CA--ACATT----T----T---GAAGGCTC------A-G--CTGAAA-T--C----AAAT-T---T--A-G----A---G-GTCAAA--GT-CAT-CTGCAA-AAT---A----A---T----------TCTGCATGGGATCGAG-------TAAT--------AC---A------AC----C----C-----------ATAACACAGCTATGAACCAT-------------T-----TGGTG---CCT-CCATGACAAACAATTT-----TTG------AGAAACGG-----A----GC-----------TTAAGATA-AA----------AA----C----TAAATG-T---TGT---GTGG-ATCA---AGTTATTCATC-C--A------AAGAT------CAAGGT---CA---------GTAAAC--AAATA--CTGCATGGTTT--T--GAATTGAACTACTCATA-AC-ACAATTGTAGAC--C--AAGTTTGGT-GACTC-----TTTTG-T--CAA-CAGTTTCTG-A-TAAATGGAGCTAAAT---G----CGAA--------Aataagtcttacgaaccagtcttacgaaccaacaccaagaaagtatcatgtatttctctgattttcgtttgaaaagccaagacaaaaatgtgtacagtatatcaaatagtgtttgatgcatgttacaatg
gi|6 : gttA--CCC----ATAACAC------------AGCTAT-GAACCA--TTTGGT-GCCT---CC-ATGA-CA---AA-CAAT--TT---T-TGA-GAAACGGAGC--TTAAG--ATAAAA--ACTAA----AT------GTT---GTGT-G--G--ATCAAG-----TTAT-TCATCC--A-AAG------ATCAAG--GT-CA-----------GTAAA----C-------AA--------A--TAC------T-------G----CA--T-----GG--TTTTG--AATTGAA-C---TACT---CA---TAA---CA----CA-AT---TGT-AGACCAA-G-TTTGGT----GACTCTTTTG-TC-----AACAGT--T--TCTGAT--AAATGGAGCTAAATGCGAAATGTT-T------TT----T----T----------------------TT--A-----------------------------A---A-ATAAAG--CT-AAT--TGAAA-AA----CTT--A---A----------TGT-TAT---GTG-AG-------CAAA--------TT---T------AT----T----C-----------AT-------------------------------T-----TGGTG---ATT-TGAAGCCA---AGT---------G------A---------------------------------------AA----------AA----C----TTTACG-T---TGT---GTAT-TCCA---AGTTATTCA-----TA------AAGGT------CAAGGTGAACAATT---TCTG-AGAA--AAtgtttttttttaaaataaagctaattgaaaaacttaatgttatgtgagcaaatttattcatttggtgatttgaagccaagtgaaaaactttacgttgtgtattccaagttattcataaaggtcaaggtgaacaatttctgagaaaatagctcaatgcaaaaacttaaaattgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|6 : gttgaccaattttatggctctggatcaaatagtttaaaaaccagaggtacacaaaaacgcaacattttgaaggctcagctgaaatcaaatttagaggtcaaagtcatctgcaaaataattctgcatgggatcgagtaatacaAACAATTTCTG-A-GAAA-ATAGCTCAAT---G----CAAA--------AACTT----AAAATtagctcaatgcaaaaacttaaaattgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|7 : gttgaccaattttatggctctggatcaaatagtttaaaaaccagaggtacacaaaaacgcaacattttgaaggctcagctgaaatcaaatttagaggtcaaagtcatctgcaaaataattctgcatgggatcgagtaatacaacccataacacagctatgaaccatttggtgcctccatgacaaacaatttttgagaaacggagcttaagataaaaactaaatgttgtgtggatcaagttattcatccaaagatcaaggtcagtaaacaaatactgcatggttttgaattgaactactcataacacaattgtagaccaagtttggtgactcttttgtcaacagtttctgataaatggagctaaatgcgaaatgtttttttttaaaataaagctaattgaaaaacttaatgttatgtgagcaaatttattcatttggtgatttgaagccaagtgaaaaactttacgttgtgtattccaagttattcataaaggtcaaggtgTAA-TTATCCACA-GAG------ATCAAG--GG-CA-------T-TC--AGA----A-------AA--------A--TGC------TGCA----T----TGTTG-----AT--T------ATT---A-C---TATC---CA---TTA---CA----TG-AC---TAT-GG-CCAGTA-TTTGGT----GACAC-TGGG-GC-C---AACAGT--T--TCAAAG--AAATGGAGCTTAATGC-AAAAATT-GA--ACATT----T----T---G------T------A-G------A----------A--T-TT-GT--A-G----A---ATTTCGAA--AA-AATGCCCAAC-AGTTATA----A---G----------TA--CAT---GT--AG-------TTAC--------AT---TGAGTTCACAA--C----C-----------ACAG--------------AC-------------TAAATGTGGCG---ACTCTGGGGC-AAACAGTTT-----CAA------AG-----AAATACA----GC-----------T--------AA----------AT----A----T------T---T-T---ATAG-GCtgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|7 : aattgTA--TCC----ATTACAT------------GACTAT-GGCCAGTATTTGGT-GACA---CT-GGGG-CC---AA-CAGT--TT---C-AAA-GAAATGGAGC--TTAAT--GCAAAA--ATTGA----AC------ATT---TTGT-A--G---------------AA-TT---TGTA-GA-------AT------------------T-TCG--AA----A-------AA--------A--TGC------C-------C----AA--C-----AG--TTATA--AGT---A-CATGTAGT---TACATTGAGTTCA----CA-AC---CAC-AGACTAA-A-TGTGGC----GACTC-TGGG-GC-A---AACAGT--T--TCAAAG--AAATACAGCTAAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttaattatcacttgaattcaatgccattcaaagaaaatactgcatggttttgagcagaactatccatcaaccaatcattacaaacagtctcttagaaatgcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|7 : aattgtaattatccacagagatcaagggcattcagaaaaatgctgcattgttgattattac---AGTTAATTATCACTTG------AA-TT------CAATGC---CA------TTCA-AAGA--AAATA--CTGCATGG--T--TTTGAGCAGAACTATCCAT------CAACC---AAT--C--A--TT------A-----------------CAAACAGTCTCTT-A-GAAATGtattttataggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttaattatcacttgaattcaatgccattcaaagaaaatactgcatggttttgagcagaactatccatcaaccaatcattacaaacagtctcttagaaatgcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|8 : aattgtaattatccacagagatcaagggcattcagaaaaatgctgcattgttgattattactatccattacatgactatggccagtatttggtgacactggggccaacagtttcaaagaaatggagcttaatgcaaaaattgaacattttgtagaatttgtagaatttcgaaaaaatgcccaacagttataagtacatgtagttacattgagttcacaaccacagactaaatgtggcgactctggggcaaacagtttcaaagaaatacagctaaatattttataggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-CA---AA-CAGT--TT---C-TAA-AAAATAGTGC--TAAGCTTATAATG--TT--T----AC------ATG---TT-T-A--G--G-CAAA-----TGAATTTAT-CATA-AAG------GTCAAG--GT-CAGTGTCATT-CCA-AAA----A-------AA--------G--TGTATGGG-T-------T----TA--A-----GAATT------AGT---A-C---TA------G---TTA---CA----CG-A----TATAGGTTCAA-A-TTCGGT----GACTC-CTGG-ACAA---AACA-T--T--TCTGAT--AAAAAGAATTTAACAC-AAAAACC-TA--ACGCT----T----T---------------------------A-T--T----A--T-AC-GCCAA-GATTAA---G-GTCGAG--GT-CAC-CCAAcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|8 : TTACAC------------GA-TATAGGTTCAAATTCGGT-GACT---CC-TGGA-CA---AAACA-T--TT---C-TGA-TAAAAAGAAT--TTAAC--ACAAAA--ACCTA----AC------GCTTTATTAT-A--C--GCCAAG--------A-TTA--------AG------GTCGAG--GT-CA-------C-CC---AA----G-------TT--------A--TGC------T-------G----CA--T-----GG--TTTTA--AGT---A-A---CACCAAGCA---TTA---CA----CT-AC---Tgttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactactgagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaaattatgtaccaattttagtgactctgttcgaaaagtatttaaaagaaatggagctaaacgcaagaaggtattatatttcaacaaacgct
gi|8 : caaacagtttctaaaaaatagtgctaagcttataatgtttacatgtttaggcaaatgaatttatcataaaggtcaaggtcagtgtcattccaaaaaaagtgtatgggtttaagaattagtactagTGAGAATGCTAAGAATAA-----A-A-TAA--TTA--TTG----GTTACGCTTAAACGTTAAAAATTAT-GTACCAATTTTAGT-GACT---CT--GTT-CG---AA-AAGTATTT---A-AAA-GAAATGGAGC--TAAAC--GCAAGA--Agagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaaattatgtaccaattttagtgactctgttcgaaaagtatttaaaagaaatggagctaaacgcaagaaggtattatatttcaacaaacgct
gi|8 : caaacagtttctaaaaaatagtgctaagcttataatgtttacatgtttaggcaaatgaatttatcataaaggtcaaggtcagtgtcattccaaaaaaagtgtatgggtttaagaattagtactagttacacgatataggttcaaattcggtgactcctggacaaaacatttctgataaaaagaatttaacacaaaaacctaacgctttattatacgccaagattaaggtcgaggtcacccaagttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactacA-AT---TAT-GTACCAA-T-TTTAGT----GACTC-TGT--TC-G---AAAAGTATT--TAAAAG--AAATGGAGCTAAACGCAAGAAGGTATT--ATATT----T----ggtattatatttcaacaaacgct
gi|9 : caaacagtttctaaaaaatagtgctaagcttataatgtttacatgtttaggcaaatgaatttatcataaaggtcaaggtcagtgtcattccaaaaaaagtgtatgggtttaagaattagtactagttacacgatataggttcaaattcggtgactcctggacaaaacatttctgataaaaagaatttaacacaaaaacctaacgctttattatacgccaagattaaggtcgaggtcacccaagttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactactgagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaTTTATCAC--AATGTGAG---GCTACAAATAATTCTAATA-CAG--CTA--TCA----ACTACAC------------AACTGC-TGACGACATTTGAT-GACT---TT-TGA--CA---AA-CAAT--TTGTTT-AAG-GAAATTGATC--TTTAC--CCAAAA--ACTTA----TC------ATC---TTGT-A--A--GTCAA------CAAA-TCATTTGTA-ATG------GTCAAG--AT-GA-------T-T---GAA----A-------AC--------T--TTC------T-------A----TA--GTTTTTGG--T------ATT---A-C---TACC---CA---TAA---TA----CA-AT---CAT-GGACCAA-G--TCGGTA---GGCTC-TGGGAAA-A---AACA----T--TAAAAG--AAACCGAGCTAGACACA------C-CA--ACATG----T----T---A------TTAATA-A-G--TT--AA-T--T----A--T-TT-GT--A-A----A---G-GTTGAA--GT-AAT-caacaaacgct
gi|9 : TA--CCC----ATAATAC------------AATCAT-GGACCAAGTC-GGTAGGCT---CT--GGG-AA---AA-AACA--TT---A-AAA-GAAACCGAGC--TAGAC--ACAC-----C--A----AC------ATG---TTATTA--A----TAAG-----TTAA-TTATTTGTA-AAG------GTTGAA--GT-AA-------T-------ATTTTA-------CA--------A--TGT------TGGCATCAT----TAT-G-----AG--T------AGT---T-G---TACA---CC---TAA---CT----CA-AC---TAT-GGattttacaatgttggcatcattatgagtagttgtacacctaactcaactatgg
Alignments
lowQualScore : 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222 1 1 55555555555555 1 1 1 111 2222222222 1111111 1111 111111111111 111111 11111 222222222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 11111111 55555555555555555555555555555555555555555555555 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 333333333333 22222222 444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 11111111 1111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111
lowQualScore : 1 22 77777 5 5 1 22222222222222 1 5 5 5 2 3 111 0 9999999999 4 55 1 666 0 3333333 66 33 0000 555555555555 1 2 0 555 444444 555 2 33 33333 2 2 33 3 111111111111 777777 2 33 4444 999999 55 2 7777777 33 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 444 333 5555 2 333 000 7777 8888 33 444 33 33 1 33 1 99999999 11111111111111111111111111111111111111111111111 44 9999 3 555 3 77 33 5555 3 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 555 1 99999999999 888888 555 666666666666 44 44 3 33333333 2 55 66 4 555555555555555555555555555555555555555555555 55 3 55 66 1 44444444 44444444 0000 000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6 6 333 7 1 5 2
lowQualScore : . .. ..... . . . .............. . . . . . . ... . .......... . .. . ... . ....... .. .. .... ............ . . . ... ...... ... . .. ..... . . .. . ............ ...... . .. .... ...... .. . ....... .. . .......................................................................... ... ... .... . ... ... .... .... .. ... .. .. . .. . ........ ............................................... .. .... . ... . .. .. .... . ...................................................................................................................................................................................................................................................................... . ... . ........... ...... ... ............ .. .. . ........ . .. .. . ............................................. .. . .. .. . ........ ........ .... ...................................................... . . ... . . . .
lowQualScore : 0 00 00000 0 5 0 55555555555555 0 5 0 0 5 2 888 4 1111111111 4 55 4 444 9 5555555 11 99 0000 888888888888 4 9 3 000 777777 000 9 99 11111 9 0 44 2 444444444444 222222 5 44 4444 222222 66 5 4444444 44 5 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 444 222 0000 2 999 666 4444 6666 44 111 22 22 8 11 3 44444444 33333333333333333333333333333333333333333333333 22 8888 1 444 1 33 99 7777 6 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 888 0 44444444444 888888 444 888888888888 22 66 3 22222222 3 55 22 0 000000000000000000000000000000000000000000000 88 6 66 77 0 44444444 55555555 6666 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 7 777 5 3 4 5
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTNCTANNAAGAGACAATTTGCAAAACATGAACTTCGAACTGGCACTTGCTNGCAAGTTCGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGNATGTTGCTGACAACATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCACGGAATTAAATGTCTCG-CT---TCTATATC-GCTTTATCAC--AAAGTGAG---GCTATGAAGAAGTC--A-A-NAG--TTA--TCC----ATTACAC------------AACTATGGACAAAATTTGGT-GACT---CT-TGGG-CA---AA-CAGT--TT---N-AAA-GAAACGGAGC--TTAACACAAAA--AC--A----AC------ATTTTGT-A--G--GTCAAG-----TTAATTATCCGTA-GAG------GTCAAG--GT-CAT-CCG-AAA----A-------AA--------A--TGC------T-------T----TA--G-----GGT------AGT---A-C-TACCCATAACA----CA-AC---TATGGACCAA-A-TTTGGT----GACTC-TGGG-NCA---AACAGT--T--TNAAAG--AAACGGAGCTAAACGCAAAAAANT-TA--ACATT----T----T---G------T------A-G--TT--AA-T--C----A--T-TC-GTA-GA---GGT-CAAG--GT-CAT-CCGAAA-AA----A--NG----------TNT-CATG---T-----AG-------TAAT--------AC---T------AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGGTGACTTNAGGNCAAACAGTTT-----CTG------AG-----A-----A-----GC-----------C--------AA----------A-----A----C----T----G-T---T-T---G------TAG-GCCA---AGTTATTCATC-CGTA------AAGGT------CAAGGT---CA-------TCCG-AAAA--AAATG--CTGCA-TGG-TT--TTTGAGTN-GTACTACCCATA-AC-ACAACTATG-----AAC--C--A--TTTGGT-GACTC----C-G-GT--CAAA-CAGTTTCTG-A-GAAACGGAGCTNAAC---G----CAAA--------AACTT----AAC--------ATA-GCCA---ATGT-A-AGG-----------------T------CAAGGTCA-C-CC-GAAAAAATGCTGCATGGTTTTGATTAGTACTATCCATAACACAACTATGGACCAAGT
Reference ( family-260 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTNCTANNAAGAGACAATTTGCAAAACATGAACTTCGAACTGGCACTTGCTNGCAAGTTCGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGNATGTTGCTGACAACATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCACGGAATTAAATGTCTCG-CT---TCTATATC-GCTTTATCAC--AAAGTGAG---GCTATGAAGAAGTC--A-A-NAG--TTA--TCC----ATTACAC------------AACTATGGACAAAATTTGGT-GACT---CT-TGGG-CA---AA-CAGT--TT---C-AAA-GAAACGGAGC--TTAACACAAAA--AC--A----AC------ATTTTGT-A--G--GCCAAG-----TTAATTATCCGTA-GAG------GTCAAG--GT-CAT-CCG-AAA----A-------AA--------A--TGC------T-------T----TA--G-----GGT------AGT---A-C-TACCCATAACA----CA-AC---TATGGACCAA-A-TTTGGT----GACTC-TGGG-NCA---AACAGT--T--TNAAAG--AAACGGAGCTAAACGCAAAAAANT-TA--ACATT----T----T---G------T------A-G--TT--AA-T--C----A--T-TC-GTA-GA---GGT-CAAG--GT-CAT-CCGAAA-AA----A--AG----------TNT-CATG---T-----AG-------TAAT--------AC---T------AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGGTGACTTNAGGCCAAACAGTTT-----CNG------AG-----G-----A-----GC-----------C--------AA----------A-----A----C----T----G-T---T-T---G------TAG-GCCA---AGTTANTCATC-CGTA------AAGGT------CAAGGT---CA-------TCCG-AAAA--AAATG--CTGCA-TGGTTT--TTTGAGTN-GTACTACCCATA-AC-ACAACTATG-----AAC--C--A--TTTGGT-GACTC----C---GT--CAAA-CAGTTTCTG-A-GAAACGGAGCTNAAC---G----CAAA--------AACTT----AAC--------ATA-GC-----ATGT-A-AGG-----------------T------CAAGGTTA-C-CA-GAAAAAANGCTGCATGGTTTTGATTAGTACTATCCATAACACAACTATGGACCAAGT
gi|1 : AGTAGTACTAGAAAAAGACAATTTGCAAAACA-GAACTTCGAACTGACACTTACTAGCAAGTTTGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGGATATTGCTGACAA-ATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCATGGAATTAAATGTTTCGACTACATGTATATC-GCTTTATCAC--AAACTTAG---GCTATGAAGAAGTC--A-A-AAG--TTA--TCC----ATTACAA------------AACTATGAACAAAATTTTGT-GACT---CT-TGGGGTA---AA-CAGT--AT---C-AAA-GATACCGAGC--TTAACACAAAA--AC--A----AC------ATTCTGT-A--G--GCTAGG-----TTAATTATTTGTA-AAG------GTCAAG--GT-CAT-CTA-AAA----A-------AA--------A--TAA------T-------T----TAAGG-----GGT------AGC---A-C-TACCCATAACA----CA-AT---TATGGACCAG-G-TTCTGT----GGCAC-TAGG-TCA---AAAAGT--T--TAAAAG--AAACAGAGCTTAGCACAAAAAAAT-TA--ACATT----T----T---G------T------A-G--TT--AA-T--C----A--T-TG-GTA-GA---GGT-CAAG--AT-CAT-ACAAAA-AG----A--AG----------TAT-CA-G---T-----AG-------TAGT--------AC---T------AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGATAACTTGAGACAAAACA-TTT-----CGG------AG-----G-----A-----GC-----------C--------AG----------A-----A----C----T----G-T---T-T---G------CAG-GCCA---AGTTAATTATT-CATA------GAGGT------TAAGAC---CA-------TCTG-AAAA--AAAT---TTGCT-TTTTTT--TTTTAGTA-ATACTACCCACA-AC-ACAGTTATG-----AAC--C--A--TTTTGT-GACAC----T---GT--CAAA-TAGTTTC---A-TAAACAGAGCTGAAT---G----CAAA--------AATCT----AAC--------ATA-G-------TGT---AGG-----------------T------TAAGGTTA-C-CA-GAAAAAAAAATGCATGGTTTTGATTAGTACTATCGATAA-GCAACTATGGACCAGGT
gi|10 : atatcatcatggtctatttgttcaataataagtagaatttgtattgtaccttgaaatgtgccagtctacacgaaggcccctgttttgactagtgacactTTCACAAT-A--ACAAGAAAATTCCCCAGAATTCAATGTCTCA------TCTATATT-GCTTGACCAC--AAAGAGAG---ACCATGAAG-AGTC------TAG--TTA--T
gi|11 : tctaaatgaaatttcattgtagtA--TTT----ATTACAC------------ACTCATAGATAACGTTTAGT-TTCT---CT--GGG-AA---AATCAGT--CT---C-AA------CAGAGA--TAAGCA---AA--GC--ATTTAAT------ATTTTGT-A--G--GCTAAG-----T-----GTC--TC-GAA------CGCATG--GC-CAT-TTG-AAA----T-------AGTGCTT---A--TGT------T-------T----T---------GGT------AGT---AACATAGCCATTACT----CA-AA---TATTGACCAA-G-TTTAAT----GACTC-TGGT-TTA---CAAAAT--G--TAAACG--AAAGAGAGCTAAACACAAAATAG--TA--ATATA----G----T---G------T------ATG--CT--AA-gaaggagagacaaagacttgacaagttacatcactacagatgcaagaccatatcatgatatttgtctatcaattttcaattaaggatatttctacacatttataaaagaagtttacattgtgttagggtcaa
gi|12 : TTA-AATTATCATAAAAGAGTTCTACGGAATTGAATGTCTAA-CT---T--AAATC-GCTTTATCAC--TAAGTGAG---GCTATAAAGAAGTT------TAG--TTA--TTTTA--GTTACAC------------AACTATAAACACAATTAGAT-GACT---CT-TGAG-CA---AG-CAGC--TT---C-AAA-TAAACGGATC--TTAATACAAAATCAT--A----AC------ATTTTGT-A--G--GCTATG-----TTAATTATC
gi|13 : ctaactacaaattttattaaggCATACAGTTT-----CTA------AA-----A-----ACATA-GT-----------CTT------AA----------C-----A----C----T----G-G---------G------TGG-GCCATTTAGTTATTCATC-CATA------AAGGT------AAAGGT---CA-------CC---ATTA--AAATG--CTGCA-TGGATTAATTAGAGAA-GAACAACCCCTACAC-AGAAATA-G-----AAC--A--A--ACTGATTGACTCGTAACTG-GT--CAAA-TGGTTTCTG-A-GAAACAGAGCTTAAC---G----CAAA--------AACTT----TAC--------Aattgaagacttgatagtct
gi|14 : C------ATTAAGT-A--G--ATCAAG-----TTTAATATCAGT------------TCAAG--GT-CATCCCG---A----A-------AA--------A--TGT------T-------G----TA--T-----GGTGTATAGAGT---A-T-T-----TAACG----TA-AC---TATAAACCAA-A-TTTGGT----GAATC-T-AG-CCA---AACATT--TTCTAAAAGAAAAACAGTGCTAAATGC-AAATACT-TAAGACGTTGAGATAAAGT---G------T------A----TT--AA-CTGT----A--T-AT-GTC-AA---GGT-GAAG--GT-CAT-TCGAAA-AA----T--TG----------CTA-CATG---T-----Actgaattgttgacgcagatgcaaccatcgtaacca
gi|15 : aacttat------------AACTATGGACCAAATTTGGT-GGTT---CT-TTAC-TA---AA-TTGT--TT---TTGAA-GAAACAGA--------CATAAAT--TA--A----AC------ATTCAGT-A--G--GCAAAA-----TTATTCATCATTA-GAT------GTCAAG--GT-CAT-CCA-AAA----AGTGCTGCAA--------A--T-C------T-------T----CA---------GT------AGG---A-A-TACCCACAACA----CA-AG---TATGAACCAA-A-TTTtt
gi|16 : gAATTTGGT-GACT---CT-TGAA-CA---AA-CAG---TT---C-AAATGAAATGGAGC--TTAACACAAA-------A----AC------ATTTTGC-A--GCAGTCTAA-----TTTATTATCAGTA-GAG------GTCAAG--GT-C-T------AG----A-------AA--------A--TGCTGCATAT-------T----TT--G-----GGT------AGT---G-C-TACCCATAACA----CA-AT---TATGGACTAA-G-TTTAGT----GATGC-T-TG-CCA---AGTAGT--T--TAAAAG--AAACGAAGCTAAATGCAAAAAttcattggaataattcagacaaaaacacttaaaataaggaggataaaatta
gi|17 : cattt--A----AT------ATTTTGT-A--G--GATAA---------ATTATTCATATGAG------TTCAA-------AT---G-AAA----A-------TATGTTGCGTG--TGT------T-------T----TA--G-------T------AGT---A--------ATA-TA----CA-AC---T--GGATCCA-A-TTTGGT----GACTC-TGAG-ACA---AGC----------AAAG--GAACA----TAAATACATAACTGT-TAGTACA-----------T---A------A------A-G--TT--TA-T--T----A--T-CT-AAA-GA---GGT-CAAAT-GT--AT-CCAAAta
gi|18 : aaattt--TCAACGCAAAA--AC--A----AC------GCGTTGT---------C--------TTAATTATTTGAA-AAG------GTCAAC--TT-TAT-TT----A----A-------AA--------C--TCC------A-------T----TG--G-----AAA------AGT---A-C-TACCTATAACA----CA-GA---TTCGGACCAG----TTACT----GACTC---AG-TCA---AACCGT--T--TCAGAG--AAACCAGGCTGAACACAAgtaatattgcaatgc
gi|19 : AATTA---TAGGAGAATTCCACAGAATCAAATGTCT---CT---TCTATATC-CCATTATCATAAAAAATGAA---GCTATtatagatattg
gi|2 : atatggaatttctaAGAGAATACCACATAATTAA-TGTCTCA-CT---T--ATATC-GCTTTACCAC--AAAGTGAA---GCTATGAGGAGGTT--C-A-GA----TA--T-C----ATTACAtgtaaatgatgaaactattcaatgtcaaagatgcacagatcacatcaaatagatatatgcaataccattatca
gi|2 : ttAAGCAAAGC--T-AATACATAC--AC--AC---AT------ATTGTGT-AAGG--GTCAAGGTTAATTAATTATCCATA-GAGAACTATGTCAAG--GC-TAT-CCA-AAAT---A-------AA--------AC-TGC------T-------TGATTTG--G-----AGT------AGT---C-T-TACCTATAACA----CA-AC---TATGAGTCAA-A-TGTGGT----GACTG-TGGA-ACA---AACAGT--T--TCAAAG--AAATGAAGCTAAACAAAAAAAATT-T------TT----T----T----------------------TT--TA-C--C----A--TATCTGTA-GA---AGT-CAAA--GT-CAG-CCAAAACAA----A--AGGCTGAATGGCTTT-CA-G---T-----AGTTGTACCTAATTATTAATGAT---T------ATAAAGC----T-----------AGAA--------------ACCATAT--------T-----TTGTATCTCTAAGGCAAACAGTTT-----CAAAAGATCAG-----G-----A-----GCTACATG-----C--------AA----------A-----A----C----TTA--A-TATCT-T---G------TA--GCTA---AGTTAATTATC-CATA------AAGGT------CAAGGT---CA-------TC---AAAA--AAATG--CTGCC-TGG--T--TTTGAGTC-ATGTTACCCATT-ACAATAGC-ATA-----AACAGA--A--TTTGGT-GAATC----T---GGGACAAA-CAAT---TGAA-GCAACAGTGCTAAAA---A----T-AA--------AACTTAAAAAAC--------AAA-GCTAATTATAC-ATAGG-----------------T------CAAGGCCATC-CA-ATAAAAATGCTGCATTGTTTTGAGTTGTTCTATCCAGTACACAACTATGAAaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcataagcaaagctaatacatacacacatattgtgtaagggtcaaggttaattaattatccatagagaactatgtcaaggctatccaaaataaaactgcttgatttggagtagtcttacctataacacaactatgagtcaaatgtggtgactgtggaacaaacagtttcaaagaaatgaagctaaacaaaaaaaattttttttttaccatatctgtagaagtcaaagtcagccaaaacaaaaggctgaatggctttcagtagttgtacctaattattaatgattataaagctagaaaccatattttgtatctctaaggcaaacagtttcaaaagatcaggagctacatgcaaaacttaatatcttgtagctaagttaattatccataaaggtcaaggtcatcaaaaaaatgctgcctggttttgagtcatgttacccattacaatagcataaacagaatttggtgaatctgggacaaacaattgaagcaacagtgctaaaaataaaacttaaaaaacaaagctaattatacataggtcaaggccatccaataaaaatgctgcattgttttgagttgttctatccagtacacaactatgaaaaaaaattggtttctcttaagcaaaaagtttaaaagaaaatgagtgtaaca
gi|2 : ttagagaataccacataattaatgtctcacttatatcgctttaccacaaagtgaagctatgaggaggttcagatatcattacaaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcatTA--TCC----AGTACAC------------AACTATGAAAAAAAATTGGT-TTCT---CT-TAAG-CA---AA-AAGT--TT---A-AAA-GAAAATGAGT--GTAACAaaaaaattggtttctcttaagcaaaaagtttaaaagaaaatgagtgtaaca
gi|20 : ttagagaataccacataattaatgtctcacttatatcgctttaccacaaagtgaagctatgaggaggttcagatatcattacaaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcataagcaaagctaatacatacacacatattgtgtaagggtcaaggttaattaattatccatagagaactatgtcaaggctatccaaaataaaactgcttgatttggagtagtcttacctataacacaactatgagtcaaatgtggtgactgtggaacaaacagtttcaaagaaatgaagctaaacaaaaaaaattttttttttaccatatctgtagaagtcaaagtcagccaaaacaaaaggctgaatggctttcagtagttgtacctaattattaatgattataaagctagaaaccatattttgtatctctaaggcaaacagtttcaaaagatcaggagctacatgcaaaacttaatatcttgtagctaagttaattatccataaaggtcaaggtcatcaaaaaaatgctgcctggttttgagtcatgttacccattacaatagcataaacagaatttggtgaatctgggacaaacaattgaagcaacagtgctaaaaataaaacttaaaaaacaaagctaattatacataggtcaaggccatccaataaaaatgctgcattgttttgagttgttcGACAATTGCACTGTATTAAATGTCTCA-C-----CTATATG-GCTTTATCAC--AAAAAGAG---GCTATGAACAAGTC--A-A-GTG--GT---TCC----AGTA
gi|21 : tgtaaccaagaataagtt---G------TGG-GCCA---GGTTATTCATC-TATA------GAGCT------CACGGT---CA-------TT---AAAA--AAATG--TTGCA-TTGTT-------AATA-GAAATACCCAAA-Agtatctacctattatgcaatta
gi|22 : agaaacagaaaataaaacgtgaaaacttaaagcAGTAGTTTTACTAAGAGA-----TG-AAAATATGAACTTCGAACTAGTACTTGCTTACAAATTCGACCATA--------------TTAGGAGCA-GTT-CTAACAACATTTACAATTgtcagcagctgta
gi|23 : tttcaatttgcgaaAG--AAACGGTACAACACGCAAATA-CT-AA--ACATTATT-T----T---A------T------AAG--TT--AT-A--C----A--T-TC-ATA-GA---GGT-CAAT--GT-CAC-ATGAAA-AA----A--
gi|24 : ccaaataccatttgCCATCACA----CA-GC---TATGGATCAA-A-TT------------C-TGGG-TTA---AAAAGT--G--TCTAAG--AAACGGAGCTAAAACCAAAAACAT-TAC-ACACT----A----T---G------T------G-GATTT--AA-
gi|25 : ATC-TGTG------AATGT------TGAGGT---CA-------TTCC-AAAA--ATATG--CTAGA-TGG--T--ACTGAGTT-ATGTTACC
gi|26 : tTCTCG-TT---T--AT-TCAGCTTTATCAC--AAATAGAG---GCTAT-AAAAAGTC--A-A-
gi|3 : AAATGTCTCG------TCTATACT-GTTTTATCCC--AAAATGAA---GCTATGAAGAAA----A-A-CCG--TTAATTCTGCCGATTACAC------------AACTGAGAACAAAATTTGGG-GACT---TT-TGGA-CA---GA-CAGT--CC---T-AAA-GAATCGCAGC--TCAAAACAAAA--ACTTA----AC------ATTTTGT-A--A--GCCTA------TTAATTAATTGTA-GAG------TTCAAG--GC-CAT-CT------------------------------TGC------T----------------G-----CAC------ATT---A-C-TA-CCATAACAATATCATACTGATATGACCCAA-AGTTTACT----GGCTA-TCAG-TCA---AACAGT--T--TAAAAG--AAACAAAGCTAAACACAAAACATG-AA--ATATT----T----T---G------T------A-AACTA--AA-A--CAACAA--T-AA-GTA-CA---GGT-CAAG--GT-TAT-CTAAAA-AA----A--CG----------TCTGCATg
gi|3 : ctacAT--------AC----------AC----C----T-----------ATAAC-------------ACG------------C-----TACCAACTTT-GGTTAAACAGTTT-----CTG------AA-----A-----A-----ACAGAGGAAAACAC--------AG----------A-----AT---C----T----G-T---T-----G------TAG-GCCA---AGTTAACTATT-CGTA------AAGGT------CAAGGT---CAAGGTCA-TCTG-AAAATAAAATGACCTGC-------T--TTTCAGTC-GTGCTACCCATA-AC-ACA-CTTTG-----AAC--A--A--TTTGAT-GACTC----CAG-GT--CAAC-TCGTTTTTG-A-AAAACGGAGCTTAAC---A----CTAG--------AACTA----AAC--------AT----------TGT-----G-----------------T--------AGGCTA-C-CCCGAAAAAAAGCTGCATGATTTTGATTATTATCATCTATATAACAACTGCGGACCcatttttaactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcatacacctataacacgctaccaactttggttaaacagtttctgaaaaacagaggaaaacacagaatctgttgtaggccaagttaactattcgtaaaggtcaaggtcaaggtcatctgaaaataaaatgacctgcttttcagtcgtgctacccataacacactttgaacaatttgatgactccaggtcaactcgtttttgaaaaacggagcttaacactagaactaaacattgtgtaggctaccccgaaaaaaagctgcatgattttgattattatcatctatataacaactgcggacctccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|4 : ctacaaatgtctcgtctatactgttttatcccaaaatgaagctatgaagaaaaaccgttaattctgccgattacacaactgagaacaaaatttggggacttttggacagacagtcctaaagaatcgcagctcaaaacaaaaacttaacattttgtaagcctattaattaattgtagagttcaaggccatcttgctgcacattactaccataacaatatcatactgatatgacccaaagtttactggctatcagtcaaacagtttaaaagaaacaaagctaaacacaaaacatgaaatattttgtaaactaaaacaacaataagtacaggtcaaggttatctaaaaaaacgtctgcatcatttttaactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcTTTGTACTACCTATAACAAAATTATGGACAAAGTtccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|4 : aaacacacaagagtTA--CCT----ATAACAA------------AATTATGGACAAAGTTTAGT-GACT---CT--GGG-TA---AA-TTGA--TT---A-AAA-GAATAAAAATAATTAAAAGATAA--AC--ATAA-ACCATAGAATTTTAT-A--G--GTTAAG-----TTAATTATTCATA-GAG------GTCAAG--TT-CAT-CTG-AAG----A-------AA--------GTCTGCATCA--T-------T----TT--GATT--GGT------AAT---A-C---CCCATAACA----CA-AA---TAAAGATCAA-A-GTTGGTATTAAACTA-T-AG-ACATTTAACAGT--T--TCTGAT--AAACAAAGGTCAATGC-AAAAACT-TC--ACATT----T----TTAGG------TCA----A-G--TA--AA-T--T----A--T-TC-GTT-GA---GAC-CAAGTTGTGCAT-T----------------G----------TTT---TG---------AG-------TATT--------AC---T------AC----A----C-----------ATAAC-------------ACAGCTATGAAGCTTT-----TGATGAC-TAAAGACAATTTTTTT-----TTG------AGAAACAG-----A-----GC-----------TTAACGCAAAA----------A-----A----CTAAAT----A-T---TGT---G------TAGTATTA---AGTTATTCTTA-CGGC------ATGGT------CAAATT---CA--------CCG-AAAA--AATTG--CTGCA-TGGTT------------ATAATACCAATA-CC-AGAAC-ATA-----AG----------TTGGT-GGCTT----CAG-GC--CAAA-CAGTTTCTA-ACCAAAC-AAGC-CAACTAAGGAATCAAATGTTTTCTAGGTC----AAA--------ATA-GCCAT--ATGTCA-AGG-----------------TTAAGGGCAAGGTTA-CTCA-AAAAAAATGCTACATTGTTTTGATT-TTACTATTCAGAACACAACTATGGACCAAttagtgactctgggtaaattgattaaaagaataaaaataattaaaagataaacataaaccatagaattttataggttaagttaattattcatagaggtcaagttcatctgaagaaagtctgcatcattttgattggtaataccccataacacaaataaagatcaaagttggtattaaactatagacatttaacagtttctgataaacaaaggtcaatgcaaaaacttcacatttttaggtcaagtaaattattcgttgagaccaagttgtgcattgttttgagtattactacacataacacagctatgaagcttttgatgactaaagacaatttttttttgagaaacagagcttaacgcaaaaaactaaatattgtgtagtattaagttattcttacggcatggtcaaattcaccgaaaaaattgctgcatggttataataccaataccagaacataagttggtggcttcaggccaaacagtttctaaccaaacaagccaactaaggaatcaaatgttttctaggtcaaaatagccatatgtcaaggttaagggcaaggttactcaaaaaaaatgctacattgttttgattttactattcagaacacaactatggaccaatcactttttgagaaatcgtgctaaactaaaaaactgagcattgtgtaaagttattcacccatagaaatcatggtcacctgaaaaaagctgcatggttttgagaagtatatggaca
gi|4 : aaacacacaagagttttgtacCC----ATAACAC------------AAATAAAGATCAAAGTTGGT--ATTAAACTATAGA-CATTTAA-CAGT--TT---C-TGA-TAAACAAAGG--TCAATGCAAAA--ACTTC----AC------ATTTT-T-A--G--GTCAAG-----TAAATTATTCGTT-GAG------ACCAAGTTGTGCAT---------------------------------TGT------T-------T----T---G-----AGT------ATT---A-C-TACACATAACA----CA-GC---TATGAAGCT----TTTGAT----GACTA--AAG-ACA---ATTTTT--T--TTTGAG--AAACAGAGCTTAACGCAAAAAACT-AA--ATATT----G----T---G------T------A-GTATT--AAGT--T----A--T-TC-TTACGGCATGGT-CAAA--TT-CA--CCGAAA-AA----AT-TG----------CTG-CATGGT-T-----A--------TAAT--------ACCAAT------AC----CAGAAC-----------ATAA--------------G--------------T-----TGGTGGCTTCAGGCCAAACAGTTTCTAACCAA------AC-----A-----A-----GC-----------C--------AACTAAGGAATCA-----A----A----T----GTT---T-T---C------TAG-GTCA---AAATAGCCATA-TGTC------AAGGTTAAGGGCAAGGT---TA-------CTCA-AAAA--AAATG--CTACA-TTG--T--TTTGA-TT-TTACTATTCAGA-AC-ACAACTATG-----GAC--------------------------------CAAT-CACTTTTTG-A-GAAATCGTGCTAAAC---T----AAAA--------AACTG----AGC--------ATT-G-------TGT-A-AAGTTATTCACCCATAGAAAT------CATGGTCA-C-CT-GAAAAAA-GCTGCATGGTTTTGAGAAGTA-TATtcactttttgagaaatcgtgctaaactaaaaaactgagcattgtgtaaagttattcacccatagaaatcatggtcacctgaaaaaagctgcatggttttgagaagtatatggaca
gi|5 : aaacacacaagagttttgtactacctataacaaaattatggacaaagtttagtgactctgggtaaattgattaaaagaataaaaataattaaaagataaacataaaccatagaattttataggttaagttaattattcatagaggtcaagttcatctgaagaaagtctgcatcattttgattggtaataccAATGA--ACATGAGAATTCCATGGAATTAAATGTCTAG-C-----CTATATC-CCTTTATCAC--ATAATGAG---GCTATGAAGAAGAC--A-AGTAGATCTA--CCC----ATTACAC------------AACTATGAAAAAAA-----------------------A---AA-TAGT--TT-----AAA-GAAATGGAGC--GTAAAACAAA-------A----TC------ATTTTAT-A--G--TTCAGG-----CTAA--A---ATA-GAG------ATTAA-----------TG-GAA----A-------AC--------A--T--------T-------T----T----------GT------AA----G-C-TACCCTTAACA----CA-GC---TATGAATCAA----TTGGT-------------G-CCA---AACAGT--T--TTTGAG--AAAAGGTGTTAAACACAAAAACA--TA--ATGTT----G----C---A------TAGACTAA-G--TT--AT-A--C----A--T-CC-AAA-GA---GGC-CAAG--GT-CAC-TCAAAG-AA----A--TG----------CTA-CATG---TTTTAGGG-------TAAT--------AT---T------AC----C----CCTTACACAACAATGG--------------ACCAACT--------T-----TGGTGATTATTTGCAAAACAGTTT-----CTG------AG-----A-----A-----ACAATCTGTACG-C--------AA----------A-----AAATTC----A----A-T---T-TTGCG------TAG-GCTT---AGCTTTTCATC-TATAGAGGTTAGGGT------CAAGGT---AA-------ACTG-AAAA--AAATG--CTGCACTG---T--TTTAATCA-GTATTACCCATT-AC-ACAACTTTA-----AAC--CAAA--TTTGGT-GATT---------GT--------AGGTC----A-AAAACAGAGCTCAAC---A----CAAA--------AAggaca
gi|6 : aacagtctgtaaataaacaaaaaagtgtaGACCAA---TTTTAT----GGCTC-TGGA-TCA---AATAGT--T--TAAAA----ACCAGAGGTACAC---AAAAACG-CA--ACATT----T----T---GAAGGCTC------A-G--CTGAAA-T--C----AAAT-T---TA-GA---GGT-CAAA--GT-CAT-CTGCAA-AAT---A--AT----------TCTGCATGGGATCG---AG-------TAAT--------AC---A------AC----C----C-----------ATAACACAGCTATGAACCAT-------------T-----TGGTGCCTCCATGACAAACAATTT-----TTG------AGAAACGG-----A-----GC-----------TTAAGATA-AA----------A-----A----C----TAAATG-T---TGT---G------TGG-ATCA---AGTTATTCATC-C--A------AAGAT------CAAGGT---CA----------GTAAAC--AAATA--CTGCA-TGGTTT--T--GAATT-GAACTACTCATA-AC-ACAATTGTA-----GAC--C--AAGTTTGGT-GACTC----TTTTGT--CAA--CAGTTTCTG-A-TAAATGGAGCTAAAT---G----CGAA--------Aataagtcttacgaaccagtcttacgaaccaacaccaagaaagtatcatgtatttctctgattttcgtttgaaaagccaagacaaaaatgtgtacagtatatcaaatagtgtttgatgcatgttacaatg
gi|6 : gttA--CCC----ATAACAC------------AGCTATGAACCA--TTTGGT-GCCT---CC-ATGA-CA---AA-CAAT--TT---T-TGA-GAAACGGAGC--TTAAGATAAAA--ACTAA----AT------GTTGTGT-G--G--ATCAAG-----TTATTCATCC--A-AAG------ATCAAG--GT-CA----GTAAA----C-------AA--------A--TAC------T-------G----CA--T-----GGTTTTG--AATTGAA-C-TACTCATAACA----CA-AT---TGTAGACCAA-G-TTTGGT----GACTCTTTTG-TC----AACAGT--T--TCTGAT--AAATGGAGCTAAATGCGAAATGTT-T------TT----T----T----------------------TT--A-----------------------A---AAT-AAAG--CT-AAT--TGAAA-AA----CTTAA----------TGT-TATG---TG----AG-------CAAA--------TT---T------AT----T----C-----------AT-------------------------------T-----TGGTGATTTGAAGCCA---AGT---------G------A----------------------------------------AA----------A-----A----C----TTTACG-T---TGT---G------TAT-TCCA---AGTTATTCA-----TA------AAGGT------CAAGGTGAACAATT----TCTG-AGAA--AAtgtttttttttaaaataaagctaattgaaaaacttaatgttatgtgagcaaatttattcatttggtgatttgaagccaagtgaaaaactttacgttgtgtattccaagttattcataaaggtcaaggtgaacaatttctgagaaaatagctcaatgcaaaaacttaaaattgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|6 : gttgaccaattttatggctctggatcaaatagtttaaaaaccagaggtacacaaaaacgcaacattttgaaggctcagctgaaatcaaatttagaggtcaaagtcatctgcaaaataattctgcatgggatcgagtaatacaAA-CAATTTCTG-A-GAAA-ATAGCTCAAT---G----CAAA--------AACTT----AAA--------ATtagctcaatgcaaaaacttaaaattgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|7 : gttgaccaattttatggctctggatcaaatagtttaaaaaccagaggtacacaaaaacgcaacattttgaaggctcagctgaaatcaaatttagaggtcaaagtcatctgcaaaataattctgcatgggatcgagtaatacaacccataacacagctatgaaccatttggtgcctccatgacaaacaatttttgagaaacggagcttaagataaaaactaaatgttgtgtggatcaagttattcatccaaagatcaaggtcagtaaacaaatactgcatggttttgaattgaactactcataacacaattgtagaccaagtttggtgactcttttgtcaacagtttctgataaatggagctaaatgcgaaatgtttttttttaaaataaagctaattgaaaaacttaatgttatgtgagcaaatttattcatttggtgatttgaagccaagtgaaaaactttacgttgtgtattccaagttattcataaaggtcaaggtgTAATTATCCACA-GAG------ATCAAG--GG-CAT-TC--AGA----A-------AA--------A--TGC------TGCA----T----TGTTG-----ATT------ATT---A-C-TATCCATTACA----TG-AC---TATGG-CCAGTA-TTTGGT----GACAC-TGGG-GCC---AACAGT--T--TCAAAG--AAATGGAGCTTAATGCAAAAA-TT-GA--ACATT----T----T---G------T------A-G-------A---------A--T-TT-GTA-GA---ATTTCGAA--AA-AATGCCCAAC-AGTTATA--AG----------TA--CATG---T-----AG-------TTAC--------AT---TGAGTTCACAA--C----C-----------ACAG--------------AC-------------TAAATGTGGCGACTCTGGGGCAAACAGTTT-----CAA------AG-----AAATACA-----GC-----------T--------AA----------A-----T----A----T------T---T-T---A------TAG-GCtgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|7 : aattg---AGTTAATTATCACTTG------AAT-T------CAATGC---CA-------TTCA-AAGA--AAATA--CTGCA-TGG--T--TTTGAGCA-GAACTATCCAT------CAACC--------AAT--C--A--TT------A---------------CAAA-CAGTCTCTT-A-GAAATGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttaattatcacttgaattcaatgccattcaaagaaaatactgcatggttttgagcagaactatccatcaaccaatcattacaaacagtctcttagaaatgcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|8 : aattgtaattatccacagagatcaagggcattcagaaaaatgctgcattgttgattattactatccattacatgactatggccagtatttggtgacactggggccaacagtttcaaagaaatggagcttaatgcaaaaattgaacattttgtagaatttgtagaatttcgaaaaaatgcccaacagttataagtacatgtagttacattgagttcacaaccacagactaaatgtggcgactctggggcaaacagtttcaaagaaatacagctaaatattttataggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAAACAGTTT-----CTA------AA-----A-----AATAGTGC-----------T--------AA----------GCTTATA----A----T----G-T---T-T---ACATGTTTAG-GCAA---ATGAATTTATC--ATA------AAGGT------CAAGGT---CAGTGTCATTCCA-AAAA--AAGTG--T---A-TGGGTT--TAAGAATTAGTACTA---GTT-AC-ACGA-TATAGGTTCAA------A--TTCGGT-GACTC----CTG-GA--CAAAACA-TTTCTG-A-TAAAAAGAATTTAAC---A----CAAA--------AACCT----AACGCTTTATTATACGCCAAG-AT-T-A-AGG-----------------T------CGAGGTCA-C-CC--AAGTTATGCTGCATGGTTTTAAGTAACACCAAGCATTACACTACTcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|8 : TGAGAATGCTAAGAATAA-----A-A-TAA--TTA--TTG----GTTACGCTTAAACGTTAAAAATTATGTACCAATTTTAGT-GACT---CT--GTT-CG---AA-AAGTATTT---A-AAA-GAAATGGAGC--TAAACGCAAGA--Agagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaaattatgtaccaattttagtgactctgttcgaaaagtatttaaaagaaatggagctaaacgcaagaaggtattatatttcaacaaacgct
gi|8 : caaacagtttctaaaaaatagtgctaagcttataatgtttacatgtttaggcaaatgaatttatcataaaggtcaaggtcagtgtcattccaaaaaaagtgtatgggtttaagaattagtactagttacacgatataggttcaaattcggtgactcctggacaaaacatttctgataaaaagaatttaacacaaaaacctaacgctttattatacgccaagattaaggtcgaggtcacccaagttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactacA-AT---TATGTACCAA-T-TTTAGT----GACTC-TGT--TCG---AAAAGTATT--TAAAAG--AAATGGAGCTAAACGCAAGAAGGTATT--ATATT----T----ggtattatatttcaacaaacgct
gi|9 : caaacagtttctaaaaaatagtgctaagcttataatgtttacatgtttaggcaaatgaatttatcataaaggtcaaggtcagtgtcattccaaaaaaagtgtatgggtttaagaattagtactagttacacgatataggttcaaattcggtgactcctggacaaaacatttctgataaaaagaatttaacacaaaaacctaacgctttattatacgccaagattaaggtcgaggtcacccaagttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactactgagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaTTTATCAC--AATGTGAG---GCTACAAATAATTCTAATA-CAG--CTA--TCA----ACTACAC------------AACTGCTGACGACATTTGAT-GACT---TT-TGA--CA---AA-CAAT--TTGTTT-AAG-GAAATTGATC--TTTACCCAAAA--ACTTA----TC------ATCTTGT-A--A--GTCAA------CAAATCATTTGTA-ATG------GTCAAG--AT-GAT-T---GAA----A-------AC--------T--TTC------T-------A----TA--GTTTTTGGT------ATT---A-C-TACCCATAATA----CA-AT---CATGGACCAA-G--TCGGTA---GGCTC-TGGGAAAA---AACA----T--TAAAAG--AAACCGAGCTAGACACA------C-CA--ACATG----T----T---A------TTAATA-A-G--TT--AA-T--T----A--T-TT-GTA-AA---GGT-TGAA--GT-AAT-caacaaacgct
gi|9 : TA--CCC----ATAATAC------------AATCATGGACCAAGTC-GGTAGGCT---CT--GGG-AA---AA-AACA--TT---A-AAA-GAAACCGAGC--TAGACACAC-----C--A----AC------ATGTTATTA--A----TAAG-----TTAATTATTTGTA-AAG------GTTGAA--GT-AAT-------ATTTTA-------CA--------A--TGT------TGGCATCAT----TAT-G-----AGT------AGT---T-G-TACACCTAACT----CA-AC---TATGGattttacaatgttggcatcattatgagtagttgtacacctaactcaactatgg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222 1 1 55555555555555 1 1 1 111 2222222222 1111111 1111 111111111111 111111 1111 2222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 11111111 555555555555555555555555555555555555555555555555 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 333333333333 111111111 3333333333333333333333333333333333333333 11 11111111 11111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11
lowQualScore : 1 22 77777 5 5 1 22222222222222 1 5 5 5 2 3 111 0 9999999999 4 55 1 666 0 3333333 66 33 0000 555555555555 1 2 0 555 444444 555 2 33 1111 2 33 3 33 0000000 777777 33 33 999999 55 2 7777777 33 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 444 333 5555 2 333 000 7777 9999999 444 33 555 33 1 66666666 33 111111111111111111111111111111111111111111111111 44 9999 3 555 77 33 6 55 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3 555 1 7777 888888 888888 555 666666666666 44 44 44 3 0 666666666 6666 2 66 4 4444444444444444444444444444444444444444 44 3 99999 2 00 66 1 44444444 44444444 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 77 6 7 1 5 2
lowQualScore : . .. ..... . . . .............. . . . . . . ... . .......... . .. . ... . ....... .. .. .... ............ . . . ... ...... ... . .. .... . .. . .. ....... ...... .. .. ...... .. . ....... .. . .......................................................................... ... ... .... . ... ... .... ....... ... .. ... .. . ........ .. ................................................ .. .... . ... .. .. . .. ................................................................................................................................................................................................................................................................ . ... . .... ...... ...... ... ............ .. .. .. . . ......... .... . .. . ........................................ .. . ..... . .. .. . ........ ........ ........................................................... .. . . . . .
lowQualScore : 0 00 00000 0 5 0 55555555555555 0 5 0 0 5 2 888 4 1111111111 4 55 4 444 9 9999999 11 99 0000 888888888888 4 9 3 000 777777 000 9 99 6666 0 44 2 77 3333333 222222 44 44 222222 66 5 4444444 44 5 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 444 222 0000 2 999 666 4444 8888888 111 22 111 11 3 00000000 44 000000000000000000000000000000000000000000000000 22 8888 1 444 33 99 5 00 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 888 7 1111 888888 888888 444 888888888888 22 66 66 3 4 222222222 8888 2 22 0 7777777777777777777777777777777777777777 99 6 11111 0 11 77 0 44444444 55555555 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 00 7 8 3 4 5
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTNCTANNAAGAGACAATTTGCAAAACATGAACTTCGAACTGGCACTTGCTNGCAAGTTCGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGNATGTTGCTGACAACATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCACGGAATTAAATGTCTCG-CT---TCTATATC-GCTTTATCAC--AAAGTGAG---GCTATGAAGAAGTC--A-AN-AG--TTA--TCC----ATTACAC------------AACTATGGACAAAATTTGGT-GACT---CT-TGGG-CA---AA-CAGT--TTN---AAAGAAACGGAGC--TTAACACAAAA--AC--A----AC------ATTTTGTA--G--GTCAAG-----TTAATTATCCGTA-GAG------GTCAAG--GT-CATCC-G-AAA----A-------AA--------A--TGC------T-------T----TA--G-----GGT------AGT---A-C-TACCCATAACA----CA-AC---TATGGACCAA-A-TTTGGT----GACTC-TGGG-NCA---AACAGT--TTN--AAAGAAA--CGGAGCTAAACGCAAAAAANT-TA--A--CATT----T----T---G------T-----A-G------TT--AA-TC----A--T-TC-GTA-GA---GGTCAAG--GT-CATCCGAAA--AA-A--NG---------TNT-----CATG---T-----AGT--------------AAT-AC---T------AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGGTGACTTNAGGNCAAACAGTTTC------T-----GAGA-----A-----GC-----------C---------AA----------A-----A----C----T----G-T-T-T---G------TAG-GCCA---AGTTATTCATC-CGTA------AAGGT------CAAGGT---CA-------TCCG-AAAA--AAA--TG--CTGCA-TGGTTT--TT-GAG---TNGTACTACCCATA-ACA-CAACTATG-----AACC--A--TTTGGT-GACT-C-----C-GGT-C-AA-----ACAGTTTCTGA-GAAACGGAGCTNAAC---G----CAAA--------AACTTAA----C--------AT-------A-G-------CCA-AT-G--T-A---AGGT------CAAGGTCACCC-GA-AAAAATGCTGCATGGTTTTGATTAGTACTATCCATAACACAACTATGGACCAAGT
Reference ( family-260 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTNCTANNAAGAGACAATTTGCAAAACATGAACTTCGAACTGGCACTTGCTNGCAAGTTCGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGNATGTTGCTGACAACATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCACGGAATTAAATGTCTCG-CT---TCTATATC-GCTTTATCAC--AAAGTGAG---GCTATGAAGAAGTC--A-AN-AG--TTA--TCC----ATTACAC------------AACTATGGACAAAATTTGGT-GACT---CT-TGGG-CA---AA-CAGT--TTN---AAAGAAACGGAGC--TTAACACAAAA--AC--A----AC------ATTTTGTA--G--GTCAAG-----TTAATTATCCGTA-GAG------GTCAAG--GT-CATCC-G-AAA----A-------AA--------A--TGC------T-------T----TA--G-----GGT------AGT---A-C-TACCCATAACA----CA-AC---TATGGACCAA-A-TTTGGT----GACTC-TGGG-NCA---AACAGT--TTN--AAAGAAA--CGGAGCTAAACGCAAAAAANT-TA--A--CATT----T----T---G------T-----A-G------TT--AA-TC----A--T-TC-GTA-GA---GGTCAAG--GT-CATCCGAAA--AA-A--NG---------TNT-----CATG---T-----AGT--------------AAT-AC---T------AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGGTGACTTNAGGNCAAACAGTTTC------T-----GAGA-----A-----GC-----------C---------AA----------A-----A----C----T----G-T-T-T---G------TAG-GCCA---AGTTATTCATC-CGTA------AAGGT------CAAGGT---CA-------TCCG-AAAA--AAA--TG--CTGCA-TGGTTT--TT-GAG---TNGTACTACCCATA-ACA-CAACTATG-----AACC--A--TTTGGT-GACT-C-----C-GGT-C-AA-----ACAGTTTCTGA-GAAACGGAGCTNAAC---G----CAAA--------AACTTAA----C--------AT-------A-G-------CCA-AT-G--T-A---AGGT------CAAGGTCACCC-GA-AAAAATGCTGCATGGTTTTGATTAGTACTATCCATAACACAACTATGGACCAAGT
gi|1 : AGTAGTACTAGAAAAAGACAATTTGCAAAACA-GAACTTCGAACTGACACTTACTAGCAAGTTTGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGGATATTGCTGACAA-ATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCATGGAATTAAATGTTTCGACTACATGTATATC-GCTTTATCAC--AAACTTAG---GCTATGAAGAAGTC--A-AA-AG--TTA--TCC----ATTACAA------------AACTATGAACAAAATTTTGT-GACT---CT-TGGGGTA---AA-CAGT--ATC---AAAGATACCGAGC--TTAACACAAAA--AC--A----AC------ATTCTGTA--G--GCTAGG-----TTAATTATTTGTA-AAG------GTCAAG--GT-CATCT-A-AAA----A-------AA--------A--TAA------T-------T----TAAGG-----GGT------AGC---A-C-TACCCATAACA----CA-AT---TATGGACCAG-G-TTCTGT----GGCAC-TAGG-TCA---AAAAGT--TTA--AAAGAAA--CAGAGCTTAGCACAAAAAAAT-TA--A--CATT----T----T---G------T-----A-G------TT--AA-TC----A--T-TG-GTA-GA---GGTCAAG--AT-CATACAAAA--AG-A--AG---------TAT-----CA-G---T-----AGT--------------AGT-AC---T------AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGATAACTTGAGACAAAACA-TTTC------G-----GAGG-----A-----GC-----------C---------AG----------A-----A----C----T----G-T-T-T---G------CAG-GCCA---AGTTAATTATT-CATA------GAGGT------TAAGAC---CA-------TCTG-AAAA--AAATTTG--CTTTT-T--TTT--TT-TAG---TAATACTACCCACA-ACA-CAGTTATG-----AACC--A--TTTTGT-GACA-C-----T--GT-C-AA-----ATAGTTTC--A-TAAACAGAGCTGAAT---G----CAAA--------AATCTAA----C--------AT-------A-G------------T-G--T-----AGGT------TAAGGTTACCA-GA-AAAAAAAATGCATGGTTTTGATTAGTACTATCGATAA-GCAACTATGGACCAGGT
gi|10 : atatcatcatggtctatttgttcaataataagtagaatttgtattgtaccttgaaatgtgccagtctacacgaaggcccctgttttgactagtgacactTTCACAAT-A--ACAAGAAAATTCCCCAGAATTCAATGTCTCA------TCTATATT-GCTTGACCAC--AAAGAGAG---ACCATGAAG-AGTC-----T-AG--TTA--T
gi|11 : tctaaatgaaatttcattgtagtA--TTT----ATTACAC------------ACTCATAGATAACGTTTAGT-TTCT---CT--GGG-AA---AATCAGT--CTC---AA-----CAGAGA--TAAGCA---AA--GC--ATTTAAT------ATTTTGTA--G--GCTAAG-----T-----GTC--TC-GAA------CGCATG--GC-CATTT-G-AAA----T-------AGTGCTT---A--TGT------T-------T----T---------GGT------AGT---AACATAGCCATTACT----CA-AA---TATTGACCAA-G-TTTAAT----GACTC-TGGT-TTA---CAAAAT--GTA--AACGAAA--GAGAGCTAAACACAAAATAG--TA--A--TATA----G----T---G------T-----ATG------CT--AA-gaaggagagacaaagacttgacaagttacatcactacagatgcaagaccatatcatgatatttgtctatcaattttcaattaaggatatttctacacatttataaaagaagtttacattgtgttagggtcaa
gi|12 : TTA-AATTATCATAAAAGAGTTCTACGGAATTGAATGTCTAA-CT---T--AAATC-GCTTTATCAC--TAAGTGAG---GCTATAAAGAAGTT-----T-AG--TTA--TTTTA--GTTACAC------------AACTATAAACACAATTAGAT-GACT---CT-TGAG-CA---AG-CAGC--TTC---AAATAAACGGATC--TTAATACAAAATCAT--A----AC------ATTTTGTA--G--GCTATG-----TTAATTATC
gi|13 : ctaactacaaattttattaaggCATACAGTTTC------T-----AAAA-----ACATA-GT-----------CTT-------AA----------C-----A----C----T----G-G-------G------TGG-GCCATTTAGTTATTCATC-CATA------AAGGT------AAAGGT---CA-------CC---ATTA--AAA--TG--CTGCA-TGGATTAATTAGAG---AAGAACAACCCCTACACA-GAAATA-G-----AACA--A--ACTGATTGACT-CGTAACT-GGT-C-AA-----ATGGTTTCTGA-GAAACAGAGCTTAAC---G----CAAA--------AACTTTA----C--------Aattgaagacttgatagtct
gi|14 : C------ATTAAGTA--G--ATCAAG-----TTTAATATCAGT------------TCAAG--GT-CATCCCG-AAA----A-------A------------TGT------T-------G----TA--T-----GGTGTATAGAGT---A-T-T-----TAACG----TA-AC---TATAAACCAA-A-TTTGGT----GAATC-TAG--CCA---AACATT--TTCTAAAAGAAAAACAGTGCTAAATGCAAATA-CT-TA--AGACGTTGAGATAAAGT---G------T-----A--------TT--AA-CTGT--A--T-AT-GTC-AA---GGTGAAG--GT-CATTCGAAA--AA-T--TG---------CTA-----CATG---T-----Actgaattgttgacgcagatgcaaccatcgtaacca
gi|15 : aacttat------------AACTATGGACCAAATTTGGT-GGTT---CT-TTAC-TA---AA-TTGT--TTTT--GAAGAAACAGA--------CATAAAT--TA--A----AC------ATTCAGTA--G--GCAAAA-----TTATTCATCATTA-GAT------GTCAAG--GT-CATCC-A-AAA----AGTGCTGCAA--------A--T-C------T-------T----CA---------GT------AGG---A-A-TACCCACAACA----CA-AG---TATGAACCAA-A-TTTtt
gi|16 : gAATTTGGT-GACT---CT-TGAA-CA---AA-CAGT--TCA---AATGAAATGGAGC--TTAACACAAA-------A----AC------ATTTTGCA--GCAGTCTAA-----TTTATTATCAGTA-GAG------GTCAAG--GT-C-T------AG----A-------AA--------A--TGCTGCATAT-------T----TT--G-----GGT------AGT---G-C-TACCCATAACA----CA-AT---TATGGACTAA-G-TTTAGT----GATGC-T-TG-CCA---AGTAGT--TTA--AAAGAAA--CGAAGCTAAATGCAAAAAttcattggaataattcagacaaaaacacttaaaataaggaggataaaatta
gi|17 : cattt--A----AT------ATTTTGTA--G--GATAA---------ATTATTCATATGAG------TTCAA-------AT---G-AAA----A-------TATGTTGCGTG--TGT------T-------T----TA--G-------T------AGT---A--------ATA-TA----CA-AC---T--GGATCCA-A-TTTGGT----GACTC-TGAG-ACA---AGC----------AAAGGAA--CA----TAAATACATAACTGT-TAGTA--CA-----------T---A------A-----A-G------TT--TA-TT----A--T-CT-AAA-GA---GGTCAAAT-GT--ATCCAAAta
gi|18 : aaattt--TCAACGCAAAA--AC--A----AC------GCGTTGT--------C--------TTAATTATTTGAA-AAG------GTCAAC--TT-TATTT-----A----A-------AA--------C--TCC------A-------T----TG--G-----AAA------AGT---A-C-TACCTATAACA----CA-GA---TTCGGACCAG----TTACT----GACTC---AG-TCA---AACCGT--TTC--AGAGAAA--CCAGGCTGAACACAAgtaatattgcaatgc
gi|19 : AATTA---TAGGAGAATTCCACAGAATCAAATGTCT---CT---TCTATATC-CCATTATCATAAAAAATGAA---GCTATtatagatattg
gi|2 : atatggaatttctaAGAGAATACCACATAATTAA-TGTCTCA-CT---T--ATATC-GCTTTACCAC--AAAGTGAA---GCTATGAGGAGGTT--C-AG-A----TA--T-C----ATTACAtgtaaatgatgaaactattcaatgtcaaagatgcacagatcacatcaaatagatatatgcaataccattatca
gi|2 : ttAAGCAAAGC--T-AATACATAC--AC--AC---AT------ATTGTGTAAGG--GTCAAGGTTAATTAATTATCCATA-GAGAACTATGTCAAG--GC-TATCC-A-AAAT---A-------AA--------AC-TGC------T-------TGATTTG--G-----AGT------AGT---C-T-TACCTATAACA----CA-AC---TATGAGTCAA-A-TGTGGT----GACTG-TGGA-ACA---AACAGT--TTC--AAAGAAA--TGAAGCTAAACAAAAAAAATT-T--------TT----T----T-------------------------TT--TA-CC----A--TATCTGTA-GA---AGTCAAA--GT-CAGCCAAAACAAA-A--GGCTGAATGGCTTT-----CA-G---T-----AGTTGTACCTAATTATTAATGAT---T------ATAAAGC----T-----------AGAA--------------ACCATAT--------T-----TTGTATCTCTAAGGCAAACAGTTTCAAAAGAT-----CAGG-----A-----GCTACATG-----C---------AA----------A-----A----C----TTAATA-TCT-T---G------TAG--CTA---AGTTAATTATC-CATA------AAGGT------CAAGGT---CA-------TC---AAAA--AAA--TG--CTGCC-TGGTTT--T--GAG---TCATGTTACCCATT-ACAATAGC-ATA-----AACAGAA--TTTGGT-GAAT-C-----T-GGGAC-AA-----ACAATT---GAAGCAACAGTGCTAAAA---A----TAAA--------A-CTTAAAAAAC--------AA-------A-G-------CTA-ATTA--T-ACATAGGT------CAAGGCCATCC-AATAAAAATGCTGCATTGTTTTGAGTTGTTCTATCCAGTACACAACTATGAAaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcataagcaaagctaatacatacacacatattgtgtaagggtcaaggttaattaattatccatagagaactatgtcaaggctatccaaaataaaactgcttgatttggagtagtcttacctataacacaactatgagtcaaatgtggtgactgtggaacaaacagtttcaaagaaatgaagctaaacaaaaaaaattttttttttaccatatctgtagaagtcaaagtcagccaaaacaaaaggctgaatggctttcagtagttgtacctaattattaatgattataaagctagaaaccatattttgtatctctaaggcaaacagtttcaaaagatcaggagctacatgcaaaacttaatatcttgtagctaagttaattatccataaaggtcaaggtcatcaaaaaaatgctgcctggttttgagtcatgttacccattacaatagcataaacagaatttggtgaatctgggacaaacaattgaagcaacagtgctaaaaataaaacttaaaaaacaaagctaattatacataggtcaaggccatccaataaaaatgctgcattgttttgagttgttctatccagtacacaactatgaaaaaaaattggtttctcttaagcaaaaagtttaaaagaaaatgagtgtaaca
gi|2 : ttagagaataccacataattaatgtctcacttatatcgctttaccacaaagtgaagctatgaggaggttcagatatcattacaaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcatTA--TCC----AGTACAC------------AACTATGAAAAAAAATTGGT-TTCT---CT-TAAG-CA---AA-AAGT--TTA---AAAGAAAATGAGT--GTAACAaaaaaattggtttctcttaagcaaaaagtttaaaagaaaatgagtgtaaca
gi|20 : ttagagaataccacataattaatgtctcacttatatcgctttaccacaaagtgaagctatgaggaggttcagatatcattacaaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcataagcaaagctaatacatacacacatattgtgtaagggtcaaggttaattaattatccatagagaactatgtcaaggctatccaaaataaaactgcttgatttggagtagtcttacctataacacaactatgagtcaaatgtggtgactgtggaacaaacagtttcaaagaaatgaagctaaacaaaaaaaattttttttttaccatatctgtagaagtcaaagtcagccaaaacaaaaggctgaatggctttcagtagttgtacctaattattaatgattataaagctagaaaccatattttgtatctctaaggcaaacagtttcaaaagatcaggagctacatgcaaaacttaatatcttgtagctaagttaattatccataaaggtcaaggtcatcaaaaaaatgctgcctggttttgagtcatgttacccattacaatagcataaacagaatttggtgaatctgggacaaacaattgaagcaacagtgctaaaaataaaacttaaaaaacaaagctaattatacataggtcaaggccatccaataaaaatgctgcattgttttgagttgttcGACAATTGCACTGTATTAAATGTCTCA-C-----CTATATG-GCTTTATCAC--AAAAAGAG---GCTATGAACAAGTC--A-AG-TG--GT---TCC----AGTA
gi|21 : tgtaaccaagaataagtt---G------TGG-GCCA---GGTTATTCATC-TATA------GAGCT------CACGGT---CA-------TT---AAAA--AAA--TG--TTGCA-TTGTT-------AA---TAGAAATACCCAAA-Agtatctacctattatgcaatta
gi|22 : agaaacagaaaataaaacgtgaaaacttaaagcAGTAGTTTTACTAAGAGA-----TG-AAAATATGAACTTCGAACTAGTACTTGCTTACAAATTCGACCATA--------------TTAGGAGCA-GTT-CTAACAACATTTACAATTgtcagcagctgta
gi|23 : tttcaatttgcgaaAGAAA--CGGTACAACACGCAAATA-CT-AA--A--CATTATT-T----T---A------T-----AAG------TT--AT-AC----A--T-TC-ATA-GA---GGTCAAT--GT-CACATGAAA--AA-A--
gi|24 : ccaaataccatttgCCATCACA----CA-GC---TATGGATCAA-A-TT------------C-TGGG-TTA---AAAAGT--GTC--TAAGAAA--CGGAGCTAAAACCAAAAACAT-TAC-A--CACT----A----T---G------T-----G-GAT----TT--AA-
gi|25 : ATC-TGTG------AATGT------TGAGGT---CA-------TTCC-AAAA--ATA--TG--CTAGA-TGG-TA--CT-GAG---TTATGTTACC
gi|26 : tTCTCG-TT---T--AT-TCAGCTTTATCAC--AAATAGAG---GCTAT-AAAAAGTC--A-A
gi|3 : AAATGTCTCG------TCTATACT-GTTTTATCCC--AAAATGAA---GCTATGAAGAAA----A-AC-CG--TTAATTCTGCCGATTACAC------------AACTGAGAACAAAATTTGGG-GACT---TT-TGGA-CA---GA-CAGT--CCT---AAAGAATCGCAGC--TCAAAACAAAA--ACTTA----AC------ATTTTGTA--A--GCCTA------TTAATTAATTGTA-GAG------TTCAAG--GC-CATCT-------------------------------TGC------T----------------G-----CAC------ATT---A-C-TA-CCATAACAATATCATACTGATATGACCCAA-AGTTTACT----GGCTA-TCAG-TCA---AACAGT--TTA--AAAGAAA--CAAAGCTAAACACAAAACATG-AA--A--TATT----T----T---G------T-----A-AAC----TA--AA-ACAACAA--T-AA-GTA-CA---GGTCAAG--GT-TATCTAAAA--AA-A--CG---------TCTG----CATg
gi|3 : ctacAT-AC----------AC----C----T-----------ATAAC-------------ACG------------C-----TACCAACTTT-GGTTAAACAGTTTC------T-----GAAA-----A-----ACAGAGGAAAACAC---------AG----------A-----AT---C----T----G-T-T-----G------TAG-GCCA---AGTTAACTATT-CGTA------AAGGT------CAAGGT---CAAGGTCA-TCTG-AAAATAAAA--TGACCTGC------TT--TT-CAG---TCGTGCTACCCATA-ACA-CA-CTTTG-----AACA--A--TTTGAT-GACT-C-----CAGGT-C-AA-----CTCGTTTTTGA-AAAACGGAGCTTAAC---A----CTAG--------AACTAAA----C--------AT----------------------T-G--T-------GT--------AGGCTACCCCGA-AAAAAAGCTGCATGATTTTGATTATTATCATCTATATAACAACTGCGGACCcatttttaactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcatacacctataacacgctaccaactttggttaaacagtttctgaaaaacagaggaaaacacagaatctgttgtaggccaagttaactattcgtaaaggtcaaggtcaaggtcatctgaaaataaaatgacctgcttttcagtcgtgctacccataacacactttgaacaatttgatgactccaggtcaactcgtttttgaaaaacggagcttaacactagaactaaacattgtgtaggctaccccgaaaaaaagctgcatgattttgattattatcatctatataacaactgcggacctccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|4 : ctacaaatgtctcgtctatactgttttatcccaaaatgaagctatgaagaaaaaccgttaattctgccgattacacaactgagaacaaaatttggggacttttggacagacagtcctaaagaatcgcagctcaaaacaaaaacttaacattttgtaagcctattaattaattgtagagttcaaggccatcttgctgcacattactaccataacaatatcatactgatatgacccaaagtttactggctatcagtcaaacagtttaaaagaaacaaagctaaacacaaaacatgaaatattttgtaaactaaaacaacaataagtacaggtcaaggttatctaaaaaaacgtctgcatcatttttaactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcTTTGTACTACCTATAACAAAATTATGGACAAAGTtccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|4 : aaacacacaagagtTA--CCT----ATAACAA------------AATTATGGACAAAGTTTAGT-GACT---CT--GGG-TA---AA-TTGA--TTA---AAAGAATAAAAATAATTAAAAGATAA--AC--ATAA-ACCATAGAATTTTATA--G--GTTAAG-----TTAATTATTCATA-GAG------GTCAAG--TT-CATCT-G-AAG----A-------AA--------GTCTGCATCA--T-------T----TT--GATT--GGT------AAT---A-C---CCCATAACA----CA-AA---TAAAGATCAA-A-GTTGGTATTAAACTA-T-AG-ACATTTAACAGT--TTC--TGATAAA--CAAAGGTCAATGC-AAAAACT-TC--A--CATT----T----TTAGG------TCA---A-G------TA--AA-TT----A--T-TC-GTT-GA---GACCAAGTTGTGCAT--------------TG---------TTT-------TG---------AGT--------------ATT-AC---T------AC----A----C-----------ATAAC-------------ACAGCTATGAAGCTTT-----TGATGAC-TAAAGACAATTTTTTTT------T-----GAGA-----A-----ACAGAG-------CTTAACGCAAAA----------A-----A----CTAAAT----A-T-TGT---G------TAGTATTA---AGTTATTCTTA-CGGC------ATGGT------CAAATT---CA--------CCG-AAAA--AAT--TG--CTGCA-TGGTT--------------ATAATACCAATA-CCA-GAAC-ATA-----AG--------TTGGT-GGCT-T-----CAGGC-C-AA-----ACAGTTTCTAACCAAAC-AAGC-CAACTAAGGAATCAAATGTTTTCTAGGTCAA----A--------AT-------A-G-------CCATAT-G--TCA---AGGTTAAGGGCAAGGTTACTCAAA-AAAAATGCTACATTGTTTTGATT-TTACTATTCAGAACACAACTATGGACCAAttagtgactctgggtaaattgattaaaagaataaaaataattaaaagataaacataaaccatagaattttataggttaagttaattattcatagaggtcaagttcatctgaagaaagtctgcatcattttgattggtaataccccataacacaaataaagatcaaagttggtattaaactatagacatttaacagtttctgataaacaaaggtcaatgcaaaaacttcacatttttaggtcaagtaaattattcgttgagaccaagttgtgcattgttttgagtattactacacataacacagctatgaagcttttgatgactaaagacaatttttttttgagaaacagagcttaacgcaaaaaactaaatattgtgtagtattaagttattcttacggcatggtcaaattcaccgaaaaaattgctgcatggttataataccaataccagaacataagttggtggcttcaggccaaacagtttctaaccaaacaagccaactaaggaatcaaatgttttctaggtcaaaatagccatatgtcaaggttaagggcaaggttactcaaaaaaaatgctacattgttttgattttactattcagaacacaactatggaccaatcactttttgagaaatcgtgctaaactaaaaaactgagcattgtgtaaagttattcacccatagaaatcatggtcacctgaaaaaagctgcatggttttgagaagtatatggaca
gi|4 : aaacacacaagagttttgtacCC----ATAACAC------------AAATAAAGATCAAAGTTGGT--ATTAAACTATAGA-CATTTAA-CAGT--TTC---TGATAAACAAAGG--TCAATGCAAAA--ACTTC----AC------ATTTT-TA--G--GTCAAG-----TAAATTATTCGTT-GAG------ACCAAGTTGTGCAT---------------------------------TGT------T-------T----T---G-----AGT------ATT---A-C-TACACATAACA----CA-GC---TATGAAGCT----TTTGAT----GACTA--AAG-ACA---ATTTTT--TTT--TGAGAAA--CAGAGCTTAACGCAAAAAACT-AA--A--TATT----G----T---G------T-----A-GTA----TT--AAGTT----A--T-TC-TTACGGCATGGTCAAA--TT-CA-CCGAAA--AA-AT-TG---------CTG-----CATGGT-T-----A-T--------------AAT-ACCAAT------AC----CAGAAC-----------ATAA--------------G--------------T-----TGGTGGCTTCAGGCCAAACAGTTTC------TAACCAAACA-----A-----GC-----------C---------AACTAAGGAATCA-----A----A----T----GTT-T-T---C------TAG-GTCA---AAATAGCCATA-TGTC------AAGGTTAAGGGCAAGGT---TA-------CTCA-AAAA--AAA--TG--CTACA-TTG-TT--TT-GA----TTTTACTATTCAGA-ACA-CAACTATG-----GAC------------------------------C-AA-----TCACTTTTTGA-GAAATCGTGCTAAAC---T----AAAA--------AACTGAG----C--------ATTGTGTAAA-GTTATTCACCC-AT-A--G-A---A-AT------CATGGTCACCT-GA-AAAAA-GCTGCATGGTTTTGAGAAGTA-TATtcactttttgagaaatcgtgctaaactaaaaaactgagcattgtgtaaagttattcacccatagaaatcatggtcacctgaaaaaagctgcatggttttgagaagtatatggaca
gi|5 : aaacacacaagagttttgtactacctataacaaaattatggacaaagtttagtgactctgggtaaattgattaaaagaataaaaataattaaaagataaacataaaccatagaattttataggttaagttaattattcatagaggtcaagttcatctgaagaaagtctgcatcattttgattggtaataccAATGA--ACATGAGAATTCCATGGAATTAAATGTCTAG-C-----CTATATC-CCTTTATCAC--ATAATGAG---GCTATGAAGAAGAC--A-AGTAGATCTA--CCC----ATTACAC------------AACTATGAAAAAAA-----------------------A---AA-TAGT--TT----AAAGAAATGGAGC--GTAAAACAAAA--TC--A-------------TTTTATA--G--TTCAGG-----CTAA--A---ATA-GAG------ATTAA----------T-G-GAA----A-------AC--------A--T--------T-------T----T----------GT------AA----G-C-TACCCTTAACA----CA-GC---TATGAATCAA----TTGGT----G----------CCA---AACAGT--TTT--TGAGAAA--AGGTGTTAAACACAAAAACAT--A--A--TGTT----G----C---A------T-----A-GACTAAGTT--AT-AC----A--T-CC-AAA-GA---GGCCAAG--GT-CACTCAAAG--AA-A--TG---------CTA-----CATG---TTTTAGGGT--------------AAT-AT---T------AC----C----CCTTACACAACAATGG--------------ACCAACT--------T-----TGGTGATTATTTGCAAAACAGTTTC------T-----GAGA-----A-----ACAATCTGTACG-C---------AA----------A-----AAATTC----A----A-T-T-TTGCG------TAG-GCTT---AGCTTTTCATC-TATAGAGGTTAGGGT------CAAGGT---AA-------ACTG-AAAA--AAA--TG--CTGCACTG--TT--TT-AAT---CAGTATTACCCATT-ACA-CAACTTTA-----AACCAAA--TTTGGT-GATTGT-----A-GGT-C-AA------------------AAACAGAGCTCAAC---A----CAAA--------AAggaca
gi|6 : aacagtctgtaaataaacaaaaaagtgtaGACCAA---TTTTAT----GGCTC-TGGA-TCA---AATAGT--TTA--AAA--AC--CAGAGGTACAC---AAAAACG-CA--A--CATT----T----T---GAAGGCTC-----A-G------CTGAAA-TC----AAAT-T---TA-GA---GGTCAAA--GT-CATCTGCAA--AATA--AT---------TCTG----CATGGGATCG---AGT--------------AAT-AC---A------AC----C----C-----------ATAACACAGCTATGAACCAT-------------T-----TGGTGCCTCCATGACAAACAATTTT------T-----GAGA-----A-----ACGGAG-------CTTAAGATA-AA----------A-----A----C----TAAATG-T-TGT---G------TGG-ATCA---AGTTATTCATC-C--A------AAGAT------CAAGGT---CA----------GTAAAC--AAA--TA--CTGCA-TGGTTT--T--GAA---TTGAACTACTCATA-ACA-CAATTGTA-----GACC--AAGTTTGGT-GACT-CTT---T-TGT-C--A-----ACAGTTTCTGA-TAAATGGAGCTAAAT---G----CGAA--------Aataagtcttacgaaccagtcttacgaaccaacaccaagaaagtatcatgtatttctctgattttcgtttgaaaagccaagacaaaaatgtgtacagtatatcaaatagtgtttgatgcatgttacaatg
gi|6 : gttA--CCC----ATAACAC------------AGCTATGAACCA--TTTGGT-GCCT---CC-ATGA-CA---AA-CAAT--TTT---TGAGAAACGGAGC--TTAAGATAAAA--ACTAA----AT------GTTGTGTG--G--ATCAAG-----TTATTCATCC--A-AAG------ATCAAG--GT-CA----GTAAA----C-------AA--------A--TAC------T-------G----CA--T-----GGTTTTG--AATTGAA-C-TACTCATAACA----CA-AT---TGTAGACCAA-G-TTTGGT----GACTCTTTTG-TC----AACAGT--TTC--TGATAAA--TGGAGCTAAATGCGAAATGTT-T--------TT----T----T-------------------------TT--A---------------------A---AATAAAG--CT-AAT-TGAAA--AA-CTTAA---------TGT-----TATG---TG----AGC--------------AAA-TT---T------AT----T----C-----------AT-------------------------------T-----TGGTGATTTGAAGCCAAG-------------T-----GA------------------------------------AA----------A-----A----C----TTTACG-T-TGT---G------TAT-TCCA---AGTTATTCA-----TA------AAGGT------CAAGGTGAACAATT----TCTG-AGAA--AAtgtttttttttaaaataaagctaattgaaaaacttaatgttatgtgagcaaatttattcatttggtgatttgaagccaagtgaaaaactttacgttgtgtattccaagttattcataaaggtcaaggtgaacaatttctgagaaaatagctcaatgcaaaaacttaaaattgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|6 : gttgaccaattttatggctctggatcaaatagtttaaaaaccagaggtacacaaaaacgcaacattttgaaggctcagctgaaatcaaatttagaggtcaaagtcatctgcaaaataattctgcatgggatcgagtaataca-GGT-C-AAGGTGAACAATTTCTGA-GAAA-ATAGCTCAAT---G----CAAA--------AACTTAA----A--------AT-------tagctcaatgcaaaaacttaaaattgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|7 : gttgaccaattttatggctctggatcaaatagtttaaaaaccagaggtacacaaaaacgcaacattttgaaggctcagctgaaatcaaatttagaggtcaaagtcatctgcaaaataattctgcatgggatcgagtaatacaacccataacacagctatgaaccatttggtgcctccatgacaaacaatttttgagaaacggagcttaagataaaaactaaatgttgtgtggatcaagttattcatccaaagatcaaggtcagtaaacaaatactgcatggttttgaattgaactactcataacacaattgtagaccaagtttggtgactcttttgtcaacagtttctgataaatggagctaaatgcgaaatgtttttttttaaaataaagctaattgaaaaacttaatgttatgtgagcaaatttattcatttggtgatttgaagccaagtgaaaaactttacgttgtgtattccaagttattcataaaTAATTATCCACA-GAG------ATCAAG--GG-CATTC---AGA----A-------AA--------A--TGC------TGCA----T----TGTTG-----ATT------ATT---A-C-TATCCATTACA----TG-AC---TATGG-CCAGTA-TTTGGT----GACAC-TGGG-GCC---AACAGT--TTC--AAAGAAA--TGGAGCTTAATGC-AAAAATT-GA--A--CATT----T----T---G------T-----A-G----------A--------A--T-TT-GTA-GA----AT-----------TTCGAAA--AA-A--TGCCCAACAGTTATAAGTACATG---T-----AGT--------------TAC-AT---TGAGTTCACAA--C----C-----------ACAG--------------AC-------------TAAATGTGGCGACTCTGGGGCAAACAGTTTC------A-----AAGAAATACA-----GC-----------T---------AA----------A-----T----A----T------T-T-T---A------TAG-GCtgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|7 : aattg---AGTTAATTATCACTTG------AAT-T------CAATGC---CA-------TTCA-AAGA--AAA--TA--CTGCA-TGG-TT--TT-GAG---CAGAACTATCCAT------CAACC--------AATC--A--TT------A---------------C-AA-----ACAGTCTCTTA-GAAATGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttaattatcacttgaattcaatgccattcaaagaaaatactgcatggttttgagcagaactatccatcaaccaatcattacaaacagtctcttagaaatgcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|8 : aattgtaattatccacagagatcaagggcattcagaaaaatgctgcattgttgattattactatccattacatgactatggccagtatttggtgacactggggccaacagtttcaaagaaatggagcttaatgcaaaaattgaacattttgtagaatttgtagaatttcgaaaaaatgcccaacagttataagtacatgtagttacattgagttcacaaccacagactaaatgtggcgactctggggcaaacagtttcaaagaaatacagctaaatattttataggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAAACAGTTTC------T-----AAAA-----AATAGTGC-----------T---------AA----------GCTTATA----A----T----G-T-T-T---ACATGTTTAG-GCAA---ATGAATTTAT--CATA------AAGGT------CAAGGT---CAGTGTCATTCCA-AAAA--AAG-------TGTA-TGG-GT--TT-AAGAATTAGTACTA---GTT-ACA-CGA-TATAGGTTCAA----A--TTCGGT-GACT-C-----CTGGA-CAAA-----ACA-TTTCTGA-TAAAAAGAATTTAAC---A----CAAA--------AACCTAA----CGCTTTATTAT-------ACG-------CCA-A--GATT-A---AGGT------CGAGGTCACCC--A-AGTTATGCTGCATGGTTTTAAGTAACACCAAGCATTACACTACTcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|8 : TGAGAATGCTAAGAATAA-----A-AT-AA--TTA--TTG----GTTACGCTTAAACGTTAAAAATTATGTACCAATTTTAGT-GACT---CT--GTT-CG---AA-AAGTATTTA---AAAGAAATGGAGC--TAAACGCAAGA--Agagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaaattatgtaccaattttagtgactctgttcgaaaagtatttaaaagaaatggagctaaacgcaagaaggtattatatttcaacaaacgct
gi|8 : caaacagtttctaaaaaatagtgctaagcttataatgtttacatgtttaggcaaatgaatttatcataaaggtcaaggtcagtgtcattccaaaaaaagtgtatgggtttaagaattagtactagttacacgatataggttcaaattcggtgactcctggacaaaacatttctgataaaaagaatttaacacaaaaacctaacgctttattatacgccaagattaaggtcgaggtcacccaagttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactacA-AT---TATGTACCAA-T-TTTAGT----GACTC-TGT--TCG---AAAAGTATTTA--AAAGAAA--TGGAGCTAAACGCAAGAAGGTATT--A--TATT----T----ggtattatatttcaacaaacgct
gi|9 : caaacagtttctaaaaaatagtgctaagcttataatgtttacatgtttaggcaaatgaatttatcataaaggtcaaggtcagtgtcattccaaaaaaagtgtatgggtttaagaattagtactagttacacgatataggttcaaattcggtgactcctggacaaaacatttctgataaaaagaatttaacacaaaaacctaacgctttattatacgccaagattaaggtcgaggtcacccaagttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactactgagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaTTTATCAC--AATGTGAG---GCTACAAATAATTCTAATAC-AG--CTA--TCA----ACTACAC------------AACTGCTGACGACATTTGAT-GACT---TT-TGA--CA---AA-CAAT--TTGTTTAAGGAAATTGATC--TTTACCCAAAA--ACTTA----TC------ATCTTGTA--A--GTCAA------CAAATCATTTGTA-ATG------GTCAAG--AT-GATT----GAA----A-------AC--------T--TTC------T-------A----TA--GTTTTTGGT------ATT---A-C-TACCCATAATA----CA-AT---CATGGACCAA-G--TCGGTA---GGCTC-TGGGAAAA---AACA----TTA--AAAGAAA--CCGAGCTAGACACA------C-CA--A--CATG----T----T---A------TTAATAA-G------TT--AA-TT----A--T-TT-GTA-AA---GGTTGAA--GT-AATcaacaaacgct
gi|9 : TA--CCC----ATAATAC------------AATCATGGACCAAGTC-GGTAGGCT---CT--GGG-AA---AA-AACA--TTA---AAAGAAACCGAGC--TAGACAC---A--CC--A----AC------ATGTTATT--A--AT-AAG-----TTAATTATTTGTA-AAG------GTTGAA--GT-AAT-------ATTTTA-------CA--------A--TGT------TGGCATCAT----TAT-G-----AGT------AGT---T-G-TACACCTAACT----CA-AC---TATGGattttacaatgttggcatcattatgagtagttgtacacctaactcaactatgg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222 1 1 55555555555555 1 1 1 111 2222222222 1111111 1111 111111111111 111111 1111 2222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 11111111 555555555555555555555555555555555555555555555555 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 333333333333 111111111 3333333333333333333333333333333333333333 11 11111111 11111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11
lowQualScore : 1 22 77777 5 5 1 22222222222222 1 5 5 5 2 3 111 0 9999999999 4 55 1 666 0 3333333 66 33 0000 555555555555 1 2 0 555 444444 555 2 33 1111 2 33 3 33 0000000 777777 33 33 999999 55 2 7777777 33 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 444 333 5555 2 333 000 7777 9999999 444 33 555 33 1 66666666 33 111111111111111111111111111111111111111111111111 44 9999 3 555 77 33 6 55 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3 555 1 7777 888888 888888 555 666666666666 44 44 44 3 0 666666666 6666 2 66 4 4444444444444444444444444444444444444444 44 3 99999 2 00 66 1 44444444 44444444 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 77 6 7 1 5 2
lowQualScore : . .. ..... . . . .............. . . . . . . ... . .......... . .. . ... . ....... .. .. .... ............ . . . ... ...... ... . .. .... . .. . .. ....... ...... .. .. ...... .. . ....... .. . .......................................................................... ... ... .... . ... ... .... ....... ... .. ... .. . ........ .. ................................................ .. .... . ... .. .. . .. ................................................................................................................................................................................................................................................................ . ... . .... ...... ...... ... ............ .. .. .. . . ......... .... . .. . ........................................ .. . ..... . .. .. . ........ ........ ........................................................... .. . . . . .
lowQualScore : 0 00 00000 0 5 0 55555555555555 0 5 0 0 5 2 888 4 1111111111 4 55 4 444 9 9999999 11 99 0000 888888888888 4 9 3 000 777777 000 9 99 6666 0 44 2 77 3333333 222222 44 44 222222 66 5 4444444 44 5 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 444 222 0000 2 999 666 4444 8888888 111 22 111 11 3 00000000 44 000000000000000000000000000000000000000000000000 22 8888 1 444 33 99 5 00 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 888 7 1111 888888 888888 444 888888888888 22 66 66 3 4 222222222 8888 2 22 0 7777777777777777777777777777777777777777 99 6 11111 0 11 77 0 44444444 55555555 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 00 7 8 3 4 5
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTNCTANNAAGAGACAATTTGCAAAACATGAACTTCGAACTGGCACTTGCTNGCAAGTTCGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGNATGTTGCTGACAACATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCACGGAATTAAATGTCTCG-CT---TCTATATC-GCTTTATCAC--AAAGTGAG---GCTATGAAGAAGTC--A-AN-AG--TTA--TCC----ATTACAC------------AACTATGGACAAAATTTGGT-GACT---CT-TGGG-CA---AA-CAGT--TTN---AAAGAAACGGAGC--TTAACACAAAA--AC--A----AC------ATTTTGTA--G--GTCAAG-----TTAATTATCCGTA-GAG------GTCAAG--GT-CATCC-G-AAA----A-------AA--------A--TGC------T-------T----TA--G-----GGT------AGT---A-C-TACCCATAACA----CA-AC---TATGGACCAA-A-TTTGGT----GACTC-TGGG-NCA---AACAGT--TTN--AAAGAAA--CGGAGCTAAACGCAAAAAANT-TA--A--CATT----T----T---G------T-----A-G------TT--AA-TC----A--T-TC-GTA-GA---GGTCAAG--GT-CATCCGAAA--AA-A--NG---------TNT-----CATG---T-----AGT--------------AAT-AC---T------AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGGTGACTTNAGGNCAAACAGTTTC------T-----GAGA-----A-----GC-----------C---------AA----------A-----A----C----T----G-T-T-T---G------TAG-GCCA---AGTTATTCATC-CGTA------AAGGT------CAAGGT---CA-------TCCG-AAAA--AAA--TG--CTGCA-TGGTTT--TT-GAG---TNGTACTACCCATA-ACA-CAACTATG-----AACC--A--TTTGGT-GACT-C-----C-GGT-C-AA-----ACAGTTTCTGA-GAAACGGAGCTNAAC---G----CAAA--------AACTTAA----C--------AT-------A-G-------CCA-AT-G--T-A---AGGT------CAAGGTCACCC-GA-AAAAATGCTGCATGGTTTTGATTAGTACTATCCATAACACAACTATGGACCAAGT
Reference ( family-260 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTNCTANNAAGAGACAATTTGCAAAACATGAACTTCGAACTGGCACTTGCTNGCAAGTTCGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGNATGTTGCTGACAACATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCACGGAATTAAATGTCTCG-CT---TCTATATC-GCTTTATCAC--AAAGTGAG---GCTATGAAGAAGTC--A-AN-AG--TTA--TCC----ATTACAC------------AACTATGGACAAAATTTGGT-GACT---CT-TGGG-CA---AA-CAGT--TTN---AAAGAAACGGAGC--TTAACACAAAA--AC--A----AC------ATTTTGTA--G--GTCAAG-----TTAATTATCCGTA-GAG------GTCAAG--GT-CATCC-G-AAA----A-------AA--------A--TGC------T-------T----TA--G-----GGT------AGT---A-C-TACCCATAACA----CA-AC---TATGGACCAA-A-TTTGGT----GACTC-TGGG-NCA---AACAGT--TTN--AAAGAAA--CGGAGCTAAACGCAAAAAANT-TA--A--CATT----T----T---G------T-----A-G------TT--AA-TC----A--T-TC-GTA-GA---GGTCAAG--GT-CATCCGAAA--AA-A--NG---------TNT-----CATG---T-----AGT--------------AAT-AC---T------AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGGTGACTTNAGGNCAAACAGTTTC------T-----GAGA-----A-----GC-----------C---------AA----------A-----A----C----T----G-T-T-T---G------TAG-GCCA---AGTTATTCATC-CGTA------AAGGT------CAAGGT---CA-------TCCG-AAAA--AAA--TG--CTGCA-TGGTTT--TT-GAG---TNGTACTACCCATA-ACA-CAACTATG-----AACC--A--TTTGGT-GACT-C-----C-GGT-C-AA-----ACAGTTTCTGA-GAAACGGAGCTNAAC---G----CAAA--------AACTTAA----C--------AT-------A-G-------CCA-AT-G--T-A---AGGT------CAAGGTCACCC-GA-AAAAATGCTGCATGGTTTTGATTAGTACTATCCATAACACAACTATGGACCAAGT
gi|1 : AGTAGTACTAGAAAAAGACAATTTGCAAAACA-GAACTTCGAACTGACACTTACTAGCAAGTTTGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGGATATTGCTGACAA-ATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCATGGAATTAAATGTTTCGACTACATGTATATC-GCTTTATCAC--AAACTTAG---GCTATGAAGAAGTC--A-AA-AG--TTA--TCC----ATTACAA------------AACTATGAACAAAATTTTGT-GACT---CT-TGGGGTA---AA-CAGT--ATC---AAAGATACCGAGC--TTAACACAAAA--AC--A----AC------ATTCTGTA--G--GCTAGG-----TTAATTATTTGTA-AAG------GTCAAG--GT-CATCT-A-AAA----A-------AA--------A--TAA------T-------T----TAAGG-----GGT------AGC---A-C-TACCCATAACA----CA-AT---TATGGACCAG-G-TTCTGT----GGCAC-TAGG-TCA---AAAAGT--TTA--AAAGAAA--CAGAGCTTAGCACAAAAAAAT-TA--A--CATT----T----T---G------T-----A-G------TT--AA-TC----A--T-TG-GTA-GA---GGTCAAG--AT-CATACAAAA--AG-A--AG---------TAT-----CA-G---T-----AGT--------------AGT-AC---T------AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGATAACTTGAGACAAAACA-TTTC------G-----GAGG-----A-----GC-----------C---------AG----------A-----A----C----T----G-T-T-T---G------CAG-GCCA---AGTTAATTATT-CATA------GAGGT------TAAGAC---CA-------TCTG-AAAA--AAATTTG--CTTTT-T--TTT--TT-TAG---TAATACTACCCACA-ACA-CAGTTATG-----AACC--A--TTTTGT-GACA-C-----T--GT-C-AA-----ATAGTTTC--A-TAAACAGAGCTGAAT---G----CAAA--------AATCTAA----C--------AT-------A-G------------T-G--T-----AGGT------TAAGGTTACCA-GA-AAAAAAAATGCATGGTTTTGATTAGTACTATCGATAA-GCAACTATGGACCAGGT
gi|10 : atatcatcatggtctatttgttcaataataagtagaatttgtattgtaccttgaaatgtgccagtctacacgaaggcccctgttttgactagtgacactTTCACAAT-A--ACAAGAAAATTCCCCAGAATTCAATGTCTCA------TCTATATT-GCTTGACCAC--AAAGAGAG---ACCATGAAG-AGTC-----T-AG--TTA--T
gi|11 : tctaaatgaaatttcattgtagtA--TTT----ATTACAC------------ACTCATAGATAACGTTTAGT-TTCT---CT--GGG-AA---AATCAGT--CTC---AA-----CAGAGA--TAAGCA---AA--GC--ATTTAAT------ATTTTGTA--G--GCTAAG-----T-----GTC--TC-GAA------CGCATG--GC-CATTT-G-AAA----T-------AGTGCTT---A--TGT------T-------T----T---------GGT------AGT---AACATAGCCATTACT----CA-AA---TATTGACCAA-G-TTTAAT----GACTC-TGGT-TTA---CAAAAT--GTA--AACGAAA--GAGAGCTAAACACAAAATAG--TA--A--TATA----G----T---G------T-----ATG------CT--AA-gaaggagagacaaagacttgacaagttacatcactacagatgcaagaccatatcatgatatttgtctatcaattttcaattaaggatatttctacacatttataaaagaagtttacattgtgttagggtcaa
gi|12 : TTA-AATTATCATAAAAGAGTTCTACGGAATTGAATGTCTAA-CT---T--AAATC-GCTTTATCAC--TAAGTGAG---GCTATAAAGAAGTT-----T-AG--TTA--TTTTA--GTTACAC------------AACTATAAACACAATTAGAT-GACT---CT-TGAG-CA---AG-CAGC--TTC---AAATAAACGGATC--TTAATACAAAATCAT--A----AC------ATTTTGTA--G--GCTATG-----TTAATTATC
gi|13 : ctaactacaaattttattaaggCATACAGTTTC------T-----AAAA-----ACATA-GT-----------CTT-------AA----------C-----A----C----T----G-G-------G------TGG-GCCATTTAGTTATTCATC-CATA------AAGGT------AAAGGT---CA-------CC---ATTA--AAA--TG--CTGCA-TGGATTAATTAGAG---AAGAACAACCCCTACACA-GAAATA-G-----AACA--A--ACTGATTGACT-CGTAACT-GGT-C-AA-----ATGGTTTCTGA-GAAACAGAGCTTAAC---G----CAAA--------AACTTTA----C--------Aattgaagacttgatagtct
gi|14 : C------ATTAAGTA--G--ATCAAG-----TTTAATATCAGT------------TCAAG--GT-CATCCCG-AAA----A-------A------------TGT------T-------G----TA--T-----GGTGTATAGAGT---A-T-T-----TAACG----TA-AC---TATAAACCAA-A-TTTGGT----GAATC-TAG--CCA---AACATT--TTCTAAAAGAAAAACAGTGCTAAATGCAAATA-CT-TA--AGACGTTGAGATAAAGT---G------T-----A--------TT--AA-CTGT--A--T-AT-GTC-AA---GGTGAAG--GT-CATTCGAAA--AA-T--TG---------CTA-----CATG---T-----Actgaattgttgacgcagatgcaaccatcgtaacca
gi|15 : aacttat------------AACTATGGACCAAATTTGGT-GGTT---CT-TTAC-TA---AA-TTGT--TTTT--GAAGAAACAGA--------CATAAAT--TA--A----AC------ATTCAGTA--G--GCAAAA-----TTATTCATCATTA-GAT------GTCAAG--GT-CATCC-A-AAA----AGTGCTGCAA--------A--T-C------T-------T----CA---------GT------AGG---A-A-TACCCACAACA----CA-AG---TATGAACCAA-A-TTTtt
gi|16 : gAATTTGGT-GACT---CT-TGAA-CA---AA-CAGT--TCA---AATGAAATGGAGC--TTAACACAAA-------A----AC------ATTTTGCA--GCAGTCTAA-----TTTATTATCAGTA-GAG------GTCAAG--GT-C-T------AG----A-------AA--------A--TGCTGCATAT-------T----TT--G-----GGT------AGT---G-C-TACCCATAACA----CA-AT---TATGGACTAA-G-TTTAGT----GATGC-T-TG-CCA---AGTAGT--TTA--AAAGAAA--CGAAGCTAAATGCAAAAAttcattggaataattcagacaaaaacacttaaaataaggaggataaaatta
gi|17 : cattt--A----AT------ATTTTGTA--G--GATAA---------ATTATTCATATGAG------TTCAA-------AT---G-AAA----A-------TATGTTGCGTG--TGT------T-------T----TA--G-------T------AGT---A--------ATA-TA----CA-AC---T--GGATCCA-A-TTTGGT----GACTC-TGAG-ACA---AGC----------AAAGGAA--CA----TAAATACATAACTGT-TAGTA--CA-----------T---A------A-----A-G------TT--TA-TT----A--T-CT-AAA-GA---GGTCAAAT-GT--ATCCAAAta
gi|18 : aaattt--TCAACGCAAAA--AC--A----AC------GCGTTGT--------C--------TTAATTATTTGAA-AAG------GTCAAC--TT-TATTT-----A----A-------AA--------C--TCC------A-------T----TG--G-----AAA------AGT---A-C-TACCTATAACA----CA-GA---TTCGGACCAG----TTACT----GACTC---AG-TCA---AACCGT--TTC--AGAGAAA--CCAGGCTGAACACAAgtaatattgcaatgc
gi|19 : AATTA---TAGGAGAATTCCACAGAATCAAATGTCT---CT---TCTATATC-CCATTATCATAAAAAATGAA---GCTATtatagatattg
gi|2 : atatggaatttctaAGAGAATACCACATAATTAA-TGTCTCA-CT---T--ATATC-GCTTTACCAC--AAAGTGAA---GCTATGAGGAGGTT--C-AG-A----TA--T-C----ATTACAtgtaaatgatgaaactattcaatgtcaaagatgcacagatcacatcaaatagatatatgcaataccattatca
gi|2 : ttAAGCAAAGC--T-AATACATAC--AC--AC---AT------ATTGTGTAAGG--GTCAAGGTTAATTAATTATCCATA-GAGAACTATGTCAAG--GC-TATCC-A-AAAT---A-------AA--------AC-TGC------T-------TGATTTG--G-----AGT------AGT---C-T-TACCTATAACA----CA-AC---TATGAGTCAA-A-TGTGGT----GACTG-TGGA-ACA---AACAGT--TTC--AAAGAAA--TGAAGCTAAACAAAAAAAATT-T--------TT----T----T-------------------------TT--TA-CC----A--TATCTGTA-GA---AGTCAAA--GT-CAGCCAAAACAAA-A--GGCTGAATGGCTTT-----CA-G---T-----AGTTGTACCTAATTATTAATGAT---T------ATAAAGC----T-----------AGAA--------------ACCATAT--------T-----TTGTATCTCTAAGGCAAACAGTTTCAAAAGAT-----CAGG-----A-----GCTACATG-----C---------AA----------A-----A----C----TTAATA-TCT-T---G------TAG--CTA---AGTTAATTATC-CATA------AAGGT------CAAGGT---CA-------TC---AAAA--AAA--TG--CTGCC-TGGTTT--T--GAG---TCATGTTACCCATT-ACAATAGC-ATA-----AACAGAA--TTTGGT-GAAT-C-----T-GGGAC-AA-----ACAATT---GAAGCAACAGTGCTAAAA---A----TAAA--------A-CTTAAAAAAC--------AA-------A-G-------CTA-ATTA--T-ACATAGGT------CAAGGCCATCC-AATAAAAATGCTGCATTGTTTTGAGTTGTTCTATCCAGTACACAACTATGAAaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcataagcaaagctaatacatacacacatattgtgtaagggtcaaggttaattaattatccatagagaactatgtcaaggctatccaaaataaaactgcttgatttggagtagtcttacctataacacaactatgagtcaaatgtggtgactgtggaacaaacagtttcaaagaaatgaagctaaacaaaaaaaattttttttttaccatatctgtagaagtcaaagtcagccaaaacaaaaggctgaatggctttcagtagttgtacctaattattaatgattataaagctagaaaccatattttgtatctctaaggcaaacagtttcaaaagatcaggagctacatgcaaaacttaatatcttgtagctaagttaattatccataaaggtcaaggtcatcaaaaaaatgctgcctggttttgagtcatgttacccattacaatagcataaacagaatttggtgaatctgggacaaacaattgaagcaacagtgctaaaaataaaacttaaaaaacaaagctaattatacataggtcaaggccatccaataaaaatgctgcattgttttgagttgttctatccagtacacaactatgaaaaaaaattggtttctcttaagcaaaaagtttaaaagaaaatgagtgtaaca
gi|2 : ttagagaataccacataattaatgtctcacttatatcgctttaccacaaagtgaagctatgaggaggttcagatatcattacaaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcatTA--TCC----AGTACAC------------AACTATGAAAAAAAATTGGT-TTCT---CT-TAAG-CA---AA-AAGT--TTA---AAAGAAAATGAGT--GTAACAaaaaaattggtttctcttaagcaaaaagtttaaaagaaaatgagtgtaaca
gi|20 : ttagagaataccacataattaatgtctcacttatatcgctttaccacaaagtgaagctatgaggaggttcagatatcattacaaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcataagcaaagctaatacatacacacatattgtgtaagggtcaaggttaattaattatccatagagaactatgtcaaggctatccaaaataaaactgcttgatttggagtagtcttacctataacacaactatgagtcaaatgtggtgactgtggaacaaacagtttcaaagaaatgaagctaaacaaaaaaaattttttttttaccatatctgtagaagtcaaagtcagccaaaacaaaaggctgaatggctttcagtagttgtacctaattattaatgattataaagctagaaaccatattttgtatctctaaggcaaacagtttcaaaagatcaggagctacatgcaaaacttaatatcttgtagctaagttaattatccataaaggtcaaggtcatcaaaaaaatgctgcctggttttgagtcatgttacccattacaatagcataaacagaatttggtgaatctgggacaaacaattgaagcaacagtgctaaaaataaaacttaaaaaacaaagctaattatacataggtcaaggccatccaataaaaatgctgcattgttttgagttgttcGACAATTGCACTGTATTAAATGTCTCA-C-----CTATATG-GCTTTATCAC--AAAAAGAG---GCTATGAACAAGTC--A-AG-TG--GT---TCC----AGTA
gi|21 : tgtaaccaagaataagtt---G------TGG-GCCA---GGTTATTCATC-TATA------GAGCT------CACGGT---CA-------TT---AAAA--AAA--TG--TTGCA-TTGTT-------AA---TAGAAATACCCAAA-Agtatctacctattatgcaatta
gi|22 : agaaacagaaaataaaacgtgaaaacttaaagcAGTAGTTTTACTAAGAGA-----TG-AAAATATGAACTTCGAACTAGTACTTGCTTACAAATTCGACCATA--------------TTAGGAGCA-GTT-CTAACAACATTTACAATTgtcagcagctgta
gi|23 : tttcaatttgcgaaAGAAA--CGGTACAACACGCAAATA-CT-AA--A--CATTATT-T----T---A------T-----AAG------TT--AT-AC----A--T-TC-ATA-GA---GGTCAAT--GT-CACATGAAA--AA-A--
gi|24 : ccaaataccatttgCCATCACA----CA-GC---TATGGATCAA-A-TT------------C-TGGG-TTA---AAAAGT--GTC--TAAGAAA--CGGAGCTAAAACCAAAAACAT-TAC-A--CACT----A----T---G------T-----G-GAT----TT--AA-
gi|25 : ATC-TGTG------AATGT------TGAGGT---CA-------TTCC-AAAA--ATA--TG--CTAGA-TGG-TA--CT-GAG---TTATGTTACC
gi|26 : tTCTCG-TT---T--AT-TCAGCTTTATCAC--AAATAGAG---GCTAT-AAAAAGTC--A-A
gi|3 : AAATGTCTCG------TCTATACT-GTTTTATCCC--AAAATGAA---GCTATGAAGAAA----A-AC-CG--TTAATTCTGCCGATTACAC------------AACTGAGAACAAAATTTGGG-GACT---TT-TGGA-CA---GA-CAGT--CCT---AAAGAATCGCAGC--TCAAAACAAAA--ACTTA----AC------ATTTTGTA--A--GCCTA------TTAATTAATTGTA-GAG------TTCAAG--GC-CATCT-------------------------------TGC------T----------------G-----CAC------ATT---A-C-TA-CCATAACAATATCATACTGATATGACCCAA-AGTTTACT----GGCTA-TCAG-TCA---AACAGT--TTA--AAAGAAA--CAAAGCTAAACACAAAACATG-AA--A--TATT----T----T---G------T-----A-AAC----TA--AA-ACAACAA--T-AA-GTA-CA---GGTCAAG--GT-TATCTAAAA--AA-A--CG---------TCTG----CATg
gi|3 : ctacAT-AC----------AC----C----T-----------ATAAC-------------ACG------------C-----TACCAACTTT-GGTTAAACAGTTTC------T-----GAAA-----A-----ACAGAGGAAAACAC---------AG----------A-----AT---C----T----G-T-T-----G------TAG-GCCA---AGTTAACTATT-CGTA------AAGGT------CAAGGT---CAAGGTCA-TCTG-AAAATAAAA--TGACCTGC------TT--TT-CAG---TCGTGCTACCCATA-ACA-CA-CTTTG-----AACA--A--TTTGAT-GACT-C-----CAGGT-C-AA-----CTCGTTTTTGA-AAAACGGAGCTTAAC---A----CTAG--------AACTAAA----C--------AT----------------------T-G--T-------GT--------AGGCTACCCCGA-AAAAAAGCTGCATGATTTTGATTATTATCATCTATATAACAACTGCGGACCcatttttaactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcatacacctataacacgctaccaactttggttaaacagtttctgaaaaacagaggaaaacacagaatctgttgtaggccaagttaactattcgtaaaggtcaaggtcaaggtcatctgaaaataaaatgacctgcttttcagtcgtgctacccataacacactttgaacaatttgatgactccaggtcaactcgtttttgaaaaacggagcttaacactagaactaaacattgtgtaggctaccccgaaaaaaagctgcatgattttgattattatcatctatataacaactgcggacctccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|4 : ctacaaatgtctcgtctatactgttttatcccaaaatgaagctatgaagaaaaaccgttaattctgccgattacacaactgagaacaaaatttggggacttttggacagacagtcctaaagaatcgcagctcaaaacaaaaacttaacattttgtaagcctattaattaattgtagagttcaaggccatcttgctgcacattactaccataacaatatcatactgatatgacccaaagtttactggctatcagtcaaacagtttaaaagaaacaaagctaaacacaaaacatgaaatattttgtaaactaaaacaacaataagtacaggtcaaggttatctaaaaaaacgtctgcatcatttttaactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcTTTGTACTACCTATAACAAAATTATGGACAAAGTtccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|4 : aaacacacaagagtTA--CCT----ATAACAA------------AATTATGGACAAAGTTTAGT-GACT---CT--GGG-TA---AA-TTGA--TTA---AAAGAATAAAAATAATTAAAAGATAA--AC--ATAA-ACCATAGAATTTTATA--G--GTTAAG-----TTAATTATTCATA-GAG------GTCAAG--TT-CATCT-G-AAG----A-------AA--------GTCTGCATCA--T-------T----TT--GATT--GGT------AAT---A-C---CCCATAACA----CA-AA---TAAAGATCAA-A-GTTGGTATTAAACTA-T-AG-ACATTTAACAGT--TTC--TGATAAA--CAAAGGTCAATGC-AAAAACT-TC--A--CATT----T----TTAGG------TCA---A-G------TA--AA-TT----A--T-TC-GTT-GA---GACCAAGTTGTGCAT--------------TG---------TTT-------TG---------AGT--------------ATT-AC---T------AC----A----C-----------ATAAC-------------ACAGCTATGAAGCTTT-----TGATGAC-TAAAGACAATTTTTTTT------T-----GAGA-----A-----ACAGAG-------CTTAACGCAAAA----------A-----A----CTAAAT----A-T-TGT---G------TAGTATTA---AGTTATTCTTA-CGGC------ATGGT------CAAATT---CA--------CCG-AAAA--AAT--TG--CTGCA-TGGTT--------------ATAATACCAATA-CCA-GAAC-ATA-----AG--------TTGGT-GGCT-T-----CAGGC-C-AA-----ACAGTTTCTAACCAAAC-AAGC-CAACTAAGGAATCAAATGTTTTCTAGGTCAA----A--------AT-------A-G-------CCATAT-G--TCA---AGGTTAAGGGCAAGGTTACTCAAA-AAAAATGCTACATTGTTTTGATT-TTACTATTCAGAACACAACTATGGACCAAttagtgactctgggtaaattgattaaaagaataaaaataattaaaagataaacataaaccatagaattttataggttaagttaattattcatagaggtcaagttcatctgaagaaagtctgcatcattttgattggtaataccccataacacaaataaagatcaaagttggtattaaactatagacatttaacagtttctgataaacaaaggtcaatgcaaaaacttcacatttttaggtcaagtaaattattcgttgagaccaagttgtgcattgttttgagtattactacacataacacagctatgaagcttttgatgactaaagacaatttttttttgagaaacagagcttaacgcaaaaaactaaatattgtgtagtattaagttattcttacggcatggtcaaattcaccgaaaaaattgctgcatggttataataccaataccagaacataagttggtggcttcaggccaaacagtttctaaccaaacaagccaactaaggaatcaaatgttttctaggtcaaaatagccatatgtcaaggttaagggcaaggttactcaaaaaaaatgctacattgttttgattttactattcagaacacaactatggaccaatcactttttgagaaatcgtgctaaactaaaaaactgagcattgtgtaaagttattcacccatagaaatcatggtcacctgaaaaaagctgcatggttttgagaagtatatggaca
gi|4 : aaacacacaagagttttgtacCC----ATAACAC------------AAATAAAGATCAAAGTTGGT--ATTAAACTATAGA-CATTTAA-CAGT--TTC---TGATAAACAAAGG--TCAATGCAAAA--ACTTC----AC------ATTTT-TA--G--GTCAAG-----TAAATTATTCGTT-GAG------ACCAAGTTGTGCAT---------------------------------TGT------T-------T----T---G-----AGT------ATT---A-C-TACACATAACA----CA-GC---TATGAAGCT----TTTGAT----GACTA--AAG-ACA---ATTTTT--TTT--TGAGAAA--CAGAGCTTAACGCAAAAAACT-AA--A--TATT----G----T---G------T-----A-GTA----TT--AAGTT----A--T-TC-TTACGGCATGGTCAAA--TT-CA-CCGAAA--AA-AT-TG---------CTG-----CATGGT-T-----A-T--------------AAT-ACCAAT------AC----CAGAAC-----------ATAA--------------G--------------T-----TGGTGGCTTCAGGCCAAACAGTTTC------TAACCAAACA-----A-----GC-----------C---------AACTAAGGAATCA-----A----A----T----GTT-T-T---C------TAG-GTCA---AAATAGCCATA-TGTC------AAGGTTAAGGGCAAGGT---TA-------CTCA-AAAA--AAA--TG--CTACA-TTG-TT--TT-GA----TTTTACTATTCAGA-ACA-CAACTATG-----GAC------------------------------C-AA-----TCACTTTTTGA-GAAATCGTGCTAAAC---T----AAAA--------AACTGAG----C--------ATTGTGTAAA-GTTATTCACCC-AT-A--G-A---A-AT------CATGGTCACCT-GA-AAAAA-GCTGCATGGTTTTGAGAAGTA-TATtcactttttgagaaatcgtgctaaactaaaaaactgagcattgtgtaaagttattcacccatagaaatcatggtcacctgaaaaaagctgcatggttttgagaagtatatggaca
gi|5 : aaacacacaagagttttgtactacctataacaaaattatggacaaagtttagtgactctgggtaaattgattaaaagaataaaaataattaaaagataaacataaaccatagaattttataggttaagttaattattcatagaggtcaagttcatctgaagaaagtctgcatcattttgattggtaataccAATGA--ACATGAGAATTCCATGGAATTAAATGTCTAG-C-----CTATATC-CCTTTATCAC--ATAATGAG---GCTATGAAGAAGAC--A-AGTAGATCTA--CCC----ATTACAC------------AACTATGAAAAAAA-----------------------A---AA-TAGT--TT----AAAGAAATGGAGC--GTAAAACAAAA--TC--A-------------TTTTATA--G--TTCAGG-----CTAA--A---ATA-GAG------ATTAA----------T-G-GAA----A-------AC--------A--T--------T-------T----T----------GT------AA----G-C-TACCCTTAACA----CA-GC---TATGAATCAA----TTGGT----G----------CCA---AACAGT--TTT--TGAGAAA--AGGTGTTAAACACAAAAACAT--A--A--TGTT----G----C---A------T-----A-GACTAAGTT--AT-AC----A--T-CC-AAA-GA---GGCCAAG--GT-CACTCAAAG--AA-A--TG---------CTA-----CATG---TTTTAGGGT--------------AAT-AT---T------AC----C----CCTTACACAACAATGG--------------ACCAACT--------T-----TGGTGATTATTTGCAAAACAGTTTC------T-----GAGA-----A-----ACAATCTGTACG-C---------AA----------A-----AAATTC----A----A-T-T-TTGCG------TAG-GCTT---AGCTTTTCATC-TATAGAGGTTAGGGT------CAAGGT---AA-------ACTG-AAAA--AAA--TG--CTGCACTG--TT--TT-AAT---CAGTATTACCCATT-ACA-CAACTTTA-----AACCAAA--TTTGGT-GATTGT-----A-GGT-C-AA------------------AAACAGAGCTCAAC---A----CAAA--------AAggaca
gi|6 : aacagtctgtaaataaacaaaaaagtgtaGACCAA---TTTTAT----GGCTC-TGGA-TCA---AATAGT--TTA--AAA--AC--CAGAGGTACAC---AAAAACG-CA--A--CATT----T----T---GAAGGCTC-----A-G------CTGAAA-TC----AAAT-T---TA-GA---GGTCAAA--GT-CATCTGCAA--AATA--AT---------TCTG----CATGGGATCG---AGT--------------AAT-AC---A------AC----C----C-----------ATAACACAGCTATGAACCAT-------------T-----TGGTGCCTCCATGACAAACAATTTT------T-----GAGA-----A-----ACGGAG-------CTTAAGATA-AA----------A-----A----C----TAAATG-T-TGT---G------TGG-ATCA---AGTTATTCATC-C--A------AAGAT------CAAGGT---CA----------GTAAAC--AAA--TA--CTGCA-TGGTTT--T--GAA---TTGAACTACTCATA-ACA-CAATTGTA-----GACC--AAGTTTGGT-GACT-CTT---T-TGT-C--A-----ACAGTTTCTGA-TAAATGGAGCTAAAT---G----CGAA--------Aataagtcttacgaaccagtcttacgaaccaacaccaagaaagtatcatgtatttctctgattttcgtttgaaaagccaagacaaaaatgtgtacagtatatcaaatagtgtttgatgcatgttacaatg
gi|6 : gttA--CCC----ATAACAC------------AGCTATGAACCA--TTTGGT-GCCT---CC-ATGA-CA---AA-CAAT--TTT---TGAGAAACGGAGC--TTAAGATAAAA--ACTAA----AT------GTTGTGTG--G--ATCAAG-----TTATTCATCC--A-AAG------ATCAAG--GT-CA----GTAAA----C-------AA--------A--TAC------T-------G----CA--T-----GGTTTTG--AATTGAA-C-TACTCATAACA----CA-AT---TGTAGACCAA-G-TTTGGT----GACTCTTTTG-TC----AACAGT--TTC--TGATAAA--TGGAGCTAAATGCGAAATGTT-T--------TT----T----T-------------------------TT--A---------------------A---AATAAAG--CT-AAT-TGAAA--AA-CTTAA---------TGT-----TATG---TG----AGC--------------AAA-TT---T------AT----T----C-----------AT-------------------------------T-----TGGTGATTTGAAGCCAAG-------------T-----GA------------------------------------AA----------A-----A----C----TTTACG-T-TGT---G------TAT-TCCA---AGTTATTCA-----TA------AAGGT------CAAGGTGAACAATT----TCTG-AGAA--AAtgtttttttttaaaataaagctaattgaaaaacttaatgttatgtgagcaaatttattcatttggtgatttgaagccaagtgaaaaactttacgttgtgtattccaagttattcataaaggtcaaggtgaacaatttctgagaaaatagctcaatgcaaaaacttaaaattgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|6 : gttgaccaattttatggctctggatcaaatagtttaaaaaccagaggtacacaaaaacgcaacattttgaaggctcagctgaaatcaaatttagaggtcaaagtcatctgcaaaataattctgcatgggatcgagtaataca-GGT-C-AAGGTGAACAATTTCTGA-GAAA-ATAGCTCAAT---G----CAAA--------AACTTAA----A--------AT-------tagctcaatgcaaaaacttaaaattgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|7 : gttgaccaattttatggctctggatcaaatagtttaaaaaccagaggtacacaaaaacgcaacattttgaaggctcagctgaaatcaaatttagaggtcaaagtcatctgcaaaataattctgcatgggatcgagtaatacaacccataacacagctatgaaccatttggtgcctccatgacaaacaatttttgagaaacggagcttaagataaaaactaaatgttgtgtggatcaagttattcatccaaagatcaaggtcagtaaacaaatactgcatggttttgaattgaactactcataacacaattgtagaccaagtttggtgactcttttgtcaacagtttctgataaatggagctaaatgcgaaatgtttttttttaaaataaagctaattgaaaaacttaatgttatgtgagcaaatttattcatttggtgatttgaagccaagtgaaaaactttacgttgtgtattccaagttattcataaaTAATTATCCACA-GAG------ATCAAG--GG-CATTC---AGA----A-------AA--------A--TGC------TGCA----T----TGTTG-----ATT------ATT---A-C-TATCCATTACA----TG-AC---TATGG-CCAGTA-TTTGGT----GACAC-TGGG-GCC---AACAGT--TTC--AAAGAAA--TGGAGCTTAATGC-AAAAATT-GA--A--CATT----T----T---G------T-----A-G----------A--------A--T-TT-GTA-GA----AT-----------TTCGAAA--AA-A--TGCCCAACAGTTATAAGTACATG---T-----AGT--------------TAC-AT---TGAGTTCACAA--C----C-----------ACAG--------------AC-------------TAAATGTGGCGACTCTGGGGCAAACAGTTTC------A-----AAGAAATACA-----GC-----------T---------AA----------A-----T----A----T------T-T-T---A------TAG-GCtgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|7 : aattg---AGTTAATTATCACTTG------AAT-T------CAATGC---CA-------TTCA-AAGA--AAA--TA--CTGCA-TGG-TT--TT-GAG---CAGAACTATCCAT------CAACC--------AATC--A--TT------A---------------C-AA-----ACAGTCTCTTA-GAAATGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttaattatcacttgaattcaatgccattcaaagaaaatactgcatggttttgagcagaactatccatcaaccaatcattacaaacagtctcttagaaatgcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|8 : aattgtaattatccacagagatcaagggcattcagaaaaatgctgcattgttgattattactatccattacatgactatggccagtatttggtgacactggggccaacagtttcaaagaaatggagcttaatgcaaaaattgaacattttgtagaatttgtagaatttcgaaaaaatgcccaacagttataagtacatgtagttacattgagttcacaaccacagactaaatgtggcgactctggggcaaacagtttcaaagaaatacagctaaatattttataggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAAACAGTTTC------T-----AAAA-----AATAGTGC-----------T---------AA----------GCTTATA----A----T----G-T-T-T---ACATGTTTAG-GCAA---ATGAATTTAT--CATA------AAGGT------CAAGGT---CAGTGTCATTCCA-AAAA--AAG-------TGTA-TGG-GT--TT-AAGAATTAGTACTA---GTT-ACA-CGA-TATAGGTTCAA----A--TTCGGT-GACT-C-----CTGGA-CAAA-----ACA-TTTCTGA-TAAAAAGAATTTAAC---A----CAAA--------AACCTAA----CGCTTTATTAT-------ACG-------CCA-A--GATT-A---AGGT------CGAGGTCACCC--A-AGTTATGCTGCATGGTTTTAAGTAACACCAAGCATTACACTACTcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|8 : TGAGAATGCTAAGAATAA-----A-AT-AA--TTA--TTG----GTTACGCTTAAACGTTAAAAATTATGTACCAATTTTAGT-GACT---CT--GTT-CG---AA-AAGTATTTA---AAAGAAATGGAGC--TAAACGCAAGA--Agagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaaattatgtaccaattttagtgactctgttcgaaaagtatttaaaagaaatggagctaaacgcaagaaggtattatatttcaacaaacgct
gi|8 : caaacagtttctaaaaaatagtgctaagcttataatgtttacatgtttaggcaaatgaatttatcataaaggtcaaggtcagtgtcattccaaaaaaagtgtatgggtttaagaattagtactagttacacgatataggttcaaattcggtgactcctggacaaaacatttctgataaaaagaatttaacacaaaaacctaacgctttattatacgccaagattaaggtcgaggtcacccaagttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactacA-AT---TATGTACCAA-T-TTTAGT----GACTC-TGT--TCG---AAAAGTATTTA--AAAGAAA--TGGAGCTAAACGCAAGAAGGTATT--A--TATT----T----ggtattatatttcaacaaacgct
gi|9 : caaacagtttctaaaaaatagtgctaagcttataatgtttacatgtttaggcaaatgaatttatcataaaggtcaaggtcagtgtcattccaaaaaaagtgtatgggtttaagaattagtactagttacacgatataggttcaaattcggtgactcctggacaaaacatttctgataaaaagaatttaacacaaaaacctaacgctttattatacgccaagattaaggtcgaggtcacccaagttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactactgagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaTTTATCAC--AATGTGAG---GCTACAAATAATTCTAATAC-AG--CTA--TCA----ACTACAC------------AACTGCTGACGACATTTGAT-GACT---TT-TGA--CA---AA-CAAT--TTGTTTAAGGAAATTGATC--TTTACCCAAAA--ACTTA----TC------ATCTTGTA--A--GTCAA------CAAATCATTTGTA-ATG------GTCAAG--AT-GATT----GAA----A-------AC--------T--TTC------T-------A----TA--GTTTTTGGT------ATT---A-C-TACCCATAATA----CA-AT---CATGGACCAA-G--TCGGTA---GGCTC-TGGGAAAA---AACA----TTA--AAAGAAA--CCGAGCTAGACACA------C-CA--A--CATG----T----T---A------TTAATAA-G------TT--AA-TT----A--T-TT-GTA-AA---GGTTGAA--GT-AATcaacaaacgct
gi|9 : TA--CCC----ATAATAC------------AATCATGGACCAAGTC-GGTAGGCT---CT--GGG-AA---AA-AACA--TTA---AAAGAAACCGAGC--TAGACAC---A--CC--A----AC------ATGTTATT--A--AT-AAG-----TTAATTATTTGTA-AAG------GTTGAA--GT-AAT-------ATTTTA-------CA--------A--TGT------TGGCATCAT----TAT-G-----AGT------AGT---T-G-TACACCTAACT----CA-AC---TATGGattttacaatgttggcatcattatgagtagttgtacacctaactcaactatgg
blockSeqs : T CT . . T T . C . . C C T TCA AACTT A AA G AAT TAATAC AT AT GCCG TTAAACGTTAAA A A AAA ATAGA TTT T AT GTTT A AA A TC ATTTA CATAGA AG CA GGTTAA AG T AACTATG TT G CTGAAGAAAGTCTGCATCATTTTGATTGGT TGA ACA ATAT T TGA AG ATTA TTTTGT TTT AT CTA AA A TGTTAGT GA GAGATAAAGTGTATTAACTGT AA ATCT C CAT TT GC T CA AGGCTGAATGGCTTTCAGTAGTTGTACCTAATTATTAATGATTATAAAGCTAGAAACCATATTTTGTATCTCTAAGGCAAACAGTTTCAAAAGATCAGGAGCTACATGCAAAACTTAATATCTTG T TTT T CACT GAGGTT TAAGGG GAA GTGTCATTCCA TA . AC C ATTAATTAG GAAT A AC A ATAGAACAAACTGATTGACTCGTAACTG GA A GGTGA G AG CA T TAAGGAAT TGTTTTCT CATTGTGTAAAGTTATTCACCCATAGAAATC CG T T G T C
blockSeqs : C T A CACTT . . G . AAGT . . TA . A . . TGAG . . . TT G . T . ATAA . . . G AT . C . . ATTTTACAATGTTGGCATCATTATGAGT . T . . . TA A TGGGAA . . A . G CATTAC . TTGAAGGCTCAGCTGAAATC . AT . . T C C . ATGCTACATGTTTTAGGGTAATATTACCCCTTACACAACAATGGACCAACTTTGGTGATTATTTGCAAAACAGTTTCTGAGAAACAATCTGTACGCAAAAAATTCAATTTTGCG . . A CCA . . . AGGTCATCTG . . . . TTTTG G C T . TTGTAGACCAAGTTTGGTGACTCTTTT T . . A CC CA A G . CGCTTTATTATACGCCAAGATTAAGGTC AA . A T A A
blockSeqs : . T A CGTTT . . A . CAG . . . . C . . TTAC . . . C A . T . TTA . . . G AG . G . . CCAAAATAAAACTGCTTGATTTGGAGT . A . . . G . TGGTT . . A . G GGTATT . TTGTAAACTAAAACAACA . CT . . . C C . TAATTCTGCATGGGATCGAGTAATACAACCCATAACACAGCTATGAACCATTTGGTGCCTCCATGACAAACAATTTTTGAGAAACGGAGCTTAAGATAAAAACTAAATGTTGTG . . T CCA . . . ATTTCTG . . . . TACTG G A A . CTTTAAACCAAATTTGGTGATTGTAG T . . G G CG T A . AAAACAAAGCTAATTATACATAGGTC A . T T T C
blockSeqs : G . CATC . . G . AAG . . . . A . . TGAA . . . C G . C . TTC . . . G CA . G . . CCCGAAAAATGTTGTATGGTGTATAG . C . . . A . TGAGA . . C . A ATGAA . GCATAGACTAAGTTATAC . TC . . . C A . ATGCCCAACAGTTATAAGTACATGTAGTTACATTGAGTTCACAACCACAGACTAAATGTGGCGACTCTGGGGCAAACAGTTTCAAAGAAATACAGCTAAATATTTTA . . A CTA . . . TTCC . . . . TTTTC A T A . TATAGGTTCAAATTCGGTGACTCCTG C . . G A TC C A . AATAGCCATATGTCAAGGTTAAGGGC G . T T A C
blockSeqs : . CTTC . . A . AAC . . . . A . . TAAG . . . A A . T . TAA . . . A TG . T . . CCAAAAAGTGCTGCAAATCTTCAGT . C . . . A . TGGAA . . C . A ACTTC . TTTAGGTCAAGTAAATT . AA . . . T C . TGTTTTGAGTATTACTACACATAACACAGCTATGAAGCTTTTGATGACTAAAGACAATTTTTTTTTGAGAAACAGAGCTTAACGCAAAAAACTAAATATTGTG . . T CTG . . . CTCA . . . . TTTTG G C A . CATAAACAGAATTTGGTGAATCTG T . . C G CA A T . CATTGTGT . . . G A C
blockSeqs : CACC . . T . AAT . . . . A . . TGGA . . . A T . C . TTA . . . A CA . G . . GAAAATATGTTGCGTGTGTTTTAGT . T . . . G . TGGGT . . C . A ACTAA . TTATTAATAAGTTAATT . TC . . . C C . ATTGCTGCATGGTTATAATACCAATACCAGAACATAAGTTGGTGGCTTCAGGCCAAACAGTTTCTAACCAAACAAGCCAACTAAGGAATCAAATGTTTTC . . G TCG . . . ACTG . . . . TTTTA G T A . CTTTGAACAATTTGATGACTCCAG T . . G T TG C A . G .
blockSeqs : CGTC . . A . T . . . . C . . ATGA . . . T G . T . AC . . . G TG . T . . TCAGAAAAATGCTGCATTGTTGATT . C . . . A . TCAGT . . A . G ACGCA . ATTTTATAAGTTATAC . TC . . . C T . CTTAATGTTATGTGAGCAAATTTATTCATTTGGTGATTTGAAGCCAAGTGAAAAACTTTACGTTGTG . . T ACG . . . TTCA . . . . TTTTG T A T . CATAAGTTGGTGGCTTCAG T . . A G TG A G .
blockSeqs : AGCC . . A . T . . . . A . . GGG . . . A A . C . A . . . G CA . G . . TTGAAATAGTGCTTATGTTTTGGT . C . . . A . TGGAT . . C . C ATTGA . GTGTAGTATTAAGTT . CC . . . C C . . . T ATG . . . CCG . . . . TTTTG A T A . CCAATCATTA A . . G G AA C G .
blockSeqs : . G . . . . C . . GGG . . . C A . T . A . . . G CG . A . . GTAAACAAATACTGCATGGTTTTG . C . . . A . TGGGG . . T . A AGTA . TAAAGTTTATT . TT . . . A T . . . T CTA . . . CC . . . . GTTTA G A T . CTATGGAC . . . . T C T A .
blockSeqs : . . . . C . . GTT . . . T G . T . A . . . G CA . A . . TGAAAACTTTCTATAGTTTTTGGT . C . . . A . TAGC . . T . G CTTA . TTTTTACC . TT . . . A . . . . A CC . . . TC . . . . TT . A . . . . . . A
blockSeqs : . . . G . . TGA . . . A G . A . A . . . G TG . A . . AGAAAATGCTGCATATTTTGGGT . C . . . G . TTGC . . A . G ATTT . TTGTAGA . T . . . . . . . T CA . . . TT . . . . TT . .
blockSeqs : . . . C . . GGG . . . A G . T . A . . . . TG . A . . TTAAAACTCCATTGGAAA . C . . . T . TAGA . . C . A CTAA . TTTTA . . . . . . . . . . GT .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . A . A . . . . A . G . . TGGAAAACATTTTGT . C . . . G . AAGA . . C . G CATA .
blockSeqs : C . . . A . . . . C . G . . CTTGCTGCAC . G . . . . . TGTT . . A . G GTTT .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . TGTTTTGAGT . . . . . . . AGT . . A . G CCA .
blockSeqs : . . . . . C . . . . A
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : CGTC****** TGGG** CTTA**** TTGTAATAAGTTAACC******************************** TCCG******** ** TTTTG**** CTNTGAACAATTTGGTGACTCCG*****************
originalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTNCTANNAAGAGACAATTTGCAAAACATGAACTTCGAACTGGCACTTGCTNGCAAGTTCGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGNATGTTGCTGACAACATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCACGGAATTAAATGTCTCG-CT---TCTATATC-GCTTTATCAC--AAAGTGAG---GCTATGAAGAAGTC--A-AN-AG--TTA--TCC----ATTACAC------------AACTATGGACAAAATTTGGT-GACT---CT-TGGG-CA---AA-CAGT--TTN---AAAGAAACGGAGC--TTAACACAAAA--AC--A----AC------ATTTTGTA--G--GTCAAG-----TTAATTATCCGTA-GAG------GTCAAG--GT-CATCC-G-AAA----A-------AA--------A--TGC------T-------T----TA--G-----GGT------AGT---A-C-TACCCATAACA----CA-AC---TATGGACCAA-A-TTTGGT----GACTC-TGGG-NCA---AACAGT--TTN--AAAGAAA--CGGAGCTAAACGCAAAAAANT-TA--A--CATT----T----T---G------T-----A-G------TT--AA-TC----A--T-TC-GTA-GA---GGTCAAG--GT-CATCCGAAA--AA-A--NG---------TNT-----CATG---T-----AGT--------------AAT-AC---T------AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGGTGACTTNAGGNCAAACAGTTTC------T-----GAGA-----A-----GC-----------C---------AA----------A-----A----C----T----G-T-T-T---G------TAG-GCCA---AGTTATTCATC-CGTA------AAGGT------CAAGGT---CA-------TCCG-AAAA--AAA--TG--CTGCA-TGGTTT--TT-GAG---TNGTACTACCCATA-ACA-CAACTATG-----AACC--A--TTTGGT-GACT-C-----C-GGT-C-AA-----ACAGTTTCTGA-GAAACGGAGCTNAAC---G----CAAA--------AACTTAA----C--------AT-------A-G-------CCA-AT-G--T-A---AGGT------CAAGGTCACCC-GA-AAAAATGCTGCATGGTTTTGATTAGTACTATCCATAACACAACTATGGACCAAGT
finalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTNCTANNAAGAGACAATTTGCAAAACATGAACTTCGAACTGGCACTTGCTNGCAAGTTCGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGNATGTTGCTGACAACATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCACGGAATTAAATGTCTCGTC------TATATC-GCTTTATCAC--AAAGTGAG---GCTATGAAGAAGTC--A-AN-AG--TTA--TCC----ATTACAC------------AACTATGGACAAAATTTGGT-GACT---CTTGGG--CA---AA-CAGT--TTN---AAAGAAACGGAGC--TTAACACAAAA--AC--A----AC------ATTTTGTA--G--GTCAAG-----TTAATTATCCGTA-GAG------GTCAAG--GT-CATCC-G-AAA----A-------AA--------A--TGC------T-------T----TA--G-----GGT------AGT---A-C-TACCCATAACA----CA-AC---TATGGACCAA-A-TTTGGT----GACTC-TGGG-NCA---AACAGT--TTN--AAAGAAA--CGGAGCTAAACGCAAAAACTTA----A--CATTTTGTAATAAGTTAACC--------------------------------A--T-TC-GTA-GA---GGTCAAG--GT-CATCCGAAA--AA-A--NG---------TNT-----CATG---T-----AGT--------------AAT-AC---T------AC----C----C-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGGTGACTTNAGGNCAAACAGTTTC------T-----GAGA-----A-----GC-----------C---------AA----------A-----A----C----T----G-T-T-T---G------TAG-GCCA---AGTTATTCATC-CGTA------AAGGT------CAAGGT---CATCCG--------AAAA--AAA--TG--CTGCA-TGGTTTTG----AG---TNGTACTACCCATA-ACA-CAACTNTGAACAATTTGGTGACTCCG-----------------GT-C-AA-----ACAGTTTCTGA-GAAACGGAGCTNAAC---G----CAAA--------AACTTAA----C--------AT-------A-G-------CCA-AT-G--T-A---AGGT------CAAGGTCACCC-GA-AAAAATGCTGCATGGTTTTGATTAGTACTATCCATAACACAACTATGGACCAAGT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222 1 1 55555555555555 1 1 1 111 111111 1111111 1111 111111111111 111111 111111111 1111111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 4444444444444444444444444444444444444 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 222222222222 11111 222222222222 333333333 11 11111111 11111111 7777777777777777777777777777777777 2222222 11
lowQualScore : 1 22 77777 5 5 1 22222222222222 1 5 5 5 2 3 111 0 222222 4 55 1 666 0 3333333 66 33 0000 555555555555 3 1 33 2 0 666666 2 33 333333333 2 33 2 2 33 8888888 777777 33 55 0 999999 55 2 777777 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5555555 5555 2 333 999 7777 2 88888 444 33 33 44 22 2 22 0 2 2 5555555 1 7777777777777777777777777777777777777 888888 66 44 2 999 44 66666 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33 555 888888888888 888888 555 999999999999 33 44 44 1 3 3 44 77 66666 2 11111 7 222222222222 55 4 55 4 4 222222222 55 3 99999 0 0 22 55 1 44444444 66666666 4444444444444444444444444444444444 6666666 8 44 8 1 88 2
lowQualScore : . .. ..... . . . .............. . . . . . . ... . ...... . .. . ... . ....... .. .. .... ............ . . .. . . ...... . .. ......... . .. . . .. ....... ...... .. .. . ...... .. . ...... .......................................................................... ....... .... . ... ... .... . ..... ... .. .. .. .. . .. . . . ....... . ..................................... ...... .. .. . ... .. ..... .............................................................................................................................................................................................................................................. .. ... ............ ...... ... ............ .. .. .. . . . .. .. ..... . ..... . ............ .. . .. . . ......... .. . ..... . . .. .. . ........ ........ .................................. ....... . .. . . .. .
lowQualScore : 0 00 00000 0 5 0 55555555555555 0 5 0 0 5 2 888 4 888888 4 55 4 444 9 9999999 11 99 0000 888888888888 2 4 99 9 3 666666 9 99 555555555 0 44 3 7 77 7777777 222222 44 99 7 222222 66 5 222222 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2222222 0000 2 999 222 4444 4 33333 111 22 22 22 99 0 99 2 1 2 9999999 5 0000000000000000000000000000000000000 222222 88 11 9 666 66 11111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22 444 333333333333 222222 000 111111111111 99 22 22 5 1 1 22 11 66666 3 00000 3 333333333333 55 0 55 0 0 111111111 11 6 11111 7 7 11 33 0 33333333 11111111 1111111111111111111111111111111111 2222222 0 44 0 4 88 5
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTNCTANNAAGAGACAATTTGCAAAACATGAACTTCGAACTGGCACTTGCTNGCAAGTTCGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGNATGTTGCTGACAACATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCACGGAATTAAATGTCTCG------CCTATATC-GCTTTATCAC--AAAGTGAG---GCTATGAAGAAGTC--A-AN-AG--TTA--TCC----ATTACAC------------AACTATGGACAAAA--TTTGGT-GACTCTT-GGGCAAA-CAGT--TTN---A----AAGAAACGGAGC--TTAACAC-AAAA--AC--A----AC------ATTTTGTA--G--GTCAAG-----TTAATTATCCGTA-GAG------GTCAAGGTCAT-CCG-AAA----A-------AA--------A--TGC------T-------T----TA--G-----GGT------AGT---A-C-TACCCATAACA----CA-AC---TATGGACCAA-A-TTTGGT----GACTC-TGGG-NCA---AACAGT--T--T-NAAAG--AAACGGAG--CTAAACGC-AAAA-AC-TT--A-ACATTTTG-TA-A---T-AA-----GTT--AAT--CA--T-TC-GTAGAGGT------CAAG--GT-CA-TCCGAAA--AA-A--TG---------TTT-----CA-TG---T-----AGT--------------AA---T-ACT------AC----CC-----------ATAAC-------------AC-------------T-----TGGTGACTCTAGGNCAAACAGTTTC------TGAGA-----A-----GC-----------C------------AAA-----A----C----T----G----T-T-T---G------TAG-GCCA---AGTTATTCATC-CGTA------AAGG------TCAAGGT---CA-------TCCG-AAA--AAAA--TG--CTGCATG-G-TT--TT-GAG---TAGTACTACCCATA-A--CA-CAACTGT-GA-AC---A--A-T--TTGGT-GACT-C-----C-G-GT-C-AA-----ACAGTTTCTGA-NAAACGGAGCTNAAC---G----CAAA--------AACTTAA----C--------ATA-GCCA-AT-G--T-A---AGGT------CAAGGTTA-CCC-GA-AAAAATGCTGCATGGTTTTGATTAGTACTATCCATAACACAACTATGGACCAAGT
Reference ( family-260 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGTAGTNCTANNAAGAGACAATTTGCAAAACATGAACTTCGAACTGGCACTTGCTNGCAAGTTCGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGNATGTTGCTGACAACATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCACGGAATTAAATGTCTCG------TCTATATC-GCTTTATCAC--AAAGTGAG---GCTATGAAGAAGTC--A-AN-AG--TTA--TCC----ATTACAC------------AACTATGGACAAAA--TTTGGT-GACTCTT-GGGCAAA-CAGT--TTN---A----AAGAAACGGAGC--TTAACAC-AAAA--AC--A----AC------ATTTTGTA--G--GTCAAG-----TTAATTATCCGTA-GAG------GTCAAGGTCAT-CCG-AAA----A-------AA--------A--TGC------T-------T----TA--G-----GGT------AGT---A-C-TACCCATAACA----CA-AC---TATGGACCAA-A-TTTGGT----GACTC-TGGG-NCA---AACAGT--T--T-NAAAG--AAACGGAG--CTAAACGC-AAAA-AC-TT--A-ACATTTTG-TA-A---T-AA-----GTT--AAC--CA--T-TC-GTAGAGGT------CAAG--GT-CA-TCCGAAA--AA-A--NG---------TNT-----CA-TG---T-----AGT--------------AA---T-ACT------AC----CC-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGGTGACTTNAGGNCAAACAGTTTC------TGAGA-----A-----GC-----------C------------AAA-----A----C----T----G----T-T-T---G------TAG-GCCA---AGTTATTCATC-CGTA------AAGG------TCAAGGT---CA-------TCCG-AAA--AAAA--TG--CTGCATG-G-TT--TT-GAG---TNGTACTACCCATA-A--CA-CAACTNT-GA-AC---A--A-T--TTGGT-GACT-C-----C-G-GT-C-AA-----ACAGTTTCTGA-GAAACGGAGCTNAAC---G----CAAA--------AACTTAA----C--------ATA-GCCA-AT-G--T-A---AGGT------CAAGGTCA-CCC-GA-AAAAATGCTGCATGGTTTTGATTAGTACTATCCATAACACAACTATGGACCAAGT
gi|1 : AGTAGTACTAGAAAAAGACAATTTGCAAAACA-GAACTTCGAACTGACACTTACTAGCAAGTTTGACCATAATCAATTGAGAAGTTTAGGAGGATATTGCTGACAA-ATTTACAATTA--ACAAGAGAATTCCATGGAATTAAATGTTTCGACTACATGTATATC-GCTTTATCAC--AAACTTAG---GCTATGAAGAAGTC--A-AA-AG--TTA--TCC----ATTACAA------------AACTATGAACAAAA--TTTTGT-GACTCTTGGGGTAAA-CAGT--ATC---A----AAGATACCGAGC--TTAACAC-AAAA--AC--A----AC------ATTCTGTA--G--GCTAGG-----TTAATTATTTGTA-AAG------GTCAAGGTCAT-CTA-AAA----A-------AA--------A--TAA------T-------T----TAAGG-----GGT------AGC---A-C-TACCCATAACA----CA-AT---TATGGACCAG-G-TTCTGT----GGCAC-TAGG-TCA---AAAAGT--T--T-AAAAG--AAACAGAG--CTTAGCACAAAAA-AA-TT--A-ACATTTTG-T---------A-----GTT--AAT--CA--T-TG-GTAGAGGT------CAAG--AT-CA-TACAAAA--AG-A--AG---------TAT-----CA--G---T-----AGT--------------AG---T-ACT------AC----CC-----------ATAA--------------AC-------------T-----TGATAACTTGAGACAAAACA-TTTC------GGAGG-----A-----GC-----------C------------AGA-----A----C----T----G----T-T-T---G------CAG-GCCA---AGTTAATTATT-CATA------GAGG------TTAAGAC---CA-------TCTG-AAA--AAAATTTG--CTTT-TT-T-TT--TT-TAG---TAATACTACCCACA-A--CA-CAGTTAT-GA-AC---C--A-T--TTTGT-GACA-C-----T---GT-C-AA-----ATAGTTTC--A-TAAACAGAGCTGAAT---G----CAAA--------AATCTAA----C--------ATA-G-----T-G--T-----AGGT------TAAGGTTA-CCA-GA-AAAAAAAATGCATGGTTTTGATTAGTACTATCGATAA-GCAACTATGGACCAGGT
gi|10 : atatcatcatggtctatttgttcaataataagtagaatttgtattgtaccttgaaatgtgccagtctacacgaaggcccctgttttgactagtgacactTTCACAAT-A--ACAAGAAAATTCCCCAGAATTCAATGTCTCA------TCTATATT-GCTTGACCAC--AAAGAGAG---ACCATGAAG-AGTC-----T-AG--TTA--T
gi|11 : tctaaatgaaatttcattgtagtA--TTT----ATTACAC------------ACTCATAGATAACG--TTTAGT-TTCTCT--GGGAAAATCAGT--CTC---A----A-----CAGAGA--TAAGCA----AA--GC--ATTTAAT------ATTTTGTA--G--GCTAAG-----T-----GTC--TC-GAA------CGCATGGCCAT-TTG-AAA----T-------AGTGCTT---A--TGT------T-------T----T---------GGT------AGT---AACATAGCCATTACT----CA-AA---TATTGACCAA-G-TTTAAT----GACTC-TGGT-TTA---CAAAAT--G--T-AAACG--AAAGAGAG--CTAAACAC-AAAA-gaaggagagacaaagacttgacaagttacatcactacagatgcaagaccatatcatgatatttgtctatcaattttcaattaaggatatttctacacatttataaaagaagtttacattgtgttagggtcaa
gi|12 : TTA-AATTATCATAAAAGAGTTCTACGGAATTGAATGTCTAA------CTTAAATC-GCTTTATCAC--TAAGTGAG---GCTATAAAGAAGTT-----T-AG--TTA--TTTTA--GTTACAC------------AACTATAAACACAA--TTAGAT-GACTCTT-GAGCAAG-CAGC--TTC---A----AATAAACGGATC--TTAATAC-AAAATCAT--A----AC------ATTTTGTA--G--GCTATG-----TTAATTATCtagtaatatagtgtatgctaa
gi|13 : ctaactacaaattttattaaggCATACAGTTTC------TAAAA-----ACATA-GT-----------CTT----------AAC-----A----C----T----G----G-------G------TGG-GCCATTTAGTTATTCATC-CATA------AAGG------TAAAGGT---CA-------CC---ATT--AAAA--TG--CTGCATG-GATTAATTAGAG---AAGAACAACCCCTACA--CA-GAAATA--GA-AC---A--A-A--CTGATTGACT-CGTAACT-G-GT-C-AA-----ATGGTTTCTGA-GAAACAGAGCTTAAC---G----CAAA--------AACTTTA----C--------Aattgaagacttgatagtct
gi|14 : C------ATTAAGTA--G--ATCAAG-----TTTAATATCAGT------------TCAAGGTCATCCCG---A----A-------AA--------A--TGT------T-------G----TA--T-----GGTGTATAGAGT---A-T-T-----TAACG----TA-AC---TATAAACCAA-A-TTTGGT----GAATC-T-AG-CCA---AACATT--TTCT-AAAAGAAAAACAGTG--CTAAATGC-AAAT-AC-TT--A-AGACGTTG-AG-A---T-AAAGTGTATT--AACTGTA--T-AT-GTCAAGGT------GAAG--GT-CA-TTCGAAA--AA-T--TG---------CTA-----CA-TG---T-----Actgaattgttgacgcagatgcaaccatcgtaacca
gi|15 : aacttat------------AACTATGGACCAAA--TTTGGT-GGTTCTT-TACTAAA-TTGT--TTTT--G----AAGAAACAGA--------CAT-AAAT--TA--A----AC------ATTCAGTA--G--GCAAAA-----TTATTCATCATTA-GAT------GTCAAGGTCAT-CCA-AAA----AGTGCTGCAA--------A--T-C------T-------T----CA---------GT------AGG---A-A-TACCCACAACA----CA-AG---TATGAACCAA-A-TTTtt
gi|16 : gAA--TTTGGT-GACTCTT-GAACAAA-CAGT--TCA---A----ATGAAATGGAGC--TTAACAC-AAA-------A----AC------ATTTTGCA--GCAGTCTAA-----TTTATTATCAGTA-GAG------GTCAAGGTC-T------AG----A-------AA--------A--TGCTGCATAT-------T----TT--G-----GGT------AGT---G-C-TACCCATAACA----CA-AT---TATGGACTAA-G-TTTAGT----GATGC-T-TG-CCA---AGTAGT--T--T-AAAAG--AAACGAAG--CTAAATGC-AAAA-Attcattggaataattcagacaaaaacacttaaaataaggaggataaaatta
gi|17 : cattt--A----AT------ATTTTGTA--G--GATAA---------ATTATTCATATGAG------TTCAA----AT---G-AAA----A-------TATGTTGCGTG--TGT------T-------T----TA--G-------T------AGT---A--------ATA-TA----CA-AC---T--GGATCCA-A-TTTGGT----GACTC-TGAG-ACA---AGC-----------AAAG--GAACA------TAAATAC-A--------T--A-ACTGTTAG-TACA---TAAA-----GTT--TAT--TA--T-CT-AAAGAGGT------CAAAT-GT--A-TCCAAAta
gi|17 : aaattt----T-T-T---G------TAG-GATA---AATTATTCATA-TG---------AGT------TCAA-------A-------T----GAA--AATA--TG--TTGCGTGTG-TT--TT--AG---TAGTA------AT--A--TA-CAACTG--GATCC---A--A-T--TTGGT-GACT-C-----T-GAGA-C-AA-----GCAgtaatattgcaatgc
gi|18 : aaatttaatat--TCAACGC-AAAA--AC--A----AC------GCGTTGT--------C--------TTAATTATTTGAA-AAG------GTCAACTTTAT-TT----A----A-------AA--------C--TCC------A-------T----TG--G-----AAA------AGT---A-C-TACCTATAACA----CA-GA---TTCGGACCAG----TTACT----GACTC---AG-TCA---AACCGT--T--T-CAGAG--AAACCAGG--CTGAACAC-AAaaggaacataaatacataactgttagtacataaagtttattatctaaagaggtcaaatgtatccaaagtaatattgcaatgc
gi|19 : AATTA---TAGGAGAATTCCACAGAATCAAATGTCTCT------TCTATATC-CCATTATCATAAAAAATGAA---GCTATtatagatattg
gi|2 : atatggaatttctaAGAGAATACCACATAATTAA-TGTCTCA------CTTATATC-GCTTTACCAC--AAAGTGAA---GCTATGAGGAGGTT--C-AG-A----TA--T-C----ATTACAtgtaaatgatgaaactattcaatgtcaaagatgcacagatcacatcaaatagatatatgcaataccattatca
gi|2 : ttAAGCAAAGC--T-AATAC-ATAC--AC--AC---AT------ATTGTGTAAGG--GTCAAGGTTAATTAATTATCCATA-GAGAACTATGTCAAGGCTAT-CCA-AAAT---A-------AA--------AC-TGC------T-------TGATTTG--G-----AGT------AGT---C-T-TACCTATAACA----CA-AC---TATGAGTCAA-A-TGTGGT----GACTG-TGGA-ACA---AACAGT--T--T-CAAAG--AAATGAAG--CTAAACAA-AAAA-AA-TT-------TTTTT-T----------------TT--A-C--CA--TATCTGTAGAAGT------CAAA--GT-CA-GCCAAAACAAA-A--GGCTGAATGGCTTT-----CA--G---T-----AGTTGTACCTAATTATTAA---TGATT------ATAAAGCT-----------AGAA--------------ACCATAT--------T-----TTGTATCTCTAAGGCAAACAGTTTCAAAAGATCAGG-----A-----GCTACATG-----C------------AAA-----A----C----TTAATA----TCT-T---G------TAG--CTA---AGTTAATTATC-CATA------AAGG------TCAAGGT---CA-------TC---AAA--AAAA--TG--CTGCCTG-G-TT--TT-GAG---TCATGTTACCCATT-A--CAATAGC-AT-AA-AC---AGAA-T--TTGGT-GAAT-C-----T-G-GGAC-AA-----ACAATT---GAAGCAACAGTGCTAAAA---A----TAAA--------A-CTTAAAAAAC--------AAA-GCTA-ATTA--T-ACATAGGT------CAAGGCCA-TCC-AATAAAAATGCTGCATTGTTTTGAGTTGTTCTATCCAGTACACAACTATGAAaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcataagcaaagctaatacatacacacatattgtgtaagggtcaaggttaattaattatccatagagaactatgtcaaggctatccaaaataaaactgcttgatttggagtagtcttacctataacacaactatgagtcaaatgtggtgactgtggaacaaacagtttcaaagaaatgaagctaaacaaaaaaaattttttttttaccatatctgtagaagtcaaagtcagccaaaacaaaaggctgaatggctttcagtagttgtacctaattattaatgattataaagctagaaaccatattttgtatctctaaggcaaacagtttcaaaagatcaggagctacatgcaaaacttaatatcttgtagctaagttaattatccataaaggtcaaggtcatcaaaaaaatgctgcctggttttgagtcatgttacccattacaatagcataaacagaatttggtgaatctgggacaaacaattgaagcaacagtgctaaaaataaaacttaaaaaacaaagctaattatacataggtcaaggccatccaataaaaatgctgcattgttttgagttgttctatccagtacacaactatgaaaaaaaattggtttctcttaagcaaaaagtttaaaagaaaatgagtgtaaca
gi|2 : ttagagaataccacataattaatgtctcacttatatcgctttaccacaaagtgaagctatgaggaggttcagatatcattacaaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcatTA--TCC----AGTACAC------------AACTATGAAAAAAA--ATTGGT-TTCTCTT-AAGCAAA-AAGT--TTA---A----AAGAAAATGAGT--GTAACAaaaaaattggtttctcttaagcaaaaagtttaaaagaaaatgagtgtaaca
gi|20 : ttagagaataccacataattaatgtctcacttatatcgctttaccacaaagtgaagctatgaggaggttcagatatcattacaaagtgaaggcatcatttagacatgtaatactatatcatgacatttgtctatcaatttttaatgaaggagatatatgcgcataagcaaagctaatacatacacacatattgtgtaagggtcaaggttaattaattatccatagagaactatgtcaaggctatccaaaataaaactgcttgatttggagtagtcttacctataacacaactatgagtcaaatgtggtgactgtggaacaaacagtttcaaagaaatgaagctaaacaaaaaaaattttttttttaccatatctgtagaagtcaaagtcagccaaaacaaaaggctgaatggctttcagtagttgtacctaattattaatgattataaagctagaaaccatattttgtatctctaaggcaaacagtttcaaaagatcaggagctacatgcaaaacttaatatcttgtagctaagttaattatccataaaggtcaaggtcatcaaaaaaatgctgcctggttttgagtcatgttacccattacaatagcataaacagaatttggtgaatctgggacaaacaattgaagcaacagtgctaaaaataaaacttaaaaaacaaagctaattatacataggtcaaggccatccaataaaaatgctgcattgttttgagttgttcGACAATTGCACTGTATTAAATGTCTCA------CCTATATG-GCTTTATCAC--AAAAAGAG---GCTATGAACAAGTC--A-AG-TG--GT---TCC----AGTA
gi|21 : tgtaaccaagaataagttAG--AAACAGAAAATAAAACGT-GAAA-AC-TT--A-A-AGCGTG-GG-C---C-AG-----GTT--ATT--CA--T-CT-ATAGAGCT------CACG--GT-CA-T-TAAAA--AA-A--TG---------TTG-----CATTGT--T-----AAT--------------AG---A-AAT------AC----CC-----------A-AA--------------Agtatctacctattatgcaatta
gi|21 : ---G------TGG-GCCA---GGTTATTCATC-TATA------GAGC------TCACGGT---CA-------TT---AAA--AAAA--TG--TTGCATT-G-TT------AA---TAGAAATACCCAAA-AGTCAGCAGCTGT-gtcagcagctgta
gi|22 : agaaacagaaaataaaacgtgaaaacttaaagcAGTAGTTTTACTAAGAGA-----TG-AAAATATGAACTTCGAACTAGTACTTGCTTACAAATTCGACCATA--------------TTAGGAGCA-GTT-CTAACAACATTTACAATTa
gi|23 : tttcaatttgcgaaAG--AAACGGTA--CAACACGC-AAAT-AC-TA--A-ACATTATT-TT-A---T-AA-----GTT--ATA--CA--T-TC-ATAGAGGT------CAAT--GT-CA-CATGAAA--AA-A--
gi|24 : ccaaataccatttgCCATCACA----CA-GC---TATGGATCAA-A-TT------------C-TGGG-TTA---AAAAGT--G--T-CTAAG--AAACGGAG--CTAAAACC-AAAA-ACATT--ACACACTATG-T
gi|25 : ATC-TGTG------AATG------TTGAGGT---CA-------TTCC-AAA--AATA--TG--CTAGATG-G-TA--CT-GAG---TTATGTTACCggatttaa
gi|26 : tTCTCG------TTTAT-TCAGCTTTATCAC--AAATAGAG---GCTAT-AAAAAGTC--A-A
gi|3 : AAATGTCTCG------TCTATACT-GTTTTATCCC--AAAATGAA---GCTATGAAGAAA----A-AC-CG--TTAATTCTGCCGATTACAC------------AACTGAGAACAAAA--TTTGGG-GACTTTT-GGACAGA-CAGT--CCT---A----AAGAATCGCAGC--TCAAAAC-AAAA--ACTTA----AC------ATTTTGTA--A--GCCTA------TTAATTAATTGTA-GAG------TTCAAGGCCAT-CT------------------------------TGC------T----------------G-----CAC------ATT---A-C-TA-CCATAACAATATCATACTGATATGACCCAA-AGTTTACT----GGCTA-TCAG-TCA---AACAGT--T--T-AAAAG--AAACAAAG--CTAAACAC--AAA-AC-ATGAA-ATATTTTG-TA-AAC-T-AA-----AAC--AAC--AA--T-AA-GTACAGGT------CAAG--GT-TA-TCTAAAA--AA-A--CG---------TCTG----CA-Tg
gi|3 : ctacA---T-AC-------AC----CT-----------ATAAC-------------ACG------------C-----TACCAACTTT-GGTTAAACAGTTTC------TGAAA-----A-----ACAGAGGAAAACAC------------AGA-----AT---C----T----G----T-T-----G------TAG-GCCA---AGTTAACTATT-CGTA------AAGGTCAAGGTCAAGGT---CA-------TCTG-AAAATAAAA--TGACCTGC------TT--TT-CAG---TCGTGCTACCCATA-A--CA-C-ACTTT-GA-AC---A--A-T--TTGAT-GACT-C-----CAG-GT-C-AA-----CTCGTTTTTGA-AAAACGGAGCTTAAC---A----CTAG--------AACTAAA----C--------AT--------T-G--T-------GT--------AGGCTACCCC-GA-AAAAAAGCTGCATGATTTTGATTATTATCATCTATATAACAACTGCGGACCcatttttaactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcatacacctataacacgctaccaactttggttaaacagtttctgaaaaacagaggaaaacacagaatctgttgtaggccaagttaactattcgtaaaggtcaaggtcaaggtcatctgaaaataaaatgacctgcttttcagtcgtgctacccataacacactttgaacaatttgatgactccaggtcaactcgtttttgaaaaacggagcttaacactagaactaaacattgtgtaggctaccccgaaaaaaagctgcatgattttgattattatcatctatataacaactgcggacctccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|4 : ctacaaatgtctcgtctatactgttttatcccaaaatgaagctatgaagaaaaaccgttaattctgccgattacacaactgagaacaaaatttggggacttttggacagacagtcctaaagaatcgcagctcaaaacaaaaacttaacattttgtaagcctattaattaattgtagagttcaaggccatcttgctgcacattactaccataacaatatcatactgatatgacccaaagtttactggctatcagtcaaacagtttaaaagaaacaaagctaaacacaaaacatgaaatattttgtaaactaaaacaacaataagtacaggtcaaggttatctaaaaaaacgtctgcatcatttttaactaaacttaactaaactaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacaagactagtctagactatatcTTTGTACTACCTATAACAAAATTATGGACAAAGTtccagaatctacgtaatttagctttaaaacagagct
gi|4 : aaacacacaagagtTA--CCT----ATAACAA------------AATTATGGACAAAG--TTTAGT-GACTCT--GGGTAAA-TTGA--TTA---A----AAGAATAAAAATAATTAAAAG-ATAA--AC--ATAA-ACCATAGAATTTTATA--G--GTTAAG-----TTAATTATTCATA-GAG------GTCAAGTTCAT-CTG-AAG----A-------AA--------GTCTGCATCA--T-------T----TT--GATT--GGT------AAT---A-C---CCCATAACA----CA-AA---TAAAGATCAA-A-GTTGGTATTAAACTA-T-AG-ACATTTAACAGT--T--T-CTGAT--AAACAAAG--GTCAATGC-AAAA-AC-TT--C-ACATTTT--TA-GGT-C-AA-----GTA--AAT--TA--T-TC-GTTGAGAC------CAAGTTGTGCA-T--------------TG---------TTT--------TG---------AGT--------------AT---T-ACT------AC----AC-----------ATAAC-------------ACAGCTATGAAGCTTT-----TGATGAC-TAAAGACAATTTTTTTT------TGAGA-----A-----ACAGAG-------CTTAACGCAA---AAA-----A----CTAAAT----A----T-TGT---G------TAGTATTA---AGTTATTCTTA-CGGC------ATGG------TCAAATT---CA--------CCG-AAA--AAAT--TG--CTGCATG-G-TT-------------ATAATACCAATA-C--CA-GAAC-------AT---A--A-G--TTGGT-GGCT-T-----CAG-GC-C-AA-----ACAGTTTCTAACCAAAC-AAGC-CAACTAAGGAATCAAATGTTTTCTAGGTCAA----A--------ATA-GCCATAT-G--TCA---AGGTTAAGGGCAAGGTTA-CTCAAA-AAAAATGCTACATTGTTTTGATT-TTACTATTCAGAACACAACTATGGACCAAttagtgactctgggtaaattgattaaaagaataaaaataattaaaagataaacataaaccatagaattttataggttaagttaattattcatagaggtcaagttcatctgaagaaagtctgcatcattttgattggtaataccccataacacaaataaagatcaaagttggtattaaactatagacatttaacagtttctgataaacaaaggtcaatgcaaaaacttcacatttttaggtcaagtaaattattcgttgagaccaagttgtgcattgttttgagtattactacacataacacagctatgaagcttttgatgactaaagacaatttttttttgagaaacagagcttaacgcaaaaaactaaatattgtgtagtattaagttattcttacggcatggtcaaattcaccgaaaaaattgctgcatggttataataccaataccagaacataagttggtggcttcaggccaaacagtttctaaccaaacaagccaactaaggaatcaaatgttttctaggtcaaaatagccatatgtcaaggttaagggcaaggttactcaaaaaaaatgctacattgttttgattttactattcagaacacaactatggaccaatcactttttgagaaatcgtgctaaactaaaaaactgagcattgtgtaaagttattcacccatagaaatcatggtcacctgaaaaaagctgcatggttttgagaagtatatggaca
gi|4 : aaacacacaagagttttgtacC----ATAACAC------------AGCTATG----AAGCTTTTGAT-GACT------AAAGA-CAAT--TTT---TTTTTGAGAAACAGAGC--TTAACGCAAAAA--ACTAA----AT------ATTGTGTA--GT-ATTAAG-----TTATTCTTACGGC-ATG------GTCAAATTCA--CCG-AAA----A-------AA--------T--TGC------T-------G----CA--T-----GGT------TAT---A-A-TACCAATACCA----GA-AC----AT------A-A-GTTGGT----GGCTT-CAGG-CCA---AACAGT--T--TCTAACC--AAAC-AAG--CC-AACTA-AGGA-AT-CA--A-ATGTTTTC-TA-GGT-C-AA-----AAT--AGC--CA--T-AT-GTCAAGGTTAAGGGCAAG--GT-TACTCAAAAA--AA-A--TG---------CTA-----CATTG---T-----TTT--------------GATTTT-ACT------AT----TC-----------AGAAC-------------AC-----------------------AACTATGGACCAATCACTTTT------TGAGA-----A-----AT-----------CGTGCTAAACTAAAAA-----A----C----T----GAGCAT-TGT---G------TA-----A---AGTTATTCACC-CATA------GAAA------TCATGGT---CA-------CCTG-AAA--AAA----G--CTGCATG-G-TT--TT-GAG---AAGTAtcactttttgagaaatcgtgctaaactaaaaaactgagcattgtgtaaagttattcacccatagaaatcatggtcacctgaaaaaagctgcatggttttgagaagtatatggaca
gi|5 : aaacacacaagagttttgtactacctataacaaaattatggacaaagtttagtgactctgggtaaattgattaaaagaataaaaataattaaaagataaacataaaccatagaattttataggttaagttaattattcatagaggtcaagttcatctgaagaaagtctgcatcattttgattggtaataccccataacacaaataaagatcaaagttggtattaaactatagacatttaacagtttctgataaacaaaggtcaatgcaaaaacttcacatttttaggtcaagtaaattattcgttgagaccaagttgtgcattgttttgagtattactacaAATGA--ACATGAGAATTCCATGGAATTAAATGTCTAG------CCTATATC-CCTTTATCAC--ATAATGAG---GCTATGAAGAAGAC--A-AGTAGATCTA--CCC----ATTACAC------------AACTATGAAAAAAA---------------------AAA-TAGT--TT----A----AAGAAATGGAGC--GTAAAAC-AAAA--TC--A-------------TTTTATA--G--TTCAGG-----CTAA--A---ATA-GAG------ATTAA--------TG-GAA----A-------AC--------A--T--------T-------T----T----------GT------AA----G-C-TACCCTTAACA----CA-GC---TATGAATCAA----TTGGT----G----------CCA---AACAGT--T--T-TTGAG--AAAAGGTG--TTAAACAC-AAAA-AC-AT--A-ATGTTGCA-TA-GAC-T-AA-----GTT--ATA--CA--T-CC-AAAGAGGC------CAAG--GT-CA-CTCAAAG--AA-A--TG---------CTA-----CA-TG---TTTTAGGGT--------------AA---T-ATT------AC----CCCTTACACAACAATGG--------------ACCAACT--------T-----TGGTGATTATTTGCAAAACAGTTTC------TGAGA-----A-----ACAATCTGTACG-C------------AAA-----AAATTC----A----A----T-T-TTGCG------TAG-GCTT---AGCTTTTCATC-TATAGAGGTTAGGG------TCAAGGT---AA-------ACTG-AAA--AAAA--TG--CTGCACT-G-TT--TT-AAT---CAGTATTACCCATT-A--CA-CAACTTT-AA-ACCA-A--A-T--TTGGT-GATTGT-----A-G-GT-C-AA------------------AAACAGAGCTCAAC---A----CAAA--------AAtatggaca
gi|6 : aacagtctgtaaataaacaaaaaagtgtaGACCAA---TTTTAT----GGCTC-TGGA-TCA---AATAGT--T--T-AAAA----ACCAGAG--GTA--CAC-AAAA-AC-GC--A-ACATTTTG--A-AGGCT-CA-----GCTGAAAT--CAAAT-T---TAGAGGT------CAAA--GT-CA-TCTGCAA--AATA--AT---------TCTG----CA-TGGGATCG---AGT--------------AA---T-ACA------AC----CC-----------ATAACACAGCTATGAACCAT-------------T-----TGGTGCCTCCATGACAAACAATTTT------TGAGA-----A-----ACGGAG-------CTTAAGATA----AAA-----A----C----TAAATG----T-TGT---G------TGG-ATCA---AGTTATTCATC-C--A------AAGA------TCAAGGT---CA----------GTAAA--CAAA--TA--CTGCATG-G-TT--TT-GAA---TTGAACTACTCATA-A--CA-CAATTGTAGA-CC---A--AGT--TTGGT-GACT-CTT---T-T-GT-C--A-----ACAGTTTCTGA-TAAATGGAGCTAAAT---G----CGAA--------Aataagtcttacgaaccagtcttacgaaccaacaccaagaaagtatcatgtatttctctgattttcgtttgaaaagccaagacaaaaatgtgtacagtatatcaaatagtgtttgatgcatgttacaatg
gi|6 : gttA--CCC----ATAACAC------------AGCTATGAACCA----TTTGGT-GCCTCCA-TGACAAA-CAAT--TTT---T----GAGAAACGGAGC--TTAAGAT-AAAA--ACTAA----AT------GTTGTGTG--G--ATCAAG-----TTATTCATCC--A-AAG------ATCAAGGTCA----GTAAA----C-------AA--------A--TAC------T-------G----CA--T-----GGTTTTG--AATTGAA-C-TACTCATAACA----CA-AT---TGTAGACCAA-G-TTTGGT----GACTCTTTTG-TC----AACAGT--T--T-CTGAT--AAATGGAG--CTAAATGC-GAAATGT-TT-------TTTTT-TA-A-----AA-------T--A----------------------------AAG--CT-AA-T-TGAAA--AA-CTTAA---------TGT-----TA-TG---TG----AGC--------------AA---A-TTT------AT----TC-----------AT-------------------------------T-----TGGTGATTTGAAGCCAAG-------------TGA---------------------------------------AAA-----A----C----TTTACG----T-TGT---G------TAT-TCCA---AGTTATTCA-----TA------AAGG------TCAAGGTGAACAATT----TCTG-AGA--AAAtgtttttttttaaaataaagctaattgaaaaacttaatgttatgtgagcaaatttattcatttggtgatttgaagccaagtgaaaaactttacgttgtgtattccaagttattcataaaggtcaaggtgaacaatttctgagaaaatagctcaatgcaaaaacttaaaattgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|6 : gttgaccaattttatggctctggatcaaatagtttaaaaaccagaggtacacaaaaacgcaacattttgaaggctcagctgaaatcaaatttagaggtcaaagtcatctgcaaaataattctgcatgggatcgagtaataca-G-GT-C-AAGGTGAACAATTTCTGA-GAAA-ATAGCTCAAT---G----CAAA--------AACTTAA----A--------ATtagctcaatgcaaaaacttaaaattgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|7 : gttgaccaattttatggctctggatcaaatagtttaaaaaccagaggtacacaaaaacgcaacattttgaaggctcagctgaaatcaaatttagaggtcaaagtcatctgcaaaataattctgcatgggatcgagtaatacaacccataacacagctatgaaccatttggtgcctccatgacaaacaatttttgagaaacggagcttaagataaaaactaaatgttgtgtggatcaagttattcatccaaagatcaaggtcagtaaacaaatactgcatggttttgaattgaactactcataacacaattgtagaccaagtttggtgactcttttgtcaacagtttctgataaatggagctaaatgcgaaatgtttttttttaaaataaagctaattgaaaaacttaatgttatgtgagcaaatttattcatttggtgatttgaagccaagtgaaaaactttacgttgtgtattccaagttattcataaaTAATTATCCACA-GAG------ATCAAGGGCAT-TC--AGA----A-------AA--------A--TGC------TGCA----T----TGTTG-----ATT------ATT---A-C-TATCCATTACA----TG-AC---TATGG-CCAGTA-TTTGGT----GACAC-TGGG-GCC---AACAGT--T--T-CAAAG--AAATGGAG--CTTAATGC-AAAA-AT-TG--A-ACATTTTG-TA-G-----A-----------------A--T-TT-GTAGA-AT------------------TTCGAAA--AA-A--TGCCCAACAGTTATAAGTACA-TG---T-----AGT--------------TA---C-ATTGAGTTCACAA--CC-----------ACAG--------------AC-------------TAAATGTGGCGACTCTGGGGCAAACAGTTTC------AAAGAAATACA-----GC-----------T------------AAA-----T----A----T---------T-T-T---A------TAG-GCtgaattgtcgcctacacctgcgctgatggaaagacgacacaaaaatcaatattcactacaac
gi|7 : aattg---AGTTAATTATCACTTG------AAT-------TCAATGC---CA-------TTCA-AAG--AAAA--TA--CTGCATG-G-TT--TT-GAG---CAGAACTATCCAT--------CAAC--------C---A--A-TCATTA---------------------C-AA-----ACAGTCTCTTA-GAAATGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagttaattatcacttgaattcaatgccattcaaagaaaatactgcatggttttgagcagaactatccatcaaccaatcattacaaacagtctcttagaaatgcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|8 : aattgtaattatccacagagatcaagggcattcagaaaaatgctgcattgttgattattactatccattacatgactatggccagtatttggtgacactggggccaacagtttcaaagaaatggagcttaatgcaaaaattgaacattttgtagaatttgtagaatttcgaaaaaatgcccaacagttataagtacatgtagttacattgagttcacaaccacagactaaatgtggcgactctggggcaaacagtttcaaagaaatacagctaaatattttataggctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCAAACAGTTTC------TAAAA-----AATAGTGC-----------T------------AAGCTTATA----A----T----G----T-T-T---ACATGTTTAG-GCAA---ATGAATTTAT--CATA------AAGG------TCAAGGT---CAGTGTCATTCCA-AAA--AAAG-------TGTATG-G-GT--TT-AAGAATTAGTACTA---GTT-A--CA-CGA-TAT-AG-GTTCAA--A-T--TCGGT-GACT-C-----CTG-GA-CAAA-----ACA-TTTCTGA-TAAAAAGAATTTAAC---A----CAAA--------AACCTAA----CGCTTTATTATACGCCA-A--GATT-A---AGGT------CGAGGTCA-CCC--A-AGTTATGCTGCATGGTTTTAAGTAACACCAAGCATTACACTACTcaaaaatgtaattaccagaaaagtaaca
gi|8 : TGAGAATGCTAAGAATAA-----A-AT-AA--TTA--TTG----GTTACGCTTAAACGTTAAAAATTATGTACCAAT--TTTAGT-GACTCT--GTTCGAA-AAGTATTTA---A----AAGAAATGGAGC--TAAACGC-AAGA--Agagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaaattatgtaccaattttagtgactctgttcgaaaagtatttaaaagaaatggagctaaacgcaagaaggtattatatttcaacaaacgct
gi|8 : caaacagtttctaaaaaatagtgctaagcttataatgtttacatgtttaggcaaatgaatttatcataaaggtcaaggtcagtgtcattccaaaaaaagtgtatgggtttaagaattagtactagttacacgatataggttcaaattcggtgactcctggacaaaacatttctgataaaaagaatttaacacaaaaacctaacgctttattatacgccaagattaaggtcgaggtcacccaagttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactacA-AT---TATGTACCAA-T-TTTAGT----GACTC-TGT--TCG---AAAAGTATT--T-AAAAG--AAATGGAG--CTAAACGC-AAGA-Aggtattatatttcaacaaacgct
gi|9 : caaacagtttctaaaaaatagtgctaagcttataatgtttacatgtttaggcaaatgaatttatcataaaggtcaaggtcagtgtcattccaaaaaaagtgtatgggtttaagaattagtactagttacacgatataggttcaaattcggtgactcctggacaaaacatttctgataaaaagaatttaacacaaaaacctaacgctttattatacgccaagattaaggtcgaggtcacccaagttatgctgcatggttttaagtaacaccaagcattacactactgagaatgctaagaataaaataattattggttacgcttaaacgttaaaTTTATCAC--AATGTGAG---GCTACAAATAATTCTAATAC-AG--CTA--TCA----ACTACAC------------AACTGCTGACGACA--TTTGAT-GACTTTT-GA-CAAA-CAAT--TTGTTTA----AGGAAATTGATC--TTTACCC-AAAA--ACTTA----TC------ATCTTGTA--A--GTCAA------CAAATCATTTGTA-ATG------GTCAAGATGAT-T---GAA----A-------AC--------T--TTC------T-------A----TA--GTTTTTGGT------ATT---A-C-TACCCATAATA----CA-AT---CATGGACCAA-G--TCGGTA---GGCTC-TGGGAAAA---AACA----T--T-AAAAG--AAACCGAG--CTAGACAC-A-------CC--A-ACATGTTATTA-A---T-AA-----GTT--AAT--TA--T-TT-GTAAAGGT------TGAA--GT-AA-Tggtattatatttcaacaaacgct
gi|9 : TA--CCC----ATAATAC------------AATCATGGACCAAG--TC-GGTAGGCTCT--GGGAAAA-AACA--TTA---A----AAGAAACCGAGC--TAGACAC----A--CC--A----AC------ATGTTATT--A--AT-AAG-----TTAATTATTTGTA-AAG------GTTGAAGTAAT-------ATTTTA-------CA--------A--TGT------TGGCATCAT----TAT-G-----AGT------AGT---T-G-TACACCTAACT----CA-AC---TATGGattttacaatgttggcatcattatgagtagttgtacacctaactcaactatgg